isoform chrom strand length exons structural_category associated_gene associated_transcript ref_length ref_exons diff_to_TSS diff_to_TTS diff_to_gene_TSS diff_to_gene_TTS subcategory RTS_stage all_canonical min_sample_cov min_cov min_cov_pos sd_cov FL.BioSample_6 FL_TPM.BioSample_6 FL_TPM.BioSample_6_log10 n_indels n_indels_junc bite iso_exp gene_exp ratio_exp FSM_class coding ORF_length CDS_length CDS_start CDS_end CDS_genomic_start CDS_genomic_end predicted_NMD perc_A_downstream_TTS seq_A_downstream_TTS dist_to_CAGE_peak within_CAGE_peak dist_to_polyA_site within_polyA_site polyA_motif polyA_dist polyA_motif_found ORF_seq ratio_TSS fl_assoc cell_barcodes PB.1.2 chr1 - 3406 8 novel_not_in_catalog WASH7P novel 1351 11 NA NA 9186 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA 8972 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.1.3 chr1 - 3150 11 novel_not_in_catalog WASH7P novel 1351 11 NA NA 9085 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA 8871 FALSE NA NA TTTAAA -30 NA NA NA 2 NA PB.1.4 chr1 - 1611 10 novel_not_in_catalog WASH7P novel 1351 11 NA NA 214 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.1.5 chr1 - 1703 11 novel_not_in_catalog WASH7P novel 1351 11 NA NA 220 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.150575 0.711856 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAACCAACAGTGTGCTTTT 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 21 NA PB.1.6 chr1 - 1463 9 novel_not_in_catalog WASH7P novel 1351 11 NA NA 206 -5 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAAACCAACAGTGTGCTTT -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.1.7 chr1 - 942 6 novel_not_in_catalog WASH7P novel 1351 11 NA NA 211 -2040 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGAGCTCTGGACTTCTCAC -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.3.3 chr1 - 1979 10 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -4464 299 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AACAGTGTGCTTTTAATAAA -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.3.4 chr1 - 1186 7 incomplete-splice_match WASH9P ENST00000623083.4 1397 10 7248 -299 7248 299 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AACAGTGTGCTTTTAATAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.3.5 chr1 - 1061 6 incomplete-splice_match WASH9P ENST00000623083.4 1397 10 7612 -299 7612 299 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AACAGTGTGCTTTTAATAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.3.6 chr1 - 2211 11 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -4940 294 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.3.7 chr1 - 1951 10 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -4458 294 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.3.14 chr1 - 1460 9 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -4455 294 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.3.15 chr1 - 1432 9 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -4464 294 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.3.16 chr1 - 1328 8 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA 6925 294 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.3.18 chr1 - 971 5 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA 7870 294 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.3.19 chr1 - 1741 11 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -4458 292 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAAACCAACAGTGTGCTTT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.3.20 chr1 - 1646 10 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -4464 292 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAAACCAACAGTGTGCTTT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.3.21 chr1 - 1554 10 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -4452 292 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAAACCAACAGTGTGCTTT 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.3.22 chr1 - 1589 10 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA 83 292 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAAACCAACAGTGTGCTTT 4544 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.3.24 chr1 - 1428 9 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -4450 291 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 CAGAAACCAACAGTGTGCTT 11 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.4.1 chr1 + 1243 2 antisense novelGene_ENSG00000228463_AS novel NA NA NA NA NA NA multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AACAAGAAAAGTCTTTTCTG NA FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 5 NA PB.13.1 chr1 + 1231 2 full-splice_match ENSG00000236601 ENST00000635159.1 994 2 -258 21 -258 -21 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAATAAATAACATCGACATT NA FALSE NA NA AATACA -17 NA NA NA 2 NA PB.13.2 chr1 + 967 2 full-splice_match ENSG00000236601 ENST00000635159.1 994 2 5 22 5 -22 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 TAAATAAATAACATCGACAT NA FALSE NA NA AATACA -16 NA NA NA 2 NA PB.14.7 chr1 + 1488 5 full-splice_match LINC01128 ENST00000445118.7 6616 5 69 5059 0 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGTGAGGTACAATAGCTATT 1 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.14.8 chr1 + 1012 3 full-splice_match LINC01128 ENST00000669922.1 5441 3 64 4365 0 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTGATGGCCTCTGTTGTT 1 TRUE NA NA AATGAA -45 NA NA NA 5 NA PB.15.1 chr1 - 1009 5 fusion ENSG00000230092_LINC00115 novel 872 5 NA NA 0 441 multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TTTATAGTAGAATGATTTAT -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.15.3 chr1 - 1691 2 fusion ENSG00000230092_LINC00115 novel 872 5 NA NA 0 9659 multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TAAAAAATGTTTCATCTACT -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.15.4 chr1 - 1294 1 full-splice_match LINC00115 ENST00000473798.1 1317 1 16 7 16 -7 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 19 4.660044 0.668390 NA NA NA NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGATATTTCCAAAGCTCA 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.17.1 chr1 - 1330 1 full-splice_match LINC02593 ENST00000609207.1 4152 1 2821 1 339 -1 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA NA NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATCTGATTACAGAGTCATTC 7417 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.18.2 chr1 + 1578 5 incomplete-splice_match SAMD11 ENST00000341065.8 2191 12 12002 1 148 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCCCGTGTCTACTGCCTCCC 1 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.19.2 chr1 - 2825 20 novel_not_in_catalog NOC2L novel 2757 19 NA NA -9 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.433716 0.535764 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTGGTGGCTCCTGGAGATT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.19.3 chr1 - 2775 19 full-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 -19 1 -19 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 422 103.502022 2.014949 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTGGTGGCTCCTGGAGATT -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 422 NA PB.19.4 chr1 - 2511 17 novel_in_catalog NOC2L novel 4201 17 NA NA 1250 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTGGTGGCTCCTGGAGATT 9771 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.19.5 chr1 - 2316 16 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 2301 1 1503 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTGGTGGCTCCTGGAGATT 9990 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.19.6 chr1 - 976 5 full-splice_match NOC2L ENST00000483767.5 1611 5 635 0 635 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTGGTGGCTCCTGGAGATT 7354 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.19.7 chr1 - 788 3 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 13638 1 1442 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTGGTGGCTCCTGGAGATT 8161 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.19.8 chr1 - 2778 19 novel_in_catalog NOC2L novel 2757 19 NA NA -8 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 240 58.863708 1.769848 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAGTGGTGGCTCCTGGAGAT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 240 NA PB.19.9 chr1 - 2620 18 novel_in_catalog NOC2L novel 2757 19 NA NA -9 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAGTGGTGGCTCCTGGAGAT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.19.10 chr1 - 1423 8 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000477976.5 4201 17 7220 0 -4178 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAGTGGTGGCTCCTGGAGAT 9296 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.19.11 chr1 - 2780 19 novel_not_in_catalog NOC2L novel 2757 19 NA NA 0 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGAGTGGTGGCTCCTGGAGA 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.19.12 chr1 - 2765 19 novel_not_in_catalog NOC2L novel 2757 19 NA NA -20 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.697920 0.431029 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGAGTGGTGGCTCCTGGAGA -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.19.13 chr1 - 2368 16 novel_in_catalog NOC2L novel 4201 17 NA NA 1455 -10 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CCATTGTGTTGAGTGGTGGC 9976 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.19.14 chr1 - 2823 20 novel_not_in_catalog NOC2L novel 2757 19 NA NA 0 -7 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTGTGTTGAGTGGTGGCTCC 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.19.15 chr1 - 930 4 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 12969 9 773 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTGTGTTGAGTGGTGGCTCC 7492 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.19.16 chr1 - 4594 18 novel_in_catalog NOC2L novel 2757 19 NA NA -7 -8 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTGTGTTGAGTGGTGGCTC -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.19.17 chr1 - 2028 13 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000477976.5 4201 17 4396 8 4396 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTGTGTTGAGTGGTGGCTC 6472 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.19.18 chr1 - 1343 8 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 8075 10 -4121 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTGTGTTGAGTGGTGGCTC 9353 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.19.19 chr1 - 2721 19 novel_not_in_catalog NOC2L novel 2757 19 NA NA -2 -9 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CATTGTGTTGAGTGGTGGCT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.19.20 chr1 - 1174 6 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 11023 11 -1173 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.697920 0.431029 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CATTGTGTTGAGTGGTGGCT 5546 FALSE NA NA GGGGCT -4 NA NA NA 11 NA PB.19.21 chr1 - 1133 6 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000477976.5 4201 17 10281 9 -1117 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CATTGTGTTGAGTGGTGGCT 5602 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.19.22 chr1 - 823 3 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000483767.5 1611 5 1412 10 1412 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CATTGTGTTGAGTGGTGGCT 8131 FALSE NA NA GGGGCT -21 NA NA NA 4 NA PB.19.23 chr1 - 2833 18 novel_in_catalog NOC2L novel 2757 19 NA NA 0 -10 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CCATTGTGTTGAGTGGTGGC 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.19.24 chr1 - 2751 19 novel_not_in_catalog NOC2L novel 2757 19 NA NA 0 -10 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CCATTGTGTTGAGTGGTGGC 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.19.25 chr1 - 2408 17 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 2125 12 1327 -10 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.433716 0.535764 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CCATTGTGTTGAGTGGTGGC 9848 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.19.26 chr1 - 1968 13 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 5237 12 4439 -10 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.943186 0.468818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CCATTGTGTTGAGTGGTGGC 6515 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.19.27 chr1 - 1839 11 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 5969 13 5171 -11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.660044 0.668390 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCATTGTGTTGAGTGGTGG 7247 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.19.28 chr1 - 1657 10 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000477976.5 4201 17 5943 10 -5455 -10 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CCATTGTGTTGAGTGGTGGC 8019 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.19.29 chr1 - 1278 7 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000477976.5 4201 17 9877 11 -1521 -11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCATTGTGTTGAGTGGTGG 5198 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.19.30 chr1 - 2681 18 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 196 13 196 -11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCATTGTGTTGAGTGGTGG 7919 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.19.31 chr1 - 2486 17 novel_in_catalog NOC2L novel 2757 19 NA NA 0 -11 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCATTGTGTTGAGTGGTGG 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.19.32 chr1 - 2171 15 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 3112 13 2314 -11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCATTGTGTTGAGTGGTGG 4390 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.19.33 chr1 - 1537 9 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000477976.5 4201 17 6334 11 -5064 -11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCATTGTGTTGAGTGGTGG 8410 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.19.34 chr1 - 1432 9 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000477976.5 4201 17 6439 11 -4959 -11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCATTGTGTTGAGTGGTGG 8515 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.19.35 chr1 - 1482 9 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 7172 13 -5024 -11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCATTGTGTTGAGTGGTGG 8450 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.19.36 chr1 - 1067 5 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 12713 13 517 -11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.697920 0.431029 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCATTGTGTTGAGTGGTGG 7236 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.19.37 chr1 - 605 2 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 14180 13 1984 -11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCATTGTGTTGAGTGGTGG 8703 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.19.38 chr1 - 3184 19 novel_in_catalog NOC2L novel 2757 19 NA NA 0 -12 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGCCATTGTGTTGAGTGGTG 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.19.39 chr1 - 1852 11 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000477976.5 4201 17 5172 12 5172 -12 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGCCATTGTGTTGAGTGGTG 7248 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.19.40 chr1 - 2678 18 novel_in_catalog NOC2L novel 2757 19 NA NA 212 -13 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGGCCATTGTGTTGAGTGGT 7935 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.19.41 chr1 - 1631 10 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 6748 16 -5448 -14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.943186 0.468818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGGCCATTGTGTTGAGTGG 8026 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.19.45 chr1 - 853 2 full-splice_match NOC2L ENST00000469563.1 878 2 0 25 0 -25 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.395840 0.732059 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAGAAAAAGAAAGAAAT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 22 NA PB.20.1 chr1 + 2299 11 novel_in_catalog KLHL17 novel 2567 12 NA NA -9 -4 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CTCAGGCTGAGCATCTCTCT -27 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.20.3 chr1 + 1338 6 incomplete-splice_match KLHL17 ENST00000338591.8 2567 12 2598 4 -370 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CTCAGGCTGAGCATCTCTCT 2580 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.20.4 chr1 + 976 3 novel_in_catalog KLHL17 novel 913 6 NA NA 578 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGCTGAGCATCTCTCTCTG 3528 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.22.2 chr1 + 2492 16 novel_in_catalog PLEKHN1 novel 3176 16 NA NA -11 126 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAGAAGAGAAGAGAGAAG -27 TRUE NA NA AAAAAG -26 NA NA NA 3 NA PB.24.1 chr1 - 964 3 novel_in_catalog HES4 novel 885 4 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTCTGCGTCACGAGTTTTC -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.24.2 chr1 - 965 4 full-splice_match HES4 ENST00000304952.11 885 4 -81 1 -6 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAGTCTGCGTCACGAGTTT 634 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.24.3 chr1 - 884 4 full-splice_match HES4 ENST00000304952.11 885 4 0 1 0 1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.943186 0.468818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAGTCTGCGTCACGAGTTT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.24.4 chr1 - 788 3 full-splice_match HES4 ENST00000484667.2 667 3 -116 -5 0 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAGTCTGCGTCACGAGTTT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.25.3 chr1 + 628 2 full-splice_match ISG15 ENST00000649529.1 637 2 0 9 0 -9 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 37 9.074821 0.957838 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAGAGAAATGGCCGCCTCT 1 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 37 NA PB.26.2 chr1 + 4077 19 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 12572 4 -523 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 1509 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 6 NA PB.26.3 chr1 + 3918 18 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 12814 5 -281 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAAAGCATTGCTTTTGTCC 1751 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 3 NA PB.26.4 chr1 + 3747 16 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 13473 4 104 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 2410 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.26.5 chr1 + 3555 15 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 13753 4 384 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 7 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 6 NA PB.26.6 chr1 + 3159 13 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 14766 4 343 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 1020 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 6 NA PB.26.7 chr1 + 2972 12 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 15129 4 706 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 1383 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 9 NA PB.26.8 chr1 + 2745 11 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 15469 5 1046 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAAAGCATTGCTTTTGTCC 1723 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 10 NA PB.26.9 chr1 + 2557 11 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 15657 5 1234 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAAAGCATTGCTTTTGTCC 1911 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 3 NA PB.26.10 chr1 + 2456 10 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 15866 4 1443 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.697920 0.431029 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 2120 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 11 NA PB.26.11 chr1 + 2283 8 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 16331 4 -1549 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.943186 0.468818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 2585 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 12 NA PB.26.12 chr1 + 2145 8 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 16469 4 -1411 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.150575 0.711856 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 2723 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 21 NA PB.26.14 chr1 + 1948 6 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 17215 4 -665 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.169513 0.620085 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 3469 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 17 NA PB.26.15 chr1 + 1838 5 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 17408 4 -472 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 3662 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.26.16 chr1 + 1784 5 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 17462 4 -418 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 3716 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 8 NA PB.26.17 chr1 + 1694 4 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 17634 4 -246 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 29 7.112698 0.852034 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 3888 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 29 NA PB.26.18 chr1 + 1574 3 full-splice_match AGRN ENST00000461111.1 3385 3 1811 0 1811 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.433716 0.535764 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 5945 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 14 NA PB.26.19 chr1 + 1495 3 full-splice_match AGRN ENST00000461111.1 3385 3 1890 0 1890 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.433716 0.535764 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 6024 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 14 NA PB.26.20 chr1 + 1751 2 incomplete-splice_match AGRN ENST00000461111.1 3385 3 1906 0 1906 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 6040 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.26.22 chr1 + 1312 2 incomplete-splice_match AGRN ENST00000461111.1 3385 3 2543 0 2543 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.943186 0.468818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 6677 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 12 NA PB.28.1 chr1 - 1776 2 full-splice_match RNF223 ENST00000453464.3 1900 2 123 1 123 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATCTTTGGCAAGAGGGCCTC 122 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.28.2 chr1 - 1896 2 full-splice_match RNF223 ENST00000453464.3 1900 2 2 2 2 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CATCTTTGGCAAGAGGGCCT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.29.1 chr1 + 976 5 full-splice_match ENSG00000217801 ENST00000394517.7 1043 5 -41 108 -20 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TATAATAATGATGGATAATT 1213 FALSE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.29.2 chr1 + 848 4 full-splice_match ENSG00000217801 ENST00000456409.6 957 4 4 105 -3 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TATAATAATGATGGATAATT -7 TRUE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.29.3 chr1 + 986 4 novel_in_catalog ENSG00000217801 novel 1043 5 NA NA 0 -5 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TGAAACAGTTTGTGCCTTCA 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.29.4 chr1 + 938 4 full-splice_match ENSG00000217801 ENST00000456409.6 957 4 18 1 3 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTCTCTTGCCTCGGCACCT 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.30.1 chr1 - 1746 8 incomplete-splice_match C1orf159 ENST00000379319.5 1097 10 14515 -887 465 5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GAGCTGCTCTCTCCCGTAGG 8377 FALSE NA NA AATGAA -25 NA NA NA 2 NA PB.30.3 chr1 - 3206 9 novel_in_catalog C1orf159 novel 2099 12 NA NA -5 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGCTGCGTTCCGAGCTGCT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.30.4 chr1 - 2932 10 full-splice_match C1orf159 ENST00000482816.5 982 10 151 -2101 -3 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGCTGCGTTCCGAGCTGCT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.30.5 chr1 - 2279 10 novel_in_catalog C1orf159 novel 2099 12 NA NA -5 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGCTGCGTTCCGAGCTGCT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.30.6 chr1 - 2013 11 full-splice_match C1orf159 ENST00000379325.7 2010 11 -5 2 -5 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGCTGCGTTCCGAGCTGCT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.30.7 chr1 - 1945 9 novel_in_catalog C1orf159 novel 2099 12 NA NA -12 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGCTGCGTTCCGAGCTGCT -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.30.8 chr1 - 1839 10 full-splice_match C1orf159 ENST00000421241.7 1832 10 -9 2 -3 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 70 17.168583 1.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGCTGCGTTCCGAGCTGCT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 70 NA PB.30.10 chr1 - 1725 9 novel_in_catalog C1orf159 novel 2099 12 NA NA -2 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGCTGCGTTCCGAGCTGCT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.30.11 chr1 - 1545 7 novel_in_catalog C1orf159 novel 2099 12 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGCTGCGTTCCGAGCTGCT 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.31.1 chr1 - 1151 4 novel_in_catalog TNFRSF18 novel 1083 5 NA NA -4 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACCTGAGTGGATGCATGCTG -20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.31.2 chr1 - 1069 5 full-splice_match TNFRSF18 ENST00000379268.7 1083 5 13 1 -8 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 44 10.791680 1.033089 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACCTGAGTGGATGCATGCTG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 44 NA PB.31.3 chr1 - 1055 5 full-splice_match TNFRSF18 ENST00000379265.5 705 5 -15 -335 6 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACCTGAGTGGATGCATGCTG -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.31.4 chr1 - 1232 5 full-splice_match TNFRSF18 ENST00000379268.7 1083 5 -151 2 -151 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GACCTGAGTGGATGCATGCT 7409 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.31.5 chr1 - 1293 4 full-splice_match TNFRSF18 ENST00000486728.5 727 4 -232 -334 -232 -2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GACCTGAGTGGATGCATGCT 8240 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.31.6 chr1 - 1129 3 novel_not_in_catalog TNFRSF18 novel 1083 5 NA NA 9 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GACCTGAGTGGATGCATGCT -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.31.7 chr1 - 1091 5 novel_not_in_catalog TNFRSF18 novel 1083 5 NA NA 5 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GACCTGAGTGGATGCATGCT 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.33.1 chr1 - 2236 7 novel_not_in_catalog SDF4 novel 2137 7 NA NA 71 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTCTTTGGGCGTGAAACAA 9039 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.33.2 chr1 - 2061 7 novel_not_in_catalog SDF4 novel 2137 7 NA NA 5 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 24 5.886371 0.769848 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTCTTTGGGCGTGAAACAA -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 24 NA PB.33.3 chr1 - 1821 6 incomplete-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 3079 -22 -326 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.697920 0.431029 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTCTTTGGGCGTGAAACAA 8911 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.33.5 chr1 - 1420 6 incomplete-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 3480 -22 75 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 25 6.131637 0.787576 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTCTTTGGGCGTGAAACAA 9312 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 25 NA PB.33.6 chr1 - 1205 4 incomplete-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 8668 -22 -1982 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.924247 0.593756 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTCTTTGGGCGTGAAACAA 8728 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.33.7 chr1 - 2012 7 full-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 -64 -15 2 -7 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 703 172.421616 2.236592 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGCTTCATTCTTTGGGCGT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 703 NA PB.33.8 chr1 - 2173 7 full-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 -224 -16 -158 -6 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTTCATTCTTTGGGCGTG 8711 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.33.10 chr1 - 2039 7 novel_not_in_catalog SDF4 novel 2137 7 NA NA 2 -6 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTTCATTCTTTGGGCGTG -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.33.11 chr1 - 2100 6 novel_in_catalog SDF4 novel 1933 7 NA NA 14 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTTCATTCTTTGGGCGTG -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.33.12 chr1 - 1938 7 full-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 5 -10 5 10 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 27 6.622167 0.821000 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGGTCAGCTTCATTCTTTG -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 27 NA PB.33.14 chr1 - 1845 7 novel_not_in_catalog SDF4 novel 1933 7 NA NA -15 -6 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTTCATTCTTTGGGCGTG 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.33.15 chr1 - 1108 3 full-splice_match SDF4 ENST00000494748.1 3516 3 2425 -17 1367 -6 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTTCATTCTTTGGGCGTG 9921 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.33.17 chr1 - 793 2 full-splice_match SDF4 ENST00000478938.1 2591 2 1817 -19 1817 -6 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTTCATTCTTTGGGCGTG 1017 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.33.18 chr1 - 1300 5 incomplete-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 8089 -12 -2561 -10 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 55 13.489600 1.129999 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGTCAGCTTCATTCTTTGGG 8149 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 55 NA PB.33.19 chr1 - 1504 5 novel_not_in_catalog SDF4 novel 1933 7 NA NA 5 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTGCCTTTTTTGGTCAGC -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.33.20 chr1 - 2669 3 full-splice_match SDF4 ENST00000494748.1 3516 3 841 6 -217 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATAGTTGCCTTTTTTG 8337 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.33.21 chr1 - 2089 7 full-splice_match SDF4 ENST00000263741.12 2079 7 -17 7 -17 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATAGTTGCCTTTTTTG -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.33.22 chr1 - 1996 7 novel_in_catalog SDF4 novel 2095 7 NA NA 12 -4 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATAGTTGCCTTTTTTG 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.33.23 chr1 - 2028 7 novel_in_catalog SDF4 novel 1933 7 NA NA 6 -4 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATAGTTGCCTTTTTTG 8911 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.33.25 chr1 - 1855 7 full-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 71 7 38 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 52 12.753804 1.105640 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATAGTTGCCTTTTTTG 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 52 NA PB.33.26 chr1 - 1638 6 incomplete-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 3233 7 -172 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.678982 0.565728 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATAGTTGCCTTTTTTG 9065 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.33.27 chr1 - 1496 6 incomplete-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 3375 7 -30 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.395840 0.732059 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATAGTTGCCTTTTTTG 9207 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 22 NA PB.33.28 chr1 - 1436 6 novel_in_catalog SDF4 novel 1933 7 NA NA 11 -4 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATAGTTGCCTTTTTTG -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.33.29 chr1 - 1376 3 full-splice_match SDF4 ENST00000494748.1 3516 3 2134 6 1076 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATAGTTGCCTTTTTTG 9630 FALSE NA NA AATACA -37 NA NA NA 4 NA PB.33.30 chr1 - 1148 3 full-splice_match SDF4 ENST00000494748.1 3516 3 2362 6 1304 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATAGTTGCCTTTTTTG 9858 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.33.31 chr1 - 960 3 full-splice_match SDF4 ENST00000494748.1 3516 3 2550 6 1492 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.697920 0.431029 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATAGTTGCCTTTTTTG 9911 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.33.32 chr1 - 941 2 incomplete-splice_match SDF4 ENST00000465727.5 2095 7 13500 7 1762 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATAGTTGCCTTTTTTG 962 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.33.33 chr1 - 868 2 full-splice_match SDF4 ENST00000478938.1 2591 2 1718 5 1718 -5 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.188451 0.503580 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAATATAGTTGCCTTTTTT 918 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.33.34 chr1 - 1834 7 full-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 -44 143 -14 -140 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAATGAGTAGCCAGGAAGTT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.33.35 chr1 - 1100 6 incomplete-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 0 1602 0 -10 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAGACAGAAAAAAGGAGTT -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.34.1 chr1 + 2777 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 22 6 22 -6 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACAAAGCCTGCCCCAGGCT 7 TRUE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 3 NA PB.34.2 chr1 + 1853 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 89 863 89 -863 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAGCTCCCTGGAGTCCGACG 74 FALSE NA NA AGTAAA -32 NA NA NA 5 NA PB.34.3 chr1 + 1382 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 108 1315 108 -1315 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAAGTTGGCAGTGCGCACGT 93 FALSE NA NA TATAAA -26 NA NA NA 8 NA PB.34.4 chr1 + 1266 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 212 1327 212 -1327 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGTCGATGAGTGTAAGTTGG 197 FALSE NA NA TATAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.34.5 chr1 + 2488 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 311 6 311 -6 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACAAAGCCTGCCCCAGGCT 296 FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 5 NA PB.34.6 chr1 + 1604 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 339 862 339 -862 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTCCCTGGAGTCCGACGC 324 FALSE NA NA AGTAAA -33 NA NA NA 8 NA PB.34.7 chr1 + 1138 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 344 1323 344 -1323 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GATGAGTGTAAGTTGGCAGT 329 FALSE NA NA TATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.34.8 chr1 + 1523 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 420 862 420 -862 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTCCCTGGAGTCCGACGC 405 FALSE NA NA AGTAAA -33 NA NA NA 3 NA PB.34.9 chr1 + 1316 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 623 866 623 -866 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATGAGCTCCCTGGAGTCCG 608 FALSE NA NA AGTAAA -29 NA NA NA 4 NA PB.34.10 chr1 + 1194 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 748 863 748 -863 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAGCTCCCTGGAGTCCGACG 733 FALSE NA NA AGTAAA -32 NA NA NA 2 NA PB.34.11 chr1 + 1962 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 837 6 837 -6 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACAAAGCCTGCCCCAGGCT 822 FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 5 NA PB.34.12 chr1 + 1726 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 1074 5 1074 -5 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACAAAGCCTGCCCCAGGCTG 1059 FALSE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 5 NA PB.34.13 chr1 + 1514 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 1285 6 1285 -6 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACAAAGCCTGCCCCAGGCT 1270 FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 8 NA PB.34.14 chr1 + 1397 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 1402 6 1402 -6 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACAAAGCCTGCCCCAGGCT 1387 FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 10 NA PB.34.15 chr1 + 1215 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 1588 2 1588 -2 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCCTGCCCCAGGCTGACC 1573 FALSE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.34.16 chr1 + 868 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 1931 6 1931 -6 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACAAAGCCTGCCCCAGGCT 1916 FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 3 NA PB.35.1 chr1 - 2080 5 novel_in_catalog UBE2J2 novel 2387 7 NA NA 1 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTTCATGCTGCTTGTGTC -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.35.2 chr1 - 2040 6 incomplete-splice_match UBE2J2 ENST00000349431.11 2260 7 5897 -4 -4388 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATGCTGCTTGTGTCTGTGTG 5887 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.35.3 chr1 - 2374 8 full-splice_match UBE2J2 ENST00000464036.5 1256 8 21 -1139 1 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CATGCTGCTTGTGTCTGTGT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.35.4 chr1 - 2562 7 full-splice_match UBE2J2 ENST00000435198.5 1056 7 -25 -1481 -5 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTTCATGCTGCTTGTGTC -25 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.35.5 chr1 - 2480 8 novel_in_catalog UBE2J2 novel 1256 8 NA NA 0 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTTCATGCTGCTTGTGTC -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.35.6 chr1 - 2425 8 full-splice_match UBE2J2 ENST00000450390.6 2455 8 25 5 -1 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTTCATGCTGCTTGTGTC 16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.35.7 chr1 - 2419 7 full-splice_match UBE2J2 ENST00000360466.6 1047 7 -122 -1250 1 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTTCATGCTGCTTGTGTC -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.35.8 chr1 - 2388 7 full-splice_match UBE2J2 ENST00000347370.6 2387 7 -1 0 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTTCATGCTGCTTGTGTC -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.35.9 chr1 - 2173 6 novel_in_catalog UBE2J2 novel 2260 7 NA NA -1 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTTCATGCTGCTTGTGTC -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.35.10 chr1 - 2146 7 novel_not_in_catalog UBE2J2 novel 2260 7 NA NA -2 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTTCATGCTGCTTGTGTC -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.35.11 chr1 - 1956 5 novel_not_in_catalog UBE2J2 novel 2387 7 NA NA -2357 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTTCATGCTGCTTGTGTC 9205 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.35.16 chr1 - 3044 7 novel_in_catalog UBE2J2 novel 2260 7 NA NA -1 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATTTCATGCTGCTTGTGT 16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.35.17 chr1 - 2246 7 full-splice_match UBE2J2 ENST00000349431.11 2260 7 11 3 1 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 94 23.054953 1.362764 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATTTCATGCTGCTTGTGT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 94 NA PB.35.18 chr1 - 2114 6 full-splice_match UBE2J2 ENST00000400929.6 1057 6 12 -1069 1 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.188451 0.503580 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGAATTTCATGCTGCTTGTG 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.35.20 chr1 - 1237 4 incomplete-splice_match UBE2J2 ENST00000400929.6 1057 6 16218 -84 -1302 84 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TTAGATGTGGTCACTTAGAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.35.21 chr1 - 1559 7 full-splice_match UBE2J2 ENST00000435198.5 1056 7 -10 -493 0 83 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTAGATGTGGTCACTTAGA -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.35.22 chr1 - 1457 8 full-splice_match UBE2J2 ENST00000450390.6 2455 8 5 993 1 83 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTAGATGTGGTCACTTAGA -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.35.23 chr1 - 1420 7 full-splice_match UBE2J2 ENST00000360466.6 1047 7 -111 -262 0 83 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.924247 0.593756 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTAGATGTGGTCACTTAGA 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.35.24 chr1 - 1382 7 full-splice_match UBE2J2 ENST00000473215.5 1028 7 12 -366 0 83 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 20 4.905309 0.690666 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTAGATGTGGTCACTTAGA 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 20 NA PB.35.25 chr1 - 1266 7 full-splice_match UBE2J2 ENST00000349431.11 2260 7 4 990 -1 83 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 342 83.880783 1.923663 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTAGATGTGGTCACTTAGA -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 342 NA PB.35.26 chr1 - 1218 6 novel_in_catalog UBE2J2 novel 2260 7 NA NA 1 83 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTAGATGTGGTCACTTAGA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.35.27 chr1 - 1192 7 novel_not_in_catalog UBE2J2 novel 2260 7 NA NA 1 83 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTAGATGTGGTCACTTAGA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.35.28 chr1 - 1178 6 novel_in_catalog UBE2J2 novel 2260 7 NA NA 1 83 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTAGATGTGGTCACTTAGA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.35.29 chr1 - 2062 7 novel_in_catalog UBE2J2 novel 2260 7 NA NA -1 82 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATTAGATGTGGTCACTTAG 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.35.30 chr1 - 1876 7 novel_not_in_catalog UBE2J2 novel 2260 7 NA NA -2 82 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATTAGATGTGGTCACTTAG -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.35.31 chr1 - 1491 8 novel_in_catalog UBE2J2 novel 1256 8 NA NA 0 82 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATTAGATGTGGTCACTTAG -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.35.32 chr1 - 1416 8 novel_not_in_catalog UBE2J2 novel 2455 8 NA NA 1 82 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATTAGATGTGGTCACTTAG -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.35.33 chr1 - 1406 8 novel_not_in_catalog UBE2J2 novel 2455 8 NA NA 1 82 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATTAGATGTGGTCACTTAG -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.35.34 chr1 - 1374 8 full-splice_match UBE2J2 ENST00000464036.5 1256 8 27 -145 0 82 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.678982 0.565728 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATTAGATGTGGTCACTTAG 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.35.35 chr1 - 1331 8 full-splice_match UBE2J2 ENST00000400930.8 1021 8 -35 -275 -4 82 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATTAGATGTGGTCACTTAG -24 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.35.37 chr1 - 1117 6 full-splice_match UBE2J2 ENST00000400929.6 1057 6 22 -82 0 82 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 25 6.131637 0.787576 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATTAGATGTGGTCACTTAG 11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 25 NA PB.35.38 chr1 - 1086 5 novel_in_catalog UBE2J2 novel 1057 6 NA NA 1 82 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATTAGATGTGGTCACTTAG 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.36.1 chr1 + 1661 10 incomplete-splice_match SCNN1D ENST00000325425.12 2679 15 5043 0 43 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCTGGCGGCCAGTGTGTGC 3150 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.37.1 chr1 - 2775 12 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 844 -493 130 13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GCTCCCGTGCCTTGCTCTGC 9924 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.37.4 chr1 - 2928 14 full-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 281 -484 281 4 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TGCTCCTGGGCTCCCGTGCC 9361 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.37.5 chr1 - 1350 2 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 5106 -484 1159 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TGCTCCTGGGCTCCCGTGCC 4971 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.37.6 chr1 - 2270 8 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 2848 -480 -1099 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TGCCTGCTCCTGGGCTCCCG 8685 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.37.7 chr1 - 1768 4 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 4326 -480 379 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TGCCTGCTCCTGGGCTCCCG 4191 FALSE NA NA GGGGCT -11 NA NA NA 2 NA PB.37.10 chr1 - 1591 4 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 4501 -478 554 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTGCCTGCTCCTGGGCTCC 4366 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.37.11 chr1 - 3810 22 novel_in_catalog ACAP3 novel 3793 24 NA NA 44 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCCCTCATCTCATGTTCTT 19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.37.12 chr1 - 3297 23 novel_not_in_catalog ACAP3 novel 3793 24 NA NA 0 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCCCTCATCTCATGTTCTT 105 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.37.13 chr1 - 3288 23 novel_not_in_catalog ACAP3 novel 3793 24 NA NA 26 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.924247 0.593756 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCCCTCATCTCATGTTCTT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.37.14 chr1 - 1697 7 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 3016 1 -931 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCCCTCATCTCATGTTCTT 8853 FALSE NA NA GGGGCT -8 NA NA NA 7 NA PB.37.15 chr1 - 1481 6 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 3413 1 -534 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCCCTCATCTCATGTTCTT 9250 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.37.16 chr1 - 1287 4 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 4326 1 379 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCCCTCATCTCATGTTCTT 4191 FALSE NA NA GGGGCT -11 NA NA NA 7 NA PB.37.17 chr1 - 1057 3 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 4758 1 811 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCCCTCATCTCATGTTCTT 4623 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.37.18 chr1 - 2687 13 novel_in_catalog ACAP3 novel 2725 14 NA NA 292 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CAGCCCTCATCTCATGTTCT 9372 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.37.19 chr1 - 1918 9 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000353662.4 2280 21 6679 -692 -1573 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CAGCCCTCATCTCATGTTCT 8211 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.37.20 chr1 - 1124 4 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 4485 5 538 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTGCAGCCCTCATCTCATGT 4350 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.37.23 chr1 - 970 5 full-splice_match ACAP3 ENST00000479108.5 485 5 -77 -408 23 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.38.2 chr1 + 1317 6 novel_in_catalog PUSL1 novel 1257 8 NA NA -42 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACCAGTTTGTTTCTTCAG NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.38.4 chr1 + 1266 8 novel_in_catalog PUSL1 novel 1257 8 NA NA -37 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GGAGACCAGTTTGTTTCTTC NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.38.5 chr1 + 1292 8 full-splice_match PUSL1 ENST00000379031.10 1257 8 -36 1 -36 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 93 22.809687 1.358119 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACCAGTTTGTTTCTTCAG NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 93 NA PB.38.6 chr1 + 1303 8 novel_not_in_catalog PUSL1 novel 1257 8 NA NA -30 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACCAGTTTGTTTCTTCAG NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.38.7 chr1 + 1185 7 novel_in_catalog PUSL1 novel 1257 8 NA NA -1 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.150575 0.711856 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACCAGTTTGTTTCTTCAG -10 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 21 NA PB.38.8 chr1 + 1542 6 novel_in_catalog PUSL1 novel 1257 8 NA NA 7 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACCAGTTTGTTTCTTCAG -2 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.38.9 chr1 + 1401 7 novel_in_catalog PUSL1 novel 1257 8 NA NA 10 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACCAGTTTGTTTCTTCAG 1 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.38.10 chr1 + 1324 7 novel_not_in_catalog PUSL1 novel 1257 8 NA NA 10 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACCAGTTTGTTTCTTCAG 1 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.38.11 chr1 + 1420 7 novel_in_catalog PUSL1 novel 1257 8 NA NA 16 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.660044 0.668390 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACCAGTTTGTTTCTTCAG 7 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 19 NA PB.38.12 chr1 + 1290 7 novel_in_catalog PUSL1 novel 1257 8 NA NA -56 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACCAGTTTGTTTCTTCAG 11 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.38.13 chr1 + 1234 7 incomplete-splice_match PUSL1 ENST00000379031.10 1257 8 216 1 -8 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACCAGTTTGTTTCTTCAG 92 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 8 NA PB.38.14 chr1 + 969 6 incomplete-splice_match PUSL1 ENST00000379031.10 1257 8 594 1 -44 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACCAGTTTGTTTCTTCAG 470 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.38.15 chr1 + 764 5 incomplete-splice_match PUSL1 ENST00000379031.10 1257 8 979 1 341 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACCAGTTTGTTTCTTCAG 855 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.40.1 chr1 - 2129 17 full-splice_match INTS11 ENST00000435064.6 2114 17 0 -15 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 295 72.353310 1.859458 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTCTTGGTGTACATGGCTGT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 295 NA PB.40.2 chr1 - 2567 16 novel_in_catalog INTS11 novel 2114 17 NA NA -3 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTGGTACTCTCTTCTTGG 12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.40.3 chr1 - 2191 16 novel_in_catalog INTS11 novel 2114 17 NA NA 0 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.40.4 chr1 - 2082 17 novel_not_in_catalog INTS11 novel 2114 17 NA NA 0 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTGGTACTCTCTTCTTGG 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.40.5 chr1 - 1556 13 incomplete-splice_match INTS11 ENST00000323275.10 2450 16 9082 -2 62 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTGGTACTCTCTTCTTGG 9118 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.40.6 chr1 - 2217 17 novel_not_in_catalog INTS11 novel 2114 17 NA NA 1 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.40.7 chr1 - 2176 16 novel_in_catalog INTS11 novel 2114 17 NA NA 0 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.40.8 chr1 - 2065 17 novel_not_in_catalog INTS11 novel 2114 17 NA NA 0 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.40.9 chr1 - 2004 17 novel_in_catalog INTS11 novel 2571 19 NA NA 0 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.40.10 chr1 - 1948 16 incomplete-splice_match INTS11 ENST00000458452.7 2571 19 3634 3 -111 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 3641 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.40.11 chr1 - 1664 14 incomplete-splice_match INTS11 ENST00000323275.10 2450 16 5286 9 11 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 5322 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.40.12 chr1 - 1526 12 incomplete-splice_match INTS11 ENST00000323275.10 2450 16 9182 9 -6 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 9218 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.40.13 chr1 - 1415 11 incomplete-splice_match INTS11 ENST00000323275.10 2450 16 9734 9 -223 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 9770 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.40.14 chr1 - 1457 8 novel_in_catalog INTS11 novel 1618 13 NA NA -181 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 7068 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.40.15 chr1 - 1306 10 incomplete-splice_match INTS11 ENST00000323275.10 2450 16 10301 9 344 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 6754 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.40.16 chr1 - 1287 7 novel_in_catalog INTS11 novel 1618 13 NA NA -1 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 7323 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.40.17 chr1 - 1211 9 incomplete-splice_match INTS11 ENST00000323275.10 2450 16 10775 9 -21 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.433716 0.535764 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 7228 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.40.18 chr1 - 1054 3 full-splice_match INTS11 ENST00000497304.6 932 3 -133 11 -133 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 8241 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.40.19 chr1 - 1074 8 incomplete-splice_match INTS11 ENST00000323275.10 2450 16 11051 9 180 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 7504 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.40.20 chr1 - 923 6 incomplete-splice_match INTS11 ENST00000470030.6 2369 10 2483 24 -250 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 8124 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.40.22 chr1 - 1552 3 full-splice_match INTS11 ENST00000498173.2 1589 3 53 -16 3 14 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTTTTTTTTTTTTTTGAC 23 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.40.23 chr1 - 1086 4 full-splice_match INTS11 ENST00000429572.5 1104 4 25 -7 1 7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 23 5.641106 0.751364 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACTTTAATTTTTTTTTTT 16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 23 NA PB.40.24 chr1 - 1276 4 full-splice_match INTS11 ENST00000493534.6 896 4 -2 -378 0 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TTTTGTTGTGAAACTTTAAT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.40.25 chr1 - 1004 4 incomplete-splice_match INTS11 ENST00000526797.5 659 7 -2 3856 0 -1 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TTTTGTTGTGAAACTTTAAT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.40.26 chr1 - 1391 4 full-splice_match INTS11 ENST00000490853.5 704 4 -9 -678 0 -6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAATGAAGTATGTTTATCT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.40.27 chr1 - 2447 2 full-splice_match INTS11 ENST00000496353.1 2428 2 -26 7 0 -7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 CAAAATGAAGTATGTTTATC 20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.41.1 chr1 - 3029 15 full-splice_match DVL1 ENST00000378888.10 3305 15 275 1 -31 -1 alternative_5end TRUE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACAGATGTGTGGCCTGTGCC 9403 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.41.2 chr1 - 2892 15 full-splice_match DVL1 ENST00000378891.9 2926 15 31 3 31 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACAGATGTGTGGCCTGTGCC 9465 FALSE NA NA GGGGCT -18 NA NA NA 2 NA PB.41.3 chr1 - 2386 11 incomplete-splice_match DVL1 ENST00000378891.9 2926 15 7331 3 -1416 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACAGATGTGTGGCCTGTGCC 7662 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.41.4 chr1 - 2000 8 incomplete-splice_match DVL1 ENST00000378891.9 2926 15 9042 3 -18 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACAGATGTGTGGCCTGTGCC 9373 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.41.5 chr1 - 1520 4 novel_not_in_catalog DVL1 novel 785 6 NA NA 856 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACAGATGTGTGGCCTGTGCC 1517 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.41.6 chr1 - 1429 2 incomplete-splice_match DVL1 ENST00000378891.9 2926 15 10944 3 1254 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACAGATGTGTGGCCTGTGCC 1915 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.41.7 chr1 - 1296 2 incomplete-splice_match DVL1 ENST00000378891.9 2926 15 11077 3 1387 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACAGATGTGTGGCCTGTGCC 2048 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.41.8 chr1 - 1986 7 incomplete-splice_match DVL1 ENST00000378888.10 3305 15 9661 2 295 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GACAGATGTGTGGCCTGTGC 9686 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.41.9 chr1 - 1890 6 incomplete-splice_match DVL1 ENST00000378891.9 2926 15 9462 4 -228 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GACAGATGTGTGGCCTGTGC 9793 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.41.10 chr1 - 1597 3 incomplete-splice_match DVL1 ENST00000378891.9 2926 15 10690 4 1000 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.414778 0.644909 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GACAGATGTGTGGCCTGTGC 1661 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.41.13 chr1 - 2695 14 incomplete-splice_match DVL1 ENST00000378891.9 2926 15 6360 8 -2387 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATGGGACAGATGTGTGGCCT 10010 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.41.14 chr1 - 2101 8 incomplete-splice_match DVL1 ENST00000378888.10 3305 15 9317 6 -49 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATGGGACAGATGTGTGGCCT 9342 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.41.15 chr1 - 1951 3 novel_in_catalog DVL1 novel 2926 15 NA NA 19 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATGGGACAGATGTGTGGCCT 9995 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.42.1 chr1 - 1981 8 novel_not_in_catalog MXRA8 novel 2231 9 NA NA 10 4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TCCCAGGTATGCTTCTGAAA 13 TRUE NA NA AAAACA -20 NA NA NA 2 NA PB.42.2 chr1 - 2401 9 novel_in_catalog MXRA8 novel 2293 10 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACTTGTCCCAGGTATGCT 3 TRUE NA NA AAAACA -30 NA NA NA 3 NA PB.42.3 chr1 - 2496 9 novel_in_catalog MXRA8 novel 2293 10 NA NA 1 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGACTTGTCCCAGGTATGC 4 TRUE NA NA AAAACA -29 NA NA NA 4 NA PB.42.4 chr1 - 2269 10 full-splice_match MXRA8 ENST00000309212.11 2293 10 22 2 10 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 30 7.357964 0.866758 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGACTTGTCCCAGGTATGC 13 TRUE NA NA AAAACA -20 NA NA NA 30 NA PB.42.5 chr1 - 2120 8 incomplete-splice_match MXRA8 ENST00000309212.11 2293 10 2850 2 -193 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGACTTGTCCCAGGTATGC 6092 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.42.6 chr1 - 1096 3 incomplete-splice_match MXRA8 ENST00000474033.5 1171 4 157 4 140 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGACTTGTCCCAGGTATGC 7690 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.42.7 chr1 - 2407 10 full-splice_match MXRA8 ENST00000309212.11 2293 10 -118 4 -118 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TTTAGACTTGTCCCAGGTAT 3124 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.43.1 chr1 - 856 3 novel_in_catalog AURKAIP1 novel 753 4 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CCTGCGGGTCTGGAGCTCCA -21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.43.2 chr1 - 1241 3 novel_in_catalog AURKAIP1 novel 1072 3 NA NA -9 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCCTGCGGGTCTGGAGCTCC 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.43.3 chr1 - 1097 3 full-splice_match AURKAIP1 ENST00000338370.7 1072 3 -32 7 -16 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 62 15.206458 1.182028 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGCCTTTCCTGCGGGTCTGG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 62 NA PB.43.4 chr1 - 1060 4 novel_in_catalog AURKAIP1 novel 875 4 NA NA 0 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCCTGCGGGTCTGGAGCTCC -21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.43.5 chr1 - 906 4 full-splice_match AURKAIP1 ENST00000338338.10 753 4 -154 1 -154 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGCCTTTCCTGCGGGTCTGG 154 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.43.6 chr1 - 884 4 full-splice_match AURKAIP1 ENST00000378853.3 875 4 -9 0 -9 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 102 25.017076 1.398237 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGCCTTTCCTGCGGGTCTGG 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 102 NA PB.43.7 chr1 - 882 4 novel_in_catalog AURKAIP1 novel 753 4 NA NA -17 1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CCTTTCCTGCGGGTCTGGAG -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.43.9 chr1 - 1374 2 incomplete-splice_match AURKAIP1 ENST00000338338.10 753 4 0 1 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 20 4.905309 0.690666 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGCCTTTCCTGCGGGTCTGG -21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 20 NA PB.43.10 chr1 - 1098 3 novel_in_catalog AURKAIP1 novel 753 4 NA NA -87 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGCCTTTCCTGCGGGTCTGG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.43.11 chr1 - 1052 4 full-splice_match AURKAIP1 ENST00000338338.10 753 4 -300 1 -300 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.414778 0.644909 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGCCTTTCCTGCGGGTCTGG 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.43.12 chr1 - 842 4 full-splice_match AURKAIP1 ENST00000338338.10 753 4 -90 1 -90 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 31 7.603229 0.880998 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGCCTTTCCTGCGGGTCTGG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 31 NA PB.43.13 chr1 - 810 4 full-splice_match AURKAIP1 ENST00000321751.9 798 4 -17 5 -13 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.188451 0.503580 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGCCTTTCCTGCGGGTCTGG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.43.14 chr1 - 755 4 full-splice_match AURKAIP1 ENST00000338338.10 753 4 -3 1 -3 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 146 35.808758 1.553989 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGCCTTTCCTGCGGGTCTGG -24 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 146 NA PB.44.1 chr1 + 2154 3 full-splice_match CPTP ENST00000343938.9 2154 3 -1 1 -1 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 194 47.581497 1.677438 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTGGGTGCCTGATTTCCTG -25 TRUE NA NA AATAAA -36 NA NA NA 194 NA PB.44.3 chr1 + 1954 2 full-splice_match CPTP ENST00000464957.1 1101 2 48 -901 2 -1 alternative_3end TRUE canonical NA NA NA NA 12 2.943186 0.468818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTGGGTGCCTGATTTCCTG -22 TRUE NA NA AATAAA -36 NA NA NA 12 NA PB.44.5 chr1 + 2045 3 full-splice_match CPTP ENST00000343938.9 2154 3 108 1 108 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 35 8.584291 0.933704 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTGGGTGCCTGATTTCCTG -5 TRUE NA NA AATAAA -36 NA NA NA 35 NA PB.44.6 chr1 + 1917 3 full-splice_match CPTP ENST00000343938.9 2154 3 236 1 -203 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.943186 0.468818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTGGGTGCCTGATTTCCTG 123 FALSE NA NA AATAAA -36 NA NA NA 12 NA PB.44.7 chr1 + 1815 2 incomplete-splice_match CPTP ENST00000343938.9 2154 3 2071 1 1632 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTGGGTGCCTGATTTCCTG 5 FALSE NA NA AATAAA -36 NA NA NA 8 NA PB.44.8 chr1 + 1714 2 incomplete-splice_match CPTP ENST00000343938.9 2154 3 2171 2 1732 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CACTGGGTGCCTGATTTCCT 105 FALSE NA NA AATAAA -35 NA NA NA 6 NA PB.45.1 chr1 - 2017 3 full-splice_match CCNL2 ENST00000463260.5 1941 3 709 -785 709 1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTTATGTTCTCCTAATTT 3082 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.45.4 chr1 - 5049 11 novel_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATTTTATGTTCTCCTAAT -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.45.9 chr1 - 1518 5 incomplete-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 1997 -231 372 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGGACGTGGTAGGTGGTCG 8795 FALSE NA NA AAGAAA -43 NA NA NA 2 NA PB.45.11 chr1 - 2451 12 novel_in_catalog CCNL2 novel 1598 12 NA NA 1 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACATCCGGAGCGTTATGGAC -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.45.12 chr1 - 2315 11 full-splice_match CCNL2 ENST00000400809.8 3112 11 9 788 -1 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.395840 0.732059 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGGACATCCGGAGCGTTATG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 22 NA PB.45.13 chr1 - 1728 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 1568 -214 47 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGGACATCCGGAGCGTTATG 8366 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.45.14 chr1 - 1290 3 full-splice_match CCNL2 ENST00000463260.5 1941 3 647 4 647 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGGACATCCGGAGCGTTATG 3020 FALSE NA NA AAAACA -12 NA NA NA 6 NA PB.45.15 chr1 - 1144 2 incomplete-splice_match CCNL2 ENST00000463260.5 1941 3 877 4 877 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGGACATCCGGAGCGTTATG 3250 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.45.16 chr1 - 4292 11 novel_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA -3 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCAGGACATCCGGAGCGT -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.45.17 chr1 - 4249 11 novel_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA -1 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 39 9.565352 0.980701 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCAGGACATCCGGAGCGT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 39 NA PB.45.18 chr1 - 3148 12 novel_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCAGGACATCCGGAGCGT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.45.19 chr1 - 3018 11 novel_not_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA 3 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCAGGACATCCGGAGCGT 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.45.20 chr1 - 2235 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 1057 -210 181 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCAGGACATCCGGAGCGT 7855 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.45.21 chr1 - 1608 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 1684 -210 59 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCAGGACATCCGGAGCGT 8482 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.45.22 chr1 - 4063 11 novel_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA 0 20 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 79 19.375971 1.287264 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGAACTTGAATCCCGTCAGC -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 79 NA PB.45.23 chr1 - 2798 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 309 -25 309 20 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGAACTTGAATCCCGTCAGC 7107 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.45.24 chr1 - 2433 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 674 -25 -97 20 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGAACTTGAATCCCGTCAGC 7472 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.45.25 chr1 - 2118 11 novel_not_in_catalog CCNL2 novel 3112 11 NA NA 1 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGTTAAAGCTATGTATGAA -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.45.26 chr1 - 3258 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 -161 -15 30 10 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 ATGAAAACTCAGAACTTGAA 9555 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.45.27 chr1 - 4630 10 novel_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA 3 6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 ATGTATGAAAACTCAGAACT 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.45.28 chr1 - 2598 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 495 -11 -276 6 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 ATGTATGAAAACTCAGAACT 7293 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.45.30 chr1 - 2483 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 609 -10 -162 5 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TATGTATGAAAACTCAGAAC 7407 FALSE NA NA GGGGCT -41 NA NA NA 3 NA PB.45.31 chr1 - 4145 11 novel_not_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA -6 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGCTATGTATGAAAACTC -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.45.32 chr1 - 3382 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 -295 -5 -104 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGCTATGTATGAAAACTC 9421 FALSE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.45.33 chr1 - 3001 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 86 -5 86 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGCTATGTATGAAAACTC 9802 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.45.34 chr1 - 2940 12 novel_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 23 5.641106 0.751364 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGCTATGTATGAAAACTC -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 23 NA PB.45.35 chr1 - 1302 5 incomplete-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 1987 -5 362 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGCTATGTATGAAAACTC 8785 FALSE NA NA AAAACA -15 NA NA NA 7 NA PB.45.36 chr1 - 1017 3 full-splice_match CCNL2 ENST00000463260.5 1941 3 711 213 711 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGCTATGTATGAAAACTC 3084 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.45.38 chr1 - 3611 12 novel_in_catalog CCNL2 novel 1598 12 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TAAAGCTATGTATGAAAACT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.45.39 chr1 - 2826 11 novel_not_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TAAAGCTATGTATGAAAACT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.45.40 chr1 - 1911 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 1175 -4 -254 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TAAAGCTATGTATGAAAACT 7973 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.45.41 chr1 - 908 2 incomplete-splice_match CCNL2 ENST00000463260.5 1941 3 903 214 903 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TAAAGCTATGTATGAAAACT 3276 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.45.43 chr1 - 2228 12 novel_in_catalog CCNL2 novel 1598 12 NA NA 0 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TTAAAGCTATGTATGAAAAC -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.45.44 chr1 - 2103 11 full-splice_match CCNL2 ENST00000400809.8 3112 11 10 999 0 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 39 9.565352 0.980701 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TTAAAGCTATGTATGAAAAC -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 39 NA PB.45.45 chr1 - 4071 11 novel_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA 0 2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 GTTAAAGCTATGTATGAAAA -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.45.46 chr1 - 1715 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 1369 -2 -60 2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.188451 0.503580 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 GTTAAAGCTATGTATGAAAA 8167 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.45.47 chr1 - 3462 8 novel_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA -2713 1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AGTTAAAGCTATGTATGAAA 6812 FALSE NA NA TTTAAA -5 NA NA NA 2 NA PB.45.48 chr1 - 1424 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 1659 -1 34 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.697920 0.431029 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AGTTAAAGCTATGTATGAAA 8457 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.45.49 chr1 - 2817 12 novel_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA 102 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGTTAAAGCTATGTATGAA 8619 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.45.50 chr1 - 1585 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 1497 0 -24 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGTTAAAGCTATGTATGAA 8295 FALSE NA NA AGTAAA -18 NA NA NA 9 NA PB.45.51 chr1 - 1104 4 incomplete-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 2267 0 642 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.943186 0.468818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGTTAAAGCTATGTATGAA 9065 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.45.52 chr1 - 2151 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 930 1 54 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 CAAGTTAAAGCTATGTATGA 7728 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.45.53 chr1 - 2842 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 233 7 233 -7 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TTAATACAAGTTAAAGCTAT 9949 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.45.57 chr1 - 929 8 incomplete-splice_match CCNL2 ENST00000400809.8 3112 11 -6 4631 -6 811 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 GAAAAAAGAAAGCACGCTAT -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.45.58 chr1 - 1857 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000408918.8 1186 6 3 -674 3 -461 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTGTGTTGCTTCTGATTCT 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.45.59 chr1 - 1213 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000408918.8 1186 6 3 -30 3 30 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 101 24.771811 1.393958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAGTTCGTGGATTAATATC 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 101 NA PB.45.60 chr1 - 977 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000408918.8 1186 6 210 -1 -151 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CTCAAGATTTCATTTGTTTT 8719 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.46.1 chr1 + 2215 2 full-splice_match MRPL20-AS1 ENST00000659048.2 2227 2 2 10 -1 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.395840 0.732059 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CTGCAAATTACTCTGTCTCT -3 TRUE NA NA TATAAA -10 NA NA NA 22 NA PB.46.2 chr1 + 1662 3 full-splice_match MRPL20-AS1 ENST00000690954.1 1673 3 -6 17 0 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAACAAACTGCAAATTACTC -23 TRUE NA NA TATAAA -3 NA NA NA 3 NA PB.46.3 chr1 + 2484 1 full-splice_match MRPL20-AS1 ENST00000692532.1 2483 1 -4 3 -1 -3 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAACAAACTGCAAATTACTC -18 TRUE NA NA TATAAA -3 NA NA NA 7 NA PB.46.4 chr1 + 1716 3 full-splice_match MRPL20-AS1 ENST00000444362.3 1759 3 37 6 0 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 122 29.922386 1.475996 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAATTACTCTGTCTCTTTTC -12 TRUE NA NA TATAAA -14 NA NA NA 122 NA PB.46.5 chr1 + 2124 2 full-splice_match MRPL20-AS1 ENST00000685968.1 2170 2 40 6 0 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAATTACTCTGTCTCTTTTC -2 TRUE NA NA TATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.46.6 chr1 + 2006 2 full-splice_match MRPL20-AS1 ENST00000576232.1 585 2 10 -1431 0 3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAAATTACTCTGTCTCTTTT -2 TRUE NA NA TATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.46.7 chr1 + 1552 2 novel_in_catalog MRPL20-AS1 novel 1843 3 NA NA 0 2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 CAAACAAACTGCAAATTACT -2 TRUE NA NA TATAAA -2 NA NA NA 2 NA PB.46.8 chr1 + 1887 3 novel_not_in_catalog MRPL20-AS1 novel 1843 3 NA NA 2 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAATTACTCTGTCTCTTTTC 0 TRUE NA NA TATAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.46.9 chr1 + 1661 3 full-splice_match MRPL20-AS1 ENST00000448629.7 1759 3 91 7 38 3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAAATTACTCTGTCTCTTTT 46 FALSE NA NA TATAAA -13 NA NA NA 3 NA PB.46.10 chr1 + 1492 2 full-splice_match MRPL20-AS1 ENST00000418833.2 2196 2 717 -13 -172 3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAAATTACTCTGTCTCTTTT 438 FALSE NA NA TATAAA -13 NA NA NA 4 NA PB.46.11 chr1 + 1233 1 full-splice_match MRPL20-AS1 ENST00000687493.1 2209 1 973 3 389 -3 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAATTACTCTGTCTCTTTTC 999 FALSE NA NA TATAAA -14 NA NA NA 5 NA PB.46.12 chr1 + 1066 1 full-splice_match MRPL20-AS1 ENST00000687493.1 2209 1 1140 3 556 -3 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAATTACTCTGTCTCTTTTC 1166 FALSE NA NA TATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.47.1 chr1 - 1493 5 novel_not_in_catalog MRPL20 novel 700 4 NA NA 4 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTTTTTAGAGTCATTTTCT 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.47.2 chr1 - 1391 4 novel_in_catalog MRPL20 novel 700 4 NA NA -9 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTTTTTAGAGTCATTTTCT -28 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.47.3 chr1 - 931 5 novel_not_in_catalog MRPL20 novel 700 4 NA NA 8 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTTTTTAGAGTCATTTTCT -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.47.4 chr1 - 1018 4 novel_in_catalog MRPL20 novel 700 4 NA NA 1 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTTTTTAGAGTCATTTTCT 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.47.5 chr1 - 699 4 full-splice_match MRPL20 ENST00000344843.12 700 4 0 1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 98 24.036015 1.380862 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTTTTTAGAGTCATTTTCT -19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 98 NA PB.47.6 chr1 - 1718 3 full-splice_match MRPL20 ENST00000487659.1 1693 3 -25 0 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TTCAGTTTTTAGAGTCATTT -19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.47.7 chr1 - 817 5 novel_in_catalog MRPL20 novel 700 4 NA NA 0 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TTCAGTTTTTAGAGTCATTT -19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.47.8 chr1 - 761 5 novel_not_in_catalog MRPL20 novel 700 4 NA NA -1 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TTCAGTTTTTAGAGTCATTT -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.47.9 chr1 - 570 4 full-splice_match MRPL20 ENST00000344843.12 700 4 0 130 0 -126 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTTTGTTTGATTTATACTT -19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.48.1 chr1 + 1351 1 full-splice_match MRPL20-DT ENST00000607307.1 1523 1 236 -64 236 64 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TACTTTGTCTCTGTGTCTTT 1950 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.48.2 chr1 + 1138 1 full-splice_match MRPL20-DT ENST00000607307.1 1523 1 447 -62 447 62 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATACTTTGTCTCTGTGTCT 2161 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.49.1 chr1 + 1718 4 novel_not_in_catalog VWA1 novel 4492 3 NA NA 0 2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CCTGCAGTCTCGCTAGGATG -14 TRUE NA NA AGTAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.49.2 chr1 + 2361 3 full-splice_match VWA1 ENST00000476993.2 4492 3 14 2117 14 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.943186 0.468818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCCTGCAGTCTCGCTAGGA 0 TRUE NA NA AGTAAA -15 NA NA NA 12 NA PB.51.1 chr1 - 1546 3 full-splice_match ANKRD65 ENST00000427211.3 1976 3 428 2 -65 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTGGGTGTCTGAGAGGTT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.51.2 chr1 - 1520 3 novel_not_in_catalog ANKRD65 novel 1976 3 NA NA -6 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTGGGTGTCTGAGAGGTT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.51.3 chr1 - 1614 2 incomplete-splice_match ANKRD65 ENST00000520296.5 1632 3 141 4 -27 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACAACTGGGTGTCTGAGAGG 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.52.1 chr1 + 2551 17 novel_not_in_catalog ATAD3B novel 4098 16 NA NA -2 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCGCCGTGTCTCTCTATTG -9 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.52.2 chr1 + 3458 16 novel_not_in_catalog ATAD3B novel 4314 14 NA NA -8 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCGCCGTGTCTCTCTATTG 4 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.52.5 chr1 + 2432 16 full-splice_match ATAD3B ENST00000673477.1 4098 16 19 1647 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 30 7.357964 0.866758 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCGCCGTGTCTCTCTATTG 12 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 30 NA PB.52.6 chr1 + 2103 15 incomplete-splice_match ATAD3B ENST00000673477.1 4098 16 5534 1645 -727 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CGCCGTGTCTCTCTATTGAC 5527 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.52.7 chr1 + 2270 14 full-splice_match ATAD3B ENST00000472194.6 4314 14 397 1647 397 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCGCCGTGTCTCTCTATTG 574 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 5 NA PB.52.8 chr1 + 2079 14 full-splice_match ATAD3B ENST00000472194.6 4314 14 588 1647 -435 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCGCCGTGTCTCTCTATTG 765 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 5 NA PB.52.9 chr1 + 1864 12 incomplete-splice_match ATAD3B ENST00000472194.6 4314 14 2867 1644 1844 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCGTGTCTCTCTATTGACT 3044 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.52.10 chr1 + 1753 11 incomplete-splice_match ATAD3B ENST00000472194.6 4314 14 4179 1644 -1280 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCGTGTCTCTCTATTGACT 4356 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.52.11 chr1 + 1506 9 incomplete-splice_match ATAD3B ENST00000472194.6 4314 14 7065 1647 522 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCGCCGTGTCTCTCTATTG 7242 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 7 NA PB.52.12 chr1 + 1360 7 incomplete-splice_match ATAD3B ENST00000472194.6 4314 14 8092 1647 1549 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCGCCGTGTCTCTCTATTG 8269 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.52.13 chr1 + 1206 6 incomplete-splice_match ATAD3B ENST00000472194.6 4314 14 8556 1645 2013 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CGCCGTGTCTCTCTATTGAC 8733 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 7 NA PB.52.14 chr1 + 1177 5 incomplete-splice_match ATAD3B ENST00000472194.6 4314 14 9777 1647 3234 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCGCCGTGTCTCTCTATTG 9954 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.52.15 chr1 + 2100 4 novel_in_catalog ATAD3B novel 2114 14 NA NA 3293 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCGCCGTGTCTCTCTATTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.52.16 chr1 + 1919 3 incomplete-splice_match ATAD3B ENST00000472194.6 4314 14 11306 1647 4763 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCGCCGTGTCTCTCTATTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.52.17 chr1 + 1548 3 incomplete-splice_match ATAD3B ENST00000472194.6 4314 14 11677 1647 5134 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCGCCGTGTCTCTCTATTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.52.18 chr1 + 1121 3 incomplete-splice_match ATAD3B ENST00000485748.5 3233 10 6647 -1 5563 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CGCCGTGTCTCTCTATTGAC NA FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.54.1 chr1 - 1431 5 novel_not_in_catalog SSU72 novel 1284 5 NA NA 20 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTGTGCCTGGTCCTGAATT 12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.54.2 chr1 - 1299 5 full-splice_match SSU72 ENST00000291386.4 1284 5 -16 1 -16 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 784 192.288116 2.283952 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTGTGCCTGGTCCTGAATT -24 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 784 NA PB.54.3 chr1 - 1243 5 full-splice_match SSU72 ENST00000291386.4 1284 5 40 1 40 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 54 13.244334 1.122030 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTGTGCCTGGTCCTGAATT 551 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 54 NA PB.54.4 chr1 - 1210 5 novel_not_in_catalog SSU72 novel 1284 5 NA NA -35 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTGTGCCTGGTCCTGAATT 11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.54.5 chr1 - 1138 5 full-splice_match SSU72 ENST00000291386.4 1284 5 145 1 -131 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTGTGCCTGGTCCTGAATT 656 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.54.6 chr1 - 1063 5 full-splice_match SSU72 ENST00000291386.4 1284 5 220 1 -56 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 437 107.181007 2.030118 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTGTGCCTGGTCCTGAATT -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 437 NA PB.54.7 chr1 - 1005 5 full-splice_match SSU72 ENST00000291386.4 1284 5 278 1 -1 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTGTGCCTGGTCCTGAATT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.54.8 chr1 - 901 4 incomplete-splice_match SSU72 ENST00000291386.4 1284 5 9943 1 9664 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.433716 0.535764 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTGTGCCTGGTCCTGAATT 9935 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.54.9 chr1 - 782 4 incomplete-splice_match SSU72 ENST00000291386.4 1284 5 10062 1 9783 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTGTGCCTGGTCCTGAATT 9832 FALSE NA NA CATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.54.12 chr1 - 2943 2 full-splice_match SSU72 ENST00000359060.5 4176 2 -271 1504 8 -1504 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 24 5.886371 0.769848 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCTTAGCCTGACATCCTG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 24 NA PB.54.13 chr1 - 2675 2 full-splice_match SSU72 ENST00000359060.5 4176 2 -3 1504 0 -1504 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCTTAGCCTGACATCCTG -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.55.1 chr1 + 2350 15 novel_in_catalog ATAD3A novel 2481 16 NA NA -26 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG 6447 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.55.2 chr1 + 2491 16 full-splice_match ATAD3A ENST00000378756.8 2481 16 -11 1 -11 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 220 53.958401 1.732059 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG -6 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 220 NA PB.55.3 chr1 + 2569 17 novel_in_catalog ATAD3A novel 2266 17 NA NA -8 2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GCCCTGTCTGTCTCTTGGCT -3 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 5 NA PB.55.4 chr1 + 2373 15 novel_in_catalog ATAD3A novel 2481 16 NA NA -2 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG 3 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.55.5 chr1 + 2421 16 novel_not_in_catalog ATAD3A novel 2481 16 NA NA 3 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG 11 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.55.6 chr1 + 2387 17 novel_not_in_catalog ATAD3A novel 2266 17 NA NA -4 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 44 10.791680 1.033089 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG 14 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 44 NA PB.55.7 chr1 + 2347 16 full-splice_match ATAD3A ENST00000378756.8 2481 16 133 1 -90 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG 138 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 7 NA PB.55.8 chr1 + 2143 15 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000536055.6 2330 16 3507 1 -1033 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.697920 0.431029 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG 3495 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 11 NA PB.55.9 chr1 + 2034 14 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000536055.6 2330 16 4838 1 -253 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.433716 0.535764 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG 4826 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 14 NA PB.55.10 chr1 + 1851 11 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000536055.6 2330 16 7619 1 2528 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 33 8.093760 0.908150 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG 7607 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 33 NA PB.55.11 chr1 + 1672 10 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000536055.6 2330 16 8039 1 2948 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.414778 0.644909 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG 8027 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 18 NA PB.55.12 chr1 + 1590 9 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000536055.6 2330 16 10247 1 -1178 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 8 NA PB.55.13 chr1 + 1433 8 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000536055.6 2330 16 11015 1 -410 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.697920 0.431029 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 11 NA PB.55.14 chr1 + 1185 6 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000536055.6 2330 16 11842 1 417 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.55.15 chr1 + 1142 5 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000536055.6 2330 16 12729 -1 1304 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TGCCCTGTCTGTCTCTTGGC NA FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 5 NA PB.55.16 chr1 + 977 3 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000400830.4 830 8 3799 -542 3799 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.55.17 chr1 + 2336 2 novel_in_catalog ATAD3A novel 830 8 NA NA 3800 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.55.18 chr1 + 1782 2 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000400830.4 830 8 4354 -542 4354 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.56.1 chr1 - 2012 1 full-splice_match FNDC10 ENST00000422725.4 2124 1 110 2 110 -2 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAGAGCTGTCTGTGTGTT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.56.2 chr1 - 1728 1 full-splice_match FNDC10 ENST00000422725.4 2124 1 394 2 394 -2 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 17 4.169513 0.620085 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAGAGCTGTCTGTGTGTT 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.56.3 chr1 - 1496 1 full-splice_match FNDC10 ENST00000422725.4 2124 1 626 2 626 -2 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 11 2.697920 0.431029 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAGAGCTGTCTGTGTGTT 622 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.56.4 chr1 - 1204 1 full-splice_match FNDC10 ENST00000422725.4 2124 1 918 2 918 -2 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAGAGCTGTCTGTGTGTT 914 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.56.5 chr1 - 1018 1 full-splice_match FNDC10 ENST00000422725.4 2124 1 1104 2 1104 -2 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAGAGCTGTCTGTGTGTT 1100 FALSE NA NA TATAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.58.1 chr1 + 987 2 full-splice_match MIB2 ENST00000477990.1 2821 2 -56 1890 6 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAGGATTTGGTTTCTAT NA FALSE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 2 NA PB.58.2 chr1 + 1475 2 full-splice_match MIB2 ENST00000477990.1 2821 2 23 1323 9 -11 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAGGAAAAAACATTTGGTA 26 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.58.3 chr1 + 1047 2 full-splice_match MIB2 ENST00000507082.1 1578 2 -59 590 -24 -15 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AACTTTCTCGCTAAATAGGA -36 TRUE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.58.5 chr1 + 2934 2 full-splice_match MIB2 ENST00000507082.1 1578 2 -44 -1312 -9 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAATAGAAAAAATGAGC -21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.58.6 chr1 + 3114 20 novel_in_catalog MIB2 novel 3252 21 NA NA 4 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACGTTGCCTCTGCTGTCTGC -8 TRUE NA NA TATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.58.7 chr1 + 2374 15 incomplete-splice_match MIB2 ENST00000504599.6 3311 19 8721 2 -56 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GGACGTTGCCTCTGCTGTCT 1113 FALSE NA NA TATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.58.8 chr1 + 1847 11 incomplete-splice_match MIB2 ENST00000514234.5 2562 16 3053 0 -5 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACGTTGCCTCTGCTGTCTGC 1766 FALSE NA NA TATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.58.9 chr1 + 1512 9 incomplete-splice_match MIB2 ENST00000514234.5 2562 16 3550 0 -108 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACGTTGCCTCTGCTGTCTGC 2263 FALSE NA NA TATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.58.10 chr1 + 1470 6 novel_in_catalog MIB2 novel 2562 16 NA NA 7 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACGTTGCCTCTGCTGTCTGC 2440 FALSE NA NA TATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.58.11 chr1 + 1527 8 incomplete-splice_match MIB2 ENST00000514234.5 2562 16 3763 0 43 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACGTTGCCTCTGCTGTCTGC 2476 FALSE NA NA TATAAA -16 NA NA NA 7 NA PB.58.12 chr1 + 1589 7 novel_in_catalog MIB2 novel 2562 16 NA NA 54 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACGTTGCCTCTGCTGTCTGC -4 TRUE NA NA TATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.58.13 chr1 + 2154 4 novel_in_catalog MIB2 novel 2562 16 NA NA 64 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACGTTGCCTCTGCTGTCTGC 6 TRUE NA NA TATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.58.14 chr1 + 1298 8 incomplete-splice_match MIB2 ENST00000514234.5 2562 16 3992 0 272 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACGTTGCCTCTGCTGTCTGC 136 FALSE NA NA TATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.58.15 chr1 + 927 5 incomplete-splice_match MIB2 ENST00000514234.5 2562 16 4734 0 47 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACGTTGCCTCTGCTGTCTGC 489 FALSE NA NA TATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.59.1 chr1 - 2031 1 full-splice_match ENSG00000272106 ENST00000607222.1 2038 1 0 7 0 -7 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 13 3.188451 0.503580 NA NA NA NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CTACCAACTGTTTTTTGTTT -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.60.2 chr1 - 1420 7 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000341832.11 2992 20 21491 4 21459 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAAGCTCCCCGTGTCGTCCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.60.3 chr1 - 1067 4 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000341832.11 2992 20 22223 4 22191 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAAGCTCCCCGTGTCGTCCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.60.5 chr1 - 2813 19 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000341832.11 2992 20 1586 8 1554 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAGGAAAGCTCCCCGTGTCG 1773 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.60.6 chr1 - 2604 21 novel_not_in_catalog CDK11B novel 2534 21 NA NA 8 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAGAGCTGTGTTTTCTCCG 23 TRUE NA NA AAGAAA -44 NA NA NA 2 NA PB.60.7 chr1 - 2674 21 full-splice_match CDK11B ENST00000340677.9 2534 21 8 -148 0 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAGAGCTGTGTTTTCTCCG -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.60.8 chr1 - 2595 20 full-splice_match CDK11B ENST00000341832.11 2992 20 32 365 0 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.697920 0.431029 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAGAGCTGTGTTTTCTCCG 15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.60.9 chr1 - 1763 13 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000407249.7 2677 20 17017 3 16977 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAGAGCTGTGTTTTCTCCG 7641 FALSE NA NA CATAAA -25 NA NA NA 2 NA PB.60.10 chr1 - 1624 12 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000407249.7 2677 20 17241 3 17201 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAGAGCTGTGTTTTCTCCG 7865 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.60.11 chr1 - 1500 11 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000407249.7 2677 20 17913 3 17873 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAGAGCTGTGTTTTCTCCG 8537 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.60.12 chr1 - 1402 11 novel_not_in_catalog CDK11B novel 2457 21 NA NA 13781 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAGAGCTGTGTTTTCTCCG 4445 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.60.13 chr1 - 1240 9 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000407249.7 2677 20 20454 3 20414 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAGAGCTGTGTTTTCTCCG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.60.14 chr1 - 1137 8 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000407249.7 2677 20 21173 3 21133 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAGAGCTGTGTTTTCTCCG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.60.15 chr1 - 1153 11 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000340677.9 2534 21 48 5343 8 691 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAGAACGAGAAAATGAAAAC 23 TRUE NA NA AAGAAA -44 NA NA NA 2 NA PB.60.18 chr1 - 896 7 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000407249.7 2677 20 9 6760 1 -575 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.697920 0.431029 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTGAGTCTTTTCTGGGGGAT -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.60.20 chr1 - 1085 7 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000407249.7 2677 20 -219 6799 -219 -614 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTGAGGCCAGGCCGGCGCCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.60.21 chr1 - 1101 8 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000340677.9 2534 21 -188 6648 -188 -614 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTGAGGCCAGGCCGGCGCCT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.60.22 chr1 - 902 8 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000340677.9 2534 21 11 6648 3 -614 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTGAGGCCAGGCCGGCGCCT -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.60.35 chr1 - 5714 9 full-splice_match SLC35E2B ENST00000611123.1 5948 9 226 8 207 -8 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATGGACTGCTTTGTTT 319 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.60.36 chr1 - 3176 9 full-splice_match SLC35E2B ENST00000611123.1 5948 9 -44 2816 23 -513 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAACAGAGCAATAATTCTGA 49 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.60.37 chr1 - 2036 5 incomplete-splice_match SLC35E2B ENST00000611123.1 5948 9 21182 2816 -1407 -513 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAACAGAGCAATAATTCTGA 7283 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.60.38 chr1 - 1955 3 full-splice_match SLC35E2B ENST00000480991.1 2860 3 392 513 392 -513 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAACAGAGCAATAATTCTGA 9082 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.60.40 chr1 - 1406 7 incomplete-splice_match CDK11A ENST00000356200.7 2653 19 18176 -344 -53 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAAGCTCCCCGTGTCGTCCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.60.41 chr1 - 1240 6 incomplete-splice_match CDK11A ENST00000356200.7 2653 19 18547 -344 -31 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAAGCTCCCCGTGTCGTCCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.60.42 chr1 - 984 4 incomplete-splice_match CDK11A ENST00000356937.7 2275 17 17801 -495 262 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAAGCTCCCCGTGTCGTCCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.60.44 chr1 - 2567 20 full-splice_match CDK11A ENST00000358779.9 2419 20 0 -148 0 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAGAGCTGTGTTTTCTCCG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.60.45 chr1 - 1591 12 incomplete-splice_match CDK11A ENST00000356200.7 2653 19 13961 3 6 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAGAGCTGTGTTTTCTCCG 7608 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.60.46 chr1 - 1475 11 incomplete-splice_match CDK11A ENST00000356200.7 2653 19 14625 3 25 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAGAGCTGTGTTTTCTCCG 8272 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.60.54 chr1 - 1026 7 incomplete-splice_match CDK11A ENST00000358779.9 2419 20 -228 6637 -195 -4910 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTGAGGCCAGGCCGGCGCCT -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.60.55 chr1 - 894 7 incomplete-splice_match CDK11A ENST00000358779.9 2419 20 -96 6637 -63 -4910 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTGAGGCCAGGCCGGCGCCT 118 FALSE NA NA CATAAA -25 NA NA NA 6 NA PB.60.56 chr1 - 843 7 incomplete-splice_match CDK11A ENST00000460465.5 2333 20 -15 6637 -15 -4910 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.697920 0.431029 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTGAGGCCAGGCCGGCGCCT -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.61.1 chr1 - 1935 7 full-splice_match SLC35E2A ENST00000647043.1 2078 7 116 27 116 -27 alternative_5end TRUE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AATAAATAAAATAAAATCAC 267 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.61.2 chr1 - 3516 6 novel_not_in_catalog SLC35E2A novel 732 4 NA NA -73 -2548 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTGCTTTGTTTTCTTCCTT 5 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.61.8 chr1 - 1815 7 novel_in_catalog SLC35E2A novel 1430 6 NA NA 5 -28 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAAAAAAAAACTTTTTTT 83 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.61.9 chr1 - 1621 7 novel_in_catalog SLC35E2A novel 1430 6 NA NA 126 -28 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAAAAAAAAACTTTTTTT 277 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.62.1 chr1 - 3495 13 novel_not_in_catalog NADK novel 3653 14 NA NA -124 -7 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 9032 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.62.2 chr1 - 3481 12 novel_in_catalog NADK novel 3235 12 NA NA 21 -7 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.62.3 chr1 - 3272 10 full-splice_match NADK ENST00000342348.9 1722 10 -318 -1232 -318 -7 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.62.4 chr1 - 3185 12 full-splice_match NADK ENST00000341426.9 3235 12 43 7 -7 -7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 56 13.734865 1.137824 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 56 NA PB.62.5 chr1 - 3155 12 novel_in_catalog NADK novel 3235 12 NA NA -51 -7 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.62.6 