isoform chrom strand length exons structural_category associated_gene associated_transcript ref_length ref_exons diff_to_TSS diff_to_TTS diff_to_gene_TSS diff_to_gene_TTS subcategory RTS_stage all_canonical min_sample_cov min_cov min_cov_pos sd_cov FL.BioSample_5 FL_TPM.BioSample_5 FL_TPM.BioSample_5_log10 n_indels n_indels_junc bite iso_exp gene_exp ratio_exp FSM_class coding ORF_length CDS_length CDS_start CDS_end CDS_genomic_start CDS_genomic_end predicted_NMD perc_A_downstream_TTS seq_A_downstream_TTS dist_to_CAGE_peak within_CAGE_peak dist_to_polyA_site within_polyA_site polyA_motif polyA_dist polyA_motif_found ORF_seq ratio_TSS fl_assoc cell_barcodes PB.1.2 chr1 - 2652 10 novel_not_in_catalog WASH7P novel 1351 11 NA NA 225 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA 11 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.1.3 chr1 - 1872 10 novel_not_in_catalog WASH7P novel 1351 11 NA NA 10309 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.1.4 chr1 - 1714 11 novel_not_in_catalog WASH7P novel 1351 11 NA NA 223 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.1.6 chr1 - 1614 10 novel_not_in_catalog WASH7P novel 1351 11 NA NA 211 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.1.7 chr1 - 1448 9 novel_not_in_catalog WASH7P novel 1351 11 NA NA 221 -5 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAAACCAACAGTGTGCTTT 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.1.8 chr1 - 1426 9 novel_not_in_catalog WASH7P novel 1351 11 NA NA 206 -5 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAAACCAACAGTGTGCTTT -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.3.2 chr1 - 1655 10 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -4455 335 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGGATGCAAACGTCTCGGGG 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.3.3 chr1 - 1498 9 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -4452 335 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGGATGCAAACGTCTCGGGG 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.3.8 chr1 - 2537 10 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA 4971 294 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA 9432 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.3.9 chr1 - 2225 11 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -4954 294 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA NA FALSE NA NA ATTAAA -4 NA NA NA 2 NA PB.3.10 chr1 - 1949 10 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -4452 294 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.3.12 chr1 - 1731 8 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA 6555 294 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.3.13 chr1 - 1716 11 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -4464 292 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.814630 0.682563 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAAACCAACAGTGTGCTTT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.3.15 chr1 - 1559 10 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -4455 294 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.3.16 chr1 - 1476 6 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA 7188 294 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.3.18 chr1 - 1435 9 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -4464 294 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.3.19 chr1 - 1400 8 incomplete-splice_match WASH9P ENST00000623083.4 1397 10 6857 -294 6857 294 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.3.20 chr1 - 1322 8 incomplete-splice_match WASH9P ENST00000623083.4 1397 10 6935 -294 6935 294 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.3.21 chr1 - 2943 11 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -4464 292 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAAACCAACAGTGTGCTTT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.3.22 chr1 - 2094 10 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA 5409 292 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAAACCAACAGTGTGCTTT 9870 FALSE NA NA AATGAA -35 NA NA NA 2 NA PB.3.24 chr1 - 1331 8 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -4464 292 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAAACCAACAGTGTGCTTT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.8.1 chr1 + 1211 2 antisense novelGene_ENSG00000228463_AS novel NA NA NA NA NA NA multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTTTCTGGTGTGCTTTTTAA NA FALSE NA NA AATAAA -25 NA NA NA 3 NA PB.10.1 chr1 + 1143 1 full-splice_match LINC01409 ENST00000592547.1 608 1 209 -744 183 744 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA NA NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATAAAAAAAAATCATACCT NA FALSE NA NA ACTAAA -39 NA NA NA 2 NA PB.11.2 chr1 + 1836 7 incomplete-splice_match LINC01128 ENST00000666741.1 5483 8 -40 5014 0 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 TACAATAGCTATTAAAAGAG 762 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.11.5 chr1 + 1656 6 incomplete-splice_match LINC01128 ENST00000691316.1 3092 7 -40 2803 0 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGTGAGGTACAATAGCTATT 816 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.11.7 chr1 + 4441 6 incomplete-splice_match LINC01128 ENST00000691316.1 3092 7 -25 3 0 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ACATCAGTTAACTTGATAAT 1 TRUE NA NA ATTAAA -29 NA NA NA 2 NA PB.12.1 chr1 - 960 4 fusion ENSG00000230092_LINC00115 novel 872 5 NA NA 0 439 multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TCTTTATAGTAGAATGATTT -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.12.2 chr1 - 1204 1 full-splice_match LINC00115 ENST00000473798.1 1317 1 118 -5 118 5 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGCTCACCTTTTATGTTT 111 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.12.3 chr1 - 1310 1 full-splice_match LINC00115 ENST00000473798.1 1317 1 0 7 0 -7 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 17 4.547151 0.657739 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGATATTTCCAAAGCTCA -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.13.1 chr1 + 1177 4 incomplete-splice_match SAMD11 ENST00000341065.8 2191 12 12473 1 619 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCCCGTGTCTACTGCCTCCC 472 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.14.1 chr1 + 1314 6 novel_in_catalog KLHL17 novel 913 6 NA NA -359 -4 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CTCAGGCTGAGCATCTCTCT 2591 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.15.2 chr1 - 2643 18 novel_in_catalog NOC2L novel 2757 19 NA NA 261 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTGGTGGCTCCTGGAGATT 7984 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.15.3 chr1 - 1966 12 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 5361 1 4563 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.744712 0.573418 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTGGTGGCTCCTGGAGATT 6639 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.15.4 chr1 - 1538 9 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 7115 14 -5081 -12 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.744712 0.573418 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGCCATTGTGTTGAGTGGTG 8393 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.15.5 chr1 - 1180 6 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 11027 1 -1169 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTGGTGGCTCCTGGAGATT 5550 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.15.6 chr1 - 1013 5 full-splice_match NOC2L ENST00000483767.5 1611 5 598 0 598 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTGGTGGCTCCTGGAGATT 7317 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.15.7 chr1 - 2746 19 novel_not_in_catalog NOC2L novel 2757 19 NA NA 0 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAGTGGTGGCTCCTGGAGAT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.15.8 chr1 - 2784 19 novel_in_catalog NOC2L novel 2757 19 NA NA -16 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 216 57.775562 1.761744 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGAGTGGTGGCTCCTGGAG -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 216 NA PB.15.9 chr1 - 2775 19 full-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 -29 11 24 -9 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 351 93.885284 1.972597 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CATTGTGTTGAGTGGTGGCT 7694 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 351 NA PB.15.10 chr1 - 1688 10 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000477976.5 4201 17 5922 0 -5476 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAGTGGTGGCTCCTGGAGAT 7998 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.15.11 chr1 - 2667 18 novel_in_catalog NOC2L novel 2757 19 NA NA 0 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGAGTGGTGGCTCCTGGAGA 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.15.12 chr1 - 2147 14 novel_in_catalog NOC2L novel 4201 17 NA NA 2444 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGAGTGGTGGCTCCTGGAGA 4520 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.15.13 chr1 - 1860 11 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000477976.5 4201 17 5175 1 5175 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGAGTGGTGGCTCCTGGAGA 7251 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.15.14 chr1 - 1285 7 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 10663 3 -1533 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.012192 0.603382 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGAGTGGTGGCTCCTGGAGA 5186 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.15.15 chr1 - 1341 8 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000477976.5 4201 17 7295 7 -4103 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTGTGTTGAGTGGTGGCTCC 9371 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.15.16 chr1 - 2601 18 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 279 10 279 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTGTGTTGAGTGGTGGCTC 8002 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.15.17 chr1 - 2097 14 novel_not_in_catalog NOC2L novel 2757 19 NA NA 3931 -8 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTGTGTTGAGTGGTGGCTC 6007 FALSE NA NA AAGAAA -42 NA NA NA 2 NA PB.15.18 chr1 - 2013 13 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 5194 10 4396 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTGTGTTGAGTGGTGGCTC 6472 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.15.19 chr1 - 1767 11 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 6044 10 5246 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTGTGTTGAGTGGTGGCTC 7322 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.15.20 chr1 - 1391 8 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000477976.5 4201 17 7244 8 -4154 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTGTGTTGAGTGGTGGCTC 9320 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.15.21 chr1 - 2806 20 novel_not_in_catalog NOC2L novel 2757 19 NA NA 0 -9 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.942274 0.468683 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CATTGTGTTGAGTGGTGGCT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.15.22 chr1 - 2152 15 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 3133 11 2335 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CATTGTGTTGAGTGGTGGCT 4411 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.15.23 chr1 - 1626 10 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 6758 11 -5438 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CATTGTGTTGAGTGGTGGCT 8036 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.15.24 chr1 - 616 2 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 14171 11 1975 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CATTGTGTTGAGTGGTGGCT 8694 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.15.25 chr1 - 2820 20 novel_not_in_catalog NOC2L novel 2757 19 NA NA 0 -10 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.814630 0.682563 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CCATTGTGTTGAGTGGTGGC 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.15.26 chr1 - 2750 19 novel_not_in_catalog NOC2L novel 2757 19 NA NA 0 -11 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCATTGTGTTGAGTGGTGG 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.15.28 chr1 - 2367 16 novel_in_catalog NOC2L novel 4201 17 NA NA 1455 -11 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCATTGTGTTGAGTGGTGG 9976 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.15.29 chr1 - 2376 16 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 2229 13 1431 -11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.209753 0.506472 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCATTGTGTTGAGTGGTGG 9952 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.15.30 chr1 - 1554 9 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000477976.5 4201 17 6317 11 -5081 -11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCATTGTGTTGAGTGGTGG 8393 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.15.31 chr1 - 1415 9 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 7239 13 -4957 -11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCATTGTGTTGAGTGGTGG 8517 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.15.32 chr1 - 1052 5 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 12728 13 532 -11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCATTGTGTTGAGTGGTGG 7251 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.15.33 chr1 - 821 3 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000483767.5 1611 5 1412 12 1412 -11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCATTGTGTTGAGTGGTGG 8131 FALSE NA NA GGGGCT -21 NA NA NA 3 NA PB.15.34 chr1 - 1053 5 full-splice_match NOC2L ENST00000483767.5 1611 5 545 13 545 -12 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGCCATTGTGTTGAGTGGTG 7264 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.15.35 chr1 - 914 4 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000483767.5 1611 5 799 13 799 -12 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGCCATTGTGTTGAGTGGTG 7518 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.15.36 chr1 - 905 4 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 12988 15 792 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGGCCATTGTGTTGAGTGGT 7511 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.15.37 chr1 - 3217 19 novel_in_catalog NOC2L novel 2757 19 NA NA -20 -14 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGGCCATTGTGTTGAGTGG -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.15.38 chr1 - 2658 19 novel_not_in_catalog NOC2L novel 2757 19 NA NA 276 -14 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGGCCATTGTGTTGAGTGG 7999 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.15.39 chr1 - 2220 15 novel_in_catalog NOC2L novel 4201 17 NA NA 2277 -14 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGGCCATTGTGTTGAGTGG 4353 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.15.43 chr1 - 853 2 full-splice_match NOC2L ENST00000469563.1 878 2 0 25 0 -25 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 24 6.419507 0.807502 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAGAAAAAGAAAGAAAT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 24 NA PB.17.1 chr1 - 976 3 novel_in_catalog HES4 novel 885 4 NA NA 0 11 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GAGTTTTCTTTCTTTGTCTT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.17.2 chr1 - 790 3 full-splice_match HES4 ENST00000484667.2 667 3 -116 -7 0 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTCTGCGTCACGAGTTTTC -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.17.3 chr1 - 882 4 full-splice_match HES4 ENST00000304952.11 885 4 2 1 1 1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 28 7.489425 0.874448 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAGTCTGCGTCACGAGTTT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 28 NA PB.18.2 chr1 + 628 2 full-splice_match ISG15 ENST00000649529.1 637 2 0 9 0 -9 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 45 12.036575 1.080503 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAGAGAAATGGCCGCCTCT 1 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 45 NA PB.19.2 chr1 + 4466 20 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 12052 4 759 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 989 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.19.3 chr1 + 4035 19 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 12614 4 -481 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 1551 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 5 NA PB.19.4 chr1 + 3695 16 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 13525 4 156 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 2462 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.19.5 chr1 + 3588 15 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 13720 4 351 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 2657 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.19.6 chr1 + 3395 14 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 14029 4 -394 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 283 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.19.7 chr1 + 3187 14 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 14237 4 -186 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 491 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 10 NA PB.19.8 chr1 + 2845 12 novel_in_catalog ENSG00000242590 novel 402 2 NA NA -6078 -5 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAAAGCATTGCTTTTGTCC 1103 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.19.9 chr1 + 3060 13 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 14865 4 442 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 1119 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 8 NA PB.19.10 chr1 + 2833 12 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 15268 4 845 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 1522 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.19.11 chr1 + 2703 11 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 15512 4 1089 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 1766 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 8 NA PB.19.12 chr1 + 2566 11 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 15649 4 1226 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 1903 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 6 NA PB.19.13 chr1 + 2475 10 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 15847 4 1424 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 2101 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 6 NA PB.19.14 chr1 + 2359 9 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 16158 4 -1722 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 2412 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.19.15 chr1 + 2287 8 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 16327 4 -1553 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 2581 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 10 NA PB.19.16 chr1 + 2128 7 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 16620 4 -1260 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.942274 0.468683 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 2874 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 11 NA PB.19.17 chr1 + 1968 6 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 17195 4 -685 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.477233 0.541234 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 3449 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 13 NA PB.19.18 chr1 + 1854 5 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 17391 5 -489 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAAAGCATTGCTTTTGTCC 3645 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 4 NA PB.19.19 chr1 + 1733 5 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 17513 4 -367 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 3767 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 5 NA PB.19.20 chr1 + 1678 4 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 17650 4 -230 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.279671 0.631410 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 3904 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 16 NA PB.19.21 chr1 + 1571 3 full-splice_match AGRN ENST00000461111.1 3385 3 1814 0 1814 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.617068 0.749510 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 5948 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 21 NA PB.19.23 chr1 + 1395 2 incomplete-splice_match AGRN ENST00000461111.1 3385 3 2460 0 2460 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 6594 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 6 NA PB.22.1 chr1 - 1899 2 full-splice_match RNF223 ENST00000453464.3 1900 2 2 -1 2 1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CTTTGGCAAGAGGGCCTCAC 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.22.2 chr1 - 1625 2 full-splice_match RNF223 ENST00000453464.3 1900 2 276 -1 276 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CTTTGGCAAGAGGGCCTCAC 275 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.23.1 chr1 + 918 4 novel_in_catalog ENSG00000217801 novel 957 4 NA NA 3 -3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACAGTTTGTGCCTTCAGT 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.23.2 chr1 + 927 4 novel_in_catalog ENSG00000217801 novel 982 4 NA NA 3 29 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CATCGCTGTATCTAATTTGT 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.24.2 chr1 - 2279 10 novel_in_catalog C1orf159 novel 2099 12 NA NA -5 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGCTGCGTTCCGAGCTGCT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.24.4 chr1 - 2020 11 full-splice_match C1orf159 ENST00000379325.7 2010 11 -12 2 -12 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGCTGCGTTCCGAGCTGCT -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.24.5 chr1 - 1945 9 novel_in_catalog C1orf159 novel 2099 12 NA NA -12 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGCTGCGTTCCGAGCTGCT -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.24.6 chr1 - 1916 11 novel_in_catalog C1orf159 novel 2099 12 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGCTGCGTTCCGAGCTGCT 14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.24.7 chr1 - 1885 10 novel_in_catalog C1orf159 novel 2099 12 NA NA -5 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGCTGCGTTCCGAGCTGCT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.24.8 chr1 - 1838 10 full-splice_match C1orf159 ENST00000421241.7 1832 10 -8 2 -2 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 41 10.966658 1.040074 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGCTGCGTTCCGAGCTGCT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 41 NA PB.24.9 chr1 - 1502 6 incomplete-splice_match C1orf159 ENST00000379319.5 1097 10 18545 -875 54 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGCTGCGTTCCGAGCTGCT 4446 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.24.10 chr1 - 1310 2 incomplete-splice_match C1orf159 ENST00000379320.5 2324 8 8113 -410 11 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGCTGCGTTCCGAGCTGCT 7967 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.24.11 chr1 - 1440 10 full-splice_match C1orf159 ENST00000421241.7 1832 10 -26 418 -20 -6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAAAAGTCCTCCAGAGCTC 5176 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.24.12 chr1 - 1444 10 full-splice_match C1orf159 ENST00000482816.5 982 10 139 -601 -9 -409 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGGGACTACGGCCTGCTTGT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.25.1 chr1 - 1291 4 full-splice_match TNFRSF18 ENST00000486728.5 727 4 -229 -335 -229 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACCTGAGTGGATGCATGCTG 8243 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.25.2 chr1 - 1141 4 novel_in_catalog TNFRSF18 novel 1083 5 NA NA 6 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACCTGAGTGGATGCATGCTG -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.25.3 chr1 - 1078 4 novel_not_in_catalog TNFRSF18 novel 1083 5 NA NA -4 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACCTGAGTGGATGCATGCTG -20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.25.4 chr1 - 1076 5 full-splice_match TNFRSF18 ENST00000379268.7 1083 5 6 1 6 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 50 13.373972 1.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACCTGAGTGGATGCATGCTG -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 50 NA PB.25.5 chr1 - 1065 5 full-splice_match TNFRSF18 ENST00000379265.5 705 5 -25 -335 -4 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACCTGAGTGGATGCATGCTG -20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.27.1 chr1 - 1962 7 full-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 7 -36 7 14 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 99 26.480465 1.422926 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAACAAAACACAACAGCAGC -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 99 NA PB.27.2 chr1 - 2014 7 novel_in_catalog SDF4 novel 2137 7 NA NA -14 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTCTTTGGGCGTGAAACAA 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.27.3 chr1 - 1479 5 incomplete-splice_match SDF4 ENST00000263741.12 2079 7 8066 -22 -2614 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTCTTTGGGCGTGAAACAA 8096 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.27.4 chr1 - 1298 4 incomplete-splice_match SDF4 ENST00000263741.12 2079 7 8721 -22 -1959 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTCTTTGGGCGTGAAACAA 8751 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.27.5 chr1 - 860 2 full-splice_match SDF4 ENST00000478938.1 2591 2 1756 -25 1756 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTCTTTGGGCGTGAAACAA 956 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.27.6 chr1 - 1643 6 incomplete-splice_match SDF4 ENST00000263741.12 2079 7 3402 -21 -33 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CATTCTTTGGGCGTGAAACA 9204 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.27.9 chr1 - 2079 6 novel_in_catalog SDF4 novel 1933 7 NA NA 5 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTTCATTCTTTGGGCGTG -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.27.10 chr1 - 2057 7 full-splice_match SDF4 ENST00000263741.12 2079 7 38 -16 8 -6 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTTCATTCTTTGGGCGTG -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.27.11 chr1 - 2006 7 full-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 -57 -16 9 -6 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 650 173.861633 2.240204 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTTCATTCTTTGGGCGTG 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 650 NA PB.27.13 chr1 - 1768 6 incomplete-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 3126 -16 -279 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTTCATTCTTTGGGCGTG 8958 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.27.14 chr1 - 1431 3 full-splice_match SDF4 ENST00000494748.1 3516 3 2102 -17 1044 -6 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTTCATTCTTTGGGCGTG 9598 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.27.15 chr1 - 1316 5 incomplete-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 8077 -16 -2573 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 29 7.756904 0.889688 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTTCATTCTTTGGGCGTG 8137 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 29 NA PB.27.16 chr1 - 1214 4 incomplete-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 8653 -16 -1997 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 27 7.221945 0.858654 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTTCATTCTTTGGGCGTG 8713 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 27 NA PB.27.17 chr1 - 951 2 full-splice_match SDF4 ENST00000478938.1 2591 2 1659 -19 1659 -6 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.547151 0.657739 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTTCATTCTTTGGGCGTG 859 FALSE NA NA GGGGCT -10 NA NA NA 17 NA PB.27.18 chr1 - 1108 3 full-splice_match SDF4 ENST00000494748.1 3516 3 2424 -16 1366 -7 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.744712 0.573418 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGCTTCATTCTTTGGGCGT 9920 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.27.19 chr1 - 1526 6 incomplete-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 3366 -14 -39 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.884548 0.769713 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TCAGCTTCATTCTTTGGGCG 9198 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 22 NA PB.27.20 chr1 - 2207 7 novel_not_in_catalog SDF4 novel 1933 7 NA NA 71 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATAGTTGCCTTTTTTG 9039 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.27.22 chr1 - 2103 7 full-splice_match SDF4 ENST00000660930.1 2137 7 5 29 5 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATAGTTGCCTTTTTTG -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.27.23 chr1 - 1905 7 novel_not_in_catalog SDF4 novel 1933 7 NA NA -8858 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATAGTTGCCTTTTTTG 11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.27.24 chr1 - 1803 6 incomplete-splice_match SDF4 ENST00000263741.12 2079 7 3214 7 -221 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATAGTTGCCTTTTTTG 9016 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.27.25 chr1 - 1640 6 incomplete-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 3231 7 -174 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.012192 0.603382 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATAGTTGCCTTTTTTG 9063 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.27.26 chr1 - 1392 6 incomplete-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 3479 7 74 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.617068 0.749510 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATAGTTGCCTTTTTTG 9311 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 21 NA PB.27.27 chr1 - 1351 5 incomplete-splice_match SDF4 ENST00000263741.12 2079 7 8165 7 -2515 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATAGTTGCCTTTTTTG 8195 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.27.28 chr1 - 971 3 full-splice_match SDF4 ENST00000494748.1 3516 3 2539 6 1481 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATAGTTGCCTTTTTTG 9900 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.27.29 chr1 - 1700 7 full-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 90 143 57 -140 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAATGAGTAGCCAGGAAGTT 9025 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.27.30 chr1 - 1778 7 full-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 11 144 11 -141 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.209753 0.506472 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 GAAATGAGTAGCCAGGAAGT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.27.31 chr1 - 1877 7 novel_not_in_catalog SDF4 novel 1933 7 NA NA 0 -145 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GCTGGAAATGAGTAGCCAGG -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.27.32 chr1 - 1261 6 incomplete-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 3469 148 64 -145 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GCTGGAAATGAGTAGCCAGG 9301 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.27.33 chr1 - 1095 6 incomplete-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 -4 1611 -4 -19 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AACTGGGTGAAAGACAGAAA 8931 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.28.2 chr1 - 2419 7 full-splice_match UBE2J2 ENST00000360466.6 1047 7 -122 -1250 1 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTTCATGCTGCTTGTGTC -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.28.3 chr1 - 2370 7 full-splice_match UBE2J2 ENST00000347370.6 2387 7 17 0 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTTCATGCTGCTTGTGTC 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.28.4 chr1 - 2367 8 full-splice_match UBE2J2 ENST00000464036.5 1256 8 23 -1134 3 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTTCATGCTGCTTGTGTC 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.28.5 chr1 - 2243 7 novel_in_catalog UBE2J2 novel 1256 8 NA NA 1 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTTCATGCTGCTTGTGTC -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.28.6 chr1 - 2080 5 novel_in_catalog UBE2J2 novel 2387 7 NA NA 1 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTTCATGCTGCTTGTGTC -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.28.8 chr1 - 2251 7 full-splice_match UBE2J2 ENST00000349431.11 2260 7 6 3 1 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 78 20.863398 1.319385 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATTTCATGCTGCTTGTGT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 78 NA PB.28.9 chr1 - 2100 6 full-splice_match UBE2J2 ENST00000400929.6 1057 6 27 -1070 -1 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATTTCATGCTGCTTGTGT 16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.28.11 chr1 - 2086 7 full-splice_match UBE2J2 ENST00000349431.11 2260 7 170 4 42 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGAATTTCATGCTGCTTGTG 160 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.28.13 chr1 - 1516 8 novel_in_catalog UBE2J2 novel 1256 8 NA NA 1 84 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TTAGATGTGGTCACTTAGAA -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.28.14 chr1 - 2057 7 novel_in_catalog UBE2J2 novel 2260 7 NA NA -1 83 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTAGATGTGGTCACTTAGA 16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.28.15 chr1 - 1421 7 full-splice_match UBE2J2 ENST00000360466.6 1047 7 -112 -262 -1 83 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.744712 0.573418 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTAGATGTGGTCACTTAGA 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.28.16 chr1 - 1407 8 novel_not_in_catalog UBE2J2 novel 2455 8 NA NA 1 83 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTAGATGTGGTCACTTAGA -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.28.17 chr1 - 1377 7 novel_not_in_catalog UBE2J2 novel 2387 7 NA NA 0 83 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTAGATGTGGTCACTTAGA -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.28.18 chr1 - 1379 8 full-splice_match UBE2J2 ENST00000464036.5 1256 8 23 -146 3 83 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 19 5.082109 0.706044 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTAGATGTGGTCACTTAGA 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.28.19 chr1 - 1382 7 full-splice_match UBE2J2 ENST00000473215.5 1028 7 12 -366 0 83 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.547151 0.657739 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTAGATGTGGTCACTTAGA 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.28.20 chr1 - 1322 7 novel_in_catalog UBE2J2 novel 1256 8 NA NA -1 83 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTAGATGTGGTCACTTAGA -21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.28.21 chr1 - 1310 8 full-splice_match UBE2J2 ENST00000400930.8 1021 8 -13 -276 -2 83 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTAGATGTGGTCACTTAGA -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.28.22 chr1 - 1223 6 novel_in_catalog UBE2J2 novel 2260 7 NA NA 1 83 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTAGATGTGGTCACTTAGA -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.28.23 chr1 - 1169 6 novel_in_catalog UBE2J2 novel 2260 7 NA NA -1 83 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.279671 0.631410 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTAGATGTGGTCACTTAGA 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.28.24 chr1 - 1133 6 full-splice_match UBE2J2 ENST00000400929.6 1057 6 7 -83 1 83 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.884548 0.769713 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTAGATGTGGTCACTTAGA -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 22 NA PB.28.25 chr1 - 1109 7 full-splice_match UBE2J2 ENST00000349431.11 2260 7 161 990 33 83 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTAGATGTGGTCACTTAGA 151 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.28.26 chr1 - 915 4 incomplete-splice_match UBE2J2 ENST00000400929.6 1057 6 16539 -83 -981 83 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTAGATGTGGTCACTTAGA NA FALSE NA NA AAAACA -39 NA NA NA 2 NA PB.28.27 chr1 - 854 2 full-splice_match UBE2J2 ENST00000467339.1 515 2 23 -362 23 83 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTAGATGTGGTCACTTAGA NA FALSE NA NA ATTAAA -25 NA NA NA 2 NA PB.28.28 chr1 - 1386 8 novel_not_in_catalog UBE2J2 novel 1256 8 NA NA 0 82 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATTAGATGTGGTCACTTAG -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.28.29 chr1 - 1269 7 full-splice_match UBE2J2 ENST00000349431.11 2260 7 0 991 0 82 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 336 89.873093 1.953630 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATTAGATGTGGTCACTTAG -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 336 NA PB.28.30 chr1 - 1091 5 novel_in_catalog UBE2J2 novel 1057 6 NA NA 1 82 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATTAGATGTGGTCACTTAG -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.28.31 chr1 - 807 3 incomplete-splice_match UBE2J2 ENST00000400929.6 1057 6 16722 -81 -798 81 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TTATTAGATGTGGTCACTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.29.1 chr1 + 2719 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 80 6 80 -6 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACAAAGCCTGCCCCAGGCT 65 FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 4 NA PB.29.2 chr1 + 1860 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 83 862 83 -862 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTCCCTGGAGTCCGACGC 68 FALSE NA NA AGTAAA -33 NA NA NA 5 NA PB.29.3 chr1 + 1389 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 101 1315 101 -1315 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAAGTTGGCAGTGCGCACGT 86 FALSE NA NA TATAAA -26 NA NA NA 3 NA PB.29.4 chr1 + 2528 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 271 6 271 -6 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACAAAGCCTGCCCCAGGCT 256 FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 5 NA PB.29.5 chr1 + 1448 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 495 862 495 -862 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTCCCTGGAGTCCGACGC 480 FALSE NA NA AGTAAA -33 NA NA NA 2 NA PB.29.6 chr1 + 2172 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 627 6 627 -6 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACAAAGCCTGCCCCAGGCT 612 FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 4 NA PB.29.7 chr1 + 1239 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 704 862 704 -862 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTCCCTGGAGTCCGACGC 689 FALSE NA NA AGTAAA -33 NA NA NA 2 NA PB.29.8 chr1 + 2037 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 761 7 761 -7 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAACAAAGCCTGCCCCAGGC 746 FALSE NA NA ATTAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.29.9 chr1 + 1040 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 900 865 900 -865 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATGAGCTCCCTGGAGTCCGA 885 FALSE NA NA AGTAAA -30 NA NA NA 2 NA PB.29.10 chr1 + 1483 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 1316 6 1316 -6 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACAAAGCCTGCCCCAGGCT 1301 FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 3 NA PB.29.11 chr1 + 1360 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 1439 6 1439 -6 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACAAAGCCTGCCCCAGGCT 1424 FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 5 NA PB.29.13 chr1 + 1052 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 1747 6 1747 -6 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACAAAGCCTGCCCCAGGCT 1732 FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 3 NA PB.30.1 chr1 - 2296 9 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 2725 -484 -1222 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TGCTCCTGGGCTCCCGTGCC 8562 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.30.3 chr1 - 2729 12 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 877 -480 163 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TGCCTGCTCCTGGGCTCCCG 9957 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.30.4 chr1 - 2218 8 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 2900 -480 -1047 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TGCCTGCTCCTGGGCTCCCG 8737 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.30.5 chr1 - 1344 2 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 5107 -479 1160 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTGCCTGCTCCTGGGCTCCC 4972 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.30.6 chr1 - 4912 22 novel_not_in_catalog ACAP3 novel 3793 24 NA NA 23 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTGCCTGCTCCTGGGCTCC -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.30.7 chr1 - 1766 4 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 4326 -478 379 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTGCCTGCTCCTGGGCTCC 4191 FALSE NA NA GGGGCT -11 NA NA NA 5 NA PB.30.8 chr1 - 1483 3 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 4811 -478 864 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTGCCTGCTCCTGGGCTCC 4676 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.30.10 chr1 - 3288 23 novel_not_in_catalog ACAP3 novel 3793 24 NA NA 26 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.617068 0.749510 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCCCTCATCTCATGTTCTT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 21 NA PB.30.11 chr1 - 3183 22 novel_not_in_catalog ACAP3 novel 3793 24 NA NA 35 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCCCTCATCTCATGTTCTT 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.30.12 chr1 - 3188 23 novel_not_in_catalog ACAP3 novel 3793 24 NA NA 14 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCCCTCATCTCATGTTCTT 231 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.30.13 chr1 - 2317 13 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 552 1 -138 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCCCTCATCTCATGTTCTT 9632 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.30.14 chr1 - 2097 11 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 1107 1 393 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCCCTCATCTCATGTTCTT 9993 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.30.15 chr1 - 1777 8 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 2860 1 -1087 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCCCTCATCTCATGTTCTT 8697 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.30.16 chr1 - 1672 7 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 3041 1 -906 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCCCTCATCTCATGTTCTT 8878 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.30.17 chr1 - 1352 5 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 4172 1 225 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCCCTCATCTCATGTTCTT 10009 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.30.18 chr1 - 3760 23 novel_in_catalog ACAP3 novel 3793 24 NA NA 26 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CAGCCCTCATCTCATGTTCT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.30.20 chr1 - 2619 16 novel_not_in_catalog ACAP3 novel 3793 24 NA NA -439 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CAGCCCTCATCTCATGTTCT 7979 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.30.21 chr1 - 2212 12 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 912 2 198 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CAGCCCTCATCTCATGTTCT 9992 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.30.22 chr1 - 1797 4 novel_in_catalog ACAP3 novel 3793 24 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 105 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.31.3 chr1 + 1293 8 novel_in_catalog PUSL1 novel 1257 8 NA NA -60 1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACCAGTTTGTTTCTTCAGCT NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.31.4 chr1 + 1381 8 novel_not_in_catalog PUSL1 novel 1257 8 NA NA -56 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACCAGTTTGTTTCTTCAG NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.31.5 chr1 + 1311 8 novel_not_in_catalog PUSL1 novel 1257 8 NA NA -38 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACCAGTTTGTTTCTTCAG NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 4 NA PB.31.6 chr1 + 1286 8 full-splice_match PUSL1 ENST00000379031.10 1257 8 -30 1 -30 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 86 23.003233 1.361789 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACCAGTTTGTTTCTTCAG NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 86 NA PB.31.7 chr1 + 1303 6 novel_in_catalog PUSL1 novel 1257 8 NA NA -28 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACCAGTTTGTTTCTTCAG NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.31.8 chr1 + 1226 7 novel_in_catalog PUSL1 novel 1257 8 NA NA -28 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.477233 0.541234 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACCAGTTTGTTTCTTCAG NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 13 NA PB.31.9 chr1 + 1503 6 novel_in_catalog PUSL1 novel 1257 8 NA NA 10 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACCAGTTTGTTTCTTCAG 1 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.31.10 chr1 + 1417 7 novel_in_catalog PUSL1 novel 1257 8 NA NA 19 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACCAGTTTGTTTCTTCAG 10 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 9 NA PB.31.11 chr1 + 1296 7 novel_in_catalog PUSL1 novel 1257 8 NA NA 23 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACCAGTTTGTTTCTTCAG 14 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.31.12 chr1 + 1179 8 full-splice_match PUSL1 ENST00000379031.10 1257 8 76 2 62 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAGACCAGTTTGTTTCTTCA 53 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.31.13 chr1 + 1280 8 novel_not_in_catalog PUSL1 novel 1257 8 NA NA 80 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACCAGTTTGTTTCTTCAG -4 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.31.14 chr1 + 1379 6 novel_in_catalog PUSL1 novel 1257 8 NA NA -44 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAGACCAGTTTGTTTCTTCA 23 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.31.15 chr1 + 1282 7 incomplete-splice_match PUSL1 ENST00000379031.10 1257 8 168 1 -23 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACCAGTTTGTTTCTTCAG 44 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 8 NA PB.33.1 chr1 - 2116 17 full-splice_match INTS11 ENST00000435064.6 2114 17 0 -2 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 267 71.417015 1.853802 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTGGTACTCTCTTCTTGG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 267 NA PB.33.2 chr1 - 2007 17 novel_in_catalog INTS11 novel 2114 17 NA NA 0 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.33.3 chr1 - 1481 11 incomplete-splice_match INTS11 ENST00000323275.10 2450 16 9679 -2 199 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTGGTACTCTCTTCTTGG 9715 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.33.4 chr1 - 2184 16 novel_in_catalog INTS11 novel 2114 17 NA NA 0 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.33.5 chr1 - 2033 16 novel_in_catalog INTS11 novel 2571 19 NA NA 0 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.33.6 chr1 - 1950 15 novel_in_catalog INTS11 novel 2114 17 NA NA -4 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC -20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.33.7 chr1 - 1995 13 incomplete-splice_match INTS11 ENST00000323275.10 2450 16 8632 9 -292 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 8668 FALSE NA NA AATACA -32 NA NA NA 2 NA PB.33.8 chr1 - 1790 14 incomplete-splice_match INTS11 ENST00000323275.10 2450 16 5160 9 -115 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 5196 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.33.9 chr1 - 1607 13 incomplete-splice_match INTS11 ENST00000323275.10 2450 16 9020 9 0 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 9056 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.33.10 chr1 - 1458 10 novel_in_catalog INTS11 novel 1618 13 NA NA -180 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 9813 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.33.11 chr1 - 1287 9 incomplete-splice_match INTS11 ENST00000323275.10 2450 16 10699 9 -97 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 7152 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.33.12 chr1 - 1152 9 incomplete-splice_match INTS11 ENST00000323275.10 2450 16 10834 9 -7 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 7287 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.33.13 chr1 - 1194 3 full-splice_match INTS11 ENST00000497304.6 932 3 -273 11 -273 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 8101 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.33.14 chr1 - 1035 8 incomplete-splice_match INTS11 ENST00000323275.10 2450 16 11090 9 219 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 7543 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.33.15 chr1 - 2064 17 novel_not_in_catalog INTS11 novel 2114 17 NA NA 0 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 GAACAAAAGACTACTTGGTA 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.33.16 chr1 - 758 5 incomplete-splice_match INTS11 ENST00000470030.6 2369 10 2733 25 0 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 GAACAAAAGACTACTTGGTA 8374 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.33.19 chr1 - 1561 3 full-splice_match INTS11 ENST00000498173.2 1589 3 27 1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TTTTGTTGTGAAACTTTAAT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.33.20 chr1 - 1074 4 full-splice_match INTS11 ENST00000429572.5 1104 4 6 24 0 -6 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.012192 0.603382 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAATGAAGTATGTTTATCT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.33.21 chr1 - 2484 2 full-splice_match INTS11 ENST00000496353.1 2428 2 -42 -14 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TTTTTGTTGTGAAACTTTAA 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.33.22 chr1 - 1426 4 full-splice_match INTS11 ENST00000470679.3 584 4 -55 -787 0 -2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TTTTTGTTGTGAAACTTTAA -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.34.2 chr1 - 2962 15 full-splice_match DVL1 ENST00000378891.9 2926 15 -39 3 -39 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACAGATGTGTGGCCTGTGCC 9395 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.34.3 chr1 - 2801 15 full-splice_match DVL1 ENST00000378888.10 3305 15 503 1 40 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACAGATGTGTGGCCTGTGCC 9631 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.34.4 chr1 - 2367 11 incomplete-splice_match DVL1 ENST00000378888.10 3305 15 7731 1 -1322 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACAGATGTGTGGCCTGTGCC 7756 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.34.5 chr1 - 1437 2 incomplete-splice_match DVL1 ENST00000378891.9 2926 15 10936 3 1246 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACAGATGTGTGGCCTGTGCC 1907 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.34.8 chr1 - 2550 13 incomplete-splice_match DVL1 ENST00000378891.9 2926 15 6713 4 -2034 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GACAGATGTGTGGCCTGTGC 7044 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.34.9 chr1 - 1870 5 incomplete-splice_match DVL1 ENST00000378888.10 3305 15 10005 2 9 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GACAGATGTGTGGCCTGTGC 9985 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.34.10 chr1 - 1703 4 incomplete-splice_match DVL1 ENST00000378891.9 2926 15 10499 4 809 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GACAGATGTGTGGCCTGTGC 1470 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.34.11 chr1 - 1579 3 incomplete-splice_match DVL1 ENST00000378891.9 2926 15 10708 4 1018 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GACAGATGTGTGGCCTGTGC 1679 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.34.13 chr1 - 1807 5 incomplete-splice_match DVL1 ENST00000378891.9 2926 15 9683 8 -7 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATGGGACAGATGTGTGGCCT 9969 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.35.1 chr1 - 2001 10 novel_in_catalog MXRA8 novel 2001 10 NA NA -6 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACTTGTCCCAGGTATGCT -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.35.2 chr1 - 1984 8 novel_not_in_catalog MXRA8 novel 2231 9 NA NA 0 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACTTGTCCCAGGTATGCT 3 TRUE NA NA AAAACA -30 NA NA NA 5 NA PB.35.3 chr1 - 1684 10 novel_not_in_catalog MXRA8 novel 2001 10 NA NA 0 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACTTGTCCCAGGTATGCT 3 TRUE NA NA AAAACA -30 NA NA NA 2 NA PB.35.4 chr1 - 1380 4 novel_in_catalog MXRA8 novel 2728 10 NA NA -22 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACTTGTCCCAGGTATGCT 7301 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.35.5 chr1 - 3546 7 novel_in_catalog MXRA8 novel 2293 10 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGACTTGTCCCAGGTATGC 3 TRUE NA NA AAAACA -30 NA NA NA 2 NA PB.35.6 chr1 - 2400 9 novel_in_catalog MXRA8 novel 2293 10 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGACTTGTCCCAGGTATGC 3 TRUE NA NA AAAACA -30 NA NA NA 5 NA PB.35.7 chr1 - 2278 10 full-splice_match MXRA8 ENST00000309212.11 2293 10 13 2 1 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 23 6.152027 0.789018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGACTTGTCCCAGGTATGC 4 TRUE NA NA AAAACA -29 NA NA NA 23 NA PB.35.8 chr1 - 1743 6 incomplete-splice_match MXRA8 ENST00000309212.11 2293 10 3422 2 -117 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGACTTGTCCCAGGTATGC 6664 FALSE NA NA GGGGCT -30 NA NA NA 5 NA PB.36.1 chr1 - 1136 3 full-splice_match AURKAIP1 ENST00000338370.7 1072 3 -45 -19 5 19 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 64 17.118685 1.233470 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTGCCGGGTGTGAGGTCT -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 64 NA PB.36.2 chr1 - 1150 3 novel_in_catalog AURKAIP1 novel 875 4 NA NA -9 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CCTGCGGGTCTGGAGCTCCA 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.36.3 chr1 - 854 3 novel_in_catalog AURKAIP1 novel 753 4 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTCCTGCGGGTCTGGAGCTC -21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.36.4 chr1 - 1236 3 novel_in_catalog AURKAIP1 novel 1072 3 NA NA -8 1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CCTTTCCTGCGGGTCTGGAG 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.36.5 chr1 - 942 3 novel_in_catalog AURKAIP1 novel 753 4 NA NA -274 1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CCTTTCCTGCGGGTCTGGAG 34 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.36.6 chr1 - 738 3 full-splice_match AURKAIP1 ENST00000338370.7 1072 3 329 5 316 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CCTTTCCTGCGGGTCTGGAG 687 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.36.7 chr1 - 1366 2 incomplete-splice_match AURKAIP1 ENST00000338338.10 753 4 8 1 8 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.209753 0.506472 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGCCTTTCCTGCGGGTCTGG -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.36.8 chr1 - 1066 4 full-splice_match AURKAIP1 ENST00000338338.10 753 4 -314 1 -314 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 19 5.082109 0.706044 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGCCTTTCCTGCGGGTCTGG -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.36.9 chr1 - 1032 3 novel_in_catalog AURKAIP1 novel 753 4 NA NA -21 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGCCTTTCCTGCGGGTCTGG 287 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.36.10 chr1 - 884 4 full-splice_match AURKAIP1 ENST00000378853.3 875 4 -9 0 -9 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 90 24.073151 1.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGCCTTTCCTGCGGGTCTGG 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 90 NA PB.36.11 chr1 - 813 4 full-splice_match AURKAIP1 ENST00000321751.9 798 4 -20 5 -16 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.477233 0.541234 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGCCTTTCCTGCGGGTCTGG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.36.12 chr1 - 758 4 full-splice_match AURKAIP1 ENST00000338338.10 753 4 -6 1 -6 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 119 31.830053 1.502837 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGCCTTTCCTGCGGGTCTGG -27 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 119 NA PB.36.13 chr1 - 841 4 full-splice_match AURKAIP1 ENST00000338338.10 753 4 -90 2 -90 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 37 9.896740 0.995492 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CAGCCTTTCCTGCGGGTCTG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 37 NA PB.37.1 chr1 + 2166 3 full-splice_match CPTP ENST00000343938.9 2154 3 -13 1 -13 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 147 39.319477 1.594608 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTGGGTGCCTGATTTCCTG 5343 FALSE NA NA AATAAA -36 NA NA NA 147 NA PB.37.2 chr1 + 1955 2 full-splice_match CPTP ENST00000464957.1 1101 2 47 -901 1 -1 alternative_3end TRUE canonical NA NA NA NA 11 2.942274 0.468683 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTGGGTGCCTGATTTCCTG -23 TRUE NA NA AATAAA -36 NA NA NA 11 NA PB.37.5 chr1 + 2066 3 full-splice_match CPTP ENST00000343938.9 2154 3 87 1 87 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 34 9.094301 0.958769 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTGGGTGCCTGATTTCCTG 10 TRUE NA NA AATAAA -36 NA NA NA 34 NA PB.37.6 chr1 + 1850 2 full-splice_match CPTP ENST00000464957.1 1101 2 154 -903 108 1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGGGTGCCTGATTTCCTGCA -5 TRUE NA NA AATAAA -38 NA NA NA 3 NA PB.37.7 chr1 + 1920 3 full-splice_match CPTP ENST00000343938.9 2154 3 233 1 -206 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTGGGTGCCTGATTTCCTG 120 FALSE NA NA AATAAA -36 NA NA NA 8 NA PB.37.8 chr1 + 1748 2 incomplete-splice_match CPTP ENST00000343938.9 2154 3 2138 1 1699 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTGGGTGCCTGATTTCCTG 72 FALSE NA NA AATAAA -36 NA NA NA 8 NA PB.37.9 chr1 + 1691 2 incomplete-splice_match CPTP ENST00000343938.9 2154 3 2195 1 1756 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTGGGTGCCTGATTTCCTG 129 FALSE NA NA AATAAA -36 NA NA NA 4 NA PB.38.1 chr1 - 2430 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 1655 -1003 30 1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTTATGTTCTCCTAATTT 8453 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.38.2 chr1 - 5049 11 novel_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATTTTATGTTCTCCTAAT -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.38.3 chr1 - 3104 11 full-splice_match CCNL2 ENST00000400809.8 3112 11 7 1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATTTTATGTTCTCCTAAT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.38.6 chr1 - 2811 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 501 -230 -270 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TATGGACGTGGTAGGTGGTC 7299 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.38.7 chr1 - 1975 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 1326 -219 -103 1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATCCGGAGCGTTATGGACGT 8124 FALSE NA NA ACTAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.38.8 chr1 - 1318 4 incomplete-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 2272 -219 647 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATCCGGAGCGTTATGGACGT 9070 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.38.9 chr1 - 4258 11 novel_in_catalog CCNL2 novel 1598 12 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.617068 0.749510 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACATCCGGAGCGTTATGGAC -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 21 NA PB.38.11 chr1 - 4135 11 novel_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA 99 1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TCAGGACATCCGGAGCGTTA 8616 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.38.12 chr1 - 3134 12 novel_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA 3 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCAGGACATCCGGAGCGT 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.38.13 chr1 - 2997 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 295 -210 295 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCAGGACATCCGGAGCGT 7093 FALSE NA NA AATGAA -3 NA NA NA 2 NA PB.38.14 chr1 - 2435 12 novel_in_catalog CCNL2 novel 1598 12 NA NA 0 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCAGGACATCCGGAGCGT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.38.15 chr1 - 2322 11 novel_not_in_catalog CCNL2 novel 1598 12 NA NA 0 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCAGGACATCCGGAGCGT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.38.16 chr1 - 2319 11 full-splice_match CCNL2 ENST00000400809.8 3112 11 1 792 1 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.884548 0.769713 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCAGGACATCCGGAGCGT -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 22 NA PB.38.17 chr1 - 2234 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 1058 -210 182 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCAGGACATCCGGAGCGT 7856 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.38.18 chr1 - 1591 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 1701 -210 76 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCAGGACATCCGGAGCGT 8499 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.38.19 chr1 - 1374 4 incomplete-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 2207 -210 582 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.209753 0.506472 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCAGGACATCCGGAGCGT 9005 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.38.20 chr1 - 1212 3 full-splice_match CCNL2 ENST00000463260.5 1941 3 721 8 721 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCAGGACATCCGGAGCGT 3094 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.38.22 chr1 - 2140 11 full-splice_match CCNL2 ENST00000400809.8 3112 11 -3 975 -3 22 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 39 10.431699 1.018355 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACTTGAATCCCGTCAGCTT -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 39 NA PB.38.23 chr1 - 1805 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 1302 -25 -127 20 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGAACTTGAATCCCGTCAGC 8100 FALSE NA NA ATTAAA -23 NA NA NA 3 NA PB.38.24 chr1 - 4093 11 novel_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA -3 6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 ATGTATGAAAACTCAGAACT -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.38.25 chr1 - 4045 11 novel_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA 1 3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 83 22.200794 1.346369 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 GCTATGTATGAAAACTCAGA -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 83 NA PB.38.26 chr1 - 2114 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 974 -6 98 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGCTATGTATGAAAACTCA 7772 FALSE NA NA AATGAA -16 NA NA NA 5 NA PB.38.27 chr1 - 2783 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 304 -5 304 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGCTATGTATGAAAACTC 7102 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.38.28 chr1 - 2293 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 794 -5 23 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGCTATGTATGAAAACTC 7592 FALSE NA NA TTTAAA -38 NA NA NA 6 NA PB.38.29 chr1 - 1874 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 1213 -5 -216 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGCTATGTATGAAAACTC 8011 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.38.30 chr1 - 1288 5 incomplete-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 2001 -5 376 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGCTATGTATGAAAACTC 8799 FALSE NA NA AAGAAA -39 NA NA NA 4 NA PB.38.31 chr1 - 4118 11 novel_not_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TAAAGCTATGTATGAAAACT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.38.32 chr1 - 3475 8 novel_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA -2723 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TAAAGCTATGTATGAAAACT 6802 FALSE NA NA TTTAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.38.34 chr1 - 2122 11 novel_not_in_catalog CCNL2 novel 3112 11 NA NA 1 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TAAAGCTATGTATGAAAACT -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.38.35 chr1 - 1134 4 incomplete-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 2241 -4 616 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TAAAGCTATGTATGAAAACT 9039 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.38.36 chr1 - 957 2 incomplete-splice_match CCNL2 ENST00000463260.5 1941 3 854 214 854 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TAAAGCTATGTATGAAAACT 3227 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.38.37 chr1 - 2999 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 86 -3 86 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TTAAAGCTATGTATGAAAAC 9802 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.38.38 chr1 - 4639 10 novel_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA 1 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGTTAAAGCTATGTATGAA -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.38.39 chr1 - 2924 12 novel_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA 3 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 23 6.152027 0.789018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGTTAAAGCTATGTATGAA 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 23 NA PB.38.40 chr1 - 1493 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 1589 0 -36 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGTTAAAGCTATGTATGAA 8387 FALSE NA NA GATAAA -35 NA NA NA 3 NA PB.38.41 chr1 - 1422 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 1660 0 35 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGTTAAAGCTATGTATGAA 8458 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.38.43 chr1 - 2827 11 novel_not_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA 1 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 CAAGTTAAAGCTATGTATGA -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.38.47 chr1 - 2371 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000408918.8 1186 6 -11 -1174 0 39 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTCAGCCAGCTTTTTTTTT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.38.48 chr1 - 1879 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000408918.8 1186 6 -20 -673 -2 -462 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATTGTGTTGCTTCTGATTC -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.38.49 chr1 - 1302 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000408918.8 1186 6 -53 -63 -35 63 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 94 25.143068 1.400418 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGACAGTTGTTGATTAGACA 8456 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 94 NA PB.38.50 chr1 - 1132 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000408918.8 1186 6 48 6 40 -6 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATATGTTCTCAAGATTTCAT 8557 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.39.1 chr1 + 2171 2 full-splice_match MRPL20-AS1 ENST00000685968.1 2170 2 -2 1 1 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTCTGTCTCTTTTCCTAAT -4 TRUE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.39.2 chr1 + 1920 3 novel_not_in_catalog MRPL20-AS1 novel 1843 3 NA NA 1 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAACAAACTGCAAATTACTC -4 TRUE NA NA TATAAA -3 NA NA NA 3 NA PB.39.3 chr1 + 1751 3 full-splice_match MRPL20-AS1 ENST00000448629.7 1759 3 2 6 -1 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 116 31.027617 1.491748 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAATTACTCTGTCTCTTTTC -3 TRUE NA NA TATAAA -14 NA NA NA 116 NA PB.39.4 chr1 + 2182 2 full-splice_match MRPL20-AS1 ENST00000418833.2 2196 2 16 -2 -1 2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.279671 0.631410 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 CAAACAAACTGCAAATTACT -18 TRUE NA NA TATAAA -2 NA NA NA 16 NA PB.39.5 chr1 + 2478 1 full-splice_match MRPL20-AS1 ENST00000691378.1 2481 1 0 3 0 -3 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 11 2.942274 0.468683 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAACAAACTGCAAATTACTC -12 TRUE NA NA TATAAA -3 NA NA NA 11 NA PB.39.6 chr1 + 1655 3 full-splice_match MRPL20-AS1 ENST00000689419.1 1659 3 0 4 0 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAACAAACTGCAAATTACTC -12 TRUE NA NA TATAAA -3 NA NA NA 4 NA PB.39.7 chr1 + 1660 3 full-splice_match MRPL20-AS1 ENST00000448629.7 1759 3 82 17 29 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAACAAACTGCAAATTACTC 37 FALSE NA NA TATAAA -3 NA NA NA 2 NA PB.39.8 chr1 + 2168 1 full-splice_match MRPL20-AS1 ENST00000687493.1 2209 1 27 14 27 -3 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAACAAACTGCAAATTACTC 53 FALSE NA NA TATAAA -3 NA NA NA 2 NA PB.39.9 chr1 + 1814 2 full-splice_match MRPL20-AS1 ENST00000418833.2 2196 2 396 -14 91 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAATTACTCTGTCTCTTTTC 117 FALSE NA NA TATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.39.10 chr1 + 1519 2 full-splice_match MRPL20-AS1 ENST00000418833.2 2196 2 691 -14 -198 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAATTACTCTGTCTCTTTTC 412 FALSE NA NA TATAAA -14 NA NA NA 7 NA PB.39.11 chr1 + 1442 1 full-splice_match MRPL20-AS1 ENST00000687493.1 2209 1 769 -2 185 -1 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTCTGTCTCTTTTCCTAAT 795 FALSE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 4 NA PB.39.12 chr1 + 1197 1 full-splice_match MRPL20-AS1 ENST00000687493.1 2209 1 998 14 414 -3 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAACAAACTGCAAATTACTC 1024 FALSE NA NA TATAAA -3 NA NA NA 5 NA PB.40.1 chr1 - 1719 3 full-splice_match MRPL20 ENST00000487659.1 1693 3 -23 -3 -1 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTTTTTAGAGTCATTTTCT -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.40.2 chr1 - 1376 4 novel_in_catalog MRPL20 novel 700 4 NA NA 3 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTTTTTAGAGTCATTTTCT -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.40.3 chr1 - 1044 4 novel_in_catalog MRPL20 novel 700 4 NA NA 0 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTTTTTAGAGTCATTTTCT -19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.40.4 chr1 - 951 5 novel_not_in_catalog MRPL20 novel 700 4 NA NA -9 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTTTTTAGAGTCATTTTCT -28 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.40.5 chr1 - 698 4 full-splice_match MRPL20 ENST00000344843.12 700 4 0 2 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 107 28.620300 1.456674 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAGTTTTTAGAGTCATTTTC -19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 107 NA PB.40.6 chr1 - 570 4 full-splice_match MRPL20 ENST00000344843.12 700 4 0 130 0 -126 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTTTGTTTGATTTATACTT -19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.40.8 chr1 - 1162 1 full-splice_match RN7SL657P ENST00000582431.2 293 1 -198 -671 -198 671 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA NA NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAGAAAAAAGGCCAGGCATC 9042 FALSE NA NA AGTAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.41.1 chr1 + 1381 1 full-splice_match MRPL20-DT ENST00000607307.1 1523 1 205 -63 205 63 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATACTTTGTCTCTGTGTCTT 1919 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.41.2 chr1 + 1273 1 full-splice_match MRPL20-DT ENST00000607307.1 1523 1 314 -64 314 64 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TACTTTGTCTCTGTGTCTTT 2028 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.42.1 chr1 + 2371 3 full-splice_match VWA1 ENST00000476993.2 4492 3 6 2115 6 2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CCTGCAGTCTCGCTAGGATG -8 TRUE NA NA AGTAAA -17 NA NA NA 5 NA PB.42.2 chr1 + 1886 2 incomplete-splice_match VWA1 ENST00000338660.5 2147 3 1763 -2 1551 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CCTGCAGTCTCGCTAGGATG 1582 FALSE NA NA AGTAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.43.1 chr1 + 1101 5 fusion ATAD3B_ATAD3C novel 3864 12 NA NA -5335 2 multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCGTGTCTCTCTATTGACT 186 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 5 NA PB.43.5 chr1 + 2453 16 full-splice_match ATAD3B ENST00000673477.1 4098 16 -2 1647 -2 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 37 9.896740 0.995492 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCGCCGTGTCTCTCTATTG -9 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 37 NA PB.43.6 chr1 + 3464 16 novel_not_in_catalog ATAD3B novel 4314 14 NA NA 8 2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCGTGTCTCTCTATTGACT 1 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.43.8 chr1 + 2380 16 full-splice_match ATAD3B ENST00000673477.1 4098 16 71 1647 52 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCGCCGTGTCTCTCTATTG 64 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.43.9 chr1 + 2247 16 full-splice_match ATAD3B ENST00000673477.1 4098 16 204 1647 185 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCGCCGTGTCTCTCTATTG 197 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.43.10 chr1 + 2005 14 full-splice_match ATAD3B ENST00000472194.6 4314 14 662 1647 -361 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCGCCGTGTCTCTCTATTG 839 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 5 NA PB.43.11 chr1 + 1765 11 incomplete-splice_match ATAD3B ENST00000472194.6 4314 14 4164 1647 -1295 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCGCCGTGTCTCTCTATTG 4341 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 9 NA PB.43.12 chr1 + 1675 9 incomplete-splice_match ATAD3B ENST00000472194.6 4314 14 6896 1647 353 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCGCCGTGTCTCTCTATTG 7073 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.43.13 chr1 + 1585 9 incomplete-splice_match ATAD3B ENST00000472194.6 4314 14 6989 1644 446 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCGTGTCTCTCTATTGACT 7166 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.43.14 chr1 + 1311 7 incomplete-splice_match ATAD3B ENST00000472194.6 4314 14 8141 1647 1598 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCGCCGTGTCTCTCTATTG 8318 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 6 NA PB.43.15 chr1 + 2358 4 novel_in_catalog ATAD3B novel 2114 14 NA NA 3035 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCGCCGTGTCTCTCTATTG 9755 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.43.16 chr1 + 1258 3 incomplete-splice_match ATAD3B ENST00000485748.5 3233 10 6508 1 5424 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCGCCGTGTCTCTCTATTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 5 NA PB.44.1 chr1 - 1578 3 full-splice_match ANKRD65 ENST00000427211.3 1976 3 396 2 71 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTGGGTGTCTGAGAGGTT 1002 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.45.1 chr1 + 2233 16 novel_not_in_catalog ATAD3A novel 830 8 NA NA -7035 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.45.2 chr1 + 2346 15 novel_in_catalog ATAD3A novel 2481 16 NA NA -22 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG -17 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.45.3 chr1 + 2488 16 full-splice_match ATAD3A ENST00000378756.8 2481 16 -8 1 -8 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 177 47.343861 1.675264 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG -3 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 177 NA PB.45.4 chr1 + 2560 17 novel_in_catalog ATAD3A novel 2266 17 NA NA -2 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG 3 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.45.5 chr1 + 2431 16 novel_not_in_catalog ATAD3A novel 2481 16 NA NA -2 1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TGCCCTGTCTGTCTCTTGGC 3 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.45.6 chr1 + 2387 17 novel_not_in_catalog ATAD3A novel 2266 17 NA NA -4 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 27 7.221945 0.858654 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG 14 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 27 NA PB.45.7 chr1 + 2193 16 full-splice_match ATAD3A ENST00000378756.8 2481 16 287 1 64 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG 292 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 8 NA PB.45.8 chr1 + 1989 13 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000536055.6 2330 16 5186 1 95 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.617068 0.749510 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG 5174 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 21 NA PB.45.9 chr1 + 1853 11 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000536055.6 2330 16 7617 1 2526 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.942274 0.468683 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG 7605 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 11 NA PB.45.10 chr1 + 1653 10 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000536055.6 2330 16 8058 1 2967 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.279671 0.631410 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG 8046 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 16 NA PB.45.11 chr1 + 1431 8 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000536055.6 2330 16 11017 1 -408 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.942274 0.468683 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 11 NA PB.45.12 chr1 + 1349 7 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000536055.6 2330 16 11370 1 -55 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 7 NA PB.45.13 chr1 + 1248 6 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000536055.6 2330 16 11779 1 354 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.942274 0.468683 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 11 NA PB.45.14 chr1 + 1299 5 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000536055.6 2330 16 12569 2 1144 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CATTGCCCTGTCTGTCTCTT NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.45.15 chr1 + 1061 4 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000536055.6 2330 16 13977 1 2552 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.942274 0.468683 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 11 NA PB.45.16 chr1 + 1939 2 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000400830.4 830 8 4197 -542 4197 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.45.17 chr1 + 1479 2 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000400830.4 830 8 4657 -542 4657 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.45.18 chr1 + 1023 2 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000400830.4 830 8 5116 -545 5116 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GCCCTGTCTGTCTCTTGGCT NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.46.1 chr1 - 1449 5 novel_not_in_catalog SSU72 novel 1284 5 NA NA 2 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTGTGCCTGGTCCTGAATT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.46.2 chr1 - 1304 5 full-splice_match SSU72 ENST00000291386.4 1284 5 -21 1 -21 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 826 220.938019 2.344270 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTGTGCCTGGTCCTGAATT -29 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 826 NA PB.46.3 chr1 - 1140 5 full-splice_match SSU72 ENST00000291386.4 1284 5 143 1 -133 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTGTGCCTGGTCCTGAATT 654 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.46.4 chr1 - 1063 5 full-splice_match SSU72 ENST00000291386.4 1284 5 220 1 -56 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 383 102.444626 2.010489 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTGTGCCTGGTCCTGAATT -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 383 NA PB.46.5 chr1 - 885 4 incomplete-splice_match SSU72 ENST00000291386.4 1284 5 9959 1 9680 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.942274 0.468683 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTGTGCCTGGTCCTGAATT 9951 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.46.6 chr1 - 738 3 full-splice_match SSU72 ENST00000378726.1 2238 3 1500 0 1500 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTGTGCCTGGTCCTGAATT 1870 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.46.7 chr1 - 1124 5 full-splice_match SSU72 ENST00000291386.4 1284 5 2 158 2 -157 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAAGGAAAGACAACGGTT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.46.9 chr1 - 2951 2 full-splice_match SSU72 ENST00000359060.5 4176 2 -279 1504 0 -1504 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 19 5.082109 0.706044 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCTTAGCCTGACATCCTG -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.46.10 chr1 - 2702 2 full-splice_match SSU72 ENST00000359060.5 4176 2 -25 1499 -22 -1499 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAGCCTGACATCCTGTTTTT 765 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.47.1 chr1 - 2000 1 full-splice_match FNDC10 ENST00000422725.4 2124 1 122 2 122 -2 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAGAGCTGTCTGTGTGTT 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.47.2 chr1 - 1809 1 full-splice_match FNDC10 ENST00000422725.4 2124 1 313 2 313 -2 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAGAGCTGTCTGTGTGTT 309 FALSE NA NA GGGGCT -26 NA NA NA 5 NA PB.47.4 chr1 - 1640 1 full-splice_match FNDC10 ENST00000422725.4 2124 1 482 2 482 -2 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAGAGCTGTCTGTGTGTT 478 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.47.5 chr1 - 1409 1 full-splice_match FNDC10 ENST00000422725.4 2124 1 713 2 713 -2 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAGAGCTGTCTGTGTGTT 709 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.47.6 chr1 - 1281 1 full-splice_match FNDC10 ENST00000422725.4 2124 1 841 2 841 -2 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAGAGCTGTCTGTGTGTT 837 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.47.7 chr1 - 1032 1 full-splice_match FNDC10 ENST00000422725.4 2124 1 1090 2 1090 -2 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAGAGCTGTCTGTGTGTT 1086 FALSE NA NA TATAAA -29 NA NA NA 3 NA PB.49.1 chr1 - 737 1 full-splice_match ENSG00000272106 ENST00000607222.1 2038 1 1299 2 1299 -2 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AACTGTTTTTTGTTTTGTTT 1674 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.49.2 chr1 - 2034 1 full-splice_match ENSG00000272106 ENST00000607222.1 2038 1 -2 6 -2 -6 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 21 5.617068 0.749510 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACCAACTGTTTTTTGTTTT -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 21 NA PB.49.3 chr1 - 1530 1 full-splice_match ENSG00000272106 ENST00000607222.1 2038 1 502 6 502 -6 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACCAACTGTTTTTTGTTTT 877 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.50.2 chr1 - 1460 8 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000341832.11 2992 20 21203 4 21171 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAAGCTCCCCGTGTCGTCCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.50.3 chr1 - 1859 11 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000341832.11 2992 20 17906 5 17874 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAAAGCTCCCCGTGTCGTCC 8538 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.50.4 chr1 - 2587 20 full-splice_match CDK11B ENST00000341832.11 2992 20 40 365 8 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAGAGCTGTGTTTTCTCCG 23 TRUE NA NA AAGAAA -44 NA NA NA 7 NA PB.50.5 chr1 - 2212 17 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000340677.9 2534 21 6530 -148 6490 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAGAGCTGTGTTTTCTCCG 6709 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.50.6 chr1 - 1966 15 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000340677.9 2534 21 13813 -148 13773 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAGAGCTGTGTTTTCTCCG 4437 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.50.7 chr1 - 1582 12 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000407249.7 2677 20 17283 3 17243 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAGAGCTGTGTTTTCTCCG 7907 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.50.8 chr1 - 1178 8 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000407249.7 2677 20 21132 3 21092 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAGAGCTGTGTTTTCTCCG NA FALSE NA NA AATACA -32 NA NA NA 8 NA PB.50.9 chr1 - 1048 7 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000407249.7 2677 20 21510 3 21470 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAGAGCTGTGTTTTCTCCG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.50.10 chr1 - 1441 10 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000407249.7 2677 20 18566 4 18526 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAAAGAGCTGTGTTTTCTCC 9190 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.50.11 chr1 - 1418 12 novel_not_in_catalog CDK11B novel 2227 18 NA NA 17288 -6 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGGAAAGAGCTGTGTTTTCT 7952 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.50.13 chr1 - 1767 13 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000407249.7 2677 20 17009 7 16969 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGAAAGAGCTGTGTTTTC 7633 FALSE NA NA CATAAA -33 NA NA NA 4 NA PB.50.14 chr1 - 1141 10 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000407249.7 2677 20 59 5487 19 698 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AGAAAATGAAAACCACCTCT 238 FALSE NA NA AAGAAA -33 NA NA NA 2 NA PB.50.15 chr1 - 1154 11 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000340677.9 2534 21 47 5343 7 691 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAGAACGAGAAAATGAAAAC 22 TRUE NA NA AAGAAA -45 NA NA NA 2 NA PB.50.17 chr1 - 894 7 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000407249.7 2677 20 8 6763 0 -578 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.012192 0.603382 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTGTGAGTCTTTTCTGGGG -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.50.18 chr1 - 974 7 novel_in_catalog CDK11B novel 2534 21 NA NA 3 -614 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTGAGGCCAGGCCGGCGCCT -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.50.19 chr1 - 894 8 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000340677.9 2534 21 19 6648 11 -614 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTGAGGCCAGGCCGGCGCCT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.50.21 chr1 - 1052 7 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000407249.7 2677 20 -188 6801 -188 -616 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGTGAGGCCAGGCCGGCGC -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.50.33 chr1 - 2248 5 full-splice_match SLC35E2B ENST00000481276.1 2199 5 -63 14 23 -14 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAAAAAAAAAATCTGT 49 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.50.34 chr1 - 2000 5 full-splice_match SLC35E2B ENST00000481276.1 2199 5 184 15 184 -15 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAAATCTG 296 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.50.38 chr1 - 1023 4 incomplete-splice_match CDK11A ENST00000356937.7 2275 17 17762 -495 223 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAAGCTCCCCGTGTCGTCCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.50.39 chr1 - 1838 11 incomplete-splice_match CDK11A ENST00000356200.7 2653 19 14608 -343 8 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAAAGCTCCCCGTGTCGTCC 8255 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.50.41 chr1 - 1056 7 incomplete-splice_match CDK11A ENST00000356200.7 2653 19 18176 6 -53 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGGAAAGAGCTGTGTTTTCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.50.42 chr1 - 1114 10 incomplete-splice_match CDK11A ENST00000358779.9 2419 20 -28 5332 5 -3605 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAGAACGAGAAAATGAAAAC -28 TRUE NA NA GGGGCT -5 NA NA NA 2 NA PB.50.44 chr1 - 808 7 incomplete-splice_match CDK11A ENST00000358779.9 2419 20 -12 6639 -12 -4912 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGTGAGGCCAGGCCGGCGC -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.53.1 chr1 - 3459 12 novel_in_catalog NADK novel 3235 12 NA NA -7 -7 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.53.2 chr1 - 3173 12 novel_in_catalog NADK novel 3235 12 NA NA 38 -7 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.53.3 chr1 - 3207 12 full-splice_match NADK ENST00000341426.9 3235 12 21 7 21 -7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 49 13.106493 1.117486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 49 NA PB.53.4 chr1 - 3154 12 full-splice_match NADK ENST00000341991.7 3098 12 -63 7 -63 -7 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 8564 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.53.5 chr1 - 2760 10 incomplete-splice_match NADK ENST00000341426.9 3235 12 16502 7 -3393 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 4441 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.53.6 chr1 - 2509 7 incomplete-splice_match NADK ENST00000342348.9 1722 10 2230 -1232 -18 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 2543 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.53.7 chr1 - 2380 6 incomplete-splice_match NADK ENST00000342348.9 1722 10 3140 -1232 -539 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 3453 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.53.8 chr1 - 2260 5 incomplete-splice_match NADK ENST00000342348.9 1722 10 3935 -1232 226 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 4248 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.53.9 chr1 - 2042 3 incomplete-splice_match NADK ENST00000342348.9 1722 10 4388 -1232 196 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 4701 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.53.10 chr1 - 1987 3 incomplete-splice_match NADK ENST00000342348.9 1722 10 4443 -1232 251 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 4756 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.53.18 chr1 - 2136 4 novel_in_catalog NADK novel 1722 10 NA NA 190 -9 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AGAAAATAAGCTGGGTTAAT 4212 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.53.19 chr1 - 1969 2 incomplete-splice_match NADK ENST00000498806.1 269 3 668 -1734 668 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AGAAAATAAGCTGGGTTAAT 5173 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.53.20 chr1 - 1905 2 incomplete-splice_match NADK ENST00000498806.1 269 3 732 -1734 732 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AGAAAATAAGCTGGGTTAAT 5237 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.53.23 chr1 - 3041 12 full-splice_match NADK ENST00000341426.9 3235 12 146 48 95 -48 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATTACGCTTTTCAGATCCT 9093 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.53.24 chr1 - 1914 12 full-splice_match NADK ENST00000341426.9 3235 12 43 1278 -7 -39 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 51 13.641452 1.134861 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTTGAGCTGCCATGCTTTTC 13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 51 NA PB.53.25 chr1 - 2160 12 novel_in_catalog NADK novel 3098 12 NA NA -76 -49 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAACCTTCCTTGAGCTGC 8551 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.53.26 chr1 - 2004 12 novel_in_catalog NADK novel 3235 12 NA NA -74 -49 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAACCTTCCTTGAGCTGC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.53.27 chr1 - 1918 12 novel_not_in_catalog NADK novel 3235 12 NA NA -307 -49 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAACCTTCCTTGAGCTGC 8320 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.53.28 chr1 - 1868 12 full-splice_match NADK ENST00000341991.7 3098 12 -58 1288 -58 -49 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAACCTTCCTTGAGCTGC 8569 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.53.29 chr1 - 1696 11 incomplete-splice_match NADK ENST00000341426.9 3235 12 13093 1288 -6802 -49 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAACCTTCCTTGAGCTGC 1032 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.53.30 chr1 - 1503 10 incomplete-splice_match NADK ENST00000341426.9 3235 12 16478 1288 -3417 -49 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAACCTTCCTTGAGCTGC 4417 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.53.31 chr1 - 1173 7 incomplete-splice_match NADK ENST00000342348.9 1722 10 2285 49 37 -49 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAACCTTCCTTGAGCTGC 2598 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.53.32 chr1 - 924 5 novel_not_in_catalog NADK novel 1722 10 NA NA 0 -49 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAACCTTCCTTGAGCTGC 21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.53.33 chr1 - 1891 12 novel_in_catalog NADK novel 3235 12 NA NA 38 -50 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CAAAAACCTTCCTTGAGCTG 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.54.2 chr1 + 3327 20 novel_in_catalog MIB2 novel 3252 21 NA NA -36 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GGACGTTGCCTCTGCTGTCT -48 TRUE NA NA TATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.54.3 chr1 + 2474 16 incomplete-splice_match MIB2 ENST00000504599.6 3311 19 8534 0 100 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACGTTGCCTCTGCTGTCTGC 926 FALSE NA NA TATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.54.4 chr1 + 1504 9 incomplete-splice_match MIB2 ENST00000514234.5 2562 16 3558 0 -100 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACGTTGCCTCTGCTGTCTGC 2271 FALSE NA NA TATAAA -16 NA NA NA 4 NA PB.54.5 chr1 + 1536 8 incomplete-splice_match MIB2 ENST00000514234.5 2562 16 3754 0 34 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACGTTGCCTCTGCTGTCTGC 2467 FALSE NA NA TATAAA -16 NA NA NA 6 NA PB.54.6 chr1 + 1535 8 novel_not_in_catalog MIB2 novel 2562 16 NA NA 69 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GGACGTTGCCTCTGCTGTCT 11 FALSE NA NA TATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.54.7 chr1 + 1373 4 novel_in_catalog MIB2 novel 1058 5 NA NA 16 4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GCCTCTGCTGTCTGCCTGGG 458 FALSE NA NA TATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.54.8 chr1 + 989 3 novel_in_catalog MIB2 novel 2562 16 NA NA -149 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACGTTGCCTCTGCTGTCTGC 1 TRUE NA NA TATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.54.9 chr1 + 586 3 full-splice_match MIB2 ENST00000511910.1 584 3 -1 -1 -1 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACGTTGCCTCTGCTGTCTGC 81 FALSE NA NA TATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.55.2 chr1 - 2982 12 novel_in_catalog GNB1 novel 3163 12 NA NA -50 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTTTGGTGTGGTGATTATT 1304 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.55.3 chr1 - 2100 3 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 101818 1 4928 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.547151 0.657739 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTTTGGTGTGGTGATTATT 1315 FALSE NA NA AAGAAA -2 NA NA NA 17 NA PB.55.5 chr1 - 3209 13 novel_not_in_catalog GNB1 novel 3163 12 NA NA -23 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GACTTTGGTGTGGTGATTAT 766 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.55.6 chr1 - 3067 12 full-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 94 2 -27 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GACTTTGGTGTGGTGATTAT 762 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.55.7 chr1 - 2985 12 full-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 176 2 55 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.547151 0.657739 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GACTTTGGTGTGGTGATTAT 844 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.55.8 chr1 - 1955 3 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 101962 2 5072 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 27 7.221945 0.858654 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GACTTTGGTGTGGTGATTAT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 27 NA PB.55.10 chr1 - 3098 11 full-splice_match GNB1 ENST00000610897.4 3145 11 41 6 11 -5 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGGACTTTGGTGTGGTGAT 18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.55.11 chr1 - 2876 11 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 51863 5 -6939 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.209753 0.506472 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGGACTTTGGTGTGGTGAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.55.12 chr1 - 2735 9 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 73215 5 514 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.477233 0.541234 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGGACTTTGGTGTGGTGAT 431 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.55.13 chr1 - 2613 8 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 75311 5 2610 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.477233 0.541234 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGGACTTTGGTGTGGTGAT 2527 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.55.14 chr1 - 2362 5 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 97779 5 889 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 28 7.489425 0.874448 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGGACTTTGGTGTGGTGAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 28 NA PB.55.15 chr1 - 2194 4 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 100595 5 3705 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 24 6.419507 0.807502 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGGACTTTGGTGTGGTGAT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 24 NA PB.55.26 chr1 - 2318 10 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 65586 530 53 -530 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAAAAAAAAAGTTCTGTT 6848 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 6 NA PB.55.27 chr1 - 2147 8 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 75252 530 2551 -530 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAAAAAAAAAGTTCTGTT 2468 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 3 NA PB.55.37 chr1 - 1502 12 novel_in_catalog GNB1 novel 3163 12 NA NA -35 1235 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACTTGAGTGTAATTGTCA 1319 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.55.38 chr1 - 1446 11 full-splice_match GNB1 ENST00000610897.4 3145 11 232 1467 -49 1235 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACTTGAGTGTAATTGTCA 870 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.55.39 chr1 - 1700 12 full-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 -4 1467 -4 1234 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAACTTGAGTGTAATTGTC 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.55.40 chr1 - 1596 12 full-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 100 1467 -21 1234 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 20 5.349589 0.728320 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAACTTGAGTGTAATTGTC 768 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 20 NA PB.55.41 chr1 - 1353 10 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 65614 1467 81 1234 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.814630 0.682563 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAACTTGAGTGTAATTGTC 6876 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.55.42 chr1 - 982 6 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 86590 1467 -10300 1234 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAACTTGAGTGTAATTGTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.55.43 chr1 - 927 6 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 86645 1467 -10245 1234 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAACTTGAGTGTAATTGTC 11 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.55.46 chr1 - 1173 8 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 75285 1471 2584 1230 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.209753 0.506472 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAGGTAAACTTGAGTGTAAT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.57.1 chr1 + 1930 9 full-splice_match GABRD ENST00000378585.7 1914 9 -21 5 -5 -5 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CCTCACTGTGCTGCGCTTCA 17 FALSE NA NA AATAAA -29 NA NA NA 2 NA PB.58.1 chr1 - 1394 4 full-splice_match TMEM52 ENST00000602604.1 878 4 -10 -506 0 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GGTCTCTGCCTATGTGGGAA -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.59.1 chr1 + 2990 16 incomplete-splice_match PRKCZ ENST00000378567.8 2385 18 59 8828 -15 2616 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAGGAAAAAAGCAGATTGGA -9 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.59.2 chr1 + 2227 17 novel_in_catalog PRKCZ novel 2385 18 NA NA -10 1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GGAAGCTCCTCTGATGCCTT -4 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.59.3 chr1 + 2314 18 full-splice_match PRKCZ ENST00000378567.8 2385 18 66 5 -8 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 37 9.896740 0.995492 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGGAAGCTCCTCTGATGCCT -2 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 37 NA PB.59.4 chr1 + 2079 17 incomplete-splice_match PRKCZ ENST00000378567.8 2385 18 5042 3 12 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAAGCTCCTCTGATGCCTTT 4974 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.59.5 chr1 + 1861 15 incomplete-splice_match PRKCZ ENST00000378567.8 2385 18 9149 2 3881 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGCTCCTCTGATGCCTTTT 9081 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.59.7 chr1 + 1997 15 novel_in_catalog PRKCZ novel 1859 8 NA NA -71 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGCTCCTCTGATGCCTTTT 1214 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 5 NA PB.59.8 chr1 + 1711 13 incomplete-splice_match PRKCZ ENST00000461106.6 1916 15 70250 -197 -215 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATGTGGAAGCTCCTCTGATG 9041 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.59.9 chr1 + 1502 11 incomplete-splice_match PRKCZ ENST00000479263.5 1747 13 4448 2 3512 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGCTCCTCTGATGCCTTTT -10 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.59.10 chr1 + 1289 9 incomplete-splice_match PRKCZ ENST00000479263.5 1747 13 11542 2 10606 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGCTCCTCTGATGCCTTTT 2658 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 5 NA PB.59.11 chr1 + 1081 7 incomplete-splice_match PRKCZ ENST00000505322.5 1859 8 3228 0 3101 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGCTCCTCTGATGCCTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.63.1 chr1 - 1527 4 full-splice_match FAAP20 ENST00000400918.7 811 4 0 -716 0 2 alternative_3end TRUE canonical NA NA NA NA 15 4.012192 0.603382 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATTTGACTGCCAAGTGTTT 311 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.63.2 chr1 - 1383 4 novel_not_in_catalog FAAP20 novel 811 4 NA NA 10 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GCCTAGTATTTGACTGCCAA 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.63.3 chr1 - 1497 4 novel_not_in_catalog