isoform chrom strand length exons structural_category associated_gene associated_transcript ref_length ref_exons diff_to_TSS diff_to_TTS diff_to_gene_TSS diff_to_gene_TTS subcategory RTS_stage all_canonical min_sample_cov min_cov min_cov_pos sd_cov FL.BioSample_4 FL_TPM.BioSample_4 FL_TPM.BioSample_4_log10 n_indels n_indels_junc bite iso_exp gene_exp ratio_exp FSM_class coding ORF_length CDS_length CDS_start CDS_end CDS_genomic_start CDS_genomic_end predicted_NMD perc_A_downstream_TTS seq_A_downstream_TTS dist_to_CAGE_peak within_CAGE_peak dist_to_polyA_site within_polyA_site polyA_motif polyA_dist polyA_motif_found ORF_seq ratio_TSS fl_assoc cell_barcodes PB.1.1 chr1 - 2153 11 novel_not_in_catalog WASH7P novel 1351 11 NA NA 10091 2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AACAGTGTGCTTTTAATAAA 9877 FALSE NA NA AATGAA -35 NA NA NA 2 NA PB.1.2 chr1 - 3088 12 novel_not_in_catalog WASH7P novel 1351 11 NA NA 214 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.1.4 chr1 - 1713 11 novel_not_in_catalog WASH7P novel 1351 11 NA NA 211 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.1.5 chr1 - 1614 10 novel_not_in_catalog WASH7P novel 1351 11 NA NA 211 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.1.6 chr1 - 1559 10 novel_not_in_catalog WASH7P novel 1351 11 NA NA 211 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.1.7 chr1 - 1456 9 novel_not_in_catalog WASH7P novel 1351 11 NA NA 215 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.1.10 chr1 - 1512 6 novel_not_in_catalog WASH7P novel 1351 11 NA NA 11825 -5 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAAACCAACAGTGTGCTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.1.11 chr1 - 1065 7 novel_not_in_catalog WASH7P novel 1351 11 NA NA 223 -2041 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GTAGAGCTCTGGACTTCTCA 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.2.1 chr1 - 963 1 full-splice_match ENSG00000268903 ENST00000494149.2 755 1 12 -220 12 220 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA NA NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATGTAAATGTTTTGGTAGGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.3.2 chr1 - 1778 11 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -4464 337 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 290 77.688400 1.890356 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GATGCAAACGTCTCGGGGTC -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 290 NA PB.3.5 chr1 - 1586 10 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -4464 299 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AACAGTGTGCTTTTAATAAA -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.3.6 chr1 - 1437 9 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -4464 299 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AACAGTGTGCTTTTAATAAA -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.3.8 chr1 - 1819 8 novel_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA 6471 294 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.3.9 chr1 - 1793 9 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -4450 294 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA 11 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.3.10 chr1 - 1718 11 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -4464 294 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.822039 0.683231 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.3.11 chr1 - 1699 10 full-splice_match WASH9P ENST00000623083.4 1397 10 -8 -294 -8 294 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA 4453 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.3.14 chr1 - 1621 10 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -4464 292 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAAACCAACAGTGTGCTTT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.3.15 chr1 - 1617 10 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA 61 294 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA 4522 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.3.16 chr1 - 1574 10 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -4452 294 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.3.17 chr1 - 1568 10 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -4464 294 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.3.18 chr1 - 1481 9 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -4458 294 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.3.19 chr1 - 1469 9 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -4464 294 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.3.20 chr1 - 1355 8 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA 6898 294 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.3.22 chr1 - 1774 12 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -4464 293 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAACCAACAGTGTGCTTTT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.3.23 chr1 - 2613 9 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -4464 292 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAAACCAACAGTGTGCTTT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.3.24 chr1 - 2266 11 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -4997 292 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAAACCAACAGTGTGCTTT NA FALSE NA NA AATAGA -43 NA NA NA 2 NA PB.3.25 chr1 - 1759 11 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -4469 292 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAAACCAACAGTGTGCTTT -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.3.26 chr1 - 1319 8 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -4452 292 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAAACCAACAGTGTGCTTT 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.3.27 chr1 - 1304 6 incomplete-splice_match WASH9P ENST00000623083.4 1397 10 7362 -292 7362 292 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAAACCAACAGTGTGCTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.11.1 chr1 + 1660 1 full-splice_match LINC01409 ENST00000591702.1 1873 1 217 -4 217 4 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAGCCTGTTGGTGGACTCT NA FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.11.2 chr1 + 1211 1 full-splice_match LINC01409 ENST00000591702.1 1873 1 664 -2 664 2 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACAAAGCCTGTTGGTGGACT NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.12.1 chr1 + 1416 6 incomplete-splice_match LINC01128 ENST00000691316.1 3092 7 -94 3097 0 -3 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAATACAGCACCTACTGTGA 762 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.12.2 chr1 + 1819 7 incomplete-splice_match LINC01128 ENST00000666741.1 5483 8 -30 5021 0 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGTGAGGTACAATAGCTATT 772 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.12.4 chr1 + 2608 3 full-splice_match LINC01128 ENST00000669922.1 5441 3 49 2784 0 -13 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACAGGAAACTTAGTTAC 816 FALSE NA NA AATATA -6 NA NA NA 2 NA PB.13.2 chr1 - 1310 1 full-splice_match LINC00115 ENST00000473798.1 1317 1 0 7 0 -7 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 14 3.750474 0.574086 NA NA NA NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGATATTTCCAAAGCTCA -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.15.1 chr1 - 2742 1 full-splice_match LINC02593 ENST00000609207.1 4152 1 1403 7 79 -2 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA NA NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AACCTGATCTGATTACAGAG 5999 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.16.2 chr1 + 1064 3 incomplete-splice_match SAMD11 ENST00000341065.8 2191 12 12780 1 926 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCCCGTGTCTACTGCCTCCC 779 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.17.1 chr1 + 988 2 incomplete-splice_match KLHL17 ENST00000338591.8 2567 12 3715 1 747 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGCTGAGCATCTCTCTCTG 3697 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.18.5 chr1 - 2199 15 novel_in_catalog NOC2L novel 4201 17 NA NA 2313 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTGGTGGCTCCTGGAGATT 4389 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.18.6 chr1 - 2061 13 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000477976.5 4201 17 4372 -1 4372 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTGGTGGCTCCTGGAGATT 6448 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.18.7 chr1 - 2198 15 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 3082 16 2284 -14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGGCCATTGTGTTGAGTGG 4360 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.18.8 chr1 - 1924 12 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 5387 17 4589 -15 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.554148 0.658407 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CAGGGCCATTGTGTTGAGTG 6665 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.18.9 chr1 - 1642 10 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 6752 1 -5444 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTGGTGGCTCCTGGAGATT 8030 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.18.11 chr1 - 2774 19 full-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 -19 2 -19 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 294 78.759964 1.896306 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAGTGGTGGCTCCTGGAGAT -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 294 NA PB.18.12 chr1 - 2371 16 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 2245 2 1447 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.822039 0.683231 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAGTGGTGGCTCCTGGAGAT 9968 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.18.13 chr1 - 1516 9 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 7149 2 -5047 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAGTGGTGGCTCCTGGAGAT 8427 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.18.14 chr1 - 2577 17 novel_in_catalog NOC2L novel 4201 17 NA NA 1182 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGAGTGGTGGCTCCTGGAGA 9703 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.18.15 chr1 - 1332 8 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 8093 3 -4103 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGAGTGGTGGCTCCTGGAGA 9371 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.18.16 chr1 - 2829 20 novel_not_in_catalog NOC2L novel 2757 19 NA NA -21 -7 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.750474 0.574086 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTGTGTTGAGTGGTGGCTCC -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.18.17 chr1 - 650 2 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 14139 9 1943 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTGTGTTGAGTGGTGGCTCC 8662 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.18.18 chr1 - 2782 19 novel_in_catalog NOC2L novel 2757 19 NA NA -20 -8 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 204 54.649773 1.737588 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTGTGTTGAGTGGTGGCTC -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 204 NA PB.18.19 chr1 - 2751 19 novel_not_in_catalog NOC2L novel 2757 19 NA NA 2 -8 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTGTGTTGAGTGGTGGCTC 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.18.20 chr1 - 1754 11 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 6057 10 5259 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTGTGTTGAGTGGTGGCTC 7335 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.18.21 chr1 - 1733 10 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000477976.5 4201 17 5869 8 -5529 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTGTGTTGAGTGGTGGCTC 7945 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.18.22 chr1 - 1711 11 novel_not_in_catalog NOC2L novel 2757 19 NA NA 0 -8 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTGTGTTGAGTGGTGGCTC 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.18.24 chr1 - 2756 19 novel_not_in_catalog NOC2L novel 2757 19 NA NA -19 -9 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CATTGTGTTGAGTGGTGGCT -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.18.25 chr1 - 2549 17 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 1985 11 1187 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CATTGTGTTGAGTGGTGGCT 9708 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.18.26 chr1 - 1263 7 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000477976.5 4201 17 9894 9 -1504 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.946801 0.469351 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CATTGTGTTGAGTGGTGGCT 5215 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.18.27 chr1 - 895 4 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000483767.5 1611 5 821 10 821 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CATTGTGTTGAGTGGTGGCT 7540 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.18.28 chr1 - 2136 15 novel_not_in_catalog NOC2L novel 2757 19 NA NA 0 -10 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CCATTGTGTTGAGTGGTGGC 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.18.29 chr1 - 1578 10 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 6805 12 -5391 -10 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CCATTGTGTTGAGTGGTGGC 8083 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.18.30 chr1 - 2819 20 novel_not_in_catalog NOC2L novel 2757 19 NA NA 0 -11 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCATTGTGTTGAGTGGTGG 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.18.31 chr1 - 2799 19 novel_not_in_catalog NOC2L novel 2757 19 NA NA -21 -11 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCATTGTGTTGAGTGGTGG -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.18.32 chr1 - 1931 12 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000477976.5 4201 17 4601 11 4601 -11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCATTGTGTTGAGTGGTGG 6677 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.18.33 chr1 - 1790 11 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000477976.5 4201 17 5235 11 5235 -11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCATTGTGTTGAGTGGTGG 7311 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.18.34 chr1 - 1150 6 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000477976.5 4201 17 10262 11 -1136 -11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCATTGTGTTGAGTGGTGG 5583 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.18.35 chr1 - 1172 6 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 11023 13 -1173 -11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.018365 0.604049 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCATTGTGTTGAGTGGTGG 5546 FALSE NA NA GGGGCT -4 NA NA NA 15 NA PB.18.36 chr1 - 1005 5 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 12775 13 579 -11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.946801 0.469351 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCATTGTGTTGAGTGGTGG 7298 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.18.38 chr1 - 2358 16 novel_in_catalog NOC2L novel 4201 17 NA NA 1463 -12 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGCCATTGTGTTGAGTGGTG 9984 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.18.39 chr1 - 3206 19 novel_in_catalog NOC2L novel 2757 19 NA NA -9 -14 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGGCCATTGTGTTGAGTGG -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.18.40 chr1 - 1475 9 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000477976.5 4201 17 6393 14 -5005 -14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGGCCATTGTGTTGAGTGG 8469 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.18.41 chr1 - 1164 7 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 10719 68 -1477 -66 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAAATTTTTTGTTTTGCAT 5242 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.18.45 chr1 - 862 2 full-splice_match NOC2L ENST00000469563.1 878 2 -9 25 -9 -25 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.893603 0.770381 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAGAAAAAGAAAGAAAT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 22 NA PB.19.1 chr1 + 2097 15 full-splice_match PLEKHN1 ENST00000379409.6 2455 15 16 342 16 -342 alternative_3end TRUE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAACCCAGTGTGATGGGGGG 20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.20.1 chr1 - 961 3 full-splice_match HES4 ENST00000428771.6 1040 3 78 1 2 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTCTGCGTCACGAGTTTTC 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.20.2 chr1 - 1040 2 full-splice_match HES4 ENST00000481869.1 1038 2 -1 -1 0 1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAGTCTGCGTCACGAGTTT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.20.3 chr1 - 962 3 novel_in_catalog HES4 novel 885 4 NA NA 0 1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAGTCTGCGTCACGAGTTT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.20.4 chr1 - 877 4 novel_not_in_catalog HES4 novel 885 4 NA NA 0 1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAGTCTGCGTCACGAGTTT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.20.5 chr1 - 882 4 full-splice_match HES4 ENST00000304952.11 885 4 2 1 1 1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.286257 0.632078 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAGTCTGCGTCACGAGTTT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.20.6 chr1 - 788 3 full-splice_match HES4 ENST00000484667.2 667 3 -116 -5 0 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAGTCTGCGTCACGAGTTT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.21.3 chr1 + 628 2 full-splice_match ISG15 ENST00000649529.1 637 2 0 9 0 -9 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 44 11.787206 1.071411 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAGAGAAATGGCCGCCTCT 1 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 44 NA PB.22.2 chr1 + 4062 19 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 12586 5 -509 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAAAGCATTGCTTTTGTCC 1523 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 4 NA PB.22.3 chr1 + 3847 17 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 13256 3 -113 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGCATTGCTTTTGTCCAT 2193 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.22.5 chr1 + 3406 14 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 14018 4 -405 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 272 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.22.6 chr1 + 3248 14 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 14176 4 -247 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 430 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 5 NA PB.22.7 chr1 + 3054 13 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 14871 4 448 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 1125 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 9 NA PB.22.8 chr1 + 2893 12 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 15208 4 785 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 1462 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.22.9 chr1 + 2922 11 novel_in_catalog ENSG00000242590 novel 402 2 NA NA -5666 -5 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAAAGCATTGCTTTTGTCC 1515 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.22.10 chr1 + 2755 11 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 15460 4 1037 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 1714 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 9 NA PB.22.11 chr1 + 2441 10 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 15880 5 1457 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAAAGCATTGCTTTTGTCC 2134 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 4 NA PB.22.12 chr1 + 2325 9 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 16191 5 -1689 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAAAGCATTGCTTTTGTCC 2445 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 3 NA PB.22.14 chr1 + 2206 8 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 16407 5 -1473 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAAAGCATTGCTTTTGTCC 2661 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 10 NA PB.22.15 chr1 + 2056 7 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 16692 4 -1188 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.822039 0.683231 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 2946 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 18 NA PB.22.16 chr1 + 1867 5 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 17379 4 -501 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.214692 0.507139 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 3633 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 12 NA PB.22.17 chr1 + 1764 5 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 17482 4 -398 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 3736 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 7 NA PB.22.18 chr1 + 1707 4 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 17621 4 -259 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 19 5.089930 0.706712 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 3875 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 19 NA PB.22.21 chr1 + 1611 3 full-splice_match AGRN ENST00000461111.1 3385 3 1773 1 1773 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAAAGCATTGCTTTTGTCC 5907 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 5 NA PB.22.22 chr1 + 1494 3 full-splice_match AGRN ENST00000461111.1 3385 3 1891 0 1891 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.750474 0.574086 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 6025 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 14 NA PB.22.23 chr1 + 1370 2 incomplete-splice_match AGRN ENST00000461111.1 3385 3 2485 0 2485 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.822039 0.683231 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 6619 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 18 NA PB.22.24 chr1 + 754 2 novel_not_in_catalog AGRN novel 3385 3 NA NA 2547 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAAAGCATTGCTTTTGTCC 6681 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.24.1 chr1 - 1902 2 full-splice_match RNF223 ENST00000453464.3 1900 2 -1 -1 -1 1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CTTTGGCAAGAGGGCCTCAC -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.24.2 chr1 - 1444 2 full-splice_match RNF223 ENST00000453464.3 1900 2 -1 457 -1 -457 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CATCGTGGTGGGTGCCTCTT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.25.2 chr1 - 2286 10 novel_in_catalog C1orf159 novel 2099 12 NA NA -12 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGCTGCGTTCCGAGCTGCT -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.25.4 chr1 - 2020 11 full-splice_match C1orf159 ENST00000379325.7 2010 11 -12 2 -12 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGCTGCGTTCCGAGCTGCT -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.25.5 chr1 - 1935 11 novel_in_catalog C1orf159 novel 2099 12 NA NA -5 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGCTGCGTTCCGAGCTGCT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.25.6 chr1 - 1839 10 full-splice_match C1orf159 ENST00000421241.7 1832 10 -9 2 -3 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 42 11.251424 1.051207 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGCTGCGTTCCGAGCTGCT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 42 NA PB.25.7 chr1 - 1623 8 incomplete-splice_match C1orf159 ENST00000379319.5 1097 10 14626 -875 576 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGCTGCGTTCCGAGCTGCT 8488 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.25.8 chr1 - 1570 7 incomplete-splice_match C1orf159 ENST00000379319.5 1097 10 15722 -875 1672 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGCTGCGTTCCGAGCTGCT 9584 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.25.9 chr1 - 2090 13 novel_not_in_catalog C1orf159 novel 2429 12 NA NA -5 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CAAGCTGCGTTCCGAGCTGC -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.25.10 chr1 - 1867 10 novel_not_in_catalog C1orf159 novel 1832 10 NA NA 2 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CAAGCTGCGTTCCGAGCTGC 16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.26.1 chr1 - 1345 4 full-splice_match TNFRSF18 ENST00000486728.5 727 4 -283 -335 -283 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACCTGAGTGGATGCATGCTG 8189 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.26.2 chr1 - 1313 5 full-splice_match TNFRSF18 ENST00000379268.7 1083 5 -231 1 -231 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACCTGAGTGGATGCATGCTG 7329 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.26.3 chr1 - 1137 4 novel_in_catalog TNFRSF18 novel 1083 5 NA NA 10 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACCTGAGTGGATGCATGCTG -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.26.4 chr1 - 1075 5 full-splice_match TNFRSF18 ENST00000379268.7 1083 5 7 1 7 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 33 8.840405 0.946472 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACCTGAGTGGATGCATGCTG -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 33 NA PB.26.5 chr1 - 1065 5 full-splice_match TNFRSF18 ENST00000379265.5 705 5 -25 -335 -4 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACCTGAGTGGATGCATGCTG -20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.26.6 chr1 - 1044 4 novel_not_in_catalog TNFRSF18 novel 1083 5 NA NA 5 -5 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGTGACCTGAGTGGATGCAT 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.27.1 chr1 + 937 5 novel_in_catalog ENSG00000217801 novel 1043 5 NA NA 3 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TATAATAATGATGGATAATT -1 TRUE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.27.2 chr1 + 836 4 novel_in_catalog ENSG00000217801 novel 957 4 NA NA 1 3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AATAATGATGGATAATTGTT 5 TRUE NA NA ATTAAA -24 NA NA NA 4 NA PB.27.3 chr1 + 1051 5 novel_not_in_catalog ENSG00000217801 novel 1043 5 NA NA 3 3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AATAATGATGGATAATTGTT 7 TRUE NA NA ATTAAA -24 NA NA NA 2 NA PB.27.4 chr1 + 919 4 full-splice_match ENSG00000217801 ENST00000456409.6 957 4 37 1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTCTCTTGCCTCGGCACCT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.28.2 chr1 - 2124 7 novel_not_in_catalog SDF4 novel 2137 7 NA NA -11 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTCTTTGGGCGTGAAACAA 8858 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.28.5 chr1 - 2015 7 full-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 -60 -22 6 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 325 87.064590 1.939842 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTCTTTGGGCGTGAAACAA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 325 NA PB.28.6 chr1 - 1955 7 full-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 0 -22 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 420 112.514236 2.051208 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTCTTTGGGCGTGAAACAA -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 420 NA PB.28.8 chr1 - 1789 6 incomplete-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 3111 -22 -294 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTCTTTGGGCGTGAAACAA 8943 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.28.10 chr1 - 1476 6 novel_in_catalog SDF4 novel 1933 7 NA NA 0 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTCTTTGGGCGTGAAACAA -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.28.11 chr1 - 877 2 full-splice_match SDF4 ENST00000478938.1 2591 2 1739 -25 1739 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.482584 0.541902 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTCTTTGGGCGTGAAACAA 939 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.28.14 chr1 - 1652 6 incomplete-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 3242 -16 -163 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.822039 0.683231 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTTCATTCTTTGGGCGTG 9074 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.28.15 chr1 - 1597 3 full-splice_match SDF4 ENST00000494748.1 3516 3 1936 -17 878 -6 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTTCATTCTTTGGGCGTG 9432 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.28.16 chr1 - 1354 3 full-splice_match SDF4 ENST00000494748.1 3516 3 2179 -17 1121 -6 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTTCATTCTTTGGGCGTG 9675 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.28.17 chr1 - 1422 6 incomplete-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 3472 -16 67 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.625712 0.750178 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTTCATTCTTTGGGCGTG 9304 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 21 NA PB.28.18 chr1 - 1290 5 incomplete-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 8103 -16 -2547 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.893603 0.770381 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTTCATTCTTTGGGCGTG 8163 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 22 NA PB.28.19 chr1 - 1254 4 incomplete-splice_match SDF4 ENST00000263741.12 2079 7 8759 -16 -1921 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTTCATTCTTTGGGCGTG 8789 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.28.20 chr1 - 1174 5 novel_not_in_catalog SDF4 novel 1933 7 NA NA -4 -6 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTTCATTCTTTGGGCGTG 17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.28.21 chr1 - 973 3 full-splice_match SDF4 ENST00000494748.1 3516 3 2560 -17 1502 -6 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTTCATTCTTTGGGCGTG 9921 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.28.23 chr1 - 1916 7 novel_not_in_catalog SDF4 novel 1933 7 NA NA 383 -8 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TCAGCTTCATTCTTTGGGCG 9351 FALSE NA NA GATAAA -44 NA NA NA 2 NA PB.28.24 chr1 - 1783 6 novel_in_catalog SDF4 novel 1933 7 NA NA 2 11 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGGTCAGCTTCATTCTTTGG -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.28.25 chr1 - 2210 7 novel_not_in_catalog SDF4 novel 1933 7 NA NA 68 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATAGTTGCCTTTTTTG 9036 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.28.26 chr1 - 2099 7 full-splice_match SDF4 ENST00000263741.12 2079 7 -27 7 9 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATAGTTGCCTTTTTTG 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.28.27 chr1 - 2034 7 full-splice_match SDF4 ENST00000263741.12 2079 7 38 7 8 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.482584 0.541902 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATAGTTGCCTTTTTTG -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.28.29 chr1 - 1698 6 incomplete-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 3173 7 -232 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATAGTTGCCTTTTTTG 19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.28.30 chr1 - 1463 6 incomplete-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 3408 7 3 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 30 8.036731 0.905079 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATAGTTGCCTTTTTTG 9240 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 30 NA PB.28.31 chr1 - 1013 3 full-splice_match SDF4 ENST00000494748.1 3516 3 2497 6 1439 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.946801 0.469351 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATAGTTGCCTTTTTTG -11 TRUE NA NA GGGGCT -25 NA NA NA 11 NA PB.28.32 chr1 - 1782 7 full-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 5 146 5 -143 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.946801 0.469351 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TGGAAATGAGTAGCCAGGAA -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.28.33 chr1 - 1101 6 incomplete-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 7 1594 7 -2 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAAGGAGTTTGAGGAGC -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.29.1 chr1 + 1918 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 25 862 25 -862 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTCCCTGGAGTCCGACGC 10 TRUE NA NA AGTAAA -33 NA NA NA 4 NA PB.29.2 chr1 + 1399 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 83 1323 83 -1323 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GATGAGTGTAAGTTGGCAGT 68 FALSE NA NA TATAAA -18 NA NA NA 5 NA PB.29.3 chr1 + 1800 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 140 865 140 -865 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATGAGCTCCCTGGAGTCCGA 125 FALSE NA NA AGTAAA -30 NA NA NA 2 NA PB.29.4 chr1 + 1657 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 285 863 285 -863 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAGCTCCCTGGAGTCCGACG 270 FALSE NA NA AGTAAA -32 NA NA NA 4 NA PB.29.5 chr1 + 2475 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 324 6 324 -6 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACAAAGCCTGCCCCAGGCT 309 FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 4 NA PB.29.6 chr1 + 1154 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 336 1315 336 -1315 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAAGTTGGCAGTGCGCACGT 321 FALSE NA NA TATAAA -26 NA NA NA 3 NA PB.29.7 chr1 + 2392 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 416 -3 416 3 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGCCCCAGGCTGACCCTCCC 401 FALSE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.29.8 chr1 + 2210 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 589 6 589 -6 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACAAAGCCTGCCCCAGGCT 574 FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 4 NA PB.29.9 chr1 + 1230 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 712 863 712 -863 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAGCTCCCTGGAGTCCGACG 697 FALSE NA NA AGTAAA -32 NA NA NA 3 NA PB.29.10 chr1 + 1987 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 812 6 812 -6 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACAAAGCCTGCCCCAGGCT 797 FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 3 NA PB.29.11 chr1 + 974 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 966 865 966 -865 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATGAGCTCCCTGGAGTCCGA 951 FALSE NA NA AGTAAA -30 NA NA NA 2 NA PB.29.12 chr1 + 1776 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 1023 6 1023 -6 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACAAAGCCTGCCCCAGGCT 1008 FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 3 NA PB.29.13 chr1 + 1405 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 1394 6 1394 -6 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACAAAGCCTGCCCCAGGCT 1379 FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 5 NA PB.30.2 chr1 - 2248 7 full-splice_match UBE2J2 ENST00000349431.11 2260 7 9 3 -1 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 76 20.359718 1.308772 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATTTCATGCTGCTTGTGT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 76 NA PB.30.3 chr1 - 2398 7 full-splice_match UBE2J2 ENST00000360466.6 1047 7 -101 -1250 0 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTTCATGCTGCTTGTGTC 17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.30.4 chr1 - 1794 3 incomplete-splice_match UBE2J2 ENST00000347370.6 2387 7 16724 0 -795 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTTCATGCTGCTTGTGTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.30.5 chr1 - 1597 2 novel_in_catalog UBE2J2 novel 2387 7 NA NA -679 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTTCATGCTGCTTGTGTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.30.8 chr1 - 3037 7 novel_in_catalog UBE2J2 novel 2260 7 NA NA 6 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATTTCATGCTGCTTGTGT 23 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.30.10 chr1 - 2115 6 full-splice_match UBE2J2 ENST00000400929.6 1057 6 12 -1070 1 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.482584 0.541902 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATTTCATGCTGCTTGTGT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.30.11 chr1 - 2361 8 full-splice_match UBE2J2 ENST00000464036.5 1256 8 27 -1132 0 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGAATTTCATGCTGCTTGTG 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.30.12 chr1 - 2215 6 novel_in_catalog UBE2J2 novel 2260 7 NA NA 0 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGAATTTCATGCTGCTTGTG -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.30.13 chr1 - 2064 5 novel_in_catalog UBE2J2 novel 1057 6 NA NA -1 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGAATTTCATGCTGCTTGTG 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.30.14 chr1 - 1412 8 novel_not_in_catalog UBE2J2 novel 2455 8 NA NA -1 86 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGATGTGGTCACTTAGAAAT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.30.15 chr1 - 1646 7 novel_in_catalog UBE2J2 novel 2260 7 NA NA 54 83 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTAGATGTGGTCACTTAGA 427 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.30.16 chr1 - 1533 7 full-splice_match UBE2J2 ENST00000435198.5 1056 7 16 -493 -1 83 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTAGATGTGGTCACTTAGA 16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.30.17 chr1 - 1420 7 full-splice_match UBE2J2 ENST00000360466.6 1047 7 -111 -262 0 83 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.554148 0.658407 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTAGATGTGGTCACTTAGA 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.30.18 chr1 - 1386 8 full-splice_match UBE2J2 ENST00000464036.5 1256 8 16 -146 1 83 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.018365 0.604049 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTAGATGTGGTCACTTAGA -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.30.19 chr1 - 1382 7 full-splice_match UBE2J2 ENST00000473215.5 1028 7 12 -366 0 83 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.750474 0.574086 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTAGATGTGGTCACTTAGA 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.30.20 chr1 - 1307 8 full-splice_match UBE2J2 ENST00000400930.8 1021 8 -10 -276 1 83 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTAGATGTGGTCACTTAGA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.30.21 chr1 - 1254 7 novel_in_catalog UBE2J2 novel 1256 8 NA NA 2 83 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTAGATGTGGTCACTTAGA -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.30.22 chr1 - 1267 7 full-splice_match UBE2J2 ENST00000349431.11 2260 7 3 990 -2 83 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 314 84.117783 1.924888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTAGATGTGGTCACTTAGA -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 314 NA PB.30.23 chr1 - 1183 6 novel_in_catalog UBE2J2 novel 2260 7 NA NA 1 83 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTAGATGTGGTCACTTAGA -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.30.24 chr1 - 1122 6 full-splice_match UBE2J2 ENST00000400929.6 1057 6 18 -83 0 83 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.893603 0.770381 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTAGATGTGGTCACTTAGA 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 22 NA PB.30.25 chr1 - 1071 6 incomplete-splice_match UBE2J2 ENST00000360466.6 1047 7 5744 -262 -4413 83 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.946801 0.469351 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTAGATGTGGTCACTTAGA 5862 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.30.26 chr1 - 2056 7 novel_in_catalog UBE2J2 novel 2260 7 NA NA -1 82 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATTAGATGTGGTCACTTAG 16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.30.27 chr1 - 1484 8 novel_in_catalog UBE2J2 novel 1256 8 NA NA 1 82 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATTAGATGTGGTCACTTAG -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.30.28 chr1 - 1344 6 novel_in_catalog UBE2J2 novel 1047 7 NA NA 1 82 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATTAGATGTGGTCACTTAG 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.30.29 chr1 - 1082 5 novel_in_catalog UBE2J2 novel 1057 6 NA NA -2 82 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATTAGATGTGGTCACTTAG 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.31.1 chr1 + 1453 9 incomplete-splice_match SCNN1D ENST00000325425.12 2679 15 5459 0 459 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCTGGCGGCCAGTGTGTGC 3566 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.31.2 chr1 + 1262 7 incomplete-splice_match SCNN1D ENST00000325425.12 2679 15 5828 0 828 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCTGGCGGCCAGTGTGTGC 3935 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.31.3 chr1 + 1081 6 incomplete-splice_match SCNN1D ENST00000325425.12 2679 15 8242 0 3242 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCTGGCGGCCAGTGTGTGC 6349 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 3 NA PB.32.2 chr1 - 1667 4 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 4427 -480 480 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TGCCTGCTCCTGGGCTCCCG 4292 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.32.3 chr1 - 2294 9 novel_not_in_catalog ACAP3 novel 2725 14 NA NA -1230 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTGCCTGCTCCTGGGCTCC 8554 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.32.4 chr1 - 1383 2 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 5067 -478 1120 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTGCCTGCTCCTGGGCTCC 4932 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.32.6 chr1 - 1800 5 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 4201 -476 254 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CCACTGCCTGCTCCTGGGCT 4066 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.32.7 chr1 - 2100 11 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 1110 -5 396 5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATCTCATGTTCTTTGTAGC 9996 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.32.8 chr1 - 3288 23 novel_not_in_catalog ACAP3 novel 3793 24 NA NA 26 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.018365 0.604049 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCCCTCATCTCATGTTCTT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.32.9 chr1 - 2511 15 novel_not_in_catalog ACAP3 novel 3793 24 NA NA -263 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCCCTCATCTCATGTTCTT 8155 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.32.10 chr1 - 2357 14 full-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 367 1 -323 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCCCTCATCTCATGTTCTT 9447 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.32.11 chr1 - 2263 12 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 862 1 148 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCCCTCATCTCATGTTCTT 9942 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.32.12 chr1 - 2121 4 novel_in_catalog ACAP3 novel 2725 14 NA NA -388 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCCCTCATCTCATGTTCTT 9396 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.32.13 chr1 - 1886 10 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 2506 1 -1441 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCCCTCATCTCATGTTCTT 8343 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.32.14 chr1 - 1637 7 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 3076 1 -871 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCCCTCATCTCATGTTCTT 8913 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.32.15 chr1 - 1551 7 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 3162 1 -785 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCCCTCATCTCATGTTCTT 8999 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.32.16 chr1 - 1285 4 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 4328 1 381 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCCCTCATCTCATGTTCTT 4193 FALSE NA NA GGGGCT -9 NA NA NA 7 NA PB.32.17 chr1 - 1127 4 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 4485 2 538 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CAGCCCTCATCTCATGTTCT 4350 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.32.18 chr1 - 1114 2 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 4854 4 907 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGCAGCCCTCATCTCATGTT 4719 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.32.19 chr1 - 970 5 full-splice_match ACAP3 ENST00000479108.5 485 5 -77 -408 23 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.33.1 chr1 + 1220 7 novel_in_catalog PUSL1 novel 1257 8 NA NA -47 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACCAGTTTGTTTCTTCAG NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.33.3 chr1 + 1374 7 novel_in_catalog PUSL1 novel 1257 8 NA NA -41 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACCAGTTTGTTTCTTCAG NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.33.4 chr1 + 1295 8 full-splice_match PUSL1 ENST00000379031.10 1257 8 -39 1 -39 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 84 22.502848 1.352237 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACCAGTTTGTTTCTTCAG NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 84 NA PB.33.5 chr1 + 1299 6 novel_in_catalog PUSL1 novel 1257 8 NA NA -24 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACCAGTTTGTTTCTTCAG NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.33.6 chr1 + 1229 7 novel_not_in_catalog PUSL1 novel 1257 8 NA NA -14 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACCAGTTTGTTTCTTCAG NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.33.7 chr1 + 1201 7 novel_in_catalog PUSL1 novel 1257 8 NA NA -3 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.286257 0.632078 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACCAGTTTGTTTCTTCAG -26 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 16 NA PB.33.8 chr1 + 1442 7 novel_in_catalog PUSL1 novel 1257 8 NA NA -6 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACCAGTTTGTTTCTTCAG -15 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 5 NA PB.33.9 chr1 + 1204 8 novel_in_catalog PUSL1 novel 1257 8 NA NA 13 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACCAGTTTGTTTCTTCAG 4 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.33.10 chr1 + 1387 7 novel_in_catalog PUSL1 novel 1257 8 NA NA 35 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACCAGTTTGTTTCTTCAG 26 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.33.11 chr1 + 1389 7 novel_not_in_catalog PUSL1 novel 1257 8 NA NA 62 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GGAGACCAGTTTGTTTCTTC 53 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.33.12 chr1 + 1162 8 full-splice_match PUSL1 ENST00000379031.10 1257 8 94 1 80 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACCAGTTTGTTTCTTCAG -4 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.33.13 chr1 + 1286 7 incomplete-splice_match PUSL1 ENST00000379031.10 1257 8 164 1 -27 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACCAGTTTGTTTCTTCAG 40 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 6 NA PB.34.1 chr1 + 2153 3 full-splice_match CPTP ENST00000343938.9 2154 3 0 1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 158 42.326782 1.626615 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTGGGTGCCTGATTTCCTG -24 TRUE NA NA AATAAA -36 NA NA NA 158 NA PB.34.3 chr1 + 1954 2 full-splice_match CPTP ENST00000464957.1 1101 2 48 -901 2 -1 alternative_3end TRUE canonical NA NA NA NA 16 4.286257 0.632078 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTGGGTGCCTGATTTCCTG -22 TRUE NA NA AATAAA -36 NA NA NA 16 NA PB.34.4 chr1 + 2045 3 full-splice_match CPTP ENST00000343938.9 2154 3 108 1 108 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 29 7.768840 0.890356 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTGGGTGCCTGATTTCCTG -5 TRUE NA NA AATAAA -36 NA NA NA 29 NA PB.34.6 chr1 + 1938 3 full-splice_match CPTP ENST00000343938.9 2154 3 212 4 212 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGCACTGGGTGCCTGATTTC 99 FALSE NA NA AATAAA -33 NA NA NA 8 NA PB.34.7 chr1 + 1727 2 incomplete-splice_match CPTP ENST00000343938.9 2154 3 2159 1 1720 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTGGGTGCCTGATTTCCTG 93 FALSE NA NA AATAAA -36 NA NA NA 6 NA PB.35.1 chr1 - 1977 16 incomplete-splice_match INTS11 ENST00000458452.7 2571 19 3629 -21 -116 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTCTTGGTGTACATGGCTGT 3636 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.35.2 chr1 - 1122 7 novel_in_catalog INTS11 novel 1618 13 NA NA 229 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTGGTACTCTCTTCTTGG 7553 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.35.3 chr1 - 2212 18 full-splice_match INTS11 ENST00000545578.5 2263 18 37 14 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACTTGGTACTCTCTTCTTG 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.35.4 chr1 - 2024 17 novel_in_catalog INTS11 novel 2114 17 NA NA 0 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACTTGGTACTCTCTTCTTG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.35.5 chr1 - 2105 17 full-splice_match INTS11 ENST00000435064.6 2114 17 0 9 0 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 245 65.633301 1.817124 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 245 NA PB.35.6 chr1 - 1044 8 incomplete-splice_match INTS11 ENST00000323275.10 2450 16 11091 -1 220 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACTTGGTACTCTCTTCTTG 7544 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.35.7 chr1 - 2569 16 novel_in_catalog INTS11 novel 2114 17 NA NA 0 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.35.8 chr1 - 2245 19 novel_in_catalog INTS11 novel 2629 19 NA NA 1 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.35.9 chr1 - 2152 18 novel_in_catalog INTS11 novel 2629 19 NA NA 3 -3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 23 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.35.10 chr1 - 2068 17 novel_not_in_catalog INTS11 novel 2571 19 NA NA 0 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.35.11 chr1 - 1829 14 incomplete-splice_match INTS11 ENST00000323275.10 2450 16 5121 9 -154 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 5157 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.35.12 chr1 - 1575 13 incomplete-splice_match INTS11 ENST00000323275.10 2450 16 9052 9 32 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.214692 0.507139 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 9088 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.35.13 chr1 - 1474 9 incomplete-splice_match INTS11 ENST00000323275.10 2450 16 10512 9 -284 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 6965 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.35.14 chr1 - 1451 11 incomplete-splice_match INTS11 ENST00000323275.10 2450 16 9698 9 218 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 9734 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.35.15 chr1 - 1246 9 incomplete-splice_match INTS11 ENST00000323275.10 2450 16 10740 9 -56 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 7193 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.35.16 chr1 - 893 6 incomplete-splice_match INTS11 ENST00000470030.6 2369 10 2513 24 -220 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 8154 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.35.17 chr1 - 1799 15 full-splice_match INTS11 ENST00000419704.5 1798 15 -5 4 0 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 GAACAAAAGACTACTTGGTA -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.35.19 chr1 - 1000 4 incomplete-splice_match INTS11 ENST00000526797.5 659 7 3 3855 -2 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TTTGTTGTGAAACTTTAATT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.35.20 chr1 - 1527 3 full-splice_match INTS11 ENST00000498173.2 1589 3 61 1 -1 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TTTTGTTGTGAAACTTTAAT 31 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.35.21 chr1 - 1092 4 full-splice_match INTS11 ENST00000429572.5 1104 4 9 3 1 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.893603 0.770381 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TTTTGTTGTGAAACTTTAAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 22 NA PB.36.2 chr1 - 3027 15 full-splice_match DVL1 ENST00000378888.10 3305 15 277 1 -29 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACAGATGTGTGGCCTGTGCC 9405 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.36.3 chr1 - 2622 13 incomplete-splice_match DVL1 ENST00000378891.9 2926 15 6642 3 -2105 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACAGATGTGTGGCCTGTGCC 6973 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.36.4 chr1 - 2514 12 incomplete-splice_match DVL1 ENST00000378891.9 2926 15 6956 3 -1791 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACAGATGTGTGGCCTGTGCC 7287 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.36.5 chr1 - 1797 5 incomplete-splice_match DVL1 ENST00000378891.9 2926 15 9698 3 8 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACAGATGTGTGGCCTGTGCC 9984 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.36.6 chr1 - 1873 6 incomplete-splice_match DVL1 ENST00000378891.9 2926 15 9480 3 -210 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACAGATGTGTGGCCTGTGCC 9811 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.36.7 chr1 - 1645 4 incomplete-splice_match DVL1 ENST00000378891.9 2926 15 10558 3 868 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACAGATGTGTGGCCTGTGCC 1529 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.36.8 chr1 - 1524 3 incomplete-splice_match DVL1 ENST00000378891.9 2926 15 10764 3 1074 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACAGATGTGTGGCCTGTGCC 1735 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.36.11 chr1 - 2953 15 full-splice_match DVL1 ENST00000378891.9 2926 15 -31 4 -31 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GACAGATGTGTGGCCTGTGC 9403 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.36.12 chr1 - 2678 13 incomplete-splice_match DVL1 ENST00000378888.10 3305 15 6966 2 -2087 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GACAGATGTGTGGCCTGTGC 6991 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.36.13 chr1 - 1418 2 incomplete-splice_match DVL1 ENST00000378891.9 2926 15 10954 4 1264 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GACAGATGTGTGGCCTGTGC 1925 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.37.1 chr1 - 1985 10 novel_in_catalog MXRA8 novel 2001 10 NA NA 0 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTTGTCCCAGGTATGCTTC 3 TRUE NA NA AAAACA -30 NA NA NA 3 NA PB.37.2 chr1 - 2280 10 full-splice_match MXRA8 ENST00000309212.11 2293 10 12 1 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 29 7.768840 0.890356 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACTTGTCCCAGGTATGCT 3 TRUE NA NA AAAACA -30 NA NA NA 29 NA PB.37.3 chr1 - 1996 8 novel_not_in_catalog MXRA8 novel 2293 10 NA NA 0 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACTTGTCCCAGGTATGCT -9 TRUE NA NA AAAACA -42 NA NA NA 2 NA PB.37.5 chr1 - 2487 9 novel_in_catalog MXRA8 novel 2293 10 NA NA 10 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGACTTGTCCCAGGTATGC 13 TRUE NA NA AAAACA -20 NA NA NA 3 NA PB.37.6 chr1 - 2141 9 novel_not_in_catalog MXRA8 novel 2001 10 NA NA 0 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGACTTGTCCCAGGTATGC 3 TRUE NA NA AAAACA -30 NA NA NA 2 NA PB.37.7 chr1 - 1603 6 incomplete-splice_match MXRA8 ENST00000309212.11 2293 10 3562 2 23 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGACTTGTCCCAGGTATGC 6804 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.38.1 chr1 - 760 4 full-splice_match AURKAIP1 ENST00000338338.10 753 4 18 -25 -16 19 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTGCCGGGTGTGAGGTCT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.38.2 chr1 - 847 4 full-splice_match AURKAIP1 ENST00000338338.10 753 4 -70 -24 -70 18 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 150 40.183655 1.604049 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CATTTGCCGGGTGTGAGGTC 238 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 150 NA PB.38.3 chr1 - 1028 3 novel_in_catalog AURKAIP1 novel 753 4 NA NA -11 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCCTGCGGGTCTGGAGCTCC -32 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.38.4 chr1 - 812 4 full-splice_match AURKAIP1 ENST00000321751.9 798 4 -13 -1 -9 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.893603 0.770381 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCCTGCGGGTCTGGAGCTCC 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 22 NA PB.38.5 chr1 - 871 3 full-splice_match AURKAIP1 ENST00000338370.7 1072 3 198 3 185 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTTCCTGCGGGTCTGGAGCT 556 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.38.6 chr1 - 1039 4 novel_in_catalog AURKAIP1 novel 875 4 NA NA -16 2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTTTCCTGCGGGTCTGGAGC -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.38.7 chr1 - 863 4 novel_not_in_catalog AURKAIP1 novel 798 4 NA NA -213 2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTTTCCTGCGGGTCTGGAGC 95 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.38.8 chr1 - 828 4 novel_not_in_catalog AURKAIP1 novel 875 4 NA NA -16 1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CCTTTCCTGCGGGTCTGGAG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.38.10 chr1 - 1349 2 incomplete-splice_match AURKAIP1 ENST00000378853.3 875 4 -9 0 -9 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.286257 0.632078 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGCCTTTCCTGCGGGTCTGG 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.38.11 chr1 - 1168 3 novel_in_catalog AURKAIP1 novel 875 4 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGCCTTTCCTGCGGGTCTGG -21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.38.12 chr1 - 1090 3 full-splice_match AURKAIP1 ENST00000338370.7 1072 3 -25 7 -9 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 56 15.001898 1.176146 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGCCTTTCCTGCGGGTCTGG 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 56 NA PB.38.13 chr1 - 1066 4 full-splice_match AURKAIP1 ENST00000338338.10 753 4 -314 1 -314 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.482584 0.541902 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGCCTTTCCTGCGGGTCTGG -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.38.14 chr1 - 963 4 full-splice_match AURKAIP1 ENST00000338338.10 753 4 -211 1 -211 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGCCTTTCCTGCGGGTCTGG 97 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.38.15 chr1 - 897 4 novel_in_catalog AURKAIP1 novel 753 4 NA NA 0 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGCCTTTCCTGCGGGTCTGG -21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.38.16 chr1 - 888 4 full-splice_match AURKAIP1 ENST00000378853.3 875 4 -13 0 -13 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 90 24.110193 1.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGCCTTTCCTGCGGGTCTGG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 90 NA PB.40.1 chr1 - 2368 12 novel_not_in_catalog CCNL2 novel 1598 12 NA NA 0 1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTTATGTTCTCCTAATTT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.40.2 chr1 - 5039 11 novel_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATTTTATGTTCTCCTAAT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.40.3 chr1 - 3936 12 novel_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATTTTATGTTCTCCTAAT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.40.4 chr1 - 3090 11 full-splice_match CCNL2 ENST00000400809.8 3112 11 21 1 3 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATTTTATGTTCTCCTAAT 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.40.6 chr1 - 4309 12 novel_not_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA 1 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAGATTTTATGTTCTCCTAA -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.40.7 chr1 - 2612 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 1470 -1000 41 -2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAGATTTTATGTTCTCCTAA 8268 FALSE NA NA AGTAAA -45 NA NA NA 3 NA PB.40.8 chr1 - 4860 10 novel_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA -3 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACATCCGGAGCGTTATGGAC -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.40.9 chr1 - 3025 11 novel_not_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA 3 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACATCCGGAGCGTTATGGAC 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.40.10 chr1 - 1203 3 full-splice_match CCNL2 ENST00000463260.5 1941 3 737 1 737 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACATCCGGAGCGTTATGGAC 3110 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.40.11 chr1 - 2448 12 novel_in_catalog CCNL2 novel 1598 12 NA NA 1 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGGACATCCGGAGCGTTATG -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.40.12 chr1 - 2335 11 novel_not_in_catalog CCNL2 novel 3112 11 NA NA -2 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGGACATCCGGAGCGTTATG -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.40.13 chr1 - 2196 11 full-splice_match CCNL2 ENST00000400809.8 3112 11 128 788 102 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGGACATCCGGAGCGTTATG 8619 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.40.14 chr1 - 1736 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 1560 -214 39 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGGACATCCGGAGCGTTATG 8358 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.40.16 chr1 - 4327 11 novel_not_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAGGACATCCGGAGCGTTAT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.40.18 chr1 - 4248 11 novel_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 23 6.161494 0.789686 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCAGGACATCCGGAGCGT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 23 NA PB.40.19 chr1 - 3820 12 novel_in_catalog CCNL2 novel 1598 12 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCAGGACATCCGGAGCGT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.40.20 chr1 - 3134 12 novel_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA 3 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.946801 0.469351 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCAGGACATCCGGAGCGT 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.40.21 chr1 - 2313 11 full-splice_match CCNL2 ENST00000400809.8 3112 11 7 792 0 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCAGGACATCCGGAGCGT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.40.22 chr1 - 2141 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 1151 -210 275 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCAGGACATCCGGAGCGT 7949 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.40.23 chr1 - 1627 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 1665 -210 40 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCAGGACATCCGGAGCGT 8463 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.40.24 chr1 - 1371 4 incomplete-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 2210 -210 585 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCAGGACATCCGGAGCGT 9008 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.40.25 chr1 - 1940 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 1351 -209 -78 -2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CACTCAGGACATCCGGAGCG 8149 FALSE NA NA AAGAAA -10 NA NA NA 4 NA PB.40.26 chr1 - 2206 11 full-splice_match CCNL2 ENST00000400809.8 3112 11 -2 908 -2 89 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 46 12.322988 1.090716 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATCTGTGTTGAAAGTCGTAT -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 46 NA PB.40.28 chr1 - 3236 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 -154 0 37 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGTTAAAGCTATGTATGAA 9562 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.40.29 chr1 - 2853 11 novel_not_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA 1 20 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGAACTTGAATCCCGTCAGC -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.40.31 chr1 - 2122 11 novel_not_in_catalog CCNL2 novel 1598 12 NA NA 0 5 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TATGTATGAAAACTCAGAAC -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.40.33 chr1 - 1496 3 full-splice_match CCNL2 ENST00000463260.5 1941 3 233 212 233 1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGCTATGTATGAAAACTCA 2606 FALSE NA NA AAGAAA -8 NA NA NA 2 NA PB.40.34 chr1 - 3454 8 novel_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA -2701 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGCTATGTATGAAAACTC 6824 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.40.35 chr1 - 2263 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 824 -5 -52 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGCTATGTATGAAAACTC 7622 FALSE NA NA TTTAAA -24 NA NA NA 3 NA PB.40.36 chr1 - 1602 8 incomplete-splice_match CCNL2 ENST00000400809.8 3112 11 3832 997 2784 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGCTATGTATGAAAACTC 6738 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.40.37 chr1 - 1388 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 1699 -5 74 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGCTATGTATGAAAACTC 8497 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.40.39 chr1 - 4163 12 novel_in_catalog CCNL2 novel 4452 13 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TAAAGCTATGTATGAAAACT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.40.40 chr1 - 2921 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 165 -4 165 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TAAAGCTATGTATGAAAACT 9881 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.40.41 chr1 - 2663 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 423 -4 -348 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TAAAGCTATGTATGAAAACT 7221 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.40.42 chr1 - 2554 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 532 -4 -239 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TAAAGCTATGTATGAAAACT 7330 FALSE NA NA AATAAA -45 NA NA NA 2 NA PB.40.43 chr1 - 2426 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 660 -4 -111 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.482584 0.541902 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TAAAGCTATGTATGAAAACT 7458 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.40.44 chr1 - 2204 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 882 -4 6 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TAAAGCTATGTATGAAAACT 7680 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.40.45 chr1 - 2019 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 1067 -4 191 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TAAAGCTATGTATGAAAACT 7865 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.40.46 chr1 - 1769 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 1317 -4 -112 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TAAAGCTATGTATGAAAACT 8115 FALSE NA NA ATTAAA -8 NA NA NA 10 NA PB.40.47 chr1 - 1006 3 full-splice_match CCNL2 ENST00000463260.5 1941 3 721 214 721 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.214692 0.507139 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TAAAGCTATGTATGAAAACT 3094 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.40.48 chr1 - 4042 11 novel_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA -1 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 74 19.823936 1.297190 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TTAAAGCTATGTATGAAAAC -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 74 NA PB.40.49 chr1 - 1174 4 incomplete-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 2198 -1 573 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.822039 0.683231 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AGTTAAAGCTATGTATGAAA 8996 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.40.51 chr1 - 4619 10 novel_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA 3 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGTTAAAGCTATGTATGAA 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.40.52 chr1 - 2930 12 novel_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA -3 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.822039 0.683231 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGTTAAAGCTATGTATGAA 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.40.53 chr1 - 2507 13 novel_in_catalog CCNL2 novel 1598 12 NA NA 0 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGTTAAAGCTATGTATGAA -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.40.54 chr1 - 2237 12 novel_in_catalog CCNL2 novel 1598 12 NA NA -2 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGTTAAAGCTATGTATGAA -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.40.55 chr1 - 1592 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 1490 0 -31 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGTTAAAGCTATGTATGAA 8288 FALSE NA NA AGTAAA -25 NA NA NA 6 NA PB.40.56 chr1 - 1357 6 incomplete-splice_match CCNL2 ENST00000492998.5 745 7 420 -830 420 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGTTAAAGCTATGTATGAA 8843 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.40.59 chr1 - 2852 8 incomplete-splice_match CCNL2 ENST00000496007.5 4452 13 -17 3843 -1 811 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 GAAAAAAGAAAGCACGCTAT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.40.60 chr1 - 1860 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000408918.8 1186 6 0 -674 0 -461 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTGTGTTGCTTCTGATTCT 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.40.61 chr1 - 943 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000408918.8 1186 6 247 -4 -114 4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGATTTCATTTGTTTTTAA 8756 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.40.62 chr1 - 1100 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000408918.8 1186 6 87 -1 79 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CTCAAGATTTCATTTGTTTT 8596 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.40.63 chr1 - 1190 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000408918.8 1186 6 -11 7 0 -7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 88 23.574411 1.372441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TATATGTTCTCAAGATTTCA -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 88 NA PB.41.1 chr1 - 1525 5 novel_not_in_catalog MRPL20 novel 700 4 NA NA 0 2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTTTAGAGTCATTTTCTGGT -19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.41.2 chr1 - 839 5 novel_not_in_catalog MRPL20 novel 700 4 NA NA 0 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTTTTTAGAGTCATTTTCT -19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.41.3 chr1 - 820 5 novel_in_catalog MRPL20 novel 700 4 NA NA 0 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTTTTTAGAGTCATTTTCT -19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.41.4 chr1 - 693 4 novel_not_in_catalog MRPL20 novel 700 4 NA NA 0 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTTTTTAGAGTCATTTTCT -19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.41.5 chr1 - 754 5 novel_not_in_catalog MRPL20 novel 700 4 NA NA 8 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAGTTTTTAGAGTCATTTTC -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.41.6 chr1 - 1031 4 novel_in_catalog MRPL20 novel 700 4 NA NA 8 1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TCAGTTTTTAGAGTCATTTT -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.41.7 chr1 - 697 4 full-splice_match MRPL20 ENST00000344843.12 700 4 0 3 0 1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 104 27.860668 1.444991 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TCAGTTTTTAGAGTCATTTT -19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 104 NA PB.41.8 chr1 - 1707 3 full-splice_match MRPL20 ENST00000487659.1 1693 3 -14 0 8 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TTCAGTTTTTAGAGTCATTT -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.41.9 chr1 - 1364 4 novel_in_catalog MRPL20 novel 1693 3 NA NA -10 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TTCAGTTTTTAGAGTCATTT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.41.10 chr1 - 1870 4 novel_not_in_catalog MRPL20 novel 1693 3 NA NA -13 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CTTCAGTTTTTAGAGTCATT -32 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.41.11 chr1 - 567 4 full-splice_match MRPL20 ENST00000344843.12 700 4 3 130 0 -126 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTTTGTTTGATTTATACTT -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.42.1 chr1 + 1694 3 full-splice_match MRPL20-AS1 ENST00000690954.1 1673 3 -27 6 1 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAATTACTCTGTCTCTTTTC -4 TRUE NA NA TATAAA -14 NA NA NA 5 NA PB.42.2 chr1 + 1618 3 full-splice_match MRPL20-AS1 ENST00000444362.3 1759 3 5 136 1 -96 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGAGTGTTTGAGTTTCATT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.42.4 chr1 + 1751 3 full-splice_match MRPL20-AS1 ENST00000444362.3 1759 3 6 2 -1 1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 137 36.701073 1.564679 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACTCTGTCTCTTTTCCTAA -3 TRUE NA NA TATAAA -18 NA NA NA 137 NA PB.42.5 chr1 + 2146 2 full-splice_match MRPL20-AS1 ENST00000685968.1 2170 2 18 6 -1 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAATTACTCTGTCTCTTTTC -24 TRUE NA NA TATAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.42.6 chr1 + 2188 2 full-splice_match MRPL20-AS1 ENST00000418833.2 2196 2 11 -3 0 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.482584 0.541902 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAACAAACTGCAAATTACTC -23 TRUE NA NA TATAAA -3 NA NA NA 13 NA PB.42.7 chr1 + 2480 1 full-splice_match MRPL20-AS1 ENST00000692532.1 2483 1 0 3 0 -3 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAACAAACTGCAAATTACTC -14 TRUE NA NA TATAAA -3 NA NA NA 10 NA PB.42.8 chr1 + 1888 3 novel_not_in_catalog MRPL20-AS1 novel 1843 3 NA NA 0 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAACAAACTGCAAATTACTC -12 TRUE NA NA TATAAA -3 NA NA NA 3 NA PB.42.9 chr1 + 1998 2 full-splice_match MRPL20-AS1 ENST00000570344.1 515 2 2 -1485 2 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAACAAACTGCAAATTACTC 0 TRUE NA NA TATAAA -3 NA NA NA 2 NA PB.42.10 chr1 + 1932 2 full-splice_match MRPL20-AS1 ENST00000418833.2 2196 2 267 -3 -9 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAACAAACTGCAAATTACTC 233 FALSE NA NA TATAAA -3 NA NA NA 4 NA PB.42.11 chr1 + 1572 2 full-splice_match MRPL20-AS1 ENST00000418833.2 2196 2 627 -3 -262 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAACAAACTGCAAATTACTC 348 FALSE NA NA TATAAA -3 NA NA NA 3 NA PB.42.12 chr1 + 1369 1 full-splice_match MRPL20-AS1 ENST00000687493.1 2209 1 826 14 242 -3 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAACAAACTGCAAATTACTC 852 FALSE NA NA TATAAA -3 NA NA NA 4 NA PB.42.13 chr1 + 1224 1 full-splice_match MRPL20-AS1 ENST00000687493.1 2209 1 971 14 387 -3 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAACAAACTGCAAATTACTC 997 FALSE NA NA TATAAA -3 NA NA NA 2 NA PB.42.14 chr1 + 1085 1 full-splice_match MRPL20-AS1 ENST00000687493.1 2209 1 1110 14 526 -3 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAACAAACTGCAAATTACTC 1136 FALSE NA NA TATAAA -3 NA NA NA 2 NA PB.42.15 chr1 + 916 1 full-splice_match MRPL20-AS1 ENST00000687493.1 2209 1 1290 3 706 -3 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAATTACTCTGTCTCTTTTC 1316 FALSE NA NA TATAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.43.1 chr1 + 1983 3 full-splice_match VWA1 ENST00000338660.5 2147 3 163 1 -4 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAGCCTGCAGTCTCGCTAGG -18 TRUE NA NA AGTAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.43.2 chr1 + 2377 3 full-splice_match VWA1 ENST00000476993.2 4492 3 0 2115 0 2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CCTGCAGTCTCGCTAGGATG -14 TRUE NA NA AGTAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.45.1 chr1 - 1793 2 full-splice_match ANKRD65 ENST00000442470.1 876 2 -201 -716 -17 -2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTGGGTGTCTGAGAGGTT 914 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.45.2 chr1 - 1640 2 full-splice_match ANKRD65 ENST00000442470.1 876 2 -48 -716 -32 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTGGGTGTCTGAGAGGTT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.46.1 chr1 + 3487 16 novel_not_in_catalog ATAD3B novel 4314 14 NA NA -16 1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CGCCGTGTCTCTCTATTGAC 2054 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.46.2 chr1 + 2453 16 full-splice_match ATAD3B ENST00000673477.1 4098 16 -2 1647 -2 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 33 8.840405 0.946472 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCGCCGTGTCTCTCTATTG -9 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 33 NA PB.46.4 chr1 + 2354 17 novel_not_in_catalog ATAD3B novel 4098 16 NA NA -6 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCGCCGTGTCTCTCTATTG 6 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 6 NA PB.46.5 chr1 + 2324 16 full-splice_match ATAD3B ENST00000673477.1 4098 16 127 1647 108 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCGCCGTGTCTCTCTATTG 120 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.46.6 chr1 + 2128 15 incomplete-splice_match ATAD3B ENST00000673477.1 4098 16 5509 1645 -752 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CGCCGTGTCTCTCTATTGAC 5502 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.46.7 chr1 + 2461 14 full-splice_match ATAD3B ENST00000472194.6 4314 14 206 1647 206 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCGCCGTGTCTCTCTATTG 383 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.46.8 chr1 + 1940 13 incomplete-splice_match ATAD3B ENST00000472194.6 4314 14 1030 1647 7 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.482584 0.541902 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCGCCGTGTCTCTCTATTG 1207 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 13 NA PB.46.9 chr1 + 1798 11 incomplete-splice_match ATAD3B ENST00000472194.6 4314 14 4131 1647 -1328 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCGCCGTGTCTCTCTATTG 4308 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.46.10 chr1 + 1611 10 incomplete-splice_match ATAD3B ENST00000472194.6 4314 14 4559 1647 -900 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCGCCGTGTCTCTCTATTG 4736 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 5 NA PB.46.11 chr1 + 1316 7 incomplete-splice_match ATAD3B ENST00000472194.6 4314 14 8136 1647 1593 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCGCCGTGTCTCTCTATTG 8313 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.46.12 chr1 + 1067 4 incomplete-splice_match ATAD3B ENST00000472194.6 4314 14 11178 1645 4635 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CGCCGTGTCTCTCTATTGAC NA FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 5 NA PB.46.13 chr1 + 1182 3 incomplete-splice_match ATAD3B ENST00000485748.5 3233 10 6584 1 5500 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCGCCGTGTCTCTCTATTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.46.14 chr1 + 879 3 incomplete-splice_match ATAD3B ENST00000485748.5 3233 10 6887 1 5803 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCGCCGTGTCTCTCTATTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.48.1 chr1 - 1449 5 novel_not_in_catalog SSU72 novel 1284 5 NA NA 2 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTGTGCCTGGTCCTGAATT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.48.2 chr1 - 1304 5 full-splice_match SSU72 ENST00000291386.4 1284 5 -21 1 -21 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 793 212.437592 2.327231 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTGTGCCTGGTCCTGAATT -29 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 793 NA PB.48.3 chr1 - 1138 5 full-splice_match SSU72 ENST00000291386.4 1284 5 145 1 -131 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTGTGCCTGGTCCTGAATT 656 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.48.4 chr1 - 1063 5 full-splice_match SSU72 ENST00000291386.4 1284 5 220 1 -56 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 384 102.870155 2.012290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTGTGCCTGGTCCTGAATT -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 384 NA PB.48.5 chr1 - 916 5 full-splice_match SSU72 ENST00000291386.4 1284 5 367 1 88 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTGTGCCTGGTCCTGAATT 878 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.48.6 chr1 - 785 4 incomplete-splice_match SSU72 ENST00000291386.4 1284 5 10059 1 9780 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTGTGCCTGGTCCTGAATT 9829 FALSE NA NA CATAAA -19 NA NA NA 10 NA PB.48.7 chr1 - 1046 5 full-splice_match SSU72 ENST00000291386.4 1284 5 0 238 0 -237 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AGATGAAAGCAATCAAGTTT -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.48.9 chr1 - 2960 2 full-splice_match SSU72 ENST00000359060.5 4176 2 -277 1493 2 -1493 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.822039 0.683231 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GACATCCTGTTTTTGACAAT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.48.10 chr1 - 2731 2 full-splice_match SSU72 ENST00000359060.5 4176 2 -59 1504 -56 -1504 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCTTAGCCTGACATCCTG -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.48.14 chr1 - 1213 2 full-splice_match SSU72 ENST00000359060.5 4176 2 -270 3233 9 -3233 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATTTTGTTATAGTGAGTGA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.49.1 chr1 - 2025 1 full-splice_match FNDC10 ENST00000422725.4 2124 1 97 2 97 -2 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAGAGCTGTCTGTGTGTT -19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.49.2 chr1 - 1730 1 full-splice_match FNDC10 ENST00000422725.4 2124 1 392 2 392 -2 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAGAGCTGTCTGTGTGTT 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.49.3 chr1 - 1470 2 genic FNDC10 novel 2124 1 NA NA -591 -2 multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAGAGCTGTCTGTGTGTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.49.4 chr1 - 1487 1 full-splice_match FNDC10 ENST00000422725.4 2124 1 635 2 635 -2 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAGAGCTGTCTGTGTGTT 631 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.49.5 chr1 - 965 1 full-splice_match FNDC10 ENST00000422725.4 2124 1 1157 2 1157 -2 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAGAGCTGTCTGTGTGTT 1153 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.49.6 chr1 - 740 1 full-splice_match FNDC10 ENST00000422725.4 2124 1 1377 7 1377 -7 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGACCAACAGAGCTGTCTGT 1373 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.50.1 chr1 + 2541 16 full-splice_match ATAD3A ENST00000378756.8 2481 16 -61 1 -61 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG 6412 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.50.2 chr1 + 3849 15 novel_in_catalog ATAD3A novel 2481 16 NA NA -8 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TTGCCCTGTCTGTCTCTTGG -3 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.50.3 chr1 + 2486 16 full-splice_match ATAD3A ENST00000378756.8 2481 16 -6 1 -6 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 186 49.827732 1.697471 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG -1 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 186 NA PB.50.4 chr1 + 2429 16 novel_not_in_catalog ATAD3A novel 2481 16 NA NA -2 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG 3 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.50.5 chr1 + 2555 17 novel_in_catalog ATAD3A novel 2266 17 NA NA 0 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG 8 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.50.6 chr1 + 2390 17 novel_not_in_catalog ATAD3A novel 2266 17 NA NA 3 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 37 9.911968 0.996160 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG 11 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 37 NA PB.50.8 chr1 + 2291 16 full-splice_match ATAD3A ENST00000378756.8 2481 16 189 1 -34 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG 194 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 8 NA PB.50.9 chr1 + 2337 16 full-splice_match ATAD3A ENST00000536055.6 2330 16 -8 1 -8 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG 365 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.50.10 chr1 + 2091 14 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000536055.6 2330 16 4781 1 241 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.214692 