chr1 - 2964 11 novel_in_catalog NADK novel 3235 12 NA NA -5 -7 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.62.7 chr1 - 2885 11 incomplete-splice_match NADK ENST00000341426.9 3235 12 13185 7 -6710 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 1124 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.62.8 chr1 - 2639 9 incomplete-splice_match NADK ENST00000342348.9 1722 10 1369 -1232 22 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 9203 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.62.9 chr1 - 2463 7 incomplete-splice_match NADK ENST00000342348.9 1722 10 2276 -1232 28 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 2589 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.62.10 chr1 - 2300 5 incomplete-splice_match NADK ENST00000342348.9 1722 10 3895 -1232 186 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.433716 0.535764 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 4208 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.62.11 chr1 - 2224 5 incomplete-splice_match NADK ENST00000342348.9 1722 10 3971 -1232 -221 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 4284 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.62.12 chr1 - 2064 3 incomplete-splice_match NADK ENST00000342348.9 1722 10 4366 -1232 174 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 4679 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.62.13 chr1 - 1871 2 incomplete-splice_match NADK ENST00000498806.1 269 3 768 -1736 768 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.433716 0.535764 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 5273 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.62.23 chr1 - 1936 12 full-splice_match NADK ENST00000341426.9 3235 12 21 1278 21 -39 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 45 11.036945 1.042849 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTTGAGCTGCCATGCTTTTC -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 45 NA PB.62.24 chr1 - 1221 7 incomplete-splice_match NADK ENST00000342348.9 1722 10 2247 39 -1 -39 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTTGAGCTGCCATGCTTTTC 2560 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.62.25 chr1 - 2007 12 novel_in_catalog NADK novel 3235 12 NA NA -77 -49 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAACCTTCCTTGAGCTGC -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.62.26 chr1 - 1889 10 full-splice_match NADK ENST00000342348.9 1722 10 -216 49 -216 -49 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAACCTTCCTTGAGCTGC 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.62.27 chr1 - 1956 13 novel_not_in_catalog NADK novel 3235 12 NA NA -76 -49 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAACCTTCCTTGAGCTGC 9957 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.62.28 chr1 - 1765 11 incomplete-splice_match NADK ENST00000341426.9 3235 12 13024 1288 -6871 -49 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAACCTTCCTTGAGCTGC 963 FALSE NA NA AATAAA -37 NA NA NA 7 NA PB.62.29 chr1 - 1614 11 incomplete-splice_match NADK ENST00000341426.9 3235 12 13175 1288 -6720 -49 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAACCTTCCTTGAGCTGC 1114 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.62.30 chr1 - 1549 10 incomplete-splice_match NADK ENST00000341426.9 3235 12 16432 1288 -3463 -49 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAACCTTCCTTGAGCTGC 4371 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.62.31 chr1 - 1424 10 novel_not_in_catalog NADK novel 1722 10 NA NA 21 -49 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAACCTTCCTTGAGCTGC -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.62.32 chr1 - 1325 8 incomplete-splice_match NADK ENST00000342348.9 1722 10 1974 49 7 -49 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAACCTTCCTTGAGCTGC 9808 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.62.33 chr1 - 1081 6 incomplete-splice_match NADK ENST00000342348.9 1722 10 3158 49 -521 -49 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAACCTTCCTTGAGCTGC 3471 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.63.1 chr1 - 3067 12 full-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 95 1 -26 -1 alternative_5end TRUE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTTTGGTGTGGTGATTATT 763 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.63.4 chr1 - 3039 12 novel_not_in_catalog GNB1 novel 3163 12 NA NA 68 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GACTTTGGTGTGGTGATTAT 1422 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.63.5 chr1 - 2325 5 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 97819 2 929 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.924247 0.593756 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GACTTTGGTGTGGTGATTAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.63.6 chr1 - 2192 4 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 100600 2 3710 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.924247 0.593756 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GACTTTGGTGTGGTGATTAT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.63.8 chr1 - 2906 11 full-splice_match GNB1 ENST00000610897.4 3145 11 235 4 -46 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GGACTTTGGTGTGGTGATTA 873 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.63.9 chr1 - 2573 7 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 84570 3 11869 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.697920 0.431029 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GGACTTTGGTGTGGTGATTA 9284 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.63.10 chr1 - 1781 2 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 103750 3 6860 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 35 8.584291 0.933704 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GGACTTTGGTGTGGTGATTA 3247 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 35 NA PB.63.11 chr1 - 2939 12 full-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 220 4 -31 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 20 4.905309 0.690666 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGGACTTTGGTGTGGTGATT 888 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 20 NA PB.63.12 chr1 - 2778 10 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 65652 4 119 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.188451 0.503580 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGGACTTTGGTGTGGTGATT 6914 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.63.13 chr1 - 2672 8 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 75253 4 2552 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.433716 0.535764 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGGACTTTGGTGTGGTGATT 2469 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 14 NA PB.63.15 chr1 - 2961 12 novel_in_catalog GNB1 novel 3163 12 NA NA -33 -5 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGGACTTTGGTGTGGTGAT 1321 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.63.16 chr1 - 2057 3 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 101857 5 4967 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.169513 0.620085 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGGACTTTGGTGTGGTGAT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.63.17 chr1 - 1916 3 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 101998 5 5108 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.395840 0.732059 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGGACTTTGGTGTGGTGAT 1495 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 22 NA PB.63.23 chr1 - 2538 3 novel_in_catalog GNB1 novel 3048 10 NA NA 3628 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAGGGACTTTGGTGTGGTGA 15 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.63.24 chr1 - 2423 6 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 86610 6 -10280 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.660044 0.668390 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAGGGACTTTGGTGTGGTGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.63.39 chr1 - 1546 11 full-splice_match GNB1 ENST00000610897.4 3145 11 132 1467 -19 1235 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACTTGAGTGTAATTGTCA 770 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.63.40 chr1 - 705 4 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 100623 1466 3733 1235 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACTTGAGTGTAATTGTCA 120 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.63.41 chr1 - 1482 12 full-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 214 1467 -37 1234 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAACTTGAGTGTAATTGTC 882 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.63.42 chr1 - 1464 12 novel_in_catalog GNB1 novel 3163 12 NA NA 2 1234 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.697920 0.431029 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAACTTGAGTGTAATTGTC 1356 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.63.43 chr1 - 1340 10 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 65624 1470 91 1231 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.678982 0.565728 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGGTAAACTTGAGTGTAATT 6886 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.63.44 chr1 - 1707 14 novel_not_in_catalog GNB1 novel 3163 12 NA NA -19 1228 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AGAAGGTAAACTTGAGTGTA 1335 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.63.46 chr1 - 1613 12 full-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 77 1473 -44 1228 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 29 7.112698 0.852034 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AGAAGGTAAACTTGAGTGTA 745 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 29 NA PB.63.47 chr1 - 1583 12 novel_not_in_catalog GNB1 novel 3163 12 NA NA -15753 1228 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AGAAGGTAAACTTGAGTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.63.49 chr1 - 1173 8 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 75283 1473 2582 1228 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 20 4.905309 0.690666 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AGAAGGTAAACTTGAGTGTA -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 20 NA PB.63.50 chr1 - 986 6 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 86580 1473 -10310 1228 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AGAAGGTAAACTTGAGTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.63.53 chr1 - 1068 4 novel_not_in_catalog GNB1 novel 708 3 NA NA 11 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATATCTGATGTATTTTTTCC 18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.64.1 chr1 + 1314 7 full-splice_match MMP23B ENST00000378675.7 1309 7 -6 1 0 -1 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGGCTCCTCGCTCATTCTT -9 TRUE NA NA GATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.65.1 chr1 + 1929 9 full-splice_match GABRD ENST00000378585.7 1914 9 -26 11 -10 6 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTCTCCCTCACTGTGCTGC 12 FALSE NA NA AATAAA -23 NA NA NA 2 NA PB.66.2 chr1 - 1387 4 full-splice_match TMEM52 ENST00000602604.1 878 4 -1 -508 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCTCTGCCTATGTGGGAAGG 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.68.1 chr1 + 2314 18 full-splice_match PRKCZ ENST00000378567.8 2385 18 66 5 -8 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 38 9.320087 0.969420 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGGAAGCTCCTCTGATGCCT -2 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 38 NA PB.68.2 chr1 + 2124 18 full-splice_match PRKCZ ENST00000378567.8 2385 18 254 7 -143 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGTGGAAGCTCCTCTGATGC 186 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 4 NA PB.68.3 chr1 + 1966 16 incomplete-splice_match PRKCZ ENST00000378567.8 2385 18 6071 8 803 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATGTGGAAGCTCCTCTGATG 6003 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.68.4 chr1 + 1995 15 novel_in_catalog PRKCZ novel 1859 8 NA NA -75 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATGTGGAAGCTCCTCTGATG 1210 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.68.5 chr1 + 1793 14 incomplete-splice_match PRKCZ ENST00000461106.6 1916 15 61309 -200 33 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGGAAGCTCCTCTGATGCCT 100 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.68.6 chr1 + 1500 11 incomplete-splice_match PRKCZ ENST00000479263.5 1747 13 4450 2 3514 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGCTCCTCTGATGCCTTTT -8 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 7 NA PB.68.7 chr1 + 1268 9 incomplete-splice_match PRKCZ ENST00000479263.5 1747 13 11563 2 10627 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGCTCCTCTGATGCCTTTT 2679 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.68.8 chr1 + 1132 8 full-splice_match PRKCZ ENST00000505322.5 1859 8 727 0 600 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGCTCCTCTGATGCCTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.72.1 chr1 - 1100 2 novel_in_catalog FAAP20 novel 2216 7 NA NA 7226 2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATTTGACTGCCAAGTGTTT 8180 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.72.3 chr1 - 2018 3 incomplete-splice_match FAAP20 ENST00000400918.7 811 4 52 -705 40 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATCTGCCTAGTATTTGACT 363 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.72.4 chr1 - 1514 4 full-splice_match FAAP20 ENST00000400918.7 811 4 0 -703 0 6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.943186 0.468818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TCAATCTGCCTAGTATTTGA 311 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.72.5 chr1 - 1492 4 novel_not_in_catalog FAAP20 novel 811 4 NA NA 10 3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATTTCAATCTGCCTAGTATT 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.72.6 chr1 - 1873 5 novel_in_catalog FAAP20 novel 2216 7 NA NA 1 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGCATTTCAATCTGCCTAGT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.72.7 chr1 - 1393 3 full-splice_match FAAP20 ENST00000400919.7 1413 3 3 17 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGCATTTCAATCTGCCTAGT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.72.8 chr1 - 709 4 full-splice_match FAAP20 ENST00000378546.9 727 4 15 3 -6 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.924247 0.593756 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAACGTCTGCCGCTTTTCTT 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.72.9 chr1 - 1194 3 full-splice_match FAAP20 ENST00000476803.1 701 3 -476 -17 50 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAAACGTCTGCCGCTTTTCT 373 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.72.10 chr1 - 693 4 novel_not_in_catalog FAAP20 novel 727 4 NA NA 0 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAAACGTCTGCCGCTTTTCT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.72.11 chr1 - 842 5 incomplete-splice_match FAAP20 ENST00000428120.5 2313 8 -21 5076 10 -6 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATGAAACGTCTGCCGCTTTT 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.72.12 chr1 - 1522 4 full-splice_match FAAP20 ENST00000420515.1 1544 4 1 21 1 -21 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAAGATCTTCTTGTGGTCCT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.74.3 chr1 - 1365 8 incomplete-splice_match MORN1 ENST00000378529.7 1500 11 21 16839 1 -338 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGTTTTTGTGTGAATGTGT -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.74.5 chr1 - 751 6 incomplete-splice_match MORN1 ENST00000378529.7 1500 11 157 29606 4 591 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTCATATGTGTGCCTTGTG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.75.2 chr1 - 2814 6 full-splice_match PEX10 ENST00000447513.7 2835 6 21 0 -3 0 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 16 3.924247 0.593756 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CTTGGTAAAACGTTGAGAGT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.75.3 chr1 - 2397 4 incomplete-splice_match PEX10 ENST00000447513.7 2835 6 3882 7 1322 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATCACTTGGTAAAACGT 5157 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.75.4 chr1 - 1456 4 incomplete-splice_match PEX10 ENST00000447513.7 2835 6 3997 833 1437 31 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 ACTAACACAAGATGGAACTT 5272 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.75.5 chr1 - 2246 6 novel_in_catalog PEX10 novel 2835 6 NA NA -233 15 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATGTGGGTACGTTACTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.75.6 chr1 - 2043 6 novel_in_catalog PEX10 novel 2835 6 NA NA -30 15 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.414778 0.644909 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATGTGGGTACGTTACTA 12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.75.7 chr1 - 1871 6 novel_in_catalog PEX10 novel 2835 6 NA NA 142 15 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATGTGGGTACGTTACTA 184 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.75.8 chr1 - 1703 4 incomplete-splice_match PEX10 ENST00000447513.7 2835 6 3734 849 1174 15 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATGTGGGTACGTTACTA 5009 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.75.9 chr1 - 1552 4 incomplete-splice_match PEX10 ENST00000447513.7 2835 6 3885 849 1325 15 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATGTGGGTACGTTACTA 5160 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.75.10 chr1 - 1183 3 incomplete-splice_match PEX10 ENST00000447513.7 2835 6 5810 849 3250 15 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATGTGGGTACGTTACTA 7085 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.75.11 chr1 - 2021 6 novel_not_in_catalog PEX10 novel 2905 6 NA NA -3 14 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CAAAATGTGGGTACGTTACT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.75.12 chr1 - 1978 6 full-splice_match PEX10 ENST00000447513.7 2835 6 7 850 7 14 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 167 40.959332 1.612353 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CAAAATGTGGGTACGTTACT -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 167 NA PB.75.13 chr1 - 1297 3 incomplete-splice_match PEX10 ENST00000447513.7 2835 6 5695 850 3135 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CAAAATGTGGGTACGTTACT 6970 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.75.14 chr1 - 1417 6 full-splice_match PEX10 ENST00000447513.7 2835 6 21 1397 -3 -533 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATGGACTGAATGAGTGCGT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.76.1 chr1 + 1379 7 full-splice_match RER1 ENST00000605895.6 3028 7 -34 1683 -21 2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 289 70.881714 1.850534 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GTTTGAGATTATTTTGACAC 6403 FALSE NA NA TATAAA -20 NA NA NA 289 NA PB.76.2 chr1 + 1275 6 full-splice_match RER1 ENST00000378513.7 3000 6 31 1694 -22 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAATTGTTTGAGATTATTTT 6402 FALSE NA NA TATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.76.3 chr1 + 3154 8 novel_not_in_catalog RER1 novel 695 8 NA NA -21 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATTACTTCTCAACTGTATG 6403 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 3 NA PB.76.4 chr1 + 1522 8 novel_not_in_catalog RER1 novel 695 8 NA NA -21 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.924247 0.593756 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAATTGTTTGAGATTATTTT 6403 FALSE NA NA TATAAA -15 NA NA NA 16 NA PB.76.5 chr1 + 1456 8 novel_not_in_catalog RER1 novel 695 8 NA NA -21 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAATTGTTTGAGATTATTTT 6403 FALSE NA NA TATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.76.7 chr1 + 1075 8 novel_not_in_catalog RER1 novel 695 8 NA NA -21 74 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.169513 0.620085 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATCGCATGGATTTCTTTT 6403 FALSE NA NA AAGAAA -15 NA NA NA 17 NA PB.76.8 chr1 + 906 7 full-splice_match RER1 ENST00000605895.6 3028 7 -14 2136 -1 73 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 188 46.109905 1.663794 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAAATCGCATGGATTTCTTT -18 TRUE NA NA AAGAAA -14 NA NA NA 188 NA PB.76.9 chr1 + 1482 7 full-splice_match RER1 ENST00000378512.5 1404 7 -71 -7 -9 7 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGATTATTTTGACACATTTC 6415 FALSE NA NA TATAAA -25 NA NA NA 2 NA PB.76.10 chr1 + 994 9 novel_not_in_catalog RER1 novel 695 8 NA NA -1 4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGTCAAATTTTCTTTTTAAA -18 TRUE NA NA CATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.76.11 chr1 + 989 8 novel_not_in_catalog RER1 novel 695 8 NA NA -1 74 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATCGCATGGATTTCTTTT -18 TRUE NA NA AAGAAA -15 NA NA NA 8 NA PB.76.12 chr1 + 993 8 novel_not_in_catalog RER1 novel 695 8 NA NA -1 74 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 47 11.527476 1.061734 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATCGCATGGATTTCTTTT -18 TRUE NA NA AAGAAA -15 NA NA NA 47 NA PB.76.13 chr1 + 3150 7 full-splice_match RER1 ENST00000378512.5 1404 7 -62 -1684 0 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCTGAATTACTTCTCAA -17 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.76.14 chr1 + 3035 7 full-splice_match RER1 ENST00000605895.6 3028 7 -8 1 5 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 57 13.980131 1.145511 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCTGAATTACTTCTCAA -12 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 57 NA PB.76.15 chr1 + 1471 9 novel_not_in_catalog RER1 novel 695 8 NA NA -4 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAATTGTTTGAGATTATTTT -8 TRUE NA NA TATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.76.16 chr1 + 1425 8 novel_not_in_catalog RER1 novel 695 8 NA NA 1 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 27 6.622167 0.821000 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAATTGTTTGAGATTATTTT -3 TRUE NA NA TATAAA -15 NA NA NA 27 NA PB.76.17 chr1 + 1578 9 novel_not_in_catalog RER1 novel 695 8 NA NA 0 7 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGATTATTTTGACACATTTC -2 TRUE NA NA TATAAA -25 NA NA NA 2 NA PB.76.18 chr1 + 895 8 novel_not_in_catalog RER1 novel 2469 6 NA NA 59 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGGGAGTCAAATTTTCTTTT 1388 FALSE NA NA CATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.76.19 chr1 + 1663 6 full-splice_match RER1 ENST00000488353.2 2469 6 814 -8 814 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAATTTTCTTTTTAAAAAGG 2974 FALSE NA NA CATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.76.20 chr1 + 1238 6 full-splice_match RER1 ENST00000488353.2 2469 6 1777 -546 1777 11 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATTTTGACACATTTCTTTG 3937 FALSE NA NA TATAAA -29 NA NA NA 5 NA PB.76.21 chr1 + 1173 6 full-splice_match RER1 ENST00000488353.2 2469 6 1836 -540 1836 5 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGAGATTATTTTGACACATT 3996 FALSE NA NA TATAAA -23 NA NA NA 4 NA PB.76.22 chr1 + 1076 5 incomplete-splice_match RER1 ENST00000488353.2 2469 6 3174 -537 3174 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GTTTGAGATTATTTTGACAC 5334 FALSE NA NA TATAAA -20 NA NA NA 6 NA PB.76.23 chr1 + 968 4 incomplete-splice_match RER1 ENST00000488353.2 2469 6 5480 -541 -2466 6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAGATTATTTTGACACATTT 7640 FALSE NA NA TATAAA -24 NA NA NA 2 NA PB.76.24 chr1 + 2640 4 incomplete-splice_match RER1 ENST00000605895.6 3028 7 7650 1 -2460 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCTGAATTACTTCTCAA 7646 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.76.25 chr1 + 2522 2 full-splice_match RER1 ENST00000462129.1 585 2 271 -2208 271 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCTGAATTACTTCTCAA NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.77.1 chr1 + 1059 1 full-splice_match ENSG00000272449 ENST00000606645.2 1061 1 0 2 0 -2 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA NA NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTTCTGCCTGAGTTTCTG 0 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 6 NA PB.78.1 chr1 + 1579 9 novel_in_catalog TNFRSF14 novel 1702 8 NA NA -34 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAACTGTCACCTCCCGGTGT 1477 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.78.2 chr1 + 2301 8 full-splice_match TNFRSF14 ENST00000355716.5 1702 8 -602 3 -22 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAACTGTCACCTCCCGGTGT 1489 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.78.3 chr1 + 3555 7 novel_in_catalog TNFRSF14 novel 1702 8 NA NA 1 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTCCTGTTTTCTATTTGTCA -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.78.4 chr1 + 1767 9 novel_in_catalog TNFRSF14 novel 1702 8 NA NA -9 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAACTGTCACCTCCCGGTGT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.78.5 chr1 + 1547 9 novel_in_catalog TNFRSF14 novel 1702 8 NA NA -9 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAACTGTCACCTCCCGGTGT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.78.6 chr1 + 1364 9 novel_in_catalog TNFRSF14 novel 1702 8 NA NA -9 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GGCTCCTGTTTTCTATTTGT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.78.7 chr1 + 1610 9 novel_in_catalog TNFRSF14 novel 1702 8 NA NA -94 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAACTGTCACCTCCCGGTGT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.78.8 chr1 + 1576 9 novel_in_catalog TNFRSF14 novel 1702 8 NA NA -51 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAACTGTCACCTCCCGGTGT 16 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.78.9 chr1 + 1728 8 full-splice_match TNFRSF14 ENST00000355716.5 1702 8 -106 80 43 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTCCTGTTTTCTATTTGTCA 32 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.78.10 chr1 + 1673 8 full-splice_match TNFRSF14 ENST00000355716.5 1702 8 26 3 -8 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAACTGTCACCTCCCGGTGT 13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.78.11 chr1 + 1437 7 incomplete-splice_match TNFRSF14 ENST00000355716.5 1702 8 1177 80 -265 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTCCTGTTTTCTATTTGTCA 12 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.78.12 chr1 + 1772 5 incomplete-splice_match TNFRSF14 ENST00000466750.5 2603 6 1339 0 -428 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAACTGTCACCTCCCGGTGT 1394 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.79.1 chr1 - 2634 19 full-splice_match PANK4 ENST00000378466.9 2641 19 0 7 0 -7 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 32 7.848495 0.894786 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAGAGGCCGGAGCCATCT 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 32 NA PB.79.2 chr1 - 2604 19 novel_in_catalog PANK4 novel 2641 19 NA NA -3 -7 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAGAGGCCGGAGCCATCT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.79.3 chr1 - 2386 17 novel_in_catalog PANK4 novel 2641 19 NA NA -416 -7 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAGAGGCCGGAGCCATCT 8945 FALSE NA NA AAAACA -43 NA NA NA 2 NA PB.79.4 chr1 - 1489 11 incomplete-splice_match PANK4 ENST00000378466.9 2641 19 8351 7 1050 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAGAGGCCGGAGCCATCT 8357 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.79.5 chr1 - 920 7 incomplete-splice_match PANK4 ENST00000378466.9 2641 19 13687 7 104 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAGAGGCCGGAGCCATCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.80.1 chr1 + 2681 7 full-splice_match PRXL2B ENST00000493183.5 840 7 -6 -1835 -6 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTTTTTGTGCTTTCTTCTT 863 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.80.2 chr1 + 2623 7 full-splice_match PRXL2B ENST00000474659.5 785 7 -29 -1809 20 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTTTTTGTGCTTTCTTCTT 889 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.80.3 chr1 + 2749 7 full-splice_match PRXL2B ENST00000378424.9 2765 7 18 -2 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TTTTTGTGCTTTCTTCTTTT -10 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.80.4 chr1 + 2708 7 full-splice_match PRXL2B ENST00000419916.8 2747 7 32 7 -8 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 58 14.225396 1.153064 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGAGCCACTTTTTGTGCTTT 1 TRUE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 58 NA PB.80.5 chr1 + 2668 7 full-splice_match PRXL2B ENST00000378427.6 2689 7 19 2 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 51 12.508538 1.097207 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGAGCCACTTTTTGTGCTTT 9 TRUE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 51 NA PB.80.7 chr1 + 2690 7 novel_in_catalog PRXL2B novel 2765 7 NA NA 4 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTTTTTGTGCTTTCTTCTT 13 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.80.8 chr1 + 2748 7 full-splice_match PRXL2B ENST00000444521.6 2827 7 73 6 6 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGAGCCACTTTTTGTGCTTT 15 TRUE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.80.9 chr1 + 2503 5 incomplete-splice_match PRXL2B ENST00000378425.9 2665 6 301 3 9 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GCCACTTTTTGTGCTTTCTT -32 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.80.10 chr1 + 2661 6 incomplete-splice_match PRXL2B ENST00000444521.6 2827 7 304 4 12 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCCACTTTTTGTGCTTTCT -29 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.80.11 chr1 + 2628 6 full-splice_match PRXL2B ENST00000481683.5 689 6 15 -1954 15 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTTTTTGTGCTTTCTTCTT -26 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.80.12 chr1 + 2592 6 full-splice_match PRXL2B ENST00000484099.5 2577 6 -17 2 -17 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTTTTTGTGCTTTCTTCTT -22 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.80.13 chr1 + 3246 4 incomplete-splice_match PRXL2B ENST00000378427.6 2689 7 286 -4 -1 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTTTTTGTGCTTTCTTCTT 1 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.80.14 chr1 + 2543 6 incomplete-splice_match PRXL2B ENST00000378427.6 2689 7 291 -3 4 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 35 8.584291 0.933704 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CACTTTTTGTGCTTTCTTCT 6 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 35 NA PB.80.15 chr1 + 2565 6 incomplete-splice_match PRXL2B ENST00000419916.8 2747 7 319 5 11 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.150575 0.711856 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCCACTTTTTGTGCTTTCT 13 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 21 NA PB.80.16 chr1 + 2410 6 incomplete-splice_match PRXL2B ENST00000378427.6 2689 7 425 -4 138 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTTTTTGTGCTTTCTTCTT 140 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.80.17 chr1 + 2272 4 incomplete-splice_match PRXL2B ENST00000484099.5 2577 6 1345 2 -171 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTTTTTGTGCTTTCTTCTT 1340 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.80.18 chr1 + 2281 4 incomplete-splice_match PRXL2B ENST00000419916.8 2747 7 1649 1 -168 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTTTTTGTGCTTTCTTCTT 1343 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.80.19 chr1 + 2171 2 full-splice_match PRXL2B ENST00000476686.1 2506 2 330 5 330 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCCACTTTTTGTGCTTTCT 1841 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 8 NA PB.81.3 chr1 + 1295 2 intergenic novelGene_45 novel NA NA NA NA NA NA multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GAGAGACATCTGTGAATACC 4612 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.82.1 chr1 - 1573 2 full-splice_match MMEL1 ENST00000464195.1 559 2 34 -1048 23 -7 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGAAATCAGAGGCCTTGC -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.84.1 chr1 + 2805 15 full-splice_match ARHGEF16 ENST00000378378.9 2822 15 11 6 11 -6 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAGAACCTGGATTTTCACA 7 TRUE NA NA ATTAAA -10 NA NA NA 7 NA PB.84.2 chr1 + 2811 15 novel_not_in_catalog ARHGEF16 novel 2822 15 NA NA 39 -5 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAACCTGGATTTTCACAG -2 TRUE NA NA ATTAAA -11 NA NA NA 6 NA PB.84.6 chr1 + 2417 14 incomplete-splice_match ARHGEF16 ENST00000378378.9 2822 15 8652 7 -2688 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TTAAGAACCTGGATTTTCAC 3030 FALSE NA NA ATTAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.84.7 chr1 + 1926 12 full-splice_match ARHGEF16 ENST00000378371.6 2219 12 288 5 288 -5 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAACCTGGATTTTCACAG 416 FALSE NA NA ATTAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.84.8 chr1 + 1683 10 incomplete-splice_match ARHGEF16 ENST00000378371.6 2219 12 2569 5 996 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAACCTGGATTTTCACAG 1014 FALSE NA NA ATTAAA -11 NA NA NA 3 NA PB.84.9 chr1 + 2202 8 full-splice_match ARHGEF16 ENST00000485984.1 2340 8 133 5 133 -5 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAACCTGGATTTTCACAG 1278 FALSE NA NA ATTAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.84.10 chr1 + 1435 8 incomplete-splice_match ARHGEF16 ENST00000378371.6 2219 12 6463 5 665 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAACCTGGATTTTCACAG 1810 FALSE NA NA ATTAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.84.11 chr1 + 1239 6 incomplete-splice_match ARHGEF16 ENST00000378371.6 2219 12 9031 5 3233 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAACCTGGATTTTCACAG 4378 FALSE NA NA ATTAAA -11 NA NA NA 4 NA PB.84.12 chr1 + 1074 5 incomplete-splice_match ARHGEF16 ENST00000378371.6 2219 12 11008 5 5210 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAACCTGGATTTTCACAG 6355 FALSE NA NA ATTAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.87.2 chr1 - 882 6 incomplete-splice_match WRAP73 ENST00000270708.12 1692 12 14911 1 241 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTACTTCTCTTCTTGAAAC NA FALSE NA NA GGGGCT -39 NA NA NA 2 NA PB.87.4 chr1 - 2008 11 full-splice_match WRAP73 ENST00000378322.7 1998 11 -15 5 -10 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.924247 0.593756 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACTACTTCTCTTCTTGAAA 16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.87.5 chr1 - 1690 12 full-splice_match WRAP73 ENST00000270708.12 1692 12 0 2 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 74 18.149643 1.258868 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACTACTTCTCTTCTTGAAA -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 74 NA PB.87.7 chr1 - 1639 12 novel_not_in_catalog WRAP73 novel 1692 12 NA NA -10 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACTACTTCTCTTCTTGAAA 16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.87.9 chr1 - 1486 11 incomplete-splice_match WRAP73 ENST00000270708.12 1692 12 2574 2 2497 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACTACTTCTCTTCTTGAAA 2560 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.87.10 chr1 - 1321 10 incomplete-splice_match WRAP73 ENST00000270708.12 1692 12 3364 2 3287 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACTACTTCTCTTCTTGAAA 3350 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.87.11 chr1 - 1096 8 incomplete-splice_match WRAP73 ENST00000270708.12 1692 12 13083 2 37 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACTACTTCTCTTCTTGAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.87.12 chr1 - 2079 2 incomplete-splice_match WRAP73 ENST00000378322.7 1998 11 16651 7 2026 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACAACTACTTCTCTTCTTGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.87.13 chr1 - 1543 11 novel_in_catalog WRAP73 novel 1692 12 NA NA 10 -4 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACAACTACTTCTCTTCTTGA -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.87.14 chr1 - 768 4 incomplete-splice_match WRAP73 ENST00000270708.12 1692 12 16600 4 1930 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACAACTACTTCTCTTCTTGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.87.16 chr1 - 1856 10 incomplete-splice_match WRAP73 ENST00000378322.7 1998 11 2502 10 2470 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATACAACTACTTCTCTTCT 2533 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.87.17 chr1 - 1590 8 incomplete-splice_match WRAP73 ENST00000378322.7 1998 11 11236 10 803 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATACAACTACTTCTCTTCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.87.19 chr1 - 2713 7 novel_in_catalog WRAP73 novel 1692 12 NA NA 14 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAAAAAAAACTTTTTTTC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.88.1 chr1 + 5410 14 full-splice_match TP73 ENST00000378295.9 5192 14 -223 5 -223 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATGACCGGTTCTCATGACT NA FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.88.2 chr1 + 1663 5 incomplete-splice_match TP73 ENST00000378290.4 1831 12 31268 -813 1848 537 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACATGGTGGGTCAGCTTTTT NA FALSE NA NA GATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.89.1 chr1 - 1517 5 full-splice_match TP73-AS1 ENST00000647831.1 3831 5 1359 955 -72 1 alternative_3end5end TRUE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CCTTGTGCTGAAAGCACTCA 1388 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.89.2 chr1 - 3572 5 full-splice_match TP73-AS1 ENST00000648600.1 3088 5 -491 7 -2 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACCCTTGTGCTGAAAGCACT -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.89.3 chr1 - 3518 5 full-splice_match TP73-AS1 ENST00000423764.6 3525 5 6 1 6 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACCCTTGTGCTGAAAGCACT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.89.6 chr1 - 1856 5 full-splice_match TP73-AS1 ENST00000423764.6 3525 5 1668 1 200 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACCCTTGTGCTGAAAGCACT 1660 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.89.8 chr1 - 3311 2 incomplete-splice_match TP73-AS1 ENST00000650545.1 2408 6 3838 1094 -19 -2 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CACCCTTGTGCTGAAAGCAC 4488 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.89.9 chr1 - 2921 5 full-splice_match TP73-AS1 ENST00000648479.1 3719 5 -667 1465 -8 -2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CACCCTTGTGCTGAAAGCAC -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.90.2 chr1 - 4283 6 novel_in_catalog LRRC47 novel 4303 7 NA NA 4 915 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGCTTGTGTAAAGACTCT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.90.3 chr1 - 2655 7 full-splice_match LRRC47 ENST00000378251.3 4303 7 -13 1661 -13 915 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 183 44.883579 1.652087 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGCTTGTGTAAAGACTCT -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 183 NA PB.90.5 chr1 - 2456 7 full-splice_match LRRC47 ENST00000378251.3 4303 7 186 1661 186 915 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGCTTGTGTAAAGACTCT 185 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.90.6 chr1 - 2000 6 incomplete-splice_match LRRC47 ENST00000378251.3 4303 7 9193 1661 -3130 915 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGCTTGTGTAAAGACTCT 9192 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.90.7 chr1 - 1814 6 incomplete-splice_match LRRC47 ENST00000378251.3 4303 7 9379 1661 -2944 915 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGCTTGTGTAAAGACTCT 9378 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.90.8 chr1 - 1718 6 incomplete-splice_match LRRC47 ENST00000378251.3 4303 7 9475 1661 -2848 915 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGCTTGTGTAAAGACTCT 9474 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.90.9 chr1 - 1601 6 incomplete-splice_match LRRC47 ENST00000378251.3 4303 7 9592 1661 -2731 915 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGCTTGTGTAAAGACTCT 9591 FALSE NA NA GGGGCT -7 NA NA NA 5 NA PB.90.10 chr1 - 1358 4 full-splice_match LRRC47 ENST00000462356.5 575 4 132 -915 4 915 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.697920 0.431029 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGCTTGTGTAAAGACTCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.90.11 chr1 - 1277 3 incomplete-splice_match LRRC47 ENST00000462356.5 575 4 1445 -915 1317 915 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.697920 0.431029 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGCTTGTGTAAAGACTCT NA FALSE NA NA AAGAAA -3 NA NA NA 11 NA PB.90.12 chr1 - 1144 2 incomplete-splice_match LRRC47 ENST00000462356.5 575 4 2637 -915 2509 915 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.924247 0.593756 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGCTTGTGTAAAGACTCT NA FALSE NA NA AAAACA -10 NA NA NA 16 NA PB.90.17 chr1 - 1416 6 incomplete-splice_match LRRC47 ENST00000378251.3 4303 7 9404 2034 -2919 542 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGATGCTATGTTGTCGTTAC 9403 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.90.18 chr1 - 1549 7 full-splice_match LRRC47 ENST00000378251.3 4303 7 7 2747 7 -16 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAATAAAGAGGAAGGATCA 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.92.1 chr1 + 1237 4 full-splice_match SMIM1 ENST00000642557.4 506 4 22 -753 0 727 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCCCTTGCCATAGTTACCT -13 TRUE NA NA AATGAA -12 NA NA NA 3 NA PB.92.2 chr1 + 1092 4 full-splice_match SMIM1 ENST00000444870.7 547 4 -16 -529 0 529 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAAGTGGGCACAGTTCTTCC -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.92.3 chr1 + 533 4 full-splice_match SMIM1 ENST00000444870.7 547 4 -13 27 3 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACACGTGAGAGCACAGGCCT -10 TRUE NA NA AATAAA -34 NA NA NA 3 NA PB.93.1 chr1 - 1680 3 incomplete-splice_match CEP104 ENST00000675966.1 7766 17 22794 1881 -6753 -936 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATCTCCACGTTTGGTAAAC NA FALSE NA NA AAAAAG -2 NA NA NA 2 NA PB.93.2 chr1 - 1733 10 incomplete-splice_match CEP104 ENST00000675966.1 7766 17 14788 2697 7 456 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTTTTTTTAATCGTAGTTTT 5946 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.93.3 chr1 - 1280 8 incomplete-splice_match CEP104 ENST00000675966.1 7766 17 16706 2697 1925 456 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTTTTTTTAATCGTAGTTTT 7864 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.93.4 chr1 - 3721 22 full-splice_match CEP104 ENST00000378230.8 6431 22 0 2710 0 443 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGAGAACATCTTTTTTT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.93.5 chr1 - 1370 9 incomplete-splice_match CEP104 ENST00000675966.1 7766 17 16186 2710 1405 443 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGAGAACATCTTTTTTT 7344 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.93.6 chr1 - 1021 4 incomplete-splice_match CEP104 ENST00000675966.1 7766 17 22442 2710 -7105 443 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGAGAACATCTTTTTTT NA FALSE NA NA AATACA -35 NA NA NA 4 NA PB.93.12 chr1 - 2302 12 full-splice_match CEP104 ENST00000494653.5 2174 12 -1 -127 -1 127 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TTAATAGAAATATTTTCATT 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.93.16 chr1 - 1161 7 novel_not_in_catalog CEP104 novel 1661 4 NA NA 0 1299 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.188451 0.503580 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTTAGACTTTAAATCTGTT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.93.17 chr1 - 1080 5 novel_not_in_catalog CEP104 novel 1661 4 NA NA 0 34 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATAATAGATTATTTATTG -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.94.1 chr1 + 3029 7 full-splice_match DFFB ENST00000378209.8 2833 7 -205 9 4 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAATAGACATGTCAAGAA -6 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 5 NA PB.94.2 chr1 + 2837 7 full-splice_match DFFB ENST00000378209.8 2833 7 -13 9 3 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAATAGACATGTCAAGAA -10 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 3 NA PB.96.4 chr1 + 1166 5 incomplete-splice_match AJAP1 ENST00000378191.5 12102 6 57896 9485 1350 5255 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTTTTTTTGTACTGTAGCA 7073 FALSE NA NA TATAAA -26 NA NA NA 2 NA PB.96.5 chr1 + 977 3 incomplete-splice_match AJAP1 ENST00000378191.5 12102 6 117714 9348 61168 5392 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 CAACTCACGTCACACACATA 5222 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.97.6 chr1 - 1642 4 full-splice_match C1orf174 ENST00000361605.4 1645 4 -3 6 -3 -6 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 177 43.411987 1.637610 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATATTTTGAAAGCAGTC -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 177 NA PB.97.8 chr1 - 1642 2 incomplete-splice_match C1orf174 ENST00000680169.1 1567 4 8946 -14 8946 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATATTTTGAAAGCAGTC 8985 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.97.9 chr1 - 1476 3 incomplete-splice_match C1orf174 ENST00000680169.1 1567 4 7287 -14 7287 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATATTTTGAAAGCAGTC 7326 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.97.10 chr1 - 1133 2 incomplete-splice_match C1orf174 ENST00000680169.1 1567 4 9455 -14 9455 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATATTTTGAAAGCAGTC 9494 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.97.11 chr1 - 1043 2 incomplete-splice_match C1orf174 ENST00000680169.1 1567 4 9545 -14 9545 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATATTTTGAAAGCAGTC 9584 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.97.12 chr1 - 1748 2 incomplete-splice_match C1orf174 ENST00000680169.1 1567 4 8839 -13 8839 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 GAAAATATTTTGAAAGCAGT 8878 FALSE NA NA AGTAAA -44 NA NA NA 2 NA PB.100.3 chr1 - 3860 23 incomplete-splice_match NPHP4 ENST00000378156.9 4955 30 44239 0 -42862 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTCCCTTGGCAGTTTTCTTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.100.4 chr1 - 3542 21 incomplete-splice_match NPHP4 ENST00000378156.9 4955 30 59170 0 -27931 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTCCCTTGGCAGTTTTCTTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.100.5 chr1 - 1319 7 incomplete-splice_match NPHP4 ENST00000478423.6 4467 26 124629 0 -143 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTCCCTTGGCAGTTTTCTTG NA FALSE NA NA GGGGCT -11 NA NA NA 3 NA PB.100.6 chr1 - 1212 6 incomplete-splice_match NPHP4 ENST00000478423.6 4467 26 125360 0 588 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTCCCTTGGCAGTTTTCTTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.100.7 chr1 - 2486 14 incomplete-splice_match NPHP4 ENST00000478423.6 4467 26 101500 2 -8075 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTTCCCTTGGCAGTTTTCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.101.2 chr1 + 3822 15 full-splice_match KCNAB2 ENST00000666163.1 3878 15 47 9 1 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.433716 0.535764 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCGGTCTCTGTGACTTTTT 3 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 14 NA PB.101.3 chr1 + 3856 16 full-splice_match KCNAB2 ENST00000378097.6 4302 16 432 14 1 0 alternative_5end TRUE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCGGTCTCTGTGACTTTTT 11 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 8 NA PB.101.5 chr1 + 3879 15 full-splice_match KCNAB2 ENST00000352527.6 4001 15 123 -1 -8 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 75 18.394909 1.264698 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCGGTCTCTGTGACTTTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 75 NA PB.101.7 chr1 + 4689 14 novel_in_catalog KCNAB2 novel 4001 15 NA NA -7 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCGGTCTCTGTGACTTTTT 13 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.101.8 chr1 + 3874 16 full-splice_match KCNAB2 ENST00000428161.6 2134 16 320 -2060 -1 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCGGTCTCTGTGACTTTTT -6 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 9 NA PB.101.9 chr1 + 1205 15 full-splice_match KCNAB2 ENST00000352527.6 4001 15 170 2626 -1 -9 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 CAAAAAGGACTACAGATCCT -6 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.101.13 chr1 + 3646 14 incomplete-splice_match KCNAB2 ENST00000669250.1 3883 15 13293 1 4673 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCGGTCTCTGTGACTTTTT 5528 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.101.15 chr1 + 3418 10 incomplete-splice_match KCNAB2 ENST00000662363.1 2958 14 19464 -1159 -2284 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GGTCTCTGTGACTTTTTGCT NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.101.16 chr1 + 3274 7 incomplete-splice_match KCNAB2 ENST00000662363.1 2958 14 24656 -1156 113 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCGGTCTCTGTGACTTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.101.17 chr1 + 3167 6 incomplete-splice_match KCNAB2 ENST00000662363.1 2958 14 28687 -1156 40 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCGGTCTCTGTGACTTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.101.18 chr1 + 2907 3 incomplete-splice_match KCNAB2 ENST00000671076.1 4620 5 2151 8 2151 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCGGTCTCTGTGACTTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.101.19 chr1 + 2717 2 incomplete-splice_match KCNAB2 ENST00000671076.1 4620 5 2853 8 2853 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.943186 0.468818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCGGTCTCTGTGACTTTTT 45 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 12 NA PB.102.2 chr1 + 1913 3 full-splice_match RNF207 ENST00000484435.1 551 3 -615 -747 39 4 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 TAAAAAAAAAAAAATTTTTT 5945 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.102.4 chr1 + 1334 3 full-splice_match RNF207 ENST00000484435.1 551 3 -35 -748 -25 5 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAAAAAAATTTTTTT -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.102.5 chr1 + 1545 2 novel_in_catalog RNF207 novel 551 3 NA NA -3 5 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAAAAAAATTTTTTT 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.103.2 chr1 - 2070 4 full-splice_match RPL22 ENST00000234875.9 2061 4 -24 15 -24 -15 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 100 24.526546 1.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCTACTCTTACTGTACGAGG -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 100 NA PB.103.6 chr1 - 1997 3 full-splice_match RPL22 ENST00000480661.1 2279 3 1825 -1543 1815 -12 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTCTTACTGTACGAGGCTT 3141 FALSE NA NA AATACA -20 NA NA NA 5 NA PB.103.7 chr1 - 1831 2 incomplete-splice_match RPL22 ENST00000234875.9 2061 4 6620 12 6578 -12 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTCTTACTGTACGAGGCTT 7904 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.103.12 chr1 - 1882 2 incomplete-splice_match RPL22 ENST00000234875.9 2061 4 6568 13 6526 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.188451 0.503580 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TACTCTTACTGTACGAGGCT 7852 FALSE NA NA ATTAAA -7 NA NA NA 13 NA PB.103.17 chr1 - 871 4 full-splice_match RPL22 ENST00000234875.9 2061 4 -9 1199 -9 356 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 196 48.072029 1.681893 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTCGTCTTACTTTCATTTT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 196 NA PB.103.18 chr1 - 765 3 full-splice_match RPL22 ENST00000480661.1 2279 3 1870 -356 1860 356 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTCGTCTTACTTTCATTTT 3186 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.103.19 chr1 - 671 2 incomplete-splice_match RPL22 ENST00000480661.1 2279 3 6561 -356 6551 356 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTCGTCTTACTTTCATTTT 7877 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.103.21 chr1 - 1203 4 full-splice_match RPL22 ENST00000497965.5 786 4 -22 -395 -22 355 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATTCGTCTTACTTTCATTT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.103.22 chr1 - 1121 5 full-splice_match RPL22 ENST00000471204.5 524 5 -125 -472 20 355 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATTCGTCTTACTTTCATTT 24 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.103.23 chr1 - 953 4 full-splice_match RPL22 ENST00000497965.5 786 4 228 -395 228 355 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATTCGTCTTACTTTCATTT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.103.24 chr1 - 843 4 novel_not_in_catalog RPL22 novel 2061 4 NA NA 1 355 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATTCGTCTTACTTTCATTT 11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.103.25 chr1 - 2243 3 full-splice_match RPL22 ENST00000480661.1 2279 3 -8 44 -8 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.697920 0.431029 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAATGGTGGTTTATCCTTG 9822 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.103.26 chr1 - 1909 3 full-splice_match RPL22 ENST00000480661.1 2279 3 326 44 316 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAATGGTGGTTTATCCTTG 9559 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.103.28 chr1 - 1207 4 novel_not_in_catalog RPL22 novel 508 4 NA NA -5 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAATGGTGGTTTATCCTTG 9835 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.103.29 chr1 - 1061 4 novel_not_in_catalog RPL22 novel 2061 4 NA NA 141 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAATGGTGGTTTATCCTTG 9981 FALSE NA NA GGGGCT -44 NA NA NA 3 NA PB.103.30 chr1 - 1008 6 novel_not_in_catalog RPL22 novel 806 5 NA NA -67 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAATGGTGGTTTATCCTTG 14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.103.31 chr1 - 984 6 novel_in_catalog RPL22 novel 806 5 NA NA 20 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAATGGTGGTTTATCCTTG 24 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.103.32 chr1 - 924 3 full-splice_match RPL22 ENST00000480661.1 2279 3 1311 44 1301 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAATGGTGGTTTATCCTTG 2627 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.103.33 chr1 - 804 4 full-splice_match RPL22 ENST00000497965.5 786 4 -22 4 -22 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAATGGTGGTTTATCCTTG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.103.34 chr1 - 666 5 full-splice_match RPL22 ENST00000471204.5 524 5 -69 -73 -69 -4 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAATGGTGGTTTATCCTTG 12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.103.35 chr1 - 462 4 full-splice_match RPL22 ENST00000234875.9 2061 4 0 1599 0 -4 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 32 7.848495 0.894786 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAATGGTGGTTTATCCTTG 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 32 NA PB.103.36 chr1 - 738 5 novel_in_catalog RPL22 novel 806 5 NA NA 512 -8 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AACCAAAATGGTGGTTTATC 661 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.104.1 chr1 - 1197 2 novel_not_in_catalog ICMT novel 328 2 NA NA -16 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACCACAGTGTGATTGTCTGG 1087 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.104.3 chr1 - 3295 7 novel_not_in_catalog ICMT novel 2612 6 NA NA 9 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACCACAGTGTGATTGTCTG 22 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.104.4 chr1 - 3208 6 novel_not_in_catalog ICMT novel 2612 6 NA NA -3 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACCACAGTGTGATTGTCTG 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.104.6 chr1 - 2624 6 novel_not_in_catalog ICMT novel 2612 6 NA NA -33 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACCACAGTGTGATTGTCTG -28 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.104.8 chr1 - 1893 2 novel_not_in_catalog ICMT novel 328 2 NA NA -825 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACCACAGTGTGATTGTCTG 278 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.104.9 chr1 - 1681 2 novel_not_in_catalog ICMT novel 2612 6 NA NA -485 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACCACAGTGTGATTGTCTG 618 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.104.11 chr1 - 1201 2 novel_not_in_catalog ICMT novel 328 2 NA NA -489 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACCACAGTGTGATTGTCTG 614 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.104.12 chr1 - 1232 2 novel_not_in_catalog ICMT novel 328 2 NA NA -164 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACCACAGTGTGATTGTCTG 939 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.104.13 chr1 - 1017 2 novel_not_in_catalog ICMT novel 328 2 NA NA -1 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACCACAGTGTGATTGTCTG 1102 FALSE NA NA GATAAA -31 NA NA NA 2 NA PB.104.17 chr1 - 2550 5 full-splice_match ICMT ENST00000343813.10 4795 5 -15 2260 -7 38 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 46 11.282211 1.052394 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CAAAGAGGCTTACGGGTTCA -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 46 NA PB.104.20 chr1 - 2340 4 full-splice_match ICMT ENST00000474756.1 1227 4 -6 -1107 -6 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.678982 0.565728 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTTCATGGCTTAATGAATT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.104.21 chr1 - 2302 5 full-splice_match ICMT ENST00000343813.10 4795 5 194 2299 194 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTTCATGGCTTAATGAATT 207 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.104.22 chr1 - 1973 2 incomplete-splice_match ICMT ENST00000489498.5 2612 6 3869 1 3861 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTTCATGGCTTAATGAATT 3874 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.104.23 chr1 - 1837 2 incomplete-splice_match ICMT ENST00000489498.5 2612 6 4005 1 3997 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTTCATGGCTTAATGAATT 4010 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.104.28 chr1 - 2615 6 full-splice_match ICMT ENST00000489498.5 2612 6 -6 3 -6 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.150575 0.711856 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGATTTCATGGCTTAATGAA -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 21 NA PB.104.31 chr1 - 2002 5 full-splice_match ICMT ENST00000343813.10 4795 5 -5 2798 3 -500 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AACTAAGATTCAGTCAGTAT 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.104.32 chr1 - 1382 5 full-splice_match ICMT ENST00000343813.10 4795 5 -24 3437 -16 -31 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAACACAGACCGCTTTAA -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.107.1 chr1 - 1618 9 full-splice_match ACOT7 ENST00000377855.6 1614 9 -4 0 -4 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 71 17.413847 1.240895 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCACGTGTCCTGGGTGGT -30 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 71 NA PB.107.2 chr1 - 1525 9 full-splice_match ACOT7 ENST00000377855.6 1614 9 89 0 89 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCACGTGTCCTGGGTGGT 8110 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.107.3 chr1 - 1419 9 full-splice_match ACOT7 ENST00000377842.7 1813 9 394 0 394 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.188451 0.503580 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCACGTGTCCTGGGTGGT -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.107.4 chr1 - 1426 9 full-splice_match ACOT7 ENST00000377845.7 1432 9 6 0 6 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.169513 0.620085 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCACGTGTCCTGGGTGGT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.107.5 chr1 - 1435 8 novel_in_catalog ACOT7 novel 1614 9 NA NA -6 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCACGTGTCCTGGGTGGT -32 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.107.6 chr1 - 1437 9 full-splice_match ACOT7 ENST00000608083.5 1403 9 -38 4 -38 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 293 71.862778 1.856504 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCACGTGTCCTGGGTGGT -1 TRUE NA NA GGGGCT -18 NA NA NA 293 NA PB.107.7 chr1 - 1329 8 novel_in_catalog ACOT7 novel 1804 9 NA NA -17 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCACGTGTCCTGGGTGGT -2 TRUE NA NA CATAAA -27 NA NA NA 4 NA PB.107.8 chr1 - 1287 8 incomplete-splice_match ACOT7 ENST00000377842.7 1813 9 9485 0 2390 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.150575 0.711856 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCACGTGTCCTGGGTGGT 9716 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 21 NA PB.107.9 chr1 - 1177 7 incomplete-splice_match ACOT7 ENST00000377842.7 1813 9 19754 0 12659 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCACGTGTCCTGGGTGGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.107.10 chr1 - 1042 7 incomplete-splice_match ACOT7 ENST00000377842.7 1813 9 19889 0 12794 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCACGTGTCCTGGGTGGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.107.11 chr1 - 926 5 incomplete-splice_match ACOT7 ENST00000377842.7 1813 9 31932 0 24837 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCACGTGTCCTGGGTGGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.107.12 chr1 - 803 4 incomplete-splice_match ACOT7 ENST00000377842.7 1813 9 40775 0 -23065 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCACGTGTCCTGGGTGGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.107.14 chr1 - 2433 5 incomplete-splice_match ACOT7 ENST00000377860.8 1472 10 -47 61227 -47 -44247 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAGAAAGAAAGAAAA 6 TRUE NA NA GGGGCT -27 NA NA NA 3 NA PB.108.1 chr1 - 1986 9 incomplete-splice_match TNFRSF25 ENST00000356876.8 1968 10 101 389 27 -24 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAGAAAACAAAACAAAACA 9031 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.108.2 chr1 - 1585 10 full-splice_match TNFRSF25 ENST00000356876.8 1968 10 -6 389 -4 -24 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.697920 0.431029 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAGAAAACAAAACAAAACA -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.108.3 chr1 - 1483 9 novel_in_catalog TNFRSF25 novel 1968 10 NA NA -10 -24 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAGAAAACAAAACAAAACA -24 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.108.4 chr1 - 1334 7 novel_in_catalog TNFRSF25 novel 1706 9 NA NA 2 -24 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAGAAAACAAAACAAAACA -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.108.5 chr1 - 1200 4 full-splice_match TNFRSF25 ENST00000453260.6 984 4 89 -305 89 -24 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAGAAAACAAAACAAAACA 8323 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.109.1 chr1 - 4185 21 novel_in_catalog PLEKHG5 novel 3731 22 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTGGGAAGAGTCCTTTGCT 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.109.2 chr1 - 2276 10 incomplete-splice_match PLEKHG5 ENST00000489097.6 3938 19 6005 1 0 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTGGGAAGAGTCCTTTGCT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.109.3 chr1 - 3676 21 full-splice_match PLEKHG5 ENST00000340850.10 3699 21 19 4 5 2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TCCACTGGGAAGAGTCCTTT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.110.2 chr1 + 3451 13 novel_not_in_catalog ESPN novel 3543 13 NA NA 0 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTCGCTGTGGCCGCGACTT -1 TRUE NA NA ATTAAA -29 NA NA NA 2 NA PB.110.4 chr1 + 1951 6 novel_not_in_catalog ESPN novel 1494 7 NA NA -1017 4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTCCGGTTCACTCACTCGCT 1630 FALSE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.110.5 chr1 + 1391 6 novel_not_in_catalog ESPN novel 1494 7 NA NA -1016 -28 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAACAACAACAAATGCTGCT 1631 FALSE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 2 NA PB.110.6 chr1 + 1905 7 novel_not_in_catalog ESPN novel 1494 7 NA NA -3 3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCTCCGGTTCACTCACTCGC 2664 FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.110.7 chr1 + 1383 7 novel_not_in_catalog ESPN novel 1339 8 NA NA -35 4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CATATATTTGCATGTTCGTT 646 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.110.8 chr1 + 1884 7 novel_not_in_catalog ESPN novel 1339 8 NA NA -2 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTCGCTGTGGCCGCGACTT -26 TRUE NA NA ATTAAA -29 NA NA NA 2 NA PB.110.9 chr1 + 1925 6 novel_not_in_catalog ESPN novel 1339 8 NA NA 45 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TCACTCGCTGTGGCCGCGAC 21 TRUE NA NA ATTAAA -27 NA NA NA 4 NA PB.110.10 chr1 + 1564 6 novel_not_in_catalog ESPN novel 813 7 NA NA -57 53 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GCCCCGTGGGTGGTGACTTT 343 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.110.11 chr1 + 1425 6 novel_not_in_catalog ESPN novel 813 7 NA NA 21 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CATGCCGACTTACATATATT -3 TRUE NA NA AAAAAG -45 NA NA NA 8 NA PB.110.12 chr1 + 2031 5 novel_not_in_catalog ESPN novel 1494 7 NA NA 26 3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCTCCGGTTCACTCACTCGC 2 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.110.13 chr1 + 1953 6 novel_not_in_catalog ESPN novel 813 7 NA NA 26 4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTCCGGTTCACTCACTCGCT 2 TRUE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 7 NA PB.110.14 chr1 + 1559 5 novel_not_in_catalog ESPN novel 1494 7 NA NA 26 52 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCCCCGTGGGTGGTGACTT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.110.15 chr1 + 1546 5 novel_not_in_catalog ESPN novel 813 7 NA NA 26 4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTCCGGTTCACTCACTCGCT 2 TRUE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.110.16 chr1 + 1331 7 novel_not_in_catalog ESPN novel 813 7 NA NA 26 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATGCCGACTTACATATATTT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.110.17 chr1 + 1858 7 novel_not_in_catalog ESPN novel 813 7 NA NA -25 1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGGCTCCGGTTCACTCACTC 4 TRUE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 7 NA PB.110.18 chr1 + 1740 5 novel_not_in_catalog ESPN novel 813 7 NA NA -25 3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCTCCGGTTCACTCACTCGC 4 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.110.19 chr1 + 1291 5 novel_not_in_catalog ESPN novel 1494 7 NA NA 241 52 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCCCCGTGGGTGGTGACTT 244 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.110.20 chr1 + 1140 4 novel_not_in_catalog ESPN novel 1494 7 NA NA -109 2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TACATATATTTGCATGTTCG 429 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.110.21 chr1 + 1637 4 novel_not_in_catalog ESPN novel 544 4 NA NA -53 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTCGCTGTGGCCGCGACTT -1 TRUE NA NA ATTAAA -29 NA NA NA 2 NA PB.111.5 chr1 - 1929 3 novel_not_in_catalog NOL9 novel 6627 12 NA NA -23 -10 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAACATGAATTTAGTTGTG -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.111.7 chr1 - 752 2 novel_not_in_catalog NOL9 novel 6627 12 NA NA 7765 -10 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAACATGAATTTAGTTGTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.111.9 chr1 - 2406 12 full-splice_match NOL9 ENST00000377705.6 6627 12 -2 4223 -2 -4223 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 20 4.905309 0.690666 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGTTCTTCAGGGACCTGG 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 20 NA PB.111.10 chr1 - 1459 8 incomplete-splice_match NOL9 ENST00000377705.6 6627 12 9642 4226 146 -4226 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CAGAAAGTTCTTCAGGGACC 9900 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.111.11 chr1 - 1869 8 novel_in_catalog NOL9 novel 6627 12 NA NA -23 -4322 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTTGTTCTAGTCTTCTGT -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.111.12 chr1 - 2275 12 full-splice_match NOL9 ENST00000377705.6 6627 12 -23 4375 -23 -4375 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CGTGAATGTCATATAGTAGT -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.111.13 chr1 - 1559 8 incomplete-splice_match NOL9 ENST00000377705.6 6627 12 0 11103 0 -221 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTTGGCTGAAGAATTATTT 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.112.2 chr1 + 2251 11 novel_in_catalog ZBTB48 novel 2347 11 NA NA 0 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATTTCAGCCTGACAGTCTG -13 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 6 NA PB.112.4 chr1 + 2252 11 novel_in_catalog ZBTB48 novel 2347 11 NA NA 4 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.697920 0.431029 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATTTCAGCCTGACAGTCTG 7 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 11 NA PB.112.5 chr1 + 1231 9 novel_in_catalog ZBTB48 novel 2347 11 NA NA 4 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTCAGCCTGACAGTCTGT 7 TRUE NA NA AATAAA -23 NA NA NA 2 NA PB.112.6 chr1 + 2301 11 full-splice_match ZBTB48 ENST00000377674.9 2347 11 44 2 21 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.188451 0.503580 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATTTCAGCCTGACAGTCTG 24 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 13 NA PB.112.7 chr1 + 1605 10 incomplete-splice_match ZBTB48 ENST00000377674.9 2347 11 1137 9 1043 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTCTCGTATTTCAGCCTGA 1070 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.112.8 chr1 + 1045 7 full-splice_match ZBTB48 ENST00000482360.5 2484 7 1437 2 -517 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATTTCAGCCTGACAGTCTG 6678 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.113.1 chr1 + 3576 4 full-splice_match PHF13 ENST00000377648.5 3632 4 21 35 -10 -35 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 31 7.603229 0.880998 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GATTCAAGGTTCAGGCGATT 5 TRUE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 31 NA PB.113.2 chr1 + 1636 4 full-splice_match PHF13 ENST00000377648.5 3632 4 23 1973 -8 -588 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCTTTTTCTTGAGTGTTA 7 TRUE NA NA AATGAA -14 NA NA NA 5 NA PB.113.3 chr1 + 2742 2 incomplete-splice_match PHF13 ENST00000377648.5 3632 4 6450 35 6419 -35 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GATTCAAGGTTCAGGCGATT 3423 FALSE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 4 NA PB.113.4 chr1 + 2598 2 incomplete-splice_match PHF13 ENST00000377648.5 3632 4 6585 44 6554 -44 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGTTCATGATTCAAGGTT 3558 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.114.2 chr1 - 4486 4 full-splice_match KLHL21 ENST00000377658.8 4487 4 0 1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.943186 0.468818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTTGGAGTCATTGCCTTTG -2 TRUE NA NA TATAAA -23 NA NA NA 12 NA PB.114.3 chr1 - 3901 4 full-splice_match KLHL21 ENST00000377658.8 4487 4 585 1 585 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTTGGAGTCATTGCCTTTG 1409 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.114.4 chr1 - 3554 4 full-splice_match KLHL21 ENST00000377658.8 4487 4 932 1 932 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTTGGAGTCATTGCCTTTG 1756 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.114.5 chr1 - 3386 3 incomplete-splice_match KLHL21 ENST00000496707.5 824 4 391 -2656 391 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTTGGAGTCATTGCCTTTG 4268 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.114.15 chr1 - 4327 4 full-splice_match KLHL21 ENST00000377658.8 4487 4 158 2 158 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATTTGGAGTCATTGCCTTT 982 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.115.1 chr1 + 1238 5 incomplete-splice_match THAP3 ENST00000054650.9 1361 6 318 0 5 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 116 28.450792 1.454094 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CGGTGTCGCTCCCATCATCA -4 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 116 NA PB.115.2 chr1 + 1653 5 incomplete-splice_match THAP3 ENST00000054650.9 1361 6 327 -424 -3 424 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GATTTCCTAACTTGGGGTCT 5 TRUE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.115.3 chr1 + 1110 5 novel_not_in_catalog THAP3 novel 1361 6 NA NA -3 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACGGTGTCGCTCCCATCATC 5 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 4 NA PB.115.4 chr1 + 1304 6 full-splice_match THAP3 ENST00000487819.5 840 6 -24 -440 3 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACGGTGTCGCTCCCATCATC 11 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 9 NA PB.115.5 chr1 + 1517 4 full-splice_match THAP3 ENST00000472925.1 983 4 -25 -509 7 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACGGTGTCGCTCCCATCAT 15 TRUE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 7 NA PB.115.6 chr1 + 1226 4 incomplete-splice_match THAP3 ENST00000054650.9 1361 6 3539 -3 12 3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGTCGCTCCCATCATCATTT 3217 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.116.2 chr1 - 2449 9 full-splice_match DNAJC11 ENST00000691481.1 3565 9 1131 -15 -833 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGGCTGGCGCTCTTCCGTGT 6195 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.116.3 chr1 - 1627 2 incomplete-splice_match DNAJC11 ENST00000689169.1 3872 4 3317 -15 3317 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGAGGCTGGCGCTCTTCCGT NA FALSE NA NA CATAAA -34 NA NA NA 10 NA PB.116.6 chr1 - 3206 16 full-splice_match DNAJC11 ENST00000377577.10 3201 16 -6 1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 149 36.544552 1.562823 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGAGGCTGGCGCTCTTCCGT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 149 NA PB.116.7 chr1 - 3042 15 full-splice_match DNAJC11 ENST00000294401.11 2210 15 110 -942 2 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGAGGCTGGCGCTCTTCCGT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.116.8 chr1 - 2834 13 incomplete-splice_match DNAJC11 ENST00000377577.10 3201 16 34080 1 474 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGAGGCTGGCGCTCTTCCGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.116.9 chr1 - 2713 12 incomplete-splice_match DNAJC11 ENST00000377577.10 3201 16 47870 1 -6870 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGAGGCTGGCGCTCTTCCGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.116.10 chr1 - 2556 10 incomplete-splice_match DNAJC11 ENST00000377577.10 3201 16 50212 1 -4528 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGAGGCTGGCGCTCTTCCGT 536 FALSE NA NA AAAAAG -34 NA NA NA 4 NA PB.116.11 chr1 - 2128 7 incomplete-splice_match DNAJC11 ENST00000689025.1 3549 9 2467 -13 514 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGAGGCTGGCGCTCTTCCGT 7542 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.116.12 chr1 - 2187 7 incomplete-splice_match DNAJC11 ENST00000689025.1 3549 9 2408 -13 455 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.433716 0.535764 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGAGGCTGGCGCTCTTCCGT 7483 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.116.13 chr1 - 1988 6 incomplete-splice_match DNAJC11 ENST00000689025.1 3549 9 7107 -13 -428 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGAGGCTGGCGCTCTTCCGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.116.14 chr1 - 1861 4 full-splice_match DNAJC11 ENST00000689169.1 3872 4 2026 -15 2026 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGAGGCTGGCGCTCTTCCGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.116.15 chr1 - 1766 3 incomplete-splice_match DNAJC11 ENST00000689169.1 3872 4 2227 -15 2227 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.943186 0.468818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGAGGCTGGCGCTCTTCCGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.116.21 chr1 - 2253 16 full-splice_match DNAJC11 ENST00000377577.10 3201 16 -1 949 -1 -6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 45 11.036945 1.042849 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AACAAACGGGTTTGGAAATT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 45 NA PB.116.22 chr1 - 1961 13 incomplete-splice_match DNAJC11 ENST00000686243.1 3712 16 33993 935 399 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AACAAACGGGTTTGGAAATT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.116.23 chr1 - 1655 11 incomplete-splice_match DNAJC11 ENST00000686243.1 3712 16 48927 935 -5801 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AACAAACGGGTTTGGAAATT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.116.24 chr1 - 1286 8 incomplete-splice_match DNAJC11 ENST00000691481.1 3565 9 2006 935 42 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AACAAACGGGTTTGGAAATT 7070 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.116.25 chr1 - 1027 6 incomplete-splice_match DNAJC11 ENST00000689025.1 3549 9 7120 935 -415 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AACAAACGGGTTTGGAAATT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.116.26 chr1 - 1784 16 full-splice_match DNAJC11 ENST00000377577.10 3201 16 -3 1420 0 -477 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATGTTTTTATTTTATATT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.118.2 chr1 + 1283 6 novel_not_in_catalog CAMTA1 novel 431 5 NA NA 0 2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACGAATGTGTGGGTCACTT -16 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 4 NA PB.118.3 chr1 + 1048 6 novel_in_catalog CAMTA1 novel 431 5 NA NA 0 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTGTGGGTCACTTGCGT -16 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 5 NA PB.118.4 chr1 + 978 5 novel_in_catalog CAMTA1 novel 431 5 NA NA 0 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTGTGGGTCACTTGCGT -16 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 6 NA PB.118.5 chr1 + 857 4 full-splice_match CAMTA1 ENST00000557126.5 486 4 -37 -334 0 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTGTGGGTCACTTGCGT -16 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 4 NA PB.118.6 chr1 + 871 4 full-splice_match CAMTA1 ENST00000476163.5 863 4 -10 2 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 32 7.848495 0.894786 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTGTGGGTCACTTGCGT -16 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 32 NA PB.118.7 chr1 + 705 5 novel_not_in_catalog CAMTA1 novel 431 5 NA NA 0 -7 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATAAAGTGTAATCTGTG -16 TRUE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.118.8 chr1 + 599 4 full-splice_match CAMTA1 ENST00000473578.5 567 4 -26 -6 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 52 12.753804 1.105640 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TAAAATTTAAGTTTAATGAG -16 TRUE NA NA AATAAA -25 NA NA NA 52 NA PB.118.9 chr1 + 497 3 full-splice_match CAMTA1 ENST00000490738.5 538 3 0 41 0 -7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATAAAGTGTAATCTGTG -16 TRUE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 5 NA PB.118.10 chr1 + 938 5 full-splice_match CAMTA1 ENST00000461311.1 431 5 -95 -412 3 -2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 54 13.244334 1.122030 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTGTGGGTCACTTGCGT -13 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 54 NA PB.118.11 chr1 + 2118 3 incomplete-splice_match CAMTA1 ENST00000473578.5 567 4 -15 45010 1 -44830 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAGAAAAAAATGAGAAGT -5 TRUE NA NA GATAAA -24 NA NA NA 4 NA PB.118.12 chr1 + 624 4 novel_not_in_catalog CAMTA1 novel 567 4 NA NA 1 -7 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATAAAGTGTAATCTGTG -5 TRUE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.118.13 chr1 + 807 4 full-splice_match CAMTA1 ENST00000476163.5 863 4 54 2 0 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTGTGGGTCACTTGCGT 11 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 3 NA PB.118.15 chr1 + 1755 2 incomplete-splice_match CAMTA1 ENST00000486138.1 392 4 12909 45366 -5213 -45366 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAGTATTATATAATTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.120.1 chr1 + 2121 4 novel_in_catalog VAMP3 novel 2178 5 NA NA -21 -8 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACATGATTGTGGCACCTG -34 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.120.2 chr1 + 2183 5 full-splice_match VAMP3 ENST00000054666.11 2178 5 -13 8 -13 -8 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 142 34.827694 1.541925 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACATGATTGTGGCACCTG -26 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 142 NA PB.120.3 chr1 + 1054 5 full-splice_match VAMP3 ENST00000054666.11 2178 5 -10 1134 -10 492 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GCTATGACCAAAGCTTCTAT -23 TRUE NA NA TTTAAA -21 NA NA NA 4 NA PB.120.4 chr1 + 2889 5 full-splice_match VAMP3 ENST00000470357.1 954 5 -310 -1625 -310 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTGTGGCACCTGTGCTCCT 1088 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.120.5 chr1 + 2353 5 full-splice_match VAMP3 ENST00000470357.1 954 5 219 -1618 219 -8 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACATGATTGTGGCACCTG 1617 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.120.6 chr1 + 2112 5 full-splice_match VAMP3 ENST00000470357.1 954 5 467 -1625 467 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTGTGGCACCTGTGCTCCT 1865 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.120.7 chr1 + 1992 3 incomplete-splice_match VAMP3 ENST00000054666.11 2178 5 5889 1 88 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.943186 0.468818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTGTGGCACCTGTGCTCCT 5876 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 12 NA PB.120.8 chr1 + 1885 3 incomplete-splice_match VAMP3 ENST00000054666.11 2178 5 5989 8 188 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACATGATTGTGGCACCTG 5976 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 7 NA PB.124.1 chr1 - 591 4 full-splice_match UTS2 ENST00000361696.10 591 4 -1 1 -1 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATATCATGAGTGGTTATTTT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.125.1 chr1 + 6386 22 full-splice_match PER3 ENST00000377532.8 6365 22 -22 1 -22 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAAATTGTCCTGCCCTGTG -33 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 3 NA PB.125.3 chr1 + 1165 5 incomplete-splice_match PER3 ENST00000377541.5 1524 10 34 15386 34 2 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTTCCTTGTATGAGAAATT 52 FALSE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.125.4 chr1 + 6256 21 novel_in_catalog PER3 novel 6261 23 NA NA -51 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAAATTGTCCTGCCCTGTG 5 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.125.5 chr1 + 1920 11 incomplete-splice_match PER3 ENST00000613533.4 6318 22 223 34832 -51 -3 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAGAAACAGAAGCTAAGTG 5 FALSE NA NA ATTAAA -32 NA NA NA 2 NA PB.125.10 chr1 + 4305 8 incomplete-splice_match PER3 ENST00000613533.4 6318 22 35776 1 -16603 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAGAAATTGTCCTGCCCTGT NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.125.11 chr1 + 4012 6 incomplete-splice_match PER3 ENST00000361923.2 6203 21 41859 1 -10246 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAAATTGTCCTGCCCTGTG NA FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 3 NA PB.125.14 chr1 + 3340 5 incomplete-splice_match PER3 ENST00000361923.2 6203 21 42938 1 -9167 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAAATTGTCCTGCCCTGTG 222 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.125.16 chr1 + 2777 3 incomplete-splice_match PER3 ENST00000361923.2 6203 21 51121 2 -984 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAGAAATTGTCCTGCCCTGT 4025 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.125.17 chr1 + 2545 2 full-splice_match PER3 ENST00000494684.1 555 2 301 -2291 301 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAGAAATTGTCCTGCCCTGT 5310 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.127.1 chr1 + 910 7 novel_not_in_catalog PARK7 novel 624 7 NA NA -65 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTGATTGTTTCTTGTTTTG 190 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.127.2 chr1 + 799 6 novel_in_catalog PARK7 novel 1088 7 NA NA -8 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTGATTGTTTCTTGTTTTG -36 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.127.3 chr1 + 916 7 full-splice_match PARK7 ENST00000493678.5 1088 7 9 163 0 60 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 1152 282.545807 2.451089 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTGCAGCTCTTAACTGTC 10 TRUE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 1152 NA PB.127.4 chr1 + 866 7 novel_not_in_catalog PARK7 novel 1088 7 NA NA 0 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTGATTGTTTCTTGTTTTG -28 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 4 NA PB.127.6 chr1 + 806 6 novel_in_catalog PARK7 novel 1088 7 NA NA 0 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTGATTGTTTCTTGTTTTG -28 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 7 NA PB.127.7 chr1 + 1010 7 full-splice_match PARK7 ENST00000338639.10 1127 7 -46 163 2 60 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 332 81.428131 1.910774 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTGCAGCTCTTAACTGTC -26 TRUE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 332 NA PB.127.8 chr1 + 877 6 novel_in_catalog PARK7 novel 1127 7 NA NA 13 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACTGATTGTTTCTTGTTTT -15 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.127.10 chr1 + 907 7 novel_in_catalog PARK7 novel 1088 7 NA NA -14 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACTGATTGTTTCTTGTTTT -13 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.127.11 chr1 + 897 7 full-splice_match PARK7 ENST00000338639.10 1127 7 6 224 6 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 126 30.903448 1.490007 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTGATTGTTTCTTGTTTTG 26 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 126 NA PB.127.12 chr1 + 1183 7 full-splice_match PARK7 ENST00000377491.5 977 7 -175 -31 8 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTGATTGTTTCTTGTTTTG 28 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.127.13 chr1 + 1640 6 incomplete-splice_match PARK7 ENST00000338639.10 1127 7 227 229 -31 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACTACTGATTGTTTCTTG -5 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.127.14 chr1 + 727 6 incomplete-splice_match PARK7 ENST00000377491.5 977 7 962 -31 89 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.188451 0.503580 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTGATTGTTTCTTGTTTTG 913 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 13 NA PB.127.15 chr1 + 575 4 incomplete-splice_match PARK7 ENST00000377491.5 977 7 7481 -31 4024 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTGATTGTTTCTTGTTTTG 7432 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.132.2 chr1 - 4008 3 novel_in_catalog ERRFI1 novel 3097 4 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.697920 0.431029 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TACCATTAGTAATGTTTCTT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.132.3 chr1 - 3097 4 full-splice_match ERRFI1 ENST00000377482.10 3097 4 0 0 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 521 127.783302 2.106474 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TACCATTAGTAATGTTTCTT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 521 NA PB.132.6 chr1 - 3171 5 novel_not_in_catalog ERRFI1 novel 3097 4 NA NA 0 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATACCATTAGTAATGTTTCT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.132.7 chr1 - 2705 4 novel_not_in_catalog ERRFI1 novel 3097 4 NA NA 0 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATACCATTAGTAATGTTTCT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.132.14 chr1 - 4115 2 incomplete-splice_match ERRFI1 ENST00000474874.5 479 3 -26 7326 0 -3 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGATACCATTAGTAATGTTT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.132.15 chr1 - 3017 3 full-splice_match ERRFI1 ENST00000469499.5 995 3 -13 -2009 0 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.697920 0.431029 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGATACCATTAGTAATGTTT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.132.16 chr1 - 2931 3 incomplete-splice_match ERRFI1 ENST00000377482.10 3097 4 10622 9 -54 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TATTTATGATACCATTAGTA 3 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.132.17 chr1 - 2791 3 incomplete-splice_match ERRFI1 ENST00000377482.10 3097 4 10768 3 92 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.697920 0.431029 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGATACCATTAGTAATGTTT 4532 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.132.25 chr1 - 3109 4 full-splice_match ERRFI1 ENST00000487559.1 787 4 -13 -2309 0 -4 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 41 10.055883 1.002420 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATGATACCATTAGTAATGTT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 41 NA PB.132.29 chr1 - 3198 3 novel_in_catalog ERRFI1 novel 3097 4 NA NA 0 -9 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TATTTATGATACCATTAGTA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.132.30 chr1 - 2614 4 full-splice_match ERRFI1 ENST00000377482.10 3097 4 0 483 0 -483 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.414778 0.644909 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTCAGTATTTCCTGGGGAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.132.33 chr1 - 2344 4 full-splice_match ERRFI1 ENST00000377482.10 3097 4 0 753 0 -753 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.697920 0.431029 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTAATTTTCCCTTACAGTT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.132.34 chr1 - 2086 4 full-splice_match ERRFI1 ENST00000377482.10 3097 4 0 1011 0 689 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAGTTTGAAGATTTCTGGC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.133.2 chr1 + 2490 9 full-splice_match SLC45A1 ENST00000471889.7 2496 9 0 6 0 2 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGCCTATGGTTTCTAGGC 10 TRUE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 4 NA PB.134.2 chr1 - 3794 5 novel_not_in_catalog RERE novel 6733 17 NA NA 3048 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AACCCTTGGGTGTCTCCCGT 7106 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.134.3 chr1 - 3459 4 incomplete-splice_match RERE ENST00000476556.5 4598 13 65055 -1687 -3529 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AACCCTTGGGTGTCTCCCGT 8291 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.134.4 chr1 - 3330 4 incomplete-splice_match RERE ENST00000476556.5 4598 13 65184 -1687 -3400 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AACCCTTGGGTGTCTCCCGT 8420 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.134.5 chr1 - 3215 4 incomplete-splice_match RERE ENST00000476556.5 4598 13 65299 -1687 -3285 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AACCCTTGGGTGTCTCCCGT 8535 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.134.6 chr1 - 2933 3 incomplete-splice_match RERE ENST00000476556.5 4598 13 67530 -1687 -1054 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AACCCTTGGGTGTCTCCCGT 5729 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.134.7 chr1 - 2768 2 incomplete-splice_match RERE ENST00000476556.5 4598 13 68195 -1687 -389 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AACCCTTGGGTGTCTCCCGT 6394 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.139.1 chr1 - 989 6 novel_in_catalog RERE novel 2990 12 NA NA 4 -1192 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTGTTGAGGTTTCTCCTT -2 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.153.1 chr1 - 1603 12 novel_not_in_catalog ENO1 novel 1819 10 NA NA 5 6956 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TAACTTTTTTCTTTCTTTTT 542 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.153.2 chr1 - 1823 12 full-splice_match ENO1 ENST00000234590.10 1781 12 -46 4 -12 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 14259 3497.240234 3.543725 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT 525 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14259 NA PB.153.3 chr1 - 1933 13 novel_not_in_catalog ENO1 novel 1837 13 NA NA -12 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATACTCCGTGTGCCTGTGTA 553 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.153.4 chr1 - 1796 12 novel_in_catalog ENO1 novel 1781 12 NA NA -72 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATACTCCGTGTGCCTGTGTA 918 FALSE NA NA AAGAAA -30 NA NA NA 3 NA PB.153.5 chr1 - 1216 6 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 5074 4 5074 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 449 110.124191 2.041883 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATACTCCGTGTGCCTGT 8919 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 449 NA PB.153.6 chr1 - 3161 11 novel_in_catalog ENO1 novel 1837 13 NA NA 0 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.188451 0.503580 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.153.7 chr1 - 2368 12 novel_in_catalog ENO1 novel 1781 12 NA NA 0 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.153.8 chr1 - 1888 12 full-splice_match ENO1 ENST00000234590.10 1781 12 -111 4 -77 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT 460 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.153.9 chr1 - 1846 13 novel_in_catalog ENO1 novel 1837 13 NA NA -14 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT -6 TRUE NA NA GGGGCT -8 NA NA NA 4 NA PB.153.10 chr1 - 1807 12 novel_not_in_catalog ENO1 novel 1781 12 NA NA 0 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.153.11 chr1 - 1942 8 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 2998 2 2998 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT 9492 FALSE NA NA TATAAA -12 NA NA NA 3 NA PB.153.12 chr1 - 1789 12 novel_not_in_catalog ENO1 novel 1781 12 NA NA -11 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.153.13 chr1 - 1722 11 novel_in_catalog ENO1 novel 1837 13 NA NA 0 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.697920 0.431029 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.153.14 chr1 - 1689 11 novel_in_catalog ENO1 novel 1837 13 NA NA 0 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.924247 0.593756 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.153.16 chr1 - 1376 10 novel_not_in_catalog ENO1 novel 1837 13 NA NA -12 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT 553 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.153.17 chr1 - 1436 9 full-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 1110 2 1110 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 253 62.052162 1.792757 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT 8791 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 253 NA PB.153.18 chr1 - 1145 6 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 5147 2 5147 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 288 70.636452 1.849029 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT 8992 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 288 NA PB.153.19 chr1 - 1022 6 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 5270 2 5270 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 265 64.995346 1.812882 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT 9115 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 265 NA PB.153.20 chr1 - 467 2 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 8649 2 8649 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT 9017 FALSE NA NA AAGAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.153.21 chr1 - 542 3 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 8285 2 8285 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.433716 0.535764 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.153.22 chr1 - 1379 8 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 3560 3 3560 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 316 77.503883 1.889323 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATACTCCGTGTGCCTGTG 9965 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 316 NA PB.153.23 chr1 - 2363 12 full-splice_match ENO1 ENST00000234590.10 1781 12 -588 6 -84 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.395840 0.732059 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATACTCCGTGTGCCTGT -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 22 NA PB.153.24 chr1 - 2131 12 novel_in_catalog ENO1 novel 1781 12 NA NA -84 1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATACTCCGTGTGCCTGT -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.153.25 chr1 - 2081 12 full-splice_match ENO1 ENST00000234590.10 1781 12 -306 6 100 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATACTCCGTGTGCCTGT 265 FALSE NA NA GGGGCT -3 NA NA NA 3 NA PB.153.26 chr1 - 2021 13 novel_in_catalog ENO1 novel 1837 13 NA NA 0 1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATACTCCGTGTGCCTGT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.153.27 chr1 - 1905 13 novel_in_catalog ENO1 novel 1837 13 NA NA 8 1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATACTCCGTGTGCCTGT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.153.28 chr1 - 1771 12 novel_not_in_catalog ENO1 novel 1837 13 NA NA 0 1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATACTCCGTGTGCCTGT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.153.29 chr1 - 1737 12 novel_not_in_catalog ENO1 novel 1837 13 NA NA 0 1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATACTCCGTGTGCCTGT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.153.30 chr1 - 1715 12 full-splice_match ENO1 ENST00000234590.10 1781 12 33 33 -7 -26 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 491 120.425339 2.080718 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 CAAAATAAAAAGCCTCAGTG 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 491 NA PB.153.31 chr1 - 1526 8 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 3412 4 3412 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATACTCCGTGTGCCTGT 9906 FALSE NA NA AAAAAG -20 NA NA NA 2 NA PB.153.32 chr1 - 1512 10 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000234590.10 1781 12 6762 6 20 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 278 68.183800 1.833681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATACTCCGTGTGCCTGT 7333 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 278 NA PB.153.33 chr1 - 1295 7 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 4380 4 4380 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 184 45.128845 1.654454 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATACTCCGTGTGCCTGT 8225 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 184 NA PB.153.34 chr1 - 1081 9 novel_not_in_catalog ENO1 novel 1837 13 NA NA 4 1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATACTCCGTGTGCCTGT 541 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.153.36 chr1 - 857 5 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 6229 4 6229 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 87 21.338095 1.329156 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATACTCCGTGTGCCTGT 11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 87 NA PB.153.37 chr1 - 2159 12 full-splice_match ENO1 ENST00000234590.10 1781 12 -385 7 21 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.414778 0.644909 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAGAATACTCCGTGTGCCTG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.153.38 chr1 - 1915 12 novel_not_in_catalog ENO1 novel 1837 13 NA NA -109 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAGAATACTCCGTGTGCCTG -42 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.153.40 chr1 - 711 4 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 7566 5 7566 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 46 11.282211 1.052394 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAGAATACTCCGTGTGCCTG -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 46 NA PB.154.1 chr1 - 2204 12 full-splice_match SLC2A5 ENST00000377424.9 4085 12 39 1842 8 1483 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 48 11.772742 1.070878 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGACGTGCTGCTGTTC -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 48 NA PB.154.2 chr1 - 2047 11 incomplete-splice_match SLC2A5 ENST00000377424.9 4085 12 11449 1842 11418 1483 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGACGTGCTGCTGTTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.154.3 chr1 - 1426 6 incomplete-splice_match SLC2A5 ENST00000377424.9 4085 12 29669 1842 -71 1483 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGACGTGCTGCTGTTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.154.5 chr1 - 1677 12 full-splice_match SLC2A5 ENST00000377424.9 4085 12 39 2369 8 956 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATGCAGTCCTCATCTCCAG -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.161.5 chr1 + 2466 2 full-splice_match SPSB1 ENST00000377399.2 1007 2 495 -1954 495 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACCATTTTTGAATTCCTC 461 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.162.1 chr1 + 1165 6 novel_in_catalog SLC25A33 novel 3865 7 NA NA -28 -2627 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGAGAATTTTTTTTCCCCAT -14 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.162.3 chr1 + 1477 7 full-splice_match SLC25A33 ENST00000302692.7 3865 7 -14 2402 -14 -2402 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 278 68.183800 1.833681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACATTTGGCTTGTGTCCTC 0 TRUE NA NA ATTAAA -22 NA NA NA 278 NA PB.162.4 chr1 + 2403 7 full-splice_match SLC25A33 ENST00000302692.7 3865 7 8 1454 8 -1454 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAATTTAAT 22 FALSE NA NA TTTAAA -18 NA NA NA 7 NA PB.162.5 chr1 + 1523 8 novel_not_in_catalog SLC25A33 novel 3865 7 NA NA 11 -2407 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGTATACATTTGGCTTGTG 25 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.162.7 chr1 + 1336 6 novel_in_catalog SLC25A33 novel 3865 7 NA NA 24 -2404 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 24 5.886371 0.769848 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TATACATTTGGCTTGTGTCC -3 TRUE NA NA ATTAAA -20 NA NA NA 24 NA PB.162.8 chr1 + 1293 7 full-splice_match SLC25A33 ENST00000302692.7 3865 7 24 2548 24 -2548 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 45 11.036945 1.042849 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACCTGTTGGACATTTCCTTT -3 TRUE NA NA CATAAA -17 NA NA NA 45 NA PB.162.9 chr1 + 1272 5 novel_in_catalog SLC25A33 novel 3865 7 NA NA 24 -2401 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACATTTGGCTTGTGTCCTCT -3 TRUE NA NA ATTAAA -23 NA NA NA 9 NA PB.162.10 chr1 + 1360 6 novel_in_catalog SLC25A33 novel 3865 7 NA NA 25 -2402 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACATTTGGCTTGTGTCCTC -2 TRUE NA NA ATTAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.162.11 chr1 + 1334 7 full-splice_match SLC25A33 ENST00000302692.7 3865 7 130 2401 