#################### Description of files #################### 48-plex_assemblies: contig sequences for 48 assemblies generated from Microbial Assembly application in SMRT Link 48-plex_bam: bam files for 48 sets of subreads 48-plex_sequences: fastq files for 48 sets of subreads 48-plex_demux_and_assembly_stats.tsv: summary table of statistics for 48 demultiplexed and assembled datasets 48-plex_sample_list.tsv: list of 48 barcodes and microbes sequenced for this dataset ############## Directory tree ############## . ├── 48-plex_assemblies │   ├── bc1018_assembly.fsa.gz │   ├── bc1019_assembly.fsa.gz │   ├── bc1031_assembly.fsa.gz │   ├── bc1034_assembly.fsa.gz │   ├── bc1037_assembly.fsa.gz │   ├── bc1040_assembly.fsa.gz │   ├── bc1043_assembly.fsa.gz │   ├── bc1044_assembly.fsa.gz │   ├── bc1046_assembly.fsa.gz │   ├── bc1047_assembly.fsa.gz │   ├── bc1050_assembly.fsa.gz │   ├── bc1052_assembly.fsa.gz │   ├── bc1053_assembly.fsa.gz │   ├── bc1054_assembly.fsa.gz │   ├── bc1055_assembly.fsa.gz │   ├── bc1058_assembly.fsa.gz │   ├── bc1059_assembly.fsa.gz │   ├── bc1060_assembly.fsa.gz │   ├── bc1061_assembly.fsa.gz │   ├── bc1062_assembly.fsa.gz │   ├── bc1065_assembly.fsa.gz │   ├── bc1066_assembly.fsa.gz │   ├── bc1068_assembly.fsa.gz │   ├── bc1070_assembly.fsa.gz │   ├── bc1074_assembly.fsa.gz │   ├── bc1076_assembly.fsa.gz │   ├── bc1077_assembly.fsa.gz │   ├── bc1078_assembly.fsa.gz │   ├── bc1079_assembly.fsa.gz │   ├── bc1081_assembly.fsa.gz │   ├── bc1082_assembly.fsa.gz │   ├── bc1083_assembly.fsa.gz │   ├── bc1084_assembly.fsa.gz │   ├── bc1087_assembly.fsa.gz │   ├── bc1091_assembly.fsa.gz │   ├── bc1092_assembly.fsa.gz │   ├── bc1094_assembly.fsa.gz │   ├── bc1095_assembly.fsa.gz │   ├── bc1099_assembly.fsa.gz │   ├── bc1101_assembly.fsa.gz │   ├── bc1102_assembly.fsa.gz │   ├── bc1106_assembly.fsa.gz │   ├── bc1109_assembly.fsa.gz │   ├── bc1111_assembly.fsa.gz │   ├── bc1117_assembly.fsa.gz │   ├── bc1118_assembly.fsa.gz │   ├── bc1119_assembly.fsa.gz │   └── bc1126_assembly.fsa.gz ├── 48-plex_bam │   ├── lima.bc1018--bc1018.bam │   ├── lima.bc1018--bc1018.bam.pbi │   ├── lima.bc1019--bc1019.bam │   ├── lima.bc1019--bc1019.bam.pbi │   ├── lima.bc1031--bc1031.bam │   ├── lima.bc1031--bc1031.bam.pbi │   ├── lima.bc1034--bc1034.bam │   ├── lima.bc1034--bc1034.bam.pbi │   ├── lima.bc1037--bc1037.bam │   ├── lima.bc1037--bc1037.bam.pbi │   ├── lima.bc1040--bc1040.bam │   ├── lima.bc1040--bc1040.bam.pbi │   ├── lima.bc1043--bc1043.bam │   ├── lima.bc1043--bc1043.bam.pbi │   ├── lima.bc1044--bc1044.bam │   ├── lima.bc1044--bc1044.bam.pbi │   ├── lima.bc1046--bc1046.bam │   ├── lima.bc1046--bc1046.bam.pbi │   ├── lima.bc1047--bc1047.bam │   ├── lima.bc1047--bc1047.bam.pbi │   ├── lima.bc1050--bc1050.bam │   ├── lima.bc1050--bc1050.bam.pbi │   ├── lima.bc1052--bc1052.bam │   ├── lima.bc1052--bc1052.bam.pbi │   ├── lima.bc1053--bc1053.bam │   ├── lima.bc1053--bc1053.bam.pbi │   ├── lima.bc1054--bc1054.bam │   ├── lima.bc1054--bc1054.bam.pbi │   ├── lima.bc1055--bc1055.bam │   ├── lima.bc1055--bc1055.bam.pbi │   ├── lima.bc1058--bc1058.bam │   ├── lima.bc1058--bc1058.bam.pbi │   ├── lima.bc1059--bc1059.bam │   ├── lima.bc1059--bc1059.bam.pbi │   ├── lima.bc1060--bc1060.bam │   ├── lima.bc1060--bc1060.bam.pbi │   ├── lima.bc1061--bc1061.bam │   ├── lima.bc1061--bc1061.bam.pbi │   ├── lima.bc1062--bc1062.bam │   ├── lima.bc1062--bc1062.bam.pbi │   ├── lima.bc1065--bc1065.bam │   ├── lima.bc1065--bc1065.bam.pbi │   ├── lima.bc1066--bc1066.bam │   ├── lima.bc1066--bc1066.bam.pbi │   ├── lima.bc1068--bc1068.bam │   ├── lima.bc1068--bc1068.bam.pbi │   ├── lima.bc1070--bc1070.bam │   ├── lima.bc1070--bc1070.bam.pbi │   ├── lima.bc1074--bc1074.bam │   ├── lima.bc1074--bc1074.bam.pbi │   ├── lima.bc1076--bc1076.bam │   ├── lima.bc1076--bc1076.bam.pbi │   ├── lima.bc1077--bc1077.bam │   ├── lima.bc1077--bc1077.bam.pbi │   ├── lima.bc1078--bc1078.bam │   ├── lima.bc1078--bc1078.bam.pbi │   ├── lima.bc1079--bc1079.bam │   ├── lima.bc1079--bc1079.bam.pbi │   ├── lima.bc1081--bc1081.bam │   ├── lima.bc1081--bc1081.bam.pbi │   ├── lima.bc1082--bc1082.bam │   ├── lima.bc1082--bc1082.bam.pbi │   ├── lima.bc1083--bc1083.bam │   ├── lima.bc1083--bc1083.bam.pbi │   ├── lima.bc1084--bc1084.bam │   ├── lima.bc1084--bc1084.bam.pbi │   ├── lima.bc1087--bc1087.bam │   ├── lima.bc1087--bc1087.bam.pbi │   ├── lima.bc1091--bc1091.bam │   ├── lima.bc1091--bc1091.bam.pbi │   ├── lima.bc1092--bc1092.bam │   ├── lima.bc1092--bc1092.bam.pbi │   ├── lima.bc1094--bc1094.bam │   ├── lima.bc1094--bc1094.bam.pbi │   ├── lima.bc1095--bc1095.bam │   ├── lima.bc1095--bc1095.bam.pbi │   ├── lima.bc1099--bc1099.bam │   ├── lima.bc1099--bc1099.bam.pbi │   ├── lima.bc1101--bc1101.bam │   ├── lima.bc1101--bc1101.bam.pbi │   ├── lima.bc1102--bc1102.bam │   ├── lima.bc1102--bc1102.bam.pbi │   ├── lima.bc1106--bc1106.bam │   ├── lima.bc1106--bc1106.bam.pbi │   ├── lima.bc1109--bc1109.bam │   ├── lima.bc1109--bc1109.bam.pbi │   ├── lima.bc1111--bc1111.bam │   ├── lima.bc1111--bc1111.bam.pbi │   ├── lima.bc1117--bc1117.bam │   ├── lima.bc1117--bc1117.bam.pbi │   ├── lima.bc1118--bc1118.bam │   ├── lima.bc1118--bc1118.bam.pbi │   ├── lima.bc1119--bc1119.bam │   ├── lima.bc1119--bc1119.bam.pbi │   ├── lima.bc1126--bc1126.bam │   └── lima.bc1126--bc1126.bam.pbi ├── 48-plex_demux_and_assembly_stats.tsv ├── 48-plex_sample_list.tsv └── 48-plex_sequences    ├── lima.bc1018--bc1018.subreadset.fastq.gz    ├── lima.bc1019--bc1019.subreadset.fastq.gz    ├── lima.bc1031--bc1031.subreadset.fastq.gz ├── lima.bc1034--bc1034.subreadset.fastq.gz    ├── lima.bc1037--bc1037.subreadset.fastq.gz    ├── lima.bc1040--bc1040.subreadset.fastq.gz    ├── lima.bc1043--bc1043.subreadset.fastq.gz    ├── lima.bc1044--bc1044.subreadset.fastq.gz    ├── lima.bc1046--bc1046.subreadset.fastq.gz    ├── lima.bc1047--bc1047.subreadset.fastq.gz    ├── lima.bc1050--bc1050.subreadset.fastq.gz     ├── lima.bc1052--bc1052.subreadset.fastq.gz    ├── lima.bc1053--bc1053.subreadset.fastq.gz    ├── lima.bc1054--bc1054.subreadset.fastq.gz    ├── lima.bc1055--bc1055.subreadset.fastq.gz    ├── lima.bc1058--bc1058.subreadset.fastq.gz    ├── lima.bc1059--bc1059.subreadset.fastq.gz    ├── lima.bc1060--bc1060.subreadset.fastq.gz    ├── lima.bc1061--bc1061.subreadset.fastq.gz    ├── lima.bc1062--bc1062.subreadset.fastq.gz    ├── lima.bc1065--bc1065.subreadset.fastq.gz    ├── lima.bc1066--bc1066.subreadset.fastq.gz    ├── lima.bc1068--bc1068.subreadset.fastq.gz    ├── lima.bc1070--bc1070.subreadset.fastq.gz    ├── lima.bc1074--bc1074.subreadset.fastq.gz    ├── lima.bc1076--bc1076.subreadset.fastq.gz    ├── lima.bc1077--bc1077.subreadset.fastq.gz    ├── lima.bc1078--bc1078.subreadset.fastq.gz    ├── lima.bc1079--bc1079.subreadset.fastq.gz    ├── lima.bc1081--bc1081.subreadset.fastq.gz    ├── lima.bc1082--bc1082.subreadset.fastq.gz    ├── lima.bc1083--bc1083.subreadset.fastq.gz    ├── lima.bc1084--bc1084.subreadset.fastq.gz    ├── lima.bc1087--bc1087.subreadset.fastq.gz    ├── lima.bc1091--bc1091.subreadset.fastq.gz    ├── lima.bc1092--bc1092.subreadset.fastq.gz    ├── lima.bc1094--bc1094.subreadset.fastq.gz    ├── lima.bc1095--bc1095.subreadset.fastq.gz    ├── lima.bc1099--bc1099.subreadset.fastq.gz    ├── lima.bc1101--bc1101.subreadset.fastq.gz     ├── lima.bc1102--bc1102.subreadset.fastq.gz    ├── lima.bc1106--bc1106.subreadset.fastq.gz    ├── lima.bc1109--bc1109.subreadset.fastq.gz    ├── lima.bc1111--bc1111.subreadset.fastq.gz    ├── lima.bc1117--bc1117.subreadset.fastq.gz    ├── lima.bc1118--bc1118.subreadset.fastq.gz    ├── lima.bc1119--bc1119.subreadset.fastq.gz    └── lima.bc1126--bc1126.subreadset.fastq.gz