FAAP20 novel 811 4 NA NA 10 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATCTGCCTAGTATTTGACT 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.63.4 chr1 - 1869 5 novel_in_catalog FAAP20 novel 2216 7 NA NA -2 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGCATTTCAATCTGCCTAGT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.63.5 chr1 - 2003 3 incomplete-splice_match FAAP20 ENST00000400918.7 811 4 58 -696 46 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAGCATTTCAATCTGCCTAG 369 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.63.8 chr1 - 1187 4 novel_in_catalog FAAP20 novel 3576 8 NA NA 606 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAACGTCTGCCGCTTTTCTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.63.9 chr1 - 1195 3 full-splice_match FAAP20 ENST00000476803.1 701 3 -476 -18 50 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAACGTCTGCCGCTTTTCTT 373 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.63.10 chr1 - 1040 3 full-splice_match FAAP20 ENST00000476803.1 701 3 -321 -18 205 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAACGTCTGCCGCTTTTCTT 528 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.63.11 chr1 - 699 4 full-splice_match FAAP20 ENST00000378546.9 727 4 25 3 1 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 20 5.349589 0.728320 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAACGTCTGCCGCTTTTCTT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 20 NA PB.63.12 chr1 - 1539 4 full-splice_match FAAP20 ENST00000420515.1 1544 4 4 1 -3 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTGGACATTTTGTGCATT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.63.13 chr1 - 1435 3 incomplete-splice_match FAAP20 ENST00000440825.6 855 4 -37 2322 -1 -1 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTGGACATTTTGTGCATT -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.65.1 chr1 - 3842 1 full-splice_match ENSG00000272161 ENST00000607720.1 493 1 -3359 10 -3359 -10 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA NA NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGTCTTTCATTCTTTTTCA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.67.2 chr1 - 1231 8 incomplete-splice_match MORN1 ENST00000378529.7 1500 11 155 16839 2 -338 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGTTTTTGTGTGAATGTGT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.68.1 chr1 - 2811 6 full-splice_match PEX10 ENST00000447513.7 2835 6 17 7 -7 -7 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATCACTTGGTAAAACGT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.68.2 chr1 - 1154 2 incomplete-splice_match PEX10 ENST00000447513.7 2835 6 5963 825 3403 39 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGATGGAACTTGAGATTTC 7238 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.68.3 chr1 - 2046 6 novel_in_catalog PEX10 novel 2835 6 NA NA -14 34 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 23 6.152027 0.789018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACACAAGATGGAACTTGAG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 23 NA PB.68.4 chr1 - 1988 6 full-splice_match PEX10 ENST00000447513.7 2835 6 17 830 -7 34 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 124 33.167450 1.520712 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACACAAGATGGAACTTGAG -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 124 NA PB.68.5 chr1 - 2085 6 novel_not_in_catalog PEX10 novel 2835 6 NA NA -3 15 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATGTGGGTACGTTACTA 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.68.6 chr1 - 2032 6 novel_not_in_catalog PEX10 novel 2905 6 NA NA 11 15 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATGTGGGTACGTTACTA -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.68.7 chr1 - 1555 4 incomplete-splice_match PEX10 ENST00000447513.7 2835 6 3882 849 1322 15 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATGTGGGTACGTTACTA 5157 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.68.8 chr1 - 1050 2 incomplete-splice_match PEX10 ENST00000447513.7 2835 6 6043 849 3483 15 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATGTGGGTACGTTACTA 7318 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.68.10 chr1 - 1338 4 incomplete-splice_match PEX10 ENST00000447513.7 2835 6 4098 850 1538 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CAAAATGTGGGTACGTTACT 5373 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.68.11 chr1 - 1356 6 full-splice_match PEX10 ENST00000447513.7 2835 6 17 1462 -7 -598 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGGCCAGAAGACACTTTATT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.69.1 chr1 + 1379 7 novel_not_in_catalog RER1 novel 3028 7 NA NA 21 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAATTGTTTGAGATTATTTT 6392 FALSE NA NA TATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.69.2 chr1 + 1078 8 novel_not_in_catalog RER1 novel 695 8 NA NA -24 74 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 24 6.419507 0.807502 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATCGCATGGATTTCTTTT 6400 FALSE NA NA AAGAAA -15 NA NA NA 24 NA PB.69.3 chr1 + 1383 7 full-splice_match RER1 ENST00000605895.6 3028 7 -35 1680 -22 5 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 217 58.043041 1.763750 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGAGATTATTTTGACACATT 6402 FALSE NA NA TATAAA -23 NA NA NA 217 NA PB.69.4 chr1 + 1480 7 full-splice_match RER1 ENST00000378512.5 1404 7 -80 4 -18 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TTAATTGTTTGAGATTATTT 6406 FALSE NA NA TATAAA -14 NA NA NA 5 NA PB.69.5 chr1 + 1023 8 novel_not_in_catalog RER1 novel 695 8 NA NA -15 4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TTGAGATTATTTTGACACAT 6409 FALSE NA NA TATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.69.6 chr1 + 2954 6 full-splice_match RER1 ENST00000378513.7 3000 6 39 7 -14 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCTGAATTACTTCTCAA 6410 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.69.7 chr1 + 1069 9 novel_not_in_catalog RER1 novel 695 8 NA NA -14 4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGTCAAATTTTCTTTTTAAA 6410 FALSE NA NA CATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.69.8 chr1 + 3039 7 full-splice_match RER1 ENST00000605895.6 3028 7 -14 3 -1 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 63 16.851206 1.226631 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CTACTTCTGAATTACTTCTC -18 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 63 NA PB.69.9 chr1 + 1507 8 novel_not_in_catalog RER1 novel 695 8 NA NA -1 2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.547151 0.657739 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GTTTGAGATTATTTTGACAC -18 TRUE NA NA TATAAA -20 NA NA NA 17 NA PB.69.10 chr1 + 993 8 novel_not_in_catalog RER1 novel 695 8 NA NA -1 74 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 36 9.629260 0.983593 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATCGCATGGATTTCTTTT -18 TRUE NA NA AAGAAA -15 NA NA NA 36 NA PB.69.11 chr1 + 974 8 novel_not_in_catalog RER1 novel 695 8 NA NA 1 74 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATCGCATGGATTTCTTTT -3 TRUE NA NA AAGAAA -15 NA NA NA 8 NA PB.69.12 chr1 + 906 7 full-splice_match RER1 ENST00000605895.6 3028 7 -13 2135 0 74 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 150 40.121918 1.603382 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATCGCATGGATTTCTTTT -17 TRUE NA NA AAGAAA -15 NA NA NA 150 NA PB.69.13 chr1 + 1440 8 novel_not_in_catalog RER1 novel 695 8 NA NA 0 2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GTTTGAGATTATTTTGACAC -17 TRUE NA NA TATAAA -20 NA NA NA 6 NA PB.69.14 chr1 + 3126 8 novel_not_in_catalog RER1 novel 695 8 NA NA -6 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATTACTTCTCAACTGTATG -10 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 6 NA PB.69.15 chr1 + 1428 8 novel_not_in_catalog RER1 novel 695 8 NA NA -2 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.477233 0.541234 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAATTGTTTGAGATTATTTT -6 TRUE NA NA TATAAA -15 NA NA NA 13 NA PB.69.16 chr1 + 883 8 novel_not_in_catalog RER1 novel 695 8 NA NA -2 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACGAGGGAGTCAAATTTTCT -6 TRUE NA NA CATAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.69.17 chr1 + 3115 7 full-splice_match RER1 ENST00000378512.5 1404 7 -28 -1683 5 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TACTTCTGAATTACTTCTCA 17 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.69.18 chr1 + 1422 8 novel_not_in_catalog RER1 novel 2469 6 NA NA 194 6 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAGATTATTTTGACACATTT 239 FALSE NA NA TATAAA -24 NA NA NA 2 NA PB.69.19 chr1 + 2125 7 novel_not_in_catalog RER1 novel 2469 6 NA NA 578 12 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATTTTGACACATTTCTTTGA 623 FALSE NA NA TATAAA -30 NA NA NA 2 NA PB.69.20 chr1 + 1265 7 novel_not_in_catalog RER1 novel 2469 6 NA NA 151 9 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATTATTTTGACACATTTCTT 1480 FALSE NA NA TATAAA -27 NA NA NA 2 NA PB.69.21 chr1 + 1224 6 full-splice_match RER1 ENST00000488353.2 2469 6 1777 -532 1777 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAATTGTTTGAGATTATTTT 3937 FALSE NA NA TATAAA -15 NA NA NA 6 NA PB.69.22 chr1 + 2909 6 full-splice_match RER1 ENST00000488353.2 2469 6 1778 -2218 1778 -2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TACTTCTGAATTACTTCTCA 3938 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.69.23 chr1 + 2829 5 incomplete-splice_match RER1 ENST00000605895.6 3028 7 5273 -5 3109 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAATTACTTCTCAACTGTAT 5269 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.69.24 chr1 + 1044 5 incomplete-splice_match RER1 ENST00000488353.2 2469 6 3201 -532 3201 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAATTGTTTGAGATTATTTT 5361 FALSE NA NA TATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.69.25 chr1 + 962 4 incomplete-splice_match RER1 ENST00000488353.2 2469 6 5484 -539 -2462 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TTGAGATTATTTTGACACAT 7644 FALSE NA NA TATAAA -22 NA NA NA 3 NA PB.69.26 chr1 + 2616 3 incomplete-splice_match RER1 ENST00000605895.6 3028 7 9016 1 -1094 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCTGAATTACTTCTCAA 9012 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.69.27 chr1 + 877 3 incomplete-splice_match RER1 ENST00000488353.2 2469 6 6910 -538 -1036 3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TTTGAGATTATTTTGACACA 9070 FALSE NA NA TATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.69.28 chr1 + 2511 2 full-splice_match RER1 ENST00000462129.1 585 2 289 -2215 289 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATTACTTCTCAACTGTATG NA FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.70.1 chr1 + 1059 1 full-splice_match ENSG00000272449 ENST00000606645.2 1061 1 0 2 0 -2 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA NA NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTTCTGCCTGAGTTTCTG 0 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.71.1 chr1 + 1555 9 novel_in_catalog TNFRSF14 novel 1702 8 NA NA -10 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAACTGTCACCTCCCGGTGT 1501 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.71.2 chr1 + 1553 9 novel_in_catalog TNFRSF14 novel 1702 8 NA NA -15 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAACTGTCACCTCCCGGTGT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.71.3 chr1 + 1767 9 novel_in_catalog TNFRSF14 novel 1702 8 NA NA -9 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAACTGTCACCTCCCGGTGT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.71.4 chr1 + 1512 9 novel_in_catalog TNFRSF14 novel 1702 8 NA NA -64 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTCCTGTTTTCTATTTGTCA 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.71.5 chr1 + 1801 8 full-splice_match TNFRSF14 ENST00000355716.5 1702 8 -181 82 -32 -2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GGCTCCTGTTTTCTATTTGT 35 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.71.6 chr1 + 1443 9 novel_not_in_catalog TNFRSF14 novel 1702 8 NA NA -23 -7 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTCGGCTCCTGTTTTCTA -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.71.7 chr1 + 1672 8 full-splice_match TNFRSF14 ENST00000355716.5 1702 8 27 3 -7 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAACTGTCACCTCCCGGTGT 14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.71.8 chr1 + 1493 7 incomplete-splice_match TNFRSF14 ENST00000355716.5 1702 8 1198 3 -244 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAACTGTCACCTCCCGGTGT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.72.1 chr1 - 2634 19 full-splice_match PANK4 ENST00000378466.9 2641 19 0 7 0 -7 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 25 6.686986 0.825230 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAGAGGCCGGAGCCATCT 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 25 NA PB.72.2 chr1 - 1750 13 incomplete-splice_match PANK4 ENST00000378466.9 2641 19 7294 7 -7 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAGAGGCCGGAGCCATCT 9844 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.72.3 chr1 - 2599 19 novel_in_catalog PANK4 novel 2641 19 NA NA 0 -8 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAAGAGGCCGGAGCCATC 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.73.1 chr1 + 2646 7 full-splice_match PRXL2B ENST00000493183.5 840 7 25 -1831 -24 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCCACTTTTTGTGCTTTCT -6 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.73.2 chr1 + 929 7 full-splice_match PRXL2B ENST00000419916.8 2747 7 -61 1879 -34 -43 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACGCACTGCTTCGCAGGCTC 194 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.73.4 chr1 + 2757 7 full-splice_match PRXL2B ENST00000378424.9 2765 7 4 4 4 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCCACTTTTTGTGCTTTCT -24 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.73.5 chr1 + 2741 7 novel_in_catalog PRXL2B novel 2689 7 NA NA 0 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCCACTTTTTGTGCTTTCT -10 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.73.6 chr1 + 2710 7 novel_in_catalog PRXL2B novel 2689 7 NA NA 0 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTTTTTGTGCTTTCTTCTT -10 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.73.7 chr1 + 2688 7 full-splice_match PRXL2B ENST00000378427.6 2689 7 0 1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 48 12.839013 1.108532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GAGCCACTTTTTGTGCTTTC -10 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 48 NA PB.73.8 chr1 + 2719 7 full-splice_match PRXL2B ENST00000419916.8 2747 7 27 1 6 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 58 15.513808 1.190718 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTTTTTGTGCTTTCTTCTT -4 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 58 NA PB.73.10 chr1 + 2503 5 incomplete-splice_match PRXL2B ENST00000378425.9 2665 6 304 0 12 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTTTTTGTGCTTTCTTCTT -29 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.73.11 chr1 + 2885 5 novel_in_catalog PRXL2B novel 2747 7 NA NA -2 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTTTTTGTGCTTTCTTCTT -7 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.73.12 chr1 + 2540 6 incomplete-splice_match PRXL2B ENST00000378427.6 2689 7 291 0 4 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 20 5.349589 0.728320 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCCACTTTTTGTGCTTTCT 6 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 20 NA PB.73.13 chr1 + 2564 6 incomplete-splice_match PRXL2B ENST00000419916.8 2747 7 319 6 11 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.209753 0.506472 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GAGCCACTTTTTGTGCTTTC 13 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 12 NA PB.73.14 chr1 + 2392 6 incomplete-splice_match PRXL2B ENST00000378427.6 2689 7 437 2 150 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGAGCCACTTTTTGTGCTTT 152 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.73.15 chr1 + 2247 4 incomplete-splice_match PRXL2B ENST00000378427.6 2689 7 1625 1 -171 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GAGCCACTTTTTGTGCTTTC 1340 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.73.16 chr1 + 2232 3 incomplete-splice_match PRXL2B ENST00000419916.8 2747 7 1794 1 -23 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTTTTTGTGCTTTCTTCTT 1488 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.76.1 chr1 - 1120 2 novel_not_in_catalog ENSG00000287828 novel 728 2 NA NA 9183 303 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AACATAAATGTCTCCTTGGA 9531 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.77.1 chr1 - 2948 4 incomplete-splice_match MEGF6 ENST00000294599.8 4501 30 37548 -1971 344 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAATATACTAAATAGTAT 2181 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.77.3 chr1 - 2759 3 full-splice_match MEGF6 ENST00000494257.1 1174 3 775 -2360 775 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 ATTAAAAATATACTAAATAG 3370 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.77.9 chr1 - 1182 6 incomplete-splice_match MEGF6 ENST00000356575.9 7443 37 117061 1969 -203 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTCGTGGCCTGTGTGTTTGC 1634 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.77.10 chr1 - 1520 9 novel_not_in_catalog MEGF6 novel 7443 37 NA NA -183 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CCTCGTGGCCTGTGTGTTTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.78.1 chr1 + 2882 15 novel_not_in_catalog ARHGEF16 novel 2822 15 NA NA -32 -5 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAACCTGGATTTTCACAG 17 TRUE NA NA ATTAAA -11 NA NA NA 5 NA PB.78.2 chr1 + 2806 15 full-splice_match ARHGEF16 ENST00000378378.9 2822 15 11 5 11 -5 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAACCTGGATTTTCACAG 7 TRUE NA NA ATTAAA -11 NA NA NA 8 NA PB.78.3 chr1 + 2808 15 novel_not_in_catalog ARHGEF16 novel 2822 15 NA NA 26 -5 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAACCTGGATTTTCACAG 22 FALSE NA NA ATTAAA -11 NA NA NA 4 NA PB.78.4 chr1 + 3154 14 novel_in_catalog ARHGEF16 novel 2822 15 NA NA 60 -5 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAACCTGGATTTTCACAG 19 FALSE NA NA ATTAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.78.5 chr1 + 2715 15 novel_not_in_catalog ARHGEF16 novel 2822 15 NA NA 135 -5 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAACCTGGATTTTCACAG 94 FALSE NA NA ATTAAA -11 NA NA NA 4 NA PB.78.8 chr1 + 2112 14 incomplete-splice_match ARHGEF16 ENST00000378378.9 2822 15 8959 5 -2381 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAACCTGGATTTTCACAG 3337 FALSE NA NA ATTAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.78.9 chr1 + 1914 12 full-splice_match ARHGEF16 ENST00000378371.6 2219 12 300 5 300 -5 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAACCTGGATTTTCACAG 428 FALSE NA NA ATTAAA -11 NA NA NA 3 NA PB.78.10 chr1 + 1979 10 novel_not_in_catalog ARHGEF16 novel 2340 8 NA NA 126 -5 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAACCTGGATTTTCACAG 126 FALSE NA NA ATTAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.78.11 chr1 + 1579 9 incomplete-splice_match ARHGEF16 ENST00000378371.6 2219 12 6156 6 358 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAGAACCTGGATTTTCACA 1503 FALSE NA NA ATTAAA -10 NA NA NA 4 NA PB.78.12 chr1 + 1326 7 incomplete-splice_match ARHGEF16 ENST00000378371.6 2219 12 7757 5 1959 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAACCTGGATTTTCACAG 3104 FALSE NA NA ATTAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.80.1 chr1 - 1765 10 incomplete-splice_match WRAP73 ENST00000378322.7 1998 11 2601 2 2569 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TACTTCTCTTCTTGAAACGT 2632 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.80.3 chr1 - 2025 11 full-splice_match WRAP73 ENST00000378322.7 1998 11 -32 5 13 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 23 6.152027 0.789018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACTACTTCTCTTCTTGAAA -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 23 NA PB.80.4 chr1 - 1887 10 novel_in_catalog WRAP73 novel 1998 11 NA NA 16 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACTACTTCTCTTCTTGAAA 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.80.5 chr1 - 1640 12 novel_not_in_catalog WRAP73 novel 1692 12 NA NA -11 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACTACTTCTCTTCTTGAAA 15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.80.6 chr1 - 1525 11 novel_in_catalog WRAP73 novel 1692 12 NA NA -10 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.279671 0.631410 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACTACTTCTCTTCTTGAAA 16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.80.7 chr1 - 1437 11 incomplete-splice_match WRAP73 ENST00000270708.12 1692 12 2623 2 2546 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACTACTTCTCTTCTTGAAA 2609 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.80.8 chr1 - 1188 9 incomplete-splice_match WRAP73 ENST00000270708.12 1692 12 11340 2 862 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACTACTTCTCTTCTTGAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.80.9 chr1 - 1994 11 novel_not_in_catalog WRAP73 novel 1998 11 NA NA 20 -5 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TACAACTACTTCTCTTCTTG 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.80.10 chr1 - 1674 12 full-splice_match WRAP73 ENST00000270708.12 1692 12 13 5 13 -5 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 83 22.200794 1.346369 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TACAACTACTTCTCTTCTTG -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 83 NA PB.80.12 chr1 - 1027 7 incomplete-splice_match WRAP73 ENST00000270708.12 1692 12 14113 5 -540 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TACAACTACTTCTCTTCTTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.80.14 chr1 - 1592 12 novel_not_in_catalog WRAP73 novel 1692 12 NA NA 9 -7 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATACAACTACTTCTCTTCT -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.82.1 chr1 - 1257 3 full-splice_match TP73-AS3 ENST00000443034.1 754 3 -217 -286 -217 286 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 TAAAGAAAATTGACATCTAT 5812 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.86.1 chr1 - 5294 4 full-splice_match TP73-AS1 ENST00000649413.1 1967 4 -488 -2839 -2 -1 alternative_3end5end TRUE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACCCTTGTGCTGAAAGCACT -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.86.2 chr1 - 3575 5 incomplete-splice_match TP73-AS1 ENST00000636630.1 2529 6 -352 -444 -2 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACCCTTGTGCTGAAAGCACT -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.86.3 chr1 - 3508 5 full-splice_match TP73-AS1 ENST00000423764.6 3525 5 16 1 16 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACCCTTGTGCTGAAAGCACT 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.87.1 chr1 - 2450 7 novel_not_in_catalog LRRC47 novel 4303 7 NA NA -13 916 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGGCTTGTGTAAAGACTCTG -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.87.2 chr1 - 2655 7 full-splice_match LRRC47 ENST00000378251.3 4303 7 -13 1661 -13 915 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 179 47.878822 1.680143 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGCTTGTGTAAAGACTCT -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 179 NA PB.87.4 chr1 - 2539 7 full-splice_match LRRC47 ENST00000378251.3 4303 7 103 1661 103 915 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGCTTGTGTAAAGACTCT 102 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.87.5 chr1 - 2405 7 full-splice_match LRRC47 ENST00000378251.3 4303 7 237 1661 237 915 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGCTTGTGTAAAGACTCT 236 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.87.6 chr1 - 2081 7 full-splice_match LRRC47 ENST00000378251.3 4303 7 561 1661 561 915 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGCTTGTGTAAAGACTCT 560 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.87.7 chr1 - 1820 6 incomplete-splice_match LRRC47 ENST00000378251.3 4303 7 9373 1661 -2950 915 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 26 6.954466 0.842264 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGCTTGTGTAAAGACTCT 9372 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 26 NA PB.87.8 chr1 - 1628 6 incomplete-splice_match LRRC47 ENST00000378251.3 4303 7 9565 1661 -2758 915 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGCTTGTGTAAAGACTCT 9564 FALSE NA NA GGGGCT -34 NA NA NA 9 NA PB.87.9 chr1 - 1356 4 full-splice_match LRRC47 ENST00000462356.5 575 4 134 -915 6 915 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.012192 0.603382 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGCTTGTGTAAAGACTCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.87.10 chr1 - 1207 2 incomplete-splice_match LRRC47 ENST00000462356.5 575 4 2574 -915 2446 915 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.209753 0.506472 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGCTTGTGTAAAGACTCT NA FALSE NA NA AAGAAA -40 NA NA NA 12 NA PB.89.1 chr1 + 1260 4 full-splice_match SMIM1 ENST00000642557.4 506 4 0 -754 0 728 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GCCCTTGCCATAGTTACCTG -2 TRUE NA NA AATGAA -13 NA NA NA 4 NA PB.89.2 chr1 + 1290 4 full-splice_match SMIM1 ENST00000444870.7 547 4 -16 -727 0 727 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCCCTTGCCATAGTTACCT -13 TRUE NA NA AATGAA -12 NA NA NA 4 NA PB.90.1 chr1 - 1939 5 incomplete-splice_match CEP104 ENST00000675966.1 7766 17 20153 1886 5372 -941 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAATTAATCTCCACGTTTGG NA FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.90.2 chr1 - 828 2 full-splice_match CEP104 ENST00000484420.1 458 2 86 -456 86 456 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTTTTTTTAATCGTAGTTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.90.3 chr1 - 3721 22 full-splice_match CEP104 ENST00000378230.8 6431 22 0 2710 0 443 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGAGAACATCTTTTTTT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.90.4 chr1 - 1899 11 incomplete-splice_match CEP104 ENST00000675966.1 7766 17 11970 2710 -2811 443 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGAGAACATCTTTTTTT 3128 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.90.5 chr1 - 1174 6 incomplete-splice_match CEP104 ENST00000675966.1 7766 17 19578 2723 4797 430 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAGAAATAAAGGCAAAAGAG NA FALSE NA NA ATTAAA -28 NA NA NA 2 NA PB.90.17 chr1 - 1159 7 novel_not_in_catalog CEP104 novel 1661 4 NA NA 0 1297 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGATTTAGACTTTAAATCTG -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.90.18 chr1 - 1631 5 novel_not_in_catalog CEP104 novel 1661 4 NA NA 0 34 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATAATAGATTATTTATTG -19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.90.20 chr1 - 1936 3 novel_not_in_catalog CEP104 novel 6449 22 NA NA 0 -3240 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATGGATTACTTATTGTCCT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.91.1 chr1 + 3033 7 full-splice_match DFFB ENST00000378209.8 2833 7 -209 9 0 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAATAGACATGTCAAGAA -10 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 9 NA PB.91.2 chr1 + 1612 8 novel_in_catalog DFFB novel 3152 8 NA NA -9 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAATAGACATGTCAAGAA 174 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.91.3 chr1 + 2839 7 full-splice_match DFFB ENST00000378209.8 2833 7 -15 9 1 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.209753 0.506472 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAATAGACATGTCAAGAA -12 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 12 NA PB.91.4 chr1 + 2304 5 incomplete-splice_match DFFB ENST00000475969.5 2731 7 8363 9 -1700 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAATAGACATGTCAAGAA 4885 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.91.5 chr1 + 2162 3 incomplete-splice_match DFFB ENST00000475969.5 2731 7 12029 9 1966 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAATAGACATGTCAAGAA 8551 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.92.2 chr1 + 1741 6 full-splice_match AJAP1 ENST00000378190.7 2383 6 642 0 642 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCTGTGCCTTCCCACTTTG 475 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.94.1 chr1 - 1655 4 full-splice_match C1orf174 ENST00000361605.4 1645 4 -16 6 5 -6 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 184 49.216217 1.692108 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATATTTTGAAAGCAGTC -28 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 184 NA PB.94.4 chr1 - 1818 5 novel_not_in_catalog C1orf174 novel 1858 5 NA NA 0 -6 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATATTTTGAAAGCAGTC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.94.6 chr1 - 1353 2 incomplete-splice_match C1orf174 ENST00000680169.1 1567 4 9235 -14 9235 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATATTTTGAAAGCAGTC 9274 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.95.1 chr1 + 1844 2 intergenic novelGene_37 novel NA NA NA NA NA NA multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATGTATTGTTTGTGTGTTAA NA FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.97.2 chr1 - 1261 6 incomplete-splice_match NPHP4 ENST00000478423.6 4467 26 125311 0 539 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTCCCTTGGCAGTTTTCTTG NA FALSE NA NA AAAAAG -24 NA NA NA 3 NA PB.97.3 chr1 - 1076 4 incomplete-splice_match NPHP4 ENST00000478423.6 4467 26 127166 0 2394 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTCCCTTGGCAGTTTTCTTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.97.4 chr1 - 855 3 incomplete-splice_match NPHP4 ENST00000478423.6 4467 26 127971 0 3199 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTCCCTTGGCAGTTTTCTTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.97.5 chr1 - 4959 30 full-splice_match NPHP4 ENST00000378156.9 4955 30 -5 1 -5 -1 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTTCCCTTGGCAGTTTTCTT 12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.97.6 chr1 - 2545 14 incomplete-splice_match NPHP4 ENST00000478423.6 4467 26 101442 1 -8133 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTTCCCTTGGCAGTTTTCTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.98.1 chr1 + 3873 16 full-splice_match KCNAB2 ENST00000378097.6 4302 16 414 15 1 0 alternative_5end TRUE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CATCGGTCTCTGTGACTTTT -7 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 7 NA PB.98.2 chr1 + 3832 15 full-splice_match KCNAB2 ENST00000666163.1 3878 15 37 9 1 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.209753 0.506472 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCGGTCTCTGTGACTTTTT -7 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 12 NA PB.98.4 chr1 + 1248 16 full-splice_match KCNAB2 ENST00000378097.6 4302 16 414 2640 1 -8 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAGGACTACAGATCCTA -7 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 2 NA PB.98.7 chr1 + 1411 4 incomplete-splice_match KCNAB2 ENST00000652845.1 932 5 -80 8025 -5 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 TAAAAATACAAAAATTAGCT 280 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.98.8 chr1 + 1316 16 full-splice_match KCNAB2 ENST00000428161.6 2134 16 271 547 8 11 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AAGCCGCCCCCGCCCGCCTG -2 TRUE NA NA AATAAA -29 NA NA NA 2 NA PB.98.10 chr1 + 1236 15 full-splice_match KCNAB2 ENST00000352527.6 4001 15 140 2625 9 -8 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAGGACTACAGATCCTA 3 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 3 NA PB.98.11 chr1 + 3883 16 full-splice_match KCNAB2 ENST00000428161.6 2134 16 320 -2069 -1 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.477233 0.541234 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGTGACTTTTTGCTCCTCTC -6 TRUE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 13 NA PB.98.13 chr1 + 3828 15 full-splice_match KCNAB2 ENST00000352527.6 4001 15 173 0 2 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 65 17.386164 1.240204 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CATCGGTCTCTGTGACTTTT -3 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 65 NA PB.98.19 chr1 + 3547 12 incomplete-splice_match KCNAB2 ENST00000662363.1 2958 14 7979 -1156 317 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCGGTCTCTGTGACTTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.98.22 chr1 + 3356 9 incomplete-splice_match KCNAB2 ENST00000662363.1 2958 14 21741 -1156 -7 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCGGTCTCTGTGACTTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 6 NA PB.98.23 chr1 + 3119 5 incomplete-splice_match KCNAB2 ENST00000662363.1 2958 14 29572 -1156 842 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCGGTCTCTGTGACTTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 7 NA PB.98.24 chr1 + 2964 4 incomplete-splice_match KCNAB2 ENST00000662363.1 2958 14 29813 -1156 1083 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCGGTCTCTGTGACTTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 6 NA PB.98.25 chr1 + 2854 3 incomplete-splice_match KCNAB2 ENST00000671076.1 4620 5 2204 8 2204 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCGGTCTCTGTGACTTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.98.26 chr1 + 2729 2 incomplete-splice_match KCNAB2 ENST00000671076.1 4620 5 2841 8 2841 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.942274 0.468683 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCGGTCTCTGTGACTTTTT 33 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 11 NA PB.99.1 chr1 - 2107 4 full-splice_match RPL22 ENST00000234875.9 2061 4 -47 1 -47 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 78 20.863398 1.319385 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACGAGGCTTTGTTTTTTTTA 9751 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 78 NA PB.99.6 chr1 - 3851 3 full-splice_match RPL22 ENST00000480661.1 2279 3 -19 -1553 13 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACGAGGCTTTGTTTTTTTT 23 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.99.7 chr1 - 1993 3 full-splice_match RPL22 ENST00000480661.1 2279 3 1839 -1553 1829 -2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACGAGGCTTTGTTTTTTTT 3155 FALSE NA NA AATACA -6 NA NA NA 8 NA PB.99.11 chr1 - 1868 2 incomplete-splice_match RPL22 ENST00000234875.9 2061 4 6583 12 6541 -12 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.814630 0.682563 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTCTTACTGTACGAGGCTT 7867 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.99.22 chr1 - 1405 6 novel_in_catalog RPL22 novel 806 5 NA NA -1 356 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTCGTCTTACTTTCATTTT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.99.23 chr1 - 942 4 novel_not_in_catalog RPL22 novel 2061 4 NA NA -1 356 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTCGTCTTACTTTCATTTT 9829 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.99.24 chr1 - 899 4 full-splice_match RPL22 ENST00000234875.9 2061 4 -38 1200 -38 355 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 205 54.833286 1.739044 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATTCGTCTTACTTTCATTT 9760 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 205 NA PB.99.25 chr1 - 749 3 full-splice_match RPL22 ENST00000480661.1 2279 3 1886 -356 1876 356 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTCGTCTTACTTTCATTTT 3202 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.99.26 chr1 - 682 2 incomplete-splice_match RPL22 ENST00000480661.1 2279 3 6549 -355 6539 355 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.209753 0.506472 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATTCGTCTTACTTTCATTT 7865 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.99.27 chr1 - 985 4 full-splice_match RPL22 ENST00000234875.9 2061 4 -124 1200 -124 355 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATTCGTCTTACTTTCATTT 9674 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.99.29 chr1 - 2245 3 full-splice_match RPL22 ENST00000480661.1 2279 3 -10 44 -10 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAATGGTGGTTTATCCTTG 9820 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.99.30 chr1 - 1211 4 novel_not_in_catalog RPL22 novel 508 4 NA NA 1 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAATGGTGGTTTATCCTTG -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.99.31 chr1 - 1020 6 novel_not_in_catalog RPL22 novel 806 5 NA NA 66 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAATGGTGGTTTATCCTTG 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.99.32 chr1 - 1009 6 novel_in_catalog RPL22 novel 806 5 NA NA -5 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAATGGTGGTTTATCCTTG -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.99.33 chr1 - 908 6 novel_in_catalog RPL22 novel 806 5 NA NA -49 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAATGGTGGTTTATCCTTG 32 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.99.34 chr1 - 500 4 full-splice_match RPL22 ENST00000234875.9 2061 4 -38 1599 -38 -4 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 34 9.094301 0.958769 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAATGGTGGTTTATCCTTG 9760 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 34 NA PB.99.35 chr1 - 561 4 novel_not_in_catalog RPL22 novel 508 4 NA NA -8 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAATGGTGGTTTATCCTTG 9822 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.100.1 chr1 + 1920 3 full-splice_match RNF207 ENST00000484435.1 551 3 -622 -747 32 4 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 TAAAAAAAAAAAAATTTTTT 5938 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.100.2 chr1 + 1998 2 incomplete-splice_match RNF207 ENST00000484435.1 551 3 -47 -748 -37 5 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAAAAAAATTTTTTT -29 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.100.3 chr1 + 1570 2 novel_in_catalog RNF207 novel 551 3 NA NA -28 5 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAAAAAAATTTTTTT -20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.100.4 chr1 + 1332 3 full-splice_match RNF207 ENST00000484435.1 551 3 -33 -748 -23 5 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAAAAAAATTTTTTT -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.101.1 chr1 - 3334 7 novel_not_in_catalog ICMT novel 2612 6 NA NA -22 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACCACAGTGTGATTGTCTG -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.101.2 chr1 - 3216 6 novel_not_in_catalog ICMT novel 2612 6 NA NA -11 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACCACAGTGTGATTGTCTG -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.101.4 chr1 - 2679 3 novel_not_in_catalog ICMT novel 1227 4 NA NA 3856 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACCACAGTGTGATTGTCTG 3869 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.101.5 chr1 - 1479 2 novel_not_in_catalog ICMT novel 328 2 NA NA -767 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACCACAGTGTGATTGTCTG 336 FALSE NA NA AAGAAA -43 NA NA NA 2 NA PB.101.6 chr1 - 1324 2 novel_not_in_catalog ICMT novel 328 2 NA NA -612 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACCACAGTGTGATTGTCTG 491 FALSE NA NA AAAACA -35 NA NA NA 2 NA PB.101.7 chr1 - 1019 2 novel_not_in_catalog ICMT novel 328 2 NA NA 44 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACCACAGTGTGATTGTCTG 1147 FALSE NA NA AATGAA -40 NA NA NA 4 NA PB.101.9 chr1 - 3704 6 novel_not_in_catalog ICMT novel 2612 6 NA NA -16 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAACCACAGTGTGATTGTCT -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.101.11 chr1 - 3026 5 novel_not_in_catalog ICMT novel 4795 5 NA NA 0 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAACCACAGTGTGATTGTCT 13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.101.12 chr1 - 1841 6 novel_not_in_catalog ICMT novel 2612 6 NA NA -16 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TCAACCACAGTGTGATTGTC -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.101.13 chr1 - 1259 2 novel_not_in_catalog ICMT novel 328 2 NA NA -11 -6 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTCAACCACAGTGTGATTG -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.101.14 chr1 - 2547 5 full-splice_match ICMT ENST00000343813.10 4795 5 -11 2259 -3 39 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 139 37.179642 1.570305 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAGAGGCTTACGGGTTCAT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 139 NA PB.101.15 chr1 - 2109 3 incomplete-splice_match ICMT ENST00000489498.5 2612 6 2379 1 2371 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTTCATGGCTTAATGAATT 2384 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.101.16 chr1 - 1864 2 incomplete-splice_match ICMT ENST00000489498.5 2612 6 3983 -4 3975 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATGGCTTAATGAATTTTTTC 3988 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.101.23 chr1 - 2604 6 full-splice_match ICMT ENST00000489498.5 2612 6 6 2 -2 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.814630 0.682563 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GATTTCATGGCTTAATGAAT 11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.101.24 chr1 - 2454 5 full-splice_match ICMT ENST00000343813.10 4795 5 40 2301 40 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGATTTCATGGCTTAATGAA 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.101.25 chr1 - 2339 4 full-splice_match ICMT ENST00000474756.1 1227 4 -7 -1105 -7 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.942274 0.468683 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGATTTCATGGCTTAATGAA -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.101.26 chr1 - 1969 2 incomplete-splice_match ICMT ENST00000489498.5 2612 6 3871 3 3863 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGATTTCATGGCTTAATGAA 3876 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.101.27 chr1 - 2039 3 incomplete-splice_match ICMT ENST00000474756.1 1227 4 1034 -1104 1026 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAGATTTCATGGCTTAATGA 1039 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.101.28 chr1 - 2443 5 full-splice_match ICMT ENST00000343813.10 4795 5 -41 2393 -33 -95 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAATGGGCAGACATTTGG -28 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.101.29 chr1 - 1460 5 full-splice_match ICMT ENST00000343813.10 4795 5 -19 3354 -11 52 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GATGCTTTGGCCCTTCATCT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.101.30 chr1 - 954 4 incomplete-splice_match ICMT ENST00000343813.10 4795 5 -19 10499 -11 -7093 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATGTAGTCCTTAATGCTTT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.103.1 chr1 + 2015 5 novel_in_catalog LINC00337 novel 1138 5 NA NA -54 11 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAATATAAGAAAAAAAAG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.104.1 chr1 - 1851 9 full-splice_match ACOT7 ENST00000361521.9 1806 9 -46 1 -46 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCACGTGTCCTGGGTGGT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.104.2 chr1 - 1618 9 full-splice_match ACOT7 ENST00000377855.6 1614 9 -4 0 -4 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 83 22.200794 1.346369 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCACGTGTCCTGGGTGGT -30 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 83 NA PB.104.3 chr1 - 1417 9 full-splice_match ACOT7 ENST00000377845.7 1432 9 15 0 15 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCACGTGTCCTGGGTGGT 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.104.4 chr1 - 1410 9 full-splice_match ACOT7 ENST00000377842.7 1813 9 403 0 403 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 19 5.082109 0.706044 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCACGTGTCCTGGGTGGT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.104.5 chr1 - 1427 9 full-splice_match ACOT7 ENST00000377855.6 1614 9 187 0 187 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCACGTGTCCTGGGTGGT 8208 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.104.6 chr1 - 1435 9 full-splice_match ACOT7 ENST00000608083.5 1403 9 -36 4 -36 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 294 78.638954 1.895638 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCACGTGTCCTGGGTGGT 1 TRUE NA NA GGGGCT -16 NA NA NA 294 NA PB.104.7 chr1 - 1278 8 incomplete-splice_match ACOT7 ENST00000377842.7 1813 9 9494 0 2399 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.942274 0.468683 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCACGTGTCCTGGGTGGT 9725 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.104.8 chr1 - 1177 7 incomplete-splice_match ACOT7 ENST00000377842.7 1813 9 19754 0 12659 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCACGTGTCCTGGGTGGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.104.9 chr1 - 1107 7 incomplete-splice_match ACOT7 ENST00000377842.7 1813 9 19824 0 12729 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.012192 0.603382 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCACGTGTCCTGGGTGGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.104.10 chr1 - 999 6 incomplete-splice_match ACOT7 ENST00000377842.7 1813 9 25796 0 18701 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCACGTGTCCTGGGTGGT 4485 FALSE NA NA AAGAAA -17 NA NA NA 5 NA PB.104.11 chr1 - 874 5 incomplete-splice_match ACOT7 ENST00000377842.7 1813 9 31984 0 24889 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCACGTGTCCTGGGTGGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.104.12 chr1 - 746 4 incomplete-splice_match ACOT7 ENST00000377842.7 1813 9 40832 0 -23008 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCACGTGTCCTGGGTGGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.105.1 chr1 - 1573 10 full-splice_match TNFRSF25 ENST00000356876.8 1968 10 6 389 6 -24 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.744712 0.573418 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAGAAAACAAAACAAAACA -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.105.2 chr1 - 1400 8 full-splice_match TNFRSF25 ENST00000510563.5 1087 8 -54 -259 12 -24 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAGAAAACAAAACAAAACA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.106.1 chr1 - 2303 10 incomplete-splice_match PLEKHG5 ENST00000489097.6 3938 19 5978 1 -27 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTGGGAAGAGTCCTTTGCT 3493 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.107.2 chr1 + 3451 13 novel_not_in_catalog ESPN novel 3543 13 NA NA 0 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTCGCTGTGGCCGCGACTT -1 TRUE NA NA ATTAAA -29 NA NA NA 3 NA PB.107.3 chr1 + 1873 7 novel_not_in_catalog ESPN novel 1494 7 NA NA -1016 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTCGCTGTGGCCGCGACTT 1631 FALSE NA NA ATTAAA -29 NA NA NA 2 NA PB.107.4 chr1 + 1404 6 novel_not_in_catalog ESPN novel 1494 7 NA NA -1002 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATGCCGACTTACATATATTT 1645 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.107.5 chr1 + 1351 7 novel_not_in_catalog ESPN novel 1494 7 NA NA 29 2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TACATATATTTGCATGTTCG 18 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.107.6 chr1 + 1447 7 novel_not_in_catalog ESPN novel 1339 8 NA NA -96 7 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATATTTGCATGTTCGTTGAC 585 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.107.7 chr1 + 1991 6 novel_not_in_catalog ESPN novel 1339 8 NA NA -35 1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGGCTCCGGTTCACTCACTC 646 FALSE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.107.8 chr1 + 1454 6 novel_not_in_catalog ESPN novel 1339 8 NA NA -15 5 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATATATTTGCATGTTCGTTG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.107.9 chr1 + 2021 5 novel_not_in_catalog ESPN novel 1339 8 NA NA 35 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTCGCTGTGGCCGCGACTT 11 TRUE NA NA ATTAAA -29 NA NA NA 2 NA PB.107.10 chr1 + 1927 6 novel_not_in_catalog ESPN novel 1339 8 NA NA 45 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTCGCTGTGGCCGCGACTT 21 TRUE NA NA ATTAAA -29 NA NA NA 4 NA PB.107.11 chr1 + 1355 6 novel_not_in_catalog ESPN novel 1339 8 NA NA 45 -28 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAACAACAACAAATGCTGCT 21 TRUE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 2 NA PB.107.12 chr1 + 1454 6 novel_not_in_catalog ESPN novel 813 7 NA NA 3 3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACATATATTTGCATGTTCGT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.107.13 chr1 + 2054 5 novel_not_in_catalog ESPN novel 1494 7 NA NA 17 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTCGCTGTGGCCGCGACTT -7 TRUE NA NA ATTAAA -29 NA NA NA 2 NA PB.107.14 chr1 + 1965 6 novel_not_in_catalog ESPN novel 813 7 NA NA 26 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CACTCGCTGTGGCCGCGACT 2 TRUE NA NA ATTAAA -28 NA NA NA 4 NA PB.107.15 chr1 + 1352 7 novel_not_in_catalog ESPN novel 813 7 NA NA 17 5 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATATATTTGCATGTTCGTTG -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.107.16 chr1 + 1946 6 novel_not_in_catalog ESPN novel 1339 8 NA NA 21 3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCTCCGGTTCACTCACTCGC -3 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.107.17 chr1 + 1474 6 novel_not_in_catalog ESPN novel 1339 8 NA NA 21 52 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCCCCGTGGGTGGTGACTT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.107.18 chr1 + 1873 7 novel_not_in_catalog ESPN novel 813 7 NA NA 26 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTCACTCGCTGTGGCCGCGA 2 TRUE NA NA ATTAAA -26 NA NA NA 7 NA PB.107.19 chr1 + 1101 4 novel_not_in_catalog ESPN novel 1494 7 NA NA -7 5 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATATATTTGCATGTTCGTTG 37 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.107.20 chr1 + 1545 4 novel_not_in_catalog ESPN novel 1494 7 NA NA 68 3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCTCCGGTTCACTCACTCGC 57 FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.107.21 chr1 + 1553 5 novel_not_in_catalog ESPN novel 544 4 NA NA -53 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTCGCTGTGGCCGCGACTT -1 TRUE NA NA ATTAAA -29 NA NA NA 2 NA PB.108.4 chr1 - 2348 11 novel_not_in_catalog NOL9 novel 6627 12 NA NA 0 -4223 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGTTCTTCAGGGACCTGG 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.108.5 chr1 - 2416 12 full-splice_match NOL9 ENST00000377705.6 6627 12 -14 4225 -14 -4225 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 29 7.756904 0.889688 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGAAAGTTCTTCAGGGACCT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 29 NA PB.108.6 chr1 - 2355 8 novel_in_catalog NOL9 novel 6627 12 NA NA 2 -4322 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTTGTTCTAGTCTTCTGT 12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.108.7 chr1 - 1413 8 incomplete-splice_match NOL9 ENST00000377705.6 6627 12 9590 4324 94 -4324 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATTTGTTCTAGTCTTCT 9848 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.108.8 chr1 - 2270 12 full-splice_match NOL9 ENST00000377705.6 6627 12 -23 4380 -23 -4380 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAATTCGTGAATGTCATATA -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.109.4 chr1 - 4486 4 full-splice_match KLHL21 ENST00000377658.8 4487 4 0 1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.744712 0.573418 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTTGGAGTCATTGCCTTTG -2 TRUE NA NA TATAAA -23 NA NA NA 14 NA PB.109.5 chr1 - 4374 4 full-splice_match KLHL21 ENST00000377658.8 4487 4 112 1 112 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTTGGAGTCATTGCCTTTG 936 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.109.6 chr1 - 4172 4 full-splice_match KLHL21 ENST00000377658.8 4487 4 314 1 314 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTTGGAGTCATTGCCTTTG 1138 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.109.7 chr1 - 4002 4 full-splice_match KLHL21 ENST00000377658.8 4487 4 484 1 484 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTTGGAGTCATTGCCTTTG 1308 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.109.8 chr1 - 3638 4 full-splice_match KLHL21 ENST00000377658.8 4487 4 848 1 848 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTTGGAGTCATTGCCTTTG 1672 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.109.9 chr1 - 3402 3 incomplete-splice_match KLHL21 ENST00000496707.5 824 4 375 -2656 375 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTTGGAGTCATTGCCTTTG 4252 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.109.10 chr1 - 2970 2 incomplete-splice_match KLHL21 ENST00000496707.5 824 4 4296 -2656 4296 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTTGGAGTCATTGCCTTTG 8173 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.110.1 chr1 + 2336 11 full-splice_match ZBTB48 ENST00000377674.9 2347 11 2 9 2 -9 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 14 3.744712 0.573418 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTCTCGTATTTCAGCCTGA -18 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 14 NA PB.110.2 chr1 + 2245 11 novel_in_catalog ZBTB48 novel 2347 11 NA NA 6 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATTTCAGCCTGACAGTCTG -7 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 6 NA PB.110.3 chr1 + 2261 11 novel_in_catalog ZBTB48 novel 2347 11 NA NA -4 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTCAGCCTGACAGTCTGT -1 TRUE NA NA AATAAA -23 NA NA NA 6 NA PB.110.4 chr1 + 1901 11 novel_not_in_catalog ZBTB48 novel 2347 11 NA NA 19 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTCAGCCTGACAGTCTGT 22 TRUE NA NA AATAAA -23 NA NA NA 2 NA PB.110.5 chr1 + 2095 10 incomplete-splice_match ZBTB48 ENST00000377674.9 2347 11 654 2 560 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATTTCAGCCTGACAGTCTG 587 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 3 NA PB.110.6 chr1 + 1427 9 incomplete-splice_match ZBTB48 ENST00000377674.9 2347 11 2081 1 1987 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTCAGCCTGACAGTCTGT 2014 FALSE NA NA AATAAA -23 NA NA NA 3 NA PB.110.7 chr1 + 1753 7 full-splice_match ZBTB48 ENST00000482360.5 2484 7 729 2 -176 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATTTCAGCCTGACAGTCTG 5970 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.110.8 chr1 + 1613 7 full-splice_match ZBTB48 ENST00000482360.5 2484 7 870 1 -35 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTCAGCCTGACAGTCTGT 6111 FALSE NA NA AATAAA -23 NA NA NA 2 NA PB.111.1 chr1 + 1647 4 full-splice_match PHF13 ENST00000377648.5 3632 4 12 1973 12 -588 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCTTTTTCTTGAGTGTTA -4 TRUE NA NA AATGAA -14 NA NA NA 4 NA PB.111.2 chr1 + 3570 4 full-splice_match PHF13 ENST00000377648.5 3632 4 21 41 -10 -41 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 52 13.908932 1.143294 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GTTCATGATTCAAGGTTCAG 5 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 52 NA PB.111.4 chr1 + 2918 2 incomplete-splice_match PHF13 ENST00000377648.5 3632 4 6269 40 6238 -40 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TTCATGATTCAAGGTTCAGG 3242 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.113.1 chr1 + 1400 6 full-splice_match THAP3 ENST00000054650.9 1361 6 -42 3 -42 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATACGGTGTCGCTCCCATCA 8068 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.113.2 chr1 + 1536 4 full-splice_match THAP3 ENST00000472925.1 983 4 -44 -509 5 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACGGTGTCGCTCCCATCAT -4 TRUE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 8 NA PB.113.4 chr1 + 1236 5 incomplete-splice_match THAP3 ENST00000054650.9 1361 6 318 2 5 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 98 26.212986 1.418517 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACGGTGTCGCTCCCATCAT -4 TRUE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 98 NA PB.113.5 chr1 + 1103 5 novel_not_in_catalog THAP3 novel 1361 6 NA NA 3 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACGGTGTCGCTCCCATCAT 11 TRUE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 3 NA PB.113.6 chr1 + 1103 4 incomplete-splice_match THAP3 ENST00000054650.9 1361 6 3662 -3 135 3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGTCGCTCCCATCATCATTT 3340 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.114.1 chr1 + 2140 3 incomplete-splice_match CAMTA1 ENST00000473578.5 567 4 -37 45010 -11 -44830 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAGAAAAAAATGAGAAGT -27 TRUE NA NA GATAAA -24 NA NA NA 3 NA PB.114.2 chr1 + 2059 2 incomplete-splice_match CAMTA1 ENST00000490738.5 538 3 0 45025 0 -44830 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAGAAAAAAATGAGAAGT -16 TRUE NA NA GATAAA -24 NA NA NA 3 NA PB.114.3 chr1 + 1048 6 novel_in_catalog CAMTA1 novel 431 5 NA NA 0 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTGTGGGTCACTTGCGT -16 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.114.4 chr1 + 941 5 full-splice_match CAMTA1 ENST00000461311.1 431 5 -98 -412 0 -2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 35 9.361781 0.971358 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTGTGGGTCACTTGCGT -16 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 35 NA PB.114.5 chr1 + 857 4 full-splice_match CAMTA1 ENST00000557126.5 486 4 -37 -334 0 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTGTGGGTCACTTGCGT -16 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 4 NA PB.114.6 chr1 + 783 3 novel_in_catalog CAMTA1 novel 863 4 NA NA 0 2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACGAATGTGTGGGTCACTT -16 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 3 NA PB.114.7 chr1 + 748 3 novel_in_catalog CAMTA1 novel 863 4 NA NA 0 2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACGAATGTGTGGGTCACTT -16 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.114.8 chr1 + 600 4 full-splice_match CAMTA1 ENST00000473578.5 567 4 -26 -7 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 53 14.176411 1.151566 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATTTAAGTTTAATGAGT -16 TRUE NA NA AATAAA -26 NA NA NA 53 NA PB.114.9 chr1 + 497 3 full-splice_match CAMTA1 ENST00000490738.5 538 3 0 41 0 -7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATAAAGTGTAATCTGTG -16 TRUE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.114.10 chr1 + 868 4 full-splice_match CAMTA1 ENST00000476163.5 863 4 -7 2 3 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 30 8.024384 0.904412 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTGTGGGTCACTTGCGT -13 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 30 NA PB.114.11 chr1 + 967 5 novel_in_catalog CAMTA1 novel 431 5 NA NA 1 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.209753 0.506472 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTGTGGGTCACTTGCGT -5 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 12 NA PB.114.12 chr1 + 693 5 novel_not_in_catalog CAMTA1 novel 431 5 NA NA 1 -8 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TAAAATAAAGTGTAATCTGT -5 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.114.13 chr1 + 872 5 full-splice_match CAMTA1 ENST00000461311.1 431 5 -29 -412 5 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTGTGGGTCACTTGCGT -4 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 8 NA PB.114.14 chr1 + 799 4 full-splice_match CAMTA1 ENST00000476163.5 863 4 62 2 8 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTGTGGGTCACTTGCGT -1 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 4 NA PB.118.1 chr1 + 1219 5 full-splice_match VAMP3 ENST00000054666.11 2178 5 -34 993 -34 633 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAACCTTCTACATCTTCATA 3825 FALSE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.118.2 chr1 + 2201 5 full-splice_match VAMP3 ENST00000054666.11 2178 5 -31 8 -31 -8 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 133 35.574768 1.551142 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACATGATTGTGGCACCTG -44 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 133 NA PB.118.4 chr1 + 1038 5 full-splice_match VAMP3 ENST00000054666.11 2178 5 -5 1145 -5 481 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGAACTATGGCTATGACC -18 TRUE NA NA TTTAAA -10 NA NA NA 4 NA PB.118.5 chr1 + 3508 5 full-splice_match VAMP3 ENST00000470357.1 954 5 -936 -1618 475 -8 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACATGATTGTGGCACCTG 462 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.118.6 chr1 + 2915 5 full-splice_match VAMP3 ENST00000470357.1 954 5 -336 -1625 -336 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTGTGGCACCTGTGCTCCT 1062 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.118.7 chr1 + 2426 5 full-splice_match VAMP3 ENST00000470357.1 954 5 146 -1618 146 -8 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACATGATTGTGGCACCTG 1544 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.118.8 chr1 + 2035 4 incomplete-splice_match VAMP3 ENST00000054666.11 2178 5 2191 8 780 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACATGATTGTGGCACCTG 2178 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 3 NA PB.118.9 chr1 + 2018 3 incomplete-splice_match VAMP3 ENST00000054666.11 2178 5 5863 1 62 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTGTGGCACCTGTGCTCCT 5850 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 4 NA PB.118.10 chr1 + 1932 3 incomplete-splice_match VAMP3 ENST00000054666.11 2178 5 5949 1 148 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.477233 0.541234 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTGTGGCACCTGTGCTCCT 5936 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 13 NA PB.119.1 chr1 - 1591 2 incomplete-splice_match DNAJC11 ENST00000689169.1 3872 4 3355 -17 3355 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGGCTGGCGCTCTTCCGTGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.119.3 chr1 - 3103 15 incomplete-splice_match DNAJC11 ENST00000377577.10 3201 16 20788 1 9 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGAGGCTGGCGCTCTTCCGT NA FALSE NA NA AAGAAA -33 NA NA NA 3 NA PB.119.4 chr1 - 3020 15 incomplete-splice_match DNAJC11 ENST00000377577.10 3201 16 20871 1 92 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGAGGCTGGCGCTCTTCCGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.119.5 chr1 - 2853 13 incomplete-splice_match DNAJC11 ENST00000377577.10 3201 16 34061 1 455 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGAGGCTGGCGCTCTTCCGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.119.6 chr1 - 2610 11 incomplete-splice_match DNAJC11 ENST00000377577.10 3201 16 48932 1 -5808 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGAGGCTGGCGCTCTTCCGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.119.7 chr1 - 2384 9 full-splice_match DNAJC11 ENST00000691481.1 3565 9 1194 -13 -770 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGAGGCTGGCGCTCTTCCGT 6258 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.119.8 chr1 - 2187 7 incomplete-splice_match DNAJC11 ENST00000689025.1 3549 9 2408 -13 455 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.012192 0.603382 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGAGGCTGGCGCTCTTCCGT 7483 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.119.9 chr1 - 2002 6 incomplete-splice_match DNAJC11 ENST00000689025.1 3549 9 7093 -13 -442 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGAGGCTGGCGCTCTTCCGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.119.10 chr1 - 1804 3 incomplete-splice_match DNAJC11 ENST00000689169.1 3872 4 2189 -15 2189 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGAGGCTGGCGCTCTTCCGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.119.14 chr1 - 3205 16 full-splice_match DNAJC11 ENST00000377577.10 3201 16 -6 2 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 155 41.459316 1.617622 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGAGGCTGGCGCTCTTCCG -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 155 NA PB.119.15 chr1 - 2258 16 full-splice_match DNAJC11 ENST00000377577.10 3201 16 -6 949 0 -6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 27 7.221945 0.858654 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AACAAACGGGTTTGGAAATT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 27 NA PB.119.16 chr1 - 1806 12 incomplete-splice_match DNAJC11 ENST00000686243.1 3712 16 47817 935 -6911 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AACAAACGGGTTTGGAAATT NA FALSE NA NA AAAAAG -32 NA NA NA 4 NA PB.119.18 chr1 - 1749 5 full-splice_match DNAJC11 ENST00000688162.1 1773 5 13 11 -2 -11 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAGAAAAATAGGTCTCAT 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.121.1 chr1 - 591 4 full-splice_match UTS2 ENST00000361696.10 591 4 -1 1 -1 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATATCATGAGTGGTTATTTT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.122.1 chr1 + 2164 13 incomplete-splice_match PER3 ENST00000377532.8 6365 22 23 34234 -6 596 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAATGAAAATCCCTTTCTG 12 TRUE NA NA AATAAA -8 NA NA NA 3 NA PB.122.2 chr1 + 1254 6 novel_in_catalog PER3 novel 1524 10 NA NA -6 2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTTCCTTGTATGAGAAATT 12 TRUE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.122.7 chr1 + 4065 6 novel_not_in_catalog PER3 novel 6203 21 NA NA -10254 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAGAAATTGTCCTGCCCTGT NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.122.10 chr1 + 3322 5 incomplete-splice_match PER3 ENST00000613533.4 6318 22 43233 0 -9146 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAAATTGTCCTGCCCTGTG 243 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 4 NA PB.122.12 chr1 + 2787 3 incomplete-splice_match PER3 ENST00000361923.2 6203 21 51112 1 -993 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAAATTGTCCTGCCCTGTG 4016 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.122.13 chr1 + 2648 2 full-splice_match PER3 ENST00000494684.1 555 2 198 -2291 198 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAGAAATTGTCCTGCCCTGT 5207 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.122.14 chr1 + 2544 2 full-splice_match PER3 ENST00000494684.1 555 2 302 -2291 302 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAGAAATTGTCCTGCCCTGT 5311 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 5 NA PB.123.1 chr1 - 1910 8 full-splice_match TNFRSF9 ENST00000377507.8 5872 8 0 3962 0 1967 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AGTGAGAAAATTAACACCTG -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.124.1 chr1 + 901 7 full-splice_match PARK7 ENST00000493678.5 1088 7 -37 224 -8 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 862 230.567291 2.362798 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTGATTGTTTCTTGTTTTG -36 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 862 NA PB.124.2 chr1 + 789 6 novel_in_catalog PARK7 novel 1088 7 NA NA 2 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTGATTGTTTCTTGTTTTG -26 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 4 NA PB.124.3 chr1 + 831 6 full-splice_match PARK7 ENST00000377493.9 795 6 -36 0 2 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTGATTGTTTCTTGTTTTG -26 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.124.5 chr1 + 989 7 full-splice_match PARK7 ENST00000338639.10 1127 7 -25 163 -6 60 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 381 101.909668 2.008215 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTGCAGCTCTTAACTGTC -5 TRUE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 381 NA PB.124.6 chr1 + 1104 7 full-splice_match PARK7 ENST00000493678.5 1088 7 -16 0 13 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GCTGGGTGTGGTGGCTCATG -15 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.124.7 chr1 + 847 7 novel_not_in_catalog PARK7 novel 1088 7 NA NA 13 -6 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAAACTACTGATTGTTTCTT -15 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 4 NA PB.124.8 chr1 + 766 6 novel_in_catalog PARK7 novel 1088 7 NA NA -13 1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGATTGTTTCTTGTTTTGTC -12 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.124.10 chr1 + 1137 7 full-splice_match PARK7 ENST00000338639.10 1127 7 -10 0 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GCTGGGTGTGGTGGCTCATG 10 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.124.11 chr1 + 851 7 full-splice_match PARK7 ENST00000493678.5 1088 7 19 218 0 5 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 129 34.504848 1.537880 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TGTTTCTTGTTTTGTCTCTC 20 TRUE NA NA AATAAA -25 NA NA NA 129 NA PB.124.12 chr1 + 924 7 novel_in_catalog PARK7 novel 1127 7 NA NA 8 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACTGATTGTTTCTTGTTTT 28 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.124.13 chr1 + 1003 7 full-splice_match PARK7 ENST00000377491.5 977 7 0 -26 0 -5 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACTACTGATTGTTTCTTG 156 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.124.14 chr1 + 588 4 incomplete-splice_match PARK7 ENST00000377491.5 977 7 7463 -26 4006 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACTACTGATTGTTTCTTG 7414 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 10 NA PB.125.3 chr1 - 3099 4 full-splice_match ERRFI1 ENST00000377482.10 3097 4 0 -2 0 2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 492 131.599884 2.119256 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CCATTAGTAATGTTTCTTGC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 492 NA PB.125.4 chr1 - 4008 3 novel_in_catalog ERRFI1 novel 3097 4 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TACCATTAGTAATGTTTCTT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.125.7 chr1 - 3113 4 full-splice_match ERRFI1 ENST00000487559.1 787 4 -13 -2313 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 32 8.559342 0.932440 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TACCATTAGTAATGTTTCTT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 32 NA PB.125.10 chr1 - 3206 3 novel_in_catalog ERRFI1 novel 3097 4 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATACCATTAGTAATGTTTCT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.125.11 chr1 - 3022 4 full-splice_match ERRFI1 ENST00000377482.10 3097 4 74 1 48 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATACCATTAGTAATGTTTCT 74 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.125.14 chr1 - 4116 2 incomplete-splice_match ERRFI1 ENST00000474874.5 479 3 -26 7325 0 -2 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GATACCATTAGTAATGTTTC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.125.15 chr1 - 2772 3 incomplete-splice_match ERRFI1 ENST00000377482.10 3097 4 10788 2 112 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.942274 0.468683 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GATACCATTAGTAATGTTTC 4552 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.125.21 chr1 - 2890 3 incomplete-splice_match ERRFI1 ENST00000377482.10 3097 4 10669 3 -7 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGATACCATTAGTAATGTTT 4433 FALSE NA NA TTTAAA -21 NA NA NA 9 NA PB.125.26 chr1 - 3168 5 novel_not_in_catalog ERRFI1 novel 3097 4 NA NA 0 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATGATACCATTAGTAATGTT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.125.27 chr1 - 3016 3 full-splice_match ERRFI1 ENST00000469499.5 995 3 -13 -2008 0 -4 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.477233 0.541234 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATGATACCATTAGTAATGTT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.125.30 chr1 - 2988 4 full-splice_match ERRFI1 ENST00000377482.10 3097 4 -3 112 -3 -112 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CACTGATTTCTGCATTATGT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.125.31 chr1 - 2637 4 full-splice_match ERRFI1 ENST00000487559.1 787 4 -13 -1837 0 -476 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTCCTGGGGATTGTTTGC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.125.33 chr1 - 2537 3 full-splice_match ERRFI1 ENST00000469499.5 995 3 -13 -1529 0 -483 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTCAGTATTTCCTGGGGAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.125.34 chr1 - 2613 4 full-splice_match ERRFI1 ENST00000377482.10 3097 4 0 484 0 -484 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.814630 0.682563 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATTCAGTATTTCCTGGGGA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.125.35 chr1 - 2342 4 full-splice_match ERRFI1 ENST00000377482.10 3097 4 0 755 0 -755 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TGACTAATTTTCCCTTACAG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.125.36 chr1 - 2087 4 full-splice_match ERRFI1 ENST00000377482.10 3097 4 0 1010 0 690 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGTTTGAAGATTTCTGGCT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.125.38 chr1 - 1547 4 full-splice_match ERRFI1 ENST00000377482.10 3097 4 0 1550 0 150 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAACAAAAATGGATCTGG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.125.39 chr1 - 1440 4 full-splice_match ERRFI1 ENST00000377482.10 3097 4 0 1657 0 43 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAATATGAAAAATTTTTTAG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.126.3 chr1 - 3436 4 incomplete-splice_match RERE ENST00000476556.5 4598 13 65078 -1687 -3506 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AACCCTTGGGTGTCTCCCGT 8314 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.126.16 chr1 - 1640 4 incomplete-splice_match RERE ENST00000476556.5 4598 13 64750 437 -3834 -437 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TTTTTTTCTTCCATAAACTA 7986 FALSE NA NA AAGAAA -33 NA NA NA 4 NA PB.130.1 chr1 + 2496 9 full-splice_match SLC45A1 ENST00000471889.7 2496 9 0 0 0 0 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TATGGTTTCTAGGCATTGCT 10 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 9 NA PB.130.2 chr1 + 2396 8 novel_in_catalog SLC45A1 novel 2496 9 NA NA 0 1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAAAGCCTATGGTTTCTAGG 10 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 2 NA PB.137.2 chr1 + 1210 2 novel_not_in_catalog RERE-AS1 novel 439 3 NA NA 119 -2404 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA AATATA -38 NA NA NA 2 NA PB.140.1 chr1 - 1575 12 novel_not_in_catalog ENO1 novel 1819 10 NA NA 0 6957 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AACTTTTTTCTTTCTTTTTG 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.140.2 chr1 - 1823 12 full-splice_match ENO1 ENST00000234590.10 1781 12 -46 4 -12 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 13142 3515.214844 3.545952 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT 525 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13142 NA PB.140.3 chr1 - 3150 11 novel_in_catalog ENO1 novel 1837 13 NA NA 7 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.140.4 chr1 - 2374 12 novel_in_catalog ENO1 novel 1837 13 NA NA 0 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.140.5 chr1 - 2298 9 full-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 248 2 248 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT 7929 FALSE NA NA AATACA -7 NA NA NA 2 NA PB.140.6 chr1 - 2158 12 full-splice_match ENO1 ENST00000234590.10 1781 12 -381 4 25 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.140.7 chr1 - 2133 12 novel_in_catalog ENO1 novel 1781 12 NA NA -84 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.140.8 chr1 - 2199 8 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 2741 2 2741 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT 9876 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.140.9 chr1 - 1941 12 novel_in_catalog ENO1 novel 1781 12 NA NA 10 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.140.10 chr1 - 1911 13 novel_not_in_catalog ENO1 novel 1837 13 NA NA 3 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.140.12 chr1 - 1722 11 novel_in_catalog ENO1 novel 1837 13 NA NA 0 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.140.13 chr1 - 1688 11 novel_in_catalog ENO1 novel 1837 13 NA NA 1 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.140.14 chr1 - 1326 7 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 4351 2 4351 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 352 94.152763 1.973833 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT 8196 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 352 NA PB.140.15 chr1 - 1416 8 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 3524 2 3524 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 392 104.851944 2.020576 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT 9989 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 392 NA PB.140.16 chr1 - 1173 6 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 5119 2 5119 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 179 47.878822 1.680143 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT 8964 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 179 NA PB.140.17 chr1 - 1041 6 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 5251 2 5251 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 168 44.936546 1.652600 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 168 NA PB.140.18 chr1 - 967 8 novel_not_in_catalog ENO1 novel 1837 13 NA NA 8 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.140.19 chr1 - 796 4 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 7484 2 7484 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 76 20.328438 1.308104 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT 9803 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 76 NA PB.140.20 chr1 - 682 4 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 7598 2 7598 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT 9917 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.140.21 chr1 - 585 3 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 8242 2 8242 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT 8610 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.140.22 chr1 - 531 3 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 8296 2 8296 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.140.24 chr1 - 2359 12 full-splice_match ENO1 ENST00000234590.10 1781 12 -584 6 -80 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.617068 0.749510 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATACTCCGTGTGCCTGT -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 21 NA PB.140.25 chr1 - 1997 12 novel_in_catalog ENO1 novel 1781 12 NA NA -48 1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATACTCCGTGTGCCTGT 117 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.140.26 chr1 - 1805 12 novel_not_in_catalog ENO1 novel 1781 12 NA NA 0 1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATACTCCGTGTGCCTGT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.140.27 chr1 - 1751 12 novel_not_in_catalog ENO1 novel 1781 12 NA NA 0 1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATACTCCGTGTGCCTGT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.140.28 chr1 - 1772 12 novel_not_in_catalog ENO1 novel 1837 13 NA NA 0 1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATACTCCGTGTGCCTGT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.140.29 chr1 - 1736 12 novel_not_in_catalog ENO1 novel 1837 13 NA NA 0 1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATACTCCGTGTGCCTGT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.140.30 chr1 - 1713 12 full-splice_match ENO1 ENST00000234590.10 1781 12 36 32 -4 -25 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 319 85.325943 1.931081 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAATAAAAAGCCTCAGTGA 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 319 NA PB.140.31 chr1 - 1576 10 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000234590.10 1781 12 6698 6 -44 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 515 137.751923 2.139098 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATACTCCGTGTGCCTGT 7269 FALSE NA NA AAAAAG -34 NA NA NA 515 NA PB.140.32 chr1 - 1108 6 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 5182 4 5182 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 251 67.137344 1.826964 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATACTCCGTGTGCCTGT 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 251 NA PB.140.33 chr1 - 947 5 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 6139 4 6139 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 153 40.924355 1.611982 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATACTCCGTGTGCCTGT 9984 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 153 NA PB.140.34 chr1 - 3461 8 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 1476 5 1476 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAGAATACTCCGTGTGCCTG 9157 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.140.35 chr1 - 2067 11 novel_in_catalog ENO1 novel 1837 13 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAGAATACTCCGTGTGCCTG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.140.36 chr1 - 1824 13 novel_in_catalog ENO1 novel 1837 13 NA NA 4 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAGAATACTCCGTGTGCCTG 13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.140.37 chr1 - 1860 12 novel_in_catalog ENO1 novel 1781 12 NA NA -142 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATGAGAATACTCCGTGTGCC 848 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.142.1 chr1 - 1318 6 incomplete-splice_match SLC2A5 ENST00000377424.9 4085 12 29778 1841 38 1484 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAAGACGTGCTGCTGTTCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.142.2 chr1 - 2204 12 full-splice_match SLC2A5 ENST00000377424.9 4085 12 39 1842 8 1483 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 29 7.756904 0.889688 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGACGTGCTGCTGTTC -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 29 NA PB.142.3 chr1 - 1664 8 incomplete-splice_match SLC2A5 ENST00000377424.9 4085 12 27760 1842 -1980 1483 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGACGTGCTGCTGTTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.142.4 chr1 - 1477 7 incomplete-splice_match SLC2A5 ENST00000377424.9 4085 12 29542 1842 -198 1483 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGACGTGCTGCTGTTC NA FALSE NA NA GGGGCT -29 NA NA NA 3 NA PB.142.5 chr1 - 1813 12 full-splice_match SLC2A5 ENST00000377424.9 4085 12 39 2233 8 1092 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTTGCTGGTTCAGCCTTC -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.142.6 chr1 - 1677 12 full-splice_match SLC2A5 ENST00000377424.9 4085 12 39 2369 8 956 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.209753 0.506472 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATGCAGTCCTCATCTCCAG -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.146.2 chr1 + 1786 5 novel_not_in_catalog H6PD novel 9147 5 NA NA -7 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGAACCTCGGATATCCTCTA -30 TRUE NA NA CATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.149.5 chr1 + 2451 2 full-splice_match SPSB1 ENST00000377399.2 1007 2 510 -1954 510 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACCATTTTTGAATTCCTC 476 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.149.6 chr1 + 2165 2 full-splice_match SPSB1 ENST00000377399.2 1007 2 796 -1954 796 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACCATTTTTGAATTCCTC 762 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 4 NA PB.150.1 chr1 + 1280 7 novel_not_in_catalog SLC25A33 novel 3865 7 NA NA -1356 -2401 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACATTTGGCTTGTGTCCTCT NA FALSE NA NA ATTAAA -23 NA NA NA 2 NA PB.150.2 chr1 + 1475 7 full-splice_match SLC25A33 ENST00000302692.7 3865 7 -12 2402 -12 -2402 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 239 63.927589 1.805688 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACATTTGGCTTGTGTCCTC 2 TRUE NA NA ATTAAA -22 NA NA NA 239 NA PB.150.4 chr1 + 1382 6 novel_in_catalog SLC25A33 novel 3865 7 NA NA 4 -2401 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACATTTGGCTTGTGTCCTCT 18 TRUE NA NA ATTAAA -23 NA NA NA 2 NA PB.150.5 chr1 + 2389 7 full-splice_match SLC25A33 ENST00000302692.7 3865 7 22 1454 22 -1454 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAATTTAAT -5 TRUE NA NA TTTAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.150.7 chr1 + 1295 7 full-splice_match SLC25A33 ENST00000302692.7 3865 7 22 2548 22 -2548 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 41 10.966658 1.040074 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACCTGTTGGACATTTCCTTT -5 TRUE NA NA CATAAA -17 NA NA NA 41 NA PB.150.8 chr1 + 1373 6 novel_in_catalog SLC25A33 novel 3865 7 NA NA 24 -2401 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACATTTGGCTTGTGTCCTCT -3 TRUE NA NA ATTAAA -23 NA NA NA 2 NA PB.150.9 chr1 + 1337 6 novel_in_catalog SLC25A33 novel 3865 7 NA NA 24 -2403 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 19 5.082109 0.706044 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATACATTTGGCTTGTGTCCT -3 TRUE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 19 NA PB.150.10 chr1 + 1013 6 incomplete-splice_match SLC25A33 ENST00000302692.7 3865 7 24 4892 24 -4892 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGTTGTTTGTGGGTATATC -3 TRUE NA NA AGTAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.150.11 chr1 + 1260 7 full-splice_match SLC25A33 ENST00000302692.7 3865 7 198 2407 198 -2407 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGTATACATTTGGCTTGTG 3 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 8 NA PB.150.14 chr1 + 1127 6 incomplete-splice_match SLC25A33 ENST00000302692.7 3865 7 14209 2407 14209 -2407 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGTATACATTTGGCTTGTG 3634 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.150.15 chr1 + 1078 6 incomplete-splice_match SLC25A33 ENST00000302692.7 3865 7 14264 2401 14264 -2401 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.942274 0.468683 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACATTTGGCTTGTGTCCTCT 3689 FALSE NA NA ATTAAA -23 NA NA NA 11 NA PB.150.16 chr1 + 919 4 incomplete-splice_match SLC25A33 ENST00000302692.7 3865 7 30797 2401 30797 -2401 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACATTTGGCTTGTGTCCTCT NA FALSE NA NA ATTAAA -23 NA NA NA 2 NA PB.151.1 chr1 + 3970 11 full-splice_match TMEM201 ENST00000340381.11 3815 11 -162 7 -162 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGATGCCTGCTGGCTGTC 10 TRUE NA NA AAAAAG -26 NA NA NA 10 NA PB.151.2 chr1 + 4016 6 full-splice_match TMEM201 ENST00000340305.9 3851 6 -171 6 -160 -6 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.209753 0.506472 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCGCTGGCGTCAGGTGCC 12 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 12 NA PB.151.3 chr1 + 3812 11 full-splice_match TMEM201 ENST00000340381.11 3815 11 2 1 2 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GCCTGCTGGCTGTCTGTATT 19 TRUE NA NA AAAAAG -32 NA NA NA 5 NA PB.151.4 chr1 + 3856 6 full-splice_match TMEM201 ENST00000340305.9 3851 6 -5 0 -5 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGGCGTCAGGTGCCGCGTCT 23 TRUE NA NA AATAAA -28 NA NA NA 2 NA PB.151.5 chr1 + 3595 10 incomplete-splice_match TMEM201 ENST00000340381.11 3815 11 7065 1 -921 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GCCTGCTGGCTGTCTGTATT 7082 FALSE NA NA AAAAAG -32 NA NA NA 2 NA PB.151.6 chr1 + 2989 7 incomplete-splice_match TMEM201 ENST00000340381.11 3815 11 12387 7 4401 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGATGCCTGCTGGCTGTC 4381 FALSE NA NA AAAAAG -26 NA NA NA 2 NA PB.151.9 chr1 + 2439 5 incomplete-splice_match TMEM201 ENST00000340381.11 3815 11 18834 8 17 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATGATGCCTGCTGGCTGT 28 FALSE NA NA AAAAAG -25 NA NA NA 2 NA PB.151.10 chr1 + 1976 2 incomplete-splice_match TMEM201 ENST00000508400.1 893 6 4079 -1630 4079 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CCTGCTGGCTGTCTGTATTC 4090 FALSE NA NA AAAAAG -33 NA NA NA 4 NA PB.152.1 chr1 - 2340 2 full-splice_match LINC02606 ENST00000641325.1 2442 2 101 1 -14 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATGAATGTGTTTGATTCTTA -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.153.1 chr1 - 1626 2 incomplete-splice_match PIK3CD-AS2 ENST00000415330.3 978 3 18 7326 18 -7326 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAACATGACGAGGAAGAAG 16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.154.1 chr1 - 4673 19 full-splice_match CLSTN1 ENST00000377298.9 4760 19 -9 96 -9 5 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCCGGAGCGGGGTTTGTCT -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.154.2 chr1 - 4628 18 full-splice_match CLSTN1 ENST00000361311.4 4647 18 19 0 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.477233 0.541234 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.154.3 chr1 - 3443 12 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 2068 -6 654 5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCCGGAGCGGGGTTTGTCT 5715 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.154.4 chr1 - 3054 10 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000650348.1 4457 19 82429 1 -7754 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT 8738 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.154.5 chr1 - 2646 7 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 16018 -6 -2077 5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCCGGAGCGGGGTTTGTCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.154.6 chr1 - 2325 5 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 17436 -6 -659 5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCCGGAGCGGGGTTTGTCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.154.8 chr1 - 4316 16 novel_not_in_catalog CLSTN1 novel 4647 18 NA NA 40 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT 690 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.154.9 chr1 - 4022 15 novel_in_catalog CLSTN1 novel 4647 18 NA NA -3625 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT 22 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.154.10 chr1 - 4079 16 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000361311.4 4647 18 68778 0 -3625 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT 22 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.154.11 chr1 - 4127 15 novel_in_catalog CLSTN1 novel 4647 18 NA NA -3730 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.154.12 chr1 - 3828 15 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000361311.4 4647 18 72461 0 58 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT 3705 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.154.13 chr1 - 3643 13 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 1745 0 331 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT 5392 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.154.14 chr1 - 3015 9 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 10323 0 -7772 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT 8720 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.154.15 chr1 - 2890 9 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000650348.1 4457 19 86132 1 -4051 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT NA FALSE NA NA AATAGA -5 NA NA NA 2 NA PB.154.16 chr1 - 2869 9 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 10469 0 -7626 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT 8866 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.154.17 chr1 - 2741 8 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 15648 0 -2447 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.154.18 chr1 - 2396 6 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 16554 0 -1541 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.012192 0.603382 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.154.19 chr1 - 2300 5 novel_not_in_catalog CLSTN1 novel 3829 14 NA NA -576 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.154.20 chr1 - 2252 5 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 17503 0 -592 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.154.21 chr1 - 2132 4 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 18048 0 -47 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.744712 0.573418 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.154.22 chr1 - 1993 3 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 19691 0 1596 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 19 5.082109 0.706044 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.154.26 chr1 - 4570 17 novel_in_catalog CLSTN1 novel 4760 19 NA NA 0 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 38 10.164219 1.007074 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACTCCAGCCGGAGCGGGG 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 38 NA PB.154.27 chr1 - 3853 14 full-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 -25 1 -25 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACTCCAGCCGGAGCGGGG 3622 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.154.29 chr1 - 3559 13 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000361311.4 4647 18 74405 1 588 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACTCCAGCCGGAGCGGGG 5649 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.154.30 chr1 - 3256 12 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000650348.1 4457 19 79210 2 5708 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACTCCAGCCGGAGCGGGG 7165 FALSE NA NA GGGGCT -22 NA NA NA 4 NA PB.154.31 chr1 - 3199 11 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 7122 1 5708 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACTCCAGCCGGAGCGGGG 7165 FALSE NA NA GGGGCT -22 NA NA NA 7 NA PB.154.32 chr1 - 2530 6 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 16419 1 -1676 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACTCCAGCCGGAGCGGGG NA FALSE NA NA AAGAAA -25 NA NA NA 6 NA PB.154.33 chr1 - 1793 2 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 20260 1 2165 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 25 6.686986 0.825230 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACTCCAGCCGGAGCGGGG -19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 25 NA PB.154.37 chr1 - 3635 17 novel_in_catalog CLSTN1 novel 4647 18 NA NA 0 -955 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CTTTGTGCTAGTGTAACCCG 631 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.154.38 chr1 - 1369 5 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 17444 942 -651 -942 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAACCCGGGACTGGAATGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.154.39 chr1 - 1550 6 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 16447 953 -1648 -953 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTGTGCTAGTGTAACCCGGG NA FALSE NA NA AAAACA -12 NA NA NA 2 NA PB.154.40 chr1 - 2527 13 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000361311.4 4647 18 74479 959 662 -959 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGTCCTTTGTGCTAGTGTAA 5723 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.154.43 chr1 - 904 5 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000377298.9 4760 19 -21 22545 -2 -1983 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAATCGAGGAGCCGGCTT 629 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.154.44 chr1 - 868 4 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000361311.4 4647 18 4 22443 4 -1983 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAATCGAGGAGCCGGCTT 635 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.154.45 chr1 - 765 4 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000361311.4 4647 18 107 22443 88 -1983 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAATCGAGGAGCCGGCTT 738 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.155.3 chr1 - 2865 5 full-splice_match CTNNBIP1 ENST00000400904.7 1206 5 173 -1832 106 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TCGTGTGTGAGCTGAGCTGG 209 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.155.4 chr1 - 2957 5 full-splice_match CTNNBIP1 ENST00000400904.7 1206 5 81 -1832 14 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 71 18.991041 1.278549 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TCGTGTGTGAGCTGAGCTGG -22 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 71 NA PB.155.5 chr1 - 2696 3 incomplete-splice_match CTNNBIP1 ENST00000377256.1 451 5 6103 -2382 6103 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TCGTGTGTGAGCTGAGCTGG 5907 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.155.8 chr1 - 3074 5 full-splice_match CTNNBIP1 ENST00000400904.7 1206 5 -37 -1831 -37 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTCGTGTGTGAGCTGAGCTG -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.155.10 chr1 - 2981 6 full-splice_match CTNNBIP1 ENST00000377263.6 3006 6 18 7 18 -7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATAGGTTCGTGTGTGAGCTG -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.155.12 chr1 - 1041 4 novel_in_catalog CTNNBIP1 novel 1206 5 NA NA 14 1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTGGGGTTTGTGTTTGAT -22 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.155.13 chr1 - 1294 6 novel_not_in_catalog CTNNBIP1 novel 3006 6 NA NA 21 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACATTTGGGGTTTGTGTTTG -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.155.14 chr1 - 1290 6 novel_not_in_catalog CTNNBIP1 novel 3006 6 NA NA 21 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACATTTGGGGTTTGTGTTTG -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.155.15 chr1 - 1264 6 novel_not_in_catalog CTNNBIP1 novel 3006 6 NA NA 14 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACATTTGGGGTTTGTGTTTG -22 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.155.16 chr1 - 1223 6 novel_not_in_catalog CTNNBIP1 novel 3006 6 NA NA 21 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACATTTGGGGTTTGTGTTTG -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.155.17 chr1 - 1135 5 full-splice_match CTNNBIP1 ENST00000400904.7 1206 5 70 1 3 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 203 54.298328 1.734787 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACATTTGGGGTTTGTGTTTG -33 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 203 NA PB.155.18 chr1 - 1151 6 full-splice_match CTNNBIP1 ENST00000377263.6 3006 6 21 1834 21 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 20 5.349589 0.728320 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACATTTGGGGTTTGTGTTTG -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 20 NA PB.155.20 chr1 - 930 5 full-splice_match CTNNBIP1 ENST00000400904.7 1206 5 -61 337 -61 4 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTATTTTTATTTCTGACTCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.155.21 chr1 - 784 5 full-splice_match CTNNBIP1 ENST00000400904.7 1206 5 84 338 17 3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTTATTTTTATTTCTGACTC -19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.156.1 chr1 + 5209 24 full-splice_match PIK3CD ENST00000377346.9 5412 24 0 203 0 -203 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAGAAAGAAAAAGCCTTT -9 TRUE NA NA AGTAAA -9 NA NA NA 5 NA PB.156.2 chr1 + 5104 23 novel_in_catalog PIK3CD novel 5412 24 NA NA 0 -203 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAGAAAGAAAAAGCCTTT -9 TRUE NA NA AGTAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.156.3 chr1 + 5312 24 novel_not_in_catalog PIK3CD novel 539 3 NA NA 1370 -204 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 GAAAAGAAAGAAAAAGCCTT -5 TRUE NA NA AGTAAA -8 NA NA NA 2 NA PB.156.4 chr1 + 3807 16 incomplete-splice_match PIK3CD ENST00000377346.9 5412 24 67136 203 2591 -203 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAGAAAGAAAAAGCCTTT 1058 FALSE NA NA AGTAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.156.5 chr1 + 3406 12 incomplete-splice_match PIK3CD ENST00000361110.6 3508 23 10617 -1679 4539 -203 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAGAAAGAAAAAGCCTTT 3006 FALSE NA NA AGTAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.156.6 chr1 + 2942 8 incomplete-splice_match PIK3CD ENST00000361110.6 3508 23 11780 -1679 5702 -203 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAGAAAGAAAAAGCCTTT 4169 FALSE NA NA AGTAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.156.7 chr1 + 2710 7 incomplete-splice_match PIK3CD ENST00000361110.6 3508 23 12102 -1679 6024 -203 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAGAAAGAAAAAGCCTTT 4491 FALSE NA NA AGTAAA -9 NA NA NA 6 NA PB.156.8 chr1 + 2407 4 incomplete-splice_match PIK3CD ENST00000361110.6 3508 23 13770 -1679 7692 -203 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAGAAAGAAAAAGCCTTT 6159 FALSE NA NA AGTAAA -9 NA NA NA 3 NA PB.156.9 chr1 + 2174 3 incomplete-splice_match PIK3CD ENST00000361110.6 3508 23 14186 -1679 8108 -203 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAGAAAGAAAAAGCCTTT 6575 FALSE NA NA AGTAAA -9 NA NA NA 4 NA PB.157.3 chr1 + 1611 5 full-splice_match NMNAT1 ENST00000377205.6 3734 5 -21 2144 -21 -315 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAGAGAAAAAAAAAAAAGA -7 TRUE NA NA AAAAAG -15 NA NA NA 6 NA PB.157.4 chr1 + 1067 5 full-splice_match NMNAT1 ENST00000403197.5 1094 5 26 1 -21 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTCTCCTGCAGTGGTCTC -7 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 4 NA PB.158.1 chr1 + 1066 3 full-splice_match UBE4B ENST00000377153.5 1273 3 -337 544 -21 -544 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATGAACACCTCTAATTG -23 TRUE NA NA ATTAAA -10 NA NA NA 2 NA PB.158.2 chr1 + 2962 17 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 112 35169 -14 159 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTTATATGTGTATATAATG -16 TRUE NA NA AATAAA -31 NA NA NA 2 NA PB.158.3 chr1 + 1600 3 full-splice_match UBE4B ENST00000377153.5 1273 3 -329 2 -13 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.744712 0.573418 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTTTCCTCTGTATGTCT -15 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 14 NA PB.158.4 chr1 + 4878 27 full-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 127 -233 1 233 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGAATTTGAATTTCAGTTTT -1 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 8 NA PB.158.5 chr1 + 5511 27 full-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 127 -866 1 -6 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAAATCTTCTTTGAGTCT -1 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 7 NA PB.158.7 chr1 + 1206 3 full-splice_match UBE4B ENST00000377153.5 1273 3 -309 376 7 -376 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGGACTGTCTTTGTTGGGAA 5 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.158.9 chr1 + 5325 27 full-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 311 -864 -131 -8 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAAGAAATCTTCTTTGAGT -39 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 5 NA PB.158.10 chr1 + 4692 27 full-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 313 -233 -129 233 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGAATTTGAATTTCAGTTTT -37 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 8 NA PB.158.11 chr1 + 5194 27 full-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 442 -864 0 -8 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAAGAAATCTTCTTTGAGT 92 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.158.12 chr1 + 4890 27 full-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 748 -866 306 -6 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAAATCTTCTTTGAGTCT 398 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.158.14 chr1 + 4413 24 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 68315 -866 286 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAAATCTTCTTTGAGTCT NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.158.15 chr1 + 4250 23 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 70230 -866 2201 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAAATCTTCTTTGAGTCT NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.158.16 chr1 + 4143 22 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 72771 -877 4742 5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTTGAGTCTCTTCTCTTTTG NA FALSE NA NA AATAAA -29 NA NA NA 2 NA PB.158.18 chr1 + 3052 19 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 89194 -235 -16 235 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATTTGAATTTCAGTTTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.158.20 