0.507139 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG 4769 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 12 NA PB.50.11 chr1 + 1948 13 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000536055.6 2330 16 5227 1 136 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG 5215 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 9 NA PB.50.12 chr1 + 1831 11 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000536055.6 2330 16 7639 1 2548 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 24 6.429385 0.808169 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG 7627 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 24 NA PB.50.13 chr1 + 1666 10 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000536055.6 2330 16 8045 1 2954 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG 8033 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 9 NA PB.50.14 chr1 + 1617 9 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000536055.6 2330 16 10220 1 -1205 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.50.15 chr1 + 1456 8 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000536055.6 2330 16 10992 1 -433 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 8 NA PB.50.16 chr1 + 1366 7 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000536055.6 2330 16 11353 1 -72 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 20 5.357821 0.728988 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 20 NA PB.50.17 chr1 + 1272 6 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000536055.6 2330 16 11755 1 330 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.50.18 chr1 + 1102 4 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000536055.6 2330 16 13936 1 2511 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 8 NA PB.50.19 chr1 + 1002 3 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000400830.4 830 8 3774 -542 3774 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 8 NA PB.50.20 chr1 + 796 2 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000400830.4 830 8 5340 -542 5340 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.51.1 chr1 - 2023 1 full-splice_match ENSG00000272106 ENST00000607222.1 2038 1 10 5 10 -5 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 13 3.482584 0.541902 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACCAACTGTTTTTTGTTTTG 0 TRUE NA NA GGGGCT -45 NA NA NA 13 NA PB.51.2 chr1 - 1081 1 full-splice_match ENSG00000272106 ENST00000607222.1 2038 1 952 5 952 -5 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACCAACTGTTTTTTGTTTTG 1327 FALSE NA NA ACTAAA -39 NA NA NA 4 NA PB.51.3 chr1 - 779 1 full-splice_match ENSG00000272106 ENST00000607222.1 2038 1 1254 5 1254 -5 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACCAACTGTTTTTTGTTTTG 1629 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.51.4 chr1 - 1531 1 full-splice_match ENSG00000272106 ENST00000607222.1 2038 1 501 6 501 -6 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACCAACTGTTTTTTGTTTT 876 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.52.3 chr1 - 1759 10 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000341832.11 2992 20 18602 4 18570 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAAGCTCCCCGTGTCGTCCT 9234 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.52.4 chr1 - 1511 8 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000341832.11 2992 20 21152 4 21120 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAAGCTCCCCGTGTCGTCCT NA FALSE NA NA AATACA -4 NA NA NA 4 NA PB.52.5 chr1 - 1396 7 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000341832.11 2992 20 21515 4 21483 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAAGCTCCCCGTGTCGTCCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.52.6 chr1 - 1314 6 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000341832.11 2992 20 21802 4 21770 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAAGCTCCCCGTGTCGTCCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.52.8 chr1 - 952 3 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000341832.11 2992 20 22538 4 22506 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAAGCTCCCCGTGTCGTCCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.52.10 chr1 - 2624 20 full-splice_match CDK11B ENST00000341832.11 2992 20 3 365 3 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAGAGCTGTGTTTTCTCCG -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.52.11 chr1 - 2154 16 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000340677.9 2534 21 9389 -148 9349 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAGAGCTGTGTTTTCTCCG 9568 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 3 NA PB.52.12 chr1 - 2051 16 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000340677.9 2534 21 9492 -148 9452 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAGAGCTGTGTTTTCTCCG 9671 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.52.13 chr1 - 1814 11 novel_in_catalog CDK11B novel 2227 18 NA NA 17216 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAGAGCTGTGTTTTCTCCG 7880 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.52.14 chr1 - 1564 12 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000407249.7 2677 20 17301 3 17261 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAGAGCTGTGTTTTCTCCG 7925 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.52.15 chr1 - 1208 9 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000407249.7 2677 20 20486 3 20446 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAGAGCTGTGTTTTCTCCG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.52.16 chr1 - 1020 7 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000407249.7 2677 20 21538 3 21498 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAGAGCTGTGTTTTCTCCG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.52.17 chr1 - 1382 10 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000407249.7 2677 20 18625 4 18585 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAAAGAGCTGTGTTTTCTCC 9249 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.52.18 chr1 - 828 5 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000407249.7 2677 20 22010 4 21970 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAAAGAGCTGTGTTTTCTCC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.52.19 chr1 - 2593 20 novel_not_in_catalog CDK11B novel 2992 20 NA NA 0 -7 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGAAAGAGCTGTGTTTTC -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.52.23 chr1 - 921 7 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000407249.7 2677 20 -19 6763 -19 -578 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTGTGAGTCTTTTCTGGGG 160 FALSE NA NA GGGGCT -7 NA NA NA 2 NA PB.52.24 chr1 - 909 8 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000340677.9 2534 21 4 6648 -4 -614 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTGAGGCCAGGCCGGCGCCT -21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.52.25 chr1 - 939 7 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000407249.7 2677 20 -73 6799 -73 -614 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTGAGGCCAGGCCGGCGCCT 106 FALSE NA NA CATAAA -13 NA NA NA 3 NA PB.52.26 chr1 - 818 7 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000407249.7 2677 20 48 6799 8 -614 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTGAGGCCAGGCCGGCGCCT 23 TRUE NA NA AAGAAA -44 NA NA NA 3 NA PB.52.27 chr1 - 880 7 novel_not_in_catalog CDK11B novel 2992 20 NA NA 3 -616 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGTGAGGCCAGGCCGGCGC -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.52.34 chr1 - 5932 9 full-splice_match SLC35E2B ENST00000611123.1 5948 9 16 0 -3 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTGCTTTGTTTTCTTCCTT 109 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.52.45 chr1 - 3175 9 full-splice_match SLC35E2B ENST00000611123.1 5948 9 -43 2816 24 -513 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAACAGAGCAATAATTCTGA 50 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.52.49 chr1 - 1126 7 incomplete-splice_match CDK11A ENST00000356200.7 2653 19 18106 6 35 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGGAAAGAGCTGTGTTTTCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.52.53 chr1 - 837 7 incomplete-splice_match CDK11A ENST00000358779.9 2419 20 -3 6601 -3 -4874 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.214692 0.507139 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTGTGAGTCTTTTCTGGGG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.52.54 chr1 - 837 7 incomplete-splice_match CDK11A ENST00000357760.6 2446 20 -12 6637 -12 -4910 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTGAGGCCAGGCCGGCGCCT -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.52.55 chr1 - 838 7 incomplete-splice_match CDK11A ENST00000460465.5 2333 20 -12 6639 -12 -4912 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGTGAGGCCAGGCCGGCGC -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.52.59 chr1 - 2018 7 full-splice_match SLC35E2A ENST00000647043.1 2078 7 59 1 59 -1 alternative_5end TRUE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGAGCTCTCCCTGCTTTGTT 210 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.52.60 chr1 - 2204 7 full-splice_match SLC35E2A ENST00000647043.1 2078 7 -128 2 -55 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGAGCTCTCCCTGCTTTGT 23 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.53.1 chr1 - 3486 12 novel_in_catalog NADK novel 3235 12 NA NA 16 -7 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.53.2 chr1 - 3179 12 full-splice_match NADK ENST00000341426.9 3235 12 49 7 -1 -7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 32 8.572514 0.933108 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 32 NA PB.53.3 chr1 - 3113 12 full-splice_match NADK ENST00000341991.7 3098 12 -22 7 -22 -7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.53.4 chr1 - 2807 10 incomplete-splice_match NADK ENST00000341426.9 3235 12 16455 7 -3440 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 4394 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.53.5 chr1 - 2538 8 incomplete-splice_match NADK ENST00000342348.9 1722 10 2042 -1232 75 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 9876 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.53.6 chr1 - 2393 7 novel_in_catalog NADK novel 1722 10 NA NA 27 -7 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 9208 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.53.7 chr1 - 2296 5 incomplete-splice_match NADK ENST00000342348.9 1722 10 3899 -1232 190 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 4212 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.53.8 chr1 - 2186 5 incomplete-splice_match NADK ENST00000342348.9 1722 10 4009 -1232 -183 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 4322 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.53.9 chr1 - 2013 3 incomplete-splice_match NADK ENST00000342348.9 1722 10 4417 -1232 225 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 4730 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.53.10 chr1 - 1887 2 incomplete-splice_match NADK ENST00000498806.1 269 3 752 -1736 752 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 5257 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.53.18 chr1 - 3277 12 novel_in_catalog NADK novel 3235 12 NA NA -68 -9 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AGAAAATAAGCTGGGTTAAT 9088 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.53.19 chr1 - 1991 2 incomplete-splice_match NADK ENST00000498806.1 269 3 646 -1734 646 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AGAAAATAAGCTGGGTTAAT 5151 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.53.20 chr1 - 2648 9 incomplete-splice_match NADK ENST00000342348.9 1722 10 1320 -1192 13 -47 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTACGCTTTTCAGATCCTT 9154 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.53.22 chr1 - 1909 12 full-splice_match NADK ENST00000341426.9 3235 12 48 1278 -2 -39 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 52 13.930334 1.143962 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTTGAGCTGCCATGCTTTTC 18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 52 NA PB.53.23 chr1 - 2025 12 novel_in_catalog NADK novel 3235 12 NA NA -95 -49 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAACCTTCCTTGAGCTGC 9061 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.53.24 chr1 - 1765 11 incomplete-splice_match NADK ENST00000341426.9 3235 12 13024 1288 -6871 -49 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAACCTTCCTTGAGCTGC 963 FALSE NA NA AATAAA -37 NA NA NA 5 NA PB.53.25 chr1 - 1685 9 novel_in_catalog NADK novel 1722 10 NA NA 9 -49 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAACCTTCCTTGAGCTGC 9150 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.53.26 chr1 - 1549 10 incomplete-splice_match NADK ENST00000341426.9 3235 12 16432 1288 -3463 -49 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAACCTTCCTTGAGCTGC 4371 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.53.27 chr1 - 1318 8 incomplete-splice_match NADK ENST00000342348.9 1722 10 1981 49 14 -49 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAACCTTCCTTGAGCTGC 9815 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.53.28 chr1 - 1179 7 incomplete-splice_match NADK ENST00000342348.9 1722 10 2279 49 31 -49 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAACCTTCCTTGAGCTGC 2592 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.54.1 chr1 + 1014 2 full-splice_match MIB2 ENST00000477990.1 2821 2 -83 1890 -21 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAGGATTTGGTTTCTAT NA FALSE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 3 NA PB.54.2 chr1 + 3246 20 full-splice_match MIB2 ENST00000355826.10 3206 20 -41 1 5 0 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACGTTGCCTCTGCTGTCTGC NA FALSE NA NA TATAAA -16 NA NA NA 4 NA PB.54.3 chr1 + 1034 2 full-splice_match MIB2 ENST00000507082.1 1578 2 -34 578 1 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAGGATTTGGTTTCTAT -11 TRUE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 6 NA PB.54.4 chr1 + 2028 13 incomplete-splice_match MIB2 ENST00000504599.6 3311 19 9286 0 29 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACGTTGCCTCTGCTGTCTGC 507 FALSE NA NA TATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.54.5 chr1 + 1702 10 incomplete-splice_match MIB2 ENST00000514234.5 2562 16 3272 0 214 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACGTTGCCTCTGCTGTCTGC 1985 FALSE NA NA TATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.54.6 chr1 + 1520 8 incomplete-splice_match MIB2 ENST00000514234.5 2562 16 3768 2 48 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GGACGTTGCCTCTGCTGTCT 2481 FALSE NA NA TATAAA -14 NA NA NA 8 NA PB.54.7 chr1 + 1401 8 incomplete-splice_match MIB2 ENST00000514234.5 2562 16 3891 -2 171 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GTTGCCTCTGCTGTCTGCCT 35 FALSE NA NA TATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.54.8 chr1 + 1029 6 incomplete-splice_match MIB2 ENST00000514234.5 2562 16 4543 0 -144 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACGTTGCCTCTGCTGTCTGC 298 FALSE NA NA TATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.54.9 chr1 + 840 4 incomplete-splice_match MIB2 ENST00000483015.1 1058 5 543 -14 -74 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GACGTTGCCTCTGCTGTCTG 8 TRUE NA NA TATAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.55.2 chr1 - 3067 11 full-splice_match GNB1 ENST00000610897.4 3145 11 76 2 46 -1 alternative_5end TRUE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTTTGGTGTGGTGATTATT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.55.4 chr1 - 2701 8 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 75226 2 2525 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 20 5.357821 0.728988 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GACTTTGGTGTGGTGATTAT 2442 FALSE NA NA AATAAA -38 NA NA NA 20 NA PB.55.10 chr1 - 2175 4 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 100615 4 3725 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.554148 0.658407 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGGACTTTGGTGTGGTGATT 112 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.55.11 chr1 - 2115 4 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 100675 4 3785 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGGACTTTGGTGTGGTGATT 172 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.55.12 chr1 - 3068 13 novel_not_in_catalog GNB1 novel 3163 12 NA NA -24 -5 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGGACTTTGGTGTGGTGAT 1330 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.55.13 chr1 - 3062 12 full-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 96 5 -25 -5 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.214692 0.507139 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGGACTTTGGTGTGGTGAT 764 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.55.14 chr1 - 2996 11 full-splice_match GNB1 ENST00000610897.4 3145 11 143 6 -8 -5 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGGACTTTGGTGTGGTGAT 781 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.55.15 chr1 - 2967 12 novel_in_catalog GNB1 novel 3163 12 NA NA -39 -5 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGGACTTTGGTGTGGTGAT 1315 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.55.16 chr1 - 2956 12 full-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 202 5 -49 -5 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGGACTTTGGTGTGGTGAT 870 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.55.17 chr1 - 2598 7 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 84543 5 11842 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.018365 0.604049 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGGACTTTGGTGTGGTGAT 9257 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.55.18 chr1 - 2449 6 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 86585 5 -10305 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.946801 0.469351 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGGACTTTGGTGTGGTGAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.55.19 chr1 - 2276 4 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 100513 5 3623 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 20 5.357821 0.728988 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGGACTTTGGTGTGGTGAT 10 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 20 NA PB.55.20 chr1 - 1976 3 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 101938 5 5048 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 23 6.161494 0.789686 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGGACTTTGGTGTGGTGAT 1435 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 23 NA PB.55.21 chr1 - 1808 2 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 103721 5 6831 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 28 7.500949 0.875116 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGGACTTTGGTGTGGTGAT 3218 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 28 NA PB.55.29 chr1 - 2162 8 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 75237 530 2536 -530 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAAAAAAAAAGTTCTGTT 2453 FALSE NA NA AATAAA -27 NA NA NA 4 NA PB.55.30 chr1 - 2005 6 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 86504 530 -10386 -530 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAAAAAAAAAGTTCTGTT NA FALSE NA NA AAAACA -5 NA NA NA 4 NA PB.55.37 chr1 - 1313 3 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 101818 788 4928 -788 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATTTTAAAAATTTTGATT 1315 FALSE NA NA AAGAAA -2 NA NA NA 2 NA PB.55.38 chr1 - 1629 13 novel_not_in_catalog GNB1 novel 3163 12 NA NA -46 1235 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACTTGAGTGTAATTGTCA 1308 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.55.40 chr1 - 1554 11 full-splice_match GNB1 ENST00000610897.4 3145 11 124 1467 -27 1235 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACTTGAGTGTAATTGTCA 762 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.55.41 chr1 - 1492 12 full-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 205 1466 -46 1235 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.482584 0.541902 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACTTGAGTGTAATTGTCA 873 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.55.42 chr1 - 1109 7 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 84571 1466 11870 1235 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACTTGAGTGTAATTGTCA 9285 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.55.43 chr1 - 1506 12 novel_in_catalog GNB1 novel 3163 12 NA NA -44 1230 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAGGTAAACTTGAGTGTAAT 1310 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.55.44 chr1 - 1480 12 novel_in_catalog GNB1 novel 3163 12 NA NA -7399 1230 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAGGTAAACTTGAGTGTAAT NA FALSE NA NA AATACA -42 NA NA NA 2 NA PB.55.45 chr1 - 1376 10 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 65587 1471 54 1230 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.214692 0.507139 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAGGTAAACTTGAGTGTAAT 6849 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 12 NA PB.55.46 chr1 - 1590 12 full-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 101 1472 -20 1229 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.893603 0.770381 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 GAAGGTAAACTTGAGTGTAA 769 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 22 NA PB.55.47 chr1 - 915 6 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 86652 1472 -10238 1229 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 GAAGGTAAACTTGAGTGTAA 18 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.55.48 chr1 - 1248 9 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 73233 1474 532 1227 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.625712 0.750178 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 CAGAAGGTAAACTTGAGTGT 449 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 21 NA PB.58.1 chr1 - 1333 3 incomplete-splice_match TMEM52 ENST00000602604.1 878 4 148 -510 137 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TCTGCCTATGTGGGAAGGAC 153 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.58.2 chr1 - 923 5 full-splice_match TMEM52 ENST00000310991.8 935 5 9 3 0 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGGTCTCTGCCTATGTGGGA 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.58.3 chr1 - 1234 2 full-splice_match TMEM52 ENST00000378602.3 1118 2 -124 8 -124 -7 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAAGTGGTCTCTGCCTATGT 353 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.59.1 chr1 + 2314 18 full-splice_match PRKCZ ENST00000378567.8 2385 18 66 5 -8 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 44 11.787206 1.071411 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGGAAGCTCCTCTGATGCCT -2 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 44 NA PB.59.2 chr1 + 2179 18 full-splice_match PRKCZ ENST00000378567.8 2385 18 200 6 108 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GTGGAAGCTCCTCTGATGCC 132 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.59.3 chr1 + 2031 17 incomplete-splice_match PRKCZ ENST00000378567.8 2385 18 5084 9 54 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GATGTGGAAGCTCCTCTGAT 5016 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.59.6 chr1 + 1529 11 incomplete-splice_match PRKCZ ENST00000479263.5 1747 13 4421 2 3485 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGCTCCTCTGATGCCTTTT 2187 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.59.7 chr1 + 948 6 incomplete-splice_match PRKCZ ENST00000505322.5 1859 8 3471 0 3344 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGCTCCTCTGATGCCTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.63.1 chr1 - 2133 6 novel_in_catalog FAAP20 novel 2216 7 NA NA -2 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATCTGCCTAGTATTTGACT 13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.63.3 chr1 - 1482 4 novel_not_in_catalog FAAP20 novel 811 4 NA NA -292 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATCTGCCTAGTATTTGACT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.63.4 chr1 - 1515 4 full-splice_match FAAP20 ENST00000400918.7 811 4 0 -704 0 -7 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 28 7.500949 0.875116 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAATCTGCCTAGTATTTGAC 311 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 28 NA PB.63.5 chr1 - 1474 4 novel_not_in_catalog FAAP20 novel 2216 7 NA NA 1 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGCATTTCAATCTGCCTAGT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.63.6 chr1 - 1378 3 full-splice_match FAAP20 ENST00000400919.7 1413 3 16 19 -8 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TCAGCATTTCAATCTGCCTA 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.63.8 chr1 - 855 5 incomplete-splice_match FAAP20 ENST00000428120.5 2313 8 -31 5073 0 -3 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAACGTCTGCCGCTTTTCTT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.63.9 chr1 - 709 4 full-splice_match FAAP20 ENST00000378546.9 727 4 15 3 -6 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.822039 0.683231 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAACGTCTGCCGCTTTTCTT 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.63.10 chr1 - 663 4 novel_not_in_catalog FAAP20 novel 2313 8 NA NA 0 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAACGTCTGCCGCTTTTCTT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.63.12 chr1 - 1567 4 full-splice_match FAAP20 ENST00000420515.1 1544 4 -24 1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTGGACATTTTGTGCATT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.64.1 chr1 + 3649 2 incomplete-splice_match SKI ENST00000378536.5 6083 7 77816 104 2489 -104 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAAGAAAAGAGCTTGGCA 2483 FALSE NA NA TATAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.65.1 chr1 - 1641 14 full-splice_match MORN1 ENST00000378531.8 1645 14 2 2 2 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TATGGAGGGCACTGCTCCTT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.65.2 chr1 - 1677 13 novel_in_catalog MORN1 novel 1645 14 NA NA 11 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TATGGAGGGCACTGCTCCTT 15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.65.3 chr1 - 1248 8 incomplete-splice_match MORN1 ENST00000378529.7 1500 11 138 16839 -15 -338 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGTTTTTGTGTGAATGTGT 142 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.66.1 chr1 - 2811 6 full-splice_match PEX10 ENST00000447513.7 2835 6 17 7 -7 -7 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATCACTTGGTAAAACGT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.66.3 chr1 - 1990 6 full-splice_match PEX10 ENST00000447513.7 2835 6 21 824 -3 40 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 115 30.807468 1.488656 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGATGGAACTTGAGATTTCC 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 115 NA PB.66.4 chr1 - 2061 6 novel_in_catalog PEX10 novel 2835 6 NA NA -24 39 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.822039 0.683231 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGATGGAACTTGAGATTTC 18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.66.5 chr1 - 1828 6 full-splice_match PEX10 ENST00000447513.7 2835 6 159 848 51 16 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAATGTGGGTACGTTACTAA 1434 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.66.6 chr1 - 2119 6 novel_in_catalog PEX10 novel 2905 6 NA NA -46 15 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATGTGGGTACGTTACTA -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.66.7 chr1 - 2032 6 novel_not_in_catalog PEX10 novel 2905 6 NA NA 11 15 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.946801 0.469351 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATGTGGGTACGTTACTA -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.66.8 chr1 - 1688 4 incomplete-splice_match PEX10 ENST00000447513.7 2835 6 3749 849 1189 15 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATGTGGGTACGTTACTA 5024 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.66.9 chr1 - 1574 4 incomplete-splice_match PEX10 ENST00000447513.7 2835 6 3863 849 1303 15 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATGTGGGTACGTTACTA 5138 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.66.10 chr1 - 1425 4 novel_in_catalog PEX10 novel 2835 6 NA NA 1448 15 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATGTGGGTACGTTACTA 5283 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.66.11 chr1 - 1317 3 incomplete-splice_match PEX10 ENST00000447513.7 2835 6 5675 850 3115 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CAAAATGTGGGTACGTTACT 6950 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.66.12 chr1 - 1091 2 incomplete-splice_match PEX10 ENST00000447513.7 2835 6 5999 852 3439 12 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGCAAAATGTGGGTACGTTA 7274 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.66.13 chr1 - 1417 6 full-splice_match PEX10 ENST00000447513.7 2835 6 21 1397 -3 -533 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATGGACTGAATGAGTGCGT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.67.1 chr1 + 1402 7 novel_not_in_catalog RER1 novel 2469 6 NA NA -582 4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TTGAGATTATTTTGACACAT 5789 FALSE NA NA TATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.67.2 chr1 + 1383 7 full-splice_match RER1 ENST00000605895.6 3028 7 -34 1679 -21 6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 178 47.684605 1.678378 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAGATTATTTTGACACATTT 6403 FALSE NA NA TATAAA -24 NA NA NA 178 NA PB.67.3 chr1 + 1493 7 full-splice_match RER1 ENST00000378512.5 1404 7 -85 -4 -23 4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TTGAGATTATTTTGACACAT 6401 FALSE NA NA TATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.67.4 chr1 + 1098 9 novel_not_in_catalog RER1 novel 695 8 NA NA -23 75 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATCGCATGGATTTCTTTTT 6401 FALSE NA NA AAGAAA -16 NA NA NA 4 NA PB.67.5 chr1 + 1552 9 novel_not_in_catalog RER1 novel 695 8 NA NA -21 7 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGATTATTTTGACACATTTC 6403 FALSE NA NA TATAAA -25 NA NA NA 2 NA PB.67.6 chr1 + 1038 8 novel_not_in_catalog RER1 novel 1404 7 NA NA -21 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGGGAGTCAAATTTTCTTTT 6403 FALSE NA NA CATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.67.7 chr1 + 1462 8 novel_not_in_catalog RER1 novel 695 8 NA NA -20 4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TTGAGATTATTTTGACACAT 6404 FALSE NA NA TATAAA -22 NA NA NA 4 NA PB.67.8 chr1 + 1072 8 novel_not_in_catalog RER1 novel 695 8 NA NA -18 74 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 27 7.233058 0.859322 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATCGCATGGATTTCTTTT 6406 FALSE NA NA AAGAAA -15 NA NA NA 27 NA PB.67.9 chr1 + 915 7 full-splice_match RER1 ENST00000605895.6 3028 7 -22 2135 -9 74 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 175 46.880932 1.670996 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATCGCATGGATTTCTTTT 6415 FALSE NA NA AAGAAA -15 NA NA NA 175 NA PB.67.10 chr1 + 1517 8 novel_not_in_catalog RER1 novel 695 8 NA NA -9 4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.214692 0.507139 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TTGAGATTATTTTGACACAT 6415 FALSE NA NA TATAAA -22 NA NA NA 12 NA PB.67.11 chr1 + 1001 8 novel_not_in_catalog RER1 novel 695 8 NA NA -9 74 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 32 8.572514 0.933108 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATCGCATGGATTTCTTTT 6415 FALSE NA NA AAGAAA -15 NA NA NA 32 NA PB.67.12 chr1 + 951 8 novel_not_in_catalog RER1 novel 695 8 NA NA -3 3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAGTCAAATTTTCTTTTTAA -20 TRUE NA NA CATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.67.13 chr1 + 3041 7 full-splice_match RER1 ENST00000605895.6 3028 7 -14 1 -1 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 67 17.948700 1.254033 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCTGAATTACTTCTCAA -18 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 67 NA PB.67.14 chr1 + 1442 8 novel_not_in_catalog RER1 novel 695 8 NA NA -1 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 24 6.429385 0.808169 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATTGTTTGAGATTATTTTGA -18 TRUE NA NA TATAAA -17 NA NA NA 24 NA PB.67.16 chr1 + 907 8 novel_not_in_catalog RER1 novel 695 8 NA NA 0 4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGTCAAATTTTCTTTTTAAA -17 TRUE NA NA CATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.67.17 chr1 + 2451 7 full-splice_match RER1 ENST00000605895.6 3028 7 -4 581 -4 -581 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACTCTCTGGCGCAGGTTAA -8 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.67.18 chr1 + 1389 8 full-splice_match RER1 ENST00000306256.13 695 8 0 -694 0 7 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGATTATTTTGACACATTTC -2 TRUE NA NA TATAAA -25 NA NA NA 2 NA PB.67.19 chr1 + 1328 7 full-splice_match RER1 ENST00000605895.6 3028 7 19 1681 3 4 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 35 9.376186 0.972026 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TTGAGATTATTTTGACACAT 15 TRUE NA NA TATAAA -22 NA NA NA 35 NA PB.67.20 chr1 + 2972 7 novel_not_in_catalog RER1 novel 2469 6 NA NA 174 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCTGAATTACTTCTCAA 219 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.67.21 chr1 + 754 7 novel_not_in_catalog RER1 novel 2469 6 NA NA 176 3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAGTCAAATTTTCTTTTTAA 221 FALSE NA NA CATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.67.22 chr1 + 1175 6 full-splice_match RER1 ENST00000488353.2 2469 6 1836 -542 1836 7 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGATTATTTTGACACATTTC 3996 FALSE NA NA TATAAA -25 NA NA NA 3 NA PB.67.23 chr1 + 1056 5 incomplete-splice_match RER1 ENST00000488353.2 2469 6 3189 -532 3189 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAATTGTTTGAGATTATTTT 5349 FALSE NA NA TATAAA -15 NA NA NA 7 NA PB.67.24 chr1 + 2702 4 incomplete-splice_match RER1 ENST00000605895.6 3028 7 7588 1 -2522 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCTGAATTACTTCTCAA 7584 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.67.25 chr1 + 1001 4 incomplete-splice_match RER1 ENST00000488353.2 2469 6 5438 -532 -2508 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAATTGTTTGAGATTATTTT 7598 FALSE NA NA TATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.67.26 chr1 + 2453 2 full-splice_match RER1 ENST00000462129.1 585 2 340 -2208 340 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCTGAATTACTTCTCAA NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.68.1 chr1 + 1059 1 full-splice_match ENSG00000272449 ENST00000606645.2 1061 1 0 2 0 -2 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA NA NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTTCTGCCTGAGTTTCTG 0 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.69.1 chr1 + 1564 9 novel_in_catalog TNFRSF14 novel 1702 8 NA NA -19 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAACTGTCACCTCCCGGTGT 1492 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.69.2 chr1 + 1937 9 novel_in_catalog TNFRSF14 novel 1702 8 NA NA -1 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAACTGTCACCTCCCGGTGT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.69.3 chr1 + 1800 9 novel_in_catalog TNFRSF14 novel 1702 8 NA NA -42 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAACTGTCACCTCCCGGTGT 49 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.69.4 chr1 + 1544 9 novel_in_catalog TNFRSF14 novel 1702 8 NA NA -107 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GGCTCCTGTTTTCTATTTGT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.69.5 chr1 + 1675 8 full-splice_match TNFRSF14 ENST00000355716.5 1702 8 24 3 9 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAACTGTCACCTCCCGGTGT 11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.69.6 chr1 + 1513 8 full-splice_match TNFRSF14 ENST00000355716.5 1702 8 186 3 0 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAACTGTCACCTCCCGGTGT -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.69.7 chr1 + 1050 5 incomplete-splice_match TNFRSF14 ENST00000466750.5 2603 6 2061 0 294 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAACTGTCACCTCCCGGTGT 15 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.70.1 chr1 + 2681 7 full-splice_match PRXL2B ENST00000493183.5 840 7 -11 -1830 -11 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GAGCCACTTTTTGTGCTTTC 858 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.70.2 chr1 + 2744 7 full-splice_match PRXL2B ENST00000378424.9 2765 7 16 5 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GAGCCACTTTTTGTGCTTTC -12 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.70.3 chr1 + 2712 7 novel_in_catalog PRXL2B novel 2689 7 NA NA 0 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CACTTTTTGTGCTTTCTTCT -10 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.70.4 chr1 + 2671 7 full-splice_match PRXL2B ENST00000378427.6 2689 7 18 0 -1 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 56 15.001898 1.176146 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCCACTTTTTGTGCTTTCT 8 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 56 NA PB.70.5 chr1 + 2705 7 full-splice_match PRXL2B ENST00000419916.8 2747 7 40 2 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 47 12.590878 1.100056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CACTTTTTGTGCTTTCTTCT 9 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 47 NA PB.70.6 chr1 + 2503 5 incomplete-splice_match PRXL2B ENST00000378425.9 2665 6 304 0 12 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTTTTTGTGCTTTCTTCTT -29 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.70.7 chr1 + 2576 6 incomplete-splice_match PRXL2B ENST00000419916.8 2747 7 312 1 4 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 24 6.429385 0.808169 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTTTTTGTGCTTTCTTCTT 6 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 24 NA PB.70.8 chr1 + 2539 6 incomplete-splice_match PRXL2B ENST00000378427.6 2689 7 291 1 4 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 28 7.500949 0.875116 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GAGCCACTTTTTGTGCTTTC 6 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 28 NA PB.70.9 chr1 + 2366 6 incomplete-splice_match PRXL2B ENST00000378427.6 2689 7 463 2 176 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGAGCCACTTTTTGTGCTTT 178 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 3 NA PB.70.10 chr1 + 2371 5 incomplete-splice_match PRXL2B ENST00000419916.8 2747 7 962 1 654 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTTTTTGTGCTTTCTTCTT 656 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.70.11 chr1 + 2286 4 incomplete-splice_match PRXL2B ENST00000378427.6 2689 7 1593 -6 -203 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TTTTTGTGCTTTCTTCTTTT 1308 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.70.12 chr1 + 2079 2 full-splice_match PRXL2B ENST00000476686.1 2506 2 429 -2 429 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTTTGTGCTTTCTTCTTTTA 1940 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.71.2 chr1 + 1292 2 intergenic novelGene_42 novel NA NA NA NA NA NA multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATATTCGAGAGACATCTGTG 4609 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.73.2 chr1 - 3049 18 novel_in_catalog PANK4 novel 2641 19 NA NA -12 -7 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAGAGGCCGGAGCCATCT -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.73.3 chr1 - 2647 19 full-splice_match PANK4 ENST00000378466.9 2641 19 -13 7 -12 -7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 23 6.161494 0.789686 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAGAGGCCGGAGCCATCT -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 23 NA PB.73.4 chr1 - 2604 19 novel_in_catalog PANK4 novel 2641 19 NA NA -3 -7 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAGAGGCCGGAGCCATCT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.73.5 chr1 - 1684 13 incomplete-splice_match PANK4 ENST00000378466.9 2641 19 7360 7 59 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAGAGGCCGGAGCCATCT 9910 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.73.6 chr1 - 977 7 incomplete-splice_match PANK4 ENST00000378466.9 2641 19 13630 7 47 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAGAGGCCGGAGCCATCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.73.7 chr1 - 1472 9 incomplete-splice_match PANK4 ENST00000378466.9 2641 19 -4 9386 -3 1281 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGTGTGATCCGGCCTTCT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.74.1 chr1 + 3238 14 novel_in_catalog ARHGEF16 novel 2822 15 NA NA -24 -5 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAACCTGGATTTTCACAG 25 FALSE NA NA ATTAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.74.2 chr1 + 2813 15 full-splice_match ARHGEF16 ENST00000378378.9 2822 15 4 5 4 -5 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAACCTGGATTTTCACAG 0 TRUE NA NA ATTAAA -11 NA NA NA 8 NA PB.74.3 chr1 + 2823 15 novel_not_in_catalog ARHGEF16 novel 2822 15 NA NA 11 -5 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAACCTGGATTTTCACAG 7 TRUE NA NA ATTAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.74.4 chr1 + 2812 15 novel_not_in_catalog ARHGEF16 novel 2822 15 NA NA 38 -5 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAACCTGGATTTTCACAG -3 TRUE NA NA ATTAAA -11 NA NA NA 3 NA PB.74.6 chr1 + 2039 13 full-splice_match ARHGEF16 ENST00000378373.5 2211 13 165 7 165 -7 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TTAAGAACCTGGATTTTCAC 285 FALSE NA NA ATTAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.74.7 chr1 + 1263 6 incomplete-splice_match ARHGEF16 ENST00000378371.6 2219 12 9006 6 3208 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAGAACCTGGATTTTCACA 4353 FALSE NA NA ATTAAA -10 NA NA NA 2 NA PB.75.3 chr1 - 2970 3 novel_in_catalog MEGF6 novel 4501 30 NA NA -177 -19 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAACAGACTAGACTGCAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.75.4 chr1 - 2741 3 full-splice_match MEGF6 ENST00000494257.1 1174 3 775 -2342 775 -19 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAACAGACTAGACTGCAT 3370 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.78.1 chr1 - 1312 5 incomplete-splice_match WRAP73 ENST00000378322.7 1998 11 14787 1 162 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTTCTCTTCTTGAAACGTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.78.2 chr1 - 1513 11 incomplete-splice_match WRAP73 ENST00000270708.12 1692 12 2550 -1 2473 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TACTTCTCTTCTTGAAACGT 2536 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.78.3 chr1 - 2046 11 novel_not_in_catalog WRAP73 novel 1692 12 NA NA 0 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACTACTTCTCTTCTTGAAA -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.78.4 chr1 - 2036 11 full-splice_match WRAP73 ENST00000378322.7 1998 11 -45 7 0 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 30 8.036731 0.905079 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACAACTACTTCTCTTCTTGA -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 30 NA PB.78.7 chr1 - 1294 10 incomplete-splice_match WRAP73 ENST00000270708.12 1692 12 3391 2 3314 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACTACTTCTCTTCTTGAAA 3377 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.78.8 chr1 - 1032 7 incomplete-splice_match WRAP73 ENST00000270708.12 1692 12 14111 2 -542 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACTACTTCTCTTCTTGAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.78.9 chr1 - 1673 12 full-splice_match WRAP73 ENST00000270708.12 1692 12 16 3 16 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 53 14.198225 1.152234 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAACTACTTCTCTTCTTGAA 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 53 NA PB.78.10 chr1 - 1888 10 novel_in_catalog WRAP73 novel 1998 11 NA NA 13 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACAACTACTTCTCTTCTTGA -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.78.11 chr1 - 1616 12 novel_not_in_catalog WRAP73 novel 1692 12 NA NA 6 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACAACTACTTCTCTTCTTGA -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.78.12 chr1 - 1202 9 incomplete-splice_match WRAP73 ENST00000270708.12 1692 12 11323 5 845 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TACAACTACTTCTCTTCTTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.79.1 chr1 + 2480 11 novel_not_in_catalog TP73 novel 1358 6 NA NA -9189 537 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACATGGTGGGTCAGCTTTTT 3 TRUE NA NA GATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.80.2 chr1 - 847 1 full-splice_match TP73-AS1 ENST00000624167.1 988 1 130 11 130 -1 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTCTTGTTCCTGGGAATTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.82.2 chr1 - 3614 6 novel_in_catalog TP73-AS1 novel 2363 6 NA NA -2 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACCCTTGTGCTGAAAGCACT -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.82.4 chr1 - 3526 5 full-splice_match TP73-AS1 ENST00000423764.6 3525 5 -2 1 -2 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACCCTTGTGCTGAAAGCACT -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.82.6 chr1 - 1863 5 full-splice_match TP73-AS1 ENST00000423764.6 3525 5 1661 1 193 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACCCTTGTGCTGAAAGCACT 1653 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.82.10 chr1 - 1654 4 incomplete-splice_match TP73-AS1 ENST00000650037.1 2564 6 3637 -61 99 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CACCCTTGTGCTGAAAGCAC 4277 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.82.11 chr1 - 2552 5 full-splice_match TP73-AS1 ENST00000650039.1 2307 5 -498 253 -2 64 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TCACCTGAATCTAGGCTTCC -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.83.2 chr1 - 2654 7 full-splice_match LRRC47 ENST00000378251.3 4303 7 -12 1661 -12 915 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 155 41.523109 1.618290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGCTTGTGTAAAGACTCT -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 155 NA PB.83.3 chr1 - 2434 7 novel_not_in_catalog LRRC47 novel 4303 7 NA NA 2 915 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGCTTGTGTAAAGACTCT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.83.4 chr1 - 2296 7 novel_not_in_catalog LRRC47 novel 4303 7 NA NA 4 915 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGCTTGTGTAAAGACTCT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.83.5 chr1 - 2261 7 full-splice_match LRRC47 ENST00000378251.3 4303 7 381 1661 381 915 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGCTTGTGTAAAGACTCT 380 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.83.6 chr1 - 1888 6 incomplete-splice_match LRRC47 ENST00000378251.3 4303 7 9305 1661 -3018 915 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGCTTGTGTAAAGACTCT 9304 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.83.7 chr1 - 1779 6 incomplete-splice_match LRRC47 ENST00000378251.3 4303 7 9414 1661 -2909 915 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGCTTGTGTAAAGACTCT 9413 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.83.8 chr1 - 1613 6 incomplete-splice_match LRRC47 ENST00000378251.3 4303 7 9580 1661 -2743 915 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGCTTGTGTAAAGACTCT 9579 FALSE NA NA GGGGCT -19 NA NA NA 10 NA PB.83.9 chr1 - 1531 5 incomplete-splice_match LRRC47 ENST00000378251.3 4303 7 11307 1661 -1016 915 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGCTTGTGTAAAGACTCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.83.10 chr1 - 1358 4 full-splice_match LRRC47 ENST00000462356.5 575 4 132 -915 4 915 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGCTTGTGTAAAGACTCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.83.11 chr1 - 1297 3 incomplete-splice_match LRRC47 ENST00000462356.5 575 4 1425 -915 1297 915 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.018365 0.604049 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGCTTGTGTAAAGACTCT NA FALSE NA NA AATACA -19 NA NA NA 15 NA PB.83.15 chr1 - 2317 7 full-splice_match LRRC47 ENST00000378251.3 4303 7 4 1982 4 594 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATTATTCAAGTGTCAGAATT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.83.16 chr1 - 1541 6 incomplete-splice_match LRRC47 ENST00000378251.3 4303 7 9311 2002 -3012 574 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTTTACGGTTTTTGATGGG 9310 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.85.1 chr1 + 1237 4 full-splice_match SMIM1 ENST00000642557.4 506 4 22 -753 0 727 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCCCTTGCCATAGTTACCT -13 TRUE NA NA AATGAA -12 NA NA NA 4 NA PB.85.2 chr1 + 1036 4 full-splice_match SMIM1 ENST00000642557.4 506 4 22 -552 0 526 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAGTAAGTGGGCACAGTTCT -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.85.3 chr1 + 1287 4 full-splice_match SMIM1 ENST00000444870.7 547 4 -13 -727 3 727 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCCCTTGCCATAGTTACCT -10 TRUE NA NA AATGAA -12 NA NA NA 3 NA PB.86.1 chr1 - 1271 8 incomplete-splice_match CEP104 ENST00000675966.1 7766 17 16715 2697 1934 456 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTTTTTTTAATCGTAGTTTT 7873 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.86.2 chr1 - 3721 22 full-splice_match CEP104 ENST00000378230.8 6431 22 0 2710 0 443 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGAGAACATCTTTTTTT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.86.3 chr1 - 1807 11 incomplete-splice_match CEP104 ENST00000675966.1 7766 17 12062 2710 -2719 443 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGAGAACATCTTTTTTT 3220 FALSE NA NA AATATA -4 NA NA NA 2 NA PB.86.4 chr1 - 1378 9 incomplete-splice_match CEP104 ENST00000675966.1 7766 17 16178 2710 1397 443 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGAGAACATCTTTTTTT 7336 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.86.5 chr1 - 1342 4 incomplete-splice_match CEP104 ENST00000675966.1 7766 17 22121 2710 7340 443 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGAGAACATCTTTTTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.86.11 chr1 - 1675 12 incomplete-splice_match CEP104 ENST00000461667.2 3328 20 9732 6567 203 349 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAACAAAAGAAAGAAGAA 9884 FALSE NA NA AAGAAA -21 NA NA NA 3 NA PB.86.13 chr1 - 1184 7 incomplete-splice_match CEP104 ENST00000675966.1 7766 17 8485 17257 -368 349 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAACAAAAGAAAGAAGAA NA FALSE NA NA AAAAAG -37 NA NA NA 2 NA PB.86.15 chr1 - 1508 9 incomplete-splice_match CEP104 ENST00000461667.2 3328 20 17455 6569 -2626 347 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AGAAAAACAAAAGAAAGAAG NA FALSE NA NA AAGAAA -39 NA NA NA 2 NA PB.86.16 chr1 - 2316 12 full-splice_match CEP104 ENST00000494653.5 2174 12 -13 -129 0 129 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AATAGAAATATTTTCATTCT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.86.21 chr1 - 1173 7 novel_not_in_catalog CEP104 novel 1661 4 NA NA 0 1297 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGATTTAGACTTTAAATCTG -19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.86.22 chr1 - 2167 4 novel_not_in_catalog CEP104 novel 1661 4 NA NA -1 46 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTATTGTCCTTATGTTCA 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.86.27 chr1 - 2932 2 incomplete-splice_match CEP104 ENST00000676046.1 1661 4 0 3236 0 -3236 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GATTACTTATTGTCCTTATG -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.87.3 chr1 - 1754 5 full-splice_match C1orf174 ENST00000680054.1 1779 5 39 -14 -12 -6 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATATTTTGAAAGCAGTC 27 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.87.4 chr1 - 1642 4 full-splice_match C1orf174 ENST00000361605.4 1645 4 -3 6 -3 -6 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 168 45.005695 1.653268 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATATTTTGAAAGCAGTC -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 168 NA PB.87.6 chr1 - 1570 4 incomplete-splice_match C1orf174 ENST00000486765.5 2517 5 4921 14 4895 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATATTTTGAAAGCAGTC 4934 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.87.7 chr1 - 1486 2 incomplete-splice_match C1orf174 ENST00000680169.1 1567 4 9102 -14 9102 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATATTTTGAAAGCAGTC 9141 FALSE NA NA GATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.87.8 chr1 - 1338 2 incomplete-splice_match C1orf174 ENST00000680169.1 1567 4 9250 -14 9250 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATATTTTGAAAGCAGTC 9289 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.87.10 chr1 - 1239 2 incomplete-splice_match C1orf174 ENST00000680169.1 1567 4 9349 -14 9349 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATATTTTGAAAGCAGTC 9388 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.87.12 chr1 - 1082 2 incomplete-splice_match C1orf174 ENST00000680169.1 1567 4 9506 -14 9506 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATATTTTGAAAGCAGTC 9545 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.88.1 chr1 + 1800 8 novel_in_catalog DFFB novel 3152 8 NA NA -4 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAATAGACATGTCAAGAA -14 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.88.2 chr1 + 3014 7 full-splice_match DFFB ENST00000378209.8 2833 7 -190 9 5 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAATAGACATGTCAAGAA 9 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.88.3 chr1 + 2851 7 full-splice_match DFFB ENST00000378209.8 2833 7 -12 -6 4 6 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGTTTGCACTCATTG -9 TRUE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 6 NA PB.88.4 chr1 + 1605 8 novel_in_catalog DFFB novel 3152 8 NA NA -2 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAATAGACATGTCAAGAA -15 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.88.5 chr1 + 2188 3 incomplete-splice_match DFFB ENST00000475969.5 2731 7 12003 9 1940 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAATAGACATGTCAAGAA 8525 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.93.2 chr1 - 1689 9 incomplete-splice_match NPHP4 ENST00000478423.6 4467 26 117769 0 -814 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTCCCTTGGCAGTTTTCTTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.93.3 chr1 - 1489 8 incomplete-splice_match NPHP4 ENST00000478423.6 4467 26 119103 1 520 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTTCCCTTGGCAGTTTTCTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.93.4 chr1 - 1885 10 incomplete-splice_match NPHP4 ENST00000478423.6 4467 26 117355 2 -1228 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTTCCCTTGGCAGTTTTCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.97.2 chr1 + 3895 16 full-splice_match KCNAB2 ENST00000378097.6 4302 16 393 14 -11 0 alternative_5end TRUE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCGGTCTCTGTGACTTTTT -28 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.97.3 chr1 + 1197 15 full-splice_match KCNAB2 ENST00000666163.1 3878 15 46 2635 0 -8 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAGGACTACAGATCCTA 2 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 3 NA PB.97.4 chr1 + 1232 16 full-splice_match KCNAB2 ENST00000378097.6 4302 16 430 2640 -1 -8 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAGGACTACAGATCCTA 9 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 2 NA PB.97.5 chr1 + 3814 15 full-splice_match KCNAB2 ENST00000666163.1 3878 15 55 9 1 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.554148 0.658407 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCGGTCTCTGTGACTTTTT 11 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 17 NA PB.97.8 chr1 + 3975 16 novel_not_in_catalog KCNAB2 novel 4001 15 NA NA -1 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCGGTCTCTGTGACTTTTT -6 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.97.9 chr1 + 3874 16 full-splice_match KCNAB2 ENST00000428161.6 2134 16 320 -2060 -1 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.946801 0.469351 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCGGTCTCTGTGACTTTTT -6 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 11 NA PB.97.12 chr1 + 3827 15 full-splice_match KCNAB2 ENST00000352527.6 4001 15 175 -1 4 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 54 14.466116 1.160352 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCGGTCTCTGTGACTTTTT -1 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 54 NA PB.97.13 chr1 + 3637 14 incomplete-splice_match KCNAB2 ENST00000669250.1 3883 15 13305 -2 4685 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GGTCTCTGTGACTTTTTGCT 5540 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 5 NA PB.97.19 chr1 + 3053 5 incomplete-splice_match KCNAB2 ENST00000662363.1 2958 14 29638 -1156 908 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCGGTCTCTGTGACTTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 9 NA PB.97.20 chr1 + 2909 3 incomplete-splice_match KCNAB2 ENST00000671076.1 4620 5 2152 5 2152 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GGTCTCTGTGACTTTTTGCT NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 8 NA PB.97.21 chr1 + 2778 2 incomplete-splice_match KCNAB2 ENST00000671076.1 4620 5 2792 8 2792 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCGGTCTCTGTGACTTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.98.1 chr1 + 1954 3 full-splice_match RNF207 ENST00000484435.1 551 3 -655 -748 -1 5 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAAAAAAATTTTTTT 5905 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.98.2 chr1 + 1576 2 novel_in_catalog RNF207 novel 551 3 NA NA -35 4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 TAAAAAAAAAAAAATTTTTT -27 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.98.3 chr1 + 1334 3 full-splice_match RNF207 ENST00000484435.1 551 3 -35 -748 -25 5 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAAAAAAATTTTTTT -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.99.4 chr1 - 2059 4 full-splice_match RPL22 ENST00000234875.9 2061 4 0 2 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 97 25.985430 1.414730 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACGAGGCTTTGTTTTTTTT 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 97 NA PB.99.5 chr1 - 1892 2 incomplete-splice_match RPL22 ENST00000234875.9 2061 4 6558 13 6516 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 23 6.161494 0.789686 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TACTCTTACTGTACGAGGCT 7842 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 23 NA PB.99.10 chr1 - 2114 4 full-splice_match RPL22 ENST00000234875.9 2061 4 -65 12 -65 -12 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTCTTACTGTACGAGGCTT 9733 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.99.15 chr1 - 1992 4 novel_not_in_catalog RPL22 novel 2061 4 NA NA 0 -85 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTTTCTATGTCTTTTTGAAC 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.99.18 chr1 - 656 2 incomplete-splice_match RPL22 ENST00000480661.1 2279 3 6585 -365 6575 365 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTTTCATTTTTTGATTACA 7901 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.99.19 chr1 - 1344 6 novel_in_catalog RPL22 novel 806 5 NA NA 60 356 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTCGTCTTACTTTCATTTT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.99.20 chr1 - 1240 5 novel_in_catalog RPL22 novel 806 5 NA NA 414 356 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTCGTCTTACTTTCATTTT 563 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.99.21 chr1 - 891 4 full-splice_match RPL22 ENST00000234875.9 2061 4 -29 1199 -29 356 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 212 56.792900 1.754294 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTCGTCTTACTTTCATTTT -19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 212 NA PB.99.22 chr1 - 2653 3 full-splice_match RPL22 ENST00000480661.1 2279 3 -19 -355 13 355 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATTCGTCTTACTTTCATTT 23 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.99.23 chr1 - 722 2 incomplete-splice_match RPL22 ENST00000480661.1 2279 3 6509 -355 6499 355 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.822039 0.683231 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATTCGTCTTACTTTCATTT 7825 FALSE NA NA ATTAAA -34 NA NA NA 18 NA PB.99.24 chr1 - 2240 3 full-splice_match RPL22 ENST00000480661.1 2279 3 -5 44 -5 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAATGGTGGTTTATCCTTG 9825 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.99.25 chr1 - 966 6 novel_in_catalog RPL22 novel 806 5 NA NA 38 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAATGGTGGTTTATCCTTG -26 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.99.26 chr1 - 956 6 novel_in_catalog RPL22 novel 806 5 NA NA 25 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAATGGTGGTTTATCCTTG 29 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.99.27 chr1 - 795 5 novel_in_catalog RPL22 novel 806 5 NA NA 436 -4 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAATGGTGGTTTATCCTTG -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.99.28 chr1 - 462 4 full-splice_match RPL22 ENST00000234875.9 2061 4 0 1599 0 -4 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 34 9.108295 0.959437 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAATGGTGGTTTATCCTTG 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 34 NA PB.99.29 chr1 - 513 4 full-splice_match RPL22 ENST00000234875.9 2061 4 -51 1599 -51 -4 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAATGGTGGTTTATCCTTG 9747 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.99.32 chr1 - 868 3 novel_in_catalog RNF207-AS1 novel 378 3 NA NA -3589 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGATATTTGAGCTGTTTTCG 24 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.101.1 chr1 + 2040 5 novel_not_in_catalog LINC00337 novel 1138 5 NA NA -82 11 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA TRUE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAATATAAGAAAAAAAAG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.102.1 chr1 - 3705 6 novel_not_in_catalog ICMT novel 2612 6 NA NA -11 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACCACAGTGTGATTGTCTG -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.102.3 chr1 - 3515 6 novel_in_catalog ICMT novel 2612 6 NA NA 1 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACCACAGTGTGATTGTCTG 14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.102.4 chr1 - 3208 6 novel_not_in_catalog ICMT novel 2612 6 NA NA -3 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACCACAGTGTGATTGTCTG 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.102.5 chr1 - 3060 5 novel_not_in_catalog ICMT novel 4795 5 NA NA -25 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACCACAGTGTGATTGTCTG -20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.102.7 chr1 - 2666 3 novel_not_in_catalog ICMT novel 1227 4 NA NA 3869 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACCACAGTGTGATTGTCTG 3882 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.102.8 chr1 - 2602 6 novel_not_in_catalog ICMT novel 2612 6 NA NA -11 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACCACAGTGTGATTGTCTG -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.102.9 chr1 - 1856 2 novel_not_in_catalog ICMT novel 328 2 NA NA -793 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACCACAGTGTGATTGTCTG 310 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.102.10 chr1 - 1692 2 novel_not_in_catalog ICMT novel 328 2 NA NA -980 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACCACAGTGTGATTGTCTG 123 FALSE NA NA ATTAAA -8 NA NA NA 2 NA PB.102.13 chr1 - 3798 7 novel_not_in_catalog ICMT novel 2612 6 NA NA -3 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAACCACAGTGTGATTGTCT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.102.15 chr1 - 1266 2 novel_not_in_catalog ICMT novel 328 2 NA NA -204 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAACCACAGTGTGATTGTCT 899 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.102.16 chr1 - 2654 6 full-splice_match ICMT ENST00000489498.5 2612 6 -3 -39 -3 39 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 23 6.161494 0.789686 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAGAGGCTTACGGGTTCAT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 23 NA PB.102.17 chr1 - 2555 5 full-splice_match ICMT ENST00000343813.10 4795 5 -19 2259 -11 39 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 106 28.396450 1.453264 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAGAGGCTTACGGGTTCAT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 106 NA PB.102.23 chr1 - 2371 5 full-splice_match ICMT ENST00000343813.10 4795 5 162 2262 162 36 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACCAAAGAGGCTTACGGGTT 175 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.102.24 chr1 - 1913 2 incomplete-splice_match ICMT ENST00000489498.5 2612 6 3966 -36 3958 36 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.822039 0.683231 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACCAAAGAGGCTTACGGGTT 3971 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.102.25 chr1 - 2350 4 full-splice_match ICMT ENST00000474756.1 1227 4 -11 -1112 -11 4 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.286257 0.632078 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATGGCTTAATGAATTTTTTC -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.102.27 chr1 - 2051 3 incomplete-splice_match ICMT ENST00000489498.5 2612 6 2437 1 2429 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTTCATGGCTTAATGAATT 2442 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.102.31 chr1 - 2172 4 incomplete-splice_match ICMT ENST00000343813.10 4795 5 1064 2301 1064 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGATTTCATGGCTTAATGAA 1077 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.102.33 chr1 - 2422 5 full-splice_match ICMT ENST00000343813.10 4795 5 -24 2397 -16 -99 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 ACACAAAAATGGGCAGACAT -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.102.34 chr1 - 1953 5 full-splice_match ICMT ENST00000343813.10 4795 5 13 2829 13 -531 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAATAATCTTAAATACTG 26 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.102.35 chr1 - 1454 5 novel_not_in_catalog ICMT novel 2612 6 NA NA -13 48 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATAGGATGCTTTGGCCCTTC -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.102.36 chr1 - 946 4 incomplete-splice_match ICMT ENST00000343813.10 4795 5 -11 10499 -3 -7093 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATGTAGTCCTTAATGCTTT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.102.37 chr1 - 845 4 incomplete-splice_match ICMT ENST00000343813.10 4795 5 -27 10616 -19 -7210 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAATATACAATTAGTGGTTT -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.104.1 chr1 + 1698 4 full-splice_match HES3 ENST00000377898.4 710 4 0 -988 0 988 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAGAGGACACCAGAGGTCTA 0 TRUE NA NA AATAAA -29 NA NA NA 2 NA PB.105.1 chr1 - 1432 9 full-splice_match ACOT7 ENST00000377845.7 1432 9 0 0 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCACGTGTCCTGGGTGGT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.105.2 chr1 - 1409 9 full-splice_match ACOT7 ENST00000377855.6 1614 9 205 0 205 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCACGTGTCCTGGGTGGT 8226 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.105.3 chr1 - 1398 9 full-splice_match ACOT7 ENST00000377842.7 1813 9 415 0 415 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.822039 0.683231 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCACGTGTCCTGGGTGGT 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.105.4 chr1 - 1435 9 full-splice_match ACOT7 ENST00000608083.5 1403 9 -36 4 -36 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 297 79.563637 1.900715 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCACGTGTCCTGGGTGGT 1 TRUE NA NA GGGGCT -16 NA NA NA 297 NA PB.105.5 chr1 - 1249 8 incomplete-splice_match ACOT7 ENST00000377842.7 1813 9 9523 0 2428 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 26 6.965167 0.842932 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCACGTGTCCTGGGTGGT 9754 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 26 NA PB.105.6 chr1 - 1061 7 incomplete-splice_match ACOT7 ENST00000377842.7 1813 9 19870 0 12775 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCACGTGTCCTGGGTGGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.105.7 chr1 - 809 4 incomplete-splice_match ACOT7 ENST00000377842.7 1813 9 40769 0 -23071 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCACGTGTCCTGGGTGGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.105.8 chr1 - 700 3 incomplete-splice_match ACOT7 ENST00000377842.7 1813 9 64389 0 549 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCACGTGTCCTGGGTGGT 196 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.105.9 chr1 - 1617 9 full-splice_match ACOT7 ENST00000377855.6 1614 9 -4 1 -4 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 71 19.020264 1.279217 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GACCCACGTGTCCTGGGTGG -30 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 71 NA PB.105.13 chr1 - 2399 5 incomplete-splice_match ACOT7 ENST00000377860.8 1472 10 -13 61227 -13 -44247 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAGAAAGAAAGAAAA 2 TRUE NA NA CATAAA -23 NA NA NA 2 NA PB.106.1 chr1 - 1579 10 full-splice_match TNFRSF25 ENST00000356876.8 1968 10 0 389 0 -24 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.822039 0.683231 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAGAAAACAAAACAAAACA -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.106.2 chr1 - 1509 9 full-splice_match TNFRSF25 ENST00000414040.6 1198 9 -52 -259 14 -24 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAGAAAACAAAACAAAACA 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.106.3 chr1 - 1294 8 incomplete-splice_match TNFRSF25 ENST00000356876.8 1968 10 1010 389 109 -24 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAGAAAACAAAACAAAACA 9940 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.107.2 chr1 - 1016 2 novel_not_in_catalog NOL9 novel 6627 12 NA NA 10876 -10 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAACATGAATTTAGTTGTG NA FALSE NA NA AAGAAA -7 NA NA NA 2 NA PB.108.2 chr1 + 2137 8 novel_not_in_catalog ESPN novel 1494 7 NA NA -1921 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTCGCTGTGGCCGCGACTTG 726 FALSE NA NA ATTAAA -30 NA NA NA 3 NA PB.108.3 chr1 + 1583 8 novel_not_in_catalog ESPN novel 1494 7 NA NA -1904 2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TACATATATTTGCATGTTCG 743 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.108.4 chr1 + 1420 6 novel_not_in_catalog ESPN novel 1494 7 NA NA -1018 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATGCCGACTTACATATATTT 1629 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.108.5 chr1 + 1496 5 novel_not_in_catalog ESPN novel 747 6 NA NA -1016 1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGGCTCCGGTTCACTCACTC 1631 FALSE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.108.6 chr1 + 1428 6 novel_not_in_catalog ESPN novel 1339 8 NA NA -8 -8 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATTTGCATGCCGACTTACA 4 TRUE NA NA AAAAAG -39 NA NA NA 2 NA PB.108.7 chr1 + 1913 6 novel_not_in_catalog ESPN novel 1339 8 NA NA 45 3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCTCCGGTTCACTCACTCGC 21 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.108.8 chr1 + 1837 7 novel_not_in_catalog ESPN novel 1339 8 NA NA 45 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTCGCTGTGGCCGCGACTT 21 TRUE NA NA ATTAAA -29 NA NA NA 8 NA PB.108.9 chr1 + 1385 6 novel_not_in_catalog ESPN novel 1339 8 NA NA 45 2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CCGACTTACATATATTTGCA 21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.108.10 chr1 + 1454 6 novel_not_in_catalog ESPN novel 813 7 NA NA 3 3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACATATATTTGCATGTTCGT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.108.11 chr1 + 1355 7 novel_not_in_catalog ESPN novel 813 7 NA NA 10 1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TTACATATATTTGCATGTTC 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.108.12 chr1 + 2041 5 novel_not_in_catalog ESPN novel 1494 7 NA NA 17 4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTCCGGTTCACTCACTCGCT -7 TRUE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.108.13 chr1 + 1517 5 novel_not_in_catalog ESPN novel 1494 7 NA NA 21 5 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATATATTTGCATGTTCGTTG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.108.14 chr1 + 1862 7 novel_not_in_catalog ESPN novel 813 7 NA NA 26 3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCTCCGGTTCACTCACTCGC 2 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.108.15 chr1 + 1951 6 novel_not_in_catalog ESPN novel 813 7 NA NA -25 4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTCCGGTTCACTCACTCGCT 4 TRUE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 9 NA PB.108.16 chr1 + 1592 4 novel_not_in_catalog ESPN novel 1494 7 NA NA -25 3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACATATATTTGCATGTTCGT 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.108.17 chr1 + 1601 5 novel_not_in_catalog ESPN novel 1494 7 NA NA -118 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTCGCTGTGGCCGCGACTT 420 FALSE NA NA ATTAAA -29 NA NA NA 2 NA PB.108.18 chr1 + 1469 5 novel_not_in_catalog ESPN novel 1494 7 NA NA 74 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTCGCTGTGGCCGCGACTT 63 FALSE NA NA ATTAAA -29 NA NA NA 2 NA PB.108.19 chr1 + 1591 4 novel_not_in_catalog ESPN novel 544 4 NA NA -21 3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCTCCGGTTCACTCACTCGC 1 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.109.4 chr1 - 2414 12 full-splice_match NOL9 ENST00000377705.6 6627 12 -12 4225 -12 -4225 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 24 6.429385 0.808169 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGAAAGTTCTTCAGGGACCT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 24 NA PB.109.5 chr1 - 1086 6 incomplete-splice_match NOL9 ENST00000377705.6 6627 12 21205 4322 77 -4322 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTTGTTCTAGTCTTCTGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.110.1 chr1 - 4486 4 full-splice_match KLHL21 ENST00000377658.8 4487 4 0 1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTTGGAGTCATTGCCTTTG -2 TRUE NA NA TATAAA -23 NA NA NA 6 NA PB.110.2 chr1 - 4315 4 full-splice_match KLHL21 ENST00000377658.8 4487 4 171 1 171 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTTGGAGTCATTGCCTTTG 995 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.110.4 chr1 - 3406 3 incomplete-splice_match KLHL21 ENST00000496707.5 824 4 371 -2656 371 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTTGGAGTCATTGCCTTTG 4248 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.110.5 chr1 - 3136 3 incomplete-splice_match KLHL21 ENST00000496707.5 824 4 641 -2656 641 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTTGGAGTCATTGCCTTTG 4518 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.110.18 chr1 - 4168 4 full-splice_match KLHL21 ENST00000377658.8 4487 4 314 5 314 -5 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATCCATTTGGAGTCATTGCC 1138 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.111.2 chr1 + 2245 11 novel_not_in_catalog ZBTB48 novel 2347 11 NA NA 6 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATTTCAGCCTGACAGTCTG -7 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.111.3 chr1 + 1260 9 novel_in_catalog ZBTB48 novel 2347 11 NA NA -4 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTCAGCCTGACAGTCTGT -1 TRUE NA NA AATAAA -23 NA NA NA 2 NA PB.111.4 chr1 + 2258 11 novel_in_catalog ZBTB48 novel 2347 11 NA NA -1 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.482584 0.541902 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTCAGCCTGACAGTCTGT 2 TRUE NA NA AATAAA -23 NA NA NA 13 NA PB.111.5 chr1 + 2292 11 novel_not_in_catalog ZBTB48 novel 2347 11 NA NA 10 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTCAGCCTGACAGTCTGT 13 TRUE NA NA AATAAA -23 NA NA NA 2 NA PB.111.6 chr1 + 2302 11 full-splice_match ZBTB48 ENST00000377674.9 2347 11 42 3 19 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GTATTTCAGCCTGACAGTCT 22 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 6 NA PB.111.7 chr1 + 1526 10 incomplete-splice_match ZBTB48 ENST00000377674.9 2347 11 1216 9 1122 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTCTCGTATTTCAGCCTGA 1149 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.112.2 chr1 + 1645 4 full-splice_match PHF13 ENST00000377648.5 3632 4 14 1973 14 -588 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCTTTTTCTTGAGTGTTA -2 TRUE NA NA AATGAA -14 NA NA NA 5 NA PB.112.3 chr1 + 3570 4 full-splice_match PHF13 ENST00000377648.5 3632 4 24 38 -7 -38 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 37 9.911968 0.996160 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CATGATTCAAGGTTCAGGCG 8 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 37 NA PB.114.1 chr1 + 1248 5 incomplete-splice_match THAP3 ENST00000054650.9 1361 6 306 2 3 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 101 27.056995 1.432280 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACGGTGTCGCTCCCATCAT -16 TRUE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 101 NA PB.114.2 chr1 + 1267 5 novel_not_in_catalog THAP3 novel 1361 6 NA NA 5 3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGTCGCTCCCATCATCATTT -4 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.114.3 chr1 + 1113 5 novel_not_in_catalog THAP3 novel 840 6 NA NA 0 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACGGTGTCGCTCCCATCATC 2 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 6 NA PB.114.4 chr1 + 1530 4 full-splice_match THAP3 ENST00000472925.1 983 4 -35 -512 -3 1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GGTGTCGCTCCCATCATCAT 5 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 5 NA PB.114.5 chr1 + 1106 4 incomplete-splice_match THAP3 ENST00000054650.9 1361 6 3657 -1 130 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GGTGTCGCTCCCATCATCAT 3335 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 5 NA PB.115.1 chr1 - 3213 16 full-splice_match DNAJC11 ENST00000377577.10 3201 16 -3 -9 0 7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 141 37.772636 1.577177 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GCTCTTCCGTGTATTGTGTG -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 141 NA PB.115.2 chr1 - 2270 8 incomplete-splice_match DNAJC11 ENST00000691481.1 3565 9 1972 -15 8 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGGCTGGCGCTCTTCCGTGT 7036 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.115.3 chr1 - 3162 16 novel_not_in_catalog DNAJC11 novel 3201 16 NA NA -2 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGAGGCTGGCGCTCTTCCGT 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.115.4 chr1 - 3047 15 full-splice_match DNAJC11 ENST00000294401.11 2210 15 105 -942 0 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGAGGCTGGCGCTCTTCCGT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.115.5 chr1 - 3068 15 incomplete-splice_match DNAJC11 ENST00000377577.10 3201 16 20823 1 44 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGAGGCTGGCGCTCTTCCGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.115.6 chr1 - 2862 13 incomplete-splice_match DNAJC11 ENST00000377577.10 3201 16 34052 1 446 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGAGGCTGGCGCTCTTCCGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.115.7 chr1 - 2625 11 incomplete-splice_match DNAJC11 ENST00000377577.10 3201 16 48917 1 -5823 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.946801 0.469351 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGAGGCTGGCGCTCTTCCGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.115.8 chr1 - 2525 10 novel_not_in_catalog DNAJC11 novel 4153 15 NA NA 535 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGAGGCTGGCGCTCTTCCGT 5719 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.115.9 chr1 - 2390 9 full-splice_match DNAJC11 ENST00000691481.1 3565 9 1188 -13 -776 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGAGGCTGGCGCTCTTCCGT 6252 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.115.10 chr1 - 2079 6 incomplete-splice_match DNAJC11 ENST00000689025.1 3549 9 7016 -13 -519 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGAGGCTGGCGCTCTTCCGT NA FALSE NA NA AATACA -28 NA NA NA 8 NA PB.115.11 chr1 - 1857 4 full-splice_match DNAJC11 ENST00000689169.1 3872 4 2030 -15 2030 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGAGGCTGGCGCTCTTCCGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.115.12 chr1 - 1752 3 incomplete-splice_match DNAJC11 ENST00000689169.1 3872 4 2241 -15 2241 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.554148 0.658407 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGAGGCTGGCGCTCTTCCGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.115.13 chr1 - 1615 2 incomplete-splice_match DNAJC11 ENST00000689169.1 3872 4 3329 -15 3329 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGAGGCTGGCGCTCTTCCGT NA FALSE NA NA CATAAA -22 NA NA NA 9 NA PB.115.19 chr1 - 2518 10 incomplete-splice_match DNAJC11 ENST00000686243.1 3712 16 50237 -12 -4491 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGAGGCTGGCGCTCTTCCG 573 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.115.20 chr1 - 1956 6 incomplete-splice_match DNAJC11 ENST00000689025.1 3549 9 7138 -12 -397 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGAGGCTGGCGCTCTTCCG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.115.21 chr1 - 1556 2 incomplete-splice_match DNAJC11 ENST00000689169.1 3872 4 3387 -14 3387 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGAGGCTGGCGCTCTTCCG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.115.22 chr1 - 2252 16 full-splice_match DNAJC11 ENST00000377577.10 3201 16 0 949 0 -6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 39 10.447750 1.019023 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AACAAACGGGTTTGGAAATT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 39 NA PB.115.23 chr1 - 2102 15 full-splice_match DNAJC11 ENST00000294401.11 2210 15 102 6 0 -6 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AACAAACGGGTTTGGAAATT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.115.24 chr1 - 1998 14 incomplete-splice_match DNAJC11 ENST00000377577.10 3201 16 23385 949 2606 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AACAAACGGGTTTGGAAATT NA FALSE NA NA ATTAAA -3 NA NA NA 2 NA PB.115.25 chr1 - 1317 8 incomplete-splice_match DNAJC11 ENST00000691481.1 3565 9 1971 939 7 -10 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TGAGAACAAACGGGTTTGGA 7035 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.115.26 chr1 - 1784 16 full-splice_match DNAJC11 ENST00000377577.10 3201 16 -3 1420 0 -477 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATGTTTTTATTTTATATT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.116.1 chr1 + 994 5 novel_in_catalog CAMTA1 novel 431 5 NA NA -16 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTGTGGGTCACTTGCGT -32 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 3 NA PB.116.2 chr1 + 1073 6 novel_not_in_catalog CAMTA1 novel 431 5 NA NA -11 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTGTGGGTCACTTGCGT -27 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.116.3 chr1 + 794 3 novel_in_catalog CAMTA1 novel 863 4 NA NA -7 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTGTGGGTCACTTGCGT -23 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.116.4 chr1 + 2129 3 incomplete-splice_match CAMTA1 ENST00000473578.5 567 4 -26 45010 0 -44830 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAGAAAAAAATGAGAAGT -16 TRUE NA NA GATAAA -24 NA NA NA 2 NA PB.116.5 chr1 + 941 5 full-splice_match CAMTA1 ENST00000461311.1 431 5 -98 -412 0 -2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 41 10.983533 1.040742 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTGTGGGTCACTTGCGT -16 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 41 NA PB.116.6 chr1 + 867 4 full-splice_match CAMTA1 ENST00000476163.5 863 4 -10 6 0 2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 29 7.768840 0.890356 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACGAATGTGTGGGTCACTT -16 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 29 NA PB.116.7 chr1 + 857 4 full-splice_match CAMTA1 ENST00000557126.5 486 4 -37 -334 0 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTGTGGGTCACTTGCGT -16 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 