130 -2401 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACATTTGGCTTGTGTCCTCT 103 FALSE NA NA ATTAAA -23 NA NA NA 7 NA PB.162.12 chr1 + 1050 7 full-splice_match SLC25A33 ENST00000302692.7 3865 7 188 2627 188 -2627 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGAGAATTTTTTTTCCCCAT -7 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.162.13 chr1 + 1211 7 full-splice_match SLC25A33 ENST00000302692.7 3865 7 247 2407 247 -2407 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGTATACATTTGGCTTGTG 52 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.162.17 chr1 + 1001 5 incomplete-splice_match SLC25A33 ENST00000302692.7 3865 7 27819 2401 27819 -2401 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACATTTGGCTTGTGTCCTCT NA FALSE NA NA ATTAAA -23 NA NA NA 10 NA PB.162.18 chr1 + 737 2 incomplete-splice_match SLC25A33 ENST00000302692.7 3865 7 40504 2404 40504 -2404 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TATACATTTGGCTTGTGTCC NA FALSE NA NA ATTAAA -20 NA NA NA 6 NA PB.163.1 chr1 + 3977 11 full-splice_match TMEM201 ENST00000340381.11 3815 11 -162 0 -162 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 20 4.905309 0.690666 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CCTGCTGGCTGTCTGTATTC 10 TRUE NA NA AAAAAG -33 NA NA NA 20 NA PB.163.2 chr1 + 4016 6 full-splice_match TMEM201 ENST00000340305.9 3851 6 -171 6 -160 -6 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCGCTGGCGTCAGGTGCC 12 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 8 NA PB.163.3 chr1 + 3808 11 full-splice_match TMEM201 ENST00000340381.11 3815 11 5 2 5 2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGCCTGCTGGCTGTCTGTAT 22 TRUE NA NA AAAAAG -31 NA NA NA 10 NA PB.163.4 chr1 + 3600 10 incomplete-splice_match TMEM201 ENST00000340381.11 3815 11 7059 2 -927 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGCCTGCTGGCTGTCTGTAT 7076 FALSE NA NA AAAAAG -31 NA NA NA 2 NA PB.163.5 chr1 + 2907 7 incomplete-splice_match TMEM201 ENST00000340381.11 3815 11 12469 7 4483 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGATGCCTGCTGGCTGTC 4463 FALSE NA NA AAAAAG -26 NA NA NA 3 NA PB.163.6 chr1 + 2777 6 incomplete-splice_match TMEM201 ENST00000340381.11 3815 11 13213 7 -4090 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGATGCCTGCTGGCTGTC 5207 FALSE NA NA AAAAAG -26 NA NA NA 2 NA PB.163.7 chr1 + 2648 6 incomplete-splice_match TMEM201 ENST00000340381.11 3815 11 13346 3 -3957 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGCCTGCTGGCTGTCTGTA 5340 FALSE NA NA AAAAAG -30 NA NA NA 2 NA PB.166.1 chr1 - 1837 2 full-splice_match PIK3CD-AS1 ENST00000377320.3 1823 2 -5 -9 -5 9 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AATTACGGGTAAGAGTATTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.167.1 chr1 - 1903 3 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 19787 -6 1692 5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCCGGAGCGGGGTTTGTCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.167.2 chr1 - 1773 2 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 20281 0 2186 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 26 6.376902 0.804610 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 26 NA PB.167.3 chr1 - 4639 18 full-splice_match CLSTN1 ENST00000361311.4 4647 18 13 -5 -6 4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.697920 0.431029 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGCCGGAGCGGGGTTTGTC -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.167.4 chr1 - 2633 7 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 16029 -4 -2066 3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.414778 0.644909 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CCAGCCGGAGCGGGGTTTGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.167.5 chr1 - 3914 15 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000361311.4 4647 18 72378 -3 -25 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TCCAGCCGGAGCGGGGTTTG 3622 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.167.6 chr1 - 4574 17 novel_in_catalog CLSTN1 novel 4647 18 NA NA -3 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 36 8.829556 0.945939 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 36 NA PB.167.7 chr1 - 4207 16 novel_in_catalog CLSTN1 novel 4647 18 NA NA -21772 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.167.8 chr1 - 3559 13 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000361311.4 4647 18 74406 0 589 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT 5650 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.167.9 chr1 - 3819 14 full-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 10 0 10 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.167.10 chr1 - 3426 12 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000650348.1 4457 19 79041 1 5539 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT 6996 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.167.11 chr1 - 3167 11 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 7155 0 5741 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT 7198 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.167.12 chr1 - 3044 10 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000650348.1 4457 19 82439 1 -7744 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT 8748 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.167.13 chr1 - 2993 9 novel_in_catalog CLSTN1 novel 4647 18 NA NA -4070 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT NA FALSE NA NA AATAGA -24 NA NA NA 2 NA PB.167.14 chr1 - 2986 9 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 10352 0 -7743 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT 8749 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.167.15 chr1 - 2837 8 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 15552 0 -2543 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.167.16 chr1 - 2475 6 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 16475 0 -1620 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.167.17 chr1 - 2311 5 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 17444 0 -651 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.660044 0.668390 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.167.18 chr1 - 2188 5 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 17567 0 -528 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 28 6.867433 0.836794 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 28 NA PB.167.19 chr1 - 2063 4 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 18117 0 22 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.167.26 chr1 - 4660 19 full-splice_match CLSTN1 ENST00000377298.9 4760 19 -3 103 -3 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.943186 0.468818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACTCCAGCCGGAGCGGGG -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.167.27 chr1 - 4649 17 novel_in_catalog CLSTN1 novel 4647 18 NA NA 5 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACTCCAGCCGGAGCGGGG 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.167.28 chr1 - 3686 13 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 1701 1 287 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACTCCAGCCGGAGCGGGG 5348 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.167.29 chr1 - 3757 14 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000361311.4 4647 18 74090 1 273 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACTCCAGCCGGAGCGGGG 5334 FALSE NA NA AAAACA -13 NA NA NA 5 NA PB.167.30 chr1 - 3492 12 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 2012 1 598 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACTCCAGCCGGAGCGGGG 5659 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.167.31 chr1 - 2621 4 novel_in_catalog CLSTN1 novel 3829 14 NA NA -592 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACTCCAGCCGGAGCGGGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.167.35 chr1 - 1754 7 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 15963 941 -2132 -941 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AACCCGGGACTGGAATGTAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.167.36 chr1 - 1284 5 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 17530 941 -565 -941 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AACCCGGGACTGGAATGTAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.167.37 chr1 - 3677 18 full-splice_match CLSTN1 ENST00000361311.4 4647 18 28 942 9 -942 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAACCCGGGACTGGAATGTA 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.167.38 chr1 - 3581 17 novel_in_catalog CLSTN1 novel 4647 18 NA NA 40 -950 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGCTAGTGTAACCCGGGACT 690 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.167.39 chr1 - 3706 19 full-splice_match CLSTN1 ENST00000377298.9 4760 19 0 1054 0 -952 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGTGCTAGTGTAACCCGGGA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.167.40 chr1 - 3644 17 novel_in_catalog CLSTN1 novel 4647 18 NA NA -6 -952 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGTGCTAGTGTAACCCGGGA 625 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.167.41 chr1 - 2389 11 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 6981 952 5567 -952 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGTGCTAGTGTAACCCGGGA 7024 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.167.42 chr1 - 881 2 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 20221 952 2126 -952 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGTGCTAGTGTAACCCGGGA 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.167.43 chr1 - 1087 4 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 18140 953 45 -953 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTGTGCTAGTGTAACCCGGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.167.44 chr1 - 2617 12 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 1933 955 519 -955 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CTTTGTGCTAGTGTAACCCG 5580 FALSE NA NA AAAACA -9 NA NA NA 2 NA PB.167.46 chr1 - 2398 7 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000361311.4 4647 18 68811 10807 -3592 9653 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 55 FALSE NA NA AATGAA -42 NA NA NA 3 NA PB.167.47 chr1 - 889 5 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000377298.9 4760 19 -6 22545 -6 -1983 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAATCGAGGAGCCGGCTT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.167.48 chr1 - 859 4 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000361311.4 4647 18 13 22443 -6 -1983 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 20 4.905309 0.690666 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAATCGAGGAGCCGGCTT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 20 NA PB.168.1 chr1 - 2873 4 novel_in_catalog CTNNBIP1 novel 3006 6 NA NA 14 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CGTGTGTGAGCTGAGCTGGT -22 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.168.3 chr1 - 2853 5 full-splice_match CTNNBIP1 ENST00000400904.7 1206 5 185 -1832 118 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TCGTGTGTGAGCTGAGCTGG 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.168.6 chr1 - 3004 6 full-splice_match CTNNBIP1 ENST00000377263.6 3006 6 0 2 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTCGTGTGTGAGCTGAGCTG -36 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.168.7 chr1 - 3056 5 full-splice_match CTNNBIP1 ENST00000400904.7 1206 5 -19 -1831 -19 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTCGTGTGTGAGCTGAGCTG -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.168.8 chr1 - 2952 5 full-splice_match CTNNBIP1 ENST00000400904.7 1206 5 85 -1831 18 -2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 66 16.187521 1.209180 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTCGTGTGTGAGCTGAGCTG -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 66 NA PB.168.13 chr1 - 2589 2 incomplete-splice_match CTNNBIP1 ENST00000377256.1 451 5 6899 -2380 6899 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTTCGTGTGTGAGCTGAGCT 6703 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.168.15 chr1 - 1066 6 full-splice_match CTNNBIP1 ENST00000377263.6 3006 6 110 1830 110 3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTGGGGTTTGTGTTTGATTG -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.168.16 chr1 - 1293 6 novel_not_in_catalog CTNNBIP1 novel 3006 6 NA NA 40 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACATTTGGGGTTTGTGTTTG 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.168.17 chr1 - 1158 6 full-splice_match CTNNBIP1 ENST00000377263.6 3006 6 14 1834 14 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.414778 0.644909 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACATTTGGGGTTTGTGTTTG -22 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.168.18 chr1 - 1135 5 full-splice_match CTNNBIP1 ENST00000400904.7 1206 5 70 1 3 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 195 47.826763 1.679671 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACATTTGGGGTTTGTGTTTG -33 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 195 NA PB.168.19 chr1 - 1039 4 novel_in_catalog CTNNBIP1 novel 1206 5 NA NA 14 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACATTTGGGGTTTGTGTTTG -22 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.168.20 chr1 - 1080 5 full-splice_match CTNNBIP1 ENST00000400904.7 1206 5 125 1 58 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 43 10.546414 1.023105 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACATTTGGGGTTTGTGTTTG 22 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 43 NA PB.168.21 chr1 - 903 4 incomplete-splice_match CTNNBIP1 ENST00000377256.1 451 5 247 -549 247 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACATTTGGGGTTTGTGTTTG 51 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.168.22 chr1 - 1273 6 full-splice_match CTNNBIP1 ENST00000377263.6 3006 6 -102 1835 -35 -2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CACATTTGGGGTTTGTGTTT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.168.23 chr1 - 796 5 full-splice_match CTNNBIP1 ENST00000400904.7 1206 5 81 329 14 12 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTTCTGACTCTTATTTTTT -22 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.168.24 chr1 - 882 5 full-splice_match CTNNBIP1 ENST00000400904.7 1206 5 -19 343 -19 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCTTTTATTTTTATTTCT -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.168.25 chr1 - 1080 2 novel_not_in_catalog CTNNBIP1 novel 3006 6 NA NA 21 -29291 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAATATGCTGCTGTTTGGTT -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.169.1 chr1 + 5209 24 full-splice_match PIK3CD ENST00000377346.9 5412 24 0 203 0 -203 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAGAAAGAAAAAGCCTTT -9 TRUE NA NA AGTAAA -9 NA NA NA 5 NA PB.169.2 chr1 + 5101 23 novel_not_in_catalog PIK3CD novel 5412 24 NA NA 0 -203 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAGAAAGAAAAAGCCTTT -9 TRUE NA NA AGTAAA -9 NA NA NA 3 NA PB.169.3 chr1 + 5306 24 novel_not_in_catalog PIK3CD novel 539 3 NA NA 1377 -203 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAGAAAGAAAAAGCCTTT 2 TRUE NA NA AGTAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.169.4 chr1 + 3518 13 incomplete-splice_match PIK3CD ENST00000361110.6 3508 23 10424 -1678 4346 -204 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 GAAAAGAAAGAAAAAGCCTT 2813 FALSE NA NA AGTAAA -8 NA NA NA 3 NA PB.169.5 chr1 + 3093 10 incomplete-splice_match PIK3CD ENST00000361110.6 3508 23 11342 -1679 5264 -203 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAGAAAGAAAAAGCCTTT 3731 FALSE NA NA AGTAAA -9 NA NA NA 4 NA PB.169.6 chr1 + 2823 8 incomplete-splice_match PIK3CD ENST00000361110.6 3508 23 11899 -1679 5821 -203 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAGAAAGAAAAAGCCTTT 4288 FALSE NA NA AGTAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.169.7 chr1 + 2244 3 incomplete-splice_match PIK3CD ENST00000361110.6 3508 23 14116 -1679 8038 -203 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAGAAAGAAAAAGCCTTT 6505 FALSE NA NA AGTAAA -9 NA NA NA 3 NA PB.169.8 chr1 + 2019 2 incomplete-splice_match PIK3CD ENST00000361110.6 3508 23 14723 -1679 8645 -203 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAGAAAGAAAAAGCCTTT 7112 FALSE NA NA AGTAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.170.3 chr1 + 1206 5 full-splice_match NMNAT1 ENST00000377205.6 3734 5 -21 2549 -21 -720 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACAAAAATTAGCTGTGTGTG -7 TRUE NA NA ACTAAA -4 NA NA NA 3 NA PB.170.4 chr1 + 1064 5 full-splice_match NMNAT1 ENST00000403197.5 1094 5 29 1 -18 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTCTCCTGCAGTGGTCTC -4 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 4 NA PB.170.6 chr1 + 818 5 novel_not_in_catalog NMNAT1 novel 3734 5 NA NA 0 11392 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGTTACGTTGAGAGGTATAT 14 TRUE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 3 NA PB.171.1 chr1 + 2944 17 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 112 35187 -14 141 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAACTTGTTGATACCTTAC -16 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 3 NA PB.171.2 chr1 + 1230 3 full-splice_match UBE4B ENST00000377153.5 1273 3 -330 373 -14 -373 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTGTCTTTGTTGGGAAATG -16 TRUE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 3 NA PB.171.3 chr1 + 5899 28 full-splice_match UBE4B ENST00000343090.11 5905 28 0 6 0 -6 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAAATCTTCTTTGAGTCT -2 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.171.4 chr1 + 5512 27 full-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 126 -866 0 -6 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.943186 0.468818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAAATCTTCTTTGAGTCT -2 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 12 NA PB.171.5 chr1 + 1586 3 full-splice_match UBE4B ENST00000377153.5 1273 3 -316 3 0 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAATGTTTCCTCTGTATGTC -2 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.171.7 chr1 + 4878 27 full-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 127 -233 1 233 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGAATTTGAATTTCAGTTTT -1 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 9 NA PB.171.8 chr1 + 4706 27 full-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 301 -235 -141 235 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATTTGAATTTCAGTTTTTT -49 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.171.9 chr1 + 1390 3 full-splice_match UBE4B ENST00000377153.5 1273 3 -121 4 -121 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATAATGTTTCCTCTGTATGT -29 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.171.10 chr1 + 5312 27 full-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 326 -866 -116 -6 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAAATCTTCTTTGAGTCT -24 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 7 NA PB.171.11 chr1 + 4632 27 full-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 381 -241 -61 241 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTTCAGTTTTTTTTTTCT 31 TRUE NA NA AATAAA -26 NA NA NA 2 NA PB.171.12 chr1 + 2692 17 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 381 35170 -61 158 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TACTTATATGTGTATATAAT 31 TRUE NA NA AATAAA -30 NA NA NA 2 NA PB.171.13 chr1 + 5244 27 full-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 392 -864 -50 -8 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAAGAAATCTTCTTTGAGT 42 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.171.14 chr1 + 5039 27 full-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 599 -866 157 -6 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAAATCTTCTTTGAGTCT 249 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.171.15 chr1 + 4935 27 full-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 701 -864 259 -8 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAAGAAATCTTCTTTGAGT 351 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.171.18 chr1 + 4453 24 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 68273 -864 244 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAAGAAATCTTCTTTGAGT NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.171.19 chr1 + 3837 20 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000343090.11 5905 28 86566 6 -2518 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAAATCTTCTTTGAGTCT NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.171.21 chr1 + 3582 18 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000343090.11 5905 28 93886 6 -1495 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAAATCTTCTTTGAGTCT NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.171.22 chr1 + 2860 16 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 97668 -235 2161 235 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATTTGAATTTCAGTTTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.171.23 chr1 + 3121 13 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000343090.11 5905 28 102068 8 6687 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAAGAAATCTTCTTTGAGT NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.171.24 chr1 + 2424 13 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 102267 -240 6760 240 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATTTCAGTTTTTTTTTTC NA FALSE NA NA AATAAA -25 NA NA NA 4 NA PB.171.25 chr1 + 2989 13 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000343090.11 5905 28 102202 6 6821 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAAATCTTCTTTGAGTCT NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 5 NA PB.171.26 chr1 + 2852 12 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000343090.11 5905 28 104219 6 8838 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAAATCTTCTTTGAGTCT NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.171.27 chr1 + 2762 11 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000343090.11 5905 28 112043 6 -13353 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAAATCTTCTTTGAGTCT NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.171.28 chr1 + 1929 9 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 116385 -233 -9137 233 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGAATTTGAATTTCAGTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 9 NA PB.171.29 chr1 + 2546 9 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000343090.11 5905 28 116273 8 -9123 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAAGAAATCTTCTTTGAGT NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.171.30 chr1 + 2430 8 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000343090.11 5905 28 118434 6 -6962 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAAATCTTCTTTGAGTCT NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.171.31 chr1 + 1616 7 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 125535 -233 13 233 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGAATTTGAATTTCAGTTTT 2929 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 5 NA PB.171.32 chr1 + 2203 7 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000343090.11 5905 28 125455 6 59 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAAATCTTCTTTGAGTCT 2975 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 6 NA PB.171.33 chr1 + 1440 6 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 128372 -235 2850 235 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATTTGAATTTCAGTTTTTT 5766 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 6 NA PB.171.34 chr1 + 2032 6 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000343090.11 5905 28 128285 6 2889 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAAATCTTCTTTGAGTCT 5805 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 6 NA PB.171.35 chr1 + 1261 5 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 135400 -235 -2724 235 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATTTGAATTTCAGTTTTTT 77 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.171.36 chr1 + 1130 4 full-splice_match UBE4B ENST00000487244.5 818 4 272 -584 272 233 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGAATTTGAATTTCAGTTTT 877 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.171.37 chr1 + 1754 4 full-splice_match UBE4B ENST00000487244.5 818 4 281 -1217 281 -6 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.188451 0.503580 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAAATCTTCTTTGAGTCT -14 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 13 NA PB.171.39 chr1 + 1028 3 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000487244.5 818 4 7688 -584 -372 233 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGAATTTGAATTTCAGTTTT 7393 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 5 NA PB.171.40 chr1 + 1486 2 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000465408.1 355 3 400 -1283 400 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAAATCTTCTTTGAGTCT 8165 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 9 NA PB.172.1 chr1 + 2330 19 incomplete-splice_match KIF1B ENST00000377093.9 7800 21 -78 11560 -78 4703 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAACAAGGAATTGATATG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.172.2 chr1 + 2986 21 full-splice_match KIF1B ENST00000377093.9 7800 21 -58 4872 -58 -3032 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAGAAATAAAATGCTCAAAA -4 TRUE NA NA GATAAA -7 NA NA NA 2 NA PB.172.3 chr1 + 2499 21 novel_not_in_catalog KIF1B novel 6816 47 NA NA -58 11524 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAGAAGAGGAAGAAGGTGAA -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.172.7 chr1 + 5960 21 full-splice_match KIF1B ENST00000377093.9 7800 21 0 1840 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.172.8 chr1 + 1570 4 incomplete-splice_match KIF1B ENST00000377093.9 7800 21 0 49106 0 -22892 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAAAAAAAAAATTTTTT -1 TRUE NA NA ACTAAA -36 NA NA NA 10 NA PB.172.12 chr1 + 5030 16 incomplete-splice_match KIF1B ENST00000377083.5 5885 21 36729 0 -11065 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 8945 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.172.13 chr1 + 1333 14 incomplete-splice_match KIF1B ENST00000377083.5 5885 21 36738 9700 -11056 4723 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAACAAGAGATGGAGAAAAG 8954 FALSE NA NA AAAACA -14 NA NA NA 2 NA PB.172.15 chr1 + 4314 9 incomplete-splice_match KIF1B ENST00000377083.5 5885 21 51732 0 46 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 2778 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.172.17 chr1 + 3634 1 full-splice_match RN7SL731P ENST00000584329.2 293 1 -3341 0 -3341 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 7405 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.172.18 chr1 + 2680 1 full-splice_match RN7SL731P ENST00000584329.2 293 1 -2387 0 -2387 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 8359 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.172.19 chr1 + 2193 1 full-splice_match RN7SL731P ENST00000584329.2 293 1 -1900 0 -1900 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 8846 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.172.20 chr1 + 1812 1 full-splice_match RN7SL731P ENST00000584329.2 293 1 -1520 1 -1520 -1 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 9226 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.172.21 chr1 + 1642 1 full-splice_match RN7SL731P ENST00000584329.2 293 1 -1349 0 -1349 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 9397 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.172.22 chr1 + 1469 1 full-splice_match RN7SL731P ENST00000584329.2 293 1 -1176 0 -1176 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 9570 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.172.23 chr1 + 1231 1 full-splice_match RN7SL731P ENST00000584329.2 293 1 -939 1 -939 -1 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 9807 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.172.24 chr1 + 988 1 full-splice_match RN7SL731P ENST00000584329.2 293 1 -696 1 -696 -1 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.172.25 chr1 + 2052 1 full-splice_match RN7SL731P ENST00000584329.2 293 1 56 -1815 56 1815 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AATAAAAGTTGAAGTCATCT NA FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.172.26 chr1 + 1917 1 full-splice_match RN7SL731P ENST00000584329.2 293 1 191 -1815 191 1815 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AATAAAAGTTGAAGTCATCT NA FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.176.1 chr1 + 1945 13 full-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 -45 368 -25 313 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 420 103.011490 2.012886 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGCTCTTTCTCCAGATTCT NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 420 NA PB.176.2 chr1 + 2289 13 full-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 -22 1 -2 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 71 17.413847 1.240895 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTTGGTCTGATTTATTTC NA FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 71 NA PB.176.3 chr1 + 1834 12 novel_in_catalog PGD novel 2268 13 NA NA 0 313 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGCTCTTTCTCCAGATTCT -4 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 8 NA PB.176.4 chr1 + 2046 12 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 357 368 -77 313 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGCTCTTTCTCCAGATTCT 29 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 7 NA PB.176.5 chr1 + 2052 12 novel_in_catalog PGD novel 2268 13 NA NA -67 312 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GATGCTCTTTCTCCAGATTC 39 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.176.6 chr1 + 1761 11 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 1328 370 760 311 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 20 4.905309 0.690666 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGATGCTCTTTCTCCAGATT 1000 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 20 NA PB.176.7 chr1 + 2044 11 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 1414 1 846 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTTGGTCTGATTTATTTC 1086 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 8 NA PB.176.8 chr1 + 1574 10 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 4015 368 3447 313 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 31 7.603229 0.880998 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGCTCTTTCTCCAGATTCT 3687 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 31 NA PB.176.9 chr1 + 1883 9 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 5097 1 4529 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTTGGTCTGATTTATTTC 4769 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 10 NA PB.176.12 chr1 + 1691 7 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 12357 1 -1413 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.678982 0.565728 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTTGGTCTGATTTATTTC NA FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 15 NA PB.176.13 chr1 + 1287 7 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 12393 369 -1377 312 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 61 14.961193 1.174966 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GATGCTCTTTCTCCAGATTC NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 61 NA PB.176.15 chr1 + 1484 6 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 14073 1 303 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTTGGTCTGATTTATTTC NA FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 8 NA PB.176.16 chr1 + 1108 6 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 14082 368 312 313 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 28 6.867433 0.836794 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGCTCTTTCTCCAGATTCT NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 28 NA PB.176.17 chr1 + 1393 6 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 14163 2 393 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CAGCTTGGTCTGATTTATTT NA FALSE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.176.18 chr1 + 1002 5 incomplete-splice_match PGD ENST00000498356.1 790 6 1695 -313 1695 313 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGCTCTTTCTCCAGATTCT -9 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 10 NA PB.176.20 chr1 + 1331 5 incomplete-splice_match PGD ENST00000498356.1 790 6 1732 -679 1732 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CAGCTTGGTCTGATTTATTT 28 FALSE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 5 NA PB.176.21 chr1 + 765 4 incomplete-splice_match PGD ENST00000498356.1 790 6 2191 -314 -1329 314 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGCTCTTTCTCCAGATTCTT 487 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 5 NA PB.176.22 chr1 + 1124 4 incomplete-splice_match PGD ENST00000498356.1 790 6 2198 -680 -1322 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTTGGTCTGATTTATTTC 494 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 9 NA PB.177.1 chr1 - 1021 8 novel_in_catalog LZIC novel 652 5 NA NA 35 -14 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAATTAATGAGAGTATAG 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.177.2 chr1 - 937 8 novel_in_catalog LZIC novel 652 5 NA NA 19 -14 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAATTAATGAGAGTATAG -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.177.5 chr1 - 3438 9 novel_not_in_catalog LZIC novel 945 8 NA NA 8 -101 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACCACTGAAATGGTATCTTA -23 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.177.10 chr1 - 2208 7 full-splice_match LZIC ENST00000400903.6 1405 7 -17 -786 -17 786 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GACCTTTTTATGTATCTGGC 575 FALSE NA NA TATAAA -5 NA NA NA 3 NA PB.177.11 chr1 - 1880 8 full-splice_match LZIC ENST00000377213.1 945 8 38 -973 22 440 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.433716 0.535764 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TTCTGTACTGTAAACTACTA -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.177.12 chr1 - 1965 8 full-splice_match LZIC ENST00000377223.6 4989 8 35 2989 35 438 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TCTTCTGTACTGTAAACTAC 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.177.14 chr1 - 1538 8 full-splice_match LZIC ENST00000377223.6 4989 8 35 3416 35 11 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CCCCAGCCTGTAAGCTGTCT 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.177.15 chr1 - 1481 8 full-splice_match LZIC ENST00000377223.6 4989 8 92 3416 92 11 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CCCCAGCCTGTAAGCTGTCT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.177.16 chr1 - 1432 7 full-splice_match LZIC ENST00000400903.6 1405 7 -17 -10 -17 10 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CCCCCAGCCTGTAAGCTGTC 575 FALSE NA NA TATAAA -5 NA NA NA 6 NA PB.177.18 chr1 - 1084 8 full-splice_match LZIC ENST00000377213.1 945 8 9 -148 -7 148 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGGCTGTTTGTTTTTAAGT -38 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.177.19 chr1 - 1339 7 full-splice_match LZIC ENST00000400903.6 1405 7 -322 388 301 145 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTAAGGCTGTTTGTTTTTA 270 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.177.20 chr1 - 1152 7 full-splice_match LZIC ENST00000400903.6 1405 7 -265 518 -265 15 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTCATCATTGTGCGTTGTGT 327 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.177.21 chr1 - 1001 8 full-splice_match LZIC ENST00000377223.6 4989 8 35 3953 35 7 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 35 8.584291 0.933704 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTATGCTCTTCATCATTGTG 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 35 NA PB.177.22 chr1 - 912 8 full-splice_match LZIC ENST00000377213.1 945 8 38 -5 22 5 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 49 12.018007 1.079832 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GTTTATGCTCTTCATCATTG -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 49 NA PB.178.1 chr1 + 1433 6 novel_in_catalog CENPS-CORT novel 571 6 NA NA -2 -8601 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTTTCTGGTTACTAATGTTG -26 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.178.2 chr1 + 1125 6 novel_not_in_catalog CENPS-CORT novel 571 6 NA NA -2 -8601 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTTTCTGGTTACTAATGTTG -26 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.178.3 chr1 + 905 5 full-splice_match CENPS ENST00000309048.8 905 5 5 -5 5 5 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 66 16.187521 1.209180 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCTGGTTACTAATGTTGTTT -21 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 66 NA PB.178.4 chr1 + 626 5 full-splice_match CENPS ENST00000309048.8 905 5 5 274 5 32 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGCTTTTTGTGCTGAATTCT -21 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 4 NA PB.178.5 chr1 + 818 6 full-splice_match CENPS-CORT ENST00000602787.6 571 6 0 -247 0 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTGATCTTTCCTCTCCTCC -24 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.178.6 chr1 + 744 3 novel_in_catalog CENPS novel 905 5 NA NA 2 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTTTTCTGGTTACTAATG -24 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.178.7 chr1 + 1407 5 full-splice_match CENPS ENST00000477755.1 914 5 -20 -473 -20 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 115 28.205528 1.450334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTTTTCTGGTTACTAATG 10 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 115 NA PB.178.8 chr1 + 948 5 full-splice_match CENPS ENST00000477755.1 914 5 -41 7 -41 -7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAGAAAAAGAAGTCAGAGGA -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.178.9 chr1 + 1448 5 novel_not_in_catalog CENPS novel 914 5 NA NA -31 2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTTTCTGGTTACTAATGTTG -1 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.178.10 chr1 + 1047 4 novel_in_catalog CENPS-CORT novel 1326 4 NA NA -52 -8908 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAATAAAATAAAAAGG -1 TRUE NA NA AATAGA -6 NA NA NA 2 NA PB.178.11 chr1 + 1141 5 fusion CENPS_CORT novel 914 5 NA NA -15 -340 multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTGATCTTTCCTCTCCTCC 15 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.178.12 chr1 + 1274 4 novel_in_catalog CENPS-CORT novel 1326 4 NA NA -32 -8604 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTTTTCTGGTTACTAATG 19 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.178.13 chr1 + 1313 6 fusion CENPS_CORT novel 914 5 NA NA -10 -340 multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.697920 0.431029 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTGATCTTTCCTCTCCTCC 20 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 11 NA PB.178.14 chr1 + 1127 5 full-splice_match CENPS ENST00000477755.1 914 5 -10 -203 -10 35 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 32 7.848495 0.894786 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTTTTGTGCTGAATTCTCCA 20 TRUE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 32 NA PB.178.15 chr1 + 1157 3 full-splice_match CENPS ENST00000462462.1 584 3 -346 -227 -6 72 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATCAGTTCATCTTTTG 24 TRUE NA NA ATTAAA -39 NA NA NA 2 NA PB.178.16 chr1 + 1266 5 full-splice_match CENPS ENST00000477755.1 914 5 120 -472 120 -2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGCTTTTCTGGTTACTAAT 150 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.178.17 chr1 + 1163 5 full-splice_match CENPS ENST00000477755.1 914 5 226 -475 -114 1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CTTTTCTGGTTACTAATGTT 256 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.178.18 chr1 + 976 5 full-splice_match CENPS ENST00000477755.1 914 5 411 -473 71 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTTTTCTGGTTACTAATG 441 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.178.19 chr1 + 750 4 incomplete-splice_match CENPS ENST00000309048.8 905 5 3427 1 2737 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTTTTCTGGTTACTAATG 3107 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.179.6 chr1 - 1326 6 full-splice_match DFFA ENST00000377038.8 6035 6 3 4706 3 415 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 76 18.640175 1.270450 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGTAATTGGCAGTGATT -21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 76 NA PB.179.7 chr1 - 1413 6 novel_in_catalog DFFA novel 6035 6 NA NA -15 414 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 CAAAAGTAATTGGCAGTGAT 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.179.10 chr1 - 1502 5 full-splice_match DFFA ENST00000377036.2 1403 5 -56 -43 -15 43 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.678982 0.565728 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGTGGCTTACGCCTGTTA 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.179.11 chr1 - 1404 5 full-splice_match DFFA ENST00000377036.2 1403 5 -2 1 -2 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.924247 0.593756 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TCTTCCTGTTGGTGTTGTAA 15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.179.12 chr1 - 1072 5 full-splice_match DFFA ENST00000377036.2 1403 5 -45 376 -4 -376 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 29 7.112698 0.852034 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACAGACTCTGGTCCAAGG 441 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 29 NA PB.180.2 chr1 + 1919 9 full-splice_match PEX14 ENST00000356607.9 1922 9 0 3 0 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 149 36.544552 1.562823 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TAATTTCTGCCTGTGGCTCC -3 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 149 NA PB.180.4 chr1 + 1786 8 novel_in_catalog PEX14 novel 1922 9 NA NA 4 -3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.678982 0.565728 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TAATTTCTGCCTGTGGCTCC 1 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 15 NA PB.180.6 chr1 + 1854 8 novel_not_in_catalog PEX14 novel 805 4 NA NA -23464 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTAATTTCTGCCTGTGGCTC 878 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.180.8 chr1 + 1657 6 incomplete-splice_match PEX14 ENST00000356607.9 1922 9 124364 3 63426 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TAATTTCTGCCTGTGGCTCC NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.180.9 chr1 + 1539 5 incomplete-splice_match PEX14 ENST00000356607.9 1922 9 143448 2 82510 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AATTTCTGCCTGTGGCTCCC NA FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 5 NA PB.180.10 chr1 + 1343 3 incomplete-splice_match PEX14 ENST00000356607.9 1922 9 149463 2 88525 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AATTTCTGCCTGTGGCTCCC 1374 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.180.11 chr1 + 1271 2 incomplete-splice_match PEX14 ENST00000356607.9 1922 9 152368 3 91430 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TAATTTCTGCCTGTGGCTCC 4279 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.181.1 chr1 + 1721 7 novel_in_catalog TARDBP novel 4185 6 NA NA -11 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT -17 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 3 NA PB.181.2 chr1 + 2739 6 full-splice_match TARDBP ENST00000240185.8 4185 6 -9 1455 -8 -6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 631 154.762497 2.189666 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT -14 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 631 NA PB.181.3 chr1 + 3681 6 full-splice_match TARDBP ENST00000240185.8 4185 6 -6 510 -5 -37 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAATCGCCACATTGTTTCAT -11 TRUE NA NA CATAAA -32 NA NA NA 2 NA PB.181.5 chr1 + 2145 7 novel_in_catalog TARDBP novel 1793 10 NA NA -2 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GTCTCAAGTCAAATGGATTC -8 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.181.7 chr1 + 1508 6 full-splice_match TARDBP ENST00000240185.8 4185 6 -3 2680 -2 -46 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAAGGAAGAGCTAAAGGA -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.181.9 chr1 + 1789 7 full-splice_match TARDBP ENST00000629725.2 1031 7 31 -789 0 -6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT -6 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 5 NA PB.181.10 chr1 + 2637 7 novel_not_in_catalog TARDBP novel 4185 6 NA NA 0 -7 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAATAATATGTGTCTTTGT -5 TRUE NA NA AATAAA -8 NA NA NA 4 NA PB.181.11 chr1 + 1687 7 novel_not_in_catalog TARDBP novel 1793 10 NA NA 1 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT -4 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.181.12 chr1 + 4270 6 full-splice_match TARDBP ENST00000240185.8 4185 6 7 -92 -1 92 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 34 8.339025 0.921115 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAGAAAAAAGAAAATAATA 2 TRUE NA NA TTTAAA -13 NA NA NA 34 NA PB.181.13 chr1 + 3405 7 novel_in_catalog TARDBP novel 1793 10 NA NA -3 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTTTAGTGTCTGGAGTCTT 0 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 5 NA PB.181.14 chr1 + 2857 7 full-splice_match TARDBP ENST00000472476.5 1001 7 5 -1861 -3 -6 alternative_3end TRUE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT 0 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 6 NA PB.181.15 chr1 + 2871 6 full-splice_match TARDBP ENST00000240185.8 4185 6 5 1309 -3 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.433716 0.535764 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GTCTCAAGTCAAATGGATTC 0 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 14 NA PB.181.17 chr1 + 2561 5 full-splice_match TARDBP ENST00000439080.6 1388 5 6 -1179 -3 -6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT 0 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 5 NA PB.181.19 chr1 + 1747 7 novel_in_catalog TARDBP novel 4185 6 NA NA -3 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT 0 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 3 NA PB.181.20 chr1 + 1794 6 full-splice_match TARDBP ENST00000240185.8 4185 6 5 2386 -3 -128 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TGTTTGGTTCTTTTGTTTTG 0 TRUE NA NA AAGAAA -31 NA NA NA 3 NA PB.181.21 chr1 + 1176 8 novel_in_catalog TARDBP novel 1793 10 NA NA -3 -6 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT 0 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 4 NA PB.181.22 chr1 + 2552 5 full-splice_match TARDBP ENST00000621715.4 816 5 -9 -1727 -1 -6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT 2 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 4 NA PB.181.23 chr1 + 2186 7 novel_in_catalog TARDBP novel 1793 10 NA NA -1 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT 2 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 6 NA PB.181.24 chr1 + 1116 8 novel_in_catalog TARDBP novel 1793 10 NA NA -1 1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 CTCAAGTCAAATGGATTCAT 2 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.181.25 chr1 + 1686 7 novel_in_catalog TARDBP novel 1793 10 NA NA 16 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT 2 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.181.26 chr1 + 2569 5 incomplete-splice_match TARDBP ENST00000315091.7 1835 6 71 146 59 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT 1103 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 10 NA PB.181.27 chr1 + 3957 5 incomplete-splice_match TARDBP ENST00000473869.5 1946 7 137 -472 125 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTTTAGTGTCTGGAGTCTT 1169 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.181.28 chr1 + 2416 5 incomplete-splice_match TARDBP ENST00000315091.7 1835 6 224 146 212 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.697920 0.431029 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT 1256 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 11 NA PB.181.29 chr1 + 2301 4 incomplete-splice_match TARDBP ENST00000611963.4 739 6 -33 156 -33 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.660044 0.668390 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT 4249 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 19 NA PB.181.30 chr1 + 3199 4 incomplete-splice_match TARDBP ENST00000611963.4 739 6 14 -789 14 -37 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAATCGCCACATTGTTTCAT 4296 FALSE NA NA CATAAA -32 NA NA NA 2 NA PB.181.31 chr1 + 2150 3 incomplete-splice_match TARDBP ENST00000620632.4 706 5 29 6 29 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 20 4.905309 0.690666 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT 6125 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 20 NA PB.181.32 chr1 + 2005 2 incomplete-splice_match TARDBP ENST00000614494.1 515 4 76 146 3 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.660044 0.668390 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT 7825 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 19 NA PB.181.41 chr1 + 2064 2 full-splice_match TARDBP ENST00000480464.2 790 2 -1275 1 106 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTTTAGTGTCTGGAGTCTT 9970 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.183.1 chr1 - 2358 2 novel_in_catalog MASP2 novel 2455 11 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCTGCTGCCACGTGTCTCT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.183.2 chr1 - 1219 4 incomplete-splice_match MASP2 ENST00000400897.8 2455 11 -34 18276 -34 -1 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCTGCTGCCACGTGTCTCT 9442 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.184.1 chr1 + 1322 1 full-splice_match TARDBP ENST00000607145.1 870 1 -453 1 -453 -1 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTGTGTGTTTGTAGTAGTC 5659 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.184.2 chr1 + 1046 1 full-splice_match TARDBP ENST00000607145.1 870 1 -177 1 -177 -1 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTGTGTGTTTGTAGTAGTC 5935 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.185.1 chr1 - 1691 7 incomplete-splice_match SRM ENST00000376957.7 1260 8 -3 3 -1 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGATTGGAGTCCTGTGTC 18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.185.2 chr1 - 1340 7 novel_in_catalog SRM novel 1260 8 NA NA -5 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGATTGGAGTCCTGTGTC 14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.185.3 chr1 - 1288 8 full-splice_match SRM ENST00000376957.7 1260 8 -31 3 -29 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 600 147.159271 2.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGATTGGAGTCCTGTGTC -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 600 NA PB.185.4 chr1 - 1267 8 novel_not_in_catalog SRM novel 1260 8 NA NA 0 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGATTGGAGTCCTGTGTC 21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.185.5 chr1 - 1180 8 full-splice_match SRM ENST00000376957.7 1260 8 77 3 77 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.395840 0.732059 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGATTGGAGTCCTGTGTC 98 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 22 NA PB.185.6 chr1 - 1111 7 novel_in_catalog SRM novel 1260 8 NA NA 0 -3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGATTGGAGTCCTGTGTC 21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.185.7 chr1 - 1084 8 full-splice_match SRM ENST00000376957.7 1260 8 173 3 -159 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.678982 0.565728 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGATTGGAGTCCTGTGTC 194 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.185.8 chr1 - 970 7 incomplete-splice_match SRM ENST00000376957.7 1260 8 718 3 386 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.169513 0.620085 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGATTGGAGTCCTGTGTC 739 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.185.9 chr1 - 803 5 incomplete-splice_match SRM ENST00000376957.7 1260 8 3259 3 -939 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGATTGGAGTCCTGTGTC 3280 FALSE NA NA GGGGCT -14 NA NA NA 7 NA PB.185.10 chr1 - 1174 7 incomplete-splice_match SRM ENST00000376957.7 1260 8 513 4 181 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAAAGATTGGAGTCCTGTGT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.187.1 chr1 - 1564 16 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 17100 -4 -146 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTCCTGACTTTTATTTTGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.187.2 chr1 - 2782 25 full-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 8 6 -7 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 292 71.617516 1.855019 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 292 NA PB.187.3 chr1 - 1887 4 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000474216.5 2007 13 10045 -6 1223 3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GATTCCTGACTTTTATTTTG 8595 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.187.4 chr1 - 2986 24 novel_in_catalog EXOSC10 novel 2796 25 NA NA 3 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.187.5 chr1 - 2865 25 novel_not_in_catalog EXOSC10 novel 2796 25 NA NA -4 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.187.6 chr1 - 2785 25 novel_in_catalog EXOSC10 novel 2796 25 NA NA 5 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.433716 0.535764 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.187.7 chr1 - 2726 24 novel_in_catalog EXOSC10 novel 2796 25 NA NA -2 -3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.187.8 chr1 - 2670 25 full-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 120 6 105 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT 105 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.187.9 chr1 - 2093 20 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 9217 6 -8029 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT 9202 FALSE NA NA AAAACA -8 NA NA NA 5 NA PB.187.10 chr1 - 1856 18 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 12021 6 -5225 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.943186 0.468818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.187.11 chr1 - 1720 17 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 12365 6 -4881 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.187.12 chr1 - 1632 16 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 17022 6 -224 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT NA FALSE NA NA AAAACA -11 NA NA NA 4 NA PB.187.13 chr1 - 1386 15 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 18717 6 65 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.943186 0.468818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.187.14 chr1 - 1244 14 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 19028 6 16 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.414778 0.644909 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.187.15 chr1 - 1021 9 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 22773 6 555 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT 2671 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.187.16 chr1 - 1034 12 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 20128 6 59 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.188451 0.503580 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT 26 FALSE NA NA ATTAAA -45 NA NA NA 13 NA PB.187.17 chr1 - 854 9 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 22940 6 722 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.943186 0.468818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT 2838 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.187.18 chr1 - 2925 25 novel_in_catalog EXOSC10 novel 2796 25 NA NA 3 -4 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GAAGAAAGCTGATTCCTGAC 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.187.19 chr1 - 2261 21 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 8703 7 -8543 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GAAGAAAGCTGATTCCTGAC 8688 FALSE NA NA AATACA -20 NA NA NA 2 NA PB.187.20 chr1 - 1501 16 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 17152 7 -94 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GAAGAAAGCTGATTCCTGAC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.187.21 chr1 - 954 10 novel_in_catalog EXOSC10 novel 2796 25 NA NA 220 -4 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GAAGAAAGCTGATTCCTGAC 2336 FALSE NA NA ATTAAA -29 NA NA NA 2 NA PB.187.22 chr1 - 2589 23 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 -1 2027 -1 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GTAAGAACTGCTCCTGGAGG -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.187.23 chr1 - 2180 19 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 3 7328 3 342 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATCTATGAAGTAAGTGG -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.187.24 chr1 - 3321 13 novel_in_catalog EXOSC10 novel 2721 24 NA NA -1 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAGAAAAAATAAACAAA -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.188.1 chr1 + 804 2 full-splice_match EXOSC10-AS1 ENST00000447600.1 487 2 -265 -52 -20 3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATACTTGCTTTTCACTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 3 NA PB.189.1 chr1 + 3642 2 full-splice_match UBIAD1 ENST00000376810.6 3654 2 10 2 10 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CACCAATGGTCTGGCTTCTG -3 TRUE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 6 NA PB.189.3 chr1 + 1549 2 full-splice_match UBIAD1 ENST00000376810.6 3654 2 28 2077 28 -2077 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 102 25.017076 1.398237 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATTAGGCGCATGGTCTTTG 15 TRUE NA NA TTTAAA -24 NA NA NA 102 NA PB.189.4 chr1 + 1560 3 novel_not_in_catalog UBIAD1 novel 1393 3 NA NA 16 -2134 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTTTTTGTTTTTTCCATTTT 3 TRUE NA NA TATAAA -42 NA NA NA 2 NA PB.189.6 chr1 + 3385 2 full-splice_match UBIAD1 ENST00000376810.6 3654 2 267 2 -63 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CACCAATGGTCTGGCTTCTG -1 TRUE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 6 NA PB.189.7 chr1 + 1450 2 full-splice_match UBIAD1 ENST00000376810.6 3654 2 299 1905 -31 -1905 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGAGTGTTGTCCTGCTTTCT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.189.8 chr1 + 1272 2 full-splice_match UBIAD1 ENST00000376810.6 3654 2 299 2083 -31 -2083 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 53 12.999069 1.113912 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGGTGAATTAGGCGCATGG -6 TRUE NA NA TTTAAA -18 NA NA NA 53 NA PB.189.10 chr1 + 1013 2 full-splice_match UBIAD1 ENST00000376810.6 3654 2 556 2085 -135 -2085 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAAGGTGAATTAGGCGCAT 251 FALSE NA NA TTTAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.190.2 chr1 - 8703 58 full-splice_match MTOR ENST00000361445.9 8721 58 11 7 11 -7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.190.3 chr1 - 4125 28 incomplete-splice_match MTOR ENST00000361445.9 8721 58 112324 7 -5202 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA AAGAAA -43 NA NA NA 5 NA PB.190.4 chr1 - 4234 29 incomplete-splice_match MTOR ENST00000361445.9 8721 58 105290 7 -12236 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA AAGAAA -2 NA NA NA 4 NA PB.190.5 chr1 - 3830 25 incomplete-splice_match MTOR ENST00000361445.9 8721 58 117795 7 269 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.190.6 chr1 - 3625 24 incomplete-splice_match MTOR ENST00000361445.9 8721 58 122989 7 98 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.190.7 chr1 - 3482 23 incomplete-splice_match MTOR ENST00000361445.9 8721 58 123229 7 338 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.190.8 chr1 - 3331 21 incomplete-splice_match MTOR ENST00000361445.9 8721 58 129370 7 -1623 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.190.9 chr1 - 3032 20 full-splice_match MTOR ENST00000376838.5 4017 20 978 7 978 -7 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.190.10 chr1 - 2847 18 incomplete-splice_match MTOR ENST00000376838.5 4017 20 2639 7 2639 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA AAAAAG -10 NA NA NA 6 NA PB.190.11 chr1 - 2639 16 incomplete-splice_match MTOR ENST00000376838.5 4017 20 3476 7 3476 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.190.12 chr1 - 2524 15 incomplete-splice_match MTOR ENST00000376838.5 4017 20 3788 7 3788 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.190.13 chr1 - 2441 15 incomplete-splice_match MTOR ENST00000376838.5 4017 20 3871 7 3871 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.190.14 chr1 - 2068 12 incomplete-splice_match MTOR ENST00000376838.5 4017 20 6924 7 6924 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.190.15 chr1 - 1994 12 incomplete-splice_match MTOR ENST00000376838.5 4017 20 6998 7 6998 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.190.16 chr1 - 1810 11 incomplete-splice_match MTOR ENST00000376838.5 4017 20 9553 7 -6342 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.433716 0.535764 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.190.17 chr1 - 1657 9 incomplete-splice_match MTOR ENST00000376838.5 4017 20 14475 7 -1420 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.190.18 chr1 - 1579 8 incomplete-splice_match MTOR ENST00000376838.5 4017 20 16088 7 57 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.190.19 chr1 - 1378 6 full-splice_match MTOR ENST00000473471.5 862 6 227 -743 227 -7 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.190.20 chr1 - 1281 5 incomplete-splice_match MTOR ENST00000473471.5 862 6 1724 -743 1724 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 8 NA PB.190.21 chr1 - 1123 3 incomplete-splice_match MTOR ENST00000473471.5 862 6 5282 -743 5282 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.678982 0.565728 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA AATACA -18 NA NA NA 15 NA PB.190.22 chr1 - 982 2 incomplete-splice_match MTOR ENST00000473471.5 862 6 6426 -743 6426 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.190.24 chr1 - 2164 13 incomplete-splice_match MTOR ENST00000376838.5 4017 20 4834 13 4834 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AATTTTAAACATATGTATAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.190.25 chr1 - 1970 18 incomplete-splice_match MTOR ENST00000376838.5 4017 20 2644 879 2644 -107 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 GAAACCATGGTGAGAAAGTT NA FALSE NA NA AAAAAG -5 NA NA NA 2 NA PB.190.29 chr1 - 2129 4 incomplete-splice_match MTOR ENST00000361445.9 8721 58 49726 101081 49726 -68662 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAGG NA FALSE NA NA AGTAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.190.33 chr1 - 1070 6 incomplete-splice_match MTOR ENST00000361445.9 8721 58 11 147184 11 -114765 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAATAAGATAATTTCAGATA 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.190.34 chr1 - 949 6 incomplete-splice_match MTOR ENST00000361445.9 8721 58 12 147304 12 -114885 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GTGAGAAGCCACGGCAGAGG 11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.192.1 chr1 + 1942 6 incomplete-splice_match DISP3 ENST00000294484.7 5265 21 51751 1 -2770 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGACTGCTGCTGTTAATACG NA FALSE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.192.2 chr1 + 1420 3 incomplete-splice_match DISP3 ENST00000304391.6 1495 5 1423 -325 1423 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGACTGCTGCTGTTAATACG NA FALSE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.193.1 chr1 + 1953 7 novel_in_catalog FBXO44 novel 3320 7 NA NA -14 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TAACCTGTGCCCTGTGGTTT 429 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.193.2 chr1 + 1440 8 novel_in_catalog FBXO44 novel 769 6 NA NA -3 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACCCAGTCTCGGGTATTTCT 440 FALSE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 3 NA PB.193.3 chr1 + 1907 6 full-splice_match FBXO44 ENST00000251547.10 2928 6 -18 1039 2 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TAACCTGTGCCCTGTGGTTT 445 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 7 NA PB.193.4 chr1 + 2037 5 novel_in_catalog FBXO44 novel 2928 6 NA NA -8 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AACCTGTGCCCTGTGGTTTC -22 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 5 NA PB.193.5 chr1 + 1765 5 full-splice_match FBXO44 ENST00000376762.8 1734 5 -33 2 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.924247 0.593756 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AACCTGTGCCCTGTGGTTTC -14 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 16 NA PB.193.6 chr1 + 2393 6 novel_in_catalog FBXO44 novel 3320 7 NA NA 3 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TAACCTGTGCCCTGTGGTTT -7 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.193.7 chr1 + 1781 9 novel_in_catalog FBXO44 novel 3320 7 NA NA 4 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACCCAGTCTCGGGTATTTCT -6 TRUE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.193.8 chr1 + 1431 8 novel_not_in_catalog FBXO44 novel 769 6 NA NA 13 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATCACCCAGTCTCGGGTA 3 TRUE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.193.9 chr1 + 1353 2 novel_in_catalog FBXO44 novel 769 6 NA NA 3219 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACCCAGTCTCGGGTATTTCT 6732 FALSE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.194.1 chr1 - 1293 6 full-splice_match FBXO2 ENST00000354287.5 1287 6 0 -6 0 6 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 119 29.186590 1.465183 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATGAAAAAATGGATAAACA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 119 NA PB.194.2 chr1 - 1838 5 novel_in_catalog FBXO2 novel 1287 6 NA NA 0 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAGGAATGAATGAAAAAATG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.194.3 chr1 - 1089 5 incomplete-splice_match FBXO2 ENST00000354287.5 1287 6 3680 2 21 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAGGAATGAATGAAAAAATG 4069 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.195.1 chr1 + 1229 6 full-splice_match FBXO6 ENST00000376753.9 1444 6 -109 324 -109 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTGTGGCTCACGCCTGTAA -5 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 5 NA PB.195.2 chr1 + 1515 6 full-splice_match FBXO6 ENST00000376753.9 1444 6 -76 5 -76 -5 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAAACCAGCCTGGGGTTGG -2 TRUE NA NA AATAAA -25 NA NA NA 2 NA PB.195.3 chr1 + 1119 6 full-splice_match FBXO6 ENST00000376753.9 1444 6 1 324 1 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTGTGGCTCACGCCTGTAA -12 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.195.4 chr1 + 1393 6 full-splice_match FBXO6 ENST00000376753.9 1444 6 2 49 2 -49 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAATAATAATAATAATAAA -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.198.1 chr1 - 1096 9 full-splice_match MAD2L2 ENST00000376692.9 1053 9 -44 1 -44 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 554 135.877060 2.133146 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG 349 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 554 NA PB.198.2 chr1 - 1639 8 novel_in_catalog MAD2L2 novel 1053 9 NA NA 7 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.198.3 chr1 - 1456 8 incomplete-splice_match MAD2L2 ENST00000376692.9 1053 9 21 1 4 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.943186 0.468818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG 11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.198.4 chr1 - 1292 8 incomplete-splice_match MAD2L2 ENST00000376692.9 1053 9 185 1 148 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 20 4.905309 0.690666 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 20 NA PB.198.5 chr1 - 1201 8 incomplete-splice_match MAD2L2 ENST00000376692.9 1053 9 276 1 239 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG 669 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.198.6 chr1 - 1220 9 full-splice_match MAD2L2 ENST00000376672.5 1002 9 -174 -44 -1 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.198.7 chr1 - 1127 8 novel_in_catalog MAD2L2 novel 1053 9 NA NA -2 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.198.8 chr1 - 1112 9 full-splice_match MAD2L2 ENST00000376667.7 872 9 27 -267 11 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 52 12.753804 1.105640 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG -21 TRUE NA NA GGGGCT -30 NA NA NA 52 NA PB.198.9 chr1 - 1070 9 full-splice_match MAD2L2 ENST00000376669.9 864 9 -9 -197 4 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.943186 0.468818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG 11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.198.10 chr1 - 1109 9 novel_not_in_catalog MAD2L2 novel 872 9 NA NA 8 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG -24 TRUE NA NA GGGGCT -33 NA NA NA 2 NA PB.198.11 chr1 - 1034 9 novel_not_in_catalog MAD2L2 novel 872 9 NA NA -43 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG 350 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.198.12 chr1 - 1017 9 novel_not_in_catalog MAD2L2 novel 1053 9 NA NA -176 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.169513 0.620085 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG -20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.198.13 chr1 - 837 7 incomplete-splice_match MAD2L2 ENST00000376692.9 1053 9 730 1 693 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG 1123 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.198.14 chr1 - 1024 9 novel_not_in_catalog MAD2L2 novel 1053 9 NA NA 4 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAGCTGAGCCATCATTAACT 11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.198.15 chr1 - 1015 9 novel_not_in_catalog MAD2L2 novel 1053 9 NA NA 5 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAGCTGAGCCATCATTAACT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.198.16 chr1 - 1082 9 novel_not_in_catalog MAD2L2 novel 1860 11 NA NA -43 -8 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGGGCTGAGCTGAGCCATCA 350 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.200.1 chr1 - 1377 5 incomplete-splice_match MTHFR ENST00000641820.1 1569 8 2092 -619 2092 18 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTCTGAACCCTTGTGCTTG 9130 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.200.2 chr1 - 1817 7 incomplete-splice_match MTHFR ENST00000641820.1 1569 8 1223 -614 1223 13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGGCAGTCTGAACCCTTGT 8261 FALSE NA NA GGGGCT -4 NA NA NA 2 NA PB.201.2 chr1 + 1378 6 full-splice_match AGTRAP ENST00000476512.5 942 6 6 -442 -1 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.943186 0.468818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGATGGGCTGTGTTTTGAAC -30 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 12 NA PB.201.3 chr1 + 1103 4 novel_in_catalog AGTRAP novel 1130 5 NA NA 2 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGATGGGCTGTGTTTTGAA -27 TRUE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.201.4 chr1 + 1231 6 full-splice_match AGTRAP ENST00000400895.6 786 6 7 -452 1 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.924247 0.593756 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGATGGGCTGTGTTTTGAAC -22 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 16 NA PB.201.5 chr1 + 1348 6 novel_in_catalog AGTRAP novel 1116 6 NA NA 2 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGATGGGCTGTGTTTTGAAC -21 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.201.6 chr1 + 1209 6 full-splice_match AGTRAP ENST00000452018.6 809 6 -41 -359 2 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.943186 0.468818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGATGGGCTGTGTTTTGAAC -21 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 12 NA PB.201.7 chr1 + 1112 5 full-splice_match AGTRAP ENST00000376629.8 1100 5 -15 3 2 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 44 10.791680 1.033089 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGATGGGCTGTGTTTTGAAC -21 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 44 NA PB.201.9 chr1 + 1033 4 incomplete-splice_match AGTRAP ENST00000314340.10 1130 5 9665 -1 0 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATGGGCTGTGTTTTGAACCA 8266 FALSE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.201.10 chr1 + 855 2 incomplete-splice_match AGTRAP ENST00000513739.5 566 4 2439 -643 936 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGATGGGCTGTGTTTTGAAC NA FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.202.1 chr1 + 5589 23 full-splice_match CLCN6 ENST00000346436.11 5589 23 0 0 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTCTGTCTCCTTTAGCCTTT -6 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 5 NA PB.202.3 chr1 + 989 6 incomplete-splice_match CLCN6 ENST00000376490.7 963 11 -22 4903 10 2536 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAATACAAAATTAGCCGG 5 TRUE NA NA AGTAAA -19 NA NA NA 4 NA PB.202.8 chr1 + 2380 6 incomplete-splice_match CLCN6 ENST00000376496.4 2922 22 17483 8678 -6106 1069 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAACATAAAAAAGAACAAG NA FALSE NA NA AATATA -11 NA NA NA 2 NA PB.202.9 chr1 + 4278 11 novel_not_in_catalog CLCN6 novel 5631 22 NA NA 3745 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CCTCTGTCTCCTTTAGCCTT NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.202.10 chr1 + 2346 8 novel_not_in_catalog CLCN6 novel 3993 27 NA NA 4650 6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTCCTTTAGCCTTTTGTCTC NA FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.202.11 chr1 + 3180 3 incomplete-splice_match CLCN6 ENST00000346436.11 5589 23 32186 0 -2640 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTCTGTCTCCTTTAGCCTTT NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.206.1 chr1 + 3007 19 full-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 -30 -1 -7 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 415 101.785164 2.007684 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGAAGGGAAGATGCTCAGGG -31 TRUE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 415 NA PB.206.2 chr1 + 2874 18 novel_in_catalog PLOD1 novel 2976 19 NA NA 2 2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGGGAAGATGCTCAGGGCG -22 TRUE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.206.3 chr1 + 3119 20 novel_in_catalog PLOD1 novel 2976 19 NA NA -3 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG -4 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 10 NA PB.206.4 chr1 + 2837 18 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 13260 -1 -6324 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.188451 0.503580 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGAAGGGAAGATGCTCAGGG NA FALSE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 13 NA PB.206.5 chr1 + 2640 17 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 15160 1 -4424 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.150575 0.711856 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG 64 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 21 NA PB.206.6 chr1 + 2488 16 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 15762 1 -3822 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.924247 0.593756 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG 45 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 16 NA PB.206.7 chr1 + 2270 13 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 22199 1 2615 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.414778 0.644909 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG 2070 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 18 NA PB.206.8 chr1 + 2197 13 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 22274 -1 2690 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGAAGGGAAGATGCTCAGGG 24 FALSE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 10 NA PB.206.10 chr1 + 2070 11 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 23798 1 4214 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 31 7.603229 0.880998 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG -3 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 31 NA PB.206.11 chr1 + 1910 10 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 25956 1 -4015 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG 2070 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 10 NA PB.206.12 chr1 + 1856 10 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 26010 1 -3961 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.433716 0.535764 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG 2124 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 14 NA PB.206.13 chr1 + 1681 8 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 29489 -1 -482 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 38 9.320087 0.969420 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGAAGGGAAGATGCTCAGGG 5603 FALSE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 38 NA PB.206.14 chr1 + 1600 8 novel_not_in_catalog PLOD1 novel 2976 19 NA NA -459 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 CACTGAAGGGAAGATGCTCA -9 TRUE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.206.15 chr1 + 1492 7 novel_in_catalog PLOD1 novel 2976 19 NA NA -440 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGAAGGGAAGATGCTCAGGG 10 TRUE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.206.16 chr1 + 1563 7 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 29948 1 -23 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 31 7.603229 0.880998 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG 427 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 31 NA PB.206.17 chr1 + 1445 6 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 30760 1 775 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.150575 0.711856 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG 1239 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 21 NA PB.206.18 chr1 + 1263 4 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 32269 1 2284 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 26 6.376902 0.804610 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG 1466 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 26 NA PB.206.19 chr1 + 1154 3 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 35956 1 -870 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 33 8.093760 0.908150 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG 6 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 33 NA PB.206.20 chr1 + 1014 2 full-splice_match PLOD1 ENST00000481933.1 2339 2 1325 0 1325 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.678982 0.565728 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG 2201 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 15 NA PB.207.1 chr1 + 4596 19 full-splice_match MFN2 ENST00000235329.10 4407 19 -196 7 10 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAAATCCTTTGTGAGATCTG 9581 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 6 NA PB.207.2 chr1 + 4517 19 full-splice_match MFN2 ENST00000235329.10 4407 19 -105 -5 -31 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GAGATCTGTCTTTTTGGGTT 34 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.207.3 chr1 + 4578 19 novel_in_catalog MFN2 novel 4772 20 NA NA 0 2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTGAGATCTGTCTTTTTGG -7 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.207.4 chr1 + 4268 18 full-splice_match MFN2 ENST00000674817.1 4514 18 249 -3 3 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTTGTGAGATCTGTCTTTTT -4 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 9 NA PB.207.5 chr1 + 4533 20 full-splice_match MFN2 ENST00000675817.1 4766 20 235 -2 0 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATCCTTTGTGAGATCTGT 2 TRUE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.207.6 chr1 + 4406 19 full-splice_match MFN2 ENST00000235329.10 4407 19 0 1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 58 14.225396 1.153064 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTTTGTGAGATCTGTCTTTT 2 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 58 NA PB.207.7 chr1 + 4013 16 full-splice_match MFN2 ENST00000675483.1 4337 16 325 -1 325 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAAATCCTTTGTGAGATCTG 7809 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 2 NA PB.207.8 chr1 + 3961 16 full-splice_match MFN2 ENST00000675483.1 4337 16 386 -10 386 2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTGAGATCTGTCTTTTTGG 7870 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 5 NA PB.207.9 chr1 + 3763 15 incomplete-splice_match MFN2 ENST00000675483.1 4337 16 4047 -8 144 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTTGTGAGATCTGTCTTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.207.10 chr1 + 3551 13 full-splice_match MFN2 ENST00000675528.1 3700 13 151 -2 151 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATCCTTTGTGAGATCTGT NA FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.207.11 chr1 + 3480 12 incomplete-splice_match MFN2 ENST00000675528.1 3700 13 337 -8 337 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTTGTGAGATCTGTCTTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.207.12 chr1 + 3377 11 full-splice_match MFN2 ENST00000675404.1 4447 11 1076 -6 1076 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGTGAGATCTGTCTTTTTG NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.207.13 chr1 + 3249 10 incomplete-splice_match MFN2 ENST00000675404.1 4447 11 1419 -7 1419 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTGAGATCTGTCTTTTTGG 302 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 5 NA PB.207.14 chr1 + 3177 9 incomplete-splice_match MFN2 ENST00000675404.1 4447 11 1634 -5 1634 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTTGTGAGATCTGTCTTTTT 517 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.207.16 chr1 + 3047 8 incomplete-splice_match MFN2 ENST00000675404.1 4447 11 3646 1 -2772 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATCCTTTGTGAGATCTGT 2529 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 7 NA PB.207.17 chr1 + 2875 7 incomplete-splice_match MFN2 ENST00000675404.1 4447 11 4206 3 -2212 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GGAAATCCTTTGTGAGATCT 3089 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 7 NA PB.207.18 chr1 + 2728 5 incomplete-splice_match MFN2 ENST00000675404.1 4447 11 5355 -5 -1063 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTTGTGAGATCTGTCTTTTT 4238 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 8 NA PB.207.19 chr1 + 2553 5 incomplete-splice_match MFN2 ENST00000675404.1 4447 11 5529 -4 -889 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTTTGTGAGATCTGTCTTTT 4412 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 10 NA PB.207.20 chr1 + 2354 4 incomplete-splice_match MFN2 ENST00000675404.1 4447 11 6329 1 -89 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATCCTTTGTGAGATCTGT 5212 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 10 NA PB.207.21 chr1 + 2266 3 full-splice_match MFN2 ENST00000676295.1 2622 3 366 -10 366 2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTGAGATCTGTCTTTTTGG 5667 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 10 NA PB.207.22 chr1 + 2136 2 full-splice_match MFN2 ENST00000675043.1 2148 2 48 -36 48 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTTTGTGAGATCTGTCTTTT 8136 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 8 NA PB.208.1 chr1 + 2299 8 novel_in_catalog MIIP novel 1541 10 NA NA 4 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTCAAGTCCCACGTGTGC -30 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.208.2 chr1 + 1554 10 full-splice_match MIIP ENST00000235332.6 1541 10 -20 7 12 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 233 57.146851 1.756992 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTCAAGTCCCACGTGTGC -22 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 233 NA PB.208.3 chr1 + 1804 9 novel_in_catalog MIIP novel 1541 10 NA NA -11 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGTCCCACGTGTGCTGGTT -13 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.208.4 chr1 + 1674 9 novel_in_catalog MIIP novel 1541 10 NA NA -2 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGTCCCACGTGTGCTGGTT -4 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 5 NA PB.208.5 chr1 + 1441 9 novel_in_catalog MIIP novel 1541 10 NA NA -2 1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CTCAAGTCCCACGTGTGCTG -4 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.208.6 chr1 + 1615 9 novel_in_catalog MIIP novel 1541 10 NA NA -1 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAGCTCAAGTCCCACGTGTG -3 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.208.7 chr1 + 2014 9 novel_in_catalog MIIP novel 1541 10 NA NA 3 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 33 8.093760 0.908150 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTCAAGTCCCACGTGTGC 1 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 33 NA PB.208.8 chr1 + 1712 10 novel_in_catalog MIIP novel 1541 10 NA NA 3 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTCAAGTCCCACGTGTGC 1 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 8 NA PB.208.9 chr1 + 1387 10 novel_not_in_catalog MIIP novel 1541 10 NA NA 3 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTCAAGTCCCACGTGTGC 1 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.208.10 chr1 + 2144 8 novel_in_catalog MIIP novel 1541 10 NA NA 6 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.395840 0.732059 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTCAAGTCCCACGTGTGC 4 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 22 NA PB.208.11 chr1 + 1498 10 novel_not_in_catalog MIIP novel 1541 10 NA NA 6 1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTCCCACGTGTGCTGGTTC 4 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.208.12 chr1 + 1331 9 novel_in_catalog MIIP novel 1541 10 NA NA 6 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 35 8.584291 0.933704 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAGCTCAAGTCCCACGTGTG 4 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 35 NA PB.208.13 chr1 + 1586 10 novel_not_in_catalog MIIP novel 1541 10 NA NA 54 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGTCCCACGTGTGCTGGTT 52 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 7 NA PB.208.14 chr1 + 2043 9 novel_not_in_catalog MIIP novel 1392 6 NA NA 80 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGTCCCACGTGTGCTGGTT 78 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.208.15 chr1 + 1344 9 incomplete-splice_match MIIP ENST00000235332.6 1541 10 2282 7 -442 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTCAAGTCCCACGTGTGC 2280 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 6 NA PB.208.16 chr1 + 1090 8 incomplete-splice_match MIIP ENST00000235332.6 1541 10 2790 7 66 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTCAAGTCCCACGTGTGC 2788 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.208.17 chr1 + 1403 6 full-splice_match MIIP ENST00000498685.5 1392 6 -11 0 -11 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGTCCCACGTGTGCTGGTT 3353 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.209.1 chr1 + 3756 15 full-splice_match TNFRSF8 ENST00000263932.7 3760 15 1 3 1 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAGGCTGAGGACATGATCA 5 TRUE NA NA CATAAA -16 NA NA NA 4 NA PB.210.2 chr1 + 2412 10 novel_not_in_catalog TNFRSF1B novel 3687 10 NA NA -6 -5514 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTTCTTGGATTCGTCTGAT -5 TRUE NA NA TATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.210.3 chr1 + 3685 10 full-splice_match TNFRSF1B ENST00000376259.7 3687 10 0 2 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 26 6.376902 0.804610 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACACGTCGACCCCTGGCTC 1 TRUE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 26 NA PB.210.6 chr1 + 3582 9 full-splice_match TNFRSF1B ENST00000492361.1 3583 9 -8 9 4 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACACGTCGACCCCTGGCTCT 5 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.210.8 chr1 + 2828 5 incomplete-splice_match TNFRSF1B ENST00000492361.1 3583 9 26065 10 1230 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACACGTCGACCCCTGGCTC 117 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.211.2 chr1 + 1889 14 incomplete-splice_match VPS13D ENST00000620676.6 16357 70 2 245037 2 9055 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGTATGTACAACAGTTGGAT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.212.1 chr1 + 1443 9 incomplete-splice_match VPS13D ENST00000646917.1 5369 34 127 61896 127 -26096 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAAGAAAAGAAGGTGCTG 7737 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.215.1 chr1 - 2673 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 145 1 121 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACGACCGGTTTGTGTGTGGT 133 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.215.4 chr1 - 2523 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 295 1 271 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACGACCGGTTTGTGTGTGGT 283 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.215.5 chr1 - 2395 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 423 1 399 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACGACCGGTTTGTGTGTGGT 411 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.215.6 chr1 - 2325 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 493 1 469 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACGACCGGTTTGTGTGTGGT 481 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.215.7 chr1 - 2332 4 novel_not_in_catalog KIAA2013 novel 2170 4 NA NA 2 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACGACCGGTTTGTGTGTGGT 14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.215.10 chr1 - 1986 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 832 1 808 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACGACCGGTTTGTGTGTGGT 820 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.215.11 chr1 - 1858 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 960 1 936 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACGACCGGTTTGTGTGTGGT 948 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.215.12 chr1 - 1673 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 1145 1 1121 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.169513 0.620085 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACGACCGGTTTGTGTGTGGT 1133 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.215.13 chr1 - 1481 2 incomplete-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 3052 1 3028 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACGACCGGTTTGTGTGTGGT 3040 FALSE NA NA GGGGCT -38 NA NA NA 3 NA PB.215.15 chr1 - 1156 2 incomplete-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 3377 1 3353 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACGACCGGTTTGTGTGTGGT 3365 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.215.17 chr1 - 1033 2 incomplete-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 3500 1 3476 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACGACCGGTTTGTGTGTGGT 3488 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.215.18 chr1 - 890 2 incomplete-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 3643 1 3619 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACGACCGGTTTGTGTGTGGT 3631 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.215.19 chr1 - 1274 2 incomplete-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 3258 2 3234 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CACGACCGGTTTGTGTGTGG 3246 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.215.20 chr1 - 2636 4 novel_not_in_catalog KIAA2013 novel 2170 4 NA NA -3 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TCACGACCGGTTTGTGTGTG 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.215.21 chr1 - 2196 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 146 477 122 115 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATACTTGAAATGGAACTC 134 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.215.22 chr1 - 2173 4 novel_not_in_catalog KIAA2013 novel 2170 4 NA NA 10 115 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATACTTGAAATGGAACTC -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.215.23 chr1 - 2069 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 273 477 249 115 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATACTTGAAATGGAACTC 261 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.215.24 chr1 - 2029 4 novel_not_in_catalog KIAA2013 novel 2170 4 NA NA -3 115 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATACTTGAAATGGAACTC 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.215.27 chr1 - 1841 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 501 477 477 115 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATACTTGAAATGGAACTC 489 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.215.28 chr1 - 1712 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 630 477 606 115 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.433716 0.535764 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATACTTGAAATGGAACTC 618 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.215.29 chr1 - 1508 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 834 477 810 115 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.169513 0.620085 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATACTTGAAATGGAACTC 822 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.215.30 chr1 - 1359 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 983 477 959 115 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.188451 0.503580 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATACTTGAAATGGAACTC 971 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.215.31 chr1 - 1217 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 1125 477 1101 115 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATACTTGAAATGGAACTC 1113 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.215.32 chr1 - 1122 2 incomplete-splice_match KIAA2013 ENST00000616327.1 2170 4 2911 -115 2911 115 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATACTTGAAATGGAACTC 2923 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.215.33 chr1 - 1007 2 incomplete-splice_match KIAA2013 ENST00000616327.1 2170 4 3026 -115 3026 115 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.169513 0.620085 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATACTTGAAATGGAACTC 3038 FALSE NA NA AATAGA -2 NA NA NA 17 NA PB.215.34 chr1 - 873 2 incomplete-splice_match KIAA2013 ENST00000616327.1 2170 4 3160 -115 3160 115 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATACTTGAAATGGAACTC 3172 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.216.1 chr1 + 3171 13 incomplete-splice_match VPS13D ENST00000646411.1 4522 21 26770 -17 125 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACCTTGTCACATGTAGCTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.216.2 chr1 + 2143 12 incomplete-splice_match VPS13D ENST00000646411.1 4522 21 28906 979 2261 337 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAGGGTCTGTGCTATGTG NA FALSE NA NA AATATA -15 NA NA NA 2 NA PB.216.3 chr1 + 2083 10 incomplete-splice_match VPS13D ENST00000646411.1 4522 21 29852 2703 3207 480 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGTTCCTAGAGGGCTGGC 867 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.216.4 chr1 + 2975 11 incomplete-splice_match VPS13D ENST00000646411.1 4522 21 29881 -17 3236 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACCTTGTCACATGTAGCTG 896 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.216.7 chr1 + 2160 5 incomplete-splice_match VPS13D ENST00000645371.1 2024 14 73030 -1348 -8914 17 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTGAGTCTGGGATGACTC NA FALSE NA NA AATAAA -32 NA NA NA 4 NA PB.216.11 chr1 + 1627 2 incomplete-splice_match VPS13D ENST00000543766.2 3838 4 41998 1684 9712 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACCTTGTCACATGTAGCTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.217.1 chr1 - 1676 6 full-splice_match DHRS3 ENST00000616661.5 2201 6 524 1 524 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.678982 0.565728 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTCCTTTGTTCAAATCTT -1 TRUE NA NA AAAAAG -5 NA NA NA 15 NA PB.217.2 chr1 - 1497 6 full-splice_match DHRS3 ENST00000616661.5 2201 6 703 1 703 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTCCTTTGTTCAAATCTT 5 TRUE NA NA GATAAA -12 NA NA NA 7 NA PB.217.3 chr1 - 1362 6 novel_in_catalog DHRS3 novel 2201 6 NA NA 17 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTCCTTTGTTCAAATCTT 0 TRUE NA NA AAAAAG -11 NA NA NA 7 NA PB.217.4 chr1 - 1080 5 incomplete-splice_match DHRS3 ENST00000616661.5 2201 6 37607 1 15705 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTCCTTTGTTCAAATCTT 64 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.217.5 chr1 - 950 4 incomplete-splice_match DHRS3 ENST00000616661.5 2201 6 38847 1 16945 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTCCTTTGTTCAAATCTT 1304 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.217.6 chr1 - 1580 5 novel_in_catalog DHRS3 novel 2201 6 NA NA 499 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GATTTCCTTTGTTCAAATCT 4 TRUE NA NA AAAAAG -30 NA NA NA 3 NA PB.217.7 chr1 - 1509 7 novel_not_in_catalog DHRS3 novel 2201 6 NA NA 528 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GATTTCCTTTGTTCAAATCT 3 TRUE NA NA AAAAAG -1 NA NA NA 2 NA PB.217.8 chr1 - 1289 6 full-splice_match DHRS3 ENST00000616661.5 2201 6 910 2 -505 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.924247 0.593756 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GATTTCCTTTGTTCAAATCT 2668 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.218.1 chr1 - 1864 4 full-splice_match PRAMEF27 ENST00000436041.6 1947 4 81 2 81 -2 alternative_5end TRUE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGAATCTGTCTGGTGCCCTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.220.1 chr1 + 776 3 antisense novelGene_LRRC38_AS novel NA NA NA NA NA NA multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGTCAGAAATCAAGTTGCTT NA FALSE NA NA AATACA -23 NA NA NA 2 NA PB.221.1 chr1 - 2104 2 full-splice_match LRRC38 ENST00000376085.4 2168 2 63 1 63 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTCAATCTCTGGTATTCTG 2813 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.221.2 chr1 - 1918 2 full-splice_match LRRC38 ENST00000376085.4 2168 2 249 1 249 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTCAATCTCTGGTATTCTG 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.221.3 chr1 - 1677 2 full-splice_match LRRC38 ENST00000376085.4 2168 2 490 1 490 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTCAATCTCTGGTATTCTG 3240 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.221.4 chr1 - 1277 2 full-splice_match LRRC38 ENST00000376085.4 2168 2 890 1 890 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTCAATCTCTGGTATTCTG 3640 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.221.5 chr1 - 1193 2 full-splice_match LRRC38 ENST00000376085.4 2168 2 973 2 973 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CACTCAATCTCTGGTATTCT 3723 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.222.1 chr1 + 1120 6 full-splice_match PDPN ENST00000621990.5 2737 6 -90 1707 -20 3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.433716 0.535764 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTCTCCGTCTGACCATTCT -30 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.222.2 chr1 + 1984 6 full-splice_match PDPN ENST00000621990.5 2737 6 -87 840 -17 335 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACCATCCAGCCTGGCACTTC -27 TRUE NA NA AATAAA -29 NA NA NA 4 NA PB.222.3 chr1 + 1337 6 full-splice_match PDPN ENST00000376057.8 2801 6 -7 1471 -7 -78 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TTTAGCTGGTCCAGATTAAT -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.222.4 chr1 + 1311 6 full-splice_match PDPN ENST00000621990.5 2737 6 -45 1471 25 -78 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TTTAGCTGGTCCAGATTAAT 15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.222.5 chr1 + 2778 6 full-splice_match PDPN ENST00000621990.5 2737 6 -43 2 27 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AACAATGAGTCAGACTTTTG 17 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 8 NA PB.222.6 chr1 + 1208 6 full-splice_match PDPN ENST00000621990.5 2737 6 -43 1572 27 126 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 26 6.376902 0.804610 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TACACATTCTGGTCTAGTTT 17 TRUE NA NA AGTAAA -39 NA NA NA 26 NA PB.222.7 chr1 + 1202 6 full-splice_match PDPN ENST00000376057.8 2801 6 27 1572 27 126 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 28 6.867433 0.836794 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TACACATTCTGGTCTAGTTT 17 TRUE NA NA AGTAAA -39 NA NA NA 28 NA PB.222.8 chr1 + 1065 6 full-splice_match PDPN ENST00000376057.8 2801 6 27 1709 27 1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 27 6.622167 0.821000 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTGTCTCCGTCTGACCATT 17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 27 NA PB.222.9 chr1 + 2750 6 full-splice_match PDPN ENST00000376057.8 2801 6 49 2 -21 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.433716 0.535764 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AACAATGAGTCAGACTTTTG 39 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 14 NA PB.222.10 chr1 + 1697 6 full-splice_match PDPN ENST00000621990.5 2737 6 -2 1042 -2 133 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATAACATTCACTTTCTGCC 58 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.222.12 chr1 + 1692 6 full-splice_match PDPN ENST00000376057.8 2801 6 70 1039 0 136 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACATTCACTTTCTGCCTCT 60 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.222.13 chr1 + 1029 6 full-splice_match PDPN ENST00000621990.5 2737 6 0 1708 0 2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.169513 0.620085 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTGTCTCCGTCTGACCATTC 60 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.222.14 chr1 + 2636 6 full-splice_match PDPN ENST00000621990.5 2737 6 99 2 98 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AACAATGAGTCAGACTTTTG 159 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.222.15 chr1 + 896 6 full-splice_match PDPN ENST00000376057.8 2801 6 198 1707 127 3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTCTCCGTCTGACCATTCT 188 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.222.16 chr1 + 996 6 full-splice_match PDPN ENST00000621990.5 2737 6 169 1572 -92 126 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TACACATTCTGGTCTAGTTT 11 FALSE NA NA AGTAAA -39 NA NA NA 2 NA PB.222.18 chr1 + 2345 5 incomplete-splice_match PDPN ENST00000475043.5 849 6 21816 -1708 21808 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AACAATGAGTCAGACTTTTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.224.2 chr1 + 2278 4 full-splice_match PRDM2 ENST00000505823.5 568 4 -55 -1655 -22 -5 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AACAAGCCTGGGAGTGATCA -5 TRUE NA NA AATAAA -23 NA NA NA 3 NA PB.224.3 chr1 + 4020 3 incomplete-splice_match PRDM2 ENST00000413440.5 6175 4 12 5826 0 3621 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAAAAAGTTTCTCATTC -12 TRUE NA NA AATAAA -43 NA NA NA 3 NA PB.224.4 chr1 + 3812 3 incomplete-splice_match PRDM2 ENST00000413440.5 6175 4 24 6022 3 3425 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 ATTGAAGAAAAAAAATCAGC 0 TRUE NA NA ATTAAA -4 NA NA NA 2 NA PB.224.18 chr1 + 2083 2 incomplete-splice_match PRDM2 ENST00000343137.8 5797 5 32479 -2 10168 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAAATTGTTTTGGACGCTTC 1590 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.224.19 chr1 + 1803 2 incomplete-splice_match PRDM2 ENST00000343137.8 5797 5 32735 22 10424 -22 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAATAAAATATTTAAAAT 1846 FALSE NA NA TATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.224.20 chr1 + 2236 2 incomplete-splice_match PRDM2 ENST00000413440.5 6175 4 32752 6 10429 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TAAACATCTGTGAAAGGACT 1851 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.224.21 chr1 + 1789 2 incomplete-splice_match PRDM2 ENST00000343137.8 5797 5 32953 -182 10642 182 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATACAAAAAGGGGTTGTCCA 2064 FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.224.22 chr1 + 1546 2 incomplete-splice_match PRDM2 ENST00000343137.8 5797 5 32992 22 10681 -22 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAATAAAATATTTAAAAT 2103 FALSE NA NA TATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.224.23 chr1 + 1156 2 incomplete-splice_match PRDM2 ENST00000343137.8 5797 5 33382 22 11071 -22 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAATAAAATATTTAAAAT 338 FALSE NA NA TATAAA -17 NA NA NA 5 NA PB.224.24 chr1 + 1589 2 incomplete-splice_match PRDM2 ENST00000413440.5 6175 4 33411 -6 11088 6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAGGACTGCATTTTGTACA 355 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.269.1 chr1 - 1963 3 full-splice_match TMEM51-AS1 ENST00000669314.1 3126 3 1176 -13 16 13 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAGAAAAAAAAA -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.269.3 chr1 - 1213 2 novel_not_in_catalog TMEM51-AS1 novel 7100 6 NA NA -44 -15385 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TATGTATTCTTTTGTGTCTA 3758 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.270.1 chr1 + 1924 3 full-splice_match TMEM51 ENST00000428417.5 1942 3 18 0 -16 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACATTTGGGTGCTGAGTTAC 8 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.270.2 chr1 + 1994 4 full-splice_match TMEM51 ENST00000376014.7 1843 4 -14 -137 -14 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TACATTTGGGTGCTGAGTTA 10 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 7 NA PB.270.3 chr1 + 2173 4 novel_not_in_catalog TMEM51 novel 1942 3 NA NA 253 1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTTGGGTGCTGAGTTACTT 14 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.270.4 chr1 + 1368 2 novel_in_catalog TMEM51 novel 1971 4 NA NA -6 1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTTGGGTGCTGAGTTACTT 0 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.270.5 chr1 + 1890 3 full-splice_match TMEM51 ENST00000400796.7 1842 3 21 -69 7 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.697920 0.431029 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACATTTGGGTGCTGAGTTAC 13 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 11 NA PB.270.6 chr1 + 1855 4 full-splice_match TMEM51 ENST00000376008.3 1971 4 14 102 -7 -17 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.660044 0.668390 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAGAA 20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.270.7 chr1 + 1780 3 full-splice_match TMEM51 ENST00000400796.7 1842 3 30 32 -5 -17 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.188451 0.503580 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAGAA 22 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.270.8 chr1 + 1952 4 full-splice_match TMEM51 ENST00000376008.3 1971 4 18 1 -3 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.678982 0.565728 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACATTTGGGTGCTGAGTTAC 24 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 15 NA PB.270.12 chr1 + 1562 2 incomplete-splice_match TMEM51 ENST00000400796.7 1842 3 61188 32 61153 -17 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAGAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.270.13 chr1 + 1458 2 incomplete-splice_match TMEM51 ENST00000376008.3 1971 4 61376 4 61355 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTACATTTGGGTGCTGAGT NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.270.14 chr1 + 1204 2 incomplete-splice_match TMEM51 ENST00000400796.7 1842 3 61547 31 61512 -16 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAGAAG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.270.15 chr1 + 1216 2 incomplete-splice_match TMEM51 ENST00000376008.3 1971 4 61621 1 61600 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACATTTGGGTGCTGAGTTAC NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 5 NA PB.273.1 chr1 + 929 4 full-splice_match EFHD2 ENST00000375980.9 2422 4 -8 1501 -8 -243 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAATATCTGTGAATGGAG -36 TRUE NA NA ACTAAA -6 NA NA NA 3 NA PB.273.3 chr1 + 2378 4 full-splice_match EFHD2 ENST00000375980.9 2422 4 34 10 34 -10 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.660044 0.668390 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATATTCTTATGTGTGTATG 6 TRUE NA NA GATAAA -5 NA NA NA 19 NA PB.273.4 chr1 + 2255 4 full-splice_match EFHD2 ENST00000375980.9 2422 4 34 133 34 -133 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GGCTTTTTGCTTCTTTTTTC 6 TRUE NA NA TATAAA -16 NA NA NA 6 NA PB.273.5 chr1 + 2202 4 full-splice_match EFHD2 ENST00000375980.9 2422 4 210 10 -167 -10 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATATTCTTATGTGTGTATG 182 FALSE NA NA GATAAA -5 NA NA NA 8 NA PB.273.6 chr1 + 2072 4 full-splice_match EFHD2 ENST00000375980.9 2422 4 341 9 -36 -9 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATATTCTTATGTGTGTATGG 54 FALSE NA NA GATAAA -6 NA NA NA 10 NA PB.273.7 chr1 + 1917 4 full-splice_match EFHD2 ENST00000375980.9 2422 4 368 137 -9 -137 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TTTGGGCTTTTTGCTTCTTT 81 FALSE NA NA TATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.273.8 chr1 + 1762 2 novel_in_catalog EFHD2 novel 2422 4 NA NA 15606 -133 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GGCTTTTTGCTTCTTTTTTC NA FALSE NA NA TATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.273.9 chr1 + 1918 3 incomplete-splice_match EFHD2 ENST00000375980.9 2422 4 16085 10 15708 -10 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATATTCTTATGTGTGTATG 86 FALSE NA NA GATAAA -5 NA NA NA 6 NA PB.273.10 chr1 + 1828 2 incomplete-splice_match EFHD2 ENST00000375980.9 2422 4 17307 9 16930 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATATTCTTATGTGTGTATGG 43 FALSE NA NA GATAAA -6 NA NA NA 9 NA PB.273.11 chr1 + 1703 2 incomplete-splice_match EFHD2 ENST00000375980.9 2422 4 17311 130 16934 -130 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TTTTTGCTTCTTTTTTCCCC 47 FALSE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.275.1 chr1 - 1938 2 novel_not_in_catalog CASP9 novel 4463 8 NA NA 14505 1105 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGGAGTTCATGTGTGACTGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.275.2 chr1 - 1501 7 incomplete-splice_match CASP9 ENST00000474305.2 1111 9 16292 -667 -856 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTCTCTTTTGCCTATTTCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.275.3 chr1 - 1447 6 incomplete-splice_match CASP9 ENST00000400777.7 1878 9 17135 -90 -5 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTCTCTTTTGCCTATTTCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.275.4 chr1 - 1070 4 incomplete-splice_match CASP9 ENST00000400777.7 1878 9 19562 -90 2422 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTCTCTTTTGCCTATTTCT NA FALSE NA NA AAAAAG -45 NA NA NA 3 NA PB.275.5 chr1 - 1974 9 full-splice_match CASP9 ENST00000333868.10 2808 9 -49 883 -47 -14 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 70 17.168583 1.