chr1 + 2699 15 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 97927 -235 2420 235 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATTTGAATTTCAGTTTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 5 NA PB.158.21 chr1 + 3177 14 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000343090.11 5905 28 99509 6 4128 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAAATCTTCTTTGAGTCT NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.158.22 chr1 + 2164 11 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 112134 -233 -13388 233 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGAATTTGAATTTCAGTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.158.23 chr1 + 2725 10 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000343090.11 5905 28 114003 6 -11393 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAAATCTTCTTTGAGTCT NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 5 NA PB.158.24 chr1 + 1991 10 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 114232 -235 -11290 235 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATTTGAATTTCAGTTTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.158.26 chr1 + 2494 8 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000343090.11 5905 28 118368 8 -7028 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAAGAAATCTTCTTTGAGT NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 5 NA PB.158.27 chr1 + 1813 8 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 118552 -241 -6970 241 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTTCAGTTTTTTTTTTCT NA FALSE NA NA AATAAA -26 NA NA NA 3 NA PB.158.28 chr1 + 2279 8 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000343090.11 5905 28 118585 6 -6811 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAAATCTTCTTTGAGTCT NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.158.29 chr1 + 2192 7 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000343090.11 5905 28 125466 6 70 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAAATCTTCTTTGAGTCT 2986 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.158.30 chr1 + 1337 5 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 135322 -233 -2802 233 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGAATTTGAATTTCAGTTTT -1 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.158.31 chr1 + 1956 5 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000343090.11 5905 28 135210 6 -2788 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAAATCTTCTTTGAGTCT 13 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.158.32 chr1 + 1117 4 full-splice_match UBE4B ENST00000487244.5 818 4 287 -586 287 235 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATTTGAATTTCAGTTTTTT -8 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 6 NA PB.158.33 chr1 + 1734 4 full-splice_match UBE4B ENST00000487244.5 818 4 301 -1217 301 -6 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.477233 0.541234 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAAATCTTCTTTGAGTCT 6 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 13 NA PB.158.34 chr1 + 1611 3 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000487244.5 818 4 7738 -1217 -322 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAAATCTTCTTTGAGTCT 7443 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 8 NA PB.158.35 chr1 + 935 3 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000487244.5 818 4 7783 -586 -277 235 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATTTGAATTTCAGTTTTTT 7488 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.158.36 chr1 + 1474 2 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000465408.1 355 3 410 -1281 410 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAAGAAATCTTCTTTGAGT 8175 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 6 NA PB.158.37 chr1 + 1357 2 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000465408.1 355 3 529 -1283 529 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAAATCTTCTTTGAGTCT 8294 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.159.1 chr1 - 964 8 novel_in_catalog LZIC novel 652 5 NA NA 92 -14 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAATTAATGAGAGTATAG -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.159.4 chr1 - 3423 9 novel_not_in_catalog LZIC novel 945 8 NA NA 22 -102 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CACCACTGAAATGGTATCTT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.159.5 chr1 - 2846 8 full-splice_match LZIC ENST00000377223.6 4989 8 22 2121 22 1306 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAATATTTGTTTGAATACCT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.159.6 chr1 - 2286 8 full-splice_match LZIC ENST00000377223.6 4989 8 58 2645 58 782 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATGTGACCTTTTTATGTATC 27 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.159.7 chr1 - 1895 8 full-splice_match LZIC ENST00000377213.1 945 8 22 -972 6 439 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CTTCTGTACTGTAAACTACT -25 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.159.8 chr1 - 1951 8 full-splice_match LZIC ENST00000377223.6 4989 8 49 2989 49 438 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TCTTCTGTACTGTAAACTAC 18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.159.9 chr1 - 1433 7 full-splice_match LZIC ENST00000400903.6 1405 7 -17 -11 -17 11 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CCCCAGCCTGTAAGCTGTCT 575 FALSE NA NA TATAAA -5 NA NA NA 2 NA PB.159.10 chr1 - 1547 8 full-splice_match LZIC ENST00000377223.6 4989 8 22 3420 22 7 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CATCCCCCAGCCTGTAAGCT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.159.11 chr1 - 1141 8 full-splice_match LZIC ENST00000377223.6 4989 8 35 3813 35 147 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAAGGCTGTTTGTTTTTAAG 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.159.12 chr1 - 836 6 novel_in_catalog LZIC novel 4989 8 NA NA 32 17 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CATCATTGTGCGTTGTGTGC 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.159.13 chr1 - 980 8 full-splice_match LZIC ENST00000377223.6 4989 8 49 3960 49 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 46 12.304054 1.090048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTTGTGTTTATGCTCTTCAT 18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 46 NA PB.159.14 chr1 - 923 8 full-splice_match LZIC ENST00000377213.1 945 8 27 -5 11 5 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.617068 0.749510 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GTTTATGCTCTTCATCATTG -20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 21 NA PB.159.15 chr1 - 1450 7 novel_not_in_catalog LZIC novel 945 8 NA NA 35 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTTGTGTTTATGCTCTTCAT 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.160.5 chr1 + 1597 4 incomplete-splice_match KIF1B ENST00000377093.9 7800 21 -27 49106 -27 -22892 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAAAAAAAAAATTTTTT 1 TRUE NA NA ACTAAA -36 NA NA NA 7 NA PB.160.6 chr1 + 5985 21 full-splice_match KIF1B ENST00000377093.9 7800 21 -26 1841 -26 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.160.8 chr1 + 2945 21 full-splice_match KIF1B ENST00000377093.9 7800 21 -17 4872 -17 -3032 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAGAAATAAAATGCTCAAAA 11 TRUE NA NA GATAAA -7 NA NA NA 2 NA PB.160.9 chr1 + 1257 9 incomplete-splice_match KIF1B ENST00000377093.9 7800 21 -5 36291 -5 -10077 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GTAAGTTTTATACTTCATTA -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.160.15 chr1 + 3295 1 full-splice_match RN7SL731P ENST00000584329.2 293 1 -3005 3 -3005 -3 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA 7741 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.160.16 chr1 + 2887 1 full-splice_match RN7SL731P ENST00000584329.2 293 1 -2594 0 -2594 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 8152 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.160.17 chr1 + 2511 1 full-splice_match RN7SL731P ENST00000584329.2 293 1 -2220 2 -2220 -2 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA 8526 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.160.18 chr1 + 1827 1 full-splice_match RN7SL731P ENST00000584329.2 293 1 -1534 0 -1534 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 9212 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.160.19 chr1 + 1692 1 full-splice_match RN7SL731P ENST00000584329.2 293 1 -1399 0 -1399 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 9347 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.160.20 chr1 + 1470 1 full-splice_match RN7SL731P ENST00000584329.2 293 1 -1177 0 -1177 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 9569 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.160.21 chr1 + 1387 1 full-splice_match RN7SL731P ENST00000584329.2 293 1 -1094 0 -1094 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 9652 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.160.22 chr1 + 1172 1 full-splice_match RN7SL731P ENST00000584329.2 293 1 -880 1 -880 -1 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 9866 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.160.23 chr1 + 1039 1 full-splice_match RN7SL731P ENST00000584329.2 293 1 -746 0 -746 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 10000 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.160.24 chr1 + 956 1 full-splice_match RN7SL731P ENST00000584329.2 293 1 -663 0 -663 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.160.25 chr1 + 1939 1 full-splice_match RN7SL731P ENST00000584329.2 293 1 169 -1815 169 1815 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AATAAAAGTTGAAGTCATCT NA FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 7 NA PB.162.2 chr1 + 1956 13 novel_in_catalog PGD novel 2268 13 NA NA -20 312 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GATGCTCTTTCTCCAGATTC NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.162.3 chr1 + 1870 12 novel_in_catalog PGD novel 2268 13 NA NA -16 313 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGCTCTTTCTCCAGATTCT NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.162.5 chr1 + 2201 12 novel_in_catalog PGD novel 2268 13 NA NA 0 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTTGGTCTGATTTATTTC -4 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.162.6 chr1 + 2265 13 full-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 2 1 2 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 27 7.221945 0.858654 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTTGGTCTGATTTATTTC -2 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 27 NA PB.162.7 chr1 + 2018 12 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 385 368 -49 313 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGCTCTTTCTCCAGATTCT 57 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 6 NA PB.162.8 chr1 + 2382 12 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 388 1 -46 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTTGGTCTGATTTATTTC 60 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.162.10 chr1 + 1730 11 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 1361 368 793 313 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 29 7.756904 0.889688 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGCTCTTTCTCCAGATTCT 1033 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 29 NA PB.162.11 chr1 + 1986 11 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 1472 1 904 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTTGGTCTGATTTATTTC 1144 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.162.12 chr1 + 1585 10 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 4004 368 3436 313 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 38 10.164219 1.007074 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGCTCTTTCTCCAGATTCT 3676 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 38 NA PB.162.15 chr1 + 1765 8 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 9006 1 -4764 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTTGGTCTGATTTATTTC 8678 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 6 NA PB.162.16 chr1 + 1282 7 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 12399 368 -1371 313 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 44 11.769095 1.070743 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGCTCTTTCTCCAGATTCT NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 44 NA PB.162.18 chr1 + 1584 7 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 12464 1 -1306 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTTGGTCTGATTTATTTC NA FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 10 NA PB.162.19 chr1 + 1172 6 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 14016 370 246 311 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 35 9.361781 0.971358 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGATGCTCTTTCTCCAGATT NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 35 NA PB.162.20 chr1 + 1462 6 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 14095 1 325 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTTGGTCTGATTTATTTC NA FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 7 NA PB.162.21 chr1 + 1064 6 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 14126 368 356 313 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 20 5.349589 0.728320 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGCTCTTTCTCCAGATTCT NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 20 NA PB.162.22 chr1 + 1334 5 incomplete-splice_match PGD ENST00000498356.1 790 6 1730 -680 1730 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTTGGTCTGATTTATTTC 26 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 5 NA PB.162.23 chr1 + 939 5 incomplete-splice_match PGD ENST00000498356.1 790 6 1758 -313 1758 313 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGCTCTTTCTCCAGATTCT 54 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 6 NA PB.162.24 chr1 + 862 4 incomplete-splice_match PGD ENST00000498356.1 790 6 2093 -313 -1427 313 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.279671 0.631410 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGCTCTTTCTCCAGATTCT 389 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 16 NA PB.162.25 chr1 + 1212 4 incomplete-splice_match PGD ENST00000498356.1 790 6 2110 -680 -1410 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.477233 0.541234 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTTGGTCTGATTTATTTC 406 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 13 NA PB.162.26 chr1 + 1124 4 incomplete-splice_match PGD ENST00000498356.1 790 6 2198 -680 -1322 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTTGGTCTGATTTATTTC 494 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.162.28 chr1 + 919 2 incomplete-splice_match PGD ENST00000498356.1 790 6 4210 -680 690 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTTGGTCTGATTTATTTC 19 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.164.1 chr1 + 750 4 novel_in_catalog CENPS novel 905 5 NA NA -49 71 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 CAAAAATCAGTTCATCTTTT 307 FALSE NA NA ATTAAA -38 NA NA NA 2 NA PB.164.2 chr1 + 846 6 full-splice_match CENPS-CORT ENST00000602787.6 571 6 -29 -246 22 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGTGATCTTTCCTCTCCTC 329 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.164.3 chr1 + 1063 6 full-splice_match CENPS-CORT ENST00000602787.6 571 6 -3 -489 -3 -103 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AATTAAGAGTTCAGAATAAC -27 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 5 NA PB.164.4 chr1 + 1128 6 novel_not_in_catalog CENPS-CORT novel 571 6 NA NA -2 -8598 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCTGGTTACTAATGTTGTTT -26 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.164.5 chr1 + 902 5 full-splice_match CENPS ENST00000309048.8 905 5 2 1 2 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 55 14.711370 1.167653 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTTTTCTGGTTACTAATG -24 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 55 NA PB.164.6 chr1 + 798 5 full-splice_match CENPS ENST00000309048.8 905 5 5 102 5 49 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.279671 0.631410 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACATGGTTGACTTTTTCA -21 TRUE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 16 NA PB.164.7 chr1 + 736 3 novel_in_catalog CENPS novel 905 5 NA NA 10 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTTTTCTGGTTACTAATG -16 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.164.8 chr1 + 1424 5 full-splice_match CENPS ENST00000477755.1 914 5 -31 -479 -31 5 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 107 28.620300 1.456674 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCTGGTTACTAATGTTGTTT -1 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 107 NA PB.164.9 chr1 + 1248 5 fusion CENPS_CORT novel 914 5 NA NA -31 -340 multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTGATCTTTCCTCTCCTCC -1 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.164.10 chr1 + 1157 5 fusion CENPS_CORT novel 914 5 NA NA -31 -340 multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTGATCTTTCCTCTCCTCC -1 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.164.11 chr1 + 1140 5 full-splice_match CENPS ENST00000477755.1 914 5 -31 -195 -31 27 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 46 12.304054 1.090048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TAGGGTGCTTTTTGTGCTGA -1 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 46 NA PB.164.12 chr1 + 1242 3 full-splice_match CENPS ENST00000462462.1 584 3 -350 -308 -10 2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTTTCTGGTTACTAATGTTG 20 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 5 NA PB.164.13 chr1 + 1431 5 novel_not_in_catalog CENPS novel 914 5 NA NA -17 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTTTTCTGGTTACTAATG 13 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.164.14 chr1 + 1316 6 fusion CENPS_CORT novel 914 5 NA NA -13 -340 multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.209753 0.506472 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTGATCTTTCCTCTCCTCC 17 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 12 NA PB.164.15 chr1 + 911 5 full-splice_match CENPS ENST00000477755.1 914 5 -6 9 -6 -9 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AGAAGAAAAAGAAGTCAGAG 24 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.165.8 chr1 - 1331 6 full-splice_match DFFA ENST00000377038.8 6035 6 -2 4706 -2 415 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 91 24.340630 1.386332 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGTAATTGGCAGTGATT 443 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 91 NA PB.165.13 chr1 - 1093 4 incomplete-splice_match DFFA ENST00000377036.2 1403 5 3295 -1 3286 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTCCTGTTGGTGTTGTAAGA 3781 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.165.14 chr1 - 1403 5 full-splice_match DFFA ENST00000377036.2 1403 5 -3 3 -3 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 33 8.826821 0.945804 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTCTTCCTGTTGGTGTTGT 14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 33 NA PB.165.15 chr1 - 1078 5 full-splice_match DFFA ENST00000377036.2 1403 5 -51 376 -10 -376 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 50 13.373972 1.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACAGACTCTGGTCCAAGG 13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 50 NA PB.167.1 chr1 + 911 5 novel_not_in_catalog PEX14 novel 637 6 NA NA -4 41861 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGATCTACAGGTGATTTAAC -7 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 3 NA PB.167.2 chr1 + 1920 9 full-splice_match PEX14 ENST00000356607.9 1922 9 0 2 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 128 34.237370 1.534500 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AATTTCTGCCTGTGGCTCCC -3 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 128 NA PB.167.4 chr1 + 1786 8 novel_in_catalog PEX14 novel 1922 9 NA NA 5 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AATTTCTGCCTGTGGCTCCC 2 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 10 NA PB.167.7 chr1 + 1695 6 incomplete-splice_match PEX14 ENST00000356607.9 1922 9 124327 2 63389 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AATTTCTGCCTGTGGCTCCC NA FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 5 NA PB.167.9 chr1 + 1448 4 incomplete-splice_match PEX14 ENST00000356607.9 1922 9 148140 2 87202 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AATTTCTGCCTGTGGCTCCC 51 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.170.1 chr1 + 2966 6 full-splice_match TARDBP ENST00000240185.8 4185 6 -237 1456 -7 -7 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAATAATATGTGTCTTTGT NA FALSE NA NA AATAAA -8 NA NA NA 2 NA PB.170.2 chr1 + 2886 7 full-splice_match TARDBP ENST00000472476.5 1001 7 -24 -1861 8 -6 alternative_3end TRUE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT NA FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.170.3 chr1 + 2736 6 full-splice_match TARDBP ENST00000240185.8 4185 6 -6 1455 -5 -6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 582 155.673035 2.192213 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT -11 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 582 NA PB.170.4 chr1 + 4280 6 full-splice_match TARDBP ENST00000240185.8 4185 6 -3 -92 -2 92 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 37 9.896740 0.995492 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAGAAAAAAGAAAATAATA -8 TRUE NA NA TTTAAA -13 NA NA NA 37 NA PB.170.5 chr1 + 2441 8 novel_in_catalog TARDBP novel 1793 10 NA NA -2 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTTTAGTGTCTGGAGTCTT -8 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.170.6 chr1 + 1712 7 novel_in_catalog TARDBP novel 4185 6 NA NA -2 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT -8 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 4 NA PB.170.7 chr1 + 1794 6 full-splice_match TARDBP ENST00000240185.8 4185 6 -3 2394 -2 -136 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTCACAGTGTTTGGTTCTT -8 TRUE NA NA AAGAAA -23 NA NA NA 3 NA PB.170.8 chr1 + 1508 6 full-splice_match TARDBP ENST00000240185.8 4185 6 -3 2680 -2 -46 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.209753 0.506472 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAAGGAAGAGCTAAAGGA -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.170.9 chr1 + 3447 6 full-splice_match TARDBP ENST00000240185.8 4185 6 0 738 0 -265 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTCTCACAATGCATTGTTA -5 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.170.10 chr1 + 1190 8 novel_in_catalog TARDBP novel 1793 10 NA NA 0 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGTCTCAAGTCAAATGGATT -5 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.170.11 chr1 + 2140 7 novel_in_catalog TARDBP novel 1793 10 NA NA 1 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGTCTCAAGTCAAATGGATT -4 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.170.12 chr1 + 1674 7 novel_not_in_catalog TARDBP novel 4185 6 NA NA 1 -10 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATTTAAATAATATGTGTCTT -4 TRUE NA NA AATAAA -5 NA NA NA 2 NA PB.170.13 chr1 + 3405 7 novel_in_catalog TARDBP novel 1793 10 NA NA -3 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTTTAGTGTCTGGAGTCTT 0 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 5 NA PB.170.14 chr1 + 2848 7 novel_in_catalog TARDBP novel 4185 6 NA NA -3 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT 0 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 6 NA PB.170.15 chr1 + 2870 6 full-splice_match TARDBP ENST00000240185.8 4185 6 5 1310 -3 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.209753 0.506472 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGTCTCAAGTCAAATGGATT 0 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 12 NA PB.170.16 chr1 + 2671 8 novel_in_catalog TARDBP novel 1793 10 NA NA -3 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTTTAGTGTCTGGAGTCTT 0 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.170.17 chr1 + 1783 7 full-splice_match TARDBP ENST00000629725.2 1031 7 37 -789 -3 -6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT 0 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 6 NA PB.170.18 chr1 + 1749 7 novel_not_in_catalog TARDBP novel 4185 6 NA NA -3 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT 0 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 3 NA PB.170.19 chr1 + 1713 7 novel_in_catalog TARDBP novel 1793 10 NA NA -3 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT 0 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 9 NA PB.170.20 chr1 + 1176 8 novel_in_catalog TARDBP novel 1793 10 NA NA -3 -6 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT 0 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.170.21 chr1 + 2552 5 full-splice_match TARDBP ENST00000621715.4 816 5 -9 -1727 -1 -6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT 2 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.170.22 chr1 + 1772 7 novel_in_catalog TARDBP novel 1835 6 NA NA -1 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT 2 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 5 NA PB.170.23 chr1 + 2612 5 incomplete-splice_match TARDBP ENST00000315091.7 1835 6 28 146 16 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.942274 0.468683 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT 1060 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 11 NA PB.170.24 chr1 + 2477 5 incomplete-splice_match TARDBP ENST00000315091.7 1835 6 163 146 151 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.209753 0.506472 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT 1195 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 12 NA PB.170.25 chr1 + 2334 4 incomplete-splice_match TARDBP ENST00000611963.4 739 6 -66 156 22 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.477233 0.541234 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT 4216 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 13 NA PB.170.26 chr1 + 2204 3 incomplete-splice_match TARDBP ENST00000620632.4 706 5 -25 6 -25 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.617068 0.749510 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT 6071 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 21 NA PB.170.27 chr1 + 2046 2 incomplete-splice_match TARDBP ENST00000614494.1 515 4 35 146 35 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 26 6.954466 0.842264 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT 7784 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 26 NA PB.170.28 chr1 + 1934 2 incomplete-splice_match TARDBP ENST00000614494.1 515 4 147 146 -7 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 20 5.349589 0.728320 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT 7896 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 20 NA PB.170.34 chr1 + 1888 2 full-splice_match TARDBP ENST00000480464.2 790 2 -1098 0 13 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GTTTAGTGTCTGGAGTCTTA NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.171.1 chr1 - 1341 8 novel_in_catalog SRM novel 1260 8 NA NA 6 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGATTGGAGTCCTGTGTC 27 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.171.2 chr1 - 1217 7 incomplete-splice_match SRM ENST00000376957.7 1260 8 471 3 139 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGATTGGAGTCCTGTGTC 492 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.171.3 chr1 - 1283 8 full-splice_match SRM ENST00000376957.7 1260 8 -26 3 -24 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 505 135.077118 2.130582 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGATTGGAGTCCTGTGTC -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 505 NA PB.171.4 chr1 - 1114 7 novel_in_catalog SRM novel 1260 8 NA NA -1 -3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGATTGGAGTCCTGTGTC 18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.171.5 chr1 - 1006 7 incomplete-splice_match SRM ENST00000376957.7 1260 8 682 3 350 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 40 10.699178 1.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGATTGGAGTCCTGTGTC 703 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 40 NA PB.171.6 chr1 - 937 6 novel_in_catalog SRM novel 1260 8 NA NA 28 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGATTGGAGTCCTGTGTC 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.171.7 chr1 - 886 6 incomplete-splice_match SRM ENST00000376957.7 1260 8 1134 3 -11 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGATTGGAGTCCTGTGTC 1155 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.173.1 chr1 - 2379 22 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 8283 -4 8268 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTCCTGACTTTTATTTTGT 8268 FALSE NA NA AGTAAA -45 NA NA NA 3 NA PB.173.2 chr1 - 2783 25 full-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 7 6 7 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 272 72.754410 1.861859 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 272 NA PB.173.3 chr1 - 3559 22 novel_in_catalog EXOSC10 novel 2796 25 NA NA 3 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.173.4 chr1 - 2986 24 novel_in_catalog EXOSC10 novel 2796 25 NA NA 3 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.173.6 chr1 - 2787 25 novel_in_catalog EXOSC10 novel 2796 25 NA NA 3 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.173.7 chr1 - 2728 24 novel_in_catalog EXOSC10 novel 2796 25 NA NA -4 -3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.173.8 chr1 - 2697 24 full-splice_match EXOSC10 ENST00000304457.11 2721 24 18 6 3 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.173.9 chr1 - 2592 24 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 1762 6 1747 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.173.10 chr1 - 2441 23 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 4051 6 4036 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.209753 0.506472 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT 4036 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.173.11 chr1 - 2090 20 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 9220 6 -8026 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT 9205 FALSE NA NA AAAACA -5 NA NA NA 2 NA PB.173.12 chr1 - 1951 19 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 11714 6 -5532 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT 9956 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.173.13 chr1 - 1843 18 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 12034 6 -5212 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.173.14 chr1 - 1654 16 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 17000 6 -246 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.744712 0.573418 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT NA FALSE NA NA AAAACA -33 NA NA NA 14 NA PB.173.15 chr1 - 1576 16 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 17078 6 -168 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.173.16 chr1 - 1410 15 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 18693 6 41 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.173.17 chr1 - 1114 12 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 20048 6 -21 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.209753 0.506472 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.173.18 chr1 - 977 11 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 22244 6 26 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT 2142 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.173.19 chr1 - 854 9 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 22940 6 722 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT 2838 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.173.20 chr1 - 759 8 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 25550 6 -1293 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT 5448 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.173.21 chr1 - 612 7 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 25919 6 -924 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT 5817 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.173.22 chr1 - 2702 24 novel_in_catalog EXOSC10 novel 2796 25 NA NA -7 -4 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GAAGAAAGCTGATTCCTGAC -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.173.23 chr1 - 1252 14 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 19019 7 7 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GAAGAAAGCTGATTCCTGAC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.173.24 chr1 - 2580 23 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 8 2027 -7 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GTAAGAACTGCTCCTGGAGG -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.173.25 chr1 - 2020 19 novel_in_catalog EXOSC10 novel 2796 25 NA NA -8488 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GTAAGAACTGCTCCTGGAGG 8743 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.173.26 chr1 - 2173 19 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 10 7328 -5 342 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATCTATGAAGTAAGTGG -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.173.29 chr1 - 2469 15 novel_in_catalog EXOSC10 novel 2721 24 NA NA 3 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAGAAAAAATAAACAAA 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.174.1 chr1 + 778 2 full-splice_match EXOSC10-AS1 ENST00000447600.1 487 2 -245 -46 0 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAGAGAATACTTGCTTTTC -1 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.175.1 chr1 - 1145 3 incomplete-splice_match MTOR ENST00000473471.5 862 6 5267 -750 5267 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGTATATGAGTGGCGTTTTA NA FALSE NA NA AATACA -33 NA NA NA 2 NA PB.175.2 chr1 - 2325 14 incomplete-splice_match MTOR ENST00000376838.5 4017 20 4472 1 4472 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATGTATATGAGTGGCGTTTT NA FALSE NA NA ATTAAA -7 NA NA NA 2 NA PB.175.4 chr1 - 4344 30 incomplete-splice_match MTOR ENST00000361445.9 8721 58 95030 7 -22496 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA AAAACA -44 NA NA NA 2 NA PB.175.6 chr1 - 8708 58 full-splice_match MTOR ENST00000361445.9 8721 58 6 7 6 -7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.175.7 chr1 - 7181 49 incomplete-splice_match MTOR ENST00000361445.9 8721 58 20870 7 20870 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.175.8 chr1 - 3830 25 incomplete-splice_match MTOR ENST00000361445.9 8721 58 117795 7 269 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.175.9 chr1 - 4026 27 incomplete-splice_match MTOR ENST00000361445.9 8721 58 115757 7 -1769 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.175.10 chr1 - 3396 22 incomplete-splice_match MTOR ENST00000361445.9 8721 58 128152 7 -2841 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.175.11 chr1 - 3002 20 full-splice_match MTOR ENST00000376838.5 4017 20 1008 7 1008 -7 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA GGGGCT -34 NA NA NA 8 NA PB.175.12 chr1 - 2825 18 incomplete-splice_match MTOR ENST00000376838.5 4017 20 2655 13 2655 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AATTTTAAACATATGTATAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.175.13 chr1 - 2484 15 incomplete-splice_match MTOR ENST00000376838.5 4017 20 3828 7 3828 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.175.14 chr1 - 2230 13 incomplete-splice_match MTOR ENST00000376838.5 4017 20 4774 7 4774 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.175.15 chr1 - 2009 12 incomplete-splice_match MTOR ENST00000376838.5 4017 20 6983 7 6983 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA AAAACA -12 NA NA NA 8 NA PB.175.16 chr1 - 1683 10 incomplete-splice_match MTOR ENST00000376838.5 4017 20 10290 7 -5605 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.175.17 chr1 - 1505 7 incomplete-splice_match MTOR ENST00000376838.5 4017 20 16670 7 -259 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.279671 0.631410 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA AATAAA -37 NA NA NA 16 NA PB.175.18 chr1 - 1281 5 incomplete-splice_match MTOR ENST00000473471.5 862 6 1724 -743 1724 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.012192 0.603382 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 15 NA PB.175.19 chr1 - 1085 3 incomplete-splice_match MTOR ENST00000473471.5 862 6 5320 -743 5320 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.175.24 chr1 - 950 6 incomplete-splice_match MTOR ENST00000361445.9 8721 58 11 147304 11 -114885 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GTGAGAAGCCACGGCAGAGG 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.176.1 chr1 + 1556 2 full-splice_match UBIAD1 ENST00000376810.6 3654 2 20 2078 20 -2078 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 100 26.747944 1.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAATTAGGCGCATGGTCTTT 7 TRUE NA NA TTTAAA -23 NA NA NA 100 NA PB.176.3 chr1 + 3628 2 full-splice_match UBIAD1 ENST00000376810.6 3654 2 25 1 25 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACCAATGGTCTGGCTTCTGG 12 TRUE NA NA ATTAAA -22 NA NA NA 5 NA PB.176.5 chr1 + 1275 2 full-splice_match UBIAD1 ENST00000376810.6 3654 2 294 2085 -36 -2085 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 33 8.826821 0.945804 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAAGGTGAATTAGGCGCAT -11 TRUE NA NA TTTAAA -16 NA NA NA 33 NA PB.177.1 chr1 + 2036 5 novel_in_catalog FBXO44 novel 2928 6 NA NA -8 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TAACCTGTGCCCTGTGGTTT -22 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.177.2 chr1 + 2579 6 novel_in_catalog FBXO44 novel 1734 5 NA NA 1 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATCACCCAGTCTCGGGTA -9 TRUE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.177.3 chr1 + 1760 5 full-splice_match FBXO44 ENST00000376762.8 1734 5 -28 2 1 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.814630 0.682563 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AACCTGTGCCCTGTGGTTTC -9 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 18 NA PB.177.4 chr1 + 1882 6 full-splice_match FBXO44 ENST00000251547.10 2928 6 7 1039 3 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TAACCTGTGCCCTGTGGTTT -7 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.177.5 chr1 + 1343 3 incomplete-splice_match FBXO44 ENST00000471895.1 769 6 39 1036 39 -1 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TAACCTGTGCCCTGTGGTTT 3552 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.178.1 chr1 - 1246 6 full-splice_match FBXO2 ENST00000354287.5 1287 6 70 -29 70 29 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTCCCTTCCCATCCTTTTCT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.178.2 chr1 - 1315 6 full-splice_match FBXO2 ENST00000354287.5 1287 6 -34 6 -34 -6 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 108 28.887781 1.460714 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAGGAAGGAATGAATGAAAA 355 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 108 NA PB.178.3 chr1 - 1837 5 novel_in_catalog FBXO2 novel 1287 6 NA NA 1 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAGGAATGAATGAAAAAATG 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.178.4 chr1 - 1237 7 novel_in_catalog FBXO2 novel 1287 6 NA NA 85 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAGGAATGAATGAAAAAATG -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.179.1 chr1 + 1526 6 full-splice_match FBXO6 ENST00000376753.9 1444 6 -87 5 -87 -5 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAAACCAGCCTGGGGTTGG -13 TRUE NA NA AATAAA -25 NA NA NA 4 NA PB.179.2 chr1 + 1396 6 full-splice_match FBXO6 ENST00000376753.9 1444 6 -1 49 -1 -49 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAATAATAATAATAATAAA -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.179.3 chr1 + 1121 6 full-splice_match FBXO6 ENST00000376753.9 1444 6 -1 324 -1 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTGTGGCTCACGCCTGTAA -14 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 10 NA PB.181.1 chr1 - 1667 8 novel_in_catalog MAD2L2 novel 1860 11 NA NA -16 4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCCATCATTAACTGGAGTG -26 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.181.2 chr1 - 1532 8 incomplete-splice_match MAD2L2 ENST00000376669.9 864 9 -46 -197 -16 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG -26 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.181.3 chr1 - 1464 8 incomplete-splice_match MAD2L2 ENST00000376692.9 1053 9 13 1 -4 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.181.4 chr1 - 1354 8 novel_in_catalog MAD2L2 novel 1053 9 NA NA -5 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.181.5 chr1 - 1297 8 incomplete-splice_match MAD2L2 ENST00000376692.9 1053 9 180 1 143 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 19 5.082109 0.706044 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.181.6 chr1 - 1125 9 full-splice_match MAD2L2 ENST00000376667.7 872 9 14 -267 -2 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 36 9.629260 0.983593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG 211 FALSE NA NA GGGGCT -43 NA NA NA 36 NA PB.181.7 chr1 - 1042 8 incomplete-splice_match MAD2L2 ENST00000376692.9 1053 9 435 1 398 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG 828 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.181.8 chr1 - 1022 9 full-splice_match MAD2L2 ENST00000376667.7 872 9 117 -267 -15 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.181.9 chr1 - 1017 9 novel_not_in_catalog MAD2L2 novel 1053 9 NA NA -176 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.209753 0.506472 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG -20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.181.10 chr1 - 1072 9 full-splice_match MAD2L2 ENST00000376692.9 1053 9 -20 1 -20 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 479 128.122650 2.107626 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG -30 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 479 NA PB.181.11 chr1 - 862 7 incomplete-splice_match MAD2L2 ENST00000376692.9 1053 9 705 1 668 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG 1098 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.181.12 chr1 - 693 5 incomplete-splice_match MAD2L2 ENST00000376692.9 1053 9 4206 1 4169 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG 4599 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.181.13 chr1 - 1457 8 novel_not_in_catalog MAD2L2 novel 1053 9 NA NA -4 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAGCTGAGCCATCATTAACT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.181.14 chr1 - 1131 8 novel_in_catalog MAD2L2 novel 1053 9 NA NA -7 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAGCTGAGCCATCATTAACT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.181.15 chr1 - 1040 9 novel_not_in_catalog MAD2L2 novel 1053 9 NA NA 5 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAGCTGAGCCATCATTAACT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.181.16 chr1 - 1951 7 novel_in_catalog MAD2L2 novel 1053 9 NA NA 7 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGAGCTGAGCCATCATTAAC -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.181.17 chr1 - 1009 9 novel_not_in_catalog MAD2L2 novel 1053 9 NA NA -176 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGAGCTGAGCCATCATTAAC -20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.181.18 chr1 - 1067 9 full-splice_match MAD2L2 ENST00000376669.9 864 9 -9 -194 4 -4 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CTGAGCTGAGCCATCATTAA 11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.183.3 chr1 + 2743 4 novel_in_catalog AGTRAP novel 1130 5 NA NA 2 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATGGGCTGTGTTTTGAACCA -27 TRUE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 5 NA PB.183.4 chr1 + 1433 6 novel_in_catalog AGTRAP novel 1116 6 NA NA 2 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGATGGGCTGTGTTTTGAAC -27 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 5 NA PB.183.5 chr1 + 1374 6 full-splice_match AGTRAP ENST00000476512.5 942 6 10 -442 3 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.012192 0.603382 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGATGGGCTGTGTTTTGAAC -26 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 15 NA PB.183.6 chr1 + 1230 6 full-splice_match AGTRAP ENST00000400895.6 786 6 8 -452 2 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.744712 0.573418 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGATGGGCTGTGTTTTGAAC -21 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 14 NA PB.183.7 chr1 + 1209 6 full-splice_match AGTRAP ENST00000452018.6 809 6 -41 -359 2 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGATGGGCTGTGTTTTGAAC -21 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 10 NA PB.183.8 chr1 + 1112 5 full-splice_match AGTRAP ENST00000376629.8 1100 5 -15 3 2 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 39 10.431699 1.018355 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGATGGGCTGTGTTTTGAAC -21 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 39 NA PB.183.9 chr1 + 1055 4 novel_in_catalog AGTRAP novel 1130 5 NA NA 0 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGATGGGCTGTGTTTTGAAC 22 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.184.3 chr1 + 5544 23 full-splice_match CLCN6 ENST00000346436.11 5589 23 45 0 5 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTCTGTCTCCTTTAGCCTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 5 NA PB.184.5 chr1 + 1448 13 incomplete-splice_match CLCN6 ENST00000376496.4 2922 22 -16 9547 13 200 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGCCCTGTGTCTTTGCCAC 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.184.6 chr1 + 981 6 incomplete-splice_match CLCN6 ENST00000376490.7 963 11 -14 4903 -11 2536 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAATACAAAATTAGCCGG 13 TRUE NA NA AGTAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.184.7 chr1 + 4676 13 incomplete-splice_match CLCN6 ENST00000346436.11 5589 23 21914 2 -1744 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCCTCTGTCTCCTTTAGCCT NA FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.184.8 chr1 + 4554 12 incomplete-splice_match CLCN6 ENST00000346436.11 5589 23 22276 0 -1382 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTCTGTCTCCTTTAGCCTTT NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.184.9 chr1 + 1479 2 novel_not_in_catalog CLCN6 novel 1032 4 NA NA -807 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTCTGTCTCCTTTAGCCTTT NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.184.13 chr1 + 1268 4 novel_in_catalog CLCN6 novel 1032 4 NA NA 128 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACCGCCGTGCCTCAGGATTC NA FALSE NA NA AGTAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.187.1 chr1 + 3150 20 novel_in_catalog PLOD1 novel 2976 19 NA NA -11 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG -35 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.187.2 chr1 + 3009 19 full-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 -25 -8 -2 7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 378 101.107231 2.004782 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGATGCTCAGGGCGAGTGG -26 TRUE NA NA ATTAAA -23 NA NA NA 378 NA PB.187.4 chr1 + 2805 18 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 13290 1 -6294 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.012192 0.603382 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG NA FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 15 NA PB.187.5 chr1 + 2588 16 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 15662 1 -3922 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.279671 0.631410 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG -7 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 16 NA PB.187.6 chr1 + 2475 16 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 15778 -2 -3806 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAGGGAAGATGCTCAGGGC 61 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.187.8 chr1 + 2270 13 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 22199 1 2615 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.744712 0.573418 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG 2070 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 14 NA PB.187.9 chr1 + 2195 13 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 22275 0 2691 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.477233 0.541234 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CTGAAGGGAAGATGCTCAGG 25 FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 13 NA PB.187.10 chr1 + 1997 11 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 23871 1 4287 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 27 7.221945 0.858654 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG -15 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 27 NA PB.187.11 chr1 + 1844 10 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 26022 1 -3949 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 36 9.629260 0.983593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG 2136 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 36 NA PB.187.12 chr1 + 1679 8 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 29489 1 -482 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.617068 0.749510 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG 5603 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 21 NA PB.187.13 chr1 + 1524 7 novel_in_catalog PLOD1 novel 2976 19 NA NA -474 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG 5611 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.187.14 chr1 + 1579 7 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 29934 -1 -37 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 23 6.152027 0.789018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGAAGGGAAGATGCTCAGGG 413 FALSE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 23 NA PB.187.15 chr1 + 1498 7 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 30015 -1 30 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.884548 0.769713 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGAAGGGAAGATGCTCAGGG 494 FALSE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 22 NA PB.187.16 chr1 + 1419 6 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 30786 1 801 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.744712 0.573418 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG -17 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 14 NA PB.187.17 chr1 + 1263 4 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 32269 1 2284 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 37 9.896740 0.995492 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG 1466 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 37 NA PB.187.18 chr1 + 1150 3 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 35960 1 -866 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 29 7.756904 0.889688 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG 10 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 29 NA PB.187.19 chr1 + 1046 3 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 36064 1 -762 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.012192 0.603382 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG 114 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 15 NA PB.187.20 chr1 + 914 2 full-splice_match PLOD1 ENST00000481933.1 2339 2 1424 1 1424 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 CACTGAAGGGAAGATGCTCA 2300 FALSE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 7 NA PB.188.1 chr1 + 4602 19 full-splice_match MFN2 ENST00000235329.10 4407 19 -196 1 10 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.942274 0.468683 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTTTGTGAGATCTGTCTTTT 9581 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 11 NA PB.188.2 chr1 + 4284 18 full-splice_match MFN2 ENST00000674817.1 4514 18 226 4 -20 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.209753 0.506472 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAAATCCTTTGTGAGATCTG 46 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 12 NA PB.188.3 chr1 + 4561 19 novel_in_catalog MFN2 novel 4772 20 NA NA -3 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TGGAAATCCTTTGTGAGATC -1 TRUE NA NA AATAAA -8 NA NA NA 2 NA PB.188.6 chr1 + 4403 19 full-splice_match MFN2 ENST00000235329.10 4407 19 2 2 0 1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 41 10.966658 1.040074 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CCTTTGTGAGATCTGTCTTT 4 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 41 NA PB.188.7 chr1 + 4123 17 incomplete-splice_match MFN2 ENST00000235329.10 4407 19 8821 -2 -2987 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTGAGATCTGTCTTTTTGG 4497 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.188.8 chr1 + 3834 15 incomplete-splice_match MFN2 ENST00000675483.1 4337 16 3970 -2 67 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATCCTTTGTGAGATCTGT NA FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 3 NA PB.188.9 chr1 + 3352 11 full-splice_match MFN2 ENST00000675404.1 4447 11 1101 -6 1101 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.209753 0.506472 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGTGAGATCTGTCTTTTTG -16 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 12 NA PB.188.10 chr1 + 3214 10 incomplete-splice_match MFN2 ENST00000675404.1 4447 11 1446 1 1446 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATCCTTTGTGAGATCTGT 329 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 8 NA PB.188.11 chr1 + 2955 8 incomplete-splice_match MFN2 ENST00000675404.1 4447 11 3744 -5 -2674 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTTGTGAGATCTGTCTTTTT 2627 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 9 NA PB.188.12 chr1 + 2722 5 incomplete-splice_match MFN2 ENST00000675404.1 4447 11 5355 1 -1063 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATCCTTTGTGAGATCTGT 4238 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 5 NA PB.188.13 chr1 + 2605 5 incomplete-splice_match MFN2 ENST00000675404.1 4447 11 5479 -6 -939 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGTGAGATCTGTCTTTTTG 4362 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 7 NA PB.188.14 chr1 + 2445 4 incomplete-splice_match MFN2 ENST00000675404.1 4447 11 6238 1 -180 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATCCTTTGTGAGATCTGT 5121 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 5 NA PB.188.15 chr1 + 2194 3 full-splice_match MFN2 ENST00000676295.1 2622 3 438 -10 438 2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTGAGATCTGTCTTTTTGG 5739 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 6 NA PB.188.16 chr1 + 2067 2 full-splice_match MFN2 ENST00000675043.1 2148 2 118 -37 118 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTTGTGAGATCTGTCTTTTT 8206 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.189.1 chr1 + 1737 10 novel_in_catalog MIIP novel 1541 10 NA NA 10 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTCAAGTCCCACGTGTGC -24 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.189.2 chr1 + 1551 10 full-splice_match MIIP ENST00000235332.6 1541 10 -12 2 -12 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 220 58.845478 1.769713 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGTCCCACGTGTGCTGGTT -14 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 220 NA PB.189.3 chr1 + 1626 9 novel_in_catalog MIIP novel 1541 10 NA NA -11 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTCAAGTCCCACGTGTGC -13 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.189.4 chr1 + 1811 8 novel_not_in_catalog MIIP novel 1541 10 NA NA -9 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGTCCCACGTGTGCTGGTT -11 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.189.5 chr1 + 1669 9 novel_in_catalog MIIP novel 1541 10 NA NA 3 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGTCCCACGTGTGCTGGTT 1 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.189.6 chr1 + 1335 9 novel_in_catalog MIIP novel 1541 10 NA NA 3 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 32 8.559342 0.932440 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTCAAGTCCCACGTGTGC 1 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 32 NA PB.189.7 chr1 + 2016 9 novel_in_catalog MIIP novel 1541 10 NA NA 6 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 29 7.756904 0.889688 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGTCCCACGTGTGCTGGTT 4 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 29 NA PB.189.8 chr1 + 2143 8 novel_in_catalog MIIP novel 1541 10 NA NA 7 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.279671 0.631410 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTCAAGTCCCACGTGTGC 5 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 16 NA PB.189.9 chr1 + 1587 10 novel_not_in_catalog MIIP novel 1541 10 NA NA 48 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTCAAGTCCCACGTGTGC 46 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.189.10 chr1 + 1287 8 incomplete-splice_match MIIP ENST00000235332.6 1541 10 2595 5 -129 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CTCAAGTCCCACGTGTGCTG 2593 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.189.11 chr1 + 1722 8 incomplete-splice_match MIIP ENST00000235332.6 1541 10 2750 -585 26 585 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATGAACTTTCTCTAAGGTTT 2748 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.189.12 chr1 + 1600 7 novel_in_catalog MIIP novel 1541 10 NA NA 39 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTCAAGTCCCACGTGTGC 2761 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.189.13 chr1 + 1047 8 incomplete-splice_match MIIP ENST00000235332.6 1541 10 2833 7 109 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTCAAGTCCCACGTGTGC 2831 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.189.14 chr1 + 1597 6 full-splice_match MIIP ENST00000466860.5 1709 6 175 -63 175 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTCAAGTCCCACGTGTGC 2897 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.190.1 chr1 + 3765 15 full-splice_match TNFRSF8 ENST00000263932.7 3760 15 -8 3 -8 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAGGCTGAGGACATGATCA -4 TRUE NA NA CATAAA -16 NA NA NA 6 NA PB.191.1 chr1 + 3591 9 full-splice_match TNFRSF1B ENST00000492361.1 3583 9 -18 10 -6 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACACGTCGACCCCTGGCTC -5 TRUE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.191.2 chr1 + 3686 10 full-splice_match TNFRSF1B ENST00000376259.7 3687 10 0 1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.477233 0.541234 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACACGTCGACCCCTGGCTCT 1 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 13 NA PB.192.2 chr1 + 1891 14 incomplete-splice_match VPS13D ENST00000620676.6 16357 70 1 245036 1 9056 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTATGTACAACAGTTGGATA -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.192.3 chr1 + 2773 19 incomplete-splice_match VPS13D ENST00000613099.4 16245 69 12 235804 12 18288 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 ATTAATGAAGATAAAATATC 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.193.1 chr1 + 3391 11 incomplete-splice_match VPS13D ENST00000011700.10 10969 52 -21 198469 -21 -26096 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAAGAAAAGAAGGTGCTG 1275 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.196.1 chr1 + 3167 13 incomplete-splice_match VPS13D ENST00000646411.1 4522 21 26772 -15 127 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACAACCTTGTCACATGTAGC NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.196.2 chr1 + 2687 9 incomplete-splice_match VPS13D ENST00000646411.1 4522 21 45290 -15 1331 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACAACCTTGTCACATGTAGC NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.196.3 chr1 + 2012 4 incomplete-splice_match VPS13D ENST00000645371.1 2024 14 77231 -1331 -4713 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACAACCTTGTCACATGTAGC NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.196.5 chr1 + 1834 3 incomplete-splice_match VPS13D ENST00000543766.2 3838 4 32567 1687 281 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TACAACCTTGTCACATGTAG NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.197.2 chr1 - 2608 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 210 1 186 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACGACCGGTTTGTGTGTGGT 198 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.197.3 chr1 - 2505 4 novel_not_in_catalog KIAA2013 novel 2170 4 NA NA -3 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACGACCGGTTTGTGTGTGGT 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.197.5 chr1 - 2302 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 516 1 492 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACGACCGGTTTGTGTGTGGT 504 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.197.6 chr1 - 1902 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 916 1 892 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACGACCGGTTTGTGTGTGGT 904 FALSE NA NA GGGGCT -5 NA NA NA 4 NA PB.197.7 chr1 - 1736 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 1082 1 1058 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACGACCGGTTTGTGTGTGGT 1070 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.197.8 chr1 - 1458 2 incomplete-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 3075 1 3051 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACGACCGGTTTGTGTGTGGT 3063 FALSE NA NA GGGGCT -15 NA NA NA 9 NA PB.197.9 chr1 - 1066 2 incomplete-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 3467 1 3443 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACGACCGGTTTGTGTGTGGT 3455 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.197.10 chr1 - 813 2 incomplete-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 3720 1 3696 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACGACCGGTTTGTGTGTGGT 3708 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.197.12 chr1 - 2041 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 776 2 752 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CACGACCGGTTTGTGTGTGG 764 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.197.13 chr1 - 1184 2 incomplete-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 3348 2 3324 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CACGACCGGTTTGTGTGTGG 3336 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.197.14 chr1 - 961 2 incomplete-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 3571 2 3547 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CACGACCGGTTTGTGTGTGG 3559 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.197.17 chr1 - 2240 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 102 477 78 115 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATACTTGAAATGGAACTC 90 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.197.18 chr1 - 2129 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 213 477 189 115 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATACTTGAAATGGAACTC 201 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.197.19 chr1 - 2029 4 novel_not_in_catalog KIAA2013 novel 2170 4 NA NA -3 115 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATACTTGAAATGGAACTC 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.197.23 chr1 - 1666 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 676 477 652 115 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATACTTGAAATGGAACTC 664 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.197.24 chr1 - 1565 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 777 477 753 115 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.942274 0.468683 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATACTTGAAATGGAACTC 765 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.197.26 chr1 - 1286 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 1056 477 1032 115 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.477233 0.541234 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATACTTGAAATGGAACTC 1044 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.197.27 chr1 - 1184 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 1158 477 1134 115 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATACTTGAAATGGAACTC 1146 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.197.28 chr1 - 1117 2 incomplete-splice_match KIAA2013 ENST00000616327.1 2170 4 2916 -115 2916 115 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATACTTGAAATGGAACTC 2928 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.197.29 chr1 - 1432 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 909 478 885 114 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.477233 0.541234 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 CAAATACTTGAAATGGAACT 897 FALSE NA NA GGGGCT -12 NA NA NA 13 NA PB.199.1 chr1 - 2246 6 full-splice_match DHRS3 ENST00000616661.5 2201 6 -46 1 -46 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTCCTTTGTTCAAATCTT 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.199.2 chr1 - 1669 6 full-splice_match DHRS3 ENST00000616661.5 2201 6 531 1 531 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 28 7.489425 0.874448 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTCCTTTGTTCAAATCTT 6 TRUE NA NA AAGAAA -9 NA NA NA 28 NA PB.199.3 chr1 - 1488 6 full-splice_match DHRS3 ENST00000616661.5 2201 6 712 1 -703 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTCCTTTGTTCAAATCTT 2470 FALSE NA NA GATAAA -3 NA NA NA 2 NA PB.199.4 chr1 - 1162 6 full-splice_match DHRS3 ENST00000616661.5 2201 6 1038 1 -377 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTCCTTTGTTCAAATCTT 2796 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.199.5 chr1 - 1965 6 full-splice_match DHRS3 ENST00000616661.5 2201 6 234 2 234 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GATTTCCTTTGTTCAAATCT -21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.199.6 chr1 - 1388 6 full-splice_match DHRS3 ENST00000616661.5 2201 6 811 2 -604 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GATTTCCTTTGTTCAAATCT 2569 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.199.7 chr1 - 1295 6 full-splice_match DHRS3 ENST00000616661.5 2201 6 904 2 -511 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.209753 0.506472 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GATTTCCTTTGTTCAAATCT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.199.8 chr1 - 1248 6 novel_in_catalog DHRS3 novel 2201 6 NA NA 31 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GATTTCCTTTGTTCAAATCT 3303 FALSE NA NA GGGGCT -6 NA NA NA 5 NA PB.199.9 chr1 - 1035 5 incomplete-splice_match DHRS3 ENST00000616661.5 2201 6 37651 2 15749 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GATTTCCTTTGTTCAAATCT 108 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.200.1 chr1 - 1974 3 incomplete-splice_match PRAMEF11 ENST00000619922.1 1845 4 2416 5 2416 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCTGTCTGGTGCCCTCTA 2438 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.202.1 chr1 - 1869 4 full-splice_match PRAMEF4 ENST00000235349.6 1840 4 -32 3 -32 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CAGAATCTGTCTGGTGCCCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.204.1 chr1 + 1124 6 full-splice_match PDPN ENST00000376057.8 2801 6 -30 1707 -30 3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.209753 0.506472 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTCTCCGTCTGACCATTCT -40 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.204.3 chr1 + 2150 6 full-splice_match PDPN ENST00000376057.8 2801 6 -17 668 -17 507 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCACAGCCCATTCCTCCC -27 TRUE NA NA AGTAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.204.4 chr1 + 2774 6 full-splice_match PDPN ENST00000376057.8 2801 6 25 2 25 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.012192 0.603382 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AACAATGAGTCAGACTTTTG 15 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 15 NA PB.204.5 chr1 + 1735 6 full-splice_match PDPN ENST00000376057.8 2801 6 27 1039 27 136 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACATTCACTTTCTGCCTCT 17 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.204.6 chr1 + 1073 6 full-splice_match PDPN ENST00000621990.5 2737 6 -43 1707 27 3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 25 6.686986 0.825230 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTCTCCGTCTGACCATTCT 17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 25 NA PB.204.7 chr1 + 1199 6 full-splice_match PDPN ENST00000376057.8 2801 6 31 1571 31 127 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.477233 0.541234 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACACATTCTGGTCTAGTTTG 21 TRUE NA NA AGTAAA -40 NA NA NA 13 NA PB.204.9 chr1 + 1195 6 full-splice_match PDPN ENST00000621990.5 2737 6 -29 1571 -29 127 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 30 8.024384 0.904412 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACACATTCTGGTCTAGTTTG 31 TRUE NA NA AGTAAA -40 NA NA NA 30 NA PB.204.10 chr1 + 1023 6 full-splice_match PDPN ENST00000376057.8 2801 6 70 1708 0 2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.942274 0.468683 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTGTCTCCGTCTGACCATTC 60 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.204.11 chr1 + 1063 6 full-splice_match PDPN ENST00000376057.8 2801 6 169 1569 98 129 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACATTCTGGTCTAGTTTGGT 159 FALSE NA NA AGTAAA -42 NA NA NA 2 NA PB.204.12 chr1 + 2501 6 full-splice_match PDPN ENST00000621990.5 2737 6 234 2 -27 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AACAATGAGTCAGACTTTTG 76 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.205.1 chr1 + 931 8 novel_not_in_catalog PRDM2 novel 7279 10 NA NA 0 2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCTTGTGATATTGGCTTG -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.205.2 chr1 + 2160 3 incomplete-splice_match PRDM2 ENST00000376048.9 2688 8 49139 0 -24 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTGTGAGGAACAAGCCTGG -7 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.205.3 chr1 + 4020 3 incomplete-splice_match PRDM2 ENST00000413440.5 6175 4 12 5826 0 3621 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAAAAAGTTTCTCATTC -12 TRUE NA NA AATAAA -43 NA NA NA 4 NA PB.205.14 chr1 + 2918 2 incomplete-splice_match PRDM2 ENST00000413440.5 6175 4 32071 5 9748 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATCTGTGAAAGGACTG 1170 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 2 NA PB.205.15 chr1 + 2367 2 incomplete-splice_match PRDM2 ENST00000413440.5 6175 4 32622 5 10299 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATCTGTGAAAGGACTG 1721 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 2 NA PB.205.16 chr1 + 1625 2 incomplete-splice_match PRDM2 ENST00000343137.8 5797 5 32913 22 10602 -22 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAATAAAATATTTAAAAT 2024 FALSE NA NA TATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.205.17 chr1 + 1593 2 incomplete-splice_match PRDM2 ENST00000413440.5 6175 4 33396 5 11073 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATCTGTGAAAGGACTG 340 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 3 NA PB.226.1 chr1 - 1381 2 full-splice_match LRRC38 ENST00000376085.4 2168 2 790 -3 790 3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATCTCTGGTATTCTGTTAT 3540 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.226.2 chr1 - 2185 2 full-splice_match LRRC38 ENST00000376085.4 2168 2 -18 1 -18 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTCAATCTCTGGTATTCTG -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.226.3 chr1 - 2122 2 full-splice_match LRRC38 ENST00000376085.4 2168 2 45 1 45 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTCAATCTCTGGTATTCTG 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.226.4 chr1 - 1840 2 full-splice_match LRRC38 ENST00000376085.4 2168 2 327 1 327 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTCAATCTCTGGTATTCTG -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.226.5 chr1 - 1942 2 full-splice_match LRRC38 ENST00000376085.4 2168 2 219 7 219 -7 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAGCCACTCAATCTCTGGT 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.226.6 chr1 - 1781 2 full-splice_match LRRC38 ENST00000376085.4 2168 2 66 321 66 -321 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATGTTTATGTTCCCCCAGA 2816 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.226.7 chr1 - 1596 2 full-splice_match LRRC38 ENST00000376085.4 2168 2 251 321 251 -321 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATGTTTATGTTCCCCCAGA 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.245.1 chr1 + 1784 7 incomplete-splice_match KAZN ENST00000400797.3 1295 8 14784 -763 14784 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAAAAAGAAAAAAAGAAA NA FALSE NA NA TTTAAA -45 NA NA NA 2 NA PB.245.2 chr1 + 1349 5 incomplete-splice_match KAZN ENST00000400797.3 1295 8 98193 -761 98193 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TGAAAAAAAAGAAAAAAAGA NA FALSE NA NA TTTAAA -43 NA NA NA 2 NA PB.248.1 chr1 + 1954 4 full-splice_match TMEM51 ENST00000376014.7 1843 4 27 -138 16 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACATTTGGGTGCTGAGTTAC 27 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 6 NA PB.248.2 chr1 + 1831 4 full-splice_match TMEM51 ENST00000376014.7 1843 4 49 -37 38 -17 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAGAA -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.248.3 chr1 + 2228 4 novel_not_in_catalog TMEM51 novel 1843 4 NA NA 198 1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTTGGGTGCTGAGTTACTT 159 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.248.4 chr1 + 1343 2 novel_in_catalog TMEM51 novel 1971 4 NA NA -5 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TACATTTGGGTGCTGAGTTA 22 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 8 NA PB.248.5 chr1 + 1954 4 full-splice_match TMEM51 ENST00000376008.3 1971 4 16 1 -5 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 25 6.686986 0.825230 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACATTTGGGTGCTGAGTTAC 22 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 25 NA PB.248.6 chr1 + 1880 3 full-splice_match TMEM51 ENST00000400796.7 1842 3 30 -68 -5 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 20 5.349589 0.728320 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TACATTTGGGTGCTGAGTTA 22 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 20 NA PB.248.8 chr1 + 1482 2 incomplete-splice_match TMEM51 ENST00000400796.7 1842 3 61267 33 61232 -18 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 CAAAAAAAAAAAAAAAAAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.248.9 chr1 + 1560 2 incomplete-splice_match TMEM51 ENST00000376008.3 1971 4 61276 2 61255 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TACATTTGGGTGCTGAGTTA NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.248.10 chr1 + 1230 2 incomplete-splice_match TMEM51 ENST00000434578.6 1861 4 61581 -83 61581 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TACATTTGGGTGCTGAGTTA NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.252.1 chr1 + 2319 4 full-splice_match EFHD2 ENST00000375980.9 2422 4 -27 130 -27 -130 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TTTTTGCTTCTTTTTTCCCC 156 FALSE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.252.3 chr1 + 2381 4 full-splice_match EFHD2 ENST00000375980.9 2422 4 31 10 31 -10 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.744712 0.573418 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATATTCTTATGTGTGTATG 3 TRUE NA NA GATAAA -5 NA NA NA 14 NA PB.252.4 chr1 + 898 4 full-splice_match EFHD2 ENST00000375980.9 2422 4 34 1490 34 -232 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGAATGGAGCAAGTTCAGGG 6 TRUE NA NA ACTAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.252.5 chr1 + 2197 4 full-splice_match EFHD2 ENST00000375980.9 2422 4 215 10 -162 -10 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATATTCTTATGTGTGTATG 187 FALSE NA NA GATAAA -5 NA NA NA 7 NA PB.252.7 chr1 + 1925 4 full-splice_match EFHD2 ENST00000375980.9 2422 4 365 132 -12 -132 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GCTTTTTGCTTCTTTTTTCC 78 FALSE NA NA TATAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.252.8 chr1 + 1969 3 incomplete-splice_match EFHD2 ENST00000375980.9 2422 4 16034 10 15657 -10 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.279671 0.631410 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATATTCTTATGTGTGTATG 35 FALSE NA NA GATAAA -5 NA NA NA 16 NA PB.252.9 chr1 + 1835 2 novel_in_catalog EFHD2 novel 2422 4 NA NA 15657 -9 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATATTCTTATGTGTGTATGG 35 FALSE NA NA GATAAA -6 NA NA NA 5 NA PB.252.10 chr1 + 2044 2 incomplete-splice_match EFHD2 ENST00000375980.9 2422 4 17091 9 16714 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATATTCTTATGTGTGTATGG 1092 FALSE NA NA GATAAA -6 NA NA NA 2 NA PB.252.11 chr1 + 1852 2 incomplete-splice_match EFHD2 ENST00000375980.9 2422 4 17282 10 16905 -10 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATATTCTTATGTGTGTATG 18 FALSE NA NA GATAAA -5 NA NA NA 6 NA PB.253.2 chr1 - 1943 9 full-splice_match CASP9 ENST00000333868.10 2808 9 -8 873 -6 -4 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 49 13.106493 1.117486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTCTTTTGCCTATTTCTTC 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 49 NA PB.253.3 chr1 - 1156 4 incomplete-splice_match CASP9 ENST00000400777.7 1878 9 19476 -90 2336 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTCTCTTTTGCCTATTTCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.253.4 chr1 - 1553 8 incomplete-splice_match CASP9 ENST00000333868.10 2808 9 6052 876 6029 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GACTCTCTTTTGCCTATTTC 8315 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.253.5 chr1 - 1098 4 incomplete-splice_match CASP9 ENST00000348549.9 1621 5 6189 7 6034 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GACTCTCTTTTGCCTATTTC 8320 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.253.6 chr1 - 2506 7 novel_in_catalog CASP9 novel 2808 9 NA NA 5866 -14 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATGGACTCTCTTTTGC 8152 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.253.7 chr1 - 1935 9 novel_not_in_catalog CASP9 novel 2808 9 NA NA -24 -14 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATGGACTCTCTTTTGC -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.253.8 chr1 - 1493 5 full-splice_match CASP9 ENST00000348549.9 1621 5 114 14 -16 -14 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.477233 0.541234 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATGGACTCTCTTTTGC -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.253.9 chr1 - 835 2 incomplete-splice_match CASP9 ENST00000424908.5 740 5 13078 -514 13078 -14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATGGACTCTCTTTTGC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.253.10 chr1 - 1554 7 novel_not_in_catalog CASP9 novel 781 5 NA NA -6 4507 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGCTCTTGTTAGATGCCT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.254.1 chr1 + 6027 15 full-splice_match DNAJC16 ENST00000375847.8 6034 15 6 1 6 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTATGGGGTAGCCCTTGCA -21 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.254.2 chr1 + 3109 15 full-splice_match DNAJC16 ENST00000375847.8 6034 15 6 2919 6 753 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AGTTCTCAAGAAAAGGAAAG -21 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.254.4 chr1 + 5293 15 full-splice_match DNAJC16 ENST00000375847.8 6034 15 21 720 21 -718 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAAAAAAAAAATTTGT -6 TRUE NA NA AATACA -12 NA NA NA 2 NA PB.254.5 chr1 + 2656 15 full-splice_match DNAJC16 ENST00000375847.8 6034 15 21 3357 21 315 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATCTTTTCCTCTGGGTG -6 TRUE NA NA AATGAA -30 NA NA NA 2 NA PB.255.1 chr1 + 1584 1 full-splice_match CHCHD2P6 ENST00000454346.1 447 1 -868 -269 -868 269 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA NA NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAGAAAAAAAAAATAG 7 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.256.1 chr1 + 3899 10 full-splice_match DDI2 ENST00000480945.6 10667 10 -4 6772 -4 1215 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AATAATTGAATATCTTATCG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.256.2 chr1 + 3652 10 full-splice_match DDI2 ENST00000480945.6 10667 10 0 7015 0 972 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.209753 0.506472 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGCATACTGTTTTAGAATGA 4 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 12 NA PB.256.4 chr1 + 3576 10 full-splice_match DDI2 ENST00000480945.6 10667 10 76 7015 -9 972 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGCATACTGTTTTAGAATGA 18 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 4 NA PB.256.7 chr1 + 1654 1 full-splice_match RSC1A1 ENST00000345034.2 2321 1 663 4 663 -4 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGCATACTGTTTTAGAATGA 531 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.256.9 chr1 + 1276 1 full-splice_match RSC1A1 ENST00000345034.2 2321 1 1044 1 1044 -1 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATACTGTTTTAGAATGAGAG 912 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 4 NA PB.256.11 chr1 + 1092 1 full-splice_match RSC1A1 ENST00000345034.2 2321 1 1227 2 1227 -2 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 CATACTGTTTTAGAATGAGA 1095 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.258.1 chr1 + 3319 15 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000375799.8 4134 20 35522 3 -10003 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CAAGGCTTGTCACTGGCCCT 1940 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.258.2 chr1 + 3020 13 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000375793.2 4004 19 41088 2 -4367 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 7576 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.258.3 chr1 + 2777 12 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000642363.1 3775 21 42633 2 -2656 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 119 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 5 NA PB.258.4 chr1 + 2631 12 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000642363.1 3775 21 42779 2 -2510 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 265 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 5 NA PB.258.5 chr1 + 2375 12 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000642363.1 3775 21 43035 2 -2254 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 521 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.258.6 chr1 + 2178 12 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000642363.1 3775 21 43232 2 -2057 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.477233 0.541234 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 718 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 13 NA PB.258.7 chr1 + 1907 8 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000642363.1 3775 21 44545 3 -744 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CAAGGCTTGTCACTGGCCCT 2031 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 6 NA PB.258.8 chr1 + 1818 7 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000642363.1 3775 21 45241 2 -48 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 2727 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 5 NA PB.258.9 chr1 + 1687 6 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000642363.1 3775 21 45974 2 685 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 3460 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 5 NA PB.258.10 chr1 + 1406 4 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000477849.1 1057 7 2066 -652 2066 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.209753 0.506472 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 4841 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 12 NA PB.258.11 chr1 + 1269 3 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000477849.1 1057 7 2504 -652 2504 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 5279 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 7 NA PB.258.12 chr1 + 1081 2 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000477849.1 1057 7 2774 -652 2774 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 5549 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 5 NA PB.259.4 chr1 - 1471 7 full-splice_match AGMAT ENST00000375826.4 3095 7 28 1596 28 -1596 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 48 12.839013 1.108532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATATTTCTATATCTTCCTTT 26 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 48 NA PB.259.7 chr1 - 1337 7 full-splice_match AGMAT ENST00000375826.4 3095 7 28 1730 28 -1730 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.209753 0.506472 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTGCTTTGATTTTTTTTCC 26 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.259.8 chr1 - 1210 7 full-splice_match AGMAT ENST00000375826.4 3095 7 28 1857 28 -1857 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 34 9.094301 0.958769 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGAAAACTTTCTGCTGAAA 26 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 34 NA PB.260.2 chr1 + 2124 9 novel_in_catalog FBLIM1 novel 3314 9 NA NA -27 29 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.209753 0.506472 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTGGTGGCTCATGCCTGT 3 TRUE NA NA AAAAAG -16 NA NA NA 12 NA PB.263.1 chr1 + 2772 11 incomplete-splice_match SPEN ENST00000375759.8 12385 15 -54 11859 -54 40 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAATGAAAAGACAGATA 85 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.263.2 chr1 + 3977 11 novel_in_catalog SPEN novel 12385 15 NA NA 0 40 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAATGAAAAGACAGATA -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.263.3 chr1 + 3878 11 novel_in_catalog SPEN novel 12385 15 NA NA 99 40 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAATGAAAAGACAGATA -22 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.263.4 chr1 + 1127 2 incomplete-splice_match SPEN ENST00000375759.8 12385 15 107 66851 107 -3106 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AACAAAAAATCTGGCAGACC -14 TRUE NA NA CATAAA -23 NA NA NA 2 NA PB.263.7 chr1 + 2125 10 novel_in_catalog SPEN novel 12385 15 NA NA 116 40 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAATGAAAAGACAGATA -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.263.8 chr1 + 4728 11 incomplete-splice_match SPEN ENST00000375759.8 12385 15 118 9731 118 2168 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAGAAGAAAATTAGGAC -3 TRUE NA NA AAGAAA -42 NA NA NA 2 NA PB.263.9 chr1 + 1486 5 incomplete-splice_match SPEN ENST00000375759.8 12385 15 118 29155 118 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 GTAAGACACAAGCAAGCTGA -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.263.10 chr1 + 2599 11 incomplete-splice_match SPEN ENST00000375759.8 12385 15 119 11859 119 40 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 26 6.954466 0.842264 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAATGAAAAGACAGATA -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 26 NA PB.263.12 chr1 + 2727 11 incomplete-splice_match SPEN ENST00000375759.8 12385 15 152 11698 152 201 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAGAAAATGAGCGAGAGCAA 31 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.263.13 chr1 + 2573 10 novel_in_catalog SPEN novel 891 7 NA NA 345 111 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 GGAAGGAAAAAGTGGAAAAG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.263.14 chr1 + 1954 9 incomplete-splice_match SPEN ENST00000673875.1 3123 12 40106 -40 -375 40 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAATGAAAAGACAGATA 2033 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.263.15 chr1 + 1669 9 incomplete-splice_match SPEN ENST00000673875.1 3123 12 40391 -40 -90 40 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAATGAAAAGACAGATA 2318 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.263.16 chr1 + 1551 9 novel_not_in_catalog SPEN novel 3123 12 NA NA 9957 40 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAATGAAAAGACAGATA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.263.17 chr1 + 1297 7 incomplete-splice_match SPEN ENST00000673875.1 3123 12 75024 -40 -27464 40 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAATGAAAAGACAGATA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.263.19 chr1 + 999 6 incomplete-splice_match SPEN ENST00000673875.1 3123 12 80148 -40 -22340 40 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAATGAAAAGACAGATA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.264.1 chr1 - 2718 16 full-splice_match ZBTB17 ENST00000375743.9 2720 16 0 2 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 38 10.164219 1.007074 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCTGCCTATAGGTCCCT -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 38 NA PB.264.2 chr1 - 2618 16 full-splice_match ZBTB17 ENST00000375743.9 2720 16 100 2 78 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCTGCCTATAGGTCCCT 118 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.264.3 chr1 - 2526 15 novel_in_catalog ZBTB17 novel 2770 16 NA NA -12 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCTGCCTATAGGTCCCT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.264.4 chr1 - 2300 13 incomplete-splice_match ZBTB17 ENST00000375743.9 2720 16 28983 2 -13 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCTGCCTATAGGTCCCT 5785 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.264.5 chr1 - 1968 11 incomplete-splice_match ZBTB17 ENST00000537142.5 2511 15 30246 0 251 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCTGCCTATAGGTCCCT 7070 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.264.6 chr1 - 1754 10 incomplete-splice_match ZBTB17 ENST00000537142.5 2511 15 30972 0 -679 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCTGCCTATAGGTCCCT 7796 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.264.7 chr1 - 1585 9 incomplete-splice_match ZBTB17 ENST00000537142.5 2511 15 31238 0 -413 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCTGCCTATAGGTCCCT 8062 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.264.8 chr1 - 1000 6 incomplete-splice_match ZBTB17 ENST00000537142.5 2511 15 32415 0 262 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCTGCCTATAGGTCCCT 9239 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.264.9 chr1 - 2738 16 full-splice_match ZBTB17 ENST00000375733.6 2770 16 31 1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAATGCTGCCTATAGGTCCC -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.265.2 chr1 - 2172 3 full-splice_match HSPB7 ENST00000487046.1 844 3 16 -1344 -14 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTCTGGAGGCCGCCTGCC 2413 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.265.4 chr1 - 2142 3 full-splice_match HSPB7 ENST00000311890.14 2144 3 0 2 0 -2 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 25 6.686986 0.825230 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GACTTCTGGAGGCCGCCTGC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 25 NA PB.265.6 chr1 - 1305 3 full-splice_match HSPB7 ENST00000311890.14 2144 3 -40 879 -10 466 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATGAAACTCCTGCCGTCCTG 2387 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.266.1 chr1 - 1692 7 full-splice_match FAM131C ENST00000375662.5 1720 7 27 1 8 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGACCTTGGCCTGGTCTCT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.266.2 chr1 - 1368 5 incomplete-splice_match FAM131C ENST00000375662.5 1720 7 11121 1 11102 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGACCTTGGCCTGGTCTCT 2385 FALSE NA NA AAAACA -39 NA NA NA 2 NA PB.267.1 chr1 + 926 2 full-splice_match SRARP ENST00000329454.2 3039 2 0 2113 0 -2113 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATGAATGCTCTGCAGGAACT 0 TRUE NA NA AATAAA -42 NA NA NA 2 NA PB.269.1 chr1 - 3877 16 novel_in_catalog EPHA2 novel 3946 17 NA NA 0 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCTTGGCTTTCAGTCTTGG 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.269.2 chr1 - 3603 15 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 7074 1 -2545 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCTTGGCTTTCAGTCTTGG 7075 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.269.3 chr1 - 2760 13 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 17953 1 -4554 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCTTGGCTTTCAGTCTTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.269.4 chr1 - 2285 11 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 20975 1 -1532 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCTTGGCTTTCAGTCTTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.269.5 chr1 - 2026 8 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 22507 1 0 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCTTGGCTTTCAGTCTTGG NA FALSE NA NA GGGGCT -16 NA NA NA 7 NA PB.269.6 chr1 - 1922 7 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 22723 1 216 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCTTGGCTTTCAGTCTTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.269.7 chr1 - 2514 13 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 18198 2 -4309 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GATCTTGGCTTTCAGTCTTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.269.8 chr1 - 1264 3 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 25718 2 3211 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GATCTTGGCTTTCAGTCTTG 40 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.269.9 chr1 - 3920 17 novel_not_in_catalog EPHA2 novel 3946 17 NA NA -2 -7 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACCGATCTTGGCTTTCAG -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.269.10 chr1 - 3939 17 full-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 0 7 0 -7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.012192 0.603382 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACCGATCTTGGCTTTCAG 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.269.11 chr1 - 3774 17 novel_not_in_catalog EPHA2 novel 3946 17 NA NA 1001 -7 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACCGATCTTGGCTTTCAG -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.269.12 chr1 - 2376 11 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 20878 7 -1629 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACCGATCTTGGCTTTCAG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.269.13 chr1 - 1729 6 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 23650 7 1143 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACCGATCTTGGCTTTCAG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.269.14 chr1 - 1604 5 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 23879 7 1372 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACCGATCTTGGCTTTCAG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.269.15 chr1 - 1414 4 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 24262 7 1755 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACCGATCTTGGCTTTCAG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.269.16 chr1 - 1134 2 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 26479 7 3972 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACCGATCTTGGCTTTCAG 801 FALSE NA NA GGGGCT -21 NA NA NA 2 NA PB.269.17 chr1 - 1000 2 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 26613 7 4106 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACCGATCTTGGCTTTCAG 935 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.269.18 chr1 - 4147 17 novel_not_in_catalog EPHA2 novel 3946 17 NA NA -66 -8 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAAACCGATCTTGGCTTTCA NA FALSE NA NA TTTAAA -36 NA NA NA 2 NA PB.270.1 chr1 - 2190 10 incomplete-splice_match ARHGEF19 ENST00000270747.8 3322 16 6126 1 0 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTTGTTTCCTGTGGCTTCT -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.270.2 chr1 - 2027 8 novel_in_catalog ARHGEF19 novel 3322 16 NA NA -25 -250 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GCTTGGAGTCTGTGATCCAT 6071 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.270.3 chr1 - 1958 10 incomplete-splice_match ARHGEF19 ENST00000270747.8 3322 16 6109 250 0 -250 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.617068 0.749510 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GCTTGGAGTCTGTGATCCAT 6096 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 21 NA PB.270.4 chr1 - 1840 11 incomplete-splice_match ARHGEF19 ENST00000270747.8 3322 16 5620 250 -21 -250 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GCTTGGAGTCTGTGATCCAT 5607 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.270.5 chr1 - 1303 2 incomplete-splice_match ARHGEF19 ENST00000478117.5 2035 11 7200 250 6715 -250 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GCTTGGAGTCTGTGATCCAT 7796 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.270.6 chr1 - 1295 7 incomplete-splice_match ARHGEF19 ENST00000270747.8 3322 16 7240 253 1114 -253 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTTGCTTGGAGTCTGTGATC 7227 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.271.2 chr1 - 976 2 full-splice_match ANO7L1 ENST00000475369.2 998 2 21 1 21 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTGCCACCTCTCCACGGCC 9530 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.272.2 chr1 - 1439 4 full-splice_match CPLANE2 ENST00000434014.1 336 4 -510 -593 14 4 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAGACGTGTTCGTTCTCAC 11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.272.3 chr1 - 1561 5 full-splice_match CPLANE2 ENST00000375599.8 1574 5 10 3 10 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAACTCCAGAGACGTGTTCG 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.275.1 chr1 + 1725 4 full-splice_match SZRD1 ENST00000401088.9 3480 4 -30 1785 -13 954 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 77 20.595917 1.313781 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAAGAACAGCTTTGCTTT 45 FALSE NA NA AATAAA -6 NA NA NA 77 NA PB.275.2 chr1 + 902 3 full-splice_match SZRD1 ENST00000492354.1 3401 3 -23 2522 0 214 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 33 8.826821 0.945804 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATTTTTGTTTGTTTATACA 3 TRUE NA NA AAAAAG -42 NA NA NA 33 NA PB.275.3 chr1 + 3487 4 full-splice_match SZRD1 ENST00000401088.9 3480 4 -8 1 -1 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 98 26.212986 1.418517 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGATCTTTGTCCTCATTTCA -5 TRUE NA NA TATAAA -32 NA NA NA 98 NA PB.275.4 chr1 + 1675 3 full-splice_match SZRD1 ENST00000401089.3 3447 3 9 1763 -1 976 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 235 62.857670 1.798358 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGATTGATGACAGACTGG -5 TRUE NA NA AATAAA -28 NA NA NA 235 NA PB.275.6 chr1 + 3437 3 full-splice_match SZRD1 ENST00000401089.3 3447 3 9 1 -1 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 301 80.511314 1.905857 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGATCTTTGTCCTCATTTCA -5 TRUE NA NA TATAAA -32 NA NA NA 301 NA PB.275.8 chr1 + 1522 4 novel_not_in_catalog SZRD1 novel 3401 3 NA NA -1 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCAGATCTTTGTCCTCATTT -5 TRUE NA NA TATAAA -30 NA NA NA 2 NA PB.275.9 chr1 + 935 4 full-splice_match SZRD1 ENST00000401088.9 3480 4 -8 2553 -1 186 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.814630 0.682563 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAATATCCTTTCTTTTTTT -5 TRUE NA NA AAAAAG -14 NA NA NA 18 NA PB.275.10 chr1 + 3510 4 novel_not_in_catalog SZRD1 novel 549 5 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGATCTTTGTCCTCATTTCA -4 TRUE NA NA TATAAA -32 NA NA NA 2 NA PB.275.12 chr1 + 1779 5 novel_not_in_catalog SZRD1 novel 549 5 NA NA -1 954 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAAGAACAGCTTTGCTTT 2 TRUE NA NA AATAAA -6 NA NA NA 2 NA PB.275.14 chr1 + 3360 2 incomplete-splice_match SZRD1 ENST00000492354.1 3401 3 25965 -2 25519 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGATCTTTGTCCTCATTTCA NA FALSE NA NA TATAAA -32 NA NA NA 5 NA PB.275.15 chr1 + 1533 2 incomplete-splice_match SZRD1 ENST00000472461.1 843 4 25562 -1087 25562 954 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAAGAACAGCTTTGCTTT NA FALSE NA NA AATAAA -6 NA NA NA 4 NA PB.275.16 chr1 + 1359 2 incomplete-splice_match SZRD1 ENST00000472461.1 843 4 25752 -1103 25752 970 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 CTTTGCAAAGATTGATGACA 118 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.276.2 chr1 - 2528 11 novel_not_in_catalog FBXO42 novel 6227 10 NA NA 17 428 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTCCTTTTCTGTGGCTTTTA -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.276.3 chr1 - 2388 10 full-splice_match FBXO42 ENST00000375592.8 6227 10 16 3823 16 419 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 28 7.489425 0.874448 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAAACCCCTTTCCTTTTCTG -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 28 NA PB.276.4 chr1 - 1668 6 incomplete-splice_match FBXO42 ENST00000375592.8 6227 10 95720 3815 -3167 427 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TTTCCTTTTCTGTGGCTTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.276.5 chr1 - 1769 7 incomplete-splice_match FBXO42 ENST00000375592.8 6227 10 57595 3816 20482 426 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTTCCTTTTCTGTGGCTTT NA FALSE NA NA AATACA -3 NA NA NA 2 NA PB.279.2 chr1 + 3068 8 novel_in_catalog NECAP2 novel 1787 9 NA NA -8 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATTGTATGTGAAAGATGAAT -16 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.279.3 chr1 + 2027 8 full-splice_match NECAP2 ENST00000337132.10 2018 8 -11 2 -8 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 316 84.523506 1.926978 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 CATTGTATGTGAAAGATGAA -16 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 316 NA PB.279.4 chr1 + 1007 8 full-splice_match NECAP2 ENST00000337132.10 2018 8 0 1011 0 -6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACACTGTTTCCTGGGATTCA -5 TRUE NA NA AGTAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.279.6 chr1 + 2140 9 novel_not_in_catalog NECAP2 novel 1787 9 NA NA -2 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATTGTATGTGAAAGATGAAT 5 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.279.7 chr1 + 1137 8 full-splice_match NECAP2 ENST00000337132.10 2018 8 18 863 0 142 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGAAGAGGTTGAGTTTG 13 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.279.8 chr1 + 1920 7 full-splice_match NECAP2 ENST00000443980.6 1929 7 9 0 2 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.547151 0.657739 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATTGTATGTGAAAGATGAAT 16 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 17 NA PB.279.9 chr1 + 1818 7 novel_in_catalog NECAP2 novel 1787 9 NA NA 2 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATTGTATGTGAAAGATGAAT 16 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.279.10 chr1 + 1888 7 incomplete-splice_match NECAP2 ENST00000492095.5 1787 9 2888 0 2859 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATTGTATGTGAAAGATGAAT 2902 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 8 NA PB.279.11 chr1 + 1795 6 incomplete-splice_match NECAP2 ENST00000492095.5 1787 9 7123 -5 7094 4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATGTGAAAGATGAATGTGTT 7137 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 5 NA PB.279.12 chr1 + 1714 5 incomplete-splice_match NECAP2 ENST00000443980.6 1929 7 7130 0 7094 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATTGTATGTGAAAGATGAAT 7137 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.279.13 chr1 + 1696 6 incomplete-splice_match NECAP2 ENST00000492095.5 1787 9 7217 0 7188 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.942274 0.468683 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATTGTATGTGAAAGATGAAT 7231 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 11 NA PB.279.14 chr1 + 1588 4 incomplete-splice_match NECAP2 ENST00000492095.5 1787 9 8361 0 -6417 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATTGTATGTGAAAGATGAAT 8375 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 6 NA PB.281.3 chr1 - 3980 25 novel_in_catalog NBPF1 novel 5932 29 NA NA 12 -2326 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GTGAGTACCTTTCTATGAAG 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.281.8 chr1 - 741 5 novel_in_catalog NBPF1 novel 488 4 NA NA 10 -91 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATGACACAGAATGTCAGGTC 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.281.12 