5 NA PB.116.8 chr1 + 705 5 novel_not_in_catalog CAMTA1 novel 431 5 NA NA 0 -7 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATAAAGTGTAATCTGTG -16 TRUE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.116.9 chr1 + 600 4 full-splice_match CAMTA1 ENST00000473578.5 567 4 -26 -7 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 59 15.805572 1.198810 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATTTAAGTTTAATGAGT -16 TRUE NA NA AATAAA -26 NA NA NA 59 NA PB.116.10 chr1 + 497 3 full-splice_match CAMTA1 ENST00000490738.5 538 3 0 41 0 -7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATAAAGTGTAATCTGTG -16 TRUE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 5 NA PB.116.11 chr1 + 858 4 novel_in_catalog CAMTA1 novel 863 4 NA NA 1 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTGTGGGTCACTTGCGT -15 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.116.12 chr1 + 1334 7 novel_not_in_catalog CAMTA1 novel 431 5 NA NA -3 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTGTGGGTCACTTGCGT 7 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 3 NA PB.116.13 chr1 + 1025 6 novel_in_catalog CAMTA1 novel 431 5 NA NA -3 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTGTGGGTCACTTGCGT 7 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 4 NA PB.116.14 chr1 + 622 5 novel_in_catalog CAMTA1 novel 392 4 NA NA -12 -6 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAATAAAGTGTAATCTGTGT -1 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.123.1 chr1 + 2180 5 full-splice_match VAMP3 ENST00000054666.11 2178 5 -10 8 -10 -8 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 112 30.003796 1.477176 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACATGATTGTGGCACCTG -23 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 112 NA PB.123.2 chr1 + 2348 6 novel_not_in_catalog VAMP3 novel 2178 5 NA NA -10 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTGTGGCACCTGTGCTCCT -23 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.123.3 chr1 + 1024 5 full-splice_match VAMP3 ENST00000054666.11 2178 5 9 1145 9 481 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGAACTATGGCTATGACC -4 TRUE NA NA TTTAAA -10 NA NA NA 3 NA PB.123.4 chr1 + 2141 5 full-splice_match VAMP3 ENST00000054666.11 2178 5 36 1 36 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 39 10.447750 1.019023 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTGTGGCACCTGTGCTCCT 23 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 39 NA PB.123.5 chr1 + 2065 4 incomplete-splice_match VAMP3 ENST00000054666.11 2178 5 2161 8 750 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACATGATTGTGGCACCTG 2148 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 4 NA PB.123.6 chr1 + 1962 3 incomplete-splice_match VAMP3 ENST00000054666.11 2178 5 5912 8 111 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.750474 0.574086 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACATGATTGTGGCACCTG 5899 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 14 NA PB.127.1 chr1 - 591 4 full-splice_match UTS2 ENST00000361696.10 591 4 -1 1 -1 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATATCATGAGTGGTTATTTT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.128.2 chr1 + 1470 11 incomplete-splice_match PER3 ENST00000377532.8 6365 22 7 36254 7 -1424 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAATTAAAAAGATGAACGA -4 TRUE NA NA ACTAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.128.3 chr1 + 6297 22 novel_in_catalog PER3 novel 6365 22 NA NA 34 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAGAAATTGTCCTGCCCTGT 52 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.128.8 chr1 + 3586 5 incomplete-splice_match PER3 ENST00000613533.4 6318 22 42969 0 -9410 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAAATTGTCCTGCCCTGTG -21 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 4 NA PB.128.11 chr1 + 3295 5 incomplete-splice_match PER3 ENST00000361923.2 6203 21 42982 2 -9123 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAGAAATTGTCCTGCCCTGT -7 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.128.12 chr1 + 2836 3 incomplete-splice_match PER3 ENST00000361923.2 6203 21 51063 1 -1042 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAAATTGTCCTGCCCTGTG 3967 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 3 NA PB.130.1 chr1 + 854 7 full-splice_match PARK7 ENST00000493373.5 624 7 -1 -229 -1 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTGATTGTTTCTTGTTTTG 254 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.130.2 chr1 + 1309 7 full-splice_match PARK7 ENST00000493678.5 1088 7 -445 224 -416 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTGATTGTTTCTTGTTTTG 7211 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.130.3 chr1 + 1948 7 novel_not_in_catalog PARK7 novel 1088 7 NA NA -383 -1107 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CATAGATTGTGATAGATTGT 7244 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.130.5 chr1 + 897 7 full-splice_match PARK7 ENST00000493678.5 1088 7 -33 224 -4 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 1003 268.694702 2.429259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTGATTGTTTCTTGTTTTG -32 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 1003 NA PB.130.6 chr1 + 866 7 novel_not_in_catalog PARK7 novel 1088 7 NA NA 0 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTGATTGTTTCTTGTTTTG -28 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.130.7 chr1 + 786 6 novel_in_catalog PARK7 novel 1088 7 NA NA 0 -5 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACTACTGATTGTTTCTTG -28 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.130.9 chr1 + 1386 5 incomplete-splice_match PARK7 ENST00000493678.5 1088 7 -27 13572 2 -24 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAAAAAAATAAAATAAAA -26 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.130.10 chr1 + 949 7 full-splice_match PARK7 ENST00000338639.10 1127 7 -46 224 2 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 433 115.996819 2.064446 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTGATTGTTTCTTGTTTTG -26 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 433 NA PB.130.11 chr1 + 837 7 full-splice_match PARK7 ENST00000493678.5 1088 7 27 224 8 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 86 23.038630 1.362457 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTGATTGTTTCTTGTTTTG 28 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 86 NA PB.130.12 chr1 + 952 7 full-splice_match PARK7 ENST00000338639.10 1127 7 12 163 12 60 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTGCAGCTCTTAACTGTC 32 TRUE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 9 NA PB.130.13 chr1 + 754 6 incomplete-splice_match PARK7 ENST00000377491.5 977 7 929 -25 56 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 19 5.089930 0.706712 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAAACTACTGATTGTTTCTT 880 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 19 NA PB.130.14 chr1 + 533 3 incomplete-splice_match PARK7 ENST00000377491.5 977 7 9011 -30 5554 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACTGATTGTTTCTTGTTTT 299 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.131.1 chr1 - 3265 4 full-splice_match ERRFI1 ENST00000377482.10 3097 4 0 -168 0 168 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TATACAGTGGAAATGAGCTG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.131.2 chr1 - 3103 4 full-splice_match ERRFI1 ENST00000377482.10 3097 4 0 -6 0 6 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 514 137.695999 2.138921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAGTAATGTTTCTTGCCTAA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 514 NA PB.131.5 chr1 - 4118 2 incomplete-splice_match ERRFI1 ENST00000474874.5 479 3 -26 7323 0 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.018365 0.604049 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TACCATTAGTAATGTTTCTT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.131.6 chr1 - 2859 3 incomplete-splice_match ERRFI1 ENST00000377482.10 3097 4 10703 0 27 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TACCATTAGTAATGTTTCTT 4467 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.131.7 chr1 - 2945 3 incomplete-splice_match ERRFI1 ENST00000377482.10 3097 4 10616 1 -60 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATACCATTAGTAATGTTTCT -3 TRUE NA NA AATAAA -23 NA NA NA 10 NA PB.131.8 chr1 - 4006 3 novel_in_catalog ERRFI1 novel 3097 4 NA NA 0 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GATACCATTAGTAATGTTTC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.131.10 chr1 - 3111 4 full-splice_match ERRFI1 ENST00000487559.1 787 4 -13 -2311 0 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 53 14.198225 1.152234 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GATACCATTAGTAATGTTTC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 53 NA PB.131.11 chr1 - 3018 3 full-splice_match ERRFI1 ENST00000469499.5 995 3 -13 -2010 0 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GATACCATTAGTAATGTTTC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.131.17 chr1 - 2748 2 incomplete-splice_match ERRFI1 ENST00000377482.10 3097 4 10921 3 245 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGATACCATTAGTAATGTTT 4685 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.131.21 chr1 - 3168 5 novel_not_in_catalog ERRFI1 novel 3097 4 NA NA 0 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATGATACCATTAGTAATGTT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.131.27 chr1 - 2551 4 full-splice_match ERRFI1 ENST00000377482.10 3097 4 70 476 44 -476 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTCCTGGGGATTGTTTGC 70 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.131.28 chr1 - 2614 4 full-splice_match ERRFI1 ENST00000377482.10 3097 4 0 483 0 -483 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.018365 0.604049 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTCAGTATTTCCTGGGGAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.131.29 chr1 - 2511 3 full-splice_match ERRFI1 ENST00000469499.5 995 3 -13 -1503 0 -509 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AAGCTGGCCTTGTGTTGCTG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.131.30 chr1 - 2344 4 full-splice_match ERRFI1 ENST00000377482.10 3097 4 0 753 0 -753 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTAATTTTCCCTTACAGTT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.131.31 chr1 - 2087 4 full-splice_match ERRFI1 ENST00000377482.10 3097 4 0 1010 0 690 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGTTTGAAGATTTCTGGCT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.131.32 chr1 - 1708 4 full-splice_match ERRFI1 ENST00000377482.10 3097 4 0 1389 0 311 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 CAAAATAAAATAGTTGAACT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.131.33 chr1 - 1550 4 full-splice_match ERRFI1 ENST00000377482.10 3097 4 -3 1550 -3 150 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAACAAAAATGGATCTGG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.132.2 chr1 - 3606 4 incomplete-splice_match RERE ENST00000476556.5 4598 13 64908 -1687 -3676 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AACCCTTGGGTGTCTCCCGT 8144 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.132.3 chr1 - 3488 4 incomplete-splice_match RERE ENST00000476556.5 4598 13 65026 -1687 -3558 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AACCCTTGGGTGTCTCCCGT 8262 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.132.4 chr1 - 3181 4 incomplete-splice_match RERE ENST00000476556.5 4598 13 65333 -1687 -3251 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AACCCTTGGGTGTCTCCCGT 8569 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.133.2 chr1 + 2495 9 full-splice_match SLC45A1 ENST00000471889.7 2496 9 0 1 0 -1 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CTATGGTTTCTAGGCATTGC 10 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 4 NA PB.148.1 chr1 - 1823 12 full-splice_match ENO1 ENST00000234590.10 1781 12 -46 4 -12 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 12803 3429.808838 3.535270 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT 525 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12803 NA PB.148.2 chr1 - 1218 6 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 5074 2 5074 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 158 42.326782 1.626615 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT 8919 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 158 NA PB.148.3 chr1 - 3161 11 novel_in_catalog ENO1 novel 1837 13 NA NA 0 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.148.4 chr1 - 1843 13 novel_in_catalog ENO1 novel 1837 13 NA NA -11 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT -3 TRUE NA NA GGGGCT -5 NA NA NA 2 NA PB.148.5 chr1 - 1828 8 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 3112 2 3112 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT 9606 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.148.6 chr1 - 1768 12 novel_not_in_catalog ENO1 novel 1837 13 NA NA 0 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.148.7 chr1 - 1767 12 full-splice_match ENO1 ENST00000234590.10 1781 12 10 4 10 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT 581 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.148.8 chr1 - 1722 11 novel_in_catalog ENO1 novel 1837 13 NA NA 0 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.148.9 chr1 - 1691 12 full-splice_match ENO1 ENST00000234590.10 1781 12 86 4 46 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 72 19.288155 1.285291 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT 657 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 72 NA PB.148.10 chr1 - 1743 12 novel_in_catalog ENO1 novel 1781 12 NA NA -15 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT -7 TRUE NA NA GGGGCT -9 NA NA NA 4 NA PB.148.11 chr1 - 1520 10 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000234590.10 1781 12 6756 4 14 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 258 69.115891 1.839578 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT 14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 258 NA PB.148.12 chr1 - 1325 7 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 4352 2 4352 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 288 77.152618 1.887351 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT 8197 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 288 NA PB.148.13 chr1 - 1054 6 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 5238 2 5238 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 281 75.277382 1.876665 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT 9083 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 281 NA PB.148.14 chr1 - 714 4 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 7566 2 7566 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 50 13.394552 1.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 50 NA PB.148.15 chr1 - 585 3 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 8242 2 8242 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT 8610 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.148.17 chr1 - 1774 12 novel_not_in_catalog ENO1 novel 1837 13 NA NA 0 2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATACTCCGTGTGCCTGTG -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.148.18 chr1 - 940 8 novel_not_in_catalog ENO1 novel 1781 12 NA NA 0 2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATACTCCGTGTGCCTGTG 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.148.19 chr1 - 2372 12 novel_in_catalog ENO1 novel 1837 13 NA NA 0 1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATACTCCGTGTGCCTGT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.148.20 chr1 - 2363 12 full-splice_match ENO1 ENST00000234590.10 1781 12 -588 6 -84 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.822039 0.683231 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATACTCCGTGTGCCTGT -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.148.21 chr1 - 2179 12 full-splice_match ENO1 ENST00000234590.10 1781 12 -404 6 2 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.018365 0.604049 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATACTCCGTGTGCCTGT -19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.148.22 chr1 - 2143 12 novel_in_catalog ENO1 novel 1781 12 NA NA -96 1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATACTCCGTGTGCCTGT -29 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.148.23 chr1 - 1809 12 novel_not_in_catalog ENO1 novel 1837 13 NA NA 0 1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATACTCCGTGTGCCTGT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.148.24 chr1 - 1739 12 novel_not_in_catalog ENO1 novel 1837 13 NA NA 0 1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATACTCCGTGTGCCTGT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.148.25 chr1 - 1687 11 novel_in_catalog ENO1 novel 1837 13 NA NA 0 1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATACTCCGTGTGCCTGT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.148.27 chr1 - 1669 11 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000234590.10 1781 12 3768 6 -2974 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 419 112.246346 2.050172 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATACTCCGTGTGCCTGT 4339 FALSE NA NA AAGAAA -40 NA NA NA 419 NA PB.148.28 chr1 - 1421 8 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 3517 4 3517 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 428 114.657364 2.059402 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATACTCCGTGTGCCTGT 9982 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 428 NA PB.148.29 chr1 - 1159 6 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 5131 4 5131 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 486 130.195038 2.114594 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATACTCCGTGTGCCTGT 8976 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 486 NA PB.148.31 chr1 - 1541 11 novel_not_in_catalog ENO1 novel 1837 13 NA NA 0 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAGAATACTCCGTGTGCCTG -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.148.32 chr1 - 1532 8 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 3403 7 3403 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATGAGAATACTCCGTGTGCC 9897 FALSE NA NA AAAAAG -29 NA NA NA 2 NA PB.148.33 chr1 - 1679 12 full-splice_match ENO1 ENST00000234590.10 1781 12 -6 108 0 -101 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAAGTGTCTAGAGTCATGTG -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.148.50 chr1 - 2449 3 full-splice_match ENO1 ENST00000492343.2 1247 3 3 -1205 0 430 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 CTAAAAGTACAAAAATTGGC -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.149.1 chr1 - 2192 12 full-splice_match SLC2A5 ENST00000377424.9 4085 12 51 1842 20 1483 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 47 12.590878 1.100056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGACGTGCTGCTGTTC 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 47 NA PB.149.2 chr1 - 1364 6 incomplete-splice_match SLC2A5 ENST00000377424.9 4085 12 29731 1842 -9 1483 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGACGTGCTGCTGTTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.149.3 chr1 - 1033 3 incomplete-splice_match SLC2A5 ENST00000377424.9 4085 12 31142 1842 1402 1483 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGACGTGCTGCTGTTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.149.4 chr1 - 2012 10 incomplete-splice_match SLC2A5 ENST00000377424.9 4085 12 12026 1843 11995 1482 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAACAAGACGTGCTGCTGTT NA FALSE NA NA AAAACA -32 NA NA NA 2 NA PB.149.5 chr1 - 1782 9 incomplete-splice_match SLC2A5 ENST00000377424.9 4085 12 21968 1844 -7772 1481 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TCAACAAGACGTGCTGCTGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.149.6 chr1 - 1677 12 full-splice_match SLC2A5 ENST00000377424.9 4085 12 39 2369 8 956 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATGCAGTCCTCATCTCCAG -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.156.7 chr1 + 2828 2 full-splice_match SPSB1 ENST00000377399.2 1007 2 133 -1954 133 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACCATTTTTGAATTCCTC 99 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.156.8 chr1 + 1036 2 full-splice_match SPSB1 ENST00000377399.2 1007 2 258 -287 258 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CTACATTGAGCTCCAATCTG 224 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.156.9 chr1 + 2434 2 full-splice_match SPSB1 ENST00000377399.2 1007 2 527 -1954 527 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACCATTTTTGAATTCCTC 493 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 7 NA PB.157.1 chr1 + 1280 7 full-splice_match SLC25A33 ENST00000302692.7 3865 7 -40 2625 -40 -2625 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATTTTTTTTCCCCATTG NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.157.2 chr1 + 1479 7 full-splice_match SLC25A33 ENST00000302692.7 3865 7 -18 2404 -18 -2404 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 263 70.455345 1.847914 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TATACATTTGGCTTGTGTCC -4 TRUE NA NA ATTAAA -20 NA NA NA 263 NA PB.157.3 chr1 + 1397 6 novel_in_catalog SLC25A33 novel 3865 7 NA NA -17 -2407 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGTATACATTTGGCTTGTG -3 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.157.5 chr1 + 1137 6 novel_in_catalog SLC25A33 novel 3865 7 NA NA 0 -2627 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGAGAATTTTTTTTCCCCAT 14 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.157.6 chr1 + 1288 5 novel_in_catalog SLC25A33 novel 3865 7 NA NA 1 -2408 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAGTATACATTTGGCTTGT 15 TRUE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 4 NA PB.157.7 chr1 + 1038 6 incomplete-splice_match SLC25A33 ENST00000302692.7 3865 7 1 4890 1 -4890 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GTTGTTTGTGGGTATATCTA 15 TRUE NA NA AGTAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.157.8 chr1 + 1528 8 novel_not_in_catalog SLC25A33 novel 3865 7 NA NA 11 -2402 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACATTTGGCTTGTGTCCTC 25 FALSE NA NA ATTAAA -22 NA NA NA 3 NA PB.157.10 chr1 + 1200 4 novel_in_catalog SLC25A33 novel 3865 7 NA NA 19 -2400 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CATTTGGCTTGTGTCCTCTT -8 TRUE NA NA ATTAAA -24 NA NA NA 2 NA PB.157.11 chr1 + 1340 6 novel_in_catalog SLC25A33 novel 3865 7 NA NA 21 -2403 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 19 5.089930 0.706712 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATACATTTGGCTTGTGTCCT -6 TRUE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 19 NA PB.157.12 chr1 + 2389 7 full-splice_match SLC25A33 ENST00000302692.7 3865 7 22 1454 22 -1454 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAATTTAAT -5 TRUE NA NA TTTAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.157.15 chr1 + 1690 2 incomplete-splice_match SLC25A33 ENST00000302692.7 3865 7 24 30117 24 -30117 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAGAAGTAATAAAATGG -3 TRUE NA NA AAGAAA -36 NA NA NA 2 NA PB.157.16 chr1 + 1293 7 full-splice_match SLC25A33 ENST00000302692.7 3865 7 24 2548 24 -2548 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 35 9.376186 0.972026 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACCTGTTGGACATTTCCTTT -3 TRUE NA NA CATAAA -17 NA NA NA 35 NA PB.157.17 chr1 + 1179 6 incomplete-splice_match SLC25A33 ENST00000302692.7 3865 7 14161 2403 14161 -2403 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.214692 0.507139 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATACATTTGGCTTGTGTCCT 3586 FALSE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 12 NA PB.157.18 chr1 + 894 6 incomplete-splice_match SLC25A33 ENST00000302692.7 3865 7 14222 2627 14222 -2627 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGAGAATTTTTTTTCCCCAT 3647 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.157.19 chr1 + 992 5 incomplete-splice_match SLC25A33 ENST00000302692.7 3865 7 27828 2401 27828 -2401 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACATTTGGCTTGTGTCCTCT NA FALSE NA NA ATTAAA -23 NA NA NA 6 NA PB.157.20 chr1 + 1846 4 incomplete-splice_match SLC25A33 ENST00000302692.7 3865 7 30811 1460 30811 -1460 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AACATTAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA TTTAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.157.21 chr1 + 893 4 incomplete-splice_match SLC25A33 ENST00000302692.7 3865 7 30822 2402 30822 -2402 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACATTTGGCTTGTGTCCTC NA FALSE NA NA ATTAAA -22 NA NA NA 6 NA PB.157.22 chr1 + 794 3 incomplete-splice_match SLC25A33 ENST00000302692.7 3865 7 33903 2407 33903 -2407 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGTATACATTTGGCTTGTG NA FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.158.1 chr1 + 3971 11 full-splice_match TMEM201 ENST00000340381.11 3815 11 -159 3 -159 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.750474 0.574086 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGCCTGCTGGCTGTCTGTA 13 TRUE NA NA AAAAAG -30 NA NA NA 14 NA PB.158.2 chr1 + 3821 11 full-splice_match TMEM201 ENST00000340381.11 3815 11 -9 3 -9 1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGCCTGCTGGCTGTCTGTA 8 TRUE NA NA AAAAAG -30 NA NA NA 10 NA PB.158.3 chr1 + 3852 6 full-splice_match TMEM201 ENST00000340305.9 3851 6 -8 7 3 -7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACCCGCTGGCGTCAGGTGC 20 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 4 NA PB.158.4 chr1 + 3091 7 incomplete-splice_match TMEM201 ENST00000340381.11 3815 11 12290 2 4304 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGCCTGCTGGCTGTCTGTAT 4284 FALSE NA NA AAAAAG -31 NA NA NA 2 NA PB.158.5 chr1 + 2682 6 incomplete-splice_match TMEM201 ENST00000340381.11 3815 11 13308 7 -3995 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGATGCCTGCTGGCTGTC 5302 FALSE NA NA AAAAAG -26 NA NA NA 4 NA PB.158.9 chr1 + 2009 2 incomplete-splice_match TMEM201 ENST00000508400.1 893 6 4044 -1628 4044 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGCCTGCTGGCTGTCTGTAT 4055 FALSE NA NA AAAAAG -31 NA NA NA 8 NA PB.159.1 chr1 - 2424 2 full-splice_match LINC02606 ENST00000641325.1 2442 2 15 3 15 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACATGAATGTGTTTGATTCT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.160.1 chr1 - 4681 18 novel_not_in_catalog CLSTN1 novel 4760 19 NA NA 0 5 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCCGGAGCGGGGTTTGTCT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.160.2 chr1 - 3976 15 novel_in_catalog CLSTN1 novel 4647 18 NA NA -3573 5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCCGGAGCGGGGTTTGTCT 74 FALSE NA NA AATGAA -23 NA NA NA 6 NA PB.160.4 chr1 - 4366 16 novel_not_in_catalog CLSTN1 novel 4457 19 NA NA -9 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTCCAGCCGGAGCGGGGTT -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.160.5 chr1 - 3708 13 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 1681 -1 267 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTCCAGCCGGAGCGGGGTT 5328 FALSE NA NA AAAACA -19 NA NA NA 2 NA PB.160.6 chr1 - 4571 17 novel_in_catalog CLSTN1 novel 4647 18 NA NA 0 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 37 9.911968 0.996160 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 37 NA PB.160.7 chr1 - 4762 20 novel_not_in_catalog CLSTN1 novel 4760 19 NA NA 0 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.160.8 chr1 - 4610 18 full-splice_match CLSTN1 ENST00000361311.4 4647 18 37 0 18 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.946801 0.469351 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT 668 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.160.9 chr1 - 4667 19 full-splice_match CLSTN1 ENST00000377298.9 4760 19 -9 102 -9 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.482584 0.541902 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.160.10 chr1 - 3968 15 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000361311.4 4647 18 72321 0 -82 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT 3565 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.160.11 chr1 - 4219 17 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000361311.4 4647 18 50676 0 -21727 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT 17 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.160.12 chr1 - 3559 13 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000361311.4 4647 18 74406 0 589 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT 5650 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.160.13 chr1 - 3493 12 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 2012 0 598 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT 5659 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.160.14 chr1 - 3138 10 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 7573 0 6159 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT 7616 FALSE NA NA ACTAAA -16 NA NA NA 9 NA PB.160.15 chr1 - 3064 10 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000650348.1 4457 19 82419 1 -7764 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT 8728 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.160.16 chr1 - 2976 9 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 10362 0 -7733 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT 8759 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.160.17 chr1 - 2768 8 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 15621 0 -2474 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.946801 0.469351 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.160.18 chr1 - 2633 7 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 16025 0 -2070 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.160.19 chr1 - 2536 6 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 16414 0 -1681 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT NA FALSE NA NA AAGAAA -30 NA NA NA 6 NA PB.160.20 chr1 - 2433 6 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 16517 0 -1578 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.160.21 chr1 - 2138 4 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 18042 0 -53 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 19 5.089930 0.706712 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.160.22 chr1 - 1921 3 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 19763 0 1668 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.160.23 chr1 - 1767 2 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 20287 0 2192 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 26 6.965167 0.842932 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 26 NA PB.160.27 chr1 - 4071 16 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000361311.4 4647 18 68785 1 -3618 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACTCCAGCCGGAGCGGGG 29 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.160.28 chr1 - 3829 14 full-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 -1 1 -1 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACTCCAGCCGGAGCGGGG 3646 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.160.29 chr1 - 2257 5 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 17497 1 -598 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACTCCAGCCGGAGCGGGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.160.32 chr1 - 1250 5 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 17564 941 -531 -941 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AACCCGGGACTGGAATGTAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.160.33 chr1 - 1601 6 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 16407 942 -1688 -942 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAACCCGGGACTGGAATGTA NA FALSE NA NA AAGAAA -37 NA NA NA 2 NA PB.160.34 chr1 - 1146 4 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 18092 942 -3 -942 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAACCCGGGACTGGAATGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.160.35 chr1 - 3629 17 novel_in_catalog CLSTN1 novel 4647 18 NA NA -6 -948 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CTAGTGTAACCCGGGACTGG -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.160.36 chr1 - 3715 19 full-splice_match CLSTN1 ENST00000377298.9 4760 19 -9 1054 -9 -952 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGTGCTAGTGTAACCCGGGA -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.160.37 chr1 - 2152 11 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000650348.1 4457 19 79749 956 6247 -955 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CTTTGTGCTAGTGTAACCCG 7704 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.160.38 chr1 - 1461 6 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 16534 955 -1561 -955 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CTTTGTGCTAGTGTAACCCG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.160.39 chr1 - 1338 5 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 17461 956 -634 -956 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CCTTTGTGCTAGTGTAACCC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.160.42 chr1 - 900 5 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000377298.9 4760 19 -17 22545 2 -1983 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAATCGAGGAGCCGGCTT 633 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.160.43 chr1 - 859 4 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000361311.4 4647 18 13 22443 -6 -1983 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.286257 0.632078 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAATCGAGGAGCCGGCTT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.161.1 chr1 - 2885 4 novel_in_catalog CTNNBIP1 novel 3006 6 NA NA 2 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CGTGTGTGAGCTGAGCTGGT -34 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.161.6 chr1 - 3057 5 full-splice_match CTNNBIP1 ENST00000400904.7 1206 5 -19 -1832 -19 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TCGTGTGTGAGCTGAGCTGG -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.161.7 chr1 - 2988 6 full-splice_match CTNNBIP1 ENST00000377263.6 3006 6 17 1 17 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.946801 0.469351 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TCGTGTGTGAGCTGAGCTGG -19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.161.8 chr1 - 2584 2 incomplete-splice_match CTNNBIP1 ENST00000377256.1 451 5 6906 -2382 6906 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TCGTGTGTGAGCTGAGCTGG 6710 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.161.10 chr1 - 2967 5 full-splice_match CTNNBIP1 ENST00000400904.7 1206 5 65 -1826 -2 -7 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 62 16.609243 1.220350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATAGGTTCGTGTGTGAGCTG -38 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 62 NA PB.161.12 chr1 - 1264 6 novel_not_in_catalog CTNNBIP1 novel 3006 6 NA NA 14 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACATTTGGGGTTTGTGTTTG -22 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.161.13 chr1 - 1290 6 novel_not_in_catalog CTNNBIP1 novel 3006 6 NA NA 21 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACATTTGGGGTTTGTGTTTG -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.161.14 chr1 - 1257 6 novel_not_in_catalog CTNNBIP1 novel 1206 5 NA NA -18 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACATTTGGGGTTTGTGTTTG 85 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.161.15 chr1 - 1224 5 full-splice_match CTNNBIP1 ENST00000400904.7 1206 5 -19 1 -19 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACATTTGGGGTTTGTGTTTG -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.161.16 chr1 - 1135 5 full-splice_match CTNNBIP1 ENST00000400904.7 1206 5 70 1 3 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 212 56.792900 1.754294 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACATTTGGGGTTTGTGTTTG -33 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 212 NA PB.161.17 chr1 - 1211 6 novel_not_in_catalog CTNNBIP1 novel 3006 6 NA NA 33 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACATTTGGGGTTTGTGTTTG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.161.18 chr1 - 1151 6 full-splice_match CTNNBIP1 ENST00000377263.6 3006 6 21 1834 21 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 19 5.089930 0.706712 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACATTTGGGGTTTGTGTTTG -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.161.19 chr1 - 1039 4 novel_in_catalog CTNNBIP1 novel 1206 5 NA NA 14 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACATTTGGGGTTTGTGTTTG -22 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.161.20 chr1 - 832 3 incomplete-splice_match CTNNBIP1 ENST00000377256.1 451 5 6134 -549 6134 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACATTTGGGGTTTGTGTTTG 5938 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.161.21 chr1 - 782 5 full-splice_match CTNNBIP1 ENST00000400904.7 1206 5 81 343 14 -2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.946801 0.469351 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCTTTTATTTTTATTTCT -22 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.162.1 chr1 + 5209 24 full-splice_match PIK3CD ENST00000377346.9 5412 24 0 203 0 -203 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAGAAAGAAAAAGCCTTT -9 TRUE NA NA AGTAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.162.2 chr1 + 5122 24 novel_not_in_catalog PIK3CD novel 5412 24 NA NA 0 -203 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAGAAAGAAAAAGCCTTT -9 TRUE NA NA AGTAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.162.3 chr1 + 5104 23 novel_in_catalog PIK3CD novel 5412 24 NA NA 0 -203 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAGAAAGAAAAAGCCTTT -9 TRUE NA NA AGTAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.162.4 chr1 + 4762 21 incomplete-splice_match PIK3CD ENST00000377346.9 5412 24 63907 203 -61 -203 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAGAAAGAAAAAGCCTTT 5640 FALSE NA NA AGTAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.162.5 chr1 + 4061 17 incomplete-splice_match PIK3CD ENST00000377346.9 5412 24 65815 203 1270 -203 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAGAAAGAAAAAGCCTTT 5 TRUE NA NA AGTAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.162.6 chr1 + 2407 4 incomplete-splice_match PIK3CD ENST00000361110.6 3508 23 13770 -1679 7692 -203 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAGAAAGAAAAAGCCTTT 6159 FALSE NA NA AGTAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.162.7 chr1 + 2219 3 incomplete-splice_match PIK3CD ENST00000361110.6 3508 23 14140 -1678 8062 -204 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 GAAAAGAAAGAAAAAGCCTT 6529 FALSE NA NA AGTAAA -8 NA NA NA 6 NA PB.162.8 chr1 + 3299 2 incomplete-splice_match PIK3CD ENST00000361110.6 3508 23 14633 -2869 8555 987 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 TAAAAAAAGAAAAAAATGAT 7022 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 2 NA PB.163.1 chr1 + 1679 5 full-splice_match NMNAT1 ENST00000377205.6 3734 5 -89 2144 -42 -315 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAGAGAAAAAAAAAAAAGA NA FALSE NA NA AAAAAG -15 NA NA NA 3 NA PB.163.6 chr1 + 1045 5 full-splice_match NMNAT1 ENST00000403197.5 1094 5 47 2 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATTTCTCCTGCAGTGGTCT 14 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 6 NA PB.163.7 chr1 + 969 6 novel_not_in_catalog NMNAT1 novel 3734 5 NA NA -6 -7 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACAACAGTTTGTGGTAGTC 21 TRUE NA NA AATAAA -7 NA NA NA 2 NA PB.163.8 chr1 + 1108 2 incomplete-splice_match NMNAT1 ENST00000462686.1 1818 6 37688 315 65 -315 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAGAGAAAAAAAAAAAAGA NA FALSE NA NA AAAAAG -15 NA NA NA 2 NA PB.164.1 chr1 + 1372 4 novel_not_in_catalog UBE4B novel 1273 3 NA NA -3 -5 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATAATGTTTCCTCTGTATG -5 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.164.2 chr1 + 4880 27 full-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 126 -234 0 234 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.214692 0.507139 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAATTTGAATTTCAGTTTTT -2 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 12 NA PB.164.3 chr1 + 5512 27 full-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 126 -866 0 -6 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAAATCTTCTTTGAGTCT -2 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 7 NA PB.164.4 chr1 + 1585 3 full-splice_match UBE4B ENST00000377153.5 1273 3 -316 4 0 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATAATGTTTCCTCTGTATGT -2 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 7 NA PB.164.5 chr1 + 1214 3 full-splice_match UBE4B ENST00000377153.5 1273 3 -315 374 1 -374 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GACTGTCTTTGTTGGGAAAT -1 TRUE NA NA AATAAA -23 NA NA NA 2 NA PB.164.6 chr1 + 4506 27 full-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 129 137 3 -137 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CACAGTTTGGGGCAACGGAA 1 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.164.7 chr1 + 2927 17 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 129 35187 3 141 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAACTTGTTGATACCTTAC 1 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.164.8 chr1 + 4660 27 full-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 345 -233 -97 233 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGAATTTGAATTTCAGTTTT -5 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 8 NA PB.164.9 chr1 + 5257 27 full-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 379 -864 -63 -8 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAAGAAATCTTCTTTGAGT 29 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 8 NA PB.164.11 chr1 + 4477 25 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 62737 -863 -5292 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 CAGAAGAAATCTTCTTTGAG 7839 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.164.12 chr1 + 3466 22 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 72806 -235 4777 235 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATTTGAATTTCAGTTTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.164.13 chr1 + 4066 22 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 72837 -866 4808 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAAATCTTCTTTGAGTCT NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.164.14 chr1 + 3819 20 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000343090.11 5905 28 86587 3 -2497 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAATCTTCTTTGAGTCTCTT NA FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 3 NA PB.164.15 chr1 + 3091 19 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 89155 -235 -55 235 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATTTGAATTTCAGTTTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.164.16 chr1 + 2645 14 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 99536 -235 4029 235 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATTTGAATTTCAGTTTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.164.17 chr1 + 3136 13 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000343090.11 5905 28 102053 8 6672 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAAGAAATCTTCTTTGAGT NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.164.18 chr1 + 2962 12 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000343090.11 5905 28 104109 6 8728 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAAATCTTCTTTGAGTCT NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.164.19 chr1 + 2692 10 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000343090.11 5905 28 114036 6 -11360 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAAATCTTCTTTGAGTCT NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.164.20 chr1 + 1915 9 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 116399 -233 -9123 233 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGAATTTGAATTTCAGTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 5 NA PB.164.21 chr1 + 2346 8 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000343090.11 5905 28 118518 6 -6878 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAAATCTTCTTTGAGTCT NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 5 NA PB.164.22 chr1 + 1477 6 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 128333 -233 2811 233 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGAATTTGAATTTCAGTTTT 5727 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 5 NA PB.164.23 chr1 + 1983 5 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000343090.11 5905 28 135183 6 -2815 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAAATCTTCTTTGAGTCT NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 8 NA PB.164.24 chr1 + 1784 4 full-splice_match UBE4B ENST00000487244.5 818 4 251 -1217 251 -6 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.946801 0.469351 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAAATCTTCTTTGAGTCT 856 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 11 NA PB.164.25 chr1 + 1613 3 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000487244.5 818 4 7736 -1217 -324 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAAATCTTCTTTGAGTCT 7441 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.164.26 chr1 + 976 3 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000487244.5 818 4 7740 -584 -320 233 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGAATTTGAATTTCAGTTTT 7445 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.164.27 chr1 + 1532 3 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000487244.5 818 4 7817 -1217 -243 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAAATCTTCTTTGAGTCT 7522 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.164.28 chr1 + 962 3 novel_not_in_catalog UBE4B novel 355 3 NA NA 120 235 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATTTGAATTTCAGTTTTTT 7885 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.165.4 chr1 + 1279 9 incomplete-splice_match KIF1B ENST00000377093.9 7800 21 -27 36291 -27 -10077 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GTAAGTTTTATACTTCATTA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.165.6 chr1 + 5965 21 full-splice_match KIF1B ENST00000377093.9 7800 21 -5 1840 -5 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.165.7 chr1 + 1575 4 incomplete-splice_match KIF1B ENST00000377093.9 7800 21 -5 49106 -5 -22892 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAAAAAAAAAATTTTTT -6 TRUE NA NA ACTAAA -36 NA NA NA 10 NA PB.165.8 chr1 + 5506 46 novel_in_catalog KIF1B novel 6816 47 NA NA 3 -545 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTCTCTTTGTGATTCTTG 2 TRUE NA NA GATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.165.9 chr1 + 1404 11 incomplete-splice_match KIF1B ENST00000377093.9 7800 21 3 32198 3 -5984 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GTACTTTCTTTTGATCTCAG 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.165.14 chr1 + 3310 1 full-splice_match RN7SL731P ENST00000584329.2 293 1 -3016 -1 -3016 1 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 7730 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.165.15 chr1 + 2847 1 full-splice_match RN7SL731P ENST00000584329.2 293 1 -2554 0 -2554 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 8192 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.165.16 chr1 + 2244 1 full-splice_match RN7SL731P ENST00000584329.2 293 1 -1952 1 -1952 -1 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 8794 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.165.17 chr1 + 1248 1 full-splice_match RN7SL731P ENST00000584329.2 293 1 -956 1 -956 -1 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 9790 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.165.18 chr1 + 1118 1 full-splice_match RN7SL731P ENST00000584329.2 293 1 -826 1 -826 -1 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 9920 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.165.25 chr1 + 6530 13 incomplete-splice_match KIF1B ENST00000377086.5 10669 49 137099 7 3094 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATCAGAAGGTTCTCGATGTG NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.166.1 chr1 - 969 8 novel_in_catalog LZIC novel 652 5 NA NA 3 -14 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAATTAATGAGAGTATAG -44 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.166.2 chr1 - 984 8 novel_in_catalog LZIC novel 652 5 NA NA 71 -15 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 TAAAAATTAATGAGAGTATA 40 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.166.9 chr1 - 2728 7 full-splice_match LZIC ENST00000400903.6 1405 7 -17 -1306 -17 1306 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAATATTTGTTTGAATACCT 575 FALSE NA NA TATAAA -5 NA NA NA 5 NA PB.166.10 chr1 - 1775 7 full-splice_match LZIC ENST00000400903.6 1405 7 69 -439 69 439 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CTTCTGTACTGTAAACTACT 661 FALSE NA NA CATAAA -39 NA NA NA 2 NA PB.166.11 chr1 - 1965 8 full-splice_match LZIC ENST00000377223.6 4989 8 35 2989 35 438 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TCTTCTGTACTGTAAACTAC 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.166.12 chr1 - 1878 8 full-splice_match LZIC ENST00000377213.1 945 8 38 -971 22 438 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TCTTCTGTACTGTAAACTAC -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.166.13 chr1 - 1613 5 novel_in_catalog LZIC novel 945 8 NA NA 10 438 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TCTTCTGTACTGTAAACTAC -21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.166.14 chr1 - 1532 8 full-splice_match LZIC ENST00000377223.6 4989 8 41 3416 41 11 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CCCCAGCCTGTAAGCTGTCT 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.166.15 chr1 - 1460 8 full-splice_match LZIC ENST00000377213.1 945 8 28 -543 12 10 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CCCCCAGCCTGTAAGCTGTC -19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.166.17 chr1 - 1213 8 full-splice_match LZIC ENST00000377213.1 945 8 19 -287 3 -246 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACAATTCTGAGTGATCTTAG -28 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.166.18 chr1 - 1125 8 full-splice_match LZIC ENST00000377223.6 4989 8 51 3813 51 147 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAAGGCTGTTTGTTTTTAAG 20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.166.19 chr1 - 989 8 full-splice_match LZIC ENST00000377223.6 4989 8 58 3942 58 18 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 35 9.376186 0.972026 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCATTGTGCGTTGTGTGCG 27 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 35 NA PB.166.20 chr1 - 1196 7 full-splice_match LZIC ENST00000400903.6 1405 7 -318 527 305 6 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTTATGCTCTTCATCATTGT 274 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.166.21 chr1 - 895 7 full-splice_match LZIC ENST00000400903.6 1405 7 -17 527 -17 6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.286257 0.632078 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTTATGCTCTTCATCATTGT 575 FALSE NA NA TATAAA -5 NA NA NA 16 NA PB.166.22 chr1 - 812 7 novel_not_in_catalog LZIC novel 1405 7 NA NA 8 5 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GTTTATGCTCTTCATCATTG 600 FALSE NA NA AAAAAG -18 NA NA NA 2 NA PB.166.23 chr1 - 919 8 full-splice_match LZIC ENST00000377213.1 945 8 28 -2 12 2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 24 6.429385 0.808169 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGTGTTTATGCTCTTCATCA -19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 24 NA PB.167.1 chr1 + 1993 13 full-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 -32 307 -12 -307 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 390 104.477501 2.019023 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AGAAAGATTTTTCTTTAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 390 NA PB.167.3 chr1 + 2290 13 full-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 -23 1 -3 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 74 19.823936 1.297190 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTTGGTCTGATTTATTTC NA FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 74 NA PB.167.4 chr1 + 1834 12 novel_in_catalog PGD novel 2268 13 NA NA 0 313 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGCTCTTTCTCCAGATTCT -4 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 6 NA PB.167.5 chr1 + 2196 12 novel_in_catalog PGD novel 2268 13 NA NA -4 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTTGGTCTGATTTATTTC 1 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.167.6 chr1 + 2007 12 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 396 368 -38 313 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGCTCTTTCTCCAGATTCT 68 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 4 NA PB.167.7 chr1 + 2171 12 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 599 1 31 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTTGGTCTGATTTATTTC 271 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 6 NA PB.167.8 chr1 + 1739 11 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 1352 368 784 313 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.554148 0.658407 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGCTCTTTCTCCAGATTCT 1024 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 17 NA PB.167.9 chr1 + 2004 11 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 1454 1 886 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTTGGTCTGATTTATTTC 1126 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.167.10 chr1 + 1559 10 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 4030 368 3462 313 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 32 8.572514 0.933108 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGCTCTTTCTCCAGATTCT 3702 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 32 NA PB.167.11 chr1 + 1857 9 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 5123 1 4555 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTTGGTCTGATTTATTTC 4795 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 5 NA PB.167.12 chr1 + 1480 9 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 5132 369 4564 312 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 19 5.089930 0.706712 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GATGCTCTTTCTCCAGATTC 4804 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 19 NA PB.167.14 chr1 + 1721 8 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 9050 1 -4720 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTTGGTCTGATTTATTTC 8722 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.167.15 chr1 + 1326 7 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 12356 367 -1414 314 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 55 14.734007 1.168321 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGCTCTTTCTCCAGATTCTT NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 55 NA PB.167.16 chr1 + 1597 7 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 12451 1 -1319 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTTGGTCTGATTTATTTC NA FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 6 NA PB.167.17 chr1 + 1151 6 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 14039 368 269 313 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 23 6.161494 0.789686 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGCTCTTTCTCCAGATTCT NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 23 NA PB.167.18 chr1 + 1395 6 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 14162 1 392 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTTGGTCTGATTTATTTC NA FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 10 NA PB.167.19 chr1 + 1002 5 incomplete-splice_match PGD ENST00000498356.1 790 6 1695 -313 1695 313 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 28 7.500949 0.875116 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGCTCTTTCTCCAGATTCT -9 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 28 NA PB.167.20 chr1 + 1313 5 incomplete-splice_match PGD ENST00000498356.1 790 6 1751 -680 1751 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTTGGTCTGATTTATTTC 47 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.167.21 chr1 + 930 5 incomplete-splice_match PGD ENST00000498356.1 790 6 1767 -313 -1753 313 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.482584 0.541902 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGCTCTTTCTCCAGATTCT 63 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 13 NA PB.167.22 chr1 + 773 4 incomplete-splice_match PGD ENST00000498356.1 790 6 2182 -313 -1338 313 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGCTCTTTCTCCAGATTCT 478 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 8 NA PB.167.23 chr1 + 1120 4 incomplete-splice_match PGD ENST00000498356.1 790 6 2202 -680 -1318 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTTGGTCTGATTTATTTC 498 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 9 NA PB.167.24 chr1 + 1037 3 incomplete-splice_match PGD ENST00000498356.1 790 6 3601 -680 81 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTTGGTCTGATTTATTTC 1897 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 7 NA PB.168.1 chr1 - 812 1 full-splice_match ENSG00000271989 ENST00000607572.1 797 1 -17 2 -17 -2 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA NA NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTTTGGTTTGTTTTTATT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.169.1 chr1 + 624 5 full-splice_match CENPS ENST00000309048.8 905 5 -36 317 -36 -11 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAATAGAGATTTAAAAAAAT 320 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.169.2 chr1 + 1159 6 novel_not_in_catalog CENPS-CORT novel 571 6 NA NA -3 -8604 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTTTTCTGGTTACTAATG -27 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.169.3 chr1 + 746 3 novel_in_catalog CENPS novel 905 5 NA NA -1 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGCTTTTCTGGTTACTAAT -27 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.169.4 chr1 + 1437 6 novel_in_catalog CENPS-CORT novel 571 6 NA NA -2 -8597 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CTGGTTACTAATGTTGTTTT -26 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 5 NA PB.169.5 chr1 + 1121 6 novel_not_in_catalog CENPS-CORT novel 571 6 NA NA -2 -8605 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGCTTTTCTGGTTACTAAT -26 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 5 NA PB.169.6 chr1 + 903 5 full-splice_match CENPS ENST00000309048.8 905 5 0 2 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 80 21.431282 1.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGCTTTTCTGGTTACTAAT -26 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 80 NA PB.169.7 chr1 + 820 6 full-splice_match CENPS-CORT ENST00000602787.6 571 6 -2 -247 -2 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTGATCTTTCCTCTCCTCC -26 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.169.8 chr1 + 1349 5 full-splice_match CENPS ENST00000477755.1 914 5 -67 -368 -67 45 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AATTAAACATGGTTGACTTT 257 FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.169.9 chr1 + 1446 5 full-splice_match CENPS ENST00000477755.1 914 5 -54 -478 -54 4 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 90 24.110193 1.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTCTGGTTACTAATGTTGTT -24 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 90 NA PB.169.10 chr1 + 1262 3 full-splice_match CENPS ENST00000462462.1 584 3 -373 -305 -33 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTTTTCTGGTTACTAATG -3 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 6 NA PB.169.11 chr1 + 1102 5 full-splice_match CENPS ENST00000477755.1 914 5 -31 -157 -31 -11 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 28 7.500949 0.875116 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAATAGAGATTTAAAAAAAT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 28 NA PB.169.12 chr1 + 921 5 full-splice_match CENPS ENST00000477755.1 914 5 -31 24 -31 -24 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 TAGAACGAAAAGCACAGAAG -1 TRUE NA NA AATACA -37 NA NA NA 6 NA PB.169.13 chr1 + 1313 6 fusion CENPS_CORT novel 914 5 NA NA -10 -340 multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTGATCTTTCCTCTCCTCC 20 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 5 NA PB.169.14 chr1 + 1269 4 novel_in_catalog CENPS-CORT novel 1326 4 NA NA -27 -8604 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTTTTCTGGTTACTAATG 24 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.170.6 chr1 - 1410 6 full-splice_match DFFA ENST00000377038.8 6035 6 61 4564 11 557 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 ACAAAAAAAATTAGCCAGCC -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.170.10 chr1 - 1333 6 full-splice_match DFFA ENST00000377038.8 6035 6 -4 4706 -4 415 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 88 23.574411 1.372441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGTAATTGGCAGTGATT 441 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 88 NA PB.170.11 chr1 - 1173 6 full-splice_match DFFA ENST00000377038.8 6035 6 156 4706 106 415 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGTAATTGGCAGTGATT 601 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.170.12 chr1 - 2637 5 full-splice_match DFFA ENST00000377036.2 1403 5 -38 -1196 3 371 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAATATCCCGCCTCCTCT -21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.170.15 chr1 - 1179 4 incomplete-splice_match DFFA ENST00000377036.2 1403 5 3209 -1 3200 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTCCTGTTGGTGTTGTAAGA 3695 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.170.16 chr1 - 935 2 incomplete-splice_match DFFA ENST00000377036.2 1403 5 8866 -1 8857 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTCCTGTTGGTGTTGTAAGA 9352 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.170.17 chr1 - 1459 5 full-splice_match DFFA ENST00000377036.2 1403 5 -56 0 -15 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 23 6.161494 0.789686 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTTCCTGTTGGTGTTGTAAG 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 23 NA PB.170.18 chr1 - 1404 5 full-splice_match DFFA ENST00000377036.2 1403 5 -2 1 -2 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TCTTCCTGTTGGTGTTGTAA 15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.170.19 chr1 - 1069 5 full-splice_match DFFA ENST00000377036.2 1403 5 -42 376 -1 -376 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 44 11.787206 1.071411 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACAGACTCTGGTCCAAGG 444 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 44 NA PB.171.1 chr1 + 2091 10 novel_not_in_catalog PEX14 novel 1922 9 NA NA -63 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TAATTTCTGCCTGTGGCTCC NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.171.2 chr1 + 1979 9 full-splice_match PEX14 ENST00000356607.9 1922 9 -63 6 -63 -6 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTTAATTTCTGCCTGTGGC NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.171.3 chr1 + 1919 9 full-splice_match PEX14 ENST00000356607.9 1922 9 0 3 0 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 123 32.950596 1.517863 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TAATTTCTGCCTGTGGCTCC -3 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 123 NA PB.171.5 chr1 + 1787 8 novel_in_catalog PEX14 novel 1922 9 NA NA 4 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AATTTCTGCCTGTGGCTCCC 1 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 6 NA PB.171.8 chr1 + 1805 7 incomplete-splice_match PEX14 ENST00000356607.9 1922 9 61277 2 339 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AATTTCTGCCTGTGGCTCCC 223 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 5 NA PB.171.13 chr1 + 1557 5 incomplete-splice_match PEX14 ENST00000356607.9 1922 9 143430 2 82492 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AATTTCTGCCTGTGGCTCCC NA FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 5 NA PB.171.14 chr1 + 1349 3 incomplete-splice_match PEX14 ENST00000356607.9 1922 9 149457 2 88519 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AATTTCTGCCTGTGGCTCCC 1368 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 8 NA PB.171.15 chr1 + 1243 2 incomplete-splice_match PEX14 ENST00000356607.9 1922 9 152397 2 91459 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AATTTCTGCCTGTGGCTCCC 4308 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.173.1 chr1 - 2376 2 novel_in_catalog MASP2 novel 2190 3 NA NA -19 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CACCTGCTGCCACGTGTCTC 9457 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.173.2 chr1 - 2219 3 full-splice_match MASP2 ENST00000480221.1 2190 3 -31 2 -19 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CACCTGCTGCCACGTGTCTC 9457 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.175.1 chr1 + 1365 8 novel_in_catalog TARDBP novel 1793 10 NA NA -14 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTTTAGTGTCTGGAGTCTT NA FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.175.2 chr1 + 2565 5 full-splice_match TARDBP ENST00000621715.4 816 5 -22 -1727 -5 -6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT -11 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 4 NA PB.175.3 chr1 + 2735 6 full-splice_match TARDBP ENST00000240185.8 4185 6 -5 1455 -4 -6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 568 152.162109 2.182307 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT -10 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 568 NA PB.175.4 chr1 + 2146 7 novel_in_catalog TARDBP novel 1793 10 NA NA -2 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TCTCAAGTCAAATGGATTCA -8 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 6 NA PB.175.5 chr1 + 1791 7 full-splice_match TARDBP ENST00000629725.2 1031 7 29 -789 -2 -6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT -8 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 3 NA PB.175.6 chr1 + 1682 7 novel_not_in_catalog TARDBP novel 4185 6 NA NA -2 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT -8 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.175.7 chr1 + 1181 8 novel_in_catalog TARDBP novel 1793 10 NA NA 0 -6 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT -5 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 4 NA PB.175.8 chr1 + 1193 8 incomplete-splice_match TARDBP ENST00000614757.4 1793 10 -8 6352 0 -7 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAGTTGTCTCAAGTCAAA -5 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 8 NA PB.175.9 chr1 + 1778 7 novel_in_catalog TARDBP novel 1835 6 NA NA 1 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT -4 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 4 NA PB.175.10 chr1 + 1504 6 full-splice_match TARDBP ENST00000240185.8 4185 6 1 2680 1 -46 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.750474 0.574086 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAAGGAAGAGCTAAAGGA -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.175.11 chr1 + 1189 8 novel_in_catalog TARDBP novel 1793 10 NA NA 1 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGTCTCAAGTCAAATGGATT -4 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 5 NA PB.175.12 chr1 + 4272 6 full-splice_match TARDBP ENST00000240185.8 4185 6 5 -92 -3 92 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 24 6.429385 0.808169 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAGAAAAAAGAAAATAATA 0 TRUE NA NA TTTAAA -13 NA NA NA 24 NA PB.175.13 chr1 + 3405 7 novel_in_catalog TARDBP novel 1793 10 NA NA -3 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTTTAGTGTCTGGAGTCTT 0 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.175.14 chr1 + 2871 6 full-splice_match TARDBP ENST00000240185.8 4185 6 5 1309 -3 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GTCTCAAGTCAAATGGATTC 0 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 7 NA PB.175.15 chr1 + 2857 7 full-splice_match TARDBP ENST00000472476.5 1001 7 5 -1861 -3 -6 alternative_3end TRUE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT 0 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 5 NA PB.175.16 chr1 + 2848 7 novel_in_catalog TARDBP novel 4185 6 NA NA -3 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT 0 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 5 NA PB.175.17 chr1 + 2671 8 novel_in_catalog TARDBP novel 1793 10 NA NA -3 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTTTAGTGTCTGGAGTCTT 0 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.175.20 chr1 + 1786 6 full-splice_match TARDBP ENST00000240185.8 4185 6 5 2394 -3 -136 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTCACAGTGTTTGGTTCTT 0 TRUE NA NA AAGAAA -23 NA NA NA 2 NA PB.175.23 chr1 + 2566 5 incomplete-splice_match TARDBP ENST00000315091.7 1835 6 74 146 62 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.018365 0.604049 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT 1106 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 15 NA PB.175.24 chr1 + 2425 5 incomplete-splice_match TARDBP ENST00000315091.7 1835 6 215 146 203 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT 1247 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 10 NA PB.175.25 chr1 + 2291 4 incomplete-splice_match TARDBP ENST00000611963.4 739 6 -23 156 -23 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 20 5.357821 0.728988 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT 4259 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 20 NA PB.175.26 chr1 + 2145 3 incomplete-splice_match TARDBP ENST00000620632.4 706 5 34 6 34 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.625712 0.750178 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT 6130 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 21 NA PB.175.27 chr1 + 2113 2 incomplete-splice_match TARDBP ENST00000614494.1 515 4 124 -10 -30 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATGGATTCATCACCTGTC 7873 FALSE NA NA AATAAA -26 NA NA NA 2 NA PB.175.28 chr1 + 1945 2 incomplete-splice_match TARDBP ENST00000614494.1 515 4 136 146 -18 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 32 8.572514 0.933108 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT 7885 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 32 NA PB.175.41 chr1 + 1173 2 full-splice_match TARDBP ENST00000480464.2 790 2 -384 1 222 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTTTAGTGTCTGGAGTCTT -2 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.176.1 chr1 - 1344 8 novel_in_catalog SRM novel 1260 8 NA NA 3 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGATTGGAGTCCTGTGTC 24 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.176.2 chr1 - 1284 8 full-splice_match SRM ENST00000376957.7 1260 8 -27 3 -25 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 483 129.391373 2.111905 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGATTGGAGTCCTGTGTC -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 483 NA PB.176.3 chr1 - 1145 8 full-splice_match SRM ENST00000376957.7 1260 8 112 3 112 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 49 13.126660 1.118154 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGATTGGAGTCCTGTGTC 133 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 49 NA PB.176.4 chr1 - 1114 7 novel_in_catalog SRM novel 1260 8 NA NA -1 -3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGATTGGAGTCCTGTGTC 18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.176.5 chr1 - 988 7 incomplete-splice_match SRM ENST00000376957.7 1260 8 700 3 368 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 26 6.965167 0.842932 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGATTGGAGTCCTGTGTC 721 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 26 NA PB.176.6 chr1 - 796 5 incomplete-splice_match SRM ENST00000376957.7 1260 8 3266 3 -932 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGATTGGAGTCCTGTGTC 3287 FALSE NA NA GGGGCT -7 NA NA NA 10 NA PB.178.1 chr1 - 1200 14 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 19082 -4 70 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTCCTGACTTTTATTTTGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.178.2 chr1 - 2787 25 full-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 3 6 3 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 272 72.866364 1.862527 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 272 NA PB.178.3 chr1 - 857 9 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 22937 6 719 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT 2835 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.178.4 chr1 - 3662 23 novel_in_catalog EXOSC10 novel 2796 25 NA NA 3 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.178.5 chr1 - 2991 24 novel_in_catalog EXOSC10 novel 2796 25 NA NA -2 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.178.6 chr1 - 2926 25 novel_in_catalog EXOSC10 novel 2796 25 NA NA 3 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.178.7 chr1 - 2787 25 novel_in_catalog EXOSC10 novel 2796 25 NA NA 3 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.178.8 chr1 - 2721 24 novel_in_catalog EXOSC10 novel 2796 25 NA NA 3 -3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.178.9 chr1 - 2609 24 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 1745 6 1730 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT 1730 FALSE NA NA AAGAAA -2 NA NA NA 6 NA PB.178.10 chr1 - 2457 23 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 4035 6 4020 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.554148 0.658407 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT 4020 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.178.11 chr1 - 2277 21 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 8688 6 -8558 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT 8673 FALSE NA NA AATACA -35 NA NA NA 4 NA PB.178.12 chr1 - 2090 20 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 9220 6 -8026 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT 9205 FALSE NA NA AAAACA -5 NA NA NA 3 NA PB.178.13 chr1 - 1633 16 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 17021 6 -225 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT NA FALSE NA NA AAAACA -12 NA NA NA 10 NA PB.178.14 chr1 - 1527 16 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 17127 6 -119 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.178.15 chr1 - 1420 15 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 18683 6 31 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.018365 0.604049 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.178.16 chr1 - 1338 13 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 19148 6 136 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT NA FALSE NA NA ATTAAA -28 NA NA NA 2 NA PB.178.17 chr1 - 1295 14 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 18977 6 -35 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.178.18 chr1 - 1034 12 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 20128 6 59 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT 26 FALSE NA NA ATTAAA -45 NA NA NA 10 NA PB.178.19 chr1 - 4234 21 novel_in_catalog EXOSC10 novel 2796 25 NA NA 3 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GAAGAAAGCTGATTCCTGAC 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.178.20 chr1 - 3563 22 novel_in_catalog EXOSC10 novel 2796 25 NA NA -2 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GAAGAAAGCTGATTCCTGAC -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.178.21 chr1 - 1869 18 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 12007 7 -5239 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GAAGAAAGCTGATTCCTGAC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.178.22 chr1 - 1768 12 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 19393 7 381 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GAAGAAAGCTGATTCCTGAC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.178.23 chr1 - 989 9 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 22804 7 586 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GAAGAAAGCTGATTCCTGAC 2702 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.178.24 chr1 - 896 10 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 22481 7 263 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GAAGAAAGCTGATTCCTGAC 2379 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.178.25 chr1 - 1884 18 novel_in_catalog EXOSC10 novel 2796 25 NA NA -5240 -5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TGAAGAAAGCTGATTCCTGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.178.26 chr1 - 2570 23 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 18 2027 3 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GTAAGAACTGCTCCTGGAGG 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.178.27 chr1 - 2165 19 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 18 7328 3 342 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATCTATGAAGTAAGTGG 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.178.28 chr1 - 2476 15 novel_in_catalog EXOSC10 novel 2721 24 NA NA -4 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAGAAAAAATAAACAAA -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.179.1 chr1 + 709 2 full-splice_match EXOSC10-AS1 ENST00000435388.2 685 2 -30 6 -30 -6 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGTTAAGAGAATACTTGCTT NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.180.3 chr1 + 1552 2 full-splice_match UBIAD1 ENST00000376810.6 3654 2 25 2077 25 -2077 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 93 24.913866 1.396441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATTAGGCGCATGGTCTTTG 12 TRUE NA NA TTTAAA -24 NA NA NA 93 NA PB.180.4 chr1 + 3340 2 full-splice_match UBIAD1 ENST00000376810.6 3654 2 312 2 -18 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CACCAATGGTCTGGCTTCTG 7 TRUE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 4 NA PB.180.6 chr1 + 1433 2 full-splice_match UBIAD1 ENST00000376810.6 3654 2 312 1909 -18 -1909 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGCAGAGTGTTGTCCTGCT 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.180.7 chr1 + 1185 2 full-splice_match UBIAD1 ENST00000376810.6 3654 2 312 2157 -18 -2157 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 39 10.447750 1.019023 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAGATAATATGTTGTTTTT 7 TRUE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 39 NA PB.180.8 chr1 + 1083 2 full-splice_match UBIAD1 ENST00000376810.6 3654 2 414 2157 84 -2157 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAGATAATATGTTGTTTTT 109 FALSE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.181.1 chr1 + 2571 2 full-splice_match DISP3 ENST00000423056.2 910 2 -10 -1651 1 1651 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GAGAAACCTGTTTATATGAT 1 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.182.3 chr1 - 4682 33 incomplete-splice_match MTOR ENST00000361445.9 8721 58 57958 7 57958 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.182.4 chr1 - 8703 58 full-splice_match MTOR ENST00000361445.9 8721 58 11 7 11 -7 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.182.5 chr1 - 6388 45 incomplete-splice_match MTOR ENST00000361445.9 8721 58 28283 7 28283 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA AAGAAA -40 NA NA NA 2 NA PB.182.6 chr1 - 4125 28 incomplete-splice_match MTOR ENST00000361445.9 8721 58 112324 7 -5202 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA AAGAAA -43 NA NA NA 2 NA PB.182.7 chr1 - 3862 26 incomplete-splice_match MTOR ENST00000361445.9 8721 58 117551 7 25 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.182.8 chr1 - 3312 21 incomplete-splice_match MTOR ENST00000361445.9 8721 58 129389 7 -1604 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.182.9 chr1 - 3090 20 full-splice_match MTOR ENST00000376838.5 4017 20 920 7 920 -7 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.182.10 chr1 - 2866 18 incomplete-splice_match MTOR ENST00000376838.5 4017 20 2620 7 2620 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA AAAAAG -29 NA NA NA 9 NA PB.182.11 chr1 - 2561 15 incomplete-splice_match MTOR ENST00000376838.5 4017 20 3751 7 3751 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.182.12 chr1 - 2447 15 incomplete-splice_match MTOR ENST00000376838.5 4017 20 3865 7 3865 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.182.13 chr1 - 2347 14 incomplete-splice_match MTOR ENST00000376838.5 4017 20 4444 7 4444 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA ATTAAA -35 NA NA NA 10 NA PB.182.14 chr1 - 2102 13 incomplete-splice_match MTOR ENST00000376838.5 4017 20 4902 7 4902 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.182.15 chr1 - 1997 12 incomplete-splice_match MTOR ENST00000376838.5 4017 20 6995 7 6995 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.182.16 chr1 - 1883 11 incomplete-splice_match MTOR ENST00000376838.5 4017 20 9480 7 -6415 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA GATAAA -27 NA NA NA 6 NA PB.182.17 chr1 - 1712 8 incomplete-splice_match MTOR ENST00000490931.1 1111 9 672 -765 -226 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA AATAAA -4 NA NA NA 2 NA PB.182.18 chr1 - 1758 10 incomplete-splice_match MTOR ENST00000376838.5 4017 20 10209 13 -5686 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.946801 0.469351 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AATTTTAAACATATGTATAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.182.19 chr1 - 1531 8 incomplete-splice_match MTOR ENST00000376838.5 4017 20 16136 7 105 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.214692 0.507139 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.182.20 chr1 - 1400 6 full-splice_match MTOR ENST00000473471.5 862 6 205 -743 205 -7 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.182.21 chr1 - 1293 5 incomplete-splice_match MTOR ENST00000473471.5 862 6 1712 -743 1712 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA AATAAA -34 NA NA NA 8 NA PB.182.22 chr1 - 1140 3 incomplete-splice_match MTOR ENST00000473471.5 862 6 5265 -743 5265 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA AATACA -35 NA NA NA 10 NA PB.182.23 chr1 - 997 2 incomplete-splice_match MTOR ENST00000473471.5 862 6 6411 -743 6411 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.482584 0.541902 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.182.26 chr1 - 1510 10 incomplete-splice_match MTOR ENST00000361445.9 8721 58 24588 106062 24588 -73643 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAATACCTTAGAAGCCGTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.184.1 chr1 + 1759 5 full-splice_match FBXO44 ENST00000376762.8 1734 5 -28 3 1 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.554148 0.658407 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TAACCTGTGCCCTGTGGTTT -9 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 17 NA PB.184.2 chr1 + 1881 6 full-splice_match FBXO44 ENST00000251547.10 2928 6 7 1040 3 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTAACCTGTGCCCTGTGGTT -7 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 8 NA PB.184.3 chr1 + 1721 5 novel_not_in_catalog FBXO44 novel 1734 5 NA NA 4 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TAACCTGTGCCCTGTGGTTT 23 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.185.1 chr1 - 1266 7 novel_in_catalog FBXO2 novel 1287 6 NA NA 85 27 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGCTCCCTTCCCATCCTTTT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.185.2 chr1 - 1522 6 full-splice_match FBXO2 ENST00000354287.5 1287 6 -225 -10 -225 10 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAAATGGATAAACACTGC 30 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.185.3 chr1 - 1294 6 full-splice_match FBXO2 ENST00000354287.5 1287 6 0 -7 0 7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 102 27.324886 1.436558 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 ATGAAAAAATGGATAAACAC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 102 NA PB.185.4 chr1 - 1197 6 full-splice_match FBXO2 ENST00000354287.5 1287 6 88 2 88 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAGGAATGAATGAAAAAATG 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.185.5 chr1 - 1203 6 novel_in_catalog FBXO2 novel 1287 6 NA NA 110 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAGGAATGAATGAAAAAATG 1399 FALSE NA NA AAAAAG -32 NA NA NA 2 NA PB.186.1 chr1 + 1187 6 full-splice_match FBXO6 ENST00000376753.9 1444 6 -67 324 -67 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTGTGGCTCACGCCTGTAA 7 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 10 NA PB.186.2 chr1 + 1395 6 full-splice_match FBXO6 ENST00000376753.9 1444 6 0 49 0 -49 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAATAATAATAATAATAAA -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.188.1 chr1 - 1456 8 incomplete-splice_match MAD2L2 ENST00000376692.9 1053 9 21 1 4 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.750474 0.574086 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG 11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.188.2 chr1 - 1356 8 novel_in_catalog MAD2L2 novel 1053 9 NA NA -7 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.554148 0.658407 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.188.3 chr1 - 1289 8 incomplete-splice_match MAD2L2 ENST00000376692.9 1053 9 188 1 151 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 20 5.357821 0.728988 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 20 NA PB.188.4 chr1 - 1142 9 novel_not_in_catalog MAD2L2 novel 1860 11 NA NA -15 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG -25 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.188.5 chr1 - 1135 8 novel_in_catalog MAD2L2 novel 1053 9 NA NA 7 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.188.6 chr1 - 1036 9 novel_not_in_catalog MAD2L2 novel 1053 9 NA NA -7 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.188.7 chr1 - 1017 9 novel_not_in_catalog MAD2L2 novel 1053 9 NA NA -176 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.286257 0.632078 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG -20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.188.8 chr1 - 1072 9 full-splice_match MAD2L2 ENST00000376692.9 1053 9 -20 1 -20 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 512 137.160217 2.137228 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG -30 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 512 NA PB.188.9 chr1 - 888 7 incomplete-splice_match MAD2L2 ENST00000376692.9 1053 9 679 1 642 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.554148 0.658407 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG 1072 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.188.10 chr1 - 802 7 incomplete-splice_match MAD2L2 ENST00000376692.9 1053 9 765 1 728 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG 1158 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.188.11 chr1 - 1080 9 full-splice_match MAD2L2 ENST00000376669.9 864 9 -20 -196 -7 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAGCTGAGCCATCATTAACT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.188.12 chr1 - 1111 9 full-splice_match MAD2L2 ENST00000376667.7 872 9 27 -266 11 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 46 12.322988 1.090716 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAGCTGAGCCATCATTAACT -21 TRUE NA NA GGGGCT -30 NA NA NA 46 NA PB.188.13 chr1 - 1034 9 novel_not_in_catalog MAD2L2 novel 872 9 NA NA -45 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGAGCTGAGCCATCATTAAC 348 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.188.14 chr1 - 1070 9 full-splice_match MAD2L2 ENST00000376672.5 1002 9 -27 -41 -27 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CTGAGCTGAGCCATCATTAA 302 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.188.15 chr1 - 1287 8 novel_not_in_catalog MAD2L2 novel 1053 9 NA NA 143 -5 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GCTGAGCTGAGCCATCATTA -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.188.16 chr1 - 1142 8 incomplete-splice_match MAD2L2 ENST00000376692.9 1053 9 321 15 284 -15 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAAGGGCTGGGCTGAGCTGA 714 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.188.17 chr1 - 1124 9 full-splice_match MAD2L2 ENST00000376667.7 872 9 -36 -216 5 -7 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATACTGTGCTGTGAGTTG 161 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.189.5 chr1 + 1375 6 full-splice_match AGTRAP ENST00000476512.5 942 6 9 -442 2 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGATGGGCTGTGTTTTGAAC -27 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 10 NA PB.189.6 chr1 + 1235 6 full-splice_match AGTRAP ENST00000400895.6 786 6 2 -451 2 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.554148 0.658407 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGATGGGCTGTGTTTTGAA -27 TRUE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 17 NA PB.189.7 chr1 + 2735 4 novel_in_catalog AGTRAP novel 1130 5 NA NA 1 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGATGGGCTGTGTTTTGAA -22 TRUE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 4 NA PB.189.8 chr1 + 1111 5 full-splice_match AGTRAP ENST00000376629.8 1100 5 -15 4 2 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 40 10.715641 1.