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATGGACTCTCTTTTGC -39 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 70 NA PB.275.6 chr1 - 1864 8 novel_in_catalog CASP9 novel 2808 9 NA NA 3 -14 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATGGACTCTCTTTTGC 36 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.275.7 chr1 - 1483 5 full-splice_match CASP9 ENST00000348549.9 1621 5 124 14 -6 -14 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATGGACTCTCTTTTGC 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.275.8 chr1 - 834 2 incomplete-splice_match CASP9 ENST00000424908.5 740 5 13078 -513 13078 -15 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAAATATGGACTCTCTTTTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.277.1 chr1 + 1796 1 full-splice_match CHCHD2P6 ENST00000454346.1 447 1 -878 -471 -878 471 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CTTCCAATTTGGAGAGTCTG -3 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.277.2 chr1 + 1594 1 full-splice_match CHCHD2P6 ENST00000454346.1 447 1 -878 -269 -878 269 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAGAAAAAAAAAATAG -3 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.278.1 chr1 + 3942 10 full-splice_match DDI2 ENST00000480945.6 10667 10 -40 6765 -40 1222 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAATATCTTATCGTAGAGTG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.278.2 chr1 + 3667 10 full-splice_match DDI2 ENST00000480945.6 10667 10 -12 7012 -12 975 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.943186 0.468818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATACTGTTTTAGAATGAGAG -8 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 12 NA PB.279.3 chr1 - 1471 7 full-splice_match AGMAT ENST00000375826.4 3095 7 28 1596 28 -1596 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 47 11.527476 1.061734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATATTTCTATATCTTCCTTT 26 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 47 NA PB.279.5 chr1 - 1396 7 full-splice_match AGMAT ENST00000375826.4 3095 7 -32 1731 -32 -1731 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.414778 0.644909 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACTGCTTTGATTTTTTTTC -34 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.279.6 chr1 - 1210 7 full-splice_match AGMAT ENST00000375826.4 3095 7 28 1857 28 -1857 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 24 5.886371 0.769848 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGAAAACTTTCTGCTGAAA 26 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 24 NA PB.279.7 chr1 - 1465 7 full-splice_match AGMAT ENST00000375826.4 3095 7 -228 1858 -228 -1858 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 CAAGAAAACTTTCTGCTGAA 3237 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.280.1 chr1 + 3273 15 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000375799.8 4134 20 35569 2 -9956 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 1987 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.280.2 chr1 + 3103 13 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000375793.2 4004 19 41005 2 -4450 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 7493 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.280.3 chr1 + 2970 13 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000375793.2 4004 19 41138 2 -4317 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 7626 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.280.4 chr1 + 2773 12 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000642363.1 3775 21 42637 2 -2652 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 123 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 6 NA PB.280.5 chr1 + 2589 12 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000642363.1 3775 21 42821 2 -2468 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 307 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.280.6 chr1 + 2366 12 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000642363.1 3775 21 43044 2 -2245 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 530 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 7 NA PB.280.7 chr1 + 2224 12 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000642363.1 3775 21 43186 2 -2103 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 672 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 5 NA PB.280.8 chr1 + 2115 11 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000642363.1 3775 21 43541 2 -1748 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 1027 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 7 NA PB.280.9 chr1 + 1898 8 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000642363.1 3775 21 44555 2 -734 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 2041 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 5 NA PB.280.10 chr1 + 1687 6 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000642363.1 3775 21 45974 2 685 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 3460 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 9 NA PB.280.11 chr1 + 1429 4 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000477849.1 1057 7 2043 -652 2043 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 4818 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 8 NA PB.280.12 chr1 + 1236 3 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000477849.1 1057 7 2537 -652 2537 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.433716 0.535764 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 5312 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 14 NA PB.280.13 chr1 + 1169 2 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000477849.1 1057 7 2685 -651 2685 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CAAGGCTTGTCACTGGCCCT 5460 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 4 NA PB.280.14 chr1 + 1010 2 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000477849.1 1057 7 2845 -652 2845 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 5620 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.281.1 chr1 - 1516 2 novel_not_in_catalog SLC25A34-AS1 novel 642 2 NA NA 245 1121 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAAAGTGCTTAGCCTGTGCC 9511 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.283.3 chr1 + 2128 9 novel_in_catalog FBLIM1 novel 3314 9 NA NA -31 29 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.660044 0.668390 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTGGTGGCTCATGCCTGT -1 TRUE NA NA AAAAAG -16 NA NA NA 19 NA PB.283.4 chr1 + 3349 9 full-splice_match FBLIM1 ENST00000375766.8 3314 9 -35 0 -24 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTCCATGTTGTGTGTAGGCT 6 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 7 NA PB.283.5 chr1 + 1980 9 novel_in_catalog FBLIM1 novel 3314 9 NA NA -24 29 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTGGTGGCTCATGCCTGT 6 FALSE NA NA AAAAAG -16 NA NA NA 5 NA PB.283.7 chr1 + 3208 9 novel_in_catalog FBLIM1 novel 3314 9 NA NA -20 1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TCCATGTTGTGTGTAGGCTC 10 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 3 NA PB.284.1 chr1 + 4015 11 novel_in_catalog SPEN novel 12385 15 NA NA -38 40 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAATGAAAAGACAGATA 101 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.284.2 chr1 + 2718 11 incomplete-splice_match SPEN ENST00000375759.8 12385 15 0 11859 0 40 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAATGAAAAGACAGATA -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.284.5 chr1 + 4737 11 incomplete-splice_match SPEN ENST00000375759.8 12385 15 109 9731 109 2168 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAGAAGAAAATTAGGAC -12 TRUE NA NA AAGAAA -42 NA NA NA 4 NA PB.284.8 chr1 + 3862 11 novel_in_catalog SPEN novel 12385 15 NA NA 115 40 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAATGAAAAGACAGATA -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.284.10 chr1 + 2126 10 novel_in_catalog SPEN novel 12385 15 NA NA 115 40 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAATGAAAAGACAGATA -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.284.11 chr1 + 1489 5 incomplete-splice_match SPEN ENST00000375759.8 12385 15 115 29155 115 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 GTAAGACACAAGCAAGCTGA -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.284.12 chr1 + 1270 2 incomplete-splice_match SPEN ENST00000375759.8 12385 15 135 66680 135 -2935 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAATTAAAATGATGGATG 14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.284.13 chr1 + 2829 10 novel_in_catalog SPEN novel 891 7 NA NA 18 40 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAATGAAAAGACAGATA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.284.17 chr1 + 1456 8 incomplete-splice_match SPEN ENST00000673875.1 3123 12 73246 -40 -29242 40 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAATGAAAAGACAGATA 9775 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.284.18 chr1 + 1179 7 incomplete-splice_match SPEN ENST00000673875.1 3123 12 75142 -40 -27346 40 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAATGAAAAGACAGATA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.284.19 chr1 + 957 5 incomplete-splice_match SPEN ENST00000673875.1 3123 12 82836 -40 -19652 40 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAATGAAAAGACAGATA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.287.1 chr1 - 4173 16 full-splice_match ZBTB17 ENST00000375743.9 2720 16 -2 -1451 1 1451 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 ACACACAAAACAAAACTGCG -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.287.2 chr1 - 2925 15 novel_in_catalog ZBTB17 novel 2720 16 NA NA 1 1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGCTGCCTATAGGTCCCTG -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.287.3 chr1 - 1556 9 incomplete-splice_match ZBTB17 ENST00000537142.5 2511 15 31268 -1 -383 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGCTGCCTATAGGTCCCTG 8092 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.287.4 chr1 - 3116 15 novel_in_catalog ZBTB17 novel 2720 16 NA NA 6 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCTGCCTATAGGTCCCT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.287.5 chr1 - 2727 16 full-splice_match ZBTB17 ENST00000375733.6 2770 16 43 0 -10 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCTGCCTATAGGTCCCT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.287.6 chr1 - 2718 16 full-splice_match ZBTB17 ENST00000375743.9 2720 16 0 2 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 34 8.339025 0.921115 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCTGCCTATAGGTCCCT -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 34 NA PB.287.7 chr1 - 2550 15 incomplete-splice_match ZBTB17 ENST00000375743.9 2720 16 3025 2 3003 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCTGCCTATAGGTCCCT 3043 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.287.8 chr1 - 2368 14 incomplete-splice_match ZBTB17 ENST00000375743.9 2720 16 27748 2 -1061 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCTGCCTATAGGTCCCT 4550 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.287.9 chr1 - 2047 12 incomplete-splice_match ZBTB17 ENST00000537142.5 2511 15 29854 0 -141 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCTGCCTATAGGTCCCT 6678 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.287.10 chr1 - 1258 5 novel_in_catalog ZBTB17 novel 2511 15 NA NA 208 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCTGCCTATAGGTCCCT 9185 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.287.11 chr1 - 1000 6 incomplete-splice_match ZBTB17 ENST00000537142.5 2511 15 32415 0 262 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCTGCCTATAGGTCCCT 9239 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.287.12 chr1 - 1365 8 incomplete-splice_match ZBTB17 ENST00000537142.5 2511 15 31553 1 -98 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAATGCTGCCTATAGGTCCC 8377 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.287.13 chr1 - 791 4 incomplete-splice_match ZBTB17 ENST00000537142.5 2511 15 32906 1 -84 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAATGCTGCCTATAGGTCCC 9730 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.288.1 chr1 - 2155 3 full-splice_match HSPB7 ENST00000406363.2 648 3 -38 -1469 0 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTCTGGAGGCCGCCTGCC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.288.2 chr1 - 2141 3 full-splice_match HSPB7 ENST00000311890.14 2144 3 2 1 0 -1 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 29 7.112698 0.852034 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTCTGGAGGCCGCCTGCC 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 29 NA PB.288.3 chr1 - 1815 2 full-splice_match HSPB7 ENST00000442459.2 2702 2 885 2 667 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTCTGGAGGCCGCCTGCC 3312 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.288.5 chr1 - 2101 3 full-splice_match HSPB7 ENST00000487046.1 844 3 85 -1342 17 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGACTTCTGGAGGCCGCCTG 2482 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.288.7 chr1 - 1263 3 full-splice_match HSPB7 ENST00000311890.14 2144 3 2 879 0 466 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATGAAACTCCTGCCGTCCTG 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.289.1 chr1 - 1692 7 full-splice_match FAM131C ENST00000375662.5 1720 7 27 1 8 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.188451 0.503580 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGACCTTGGCCTGGTCTCT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.289.2 chr1 - 1516 6 novel_in_catalog FAM131C novel 1720 7 NA NA -1 -3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGATGACCTTGGCCTGGTCT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.290.1 chr1 + 918 2 full-splice_match SRARP ENST00000329454.2 3039 2 0 2121 0 -2121 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAACAGCGATGAATGCTCTG 0 TRUE NA NA AATAAA -34 NA NA NA 7 NA PB.291.1 chr1 - 1716 6 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 23669 1 1162 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCTTGGCTTTCAGTCTTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.291.3 chr1 - 3852 17 full-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 92 2 75 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GATCTTGGCTTTCAGTCTTG 93 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.291.4 chr1 - 3066 15 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 7610 2 -2009 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GATCTTGGCTTTCAGTCTTG 7611 FALSE NA NA GGGGCT -34 NA NA NA 2 NA PB.291.5 chr1 - 1332 3 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 25650 2 3143 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GATCTTGGCTTTCAGTCTTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.291.6 chr1 - 1179 3 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 25803 2 3296 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GATCTTGGCTTTCAGTCTTG 125 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.291.7 chr1 - 4011 17 full-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 -72 7 -72 -7 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACCGATCTTGGCTTTCAG NA FALSE NA NA TTTAAA -42 NA NA NA 2 NA PB.291.8 chr1 - 3871 16 novel_in_catalog EPHA2 novel 3946 17 NA NA 0 -7 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACCGATCTTGGCTTTCAG 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.291.9 chr1 - 3939 17 full-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 0 7 0 -7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.660044 0.668390 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACCGATCTTGGCTTTCAG 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.291.10 chr1 - 3669 16 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 5154 7 -4465 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACCGATCTTGGCTTTCAG 5155 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.291.11 chr1 - 2694 13 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 18013 7 -4494 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACCGATCTTGGCTTTCAG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.291.12 chr1 - 2340 11 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 20914 7 -1593 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACCGATCTTGGCTTTCAG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.291.13 chr1 - 2067 8 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 22460 7 -47 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACCGATCTTGGCTTTCAG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.291.14 chr1 - 1901 7 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 22738 7 231 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACCGATCTTGGCTTTCAG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.291.15 chr1 - 1455 4 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 24221 7 1714 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACCGATCTTGGCTTTCAG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.291.16 chr1 - 1006 2 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 26607 7 4100 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACCGATCTTGGCTTTCAG 929 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.291.17 chr1 - 3987 18 novel_not_in_catalog EPHA2 novel 3946 17 NA NA -11745 -8 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAAACCGATCTTGGCTTTCA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.291.18 chr1 - 3661 17 full-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 0 285 0 -285 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAGAGAATGTGTGTGTGTGG 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.292.1 chr1 - 2255 10 novel_not_in_catalog ARHGEF19 novel 3322 16 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTTGTTTCCTGTGGCTTCT 6096 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.292.2 chr1 - 2250 8 novel_in_catalog ARHGEF19 novel 3322 16 NA NA -2 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTTATTTGTTTCCTGTGGCT 6094 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.292.3 chr1 - 912 4 novel_not_in_catalog ARHGEF19 novel 2035 11 NA NA 4338 -246 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GGAGTCTGTGATCCATCTGA 8048 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.292.4 chr1 - 3074 16 full-splice_match ARHGEF19 ENST00000270747.8 3322 16 0 248 0 -248 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTGGAGTCTGTGATCCATCT -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.292.5 chr1 - 1920 10 incomplete-splice_match ARHGEF19 ENST00000270747.8 3322 16 6147 250 21 -250 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GCTTGGAGTCTGTGATCCAT 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.292.6 chr1 - 1821 11 incomplete-splice_match ARHGEF19 ENST00000270747.8 3322 16 5639 250 -2 -250 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.697920 0.431029 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GCTTGGAGTCTGTGATCCAT 5626 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.292.7 chr1 - 1702 10 incomplete-splice_match ARHGEF19 ENST00000270747.8 3322 16 6365 250 239 -250 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GCTTGGAGTCTGTGATCCAT 6352 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.293.1 chr1 - 994 2 full-splice_match ANO7L1 ENST00000475369.2 998 2 1 3 1 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACTGCCACCTCTCCACGG 9510 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.294.2 chr1 - 1551 5 full-splice_match CPLANE2 ENST00000375599.8 1574 5 14 9 14 -9 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGTGCTGAACTCCAGAGACG 11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.297.1 chr1 + 3528 4 full-splice_match SZRD1 ENST00000401088.9 3480 4 -53 5 -36 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 123 30.167652 1.479542 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGTCAGATCTTTGTCCTCAT 22 FALSE NA NA TATAAA -28 NA NA NA 123 NA PB.297.3 chr1 + 884 3 full-splice_match SZRD1 ENST00000401089.3 3447 3 10 2553 0 186 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 31 7.603229 0.880998 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAATATCCTTTCTTTTTTT -4 TRUE NA NA AAAAAG -14 NA NA NA 31 NA PB.297.5 chr1 + 996 3 full-splice_match SZRD1 ENST00000492354.1 3401 3 -34 2439 -4 297 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGGGTAGTTTGGTAG -8 TRUE NA NA AAAAAG -41 NA NA NA 2 NA PB.297.6 chr1 + 935 4 full-splice_match SZRD1 ENST00000401088.9 3480 4 -8 2553 -1 186 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 24 5.886371 0.769848 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAATATCCTTTCTTTTTTT -5 TRUE NA NA AAAAAG -14 NA NA NA 24 NA PB.297.7 chr1 + 3439 3 full-splice_match SZRD1 ENST00000401089.3 3447 3 7 1 -3 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 336 82.409195 1.915976 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGATCTTTGTCCTCATTTCA -7 TRUE NA NA TATAAA -32 NA NA NA 336 NA PB.297.8 chr1 + 3559 5 full-splice_match SZRD1 ENST00000472351.5 791 5 -14 -2754 -2 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGATCTTTGTCCTCATTTCA -6 TRUE NA NA TATAAA -32 NA NA NA 3 NA PB.297.9 chr1 + 1674 3 full-splice_match SZRD1 ENST00000401089.3 3447 3 17 1756 0 983 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 235 57.637383 1.760704 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GATGACAGACTGGTTCCTCA 3 TRUE NA NA AATAAA -35 NA NA NA 235 NA PB.297.10 chr1 + 1703 4 full-splice_match SZRD1 ENST00000401088.9 3480 4 -8 1785 -1 954 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 75 18.394909 1.264698 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAAGAACAGCTTTGCTTT -5 TRUE NA NA AATAAA -6 NA NA NA 75 NA PB.297.11 chr1 + 1527 4 novel_not_in_catalog SZRD1 novel 3480 4 NA NA -1 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGATCTTTGTCCTCATTTCA -5 TRUE NA NA TATAAA -32 NA NA NA 2 NA PB.297.13 chr1 + 1779 5 full-splice_match SZRD1 ENST00000475554.5 583 5 -8 -1188 0 954 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAAGAACAGCTTTGCTTT -4 TRUE NA NA AATAAA -6 NA NA NA 2 NA PB.297.14 chr1 + 1045 4 full-splice_match SZRD1 ENST00000401088.9 3480 4 -7 2442 0 297 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGGGTAGTTTGGTAG -4 TRUE NA NA AAAAAG -41 NA NA NA 2 NA PB.297.15 chr1 + 3175 2 novel_in_catalog SZRD1 novel 3447 3 NA NA -1 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGATCTTTGTCCTCATTTCA 2 TRUE NA NA TATAAA -32 NA NA NA 2 NA PB.297.17 chr1 + 3270 2 incomplete-splice_match SZRD1 ENST00000492354.1 3401 3 26055 -2 25609 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGATCTTTGTCCTCATTTCA NA FALSE NA NA TATAAA -32 NA NA NA 3 NA PB.297.18 chr1 + 1457 2 incomplete-splice_match SZRD1 ENST00000472461.1 843 4 25634 -1083 25634 950 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TTGGAAAAAGAACAGCTTTG 0 TRUE NA NA AATAAA -2 NA NA NA 5 NA PB.297.19 chr1 + 3166 2 incomplete-splice_match SZRD1 ENST00000492354.1 3401 3 26158 -1 25712 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CAGATCTTTGTCCTCATTTC 78 FALSE NA NA TATAAA -31 NA NA NA 4 NA PB.298.2 chr1 - 2879 9 novel_in_catalog FBXO42 novel 6227 10 NA NA 16 428 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTCCTTTTCTGTGGCTTTTA -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.298.3 chr1 - 2396 10 full-splice_match FBXO42 ENST00000375592.8 6227 10 17 3814 17 428 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 43 10.546414 1.023105 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTCCTTTTCTGTGGCTTTTA -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 43 NA PB.298.4 chr1 - 2552 11 novel_not_in_catalog FBXO42 novel 6227 10 NA NA 26 427 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TTTCCTTTTCTGTGGCTTTT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.298.5 chr1 - 2279 9 novel_in_catalog FBXO42 novel 6227 10 NA NA 16 427 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TTTCCTTTTCTGTGGCTTTT -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.298.6 chr1 - 1715 7 incomplete-splice_match FBXO42 ENST00000375592.8 6227 10 57650 3815 20537 427 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TTTCCTTTTCTGTGGCTTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.298.7 chr1 - 1472 5 incomplete-splice_match FBXO42 ENST00000375592.8 6227 10 96700 3815 -2187 427 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TTTCCTTTTCTGTGGCTTTT 969 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.298.8 chr1 - 1165 2 incomplete-splice_match FBXO42 ENST00000456164.5 1153 3 1106 -427 1106 427 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TTTCCTTTTCTGTGGCTTTT 4428 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.298.9 chr1 - 2507 11 novel_not_in_catalog FBXO42 novel 6227 10 NA NA 36 426 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.924247 0.593756 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTTCCTTTTCTGTGGCTTT 12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.298.10 chr1 - 1837 8 incomplete-splice_match FBXO42 ENST00000375592.8 6227 10 46642 3816 9529 426 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTTCCTTTTCTGTGGCTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.298.12 chr1 - 3163 4 incomplete-splice_match FBXO42 ENST00000375592.8 6227 10 26 45499 26 -25 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAGAAACAAAGAAAG 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.299.2 chr1 + 1923 7 novel_not_in_catalog NECAP2 novel 2018 8 NA NA -12 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TCATTGTATGTGAAAGATGA -20 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.299.3 chr1 + 2031 8 full-splice_match NECAP2 ENST00000337132.10 2018 8 -14 1 -11 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 355 87.069237 1.939865 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATTGTATGTGAAAGATGAAT -19 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 355 NA PB.299.4 chr1 + 1950 8 full-splice_match NECAP2 ENST00000457722.6 935 8 -11 -1004 -8 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATTGTATGTGAAAGATGAAT -16 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 5 NA PB.299.5 chr1 + 2134 9 full-splice_match NECAP2 ENST00000459640.5 981 9 -32 -1121 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATTGTATGTGAAAGATGAAT -5 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.299.7 chr1 + 1934 7 full-splice_match NECAP2 ENST00000443980.6 1929 7 -5 0 -5 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.188451 0.503580 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATTGTATGTGAAAGATGAAT 2 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 13 NA PB.299.9 chr1 + 1142 8 full-splice_match NECAP2 ENST00000337132.10 2018 8 13 863 0 142 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGAAGAGGTTGAGTTTG 8 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 6 NA PB.299.10 chr1 + 3039 8 novel_in_catalog NECAP2 novel 1787 9 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATTGTATGTGAAAGATGAAT 13 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.299.11 chr1 + 1825 8 full-splice_match NECAP2 ENST00000337132.10 2018 8 18 175 0 -174 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GCTTGGTTTACTGGTTTATA 13 TRUE NA NA AGTAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.299.12 chr1 + 2094 9 novel_not_in_catalog NECAP2 novel 1787 9 NA NA 2 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATTGTATGTGAAAGATGAAT 16 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.299.13 chr1 + 1818 7 novel_in_catalog NECAP2 novel 1787 9 NA NA 2 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATTGTATGTGAAAGATGAAT 16 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.299.14 chr1 + 1836 7 incomplete-splice_match NECAP2 ENST00000492095.5 1787 9 2940 0 2911 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATTGTATGTGAAAGATGAAT 2954 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 8 NA PB.299.15 chr1 + 1698 6 incomplete-splice_match NECAP2 ENST00000492095.5 1787 9 7215 0 7186 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATTGTATGTGAAAGATGAAT 7229 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 9 NA PB.299.16 chr1 + 1520 4 incomplete-splice_match NECAP2 ENST00000492095.5 1787 9 8429 0 -6349 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATTGTATGTGAAAGATGAAT 8443 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 6 NA PB.299.17 chr1 + 2065 3 incomplete-splice_match NECAP2 ENST00000496239.5 4619 7 10505 0 -4258 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATTGTATGTGAAAGATGAAT NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.299.18 chr1 + 1270 2 full-splice_match NECAP2 ENST00000509727.1 550 2 339 -1059 339 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATTGTATGTGAAAGATGAAT NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 8 NA PB.301.4 chr1 - 4473 28 novel_not_in_catalog NBPF1 novel 5932 29 NA NA 12 -18 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 CGAAGAAAAGAAGGAGAAGG 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.301.6 chr1 - 760 5 novel_in_catalog NBPF1 novel 488 4 NA NA -16 -98 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TTTCATTATGACACAGAATG -20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.301.11 chr1 - 941 4 novel_in_catalog NBPF1 novel 5932 29 NA NA -18 -757 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATGCACATTGTGCTTAT -22 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.301.14 chr1 - 2635 1 full-splice_match NBPF1 ENST00000599908.1 3447 1 819 -7 819 7 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAATACATGTTGTGCTTAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.301.15 chr1 - 4202 3 novel_not_in_catalog NBPF1 novel 2752 3 NA NA -12 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TAACATCTAAATACATGTTG 12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.301.16 chr1 - 2721 3 full-splice_match NBPF1 ENST00000599069.5 2752 3 12 19 12 -5 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 CAAGTAACATCTAAATACAT 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.301.17 chr1 - 4004 3 novel_not_in_catalog NBPF1 novel 2752 3 NA NA 10 -205 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAGAAAGAATTGAAGCTG 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.301.18 chr1 - 2548 3 novel_not_in_catalog NBPF1 novel 2752 3 NA NA 12 -1659 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTCTGCTTCTGTCTGTTA 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.301.19 chr1 - 1419 3 novel_not_in_catalog NBPF1 novel 5932 29 NA NA 12 -2788 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATGAGTCTATCTTTTACTGA 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.301.20 chr1 - 2767 3 full-splice_match NBPF1 ENST00000449853.2 2755 3 -16 4 12 -4 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 25 6.131637 0.787576 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATAAGTCATTTTCTGGACAT 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 25 NA PB.301.21 chr1 - 3578 2 incomplete-splice_match NBPF1 ENST00000599069.5 2752 3 16 5822 -12 -5 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TATAAGTCATTTTCTGGACA 12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.301.27 chr1 - 2155 3 full-splice_match NBPF1 ENST00000449853.2 2755 3 -12 612 -12 -612 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACTTCTGTGCAGGATTTTG 12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.302.1 chr1 + 1107 1 full-splice_match ENSG00000261135 ENST00000562878.1 1110 1 1 2 1 -2 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA NA NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TATCTGCTGACTCATCTTTG NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.303.4 chr1 - 2770 14 novel_in_catalog CROCCP2 novel 2575 13 NA NA 0 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTATGTCAGTGTTCTCCT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.303.5 chr1 - 1617 6 full-splice_match CROCCP2 ENST00000640476.1 1750 6 131 2 131 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTATGTCAGTGTTCTCCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.303.6 chr1 - 1042 3 incomplete-splice_match CROCCP2 ENST00000639481.1 1296 4 596 5 596 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTATGTCAGTGTTCTCCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.303.7 chr1 - 873 2 incomplete-splice_match CROCCP2 ENST00000639481.1 1296 4 6515 5 6515 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTATGTCAGTGTTCTCCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.303.8 chr1 - 2262 10 incomplete-splice_match CROCCP2 ENST00000639456.1 2575 13 9602 -14 -3975 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACTATGTCAGTGTTCTCC 9602 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.303.9 chr1 - 1817 7 incomplete-splice_match CROCCP2 ENST00000639456.1 2575 13 13111 -14 -466 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACTATGTCAGTGTTCTCC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.303.10 chr1 - 1760 7 novel_in_catalog CROCCP2 novel 2773 18 NA NA 191 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACTATGTCAGTGTTCTCC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.303.12 chr1 - 1100 3 novel_in_catalog CROCCP2 novel 2773 18 NA NA 2441 -4 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GTAACTATGTCAGTGTTCTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.303.13 chr1 - 2588 12 novel_in_catalog CROCCP2 novel 2575 13 NA NA -28 7 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAGTGTAACTATGTCAGT -28 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.303.16 chr1 - 1027 2 novel_in_catalog CROCCP2 novel 2575 13 NA NA -873 -5386 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAGAAACAAAAAGAAAA NA FALSE NA NA GGGGCT -18 NA NA NA 2 NA PB.306.1 chr1 + 3108 10 novel_not_in_catalog MST1P2 novel 2291 18 NA NA -49 57 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACCAAGGACTTTCTTAAATG 815 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.306.2 chr1 + 2780 12 novel_not_in_catalog MST1P2 novel 2291 18 NA NA -35 129 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAGTGCAGTTTGTTTTCATG 829 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 5 NA PB.306.3 chr1 + 2692 13 novel_not_in_catalog MST1P2 novel 2291 18 NA NA -20 57 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACCAAGGACTTTCTTAAATG -1 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 5 NA PB.306.4 chr1 + 2483 13 novel_not_in_catalog MST1P2 novel 2291 18 NA NA -20 57 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACCAAGGACTTTCTTAAATG -1 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 3 NA PB.306.5 chr1 + 2494 14 novel_in_catalog MST1P2 novel 2291 18 NA NA -17 56 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 CACCAAGGACTTTCTTAAAT 2 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.306.6 chr1 + 2989 11 novel_not_in_catalog MST1P2 novel 2291 18 NA NA -14 57 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACCAAGGACTTTCTTAAATG 5 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 7 NA PB.306.7 chr1 + 2095 7 novel_not_in_catalog MST1P2 novel 2291 18 NA NA 1841 54 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TTCACCAAGGACTTTCTTAA 1860 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.306.8 chr1 + 1850 8 novel_in_catalog MST1P2 novel 2291 18 NA NA 2095 56 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 CACCAAGGACTTTCTTAAAT 21 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.306.9 chr1 + 1853 7 novel_in_catalog MST1P2 novel 2291 18 NA NA 2338 130 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTGCAGTTTGTTTTCATGG 264 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.306.10 chr1 + 1608 8 novel_in_catalog MST1P2 novel 2291 18 NA NA 2338 57 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACCAAGGACTTTCTTAAATG 264 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.309.1 chr1 - 2075 6 novel_in_catalog MFAP2 novel 1045 9 NA NA 0 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGATCAAGTCACTTTTT 14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.309.2 chr1 - 1913 7 novel_in_catalog MFAP2 novel 1045 9 NA NA 0 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGATCAAGTCACTTTTT 14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.309.3 chr1 - 1815 8 novel_in_catalog MFAP2 novel 1045 9 NA NA -3 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGATCAAGTCACTTTTT 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.309.4 chr1 - 1151 8 novel_not_in_catalog MFAP2 novel 1045 9 NA NA -32 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGATCAAGTCACTTTTT 944 FALSE NA NA GGGGCT -36 NA NA NA 5 NA PB.309.5 chr1 - 1187 9 novel_not_in_catalog MFAP2 novel 1045 9 NA NA -53 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGATCAAGTCACTTTTT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.309.6 chr1 - 1080 9 full-splice_match MFAP2 ENST00000375535.4 1045 9 -39 4 -27 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 388 95.162994 1.978468 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGATCAAGTCACTTTTT -25 TRUE NA NA GGGGCT -31 NA NA NA 388 NA PB.309.7 chr1 - 1082 9 novel_not_in_catalog MFAP2 novel 1045 9 NA NA -956 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.943186 0.468818 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGATCAAGTCACTTTTT 20 TRUE NA NA AAGAAA -44 NA NA NA 12 NA PB.309.8 chr1 - 1022 9 novel_not_in_catalog MFAP2 novel 1045 9 NA NA -18 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGATCAAGTCACTTTTT -16 TRUE NA NA GGGGCT -22 NA NA NA 2 NA PB.309.9 chr1 - 951 8 novel_in_catalog MFAP2 novel 1045 9 NA NA 0 -4 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGATCAAGTCACTTTTT 14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.310.1 chr1 - 4028 29 full-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 -32 0 -32 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA 13 FALSE NA NA GGGGCT -10 NA NA NA 8 NA PB.310.2 chr1 - 4001 29 full-splice_match ATP13A2 ENST00000452699.5 3981 29 -20 0 -20 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA -20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.310.3 chr1 - 3923 29 novel_in_catalog ATP13A2 novel 3981 29 NA NA 18 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA 31 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.310.5 chr1 - 3252 23 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 9552 0 -1529 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA 9597 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.310.6 chr1 - 3159 22 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 9837 0 -1244 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA 9882 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.310.7 chr1 - 2898 19 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 11787 0 150 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.310.8 chr1 - 2689 18 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 14831 0 -403 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.310.9 chr1 - 2442 16 novel_in_catalog ATP13A2 novel 3996 29 NA NA 197 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.310.10 chr1 - 2537 17 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 15506 0 -139 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.310.11 chr1 - 2292 15 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 15925 0 280 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.310.12 chr1 - 2058 13 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 19346 0 -724 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA GGGGCT -15 NA NA NA 10 NA PB.310.13 chr1 - 1912 12 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 19575 0 -495 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA GGGGCT -6 NA NA NA 2 NA PB.310.14 chr1 - 1645 10 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 20105 0 35 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.310.15 chr1 - 1522 9 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 21674 0 -251 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.310.16 chr1 - 1328 8 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 21991 0 66 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.310.17 chr1 - 1192 6 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 23459 0 1534 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.310.18 chr1 - 1564 10 novel_in_catalog ATP13A2 novel 3996 29 NA NA -209 -4 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTGGCTCTGCTGTGCCTGTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.311.1 chr1 - 1019 8 full-splice_match SDHB ENST00000375499.8 1015 8 -14 10 -14 -10 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 651 159.667816 2.203217 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAAAAAAAGAACCTGTTC 96 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 651 NA PB.311.2 chr1 - 1163 3 incomplete-splice_match SDHB ENST00000375499.8 1015 8 29244 13 -1628 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAGAACCTG NA FALSE NA NA ATTAAA -8 NA NA NA 2 NA PB.311.3 chr1 - 1110 8 full-splice_match SDHB ENST00000375499.8 1015 8 -108 13 -108 -13 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 512 125.575912 2.098906 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAGAACCTG 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 512 NA PB.311.4 chr1 - 963 8 novel_in_catalog SDHB novel 1015 8 NA NA -15 -13 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAGAACCTG 95 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.311.5 chr1 - 819 7 incomplete-splice_match SDHB ENST00000375499.8 1015 8 9242 13 87 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAGAACCTG 9352 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.311.6 chr1 - 667 5 incomplete-splice_match SDHB ENST00000375499.8 1015 8 25332 13 -5540 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAGAACCTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.311.7 chr1 - 945 8 novel_not_in_catalog SDHB novel 1015 8 NA NA -14 -10 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAGAAATAAATGTTATTCTA 96 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.311.8 chr1 - 933 8 full-splice_match SDHB ENST00000375499.8 1015 8 42 40 17 -10 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAGAAATAAATGTTATTCTA 152 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.312.1 chr1 + 2293 10 novel_in_catalog CROCC novel 6660 37 NA NA -5212 -6 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAAAGTTTGTACAGCTGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.312.3 chr1 + 1290 5 novel_in_catalog CROCC novel 6660 37 NA NA 401 -7 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TAAAAAAGTTTGTACAGCTG 5551 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.312.4 chr1 + 1809 8 incomplete-splice_match CROCC ENST00000375541.10 6660 37 44538 6 441 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAAAGTTTGTACAGCTGT 5591 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.312.5 chr1 + 1395 6 novel_not_in_catalog CROCC novel 6660 37 NA NA -595 -6 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAAAGTTTGTACAGCTGT 8312 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.312.6 chr1 + 1277 6 novel_not_in_catalog CROCC novel 6660 37 NA NA -478 -7 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TAAAAAAGTTTGTACAGCTG 8429 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.312.7 chr1 + 2022 4 novel_in_catalog CROCC novel 6660 37 NA NA -439 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAAAGTTTGTACAGCTGT 8468 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.312.8 chr1 + 1002 4 novel_in_catalog CROCC novel 6660 37 NA NA 79 -7 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TAAAAAAGTTTGTACAGCTG 8986 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.312.9 chr1 + 1151 5 incomplete-splice_match CROCC ENST00000375541.10 6660 37 47967 7 113 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TAAAAAAGTTTGTACAGCTG 9020 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.312.10 chr1 + 1427 2 incomplete-splice_match CROCC ENST00000375541.10 6660 37 48901 -6 1047 6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACAGCTGTGTCCCTTTTCTA 9954 FALSE NA NA AAAAAG -6 NA NA NA 2 NA PB.313.2 chr1 - 2874 5 novel_not_in_catalog PADI2 novel 4361 16 NA NA -222 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATATGGCTGTTGGTGTGATG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.313.5 chr1 - 1807 5 novel_not_in_catalog PADI2 novel 4361 16 NA NA -227 -48 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATTTTGAAGAACCGATTTAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.314.1 chr1 + 3180 16 full-splice_match PADI3 ENST00000375460.3 3189 16 0 9 0 -9 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACACAAATGGCTTGGCTC 1 TRUE NA NA AATAAA -8 NA NA NA 3 NA PB.315.1 chr1 + 4364 27 novel_in_catalog ARHGEF10L novel 4625 29 NA NA 125 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGGACTTGGATTGAGGTTTT 20 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.315.2 chr1 + 4331 26 novel_in_catalog ARHGEF10L novel 4035 27 NA NA -95 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGGACTTGGATTGAGGTTTT 1 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.315.5 chr1 + 3358 18 incomplete-splice_match ARHGEF10L ENST00000375408.7 3685 20 3561 0 3561 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTTGGATTGAGGTTTTGTT 3261 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.315.7 chr1 + 1930 7 incomplete-splice_match ARHGEF10L ENST00000375408.7 3685 20 36324 0 14887 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTTGGATTGAGGTTTTGTT NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.315.8 chr1 + 1493 5 incomplete-splice_match ARHGEF10L ENST00000375408.7 3685 20 38368 0 16931 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTTGGATTGAGGTTTTGTT NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.315.10 chr1 + 1305 3 incomplete-splice_match ARHGEF10L ENST00000375408.7 3685 20 69276 -5 -6455 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GATTGAGGTTTTGTTGTGGT NA FALSE NA NA AATAAA -25 NA NA NA 5 NA PB.317.1 chr1 + 1961 4 novel_not_in_catalog ACTL8 novel 1841 3 NA NA -2 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGGCTCCTGTGATGG -18 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.317.2 chr1 + 1837 3 full-splice_match ACTL8 ENST00000375406.2 1841 3 2 2 2 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 65 15.942255 1.202550 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGGCTCCTGTGATGG -14 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 65 NA PB.317.3 chr1 + 1823 3 novel_not_in_catalog ACTL8 novel 1670 2 NA NA 3998 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.169513 0.620085 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGGCTCCTGTGATGG 1 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 17 NA PB.317.4 chr1 + 1341 2 full-splice_match ACTL8 ENST00000617065.1 1670 2 329 0 329 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGGCTCCTGTGATGG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.319.1 chr1 - 4034 13 full-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 6 0 6 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGGATTTTGCATTTCTTTT -1 TRUE NA NA AAAACA -12 NA NA NA 2 NA PB.319.2 chr1 - 3571 11 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 10521 0 9405 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGGATTTTGCATTTCTTTT 9406 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.319.3 chr1 - 3245 8 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 17385 0 -13246 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.697920 0.431029 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGGATTTTGCATTTCTTTT 3247 FALSE NA NA AAGAAA -42 NA NA NA 11 NA PB.319.4 chr1 - 3098 7 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 18906 0 -11725 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.169513 0.620085 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGGATTTTGCATTTCTTTT 4768 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.319.5 chr1 - 2990 6 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 23081 0 -7550 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.660044 0.668390 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGGATTTTGCATTTCTTTT 8943 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.319.6 chr1 - 2851 5 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 25982 0 -4649 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 25 6.131637 0.787576 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGGATTTTGCATTTCTTTT NA FALSE NA NA AAGAAA -14 NA NA NA 25 NA PB.319.14 chr1 - 2573 3 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 27495 1 -3136 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 30 7.357964 0.866758 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTTGGATTTTGCATTTCTTT 92 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 30 NA PB.319.20 chr1 - 3471 10 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 14039 3 12923 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 27 6.622167 0.821000 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTCTTGGATTTTGCATTTCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 27 NA PB.319.21 chr1 - 2704 5 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 26126 3 -4505 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 28 6.867433 0.836794 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTCTTGGATTTTGCATTTCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 28 NA PB.319.25 chr1 - 4106 13 full-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 -72 6 -72 -6 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTGTCTTGGATTTTGCATT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.319.26 chr1 - 3818 12 full-splice_match RCC2 ENST00000375433.3 2030 12 101 -1889 101 -27 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAATAAACAACAACATTGTC 3017 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.319.28 chr1 - 3638 12 full-splice_match RCC2 ENST00000375433.3 2030 12 281 -1889 281 -27 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAATAAACAACAACATTGTC 3197 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.319.29 chr1 - 3327 9 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 16863 27 -13768 -27 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.943186 0.468818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAATAAACAACAACATTGTC 2725 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.319.31 chr1 - 3701 12 full-splice_match RCC2 ENST00000375433.3 2030 12 217 -1888 217 -28 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.678982 0.565728 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 TAAATAAACAACAACATTGT 3133 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.319.33 chr1 - 2707 11 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375433.3 2030 12 9362 -1009 9362 172 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATGATGTAGTTGTTGT 9363 FALSE NA NA AAAAAG -25 NA NA NA 2 NA PB.319.35 chr1 - 1325 10 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375433.3 2030 12 12978 178 12978 -178 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGTTGATTTACCATTCCTAC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.320.1 chr1 - 3132 15 full-splice_match ALDH4A1 ENST00000375341.8 3139 15 5 2 3 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 44 10.791680 1.033089 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATCACAGTGGTGGATGGTC -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 44 NA PB.320.2 chr1 - 2984 14 full-splice_match ALDH4A1 ENST00000538839.5 2957 14 -27 0 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATCACAGTGGTGGATGGTC -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.320.3 chr1 - 2678 11 incomplete-splice_match ALDH4A1 ENST00000538309.5 1940 15 5393 -1301 121 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATCACAGTGGTGGATGGTC 5265 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.320.4 chr1 - 2491 9 incomplete-splice_match ALDH4A1 ENST00000538309.5 1940 15 7704 -1301 2432 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATCACAGTGGTGGATGGTC 7576 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.320.5 chr1 - 2309 8 incomplete-splice_match ALDH4A1 ENST00000538309.5 1940 15 9122 -1301 3850 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATCACAGTGGTGGATGGTC 8994 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.320.7 chr1 - 2204 7 novel_in_catalog ALDH4A1 novel 3139 15 NA NA 2457 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATCACAGTGGTGGATGGTC 7601 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.320.8 chr1 - 2017 6 incomplete-splice_match ALDH4A1 ENST00000538309.5 1940 15 13427 -1301 8155 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATCACAGTGGTGGATGGTC 8567 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.320.9 chr1 - 1819 4 incomplete-splice_match ALDH4A1 ENST00000538309.5 1940 15 14525 -1301 9253 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATCACAGTGGTGGATGGTC 9665 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.320.10 chr1 - 1612 2 incomplete-splice_match ALDH4A1 ENST00000538309.5 1940 15 16343 -1301 11071 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATCACAGTGGTGGATGGTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.320.12 chr1 - 3381 15 full-splice_match ALDH4A1 ENST00000375341.8 3139 15 -245 3 -76 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAATCACAGTGGTGGATGGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.320.13 chr1 - 2914 13 incomplete-splice_match ALDH4A1 ENST00000538309.5 1940 15 1471 -1300 1471 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAATCACAGTGGTGGATGGT 1343 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.322.1 chr1 - 1309 9 novel_not_in_catalog IFFO2 novel 6179 9 NA NA -16193 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CTTTGCAGTGTTAACTGTGC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.324.1 chr1 - 5073 34 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 93020 4 1603 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGGAAGGTGTTGCCTGC NA FALSE NA NA AATACA -28 NA NA NA 2 NA PB.324.2 chr1 - 3893 26 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 100043 4 335 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGGAAGGTGTTGCCTGC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.324.3 chr1 - 2077 12 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 10824 0 -652 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGGAAGGTGTTGCCTGC 6057 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.324.4 chr1 - 1814 11 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 11549 0 73 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.697920 0.431029 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGGAAGGTGTTGCCTGC 6782 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.324.5 chr1 - 1700 10 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 12057 0 581 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGGAAGGTGTTGCCTGC 7290 FALSE NA NA GATAAA -41 NA NA NA 4 NA PB.324.6 chr1 - 1267 7 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 18154 0 -4522 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.414778 0.644909 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGGAAGGTGTTGCCTGC 1132 FALSE NA NA TATAAA -11 NA NA NA 18 NA PB.324.7 chr1 - 892 5 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 20383 0 -2293 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.678982 0.565728 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGGAAGGTGTTGCCTGC 3361 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.324.8 chr1 - 3636 24 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 103538 5 -1812 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAGGAAGGTGTTGCCTG NA FALSE NA NA AGTAAA -14 NA NA NA 9 NA PB.324.9 chr1 - 3453 23 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 104447 5 -903 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAGGAAGGTGTTGCCTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.324.10 chr1 - 2679 18 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 4510 1 -280 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.433716 0.535764 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAGGAAGGTGTTGCCTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.324.11 chr1 - 2208 13 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 9926 1 932 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.169513 0.620085 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAGGAAGGTGTTGCCTG 5159 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.324.12 chr1 - 1932 11 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 11430 1 -46 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.188451 0.503580 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAGGAAGGTGTTGCCTG 6663 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.324.13 chr1 - 1421 8 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 17005 1 5529 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.414778 0.644909 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAGGAAGGTGTTGCCTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.324.14 chr1 - 1123 6 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 18705 1 -3971 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.697920 0.431029 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAGGAAGGTGTTGCCTG 1683 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.324.15 chr1 - 983 4 full-splice_match UBR4 ENST00000375225.7 1533 4 545 5 -389 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.678982 0.565728 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAGGAAGGTGTTGCCTG 6199 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.324.16 chr1 - 3017 20 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 783 2 783 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGAAAAGGAAGGTGTTGCCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.324.17 chr1 - 1565 9 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 16031 2 4555 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.169513 0.620085 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGAAAAGGAAGGTGTTGCCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.324.18 chr1 - 3171 21 full-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 301 3 301 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TTGAAAAGGAAGGTGTTGCC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.324.20 chr1 - 3333 22 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 105107 8 -243 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATTGAAAAGGAAGGTGTTGC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.324.21 chr1 - 2418 15 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 8323 5 -671 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.414778 0.644909 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 CATTGAAAAGGAAGGTGTTG 3556 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.324.22 chr1 - 1018 5 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 20251 6 -2425 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ACATTGAAAAGGAAGGTGTT 3229 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.324.24 chr1 - 1493 12 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 99807 22683 99 -3098 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GTAGATCATGGCACTGCACA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.324.25 chr1 - 1346 11 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 100110 22683 402 -3098 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GTAGATCATGGCACTGCACA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.324.26 chr1 - 2824 20 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 90652 25866 -765 6190 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAATGACCATAGGACAGTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.324.27 chr1 - 2398 16 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 94629 25866 -2950 6190 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAATGACCATAGGACAGTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.325.1 chr1 - 4425 29 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 52368 46719 -6198 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 8815 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.325.2 chr1 - 4555 30 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 50125 46719 7914 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 6572 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.325.3 chr1 - 4717 31 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 49328 46719 7117 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 5775 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.325.5 chr1 - 5785 37 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 45273 46719 3062 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 1720 FALSE NA NA AGTAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.325.6 chr1 - 4096 27 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 53929 46719 -4637 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 489 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.325.7 chr1 - 3767 25 novel_not_in_catalog UBR4 novel 15892 106 NA NA -3344 -16 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 1782 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.325.8 chr1 - 3473 23 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 56762 46719 -1804 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 3322 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.325.9 chr1 - 3208 22 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 57851 46719 -715 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 4411 FALSE NA NA AAAAAG -27 NA NA NA 2 NA PB.325.10 chr1 - 3084 21 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 58428 46719 -138 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 4988 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.325.11 chr1 - 2856 20 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 59505 46719 939 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 6065 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.325.12 chr1 - 2609 18 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 62137 46719 -2001 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 8697 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.325.13 chr1 - 2474 17 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 63264 46719 -874 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 9824 FALSE NA NA AAAACA -43 NA NA NA 7 NA PB.325.14 chr1 - 2425 17 novel_not_in_catalog UBR4 novel 15892 106 NA NA -807 -16 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 9891 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.325.15 chr1 - 2437 18 novel_in_catalog UBR4 novel 2954 21 NA NA -753 -16 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 9945 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.325.16 chr1 - 2299 16 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 64331 46719 193 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 7823 FALSE NA NA AAGAAA -35 NA NA NA 7 NA PB.325.17 chr1 - 2130 15 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 65385 46719 1247 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 8877 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.325.18 chr1 - 1992 14 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 66217 46719 2079 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 9709 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.325.19 chr1 - 1901 13 novel_not_in_catalog UBR4 novel 15892 106 NA NA 4366 -16 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA NA FALSE NA NA AAGAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.325.20 chr1 - 1836 13 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 68575 46719 4437 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.325.21 chr1 - 1840 5 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000425413.5 2954 21 24078 29 79 -16 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 3656 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.325.22 chr1 - 1650 12 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 68883 46719 4745 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.188451 0.503580 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.325.23 chr1 - 1540 11 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 69447 46719 5309 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.325.24 chr1 - 1435 10 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000425413.5 2954 21 12553 29 6981 -16 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.325.25 chr1 - 1307 9 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000425413.5 2954 21 13582 29 8010 -16 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.395840 0.732059 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 22 NA PB.325.26 chr1 - 1156 8 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000425413.5 2954 21 22665 29 -1334 -16 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.678982 0.565728 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 2243 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.325.27 chr1 - 982 6 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000425413.5 2954 21 23969 29 -30 -16 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.697920 0.431029 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 3547 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.325.28 chr1 - 796 5 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000425413.5 2954 21 25122 29 1123 -16 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 4700 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.326.1 chr1 + 872 1 full-splice_match KLHDC7A ENST00000400664.3 5045 1 4157 16 4157 -16 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA NA NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AATAAAACTAAATATGTACA 3926 FALSE NA NA ATTAAA -23 NA NA NA 2 NA PB.327.1 chr1 - 2691 17 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 -10 108822 -10 -32408 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AGAAAAAAAAATATGTCTTT 182 FALSE NA NA GGGGCT -44 NA NA NA 2 NA PB.327.2 chr1 - 1629 9 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 2 118453 2 -42039 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAATACAAAAATTAGCTG -1 TRUE NA NA GGGGCT -32 NA NA NA 2 NA PB.328.6 chr1 + 1201 8 fusion EMC1-AS1_MRTO4 novel 409 3 NA NA 124 525 multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAAAGAATACA 88 FALSE NA NA AGTAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.328.9 chr1 + 1623 8 full-splice_match MRTO4 ENST00000330263.5 2049 8 -257 683 -257 -683 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CACTTGCCTGTGGTCCCCAC -24 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.328.10 chr1 + 1536 7 novel_in_catalog MRTO4 novel 2049 8 NA NA -238 -683 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CACTTGCCTGTGGTCCCCAC -5 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.328.11 chr1 + 1423 8 full-splice_match MRTO4 ENST00000330263.5 2049 8 -238 864 -238 525 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 28 6.867433 0.836794 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAAAGAATACA -5 TRUE NA NA AGTAAA -11 NA NA NA 28 NA PB.328.16 chr1 + 1046 9 novel_not_in_catalog MRTO4 novel 2049 8 NA NA -26 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACAGTGGCCCTCTTTTTTC 122 FALSE NA NA AGTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.328.17 chr1 + 1362 8 full-splice_match MRTO4 ENST00000330263.5 2049 8 5 682 5 -682 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 89 21.828625 1.339026 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTGCCTGTGGTCCCCACT -4 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 89 NA PB.328.18 chr1 + 1192 8 full-splice_match MRTO4 ENST00000330263.5 2049 8 -7 864 -7 525 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 152 37.280350 1.571480 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAAAGAATACA -16 TRUE NA NA AGTAAA -11 NA NA NA 152 NA PB.328.23 chr1 + 1054 8 full-splice_match MRTO4 ENST00000330263.5 2049 8 0 995 0 394 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 39 9.565352 0.980701 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGTGCCTGTAGTCCCAGCT -9 TRUE NA NA AATAGA -27 NA NA NA 39 NA PB.328.25 chr1 + 929 8 full-splice_match MRTO4 ENST00000330263.5 2049 8 15 1105 -15 284 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 53 12.999069 1.113912 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGCCGAGGTGGGCAGATCA 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 53 NA PB.328.26 chr1 + 1540 8 novel_in_catalog MRTO4 novel 2049 8 NA NA 0 525 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAAAGAATACA 21 TRUE NA NA AGTAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.328.27 chr1 + 1282 8 novel_in_catalog MRTO4 novel 2049 8 NA NA 0 267 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATCCCAGCACTTTGGGAAG 21 TRUE NA NA AATAAA -33 NA NA NA 4 NA PB.328.28 chr1 + 1096 7 novel_in_catalog MRTO4 novel 2049 8 NA NA 0 525 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAAAGAATACA 21 TRUE NA NA AGTAAA -11 NA NA NA 3 NA PB.328.32 chr1 + 746 6 incomplete-splice_match MRTO4 ENST00000330263.5 2049 8 4198 1130 -1709 259 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACGCCTGGAATCCCAGCACT 4189 FALSE NA NA AATAAA -25 NA NA NA 2 NA PB.328.33 chr1 + 1132 5 incomplete-splice_match MRTO4 ENST00000330263.5 2049 8 5270 684 -637 -684 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CCACTTGCCTGTGGTCCCCA 5261 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 5 NA PB.328.34 chr1 + 910 3 full-splice_match MRTO4 ENST00000479559.1 409 3 206 -707 206 -682 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTGCCTGTGGTCCCCACT 6104 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.329.3 chr1 - 4214 23 full-splice_match EMC1 ENST00000477853.6 6640 23 -3 2429 -1 59 alternative_3end TRUE canonical NA NA NA NA 26 6.376902 0.804610 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTGTTTAAGTCCTCTTTTG 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 26 NA PB.329.4 chr1 - 1821 4 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000691945.1 4156 6 5355 1284 -74 59 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTGTTTAAGTCCTCTTTTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.329.6 chr1 - 4459 24 novel_not_in_catalog EMC1 novel 5624 24 NA NA 5 57 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACACTGTTTAAGTCCTCTTT -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.329.7 chr1 - 1700 4 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000691945.1 4156 6 5474 1286 45 57 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACACTGTTTAAGTCCTCTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.329.10 chr1 - 2788 11 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000375208.7 4084 22 16362 -52 -2844 52 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAATGACACTGTTTAAGTCC 7267 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.329.11 chr1 - 2298 8 full-splice_match EMC1 ENST00000688918.1 4034 8 445 1291 -350 52 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAATGACACTGTTTAAGTCC 9836 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.329.12 chr1 - 2110 6 full-splice_match EMC1 ENST00000691945.1 4156 6 755 1291 510 52 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAATGACACTGTTTAAGTCC NA FALSE NA NA AAAAAG -16 NA NA NA 2 NA PB.329.13 chr1 - 2024 6 full-splice_match EMC1 ENST00000691945.1 4156 6 841 1291 596 52 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAATGACACTGTTTAAGTCC NA FALSE NA NA AATGAA -41 NA NA NA 3 NA PB.329.14 chr1 - 1521 2 full-splice_match EMC1 ENST00000461353.1 2175 2 1503 -849 1503 52 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAATGACACTGTTTAAGTCC NA FALSE NA NA AAAACA -45 NA NA NA 6 NA PB.329.15 chr1 - 4092 23 full-splice_match EMC1 ENST00000477853.6 6640 23 -13 2561 5 -73 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTCCTTGGTCATAGAGTTGG -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.329.16 chr1 - 1396 2 full-splice_match EMC1 ENST00000461353.1 2175 2 1503 -724 1503 -73 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTCCTTGGTCATAGAGTTGG NA FALSE NA NA AAAACA -45 NA NA NA 2 NA PB.329.17 chr1 - 2569 16 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000375208.7 4084 22 11534 785 580 12 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTTTTGTGTTTCTCAATTTT 2439 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.329.18 chr1 - 2360 15 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000375199.7 5408 23 12242 2059 1301 12 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTTTTGTGTTTCTCAATTTT 3160 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.329.19 chr1 - 2085 12 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000375208.7 4084 22 14339 785 3385 12 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTTTTGTGTTTCTCAATTTT 5244 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.329.20 chr1 - 618 2 full-splice_match EMC1 ENST00000461353.1 2175 2 1569 -12 1569 12 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTTTTGTGTTTCTCAATTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.329.21 chr1 - 3254 22 full-splice_match EMC1 ENST00000688219.1 6517 22 -17 3280 1 5 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTTTGCCTTTTGTGTTTCT -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.329.22 chr1 - 3314 23 novel_in_catalog EMC1 novel 5475 23 NA NA 0 11 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CCTTTTGTGTTTCTCAATTT -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.329.23 chr1 - 1571 8 full-splice_match EMC1 ENST00000688918.1 4034 8 334 2129 334 11 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CCTTTTGTGTTTCTCAATTT 9725 FALSE NA NA AAGAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.329.24 chr1 - 1044 5 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000691945.1 4156 6 4726 2129 -457 11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CCTTTTGTGTTTCTCAATTT NA FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.329.25 chr1 - 2703 17 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000375208.7 4084 22 11086 788 132 9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGCCTTTTGTGTTTCTCAAT 1991 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.329.26 chr1 - 890 4 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000691945.1 4156 6 5439 2131 10 9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGCCTTTTGTGTTTCTCAAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.329.27 chr1 - 3378 23 full-splice_match EMC1 ENST00000477853.6 6640 23 -39 3301 -11 -16 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 165 40.468800 1.607120 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGGCCTGTTTAAATTGACTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 165 NA PB.329.28 chr1 - 1472 8 full-splice_match EMC1 ENST00000688918.1 4034 8 427 2135 -368 5 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTTTGCCTTTTGTGTTTCT 9818 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.329.29 chr1 - 1212 6 full-splice_match EMC1 ENST00000691945.1 4156 6 803 2141 558 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GACTTTACTTTGCCTTTTGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.329.30 chr1 - 3315 23 full-splice_match EMC1 ENST00000688667.1 5475 23 22 2138 2 2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTTACTTTGCCTTTTGTGTT 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.329.31 chr1 - 2628 17 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000375208.7 4084 22 11154 795 200 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTTACTTTGCCTTTTGTGTT 2059 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.329.32 chr1 - 3310 22 novel_in_catalog EMC1 novel 6640 23 NA NA 0 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTTACTTTGCCTTTTGTG -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.329.33 chr1 - 1349 7 full-splice_match EMC1 ENST00000693007.1 4889 7 1400 2140 47 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTTACTTTGCCTTTTGTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.329.34 chr1 - 2808 18 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000375208.7 4084 22 10402 798 -552 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GACTTTACTTTGCCTTTTGT 1 TRUE NA NA AAGAAA -9 NA NA NA 4 NA PB.329.35 chr1 - 1731 10 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000486405.2 2991 24 18549 -356 -644 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGACTTTACTTTGCCTTTTG 9467 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.329.36 chr1 - 3323 23 novel_in_catalog EMC1 novel 6640 23 NA NA -1 -6 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATTGACTTTACTTTGCCT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.329.37 chr1 - 3200 22 full-splice_match EMC1 ENST00000690732.1 6478 22 -13 3291 5 -6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATTGACTTTACTTTGCCT -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.329.38 chr1 - 1936 11 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000375208.7 4084 22 16359 803 -2847 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATTGACTTTACTTTGCCT 7264 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.329.39 chr1 - 1272 6 full-splice_match EMC1 ENST00000691945.1 4156 6 738 2146 493 -6 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATTGACTTTACTTTGCCT NA FALSE NA NA AAAAAG -33 NA NA NA 4 NA PB.329.40 chr1 - 958 4 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000691945.1 4156 6 5356 2146 -73 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATTGACTTTACTTTGCCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.329.41 chr1 - 3080 21 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000692207.1 5360 22 7532 2147 185 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAATTGACTTTACTTTGCC 7547 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.329.42 chr1 - 1335 5 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000486405.2 2991 24 -15 22231 0 -23 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAACACAACAAAGA 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.331.2 chr1 - 1354 7 full-splice_match AKR7A2 ENST00000235835.8 1360 7 1 5 1 -5 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 482 118.217949 2.072683 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAAACTTGCTTTCTCTGCT -33 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 482 NA PB.331.3 chr1 - 1226 6 full-splice_match AKR7A2 ENST00000330072.9 1171 6 -25 -30 -16 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAACTTGCTTTCTCTGCTG -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.331.4 chr1 - 1233 6 novel_in_catalog AKR7A2 novel 1360 7 NA NA -16 -5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAAACTTGCTTTCTCTGCT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.331.5 chr1 - 1123 7 full-splice_match AKR7A2 ENST00000235835.8 1360 7 232 5 -5 -5 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAAACTTGCTTTCTCTGCT 198 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.331.7 chr1 - 1000 6 incomplete-splice_match AKR7A2 ENST00000235835.8 1360 7 3539 5 -100 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAAACTTGCTTTCTCTGCT 3505 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.332.1 chr1 + 1845 9 full-splice_match SLC66A1 ENST00000375155.7 1805 9 -44 4 -44 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 30 7.357964 0.866758 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGAGACCTGCTTCTGTTGC NA FALSE NA NA AATAAA -30 NA NA NA 30 NA PB.332.2 chr1 + 1790 9 novel_in_catalog SLC66A1 novel 1805 9 NA NA -20 -4 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGAGACCTGCTTCTGTTGC -9 TRUE NA NA AATAAA -30 NA NA NA 5 NA PB.332.5 chr1 + 1498 9 full-splice_match SLC66A1 ENST00000375155.7 1805 9 -5 312 -5 1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCTCGCACCTGTAATCCTAG 6 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 10 NA PB.332.7 chr1 + 2154 8 full-splice_match SLC66A1 ENST00000375153.8 2175 8 20 1 5 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGACCTGCTTCTGTTGCTCC 31 FALSE NA NA AATAAA -33 NA NA NA 6 NA PB.332.8 chr1 + 853 2 incomplete-splice_match SLC66A1 ENST00000497827.1 1428 8 14516 -269 2491 -28 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAATAAAAAAGATAAC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.333.1 chr1 + 2017 4 full-splice_match NBL1 ENST00000602662.1 1623 4 2 -396 2 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTGTTCTCCTCCTCACTGA -29 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.333.3 chr1 + 3300 3 incomplete-splice_match MICOS10 ENST00000498642.5 669 5 -51 -18 -1 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAATAAATTAAACAAAAAGA -20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.333.6 chr1 + 682 5 full-splice_match MICOS10 ENST00000481464.5 657 5 -49 24 -1 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAATAAATTAAACAAAAAGA -20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.333.7 chr1 + 525 4 full-splice_match MICOS10 ENST00000322753.7 3723 4 11 3187 -1 3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 80 19.621237 1.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTGCATGGCCTTTGTTTCT -20 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 80 NA PB.333.11 chr1 + 549 5 full-splice_match MICOS10 ENST00000467029.5 583 5 16 18 16 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAATAAATTAAACAAAAAGA 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.333.14 chr1 + 2015 1 full-splice_match ENSG00000226396 ENST00000457263.1 455 1 -1515 -45 -1515 45 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAATAAATAAAAAAAGT 8790 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.333.15 chr1 + 1551 1 full-splice_match ENSG00000226396 ENST00000457263.1 455 1 -1051 -45 -1051 45 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAATAAATAAAAAAAGT 9254 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 3 NA PB.333.19 chr1 + 2022 4 full-splice_match NBL1 ENST00000375136.8 2024 4 2 0 2 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 98 24.036015 1.380862 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTGTTCTCCTCCTCACTGA -13 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 98 NA PB.333.20 chr1 + 1910 4 full-splice_match NBL1 ENST00000375136.8 2024 4 114 0 114 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTGTTCTCCTCCTCACTGA 99 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.333.21 chr1 + 1724 3 incomplete-splice_match NBL1 ENST00000548815.2 1953 4 7566 4 7566 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.924247 0.593756 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTGTTCTCCTCCTCACTGA 111 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 16 NA PB.334.1 chr1 - 1767 10 full-splice_match CAPZB ENST00000375142.5 1686 10 -34 -47 -6 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGCGCTGGCCTTCTGTGTTC 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.334.3 chr1 - 1687 9 full-splice_match CAPZB ENST00000264202.8 1675 9 -15 3 -15 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 1347 330.372559 2.519004 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTAGCGCTGGCCTTCTGTGT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 1347 NA PB.334.4 chr1 - 912 2 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000674299.1 1734 3 1934 -360 1934 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 45 11.036945 1.042849 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TAGCGCTGGCCTTCTGTGTT 805 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 45 NA PB.334.5 chr1 - 1797 10 novel_not_in_catalog CAPZB novel 6180 10 NA NA 0 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTAGCGCTGGCCTTCTGT 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.334.6 chr1 - 1623 9 novel_not_in_catalog CAPZB novel 1675 9 NA NA -28420 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTAGCGCTGGCCTTCTGT 3661 FALSE NA NA GATAAA -39 NA NA NA 2 NA PB.334.7 chr1 - 1007 4 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 128004 -579 -10298 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.433716 0.535764 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTAGCGCTGGCCTTCTGT 987 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.334.9 chr1 - 2395 8 full-splice_match CAPZB ENST00000482808.2 2063 8 24 -356 0 -5 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGTTAGCGCTGGCCTTCTG 15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.334.10 chr1 - 1666 9 novel_not_in_catalog CAPZB novel 1675 9 NA NA -32089 -5 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGTTAGCGCTGGCCTTCTG -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.334.11 chr1 - 1508 8 novel_in_catalog CAPZB novel 1675 9 NA NA -10 -5 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGTTAGCGCTGGCCTTCTG -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.334.12 chr1 - 1424 7 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 99089 -578 -11 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 29 7.112698 0.852034 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGTTAGCGCTGGCCTTCTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 29 NA PB.334.14 chr1 - 1582 9 full-splice_match CAPZB ENST00000264202.8 1675 9 44 49 -10 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 218 53.467869 1.728093 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAGAAAAGAAAAGAA -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 218 NA PB.334.15 chr1 - 1312 6 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 106009 -535 6909 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAGAAAAGAAAAGAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.334.16 chr1 - 1196 5 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 127101 -535 -11201 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.188451 0.503580 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAGAAAAGAAAAGAA 84 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.334.17 chr1 - 1096 5 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 127201 -535 -11101 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAGAAAAGAAAAGAA 184 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.334.18 chr1 - 925 3 full-splice_match CAPZB ENST00000674299.1 1734 3 1122 -313 1122 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.697920 0.431029 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAGAAAAGAAAAGAA -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.334.19 chr1 - 1447 8 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 64988 -534 61 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAAAGAAAAGAAAAGA 78 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.334.20 chr1 - 1450 10 full-splice_match CAPZB ENST00000375142.5 1686 10 -45 281 7 33 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTCCGTGTGTGTTTGGGAG -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.334.21 chr1 - 1355 9 full-splice_match CAPZB ENST00000264202.8 1675 9 -10 330 -10 32 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 587 143.970825 2.158274 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATTCCGTGTGTGTTTGGGA 94 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 587 NA PB.334.22 chr1 - 1241 8 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 64915 -255 -12 33 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.678982 0.565728 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTCCGTGTGTGTTTGGGAG 5 TRUE NA NA AATACA -31 NA NA NA 15 NA PB.334.23 chr1 - 1078 10 novel_not_in_catalog CAPZB novel 1686 10 NA NA -6 33 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTCCGTGTGTGTTTGGGAG 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.334.24 chr1 - 1030 6 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 106011 -255 6911 33 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTCCGTGTGTGTTTGGGAG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.334.25 chr1 - 841 5 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 127176 -255 -11126 33 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTCCGTGTGTGTTTGGGAG 159 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.334.26 chr1 - 1362 8 novel_in_catalog CAPZB novel 1675 9 NA NA -135 31 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTATTCCGTGTGTGTTTGGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.334.27 chr1 - 1106 7 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 99077 -248 -23 26 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAATCTTATTCCGTGTGTGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.334.28 chr1 - 867 6 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 106101 -182 7001 -40 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAATGTAAAACAAAAAA 48 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.334.29 chr1 - 1087 9 full-splice_match CAPZB ENST00000264202.8 1675 9 6 582 4 2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 204 50.034153 1.699267 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTCCGGCTCCGAGCCTGCTT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 204 NA PB.334.30 chr1 - 1016 9 full-splice_match CAPZB ENST00000264202.8 1675 9 77 582 15 2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTCCGGCTCCGAGCCTGCTT 181 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.334.31 chr1 - 1164 10 full-splice_match CAPZB ENST00000375142.5 1686 10 -13 535 -13 1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CCTCCGGCTCCGAGCCTGCT -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.334.46 chr1 - 721 5 novel_not_in_catalog CAPZB novel 4666 2 NA NA -10 -127 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TGTCTTGCCCCTGTTCCTGC 94 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.335.1 chr1 + 2959 4 novel_not_in_catalog HTR6 novel 3800 3 NA NA -42 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTGGCTGTGGTGTGGACTG 6433 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.337.2 chr1 - 2772 14 novel_in_catalog TMCO4 novel 2946 16 NA NA 9 6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTTCTTGAGCATGTACCAC -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.337.3 chr1 - 2959 16 full-splice_match TMCO4 ENST00000294543.11 2946 16 -10 -3 -10 3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACCACTTCTTGAGCATGTAC 396 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.337.4 chr1 - 2129 9 incomplete-splice_match TMCO4 ENST00000294543.11 2946 16 52720 -3 -8777 3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACCACTTCTTGAGCATGTAC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.337.5 chr1 - 2169 9 incomplete-splice_match TMCO4 ENST00000294543.11 2946 16 52656 21 -8841 -19 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AATAAATAATAATAAGAAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.337.6 chr1 - 1745 6 incomplete-splice_match TMCO4 ENST00000294543.11 2946 16 59037 21 -2460 -19 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AATAAATAATAATAAGAAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.337.7 chr1 - 1548 5 incomplete-splice_match TMCO4 ENST00000294543.11 2946 16 60050 21 -1447 -19 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AATAAATAATAATAAGAAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.337.8 chr1 - 1422 3 incomplete-splice_match TMCO4 ENST00000489814.5 1722 5 37532 19 323 -19 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AATAAATAATAATAAGAAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.337.9 chr1 - 2528 15 novel_in_catalog TMCO4 novel 2946 16 NA NA 4 -357 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTCCAGGGCTGCCCACCAG 386 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.337.10 chr1 - 3127 8 incomplete-splice_match TMCO4 ENST00000375127.5 2403 16 12288 61081 -6292 3842 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACCACCAAGCCCTTCCTAT 28 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.337.11 chr1 - 2377 2 incomplete-splice_match TMCO4 ENST00000375127.5 2403 16 52843 61081 -8082 3842 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACCACCAAGCCCTTCCTAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.337.12 chr1 - 982 7 novel_in_catalog TMCO4 novel 647 5 NA NA 0 13 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTATGTCTCAGTGTCTCTG -20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.339.1 chr1 + 1185 5 full-splice_match PLA2G5 ENST00000375108.4 1918 5 0 733 0 -12 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTTTCCTCTGCTGTGGGGG 9 TRUE NA NA AATAAA -35 NA NA NA 3 NA PB.340.1 chr1 - 849 5 full-splice_match PLA2G2A ENST00000482011.2 608 5 0 -241 0 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATATGTGTGTGTGTATGCAT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.341.4 chr1 - 1373 2 full-splice_match CAMK2N1 ENST00000375078.4 2326 2 950 3 -615 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCACTCCTCTCTTTTCTCTG 2094 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.342.1 chr1 + 2990 2 full-splice_match UBXN10 ENST00000375099.4 5562 2 -3 2575 -3 -2575 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAGATGATACGATAAAAA -13 TRUE NA NA AATAAA -42 NA NA NA 2 NA PB.343.1 chr1 + 965 4 full-splice_match CDA ENST00000375071.4 809 4 -160 4 -149 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.943186 0.468818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGGATCAAAGCGTGTGTCTT -21 TRUE NA NA TATAAA -16 NA NA NA 12 NA PB.343.2 chr1 + 910 3 full-splice_match CDA ENST00000461985.1 762 3 -149 1 -149 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATCAAAGCGTGTGTCTTGCT -21 TRUE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.343.3 chr1 + 788 2 novel_in_catalog CDA novel 762 3 NA NA -140 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GATCAAAGCGTGTGTCTTGC -12 TRUE NA NA TATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.343.4 chr1 + 811 4 full-splice_match CDA ENST00000375071.4 809 4 -13 11 -2 -11 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 23 5.641106 0.751364 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AACATCCTGGATCAAAGCGT -6 TRUE NA NA TATAAA -9 NA NA NA 23 NA PB.344.1 chr1 - 2378 4 novel_not_in_catalog MUL1 novel 2428 4 NA NA 32 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGTGCTAGCCTGTTGCTTT 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.344.2 chr1 - 2426 4 full-splice_match MUL1 ENST00000264198.5 2428 4 0 2 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 210 51.505745 1.711856 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGTGCTAGCCTGTTGCTTT -23 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 210 NA PB.344.3 chr1 - 2179 3 incomplete-splice_match MUL1 ENST00000264198.5 2428 4 4842 2 4842 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGTGCTAGCCTGTTGCTTT 4819 FALSE NA NA AATAAA -42 NA NA NA 7 NA PB.344.4 chr1 - 2049 2 incomplete-splice_match MUL1 ENST00000264198.5 2428 4 6004 2 6004 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGTGCTAGCCTGTTGCTTT 5981 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.345.1 chr1 - 1800 12 novel_not_in_catalog DDOST novel 2126 11 NA NA 5 2407 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACTAGCCTTTACCTTCCTA -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.345.2 chr1 - 1943 12 novel_not_in_catalog DDOST novel 2126 11 NA NA 17 2406 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACTAGCCTTTACCTTCCT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.345.4 chr1 - 1236 5 incomplete-splice_match DDOST ENST00000602624.7 1941 11 7043 -4 -1242 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACCTGGCCCCGGTCCTGGTT 7197 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.345.7 chr1 - 1958 11 full-splice_match DDOST ENST00000602624.7 1941 11 -20 3 -1 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 395 96.879852 1.986233 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAACTTCACCTGGCCCCGGT -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 395 NA PB.345.11 chr1 - 1065 4 incomplete-splice_match DDOST ENST00000602624.7 1941 11 7655 3 -630 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAACTTCACCTGGCCCCGGT 7809 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.345.15 chr1 - 1691 10 incomplete-splice_match DDOST ENST00000602624.7 1941 11 389 66 389 -66 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAATATAAATAAATAAATAA 543 FALSE NA NA AAGAAA -28 NA NA NA 6 NA PB.345.16 chr1 - 1527 9 incomplete-splice_match DDOST ENST00000602624.7 1941 11 5246 66 -3039 -66 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAATATAAATAAATAAATAA 5400 FALSE NA NA AATAAA -25 NA NA NA 8 NA PB.345.20 chr1 - 910 3 incomplete-splice_match DDOST ENST00000602624.7 1941 11 8402 66 117 -66 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAATATAAATAAATAAATAA 8556 FALSE NA NA GATAAA -37 NA NA NA 3 NA PB.345.22 chr1 - 1571 11 full-splice_match DDOST ENST00000602624.7 1941 11 -34 404 -15 -404 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 857 210.192490 2.322617 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGTGGCATTTTTCCTAT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 857 NA PB.345.23 chr1 - 1679 10 novel_in_catalog DDOST novel 2126 11 NA NA 0 -404 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGTGGCATTTTTCCTAT -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.345.24 chr1 - 1659 11 full-splice_match DDOST ENST00000415136.6 2126 11 46 421 46 -411 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 531 130.235962 2.114731 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AATTGCTAAAAGTGGCATTT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 531 NA PB.345.26 chr1 - 1483 11 full-splice_match DDOST ENST00000602624.7 1941 11 47 411 47 -411 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AATTGCTAAAAGTGGCATTT 201 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.345.27 chr1 - 1393 11 full-splice_match DDOST ENST00000602624.7 1941 11 137 411 137 -411 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AATTGCTAAAAGTGGCATTT 291 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.345.28 chr1 - 1280 10 incomplete-splice_match DDOST ENST00000602624.7 1941 11 455 411 455 -411 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 34 8.339025 0.921115 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AATTGCTAAAAGTGGCATTT 609 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 34 NA PB.345.29 chr1 - 1133 8 incomplete-splice_match DDOST ENST00000602624.7 1941 11 5616 411 -2669 -411 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 24 5.886371 0.769848 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AATTGCTAAAAGTGGCATTT 5770 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 24 NA PB.345.30 chr1 - 1037 7 incomplete-splice_match DDOST ENST00000602624.7 1941 11 5853 411 -2432 -411 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AATTGCTAAAAGTGGCATTT 6007 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.345.31 chr1 - 930 6 incomplete-splice_match DDOST ENST00000602624.7 1941 11 6692 411 -1593 -411 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AATTGCTAAAAGTGGCATTT 6846 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.345.32 chr1 - 799 5 incomplete-splice_match DDOST ENST00000602624.7 1941 11 7065 411 -1220 -411 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AATTGCTAAAAGTGGCATTT 7219 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.345.33 chr1 - 701 4 incomplete-splice_match DDOST ENST00000602624.7 1941 11 7611 411 -674 -411 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AATTGCTAAAAGTGGCATTT 7765 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.345.34 chr1 - 1747 10 novel_in_catalog DDOST novel 2126 11 NA NA -76 -412 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GAATTGCTAAAAGTGGCATT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.345.35 chr1 - 1457 10 novel_in_catalog DDOST novel 2126 11 NA NA -20 -412 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GAATTGCTAAAAGTGGCATT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.345.36 chr1 - 1455 10 novel_in_catalog DDOST novel 2126 11 NA NA 5 -413 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TGAATTGCTAAAAGTGGCAT -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.346.1 chr1 - 1759 8 novel_in_catalog KIF17 novel 3969 15 NA NA -7 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGCTCCCCTTCTCTGACCC 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.346.2 chr1 - 1400 5 incomplete-splice_match KIF17 ENST00000490034.5 1931 9 15582 2 2330 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGCTCCCCTTCTCTGACCC 3535 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.348.1 chr1 + 1342 4 incomplete-splice_match PINK1 ENST00000321556.5 2657 8 20 6527 20 -6332 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACCCTCTGTATCCCCTAACT 3 TRUE NA NA CATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.348.2 chr1 + 1849 8 full-splice_match PINK1 ENST00000321556.5 2657 8 35 773 35 -578 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTGTCGTGATGGTCTGTGA 18 TRUE NA NA ACTAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.348.3 chr1 + 2423 8 full-splice_match PINK1 ENST00000321556.5 2657 8 39 195 39 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.924247 0.593756 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATGACGTATGTGCCTTGA 22 TRUE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 16 NA PB.348.4 chr1 + 2188 8 full-splice_match PINK1 ENST00000321556.5 2657 8 274 195 274 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATGACGTATGTGCCTTGA 220 FALSE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.348.5 chr1 + 1913 7 incomplete-splice_match PINK1 ENST00000321556.5 2657 8 4455 195 -216 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATGACGTATGTGCCTTGA 4401 FALSE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 9 NA PB.348.6 chr1 + 1287 7 incomplete-splice_match PINK1 ENST00000321556.5 2657 8 4503 773 -168 -578 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTGTCGTGATGGTCTGTGA 4449 FALSE NA NA ACTAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.348.7 chr1 + 2017 7 incomplete-splice_match PINK1 ENST00000321556.5 2657 8 4545 1 -126 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTGTTCTAGTTTTCTCTT 4491 FALSE NA NA AGTAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.348.8 chr1 + 1744 7 incomplete-splice_match PINK1 ENST00000321556.5 2657 8 4623 196 -48 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAGATGACGTATGTGCCTTG 4569 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.348.9 chr1 + 1114 6 incomplete-splice_match PINK1 ENST00000321556.5 2657 8 6438 773 1767 -578 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTGTCGTGATGGTCTGTGA 6384 FALSE NA NA ACTAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.348.10 chr1 + 1615 6 incomplete-splice_match PINK1 ENST00000321556.5 2657 8 6515 195 1844 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATGACGTATGTGCCTTGA 6461 FALSE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.348.11 chr1 + 1504 5 incomplete-splice_match PINK1 ENST00000321556.5 2657 8 11123 195 -927 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATGACGTATGTGCCTTGA NA FALSE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.348.12 chr1 + 1302 4 full-splice_match PINK1 ENST00000400490.2 1658 4 162 194 162 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATGACGTATGTGCCTTGA NA FALSE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.348.13 chr1 + 1247 3 incomplete-splice_match PINK1 ENST00000400490.2 1658 4 2998 194 2998 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATGACGTATGTGCCTTGA NA FALSE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.348.14 chr1 + 1101 2 incomplete-splice_match PINK1 ENST00000400490.2 1658 4 3506 194 3506 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATGACGTATGTGCCTTGA NA FALSE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 6 NA PB.352.1 chr1 - 3885 12 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000312239.10 3884 13 6111 -4 0 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AACCGTAGCTTATATTTAAA 2 TRUE NA NA ACTAAA -2 NA NA NA 4 NA PB.352.4 chr1 - 5118 21 fusion EIF4G3_HP1BP3 novel 3884 13 NA NA 1821 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GCTGAACCGTAGCTTATATT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.352.5 chr1 - 4019 13 novel_in_catalog HP1BP3 novel 3884 13 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GCTGAACCGTAGCTTATATT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.352.9 chr1 - 4000 13 full-splice_match HP1BP3 ENST00000438032.6 6406 13 -15 2421 1 -5 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 31 7.603229 0.880998 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAAGCTGCTGAACCGTAG -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 31 NA PB.352.10 chr1 - 3796 12 novel_in_catalog HP1BP3 novel 6406 13 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 33 8.093760 0.908150 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TGCTGAACCGTAGCTTATAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 33 NA PB.352.11 chr1 - 3584 10 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000312239.10 3884 13 9901 1 -147 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TGCTGAACCGTAGCTTATAT 10018 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.352.12 chr1 - 2927 6 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 9591 -2 9591 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TGCTGAACCGTAGCTTATAT 9574 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.352.13 chr1 - 2570 3 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 27418 -2 2160 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TGCTGAACCGTAGCTTATAT 2277 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.352.17 chr1 - 4349 13 novel_in_catalog HP1BP3 novel 3884 13 NA NA 5 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAGCTGCTGAACCGTAGC -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.352.18 chr1 - 3120 7 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 7340 4 7340 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAGCTGCTGAACCGTAGC 8343 FALSE NA NA AGTAAA -42 NA NA NA 7 NA PB.352.19 chr1 - 3014 6 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 9498 4 9498 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAGCTGCTGAACCGTAGC 9481 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.352.22 chr1 - 3899 13 full-splice_match HP1BP3 ENST00000312239.10 3884 13 -23 8 -9 -5 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAAGCTGCTGAACCGTAG -23 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.352.26 chr1 - 1527 8 novel_in_catalog HP1BP3 novel 4822 9 NA NA 7363 -5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAAGCTGCTGAACCGTAG 8366 FALSE NA NA AGTAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.352.27 chr1 - 3898 13 novel_in_catalog HP1BP3 novel 3884 13 NA NA -6 1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAGAAAAGGAA -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.352.28 chr1 - 3564 13 novel_in_catalog HP1BP3 novel 3884 13 NA NA 0 1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.678982 0.565728 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAGAAAAGGAA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.352.29 chr1 - 2475 6 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 9589 452 9589 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAGAAAAGGAA 9572 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.352.30 chr1 - 1964 14 novel_in_catalog HP1BP3 novel 6406 13 NA NA 5 1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAGAAAAGGAA 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.352.32 chr1 - 1434 11 novel_in_catalog HP1BP3 novel 6406 13 NA NA -20 1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAGAAAAGGAA 10028 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.352.33 chr1 - 3247 12 novel_in_catalog HP1BP3 novel 3884 13 NA NA -1 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAAAAAAAGAAAAGGA -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.352.34 chr1 - 2658 7 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 7353 453 7353 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAAAAAAAGAAAAGGA 8356 FALSE NA NA AGTAAA -29 NA NA NA 4 NA PB.352.35 chr1 - 2476 5 novel_in_catalog HP1BP3 novel 6406 13 NA NA -4 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAAAAAAAGAAAAGGA -20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.352.36 chr1 - 2019 2 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 29401 453 4143 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAAAAAAAGAAAAGGA 4260 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.352.42 chr1 - 2345 4 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 25120 454 -138 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 TTAAAAAAAAAAAGAAAAGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.352.43 chr1 - 3534 13 full-splice_match HP1BP3 ENST00000438032.6 6406 13 1 2871 1 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 54 13.244334 1.122030 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 ATTAAAAAAAAAAAGAAAAG 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 54 NA PB.352.44 chr1 - 3441 13 full-splice_match HP1BP3 ENST00000312239.10 3884 13 -15 458 -1 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.433716 0.535764 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 ATTAAAAAAAAAAAGAAAAG -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.352.45 chr1 - 3348 12 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000312239.10 3884 13 6186 458 75 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 ATTAAAAAAAAAAAGAAAAG 6841 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.352.46 chr1 - 3339 12 novel_in_catalog HP1BP3 novel 6406 13 NA NA 0 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 52 12.753804 1.105640 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 ATTAAAAAAAAAAAGAAAAG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 52 NA PB.352.50 chr1 - 3414 9 full-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 949 459 949 -6 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AGATATTAAAAAAAAAAAGA 6487 FALSE NA NA AATATA -42 NA NA NA 2 NA PB.352.52 chr1 - 2301 5 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 17807 528 -6947 -75 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TTTGTGGGTTTTTTTCCCCT 8287 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.352.53 chr1 - 2084 3 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000488722.5 639 5 2115 76 2115 -76 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTTGTGGGTTTTTTTCCCC 2232 FALSE NA NA AATGAA -3 NA NA NA 4 NA PB.352.54 chr1 - 3144 12 novel_in_catalog HP1BP3 novel 6406 13 NA NA -1 -203 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAGCATGAGTTGTCACTTCT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.352.55 chr1 - 973 6 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 9587 1956 9587 954 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTTTAGGTGCTTTTATTG 9570 FALSE NA NA AGTAAA -1 NA NA NA 2 NA PB.352.56 chr1 - 1938 13 full-splice_match HP1BP3 ENST00000312239.10 3884 13 -14 1960 0 953 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAGCTTTAGGTGCTTTTATT -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.352.57 chr1 - 1843 12 novel_in_catalog HP1BP3 novel 6406 13 NA NA -1 953 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.678982 0.565728 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAGCTTTAGGTGCTTTTATT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.352.58 chr1 - 1742 12 novel_in_catalog HP1BP3 novel 6406 13 NA NA 95 953 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAGCTTTAGGTGCTTTTATT 95 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.352.59 chr1 - 1451 9 full-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 1414 1957 1414 953 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAGCTTTAGGTGCTTTTATT 6952 FALSE NA NA TTTAAA -25 NA NA NA 3 NA PB.352.60 chr1 - 1267 8 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 3975 1957 3975 953 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAGCTTTAGGTGCTTTTATT 9513 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.352.61 chr1 - 2067 13 novel_in_catalog HP1BP3 novel 3884 13 NA NA 5 952 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CTAGCTTTAGGTGCTTTTAT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.352.62 chr1 - 2030 13 full-splice_match HP1BP3 ENST00000438032.6 6406 13 0 4376 0 950 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 20 4.905309 0.690666 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGCTAGCTTTAGGTGCTTTT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 20 NA PB.352.64 chr1 - 1872 13 full-splice_match HP1BP3 ENST00000438032.6 6406 13 -6 4540 -1 786 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAAGTAAATTTTATAGGA -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.352.65 chr1 - 2566 10 novel_not_in_catalog HP1BP3 novel 970 8 NA NA 1 3141 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTTTCTAGTCTGGATGTCT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.352.66 chr1 - 2541 10 novel_not_in_catalog HP1BP3 novel 970 8 NA NA 0 3141 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTTTCTAGTCTGGATGTCT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.352.67 chr1 - 2449 10 novel_not_in_catalog HP1BP3 novel 970 8 NA NA -3 3141 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTTTCTAGTCTGGATGTCT -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.352.68 chr1 - 2345 9 novel_not_in_catalog HP1BP3 novel 970 8 NA NA 0 3141 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTTTCTAGTCTGGATGTCT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.352.69 chr1 - 1898 6 novel_not_in_catalog HP1BP3 novel 970 8 NA NA 1475 3141 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTTTCTAGTCTGGATGTCT 7013 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.352.73 chr1 - 2056 7 novel_not_in_catalog HP1BP3 novel 970 8 NA NA -71 3140 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGTTTCTAGTCTGGATGTC 9977 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.352.75 chr1 - 3220 5 novel_in_catalog HP1BP3 novel 928 5 NA NA 6 -110 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCCTCCCTGGTCTTTTCC 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.352.76 chr1 - 2895 5 full-splice_match HP1BP3 ENST00000375000.5 928 5 -9 -1958 3 -110 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCCTCCCTGGTCTTTTCC 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.352.80 chr1 - 2057 4 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000417710.5 572 5 -378 1879 5 -16 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAACAAAGACACAAGCCG -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.352.81 chr1 - 1614 4 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000312239.10 3884 13 -29 32787 -15 -16 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAACAAAGACACAAGCCG -29 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.352.82 chr1 - 1498 3 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000424732.5 970 8 5 18267 0 -16 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAACAAAGACACAAGCCG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.352.83 chr1 - 907 4 novel_in_catalog HP1BP3 novel 928 5 NA NA 0 -16 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAACAAAGACACAAGCCG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.352.84 chr1 - 1830 4 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000417710.5 572 5 -371 2099 -2 -31 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAATATAATATAAAAGAT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.352.85 chr1 - 1503 4 novel_in_catalog HP1BP3 novel 928 5 NA NA -3 -31 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAATATAATATAAAAGAT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.352.86 chr1 - 1482 4 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000438032.6 6406 13 -8 35420 -3 -31 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAATATAATATAAAAGAT -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.352.87 chr1 - 1382 4 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000312239.10 3884 13 -17 33007 -3 -31 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAATATAATATAAAAGAT -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.352.88 chr1 - 1236 5 novel_in_catalog HP1BP3 novel 928 5 NA NA 1 -31 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAATATAATATAAAAGAT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.352.89 chr1 - 1286 3 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000424732.5 970 8 -3 18487 -3 -31 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAATATAATATAAAAGAT -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.352.90 chr1 - 909 5 full-splice_match HP1BP3 ENST00000375000.5 928 5 -12 31 0 -31 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAATATAATATAAAAGAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.352.91 chr1 - 883 5 novel_in_catalog HP1BP3 novel 928 5 NA NA 0 -31 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAATATAATATAAAAGAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.352.94 chr1 - 1146 4 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375000.5 928 5 -18 391 -6 -391 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TACTTTTTAATTTTTAATTT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.352.99 chr1 - 1082 2 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000435383.2 1597 11 40467 -542 40467 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAGAAAGTAAAGTGACTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.352.105 chr1 - 1125 4 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000435383.2 1597 11 33727 -270 33727 249 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAATTTAAAAAATCACAAT NA FALSE NA NA CATAAA -42 NA NA NA 2 NA PB.352.106 chr1 - 2964 19 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681717.1 5993 34 164590 529 -35092 8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAAAAAAAAGTTGAGA -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.352.107 chr1 - 2623 18 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681717.1 5993 34 171611 529 -28071 8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAAAAAAAAGTTGAGA 7015 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.352.108 chr1 - 2118 14 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681717.1 5993 34 190432 529 -9250 8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAAAAAAAAGTTGAGA NA FALSE NA NA TATAAA -45 NA NA NA 3 NA PB.352.109 chr1 - 1563 10 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681717.1 5993 34 199586 529 -96 8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAAAAAAAAGTTGAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.352.110 chr1 - 1502 10 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681717.1 5993 34 199647 529 -35 8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAAAAAAAAGTTGAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.352.111 chr1 - 1402 9 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681717.1 5993 34 201474 529 1792 8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAAAAAAAAGTTGAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.352.112 chr1 - 2705 18 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681717.1 5993 34 171514 544 -28168 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAATGTTTAGCAAAAA 6918 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.352.113 chr1 - 2288 16 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681717.1 5993 34 186394 544 -13288 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAATGTTTAGCAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.352.114 chr1 - 1876 12 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681717.1 5993 34 195877 544 -3805 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAATGTTTAGCAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.352.115 chr1 - 1715 11 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681717.1 5993 34 197338 544 -2344 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAATGTTTAGCAAAAA NA FALSE NA NA TTTAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.352.116 chr1 - 1297 8 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000435383.2 1597 11 10268 7 10268 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAATGTTTAGCAAAAA NA FALSE NA NA AAGAAA -3 NA NA NA 4 NA PB.352.117 chr1 - 1178 8 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000435383.2 1597 11 10387 7 10387 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAATGTTTAGCAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.352.118 chr1 - 908 5 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000435383.2 1597 11 26106 7 26106 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAATGTTTAGCAAAAA NA FALSE NA NA AATAGA -5 NA NA NA 3 NA PB.352.119 chr1 - 3088 21 novel_in_catalog EIF4G3 novel 5793 31 NA NA 41680 -8 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 TAAAAAAATGTTTAGCAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.352.120 chr1 - 1800 12 novel_in_catalog EIF4G3 novel 5793 31 NA NA -6209 -9 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 TTAAAAAAATGTTTAGCAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.352.121 chr1 - 1015 7 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000435383.2 1597 11 22084 56 22084 -56 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATATTTTCTGTTTTAAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.352.122 chr1 - 3365 24 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681767.1 5884 33 109372 817 -94 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAATGAAACAAAAGAAACA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.352.123 chr1 - 2825 21 novel_in_catalog EIF4G3 novel 5793 31 NA NA 41671 14 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAATGAAACAAAAGAAACA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.352.124 chr1 - 1977 16 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681717.1 5993 34 186432 817 -13250 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAATGAAACAAAAGAAACA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.352.125 chr1 - 1264 10 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681717.1 5993 34 199597 817 -85 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAATGAAACAAAAGAAACA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.352.126 chr1 - 1016 8 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000435383.2 1597 11 10276 280 10276 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAATGAAACAAAAGAAACA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.353.2 chr1 - 5096 19 full-splice_match ECE1 ENST00000415912.6 5099 19 0 3 0 0 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 13 3.188451 0.503580 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GGCCATGTGTCTGGGTGTCT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.353.3 chr1 - 5053 19 full-splice_match ECE1 ENST00000374893.11 5067 19 14 0 14 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GGCCATGTGTCTGGGTGTCT -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.353.4 chr1 - 4419 15 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 19263 -1334 -3569 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GGCCATGTGTCTGGGTGTCT 1645 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.353.10 chr1 - 4259 13 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 21955 -1333 -877 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GGGCCATGTGTCTGGGTGTC 4337 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.353.12 chr1 - 3818 10 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 34481 -1332 -6718 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGGGCCATGTGTCTGGGTGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.353.13 chr1 - 2949 2 full-splice_match ECE1 ENST00000531334.1 653 2 266 -2562 266 -2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGGGCCATGTGTCTGGGTGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.353.20 chr1 - 3747 19 full-splice_match ECE1 ENST00000415912.6 5099 19 -6 1358 -6 -21 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAGAAAAGAGAAAC 385 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.353.21 chr1 - 3671 18 full-splice_match ECE1 ENST00000264205.10 2381 18 42 -1332 42 -21 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAGAAAAGAGAAAC -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.353.22 chr1 - 3680 19 full-splice_match ECE1 ENST00000374893.11 5067 19 32 1355 32 -21 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAGAAAAGAGAAAC 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.353.23 chr1 - 2215 8 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 42764 21 1565 -21 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAGAAAAGAGAAAC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.353.24 chr1 - 1702 3 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 54221 21 -3247 -21 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAGAAAAGAGAAAC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.353.28 chr1 - 2799 18 full-splice_match ECE1 ENST00000264205.10 2381 18 -17 -401 -17 278 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGAATTGGTATATTTATT 8728 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.353.29 chr1 - 2195 15 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 19201 952 -3631 278 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGAATTGGTATATTTATT 1583 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.353.30 chr1 - 1590 11 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 32308 952 -8891 278 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGAATTGGTATATTTATT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.353.31 chr1 - 1992 14 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 20834 953 -1998 277 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 GAAAGAATTGGTATATTTAT 3216 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.353.32 chr1 - 2948 19 novel_in_catalog ECE1 novel 5099 19 NA NA 0 274 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGGAAAGAATTGGTATATT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.353.33 chr1 - 2738 19 full-splice_match ECE1 ENST00000374893.11 5067 19 39 2290 39 274 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGGAAAGAATTGGTATATT 15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.353.34 chr1 - 2673 18 full-splice_match ECE1 ENST00000264205.10 2381 18 105 -397 105 274 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGGAAAGAATTGGTATATT 8850 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.353.35 chr1 - 2292 16 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 6794 956 6794 274 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGGAAAGAATTGGTATATT 6931 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.353.36 chr1 - 2818 19 full-splice_match ECE1 ENST00000415912.6 5099 19 -40 2321 28 246 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.169513 0.620085 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAACACATTTAAACACTT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.355.3 chr1 + 3575 14 full-splice_match NBPF3 ENST00000454000.6 2133 14 -9 -1433 -9 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTCTGGACTGTTGGATTGTT -1 TRUE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.355.5 chr1 + 4307 18 full-splice_match NBPF3 ENST00000318220.10 4401 18 -12 106 -3 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTCTGGACTGTTGGATTGT 5 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.355.6 chr1 + 4452 18 novel_not_in_catalog NBPF3 novel 4401 18 NA NA 0 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTCTGGACTGTTGGATTGT 17 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.355.7 chr1 + 4192 19 novel_not_in_catalog NBPF3 novel 4401 18 NA NA 0 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTCTGGACTGTTGGATTGT 17 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 8 NA PB.355.9 chr1 + 4376 19 novel_not_in_catalog NBPF3 novel 4401 18 NA NA 1 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTCTGGACTGTTGGATTGT 19 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 5 NA PB.355.10 chr1 + 2528 3 novel_not_in_catalog NBPF3 novel 1417 3 NA NA -3 2599 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAGAAAGAATTGAGGCTG 23 TRUE NA NA AATAAA -31 NA NA NA 2 NA PB.355.11 chr1 + 2732 3 novel_not_in_catalog NBPF3 novel 1417 3 NA NA 5 2811 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATACATGTGCTTATAAAT -20 TRUE NA NA AATAAA -28 NA NA NA 2 NA PB.355.12 chr1 + 2620 9 incomplete-splice_match NBPF3 ENST00000619554.1 1831 14 4891 -1487 46 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTCTGGACTGTTGGATTGT 4984 FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.357.2 chr1 - 3288 25 full-splice_match RAP1GAP ENST00000495204.5 2489 25 -14 -785 -14 -1 alternative_3end TRUE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACCCAGAGTTGGGCCTGGC -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.357.3 chr1 - 1310 5 incomplete-splice_match RAP1GAP ENST00000374763.6 3334 23 20530 2 20530 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACCCAGAGTTGGGCCTGGC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.357.4 chr1 - 1381 16 novel_not_in_catalog RAP1GAP novel 1328 10 NA NA 4 3691 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAGACTGGCCTCTCCTCATT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.358.1 chr1 + 2604 12 full-splice_match ALPL ENST00000374840.8 2536 12 -83 15 -57 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAATATTTCCGAGGACAGAG 361 FALSE NA NA AATAAA -8 NA NA NA 10 NA PB.358.2 chr1 + 2524 6 incomplete-splice_match ALPL ENST00000374840.8 2536 12 -65 12582 -39 1617 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAAGAAAGAAG 379 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 3 NA PB.358.3 chr1 + 2427 11 full-splice_match ALPL ENST00000540617.5 2131 11 -70 -226 -39 2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TTCCGAGGACAGAGCTGAGT 379 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.358.4 chr1 + 2438 11 novel_in_catalog ALPL novel 2536 12 NA NA -19 3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TCCGAGGACAGAGCTGAGTC 399 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 6 NA PB.358.5 chr1 + 2561 12 full-splice_match ALPL ENST00000374840.8 2536 12 -26 1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGAGCTGAGTCTTTGTGG 418 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 5 NA PB.358.6 chr1 + 2279 10 incomplete-splice_match ALPL ENST00000374832.5 2193 12 9345 -399 9345 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGAGCTGAGTCTTTGTGGTC 6516 FALSE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 2 NA PB.358.7 chr1 + 1876 8 incomplete-splice_match ALPL ENST00000374832.5 2193 12 11991 -394 -7033 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGGACAGAGCTGAGTCTTTG 23 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.358.8 chr1 + 1657 6 novel_in_catalog ALPL novel 2241 10 NA NA -6191 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GACAGAGCTGAGTCTTTGTG 14 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.358.9 chr1 + 1666 6 incomplete-splice_match ALPL ENST00000374832.5 2193 12 16843 -393 -2181 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGACAGAGCTGAGTCTTT 6 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 7 NA PB.358.10 chr1 + 1622 6 novel_not_in_catalog ALPL novel 733 4 NA NA -1602 1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGAGCTGAGTCTTTGTGGTC 3 TRUE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 2 NA PB.358.11 chr1 + 1289 3 incomplete-splice_match ALPL ENST00000374829.2 1595 4 1298 -3 1298 3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TCCGAGGACAGAGCTGAGTC 11 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 6 NA PB.358.12 chr1 + 1132 2 incomplete-splice_match ALPL ENST00000374829.2 1595 4 2061 -12 2061 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGAGCTGAGTCTTTGTGGTC 15 FALSE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 2 NA PB.359.1 chr1 - 1537 11 incomplete-splice_match USP48 ENST00000529637.5 3228 27 76400 -465 -1976 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CCTAAGTGTGGAAAAGTGTC NA FALSE NA NA AATGAA -38 NA NA NA 2 NA PB.359.2 chr1 - 3812 27 full-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 2 605 2 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TCCTAAGTGTGGAAAAGTGT 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.359.3 chr1 - 936 6 incomplete-splice_match USP48 ENST00000529637.5 3228 27 81444 -455 3068 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAACTTGTCCTAAGTGTG 4218 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.359.4 chr1 - 1789 14 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 62038 620 35 -15 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGTGAAGAACTTGTCCTA 3974 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.359.5 chr1 - 1129 11 incomplete-splice_match USP48 ENST00000529637.5 3228 27 76488 -145 -1888 -23 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TGAAGGAAATGTTTCCAATT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.359.6 chr1 - 3314 26 novel_in_catalog USP48 novel 4309 26 NA NA 19 -26 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTTGAAGGAAATGTTTCCA -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.359.7 chr1 - 1773 16 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 59131 927 1101 -26 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTTGAAGGAAATGTTTCCA 1067 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.359.8 chr1 - 941 9 incomplete-splice_match USP48 ENST00000529637.5 3228 27 77240 -142 -1136 -26 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTTGAAGGAAATGTTTCCA 14 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.359.9 chr1 - 3490 27 full-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 0 929 0 -28 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.678982 0.565728 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGACTTGAAGGAAATGTTTC 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.359.10 chr1 - 1553 15 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 61482 929 -521 -28 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGACTTGAAGGAAATGTTTC 3418 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.359.11 chr1 - 1785 14 novel_in_catalog USP48 novel 4419 27 NA NA 850 -33 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 ACATCAGACTTGAAGGAAAT 816 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.359.12 chr1 - 2327 20 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 36057 935 1099 -34 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 GACATCAGACTTGAAGGAAA 9381 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.359.14 chr1 - 2277 16 novel_in_catalog USP48 novel 4419 27 NA NA 0 8380 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GTACTGAACGCTACTGACAT 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.359.16 chr1 - 2103 14 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 -17 42738 -17 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 233 57.146851 1.756992 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 233 NA PB.359.17 chr1 - 1860 14 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 226 42738 20 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT 278 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.359.19 chr1 - 1859 13 novel_in_catalog USP48 novel 4309 26 NA NA 29 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.359.20 chr1 - 1777 12 novel_not_in_catalog USP48 novel 4419 27 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.359.21 chr1 - 1641 12 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 26445 42738 -8513 0 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT NA FALSE NA NA TATAAA -23 NA NA NA 4 NA PB.359.22 chr1 - 1500 12 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 26586 42738 -8372 0 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.359.23 chr1 - 1355 10 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 30497 42738 -4461 0 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT 3821 FALSE NA NA AAGAAA -25 NA NA NA 6 NA PB.359.24 chr1 - 1320 9 novel_not_in_catalog USP48 novel 4309 26 NA NA 23 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.359.25 chr1 - 1120 8 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 34878 42738 -80 0 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.188451 0.503580 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT 8202 FALSE NA NA AAAAAG -17 NA NA NA 13 NA PB.359.26 chr1 - 919 7 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 36067 42738 1109 0 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT 9391 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.359.27 chr1 - 2094 14 novel_in_catalog USP48 novel 4419 27 NA NA 0 -8 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAATAAAGGTAACACTTTAA 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.359.28 chr1 - 2428 11 full-splice_match USP48 ENST00000421625.6 2818 11 388 2 8 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTGTACTTGTGGTTTGTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.359.29 chr1 - 1792 9 incomplete-splice_match USP48 ENST00000421625.6 2818 11 27024 2 -8391 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTGTACTTGTGGTTTGTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.359.30 chr1 - 2239 11 full-splice_match USP48 ENST00000421625.6 2818 11 576 3 -39 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAATTGTACTTGTGGTTTGT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.359.31 chr1 - 1404 5 incomplete-splice_match USP48 ENST00000421625.6 2818 11 35323 3 -92 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAATTGTACTTGTGGTTTGT 8190 FALSE NA NA GATAAA -3 NA NA NA 4 NA PB.359.32 chr1 - 2355 11 full-splice_match USP48 ENST00000421625.6 2818 11 459 4 2 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 66 16.187521 1.209180 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATAATTGTACTTGTGGTTTG 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 66 NA PB.359.33 chr1 - 1524 7 incomplete-splice_match USP48 ENST00000421625.6 2818 11 31056 4 -4359 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATAATTGTACTTGTGGTTTG 3923 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.359.34 chr1 - 1885 11 full-splice_match USP48 ENST00000421625.6 2818 11 457 476 0 285 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.433716 0.535764 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCTGCATCCATGAGTATT 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.359.35 chr1 - 1219 9 incomplete-splice_match USP48 ENST00000421625.6 2818 11 553 8643 -62 -7882 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAGATGGAGGGGAAGAAA -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.359.36 chr1 - 1307 9 incomplete-splice_match USP48 ENST00000421625.6 2818 11 457 8651 0 -7890 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.943186 0.468818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AGACATAGAAAAGATGGAGG 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.359.37 chr1 - 1044 2 novel_not_in_catalog USP48 novel 4419 27 NA NA 0 -18932 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATATGTATTTTTCATACTT 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.361.1 chr1 + 1204 3 full-splice_match LINC00339 ENST00000642072.1 338 3 -23 -843 1 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAAATATGTGCTGTGGTG -6 TRUE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 3 NA PB.361.2 chr1 + 1080 2 full-splice_match LINC00339 ENST00000416769.2 1077 2 -9 6 4 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.433716 0.535764 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAAATATGTGCTGTGGTG -3 TRUE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 14 NA PB.362.1 chr1 + 969 6 full-splice_match CDC42 ENST00000656825.1 10503 6 11 9523 3 261 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 488 119.689545 2.078056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GTGGATGACTCTGTAACAGA 15 TRUE NA NA TTTAAA -15 NA NA NA 488 NA PB.362.2 chr1 + 2108 6 full-splice_match CDC42 ENST00000656825.1 10503 6 -22 8417 19 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 338 82.899727 1.918553 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAAGCCAGCCTGAGGGTTGT -18 TRUE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 338 NA PB.362.4 chr1 + 759 6 full-splice_match CDC42 ENST00000656825.1 10503 6 0 9744 0 40 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 30 7.357964 0.866758 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AATAATGACAAATGCCCTGC 4 TRUE NA NA ATTAAA -20 NA NA NA 30 NA PB.362.5 chr1 + 1677 7 full-splice_match CDC42 ENST00000344548.7 2256 7 46 533 2 -510 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTCATTGTCTTATATGCTT 9 TRUE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 4 NA PB.362.6 chr1 + 1871 6 full-splice_match CDC42 ENST00000656825.1 10503 6 8 8624 0 -187 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 24 5.886371 0.769848 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATGCAGACTCTTCTTAAGT 12 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 24 NA PB.362.7 chr1 + 1546 6 full-splice_match CDC42 ENST00000656825.1 10503 6 10 8947 2 -510 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 93 22.809687 1.358119 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTCATTGTCTTATATGCTT 14 TRUE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 93 NA PB.362.8 chr1 + 2202 7 full-splice_match CDC42 ENST00000344548.7 2256 7 52 2 3 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCCAGCCTGAGGGTTGTT 15 TRUE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 4 NA PB.362.9 chr1 + 1419 6 full-splice_match CDC42 ENST00000315554.13 1435 6 11 5 3 -5 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.943186 0.468818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATAAATGCCTGATGAAGCTT 15 TRUE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 12 NA PB.362.12 chr1 + 2177 6 full-splice_match CDC42 ENST00000400259.5 2274 6 118 -21 28 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCCAGCCTGAGGGTTGTT 16 FALSE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.362.13 chr1 + 2060 5 incomplete-splice_match CDC42 ENST00000344548.7 2256 7 25759 -3 24941 3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.169513 0.620085 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCCTGAGGGTTGTTATTTT NA FALSE NA NA ATTAAA -24 NA NA NA 17 NA PB.362.15 chr1 + 1706 5 incomplete-splice_match CDC42 ENST00000344548.7 2256 7 25900 210 25082 -187 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATGCAGACTCTTCTTAAGT NA FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.362.16 chr1 + 1896 4 incomplete-splice_match CDC42 ENST00000344548.7 2256 7 29054 4 28236 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.169513 0.620085 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACAAGCCAGCCTGAGGGTTG NA FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 17 NA PB.362.17 chr1 + 1351 4 incomplete-splice_match CDC42 ENST00000662562.1 1645 7 28252 -837 28252 -510 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTCATTGTCTTATATGCTT NA FALSE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 7 NA PB.362.18 chr1 + 1247 3 incomplete-splice_match CDC42 ENST00000662562.1 1645 7 33000 -837 33000 -510 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTCATTGTCTTATATGCTT 2124 FALSE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.362.19 chr1 + 1140 2 incomplete-splice_match CDC42 ENST00000662562.1 1645 7 33227 -837 33227 -510 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTCATTGTCTTATATGCTT 2351 FALSE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.362.20 chr1 + 1659 2 incomplete-splice_match CDC42 ENST00000344548.7 2256 7 34054 5 33236 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 20 4.905309 0.690666 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CACAAGCCAGCCTGAGGGTT 2360 FALSE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 20 NA PB.362.21 chr1 + 1567 2 incomplete-splice_match CDC42 ENST00000344548.7 2256 7 34154 -3 33336 3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.943186 0.468818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCCTGAGGGTTGTTATTTT 2460 FALSE NA NA ATTAAA -24 NA NA NA 12 NA PB.362.22 chr1 + 982 2 incomplete-splice_match CDC42 ENST00000662562.1 1645 7 33364 -816 33364 -531 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAAAATTTTTTTCCCTTT 2488 FALSE NA NA AATGAA -15 NA NA NA 2 NA PB.365.2 chr1 - 3920 23 incomplete-splice_match HSPG2 ENST00000374695.8 14341 97 100481 1 88 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGGGGCCTCCTGAGTCTTTG 14 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.365.3 chr1 - 3607 21 incomplete-splice_match HSPG2 ENST00000374695.8 14341 97 102552 1 -1181 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGGGGCCTCCTGAGTCTTTG 2085 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.365.4 chr1 - 2905 15 incomplete-splice_match HSPG2 ENST00000374695.8 14341 97 105738 1 -859 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGGGGCCTCCTGAGTCTTTG 5271 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.365.5 chr1 - 2676 13 incomplete-splice_match HSPG2 ENST00000374695.8 14341 97 106229 1 -368 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGGGGCCTCCTGAGTCTTTG 5762 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.365.6 chr1 - 2328 11 full-splice_match HSPG2 ENST00000486901.1 3586 11 1258 0 1258 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGGGGCCTCCTGAGTCTTTG 7388 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.365.7 chr1 - 2182 10 incomplete-splice_match HSPG2 ENST00000486901.1 3586 11 1707 0 1707 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGGGGCCTCCTGAGTCTTTG 7837 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.365.8 chr1 - 1515 2 full-splice_match HSPG2 ENST00000481644.1 839 2 380 -1056 380 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGGGGCCTCCTGAGTCTTTG -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.365.10 chr1 - 4595 26 incomplete-splice_match HSPG2 ENST00000374695.8 14341 97 97431 2 -873 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGGGGCCTCCTGAGTCTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.365.11 chr1 - 6281 37 incomplete-splice_match HSPG2 ENST00000374695.8 14341 97 89562 2 210 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGGGGCCTCCTGAGTCTTT 6887 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.365.12 chr1 - 6506 38 incomplete-splice_match HSPG2 ENST00000374695.8 14341 97 89220 2 -132 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGGGGCCTCCTGAGTCTTT 6545 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.365.13 chr1 - 3345 19 incomplete-splice_match HSPG2 ENST00000374695.8 14341 97 103767 2 34 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGGGGCCTCCTGAGTCTTT 3300 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.365.14 chr1 - 1886 9 incomplete-splice_match HSPG2 ENST00000486901.1 3586 11 2410 1 2410 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGGGGCCTCCTGAGTCTTT 8540 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.365.15 chr1 - 1685 7 incomplete-splice_match HSPG2 ENST00000486901.1 3586 11 2823 1 2823 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGGGGCCTCCTGAGTCTTT 8953 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.365.16 chr1 - 1561 5 incomplete-splice_match HSPG2 ENST00000486901.1 3586 11 6118 1 -329 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGGGGCCTCCTGAGTCTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.365.17 chr1 - 1374 3 incomplete-splice_match HSPG2 ENST00000486901.1 3586 11 6566 1 119 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.188451 0.503580 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGGGGCCTCCTGAGTCTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.365.19 chr1 - 3703 21 incomplete-splice_match HSPG2 ENST00000374695.8 14341 97 102454 3 -1279 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CCAGGGGCCTCCTGAGTCTT 1987 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.365.20 chr1 - 2108 10 incomplete-splice_match HSPG2 ENST00000486901.1 3586 11 1779 2 1779 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CCAGGGGCCTCCTGAGTCTT 7909 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.366.1 chr1 + 5971 18 full-splice_match ZBTB40 ENST00000375647.5 8701 18 0 2730 0 -2730 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAGAAAAAACAAACAA -3 TRUE NA NA AAAACA -41 NA NA NA 2 NA PB.372.1 chr1 + 1469 10 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000692975.1 3793 18 34 14473 9 -7411 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CTGTATTTTCTTCATAGCTG -28 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.372.2 chr1 + 2985 19 full-splice_match KDM1A ENST00000356634.7 3033 19 41 7 21 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 37 9.074821 0.957838 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG -16 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 37 NA PB.372.3 chr1 + 3038 20 novel_in_catalog KDM1A novel 3085 21 NA NA 28 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 27 6.622167 0.821000 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG -9 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 27 NA PB.372.4 chr1 + 2823 19 full-splice_match KDM1A ENST00000356634.7 3033 19 212 -2 192 2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CCTCTCTTTTGTTCCTTTGA 155 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.372.5 chr1 + 2528 18 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000356634.7 3033 19 11019 7 10999 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.943186 0.468818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG 2728 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 12 NA PB.372.6 chr1 + 2569 19 novel_in_catalog KDM1A novel 3085 21 NA NA 11018 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG 2747 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 10 NA PB.372.7 chr1 + 963 10 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000688680.1 3984 15 11113 7419 11088 -7419 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GTGAAATTCTGTATTTTCTT -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.372.9 chr1 + 2361 17 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000356634.7 3033 19 30938 7 -39 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.150575 0.711856 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG NA FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 21 NA PB.372.10 chr1 + 2285 17 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000356634.7 3033 19 31014 7 37 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG 65 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 10 NA PB.372.11 chr1 + 2147 15 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000356634.7 3033 19 35621 7 4644 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 31 7.603229 0.880998 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG 4672 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 31 NA PB.372.12 chr1 + 1952 13 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000356634.7 3033 19 38031 7 7054 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 27 6.622167 0.821000 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG 7082 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 27 NA PB.372.13 chr1 + 1862 12 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000356634.7 3033 19 39628 7 -6123 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.924247 0.593756 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG -1 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 16 NA PB.372.14 chr1 + 1859 12 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000465864.2 3039 19 39654 -10 -6102 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG 20 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 4 NA PB.372.16 chr1 + 1717 11 full-splice_match KDM1A ENST00000686793.1 2133 11 422 -6 422 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 23 5.641106 0.751364 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG 9515 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 23 NA PB.372.18 chr1 + 2332 10 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000691682.1 3710 19 49641 -49 914 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAAAATTGGCCCTCTCTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.372.20 chr1 + 1539 9 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000686793.1 2133 11 3053 -7 -134 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 54 13.244334 1.122030 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAATTGGCCCTCTCTTTTGT NA FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 54 NA PB.372.21 chr1 + 1403 8 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000686793.1 2133 11 3952 -6 765 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 29 7.112698 0.852034 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG 760 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 29 NA PB.372.22 chr1 + 1321 7 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000689971.1 1823 8 2444 -10 1941 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.924247 0.593756 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG 1936 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 16 NA PB.372.24 chr1 + 1891 6 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000689971.1 1823 8 5698 -10 -231 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG 5190 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 2 NA PB.372.25 chr1 + 1212 6 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000689971.1 1823 8 6377 -10 -3 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 24 5.886371 0.769848 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG 5869 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 24 NA PB.372.26 chr1 + 1113 6 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000689971.1 1823 8 6477 -11 97 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 24 5.886371 0.769848 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAATTGGCCCTCTCTTTTGT 5969 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 24 NA PB.372.27 chr1 + 1682 5 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000685243.1 1123 6 106 4 106 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG 7757 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 4 NA PB.372.28 chr1 + 938 5 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000494920.1 905 6 1900 -328 121 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.660044 0.668390 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG 7772 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 19 NA PB.372.29 chr1 + 757 3 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000494920.1 905 6 4234 -328 595 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG NA FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 5 NA PB.372.30 chr1 + 1326 2 full-splice_match KDM1A ENST00000690907.1 3464 2 2191 -53 681 2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CCTCTCTTTTGTTCCTTTGA NA FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.372.31 chr1 + 1963 1 full-splice_match KDM1A ENST00000602503.1 2810 1 843 4 843 2 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATATAAAATTGGCCCTCTCT NA FALSE NA NA AATAAA -6 NA NA NA 2 NA PB.372.32 chr1 + 1214 1 full-splice_match KDM1A ENST00000602503.1 2810 1 1596 0 1596 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG NA FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 5 NA PB.372.33 chr1 + 1106 1 full-splice_match KDM1A ENST00000602503.1 2810 1 1710 -6 1710 -1 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GGCCCTCTCTTTTGTTCCTT NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.373.3 chr1 - 1167 4 full-splice_match LUZP1 ENST00000471849.5 1190 4 12 11 12 -11 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAACAAGAAACAAATCAGAA -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.373.4 chr1 - 1104 3 incomplete-splice_match LUZP1 ENST00000302291.8 8898 5 8972 9424 9 -11 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 26 6.376902 0.804610 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAACAAGAAACAAATCAGAA -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 26 NA PB.373.10 chr1 - 898 2 intergenic novelGene_313 novel NA NA NA NA NA NA multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA AAAAAG -32 NA NA NA 2 NA PB.375.1 chr1 - 1782 1 full-splice_match LINC01355 ENST00000566551.1 5444 1 3661 1 2363 -1 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTGAGTTTTTTTTGTCTTA NA FALSE NA NA AGTAAA -7 NA NA NA 4 NA PB.375.2 chr1 - 1600 1 full-splice_match LINC01355 ENST00000566551.1 5444 1 3843 1 2545 -1 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTGAGTTTTTTTTGTCTTA NA FALSE NA NA ATTAAA -37 NA NA NA 3 NA PB.375.3 chr1 - 1099 1 full-splice_match LINC01355 ENST00000566551.1 5444 1 4343 2 3045 -2 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GAGTGAGTTTTTTTTGTCTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.380.9 chr1 - 2546 10 full-splice_match HNRNPR ENST00000478691.5 7646 10 -26 5126 -26 -28 alternative_3end FALSE noncanonical NA NA NA NA 47 11.527476 1.061734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATAAAACTAAAAAATCTAT 288 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 47 NA PB.380.11 chr1 - 2700 11 full-splice_match HNRNPR ENST00000374612.5 2694 11 5 -11 0 8 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 201 49.298355 1.692832 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAATTCAATTGTGTCCTAAA 333 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 201 NA PB.380.12 chr1 - 2633 11 full-splice_match HNRNPR ENST00000374612.5 2694 11 72 -11 31 8 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.924247 0.593756 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAATTCAATTGTGTCCTAAA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.380.13 chr1 - 2369 9 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000374612.5 2694 11 5764 -6 -9 3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTTCAAATTCAATTGTGTC 6092 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.380.14 chr1 - 2567 10 novel_in_catalog HNRNPR novel 2694 11 NA NA -26 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 430 105.464149 2.023105 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACCTATTTCAAATTCAATTG 288 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 430 NA PB.380.15 chr1 - 2433 9 full-splice_match HNRNPR ENST00000606561.5 1837 9 -55 -541 -14 -6 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 300 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.380.17 chr1 - 1822 5 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000427764.3 1788 9 19420 -670 -7987 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACCTATTTCAAATTCAATTG 2021 FALSE NA NA AAAAAG -42 NA NA NA 6 NA PB.380.19 chr1 - 2580 11 novel_in_catalog HNRNPR novel 7751 11 NA NA 0 -5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAACATTACCTATTTCAAAT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.380.20 chr1 - 2673 11 full-splice_match HNRNPR ENST00000374616.7 2691 11 9 9 -6 -6 reference_match FALSE noncanonical NA NA NA NA 29 7.112698 0.852034 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA -19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 29 NA PB.380.21 chr1 - 2611 4 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000427764.3 1788 9 21462 -662 -5945 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 4063 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.380.22 chr1 - 2545 10 novel_in_catalog HNRNPR novel 7751 11 NA NA -1 -6 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.433716 0.535764 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.380.23 chr1 - 2475 10 novel_in_catalog HNRNPR novel 2694 11 NA NA -2 -6 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.380.24 chr1 - 2456 10 full-splice_match HNRNPR ENST00000478691.5 7646 10 86 5104 31 -6 alternative_3end5end FALSE noncanonical NA NA NA NA 13 3.188451 0.503580 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.380.25 chr1 - 2520 10 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000374612.5 2694 11 3358 6 44 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 3686 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.380.26 chr1 - 2447 10 novel_in_catalog HNRNPR novel 7751 11 NA NA 31 -6 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 52 12.753804 1.105640 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 52 NA PB.380.27 chr1 - 2382 9 full-splice_match HNRNPR ENST00000606561.5 1837 9 -4 -541 -4 -6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 41 10.055883 1.002420 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 41 NA PB.380.30 chr1 - 2319 9 novel_in_catalog HNRNPR novel 2694 11 NA NA -4 -6 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.924247 0.593756 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.380.31 chr1 - 2296 8 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000374612.5 2694 11 6453 6 680 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.169513 0.620085 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 6781 FALSE NA NA AATAAA -33 NA NA NA 17 NA PB.380.32 chr1 - 2223 8 novel_in_catalog HNRNPR novel 1837 9 NA NA 0 -6 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 333 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.380.33 chr1 - 2149 7 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000374612.5 2694 11 10722 6 31 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.943186 0.468818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.380.35 chr1 - 2180 5 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000427764.3 1788 9 19054 -662 -8353 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 9878 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.380.37 chr1 - 2045 6 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000427764.3 1788 9 17297 -662 9920 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 37 9.074821 0.957838 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 8121 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 37 NA PB.380.39 chr1 - 1914 6 novel_in_catalog HNRNPR novel 7751 11 NA NA 89 -6 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.380.40 chr1 - 1753 4 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000427764.3 1788 9 22320 -662 -5087 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 34 8.339025 0.921115 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 4921 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 34 NA PB.380.41 chr1 - 1531 3 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000641107.1 646 5 -85 5829 -85 -6 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 27 6.622167 0.821000 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 9923 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 27 NA PB.380.42 chr1 - 1446 3 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000641107.1 646 5 0 5829 0 -6 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.395840 0.732059 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 5028 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 22 NA PB.380.43 chr1 - 1377 2 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000476660.1 1637 3 569 30 569 -28 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 57 13.980131 1.145511 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATAAAACTAAAAAATCTAT 7305 FALSE NA NA TATAAA -14 NA NA NA 57 NA PB.380.50 chr1 - 3012 11 full-splice_match HNRNPR ENST00000302271.11 7751 11 -366 5105 -314 -7 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 CAAAACATTACCTATTTCAA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.380.51 chr1 - 2226 8 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000427764.3 1788 9 2466 -661 7 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 CAAAACATTACCTATTTCAA 6108 FALSE NA NA ATTAAA -38 NA NA NA 3 NA PB.380.52 chr1 - 1622 4 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000427764.3 1788 9 22448 -659 -4959 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 57 13.980131 1.145511 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TTCAAAACATTACCTATTTC 5049 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 57 NA PB.380.62 chr1 - 1581 7 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000374612.5 2694 11 10689 607 -2 -60 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAAAAATTGGCTTAA NA FALSE NA NA ACTAAA -13 NA NA NA 6 NA PB.380.63 chr1 - 1456 6 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000427764.3 1788 9 17285 -61 9908 -60 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAAAAATTGGCTTAA 8109 FALSE NA NA AATAAA -32 NA NA NA 9 NA PB.380.64 chr1 - 1252 5 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000427764.3 1788 9 19381 -61 -8026 -60 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAAAAATTGGCTTAA 1982 FALSE NA NA AAGAAA -2 NA NA NA 5 NA PB.380.67 chr1 - 1349 10 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000374612.5 2694 11 14 1465 2 -797 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 65 15.942255 1.202550 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAGAAAAGGAAAGAGCGCCA 342 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 65 NA PB.380.70 chr1 - 1175 9 novel_in_catalog HNRNPR novel 2694 11 NA NA 7 -797 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 104 25.507608 1.406670 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAGAAAAGGAAAGAGCGCCA 347 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 104 NA PB.380.75 chr1 - 805 6 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000374612.5 2694 11 10690 1516 -1 -848 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAGAAATAGAAGGGGAAGA NA FALSE NA NA ACTAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.380.76 chr1 - 1229 9 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000374612.5 2694 11 14 3815 2 -2 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAGATTATGCATTTGTTCA 342 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.380.77 chr1 - 1131 8 novel_in_catalog HNRNPR novel 2694 11 NA NA -2 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAGATTATGCATTTGTTCA 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.380.78 chr1 - 1069 8 novel_in_catalog HNRNPR novel 2694 11 NA NA 0 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAGATTATGCATTTGTTCA 333 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.380.79 chr1 - 1510 9 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000374612.5 2694 11 -326 3874 -312 -61 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAGAAATATTGGAAAAGTCA 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.380.80 chr1 - 963 8 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000374612.5 2694 11 13 8862 1 -165 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.433716 0.535764 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGAAGAATCGGGGGTT 341 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.380.82 chr1 - 780 7 novel_in_catalog HNRNPR novel 1032 8 NA NA 0 -165 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGAAGAATCGGGGGTT -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.380.89 chr1 - 854 6 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000374612.5 2694 11 5 13710 0 -5013 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAATGTTTGTAGTTAACA 333 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.382.1 chr1 - 4271 3 full-splice_match ZNF436 ENST00000374608.3 3788 3 46 -529 46 2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACCTGAGAATTATTTTAG -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.382.6 chr1 - 3480 3 full-splice_match ZNF436 ENST00000374608.3 3788 3 308 0 308 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GCTTCTGTGAGCCACTATGG -1 TRUE NA NA AAAACA -24 NA NA NA 2 NA PB.383.1 chr1 - 1570 11 full-splice_match TCEA3 ENST00000450454.7 1719 11 -6 155 -6 -155 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGACCTGAGGTGTCATATCT 57 FALSE NA NA GGGGCT -32 NA NA NA 5 NA PB.383.2 chr1 - 1501 10 novel_in_catalog TCEA3 novel 1719 11 NA NA 0 -155 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGACCTGAGGTGTCATATCT -19 TRUE NA NA GGGGCT -26 NA NA NA 4 NA PB.383.3 chr1 - 1199 10 novel_in_catalog TCEA3 novel 1719 11 NA NA -2 -459 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGAACTCTGTCTGAGTGGGA -21 TRUE NA NA GGGGCT -28 NA NA NA 5 NA PB.383.4 chr1 - 1095 10 novel_in_catalog TCEA3 novel 1719 11 NA NA -28 -459 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGAACTCTGTCTGAGTGGGA 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.383.6 chr1 - 1046 10 incomplete-splice_match TCEA3 ENST00000450454.7 1719 11 5632 466 120 -466 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATACTGAACTCTGTCTG 5695 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.383.7 chr1 - 1151 11 full-splice_match TCEA3 ENST00000450454.7 1719 11 98 470 -32 -470 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGGAAAATACTGAACTCTG -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.384.1 chr1 + 3281 1 full-splice_match ZNF436-AS1 ENST00000335648.3 2547 1 -734 0 -447 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCACAATTGTCATAGTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.384.2 chr1 + 2816 1 full-splice_match ZNF436-AS1 ENST00000335648.3 2547 1 -270 1 2 -1 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CAGCACAATTGTCATAGTTT 4 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 10 NA PB.384.3 chr1 + 1189 2 full-splice_match ZNF436-AS1 ENST00000454117.2 1266 2 20 57 5 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCACAATTGTCATAGTTTT 7 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 5 NA PB.384.4 chr1 + 885 3 full-splice_match ZNF436-AS1 ENST00000437367.4 898 3 5 8 5 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CAGCACAATTGTCATAGTTT 7 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.385.1 chr1 - 2076 7 incomplete-splice_match ASAP3 ENST00000495646.5 2552 10 2402 0 -743 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCCAGTGGTTTCATTTATGT 2400 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.385.2 chr1 - 4086 25 full-splice_match ASAP3 ENST00000336689.8 4051 25 -36 1 -23 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTCCAGTGGTTTCATTTATG -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.385.3 chr1 - 2433 9 incomplete-splice_match ASAP3 ENST00000495646.5 2552 10 649 1 649 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTCCAGTGGTTTCATTTATG 647 FALSE NA NA AAAACA -39 NA NA NA 2 NA PB.385.4 chr1 - 2826 12 incomplete-splice_match ASAP3 ENST00000336689.8 4051 25 46883 4 -328 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTTTCCAGTGGTTTCATTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.385.5 chr1 - 2552 11 incomplete-splice_match ASAP3 ENST00000336689.8 4051 25 47242 4 31 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTTTCCAGTGGTTTCATTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.385.6 chr1 - 1811 4 incomplete-splice_match ASAP3 ENST00000495646.5 2552 10 3468 4 323 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTTTCCAGTGGTTTCATTT 3466 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.387.1 chr1 - 2472 7 novel_not_in_catalog E2F2 novel 550 2 NA NA -13 1226 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CAACTGGCTTCCTCTACCTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.387.2 chr1 - 2010 7 novel_not_in_catalog E2F2 novel 550 2 NA NA 3 780 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCCTGTAACTCCAGCTACTC -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.387.8 chr1 - 5203 7 full-splice_match E2F2 ENST00000361729.3 5196 7 0 -7 0 7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GCATCTTGTCTTTGTCGTGC -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.387.9 chr1 - 5291 7 full-splice_match E2F2 ENST00000361729.3 5196 7 -96 1 -96 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTCTGGGCATCTTGTCTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.387.10 chr1 - 4018 3 incomplete-splice_match E2F2 ENST00000361729.3 5196 7 12103 1 266 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTCTGGGCATCTTGTCTT 5677 FALSE NA NA AAGAAA -29 NA NA NA 5 NA PB.389.1 chr1 - 1465 3 full-splice_match ID3 ENST00000374561.6 950 3 -29 -486 -29 486 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CCTGGTTTCATTTCCTTCTT 311 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.389.2 chr1 - 957 3 full-splice_match ID3 ENST00000374561.6 950 3 0 -7 0 7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 1244 305.110229 2.484457 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACACCCGTCTCCATTAAGTA -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 1244 NA PB.389.3 chr1 - 902 3 novel_not_in_catalog ID3 novel 950 3 NA NA -2 7 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACACCCGTCTCCATTAAGTA -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.389.4 chr1 - 947 3 novel_not_in_catalog ID3 novel 950 3 NA NA 2 6 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GACACCCGTCTCCATTAAGT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.389.6 chr1 - 1438 3 full-splice_match ID3 ENST00000374561.6 950 3 -490 2 -490 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATATGATGACACCCGTCTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.389.7 chr1 - 1291 3 full-splice_match ID3 ENST00000374561.6 950 3 -343 2 -343 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATATGATGACACCCGTCTC -3 TRUE NA NA CATAAA -24 NA NA NA 2 NA PB.389.8 chr1 - 889 3 full-splice_match ID3 ENST00000374561.6 950 3 59 2 1 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATATGATGACACCCGTCTC 399 FALSE NA NA AAGAAA -27 NA NA NA 10 NA PB.389.9 chr1 - 1034 3 full-splice_match ID3 ENST00000374561.6 950 3 -87 3 -87 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.433716 0.535764 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GTATATGATGACACCCGTCT 253 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.389.11 chr1 - 718 3 full-splice_match ID3 ENST00000374561.6 950 3 223 9 165 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTGTGTATATGATGACAC 563 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.389.12 chr1 - 1454 2 full-splice_match ID3 ENST00000486541.1 892 2 -56 -506 2 -5 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 34 8.339025 0.921115 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACACTTGTGTATATGATG 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 34 NA PB.389.13 chr1 - 1044 2 full-splice_match ID3 ENST00000463312.1 623 2 -426 5 0 -5 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACACTTGTGTATATGATG -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.390.1 chr1 + 744 6 full-splice_match RPL11 ENST00000643754.2 1017 6 -148 421 -84 2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAAATGTGCAATTCTGTTGT NA FALSE NA NA AATAAA -41 NA NA NA 2 NA PB.390.2 chr1 + 615 6 full-splice_match RPL11 ENST00000643754.2 1017 6 -18 420 -18 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 191 46.845703 1.670670 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATGTGCAATTCTGTTGTG 6 FALSE NA NA AATAAA -42 NA NA NA 191 NA PB.390.5 chr1 + 2038 4 incomplete-splice_match RPL11 ENST00000443624.6 1600 5 0 -3 0 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATGTGCAATTCTGTTGTG 5 TRUE NA NA AATAAA -42 NA NA NA 3 NA PB.390.6 chr1 + 1602 5 full-splice_match RPL11 ENST00000443624.6 1600 5 0 -2 0 2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.697920 0.431029 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAAATGTGCAATTCTGTTGT 5 TRUE NA NA AATAAA -41 NA NA NA 11 NA PB.390.7 chr1 + 1376 5 full-splice_match RPL11 ENST00000458455.2 879 5 -500 3 0 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATGTGCAATTCTGTTGTG 5 TRUE NA NA AATAAA -42 NA NA NA 2 NA PB.390.8 chr1 + 813 6 full-splice_match RPL11 ENST00000467075.2 823 6 0 10 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATGTGCAATTCTGTTGTG 20 FALSE NA NA AATAAA -42 NA NA NA 7 NA PB.390.9 chr1 + 582 5 full-splice_match RPL11 ENST00000458455.2 879 5 302 -5 -1 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AATTCTGTTGTGTGTTCTGT 807 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 4 NA PB.390.11 chr1 + 1188 2 incomplete-splice_match RPL11 ENST00000458455.2 879 5 2487 3 2184 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATGTGCAATTCTGTTGTG 131 FALSE NA NA AATAAA -42 NA NA NA 2 NA PB.390.16 chr1 + 2721 11 full-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 -46 2163 -23 -2127 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 106 25.998138 1.414942 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATTTATATTATCCCCCAGGT 270 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 106 NA PB.390.17 chr1 + 1358 4 incomplete-splice_match ELOA ENST00000609199.2 5075 10 6 10110 6 969 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 77 18.885441 1.276127 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAATGACTCTAAAAG -1 TRUE NA NA GATAAA -7 NA NA NA 77 NA PB.390.18 chr1 + 2792 10 novel_in_catalog ELOA novel 4838 11 NA NA -2 -2119 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCCAGGTTTGTTTTT -12 TRUE NA NA AATAAA -26 NA NA NA 2 NA PB.390.19 chr1 + 4815 11 full-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 4 19 4 -9 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 24 5.886371 0.769848 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAATAAAAAACAAACTCCAT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 24 NA PB.390.20 chr1 + 2655 11 full-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 23 2160 23 -2124 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 24 5.886371 0.769848 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATATTATCCCCCAGGTTTG 13 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 24 NA PB.390.22 chr1 + 4519 8 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 7402 19 6839 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAATAAAAAACAAACTCCAT 7392 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.390.23 chr1 + 2249 8 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 7536 2155 6973 -2119 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCCAGGTTTGTTTTT 7526 FALSE NA NA AATAAA -26 NA NA NA 8 NA PB.390.24 chr1 + 1936 8 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 7849 2155 7286 -2119 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCCAGGTTTGTTTTT 7839 FALSE NA NA AATAAA -26 NA NA NA 2 NA PB.390.25 chr1 + 3944 8 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 7995 1 7432 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATATACTGTGTCTTCCTTAC 7985 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.390.26 chr1 + 1776 8 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 8004 2160 7441 -2124 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATATTATCCCCCAGGTTTG 7994 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 8 NA PB.390.27 chr1 + 1677 8 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 8109 2154 7546 -2118 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCCCCAGGTTTGTTTTTG 8099 FALSE NA NA AATAAA -27 NA NA NA 7 NA PB.390.28 chr1 + 3782 8 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 8139 19 7576 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAATAAAAAACAAACTCCAT 8129 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.390.29 chr1 + 1565 8 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 8215 2160 7652 -2124 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATATTATCCCCCAGGTTTG 8205 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 4 NA PB.390.30 chr1 + 3547 8 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 8374 19 7811 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAATAAAAAACAAACTCCAT 8364 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.390.31 chr1 + 1359 8 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 8421 2160 7858 -2124 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.188451 0.503580 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATATTATCCCCCAGGTTTG 8411 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 13 NA PB.390.32 chr1 + 1218 7 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 8934 2164 8371 -2128 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATTTATATTATCCCCCAGG 8924 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.390.33 chr1 + 3275 7 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 9022 19 8459 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAATAAAAAACAAACTCCAT 9012 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.390.34 chr1 + 3219 6 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 10677 1 10114 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATATACTGTGTCTTCCTTAC NA FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 3 NA PB.390.35 chr1 + 1047 6 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 10690 2160 10127 -2124 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATATTATCCCCCAGGTTTG NA FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 4 NA PB.390.36 chr1 + 2984 4 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 12383 19 11820 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAATAAAAAACAAACTCCAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.390.37 chr1 + 841 4 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 12390 2155 11827 -2119 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCCAGGTTTGTTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -26 NA NA NA 4 NA PB.390.38 chr1 + 2836 4 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 12531 19 11968 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAATAAAAAACAAACTCCAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.390.39 chr1 + 2571 2 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 13613 19 13050 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAATAAAAAACAAACTCCAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.391.1 chr1 + 1093 6 full-splice_match PITHD1 ENST00000246151.9 1590 6 -35 532 -35 -532 alternative_3end TRUE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGATTGTTGTGTGACTTGT -21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.391.2 chr1 + 1620 6 full-splice_match PITHD1 ENST00000246151.9 1590 6 -32 2 -32 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 224 54.939461 1.739884 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTTTGTATTTTCTTTTG -18 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 224 NA PB.391.3 chr1 + 1562 5 novel_in_catalog PITHD1 novel 1590 6 NA NA -18 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.943186 0.468818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTTTGTATTTTCTTTTG -4 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 12 NA PB.391.4 chr1 + 1476 6 full-splice_match PITHD1 ENST00000246151.9 1590 6 112 2 112 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.188451 0.503580 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTTTGTATTTTCTTTTG 126 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 13 NA PB.391.5 chr1 + 1314 6 full-splice_match PITHD1 ENST00000246151.9 1590 6 274 2 274 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTTTGTATTTTCTTTTG 288 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 9 NA PB.391.6 chr1 + 1207 4 incomplete-splice_match PITHD1 ENST00000246151.9 1590 6 1487 2 548 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTTTGTATTTTCTTTTG 1501 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 10 NA PB.391.7 chr1 + 1020 2 incomplete-splice_match PITHD1 ENST00000374524.1 1292 4 1167 3 1167 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.433716 0.535764 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAATGTTTGTATTTTCTTTT 7955 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 14 NA PB.392.1 chr1 - 1136 5 novel_in_catalog ELOA-AS1 novel 1112 4 NA NA 9 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAAGTTGCCTTCAGGGCTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.392.2 chr1 - 943 4 full-splice_match ELOA-AS1 ENST00000427796.6 1112 4 32 137 -3 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAAGTTGCCTTCAGGGCTA -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.392.3 chr1 - 844 4 full-splice_match ELOA-AS1 ENST00000427796.6 1112 4 28 240 -7 -103 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAACAAACCAATTTCCAAC -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.393.1 chr1 - 1904 11 novel_in_catalog GALE novel 1516 12 NA NA 3 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCAGGTTCTCACAGATGGTC -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.393.2 chr1 - 1629 12 full-splice_match GALE ENST00000374497.7 1488 12 -140 -1 -19 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCAGGTTCTCACAGATGGTC -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.393.3 chr1 - 1523 12 full-splice_match GALE ENST00000617979.5 1516 12 -7 0 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 345 84.616585 1.927455 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCAGGTTCTCACAGATGGTC -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 345 NA PB.393.4 chr1 - 1439 11 novel_in_catalog GALE novel 1516 12 NA NA -1 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 20 4.905309 0.690666 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCAGGTTCTCACAGATGGTC -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 20 NA PB.393.5 chr1 - 1458 10 novel_in_catalog GALE novel 1516 12 NA NA -14 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCAGGTTCTCACAGATGGTC -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.393.6 chr1 - 1400 11 novel_in_catalog GALE novel 1516 12 NA NA 0 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCAGGTTCTCACAGATGGTC 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.393.7 chr1 - 1374 10 incomplete-splice_match GALE ENST00000374497.7 1488 12 1418 -1 129 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCAGGTTCTCACAGATGGTC 1791 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.393.8 chr1 - 1761 12 full-splice_match GALE ENST00000374497.7 1488 12 -273 0 77 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GGCAGGTTCTCACAGATGGT 100 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.393.9 chr1 - 925 7 incomplete-splice_match GALE ENST00000374497.7 1488 12 2651 0 -682 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GGCAGGTTCTCACAGATGGT 3024 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.393.10 chr1 - 1388 11 novel_in_catalog GALE novel 1516 12 NA NA 0 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 58 14.225396 1.153064 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GGGCAGGTTCTCACAGATGG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 58 NA PB.393.11 chr1 - 1621 11 full-splice_match GALE ENST00000459934.5 1563 11 1 -59 0 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.414778 0.644909 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GGGGCAGGTTCTCACAGATG 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.393.12 chr1 - 1497 10 novel_in_catalog GALE novel 1563 11 NA NA -1 1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGGGGCAGGTTCTCACAGAT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.393.13 chr1 - 1190 9 incomplete-splice_match GALE ENST00000374497.7 1488 12 1754 3 465 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGGGGCAGGTTCTCACAGAT 2127 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.393.14 chr1 - 1103 8 incomplete-splice_match GALE ENST00000374497.7 1488 12 2225 3 936 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGGGGCAGGTTCTCACAGAT 2598 FALSE NA NA CATAAA -4 NA NA NA 7 NA PB.393.15 chr1 - 1578 11 incomplete-splice_match GALE ENST00000374497.7 1488 12 855 5 -14 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTGGGGCAGGTTCTCACAG -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.393.16 chr1 - 1309 10 novel_in_catalog GALE novel 1516 12 NA NA -3 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTGGGGCAGGTTCTCACAG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.393.17 chr1 - 1698 13 novel_not_in_catalog GALE novel 1516 12 NA NA 0 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACACTGGGGCAGGTTCTCAC 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.393.18 chr1 - 2601 10 novel_in_catalog GALE novel 1516 12 NA NA 213 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TACACTGGGGCAGGTTCTCA 586 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.393.19 chr1 - 1470 12 novel_not_in_catalog GALE novel 1516 12 NA NA -3 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TACACTGGGGCAGGTTCTCA -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.394.1 chr1 - 1617 9 full-splice_match HMGCL ENST00000374490.8 1570 9 -49 2 -49 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 326 79.956535 1.902854 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATTCCAGCATTCGGTTGTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 326 NA PB.394.2 chr1 - 1521 8 novel_in_catalog HMGCL novel 1570 9 NA NA -9 6 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CATTCGGTTGTGCAGCTGTG -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.394.3 chr1 - 1167 5 incomplete-splice_match HMGCL ENST00000374490.8 1570 9 11138 -6 30 6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CATTCGGTTGTGCAGCTGTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.394.4 chr1 - 1451 8 incomplete-splice_match HMGCL ENST00000374490.8 1570 9 4886 -5 -3010 5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCATTCGGTTGTGCAGCTGT 4930 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.394.6 chr1 - 1479 9 novel_in_catalog HMGCL novel 1570 9 NA NA -13 4 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCATTCGGTTGTGCAGCTG -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.394.7 chr1 - 1553 9 novel_not_in_catalog HMGCL novel 2151 10 NA NA -9 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.188451 0.503580 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATTCCAGCATTCGGTTGTG -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.394.8 chr1 - 1461 8 novel_in_catalog HMGCL novel 1570 9 NA NA -1 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATTCCAGCATTCGGTTGTG 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.394.9 chr1 - 1363 7 full-splice_match HMGCL ENST00000436439.6 1354 7 -10 1 -9 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 29 7.112698 0.852034 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAATTCCAGCATTCGGTTGT -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 29 NA PB.395.1 chr1 + 1633 10 full-splice_match LYPLA2 ENST00000374514.8 1635 10 0 2 0 -2 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 877 215.097809 2.332636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT -9 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 877 NA PB.395.2 chr1 + 1727 7 incomplete-splice_match LYPLA2 ENST00000495365.5 842 9 -41 -662 17 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 8 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.395.3 chr1 + 1884 7 incomplete-splice_match LYPLA2 ENST00000374514.8 1635 10 18 2 18 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 9 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.395.4 chr1 + 1860 9 novel_in_catalog LYPLA2 novel 1635 10 NA NA 20 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 11 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.395.5 chr1 + 1792 8 full-splice_match LYPLA2 ENST00000374502.7 1072 8 -53 -667 -19 -2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 25 6.131637 0.787576 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 14 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 25 NA PB.395.6 chr1 + 1604 10 novel_not_in_catalog LYPLA2 novel 1635 10 NA NA -19 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 14 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.395.7 chr1 + 1712 10 novel_in_catalog LYPLA2 novel 1635 10 NA NA -16 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.924247 0.593756 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 17 FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 16 NA PB.395.8 chr1 + 1701 9 novel_in_catalog LYPLA2 novel 1635 10 NA NA -9 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT -5 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 9 NA PB.395.9 chr1 + 1568 9 novel_in_catalog LYPLA2 novel 1635 10 NA NA -9 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.150575 0.711856 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT -5 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 21 NA PB.395.10 chr1 + 1475 10 full-splice_match LYPLA2 ENST00000374503.7 868 10 -25 -582 -9 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT -5 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 8 NA PB.395.11 chr1 + 1494 8 novel_not_in_catalog LYPLA2 novel 1635 10 NA NA -7 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT -3 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.395.12 chr1 + 1670 9 incomplete-splice_match LYPLA2 ENST00000374514.8 1635 10 44 2 2 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 6 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 8 NA PB.395.13 chr1 + 1577 10 novel_in_catalog LYPLA2 novel 717 9 NA NA -3 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT -9 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.395.14 chr1 + 1462 9 incomplete-splice_match LYPLA2 ENST00000374514.8 1635 10 1577 2 730 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.169513 0.620085 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 745 FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 17 NA PB.395.15 chr1 + 1254 5 incomplete-splice_match LYPLA2 ENST00000374501.1 1117 6 230 -260 -209 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 221 FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 7 NA PB.395.16 chr1 + 985 2 incomplete-splice_match LYPLA2 ENST00000472213.1 822 3 380 -456 380 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.188451 0.503580 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 810 FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 13 NA PB.396.1 chr1 - 2207 8 novel_not_in_catalog FUCA1 novel 2043 8 NA NA 3 -7 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAAACATGGTATAGCTT 34 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.396.2 chr1 - 1808 8 full-splice_match FUCA1 ENST00000374479.4 2043 8 228 7 228 -7 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAAACATGGTATAGCTT 259 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.396.3 chr1 - 1342 5 incomplete-splice_match FUCA1 ENST00000374479.4 2043 8 8415 7 8415 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAAACATGGTATAGCTT 8446 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.396.4 chr1 - 1212 4 incomplete-splice_match FUCA1 ENST00000374479.4 2043 8 13782 7 13782 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAAACATGGTATAGCTT 175 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.396.5 chr1 - 2088 8 full-splice_match FUCA1 ENST00000374479.4 2043 8 -53 8 -53 -8 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 240 58.863708 1.769848 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 CAAAAAAACATGGTATAGCT -22 TRUE NA NA AAAAAG -14 NA NA NA 240 NA PB.396.6 chr1 - 1039 3 incomplete-splice_match FUCA1 ENST00000374479.4 2043 8 19474 8 19474 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 CAAAAAAACATGGTATAGCT 5867 FALSE NA NA AATGAA -5 NA NA NA 10 NA PB.396.7 chr1 - 1495 6 incomplete-splice_match FUCA1 ENST00000374479.4 2043 8 5019 20 5019 -20 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AATCATTTCTACCAAAAAAA 5050 FALSE NA NA AAAACA -35 NA NA NA 6 NA PB.397.2 chr1 - 3590 7 novel_not_in_catalog SRSF10 novel 7656 6 NA NA 0 5 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GGTTTTTTTAAGATTTTGCT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.397.3 chr1 - 3707 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000374452.9 1194 6 -19 -2494 0 -9 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAATAAATCTTGGGTTTT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.397.4 chr1 - 3467 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000344989.10 3487 6 11 9 7 -9 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 37 9.074821 0.957838 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAATAAATCTTGGGTTTT 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 37 NA PB.397.5 chr1 - 3420 5 full-splice_match SRSF10 ENST00000484146.6 1089 5 29 -2360 0 -9 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAATAAATCTTGGGTTTT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.397.15 chr1 - 3432 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000344989.10 3487 6 -40 95 -15 -95 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGAAGTAAAAGGCCTTTG -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.397.16 chr1 - 3595 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000374453.7 866 6 -33 -2696 0 -118 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATTGAGAACTAACCGTAGTT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.397.17 chr1 - 3466 7 novel_not_in_catalog SRSF10 novel 7656 6 NA NA 0 -119 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 CATTGAGAACTAACCGTAGT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.397.21 chr1 - 4676 7 novel_in_catalog SRSF10 novel 2839 7 NA NA -10 -4 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATGTTTTGGATTCCTTA -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.397.22 chr1 - 5094 6 novel_in_catalog SRSF10 novel 2839 7 NA NA 0 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATGTTTTGGATTCCTTA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.397.23 chr1 - 4218 6 novel_not_in_catalog SRSF10 novel 7656 6 NA NA 0 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATGTTTTGGATTCCTTA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.397.26 chr1 - 2366 8 novel_not_in_catalog SRSF10 novel 2839 7 NA NA 0 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATGTTTTGGATTCCTTA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.397.28 chr1 - 2264 7 novel_in_catalog SRSF10 novel 2839 7 NA NA 0 -4 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATGTTTTGGATTCCTTA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.397.29 chr1 - 2072 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000374452.9 1194 6 -20 -858 -1 -4 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.188451 0.503580 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATGTTTTGGATTCCTTA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.397.30 chr1 - 1940 7 novel_not_in_catalog SRSF10 novel 7656 6 NA NA 0 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.924247 0.593756 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATGTTTTGGATTCCTTA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.397.32 chr1 - 1903 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000344989.10 3487 6 -63 1647 -38 -6 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 301 73.824905 1.868203 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACAAAATGTTTTGGATTCCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 301 NA PB.397.33 chr1 - 1784 5 full-splice_match SRSF10 ENST00000484146.6 1089 5 29 -724 0 -4 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 36 8.829556 0.945939 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATGTTTTGGATTCCTTA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 36 NA PB.397.34 chr1 - 1655 4 novel_in_catalog SRSF10 novel 2839 7 NA NA 3 -4 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATGTTTTGGATTCCTTA 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.397.35 chr1 - 1653 5 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000344989.10 3487 6 1562 1645 177 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATGTTTTGGATTCCTTA 1592 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.397.37 chr1 - 1424 3 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000341154.10 2839 7 8983 4 3108 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.433716 0.535764 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATGTTTTGGATTCCTTA 8417 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.397.38 chr1 - 1430 2 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000484146.6 1089 5 8352 -724 3048 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATGTTTTGGATTCCTTA 8357 FALSE NA NA ATTAAA -3 NA NA NA 6 NA PB.397.46 chr1 - 1559 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000344989.10 3487 6 4 1924 0 -283 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AATATACTAGAGTTATAATA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.397.47 chr1 - 931 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000344989.10 3487 6 4 2552 0 -49 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGCCATAGTCTCTTACAGTG 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.397.48 chr1 - 959 7 novel_not_in_catalog SRSF10 novel 7656 6 NA NA -3 -155 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTGTGGAAACTAATCCCT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.397.49 chr1 - 810 5 full-splice_match SRSF10 ENST00000484146.6 1089 5 -10 289 -10 -155 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTGTGGAAACTAATCCCT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.397.50 chr1 - 4080 6 novel_in_catalog SRSF10 novel 2839 7 NA NA 0 155 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TACTTGTGGAAACTAATCCC 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.397.51 chr1 - 1250 7 novel_in_catalog SRSF10 novel 2839 7 NA NA 0 155 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TACTTGTGGAAACTAATCCC 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.397.52 chr1 - 823 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000344989.10 3487 6 4 2660 0 154 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 32 7.848495 0.894786 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GTACTTGTGGAAACTAATCC 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 32 NA PB.397.53 chr1 - 3124 5 novel_in_catalog SRSF10 novel 7656 6 NA NA 0 -19 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AATAAAAACAAAATGAAGGA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.397.54 chr1 - 2901 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000492112.3 7656 6 0 4755 0 -19 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 49 12.018007 1.079832 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AATAAAAACAAAATGAAGGA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 49 NA PB.397.55 chr1 - 2545 3 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000485841.5 3957 4 5650 -1277 3050 -19 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AATAAAAACAAAATGAAGGA 8359 FALSE NA NA ATTAAA -1 NA NA NA 4 NA PB.397.56 chr1 - 2375 2 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000485841.5 3957 4 6043 -1277 3443 -19 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AATAAAAACAAAATGAAGGA 8752 FALSE NA NA AAAAAG -26 NA NA NA 5 NA PB.397.66 chr1 - 4904 6 novel_in_catalog SRSF10 novel 7656 6 NA NA 5 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.397.67 chr1 - 2533 3 novel_in_catalog SRSF10 novel 3957 4 NA NA -953 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA 4356 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.397.68 chr1 - 2060 7 novel_in_catalog SRSF10 novel 7656 6 NA NA -6 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.924247 0.593756 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.397.69 chr1 - 2040 7 novel_not_in_catalog SRSF10 novel 7656 6 NA NA 0 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.397.70 chr1 - 2022 4 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000484146.6 1089 5 -13 3206 -13 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.397.71 chr1 - 1847 5 novel_in_catalog SRSF10 novel 7656 6 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.397.72 chr1 - 1757 5 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000374452.9 1194 6 -19 3072 0 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.397.73 chr1 - 1665 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000492112.3 7656 6 -41 6032 -12 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 264 64.750084 1.811240 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 264 NA PB.397.75 chr1 - 1489 5 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000492112.3 7656 6 1508 6032 127 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA 1542 FALSE NA NA CATAAA -38 NA NA NA 6 NA PB.397.76 chr1 - 1375 4 full-splice_match SRSF10 ENST00000485841.5 3957 4 2582 0 -18 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA 5291 FALSE NA NA GGGGCT -24 NA NA NA 6 NA PB.397.78 chr1 - 1255 3 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000485841.5 3957 4 5663 0 3063 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA 8372 FALSE NA NA AATACA -16 NA NA NA 8 NA PB.397.79 chr1 - 1166 3 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000338597.9 813 5 6034 -596 3149 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA 8458 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.397.84 chr1 - 1196 