chr1 - 2098 3 novel_not_in_catalog NBPF1 novel 5932 29 NA NA 12 -2506 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATCTCCATGTCCAGTATTTT 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.281.13 chr1 - 1221 3 novel_not_in_catalog NBPF1 novel 5932 29 NA NA 10 2642 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AACAATGGGGAAAAAAAGCT 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.281.14 chr1 - 1036 3 novel_not_in_catalog NBPF1 novel 5932 29 NA NA 7 2482 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAATAAAAAACTTGTATGC 31 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.281.15 chr1 - 4209 3 novel_not_in_catalog NBPF1 novel 2752 3 NA NA 10 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AACATCTAAATACATGTTGT 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.281.16 chr1 - 2702 3 full-splice_match NBPF1 ENST00000599069.5 2752 3 35 15 7 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TAACATCTAAATACATGTTG 31 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.281.17 chr1 - 2086 1 full-splice_match NBPF1 ENST00000599908.1 3447 1 1355 6 1355 -6 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 TCAAGTAACATCTAAATACA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.281.19 chr1 - 2548 3 novel_not_in_catalog NBPF1 novel 2752 3 NA NA 12 -1659 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTCTGCTTCTGTCTGTTA 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.281.20 chr1 - 2781 3 full-splice_match NBPF1 ENST00000449853.2 2755 3 -30 4 -2 -4 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATAAGTCATTTTCTGGACAT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.281.21 chr1 - 2622 3 full-splice_match NBPF1 ENST00000449853.2 2755 3 128 5 81 -5 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TATAAGTCATTTTCTGGACA 152 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.281.26 chr1 - 2152 3 full-splice_match NBPF1 ENST00000449853.2 2755 3 -8 611 -8 -611 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.547151 0.657739 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTTCTGTGCAGGATTTTGA 16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.282.1 chr1 + 1114 1 full-splice_match ENSG00000261135 ENST00000562878.1 1110 1 -5 1 -5 -1 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA NA NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATCTGCTGACTCATCTTTGA NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 5 NA PB.283.2 chr1 - 2793 14 novel_in_catalog CROCCP2 novel 2575 13 NA NA -9 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTATGTCAGTGTTCTCCT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.283.3 chr1 - 2586 12 novel_in_catalog CROCCP2 novel 2575 13 NA NA -18 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTATGTCAGTGTTCTCCT -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.283.4 chr1 - 1782 2 incomplete-splice_match CROCCP2 ENST00000639481.1 1296 4 5606 5 5606 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTATGTCAGTGTTCTCCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.283.5 chr1 - 1303 4 incomplete-splice_match CROCCP2 ENST00000639456.1 2575 13 17463 -15 -837 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTATGTCAGTGTTCTCCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.283.6 chr1 - 919 2 incomplete-splice_match CROCCP2 ENST00000639481.1 1296 4 6469 5 6469 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTATGTCAGTGTTCTCCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.283.7 chr1 - 2999 14 novel_in_catalog CROCCP2 novel 2575 13 NA NA -9 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACTATGTCAGTGTTCTCC -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.283.10 chr1 - 1240 3 incomplete-splice_match CROCCP2 ENST00000639481.1 1296 4 395 8 395 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGTAACTATGTCAGTGTTCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.283.11 chr1 - 1040 3 novel_in_catalog CROCCP2 novel 2773 18 NA NA 2495 7 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAGTGTAACTATGTCAGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.284.1 chr1 - 963 1 full-splice_match ENSG00000238142 ENST00000692736.1 964 1 0 1 0 1 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACGTTGGTTTTATCATTTTA 166 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.284.2 chr1 - 1140 1 full-splice_match ENSG00000238142 ENST00000685891.1 1145 1 -2 7 -2 2 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACTTACGTTGGTTTTATC -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.285.1 chr1 + 2600 15 novel_not_in_catalog MST1P2 novel 2291 18 NA NA -24 52 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTTCACCAAGGACTTTCTT -5 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.285.2 chr1 + 3159 10 novel_not_in_catalog MST1P2 novel 2291 18 NA NA -23 130 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTGCAGTTTGTTTTCATGG -4 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.285.3 chr1 + 2486 13 novel_not_in_catalog MST1P2 novel 2291 18 NA NA -23 57 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACCAAGGACTTTCTTAAATG -4 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 4 NA PB.285.4 chr1 + 2689 12 novel_not_in_catalog MST1P2 novel 2291 18 NA NA -20 57 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACCAAGGACTTTCTTAAATG -1 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.285.5 chr1 + 3064 11 novel_not_in_catalog MST1P2 novel 2291 18 NA NA -17 129 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAGTGCAGTTTGTTTTCATG 2 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 7 NA PB.285.6 chr1 + 2691 13 novel_not_in_catalog MST1P2 novel 2291 18 NA NA -19 57 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACCAAGGACTTTCTTAAATG 0 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 5 NA PB.285.7 chr1 + 2489 14 novel_not_in_catalog MST1P2 novel 2291 18 NA NA -19 57 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACCAAGGACTTTCTTAAATG 0 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 5 NA PB.285.8 chr1 + 1778 7 novel_not_in_catalog MST1P2 novel 2291 18 NA NA 2161 57 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACCAAGGACTTTCTTAAATG 87 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.285.9 chr1 + 2073 5 novel_in_catalog MST1P2 novel 2291 18 NA NA 2338 135 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTTTGTTTTCATGGTCTTA 264 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.285.10 chr1 + 1521 8 novel_in_catalog MST1P2 novel 2291 18 NA NA 2423 55 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TCACCAAGGACTTTCTTAAA 349 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.285.11 chr1 + 1382 6 novel_in_catalog MST1P2 novel 2291 18 NA NA 2863 57 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACCAAGGACTTTCTTAAATG 789 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.285.12 chr1 + 1052 4 novel_in_catalog MST1P2 novel 2291 18 NA NA 3372 57 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACCAAGGACTTTCTTAAATG 1298 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 4 NA PB.285.13 chr1 + 1001 4 novel_in_catalog MST1P2 novel 2291 18 NA NA 3495 129 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAGTGCAGTTTGTTTTCATG 1421 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.288.1 chr1 - 2075 6 novel_in_catalog MFAP2 novel 1045 9 NA NA 0 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGATCAAGTCACTTTTT 14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.288.2 chr1 - 1913 7 novel_in_catalog MFAP2 novel 1045 9 NA NA 0 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGATCAAGTCACTTTTT 14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.288.3 chr1 - 1827 8 novel_in_catalog MFAP2 novel 1045 9 NA NA -4 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGATCAAGTCACTTTTT -2 TRUE NA NA GGGGCT -8 NA NA NA 4 NA PB.288.4 chr1 - 1156 8 novel_in_catalog MFAP2 novel 1045 9 NA NA -1 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGATCAAGTCACTTTTT 1 TRUE NA NA GGGGCT -5 NA NA NA 4 NA PB.288.5 chr1 - 1091 9 full-splice_match MFAP2 ENST00000375535.4 1045 9 -50 4 -38 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 411 109.934052 2.041132 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGATCAAGTCACTTTTT 938 FALSE NA NA GGGGCT -42 NA NA NA 411 NA PB.288.6 chr1 - 1081 9 novel_not_in_catalog MFAP2 novel 1045 9 NA NA -955 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGATCAAGTCACTTTTT 21 TRUE NA NA AAGAAA -43 NA NA NA 10 NA PB.288.7 chr1 - 993 8 novel_in_catalog MFAP2 novel 1045 9 NA NA -30 -4 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGATCAAGTCACTTTTT 946 FALSE NA NA GGGGCT -34 NA NA NA 3 NA PB.288.8 chr1 - 954 8 novel_in_catalog MFAP2 novel 1045 9 NA NA 0 -4 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGATCAAGTCACTTTTT 14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.288.9 chr1 - 1013 8 novel_in_catalog MFAP2 novel 1045 9 NA NA -38 -4 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGATCAAGTCACTTTTT 938 FALSE NA NA GGGGCT -42 NA NA NA 3 NA PB.289.1 chr1 - 3989 29 novel_in_catalog ATP13A2 novel 3996 29 NA NA -20 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA -20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.289.2 chr1 - 4012 29 full-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 -16 0 -16 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.289.3 chr1 - 3980 29 full-splice_match ATP13A2 ENST00000452699.5 3981 29 1 0 1 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.289.4 chr1 - 3508 26 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 6866 0 10 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA 6911 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.289.5 chr1 - 3144 22 novel_in_catalog ATP13A2 novel 3996 29 NA NA -1256 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA 9870 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.289.6 chr1 - 2894 19 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 11791 0 154 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.289.8 chr1 - 2664 18 novel_in_catalog ATP13A2 novel 3996 29 NA NA 214 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.289.9 chr1 - 2476 17 novel_in_catalog ATP13A2 novel 3996 29 NA NA -360 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.289.10 chr1 - 2088 14 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 18269 0 -1801 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.289.11 chr1 - 1557 9 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 21639 0 -286 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.289.12 chr1 - 1396 8 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 21923 0 -2 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.289.13 chr1 - 1265 7 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 22170 0 245 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.289.14 chr1 - 1096 6 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 23555 0 1630 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.289.15 chr1 - 3172 22 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 9823 1 -1258 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTCTGCTGTGCCTGTCTTGT 9868 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.289.16 chr1 - 2555 17 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 15487 1 -158 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTCTGCTGTGCCTGTCTTGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.289.17 chr1 - 1747 11 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 19852 1 -218 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTCTGCTGTGCCTGTCTTGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.290.1 chr1 - 2264 7 novel_in_catalog SDHB novel 1015 8 NA NA -20 -13 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAGAACCTG 90 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.290.2 chr1 - 1098 8 full-splice_match SDHB ENST00000375499.8 1015 8 -96 13 -96 -13 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 55 14.711370 1.167653 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAGAACCTG 14 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 55 NA PB.290.3 chr1 - 1022 8 full-splice_match SDHB ENST00000375499.8 1015 8 -20 13 -20 -13 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 869 232.439636 2.366310 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAGAACCTG 90 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 869 NA PB.290.4 chr1 - 960 8 novel_in_catalog SDHB novel 1015 8 NA NA -12 -13 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAGAACCTG -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.290.5 chr1 - 920 7 incomplete-splice_match SDHB ENST00000375499.8 1015 8 9141 13 -14 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAGAACCTG 9251 FALSE NA NA AATACA -6 NA NA NA 5 NA PB.290.6 chr1 - 753 6 incomplete-splice_match SDHB ENST00000375499.8 1015 8 20923 13 -9949 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAGAACCTG NA FALSE NA NA ATTAAA -39 NA NA NA 4 NA PB.291.1 chr1 - 2875 5 novel_not_in_catalog PADI2 novel 4361 16 NA NA -223 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATATGGCTGTTGGTGTGATG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.291.2 chr1 - 1813 5 novel_not_in_catalog PADI2 novel 4361 16 NA NA -233 -48 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATTTTGAAGAACCGATTTAT NA FALSE NA NA AATATA -5 NA NA NA 2 NA PB.292.1 chr1 + 2440 11 incomplete-splice_match CROCC ENST00000375541.10 6660 37 38920 7 -5177 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TAAAAAAGTTTGTACAGCTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.292.2 chr1 + 1774 8 novel_in_catalog CROCC novel 6660 37 NA NA -294 -7 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TAAAAAAGTTTGTACAGCTG 4856 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.292.3 chr1 + 1926 9 novel_in_catalog CROCC novel 6660 37 NA NA -253 -6 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAAAGTTTGTACAGCTGT 4897 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.292.4 chr1 + 1673 7 novel_in_catalog CROCC novel 6660 37 NA NA 407 7 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGCTGTGTCCCTTTTCTAG 5557 FALSE NA NA AAAAAG -7 NA NA NA 3 NA PB.292.5 chr1 + 1294 5 novel_in_catalog CROCC novel 6660 37 NA NA -656 -6 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAAAGTTTGTACAGCTGT 8251 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.293.2 chr1 + 2737 13 incomplete-splice_match ARHGEF10L ENST00000375408.7 3685 20 14003 -6 -1938 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTGAGGTTTTGTTGTGGTT NA FALSE NA NA AATAAA -26 NA NA NA 2 NA PB.293.3 chr1 + 1933 7 incomplete-splice_match ARHGEF10L ENST00000375408.7 3685 20 36320 1 14883 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GACTTGGATTGAGGTTTTGT NA FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.293.4 chr1 + 1715 6 incomplete-splice_match ARHGEF10L ENST00000375408.7 3685 20 37694 1 16257 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GACTTGGATTGAGGTTTTGT NA FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 5 NA PB.293.5 chr1 + 1094 2 full-splice_match ARHGEF10L ENST00000495593.1 2261 2 1166 1 1166 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GATTGAGGTTTTGTTGTGGT 6164 FALSE NA NA AATAAA -25 NA NA NA 3 NA PB.295.1 chr1 + 1837 3 full-splice_match ACTL8 ENST00000375406.2 1841 3 2 2 2 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 37 9.896740 0.995492 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGGCTCCTGTGATGG -14 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 37 NA PB.295.2 chr1 + 1823 3 novel_not_in_catalog ACTL8 novel 1670 2 NA NA 3998 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGGCTCCTGTGATGG 1 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 10 NA PB.295.3 chr1 + 1443 2 full-splice_match ACTL8 ENST00000617065.1 1670 2 227 0 227 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGGCTCCTGTGATGG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.296.1 chr1 - 3823 12 novel_in_catalog RCC2 novel 4040 13 NA NA -74 2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGATTTTGCATTTCTTTTTC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.296.2 chr1 - 3405 10 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 14108 0 12992 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.012192 0.603382 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGGATTTTGCATTTCTTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.296.4 chr1 - 3005 6 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 23030 36 -7601 -36 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.617068 0.749510 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAACATTTTAAATAAACAAC 8892 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 21 NA PB.296.5 chr1 - 2693 4 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 26498 0 -4133 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGGATTTTGCATTTCTTTT NA FALSE NA NA AAAACA -34 NA NA NA 3 NA PB.296.6 chr1 - 2787 5 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 26046 0 -4585 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.012192 0.603382 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGGATTTTGCATTTCTTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.296.7 chr1 - 2505 2 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 29634 0 -997 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.279671 0.631410 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGGATTTTGCATTTCTTTT 2231 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.296.14 chr1 - 3476 10 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 14036 1 12920 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTTGGATTTTGCATTTCTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.296.15 chr1 - 3209 8 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 17420 1 -13211 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTTGGATTTTGCATTTCTTT 3282 FALSE NA NA AAGAAA -7 NA NA NA 10 NA PB.296.16 chr1 - 2612 4 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 26578 1 -4053 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.617068 0.749510 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTTGGATTTTGCATTTCTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 21 NA PB.296.20 chr1 - 3646 12 full-splice_match RCC2 ENST00000375433.3 2030 12 298 -1914 298 -2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TCTTGGATTTTGCATTTCTT 3214 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.296.23 chr1 - 3771 12 full-splice_match RCC2 ENST00000375433.3 2030 12 148 -1889 148 -27 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.279671 0.631410 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAATAAACAACAACATTGTC 3064 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.296.24 chr1 - 3141 7 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 18860 3 -11771 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTCTTGGATTTTGCATTTCT 4722 FALSE NA NA AAGAAA -24 NA NA NA 10 NA PB.296.28 chr1 - 2891 6 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 23165 15 -7466 -15 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 20 5.349589 0.728320 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACATTGTCTACTGTCTTGGA 9027 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 20 NA PB.296.29 chr1 - 3587 11 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 10478 27 9362 -27 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAATAAACAACAACATTGTC 9363 FALSE NA NA AAAAAG -25 NA NA NA 5 NA PB.296.30 chr1 - 2531 3 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 27511 27 -3120 -27 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAATAAACAACAACATTGTC 108 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.296.34 chr1 - 3300 9 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 16888 29 -13743 -29 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 TTAAATAAACAACAACATTG 2750 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.296.36 chr1 - 1680 3 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375433.3 2030 12 26366 -1009 -3149 172 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATGATGTAGTTGTTGT 79 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.299.1 chr1 - 3353 15 full-splice_match ALDH4A1 ENST00000375341.8 3139 15 -216 2 -47 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATCACAGTGGTGGATGGTC -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.299.2 chr1 - 3136 15 full-splice_match ALDH4A1 ENST00000375341.8 3139 15 0 3 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 35 9.361781 0.971358 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAATCACAGTGGTGGATGGT -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 35 NA PB.299.3 chr1 - 2128 16 full-splice_match ALDH4A1 ENST00000290597.9 2124 16 -6 2 -4 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATCACAGTGGTGGATGGTC -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.299.4 chr1 - 1715 3 incomplete-splice_match ALDH4A1 ENST00000538309.5 1940 15 15440 -1301 10168 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATCACAGTGGTGGATGGTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.299.9 chr1 - 2926 13 incomplete-splice_match ALDH4A1 ENST00000538309.5 1940 15 1459 -1300 1459 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAATCACAGTGGTGGATGGT 1331 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.299.10 chr1 - 2654 10 incomplete-splice_match ALDH4A1 ENST00000538309.5 1940 15 7460 -1300 2188 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAATCACAGTGGTGGATGGT 7332 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.299.11 chr1 - 2521 10 incomplete-splice_match ALDH4A1 ENST00000538309.5 1940 15 7593 -1300 2321 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAATCACAGTGGTGGATGGT 7465 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.299.12 chr1 - 2011 6 incomplete-splice_match ALDH4A1 ENST00000538309.5 1940 15 13432 -1300 8160 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAATCACAGTGGTGGATGGT 8572 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.299.13 chr1 - 1545 2 incomplete-splice_match ALDH4A1 ENST00000538309.5 1940 15 16409 -1300 11137 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAATCACAGTGGTGGATGGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.299.14 chr1 - 880 8 novel_in_catalog ALDH4A1 novel 844 6 NA NA -59 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAGATTTGGATGTAGTCTC 151 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.299.15 chr1 - 1268 7 incomplete-splice_match ALDH4A1 ENST00000375341.8 3139 15 0 11136 0 -6 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AGAGAAAGATTTGGATGTAG -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.303.1 chr1 - 4522 30 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 96459 4 -1120 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGGAAGGTGTTGCCTGC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.303.2 chr1 - 5182 34 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 92911 4 1494 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGGAAGGTGTTGCCTGC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.303.3 chr1 - 4038 28 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 99465 4 -243 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGGAAGGTGTTGCCTGC NA FALSE NA NA AATAGA -3 NA NA NA 4 NA PB.303.4 chr1 - 3688 25 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 103377 4 -1973 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGGAAGGTGTTGCCTGC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.303.5 chr1 - 3563 24 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 103612 4 -1738 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGGAAGGTGTTGCCTGC NA FALSE NA NA AATAGA -27 NA NA NA 4 NA PB.303.6 chr1 - 3219 21 full-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 256 0 256 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGGAAGGTGTTGCCTGC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.303.7 chr1 - 2753 18 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 4437 0 -353 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGGAAGGTGTTGCCTGC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.303.8 chr1 - 1779 11 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 11584 0 108 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGGAAGGTGTTGCCTGC 6817 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.303.9 chr1 - 833 4 full-splice_match UBR4 ENST00000375225.7 1533 4 696 4 -238 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGGAAGGTGTTGCCTGC 6350 FALSE NA NA AAGAAA -12 NA NA NA 3 NA PB.303.10 chr1 - 726 4 full-splice_match UBR4 ENST00000375225.7 1533 4 803 4 -131 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGGAAGGTGTTGCCTGC 6457 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.303.11 chr1 - 2642 17 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 5245 1 455 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAGGAAGGTGTTGCCTG 478 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.303.12 chr1 - 2423 15 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 8322 1 -672 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.477233 0.541234 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAGGAAGGTGTTGCCTG 3555 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.303.13 chr1 - 2124 12 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 10776 1 -700 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.814630 0.682563 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAGGAAGGTGTTGCCTG 6009 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.303.14 chr1 - 1170 6 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 18658 1 -4018 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAGGAAGGTGTTGCCTG 1636 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.303.15 chr1 - 1403 8 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 17022 2 5546 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.617068 0.749510 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGAAAAGGAAGGTGTTGCCT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 21 NA PB.303.16 chr1 - 970 5 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 20303 2 -2373 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGAAAAGGAAGGTGTTGCCT 3281 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.303.17 chr1 - 1919 11 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 11441 3 -35 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.942274 0.468683 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TTGAAAAGGAAGGTGTTGCC 6674 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.303.18 chr1 - 3862 26 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 100070 8 362 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATTGAAAAGGAAGGTGTTGC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.303.19 chr1 - 2914 19 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 3326 4 -1464 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATTGAAAAGGAAGGTGTTGC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.303.20 chr1 - 1635 9 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 15959 4 4483 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATTGAAAAGGAAGGTGTTGC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.303.21 chr1 - 920 4 full-splice_match UBR4 ENST00000375225.7 1533 4 605 8 -329 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.209753 0.506472 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATTGAAAAGGAAGGTGTTGC 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.303.22 chr1 - 4844 33 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 94827 9 -2752 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 CATTGAAAAGGAAGGTGTTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.303.23 chr1 - 4382 29 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 97425 9 -154 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 CATTGAAAAGGAAGGTGTTG NA FALSE NA NA AAAAAG -11 NA NA NA 3 NA PB.303.24 chr1 - 1264 7 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 18151 6 -4525 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.209753 0.506472 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ACATTGAAAAGGAAGGTGTT 1129 FALSE NA NA TATAAA -14 NA NA NA 12 NA PB.303.26 chr1 - 2864 21 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 91376 22687 -41 -3102 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACAGGTAGATCATGGCACTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.303.27 chr1 - 1472 12 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 97691 25866 112 6190 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAATGACCATAGGACAGTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.304.1 chr1 + 1934 10 full-splice_match IGSF21 ENST00000251296.4 1892 10 -43 1 -43 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACCTCGGTTTGTGGCTCTGC -2 TRUE NA NA ATTAAA -22 NA NA NA 5 NA PB.305.1 chr1 - 4540 30 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 50140 46719 7929 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 6587 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.305.2 chr1 - 5373 35 novel_in_catalog UBR4 novel 15892 106 NA NA 4259 -16 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 2917 FALSE NA NA AAGAAA -6 NA NA NA 2 NA PB.305.3 chr1 - 4254 28 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 53428 46719 -5138 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 9875 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.305.6 chr1 - 10125 68 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 -6 46719 -6 -16 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA -9 TRUE NA NA GGGGCT -40 NA NA NA 5 NA PB.305.7 chr1 - 3774 25 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 55218 46719 -3348 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 1778 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.305.8 chr1 - 3605 24 novel_not_in_catalog UBR4 novel 15892 106 NA NA -2204 -16 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 2922 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.305.9 chr1 - 3392 23 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 56843 46719 -1723 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 3403 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.305.10 chr1 - 3208 22 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 57851 46719 -715 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 4411 FALSE NA NA AAAAAG -27 NA NA NA 5 NA PB.305.11 chr1 - 3088 21 novel_not_in_catalog UBR4 novel 6175 41 NA NA -706 -16 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 4420 FALSE NA NA AAAAAG -18 NA NA NA 2 NA PB.305.12 chr1 - 3059 21 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 58453 46719 -113 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 5013 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.305.13 chr1 - 2957 21 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 58555 46719 -11 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 5115 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.305.14 chr1 - 2757 20 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 59604 46719 1038 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 6164 FALSE NA NA GGGGCT -10 NA NA NA 4 NA PB.305.15 chr1 - 2626 19 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 61685 46719 -2453 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 8245 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.305.16 chr1 - 2419 17 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 63319 46719 -819 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 9879 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.305.17 chr1 - 2313 17 novel_not_in_catalog UBR4 novel 15892 106 NA NA -716 -16 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 9982 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.305.18 chr1 - 2213 16 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 64417 46719 279 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 7909 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.305.19 chr1 - 2003 14 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 66206 46719 2068 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 9698 FALSE NA NA TTTAAA -8 NA NA NA 5 NA PB.305.20 chr1 - 1902 13 novel_not_in_catalog UBR4 novel 15892 106 NA NA 4365 -16 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA NA FALSE NA NA AAGAAA -23 NA NA NA 2 NA PB.305.21 chr1 - 1825 13 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 68586 46719 4448 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.305.22 chr1 - 1422 10 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000425413.5 2954 21 12566 29 6994 -16 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.744712 0.573418 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.305.23 chr1 - 1236 9 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000425413.5 2954 21 13653 29 8081 -16 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.942274 0.468683 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.305.24 chr1 - 709 5 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000425413.5 2954 21 25209 29 1210 -16 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 4787 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.305.25 chr1 - 1640 12 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 68892 46720 4754 -17 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.209753 0.506472 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 TAAAAAGAGCAAGAAAGAAG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.305.26 chr1 - 991 6 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000425413.5 2954 21 23959 30 -40 -17 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.744712 0.573418 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 TAAAAAGAGCAAGAAAGAAG 3537 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.305.27 chr1 - 2083 15 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 65429 46722 1291 -19 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 ACTAAAAAGAGCAAGAAAGA 8921 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.305.32 chr1 - 2728 17 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 -47 108822 -47 -32408 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AGAAAAAAAAATATGTCTTT 145 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.307.4 chr1 + 960 2 full-splice_match EMC1-AS1 ENST00000437898.2 653 2 49 -356 43 356 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 CACATGGCTGAAGGGAACAA 7 TRUE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.308.1 chr1 - 4221 23 full-splice_match EMC1 ENST00000477853.6 6640 23 -17 2436 1 52 alternative_3end TRUE canonical NA NA NA NA 24 6.419507 0.807502 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAATGACACTGTTTAAGTCC -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 24 NA PB.308.2 chr1 - 2073 6 full-splice_match EMC1 ENST00000691945.1 4156 6 799 1284 554 59 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTGTTTAAGTCCTCTTTTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.308.4 chr1 - 2738 10 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000375208.7 4084 22 18411 -57 -795 57 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACACTGTTTAAGTCCTCTTT 9316 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.308.5 chr1 - 3385 16 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000375208.7 4084 22 11555 -52 601 52 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAATGACACTGTTTAAGTCC 2460 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.308.6 chr1 - 1513 2 full-splice_match EMC1 ENST00000461353.1 2175 2 1511 -849 1511 52 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAATGACACTGTTTAAGTCC NA FALSE NA NA AAAACA -37 NA NA NA 2 NA PB.308.8 chr1 - 4086 23 full-splice_match EMC1 ENST00000477853.6 6640 23 -7 2561 -5 -73 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTCCTTGGTCATAGAGTTGG -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.308.9 chr1 - 1752 5 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000691945.1 4156 6 4731 1416 -452 -73 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTCCTTGGTCATAGAGTTGG NA FALSE NA NA AATAAA -4 NA NA NA 2 NA PB.308.10 chr1 - 1900 6 full-splice_match EMC1 ENST00000691945.1 4156 6 839 1417 594 -74 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTTCCTTGGTCATAGAGTTG NA FALSE NA NA AATGAA -43 NA NA NA 2 NA PB.308.11 chr1 - 2240 13 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000375208.7 4084 22 13405 786 2451 11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CCTTTTGTGTTTCTCAATTT 4310 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.308.12 chr1 - 2449 16 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000375208.7 4084 22 11635 804 681 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAATTGACTTTACTTTGCC 2540 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.308.13 chr1 - 1644 9 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000486405.2 2991 24 18810 -368 -383 10 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCTTTTGTGTTTCTCAATT 9728 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.308.14 chr1 - 3188 22 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000375199.7 5408 23 6533 2071 -809 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTTACTTTGCCTTTTGTG 6553 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.308.15 chr1 - 2573 17 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000375208.7 4084 22 11207 797 253 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTTACTTTGCCTTTTGTG 2112 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.308.16 chr1 - 1890 10 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000486405.2 2991 24 18392 -358 -801 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTTACTTTGCCTTTTGTG 9310 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.308.17 chr1 - 1432 8 full-splice_match EMC1 ENST00000688918.1 4034 8 462 2140 -333 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTTACTTTGCCTTTTGTG 9853 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.308.18 chr1 - 1168 6 full-splice_match EMC1 ENST00000691945.1 4156 6 848 2140 603 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTTACTTTGCCTTTTGTG NA FALSE NA NA AATGAA -34 NA NA NA 6 NA PB.308.19 chr1 - 1054 5 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000691945.1 4156 6 4705 2140 -478 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTTACTTTGCCTTTTGTG NA FALSE NA NA AATAAA -30 NA NA NA 7 NA PB.308.20 chr1 - 939 4 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000691945.1 4156 6 5381 2140 -48 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTTACTTTGCCTTTTGTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.308.21 chr1 - 3367 23 full-splice_match EMC1 ENST00000477853.6 6640 23 -13 3286 5 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 135 36.109726 1.557624 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GACTTTACTTTGCCTTTTGT -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 135 NA PB.308.22 chr1 - 3010 20 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000375208.7 4084 22 7858 798 503 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GACTTTACTTTGCCTTTTGT 7865 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.308.23 chr1 - 1725 10 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000486405.2 2991 24 18556 -357 -637 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GACTTTACTTTGCCTTTTGT 9474 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.308.24 chr1 - 1941 11 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000375208.7 4084 22 16358 799 -2848 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGACTTTACTTTGCCTTTTG 7263 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.308.25 chr1 - 2723 18 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000375208.7 4084 22 10482 803 -472 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATTGACTTTACTTTGCCT 1387 FALSE NA NA ATTAAA -43 NA NA NA 4 NA PB.308.26 chr1 - 2102 12 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000375208.7 4084 22 14304 803 3350 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATTGACTTTACTTTGCCT 5209 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.308.27 chr1 - 1455 8 novel_in_catalog EMC1 novel 4034 8 NA NA -391 -6 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATTGACTTTACTTTGCCT 9795 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.308.28 chr1 - 1301 7 full-splice_match EMC1 ENST00000693007.1 4889 7 1442 2146 89 -6 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATTGACTTTACTTTGCCT NA FALSE NA NA AATAGA -29 NA NA NA 3 NA PB.308.29 chr1 - 3279 23 novel_in_catalog EMC1 novel 5475 23 NA NA 0 -7 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAATTGACTTTACTTTGCC 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.308.30 chr1 - 790 4 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000691945.1 4156 6 5523 2147 94 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAATTGACTTTACTTTGCC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.308.31 chr1 - 2629 17 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000375208.7 4084 22 11135 813 181 -16 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGGCCTGTTTAAATTGACTT 2040 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.309.1 chr1 - 1226 7 full-splice_match AKR7A3 ENST00000361640.5 1215 7 2 -13 2 13 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TAGTCTGTTTGCGTTGCTAT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.311.2 chr1 + 1322 9 novel_not_in_catalog MRTO4 novel 2049 8 NA NA -222 115 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GACACCCTCTCAGTGCCTCT 11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.311.4 chr1 + 1400 8 full-splice_match MRTO4 ENST00000330263.5 2049 8 -215 864 -215 525 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.617068 0.749510 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAAAGAATACA 18 TRUE NA NA AGTAAA -11 NA NA NA 21 NA PB.311.5 chr1 + 1577 8 full-splice_match MRTO4 ENST00000330263.5 2049 8 -214 686 -214 -686 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.744712 0.573418 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGCCACTTGCCTGTGGTCCC 19 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 14 NA PB.311.6 chr1 + 1103 8 full-splice_match MRTO4 ENST00000330263.5 2049 8 -195 1141 -195 248 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CGCGGTGGCTCACGCCTGGA -2 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.311.7 chr1 + 1033 9 novel_not_in_catalog MRTO4 novel 2049 8 NA NA -13 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACAGTGGCCCTCTTTTTTC -22 TRUE NA NA AGTAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.311.8 chr1 + 1365 8 full-splice_match MRTO4 ENST00000330263.5 2049 8 0 684 0 -684 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 70 18.723562 1.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CCACTTGCCTGTGGTCCCCA -9 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 70 NA PB.311.9 chr1 + 1061 8 full-splice_match MRTO4 ENST00000330263.5 2049 8 -7 995 -7 394 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 30 8.024384 0.904412 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGTGCCTGTAGTCCCAGCT -16 TRUE NA NA AATAGA -27 NA NA NA 30 NA PB.311.11 chr1 + 2047 8 full-splice_match MRTO4 ENST00000330263.5 2049 8 0 2 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACAGTGGCCCTCTTTTTTC -9 TRUE NA NA AGTAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.311.12 chr1 + 1185 8 full-splice_match MRTO4 ENST00000330263.5 2049 8 0 864 0 525 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 114 30.492657 1.484195 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAAAGAATACA -9 TRUE NA NA AGTAAA -11 NA NA NA 114 NA PB.311.15 chr1 + 931 8 full-splice_match MRTO4 ENST00000330263.5 2049 8 19 1099 -11 290 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 48 12.839013 1.108532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGGTGGGCAGATCATAAGGT 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 48 NA PB.311.17 chr1 + 1518 8 novel_in_catalog MRTO4 novel 2049 8 NA NA 22 525 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAAAGAATACA 43 FALSE NA NA AGTAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.311.18 chr1 + 1026 6 incomplete-splice_match MRTO4 ENST00000330263.5 2049 8 4184 864 -1723 525 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAAAGAATACA 4175 FALSE NA NA AGTAAA -11 NA NA NA 4 NA PB.311.19 chr1 + 918 5 incomplete-splice_match MRTO4 ENST00000330263.5 2049 8 5304 864 -603 525 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAAAGAATACA 5295 FALSE NA NA AGTAAA -11 NA NA NA 6 NA PB.311.20 chr1 + 1085 5 incomplete-splice_match MRTO4 ENST00000330263.5 2049 8 5320 681 -587 -681 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTTGCCTGTGGTCCCCACTG 5311 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 3 NA PB.312.2 chr1 - 1354 7 full-splice_match AKR7A2 ENST00000235835.8 1360 7 1 5 1 -5 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 406 108.596657 2.035816 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAAACTTGCTTTCTCTGCT -33 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 406 NA PB.312.3 chr1 - 1229 6 novel_in_catalog AKR7A2 novel 1360 7 NA NA -12 -5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAAACTTGCTTTCTCTGCT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.312.4 chr1 - 1183 7 full-splice_match AKR7A2 ENST00000235835.8 1360 7 172 5 -65 -5 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAAACTTGCTTTCTCTGCT 138 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.312.5 chr1 - 1105 7 full-splice_match AKR7A2 ENST00000235835.8 1360 7 250 5 13 -5 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAAACTTGCTTTCTCTGCT 216 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.312.6 chr1 - 1010 6 incomplete-splice_match AKR7A2 ENST00000235835.8 1360 7 3529 5 -110 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAAACTTGCTTTCTCTGCT 3495 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.313.1 chr1 + 1814 9 novel_in_catalog SLC66A1 novel 1805 9 NA NA -44 -4 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGAGACCTGCTTCTGTTGC NA FALSE NA NA AATAAA -30 NA NA NA 2 NA PB.313.2 chr1 + 1842 9 full-splice_match SLC66A1 ENST00000375155.7 1805 9 -38 1 -38 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.884548 0.769713 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGACCTGCTTCTGTTGCTCC NA FALSE NA NA AATAAA -33 NA NA NA 22 NA PB.313.3 chr1 + 1508 9 full-splice_match SLC66A1 ENST00000375155.7 1805 9 -15 312 -15 1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCTCGCACCTGTAATCCTAG -4 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 6 NA PB.313.6 chr1 + 1602 8 novel_in_catalog SLC66A1 novel 1805 9 NA NA -2 -28 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAATAAAAAAGATAAC 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.313.7 chr1 + 2154 8 full-splice_match SLC66A1 ENST00000375153.8 2175 8 20 1 5 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGACCTGCTTCTGTTGCTCC 31 FALSE NA NA AATAAA -33 NA NA NA 4 NA PB.314.1 chr1 + 525 4 full-splice_match MICOS10 ENST00000322753.7 3723 4 11 3187 -1 3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 73 19.525999 1.290613 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTGCATGGCCTTTGTTTCT -20 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 73 NA PB.314.4 chr1 + 3273 3 incomplete-splice_match MICOS10 ENST00000498642.5 669 5 -24 -18 16 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAATAAATTAAACAAAAAGA 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.314.6 chr1 + 630 5 full-splice_match MICOS10 ENST00000481464.5 657 5 3 24 1 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAATAAATTAAACAAAAAGA 32 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.315.1 chr1 - 1326 6 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 106043 -583 6943 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 35 9.361781 0.971358 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGCGCTGGCCTTCTGTGTTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 35 NA PB.315.3 chr1 - 1683 9 full-splice_match CAPZB ENST00000264202.8 1675 9 -10 2 -10 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 1466 392.124878 2.593424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TAGCGCTGGCCTTCTGTGTT 94 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 1466 NA PB.315.4 chr1 - 1066 4 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 127948 -582 -10354 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 38 10.164219 1.007074 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TAGCGCTGGCCTTCTGTGTT -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 38 NA PB.315.5 chr1 - 920 2 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000674299.1 1734 3 1926 -360 1926 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.884548 0.769713 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TAGCGCTGGCCTTCTGTGTT 797 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 22 NA PB.315.6 chr1 - 1796 10 full-splice_match CAPZB ENST00000375142.5 1686 10 -67 -43 -13 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTAGCGCTGGCCTTCTGT 91 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.315.7 chr1 - 1458 7 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 99056 -579 -44 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 34 9.094301 0.958769 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTAGCGCTGGCCTTCTGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 34 NA PB.315.8 chr1 - 1207 5 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 127134 -579 -11168 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 32 8.559342 0.932440 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTAGCGCTGGCCTTCTGT 117 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 32 NA PB.315.13 chr1 - 1109 5 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 127188 -535 -11114 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAGAAAAGAAAAGAA 171 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.315.15 chr1 - 651 3 full-splice_match CAPZB ENST00000674299.1 1734 3 1117 -34 1117 34 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTCCGTGTGTGTTTGGGAGT -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.315.16 chr1 - 1348 9 full-splice_match CAPZB ENST00000264202.8 1675 9 -2 329 -2 33 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 466 124.645424 2.095676 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTCCGTGTGTGTTTGGGAG -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 466 NA PB.315.17 chr1 - 996 6 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 106045 -255 6945 33 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.477233 0.541234 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTCCGTGTGTGTTTGGGAG -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.315.18 chr1 - 1179 8 novel_in_catalog CAPZB novel 1675 9 NA NA -5 32 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATTCCGTGTGTGTTTGGGA -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.315.19 chr1 - 1112 7 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 99077 -254 -23 32 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATTCCGTGTGTGTTTGGGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.315.20 chr1 - 832 5 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 127184 -254 -11118 32 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATTCCGTGTGTGTTTGGGA 167 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.315.21 chr1 - 1465 10 novel_not_in_catalog CAPZB novel 1686 10 NA NA 0 31 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTATTCCGTGTGTGTTTGGG 15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.315.22 chr1 - 1313 9 novel_not_in_catalog CAPZB novel 1675 9 NA NA -32086 6 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAGAGAGAAGAAAAACTGG -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.315.24 chr1 - 1119 9 full-splice_match CAPZB ENST00000264202.8 1675 9 -26 582 -26 2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 179 47.878822 1.680143 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTCCGGCTCCGAGCCTGCTT 78 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 179 NA PB.316.1 chr1 + 2022 4 full-splice_match NBL1 ENST00000375136.8 2024 4 2 0 2 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 94 25.143068 1.400418 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTGTTCTCCTCCTCACTGA -13 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 94 NA PB.316.3 chr1 + 1756 3 incomplete-splice_match NBL1 ENST00000548815.2 1953 4 7534 4 7534 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.942274 0.468683 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTGTTCTCCTCCTCACTGA 79 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 11 NA PB.317.1 chr1 - 2350 10 incomplete-splice_match TMCO4 ENST00000294543.11 2946 16 44149 -26 15660 26 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATACCAAGTGGTTGCCTGGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.317.4 chr1 - 2925 16 full-splice_match TMCO4 ENST00000294543.11 2946 16 0 21 0 -19 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AATAAATAATAATAAGAAGA -20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.317.5 chr1 - 2851 15 novel_in_catalog TMCO4 novel 2946 16 NA NA -5 -19 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AATAAATAATAATAAGAAGA 401 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.317.6 chr1 - 1866 7 incomplete-splice_match TMCO4 ENST00000294543.11 2946 16 54326 21 -7171 -19 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AATAAATAATAATAAGAAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.317.7 chr1 - 1586 5 incomplete-splice_match TMCO4 ENST00000294543.11 2946 16 60012 21 -1485 -19 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AATAAATAATAATAAGAAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.317.8 chr1 - 1462 4 incomplete-splice_match TMCO4 ENST00000489814.5 1722 5 1006 19 1006 -19 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AATAAATAATAATAAGAAGA 488 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.318.1 chr1 - 2003 4 full-splice_match PLA2G2D ENST00000375105.8 2651 4 -68 716 -38 2 alternative_3end5end TRUE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGAATCCTTGTCTCAGGCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.319.1 chr1 + 2368 8 full-splice_match OTUD3 ENST00000375120.4 6515 8 0 4147 0 1854 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACATTTATTTCTTTTTATTT -17 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.321.1 chr1 - 1412 2 full-splice_match CAMK2N1 ENST00000375078.4 2326 2 913 1 -652 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTCCTCTCTTTTCTCTGCT 2057 FALSE NA NA GGGGCT -5 NA NA NA 2 NA PB.322.1 chr1 + 963 2 full-splice_match ENSG00000227066 ENST00000652935.1 1094 2 128 3 128 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAACCTGGTGTCTGAGGGGT 347 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.323.1 chr1 + 968 4 full-splice_match CDA ENST00000375071.4 809 4 -160 1 -149 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATCAAAGCGTGTGTCTTGCT -21 TRUE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 10 NA PB.323.2 chr1 + 807 4 full-splice_match CDA ENST00000375071.4 809 4 1 1 1 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.744712 0.573418 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATCAAAGCGTGTGTCTTGCT 8 TRUE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 14 NA PB.324.2 chr1 - 2401 4 novel_not_in_catalog MUL1 novel 2428 4 NA NA 42 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGTGCTAGCCTGTTGCTTT 19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.324.3 chr1 - 2315 3 novel_in_catalog MUL1 novel 2428 4 NA NA -10 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGTGCTAGCCTGTTGCTTT -33 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.324.4 chr1 - 2426 4 full-splice_match MUL1 ENST00000264198.5 2428 4 0 2 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 205 54.833286 1.739044 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGTGCTAGCCTGTTGCTTT -23 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 205 NA PB.324.5 chr1 - 2271 4 full-splice_match MUL1 ENST00000264198.5 2428 4 155 2 155 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGTGCTAGCCTGTTGCTTT 132 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.324.6 chr1 - 2071 2 incomplete-splice_match MUL1 ENST00000264198.5 2428 4 5982 2 5982 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGTGCTAGCCTGTTGCTTT 5959 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.324.7 chr1 - 1992 2 incomplete-splice_match MUL1 ENST00000264198.5 2428 4 6061 2 6061 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGTGCTAGCCTGTTGCTTT 6038 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.324.12 chr1 - 1484 4 full-splice_match MUL1 ENST00000264198.5 2428 4 10 934 10 -934 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAGCCAGTGATCAGCAGCT -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.325.1 chr1 - 1949 4 novel_not_in_catalog PINK1-AS novel 4443 3 NA NA -769 -5153 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 TAAAAGGGTCCACACAAAAT 8561 FALSE NA NA GATAAA -32 NA NA NA 2 NA PB.325.3 chr1 - 1786 12 novel_not_in_catalog DDOST novel 2126 11 NA NA -4 2407 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACTAGCCTTTACCTTCCTA 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.325.8 chr1 - 1948 11 full-splice_match DDOST ENST00000602624.7 1941 11 -10 3 9 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 239 63.927589 1.805688 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAACTTCACCTGGCCCCGGT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 239 NA PB.325.16 chr1 - 1673 10 incomplete-splice_match DDOST ENST00000602624.7 1941 11 407 66 407 -66 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.814630 0.682563 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAATATAAATAAATAAATAA 561 FALSE NA NA AAGAAA -10 NA NA NA 18 NA PB.325.23 chr1 - 1563 11 full-splice_match DDOST ENST00000602624.7 1941 11 -10 388 9 -388 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 909 243.138824 2.385854 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CTATGTGCAGTCACTCCTCT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 909 NA PB.325.24 chr1 - 1387 10 novel_in_catalog DDOST novel 2126 11 NA NA 1 -405 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAAAGTGGCATTTTTCCTA 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.325.26 chr1 - 1659 11 full-splice_match DDOST ENST00000415136.6 2126 11 46 421 46 -411 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 332 88.803177 1.948429 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AATTGCTAAAAGTGGCATTT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 332 NA PB.325.27 chr1 - 1427 10 novel_in_catalog DDOST novel 2126 11 NA NA -8 -411 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AATTGCTAAAAGTGGCATTT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.325.28 chr1 - 1323 10 incomplete-splice_match DDOST ENST00000602624.7 1941 11 412 411 412 -411 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 25 6.686986 0.825230 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AATTGCTAAAAGTGGCATTT 566 FALSE NA NA AAGAAA -5 NA NA NA 25 NA PB.325.29 chr1 - 1149 8 incomplete-splice_match DDOST ENST00000602624.7 1941 11 5600 411 -2685 -411 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 25 6.686986 0.825230 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AATTGCTAAAAGTGGCATTT 5754 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 25 NA PB.325.30 chr1 - 897 6 incomplete-splice_match DDOST ENST00000602624.7 1941 11 6725 411 -1560 -411 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AATTGCTAAAAGTGGCATTT 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.325.31 chr1 - 735 5 incomplete-splice_match DDOST ENST00000602624.7 1941 11 7129 411 -1156 -411 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AATTGCTAAAAGTGGCATTT 7283 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.325.32 chr1 - 960 6 incomplete-splice_match DDOST ENST00000602624.7 1941 11 6661 412 -1624 -412 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.744712 0.573418 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GAATTGCTAAAAGTGGCATT 6815 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.325.33 chr1 - 1517 9 novel_in_catalog DDOST novel 2126 11 NA NA 5 -413 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TGAATTGCTAAAAGTGGCAT -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.325.34 chr1 - 1452 11 full-splice_match DDOST ENST00000602624.7 1941 11 75 414 75 -414 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.942274 0.468683 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TTGAATTGCTAAAAGTGGCA 229 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.326.1 chr1 - 3711 15 full-splice_match KIF17 ENST00000247986.2 3969 15 253 5 243 -5 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGATAAGCTCCCCTTCTCT 243 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.328.3 chr1 - 3157 8 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 4049 -7 4049 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AACCGTAGCTTATATTTAAA 9587 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.328.4 chr1 - 3019 6 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 9504 -7 9504 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AACCGTAGCTTATATTTAAA 9487 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.328.5 chr1 - 2773 4 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 25153 -7 -105 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AACCGTAGCTTATATTTAAA 12 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.328.7 chr1 - 4026 13 novel_in_catalog HP1BP3 novel 3884 13 NA NA -6 1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CTGAACCGTAGCTTATATTT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.328.9 chr1 - 3394 9 full-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 1431 -3 1431 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GCTGAACCGTAGCTTATATT 6969 FALSE NA NA TTTAAA -8 NA NA NA 2 NA PB.328.10 chr1 - 3241 8 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 3961 -3 3961 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GCTGAACCGTAGCTTATATT 9499 FALSE NA NA ATTAAA -3 NA NA NA 2 NA PB.328.11 chr1 - 2671 4 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 25251 -3 -7 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GCTGAACCGTAGCTTATATT 110 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.328.17 chr1 - 3992 13 full-splice_match HP1BP3 ENST00000438032.6 6406 13 0 2414 0 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 27 7.221945 0.858654 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TGCTGAACCGTAGCTTATAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 27 NA PB.328.18 chr1 - 3795 12 novel_in_catalog HP1BP3 novel 6406 13 NA NA 1 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 23 6.152027 0.789018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TGCTGAACCGTAGCTTATAT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 23 NA PB.328.19 chr1 - 2478 2 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 29397 -2 4139 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TGCTGAACCGTAGCTTATAT 4256 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.328.22 chr1 - 3897 13 full-splice_match HP1BP3 ENST00000312239.10 3884 13 -20 7 -6 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAGCTGCTGAACCGTAGC -20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.328.26 chr1 - 3895 13 novel_not_in_catalog HP1BP3 novel 3884 13 NA NA -6 1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAGAAAAGGAA -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.328.27 chr1 - 3567 13 full-splice_match HP1BP3 ENST00000312239.10 3884 13 -138 455 -124 1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAGAAAAGGAA -21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.328.28 chr1 - 3558 13 novel_in_catalog HP1BP3 novel 6406 13 NA NA 6 1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.279671 0.631410 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAGAAAAGGAA 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.328.29 chr1 - 3253 12 novel_in_catalog HP1BP3 novel 3884 13 NA NA -6 1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAGAAAAGGAA -20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.328.30 chr1 - 2270 4 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 25197 452 -61 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAGAAAAGGAA 56 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.328.31 chr1 - 1969 14 novel_in_catalog HP1BP3 novel 6406 13 NA NA 0 1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAGAAAAGGAA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.328.32 chr1 - 2023 2 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 29397 453 4139 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.744712 0.573418 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAAAAAAAGAAAAGGA 4256 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.328.33 chr1 - 3537 13 full-splice_match HP1BP3 ENST00000438032.6 6406 13 0 2869 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 40 10.699178 1.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAAAAAAAGAAAAGGA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 40 NA PB.328.34 chr1 - 3425 12 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000312239.10 3884 13 6111 456 0 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.279671 0.631410 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAAAAAAAGAAAAGGA 2 TRUE NA NA ACTAAA -2 NA NA NA 16 NA PB.328.35 chr1 - 2974 9 full-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 1395 453 1395 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAAAAAAAGAAAAGGA 6933 FALSE NA NA TTTAAA -44 NA NA NA 6 NA PB.328.36 chr1 - 2146 2 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 29274 453 4016 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAAAAAAAGAAAAGGA 4133 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.328.41 chr1 - 3381 13 novel_not_in_catalog HP1BP3 novel 3884 13 NA NA -15 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 ATTAAAAAAAAAAAGAAAAG -29 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.328.42 chr1 - 3339 12 novel_in_catalog HP1BP3 novel 6406 13 NA NA 0 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 52 13.908932 1.143294 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 ATTAAAAAAAAAAAGAAAAG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 52 NA PB.328.43 chr1 - 3143 11 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000312239.10 3884 13 6824 458 713 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 ATTAAAAAAAAAAAGAAAAG 7479 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.328.44 chr1 - 2772 8 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 3972 455 3972 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 ATTAAAAAAAAAAAGAAAAG 9510 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.328.45 chr1 - 2589 6 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 9472 455 9472 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 ATTAAAAAAAAAAAGAAAAG 9455 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.328.46 chr1 - 2401 5 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 17780 455 -6974 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.209753 0.506472 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 ATTAAAAAAAAAAAGAAAAG 8260 FALSE NA NA AAGAAA -9 NA NA NA 12 NA PB.328.47 chr1 - 2112 3 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 27419 455 2161 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 ATTAAAAAAAAAAAGAAAAG 2278 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.328.52 chr1 - 3369 13 full-splice_match HP1BP3 ENST00000312239.10 3884 13 -17 532 -3 -76 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTTGTGGGTTTTTTTCCCC -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.328.53 chr1 - 2592 7 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 7343 529 7343 -76 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTTGTGGGTTTTTTTCCCC 8346 FALSE NA NA AGTAAA -39 NA NA NA 2 NA PB.328.55 chr1 - 2034 13 full-splice_match HP1BP3 ENST00000438032.6 6406 13 0 4372 0 954 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.547151 0.657739 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTTTAGGTGCTTTTATTG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.328.56 chr1 - 1963 13 full-splice_match HP1BP3 ENST00000312239.10 3884 13 -38 1959 -24 954 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTTTAGGTGCTTTTATTG -38 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.328.57 chr1 - 1847 12 novel_in_catalog HP1BP3 novel 6406 13 NA NA 0 947 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.814630 0.682563 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTTGCTAGCTTTAGGTGCT -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.328.58 chr1 - 2052 13 novel_in_catalog HP1BP3 novel 3884 13 NA NA 1 947 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTTGCTAGCTTTAGGTGCT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.328.59 chr1 - 1284 8 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 3952 1963 3952 947 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTTGCTAGCTTTAGGTGCT 9490 FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.328.60 chr1 - 1889 13 novel_in_catalog HP1BP3 novel 3884 13 NA NA -2 786 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAAGTAAATTTTATAGGA -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.328.62 chr1 - 2026 7 novel_not_in_catalog HP1BP3 novel 970 8 NA NA -38 3143 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTTCTAGTCTGGATGTCTTT 10010 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.328.64 chr1 - 1675 4 novel_not_in_catalog HP1BP3 novel 970 8 NA NA 7341 3142 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTTTCTAGTCTGGATGTCTT 8344 FALSE NA NA AGTAAA -41 NA NA NA 2 NA PB.328.66 chr1 - 2573 10 novel_not_in_catalog HP1BP3 novel 970 8 NA NA -6 3141 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTTTCTAGTCTGGATGTCT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.328.67 chr1 - 2345 9 novel_not_in_catalog HP1BP3 novel 970 8 NA NA 0 3141 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTTTCTAGTCTGGATGTCT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.328.68 chr1 - 2168 8 novel_not_in_catalog HP1BP3 novel 970 8 NA NA 694 3141 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTTTCTAGTCTGGATGTCT 7460 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.328.69 chr1 - 2556 10 novel_not_in_catalog HP1BP3 novel 970 8 NA NA 0 3140 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGTTTCTAGTCTGGATGTC -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.328.70 chr1 - 2448 10 novel_not_in_catalog HP1BP3 novel 970 8 NA NA -3 3140 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGTTTCTAGTCTGGATGTC -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.328.72 chr1 - 1914 10 novel_not_in_catalog HP1BP3 novel 970 8 NA NA 23 2537 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGATTCTGAGTTCTCTTTTG 23 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.328.74 chr1 - 1032 7 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000424732.5 970 8 12 8046 7 -8046 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TATTTTTTTGCCCCATTATG 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.328.76 chr1 - 1514 3 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000424732.5 970 8 -11 18267 0 -16 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAACAAAGACACAAGCCG -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.328.77 chr1 - 1828 4 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000417710.5 572 5 -369 2099 0 -31 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAATATAATATAAAAGAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.328.78 chr1 - 1469 4 novel_in_catalog HP1BP3 novel 928 5 NA NA 19 -31 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAATATAATATAAAAGAT 31 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.328.80 chr1 - 1474 4 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000438032.6 6406 13 0 35420 0 -31 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.814630 0.682563 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAATATAATATAAAAGAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.328.81 chr1 - 1394 4 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000312239.10 3884 13 -29 33007 -15 -31 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAATATAATATAAAAGAT -29 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.328.82 chr1 - 1246 5 novel_in_catalog HP1BP3 novel 928 5 NA NA 5 -31 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAATATAATATAAAAGAT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.328.83 chr1 - 1278 3 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000424732.5 970 8 5 18487 0 -31 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.209753 0.506472 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAATATAATATAAAAGAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.328.84 chr1 - 883 5 novel_in_catalog HP1BP3 novel 928 5 NA NA 0 -31 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAATATAATATAAAAGAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.329.1 chr1 + 1861 8 full-splice_match PINK1 ENST00000321556.5 2657 8 23 773 23 -578 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTGTCGTGATGGTCTGTGA 6 TRUE NA NA ACTAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.329.2 chr1 + 2430 8 full-splice_match PINK1 ENST00000321556.5 2657 8 32 195 32 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.814630 0.682563 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATGACGTATGTGCCTTGA 15 TRUE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 18 NA PB.329.3 chr1 + 1678 8 full-splice_match PINK1 ENST00000321556.5 2657 8 205 774 205 -579 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTGTGTCGTGATGGTCTGTG 151 FALSE NA NA ACTAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.329.4 chr1 + 2229 8 full-splice_match PINK1 ENST00000321556.5 2657 8 233 195 233 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATGACGTATGTGCCTTGA 179 FALSE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.329.5 chr1 + 1434 8 full-splice_match PINK1 ENST00000321556.5 2657 8 450 773 450 -578 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTGTCGTGATGGTCTGTGA 396 FALSE NA NA ACTAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.329.6 chr1 + 1964 7 incomplete-splice_match PINK1 ENST00000321556.5 2657 8 4404 195 -267 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATGACGTATGTGCCTTGA 4350 FALSE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 8 NA PB.329.7 chr1 + 1847 7 incomplete-splice_match PINK1 ENST00000321556.5 2657 8 4521 195 -150 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATGACGTATGTGCCTTGA 4467 FALSE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.329.8 chr1 + 1745 7 incomplete-splice_match PINK1 ENST00000321556.5 2657 8 4623 195 -48 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATGACGTATGTGCCTTGA 4569 FALSE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 7 NA PB.329.9 chr1 + 1545 5 incomplete-splice_match PINK1 ENST00000321556.5 2657 8 11082 195 -968 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATGACGTATGTGCCTTGA NA FALSE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 5 NA PB.329.10 chr1 + 1674 3 incomplete-splice_match PINK1 ENST00000492302.1 3821 5 7530 1 151 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAGATGACGTATGTGCCTTG NA FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.329.11 chr1 + 1253 3 incomplete-splice_match PINK1 ENST00000400490.2 1658 4 2992 194 2992 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATGACGTATGTGCCTTGA NA FALSE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 6 NA PB.329.12 chr1 + 971 2 incomplete-splice_match PINK1 ENST00000400490.2 1658 4 3636 194 3636 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATGACGTATGTGCCTTGA NA FALSE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.331.1 chr1 - 1070 2 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000435383.2 1597 11 40479 -542 40479 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.942274 0.468683 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAGAAAGTAAAGTGACTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.331.4 chr1 - 1946 13 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681717.1 5993 34 193476 544 -6206 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAATGTTTAGCAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.331.5 chr1 - 1740 11 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681717.1 5993 34 197328 529 -2354 8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAAAAAAAAGTTGAGA NA FALSE NA NA TTTAAA -21 NA NA NA 3 NA PB.331.6 chr1 - 976 6 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000435383.2 1597 11 23635 -8 23635 8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAAAAAAAAGTTGAGA NA FALSE NA NA AGTAAA -1 NA NA NA 2 NA PB.331.7 chr1 - 1356 9 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681717.1 5993 34 201506 543 1824 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAATGTTTAGCAAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.331.8 chr1 - 3862 24 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681767.1 5884 33 109148 544 -318 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAATGTTTAGCAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.331.9 chr1 - 1821 12 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681717.1 5993 34 195932 544 -3750 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAATGTTTAGCAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.331.10 chr1 - 1532 10 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681717.1 5993 34 199602 544 -80 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAATGTTTAGCAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.331.11 chr1 - 1239 8 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000435383.2 1597 11 10326 7 10326 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAATGTTTAGCAAAAA NA FALSE NA NA AAAACA -12 NA NA NA 5 NA PB.331.12 chr1 - 2979 20 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681767.1 5884 33 157414 545 -42268 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 TAAAAAAATGTTTAGCAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.331.13 chr1 - 2514 18 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681717.1 5993 34 171432 817 -28250 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAATGAAACAAAAGAAACA 6836 FALSE NA NA AAAAAG -29 NA NA NA 2 NA PB.331.14 chr1 - 1146 9 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681717.1 5993 34 201442 817 1760 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAATGAAACAAAAGAAACA NA FALSE NA NA AAAAAG -3 NA NA NA 2 NA PB.331.16 chr1 - 2456 12 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000264211.13 5793 31 81398 55813 12849 30819 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 GAAAGAAAGAAAAACCTCAT 9080 FALSE NA NA AATAAA -34 NA NA NA 2 NA PB.348.2 chr1 - 5028 19 full-splice_match ECE1 ENST00000374893.11 5067 19 39 0 39 0 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GGCCATGTGTCTGGGTGTCT 15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.348.3 chr1 - 4489 15 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 19193 -1334 -3639 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GGCCATGTGTCTGGGTGTCT 1575 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.348.4 chr1 - 4404 14 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 20709 -1334 -2123 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GGCCATGTGTCTGGGTGTCT 3091 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.348.5 chr1 - 3623 8 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 42711 -1334 1512 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GGCCATGTGTCTGGGTGTCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.348.6 chr1 - 2955 2 full-splice_match ECE1 ENST00000531334.1 653 2 262 -2564 262 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GGCCATGTGTCTGGGTGTCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.348.15 chr1 - 5100 19 full-splice_match ECE1 ENST00000415912.6 5099 19 -6 5 -6 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.547151 0.657739 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGGGCCATGTGTCTGGGTGT 385 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.348.16 chr1 - 4084 12 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 23515 -1332 683 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGGGCCATGTGTCTGGGTGT 5897 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.348.17 chr1 - 3423 6 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 45915 -1332 4716 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGGGCCATGTGTCTGGGTGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.348.18 chr1 - 3818 10 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 34479 -1330 -6720 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGAGGGCCATGTGTCTGGGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.348.19 chr1 - 3166 3 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 54108 -1330 -3360 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGAGGGCCATGTGTCTGGGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.348.20 chr1 - 3052 3 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 54222 -1330 -3246 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGAGGGCCATGTGTCTGGGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.348.21 chr1 - 3760 19 full-splice_match ECE1 ENST00000415912.6 5099 19 -19 1358 -19 -21 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAGAAAAGAGAAAC -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.348.22 chr1 - 3687 19 full-splice_match ECE1 ENST00000374893.11 5067 19 25 1355 25 -21 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAGAAAAGAGAAAC 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.348.23 chr1 - 3001 14 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 20757 21 -2075 -21 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAGAAAAGAGAAAC 3139 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.348.28 chr1 - 2762 19 full-splice_match ECE1 ENST00000374893.11 5067 19 19 2286 19 278 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.942274 0.468683 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGAATTGGTATATTTATT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.348.29 chr1 - 1395 9 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 41364 952 165 278 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGAATTGGTATATTTATT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.348.30 chr1 - 1221 7 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 43645 952 2446 278 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGAATTGGTATATTTATT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.348.31 chr1 - 2828 19 full-splice_match ECE1 ENST00000415912.6 5099 19 -19 2290 -19 277 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.477233 0.541234 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 GAAAGAATTGGTATATTTAT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.348.32 chr1 - 2787 18 full-splice_match ECE1 ENST00000264205.10 2381 18 -10 -396 -10 273 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TAAGGAAAGAATTGGTATAT 8735 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.348.33 chr1 - 2165 15 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 19226 957 -3606 273 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TAAGGAAAGAATTGGTATAT 1608 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.348.34 chr1 - 1541 10 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 34469 957 -6730 273 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TAAGGAAAGAATTGGTATAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.348.35 chr1 - 1907 13 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 21990 984 -842 246 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAACACATTTAAACACTT 4372 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.350.1 chr1 + 4192 19 novel_not_in_catalog NBPF3 novel 4401 18 NA NA 0 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTCTGGACTGTTGGATTGT 17 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.350.3 chr1 + 4108 18 novel_in_catalog NBPF3 novel 4401 18 NA NA 1 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTCTGGACTGTTGGATTGTT 19 TRUE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.350.5 chr1 + 4372 19 novel_not_in_catalog NBPF3 novel 4401 18 NA NA -3 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTCTGGACTGTTGGATTGT 23 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 6 NA PB.350.6 chr1 + 2198 5 incomplete-splice_match NBPF3 ENST00000469876.5 981 9 6683 -1592 6665 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTCTGGACTGTTGGATTGT NA FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.351.1 chr1 - 2092 5 novel_not_in_catalog NBPF2P novel 661 5 NA NA 125 1517 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTCTGGACTGTTGGATTGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.351.2 chr1 - 1879 3 novel_not_in_catalog NBPF2P novel 661 5 NA NA 1663 1517 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTCTGGACTGTTGGATTGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.352.1 chr1 - 3760 25 full-splice_match RAP1GAP ENST00000374765.9 3322 25 -433 -5 -433 5 alternative_5end TRUE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGTTGGGCCTGGCTTTGTGT 9382 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.352.2 chr1 - 3296 25 full-splice_match RAP1GAP ENST00000495204.5 2489 25 -21 -786 -21 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACCCAGAGTTGGGCCTGGCT -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.352.3 chr1 - 1842 9 incomplete-splice_match RAP1GAP ENST00000374761.6 3318 23 14287 1 11760 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACCCAGAGTTGGGCCTGGCT 9195 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.352.4 chr1 - 1597 7 incomplete-splice_match RAP1GAP ENST00000611549.4 4294 25 66462 0 17203 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACCCAGAGTTGGGCCTGGCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.352.5 chr1 - 1550 7 incomplete-splice_match RAP1GAP ENST00000374763.6 3334 23 17219 1 17219 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACCCAGAGTTGGGCCTGGCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.352.6 chr1 - 3284 25 novel_in_catalog RAP1GAP novel 2489 25 NA NA 33 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACCCAGAGTTGGGCCTGGC 27 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.352.7 chr1 - 3296 25 novel_in_catalog RAP1GAP novel 3322 25 NA NA 0 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACCCAGAGTTGGGCCTGGC -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.352.8 chr1 - 2265 13 incomplete-splice_match RAP1GAP ENST00000374761.6 3318 23 11077 2 8550 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACCCAGAGTTGGGCCTGGC 5985 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.354.1 chr1 - 1720 13 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 67700 605 5697 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TCCTAAGTGTGGAAAAGTGT 9636 FALSE NA NA AATACA -25 NA NA NA 2 NA PB.354.2 chr1 - 1260 9 incomplete-splice_match USP48 ENST00000529637.5 3228 27 77243 -464 -1133 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TCCTAAGTGTGGAAAAGTGT 17 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.354.3 chr1 - 992 6 incomplete-splice_match USP48 ENST00000529637.5 3228 27 81397 -464 3021 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TCCTAAGTGTGGAAAAGTGT 4171 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.354.4 chr1 - 3799 27 full-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 14 606 14 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GTCCTAAGTGTGGAAAAGTG 22 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.354.5 chr1 - 1973 15 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 61384 607 -619 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGTCCTAAGTGTGGAAAAGT 3320 FALSE NA NA AATATA -21 NA NA NA 2 NA PB.354.6 chr1 - 1519 11 incomplete-splice_match USP48 ENST00000529637.5 3228 27 76415 -462 -1961 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGTCCTAAGTGTGGAAAAGT NA FALSE NA NA AATGAA -23 NA NA NA 8 NA PB.354.7 chr1 - 1465 14 incomplete-splice_match USP48 ENST00000400301.5 4309 26 61467 922 -582 -21 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGGAAATGTTTCCAATTTT 3357 FALSE NA NA AAGAAA -1 NA NA NA 3 NA PB.354.8 chr1 - 2150 19 novel_in_catalog USP48 novel 4419 27 NA NA -3630 -23 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TGAAGGAAATGTTTCCAATT NA FALSE NA NA ATTAAA -5 NA NA NA 2 NA PB.354.9 chr1 - 1569 15 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 61468 927 -535 -26 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTTGAAGGAAATGTTTCCA 3404 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.354.10 chr1 - 1242 12 incomplete-splice_match USP48 ENST00000529637.5 3228 27 76218 -142 -2158 -26 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTTGAAGGAAATGTTTCCA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.354.11 chr1 - 1156 11 incomplete-splice_match USP48 ENST00000529637.5 3228 27 76458 -142 -1918 -26 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTTGAAGGAAATGTTTCCA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.354.12 chr1 - 3480 27 full-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 10 929 10 -28 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.279671 0.631410 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGACTTGAAGGAAATGTTTC 18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.354.13 chr1 - 2302 19 novel_in_catalog USP48 novel 4419 27 NA NA -3787 -28 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGACTTGAAGGAAATGTTTC NA FALSE NA NA AGTAAA -25 NA NA NA 2 NA PB.354.14 chr1 - 1403 13 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 67693 929 5690 -28 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGACTTGAAGGAAATGTTTC 9629 FALSE NA NA AATACA -32 NA NA NA 4 NA PB.354.15 chr1 - 992 9 incomplete-splice_match USP48 ENST00000529637.5 3228 27 77187 -140 -1189 -28 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGACTTGAAGGAAATGTTTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.354.17 chr1 - 2102 14 novel_in_catalog USP48 novel 4419 27 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.354.18 chr1 - 2094 14 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 -8 42738 -8 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 168 44.936546 1.652600 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 168 NA PB.354.19 chr1 - 1967 14 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 119 42738 -39 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.012192 0.603382 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.354.20 chr1 - 1888 13 novel_in_catalog USP48 novel 4419 27 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.354.21 chr1 - 1909 14 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 177 42738 19 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT 229 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.354.22 chr1 - 1689 3 incomplete-splice_match USP48 ENST00000374732.7 3037 15 -224 42133 -224 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT NA FALSE NA NA TATAAA -26 NA NA NA 2 NA PB.354.23 chr1 - 1734 13 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 25392 42738 -9566 0 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.942274 0.468683 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.354.24 chr1 - 1639 12 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 26447 42738 -8511 0 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT NA FALSE NA NA TATAAA -21 NA NA NA 4 NA PB.354.25 chr1 - 1364 9 novel_not_in_catalog USP48 novel 4309 26 NA NA -21 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.354.26 chr1 - 1366 3 incomplete-splice_match USP48 ENST00000487880.2 524 4 1553 0 102 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT 68 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.354.27 chr1 - 1282 10 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 30570 42738 -4388 0 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.209753 0.506472 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT 3894 FALSE NA NA CATAAA -3 NA NA NA 12 NA PB.354.28 chr1 - 1132 8 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 34866 42738 -92 0 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT 8190 FALSE NA NA GATAAA -3 NA NA NA 4 NA PB.354.29 chr1 - 1030 3 incomplete-splice_match USP48 ENST00000487880.2 524 4 1889 0 438 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT 404 FALSE NA NA AAGAAA -3 NA NA NA 2 NA PB.354.30 chr1 - 926 7 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 36060 42738 1102 0 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT 9384 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.354.31 chr1 - 804 6 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 46623 42738 -3690 0 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.354.32 chr1 - 1490 12 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 26588 42746 -8370 -8 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAATAAAGGTAACACTTTAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.354.33 chr1 - 2356 11 novel_in_catalog USP48 novel 2818 11 NA NA 19 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTGTACTTGTGGTTTGTC -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.354.34 chr1 - 2179 11 full-splice_match USP48 ENST00000421625.6 2818 11 637 2 22 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTGTACTTGTGGTTTGTC 232 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.354.35 chr1 - 1977 10 incomplete-splice_match USP48 ENST00000529637.5 3228 27 25261 48486 -9539 -2 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTGTACTTGTGGTTTGTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.354.36 chr1 - 1159 3 incomplete-splice_match USP48 ENST00000421625.6 2818 11 46998 2 -3772 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTGTACTTGTGGTTTGTC NA FALSE NA NA AGTAAA -10 NA NA NA 2 NA PB.354.37 chr1 - 2349 11 full-splice_match USP48 ENST00000421625.6 2818 11 466 3 9 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 68 18.188602 1.259799 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAATTGTACTTGTGGTTTGT 17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 68 NA PB.354.38 chr1 - 2164 10 novel_in_catalog USP48 novel 2818 11 NA NA 14 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAATTGTACTTGTGGTTTGT 22 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.354.39 chr1 - 1778 9 incomplete-splice_match USP48 ENST00000421625.6 2818 11 27036 4 -8379 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATAATTGTACTTGTGGTTTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.354.40 chr1 - 1497 6 incomplete-splice_match USP48 ENST00000529637.5 3228 27 31376 48488 -3424 -4 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATAATTGTACTTGTGGTTTG 4858 FALSE NA NA AATAAA -41 NA NA NA 2 NA PB.354.41 chr1 - 1280 5 incomplete-splice_match USP48 ENST00000421625.6 2818 11 35446 4 31 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATAATTGTACTTGTGGTTTG 8313 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.354.42 chr1 - 1964 11 full-splice_match USP48 ENST00000421625.6 2818 11 457 397 0 364 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.942274 0.468683 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATGGAAAAAGCAACTTGCCT 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.354.43 chr1 - 1823 11 full-splice_match USP48 ENST00000421625.6 2818 11 526 469 69 292 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATCCATGAGTATTGTAGATA 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.354.45 chr1 - 1303 9 incomplete-splice_match USP48 ENST00000421625.6 2818 11 467 8645 10 -7884 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AGAAAAGATGGAGGGGAAGA 18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.354.46 chr1 - 944 6 incomplete-splice_match USP48 ENST00000421625.6 2818 11 480 23655 23 1501 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATTCAAATTTTGGTGTATG -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.355.1 chr1 + 2416 11 full-splice_match ALPL ENST00000540617.5 2131 11 -54 -231 -23 -4 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGGACAGAGCTGAGTCTTTG 395 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.355.2 chr1 + 2572 12 full-splice_match ALPL ENST00000374840.8 2536 12 -45 9 -19 2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 19 5.082109 0.706044 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TTCCGAGGACAGAGCTGAGT 399 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 19 NA PB.355.3 chr1 + 2420 11 novel_in_catalog ALPL novel 2536 12 NA NA 2 -5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGACAGAGCTGAGTCTTT 420 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.355.4 chr1 + 1451 4 incomplete-splice_match ALPL ENST00000374832.5 2193 12 22395 -383 -804 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAATATTTCCGAGGACAGAG -17 TRUE NA NA AATAAA -8 NA NA NA 3 NA PB.355.5 chr1 + 1393 4 incomplete-splice_match ALPL ENST00000374832.5 2193 12 22460 -390 -739 3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TCCGAGGACAGAGCTGAGTC -5 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.355.6 chr1 + 1264 3 incomplete-splice_match ALPL ENST00000374829.2 1595 4 1329 -9 1329 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GACAGAGCTGAGTCTTTGTG -3 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.355.7 chr1 + 1045 2 incomplete-splice_match ALPL ENST00000374829.2 1595 4 2132 4 2132 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAATATTTCCGAGGACAGAG 5 TRUE NA NA AATAAA -8 NA NA NA 2 NA PB.357.2 chr1 - 3196 18 incomplete-splice_match HSPG2 ENST00000374695.8 14341 97 103999 1 266 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGGGGCCTCCTGAGTCTTTG 3532 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.357.3 chr1 - 2377 11 full-splice_match HSPG2 ENST00000486901.1 3586 11 1209 0 1209 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGGGGCCTCCTGAGTCTTTG 7339 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.357.4 chr1 - 2258 10 incomplete-splice_match HSPG2 ENST00000486901.1 3586 11 1631 0 1631 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGGGGCCTCCTGAGTCTTTG 7761 FALSE NA NA GGGGCT -6 NA NA NA 5 NA PB.357.5 chr1 - 2037 10 incomplete-splice_match HSPG2 ENST00000486901.1 3586 11 1852 0 1852 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGGGGCCTCCTGAGTCTTTG 7982 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.357.6 chr1 - 1876 9 incomplete-splice_match HSPG2 ENST00000486901.1 3586 11 2421 0 2421 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGGGGCCTCCTGAGTCTTTG 8551 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.357.7 chr1 - 1423 3 incomplete-splice_match HSPG2 ENST00000486901.1 3586 11 6518 0 71 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGGGGCCTCCTGAGTCTTTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.357.8 chr1 - 1348 2 full-splice_match HSPG2 ENST00000481644.1 839 2 547 -1056 547 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGGGGCCTCCTGAGTCTTTG 163 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.357.9 chr1 - 1270 2 full-splice_match HSPG2 ENST00000481644.1 839 2 625 -1056 625 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGGGGCCTCCTGAGTCTTTG 241 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.357.11 chr1 - 3409 19 incomplete-splice_match HSPG2 ENST00000374695.8 14341 97 103703 2 -30 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGGGGCCTCCTGAGTCTTT 3236 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.357.12 chr1 - 2747 14 incomplete-splice_match HSPG2 ENST00000374695.8 14341 97 106033 2 -564 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGGGGCCTCCTGAGTCTTT 5566 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.357.13 chr1 - 2562 12 incomplete-splice_match HSPG2 ENST00000374695.8 14341 97 107232 2 635 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGGGGCCTCCTGAGTCTTT 6765 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.357.14 chr1 - 1709 7 incomplete-splice_match HSPG2 ENST00000486901.1 3586 11 2799 1 2799 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGGGGCCTCCTGAGTCTTT 8929 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.357.15 chr1 - 1564 5 incomplete-splice_match HSPG2 ENST00000486901.1 3586 11 6115 1 -332 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.209753 0.506472 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGGGGCCTCCTGAGTCTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.357.16 chr1 - 1514 2 full-splice_match HSPG2 ENST00000481644.1 839 2 380 -1055 380 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGGGGCCTCCTGAGTCTTT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.359.3 chr1 + 1213 3 full-splice_match LINC00339 ENST00000642072.1 338 3 -29 -846 0 1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATGTGCTGTGGTGATT -12 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.359.4 chr1 + 1092 2 full-splice_match LINC00339 ENST00000416769.2 1077 2 -18 3 0 1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.477233 0.541234 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATGTGCTGTGGTGATT -12 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 13 NA PB.360.1 chr1 + 1466 6 full-splice_match CDC42 ENST00000315554.13 1435 6 -34 3 7 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAATGCCTGATGAAGCTTTA 0 TRUE NA NA ATTAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.360.2 chr1 + 970 6 full-splice_match CDC42 ENST00000656825.1 10503 6 10 9523 2 261 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 415 111.003967 2.045339 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GTGGATGACTCTGTAACAGA 14 TRUE NA NA TTTAAA -15 NA NA NA 415 NA PB.360.3 chr1 + 2110 6 full-splice_match CDC42 ENST00000656825.1 10503 6 -24 8417 17 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 391 104.584465 2.019467 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAAGCCAGCCTGAGGGTTGT 10 FALSE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 391 NA PB.360.4 chr1 + 751 6 full-splice_match CDC42 ENST00000656825.1 10503 6 8 9744 0 40 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 45 12.036575 1.080503 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AATAATGACAAATGCCCTGC 12 TRUE NA NA ATTAAA -20 NA NA NA 45 NA PB.360.5 chr1 + 1548 6 full-splice_match CDC42 ENST00000656825.1 10503 6 8 8947 0 -510 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 116 31.027617 1.491748 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTCATTGTCTTATATGCTT 12 TRUE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 116 NA PB.360.6 chr1 + 894 7 full-splice_match CDC42 ENST00000344548.7 2256 7 52 1310 3 60 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACCTACCCACATGCACTCGT 15 TRUE NA NA ATTAAA -40 NA NA NA 10 NA PB.360.7 chr1 + 2201 7 full-splice_match CDC42 ENST00000344548.7 2256 7 51 4 2 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACAAGCCAGCCTGAGGGTTG 14 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 10 NA PB.360.9 chr1 + 1868 6 full-splice_match CDC42 ENST00000656825.1 10503 6 11 8624 3 -187 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.279671 0.631410 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATGCAGACTCTTCTTAAGT 15 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 16 NA PB.360.10 chr1 + 1652 6 incomplete-splice_match CDC42 ENST00000344548.7 2256 7 21422 533 20604 -510 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTCATTGTCTTATATGCTT NA FALSE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.360.11 chr1 + 2060 5 incomplete-splice_match CDC42 ENST00000344548.7 2256 7 25759 -3 24941 3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCCTGAGGGTTGTTATTTT NA FALSE NA NA ATTAAA -24 NA NA NA 6 NA PB.360.13 chr1 + 1766 5 incomplete-splice_match CDC42 ENST00000344548.7 2256 7 25838 212 25020 -189 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TTAATGCAGACTCTTCTTAA NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.360.15 chr1 + 1420 5 incomplete-splice_match CDC42 ENST00000662562.1 1645 7 25045 -837 25045 -510 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTCATTGTCTTATATGCTT NA FALSE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 6 NA PB.360.16 chr1 + 1898 4 incomplete-splice_match CDC42 ENST00000344548.7 2256 7 29054 2 28236 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCCAGCCTGAGGGTTGTT NA FALSE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 6 NA PB.360.17 chr1 + 1657 4 incomplete-splice_match CDC42 ENST00000344548.7 2256 7 29087 210 28269 -187 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATGCAGACTCTTCTTAAGT NA FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.360.18 chr1 + 1198 4 incomplete-splice_match CDC42 ENST00000315554.13 1435 6 29055 6 28278 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TATAAATGCCTGATGAAGCT NA FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.360.19 chr1 + 1272 3 incomplete-splice_match CDC42 ENST00000662562.1 1645 7 32975 -837 32975 -510 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTCATTGTCTTATATGCTT 2099 FALSE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.360.20 chr1 + 1754 3 incomplete-splice_match CDC42 ENST00000344548.7 2256 7 33840 4 33022 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACAAGCCAGCCTGAGGGTTG 2146 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 8 NA PB.360.21 chr1 + 1420 2 incomplete-splice_match CDC42 ENST00000344548.7 2256 7 34087 211 33269 -188 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAATGCAGACTCTTCTTAAG 2393 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.360.22 chr1 + 1600 2 incomplete-splice_match CDC42 ENST00000344548.7 2256 7 34114 4 33296 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.744712 0.573418 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACAAGCCAGCCTGAGGGTTG 2420 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 14 NA PB.361.1 chr1 + 1507 4 incomplete-splice_match ZBTB40 