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGATGGGCTGTGTTTTGAA -21 TRUE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 40 NA PB.190.2 chr1 + 1336 5 incomplete-splice_match CLCN6 ENST00000376497.7 814 6 -28 313 -6 -313 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAGAAAAAACATCAATGGGG -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.190.4 chr1 + 5547 23 full-splice_match CLCN6 ENST00000346436.11 5589 23 40 2 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCCTCTGTCTCCTTTAGCCT -5 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 6 NA PB.190.5 chr1 + 870 6 incomplete-splice_match CLCN6 ENST00000376490.7 963 11 -29 5029 3 2410 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAAAGTGCAAGTCTGGCC -2 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.190.7 chr1 + 1200 6 full-splice_match CLCN6 ENST00000376497.7 814 6 31 -417 13 417 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAACAAGTCCACAGCCTGA 8 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.190.8 chr1 + 4049 9 incomplete-splice_match CLCN6 ENST00000346436.11 5589 23 27780 2 4122 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCCTCTGTCTCCTTTAGCCT NA FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.190.9 chr1 + 3241 4 incomplete-splice_match CLCN6 ENST00000346436.11 5589 23 31289 1 -3537 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CCTCTGTCTCCTTTAGCCTT NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.191.4 chr1 - 2536 12 novel_in_catalog MTHFR novel 7018 12 NA NA 0 18 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTCTGAACCCTTGTGCTTG -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.193.1 chr1 + 3021 19 novel_not_in_catalog PLOD1 novel 2976 19 NA NA -11 16 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGGGCGAGTGGGTGTGTGTG -35 TRUE NA NA ATTAAA -32 NA NA NA 2 NA PB.193.2 chr1 + 3145 20 novel_in_catalog PLOD1 novel 2976 19 NA NA -5 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CTGAAGGGAAGATGCTCAGG -29 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 6 NA PB.193.3 chr1 + 3003 19 full-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 -28 1 -5 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 372 99.655464 1.998501 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG -29 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 372 NA PB.193.4 chr1 + 2859 18 novel_in_catalog PLOD1 novel 2976 19 NA NA -5 1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAGGGAAGATGCTCAGGGC -29 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.193.5 chr1 + 3807 18 novel_in_catalog PLOD1 novel 2976 19 NA NA -5 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG -6 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.193.6 chr1 + 2906 19 novel_not_in_catalog PLOD1 novel 2976 19 NA NA -3 1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAGGGAAGATGCTCAGGGC -4 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.193.7 chr1 + 2583 16 novel_in_catalog PLOD1 novel 2976 19 NA NA -4514 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG 1768 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.193.8 chr1 + 2690 17 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 15110 1 -4474 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 34 9.108295 0.959437 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG 14 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 34 NA PB.193.9 chr1 + 2507 16 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 15745 -1 -3839 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.946801 0.469351 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGAAGGGAAGATGCTCAGGG 28 FALSE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 11 NA PB.193.10 chr1 + 2384 15 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 17968 1 -1616 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.018365 0.604049 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG 53 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 15 NA PB.193.11 chr1 + 2242 13 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 22227 1 2643 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.554148 0.658407 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG 2098 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 17 NA PB.193.12 chr1 + 2096 12 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 23200 1 3616 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 25 6.697276 0.825898 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG 950 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 25 NA PB.193.13 chr1 + 1886 10 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 25980 1 -3991 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 44 11.787206 1.071411 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG 2094 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 44 NA PB.193.14 chr1 + 1613 8 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 29557 -1 -414 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 33 8.840405 0.946472 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGAAGGGAAGATGCTCAGGG 36 FALSE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 33 NA PB.193.15 chr1 + 1534 7 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 29977 1 6 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG 456 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 7 NA PB.193.16 chr1 + 1446 6 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 30761 -1 776 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 29 7.768840 0.890356 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGAAGGGAAGATGCTCAGGG 1240 FALSE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 29 NA PB.193.17 chr1 + 1254 4 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 32278 1 2293 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 41 10.983533 1.040742 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG 1475 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 41 NA PB.193.18 chr1 + 1161 3 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 35951 -1 -875 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.214692 0.507139 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGAAGGGAAGATGCTCAGGG 1 TRUE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 12 NA PB.193.19 chr1 + 1078 3 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 36032 1 -794 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 30 8.036731 0.905079 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG 82 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 30 NA PB.193.20 chr1 + 920 2 full-splice_match PLOD1 ENST00000481933.1 2339 2 1419 0 1419 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG 2295 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 10 NA PB.194.2 chr1 + 4591 19 full-splice_match MFN2 ENST00000235329.10 4407 19 -190 6 -5 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATCCTTTGTGAGATCTGT 9587 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 10 NA PB.194.3 chr1 + 4602 20 novel_in_catalog MFN2 novel 4772 20 NA NA 24 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGATCTGTCTTTTTGGGTTC 18 FALSE NA NA AATAAA -23 NA NA NA 2 NA PB.194.5 chr1 + 4567 19 novel_in_catalog MFN2 novel 4407 19 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTTGTGAGATCTGTCTTTTT 2 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.194.6 chr1 + 4477 20 novel_in_catalog MFN2 novel 4772 20 NA NA 0 2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTGAGATCTGTCTTTTTGG 2 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.194.7 chr1 + 4405 19 full-splice_match MFN2 ENST00000235329.10 4407 19 0 2 0 1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 56 15.001898 1.176146 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CCTTTGTGAGATCTGTCTTT 2 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 56 NA PB.194.8 chr1 + 4260 18 full-splice_match MFN2 ENST00000674817.1 4514 18 257 -3 0 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTTGTGAGATCTGTCTTTTT 4 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 7 NA PB.194.9 chr1 + 3934 16 full-splice_match MFN2 ENST00000675483.1 4337 16 411 -8 411 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTTGTGAGATCTGTCTTTTT 7895 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.194.10 chr1 + 3682 14 incomplete-splice_match MFN2 ENST00000675483.1 4337 16 5107 -9 1204 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGTGAGATCTGTCTTTTTG NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.194.11 chr1 + 3621 13 full-splice_match MFN2 ENST00000675528.1 3700 13 88 -9 88 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGTGAGATCTGTCTTTTTG NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.194.12 chr1 + 3504 12 incomplete-splice_match MFN2 ENST00000675528.1 3700 13 307 -2 307 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATCCTTTGTGAGATCTGT NA FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 5 NA PB.194.13 chr1 + 3385 11 full-splice_match MFN2 ENST00000675404.1 4447 11 1066 -4 1066 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTTTGTGAGATCTGTCTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.194.14 chr1 + 3129 9 incomplete-splice_match MFN2 ENST00000675404.1 4447 11 1676 1 1676 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATCCTTTGTGAGATCTGT 559 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 9 NA PB.194.15 chr1 + 2951 8 incomplete-splice_match MFN2 ENST00000675404.1 4447 11 3747 -4 -2671 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTTTGTGAGATCTGTCTTTT 2630 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 8 NA PB.194.16 chr1 + 2799 6 incomplete-splice_match MFN2 ENST00000675404.1 4447 11 4495 1 -1923 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATCCTTTGTGAGATCTGT 3378 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 6 NA PB.194.17 chr1 + 2684 5 incomplete-splice_match MFN2 ENST00000675404.1 4447 11 5399 -5 -1019 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTTGTGAGATCTGTCTTTTT 4282 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 6 NA PB.194.18 chr1 + 2568 5 incomplete-splice_match MFN2 ENST00000675404.1 4447 11 5509 1 -909 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATCCTTTGTGAGATCTGT 4392 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 6 NA PB.194.19 chr1 + 2382 4 incomplete-splice_match MFN2 ENST00000675404.1 4447 11 6301 1 -117 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATCCTTTGTGAGATCTGT 5184 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 4 NA PB.194.20 chr1 + 2335 3 full-splice_match MFN2 ENST00000676295.1 2622 3 289 -2 289 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.750474 0.574086 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATCCTTTGTGAGATCTGT 5590 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 14 NA PB.194.21 chr1 + 2244 3 full-splice_match MFN2 ENST00000676295.1 2622 3 388 -10 388 2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTGAGATCTGTCTTTTTGG 5689 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 5 NA PB.194.22 chr1 + 2130 2 full-splice_match MFN2 ENST00000675043.1 2148 2 56 -38 56 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGTGAGATCTGTCTTTTTG 8144 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 9 NA PB.195.1 chr1 + 1550 10 full-splice_match MIIP ENST00000235332.6 1541 10 -11 2 -11 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 231 61.882828 1.791570 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGTCCCACGTGTGCTGGTT -13 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 231 NA PB.195.2 chr1 + 1717 10 novel_in_catalog MIIP novel 1541 10 NA NA -2 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTCAAGTCCCACGTGTGC -4 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 10 NA PB.195.3 chr1 + 1674 9 novel_in_catalog MIIP novel 1541 10 NA NA -2 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGTCCCACGTGTGCTGGTT -4 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 9 NA PB.195.4 chr1 + 2147 8 novel_in_catalog MIIP novel 1541 10 NA NA 3 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.822039 0.683231 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTCAAGTCCCACGTGTGC 1 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 18 NA PB.195.5 chr1 + 2013 9 novel_in_catalog MIIP novel 1541 10 NA NA 3 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 34 9.108295 0.959437 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAGCTCAAGTCCCACGTGTG 1 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 34 NA PB.195.6 chr1 + 1918 8 novel_in_catalog MIIP novel 1541 10 NA NA 3 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTCAAGTCCCACGTGTGC 1 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.195.7 chr1 + 1335 9 novel_in_catalog MIIP novel 1541 10 NA NA 3 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 26 6.965167 0.842932 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTCAAGTCCCACGTGTGC 1 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 26 NA PB.195.8 chr1 + 2078 8 novel_in_catalog MIIP novel 1541 10 NA NA 25 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGTCCCACGTGTGCTGGTT 23 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.195.9 chr1 + 2219 7 novel_in_catalog MIIP novel 1541 10 NA NA -578 1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CTCAAGTCCCACGTGTGCTG 2144 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.195.10 chr1 + 1452 9 incomplete-splice_match MIIP ENST00000235332.6 1541 10 2179 2 -545 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGTCCCACGTGTGCTGGTT 2177 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.195.11 chr1 + 1309 9 incomplete-splice_match MIIP ENST00000235332.6 1541 10 2317 7 -407 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTCAAGTCCCACGTGTGC 2315 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.195.12 chr1 + 1195 8 incomplete-splice_match MIIP ENST00000235332.6 1541 10 2685 7 -39 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTCAAGTCCCACGTGTGC 2683 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.195.13 chr1 + 823 6 incomplete-splice_match MIIP ENST00000235332.6 1541 10 9567 2 -31 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGTCCCACGTGTGCTGGTT 9565 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.195.14 chr1 + 1437 4 incomplete-splice_match MIIP ENST00000466860.5 1709 6 6845 -68 -29 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGTCCCACGTGTGCTGGTT 9567 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.196.1 chr1 + 1941 2 incomplete-splice_match TNFRSF8 ENST00000413146.6 2363 5 12515 3 12480 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAGGCTGAGGACATGATCA NA FALSE NA NA CATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.197.2 chr1 + 3685 10 full-splice_match TNFRSF1B ENST00000376259.7 3687 10 0 2 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.018365 0.604049 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACACGTCGACCCCTGGCTC 1 TRUE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 15 NA PB.198.2 chr1 + 2636 18 incomplete-splice_match VPS13D ENST00000620676.6 16357 70 2 238677 2 15415 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGACCTGAGGGTTCACTTG -2 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.198.3 chr1 + 1028 7 incomplete-splice_match VPS13D ENST00000620676.6 16357 70 9 258020 9 -3928 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATGTATGTTTTAAATTTATA 5 TRUE NA NA AATATA -15 NA NA NA 2 NA PB.198.4 chr1 + 1356 8 novel_not_in_catalog VPS13D novel 16245 69 NA NA -15 -1788 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAGAATAAAAATGAATA 18 TRUE NA NA AATATA -21 NA NA NA 2 NA PB.200.1 chr1 - 2698 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 120 1 96 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACGACCGGTTTGTGTGTGGT 108 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.200.4 chr1 - 2292 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 526 1 502 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACGACCGGTTTGTGTGTGGT 514 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.200.5 chr1 - 2042 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 776 1 752 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACGACCGGTTTGTGTGTGGT 764 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.200.6 chr1 - 1819 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 999 1 975 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACGACCGGTTTGTGTGTGGT 987 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.200.7 chr1 - 1462 2 incomplete-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 3071 1 3047 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACGACCGGTTTGTGTGTGGT 3059 FALSE NA NA GGGGCT -19 NA NA NA 5 NA PB.200.8 chr1 - 1317 2 incomplete-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 3216 1 3192 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.482584 0.541902 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACGACCGGTTTGTGTGTGGT 3204 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.200.9 chr1 - 1060 2 incomplete-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 3473 1 3449 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACGACCGGTTTGTGTGTGGT 3461 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.200.10 chr1 - 907 2 incomplete-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 3626 1 3602 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACGACCGGTTTGTGTGTGGT 3614 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.200.11 chr1 - 799 2 incomplete-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 3734 1 3710 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACGACCGGTTTGTGTGTGGT 3722 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.200.14 chr1 - 1631 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 1186 2 1162 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CACGACCGGTTTGTGTGTGG 1174 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.200.15 chr1 - 1264 3 novel_not_in_catalog KIAA2013 novel 2819 3 NA NA 3169 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CACGACCGGTTTGTGTGTGG 3181 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.200.16 chr1 - 1701 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 1115 3 1091 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TCACGACCGGTTTGTGTGTG 1103 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.200.19 chr1 - 2129 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 213 477 189 115 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATACTTGAAATGGAACTC 201 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.200.20 chr1 - 1998 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 344 477 320 115 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATACTTGAAATGGAACTC 332 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.200.23 chr1 - 1812 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 530 477 506 115 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.018365 0.604049 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATACTTGAAATGGAACTC 518 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.200.24 chr1 - 1699 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 643 477 619 115 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATACTTGAAATGGAACTC 631 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.200.25 chr1 - 1526 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 816 477 792 115 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.482584 0.541902 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATACTTGAAATGGAACTC 804 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.200.26 chr1 - 1384 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 958 477 934 115 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATACTTGAAATGGAACTC 946 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.200.27 chr1 - 1360 4 novel_not_in_catalog KIAA2013 novel 2170 4 NA NA 883 115 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATACTTGAAATGGAACTC 895 FALSE NA NA GGGGCT -14 NA NA NA 2 NA PB.200.28 chr1 - 1235 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 1107 477 1083 115 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.482584 0.541902 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATACTTGAAATGGAACTC 1095 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.200.29 chr1 - 1122 2 incomplete-splice_match KIAA2013 ENST00000616327.1 2170 4 2911 -115 2911 115 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATACTTGAAATGGAACTC 2923 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.200.30 chr1 - 968 2 incomplete-splice_match KIAA2013 ENST00000616327.1 2170 4 3065 -115 3065 115 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATACTTGAAATGGAACTC 3077 FALSE NA NA GGGGCT -1 NA NA NA 4 NA PB.201.1 chr1 + 3056 18 incomplete-splice_match VPS13D ENST00000646411.1 4522 21 12190 912 871 404 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TATTGCACTAATTCTAGATG NA FALSE NA NA TATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.201.2 chr1 + 2053 12 incomplete-splice_match VPS13D ENST00000646411.1 4522 21 28996 979 2351 337 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAGGGTCTGTGCTATGTG 11 FALSE NA NA AATATA -15 NA NA NA 2 NA PB.201.4 chr1 + 1704 9 incomplete-splice_match VPS13D ENST00000646411.1 4522 21 45279 979 1320 337 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAGGGTCTGTGCTATGTG NA FALSE NA NA AATATA -15 NA NA NA 2 NA PB.201.5 chr1 + 2526 8 incomplete-splice_match VPS13D ENST00000646411.1 4522 21 47587 -31 -3316 16 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGCTGAGTCTGGGATGACT NA FALSE NA NA AATAAA -31 NA NA NA 2 NA PB.201.7 chr1 + 1246 5 incomplete-splice_match VPS13D ENST00000645371.1 2024 14 73000 -404 -8944 404 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TATTGCACTAATTCTAGATG NA FALSE NA NA TATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.201.9 chr1 + 1728 4 incomplete-splice_match VPS13D ENST00000645371.1 2024 14 77250 -1066 -4694 -250 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGGGGGATGAAATAGGAG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.202.1 chr1 - 2215 6 full-splice_match DHRS3 ENST00000616661.5 2201 6 -15 1 -15 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTCCTTTGTTCAAATCTT -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.202.2 chr1 - 1937 6 full-splice_match DHRS3 ENST00000616661.5 2201 6 263 1 263 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTCCTTTGTTCAAATCTT 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.202.3 chr1 - 1684 6 full-splice_match DHRS3 ENST00000616661.5 2201 6 516 1 516 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 25 6.697276 0.825898 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTCCTTTGTTCAAATCTT -9 TRUE NA NA AAAAAG -13 NA NA NA 25 NA PB.202.4 chr1 - 1484 6 full-splice_match DHRS3 ENST00000616661.5 2201 6 716 1 -699 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTCCTTTGTTCAAATCTT 2474 FALSE NA NA AAAAAG -25 NA NA NA 4 NA PB.202.5 chr1 - 1366 6 novel_in_catalog DHRS3 novel 2201 6 NA NA 13 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTCCTTTGTTCAAATCTT -4 TRUE NA NA AAAAAG -15 NA NA NA 4 NA PB.202.6 chr1 - 1299 6 full-splice_match DHRS3 ENST00000616661.5 2201 6 901 1 -514 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTCCTTTGTTCAAATCTT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.202.7 chr1 - 1282 6 novel_in_catalog DHRS3 novel 2201 6 NA NA -2 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTCCTTTGTTCAAATCTT 18 TRUE NA NA GGGGCT -39 NA NA NA 3 NA PB.202.8 chr1 - 1180 6 full-splice_match DHRS3 ENST00000616661.5 2201 6 1020 1 -395 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTCCTTTGTTCAAATCTT 2778 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.202.10 chr1 - 1053 5 incomplete-splice_match DHRS3 ENST00000616661.5 2201 6 37632 3 15730 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGATTTCCTTTGTTCAAATC 89 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.203.1 chr1 - 1641 3 novel_not_in_catalog PRAMEF11 novel 1845 4 NA NA 3062 -5 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCTGTCTGGTGCCCTCTA 3084 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.203.2 chr1 - 1377 2 incomplete-splice_match PRAMEF11 ENST00000619922.1 1845 4 3679 5 3679 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCTGTCTGGTGCCCTCTA 3701 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.204.1 chr1 - 1867 4 full-splice_match PRAMEF8 ENST00000357367.6 1844 4 -21 -2 -1 2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATCTGGTGTCCTCCGTAATT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.206.2 chr1 + 1208 6 full-splice_match PDPN ENST00000621990.5 2737 6 -43 1572 27 126 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 28 7.500949 0.875116 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TACACATTCTGGTCTAGTTT 17 TRUE NA NA AGTAAA -39 NA NA NA 28 NA PB.206.3 chr1 + 1066 6 full-splice_match PDPN ENST00000376057.8 2801 6 27 1708 27 2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.893603 0.770381 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTGTCTCCGTCTGACCATTC 17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 22 NA PB.206.4 chr1 + 1064 6 full-splice_match PDPN ENST00000621990.5 2737 6 -35 1708 -35 2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 45 12.055097 1.081171 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTGTCTCCGTCTGACCATTC 25 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 45 NA PB.206.5 chr1 + 2770 6 full-splice_match PDPN ENST00000621990.5 2737 6 -35 2 -35 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.214692 0.507139 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AACAATGAGTCAGACTTTTG 25 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 12 NA PB.206.6 chr1 + 2764 6 full-splice_match PDPN ENST00000376057.8 2801 6 35 2 -35 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AACAATGAGTCAGACTTTTG 25 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 10 NA PB.206.7 chr1 + 1713 6 full-splice_match PDPN ENST00000376057.8 2801 6 49 1039 -21 136 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACATTCACTTTCTGCCTCT 39 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.206.8 chr1 + 925 6 full-splice_match PDPN ENST00000376057.8 2801 6 169 1707 98 3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTCTCCGTCTGACCATTCT 159 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.206.9 chr1 + 949 6 full-splice_match PDPN ENST00000376057.8 2801 6 280 1572 -51 126 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TACACATTCTGGTCTAGTTT 52 FALSE NA NA AGTAAA -39 NA NA NA 2 NA PB.206.10 chr1 + 2355 5 incomplete-splice_match PDPN ENST00000475043.5 849 6 21805 -1707 21797 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 CAACAATGAGTCAGACTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.207.1 chr1 + 1715 2 novel_in_catalog PRDM2 novel 628 6 NA NA -10 -16872 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAGAAGAAAAATAAAAATC -16 TRUE NA NA AATATA -26 NA NA NA 2 NA PB.207.2 chr1 + 713 7 incomplete-splice_match PRDM2 ENST00000311066.10 7279 10 -6 51984 -6 -31 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAATAAAAACAAAGGAAAC -12 TRUE NA NA AATAAA -40 NA NA NA 3 NA PB.207.6 chr1 + 2167 3 incomplete-splice_match PRDM2 ENST00000376048.9 2688 8 49141 -9 -22 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AACAAGCCTGGGAGTGATCA -5 TRUE NA NA AATAAA -23 NA NA NA 5 NA PB.207.7 chr1 + 4020 3 incomplete-splice_match PRDM2 ENST00000413440.5 6175 4 12 5826 0 3621 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAAAAAGTTTCTCATTC -12 TRUE NA NA AATAAA -43 NA NA NA 6 NA PB.207.8 chr1 + 1305 3 novel_in_catalog PRDM2 novel 5797 5 NA NA 0 -22 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAATAAAATATTTAAAAT -12 TRUE NA NA TATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.207.10 chr1 + 2577 1 full-splice_match ENSG00000289380 ENST00000690275.1 688 1 500 -2389 500 2389 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAATGAGC 476 FALSE NA NA AATACA -43 NA NA NA 2 NA PB.207.11 chr1 + 2407 1 full-splice_match ENSG00000289380 ENST00000690275.1 688 1 670 -2389 670 2389 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAATGAGC 646 FALSE NA NA AATACA -43 NA NA NA 2 NA PB.207.24 chr1 + 2330 2 incomplete-splice_match PRDM2 ENST00000343137.8 5797 5 32208 22 9897 -22 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAATAAAATATTTAAAAT 1319 FALSE NA NA TATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.207.25 chr1 + 1419 2 incomplete-splice_match PRDM2 ENST00000343137.8 5797 5 33119 22 10808 -22 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAATAAAATATTTAAAAT 75 FALSE NA NA TATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.207.26 chr1 + 1222 2 incomplete-splice_match PRDM2 ENST00000343137.8 5797 5 33316 22 11005 -22 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAATAAAATATTTAAAAT 272 FALSE NA NA TATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.236.1 chr1 - 1456 2 novel_not_in_catalog LRRC38 novel 2168 2 NA NA 235 66761 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTTTTTACAGAGTCTCTT -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.236.2 chr1 - 2173 2 full-splice_match LRRC38 ENST00000376085.4 2168 2 -6 1 -6 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTCAATCTCTGGTATTCTG -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.236.3 chr1 - 1902 2 full-splice_match LRRC38 ENST00000376085.4 2168 2 265 1 265 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.625712 0.750178 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTCAATCTCTGGTATTCTG 3015 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 21 NA PB.236.4 chr1 - 1146 2 full-splice_match LRRC38 ENST00000376085.4 2168 2 1021 1 1021 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTCAATCTCTGGTATTCTG 3771 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.236.6 chr1 - 1292 2 full-splice_match LRRC38 ENST00000376085.4 2168 2 874 2 874 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CACTCAATCTCTGGTATTCT 3624 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.236.7 chr1 - 2013 2 full-splice_match LRRC38 ENST00000376085.4 2168 2 148 7 148 -7 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAGCCACTCAATCTCTGGT 2898 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.242.1 chr1 + 1902 4 full-splice_match TMEM51 ENST00000376014.7 1843 4 -22 -37 12 -17 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAGAA 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.242.2 chr1 + 1880 3 full-splice_match TMEM51 ENST00000428417.5 1942 3 61 1 16 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TACATTTGGGTGCTGAGTTA 27 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 8 NA PB.242.3 chr1 + 1931 4 full-splice_match TMEM51 ENST00000376014.7 1843 4 49 -137 38 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TACATTTGGGTGCTGAGTTA -1 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.242.4 chr1 + 1896 3 full-splice_match TMEM51 ENST00000400796.7 1842 3 14 -68 0 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 20 5.357821 0.728988 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TACATTTGGGTGCTGAGTTA 6 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 20 NA PB.242.5 chr1 + 1864 4 full-splice_match TMEM51 ENST00000376008.3 1971 4 5 102 5 -17 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAGAA 11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.242.6 chr1 + 1954 4 full-splice_match TMEM51 ENST00000376008.3 1971 4 16 1 -5 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.554148 0.658407 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACATTTGGGTGCTGAGTTAC 22 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 17 NA PB.242.7 chr1 + 1747 4 novel_not_in_catalog TMEM51 novel 1942 3 NA NA 20303 -17 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAGAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.242.9 chr1 + 1747 2 incomplete-splice_match TMEM51 ENST00000376008.3 1971 4 61086 5 61065 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGTACATTTGGGTGCTGAG NA FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.242.11 chr1 + 1600 2 incomplete-splice_match TMEM51 ENST00000376008.3 1971 4 61233 5 61212 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGTACATTTGGGTGCTGAG NA FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.242.12 chr1 + 1445 2 incomplete-splice_match TMEM51 ENST00000376008.3 1971 4 61392 1 61371 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACATTTGGGTGCTGAGTTAC NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.242.13 chr1 + 1091 2 novel_not_in_catalog TMEM51 novel 1942 3 NA NA 61436 -17 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAGAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.243.1 chr1 - 1962 3 full-splice_match TMEM51-AS1 ENST00000669314.1 3126 3 1176 -12 16 12 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAGAAAAAAAA -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.245.2 chr1 + 2258 4 full-splice_match EFHD2 ENST00000375980.9 2422 4 31 133 31 -133 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GGCTTTTTGCTTCTTTTTTC 3 TRUE NA NA TATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.245.3 chr1 + 2379 4 full-splice_match EFHD2 ENST00000375980.9 2422 4 34 9 34 -9 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.482584 0.541902 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATATTCTTATGTGTGTATGG 6 TRUE NA NA GATAAA -6 NA NA NA 13 NA PB.245.4 chr1 + 897 4 full-splice_match EFHD2 ENST00000375980.9 2422 4 37 1488 37 -230 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATGGAGCAAGTTCAGGGGT 9 TRUE NA NA ACTAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.245.5 chr1 + 2115 4 full-splice_match EFHD2 ENST00000375980.9 2422 4 175 132 175 -132 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GCTTTTTGCTTCTTTTTTCC 147 FALSE NA NA TATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.245.6 chr1 + 2197 4 full-splice_match EFHD2 ENST00000375980.9 2422 4 216 9 -161 -9 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.214692 0.507139 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATATTCTTATGTGTGTATGG 188 FALSE NA NA GATAAA -6 NA NA NA 12 NA PB.245.7 chr1 + 2068 4 full-splice_match EFHD2 ENST00000375980.9 2422 4 344 10 -33 -10 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATATTCTTATGTGTGTATG 57 FALSE NA NA GATAAA -5 NA NA NA 6 NA PB.245.9 chr1 + 1862 3 incomplete-splice_match EFHD2 ENST00000375980.9 2422 4 16019 132 15642 -132 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GCTTTTTGCTTCTTTTTTCC 20 FALSE NA NA TATAAA -17 NA NA NA 9 NA PB.245.10 chr1 + 1916 3 incomplete-splice_match EFHD2 ENST00000375980.9 2422 4 16088 9 15711 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.482584 0.541902 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATATTCTTATGTGTGTATGG 89 FALSE NA NA GATAAA -6 NA NA NA 13 NA PB.245.11 chr1 + 1775 2 incomplete-splice_match EFHD2 ENST00000375980.9 2422 4 17369 0 16992 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.286257 0.632078 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTGTGTATGGTTCTTGATG 35 FALSE NA NA GATAAA -15 NA NA NA 16 NA PB.246.2 chr1 - 1951 9 full-splice_match CASP9 ENST00000333868.10 2808 9 -18 875 -16 -6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 58 15.537680 1.191386 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTCTCTTTTGCCTATTTCT -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 58 NA PB.246.3 chr1 - 1881 8 novel_in_catalog CASP9 novel 2808 9 NA NA 2 -6 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTCTCTTTTGCCTATTTCT 27 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.246.4 chr1 - 1364 6 incomplete-splice_match CASP9 ENST00000400777.7 1878 9 17218 -90 78 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTCTCTTTTGCCTATTTCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.246.5 chr1 - 1483 5 full-splice_match CASP9 ENST00000348549.9 1621 5 124 14 -6 -14 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATGGACTCTCTTTTGC 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.246.6 chr1 - 1126 4 incomplete-splice_match CASP9 ENST00000400777.7 1878 9 19498 -82 2358 -14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATGGACTCTCTTTTGC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.246.7 chr1 - 1519 7 novel_in_catalog CASP9 novel 2808 9 NA NA 6020 -15 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAAATATGGACTCTCTTTTG 8306 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.247.1 chr1 + 3104 15 full-splice_match DNAJC16 ENST00000375847.8 6034 15 6 2924 6 748 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATGTGAGTTCTCAAGAAAAG -21 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.247.3 chr1 + 6012 15 full-splice_match DNAJC16 ENST00000375847.8 6034 15 19 3 19 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAATTATGGGGTAGCCCTTG -8 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.247.5 chr1 + 5285 15 full-splice_match DNAJC16 ENST00000375847.8 6034 15 29 720 29 -718 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAAAAAAAAAATTTGT 2 TRUE NA NA AATACA -12 NA NA NA 5 NA PB.248.1 chr1 + 1585 1 full-splice_match CHCHD2P6 ENST00000454346.1 447 1 -868 -270 -868 270 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA NA NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAGAAAAAAAAAATAGC 7 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.249.2 chr1 + 3656 10 full-splice_match DDI2 ENST00000480945.6 10667 10 -4 7015 -4 972 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGCATACTGTTTTAGAATGA 0 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 10 NA PB.249.3 chr1 + 3898 10 full-splice_match DDI2 ENST00000480945.6 10667 10 4 6765 4 1222 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAATATCTTATCGTAGAGTG 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.249.5 chr1 + 1595 1 full-splice_match RSC1A1 ENST00000345034.2 2321 1 722 4 722 -4 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGCATACTGTTTTAGAATGA 590 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.249.6 chr1 + 1395 1 full-splice_match RSC1A1 ENST00000345034.2 2321 1 921 5 921 -5 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAGCATACTGTTTTAGAATG 789 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.249.7 chr1 + 743 1 full-splice_match RSC1A1 ENST00000345034.2 2321 1 1579 -1 1579 1 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGTTTTAGAATGAGAGTA 1447 FALSE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 2 NA PB.249.9 chr1 + 860 1 full-splice_match RSC1A1 ENST00000345034.2 2321 1 1700 -239 1700 239 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AATAATTGAATATCTTATCG 1568 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.250.1 chr1 + 3504 16 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000375793.2 4004 19 33555 2 -11900 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 43 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.250.2 chr1 + 3450 16 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000375799.8 4134 20 34284 2 -11241 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 702 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.250.3 chr1 + 3118 13 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000375793.2 4004 19 40991 1 -4464 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGGCTTGTCACTGGCCCTTT 7479 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.250.4 chr1 + 3029 13 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000375793.2 4004 19 41079 2 -4376 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 7567 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.250.5 chr1 + 2789 12 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000642363.1 3775 21 42621 2 -2668 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 107 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 5 NA PB.250.6 chr1 + 2410 12 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000642363.1 3775 21 43000 2 -2289 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 486 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 5 NA PB.250.7 chr1 + 2284 12 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000642363.1 3775 21 43126 2 -2163 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 612 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.250.8 chr1 + 2171 12 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000642363.1 3775 21 43239 2 -2050 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 725 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 5 NA PB.250.9 chr1 + 2102 11 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000642363.1 3775 21 43554 2 -1735 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 1040 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.250.10 chr1 + 2118 9 novel_in_catalog PLEKHM2 novel 4004 19 NA NA -1551 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 1224 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.250.11 chr1 + 1957 9 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000642363.1 3775 21 44128 2 -1161 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 1614 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 7 NA PB.250.12 chr1 + 2955 6 novel_in_catalog PLEKHM2 novel 4004 19 NA NA -1078 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 1697 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.250.13 chr1 + 1709 7 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000642363.1 3775 21 45350 2 61 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 2836 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.250.14 chr1 + 1575 6 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000642363.1 3775 21 46086 2 797 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 3572 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 7 NA PB.250.15 chr1 + 1303 4 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000477849.1 1057 7 2169 -652 2169 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 4944 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 8 NA PB.250.16 chr1 + 1154 3 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000477849.1 1057 7 2618 -651 2618 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CAAGGCTTGTCACTGGCCCT 5393 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 4 NA PB.251.5 chr1 - 1227 7 full-splice_match AGMAT ENST00000375826.4 3095 7 11 1857 11 -1857 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 23 6.161494 0.789686 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGAAAACTTTCTGCTGAAA 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 23 NA PB.252.1 chr1 + 3356 9 full-splice_match FBLIM1 ENST00000375766.8 3314 9 -42 0 -31 0 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTCCATGTTGTGTGTAGGCT -1 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 6 NA PB.252.2 chr1 + 2128 9 novel_in_catalog FBLIM1 novel 3314 9 NA NA -31 29 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.946801 0.469351 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTGGTGGCTCATGCCTGT -1 TRUE NA NA AAAAAG -16 NA NA NA 11 NA PB.252.4 chr1 + 3194 9 novel_in_catalog FBLIM1 novel 3314 9 NA NA -13 -9 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGAAGCTCTTCCATGTTGT -23 TRUE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.252.6 chr1 + 1931 9 novel_in_catalog FBLIM1 novel 3314 9 NA NA 0 1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAAAAAAAAAGTGCCTTT -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.255.2 chr1 + 2609 11 incomplete-splice_match SPEN ENST00000375759.8 12385 15 109 11859 109 40 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 26 6.965167 0.842932 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAATGAAAAGACAGATA -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 26 NA PB.255.3 chr1 + 1495 5 incomplete-splice_match SPEN ENST00000375759.8 12385 15 109 29155 109 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 GTAAGACACAAGCAAGCTGA -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.255.4 chr1 + 4730 11 incomplete-splice_match SPEN ENST00000375759.8 12385 15 115 9732 115 2167 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 GAAAAAGAAGAAAATTAGGA -6 TRUE NA NA GATAAA -45 NA NA NA 2 NA PB.255.6 chr1 + 4253 10 novel_in_catalog SPEN novel 12385 15 NA NA 115 2167 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 GAAAAAGAAGAAAATTAGGA -6 TRUE NA NA GATAAA -45 NA NA NA 2 NA PB.255.7 chr1 + 2126 10 novel_in_catalog SPEN novel 12385 15 NA NA 115 40 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAATGAAAAGACAGATA -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.255.9 chr1 + 3857 11 novel_in_catalog SPEN novel 12385 15 NA NA 120 40 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAATGAAAAGACAGATA -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.255.11 chr1 + 1909 9 incomplete-splice_match SPEN ENST00000673875.1 3123 12 40151 -40 -330 40 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAATGAAAAGACAGATA 2078 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.255.13 chr1 + 1515 9 incomplete-splice_match SPEN ENST00000673875.1 3123 12 40545 -40 64 40 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAATGAAAAGACAGATA 2472 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.255.15 chr1 + 1351 8 incomplete-splice_match SPEN ENST00000673875.1 3123 12 73351 -40 -29137 40 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAATGAAAAGACAGATA 9880 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.255.16 chr1 + 1208 7 incomplete-splice_match SPEN ENST00000673875.1 3123 12 75113 -40 -27375 40 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAATGAAAAGACAGATA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.255.19 chr1 + 928 5 incomplete-splice_match SPEN ENST00000673875.1 3123 12 82865 -40 -19623 40 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAATGAAAAGACAGATA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.256.1 chr1 - 1977 11 incomplete-splice_match ZBTB17 ENST00000537142.5 2511 15 30238 -1 243 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGCTGCCTATAGGTCCCTG 7062 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.256.2 chr1 - 2751 16 full-splice_match ZBTB17 ENST00000375733.6 2770 16 19 0 -9 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCTGCCTATAGGTCCCT 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.256.3 chr1 - 2718 16 full-splice_match ZBTB17 ENST00000375743.9 2720 16 0 2 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 35 9.376186 0.972026 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCTGCCTATAGGTCCCT -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 35 NA PB.256.4 chr1 - 2511 15 novel_in_catalog ZBTB17 novel 2720 16 NA NA 0 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCTGCCTATAGGTCCCT -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.256.5 chr1 - 2196 13 incomplete-splice_match ZBTB17 ENST00000375743.9 2720 16 29087 2 91 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCTGCCTATAGGTCCCT 5889 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.256.6 chr1 - 1775 10 incomplete-splice_match ZBTB17 ENST00000537142.5 2511 15 30951 0 -700 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCTGCCTATAGGTCCCT 7775 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.256.7 chr1 - 1275 3 incomplete-splice_match ZBTB17 ENST00000537142.5 2511 15 32748 0 53 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCTGCCTATAGGTCCCT 9572 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.256.8 chr1 - 968 6 incomplete-splice_match ZBTB17 ENST00000537142.5 2511 15 32447 0 -248 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCTGCCTATAGGTCCCT 9271 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.256.9 chr1 - 2584 15 incomplete-splice_match ZBTB17 ENST00000375743.9 2720 16 2990 3 2968 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAATGCTGCCTATAGGTCCC 3008 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.256.10 chr1 - 1578 9 incomplete-splice_match ZBTB17 ENST00000537142.5 2511 15 31244 1 -407 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAATGCTGCCTATAGGTCCC 8068 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.257.2 chr1 - 2143 3 full-splice_match HSPB7 ENST00000311890.14 2144 3 0 1 0 -1 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 23 6.161494 0.789686 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTCTGGAGGCCGCCTGCC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 23 NA PB.257.4 chr1 - 2155 3 full-splice_match HSPB7 ENST00000487046.1 844 3 32 -1343 0 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GACTTCTGGAGGCCGCCTGC 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.257.5 chr1 - 1947 3 full-splice_match HSPB7 ENST00000311890.14 2144 3 195 2 -23 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GACTTCTGGAGGCCGCCTGC 2622 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.258.1 chr1 - 1692 7 full-splice_match FAM131C ENST00000375662.5 1720 7 27 1 8 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGACCTTGGCCTGGTCTCT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.259.1 chr1 - 1868 7 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 22776 2 269 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GATCTTGGCTTTCAGTCTTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.259.2 chr1 - 1395 4 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 24286 2 1779 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GATCTTGGCTTTCAGTCTTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.259.3 chr1 - 1891 6 novel_not_in_catalog EPHA2 novel 3946 17 NA NA 1125 -6 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCGATCTTGGCTTTCAGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.259.4 chr1 - 3826 17 full-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 113 7 96 -7 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACCGATCTTGGCTTTCAG 114 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.259.5 chr1 - 3506 15 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 7165 7 -2454 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACCGATCTTGGCTTTCAG 7166 FALSE NA NA AATGAA -37 NA NA NA 2 NA PB.259.6 chr1 - 3263 15 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 7408 7 -2211 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACCGATCTTGGCTTTCAG 7409 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.259.7 chr1 - 3002 15 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 7669 7 -1950 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACCGATCTTGGCTTTCAG 7670 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.259.8 chr1 - 2401 12 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 20388 7 -2119 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACCGATCTTGGCTTTCAG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.259.9 chr1 - 2255 11 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 20999 7 -1508 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACCGATCTTGGCTTTCAG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.259.10 chr1 - 1718 6 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 23661 7 1154 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACCGATCTTGGCTTTCAG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.259.11 chr1 - 1562 5 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 23921 7 1414 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACCGATCTTGGCTTTCAG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.259.12 chr1 - 3927 17 full-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 11 8 -6 -8 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 19 5.089930 0.706712 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAAACCGATCTTGGCTTTCA 12 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.259.13 chr1 - 2018 8 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 22508 8 1 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAAACCGATCTTGGCTTTCA NA FALSE NA NA GGGGCT -15 NA NA NA 2 NA PB.259.15 chr1 - 2198 12 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 20314 284 -2193 -284 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAGAATGTGTGTGTGTGGC NA FALSE NA NA GGGGCT -36 NA NA NA 2 NA PB.260.1 chr1 - 1932 10 incomplete-splice_match ARHGEF19 ENST00000270747.8 3322 16 6134 251 8 -251 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.286257 0.632078 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGCTTGGAGTCTGTGATCCA -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.260.2 chr1 - 1825 11 incomplete-splice_match ARHGEF19 ENST00000270747.8 3322 16 5634 251 -7 -251 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGCTTGGAGTCTGTGATCCA 5621 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.260.3 chr1 - 1679 10 novel_in_catalog ARHGEF19 novel 3322 16 NA NA 7 -253 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTTGCTTGGAGTCTGTGATC 5635 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.262.1 chr1 - 1559 5 full-splice_match CPLANE2 ENST00000375599.8 1574 5 10 5 10 -5 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CTGAACTCCAGAGACGTGTT 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.264.2 chr1 + 919 2 full-splice_match SRARP ENST00000329454.2 3039 2 0 2120 0 -2120 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACAGCGATGAATGCTCTGC 0 TRUE NA NA AATAAA -35 NA NA NA 2 NA PB.265.1 chr1 + 3586 5 novel_not_in_catalog SZRD1 novel 791 5 NA NA -13 1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CAGATCTTTGTCCTCATTTC 45 FALSE NA NA TATAAA -31 NA NA NA 2 NA PB.265.2 chr1 + 1700 3 novel_not_in_catalog SZRD1 novel 3447 3 NA NA -11 954 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAAGAACAGCTTTGCTTT 47 FALSE NA NA AATAAA -6 NA NA NA 2 NA PB.265.3 chr1 + 3464 3 novel_not_in_catalog SZRD1 novel 3401 3 NA NA -4 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGATCTTTGTCCTCATTTCA -8 TRUE NA NA TATAAA -32 NA NA NA 3 NA PB.265.5 chr1 + 934 4 full-splice_match SZRD1 ENST00000401088.9 3480 4 -7 2553 0 186 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.554148 0.658407 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAATATCCTTTCTTTTTTT -4 TRUE NA NA AAAAAG -14 NA NA NA 17 NA PB.265.6 chr1 + 909 3 full-splice_match SZRD1 ENST00000492354.1 3401 3 -28 2520 2 216 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 33 8.840405 0.946472 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TTTTTGTTTGTTTATACAAA -2 TRUE NA NA AAAAAG -44 NA NA NA 33 NA PB.265.7 chr1 + 1704 4 full-splice_match SZRD1 ENST00000401088.9 3480 4 -9 1785 -2 954 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 74 19.823936 1.297190 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAAGAACAGCTTTGCTTT -6 TRUE NA NA AATAAA -6 NA NA NA 74 NA PB.265.8 chr1 + 3437 3 full-splice_match SZRD1 ENST00000401089.3 3447 3 9 1 -1 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 297 79.563637 1.900715 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGATCTTTGTCCTCATTTCA -5 TRUE NA NA TATAAA -32 NA NA NA 297 NA PB.265.10 chr1 + 1673 3 full-splice_match SZRD1 ENST00000401089.3 3447 3 10 1764 0 975 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 214 57.328682 1.758372 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 CAAAGATTGATGACAGACTG -4 TRUE NA NA AATAAA -27 NA NA NA 214 NA PB.265.11 chr1 + 3483 4 full-splice_match SZRD1 ENST00000401088.9 3480 4 -5 2 2 1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 96 25.717539 1.410229 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CAGATCTTTGTCCTCATTTC -2 TRUE NA NA TATAAA -31 NA NA NA 96 NA PB.265.14 chr1 + 3199 2 incomplete-splice_match SZRD1 ENST00000492354.1 3401 3 26126 -2 25680 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGATCTTTGTCCTCATTTCA 46 FALSE NA NA TATAAA -32 NA NA NA 4 NA PB.265.15 chr1 + 1404 2 incomplete-splice_match SZRD1 ENST00000472461.1 843 4 25691 -1087 25691 954 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAAGAACAGCTTTGCTTT 57 FALSE NA NA AATAAA -6 NA NA NA 10 NA PB.266.4 chr1 - 2509 11 novel_not_in_catalog FBXO42 novel 6227 10 NA NA 38 427 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TTTCCTTTTCTGTGGCTTTT 14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.266.5 chr1 - 1907 8 incomplete-splice_match FBXO42 ENST00000375592.8 6227 10 46573 3815 9460 427 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TTTCCTTTTCTGTGGCTTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.266.6 chr1 - 1570 6 incomplete-splice_match FBXO42 ENST00000375592.8 6227 10 95818 3815 -3069 427 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TTTCCTTTTCTGTGGCTTTT 87 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.266.7 chr1 - 1328 4 incomplete-splice_match FBXO42 ENST00000375592.8 6227 10 98823 3815 -64 427 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TTTCCTTTTCTGTGGCTTTT 3092 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.266.8 chr1 - 2428 10 novel_in_catalog FBXO42 novel 6227 10 NA NA 12 426 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTTCCTTTTCTGTGGCTTT -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.266.9 chr1 - 2375 10 full-splice_match FBXO42 ENST00000375592.8 6227 10 36 3816 36 426 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 30 8.036731 0.905079 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTTCCTTTTCTGTGGCTTT 12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 30 NA PB.266.10 chr1 - 2252 9 novel_in_catalog FBXO42 novel 6227 10 NA NA 36 420 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAACCCCTTTCCTTTTCTGT 12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.266.11 chr1 - 2055 9 incomplete-splice_match FBXO42 ENST00000375592.8 6227 10 37169 3822 56 420 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAACCCCTTTCCTTTTCTGT NA FALSE NA NA GGGGCT -35 NA NA NA 2 NA PB.266.16 chr1 - 1015 5 novel_not_in_catalog FBXO42 novel 6227 10 NA NA -13388 -3458 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACATTGGACTTTATGTGTGG NA FALSE NA NA AATATA -5 NA NA NA 2 NA PB.267.1 chr1 + 1972 8 full-splice_match NECAP2 ENST00000457722.6 935 8 -33 -1004 -30 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATTGTATGTGAAAGATGAAT 8 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.267.2 chr1 + 3068 8 novel_in_catalog NECAP2 novel 1787 9 NA NA -8 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATTGTATGTGAAAGATGAAT -16 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.267.3 chr1 + 1850 7 novel_in_catalog NECAP2 novel 1787 9 NA NA -8 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATTGTATGTGAAAGATGAAT -16 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.267.4 chr1 + 2027 8 full-splice_match NECAP2 ENST00000337132.10 2018 8 -10 1 -7 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 310 83.046219 1.919320 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATTGTATGTGAAAGATGAAT -15 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 310 NA PB.267.5 chr1 + 2134 9 full-splice_match NECAP2 ENST00000459640.5 981 9 -32 -1121 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATTGTATGTGAAAGATGAAT -5 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.267.6 chr1 + 1155 8 full-splice_match NECAP2 ENST00000337132.10 2018 8 0 863 0 142 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGAAGAGGTTGAGTTTG -5 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 5 NA PB.267.8 chr1 + 1923 7 full-splice_match NECAP2 ENST00000443980.6 1929 7 6 0 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.946801 0.469351 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATTGTATGTGAAAGATGAAT 13 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 11 NA PB.267.9 chr1 + 1893 7 novel_not_in_catalog NECAP2 novel 2018 8 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TTGTATGTGAAAGATGAATG 13 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.267.12 chr1 + 1835 8 novel_not_in_catalog NECAP2 novel 2018 8 NA NA 2 3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TATGTGAAAGATGAATGTGT 16 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.267.13 chr1 + 1790 6 incomplete-splice_match NECAP2 ENST00000492095.5 1787 9 7123 0 7094 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATTGTATGTGAAAGATGAAT 7137 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 10 NA PB.267.14 chr1 + 1698 6 incomplete-splice_match NECAP2 ENST00000492095.5 1787 9 7215 0 7186 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATTGTATGTGAAAGATGAAT 7229 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 9 NA PB.267.15 chr1 + 1520 4 incomplete-splice_match NECAP2 ENST00000492095.5 1787 9 8429 0 -6349 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATTGTATGTGAAAGATGAAT 8443 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 7 NA PB.267.16 chr1 + 1266 2 full-splice_match NECAP2 ENST00000509727.1 550 2 343 -1059 343 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATTGTATGTGAAAGATGAAT NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 10 NA PB.270.2 chr1 - 4471 28 novel_not_in_catalog NBPF1 novel 5932 29 NA NA 12 -20 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AACGAAGAAAAGAAGGAGAA 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.270.4 chr1 - 1513 2 incomplete-splice_match NBPF1 ENST00000392963.5 2672 19 12297 26170 10412 2539 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAACAAACAAACAAAAA NA FALSE NA NA AAAACA -43 NA NA NA 2 NA PB.270.9 chr1 - 2097 3 novel_not_in_catalog NBPF1 novel 5932 29 NA NA 12 -2507 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CATCTCCATGTCCAGTATTT 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.270.10 chr1 - 4203 3 novel_not_in_catalog NBPF1 novel 2752 3 NA NA 12 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAGTAACATCTAAATACATG 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.270.11 chr1 - 4033 3 novel_not_in_catalog NBPF1 novel 2752 3 NA NA -18 -204 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAGAAAGAATTGAAGCTGT -22 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.270.12 chr1 - 2562 3 novel_not_in_catalog NBPF1 novel 2752 3 NA NA 0 -1657 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTCTGCTTCTGTCTGTTAGA -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.270.13 chr1 - 3602 2 incomplete-splice_match NBPF1 ENST00000599069.5 2752 3 -2 5816 -2 1 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TCATTTTCTGGACATAGGTT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.270.15 chr1 - 2770 3 full-splice_match NBPF1 ENST00000449853.2 2755 3 -18 3 10 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.482584 0.541902 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAGTCATTTTCTGGACATA 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.270.19 chr1 - 2984 2 incomplete-splice_match NBPF1 ENST00000599069.5 2752 3 10 6422 10 -605 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GTGCAGGATTTTGAGTGAAC 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.270.20 chr1 - 2182 3 full-splice_match NBPF1 ENST00000449853.2 2755 3 -38 611 -10 -611 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTTCTGTGCAGGATTTTGA -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.271.1 chr1 + 1099 1 full-splice_match ENSG00000261135 ENST00000562878.1 1110 1 9 2 9 -2 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA NA NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TATCTGCTGACTCATCTTTG NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 5 NA PB.272.1 chr1 - 1282 4 full-splice_match CROCCP2 ENST00000639481.1 1296 4 9 5 9 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTATGTCAGTGTTCTCCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.272.2 chr1 - 1016 2 incomplete-splice_match CROCCP2 ENST00000639481.1 1296 4 6372 5 6372 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTATGTCAGTGTTCTCCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.272.3 chr1 - 868 2 incomplete-splice_match CROCCP2 ENST00000639481.1 1296 4 6520 5 6520 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTATGTCAGTGTTCTCCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.276.2 chr1 + 3067 11 novel_not_in_catalog MST1P2 novel 2291 18 NA NA -17 132 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGCAGTTTGTTTTCATGGTC 2 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 4 NA PB.276.3 chr1 + 1897 14 novel_not_in_catalog MST1P2 novel 2291 18 NA NA -35 135 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTTTGTTTTCATGGTCTTA 829 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.276.5 chr1 + 2569 13 novel_not_in_catalog MST1P2 novel 2291 18 NA NA -20 135 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTTTGTTTTCATGGTCTTA -1 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.276.6 chr1 + 2746 13 novel_not_in_catalog MST1P2 novel 2291 18 NA NA 0 135 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTTTGTTTTCATGGTCTTA 19 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.276.7 chr1 + 1827 7 novel_not_in_catalog MST1P2 novel 2291 18 NA NA 2112 57 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACCAAGGACTTTCTTAAATG 38 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.276.8 chr1 + 2165 6 novel_in_catalog MST1P2 novel 2291 18 NA NA 2158 135 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTTTGTTTTCATGGTCTTA 84 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.276.9 chr1 + 1939 5 novel_in_catalog MST1P2 novel 2291 18 NA NA 2394 57 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACCAAGGACTTTCTTAAATG 320 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.276.10 chr1 + 1482 8 novel_in_catalog MST1P2 novel 2291 18 NA NA 2464 57 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACCAAGGACTTTCTTAAATG 390 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.276.11 chr1 + 1773 6 novel_in_catalog MST1P2 novel 2291 18 NA NA 2508 132 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGCAGTTTGTTTTCATGGTC 434 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.276.12 chr1 + 1470 7 novel_not_in_catalog MST1P2 novel 2291 18 NA NA 2542 130 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTGCAGTTTGTTTTCATGG 468 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.276.13 chr1 + 1568 5 novel_in_catalog MST1P2 novel 2291 18 NA NA 2837 129 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAGTGCAGTTTGTTTTCATG 763 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.276.14 chr1 + 1189 4 novel_in_catalog MST1P2 novel 2291 18 NA NA 3313 135 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTTTGTTTTCATGGTCTTA 1239 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.279.1 chr1 - 1012 1 full-splice_match ENSG00000238142 ENST00000666544.1 1048 1 27 9 27 -4 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA NA NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATCTTTAAACTTACGTTGGT 105 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.280.1 chr1 - 2075 6 novel_in_catalog MFAP2 novel 1045 9 NA NA 0 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGATCAAGTCACTTTTT 14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.280.2 chr1 - 1926 7 novel_in_catalog MFAP2 novel 1045 9 NA NA -1 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGATCAAGTCACTTTTT 1 TRUE NA NA GGGGCT -5 NA NA NA 5 NA PB.280.3 chr1 - 1814 8 novel_in_catalog MFAP2 novel 1045 9 NA NA -2 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGATCAAGTCACTTTTT 11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.280.4 chr1 - 1246 9 novel_not_in_catalog MFAP2 novel 1045 9 NA NA -557 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGATCAAGTCACTTTTT 419 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.280.5 chr1 - 1156 8 novel_in_catalog MFAP2 novel 1045 9 NA NA -1 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGATCAAGTCACTTTTT 1 TRUE NA NA GGGGCT -5 NA NA NA 6 NA PB.280.6 chr1 - 1081 9 novel_not_in_catalog MFAP2 novel 1045 9 NA NA -955 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGATCAAGTCACTTTTT 21 TRUE NA NA AAGAAA -43 NA NA NA 6 NA PB.280.7 chr1 - 1077 9 full-splice_match MFAP2 ENST00000375535.4 1045 9 -36 4 -24 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 374 100.191246 2.000830 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGATCAAGTCACTTTTT -22 TRUE NA NA GGGGCT -28 NA NA NA 374 NA PB.280.8 chr1 - 1005 9 novel_not_in_catalog MFAP2 novel 1045 9 NA NA -1 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGATCAAGTCACTTTTT 1 TRUE NA NA GGGGCT -5 NA NA NA 7 NA PB.280.9 chr1 - 976 8 novel_in_catalog MFAP2 novel 1045 9 NA NA -13 -4 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGATCAAGTCACTTTTT -11 TRUE NA NA GGGGCT -17 NA NA NA 4 NA PB.280.10 chr1 - 1099 9 novel_not_in_catalog MFAP2 novel 1045 9 NA NA -965 -6 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 ACAAAAGATCAAGTCACTTT 11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.281.1 chr1 - 3996 29 full-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 0 0 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.281.2 chr1 - 4001 29 full-splice_match ATP13A2 ENST00000452699.5 3981 29 -20 0 -20 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA -20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.281.3 chr1 - 3505 26 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000452699.5 3981 29 6854 0 -2 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA 6899 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.281.4 chr1 - 3149 23 novel_in_catalog ATP13A2 novel 3996 29 NA NA 671 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA 7572 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.281.5 chr1 - 2890 19 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 11795 0 158 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.281.6 chr1 - 2556 17 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 15487 0 -158 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.281.7 chr1 - 2552 17 novel_in_catalog ATP13A2 novel 3996 29 NA NA -436 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.281.8 chr1 - 2477 14 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 17880 0 -2190 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.281.9 chr1 - 2229 14 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 18128 0 -1942 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.281.10 chr1 - 2035 13 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 19369 0 -701 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.281.11 chr1 - 1682 10 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 20068 0 -2 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.281.12 chr1 - 1558 9 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 21638 0 -287 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.281.13 chr1 - 1396 8 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 21923 0 -2 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.281.14 chr1 - 1229 7 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 22206 0 281 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.281.15 chr1 - 1047 5 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 23691 0 1766 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.281.16 chr1 - 1164 6 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 23487 0 1562 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.281.17 chr1 - 1306 8 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 22012 1 87 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTCTGCTGTGCCTGTCTTGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.282.1 chr1 - 1190 8 full-splice_match SDHB ENST00000375499.8 1015 8 -188 13 -188 -13 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAGAACCTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.282.2 chr1 - 1081 8 full-splice_match SDHB ENST00000375499.8 1015 8 -79 13 -79 -13 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 985 263.872681 2.421394 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAGAACCTG 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 985 NA PB.282.3 chr1 - 970 8 novel_in_catalog SDHB novel 1015 8 NA NA -22 -13 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAGAACCTG 88 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.282.4 chr1 - 850 7 incomplete-splice_match SDHB ENST00000375499.8 1015 8 9211 13 56 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAGAACCTG 9321 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.282.5 chr1 - 972 8 full-splice_match SDHB ENST00000375499.8 1015 8 -9 52 -9 -22 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 60 16.073462 1.