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000492112.3 7656 6 0 6460 0 168 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTTGGTAGAACTGTTAACC 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.397.85 chr1 - 4307 6 novel_in_catalog SRSF10 novel 7656 6 NA NA 5 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCTTAAGAGTCCAGTTTG 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.397.86 chr1 - 3826 7 novel_in_catalog SRSF10 novel 7656 6 NA NA 0 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCTTAAGAGTCCAGTTTG 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.397.87 chr1 - 1638 4 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000338597.9 813 5 2004 1 -881 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCTTAAGAGTCCAGTTTG 4428 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.397.88 chr1 - 1495 7 novel_in_catalog SRSF10 novel 1390 5 NA NA -13 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCTTAAGAGTCCAGTTTG -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.397.89 chr1 - 1184 5 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000374452.9 1194 6 -43 3669 5 -1 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCTTAAGAGTCCAGTTTG 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.397.90 chr1 - 1051 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000492112.3 7656 6 -24 6629 5 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 91 22.319157 1.348678 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCTTAAGAGTCCAGTTTG 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 91 NA PB.397.98 chr1 - 1512 3 full-splice_match SRSF10 ENST00000485292.1 790 3 -28 -694 -3 174 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AGAAAATAATAGCTATATCT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.397.100 chr1 - 820 2 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000343255.9 2917 6 0 9052 0 20 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAGAAAAAATAAAGAAAA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.397.101 chr1 - 441 3 full-splice_match SRSF10 ENST00000485292.1 790 3 4 345 0 20 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAGAAAAAATAAAGAAAA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.400.1 chr1 - 2912 8 novel_not_in_catalog IL22RA1 novel 2817 7 NA NA -40 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CCTGTTGTGATTTTTTTTTT -32 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.400.2 chr1 - 2834 7 full-splice_match IL22RA1 ENST00000270800.2 2817 7 -17 0 -17 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.188451 0.503580 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CCTGTTGTGATTTTTTTTTT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.402.1 chr1 + 2350 3 full-splice_match PNRC2 ENST00000471915.5 380 3 21 -1991 21 -6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAAAATGGTTTTGATTGCT NA FALSE NA NA AATAAA -29 NA NA NA 2 NA PB.402.3 chr1 + 2264 3 full-splice_match PNRC2 ENST00000471915.5 380 3 107 -1991 107 -6 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAAAATGGTTTTGATTGCT 12 TRUE NA NA AATAAA -29 NA NA NA 4 NA PB.402.5 chr1 + 2432 3 novel_not_in_catalog PNRC2 novel 380 3 NA NA 146 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GCTTGGTTTTATTTTAAAAA 51 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 5 NA PB.402.6 chr1 + 2935 3 full-splice_match PNRC2 ENST00000334351.8 2400 3 -541 6 178 -6 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.697920 0.431029 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAAAATGGTTTTGATTGCT 2 TRUE NA NA AATAAA -29 NA NA NA 11 NA PB.402.7 chr1 + 2131 3 full-splice_match PNRC2 ENST00000334351.8 2400 3 -515 784 204 -768 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAGTTTTCTTGGCCTTTAT 28 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.402.8 chr1 + 2401 3 full-splice_match PNRC2 ENST00000334351.8 2400 3 -7 6 -7 -6 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 313 76.768089 1.885181 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAAAATGGTTTTGATTGCT 4 TRUE NA NA AATAAA -29 NA NA NA 313 NA PB.402.13 chr1 + 3313 2 incomplete-splice_match PNRC2 ENST00000471915.5 380 3 719 -1980 0 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGGTTTTATTTTAAAAATGG 11 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 6 NA PB.402.15 chr1 + 1615 3 full-splice_match PNRC2 ENST00000334351.8 2400 3 0 785 0 -769 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 136 33.356102 1.523175 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAAAGTTTTCTTGGCCTTTA 11 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 136 NA PB.402.16 chr1 + 1488 3 full-splice_match PNRC2 ENST00000334351.8 2400 3 0 912 0 670 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTCTAATAGTGCTCTGGCC 11 TRUE NA NA AATACA -28 NA NA NA 9 NA PB.402.18 chr1 + 1347 2 incomplete-splice_match PNRC2 ENST00000334351.8 2400 3 1198 785 1198 -769 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAAAGTTTTCTTGGCCTTTA 1209 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 8 NA PB.402.19 chr1 + 2113 2 incomplete-splice_match PNRC2 ENST00000334351.8 2400 3 1212 5 1212 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.678982 0.565728 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAATGGTTTTGATTGCTT 1223 FALSE NA NA AATAAA -30 NA NA NA 15 NA PB.402.21 chr1 + 2040 2 incomplete-splice_match PNRC2 ENST00000334351.8 2400 3 1284 6 1284 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAAAATGGTTTTGATTGCT 1295 FALSE NA NA AATAAA -29 NA NA NA 7 NA PB.403.1 chr1 - 2564 8 full-splice_match STPG1 ENST00000003583.12 2544 8 -15 -5 -15 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTTTTGGGTACCCCTTAA 15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.403.2 chr1 - 2258 5 incomplete-splice_match STPG1 ENST00000003583.12 2544 8 33901 -5 -1 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTTTTGGGTACCCCTTAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.403.3 chr1 - 2675 9 full-splice_match STPG1 ENST00000337248.9 2726 9 48 3 -9 3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.414778 0.644909 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGAGCTTTTGGGTACCCCTT 21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.403.5 chr1 - 1585 9 full-splice_match STPG1 ENST00000337248.9 2726 9 42 1099 -15 -1093 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTCCTGCCTTTCTCATTTG 15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.404.1 chr1 + 1882 8 novel_not_in_catalog NIPAL3 novel 1757 8 NA NA -22 1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGACTGGCTTCTTTCACTG -19 TRUE NA NA AATAAA -23 NA NA NA 2 NA PB.404.2 chr1 + 912 2 full-splice_match NIPAL3 ENST00000488155.1 931 2 -29 48 -19 -48 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAGGAAAAAAAAAAAAAA -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.404.3 chr1 + 5377 12 full-splice_match NIPAL3 ENST00000374399.9 5372 12 -6 1 -6 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGCTGAGTTCGTGTCTTA -3 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 7 NA PB.404.5 chr1 + 1724 12 full-splice_match NIPAL3 ENST00000374399.9 5372 12 0 3648 0 2950 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 30 7.357964 0.866758 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGGATGCGTTATCTTGGT 3 TRUE NA NA AAAAAG -15 NA NA NA 30 NA PB.404.9 chr1 + 1652 12 novel_not_in_catalog NIPAL3 novel 1676 12 NA NA 0 -9 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAATTAAAAATAAATAAAT 3 TRUE NA NA AAGAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.404.10 chr1 + 1679 12 full-splice_match NIPAL3 ENST00000339255.2 1676 12 -12 9 0 -9 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 38 9.320087 0.969420 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAATTAAAAATAAATAAAT 3 TRUE NA NA AAGAAA -15 NA NA NA 38 NA PB.404.11 chr1 + 1316 11 novel_in_catalog NIPAL3 novel 5372 12 NA NA 0 2892 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TTTTGTTTCTAACTGAGAAC 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.404.12 chr1 + 1329 11 novel_in_catalog NIPAL3 novel 1676 12 NA NA 0 -9 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAATTAAAAATAAATAAAT 3 TRUE NA NA AAGAAA -15 NA NA NA 5 NA PB.404.15 chr1 + 1372 11 incomplete-splice_match NIPAL3 ENST00000374399.9 5372 12 3738 3648 3682 2950 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGGATGCGTTATCTTGGT 3680 FALSE NA NA AAAAAG -15 NA NA NA 2 NA PB.404.16 chr1 + 1327 11 incomplete-splice_match NIPAL3 ENST00000339255.2 1676 12 3726 9 3682 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAATTAAAAATAAATAAAT 3680 FALSE NA NA AAGAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.405.1 chr1 + 2668 5 full-splice_match RCAN3 ENST00000538532.6 2421 5 -34 -213 -34 -6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAACTCAGCATTGTGCCCAT NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.405.3 chr1 + 1542 5 novel_in_catalog RCAN3 novel 6863 5 NA NA 0 -109 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 GTTACTCAGTATACATGAAA -1 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.405.5 chr1 + 1452 5 novel_in_catalog RCAN3 novel 6863 5 NA NA 31 -107 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TACTCAGTATACATGAAATT 4 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.405.6 chr1 + 1482 5 full-splice_match RCAN3 ENST00000374395.9 6863 5 100 5281 39 -102 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGTATACATGAAATTTTTTG 12 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.405.7 chr1 + 2421 4 full-splice_match RCAN3 ENST00000616511.4 2527 4 101 5 101 -5 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACTCAGCATTGTGCCCATT -15 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.405.8 chr1 + 2659 5 full-splice_match RCAN3 ENST00000374395.9 6863 5 177 4027 116 -6 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAACTCAGCATTGTGCCCAT 0 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 8 NA PB.405.9 chr1 + 2500 4 incomplete-splice_match RCAN3 ENST00000538532.6 2421 5 11986 -215 -10 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTCAGCATTGTGCCCATTT 6766 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.405.10 chr1 + 1962 2 incomplete-splice_match RCAN3 ENST00000482807.1 497 3 106 -1158 106 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCATTGTGCCCATTTTTTA NA FALSE NA NA AATAAA -23 NA NA NA 3 NA PB.407.1 chr1 + 1262 4 full-splice_match NCMAP ENST00000374392.3 3980 4 8 2710 8 -2710 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTACCTTTGTCCTTCCT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.408.1 chr1 + 1038 8 novel_in_catalog SRRM1 novel 3735 17 NA NA -69 -17 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAATTCCAAAAAAGAA 83 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.408.4 chr1 + 3786 18 novel_in_catalog SRRM1 novel 3110 18 NA NA 1 -20 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 36 8.829556 0.945939 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAAATTTTGCCACTCTTA -18 TRUE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 36 NA PB.408.5 chr1 + 2379 16 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000479034.5 2671 17 -35 1397 1 690 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAAGCCCCCAGCACCTCC -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.408.6 chr1 + 2171 6 novel_in_catalog SRRM1 novel 3735 17 NA NA 1 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAAGAAAAGGAGAAGGA -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.408.7 chr1 + 1883 14 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 -29 4069 1 -52 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGAGAAGAACGGCTTCAC -18 TRUE NA NA AATACA -28 NA NA NA 2 NA PB.408.8 chr1 + 540 5 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000468822.5 768 7 -2 2463 1 19 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.433716 0.535764 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AGAGAAAAAAGGGAGCGGTC -18 TRUE NA NA GATAAA -28 NA NA NA 14 NA PB.408.9 chr1 + 1467 6 novel_in_catalog SRRM1 novel 673 6 NA NA 0 -17 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAGATAAAAGAGATAAGGA -16 TRUE NA NA AAAAAG -13 NA NA NA 3 NA PB.408.10 chr1 + 2613 7 novel_in_catalog SRRM1 novel 3735 17 NA NA 3 -17 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAATTCCAAAAAAGAA -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.408.13 chr1 + 2528 16 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 -19 1812 -5 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 57 13.980131 1.145511 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAACACAAGAAGGAAAA -8 TRUE NA NA AAAAAG -43 NA NA NA 57 NA PB.408.14 chr1 + 1312 9 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000479034.5 2671 17 -25 16513 -5 -47 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAAAGTCGTGTTTCTG -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.408.15 chr1 + 2311 5 novel_in_catalog SRRM1 novel 673 6 NA NA -2 23 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.660044 0.668390 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAAAGGGAGCGGTCTCGT -5 TRUE NA NA GATAAA -32 NA NA NA 19 NA PB.408.16 chr1 + 2558 4 full-splice_match SRRM1 ENST00000462710.5 2624 4 -5 71 0 -17 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.188451 0.503580 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAGATAAAAGAGATAAGGA -3 TRUE NA NA AAAAAG -13 NA NA NA 13 NA PB.408.17 chr1 + 3855 18 novel_in_catalog SRRM1 novel 3735 17 NA NA 0 -19 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATTTTGCCACTCTTAC 2 TRUE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 4 NA PB.408.18 chr1 + 3732 17 full-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 -9 12 0 -12 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 34 8.339025 0.921115 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TTGCCACTCTTACTTAGTAG 2 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 34 NA PB.408.19 chr1 + 3719 17 novel_in_catalog SRRM1 novel 3735 17 NA NA 0 -19 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.943186 0.468818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATTTTGCCACTCTTAC 2 TRUE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 12 NA PB.408.21 chr1 + 2555 17 full-splice_match SRRM1 ENST00000479034.5 2671 17 -10 126 -1 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 44 10.791680 1.033089 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAACACAAGAAGGAAAA 7 TRUE NA NA AAAAAG -43 NA NA NA 44 NA PB.408.22 chr1 + 2480 3 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000600523.5 575 6 5 -114 0 114 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 GAAGAAAGAAGAAATAAAAC 2 TRUE NA NA AAGAAA -35 NA NA NA 7 NA PB.408.25 chr1 + 947 8 novel_in_catalog SRRM1 novel 3735 17 NA NA 0 -18 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 GAAAAAAATTCCAAAAAAGA 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.408.26 chr1 + 614 6 full-splice_match SRRM1 ENST00000490543.5 673 6 -12 71 0 -17 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAGATAAAAGAGATAAGGA 2 TRUE NA NA AAAAAG -13 NA NA NA 2 NA PB.408.27 chr1 + 2881 6 novel_in_catalog SRRM1 novel 3735 17 NA NA -1 -18 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 GAAAAAAATTCCAAAAAAGA 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.408.29 chr1 + 2187 4 full-splice_match SRRM1 ENST00000466910.5 799 4 26 -1414 -1 115 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAGAAGAAATAAAACA 7 TRUE NA NA AAGAAA -36 NA NA NA 9 NA PB.408.31 chr1 + 811 7 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000479034.5 2671 17 -10 19105 -1 -19 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 77 18.885441 1.276127 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 GGAAAAAAATTCCAAAAAAG 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 77 NA PB.408.33 chr1 + 3754 18 novel_in_catalog SRRM1 novel 3110 18 NA NA 1 -19 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.943186 0.468818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATTTTGCCACTCTTAC 9 TRUE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 12 NA PB.408.34 chr1 + 3625 17 novel_in_catalog SRRM1 novel 3735 17 NA NA 1 -19 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATTTTGCCACTCTTAC 9 TRUE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.408.37 chr1 + 1911 12 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000479034.5 2671 17 -3 8530 0 -3 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAACTCCTGAACATCTTTGA 14 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.408.40 chr1 + 3588 15 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 3364 12 -1868 -12 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TTGCCACTCTTACTTAGTAG 3090 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.408.41 chr1 + 2023 2 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000495561.1 563 3 -1566 1518 -1482 -17 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAGATAAAAGAGATAAGGA 3476 FALSE NA NA AAAAAG -13 NA NA NA 2 NA PB.408.43 chr1 + 1161 2 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000495561.1 563 3 -704 1518 -620 -17 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAGATAAAAGAGATAAGGA 4338 FALSE NA NA AAAAAG -13 NA NA NA 2 NA PB.408.48 chr1 + 3315 14 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 5707 11 391 -11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGCCACTCTTACTTAGTAGT 75 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.408.50 chr1 + 1875 12 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000479034.5 2671 17 6708 1397 28 690 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAAGCCCCCAGCACCTCC 1082 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.408.54 chr1 + 2940 11 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 9157 20 -38 -20 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAAATTTTGCCACTCTTA 3525 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.408.58 chr1 + 2800 11 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 9297 20 102 -20 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAAATTTTGCCACTCTTA 3665 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 3 NA PB.408.60 chr1 + 2545 9 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 11660 18 -49 -18 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATTTTGCCACTCTTACT 75 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 3 NA PB.408.61 chr1 + 2585 10 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000374389.8 3110 18 11664 -636 -48 -19 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATTTTGCCACTCTTAC 76 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 4 NA PB.408.62 chr1 + 2509 9 novel_in_catalog SRRM1 novel 3735 17 NA NA -20 -19 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATTTTGCCACTCTTAC 104 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 4 NA PB.408.66 chr1 + 2343 8 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 17450 19 5698 -19 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATTTTGCCACTCTTAC 4966 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.408.68 chr1 + 2278 8 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000374389.8 3110 18 18070 -636 -5186 -19 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATTTTGCCACTCTTAC 5583 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 8 NA PB.408.69 chr1 + 2128 7 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000374389.8 3110 18 19483 -636 -3773 -19 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATTTTGCCACTCTTAC 6996 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 3 NA PB.408.72 chr1 + 2058 5 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 23518 19 265 -19 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATTTTGCCACTCTTAC NA FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 5 NA PB.408.73 chr1 + 1911 4 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 25862 19 -419 -19 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATTTTGCCACTCTTAC NA FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 4 NA PB.408.74 chr1 + 1723 4 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 26058 11 -223 -11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGCCACTCTTACTTAGTAGT NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 10 NA PB.408.75 chr1 + 1584 4 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 26188 20 -93 -20 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.697920 0.431029 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAAATTTTGCCACTCTTA NA FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 11 NA PB.408.76 chr1 + 1525 4 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 26248 19 -33 -19 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.660044 0.668390 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATTTTGCCACTCTTAC NA FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 19 NA PB.408.77 chr1 + 1428 3 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 26877 19 596 -19 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.924247 0.593756 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATTTTGCCACTCTTAC NA FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 16 NA PB.408.78 chr1 + 1284 2 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 28099 11 1818 -11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 41 10.055883 1.002420 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGCCACTCTTACTTAGTAGT NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 41 NA PB.410.1 chr1 + 2753 6 full-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 -81 1581 -16 -1527 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAGGAAGATGCACTATTCAG 7 TRUE NA NA ATTAAA -23 NA NA NA 3 NA PB.410.2 chr1 + 4314 6 full-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 -65 4 0 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 335 82.163925 1.914681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGTGTTTGAGACTACTA 23 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 335 NA PB.410.3 chr1 + 2318 6 full-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 -65 2000 0 -1946 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAGACAAAAGCAAAACCA 23 TRUE NA NA AATAAA -27 NA NA NA 3 NA PB.410.4 chr1 + 1428 6 full-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 -65 2890 0 1524 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAATATTGTTTCAATTTAGT 23 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.410.5 chr1 + 1736 6 full-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 -15 2532 -15 1882 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 24 5.886371 0.769848 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATCATAGAGCTTGCTATTT 73 FALSE NA NA AAAAAG -14 NA NA NA 24 NA PB.410.7 chr1 + 943 6 full-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 -62 3372 3 1042 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 50 12.263273 1.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAGAGATGTCTTCATGTC 26 TRUE NA NA AGTAAA -12 NA NA NA 50 NA PB.410.8 chr1 + 1896 6 full-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 -3 2360 -3 2054 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACATTTAATGTAGATGACCT -3 TRUE NA NA AGTAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.410.9 chr1 + 4249 6 full-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 0 4 0 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 76 18.640175 1.270450 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGTGTTTGAGACTACTA 0 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 76 NA PB.410.10 chr1 + 4155 6 full-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 94 4 94 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGTGTTTGAGACTACTA 56 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.410.20 chr1 + 4058 5 incomplete-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 52307 4 52307 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.395840 0.732059 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGTGTTTGAGACTACTA NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 22 NA PB.410.24 chr1 + 3789 3 incomplete-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 81607 5 81607 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.433716 0.535764 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAAGTGTTTGAGACTACT NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 14 NA PB.410.25 chr1 + 3605 2 incomplete-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 94485 54 94485 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATAAAGGATTCTTTTTTCCC NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 10 NA PB.412.2 chr1 - 2416 5 full-splice_match RUNX3 ENST00000308873.11 4267 5 309 1542 309 -24 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAACAAA -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.412.4 chr1 - 2084 5 full-splice_match RUNX3 ENST00000308873.11 4267 5 641 1542 641 -24 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAACAAA 639 FALSE NA NA GGGGCT -28 NA NA NA 2 NA PB.412.5 chr1 - 2017 4 incomplete-splice_match RUNX3 ENST00000496967.1 572 5 1086 -1519 1086 -24 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAACAAA -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.414.1 chr1 - 1703 7 full-splice_match SYF2 ENST00000236273.9 1757 7 0 54 0 -54 alternative_3end TRUE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGAGGGAAAGGTTGTTATTT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.414.2 chr1 - 1217 6 full-splice_match SYF2 ENST00000354361.3 926 6 -6 -285 -6 285 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACATTTTTAGTCTATCATTT 3766 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.414.3 chr1 - 1567 6 incomplete-splice_match SYF2 ENST00000236273.9 1757 7 16 406 0 283 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAACATTTTTAGTCTATCAT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.414.4 chr1 - 1358 7 full-splice_match SYF2 ENST00000236273.9 1757 7 -13 412 -13 277 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 243 59.599506 1.775243 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATTTCTAACATTTTTAGTC 3743 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 243 NA PB.414.5 chr1 - 978 4 incomplete-splice_match SYF2 ENST00000354361.3 926 6 4331 -283 4277 283 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAACATTTTTAGTCTATCAT 8103 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.414.6 chr1 - 1212 6 incomplete-splice_match SYF2 ENST00000236273.9 1757 7 370 407 300 282 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CTAACATTTTTAGTCTATCA 4126 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.414.7 chr1 - 1081 5 incomplete-splice_match SYF2 ENST00000236273.9 1757 7 3477 411 3407 278 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.188451 0.503580 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATTTCTAACATTTTTAGTCT 7233 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.414.8 chr1 - 1035 7 full-splice_match SYF2 ENST00000236273.9 1757 7 3 719 3 -30 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 153 37.525616 1.574328 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTTTAAATGTATATGGCTG 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 153 NA PB.414.9 chr1 - 746 4 incomplete-splice_match SYF2 ENST00000354361.3 926 6 4249 31 4195 -31 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TATTTTAAATGTATATGGCT 8021 FALSE NA NA AAAAAG -45 NA NA NA 2 NA PB.414.10 chr1 - 915 7 full-splice_match SYF2 ENST00000236273.9 1757 7 6 836 6 -147 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 94 23.054953 1.362764 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATATCCTTTCATGTATATT 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 94 NA PB.415.1 chr1 + 842 2 antisense novelGene_ENSG00000233755_AS novel NA NA NA NA NA NA multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAATCGAC NA FALSE NA NA AAAACA -10 NA NA NA 2 NA PB.416.1 chr1 - 2940 4 full-splice_match RSRP1 ENST00000498238.1 2941 4 0 1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 72 17.659113 1.246969 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGTCTTTATTGTATATATAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 72 NA PB.416.2 chr1 - 2828 5 novel_in_catalog RSRP1 novel 2941 4 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGTCTTTATTGTATATATAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.416.4 chr1 - 2164 6 novel_in_catalog RSRP1 novel 1425 5 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGTCTTTATTGTATATATAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.416.5 chr1 - 2015 5 full-splice_match RSRP1 ENST00000568254.5 2013 5 3 -5 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGTCTTTATTGTATATATAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.416.6 chr1 - 1625 7 novel_not_in_catalog RSRP1 novel 1425 5 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGTCTTTATTGTATATATAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.416.7 chr1 - 1675 2 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000566395.5 824 5 1767 -5 440 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGTCTTTATTGTATATATAT 2720 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.416.8 chr1 - 1507 2 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000566395.5 824 5 1935 -5 -495 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGTCTTTATTGTATATATAT 2888 FALSE NA NA AATAGA -28 NA NA NA 4 NA PB.416.9 chr1 - 1312 6 novel_in_catalog RSRP1 novel 1425 5 NA NA 0 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGTCTTTATTGTATATATAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.416.11 chr1 - 1403 2 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000566395.5 824 5 2039 -5 -391 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGTCTTTATTGTATATATAT 2992 FALSE NA NA GATAAA -22 NA NA NA 6 NA PB.416.12 chr1 - 1345 4 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000243189.12 1425 5 358 1 350 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGTCTTTATTGTATATATAT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.416.13 chr1 - 1325 5 full-splice_match RSRP1 ENST00000566395.5 824 5 -496 -5 -391 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGTCTTTATTGTATATATAT 457 FALSE NA NA AAAACA -28 NA NA NA 2 NA PB.416.14 chr1 - 1232 2 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000566395.5 824 5 2210 -5 -220 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGTCTTTATTGTATATATAT 3163 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.416.15 chr1 - 980 2 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000566395.5 824 5 2456 1 26 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTCTTAGTCTTTATTGTAT 3409 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.416.16 chr1 - 2059 6 novel_in_catalog RSRP1 novel 3034 6 NA NA 0 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAGTCTTTATTGTATATATA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.416.17 chr1 - 1468 6 novel_in_catalog RSRP1 novel 1425 5 NA NA 0 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.943186 0.468818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAGTCTTTATTGTATATATA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.416.18 chr1 - 1356 7 novel_in_catalog RSRP1 novel 1425 5 NA NA 0 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAGTCTTTATTGTATATATA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.416.19 chr1 - 1423 5 full-splice_match RSRP1 ENST00000243189.12 1425 5 0 2 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 69 16.923317 1.228485 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAGTCTTTATTGTATATATA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 69 NA PB.416.20 chr1 - 1094 2 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000566395.5 824 5 2347 -4 -83 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAGTCTTTATTGTATATATA 3300 FALSE NA NA AATATA -5 NA NA NA 5 NA PB.416.21 chr1 - 713 2 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000566395.5 824 5 2728 -4 -153 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAGTCTTTATTGTATATATA 3681 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.416.22 chr1 - 2285 5 novel_in_catalog RSRP1 novel 1425 5 NA NA 0 1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 36 8.829556 0.945939 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TCTTAGTCTTTATTGTATAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 36 NA PB.416.23 chr1 - 2395 5 novel_not_in_catalog RSRP1 novel 2941 4 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTCTTAGTCTTTATTGTAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.416.24 chr1 - 2413 3 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000498238.1 2941 4 800 7 -14 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTCTTAGTCTTTATTGTAT 834 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.416.26 chr1 - 2346 3 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000498238.1 2941 4 867 7 40 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTCTTAGTCTTTATTGTAT 901 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.416.27 chr1 - 2171 6 novel_in_catalog RSRP1 novel 3034 6 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTCTTAGTCTTTATTGTAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.416.28 chr1 - 1884 6 novel_in_catalog RSRP1 novel 3034 6 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTCTTAGTCTTTATTGTAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.416.30 chr1 - 1823 2 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000566395.5 824 5 1613 1 286 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTCTTAGTCTTTATTGTAT 2566 FALSE NA NA AATAAA -6 NA NA NA 2 NA PB.416.34 chr1 - 1962 3 full-splice_match RSRP1 ENST00000431849.3 1954 3 -8 0 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.678982 0.565728 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAAAAAATGCTGTAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.416.35 chr1 - 1311 4 novel_in_catalog RSRP1 novel 2941 4 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.678982 0.565728 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAAAAAATGCTGTAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.416.36 chr1 - 1296 2 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000431849.3 1954 3 937 0 26 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAAAAAATGCTGTAT 979 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.416.37 chr1 - 1082 5 novel_in_catalog RSRP1 novel 3034 6 NA NA 0 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAAAAAATGCTGTAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.416.38 chr1 - 1082 4 novel_in_catalog RSRP1 novel 2941 4 NA NA 0 -229 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AGCAAAGGTACACGTTGTAA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.419.1 chr1 + 1205 1 full-splice_match ENSG00000272432 ENST00000607698.1 485 1 -712 -8 -712 8 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA NA NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATTGTGGGTTAATTGCC NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.420.1 chr1 - 1804 2 fusion ENSG00000259984_SDHDP6 novel 459 2 NA NA -386 415 multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AGAAAATTAGACAGTGTTTA 506 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.420.2 chr1 - 3262 2 full-splice_match RSRP1 ENST00000568399.1 629 2 -984 -1649 -4 1649 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATCATTGTTATTGTTTTT 140 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.421.1 chr1 + 1297 7 full-splice_match TMEM50A ENST00000374358.5 2266 7 -425 1394 -408 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAATAAAAAGAAATTACA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.421.2 chr1 + 1061 7 full-splice_match TMEM50A ENST00000374358.5 2266 7 -20 1225 -3 -129 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 712 174.628998 2.242116 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATATTCCGTGGTCAAAA -8 TRUE NA NA TATAAA -16 NA NA NA 712 NA PB.421.3 chr1 + 2286 7 full-splice_match TMEM50A ENST00000374358.5 2266 7 -22 2 -5 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 190 46.600437 1.668390 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGTTTTTAGTCTTTAATTT -10 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 190 NA PB.421.4 chr1 + 2173 6 full-splice_match TMEM50A ENST00000498135.5 776 6 -5 -1392 -5 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGTTTTTAGTCTTTAATTT -10 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 7 NA PB.421.5 chr1 + 850 7 full-splice_match TMEM50A ENST00000374358.5 2266 7 -20 1436 -3 -42 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ACATGAATAATTTTTGTCAA -8 TRUE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 4 NA PB.421.6 chr1 + 2186 6 full-splice_match TMEM50A ENST00000480937.5 1102 6 -5 -1079 1 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAGTTTTTAGTCTTTAATT -4 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 5 NA PB.421.7 chr1 + 1413 7 full-splice_match TMEM50A ENST00000374358.5 2266 7 0 853 0 229 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.943186 0.468818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CATTTCATCTGTGTACTGAA 12 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 12 NA PB.421.8 chr1 + 1179 7 novel_not_in_catalog TMEM50A novel 2266 7 NA NA 1 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGTTTTTAGTCTTTAATTT -4 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.421.9 chr1 + 964 6 full-splice_match TMEM50A ENST00000480937.5 1102 6 -5 143 1 -129 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATATTCCGTGGTCAAAA -4 TRUE NA NA TATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.421.10 chr1 + 795 6 full-splice_match TMEM50A ENST00000480937.5 1102 6 -5 312 1 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAATAAAAAGAAATTACA -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.421.11 chr1 + 775 6 full-splice_match TMEM50A ENST00000498135.5 776 6 1 0 1 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.660044 0.668390 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAATAAAAAGAAATTACA -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.421.12 chr1 + 925 6 full-splice_match TMEM50A ENST00000498135.5 776 6 20 -169 3 -129 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATATTCCGTGGTCAAAA 15 TRUE NA NA TATAAA -16 NA NA NA 4 NA PB.421.13 chr1 + 2173 7 full-splice_match TMEM50A ENST00000374358.5 2266 7 90 3 -36 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAGTTTTTAGTCTTTAATT 44 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.421.14 chr1 + 2512 7 novel_in_catalog TMEM50A novel 2266 7 NA NA -13 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGTTTTTAGTCTTTAATTT 67 FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.421.15 chr1 + 1101 7 novel_in_catalog TMEM50A novel 799 6 NA NA 6 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.943186 0.468818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAATAAAAAGAAATTACA 86 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.421.16 chr1 + 945 7 novel_in_catalog TMEM50A novel 799 6 NA NA 161 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 TAAAAATAAAAAGAAATTAC 241 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.421.17 chr1 + 749 6 incomplete-splice_match TMEM50A ENST00000374358.5 2266 7 2140 1394 2014 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.943186 0.468818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAATAAAAAGAAATTACA 2094 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.421.18 chr1 + 855 6 incomplete-splice_match TMEM50A ENST00000374358.5 2266 7 2202 1226 -2056 -130 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TAAAATATTCCGTGGTCAAA -2 TRUE NA NA TATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.421.19 chr1 + 2022 5 incomplete-splice_match TMEM50A ENST00000374358.5 2266 7 4640 2 382 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGTTTTTAGTCTTTAATTT 2436 FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 5 NA PB.421.20 chr1 + 1879 4 incomplete-splice_match TMEM50A ENST00000374358.5 2266 7 13334 3 9076 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.188451 0.503580 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAGTTTTTAGTCTTTAATT NA FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 13 NA PB.421.21 chr1 + 1763 2 incomplete-splice_match TMEM50A ENST00000374358.5 2266 7 18457 2 14199 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGTTTTTAGTCTTTAATTT NA FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.422.2 chr1 + 963 6 incomplete-splice_match MACO1 ENST00000647928.1 2887 11 -107 40775 -5 -328 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.697920 0.431029 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AACAAAAAACTCTCCACAAC 515 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.422.3 chr1 + 2532 11 full-splice_match MACO1 ENST00000374343.5 3940 11 3 1405 3 -426 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.697920 0.431029 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AACCCTTTATGTTTGTTTTG -2 TRUE NA NA AAAAAG -18 NA NA NA 11 NA PB.422.4 chr1 + 2294 11 full-splice_match MACO1 ENST00000374343.5 3940 11 -3 1649 -3 -670 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATTTTGTGGAACTGTATCT -8 TRUE NA NA GATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.422.6 chr1 + 1546 8 incomplete-splice_match MACO1 ENST00000374343.5 3940 11 68 14498 5 -13519 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 GAAACAGTTAATGGAAGAGA -1 TRUE NA NA AAAAAG -36 NA NA NA 5 NA PB.422.7 chr1 + 867 6 incomplete-splice_match MACO1 ENST00000647928.1 2887 11 78 40686 78 -239 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AATAAATAACAACAATATTC 6 TRUE NA NA AAAAAG -41 NA NA NA 8 NA PB.422.8 chr1 + 2257 11 full-splice_match MACO1 ENST00000374343.5 3940 11 198 1485 135 -506 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TTCAAGTAGCCAACTTTGCC 63 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.422.10 chr1 + 1158 6 incomplete-splice_match MACO1 ENST00000374343.5 3940 11 17952 14489 -44 -13510 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AATGGAAGAGAAAAAGAGGA NA FALSE NA NA AAAAAG -45 NA NA NA 2 NA PB.422.12 chr1 + 972 4 incomplete-splice_match MACO1 ENST00000374343.5 3940 11 25732 14489 7736 -13510 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AATGGAAGAGAAAAAGAGGA NA FALSE NA NA AAAAAG -45 NA NA NA 2 NA PB.422.13 chr1 + 1553 6 incomplete-splice_match MACO1 ENST00000374343.5 3940 11 27545 1482 9549 -503 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGTAGCCAACTTTGCCTTT NA FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.422.14 chr1 + 1368 6 incomplete-splice_match MACO1 ENST00000374343.5 3940 11 27730 1482 9734 -503 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGTAGCCAACTTTGCCTTT NA FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.422.15 chr1 + 1215 6 incomplete-splice_match MACO1 ENST00000374343.5 3940 11 27883 1482 9887 -503 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGTAGCCAACTTTGCCTTT NA FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 5 NA PB.422.16 chr1 + 994 5 incomplete-splice_match MACO1 ENST00000647928.1 2887 11 53268 499 35335 -499 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCCAACTTTGCCTTTTATG NA FALSE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 7 NA PB.422.17 chr1 + 1559 4 incomplete-splice_match MACO1 ENST00000647928.1 2887 11 54752 -212 36819 212 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TTTTTTTTTTTGTTTTGTTT NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.422.18 chr1 + 2153 3 incomplete-splice_match MACO1 ENST00000374343.5 3940 11 58361 4 40365 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAACTAGTTTTCTGCCTTT 82 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 4 NA PB.423.1 chr1 + 1137 9 fusion ENSG00000225643_LDLRAP1 novel 2914 9 NA NA -32 42 multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGGACAGGGGTTGAGTCTG NA FALSE NA NA CATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.423.2 chr1 + 2674 7 novel_in_catalog LDLRAP1 novel 2914 9 NA NA -18 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGCAACGCTCATCAGGTGG 3 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.423.3 chr1 + 4552 8 incomplete-splice_match LDLRAP1 ENST00000374338.5 2914 9 0 2 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGCAACGCTCATCAGGTGG -29 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.423.4 chr1 + 2912 9 full-splice_match LDLRAP1 ENST00000374338.5 2914 9 0 2 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 104 25.507608 1.406670 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGCAACGCTCATCAGGTGG -29 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 104 NA PB.423.7 chr1 + 1294 8 fusion ENSG00000225643_LDLRAP1 novel 2914 9 NA NA 7 273 multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAACAGGAAGTATTTCTGCA -22 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.423.8 chr1 + 2865 9 full-splice_match LDLRAP1 ENST00000374338.5 2914 9 58 -9 58 9 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATCAGGTGGAGTAGACTGGC 29 TRUE NA NA AATAAA -31 NA NA NA 2 NA PB.423.9 chr1 + 3168 9 novel_not_in_catalog LDLRAP1 novel 4670 7 NA NA 299 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGCAACGCTCATCAGGTGG 270 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.423.10 chr1 + 2632 7 novel_in_catalog LDLRAP1 novel 657 4 NA NA -83 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CAAGCAACGCTCATCAGGTG -6 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.423.11 chr1 + 2884 9 novel_in_catalog LDLRAP1 novel 4670 7 NA NA -78 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGCAACGCTCATCAGGTGG -1 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 5 NA PB.423.12 chr1 + 2840 9 novel_not_in_catalog LDLRAP1 novel 4670 7 NA NA -78 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGCAACGCTCATCAGGTGG -1 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.423.16 chr1 + 2608 8 incomplete-splice_match LDLRAP1 ENST00000374338.5 2914 9 10443 -2 685 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACGCTCATCAGGTGGAGTA 4128 FALSE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 2 NA PB.423.17 chr1 + 2447 6 incomplete-splice_match LDLRAP1 ENST00000374338.5 2914 9 13575 2 2300 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGCAACGCTCATCAGGTGG 200 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.423.18 chr1 + 2251 4 full-splice_match LDLRAP1 ENST00000484476.5 657 4 290 -1884 290 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGCAACGCTCATCAGGTGG 298 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.423.19 chr1 + 2121 3 incomplete-splice_match LDLRAP1 ENST00000484476.5 657 4 927 -1884 109 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGCAACGCTCATCAGGTGG 84 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.424.1 chr1 + 1244 4 incomplete-splice_match MAN1C1 ENST00000475314.5 893 5 560 -465 560 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AATAAGAAATATGATTGGGC 6714 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.425.1 chr1 + 4145 12 full-splice_match SELENON ENST00000374315.1 4212 12 65 2 27 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACTAGAGTGGTTCTAAGTG 53 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.425.2 chr1 + 3975 11 incomplete-splice_match SELENON ENST00000374315.1 4212 12 864 2 826 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACTAGAGTGGTTCTAAGTG 852 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.425.3 chr1 + 3216 6 incomplete-splice_match SELENON ENST00000361547.7 4314 13 11308 3 11270 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAACTAGAGTGGTTCTAAGT 2846 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 6 NA PB.425.4 chr1 + 3099 5 incomplete-splice_match SELENON ENST00000361547.7 4314 13 11580 3 11542 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAACTAGAGTGGTTCTAAGT 3118 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 3 NA PB.425.5 chr1 + 2799 3 incomplete-splice_match SELENON ENST00000361547.7 4314 13 13776 2 13738 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACTAGAGTGGTTCTAAGTG 5314 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.425.6 chr1 + 2754 2 incomplete-splice_match SELENON ENST00000361547.7 4314 13 13904 2 13866 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACTAGAGTGGTTCTAAGTG 5442 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.426.1 chr1 - 1676 11 novel_in_catalog RHCE novel 1810 12 NA NA -3 2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GATGATGCTATCAATATTTT -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.428.3 chr1 - 2114 3 full-splice_match AUNIP ENST00000374298.4 2161 3 47 0 47 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 32 7.848495 0.894786 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GCTCTTGTGATAATTGGTAA -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 32 NA PB.428.7 chr1 - 1306 3 full-splice_match AUNIP ENST00000374298.4 2161 3 34 821 34 -821 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 33 8.093760 0.908150 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGACAGTGGGATTGGCATC -15 TRUE NA NA GGGGCT -2 NA NA NA 33 NA PB.429.1 chr1 - 2168 5 full-splice_match STMN1 ENST00000426559.6 948 5 47 -1267 0 8 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGTTGCCATGTCAATTTTTA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.429.3 chr1 - 1509 5 full-splice_match STMN1 ENST00000455785.7 1443 5 -68 2 -21 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 645 158.196213 2.199196 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AACTCCTGTGAAATGACTAA 518 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 645 NA PB.429.5 chr1 - 1375 5 novel_not_in_catalog STMN1 novel 1443 5 NA NA 0 7 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 GAAATGACTAAAGGGAACCT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.429.6 chr1 - 1594 5 full-splice_match STMN1 ENST00000399728.5 1712 5 118 0 118 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AACTCCTGTGAAATGACTAA 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.429.7 chr1 - 1998 2 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 2607 -620 1292 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGCAACTCCTGTGAAATGAC 4484 FALSE NA NA AAAACA -22 NA NA NA 2 NA PB.429.8 chr1 - 1595 5 novel_not_in_catalog STMN1 novel 1712 5 NA NA 30 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGCAACTCCTGTGAAATGAC 882 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.429.9 chr1 - 1382 4 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 415 -620 415 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.660044 0.668390 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGCAACTCCTGTGAAATGAC 2292 FALSE NA NA AAAACA -4 NA NA NA 19 NA PB.429.10 chr1 - 997 2 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 3608 -620 2293 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 31 7.603229 0.880998 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGCAACTCCTGTGAAATGAC 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 31 NA PB.429.12 chr1 - 1196 3 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 1450 -619 135 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 27 6.622167 0.821000 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAGCAACTCCTGTGAAATGA 3327 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 27 NA PB.429.13 chr1 - 3415 4 full-splice_match STMN1 ENST00000465604.1 2947 4 -24 -444 -22 -6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGTAGCAACTCCTGTGAAAT 5 TRUE NA NA GGGGCT -7 NA NA NA 4 NA PB.429.14 chr1 - 1294 5 full-splice_match STMN1 ENST00000455785.7 1443 5 0 149 0 -147 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 44 10.791680 1.033089 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AGAGAACAGTTGAGAGAGAA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 44 NA PB.429.15 chr1 - 1102 5 full-splice_match STMN1 ENST00000455785.7 1443 5 0 341 0 111 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 39 9.565352 0.980701 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATGACCGCACGTTCTCTG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 39 NA PB.429.17 chr1 - 1312 5 novel_in_catalog STMN1 novel 1443 5 NA NA 4 10 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTTCTTTTGAGTTAGGTTA -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.429.18 chr1 - 1050 5 full-splice_match STMN1 ENST00000455785.7 1443 5 -60 453 -13 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5514 1352.393677 3.131103 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGGTGGCAGTGACTTCTTTT 526 FALSE NA NA GGGGCT -45 NA NA NA 5514 NA PB.429.19 chr1 - 2236 2 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 1931 -182 616 9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GACTTCTTTTGAGTTAGGTT 3808 FALSE NA NA TTTAAA -29 NA NA NA 2 NA PB.429.20 chr1 - 969 4 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 387 -179 387 6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 85 20.847565 1.319055 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTGACTTCTTTTGAGTTAG -6 TRUE NA NA AAAACA -32 NA NA NA 85 NA PB.429.21 chr1 - 568 2 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 3596 -179 2281 6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.943186 0.468818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTGACTTCTTTTGAGTTAG 5473 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.429.22 chr1 - 2045 2 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 2118 -178 803 5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAGTGACTTCTTTTGAGTTA 3995 FALSE NA NA AATGAA -22 NA NA NA 2 NA PB.429.23 chr1 - 1142 5 novel_not_in_catalog STMN1 novel 1712 5 NA NA 108 2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGGCAGTGACTTCTTTTGAG -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.429.24 chr1 - 984 5 novel_not_in_catalog STMN1 novel 1443 5 NA NA 0 1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GTGGCAGTGACTTCTTTTGA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.429.25 chr1 - 1640 2 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 2518 -173 1203 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGTGGCAGTGACTTCTTTTG 4395 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.429.26 chr1 - 1351 2 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 2807 -173 1492 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGTGGCAGTGACTTCTTTTG 4684 FALSE NA NA AAGAAA -22 NA NA NA 5 NA PB.429.27 chr1 - 1154 5 full-splice_match STMN1 ENST00000399728.5 1712 5 108 450 108 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 29 7.112698 0.852034 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGTGGCAGTGACTTCTTTTG -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 29 NA PB.429.28 chr1 - 961 5 novel_not_in_catalog STMN1 novel 1443 5 NA NA 2 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGTGGCAGTGACTTCTTTTG 0 TRUE NA NA GGGGCT -30 NA NA NA 3 NA PB.429.29 chr1 - 886 3 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 1314 -173 -1 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 64 15.696989 1.195816 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGTGGCAGTGACTTCTTTTG 3191 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 64 NA PB.429.30 chr1 - 632 2 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 3526 -173 2211 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.697920 0.431029 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGTGGCAGTGACTTCTTTTG 18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.429.31 chr1 - 2948 4 full-splice_match STMN1 ENST00000465604.1 2947 4 -2 1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.943186 0.468818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGGTGGCAGTGACTTCTTTT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.429.32 chr1 - 1300 5 full-splice_match STMN1 ENST00000399728.5 1712 5 -39 451 -39 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGGTGGCAGTGACTTCTTTT 813 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.429.33 chr1 - 1069 5 novel_not_in_catalog STMN1 novel 1712 5 NA NA 108 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.188451 0.503580 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGGTGGCAGTGACTTCTTTT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.429.34 chr1 - 998 2 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 3159 -172 1844 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGGTGGCAGTGACTTCTTTT 5036 FALSE NA NA AATAAA -5 NA NA NA 2 NA PB.429.35 chr1 - 3349 3 novel_in_catalog STMN1 novel 1443 5 NA NA 0 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTTGGTGGCAGTGACTTCTT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.429.36 chr1 - 1912 2 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 2242 -169 927 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTTGGTGGCAGTGACTTCT 4119 FALSE NA NA TTTAAA -31 NA NA NA 2 NA PB.429.37 chr1 - 1802 2 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 2352 -169 1037 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTTGGTGGCAGTGACTTCT 4229 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.429.38 chr1 - 860 5 full-splice_match STMN1 ENST00000455785.7 1443 5 0 583 0 42 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.697920 0.431029 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAGAGTATGTAGTGGCTT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.429.39 chr1 - 598 5 full-splice_match STMN1 ENST00000455785.7 1443 5 0 845 0 -220 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTGGCCAGTGTCATTTTAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.430.2 chr1 + 1974 7 full-splice_match MTFR1L ENST00000374303.7 1953 7 -18 -3 -3 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 219 53.713135 1.730080 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTGCTGTGTCCATCTCTT -35 TRUE NA NA ATTAAA -24 NA NA NA 219 NA PB.430.3 chr1 + 2052 8 novel_in_catalog MTFR1L novel 1953 7 NA NA 4 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTGCTGTGTCCATCTCTT -27 TRUE NA NA ATTAAA -24 NA NA NA 8 NA PB.430.4 chr1 + 2467 6 novel_in_catalog MTFR1L novel 1953 7 NA NA -1 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCATTTGCTGTGTCCAT -18 TRUE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.430.5 chr1 + 1842 6 novel_in_catalog MTFR1L novel 1953 7 NA NA -1 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCATTTGCTGTGTCCAT -18 TRUE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 4 NA PB.430.6 chr1 + 1919 7 novel_not_in_catalog MTFR1L novel 1953 7 NA NA 1 1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAATGCATTTGCTGTGTCCA -15 TRUE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.430.7 chr1 + 1190 7 full-splice_match MTFR1L ENST00000474295.5 1873 7 27 656 1 -48 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAGAGAAGTTGTTTCTGG -15 TRUE NA NA AATGAA -20 NA NA NA 6 NA PB.430.8 chr1 + 1910 7 full-splice_match MTFR1L ENST00000374307.9 1868 7 -44 2 4 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.169513 0.620085 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCATTTGCTGTGTCCAT -12 TRUE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 17 NA PB.430.9 chr1 + 1292 7 full-splice_match MTFR1L ENST00000374303.7 1953 7 9 652 8 -48 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 27 6.622167 0.821000 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAGAGAAGTTGTTTCTGG -8 TRUE NA NA AATGAA -20 NA NA NA 27 NA PB.430.10 chr1 + 1810 7 full-splice_match MTFR1L ENST00000474295.5 1873 7 57 6 0 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 36 8.829556 0.945939 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCATTTGCTGTGTCCAT 15 TRUE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 36 NA PB.430.11 chr1 + 1946 7 novel_in_catalog MTFR1L novel 1953 7 NA NA 1 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTGCTGTGTCCATCTCTT 16 TRUE NA NA ATTAAA -24 NA NA NA 4 NA PB.430.12 chr1 + 1956 7 novel_in_catalog MTFR1L novel 2053 7 NA NA 13 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCATTTGCTGTGTCCAT 0 TRUE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 5 NA PB.430.13 chr1 + 1626 5 incomplete-splice_match MTFR1L ENST00000466284.1 3262 6 2151 0 678 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCATTTGCTGTGTCCAT 2809 FALSE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.430.14 chr1 + 1725 5 incomplete-splice_match MTFR1L ENST00000374300.7 2053 7 2856 2 688 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCATTTGCTGTGTCCAT 2819 FALSE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 5 NA PB.430.15 chr1 + 1550 3 full-splice_match MTFR1L ENST00000497956.1 2531 3 980 1 980 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAGAATGCATTTGCTGTGTC 5747 FALSE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.430.16 chr1 + 1394 3 full-splice_match MTFR1L ENST00000497956.1 2531 3 1139 -2 1139 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCATTTGCTGTGTCCAT 5906 FALSE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 6 NA PB.430.17 chr1 + 1303 2 incomplete-splice_match MTFR1L ENST00000497956.1 2531 3 3912 -2 3912 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCATTTGCTGTGTCCAT 8679 FALSE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 4 NA PB.430.18 chr1 + 1088 2 incomplete-splice_match MTFR1L ENST00000497956.1 2531 3 4127 -2 4127 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.697920 0.431029 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCATTTGCTGTGTCCAT 8894 FALSE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 11 NA PB.431.8 chr1 - 1627 10 incomplete-splice_match PAFAH2 ENST00000374284.5 2523 11 7296 703 -6639 -703 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGCCGTGATCACATTTTCTA 7385 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.432.1 chr1 + 4003 11 full-splice_match EXTL1 ENST00000374280.4 4020 11 0 17 0 -17 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACGCTCCAGGCTATAAATAC -2 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.432.3 chr1 + 3252 11 full-splice_match EXTL1 ENST00000374280.4 4020 11 750 18 -664 -18 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 CACGCTCCAGGCTATAAATA 7 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.432.4 chr1 + 2079 8 incomplete-splice_match EXTL1 ENST00000374280.4 4020 11 8772 17 -1583 -17 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACGCTCCAGGCTATAAATAC 8029 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.432.5 chr1 + 1585 3 incomplete-splice_match EXTL1 ENST00000374280.4 4020 11 11949 17 1594 -17 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACGCTCCAGGCTATAAATAC NA FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.433.1 chr1 + 4154 3 full-splice_match PDIK1L ENST00000374269.2 4113 3 -66 25 -66 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AACAAAAAAAAAACTGAAAA 552 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 2 NA PB.433.3 chr1 + 3798 2 novel_in_catalog PDIK1L novel 4113 3 NA NA -12 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AACAAAAAAAAAACTGAAAA -18 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 3 NA PB.433.6 chr1 + 4088 3 full-splice_match PDIK1L ENST00000374269.2 4113 3 0 25 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 46 11.282211 1.052394 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AACAAAAAAAAAACTGAAAA -6 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 46 NA PB.433.8 chr1 + 3881 2 incomplete-splice_match PDIK1L ENST00000374271.8 4279 4 2570 13 2570 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AACAAAAAAAAAACTGAAAA 2577 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 2 NA PB.433.9 chr1 + 3745 2 incomplete-splice_match PDIK1L ENST00000374271.8 4279 4 2706 13 2706 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AACAAAAAAAAAACTGAAAA 2713 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 2 NA PB.434.1 chr1 + 630 3 full-splice_match ZNF593 ENST00000374266.7 638 3 0 8 0 -8 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGAGAACTTGCCTCCAAC -21 TRUE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 7 NA PB.435.1 chr1 + 2582 21 full-splice_match CNKSR1 ENST00000374253.9 2538 21 -49 5 -24 -3 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGAATGAGTCTACATGTAA 7486 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.435.2 chr1 + 2523 21 full-splice_match CNKSR1 ENST00000361530.11 2535 21 7 5 -5 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.697920 0.431029 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGAATGAGTCTACATGTAA -11 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 11 NA PB.435.3 chr1 + 2472 21 novel_not_in_catalog CNKSR1 novel 2535 21 NA NA -5 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGAATGAGTCTACATGTAA -11 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 5 NA PB.435.4 chr1 + 1716 13 incomplete-splice_match CNKSR1 ENST00000531191.5 2673 20 3564 -32 528 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TAAGAATGAGTCTACATGTA 1699 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.435.5 chr1 + 1136 7 incomplete-splice_match CNKSR1 ENST00000531191.5 2673 20 7029 -33 -96 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGAATGAGTCTACATGTAA 5164 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.436.2 chr1 + 3926 14 full-splice_match CEP85 ENST00000451429.8 3934 14 7 1 5 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 55 13.489600 1.129999 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CTCCTCAGTTTTCCATACCC -3 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 55 NA PB.436.4 chr1 + 1487 8 incomplete-splice_match CEP85 ENST00000252992.8 3935 14 9 10302 9 -3887 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AATAATTTGAAAAAGAAATG 1 TRUE NA NA GATAAA -7 NA NA NA 9 NA PB.436.6 chr1 + 3686 12 incomplete-splice_match CEP85 ENST00000252992.8 3935 14 10020 7 10020 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAGACTCCTCAGTTTTCC 10012 FALSE NA NA AATAAA -8 NA NA NA 2 NA PB.436.7 chr1 + 1258 6 incomplete-splice_match CEP85 ENST00000252992.8 3935 14 10025 10293 10025 -3878 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAAGAAATGCCAGAAGGA 10017 FALSE NA NA GATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.436.8 chr1 + 3428 11 incomplete-splice_match CEP85 ENST00000252992.8 3935 14 21137 0 761 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCCTCAGTTTTCCATACCCT 52 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.436.9 chr1 + 2972 11 incomplete-splice_match CEP85 ENST00000451429.8 3934 14 21592 0 1214 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCCTCAGTTTTCCATACCCT 505 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.436.10 chr1 + 2792 10 incomplete-splice_match CEP85 ENST00000252992.8 3935 14 23502 2 31 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTCCTCAGTTTTCCATACC 2417 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 3 NA PB.436.11 chr1 + 2734 9 incomplete-splice_match CEP85 ENST00000453146.1 2821 10 500 -1 500 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCCTCAGTTTTCCATACCCT 2886 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.436.12 chr1 + 2585 8 incomplete-splice_match CEP85 ENST00000453146.1 2821 10 2005 -1 2005 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCCTCAGTTTTCCATACCCT 4391 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.436.13 chr1 + 2480 8 incomplete-splice_match CEP85 ENST00000453146.1 2821 10 2108 1 2108 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTCCTCAGTTTTCCATACC 4494 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 6 NA PB.436.15 chr1 + 2370 7 incomplete-splice_match CEP85 ENST00000453146.1 2821 10 10900 -1 -717 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCCTCAGTTTTCCATACCCT NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 5 NA PB.436.16 chr1 + 2185 6 incomplete-splice_match CEP85 ENST00000453146.1 2821 10 11909 -1 292 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCCTCAGTTTTCCATACCCT 308 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 7 NA PB.436.17 chr1 + 2080 5 incomplete-splice_match CEP85 ENST00000453146.1 2821 10 13344 68 -11 -68 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATGAATCTTTGTTATGTCCA 1743 FALSE NA NA CATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.436.18 chr1 + 1962 3 incomplete-splice_match CEP85 ENST00000469609.5 2384 7 5715 6 3540 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAGACTCCTCAGTTTTCC 5731 FALSE NA NA AATAAA -8 NA NA NA 2 NA PB.436.19 chr1 + 1882 2 incomplete-splice_match CEP85 ENST00000453146.1 2821 10 18879 -1 5087 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCCTCAGTTTTCCATACCCT 13 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 5 NA PB.436.20 chr1 + 1750 2 incomplete-splice_match CEP85 ENST00000453146.1 2821 10 19011 -1 5219 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCCTCAGTTTTCCATACCCT 145 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 9 NA PB.437.1 chr1 - 1764 9 full-splice_match TRIM63 ENST00000374272.4 1770 9 0 6 0 -6 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGGAGCCGGGGTTTCATT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.438.3 chr1 - 2542 13 full-splice_match UBXN11 ENST00000475591.5 2542 13 -2 2 -2 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AACCCGCTGCTCCGCCAGGC -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.438.6 chr1 - 2413 12 novel_in_catalog UBXN11 novel 2542 13 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AACCCGCTGCTCCGCCAGGC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.438.7 chr1 - 2417 11 novel_in_catalog UBXN11 novel 1944 15 NA NA -3 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AACCCGCTGCTCCGCCAGGC -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.438.13 chr1 - 1571 14 full-splice_match UBXN11 ENST00000357089.8 1555 14 -16 0 -3 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AACCCGCTGCTCCGCCAGGC -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.438.17 chr1 - 1436 12 novel_in_catalog UBXN11 novel 1944 15 NA NA -3 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AACCCGCTGCTCCGCCAGGC -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.438.22 chr1 - 1327 11 incomplete-splice_match UBXN11 ENST00000357089.8 1555 14 8622 0 16 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AACCCGCTGCTCCGCCAGGC 9054 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.438.23 chr1 - 1203 9 novel_in_catalog UBXN11 novel 1944 15 NA NA -3 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AACCCGCTGCTCCGCCAGGC -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.438.27 chr1 - 1668 15 full-splice_match UBXN11 ENST00000374222.6 1660 15 -13 5 -4 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CTCAACCCGCTGCTCCGCCA -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.439.1 chr1 + 941 3 full-splice_match SH3BGRL3 ENST00000270792.10 751 3 -191 1 -191 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTGTGTCTGGTTGGTTGTG 133 FALSE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.439.2 chr1 + 783 3 full-splice_match SH3BGRL3 ENST00000270792.10 751 3 -33 1 -33 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 509 124.840118 2.096354 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTGTGTCTGGTTGGTTGTG -2 TRUE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 509 NA PB.439.3 chr1 + 896 2 full-splice_match SH3BGRL3 ENST00000319041.6 768 2 -57 -71 -21 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.924247 0.593756 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTGTGTCTGGTTGGTTGTG -18 TRUE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 16 NA PB.440.3 chr1 + 2223 5 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3458 5 NA NA -42 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACTGTCATCCCCTTGTCA 5 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.440.4 chr1 + 3382 5 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3458 5 NA NA -39 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCAAACTGTCATCCCCTTGT -1 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.440.5 chr1 + 3442 5 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3458 5 NA NA -37 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 30 7.357964 0.866758 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACTGTCATCCCCTTGTCA 1 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 30 NA PB.440.8 chr1 + 1005 4 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 1 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATCCCCTTGTCAGATGTTTT 1 TRUE NA NA AATAAA -28 NA NA NA 2 NA PB.440.10 chr1 + 997 4 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 3 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCAAACTGTCATCCCCTTGT 3 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.440.11 chr1 + 3455 5 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 11 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATCCCCTTGTCAGATGTTTT 11 TRUE NA NA AATAAA -28 NA NA NA 2 NA PB.440.12 chr1 + 3295 4 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 581 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATCCCCTTGTCAGATGTTTT 553 FALSE NA NA AATAAA -28 NA NA NA 3 NA PB.440.14 chr1 + 2939 3 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 14588 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAAACTGTCATCCCCTTGTC NA FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.440.15 chr1 + 2761 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3458 5 NA NA 15581 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACTGTCATCCCCTTGTCA NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 6 NA PB.440.16 chr1 + 2766 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 15626 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAAACTGTCATCCCCTTGTC NA FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.440.17 chr1 + 2545 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 15744 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATCCCCTTGTCAGATGTTT NA FALSE NA NA AATAAA -27 NA NA NA 4 NA PB.440.21 chr1 + 2348 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3458 5 NA NA 15994 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACTGTCATCCCCTTGTCA 118 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.440.22 chr1 + 2236 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 16054 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATCCCCTTGTCAGATGTTTT 178 FALSE NA NA AATAAA -28 NA NA NA 2 NA PB.440.24 chr1 + 2018 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3458 5 NA NA 16324 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACTGTCATCCCCTTGTCA 133 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.440.27 chr1 + 1871 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 16469 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCAAACTGTCATCCCCTTGT 278 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.440.30 chr1 + 1663 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3458 5 NA NA 16679 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACTGTCATCCCCTTGTCA 488 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 10 NA PB.440.34 chr1 + 1506 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3458 5 NA NA 16776 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACTGTCATCCCCTTGTCA 585 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 6 NA PB.440.37 chr1 + 1369 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3458 5 NA NA 16973 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACTGTCATCCCCTTGTCA 782 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 7 NA PB.440.38 chr1 + 1300 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 16981 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAAACTGTCATCCCCTTGTC 790 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.440.42 chr1 + 1250 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 17040 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATCCCCTTGTCAGATGTTTT 4 TRUE NA NA AATAAA -28 NA NA NA 2 NA PB.440.46 chr1 + 1089 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 17191 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCAAACTGTCATCCCCTTGT 84 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 5 NA PB.440.47 chr1 + 1138 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 17203 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAAACTGTCATCCCCTTGTC 96 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 9 NA PB.440.49 chr1 + 946 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 17394 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCAAACTGTCATCCCCTTGT 136 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 5 NA PB.441.1 chr1 - 1038 7 novel_in_catalog CRYBG2 novel 5239 20 NA NA -88 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCTTGTCTCTGTGCACCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.443.1 chr1 + 1643 6 full-splice_match DHDDS ENST00000374185.7 1148 6 -26 -469 0 80 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAAATAACCCAGGAGATG -12 TRUE NA NA AGTAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.443.2 chr1 + 1569 9 full-splice_match DHDDS ENST00000236342.12 3288 9 2 1717 0 216 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AGTTATTTGGGTAAGGAAAA -5 TRUE NA NA AGTAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.443.3 chr1 + 1106 8 full-splice_match DHDDS ENST00000525682.6 1235 8 -16 145 0 2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AATGGTGTTCCCTTTGCTTG -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.443.4 chr1 + 867 7 novel_not_in_catalog DHDDS novel 868 7 NA NA 0 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAATATTTGGTCCCTCTCA -5 TRUE NA NA ATTAAA -25 NA NA NA 2 NA PB.443.5 chr1 + 839 2 full-splice_match DHDDS ENST00000527611.1 297 2 0 -542 0 542 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG -5 TRUE NA NA AAAAAG -24 NA NA NA 2 NA PB.443.6 chr1 + 1266 9 full-splice_match DHDDS ENST00000236342.12 3288 9 3 2019 1 61 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 23 5.641106 0.751364 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCTTTGGGCTGCCTGGGAC -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 23 NA PB.443.7 chr1 + 2257 9 full-splice_match DHDDS ENST00000236342.12 3288 9 4 1027 2 906 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAATGCTACTCTCTTTAAAG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.443.8 chr1 + 3262 9 full-splice_match DHDDS ENST00000236342.12 3288 9 16 10 -2 2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 34 8.339025 0.921115 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGATGTAAAACTTGTTTGCT 9 TRUE NA NA AATAGA -17 NA NA NA 34 NA PB.443.9 chr1 + 1373 9 full-splice_match DHDDS ENST00000236342.12 3288 9 16 1899 -2 34 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTGCCTGTCTCTTAGATG 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.443.10 chr1 + 925 7 full-splice_match DHDDS ENST00000427245.6 868 7 23 -80 0 80 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAAATAACCCAGGAGATG 11 TRUE NA NA AGTAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.443.13 chr1 + 1197 2 incomplete-splice_match DHDDS ENST00000531955.5 559 3 -358 4166 0 -11 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAGAAAAAAAAAATGACATT -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.443.14 chr1 + 3366 9 novel_in_catalog DHDDS novel 3288 9 NA NA 4 2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGATGTAAAACTTGTTTGCT -9 TRUE NA NA AATAGA -17 NA NA NA 3 NA PB.443.15 chr1 + 1473 9 novel_in_catalog DHDDS novel 703 6 NA NA -7 34 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTGCCTGTCTCTTAGATG -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.443.17 chr1 + 1283 9 novel_in_catalog DHDDS novel 703 6 NA NA -1 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAATGAATGGTGTTCCCTTT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.443.18 chr1 + 1125 8 incomplete-splice_match DHDDS ENST00000360009.6 3245 9 564 2070 28 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGAATGGTGTTCCCTTTG 111 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.443.19 chr1 + 2657 4 incomplete-splice_match DHDDS ENST00000236342.12 3288 9 15310 8 1267 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATGTAAAACTTGTTTGCTAA NA FALSE NA NA AATAGA -19 NA NA NA 2 NA PB.444.1 chr1 + 1720 6 full-splice_match HMGN2 ENST00000361427.6 1940 6 -452 672 -452 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 1654 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 3 NA PB.444.2 chr1 + 1546 6 full-splice_match HMGN2 ENST00000361427.6 1940 6 -279 673 -279 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATGCTGCCTCTGATCTTT 1827 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 4 NA PB.444.4 chr1 + 1289 6 full-splice_match HMGN2 ENST00000361427.6 1940 6 -21 672 -21 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 10416 2554.685059 3.407337 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT -13 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 10416 NA PB.444.6 chr1 + 1205 6 novel_not_in_catalog HMGN2 novel 1940 6 NA NA -3 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GGAATGCTGCCTCTGATCTT 15 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.444.7 chr1 + 1232 6 full-splice_match HMGN2 ENST00000361427.6 1940 6 36 672 -1 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 403 98.841980 1.994941 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT -9 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 403 NA PB.444.8 chr1 + 1207 5 novel_in_catalog HMGN2 novel 1148 7 NA NA -6 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT -14 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 5 NA PB.444.9 chr1 + 3056 2 full-splice_match HMGN2 ENST00000493418.1 1496 2 -950 -610 2 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT -6 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 5 NA PB.444.10 chr1 + 2195 3 incomplete-splice_match HMGN2 ENST00000479815.5 1030 4 16 -736 2 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GCTTGGAATGCTGCCTCTGA -6 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.444.11 chr1 + 1389 5 full-splice_match HMGN2 ENST00000464888.5 565 5 -12 -812 -12 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 9 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 5 NA PB.444.15 chr1 + 2584 3 novel_in_catalog HMGN2 novel 1148 7 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 23 5.641106 0.751364 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 23 NA PB.444.16 chr1 + 1872 6 full-splice_match HMGN2 ENST00000361427.6 1940 6 66 2 0 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 42 10.301149 1.012886 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTGCTTTGTCCATTCCCT 0 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 42 NA PB.444.17 chr1 + 1729 4 full-splice_match HMGN2 ENST00000479815.5 1030 4 43 -742 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.169513 0.620085 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 17 NA PB.444.19 chr1 + 1554 5 full-splice_match HMGN2 ENST00000460563.5 1045 5 29 -538 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 39 9.565352 0.980701 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 39 NA PB.444.20 chr1 + 1260 6 full-splice_match HMGN2 ENST00000463817.5 853 6 -5 -402 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 8 NA PB.444.21 chr1 + 1287 6 full-splice_match HMGN2 ENST00000467700.5 932 6 -11 -344 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 25 6.131637 0.787576 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 25 NA PB.444.22 chr1 + 1208 6 novel_not_in_catalog HMGN2 novel 1148 7 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 5 NA PB.444.24 chr1 + 1127 4 novel_in_catalog HMGN2 novel 1148 7 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.444.25 chr1 + 516 6 full-splice_match HMGN2 ENST00000361427.6 1940 6 66 1358 0 56 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAACACTTCATTGTTGTTTT 0 TRUE NA NA TTTAAA -21 NA NA NA 4 NA PB.444.26 chr1 + 1187 6 novel_not_in_catalog HMGN2 novel 1940 6 NA NA 2 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 23 5.641106 0.751364 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATGCTGCCTCTGATCTTT 2 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 23 NA PB.444.27 chr1 + 1989 4 incomplete-splice_match HMGN2 ENST00000460563.5 1045 5 33 -532 -1 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GCTTGGAATGCTGCCTCTGA 4 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 4 NA PB.444.28 chr1 + 1109 6 full-splice_match HMGN2 ENST00000361427.6 1940 6 159 672 82 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 148 36.299286 1.559898 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 20 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 148 NA PB.444.29 chr1 + 1329 5 full-splice_match HMGN2 ENST00000466194.1 952 5 28 -405 28 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 11 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 3 NA PB.444.30 chr1 + 1769 3 incomplete-splice_match HMGN2 ENST00000479815.5 1030 4 858 -742 -108 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 98 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 3 NA PB.444.31 chr1 + 2146 2 full-splice_match HMGN2 ENST00000493418.1 1496 2 -40 -610 -40 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 166 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.444.32 chr1 + 1730 5 full-splice_match HMGN2 ENST00000466194.1 952 5 297 -1075 74 -2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTGCTTTGTCCATTCCCT 280 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.444.33 chr1 + 1490 3 incomplete-splice_match HMGN2 ENST00000460563.5 1045 5 1122 -537 170 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATGCTGCCTCTGATCTTT 376 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 5 NA PB.444.34 chr1 + 1030 4 incomplete-splice_match HMGN2 ENST00000466194.1 952 5 502 -405 279 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 396 97.125122 1.987332 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 485 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 396 NA PB.444.35 chr1 + 1206 3 incomplete-splice_match HMGN2 ENST00000466194.1 952 5 673 -400 450 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CTTGGAATGCTGCCTCTGAT 656 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 9 NA PB.444.36 chr1 + 1633 2 full-splice_match HMGN2 ENST00000493418.1 1496 2 473 -610 473 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 679 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.444.37 chr1 + 1478 2 full-splice_match HMGN2 ENST00000493418.1 1496 2 620 -602 620 -8 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGGCTTGGAATGCTGCCTCT 826 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 5 NA PB.444.38 chr1 + 1544 2 incomplete-splice_match HMGN2 ENST00000361427.6 1940 6 2211 3 1222 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAATTGCTTTGTCCATTCCC 1428 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 5 NA PB.444.39 chr1 + 874 2 incomplete-splice_match HMGN2 ENST00000466194.1 952 5 1446 -405 1223 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 1429 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 3 NA PB.446.1 chr1 + 3155 22 full-splice_match RPS6KA1 ENST00000374168.7 3192 22 35 2 18 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.697920 0.431029 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCACGCTCTCCTGCACTC 22 TRUE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 11 NA PB.446.2 chr1 + 2968 21 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000526792.5 2596 22 5705 -591 5595 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAAGCACGCTCTCCTGCACT 5508 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.446.3 chr1 + 3033 21 full-splice_match RPS6KA1 ENST00000530003.5 3023 21 0 -10 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCACGCTCTCCTGCACTCT -15 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.446.4 chr1 + 3113 21 full-splice_match RPS6KA1 ENST00000531382.5 2359 21 -7 -747 0 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.433716 0.535764 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCACGCTCTCCTGCACTC -8 TRUE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 14 NA PB.446.5 chr1 + 2775 19 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000531382.5 2359 21 1373 -753 -18 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCTCTCCTGCACTCTTCATC 1372 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 5 NA PB.446.6 chr1 + 2716 18 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000531382.5 2359 21 5556 -751 -38 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACGCTCTCCTGCACTCTTCA 5555 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.446.7 chr1 + 2564 16 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000374163.5 3202 22 7547 7 -1810 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCACGCTCTCCTGCACTC 11 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 4 NA PB.446.8 chr1 + 2455 15 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000374163.5 3202 22 8372 7 -985 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCACGCTCTCCTGCACTC 10 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 4 NA PB.446.9 chr1 + 2304 14 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000374163.5 3202 22 8867 7 -490 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCACGCTCTCCTGCACTC 505 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 7 NA PB.446.10 chr1 + 2169 12 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000374163.5 3202 22 9729 7 372 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCACGCTCTCCTGCACTC 1367 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 5 NA PB.446.11 chr1 + 2098 11 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000374163.5 3202 22 10834 1 -367 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCTCTCCTGCACTCTTCATC 2472 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.446.12 chr1 + 1900 9 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000374163.5 3202 22 13011 7 1810 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCACGCTCTCCTGCACTC 4649 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 5 NA PB.446.13 chr1 + 1724 8 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000374163.5 3202 22 14974 8 3773 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAAGCACGCTCTCCTGCACT 6612 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 6 NA PB.446.14 chr1 + 1569 6 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000374163.5 3202 22 15697 3 4496 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACGCTCTCCTGCACTCTTCA 7335 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 5 NA PB.446.15 chr1 + 1441 5 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000374163.5 3202 22 25606 7 219 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.697920 0.431029 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCACGCTCTCCTGCACTC NA FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 11 NA PB.446.16 chr1 + 1335 5 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000374163.5 3202 22 25712 7 325 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCACGCTCTCCTGCACTC NA FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.446.17 chr1 + 1237 4 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000374163.5 3202 22 26047 8 -381 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAAGCACGCTCTCCTGCACT NA FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 7 NA PB.446.18 chr1 + 1202 3 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000438977.1 639 4 -95 -289 -95 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCACGCTCTCCTGCACTC NA FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 3 NA PB.446.19 chr1 + 1010 2 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000438977.1 639 4 1027 -289 1027 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCACGCTCTCCTGCACTC NA FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 3 NA PB.449.1 chr1 + 6025 19 full-splice_match ARID1A ENST00000374152.7 6460 19 837 -402 92 14 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 504 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.449.8 chr1 + 4754 13 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000636219.1 7058 19 33401 943 -1207 15 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAATA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.449.10 chr1 + 4497 12 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000374152.7 6460 19 37340 -402 -18 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.449.11 chr1 + 4257 10 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000374152.7 6460 19 38893 -402 -1369 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.449.12 chr1 + 4090 10 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000636219.1 7058 19 38312 944 -1205 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.449.13 chr1 + 3813 8 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000636219.1 7058 19 42882 943 -424 15 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAATA 1289 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.449.14 chr1 + 3661 7 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000636219.1 7058 19 43215 944 -91 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 1622 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.449.15 chr1 + 3547 6 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000636219.1 7058 19 43687 944 377 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 2094 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.449.16 chr1 + 3397 5 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000636219.1 7058 19 43921 943 611 15 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAATA 2328 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.449.17 chr1 + 3177 4 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000636219.1 7058 19 44224 944 914 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 2631 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.449.18 chr1 + 3066 3 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000636219.1 7058 19 44766 943 -447 15 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAATA 3173 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.449.19 chr1 + 2763 3 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000636219.1 7058 19 45068 944 -145 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 3475 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.449.20 chr1 + 2483 3 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000636219.1 7058 19 45348 944 135 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.697920 0.431029 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 3755 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.449.21 chr1 + 3198 2 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000466382.2 2699 6 2621 -917 715 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TTGGTAAGACTTTTGTGAAG 4335 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.449.22 chr1 + 2257 2 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000466382.2 2699 6 2623 22 717 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.414778 0.644909 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 4337 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.449.23 chr1 + 2156 2 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000466382.2 2699 6 2725 21 819 15 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAATA 4439 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.449.24 chr1 + 3036 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 24 -14 24 14 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 6873 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.449.25 chr1 + 1989 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 1071 -14 1071 14 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 15 3.678982 0.565728 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 7920 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.449.26 chr1 + 1837 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 1223 -14 1223 14 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 21 5.150575 0.711856 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 8072 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 21 NA PB.449.27 chr1 + 1728 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 1332 -14 1332 14 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 13 3.188451 0.503580 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 8181 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.449.28 chr1 + 1579 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 1481 -14 1481 14 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 14 3.433716 0.535764 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 8330 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.449.29 chr1 + 1447 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 1613 -14 1613 14 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 11 2.697920 0.431029 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 8462 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.449.30 chr1 + 1051 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 2009 -14 2009 14 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 8858 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.449.31 chr1 + 900 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 2160 -14 2160 14 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 9009 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.449.32 chr1 + 1773 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 2231 -958 2231 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGACTTTTGTGAAGCTTTT 9080 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.449.33 chr1 + 576 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 2484 -14 2484 14 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 9333 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.449.34 chr1 + 1469 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 2535 -958 2535 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGACTTTTGTGAAGCTTTT 9384 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 7 NA PB.449.35 chr1 + 1347 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 2656 -957 2656 -1 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAGACTTTTGTGAAGCTTT 9505 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.449.36 chr1 + 1185 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 2818 -957 2818 -1 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAGACTTTTGTGAAGCTTT 9667 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.451.1 chr1 + 2130 4 full-splice_match PIGV ENST00000674222.1 4377 4 -17 2264 0 1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 23 5.641106 0.751364 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACATGCAATGAATTGCCTTT -28 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 23 NA PB.451.2 chr1 + 2027 4 full-splice_match PIGV ENST00000674222.1 4377 4 -15 2365 0 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 37 9.074821 0.957838 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATGCGACATTGTTTCTGA -26 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 37 NA PB.451.3 chr1 + 1653 4 full-splice_match PIGV ENST00000674222.1 4377 4 -15 2739 0 113 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TCTGCTGCCCTGGGATCATT -26 TRUE NA NA AGTAAA -20 NA NA NA 9 NA PB.451.4 chr1 + 2291 4 full-splice_match PIGV ENST00000688522.1 2396 4 17 88 0 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.414778 0.644909 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATGCGACATTGTTTCTGA -11 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 18 NA PB.451.5 chr1 + 1916 4 full-splice_match PIGV ENST00000688522.1 2396 4 17 463 0 112 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTCTGCTGCCCTGGGATCAT -11 TRUE NA NA AGTAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.451.6 chr1 + 2385 4 full-splice_match PIGV ENST00000688522.1 2396 4 24 -13 -4 1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.697920 0.431029 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACATGCAATGAATTGCCTTT -4 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 11 NA PB.451.7 chr1 + 2172 4 full-splice_match PIGV ENST00000688522.1 2396 4 235 -11 8 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATACATGCAATGAATTGCCT -9 TRUE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 10 NA PB.451.8 chr1 + 1698 4 full-splice_match PIGV ENST00000688522.1 2396 4 235 463 8 112 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTCTGCTGCCCTGGGATCAT -9 TRUE NA NA AGTAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.451.9 chr1 + 1876 3 full-splice_match PIGV ENST00000691135.1 4858 3 2894 88 1563 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATGCGACATTGTTTCTGA 2678 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.451.10 chr1 + 1654 2 incomplete-splice_match PIGV ENST00000674317.1 2245 4 5004 8 5004 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATGCGACATTGTTTCTGA 6119 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.451.11 chr1 + 1448 2 incomplete-splice_match PIGV ENST00000674317.1 2245 4 5217 1 5217 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACATTGTTTCTGATGTTTTT 6332 FALSE NA NA AATAAA -25 NA NA NA 2 NA PB.451.12 chr1 + 1315 2 incomplete-splice_match PIGV ENST00000674317.1 2245 4 5343 8 5343 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATGCGACATTGTTTCTGA 6458 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.452.1 chr1 + 2891 8 full-splice_match ZDHHC18 ENST00000374142.9 5045 8 263 1891 263 1750 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGAGTTGCTTTGCTTTGGT 9 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 4 NA PB.452.2 chr1 + 2721 8 full-splice_match ZDHHC18 ENST00000374142.9 5045 8 433 1891 433 1750 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGAGTTGCTTTGCTTTGGT 91 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 5 NA PB.452.3 chr1 + 2366 5 incomplete-splice_match ZDHHC18 ENST00000488397.3 1275 7 -36 1889 -36 1750 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGAGTTGCTTTGCTTTGGT NA FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 5 NA PB.452.4 chr1 + 2161 3 incomplete-splice_match ZDHHC18 ENST00000488397.3 1275 7 816 1883 49 1756 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TGCTTTGCTTTGGTTTGGTT NA FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 4 NA PB.454.3 chr1 - 1975 4 incomplete-splice_match GPN2 ENST00000374135.9 4665 5 0 3250 0 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTTTTTGTGACTTCCAAAC -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.454.4 chr1 - 1436 5 novel_not_in_catalog GPN2 novel 4665 5 NA NA 9 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTTTTTGTGACTTCCAAAC 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.454.5 chr1 - 1426 5 full-splice_match GPN2 ENST00000374135.9 4665 5 -12 3251 -12 -7 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 162 39.733006 1.599151 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TACTTTTTGTGACTTCCAAA -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 162 NA PB.454.7 chr1 - 1077 5 full-splice_match GPN2 ENST00000374135.9 4665 5 337 3251 314 -7 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TACTTTTTGTGACTTCCAAA 380 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.455.1 chr1 - 2711 6 novel_in_catalog GPATCH3 novel 2125 7 NA NA 10 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTCCCTTACTTTTCTAAT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.455.2 chr1 - 2122 7 full-splice_match GPATCH3 ENST00000361720.10 2125 7 2 1 2 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 79 19.375971 1.287264 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTCCCTTACTTTTCTAAT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 79 NA PB.455.3 chr1 - 1739 7 full-splice_match GPATCH3 ENST00000361720.10 2125 7 385 1 385 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTCCCTTACTTTTCTAAT 374 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.455.4 chr1 - 1048 4 incomplete-splice_match GPATCH3 ENST00000361720.10 2125 7 7017 3 -2 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GGAGCTCCCTTACTTTTCTA 7006 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.456.1 chr1 + 1306 1 full-splice_match SFN ENST00000339276.6 1308 1 2 0 2 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 376 92.219810 1.964824 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTCCTGTCTCTCTTCCAGTT 2 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 376 NA PB.456.3 chr1 + 1208 1 full-splice_match SFN ENST00000339276.6 1308 1 100 0 100 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTCCTGTCTCTCTTCCAGTT 100 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 9 NA PB.456.5 chr1 + 1048 1 full-splice_match SFN ENST00000339276.6 1308 1 260 0 260 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTCCTGTCTCTCTTCCAGTT 260 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 6 NA PB.456.6 chr1 + 918 1 full-splice_match SFN ENST00000339276.6 1308 1 390 0 390 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTCCTGTCTCTCTTCCAGTT 390 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.457.1 chr1 - 1167 2 full-splice_match NR0B2 ENST00000254227.4 1165 2 -2 0 -2 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 185 45.374111 1.656808 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TTGGAGCCTGATACTGTCAT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 185 NA PB.457.2 chr1 - 1474 2 novel_not_in_catalog NR0B2 novel 1165 2 NA NA 3 -6 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.188451 0.503580 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACACTTGGAGCCTGATAC 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.457.3 chr1 - 1292 3 novel_not_in_catalog NR0B2 novel 1165 2 NA NA -2 -6 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACACTTGGAGCCTGATAC -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.457.4 chr1 - 1350 2 full-splice_match NR0B2 ENST00000254227.4 1165 2 -191 6 -191 -6 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACACTTGGAGCCTGATAC 7275 FALSE NA NA AATGAA -45 NA NA NA 2 NA PB.458.3 chr1 + 1337 9 full-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 -19 474 -19 213 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2519 617.823669 2.790864 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTCTGTGTCCTCTCTTGCC -31 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 