ENST00000375647.5 8701 18 4 29206 4 -4293 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAATCAATGACTTGAGTACC 1 TRUE NA NA AAAAAG -11 NA NA NA 2 NA PB.363.1 chr1 + 4013 10 incomplete-splice_match ZBTB40 ENST00000375647.5 8701 18 57286 2729 57270 -2729 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAGAAAAAACAAACAAC NA FALSE NA NA AAAACA -42 NA NA NA 2 NA PB.364.1 chr1 + 1306 7 incomplete-splice_match EPHB2 ENST00000374632.7 3677 16 195089 518 40900 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAAAGGGAATGGGAA NA FALSE NA NA AAGAAA -21 NA NA NA 3 NA PB.369.1 chr1 + 1486 10 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000692975.1 3793 18 17 14473 -8 -7411 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CTGTATTTTCTTCATAGCTG -45 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.369.2 chr1 + 2980 19 full-splice_match KDM1A ENST00000356634.7 3033 19 46 7 26 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.617068 0.749510 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG -11 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 21 NA PB.369.3 chr1 + 3039 20 novel_in_catalog KDM1A novel 3085 21 NA NA 28 1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.744712 0.573418 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAATTGGCCCTCTCTTTTGT -9 TRUE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 14 NA PB.369.4 chr1 + 2799 19 full-splice_match KDM1A ENST00000356634.7 3033 19 234 0 214 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GCCCTCTCTTTTGTTCCTTT 177 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.369.5 chr1 + 2812 20 novel_in_catalog KDM1A novel 3085 21 NA NA 254 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG 217 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 5 NA PB.369.6 chr1 + 2718 19 full-splice_match KDM1A ENST00000356634.7 3033 19 315 0 295 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GCCCTCTCTTTTGTTCCTTT 258 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.369.7 chr1 + 2588 19 full-splice_match KDM1A ENST00000356634.7 3033 19 438 7 418 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG 381 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 8 NA PB.369.8 chr1 + 2593 19 novel_in_catalog KDM1A novel 3085 21 NA NA 11001 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GCCCTCTCTTTTGTTCCTTT 2730 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 10 NA PB.369.9 chr1 + 2452 18 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000356634.7 3033 19 11096 6 11076 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAATTGGCCCTCTCTTTTGT 2805 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 9 NA PB.369.10 chr1 + 2421 18 novel_in_catalog KDM1A novel 3085 21 NA NA -5999 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG NA FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 3 NA PB.369.12 chr1 + 2211 16 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000356634.7 3033 19 34328 7 3351 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.617068 0.749510 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG 3379 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 21 NA PB.369.13 chr1 + 2084 15 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000356634.7 3033 19 35684 7 4707 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.942274 0.468683 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG 4735 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 11 NA PB.369.14 chr1 + 1955 13 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000356634.7 3033 19 38035 0 7058 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.744712 0.573418 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GCCCTCTCTTTTGTTCCTTT 7086 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 14 NA PB.369.15 chr1 + 2554 12 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000691682.1 3710 19 39670 -50 -6086 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG 36 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 4 NA PB.369.16 chr1 + 1814 12 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000356634.7 3033 19 39676 7 -6075 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 26 6.954466 0.842264 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG 47 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 26 NA PB.369.17 chr1 + 1773 11 full-splice_match KDM1A ENST00000686793.1 2133 11 373 -13 373 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GCCCTCTCTTTTGTTCCTTT 9466 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.369.18 chr1 + 1612 10 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000686793.1 2133 11 906 -6 906 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 27 7.221945 0.858654 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG 9999 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 27 NA PB.369.19 chr1 + 1562 10 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000686793.1 2133 11 963 -13 963 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GCCCTCTCTTTTGTTCCTTT NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 6 NA PB.369.20 chr1 + 1378 8 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000686793.1 2133 11 3977 -6 790 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 44 11.769095 1.070743 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG 785 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 44 NA PB.369.21 chr1 + 1914 6 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000687202.1 5783 18 57823 -58 32 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CCCTCTCTTTTGTTCCTTTG 5904 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.369.22 chr1 + 1152 6 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000689971.1 1823 8 6437 -10 57 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.884548 0.769713 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG 5929 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 22 NA PB.369.23 chr1 + 4559 2 full-splice_match KDM1A ENST00000690907.1 3464 2 -1052 -43 -702 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAAAATTGGCCCTCTCTTTT 6949 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.369.24 chr1 + 1054 5 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000494920.1 905 6 1791 -335 12 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.477233 0.541234 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GCCCTCTCTTTTGTTCCTTT 7663 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 13 NA PB.369.25 chr1 + 1683 5 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000685243.1 1123 6 105 4 105 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG 7756 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 2 NA PB.369.26 chr1 + 919 5 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000494920.1 905 6 1918 -327 139 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.942274 0.468683 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAAAATTGGCCCTCTCTTTT 7790 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 11 NA PB.369.27 chr1 + 868 4 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000494920.1 905 6 2352 -335 223 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GCCCTCTCTTTTGTTCCTTT 8224 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 9 NA PB.369.28 chr1 + 746 3 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000494920.1 905 6 4253 -336 614 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CCCTCTCTTTTGTTCCTTTG NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 7 NA PB.369.29 chr1 + 2102 1 full-splice_match KDM1A ENST00000602503.1 2810 1 717 -9 717 2 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CCTCTCTTTTGTTCCTTTGA NA FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.369.30 chr1 + 1294 1 full-splice_match KDM1A ENST00000602503.1 2810 1 1516 0 1516 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG NA FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 4 NA PB.369.31 chr1 + 1119 1 full-splice_match KDM1A ENST00000602503.1 2810 1 1700 -9 1700 2 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CCTCTCTTTTGTTCCTTTGA NA FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.370.2 chr1 - 1172 4 full-splice_match LUZP1 ENST00000471849.5 1190 4 7 11 7 -11 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.279671 0.631410 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAACAAGAAACAAATCAGAA -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.370.3 chr1 - 1107 3 incomplete-splice_match LUZP1 ENST00000302291.8 8898 5 8969 9424 6 -11 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 23 6.152027 0.789018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAACAAGAAACAAATCAGAA -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 23 NA PB.370.4 chr1 - 958 2 incomplete-splice_match LUZP1 ENST00000475164.2 613 4 24623 -697 24623 -15 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATGAAACAAGAAACAAATC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.371.1 chr1 - 2115 2 novel_not_in_catalog HTR1D novel 3319 2 NA NA -44 -1071 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AATCAACAGAATTGTTCTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.373.1 chr1 - 1835 2 full-splice_match LINC01355 ENST00000660265.1 3554 2 1721 -2 1432 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GAGTTTTTTTTGTCTTATTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.373.2 chr1 - 1680 1 full-splice_match LINC01355 ENST00000566551.1 5444 1 3763 1 2465 -1 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTGAGTTTTTTTTGTCTTA NA FALSE NA NA AATGAA -14 NA NA NA 3 NA PB.373.3 chr1 - 1243 1 full-splice_match LINC01355 ENST00000566551.1 5444 1 4200 1 2902 -1 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTGAGTTTTTTTTGTCTTA NA FALSE NA NA AATAAA -3 NA NA NA 3 NA PB.373.4 chr1 - 3278 1 full-splice_match LINC01355 ENST00000566551.1 5444 1 2164 2 866 -2 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GAGTGAGTTTTTTTTGTCTT NA FALSE NA NA ACTAAA -31 NA NA NA 2 NA PB.373.5 chr1 - 1752 2 full-splice_match LINC01355 ENST00000604481.1 400 2 -1376 24 -78 -24 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAAAGAAGAGAGAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.373.6 chr1 - 1082 1 full-splice_match LINC01355 ENST00000566551.1 5444 1 1291 3071 -7 -24 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAAAGAAGAGAGAAA NA FALSE NA NA AATACA -34 NA NA NA 2 NA PB.378.2 chr1 - 897 2 full-splice_match HNRNPR ENST00000464516.1 557 2 -343 3 -343 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GTATACTTCCTTTTGGTTAG 3181 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.380.5 chr1 - 2050 5 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000427764.3 1788 9 19440 -918 -7967 247 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAAAAAAAAACAGGTTC 2041 FALSE NA NA AAAAAG -22 NA NA NA 2 NA PB.380.11 chr1 - 2519 10 novel_in_catalog HNRNPR novel 7751 11 NA NA -4 14 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 428 114.481201 2.058734 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AATTGTGTCCTAAAACATTA -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 428 NA PB.380.14 chr1 - 2532 10 full-splice_match HNRNPR ENST00000478691.5 7646 10 27 5087 1 8 alternative_3end FALSE noncanonical NA NA NA NA 42 11.234137 1.050540 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAATTCAATTGTGTCCTAAA 341 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 42 NA PB.380.15 chr1 - 2401 9 full-splice_match HNRNPR ENST00000606561.5 1837 9 -6 -558 -6 8 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 52 13.908932 1.143294 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAATTCAATTGTGTCCTAAA -19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 52 NA PB.380.16 chr1 - 2109 7 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000374612.5 2694 11 10779 -11 88 8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 23 6.152027 0.789018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAATTCAATTGTGTCCTAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 23 NA PB.380.17 chr1 - 3027 11 full-splice_match HNRNPR ENST00000374612.5 2694 11 -331 -2 -317 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACCTATTTCAAATTCAATTG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.380.19 chr1 - 2683 11 full-splice_match HNRNPR ENST00000374612.5 2694 11 5 6 0 -6 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 232 62.055233 1.792778 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 333 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 232 NA PB.380.20 chr1 - 2350 9 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000374612.5 2694 11 5771 6 -2 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.547151 0.657739 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 6099 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.380.22 chr1 - 2964 10 novel_in_catalog HNRNPR novel 2694 11 NA NA -431 -6 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.380.23 chr1 - 2611 10 novel_in_catalog HNRNPR novel 7751 11 NA NA -26 -6 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 288 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.380.24 chr1 - 2550 10 novel_in_catalog HNRNPR novel 2694 11 NA NA -3 -6 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.209753 0.506472 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.380.25 chr1 - 2525 10 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000374612.5 2694 11 3353 6 39 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 3681 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.380.26 chr1 - 2500 10 novel_in_catalog HNRNPR novel 7751 11 NA NA 3 -6 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 336 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.380.28 chr1 - 2392 9 novel_in_catalog HNRNPR novel 2694 11 NA NA 0 -6 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 333 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.380.29 chr1 - 2314 9 novel_in_catalog HNRNPR novel 2694 11 NA NA 1 -6 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.744712 0.573418 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.380.30 chr1 - 2270 8 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000427764.3 1788 9 2423 -662 -36 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 6065 FALSE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.380.31 chr1 - 2215 8 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000374612.5 2694 11 6534 6 761 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 23 6.152027 0.789018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 6862 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 23 NA PB.380.32 chr1 - 2098 7 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000427764.3 1788 9 3223 -662 764 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 6865 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.380.33 chr1 - 2028 7 novel_in_catalog HNRNPR novel 7751 11 NA NA 771 -6 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 6872 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.380.35 chr1 - 1958 6 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000427764.3 1788 9 17384 -662 10007 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 44 11.769095 1.070743 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 8208 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 44 NA PB.380.36 chr1 - 1757 4 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000427764.3 1788 9 22316 -662 -5091 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 43 11.501616 1.060759 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 4917 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 43 NA PB.380.37 chr1 - 1649 4 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000427764.3 1788 9 22424 -662 -4983 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 55 14.711370 1.167653 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 5025 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 55 NA PB.380.38 chr1 - 1519 3 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000641107.1 646 5 -73 5829 -73 -6 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.884548 0.769713 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 9935 FALSE NA NA AATAAA -4 NA NA NA 22 NA PB.380.39 chr1 - 1372 2 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000476660.1 1637 3 596 8 596 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 39 10.431699 1.018355 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 7332 FALSE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 39 NA PB.380.40 chr1 - 1449 3 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000641107.1 646 5 -3 5829 -3 -6 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 31 8.291862 0.918652 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 10005 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 31 NA PB.380.57 chr1 - 1630 8 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000374612.5 2694 11 6518 607 745 -60 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAAAAATTGGCTTAA 6846 FALSE NA NA CATAAA -8 NA NA NA 4 NA PB.380.58 chr1 - 1446 6 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000427764.3 1788 9 17295 -61 9918 -60 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.744712 0.573418 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAAAAATTGGCTTAA 8119 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 14 NA PB.380.61 chr1 - 935 3 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000641107.1 646 5 -90 6430 -90 -60 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAAAAATTGGCTTAA 9918 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 5 NA PB.380.62 chr1 - 1348 10 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000374612.5 2694 11 15 1465 3 -797 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 73 19.525999 1.290613 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAGAAAAGGAAAGAGCGCCA 343 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 73 NA PB.380.63 chr1 - 1181 9 novel_in_catalog HNRNPR novel 2694 11 NA NA 1 -797 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 98 26.212986 1.418517 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAGAAAAGGAAAGAGCGCCA 341 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 98 NA PB.380.64 chr1 - 1150 9 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000374612.5 2694 11 3403 1465 89 -797 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAGAAAAGGAAAGAGCGCCA 3731 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.380.67 chr1 - 1333 3 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000427764.3 1788 9 21364 848 -6043 -848 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAGAAATAGAAGGGGAAGA 3965 FALSE NA NA TTTAAA -23 NA NA NA 2 NA PB.380.74 chr1 - 1225 9 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000302271.11 7751 11 -23 8913 3 -2 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAGATTATGCATTTGTTCA 343 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.380.75 chr1 - 1069 8 novel_in_catalog HNRNPR novel 2694 11 NA NA 0 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAGATTATGCATTTGTTCA 333 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.380.76 chr1 - 960 8 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000302271.11 7751 11 -25 13960 1 -165 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGAAGAATCGGGGGTT 341 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.380.77 chr1 - 815 7 novel_in_catalog HNRNPR novel 1032 8 NA NA 0 -165 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGAAGAATCGGGGGTT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.380.81 chr1 - 899 7 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000374612.5 2694 11 15 11763 3 -3066 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAGAATTCAGTAAAGTCACA 343 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.382.2 chr1 - 4254 3 full-splice_match ZNF436 ENST00000374608.3 3788 3 60 -526 60 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AGCAAACCTGAGAATTATTT 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.382.3 chr1 - 4143 3 full-splice_match ZNF436 ENST00000374608.3 3788 3 171 -526 171 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AGCAAACCTGAGAATTATTT 18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.383.1 chr1 - 1561 11 full-splice_match TCEA3 ENST00000450454.7 1719 11 3 155 3 -155 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGACCTGAGGTGTCATATCT -16 TRUE NA NA GGGGCT -23 NA NA NA 10 NA PB.383.2 chr1 - 1205 10 novel_in_catalog TCEA3 novel 1719 11 NA NA -6 -457 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCTGTCTGAGTGGGATG 57 FALSE NA NA GGGGCT -32 NA NA NA 5 NA PB.383.3 chr1 - 1224 11 full-splice_match TCEA3 ENST00000450454.7 1719 11 29 466 -12 -466 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 29 7.756904 0.889688 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATACTGAACTCTGTCTG 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 29 NA PB.383.4 chr1 - 933 7 novel_not_in_catalog TCEA3 novel 1719 11 NA NA 14279 -466 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATACTGAACTCTGTCTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.384.1 chr1 - 1410 2 incomplete-splice_match ASAP3 ENST00000465372.5 936 5 2458 -971 2458 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAGTGGTTTCATTTATGTGA 5601 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.384.2 chr1 - 2056 6 incomplete-splice_match ASAP3 ENST00000495646.5 2552 10 2982 0 -163 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCCAGTGGTTTCATTTATGT 2980 FALSE NA NA AAGAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.384.4 chr1 - 4111 25 full-splice_match ASAP3 ENST00000336689.8 4051 25 -64 4 -51 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTTTCCAGTGGTTTCATTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.384.5 chr1 - 3108 16 incomplete-splice_match ASAP3 ENST00000336689.8 4051 25 43027 4 1119 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTTTCCAGTGGTTTCATTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.385.1 chr1 - 2748 8 novel_not_in_catalog E2F2 novel 5196 7 NA NA -81 1224 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCCAACTGGCTTCCTCTACC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.385.2 chr1 - 1993 7 novel_not_in_catalog E2F2 novel 550 2 NA NA 6 766 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCATGGTTGCAGGCGCCTGT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.385.10 chr1 - 5189 7 full-splice_match E2F2 ENST00000361729.3 5196 7 6 1 6 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTCTGGGCATCTTGTCTT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.385.11 chr1 - 4134 4 incomplete-splice_match E2F2 ENST00000361729.3 5196 7 10205 1 -1632 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTCTGGGCATCTTGTCTT 9944 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.385.12 chr1 - 3810 2 incomplete-splice_match E2F2 ENST00000361729.3 5196 7 14799 1 2962 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTCTGGGCATCTTGTCTT 8373 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.386.1 chr1 + 2824 1 full-splice_match ZNF436-AS1 ENST00000335648.3 2547 1 -277 0 -4 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCACAATTGTCATAGTTTT -3 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 5 NA PB.386.2 chr1 + 2584 1 full-splice_match ZNF436-AS1 ENST00000335648.3 2547 1 -37 0 -24 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCACAATTGTCATAGTTTT -18 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 4 NA PB.387.1 chr1 + 622 6 full-splice_match RPL11 ENST00000643754.2 1017 6 -25 420 -25 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 178 47.611343 1.677710 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATGTGCAATTCTGTTGTG -1 TRUE NA NA AATAAA -42 NA NA NA 178 NA PB.387.3 chr1 + 1602 5 full-splice_match RPL11 ENST00000443624.6 1600 5 1 -3 1 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.477233 0.541234 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATGTGCAATTCTGTTGTG 6 TRUE NA NA AATAAA -42 NA NA NA 13 NA PB.387.4 chr1 + 813 6 full-splice_match RPL11 ENST00000467075.2 823 6 0 10 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATGTGCAATTCTGTTGTG 20 FALSE NA NA AATAAA -42 NA NA NA 2 NA PB.387.5 chr1 + 544 5 full-splice_match RPL11 ENST00000458455.2 879 5 332 3 29 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATGTGCAATTCTGTTGTG -4 TRUE NA NA AATAAA -42 NA NA NA 3 NA PB.387.7 chr1 + 1397 3 incomplete-splice_match RPL11 ENST00000443624.6 1600 5 2031 -2 1228 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAAATGTGCAATTCTGTTGT 25 FALSE NA NA AATAAA -41 NA NA NA 2 NA PB.387.9 chr1 + 1031 2 incomplete-splice_match RPL11 ENST00000458455.2 879 5 2652 -5 2349 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AATTCTGTTGTGTGTTCTGT 296 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.388.1 chr1 - 1438 3 full-splice_match ID3 ENST00000374561.6 950 3 -2 -486 -2 486 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CCTGGTTTCATTTCCTTCTT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.388.2 chr1 - 955 3 full-splice_match ID3 ENST00000374561.6 950 3 0 -5 0 5 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 1106 295.832275 2.471045 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TGACACCCGTCTCCATTAAG -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 1106 NA PB.388.6 chr1 - 1291 3 full-splice_match ID3 ENST00000374561.6 950 3 -343 2 -343 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATATGATGACACCCGTCTC -3 TRUE NA NA CATAAA -24 NA NA NA 5 NA PB.388.7 chr1 - 885 3 full-splice_match ID3 ENST00000374561.6 950 3 63 2 5 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.209753 0.506472 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATATGATGACACCCGTCTC 403 FALSE NA NA AAGAAA -23 NA NA NA 12 NA PB.388.8 chr1 - 1091 3 full-splice_match ID3 ENST00000374561.6 950 3 -146 5 -146 3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GTGTATATGATGACACCCGT 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.388.9 chr1 - 1046 2 full-splice_match ID3 ENST00000463312.1 623 2 -424 1 2 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTGTGTATATGATGACAC 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.388.10 chr1 - 1456 2 full-splice_match ID3 ENST00000486541.1 892 2 -58 -506 0 -5 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 24 6.419507 0.807502 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACACTTGTGTATATGATG -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 24 NA PB.388.11 chr1 - 700 3 full-splice_match ID3 ENST00000374561.6 950 3 237 13 179 -5 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACACTTGTGTATATGATG 577 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.389.1 chr1 + 4665 11 full-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 -46 219 -23 -183 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATCCTTGGTGTACTGAGCAG 270 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.389.2 chr1 + 4819 11 full-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 0 19 0 -9 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 27 7.221945 0.858654 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAATAAAAAACAAACTCCAT -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 27 NA PB.389.3 chr1 + 2681 11 full-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 0 2157 0 -2121 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 113 30.225178 1.480369 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTATCCCCCAGGTTTGTTT -10 TRUE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 113 NA PB.389.4 chr1 + 1341 4 incomplete-splice_match ELOA ENST00000609199.2 5075 10 23 10110 0 969 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 89 23.805672 1.376680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAATGACTCTAAAAG -10 TRUE NA NA GATAAA -7 NA NA NA 89 NA PB.389.7 chr1 + 2520 9 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 6370 2154 5807 -2118 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCCCCAGGTTTGTTTTTG 6360 FALSE NA NA AATAAA -27 NA NA NA 3 NA PB.389.8 chr1 + 2440 9 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 6449 2155 5886 -2119 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCCAGGTTTGTTTTT 6439 FALSE NA NA AATAAA -26 NA NA NA 3 NA PB.389.9 chr1 + 2344 8 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 7441 2155 6878 -2119 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCCAGGTTTGTTTTT 7431 FALSE NA NA AATAAA -26 NA NA NA 3 NA PB.389.10 chr1 + 2184 8 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 7597 2159 7034 -2123 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATATTATCCCCCAGGTTTGT 7587 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.389.11 chr1 + 1986 8 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 7790 2164 7227 -2128 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATTTATATTATCCCCCAGG 7780 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.389.12 chr1 + 1876 8 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 7909 2155 7346 -2119 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCCAGGTTTGTTTTT 7899 FALSE NA NA AATAAA -26 NA NA NA 10 NA PB.389.13 chr1 + 1732 8 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 8049 2159 7486 -2123 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATATTATCCCCCAGGTTTGT 8039 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 4 NA PB.389.14 chr1 + 1525 8 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 8260 2155 7697 -2119 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCCAGGTTTGTTTTT 8250 FALSE NA NA AATAAA -26 NA NA NA 10 NA PB.389.15 chr1 + 3595 8 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 8344 1 7781 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATATACTGTGTCTTCCTTAC 8334 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.389.16 chr1 + 1399 8 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 8378 2163 7815 -2127 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATTTATATTATCCCCCAGGT 8368 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 5 NA PB.389.17 chr1 + 1330 8 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 8456 2154 7893 -2118 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCCCCAGGTTTGTTTTTG 8446 FALSE NA NA AATAAA -27 NA NA NA 4 NA PB.389.18 chr1 + 1218 7 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 8945 2153 8382 -2117 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCCCCCAGGTTTGTTTTTGT 8935 FALSE NA NA AATAAA -28 NA NA NA 7 NA PB.389.20 chr1 + 3208 6 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 10687 2 10124 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CATATACTGTGTCTTCCTTA NA FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 3 NA PB.389.21 chr1 + 1002 6 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 10735 2160 10172 -2124 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATATTATCCCCCAGGTTTG NA FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 4 NA PB.389.22 chr1 + 3103 5 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 10900 1 10337 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATATACTGTGTCTTCCTTAC NA FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.389.23 chr1 + 3034 5 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 10951 19 10388 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAATAAAAAACAAACTCCAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.389.24 chr1 + 883 5 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 10967 2154 10404 -2118 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCCCCAGGTTTGTTTTTG NA FALSE NA NA AATAAA -27 NA NA NA 2 NA PB.389.25 chr1 + 787 4 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 12445 2154 11882 -2118 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCCCCAGGTTTGTTTTTG NA FALSE NA NA AATAAA -27 NA NA NA 2 NA PB.389.26 chr1 + 2737 3 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 12880 19 12317 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAATAAAAAACAAACTCCAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.390.1 chr1 + 1103 6 full-splice_match PITHD1 ENST00000246151.9 1590 6 -45 532 -45 -532 alternative_3end TRUE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGATTGTTGTGTGACTTGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.390.2 chr1 + 1519 5 novel_in_catalog PITHD1 novel 1590 6 NA NA -40 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTTTGTATTTTCTTTTG NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.390.3 chr1 + 1640 6 novel_not_in_catalog PITHD1 novel 1590 6 NA NA -35 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTTTGTATTTTCTTTTG -21 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 5 NA PB.390.4 chr1 + 1620 6 full-splice_match PITHD1 ENST00000246151.9 1590 6 -32 2 -32 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 240 64.195068 1.807502 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTTTGTATTTTCTTTTG -18 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 240 NA PB.390.5 chr1 + 2718 4 novel_in_catalog PITHD1 novel 1590 6 NA NA -25 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAATGTTTGTATTTTCTTTT -11 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.390.6 chr1 + 1559 5 novel_in_catalog PITHD1 novel 1590 6 NA NA -15 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 19 5.082109 0.706044 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTTTGTATTTTCTTTTG -1 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 19 NA PB.390.7 chr1 + 1523 6 full-splice_match PITHD1 ENST00000246151.9 1590 6 65 2 65 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.942274 0.468683 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTTTGTATTTTCTTTTG 79 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 11 NA PB.390.8 chr1 + 1343 6 full-splice_match PITHD1 ENST00000246151.9 1590 6 245 2 245 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 19 5.082109 0.706044 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTTTGTATTTTCTTTTG 259 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 19 NA PB.390.9 chr1 + 1231 4 incomplete-splice_match PITHD1 ENST00000246151.9 1590 6 1463 2 524 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTTTGTATTTTCTTTTG 1477 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 9 NA PB.390.10 chr1 + 1065 2 incomplete-splice_match PITHD1 ENST00000374524.1 1292 4 1123 2 1123 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.477233 0.541234 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTTTGTATTTTCTTTTG 7911 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 13 NA PB.390.11 chr1 + 975 2 incomplete-splice_match PITHD1 ENST00000374524.1 1292 4 1213 2 1213 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTTTGTATTTTCTTTTG 8001 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 7 NA PB.391.1 chr1 - 1130 5 novel_in_catalog ELOA-AS1 novel 1112 4 NA NA -7 1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGTTGCCTTCAGGGCTAC -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.391.2 chr1 - 964 4 full-splice_match ELOA-AS1 ENST00000664563.2 970 4 6 0 -5 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAAGTTGCCTTCAGGGCTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.391.3 chr1 - 781 3 full-splice_match ELOA-AS1 ENST00000686609.1 808 3 23 4 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAAGTTGCCTTCAGGGCTA -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.391.4 chr1 - 861 4 full-splice_match ELOA-AS1 ENST00000664563.2 970 4 6 103 -5 -103 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAACAAACCAATTTCCAAC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.392.1 chr1 - 1674 11 novel_in_catalog GALE novel 1488 12 NA NA 39 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCAGGTTCTCACAGATGGTC 62 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.392.2 chr1 - 1640 12 full-splice_match GALE ENST00000374497.7 1488 12 -151 -1 -30 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCAGGTTCTCACAGATGGTC 222 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.392.3 chr1 - 1503 10 novel_in_catalog GALE novel 1516 12 NA NA -3 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCAGGTTCTCACAGATGGTC -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.392.4 chr1 - 1494 12 novel_not_in_catalog GALE novel 1516 12 NA NA 1 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCAGGTTCTCACAGATGGTC 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.392.5 chr1 - 1275 9 incomplete-splice_match GALE ENST00000374497.7 1488 12 1673 -1 384 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCAGGTTCTCACAGATGGTC 2046 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.392.6 chr1 - 1087 8 incomplete-splice_match GALE ENST00000374497.7 1488 12 2245 -1 956 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCAGGTTCTCACAGATGGTC 2618 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.392.7 chr1 - 1579 12 novel_not_in_catalog GALE novel 1516 12 NA NA 0 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GGCAGGTTCTCACAGATGGT 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.392.8 chr1 - 1533 12 full-splice_match GALE ENST00000617979.5 1516 12 -18 1 1 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 334 89.338135 1.951037 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GGCAGGTTCTCACAGATGGT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 334 NA PB.392.9 chr1 - 1438 11 novel_in_catalog GALE novel 1516 12 NA NA -1 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GGCAGGTTCTCACAGATGGT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.392.10 chr1 - 1390 11 novel_in_catalog GALE novel 1516 12 NA NA -1 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 59 15.781287 1.198142 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GGCAGGTTCTCACAGATGGT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 59 NA PB.392.11 chr1 - 1312 10 novel_in_catalog GALE novel 1516 12 NA NA -1 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GGCAGGTTCTCACAGATGGT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.392.12 chr1 - 1425 11 incomplete-splice_match GALE ENST00000374497.7 1488 12 1012 1 46 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GGGCAGGTTCTCACAGATGG 1385 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.392.13 chr1 - 1895 11 novel_in_catalog GALE novel 1516 12 NA NA -1 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTGGGGCAGGTTCTCACAG -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.392.14 chr1 - 1621 11 full-splice_match GALE ENST00000459934.5 1563 11 -2 -56 -1 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.942274 0.468683 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTGGGGCAGGTTCTCACAG -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.392.15 chr1 - 1638 11 incomplete-splice_match GALE ENST00000374497.7 1488 12 795 5 -37 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTGGGGCAGGTTCTCACAG 1168 FALSE NA NA AATAGA -20 NA NA NA 2 NA PB.392.16 chr1 - 1397 11 novel_in_catalog GALE novel 1516 12 NA NA -1 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTGGGGCAGGTTCTCACAG -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.392.17 chr1 - 1652 11 novel_in_catalog GALE novel 1516 12 NA NA -1 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACACTGGGGCAGGTTCTCAC -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.393.1 chr1 - 1522 8 novel_in_catalog HMGCL novel 1570 9 NA NA -9 7 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTCGGTTGTGCAGCTGTGT -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.393.2 chr1 - 1621 9 full-splice_match HMGCL ENST00000374490.8 1570 9 -54 3 -54 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 294 78.638954 1.895638 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAATTCCAGCATTCGGTTGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 294 NA PB.393.3 chr1 - 1060 4 incomplete-splice_match HMGCL ENST00000374490.8 1570 9 14633 -4 3525 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCATTCGGTTGTGCAGCTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.393.4 chr1 - 1558 9 novel_not_in_catalog HMGCL novel 2151 10 NA NA -14 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATTCCAGCATTCGGTTGTG -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.393.5 chr1 - 1469 9 novel_in_catalog HMGCL novel 1570 9 NA NA -9 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATTCCAGCATTCGGTTGTG -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.393.6 chr1 - 1364 7 full-splice_match HMGCL ENST00000436439.6 1354 7 -10 0 -9 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 20 5.349589 0.728320 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATTCCAGCATTCGGTTGTG -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 20 NA PB.393.7 chr1 - 1326 7 incomplete-splice_match HMGCL ENST00000374490.8 1570 9 7930 2 34 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATTCCAGCATTCGGTTGTG 7974 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.393.8 chr1 - 1109 5 incomplete-splice_match HMGCL ENST00000374490.8 1570 9 11188 2 80 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATTCCAGCATTCGGTTGTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.393.10 chr1 - 1794 6 full-splice_match HMGCL ENST00000513148.1 2011 6 -26 243 -13 -243 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACGGTGGCTCACGCCTGTAA -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.393.11 chr1 - 1144 6 full-splice_match HMGCL ENST00000513148.1 2011 6 -71 938 -58 -938 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TACAAATGGTGAAATCAGGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.394.2 chr1 + 1657 10 novel_not_in_catalog LYPLA2 novel 1635 10 NA NA 0 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT -9 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.394.3 chr1 + 1633 10 full-splice_match LYPLA2 ENST00000374514.8 1635 10 0 2 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 827 221.205505 2.344796 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT -9 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 827 NA PB.394.5 chr1 + 2155 6 novel_in_catalog LYPLA2 novel 1072 8 NA NA 17 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAACGCTCAGGCCTGGCTGA 8 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.394.6 chr1 + 1718 10 novel_in_catalog LYPLA2 novel 1635 10 NA NA 20 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.942274 0.468683 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 11 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 11 NA PB.394.7 chr1 + 1857 9 novel_in_catalog LYPLA2 novel 1635 10 NA NA -19 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 14 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.394.8 chr1 + 1697 9 novel_in_catalog LYPLA2 novel 1635 10 NA NA -19 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 14 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.394.9 chr1 + 1691 9 incomplete-splice_match LYPLA2 ENST00000374514.8 1635 10 23 2 -19 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 14 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 7 NA PB.394.10 chr1 + 1578 9 novel_in_catalog LYPLA2 novel 1635 10 NA NA -19 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.477233 0.541234 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 14 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 13 NA PB.394.11 chr1 + 1540 9 full-splice_match LYPLA2 ENST00000495365.5 842 9 -35 -663 -19 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACGCTCAGGCCTGGCTGATT 14 TRUE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.394.12 chr1 + 1485 10 full-splice_match LYPLA2 ENST00000374503.7 868 10 -35 -582 -19 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 14 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 9 NA PB.394.14 chr1 + 1705 9 novel_in_catalog LYPLA2 novel 1635 10 NA NA -13 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT -9 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.394.15 chr1 + 1782 8 full-splice_match LYPLA2 ENST00000374502.7 1072 8 -43 -667 -9 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.744712 0.573418 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT -5 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 14 NA PB.394.17 chr1 + 1592 10 novel_in_catalog LYPLA2 novel 717 9 NA NA -18 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 5 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.394.18 chr1 + 1682 10 novel_in_catalog LYPLA2 novel 717 9 NA NA -3 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT -9 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.394.19 chr1 + 1441 9 incomplete-splice_match LYPLA2 ENST00000374514.8 1635 10 1598 2 751 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 766 FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 5 NA PB.394.20 chr1 + 1296 6 full-splice_match LYPLA2 ENST00000374501.1 1117 6 81 -260 81 -2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.012192 0.603382 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 72 FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 15 NA PB.394.21 chr1 + 1132 3 incomplete-splice_match LYPLA2 ENST00000374501.1 1117 6 571 -260 132 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 562 FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 7 NA PB.394.22 chr1 + 977 2 incomplete-splice_match LYPLA2 ENST00000472213.1 822 3 388 -456 388 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 818 FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 9 NA PB.395.1 chr1 - 2202 8 novel_not_in_catalog FUCA1 novel 2043 8 NA NA 8 -7 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAAACATGGTATAGCTT 39 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.395.2 chr1 - 1103 4 incomplete-splice_match FUCA1 ENST00000374479.4 2043 8 13891 7 13891 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAAACATGGTATAGCTT 284 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.395.3 chr1 - 976 3 incomplete-splice_match FUCA1 ENST00000374479.4 2043 8 19538 7 19538 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAAACATGGTATAGCTT 5931 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.395.4 chr1 - 2068 8 full-splice_match FUCA1 ENST00000374479.4 2043 8 -33 8 -33 -8 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 199 53.228409 1.726143 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 CAAAAAAACATGGTATAGCT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 199 NA PB.395.5 chr1 - 1634 7 incomplete-splice_match FUCA1 ENST00000374479.4 2043 8 2661 20 2661 -20 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AATCATTTCTACCAAAAAAA 2692 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.395.6 chr1 - 1528 7 incomplete-splice_match FUCA1 ENST00000374479.4 2043 8 2767 20 2767 -20 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AATCATTTCTACCAAAAAAA 2798 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.395.7 chr1 - 1051 3 incomplete-splice_match FUCA1 ENST00000374479.4 2043 8 19450 20 19450 -20 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AATCATTTCTACCAAAAAAA 5843 FALSE NA NA AATGAA -29 NA NA NA 6 NA PB.395.8 chr1 - 1356 5 incomplete-splice_match FUCA1 ENST00000374479.4 2043 8 8387 21 8387 -21 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 CAATCATTTCTACCAAAAAA 8418 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.395.9 chr1 - 1839 8 full-splice_match FUCA1 ENST00000374479.4 2043 8 181 23 181 -23 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 CACAATCATTTCTACCAAAA 212 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.396.3 chr1 - 3900 7 novel_in_catalog SRSF10 novel 2839 7 NA NA 0 -9 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAATAAATCTTGGGTTTT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.396.4 chr1 - 3576 7 novel_not_in_catalog SRSF10 novel 7656 6 NA NA 0 -9 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAATAAATCTTGGGTTTT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.396.5 chr1 - 3474 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000344989.10 3487 6 4 9 0 -9 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 26 6.954466 0.842264 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAATAAATCTTGGGTTTT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 26 NA PB.396.6 chr1 - 3420 5 full-splice_match SRSF10 ENST00000484146.6 1089 5 29 -2360 0 -9 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAATAAATCTTGGGTTTT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.396.14 chr1 - 3390 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000344989.10 3487 6 -28 125 -3 -125 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.477233 0.541234 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TAAATTCATTGAGAACTAAC 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.396.15 chr1 - 3328 5 full-splice_match SRSF10 ENST00000484146.6 1089 5 5 -2244 5 -125 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TAAATTCATTGAGAACTAAC 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.396.16 chr1 - 2888 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000344989.10 3487 6 4 595 0 -595 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATGGTTGTGTGGCTCAGAGA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.396.17 chr1 - 1581 4 novel_not_in_catalog SRSF10 novel 3957 4 NA NA 3054 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATGTTTTGGATTCCTTAG 8363 FALSE NA NA AATACA -25 NA NA NA 3 NA PB.396.22 chr1 - 2581 4 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000341154.10 2839 7 4865 4 -1010 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATGTTTTGGATTCCTTA 4299 FALSE NA NA TATAAA -24 NA NA NA 3 NA PB.396.24 chr1 - 2296 7 novel_not_in_catalog SRSF10 novel 2839 7 NA NA -13 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATGTTTTGGATTCCTTA -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.396.26 chr1 - 2264 7 novel_in_catalog SRSF10 novel 2839 7 NA NA 0 -4 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATGTTTTGGATTCCTTA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.396.27 chr1 - 2081 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000374452.9 1194 6 -29 -858 -6 -4 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 23 6.152027 0.789018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATGTTTTGGATTCCTTA -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 23 NA PB.396.28 chr1 - 2116 4 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000453840.7 1808 6 4696 4 -548 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATGTTTTGGATTCCTTA 4761 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.396.29 chr1 - 1940 7 novel_not_in_catalog SRSF10 novel 7656 6 NA NA 0 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.477233 0.541234 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATGTTTTGGATTCCTTA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.396.30 chr1 - 1784 5 full-splice_match SRSF10 ENST00000484146.6 1089 5 29 -724 0 -4 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 36 9.629260 0.983593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATGTTTTGGATTCCTTA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 36 NA PB.396.31 chr1 - 1879 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000344989.10 3487 6 -37 1645 -12 -4 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 304 81.313751 1.910164 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATGTTTTGGATTCCTTA -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 304 NA PB.396.33 chr1 - 1728 5 full-splice_match SRSF10 ENST00000484146.6 1089 5 85 -724 0 -4 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATGTTTTGGATTCCTTA 90 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.396.34 chr1 - 1579 4 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000341154.10 2839 7 5867 4 -8 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATGTTTTGGATTCCTTA 5301 FALSE NA NA GGGGCT -14 NA NA NA 9 NA PB.396.35 chr1 - 1383 3 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000341154.10 2839 7 9024 4 3149 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 19 5.082109 0.706044 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATGTTTTGGATTCCTTA 8458 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.396.41 chr1 - 4667 7 novel_in_catalog SRSF10 novel 2839 7 NA NA -3 -6 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACAAAATGTTTTGGATTCCT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.396.42 chr1 - 5091 6 novel_in_catalog SRSF10 novel 2839 7 NA NA 0 -7 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CACAAAATGTTTTGGATTCC 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.396.44 chr1 - 1641 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000344989.10 3487 6 -37 1883 -12 -242 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAACACATGCTAGGATATAA -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.396.45 chr1 - 1068 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000344989.10 3487 6 -38 2457 -13 40 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTGGCAAATCTTGCCTTTG -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.396.46 chr1 - 932 5 full-splice_match SRSF10 ENST00000484146.6 1089 5 -12 169 -12 -35 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACAGTGCCTCTGTTGGTCTG -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.396.47 chr1 - 824 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000344989.10 3487 6 4 2659 0 155 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 26 6.954466 0.842264 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TACTTGTGGAAACTAATCCC 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 26 NA PB.396.49 chr1 - 2901 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000492112.3 7656 6 0 4755 0 -19 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 43 11.501616 1.060759 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AATAAAAACAAAATGAAGGA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 43 NA PB.396.50 chr1 - 2597 4 full-splice_match SRSF10 ENST00000485841.5 3957 4 2637 -1277 37 -19 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AATAAAAACAAAATGAAGGA 5346 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.396.51 chr1 - 2487 3 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000485841.5 3957 4 5708 -1277 3108 -19 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AATAAAAACAAAATGAAGGA 8417 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.396.63 chr1 - 4921 6 novel_in_catalog SRSF10 novel 7656 6 NA NA -12 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.396.64 chr1 - 2963 4 full-splice_match SRSF10 ENST00000485841.5 3957 4 994 0 994 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA 3703 FALSE NA NA AAAACA -45 NA NA NA 2 NA PB.396.65 chr1 - 2414 5 novel_not_in_catalog SRSF10 novel 1390 5 NA NA 11 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA 16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.396.66 chr1 - 2406 5 full-splice_match SRSF10 ENST00000495785.1 1390 5 -56 -960 0 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.396.67 chr1 - 2183 6 novel_in_catalog SRSF10 novel 2839 7 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.396.68 chr1 - 2084 7 novel_not_in_catalog SRSF10 novel 7656 6 NA NA -15 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.396.69 chr1 - 2050 7 novel_in_catalog SRSF10 novel 7656 6 NA NA 0 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.396.70 chr1 - 1980 4 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000484146.6 1089 5 29 3206 0 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.396.71 chr1 - 1866 5 novel_in_catalog SRSF10 novel 7656 6 NA NA 10 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA 15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.396.72 chr1 - 1799 5 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000374452.9 1194 6 -61 3072 -13 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.396.73 chr1 - 1679 4 full-splice_match SRSF10 ENST00000485841.5 3957 4 2278 0 -322 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA 4987 FALSE NA NA AAAAAG -15 NA NA NA 3 NA PB.396.74 chr1 - 1666 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000492112.3 7656 6 -42 6032 -13 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 228 60.985313 1.785225 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 228 NA PB.396.75 chr1 - 1483 5 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000492112.3 7656 6 1514 6032 133 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA 1548 FALSE NA NA CATAAA -32 NA NA NA 2 NA PB.396.76 chr1 - 1375 4 full-splice_match SRSF10 ENST00000485841.5 3957 4 2582 0 -18 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA 5291 FALSE NA NA GGGGCT -24 NA NA NA 3 NA PB.396.77 chr1 - 1279 3 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000485841.5 3957 4 5639 0 3039 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA 8348 FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.396.78 chr1 - 1222 3 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000485841.5 3957 4 5696 0 3096 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA 8405 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.396.83 chr1 - 1220 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000492112.3 7656 6 -26 6462 3 166 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.209753 0.506472 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATATTTGGTAGAACTGTTAA 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.396.84 chr1 - 3865 7 novel_in_catalog SRSF10 novel 7656 6 NA NA -10 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCTTAAGAGTCCAGTTTG -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.396.85 chr1 - 1467 7 novel_in_catalog SRSF10 novel 1390 5 NA NA -10 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCTTAAGAGTCCAGTTTG 20 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.396.86 chr1 - 1043 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000492112.3 7656 6 -16 6629 -12 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 75 20.060959 1.302352 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCTTAAGAGTCCAGTTTG 18 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 75 NA PB.396.87 chr1 - 4278 6 novel_in_catalog SRSF10 novel 7656 6 NA NA 0 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGCCACTCTTAAGAGTCCA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.396.93 chr1 - 820 2 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000343255.9 2917 6 0 9052 0 20 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.942274 0.468683 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAGAAAAAATAAAGAAAA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.398.1 chr1 - 3158 18 incomplete-splice_match MYOM3 ENST00000374434.4 5760 37 32012 1 4009 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACAAAGTAACACCTGCCTCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.398.2 chr1 - 2150 9 incomplete-splice_match MYOM3 ENST00000338909.9 2693 10 635 13 635 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AACACCACAAAGTAACACCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.398.3 chr1 - 1845 5 incomplete-splice_match MYOM3 ENST00000338909.9 2693 10 4485 13 4485 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AACACCACAAAGTAACACCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.399.2 chr1 + 2284 3 full-splice_match PNRC2 ENST00000471915.5 380 3 88 -1992 88 -5 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAATGGTTTTGATTGCTT -7 TRUE NA NA AATAAA -30 NA NA NA 2 NA PB.399.3 chr1 + 1668 3 novel_not_in_catalog PNRC2 novel 380 3 NA NA 146 -768 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAGTTTTCTTGGCCTTTAT 51 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.399.4 chr1 + 2931 3 full-splice_match PNRC2 ENST00000334351.8 2400 3 -550 19 169 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CTTGGTTTTATTTTAAAAAT -7 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 4 NA PB.399.8 chr1 + 922 3 full-splice_match PNRC2 ENST00000334351.8 2400 3 -8 1486 -8 96 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 TAAAAAAAATAGACCATCTC 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.399.9 chr1 + 2400 3 full-splice_match PNRC2 ENST00000334351.8 2400 3 -6 6 -6 -6 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 330 88.268219 1.945804 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAAAATGGTTTTGATTGCT 5 TRUE NA NA AATAAA -29 NA NA NA 330 NA PB.399.11 chr1 + 3328 2 incomplete-splice_match PNRC2 ENST00000471915.5 380 3 716 -1992 -3 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAATGGTTTTGATTGCTT 8 TRUE NA NA AATAAA -30 NA NA NA 3 NA PB.399.12 chr1 + 1815 3 full-splice_match PNRC2 ENST00000334351.8 2400 3 0 585 0 -569 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACCCTAGTGTAATAAGTTTT 11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.399.14 chr1 + 1616 3 full-splice_match PNRC2 ENST00000334351.8 2400 3 0 784 0 -768 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 110 29.422739 1.468683 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAGTTTTCTTGGCCTTTAT 11 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 110 NA PB.399.15 chr1 + 1487 3 full-splice_match PNRC2 ENST00000334351.8 2400 3 0 913 0 669 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATTCTAATAGTGCTCTGGC 11 TRUE NA NA AATACA -27 NA NA NA 8 NA PB.399.16 chr1 + 2248 3 full-splice_match PNRC2 ENST00000334351.8 2400 3 132 20 132 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GCTTGGTTTTATTTTAAAAA 143 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.399.18 chr1 + 2180 2 incomplete-splice_match PNRC2 ENST00000334351.8 2400 3 1126 24 1126 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTGGCTTGGTTTTATTTTA 1137 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 10 NA PB.399.19 chr1 + 1303 2 incomplete-splice_match PNRC2 ENST00000334351.8 2400 3 1243 784 1243 -768 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAGTTTTCTTGGCCTTTAT 1254 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 6 NA PB.400.1 chr1 - 2841 7 full-splice_match IL22RA1 ENST00000270800.2 2817 7 -24 0 -24 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CCTGTTGTGATTTTTTTTTT -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.401.1 chr1 - 4573 7 full-splice_match IFNLR1 ENST00000327535.6 4566 7 8 -15 8 15 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCGTATGCTCTTATCT -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.402.1 chr1 + 3193 3 antisense novelGene_IFNLR1_AS novel NA NA NA NA NA NA multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCCCAAGACTACCTGAG NA FALSE NA NA ATTAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.404.3 chr1 + 1706 12 novel_not_in_catalog NIPAL3 novel 5372 12 NA NA -9 2950 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGGATGCGTTATCTTGGT -6 TRUE NA NA AAAAAG -15 NA NA NA 2 NA PB.404.4 chr1 + 1335 11 novel_in_catalog NIPAL3 novel 1676 12 NA NA -6 -9 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAATTAAAAATAAATAAAT -3 TRUE NA NA AAGAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.404.6 chr1 + 5369 12 full-splice_match NIPAL3 ENST00000374399.9 5372 12 0 3 0 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGACAGCTGAGTTCGTGTCT 3 TRUE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 4 NA PB.404.11 chr1 + 1724 12 full-splice_match NIPAL3 ENST00000374399.9 5372 12 0 3648 0 2950 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 29 7.756904 0.889688 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGGATGCGTTATCTTGGT 3 TRUE NA NA AAAAAG -15 NA NA NA 29 NA PB.404.12 chr1 + 1679 12 full-splice_match NIPAL3 ENST00000339255.2 1676 12 -12 9 0 -9 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 35 9.361781 0.971358 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAATTAAAAATAAATAAAT 3 TRUE NA NA AAGAAA -15 NA NA NA 35 NA PB.404.15 chr1 + 1070 5 incomplete-splice_match NIPAL3 ENST00000339255.2 1676 12 40340 -395 -12 327 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTTTAGGTGTATTCCTGTT NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.405.1 chr1 + 2690 5 full-splice_match RCAN3 ENST00000538532.6 2421 5 -56 -213 -56 -6 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAACTCAGCATTGTGCCCAT NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.405.3 chr1 + 1489 5 full-splice_match RCAN3 ENST00000374395.9 6863 5 89 5285 28 -106 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ACTCAGTATACATGAAATTT 1 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 5 NA PB.405.4 chr1 + 2712 5 novel_in_catalog RCAN3 novel 6863 5 NA NA 30 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAACTCAGCATTGTGCCCAT 3 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 7 NA PB.405.5 chr1 + 1231 3 incomplete-splice_match RCAN3 ENST00000374395.9 6863 5 150 9011 89 -3250 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAATTAAAAAAAAAAGGTTT -27 TRUE NA NA ATTAAA -44 NA NA NA 2 NA PB.405.6 chr1 + 2685 5 full-splice_match RCAN3 ENST00000374395.9 6863 5 152 4026 91 -5 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACTCAGCATTGTGCCCATT -25 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 6 NA PB.405.7 chr1 + 2636 5 full-splice_match RCAN3 ENST00000374395.9 6863 5 206 4021 145 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCATTGTGCCCATTTTTTA 29 TRUE NA NA AATAAA -23 NA NA NA 2 NA PB.407.1 chr1 + 3870 18 novel_in_catalog SRRM1 novel 3110 18 NA NA -81 -18 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATTTTGCCACTCTTACT 71 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.407.3 chr1 + 3896 18 novel_in_catalog SRRM1 novel 3735 17 NA NA -20 -19 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATTTTGCCACTCTTAC 31 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.407.4 chr1 + 2918 6 novel_in_catalog SRRM1 novel 3735 17 NA NA 1 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAAGAAAAGGAGAAGGA -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.407.6 chr1 + 2617 7 novel_in_catalog SRRM1 novel 3735 17 NA NA 1 -18 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 GAAAAAAATTCCAAAAAAGA -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.407.7 chr1 + 2538 16 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 -29 1812 1 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 50 13.373972 1.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAACACAAGAAGGAAAA -18 TRUE NA NA AAAAAG -43 NA NA NA 50 NA PB.407.8 chr1 + 1977 14 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 -29 3975 1 42 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAACAAAGAAGCTCCCCAGT -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.407.9 chr1 + 1166 9 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000479034.5 2671 17 -35 16669 1 -203 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGAAGCCTCCCAAGAGGA -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.407.10 chr1 + 670 6 full-splice_match SRRM1 ENST00000490543.5 673 6 -32 35 1 19 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AGAGAAAAAAGGGAGCGGTC -18 TRUE NA NA GATAAA -28 NA NA NA 2 NA PB.407.11 chr1 + 544 5 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000468822.5 768 7 -2 2459 1 23 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.547151 0.657739 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAAAGGGAGCGGTCTCGT -18 TRUE NA NA GATAAA -32 NA NA NA 17 NA PB.407.13 chr1 + 836 7 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000479034.5 2671 17 -33 19103 0 -17 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 79 21.130877 1.324918 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAATTCCAAAAAAGAA -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 79 NA PB.407.14 chr1 + 2572 17 full-splice_match SRRM1 ENST00000479034.5 2671 17 -27 126 6 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 45 12.036575 1.080503 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAACACAAGAAGGAAAA -10 TRUE NA NA AAAAAG -43 NA NA NA 45 NA PB.407.15 chr1 + 3725 17 full-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 -9 19 0 -19 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 35 9.361781 0.971358 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATTTTGCCACTCTTAC 2 TRUE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 35 NA PB.407.16 chr1 + 2581 4 full-splice_match SRRM1 ENST00000462710.5 2624 4 8 35 -1 19 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.884548 0.769713 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AGAGAAAAAAGGGAGCGGTC 10 TRUE NA NA GATAAA -28 NA NA NA 22 NA PB.407.19 chr1 + 1302 9 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000479034.5 2671 17 -15 16513 0 -47 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAAAGTCGTGTTTCTG 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.407.20 chr1 + 728 7 full-splice_match SRRM1 ENST00000468822.5 768 7 18 22 0 -17 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAATTCCAAAAAAGAA 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.407.21 chr1 + 2316 15 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 -8 3083 1 690 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAAGCCCCCAGCACCTCC 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.407.23 chr1 + 2190 4 full-splice_match SRRM1 ENST00000466910.5 799 4 23 -1414 2 115 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAGAAGAAATAAAACA 4 TRUE NA NA AAGAAA -36 NA NA NA 8 NA PB.407.24 chr1 + 3761 18 novel_in_catalog SRRM1 novel 3110 18 NA NA -1 -20 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 19 5.082109 0.706044 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAAATTTTGCCACTCTTA 7 TRUE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 19 NA PB.407.27 chr1 + 2292 5 novel_in_catalog SRRM1 novel 673 6 NA NA -1 19 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 20 5.349589 0.728320 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AGAGAAAAAAGGGAGCGGTC 10 TRUE NA NA GATAAA -28 NA NA NA 20 NA PB.407.28 chr1 + 2474 3 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000600523.5 575 6 11 -114 0 114 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.942274 0.468683 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 GAAGAAAGAAGAAATAAAAC 8 TRUE NA NA AAGAAA -35 NA NA NA 11 NA PB.407.29 chr1 + 3754 18 novel_in_catalog SRRM1 novel 3110 18 NA NA 1 -19 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATTTTGCCACTCTTAC 9 TRUE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 8 NA PB.407.31 chr1 + 3711 17 novel_in_catalog SRRM1 novel 3735 17 NA NA -1 -19 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATTTTGCCACTCTTAC 10 TRUE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 10 NA PB.407.32 chr1 + 1358 6 novel_not_in_catalog SRRM1 novel 673 6 NA NA -1 -17 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAGATAAAAGAGATAAGGA 10 TRUE NA NA AAAAAG -13 NA NA NA 2 NA PB.407.33 chr1 + 2347 16 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000479034.5 2671 17 -3 1397 0 690 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAAGCCCCCAGCACCTCC 14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.407.35 chr1 + 614 5 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000596378.1 2314 15 3178 17005 -1797 -6 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAAGAAAAGGAGAAGGA 3161 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.407.36 chr1 + 2251 2 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000495561.1 563 3 -1794 1518 -1710 -17 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAGATAAAAGAGATAAGGA 3248 FALSE NA NA AAAAAG -13 NA NA NA 5 NA PB.407.37 chr1 + 1519 2 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000495561.1 563 3 -1062 1518 -978 -17 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAGATAAAAGAGATAAGGA 3980 FALSE NA NA AAAAAG -13 NA NA NA 2 NA PB.407.39 chr1 + 1171 2 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000495561.1 563 3 -714 1518 -630 -17 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAGATAAAAGAGATAAGGA 4328 FALSE NA NA AAAAAG -13 NA NA NA 4 NA PB.407.40 chr1 + 1042 2 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000495561.1 563 3 -585 1518 -501 -17 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAGATAAAAGAGATAAGGA 4457 FALSE NA NA AAAAAG -13 NA NA NA 2 NA PB.407.41 chr1 + 878 2 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000495561.1 563 3 -421 1518 -337 -17 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAGATAAAAGAGATAAGGA 4621 FALSE NA NA AAAAAG -13 NA NA NA 2 NA PB.407.42 chr1 + 3394 14 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 5620 19 304 -19 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATTTTGCCACTCTTAC 5346 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.407.43 chr1 + 3358 15 novel_in_catalog SRRM1 novel 2671 17 NA NA 382 -19 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATTTTGCCACTCTTAC 66 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 3 NA PB.407.48 chr1 + 2832 11 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 9265 20 70 -20 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAAATTTTGCCACTCTTA 3633 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 3 NA PB.407.51 chr1 + 2626 9 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 11577 20 -132 -20 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAAATTTTGCCACTCTTA -8 TRUE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 4 NA PB.407.52 chr1 + 2467 10 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000374389.8 3110 18 11781 -635 26 -20 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAAATTTTGCCACTCTTA 193 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.407.54 chr1 + 2334 8 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000374389.8 3110 18 18013 -635 -5243 -20 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAAATTTTGCCACTCTTA 5526 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 3 NA PB.407.55 chr1 + 2259 7 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000374389.8 3110 18 19360 -644 -3896 -11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGCCACTCTTACTTAGTAGT 6873 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.407.56 chr1 + 2182 6 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 19383 20 -3870 -20 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAAATTTTGCCACTCTTA 6899 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.407.59 chr1 + 2057 5 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 23518 20 265 -20 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAAATTTTGCCACTCTTA NA FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 10 NA PB.407.60 chr1 + 1929 4 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 25844 19 -437 -19 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATTTTGCCACTCTTAC NA FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 5 NA PB.407.61 chr1 + 1841 4 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 25940 11 -341 -11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGCCACTCTTACTTAGTAGT NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.407.62 chr1 + 1714 4 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 26059 19 -222 -19 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.012192 0.603382 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATTTTGCCACTCTTAC NA FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 15 NA PB.407.63 chr1 + 1486 3 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 26818 20 537 -20 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 25 6.686986 0.825230 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAAATTTTGCCACTCTTA NA FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 25 NA PB.407.64 chr1 + 1369 3 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 26936 19 655 -19 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.814630 0.682563 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATTTTGCCACTCTTAC NA FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 18 NA PB.407.65 chr1 + 1288 2 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 28095 11 1814 -11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 29 7.756904 0.889688 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGCCACTCTTACTTAGTAGT NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 29 NA PB.407.66 chr1 + 1217 2 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 28158 19 1877 -19 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.012192 0.603382 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATTTTGCCACTCTTAC NA FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 15 NA PB.407.67 chr1 + 1150 2 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 28225 19 1944 -19 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATTTTGCCACTCTTAC NA FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 5 NA PB.408.2 chr1 - 2676 9 full-splice_match STPG1 ENST00000337248.9 2726 9 48 2 -9 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.617068 0.749510 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAGCTTTTGGGTACCCCTTA 21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 21 NA PB.408.3 chr1 - 2581 8 full-splice_match STPG1 ENST00000003583.12 2544 8 -34 -3 23 3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGAGCTTTTGGGTACCCCTT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.408.5 chr1 - 2824 10 novel_in_catalog STPG1 novel 6016 10 NA NA 11 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TATTGAGCTTTTGGGTACCC -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.408.6 chr1 - 1585 9 full-splice_match STPG1 ENST00000337248.9 2726 9 42 1099 -15 -1093 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTCCTGCCTTTCTCATTTG 15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.408.7 chr1 - 841 7 incomplete-splice_match STPG1 ENST00000337248.9 2726 9 11 12737 11 -693 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CCGGGACCTGGTTATTACAA -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.408.8 chr1 - 1236 4 incomplete-splice_match STPG1 ENST00000337248.9 2726 9 50 26085 -7 -3811 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAATTAGCCAGGAGTGGT 23 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.409.2 chr1 + 4311 6 full-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 -62 4 3 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 429 114.748680 2.059748 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGTGTTTGAGACTACTA 26 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 429 NA PB.409.3 chr1 + 4301 7 novel_in_catalog CLIC4 novel 2723 7 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATAAAGGATTCTTTTTTCCC 23 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.409.4 chr1 + 4154 5 novel_in_catalog CLIC4 novel 2723 7 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATAAAGGATTCTTTTTTCCC 23 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.409.5 chr1 + 1775 6 full-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 -55 2533 10 1881 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.884548 0.769713 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAATCATAGAGCTTGCTATT 33 FALSE NA NA AAAAAG -13 NA NA NA 22 NA PB.409.6 chr1 + 2734 6 full-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 -62 1581 3 -1527 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAGGAAGATGCACTATTCAG 26 TRUE NA NA ATTAAA -23 NA NA NA 5 NA PB.409.8 chr1 + 943 6 full-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 -62 3372 3 1042 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 43 11.501616 1.060759 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAGAGATGTCTTCATGTC 26 TRUE NA NA AGTAAA -12 NA NA NA 43 NA PB.409.10 chr1 + 1447 6 full-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 -4 2810 -4 1604 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTACAGATTTTGCTATATT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.409.11 chr1 + 2253 6 full-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 0 2000 0 -1946 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAGACAAAAGCAAAACCA 0 TRUE NA NA AATAAA -27 NA NA NA 2 NA PB.409.12 chr1 + 4112 6 full-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 137 4 137 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGTGTTTGAGACTACTA 99 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 7 NA PB.409.19 chr1 + 3915 4 incomplete-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 68692 4 68692 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGTGTTTGAGACTACTA 15 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 9 NA PB.409.21 chr1 + 3793 3 incomplete-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 81603 5 81603 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.942274 0.468683 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAAGTGTTTGAGACTACT NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 11 NA PB.409.23 chr1 + 3577 2 incomplete-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 94513 54 94513 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATAAAGGATTCTTTTTTCCC 9 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 8 NA PB.410.7 chr1 - 2407 5 full-splice_match RUNX3 ENST00000308873.11 4267 5 318 1542 318 -24 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAACAAA 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.410.8 chr1 - 2241 5 full-splice_match RUNX3 ENST00000308873.11 4267 5 484 1542 484 -24 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAACAAA 482 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.410.9 chr1 - 1848 3 incomplete-splice_match RUNX3 ENST00000496967.1 572 5 9484 -1519 9484 -24 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAACAAA 9963 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.410.11 chr1 - 2073 5 full-splice_match RUNX3 ENST00000308873.11 4267 5 651 1543 651 -25 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 CAAAAAAAAAAAAAAAACAA 649 FALSE NA NA GGGGCT -18 NA NA NA 6 NA PB.412.1 chr1 - 1674 7 full-splice_match SYF2 ENST00000236273.9 1757 7 -13 96 -13 -96 alternative_3end TRUE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AATACTATTATCACTGCAAT 3743 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.412.2 chr1 - 1014 4 incomplete-splice_match SYF2 ENST00000354361.3 926 6 4287 -275 4233 275 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.744712 0.573418 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAATTTCTAACATTTTTAG 8059 FALSE NA NA AAAAAG -7 NA NA NA 14 NA PB.412.3 chr1 - 1350 7 full-splice_match SYF2 ENST00000236273.9 1757 7 1 406 1 283 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 239 63.927589 1.805688 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAACATTTTTAGTCTATCAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 239 NA PB.412.4 chr1 - 868 3 incomplete-splice_match SYF2 ENST00000354361.3 926 6 5026 -283 4972 283 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAACATTTTTAGTCTATCAT 8798 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.412.5 chr1 - 2087 6 novel_in_catalog SYF2 novel 1757 7 NA NA 3 276 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAATTTCTAACATTTTTAGT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.412.6 chr1 - 1116 5 incomplete-splice_match SYF2 ENST00000236273.9 1757 7 3440 413 3370 276 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAATTTCTAACATTTTTAGT 7196 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.412.7 chr1 - 1237 6 full-splice_match SYF2 ENST00000354361.3 926 6 -36 -275 -20 275 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAATTTCTAACATTTTTAG 3736 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.412.8 chr1 - 1263 6 incomplete-splice_match SYF2 ENST00000236273.9 1757 7 312 414 242 275 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAATTTCTAACATTTTTAG -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.412.9 chr1 - 858 5 incomplete-splice_match SYF2 ENST00000236273.9 1757 7 3396 715 3326 -26 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAATGTATATGGCTGTTTA 7152 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.412.10 chr1 - 1797 6 novel_in_catalog SYF2 novel 1757 7 NA NA 3 -30 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTTTAAATGTATATGGCTG 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.412.11 chr1 - 1031 7 full-splice_match SYF2 ENST00000236273.9 1757 7 6 720 6 -31 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 136 36.377205 1.560829 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TATTTTAAATGTATATGGCT 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 136 NA PB.412.12 chr1 - 782 5 incomplete-splice_match SYF2 ENST00000236273.9 1757 7 3467 720 3397 -31 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TATTTTAAATGTATATGGCT 7223 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.412.13 chr1 - 918 7 full-splice_match SYF2 ENST00000236273.9 1757 7 3 836 3 -147 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 77 20.595917 1.313781 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATATCCTTTCATGTATATT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 77 NA PB.412.14 chr1 - 714 5 incomplete-splice_match SYF2 ENST00000236273.9 1757 7 3419 836 3349 -147 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATATCCTTTCATGTATATT 7175 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.413.2 chr1 - 2828 5 novel_in_catalog RSRP1 novel 2941 4 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGTCTTTATTGTATATATAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.413.3 chr1 - 2401 5 novel_not_in_catalog RSRP1 novel 2941 4 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGTCTTTATTGTATATATAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.413.4 chr1 - 2208 4 novel_in_catalog RSRP1 novel 3034 6 NA NA 352 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGTCTTTATTGTATATATAT -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.413.5 chr1 - 2060 6 novel_in_catalog RSRP1 novel 3034 6 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGTCTTTATTGTATATATAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.413.6 chr1 - 2079 2 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000566395.5 824 5 1363 -5 36 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGTCTTTATTGTATATATAT 2316 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.413.8 chr1 - 1860 2 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000566395.5 824 5 1575 2 248 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CATTCTTAGTCTTTATTGTA 2528 FALSE NA NA AATAAA -44 NA NA NA 4 NA PB.413.9 chr1 - 1753 2 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000566395.5 824 5 1689 -5 362 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGTCTTTATTGTATATATAT 2642 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.413.10 chr1 - 1646 2 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000566395.5 824 5 1796 -5 469 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGTCTTTATTGTATATATAT 2749 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.413.11 chr1 - 1223 2 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000566395.5 824 5 2219 -5 -211 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGTCTTTATTGTATATATAT 3172 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.413.12 chr1 - 1044 2 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000566395.5 824 5 2398 -5 -32 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGTCTTTATTGTATATATAT 3351 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 7 NA PB.413.13 chr1 - 883 4 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000243189.12 1425 5 820 1 6 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGTCTTTATTGTATATATAT 854 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.413.14 chr1 - 2288 5 novel_in_catalog RSRP1 novel 1425 5 NA NA 0 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 25 6.686986 0.825230 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAGTCTTTATTGTATATATA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 25 NA PB.413.15 chr1 - 2176 6 novel_in_catalog RSRP1 novel 1425 5 NA NA 0 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAGTCTTTATTGTATATATA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.413.16 chr1 - 2246 3 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000498238.1 2941 4 972 2 53 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAGTCTTTATTGTATATATA 1006 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.413.17 chr1 - 2163 6 novel_in_catalog RSRP1 novel 1425 5 NA NA 0 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAGTCTTTATTGTATATATA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.413.18 chr1 - 1642 4 novel_in_catalog RSRP1 novel 3034 6 NA NA 6 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAGTCTTTATTGTATATATA 959 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.413.19 chr1 - 788 2 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000566395.5 824 5 2653 -4 223 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAGTCTTTATTGTATATATA 3606 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.413.20 chr1 - 1442 2 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000566395.5 824 5 1996 -1 -434 1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TCTTAGTCTTTATTGTATAT 2949 FALSE NA NA AATGAA -11 NA NA NA 3 NA PB.413.21 chr1 - 2934 4 full-splice_match RSRP1 ENST00000498238.1 2941 4 0 7 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 48 12.839013 1.108532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTCTTAGTCTTTATTGTAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 48 NA PB.413.22 chr1 - 2809 5 novel_in_catalog RSRP1 novel 2941 4 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTCTTAGTCTTTATTGTAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.413.23 chr1 - 2009 5 full-splice_match RSRP1 ENST00000568254.5 2013 5 3 1 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTCTTAGTCTTTATTGTAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.413.24 chr1 - 1463 6 novel_in_catalog RSRP1 novel 3034 6 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTCTTAGTCTTTATTGTAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.413.25 chr1 - 1334 4 novel_in_catalog RSRP1 novel 1425 5 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTCTTAGTCTTTATTGTAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.413.26 chr1 - 1400 4 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000243189.12 1425 5 297 7 289 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTCTTAGTCTTTATTGTAT 331 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.413.27 chr1 - 1316 2 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000566395.5 824 5 2120 1 -310 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTCTTAGTCTTTATTGTAT 3073 FALSE NA NA ATTAAA -44 NA NA NA 5 NA PB.413.28 chr1 - 1114 2 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000566395.5 824 5 2322 1 -108 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTCTTAGTCTTTATTGTAT 3275 FALSE NA NA AATATA -30 NA NA NA 4 NA PB.413.29 chr1 - 1033 3 full-splice_match RSRP1 ENST00000564223.5 395 3 -603 -35 -152 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTCTTAGTCTTTATTGTAT 3231 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.413.30 chr1 - 902 2 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000566395.5 824 5 2534 1 104 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTCTTAGTCTTTATTGTAT 3487 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.413.31 chr1 - 1416 5 full-splice_match RSRP1 ENST00000243189.12 1425 5 1 8 1 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 56 14.978849 1.175478 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CATTCTTAGTCTTTATTGTA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 56 NA PB.413.32 chr1 - 2395 3 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000498238.1 2941 4 483 342 -331 -228 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAGAAGAAAACTGATGGC 517 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.413.35 chr1 - 1962 3 full-splice_match RSRP1 ENST00000431849.3 1954 3 -8 0 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 19 5.082109 0.706044 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAAAAAATGCTGTAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.413.36 chr1 - 1311 4 novel_in_catalog RSRP1 novel 2941 4 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.814630 0.682563 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAAAAAATGCTGTAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.413.37 chr1 - 1287 2 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000431849.3 1954 3 946 0 35 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAAAAAATGCTGTAT 988 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.415.2 chr1 - 2492 2 full-splice_match RSRP1 ENST00000568399.1 629 2 -214 -1649 -36 1649 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATCATTGTTATTGTTTTT 910 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.416.1 chr1 + 896 7 novel_not_in_catalog TMEM50A novel 2266 7 NA NA -17 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAATAAAAAGAAATTACA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.416.2 chr1 + 904 7 full-splice_match TMEM50A ENST00000374358.5 2266 7 -32 1394 -15 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 605 161.825073 2.209046 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAATAAAAAGAAATTACA -20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 605 NA PB.416.3 chr1 + 2289 7 full-splice_match TMEM50A ENST00000374358.5 2266 7 -26 3 -9 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 173 46.273945 1.665336 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAGTTTTTAGTCTTTAATT -14 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 173 NA PB.416.4 chr1 + 1444 7 full-splice_match TMEM50A ENST00000374358.5 2266 7 -26 848 -9 234 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CATCTGTGTACTGAACCACT -14 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 7 NA PB.416.6 chr1 + 2195 6 full-splice_match TMEM50A ENST00000480937.5 1102 6 -13 -1080 -7 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGTTTTTAGTCTTTAATTT -12 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.416.8 chr1 + 2166 6 full-splice_match TMEM50A ENST00000498135.5 776 6 1 -1391 1 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.209753 0.506472 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAGTTTTTAGTCTTTAATT -4 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 12 NA PB.416.9 chr1 + 1057 7 full-splice_match TMEM50A ENST00000374358.5 2266 7 -16 1225 1 -129 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 59 15.781287 1.198142 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATATTCCGTGGTCAAAA -4 TRUE NA NA TATAAA -16 NA NA NA 59 NA PB.416.10 chr1 + 963 6 full-splice_match TMEM50A ENST00000480937.5 1102 6 -5 144 1 -130 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TAAAATATTCCGTGGTCAAA -4 TRUE NA NA TATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.416.11 chr1 + 795 6 full-splice_match TMEM50A ENST00000480937.5 1102 6 -5 312 1 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAATAAAAAGAAATTACA -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.416.12 chr1 + 775 6 full-splice_match TMEM50A ENST00000498135.5 776 6 1 0 1 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.547151 0.657739 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAATAAAAAGAAATTACA -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.416.13 chr1 + 2174 7 full-splice_match TMEM50A ENST00000374358.5 2266 7 90 2 -36 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGTTTTTAGTCTTTAATTT 44 FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.416.14 chr1 + 782 7 full-splice_match TMEM50A ENST00000374358.5 2266 7 90 1394 -36 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAATAAAAAGAAATTACA 44 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.416.15 chr1 + 2522 7 novel_in_catalog TMEM50A novel 2266 7 NA NA -23 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGTTTTTAGTCTTTAATTT 57 FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.416.16 chr1 + 1107 7 novel_in_catalog TMEM50A novel 799 6 NA NA 0 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.279671 0.631410 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAATAAAAAGAAATTACA 80 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.416.17 chr1 + 981 7 novel_in_catalog TMEM50A novel 799 6 NA NA 126 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAATAAAAAGAAATTACA 206 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.416.18 chr1 + 2009 5 incomplete-splice_match TMEM50A ENST00000374358.5 2266 7 4653 2 395 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGTTTTTAGTCTTTAATTT 2449 FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 5 NA PB.416.19 chr1 + 1904 4 incomplete-splice_match TMEM50A ENST00000374358.5 2266 7 13310 2 9052 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGTTTTTAGTCTTTAATTT NA FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 7 NA PB.417.1 chr1 - 1604 11 novel_in_catalog RHCE novel 1810 12 NA NA -4 -20 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAATTAAAGACTAAAAA -19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.418.1 chr1 + 1364 6 incomplete-splice_match MACO1 ENST00000647928.1 2887 11 -121 40388 -19 59 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 GAAAACTGTATTCCTAATAA 501 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.418.2 chr1 + 2336 11 full-splice_match MACO1 ENST00000374343.5 3940 11 -44 1648 -5 -669 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTTGTGGAACTGTATCTG 515 FALSE NA NA GATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.418.4 chr1 + 2468 11 full-splice_match MACO1 ENST00000374343.5 3940 11 -6 1478 -6 -499 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCCAACTTTGCCTTTTATG -11 TRUE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 6 NA PB.418.5 chr1 + 958 6 incomplete-splice_match MACO1 ENST00000647928.1 2887 11 -69 40742 -6 -295 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.547151 0.657739 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 GAATACCGAGAAAAAGGGAA -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.418.7 chr1 + 2337 11 full-splice_match MACO1 ENST00000374343.5 3940 11 125 1478 62 -499 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCCAACTTTGCCTTTTATG -10 TRUE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 6 NA PB.418.9 chr1 + 2103 10 incomplete-splice_match MACO1 ENST00000374343.5 3940 11 15941 1479 -2055 -500 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGCCAACTTTGCCTTTTAT 9511 FALSE NA NA ATTAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.418.11 chr1 + 1855 8 novel_not_in_catalog MACO1 novel 3940 11 NA NA 5415 -503 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGTAGCCAACTTTGCCTTT NA FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.418.12 chr1 + 1638 7 incomplete-splice_match MACO1 ENST00000374343.5 3940 11 25904 1479 7908 -500 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGCCAACTTTGCCTTTTAT NA FALSE NA NA ATTAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.418.13 chr1 + 1521 6 incomplete-splice_match MACO1 ENST00000374343.5 3940 11 27581 1478 9585 -499 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCCAACTTTGCCTTTTATG NA FALSE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 5 NA PB.418.14 chr1 + 1243 6 incomplete-splice_match MACO1 ENST00000374343.5 3940 11 27688 1649 9692 -670 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATTTTGTGGAACTGTATCT NA FALSE NA NA GATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.418.15 chr1 + 1369 6 incomplete-splice_match MACO1 ENST00000374343.5 3940 11 27729 1482 9733 -503 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGTAGCCAACTTTGCCTTT NA FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 10 NA PB.418.16 chr1 + 1224 6 incomplete-splice_match MACO1 ENST00000374343.5 3940 11 27878 1478 9882 -499 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCCAACTTTGCCTTTTATG NA FALSE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 6 NA PB.418.17 chr1 + 1078 5 incomplete-splice_match MACO1 ENST00000647928.1 2887 11 53183 500 35250 -500 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGCCAACTTTGCCTTTTAT NA FALSE NA NA ATTAAA -20 NA NA NA 5 NA PB.418.18 chr1 + 2159 3 incomplete-splice_match MACO1 ENST00000374343.5 3940 11 58353 6 40357 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATAAAACTAGTTTTCTGCCT 74 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.419.1 chr1 + 2912 9 full-splice_match LDLRAP1 ENST00000374338.5 2914 9 0 2 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 73 19.525999 1.290613 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGCAACGCTCATCAGGTGG -29 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 73 NA PB.419.3 chr1 + 1105 9 fusion ENSG00000225643_LDLRAP1 novel 2914 9 NA NA 0 42 multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGGACAGGGGTTGAGTCTG -29 TRUE NA NA CATAAA -16 NA NA NA 5 NA PB.419.5 chr1 + 2907 9 novel_not_in_catalog LDLRAP1 novel 2914 9 NA NA 18 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGCAACGCTCATCAGGTGG -11 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.419.6 chr1 + 2889 9 novel_in_catalog LDLRAP1 novel 4670 7 NA NA -83 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGCAACGCTCATCAGGTGG -6 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 6 NA PB.419.8 chr1 + 2585 7 incomplete-splice_match LDLRAP1 ENST00000374338.5 2914 9 11257 2 -18 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGCAACGCTCATCAGGTGG 4942 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 10 NA PB.419.9 chr1 + 2444 6 incomplete-splice_match LDLRAP1 ENST00000374338.5 2914 9 13578 2 2303 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGCAACGCTCATCAGGTGG 203 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.419.10 chr1 + 2261 4 full-splice_match LDLRAP1 ENST00000484476.5 657 4 280 -1884 280 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGCAACGCTCATCAGGTGG 288 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.419.11 chr1 + 2102 3 incomplete-splice_match LDLRAP1 ENST00000484476.5 657 4 946 -1884 128 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGCAACGCTCATCAGGTGG 103 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.419.12 chr1 + 2075 2 incomplete-splice_match LDLRAP1 ENST00000470950.1 995 3 579 -1248 579 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGCAACGCTCATCAGGTGG 1511 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.422.1 chr1 + 1024 3 full-splice_match MAN1C1 ENST00000487493.1 1145 3 270 -149 270 -9 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AATAAGAAATATGATTGGGC 9549 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.424.1 chr1 + 2496 11 incomplete-splice_match SELENON ENST00000374315.1 4212 12 861 1484 823 747 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACTTTCTCATGGTTTGTA 849 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.424.2 chr1 + 3529 8 incomplete-splice_match SELENON ENST00000361547.7 4314 13 8831 2 8793 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACTAGAGTGGTTCTAAGTG 369 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.424.3 chr1 + 3251 6 incomplete-splice_match SELENON ENST00000361547.7 4314 13 11274 2 11236 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACTAGAGTGGTTCTAAGTG 2812 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.424.4 chr1 + 3086 5 incomplete-splice_match SELENON ENST00000361547.7 4314 13 11594 2 11556 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACTAGAGTGGTTCTAAGTG 3132 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.425.1 chr1 - 1396 1 full-splice_match ENSG00000228172 ENST00000536896.2 2307 1 882 29 -143 -29 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA NA NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAACAAACAAAACAAACAAA 748 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.426.1 chr1 - 2118 3 full-splice_match AUNIP ENST00000374298.4 2161 3 43 0 43 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 36 9.629260 0.983593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GCTCTTGTGATAATTGGTAA -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 36 NA PB.426.4 chr1 - 1231 3 full-splice_match AUNIP ENST00000374298.4 2161 3 120 810 120 -810 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTGGCATCATGGCTTTCCC 2674 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.426.5 chr1 - 1299 3 full-splice_match AUNIP ENST00000374298.4 2161 3 40 822 40 -822 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 29 7.756904 0.889688 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAGACAGTGGGATTGGCAT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 29 NA PB.429.1 chr1 - 1652 5 full-splice_match STMN1 ENST00000455785.7 1443 5 0 -209 0 209 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACATCTGTATAAAAGCTCTT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.429.2 chr1 - 1355 3 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 1332 -660 17 35 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TCTAAAGTAGCATTTGACTC -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.429.3 chr1 - 1462 5 full-splice_match STMN1 ENST00000455785.7 1443 5 -24 5 23 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 665 177.873825 2.250112 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGCAACTCCTGTGAAATGAC 3 TRUE NA NA GGGGCT -9 NA NA NA 665 NA PB.429.6 chr1 - 3396 4 full-splice_match STMN1 ENST00000465604.1 2947 4 -2 -447 0 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGCAACTCCTGTGAAATGAC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.429.8 chr1 - 1026 2 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 3579 -620 2264 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.547151 0.657739 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGCAACTCCTGTGAAATGAC 5456 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.429.10 chr1 - 1590 5 full-splice_match STMN1 ENST00000399728.5 1712 5 117 5 117 -5 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GTAGCAACTCCTGTGAAATG 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.429.12 chr1 - 1297 5 full-splice_match STMN1 ENST00000455785.7 1443 5 0 146 0 -144 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 43 11.501616 1.060759 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 GAACAGTTGAGAGAGAATCT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 43 NA PB.429.13 chr1 - 1060 3 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 1443 -476 128 -147 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AGAGAACAGTTGAGAGAGAA 3320 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.429.14 chr1 - 1102 5 full-splice_match STMN1 ENST00000455785.7 1443 5 0 341 0 111 