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATAAAAATTTTAAGAAATA -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 60 NA PB.283.1 chr1 - 2873 5 novel_not_in_catalog PADI2 novel 4361 16 NA NA -221 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATATGGCTGTTGGTGTGATG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.284.1 chr1 - 1663 11 full-splice_match PADI2 ENST00000375481.1 1607 11 -57 1 -41 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 GGAAAGGTGTATAATGAGAT 4089 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.285.2 chr1 + 2228 10 novel_in_catalog CROCC novel 6660 37 NA NA -5147 -6 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAAAGTTTGTACAGCTGT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.285.3 chr1 + 2400 11 incomplete-splice_match CROCC ENST00000375541.10 6660 37 38961 6 -5136 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAAAGTTTGTACAGCTGT 14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.285.4 chr1 + 1789 8 incomplete-splice_match CROCC ENST00000375541.10 6660 37 44558 6 461 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAAAGTTTGTACAGCTGT 5611 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.286.2 chr1 + 4343 26 novel_in_catalog ARHGEF10L novel 4035 27 NA NA -104 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTTGGATTGAGGTTTTGTT -8 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.286.5 chr1 + 2050 8 incomplete-splice_match ARHGEF10L ENST00000375408.7 3685 20 30238 6 8801 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATCTGGACTTGGATTGAGGT 8378 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.286.6 chr1 + 1732 6 incomplete-splice_match ARHGEF10L ENST00000375408.7 3685 20 37678 0 16241 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTTGGATTGAGGTTTTGTT NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 5 NA PB.286.7 chr1 + 1517 5 incomplete-splice_match ARHGEF10L ENST00000375408.7 3685 20 38343 1 16906 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GACTTGGATTGAGGTTTTGT NA FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.286.9 chr1 + 1374 4 incomplete-splice_match ARHGEF10L ENST00000375408.7 3685 20 46224 1 24787 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GACTTGGATTGAGGTTTTGT NA FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.286.10 chr1 + 1197 3 incomplete-splice_match ARHGEF10L ENST00000375408.7 3685 20 69385 -6 -6346 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTGAGGTTTTGTTGTGGTT NA FALSE NA NA AATAAA -26 NA NA NA 3 NA PB.288.1 chr1 + 1837 3 full-splice_match ACTL8 ENST00000375406.2 1841 3 2 2 2 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 43 11.519315 1.061427 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGGCTCCTGTGATGG -14 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 43 NA PB.288.2 chr1 + 1797 3 novel_not_in_catalog ACTL8 novel 1670 2 NA NA 4023 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CAATGCTGGCTCCTGTGATG -4 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 10 NA PB.288.3 chr1 + 1416 2 full-splice_match ACTL8 ENST00000617065.1 1670 2 254 0 254 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGGCTCCTGTGATGG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.289.1 chr1 - 3773 12 full-splice_match RCC2 ENST00000375433.3 2030 12 173 -1916 173 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.946801 0.469351 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGGATTTTGCATTTCTTTT 3089 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.289.2 chr1 - 3644 12 full-splice_match RCC2 ENST00000375433.3 2030 12 302 -1916 302 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 26 6.965167 0.842932 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGGATTTTGCATTTCTTTT 3218 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 26 NA PB.289.3 chr1 - 3101 7 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 18903 0 -11728 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGGATTTTGCATTTCTTTT 4765 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.289.4 chr1 - 3032 6 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 23039 0 -7592 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGGATTTTGCATTTCTTTT 8901 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.289.12 chr1 - 3338 9 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 16878 1 -13753 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTTGGATTTTGCATTTCTTT 2740 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.289.13 chr1 - 3239 8 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 17390 1 -13241 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTTGGATTTTGCATTTCTTT 3252 FALSE NA NA AAGAAA -37 NA NA NA 9 NA PB.289.14 chr1 - 3184 8 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 17445 1 -13186 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTTGGATTTTGCATTTCTTT 3307 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.289.15 chr1 - 2982 4 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 26208 1 -4423 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTTGGATTTTGCATTTCTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.289.18 chr1 - 3392 10 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 14119 2 13003 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.554148 0.658407 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TCTTGGATTTTGCATTTCTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.289.21 chr1 - 2620 4 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 26568 3 -4063 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.018365 0.604049 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTCTTGGATTTTGCATTTCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.289.24 chr1 - 2924 6 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 23129 18 -7502 -18 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.625712 0.750178 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACAACATTGTCTACTGTCTT 8991 FALSE NA NA AATGAA -36 NA NA NA 21 NA PB.289.25 chr1 - 4070 13 full-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 -57 27 -57 -27 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAATAAACAACAACATTGTC -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.289.26 chr1 - 3525 6 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 22519 27 -8112 -27 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAATAAACAACAACATTGTC 8381 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.289.29 chr1 - 3245 5 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 25561 27 -5070 -27 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAATAAACAACAACATTGTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.289.30 chr1 - 2786 5 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 26020 27 -4611 -27 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.750474 0.574086 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAATAAACAACAACATTGTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.289.31 chr1 - 2666 4 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 26498 27 -4133 -27 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAATAAACAACAACATTGTC NA FALSE NA NA AAAACA -34 NA NA NA 7 NA PB.289.32 chr1 - 2487 2 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 29625 27 -1006 -27 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 20 5.357821 0.728988 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAATAAACAACAACATTGTC 2222 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 20 NA PB.289.34 chr1 - 2134 6 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375433.3 2030 12 21914 -1009 -7601 172 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATGATGTAGTTGTTGT 8892 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.289.35 chr1 - 1895 5 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375433.3 2030 12 24915 -1009 -4600 172 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATGATGTAGTTGTTGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.289.36 chr1 - 1607 2 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375433.3 2030 12 28509 -1009 -1006 172 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATGATGTAGTTGTTGT 2222 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.289.40 chr1 - 1644 12 full-splice_match RCC2 ENST00000375433.3 2030 12 208 178 208 -178 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGTTGATTTACCATTCCTAC 3124 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.290.2 chr1 - 2457 10 novel_in_catalog ALDH4A1 novel 2957 14 NA NA -6 1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATCACAGTGGTGGATGGTCT 7 TRUE NA NA GGGGCT -42 NA NA NA 2 NA PB.290.3 chr1 - 3151 15 full-splice_match ALDH4A1 ENST00000375341.8 3139 15 -14 2 -14 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 45 12.055097 1.081171 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATCACAGTGGTGGATGGTC 196 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 45 NA PB.290.4 chr1 - 2970 14 incomplete-splice_match ALDH4A1 ENST00000538309.5 1940 15 859 -1301 859 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATCACAGTGGTGGATGGTC 731 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.290.5 chr1 - 2655 10 incomplete-splice_match ALDH4A1 ENST00000538309.5 1940 15 7460 -1301 2188 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATCACAGTGGTGGATGGTC 7332 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.290.6 chr1 - 2171 6 incomplete-splice_match ALDH4A1 ENST00000538309.5 1940 15 13273 -1301 8001 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATCACAGTGGTGGATGGTC 8413 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.290.7 chr1 - 1839 4 incomplete-splice_match ALDH4A1 ENST00000538309.5 1940 15 14505 -1301 9233 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATCACAGTGGTGGATGGTC 9645 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.290.8 chr1 - 1668 3 incomplete-splice_match ALDH4A1 ENST00000538309.5 1940 15 15487 -1301 10215 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATCACAGTGGTGGATGGTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.290.9 chr1 - 1544 2 incomplete-splice_match ALDH4A1 ENST00000538309.5 1940 15 16411 -1301 11139 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATCACAGTGGTGGATGGTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.290.11 chr1 - 1958 5 incomplete-splice_match ALDH4A1 ENST00000538309.5 1940 15 13644 -1299 8372 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TTAATCACAGTGGTGGATGG 8784 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.290.12 chr1 - 1270 7 incomplete-splice_match ALDH4A1 ENST00000375341.8 3139 15 0 11134 0 -4 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAAAGATTTGGATGTAGTC -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.293.1 chr1 - 4458 30 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 96523 4 -1056 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGGAAGGTGTTGCCTGC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.293.2 chr1 - 4721 32 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 95403 4 -2176 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGGAAGGTGTTGCCTGC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.293.3 chr1 - 2786 18 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 4400 4 -390 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.214692 0.507139 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATTGAAAAGGAAGGTGTTGC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.293.4 chr1 - 1961 12 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 10940 0 -536 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.946801 0.469351 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGGAAGGTGTTGCCTGC 6173 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.293.5 chr1 - 1092 6 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 18737 0 -3939 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGGAAGGTGTTGCCTGC 1715 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.293.6 chr1 - 5465 37 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 90659 5 -758 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAGGAAGGTGTTGCCTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.293.7 chr1 - 2992 20 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 809 1 809 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.946801 0.469351 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAGGAAGGTGTTGCCTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.293.8 chr1 - 2451 15 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 8294 1 -700 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 20 5.357821 0.728988 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAGGAAGGTGTTGCCTG 3527 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 20 NA PB.293.9 chr1 - 2193 13 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 9941 1 947 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAGGAAGGTGTTGCCTG 5174 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.293.10 chr1 - 1835 11 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 11527 1 51 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAGGAAGGTGTTGCCTG 6760 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.293.11 chr1 - 1690 10 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 12066 1 590 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAGGAAGGTGTTGCCTG 7299 FALSE NA NA GATAAA -32 NA NA NA 7 NA PB.293.12 chr1 - 1555 9 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 16042 1 4566 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAGGAAGGTGTTGCCTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.293.13 chr1 - 1404 8 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 17022 1 5546 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.625712 0.750178 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAGGAAGGTGTTGCCTG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 21 NA PB.293.14 chr1 - 1255 7 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 18165 1 -4511 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.946801 0.469351 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAGGAAGGTGTTGCCTG 1143 FALSE NA NA GGGGCT -45 NA NA NA 11 NA PB.293.15 chr1 - 948 4 full-splice_match UBR4 ENST00000375225.7 1533 4 580 5 -354 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAGGAAGGTGTTGCCTG -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.293.16 chr1 - 928 5 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 20346 1 -2330 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.214692 0.507139 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAGGAAGGTGTTGCCTG 3324 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.293.17 chr1 - 660 4 full-splice_match UBR4 ENST00000375225.7 1533 4 868 5 -66 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAGGAAGGTGTTGCCTG 6522 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.293.18 chr1 - 3162 21 full-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 311 2 311 2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGAAAAGGAAGGTGTTGCCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.293.19 chr1 - 5118 34 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 92971 8 1554 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATTGAAAAGGAAGGTGTTGC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.293.20 chr1 - 4620 31 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 96240 8 -1339 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATTGAAAAGGAAGGTGTTGC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.293.21 chr1 - 3611 24 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 103560 8 -1790 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATTGAAAAGGAAGGTGTTGC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.293.22 chr1 - 3366 22 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 105074 8 -276 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATTGAAAAGGAAGGTGTTGC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.293.23 chr1 - 2627 17 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 5257 4 467 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATTGAAAAGGAAGGTGTTGC 490 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.293.28 chr1 - 2368 18 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 94828 22683 -2751 -3098 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GTAGATCATGGCACTGCACA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.293.29 chr1 - 1503 12 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 97660 25866 81 6190 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAATGACCATAGGACAGTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.294.1 chr1 + 1918 10 full-splice_match IGSF21 ENST00000251296.4 1892 10 -27 1 -27 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACCTCGGTTTGTGGCTCTGC -18 TRUE NA NA ATTAAA -22 NA NA NA 6 NA PB.294.2 chr1 + 1679 10 novel_not_in_catalog IGSF21 novel 1892 10 NA NA -25 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACCTCGGTTTGTGGCTCTGC -16 TRUE NA NA ATTAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.295.2 chr1 - 4462 29 novel_not_in_catalog UBR4 novel 15892 106 NA NA -6238 -16 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 8775 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.295.3 chr1 - 5009 32 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 48595 46719 6384 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 5042 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.295.5 chr1 - 3879 26 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 54748 46719 -3818 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 1308 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.295.6 chr1 - 3565 24 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 56405 46719 -2161 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 2965 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.295.7 chr1 - 2977 21 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 58535 46719 -31 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 5095 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.295.8 chr1 - 2541 18 novel_in_catalog UBR4 novel 2954 21 NA NA -857 -16 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 9841 FALSE NA NA AAAACA -26 NA NA NA 2 NA PB.295.9 chr1 - 2441 17 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 63297 46719 -841 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 9857 FALSE NA NA AAAACA -10 NA NA NA 2 NA PB.295.10 chr1 - 2295 16 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 64335 46719 197 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.946801 0.469351 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 7827 FALSE NA NA AAGAAA -31 NA NA NA 11 NA PB.295.11 chr1 - 2118 15 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 65397 46719 1259 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 8889 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.295.12 chr1 - 2028 14 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 66181 46719 2043 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 9673 FALSE NA NA TTTAAA -33 NA NA NA 3 NA PB.295.13 chr1 - 1868 13 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 68543 46719 4405 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.295.14 chr1 - 1653 12 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 68880 46719 4742 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.295.15 chr1 - 1489 10 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000425413.5 2954 21 12499 29 6927 -16 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.946801 0.469351 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.295.16 chr1 - 1321 9 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000425413.5 2954 21 13568 29 7996 -16 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 24 6.429385 0.808169 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 24 NA PB.295.17 chr1 - 1187 8 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000425413.5 2954 21 22634 29 -1365 -16 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.482584 0.541902 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 2212 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.295.18 chr1 - 1045 7 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000425413.5 2954 21 23435 29 -564 -16 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 3013 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.295.19 chr1 - 943 6 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000425413.5 2954 21 24008 29 9 -16 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 3586 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.295.20 chr1 - 783 5 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000425413.5 2954 21 25135 29 1136 -16 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 4713 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.295.21 chr1 - 1859 13 novel_not_in_catalog UBR4 novel 15892 106 NA NA 4407 -17 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 TAAAAAGAGCAAGAAAGAAG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.295.22 chr1 - 1773 12 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000425413.5 2954 21 9966 30 4394 -17 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 TAAAAAGAGCAAGAAAGAAG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.297.1 chr1 + 1561 7 novel_in_catalog MRTO4 novel 2049 8 NA NA -255 -684 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CCACTTGCCTGTGGTCCCCA -22 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.297.2 chr1 + 1597 8 full-splice_match MRTO4 ENST00000330263.5 2049 8 -230 682 -230 -682 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.482584 0.541902 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTGCCTGTGGTCCCCACT 3 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 13 NA PB.297.5 chr1 + 1406 8 full-splice_match MRTO4 ENST00000330263.5 2049 8 -221 864 -221 525 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 37 9.911968 0.996160 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAAAGAATACA 12 TRUE NA NA AGTAAA -11 NA NA NA 37 NA PB.297.7 chr1 + 1192 8 full-splice_match MRTO4 ENST00000330263.5 2049 8 -7 864 -7 525 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 131 35.093727 1.545229 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAAAGAATACA -16 TRUE NA NA AGTAAA -11 NA NA NA 131 NA PB.297.8 chr1 + 1023 9 novel_not_in_catalog MRTO4 novel 2049 8 NA NA -7 525 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAAAGAATACA -16 TRUE NA NA AGTAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.297.10 chr1 + 921 8 full-splice_match MRTO4 ENST00000330263.5 2049 8 15 1113 -15 276 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 47 12.590878 1.100056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTTTGGGAAGCCGAGGTGG 6 TRUE NA NA AATAAA -42 NA NA NA 47 NA PB.297.11 chr1 + 1804 6 novel_in_catalog MRTO4 novel 2049 8 NA NA 0 525 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAAAGAATACA -9 TRUE NA NA AGTAAA -11 NA NA NA 5 NA PB.297.12 chr1 + 1367 8 full-splice_match MRTO4 ENST00000330263.5 2049 8 0 682 0 -682 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 80 21.431282 1.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTGCCTGTGGTCCCCACT -9 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 80 NA PB.297.13 chr1 + 1013 9 novel_not_in_catalog MRTO4 novel 2049 8 NA NA 7 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACAGTGGCCCTCTTTTTTC -2 TRUE NA NA AGTAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.297.14 chr1 + 1033 8 full-splice_match MRTO4 ENST00000330263.5 2049 8 13 1003 13 386 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 40 10.715641 1.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATAGTGGCATGTGCCTGTAG 4 TRUE NA NA AATAGA -19 NA NA NA 40 NA PB.297.17 chr1 + 1263 8 novel_in_catalog MRTO4 novel 2049 8 NA NA 0 248 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CGCGGTGGCTCACGCCTGGA 21 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.297.18 chr1 + 1518 8 novel_in_catalog MRTO4 novel 2049 8 NA NA 22 525 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAAAGAATACA 43 FALSE NA NA AGTAAA -11 NA NA NA 3 NA PB.297.19 chr1 + 1069 6 incomplete-splice_match MRTO4 ENST00000330263.5 2049 8 4141 864 -1766 525 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAAAGAATACA 4132 FALSE NA NA AGTAAA -11 NA NA NA 4 NA PB.297.20 chr1 + 1126 5 incomplete-splice_match MRTO4 ENST00000330263.5 2049 8 5278 682 -629 -682 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTGCCTGTGGTCCCCACT 5269 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.298.1 chr1 - 2301 8 full-splice_match EMC1 ENST00000688918.1 4034 8 449 1284 -346 59 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTGTTTAAGTCCTCTTTTG 9840 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.298.2 chr1 - 1518 2 full-splice_match EMC1 ENST00000461353.1 2175 2 1511 -854 1511 57 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACACTGTTTAAGTCCTCTTT NA FALSE NA NA AAAACA -37 NA NA NA 5 NA PB.298.5 chr1 - 4204 23 full-splice_match EMC1 ENST00000477853.6 6640 23 0 2436 0 52 alternative_3end TRUE canonical NA NA NA NA 20 5.357821 0.728988 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAATGACACTGTTTAAGTCC 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 20 NA PB.298.6 chr1 - 3435 17 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000375208.7 4084 22 11194 -52 240 52 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAATGACACTGTTTAAGTCC 2099 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.298.7 chr1 - 2346 8 full-splice_match EMC1 ENST00000688918.1 4034 8 397 1291 397 52 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAATGACACTGTTTAAGTCC 9788 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.298.8 chr1 - 2122 6 full-splice_match EMC1 ENST00000691945.1 4156 6 743 1291 498 52 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAATGACACTGTTTAAGTCC NA FALSE NA NA AAAAAG -28 NA NA NA 2 NA PB.298.9 chr1 - 1899 6 full-splice_match EMC1 ENST00000691945.1 4156 6 853 1404 608 -61 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AGAGTTGGGGAATGACAGAA NA FALSE NA NA AATGAA -29 NA NA NA 2 NA PB.298.10 chr1 - 1644 4 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000691945.1 4156 6 5410 1406 -19 -63 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATAGAGTTGGGGAATGACAG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.298.11 chr1 - 4096 23 full-splice_match EMC1 ENST00000477853.6 6640 23 -18 2562 0 -74 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTTCCTTGGTCATAGAGTTG -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.298.12 chr1 - 2033 7 full-splice_match EMC1 ENST00000693007.1 4889 7 1439 1417 86 -74 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTTCCTTGGTCATAGAGTTG NA FALSE NA NA AATAGA -32 NA NA NA 2 NA PB.298.13 chr1 - 3623 23 full-splice_match EMC1 ENST00000477853.6 6640 23 -13 3030 5 255 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAGTTTCGTGCTGTCATTTA -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.298.14 chr1 - 2454 16 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000375208.7 4084 22 11649 785 695 12 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTTTTGTGTTTCTCAATTTT 2554 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.298.15 chr1 - 2283 14 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000375208.7 4084 22 12708 785 1754 12 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTTTTGTGTTTCTCAATTTT 3613 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.298.16 chr1 - 2773 18 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000375208.7 4084 22 10448 787 -506 10 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCTTTTGTGTTTCTCAATT 1353 FALSE NA NA AATACA -6 NA NA NA 3 NA PB.298.17 chr1 - 2594 17 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000375208.7 4084 22 11196 787 242 10 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCTTTTGTGTTTCTCAATT 2101 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.298.18 chr1 - 3345 23 full-splice_match EMC1 ENST00000688667.1 5475 23 -5 2135 -5 5 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTTTGCCTTTTGTGTTTCT -18 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.298.19 chr1 - 1972 11 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000375208.7 4084 22 16334 792 -2872 5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTTTGCCTTTTGTGTTTCT 7239 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.298.20 chr1 - 3368 23 full-splice_match EMC1 ENST00000477853.6 6640 23 -13 3285 5 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 121 32.414814 1.510743 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTTACTTTGCCTTTTGTG -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 121 NA PB.298.21 chr1 - 3299 22 full-splice_match EMC1 ENST00000375208.7 4084 22 -12 797 8 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTTACTTTGCCTTTTGTG -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.298.22 chr1 - 1833 10 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000486405.2 2991 24 18449 -358 -744 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTTACTTTGCCTTTTGTG 9367 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.298.23 chr1 - 1258 6 full-splice_match EMC1 ENST00000691945.1 4156 6 758 2140 513 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTTACTTTGCCTTTTGTG NA FALSE NA NA AAAAAG -13 NA NA NA 3 NA PB.298.24 chr1 - 3271 23 full-splice_match EMC1 ENST00000477853.6 6640 23 83 3286 24 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GACTTTACTTTGCCTTTTGT 88 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.298.25 chr1 - 1117 5 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000691945.1 4156 6 4641 2141 -542 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GACTTTACTTTGCCTTTTGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.298.26 chr1 - 2127 12 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000375208.7 4084 22 14283 799 3329 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGACTTTACTTTGCCTTTTG 5188 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.298.27 chr1 - 1542 8 full-splice_match EMC1 ENST00000688918.1 4034 8 349 2143 349 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGACTTTACTTTGCCTTTT 9740 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.298.28 chr1 - 3187 22 full-splice_match EMC1 ENST00000690732.1 6478 22 0 3291 0 -6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATTGACTTTACTTTGCCT 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.298.29 chr1 - 1666 9 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000486405.2 2991 24 18772 -352 -421 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATTGACTTTACTTTGCCT 9690 FALSE NA NA GATAAA -3 NA NA NA 6 NA PB.298.30 chr1 - 826 4 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000691945.1 4156 6 5488 2146 59 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATTGACTTTACTTTGCCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.298.31 chr1 - 1287 7 full-splice_match EMC1 ENST00000693007.1 4889 7 1455 2147 102 -7 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAATTGACTTTACTTTGCC NA FALSE NA NA AATAGA -16 NA NA NA 6 NA PB.298.32 chr1 - 1398 8 full-splice_match EMC1 ENST00000688918.1 4034 8 480 2156 -315 -16 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGGCCTGTTTAAATTGACTT 9871 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.298.33 chr1 - 1348 5 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000486405.2 2991 24 -28 22231 5 -23 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAACACAACAAAGA -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.301.1 chr1 - 1017 7 novel_not_in_catalog AKR7A2 novel 989 3 NA NA -16 4961 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAATTGACTGTGTATATAAC -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.301.3 chr1 - 1353 7 full-splice_match AKR7A2 ENST00000235835.8 1360 7 2 5 2 -5 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 295 79.027855 1.897780 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAAACTTGCTTTCTCTGCT -32 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 295 NA PB.301.4 chr1 - 1302 7 full-splice_match AKR7A2 ENST00000235835.8 1360 7 53 5 3 -5 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 145 38.844200 1.589326 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAAACTTGCTTTCTCTGCT 19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 145 NA PB.301.5 chr1 - 1226 6 novel_in_catalog AKR7A2 novel 1360 7 NA NA -9 -5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAAACTTGCTTTCTCTGCT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.301.6 chr1 - 1245 6 full-splice_match AKR7A2 ENST00000330072.9 1171 6 -45 -29 5 -5 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAAACTTGCTTTCTCTGCT -29 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.301.7 chr1 - 1195 7 full-splice_match AKR7A2 ENST00000235835.8 1360 7 160 5 -77 -5 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.750474 0.574086 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAAACTTGCTTTCTCTGCT 126 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.301.8 chr1 - 967 6 incomplete-splice_match AKR7A2 ENST00000235835.8 1360 7 3572 5 -67 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAAACTTGCTTTCTCTGCT 3538 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.301.9 chr1 - 729 4 incomplete-splice_match AKR7A2 ENST00000330072.9 1171 6 4699 -29 1110 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAAACTTGCTTTCTCTGCT 4715 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.302.1 chr1 + 1824 9 full-splice_match SLC66A1 ENST00000375155.7 1805 9 -20 1 -20 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 25 6.697276 0.825898 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGACCTGCTTCTGTTGCTCC -9 TRUE NA NA AATAAA -33 NA NA NA 25 NA PB.302.3 chr1 + 1874 8 full-splice_match SLC66A1 ENST00000375153.8 2175 8 -12 313 -12 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GGCTCGCACCTGTAATCCTA -1 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.302.4 chr1 + 2182 8 full-splice_match SLC66A1 ENST00000375153.8 2175 8 -11 4 -11 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGAGACCTGCTTCTGTTGC 0 TRUE NA NA AATAAA -30 NA NA NA 7 NA PB.302.5 chr1 + 1496 9 full-splice_match SLC66A1 ENST00000375155.7 1805 9 0 309 0 4 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CGCACCTGTAATCCTAGCAC 11 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 6 NA PB.302.6 chr1 + 1425 7 incomplete-splice_match SLC66A1 ENST00000375153.8 2175 8 5459 1 5056 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGACCTGCTTCTGTTGCTCC 5435 FALSE NA NA AATAAA -33 NA NA NA 2 NA PB.303.1 chr1 + 710 5 full-splice_match MICOS10 ENST00000481464.5 657 5 -49 -4 -1 3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTGCATGGCCTTTGTTTCT -20 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.303.2 chr1 + 597 5 full-splice_match MICOS10 ENST00000467029.5 583 5 -4 -10 2 3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTGCATGGCCTTTGTTTCT -13 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 4 NA PB.303.3 chr1 + 515 4 full-splice_match MICOS10 ENST00000322753.7 3723 4 21 3187 -1 3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 59 15.805572 1.198810 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTGCATGGCCTTTGTTTCT -10 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 59 NA PB.303.6 chr1 + 3275 3 incomplete-splice_match MICOS10 ENST00000498642.5 669 5 -26 -18 14 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAATAAATTAAACAAAAAGA 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.303.11 chr1 + 1657 1 full-splice_match ENSG00000226396 ENST00000457263.1 455 1 -1157 -45 -1157 45 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA NA NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAATAAATAAAAAAAGT 9148 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.304.1 chr1 - 1096 4 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 127915 -579 -10387 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 20 5.357821 0.728988 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTAGCGCTGGCCTTCTGT 898 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 20 NA PB.304.2 chr1 - 1758 10 full-splice_match CAPZB ENST00000375142.5 1686 10 -26 -46 2 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TAGCGCTGGCCTTCTGTGTT 17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.304.3 chr1 - 1694 9 novel_not_in_catalog CAPZB novel 1675 9 NA NA -32113 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TAGCGCTGGCCTTCTGTGTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.304.4 chr1 - 1688 9 full-splice_match CAPZB ENST00000264202.8 1675 9 -15 2 -15 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 1424 381.476837 2.581468 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TAGCGCTGGCCTTCTGTGTT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 1424 NA PB.304.5 chr1 - 1568 8 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 64915 -582 -12 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.750474 0.574086 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TAGCGCTGGCCTTCTGTGTT 5 TRUE NA NA AATACA -31 NA NA NA 14 NA PB.304.6 chr1 - 1462 7 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 99055 -582 -45 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.822039 0.683231 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TAGCGCTGGCCTTCTGTGTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.304.7 chr1 - 899 2 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000674299.1 1734 3 1947 -360 1947 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.750474 0.574086 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TAGCGCTGGCCTTCTGTGTT 818 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.304.9 chr1 - 1891 9 full-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 150 -579 150 -4 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTAGCGCTGGCCTTCTGT 1129 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.304.10 chr1 - 1621 9 full-splice_match CAPZB ENST00000264202.8 1675 9 49 5 -5 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTAGCGCTGGCCTTCTGT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.304.11 chr1 - 1531 8 novel_in_catalog CAPZB novel 1675 9 NA NA -4 -4 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTAGCGCTGGCCTTCTGT 11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.304.12 chr1 - 1162 5 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 127179 -579 -11123 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 20 5.357821 0.728988 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTAGCGCTGGCCTTCTGT 162 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 20 NA PB.304.13 chr1 - 1600 9 novel_not_in_catalog CAPZB novel 1675 9 NA NA -32023 -5 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGTTAGCGCTGGCCTTCTG 58 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.304.14 chr1 - 1317 6 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 106047 -578 6947 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 41 10.983533 1.040742 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGTTAGCGCTGGCCTTCTG -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 41 NA PB.304.15 chr1 - 1592 9 novel_not_in_catalog CAPZB novel 1675 9 NA NA -28433 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAGAAAAGAAAAGAA 3648 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.304.17 chr1 - 954 4 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 128013 -535 -10289 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAGAAAAGAAAAGAA 996 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.304.18 chr1 - 1194 5 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 127102 -534 -11200 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAAAGAAAAGAAAAGA 85 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.304.19 chr1 - 1130 7 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 99060 -255 -40 33 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTCCGTGTGTGTTTGGGAG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.304.20 chr1 - 916 5 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 127101 -255 -11201 33 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTCCGTGTGTGTTTGGGAG 84 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.304.21 chr1 - 1347 9 full-splice_match CAPZB ENST00000264202.8 1675 9 -2 330 -2 32 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 564 151.090546 2.179237 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATTCCGTGTGTGTTTGGGA -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 564 NA PB.304.22 chr1 - 1144 10 novel_not_in_catalog CAPZB novel 1686 10 NA NA -53 26 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAATCTTATTCCGTGTGTGT 51 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.304.23 chr1 - 988 7 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 99129 -182 29 -40 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAATGTAAAACAAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.304.24 chr1 - 1083 9 full-splice_match CAPZB ENST00000264202.8 1675 9 10 582 8 2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 180 48.220387 1.683231 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTCCGGCTCCGAGCCTGCTT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 180 NA PB.304.25 chr1 - 974 8 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 64929 -2 2 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTCCGGCTCCGAGCCTGCTT 19 FALSE NA NA AATACA -17 NA NA NA 3 NA PB.305.1 chr1 + 1723 2 novel_in_catalog NBL1 novel 2024 4 NA NA 0 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTGTTCTCCTCCTCACTGA -15 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.305.2 chr1 + 914 4 full-splice_match NBL1 ENST00000375136.8 2024 4 0 1110 0 213 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCAGAGGTCTTCAGGGCT -15 TRUE NA NA AATATA -19 NA NA NA 2 NA PB.305.3 chr1 + 2022 4 full-splice_match NBL1 ENST00000375136.8 2024 4 2 0 2 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 76 20.359718 1.308772 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTGTTCTCCTCCTCACTGA -13 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 76 NA PB.305.4 chr1 + 1890 3 incomplete-splice_match NBL1 ENST00000548815.2 1953 4 7401 3 7401 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTGTTCTCCTCCTCACTGAC 7448 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.305.5 chr1 + 1732 3 incomplete-splice_match NBL1 ENST00000548815.2 1953 4 7558 4 7558 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTGTTCTCCTCCTCACTGA 103 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 5 NA PB.309.1 chr1 - 1269 2 incomplete-splice_match TMCO4 ENST00000489814.5 1722 5 43948 -28 6739 26 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATACCAAGTGGTTGCCTGGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.309.3 chr1 - 3069 16 novel_not_in_catalog TMCO4 novel 2946 16 NA NA 1 3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACCACTTCTTGAGCATGTAC 383 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.309.4 chr1 - 2879 15 novel_in_catalog TMCO4 novel 2946 16 NA NA -10 2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TACCACTTCTTGAGCATGTA 396 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.309.5 chr1 - 1975 8 incomplete-splice_match TMCO4 ENST00000294543.11 2946 16 53436 -2 -8061 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TACCACTTCTTGAGCATGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.309.6 chr1 - 2935 16 full-splice_match TMCO4 ENST00000294543.11 2946 16 -10 21 -10 -19 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AATAAATAATAATAAGAAGA 396 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.309.8 chr1 - 1492 4 incomplete-splice_match TMCO4 ENST00000489814.5 1722 5 976 19 976 -19 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AATAAATAATAATAAGAAGA 458 FALSE NA NA AAAAAG -24 NA NA NA 4 NA PB.311.1 chr1 - 887 5 full-splice_match PLA2G2A ENST00000482011.2 608 5 -43 -236 -40 1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CATGTATATGTGTGTGTGTA 4351 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.312.1 chr1 + 1167 5 full-splice_match PLA2G5 ENST00000375108.4 1918 5 0 751 0 2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AATAAAAACCACATTGGCAT 9 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.313.1 chr1 - 2034 2 genic PLA2G2C novel 3249 4 NA NA 33 -7789 multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA AAAAAG -17 NA NA NA 2 NA PB.314.1 chr1 - 1374 2 full-splice_match CAMK2N1 ENST00000375078.4 2326 2 951 1 -614 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTCCTCTCTTTTCTCTGCT 2095 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.315.1 chr1 + 1394 2 full-splice_match UBXN10 ENST00000375099.4 5562 2 -32 4200 -32 -4200 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAACTATCTAACTGGCATTT 420 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.316.1 chr1 + 968 4 full-splice_match CDA ENST00000375071.4 809 4 -160 1 -149 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.214692 0.507139 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATCAAAGCGTGTGTCTTGCT -21 TRUE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 12 NA PB.316.2 chr1 + 877 4 full-splice_match CDA ENST00000375071.4 809 4 -69 1 -58 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATCAAAGCGTGTGTCTTGCT 70 FALSE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.316.3 chr1 + 805 4 full-splice_match CDA ENST00000375071.4 809 4 3 1 3 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATCAAAGCGTGTGTCTTGCT 10 TRUE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 10 NA PB.317.1 chr1 - 2426 4 full-splice_match MUL1 ENST00000264198.5 2428 4 0 2 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 208 55.721336 1.746022 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGTGCTAGCCTGTTGCTTT -23 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 208 NA PB.317.2 chr1 - 2287 4 full-splice_match MUL1 ENST00000264198.5 2428 4 139 2 139 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGTGCTAGCCTGTTGCTTT 116 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.317.3 chr1 - 2040 2 incomplete-splice_match MUL1 ENST00000264198.5 2428 4 6013 2 6013 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGTGCTAGCCTGTTGCTTT 5990 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.318.1 chr1 - 1800 12 novel_not_in_catalog DDOST novel 2126 11 NA NA 5 2407 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACTAGCCTTTACCTTCCTA -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.318.2 chr1 - 1605 11 novel_not_in_catalog DDOST novel 2126 11 NA NA 382 2407 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACTAGCCTTTACCTTCCTA 536 FALSE NA NA AAGAAA -35 NA NA NA 2 NA PB.318.6 chr1 - 2093 11 full-splice_match DDOST ENST00000415136.6 2126 11 20 13 20 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAACTTCACCTGGCCCCGGT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.318.7 chr1 - 1946 11 full-splice_match DDOST ENST00000602624.7 1941 11 -8 3 -8 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 79 21.163391 1.325585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAACTTCACCTGGCCCCGGT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 79 NA PB.318.8 chr1 - 1369 6 incomplete-splice_match DDOST ENST00000602624.7 1941 11 6661 3 -1624 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAACTTCACCTGGCCCCGGT 6815 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.318.19 chr1 - 915 3 incomplete-splice_match DDOST ENST00000602624.7 1941 11 8397 66 112 -66 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAATATAAATAAATAAATAA 8551 FALSE NA NA GATAAA -42 NA NA NA 5 NA PB.318.23 chr1 - 1572 11 full-splice_match DDOST ENST00000602624.7 1941 11 -42 411 -23 -411 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 1231 329.773865 2.518216 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AATTGCTAAAAGTGGCATTT -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 1231 NA PB.318.24 chr1 - 1009 7 incomplete-splice_match DDOST ENST00000602624.7 1941 11 5888 404 -2397 -404 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGTGGCATTTTTCCTAT 6042 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.318.25 chr1 - 1672 10 novel_in_catalog DDOST novel 2126 11 NA NA 0 -411 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AATTGCTAAAAGTGGCATTT -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.318.26 chr1 - 1401 11 full-splice_match DDOST ENST00000602624.7 1941 11 129 411 129 -411 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 27 7.233058 0.859322 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AATTGCTAAAAGTGGCATTT 283 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 27 NA PB.318.27 chr1 - 1238 9 incomplete-splice_match DDOST ENST00000602624.7 1941 11 5190 411 -3095 -411 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.822039 0.683231 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AATTGCTAAAAGTGGCATTT 5344 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.318.28 chr1 - 1120 8 incomplete-splice_match DDOST ENST00000602624.7 1941 11 5629 411 -2656 -411 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.893603 0.770381 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AATTGCTAAAAGTGGCATTT 5783 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 22 NA PB.318.29 chr1 - 943 6 incomplete-splice_match DDOST ENST00000602624.7 1941 11 6679 411 -1606 -411 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.214692 0.507139 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AATTGCTAAAAGTGGCATTT 6833 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.318.30 chr1 - 814 5 incomplete-splice_match DDOST ENST00000602624.7 1941 11 7050 411 -1235 -411 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AATTGCTAAAAGTGGCATTT 7204 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.318.31 chr1 - 1655 11 full-splice_match DDOST ENST00000415136.6 2126 11 49 422 49 -412 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 103 27.592777 1.440795 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GAATTGCTAAAAGTGGCATT 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 103 NA PB.318.32 chr1 - 1423 10 novel_in_catalog DDOST novel 2126 11 NA NA -5 -412 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GAATTGCTAAAAGTGGCATT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.318.33 chr1 - 640 4 incomplete-splice_match DDOST ENST00000602624.7 1941 11 7671 412 -614 -412 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GAATTGCTAAAAGTGGCATT 7825 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.318.34 chr1 - 1438 10 novel_in_catalog DDOST novel 1941 11 NA NA 0 -416 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CTTTGAATTGCTAAAAGTGG 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.319.1 chr1 - 1793 8 novel_in_catalog KIF17 novel 3958 15 NA NA -44 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGCTCCCCTTCTCTGACCC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.320.2 chr1 - 3283 8 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 3940 -24 3940 21 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAGGTTTTGAGTATAGTAT 9478 FALSE NA NA ATTAAA -24 NA NA NA 2 NA PB.320.4 chr1 - 4151 12 novel_in_catalog HP1BP3 novel 3884 13 NA NA 1 1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CTGAACCGTAGCTTATATTT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.320.5 chr1 - 3797 12 novel_in_catalog HP1BP3 novel 6406 13 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.554148 0.658407 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GCTGAACCGTAGCTTATATT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.320.6 chr1 - 4013 13 novel_in_catalog HP1BP3 novel 3884 13 NA NA 6 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GCTGAACCGTAGCTTATATT 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.320.10 chr1 - 4352 13 novel_in_catalog HP1BP3 novel 3884 13 NA NA -6 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TGCTGAACCGTAGCTTATAT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.320.11 chr1 - 3422 9 full-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 1402 -2 1402 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TGCTGAACCGTAGCTTATAT 6940 FALSE NA NA TTTAAA -37 NA NA NA 2 NA PB.320.12 chr1 - 3097 7 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 7362 5 7362 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAAGCTGCTGAACCGTAG 8365 FALSE NA NA AGTAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.320.13 chr1 - 2848 5 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 17790 -2 -6964 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TGCTGAACCGTAGCTTATAT 8270 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.320.17 chr1 - 3990 13 full-splice_match HP1BP3 ENST00000438032.6 6406 13 0 2416 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 25 6.697276 0.825898 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCTGCTGAACCGTAGCTTAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 25 NA PB.320.19 chr1 - 3596 11 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000312239.10 3884 13 6822 7 711 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAGCTGCTGAACCGTAGC 7477 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.320.20 chr1 - 2590 3 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 27392 4 2134 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAGCTGCTGAACCGTAGC 2251 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.320.26 chr1 - 2267 4 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 25200 452 -58 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAGAAAAGGAA 59 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.320.27 chr1 - 2142 3 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 27392 452 2134 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAGAAAAGGAA 2251 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.320.28 chr1 - 2038 2 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 29383 452 4125 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAGAAAAGGAA 4242 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.320.31 chr1 - 3823 13 novel_in_catalog HP1BP3 novel 3884 13 NA NA 1 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAAAAAAAGAAAAGGA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.320.32 chr1 - 3294 12 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000312239.10 3884 13 6242 456 131 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAAAAAAAGAAAAGGA 6897 FALSE NA NA TTTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.320.33 chr1 - 2996 9 full-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 1373 453 1373 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAAAAAAAGAAAAGGA 6911 FALSE NA NA TATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.320.34 chr1 - 2591 6 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 9472 453 9472 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAAAAAAAGAAAAGGA 9455 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.320.38 chr1 - 4975 9 full-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 -608 455 -608 -2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 ATTAAAAAAAAAAAGAAAAG 4930 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.320.39 chr1 - 3889 13 novel_in_catalog HP1BP3 novel 3884 13 NA NA 0 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 ATTAAAAAAAAAAAGAAAAG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.320.40 chr1 - 3558 13 novel_in_catalog HP1BP3 novel 3884 13 NA NA 3 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.750474 0.574086 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 ATTAAAAAAAAAAAGAAAAG 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.320.41 chr1 - 3535 13 full-splice_match HP1BP3 ENST00000438032.6 6406 13 0 2871 0 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 47 12.590878 1.100056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 ATTAAAAAAAAAAAGAAAAG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 47 NA PB.320.42 chr1 - 3441 13 full-splice_match HP1BP3 ENST00000312239.10 3884 13 -15 458 -1 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.946801 0.469351 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 ATTAAAAAAAAAAAGAAAAG -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.320.43 chr1 - 3339 12 novel_in_catalog HP1BP3 novel 6406 13 NA NA 0 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 57 15.269789 1.183833 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 ATTAAAAAAAAAAAGAAAAG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 57 NA PB.320.44 chr1 - 3228 11 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000312239.10 3884 13 6739 458 628 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 ATTAAAAAAAAAAAGAAAAG 7394 FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.320.45 chr1 - 3092 10 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000312239.10 3884 13 9936 458 -112 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 ATTAAAAAAAAAAAGAAAAG 9936 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.320.46 chr1 - 2936 9 full-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 1431 455 1431 -2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 ATTAAAAAAAAAAAGAAAAG 6969 FALSE NA NA TTTAAA -8 NA NA NA 4 NA PB.320.47 chr1 - 2670 7 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 7339 455 7339 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 ATTAAAAAAAAAAAGAAAAG 8342 FALSE NA NA AGTAAA -43 NA NA NA 6 NA PB.320.48 chr1 - 2344 4 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 25120 455 -138 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.482584 0.541902 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 ATTAAAAAAAAAAAGAAAAG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.320.55 chr1 - 3658 13 novel_not_in_catalog HP1BP3 novel 3884 13 NA NA -6 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 ATATTAAAAAAAAAAAGAAA -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.320.56 chr1 - 1452 9 novel_in_catalog HP1BP3 novel 4822 9 NA NA 1189 -4 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 ATATTAAAAAAAAAAAGAAA 6727 FALSE NA NA CATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.320.57 chr1 - 3473 13 novel_not_in_catalog HP1BP3 novel 3884 13 NA NA 1 -76 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTTGTGGGTTTTTTTCCCC 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.320.58 chr1 - 2434 6 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 9553 529 9553 -76 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTTGTGGGTTTTTTTCCCC 9536 FALSE NA NA AGTAAA -35 NA NA NA 2 NA PB.320.59 chr1 - 2708 8 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 3961 530 3961 -77 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATTTGTGGGTTTTTTTCCC 9499 FALSE NA NA ATTAAA -3 NA NA NA 3 NA PB.320.60 chr1 - 3060 12 novel_in_catalog HP1BP3 novel 6406 13 NA NA -1 -287 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATCCTGGGGTTACAGAT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.320.61 chr1 - 1587 10 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000312239.10 3884 13 9940 1959 -108 954 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTTTAGGTGCTTTTATTG 9940 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.320.62 chr1 - 2033 13 full-splice_match HP1BP3 ENST00000438032.6 6406 13 0 4373 0 953 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.482584 0.541902 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAGCTTTAGGTGCTTTTATT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.320.63 chr1 - 1953 13 full-splice_match HP1BP3 ENST00000312239.10 3884 13 -29 1960 -15 953 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAGCTTTAGGTGCTTTTATT -29 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.320.64 chr1 - 1837 12 novel_in_catalog HP1BP3 novel 6406 13 NA NA 0 953 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.946801 0.469351 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAGCTTTAGGTGCTTTTATT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.320.65 chr1 - 1677 11 novel_in_catalog HP1BP3 novel 6406 13 NA NA 3 951 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GCTAGCTTTAGGTGCTTTTA 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.320.66 chr1 - 2064 13 novel_in_catalog HP1BP3 novel 3884 13 NA NA 6 950 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGCTAGCTTTAGGTGCTTTT -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.320.67 chr1 - 1334 2 intergenic novelGene_258 novel NA NA NA NA NA NA multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG NA FALSE NA NA AAAAAG -21 NA NA NA 2 NA PB.320.68 chr1 - 2896 10 novel_not_in_catalog HP1BP3 novel 970 8 NA NA 0 3142 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTTTCTAGTCTGGATGTCTT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.320.69 chr1 - 2450 10 novel_not_in_catalog HP1BP3 novel 970 8 NA NA -3 3142 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTTTCTAGTCTGGATGTCTT -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.320.72 chr1 - 2561 10 novel_not_in_catalog HP1BP3 novel 970 8 NA NA 6 3141 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTTTCTAGTCTGGATGTCT 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.320.73 chr1 - 2547 10 novel_not_in_catalog HP1BP3 novel 970 8 NA NA -1 3141 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTTTCTAGTCTGGATGTCT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.320.74 chr1 - 2345 9 novel_not_in_catalog HP1BP3 novel 970 8 NA NA 0 3141 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTTTCTAGTCTGGATGTCT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.320.77 chr1 - 2880 5 novel_in_catalog HP1BP3 novel 928 5 NA NA -3 -110 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCCTCCCTGGTCTTTTCC -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.320.79 chr1 - 1714 4 novel_in_catalog HP1BP3 novel 928 5 NA NA 6 -16 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAACAAAGACACAAGCCG 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.320.80 chr1 - 1702 4 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000438032.6 6406 13 -8 35200 -3 -16 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAACAAAGACACAAGCCG -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.320.81 chr1 - 1506 3 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000424732.5 970 8 -3 18267 -3 -16 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAACAAAGACACAAGCCG -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.320.82 chr1 - 1093 5 novel_in_catalog HP1BP3 novel 928 5 NA NA 10 -16 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAACAAAGACACAAGCCG 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.320.83 chr1 - 1828 4 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000417710.5 572 5 -369 2099 0 -31 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAATATAATATAAAAGAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.320.84 chr1 - 1499 4 novel_in_catalog HP1BP3 novel 928 5 NA NA 1 -31 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAATATAATATAAAAGAT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.320.85 chr1 - 1482 4 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000438032.6 6406 13 -8 35420 -3 -31 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAATATAATATAAAAGAT -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.320.86 chr1 - 1394 4 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000312239.10 3884 13 -29 33007 -15 -31 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAATATAATATAAAAGAT -29 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.320.87 chr1 - 1278 3 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000424732.5 970 8 5 18487 0 -31 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAATATAATATAAAAGAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.320.89 chr1 - 1245 5 novel_in_catalog HP1BP3 novel 928 5 NA NA 5 -32 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 TAAAAATATAATATAAAAGA -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.320.90 chr1 - 890 5 novel_in_catalog HP1BP3 novel 928 5 NA NA -3 -32 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 TAAAAATATAATATAAAAGA -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.320.91 chr1 - 1104 4 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000438032.6 6406 13 -6 35796 -1 -407 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATAAAGTGATGGCAGTTACT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.321.3 chr1 - 1059 2 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000435383.2 1597 11 40489 -541 40489 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 TAAAAGAAAGTAAAGTGACT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.321.4 chr1 - 2041 10 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681717.1 5993 34 199602 35 -80 -35 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAATATAAAGAACAAAATA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.321.7 chr1 - 2805 18 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681717.1 5993 34 171429 529 -28253 8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAAAAAAAAGTTGAGA 6833 FALSE NA NA AAAAAG -32 NA NA NA 3 NA PB.321.8 chr1 - 2632 18 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681717.1 5993 34 171602 529 -28080 8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAAAAAAAAGTTGAGA 7006 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.321.9 chr1 - 2332 16 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681717.1 5993 34 186365 529 -13317 8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAAAAAAAAGTTGAGA NA FALSE NA NA AATAAA -5 NA NA NA 4 NA PB.321.10 chr1 - 2066 14 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681717.1 5993 34 190484 529 -9198 8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAAAAAAAAGTTGAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.321.11 chr1 - 1305 8 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000435383.2 1597 11 10275 -8 10275 8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAAAAAAAAGTTGAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.321.12 chr1 - 960 5 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000435383.2 1597 11 26069 -8 26069 8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAAAAAAAAGTTGAGA NA FALSE NA NA GATAAA -36 NA NA NA 9 NA PB.321.13 chr1 - 846 4 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000435383.2 1597 11 33744 -8 33744 8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAAAAAAAAGTTGAGA NA FALSE NA NA CATAAA -25 NA NA NA 3 NA PB.321.14 chr1 - 3458 23 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681717.1 5993 34 151121 544 41569 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAATGTTTAGCAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.321.16 chr1 - 1915 13 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681717.1 5993 34 193507 544 -6175 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAATGTTTAGCAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.321.17 chr1 - 1616 10 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681717.1 5993 34 199518 544 -164 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAATGTTTAGCAAAAA NA FALSE NA NA GGGGCT -37 NA NA NA 6 NA PB.321.18 chr1 - 1424 9 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681717.1 5993 34 201437 544 1755 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAATGTTTAGCAAAAA NA FALSE NA NA AGTAAA -4 NA NA NA 5 NA PB.321.19 chr1 - 976 6 novel_in_catalog EIF4G3 novel 1597 11 NA NA 22025 -7 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAATGTTTAGCAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.321.20 chr1 - 2842 19 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681717.1 5993 34 164695 546 -34987 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 TTAAAAAAATGTTTAGCAAA 99 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.321.21 chr1 - 1917 15 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681717.1 5993 34 188635 817 -11047 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAATGAAACAAAAGAAACA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.321.22 chr1 - 1694 13 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681717.1 5993 34 193455 817 -6227 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAATGAAACAAAAGAAACA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.321.23 chr1 - 1257 10 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681717.1 5993 34 199604 817 -78 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAATGAAACAAAAGAAACA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.322.1 chr1 + 1851 8 full-splice_match PINK1 ENST00000321556.5 2657 8 34 772 34 -577 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GTGTCGTGATGGTCTGTGAA 17 TRUE NA NA ACTAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.322.2 chr1 + 2417 8 full-splice_match PINK1 ENST00000321556.5 2657 8 45 195 45 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATGACGTATGTGCCTTGA 28 FALSE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 8 NA PB.322.3 chr1 + 2232 8 full-splice_match PINK1 ENST00000321556.5 2657 8 229 196 229 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAGATGACGTATGTGCCTTG 175 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.322.4 chr1 + 2109 8 full-splice_match PINK1 ENST00000321556.5 2657 8 353 195 353 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATGACGTATGTGCCTTGA 299 FALSE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.322.5 chr1 + 1505 8 full-splice_match PINK1 ENST00000321556.5 2657 8 379 773 379 -578 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTGTCGTGATGGTCTGTGA 325 FALSE NA NA ACTAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.322.6 chr1 + 1958 7 incomplete-splice_match PINK1 ENST00000321556.5 2657 8 4410 195 -261 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATGACGTATGTGCCTTGA 4356 FALSE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.322.7 chr1 + 1789 7 incomplete-splice_match PINK1 ENST00000321556.5 2657 8 4579 195 -92 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATGACGTATGTGCCTTGA 4525 FALSE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 5 NA PB.322.8 chr1 + 1207 7 incomplete-splice_match PINK1 ENST00000321556.5 2657 8 4583 773 -88 -578 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTGTCGTGATGGTCTGTGA 4529 FALSE NA NA ACTAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.322.9 chr1 + 1659 6 incomplete-splice_match PINK1 ENST00000321556.5 2657 8 6471 195 1800 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATGACGTATGTGCCTTGA 6417 FALSE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 5 NA PB.322.10 chr1 + 1502 5 incomplete-splice_match PINK1 ENST00000321556.5 2657 8 11125 195 -925 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATGACGTATGTGCCTTGA NA FALSE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.322.11 chr1 + 1328 4 full-splice_match PINK1 ENST00000400490.2 1658 4 136 194 136 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATGACGTATGTGCCTTGA NA FALSE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.322.12 chr1 + 1230 3 incomplete-splice_match PINK1 ENST00000400490.2 1658 4 3014 195 3014 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAGATGACGTATGTGCCTTG NA FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.322.13 chr1 + 976 2 incomplete-splice_match PINK1 ENST00000400490.2 1658 4 3631 194 3631 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATGACGTATGTGCCTTGA NA FALSE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.327.1 chr1 - 1163 9 novel_in_catalog EIF4G3 novel 6397 37 NA NA -4 36 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAAAACTGTAAGAGATTT -22 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.327.7 chr1 - 1718 1 full-splice_match RPS15AP6 ENST00000420703.1 385 1 -790 -543 -790 543 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAGAAA 8418 FALSE NA NA TTTAAA -38 NA NA NA 2 NA PB.327.8 chr1 - 1149 1 full-splice_match RPS15AP6 ENST00000420703.1 385 1 -406 -358 -406 358 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TGAAAAAAAAAAAAAAAAAA 8802 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.327.20 chr1 - 1410 2 full-splice_match EIF4G3 ENST00000634778.1 1343 2 -71 4 -2 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAGATGTGTTGTGTTTTTAT -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.328.1 chr1 - 3959 11 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 32228 -1337 -8971 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CATGTGTCTGGGTGTCTGTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.328.4 chr1 - 5036 19 full-splice_match ECE1 ENST00000374893.11 5067 19 31 0 31 0 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GGCCATGTGTCTGGGTGTCT 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.328.5 chr1 - 4457 15 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 19225 -1334 -3607 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GGCCATGTGTCTGGGTGTCT 1607 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.328.6 chr1 - 3618 8 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 42716 -1334 1517 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GGCCATGTGTCTGGGTGTCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.328.7 chr1 - 3783 10 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 34518 -1334 -6681 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GGCCATGTGTCTGGGTGTCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.328.15 chr1 - 3099 3 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 54178 -1333 -3290 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GGGCCATGTGTCTGGGTGTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.328.17 chr1 - 5096 19 full-splice_match ECE1 ENST00000415912.6 5099 19 -3 6 -3 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.286257 0.632078 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GAGGGCCATGTGTCTGGGTG -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.328.18 chr1 - 3317 5 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 51536 -1331 -5932 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GAGGGCCATGTGTCTGGGTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.328.19 chr1 - 3771 19 full-splice_match ECE1 ENST00000415912.6 5099 19 -30 1358 -30 -21 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAGAAAAGAGAAAC 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.328.20 chr1 - 3690 19 full-splice_match ECE1 ENST00000374893.11 5067 19 22 1355 22 -21 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAGAAAAGAGAAAC -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.328.21 chr1 - 3551 18 full-splice_match ECE1 ENST00000264205.10 2381 18 162 -1332 162 -21 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAGAAAAGAGAAAC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.328.22 chr1 - 2477 10 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 34469 21 -6730 -21 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAGAAAAGAGAAAC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.328.23 chr1 - 2274 8 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 42705 21 1506 -21 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAGAAAAGAGAAAC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.328.24 chr1 - 1816 3 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 54107 21 -3361 -21 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAGAAAAGAGAAAC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.328.26 chr1 - 2762 19 full-splice_match ECE1 ENST00000374893.11 5067 19 19 2286 19 278 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGAATTGGTATATTTATT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.328.27 chr1 - 2439 16 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 6651 952 6651 278 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGAATTGGTATATTTATT 9959 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.328.28 chr1 - 1050 5 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 51520 952 -5948 278 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGAATTGGTATATTTATT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.328.29 chr1 - 2818 19 full-splice_match ECE1 ENST00000415912.6 5099 19 -9 2290 -9 277 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 GAAAGAATTGGTATATTTAT 382 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.328.30 chr1 - 1215 7 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 43647 956 2448 274 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGGAAAGAATTGGTATATT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.328.31 chr1 - 1737 12 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 23573 957 741 273 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TAAGGAAAGAATTGGTATAT 5955 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.328.32 chr1 - 1419 9 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 41335 957 136 273 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TAAGGAAAGAATTGGTATAT NA FALSE NA NA AAAACA -11 NA NA NA 3 NA PB.330.1 chr1 + 4313 18 full-splice_match NBPF3 ENST00000318220.10 4401 18 -18 106 -9 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTCTGGACTGTTGGATTGT -1 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 7 NA PB.330.3 chr1 + 2786 3 novel_not_in_catalog NBPF3 novel 1417 3 NA NA 2 2847 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GTCTGGTGGCTCACGTGTGT 13 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 5 NA PB.330.4 chr1 + 4378 19 novel_not_in_catalog NBPF3 novel 4401 18 NA NA 0 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTCTGGACTGTTGGATTGT 17 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.330.5 chr1 + 4194 19 novel_not_in_catalog NBPF3 novel 4401 18 NA NA 0 1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TCTGGACTGTTGGATTGTTT 17 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 7 NA PB.330.6 chr1 + 1066 3 novel_not_in_catalog NBPF3 novel 3767 15 NA NA 0 1131 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTCTGCTTCTGTCTGTTA 17 TRUE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 4 NA PB.330.7 chr1 + 4107 18 novel_in_catalog NBPF3 novel 4401 18 NA NA 1 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTCTGGACTGTTGGATTGT 19 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.330.8 chr1 + 2157 3 novel_not_in_catalog NBPF3 novel 1417 3 NA NA 1 2224 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTCCAGAAATCTTTTTTAT 19 TRUE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.330.12 chr1 + 2635 9 incomplete-splice_match NBPF3 ENST00000619554.1 1831 14 4876 -1487 31 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTCTGGACTGTTGGATTGT 4969 FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.332.2 chr1 - 1279 4 incomplete-splice_match RAP1GAP ENST00000471600.6 3238 25 53363 1 21584 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACCCAGAGTTGGGCCTGGCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.332.4 chr1 - 3293 25 full-splice_match RAP1GAP ENST00000495204.5 2489 25 -19 -785 -19 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACCCAGAGTTGGGCCTGGC -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.332.5 chr1 - 1857 8 incomplete-splice_match RAP1GAP ENST00000374761.6 3318 23 16286 2 13759 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACCCAGAGTTGGGCCTGGC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.332.6 chr1 - 1642 8 novel_in_catalog RAP1GAP novel 3426 27 NA NA 13946 -5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTGTACCCAGAGTTGGGCC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.332.7 chr1 - 1565 15 incomplete-splice_match RAP1GAP ENST00000495204.5 2489 25 -60 12339 7 3689 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTAGACTGGCCTCTCCTCA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.333.1 chr1 - 1555 12 incomplete-splice_match USP48 ENST00000529637.5 3228 27 76227 -464 -2149 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TCCTAAGTGTGGAAAAGTGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.333.2 chr1 - 1286 9 incomplete-splice_match USP48 ENST00000529637.5 3228 27 77217 -464 -1159 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TCCTAAGTGTGGAAAAGTGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.333.3 chr1 - 1125 8 incomplete-splice_match USP48 ENST00000529637.5 3228 27 78711 -463 335 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GTCCTAAGTGTGGAAAAGTG 1485 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.333.4 chr1 - 3802 27 full-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 10 607 10 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGTCCTAAGTGTGGAAAAGT 18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.333.5 chr1 - 2189 17 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 54554 614 -2025 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAACTTGTCCTAAGTGTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.333.6 chr1 - 2512 21 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 34896 923 -62 -22 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GAAGGAAATGTTTCCAATTT 8220 FALSE NA NA TTTAAA -2 NA NA NA 4 NA PB.333.7 chr1 - 3426 26 novel_in_catalog USP48 novel 4419 27 NA NA 0 -23 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TGAAGGAAATGTTTCCAATT 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.333.8 chr1 - 3491 27 full-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 0 928 0 -27 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GACTTGAAGGAAATGTTTCC 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.333.9 chr1 - 1024 9 incomplete-splice_match USP48 ENST00000529637.5 3228 27 77157 -142 -1219 -26 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTTGAAGGAAATGTTTCCA NA FALSE NA NA AATATA -17 NA NA NA 2 NA PB.333.10 chr1 - 1192 11 incomplete-splice_match USP48 ENST00000529637.5 3228 27 76420 -140 -1956 -28 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGACTTGAAGGAAATGTTTC NA FALSE NA NA AATGAA -18 NA NA NA 5 NA PB.333.11 chr1 - 1616 15 novel_in_catalog USP48 novel 4419 27 NA NA -592 -33 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 ACATCAGACTTGAAGGAAAT 3347 FALSE NA NA AAGAAA -11 NA NA NA 6 NA PB.333.14 chr1 - 2155 14 novel_in_catalog USP48 novel 3228 27 NA NA -13 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.333.15 chr1 - 2101 14 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 -15 42738 -15 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 199 53.310318 1.726811 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 199 NA PB.333.16 chr1 - 1850 14 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 236 42738 30 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT 288 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.333.17 chr1 - 1964 14 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 122 42738 -36 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.554148 0.658407 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.333.18 chr1 - 1878 13 novel_in_catalog USP48 novel 4309 26 NA NA 10 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT 18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.333.19 chr1 - 1610 3 incomplete-splice_match USP48 ENST00000487880.2 524 4 1309 0 -142 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.333.20 chr1 - 1574 12 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 26512 42738 -8446 0 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT NA FALSE NA NA AAGAAA -37 NA NA NA 5 NA PB.333.21 chr1 - 1426 11 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 30086 42738 -4872 0 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT 3410 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.333.22 chr1 - 1158 3 incomplete-splice_match USP48 ENST00000487880.2 524 4 1761 0 310 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT 276 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.333.23 chr1 - 1013 8 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 34985 42738 27 0 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT 8309 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.333.24 chr1 - 2358 11 full-splice_match USP48 ENST00000421625.6 2818 11 457 3 0 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 66 17.680809 1.247502 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAATTGTACTTGTGGTTTGT 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 66 NA PB.333.25 chr1 - 2447 11 full-splice_match USP48 ENST00000421625.6 2818 11 369 2 -11 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTGTACTTGTGGTTTGTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.333.26 chr1 - 1876 9 incomplete-splice_match USP48 ENST00000421625.6 2818 11 26940 2 -8475 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTGTACTTGTGGTTTGTC NA FALSE NA NA AATACA -2 NA NA NA 3 NA PB.333.27 chr1 - 1621 7 incomplete-splice_match USP48 ENST00000421625.6 2818 11 30961 2 -4454 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTGTACTTGTGGTTTGTC 3828 FALSE NA NA AAGAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.333.28 chr1 - 1765 11 full-splice_match USP48 ENST00000421625.6 2818 11 576 477 -39 284 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CACTCTGCATCCATGAGTAT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.333.29 chr1 - 1881 11 full-splice_match USP48 ENST00000421625.6 2818 11 457 480 0 281 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAGCACTCTGCATCCATGAG 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.333.30 chr1 - 3401 9 incomplete-splice_match USP48 ENST00000421625.6 2818 11 471 6543 14 -5782 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGAGTCTTGCTCTGTTGCCC 22 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.333.31 chr1 - 1351 9 incomplete-splice_match USP48 ENST00000421625.6 2818 11 417 8647 6 -7886 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.214692 0.507139 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 ATAGAAAAGATGGAGGGGAA 12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.333.32 chr1 - 963 6 incomplete-splice_match USP48 ENST00000421625.6 2818 11 457 23659 0 1497 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGGTATTCAAATTTTGGTG 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.334.1 chr1 + 2523 6 incomplete-splice_match ALPL ENST00000374840.8 2536 12 -65 12583 -39 1616 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 TAAAAAAAAAAAAGAAAGAA 379 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 3 NA PB.334.2 chr1 + 2442 11 novel_in_catalog ALPL novel 2536 12 NA NA -19 -4 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGGACAGAGCTGAGTCTTTG 399 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 5 NA PB.334.3 chr1 + 2568 12 full-splice_match ALPL ENST00000374840.8 2536 12 -38 6 -12 5 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.822039 0.683231 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CGAGGACAGAGCTGAGTCTT 406 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 18 NA PB.334.4 chr1 + 1947 8 incomplete-splice_match ALPL ENST00000374832.5 2193 12 11909 -383 -7115 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAATATTTCCGAGGACAGAG 14 FALSE NA NA AATAAA -8 NA NA NA 2 NA PB.334.5 chr1 + 1468 4 incomplete-splice_match ALPL ENST00000374832.5 2193 12 22385 -390 -814 3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TCCGAGGACAGAGCTGAGTC -27 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.334.6 chr1 + 1338 3 incomplete-splice_match ALPL ENST00000374829.2 1595 4 1257 -11 1257 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CAGAGCTGAGTCTTTGTGGT 0 TRUE NA NA AATAAA -23 NA NA NA 5 NA PB.335.1 chr1 + 1071 2 full-splice_match LINC00339 ENST00000416769.2 1077 2 0 6 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.893603 0.770381 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAAATATGTGCTGTGGTG 6 TRUE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 22 NA PB.336.1 chr1 + 2239 7 full-splice_match CDC42 ENST00000344548.7 2256 7 13 4 13 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACAAGCCAGCCTGAGGGTTG 6 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 10 NA PB.336.2 chr1 + 2109 6 full-splice_match CDC42 ENST00000656825.1 10503 6 -24 8418 17 -4 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 317 84.921455 1.929017 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACAAGCCAGCCTGAGGGTTG 10 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 317 NA PB.336.3 chr1 + 972 6 full-splice_match CDC42 ENST00000656825.1 10503 6 8 9523 0 261 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 443 118.675728 2.074362 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GTGGATGACTCTGTAACAGA 12 TRUE NA NA TTTAAA -15 NA NA NA 443 NA PB.336.4 chr1 + 776 6 full-splice_match CDC42 ENST00000315554.13 1435 6 -24 683 17 114 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAGCCTCTGCGTCTTTTTA 10 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.336.5 chr1 + 1558 6 full-splice_match CDC42 ENST00000656825.1 10503 6 -2 8947 0 -510 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 121 32.414814 1.510743 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTCATTGTCTTATATGCTT 2 TRUE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 121 NA PB.336.6 chr1 + 1695 7 full-splice_match CDC42 ENST00000344548.7 2256 7 28 533 -11 -510 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTCATTGTCTTATATGCTT -9 TRUE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.336.7 chr1 + 1876 6 full-splice_match CDC42 ENST00000656825.1 10503 6 2 8625 1 -188 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.625712 0.750178 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAATGCAGACTCTTCTTAAG 6 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 21 NA PB.336.9 chr1 + 749 6 full-splice_match CDC42 ENST00000656825.1 10503 6 10 9744 2 40 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 38 10.179859 1.007742 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AATAATGACAAATGCCCTGC 14 TRUE NA NA ATTAAA -20 NA NA NA 38 NA PB.336.11 chr1 + 1415 6 full-splice_match CDC42 ENST00000315554.13 1435 6 14 6 6 -6 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TATAAATGCCTGATGAAGCT 18 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 9 NA PB.336.14 chr1 + 1898 4 incomplete-splice_match CDC42 ENST00000344548.7 2256 7 29054 2 28236 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.018365 0.604049 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCCAGCCTGAGGGTTGTT NA FALSE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 15 NA PB.336.15 chr1 + 1367 4 incomplete-splice_match CDC42 ENST00000662562.1 1645 7 28236 -837 28236 -510 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTCATTGTCTTATATGCTT NA FALSE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 6 NA PB.336.16 chr1 + 1767 3 incomplete-splice_match CDC42 ENST00000344548.7 2256 7 33827 4 33009 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACAAGCCAGCCTGAGGGTTG 2133 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 6 NA PB.336.17 chr1 + 1186 2 incomplete-splice_match CDC42 ENST00000662562.1 1645 7 33181 -837 33181 -510 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTCATTGTCTTATATGCTT 2305 FALSE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 6 NA PB.336.18 chr1 + 1555 2 incomplete-splice_match CDC42 ENST00000344548.7 2256 7 34159 4 33341 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACAAGCCAGCCTGAGGGTTG 2465 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 8 NA PB.336.19 chr1 + 1014 2 incomplete-splice_match CDC42 ENST00000662562.1 1645 7 33353 -837 33353 -510 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTCATTGTCTTATATGCTT 2477 FALSE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 6 NA PB.339.2 chr1 - 2208 10 incomplete-splice_match HSPG2 ENST00000486901.1 3586 11 1681 0 1681 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGGGGCCTCCTGAGTCTTTG 7811 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.339.3 chr1 - 1515 2 full-splice_match HSPG2 ENST00000481644.1 839 2 380 -1056 380 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGGGGCCTCCTGAGTCTTTG -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.339.5 chr1 - 3604 21 incomplete-splice_match HSPG2 ENST00000374695.8 14341 97 102554 2 -1179 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGGGGCCTCCTGAGTCTTT 2087 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.339.6 chr1 - 3766 21 incomplete-splice_match HSPG2 ENST00000374695.8 14341 97 102392 2 -1341 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGGGGCCTCCTGAGTCTTT 1925 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.339.7 chr1 - 3200 18 incomplete-splice_match HSPG2 ENST00000374695.8 14341 97 103994 2 261 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGGGGCCTCCTGAGTCTTT 3527 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.339.8 chr1 - 3040 16 incomplete-splice_match HSPG2 ENST00000374695.8 14341 97 105513 2 -1084 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGGGGCCTCCTGAGTCTTT 5046 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.339.9 chr1 - 2574 12 incomplete-splice_match HSPG2 ENST00000374695.8 14341 97 107220 2 623 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGGGGCCTCCTGAGTCTTT 6753 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.339.10 chr1 - 2376 11 full-splice_match HSPG2 ENST00000486901.1 3586 11 1209 1 1209 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGGGGCCTCCTGAGTCTTT 7339 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.339.11 chr1 - 2082 10 incomplete-splice_match HSPG2 ENST00000486901.1 3586 11 1806 1 1806 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGGGGCCTCCTGAGTCTTT 7936 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.339.12 chr1 - 1839 8 incomplete-splice_match HSPG2 ENST00000486901.1 3586 11 2559 1 2559 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGGGGCCTCCTGAGTCTTT 8689 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.339.13 chr1 - 1716 7 incomplete-splice_match HSPG2 ENST00000486901.1 3586 11 2792 1 2792 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGGGGCCTCCTGAGTCTTT 8922 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.339.14 chr1 - 1487 4 incomplete-splice_match HSPG2 ENST00000486901.1 3586 11 6352 1 -95 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.214692 0.507139 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGGGGCCTCCTGAGTCTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.339.15 chr1 - 1348 2 full-splice_match HSPG2 ENST00000481644.1 839 2 546 -1055 546 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGGGGCCTCCTGAGTCTTT 162 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.340.1 chr1 + 6214 10 incomplete-splice_match ZBTB40 ENST00000375647.5 8701 18 57343 471 57327 -471 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 TGAAAAAAATTAGGCTACAT NA FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.342.1 chr1 + 3045 15 incomplete-splice_match EPHB2 ENST00000400191.7 10816 17 70491 7750 6278 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 GGAAAAAAAAAGGGAATGGG NA FALSE NA NA AAGAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.342.2 chr1 + 1257 2 incomplete-splice_match EPHB2 ENST00000374632.7 3677 16 201502 -320 47313 320 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACCTTTTGAGGACTTGATCC NA FALSE NA NA AATGAA -21 NA NA NA 3 NA PB.345.5 chr1 - 4139 2 incomplete-splice_match LUZP1 ENST00000302291.8 8898 5 86574 930 42445 -930 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGTGCGAGTCTGTGATGCCA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.346.3 chr1 - 1172 4 full-splice_match LUZP1 ENST00000471849.5 1190 4 7 11 7 -11 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAACAAGAAACAAATCAGAA -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.346.4 chr1 - 1106 3 incomplete-splice_match LUZP1 ENST00000302291.8 8898 5 8970 9424 7 -11 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 19 5.089930 0.706712 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAACAAGAAACAAATCAGAA -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.350.1 chr1 - 1786 1 full-splice_match LINC01355 ENST00000566551.1 5444 1 3657 1 2359 -1 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTGAGTTTTTTTTGTCTTA NA FALSE NA NA AGTAAA -11 NA NA NA 5 NA PB.350.2 chr1 - 1389 1 full-splice_match LINC01355 ENST00000566551.1 5444 1 4054 1 2756 -1 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTGAGTTTTTTTTGTCTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.351.1 chr1 + 3067 20 novel_in_catalog KDM1A novel 3085 21 NA NA 0 1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.482584 0.541902 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAATTGGCCCTCTCTTTTGT -37 TRUE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 13 NA PB.351.2 chr1 + 2999 19 full-splice_match KDM1A ENST00000356634.7 3033 19 27 7 7 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.893603 0.770381 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG -30 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 