2519 NA PB.458.5 chr1 + 1411 8 novel_in_catalog NUDC novel 1792 9 NA NA -3 211 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TCCTTCTGTGTCCTCTCTTG -15 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.458.6 chr1 + 1310 9 novel_not_in_catalog NUDC novel 1792 9 NA NA 0 211 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TCCTTCTGTGTCCTCTCTTG -12 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.458.7 chr1 + 1005 7 novel_in_catalog NUDC novel 1792 9 NA NA 0 212 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CCTTCTGTGTCCTCTCTTGC -12 TRUE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 6 NA PB.458.8 chr1 + 2343 6 novel_in_catalog NUDC novel 1792 9 NA NA 2 213 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTCTGTGTCCTCTCTTGCC -10 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.458.9 chr1 + 2157 8 novel_in_catalog NUDC novel 1792 9 NA NA 2 213 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTCTGTGTCCTCTCTTGCC -10 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.458.10 chr1 + 1801 9 full-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 2 -11 2 11 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 107 26.243404 1.419020 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATGTATGTTTCTGAGCAAAG -10 TRUE NA NA AATAAA -25 NA NA NA 107 NA PB.458.11 chr1 + 1495 9 full-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 2 295 2 -295 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.414778 0.644909 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGTGATGGTTCATGTCTGTA -10 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 18 NA PB.458.13 chr1 + 1409 8 novel_in_catalog NUDC novel 1792 9 NA NA 3 213 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTCTGTGTCCTCTCTTGCC -9 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 5 NA PB.458.14 chr1 + 1478 10 novel_not_in_catalog NUDC novel 1792 9 NA NA 9 211 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 69 16.923317 1.228485 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TCCTTCTGTGTCCTCTCTTG -3 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 69 NA PB.458.17 chr1 + 1439 7 novel_in_catalog NUDC novel 1792 9 NA NA 17 -24 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAATAAATAAATAAAA 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.458.18 chr1 + 1458 10 novel_not_in_catalog NUDC novel 1792 9 NA NA 17 212 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CCTTCTGTGTCCTCTCTTGC 5 TRUE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.458.19 chr1 + 1157 8 novel_not_in_catalog NUDC novel 1792 9 NA NA 17 210 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTCCTTCTGTGTCCTCTCTT 5 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.458.20 chr1 + 2214 7 novel_in_catalog NUDC novel 1792 9 NA NA 39 213 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTCTGTGTCCTCTCTTGCC 27 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.458.21 chr1 + 1692 9 full-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 111 -11 111 11 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATGTATGTTTCTGAGCAAAG 43 FALSE NA NA AATAAA -25 NA NA NA 2 NA PB.458.22 chr1 + 1323 8 incomplete-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 2344 284 1945 -284 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATGTCTGTAATCCCAGCACT 2276 FALSE NA NA ATTAAA -28 NA NA NA 2 NA PB.458.23 chr1 + 1133 8 incomplete-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 2344 474 1945 213 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 43 10.546414 1.023105 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTCTGTGTCCTCTCTTGCC 2276 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 43 NA PB.458.25 chr1 + 1246 8 novel_not_in_catalog NUDC novel 607 2 NA NA -10908 213 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTCTGTGTCCTCTCTTGCC NA FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.458.27 chr1 + 961 7 incomplete-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 19806 474 -3586 213 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 38 9.320087 0.969420 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTCTGTGTCCTCTCTTGCC 5340 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 38 NA PB.458.28 chr1 + 844 6 incomplete-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 20015 474 -3377 213 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTCTGTGTCCTCTCTTGCC 5549 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 6 NA PB.458.29 chr1 + 1231 5 incomplete-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 20919 24 -2473 -24 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAATAAATAAATAAAA 6453 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.458.30 chr1 + 773 5 incomplete-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 20927 474 -2465 213 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTCTGTGTCCTCTCTTGCC 6461 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 9 NA PB.458.31 chr1 + 1085 4 incomplete-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 21159 24 -2233 -24 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAATAAATAAATAAAA 6693 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.458.32 chr1 + 575 4 incomplete-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 21219 474 -2173 213 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTCTGTGTCCTCTCTTGCC 6753 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.458.33 chr1 + 981 4 incomplete-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 21263 24 -2129 -24 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAATAAATAAATAAAA 6797 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.459.1 chr1 - 2359 3 novel_in_catalog KDF1 novel 1855 4 NA NA 18 -8 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAGGTAATTGGTATCTGCC -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.459.2 chr1 - 1776 4 novel_not_in_catalog KDF1 novel 1855 4 NA NA 12 -8 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAGGTAATTGGTATCTGCC -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.459.3 chr1 - 1379 3 incomplete-splice_match KDF1 ENST00000320567.6 1855 4 8405 8 8405 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAGGTAATTGGTATCTGCC 8381 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.459.5 chr1 - 1776 4 full-splice_match KDF1 ENST00000320567.6 1855 4 69 10 69 -10 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 23 5.641106 0.751364 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACAAAGGTAATTGGTATCTG 45 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 23 NA PB.460.1 chr1 - 2242 2 full-splice_match TENT5B ENST00000289166.6 2382 2 138 2 138 -2 alternative_5end TRUE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCTTAGTGCCATGCTTCC 143 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.460.4 chr1 - 2378 2 full-splice_match TENT5B ENST00000289166.6 2382 2 1 3 1 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 34 8.339025 0.921115 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAACCTTAGTGCCATGCTTC 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 34 NA PB.461.1 chr1 + 918 2 full-splice_match TRNP1 ENST00000522111.3 1961 2 810 233 183 -233 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATGCATGGGGTTCTGAGG 4 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.462.1 chr1 + 4220 16 full-splice_match WDTC1 ENST00000319394.8 4706 16 91 395 55 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGGTGTGGCTGGTGGCATTT -15 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 8 NA PB.462.2 chr1 + 4518 16 full-splice_match WDTC1 ENST00000319394.8 4706 16 113 75 77 -58 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAGATATGTGTGTGTGTATA 7 TRUE NA NA AATATA -15 NA NA NA 2 NA PB.462.3 chr1 + 3845 14 incomplete-splice_match WDTC1 ENST00000319394.8 4706 16 28518 396 2102 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TAGGTGTGGCTGGTGGCATT NA FALSE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 3 NA PB.462.4 chr1 + 3161 9 incomplete-splice_match WDTC1 ENST00000319394.8 4706 16 59459 395 6382 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGGTGTGGCTGGTGGCATTT NA FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.462.5 chr1 + 2943 6 incomplete-splice_match WDTC1 ENST00000361771.7 4275 16 62379 4 -7967 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TAGGTGTGGCTGGTGGCATT NA FALSE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.462.6 chr1 + 2765 5 incomplete-splice_match WDTC1 ENST00000361771.7 4275 16 63339 3 -7007 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGGTGTGGCTGGTGGCATTT NA FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.462.7 chr1 + 2487 4 incomplete-splice_match WDTC1 ENST00000361771.7 4275 16 66731 3 -3615 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGGTGTGGCTGGTGGCATTT NA FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 5 NA PB.462.9 chr1 + 2199 2 incomplete-splice_match WDTC1 ENST00000472249.2 628 3 37 -1351 37 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGGTGTGGCTGGTGGCATTT NA FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 5 NA PB.462.10 chr1 + 2100 2 incomplete-splice_match WDTC1 ENST00000472249.2 628 3 136 -1351 136 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGGTGTGGCTGGTGGCATTT NA FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 6 NA PB.462.11 chr1 + 2399 2 incomplete-splice_match WDTC1 ENST00000472249.2 628 3 157 -1671 157 -58 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAGATATGTGTGTGTGTATA NA FALSE NA NA AATATA -15 NA NA NA 2 NA PB.463.1 chr1 + 1598 6 full-splice_match TMEM222 ENST00000374076.9 1596 6 -3 1 -3 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.660044 0.668390 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTGGTGCCCTGTCATTGT -9 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 19 NA PB.463.2 chr1 + 1512 6 full-splice_match TMEM222 ENST00000608611.5 1511 6 -2 1 -1 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 199 48.807827 1.688489 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTGGTGCCCTGTCATTGT -25 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 199 NA PB.463.3 chr1 + 1323 2 novel_not_in_catalog TMEM222 novel 1511 6 NA NA 0 -6034 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAGGGAAAAAAAAG -23 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 8 NA PB.463.4 chr1 + 1748 8 full-splice_match TMEM222 ENST00000486082.5 994 8 -3 -751 3 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTGGTGCCCTGTCATTGT -20 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.463.6 chr1 + 1591 7 full-splice_match TMEM222 ENST00000478104.5 986 7 -30 -575 1 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTGGTGCCCTGTCATTGT -16 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 7 NA PB.463.7 chr1 + 1495 6 novel_not_in_catalog TMEM222 novel 1596 6 NA NA 2 1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTGGTGCCCTGTCATTGTTT -15 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.463.8 chr1 + 2244 2 novel_not_in_catalog TMEM222 novel 368 4 NA NA 9 -6034 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAGGGAAAAAAAAG -8 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.463.10 chr1 + 4257 1 full-splice_match ACTG1P20 ENST00000486001.1 468 1 -3060 -729 -3060 729 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAGGGAAAAAAAAG -2 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.463.11 chr1 + 1636 7 full-splice_match TMEM222 ENST00000464720.5 1665 7 28 1 -6 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.169513 0.620085 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTGGTGCCCTGTCATTGT 4 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 17 NA PB.463.12 chr1 + 2565 5 full-splice_match TMEM222 ENST00000464813.5 1071 5 9 -1503 5 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTGGTGCCCTGTCATTGT 19 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 5 NA PB.463.13 chr1 + 1697 1 full-splice_match ACTG1P20 ENST00000486001.1 468 1 -500 -729 -500 729 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAGGGAAAAAAAAG 2558 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.463.14 chr1 + 1551 1 full-splice_match ACTG1P20 ENST00000486001.1 468 1 -354 -729 -354 729 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAGGGAAAAAAAAG 2704 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.463.15 chr1 + 1400 1 full-splice_match ACTG1P20 ENST00000486001.1 468 1 -203 -729 -203 729 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAGGGAAAAAAAAG 2855 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.463.16 chr1 + 1341 5 incomplete-splice_match TMEM222 ENST00000608611.5 1511 6 8497 1 -1601 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTGGTGCCCTGTCATTGT 4423 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 8 NA PB.463.17 chr1 + 1047 2 incomplete-splice_match TMEM222 ENST00000471456.1 2861 3 1910 0 793 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTGGTGCCCTGTCATTGT 7934 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.464.1 chr1 - 3615 12 full-splice_match SLC9A1 ENST00000263980.8 4737 12 1117 5 590 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATAGAGTCAAGGGCTGCTTT 1480 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.464.2 chr1 - 4733 12 full-splice_match SLC9A1 ENST00000263980.8 4737 12 -2 6 -2 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAGAGTCAAGGGCTGCTT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.464.3 chr1 - 3128 10 incomplete-splice_match SLC9A1 ENST00000263980.8 4737 12 45347 6 -5756 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAGAGTCAAGGGCTGCTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.464.4 chr1 - 2840 9 incomplete-splice_match SLC9A1 ENST00000263980.8 4737 12 47296 6 -3807 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAGAGTCAAGGGCTGCTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.464.5 chr1 - 2659 8 incomplete-splice_match SLC9A1 ENST00000263980.8 4737 12 49037 6 -2066 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAGAGTCAAGGGCTGCTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.464.6 chr1 - 2367 6 full-splice_match SLC9A1 ENST00000447808.1 887 6 50 -1530 50 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAGAGTCAAGGGCTGCTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.464.7 chr1 - 2113 4 incomplete-splice_match SLC9A1 ENST00000374089.5 3165 7 1899 0 672 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAGAGTCAAGGGCTGCTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.464.8 chr1 - 2006 3 incomplete-splice_match SLC9A1 ENST00000374089.5 3165 7 2195 0 968 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAGAGTCAAGGGCTGCTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.465.1 chr1 - 3866 28 full-splice_match MAP3K6 ENST00000374040.7 4309 28 449 -6 449 4 alternative_5end TRUE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGTCCTGGCAATTTTGGAGG 8414 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.465.2 chr1 - 2879 22 incomplete-splice_match MAP3K6 ENST00000493901.6 3654 27 2072 -28 33 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGTCCTGGCAATTTTGGAGG 4255 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.465.3 chr1 - 1670 12 incomplete-splice_match MAP3K6 ENST00000493901.6 3654 27 5335 -28 -1625 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGTCCTGGCAATTTTGGAGG 7518 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.465.4 chr1 - 2344 17 incomplete-splice_match MAP3K6 ENST00000493901.6 3654 27 3513 -27 1474 3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTGTCCTGGCAATTTTGGAG 5696 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.465.5 chr1 - 1048 8 incomplete-splice_match MAP3K6 ENST00000671291.1 3287 20 4967 -27 46 3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTGTCCTGGCAATTTTGGAG 9189 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.465.6 chr1 - 1556 11 incomplete-splice_match MAP3K6 ENST00000493901.6 3654 27 5997 -26 -963 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTTGTCCTGGCAATTTTGGA 8180 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.465.7 chr1 - 1289 9 incomplete-splice_match MAP3K6 ENST00000493901.6 3654 27 6460 -26 -500 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTTGTCCTGGCAATTTTGGA 8643 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.465.8 chr1 - 3998 29 full-splice_match MAP3K6 ENST00000357582.3 4438 29 438 2 335 0 alternative_5end TRUE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCTTTGTCCTGGCAATTT 8300 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.465.9 chr1 - 3006 23 incomplete-splice_match MAP3K6 ENST00000493901.6 3654 27 1842 -22 -197 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCTTTGTCCTGGCAATTT 4025 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.465.10 chr1 - 2135 15 incomplete-splice_match MAP3K6 ENST00000493901.6 3654 27 3947 -22 1908 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCTTTGTCCTGGCAATTT 6130 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.465.11 chr1 - 1144 8 incomplete-splice_match MAP3K6 ENST00000671291.1 3287 20 4865 -21 -56 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAACCTTTGTCCTGGCAATT 9087 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.466.1 chr1 + 1778 14 novel_in_catalog SYTL1 novel 1936 15 NA NA -1 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAAAAGGCTGGTGTCTGC -34 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.466.2 chr1 + 2342 13 novel_in_catalog SYTL1 novel 2525 13 NA NA 1 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAAAAGGCTGGTGTCTGC -30 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.466.3 chr1 + 2644 12 novel_in_catalog SYTL1 novel 2525 13 NA NA 4 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAAAAGGCTGGTGTCTGC -27 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 4 NA PB.466.4 chr1 + 1930 15 full-splice_match SYTL1 ENST00000616558.5 1936 15 4 2 4 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 43 10.546414 1.023105 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAAAAGGCTGGTGTCTGC -27 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 43 NA PB.466.5 chr1 + 1892 15 full-splice_match SYTL1 ENST00000318074.9 1900 15 6 2 6 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAAAAGGCTGGTGTCTGC -25 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 8 NA PB.466.6 chr1 + 2167 14 novel_in_catalog SYTL1 novel 1936 15 NA NA -12 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAAAAGGCTGGTGTCTGC -8 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.466.7 chr1 + 2064 12 incomplete-splice_match SYTL1 ENST00000483926.5 2525 13 3390 0 574 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAAAAGGCTGGTGTCTGC 633 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.466.8 chr1 + 1428 12 incomplete-splice_match SYTL1 ENST00000543823.1 2229 14 2934 0 263 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAAAAGGCTGGTGTCTGC 2993 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.466.9 chr1 + 1196 9 incomplete-splice_match SYTL1 ENST00000543823.1 2229 14 4564 0 -39 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAAAAGGCTGGTGTCTGC 4623 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.466.10 chr1 + 1743 4 full-splice_match SYTL1 ENST00000615284.1 793 4 -957 7 371 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAAAAGGCTGGTGTCTGC 5304 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.468.2 chr1 + 2122 2 full-splice_match GPR3 ENST00000374024.4 2137 2 12 3 12 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.697920 0.431029 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATGTTTCCCTATGTGT 8 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 11 NA PB.470.14 chr1 - 3518 4 incomplete-splice_match WASF2 ENST00000618852.5 5681 9 75203 1402 75087 -1402 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 4041 FALSE NA NA AATGAA -42 NA NA NA 7 NA PB.470.34 chr1 - 3458 9 full-splice_match WASF2 ENST00000618852.5 5681 9 9 2214 9 1753 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GGTTCTGCCTCTGTGCCCTT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.470.35 chr1 - 3263 9 full-splice_match WASF2 ENST00000618852.5 5681 9 0 2418 0 1549 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGCCAACAGTGAGGTTTCTT -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.470.36 chr1 - 1892 9 full-splice_match WASF2 ENST00000618852.5 5681 9 17 3772 17 195 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CATTTTCAGGCCCTGTGGGG 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.470.37 chr1 - 899 6 novel_not_in_catalog WASF2 novel 5681 9 NA NA 0 -7788 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GTGAGGGGAAAGGGGCCTCT -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.470.38 chr1 - 754 5 incomplete-splice_match WASF2 ENST00000536657.1 1083 8 -116 7796 0 -7796 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 85 20.847565 1.319055 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGCATAGGGTGAGGGGAAAG -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 85 NA PB.471.1 chr1 - 2941 2 incomplete-splice_match AHDC1 ENST00000644989.1 6103 6 53514 408 3580 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAAGACAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.471.2 chr1 - 2703 2 incomplete-splice_match AHDC1 ENST00000644989.1 6103 6 53752 408 3818 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAAGACAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.471.3 chr1 - 2016 2 incomplete-splice_match AHDC1 ENST00000644989.1 6103 6 54439 408 4505 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAAGACAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.471.4 chr1 - 1815 2 incomplete-splice_match AHDC1 ENST00000644989.1 6103 6 54640 408 4706 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAAGACAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.471.6 chr1 - 1378 2 incomplete-splice_match AHDC1 ENST00000644989.1 6103 6 55077 408 5143 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAAGACAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.471.7 chr1 - 1185 2 incomplete-splice_match AHDC1 ENST00000644989.1 6103 6 55270 408 5336 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAAGACAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.471.8 chr1 - 4178 2 incomplete-splice_match AHDC1 ENST00000644989.1 6103 6 52276 409 2342 3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 GAAAAAGACAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.471.9 chr1 - 3340 2 incomplete-splice_match AHDC1 ENST00000644989.1 6103 6 53113 410 3179 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AGAAAAAGACAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.471.10 chr1 - 1925 4 novel_not_in_catalog AHDC1 novel 6428 9 NA NA -6 2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AGAAAAAGACAAAAAAAAAA -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.471.11 chr1 - 1568 2 incomplete-splice_match AHDC1 ENST00000644989.1 6103 6 54885 410 4951 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AGAAAAAGACAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.472.1 chr1 - 2014 11 full-splice_match FGR ENST00000374004.5 2350 11 344 -8 344 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATACCCTTGAACCTTCCT 9193 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.472.2 chr1 - 2476 13 full-splice_match FGR ENST00000399173.5 2483 13 4 3 4 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATGAAATACCCTTGAACCTT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.472.3 chr1 - 2404 13 full-splice_match FGR ENST00000374005.8 2637 13 -3 236 -3 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAACCATGAAATACCCTTGA -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.472.4 chr1 - 2383 13 full-splice_match FGR ENST00000399173.5 2483 13 92 8 -13 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAACCATGAAATACCCTTGA 9369 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.472.5 chr1 - 1628 7 incomplete-splice_match FGR ENST00000374004.5 2350 11 7100 0 7100 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAACCATGAAATACCCTTGA 9677 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.472.6 chr1 - 1440 6 incomplete-splice_match FGR ENST00000374004.5 2350 11 8300 0 8300 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAACCATGAAATACCCTTGA 9470 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.472.7 chr1 - 1187 4 incomplete-splice_match FGR ENST00000374004.5 2350 11 9135 0 9135 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAACCATGAAATACCCTTGA 9988 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.474.1 chr1 + 1085 8 novel_in_catalog FAM76A novel 2273 8 NA NA 14 1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATGTCTGAATTATAGATTCT 0 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.474.2 chr1 + 1115 5 novel_not_in_catalog FAM76A novel 1027 8 NA NA -14 -19925 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 TAAAAAAAATAGGCTATGGT 7 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.474.3 chr1 + 2392 9 full-splice_match FAM76A ENST00000373954.11 3579 9 35 1152 0 0 alternative_3end TRUE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAGGAA 21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.475.1 chr1 + 1281 9 full-splice_match STX12 ENST00000373943.9 3034 9 -12 1765 -12 -1765 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATTTACCTTTTTACTAG -22 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.475.2 chr1 + 3036 9 full-splice_match STX12 ENST00000373943.9 3034 9 -6 4 -6 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.697920 0.431029 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATTCTCCTTATCTGTGC -16 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 11 NA PB.475.3 chr1 + 2894 9 full-splice_match STX12 ENST00000373943.9 3034 9 0 140 0 -140 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.660044 0.668390 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATACTGTGTGACCTGTGGT -10 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 19 NA PB.475.4 chr1 + 2045 9 full-splice_match STX12 ENST00000373943.9 3034 9 22 967 6 -967 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAATGTTGTCCACTTCCCTT 12 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 8 NA PB.475.5 chr1 + 2326 9 full-splice_match STX12 ENST00000373943.9 3034 9 33 675 -3 -675 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 45 11.036945 1.042849 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TTTGTAGTATGTTTTTATGA 23 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 45 NA PB.475.6 chr1 + 813 7 incomplete-splice_match STX12 ENST00000373943.9 3034 9 71 6374 35 -5 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAGAAAGAAAGAAAGA 61 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.475.7 chr1 + 1963 6 incomplete-splice_match STX12 ENST00000373943.9 3034 9 28480 673 -8224 -673 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGTAGTATGTTTTTATGAGT NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 5 NA PB.475.9 chr1 + 2439 4 incomplete-splice_match STX12 ENST00000373943.9 3034 9 38977 3 1949 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATTCTCCTTATCTGTGCC NA FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.475.10 chr1 + 1694 3 incomplete-splice_match STX12 ENST00000373943.9 3034 9 44631 676 7603 -676 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTTTGTAGTATGTTTTTATG NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.475.11 chr1 + 1589 2 incomplete-splice_match STX12 ENST00000373943.9 3034 9 46462 676 9434 -676 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTTTGTAGTATGTTTTTATG NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.476.1 chr1 - 845 5 full-splice_match IFI6 ENST00000361157.11 812 5 -39 6 -19 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 158 38.751942 1.588293 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAACACTTTGTCCTGCTGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 158 NA PB.476.2 chr1 - 969 5 full-splice_match IFI6 ENST00000361157.11 812 5 -163 6 -143 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAACACTTTGTCCTGCTGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.476.3 chr1 - 830 5 full-splice_match IFI6 ENST00000339145.8 822 5 -14 6 0 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAACACTTTGTCCTGCTGT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.476.4 chr1 - 818 5 full-splice_match IFI6 ENST00000362020.4 828 5 6 4 0 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 34 8.339025 0.921115 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAACACTTTGTCCTGCTGT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 34 NA PB.476.5 chr1 - 634 3 incomplete-splice_match IFI6 ENST00000339145.8 822 5 3643 6 3643 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAACACTTTGTCCTGCTGT 3655 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.477.1 chr1 + 2648 7 full-splice_match PPP1R8 ENST00000431586.1 1029 7 -524 -1095 -14 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTGGGTGCAGGCTGTGAA 0 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.477.2 chr1 + 2311 7 full-splice_match PPP1R8 ENST00000311772.10 2340 7 24 5 -8 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 GGAAATTCTAATGAGAGAAT 6 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 10 NA PB.477.3 chr1 + 2167 7 full-splice_match PPP1R8 ENST00000311772.10 2340 7 24 149 -8 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 132 32.375042 1.510210 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTGGGTGCAGGCTGTGAA 6 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 132 NA PB.477.5 chr1 + 1943 5 incomplete-splice_match PPP1R8 ENST00000373931.8 2651 7 7954 145 7452 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTGGGTGCAGGCTGTGAA 4374 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.477.7 chr1 + 1724 4 incomplete-splice_match PPP1R8 ENST00000373931.8 2651 7 10334 145 -8937 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTGGGTGCAGGCTGTGAA 138 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.477.8 chr1 + 1535 3 incomplete-splice_match PPP1R8 ENST00000236412.11 2414 6 12482 1 -6797 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.188451 0.503580 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTGGGTGCAGGCTGTGAA 2278 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 13 NA PB.479.1 chr1 + 2712 6 full-splice_match THEMIS2 ENST00000373921.8 2713 6 0 1 0 1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 34 8.339025 0.921115 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATGAATGAGAACGGTATCAT -5 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 34 NA PB.479.2 chr1 + 2302 5 novel_in_catalog THEMIS2 novel 2713 6 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TGAATGAGAACGGTATCATT -5 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 3 NA PB.479.3 chr1 + 1228 4 full-splice_match THEMIS2 ENST00000373927.7 1082 4 -5 -141 0 1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATGAATGAGAACGGTATCAT -5 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 6 NA PB.479.4 chr1 + 1081 3 novel_in_catalog THEMIS2 novel 1082 4 NA NA 0 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TATGAATGAGAACGGTATCA 0 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.479.5 chr1 + 1918 3 incomplete-splice_match THEMIS2 ENST00000456990.1 1926 5 2359 0 -1308 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TATGAATGAGAACGGTATCA 2437 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.479.6 chr1 + 1521 3 incomplete-splice_match THEMIS2 ENST00000456990.1 1926 5 2764 -8 -903 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AGAACGGTATCATTTATTAA 2842 FALSE NA NA AATAAA -28 NA NA NA 2 NA PB.479.7 chr1 + 1123 3 incomplete-splice_match THEMIS2 ENST00000456990.1 1926 5 3154 0 -513 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TATGAATGAGAACGGTATCA 310 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.479.8 chr1 + 1022 2 full-splice_match THEMIS2 ENST00000492877.1 2861 2 1841 -2 1841 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TGAATGAGAACGGTATCATT 1649 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 3 NA PB.480.3 chr1 + 1738 7 full-splice_match SMPDL3B ENST00000373888.8 1548 7 -39 -151 0 151 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAATGCATTAAGTGTG 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.480.4 chr1 + 1586 7 full-splice_match SMPDL3B ENST00000373888.8 1548 7 -39 1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCAAGGCTTCCCACAGTC 6 TRUE NA NA GATAAA -22 NA NA NA 4 NA PB.480.5 chr1 + 1863 8 full-splice_match SMPDL3B ENST00000373894.8 1866 8 2 1 2 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.169513 0.620085 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTCTGTGTTGTGTTCCTTT 8 TRUE NA NA AAAACA -19 NA NA NA 17 NA PB.480.6 chr1 + 1745 8 full-splice_match SMPDL3B ENST00000373894.8 1866 8 120 1 10 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTCTGTGTTGTGTTCCTTT 82 FALSE NA NA AAAACA -19 NA NA NA 3 NA PB.480.7 chr1 + 1405 6 incomplete-splice_match SMPDL3B ENST00000548116.5 1913 8 14035 8 13954 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGATTCTGTGTTGTGTTCCT 5396 FALSE NA NA AAAACA -17 NA NA NA 2 NA PB.481.1 chr1 - 1994 10 novel_not_in_catalog RPA2 novel 1584 9 NA NA 0 -5 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAAATTCTCGTTTTTCTTT -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.481.2 chr1 - 1230 6 incomplete-splice_match RPA2 ENST00000373912.8 1584 9 7532 5 7470 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.660044 0.668390 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAAATTCTCGTTTTTCTTT 7690 FALSE NA NA AAAAAG -20 NA NA NA 19 NA PB.481.4 chr1 - 1439 8 novel_in_catalog RPA2 novel 1584 9 NA NA 26 2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AACTTGTAAAAATTCTCGTT 18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.481.5 chr1 - 1597 9 full-splice_match RPA2 ENST00000373912.8 1584 9 -25 12 -12 2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 1120 274.697327 2.438854 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AACTTGTAAAAATTCTCGTT -33 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 1120 NA PB.481.6 chr1 - 1834 8 full-splice_match RPA2 ENST00000313433.11 1237 8 -62 -535 0 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACTTGTAAAAATTCTCG -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.481.7 chr1 - 1733 9 full-splice_match RPA2 ENST00000373912.8 1584 9 -164 15 7 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 38 9.320087 0.969420 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AGTAACTTGTAAAAATTCTC -6 TRUE NA NA AAGAAA -8 NA NA NA 38 NA PB.481.8 chr1 - 1762 9 novel_not_in_catalog RPA2 novel 1584 9 NA NA -29 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AGTAACTTGTAAAAATTCTC 116 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.481.9 chr1 - 1544 9 full-splice_match RPA2 ENST00000373909.7 1162 9 3 -385 3 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AGTAACTTGTAAAAATTCTC -10 TRUE NA NA AAGAAA -12 NA NA NA 9 NA PB.481.10 chr1 - 1062 5 incomplete-splice_match RPA2 ENST00000373912.8 1584 9 16910 15 -580 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.924247 0.593756 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AGTAACTTGTAAAAATTCTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.481.11 chr1 - 995 3 incomplete-splice_match RPA2 ENST00000373912.8 1584 9 20095 15 2605 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AGTAACTTGTAAAAATTCTC NA FALSE NA NA TATAAA -30 NA NA NA 2 NA PB.481.12 chr1 - 852 3 incomplete-splice_match RPA2 ENST00000373912.8 1584 9 20238 15 2748 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.697920 0.431029 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AGTAACTTGTAAAAATTCTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.481.13 chr1 - 1576 9 novel_in_catalog RPA2 novel 1584 9 NA NA 4 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TAGTAACTTGTAAAAATTCT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.481.14 chr1 - 1483 8 novel_in_catalog RPA2 novel 1584 9 NA NA 10 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 25 6.131637 0.787576 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TAGTAACTTGTAAAAATTCT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 25 NA PB.481.15 chr1 - 1354 8 full-splice_match RPA2 ENST00000313433.11 1237 8 416 -533 416 -2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TAGTAACTTGTAAAAATTCT 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.481.16 chr1 - 1124 10 novel_in_catalog RPA2 novel 1584 9 NA NA 4 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TAGTAACTTGTAAAAATTCT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.481.17 chr1 - 971 4 incomplete-splice_match RPA2 ENST00000373912.8 1584 9 17511 16 21 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.697920 0.431029 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TAGTAACTTGTAAAAATTCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.481.18 chr1 - 1391 9 full-splice_match RPA2 ENST00000373912.8 1584 9 107 86 45 -72 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAGAAGAAGTGTTACTGC 265 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.483.4 chr1 - 2146 17 incomplete-splice_match EYA3 ENST00000373871.8 5999 18 30555 3727 32 -603 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAATGAAAAAGAAAAGG 101 FALSE NA NA TTTAAA -1 NA NA NA 2 NA PB.483.9 chr1 - 781 4 incomplete-splice_match EYA3 ENST00000373864.5 2459 14 68309 603 21308 -603 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAATGAAAAAGAAAAGG NA FALSE NA NA AATAAA -5 NA NA NA 2 NA PB.483.10 chr1 - 1936 18 novel_in_catalog EYA3 novel 1729 17 NA NA 6 2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGTTGGCATTATTATCTCAT -21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.483.13 chr1 - 1777 16 incomplete-splice_match EYA3 ENST00000373871.8 5999 18 -21 18130 6 -1 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACCTATTATTTTCTAGCCCC -21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.483.14 chr1 - 1522 14 novel_not_in_catalog EYA3 novel 1806 17 NA NA 2 1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATGCACCTATTATTTTCTAG 71 FALSE NA NA AAAAAG -28 NA NA NA 2 NA PB.483.15 chr1 - 1831 17 full-splice_match EYA3 ENST00000471498.5 1806 17 -27 2 13 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATGATGCACCTATTATTTTC -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.483.16 chr1 - 1603 15 incomplete-splice_match EYA3 ENST00000373863.3 1729 17 -38 11208 -5 -2 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.660044 0.668390 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATGATGCACCTATTATTTTC 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.483.17 chr1 - 1083 9 incomplete-splice_match EYA3 ENST00000373863.3 1729 17 -56 33527 -10 -4 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAGAAAAATGTAAAAAGA -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.483.19 chr1 - 1263 1 full-splice_match RN7SL559P ENST00000476501.3 297 1 -943 -23 -943 23 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA NA NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAGAATAATTGGAAGCAAA NA FALSE NA NA AATAAA -31 NA NA NA 2 NA PB.484.1 chr1 - 888 1 full-splice_match SPCS2P4 ENST00000436160.1 681 1 -199 -8 -199 8 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA NA NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAAGTAGCCCTCTTTCTCC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.485.2 chr1 - 1879 10 full-splice_match DNAJC8 ENST00000489277.5 1600 10 -1 -278 -1 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAGCGTCCAGCTCACAGTC -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.485.3 chr1 - 1204 3 incomplete-splice_match DNAJC8 ENST00000603289.5 483 5 55 825 55 -3 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAGCGTCCAGCTCACAGTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.485.5 chr1 - 1748 9 full-splice_match DNAJC8 ENST00000263697.6 1763 9 11 4 2 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 54 13.244334 1.122030 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAGCGTCCAGCTCACAGT 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 54 NA PB.485.6 chr1 - 1486 9 full-splice_match DNAJC8 ENST00000263697.6 1763 9 -4 281 -4 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 1860 456.193756 2.659149 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 1860 NA PB.485.7 chr1 - 1342 8 novel_not_in_catalog DNAJC8 novel 1763 9 NA NA -1 5 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTGATGTACTTTTCCTTGT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.485.8 chr1 - 3541 7 novel_in_catalog DNAJC8 novel 1600 10 NA NA 0 1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCCATTGATGTACTTTTCC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.485.9 chr1 - 1580 10 full-splice_match DNAJC8 ENST00000489277.5 1600 10 20 0 -1 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 33 8.093760 0.908150 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC 20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 33 NA PB.485.10 chr1 - 1489 9 novel_in_catalog DNAJC8 novel 1600 10 NA NA -5 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.924247 0.593756 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC 16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.485.11 chr1 - 1468 9 novel_not_in_catalog DNAJC8 novel 1600 10 NA NA 0 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC 21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.485.12 chr1 - 1373 8 novel_not_in_catalog DNAJC8 novel 1600 10 NA NA 0 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC 21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.485.13 chr1 - 1384 8 novel_in_catalog DNAJC8 novel 1600 10 NA NA -1 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.485.14 chr1 - 1390 8 novel_in_catalog DNAJC8 novel 1763 9 NA NA 0 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.485.15 chr1 - 1407 8 novel_in_catalog DNAJC8 novel 1600 10 NA NA -1 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.485.16 chr1 - 1244 6 novel_in_catalog DNAJC8 novel 1600 10 NA NA 0 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.485.17 chr1 - 1263 7 incomplete-splice_match DNAJC8 ENST00000489277.5 1600 10 18037 0 -6179 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 28 6.867433 0.836794 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC NA FALSE NA NA CATAAA -15 NA NA NA 28 NA PB.485.18 chr1 - 1042 4 novel_not_in_catalog DNAJC8 novel 1600 10 NA NA 0 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 49 12.018007 1.079832 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 49 NA PB.485.19 chr1 - 1088 5 incomplete-splice_match DNAJC8 ENST00000489277.5 1600 10 23018 0 -1198 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 39 9.565352 0.980701 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 39 NA PB.485.20 chr1 - 924 3 incomplete-splice_match DNAJC8 ENST00000603289.5 483 5 57 1103 57 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 25 6.131637 0.787576 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 25 NA PB.485.21 chr1 - 846 2 incomplete-splice_match DNAJC8 ENST00000603289.5 483 5 1570 1103 1570 0 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.485.23 chr1 - 1159 9 full-splice_match DNAJC8 ENST00000263697.6 1763 9 5 599 1 -318 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 140 34.337166 1.535764 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GTTGCTGTGACTTCAGAGAC 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 140 NA PB.485.24 chr1 - 1267 10 full-splice_match DNAJC8 ENST00000489277.5 1600 10 7 326 2 -326 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAACAGTGTTGCTGTGACT 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.485.25 chr1 - 1054 8 novel_in_catalog DNAJC8 novel 1763 9 NA NA 0 -326 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAACAGTGTTGCTGTGACT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.485.26 chr1 - 704 9 full-splice_match DNAJC8 ENST00000263697.6 1763 9 11 1048 2 -767 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AATACGAAGGGGAAGAAAGA 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.486.1 chr1 + 2154 3 full-splice_match XKR8 ENST00000373884.6 2178 3 24 0 24 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 35 8.584291 0.933704 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAACCTAGTCTGTGTCATCA -5 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 35 NA PB.486.2 chr1 + 2050 3 full-splice_match XKR8 ENST00000373884.6 2178 3 128 0 56 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAACCTAGTCTGTGTCATCA 56 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 7 NA PB.486.3 chr1 + 2120 4 novel_in_catalog XKR8 novel 2427 6 NA NA 94 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAACCTAGTCTGTGTCATCA 94 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.486.4 chr1 + 1831 3 full-splice_match XKR8 ENST00000373884.6 2178 3 348 -1 59 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACCTAGTCTGTGTCATCAA 276 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.486.5 chr1 + 1790 2 incomplete-splice_match XKR8 ENST00000373884.6 2178 3 3522 0 3233 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAACCTAGTCTGTGTCATCA 3450 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.487.4 chr1 + 1882 2 full-splice_match ATP5IF1 ENST00000465645.1 1855 2 -20 -7 -8 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 117 28.696058 1.457822 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTTGATGCCTTCTTCTATCT -5 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 117 NA PB.487.5 chr1 + 479 3 full-splice_match ATP5IF1 ENST00000335514.10 503 3 22 2 4 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 41 10.055883 1.002420 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AACTGTGTTTGATGCCTTCT 7 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 41 NA PB.488.2 chr1 + 3489 10 full-splice_match SESN2 ENST00000253063.4 3462 10 -28 1 -28 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTCCCTTTTTATGGGCTGT 5 TRUE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 5 NA PB.489.1 chr1 + 901 3 full-splice_match MED18 ENST00000373842.9 1829 3 -24 952 14 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GAAAAAATATGTTTGCTTTT -41 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.489.3 chr1 + 1477 4 novel_not_in_catalog MED18 novel 1106 4 NA NA -18 1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATGTCTGTGTAATTCTGATT -35 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.489.6 chr1 + 1288 4 novel_not_in_catalog MED18 novel 1106 4 NA NA -9 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 23 5.641106 0.751364 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACATGTCTGTGTAATTCTGA -26 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 23 NA PB.489.7 chr1 + 1048 4 novel_not_in_catalog MED18 novel 1829 3 NA NA -9 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CATGTCTGTGTAATTCTGAT -26 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.489.8 chr1 + 1838 3 full-splice_match MED18 ENST00000373842.9 1829 3 -8 -1 -8 1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATGTCTGTGTAATTCTGATT -25 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.489.10 chr1 + 861 2 novel_not_in_catalog MED18 novel 1106 4 NA NA 4272 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACATGTCTGTGTAATTCTGA 5498 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.490.3 chr1 + 2655 12 novel_in_catalog PHACTR4 novel 6048 14 NA NA -40 139 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 GCAAAAAAAAAAAAAAAAAA -26 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.490.4 chr1 + 1824 11 novel_in_catalog PHACTR4 novel 6048 14 NA NA -40 -5368 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TACCTGGAAAGCACTCTCTT -26 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.490.6 chr1 + 2186 13 novel_in_catalog PHACTR4 novel 3078 17 NA NA 9 -5368 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TACCTGGAAAGCACTCTCTT 23 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.490.8 chr1 + 3228 14 full-splice_match PHACTR4 ENST00000373839.8 6048 14 -15 2835 -14 -16 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 29 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.490.9 chr1 + 3469 15 novel_not_in_catalog PHACTR4 novel 6048 14 NA NA 1 141 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG 45 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 3 NA PB.490.10 chr1 + 3369 14 full-splice_match PHACTR4 ENST00000373839.8 6048 14 1 2678 1 141 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG 45 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 4 NA PB.490.11 chr1 + 2140 12 incomplete-splice_match PHACTR4 ENST00000373839.8 6048 14 1 8576 1 -5368 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TACCTGGAAAGCACTCTCTT 45 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.490.12 chr1 + 2210 13 novel_not_in_catalog PHACTR4 novel 6048 14 NA NA 27 -5368 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TACCTGGAAAGCACTCTCTT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.490.21 chr1 + 2345 8 incomplete-splice_match PHACTR4 ENST00000373836.4 3107 13 35461 -383 -18063 141 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG NA FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 3 NA PB.490.22 chr1 + 2061 8 incomplete-splice_match PHACTR4 ENST00000373836.4 3107 13 35745 -383 -17779 141 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG NA FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.490.23 chr1 + 1915 8 incomplete-splice_match PHACTR4 ENST00000373836.4 3107 13 35890 -382 -17634 140 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.490.24 chr1 + 1370 3 incomplete-splice_match PHACTR4 ENST00000632964.1 1853 4 -47 2678 -47 141 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG NA FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 4 NA PB.490.25 chr1 + 1075 2 incomplete-splice_match PHACTR4 ENST00000632964.1 1853 4 1318 2835 1318 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.492.1 chr1 + 2701 14 full-splice_match RCC1 ENST00000649185.1 2686 14 0 -15 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.492.2 chr1 + 909 2 novel_in_catalog SNHG3 novel 2201 3 NA NA 0 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTTGTGGTTCATTTTTG NA FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 2 NA PB.492.3 chr1 + 936 3 novel_not_in_catalog SNHG3 novel 2201 3 NA NA 22 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTTGTGGTTCATTTTTG NA FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 2 NA PB.492.4 chr1 + 2512 12 novel_in_catalog RCC1 novel 2551 13 NA NA -1 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAAATAGGCCACTTGTTTT -5 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 4 NA PB.492.5 chr1 + 2596 14 novel_in_catalog RCC1 novel 2686 14 NA NA 0 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC -4 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 5 NA PB.492.6 chr1 + 1548 2 incomplete-splice_match SNHG3 ENST00000413987.1 2201 3 63 1259 63 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.697920 0.431029 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTTGTGGTTCATTTTTG -4 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 11 NA PB.492.7 chr1 + 987 4 novel_not_in_catalog SNHG3 novel 2201 3 NA NA 63 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTTGTGGTTCATTTTTG -4 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 5 NA PB.492.8 chr1 + 967 4 novel_not_in_catalog SNHG3 novel 2201 3 NA NA 63 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAACCAGTGGTTTTAGTATG -4 TRUE NA NA AGTAAA -14 NA NA NA 5 NA PB.492.9 chr1 + 859 2 novel_in_catalog SNHG3 novel 2201 3 NA NA 63 13 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 27 6.622167 0.821000 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTTTGTGGAGGTGGCTGT -4 TRUE NA NA AATAAA -23 NA NA NA 27 NA PB.492.10 chr1 + 891 3 full-splice_match SNHG3 ENST00000413987.1 2201 3 64 1246 64 13 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 195 47.826763 1.679671 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTTTGTGGAGGTGGCTGT -3 TRUE NA NA AATAAA -23 NA NA NA 195 NA PB.492.11 chr1 + 2654 13 full-splice_match RCC1 ENST00000683442.1 2551 13 1 -104 1 -103 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ACAACTTAAGTGATGTCAAG -3 TRUE NA NA AATAAA -23 NA NA NA 2 NA PB.492.12 chr1 + 2562 13 novel_in_catalog RCC1 novel 2686 14 NA NA 1 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC -3 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.492.14 chr1 + 2543 13 full-splice_match RCC1 ENST00000683442.1 2551 13 2 6 2 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC -2 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 9 NA PB.492.15 chr1 + 2400 12 full-splice_match RCC1 ENST00000398958.6 2715 12 102 213 2 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC -2 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.492.16 chr1 + 1235 4 novel_not_in_catalog SNHG3 novel 2201 3 NA NA 65 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAACCAGTGGTTTTAGTATG -2 TRUE NA NA AGTAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.492.17 chr1 + 2129 3 full-splice_match SNHG3 ENST00000413987.1 2201 3 70 2 70 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACCAGTGGTTTTAGTATGT 3 TRUE NA NA AGTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.492.18 chr1 + 2568 1 full-splice_match SNORA73A ENST00000364938.1 206 1 -300 -2062 -300 2062 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTTGTGGTTCATTTTTG 423 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 2 NA PB.492.19 chr1 + 2326 1 full-splice_match SNORA73A ENST00000364938.1 206 1 -60 -2060 -60 2060 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCATGTTTGTGGTTCATTTT 663 FALSE NA NA AATAAA -8 NA NA NA 2 NA PB.492.20 chr1 + 838 2 full-splice_match SNHG3 ENST00000437681.1 2614 2 1776 0 1776 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTTGTGGTTCATTTTTG 704 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 9 NA PB.492.21 chr1 + 1284 1 full-splice_match SNORA73B ENST00000363217.1 204 1 -209 -871 -209 871 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTTGTGGTTCATTTTTG 164 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 5 NA PB.492.22 chr1 + 940 1 full-splice_match SNORA73B ENST00000363217.1 204 1 135 -871 135 871 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTTGTGGTTCATTTTTG 133 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 2 NA PB.492.26 chr1 + 2342 10 incomplete-splice_match RCC1 ENST00000683442.1 2551 13 10734 6 -1359 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC 4779 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.492.27 chr1 + 1592 10 full-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 15 817 15 2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTTCCTCCTCTTTGGAATTT 6153 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.492.28 chr1 + 1625 10 full-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 116 683 -5 136 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.188451 0.503580 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTGGTTGGCCCTGGCTTTGC 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.492.29 chr1 + 2478 11 novel_in_catalog RCC1 novel 1577 11 NA NA -25 93 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 75 18.394909 1.264698 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GTGTTGAGGCTACAACTTAA -10 TRUE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 75 NA PB.492.30 chr1 + 2326 10 full-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 98 0 -23 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 324 79.466011 1.900181 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC -8 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 324 NA PB.492.31 chr1 + 1609 11 novel_in_catalog RCC1 novel 1577 11 NA NA -7 67 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGGAACATGGCTCACTC 8 TRUE NA NA AATAAA -25 NA NA NA 10 NA PB.492.32 chr1 + 2522 10 full-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 114 -212 -7 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATTTTGTTTGGGTATTTC 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.492.33 chr1 + 2189 9 novel_in_catalog RCC1 novel 2424 10 NA NA -7 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAAATAGGCCACTTGTTTT 8 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 4 NA PB.492.34 chr1 + 2418 10 full-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 116 -110 -5 -103 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 25 6.131637 0.787576 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ACAACTTAAGTGATGTCAAG 10 TRUE NA NA AATAAA -23 NA NA NA 25 NA PB.492.35 chr1 + 1488 10 full-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 116 820 -5 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 20 4.905309 0.690666 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTCCTTCCTCCTCTTTGGAA 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 20 NA PB.492.36 chr1 + 2398 11 full-splice_match RCC1 ENST00000373831.7 1577 11 -2 -819 -2 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC 13 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 8 NA PB.492.37 chr1 + 2223 9 novel_in_catalog RCC1 novel 2424 10 NA NA -2 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC 13 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.492.38 chr1 + 2152 9 novel_in_catalog RCC1 novel 2424 10 NA NA -2 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC 13 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.492.39 chr1 + 2292 10 novel_not_in_catalog RCC1 novel 538 6 NA NA 45 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC 30 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.492.41 chr1 + 2214 9 incomplete-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 11759 0 -2040 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.492.42 chr1 + 2174 8 incomplete-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 13761 -99 -38 93 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.150575 0.711856 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GTGTTGAGGCTACAACTTAA NA FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 21 NA PB.492.43 chr1 + 1957 7 incomplete-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 14059 0 260 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 23 5.641106 0.751364 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 23 NA PB.492.44 chr1 + 1908 7 incomplete-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 14118 -10 319 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTTGTTTTCTACACATTCC NA FALSE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 2 NA PB.492.45 chr1 + 956 6 incomplete-splice_match RCC1 ENST00000373831.7 1577 11 16820 -1 -1016 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CCTTCCTCCTCTTTGGAATT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.492.46 chr1 + 1860 6 incomplete-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 16954 -99 -1003 93 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GTGTTGAGGCTACAACTTAA NA FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.492.47 chr1 + 1759 5 incomplete-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 17167 -100 -790 94 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.414778 0.644909 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGTTGAGGCTACAACTTAAG NA FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 18 NA PB.492.48 chr1 + 1548 4 incomplete-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 17768 0 -189 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.924247 0.593756 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 16 NA PB.492.49 chr1 + 1307 2 incomplete-splice_match RCC1 ENST00000478232.1 509 3 652 -1085 652 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 34 8.339025 0.921115 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 34 NA PB.492.50 chr1 + 1376 2 incomplete-splice_match RCC1 ENST00000478232.1 509 3 778 -1280 778 -18 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAGGAAAAGTTTTGTTTGAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.492.51 chr1 + 1179 2 incomplete-splice_match RCC1 ENST00000478232.1 509 3 780 -1085 780 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 28 6.867433 0.836794 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 28 NA PB.494.1 chr1 + 1062 9 full-splice_match TRNAU1AP ENST00000373830.4 1799 9 -73 810 -73 -9 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAATAATGACTGTTTTTGGA -2 TRUE NA NA TTTAAA -40 NA NA NA 6 NA PB.494.2 chr1 + 1898 9 novel_in_catalog TRNAU1AP novel 1132 10 NA NA -2 -5 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATGAATGTTTCTACAACACT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.494.3 chr1 + 1132 10 novel_in_catalog TRNAU1AP novel 1132 10 NA NA -2 -6 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 CATGAATGTTTCTACAACAC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.494.4 chr1 + 1016 9 full-splice_match TRNAU1AP ENST00000373830.4 1799 9 11 772 -1 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 97 23.790749 1.376408 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACACTGCTGCATTCATTTG 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 97 NA PB.494.5 chr1 + 1781 9 full-splice_match TRNAU1AP ENST00000373830.4 1799 9 15 3 1 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.943186 0.468818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTATTAGTCTTTTTATTCTT 5 TRUE NA NA AATATA -4 NA NA NA 12 NA PB.494.6 chr1 + 1157 10 full-splice_match TRNAU1AP ENST00000480930.5 1132 10 4 -29 -3 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACACTGCTGCATTCATTTG 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.494.7 chr1 + 1460 6 novel_in_catalog TRNAU1AP novel 1132 10 NA NA -1 -17 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 ATAAAAAAAAAAAAAAAGTT 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.494.8 chr1 + 1386 10 novel_in_catalog TRNAU1AP novel 1132 10 NA NA -1 -5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATGAATGTTTCTACAACACT 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.494.9 chr1 + 1040 7 incomplete-splice_match TRNAU1AP ENST00000480930.5 1132 10 12 9969 4 443 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAAATTACTTCCATTTTT 16 TRUE NA NA AATAAA -5 NA NA NA 2 NA PB.494.10 chr1 + 1056 9 novel_in_catalog TRNAU1AP novel 1008 8 NA NA -19 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAATGTTTCTACAACACTGC 119 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.494.11 chr1 + 673 5 incomplete-splice_match TRNAU1AP ENST00000491577.5 1610 8 11647 -9 4120 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACACTGCTGCATTCATTTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.495.1 chr1 - 1512 4 novel_in_catalog SNHG12 novel 1104 5 NA NA 1 20 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAAAGAAGAATAAAAAG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.495.2 chr1 - 1065 5 full-splice_match SNHG12 ENST00000470977.6 1104 5 6 33 1 20 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAAAGAAGAATAAAAAG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.495.3 chr1 - 1048 5 full-splice_match SNHG12 ENST00000461832.2 1082 5 1 33 1 20 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.169513 0.620085 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAAAGAAGAATAAAAAG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.495.5 chr1 - 821 5 full-splice_match SNHG12 ENST00000461832.2 1082 5 228 33 -22 20 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAAAGAAGAATAAAAAG 224 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.496.1 chr1 + 2013 2 full-splice_match RAB42 ENST00000465518.3 2236 2 216 7 216 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATCTCCATCTCAGAATCTGC 216 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.496.2 chr1 + 805 2 full-splice_match RAB42 ENST00000465518.3 2236 2 216 1215 216 -1209 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGTCATGCTTCCTGGATT 216 FALSE NA NA TATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.498.1 chr1 - 1441 6 full-splice_match TAF12 ENST00000263974.4 1359 6 -80 -2 0 2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGACAGGGTACCTTTGAA 5185 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.498.2 chr1 - 1166 6 novel_not_in_catalog TAF12 novel 1100 6 NA NA -65 2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGACAGGGTACCTTTGAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.498.3 chr1 - 990 5 incomplete-splice_match TAF12 ENST00000263974.4 1359 6 20860 -2 88 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGACAGGGTACCTTTGAA NA FALSE NA NA AAGAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.498.4 chr1 - 1182 7 full-splice_match TAF12 ENST00000690860.1 1196 7 10 4 6 1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GAAAGACAGGGTACCTTTGA -20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.498.5 chr1 - 1122 6 full-splice_match TAF12 ENST00000373824.9 1335 6 -37 250 0 1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 371 90.993484 1.959010 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GAAAGACAGGGTACCTTTGA -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 371 NA PB.498.6 chr1 - 851 5 full-splice_match TAF12 ENST00000691050.1 785 5 -70 4 0 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GAAAGACAGGGTACCTTTGA 5185 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.498.7 chr1 - 793 5 incomplete-splice_match TAF12 ENST00000263974.4 1359 6 21056 -1 284 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GAAAGACAGGGTACCTTTGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.498.8 chr1 - 954 6 full-splice_match TAF12 ENST00000373824.9 1335 6 -24 405 -6 -28 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 29 7.112698 0.852034 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGCATTATGGTCTTTTTG 5179 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 29 NA PB.499.1 chr1 + 1966 10 full-splice_match GMEB1 ENST00000373816.6 6358 10 -53 4445 -47 22 alternative_3end5end TRUE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAATGTTGGGTTCTTCCCA 2 TRUE NA NA TTTAAA -33 NA NA NA 5 NA PB.499.2 chr1 + 1943 10 novel_not_in_catalog GMEB1 novel 2063 9 NA NA -44 83 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGTTGAGAGTAGGTCATTC 5 TRUE NA NA AAAACA -15 NA NA NA 3 NA PB.499.3 chr1 + 2122 10 full-splice_match GMEB1 ENST00000294409.2 1912 10 -12 -198 -10 6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTCCAGGCTCGTCTGTGT -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.499.4 chr1 + 1912 10 full-splice_match GMEB1 ENST00000294409.2 1912 10 0 0 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAAACAAAATC 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.499.5 chr1 + 1880 10 full-splice_match GMEB1 ENST00000373816.6 6358 10 -2 4480 -2 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 20 4.905309 0.690666 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAAACAAAATC 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 20 NA PB.499.6 chr1 + 1720 9 incomplete-splice_match GMEB1 ENST00000361872.8 1894 10 14907 13 121 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAAACAAAATC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.499.7 chr1 + 1184 4 incomplete-splice_match GMEB1 ENST00000480454.1 2063 9 18884 192 18884 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAAACAAAATC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.500.1 chr1 + 2598 5 full-splice_match YTHDF2 ENST00000373812.8 2744 5 -508 654 -189 -4 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.500.2 chr1 + 2409 5 full-splice_match YTHDF2 ENST00000373812.8 2744 5 -319 654 0 -4 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.500.3 chr1 + 1297 4 novel_in_catalog YTHDF2 novel 2825 6 NA NA -138 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCTAGTACCATTTAGTA -12 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 5 NA PB.500.4 chr1 + 2218 5 full-splice_match YTHDF2 ENST00000373812.8 2744 5 -128 654 -128 -4 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 50 12.263273 1.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 50 NA PB.500.5 chr1 + 3181 3 novel_in_catalog YTHDF2 novel 2594 4 NA NA -5 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.500.6 chr1 + 2092 5 full-splice_match YTHDF2 ENST00000373812.8 2744 5 -2 654 -2 -4 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 451 110.614723 2.043813 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 451 NA PB.500.7 chr1 + 1135 3 novel_in_catalog YTHDF2 novel 2825 6 NA NA -1 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCTAGTACCATTTAGTA -12 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.500.8 chr1 + 1151 4 novel_in_catalog YTHDF2 novel 2825 6 NA NA -2 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 35 8.584291 0.933704 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCTAGTACCATTTAGTA -3 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 35 NA PB.500.9 chr1 + 3242 4 full-splice_match YTHDF2 ENST00000478283.5 2594 4 1 -649 1 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCTAGTACCATTTAGTA 0 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.500.10 chr1 + 2732 5 full-splice_match YTHDF2 ENST00000373812.8 2744 5 11 1 1 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.150575 0.711856 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCTAGTACCATTTAGTA 0 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 21 NA PB.500.11 chr1 + 2589 4 full-splice_match YTHDF2 ENST00000478283.5 2594 4 1 4 1 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.924247 0.593756 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.500.12 chr1 + 2175 6 novel_in_catalog YTHDF2 novel 2744 5 NA NA 1 -4 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.500.14 chr1 + 2040 4 full-splice_match YTHDF2 ENST00000541996.5 2719 4 25 654 0 -4 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA 14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.500.15 chr1 + 1051 4 novel_in_catalog YTHDF2 novel 2825 6 NA NA 83 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCTAGTACCATTTAGTA -1 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.500.16 chr1 + 1906 5 full-splice_match YTHDF2 ENST00000373812.8 2744 5 184 654 159 -4 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.697920 0.431029 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA 29 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.500.17 chr1 + 2362 4 full-splice_match YTHDF2 ENST00000478283.5 2594 4 228 4 213 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA 83 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.500.18 chr1 + 1904 4 novel_in_catalog YTHDF2 novel 358 3 NA NA 1 -4 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.697920 0.431029 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA 656 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.500.19 chr1 + 1680 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000478283.5 2594 4 5550 4 3409 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.169513 0.620085 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA 4408 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.500.20 chr1 + 2175 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000373812.8 2744 5 5718 1 3567 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCTAGTACCATTTAGTA 4566 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 3 NA PB.500.21 chr1 + 1509 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000478283.5 2594 4 5721 4 3580 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.924247 0.593756 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA 4579 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.500.22 chr1 + 1424 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000478283.5 2594 4 5806 4 3665 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA 4664 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.500.23 chr1 + 1341 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000478283.5 2594 4 5889 4 3748 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.150575 0.711856 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA 4747 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 21 NA PB.500.24 chr1 + 1220 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000478283.5 2594 4 6010 4 3869 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA 4868 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.500.25 chr1 + 1066 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000478283.5 2594 4 6164 4 4023 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 20 4.905309 0.690666 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA 5022 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 20 NA PB.500.26 chr1 + 870 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000478283.5 2594 4 6360 4 4219 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.943186 0.468818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA 5218 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.500.27 chr1 + 1522 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000373812.8 2744 5 6371 1 4220 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCTAGTACCATTTAGTA 5219 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.500.28 chr1 + 700 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000478283.5 2594 4 6530 4 4389 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA 5388 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.500.29 chr1 + 1278 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000373812.8 2744 5 6615 1 4464 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.697920 0.431029 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCTAGTACCATTTAGTA 5463 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 11 NA PB.500.30 chr1 + 1184 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000373812.8 2744 5 6709 1 4558 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCTAGTACCATTTAGTA 5557 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 6 NA PB.500.31 chr1 + 1096 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000373812.8 2744 5 6797 1 4646 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCTAGTACCATTTAGTA 5645 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 6 NA PB.500.32 chr1 + 981 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000373812.8 2744 5 6912 1 4761 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.924247 0.593756 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCTAGTACCATTTAGTA 5760 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 16 NA PB.500.33 chr1 + 875 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000373812.8 2744 5 7018 1 4867 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.678982 0.565728 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCTAGTACCATTTAGTA 5866 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 15 NA PB.501.1 chr1 - 1246 1 full-splice_match ENSG00000289291 ENST00000691740.1 1627 1 381 0 381 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCAGTCTTTCGGTTTTTT 380 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.501.2 chr1 - 1634 1 full-splice_match ENSG00000289291 ENST00000691740.1 1627 1 -15 8 -15 -8 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATCGCTATCAGTCTTTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.501.3 chr1 - 1352 1 full-splice_match ENSG00000289291 ENST00000691740.1 1627 1 267 8 267 -8 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATCGCTATCAGTCTTTC 266 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.502.1 chr1 - 2777 2 full-splice_match TMEM200B ENST00000420504.2 2553 2 -216 -8 -216 3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTGTGGTGTGTCTGAGTCA 7965 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.502.3 chr1 - 2504 2 full-splice_match TMEM200B ENST00000521452.2 2468 2 -36 0 -36 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTTACTGTGGTGTGTCTGAG 6743 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.503.1 chr1 - 2292 6 full-splice_match SRSF4 ENST00000373795.7 2300 6 4 4 4 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 84 20.602299 1.313916 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATTTCATGGTGTTTGAA -26 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 84 NA PB.503.2 chr1 - 2183 5 full-splice_match SRSF4 ENST00000466448.4 1264 5 5 -924 3 -4 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATTTCATGGTGTTTGAA -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.503.3 chr1 - 1814 4 incomplete-splice_match SRSF4 ENST00000634348.1 8128 7 14092 -106 138 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.697920 0.431029 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATTTCATGGTGTTTGAA 1031 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.503.4 chr1 - 1629 3 incomplete-splice_match SRSF4 ENST00000634348.1 8128 7 18740 -106 4786 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.697920 0.431029 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATTTCATGGTGTTTGAA 5679 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.503.11 chr1 - 2028 5 incomplete-splice_match SRSF4 ENST00000373795.7 2300 6 21394 6 57 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACAAAATTTCATGGTGTTTG NA FALSE NA NA AAGAAA -21 NA NA NA 8 NA PB.503.12 chr1 - 2100 5 full-splice_match SRSF4 ENST00000466448.4 1264 5 -18 -818 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAGAAAAGAAAAGAAT -30 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.503.13 chr1 - 1915 5 incomplete-splice_match SRSF4 ENST00000373795.7 2300 6 21403 110 66 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAGAAAAGAAAAGAAT NA FALSE NA NA AAGAAA -12 NA NA NA 8 NA PB.503.14 chr1 - 1920 4 incomplete-splice_match SRSF4 ENST00000634348.1 8128 7 13880 0 -63 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAGAAAAGAAAAGAAT 819 FALSE NA NA AATATA -1 NA NA NA 2 NA PB.503.15 chr1 - 1792 4 incomplete-splice_match SRSF4 ENST00000634348.1 8128 7 14008 0 54 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.188451 0.503580 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAGAAAAGAAAAGAAT 947 FALSE NA NA AATAAA -31 NA NA NA 13 NA PB.503.20 chr1 - 2204 6 full-splice_match SRSF4 ENST00000373795.7 2300 6 -15 111 -15 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 179 43.902515 1.642489 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAAGAAAAGAAAAGAA -45 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 179 NA PB.503.21 chr1 - 1675 3 incomplete-splice_match SRSF4 ENST00000634348.1 8128 7 18587 1 4633 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.433716 0.535764 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAAGAAAAGAAAAGAA 5526 FALSE NA NA AAAAAG -31 NA NA NA 14 NA PB.503.22 chr1 - 1500 3 incomplete-splice_match SRSF4 ENST00000634348.1 8128 7 18762 1 4808 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.697920 0.431029 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAAGAAAAGAAAAGAA 5701 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.503.26 chr1 - 1308 6 full-splice_match SRSF4 ENST00000373795.7 2300 6 -98 1090 -98 -162 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGGGCAGGAAGAGAAGCAG 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.505.1 chr1 + 2028 13 incomplete-splice_match EPB41 ENST00000646800.1 6388 19 -36 14456 -24 4123 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACACAGGTTTGTGCCAAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.505.2 chr1 + 5815 19 novel_in_catalog EPB41 novel 5772 18 NA NA -13 -18 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAACAACAACAAAAAGA -36 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.505.4 chr1 + 5653 17 novel_in_catalog EPB41 novel 5772 18 NA NA -7 -18 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAACAACAACAAAAAGA -30 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.505.5 chr1 + 5758 18 full-splice_match EPB41 ENST00000647103.1 5772 18 -7 21 -7 -18 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAACAACAACAAAAAGA -30 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.505.7 chr1 + 1942 6 incomplete-splice_match EPB41 ENST00000482464.6 2154 14 -16 49030 0 -37808 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAAGAAAATGGAAAATC -11 TRUE NA NA TATAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.505.8 chr1 + 5965 19 novel_in_catalog EPB41 novel 6031 21 NA NA -29 -18 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAACAACAACAAAAAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.505.10 chr1 + 5848 18 novel_in_catalog EPB41 novel 6031 21 NA NA 0 -18 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAACAACAACAAAAAGA 19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.505.11 chr1 + 2049 12 incomplete-splice_match EPB41 ENST00000373797.2 2407 15 -5 11912 0 -1205 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGGTATGTCATCAGTCCAA 19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.505.12 chr1 + 656 3 incomplete-splice_match EPB41 ENST00000373797.2 2407 15 51 71855 -1 -61148 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAATTAAGGAAGGAGAAGGA -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.505.14 chr1 + 5523 18 novel_in_catalog EPB41 novel 2937 20 NA NA 2 -18 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAACAACAACAAAAAGA 111 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.505.15 chr1 + 5245 17 incomplete-splice_match EPB41 ENST00000647103.1 5772 18 100743 21 223 -18 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAACAACAACAAAAAGA 332 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.505.16 chr1 + 5011 16 incomplete-splice_match EPB41 ENST00000647103.1 5772 18 106401 21 5881 -18 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAACAACAACAAAAAGA 5990 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.505.18 chr1 + 4029 8 incomplete-splice_match EPB41 ENST00000647103.1 5772 18 152312 21 -15 -18 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAACAACAACAAAAAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.505.19 chr1 + 3711 6 full-splice_match EPB41 ENST00000490308.2 922 6 110 -2899 110 -18 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAACAACAACAAAAAGA 2400 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.505.20 chr1 + 3429 4 incomplete-splice_match EPB41 ENST00000460378.1 5212 5 13165 18 11810 -18 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAACAACAACAAAAAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.506.1 chr1 + 3592 20 incomplete-splice_match PTPRU ENST00000428026.6 5550 30 43573 14 571 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGAGCAGCCCTGTGTGTG 8139 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.506.2 chr1 + 3361 19 incomplete-splice_match PTPRU ENST00000373779.8 5573 30 46374 1 -827 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGAGCAGCCCTGTGTGTG NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.506.3 chr1 + 3205 17 incomplete-splice_match PTPRU ENST00000428026.6 5550 30 48238 14 1064 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGAGCAGCCCTGTGTGTG 1058 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.506.4 chr1 + 2495 10 incomplete-splice_match PTPRU ENST00000428026.6 5550 30 75093 14 296 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGAGCAGCCCTGTGTGTG NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 8 NA PB.506.5 chr1 + 2288 9 incomplete-splice_match PTPRU ENST00000428026.6 5550 30 76092 14 1295 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGAGCAGCCCTGTGTGTG NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.506.6 chr1 + 2105 8 incomplete-splice_match PTPRU ENST00000428026.6 5550 30 78940 14 -2271 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGAGCAGCCCTGTGTGTG NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.506.7 chr1 + 1753 5 full-splice_match PTPRU ENST00000465525.6 1650 5 484 -587 484 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGAGCAGCCCTGTGTGTG NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.506.8 chr1 + 1572 4 full-splice_match PTPRU ENST00000492954.1 625 4 202 -1149 202 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGAGCAGCCCTGTGTGTG NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 8 NA PB.506.9 chr1 + 1435 3 incomplete-splice_match PTPRU ENST00000492954.1 625 4 476 -1152 476 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GAGCAGCCCTGTGTGTGTCT NA FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.507.1 chr1 - 2281 10 full-splice_match MECR ENST00000263702.11 2515 10 8 226 -2 -10 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.188451 0.503580 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TAATTACCATAGTGACTAAT -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.507.4 chr1 - 1736 11 novel_in_catalog MECR novel 2515 10 NA NA 3 -5 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGTAGAAGTCATCCCT -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.507.5 chr1 - 1561 11 novel_in_catalog MECR novel 2416 10 NA NA 0 -5 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGTAGAAGTCATCCCT 17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.507.6 chr1 - 1531 11 novel_in_catalog MECR novel 2416 10 NA NA 2 -5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGTAGAAGTCATCCCT 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.507.7 chr1 - 1439 10 full-splice_match MECR ENST00000373791.7 2416 10 28 949 1 -5 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.188451 0.503580 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGTAGAAGTCATCCCT 18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.507.8 chr1 - 1424 11 novel_in_catalog MECR novel 2515 10 NA NA 0 -5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.924247 0.593756 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGTAGAAGTCATCCCT -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.507.9 chr1 - 1357 10 novel_in_catalog MECR novel 2515 10 NA NA 3 -5 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGTAGAAGTCATCCCT -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.507.10 chr1 - 1362 10 full-splice_match MECR ENST00000263702.11 2515 10 -12 1165 -4 -5 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 178 43.657249 1.640056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGTAGAAGTCATCCCT -32 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 178 NA PB.507.11 chr1 - 1244 9 novel_in_catalog MECR novel 2515 10 NA NA 3 -5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGTAGAAGTCATCCCT -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.507.12 chr1 - 1134 8 novel_in_catalog MECR novel 2515 10 NA NA 0 -5 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGTAGAAGTCATCCCT -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.507.13 chr1 - 1216 9 incomplete-splice_match MECR ENST00000373791.7 2416 10 14169 949 -142 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGTAGAAGTCATCCCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.507.14 chr1 - 1179 10 full-splice_match MECR ENST00000263702.11 2515 10 171 1165 128 -5 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGTAGAAGTCATCCCT 5700 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.507.15 chr1 - 1070 9 incomplete-splice_match MECR ENST00000373791.7 2416 10 14315 949 4 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGTAGAAGTCATCCCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.507.16 chr1 - 1500 10 full-splice_match MECR ENST00000373791.7 2416 10 -34 950 -16 -6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 CAAAAAGTAGAAGTCATCCC 5505 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.507.17 chr1 - 1368 10 novel_in_catalog MECR novel 2515 10 NA NA 0 -6 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 CAAAAAGTAGAAGTCATCCC -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.509.1 chr1 - 2182 8 full-splice_match LAPTM5 ENST00000294507.4 2177 8 3 -8 3 8 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TGATGTGTTTCTGGAAATAC 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.509.2 chr1 - 2087 8 novel_not_in_catalog LAPTM5 novel 2177 8 NA NA -609 2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGGCTGATGTGTTTCTGG 9903 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.509.3 chr1 - 2466 8 full-splice_match LAPTM5 ENST00000464569.1 953 8 -93 -1420 -93 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGTCTGGCTGATGTGTTTCT 8384 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.509.4 chr1 - 2252 8 full-splice_match LAPTM5 ENST00000294507.4 2177 8 -75 0 -75 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 543 133.179138 2.124436 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGTCTGGCTGATGTGTTTCT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 543 NA PB.509.5 chr1 - 2100 7 novel_in_catalog LAPTM5 novel 2177 8 NA NA 0 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGTCTGGCTGATGTGTTTCT 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.509.6 chr1 - 2006 6 novel_in_catalog LAPTM5 novel 2177 8 NA NA 0 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 23 5.641106 0.751364 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGTCTGGCTGATGTGTTTCT 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 23 NA PB.509.7 chr1 - 2035 7 incomplete-splice_match LAPTM5 ENST00000464569.1 953 8 3706 -1420 3706 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 27 6.622167 0.821000 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGTCTGGCTGATGTGTTTCT 9823 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 27 NA PB.509.8 chr1 - 1829 5 novel_in_catalog LAPTM5 novel 2177 8 NA NA 0 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGTCTGGCTGATGTGTTTCT 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.509.9 chr1 - 1892 5 incomplete-splice_match LAPTM5 ENST00000464569.1 953 8 6290 -1420 6290 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.188451 0.503580 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGTCTGGCTGATGTGTTTCT 8064 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.509.10 chr1 - 1708 4 incomplete-splice_match LAPTM5 ENST00000464569.1 953 8 7220 -1420 7220 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 29 7.112698 0.852034 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGTCTGGCTGATGTGTTTCT 8994 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 29 NA PB.509.11 chr1 - 1530 2 incomplete-splice_match LAPTM5 ENST00000464569.1 953 8 10976 -1420 10976 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 46 11.282211 1.052394 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGTCTGGCTGATGTGTTTCT 7284 FALSE NA NA AAAAAG -29 NA NA NA 46 NA PB.509.18 chr1 - 1240 8 full-splice_match LAPTM5 ENST00000294507.4 2177 8 -33 970 -33 450 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 81 19.866503 1.298121 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACAACAGTCTATTGCATT 12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 81 NA PB.509.19 chr1 - 1080 7 incomplete-splice_match LAPTM5 ENST00000464569.1 953 8 3691 -450 3691 450 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACAACAGTCTATTGCATT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.510.1 chr1 - 3985 2 incomplete-splice_match SDC3 ENST00000336798.11 6392 3 4370 0 4370 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATGTGCCGTGTCCAGAGTAT 6416 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.510.11 chr1 - 4458 3 full-splice_match SDC3 ENST00000336798.11 6392 3 1929 5 1929 -5 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATGATGTGCCGTGTCCAG 3975 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.512.1 chr1 + 1768 4 novel_in_catalog MATN1-AS1 novel 1530 5 NA NA -5 29 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATATAAAATTCAAATAAAT -17 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 2 NA PB.512.2 chr1 + 1235 3 incomplete-splice_match MATN1-AS1 ENST00000649861.1 1530 5 2185 -33 2185 -31 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 TAAAATTCAAATAAATTCAA 2575 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.514.11 chr1 - 1394 7 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000373742.6 3515 20 113455 -326 1414 90 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAACAAACAAAAACAA NA FALSE NA NA AGTAAA -1 NA NA NA 2 NA PB.514.12 chr1 - 1408 7 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000498419.5 3068 17 42721 -90 1406 90 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAACAAACAAAAACAA NA FALSE NA NA AGTAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.514.13 chr1 - 1148 5 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000498419.5 3068 17 49596 -90 -91 90 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAACAAACAAAAACAA NA FALSE NA NA AAGAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.514.15 chr1 - 2888 16 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000373741.8 4242 22 73490 -6 2558 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAGAAAAAAAGG 83 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.514.16 chr1 - 1383 8 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000498419.5 3068 17 41306 0 4 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAGAAAAAAAGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.514.17 chr1 - 3299 18 full-splice_match PUM1 ENST00000424085.6 4631 18 -22 1354 0 -10 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAAAAAAGCTTTAAAA -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.514.18 chr1 - 4021 22 novel_in_catalog PUM1 novel 5375 22 NA NA 0 -13 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.514.19 chr1 - 4006 22 full-splice_match PUM1 ENST00000426105.7 5385 22 22 1357 0 -13 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.395840 0.732059 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 22 NA PB.514.20 chr1 - 3934 22 novel_in_catalog PUM1 novel 5360 22 NA NA 0 -13 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.514.21 chr1 - 4009 22 novel_not_in_catalog PUM1 novel 5375 22 NA NA 1 -13 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.514.22 chr1 - 4015 22 novel_in_catalog PUM1 novel 5360 22 NA NA 0 -13 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.514.23 chr1 - 3904 21 novel_in_catalog PUM1 novel 5375 22 NA NA 0 -13 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.514.24 chr1 - 3925 22 novel_in_catalog PUM1 novel 5360 22 NA NA 0 -13 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.514.25 chr1 - 3925 22 novel_in_catalog PUM1 novel 5385 22 NA NA 0 -13 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.514.26 chr1 - 4003 22 full-splice_match PUM1 ENST00000257075.9 5360 22 0 1357 0 -13 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.395840 0.732059 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 22 NA PB.514.27 chr1 - 3845 21 novel_in_catalog PUM1 novel 5385 22 NA NA 0 -13 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.514.28 chr1 - 3769 21 novel_in_catalog PUM1 novel 5385 22 NA NA 0 -13 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.514.29 chr1 - 3761 21 novel_in_catalog PUM1 novel 5360 22 NA NA 2 -13 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.514.30 chr1 - 3721 20 novel_in_catalog PUM1 novel 5385 22 NA NA 0 -13 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.514.31 chr1 - 3570 21 novel_in_catalog PUM1 novel 5360 22 NA NA 2608 -13 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 6690 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.514.32 chr1 - 3632 20 novel_in_catalog PUM1 novel 3936 22 NA NA 2 -13 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.514.33 chr1 - 3573 20 novel_in_catalog PUM1 novel 5360 22 NA NA -2 -13 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.514.34 chr1 - 3718 20 novel_in_catalog PUM1 novel 5360 22 NA NA 0 -13 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.514.35 chr1 - 3128 17 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000373741.8 4242 22 70838 13 -49 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.514.36 chr1 - 3097 17 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000257075.9 5360 22 70570 1357 -24 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.514.37 chr1 - 2577 14 novel_in_catalog PUM1 novel 3515 20 NA NA -31 -13 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA AGTAAA -26 NA NA NA 2 NA PB.514.38 chr1 - 2558 13 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000373742.6 3515 20 90980 -217 54 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA AAGAAA -35 NA NA NA 5 NA PB.514.39 chr1 - 2281 12 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000373742.6 3515 20 97415 -217 -1990 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 6385 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.514.41 chr1 - 2041 10 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000498419.5 3068 17 28866 19 187 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 8562 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.514.42 chr1 - 1782 9 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000498419.5 3068 17 30196 19 9 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 9892 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.514.44 chr1 - 1825 9 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000373742.6 3515 20 100873 -217 -40 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 9843 FALSE NA NA ATTAAA -37 NA NA NA 5 NA PB.514.45 chr1 - 1657 9 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000373742.6 3515 20 101041 -217 128 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.514.46 chr1 - 1582 8 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000498419.5 3068 17 41088 19 -214 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.514.47 chr1 - 1390 8 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000373742.6 3515 20 112000 -217 -28 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.514.48 chr1 - 1260 6 novel_not_in_catalog PUM1 novel 3068 17 NA NA -3829 -13 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.514.49 chr1 - 1282 7 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000373742.6 3515 20 113458 -217 1417 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA AATGAA -16 NA NA NA 6 NA PB.514.50 chr1 - 1228 7 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000498419.5 3068 17 42792 19 1477 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.514.51 chr1 - 1138 6 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000373742.6 3515 20 115574 -217 3533 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.514.53 chr1 - 1006 5 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000498419.5 3068 17 49629 19 -58 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.514.54 chr1 - 923 4 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000498419.5 3068 17 52934 19 3247 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.514.55 chr1 - 797 3 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000530669.1 582 5 4098 -442 4098 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA AATAAA -25 NA NA NA 3 NA PB.514.72 chr1 - 855 6 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000440538.6 3936 22 -30 62352 3 -14 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAACGACAAAGGTGAAAAG -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.515.1 chr1 - 2506 6 novel_in_catalog NKAIN1 novel 2922 7 NA NA 334 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCTTCCTGTCCTGCCCATT 398 FALSE NA NA GGGGCT -44 NA NA NA 2 NA PB.515.2 chr1 - 2110 3 incomplete-splice_match NKAIN1 ENST00000526106.5 569 5 5563 -1843 -914 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCTTCCTGTCCTGCCCATT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.517.1 chr1 - 1829 11 novel_not_in_catalog SNRNP40 novel 1615 10 NA NA 0 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGAAGCTGCTCACTTGTTT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.517.2 chr1 - 1613 10 full-splice_match SNRNP40 ENST00000263694.9 1615 10 0 2 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 191 46.845703 1.670670 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGAAGCTGCTCACTTGTTT -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 191 NA PB.517.3 chr1 - 1498 10 full-splice_match SNRNP40 ENST00000263694.9 1615 10 115 2 109 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGAAGCTGCTCACTTGTTT 143 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.517.4 chr1 - 1246 8 incomplete-splice_match SNRNP40 ENST00000263694.9 1615 10 4841 2 -2528 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGAAGCTGCTCACTTGTTT 4869 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.517.5 chr1 - 923 5 incomplete-splice_match SNRNP40 ENST00000489853.1 1928 6 10982 -103 -1835 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAAGAAGCTGCTCACTTGTT NA FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 4 NA PB.517.6 chr1 - 1539 10 full-splice_match SNRNP40 ENST00000263694.9 1615 10 -33 109 -33 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 1236 303.148102 2.481655 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAGCCATGTGGATTGGAT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 1236 NA PB.517.7 chr1 - 903 6 full-splice_match SNRNP40 ENST00000489853.1 1928 6 1028 -3 1028 2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CATGTGGATTGGATTTATTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.517.8 chr1 - 1713 11 novel_not_in_catalog SNRNP40 novel 1615 10 NA NA 9 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 30 7.357964 0.866758 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAGCCATGTGGATTGGAT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 30 NA PB.517.9 chr1 - 1528 10 novel_not_in_catalog SNRNP40 novel 1615 10 NA NA 0 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAGCCATGTGGATTGGAT -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.517.10 chr1 - 1462 10 full-splice_match SNRNP40 ENST00000263694.9 1615 10 44 109 38 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.924247 0.593756 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAGCCATGTGGATTGGAT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.517.11 chr1 - 1402 9 novel_in_catalog SNRNP40 novel 1615 10 NA NA 0 -3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAGCCATGTGGATTGGAT -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.517.12 chr1 - 1442 9 novel_in_catalog SNRNP40 novel 1615 10 NA NA 2 -3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAGCCATGTGGATTGGAT -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.517.13 chr1 - 1329 9 incomplete-splice_match SNRNP40 ENST00000263694.9 1615 10 3439 109 3433 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 24 5.886371 0.769848 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAGCCATGTGGATTGGAT 3467 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 24 NA PB.517.14 chr1 - 1181 8 novel_not_in_catalog SNRNP40 novel 1615 10 NA NA 145 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAGCCATGTGGATTGGAT 7542 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.517.15 chr1 - 1181 8 incomplete-splice_match SNRNP40 ENST00000263694.9 1615 10 4799 109 -2570 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 31 7.603229 0.880998 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAGCCATGTGGATTGGAT 4827 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 31 NA PB.517.16 chr1 - 1009 7 incomplete-splice_match SNRNP40 ENST00000263694.9 1615 10 7464 109 95 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.943186 0.468818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAGCCATGTGGATTGGAT 7492 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.517.17 chr1 - 776 5 incomplete-splice_match SNRNP40 ENST00000489853.1 1928 6 11023 3 -1794 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.697920 0.431029 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAGCCATGTGGATTGGAT NA FALSE NA NA AAAACA -1 NA NA NA 11 NA PB.517.18 chr1 - 685 4 full-splice_match SNRNP40 ENST00000373720.3 1087 4 435 -33 435 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAGCCATGTGGATTGGAT -6 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.517.19 chr1 - 532 2 full-splice_match SNRNP40 ENST00000486941.1 743 2 207 4 207 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAGCCATGTGGATTGGAT 7610 FALSE NA NA CATAAA -39 NA NA NA 4 NA PB.518.1 chr1 + 1352 6 novel_in_catalog ZCCHC17 novel 1489 7 NA NA 0 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACTTACTGAGTTATTTTT -20 TRUE NA NA ACTAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.518.2 chr1 + 939 7 incomplete-splice_match ZCCHC17 ENST00000344147.10 1568 8 -34 15720 0 248 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAGAAAAATGAA -20 TRUE NA NA AAAAAG -15 NA NA NA 6 NA PB.518.3 chr1 + 1597 8 full-splice_match ZCCHC17 ENST00000344147.10 1568 8 -32 3 2 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 170 41.695129 1.620085 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACTTACTGAGTTATTTTT -18 TRUE NA NA ACTAAA -20 NA NA NA 170 NA PB.518.4 chr1 + 670 7 incomplete-splice_match ZCCHC17 ENST00000344147.10 1568 8 -22 15977 2 -9 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AGAAAAAGAAAGAAGGTGAA -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.518.6 chr1 + 1645 9 full-splice_match ZCCHC17 ENST00000546109.5 1705 9 40 20 -10 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.433716 0.535764 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACTTACTGAGTTATTTTT 4 TRUE NA NA ACTAAA -20 NA NA NA 14 NA PB.518.7 chr1 + 1473 7 full-splice_match ZCCHC17 ENST00000616393.4 1534 7 41 20 -9 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACTTACTGAGTTATTTTT 5 TRUE NA NA ACTAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.518.8 chr1 + 1227 8 novel_not_in_catalog ZCCHC17 novel 1568 8 NA NA -9 12531 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGAAATGTCTGTTTAGTA 5 TRUE NA NA AATAAA -26 NA NA NA 3 NA PB.518.10 chr1 + 1666 8 full-splice_match ZCCHC17 ENST00000373714.5 1730 8 60 4 32 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAACTTACTGAGTTATTTT 50 FALSE NA NA ACTAAA -19 NA NA NA 5 NA PB.518.15 chr1 + 1402 6 incomplete-splice_match ZCCHC17 ENST00000344147.10 1568 8 22075 3 22071 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACTTACTGAGTTATTTTT NA FALSE NA NA ACTAAA -20 NA NA NA 6 NA PB.518.17 chr1 + 1286 5 incomplete-splice_match ZCCHC17 ENST00000344147.10 1568 8 40205 -3 40201 