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 30 8.024384 0.904412 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATGACCGCACGTTCTCTG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 30 NA PB.429.15 chr1 - 1185 5 full-splice_match STMN1 ENST00000399728.5 1712 5 87 440 87 10 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTTCTTTTGAGTTAGGTTA 939 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.429.16 chr1 - 1080 5 full-splice_match STMN1 ENST00000455785.7 1443 5 -83 446 -36 6 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4907 1312.521606 3.118106 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTGACTTCTTTTGAGTTAG 503 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4907 NA PB.429.18 chr1 - 1451 2 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 2716 -182 1401 9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GACTTCTTTTGAGTTAGGTT 4593 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.429.19 chr1 - 953 4 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 406 -182 406 9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GACTTCTTTTGAGTTAGGTT 2283 FALSE NA NA AAAACA -13 NA NA NA 7 NA PB.429.20 chr1 - 2213 5 novel_in_catalog STMN1 novel 1712 5 NA NA 27 6 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTGACTTCTTTTGAGTTAG 615 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.429.21 chr1 - 1302 5 novel_in_catalog STMN1 novel 1443 5 NA NA 10 6 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTGACTTCTTTTGAGTTAG 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.429.22 chr1 - 944 5 novel_not_in_catalog STMN1 novel 1443 5 NA NA -22 6 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTGACTTCTTTTGAGTTAG 5 TRUE NA NA GGGGCT -7 NA NA NA 5 NA PB.429.23 chr1 - 1121 5 full-splice_match STMN1 ENST00000399728.5 1712 5 143 448 143 2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.884548 0.769713 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGGCAGTGACTTCTTTTGAG -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 22 NA PB.429.24 chr1 - 1267 2 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 2892 -174 1577 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GTGGCAGTGACTTCTTTTGA 4769 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.429.25 chr1 - 2949 4 full-splice_match STMN1 ENST00000465604.1 2947 4 -2 0 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.547151 0.657739 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGTGGCAGTGACTTCTTTTG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.429.26 chr1 - 1736 2 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 2422 -173 1107 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGTGGCAGTGACTTCTTTTG 4299 FALSE NA NA AAAAAG -43 NA NA NA 2 NA PB.429.27 chr1 - 1253 6 novel_not_in_catalog STMN1 novel 1443 5 NA NA 0 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGTGGCAGTGACTTCTTTTG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.429.28 chr1 - 1301 5 novel_not_in_catalog STMN1 novel 1712 5 NA NA -123 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGTGGCAGTGACTTCTTTTG 729 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.429.29 chr1 - 908 4 novel_not_in_catalog STMN1 novel 1443 5 NA NA 0 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGTGGCAGTGACTTCTTTTG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.429.30 chr1 - 769 3 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 1431 -173 116 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 32 8.559342 0.932440 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGTGGCAGTGACTTCTTTTG 3308 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 32 NA PB.429.31 chr1 - 657 2 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 3501 -173 2186 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 23 6.152027 0.789018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGTGGCAGTGACTTCTTTTG -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 23 NA PB.429.32 chr1 - 2622 2 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 1535 -172 220 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGGTGGCAGTGACTTCTTTT 3412 FALSE NA NA CATAAA -39 NA NA NA 2 NA PB.429.33 chr1 - 982 5 novel_not_in_catalog STMN1 novel 1443 5 NA NA 0 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGGTGGCAGTGACTTCTTTT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.429.34 chr1 - 1060 2 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 3094 -169 1779 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTTGGTGGCAGTGACTTCT 4971 FALSE NA NA AATAAA -38 NA NA NA 2 NA PB.429.35 chr1 - 1031 5 novel_not_in_catalog STMN1 novel 1712 5 NA NA 143 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 29 7.756904 0.889688 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTTGGTGGCAGTGACTTCT -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 29 NA PB.429.36 chr1 - 880 3 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 1316 -169 1 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 58 15.513808 1.190718 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTTGGTGGCAGTGACTTCT 3193 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 58 NA PB.429.37 chr1 - 1284 5 full-splice_match STMN1 ENST00000399728.5 1712 5 -27 455 -27 -5 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTGTTGGTGGCAGTGACTTC 825 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.429.38 chr1 - 860 5 full-splice_match STMN1 ENST00000455785.7 1443 5 0 583 0 42 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAGAGTATGTAGTGGCTT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.430.3 chr1 - 1813 11 full-splice_match PAFAH2 ENST00000374282.8 3487 11 -25 1699 -25 -696 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATCACATTTTCTATTTATTT -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.431.1 chr1 + 1201 7 full-splice_match MTFR1L ENST00000474295.5 1873 7 22 650 -3 -42 alternative_3end TRUE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GAAGTTGTTTCTGGTTTTTC -20 TRUE NA NA AATGAA -26 NA NA NA 5 NA PB.431.2 chr1 + 1956 7 full-splice_match MTFR1L ENST00000374303.7 1953 7 -1 -2 -1 2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 188 50.286137 1.701448 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CATTTGCTGTGTCCATCTCT -18 TRUE NA NA ATTAAA -23 NA NA NA 188 NA PB.431.3 chr1 + 1302 7 full-splice_match MTFR1L ENST00000374303.7 1953 7 -1 652 -1 -48 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.279671 0.631410 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAGAGAAGTTGTTTCTGG -18 TRUE NA NA AATGAA -20 NA NA NA 16 NA PB.431.4 chr1 + 1845 6 novel_in_catalog MTFR1L novel 1953 7 NA NA 0 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTGCTGTGTCCATCTCTT -16 TRUE NA NA ATTAAA -24 NA NA NA 3 NA PB.431.5 chr1 + 2034 8 novel_in_catalog MTFR1L novel 1953 7 NA NA 7 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTGCTGTGTCCATCTCTT -9 TRUE NA NA ATTAAA -24 NA NA NA 5 NA PB.431.6 chr1 + 2138 8 novel_in_catalog MTFR1L novel 1953 7 NA NA -9 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCATTTGCTGTGTCCAT -2 TRUE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 4 NA PB.431.7 chr1 + 1900 7 full-splice_match MTFR1L ENST00000374307.9 1868 7 -34 2 -9 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.617068 0.749510 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCATTTGCTGTGTCCAT -2 TRUE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 21 NA PB.431.8 chr1 + 1822 7 full-splice_match MTFR1L ENST00000474295.5 1873 7 45 6 -4 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 37 9.896740 0.995492 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCATTTGCTGTGTCCAT 3 TRUE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 37 NA PB.431.9 chr1 + 1954 7 full-splice_match MTFR1L ENST00000524618.5 1217 7 -7 -730 0 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTGCTGTGTCCATCTCTT 8 TRUE NA NA ATTAAA -24 NA NA NA 3 NA PB.431.10 chr1 + 2430 6 novel_in_catalog MTFR1L novel 1953 7 NA NA 4 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCATTTGCTGTGTCCAT 19 TRUE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 5 NA PB.431.11 chr1 + 2130 7 full-splice_match MTFR1L ENST00000374301.7 2099 7 -34 3 -29 1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAATGCATTTGCTGTGTCCA 127 FALSE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.431.12 chr1 + 2015 7 full-splice_match MTFR1L ENST00000374300.7 2053 7 37 1 37 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGCATTTGCTGTGTCCATC 0 TRUE NA NA ATTAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.431.13 chr1 + 1784 6 incomplete-splice_match MTFR1L ENST00000374300.7 2053 7 2282 2 114 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCATTTGCTGTGTCCAT 2245 FALSE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.431.14 chr1 + 1643 4 incomplete-splice_match MTFR1L ENST00000374300.7 2053 7 5492 1 688 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGCATTTGCTGTGTCCATC 5455 FALSE NA NA ATTAAA -20 NA NA NA 5 NA PB.431.15 chr1 + 1413 3 full-splice_match MTFR1L ENST00000497956.1 2531 3 1120 -2 1120 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCATTTGCTGTGTCCAT 5887 FALSE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.431.16 chr1 + 1226 2 incomplete-splice_match MTFR1L ENST00000497956.1 2531 3 3989 -2 3989 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCATTTGCTGTGTCCAT 8756 FALSE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 9 NA PB.431.17 chr1 + 1107 2 incomplete-splice_match MTFR1L ENST00000497956.1 2531 3 4104 2 4104 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGAGAATGCATTTGCTGTGT 8871 FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.432.1 chr1 + 4271 3 full-splice_match PDIK1L ENST00000619836.4 4252 3 -18 -1 -18 1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 ACAAAAAAAAAACTGAAAAT -11 TRUE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 5 NA PB.432.2 chr1 + 4298 4 full-splice_match PDIK1L ENST00000374271.8 4279 4 -32 13 -19 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AACAAAAAAAAAACTGAAAA -25 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 3 NA PB.432.3 chr1 + 4084 3 full-splice_match PDIK1L ENST00000374269.2 4113 3 4 25 4 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 33 8.826821 0.945804 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AACAAAAAAAAAACTGAAAA -2 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 33 NA PB.433.1 chr1 + 630 3 full-splice_match ZNF593 ENST00000374266.7 638 3 0 8 0 -8 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGAGAACTTGCCTCCAAC -21 TRUE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 9 NA PB.434.2 chr1 + 2544 21 full-splice_match CNKSR1 ENST00000374253.9 2538 21 -11 5 -5 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGAATGAGTCTACATGTAA -11 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.434.3 chr1 + 2495 21 novel_in_catalog CNKSR1 novel 2535 21 NA NA -2 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGAATGAGTCTACATGTAA -2 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.434.4 chr1 + 2514 21 full-splice_match CNKSR1 ENST00000361530.11 2535 21 16 5 -2 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.012192 0.603382 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGAATGAGTCTACATGTAA -2 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 15 NA PB.434.6 chr1 + 1702 13 incomplete-splice_match CNKSR1 ENST00000531191.5 2673 20 3578 -32 542 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TAAGAATGAGTCTACATGTA 1713 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.435.1 chr1 - 1768 9 full-splice_match TRIM63 ENST00000374272.4 1770 9 -5 7 -5 -7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAAAGGAGCCGGGGTTTCAT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.436.3 chr1 - 1695 15 novel_in_catalog UBXN11 novel 1792 16 NA NA -2 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AACCCGCTGCTCCGCCAGGC -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.436.5 chr1 - 1620 14 full-splice_match UBXN11 ENST00000357089.8 1555 14 -65 0 -52 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AACCCGCTGCTCCGCCAGGC -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.436.7 chr1 - 1437 12 novel_in_catalog UBXN11 novel 1944 15 NA NA -4 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AACCCGCTGCTCCGCCAGGC -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.436.12 chr1 - 1201 10 novel_in_catalog UBXN11 novel 1944 15 NA NA -2 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AACCCGCTGCTCCGCCAGGC -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.437.1 chr1 + 4847 13 novel_in_catalog CEP85 novel 3934 14 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCCTCAGTTTTCCATACCCT -10 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.437.2 chr1 + 3932 14 full-splice_match CEP85 ENST00000451429.8 3934 14 0 2 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 46 12.304054 1.090048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTCCTCAGTTTTCCATACC -10 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 46 NA PB.437.3 chr1 + 1496 8 incomplete-splice_match CEP85 ENST00000252992.8 3935 14 0 10302 0 -3887 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.209753 0.506472 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AATAATTTGAAAAAGAAATG -8 TRUE NA NA GATAAA -7 NA NA NA 12 NA PB.437.5 chr1 + 3533 11 incomplete-splice_match CEP85 ENST00000451429.8 3934 14 21029 2 651 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTCCTCAGTTTTCCATACC 606 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.437.6 chr1 + 2988 11 incomplete-splice_match CEP85 ENST00000252992.8 3935 14 21575 2 1199 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTCCTCAGTTTTCCATACC 490 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 3 NA PB.437.7 chr1 + 2889 10 full-splice_match CEP85 ENST00000453146.1 2821 10 -67 -1 -67 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCCTCAGTTTTCCATACCCT 2319 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 5 NA PB.437.8 chr1 + 2459 7 incomplete-splice_match CEP85 ENST00000453146.1 2821 10 10809 1 -808 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTCCTCAGTTTTCCATACC NA FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.437.9 chr1 + 2366 7 incomplete-splice_match CEP85 ENST00000252992.8 3935 14 34378 0 -710 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCCTCAGTTTTCCATACCCT NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 6 NA PB.437.10 chr1 + 2171 6 incomplete-splice_match CEP85 ENST00000453146.1 2821 10 11923 -1 306 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCCTCAGTTTTCCATACCCT 322 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.437.11 chr1 + 2047 4 incomplete-splice_match CEP85 ENST00000453146.1 2821 10 14359 -1 567 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCCTCAGTTTTCCATACCCT 2758 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.437.12 chr1 + 1832 2 incomplete-splice_match CEP85 ENST00000453146.1 2821 10 18922 6 5130 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAGACTCCTCAGTTTTCC 56 FALSE NA NA AATAAA -8 NA NA NA 2 NA PB.437.13 chr1 + 1758 2 incomplete-splice_match CEP85 ENST00000453146.1 2821 10 19003 -1 5211 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCCTCAGTTTTCCATACCCT 137 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 5 NA PB.437.14 chr1 + 1707 2 incomplete-splice_match CEP85 ENST00000453146.1 2821 10 19054 -1 5262 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCCTCAGTTTTCCATACCCT 188 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.437.20 chr1 + 2747 2 fusion CEP85_SH3BGRL3 novel 751 3 NA NA -1442 -7 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTGGCACTGTGTCTGGTTG 2105 FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.437.21 chr1 + 1688 3 full-splice_match SH3BGRL3 ENST00000270792.10 751 3 -939 2 -939 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CACTGTGTCTGGTTGGTTGT 13 FALSE NA NA ATTAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.437.22 chr1 + 1105 3 full-splice_match SH3BGRL3 ENST00000270792.10 751 3 -356 2 -356 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CACTGTGTCTGGTTGGTTGT 596 FALSE NA NA ATTAAA -20 NA NA NA 6 NA PB.437.23 chr1 + 788 3 full-splice_match SH3BGRL3 ENST00000270792.10 751 3 -38 1 -38 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 422 112.876328 2.052603 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTGTGTCTGGTTGGTTGTG 286 FALSE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 422 NA PB.437.24 chr1 + 878 2 full-splice_match SH3BGRL3 ENST00000319041.6 768 2 -39 -71 -3 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 19 5.082109 0.706044 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTGTGTCTGGTTGGTTGTG 0 TRUE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 19 NA PB.438.4 chr1 + 3386 5 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3458 5 NA NA -42 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAAACTGTCATCCCCTTGTC 5 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 5 NA PB.438.6 chr1 + 1488 4 full-splice_match LIN28A ENST00000326279.11 3975 4 -39 2526 -39 -2517 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATATTTTAATCTAAGGCCCT -1 TRUE NA NA TATAAA -23 NA NA NA 2 NA PB.438.7 chr1 + 3404 5 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3458 5 NA NA 1 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 20 5.349589 0.728320 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACTGTCATCCCCTTGTCA 1 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 20 NA PB.438.9 chr1 + 3334 5 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3458 5 NA NA 11 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACTGTCATCCCCTTGTCA 11 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 5 NA PB.438.10 chr1 + 3335 5 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 77 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATCCCCTTGTCAGATGTTT 49 FALSE NA NA AATAAA -27 NA NA NA 2 NA PB.438.13 chr1 + 2798 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 15543 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAAACTGTCATCCCCTTGTC NA FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.438.16 chr1 + 2481 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3458 5 NA NA 15861 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACTGTCATCCCCTTGTCA NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.438.20 chr1 + 1954 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 16326 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCAAACTGTCATCCCCTTGT 135 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.438.24 chr1 + 1655 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 16685 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCAAACTGTCATCCCCTTGT 494 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 7 NA PB.438.27 chr1 + 1413 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 16868 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAAACTGTCATCCCCTTGTC 677 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 6 NA PB.438.28 chr1 + 1394 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3458 5 NA NA 16948 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACTGTCATCCCCTTGTCA 757 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 6 NA PB.438.30 chr1 + 1308 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 16972 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCAAACTGTCATCCCCTTGT 781 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.438.33 chr1 + 1312 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 17037 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATCCCCTTGTCAGATGTTT 1 TRUE NA NA AATAAA -27 NA NA NA 5 NA PB.438.35 chr1 + 1180 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3458 5 NA NA 17102 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACTGTCATCCCCTTGTCA -5 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.438.36 chr1 + 1182 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3458 5 NA NA 17160 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACTGTCATCCCCTTGTCA 53 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.438.38 chr1 + 939 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 17350 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATCCCCTTGTCAGATGTTT 92 FALSE NA NA AATAAA -27 NA NA NA 2 NA PB.438.40 chr1 + 933 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 17407 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCAAACTGTCATCCCCTTGT 149 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.439.1 chr1 - 1153 8 incomplete-splice_match CRYBG2 ENST00000308182.10 5239 20 17657 1 -90 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCTTGTCTCTGTGCACCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.439.2 chr1 - 1022 7 novel_in_catalog CRYBG2 novel 5239 20 NA NA -72 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCTTGTCTCTGTGCACCT -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.441.1 chr1 + 3054 7 novel_in_catalog DHDDS novel 1235 8 NA NA 0 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CTTAGATGTAAAACTTGTTT -5 TRUE NA NA AATAGA -14 NA NA NA 2 NA PB.441.2 chr1 + 1636 6 full-splice_match DHDDS ENST00000374185.7 1148 6 -19 -469 0 80 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAAATAACCCAGGAGATG -5 TRUE NA NA AGTAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.441.3 chr1 + 1102 8 full-splice_match DHDDS ENST00000525682.6 1235 8 -16 149 0 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGAATGGTGTTCCCTTTG -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.441.4 chr1 + 1106 9 novel_in_catalog DHDDS novel 3288 9 NA NA 0 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATCAGTTCCCTGCTCCAT -5 TRUE NA NA AGTAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.441.5 chr1 + 1388 9 full-splice_match DHDDS ENST00000236342.12 3288 9 4 1896 2 37 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGCCTGTCTCTTAGATGCAC -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.441.6 chr1 + 1192 9 full-splice_match DHDDS ENST00000236342.12 3288 9 14 2082 -4 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 19 5.082109 0.706044 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGAATGGTGTTCCCTTTG 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.441.7 chr1 + 3257 9 full-splice_match DHDDS ENST00000236342.12 3288 9 18 13 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.012192 0.603382 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CTTAGATGTAAAACTTGTTT 11 TRUE NA NA AATAGA -14 NA NA NA 15 NA PB.441.9 chr1 + 3249 9 novel_in_catalog DHDDS novel 3288 9 NA NA 4 -4 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAACTTGTTTGCTAACTGC -9 TRUE NA NA AATAGA -23 NA NA NA 3 NA PB.441.10 chr1 + 1190 2 incomplete-splice_match DHDDS ENST00000531955.5 559 3 -351 4166 4 -11 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAGAAAAAAAAAATGACATT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.441.11 chr1 + 1470 9 novel_in_catalog DHDDS novel 703 6 NA NA -7 31 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATCAGCTGCCTGTCTCTTAG -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.441.12 chr1 + 1290 9 novel_in_catalog DHDDS novel 703 6 NA NA -4 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGAATGGTGTTCCCTTTG -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.441.13 chr1 + 1185 8 novel_in_catalog DHDDS novel 703 6 NA NA -4 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGAATGGTGTTCCCTTTG -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.441.15 chr1 + 3341 9 novel_in_catalog DHDDS novel 703 6 NA NA 0 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TTAGATGTAAAACTTGTTTG 14 TRUE NA NA AATAGA -15 NA NA NA 2 NA PB.441.16 chr1 + 2992 6 incomplete-splice_match DHDDS ENST00000236342.12 3288 9 10409 6 -106 6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GTAAAACTTGTTTGCTAACT 9922 FALSE NA NA AATAGA -21 NA NA NA 3 NA PB.441.17 chr1 + 2877 6 incomplete-splice_match DHDDS ENST00000236342.12 3288 9 10517 13 2 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CTTAGATGTAAAACTTGTTT NA FALSE NA NA AATAGA -14 NA NA NA 2 NA PB.441.18 chr1 + 2660 4 incomplete-splice_match DHDDS ENST00000236342.12 3288 9 15302 13 1259 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CTTAGATGTAAAACTTGTTT NA FALSE NA NA AATAGA -14 NA NA NA 2 NA PB.441.19 chr1 + 2501 2 incomplete-splice_match DHDDS ENST00000360009.6 3245 9 27699 -7 13690 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAAACTTGTTTGCTAACTG NA FALSE NA NA AATAGA -22 NA NA NA 3 NA PB.442.1 chr1 + 1736 6 full-splice_match HMGN2 ENST00000361427.6 1940 6 -468 672 -468 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 1638 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 3 NA PB.442.2 chr1 + 1520 6 full-splice_match HMGN2 ENST00000361427.6 1940 6 -252 672 -252 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 1854 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 3 NA PB.442.3 chr1 + 1291 6 full-splice_match HMGN2 ENST00000361427.6 1940 6 -24 673 -24 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6291 1682.713257 3.226010 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATGCTGCCTCTGATCTTT -16 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 6291 NA PB.442.4 chr1 + 2058 4 incomplete-splice_match HMGN2 ENST00000460563.5 1045 5 -30 -538 -3 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 15 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.442.6 chr1 + 1229 6 full-splice_match HMGN2 ENST00000361427.6 1940 6 39 672 2 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3338 892.846375 2.950777 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT -6 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 3338 NA PB.442.8 chr1 + 1388 5 full-splice_match HMGN2 ENST00000464888.5 565 5 -11 -812 -11 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 10 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 4 NA PB.442.11 chr1 + 3029 2 full-splice_match HMGN2 ENST00000493418.1 1496 2 -923 -610 0 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 9 NA PB.442.12 chr1 + 2174 3 incomplete-splice_match HMGN2 ENST00000479815.5 1030 4 43 -742 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.442.13 chr1 + 1872 6 full-splice_match HMGN2 ENST00000361427.6 1940 6 66 2 0 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 41 10.966658 1.040074 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTGCTTTGTCCATTCCCT 0 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 41 NA PB.442.14 chr1 + 1729 4 full-splice_match HMGN2 ENST00000479815.5 1030 4 43 -742 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 20 5.349589 0.728320 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 20 NA PB.442.16 chr1 + 1554 5 full-splice_match HMGN2 ENST00000460563.5 1045 5 29 -538 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 37 9.896740 0.995492 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 37 NA PB.442.17 chr1 + 1287 6 full-splice_match HMGN2 ENST00000467700.5 932 6 -11 -344 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 35 9.361781 0.971358 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 35 NA PB.442.18 chr1 + 1259 6 full-splice_match HMGN2 ENST00000463817.5 853 6 -5 -401 0 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATGCTGCCTCTGATCTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 4 NA PB.442.19 chr1 + 1225 6 novel_in_catalog HMGN2 novel 1148 7 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 4 NA PB.442.20 chr1 + 1208 6 novel_not_in_catalog HMGN2 novel 1148 7 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 7 NA PB.442.21 chr1 + 1196 6 novel_not_in_catalog HMGN2 novel 1148 7 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.442.22 chr1 + 1189 6 novel_not_in_catalog HMGN2 novel 1940 6 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.744712 0.573418 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATGCTGCCTCTGATCTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 14 NA PB.442.23 chr1 + 517 6 full-splice_match HMGN2 ENST00000361427.6 1940 6 66 1357 0 57 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACACTTCATTGTTGTTTTT 0 TRUE NA NA TTTAAA -22 NA NA NA 7 NA PB.442.24 chr1 + 2580 3 novel_in_catalog HMGN2 novel 1148 7 NA NA -1 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.814630 0.682563 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 4 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 18 NA PB.442.25 chr1 + 1188 6 novel_not_in_catalog HMGN2 novel 1148 7 NA NA -1 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 4 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.442.26 chr1 + 2399 4 novel_in_catalog HMGN2 novel 1148 7 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATGCTGCCTCTGATCTTT 9 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 6 NA PB.442.27 chr1 + 1184 6 full-splice_match HMGN2 ENST00000467700.5 932 6 92 -344 92 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 30 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.442.28 chr1 + 2266 3 incomplete-splice_match HMGN2 ENST00000479815.5 1030 4 361 -742 307 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 146 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.442.29 chr1 + 1378 5 full-splice_match HMGN2 ENST00000466194.1 952 5 -24 -402 -24 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGGAATGCTGCCTCTGATCT 504 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 6 NA PB.442.30 chr1 + 1721 3 incomplete-splice_match HMGN2 ENST00000479815.5 1030 4 905 -741 -61 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATGCTGCCTCTGATCTTT 145 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 4 NA PB.442.31 chr1 + 1082 5 full-splice_match HMGN2 ENST00000466194.1 952 5 275 -405 52 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 164 43.866631 1.642134 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 258 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 164 NA PB.442.32 chr1 + 1733 5 full-splice_match HMGN2 ENST00000466194.1 952 5 294 -1075 71 -2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTGCTTTGTCCATTCCCT 277 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.442.33 chr1 + 1404 4 incomplete-splice_match HMGN2 ENST00000460563.5 1045 5 1033 -537 81 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATGCTGCCTCTGATCTTT 287 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.442.34 chr1 + 1542 3 incomplete-splice_match HMGN2 ENST00000460563.5 1045 5 1071 -538 119 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 325 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 4 NA PB.442.35 chr1 + 1034 4 incomplete-splice_match HMGN2 ENST00000466194.1 952 5 498 -405 275 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 481 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.442.36 chr1 + 1179 3 incomplete-splice_match HMGN2 ENST00000466194.1 952 5 705 -405 482 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 688 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 4 NA PB.442.37 chr1 + 1066 3 incomplete-splice_match HMGN2 ENST00000466194.1 952 5 818 -405 595 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 801 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 4 NA PB.442.38 chr1 + 1003 3 incomplete-splice_match HMGN2 ENST00000466194.1 952 5 879 -403 656 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 178 47.611343 1.677710 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GGAATGCTGCCTCTGATCTT 862 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 178 NA PB.442.39 chr1 + 920 2 incomplete-splice_match HMGN2 ENST00000466194.1 952 5 1400 -405 1177 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 161 43.064190 1.634116 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 1383 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 161 NA PB.442.40 chr1 + 1579 2 incomplete-splice_match HMGN2 ENST00000361427.6 1940 6 2174 5 1185 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTAATTGCTTTGTCCATTC 1391 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.445.1 chr1 + 3149 22 full-splice_match RPS6KA1 ENST00000374168.7 3192 22 41 2 24 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCACGCTCTCCTGCACTC 28 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 9 NA PB.445.2 chr1 + 3113 21 full-splice_match RPS6KA1 ENST00000531382.5 2359 21 -7 -747 0 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 19 5.082109 0.706044 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCACGCTCTCCTGCACTC -8 TRUE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 19 NA PB.445.3 chr1 + 2779 19 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000531382.5 2359 21 1363 -747 -28 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCACGCTCTCCTGCACTC 1362 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 8 NA PB.445.4 chr1 + 2551 16 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000374163.5 3202 22 7559 8 -1798 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAAGCACGCTCTCCTGCACT 23 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 3 NA PB.445.5 chr1 + 2297 14 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000374163.5 3202 22 8874 7 -483 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCACGCTCTCCTGCACTC 512 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 8 NA PB.445.6 chr1 + 2049 10 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000374163.5 3202 22 11156 7 -45 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCACGCTCTCCTGCACTC 2794 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 6 NA PB.445.7 chr1 + 1866 9 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000374163.5 3202 22 13045 7 1844 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCACGCTCTCCTGCACTC 4683 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 8 NA PB.445.8 chr1 + 1763 8 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000374163.5 3202 22 14936 7 3735 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCACGCTCTCCTGCACTC 6574 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 5 NA PB.445.9 chr1 + 1564 6 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000374163.5 3202 22 15697 8 4496 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 19 5.082109 0.706044 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAAGCACGCTCTCCTGCACT 7335 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 19 NA PB.445.10 chr1 + 1408 5 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000374163.5 3202 22 25639 7 252 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCACGCTCTCCTGCACTC NA FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 9 NA PB.445.12 chr1 + 1301 5 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000374163.5 3202 22 25746 7 359 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCACGCTCTCCTGCACTC NA FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.445.13 chr1 + 1162 3 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000438977.1 639 4 -55 -289 -55 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCACGCTCTCCTGCACTC NA FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 5 NA PB.445.14 chr1 + 976 2 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000438977.1 639 4 1061 -289 1061 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCACGCTCTCCTGCACTC NA FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.447.1 chr1 + 6303 20 novel_in_catalog ARID1A novel 8595 20 NA NA 954 14 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 73 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.447.10 chr1 + 5596 18 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000374152.7 6460 19 2554 -402 1809 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 245 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.447.17 chr1 + 5127 16 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000374152.7 6460 19 32157 -402 -3196 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.447.18 chr1 + 4425 12 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000636219.1 7058 19 36665 943 52 15 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAATA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.447.19 chr1 + 4154 10 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000374152.7 6460 19 38997 -403 -1265 15 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAATA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.447.20 chr1 + 4014 9 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000374152.7 6460 19 42255 -402 -1796 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.447.21 chr1 + 3850 8 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000636219.1 7058 19 42845 943 -461 15 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAATA 1252 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.447.22 chr1 + 3751 8 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000374152.7 6460 19 43691 -402 -360 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 1353 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.447.23 chr1 + 3580 7 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000636219.1 7058 19 43296 944 -10 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 1703 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.447.25 chr1 + 3428 6 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000636219.1 7058 19 43807 943 497 15 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAATA 2214 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.447.26 chr1 + 3176 4 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000636219.1 7058 19 44225 944 915 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 2632 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.447.27 chr1 + 2983 3 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000636219.1 7058 19 44848 944 -365 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 3255 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.447.28 chr1 + 2880 3 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000636219.1 7058 19 44952 943 -261 15 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAATA 3359 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.447.29 chr1 + 2649 3 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000636219.1 7058 19 45183 943 -30 15 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAATA 3590 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.447.30 chr1 + 2433 3 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000636219.1 7058 19 45399 943 186 15 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAATA 3806 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.447.31 chr1 + 2255 2 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000466382.2 2699 6 2625 22 719 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 4339 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.447.32 chr1 + 3154 2 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000466382.2 2699 6 2666 -918 760 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TGGTAAGACTTTTGTGAAGC 4380 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.447.33 chr1 + 2495 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 565 -14 565 14 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 7414 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.447.34 chr1 + 2295 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 764 -13 764 13 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 GTAAAAAAAAAAAAAAAAAA 7613 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.447.35 chr1 + 2052 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 1008 -14 1008 14 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 14 3.744712 0.573418 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 7857 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.447.36 chr1 + 1935 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 1125 -14 1125 14 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 22 5.884548 0.769713 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 7974 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 22 NA PB.447.37 chr1 + 1761 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 1299 -14 1299 14 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 16 4.279671 0.631410 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 8148 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.447.38 chr1 + 1652 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 1408 -14 1408 14 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 8257 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.447.39 chr1 + 1458 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 1602 -14 1602 14 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 18 4.814630 0.682563 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 8451 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.447.40 chr1 + 1240 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 1820 -14 1820 14 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 14 3.744712 0.573418 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 8669 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.447.41 chr1 + 1112 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 1948 -14 1948 14 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 19 5.082109 0.706044 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 8797 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.447.42 chr1 + 1901 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 2099 -954 2099 -4 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TGGTAAGACTTTTGTGAAGC 8948 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.447.43 chr1 + 909 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 2151 -14 2151 14 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 9000 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.447.44 chr1 + 779 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 2281 -14 2281 14 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 9130 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.447.45 chr1 + 1431 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 2573 -958 2573 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGACTTTTGTGAAGCTTTT 9422 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.447.46 chr1 + 1072 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 2931 -957 2931 -1 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 15 4.012192 0.603382 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAGACTTTTGTGAAGCTTT 9780 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 15 NA PB.448.1 chr1 + 2122 4 novel_in_catalog PIGV novel 1624 5 NA NA -1 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATGCGACATTGTTTCTGA 0 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.448.2 chr1 + 1901 3 full-splice_match PIGV ENST00000688730.1 1984 3 2 81 0 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACATTGTTTCTGATGTTTTT -28 TRUE NA NA AATAAA -25 NA NA NA 2 NA PB.448.3 chr1 + 1654 4 full-splice_match PIGV ENST00000674222.1 4377 4 -17 2740 0 112 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTCTGCTGCCCTGGGATCAT -28 TRUE NA NA AGTAAA -19 NA NA NA 9 NA PB.448.4 chr1 + 2127 4 full-splice_match PIGV ENST00000674222.1 4377 4 -15 2265 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 49 13.106493 1.117486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TACATGCAATGAATTGCCTT -26 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 49 NA PB.448.5 chr1 + 2398 4 full-splice_match PIGV ENST00000688522.1 2396 4 8 -10 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.744712 0.573418 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TATACATGCAATGAATTGCC -20 TRUE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 14 NA PB.448.6 chr1 + 1916 4 full-splice_match PIGV ENST00000688522.1 2396 4 17 463 0 112 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTCTGCTGCCCTGGGATCAT -11 TRUE NA NA AGTAAA -19 NA NA NA 4 NA PB.448.7 chr1 + 2152 4 full-splice_match PIGV ENST00000688522.1 2396 4 257 -13 12 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACATGCAATGAATTGCCTTT 13 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 7 NA PB.448.8 chr1 + 1445 2 incomplete-splice_match PIGV ENST00000674317.1 2245 4 5320 -99 5320 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AATGAATTGCCTTTTTAAAA 6435 FALSE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.448.9 chr1 + 1077 2 incomplete-splice_match PIGV ENST00000674317.1 2245 4 5581 8 5581 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATGCGACATTGTTTCTGA 6696 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.448.10 chr1 + 1120 2 incomplete-splice_match PIGV ENST00000674317.1 2245 4 5645 -99 5645 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AATGAATTGCCTTTTTAAAA 6760 FALSE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 5 NA PB.450.2 chr1 + 2595 7 incomplete-splice_match ZDHHC18 ENST00000374141.6 1002 8 550 -1750 534 1750 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGAGTTGCTTTGCTTTGGT 503 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 4 NA PB.450.3 chr1 + 2392 5 incomplete-splice_match ZDHHC18 ENST00000488397.3 1275 7 -62 1889 -62 1750 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGAGTTGCTTTGCTTTGGT NA FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.450.4 chr1 + 2169 3 incomplete-splice_match ZDHHC18 ENST00000488397.3 1275 7 802 1889 35 1750 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGAGTTGCTTTGCTTTGGT NA FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 5 NA PB.452.1 chr1 - 1311 5 novel_not_in_catalog GPN2 novel 4665 5 NA NA -16 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TATATTTTGTGTATTCTCTT -22 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.452.2 chr1 - 1415 5 full-splice_match GPN2 ENST00000374135.9 4665 5 0 3250 0 -6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 160 42.796711 1.631410 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTTTTTGTGACTTCCAAAC -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 160 NA PB.452.3 chr1 - 1220 5 full-splice_match GPN2 ENST00000374135.9 4665 5 194 3251 171 -7 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TACTTTTTGTGACTTCCAAA 9972 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.453.1 chr1 - 2118 7 full-splice_match GPATCH3 ENST00000361720.10 2125 7 6 1 6 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 60 16.048767 1.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTCCCTTACTTTTCTAAT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 60 NA PB.453.2 chr1 - 1993 7 novel_not_in_catalog GPATCH3 novel 2125 7 NA NA 1 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTCCCTTACTTTTCTAAT -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.453.3 chr1 - 1566 6 incomplete-splice_match GPATCH3 ENST00000361720.10 2125 7 2824 1 2824 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTCCCTTACTTTTCTAAT 2813 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.453.4 chr1 - 1766 7 full-splice_match GPATCH3 ENST00000361720.10 2125 7 357 2 357 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAGCTCCCTTACTTTTCTAA 346 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.454.1 chr1 + 1306 1 full-splice_match SFN ENST00000339276.6 1308 1 2 0 2 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 316 84.523506 1.926978 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTCCTGTCTCTCTTCCAGTT 2 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 316 NA PB.454.3 chr1 + 1215 1 full-splice_match SFN ENST00000339276.6 1308 1 93 0 93 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTCCTGTCTCTCTTCCAGTT 93 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 8 NA PB.454.4 chr1 + 1040 1 full-splice_match SFN ENST00000339276.6 1308 1 268 0 268 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTCCTGTCTCTCTTCCAGTT 268 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.454.5 chr1 + 862 1 full-splice_match SFN ENST00000339276.6 1308 1 446 0 446 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTCCTGTCTCTCTTCCAGTT 446 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 5 NA PB.455.1 chr1 - 1168 2 full-splice_match NR0B2 ENST00000254227.4 1165 2 -2 -1 -2 1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 173 46.273945 1.665336 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGGAGCCTGATACTGTCATT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 173 NA PB.455.2 chr1 - 1477 2 novel_not_in_catalog NR0B2 novel 1165 2 NA NA 0 -6 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 19 5.082109 0.706044 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACACTTGGAGCCTGATAC -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.456.1 chr1 + 2182 8 novel_in_catalog NUDC novel 1792 9 NA NA -25 211 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TCCTTCTGTGTCCTCTCTTG -37 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.456.2 chr1 + 1339 9 full-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 -21 474 -21 213 alternative_3end TRUE canonical NA NA NA NA 2313 618.679993 2.791466 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTCTGTGTCCTCTCTTGCC -33 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 2313 NA PB.456.4 chr1 + 1434 10 novel_not_in_catalog NUDC novel 1792 9 NA NA -11 213 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTCTGTGTCCTCTCTTGCC -23 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.456.5 chr1 + 1315 9 novel_not_in_catalog NUDC novel 1792 9 NA NA -3 213 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTCTGTGTCCTCTCTTGCC -15 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 5 NA PB.456.6 chr1 + 1009 7 novel_in_catalog NUDC novel 1792 9 NA NA -3 213 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTCTGTGTCCTCTCTTGCC -15 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 6 NA PB.456.7 chr1 + 1799 9 full-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 3 -10 3 10 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 110 29.422739 1.468683 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TATGTATGTTTCTGAGCAAA -9 TRUE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 110 NA PB.456.8 chr1 + 1410 8 novel_in_catalog NUDC novel 1792 9 NA NA 0 211 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TCCTTCTGTGTCCTCTCTTG -12 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.456.9 chr1 + 1937 10 novel_not_in_catalog NUDC novel 1792 9 NA NA 2 -24 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAATAAATAAATAAAA -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.456.11 chr1 + 1485 10 novel_not_in_catalog NUDC novel 1792 9 NA NA 2 211 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 47 12.571534 1.099388 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TCCTTCTGTGTCCTCTCTTG -10 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 47 NA PB.456.12 chr1 + 1495 9 full-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 2 295 2 -295 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.279671 0.631410 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGTGATGGTTCATGTCTGTA -10 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 16 NA PB.456.14 chr1 + 1409 8 novel_in_catalog NUDC novel 1792 9 NA NA 3 213 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTCTGTGTCCTCTCTTGCC -9 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.456.15 chr1 + 1407 8 novel_in_catalog NUDC novel 1792 9 NA NA 3 213 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTCTGTGTCCTCTCTTGCC -9 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.456.17 chr1 + 1329 9 novel_not_in_catalog NUDC novel 1792 9 NA NA 13 213 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTCTGTGTCCTCTCTTGCC 1 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 7 NA PB.456.18 chr1 + 2328 6 novel_in_catalog NUDC novel 1792 9 NA NA 17 213 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTCTGTGTCCTCTCTTGCC 5 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.456.19 chr1 + 1162 9 full-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 156 474 156 213 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 31 8.291862 0.918652 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTCTGTGTCCTCTCTTGCC 88 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 31 NA PB.456.20 chr1 + 1540 8 incomplete-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 2387 24 1988 -24 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAATAAATAAATAAAA 2319 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.456.23 chr1 + 997 7 incomplete-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 19770 474 -3622 213 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 30 8.024384 0.904412 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTCTGTGTCCTCTCTTGCC 5304 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 30 NA PB.456.24 chr1 + 1386 7 incomplete-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 19866 -11 -3526 11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATGTATGTTTCTGAGCAAAG 5400 FALSE NA NA AATAAA -25 NA NA NA 7 NA PB.456.25 chr1 + 901 7 incomplete-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 19866 474 -3526 213 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.744712 0.573418 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTCTGTGTCCTCTCTTGCC 5400 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 14 NA PB.456.26 chr1 + 1285 6 incomplete-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 20024 24 -3368 -24 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAATAAATAAATAAAA 5558 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.456.27 chr1 + 816 6 incomplete-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 20043 474 -3349 213 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.209753 0.506472 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTCTGTGTCCTCTCTTGCC 5577 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 12 NA PB.456.28 chr1 + 717 5 incomplete-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 20983 474 -2409 213 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTCTGTGTCCTCTCTTGCC 6517 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.457.1 chr1 - 2320 3 novel_in_catalog KDF1 novel 1855 4 NA NA 62 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAATTGGTATCTGCCTGCTT 38 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.457.2 chr1 - 1781 4 novel_not_in_catalog KDF1 novel 1855 4 NA NA 12 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAATTGGTATCTGCCTGCTT -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.457.4 chr1 - 1769 4 full-splice_match KDF1 ENST00000320567.6 1855 4 77 9 77 -9 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 38 10.164219 1.007074 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CAAAGGTAATTGGTATCTGC -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 38 NA PB.459.1 chr1 - 2379 2 full-splice_match TENT5B ENST00000289166.6 2382 2 1 2 1 -2 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 22 5.884548 0.769713 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCTTAGTGCCATGCTTCC 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 22 NA PB.459.2 chr1 - 2217 2 full-splice_match TENT5B ENST00000289166.6 2382 2 163 2 163 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCTTAGTGCCATGCTTCC 168 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.459.4 chr1 - 2107 2 full-splice_match TENT5B ENST00000289166.6 2382 2 272 3 272 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAACCTTAGTGCCATGCTTC 277 FALSE NA NA GGGGCT -45 NA NA NA 2 NA PB.461.1 chr1 + 1078 2 full-splice_match TRNP1 ENST00000522111.3 1961 2 650 233 23 -233 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATGCATGGGGTTCTGAGG 366 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.462.1 chr1 + 4215 16 full-splice_match WDTC1 ENST00000319394.8 4706 16 95 396 59 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TAGGTGTGGCTGGTGGCATT -11 TRUE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 3 NA PB.462.2 chr1 + 3405 10 incomplete-splice_match WDTC1 ENST00000319394.8 4706 16 57590 396 4513 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TAGGTGTGGCTGGTGGCATT NA FALSE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 3 NA PB.462.3 chr1 + 2928 6 incomplete-splice_match WDTC1 ENST00000361771.7 4275 16 62398 0 -7948 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGTGGCTGGTGGCATTTGTG NA FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.462.4 chr1 + 2797 5 incomplete-splice_match WDTC1 ENST00000361771.7 4275 16 63310 0 -7036 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGTGGCTGGTGGCATTTGTG NA FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 5 NA PB.462.5 chr1 + 2591 4 incomplete-splice_match WDTC1 ENST00000361771.7 4275 16 66627 3 -3719 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGGTGTGGCTGGTGGCATTT NA FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 5 NA PB.462.6 chr1 + 2368 3 incomplete-splice_match WDTC1 ENST00000361771.7 4275 16 69008 4 -1338 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TAGGTGTGGCTGGTGGCATT NA FALSE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.463.1 chr1 + 1595 6 full-splice_match TMEM222 ENST00000374076.9 1596 6 0 1 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.942274 0.468683 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTGGTGCCCTGTCATTGT -6 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 11 NA PB.463.3 chr1 + 1512 6 full-splice_match TMEM222 ENST00000608611.5 1511 6 -2 1 -1 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 166 44.401588 1.647398 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTGGTGCCCTGTCATTGT -25 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 166 NA PB.463.4 chr1 + 1313 2 novel_not_in_catalog TMEM222 novel 368 4 NA NA 3 -6035 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 CAAAAAAAAGGGAAAAAAAA -14 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 6 NA PB.463.6 chr1 + 1574 7 full-splice_match TMEM222 ENST00000478104.5 986 7 -13 -575 -9 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTGGTGCCCTGTCATTGT 1 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 6 NA PB.463.7 chr1 + 1724 8 full-splice_match TMEM222 ENST00000486082.5 994 8 21 -751 -6 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTGGTGCCCTGTCATTGT 4 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.463.8 chr1 + 2567 5 full-splice_match TMEM222 ENST00000464813.5 1071 5 7 -1503 3 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTGGTGCCCTGTCATTGT 17 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.463.9 chr1 + 1623 7 full-splice_match TMEM222 ENST00000464720.5 1665 7 41 1 3 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.942274 0.468683 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTGGTGCCCTGTCATTGT 17 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 11 NA PB.463.10 chr1 + 3132 7 novel_in_catalog TMEM222 novel 1665 7 NA NA 5 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTGGTGCCCTGTCATTGT 19 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.463.11 chr1 + 1671 1 full-splice_match ACTG1P20 ENST00000486001.1 468 1 -474 -729 -474 729 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA NA NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAGGGAAAAAAAAG 2584 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.463.13 chr1 + 1315 5 incomplete-splice_match TMEM222 ENST00000608611.5 1511 6 8523 1 -1575 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTGGTGCCCTGTCATTGT 4449 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 6 NA PB.463.14 chr1 + 1387 5 incomplete-splice_match TMEM222 ENST00000464720.5 1665 7 8785 1 -1314 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTGGTGCCCTGTCATTGT 4710 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.463.15 chr1 + 3031 2 full-splice_match TMEM222 ENST00000470223.1 2841 2 -190 0 -190 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTGGTGCCCTGTCATTGT 6951 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.463.16 chr1 + 2315 2 full-splice_match TMEM222 ENST00000470223.1 2841 2 526 0 526 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTGGTGCCCTGTCATTGT 7667 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.463.17 chr1 + 1197 3 full-splice_match TMEM222 ENST00000471456.1 2861 3 1664 0 547 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTGGTGCCCTGTCATTGT 7688 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 6 NA PB.464.1 chr1 - 4489 12 full-splice_match SLC9A1 ENST00000263980.8 4737 12 247 1 247 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTCAAGGGCTGCTTTCTGG 610 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.464.2 chr1 - 2206 5 incomplete-splice_match SLC9A1 ENST00000374089.5 3165 7 1551 1 324 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAATAGAGTCAAGGGCTGCT NA FALSE NA NA GGGGCT -26 NA NA NA 5 NA PB.464.3 chr1 - 3308 11 incomplete-splice_match SLC9A1 ENST00000263980.8 4737 12 41119 6 -9984 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAGAGTCAAGGGCTGCTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.464.4 chr1 - 2083 4 incomplete-splice_match SLC9A1 ENST00000374089.5 3165 7 1929 0 702 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAGAGTCAAGGGCTGCTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.464.5 chr1 - 1953 3 incomplete-splice_match SLC9A1 ENST00000374089.5 3165 7 2248 0 1021 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAGAGTCAAGGGCTGCTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.464.7 chr1 - 4769 12 full-splice_match SLC9A1 ENST00000263980.8 4737 12 -39 7 -39 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAATAGAGTCAAGGGCTGCT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.464.8 chr1 - 3860 12 full-splice_match SLC9A1 ENST00000263980.8 4737 12 870 7 343 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAATAGAGTCAAGGGCTGCT 1233 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.464.12 chr1 - 3576 11 incomplete-splice_match SLC9A1 ENST00000263980.8 4737 12 40849 8 -10254 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TTAATAGAGTCAAGGGCTGC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.464.13 chr1 - 2366 6 full-splice_match SLC9A1 ENST00000447808.1 887 6 49 -1528 49 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TTAATAGAGTCAAGGGCTGC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.465.1 chr1 + 1729 14 novel_in_catalog SYTL1 novel 1936 15 NA NA 0 1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATAAAAGGCTGGTGTCTGCT -31 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.465.2 chr1 + 2801 12 novel_in_catalog SYTL1 novel 1936 15 NA NA 1 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CAATAAAAGGCTGGTGTCTG -30 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.465.3 chr1 + 2831 11 novel_in_catalog SYTL1 novel 2525 13 NA NA -12 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAAAAGGCTGGTGTCTGC -8 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.465.4 chr1 + 1911 15 full-splice_match SYTL1 ENST00000616558.5 1936 15 23 2 -12 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 28 7.489425 0.874448 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAAAAGGCTGGTGTCTGC -8 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 28 NA PB.465.5 chr1 + 2154 14 novel_in_catalog SYTL1 novel 1936 15 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CAATAAAAGGCTGGTGTCTG 4 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.465.6 chr1 + 1854 15 full-splice_match SYTL1 ENST00000318074.9 1900 15 44 2 9 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAAAAGGCTGGTGTCTGC 13 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.465.7 chr1 + 2297 13 novel_in_catalog SYTL1 novel 2525 13 NA NA 11 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAAAAGGCTGGTGTCTGC 15 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.465.8 chr1 + 2088 15 novel_in_catalog SYTL1 novel 1936 15 NA NA 28 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAAAAGGCTGGTGTCTGC 32 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.465.9 chr1 + 1823 15 full-splice_match SYTL1 ENST00000616558.5 1936 15 111 2 76 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAAAAGGCTGGTGTCTGC 80 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.465.10 chr1 + 1282 10 incomplete-splice_match SYTL1 ENST00000543823.1 2229 14 4233 0 -370 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAAAAGGCTGGTGTCTGC 4292 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 5 NA PB.465.11 chr1 + 918 4 full-splice_match SYTL1 ENST00000615284.1 793 4 -132 7 -132 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAAAAGGCTGGTGTCTGC 6129 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.466.2 chr1 - 1760 12 incomplete-splice_match MAP3K6 ENST00000493901.6 3654 27 5246 -29 -1714 5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GTCCTGGCAATTTTGGAGGT 7429 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.466.3 chr1 - 1112 8 incomplete-splice_match MAP3K6 ENST00000671291.1 3287 20 4904 -28 -17 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGTCCTGGCAATTTTGGAGG 9126 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.466.4 chr1 - 1875 13 incomplete-splice_match MAP3K6 ENST00000493901.6 3654 27 4794 -27 -2166 3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTGTCCTGGCAATTTTGGAG 6977 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.466.5 chr1 - 2183 16 incomplete-splice_match MAP3K6 ENST00000493901.6 3654 27 3817 -22 1778 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCTTTGTCCTGGCAATTT 6000 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.466.6 chr1 - 2020 14 incomplete-splice_match MAP3K6 ENST00000493901.6 3654 27 4397 -21 2358 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAACCTTTGTCCTGGCAATT 6580 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.466.7 chr1 - 1693 6 novel_in_catalog MAP3K6 novel 3287 20 NA NA -61 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAACCTTTGTCCTGGCAATT 9082 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.466.8 chr1 - 1456 10 incomplete-splice_match MAP3K6 ENST00000493901.6 3654 27 6189 -21 -771 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAACCTTTGTCCTGGCAATT 8372 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.466.9 chr1 - 2766 21 incomplete-splice_match MAP3K6 ENST00000493901.6 3654 27 2567 -20 528 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGAACCTTTGTCCTGGCAAT 4750 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.467.30 chr1 - 3269 9 full-splice_match WASF2 ENST00000618852.5 5681 9 -2 2414 -2 1553 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAGTGAGGTTTCTTTTCT -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.467.31 chr1 - 1860 9 full-splice_match WASF2 ENST00000618852.5 5681 9 0 3821 0 146 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGATATATCCAAGTGCTT -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.468.1 chr1 - 5873 8 novel_in_catalog AHDC1 novel 6428 9 NA NA 2 4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAAGACAAAAAAAAAAAA -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.468.2 chr1 - 3417 2 incomplete-splice_match AHDC1 ENST00000644989.1 6103 6 53038 408 3104 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAAGACAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.468.3 chr1 - 1714 2 incomplete-splice_match AHDC1 ENST00000644989.1 6103 6 54741 408 4807 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAAGACAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA ACTAAA -43 NA NA NA 3 NA PB.468.4 chr1 - 1392 2 incomplete-splice_match AHDC1 ENST00000644989.1 6103 6 55063 408 5129 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAAGACAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.468.5 chr1 - 1249 2 incomplete-splice_match AHDC1 ENST00000644989.1 6103 6 55205 409 5271 3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 GAAAAAGACAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.468.6 chr1 - 2767 2 incomplete-splice_match AHDC1 ENST00000644989.1 6103 6 53686 410 3752 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AGAAAAAGACAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.468.7 chr1 - 1628 2 incomplete-splice_match AHDC1 ENST00000644989.1 6103 6 54825 410 4891 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AGAAAAAGACAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.469.1 chr1 - 2378 13 full-splice_match FGR ENST00000374005.8 2637 13 23 236 23 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.942274 0.468683 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAACCATGAAATACCCTTGA -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.469.2 chr1 - 2367 13 full-splice_match FGR ENST00000399173.5 2483 13 108 8 3 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAACCATGAAATACCCTTGA -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.469.3 chr1 - 1678 7 incomplete-splice_match FGR ENST00000374004.5 2350 11 7050 0 7050 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAACCATGAAATACCCTTGA 9627 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.469.4 chr1 - 2470 13 full-splice_match FGR ENST00000399173.5 2483 13 4 9 4 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 CAAACCATGAAATACCCTTG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.470.2 chr1 + 2122 2 full-splice_match GPR3 ENST00000374024.4 2137 2 12 3 12 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATGTTTCCCTATGTGT 8 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 10 NA PB.471.1 chr1 + 1146 5 novel_not_in_catalog FAM76A novel 1027 8 NA NA -10 -19925 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 TAAAAAAAATAGGCTATGGT -24 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.471.2 chr1 + 1966 8 full-splice_match FAM76A ENST00000373949.5 2273 8 -55 362 12 129 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATATCAGTTGTCATACTGG -2 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.471.3 chr1 + 2045 9 full-splice_match FAM76A ENST00000373954.11 3579 9 21 1513 -14 130 alternative_3end TRUE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATATCAGTTGTCATACTGGG 7 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.471.4 chr1 + 1151 9 novel_in_catalog FAM76A novel 3579 9 NA NA 0 1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATGTCTGAATTATAGATTCT 21 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.471.5 chr1 + 1760 4 incomplete-splice_match FAM76A ENST00000373954.11 3579 9 23142 1152 4329 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAGGAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.472.1 chr1 + 2074 9 full-splice_match STX12 ENST00000373943.9 3034 9 -12 972 -12 -972 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AATATAAATGTTGTCCACTT -22 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 5 NA PB.472.2 chr1 + 1270 9 novel_not_in_catalog STX12 novel 3034 9 NA NA -12 2258 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTTCGCCCACTTTTTGATGG -22 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.472.4 chr1 + 2289 8 novel_in_catalog STX12 novel 3034 9 NA NA 0 -675 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TTTGTAGTATGTTTTTATGA -10 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.472.5 chr1 + 855 7 incomplete-splice_match STX12 ENST00000373943.9 3034 9 29 6374 -7 -5 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAGAAAGAAAGAAAGA 19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.472.6 chr1 + 2999 9 full-splice_match STX12 ENST00000373943.9 3034 9 33 2 -3 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.814630 0.682563 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTCTCCTTATCTGTGCCT 23 TRUE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 18 NA PB.472.7 chr1 + 2860 9 full-splice_match STX12 ENST00000373943.9 3034 9 33 141 -3 -141 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAATACTGTGTGACCTGTGG 23 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 10 NA PB.472.8 chr1 + 2326 9 full-splice_match STX12 ENST00000373943.9 3034 9 33 675 -3 -675 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 43 11.501616 1.060759 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TTTGTAGTATGTTTTTATGA 23 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 43 NA PB.472.9 chr1 + 2280 8 novel_in_catalog STX12 novel 3034 9 NA NA -3 -677 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CTTTTGTAGTATGTTTTTAT 23 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.472.10 chr1 + 1900 6 incomplete-splice_match STX12 ENST00000373943.9 3034 9 28540 676 -8164 -676 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTTTGTAGTATGTTTTTATG NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.472.12 chr1 + 1764 4 incomplete-splice_match STX12 ENST00000373943.9 3034 9 38981 674 1953 -674 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TTGTAGTATGTTTTTATGAG NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.472.13 chr1 + 2401 4 incomplete-splice_match STX12 ENST00000373943.9 3034 9 39025 -7 1997 7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATCTGTGCCTTGATTATCA NA FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.473.1 chr1 + 1238 7 full-splice_match PPP1R8 ENST00000311772.10 2340 7 -51 1153 -51 91 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAACTTTCCATGTGTGCG NA FALSE NA NA AATGAA -9 NA NA NA 3 NA PB.473.2 chr1 + 1021 7 full-splice_match PPP1R8 ENST00000311772.10 2340 7 23 1296 -9 -52 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAGAAGAAGAAATATGCAAA 5 TRUE NA NA AATGAA -4 NA NA NA 5 NA PB.473.3 chr1 + 2300 7 full-splice_match PPP1R8 ENST00000311772.10 2340 7 32 8 0 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TGTGGAAATTCTAATGAGAG 14 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 8 NA PB.473.4 chr1 + 2159 7 full-splice_match PPP1R8 ENST00000311772.10 2340 7 32 149 0 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 111 29.690218 1.472613 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTGGGTGCAGGCTGTGAA 14 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 111 NA PB.473.5 chr1 + 2016 5 incomplete-splice_match PPP1R8 ENST00000373931.8 2651 7 7881 145 7379 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTGGGTGCAGGCTGTGAA 4301 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.473.6 chr1 + 1866 4 incomplete-splice_match PPP1R8 ENST00000373931.8 2651 7 10192 145 -9079 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTGGGTGCAGGCTGTGAA 6612 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.473.7 chr1 + 1743 4 incomplete-splice_match PPP1R8 ENST00000373931.8 2651 7 10315 145 -8956 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTGGGTGCAGGCTGTGAA 119 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.473.8 chr1 + 1547 3 incomplete-splice_match PPP1R8 ENST00000236412.11 2414 6 12470 1 -6809 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTGGGTGCAGGCTGTGAA 2266 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 10 NA PB.474.1 chr1 - 815 5 full-splice_match IFI6 ENST00000361157.11 812 5 0 -3 0 3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 130 34.772327 1.541234 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGTCCTGCTGTCAATCATGT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 130 NA PB.474.2 chr1 - 666 4 incomplete-splice_match IFI6 ENST00000361157.11 812 5 2925 -3 2911 3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGTCCTGCTGTCAATCATGT 44 TRUE NA NA AAGAAA -27 NA NA NA 2 NA PB.474.3 chr1 - 830 5 full-splice_match IFI6 ENST00000339145.8 822 5 -14 6 0 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAACACTTTGTCCTGCTGT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.474.4 chr1 - 871 5 full-splice_match IFI6 ENST00000361157.11 812 5 -65 6 -45 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAACACTTTGTCCTGCTGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.474.5 chr1 - 848 5 full-splice_match IFI6 ENST00000362020.4 828 5 -24 4 -10 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 25 6.686986 0.825230 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAACACTTTGTCCTGCTGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 25 NA PB.474.6 chr1 - 609 3 incomplete-splice_match IFI6 ENST00000339145.8 822 5 3668 6 3668 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAACACTTTGTCCTGCTGT 3680 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.475.1 chr1 + 2344 5 novel_in_catalog THEMIS2 novel 2713 6 NA NA -43 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TATGAATGAGAACGGTATCA 9022 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.475.2 chr1 + 2712 6 full-splice_match THEMIS2 ENST00000373921.8 2713 6 0 1 0 1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.814630 0.682563 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATGAATGAGAACGGTATCAT -5 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 18 NA PB.475.3 chr1 + 1228 4 full-splice_match THEMIS2 ENST00000373927.7 1082 4 -5 -141 0 1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATGAATGAGAACGGTATCAT -5 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.475.4 chr1 + 1087 3 novel_in_catalog THEMIS2 novel 1650 5 NA NA 0 1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATGAATGAGAACGGTATCAT -5 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 4 NA PB.475.5 chr1 + 2569 5 novel_in_catalog THEMIS2 novel 2713 6 NA NA 0 2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AATGAGAACGGTATCATTTA 0 TRUE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 3 NA PB.475.6 chr1 + 2294 4 incomplete-splice_match THEMIS2 ENST00000373921.8 2713 6 7254 2 67 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TATGAATGAGAACGGTATCA 145 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.475.7 chr1 + 1873 3 incomplete-splice_match THEMIS2 ENST00000456990.1 1926 5 2404 0 -1263 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TATGAATGAGAACGGTATCA 2482 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.476.2 chr1 + 1857 8 full-splice_match SMPDL3B ENST00000373894.8 1866 8 7 2 7 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 20 5.349589 0.728320 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GATTCTGTGTTGTGTTCCTT 13 FALSE NA NA AAAACA -18 NA NA NA 20 NA PB.477.1 chr1 - 1645 9 full-splice_match RPA2 ENST00000373912.8 1584 9 -76 15 -63 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 912 243.941254 2.387285 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AGTAACTTGTAAAAATTCTC 82 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 912 NA PB.477.2 chr1 - 1524 8 novel_in_catalog RPA2 novel 1584 9 NA NA -7 -5 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 34 9.094301 0.958769 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAAATTCTCGTTTTTCTTT -28 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 34 NA PB.477.3 chr1 - 1106 5 incomplete-splice_match RPA2 ENST00000373912.8 1584 9 16876 5 -614 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 26 6.954466 0.842264 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAAATTCTCGTTTTTCTTT NA FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 26 NA PB.477.4 chr1 - 1729 9 novel_not_in_catalog RPA2 novel 1584 9 NA NA 0 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAAAATTCTCGTTTTTCTT -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.477.6 chr1 - 1464 9 full-splice_match RPA2 ENST00000373912.8 1584 9 107 13 45 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAACTTGTAAAAATTCTCGT 265 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.477.7 chr1 - 1815 8 full-splice_match RPA2 ENST00000313433.11 1237 8 -44 -534 18 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AGTAACTTGTAAAAATTCTC 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.477.8 chr1 - 951 4 incomplete-splice_match RPA2 ENST00000373912.8 1584 9 17532 15 42 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AGTAACTTGTAAAAATTCTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.477.9 chr1 - 1580 9 novel_in_catalog RPA2 novel 1584 9 NA NA 0 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TAGTAACTTGTAAAAATTCT -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.477.10 chr1 - 1537 9 full-splice_match RPA2 ENST00000373909.7 1162 9 9 -384 9 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TAGTAACTTGTAAAAATTCT -4 TRUE NA NA AAGAAA -6 NA NA NA 9 NA PB.477.11 chr1 - 1435 8 novel_in_catalog RPA2 novel 1584 9 NA NA 26 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TAGTAACTTGTAAAAATTCT 18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.477.12 chr1 - 1392 8 full-splice_match RPA2 ENST00000313433.11 1237 8 378 -533 378 -2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.744712 0.573418 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TAGTAACTTGTAAAAATTCT 598 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.477.13 chr1 - 1235 7 incomplete-splice_match RPA2 ENST00000373912.8 1584 9 7377 16 7315 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.279671 0.631410 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TAGTAACTTGTAAAAATTCT 7535 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.477.14 chr1 - 1735 9 full-splice_match RPA2 ENST00000373912.8 1584 9 -168 17 3 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 30 8.024384 0.904412 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 GTAGTAACTTGTAAAAATTC -10 TRUE NA NA AAGAAA -12 NA NA NA 30 NA PB.477.15 chr1 - 1527 9 full-splice_match RPA2 ENST00000373912.8 1584 9 26 31 26 -17 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 113 30.225178 1.480369 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAACAGTTCTATTGTAGTA 18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 113 NA PB.479.1 chr1 - 680 2 incomplete-splice_match EYA3 ENST00000373864.5 2459 14 79626 487 32625 -487 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACATCTCTTGCAGTCTTAG 647 FALSE NA NA AAAAAG -24 NA NA NA 2 NA PB.479.4 chr1 - 1689 16 novel_in_catalog EYA3 novel 1806 17 NA NA -3 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACCTATTATTTTCTAGCCCC -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.479.5 chr1 - 1762 16 incomplete-splice_match EYA3 ENST00000373871.8 5999 18 -10 18134 -10 1 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATGCACCTATTATTTTCTAG -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.479.6 chr1 - 1616 15 incomplete-splice_match EYA3 ENST00000373863.3 1729 17 -51 11208 -5 -2 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATGATGCACCTATTATTTTC -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.479.7 chr1 - 1047 9 incomplete-splice_match EYA3 ENST00000373863.3 1729 17 -20 33527 13 -4 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAGAAAAATGTAAAAAGA 26 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.479.10 chr1 - 1478 1 full-splice_match RN7SL559P ENST00000476501.3 297 1 -1181 0 -1181 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA NA NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAGAAAAAAAAAATGTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.480.1 chr1 - 1806 2 full-splice_match PTAFR ENST00000373857.8 3993 2 0 2187 0 320 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA -9 TRUE NA NA AAGAAA -44 NA NA NA 3 NA PB.481.1 chr1 + 2151 3 full-splice_match XKR8 ENST00000373884.6 2178 3 27 0 27 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 31 8.291862 0.918652 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAACCTAGTCTGTGTCATCA -2 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 31 NA PB.481.2 chr1 + 2460 5 novel_in_catalog XKR8 novel 2427 6 NA NA -22 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAACCTAGTCTGTGTCATCA 7 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.481.3 chr1 + 1971 3 full-splice_match XKR8 ENST00000373884.6 2178 3 207 0 -82 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAACCTAGTCTGTGTCATCA 135 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.481.4 chr1 + 1853 3 full-splice_match XKR8 ENST00000373884.6 2178 3 326 -1 37 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACCTAGTCTGTGTCATCAA 254 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.481.5 chr1 + 1647 2 incomplete-splice_match XKR8 ENST00000373884.6 2178 3 3664 1 3375 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CCAACCTAGTCTGTGTCATC 3592 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.482.2 chr1 - 1517 7 incomplete-splice_match DNAJC8 ENST00000263697.6 1763 9 18065 3 -6155 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAGCGTCCAGCTCACAGTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.482.4 chr1 - 1755 9 full-splice_match DNAJC8 ENST00000263697.6 1763 9 4 4 0 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 62 16.583725 1.219682 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAGCGTCCAGCTCACAGT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 62 NA PB.482.5 chr1 - 1205 3 incomplete-splice_match DNAJC8 ENST00000603289.5 483 5 52 827 52 -5 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGAAAGCGTCCAGCTCACAG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.482.6 chr1 - 1379 5 incomplete-splice_match DNAJC8 ENST00000263697.6 1763 9 23005 7 -1215 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TATGAAAGCGTCCAGCTCAC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.482.7 chr1 - 1488 9 full-splice_match DNAJC8 ENST00000263697.6 1763 9 3 272 -1 9 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 1583 423.419952 2.626771 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGTACTTTTCCTTGTACTC -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 1583 NA PB.482.8 chr1 - 1990 8 novel_in_catalog DNAJC8 novel 1763 9 NA NA 1 5 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTGATGTACTTTTCCTTGT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.482.9 chr1 - 3544 7 novel_in_catalog DNAJC8 novel 1763 9 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.482.10 chr1 - 1580 10 full-splice_match DNAJC8 ENST00000489277.5 1600 10 20 0 -1 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 34 9.094301 0.958769 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC 20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 34 NA PB.482.11 chr1 - 1505 9 novel_in_catalog DNAJC8 novel 1600 10 NA NA 0 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.482.12 chr1 - 1489 9 novel_not_in_catalog DNAJC8 novel 1600 10 NA NA 0 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.482.13 chr1 - 1412 8 novel_in_catalog DNAJC8 novel 1600 10 NA NA -2 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.482.14 chr1 - 1387 8 novel_not_in_catalog DNAJC8 novel 1600 10 NA NA 2 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.482.15 chr1 - 1380 8 novel_in_catalog DNAJC8 novel 1763 9 NA NA 0 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.482.16 chr1 - 1384 8 novel_in_catalog DNAJC8 novel 1600 10 NA NA -1 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.942274 0.468683 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.482.17 chr1 - 1362 8 incomplete-splice_match DNAJC8 ENST00000489277.5 1600 10 4013 0 3992 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.744712 0.573418 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC 8920 FALSE NA NA ATTAAA -20 NA NA NA 14 NA PB.482.18 chr1 - 1247 7 incomplete-splice_match DNAJC8 ENST00000489277.5 1600 10 18053 0 -6163 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.279671 0.631410 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.482.19 chr1 - 1042 4 novel_not_in_catalog DNAJC8 novel 1600 10 NA NA 0 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 36 9.629260 0.983593 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 36 NA PB.482.20 chr1 - 1075 5 incomplete-splice_match DNAJC8 ENST00000489277.5 1600 10 23031 0 -1185 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 55 14.711370 1.167653 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 55 NA PB.482.21 chr1 - 917 3 incomplete-splice_match DNAJC8 ENST00000603289.5 483 5 64 1103 64 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.279671 0.631410 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.482.23 chr1 - 1153 9 full-splice_match DNAJC8 ENST00000263697.6 1763 9 3 607 -1 -326 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 132 35.307285 1.547864 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAACAGTGTTGCTGTGACT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 132 NA PB.482.24 chr1 - 964 8 incomplete-splice_match DNAJC8 ENST00000489277.5 1600 10 4085 326 4064 -326 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAACAGTGTTGCTGTGACT 8992 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.482.25 chr1 - 1156 9 novel_in_catalog DNAJC8 novel 1600 10 NA NA 0 -328 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TTAAAACAGTGTTGCTGTGA 21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.483.1 chr1 + 1883 2 full-splice_match ATP5IF1 ENST00000465645.1 1855 2 -29 1 1 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 113 30.225178 1.480369 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAACTGTGTTTGATGCCTTC -14 TRUE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 113 NA PB.484.2 chr1 + 3455 10 full-splice_match SESN2 ENST00000253063.4 3462 10 6 1 6 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTCCCTTTTTATGGGCTGT 9 TRUE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 7 NA PB.484.7 chr1 + 2063 3 incomplete-splice_match SESN2 ENST00000253063.4 3462 10 15352 4 15352 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATACTCCCTTTTTATGGGC NA FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.485.1 chr1 + 1243 4 novel_not_in_catalog MED18 novel 862 3 NA NA 8 -10 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 CAATGAAGAGACATGTCTGT -47 TRUE NA NA AATAAA -3 NA NA NA 2 NA PB.485.2 chr1 + 1299 4 novel_not_in_catalog MED18 novel 1106 4 NA NA -18 1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 25 6.686986 0.825230 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATGTCTGTGTAATTCTGATT -35 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 25 NA PB.485.5 chr1 + 1833 3 full-splice_match MED18 ENST00000373842.9 1829 3 -3 -1 -3 1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATGTCTGTGTAATTCTGATT -20 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.485.8 chr1 + 971 4 novel_not_in_catalog MED18 novel 1106 4 NA NA 47 1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATGTCTGTGTAATTCTGATT 52 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.486.2 chr1 + 2275 12 incomplete-splice_match PHACTR4 ENST00000373839.8 6048 14 -134 8576 -3 -5368 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TACCTGGAAAGCACTCTCTT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.486.5 chr1 + 2156 12 incomplete-splice_match PHACTR4 ENST00000373839.8 6048 14 -15 8576 -14 -5368 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TACCTGGAAAGCACTCTCTT 29 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.486.6 chr1 + 3218 14 full-splice_match PHACTR4 ENST00000373839.8 6048 14 -5 2835 -4 -16 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 39 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.486.7 chr1 + 3370 14 full-splice_match PHACTR4 ENST00000373839.8 6048 14 0 2678 0 141 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG 44 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 5 NA PB.486.14 chr1 + 1952 10 incomplete-splice_match PHACTR4 ENST00000373836.4 3107 13 20963 5515 20963 -5368 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TACCTGGAAAGCACTCTCTT 29 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.486.15 chr1 + 1644 8 incomplete-splice_match PHACTR4 ENST00000373836.4 3107 13 27616 5515 -25908 -5368 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TACCTGGAAAGCACTCTCTT 5519 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.486.16 chr1 + 2844 10 incomplete-splice_match PHACTR4 ENST00000373836.4 3107 13 27645 -383 -25879 141 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG 5548 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.486.17 chr1 + 2129 8 incomplete-splice_match PHACTR4 ENST00000373836.4 3107 13 35676 -382 -17848 140 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.486.18 chr1 + 2023 8 incomplete-splice_match PHACTR4 ENST00000373836.4 3107 13 35782 -382 -17742 140 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.486.19 chr1 + 1665 7 incomplete-splice_match PHACTR4 ENST00000373836.4 3107 13 38096 -383 -15428 141 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG NA FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 4 NA PB.486.21 chr1 + 1327 3 incomplete-splice_match PHACTR4 ENST00000632964.1 1853 4 -4 2678 -4 141 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG NA FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.486.22 chr1 + 1170 3 incomplete-splice_match PHACTR4 ENST00000632964.1 1853 4 -4 2835 -4 -16 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.487.1 chr1 - 1127 2 genic ENSG00000270605 novel 1945 1 NA NA -5761 -4 multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGTATGATTGTTTCTTGAAC -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.488.1 chr1 + 989 4 novel_not_in_catalog SNHG3 novel 2201 3 NA NA 61 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTTGTGGTTCATTTTTG -6 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 7 NA PB.488.2 chr1 + 896 3 novel_not_in_catalog SNHG3 novel 2201 3 NA NA 62 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTTGTGGTTCATTTTTG -5 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 3 NA PB.488.3 chr1 + 2545 13 full-splice_match RCC1 ENST00000683442.1 2551 13 0 6 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.209753 0.506472 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC -4 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 12 NA PB.488.4 chr1 + 2402 12 full-splice_match RCC1 ENST00000398958.6 2715 12 100 213 0 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC -4 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.488.5 chr1 + 1548 2 incomplete-splice_match SNHG3 ENST00000413987.1 2201 3 63 1259 63 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTTGTGGTTCATTTTTG -4 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 2 NA PB.488.6 chr1 + 879 3 full-splice_match SNHG3 ENST00000413987.1 2201 3 63 1259 63 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 128 34.237370 1.534500 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTTGTGGTTCATTTTTG -4 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 128 NA PB.488.7 chr1 + 2510 12 novel_in_catalog RCC1 novel 2551 13 NA NA 1 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAAATAGGCCACTTGTTTT -3 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 3 NA PB.488.8 chr1 + 845 2 novel_in_catalog SNHG3 novel 2201 3 NA NA 64 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.547151 0.657739 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTTGTGGTTCATTTTTG -3 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 17 NA PB.488.9 chr1 + 2594 14 novel_in_catalog RCC1 novel 2686 14 NA NA 2 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC -2 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 5 NA PB.488.10 chr1 + 2129 3 full-splice_match SNHG3 ENST00000413987.1 2201 3 70 2 70 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACCAGTGGTTTTAGTATGT 3 TRUE NA NA AGTAAA -15 NA NA NA 5 NA PB.488.11 chr1 + 1426 1 full-splice_match SNORA73B ENST00000363217.1 204 1 -352 -870 -352 870 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CATGTTTGTGGTTCATTTTT 21 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.488.12 chr1 + 1080 1 full-splice_match SNORA73B ENST00000363217.1 204 1 -5 -871 -5 871 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTTGTGGTTCATTTTTG 368 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 6 NA PB.488.16 chr1 + 2358 10 incomplete-splice_match RCC1 ENST00000683442.1 2551 13 10718 6 -1375 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC 4763 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.488.17 chr1 + 1659 11 novel_in_catalog RCC1 novel 1577 11 NA NA -31 93 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATATGGTTAGACGTTTCTCC -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.488.18 chr1 + 1556 10 full-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 116 752 -5 67 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 35 9.361781 0.971358 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGGAACATGGCTCACTC 10 TRUE NA NA AATAAA -25 NA NA NA 35 NA PB.488.19 chr1 + 2324 10 full-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 100 0 -21 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 305 81.581230 1.911590 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC -6 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 305 NA PB.488.20 chr1 + 2619 10 full-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 114 -309 -7 -8 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAAAAATTTTTTTTTTTT 8 TRUE NA NA AATAGA -29 NA NA NA 4 NA PB.488.21 chr1 + 2574 11 novel_in_catalog RCC1 novel 1577 11 NA NA -7 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTTTGTTTGGGTATTTCT 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.488.22 chr1 + 2476 12 novel_not_in_catalog RCC1 novel 1577 11 NA NA -7 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC 8 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.488.23 chr1 + 2459 11 novel_in_catalog RCC1 novel 1577 11 NA NA -7 92 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 57 15.246328 1.183165 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GGTGTTGAGGCTACAACTTA 8 TRUE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 57 NA PB.488.24 chr1 + 2189 9 novel_in_catalog RCC1 novel 2424 10 NA NA -7 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAAATAGGCCACTTGTTTT 8 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 4 NA PB.488.25 chr1 + 2129 9 novel_in_catalog RCC1 novel 2424 10 NA NA -6 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC 9 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.488.26 chr1 + 1922 10 full-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 116 386 -5 -371 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGAAAAAAGTGATTCTCCC 10 TRUE NA NA AAAAAG -20 NA NA NA 3 NA PB.488.27 chr1 + 2500 10 full-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 119 -195 -2 -18 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 28 7.489425 0.874448 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAGGAAAAGTTTTGTTTGAA 13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 28 NA PB.488.28 chr1 + 2398 11 full-splice_match RCC1 ENST00000373831.7 1577 11 -2 -819 -2 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC 13 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 5 NA PB.488.29 chr1 + 2376 11 novel_in_catalog RCC1 novel 1577 11 NA NA 1 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAAATAGGCCACTTGTTTT -14 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 3 NA PB.488.31 chr1 + 2515 9 novel_in_catalog RCC1 novel 2424 10 NA NA 14 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC -1 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 6 NA PB.488.32 chr1 + 2347 11 novel_not_in_catalog RCC1 novel 1577 11 NA NA 40 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAAATAGGCCACTTGTTTT 25 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.488.33 chr1 + 2292 10 novel_not_in_catalog RCC1 novel 538 6 NA NA 45 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC 30 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 5 NA PB.488.34 chr1 + 2217 9 incomplete-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 11757 -1 -2042 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.744712 0.573418 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATAGGCCACTTGTTTTCT NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 14 NA PB.488.35 chr1 + 2046 8 incomplete-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 13790 0 -9 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.744712 0.573418 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 14 NA PB.488.36 chr1 + 2131 8 incomplete-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 13817 -112 18 -101 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AACTTAAGTGATGTCAAGAT NA FALSE NA NA AATAAA -25 NA NA NA 2 NA PB.488.37 chr1 + 1878 7 incomplete-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 14138 0 339 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 27 7.221945 0.858654 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 27 NA PB.488.38 chr1 + 1694 5 incomplete-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 17132 0 -825 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 23 6.152027 0.789018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 23 NA PB.488.39 chr1 + 1570 4 incomplete-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 17746 0 -211 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.209753 0.506472 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 12 NA PB.488.40 chr1 + 1458 4 incomplete-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 17857 1 -100 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAAATAGGCCACTTGTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 8 NA PB.488.41 chr1 + 1526 3 full-splice_match RCC1 ENST00000478232.1 509 3 168 -1185 168 94 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGTTGAGGCTACAACTTAAG NA FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 5 NA PB.488.42 chr1 + 1581 3 full-splice_match RCC1 ENST00000478232.1 509 3 221 -1293 221 -5 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GTTTGAATTTTGTTTGGGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.488.43 chr1 + 1307 2 incomplete-splice_match RCC1 ENST00000478232.1 509 3 652 -1085 652 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 23 6.152027 0.789018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 23 NA PB.488.44 chr1 + 1244 2 incomplete-splice_match RCC1 ENST00000478232.1 509 3 715 -1085 715 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.490.1 chr1 + 1095 9 full-splice_match TRNAU1AP ENST00000373830.4 1799 9 -105 809 -105 -8 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAATGACTGTTTTTGGAG NA FALSE NA NA TTTAAA -41 NA NA NA 5 NA PB.490.2 chr1 + 1177 10 full-splice_match TRNAU1AP ENST00000480930.5 1132 10 -16 -29 -2 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACACTGCTGCATTCATTTG -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.490.4 chr1 + 1117 10 novel_in_catalog TRNAU1AP novel 1132 10 NA NA 0 -9 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAATAATGACTGTTTTTGGA -8 TRUE NA NA TTTAAA -40 NA NA NA 3 NA PB.490.5 chr1 + 1757 9 full-splice_match TRNAU1AP ENST00000373830.4 1799 9 13 29 1 -29 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAATACAAACACAAAT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.490.6 chr1 + 998 9 full-splice_match TRNAU1AP ENST00000373830.4 1799 9 14 787 0 -6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 83 22.200794 1.346369 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 CATGAATGTTTCTACAACAC 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 83 NA PB.490.7 chr1 + 1602 9 full-splice_match TRNAU1AP ENST00000373830.4 1799 9 15 182 1 -182 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CAACCTTGTCATGTGTTGGG 5 TRUE NA NA AGTAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.490.8 chr1 + 1121 9 novel_in_catalog TRNAU1AP novel 1008 8 NA NA 43 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATGTTTCTACAACACTGCT 55 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.490.9 chr1 + 1081 9 novel_in_catalog TRNAU1AP novel 1008 8 NA NA -32 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACACTGCTGCATTCATTTG 106 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.490.10 chr1 + 977 9 novel_not_in_catalog TRNAU1AP novel 1008 8 NA NA 24 -9 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAATAATGACTGTTTTTGGA 176 FALSE NA NA TTTAAA -40 NA NA NA 5 NA PB.490.11 chr1 + 793 6 incomplete-splice_match TRNAU1AP ENST00000484775.1 1008 8 4116 16 4116 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATGAATGTTTCTACAACACT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.491.1 chr1 - 1625 4 full-splice_match SNHG12 ENST00000461448.6 1644 4 -14 33 0 20 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAAAGAAGAATAAAAAG -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.491.2 chr1 - 1048 5 full-splice_match SNHG12 ENST00000461832.2 1082 5 1 33 1 20 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.744712 0.573418 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAAAGAAGAATAAAAAG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.493.1 chr1 + 1943 10 full-splice_match GMEB1 ENST00000294409.2 1912 10 4 -35 0 22 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAATGTTGGGTTCTTCCCA 5 TRUE NA NA TTTAAA -33 NA NA NA 9 NA PB.493.2 chr1 + 1909 10 full-splice_match GMEB1 ENST00000373816.6 6358 10 2 4447 2 20 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.279671 0.631410 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGAAAATGTTGGGTTCTTCC 7 TRUE NA NA TTTAAA -31 NA NA NA 16 NA PB.493.3 chr1 + 1823 9 incomplete-splice_match GMEB1 ENST00000361872.8 1894 10 14804 13 18 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAAACAAAATC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.493.4 chr1 + 1458 6 incomplete-splice_match GMEB1 ENST00000480454.1 2063 9 9376 192 9376 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAAACAAAATC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.493.5 chr1 + 1036 3 incomplete-splice_match GMEB1 ENST00000480454.1 2063 9 20654 192 20654 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAAACAAAATC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.495.1 chr1 + 2409 5 full-splice_match YTHDF2 ENST00000373812.8 2744 5 -319 654 0 -4 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.495.2 chr1 + 2025 6 full-splice_match YTHDF2 ENST00000542507.5 2825 6 147 653 147 -4 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.495.3 chr1 + 1299 4 novel_in_catalog YTHDF2 novel 2825 6 NA NA -140 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCTAGTACCATTTAGTA -14 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.495.4 chr1 + 2871 5 full-splice_match YTHDF2 ENST00000373812.8 2744 5 -128 1 -128 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCTAGTACCATTTAGTA -2 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.495.5 chr1 + 2218 5 full-splice_match YTHDF2 ENST00000373812.8 2744 5 -128 654 -128 -4 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 40 10.699178 1.