22 NA PB.351.3 chr1 + 1513 11 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000688680.1 3984 15 50 7411 25 -7411 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CTGTATTTTCTTCATAGCTG -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.351.4 chr1 + 2854 19 full-splice_match KDM1A ENST00000356634.7 3033 19 172 7 152 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG 115 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 4 NA PB.351.5 chr1 + 2794 20 novel_in_catalog KDM1A novel 3085 21 NA NA 279 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GCCCTCTCTTTTGTTCCTTT 242 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.351.6 chr1 + 2647 19 full-splice_match KDM1A ENST00000356634.7 3033 19 377 9 357 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATAAAATTGGCCCTCTCTTT 320 FALSE NA NA AATAAA -8 NA NA NA 9 NA PB.351.7 chr1 + 2639 20 novel_in_catalog KDM1A novel 3085 21 NA NA 427 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.946801 0.469351 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG 390 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 11 NA PB.351.8 chr1 + 2569 19 novel_in_catalog KDM1A novel 3085 21 NA NA 11017 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAAAATTGGCCCTCTCTTTT 2746 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 3 NA PB.351.9 chr1 + 2508 18 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000356634.7 3033 19 11039 7 11019 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.893603 0.770381 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG 2748 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 22 NA PB.351.10 chr1 + 2490 19 novel_in_catalog KDM1A novel 3085 21 NA NA 11104 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GCCCTCTCTTTTGTTCCTTT 4 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.351.13 chr1 + 2309 17 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000356634.7 3033 19 30990 7 13 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.286257 0.632078 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG 41 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 16 NA PB.351.14 chr1 + 2180 16 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000356634.7 3033 19 34359 7 3382 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.018365 0.604049 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG 3410 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 15 NA PB.351.15 chr1 + 2874 15 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000691682.1 3710 19 35628 -50 4646 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG 4674 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 2 NA PB.351.16 chr1 + 2027 14 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000356634.7 3033 19 36512 6 5535 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 24 6.429385 0.808169 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAATTGGCCCTCTCTTTTGT 5563 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 24 NA PB.351.17 chr1 + 1955 13 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000356634.7 3033 19 38035 0 7058 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.822039 0.683231 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GCCCTCTCTTTTGTTCCTTT 7086 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 18 NA PB.351.18 chr1 + 1836 12 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000356634.7 3033 19 39654 7 -6097 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 23 6.161494 0.789686 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG 25 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 23 NA PB.351.19 chr1 + 1735 11 full-splice_match KDM1A ENST00000686793.1 2133 11 411 -13 411 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.482584 0.541902 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GCCCTCTCTTTTGTTCCTTT 9504 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 13 NA PB.351.21 chr1 + 2352 10 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000691682.1 3710 19 49622 -50 895 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG 9988 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 2 NA PB.351.22 chr1 + 1601 10 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000686793.1 2133 11 916 -5 916 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 24 6.429385 0.808169 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAAAATTGGCCCTCTCTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 24 NA PB.351.24 chr1 + 1492 9 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000686793.1 2133 11 3106 -13 -81 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GCCCTCTCTTTTGTTCCTTT NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.351.25 chr1 + 1403 8 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000686793.1 2133 11 3952 -6 765 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 37 9.911968 0.996160 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG 760 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 37 NA PB.351.26 chr1 + 1218 6 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000689971.1 1823 8 6372 -11 -8 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 28 7.500949 0.875116 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAATTGGCCCTCTCTTTTGT 5864 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 28 NA PB.351.27 chr1 + 1108 6 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000689971.1 1823 8 6481 -10 101 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.286257 0.632078 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG 5973 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 16 NA PB.351.28 chr1 + 916 5 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000494920.1 905 6 1922 -328 143 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.893603 0.770381 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG 7794 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 22 NA PB.351.29 chr1 + 2924 1 full-splice_match KDM1A ENST00000602503.1 2810 1 -114 0 -114 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG 9397 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 2 NA PB.351.30 chr1 + 732 3 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000494920.1 905 6 4259 -328 620 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG NA FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 6 NA PB.351.31 chr1 + 686 3 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000494920.1 905 6 4312 -335 673 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GCCCTCTCTTTTGTTCCTTT NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.351.32 chr1 + 1193 1 full-splice_match KDM1A ENST00000602503.1 2810 1 1620 -3 1620 -1 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGGCCCTCTCTTTTGTTC NA FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 3 NA PB.352.1 chr1 - 2286 2 full-splice_match LINC01355 ENST00000604481.1 400 2 -1910 24 75 -24 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAAAGAAGAGAGAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.352.2 chr1 - 1693 2 full-splice_match LINC01355 ENST00000604481.1 400 2 -1318 25 -20 -25 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 TAAGAAAAAAGAAGAGAGAA NA FALSE NA NA TTTAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.358.1 chr1 - 1615 2 full-splice_match HNRNPR ENST00000464516.1 557 2 -1049 -9 -1049 9 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TTGGTTAGTGTTTTCCAGAA 2475 FALSE NA NA AATAAA -34 NA NA NA 2 NA PB.359.4 chr1 - 1777 3 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000641107.1 646 5 -75 5573 -75 247 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAAAAAAAAACAGGTTC 9933 FALSE NA NA AATAAA -6 NA NA NA 2 NA PB.359.11 chr1 - 2405 9 full-splice_match HNRNPR ENST00000606561.5 1837 9 -4 -564 -4 14 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 38 10.179859 1.007742 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AATTGTGTCCTAAAACATTA -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 38 NA PB.359.13 chr1 - 1819 5 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000427764.3 1788 9 19432 -679 -7975 8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 68 18.216591 1.260467 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAATTCAATTGTGTCCTAAA 2033 FALSE NA NA AAAAAG -30 NA NA NA 68 NA PB.359.14 chr1 - 1416 2 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000476660.1 1637 3 569 -9 569 8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 68 18.216591 1.260467 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAATTCAATTGTGTCCTAAA 7305 FALSE NA NA TATAAA -14 NA NA NA 68 NA PB.359.17 chr1 - 2519 10 novel_in_catalog HNRNPR novel 2694 11 NA NA 0 -6 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 402 107.692200 2.032184 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 402 NA PB.359.18 chr1 - 3142 10 novel_not_in_catalog HNRNPR novel 2694 11 NA NA 99 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACCTATTTCAAATTCAATTG 468 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.359.19 chr1 - 3024 11 full-splice_match HNRNPR ENST00000302271.11 7751 11 -369 5096 -317 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACCTATTTCAAATTCAATTG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.359.20 chr1 - 2680 11 full-splice_match HNRNPR ENST00000302271.11 7751 11 -33 5104 0 -6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 216 57.864464 1.762412 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 333 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 216 NA PB.359.21 chr1 - 2234 5 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000427764.3 1788 9 19008 -670 -8399 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACCTATTTCAAATTCAATTG 9832 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.359.27 chr1 - 3263 5 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000427764.3 1788 9 17971 -662 -9436 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 8795 FALSE NA NA AATACA -19 NA NA NA 2 NA PB.359.28 chr1 - 2662 11 full-splice_match HNRNPR ENST00000374616.7 2691 11 20 9 5 -6 reference_match FALSE noncanonical NA NA NA NA 19 5.089930 0.706712 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.359.29 chr1 - 2545 10 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000374612.5 2694 11 3333 6 19 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 3661 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.359.30 chr1 - 2548 10 novel_in_catalog HNRNPR novel 7751 11 NA NA -4 -6 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.893603 0.770381 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 22 NA PB.359.31 chr1 - 2514 10 full-splice_match HNRNPR ENST00000478691.5 7646 10 28 5104 2 -6 alternative_3end FALSE noncanonical NA NA NA NA 32 8.572514 0.933108 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 342 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 32 NA PB.359.32 chr1 - 2459 10 full-splice_match HNRNPR ENST00000478691.5 7646 10 83 5104 28 -6 alternative_3end5end FALSE noncanonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.359.33 chr1 - 2514 10 novel_in_catalog HNRNPR novel 7751 11 NA NA 2 -6 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.359.34 chr1 - 2329 9 novel_in_catalog HNRNPR novel 2694 11 NA NA 1 -6 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.214692 0.507139 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 341 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.359.35 chr1 - 2352 9 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000374612.5 2694 11 5769 6 -4 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 19 5.089930 0.706712 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 6097 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.359.37 chr1 - 2203 8 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000374612.5 2694 11 6546 6 773 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.625712 0.750178 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 6874 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 21 NA PB.359.38 chr1 - 2058 6 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000427764.3 1788 9 17284 -662 9907 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 33 8.840405 0.946472 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 8108 FALSE NA NA AATAAA -33 NA NA NA 33 NA PB.359.40 chr1 - 1935 6 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000427764.3 1788 9 17407 -662 -10000 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.750474 0.574086 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 8231 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.359.42 chr1 - 1612 4 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000427764.3 1788 9 22461 -662 -4946 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 75 20.091827 1.303019 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 5062 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 75 NA PB.359.43 chr1 - 1428 3 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000641107.1 646 5 18 5829 18 -6 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 30 8.036731 0.905079 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 5046 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 30 NA PB.359.47 chr1 - 1657 4 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000427764.3 1788 9 22394 -640 -5013 -28 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATAAAACTAAAAAATCTAT 4995 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.359.58 chr1 - 1635 8 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000374612.5 2694 11 6513 607 740 -60 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAAAAATTGGCTTAA 6841 FALSE NA NA CATAAA -13 NA NA NA 3 NA PB.359.59 chr1 - 1637 4 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000427764.3 1788 9 21835 -61 -5572 -60 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAAAAATTGGCTTAA 4436 FALSE NA NA TTTAAA -9 NA NA NA 3 NA PB.359.60 chr1 - 1388 6 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000427764.3 1788 9 17353 -61 9976 -60 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAAAAATTGGCTTAA 8177 FALSE NA NA AAAAAG -25 NA NA NA 2 NA PB.359.66 chr1 - 1358 10 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000374612.5 2694 11 5 1465 0 -797 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 57 15.269789 1.183833 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAGAAAAGGAAAGAGCGCCA 333 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 57 NA PB.359.67 chr1 - 1249 9 novel_in_catalog HNRNPR novel 2694 11 NA NA 0 -797 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAGAAAAGGAAAGAGCGCCA -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.359.69 chr1 - 1156 9 novel_in_catalog HNRNPR novel 7751 11 NA NA 0 -797 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 97 25.985430 1.414730 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAGAAAAGGAAAGAGCGCCA -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 97 NA PB.359.72 chr1 - 1029 8 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000374612.5 2694 11 5716 1516 -57 -848 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAGAAATAGAAGGGGAAGA 6044 FALSE NA NA ATTAAA -37 NA NA NA 3 NA PB.359.74 chr1 - 1241 9 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000374612.5 2694 11 2 3815 2 -2 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAGATTATGCATTTGTTCA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.359.75 chr1 - 1031 8 novel_in_catalog HNRNPR novel 2694 11 NA NA 4 -29 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 GGAAAACTCGAAAGAGTAAA 344 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.359.76 chr1 - 955 8 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000374612.5 2694 11 21 8862 -6 -165 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.482584 0.541902 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGAAGAATCGGGGGTT -19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.359.77 chr1 - 793 7 novel_in_catalog HNRNPR novel 1032 8 NA NA 2 -165 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGAAGAATCGGGGGTT 342 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.361.3 chr1 - 4146 3 full-splice_match ZNF436 ENST00000374608.3 3788 3 168 -526 168 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AGCAAACCTGAGAATTATTT 15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.361.4 chr1 - 3737 3 full-splice_match ZNF436 ENST00000374608.3 3788 3 51 0 51 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GCTTCTGTGAGCCACTATGG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.361.5 chr1 - 3631 3 full-splice_match ZNF436 ENST00000374608.3 3788 3 156 1 156 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGCTTCTGTGAGCCACTATG 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.362.1 chr1 - 1570 11 full-splice_match TCEA3 ENST00000450454.7 1719 11 -9 158 -9 -158 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CTTAGACCTGAGGTGTCATA 54 FALSE NA NA GGGGCT -35 NA NA NA 6 NA PB.362.2 chr1 - 1488 10 novel_in_catalog TCEA3 novel 1719 11 NA NA 13 -155 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGACCTGAGGTGTCATATCT -6 TRUE NA NA GGGGCT -13 NA NA NA 2 NA PB.362.3 chr1 - 1250 11 full-splice_match TCEA3 ENST00000450454.7 1719 11 3 466 3 -466 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 29 7.768840 0.890356 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATACTGAACTCTGTCTG -16 TRUE NA NA GGGGCT -23 NA NA NA 29 NA PB.362.4 chr1 - 1202 10 novel_in_catalog TCEA3 novel 1719 11 NA NA -4 -458 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAACTCTGTCTGAGTGGGAT -23 TRUE NA NA GGGGCT -30 NA NA NA 6 NA PB.362.5 chr1 - 947 7 novel_not_in_catalog TCEA3 novel 1719 11 NA NA 14265 -466 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATACTGAACTCTGTCTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.362.6 chr1 - 840 7 novel_not_in_catalog TCEA3 novel 1719 11 NA NA 14372 -466 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATACTGAACTCTGTCTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.363.1 chr1 + 1197 2 full-splice_match ZNF436-AS1 ENST00000454117.2 1266 2 15 54 0 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACAATTGTCATAGTTTTTTG 2 TRUE NA NA AATAAA -25 NA NA NA 6 NA PB.363.2 chr1 + 2888 1 full-splice_match ZNF436-AS1 ENST00000335648.3 2547 1 -267 -74 5 17 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 14 3.750474 0.574086 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCCTGTTTTGTCATCTCT 7 TRUE NA NA TTTAAA -19 NA NA NA 14 NA PB.363.3 chr1 + 2595 1 full-splice_match ZNF436-AS1 ENST00000335648.3 2547 1 -48 0 -35 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCACAATTGTCATAGTTTT -29 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.363.4 chr1 + 2002 1 full-splice_match ZNF436-AS1 ENST00000335648.3 2547 1 545 0 543 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCACAATTGTCATAGTTTT 564 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.364.1 chr1 - 2190 8 incomplete-splice_match ASAP3 ENST00000495646.5 2552 10 2125 0 -1020 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCCAGTGGTTTCATTTATGT 2123 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.364.2 chr1 - 1987 5 incomplete-splice_match ASAP3 ENST00000495646.5 2552 10 3144 0 -1 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCCAGTGGTTTCATTTATGT 3142 FALSE NA NA AAAACA -40 NA NA NA 2 NA PB.364.4 chr1 - 4073 25 full-splice_match ASAP3 ENST00000336689.8 4051 25 -26 4 -13 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTTTCCAGTGGTTTCATTT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.364.5 chr1 - 3557 21 incomplete-splice_match ASAP3 ENST00000336689.8 4051 25 32672 4 -9236 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTTTCCAGTGGTTTCATTT NA FALSE NA NA AAAAAG -14 NA NA NA 2 NA PB.364.6 chr1 - 3203 17 incomplete-splice_match ASAP3 ENST00000336689.8 4051 25 42757 4 849 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTTTCCAGTGGTTTCATTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.364.7 chr1 - 2698 12 incomplete-splice_match ASAP3 ENST00000336689.8 4051 25 47011 4 -200 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTTTCCAGTGGTTTCATTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.366.1 chr1 - 2473 7 novel_not_in_catalog E2F2 novel 550 2 NA NA -14 1226 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CAACTGGCTTCCTCTACCTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.366.2 chr1 - 2198 8 novel_not_in_catalog E2F2 novel 5196 7 NA NA 19 774 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCAGGCGCCTGTAACTCCAG 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.366.3 chr1 - 1856 7 novel_not_in_catalog E2F2 novel 550 2 NA NA 144 767 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATGGTTGCAGGCGCCTGTA 134 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.366.5 chr1 - 5231 7 novel_not_in_catalog E2F2 novel 5196 7 NA NA -32 9 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCTTGTCTTTGTCGTGCTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.366.12 chr1 - 5195 7 full-splice_match E2F2 ENST00000361729.3 5196 7 0 1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.214692 0.507139 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTCTGGGCATCTTGTCTT -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.366.13 chr1 - 4521 7 full-splice_match E2F2 ENST00000361729.3 5196 7 674 1 674 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTCTGGGCATCTTGTCTT 664 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.367.1 chr1 - 1434 3 full-splice_match ID3 ENST00000374561.6 950 3 2 -486 2 486 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CCTGGTTTCATTTCCTTCTT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.367.2 chr1 - 985 3 full-splice_match ID3 ENST00000374561.6 950 3 -29 -6 -29 6 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 1214 325.219727 2.512177 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GACACCCGTCTCCATTAAGT 311 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 1214 NA PB.367.4 chr1 - 1131 3 full-splice_match ID3 ENST00000374561.6 950 3 -182 1 -182 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATATGATGACACCCGTCTCC 158 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.367.5 chr1 - 1054 2 full-splice_match ID3 ENST00000463312.1 623 2 -424 -7 2 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATATGATGACACCCGTCTCC 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.367.6 chr1 - 713 3 full-splice_match ID3 ENST00000374561.6 950 3 236 1 178 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATATGATGACACCCGTCTCC 576 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.367.7 chr1 - 889 3 novel_not_in_catalog ID3 novel 950 3 NA NA 2 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATATGATGACACCCGTCTC 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.367.9 chr1 - 1456 2 full-splice_match ID3 ENST00000486541.1 892 2 -58 -506 0 -5 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 40 10.715641 1.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACACTTGTGTATATGATG -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 40 NA PB.367.11 chr1 - 1027 3 full-splice_match ID3 ENST00000374561.6 950 3 -90 13 -90 -5 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACACTTGTGTATATGATG 250 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.367.12 chr1 - 872 3 full-splice_match ID3 ENST00000374561.6 950 3 65 13 7 -5 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.750474 0.574086 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACACTTGTGTATATGATG 405 FALSE NA NA AAGAAA -21 NA NA NA 14 NA PB.369.1 chr1 + 2150 4 incomplete-splice_match RPL11 ENST00000443624.6 1600 5 -105 -10 -41 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAATTCTGTTGTGTGTTCTG NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.369.2 chr1 + 1017 6 full-splice_match RPL11 ENST00000643754.2 1017 6 0 0 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CAGGCTCAGGTTTCTTTTAC 5 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.369.3 chr1 + 597 6 full-splice_match RPL11 ENST00000643754.2 1017 6 0 420 0 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 152 40.719437 1.609802 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATGTGCAATTCTGTTGTG 5 TRUE NA NA AATAAA -42 NA NA NA 152 NA PB.369.4 chr1 + 813 6 full-splice_match RPL11 ENST00000467075.2 823 6 0 10 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATGTGCAATTCTGTTGTG 20 FALSE NA NA AATAAA -42 NA NA NA 2 NA PB.369.5 chr1 + 549 5 full-splice_match RPL11 ENST00000458455.2 879 5 334 -4 31 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.286257 0.632078 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAATTCTGTTGTGTGTTCTG -2 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 16 NA PB.369.6 chr1 + 483 5 full-splice_match RPL11 ENST00000458455.2 879 5 400 -4 97 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAATTCTGTTGTGTGTTCTG 15 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.370.1 chr1 - 1605 2 antisense novelGene_MDS2_AS novel NA NA NA NA NA NA multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTCCATGTGTCATGTGGTTT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.371.3 chr1 + 2683 11 full-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 0 2155 0 -2119 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 107 28.664341 1.457342 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCCAGGTTTGTTTTT -10 TRUE NA NA AATAAA -26 NA NA NA 107 NA PB.371.4 chr1 + 1315 4 incomplete-splice_match ELOA ENST00000609199.2 5075 10 49 10110 26 969 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 88 23.574411 1.372441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAATGACTCTAAAAG 16 TRUE NA NA GATAAA -7 NA NA NA 88 NA PB.371.5 chr1 + 4810 11 full-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 9 19 9 -9 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 25 6.697276 0.825898 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAATAAAAAACAAACTCCAT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 25 NA PB.371.7 chr1 + 2331 8 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 7452 2157 6889 -2121 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTATCCCCCAGGTTTGTTT 7442 FALSE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 7 NA PB.371.9 chr1 + 2087 8 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 7699 2154 7136 -2118 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCCCCAGGTTTGTTTTTG 7689 FALSE NA NA AATAAA -27 NA NA NA 4 NA PB.371.10 chr1 + 1911 8 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 7874 2155 7311 -2119 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCCAGGTTTGTTTTT 7864 FALSE NA NA AATAAA -26 NA NA NA 6 NA PB.371.11 chr1 + 1636 8 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 8149 2155 7586 -2119 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCCAGGTTTGTTTTT 8139 FALSE NA NA AATAAA -26 NA NA NA 6 NA PB.371.12 chr1 + 1534 8 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 8246 2160 7683 -2124 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATATTATCCCCCAGGTTTG 8236 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 4 NA PB.371.13 chr1 + 1448 8 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 8337 2155 7774 -2119 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCCAGGTTTGTTTTT 8327 FALSE NA NA AATAAA -26 NA NA NA 4 NA PB.371.14 chr1 + 3499 8 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 8422 19 7859 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAATAAAAAACAAACTCCAT 8412 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.371.15 chr1 + 3318 7 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 8997 1 8434 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATATACTGTGTCTTCCTTAC 8987 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 3 NA PB.371.16 chr1 + 1060 6 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 10677 2160 10114 -2124 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATATTATCCCCCAGGTTTG NA FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.371.17 chr1 + 945 5 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 10905 2154 10342 -2118 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCCCCAGGTTTGTTTTTG NA FALSE NA NA AATAAA -27 NA NA NA 4 NA PB.371.18 chr1 + 886 5 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 10959 2159 10396 -2123 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATATTATCCCCCAGGTTTGT NA FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 5 NA PB.371.19 chr1 + 2678 2 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 13506 19 12943 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAATAAAAAACAAACTCCAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.372.1 chr1 + 1623 6 full-splice_match PITHD1 ENST00000246151.9 1590 6 -35 2 -35 -2 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 220 58.936028 1.770381 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTTTGTATTTTCTTTTG -21 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 220 NA PB.372.2 chr1 + 1559 5 novel_in_catalog PITHD1 novel 1590 6 NA NA -15 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTTTGTATTTTCTTTTG -1 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 9 NA PB.372.3 chr1 + 1067 6 full-splice_match PITHD1 ENST00000246151.9 1590 6 -9 532 -9 -532 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGATTGTTGTGTGACTTGT 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.372.4 chr1 + 2314 5 novel_in_catalog PITHD1 novel 1590 6 NA NA -2 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTTTGTATTTTCTTTTG 12 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.372.5 chr1 + 1437 6 full-splice_match PITHD1 ENST00000246151.9 1590 6 151 2 151 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTTTGTATTTTCTTTTG 165 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 6 NA PB.372.6 chr1 + 1314 6 full-splice_match PITHD1 ENST00000246151.9 1590 6 274 2 274 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTTTGTATTTTCTTTTG 288 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 10 NA PB.372.7 chr1 + 1141 3 incomplete-splice_match PITHD1 ENST00000374524.1 1292 4 512 2 512 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTTTGTATTTTCTTTTG 7300 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 9 NA PB.372.8 chr1 + 990 2 incomplete-splice_match PITHD1 ENST00000374524.1 1292 4 1198 2 1198 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTTTGTATTTTCTTTTG 7986 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 9 NA PB.373.1 chr1 - 962 4 full-splice_match ELOA-AS1 ENST00000427796.6 1112 4 13 137 1 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.946801 0.469351 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAAGTTGCCTTCAGGGCTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.374.1 chr1 - 1635 12 full-splice_match GALE ENST00000374497.7 1488 12 -146 -1 -25 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCAGGTTCTCACAGATGGTC -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.374.2 chr1 - 1624 11 full-splice_match GALE ENST00000459934.5 1563 11 1 -62 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.554148 0.658407 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCAGGTTCTCACAGATGGTC 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.374.3 chr1 - 1551 10 novel_in_catalog GALE novel 1516 12 NA NA -24 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCAGGTTCTCACAGATGGTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.374.4 chr1 - 1474 12 novel_not_in_catalog GALE novel 1516 12 NA NA 0 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCAGGTTCTCACAGATGGTC 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.374.5 chr1 - 1523 12 full-splice_match GALE ENST00000617979.5 1516 12 -8 1 -1 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 318 85.189346 1.930385 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GGCAGGTTCTCACAGATGGT -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 318 NA PB.374.6 chr1 - 1158 8 incomplete-splice_match GALE ENST00000374497.7 1488 12 2174 -1 885 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCAGGTTCTCACAGATGGTC 2547 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.374.7 chr1 - 1067 8 incomplete-splice_match GALE ENST00000374497.7 1488 12 2265 -1 976 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCAGGTTCTCACAGATGGTC 2638 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.374.8 chr1 - 960 7 incomplete-splice_match GALE ENST00000374497.7 1488 12 2617 -1 -716 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCAGGTTCTCACAGATGGTC 2990 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.374.9 chr1 - 1314 10 novel_in_catalog GALE novel 1516 12 NA NA -3 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GGCAGGTTCTCACAGATGGT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.374.10 chr1 - 1273 9 incomplete-splice_match GALE ENST00000374497.7 1488 12 1674 0 385 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.214692 0.507139 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GGCAGGTTCTCACAGATGGT 2047 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.374.11 chr1 - 1432 11 novel_in_catalog GALE novel 1516 12 NA NA 0 1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.214692 0.507139 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGGGGCAGGTTCTCACAGAT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.374.12 chr1 - 1384 11 novel_in_catalog GALE novel 1516 12 NA NA 0 1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 65 17.412918 1.240872 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGGGGCAGGTTCTCACAGAT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 65 NA PB.374.13 chr1 - 1638 11 incomplete-splice_match GALE ENST00000374497.7 1488 12 795 5 -37 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTGGGGCAGGTTCTCACAG 1168 FALSE NA NA AATAGA -20 NA NA NA 5 NA PB.374.14 chr1 - 1893 11 novel_in_catalog GALE novel 1516 12 NA NA -1 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACACTGGGGCAGGTTCTCAC -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.375.1 chr1 - 1589 9 full-splice_match HMGCL ENST00000374490.8 1570 9 -13 -6 -13 6 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 309 82.778328 1.917917 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CATTCGGTTGTGCAGCTGTG -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 309 NA PB.375.2 chr1 - 1332 7 incomplete-splice_match HMGCL ENST00000374490.8 1570 9 7930 -4 34 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCATTCGGTTGTGCAGCTG 7974 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.375.3 chr1 - 1133 5 incomplete-splice_match HMGCL ENST00000374490.8 1570 9 11170 -4 62 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCATTCGGTTGTGCAGCTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.375.4 chr1 - 1735 10 novel_not_in_catalog HMGCL novel 2151 10 NA NA -4 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATTCCAGCATTCGGTTGTG -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.375.5 chr1 - 1558 9 novel_not_in_catalog HMGCL novel 2151 10 NA NA -14 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATTCCAGCATTCGGTTGTG -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.375.6 chr1 - 1434 8 incomplete-splice_match HMGCL ENST00000374490.8 1570 9 4896 2 -3000 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATTCCAGCATTCGGTTGTG 4940 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.375.7 chr1 - 1368 7 full-splice_match HMGCL ENST00000436439.6 1354 7 -14 0 -13 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.482584 0.541902 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATTCCAGCATTCGGTTGTG -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.375.8 chr1 - 1202 5 incomplete-splice_match HMGCL ENST00000374490.8 1570 9 11094 3 -14 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAATTCCAGCATTCGGTTGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.375.9 chr1 - 762 2 incomplete-splice_match HMGCL ENST00000235958.4 1101 5 20917 -21 9836 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATAATTCCAGCATTCGGTTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.375.10 chr1 - 1795 6 full-splice_match HMGCL ENST00000513148.1 2011 6 -27 243 -14 -243 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACGGTGGCTCACGCCTGTAA -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.376.2 chr1 + 1656 10 novel_not_in_catalog LYPLA2 novel 1635 10 NA NA 0 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAACGCTCAGGCCTGGCTGA -9 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.376.3 chr1 + 1633 10 full-splice_match LYPLA2 ENST00000374514.8 1635 10 0 2 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 771 206.543991 2.315012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT -9 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 771 NA PB.376.4 chr1 + 2170 6 novel_in_catalog LYPLA2 novel 1635 10 NA NA 9 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 0 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.376.5 chr1 + 2159 6 novel_in_catalog LYPLA2 novel 1072 8 NA NA 14 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 5 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.376.6 chr1 + 1696 9 incomplete-splice_match LYPLA2 ENST00000374514.8 1635 10 18 2 18 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 9 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.376.7 chr1 + 1860 9 novel_in_catalog LYPLA2 novel 1635 10 NA NA 20 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 11 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.376.8 chr1 + 1714 9 novel_in_catalog LYPLA2 novel 1635 10 NA NA 20 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 11 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 6 NA PB.376.9 chr1 + 1798 8 novel_in_catalog LYPLA2 novel 1635 10 NA NA -19 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 14 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.376.10 chr1 + 1792 8 full-splice_match LYPLA2 ENST00000374502.7 1072 8 -53 -667 -19 -2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.018365 0.604049 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 14 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 15 NA PB.376.11 chr1 + 1784 10 novel_not_in_catalog LYPLA2 novel 1635 10 NA NA -19 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 14 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.376.12 chr1 + 1715 10 novel_in_catalog LYPLA2 novel 1635 10 NA NA -19 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.554148 0.658407 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 14 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 17 NA PB.376.13 chr1 + 1578 9 novel_in_catalog LYPLA2 novel 1635 10 NA NA -19 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.018365 0.604049 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 14 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 15 NA PB.376.14 chr1 + 1485 10 full-splice_match LYPLA2 ENST00000374503.7 868 10 -35 -582 -19 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 14 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 6 NA PB.376.17 chr1 + 1670 10 novel_not_in_catalog LYPLA2 novel 1117 6 NA NA 140 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 145 FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.376.18 chr1 + 1616 10 novel_not_in_catalog LYPLA2 novel 1117 6 NA NA -269 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 486 FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.376.20 chr1 + 1468 9 incomplete-splice_match LYPLA2 ENST00000374514.8 1635 10 1571 2 724 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 20 5.357821 0.728988 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 739 FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 20 NA PB.376.21 chr1 + 1264 5 incomplete-splice_match LYPLA2 ENST00000374501.1 1117 6 220 -260 -219 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 211 FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 6 NA PB.376.22 chr1 + 1135 3 incomplete-splice_match LYPLA2 ENST00000374501.1 1117 6 568 -260 129 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 559 FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.376.24 chr1 + 1010 2 incomplete-splice_match LYPLA2 ENST00000472213.1 822 3 355 -456 355 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 785 FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 6 NA PB.376.25 chr1 + 892 2 incomplete-splice_match LYPLA2 ENST00000472213.1 822 3 473 -456 473 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 903 FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.377.1 chr1 - 2083 8 full-splice_match FUCA1 ENST00000374479.4 2043 8 -47 7 -47 -7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 221 59.203918 1.772350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAAACATGGTATAGCTT -16 TRUE NA NA AAAAAG -8 NA NA NA 221 NA PB.377.2 chr1 - 1497 6 incomplete-splice_match FUCA1 ENST00000374479.4 2043 8 5030 7 5030 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAAACATGGTATAGCTT 5061 FALSE NA NA AAAACA -24 NA NA NA 2 NA PB.377.3 chr1 - 1190 4 incomplete-splice_match FUCA1 ENST00000374479.4 2043 8 13804 7 13804 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAAACATGGTATAGCTT 197 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.377.4 chr1 - 1139 4 incomplete-splice_match FUCA1 ENST00000374479.4 2043 8 13855 7 13855 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAAACATGGTATAGCTT 248 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.377.5 chr1 - 961 3 incomplete-splice_match FUCA1 ENST00000374479.4 2043 8 19553 7 19553 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAAACATGGTATAGCTT 5946 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.377.6 chr1 - 2201 8 novel_not_in_catalog FUCA1 novel 2043 8 NA NA 8 -8 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 CAAAAAAACATGGTATAGCT 39 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.377.7 chr1 - 1540 7 incomplete-splice_match FUCA1 ENST00000374479.4 2043 8 2752 23 2752 -23 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 CACAATCATTTCTACCAAAA 2783 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.377.8 chr1 - 2142 2 genic FUCA1 novel 2043 8 NA NA -62 -19647 multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 CAAAAAAAAAAAAAAAAGAA -31 TRUE NA NA AAAAAG -23 NA NA NA 2 NA PB.378.1 chr1 - 3529 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000344989.10 3487 6 -28 -14 -3 14 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 32 8.572514 0.933108 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGATTTTGCTCTTAGATTT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 32 NA PB.378.2 chr1 - 3466 5 full-splice_match SRSF10 ENST00000484146.6 1089 5 -17 -2360 -17 -9 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAATAAATCTTGGGTTTT -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.378.3 chr1 - 2994 3 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000344989.10 3487 6 8453 9 3174 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAATAAATCTTGGGTTTT 8483 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.378.10 chr1 - 3355 5 full-splice_match SRSF10 ENST00000484146.6 1089 5 -15 -2251 -15 -118 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATTGAGAACTAACCGTAGTT -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.378.11 chr1 - 3362 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000453840.7 1808 6 -31 -1523 0 -118 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATTGAGAACTAACCGTAGTT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.378.15 chr1 - 2002 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000344989.10 3487 6 -32 1517 -7 124 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAATCTGGAAGTGGAATT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.378.17 chr1 - 1625 3 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000374452.9 1194 6 8397 -859 3141 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATGTTTTGGATTCCTTAG 8450 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.378.19 chr1 - 2366 8 novel_not_in_catalog SRSF10 novel 2839 7 NA NA 0 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATGTTTTGGATTCCTTA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.378.20 chr1 - 1940 7 novel_not_in_catalog SRSF10 novel 7656 6 NA NA 0 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.482584 0.541902 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATGTTTTGGATTCCTTA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.378.22 chr1 - 1784 5 full-splice_match SRSF10 ENST00000484146.6 1089 5 29 -724 0 -4 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 30 8.036731 0.905079 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATGTTTTGGATTCCTTA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 30 NA PB.378.24 chr1 - 1877 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000344989.10 3487 6 -35 1645 -10 -4 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 241 64.561737 1.809975 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATGTTTTGGATTCCTTA -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 241 NA PB.378.25 chr1 - 1645 5 novel_not_in_catalog SRSF10 novel 7656 6 NA NA 28 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATGTTTTGGATTCCTTA 5337 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.378.26 chr1 - 1554 4 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000341154.10 2839 7 5892 4 17 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.214692 0.507139 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATGTTTTGGATTCCTTA 5326 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.378.28 chr1 - 1422 3 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000453840.7 1808 6 8351 4 3107 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATGTTTTGGATTCCTTA 8416 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.378.35 chr1 - 2070 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000374452.9 1194 6 -19 -857 0 -5 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.286257 0.632078 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAAAATGTTTTGGATTCCTT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.378.36 chr1 - 2300 7 novel_in_catalog SRSF10 novel 2839 7 NA NA -12 -6 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.946801 0.469351 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACAAAATGTTTTGGATTCCT -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.378.37 chr1 - 2252 7 novel_not_in_catalog SRSF10 novel 2839 7 NA NA 0 -6 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACAAAATGTTTTGGATTCCT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.378.39 chr1 - 5097 6 novel_in_catalog SRSF10 novel 2839 7 NA NA -4 -9 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATCACAAAATGTTTTGGATT -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.378.41 chr1 - 1555 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000453840.7 1808 6 -31 284 0 -284 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TAATATACTAGAGTTATAAT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.378.42 chr1 - 1057 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000374452.9 1194 6 -19 156 0 155 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TACTTGTGGAAACTAATCCC 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.378.43 chr1 - 926 7 novel_not_in_catalog SRSF10 novel 7656 6 NA NA 0 155 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TACTTGTGGAAACTAATCCC 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.378.44 chr1 - 3327 7 novel_in_catalog SRSF10 novel 7656 6 NA NA 0 -19 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AATAAAAACAAAATGAAGGA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.378.45 chr1 - 2943 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000492112.3 7656 6 -42 4755 -13 -19 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 36 9.644077 0.984261 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AATAAAAACAAAATGAAGGA -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 36 NA PB.378.46 chr1 - 2654 4 full-splice_match SRSF10 ENST00000485841.5 3957 4 2580 -1277 -20 -19 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AATAAAAACAAAATGAAGGA 5289 FALSE NA NA GGGGCT -26 NA NA NA 4 NA PB.378.47 chr1 - 2471 3 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000485841.5 3957 4 5724 -1277 3124 -19 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AATAAAAACAAAATGAAGGA 8433 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.378.59 chr1 - 4469 7 novel_in_catalog SRSF10 novel 7656 6 NA NA -17 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.378.60 chr1 - 2550 4 full-splice_match SRSF10 ENST00000485841.5 3957 4 1407 0 -1193 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA 4116 FALSE NA NA ACTAAA -2 NA NA NA 4 NA PB.378.61 chr1 - 2227 6 novel_in_catalog SRSF10 novel 2839 7 NA NA -15 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.378.62 chr1 - 2040 7 novel_not_in_catalog SRSF10 novel 7656 6 NA NA 0 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.378.63 chr1 - 2050 7 novel_in_catalog SRSF10 novel 7656 6 NA NA 0 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.378.64 chr1 - 1980 4 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000484146.6 1089 5 29 3206 0 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.378.65 chr1 - 1847 5 novel_in_catalog SRSF10 novel 7656 6 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.378.66 chr1 - 1810 5 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000374453.7 866 6 -89 2761 -27 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.378.67 chr1 - 1666 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000492112.3 7656 6 -42 6032 -13 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 202 54.113991 1.733310 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 202 NA PB.378.68 chr1 - 1508 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000492112.3 7656 6 116 6032 60 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA 150 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.378.69 chr1 - 1278 3 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000485841.5 3957 4 5640 0 3040 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA 8349 FALSE NA NA ATTAAA -11 NA NA NA 8 NA PB.378.70 chr1 - 1177 3 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000485841.5 3957 4 5741 0 3141 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA 8450 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.378.76 chr1 - 1622 7 novel_in_catalog SRSF10 novel 7656 6 NA NA 0 168 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTTGGTAGAACTGTTAACC 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.378.77 chr1 - 1193 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000343255.9 2917 6 0 1724 0 168 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTTGGTAGAACTGTTAACC 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.378.78 chr1 - 3850 7 novel_in_catalog SRSF10 novel 7656 6 NA NA 5 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCTTAAGAGTCCAGTTTG 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.378.79 chr1 - 1027 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000492112.3 7656 6 0 6629 0 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 73 19.556046 1.291281 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCTTAAGAGTCCAGTTTG 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 73 NA PB.378.88 chr1 - 819 2 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000343255.9 2917 6 0 9053 0 19 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 GAAAAGAAAAAATAAAGAAA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.380.2 chr1 + 2922 3 full-splice_match PNRC2 ENST00000334351.8 2400 3 -541 19 178 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CTTGGTTTTATTTTAAAAAT 2 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 4 NA PB.380.3 chr1 + 2415 3 novel_not_in_catalog PNRC2 novel 2428 4 NA NA 178 -5 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAATGGTTTTGATTGCTT 2 TRUE NA NA AATAAA -30 NA NA NA 4 NA PB.380.6 chr1 + 2394 3 full-splice_match PNRC2 ENST00000334351.8 2400 3 0 6 0 -6 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 298 79.831528 1.902174 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAAAATGGTTTTGATTGCT 11 TRUE NA NA AATAAA -29 NA NA NA 298 NA PB.380.7 chr1 + 1890 3 full-splice_match PNRC2 ENST00000334351.8 2400 3 -3 513 -3 -497 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTATGGGACTATCTTTTTT 8 TRUE NA NA AAAAAG -41 NA NA NA 2 NA PB.380.10 chr1 + 2681 2 incomplete-splice_match PNRC2 ENST00000334351.8 2400 3 0 24 0 -8 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTGGCTTGGTTTTATTTTA 11 TRUE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.380.13 chr1 + 1622 3 full-splice_match PNRC2 ENST00000334351.8 2400 3 0 778 0 -762 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 127 34.022163 1.531762 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTCTTGGCCTTTATCTTACA 11 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 127 NA PB.380.14 chr1 + 1487 3 full-splice_match PNRC2 ENST00000334351.8 2400 3 0 913 0 669 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.750474 0.574086 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATTCTAATAGTGCTCTGGC 11 TRUE NA NA AATACA -27 NA NA NA 14 NA PB.380.16 chr1 + 1401 2 incomplete-splice_match PNRC2 ENST00000471915.5 380 3 722 -71 3 71 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AGAAGACCAAGGAACAGAAT 14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.380.18 chr1 + 1488 3 full-splice_match PNRC2 ENST00000334351.8 2400 3 127 785 127 -769 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAAAGTTTTCTTGGCCTTTA 138 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.380.19 chr1 + 2259 3 full-splice_match PNRC2 ENST00000334351.8 2400 3 136 5 136 -5 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAATGGTTTTGATTGCTT 147 FALSE NA NA AATAAA -30 NA NA NA 6 NA PB.380.20 chr1 + 3035 2 incomplete-splice_match PNRC2 ENST00000334351.8 2400 3 271 24 271 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTGGCTTGGTTTTATTTTA 282 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.380.21 chr1 + 1351 2 incomplete-splice_match PNRC2 ENST00000334351.8 2400 3 1194 785 1194 -769 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAAAGTTTTCTTGGCCTTTA 1205 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 5 NA PB.380.23 chr1 + 2099 2 incomplete-splice_match PNRC2 ENST00000334351.8 2400 3 1207 24 1207 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 19 5.089930 0.706712 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTGGCTTGGTTTTATTTTA 1218 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 19 NA PB.381.1 chr1 + 1881 3 antisense novelGene_IFNLR1_AS novel NA NA NA NA NA NA multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAAGATGTCCCCTTTGGTGC NA FALSE NA NA ACTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.382.1 chr1 - 2912 8 novel_not_in_catalog IL22RA1 novel 2817 7 NA NA -40 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CCTGTTGTGATTTTTTTTTT -32 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.383.1 chr1 + 2666 16 full-splice_match GRHL3 ENST00000361548.9 2834 16 163 5 -46 1 alternative_5end TRUE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CATTACTTCACATGCTGCTC 2 TRUE NA NA AATAAA -23 NA NA NA 2 NA PB.384.2 chr1 + 1351 11 novel_in_catalog NIPAL3 novel 1676 12 NA NA -22 -9 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAATTAAAAATAAATAAAT -19 TRUE NA NA AAGAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.384.3 chr1 + 1393 11 novel_in_catalog NIPAL3 novel 5372 12 NA NA -19 2950 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGGATGCGTTATCTTGGT -16 TRUE NA NA AAAAAG -15 NA NA NA 2 NA PB.384.7 chr1 + 5371 12 full-splice_match NIPAL3 ENST00000374399.9 5372 12 0 1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGCTGAGTTCGTGTCTTA 3 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 8 NA PB.384.12 chr1 + 1724 12 full-splice_match NIPAL3 ENST00000374399.9 5372 12 0 3648 0 2950 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 25 6.697276 0.825898 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGGATGCGTTATCTTGGT 3 TRUE NA NA AAAAAG -15 NA NA NA 25 NA PB.384.13 chr1 + 1679 12 full-splice_match NIPAL3 ENST00000339255.2 1676 12 -12 9 0 -9 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 23 6.161494 0.789686 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAATTAAAAATAAATAAAT 3 TRUE NA NA AAGAAA -15 NA NA NA 23 NA PB.384.14 chr1 + 893 2 full-splice_match NIPAL3 ENST00000488155.1 931 2 -10 48 0 -48 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAGGAAAAAAAAAAAAAA 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.385.1 chr1 + 1549 5 novel_in_catalog RCAN3 novel 6863 5 NA NA 0 -102 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGTATACATGAAATTTTTTG -1 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.385.2 chr1 + 858 5 novel_in_catalog RCAN3 novel 6863 5 NA NA 31 -119 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 GAAACTGAAGAGGAAGAAGA 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.385.3 chr1 + 1451 5 novel_in_catalog RCAN3 novel 6863 5 NA NA 37 -102 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGTATACATGAAATTTTTTG 10 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 4 NA PB.385.4 chr1 + 1482 5 full-splice_match RCAN3 ENST00000374395.9 6863 5 100 5281 39 -102 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGTATACATGAAATTTTTTG 12 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 7 NA PB.385.6 chr1 + 2687 5 full-splice_match RCAN3 ENST00000374395.9 6863 5 149 4027 88 -6 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.286257 0.632078 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAACTCAGCATTGTGCCCAT -28 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 16 NA PB.385.7 chr1 + 2649 5 novel_in_catalog RCAN3 novel 6863 5 NA NA 94 -5 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACTCAGCATTGTGCCCATT -22 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.387.1 chr1 + 2430 5 novel_in_catalog SRRM1 novel 673 6 NA NA -126 2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAGAAAAAGAAAGCAGCAGA 26 FALSE NA NA GATAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.387.2 chr1 + 2665 7 novel_in_catalog SRRM1 novel 3735 17 NA NA -47 -18 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 GAAAAAAATTCCAAAAAAGA 4 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.387.3 chr1 + 3738 17 novel_in_catalog SRRM1 novel 3735 17 NA NA 1 -20 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.482584 0.541902 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAAATTTTGCCACTCTTA -18 TRUE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 13 NA PB.387.4 chr1 + 3654 17 novel_in_catalog SRRM1 novel 3735 17 NA NA 1 -20 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAAATTTTGCCACTCTTA -18 TRUE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.387.6 chr1 + 2532 16 novel_in_catalog SRRM1 novel 3735 17 NA NA 1 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAACACAAGAAGGAAAA -18 TRUE NA NA AAAAAG -43 NA NA NA 10 NA PB.387.7 chr1 + 2334 15 novel_in_catalog SRRM1 novel 3735 17 NA NA 1 690 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAAGCCCCCAGCACCTCC -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.387.9 chr1 + 2171 6 novel_in_catalog SRRM1 novel 3735 17 NA NA 1 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAAGAAAAGGAGAAGGA -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.387.10 chr1 + 1594 11 novel_in_catalog SRRM1 novel 3735 17 NA NA 1 484 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACATCTGTGTGTGCAGCA -18 TRUE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.387.11 chr1 + 1267 4 novel_in_catalog SRRM1 novel 575 6 NA NA 1 115 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAGAAGAAATAAAACA -18 TRUE NA NA AAGAAA -36 NA NA NA 2 NA PB.387.12 chr1 + 634 6 full-splice_match SRRM1 ENST00000490543.5 673 6 -32 71 1 -17 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAGATAAAAGAGATAAGGA -18 TRUE NA NA AAAAAG -13 NA NA NA 2 NA PB.387.13 chr1 + 518 5 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000468822.5 768 7 20 2463 2 19 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 19 5.089930 0.706712 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AGAGAAAAAAGGGAGCGGTC 4 TRUE NA NA GATAAA -28 NA NA NA 19 NA PB.387.15 chr1 + 1384 6 novel_not_in_catalog SRRM1 novel 673 6 NA NA 0 -17 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAGATAAAAGAGATAAGGA -16 TRUE NA NA AAAAAG -13 NA NA NA 2 NA PB.387.16 chr1 + 746 7 full-splice_match SRRM1 ENST00000468822.5 768 7 0 22 0 -17 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAATTCCAAAAAAGAA -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.387.17 chr1 + 2302 5 novel_in_catalog SRRM1 novel 673 6 NA NA 0 21 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.893603 0.770381 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AGAAAAAAGGGAGCGGTCTC 2 TRUE NA NA GATAAA -30 NA NA NA 22 NA PB.387.18 chr1 + 3725 17 full-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 -9 19 0 -19 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 43 11.519315 1.061427 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATTTTGCCACTCTTAC 2 TRUE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 43 NA PB.387.19 chr1 + 2560 17 full-splice_match SRRM1 ENST00000479034.5 2671 17 -15 126 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 37 9.911968 0.996160 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAACACAAGAAGGAAAA 2 TRUE NA NA AAAAAG -43 NA NA NA 37 NA PB.387.20 chr1 + 2518 16 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 -9 1812 0 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 43 11.519315 1.061427 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAACACAAGAAGGAAAA 2 TRUE NA NA AAAAAG -43 NA NA NA 43 NA PB.387.21 chr1 + 2480 3 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000600523.5 575 6 5 -114 0 114 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 GAAGAAAGAAGAAATAAAAC 2 TRUE NA NA AAGAAA -35 NA NA NA 8 NA PB.387.25 chr1 + 948 8 novel_in_catalog SRRM1 novel 3735 17 NA NA 0 -17 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAATTCCAAAAAAGAA 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.387.26 chr1 + 816 7 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000479034.5 2671 17 -15 19105 0 -19 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 75 20.091827 1.303019 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 GGAAAAAAATTCCAAAAAAG 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 75 NA PB.387.27 chr1 + 804 7 novel_not_in_catalog SRRM1 novel 3735 17 NA NA 0 -19 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 GGAAAAAAATTCCAAAAAAG 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.387.28 chr1 + 3770 18 novel_in_catalog SRRM1 novel 3110 18 NA NA -1 -11 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 28 7.500949 0.875116 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGCCACTCTTACTTAGTAGT 7 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 28 NA PB.387.29 chr1 + 1862 14 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 -8 4069 1 -52 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGAGAAGAACGGCTTCAC 3 TRUE NA NA AATACA -28 NA NA NA 2 NA PB.387.31 chr1 + 2583 4 full-splice_match SRRM1 ENST00000462710.5 2624 4 8 33 -1 21 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.625712 0.750178 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AGAAAAAAGGGAGCGGTCTC 10 TRUE NA NA GATAAA -30 NA NA NA 21 NA PB.387.32 chr1 + 2187 4 full-splice_match SRRM1 ENST00000466910.5 799 4 26 -1414 -1 115 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAGAAGAAATAAAACA 7 TRUE NA NA AAGAAA -36 NA NA NA 4 NA PB.387.33 chr1 + 3670 18 novel_in_catalog SRRM1 novel 3110 18 NA NA 1 -19 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATTTTGCCACTCTTAC 9 TRUE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 4 NA PB.387.34 chr1 + 2602 7 novel_in_catalog SRRM1 novel 3735 17 NA NA 1 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAAGAAAAGGAGAAGGA 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.387.35 chr1 + 2352 16 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000479034.5 2671 17 -8 1397 1 690 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAAGCCCCCAGCACCTCC 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.387.36 chr1 + 1295 9 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000479034.5 2671 17 -8 16513 1 -47 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAAAGTCGTGTTTCTG 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.387.38 chr1 + 3748 18 novel_in_catalog SRRM1 novel 3110 18 NA NA 0 -20 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAAATTTTGCCACTCTTA 14 TRUE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 6 NA PB.387.44 chr1 + 2203 2 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000495561.1 563 3 -1746 1518 -1662 -17 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAGATAAAAGAGATAAGGA 3296 FALSE NA NA AAAAAG -13 NA NA NA 2 NA PB.387.46 chr1 + 1700 2 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000495561.1 563 3 -1243 1518 -1159 -17 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAGATAAAAGAGATAAGGA 3799 FALSE NA NA AAAAAG -13 NA NA NA 2 NA PB.387.47 chr1 + 1456 2 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000495561.1 563 3 -999 1518 -915 -17 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAGATAAAAGAGATAAGGA 4043 FALSE NA NA AAAAAG -13 NA NA NA 2 NA PB.387.48 chr1 + 1348 2 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000495561.1 563 3 -891 1518 -807 -17 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAGATAAAAGAGATAAGGA 4151 FALSE NA NA AAAAAG -13 NA NA NA 2 NA PB.387.51 chr1 + 3397 15 novel_in_catalog SRRM1 novel 2671 17 NA NA 343 -19 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATTTTGCCACTCTTAC 27 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 4 NA PB.387.52 chr1 + 3210 13 novel_not_in_catalog SRRM1 novel 3735 17 NA NA 63 -12 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TTGCCACTCTTACTTAGTAG 1117 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.387.56 chr1 + 2913 12 novel_in_catalog SRRM1 novel 2671 17 NA NA 32 -19 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATTTTGCCACTCTTAC 3595 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.387.65 chr1 + 2427 9 novel_in_catalog SRRM1 novel 3735 17 NA NA 22 -19 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATTTTGCCACTCTTAC 189 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 4 NA PB.387.66 chr1 + 2446 10 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000374389.8 3110 18 11803 -636 48 -19 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATTTTGCCACTCTTAC 215 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.387.70 chr1 + 2216 7 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000374389.8 3110 18 19394 -635 -3862 -20 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAAATTTTGCCACTCTTA 6907 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 6 NA PB.387.71 chr1 + 2100 6 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000374389.8 3110 18 19888 -635 -3368 -20 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAAATTTTGCCACTCTTA 7401 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.387.73 chr1 + 2062 5 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 23514 19 261 -19 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.946801 0.469351 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATTTTGCCACTCTTAC NA FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 11 NA PB.387.75 chr1 + 1922 4 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 25850 20 -431 -20 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAAATTTTGCCACTCTTA NA FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 8 NA PB.387.76 chr1 + 1714 4 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 26059 19 -222 -19 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.018365 0.604049 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATTTTGCCACTCTTAC NA FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 15 NA PB.387.77 chr1 + 1387 4 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 26169 236 -112 -236 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATGAAATGTCATGGCTCTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.387.78 chr1 + 1538 4 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 26234 20 -47 -20 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.750474 0.574086 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAAATTTTGCCACTCTTA NA FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 14 NA PB.387.79 chr1 + 1454 3 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 26851 19 570 -19 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATTTTGCCACTCTTAC NA FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 10 NA PB.387.80 chr1 + 1359 3 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 26946 19 665 -19 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATTTTGCCACTCTTAC NA FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 3 NA PB.387.81 chr1 + 1249 2 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 28126 19 1845 -19 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 38 10.179859 1.007742 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATTTTGCCACTCTTAC NA FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 38 NA PB.388.2 chr1 - 2589 8 full-splice_match STPG1 ENST00000003583.12 2544 8 -40 -5 17 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTTTTGGGTACCCCTTAA -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.388.3 chr1 - 1760 2 incomplete-splice_match STPG1 ENST00000003583.12 2544 8 52735 -5 18833 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTTTTGGGTACCCCTTAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.388.4 chr1 - 2759 9 novel_in_catalog STPG1 novel 2726 9 NA NA 0 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAGCTTTTGGGTACCCCTTA -27 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.388.5 chr1 - 2679 9 full-splice_match STPG1 ENST00000337248.9 2726 9 42 5 -15 1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.214692 0.507139 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTGAGCTTTTGGGTACCCC 15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.388.6 chr1 - 1254 6 incomplete-splice_match STPG1 ENST00000003583.12 2544 8 29728 1094 -4174 -1094 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CACTCCTGCCTTTCTCATTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.388.7 chr1 - 1016 5 incomplete-splice_match STPG1 ENST00000337248.9 2726 9 14 22263 14 11 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAATAGGTGTTTTAACAGT -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.390.1 chr1 - 2407 5 full-splice_match RUNX3 ENST00000308873.11 4267 5 318 1542 318 -24 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAACAAA 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.390.2 chr1 - 1698 2 incomplete-splice_match RUNX3 ENST00000496967.1 572 5 21456 -1519 21456 -24 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAACAAA 3872 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.390.4 chr1 - 2058 5 full-splice_match RUNX3 ENST00000308873.11 4267 5 666 1543 666 -25 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 CAAAAAAAAAAAAAAAACAA 664 FALSE NA NA GGGGCT -3 NA NA NA 2 NA PB.391.1 chr1 - 1697 7 full-splice_match SYF2 ENST00000236273.9 1757 7 6 54 6 -54 alternative_3end TRUE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGAGGGAAAGGTTGTTATTT 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.391.2 chr1 - 1562 6 incomplete-splice_match SYF2 ENST00000236273.9 1757 7 22 405 6 284 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACATTTTTAGTCTATCATT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.391.3 chr1 - 813 2 incomplete-splice_match SYF2 ENST00000354361.3 926 6 7423 -284 7369 284 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACATTTTTAGTCTATCATT 7438 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.391.4 chr1 - 1348 7 full-splice_match SYF2 ENST00000236273.9 1757 7 3 406 3 283 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 218 58.400246 1.766415 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAACATTTTTAGTCTATCAT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 218 NA PB.391.5 chr1 - 1219 6 full-splice_match SYF2 ENST00000354361.3 926 6 -10 -283 6 283 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAACATTTTTAGTCTATCAT 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.391.6 chr1 - 981 4 incomplete-splice_match SYF2 ENST00000354361.3 926 6 4327 -282 4273 282 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CTAACATTTTTAGTCTATCA 8099 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.391.7 chr1 - 1147 5 incomplete-splice_match SYF2 ENST00000236273.9 1757 7 3410 412 3340 277 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATTTCTAACATTTTTAGTC 7166 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.391.8 chr1 - 603 3 incomplete-splice_match SYF2 ENST00000354361.3 926 6 4988 20 4934 -20 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATATGGCTGTTTAATCTTT 8760 FALSE NA NA TATAAA -4 NA NA NA 2 NA PB.391.9 chr1 - 963 6 incomplete-splice_match SYF2 ENST00000236273.9 1757 7 312 714 242 -25 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAATGTATATGGCTGTTTAA -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.391.10 chr1 - 1034 7 full-splice_match SYF2 ENST00000236273.9 1757 7 3 720 3 -31 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 130 34.825836 1.541902 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TATTTTAAATGTATATGGCT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 130 NA PB.391.11 chr1 - 779 6 full-splice_match SYF2 ENST00000354361.3 926 6 1 146 1 -146 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATATCCTTTCATGTATATTT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.391.12 chr1 - 915 7 full-splice_match SYF2 ENST00000236273.9 1757 7 6 836 6 -147 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 78 20.895500 1.320053 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATATCCTTTCATGTATATT 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 78 NA PB.392.1 chr1 + 2344 6 full-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 -91 2000 -26 -1946 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAGACAAAAGCAAAACCA -3 TRUE NA NA AATAAA -27 NA NA NA 2 NA PB.392.2 chr1 + 830 6 full-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 -91 3514 -26 900 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAGAAATGACTGGCATCT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.392.3 chr1 + 4315 6 full-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 -66 4 -1 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 351 94.029755 1.973265 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGTGTTTGAGACTACTA 22 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 351 NA PB.392.4 chr1 + 943 6 full-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 -62 3372 3 1042 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 39 10.447750 1.019023 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAGAGATGTCTTCATGTC 26 TRUE NA NA AGTAAA -12 NA NA NA 39 NA PB.392.6 chr1 + 4089 5 novel_in_catalog CLIC4 novel 2723 7 NA NA -16 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATAAAGGATTCTTTTTTCCC 72 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.392.7 chr1 + 2662 6 full-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 0 1591 0 -1537 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TATCTGGTTCAAGGAAGATG 0 TRUE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 3 NA PB.392.8 chr1 + 1721 6 full-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 0 2532 0 1882 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATCATAGAGCTTGCTATTT 0 TRUE NA NA AAAAAG -14 NA NA NA 6 NA PB.392.14 chr1 + 4015 5 incomplete-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 52350 4 52350 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGTGTTTGAGACTACTA -1 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.392.18 chr1 + 3912 4 incomplete-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 68645 54 68645 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATAAAGGATTCTTTTTTCCC NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.392.21 chr1 + 3790 3 incomplete-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 81607 4 81607 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGTGTTTGAGACTACTA NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 6 NA PB.392.23 chr1 + 3615 2 incomplete-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 94524 5 94524 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAAGTGTTTGAGACTACT 20 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 8 NA PB.393.1 chr1 - 2750 3 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000498238.1 2941 4 481 -11 -333 11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 ATATATATAACCTAATGGAT 515 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.393.2 chr1 - 956 2 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000566395.5 824 5 2498 -17 68 11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 ATATATATAACCTAATGGAT 3451 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.393.3 chr1 - 2157 2 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000566395.5 824 5 1285 -5 -42 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGTCTTTATTGTATATATAT 2238 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.393.4 chr1 - 2060 6 novel_in_catalog RSRP1 novel 3034 6 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGTCTTTATTGTATATATAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.393.5 chr1 - 1867 2 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000566395.5 824 5 1575 -5 248 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGTCTTTATTGTATATATAT 2528 FALSE NA NA AATAAA -44 NA NA NA 3 NA PB.393.6 chr1 - 1680 2 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000566395.5 824 5 1762 -5 435 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGTCTTTATTGTATATATAT 2715 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.393.7 chr1 - 1469 6 novel_in_catalog RSRP1 novel 1425 5 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.018365 0.604049 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGTCTTTATTGTATATATAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.393.8 chr1 - 1278 4 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000243189.12 1425 5 425 1 -389 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGTCTTTATTGTATATATAT 459 FALSE NA NA AAAACA -26 NA NA NA 2 NA PB.393.9 chr1 - 1280 2 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000566395.5 824 5 2162 -5 -268 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGTCTTTATTGTATATATAT 3115 FALSE NA NA ATTAAA -2 NA NA NA 5 NA PB.393.10 chr1 - 859 4 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000243189.12 1425 5 844 1 17 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGTCTTTATTGTATATATAT 878 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.393.11 chr1 - 833 2 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000566395.5 824 5 2609 -5 179 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGTCTTTATTGTATATATAT 3562 FALSE NA NA AAGAAA -28 NA NA NA 2 NA PB.393.12 chr1 - 2827 5 novel_in_catalog RSRP1 novel 2941 4 NA NA 0 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAGTCTTTATTGTATATATA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.393.13 chr1 - 1947 7 novel_in_catalog RSRP1 novel 3034 6 NA NA 0 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAGTCTTTATTGTATATATA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.393.14 chr1 - 1556 3 novel_in_catalog RSRP1 novel 3034 6 NA NA -93 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAGTCTTTATTGTATATATA 2187 FALSE NA NA AAAAAG -38 NA NA NA 5 NA PB.393.15 chr1 - 695 2 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000566395.5 824 5 2746 -4 -135 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAGTCTTTATTGTATATATA 3699 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.393.16 chr1 - 2319 5 novel_in_catalog RSRP1 novel 3034 6 NA NA -33 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 33 8.840405 0.946472 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTCTTAGTCTTTATTGTAT -2 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 33 NA PB.393.17 chr1 - 2937 4 full-splice_match RSRP1 ENST00000498238.1 2941 4 0 4 0 2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 58 15.537680 1.191386 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CTTAGTCTTTATTGTATATA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 58 NA PB.393.18 chr1 - 1421 5 full-splice_match RSRP1 ENST00000243189.12 1425 5 0 4 0 2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 56 15.001898 1.176146 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CTTAGTCTTTATTGTATATA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 56 NA PB.393.19 chr1 - 2809 5 novel_in_catalog RSRP1 novel 2941 4 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTCTTAGTCTTTATTGTAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.393.20 chr1 - 2364 3 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000498238.1 2941 4 849 7 22 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTCTTAGTCTTTATTGTAT 883 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.393.21 chr1 - 2171 6 novel_in_catalog RSRP1 novel 3034 6 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTCTTAGTCTTTATTGTAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.393.22 chr1 - 1369 2 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000566395.5 824 5 2067 1 -363 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTCTTAGTCTTTATTGTAT 3020 FALSE NA NA AATAGA -3 NA NA NA 9 NA PB.393.23 chr1 - 1114 4 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000243189.12 1425 5 583 7 -231 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTCTTAGTCTTTATTGTAT 617 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.393.24 chr1 - 1049 2 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000566395.5 824 5 2387 1 -43 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTCTTAGTCTTTATTGTAT 3340 FALSE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 7 NA PB.393.26 chr1 - 1962 3 full-splice_match RSRP1 ENST00000431849.3 1954 3 -8 0 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.482584 0.541902 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAAAAAATGCTGTAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.393.27 chr1 - 1311 4 novel_in_catalog RSRP1 novel 2941 4 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.946801 0.469351 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAAAAAATGCTGTAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.393.28 chr1 - 1082 5 novel_in_catalog RSRP1 novel 3034 6 NA NA 0 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAAAAAATGCTGTAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.393.29 chr1 - 1037 4 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000568254.5 2013 5 3 1817 0 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAAAAAATGCTGTAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.395.1 chr1 + 1205 1 full-splice_match ENSG00000272432 ENST00000607698.1 485 1 -712 -8 -712 8 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA NA NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATTGTGGGTTAATTGCC NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.397.1 chr1 + 900 7 full-splice_match TMEM50A ENST00000374358.5 2266 7 -28 1394 -11 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 619 165.824554 2.219649 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAATAAAAAGAAATTACA -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 619 NA PB.397.2 chr1 + 2288 7 full-splice_match TMEM50A ENST00000374358.5 2266 7 -24 2 -7 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 175 46.880932 1.670996 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGTTTTTAGTCTTTAATTT -12 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 175 NA PB.397.4 chr1 + 954 6 full-splice_match TMEM50A ENST00000498135.5 776 6 -9 -169 -9 -129 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATATTCCGTGGTCAAAA -14 TRUE NA NA TATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.397.5 chr1 + 785 6 full-splice_match TMEM50A ENST00000498135.5 776 6 -9 0 -9 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.482584 0.541902 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAATAAAAAGAAATTACA -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.397.6 chr1 + 2174 6 full-splice_match TMEM50A ENST00000498135.5 776 6 -7 -1391 -7 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAGTTTTTAGTCTTTAATT -12 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.397.8 chr1 + 1429 7 full-splice_match TMEM50A ENST00000374358.5 2266 7 -16 853 1 229 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.482584 0.541902 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CATTTCATCTGTGTACTGAA -4 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 13 NA PB.397.9 chr1 + 1057 7 full-splice_match TMEM50A ENST00000374358.5 2266 7 -16 1225 1 -129 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 60 16.073462 1.