3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.188451 0.503580 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTGAGTTATTTTTCCTATA NA FALSE NA NA ACTAAA -26 NA NA NA 13 NA PB.518.19 chr1 + 1205 4 incomplete-splice_match ZCCHC17 ENST00000344147.10 1568 8 41961 3 41957 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACTTACTGAGTTATTTTT NA FALSE NA NA ACTAAA -20 NA NA NA 5 NA PB.518.20 chr1 + 1118 3 incomplete-splice_match ZCCHC17 ENST00000344147.10 1568 8 49639 3 49635 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACTTACTGAGTTATTTTT NA FALSE NA NA ACTAAA -20 NA NA NA 5 NA PB.518.21 chr1 + 1034 2 incomplete-splice_match ZCCHC17 ENST00000344147.10 1568 8 51811 3 51807 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACTTACTGAGTTATTTTT 2159 FALSE NA NA ACTAAA -20 NA NA NA 6 NA PB.518.22 chr1 + 928 2 incomplete-splice_match ZCCHC17 ENST00000344147.10 1568 8 51917 3 51913 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACTTACTGAGTTATTTTT 2265 FALSE NA NA ACTAAA -20 NA NA NA 6 NA PB.519.1 chr1 + 1934 11 full-splice_match SERINC2 ENST00000373710.5 2146 11 212 0 212 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTCTGTGCCCCTCACCC 0 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.519.2 chr1 + 1995 11 novel_not_in_catalog SERINC2 novel 1900 10 NA NA -20 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACCATGTTCTGTGCCCCTCA -27 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.519.3 chr1 + 1727 9 novel_in_catalog SERINC2 novel 1900 10 NA NA -19 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTCTGTGCCCCTCACCC -26 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.519.4 chr1 + 1582 11 novel_not_in_catalog SERINC2 novel 1900 10 NA NA -19 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTCTGTGCCCCTCACCC -26 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.519.5 chr1 + 1901 10 full-splice_match SERINC2 ENST00000373709.8 1900 10 -3 2 -3 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 190 46.600437 1.668390 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CATGTTCTGTGCCCCTCACC -10 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 190 NA PB.519.7 chr1 + 1786 9 novel_in_catalog SERINC2 novel 1900 10 NA NA 30 -3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACCATGTTCTGTGCCCCTCA 23 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.519.8 chr1 + 1472 8 incomplete-splice_match SERINC2 ENST00000491976.1 2807 11 11042 1 11042 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CATGTTCTGTGCCCCTCACC 1059 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.519.9 chr1 + 1233 5 incomplete-splice_match SERINC2 ENST00000491976.1 2807 11 12840 4 12840 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACCATGTTCTGTGCCCCTC -9 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 8 NA PB.519.10 chr1 + 973 3 incomplete-splice_match SERINC2 ENST00000491976.1 2807 11 15583 3 15583 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACCATGTTCTGTGCCCCTCA 384 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.520.1 chr1 - 909 4 full-splice_match FABP3 ENST00000373713.7 1097 4 -20 208 -20 -208 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACGTTGCCTTTACACTGCCC 244 FALSE NA NA TTTAAA -43 NA NA NA 5 NA PB.520.2 chr1 - 960 4 full-splice_match FABP3 ENST00000373713.7 1097 4 -267 404 -267 56 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCAGTTGCCTTTTTGCCT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.520.3 chr1 - 693 4 full-splice_match FABP3 ENST00000373713.7 1097 4 0 404 0 56 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCAGTTGCCTTTTTGCCT -1 TRUE NA NA TTTAAA -23 NA NA NA 8 NA PB.521.1 chr1 - 1631 5 full-splice_match PEF1 ENST00000373703.5 1614 5 -18 1 2 -1 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 425 104.237816 2.018025 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTTCCATGTTTTCCACCAT 279 FALSE NA NA GGGGCT -43 NA NA NA 425 NA PB.521.2 chr1 - 1812 5 full-splice_match PEF1 ENST00000489164.5 865 5 -25 -922 -13 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTTCCATGTTTTCCACCAT 559 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.521.3 chr1 - 1512 5 novel_in_catalog PEF1 novel 1614 5 NA NA -9 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTTCCATGTTTTCCACCAT -7 TRUE NA NA GGGGCT -34 NA NA NA 3 NA PB.521.4 chr1 - 1165 6 novel_not_in_catalog PEF1 novel 1614 5 NA NA -3 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTTCCATGTTTTCCACCAT -1 TRUE NA NA GGGGCT -28 NA NA NA 4 NA PB.521.5 chr1 - 1986 5 full-splice_match PEF1 ENST00000373703.5 1614 5 -374 2 -354 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAGTTCCATGTTTTCCACCA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.521.6 chr1 - 1517 5 novel_not_in_catalog PEF1 novel 1614 5 NA NA 3 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAGTTCCATGTTTTCCACCA 5 TRUE NA NA GGGGCT -22 NA NA NA 2 NA PB.521.7 chr1 - 1465 4 incomplete-splice_match PEF1 ENST00000373703.5 1614 5 9465 2 61 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.433716 0.535764 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAGTTCCATGTTTTCCACCA 9762 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.521.8 chr1 - 1352 4 incomplete-splice_match PEF1 ENST00000373703.5 1614 5 9578 2 -38 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAGTTCCATGTTTTCCACCA 9875 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.521.9 chr1 - 1035 6 novel_not_in_catalog PEF1 novel 1614 5 NA NA 3 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GGAGTTCCATGTTTTCCACC 5 TRUE NA NA GGGGCT -22 NA NA NA 2 NA PB.522.3 chr1 - 1561 19 incomplete-splice_match COL16A1 ENST00000373672.8 5418 71 37962 259 26 -11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAATAATAAAGAAACAAAAC 7175 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.522.4 chr1 - 1244 13 incomplete-splice_match COL16A1 ENST00000373672.8 5418 71 42332 259 75 -11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAATAATAAAGAAACAAAAC 8735 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.522.5 chr1 - 1055 9 incomplete-splice_match COL16A1 ENST00000373672.8 5418 71 45063 259 2806 -11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAATAATAAAGAAACAAAAC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.522.6 chr1 - 1329 15 incomplete-splice_match COL16A1 ENST00000373672.8 5418 71 41359 319 798 6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGGTTGTGAATGTTTTTT 7762 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 2 NA PB.523.1 chr1 - 1410 7 incomplete-splice_match ADGRB2 ENST00000398556.7 4879 29 26837 1 2761 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTTGCTGCTGAGCTGTTT 4153 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.524.1 chr1 + 2182 12 full-splice_match TINAGL1 ENST00000271064.12 2207 12 23 2 -4 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.678982 0.565728 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACTACAGTGTCTTGGAACC -3 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 15 NA PB.524.2 chr1 + 2057 11 novel_in_catalog TINAGL1 novel 2207 12 NA NA -4 1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAACTACAGTGTCTTGGAAC -3 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.524.4 chr1 + 1685 9 incomplete-splice_match TINAGL1 ENST00000537531.2 1841 11 5054 -2 -314 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACTACAGTGTCTTGGAACC 4007 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.524.5 chr1 + 894 2 incomplete-splice_match TINAGL1 ENST00000463112.1 3075 5 3195 2 1557 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACTACAGTGTCTTGGAACC 3196 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.525.1 chr1 - 2007 9 incomplete-splice_match SPOCD1 ENST00000533231.5 3774 15 16690 -59 31 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GATTGCATCTGCTAGCTGGT 16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.525.2 chr1 - 2075 9 incomplete-splice_match SPOCD1 ENST00000533231.5 3774 15 16614 -51 10 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATTGGGATTGCATCTGC 6 TRUE NA NA GGGGCT -2 NA NA NA 3 NA PB.525.3 chr1 - 1894 9 incomplete-splice_match SPOCD1 ENST00000533231.5 3774 15 16795 -51 35 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATTGGGATTGCATCTGC 24 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.525.5 chr1 - 2585 3 full-splice_match SPOCD1 ENST00000468720.5 2667 3 43 39 -12 -19 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAACAAACAAACAAACA -27 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.529.1 chr1 + 1917 9 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 -167 963 -167 290 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATAAAAAAAAGAAGTTGAG NA FALSE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 8 NA PB.529.2 chr1 + 1771 9 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 -2 944 -2 309 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 184 45.128845 1.654454 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 GTAAAAAAAAAAAACACACA 2 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 184 NA PB.529.4 chr1 + 1481 9 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 -5 1237 -5 16 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATATCAGTTATGAGCAA -1 TRUE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.529.5 chr1 + 2120 9 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 -2 595 -2 -595 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.414778 0.644909 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAACAACAAAAT 2 TRUE NA NA ATTAAA -33 NA NA NA 18 NA PB.529.6 chr1 + 1714 8 novel_in_catalog KHDRBS1 novel 2713 9 NA NA -2 311 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAACACACAAA 2 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.529.8 chr1 + 2299 11 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000484270.2 1989 11 -312 2 2 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GATGAATGGTCCCACTCTGG 6 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 6 NA PB.529.9 chr1 + 1631 8 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000492989.1 1215 8 -126 -290 2 290 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATAAAAAAAAGAAGTTGAG 6 TRUE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 6 NA PB.529.10 chr1 + 2707 9 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 3 3 3 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 37 9.074821 0.957838 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGTAAATGTGATGAATTG 7 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 37 NA PB.529.11 chr1 + 1641 9 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 109 963 -19 290 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATAAAAAAAAGAAGTTGAG 113 FALSE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.529.12 chr1 + 2008 9 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 110 595 -18 -595 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAACAACAAAAT 114 FALSE NA NA ATTAAA -33 NA NA NA 2 NA PB.529.13 chr1 + 2600 9 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 115 -2 -13 2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAATGTGATGAATTGTCATT 119 FALSE NA NA AATAAA -25 NA NA NA 2 NA PB.529.14 chr1 + 1495 9 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 255 963 -59 290 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.943186 0.468818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATAAAAAAAAGAAGTTGAG 259 FALSE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 12 NA PB.529.15 chr1 + 1344 9 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 406 963 92 290 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.678982 0.565728 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATAAAAAAAAGAAGTTGAG 18 TRUE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 15 NA PB.529.16 chr1 + 2302 9 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 408 3 94 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGTAAATGTGATGAATTG 20 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 8 NA PB.529.18 chr1 + 1227 8 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 16464 942 16150 311 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 31 7.603229 0.880998 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAACACACAAA NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 31 NA PB.529.19 chr1 + 1583 8 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 16455 595 16141 -595 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAACAACAAAAT NA FALSE NA NA ATTAAA -33 NA NA NA 3 NA PB.529.20 chr1 + 2157 8 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 16472 4 16158 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 CAAAGTAAATGTGATGAATT NA FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 8 NA PB.529.21 chr1 + 2100 8 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 16535 -2 16221 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAATGTGATGAATTGTCATT NA FALSE NA NA AATAAA -25 NA NA NA 3 NA PB.529.22 chr1 + 1023 7 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 17749 962 17435 291 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 23 5.641106 0.751364 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 ATAAAAAAAAGAAGTTGAGT NA FALSE NA NA TATAAA -20 NA NA NA 23 NA PB.529.23 chr1 + 1923 6 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 19355 3 19041 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGTAAATGTGATGAATTG NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 9 NA PB.529.24 chr1 + 1277 6 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000492989.1 1215 8 19281 -658 19095 -595 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAACAACAAAAT -6 TRUE NA NA ATTAAA -33 NA NA NA 5 NA PB.529.25 chr1 + 908 6 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000492989.1 1215 8 19282 -290 19096 290 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.188451 0.503580 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATAAAAAAAAGAAGTTGAG -5 TRUE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 13 NA PB.529.26 chr1 + 1161 5 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000492989.1 1215 8 22972 -658 22786 -595 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAACAACAAAAT 3685 FALSE NA NA ATTAAA -33 NA NA NA 3 NA PB.529.27 chr1 + 780 5 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000492989.1 1215 8 22985 -290 22799 290 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATAAAAAAAAGAAGTTGAG 3698 FALSE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 9 NA PB.529.28 chr1 + 1710 5 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 23143 3 22829 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.943186 0.468818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGTAAATGTGATGAATTG 3728 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 12 NA PB.529.29 chr1 + 1040 4 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000492989.1 1215 8 23884 -658 23698 -595 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAACAACAAAAT 4597 FALSE NA NA ATTAAA -33 NA NA NA 5 NA PB.529.30 chr1 + 1561 4 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 24083 3 23769 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.943186 0.468818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGTAAATGTGATGAATTG 4668 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 12 NA PB.529.31 chr1 + 1438 3 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000307714.12 2738 9 24663 3 24407 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 49 12.018007 1.079832 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGTAAATGTGATGAATTG 5306 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 49 NA PB.529.32 chr1 + 816 2 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000492989.1 1215 8 25518 -658 25332 -595 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAACAACAAAAT 6231 FALSE NA NA ATTAAA -33 NA NA NA 2 NA PB.529.36 chr1 + 820 3 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000484270.2 1989 11 28467 -1 28467 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAATGGTCCCACTCTGGTAG 9366 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.530.12 chr1 - 2058 6 full-splice_match PTP4A2 ENST00000647444.2 3910 6 20 1832 10 10 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAACAAA -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.530.15 chr1 - 1697 5 full-splice_match PTP4A2 ENST00000602725.5 3353 5 -176 1832 -176 10 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.943186 0.468818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAACAAA NA FALSE NA NA AGTAAA -28 NA NA NA 12 NA PB.530.16 chr1 - 1621 4 full-splice_match PTP4A2 ENST00000602683.5 667 4 -549 -405 -175 10 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAACAAA NA FALSE NA NA AGTAAA -27 NA NA NA 2 NA PB.530.17 chr1 - 1349 4 full-splice_match PTP4A2 ENST00000457805.6 1032 4 -36 -281 -36 10 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAACAAA 201 FALSE NA NA ATTAAA -3 NA NA NA 4 NA PB.530.18 chr1 - 984 4 incomplete-splice_match PTP4A2 ENST00000602725.5 3353 5 3519 1832 3145 10 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.188451 0.503580 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAACAAA 3641 FALSE NA NA TTTAAA -21 NA NA NA 13 NA PB.530.19 chr1 - 868 3 incomplete-splice_match PTP4A2 ENST00000457805.6 1032 4 7588 -281 -500 10 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAACAAA 7825 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.530.21 chr1 - 1972 5 novel_in_catalog PTP4A2 novel 3910 6 NA NA 2 9 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAACAA -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.530.23 chr1 - 1944 6 full-splice_match PTP4A2 ENST00000647444.2 3910 6 133 1833 -49 9 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.697920 0.431029 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAACAA 104 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.530.24 chr1 - 1785 6 novel_in_catalog PTP4A2 novel 2213 8 NA NA 6753 9 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAACAA 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.530.25 chr1 - 1639 5 novel_in_catalog PTP4A2 novel 2213 8 NA NA -6 9 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAACAA 548 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.530.26 chr1 - 1490 4 full-splice_match PTP4A2 ENST00000457805.6 1032 4 -178 -280 -63 9 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAACAA 59 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.530.27 chr1 - 1482 5 full-splice_match PTP4A2 ENST00000602725.5 3353 5 38 1833 19 9 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.169513 0.620085 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAACAA 160 FALSE NA NA ATTAAA -44 NA NA NA 17 NA PB.530.28 chr1 - 1304 5 full-splice_match PTP4A2 ENST00000602725.5 3353 5 216 1833 92 9 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 33 8.093760 0.908150 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAACAA 338 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 33 NA PB.530.30 chr1 - 1107 5 full-splice_match PTP4A2 ENST00000602725.5 3353 5 413 1833 39 9 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAACAA 535 FALSE NA NA AATAAA -43 NA NA NA 8 NA PB.530.32 chr1 - 1083 4 full-splice_match PTP4A2 ENST00000457805.6 1032 4 229 -280 -16 9 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAACAA 466 FALSE NA NA ATTAAA -24 NA NA NA 7 NA PB.530.34 chr1 - 1517 5 novel_in_catalog PTP4A2 novel 3910 6 NA NA 60 2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAGAGAAAAGGAATTAATT 41 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.530.35 chr1 - 1664 6 full-splice_match PTP4A2 ENST00000647444.2 3910 6 6 2240 -4 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.188451 0.503580 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA -23 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.530.37 chr1 - 1577 5 novel_in_catalog PTP4A2 novel 3910 6 NA NA 0 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA -29 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.530.45 chr1 - 1556 6 full-splice_match PTP4A2 ENST00000647444.2 3910 6 114 2240 -68 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.395840 0.732059 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 85 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 22 NA PB.530.48 chr1 - 1461 7 novel_in_catalog PTP4A2 novel 3910 6 NA NA -4 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA -23 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.530.50 chr1 - 1478 6 incomplete-splice_match PTP4A2 ENST00000649841.1 2213 8 7547 398 7547 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 8111 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.530.53 chr1 - 1386 6 novel_in_catalog PTP4A2 novel 2213 8 NA NA 6745 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.530.54 chr1 - 1318 6 novel_in_catalog PTP4A2 novel 3910 6 NA NA -7 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.943186 0.468818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.530.55 chr1 - 1370 6 full-splice_match PTP4A2 ENST00000647444.2 3910 6 300 2240 -26 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 24 5.886371 0.769848 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 271 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 24 NA PB.530.56 chr1 - 1316 6 novel_in_catalog PTP4A2 novel 2213 8 NA NA 0 -3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.530.57 chr1 - 1308 6 novel_not_in_catalog PTP4A2 novel 3910 6 NA NA 202 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 766 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.530.58 chr1 - 1349 5 novel_in_catalog PTP4A2 novel 3910 6 NA NA 46 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 199 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.530.59 chr1 - 1266 5 full-splice_match PTP4A2 ENST00000602725.5 3353 5 -153 2240 -153 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.169513 0.620085 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA NA FALSE NA NA AGTAAA -5 NA NA NA 17 NA PB.530.60 chr1 - 1099 5 full-splice_match PTP4A2 ENST00000602725.5 3353 5 14 2240 -5 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 28 6.867433 0.836794 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 136 FALSE NA NA AAAAAG -36 NA NA NA 28 NA PB.530.61 chr1 - 965 5 full-splice_match PTP4A2 ENST00000602725.5 3353 5 148 2240 24 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.169513 0.620085 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 270 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.530.62 chr1 - 876 4 novel_in_catalog PTP4A2 novel 3910 6 NA NA 2 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.530.63 chr1 - 864 5 full-splice_match PTP4A2 ENST00000602725.5 3353 5 249 2240 -62 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 20 4.905309 0.690666 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 371 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 20 NA PB.530.64 chr1 - 805 4 full-splice_match PTP4A2 ENST00000457805.6 1032 4 100 127 91 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 337 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.530.65 chr1 - 1231 5 novel_in_catalog PTP4A2 novel 2213 8 NA NA -6 -4 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 TAAGAAAAGAGAAAGAGAAA 548 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.530.66 chr1 - 1407 6 novel_not_in_catalog PTP4A2 novel 3910 6 NA NA 67 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AACAAAAGCAAACAAAAAAG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.530.68 chr1 - 1265 6 novel_not_in_catalog PTP4A2 novel 3910 6 NA NA 235 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AACAAAAGCAAACAAAAAAG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.531.1 chr1 + 1936 10 novel_not_in_catalog TMEM39B novel 1834 10 NA NA -33 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG 2 TRUE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 3 NA PB.531.2 chr1 + 1883 10 novel_not_in_catalog TMEM39B novel 1834 10 NA NA -10 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG -41 TRUE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 2 NA PB.531.3 chr1 + 1797 9 novel_not_in_catalog TMEM39B novel 1778 9 NA NA -10 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAACAAGCCTGTGTCCTGTG -41 TRUE NA NA AAAAAG -18 NA NA NA 2 NA PB.531.5 chr1 + 1627 8 novel_in_catalog TMEM39B novel 1778 9 NA NA -2 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG -33 TRUE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 7 NA PB.531.6 chr1 + 1883 10 novel_in_catalog TMEM39B novel 1834 10 NA NA 0 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG -31 TRUE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 4 NA PB.531.7 chr1 + 1541 7 full-splice_match TMEM39B ENST00000441402.5 1538 7 -8 5 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 66 16.187521 1.209180 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG -31 TRUE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 66 NA PB.531.8 chr1 + 1777 9 full-splice_match TMEM39B ENST00000336294.10 1778 9 -1 2 -1 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 67 16.432785 1.215711 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG -28 TRUE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 67 NA PB.531.9 chr1 + 1712 9 novel_in_catalog TMEM39B novel 1778 9 NA NA 0 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG -27 TRUE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 2 NA PB.531.10 chr1 + 1756 9 novel_not_in_catalog TMEM39B novel 1778 9 NA NA 8 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG 11 TRUE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 2 NA PB.531.11 chr1 + 2846 7 novel_not_in_catalog TMEM39B novel 1538 7 NA NA 5 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACAAGCCTGTGTCCTGTGGT 24 TRUE NA NA AAAAAG -20 NA NA NA 2 NA PB.531.13 chr1 + 1357 7 incomplete-splice_match TMEM39B ENST00000336294.10 1778 9 2843 2 -349 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG 2816 FALSE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 4 NA PB.531.14 chr1 + 1234 5 incomplete-splice_match TMEM39B ENST00000468135.5 1834 10 4193 5 1031 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG 4196 FALSE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 4 NA PB.531.15 chr1 + 2506 5 novel_not_in_catalog TMEM39B novel 2087 9 NA NA 1118 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG 4283 FALSE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 2 NA PB.531.16 chr1 + 999 4 incomplete-splice_match TMEM39B ENST00000468135.5 1834 10 18784 5 15622 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG 8312 FALSE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 4 NA PB.531.17 chr1 + 869 4 incomplete-splice_match TMEM39B ENST00000468135.5 1834 10 18914 5 15752 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG 8442 FALSE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 2 NA PB.532.2 chr1 + 2225 14 novel_in_catalog KPNA6 novel 7355 14 NA NA -13 -1735 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATTGAGTTATTTAATTTTTT -11 TRUE NA NA AAAACA -43 NA NA NA 2 NA PB.532.3 chr1 + 2224 14 full-splice_match KPNA6 ENST00000373625.8 7355 14 5 5126 3 -1736 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 32 7.848495 0.894786 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GATTGAGTTATTTAATTTTT 7 TRUE NA NA AAAACA -42 NA NA NA 32 NA PB.532.4 chr1 + 3955 14 full-splice_match KPNA6 ENST00000373625.8 7355 14 9 3391 7 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 41 10.055883 1.002420 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 11 TRUE NA NA ATTAAA -20 NA NA NA 41 NA PB.532.7 chr1 + 3725 12 incomplete-splice_match KPNA6 ENST00000373625.8 7355 14 48824 3390 18 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 3 NA PB.532.8 chr1 + 3525 10 incomplete-splice_match KPNA6 ENST00000373625.8 7355 14 50245 3390 1439 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 4 NA PB.532.9 chr1 + 1613 9 incomplete-splice_match KPNA6 ENST00000373625.8 7355 14 51439 5146 2633 -1756 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATATTAATCTTGTACGCTTG NA FALSE NA NA AAAACA -22 NA NA NA 6 NA PB.532.10 chr1 + 3317 8 incomplete-splice_match KPNA6 ENST00000471599.5 3941 14 52572 0 3768 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 5 NA PB.532.11 chr1 + 1460 7 incomplete-splice_match KPNA6 ENST00000471599.5 3941 14 53936 1736 5132 -1736 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GATTGAGTTATTTAATTTTT NA FALSE NA NA AAAACA -42 NA NA NA 3 NA PB.532.13 chr1 + 2945 5 incomplete-splice_match KPNA6 ENST00000471599.5 3941 14 55210 1 6406 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA ATTAAA -20 NA NA NA 6 NA PB.532.14 chr1 + 2777 3 incomplete-splice_match KPNA6 ENST00000471599.5 3941 14 59108 0 10304 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 4 NA PB.532.15 chr1 + 2592 2 incomplete-splice_match KPNA6 ENST00000471599.5 3941 14 61878 0 13074 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 4 NA PB.534.1 chr1 + 2516 11 full-splice_match TXLNA ENST00000373610.8 4865 11 11 2338 11 -2338 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGAAGGTGTTTTTTTCTTTA 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.534.3 chr1 + 3723 12 novel_not_in_catalog TXLNA novel 4865 11 NA NA 68 9 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTCCTGACCTGTGTATTCCT 18 TRUE NA NA AATAAA -25 NA NA NA 3 NA PB.534.4 chr1 + 2951 4 incomplete-splice_match TXLNA ENST00000373610.8 4865 11 68 11381 68 -11381 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAACAAAGAATATAAAAC 18 TRUE NA NA TATAAA -35 NA NA NA 2 NA PB.534.5 chr1 + 4795 11 full-splice_match TXLNA ENST00000373610.8 4865 11 69 1 69 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 29 7.112698 0.852034 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTGTTTCTCTCCTGACCT 19 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 29 NA PB.534.6 chr1 + 5005 10 full-splice_match TXLNA ENST00000373609.1 5012 10 6 1 6 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTGTTTCTCTCCTGACCT -19 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 8 NA PB.534.7 chr1 + 4344 9 incomplete-splice_match TXLNA ENST00000373609.1 5012 10 1393 2 1393 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACTTGTTTCTCTCCTGACC 1306 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.534.8 chr1 + 4200 8 incomplete-splice_match TXLNA ENST00000373609.1 5012 10 4484 2 4484 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACTTGTTTCTCTCCTGACC 1101 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.534.9 chr1 + 3996 7 incomplete-splice_match TXLNA ENST00000373609.1 5012 10 8028 -1 8028 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTGTTTCTCTCCTGACCTGT 4645 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.534.11 chr1 + 3691 5 incomplete-splice_match TXLNA ENST00000373609.1 5012 10 12322 1 12322 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTGTTTCTCTCCTGACCT 8939 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.535.1 chr1 + 1386 5 full-splice_match CCDC28B ENST00000421922.6 1415 5 18 11 -2 -7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGAAAGCAAGCGGCTCCG 20 TRUE NA NA ATTAAA -5 NA NA NA 10 NA PB.535.2 chr1 + 810 6 full-splice_match CCDC28B ENST00000373602.10 880 6 59 11 1 -7 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 41 10.055883 1.002420 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGAAAGCAAGCGGCTCCG 23 TRUE NA NA ATTAAA -5 NA NA NA 41 NA PB.535.3 chr1 + 985 5 incomplete-splice_match CCDC28B ENST00000373602.10 880 6 1087 11 -14 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.678982 0.565728 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGAAAGCAAGCGGCTCCG 3 TRUE NA NA ATTAAA -5 NA NA NA 15 NA PB.537.1 chr1 + 2245 4 full-splice_match IQCC ENST00000617816.1 2089 4 -23 -133 -23 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTCTGAGTCTGGCTGCTTT -11 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 4 NA PB.537.2 chr1 + 2034 5 full-splice_match IQCC ENST00000291358.11 2012 5 -23 1 -23 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 37 9.074821 0.957838 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTCTGAGTCTGGCTGCTTT -11 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 37 NA PB.537.3 chr1 + 2655 3 novel_in_catalog IQCC novel 2252 5 NA NA 1 3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGAGTCTGGCTGCTTTCATT 13 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.537.4 chr1 + 1850 4 novel_not_in_catalog IQCC novel 2012 5 NA NA 594 5 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTCTGGCTGCTTTCATTTC 575 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.537.5 chr1 + 1645 3 incomplete-splice_match IQCC ENST00000291358.11 2012 5 1013 -5 1013 5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTCTGGCTGCTTTCATTTC 994 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.538.1 chr1 - 1896 11 novel_in_catalog TMEM234 novel 1538 11 NA NA 0 7 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAATATACCAATTCTCTCTC -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.538.2 chr1 - 1413 4 full-splice_match TMEM234 ENST00000373593.5 1411 4 -4 2 0 1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAGGTTAGTAAGTATTCT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.538.3 chr1 - 1217 5 full-splice_match TMEM234 ENST00000487174.1 972 5 278 -523 278 -7 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAACAGACAAGAGGTTAGTA 304 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.538.4 chr1 - 1090 5 full-splice_match TMEM234 ENST00000309777.11 1107 5 10 7 0 -7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 34 8.339025 0.921115 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAACAGACAAGAGGTTAGTA 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 34 NA PB.539.1 chr1 + 1457 11 full-splice_match EIF3I ENST00000677711.1 1700 11 242 1 -35 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 1815 445.156799 2.648513 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTTGTGGTGTCTGTTTCA 786 FALSE NA NA AATAAA -33 NA NA NA 1815 NA PB.539.2 chr1 + 1182 11 full-splice_match EIF3I ENST00000677711.1 1700 11 242 276 -35 -5 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 276 67.693268 1.830545 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAATACAAAAATTAGCCA 786 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 276 NA PB.539.3 chr1 + 1311 11 full-splice_match EIF3I ENST00000677711.1 1700 11 276 113 -1 -10 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 262 64.259552 1.807938 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAGAAGAAGG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 262 NA PB.539.4 chr1 + 1706 10 full-splice_match EIF3I ENST00000677183.1 1652 10 -11 -43 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATATTTTGTGGTGTCTGTTT 3 TRUE NA NA AATAAA -31 NA NA NA 5 NA PB.539.5 chr1 + 1514 10 full-splice_match EIF3I ENST00000678883.1 1400 10 -17 -97 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATTTTGTGGTGTCTGTTTC 3 TRUE NA NA AATAAA -32 NA NA NA 5 NA PB.539.6 chr1 + 1441 9 full-splice_match EIF3I ENST00000677540.1 1434 9 -6 -1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTTGTGGTGTCTGTTTCA 3 TRUE NA NA AATAAA -33 NA NA NA 2 NA PB.539.7 chr1 + 1346 10 full-splice_match EIF3I ENST00000677767.1 1343 10 0 -3 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTTGTGGTGTCTGTTTCA 3 TRUE NA NA AATAAA -33 NA NA NA 5 NA PB.539.8 chr1 + 1273 11 full-splice_match EIF3I ENST00000678689.1 1276 11 2 1 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATATTTTGTGGTGTCTGTTT 3 TRUE NA NA AATAAA -31 NA NA NA 9 NA PB.539.9 chr1 + 1254 10 full-splice_match EIF3I ENST00000678968.1 1256 10 0 2 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATTTTGTGGTGTCTGTTTC 3 TRUE NA NA AATAAA -32 NA NA NA 10 NA PB.539.10 chr1 + 1265 9 novel_in_catalog EIF3I novel 1416 11 NA NA 0 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATTTTGTGGTGTCTGTTTC 3 TRUE NA NA AATAAA -32 NA NA NA 2 NA PB.539.11 chr1 + 1270 10 full-splice_match EIF3I ENST00000677353.1 1250 10 -21 1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.660044 0.668390 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTTGTGGTGTCTGTTTCA 3 TRUE NA NA AATAAA -33 NA NA NA 19 NA PB.539.12 chr1 + 1163 11 full-splice_match EIF3I ENST00000678689.1 1276 11 2 111 0 -10 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAGAAGAAGG 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.539.13 chr1 + 995 10 full-splice_match EIF3I ENST00000677353.1 1250 10 -21 276 0 -5 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAATACAAAAATTAGCCA 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.539.14 chr1 + 980 10 full-splice_match EIF3I ENST00000678968.1 1256 10 0 276 0 -5 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAATACAAAAATTAGCCA 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.539.15 chr1 + 988 7 full-splice_match EIF3I ENST00000679290.1 987 7 0 -1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTTGTGGTGTCTGTTTCA 3 TRUE NA NA AATAAA -33 NA NA NA 6 NA PB.539.16 chr1 + 1391 11 full-splice_match EIF3I ENST00000373586.2 1417 11 25 1 2 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTTGTGGTGTCTGTTTCA 9 FALSE NA NA AATAAA -33 NA NA NA 2 NA PB.539.17 chr1 + 1405 11 novel_not_in_catalog EIF3I novel 1700 11 NA NA 0 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATATTTTGTGGTGTCTGTTT 18 FALSE NA NA AATAAA -31 NA NA NA 2 NA PB.539.18 chr1 + 1206 10 full-splice_match EIF3I ENST00000471486.6 1482 10 2 274 0 -5 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAATACAAAAATTAGCCA 18 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.539.19 chr1 + 1479 10 full-splice_match EIF3I ENST00000471486.6 1482 10 3 0 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.678982 0.565728 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATTTTGTGGTGTCTGTTTC 19 FALSE NA NA AATAAA -32 NA NA NA 15 NA PB.539.20 chr1 + 1200 8 incomplete-splice_match EIF3I ENST00000677844.1 1264 9 716 -147 0 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATATTTTGTGGTGTCTGTTT 19 FALSE NA NA AATAAA -31 NA NA NA 5 NA PB.539.21 chr1 + 1383 10 full-splice_match EIF3I ENST00000471486.6 1482 10 100 -1 97 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 362 88.786095 1.948345 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTTGTGGTGTCTGTTTCA 116 FALSE NA NA AATAAA -33 NA NA NA 362 NA PB.539.22 chr1 + 1177 9 incomplete-splice_match EIF3I ENST00000471486.6 1482 10 1597 111 1594 -10 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAGAAGAAGG 1613 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.539.23 chr1 + 976 9 incomplete-splice_match EIF3I ENST00000471486.6 1482 10 1635 274 1632 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAATACAAAAATTAGCCA 1651 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.539.24 chr1 + 1249 9 incomplete-splice_match EIF3I ENST00000471486.6 1482 10 1636 0 1633 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 51 12.508538 1.097207 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATTTTGTGGTGTCTGTTTC 1652 FALSE NA NA AATAAA -32 NA NA NA 51 NA PB.539.25 chr1 + 1062 8 incomplete-splice_match EIF3I ENST00000677183.1 1652 10 2019 67 1997 -10 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAGAAGAAGG 2016 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.539.26 chr1 + 1102 7 incomplete-splice_match EIF3I ENST00000471486.6 1482 10 3765 1 -1136 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 36 8.829556 0.945939 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATATTTTGTGGTGTCTGTTT 3781 FALSE NA NA AATAAA -31 NA NA NA 36 NA PB.539.27 chr1 + 915 7 incomplete-splice_match EIF3I ENST00000677183.1 1652 10 3861 67 -1059 -10 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAGAAGAAGG 3858 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.539.28 chr1 + 1018 7 incomplete-splice_match EIF3I ENST00000471486.6 1482 10 3851 -1 -1050 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 24 5.886371 0.769848 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTTGTGGTGTCTGTTTCA 3867 FALSE NA NA AATAAA -33 NA NA NA 24 NA PB.539.29 chr1 + 883 6 incomplete-splice_match EIF3I ENST00000471486.6 1482 10 4066 1 -835 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 34 8.339025 0.921115 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATATTTTGTGGTGTCTGTTT 24 FALSE NA NA AATAAA -31 NA NA NA 34 NA PB.539.30 chr1 + 793 5 full-splice_match EIF3I ENST00000678306.1 1795 5 1225 -223 949 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTTGTGGTGTCTGTTTCA 2084 FALSE NA NA AATAAA -33 NA NA NA 3 NA PB.540.2 chr1 + 2181 13 novel_in_catalog LCK novel 2091 13 NA NA 0 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACATCTCTTTGCTGTCCACT -9 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 3 NA PB.540.3 chr1 + 2091 13 full-splice_match LCK ENST00000336890.10 2091 13 -1 1 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 130 31.884510 1.503580 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACATCTCTTTGCTGTCCACT -9 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 130 NA PB.540.4 chr1 + 1938 12 novel_in_catalog LCK novel 2091 13 NA NA 0 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.924247 0.593756 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACATCTCTTTGCTGTCCACT -9 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 16 NA PB.540.5 chr1 + 2501 11 novel_in_catalog LCK novel 2091 13 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACATCTCTTTGCTGTCCACT -8 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 4 NA PB.540.6 chr1 + 2207 13 full-splice_match LCK ENST00000619559.4 2099 13 -111 3 -111 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTACATCTCTTTGCTGTCC NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.540.7 chr1 + 2127 13 novel_in_catalog LCK novel 2099 13 NA NA -7 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACATCTCTTTGCTGTCCACT NA FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 3 NA PB.540.8 chr1 + 2260 12 novel_in_catalog LCK novel 2099 13 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTACATCTCTTTGCTGTCC -1 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.540.9 chr1 + 1956 12 novel_in_catalog LCK novel 2099 13 NA NA 0 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACATCTCTTTGCTGTCCAC -1 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.540.10 chr1 + 1930 12 novel_in_catalog LCK novel 2099 13 NA NA -5 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACATCTCTTTGCTGTCCACT 5 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 7 NA PB.540.11 chr1 + 2177 12 incomplete-splice_match LCK ENST00000336890.10 2091 13 22863 4 -4 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTACATCTCTTTGCTGTCC 6 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.540.12 chr1 + 2016 13 novel_not_in_catalog LCK novel 2099 13 NA NA 1 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTACATCTCTTTGCTGTCC 11 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.540.13 chr1 + 2075 13 full-splice_match LCK ENST00000619559.4 2099 13 23 1 2 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 60 14.715927 1.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACATCTCTTTGCTGTCCAC 12 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 60 NA PB.540.14 chr1 + 1963 12 incomplete-splice_match LCK ENST00000619559.4 2099 13 233 1 212 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.924247 0.593756 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACATCTCTTTGCTGTCCAC 7 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 16 NA PB.540.15 chr1 + 1846 11 incomplete-splice_match LCK ENST00000619559.4 2099 13 655 -2 634 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCTCTTTGCTGTCCACTCT 429 FALSE NA NA AATAAA -23 NA NA NA 3 NA PB.540.16 chr1 + 1729 10 incomplete-splice_match LCK ENST00000619559.4 2099 13 943 1 -566 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACATCTCTTTGCTGTCCAC 717 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 5 NA PB.540.17 chr1 + 1576 8 incomplete-splice_match LCK ENST00000619559.4 2099 13 1481 2 -28 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GTACATCTCTTTGCTGTCCA 1255 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 8 NA PB.540.18 chr1 + 1310 6 incomplete-splice_match LCK ENST00000373564.7 2137 11 24709 0 328 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACATCTCTTTGCTGTCCACT 1611 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 3 NA PB.540.19 chr1 + 1450 7 incomplete-splice_match LCK ENST00000619559.4 2099 13 1849 1 340 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACATCTCTTTGCTGTCCAC 1623 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 9 NA PB.540.20 chr1 + 2023 4 incomplete-splice_match LCK ENST00000333070.4 2166 13 4536 -8 3048 5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTTTGCTGTCCACTCTTTGT 4331 FALSE NA NA AATAAA -27 NA NA NA 2 NA PB.540.21 chr1 + 982 4 incomplete-splice_match LCK ENST00000333070.4 2166 13 5571 -2 4083 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACATCTCTTTGCTGTCCACT 5366 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 5 NA PB.541.1 chr1 - 2631 6 full-splice_match MTMR9LP ENST00000690989.1 2666 6 31 4 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATCAGCTTGCTGGGGTGTCA 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.541.2 chr1 - 1499 8 full-splice_match MTMR9LP ENST00000688982.1 1549 8 49 1 -1 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATCAGCTTGCTGGGGTGTCA 29 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.542.1 chr1 + 2104 14 full-splice_match HDAC1 ENST00000373548.8 2118 14 12 2 12 -2 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 1105 271.018341 2.432999 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCTCCTGAGCTTGTTTC 5 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 1105 NA PB.542.2 chr1 + 2026 13 novel_not_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA 12 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCTCCTGAGCTTGTTTCC 5 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.542.3 chr1 + 1200 2 incomplete-splice_match HDAC1 ENST00000463172.5 895 5 -42 23749 12 -23749 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAATATGAAAAAAATTA 5 TRUE NA NA AAGAAA -13 NA NA NA 3 NA PB.542.4 chr1 + 2151 15 novel_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA 17 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATATCCTCCTGAGCTTGTTT 10 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.542.5 chr1 + 4903 12 novel_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA 21 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCTCCTGAGCTTGTTTCC 14 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 6 NA PB.542.6 chr1 + 1893 12 novel_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA 21 2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTCCTGAGCTTGTTTCCTAT 14 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.542.7 chr1 + 3483 13 novel_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA 24 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCTCCTGAGCTTGTTTCC 17 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 4 NA PB.542.8 chr1 + 2546 13 novel_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA -24 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCTCCTGAGCTTGTTTC 21 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.542.9 chr1 + 2469 14 novel_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA -24 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.188451 0.503580 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCTCCTGAGCTTGTTTC 21 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 13 NA PB.542.10 chr1 + 1400 12 incomplete-splice_match HDAC1 ENST00000373548.8 2118 14 28 1415 -24 430 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 25 6.131637 0.787576 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 GAAAAAGAGAAAGACCCAGA 21 TRUE NA NA AAAAAG -24 NA NA NA 25 NA PB.542.11 chr1 + 2038 13 novel_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA -23 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCTCCTGAGCTTGTTTC 22 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.542.12 chr1 + 1723 12 novel_not_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA -21 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.660044 0.668390 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCTCCTGAGCTTGTTTCC 24 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 19 NA PB.542.13 chr1 + 3930 12 novel_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA -18 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCTCCTGAGCTTGTTTC 27 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.542.14 chr1 + 1964 13 novel_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA -12 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.943186 0.468818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCTCCTGAGCTTGTTTCC -18 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 12 NA PB.542.15 chr1 + 2036 14 novel_not_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA -11 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCTCCTGAGCTTGTTTC -17 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.542.16 chr1 + 1982 13 novel_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA -11 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.414778 0.644909 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCTCCTGAGCTTGTTTC -17 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 18 NA PB.542.17 chr1 + 5338 11 novel_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA -8 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCTCCTGAGCTTGTTTCC -14 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.542.18 chr1 + 1228 3 novel_not_in_catalog HDAC1 novel 895 5 NA NA -7 -22210 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATCTCTTTGATGAGCATTT -13 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.542.19 chr1 + 2826 5 full-splice_match HDAC1 ENST00000463172.5 895 5 -2 -1929 0 234 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAATATCTAAGACATGAT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.542.20 chr1 + 1921 13 incomplete-splice_match HDAC1 ENST00000373548.8 2118 14 10597 2 10519 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 23 5.641106 0.751364 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCTCCTGAGCTTGTTTC NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 23 NA PB.542.21 chr1 + 1728 11 incomplete-splice_match HDAC1 ENST00000373548.8 2118 14 32418 1 -2688 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 30 7.357964 0.866758 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCTCCTGAGCTTGTTTCC 1753 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 30 NA PB.542.22 chr1 + 1567 10 incomplete-splice_match HDAC1 ENST00000373548.8 2118 14 34964 1 -142 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 28 6.867433 0.836794 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCTCCTGAGCTTGTTTCC 4299 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 28 NA PB.542.23 chr1 + 1670 10 novel_in_catalog HDAC1 novel 2409 7 NA NA 51 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCTCCTGAGCTTGTTTCC 4577 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.542.24 chr1 + 1428 9 incomplete-splice_match HDAC1 ENST00000373548.8 2118 14 35559 3 368 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 29 7.112698 0.852034 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATATCCTCCTGAGCTTGTTT 4894 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 29 NA PB.542.25 chr1 + 2212 7 full-splice_match HDAC1 ENST00000476391.5 2409 7 187 10 187 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCTCCTGAGCTTGTTTCC 6919 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 4 NA PB.542.26 chr1 + 1617 7 full-splice_match HDAC1 ENST00000476391.5 2409 7 782 10 113 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCTCCTGAGCTTGTTTCC 7514 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 4 NA PB.542.27 chr1 + 1417 7 full-splice_match HDAC1 ENST00000476391.5 2409 7 979 13 310 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TATATCCTCCTGAGCTTGTT 7711 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.542.28 chr1 + 1288 7 full-splice_match HDAC1 ENST00000476391.5 2409 7 1111 10 442 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.414778 0.644909 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCTCCTGAGCTTGTTTCC 7843 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 18 NA PB.542.29 chr1 + 1183 6 incomplete-splice_match HDAC1 ENST00000476391.5 2409 7 1300 7 631 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTCCTGAGCTTGTTTCCTAT 8032 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 6 NA PB.542.30 chr1 + 1104 6 incomplete-splice_match HDAC1 ENST00000476391.5 2409 7 1376 10 -680 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.678982 0.565728 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCTCCTGAGCTTGTTTCC 25 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 15 NA PB.542.31 chr1 + 960 5 incomplete-splice_match HDAC1 ENST00000476391.5 2409 7 2085 10 29 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 26 6.376902 0.804610 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCTCCTGAGCTTGTTTCC 734 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 26 NA PB.542.32 chr1 + 879 4 incomplete-splice_match HDAC1 ENST00000476391.5 2409 7 2263 6 207 3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TCCTGAGCTTGTTTCCTATG 912 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.542.33 chr1 + 811 3 incomplete-splice_match HDAC1 ENST00000471488.1 726 4 554 -546 554 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCTCCTGAGCTTGTTTCC 1259 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.542.34 chr1 + 657 2 incomplete-splice_match HDAC1 ENST00000471488.1 726 4 1166 -546 1166 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCTCCTGAGCTTGTTTCC 1871 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 5 NA PB.543.1 chr1 - 1794 2 full-splice_match MARCKSL1 ENST00000329421.8 1546 2 0 -248 0 248 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAATGAAAATAGTATCTC -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.543.2 chr1 - 1581 2 full-splice_match MARCKSL1 ENST00000329421.8 1546 2 -36 1 -36 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3370 826.544617 2.917266 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTGGTGCTTTAATGAGTGG 3404 FALSE NA NA TTTAAA -21 NA NA NA 3370 NA PB.543.11 chr1 - 1349 2 full-splice_match MARCKSL1 ENST00000329421.8 1546 2 195 2 195 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 58 14.225396 1.153064 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGTGGTGCTTTAATGAGTG 3635 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 58 NA PB.543.14 chr1 - 1442 2 full-splice_match MARCKSL1 ENST00000329421.8 1546 2 0 104 0 -104 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.414778 0.644909 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACCCCAGATTTGTACTTT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.543.15 chr1 - 1309 2 full-splice_match MARCKSL1 ENST00000329421.8 1546 2 0 237 0 -237 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 146 35.808758 1.553989 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGCCTGTGAATCAACTGTGT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 146 NA PB.543.16 chr1 - 1158 2 full-splice_match MARCKSL1 ENST00000329421.8 1546 2 151 237 151 -237 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGCCTGTGAATCAACTGTGT 3591 FALSE NA NA GGGGCT -4 NA NA NA 2 NA PB.543.17 chr1 - 1081 2 full-splice_match MARCKSL1 ENST00000329421.8 1546 2 228 237 228 -237 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGCCTGTGAATCAACTGTGT 3668 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.545.1 chr1 - 2067 11 fusion BSDC1_FAM229A novel 4599 10 NA NA 0 1213 multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTTTGTCGTTAGTATATC 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.545.3 chr1 - 2301 6 incomplete-splice_match BSDC1 ENST00000455895.7 3309 11 15697 474 -3962 6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAAAGGTGTCTGGGGGTCTG 8032 FALSE NA NA GGGGCT -39 NA NA NA 2 NA PB.545.5 chr1 - 2024 3 incomplete-splice_match BSDC1 ENST00000455895.7 3309 11 17803 479 -1856 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCTGAAAGGTGTCTGGGG NA FALSE NA NA GGGGCT -43 NA NA NA 2 NA PB.545.6 chr1 - 1620 2 incomplete-splice_match BSDC1 ENST00000444377.5 2925 12 25905 -1 6259 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCTGAAAGGTGTCTGGGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.545.8 chr1 - 2873 11 full-splice_match BSDC1 ENST00000446293.6 1505 11 -4 -1364 -3 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.943186 0.468818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAAGCTGAAAGGTGTCTGGG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.545.9 chr1 - 2816 11 full-splice_match BSDC1 ENST00000455895.7 3309 11 13 480 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 71 17.413847 1.240895 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAAGCTGAAAGGTGTCTGGG 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 71 NA PB.545.10 chr1 - 2347 7 incomplete-splice_match BSDC1 ENST00000455895.7 3309 11 13196 555 -6463 -17 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAGAAAGAAAAAAGAA 5531 FALSE NA NA AAGAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.545.11 chr1 - 2148 5 incomplete-splice_match BSDC1 ENST00000455895.7 3309 11 16209 555 -3450 -17 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAGAAAGAAAAAAGAA 8544 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.545.12 chr1 - 1794 3 incomplete-splice_match BSDC1 ENST00000455895.7 3309 11 17957 555 -1702 -17 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAGAAAGAAAAAAGAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.545.14 chr1 - 1647 3 incomplete-splice_match BSDC1 ENST00000455895.7 3309 11 18103 556 -1556 -18 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAAGAAAGAAAAAAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.545.20 chr1 - 1727 10 full-splice_match BSDC1 ENST00000341071.11 4599 10 -5 2877 0 -15 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAAAAAAAAAAAAGGAAA 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.545.21 chr1 - 1675 10 incomplete-splice_match BSDC1 ENST00000455895.7 3309 11 10 3416 0 -16 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.395840 0.732059 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 GAAAAAAAAAAAAAAAGGAA 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 22 NA PB.545.22 chr1 - 1617 10 full-splice_match BSDC1 ENST00000373520.8 1630 10 -3 16 0 -16 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 GAAAAAAAAAAAAAAAGGAA 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.545.23 chr1 - 1926 9 incomplete-splice_match BSDC1 ENST00000444377.5 2925 12 -6 10399 -3 1118 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGGTGTCAGTCAGCCTTTT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.545.24 chr1 - 1979 9 incomplete-splice_match BSDC1 ENST00000446293.6 1505 11 -11 9040 0 1113 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAGCCTTGGTGTCAGTCAGC -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.546.1 chr1 + 1917 5 full-splice_match ZBTB8A ENST00000373510.9 7077 5 3 5157 1 -206 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAACTTTATGTAAGACAATT -18 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 8 NA PB.550.1 chr1 - 1965 6 full-splice_match ZBTB8OS ENST00000436661.6 514 6 -437 -1014 -94 4 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTTATTGTTGTTTTTGTTTA 231 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.550.2 chr1 - 1585 7 novel_in_catalog ZBTB8OS novel 1567 7 NA NA 0 -5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAATTTCTTTATTGTTGT 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.550.3 chr1 - 1561 7 full-splice_match ZBTB8OS ENST00000468695.6 1567 7 1 5 0 -5 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 26 6.376902 0.804610 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAATTTCTTTATTGTTGT -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 26 NA PB.550.4 chr1 - 1562 6 novel_in_catalog ZBTB8OS novel 548 6 NA NA -2 -5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAATTTCTTTATTGTTGT 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.550.5 chr1 - 1499 5 novel_in_catalog ZBTB8OS novel 620 7 NA NA 0 -5 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAATTTCTTTATTGTTGT 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.550.6 chr1 - 1517 5 novel_in_catalog ZBTB8OS novel 620 7 NA NA 4 -5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAATTTCTTTATTGTTGT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.550.7 chr1 - 1289 3 novel_in_catalog ZBTB8OS novel 514 6 NA NA 0 -5 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAATTTCTTTATTGTTGT 668 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.550.8 chr1 - 1162 2 incomplete-splice_match ZBTB8OS ENST00000467652.5 388 3 4513 -1005 4513 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAATTTCTTTATTGTTGT NA FALSE NA NA ATTAAA -33 NA NA NA 3 NA PB.550.9 chr1 - 1953 7 full-splice_match ZBTB8OS ENST00000468695.6 1567 7 -392 6 -39 -6 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAATTTCTTTATTGTTG 286 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.550.10 chr1 - 1626 7 full-splice_match ZBTB8OS ENST00000373501.6 598 7 -24 -1004 0 -6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAATTTCTTTATTGTTG -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.550.11 chr1 - 1535 6 novel_in_catalog ZBTB8OS novel 620 7 NA NA 0 -6 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAATTTCTTTATTGTTG 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.550.12 chr1 - 1503 6 full-splice_match ZBTB8OS ENST00000436661.6 514 6 15 -1004 4 -6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAATTTCTTTATTGTTG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.550.13 chr1 - 962 6 full-splice_match ZBTB8OS ENST00000436661.6 514 6 -453 5 -110 -5 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGAACTGTTTTTGTTTTCC 215 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.550.14 chr1 - 983 7 full-splice_match ZBTB8OS ENST00000468695.6 1567 7 -431 1015 -78 -5 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGAACTGTTTTTGTTTTCC 247 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.550.15 chr1 - 537 7 full-splice_match ZBTB8OS ENST00000468695.6 1567 7 15 1015 0 -5 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGAACTGTTTTTGTTTTCC 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.550.16 chr1 - 577 7 full-splice_match ZBTB8OS ENST00000476493.6 588 7 15 -4 0 4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CGAAGAACTGTTTTTGTTTT 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.552.1 chr1 + 2476 12 full-splice_match RBBP4 ENST00000373493.10 7883 12 -153 5560 -87 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.552.2 chr1 + 2374 12 full-splice_match RBBP4 ENST00000373493.10 7883 12 -51 5560 15 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 950 233.002182 2.367360 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT 9 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 950 NA PB.552.3 chr1 + 1606 12 novel_not_in_catalog RBBP4 novel 7883 12 NA NA -6 19678 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAGAACAAGGCAGAAGTG -37 TRUE NA NA AGTAAA -7 NA NA NA 2 NA PB.552.4 chr1 + 2201 12 full-splice_match RBBP4 ENST00000373493.10 7883 12 -26 5708 4 -148 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 201 49.298355 1.692832 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGAGTTGCTTTTTTTTTTT -27 TRUE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 201 NA PB.552.6 chr1 + 2096 12 novel_not_in_catalog RBBP4 novel 7883 12 NA NA -14 -148 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGAGTTGCTTTTTTTTTTT -15 TRUE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.552.7 chr1 + 2067 12 full-splice_match RBBP4 ENST00000373493.10 7883 12 -12 5828 -12 179 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 GACCACCAAGTTGTAAAGAT -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.552.8 chr1 + 2449 11 novel_in_catalog RBBP4 novel 7883 12 NA NA -9 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT -10 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.552.9 chr1 + 2455 13 novel_in_catalog RBBP4 novel 7883 12 NA NA -9 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACCCCATGCTGATGGGTTTT -10 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.552.10 chr1 + 2282 13 novel_not_in_catalog RBBP4 novel 7883 12 NA NA -9 -148 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGAGTTGCTTTTTTTTTTT -10 TRUE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.552.12 chr1 + 1466 12 full-splice_match RBBP4 ENST00000373493.10 7883 12 -9 6426 -9 -123 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGACTTTATTCAGCTATCCC -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.552.13 chr1 + 1503 13 novel_in_catalog RBBP4 novel 7883 12 NA NA -9 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATAACCCCATGCTGATGGGT -10 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 10 NA PB.552.15 chr1 + 704 2 full-splice_match RBBP4 ENST00000465780.1 690 2 -27 13 -9 -13 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.188451 0.503580 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAAGAAAAAAGTATTA -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.552.17 chr1 + 2421 13 novel_not_in_catalog RBBP4 novel 7883 12 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT -1 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.552.18 chr1 + 1614 13 novel_in_catalog RBBP4 novel 7883 12 NA NA 0 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACCCCATGCTGATGGGTT -1 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 7 NA PB.552.19 chr1 + 2322 12 full-splice_match RBBP4 ENST00000373493.10 7883 12 1 5560 -1 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.169513 0.620085 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 17 NA PB.552.21 chr1 + 1435 12 full-splice_match RBBP4 ENST00000373485.5 1417 12 -25 7 -1 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 20 4.905309 0.690666 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACCCCATGCTGATGGGTT 0 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 20 NA PB.552.25 chr1 + 2277 12 full-splice_match RBBP4 ENST00000373493.10 7883 12 52 5554 -18 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 122 29.922386 1.475996 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATGCTGATGGGTTTTATTTA 51 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 122 NA PB.552.29 chr1 + 2356 12 novel_not_in_catalog RBBP4 novel 783 8 NA NA 18 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATAACCCCATGCTGATGGGT 50 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.552.30 chr1 + 1891 10 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000458695.6 1674 12 6091 -462 5960 -149 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAAGAGTTGCTTTTTTTTTT 5711 FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 4 NA PB.552.33 chr1 + 1766 9 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000458695.6 1674 12 16868 -462 -95 -149 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAAGAGTTGCTTTTTTTTTT 6316 FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 7 NA PB.552.34 chr1 + 1898 9 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000458695.6 1674 12 16891 -617 -72 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATGCTGATGGGTTTTATTTA 6339 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 3 NA PB.552.35 chr1 + 2342 9 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000458695.6 1674 12 16910 -1080 -53 463 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCGCTTAGTTTTTTGTTG 6358 FALSE NA NA GATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.552.36 chr1 + 1812 9 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000458695.6 1674 12 16971 -611 8 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 29 7.112698 0.852034 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT 6419 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 29 NA PB.552.39 chr1 + 1544 8 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000492348.6 1547 10 17570 -299 218 -148 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.188451 0.503580 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGAGTTGCTTTTTTTTTTT 6879 FALSE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 13 NA PB.552.40 chr1 + 1667 8 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000492348.6 1547 10 17594 -446 242 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 48 11.772742 1.070878 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACCCCATGCTGATGGGTT 6903 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 48 NA PB.552.41 chr1 + 1562 7 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000460669.5 783 8 -73 2 -59 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.678982 0.565728 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT 7126 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 15 NA PB.552.43 chr1 + 1347 7 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000460669.5 783 8 -6 150 -6 -148 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGAGTTGCTTTTTTTTTTT 7193 FALSE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 3 NA PB.552.44 chr1 + 1461 6 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000460669.5 783 8 124 4 -25 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 36 8.829556 0.945939 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATAACCCCATGCTGATGGGT 7323 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 36 NA PB.552.45 chr1 + 1189 5 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000460669.5 783 8 377 151 228 -149 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.697920 0.431029 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAAGAGTTGCTTTTTTTTTT 7576 FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 11 NA PB.552.46 chr1 + 1343 5 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000460669.5 783 8 378 -4 229 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATGCTGATGGGTTTTATTTA 7577 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.552.48 chr1 + 1283 5 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000460669.5 783 8 432 2 283 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 58 14.225396 1.153064 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT 7631 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 58 NA PB.552.52 chr1 + 1146 3 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000460669.5 783 8 3569 3 3420 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 34 8.339025 0.921115 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACCCCATGCTGATGGGTT NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 34 NA PB.552.53 chr1 + 999 3 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000460669.5 783 8 3569 150 3420 -148 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.414778 0.644909 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGAGTTGCTTTTTTTTTTT NA FALSE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 18 NA PB.553.3 chr1 - 3036 5 full-splice_match SYNC ENST00000409190.8 3503 5 -4 471 -4 -471 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAC -14 TRUE NA NA GGGGCT -16 NA NA NA 2 NA PB.553.4 chr1 - 2945 4 full-splice_match SYNC ENST00000373484.4 1824 4 -7 -1114 -7 -471 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAC -3 TRUE NA NA GGGGCT -5 NA NA NA 2 NA PB.553.6 chr1 - 1734 3 incomplete-splice_match SYNC ENST00000373484.4 1824 4 7620 -967 7620 -618 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAAAAAGCAACTCTT 7660 FALSE NA NA GGGGCT -10 NA NA NA 2 NA PB.553.8 chr1 - 2727 5 full-splice_match SYNC ENST00000409190.8 3503 5 26 750 12 -750 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 GGTTATGTAGAAAAGCAATT 16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.553.9 chr1 - 2622 5 full-splice_match SYNC ENST00000409190.8 3503 5 -8 889 -8 696 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGCTCTGGGACTATTACATT -18 TRUE NA NA GGGGCT -20 NA NA NA 2 NA PB.553.10 chr1 - 1954 4 full-splice_match SYNC ENST00000373484.4 1824 4 12 -142 12 142 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTTTTTGTTCAAGGATATG 16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.554.3 chr1 + 4828 4 incomplete-splice_match KIAA1522 ENST00000373480.1 5294 7 3063 0 3063 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCTGTGGCTACTGCTTCTTA 799 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.554.4 chr1 + 4094 2 incomplete-splice_match KIAA1522 ENST00000373480.1 5294 7 4785 2 4785 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGGCTGTGGCTACTGCTTCT 2521 FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 3 NA PB.554.5 chr1 + 3733 2 incomplete-splice_match KIAA1522 ENST00000373480.1 5294 7 5148 0 5148 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCTGTGGCTACTGCTTCTTA 103 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.554.6 chr1 + 3335 2 incomplete-splice_match KIAA1522 ENST00000373480.1 5294 7 5545 1 5545 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GGCTGTGGCTACTGCTTCTT -5 TRUE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 4 NA PB.554.7 chr1 + 2996 2 incomplete-splice_match KIAA1522 ENST00000373480.1 5294 7 5885 0 5885 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCTGTGGCTACTGCTTCTTA 19 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.554.8 chr1 + 2780 2 incomplete-splice_match KIAA1522 ENST00000373480.1 5294 7 6100 1 6100 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GGCTGTGGCTACTGCTTCTT 234 FALSE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 9 NA PB.554.9 chr1 + 2618 2 incomplete-splice_match KIAA1522 ENST00000373480.1 5294 7 6263 0 6263 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCTGTGGCTACTGCTTCTTA 397 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 7 NA PB.554.10 chr1 + 2441 2 incomplete-splice_match KIAA1522 ENST00000373480.1 5294 7 6440 0 6440 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCTGTGGCTACTGCTTCTTA 574 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 7 NA PB.554.11 chr1 + 2263 2 incomplete-splice_match KIAA1522 ENST00000373480.1 5294 7 6618 0 6618 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCTGTGGCTACTGCTTCTTA 752 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 6 NA PB.556.1 chr1 - 2897 13 full-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 9 -463 8 461 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TACTCTAGGTCAAGCTCATT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.556.2 chr1 - 1455 2 full-splice_match YARS1 ENST00000490826.1 2178 2 1188 -465 1188 458 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATTTACTCTAGGTCAAGCTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.556.3 chr1 - 2278 12 full-splice_match YARS1 ENST00000675785.1 2248 12 41 -71 18 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GTCTGGATGTGAGCTGGACC 11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.556.4 chr1 - 2357 13 full-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 86 0 0 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 26 6.376902 0.804610 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGTCTGGATGTGAGCTGGAC 880 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 26 NA PB.556.5 chr1 - 2312 12 novel_in_catalog YARS1 novel 2443 13 NA NA -3 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGTCTGGATGTGAGCTGGAC 30 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.556.6 chr1 - 2044 11 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 6665 8 954 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 26 6.376902 0.804610 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG 7459 FALSE NA NA GGGGCT -25 NA NA NA 26 NA PB.556.7 chr1 - 1387 5 full-splice_match YARS1 ENST00000487404.5 2197 5 1252 -442 -400 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.395840 0.732059 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGTCTGGATGTGAGCTGGAC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 22 NA PB.556.8 chr1 - 895 2 full-splice_match YARS1 ENST00000490826.1 2178 2 1288 -5 1288 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.697920 0.431029 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGTCTGGATGTGAGCTGGAC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.556.10 chr1 - 2464 13 full-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 -22 1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 626 153.536179 2.186211 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GTGTCTGGATGTGAGCTGGA -30 TRUE NA NA AAAAAG -18 NA NA NA 626 NA PB.556.11 chr1 - 2333 12 novel_in_catalog YARS1 novel 2443 13 NA NA -13 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GTGTCTGGATGTGAGCTGGA 20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.556.12 chr1 - 2236 12 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 6336 1 625 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 20 4.905309 0.690666 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GTGTCTGGATGTGAGCTGGA 7130 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 20 NA PB.556.13 chr1 - 1942 10 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 10753 1 -25 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GTGTCTGGATGTGAGCTGGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.556.14 chr1 - 1157 3 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000469100.5 2247 4 1856 3 464 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.150575 0.711856 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GTGTCTGGATGTGAGCTGGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 21 NA PB.556.16 chr1 - 2081 11 full-splice_match YARS1 ENST00000674629.1 2075 11 34 -40 -6 1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGGTGTCTGGATGTGAGCT 27 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.556.17 chr1 - 1663 8 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 26175 4 -4449 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 39 9.565352 0.980701 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGGTGTCTGGATGTGAGCT 7922 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 39 NA PB.556.19 chr1 - 2504 14 novel_in_catalog YARS1 novel 2443 13 NA NA 0 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG -30 TRUE NA NA AAAAAG -18 NA NA NA 2 NA PB.556.20 chr1 - 2224 11 novel_in_catalog YARS1 novel 3263 13 NA NA 0 -3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG -19 TRUE NA NA AAAAAG -7 NA NA NA 2 NA PB.556.21 chr1 - 2004 10 novel_in_catalog YARS1 novel 2248 12 NA NA 0 -3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG -30 TRUE NA NA AAAAAG -18 NA NA NA 2 NA PB.556.22 chr1 - 1786 9 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 19540 8 396 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.678982 0.565728 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG 1287 FALSE NA NA AAGAAA -13 NA NA NA 15 NA PB.556.23 chr1 - 1496 6 full-splice_match YARS1 ENST00000478828.1 1044 6 292 -744 292 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.395840 0.732059 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 22 NA PB.556.24 chr1 - 1263 4 full-splice_match YARS1 ENST00000469100.5 2247 4 974 10 -418 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 20 4.905309 0.690666 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 20 NA PB.556.26 chr1 - 2363 12 novel_in_catalog YARS1 novel 2443 13 NA NA 0 -4 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAACAAGGGTGTCTGGATGT -30 TRUE NA NA AAAAAG -18 NA NA NA 2 NA PB.556.27 chr1 - 1028 3 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000469100.5 2247 4 1977 11 585 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 26 6.376902 0.804610 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAACAAGGGTGTCTGGATGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 26 NA PB.556.29 chr1 - 2297 5 novel_in_catalog YARS1 novel 1044 6 NA NA 315 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATGCCACAGTCCTTATAATT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.556.30 chr1 - 2023 13 full-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 -22 442 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 141 34.582428 1.538856 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATGCCACAGTCCTTATAATT -30 TRUE NA NA AAAAAG -18 NA NA NA 141 NA PB.556.31 chr1 - 1792 12 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 6339 442 628 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATGCCACAGTCCTTATAATT 7133 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.556.32 chr1 - 1431 10 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000675785.1 2248 12 10845 372 45 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATGCCACAGTCCTTATAATT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.556.33 chr1 - 1268 8 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000675785.1 2248 12 26154 372 -4492 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATGCCACAGTCCTTATAATT 7879 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.556.34 chr1 - 1113 7 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000675785.1 2248 12 30395 372 -251 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATGCCACAGTCCTTATAATT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.556.35 chr1 - 1914 13 full-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 86 443 0 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.697920 0.431029 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TATGCCACAGTCCTTATAAT 880 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.556.36 chr1 - 1668 11 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000675785.1 2248 12 6628 373 895 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TATGCCACAGTCCTTATAAT 7400 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.556.37 chr1 - 1506 10 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000675785.1 2248 12 10769 373 -31 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TATGCCACAGTCCTTATAAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.556.38 chr1 - 1190 7 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000675785.1 2248 12 30317 373 -329 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TATGCCACAGTCCTTATAAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.556.39 chr1 - 1007 6 full-splice_match YARS1 ENST00000478828.1 1044 6 346 -309 346 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TATGCCACAGTCCTTATAAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.556.45 chr1 - 2039 8 novel_in_catalog YARS1 novel 1018 9 NA NA -5 174 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAGA 767 FALSE NA NA AAAAAG -23 NA NA NA 2 NA PB.556.46 chr1 - 1987 7 novel_in_catalog YARS1 novel 1018 9 NA NA 0 174 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAGA -30 TRUE NA NA AAAAAG -18 NA NA NA 3 NA PB.556.50 chr1 - 1320 7 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000616261.2 1018 9 -6 4282 -6 1 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAGTGT 27 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.556.51 chr1 - 1282 6 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 26 15413 -15 1 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAGTGT 18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.557.1 chr1 - 1052 6 novel_not_in_catalog TMEM54 novel 1030 6 NA NA -5 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.471593 0.167788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATTTGGCTGCATGCAGGGG 11 TRUE NA NA GGGGCT -23 NA NA NA 6 NA PB.557.2 chr1 - 998 6 full-splice_match TMEM54 ENST00000373463.8 1030 6 32 0 -5 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 64 15.696989 1.195816 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATTTGGCTGCATGCAGGGG 11 TRUE NA NA GGGGCT -23 NA NA NA 64 NA PB.557.3 chr1 - 919 5 full-splice_match TMEM54 ENST00000475208.5 768 5 100 -251 14 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATTTGGCTGCATGCAGGGG 30 TRUE NA NA GGGGCT -4 NA NA NA 2 NA PB.557.4 chr1 - 901 6 full-splice_match TMEM54 ENST00000474144.5 748 6 -7 -146 -7 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATTTGGCTGCATGCAGGGG 9 TRUE NA NA GGGGCT -25 NA NA NA 4 NA PB.557.5 chr1 - 893 6 full-splice_match TMEM54 ENST00000373463.8 1030 6 137 0 100 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATTTGGCTGCATGCAGGGG 116 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.558.1 chr1 - 1917 8 incomplete-splice_match RNF19B ENST00000235150.5 2677 9 15034 2 14910 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTTACCTCATTTTCCTTG 9509 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.558.2 chr1 - 1739 8 incomplete-splice_match RNF19B ENST00000235150.5 2677 9 15212 2 15088 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTTACCTCATTTTCCTTG 9687 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.558.3 chr1 - 1532 6 incomplete-splice_match RNF19B ENST00000373456.11 2560 9 18157 6 18157 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTTACCTCATTTTCCTTG NA FALSE NA NA GGGGCT -13 NA NA NA 3 NA PB.558.5 chr1 - 1071 3 incomplete-splice_match RNF19B ENST00000373456.11 2560 9 22299 11 22299 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATTCAACTTACCTCATTTT NA FALSE NA NA AATACA -45 NA NA NA 2 NA PB.558.6 chr1 - 911 2 incomplete-splice_match RNF19B ENST00000373456.11 2560 9 26182 11 26182 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATTCAACTTACCTCATTTT 3797 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.559.1 chr1 + 1536 7 full-splice_match S100PBP ENST00000373476.5 3320 7 113 1671 -2 -2 alternative_3end5end TRUE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATGCCCATTGCCGACTTG -15 TRUE NA NA TTTAAA -19 NA NA NA 4 NA PB.559.2 chr1 + 2110 5 incomplete-splice_match S100PBP ENST00000531123.5 1688 7 -3 12268 -3 4306 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 GAAAAAAAAAATTAGCCAGG 2 TRUE NA NA TATAAA -26 NA NA NA 3 NA PB.559.3 chr1 + 3272 7 novel_in_catalog S100PBP novel 4220 7 NA NA 2 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CCTAAGTGTTTACTGTTTTT 7 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.559.4 chr1 + 1645 7 novel_in_catalog S100PBP novel 4220 7 NA NA -1 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAAATGCCCATTGCCGACTT 21 TRUE NA NA TTTAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.559.5 chr1 + 1634 7 full-splice_match S100PBP ENST00000373475.10 4220 7 -61 2647 0 43 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 55 13.489600 1.129999 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GATTTTGTGTGTGTGTGTCT 22 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 55 NA PB.559.7 chr1 + 4252 7 full-splice_match S100PBP ENST00000373475.10 4220 7 -33 1 28 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.395840 0.732059 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACATATGTACTGTGGCGGTC 3 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 22 NA PB.559.10 chr1 + 1631 7 novel_in_catalog S100PBP novel 706 3 NA NA 5 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATGCCCATTGCCGACTTG 51 FALSE NA NA TTTAAA -19 NA NA NA 4 NA PB.559.11 chr1 + 1589 7 novel_in_catalog S100PBP novel 706 3 NA NA 17 4 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CCATTGCCGACTTGAATTTT 102 FALSE NA NA TTTAAA -25 NA NA NA 2 NA PB.559.13 chr1 + 1475 6 incomplete-splice_match S100PBP ENST00000373476.5 3320 7 7895 1663 440 6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTGCCGACTTGAATTTTTT 7684 FALSE NA NA TTTAAA -27 NA NA NA 5 NA PB.559.14 chr1 + 1190 5 incomplete-splice_match S100PBP ENST00000373476.5 3320 7 8847 1664 1392 5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CATTGCCGACTTGAATTTTT 8636 FALSE NA NA TTTAAA -26 NA NA NA 4 NA PB.559.15 chr1 + 3628 5 incomplete-splice_match S100PBP ENST00000373475.10 4220 7 8880 3 1636 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGACATATGTACTGTGGCGG 8880 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.559.16 chr1 + 930 5 incomplete-splice_match S100PBP ENST00000373476.5 3320 7 9107 1664 1652 5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CATTGCCGACTTGAATTTTT 8896 FALSE NA NA TTTAAA -26 NA NA NA 3 NA PB.559.17 chr1 + 3521 5 novel_in_catalog S100PBP novel 4220 7 NA NA 1742 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACATATGTACTGTGGCGGTC 8986 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.559.19 chr1 + 3045 2 full-splice_match S100PBP ENST00000475486.1 665 2 313 -2693 313 3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTACTGTGGCGGTCTGTC 6703 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.560.6 chr1 - 3481 6 full-splice_match AK2 ENST00000548033.5 936 6 -54 -2491 -8 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGAGGTTCTGCATGCATTAT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.560.8 chr1 - 3572 7 full-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 22 3 2 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 27 6.622167 0.821000 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGAGAGGTTCTGCATGCATT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 27 NA PB.560.9 chr1 - 2759 8 full-splice_match AK2 ENST00000467905.5 880 8 -5 -1874 -5 11 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTATTGTTTGTTTGCTTC -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.560.10 chr1 - 2618 6 full-splice_match AK2 ENST00000629371.2 3576 6 17 941 -8 11 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTATTGTTTGTTTGCTTC -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.560.11 chr1 - 2597 7 full-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 105 895 62 11 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.943186 0.468818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTATTGTTTGTTTGCTTC 153 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.560.13 chr1 - 2303 4 incomplete-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 15436 895 243 11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTATTGTTTGTTTGCTTC 563 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.560.14 chr1 - 2199 3 novel_in_catalog AK2 novel 3576 6 NA NA 8 11 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTATTGTTTGTTTGCTTC 76 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.560.15 chr1 - 2135 2 incomplete-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 23495 895 -101 11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.188451 0.503580 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTATTGTTTGTTTGCTTC 8622 FALSE NA NA AATGAA -12 NA NA NA 13 NA PB.560.18 chr1 - 3845 7 novel_in_catalog AK2 novel 2840 8 NA NA -8 10 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GAGCTATTGTTTGTTTGCTT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.560.19 chr1 - 2543 6 full-splice_match AK2 ENST00000548033.5 936 6 -11 -1596 -7 10 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GAGCTATTGTTTGTTTGCTT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.560.20 chr1 - 2442 5 novel_in_catalog AK2 novel 3576 6 NA NA -1 10 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GAGCTATTGTTTGTTTGCTT 86 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.560.22 chr1 - 5051 6 full-splice_match AK2 ENST00000672715.1 5970 6 22 897 2 9 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGAGCTATTGTTTGTTTGCT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.560.23 chr1 - 2427 5 incomplete-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 15179 897 -1 9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGAGCTATTGTTTGTTTGCT 306 FALSE NA NA TTTAAA -17 NA NA NA 10 NA PB.560.24 chr1 - 2004 2 incomplete-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 23624 897 28 9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGAGCTATTGTTTGTTTGCT 8751 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.560.30 chr1 - 2707 7 full-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 -8 898 -5 8 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 366 89.767159 1.953117 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTGAGCTATTGTTTGTTTGC -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 366 NA PB.560.31 chr1 - 2596 8 novel_not_in_catalog AK2 novel 880 8 NA NA -8 8 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTGAGCTATTGTTTGTTTGC -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.560.33 chr1 - 1669 7 full-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 -8 1936 -5 197 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 899 220.493652 2.343396 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCTGTTGTGGCATTT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 899 NA PB.560.34 chr1 - 4149 7 full-splice_match AK2 ENST00000550338.5 886 7 23 -3286 -2 198 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCCCTGTTGTGGCATTTT 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.560.35 chr1 - 2791 7 novel_in_catalog AK2 novel 2840 8 NA NA -2 198 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCCCTGTTGTGGCATTTT 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.560.37 chr1 - 2393 4 novel_in_catalog AK2 novel 2840 8 NA NA 246 198 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCCCTGTTGTGGCATTTT 566 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.560.38 chr1 - 1702 8 novel_not_in_catalog AK2 novel 880 8 NA NA 9 198 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCCCTGTTGTGGCATTTT 77 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.560.39 chr1 - 1521 6 full-splice_match AK2 ENST00000548033.5 936 6 -28 -557 0 198 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.924247 0.593756 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCCCTGTTGTGGCATTTT 63 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.560.40 chr1 - 1389 5 incomplete-splice_match AK2 ENST00000548033.5 936 6 15136 -557 -1 198 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCCCTGTTGTGGCATTTT 306 FALSE NA NA TTTAAA -17 NA NA NA 9 NA PB.560.41 chr1 - 1085 2 full-splice_match AK2 ENST00000482191.1 599 2 112 -598 112 198 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCCCTGTTGTGGCATTTT 9765 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.560.43 chr1 - 4005 6 full-splice_match AK2 ENST00000672715.1 5970 6 29 1936 9 197 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 30 7.357964 0.866758 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCTGTTGTGGCATTT 77 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 30 NA PB.560.44 chr1 - 3888 5 incomplete-splice_match AK2 ENST00000672715.1 5970 6 12314 1936 -2866 197 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCTGTTGTGGCATTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.560.47 chr1 - 1756 7 novel_not_in_catalog AK2 novel 886 7 NA NA 1 197 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCTGTTGTGGCATTT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.560.48 chr1 - 1750 8 novel_in_catalog AK2 novel 886 7 NA NA 9 197 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.188451 0.503580 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCTGTTGTGGCATTT 77 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.560.49 chr1 - 1681 8 full-splice_match AK2 ENST00000467905.5 880 8 32 -833 9 197 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 23 5.641106 0.751364 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCTGTTGTGGCATTT 77 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 23 NA PB.560.51 chr1 - 1239 4 incomplete-splice_match AK2 ENST00000548033.5 936 6 15416 -556 266 197 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.943186 0.468818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCTGTTGTGGCATTT 586 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.560.53 chr1 - 1101 2 incomplete-splice_match AK2 ENST00000548033.5 936 6 23445 -556 -108 197 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.188451 0.503580 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCTGTTGTGGCATTT 8615 FALSE NA NA AATGAA -19 NA NA NA 13 NA PB.560.54 chr1 - 976 2 incomplete-splice_match AK2 ENST00000548033.5 936 6 23570 -556 17 197 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.188451 0.503580 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCTGTTGTGGCATTT 8740 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.560.56 chr1 - 1533 6 full-splice_match AK2 ENST00000629371.2 3576 6 60 1983 -7 196 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTATCCCCTGTTGTGGCATT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.560.58 chr1 - 1454 6 incomplete-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 12374 1937 -2806 196 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTATCCCCTGTTGTGGCATT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.560.59 chr1 - 1629 8 novel_in_catalog AK2 novel 886 7 NA NA -5 39 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAGCTATGTCATCCAAAGAT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.560.60 chr1 - 1385 7 full-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 118 2094 75 39 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAGCTATGTCATCCAAAGAT 166 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.560.61 chr1 - 1484 7 full-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 15 2098 0 35 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 80 19.621237 1.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TCCTAAGCTATGTCATCCAA 63 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 80 NA PB.560.62 chr1 - 1001 7 full-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 32 2564 -7 -31 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGGAATCGGGTTTTCATTT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.560.63 chr1 - 1796 6 full-splice_match AK2 ENST00000672715.1 5970 6 4 4170 -2 888 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CTTTTGAATTCAGATTGTCT 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.560.64 chr1 - 802 5 full-splice_match AK2 ENST00000354858.11 5059 5 110 4147 -8 5 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGCGTGTGTGCTACTCTCAT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.560.65 chr1 - 2031 5 novel_in_catalog AK2 novel 5970 6 NA NA -1 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCTTTGGCGTGTGTGCTAC 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.560.66 chr1 - 994 7 full-splice_match AK2 ENST00000550338.5 886 7 54 -162 -4 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 20 4.905309 0.690666 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCTTTGGCGTGTGTGCTAC 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 20 NA PB.560.67 chr1 - 824 6 full-splice_match AK2 ENST00000672715.1 5970 6 87 5059 44 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCTTTGGCGTGTGTGCTAC 135 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.560.68 chr1 - 918 6 full-splice_match AK2 ENST00000672715.1 5970 6 -8 5060 -5 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 416 102.030434 2.008730 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCTTTGGCGTGTGTGCTA -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 416 NA PB.560.69 chr1 - 791 5 full-splice_match AK2 ENST00000480134.5 811 5 18 2 4 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 30 7.357964 0.866758 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCTTTGGCGTGTGTGCTA 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 30 NA PB.560.72 chr1 - 1033 5 full-splice_match AK2 ENST00000487289.1 920 5 -7 -106 -7 106 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATATTCATTTTCTTTTCAAA -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.560.73 chr1 - 899 5 full-splice_match AK2 ENST00000487289.1 920 5 -24 45 0 -45 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.962124 0.292726 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACATTATTACTTTGATTTCC 63 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.561.1 chr1 + 1810 8 full-splice_match AZIN2 ENST00000471119.5 1806 8 -5 1 0 0 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAGCGGAATCTGGCAGTTTG -7 TRUE NA NA AATAAA -26 NA NA NA 4 NA PB.561.2 chr1 + 2057 11 novel_in_catalog AZIN2 novel 5240 12 NA NA -1 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TAAAAACTGCAGCGGAATCT -5 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 9 NA PB.561.3 chr1 + 1576 9 novel_in_catalog AZIN2 novel 5240 12 NA NA 0 -128 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGCTGTGTCTGCCTCCTCTG -2 TRUE NA NA CATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.564.3 chr1 - 3256 6 novel_in_catalog TRIM62 novel 3817 5 NA NA 0 -5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.981062 -0.008304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAGTAGCCAGTTCCATTCAT -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.564.6 chr1 - 3808 5 full-splice_match TRIM62 ENST00000291416.10 3817 5 0 9 0 -9 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 26 6.376902 0.804610 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATGTCAGTAGCCAGTTCCAT 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 26 NA PB.564.7 chr1 - 2494 3 incomplete-splice_match TRIM62 ENST00000543586.1 1638 5 16805 -1294 16805 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATGTCAGTAGCCAGTTCCAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.565.2 chr1 + 3162 8 novel_in_catalog ZNF362 novel 3187 9 NA NA -101 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GTGGCGGTGGTGTTTGGCGT 81 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.565.3 chr1 + 3055 8 novel_in_catalog ZNF362 novel 3187 9 NA NA 6 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GTGGCGGTGGTGTTTGGCGT -28 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 9 NA PB.565.4 chr1 + 1556 5 novel_in_catalog ZNF362 novel 3187 9 NA NA 17 378 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAGCATATGATTCATCCAT -17 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.565.5 chr1 + 3135 9 full-splice_match ZNF362 ENST00000539719.6 3187 9 53 -1 0 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TGGCGGTGGTGTTTGGCGTG 19 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 5 NA PB.568.1 chr1 - 1489 2 incomplete-splice_match PHC2 ENST00000373418.7 2550 7 20921 0 6292 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.716858 0.234734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TCTCTTTGGTGCCTTTCTCC 3308 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.568.2 chr1 - 2810 8 incomplete-splice_match PHC2 ENST00000373422.8 4255 14 75426 3 -317 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TCTCTTTGGTGCCTTTCTCC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.568.3 chr1 - 2592 8 incomplete-splice_match PHC2 ENST00000373422.8 4255 14 75644 3 -99 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TCTCTTTGGTGCCTTTCTCC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.568.4 chr1 - 2472 7 full-splice_match PHC2 ENST00000373418.7 2550 7 78 0 4 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TCTCTTTGGTGCCTTTCTCC 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.568.5 chr1 - 2165 6 novel_in_catalog PHC2 novel 2548 8 NA NA 965 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.226327 0.088606 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TCTCTTTGGTGCCTTTCTCC NA FALSE NA NA AAAACA -25 NA NA NA 5 NA PB.568.6 chr1 - 2201 6 incomplete-splice_match PHC2 ENST00000373418.7 2550 7 15653 0 1024 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.452655 0.389636 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TCTCTTTGGTGCCTTTCTCC NA FALSE NA NA GGGGCT -32 NA NA NA 10 NA PB.568.7 chr1 - 2059 5 incomplete-splice_match PHC2 ENST00000373418.7 2550 7 17480 0 2851 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.678982 0.565728 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TCTCTTTGGTGCCTTTCTCC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.568.8 chr1 - 1890 4 incomplete-splice_match PHC2 ENST00000373418.7 2550 7 18461 0 3832 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.207389 0.343879 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TCTCTTTGGTGCCTTTCTCC 848 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.568.9 chr1 - 1750 3 incomplete-splice_match PHC2 ENST00000373418.7 2550 7 19736 0 5107 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.433716 0.535764 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TCTCTTTGGTGCCTTTCTCC 2123 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.568.10 chr1 - 1576 2 incomplete-splice_match PHC2 ENST00000373418.7 2550 7 20834 0 6205 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.697920 0.431029 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TCTCTTTGGTGCCTTTCTCC 3221 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.568.14 chr1 - 3961 15 novel_not_in_catalog PHC2 novel 3993 15 NA NA 22 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GTCTCTTTGGTGCCTTTCTC 2719 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.568.15 chr1 - 1944 5 incomplete-splice_match PHC2 ENST00000373418.7 2550 7 17594 1 2965 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GTCTCTTTGGTGCCTTTCTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.570.1 chr1 + 3051 7 novel_not_in_catalog ZSCAN20 novel 4316 8 NA NA 6884 -854 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTTTTAAGTGTAATTTGTT 6893 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.574.1 chr1 + 1380 2 full-splice_match GJB5 ENST00000338513.1 1355 2 -25 0 -25 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.490531 -0.309334 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCCAGGTGCCCTCTGGTTGT -43 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.576.1 chr1 - 2788 2 full-splice_match SMIM12 ENST00000423898.1 897 2 -73 -1818 -35 1519 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.735796 -0.133242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAATAGTAAATGTCATTT 7839 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.576.2 chr1 - 2525 2 full-splice_match SMIM12 ENST00000521580.3 5694 2 0 3169 0 1519 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.678982 0.565728 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAATAGTAAATGTCATTT 13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.576.4 chr1 - 1220 2 full-splice_match SMIM12 ENST00000423898.1 8