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 40 NA PB.495.7 chr1 + 2095 5 full-splice_match YTHDF2 ENST00000373812.8 2744 5 -5 654 -5 -4 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 441 117.958435 2.071729 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 441 NA PB.495.8 chr1 + 1156 4 novel_in_catalog YTHDF2 novel 2825 6 NA NA 3 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 44 11.769095 1.070743 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCTAGTACCATTTAGTA -8 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 44 NA PB.495.9 chr1 + 2589 4 full-splice_match YTHDF2 ENST00000478283.5 2594 4 -5 10 5 -10 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACTGGAAAATGAAAAAAAA -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.495.10 chr1 + 2732 5 full-splice_match YTHDF2 ENST00000373812.8 2744 5 11 1 1 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 23 6.152027 0.789018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCTAGTACCATTTAGTA 0 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 23 NA PB.495.12 chr1 + 2052 4 full-splice_match YTHDF2 ENST00000541996.5 2719 4 11 656 1 -6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 GGAAAATGAAAAAAAAAAGA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.495.13 chr1 + 1847 3 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000478283.5 2594 4 1319 4 519 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.814630 0.682563 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA 177 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.495.14 chr1 + 1672 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000478283.5 2594 4 5558 4 3417 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA 4416 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.495.15 chr1 + 1508 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000478283.5 2594 4 5722 4 3581 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.942274 0.468683 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA 4580 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.495.16 chr1 + 1376 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000478283.5 2594 4 5854 4 3713 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.477233 0.541234 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA 4712 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.495.17 chr1 + 1193 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000478283.5 2594 4 6037 4 3896 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA 4895 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.495.18 chr1 + 1077 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000478283.5 2594 4 6153 4 4012 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA 5011 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.495.19 chr1 + 799 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000478283.5 2594 4 6431 4 4290 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA 5289 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.495.20 chr1 + 1370 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000373812.8 2744 5 6523 1 4372 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCTAGTACCATTTAGTA 5371 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 10 NA PB.495.21 chr1 + 1225 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000373812.8 2744 5 6668 1 4517 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.814630 0.682563 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCTAGTACCATTTAGTA 5516 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 18 NA PB.495.22 chr1 + 1091 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000373812.8 2744 5 6802 1 4651 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.814630 0.682563 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCTAGTACCATTTAGTA 5650 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 18 NA PB.495.23 chr1 + 961 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000373812.8 2744 5 6932 1 4781 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.012192 0.603382 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCTAGTACCATTTAGTA 5780 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 15 NA PB.496.1 chr1 - 1390 6 full-splice_match TAF12 ENST00000263974.4 1359 6 -29 -2 -15 2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGACAGGGTACCTTTGAA 21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.496.2 chr1 - 1123 6 full-splice_match TAF12 ENST00000373824.9 1335 6 -37 249 0 2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 290 77.569038 1.889688 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGACAGGGTACCTTTGAA -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 290 NA PB.496.3 chr1 - 1045 5 novel_in_catalog TAF12 novel 1438 7 NA NA 0 2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGACAGGGTACCTTTGAA -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.496.4 chr1 - 1148 6 full-splice_match TAF12 ENST00000689843.1 1099 6 -53 4 3 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GAAAGACAGGGTACCTTTGA -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.496.5 chr1 - 1052 6 full-splice_match TAF12 ENST00000373824.9 1335 6 33 250 -15 1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 27 7.221945 0.858654 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GAAAGACAGGGTACCTTTGA 21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 27 NA PB.496.6 chr1 - 945 6 full-splice_match TAF12 ENST00000373824.9 1335 6 -18 408 0 -31 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 28 7.489425 0.874448 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GACAAAGCATTATGGTCTTT 5185 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 28 NA PB.498.1 chr1 - 2766 9 novel_in_catalog SRSF4 novel 2952 10 NA NA 11 2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TCATGGTGTTTGAATTGAAG 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.498.2 chr1 - 2294 6 full-splice_match SRSF4 ENST00000373795.7 2300 6 2 4 2 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 58 15.513808 1.190718 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATTTCATGGTGTTTGAA -28 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 58 NA PB.498.3 chr1 - 2237 6 full-splice_match SRSF4 ENST00000373795.7 2300 6 59 4 39 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATTTCATGGTGTTTGAA 29 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.498.4 chr1 - 2206 5 full-splice_match SRSF4 ENST00000466448.4 1264 5 -18 -924 0 -4 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATTTCATGGTGTTTGAA -30 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.498.5 chr1 - 2079 6 full-splice_match SRSF4 ENST00000373795.7 2300 6 217 4 197 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATTTCATGGTGTTTGAA 5171 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.498.6 chr1 - 1935 5 incomplete-splice_match SRSF4 ENST00000373795.7 2300 6 21489 4 152 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATTTCATGGTGTTTGAA 22 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.498.7 chr1 - 1825 4 incomplete-splice_match SRSF4 ENST00000634348.1 8128 7 14081 -106 127 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATTTCATGGTGTTTGAA 1020 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.498.8 chr1 - 1721 3 incomplete-splice_match SRSF4 ENST00000634348.1 8128 7 18648 -106 4694 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATTTCATGGTGTTTGAA 5587 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.498.9 chr1 - 1647 2 incomplete-splice_match SRSF4 ENST00000466448.4 1264 5 27020 -924 4678 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATTTCATGGTGTTTGAA 5571 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.498.16 chr1 - 2861 5 incomplete-splice_match SRSF4 ENST00000634348.1 8128 7 7567 0 -5364 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAGAAAAGAAAAGAAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.498.17 chr1 - 2100 5 full-splice_match SRSF4 ENST00000466448.4 1264 5 -18 -818 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAGAAAAGAAAAGAAT -30 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.498.18 chr1 - 1962 6 full-splice_match SRSF4 ENST00000373795.7 2300 6 228 110 208 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAGAAAAGAAAAGAAT 5182 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.498.19 chr1 - 1728 4 incomplete-splice_match SRSF4 ENST00000634348.1 8128 7 14072 0 118 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAGAAAAGAAAAGAAT 1011 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.498.24 chr1 - 2204 6 full-splice_match SRSF4 ENST00000373795.7 2300 6 -15 111 -15 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 133 35.574768 1.551142 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAAGAAAAGAAAAGAA -45 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 133 NA PB.498.25 chr1 - 1827 5 incomplete-splice_match SRSF4 ENST00000373795.7 2300 6 21490 111 153 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.477233 0.541234 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAAGAAAAGAAAAGAA 23 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.498.26 chr1 - 1562 3 incomplete-splice_match SRSF4 ENST00000634348.1 8128 7 18700 1 4746 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.209753 0.506472 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAAGAAAAGAAAAGAA 5639 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.498.27 chr1 - 1452 2 incomplete-splice_match SRSF4 ENST00000634348.1 8128 7 23313 1 9359 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.477233 0.541234 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAAGAAAAGAAAAGAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.498.32 chr1 - 1209 6 full-splice_match SRSF4 ENST00000373795.7 2300 6 4 1087 4 -159 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.477233 0.541234 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 GGCAGGAAGAGAAGCAGAGA -26 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.499.1 chr1 + 1904 12 incomplete-splice_match EPB41 ENST00000646189.1 3977 15 -19 18915 -7 -1260 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 GAAAAAGGAAGACGAGCCAC -30 TRUE NA NA AAAACA -42 NA NA NA 2 NA PB.499.2 chr1 + 5739 18 full-splice_match EPB41 ENST00000647103.1 5772 18 12 21 0 -18 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAACAACAACAAAAAGA -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.499.3 chr1 + 5802 19 novel_in_catalog EPB41 novel 5925 21 NA NA 0 -18 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAACAACAACAAAAAGA -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.499.4 chr1 + 1992 13 incomplete-splice_match EPB41 ENST00000646800.1 6388 19 0 14456 0 4123 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACACAGGTTTGTGCCAAT -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.499.5 chr1 + 1942 6 incomplete-splice_match EPB41 ENST00000482464.6 2154 14 -16 49030 0 -37808 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAAGAAAATGGAAAATC -11 TRUE NA NA TATAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.499.7 chr1 + 5781 17 novel_in_catalog EPB41 novel 2937 20 NA NA -37 -18 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAACAACAACAAAAAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.499.8 chr1 + 2092 6 incomplete-splice_match EPB41 ENST00000373797.2 2407 15 -46 48515 -16 -37808 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAAGAAAATGGAAAATC -22 TRUE NA NA TATAAA -11 NA NA NA 3 NA PB.499.10 chr1 + 5848 18 novel_in_catalog EPB41 novel 6031 21 NA NA 0 -18 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAACAACAACAAAAAGA 19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.499.11 chr1 + 779 3 incomplete-splice_match EPB41 ENST00000373797.2 2407 15 -5 71788 0 -61081 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAGCAGAAACAGAATTAA 19 TRUE NA NA AGTAAA -19 NA NA NA 10 NA PB.499.16 chr1 + 4087 8 incomplete-splice_match EPB41 ENST00000647103.1 5772 18 152254 21 -73 -18 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAACAACAACAAAAAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.499.21 chr1 + 3638 6 full-splice_match EPB41 ENST00000490308.2 922 6 183 -2899 183 -18 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAACAACAACAAAAAGA 2473 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.499.22 chr1 + 3493 4 incomplete-splice_match EPB41 ENST00000460378.1 5212 5 13101 18 11746 -18 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAACAACAACAAAAAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.499.23 chr1 + 3335 3 incomplete-splice_match EPB41 ENST00000460378.1 5212 5 16189 18 14834 -18 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAACAACAACAAAAAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.500.1 chr1 - 2301 10 full-splice_match MECR ENST00000263702.11 2515 10 -11 225 -3 -9 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AATTACCATAGTGACTAATG -31 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.500.2 chr1 - 1649 6 incomplete-splice_match MECR ENST00000373791.7 2416 10 27753 10 -1 -10 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TAATTACCATAGTGACTAAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.500.5 chr1 - 1598 11 novel_not_in_catalog MECR novel 2515 10 NA NA 3 -5 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGTAGAAGTCATCCCT -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.500.6 chr1 - 1523 12 novel_in_catalog MECR novel 2515 10 NA NA -1 -5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGTAGAAGTCATCCCT 12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.500.7 chr1 - 1535 11 novel_in_catalog MECR novel 2416 10 NA NA 2 -5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGTAGAAGTCATCCCT 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.500.8 chr1 - 1498 11 novel_in_catalog MECR novel 2515 10 NA NA -3 -5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGTAGAAGTCATCCCT -23 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.500.9 chr1 - 1424 11 novel_in_catalog MECR novel 2515 10 NA NA 0 -5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGTAGAAGTCATCCCT -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.500.10 chr1 - 1447 10 full-splice_match MECR ENST00000373791.7 2416 10 20 949 2 -5 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 19 5.082109 0.706044 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGTAGAAGTCATCCCT 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.500.11 chr1 - 1361 10 full-splice_match MECR ENST00000263702.11 2515 10 -11 1165 -3 -5 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 167 44.669067 1.650007 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGTAGAAGTCATCCCT -31 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 167 NA PB.500.12 chr1 - 1121 9 incomplete-splice_match MECR ENST00000373791.7 2416 10 14264 949 -47 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGTAGAAGTCATCCCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.500.13 chr1 - 628 5 incomplete-splice_match MECR ENST00000473030.5 919 8 14609 -52 1166 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGTAGAAGTCATCCCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.501.1 chr1 + 5545 30 full-splice_match PTPRU ENST00000428026.6 5550 30 -9 14 -9 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGAGCAGCCCTGTGTGTG 19 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.501.2 chr1 + 4710 25 novel_in_catalog PTPRU novel 1590 14 NA NA -24 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGAGCAGCCCTGTGTGTG -2 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.501.3 chr1 + 4474 24 incomplete-splice_match PTPRU ENST00000373779.8 5573 30 24212 2 553 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CACAGAGCAGCCCTGTGTGT 547 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.501.4 chr1 + 3056 16 incomplete-splice_match PTPRU ENST00000373779.8 5573 30 55422 1 8221 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGAGCAGCCCTGTGTGTG 8215 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.501.5 chr1 + 2468 10 incomplete-splice_match PTPRU ENST00000428026.6 5550 30 75120 14 323 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGAGCAGCCCTGTGTGTG NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.501.6 chr1 + 2191 8 incomplete-splice_match PTPRU ENST00000428026.6 5550 30 78854 14 -2357 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGAGCAGCCCTGTGTGTG NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.501.7 chr1 + 2086 7 incomplete-splice_match PTPRU ENST00000428026.6 5550 30 79453 14 -1758 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGAGCAGCCCTGTGTGTG NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 6 NA PB.501.8 chr1 + 1862 6 incomplete-splice_match PTPRU ENST00000428026.6 5550 30 81273 14 62 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGAGCAGCCCTGTGTGTG NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.501.9 chr1 + 1684 5 full-splice_match PTPRU ENST00000465525.6 1650 5 553 -587 553 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGAGCAGCCCTGTGTGTG NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.501.10 chr1 + 1570 4 full-splice_match PTPRU ENST00000492954.1 625 4 204 -1149 204 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGAGCAGCCCTGTGTGTG NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.504.1 chr1 - 2244 8 full-splice_match LAPTM5 ENST00000294507.4 2177 8 -67 0 -67 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 468 125.180382 2.097536 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGTCTGGCTGATGTGTTTCT 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 468 NA PB.504.2 chr1 - 2144 7 novel_in_catalog LAPTM5 novel 2177 8 NA NA -44 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGTCTGGCTGATGTGTTTCT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.504.3 chr1 - 2146 8 full-splice_match LAPTM5 ENST00000294507.4 2177 8 31 0 14 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.477233 0.541234 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGTCTGGCTGATGTGTTTCT 8262 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.504.4 chr1 - 2035 7 incomplete-splice_match LAPTM5 ENST00000464569.1 953 8 3706 -1420 3706 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.744712 0.573418 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGTCTGGCTGATGTGTTTCT 9823 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.504.5 chr1 - 2014 6 novel_in_catalog LAPTM5 novel 2177 8 NA NA -8 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.279671 0.631410 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGTCTGGCTGATGTGTTTCT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.504.6 chr1 - 1932 6 incomplete-splice_match LAPTM5 ENST00000464569.1 953 8 4548 -1420 4548 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.279671 0.631410 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGTCTGGCTGATGTGTTTCT 16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.504.7 chr1 - 1817 5 incomplete-splice_match LAPTM5 ENST00000464569.1 953 8 6365 -1420 6365 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGTCTGGCTGATGTGTTTCT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.504.8 chr1 - 1621 3 incomplete-splice_match LAPTM5 ENST00000464569.1 953 8 8547 -1420 8547 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 54 14.443891 1.159684 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGTCTGGCTGATGTGTTTCT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 54 NA PB.504.15 chr1 - 1245 8 full-splice_match LAPTM5 ENST00000294507.4 2177 8 -38 970 -38 450 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 80 21.398355 1.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACAACAGTCTATTGCATT 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 80 NA PB.505.1 chr1 - 4425 3 full-splice_match SDC3 ENST00000336798.11 6392 3 1967 0 1967 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATGTGCCGTGTCCAGAGTAT 4013 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.507.1 chr1 + 1827 4 novel_in_catalog MATN1-AS1 novel 1530 5 NA NA -11 18 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATATCACTGAAAATTTTCTT -23 TRUE NA NA AATAAA -35 NA NA NA 4 NA PB.509.3 chr1 - 3589 19 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000257075.9 5360 22 58594 1247 -12000 91 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAACAAACAAAAACAAA NA FALSE NA NA ATTAAA -41 NA NA NA 2 NA PB.509.14 chr1 - 4092 23 novel_not_in_catalog PUM1 novel 5385 22 NA NA 0 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAGCTTTAAAAAAAAAAGA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.509.15 chr1 - 745 3 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000530669.1 582 5 4153 -445 4153 -10 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAAAAAAGCTTTAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.509.16 chr1 - 4006 22 full-splice_match PUM1 ENST00000426105.7 5385 22 22 1357 0 -13 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 24 6.419507 0.807502 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 24 NA PB.509.17 chr1 - 3920 21 novel_in_catalog PUM1 novel 5385 22 NA NA 0 -13 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.509.18 chr1 - 4000 22 full-splice_match PUM1 ENST00000257075.9 5360 22 3 1357 0 -13 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 29 7.756904 0.889688 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 29 NA PB.509.19 chr1 - 3925 22 novel_in_catalog PUM1 novel 5360 22 NA NA 0 -13 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.509.20 chr1 - 3907 21 novel_in_catalog PUM1 novel 5375 22 NA NA 0 -13 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.509.21 chr1 - 3947 22 novel_in_catalog PUM1 novel 5385 22 NA NA 0 -13 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.509.22 chr1 - 3721 20 novel_in_catalog PUM1 novel 5375 22 NA NA 0 -13 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.509.23 chr1 - 3697 21 novel_in_catalog PUM1 novel 3936 22 NA NA 3 -13 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.509.24 chr1 - 3637 20 novel_in_catalog PUM1 novel 5385 22 NA NA 0 -13 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.509.25 chr1 - 3723 20 novel_in_catalog PUM1 novel 5360 22 NA NA -2 -13 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.509.26 chr1 - 3283 18 novel_in_catalog PUM1 novel 5375 22 NA NA 0 -13 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.509.27 chr1 - 3098 17 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000373741.8 4242 22 70868 13 -19 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.509.28 chr1 - 2625 14 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000373742.6 3515 20 85654 -217 2 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA AAAACA -7 NA NA NA 2 NA PB.509.29 chr1 - 2580 14 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000498419.5 3068 17 14979 19 53 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.509.30 chr1 - 2202 11 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000373742.6 3515 20 98537 -217 -868 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 7507 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.509.31 chr1 - 2093 10 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000498419.5 3068 17 28814 19 135 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 8510 FALSE NA NA AAGAAA -4 NA NA NA 3 NA PB.509.32 chr1 - 2068 10 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000373742.6 3515 20 99559 -217 154 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 8529 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.509.33 chr1 - 1947 10 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000373742.6 3515 20 99680 -217 275 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 8650 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.509.34 chr1 - 1824 9 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000498419.5 3068 17 30154 19 -33 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 9850 FALSE NA NA ATTAAA -30 NA NA NA 7 NA PB.509.35 chr1 - 1713 9 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000373742.6 3515 20 100985 -217 72 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 9955 FALSE NA NA TATAAA -1 NA NA NA 3 NA PB.509.37 chr1 - 1587 8 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000373742.6 3515 20 111803 -217 -225 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.509.38 chr1 - 1551 8 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000498419.5 3068 17 41119 19 -183 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.509.39 chr1 - 1321 7 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000373742.6 3515 20 113419 -217 1378 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA AGTAAA -37 NA NA NA 3 NA PB.509.40 chr1 - 1395 8 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000498419.5 3068 17 41275 19 -27 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.509.41 chr1 - 1260 6 novel_not_in_catalog PUM1 novel 3068 17 NA NA -3829 -13 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.509.42 chr1 - 1214 7 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000498419.5 3068 17 42806 19 1491 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.509.43 chr1 - 1171 6 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000373742.6 3515 20 115541 -217 3500 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.509.44 chr1 - 993 5 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000498419.5 3068 17 49642 19 -45 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.942274 0.468683 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.509.45 chr1 - 847 4 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000498419.5 3068 17 53010 19 3323 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.509.47 chr1 - 1308 2 intergenic novelGene_357 novel NA NA NA NA NA NA multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA AAGAAA -41 NA NA NA 2 NA PB.509.49 chr1 - 1977 11 novel_not_in_catalog PUM1 novel 1103 7 NA NA 3 -1691 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGGGGCTTTGTCGGTCTTGT -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.509.59 chr1 - 904 7 full-splice_match PUM1 ENST00000480602.1 906 7 -12 14 0 -14 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAACGACAAAGGTGAAAAG 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.509.60 chr1 - 838 6 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000440538.6 3936 22 -14 62353 0 -15 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 GAAAACGACAAAGGTGAAAA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.512.1 chr1 - 1835 11 novel_not_in_catalog SNRNP40 novel 1615 10 NA NA 0 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGAAGCTGCTCACTTGTTT -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.512.2 chr1 - 1613 10 full-splice_match SNRNP40 ENST00000263694.9 1615 10 0 2 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 144 38.517040 1.585653 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGAAGCTGCTCACTTGTTT -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 144 NA PB.512.3 chr1 - 1454 10 full-splice_match SNRNP40 ENST00000263694.9 1615 10 159 2 153 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGAAGCTGCTCACTTGTTT 187 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.512.4 chr1 - 1305 8 incomplete-splice_match SNRNP40 ENST00000263694.9 1615 10 4782 2 -2587 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGAAGCTGCTCACTTGTTT 4810 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.512.5 chr1 - 921 5 incomplete-splice_match SNRNP40 ENST00000489853.1 1928 6 10983 -102 -1834 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CCAAGAAGCTGCTCACTTGT NA FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 2 NA PB.512.6 chr1 - 1555 10 full-splice_match SNRNP40 ENST00000263694.9 1615 10 -49 109 -49 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 1139 304.659088 2.483814 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAGCCATGTGGATTGGAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 1139 NA PB.512.7 chr1 - 1713 11 novel_not_in_catalog SNRNP40 novel 1615 10 NA NA 9 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 34 9.094301 0.958769 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAGCCATGTGGATTGGAT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 34 NA PB.512.8 chr1 - 1346 10 full-splice_match SNRNP40 ENST00000263694.9 1615 10 160 109 154 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAGCCATGTGGATTGGAT 188 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.512.9 chr1 - 1191 8 incomplete-splice_match SNRNP40 ENST00000263694.9 1615 10 4789 109 -2580 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.279671 0.631410 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAGCCATGTGGATTGGAT 4817 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.512.10 chr1 - 1067 7 incomplete-splice_match SNRNP40 ENST00000263694.9 1615 10 7406 109 37 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 19 5.082109 0.706044 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAGCCATGTGGATTGGAT 7434 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.512.11 chr1 - 891 6 full-splice_match SNRNP40 ENST00000489853.1 1928 6 1034 3 1034 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAGCCATGTGGATTGGAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.512.13 chr1 - 1291 6 incomplete-splice_match SNRNP40 ENST00000263694.9 1615 10 -8 11340 -8 300 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAACACACTCTTGCTCTTTC -20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.513.2 chr1 + 1369 6 novel_in_catalog ZCCHC17 novel 1489 7 NA NA -1 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACTTACTGAGTTATTTTT -1 TRUE NA NA ACTAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.513.3 chr1 + 1392 6 novel_in_catalog ZCCHC17 novel 1534 7 NA NA 0 -4 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAACTTACTGAGTTATTTT 0 TRUE NA NA ACTAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.513.5 chr1 + 2168 8 full-splice_match ZCCHC17 ENST00000344147.10 1568 8 -32 -568 2 551 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GATTAACAGGCTCCGAGACT -18 TRUE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.513.6 chr1 + 1667 9 full-splice_match ZCCHC17 ENST00000546109.5 1705 9 18 20 2 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.942274 0.468683 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACTTACTGAGTTATTTTT -18 TRUE NA NA ACTAAA -20 NA NA NA 11 NA PB.513.7 chr1 + 1618 8 novel_in_catalog ZCCHC17 novel 1730 8 NA NA 2 -3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACTTACTGAGTTATTTTT -18 TRUE NA NA ACTAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.513.8 chr1 + 1597 8 full-splice_match ZCCHC17 ENST00000344147.10 1568 8 -32 3 2 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 152 40.656876 1.609134 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACTTACTGAGTTATTTTT -18 TRUE NA NA ACTAAA -20 NA NA NA 152 NA PB.513.9 chr1 + 1368 8 novel_not_in_catalog ZCCHC17 novel 1568 8 NA NA 2 12531 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGAAATGTCTGTTTAGTA -18 TRUE NA NA AATAAA -26 NA NA NA 3 NA PB.513.10 chr1 + 936 7 incomplete-splice_match ZCCHC17 ENST00000344147.10 1568 8 -32 15721 2 247 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAAAAAAGAAAAATGA -18 TRUE NA NA AAAAAG -14 NA NA NA 5 NA PB.513.11 chr1 + 1467 7 novel_in_catalog ZCCHC17 novel 1730 8 NA NA 0 -4 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAACTTACTGAGTTATTTT -10 TRUE NA NA ACTAAA -19 NA NA NA 5 NA PB.513.12 chr1 + 1048 10 novel_not_in_catalog ZCCHC17 novel 1705 9 NA NA 11 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAACTTACTGAGTTATTTT 1 TRUE NA NA ACTAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.513.14 chr1 + 1473 7 full-splice_match ZCCHC17 ENST00000616393.4 1534 7 41 20 -9 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACTTACTGAGTTATTTTT 5 TRUE NA NA ACTAAA -20 NA NA NA 8 NA PB.513.16 chr1 + 657 7 incomplete-splice_match ZCCHC17 ENST00000344147.10 1568 8 -9 15977 -9 -9 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AGAAAAAGAAAGAAGGTGAA 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.513.18 chr1 + 1285 5 incomplete-splice_match ZCCHC17 ENST00000344147.10 1568 8 40200 3 40196 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.209753 0.506472 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACTTACTGAGTTATTTTT NA FALSE NA NA ACTAAA -20 NA NA NA 12 NA PB.513.21 chr1 + 971 2 incomplete-splice_match ZCCHC17 ENST00000344147.10 1568 8 51874 3 51870 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.279671 0.631410 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACTTACTGAGTTATTTTT 2222 FALSE NA NA ACTAAA -20 NA NA NA 16 NA PB.513.22 chr1 + 922 2 novel_not_in_catalog ZCCHC17 novel 1489 7 NA NA 66869 -19 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATGTGTTTGGTTTTAAAC NA FALSE NA NA ACTAAA -4 NA NA NA 2 NA PB.514.1 chr1 + 1907 10 full-splice_match SERINC2 ENST00000373709.8 1900 10 -11 4 -11 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 169 45.204025 1.655177 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACCATGTTCTGTGCCCCTCA -18 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 169 NA PB.514.2 chr1 + 1918 11 novel_not_in_catalog SERINC2 novel 1900 10 NA NA 30 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CATGTTCTGTGCCCCTCACC 23 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.514.3 chr1 + 1763 9 incomplete-splice_match SERINC2 ENST00000491976.1 2807 11 9924 0 9924 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTCTGTGCCCCTCACCC 9 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 7 NA PB.514.4 chr1 + 1666 9 incomplete-splice_match SERINC2 ENST00000491976.1 2807 11 10017 4 10017 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACCATGTTCTGTGCCCCTC 34 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.514.5 chr1 + 1584 8 incomplete-splice_match SERINC2 ENST00000491976.1 2807 11 10931 0 10931 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTCTGTGCCCCTCACCC 948 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 6 NA PB.514.6 chr1 + 1448 7 incomplete-splice_match SERINC2 ENST00000491976.1 2807 11 11523 0 11523 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTCTGTGCCCCTCACCC 1 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 7 NA PB.514.7 chr1 + 1269 6 incomplete-splice_match SERINC2 ENST00000491976.1 2807 11 12067 1 12067 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CATGTTCTGTGCCCCTCACC 81 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.514.8 chr1 + 1172 5 incomplete-splice_match SERINC2 ENST00000491976.1 2807 11 12905 0 12905 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTCTGTGCCCCTCACCC 56 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.514.9 chr1 + 949 3 incomplete-splice_match SERINC2 ENST00000491976.1 2807 11 15606 4 15606 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACCATGTTCTGTGCCCCTC 407 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.515.1 chr1 - 887 4 full-splice_match FABP3 ENST00000373713.7 1097 4 0 210 0 -210 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACACGTTGCCTTTACACTGC -1 TRUE NA NA TTTAAA -23 NA NA NA 2 NA PB.515.2 chr1 - 723 4 full-splice_match FABP3 ENST00000373713.7 1097 4 0 374 0 86 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AACTCTGGGAGTCTTGGTTT -1 TRUE NA NA TTTAAA -23 NA NA NA 7 NA PB.516.1 chr1 - 1653 5 full-splice_match PEF1 ENST00000373703.5 1614 5 -9 -30 -9 30 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 445 119.028351 2.075650 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TACAGGTCCATCCACTCATC -7 TRUE NA NA GGGGCT -34 NA NA NA 445 NA PB.516.2 chr1 - 1503 4 incomplete-splice_match PEF1 ENST00000373703.5 1614 5 9428 1 24 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.744712 0.573418 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTTCCATGTTTTCCACCAT 9725 FALSE NA NA GGGGCT -9 NA NA NA 14 NA PB.516.3 chr1 - 1354 4 incomplete-splice_match PEF1 ENST00000373703.5 1614 5 9577 1 -39 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTTCCATGTTTTCCACCAT 9874 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.516.4 chr1 - 1159 6 novel_not_in_catalog PEF1 novel 1614 5 NA NA 3 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTTCCATGTTTTCCACCAT 5 TRUE NA NA GGGGCT -22 NA NA NA 6 NA PB.516.5 chr1 - 1061 6 novel_not_in_catalog PEF1 novel 1614 5 NA NA -9 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTTCCATGTTTTCCACCAT -7 TRUE NA NA GGGGCT -34 NA NA NA 2 NA PB.516.7 chr1 - 1724 6 novel_not_in_catalog PEF1 novel 1614 5 NA NA 3 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAGTTCCATGTTTTCCACCA 5 TRUE NA NA GGGGCT -22 NA NA NA 2 NA PB.516.8 chr1 - 1308 4 full-splice_match PEF1 ENST00000478502.5 750 4 23 -581 3 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 27 7.221945 0.858654 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAGTTCCATGTTTTCCACCA 5 TRUE NA NA GGGGCT -22 NA NA NA 27 NA PB.516.9 chr1 - 1144 3 incomplete-splice_match PEF1 ENST00000373703.5 1614 5 11692 3 2076 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GGAGTTCCATGTTTTCCACC 2351 FALSE NA NA AATGAA -42 NA NA NA 8 NA PB.516.10 chr1 - 1023 2 incomplete-splice_match PEF1 ENST00000373703.5 1614 5 12333 3 2717 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GGAGTTCCATGTTTTCCACC 2992 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.517.2 chr1 - 2565 37 novel_in_catalog COL16A1 novel 5418 71 NA NA -3 -11 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAATAATAAAGAAACAAAAC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.517.3 chr1 - 2457 35 incomplete-splice_match COL16A1 ENST00000373672.8 5418 71 21033 259 764 -11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAATAATAAAGAAACAAAAC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.517.4 chr1 - 2208 30 incomplete-splice_match COL16A1 ENST00000373672.8 5418 71 24350 259 4081 -11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAATAATAAAGAAACAAAAC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.517.5 chr1 - 920 7 incomplete-splice_match COL16A1 ENST00000373672.8 5418 71 46953 259 -1216 -11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAATAATAAAGAAACAAAAC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.518.1 chr1 - 1341 6 incomplete-splice_match ADGRB2 ENST00000398556.7 4879 29 27268 1 3192 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTTGCTGCTGAGCTGTTT 4584 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.518.2 chr1 - 967 5 incomplete-splice_match ADGRB2 ENST00000398556.7 4879 29 28337 1 4261 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTTGCTGCTGAGCTGTTT 5653 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.519.1 chr1 + 3015 11 novel_in_catalog TINAGL1 novel 2207 12 NA NA -4 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACTACAGTGTCTTGGAACC -3 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.519.2 chr1 + 2182 12 full-splice_match TINAGL1 ENST00000271064.12 2207 12 23 2 -4 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.477233 0.541234 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACTACAGTGTCTTGGAACC -3 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 13 NA PB.519.3 chr1 + 932 3 incomplete-splice_match TINAGL1 ENST00000463112.1 3075 5 2324 2 686 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACTACAGTGTCTTGGAACC 2325 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.521.1 chr1 - 2050 9 incomplete-splice_match SPOCD1 ENST00000533231.5 3774 15 16647 -59 -12 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GATTGCATCTGCTAGCTGGT -27 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.521.2 chr1 - 1925 9 incomplete-splice_match SPOCD1 ENST00000533231.5 3774 15 16772 -59 12 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GATTGCATCTGCTAGCTGGT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.521.3 chr1 - 2610 3 full-splice_match SPOCD1 ENST00000468720.5 2667 3 18 39 18 -19 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAACAAACAAACAAACA 14 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.521.4 chr1 - 1773 3 full-splice_match SPOCD1 ENST00000468720.5 2667 3 159 735 3 -715 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CCTAAAGCAATGATTGTTTT -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.524.1 chr1 + 2002 9 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 -252 963 -252 290 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATAAAAAAAAGAAGTTGAG NA FALSE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.524.2 chr1 + 1799 9 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 -49 963 -49 290 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 154 41.191833 1.614811 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATAAAAAAAAGAAGTTGAG NA FALSE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 154 NA PB.524.3 chr1 + 2608 8 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000492989.1 1215 8 -142 -1251 -14 -2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAGTAAATGTGATGAATTGT -10 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 5 NA PB.524.5 chr1 + 1084 2 novel_not_in_catalog KHDRBS1 novel 2713 9 NA NA -5 289 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 TAATAAAAAAAAGAAGTTGA -1 TRUE NA NA TATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.524.8 chr1 + 2302 11 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000484270.2 1989 11 -314 1 0 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATGAATGGTCCCACTCTGGT 4 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 5 NA PB.524.9 chr1 + 2708 9 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 2 3 2 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 44 11.769095 1.070743 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGTAAATGTGATGAATTG 6 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 44 NA PB.524.10 chr1 + 2116 9 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 2 595 2 -595 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 20 5.349589 0.728320 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAACAACAAAAT 6 TRUE NA NA ATTAAA -33 NA NA NA 20 NA PB.524.11 chr1 + 1688 9 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 2 1023 2 230 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TTAAGTGTGTAGATGCTTTT 6 TRUE NA NA AATAGA -24 NA NA NA 2 NA PB.524.12 chr1 + 1631 8 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000492989.1 1215 8 -126 -290 2 290 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATAAAAAAAAGAAGTTGAG 6 TRUE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 5 NA PB.524.13 chr1 + 1623 9 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 127 963 -1 290 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATAAAAAAAAGAAGTTGAG 131 FALSE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 4 NA PB.524.14 chr1 + 2537 9 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 173 3 45 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGTAAATGTGATGAATTG 177 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.524.15 chr1 + 1912 9 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 206 595 78 -595 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAACAACAAAAT 210 FALSE NA NA ATTAAA -33 NA NA NA 2 NA PB.524.16 chr1 + 1481 9 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 269 963 -45 290 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATAAAAAAAAGAAGTTGAG 273 FALSE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 7 NA PB.524.17 chr1 + 1774 9 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 344 595 30 -595 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAACAACAAAAT 20 FALSE NA NA ATTAAA -33 NA NA NA 3 NA PB.524.18 chr1 + 1272 8 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000492989.1 1215 8 233 -290 47 290 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATAAAAAAAAGAAGTTGAG -27 TRUE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.524.19 chr1 + 1331 9 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 419 963 105 290 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.547151 0.657739 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATAAAAAAAAGAAGTTGAG 31 FALSE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 17 NA PB.524.21 chr1 + 2199 8 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 16431 3 16117 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGTAAATGTGATGAATTG NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 10 NA PB.524.22 chr1 + 1250 8 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 16441 942 16127 311 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 42 11.234137 1.050540 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAACACACAAA NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 42 NA PB.524.23 chr1 + 1588 8 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 16448 597 16134 -597 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 ATAAAAAAAAAAACAACAAA NA FALSE NA NA ATTAAA -31 NA NA NA 2 NA PB.524.24 chr1 + 2035 7 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 17696 3 17382 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGTAAATGTGATGAATTG NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 10 NA PB.524.25 chr1 + 1880 6 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 19398 3 19084 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGTAAATGTGATGAATTG NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 5 NA PB.524.26 chr1 + 1247 6 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000492989.1 1215 8 19311 -658 19125 -595 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAACAACAAAAT 24 FALSE NA NA ATTAAA -33 NA NA NA 2 NA PB.524.28 chr1 + 843 5 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000492989.1 1215 8 22922 -290 22736 290 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATAAAAAAAAGAAGTTGAG 3635 FALSE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 8 NA PB.524.29 chr1 + 1135 5 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000492989.1 1215 8 22998 -658 22812 -595 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAACAACAAAAT 3711 FALSE NA NA ATTAAA -33 NA NA NA 2 NA PB.524.30 chr1 + 1717 5 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 23136 3 22822 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.209753 0.506472 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGTAAATGTGATGAATTG 3721 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 12 NA PB.524.31 chr1 + 716 4 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000492989.1 1215 8 23840 -290 23654 290 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATAAAAAAAAGAAGTTGAG 4553 FALSE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 8 NA PB.524.32 chr1 + 1561 4 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 24083 3 23769 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.279671 0.631410 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGTAAATGTGATGAATTG 4668 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 16 NA PB.524.33 chr1 + 1475 3 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000307714.12 2738 9 24626 3 24370 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.477233 0.541234 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGTAAATGTGATGAATTG 5269 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 13 NA PB.524.34 chr1 + 883 3 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000492989.1 1215 8 24556 -658 24370 -595 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAACAACAAAAT 5269 FALSE NA NA ATTAAA -33 NA NA NA 7 NA PB.524.35 chr1 + 1391 2 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000307714.12 2738 9 25605 3 25349 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 43 11.501616 1.060759 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGTAAATGTGATGAATTG 6248 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 43 NA PB.524.46 chr1 + 780 2 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000484270.2 1989 11 31118 -1 31118 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAATGGTCCCACTCTGGTAG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 5 NA PB.525.1 chr1 + 1682 8 novel_in_catalog TMEM39B novel 1778 9 NA NA -38 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG -3 TRUE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 3 NA PB.525.2 chr1 + 1802 9 novel_not_in_catalog TMEM39B novel 1778 9 NA NA -33 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG 2 TRUE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 2 NA PB.525.3 chr1 + 1646 8 novel_in_catalog TMEM39B novel 1778 9 NA NA -21 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG 14 FALSE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 5 NA PB.525.4 chr1 + 1726 9 novel_in_catalog TMEM39B novel 1778 9 NA NA -10 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG -41 TRUE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 3 NA PB.525.5 chr1 + 1786 9 full-splice_match TMEM39B ENST00000336294.10 1778 9 -10 2 -6 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 66 17.653643 1.246834 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG -37 TRUE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 66 NA PB.525.6 chr1 + 1883 10 novel_in_catalog TMEM39B novel 1834 10 NA NA 0 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG -31 TRUE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 3 NA PB.525.7 chr1 + 1541 7 full-splice_match TMEM39B ENST00000441402.5 1538 7 -8 5 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 60 16.048767 1.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG -31 TRUE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 60 NA PB.525.8 chr1 + 1697 9 novel_not_in_catalog TMEM39B novel 1778 9 NA NA 0 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG -27 TRUE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 2 NA PB.525.9 chr1 + 1687 9 full-splice_match TMEM39B ENST00000336294.10 1778 9 89 2 43 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG 62 FALSE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 7 NA PB.525.11 chr1 + 1385 6 incomplete-splice_match TMEM39B ENST00000441402.5 1538 7 2047 5 -1141 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG 2024 FALSE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 2 NA PB.525.12 chr1 + 1482 7 incomplete-splice_match TMEM39B ENST00000336294.10 1778 9 2718 2 -474 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG 2691 FALSE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 2 NA PB.525.13 chr1 + 1265 6 incomplete-splice_match TMEM39B ENST00000468135.5 1834 10 3845 5 683 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG 3848 FALSE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 6 NA PB.525.14 chr1 + 996 4 incomplete-splice_match TMEM39B ENST00000468135.5 1834 10 18787 5 15625 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG 8315 FALSE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 4 NA PB.526.1 chr1 + 3992 13 novel_not_in_catalog KPNA6 novel 7355 14 NA NA -13 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA -11 TRUE NA NA ATTAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.526.3 chr1 + 3968 14 full-splice_match KPNA6 ENST00000373625.8 7355 14 -3 3390 -3 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 28 7.489425 0.874448 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA -1 TRUE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 28 NA PB.526.5 chr1 + 2225 14 full-splice_match KPNA6 ENST00000373625.8 7355 14 2 5128 0 -1738 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.884548 0.769713 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TGGATTGAGTTATTTAATTT 4 TRUE NA NA AAAACA -40 NA NA NA 22 NA PB.526.7 chr1 + 2299 15 novel_not_in_catalog KPNA6 novel 7355 14 NA NA 38 -1736 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GATTGAGTTATTTAATTTTT 7 TRUE NA NA AAAACA -42 NA NA NA 2 NA PB.526.10 chr1 + 2083 13 incomplete-splice_match KPNA6 ENST00000373625.8 7355 14 46600 5125 -2206 -1735 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATTGAGTTATTTAATTTTTT NA FALSE NA NA AAAACA -43 NA NA NA 2 NA PB.526.11 chr1 + 1924 11 incomplete-splice_match KPNA6 ENST00000373625.8 7355 14 49289 5126 483 -1736 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GATTGAGTTATTTAATTTTT NA FALSE NA NA AAAACA -42 NA NA NA 3 NA PB.526.12 chr1 + 3601 11 incomplete-splice_match KPNA6 ENST00000373625.8 7355 14 49347 3391 541 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA ATTAAA -20 NA NA NA 7 NA PB.526.13 chr1 + 1765 10 incomplete-splice_match KPNA6 ENST00000373625.8 7355 14 50270 5125 1464 -1735 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATTGAGTTATTTAATTTTTT NA FALSE NA NA AAAACA -43 NA NA NA 4 NA PB.526.14 chr1 + 1619 9 incomplete-splice_match KPNA6 ENST00000373625.8 7355 14 51453 5126 2647 -1736 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GATTGAGTTATTTAATTTTT NA FALSE NA NA AAAACA -42 NA NA NA 5 NA PB.526.15 chr1 + 3286 8 incomplete-splice_match KPNA6 ENST00000471599.5 3941 14 52603 0 3799 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.526.17 chr1 + 2699 3 incomplete-splice_match KPNA6 ENST00000471599.5 3941 14 59185 1 10381 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA ATTAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.526.18 chr1 + 2570 2 incomplete-splice_match KPNA6 ENST00000471599.5 3941 14 61899 1 13095 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA ATTAAA -20 NA NA NA 6 NA PB.526.19 chr1 + 2506 2 incomplete-splice_match KPNA6 ENST00000471599.5 3941 14 61963 1 13159 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA ATTAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.528.1 chr1 + 4795 11 full-splice_match TXLNA ENST00000373610.8 4865 11 68 2 68 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 20 5.349589 0.728320 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACTTGTTTCTCTCCTGACC 18 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 20 NA PB.528.2 chr1 + 5011 10 full-splice_match TXLNA ENST00000373609.1 5012 10 0 1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTGTTTCTCTCCTGACCT -25 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 9 NA PB.528.3 chr1 + 4360 9 incomplete-splice_match TXLNA ENST00000373609.1 5012 10 1378 1 1378 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTGTTTCTCTCCTGACCT 1291 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.528.4 chr1 + 3932 6 incomplete-splice_match TXLNA ENST00000373609.1 5012 10 10020 1 10020 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTGTTTCTCTCCTGACCT 6637 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.528.5 chr1 + 3747 5 incomplete-splice_match TXLNA ENST00000373609.1 5012 10 12265 2 12265 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACTTGTTTCTCTCCTGACC 8882 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 6 NA PB.528.6 chr1 + 3632 2 incomplete-splice_match TXLNA ENST00000373609.1 5012 10 13847 1 13847 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTGTTTCTCTCCTGACCT NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.528.7 chr1 + 3421 2 incomplete-splice_match TXLNA ENST00000373609.1 5012 10 14058 1 14058 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTGTTTCTCTCCTGACCT NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.529.1 chr1 + 1307 2 full-splice_match CCDC28B ENST00000680626.1 3507 2 -14 2214 -11 -28 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAACAAAAAAAAAATTTTTT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.529.2 chr1 + 1402 5 full-splice_match CCDC28B ENST00000421922.6 1415 5 2 11 -1 -7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGAAAGCAAGCGGCTCCG 4 TRUE NA NA ATTAAA -5 NA NA NA 6 NA PB.529.3 chr1 + 820 6 full-splice_match CCDC28B ENST00000373602.10 880 6 49 11 0 -7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 25 6.686986 0.825230 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGAAAGCAAGCGGCTCCG 13 TRUE NA NA ATTAAA -5 NA NA NA 25 NA PB.529.4 chr1 + 978 5 incomplete-splice_match CCDC28B ENST00000373602.10 880 6 1094 11 -7 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.477233 0.541234 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGAAAGCAAGCGGCTCCG 10 TRUE NA NA ATTAAA -5 NA NA NA 13 NA PB.530.16 chr1 - 2025 6 full-splice_match PTP4A2 ENST00000647444.2 3910 6 53 1832 43 10 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAACAAA 24 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.530.18 chr1 - 1552 5 full-splice_match PTP4A2 ENST00000602725.5 3353 5 -31 1832 -31 10 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.209753 0.506472 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAACAAA 91 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.530.19 chr1 - 1273 4 full-splice_match PTP4A2 ENST00000602683.5 667 4 -201 -405 49 10 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAACAAA 295 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.530.21 chr1 - 785 2 full-splice_match PTP4A2 ENST00000489313.1 1551 2 1166 -400 1166 10 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAACAAA 9491 FALSE NA NA AAGAAA -40 NA NA NA 5 NA PB.530.25 chr1 - 1920 5 novel_in_catalog PTP4A2 novel 3910 6 NA NA 54 9 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAACAA 35 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.530.28 chr1 - 1793 6 novel_in_catalog PTP4A2 novel 2213 8 NA NA 6745 9 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAACAA -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.530.29 chr1 - 1824 6 full-splice_match PTP4A2 ENST00000647444.2 3910 6 253 1833 71 9 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAACAA 224 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.530.30 chr1 - 1651 5 full-splice_match PTP4A2 ENST00000602725.5 3353 5 -131 1833 -131 9 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.012192 0.603382 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAACAA NA FALSE NA NA CATAAA -34 NA NA NA 15 NA PB.530.31 chr1 - 1627 5 novel_in_catalog PTP4A2 novel 3910 6 NA NA -2 9 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAACAA 12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.530.32 chr1 - 1350 5 full-splice_match PTP4A2 ENST00000602725.5 3353 5 170 1833 46 9 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 33 8.826821 0.945804 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAACAA 292 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 33 NA PB.530.33 chr1 - 1212 5 full-splice_match PTP4A2 ENST00000602725.5 3353 5 308 1833 -3 9 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.477233 0.541234 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAACAA 430 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.530.34 chr1 - 976 4 incomplete-splice_match PTP4A2 ENST00000602725.5 3353 5 3526 1833 3152 9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.477233 0.541234 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAACAA 3648 FALSE NA NA TTTAAA -14 NA NA NA 13 NA PB.530.35 chr1 - 874 3 incomplete-splice_match PTP4A2 ENST00000457805.6 1032 4 7581 -280 -507 9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.477233 0.541234 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAACAA 7818 FALSE NA NA AAGAAA -1 NA NA NA 13 NA PB.530.37 chr1 - 1647 6 full-splice_match PTP4A2 ENST00000647444.2 3910 6 23 2240 13 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.814630 0.682563 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.530.38 chr1 - 1578 5 novel_in_catalog PTP4A2 novel 3910 6 NA NA -1 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA -30 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.530.39 chr1 - 1547 7 novel_not_in_catalog PTP4A2 novel 3910 6 NA NA 0 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA -19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.530.40 chr1 - 1576 7 novel_not_in_catalog PTP4A2 novel 3910 6 NA NA 2 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA -27 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.530.44 chr1 - 1545 7 novel_in_catalog PTP4A2 novel 2213 8 NA NA -6 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.530.45 chr1 - 1554 6 full-splice_match PTP4A2 ENST00000647444.2 3910 6 116 2240 -66 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.942274 0.468683 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 87 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.530.48 chr1 - 1471 5 novel_in_catalog PTP4A2 novel 3910 6 NA NA -76 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 77 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.530.49 chr1 - 1455 7 novel_in_catalog PTP4A2 novel 3910 6 NA NA 2 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.530.52 chr1 - 1467 6 full-splice_match PTP4A2 ENST00000647444.2 3910 6 203 2240 21 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.744712 0.573418 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 174 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.530.54 chr1 - 1386 6 novel_in_catalog PTP4A2 novel 2213 8 NA NA 6745 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.530.56 chr1 - 1305 6 full-splice_match PTP4A2 ENST00000647444.2 3910 6 365 2240 39 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 336 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.530.57 chr1 - 1311 6 novel_not_in_catalog PTP4A2 novel 2213 8 NA NA 3 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.530.59 chr1 - 1249 5 full-splice_match PTP4A2 ENST00000602725.5 3353 5 -136 2240 -136 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 39 10.431699 1.018355 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA NA FALSE NA NA CATAAA -39 NA NA NA 39 NA PB.530.60 chr1 - 1072 5 full-splice_match PTP4A2 ENST00000602725.5 3353 5 41 2240 22 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.617068 0.749510 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 163 FALSE NA NA ATTAAA -41 NA NA NA 21 NA PB.530.61 chr1 - 1070 4 full-splice_match PTP4A2 ENST00000457805.6 1032 4 -165 127 -50 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 72 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.530.62 chr1 - 974 5 full-splice_match PTP4A2 ENST00000602725.5 3353 5 139 2240 15 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 261 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.530.63 chr1 - 854 5 full-splice_match PTP4A2 ENST00000602725.5 3353 5 259 2240 -52 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 381 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.530.64 chr1 - 832 4 full-splice_match PTP4A2 ENST00000457805.6 1032 4 73 127 64 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 310 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.530.65 chr1 - 715 5 full-splice_match PTP4A2 ENST00000602725.5 3353 5 398 2240 24 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 520 FALSE NA NA AATAAA -2 NA NA NA 2 NA PB.531.1 chr1 + 2247 4 full-splice_match IQCC ENST00000617816.1 2089 4 -27 -131 -27 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGATTCTGAGTCTGGCTGCT -15 TRUE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 3 NA PB.531.2 chr1 + 2034 5 full-splice_match IQCC ENST00000291358.11 2012 5 -23 1 -23 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 31 8.291862 0.918652 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTCTGAGTCTGGCTGCTTT -11 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 31 NA PB.531.3 chr1 + 2662 3 novel_in_catalog IQCC novel 2252 5 NA NA -13 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAGATTCTGAGTCTGGCTGC -1 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 3 NA PB.531.4 chr1 + 1437 2 novel_not_in_catalog IQCC novel 2012 5 NA NA 1401 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTCTGAGTCTGGCTGCTTT 1382 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 3 NA PB.532.1 chr1 - 1880 11 novel_in_catalog TMEM234 novel 1538 11 NA NA -1 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACCCTGCTGTGCCAAATATA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.532.2 chr1 - 1394 4 full-splice_match TMEM234 ENST00000373593.5 1411 4 15 2 5 1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAGGTTAGTAAGTATTCT 17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.532.3 chr1 - 1090 5 full-splice_match TMEM234 ENST00000309777.11 1107 5 10 7 0 -7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 32 8.559342 0.932440 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAACAGACAAGAGGTTAGTA 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 32 NA PB.533.1 chr1 + 2054 11 full-splice_match EIF3I ENST00000677711.1 1700 11 -357 3 47 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATATTTTGTGGTGTCTGTTT 187 FALSE NA NA AATAAA -31 NA NA NA 2 NA PB.533.2 chr1 + 1434 11 full-splice_match EIF3I ENST00000677711.1 1700 11 264 2 -13 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 1866 499.116638 2.698202 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATTTTGTGGTGTCTGTTTC 808 FALSE NA NA AATAAA -32 NA NA NA 1866 NA PB.533.3 chr1 + 1525 10 full-splice_match EIF3I ENST00000678883.1 1400 10 -28 -97 -9 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATTTTGTGGTGTCTGTTTC -8 TRUE NA NA AATAAA -32 NA NA NA 3 NA PB.533.5 chr1 + 1294 10 full-splice_match EIF3I ENST00000677580.1 1200 10 -28 -66 0 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTTGTGGTGTCTGTTTCA 1 TRUE NA NA AATAAA -33 NA NA NA 3 NA PB.533.6 chr1 + 1412 11 full-splice_match EIF3I ENST00000373586.2 1417 11 2 3 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATATTTTGTGGTGTCTGTTT 3 TRUE NA NA AATAAA -31 NA NA NA 4 NA PB.533.7 chr1 + 1308 11 full-splice_match EIF3I ENST00000677711.1 1700 11 279 113 0 -10 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 209 55.903206 1.747437 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAGAAGAAGG 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 209 NA PB.533.8 chr1 + 1269 10 full-splice_match EIF3I ENST00000677353.1 1250 10 -21 2 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATTTTGTGGTGTCTGTTTC 3 TRUE NA NA AATAAA -32 NA NA NA 9 NA PB.533.9 chr1 + 1274 11 full-splice_match EIF3I ENST00000678689.1 1276 11 2 0 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATTTTGTGGTGTCTGTTTC 3 TRUE NA NA AATAAA -32 NA NA NA 8 NA PB.533.10 chr1 + 1254 10 full-splice_match EIF3I ENST00000678968.1 1256 10 0 2 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATTTTGTGGTGTCTGTTTC 3 TRUE NA NA AATAAA -32 NA NA NA 7 NA PB.533.11 chr1 + 1162 11 full-splice_match EIF3I ENST00000678689.1 1276 11 2 112 0 -11 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 CAAAAAAAAAAAAGAAGAAG 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.533.12 chr1 + 1030 9 full-splice_match EIF3I ENST00000677640.1 1141 9 0 111 0 -10 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAGAAGAAGG 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.533.13 chr1 + 1145 11 full-splice_match EIF3I ENST00000677711.1 1700 11 279 276 0 -5 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 227 60.717834 1.783316 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAATACAAAAATTAGCCA 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 227 NA PB.533.14 chr1 + 984 7 full-splice_match EIF3I ENST00000679290.1 987 7 0 3 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGATATTTTGTGGTGTCTGT 3 TRUE NA NA AATAAA -29 NA NA NA 8 NA PB.533.15 chr1 + 1335 10 full-splice_match EIF3I ENST00000677767.1 1343 10 11 -3 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTTGTGGTGTCTGTTTCA -3 TRUE NA NA AATAAA -33 NA NA NA 6 NA PB.533.16 chr1 + 1478 10 full-splice_match EIF3I ENST00000471486.6 1482 10 4 0 1 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.279671 0.631410 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATTTTGTGGTGTCTGTTTC 20 FALSE NA NA AATAAA -32 NA NA NA 16 NA PB.533.18 chr1 + 1379 10 full-splice_match EIF3I ENST00000471486.6 1482 10 100 3 97 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 165 44.134109 1.644774 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGATATTTTGTGGTGTCTGT 116 FALSE NA NA AATAAA -29 NA NA NA 165 NA PB.533.19 chr1 + 1231 9 incomplete-splice_match EIF3I ENST00000677353.1 1250 10 109 3 97 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATATTTTGTGGTGTCTGTTT 116 FALSE NA NA AATAAA -31 NA NA NA 5 NA PB.533.20 chr1 + 1238 9 incomplete-splice_match EIF3I ENST00000471486.6 1482 10 1646 1 1643 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 50 13.373972 1.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATATTTTGTGGTGTCTGTTT 1662 FALSE NA NA AATAAA -31 NA NA NA 50 NA PB.533.21 chr1 + 1114 9 incomplete-splice_match EIF3I ENST00000471486.6 1482 10 1660 111 1657 -10 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAGAAGAAGG 1676 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.533.22 chr1 + 925 8 incomplete-splice_match EIF3I ENST00000677183.1 1652 10 1992 231 1970 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 TAAAAATACAAAAATTAGCC 1989 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.533.23 chr1 + 1131 7 incomplete-splice_match EIF3I ENST00000471486.6 1482 10 3738 -1 -1163 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 35 9.361781 0.971358 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTTGTGGTGTCTGTTTCA 3754 FALSE NA NA AATAAA -33 NA NA NA 35 NA PB.533.24 chr1 + 925 7 incomplete-splice_match EIF3I ENST00000677183.1 1652 10 3851 67 -1069 -10 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAGAAGAAGG 3848 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.533.25 chr1 + 1004 7 incomplete-splice_match EIF3I ENST00000471486.6 1482 10 3864 0 -1037 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 31 8.291862 0.918652 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATTTTGTGGTGTCTGTTTC 3880 FALSE NA NA AATAAA -32 NA NA NA 31 NA PB.533.26 chr1 + 853 5 full-splice_match EIF3I ENST00000678306.1 1795 5 1165 -223 889 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 23 6.152027 0.789018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTTGTGGTGTCTGTTTCA 2024 FALSE NA NA AATAAA -33 NA NA NA 23 NA PB.533.27 chr1 + 740 4 incomplete-splice_match EIF3I ENST00000678306.1 1795 5 1395 -223 1119 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTTGTGGTGTCTGTTTCA 2254 FALSE NA NA AATAAA -33 NA NA NA 8 NA PB.533.28 chr1 + 551 2 incomplete-splice_match EIF3I ENST00000678106.1 2075 3 3344 -102 3344 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTTGTGGTGTCTGTTTCA 4479 FALSE NA NA AATAAA -33 NA NA NA 3 NA PB.534.1 chr1 + 934 2 full-splice_match FAM167B ENST00000373582.4 947 2 12 1 12 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATCAAGGTCTCTTGCAGTCG 6 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 7 NA PB.535.2 chr1 + 2091 13 full-splice_match LCK ENST00000336890.10 2091 13 -1 1 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 151 40.389397 1.606267 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACATCTCTTTGCTGTCCACT -9 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 151 NA PB.535.3 chr1 + 1937 12 novel_in_catalog LCK novel 2091 13 NA NA 0 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.744712 0.573418 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACATCTCTTTGCTGTCCAC -9 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 14 NA PB.535.4 chr1 + 2263 12 novel_in_catalog LCK novel 2099 13 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACATCTCTTTGCTGTCCACT -1 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 3 NA PB.535.5 chr1 + 2183 12 incomplete-splice_match LCK ENST00000336890.10 2091 13 22860 1 4 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACATCTCTTTGCTGTCCACT 3 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 9 NA PB.535.6 chr1 + 2084 13 full-splice_match LCK ENST00000619559.4 2099 13 14 1 4 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 70 18.723562 1.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACATCTCTTTGCTGTCCAC 3 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 70 NA PB.535.7 chr1 + 1916 12 novel_in_catalog LCK novel 2099 13 NA NA 8 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACATCTCTTTGCTGTCCAC 0 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 8 NA PB.535.8 chr1 + 1822 11 novel_in_catalog LCK novel 2091 13 NA NA 200 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACATCTCTTTGCTGTCCAC 192 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.535.9 chr1 + 1964 12 incomplete-splice_match LCK ENST00000619559.4 2099 13 233 0 212 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACATCTCTTTGCTGTCCACT 7 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 10 NA PB.535.10 chr1 + 1857 11 incomplete-splice_match LCK ENST00000619559.4 2099 13 641 1 620 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACATCTCTTTGCTGTCCAC 415 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 6 NA PB.535.11 chr1 + 1750 10 incomplete-splice_match LCK ENST00000619559.4 2099 13 922 1 -587 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACATCTCTTTGCTGTCCAC 696 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.535.12 chr1 + 1592 9 incomplete-splice_match LCK ENST00000373564.7 2137 11 23799 1 -582 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACATCTCTTTGCTGTCCAC 701 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.535.13 chr1 + 1625 9 incomplete-splice_match LCK ENST00000619559.4 2099 13 1282 3 -227 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTACATCTCTTTGCTGTCC 1056 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 8 NA PB.535.14 chr1 + 1495 7 incomplete-splice_match LCK ENST00000619559.4 2099 13 1802 3 293 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTACATCTCTTTGCTGTCC 1576 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.535.15 chr1 + 1442 7 incomplete-splice_match LCK ENST00000619559.4 2099 13 1858 0 349 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACATCTCTTTGCTGTCCACT 1632 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.535.16 chr1 + 1224 6 incomplete-splice_match LCK ENST00000619559.4 2099 13 2349 0 840 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.209753 0.506472 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACATCTCTTTGCTGTCCACT 2123 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 12 NA PB.535.17 chr1 + 1060 5 incomplete-splice_match LCK ENST00000619559.4 2099 13 2630 0 1121 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.477233 0.541234 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACATCTCTTTGCTGTCCACT 2404 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 13 NA PB.536.1 chr1 - 2660 6 full-splice_match MTMR9LP ENST00000690989.1 2666 6 2 4 -1 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATCAGCTTGCTGGGGTGTCA -22 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.537.1 chr1 + 2117 14 full-splice_match HDAC1 ENST00000373548.8 2118 14 0 1 0 -1 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 983 262.932312 2.419844 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCTCCTGAGCTTGTTTCC -7 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 983 NA PB.537.2 chr1 + 2158 15 novel_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA 12 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCTCCTGAGCTTGTTTCC 5 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.537.3 chr1 + 2029 13 novel_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA 12 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCTCCTGAGCTTGTTTC 5 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.537.4 chr1 + 2567 13 novel_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA 13 4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CCTGAGCTTGTTTCCTATGT 6 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 3 NA PB.537.5 chr1 + 1986 13 novel_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA 17 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCTCCTGAGCTTGTTTC 10 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.537.6 chr1 + 3486 13 novel_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA 21 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCTCCTGAGCTTGTTTCC 14 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.537.7 chr1 + 5357 11 novel_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA 24 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCTCCTGAGCTTGTTTC 17 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.537.8 chr1 + 2474 14 novel_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA 24 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCTCCTGAGCTTGTTTCC 17 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 7 NA PB.537.9 chr1 + 2054 14 novel_not_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA 24 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCTCCTGAGCTTGTTTCC 17 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 5 NA PB.537.10 chr1 + 5177 11 novel_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA -24 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATATCCTCCTGAGCTTGTTT 21 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.537.11 chr1 + 2031 14 novel_not_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA -18 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCTCCTGAGCTTGTTTC 27 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.537.12 chr1 + 1712 12 novel_not_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA -12 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.209753 0.506472 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATATCCTCCTGAGCTTGTTT -18 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 12 NA PB.537.13 chr1 + 1369 12 incomplete-splice_match HDAC1 ENST00000373548.8 2118 14 44 1430 -8 415 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 30 8.024384 0.904412 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 GTCAAAACAGAGGATGAAAA -14 TRUE NA NA AAAAAG -9 NA NA NA 30 NA PB.537.14 chr1 + 1978 13 novel_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA -7 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.279671 0.631410 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCTCCTGAGCTTGTTTC -13 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 16 NA PB.537.15 chr1 + 1222 3 novel_not_in_catalog HDAC1 novel 721 7 NA NA 0 -22209 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATCTCTTTGATGAGCATTTG -6 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 6 NA PB.537.16 chr1 + 2604 13 novel_not_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA 32 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCTCCTGAGCTTGTTTC 52 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.537.17 chr1 + 2165 14 novel_not_in_catalog HDAC1 novel 2409 7 NA NA 90 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TATATCCTCCTGAGCTTGTT 11 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.537.18 chr1 + 1576 11 novel_not_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA 10511 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTTGTTTCCTATGTGTCC NA FALSE NA NA AATAAA -25 NA NA NA 2 NA PB.537.19 chr1 + 1923 13 incomplete-splice_match HDAC1 ENST00000373548.8 2118 14 10596 1 10518 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.942274 0.468683 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCTCCTGAGCTTGTTTCC NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 11 NA PB.537.20 chr1 + 1775 12 incomplete-splice_match HDAC1 ENST00000373548.8 2118 14 24675 1 -10431 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.547151 0.657739 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCTCCTGAGCTTGTTTCC NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 17 NA PB.537.23 chr1 + 1658 10 incomplete-splice_match HDAC1 ENST00000373548.8 2118 14 34875 -1 -231 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 19 5.082109 0.706044 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CCTCCTGAGCTTGTTTCCTA 4210 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 19 NA PB.537.24 chr1 + 1502 9 incomplete-splice_match HDAC1 ENST00000373548.8 2118 14 35486 2 295 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 35 9.361781 0.971358 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCTCCTGAGCTTGTTTC 4821 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 35 NA PB.537.25 chr1 + 1395 8 incomplete-splice_match HDAC1 ENST00000373548.8 2118 14 36984 1 -413 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 24 6.419507 0.807502 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCTCCTGAGCTTGTTTCC 6319 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 24 NA PB.537.26 chr1 + 2343 7 full-splice_match HDAC1 ENST00000476391.5 2409 7 56 10 56 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCTCCTGAGCTTGTTTCC 6788 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.537.27 chr1 + 2045 7 full-splice_match HDAC1 ENST00000476391.5 2409 7 354 10 -315 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCTCCTGAGCTTGTTTCC 7086 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.537.28 chr1 + 1525 7 full-splice_match HDAC1 ENST00000476391.5 2409 7 873 11 204 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCTCCTGAGCTTGTTTC 7605 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.537.29 chr1 + 1247 7 full-splice_match HDAC1 ENST00000476391.5 2409 7 1150 12 481 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 24 6.419507 0.807502 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATATCCTCCTGAGCTTGTTT 7882 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 24 NA PB.537.30 chr1 + 1106 6 incomplete-splice_match HDAC1 ENST00000476391.5 2409 7 1373 11 -683 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.884548 0.769713 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCTCCTGAGCTTGTTTC 22 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 22 NA PB.537.32 chr1 + 758 3 incomplete-splice_match HDAC1 ENST00000471488.1 726 4 607 -546 607 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCTCCTGAGCTTGTTTCC 1312 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 9 NA PB.538.1 chr1 - 1782 2 full-splice_match MARCKSL1 ENST00000329421.8 1546 2 0 -236 0 236 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAGAGGCTCACAAAAATGA -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.538.2 chr1 - 1348 2 full-splice_match MARCKSL1 ENST00000329421.8 1546 2 204 -6 204 6 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CTTTAATGAGTGGTCTTCTG 3644 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.538.4 chr1 - 1586 2 full-splice_match MARCKSL1 ENST00000329421.8 1546 2 -38 -2 -38 2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3176 849.514709 2.929171 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GGTGCTTTAATGAGTGGTCT 3402 FALSE NA NA TTTAAA -23 NA NA NA 3176 NA PB.538.7 chr1 - 1765 2 full-splice_match MARCKSL1 ENST00000329421.8 1546 2 -220 1 -220 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTGGTGCTTTAATGAGTGG 3220 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.538.8 chr1 - 1480 2 full-splice_match MARCKSL1 ENST00000329421.8 1546 2 65 1 65 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTGGTGCTTTAATGAGTGG 3505 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.538.13 chr1 - 1515 3 novel_not_in_catalog MARCKSL1 novel 1546 2 NA NA -15180 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGTGGTGCTTTAATGAGTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.538.14 chr1 - 1319 2 novel_not_in_catalog MARCKSL1 novel 1546 2 NA NA 0 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGTGGTGCTTTAATGAGTG -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.538.19 chr1 - 1442 2 full-splice_match MARCKSL1 ENST00000329421.8 1546 2 0 104 0 -104 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.477233 0.541234 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACCCCAGATTTGTACTTT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.538.20 chr1 - 1309 2 full-splice_match MARCKSL1 ENST00000329421.8 1546 2 0 237 0 -237 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 139 37.179642 1.570305 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGCCTGTGAATCAACTGTGT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 139 NA PB.538.23 chr1 - 1072 2 full-splice_match MARCKSL1 ENST00000329421.8 1546 2 237 237 237 -237 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGCCTGTGAATCAACTGTGT 3677 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.539.1 chr1 - 2132 2 full-splice_match FAM229A ENST00000416512.1 2759 2 626 1 626 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CACTCCGGGCTGGCAGTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.541.1 chr1 + 1007 3 novel_in_catalog ZBTB8B novel 12831 4 NA NA -15 -10807 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 ATTAAAGAGAAACCTTCATT -8 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.542.1 chr1 - 2398 6 incomplete-splice_match BSDC1 ENST00000455895.7 3309 11 15601 473 -4058 7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAAGGTGTCTGGGGGTCTGT 7936 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.542.2 chr1 - 2207 4 incomplete-splice_match BSDC1 ENST00000455895.7 3309 11 16398 473 -3261 7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAAGGTGTCTGGGGGTCTGT 8733 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.542.3 chr1 - 2824 11 full-splice_match BSDC1 ENST00000455895.7 3309 11 10 475 0 5 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 63 16.851206 1.226631 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGAAAGGTGTCTGGGGGTCT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 63 NA PB.542.4 chr1 - 1577 2 incomplete-splice_match BSDC1 ENST00000444377.5 2925 12 25952 -5 6306 5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGAAAGGTGTCTGGGGGTCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.542.5 chr1 - 1742 3 incomplete-splice_match BSDC1 ENST00000455895.7 3309 11 18088 476 -1571 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CTGAAAGGTGTCTGGGGGTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.542.6 chr1 - 2871 11 full-splice_match BSDC1 ENST00000446293.6 1505 11 -1 -1365 0 1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.279671 0.631410 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCTGAAAGGTGTCTGGGG 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.542.7 chr1 - 1895 3 incomplete-splice_match BSDC1 ENST00000455895.7 3309 11 17932 479 -1727 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCTGAAAGGTGTCTGGGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.542.8 chr1 - 2628 10 novel_in_catalog BSDC1 novel 3309 11 NA NA -1 -17 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAGAAAGAAAAAAGAA 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.542.9 chr1 - 2264 6 incomplete-splice_match BSDC1 ENST00000455895.7 3309 11 15653 555 -4006 -17 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAGAAAGAAAAAAGAA 7988 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.542.15 chr1 - 1730 10 full-splice_match BSDC1 ENST00000341071.11 4599 10 -8 2877 -3 -15 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAAAAAAAAAAAAGGAAA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.542.16 chr1 - 1618 10 full-splice_match BSDC1 ENST00000373520.8 1630 10 -3 15 0 -15 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAAAAAAAAAAAAGGAAA 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.542.17 chr1 - 1378 7 incomplete-splice_match BSDC1 ENST00000373520.8 1630 10 10523 15 -9123 -15 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAAAAAAAAAAAAGGAAA 2871 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.542.18 chr1 - 1675 10 incomplete-splice_match BSDC1 ENST00000455895.7 3309 11 10 3416 0 -16 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 24 6.419507 0.807502 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 GAAAAAAAAAAAAAAAGGAA 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 24 NA PB.542.19 chr1 - 1924 9 incomplete-splice_match BSDC1 ENST00000444377.5 2925 12 -3 10398 0 1119 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGGTGTCAGTCAGCCTTTTT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.546.1 chr1 - 2034 6 novel_in_catalog ZBTB8OS novel 598 7 NA NA -52 -5 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAATTTCTTTATTGTTGT 273 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.546.2 chr1 - 1981 7 full-splice_match ZBTB8OS ENST00000468695.6 1567 7 -419 5 -66 -5 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAATTTCTTTATTGTTGT 259 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.546.3 chr1 - 1926 6 full-splice_match ZBTB8OS ENST00000436661.6 514 6 -407 -1005 -64 -5 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAATTTCTTTATTGTTGT 261 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.546.4 chr1 - 1556 7 full-splice_match ZBTB8OS ENST00000468695.6 1567 7 5 6 4 -6 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 19 5.082109 0.706044 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAATTTCTTTATTGTTG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.546.5 chr1 - 1285 3 novel_in_catalog ZBTB8OS novel 817 4 NA NA -2 -5 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAATTTCTTTATTGTTGT -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.546.6 chr1 - 1262 4 incomplete-splice_match ZBTB8OS ENST00000436661.6 514 6 16592 -1005 93 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAATTTCTTTATTGTTGT NA FALSE NA NA GGGGCT -36 NA NA NA 2 NA PB.546.7 chr1 - 1584 7 novel_in_catalog ZBTB8OS novel 1567 7 NA NA 0 -6 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAATTTCTTTATTGTTG 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.546.8 chr1 - 1529 6 novel_in_catalog ZBTB8OS novel 620 7 NA NA 2 -6 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAATTTCTTTATTGTTG 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.546.9 chr1 - 1504 5 novel_in_catalog ZBTB8OS novel 620 7 NA NA 2 -6 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAATTTCTTTATTGTTG 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.546.10 chr1 - 1508 6 full-splice_match ZBTB8OS ENST00000436661.6 514 6 10 -1004 0 -6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAATTTCTTTATTGTTG -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.546.11 chr1 - 1672 6 novel_in_catalog ZBTB8OS novel 588 7 NA NA -68 -5 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGAACTGTTTTTGTTTTCC 257 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.546.12 chr1 - 1189 5 novel_in_catalog ZBTB8OS novel 514 6 NA NA 4 -5 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGAACTGTTTTTGTTTTCC -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.546.13 chr1 - 550 6 novel_in_catalog ZBTB8OS novel 548 6 NA NA 0 -5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGAACTGTTTTTGTTTTCC 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.546.14 chr1 - 590 7 novel_in_catalog ZBTB8OS novel 588 7 NA NA 0 -5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGAACTGTTTTTGTTTTCC -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.546.15 chr1 - 547 7 full-splice_match ZBTB8OS ENST00000468695.6 1567 7 5 1015 4 -5 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGAACTGTTTTTGTTTTCC -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.546.16 chr1 - 1012 7 full-splice_match ZBTB8OS ENST00000468695.6 1567 7 -461 1016 -108 5 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAAGAACTGTTTTTGTTTTC 217 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.546.17 chr1 - 456 6 novel_in_catalog ZBTB8OS novel 1567 7 NA NA 45 5 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAAGAACTGTTTTTGTTTTC 748 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.546.21 chr1 - 1602 2 intergenic novelGene_378 novel NA NA NA NA NA NA multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAGAAAAAAAAATCTTTTTT 2422 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.546.23 chr1 - 1028 2 genic ZBTB8OS novel 312 2 NA NA 2 -14921 multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATATTATAGGCCGTTTG 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.547.1 chr1 + 2381 12 full-splice_match RBBP4 ENST00000373493.10 7883 12 -60 5562 6 -2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 698 186.700653 2.271146 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATAACCCCATGCTGATGGGT 0 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 698 NA PB.547.2 chr1 + 2475 13 novel_in_catalog RBBP4 novel 7883 12 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT -31 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.547.4 chr1 + 2193 12 full-splice_match RBBP4 ENST00000373493.10 7883 12 -18 5708 12 -148 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 152 40.656876 1.609134 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGAGTTGCTTTTTTTTTTT -19 TRUE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 152 NA PB.547.5 chr1 + 2244 12 novel_not_in_catalog RBBP4 novel 7883 12 NA NA -14 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT -15 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.547.8 chr1 + 2801 12 full-splice_match RBBP4 ENST00000373493.10 7883 12 -9 5091 -9 463 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCGCTTAGTTTTTTGTTG -10 TRUE NA NA GATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.547.9 chr1 + 2430 13 novel_not_in_catalog RBBP4 novel 7883 12 NA NA -9 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT -10 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 7 NA PB.547.10 chr1 + 1692 12 full-splice_match RBBP4 ENST00000373493.10 7883 12 -9 6200 -9 -29 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TTTCAGACTCATTTAAGTAA -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.547.11 chr1 + 704 2 full-splice_match RBBP4 ENST00000465780.1 690 2 -27 13 -9 -13 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAAGAAAAAAGTATTA -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.547.13 chr1 + 2303 12 novel_not_in_catalog RBBP4 novel 7883 12 NA NA -1 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT -2 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.547.14 chr1 + 1438 12 full-splice_match RBBP4 ENST00000373485.5 1417 12 -27 6 -1 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 30 8.024384 0.904412 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT -2 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 30 NA PB.547.16 chr1 + 2414 13 novel_in_catalog RBBP4 novel 7883 12 NA NA -1 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.547.17 chr1 + 2328 12 full-splice_match RBBP4 ENST00000373493.10 7883 12 1 5554 -1 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 229 61.252792 1.787126 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATGCTGATGGGTTTTATTTA 0 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 229 NA PB.547.20 chr1 + 1490 13 novel_in_catalog RBBP4 novel 7883 12 NA NA 0 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT 5 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 8 NA PB.547.22 chr1 + 2264 13 novel_not_in_catalog RBBP4 novel 7883 12 NA NA 0 -148 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGAGTTGCTTTTTTTTTTT 8 TRUE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.547.23 chr1 + 1605 13 novel_in_catalog RBBP4 novel 7883 12 NA NA 0 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT 9 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 5 NA PB.547.24 chr1 + 2110 11 novel_in_catalog RBBP4 novel 7883 12 NA NA -2 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT 23 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.547.25 chr1 + 2271 12 full-splice_match RBBP4 ENST00000373493.10 7883 12 52 5560 -18 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 88 23.538191 1.371773 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT 51 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 88 NA PB.547.28 chr1 + 2080 12 full-splice_match RBBP4 ENST00000373493.10 7883 12 94 5709 24 -149 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 23 6.152027 0.789018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAAGAGTTGCTTTTTTTTTT 93 FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 23 NA PB.547.29 chr1 + 2567 12 novel_in_catalog RBBP4 novel 783 8 NA NA -21 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT 9 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.547.30 chr1 + 2173 11 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000458695.6 1674 12 593 -611 462 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT 213 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.547.31 chr1 + 1968 11 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000458695.6 1674 12 650 -463 519 -148 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGAGTTGCTTTTTTTTTTT 270 FALSE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.547.32 chr1 + 2109 11 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000458695.6 1674 12 657 -611 526 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.617068 0.749510 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT 277 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 21 NA PB.547.35 chr1 + 1860 10 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000458695.6 1674 12 6123 -463 5992 -148 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGAGTTGCTTTTTTTTTTT 5743 FALSE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 6 NA PB.547.36 chr1 + 1916 9 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000458695.6 1674 12 16867 -611 -96 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 33 8.826821 0.945804 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT 6315 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 33 NA PB.547.38 chr1 + 1851 9 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000458695.6 1674 12 16932 -611 -31 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT 6380 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 9 NA PB.547.39 chr1 + 1688 9 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000458695.6 1674 12 16946 -462 -17 -149 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAAGAGTTGCTTTTTTTTTT 6394 FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 9 NA PB.547.40 chr1 + 1701 8 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000492348.6 1547 10 17560 -446 208 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 34 9.094301 0.958769 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACCCCATGCTGATGGGTT 6869 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 34 NA PB.547.41 chr1 + 1494 8 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000492348.6 1547 10 17620 -299 -256 -148 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGAGTTGCTTTTTTTTTTT 6929 FALSE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 6 NA PB.547.43 chr1 + 1584 7 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000460669.5 783 8 -96 3 -82 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 60 16.048767 1.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACCCCATGCTGATGGGTT 7103 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 60 NA PB.547.45 chr1 + 1335 7 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000460669.5 783 8 6 150 6 -148 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGAGTTGCTTTTTTTTTTT 7205 FALSE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 5 NA PB.547.47 chr1 + 1402 6 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000460669.5 783 8 185 2 36 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 41 10.966658 1.040074 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT 7384 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 41 NA PB.547.48 chr1 + 1190 5 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000460669.5 783 8 377 150 228 -148 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.942274 0.468683 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGAGTTGCTTTTTTTTTTT 7576 FALSE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 11 NA PB.547.49 chr1 + 1238 4 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000460669.5 783 8 3362 3 3213 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 48 12.839013 1.108532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACCCCATGCTGATGGGTT NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 48 NA PB.547.50 chr1 + 1153 3 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000460669.5 783 8 3563 2 3414 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 31 8.291862 0.918652 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 31 NA PB.547.51 chr1 + 1001 3 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000460669.5 783 8 3566 151 3417 -149 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.279671 0.631410 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAAGAGTTGCTTTTTTTTTT NA FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 16 NA PB.547.53 chr1 + 1090 2 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000460669.5 783 8 3717 2 3568 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 25 6.686986 0.825230 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 25 NA PB.549.3 chr1 - 3032 5 full-splice_match SYNC ENST00000409190.8 3503 5 0 471 0 -471 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAC -10 TRUE NA NA GGGGCT -12 NA NA NA 4 NA PB.549.5 chr1 - 1797 4 incomplete-splice_match SYNC ENST00000409190.8 3503 5 7527 742 7513 -742 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AGAAAAGCAATTTATTCCAT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.549.6 chr1 - 2607 5 full-splice_match SYNC ENST00000409190.8 3503 5 10 886 -4 699 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TCTGGGACTATTACATTTAA 0 TRUE NA NA GGGGCT -2 NA NA NA 2 NA PB.549.8 chr1 - 1988 5 full-splice_match SYNC ENST00000409190.8 3503 5 20 1495 6 90 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTCTTTTGTGCCACGAGTG 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.550.2 chr1 + 5290 7 full-splice_match KIAA1522 ENST00000373481.7 5293 7 1 2 1 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGGCTGTGGCTACTGCTTCT 13 TRUE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.550.3 chr1 + 3890 2 incomplete-splice_match KIAA1522 ENST00000373480.1 5294 7 4991 0 4991 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCTGTGGCTACTGCTTCTTA 2727 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.550.4 chr1 + 3439 2 incomplete-splice_match KIAA1522 ENST00000373480.1 5294 7 5442 0 5442 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCTGTGGCTACTGCTTCTTA 58 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.550.5 chr1 + 3134 2 incomplete-splice_match KIAA1522 ENST00000373480.1 5294 7 5747 0 5747 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCTGTGGCTACTGCTTCTTA 146 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.550.6 chr1 + 2705 2 incomplete-splice_match KIAA1522 ENST00000373480.1 5294 7 6175 1 6175 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GGCTGTGGCTACTGCTTCTT 309 FALSE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.550.7 chr1 + 2432 2 incomplete-splice_match KIAA1522 ENST00000373480.1 5294 7 6449 0 6449 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCTGTGGCTACTGCTTCTTA 583 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 5 NA PB.550.8 chr1 + 2370 2 incomplete-splice_match KIAA1522 ENST00000373480.1 5294 7 6510 1 6510 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GGCTGTGGCTACTGCTTCTT 644 FALSE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.550.9 chr1 + 2126 2 incomplete-splice_match KIAA1522 ENST00000373480.1 5294 7 6755 0 6755 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCTGTGGCTACTGCTTCTTA 889 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 9 NA PB.552.1 chr1 - 2902 13 full-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 4 -463 3 461 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TACTCTAGGTCAAGCTCATT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.552.3 chr1 - 1939 10 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 10759 -2 -19 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TCTGGATGTGAGCTGGACCA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.552.4 chr1 - 2465 13 full-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 -22 0 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 612 163.697418 2.214042 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGTCTGGATGTGAGCTGGAC -30 TRUE NA NA AAAAAG -18 NA NA NA 612 NA PB.552.5 chr1 - 956 2 full-splice_match YARS1 ENST00000490826.1 2178 2 1219 3 1219 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 19 5.082109 0.706044 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.552.6 chr1 - 2208 12 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 6364 1 653 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.547151 0.657739 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GTGTCTGGATGTGAGCTGGA 7158 FALSE NA NA AGTAAA -43 NA NA NA 17 NA PB.552.7 chr1 - 1945 10 novel_in_catalog YARS1 novel 2075 11 NA NA -3 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GTGTCTGGATGTGAGCTGGA 30 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.552.8 chr1 - 1645 7 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 30282 1 -342 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GTGTCTGGATGTGAGCTGGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.552.9 chr1 - 1803 9 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 19529 2 385 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.744712 0.573418 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGTGTCTGGATGTGAGCTGG 1276 FALSE NA NA CATAAA -10 NA NA NA 14 NA PB.552.12 chr1 - 2350 12 novel_in_catalog YARS1 novel 2443 13 NA NA 3 -3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.552.13 chr1 - 2315 12 full-splice_match YARS1 ENST00000675785.1 2248 12 -5 -62 -5 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG 767 FALSE NA NA AAAAAG -23 NA NA NA 2 NA PB.552.14 chr1 - 2262 12 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 6303 8 592 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG 7097 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.552.15 chr1 - 2118 11 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 6591 8 880 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG 7385 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.552.16 chr1 - 2119 11 full-splice_match YARS1 ENST00000674629.1 2075 11 -8 -36 4 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG -15 TRUE NA NA AAAAAG -3 NA NA NA 8 NA PB.552.17 chr1 - 2003 11 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 6706 8 995 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.279671 0.631410 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG 7500 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.552.18 chr1 - 1996 10 novel_in_catalog YARS1 novel 2075 11 NA NA -1 -3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG -22 TRUE NA NA AAAAAG -10 NA NA NA 2 NA PB.552.19 chr1 - 1854 10 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 10834 8 56 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.942274 0.468683 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.552.21 chr1 - 1664 8 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 26170 8 -4454 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 27 7.221945 0.858654 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG 7917 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 27 NA PB.552.22 chr1 - 1522 7 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 30398 8 -226 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 38 10.164219 1.007074 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 38 NA PB.552.23 chr1 - 1397 5 full-splice_match YARS1 ENST00000487404.5 2197 5 1234 -434 -418 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 34 9.094301 0.958769 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG NA FALSE NA NA GATAAA -1 NA NA NA 34 NA PB.552.24 chr1 - 1227 4 full-splice_match YARS1 ENST00000469100.5 2247 4 1010 10 -382 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 29 7.756904 0.889688 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 29 NA PB.552.25 chr1 - 1150 3 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000469100.5 2247 4 1856 10 464 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.279671 0.631410 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.552.26 chr1 - 1073 3 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000469100.5 2247 4 1933 10 541 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.209753 0.506472 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.552.28 chr1 - 2302 12 novel_in_catalog YARS1 novel 2443 13 NA NA -2 -4 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAACAAGGGTGTCTGGATGT 31 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.552.30 chr1 - 2566 13 novel_in_catalog YARS1 novel 3263 13 NA NA -4 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATGCCACAGTCCTTATAATT 768 FALSE NA NA AAAAAG -22 NA NA NA 2 NA PB.552.31 chr1 - 2022 13 full-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 -22 443 0 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 154 41.191833 1.614811 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TATGCCACAGTCCTTATAAT -30 TRUE NA NA AAAAAG -18 NA NA NA 154 NA PB.552.32 chr1 - 1830 12 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 6301 442 590 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATGCCACAGTCCTTATAATT 7095 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.552.33 chr1 - 1471 10 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000675785.1 2248 12 10805 372 5 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATGCCACAGTCCTTATAATT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.552.34 chr1 - 1293 8 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000675785.1 2248 12 26129 372 -4517 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.744712 0.573418 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATGCCACAGTCCTTATAATT 7854 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.552.35 chr1 - 1586 11 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000675785.1 2248 12 6710 373 977 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TATGCCACAGTCCTTATAAT 7482 FALSE NA NA GGGGCT -2 NA NA NA 4 NA PB.552.36 chr1 - 996 6 full-splice_match YARS1 ENST00000478828.1 1044 6 357 -309 357 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TATGCCACAGTCCTTATAAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.552.37 chr1 - 1197 7 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000675785.1 2248 12 30303 380 -343 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAATTTATGCCACAGTCC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.552.41 chr1 - 2034 8 novel_in_catalog YARS1 novel 1018 9 NA NA 0 174 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAGA -30 TRUE NA NA AAAAAG -18 NA NA NA 2 NA PB.552.42 chr1 - 1491 8 novel_not_in_catalog YARS1 novel 1018 9 NA NA 0 174 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAGA -30 TRUE NA NA AAAAAG -18 NA NA NA 2 NA PB.552.45 chr1 - 1308 6 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 0 15413 0 1 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAGTGT -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.555.1 chr1 - 1052 6 novel_not_in_catalog TMEM54 novel 1030 6 NA NA -5 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATTTGGCTGCATGCAGGGG 11 TRUE NA NA GGGGCT -23 NA NA NA 5 NA PB.555.2 chr1 - 998 6 full-splice_match TMEM54 ENST00000373463.8 1030 6 32 0 -5 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 53 14.176411 1.151566 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATTTGGCTGCATGCAGGGG 11 TRUE NA NA GGGGCT -23 NA NA NA 53 NA PB.556.1 chr1 - 1539 6 incomplete-splice_match RNF19B ENST00000356990.9 2598 9 18200 -3 18200 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTTACCTCATTTTCCTTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.556.2 chr1 - 1388 5 incomplete-splice_match RNF19B ENST00000373456.11 2560 9 19074 6 19074 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTTACCTCATTTTCCTTG NA FALSE NA NA AATAAA -23 NA NA NA 7 NA PB.556.3 chr1 - 1216 4 incomplete-splice_match RNF19B ENST00000373456.11 2560 9 20600 6 20600 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTTACCTCATTTTCCTTG NA FALSE NA NA CATAAA -7 NA NA NA 3 NA PB.556.4 chr1 - 1100 3 incomplete-splice_match RNF19B ENST00000373456.11 2560 9 22275 6 22275 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTTACCTCATTTTCCTTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.556.5 chr1 - 1703 7 incomplete-splice_match RNF19B ENST00000373456.11 2560 9 16324 11 16324 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATTCAACTTACCTCATTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.558.1 chr1 + 1656 7 full-splice_match S100PBP ENST00000373475.10 4220 7 -82 2646 -4 44 alternative_3end5end TRUE canonical NA NA NA NA 55 14.711370 1.167653 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTTTGTGTGTGTGTGTCTG 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 55 NA PB.558.3 chr1 + 3247 7 full-splice_match S100PBP ENST00000373475.10 4220 7 -48 1021 13 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CCTAAGTGTTTACTGTTTTT -12 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.558.4 chr1 + 4253 7 full-splice_match S100PBP ENST00000373475.10 4220 7 -34 1 27 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.209753 0.506472 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACATATGTACTGTGGCGGTC 2 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 12 NA PB.558.5 chr1 + 2067 5 incomplete-splice_match S100PBP ENST00000356689.7 3583 7 27 6258 27 4307 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAAAAAAATTAGCCAGGC 2 TRUE NA NA TATAAA -27 NA NA NA 3 NA PB.558.6 chr1 + 1661 7 novel_in_catalog S100PBP novel 4220 7 NA NA 21 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATGCCCATTGCCGACTTG 24 FALSE NA NA TTTAAA -19 NA NA NA 4 NA PB.558.10 chr1 + 1594 7 novel_not_in_catalog S100PBP novel 665 2 NA NA 505 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATGCCCATTGCCGACTTG 590 FALSE NA NA TTTAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.558.11 chr1 + 1419 6 novel_in_catalog S100PBP novel 3320 7 NA NA 493 6 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTGCCGACTTGAATTTTTT 7737 FALSE NA NA TTTAAA -27 NA NA NA 2 NA PB.558.12 chr1 + 1290 5 novel_in_catalog S100PBP novel 3320 7 NA NA 1289 5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CATTGCCGACTTGAATTTTT 8533 FALSE NA NA TTTAAA -26 NA NA NA 3 NA PB.558.13 chr1 + 662 5 incomplete-splice_match S100PBP ENST00000373476.5 3320 7 9375 1664 1920 5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CATTGCCGACTTGAATTTTT 9164 FALSE NA NA TTTAAA -26 NA NA NA 2 NA PB.558.14 chr1 + 3061 3 incomplete-splice_match S100PBP ENST00000373475.10 4220 7 12392 2 5148 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GACATATGTACTGTGGCGGT NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.559.4 chr1 - 5940 6 full-splice_match AK2 ENST00000672715.1 5970 6 29 1 9 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGAGGTTCTGCATGCATTAT 77 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.559.5 chr1 - 3576 7 full-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 20 1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.477233 0.541234 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGAGGTTCTGCATGCATTAT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.559.9 chr1 - 2787 8 novel_in_catalog AK2 novel 886 7 NA NA -7 10 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GAGCTATTGTTTGTTTGCTT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.559.10 chr1 - 5044 6 full-splice_match AK2 ENST00000672715.1 5970 6 29 897 9 9 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGAGCTATTGTTTGTTTGCT 77 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.559.11 chr1 - 3844 7 novel_in_catalog AK2 novel 2840 8 NA NA -8 9 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGAGCTATTGTTTGTTTGCT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.559.12 chr1 - 2729 8 full-splice_match AK2 ENST00000467905.5 880 8 23 -1872 0 9 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGAGCTATTGTTTGTTTGCT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.559.13 chr1 - 2699 7 full-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 1 897 1 9 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 329 88.000740 1.944486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGAGCTATTGTTTGTTTGCT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 329 NA PB.559.14 chr1 - 2553 6 incomplete-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 12315 897 -2865 9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGAGCTATTGTTTGTTTGCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.559.15 chr1 - 2422 5 incomplete-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 15184 897 4 9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGAGCTATTGTTTGTTTGCT 311 FALSE NA NA TTTAAA -12 NA NA NA 5 NA PB.559.16 chr1 - 2114 2 incomplete-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 23514 897 -82 9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.942274 0.468683 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGAGCTATTGTTTGTTTGCT 8641 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.559.24 chr1 - 2553 6 full-splice_match AK2 ENST00000548033.5 936 6 -23 -1594 0 8 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTGAGCTATTGTTTGTTTGC -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.559.25 chr1 - 1670 7 full-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 -9 1936 -6 197 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 818 218.798187 2.340044 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCTGTTGTGGCATTT -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 818 NA PB.559.26 chr1 - 2693 6 novel_in_catalog AK2 novel 2840 8 NA NA 1 198 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCCCTGTTGTGGCATTTT 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.559.28 chr1 - 1755 7 full-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 -93 1935 28 198 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCCCTGTTGTGGCATTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.559.29 chr1 - 1711 8 novel_not_in_catalog AK2 novel 2840 8 NA NA 0 198 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCCCTGTTGTGGCATTTT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.559.30 chr1 - 1683 8 full-splice_match AK2 ENST00000467905.5 880 8 31 -834 8 198 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.617068 0.749510 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCCCTGTTGTGGCATTTT 76 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 21 NA PB.559.32 chr1 - 1516 6 incomplete-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 12314 1935 -2866 198 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.547151 0.657739 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCCCTGTTGTGGCATTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.559.35 chr1 - 5149 5 novel_in_catalog AK2 novel 5970 6 NA NA -2 197 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCTGTTGTGGCATTT 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.559.36 chr1 - 4160 7 full-splice_match AK2 ENST00000550338.5 886 7 11 -3285 -5 197 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCTGTTGTGGCATTT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.559.37 chr1 - 4005 6 full-splice_match AK2 ENST00000672715.1 5970 6 29 1936 9 197 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 23 6.152027 0.789018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCTGTTGTGGCATTT 77 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 23 NA PB.559.38 chr1 - 3947 5 full-splice_match AK2 ENST00000480134.5 811 5 -14 -3122 -5 197 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCTGTTGTGGCATTT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.559.40 chr1 - 2790 7 novel_in_catalog AK2 novel 2840 8 NA NA -2 197 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.942274 0.468683 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCTGTTGTGGCATTT 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.559.41 chr1 - 1936 2 full-splice_match AK2 ENST00000482191.1 599 2 -740 -597 190 197 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCTGTTGTGGCATTT 8913 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.559.43 chr1 - 1744 8 novel_in_catalog AK2 novel 886 7 NA NA -4 197 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.012192 0.603382 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCTGTTGTGGCATTT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.559.44 chr1 - 1500 6 full-splice_match AK2 ENST00000548033.5 936 6 -8 -556 -4 197 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCTGTTGTGGCATTT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.559.45 chr1 - 1388 5 incomplete-splice_match AK2 ENST00000548033.5 936 6 15136 -556 -1 197 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.617068 0.749510 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCTGTTGTGGCATTT 306 FALSE NA NA TTTAAA -17 NA NA NA 21 NA PB.559.46 chr1 - 1270 2 full-splice_match AK2 ENST00000482191.1 599 2 -74 -597 -74 197 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCTGTTGTGGCATTT 9579 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.559.47 chr1 - 1182 3 incomplete-splice_match AK2 ENST00000548033.5 936 6 22245 -556 -1308 197 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 27 7.221945 0.858654 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCTGTTGTGGCATTT 7415 FALSE NA NA AATGAA -33 NA NA NA 27 NA PB.559.48 chr1 - 992 2 incomplete-splice_match AK2 ENST00000548033.5 936 6 23554 -556 1 197 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCTGTTGTGGCATTT 8724 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.559.50 chr1 - 1480 7 full-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 32 2085 -7 48 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 87 23.270712 1.366810 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CATCCAAAGATTGTCCTTTC -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 87 NA PB.559.51 chr1 - 1027 7 full-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 -62 2632 -34 13 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAATTAATTTTTTAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.559.52 chr1 - 1771 6 full-splice_match AK2 ENST00000672715.1 5970 6 29 4170 9 888 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CTTTTGAATTCAGATTGTCT 77 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.559.53 chr1 - 1000 7 full-splice_match AK2 ENST00000550338.5 886 7 48 -162 9 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.744712 0.573418 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCTTTGGCGTGTGTGCTAC 77 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.559.54 chr1 - 944 6 full-splice_match AK2 ENST00000672715.1 5970 6 -33 5059 -5 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 346 92.547890 1.966367 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCTTTGGCGTGTGTGCTAC 15 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 346 NA PB.559.55 chr1 - 787 5 full-splice_match AK2 ENST00000480134.5 811 5 23 1 9 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.744712 0.573418 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCTTTGGCGTGTGTGCTAC 77 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.559.56 chr1 - 756 5 full-splice_match AK2 ENST00000354858.11 5059 5 150 4153 9 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCTTTGGCGTGTGTGCTAC 77 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.559.57 chr1 - 783 6 full-splice_match AK2 ENST00000672715.1 5970 6 128 5059 85 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCTTTGGCGTGTGTGCTAC 176 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.559.58 chr1 - 2025 5 novel_in_catalog AK2 novel 5970 6 NA NA -2 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCTTTGGCGTGTGTGCTA 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.559.59 chr1 - 890 6 full-splice_match AK2 ENST00000672715.1 5970 6 20 5060 0 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCTTTGGCGTGTGTGCTA -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.559.61 chr1 - 1061 5 full-splice_match AK2 ENST00000487289.1 920 5 -35 -106 -2 106 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATATTCATTTTCTTTTCAAA 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.559.62 chr1 - 1008 6 novel_in_catalog AK2 novel 920 5 NA NA 9 -40 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATTACTTTGATTTCCTAATG 77 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.559.63 chr1 - 888 5 full-splice_match AK2 ENST00000487289.1 920 5 -13 45 6 -45 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACATTATTACTTTGATTTCC 74 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.562.1 chr1 - 3815 5 full-splice_match TRIM62 ENST00000291416.10 3817 5 0 2 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 19 5.082109 0.706044 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGCCAGTTCCATTCATTTT 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.562.2 chr1 - 3262 6 novel_in_catalog TRIM62 novel 3817 5 NA NA -5 -4 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGTAGCCAGTTCCATTCATT 13 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.562.3 chr1 - 2619 3 incomplete-splice_match TRIM62 ENST00000543586.1 1638 5 16685 -1299 16685 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGTAGCCAGTTCCATTCATT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.562.4 chr1 - 2404 2 incomplete-splice_match TRIM62 ENST00000543586.1 1638 5 18219 -1299 18219 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGTAGCCAGTTCCATTCATT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.563.3 chr1 + 3133 9 full-splice_match ZNF362 ENST00000539719.6 3187 9 53 1 0 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GGTGGCGGTGGTGTTTGGCG 19 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.563.4 chr1 + 3009 8 novel_in_catalog ZNF362 novel 3187 9 NA NA 0 1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TGGCGGTGGTGTTTGGCGTG 19 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 8 NA PB.563.7 chr1 + 1979 3 incomplete-splice_match ZNF362 ENST00000373428.5 2936 8 24411 0 14636 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GTGGCGGTGGTGTTTGGCGT NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 5 NA PB.565.1 chr1 - 1472 2 incomplete-splice_match PHC2 ENST00000373418.7 2550 7 20940 -2 6311 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.279671 0.631410 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TCTTTGGTGCCTTTCTCCCC 3327 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.565.2 chr1 - 1982 5 incomplete-splice_match PHC2 ENST00000373418.7 2550 7 17558 -1 2929 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTCTTTGGTGCCTTTCTCCC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.565.3 chr1 - 3989 15 full-splice_match PHC2 ENST00000683057.1 3993 15 4 0 4 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TCTCTTTGGTGCCTTTCTCC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.565.4 chr1 - 2237 7 novel_in_catalog PHC2 novel 2548 8 NA NA -17 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TCTCTTTGGTGCCTTTCTCC 234 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.565.5 chr1 - 2084 6 incomplete-splice_match PHC2 ENST00000373418.7 2550 7 15770 0 1141 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TCTCTTTGGTGCCTTTCTCC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.565.6 chr1 - 1721 3 incomplete-splice_match PHC2 ENST00000373418.7 2550 7 19765 0 5136 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TCTCTTTGGTGCCTTTCTCC 2152 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.565.7 chr1 - 1601 2 incomplete-splice_match PHC2 ENST00000373418.7 2550 7 20809 0 6180 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.477233 0.541234 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TCTCTTTGGTGCCTTTCTCC 3196 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.565.14 chr1 - 2263 6 incomplete-splice_match PHC2 ENST00000373418.7 2550 7 15590 1 961 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GTCTCTTTGGTGCCTTTCTC NA FALSE NA NA AAAACA -29 NA NA NA 6 NA PB.565.15 chr1 - 1830 4 incomplete-splice_match PHC2 ENST00000373418.7 2550 7 18520 1 3891 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 24 6.419507 0.807502 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GTCTCTTTGGTGCCTTTCTC 907 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 24 NA PB.571.1 chr1 + 1355 2 full-splice_match GJB5 ENST00000338513.1 1355 2 0 0 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCCAGGTGCCCTCTGGTTGT -18 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.573.4 chr1 - 2718 2 full-splice_match SMIM12 ENST00000423898.1 897 2 1 -1822 1 1523 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATAGTAAATGTCATTTTGGA 7913 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.573.5 chr1 - 2529 2 full-splice_match SMIM12 ENST00000521580.3 5694 2 -4 3169 2 1519 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.884548 0.769713 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAATAGTAAATGTCATTT 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 22 NA PB.573.6 chr1 - 1977 3 novel_not_in_catalog SMIM12 novel 5694 2 NA NA -36 1519 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAATAGTAAATGTCATTT 7838 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.573.9 chr1 - 1888 2 novel_not_in_catalog SMIM12 novel 2817 2 NA NA -8 4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AATGATCGAATCTTATCATC -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.573.10 chr1 - 1098 3 novel_not_in_catalog SMIM12 novel 2817 2 NA NA 9 4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AATGATCGAATCTTATCATC 7903 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.573.11 chr1 - 1052 2 full-splice_match SMIM12 ENST00000521580.3 5694 2 -42 4684 -36 4 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 178 47.611343 1.677710 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AATGATCGAATCTTATCATC 7838 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 178 NA PB.573.12 chr1 - 998 2 novel_not_in_catalog SMIM12 novel 5694 2 NA NA 20 4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AATGATCGAATCTTATCATC 7932 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.573.13 chr1 - 1235 2 full-splice_match SMIM12 ENST00000423898.1 897 2 -37 -301 1 2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 38 10.164219 1.007074 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATAATGATCGAATCTTATCA 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 38 NA PB.573.15 chr1 - 3269 2 novel_not_in_catalog SMIM12 novel 2817 2 NA NA -29 2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATAATGATCGAATCTTATCA -22 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.573.16 chr1 - 3025 2 novel_not_in_catalog SMIM12 novel 2817 2 NA NA 5 2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATAATGATCGAATCTTATCA 18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.574.1 chr1 - 914 3 full-splice_match TMEM35B ENST00000373337.3 922 3 8 0 8 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 183 48.948738 1.689741 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTTCATGTCTCTTTTGCCTC -22 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 183 NA PB.575.1 chr1 + 2223 2 full-splice_match GJB3 ENST00000373366.3 2192 2 -30 -1 -30 1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGGTTGGCTCTGTCTCTGGT -2 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 4 NA PB.575.2 chr1 + 1990 2 full-splice_match GJB3 ENST00000373366.3 2192 2 201 1 201 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACAGGTTGGCTCTGTCTCTG 203 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.576.4 chr1 - 3108 16 full-splice_match ZMYM6 ENST00000357182.9 5122 16 -2 2016 -2 -2016 alternative_3end TRUE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATCTCTGAATTGGAAACA -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.577.4 chr1 + 3993 9 full-splice_match ZMYM1 ENST00000373329.5 3980 9 -11 -2 -2 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATGTTTTGATCTTTCCTA -14 TRUE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.577.5 chr1 + 1918 10 full-splice_match ZMYM1 ENST00000359858.9 4161 10 -5 2248 -2 396 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAGATAAAGGAGAAGAAA -14 TRUE NA NA AATAAA -33 NA NA NA 5 NA PB.577.9 chr1 + 2898 10 novel_not_in_catalog ZMYM1 novel 3055 11 NA NA -2 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AGAAAAGAAGAAAAATTCAG -5 TRUE NA NA TTTAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.577.10 chr1 + 4148 10 full-splice_match ZMYM1 ENST00000359858.9 4161 10 6 7 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATCAAATGTTTTGATCTTT -3 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 6 NA PB.577.11 chr1 + 2764 9 full-splice_match ZMYM1 ENST00000373329.5 3980 9 0 1216 0 2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAGAAGAAAAATTCAGAA -3 TRUE NA NA TTTAAA -22 NA NA NA 3 NA PB.577.14 chr1 + 1778 3 incomplete-splice_match ZMYM1 ENST00000488455.5 3055 11 32453 0 7596 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AGAAAAGAAGAAAAATTCAG NA FALSE NA NA TTTAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.578.2 chr1 - 1103 10 novel_in_catalog SFPQ novel 874 9 NA NA -334 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TCCTTTGGTTTTGTTTTTGT 37 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.578.3 chr1 - 4667 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 -1835 3 -874 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 9519 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.578.4 chr1 - 4166 3 full-splice_match SFPQ ENST00000466213.5 1431 3 -2736 1 -376 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 9538 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.578.5 chr1 - 4358 3 full-splice_match SFPQ ENST00000466213.5 1431 3 -2928 1 -568 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 9825 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.578.6 chr1 - 3984 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 -1152 3 -191 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 9723 FALSE NA NA TTTAAA -44 NA NA NA 2 NA PB.578.7 chr1 - 3860 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 -1028 3 -67 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 9847 FALSE NA NA AATGAA -12 NA NA NA 2 NA PB.578.8 chr1 - 3757 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 -925 3 36 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 9950 FALSE NA NA ATTAAA -42 NA NA NA 2 NA PB.578.9 chr1 - 3410 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 -578 3 121 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 9722 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.578.10 chr1 - 3278 3 full-splice_match SFPQ ENST00000466213.5 1431 3 -1848 1 250 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 9851 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.578.11 chr1 - 3213 4 full-splice_match SFPQ ENST00000485365.1 693 4 -2521 1 -2521 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 9017 FALSE NA NA AGTAAA -22 NA NA NA 3 NA PB.578.12 chr1 - 3007 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 -175 3 -175 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 10005 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.578.13 chr1 - 2840 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 -8 3 -8 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 8694 FALSE NA NA AATGAA -5 NA NA NA 2 NA PB.578.14 chr1 - 2690 3 full-splice_match SFPQ ENST00000466213.5 1431 3 -1260 1 139 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.942274 0.468683 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 8841 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.578.15 chr1 - 2546 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 286 3 286 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 8988 FALSE NA NA AAAAAG -18 NA NA NA 4 NA PB.578.16 chr1 - 2423 4 full-splice_match SFPQ ENST00000490668.5 434 4 -1990 1 -1728 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 9810 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.578.17 chr1 - 2399 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 433 3 433 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 9135 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.578.18 chr1 - 1932 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 900 3 -499 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.279671 0.631410 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 9602 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.578.19 chr1 - 1766 3 full-splice_match SFPQ ENST00000466213.5 1431 3 -336 1 -336 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 9765 FALSE NA NA ATTAAA -7 NA NA NA 6 NA PB.578.20 chr1 - 1642 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 1190 3 -209 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.209753 0.506472 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 9892 FALSE NA NA ATTAAA -31 NA NA NA 12 NA PB.578.21 chr1 - 1446 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 1386 3 -13 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 5283 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.578.22 chr1 - 1361 11 novel_in_catalog SFPQ novel 874 9 NA NA -938 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 8 TRUE NA NA AAAAAG -22 NA NA NA 9 NA PB.578.23 chr1 - 1228 11 novel_in_catalog SFPQ novel 874 9 NA NA -805 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 1765 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.578.24 chr1 - 1284 2 full-splice_match SFPQ ENST00000471991.5 440 2 -847 3 -372 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 6034 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.578.25 chr1 - 1277 4 full-splice_match SFPQ ENST00000490668.5 434 4 -844 1 -582 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 9811 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.578.26 chr1 - 1107 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 1725 3 185 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.942274 0.468683 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 5622 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.578.28 chr1 - 812 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 2020 3 480 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 5917 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.578.29 chr1 - 5116 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 -2285 4 -1324 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCTTTGGTTTTGTTTTT 9069 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.578.30 chr1 - 3648 3 full-splice_match SFPQ ENST00000466213.5 1431 3 -2219 2 -121 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCTTTGGTTTTGTTTTT 9480 FALSE NA NA TATAAA -45 NA NA NA 2 NA PB.578.31 chr1 - 3175 3 full-splice_match SFPQ ENST00000466213.5 1431 3 -1746 2 -347 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCTTTGGTTTTGTTTTT 9953 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.578.32 chr1 - 2304 12 novel_in_catalog SFPQ novel 874 9 NA NA 0 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCTTTGGTTTTGTTTTT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.578.33 chr1 - 2198 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 633 4 633 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCTTTGGTTTTGTTTTT 9335 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.578.34 chr1 - 1625 12 novel_in_catalog SFPQ novel 874 9 NA NA 676 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCTTTGGTTTTGTTTTT 675 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.578.35 chr1 - 1172 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 1659 4 119 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCTTTGGTTTTGTTTTT 5556 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.578.36 chr1 - 878 9 full-splice_match SFPQ ENST00000470472.5 874 9 -8 4 -8 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCTTTGGTTTTGTTTTT 2562 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.578.37 chr1 - 982 3 full-splice_match SFPQ ENST00000466213.5 1431 3 447 2 306 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCTTTGGTTTTGTTTTT 5743 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.578.38 chr1 - 1254 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 1575 6 35 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.744712 0.573418 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTATCCTTTGGTTTTGTTT 5472 FALSE NA NA ACTAAA -19 NA NA NA 14 NA PB.578.39 chr1 - 4454 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 -1626 7 -665 -5 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTATCCTTTGGTTTTGTT 9728 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.578.40 chr1 - 3314 4 full-splice_match SFPQ ENST00000490668.5 434 4 -2885 5 -2623 -5 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTATCCTTTGGTTTTGTT 8 TRUE NA NA AATAAA -31 NA NA NA 2 NA PB.578.41 chr1 - 1024 3 novel_not_in_catalog SFPQ novel 2835 3 NA NA 350 -5 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTATCCTTTGGTTTTGTT 5787 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.578.42 chr1 - 3742 10 full-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 0 -2 0 2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CATGGTGTTGTCAGTTAATT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.578.57 chr1 - 2723 10 full-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 351 666 351 -666 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGTCTTTTCATGTATTCAA 350 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.578.58 chr1 - 2301 10 full-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 773 666 773 -666 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGTCTTTTCATGTATTCAA 772 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.578.59 chr1 - 2399 10 full-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 675 666 675 -666 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.012192 0.603382 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGTCTTTTCATGTATTCAA 674 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.578.60 chr1 - 1987 9 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 1779 666 -792 -666 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGTCTTTTCATGTATTCAA 1778 FALSE NA NA GATAAA -38 NA NA NA 9 NA PB.578.61 chr1 - 1839 8 novel_not_in_catalog SFPQ novel 3740 10 NA NA -245 -666 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGTCTTTTCATGTATTCAA 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.578.62 chr1 - 1547 6 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 3779 666 1208 -666 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.279671 0.631410 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGTCTTTTCATGTATTCAA -19 TRUE NA NA AATACA -24 NA NA NA 16 NA PB.578.64 chr1 - 1349 5 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 4075 666 -1028 -666 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 33 8.826821 0.945804 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGTCTTTTCATGTATTCAA 4074 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 33 NA PB.578.65 chr1 - 1209 4 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 5127 666 24 -666 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 29 7.756904 0.889688 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGTCTTTTCATGTATTCAA 5126 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 29 NA PB.578.69 chr1 - 3067 10 full-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 0 673 0 -673 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.617068 0.749510 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACATGAAGTCTTTTCATG -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 21 NA PB.578.70 chr1 - 2919 10 full-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 148 673 148 -673 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACATGAAGTCTTTTCATG 147 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.578.71 chr1 - 2552 10 full-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 515 673 515 -673 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACATGAAGTCTTTTCATG 514 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.578.72 chr1 - 2066 9 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 1693 673 -878 -673 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 37 9.896740 0.995492 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACATGAAGTCTTTTCATG 1692 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 37 NA PB.578.73 chr1 - 1899 8 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 2205 673 -366 -673 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.942274 0.468683 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACATGAAGTCTTTTCATG 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.578.74 chr1 - 1773 8 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 2331 673 -240 -673 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.942274 0.468683 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACATGAAGTCTTTTCATG 11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.578.76 chr1 - 1688 8 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 2416 673 -155 -673 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 43 11.501616 1.060759 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACATGAAGTCTTTTCATG 2415 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 43 NA PB.578.77 chr1 - 1472 6 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 3847 673 -1256 -673 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.617068 0.749510 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACATGAAGTCTTTTCATG 3846 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 21 NA PB.578.78 chr1 - 1136 3 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 5914 673 811 -673 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.617068 0.749510 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACATGAAGTCTTTTCATG 5913 FALSE NA NA AATATA -3 NA NA NA 21 NA PB.578.79 chr1 - 1050 2 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 6080 673 977 -673 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACATGAAGTCTTTTCATG 6079 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.578.81 chr1 - 2920 10 full-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 4 816 4 -816 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TGATCTATCCTTTACTTGAA 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.578.82 chr1 - 1106 4 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 5079 817 -24 -817 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATGATCTATCCTTTACTTGA 5078 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.578.83 chr1 - 1923 9 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 1691 818 -880 -818 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATGATCTATCCTTTACTTG 1690 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.578.84 chr1 - 1367 6 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 3805 820 1234 -820 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CCTATGATCTATCCTTTACT 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.578.85 chr1 - 992 6 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 3828 1172 1257 -1172 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 25 6.686986 0.825230 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTTTGCCATTCATGCTTCT 30 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 25 NA PB.578.86 chr1 - 1567 9 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 1692 1173 -879 -1173 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 53 14.176411 1.151566 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTTTGCCATTCATGCTTC 1691 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 53 NA PB.578.87 chr1 - 648 3 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 5902 1173 799 -1173 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTTTGCCATTCATGCTTC 5901 FALSE NA NA AATATA -15 NA NA NA 2 NA PB.578.90 chr1 - 2554 10 full-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 0 1186 0 -1186 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 37 9.896740 0.995492 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATATTGATCTTCAACTTTG -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 37 NA PB.578.91 chr1 - 2245 11 novel_not_in_catalog SFPQ novel 3740 10 NA NA 0 -1186 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATATTGATCTTCAACTTTG -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.578.92 chr1 - 2254 10 full-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 300 1186 300 -1186 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATATTGATCTTCAACTTTG 299 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.578.93 chr1 - 2120 10 full-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 434 1186 434 -1186 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATATTGATCTTCAACTTTG 433 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.578.94 chr1 - 1915 10 full-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 639 1186 639 -1186 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATATTGATCTTCAACTTTG 638 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.578.95 chr1 - 1681 10 full-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 873 1186 873 -1186 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.547151 0.657739 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATATTGATCTTCAACTTTG 872 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.578.96 chr1 - 1087 7 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 2604 1186 33 -1186 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 19 5.082109 0.706044 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATATTGATCTTCAACTTTG 2603 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.578.97 chr1 - 916 6 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 3890 1186 -1213 -1186 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATATTGATCTTCAACTTTG 3889 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.578.98 chr1 - 830 5 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 4074 1186 -1029 -1186 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.012192 0.603382 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATATTGATCTTCAACTTTG 4073 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.578.99 chr1 - 734 4 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 5082 1186 -21 -1186 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATATTGATCTTCAACTTTG 5081 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.578.100 chr1 - 1840 10 full-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 713 1187 713 -1187 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAATATTGATCTTCAACTTT 712 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.578.101 chr1 - 1352 8 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 2238 1187 -333 -1187 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.617068 0.749510 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAATATTGATCTTCAACTTT 38 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 21 NA PB.578.102 chr1 - 1180 8 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 2410 1187 -161 -1187 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAATATTGATCTTCAACTTT 2409 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.578.104 chr1 - 1814 7 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 0 5134 0 -5134 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAGAGAGGAAGAGATGATGA -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.578.105 chr1 - 968 7 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 846 5134 846 -5134 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAGAGAGGAAGAGATGATGA 845 FALSE NA NA GGGGCT -19 NA NA NA 3 NA PB.578.106 chr1 - 792 6 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 1712 5136 -859 -5136 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AGAAGAGAGGAAGAGATGAT 1711 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.578.107 chr1 - 1640 5 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 0 6318 0 -6318 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAGACAAATTGGAAAGTG -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.580.1 chr1 + 798 4 full-splice_match ZMYM4 ENST00000441447.1 466 4 -349 17 -25 -17 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAATGAAATACAAATTCAA -19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.580.2 chr1 + 729 3 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000314607.11 7366 30 -18 62846 -18 -17 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAATGAAATACAAATTCAA -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.580.3 chr1 + 990 6 novel_in_catalog ZMYM4 novel 7366 30 NA NA -85 2549 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 ACAATGCTCAAGTAAACATT 8 TRUE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.580.7 chr1 + 1363 2 genic RPL5P4 novel 886 1 NA NA -1442 56 multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AACAACAACAACAAAAAACA NA FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.580.8 chr1 + 4626 28 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000314607.11 7366 30 90654 1879 -2342 -1879 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAAGATAGTGAAGTGGT NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.580.13 chr1 + 3429 20 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000314607.11 7366 30 117365 1879 -6606 -1879 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAAGATAGTGAAGTGGT NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 4 NA PB.580.14 chr1 + 4101 17 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000314607.11 7366 30 120259 606 -3712 -606 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGTGTAATAGTCCCCACTA NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.580.15 chr1 + 2692 16 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000314607.11 7366 30 121260 1879 -2711 -1879 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAAGATAGTGAAGTGGT NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.580.18 chr1 + 2061 11 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000457946.1 6003 24 35730 1879 4755 -1879 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAAGATAGTGAAGTGGT 3241 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 6 NA PB.580.19 chr1 + 1897 9 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000457946.1 6003 24 37157 1880 -5982 -1880 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 TAAAAAAGATAGTGAAGTGG 4668 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.580.20 chr1 + 1757 9 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000457946.1 6003 24 37297 1880 -5842 -1880 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 TAAAAAAGATAGTGAAGTGG 4808 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.580.23 chr1 + 1609 7 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000457946.1 6003 24 43329 1880 190 -1880 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 TAAAAAAGATAGTGAAGTGG NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.580.24 chr1 + 3308 7 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000457946.1 6003 24 43395 115 256 -115 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGGGTGAGTTCTTCTTCTT NA FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.580.25 chr1 + 1478 7 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000457946.1 6003 24 43461 1879 322 -1879 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAAGATAGTGAAGTGGT NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 4 NA PB.580.27 chr1 + 3114 5 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000457946.1 6003 24 46301 120 3162 -120 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTTGATGGGTGAGTTCTTC NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.580.28 chr1 + 1256 5 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000457946.1 6003 24 46401 1878 3262 -1878 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGATAGTGAAGTGGTC NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.580.29 chr1 + 1151 4 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000457946.1 6003 24 52317 1879 9178 -1879 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAAGATAGTGAAGTGGT NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 5 NA PB.580.30 chr1 + 2891 4 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000457946.1 6003 24 52335 121 9196 -121 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TATTTGATGGGTGAGTTCTT NA FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.580.31 chr1 + 2244 3 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000457946.1 6003 24 53760 725 10621 -725 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATTCCATCTGTGTTTGTCA NA FALSE NA NA AGTAAA -23 NA NA NA 2 NA PB.580.32 chr1 + 961 3 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000457946.1 6003 24 53888 1880 10749 -1880 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 TAAAAAAGATAGTGAAGTGG NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.580.33 chr1 + 2661 3 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000457946.1 6003 24 53951 117 10812 -117 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGATGGGTGAGTTCTTCTTC NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.580.34 chr1 + 2208 2 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000457946.1 6003 24 56765 484 13626 -484 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AGAAAAAAAAATCTGTATCT NA FALSE NA NA GATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.580.35 chr1 + 2550 2 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000457946.1 6003 24 56792 115 13653 -115 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGGGTGAGTTCTTCTTCTT NA FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 6 NA PB.581.4 chr1 - 4154 21 full-splice_match KIAA0319L ENST00000325722.8 4777 21 10 613 -5 0 alternative_3end TRUE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.581.6 chr1 - 2326 12 incomplete-splice_match KIAA0319L ENST00000325722.8 4777 21 101348 613 -1348 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.581.7 chr1 - 1579 6 incomplete-splice_match KIAA0319L ENST00000373266.8 2377 12 6382 0 -126 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 6389 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.581.8 chr1 - 1417 5 incomplete-splice_match KIAA0319L ENST00000373266.8 2377 12 10413 0 -64 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 9261 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.581.12 chr1 - 2481 13 incomplete-splice_match KIAA0319L ENST00000325722.8 4777 21 96966 777 -5730 -164 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAATAAAAAAAAAAATTA NA FALSE NA NA CATAAA -39 NA NA NA 3 NA PB.581.15 chr1 - 1679 8 incomplete-splice_match KIAA0319L ENST00000373266.8 2377 12 4232 164 -469 -164 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAATAAAAAAAAAAATTA 4239 FALSE NA NA AAAAAG -5 NA NA NA 2 NA PB.581.17 chr1 - 1117 4 incomplete-splice_match KIAA0319L ENST00000373266.8 2377 12 11680 165 228 -165 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAATAAAAAAAAAAATT 4410 FALSE NA NA AAGAAA -24 NA NA NA 2 NA PB.581.23 chr1 - 3110 19 incomplete-splice_match KIAA0319L ENST00000325722.8 4777 21 -13 8752 -11 23 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGATGGATTTTCCTTTGAA 244 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.581.24 chr1 - 2267 13 incomplete-splice_match KIAA0319L ENST00000325722.8 4777 21 13 18143 -2 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.547151 0.657739 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAGAAGGTACCTCTCTGCC 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.581.25 chr1 - 2165 13 incomplete-splice_match KIAA0319L ENST00000426982.6 3213 21 24 16670 -19 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAGAAGGTACCTCTCTGCC 29 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.581.26 chr1 - 1948 11 novel_in_catalog KIAA0319L novel 2171 13 NA NA -7 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAGAAGGTACCTCTCTGCC 248 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.581.27 chr1 - 1740 12 novel_in_catalog KIAA0319L novel 2171 13 NA NA 1 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAGAAGGTACCTCTCTGCC 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.581.28 chr1 - 1166 10 incomplete-splice_match KIAA0319L ENST00000440579.5 2171 13 75998 0 -8083 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAGAAGGTACCTCTCTGCC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.581.29 chr1 - 1832 8 novel_not_in_catalog KIAA0319L novel 1489 6 NA NA 1 2101 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACCCAAGTCACCTCTTGAAT 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.581.30 chr1 - 1768 8 novel_not_in_catalog KIAA0319L novel 1489 6 NA NA -11 2101 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACCCAAGTCACCTCTTGAAT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.582.1 chr1 + 4745 7 incomplete-splice_match NCDN ENST00000356090.8 3433 8 -2 7 -2 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACGAGAAGCCTCCTGCGTGG -25 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.582.2 chr1 + 3895 8 novel_in_catalog NCDN novel 3433 8 NA NA -2 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AAGCCTCCTGCGTGGTCTGC -25 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.582.3 chr1 + 3421 8 full-splice_match NCDN ENST00000356090.8 3433 8 5 7 -2 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 46 12.304054 1.090048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACGAGAAGCCTCCTGCGTGG -18 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 46 NA PB.582.5 chr1 + 3681 8 novel_in_catalog NCDN novel 3433 8 NA NA 1 2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAGAAGCCTCCTGCGTGGTC -15 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.582.6 chr1 + 3562 8 novel_not_in_catalog NCDN novel 3433 8 NA NA 1 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GACGAGAAGCCTCCTGCGTG -15 TRUE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.582.8 chr1 + 3684 7 full-splice_match NCDN ENST00000373243.7 3698 7 7 7 7 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACGAGAAGCCTCCTGCGTGG -9 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 6 NA PB.582.9 chr1 + 2540 5 incomplete-splice_match NCDN ENST00000373243.7 3698 7 3111 8 -1558 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GACGAGAAGCCTCCTGCGTG 330 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.582.10 chr1 + 2412 5 incomplete-splice_match NCDN ENST00000373243.7 3698 7 3240 7 -1429 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACGAGAAGCCTCCTGCGTGG 459 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.582.11 chr1 + 2143 4 incomplete-splice_match NCDN ENST00000373243.7 3698 7 4604 9 -65 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGACGAGAAGCCTCCTGCGT 1823 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.582.12 chr1 + 2064 4 incomplete-splice_match NCDN ENST00000373243.7 3698 7 4685 7 16 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACGAGAAGCCTCCTGCGTGG 1904 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 3 NA PB.582.13 chr1 + 1896 3 incomplete-splice_match NCDN ENST00000373243.7 3698 7 5423 5 754 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAGAAGCCTCCTGCGTGGTC 2642 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.582.14 chr1 + 1766 3 incomplete-splice_match NCDN ENST00000373243.7 3698 7 5551 7 882 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACGAGAAGCCTCCTGCGTGG 2770 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 4 NA PB.582.15 chr1 + 1603 2 incomplete-splice_match NCDN ENST00000373243.7 3698 7 6052 9 1383 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGACGAGAAGCCTCCTGCGT 3271 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.583.1 chr1 - 895 3 full-splice_match TFAP2E-AS1 ENST00000444348.2 902 3 -4 11 -4 -5 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACACATCAATGGATGGTG -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.584.4 chr1 - 2367 6 full-splice_match PSMB2 ENST00000373237.4 4426 6 17 2042 17 1051 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTGGGTGTCTTATACACT 24 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.584.12 chr1 - 2160 6 full-splice_match PSMB2 ENST00000373237.4 4426 6 -14 2280 -14 813 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATGTGTGTTTCAGAATGT -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.584.20 chr1 - 1737 7 novel_not_in_catalog PSMB2 novel 4426 6 NA NA 7 810 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACCAGATGTGTGTTTCAGAA 14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.584.24 chr1 - 746 6 novel_not_in_catalog PSMB2 novel 4426 6 NA NA 7 -505 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCCCTCTGGTCCAGGTCTC 14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.584.25 chr1 - 764 6 full-splice_match PSMB2 ENST00000373237.4 4426 6 64 3598 64 -505 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.477233 0.541234 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCCCTCTGGTCCAGGTCTC 71 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.584.26 chr1 - 862 6 full-splice_match PSMB2 ENST00000373237.4 4426 6 -35 3599 -35 -506 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 565 151.125885 2.179339 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GAGCCCTCTGGTCCAGGTCT -28 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 565 NA PB.584.27 chr1 - 662 6 full-splice_match PSMB2 ENST00000373237.4 4426 6 165 3599 165 -506 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GAGCCCTCTGGTCCAGGTCT 172 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.584.28 chr1 - 678 6 novel_not_in_catalog PSMB2 novel 4426 6 NA NA -8 -507 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGAGCCCTCTGGTCCAGGTC -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.585.1 chr1 - 2840 2 full-splice_match C1orf216 ENST00000270815.5 2628 2 -211 -1 -201 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTTCTTGAGTATGTGTTTT 7055 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.585.4 chr1 - 2951 2 full-splice_match C1orf216 ENST00000270815.5 2628 2 -330 7 -320 -7 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAATTACATTTCTTGAGTA 6936 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.585.5 chr1 - 2600 2 full-splice_match C1orf216 ENST00000270815.5 2628 2 21 7 21 -7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 46 12.304054 1.090048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAATTACATTTCTTGAGTA 11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 46 NA PB.586.2 chr1 - 4006 13 incomplete-splice_match CLSPN ENST00000373220.7 3977 24 21323 -2166 169 2042 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTTGAATGCTCATTCTTG NA FALSE NA NA AAGAAA -43 NA NA NA 2 NA PB.586.3 chr1 - 3528 11 incomplete-splice_match CLSPN ENST00000373220.7 3977 24 23044 -2152 1890 2028 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGATTTGCTGTCCAGCTTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.586.10 chr1 - 3669 16 incomplete-splice_match CLSPN ENST00000373220.7 3977 24 18535 -1442 -2619 1318 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATCATTCTCCATTTTCCCTG 9155 FALSE NA NA TTTAAA -24 NA NA NA 2 NA PB.586.13 chr1 - 2035 10 incomplete-splice_match CLSPN ENST00000318121.8 8512 25 4646 17675 4596 -2822 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAGAAATAGAAACAAAAGAT 4646 FALSE NA NA AATATA -39 NA NA NA 8 NA PB.586.18 chr1 - 1424 8 incomplete-splice_match CLSPN ENST00000318121.8 8512 25 6704 17675 6654 -2822 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAGAAATAGAAACAAAAGAT 6704 FALSE NA NA ATTAAA -25 NA NA NA 9 NA PB.586.19 chr1 - 1267 7 incomplete-splice_match CLSPN ENST00000318121.8 8512 25 7539 17675 7489 -2822 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAGAAATAGAAACAAAAGAT 7539 FALSE NA NA AATGAA -41 NA NA NA 9 NA PB.586.20 chr1 - 1135 5 incomplete-splice_match CLSPN ENST00000318121.8 8512 25 8797 17675 8747 -2822 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAGAAATAGAAACAAAAGAT 8797 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.586.24 chr1 - 2104 10 incomplete-splice_match CLSPN ENST00000520551.1 4010 25 -66 14893 -16 -4333 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 GAAGAGGAGGAGAAAGAAGA -16 TRUE NA NA GGGGCT -9 NA NA NA 9 NA PB.586.25 chr1 - 1402 8 incomplete-splice_match CLSPN ENST00000520551.1 4010 25 5608 14944 5608 -4384 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 GAAGATGGAGAAGAGAAGGT 5658 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.586.30 chr1 - 1387 5 incomplete-splice_match CLSPN ENST00000373220.7 3977 24 6707 23447 6707 -12887 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 6757 FALSE NA NA AAAAAG -8 NA NA NA 2 NA PB.594.2 chr1 + 1732 6 incomplete-splice_match AGO3 ENST00000373191.9 19660 19 -15 67423 -5 21668 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAATAAAAATAAAAATAA -23 TRUE NA NA GATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.594.4 chr1 + 3262 19 full-splice_match AGO3 ENST00000373191.9 19660 19 27 16371 27 -110 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATCAAAGTGATTTTTCAGAA 19 TRUE NA NA AGTAAA -45 NA NA NA 6 NA PB.594.6 chr1 + 1571 6 incomplete-splice_match AGO3 ENST00000373191.9 19660 19 146 67423 -7 21668 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAATAAAAATAAAAATAA 17 TRUE NA NA GATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.594.7 chr1 + 3085 19 full-splice_match AGO3 ENST00000373191.9 19660 19 180 16395 27 -134 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAATACACACCTTCATG 51 FALSE NA NA AGTAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.594.13 chr1 + 1128 5 incomplete-splice_match AGO3 ENST00000634486.1 3599 21 108753 49 -3416 -49 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAAGGTGTCTGTGTATTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.597.1 chr1 - 1349 1 full-splice_match ENSG00000271914 ENST00000606838.1 396 1 -954 1 -954 -1 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA NA NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACATCTGACTCCAATTCTTA -22 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.598.1 chr1 + 1665 6 full-splice_match ADPRS ENST00000373178.5 1651 6 -15 1 -15 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 371 99.234879 1.996664 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCACTGTTTCTTGTTTCTC -17 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 371 NA PB.598.2 chr1 + 1738 5 novel_in_catalog ADPRS novel 1651 6 NA NA -4 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCACTGTTTCTTGTTTCTC -6 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.598.3 chr1 + 1557 5 novel_in_catalog ADPRS novel 1651 6 NA NA -4 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.942274 0.468683 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCACTGTTTCTTGTTTCTC -6 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 11 NA PB.598.5 chr1 + 1300 4 incomplete-splice_match ADPRS ENST00000373178.5 1651 6 2748 8 2748 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATCTCACCACTGTTTCTT 2746 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 7 NA PB.598.6 chr1 + 973 3 incomplete-splice_match ADPRS ENST00000373178.5 1651 6 3166 1 3166 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCACTGTTTCTTGTTTCTC 3164 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 4 NA PB.599.4 chr1 + 3232 16 novel_in_catalog MAP7D1 novel 3324 17 NA NA 3 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCCTGCCTGTTCTTGGAG 4 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.599.5 chr1 + 3244 18 novel_in_catalog MAP7D1 novel 3238 18 NA NA 3 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCCTGCCTGTTCTTGGAG 4 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.599.8 chr1 + 3334 17 novel_in_catalog MAP7D1 novel 3372 17 NA NA -7 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CAATCCTGCCTGTTCTTGGA 9 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 4 NA PB.599.9 chr1 + 3239 16 full-splice_match MAP7D1 ENST00000316156.8 3456 16 215 2 5 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 23 6.152027 0.789018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCCTGCCTGTTCTTGGAG 21 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 23 NA PB.599.10 chr1 + 3350 17 full-splice_match MAP7D1 ENST00000474796.2 3372 17 20 2 5 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 51 13.641452 1.134861 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCCTGCCTGTTCTTGGAG 21 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 51 NA PB.599.11 chr1 + 3253 18 full-splice_match MAP7D1 ENST00000373150.8 3238 18 -17 2 6 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 25 6.686986 0.825230 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCCTGCCTGTTCTTGGAG 22 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 25 NA PB.599.12 chr1 + 3142 17 novel_in_catalog MAP7D1 novel 3238 18 NA NA 6 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCCTGCCTGTTCTTGGAG 22 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 8 NA PB.599.13 chr1 + 3101 18 full-splice_match MAP7D1 ENST00000373150.8 3238 18 135 2 131 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCCTGCCTGTTCTTGGAG 88 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.599.14 chr1 + 2575 16 novel_in_catalog MAP7D1 novel 3238 18 NA NA -712 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCTGCCTGTTCTTGGAGC 98 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.599.15 chr1 + 2283 13 novel_in_catalog MAP7D1 novel 3238 18 NA NA 1394 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCCTGCCTGTTCTTGGAG 808 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.599.16 chr1 + 2377 12 incomplete-splice_match MAP7D1 ENST00000316156.8 3456 16 17399 2 1396 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCCTGCCTGTTCTTGGAG 810 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.599.17 chr1 + 2396 13 incomplete-splice_match MAP7D1 ENST00000474796.2 3372 17 17296 2 1488 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCCTGCCTGTTCTTGGAG 902 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 5 NA PB.599.18 chr1 + 2171 11 incomplete-splice_match MAP7D1 ENST00000474796.2 3372 17 20130 2 -427 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCCTGCCTGTTCTTGGAG 3736 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.599.19 chr1 + 1954 11 incomplete-splice_match MAP7D1 ENST00000373150.8 3238 18 20309 2 -210 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCCTGCCTGTTCTTGGAG 3953 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.599.20 chr1 + 1840 10 incomplete-splice_match MAP7D1 ENST00000373150.8 3238 18 20538 2 19 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCCTGCCTGTTCTTGGAG 206 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 7 NA PB.599.21 chr1 + 1526 9 incomplete-splice_match MAP7D1 ENST00000373150.8 3238 18 21882 2 -331 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCCTGCCTGTTCTTGGAG 577 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 10 NA PB.599.22 chr1 + 1364 8 incomplete-splice_match MAP7D1 ENST00000373148.5 1797 10 990 -15 48 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCCTGCCTGTTCTTGGAG 185 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 9 NA PB.599.23 chr1 + 1161 7 incomplete-splice_match MAP7D1 ENST00000373148.5 1797 10 1281 -15 -271 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 33 8.826821 0.945804 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCCTGCCTGTTCTTGGAG 270 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 33 NA PB.599.24 chr1 + 1032 6 incomplete-splice_match MAP7D1 ENST00000373148.5 1797 10 1507 -15 -45 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCCTGCCTGTTCTTGGAG 496 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 5 NA PB.599.25 chr1 + 954 5 incomplete-splice_match MAP7D1 ENST00000373148.5 1797 10 1821 -15 269 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCCTGCCTGTTCTTGGAG 156 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 8 NA PB.599.26 chr1 + 880 3 incomplete-splice_match MAP7D1 ENST00000487114.1 890 4 650 -532 650 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCCTGCCTGTTCTTGGAG 537 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 6 NA PB.600.1 chr1 - 1754 4 novel_in_catalog TRAPPC3 novel 1282 5 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCATGTCCTGTTTTCTTTC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.600.2 chr1 - 1181 4 novel_in_catalog TRAPPC3 novel 1282 5 NA NA 0 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCATGTCCTGTTTTCTTTC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.600.3 chr1 - 1543 5 full-splice_match TRAPPC3 ENST00000373162.5 1056 5 -7 -480 -7 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 53 14.176411 1.151566 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCATGTCCTGTTTTCTTT -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 53 NA PB.600.5 chr1 - 1291 5 full-splice_match TRAPPC3 ENST00000373166.8 1282 5 -18 9 -7 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 629 168.244568 2.225941 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATCCCAATCATGTCCTGT -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 629 NA PB.600.6 chr1 - 1279 5 novel_not_in_catalog TRAPPC3 novel 1282 5 NA NA -5 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCATGTCCTGTTTTCTTT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.600.7 chr1 - 1310 5 full-splice_match TRAPPC3 ENST00000373162.5 1056 5 226 -480 16 -2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCATGTCCTGTTTTCTTT 6680 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.600.8 chr1 - 1022 3 incomplete-splice_match TRAPPC3 ENST00000373166.8 1282 5 9677 2 1189 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCATGTCCTGTTTTCTTT 9677 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.600.9 chr1 - 899 2 full-splice_match TRAPPC3 ENST00000469757.1 221 2 10 -688 0 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCATGTCCTGTTTTCTTT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.600.10 chr1 - 1552 5 novel_in_catalog TRAPPC3 novel 1336 5 NA NA 0 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATCCCAATCATGTCCTGT -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.600.11 chr1 - 1297 5 full-splice_match TRAPPC3 ENST00000616395.4 1336 5 28 11 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.012192 0.603382 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATCCCAATCATGTCCTGT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.600.12 chr1 - 1080 3 full-splice_match TRAPPC3 ENST00000616074.4 1114 3 23 11 -5 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.477233 0.541234 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATCCCAATCATGTCCTGT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.600.13 chr1 - 905 2 incomplete-splice_match TRAPPC3 ENST00000373166.8 1282 5 11528 9 3040 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATCCCAATCATGTCCTGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.600.14 chr1 - 734 5 full-splice_match TRAPPC3 ENST00000373166.8 1282 5 88 460 53 22 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACCCCATGTGTGCACATTCA 6553 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.600.15 chr1 - 1063 5 full-splice_match TRAPPC3 ENST00000373162.5 1056 5 11 -18 0 18 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATTTACCCCATGTGTGCACA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.600.16 chr1 - 816 5 full-splice_match TRAPPC3 ENST00000373166.8 1282 5 0 466 0 16 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 62 16.583725 1.219682 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CCATTTACCCCATGTGTGCA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 62 NA PB.602.1 chr1 - 872 3 full-splice_match EVA1B ENST00000490466.2 980 3 107 1 107 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTCAGTCTCTCCCTCTGTT 567 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.603.1 chr1 - 2440 2 incomplete-splice_match STK40 ENST00000373129.7 3846 12 42435 -4 17891 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GCCTGCGTCTCCTGCCTTCT 5669 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.603.5 chr1 - 2924 7 incomplete-splice_match STK40 ENST00000373129.7 3846 12 30622 2 6078 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTGTGGCCTGCGTCTCCTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.603.8 chr1 - 3619 11 full-splice_match STK40 ENST00000373132.4 3645 11 24 2 -12 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.012192 0.603382 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AACCACTGTGGCCTGCGTCT 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.603.13 chr1 - 3381 10 incomplete-splice_match STK40 ENST00000373130.7 3628 11 24622 7 74 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAACCACTGTGGCCTGCGTC 5161 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.603.14 chr1 - 2512 3 incomplete-splice_match STK40 ENST00000373129.7 3846 12 41941 7 17397 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAACCACTGTGGCCTGCGTC 5175 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.603.15 chr1 - 2652 4 incomplete-splice_match STK40 ENST00000373129.7 3846 12 41660 8 17116 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GGAACCACTGTGGCCTGCGT 4894 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.603.17 chr1 - 3213 8 incomplete-splice_match STK40 ENST00000373129.7 3846 12 27521 9 2977 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGGAACCACTGTGGCCTGCG 8064 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.604.1 chr1 - 882 2 full-splice_match LSM10 ENST00000315732.3 860 2 -6 -16 -6 16 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 129 34.504848 1.537880 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCCATTTCTCATGCAGTTGT -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 129 NA PB.605.1 chr1 - 1476 10 full-splice_match OSCP1 ENST00000235532.9 1455 10 -23 2 -23 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 19 5.082109 0.706044 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GACCTTTCCCATTTTATTCT 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.605.2 chr1 - 764 5 full-splice_match OSCP1 ENST00000354267.3 767 5 -3 6 -3 -6 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGAAATGCAATGTATTTAG -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.606.2 chr1 + 2402 9 incomplete-splice_match THRAP3 ENST00000354618.10 4405 12 -33 8718 -22 2470 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAACATAAGGAGAGAGA 13 FALSE NA NA AATACA -42 NA NA NA 3 NA PB.606.3 chr1 + 2011 6 incomplete-splice_match THRAP3 ENST00000354618.10 4405 12 -14 13929 -3 -2741 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.012192 0.603382 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AACAAAAAGGAACAGGAGTT -22 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.606.6 chr1 + 2500 9 incomplete-splice_match THRAP3 ENST00000354618.10 4405 12 -12 8599 -1 2589 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAGAAACAGAAGTACGTAA -20 TRUE NA NA CATAAA -6 NA NA NA 4 NA PB.606.14 chr1 + 4403 12 full-splice_match THRAP3 ENST00000354618.10 4405 12 -1 3 -1 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.012192 0.603382 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAACGGGTTCTGTTCATTGT -9 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 15 NA PB.606.33 chr1 + 2916 8 novel_not_in_catalog THRAP3 novel 4405 12 NA NA -413 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAAACGGGTTCTGTTCATTG NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.606.35 chr1 + 2807 8 incomplete-splice_match THRAP3 ENST00000354618.10 4405 12 64975 3 -300 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAACGGGTTCTGTTCATTGT NA FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.606.37 chr1 + 2560 8 incomplete-splice_match THRAP3 ENST00000354618.10 4405 12 65222 3 -53 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAACGGGTTCTGTTCATTGT NA FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 3 NA PB.606.38 chr1 + 2420 7 incomplete-splice_match THRAP3 ENST00000354618.10 4405 12 66971 3 1696 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAACGGGTTCTGTTCATTGT NA FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 5 NA PB.606.39 chr1 + 1464 6 novel_not_in_catalog THRAP3 novel 4405 12 NA NA 2915 421 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGTTTGGGACCAAACTGCTT NA FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.606.40 chr1 + 2134 5 incomplete-splice_match THRAP3 ENST00000354618.10 4405 12 69449 3 4174 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.012192 0.603382 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAACGGGTTCTGTTCATTGT NA FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 15 NA PB.606.41 chr1 + 1933 4 novel_not_in_catalog THRAP3 novel 4405 12 NA NA 7019 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAACGGGTTCTGTTCATTGT 745 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 5 NA PB.606.42 chr1 + 1723 3 novel_not_in_catalog THRAP3 novel 4405 12 NA NA 11344 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAACGGGTTCTGTTCATTGT 278 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 4 NA PB.607.1 chr1 - 1336 8 full-splice_match MRPS15 ENST00000373116.6 953 8 13 -396 13 396 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.477233 0.541234 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGCTGAAGTGTGAGAAGCT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.607.2 chr1 - 951 8 full-splice_match MRPS15 ENST00000373116.6 953 8 0 2 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 325 86.930817 1.939174 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGAGGAGAAGGAATTTATT -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 325 NA PB.607.3 chr1 - 751 6 novel_in_catalog MRPS15 novel 953 8 NA NA 13 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TTCTTTCTGTCTTGAAGAAT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.607.4 chr1 - 1191 7 incomplete-splice_match MRPS15 ENST00000373116.6 953 8 0 57 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTCTTTCTGTCTTGAAGA -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.608.1 chr1 - 3007 17 full-splice_match CSF3R ENST00000373106.6 3008 17 0 1 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.477233 0.541234 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACCTGAGTCTCTGTTATTTA 8 TRUE NA NA GGGGCT -14 NA NA NA 13 NA PB.608.2 chr1 - 2941 17 novel_not_in_catalog CSF3R novel 3008 17 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACCTGAGTCTCTGTTATTTA 8 TRUE NA NA GGGGCT -14 NA NA NA 2 NA PB.608.3 chr1 - 1813 9 incomplete-splice_match CSF3R ENST00000361632.8 2847 15 7394 0 262 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACCTGAGTCTCTGTTATTTA 4620 FALSE NA NA GGGGCT -35 NA NA NA 2 NA PB.608.4 chr1 - 2522 14 novel_not_in_catalog CSF3R novel 2847 15 NA NA -61 4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTTTTTGTTGTTGTTTATA 7840 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.608.5 chr1 - 1443 7 incomplete-splice_match CSF3R ENST00000361632.8 2847 15 9740 35 1695 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTTTTTGTTGTTGTTTATA 6966 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.608.6 chr1 - 1254 6 incomplete-splice_match CSF3R ENST00000361632.8 2847 15 10323 35 -1120 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTTTTTGTTGTTGTTTATA 7549 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.608.7 chr1 - 2165 12 incomplete-splice_match CSF3R ENST00000373106.6 3008 17 0 2707 0 -2 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAATAAATAAATAAATAA 8 TRUE NA NA GGGGCT -14 NA NA NA 5 NA PB.608.8 chr1 - 1642 9 full-splice_match CSF3R ENST00000464365.2 1659 9 15 2 15 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAATAAATAAATAAATAA 7916 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.611.1 chr1 - 1386 3 full-splice_match LINC01137 ENST00000424989.2 1419 3 28 5 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 25 6.686986 0.825230 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCAGTTATTTTTCTCTGC -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 25 NA PB.611.2 chr1 - 1296 2 full-splice_match LINC01137 ENST00000689160.1 1306 2 5 5 -3 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCAGTTATTTTTCTCTGC -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.611.3 chr1 - 1380 3 novel_in_catalog LINC01137 novel 1419 3 NA NA -7 -3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAAGCAGTTATTTTTCTCTG -28 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.612.2 chr1 - 1745 3 incomplete-splice_match MEAF6 ENST00000373074.5 2005 6 12297 -745 11548 9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTTTTGACTCTGGCTATTTA NA FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.612.3 chr1 - 2121 7 full-splice_match MEAF6 ENST00000296214.10 4702 7 3 2578 0 4 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 30 8.024384 0.904412 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTTTTTTTTTGACTCTGGCT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 30 NA PB.612.5 chr1 - 1082 3 incomplete-splice_match MEAF6 ENST00000373074.5 2005 6 12350 -135 11601 135 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATGGCATATGGAAAGTCTCA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.612.6 chr1 - 1835 7 full-splice_match MEAF6 ENST00000296214.10 4702 7 -326 3193 -326 125 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAATCACCATGGCATATG NA FALSE NA NA AGTAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.612.7 chr1 - 1555 8 full-splice_match MEAF6 ENST00000475828.5 1408 8 2 -149 2 125 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAATCACCATGGCATATG 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.612.8 chr1 - 1564 7 full-splice_match MEAF6 ENST00000296214.10 4702 7 -55 3193 -55 125 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 33 8.826821 0.945804 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAATCACCATGGCATATG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 33 NA PB.612.9 chr1 - 1506 7 full-splice_match MEAF6 ENST00000296214.10 4702 7 3 3193 0 125 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 185 49.483696 1.694462 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAATCACCATGGCATATG -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 185 NA PB.612.10 chr1 - 1533 2 incomplete-splice_match MEAF6 ENST00000373074.5 2005 6 17774 -125 17025 125 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAATCACCATGGCATATG NA FALSE NA NA AATAAA -7 NA NA NA 2 NA PB.612.11 chr1 - 1421 7 full-splice_match MEAF6 ENST00000296214.10 4702 7 88 3193 -11 125 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAATCACCATGGCATATG 84 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.612.12 chr1 - 1209 7 novel_in_catalog MEAF6 novel 4702 7 NA NA -3 125 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAATCACCATGGCATATG 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.612.13 chr1 - 1188 6 full-splice_match MEAF6 ENST00000373073.8 603 6 -9 -576 -6 125 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.209753 0.506472 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAATCACCATGGCATATG -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.612.14 chr1 - 1177 4 incomplete-splice_match MEAF6 ENST00000373074.5 2005 6 4964 -125 4215 125 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAATCACCATGGCATATG 5457 FALSE NA NA AAGAAA -23 NA NA NA 9 NA PB.612.15 chr1 - 961 2 incomplete-splice_match MEAF6 ENST00000373074.5 2005 6 18346 -125 17597 125 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAATCACCATGGCATATG NA FALSE NA NA GATAAA -37 NA NA NA 2 NA PB.612.17 chr1 - 1106 7 novel_in_catalog MEAF6 novel 2147 8 NA NA 0 18 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACCCGAGATTGTTTTTTC -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.612.18 chr1 - 1407 7 full-splice_match MEAF6 ENST00000296214.10 4702 7 -6 3301 -6 17 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 298 79.708878 1.901507 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAACCCGAGATTGTTTTTT -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 298 NA PB.612.19 chr1 - 896 3 incomplete-splice_match MEAF6 ENST00000373074.5 2005 6 12418 -17 11669 17 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAACCCGAGATTGTTTTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.612.20 chr1 - 1343 6 novel_in_catalog MEAF6 novel 4702 7 NA NA 2 5 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATGCTTTACTTTTAAACCCG 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.612.21 chr1 - 1299 7 full-splice_match MEAF6 ENST00000296214.10 4702 7 90 3313 -9 5 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATGCTTTACTTTTAAACCCG 86 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.612.22 chr1 - 1466 8 novel_not_in_catalog MEAF6 novel 2147 8 NA NA -3 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATTCTCATGCTTTACTTT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.612.23 chr1 - 1428 8 full-splice_match MEAF6 ENST00000475828.5 1408 8 1 -21 1 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 28 7.489425 0.874448 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATTCTCATGCTTTACTTT 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 28 NA PB.612.24 chr1 - 1049 6 full-splice_match MEAF6 ENST00000373073.8 603 6 2 -448 2 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATTCTCATGCTTTACTTT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.612.25 chr1 - 1124 5 incomplete-splice_match MEAF6 ENST00000373074.5 2005 6 4758 3 4009 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATTCTCATGCTTTACTTT 5251 FALSE NA NA AAGAAA -3 NA NA NA 8 NA PB.612.26 chr1 - 937 3 incomplete-splice_match MEAF6 ENST00000373074.5 2005 6 12357 3 11608 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATTCTCATGCTTTACTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.612.27 chr1 - 1292 7 full-splice_match MEAF6 ENST00000296214.10 4702 7 7 3403 -3 2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAATGGAAAAACATAAGT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.612.28 chr1 - 1186 7 full-splice_match MEAF6 ENST00000296214.10 4702 7 3 3513 0 -108 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAATGGGAAACTTGCCTC -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.612.29 chr1 - 1019 7 full-splice_match MEAF6 ENST00000296214.10 4702 7 -18 3701 -18 68 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAATATCTGGCATTTTCTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.613.1 chr1 - 1771 2 full-splice_match SNIP1 ENST00000638725.1 2761 2 1144 -154 1144 154 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATTTCAAAGAGTAATGCTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.613.10 chr1 - 2099 4 full-splice_match SNIP1 ENST00000296215.8 4554 4 3 2452 0 -211 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGACAGCGTTCTTTCTTTAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.614.1 chr1 - 2382 16 full-splice_match GNL2 ENST00000373062.8 2350 16 0 -32 0 32 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 447 119.563316 2.077598 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACATTTCTAAGGCCCTAATG 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 447 NA PB.614.2 chr1 - 3503 4 full-splice_match GNL2 ENST00000462812.5 2409 4 -1094 0 -1094 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGTTAGAAATTGTGTTTTCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.614.3 chr1 - 2335 15 novel_not_in_catalog GNL2 novel 2350 16 NA NA 0 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGTTAGAAATTGTGTTTTCT 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.614.4 chr1 - 2160 15 incomplete-splice_match GNL2 ENST00000373062.8 2350 16 2101 1 256 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGTTAGAAATTGTGTTTTCT 2104 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.614.5 chr1 - 2048 14 incomplete-splice_match GNL2 ENST00000373062.8 2350 16 3168 1 1323 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.942274 0.468683 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGTTAGAAATTGTGTTTTCT 3171 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.614.6 chr1 - 1432 9 incomplete-splice_match GNL2 ENST00000373062.8 2350 16 13608 1 480 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGTTAGAAATTGTGTTTTCT NA FALSE NA NA AAAACA -23 NA NA NA 2 NA PB.614.7 chr1 - 773 4 full-splice_match GNL2 ENST00000462812.5 2409 4 1636 0 -840 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGTTAGAAATTGTGTTTTCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.614.8 chr1 - 2519 16 novel_not_in_catalog GNL2 novel 2350 16 NA NA 0 1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GGCAGTTAGAAATTGTGTTT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.614.9 chr1 - 869 5 incomplete-splice_match GNL2 ENST00000373062.8 2350 16 21535 10 -3509 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACAGGCAGTTAGAAATT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.614.10 chr1 - 2543 17 novel_in_catalog GNL2 novel 2350 16 NA NA 0 -6 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.279671 0.631410 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAACAGGCAGTTAGAAAT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.614.11 chr1 - 1912 13 incomplete-splice_match GNL2 ENST00000373062.8 2350 16 5160 11 3315 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.744712 0.573418 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAACAGGCAGTTAGAAAT 5163 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.614.12 chr1 - 1775 12 incomplete-splice_match GNL2 ENST00000373062.8 2350 16 8507 11 -4084 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAACAGGCAGTTAGAAAT 8510 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.614.13 chr1 - 1529 10 incomplete-splice_match GNL2 ENST00000373062.8 2350 16 13060 11 46 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAACAGGCAGTTAGAAAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.614.14 chr1 - 1296 8 incomplete-splice_match GNL2 ENST00000373062.8 2350 16 19400 11 -5644 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.012192 0.603382 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAACAGGCAGTTAGAAAT NA FALSE NA NA AATACA -12 NA NA NA 15 NA PB.614.15 chr1 - 1148 7 incomplete-splice_match GNL2 ENST00000373062.8 2350 16 20276 11 -4768 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAACAGGCAGTTAGAAAT NA FALSE NA NA AATATA -22 NA NA NA 5 NA PB.614.16 chr1 - 1081 6 incomplete-splice_match GNL2 ENST00000373062.8 2350 16 21114 11 -3930 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAACAGGCAGTTAGAAAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.614.17 chr1 - 969 6 incomplete-splice_match GNL2 ENST00000373062.8 2350 16 21226 11 -3818 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAACAGGCAGTTAGAAAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.614.19 chr1 - 1646 11 incomplete-splice_match GNL2 ENST00000373062.8 2350 16 5111 1501 3266 -1496 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAGAACAAAGAAAAACACTG 5114 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 7 NA PB.614.21 chr1 - 1107 7 incomplete-splice_match GNL2 ENST00000373062.8 2350 16 13608 1501 480 -1496 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAGAACAAAGAAAAACACTG NA FALSE NA NA AAAACA -23 NA NA NA 3 NA PB.614.24 chr1 - 1272 10 incomplete-splice_match GNL2 ENST00000373062.8 2350 16 -12 8777 -12 2 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAGTATTTGGCCCTGATAGG -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.615.1 chr1 + 2761 6 novel_not_in_catalog ZC3H12A novel 2721 6 NA NA -28 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGAGGTGATTGTCTTTGTT 36 FALSE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 2 NA PB.615.2 chr1 + 3247 5 novel_not_in_catalog ZC3H12A novel 2721 6 NA NA 0 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGAGGTGATTGTCTTTGTT 0 TRUE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 3 NA PB.615.3 chr1 + 2848 5 incomplete-splice_match ZC3H12A ENST00000373087.7 2654 6 0 2 0 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGAGGTGATTGTCTTTGTT 0 TRUE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 2 NA PB.615.4 chr1 + 2649 6 novel_not_in_catalog ZC3H12A novel 2654 6 NA NA 0 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 29 7.756904 0.889688 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGAGGTGATTGTCTTTGTT 0 TRUE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 29 NA PB.615.5 chr1 + 2406 4 incomplete-splice_match ZC3H12A ENST00000373087.7 2654 6 5416 11 -3 6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGCCCTTTCAAGAGGTGATT 0 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.616.2 chr1 + 2398 10 full-splice_match CDCA8 ENST00000373055.6 2371 10 -37 10 -2 -4 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 228 60.985313 1.785225 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TCTTTTGTAATCACTGTTCA -4 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 228 NA PB.616.3 chr1 + 2298 11 full-splice_match CDCA8 ENST00000327331.2 2303 11 8 -3 8 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 96 25.678026 1.409562 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAATCACTGTTCATCCTGCC 6 TRUE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 96 NA PB.616.4 chr1 + 2248 10 full-splice_match CDCA8 ENST00000373055.6 2371 10 -20 143 15 -137 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 54 14.443891 1.159684 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGTATTCTTTTAAGTTCTTT 13 TRUE NA NA AGTAAA -17 NA NA NA 54 NA PB.616.5 chr1 + 2132 11 full-splice_match CDCA8 ENST00000327331.2 2303 11 15 156 15 -156 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.547151 0.657739 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAACAGTCCTGTTCAAGTT 13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.616.8 chr1 + 2240 9 novel_in_catalog CDCA8 novel 2371 10 NA NA 2 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATCACTGTTCATCCTGCCT -18 TRUE NA NA AATAAA -25 NA NA NA 4 NA PB.616.9 chr1 + 1984 8 novel_in_catalog CDCA8 novel 2303 11 NA NA 8 -3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAATCACTGTTCATCCTGCC -12 TRUE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 2 NA PB.616.10 chr1 + 2159 10 full-splice_match CDCA8 ENST00000373055.6 2371 10 202 10 202 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TCTTTTGTAATCACTGTTCA 182 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 7 NA PB.616.11 chr1 + 2063 9 novel_in_catalog CDCA8 novel 2371 10 NA NA 209 -3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAATCACTGTTCATCCTGCC 189 FALSE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 3 NA PB.616.12 chr1 + 2062 9 incomplete-splice_match CDCA8 ENST00000373055.6 2371 10 426 3 426 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAATCACTGTTCATCCTGCC 406 FALSE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 2 NA PB.616.13 chr1 + 1825 8 incomplete-splice_match CDCA8 ENST00000373055.6 2371 10 3402 140 3402 -134 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTCTTTTAAGTTCTTTTAT 2960 FALSE NA NA AGTAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.616.14 chr1 + 1952 8 incomplete-splice_match CDCA8 ENST00000373055.6 2371 10 3413 2 3413 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATCACTGTTCATCCTGCCT 2971 FALSE NA NA AATAAA -25 NA NA NA 5 NA PB.616.16 chr1 + 1694 6 incomplete-splice_match CDCA8 ENST00000373055.6 2371 10 7923 162 7923 -156 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAACAGTCCTGTTCAAGTT 1460 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.616.17 chr1 + 1848 6 incomplete-splice_match CDCA8 ENST00000373055.6 2371 10 7928 3 7928 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAATCACTGTTCATCCTGCC 1465 FALSE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 5 NA PB.616.18 chr1 + 1548 4 incomplete-splice_match CDCA8 ENST00000373055.6 2371 10 10734 162 10734 -156 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAACAGTCCTGTTCAAGTT 4271 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.616.19 chr1 + 1664 4 incomplete-splice_match CDCA8 ENST00000373055.6 2371 10 10777 3 10777 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.547151 0.657739 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAATCACTGTTCATCCTGCC 4314 FALSE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 17 NA PB.616.20 chr1 + 1543 3 incomplete-splice_match CDCA8 ENST00000373055.6 2371 10 12991 3 12991 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAATCACTGTTCATCCTGCC 6528 FALSE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 7 NA PB.616.21 chr1 + 1297 2 incomplete-splice_match CDCA8 ENST00000373055.6 2371 10 14488 162 14488 -156 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAACAGTCCTGTTCAAGTT 8025 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.616.22 chr1 + 1453 2 incomplete-splice_match CDCA8 ENST00000373055.6 2371 10 14491 3 14491 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAATCACTGTTCATCCTGCC 8028 FALSE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 5 NA PB.617.1 chr1 + 1973 4 full-splice_match MANEAL ENST00000373045.11 2640 4 665 2 29 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGTAAGCATTCCTTTTGCT 0 TRUE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.617.2 chr1 + 1808 4 full-splice_match MANEAL ENST00000373045.11 2640 4 834 -2 198 2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGCATTCCTTTTGCTCTCT 169 FALSE NA NA ATTAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.617.3 chr1 + 1604 2 incomplete-splice_match MANEAL ENST00000525897.1 1294 4 1374 -683 1294 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGTAAGCATTCCTTTTGCT 1385 FALSE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.618.1 chr1 - 2679 5 full-splice_match C1orf109 ENST00000486637.2 2696 5 9 8 0 -7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 38 10.164219 1.007074 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAGCATTTAAGTGTCAA -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 38 NA PB.618.2 chr1 - 2636 7 novel_in_catalog C1orf109 novel 2570 7 NA NA -21 -7 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAGCATTTAAGTGTCAA -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.618.3 chr1 - 2599 6 novel_in_catalog C1orf109 novel 919 5 NA NA 0 -7 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAGCATTTAAGTGTCAA 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.618.4 chr1 - 2555 5 novel_in_catalog C1orf109 novel 2696 5 NA NA 34 -7 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAGCATTTAAGTGTCAA 1804 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.618.5 chr1 - 2470 5 novel_in_catalog C1orf109 novel 2696 5 NA NA 4 -7 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 113 30.225178 1.480369 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAGCATTTAAGTGTCAA -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 113 NA PB.618.6 chr1 - 2383 5 novel_in_catalog C1orf109 novel 919 5 NA NA 0 -7 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAGCATTTAAGTGTCAA 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.618.7 chr1 - 2347 5 full-splice_match C1orf109 ENST00000358011.8 2355 5 0 8 0 -7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAGCATTTAAGTGTCAA -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.618.8 chr1 - 2335 4 novel_not_in_catalog C1orf109 novel 919 5 NA NA 4 -7 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAGCATTTAAGTGTCAA -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.618.9 chr1 - 2098 4 incomplete-splice_match C1orf109 ENST00000358011.8 2355 5 699 8 -132 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAGCATTTAAGTGTCAA 2431 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.618.10 chr1 - 1791 3 incomplete-splice_match C1orf109 ENST00000358011.8 2355 5 4159 8 -2169 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAGCATTTAAGTGTCAA 5891 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.618.11 chr1 - 1620 2 incomplete-splice_match C1orf109 ENST00000358011.8 2355 5 7165 8 837 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAGCATTTAAGTGTCAA 8897 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.618.12 chr1 - 1488 1 full-splice_match C1orf109 ENST00000609516.1 2622 1 1127 7 1127 -7 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 14 3.744712 0.573418 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAGCATTTAAGTGTCAA 9187 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.618.13 chr1 - 1393 1 full-splice_match C1orf109 ENST00000609516.1 2622 1 1222 7 1222 -7 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAGCATTTAAGTGTCAA 9282 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.618.14 chr1 - 1289 1 full-splice_match C1orf109 ENST00000609516.1 2622 1 1326 7 1326 -7 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAGCATTTAAGTGTCAA 9386 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.618.15 chr1 - 1090 1 full-splice_match C1orf109 ENST00000609516.1 2622 1 1525 7 1525 -7 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 16 4.279671 0.631410 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAGCATTTAAGTGTCAA 9585 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.618.16 chr1 - 974 1 full-splice_match C1orf109 ENST00000609516.1 2622 1 1641 7 1641 -7 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAGCATTTAAGTGTCAA 9701 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.618.17 chr1 - 801 1 full-splice_match C1orf109 ENST00000609516.1 2622 1 1814 7 1814 -7 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 9 2.407315 0.381533 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAGCATTTAAGTGTCAA 9874 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.618.19 chr1 - 2047 5 novel_in_catalog C1orf109 novel 2696 5 NA NA 3 522 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAATGAAAATAACTTTTT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.618.20 chr1 - 1831 5 novel_in_catalog C1orf109 novel 2696 5 NA NA -2 522 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.012192 0.603382 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAATGAAAATAACTTTTT -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.620.1 chr1 - 1198 2 incomplete-splice_match YRDC ENST00000373044.3 1848 5 3764 -2 3764 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.802438 -0.095588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTTTTTCTTCTTTTGAATT 3748 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.620.3 chr1 - 1808 5 full-splice_match YRDC ENST00000373044.3 1848 5 41 -1 41 1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 23 6.152027 0.789018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGTTTTTCTTCTTTTGAAT 9420 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 23 NA PB.620.4 chr1 - 1426 4 incomplete-splice_match YRDC ENST00000373044.3 1848 5 999 -1 999 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.872356 0.272388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGTTTTTCTTCTTTTGAAT 983 FALSE NA NA AATAAA -23 NA NA NA 7 NA PB.620.5 chr1 - 1317 3 incomplete-splice_match YRDC ENST00000373044.3 1848 5 1232 -1 1232 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGTTTTTCTTCTTTTGAAT 1216 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.620.7 chr1 - 1521 5 full-splice_match YRDC ENST00000373044.3 1848 5 327 0 327 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.604877 0.205442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTTGTTTTTCTTCTTTTGAA 9706 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.620.9 chr1 - 1165 5 full-splice_match YRDC ENST00000373044.3 1848 5 39 644 39 -644 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.139836 0.330380 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTGAGAGCCTCCTCTCTGG 23 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.620.10 chr1 - 925 5 full-splice_match YRDC ENST00000373044.3 1848 5 274 649 274 -649 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATCTAGTGAGAGCCTCCTC 9653 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.622.1 chr1 + 1197 3 full-splice_match C1orf122 ENST00000468084.1 1234 3 37 0 -6 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.069918 0.029350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTCTCCTGGTGACCGACGTT -3 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.622.2 chr1 + 706 3 full-splice_match C1orf122 ENST00000468084.1 1234 3 531 -3 488 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.337397 0.126260 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TCCTGGTGACCGACGTTTCC -3 TRUE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 5 NA PB.622.3 chr1 + 599 2 full-splice_match C1orf122 ENST00000373043.1 2229 2 1632 -2 821 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.674794 0.427290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTGGTGACCGACGTTTCCTT 0 TRUE NA NA ATTAAA -20 NA NA NA 10 NA PB.623.7 chr1 - 1258 3 incomplete-splice_match MTF1 ENST00000373036.5 7937 11 36891 5380 35838 -5380 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.534959 -0.271680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAAAACAAAAAACAAAAA 873 FALSE NA NA AATATA -9 NA NA NA 2 NA PB.624.1 chr1 - 3916 18 novel_not_in_catalog INPP5B novel 3230 23 NA NA -16 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.942274 0.468683 NA NA TRU