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATATTCCGTGGTCAAAA -4 TRUE NA NA TATAAA -16 NA NA NA 60 NA PB.397.10 chr1 + 2170 6 full-splice_match TMEM50A ENST00000480937.5 1102 6 11 -1079 0 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAGTTTTTAGTCTTTAATT 12 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.397.11 chr1 + 779 6 full-splice_match TMEM50A ENST00000480937.5 1102 6 11 312 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAATAAAAAGAAATTACA 12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.397.12 chr1 + 2127 7 full-splice_match TMEM50A ENST00000374358.5 2266 7 46 93 46 -93 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AATAATGTGTCTGTAACCAA 0 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 10 NA PB.397.13 chr1 + 766 7 full-splice_match TMEM50A ENST00000374358.5 2266 7 106 1394 -20 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAATAAAAAGAAATTACA 60 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.397.14 chr1 + 1120 7 novel_in_catalog TMEM50A novel 799 6 NA NA -13 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAATAAAAAGAAATTACA 67 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.397.15 chr1 + 2104 6 incomplete-splice_match TMEM50A ENST00000374358.5 2266 7 2176 3 2050 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAGTTTTTAGTCTTTAATT 2130 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.397.16 chr1 + 1820 3 incomplete-splice_match TMEM50A ENST00000374358.5 2266 7 14582 2 10324 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGTTTTTAGTCTTTAATTT NA FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 10 NA PB.398.1 chr1 + 1066 6 incomplete-splice_match MACO1 ENST00000647928.1 2887 11 -121 40686 -19 -239 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AATAAATAACAACAATATTC 501 FALSE NA NA AAAAAG -41 NA NA NA 5 NA PB.398.3 chr1 + 3935 11 full-splice_match MACO1 ENST00000374343.5 3940 11 -3 8 -3 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGATAAAACTAGTTTTCTGC -8 TRUE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.398.4 chr1 + 1006 6 incomplete-splice_match MACO1 ENST00000647928.1 2887 11 -61 40686 2 -239 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AATAAATAACAACAATATTC -3 TRUE NA NA AAAAAG -41 NA NA NA 10 NA PB.398.5 chr1 + 2461 11 full-splice_match MACO1 ENST00000374343.5 3940 11 1 1478 1 -499 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.214692 0.507139 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCCAACTTTGCCTTTTATG -4 TRUE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 12 NA PB.398.7 chr1 + 2350 11 full-splice_match MACO1 ENST00000374343.5 3940 11 108 1482 45 -503 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGTAGCCAACTTTGCCTTT -1 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.398.11 chr1 + 1815 8 incomplete-splice_match MACO1 ENST00000374343.5 3940 11 23453 1483 5457 -504 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAAGTAGCCAACTTTGCCTT NA FALSE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 4 NA PB.398.12 chr1 + 1555 6 incomplete-splice_match MACO1 ENST00000374343.5 3940 11 27547 1478 9551 -499 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCCAACTTTGCCTTTTATG NA FALSE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 6 NA PB.398.13 chr1 + 1360 6 incomplete-splice_match MACO1 ENST00000374343.5 3940 11 27738 1482 9742 -503 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGTAGCCAACTTTGCCTTT NA FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 6 NA PB.398.14 chr1 + 1145 6 incomplete-splice_match MACO1 ENST00000374343.5 3940 11 27786 1649 9790 -670 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATTTTGTGGAACTGTATCT NA FALSE NA NA GATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.398.15 chr1 + 1184 6 incomplete-splice_match MACO1 ENST00000374343.5 3940 11 27918 1478 9922 -499 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCCAACTTTGCCTTTTATG NA FALSE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.398.17 chr1 + 926 4 incomplete-splice_match MACO1 ENST00000647928.1 2887 11 54676 497 36743 -497 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CCAACTTTGCCTTTTATGTA NA FALSE NA NA ATTAAA -23 NA NA NA 3 NA PB.399.1 chr1 + 2914 9 full-splice_match LDLRAP1 ENST00000374338.5 2914 9 -3 3 -3 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 108 28.932232 1.461382 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CAAGCAACGCTCATCAGGTG -32 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 108 NA PB.399.3 chr1 + 3171 9 novel_not_in_catalog LDLRAP1 novel 4670 7 NA NA 296 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGCAACGCTCATCAGGTGG 267 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.399.4 chr1 + 2628 7 novel_in_catalog LDLRAP1 novel 657 4 NA NA -78 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGCAACGCTCATCAGGTGG -1 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.399.5 chr1 + 2882 9 novel_in_catalog LDLRAP1 novel 4670 7 NA NA -76 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGCAACGCTCATCAGGTGG 1 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 10 NA PB.399.9 chr1 + 2607 8 incomplete-splice_match LDLRAP1 ENST00000374338.5 2914 9 10440 2 682 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGCAACGCTCATCAGGTGG 4125 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 5 NA PB.399.10 chr1 + 2731 6 novel_in_catalog LDLRAP1 novel 4670 7 NA NA 2013 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGCAACGCTCATCAGGTGG 6973 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.399.11 chr1 + 2354 5 incomplete-splice_match LDLRAP1 ENST00000374338.5 2914 9 19037 9 -173 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 GAAACTCAAGCAACGCTCAT 5662 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.399.12 chr1 + 2281 4 full-splice_match LDLRAP1 ENST00000484476.5 657 4 260 -1884 260 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGCAACGCTCATCAGGTGG 268 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.399.13 chr1 + 2073 2 incomplete-splice_match LDLRAP1 ENST00000470950.1 995 3 581 -1248 581 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGCAACGCTCATCAGGTGG 1513 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 6 NA PB.401.1 chr1 + 1429 5 incomplete-splice_match MAN1C1 ENST00000374329.1 2461 11 62030 9 -437 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AATAAGAAATATGATTGGGC 197 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.402.1 chr1 + 3933 11 incomplete-splice_match SELENON ENST00000374315.1 4212 12 906 2 868 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACTAGAGTGGTTCTAAGTG 894 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.402.2 chr1 + 3232 6 incomplete-splice_match SELENON ENST00000361547.7 4314 13 11292 3 11254 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAACTAGAGTGGTTCTAAGT 2830 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.402.3 chr1 + 2917 4 incomplete-splice_match SELENON ENST00000361547.7 4314 13 12570 2 12532 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACTAGAGTGGTTCTAAGTG 4108 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.402.4 chr1 + 2777 2 incomplete-splice_match SELENON ENST00000361547.7 4314 13 13881 2 13843 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACTAGAGTGGTTCTAAGTG 5419 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.404.1 chr1 - 2163 3 full-splice_match AUNIP ENST00000374298.4 2161 3 0 -2 0 2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 40 10.715641 1.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TCTTGTGATAATTGGTAATT -49 TRUE NA NA GGGGCT -36 NA NA NA 40 NA PB.404.3 chr1 - 1925 2 incomplete-splice_match AUNIP ENST00000374298.4 2161 3 21960 1 50 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GGCTCTTGTGATAATTGGTA 6095 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.404.5 chr1 - 1316 3 full-splice_match AUNIP ENST00000374298.4 2161 3 29 816 29 -816 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 34 9.108295 0.959437 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTGGGATTGGCATCATGGC -20 TRUE NA NA GGGGCT -7 NA NA NA 34 NA PB.408.1 chr1 - 1461 5 full-splice_match STMN1 ENST00000455785.7 1443 5 -22 4 -22 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 616 165.020874 2.217539 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GCAACTCCTGTGAAATGACT 5 TRUE NA NA GGGGCT -7 NA NA NA 616 NA PB.408.2 chr1 - 1366 5 novel_not_in_catalog STMN1 novel 1443 5 NA NA 0 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AACTCCTGTGAAATGACTAA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.408.3 chr1 - 3396 4 full-splice_match STMN1 ENST00000465604.1 2947 4 -2 -447 0 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGCAACTCCTGTGAAATGAC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.408.5 chr1 - 2907 2 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 1697 -619 382 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAGCAACTCCTGTGAAATGA 3574 FALSE NA NA ATTAAA -36 NA NA NA 2 NA PB.408.7 chr1 - 1328 3 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 1318 -619 3 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAGCAACTCCTGTGAAATGA 3195 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.408.8 chr1 - 1186 3 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 1460 -619 145 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAGCAACTCCTGTGAAATGA 3337 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.408.9 chr1 - 1089 2 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 3515 -619 2200 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.286257 0.632078 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAGCAACTCCTGTGAAATGA 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.408.10 chr1 - 1512 5 novel_not_in_catalog STMN1 novel 1712 5 NA NA 111 -5 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GTAGCAACTCCTGTGAAATG -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.408.12 chr1 - 985 2 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 3479 -479 2164 -144 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 GAACAGTTGAGAGAGAATCT 19 TRUE NA NA AAAAAG -5 NA NA NA 3 NA PB.408.13 chr1 - 1295 5 full-splice_match STMN1 ENST00000455785.7 1443 5 0 148 0 -146 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 36 9.644077 0.984261 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 GAGAACAGTTGAGAGAGAAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 36 NA PB.408.14 chr1 - 1108 5 full-splice_match STMN1 ENST00000455785.7 1443 5 0 335 0 117 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 27 7.233058 0.859322 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CCGCACGTTCTCTGCCCCGT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 27 NA PB.408.15 chr1 - 1044 5 full-splice_match STMN1 ENST00000455785.7 1443 5 -53 452 -6 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5108 1368.387451 3.136209 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGTGGCAGTGACTTCTTTTG 533 FALSE NA NA GGGGCT -38 NA NA NA 5108 NA PB.408.16 chr1 - 974 5 novel_not_in_catalog STMN1 novel 1443 5 NA NA 0 10 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTTCTTTTGAGTTAGGTTA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.408.17 chr1 - 1088 5 novel_not_in_catalog STMN1 novel 1443 5 NA NA -8 6 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTGACTTCTTTTGAGTTAG -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.408.18 chr1 - 1033 6 novel_not_in_catalog STMN1 novel 1443 5 NA NA 0 5 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAGTGACTTCTTTTGAGTTA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.408.19 chr1 - 968 4 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 387 -178 387 5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 35 9.376186 0.972026 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAGTGACTTCTTTTGAGTTA -6 TRUE NA NA AAAACA -32 NA NA NA 35 NA PB.408.20 chr1 - 987 5 novel_not_in_catalog STMN1 novel 1443 5 NA NA 0 4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GCAGTGACTTCTTTTGAGTT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.408.21 chr1 - 2730 2 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 1430 -175 115 2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGGCAGTGACTTCTTTTGAG 3307 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.408.22 chr1 - 1210 5 novel_not_in_catalog STMN1 novel 1712 5 NA NA 39 1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GTGGCAGTGACTTCTTTTGA 891 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.408.24 chr1 - 780 3 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 1421 -174 106 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GTGGCAGTGACTTCTTTTGA 3298 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.408.25 chr1 - 2949 4 full-splice_match STMN1 ENST00000465604.1 2947 4 -2 0 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.018365 0.604049 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGTGGCAGTGACTTCTTTTG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.408.26 chr1 - 1548 2 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 2610 -173 1295 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGTGGCAGTGACTTCTTTTG 4487 FALSE NA NA AAAACA -19 NA NA NA 3 NA PB.408.27 chr1 - 1279 5 full-splice_match STMN1 ENST00000399728.5 1712 5 -17 450 -17 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGTGGCAGTGACTTCTTTTG 835 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.408.28 chr1 - 1300 2 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 2858 -173 1543 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGTGGCAGTGACTTCTTTTG 4735 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.408.29 chr1 - 1282 5 novel_not_in_catalog STMN1 novel 1712 5 NA NA -104 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGTGGCAGTGACTTCTTTTG 748 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.408.30 chr1 - 1112 5 novel_not_in_catalog STMN1 novel 1712 5 NA NA 136 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGTGGCAGTGACTTCTTTTG -21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.408.31 chr1 - 1025 2 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 3133 -173 1818 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGTGGCAGTGACTTCTTTTG 5010 FALSE NA NA AATAAA -31 NA NA NA 2 NA PB.408.33 chr1 - 916 5 novel_not_in_catalog STMN1 novel 1443 5 NA NA 0 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGTGGCAGTGACTTCTTTTG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.408.34 chr1 - 592 2 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 3566 -173 2251 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.286257 0.632078 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGTGGCAGTGACTTCTTTTG 5443 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.408.35 chr1 - 1312 5 novel_in_catalog STMN1 novel 1443 5 NA NA -7 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGGTGGCAGTGACTTCTTTT -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.408.36 chr1 - 1125 5 full-splice_match STMN1 ENST00000399728.5 1712 5 136 451 136 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.018365 0.604049 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGGTGGCAGTGACTTCTTTT -21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.408.37 chr1 - 1059 5 novel_not_in_catalog STMN1 novel 1712 5 NA NA 118 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGGTGGCAGTGACTTCTTTT 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.408.38 chr1 - 865 3 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 1334 -172 19 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 50 13.394552 1.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGGTGGCAGTGACTTCTTTT -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 50 NA PB.408.39 chr1 - 1040 5 full-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 -4 -169 -4 -4 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTTGGTGGCAGTGACTTCT -11 TRUE NA NA AAGAAA -3 NA NA NA 2 NA PB.408.40 chr1 - 860 5 full-splice_match STMN1 ENST00000455785.7 1443 5 0 583 0 42 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 19 5.089930 0.706712 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAGAGTATGTAGTGGCTT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.409.2 chr1 + 1994 7 full-splice_match MTFR1L ENST00000524618.5 1217 7 -47 -730 0 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTGCTGTGTCCATCTCTT -32 TRUE NA NA ATTAAA -24 NA NA NA 2 NA PB.409.3 chr1 + 1966 7 full-splice_match MTFR1L ENST00000374303.7 1953 7 -10 -3 4 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 173 46.345150 1.666004 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTGCTGTGTCCATCTCTT -27 TRUE NA NA ATTAAA -24 NA NA NA 173 NA PB.409.4 chr1 + 1275 7 full-splice_match MTFR1L ENST00000374307.9 1868 7 -59 652 4 -48 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAGAGAAGTTGTTTCTGG -27 TRUE NA NA AATGAA -20 NA NA NA 3 NA PB.409.5 chr1 + 2039 8 novel_in_catalog MTFR1L novel 1953 7 NA NA -1 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGCATTTGCTGTGTCCATC -18 TRUE NA NA ATTAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.409.6 chr1 + 1977 7 novel_in_catalog MTFR1L novel 1953 7 NA NA 1 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTGCTGTGTCCATCTCTT -15 TRUE NA NA ATTAAA -24 NA NA NA 2 NA PB.409.7 chr1 + 1187 7 full-splice_match MTFR1L ENST00000474295.5 1873 7 30 656 4 -48 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAGAGAAGTTGTTTCTGG -12 TRUE NA NA AATGAA -20 NA NA NA 4 NA PB.409.8 chr1 + 1901 7 full-splice_match MTFR1L ENST00000374307.9 1868 7 -35 2 -10 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.482584 0.541902 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCATTTGCTGTGTCCAT -3 TRUE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 13 NA PB.409.9 chr1 + 1827 7 full-splice_match MTFR1L ENST00000474295.5 1873 7 40 6 -9 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 40 10.715641 1.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCATTTGCTGTGTCCAT -2 TRUE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 40 NA PB.409.10 chr1 + 1817 6 novel_in_catalog MTFR1L novel 1953 7 NA NA 0 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCATTTGCTGTGTCCAT 7 TRUE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 7 NA PB.409.11 chr1 + 1275 7 full-splice_match MTFR1L ENST00000374303.7 1953 7 26 652 -1 -48 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.625712 0.750178 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAGAGAAGTTGTTTCTGG 9 TRUE NA NA AATGAA -20 NA NA NA 21 NA PB.409.12 chr1 + 2441 6 novel_in_catalog MTFR1L novel 1953 7 NA NA -2 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTGCTGTGTCCATCTCTT 13 TRUE NA NA ATTAAA -24 NA NA NA 2 NA PB.409.13 chr1 + 2313 7 novel_in_catalog MTFR1L novel 1953 7 NA NA -5 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCATTTGCTGTGTCCAT 27 TRUE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.409.14 chr1 + 1988 7 novel_in_catalog MTFR1L novel 2099 7 NA NA 0 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCATTTGCTGTGTCCAT -11 TRUE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.409.15 chr1 + 2016 7 full-splice_match MTFR1L ENST00000374300.7 2053 7 34 3 34 1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAATGCATTTGCTGTGTCCA 21 FALSE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 5 NA PB.409.16 chr1 + 1905 7 full-splice_match MTFR1L ENST00000374300.7 2053 7 151 -3 151 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTGCTGTGTCCATCTCTT 114 FALSE NA NA ATTAAA -24 NA NA NA 5 NA PB.409.17 chr1 + 1712 5 incomplete-splice_match MTFR1L ENST00000374307.9 1868 7 3658 2 665 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCATTTGCTGTGTCCAT 2796 FALSE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.409.18 chr1 + 1566 3 full-splice_match MTFR1L ENST00000497956.1 2531 3 972 -7 972 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTGCTGTGTCCATCTCTT 5739 FALSE NA NA ATTAAA -24 NA NA NA 4 NA PB.409.19 chr1 + 1265 2 incomplete-splice_match MTFR1L ENST00000497956.1 2531 3 3950 -2 3950 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCATTTGCTGTGTCCAT 8717 FALSE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 6 NA PB.409.20 chr1 + 1114 2 incomplete-splice_match MTFR1L ENST00000497956.1 2531 3 4105 -6 4105 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CATTTGCTGTGTCCATCTCT 8872 FALSE NA NA ATTAAA -23 NA NA NA 8 NA PB.410.1 chr1 + 3999 11 full-splice_match EXTL1 ENST00000374280.4 4020 11 4 17 4 -17 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACGCTCCAGGCTATAAATAC 2 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.411.1 chr1 + 4385 3 full-splice_match PDIK1L ENST00000619836.4 4252 3 -133 0 -133 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AACAAAAAAAAAACTGAAAA NA FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 4 NA PB.411.3 chr1 + 3805 2 novel_in_catalog PDIK1L novel 4113 3 NA NA -19 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AACAAAAAAAAAACTGAAAA -25 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 2 NA PB.411.4 chr1 + 4296 4 full-splice_match PDIK1L ENST00000374271.8 4279 4 -30 13 -17 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AACAAAAAAAAAACTGAAAA -23 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 2 NA PB.411.7 chr1 + 4084 3 full-splice_match PDIK1L ENST00000374269.2 4113 3 4 25 4 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 45 12.055097 1.081171 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AACAAAAAAAAAACTGAAAA -2 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 45 NA PB.412.1 chr1 + 614 3 full-splice_match ZNF593 ENST00000374266.7 638 3 16 8 16 -8 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.214692 0.507139 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGAGAACTTGCCTCCAAC -5 TRUE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 12 NA PB.413.2 chr1 + 2544 21 full-splice_match CNKSR1 ENST00000374253.9 2538 21 -11 5 -5 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGAATGAGTCTACATGTAA -11 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.413.3 chr1 + 2523 21 full-splice_match CNKSR1 ENST00000361530.11 2535 21 7 5 -5 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGAATGAGTCTACATGTAA -11 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 7 NA PB.413.5 chr1 + 1078 6 incomplete-splice_match CNKSR1 ENST00000531191.5 2673 20 7255 -32 130 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TAAGAATGAGTCTACATGTA 5390 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.414.1 chr1 + 4036 15 novel_not_in_catalog CEP85 novel 3934 14 NA NA -4 2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CTCAGTTTTCCATACCCTTC -14 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.414.4 chr1 + 1491 8 incomplete-splice_match CEP85 ENST00000252992.8 3935 14 5 10302 5 -3887 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AATAATTTGAAAAAGAAATG -3 TRUE NA NA GATAAA -7 NA NA NA 10 NA PB.414.5 chr1 + 3919 14 full-splice_match CEP85 ENST00000451429.8 3934 14 14 1 12 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 60 16.073462 1.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CTCCTCAGTTTTCCATACCC 4 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 60 NA PB.414.6 chr1 + 3783 13 incomplete-splice_match CEP85 ENST00000451429.8 3934 14 5602 0 5600 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCCTCAGTTTTCCATACCCT 5592 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.414.7 chr1 + 3345 11 incomplete-splice_match CEP85 ENST00000451429.8 3934 14 21219 0 841 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCCTCAGTTTTCCATACCCT 132 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.414.8 chr1 + 2852 10 incomplete-splice_match CEP85 ENST00000252992.8 3935 14 23444 0 -27 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCCTCAGTTTTCCATACCCT 2359 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.414.9 chr1 + 2639 8 incomplete-splice_match CEP85 ENST00000453146.1 2821 10 1944 6 1944 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAGACTCCTCAGTTTTCC 4330 FALSE NA NA AATAAA -8 NA NA NA 5 NA PB.414.10 chr1 + 2461 7 incomplete-splice_match CEP85 ENST00000453146.1 2821 10 10809 -1 -808 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCCTCAGTTTTCCATACCCT NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.414.11 chr1 + 2241 6 incomplete-splice_match CEP85 ENST00000453146.1 2821 10 11855 -3 238 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CTCAGTTTTCCATACCCTTC 254 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.414.12 chr1 + 2284 4 incomplete-splice_match CEP85 ENST00000453146.1 2821 10 14120 1 328 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTCCTCAGTTTTCCATACC 2519 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.414.13 chr1 + 1948 3 incomplete-splice_match CEP85 ENST00000453146.1 2821 10 17350 -1 3558 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCCTCAGTTTTCCATACCCT 5749 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 5 NA PB.414.14 chr1 + 1809 2 incomplete-splice_match CEP85 ENST00000453146.1 2821 10 18950 1 5158 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTCCTCAGTTTTCCATACC 84 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 9 NA PB.414.15 chr1 + 1722 2 incomplete-splice_match CEP85 ENST00000469609.5 2384 7 7429 -5 5254 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAGTTTTCCATACCCTTCCA 180 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.415.9 chr1 - 1821 11 full-splice_match PAFAH2 ENST00000374282.8 3487 11 -34 1700 20 -697 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GATCACATTTTCTATTTATT -27 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.416.11 chr1 - 1428 12 novel_in_catalog UBXN11 novel 1944 15 NA NA 0 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AACCCGCTGCTCCGCCAGGC -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.417.1 chr1 - 998 7 novel_in_catalog CRYBG2 novel 5239 20 NA NA -48 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCTTGTCTCTGTGCACCT 11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.418.1 chr1 + 1172 3 full-splice_match SH3BGRL3 ENST00000270792.10 751 3 -424 3 -424 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GCACTGTGTCTGGTTGGTTG 528 FALSE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.418.2 chr1 + 913 2 full-splice_match SH3BGRL3 ENST00000319041.6 768 2 -74 -71 -38 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTGTGTCTGGTTGGTTGTG 286 FALSE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 7 NA PB.418.3 chr1 + 817 3 novel_not_in_catalog SH3BGRL3 novel 751 3 NA NA -38 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTGTGTCTGGTTGGTTGTG 286 FALSE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.418.4 chr1 + 783 3 full-splice_match SH3BGRL3 ENST00000270792.10 751 3 -33 1 -33 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 470 125.908791 2.100056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTGTGTCTGGTTGGTTGTG -2 TRUE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 470 NA PB.419.4 chr1 + 3384 5 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3458 5 NA NA -39 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACTGTCATCCCCTTGTCA -1 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 10 NA PB.419.5 chr1 + 2219 5 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3458 5 NA NA -39 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAAACTGTCATCCCCTTGTC -1 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.419.8 chr1 + 3399 5 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 13 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATCCCCTTGTCAGATGTTT 13 TRUE NA NA AATAAA -27 NA NA NA 10 NA PB.419.9 chr1 + 989 4 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 11 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCAAACTGTCATCCCCTTGT 11 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.419.10 chr1 + 3943 4 full-splice_match LIN28A ENST00000326279.11 3975 4 22 10 22 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAAACTGTCATCCCCTTGTC 22 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.419.12 chr1 + 3072 3 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 14512 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAAACTGTCATCCCCTTGTC NA FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.419.16 chr1 + 2761 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 15589 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATCCCCTTGTCAGATGTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -28 NA NA NA 4 NA PB.419.17 chr1 + 2767 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 15627 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAAACTGTCATCCCCTTGTC NA FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.419.21 chr1 + 2394 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3458 5 NA NA 15948 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACTGTCATCCCCTTGTCA 72 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.419.25 chr1 + 2116 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 16165 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAAACTGTCATCCCCTTGTC 289 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.419.28 chr1 + 2014 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 16336 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATCCCCTTGTCAGATGTTTT 145 FALSE NA NA AATAAA -28 NA NA NA 3 NA PB.419.31 chr1 + 1862 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 16478 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCAAACTGTCATCCCCTTGT 287 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.419.32 chr1 + 1871 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3458 5 NA NA 16482 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACTGTCATCCCCTTGTCA 291 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.419.34 chr1 + 1588 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 16752 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCAAACTGTCATCCCCTTGT 561 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 5 NA PB.419.36 chr1 + 1496 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3458 5 NA NA 16846 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACTGTCATCCCCTTGTCA 655 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.419.38 chr1 + 1435 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 16897 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCAAACTGTCATCCCCTTGT 706 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.419.39 chr1 + 1385 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3458 5 NA NA 16897 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACTGTCATCCCCTTGTCA 706 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 7 NA PB.419.40 chr1 + 1356 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3458 5 NA NA 16996 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAAACTGTCATCCCCTTGTC 805 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.419.42 chr1 + 1320 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3458 5 NA NA 17022 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACTGTCATCCCCTTGTCA -14 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 7 NA PB.419.43 chr1 + 1259 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 17022 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAAACTGTCATCCCCTTGTC -14 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 5 NA PB.419.45 chr1 + 1227 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 17123 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATCCCCTTGTCAGATGTTTT 16 FALSE NA NA AATAAA -28 NA NA NA 2 NA PB.419.47 chr1 + 1122 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3458 5 NA NA 17160 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACTGTCATCCCCTTGTCA 53 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.419.49 chr1 + 1036 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 17253 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATCCCCTTGTCAGATGTTT -5 TRUE NA NA AATAAA -27 NA NA NA 2 NA PB.419.52 chr1 + 1024 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 17316 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCAAACTGTCATCCCCTTGT 58 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 5 NA PB.419.55 chr1 + 916 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 17433 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATCCCCTTGTCAGATGTTT 175 FALSE NA NA AATAAA -27 NA NA NA 3 NA PB.422.1 chr1 + 1422 9 full-splice_match DHDDS ENST00000236342.12 3288 9 -34 1900 5 33 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CAGCTGCCTGTCTCTTAGAT 4212 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.422.2 chr1 + 1204 9 full-splice_match DHDDS ENST00000236342.12 3288 9 2 2082 0 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGAATGGTGTTCCCTTTG -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.422.3 chr1 + 1101 8 full-splice_match DHDDS ENST00000525682.6 1235 8 -16 150 0 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAATGAATGGTGTTCCCTTT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.422.4 chr1 + 941 7 full-splice_match DHDDS ENST00000427245.6 868 7 7 -80 0 80 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAAATAACCCAGGAGATG -5 TRUE NA NA AGTAAA -12 NA NA NA 4 NA PB.422.5 chr1 + 1307 10 novel_not_in_catalog DHDDS novel 3288 9 NA NA 3 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGAATGGTGTTCCCTTTG -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.422.6 chr1 + 1621 6 full-splice_match DHDDS ENST00000374185.7 1148 6 -5 -468 -2 79 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 CAAAAAATAACCCAGGAGAT 9 TRUE NA NA AGTAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.422.7 chr1 + 3266 9 full-splice_match DHDDS ENST00000236342.12 3288 9 18 4 0 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 35 9.376186 0.972026 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAACTTGTTTGCTAACTGC 11 TRUE NA NA AATAGA -23 NA NA NA 35 NA PB.422.8 chr1 + 3151 8 full-splice_match DHDDS ENST00000525682.6 1235 8 3 -1919 0 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TCTTAGATGTAAAACTTGTT 14 TRUE NA NA AATAGA -13 NA NA NA 8 NA PB.422.10 chr1 + 1200 2 incomplete-splice_match DHDDS ENST00000531955.5 559 3 -361 4166 -1 -11 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAGAAAAAAAAAATGACATT -19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.422.11 chr1 + 1200 9 novel_in_catalog DHDDS novel 3288 9 NA NA 0 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGAATGGTGTTCCCTTTG -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.422.12 chr1 + 1275 9 novel_in_catalog DHDDS novel 3245 9 NA NA 0 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGAATGGTGTTCCCTTTG -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.422.13 chr1 + 1993 9 novel_in_catalog DHDDS novel 3288 9 NA NA 4 653 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CACTCTTCGAGGTTTCTCTC -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.422.15 chr1 + 1289 9 novel_in_catalog DHDDS novel 703 6 NA NA -7 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAATGAATGGTGTTCCCTTT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.422.16 chr1 + 3365 9 novel_in_catalog DHDDS novel 703 6 NA NA -4 -4 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAACTTGTTTGCTAACTGC -2 TRUE NA NA AATAGA -23 NA NA NA 7 NA PB.422.17 chr1 + 3079 7 incomplete-splice_match DHDDS ENST00000236342.12 3288 9 5872 10 -4643 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGATGTAAAACTTGTTTGCT 5385 FALSE NA NA AATAGA -17 NA NA NA 3 NA PB.422.19 chr1 + 2647 4 incomplete-splice_match DHDDS ENST00000236342.12 3288 9 15323 5 1280 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAAACTTGTTTGCTAACTG NA FALSE NA NA AATAGA -22 NA NA NA 2 NA PB.423.1 chr1 + 1471 5 full-splice_match HMGN2 ENST00000464888.5 565 5 -101 -805 -35 -7 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGCTTGGAATGCTGCCTCTG 2071 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.423.2 chr1 + 1309 6 full-splice_match HMGN2 ENST00000361427.6 1940 6 -16 647 -16 25 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 9287 2487.904053 3.395834 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGTGGGGTAACCTGGTTTA -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9287 NA PB.423.3 chr1 + 1243 5 novel_in_catalog HMGN2 novel 1148 7 NA NA -20 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT -12 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 3 NA PB.423.5 chr1 + 1612 5 full-splice_match HMGN2 ENST00000460563.5 1045 5 -30 -537 -3 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATGCTGCCTCTGATCTTT 15 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 4 NA PB.423.7 chr1 + 1138 5 novel_in_catalog HMGN2 novel 1148 7 NA NA -3 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT -11 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 3 NA PB.423.8 chr1 + 1223 6 full-splice_match HMGN2 ENST00000361427.6 1940 6 39 678 2 -6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 185 49.559841 1.695130 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GCTTGGAATGCTGCCTCTGA -6 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 185 NA PB.423.9 chr1 + 3020 2 novel_in_catalog HMGN2 novel 952 5 NA NA -1 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATGCTGCCTCTGATCTTT 20 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.423.11 chr1 + 3029 2 full-splice_match HMGN2 ENST00000493418.1 1496 2 -923 -610 0 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 8 NA PB.423.12 chr1 + 2409 4 novel_in_catalog HMGN2 novel 1148 7 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 4 NA PB.423.13 chr1 + 1872 6 full-splice_match HMGN2 ENST00000361427.6 1940 6 66 2 0 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 35 9.376186 0.972026 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTGCTTTGTCCATTCCCT 0 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 35 NA PB.423.14 chr1 + 1858 3 novel_in_catalog HMGN2 novel 565 5 NA NA 0 16 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTTTTTTTTTTTTTTTAAA 0 TRUE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.423.15 chr1 + 1729 4 full-splice_match HMGN2 ENST00000479815.5 1030 4 43 -742 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.822039 0.683231 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 18 NA PB.423.17 chr1 + 1554 5 full-splice_match HMGN2 ENST00000460563.5 1045 5 29 -538 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.625712 0.750178 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 21 NA PB.423.18 chr1 + 1377 5 full-splice_match HMGN2 ENST00000464888.5 565 5 0 -812 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 6 NA PB.423.19 chr1 + 1208 6 novel_not_in_catalog HMGN2 novel 1148 7 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 7 NA PB.423.20 chr1 + 1196 6 novel_not_in_catalog HMGN2 novel 1148 7 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.423.21 chr1 + 1190 6 novel_not_in_catalog HMGN2 novel 1148 7 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.482584 0.541902 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 13 NA PB.423.22 chr1 + 1172 5 novel_in_catalog HMGN2 novel 1148 7 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 9 NA PB.423.23 chr1 + 2580 3 novel_in_catalog HMGN2 novel 1148 7 NA NA -1 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 19 5.089930 0.706712 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 4 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 19 NA PB.423.24 chr1 + 1317 6 full-splice_match HMGN2 ENST00000361427.6 1940 6 75 548 0 124 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AGTCAGCTTCCAAAACACAC 9 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.423.25 chr1 + 1277 6 full-splice_match HMGN2 ENST00000467700.5 932 6 -2 -343 0 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.893603 0.770381 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATGCTGCCTCTGATCTTT 9 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 22 NA PB.423.27 chr1 + 454 6 full-splice_match HMGN2 ENST00000361427.6 1940 6 75 1411 0 3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATTTTGTTTTACTTTTT 9 FALSE NA NA TATAAA -6 NA NA NA 2 NA PB.423.28 chr1 + 1169 6 full-splice_match HMGN2 ENST00000361427.6 1940 6 99 672 22 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 201 53.846100 1.731154 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 33 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 201 NA PB.423.29 chr1 + 1390 5 full-splice_match HMGN2 ENST00000466194.1 952 5 -33 -405 -33 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 495 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 5 NA PB.423.30 chr1 + 1767 3 incomplete-splice_match HMGN2 ENST00000479815.5 1030 4 860 -742 -106 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 100 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 4 NA PB.423.31 chr1 + 1082 5 full-splice_match HMGN2 ENST00000466194.1 952 5 275 -405 52 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 258 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.423.32 chr1 + 1027 4 incomplete-splice_match HMGN2 ENST00000466194.1 952 5 504 -404 281 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 101 27.056995 1.432280 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATGCTGCCTCTGATCTTT 487 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 101 NA PB.423.33 chr1 + 1220 3 incomplete-splice_match HMGN2 ENST00000466194.1 952 5 663 -404 440 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATGCTGCCTCTGATCTTT 646 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.423.34 chr1 + 1141 3 incomplete-splice_match HMGN2 ENST00000466194.1 952 5 743 -405 520 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 726 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 3 NA PB.423.35 chr1 + 1429 2 full-splice_match HMGN2 ENST00000493418.1 1496 2 675 -608 675 -2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GGAATGCTGCCTCTGATCTT 881 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.423.37 chr1 + 950 2 incomplete-splice_match HMGN2 ENST00000466194.1 952 5 1364 -399 1141 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 364 97.512337 1.989060 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GCTTGGAATGCTGCCTCTGA 1347 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 364 NA PB.426.1 chr1 + 3114 22 full-splice_match RPS6KA1 ENST00000374168.7 3192 22 76 2 59 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCACGCTCTCCTGCACTC 63 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 5 NA PB.426.2 chr1 + 2948 21 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000526792.5 2596 22 5725 -591 5615 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAAGCACGCTCTCCTGCACT 5528 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.426.3 chr1 + 3113 21 full-splice_match RPS6KA1 ENST00000531382.5 2359 21 -7 -747 0 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 20 5.357821 0.728988 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCACGCTCTCCTGCACTC -8 TRUE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 20 NA PB.426.4 chr1 + 2724 18 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000531382.5 2359 21 5544 -747 -50 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCACGCTCTCCTGCACTC 5543 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 7 NA PB.426.5 chr1 + 2515 16 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000374163.5 3202 22 7599 4 -1758 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CACGCTCTCCTGCACTCTTC 63 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.426.6 chr1 + 2361 14 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000374163.5 3202 22 8810 7 -547 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCACGCTCTCCTGCACTC 448 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 4 NA PB.426.7 chr1 + 2223 13 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000374163.5 3202 22 9359 8 2 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.946801 0.469351 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAAGCACGCTCTCCTGCACT 997 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 11 NA PB.426.8 chr1 + 2001 10 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000374163.5 3202 22 11204 7 3 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCACGCTCTCCTGCACTC 2842 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 6 NA PB.426.9 chr1 + 1894 9 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000374163.5 3202 22 13017 7 1816 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCACGCTCTCCTGCACTC 4655 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 4 NA PB.426.10 chr1 + 1735 8 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000374163.5 3202 22 14963 8 3762 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAAGCACGCTCTCCTGCACT 6601 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 8 NA PB.426.11 chr1 + 1558 6 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000374163.5 3202 22 15704 7 4503 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCACGCTCTCCTGCACTC 7342 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 8 NA PB.426.12 chr1 + 1473 6 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000374163.5 3202 22 15789 7 4588 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCACGCTCTCCTGCACTC 7427 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 4 NA PB.426.13 chr1 + 1382 5 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000374163.5 3202 22 25664 8 277 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAAGCACGCTCTCCTGCACT NA FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 8 NA PB.426.14 chr1 + 1263 4 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000374163.5 3202 22 26022 7 -406 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCACGCTCTCCTGCACTC NA FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 5 NA PB.426.15 chr1 + 1180 3 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000438977.1 639 4 -66 -296 -66 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTCTCCTGCACTCTTCATCC NA FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.426.16 chr1 + 1109 3 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000438977.1 639 4 -2 -289 -2 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCACGCTCTCCTGCACTC NA FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 10 NA PB.426.17 chr1 + 1005 2 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000438977.1 639 4 1031 -288 1031 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAAGCACGCTCTCCTGCACT NA FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.430.1 chr1 + 5385 17 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000374152.7 6460 19 3837 -403 3092 15 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAATA 1528 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.430.7 chr1 + 4665 13 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000374152.7 6460 19 34238 -403 -1115 15 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAATA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.430.8 chr1 + 4463 12 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000374152.7 6460 19 37374 -402 16 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.430.9 chr1 + 4324 11 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000636219.1 7058 19 36855 944 242 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.430.11 chr1 + 4114 10 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000374152.7 6460 19 39037 -403 -1225 15 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAATA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.430.12 chr1 + 3796 8 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000374152.7 6460 19 43646 -402 -405 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 1308 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.430.13 chr1 + 3680 7 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000636219.1 7058 19 43196 944 -110 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 1603 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.430.14 chr1 + 3441 6 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000636219.1 7058 19 43793 944 483 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 2200 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.430.15 chr1 + 3315 5 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000636219.1 7058 19 44002 944 692 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 2409 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.430.16 chr1 + 3058 3 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000636219.1 7058 19 44773 944 -440 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 3180 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.430.17 chr1 + 2771 3 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000636219.1 7058 19 45061 943 -152 15 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAATA 3468 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.430.18 chr1 + 2568 3 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000636219.1 7058 19 45264 943 51 15 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAATA 3671 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.430.19 chr1 + 2374 3 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000636219.1 7058 19 45457 944 244 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 3864 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.430.20 chr1 + 2268 2 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000466382.2 2699 6 2612 22 706 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 4326 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.430.21 chr1 + 2058 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 1002 -14 1002 14 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 11 2.946801 0.469351 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 7851 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.430.22 chr1 + 1919 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 1141 -14 1141 14 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 16 4.286257 0.632078 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 7990 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.430.23 chr1 + 1771 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 1289 -14 1289 14 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 17 4.554148 0.658407 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 8138 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.430.24 chr1 + 1608 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 1452 -14 1452 14 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 11 2.946801 0.469351 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 8301 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.430.25 chr1 + 1479 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 1582 -15 1582 15 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 15 4.018365 0.604049 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAATA 8431 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.430.26 chr1 + 1389 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 1671 -14 1671 14 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 8520 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.430.27 chr1 + 1282 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 1779 -15 1779 15 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 11 2.946801 0.469351 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAATA 8628 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.430.28 chr1 + 1145 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 1915 -14 1915 14 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 20 5.357821 0.728988 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 8764 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 20 NA PB.430.29 chr1 + 1009 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 2052 -15 2052 15 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAATA 8901 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.430.30 chr1 + 878 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 2183 -15 2183 15 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAATA 9032 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.430.31 chr1 + 717 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 2343 -14 2343 14 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 9192 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.430.32 chr1 + 1525 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 2478 -957 2478 -1 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAGACTTTTGTGAAGCTTT 9327 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 6 NA PB.430.33 chr1 + 1416 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 2585 -955 2585 -3 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GGTAAGACTTTTGTGAAGCT 9434 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 6 NA PB.430.34 chr1 + 1300 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 2704 -958 2704 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGACTTTTGTGAAGCTTTT 9553 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.430.35 chr1 + 1144 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 2857 -955 2857 -3 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GGTAAGACTTTTGTGAAGCT 9706 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 5 NA PB.430.36 chr1 + 1019 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 2984 -957 2984 -1 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 17 4.554148 0.658407 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAGACTTTTGTGAAGCTTT 9833 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 17 NA PB.432.1 chr1 + 2518 4 novel_in_catalog PIGV novel 1624 5 NA NA 224 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATGCGACATTGTTTCTGA NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.432.2 chr1 + 2129 4 full-splice_match PIGV ENST00000674222.1 4377 4 -19 2267 0 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 46 12.322988 1.090716 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TATACATGCAATGAATTGCC -30 TRUE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 46 NA PB.432.3 chr1 + 1655 4 full-splice_match PIGV ENST00000674222.1 4377 4 -17 2739 0 113 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TCTGCTGCCCTGGGATCATT -28 TRUE NA NA AGTAAA -20 NA NA NA 9 NA PB.432.4 chr1 + 2203 5 novel_not_in_catalog PIGV novel 4377 4 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 CAATGAATTGCCTTTTTAAA -26 TRUE NA NA ATTAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.432.5 chr1 + 1299 3 incomplete-splice_match PIGV ENST00000687468.1 2247 4 -15 3311 0 -740 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATGTCTACTGGAATGTTGGC -26 TRUE NA NA AATATA -15 NA NA NA 2 NA PB.432.6 chr1 + 2293 4 full-splice_match PIGV ENST00000688522.1 2396 4 15 88 1 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.018365 0.604049 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATGCGACATTGTTTCTGA -13 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 15 NA PB.432.7 chr1 + 1558 5 novel_not_in_catalog PIGV novel 4377 4 NA NA 0 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 CAATGAATTGCCTTTTTAAA -11 TRUE NA NA ATTAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.432.8 chr1 + 2380 4 full-splice_match PIGV ENST00000688522.1 2396 4 31 -15 3 3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.214692 0.507139 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATGCAATGAATTGCCTTTTT 3 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 12 NA PB.432.9 chr1 + 2722 4 full-splice_match PIGV ENST00000674273.1 4972 4 -10 2260 8 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TATACATGCAATGAATTGCC -9 TRUE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 5 NA PB.432.10 chr1 + 2067 4 full-splice_match PIGV ENST00000688522.1 2396 4 241 88 -4 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATGCGACATTGTTTCTGA -3 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 7 NA PB.432.11 chr1 + 2274 4 full-splice_match PIGV ENST00000374145.6 2181 4 40 -133 22 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AATGAATTGCCTTTTTAAAA 23 TRUE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.432.12 chr1 + 1728 2 incomplete-splice_match PIGV ENST00000674317.1 2245 4 4937 1 4937 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACATTGTTTCTGATGTTTTT 6052 FALSE NA NA AATAAA -25 NA NA NA 2 NA PB.432.13 chr1 + 1634 2 incomplete-splice_match PIGV ENST00000674317.1 2245 4 5131 -99 5131 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AATGAATTGCCTTTTTAAAA 6246 FALSE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.432.14 chr1 + 1219 2 incomplete-splice_match PIGV ENST00000674317.1 2245 4 5439 8 5439 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATGCGACATTGTTTCTGA 6554 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.432.15 chr1 + 1158 2 incomplete-splice_match PIGV ENST00000674317.1 2245 4 5599 -91 5599 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATACATGCAATGAATTGCCT 6714 FALSE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.433.1 chr1 + 3153 8 full-splice_match ZDHHC18 ENST00000374142.9 5045 8 0 1892 0 1749 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAAGAGTTGCTTTGCTTTGG -23 TRUE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.433.2 chr1 + 2900 8 full-splice_match ZDHHC18 ENST00000374142.9 5045 8 254 1891 254 1750 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGAGTTGCTTTGCTTTGGT 0 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.433.3 chr1 + 2575 7 incomplete-splice_match ZDHHC18 ENST00000374141.6 1002 8 570 -1750 554 1750 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGAGTTGCTTTGCTTTGGT 523 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.433.4 chr1 + 2392 5 incomplete-splice_match ZDHHC18 ENST00000488397.3 1275 7 -62 1889 -62 1750 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGAGTTGCTTTGCTTTGGT NA FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 7 NA PB.433.5 chr1 + 2149 3 incomplete-splice_match ZDHHC18 ENST00000488397.3 1275 7 822 1889 55 1750 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGAGTTGCTTTGCTTTGGT NA FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 3 NA PB.435.1 chr1 - 1943 4 incomplete-splice_match GPN2 ENST00000374135.9 4665 5 37 3245 14 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TTGTGACTTCCAAACTTTTC 31 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.435.2 chr1 - 1436 5 novel_not_in_catalog GPN2 novel 4665 5 NA NA 9 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTTTTTGTGACTTCCAAAC 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.435.3 chr1 - 1415 5 full-splice_match GPN2 ENST00000374135.9 4665 5 0 3250 0 -6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 146 39.112091 1.592311 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTTTTTGTGACTTCCAAAC -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 146 NA PB.435.4 chr1 - 1175 5 full-splice_match GPN2 ENST00000374135.9 4665 5 240 3250 217 -6 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTTTTTGTGACTTCCAAAC 283 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.435.5 chr1 - 1292 5 full-splice_match GPN2 ENST00000374135.9 4665 5 122 3251 99 -7 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TACTTTTTGTGACTTCCAAA 9900 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.435.6 chr1 - 1058 5 novel_not_in_catalog GPN2 novel 4665 5 NA NA 363 -7 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TACTTTTTGTGACTTCCAAA 429 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.436.1 chr1 - 2122 7 full-splice_match GPATCH3 ENST00000361720.10 2125 7 2 1 2 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 72 19.288155 1.285291 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTCCCTTACTTTTCTAAT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 72 NA PB.436.2 chr1 - 1316 6 incomplete-splice_match GPATCH3 ENST00000361720.10 2125 7 3074 1 3074 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTCCCTTACTTTTCTAAT 3063 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.436.3 chr1 - 894 3 full-splice_match GPATCH3 ENST00000450844.1 521 3 195 -568 195 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTCCCTTACTTTTCTAAT 7759 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.436.4 chr1 - 1598 6 incomplete-splice_match GPATCH3 ENST00000361720.10 2125 7 2791 2 2791 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAGCTCCCTTACTTTTCTAA 2780 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.436.5 chr1 - 1753 7 full-splice_match GPATCH3 ENST00000361720.10 2125 7 369 3 369 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GGAGCTCCCTTACTTTTCTA 358 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.437.2 chr1 + 1308 1 full-splice_match SFN ENST00000339276.6 1308 1 0 0 0 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 364 97.512337 1.989060 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTCCTGTCTCTCTTCCAGTT 0 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 364 NA PB.437.5 chr1 + 1044 1 full-splice_match SFN ENST00000339276.6 1308 1 264 0 264 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTCCTGTCTCTCTTCCAGTT 264 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 6 NA PB.438.1 chr1 - 1164 2 full-splice_match NR0B2 ENST00000254227.4 1165 2 3 -2 3 2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 165 44.202023 1.645442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GGAGCCTGATACTGTCATTT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 165 NA PB.438.2 chr1 - 1479 2 novel_not_in_catalog NR0B2 novel 1165 2 NA NA -2 -6 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.018365 0.604049 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACACTTGGAGCCTGATAC -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.439.1 chr1 + 1337 9 full-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 -19 474 -19 213 alternative_3end TRUE canonical NA NA NA NA 2315 620.167725 2.792509 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTCTGTGTCCTCTCTTGCC -31 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 2315 NA PB.439.2 chr1 + 1513 7 novel_in_catalog NUDC novel 1792 9 NA NA -9 213 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTCTGTGTCCTCTCTTGCC -21 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.439.3 chr1 + 1050 7 novel_in_catalog NUDC novel 1792 9 NA NA -3 212 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CCTTCTGTGTCCTCTCTTGC -15 TRUE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.439.4 chr1 + 1800 9 full-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 2 -10 2 10 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 112 30.003796 1.477176 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TATGTATGTTTCTGAGCAAA -10 TRUE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 112 NA PB.439.5 chr1 + 1312 9 novel_not_in_catalog NUDC novel 1792 9 NA NA 0 213 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTCTGTGTCCTCTCTTGCC -12 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.439.6 chr1 + 1759 8 incomplete-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 2 474 2 213 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTCTGTGTCCTCTCTTGCC -10 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.439.7 chr1 + 1410 8 novel_in_catalog NUDC novel 1792 9 NA NA 2 213 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTCTGTGTCCTCTCTTGCC -10 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 5 NA PB.439.8 chr1 + 1486 10 novel_not_in_catalog NUDC novel 1792 9 NA NA 2 212 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 55 14.734007 1.168321 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CCTTCTGTGTCCTCTCTTGC -10 TRUE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 55 NA PB.439.9 chr1 + 1428 9 novel_not_in_catalog NUDC novel 1792 9 NA NA 2 214 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TTCTGTGTCCTCTCTTGCCT -10 TRUE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.439.10 chr1 + 1004 7 novel_in_catalog NUDC novel 1792 9 NA NA 2 213 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTCTGTGTCCTCTCTTGCC -10 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 5 NA PB.439.11 chr1 + 1491 9 full-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 6 295 6 -295 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGTGATGGTTCATGTCTGTA -6 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 9 NA PB.439.12 chr1 + 1401 8 novel_in_catalog NUDC novel 1792 9 NA NA 9 213 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTCTGTGTCCTCTCTTGCC -3 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.439.13 chr1 + 1397 8 novel_in_catalog NUDC novel 1792 9 NA NA 13 211 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TCCTTCTGTGTCCTCTCTTG 1 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.439.14 chr1 + 1251 9 full-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 68 473 68 214 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 60 16.073462 1.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TTCTGTGTCCTCTCTTGCCT 0 TRUE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 60 NA PB.439.15 chr1 + 928 7 novel_in_catalog NUDC novel 1792 9 NA NA 77 212 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CCTTCTGTGTCCTCTCTTGC 9 FALSE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 4 NA PB.439.16 chr1 + 1349 10 novel_not_in_catalog NUDC novel 1792 9 NA NA 140 213 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTCTGTGTCCTCTCTTGCC 72 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.439.17 chr1 + 1562 9 novel_in_catalog NUDC novel 816 5 NA NA -82 211 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TCCTTCTGTGTCCTCTCTTG 249 FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.439.18 chr1 + 1534 8 incomplete-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 2393 24 1994 -24 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAATAAATAAATAAAA 2325 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.439.21 chr1 + 944 7 incomplete-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 19823 474 -3569 213 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 27 7.233058 0.859322 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTCTGTGTCCTCTCTTGCC 5357 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 27 NA PB.439.22 chr1 + 1322 7 incomplete-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 19895 24 -3497 -24 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAATAAATAAATAAAA 5429 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.439.23 chr1 + 1338 6 incomplete-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 20006 -11 -3386 11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATGTATGTTTCTGAGCAAAG 5540 FALSE NA NA AATAAA -25 NA NA NA 2 NA PB.439.24 chr1 + 840 6 incomplete-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 20019 474 -3373 213 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTCTGTGTCCTCTCTTGCC 5553 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 6 NA PB.439.25 chr1 + 1195 5 incomplete-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 20955 24 -2437 -24 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAATAAATAAATAAAA 6489 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.439.26 chr1 + 1015 4 incomplete-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 21229 24 -2163 -24 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAATAAATAAATAAAA 6763 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.439.27 chr1 + 471 3 incomplete-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 23647 474 255 213 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTCTGTGTCCTCTCTTGCC 9 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.440.1 chr1 - 1774 4 full-splice_match KDF1 ENST00000320567.6 1855 4 72 9 72 -9 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 33 8.840405 0.946472 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CAAAGGTAATTGGTATCTGC 48 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 33 NA PB.440.2 chr1 - 2326 3 novel_in_catalog KDF1 novel 1855 4 NA NA 58 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTGGTATCTGCCTGCTTTC 34 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.440.3 chr1 - 1878 5 novel_not_in_catalog KDF1 novel 1855 4 NA NA 18 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTGGTATCTGCCTGCTTT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.440.4 chr1 - 1824 4 novel_not_in_catalog KDF1 novel 1855 4 NA NA -30 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTGGTATCTGCCTGCTTT NA FALSE NA NA GGGGCT -27 NA NA NA 2 NA PB.440.6 chr1 - 1434 3 incomplete-splice_match KDF1 ENST00000320567.6 1855 4 8347 11 8347 -11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TACAAAGGTAATTGGTATCT 8323 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.441.3 chr1 - 2378 2 full-splice_match TENT5B ENST00000289166.6 2382 2 1 3 1 -3 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 21 5.625712 0.750178 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAACCTTAGTGCCATGCTTC 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 21 NA PB.443.1 chr1 + 4280 16 full-splice_match WDTC1 ENST00000319394.8 4706 16 31 395 -5 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGGTGTGGCTGGTGGCATTT 22 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 6 NA PB.443.2 chr1 + 3993 15 incomplete-splice_match WDTC1 ENST00000319394.8 4706 16 26321 396 -95 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TAGGTGTGGCTGGTGGCATT NA FALSE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 4 NA PB.443.3 chr1 + 3017 7 incomplete-splice_match WDTC1 ENST00000361771.7 4275 16 61656 4 8615 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TAGGTGTGGCTGGTGGCATT NA FALSE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.443.4 chr1 + 2862 6 incomplete-splice_match WDTC1 ENST00000361771.7 4275 16 62461 3 -7885 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGGTGTGGCTGGTGGCATTT NA FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.443.5 chr1 + 3358 5 novel_not_in_catalog WDTC1 novel 628 3 NA NA -5308 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGGTGTGGCTGGTGGCATTT NA FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.443.6 chr1 + 2661 4 incomplete-splice_match WDTC1 ENST00000361771.7 4275 16 66557 3 -3789 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGGTGTGGCTGGTGGCATTT NA FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 6 NA PB.443.7 chr1 + 2468 4 incomplete-splice_match WDTC1 ENST00000361771.7 4275 16 66749 4 -3597 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TAGGTGTGGCTGGTGGCATT NA FALSE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.443.8 chr1 + 2353 3 incomplete-splice_match WDTC1 ENST00000361771.7 4275 16 69026 1 -1320 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GTGTGGCTGGTGGCATTTGT NA FALSE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.443.9 chr1 + 2224 2 incomplete-splice_match WDTC1 ENST00000472249.2 628 3 11 -1350 11 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TAGGTGTGGCTGGTGGCATT NA FALSE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.444.1 chr1 + 1519 6 novel_not_in_catalog TMEM222 novel 1613 6 NA NA -17 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTGGTGCCCTGTCATTGT -41 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.444.2 chr1 + 1513 6 full-splice_match TMEM222 ENST00000608611.5 1511 6 -3 1 -2 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 202 54.113991 1.733310 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTGGTGCCCTGTCATTGT -26 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 202 NA PB.444.4 chr1 + 1316 2 novel_not_in_catalog TMEM222 novel 368 4 NA NA 1 -6034 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAGGGAAAAAAAAG -16 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 6 NA PB.444.5 chr1 + 1711 8 full-splice_match TMEM222 ENST00000486082.5 994 8 34 -751 3 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTGGTGCCCTGTCATTGT 17 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.444.6 chr1 + 1558 7 full-splice_match TMEM222 ENST00000478104.5 986 7 3 -575 3 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTGGTGCCCTGTCATTGT 17 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.444.7 chr1 + 1621 7 full-splice_match TMEM222 ENST00000464720.5 1665 7 43 1 5 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTGGTGCCCTGTCATTGT 19 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 9 NA PB.444.8 chr1 + 3321 5 novel_in_catalog TMEM222 novel 1613 6 NA NA -7 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTGGTGCCCTGTCATTGT 22 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.444.9 chr1 + 2562 5 full-splice_match TMEM222 ENST00000464813.5 1071 5 12 -1503 -7 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTGGTGCCCTGTCATTGT 22 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.444.10 chr1 + 942 1 full-splice_match ACTG1P20 ENST00000486001.1 468 1 255 -729 255 729 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA NA NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAGGGAAAAAAAAG 135 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.444.12 chr1 + 1308 5 incomplete-splice_match TMEM222 ENST00000608611.5 1511 6 8530 1 -1568 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTGGTGCCCTGTCATTGT 4456 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 9 NA PB.444.13 chr1 + 1259 4 incomplete-splice_match TMEM222 ENST00000478104.5 986 7 11751 -575 573 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTGGTGCCCTGTCATTGT 7714 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.444.14 chr1 + 1099 2 incomplete-splice_match TMEM222 ENST00000471456.1 2861 3 1858 0 741 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTGGTGCCCTGTCATTGT 7882 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 5 NA PB.445.1 chr1 - 2219 4 incomplete-splice_match SLC9A1 ENST00000374089.5 3165 7 1798 -5 571 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTCAAGGGCTGCTTTCTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.445.2 chr1 - 4770 12 full-splice_match SLC9A1 ENST00000263980.8 4737 12 -39 6 -39 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAGAGTCAAGGGCTGCTT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.445.3 chr1 - 3250 11 incomplete-splice_match SLC9A1 ENST00000263980.8 4737 12 41177 6 -9926 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAGAGTCAAGGGCTGCTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.445.4 chr1 - 2659 8 incomplete-splice_match SLC9A1 ENST00000263980.8 4737 12 49037 6 -2066 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAGAGTCAAGGGCTGCTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.445.5 chr1 - 2458 7 full-splice_match SLC9A1 ENST00000374089.5 3165 7 707 0 -520 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAGAGTCAAGGGCTGCTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.445.6 chr1 - 2259 5 incomplete-splice_match SLC9A1 ENST00000374089.5 3165 7 1499 0 272 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAGAGTCAAGGGCTGCTT NA FALSE NA NA ATTAAA -26 NA NA NA 3 NA PB.445.7 chr1 - 2140 5 incomplete-splice_match SLC9A1 ENST00000374089.5 3165 7 1618 0 391 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAGAGTCAAGGGCTGCTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.445.11 chr1 - 1957 3 incomplete-splice_match SLC9A1 ENST00000374089.5 3165 7 2243 1 1016 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAATAGAGTCAAGGGCTGCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.445.14 chr1 - 3420 11 incomplete-splice_match SLC9A1 ENST00000263980.8 4737 12 41005 8 -10098 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TTAATAGAGTCAAGGGCTGC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.446.1 chr1 + 2959 11 novel_in_catalog SYTL1 novel 2525 13 NA NA -1 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAAAAGGCTGGTGTCTGC -34 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.446.2 chr1 + 2648 12 novel_in_catalog SYTL1 novel 1936 15 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAAAAGGCTGGTGTCTGC -31 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.446.3 chr1 + 2472 13 novel_in_catalog SYTL1 novel 1936 15 NA NA -12 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAAAAGGCTGGTGTCTGC -8 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.446.4 chr1 + 1892 15 full-splice_match SYTL1 ENST00000616558.5 1936 15 42 2 7 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 41 10.983533 1.040742 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAAAAGGCTGGTGTCTGC 11 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 41 NA PB.446.5 chr1 + 2288 13 novel_not_in_catalog SYTL1 novel 1936 15 NA NA 13 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CAATAAAAGGCTGGTGTCTG 17 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.446.6 chr1 + 1428 12 incomplete-splice_match SYTL1 ENST00000543823.1 2229 14 2934 0 263 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAAAAGGCTGGTGTCTGC 2993 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.447.2 chr1 - 2334 17 incomplete-splice_match MAP3K6 ENST00000493901.6 3654 27 3523 -27 1484 3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTGTCCTGGCAATTTTGGAG 5706 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.447.3 chr1 - 2110 15 incomplete-splice_match MAP3K6 ENST00000493901.6 3654 27 3977 -27 1938 3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTGTCCTGGCAATTTTGGAG 6160 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.447.4 chr1 - 1636 11 incomplete-splice_match MAP3K6 ENST00000493901.6 3654 27 5918 -27 -1042 3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTGTCCTGGCAATTTTGGAG 8101 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.447.5 chr1 - 1020 8 incomplete-splice_match MAP3K6 ENST00000671291.1 3287 20 4995 -27 74 3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTGTCCTGGCAATTTTGGAG 9217 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.447.7 chr1 - 2543 20 incomplete-splice_match MAP3K6 ENST00000493901.6 3654 27 3015 -22 976 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCTTTGTCCTGGCAATTT 5198 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.447.8 chr1 - 1753 12 incomplete-splice_match MAP3K6 ENST00000493901.6 3654 27 5246 -22 -1714 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCTTTGTCCTGGCAATTT 7429 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.447.9 chr1 - 1175 9 incomplete-splice_match MAP3K6 ENST00000493901.6 3654 27 6569 -21 -391 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAACCTTTGTCCTGGCAATT 8752 FALSE NA NA GGGGCT -23 NA NA NA 2 NA PB.447.10 chr1 - 3348 25 incomplete-splice_match MAP3K6 ENST00000493901.6 3654 27 710 -20 710 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGAACCTTTGTCCTGGCAAT 2893 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.448.1 chr1 + 2132 2 full-splice_match GPR3 ENST00000374024.4 2137 2 2 3 2 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATGTTTCCCTATGTGT -2 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 10 NA PB.449.14 chr1 - 4099 8 incomplete-splice_match WASF2 ENST00000618852.5 5681 9 61232 1402 61116 -1402 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA AAAAAG -44 NA NA NA 2 NA PB.449.16 chr1 - 3380 3 incomplete-splice_match WASF2 ENST00000618852.5 5681 9 77446 1402 77330 -1402 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 6284 FALSE NA NA AATGAA -34 NA NA NA 5 NA PB.449.33 chr1 - 3192 2 incomplete-splice_match WASF2 ENST00000618852.5 5681 9 79998 1403 79882 -1403 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 8836 FALSE NA NA ACTAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.449.35 chr1 - 2340 9 full-splice_match WASF2 ENST00000618852.5 5681 9 0 3341 0 626 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATGATGCCTTTCTGTA -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.449.36 chr1 - 1860 9 full-splice_match WASF2 ENST00000618852.5 5681 9 0 3821 0 146 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGATATATCCAAGTGCTT -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.449.37 chr1 - 741 5 incomplete-splice_match WASF2 ENST00000536657.1 1083 8 -95 7788 21 -7788 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 93 24.913866 1.396441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GTGAGGGGAAAGGGGCCTCT 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 93 NA PB.451.1 chr1 - 5855 8 novel_in_catalog AHDC1 novel 6428 9 NA NA -2 4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAAGACAAAAAAAAAAAA 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.451.2 chr1 - 2892 2 incomplete-splice_match AHDC1 ENST00000644989.1 6103 6 53563 408 3629 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAAGACAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.451.3 chr1 - 2808 2 incomplete-splice_match AHDC1 ENST00000644989.1 6103 6 53647 408 3713 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAAGACAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.451.4 chr1 - 1513 2 incomplete-splice_match AHDC1 ENST00000644989.1 6103 6 54942 408 5008 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAAGACAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.451.6 chr1 - 3601 2 incomplete-splice_match AHDC1 ENST00000644989.1 6103 6 52852 410 2918 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AGAAAAAGACAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.451.7 chr1 - 1232 2 incomplete-splice_match AHDC1 ENST00000644989.1 6103 6 55221 410 5287 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AGAAAAAGACAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.452.1 chr1 - 2472 13 full-splice_match FGR ENST00000399173.5 2483 13 4 7 4 1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACCATGAAATACCCTTGAA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.452.2 chr1 - 2475 13 novel_not_in_catalog FGR novel 2637 13 NA NA 521 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAACCATGAAATACCCTTGA 2547 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.452.3 chr1 - 2333 13 full-splice_match FGR ENST00000399173.5 2483 13 142 8 37 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAACCATGAAATACCCTTGA -13 TRUE NA NA GGGGCT -45 NA NA NA 4 NA PB.452.4 chr1 - 2065 10 novel_not_in_catalog FGR novel 2350 11 NA NA 827 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAACCATGAAATACCCTTGA 9676 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.452.5 chr1 - 1416 6 incomplete-splice_match FGR ENST00000374004.5 2350 11 8324 0 8324 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAACCATGAAATACCCTTGA 9494 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.452.6 chr1 - 2356 13 full-splice_match FGR ENST00000374005.8 2637 13 44 237 -7 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 CAAACCATGAAATACCCTTG -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.454.1 chr1 + 2050 9 full-splice_match FAM76A ENST00000373954.11 3579 9 14 1515 14 128 alternative_3end TRUE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TTATATCAGTTGTCATACTG 0 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.454.2 chr1 + 3474 8 full-splice_match FAM76A ENST00000373949.5 2273 8 -46 -1155 -14 3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAATTGTTGGATTTTGTTTT 7 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.454.3 chr1 + 1493 8 full-splice_match FAM76A ENST00000530324.5 1027 8 -46 -420 -14 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGATGTCTGAATTATAGATT 7 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.454.6 chr1 + 1287 2 novel_not_in_catalog FAM76A novel 1661 7 NA NA 2 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGTGTAATTGTTGGATTTT 23 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.455.1 chr1 + 1510 9 full-splice_match STX12 ENST00000373943.9 3034 9 -12 1536 -12 -1536 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTGGTCAGTTACTGGAGT -22 TRUE NA NA AGTAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.455.2 chr1 + 1270 9 novel_not_in_catalog STX12 novel 3034 9 NA NA -12 2258 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTTCGCCCACTTTTTGATGG -22 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.455.3 chr1 + 895 7 incomplete-splice_match STX12 ENST00000373943.9 3034 9 -12 6375 -12 -6 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 TAAAAAAGAAAGAAAGAAAG -22 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.455.4 chr1 + 2067 9 full-splice_match STX12 ENST00000373943.9 3034 9 0 967 0 -967 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAATGTTGTCCACTTCCCTT -10 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 6 NA PB.455.5 chr1 + 1943 9 full-splice_match STX12 ENST00000373943.9 3034 9 1 1090 1 -1090 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATAACACTGGTTTCAAAT -9 TRUE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 2 NA PB.455.6 chr1 + 2998 9 full-splice_match STX12 ENST00000373943.9 3034 9 33 3 -3 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.214692 0.507139 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATTCTCCTTATCTGTGCC 23 TRUE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 12 NA PB.455.7 chr1 + 2327 9 full-splice_match STX12 ENST00000373943.9 3034 9 33 674 -3 -674 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 36 9.644077 0.984261 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TTGTAGTATGTTTTTATGAG 23 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 36 NA PB.455.8 chr1 + 2855 9 full-splice_match STX12 ENST00000373943.9 3034 9 39 140 3 -140 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.946801 0.469351 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATACTGTGTGACCTGTGGT 29 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 11 NA PB.455.9 chr1 + 2265 9 full-splice_match STX12 ENST00000373943.9 3034 9 95 674 59 -674 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TTGTAGTATGTTTTTATGAG 85 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.455.10 chr1 + 2573 6 incomplete-splice_match STX12 ENST00000373943.9 3034 9 28549 -6 -8155 6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTATCTGTGCCTTGATTATC NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.455.12 chr1 + 1820 5 incomplete-splice_match STX12 ENST00000373943.9 3034 9 37046 680 18 -680 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCTTTTGTAGTATGTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 8 NA PB.455.13 chr1 + 1638 3 incomplete-splice_match STX12 ENST00000373943.9 3034 9 44688 675 7660 -675 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TTTGTAGTATGTTTTTATGA NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.455.14 chr1 + 1812 2 incomplete-splice_match STX12 ENST00000373943.9 3034 9 46240 675 9212 -675 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TTTGTAGTATGTTTTTATGA NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.456.1 chr1 + 2540 7 full-splice_match PPP1R8 ENST00000373931.8 2651 7 -35 146 5 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATTTGGGTGCAGGCTGTGA -13 TRUE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 3 NA PB.456.2 chr1 + 2169 7 full-splice_match PPP1R8 ENST00000311772.10 2340 7 22 149 -10 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 106 28.396450 1.453264 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTGGGTGCAGGCTGTGAA 4 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 106 NA PB.456.3 chr1 + 1015 7 full-splice_match PPP1R8 ENST00000311772.10 2340 7 29 1296 -3 -52 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAGAAGAAGAAATATGCAAA 11 TRUE NA NA AATGAA -4 NA NA NA 7 NA PB.456.4 chr1 + 2634 7 full-splice_match PPP1R8 ENST00000431586.1 1029 7 -510 -1095 0 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTGGGTGCAGGCTGTGAA 14 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 9 NA PB.456.5 chr1 + 2312 7 full-splice_match PPP1R8 ENST00000311772.10 2340 7 32 -4 0 4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AATGAGAGAATGTAGTCCCC 14 TRUE NA NA AATAAA -28 NA NA NA 7 NA PB.456.7 chr1 + 2081 7 novel_not_in_catalog PPP1R8 novel 2340 7 NA NA 0 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTGGGTGCAGGCTGTGAA 14 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.456.8 chr1 + 1942 6 novel_in_catalog PPP1R8 novel 2414 6 NA NA 0 3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GGGTGCAGGCTGTGAATTTG 14 TRUE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.456.11 chr1 + 2051 6 incomplete-splice_match PPP1R8 ENST00000373931.8 2651 7 1964 145 1462 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTGGGTGCAGGCTGTGAA 1986 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 5 NA PB.456.12 chr1 + 1866 4 incomplete-splice_match PPP1R8 ENST00000373931.8 2651 7 10192 145 -9079 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTGGGTGCAGGCTGTGAA 6612 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.456.13 chr1 + 1708 4 incomplete-splice_match PPP1R8 ENST00000373931.8 2651 7 10350 145 -8921 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTGGGTGCAGGCTGTGAA 154 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.456.14 chr1 + 1789 3 incomplete-splice_match PPP1R8 ENST00000373931.8 2651 7 12364 1 -6907 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 GGAAATTCTAATGAGAGAAT 2168 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.456.15 chr1 + 1575 3 incomplete-splice_match PPP1R8 ENST00000236412.11 2414 6 12441 2 -6838 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATTTGGGTGCAGGCTGTGA 2237 FALSE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 4 NA PB.457.1 chr1 - 834 5 full-splice_match IFI6 ENST00000361157.11 812 5 -30 8 -10 -6 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 130 34.825836 1.541902 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGAAAACACTTTGTCCTGCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 130 NA PB.457.2 chr1 - 818 5 full-splice_match IFI6 ENST00000362020.4 828 5 6 4 0 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.750474 0.574086 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAACACTTTGTCCTGCTGT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.457.3 chr1 - 666 4 incomplete-splice_match IFI6 ENST00000361157.11 812 5 2916 6 2902 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAACACTTTGTCCTGCTGT 35 TRUE NA NA AAGAAA -36 NA NA NA 4 NA PB.458.1 chr1 + 2742 6 full-splice_match THEMIS2 ENST00000373921.8 2713 6 -31 2 -30 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.286257 0.632078 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TATGAATGAGAACGGTATCA 9035 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 16 NA PB.458.2 chr1 + 1089 3 novel_in_catalog THEMIS2 novel 1082 4 NA NA -4 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TCTATGAATGAGAACGGTAT -10 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.458.3 chr1 + 2304 5 novel_in_catalog THEMIS2 novel 2713 6 NA NA 0 2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AATGAGAACGGTATCATTTA -5 TRUE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 2 NA PB.458.4 chr1 + 1638 5 full-splice_match THEMIS2 ENST00000373925.5 1650 5 0 12 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TATGAATGAGAACGGTATCA -5 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.458.5 chr1 + 1228 4 full-splice_match THEMIS2 ENST00000373927.7 1082 4 -5 -141 0 1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.946801 0.469351 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATGAATGAGAACGGTATCAT -5 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 11 NA PB.458.6 chr1 + 1884 3 incomplete-splice_match THEMIS2 ENST00000456990.1 1926 5 2394 -1 -1273 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATGAATGAGAACGGTATCAT 2472 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 4 NA PB.458.7 chr1 + 1397 3 incomplete-splice_match THEMIS2 ENST00000456990.1 1926 5 2884 -4 -783 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AATGAGAACGGTATCATTTA 40 FALSE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 2 NA PB.459.1 chr1 + 1938 7 full-splice_match SMPDL3B ENST00000373888.8 1548 7 -101 -289 -62 289 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAGTACTGAGAGAAGGGCTA NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.459.2 chr1 + 1754 7 full-splice_match SMPDL3B ENST00000373888.8 1548 7 -54 -152 -15 152 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ACAAAATGCATTAAGTGTGT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.459.3 chr1 + 1600 7 full-splice_match SMPDL3B ENST00000373888.8 1548 7 -53 1 -14 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCAAGGCTTCCCACAGTC -8 TRUE NA NA GATAAA -22 NA NA NA 5 NA PB.459.4 chr1 + 1864 8 full-splice_match SMPDL3B ENST00000373894.8 1866 8 0 2 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 20 5.357821 0.728988 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GATTCTGTGTTGTGTTCCTT 6 TRUE NA NA AAAACA -18 NA NA NA 20 NA PB.459.6 chr1 + 1647 8 full-splice_match SMPDL3B ENST00000373894.8 1866 8 216 3 106 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGATTCTGTGTTGTGTTCCT 75 FALSE NA NA AAAACA -17 NA NA NA 4 NA PB.460.1 chr1 - 1594 9 full-splice_match RPA2 ENST00000373912.8 1584 9 -25 15 -12 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 1052 281.821381 2.449974 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AGTAACTTGTAAAAATTCTC -33 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 1052 NA PB.460.2 chr1 - 1836 8 full-splice_match RPA2 ENST00000313433.11 1237 8 -65 -534 -3 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AGTAACTTGTAAAAATTCTC -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.460.3 chr1 - 1448 8 novel_in_catalog RPA2 novel 1584 9 NA NA 23 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.946801 0.469351 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAAAATTCTCGTTTTTCTT 15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.460.4 chr1 - 1396 7 novel_in_catalog RPA2 novel 1584 9 NA NA 0 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAAAATTCTCGTTTTTCTT -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.460.5 chr1 - 1056 5 incomplete-splice_match RPA2 ENST00000373912.8 1584 9 16925 6 -565 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAAAATTCTCGTTTTTCTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.460.6 chr1 - 1644 10 novel_not_in_catalog RPA2 novel 1584 9 NA NA 26 2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AACTTGTAAAAATTCTCGTT 18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.460.7 chr1 - 1547 9 full-splice_match RPA2 ENST00000373909.7 1162 9 3 -388 3 2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AACTTGTAAAAATTCTCGTT -10 TRUE NA NA AAGAAA -12 NA NA NA 9 NA PB.460.8 chr1 - 855 3 incomplete-splice_match RPA2 ENST00000373912.8 1584 9 20236 14 2746 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACTTGTAAAAATTCTCG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.460.9 chr1 - 1484 8 novel_in_catalog RPA2 novel 1584 9 NA NA 10 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 27 7.233058 0.859322 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AGTAACTTGTAAAAATTCTC 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 27 NA PB.460.10 chr1 - 1432 8 full-splice_match RPA2 ENST00000313433.11 1237 8 339 -534 339 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 19 5.089930 0.706712 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AGTAACTTGTAAAAATTCTC 559 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.460.11 chr1 - 1242 7 incomplete-splice_match RPA2 ENST00000373912.8 1584 9 7371 15 7309 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AGTAACTTGTAAAAATTCTC 7529 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.460.13 chr1 - 1719 9 novel_not_in_catalog RPA2 novel 1584 9 NA NA 0 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TAGTAACTTGTAAAAATTCT -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.460.14 chr1 - 1736 9 full-splice_match RPA2 ENST00000373912.8 1584 9 -168 16 3 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 32 8.572514 0.933108 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TAGTAACTTGTAAAAATTCT -10 TRUE NA NA AAGAAA -12 NA NA NA 32 NA PB.460.15 chr1 - 1124 10 novel_in_catalog RPA2 novel 1584 9 NA NA 4 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TAGTAACTTGTAAAAATTCT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.460.16 chr1 - 1030 4 incomplete-splice_match RPA2 ENST00000373912.8 1584 9 17452 16 -38 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.482584 0.541902 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TAGTAACTTGTAAAAATTCT NA FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 13 NA PB.460.17 chr1 - 1353 8 full-splice_match RPA2 ENST00000313433.11 1237 8 416 -532 416 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.750474 0.574086 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 GTAGTAACTTGTAAAAATTC 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.460.18 chr1 - 767 2 incomplete-splice_match RPA2 ENST00000373912.8 1584 9 20487 34 2997 -20 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AATAAAACAGTTCTATTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.461.1 chr1 - 6018 18 full-splice_match EYA3 ENST00000373871.8 5999 18 -18 -1 9 1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TTTGCTCCTGTGTCTTTTCT -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.461.9 chr1 - 792 4 incomplete-splice_match EYA3 ENST00000373864.5 2459 14 68298 603 21297 -603 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAATGAAAAAGAAAAGG NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.461.11 chr1 - 1752 16 incomplete-splice_match EYA3 ENST00000373871.8 5999 18 0 18134 0 1 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATGCACCTATTATTTTCTAG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.461.12 chr1 - 1617 15 incomplete-splice_match EYA3 ENST00000373863.3 1729 17 -49 11205 -3 1 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATGCACCTATTATTTTCTAG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.461.19 chr1 - 804 1 full-splice_match RN7SL559P ENST00000476501.3 297 1 -507 0 -507 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAGAAAAAAAAAATGTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.462.1 chr1 - 1805 2 full-splice_match PTAFR ENST00000373857.8 3993 2 0 2188 0 319 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA -9 TRUE NA NA AAGAAA -44 NA NA NA 2 NA PB.463.1 chr1 + 2171 3 full-splice_match XKR8 ENST00000373884.6 2178 3 7 0 7 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 33 8.840405 0.946472 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAACCTAGTCTGTGTCATCA -22 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 33 NA PB.463.2 chr1 + 1782 2 incomplete-splice_match XKR8 ENST00000373884.6 2178 3 3531 -1 3242 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACCTAGTCTGTGTCATCAA 3459 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.464.1 chr1 + 1884 2 full-splice_match ATP5IF1 ENST00000465645.1 1855 2 -30 1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 120 32.146923 1.507139 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAACTGTGTTTGATGCCTTC -15 TRUE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 120 NA PB.464.3 chr1 + 491 3 full-splice_match ATP5IF1 ENST00000335514.10 503 3 10 2 -8 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 31 8.304622 0.919320 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AACTGTGTTTGATGCCTTCT -5 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 31 NA PB.464.6 chr1 + 1793 2 full-splice_match ATP5IF1 ENST00000465645.1 1855 2 62 0 62 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AACTGTGTTTGATGCCTTCT 77 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 3 NA PB.465.2 chr1 + 3473 10 full-splice_match SESN2 ENST00000253063.4 3462 10 -13 2 -13 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACTCCCTTTTTATGGGCTG -10 TRUE NA NA AATAAA -23 NA NA NA 6 NA PB.465.8 chr1 + 1900 2 incomplete-splice_match SESN2 ENST00000253063.4 3462 10 19599 1 19599 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTCCCTTTTTATGGGCTGT NA FALSE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 3 NA PB.466.4 chr1 + 1846 3 full-splice_match MED18 ENST00000373842.9 1829 3 -23 6 15 -5 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAGACATGTCTGTGTAAT -40 TRUE NA NA AATAAA -8 NA NA NA 2 NA PB.466.7 chr1 + 1142 4 full-splice_match MED18 ENST00000398997.2 1106 4 -34 -2 19 1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATGTCTGTGTAATTCTGATT -36 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.466.9 chr1 + 1287 4 novel_not_in_catalog MED18 novel 1106 4 NA NA -8 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.625712 0.750178 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACATGTCTGTGTAATTCTGA -25 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 21 NA PB.466.10 chr1 + 1043 4 novel_not_in_catalog MED18 novel 1106 4 NA NA -3 1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATGTCTGTGTAATTCTGATT -20 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.467.1 chr1 - 1751 9 full-splice_match DNAJC8 ENST00000263697.6 1763 9 9 3 0 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 66 17.680809 1.247502 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAGCGTCCAGCTCACAGTC 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 66 NA PB.467.2 chr1 - 1661 8 novel_in_catalog DNAJC8 novel 1600 10 NA NA 0 -3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAGCGTCCAGCTCACAGTC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.467.3 chr1 - 1494 6 incomplete-splice_match DNAJC8 ENST00000263697.6 1763 9 22390 3 -1830 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAGCGTCCAGCTCACAGTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.467.4 chr1 - 1299 4 novel_not_in_catalog DNAJC8 novel 1763 9 NA NA 0 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAGCGTCCAGCTCACAGTC 21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.467.6 chr1 - 1375 5 incomplete-splice_match DNAJC8 ENST00000263697.6 1763 9 23012 4 -1208 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAGCGTCCAGCTCACAGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.467.7 chr1 - 1760 9 novel_in_catalog DNAJC8 novel 1600 10 NA NA 0 -5 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGAAAGCGTCCAGCTCACAG 21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.467.8 chr1 - 1875 10 full-splice_match DNAJC8 ENST00000489277.5 1600 10 0 -275 0 -6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATGAAAGCGTCCAGCTCACA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.467.10 chr1 - 3531 7 novel_in_catalog DNAJC8 novel 1600 10 NA NA 4 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.467.11 chr1 - 1591 10 full-splice_match DNAJC8 ENST00000489277.5 1600 10 9 0 4 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 35 9.376186 0.972026 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 35 NA PB.467.12 chr1 - 1495 9 novel_in_catalog DNAJC8 novel 1600 10 NA NA 5 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.750474 0.574086 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.467.13 chr1 - 1477 9 novel_not_in_catalog DNAJC8 novel 1600 10 NA NA 7 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC 12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.467.14 chr1 - 1488 9 full-splice_match DNAJC8 ENST00000263697.6 1763 9 -6 281 -6 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 1627 435.858704 2.639346 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 1627 NA PB.467.15 chr1 - 1381 8 novel_in_catalog DNAJC8 novel 1600 10 NA NA 0 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC 21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.467.16 chr1 - 1407 8 novel_in_catalog DNAJC8 novel 1600 10 NA NA -1 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.467.17 chr1 - 1394 8 novel_in_catalog DNAJC8 novel 1600 10 NA NA -4 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.467.18 chr1 - 1362 8 novel_in_catalog DNAJC8 novel 1600 10 NA NA 0 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC 21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.467.19 chr1 - 1377 8 novel_in_catalog DNAJC8 novel 1600 10 NA NA -1 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.467.20 chr1 - 1375 8 incomplete-splice_match DNAJC8 ENST00000489277.5 1600 10 4000 0 3979 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.625712 0.750178 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC 8907 FALSE NA NA ATTAAA -33 NA NA NA 21 NA PB.467.21 chr1 - 1269 7 incomplete-splice_match DNAJC8 ENST00000489277.5 1600 10 18031 0 -6185 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.554148 0.658407 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC NA FALSE NA NA AATAAA -6 NA NA NA 17 NA PB.467.22 chr1 - 1177 6 incomplete-splice_match DNAJC8 ENST00000489277.5 1600 10 22425 0 -1791 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 26 6.965167 0.842932 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 26 NA PB.467.23 chr1 - 1042 4 novel_not_in_catalog DNAJC8 novel 1600 10 NA NA 0 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 53 14.198225 1.152234 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 53 NA PB.467.24 chr1 - 1040 4 incomplete-splice_match DNAJC8 ENST00000489277.5 1600 10 24624 0 408 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 42 11.251424 1.051207 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC NA FALSE NA NA AAAAAG -31 NA NA NA 42 NA PB.467.25 chr1 - 910 3 incomplete-splice_match DNAJC8 ENST00000603289.5 483 5 71 1103 71 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.750474 0.574086 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.467.26 chr1 - 833 2 incomplete-splice_match DNAJC8 ENST00000603289.5 483 5 1583 1103 1583 0 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.467.28 chr1 - 1164 9 full-splice_match DNAJC8 ENST00000263697.6 1763 9 0 599 0 -318 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 147 39.379982 1.595276 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GTTGCTGTGACTTCAGAGAC -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 147 NA PB.467.29 chr1 - 722 4 novel_not_in_catalog DNAJC8 novel 1763 9 NA NA -2 -326 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAACAGTGTTGCTGTGACT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.468.5 chr1 + 2165 12 incomplete-splice_match PHACTR4 ENST00000373839.8 6048 14 -24 8576 6 -5368 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TACCTGGAAAGCACTCTCTT 20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.468.6 chr1 + 3258 15 novel_in_catalog PHACTR4 novel 3078 17 NA NA 9 -16 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 23 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.468.7 chr1 + 3385 14 full-splice_match PHACTR4 ENST00000373839.8 6048 14 -15 2678 -14 141 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG 29 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 5 NA PB.468.8 chr1 + 1993 10 incomplete-splice_match PHACTR4 ENST00000373839.8 6048 14 -15 11101 -14 -7893 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTTGTATGTTTCTGACTTTA 29 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.468.10 chr1 + 2264 14 novel_not_in_catalog PHACTR4 novel 3078 17 NA NA 1 -5368 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TACCTGGAAAGCACTCTCTT 45 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.468.17 chr1 + 1892 10 incomplete-splice_match PHACTR4 ENST00000373836.4 3107 13 21023 5515 21023 -5368 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TACCTGGAAAGCACTCTCTT 89 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.468.18 chr1 + 2889 10 incomplete-splice_match PHACTR4 ENST00000373836.4 3107 13 27599 -382 -25925 140 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 5502 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.468.19 chr1 + 2130 8 incomplete-splice_match PHACTR4 ENST00000373836.4 3107 13 35676 -383 -17848 141 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG NA FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.468.20 chr1 + 1779 8 incomplete-splice_match PHACTR4 ENST00000373836.4 3107 13 35869 -225 -17655 -17 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.468.21 chr1 + 1757 7 incomplete-splice_match PHACTR4 ENST00000373836.4 3107 13 38004 -383 -15520 141 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG NA FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.468.22 chr1 + 1584 6 incomplete-splice_match PHACTR4 ENST00000373836.4 3107 13 42336 -383 -11188 141 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG NA FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 4 NA PB.468.23 chr1 + 1395 4 incomplete-splice_match PHACTR4 ENST00000373836.4 3107 13 52815 -383 -709 141 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG NA FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 3 NA PB.470.1 chr1 + 942 3 full-splice_match SNHG3 ENST00000413987.1 2201 3 0 1259 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTTGTGGTTCATTTTTG NA FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 5 NA PB.470.2 chr1 + 910 3 novel_not_in_catalog SNHG3 novel 2201 3 NA NA 61 13 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTTTGTGGAGGTGGCTGT -6 TRUE NA NA AATAAA -23 NA NA NA 3 NA PB.470.3 chr1 + 1729 13 full-splice_match RCC1 ENST00000683442.1 2551 13 -1 823 -1 2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTTCCTCCTCTTTGGAATTT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.470.4 chr1 + 2545 13 full-splice_match RCC1 ENST00000683442.1 2551 13 0 6 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC -4 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 6 NA PB.470.5 chr1 + 2402 12 full-splice_match RCC1 ENST00000398958.6 2715 12 100 213 0 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC -4 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.470.6 chr1 + 2136 3 full-splice_match SNHG3 ENST00000413987.1 2201 3 63 2 63 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACCAGTGGTTTTAGTATGT -4 TRUE NA NA AGTAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.470.7 chr1 + 1237 4 novel_not_in_catalog SNHG3 novel 2201 3 NA NA 63 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAACCAGTGGTTTTAGTATG -4 TRUE NA NA AGTAAA -14 NA NA NA 6 NA PB.470.8 chr1 + 987 4 novel_not_in_catalog SNHG3 novel 2201 3 NA NA 63 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTTGTGGTTCATTTTTG -4 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 2 NA PB.470.9 chr1 + 879 3 full-splice_match SNHG3 ENST00000413987.1 2201 3 63 1259 63 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 156 41.791000 1.621083 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTTGTGGTTCATTTTTG -4 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 156 NA PB.470.10 chr1 + 2511 12 novel_in_catalog RCC1 novel 2551 13 NA NA 1 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC -3 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.470.11 chr1 + 1547 2 incomplete-splice_match SNHG3 ENST00000413987.1 2201 3 64 1259 64 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.946801 0.469351 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTTGTGGTTCATTTTTG -3 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 11 NA PB.470.12 chr1 + 845 2 novel_in_catalog SNHG3 novel 2201 3 NA NA 64 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.554148 0.658407 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTTGTGGTTCATTTTTG -3 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 17 NA PB.470.13 chr1 + 3589 1 full-splice_match SNORA73A ENST00000364938.1 206 1 -1321 -2062 -1321 2062 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA NA NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTTGTGGTTCATTTTTG -2 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 6 NA PB.470.14 chr1 + 2450 13 novel_in_catalog RCC1 novel 2686 14 NA NA 2 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAAATAGGCCACTTGTTTT -2 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.470.16 chr1 + 1328 1 full-splice_match SNORA73B ENST00000363217.1 204 1 -254 -870 -254 870 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA NA NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CATGTTTGTGGTTCATTTTT 119 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.470.17 chr1 + 2490 12 novel_in_catalog RCC1 novel 2686 14 NA NA -1217 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAAATAGGCCACTTGTTTT 299 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.470.22 chr1 + 2346 10 incomplete-splice_match RCC1 ENST00000683442.1 2551 13 10728 8 -1365 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATAAAATAGGCCACTTGTTT 4773 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.470.23 chr1 + 2409 10 full-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 115 -100 -6 94 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 309 82.778328 1.917917 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGTTGAGGCTACAACTTAAG 9 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 309 NA PB.470.24 chr1 + 2550 9 novel_in_catalog RCC1 novel 2424 10 NA NA -12 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC 3 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.470.25 chr1 + 2483 11 novel_in_catalog RCC1 novel 1577 11 NA NA -12 -96 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGTGATGTCAAGATGTCCT 3 TRUE NA NA AATAAA -30 NA NA NA 2 NA PB.470.26 chr1 + 2402 11 full-splice_match RCC1 ENST00000373831.7 1577 11 -6 -819 -6 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC 9 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 10 NA PB.470.27 chr1 + 2390 11 novel_in_catalog RCC1 novel 1577 11 NA NA -5 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATAAAATAGGCCACTTGTTT 10 TRUE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.470.28 chr1 + 1607 11 novel_in_catalog RCC1 novel 1577 11 NA NA -5 67 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGGAACATGGCTCACTC 10 TRUE NA NA AATAAA -25 NA NA NA 7 NA PB.470.29 chr1 + 2356 11 novel_in_catalog RCC1 novel 1577 11 NA NA -2 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 54 14.466116 1.160352 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC 13 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 54 NA PB.470.30 chr1 + 2181 9 novel_in_catalog RCC1 novel 2424 10 NA NA 2 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC 17 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 5 NA PB.470.31 chr1 + 1537 10 full-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 135 752 5 67 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.893603 0.770381 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGGAACATGGCTCACTC -10 TRUE NA NA AATAAA -25 NA NA NA 22 NA PB.470.32 chr1 + 2481 10 full-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 154 -211 24 -2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGAATTTTGTTTGGGTATTT 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.470.35 chr1 + 2170 8 incomplete-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 13666 0 -133 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.018365 0.604049 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 15 NA PB.470.36 chr1 + 1335 8 incomplete-splice_match RCC1 ENST00000373831.7 1577 11 13563 -2 -115 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTTCCTCCTCTTTGGAATTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.470.37 chr1 + 2055 8 incomplete-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 13781 0 -18 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.822039 0.683231 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 18 NA PB.470.38 chr1 + 1925 7 incomplete-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 14091 0 292 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.482584 0.541902 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 13 NA PB.470.39 chr1 + 1793 6 incomplete-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 16922 0 -1035 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 19 5.089930 0.706712 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 19 NA PB.470.40 chr1 + 1710 5 incomplete-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 17116 0 -841 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.286257 0.632078 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 16 NA PB.470.41 chr1 + 1539 4 incomplete-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 17777 0 -180 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.286257 0.632078 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 16 NA PB.470.42 chr1 + 1346 3 full-splice_match RCC1 ENST00000478232.1 509 3 248 -1085 248 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 23 6.161494 0.789686 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 23 NA PB.470.43 chr1 + 1520 2 incomplete-splice_match RCC1 ENST00000478232.1 509 3 652 -1298 652 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTTTGTTTGGGTATTTCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.470.44 chr1 + 1185 2 incomplete-splice_match RCC1 ENST00000478232.1 509 3 774 -1085 774 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 25 6.697276 0.825898 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 25 NA PB.472.1 chr1 + 1087 9 full-splice_match TRNAU1AP ENST00000373830.4 1799 9 -97 809 -97 -8 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAATGACTGTTTTTGGAG NA FALSE NA NA TTTAAA -41 NA NA NA 7 NA PB.472.2 chr1 + 1875 9 full-splice_match TRNAU1AP ENST00000373830.4 1799 9 -77 1 -77 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTAGTCTTTTTATTCTTCT -6 TRUE NA NA AATATA -6 NA NA NA 3 NA PB.472.3 chr1 + 1196 10 novel_in_catalog TRNAU1AP novel 1132 10 NA NA -56 -8 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATCATGAATGTTTCTACAAC 15 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.472.4 chr1 + 1151 10 full-splice_match TRNAU1AP ENST00000480930.5 1132 10 -4 -15 -2 -5 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATGAATGTTTCTACAACACT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.472.5 chr1 + 1032 9 full-splice_match TRNAU1AP ENST00000373830.4 1799 9 15 752 1 18 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 94 25.181757 1.401086 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACCATTTGAGTTTGAAGACC 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 94 NA PB.472.6 chr1 + 1785 9 full-splice_match TRNAU1AP ENST00000373830.4 1799 9 12 2 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TATTAGTCTTTTTATTCTTC 2 TRUE NA NA AATATA -5 NA NA NA 10 NA PB.472.7 chr1 + 1297 10 novel_not_in_catalog TRNAU1AP novel 1132 10 NA NA 1 -5 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATGAATGTTTCTACAACACT 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.472.8 chr1 + 849 8 novel_in_catalog TRNAU1AP novel 1799 9 NA NA 1 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACACTGCTGCATTCATTTG 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.472.9 chr1 + 1050 9 novel_in_catalog TRNAU1AP novel 1008 8 NA NA -1 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACACTGCTGCATTCATTTG 137 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.474.1 chr1 - 2090 3 novel_in_catalog SNHG12 novel 1800 4 NA NA 1 20 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAAAGAAGAATAAAAAG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.474.2 chr1 - 1626 4 full-splice_match SNHG12 ENST00000461448.6 1644 4 -15 33 1 20 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAAAGAAGAATAAAAAG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.474.3 chr1 - 1433 2 incomplete-splice_match SNHG12 ENST00000464612.5 719 4 155 33 155 20 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAAAGAAGAATAAAAAG 1014 FALSE NA NA GATAAA -25 NA NA NA 2 NA PB.474.4 chr1 - 1174 7 novel_not_in_catalog SNHG12 novel 1871 6 NA NA 23 20 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAAAGAAGAATAAAAAG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.474.5 chr1 - 1168 2 incomplete-splice_match SNHG12 ENST00000650259.1 389 3 -405 -20 -405 20 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAAAGAAGAATAAAAAG 1279 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.474.6 chr1 - 1068 5 full-splice_match SNHG12 ENST00000470977.6 1104 5 3 33 -2 20 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAAAGAAGAATAAAAAG -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.474.7 chr1 - 1048 5 full-splice_match SNHG12 ENST00000461832.2 1082 5 1 33 1 20 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 24 6.429385 0.808169 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAAAGAAGAATAAAAAG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 24 NA PB.474.8 chr1 - 1101 3 full-splice_match SNHG12 ENST00000474814.1 1903 3 770 32 -91 20 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAAAGAAGAATAAAAAG 768 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.474.9 chr1 - 960 5 novel_in_catalog SNHG12 novel 1871 6 NA NA -21 20 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAAAGAAGAATAAAAAG 225 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.474.10 chr1 - 1030 2 incomplete-splice_match SNHG12 ENST00000650259.1 389 3 -267 -20 -267 20 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAAAGAAGAATAAAAAG 1417 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.474.11 chr1 - 940 5 full-splice_match SNHG12 ENST00000461832.2 1082 5 109 33 54 20 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAAAGAAGAATAAAAAG 105 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.476.1 chr1 + 1965 10 full-splice_match GMEB1 ENST00000361872.8 1894 10 -50 -21 -50 21 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 15 4.018365 0.604049 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAAAATGTTGGGTTCTTCCC -1 TRUE NA NA TTTAAA -32 NA NA NA 15 NA PB.476.2 chr1 + 1924 10 full-splice_match GMEB1 ENST00000294409.2 1912 10 -12 0 -10 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAAACAAAATC -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.476.3 chr1 + 1613 7 incomplete-splice_match GMEB1 ENST00000480454.1 2063 9 7989 192 7989 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAAACAAAATC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.476.4 chr1 + 1301 5 incomplete-splice_match GMEB1 ENST00000480454.1 2063 9 13414 192 13414 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAAACAAAATC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.476.5 chr1 + 1151 4 incomplete-splice_match GMEB1 ENST00000480454.1 2063 9 18917 192 18917 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAAACAAAATC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.476.6 chr1 + 869 2 incomplete-splice_match GMEB1 ENST00000480454.1 2063 9 27011 192 27011 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAAACAAAATC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.477.1 chr1 - 1419 6 full-splice_match TAF12 ENST00000263974.4 1359 6 -58 -2 0 2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGACAGGGTACCTTTGAA -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.477.2 chr1 - 1055 6 full-splice_match TAF12 ENST00000689843.1 1099 6 41 3 39 2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGACAGGGTACCTTTGAA 5304 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.477.3 chr1 - 787 5 incomplete-splice_match TAF12 ENST00000263974.4 1359 6 21063 -2 291 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGACAGGGTACCTTTGAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.477.4 chr1 - 1122 6 full-splice_match TAF12 ENST00000373824.9 1335 6 -37 250 0 1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 312 83.582001 1.922113 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GAAAGACAGGGTACCTTTGA -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 312 NA PB.477.5 chr1 - 829 5 full-splice_match TAF12 ENST00000691050.1 785 5 -48 4 0 1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GAAAGACAGGGTACCTTTGA -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.477.6 chr1 - 922 6 full-splice_match TAF12 ENST00000373824.9 1335 6 -2 415 -2 -38 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 28 7.500949 0.875116 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AATATGGGACAAAGCATTAT -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 28 NA PB.479.1 chr1 + 2409 5 full-splice_match YTHDF2 ENST00000373812.8 2744 5 -319 654 0 -4 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.479.2 chr1 + 2222 5 full-splice_match YTHDF2 ENST00000373812.8 2744 5 -132 654 -132 -4 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 59 15.805572 1.198810 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 59 NA PB.479.3 chr1 + 2094 5 full-splice_match YTHDF2 ENST00000373812.8 2744 5 -4 654 -4 -4 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 403 107.960091 2.033263 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 403 NA PB.479.4 chr1 + 2597 4 full-splice_match YTHDF2 ENST00000478283.5 2594 4 -7 4 3 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.214692 0.507139 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.479.5 chr1 + 2060 4 full-splice_match YTHDF2 ENST00000541996.5 2719 4 5 654 5 -4 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.479.6 chr1 + 2732 5 full-splice_match YTHDF2 ENST00000373812.8 2744 5 11 1 1 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 20 5.357821 0.728988 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCTAGTACCATTTAGTA 0 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 20 NA PB.479.8 chr1 + 1350 5 novel_not_in_catalog YTHDF2 novel 2825 6 NA NA 1 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCTAGTACCATTTAGTA 0 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.479.9 chr1 + 1148 4 novel_in_catalog YTHDF2 novel 2825 6 NA NA 1 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 41 10.983533 1.040742 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCTAGTACCATTTAGTA 0 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 41 NA PB.479.10 chr1 + 1904 5 full-splice_match YTHDF2 ENST00000373812.8 2744 5 186 654 161 -4 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.946801 0.469351 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA 31 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.479.11 chr1 + 1904 4 novel_in_catalog YTHDF2 novel 358 3 NA NA 1 -4 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA 656 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.479.12 chr1 + 1771 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000478283.5 2594 4 5459 4 3318 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA 4317 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.479.13 chr1 + 1625 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000478283.5 2594 4 5605 4 3464 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA 4463 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.479.14 chr1 + 1430 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000478283.5 2594 4 5800 4 3659 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.946801 0.469351 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA 4658 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.479.15 chr1 + 1235 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000478283.5 2594 4 5995 4 3854 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.893603 0.770381 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA 4853 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 22 NA PB.479.16 chr1 + 1742 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000373812.8 2744 5 6151 1 4000 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCTAGTACCATTTAGTA 4999 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.479.17 chr1 + 1070 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000478283.5 2594 4 6160 4 4019 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.946801 0.469351 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA 5018 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.479.18 chr1 + 851 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000478283.5 2594 4 6379 4 4238 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA 5237 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.479.19 chr1 + 1497 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000373812.8 2744 5 6395 2 4244 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CACTTCTAGTACCATTTAGT 5243 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.479.20 chr1 + 1396 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000373812.8 2744 5 6497 1 4346 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCTAGTACCATTTAGTA 5345 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 5 NA PB.479.21 chr1 + 652 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000478283.5 2594 4 6578 4 4437 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA 5436 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.479.22 chr1 + 1217 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000373812.8 2744 5 6676 1 4525 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.482584 0.541902 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCTAGTACCATTTAGTA 5524 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 13 NA PB.479.23 chr1 + 1124 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000373812.8 2744 5 6770 0 4619 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CTTCTAGTACCATTTAGTAT 5618 FALSE NA NA AATAAA -23 NA NA NA 7 NA PB.479.24 chr1 + 1005 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000373812.8 2744 5 6888 1 4737 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCTAGTACCATTTAGTA 5736 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 9 NA PB.480.1 chr1 - 1671 1 full-splice_match ENSG00000289291 ENST00000691740.1 1627 1 -52 8 -52 -8 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATCGCTATCAGTCTTTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.480.2 chr1 - 1369 1 full-splice_match ENSG00000289291 ENST00000691740.1 1627 1 250 8 250 -8 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATCGCTATCAGTCTTTC 249 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.483.1 chr1 - 2492 2 full-splice_match TMEM200B ENST00000521452.2 2468 2 -23 -1 -23 1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTACTGTGGTGTGTCTGAGT -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.484.2 chr1 - 2783 9 novel_in_catalog SRSF4 novel 2952 10 NA NA -2 -4 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATTTCATGGTGTTTGAA -22 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.484.3 chr1 - 2525 5 incomplete-splice_match SRSF4 ENST00000373795.7 2300 6 20899 4 -438 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATTTCATGGTGTTTGAA NA FALSE NA NA AAAAAG -7 NA NA NA 2 NA PB.484.4 chr1 - 2296 6 full-splice_match SRSF4 ENST00000373795.7 2300 6 0 4 0 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 71 19.020264 1.279217 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATTTCATGGTGTTTGAA -30 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 71 NA PB.484.5 chr1 - 2198 5 full-splice_match SRSF4 ENST00000466448.4 1264 5 -10 -924 -2 -4 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATTTCATGGTGTTTGAA -22 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.484.6 chr1 - 2150 6 full-splice_match SRSF4 ENST00000373795.7 2300 6 146 4 126 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATTTCATGGTGTTTGAA 5100 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.484.7 chr1 - 1898 4 incomplete-splice_match SRSF4 ENST00000634348.1 8128 7 14008 -106 54 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATTTCATGGTGTTTGAA 947 FALSE NA NA AATAAA -31 NA NA NA 7 NA PB.484.8 chr1 - 1787 3 incomplete-splice_match SRSF4 ENST00000634348.1 8128 7 18582 -106 4628 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATTTCATGGTGTTTGAA 5521 FALSE NA NA AAAAAG -36 NA NA NA 3 NA PB.484.12 chr1 - 1569 2 incomplete-splice_match SRSF4 ENST00000634348.1 8128 7 23300 -103 9346 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GACAAAATTTCATGGTGTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.484.13 chr1 - 2197 6 full-splice_match SRSF4 ENST00000373795.7 2300 6 -7 110 -7 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 134 35.897400 1.555063 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAGAAAAGAAAAGAAT -37 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 134 NA PB.484.14 chr1 - 1989 6 full-splice_match SRSF4 ENST00000373795.7 2300 6 201 110 181 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAGAAAAGAAAAGAAT 5155 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.484.15 chr1 - 1792 4 incomplete-splice_match SRSF4 ENST00000634348.1 8128 7 14008 0 54 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAGAAAAGAAAAGAAT 947 FALSE NA NA AATAAA -31 NA NA NA 8 NA PB.484.16 chr1 - 1627 3 incomplete-splice_match SRSF4 ENST00000634348.1 8128 7 18636 0 4682 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 23 6.161494 0.789686 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAGAAAAGAAAAGAAT 5575 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 23 NA PB.484.20 chr1 - 2091 5 full-splice_match SRSF4 ENST00000466448.4 1264 5 -10 -817 -2 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.214692 0.507139 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAAGAAAAGAAAAGAA -22 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.484.21 chr1 - 1427 2 incomplete-splice_match SRSF4 ENST00000634348.1 8128 7 23338 1 9384 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.018365 0.604049 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAAGAAAAGAAAAGAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.484.23 chr1 - 2724 5 incomplete-splice_match SRSF4 ENST00000373795.7 2300 6 20591 113 -746 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 ATTAAAAAAGAAAAGAAAAG NA FALSE NA NA AAGAAA -28 NA NA NA 2 NA PB.484.26 chr1 - 1201 6 full-splice_match SRSF4 ENST00000373795.7 2300 6 8 1091 -2 -163 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.214692 0.507139 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 GAAGGGCAGGAAGAGAAGCA -22 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.485.1 chr1 + 5827 19 novel_in_catalog EPB41 novel 5925 21 NA NA -13 -18 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAACAACAACAAAAAGA -36 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.485.2 chr1 + 1886 12 incomplete-splice_match EPB41 ENST00000646189.1 3977 15 0 18914 0 -1259 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAGGAAGACGAGCCACC -11 TRUE NA NA AAAACA -43 NA NA NA 2 NA PB.485.3 chr1 + 5736 18 full-splice_match EPB41 ENST00000647103.1 5772 18 15 21 3 -18 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAACAACAACAAAAAGA -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.485.4 chr1 + 5889 18 novel_in_catalog EPB41 novel 2937 20 NA NA -16 -18 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAACAACAACAAAAAGA -22 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.485.5 chr1 + 5726 17 novel_in_catalog EPB41 novel 2937 20 NA NA 0 -18 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAACAACAACAAAAAGA 12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.485.6 chr1 + 2051 6 incomplete-splice_match EPB41 ENST00000373797.2 2407 15 -5 48515 0 -37808 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAAGAAAATGGAAAATC 19 TRUE NA NA TATAAA -11 NA NA NA 6 NA PB.485.8 chr1 + 786 3 incomplete-splice_match EPB41 ENST00000373797.2 2407 15 -4 71780 1 -61073 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAACAGAATTAAAAGCTTCC 20 TRUE NA NA AGTAAA -27 NA NA NA 6 NA PB.485.11 chr1 + 4317 10 incomplete-splice_match EPB41 ENST00000647103.1 5772 18 146114 21 -6213 -18 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAACAACAACAAAAAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.485.12 chr1 + 4120 8 incomplete-splice_match EPB41 ENST00000647103.1 5772 18 152221 21 -106 -18 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAACAACAACAAAAAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.485.13 chr1 + 3798 6 full-splice_match EPB41 ENST00000490308.2 922 6 23 -2899 23 -18 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAACAACAACAAAAAGA 2313 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.485.14 chr1 + 3350 3 incomplete-splice_match EPB41 ENST00000460378.1 5212 5 16174 18 14819 -18 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAACAACAACAAAAAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.486.1 chr1 + 5563 30 full-splice_match PTPRU ENST00000428026.6 5550 30 -27 14 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGAGCAGCCCTGTGTGTG 1 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.486.2 chr1 + 5572 30 full-splice_match PTPRU ENST00000373779.8 5573 30 0 1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGAGCAGCCCTGTGTGTG 1 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.486.3 chr1 + 4169 23 incomplete-splice_match PTPRU ENST00000373779.8 5573 30 39062 1 -3967 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGAGCAGCCCTGTGTGTG 3601 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.486.4 chr1 + 3081 16 incomplete-splice_match PTPRU ENST00000373779.8 5573 30 55397 1 8196 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGAGCAGCCCTGTGTGTG 8190 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.486.5 chr1 + 2753 14 incomplete-splice_match PTPRU ENST00000373779.8 5573 30 68281 1 -6543 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGAGCAGCCCTGTGTGTG NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.486.6 chr1 + 2429 10 incomplete-splice_match PTPRU ENST00000428026.6 5550 30 75159 14 362 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGAGCAGCCCTGTGTGTG NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.486.7 chr1 + 2014 7 incomplete-splice_match PTPRU ENST00000428026.6 5550 30 79525 14 -1686 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGAGCAGCCCTGTGTGTG NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 8 NA PB.486.8 chr1 + 1801 6 incomplete-splice_match PTPRU ENST00000428026.6 5550 30 81334 14 123 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGAGCAGCCCTGTGTGTG NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.486.9 chr1 + 1571 4 full-splice_match PTPRU ENST00000492954.1 625 4 203 -1149 203 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGAGCAGCCCTGTGTGTG NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 6 NA PB.486.10 chr1 + 1365 3 incomplete-splice_match PTPRU ENST00000492954.1 625 4 543 -1149 543 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGAGCAGCCCTGTGTGTG NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 5 NA PB.488.1 chr1 - 2300 10 full-splice_match MECR ENST00000263702.11 2515 10 -11 226 -3 -10 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.750474 0.574086 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TAATTACCATAGTGACTAAT -31 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.488.5 chr1 - 1552 11 novel_not_in_catalog MECR novel 2515 10 NA NA -3 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGTAGAAGTCATCCCTG -31 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.488.6 chr1 - 1545 12 novel_in_catalog MECR novel 2515 10 NA NA 0 -5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGTAGAAGTCATCCCT -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.488.7 chr1 - 1518 11 novel_in_catalog MECR novel 2416 10 NA NA 0 -5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGTAGAAGTCATCCCT 23 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.488.8 chr1 - 1484 11 novel_in_catalog MECR novel 2515 10 NA NA 1 -5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGTAGAAGTCATCCCT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.488.9 chr1 - 1452 11 novel_not_in_catalog MECR novel 2515 10 NA NA 3 -5 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGTAGAAGTCATCCCT -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.488.10 chr1 - 1439 10 full-splice_match MECR ENST00000373791.7 2416 10 28 949 1 -5 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 19 5.089930 0.706712 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGTAGAAGTCATCCCT 18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.488.11 chr1 - 1424 11 novel_in_catalog MECR novel 2515 10 NA NA 0 -5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.286257 0.632078 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGTAGAAGTCATCCCT -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.488.12 chr1 - 1420 10 novel_in_catalog MECR novel 2416 10 NA NA 1 -5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGTAGAAGTCATCCCT 18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.488.13 chr1 - 1393 10 novel_in_catalog MECR novel 2515 10 NA NA -6 -5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGTAGAAGTCATCCCT -34 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.488.14 chr1 - 1361 10 full-splice_match MECR ENST00000263702.11 2515 10 -11 1165 -3 -5 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 165 44.202023 1.645442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGTAGAAGTCATCCCT -31 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 165 NA PB.488.15 chr1 - 1276 10 full-splice_match MECR ENST00000263702.11 2515 10 74 1165 31 -5 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGTAGAAGTCATCCCT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.488.16 chr1 - 1274 9 novel_in_catalog MECR novel 2515 10 NA NA 2 -5 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGTAGAAGTCATCCCT -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.488.17 chr1 - 1236 3 incomplete-splice_match MECR ENST00000483435.5 571 4 3587 5 3587 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGTAGAAGTCATCCCT NA FALSE NA NA AAGAAA -26 NA NA NA 2 NA PB.488.18 chr1 - 1146 9 incomplete-splice_match MECR ENST00000373791.7 2416 10 14239 949 -72 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGTAGAAGTCATCCCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.488.19 chr1 - 999 8 incomplete-splice_match MECR ENST00000373791.7 2416 10 14837 949 -58 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGTAGAAGTCATCCCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.490.1 chr1 - 2185 8 full-splice_match LAPTM5 ENST00000294507.4 2177 8 0 -8 0 8 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TGATGTGTTTCTGGAAATAC 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.490.2 chr1 - 2249 8 full-splice_match LAPTM5 ENST00000294507.4 2177 8 -72 0 -72 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 470 125.908791 2.100056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGTCTGGCTGATGTGTTTCT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 470 NA PB.490.3 chr1 - 2152 8 novel_not_in_catalog LAPTM5 novel 2177 8 NA NA -676 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGTCTGGCTGATGTGTTTCT 9836 FALSE NA NA AGTAAA -8 NA NA NA 2 NA PB.490.4 chr1 - 2153 7 novel_in_catalog LAPTM5 novel 2177 8 NA NA -70 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGTCTGGCTGATGTGTTTCT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.490.5 chr1 - 2035 7 incomplete-splice_match LAPTM5 ENST00000464569.1 953 8 3706 -1420 3706 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 27 7.233058 0.859322 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGTCTGGCTGATGTGTTTCT 9823 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 27 NA PB.490.6 chr1 - 2006 6 novel_in_catalog LAPTM5 novel 2177 8 NA NA 0 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGTCTGGCTGATGTGTTTCT 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.490.7 chr1 - 1829 5 novel_in_catalog LAPTM5 novel 2177 8 NA NA 0 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGTCTGGCTGATGTGTTTCT 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.490.8 chr1 - 1912 6 incomplete-splice_match LAPTM5 ENST00000464569.1 953 8 4568 -1420 4568 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 25 6.697276 0.825898 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGTCTGGCTGATGTGTTTCT 6342 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 25 NA PB.490.9 chr1 - 1807 5 incomplete-splice_match LAPTM5 ENST00000464569.1 953 8 6375 -1420 6375 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGTCTGGCTGATGTGTTTCT 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.490.10 chr1 - 1621 3 incomplete-splice_match LAPTM5 ENST00000464569.1 953 8 8547 -1420 8547 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.822039 0.683231 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGTCTGGCTGATGTGTTTCT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.490.11 chr1 - 1510 2 incomplete-splice_match LAPTM5 ENST00000464569.1 953 8 10996 -1420 10996 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 30 8.036731 0.905079 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGTCTGGCTGATGTGTTTCT 7304 FALSE NA NA AAAAAG -9 NA NA NA 30 NA PB.490.18 chr1 - 2192 8 novel_not_in_catalog LAPTM5 novel 2177 8 NA NA 0 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTGTCTGGCTGATGTGTTTC 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.490.19 chr1 - 2366 8 novel_not_in_catalog LAPTM5 novel 2177 8 NA NA 1054 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTCTGTCTGGCTGATGTGTT 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.490.20 chr1 - 1494 8 full-splice_match LAPTM5 ENST00000464569.1 953 8 -91 -450 -91 450 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACAACAGTCTATTGCATT 8386 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.490.21 chr1 - 1207 8 full-splice_match LAPTM5 ENST00000294507.4 2177 8 0 970 0 450 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 55 14.734007 1.168321 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACAACAGTCTATTGCATT 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 55 NA PB.490.22 chr1 - 1065 7 incomplete-splice_match LAPTM5 ENST00000464569.1 953 8 3706 -450 3706 450 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACAACAGTCTATTGCATT 9823 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.494.1 chr1 + 1808 4 novel_in_catalog MATN1-AS1 novel 1530 5 NA NA -14 -4 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAATTTAGCTTTTTCATCC -26 TRUE NA NA AATAAA -41 NA NA NA 2 NA PB.496.2 chr1 - 2382 11 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000498419.5 3068 17 27747 -91 -932 91 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAACAAACAAAAACAAA 7443 FALSE NA NA AAGAAA -27 NA NA NA 2 NA PB.496.8 chr1 - 3112 16 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000373741.8 4242 22 73356 -96 2424 90 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAACAAACAAAAACAA NA FALSE NA NA AGTAAA -8 NA NA NA 2 NA PB.496.9 chr1 - 1863 9 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000498419.5 3068 17 30224 -90 37 90 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAACAAACAAAAACAA 9920 FALSE NA NA TATAAA -36 NA NA NA 2 NA PB.496.10 chr1 - 3925 22 novel_in_catalog PUM1 novel 5385 22 NA NA 0 -13 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.496.12 chr1 - 3783 21 novel_in_catalog PUM1 novel 5375 22 NA NA -2 -13 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.496.13 chr1 - 3898 21 novel_in_catalog PUM1 novel 5360 22 NA NA 0 -13 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.496.14 chr1 - 3765 21 novel_in_catalog PUM1 novel 5360 22 NA NA 1 -13 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.496.15 chr1 - 3938 22 novel_in_catalog PUM1 novel 5360 22 NA NA 3 -13 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.496.16 chr1 - 3721 20 novel_in_catalog PUM1 novel 5385 22 NA NA 0 -13 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.496.17 chr1 - 4003 22 novel_in_catalog PUM1 novel 5375 22 NA NA 0 -13 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 26 6.965167 0.842932 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 26 NA PB.496.18 chr1 - 3846 21 novel_in_catalog PUM1 novel 5360 22 NA NA 2 -13 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA -25 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.496.19 chr1 - 4010 22 novel_in_catalog PUM1 novel 5360 22 NA NA 5 -13 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.496.20 chr1 - 4009 22 full-splice_match PUM1 ENST00000373747.7 5375 22 9 1357 0 -13 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 23 6.161494 0.789686 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 23 NA PB.496.21 chr1 - 3713 21 novel_in_catalog PUM1 novel 5385 22 NA NA -3 -13 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA -21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.496.22 chr1 - 3632 20 novel_in_catalog PUM1 novel 3936 22 NA NA 2 -13 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.496.23 chr1 - 3103 17 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000373747.7 5375 22 70579 1357 -21 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.496.24 chr1 - 3041 17 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000257075.9 5360 22 70626 1357 -13 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.496.25 chr1 - 2857 16 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000373741.8 4242 22 73502 13 2570 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 95 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.496.27 chr1 - 2601 15 novel_in_catalog PUM1 novel 3515 20 NA NA 812 -13 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.496.29 chr1 - 2387 13 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000440538.6 3936 22 90975 19 150 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 46 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.496.30 chr1 - 2226 11 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000498419.5 3068 17 27793 19 -886 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 7489 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.496.31 chr1 - 2064 10 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000498419.5 3068 17 28843 19 164 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 8539 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.496.33 chr1 - 1927 10 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000498419.5 3068 17 28980 19 301 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 8676 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.496.34 chr1 - 1957 10 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000373742.6 3515 20 99670 -217 265 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 8640 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.496.35 chr1 - 1804 9 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000373742.6 3515 20 100894 -217 -19 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 9864 FALSE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.496.36 chr1 - 1733 9 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000498419.5 3068 17 30245 19 58 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 9941 FALSE NA NA TATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.496.37 chr1 - 1576 8 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000498419.5 3068 17 41094 19 -208 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.496.39 chr1 - 1399 8 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000498419.5 3068 17 41271 19 -31 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.496.40 chr1 - 1377 8 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000373742.6 3515 20 112013 -217 -15 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.496.41 chr1 - 1275 7 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000498419.5 3068 17 42745 19 1430 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA AATGAA -3 NA NA NA 5 NA PB.496.42 chr1 - 1218 7 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000373742.6 3515 20 113522 -217 1481 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.496.43 chr1 - 1120 6 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000498419.5 3068 17 44872 19 3557 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.496.44 chr1 - 953 5 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000498419.5 3068 17 49682 19 -5 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA GGGGCT -39 NA NA NA 6 NA PB.496.45 chr1 - 829 4 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000498419.5 3068 17 53028 19 3341 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.496.46 chr1 - 699 3 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000530669.1 582 5 4196 -442 4196 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.496.57 chr1 - 840 6 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000440538.6 3936 22 -14 62351 0 -13 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.946801 0.469351 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAACGACAAAGGTGAAAAGA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.496.65 chr1 - 2141 2 intergenic novelGene_409 novel NA NA NA NA NA NA multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAGAAAAA 2406 FALSE NA NA AAAAAG -12 NA NA NA 2 NA PB.497.2 chr1 - 2389 5 incomplete-splice_match NKAIN1 ENST00000373736.7 2922 7 54560 1 2826 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCTTCCTGTCCTGCCCATT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.497.3 chr1 - 2524 6 incomplete-splice_match NKAIN1 ENST00000373736.7 2922 7 51702 2 -32 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCTTCCTGTCCTGCCCAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.497.4 chr1 - 2035 2 incomplete-splice_match NKAIN1 ENST00000526106.5 569 5 6225 -1842 -252 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCTTCCTGTCCTGCCCAT 663 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.500.1 chr1 - 1611 10 full-splice_match SNRNP40 ENST00000263694.9 1615 10 2 2 2 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 137 36.701073 1.564679 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGAAGCTGCTCACTTGTTT -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 137 NA PB.500.2 chr1 - 1305 8 incomplete-splice_match SNRNP40 ENST00000263694.9 1615 10 4782 2 -2587 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGAAGCTGCTCACTTGTTT 4810 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.500.3 chr1 - 1164 7 incomplete-splice_match SNRNP40 ENST00000263694.9 1615 10 7416 2 47 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGAAGCTGCTCACTTGTTT 7444 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.500.4 chr1 - 992 6 full-splice_match SNRNP40 ENST00000489853.1 1928 6 1040 -104 1040 -2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGAAGCTGCTCACTTGTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.500.5 chr1 - 1046 6 full-splice_match SNRNP40 ENST00000489853.1 1928 6 985 -103 985 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAAGAAGCTGCTCACTTGTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.500.6 chr1 - 1518 10 full-splice_match SNRNP40 ENST00000263694.9 1615 10 -12 109 -12 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 1053 282.089264 2.450387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAGCCATGTGGATTGGAT 16 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 1053 NA PB.500.7 chr1 - 1722 11 novel_not_in_catalog SNRNP40 novel 1615 10 NA NA 0 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 23 6.161494 0.789686 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAGCCATGTGGATTGGAT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 23 NA PB.500.8 chr1 - 1507 10 novel_not_in_catalog SNRNP40 novel 1615 10 NA NA 15 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAGCCATGTGGATTGGAT 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.500.10 chr1 - 1429 9 novel_in_catalog SNRNP40 novel 1615 10 NA NA 9 -3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAGCCATGTGGATTGGAT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.500.11 chr1 - 1367 10 full-splice_match SNRNP40 ENST00000263694.9 1615 10 139 109 133 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.018365 0.604049 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAGCCATGTGGATTGGAT 167 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.500.12 chr1 - 1313 8 novel_not_in_catalog SNRNP40 novel 1615 10 NA NA 13 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAGCCATGTGGATTGGAT 7410 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.500.13 chr1 - 1194 8 incomplete-splice_match SNRNP40 ENST00000263694.9 1615 10 4786 109 -2583 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 24 6.429385 0.808169 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAGCCATGTGGATTGGAT 4814 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 24 NA PB.500.14 chr1 - 1100 7 incomplete-splice_match SNRNP40 ENST00000263694.9 1615 10 7373 109 4 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.946801 0.469351 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAGCCATGTGGATTGGAT 7401 FALSE NA NA AATAAA -23 NA NA NA 11 NA PB.500.15 chr1 - 882 6 full-splice_match SNRNP40 ENST00000489853.1 1928 6 1043 3 1043 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.482584 0.541902 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAGCCATGTGGATTGGAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.500.16 chr1 - 779 5 incomplete-splice_match SNRNP40 ENST00000489853.1 1928 6 11020 3 -1797 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAGCCATGTGGATTGGAT NA FALSE NA NA AAAACA -4 NA NA NA 3 NA PB.500.17 chr1 - 592 3 incomplete-splice_match SNRNP40 ENST00000373720.3 1087 4 1753 -33 1753 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAGCCATGTGGATTGGAT 1312 FALSE NA NA GATAAA -22 NA NA NA 4 NA PB.500.19 chr1 - 991 7 incomplete-splice_match SNRNP40 ENST00000263694.9 1615 10 7480 111 111 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.482584 0.541902 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACAAGAGCCATGTGGATTGG 7508 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.500.23 chr1 - 1509 5 novel_not_in_catalog SNRNP40 novel 677 2 NA NA 61 5883 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GCGTGTATGTGTGTATGTAC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.501.2 chr1 + 1646 9 full-splice_match ZCCHC17 ENST00000546109.5 1705 9 16 43 0 -26 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.482584 0.541902 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAATGGAAATGTGTTTGGT -20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.501.3 chr1 + 1602 8 full-splice_match ZCCHC17 ENST00000344147.10 1568 8 -32 -2 2 2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 133 35.629509 1.551810 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TACTGAGTTATTTTTCCTAT -18 TRUE NA NA ACTAAA -25 NA NA NA 133 NA PB.501.4 chr1 + 1258 5 novel_in_catalog ZCCHC17 novel 1489 7 NA NA 2 -3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACTTACTGAGTTATTTTT -18 TRUE NA NA ACTAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.501.5 chr1 + 937 7 incomplete-splice_match ZCCHC17 ENST00000344147.10 1568 8 -32 15720 2 248 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAGAAAAATGAA -18 TRUE NA NA AAAAAG -15 NA NA NA 2 NA PB.501.6 chr1 + 2162 8 full-splice_match ZCCHC17 ENST00000344147.10 1568 8 -26 -568 -2 551 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GATTAACAGGCTCCGAGACT -12 TRUE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.501.8 chr1 + 1331 6 novel_in_catalog ZCCHC17 novel 1489 7 NA NA 11 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACTTACTGAGTTATTTTT 1 TRUE NA NA ACTAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.501.9 chr1 + 1427 7 full-splice_match ZCCHC17 ENST00000618216.4 1489 7 41 21 -9 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAACTTACTGAGTTATTTT 5 TRUE NA NA ACTAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.501.10 chr1 + 657 7 incomplete-splice_match ZCCHC17 ENST00000344147.10 1568 8 -9 15977 -9 -9 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.482584 0.541902 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AGAAAAAGAAAGAAGGTGAA 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.501.11 chr1 + 1661 9 novel_not_in_catalog ZCCHC17 novel 1705 9 NA NA 1 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAACTTACTGAGTTATTTT 15 TRUE NA NA ACTAAA -19 NA NA NA 4 NA PB.501.13 chr1 + 1675 8 full-splice_match ZCCHC17 ENST00000373714.5 1730 8 36 19 8 -19 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATGTGTTTGGTTTTAAAC 26 TRUE NA NA ACTAAA -4 NA NA NA 4 NA PB.501.15 chr1 + 1402 6 incomplete-splice_match ZCCHC17 ENST00000344147.10 1568 8 22075 3 22071 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACTTACTGAGTTATTTTT NA FALSE NA NA ACTAAA -20 NA NA NA 7 NA PB.501.19 chr1 + 1343 5 incomplete-splice_match ZCCHC17 ENST00000344147.10 1568 8 40141 4 40137 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAACTTACTGAGTTATTTT NA FALSE NA NA ACTAAA -19 NA NA NA 6 NA PB.501.20 chr1 + 1185 4 incomplete-splice_match ZCCHC17 ENST00000344147.10 1568 8 41981 3 41977 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACTTACTGAGTTATTTTT NA FALSE NA NA ACTAAA -20 NA NA NA 8 NA PB.501.21 chr1 + 1013 2 incomplete-splice_match ZCCHC17 ENST00000344147.10 1568 8 51809 26 51805 -26 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAATGGAAATGTGTTTGGT 2157 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.501.22 chr1 + 978 2 incomplete-splice_match ZCCHC17 ENST00000344147.10 1568 8 51867 3 51863 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACTTACTGAGTTATTTTT 2215 FALSE NA NA ACTAAA -20 NA NA NA 7 NA PB.503.1 chr1 + 2028 10 full-splice_match SERINC2 ENST00000536859.5 2072 10 41 3 -2 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTCTGTGCCCCTCACCC -5 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.503.2 chr1 + 1960 10 novel_not_in_catalog SERINC2 novel 2146 11 NA NA -268 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTCTGTGCCCCTCACCC 2725 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.503.3 chr1 + 1927 10 full-splice_match SERINC2 ENST00000373709.8 1900 10 -28 1 -28 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 160 42.862564 1.632078 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTCTGTGCCCCTCACCC 2965 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 160 NA PB.503.4 chr1 + 1722 9 novel_in_catalog SERINC2 novel 1900 10 NA NA -18 -4 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACCATGTTCTGTGCCCCTC -25 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.503.5 chr1 + 1843 10 full-splice_match SERINC2 ENST00000373709.8 1900 10 56 1 56 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTCTGTGCCCCTCACCC 49 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.503.6 chr1 + 2121 11 novel_not_in_catalog SERINC2 novel 2807 11 NA NA 0 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACCATGTTCTGTGCCCCTC -28 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.503.7 chr1 + 1643 8 incomplete-splice_match SERINC2 ENST00000491976.1 2807 11 10868 4 10868 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACCATGTTCTGTGCCCCTC 885 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 8 NA PB.503.8 chr1 + 1452 7 incomplete-splice_match SERINC2 ENST00000491976.1 2807 11 11516 3 11516 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACCATGTTCTGTGCCCCTCA -6 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 7 NA PB.503.9 chr1 + 1328 6 incomplete-splice_match SERINC2 ENST00000491976.1 2807 11 12009 0 12009 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTCTGTGCCCCTCACCC 23 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 5 NA PB.503.10 chr1 + 935 3 incomplete-splice_match SERINC2 ENST00000491976.1 2807 11 15620 4 15620 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACCATGTTCTGTGCCCCTC 421 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 5 NA PB.503.11 chr1 + 1078 2 incomplete-splice_match SERINC2 ENST00000491976.1 2807 11 18909 0 18909 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTCTGTGCCCCTCACCC 3219 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.504.1 chr1 - 723 4 full-splice_match FABP3 ENST00000373713.7 1097 4 0 374 0 86 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AACTCTGGGAGTCTTGGTTT -1 TRUE NA NA TTTAAA -23 NA NA NA 6 NA PB.504.2 chr1 - 830 4 full-splice_match FABP3 ENST00000373713.7 1097 4 -137 404 -137 56 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCAGTTGCCTTTTTGCCT 127 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.505.1 chr1 - 1631 5 full-splice_match PEF1 ENST00000373703.5 1614 5 -18 1 2 -1 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 372 99.655464 1.998501 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTTCCATGTTTTCCACCAT 279 FALSE NA NA GGGGCT -43 NA NA NA 372 NA PB.505.2 chr1 - 1512 5 novel_in_catalog PEF1 novel 1614 5 NA NA -9 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTTCCATGTTTTCCACCAT -7 TRUE NA NA GGGGCT -34 NA NA NA 3 NA PB.505.3 chr1 - 1446 4 incomplete-splice_match PEF1 ENST00000373703.5 1614 5 9485 1 81 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 25 6.697276 0.825898 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTTCCATGTTTTCCACCAT 9782 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 25 NA PB.505.4 chr1 - 1352 4 incomplete-splice_match PEF1 ENST00000373703.5 1614 5 9579 1 -37 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTTCCATGTTTTCCACCAT 9876 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.505.5 chr1 - 1309 4 full-splice_match PEF1 ENST00000478502.5 750 4 23 -582 3 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.822039 0.683231 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTTCCATGTTTTCCACCAT 5 TRUE NA NA GGGGCT -22 NA NA NA 18 NA PB.505.6 chr1 - 1177 3 novel_in_catalog PEF1 novel 750 4 NA NA -9 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTTCCATGTTTTCCACCAT -7 TRUE NA NA GGGGCT -34 NA NA NA 2 NA PB.505.7 chr1 - 1015 2 novel_in_catalog PEF1 novel 750 4 NA NA -3 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTTCCATGTTTTCCACCAT -1 TRUE NA NA GGGGCT -28 NA NA NA 2 NA PB.505.10 chr1 - 1023 2 incomplete-splice_match PEF1 ENST00000373703.5 1614 5 12334 2 2718 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAGTTCCATGTTTTCCACCA 2993 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.505.11 chr1 - 1176 3 incomplete-splice_match PEF1 ENST00000373703.5 1614 5 11659 4 2043 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGGAGTTCCATGTTTTCCAC 2318 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.506.1 chr1 - 5133 71 full-splice_match COL16A1 ENST00000373672.8 5418 71 26 259 26 -11 alternative_3end TRUE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAATAATAAAGAAACAAAAC -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.506.2 chr1 - 2474 35 novel_in_catalog COL16A1 novel 5418 71 NA NA 511 -11 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAATAATAAAGAAACAAAAC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.506.3 chr1 - 2307 32 novel_in_catalog COL16A1 novel 5418 71 NA NA 2826 -11 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAATAATAAAGAAACAAAAC NA FALSE NA NA AAGAAA -28 NA NA NA 2 NA PB.506.4 chr1 - 2029 27 incomplete-splice_match COL16A1 ENST00000373672.8 5418 71 31233 259 368 -11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAATAATAAAGAAACAAAAC 446 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.506.5 chr1 - 1778 23 novel_in_catalog COL16A1 novel 5418 71 NA NA -1041 -11 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAATAATAAAGAAACAAAAC 1587 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.506.6 chr1 - 1389 15 incomplete-splice_match COL16A1 ENST00000373672.8 5418 71 41299 319 738 6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGGTTGTGAATGTTTTTT 7702 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.506.7 chr1 - 1614 21 incomplete-splice_match COL16A1 ENST00000373672.8 5418 71 35808 331 -1824 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGGACTCTGTGACAGGTTG 5021 FALSE NA NA AAGAAA -31 NA NA NA 2 NA PB.507.1 chr1 - 2045 8 novel_in_catalog ADGRB2 novel 2936 10 NA NA -250 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTTGCTGCTGAGCTGTTT 9091 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.508.1 chr1 - 2073 9 incomplete-splice_match SPOCD1 ENST00000533231.5 3774 15 16616 -51 12 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATTGGGATTGCATCTGC 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.508.2 chr1 - 1960 8 novel_in_catalog SPOCD1 novel 2105 9 NA NA 7 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GATTGCATCTGCTAGCTGGT 3 TRUE NA NA GGGGCT -5 NA NA NA 2 NA PB.509.1 chr1 + 1856 11 novel_in_catalog TINAGL1 novel 2207 12 NA NA -4 1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAACTACAGTGTCTTGGAAC -3 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.509.2 chr1 + 2179 12 full-splice_match TINAGL1 ENST00000271064.12 2207 12 24 4 -3 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.018365 0.604049 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATAACTACAGTGTCTTGGAA -2 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 15 NA PB.509.3 chr1 + 1556 8 incomplete-splice_match TINAGL1 ENST00000537531.2 1841 11 5402 -2 34 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACTACAGTGTCTTGGAACC 35 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.511.1 chr1 + 2877 9 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 -167 3 -167 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGTAAATGTGATGAATTG NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.511.2 chr1 + 1917 9 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 -167 963 -167 290 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATAAAAAAAAGAAGTTGAG NA FALSE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 7 NA PB.511.3 chr1 + 1669 8 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000492989.1 1215 8 -164 -290 -36 290 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATAAAAAAAAGAAGTTGAG NA FALSE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.511.4 chr1 + 2323 11 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000484270.2 1989 11 -333 -1 -19 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAATGGTCCCACTCTGGTAG -15 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.511.5 chr1 + 1761 9 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 -11 963 -11 290 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 150 40.183655 1.604049 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATAAAAAAAAGAAGTTGAG -7 TRUE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 150 NA PB.511.6 chr1 + 1429 6 novel_in_catalog KHDRBS1 novel 2713 9 NA NA -8 290 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATAAAAAAAAGAAGTTGAG -4 TRUE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.511.9 chr1 + 1292 5 novel_in_catalog KHDRBS1 novel 2713 9 NA NA -5 290 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATAAAAAAAAGAAGTTGAG -1 TRUE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.511.10 chr1 + 2708 9 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 2 3 2 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 26 6.965167 0.842932 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGTAAATGTGATGAATTG 6 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 26 NA PB.511.11 chr1 + 2116 9 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 2 595 2 -595 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.822039 0.683231 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAACAACAAAAT 6 TRUE NA NA ATTAAA -33 NA NA NA 18 NA PB.511.12 chr1 + 2607 9 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 103 3 -25 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGTAAATGTGATGAATTG 107 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.511.13 chr1 + 1536 9 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 214 963 86 290 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATAAAAAAAAGAAGTTGAG 218 FALSE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 5 NA PB.511.14 chr1 + 1778 9 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 340 595 26 -595 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAACAACAAAAT 16 FALSE NA NA ATTAAA -33 NA NA NA 3 NA PB.511.15 chr1 + 2368 9 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 343 2 29 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAGTAAATGTGATGAATTGT 19 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 3 NA PB.511.17 chr1 + 1380 9 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 370 963 56 290 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.750474 0.574086 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATAAAAAAAAGAAGTTGAG -18 TRUE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 14 NA PB.511.21 chr1 + 1243 8 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 16427 963 16113 290 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.625712 0.750178 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATAAAAAAAAGAAGTTGAG NA FALSE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 21 NA PB.511.22 chr1 + 2162 8 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 16468 3 16154 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGTAAATGTGATGAATTG NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 8 NA PB.511.23 chr1 + 1562 8 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 16476 595 16162 -595 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAACAACAAAAT NA FALSE NA NA ATTAAA -33 NA NA NA 3 NA PB.511.24 chr1 + 2015 7 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 17716 3 17402 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGTAAATGTGATGAATTG NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 6 NA PB.511.25 chr1 + 1397 7 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 17742 595 17428 -595 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAACAACAAAAT NA FALSE NA NA ATTAAA -33 NA NA NA 5 NA PB.511.26 chr1 + 1552 8 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000484270.2 1989 11 19004 1 19004 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATGAATGGTCCCACTCTGGT NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.511.27 chr1 + 920 6 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000492989.1 1215 8 19270 -290 19084 290 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.946801 0.469351 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATAAAAAAAAGAAGTTGAG NA FALSE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 11 NA PB.511.28 chr1 + 1838 6 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 19440 3 19126 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGTAAATGTGATGAATTG 25 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.511.30 chr1 + 818 5 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000492989.1 1215 8 22947 -290 22761 290 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATAAAAAAAAGAAGTTGAG 3660 FALSE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 10 NA PB.511.31 chr1 + 1152 5 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000492989.1 1215 8 22981 -658 22795 -595 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAACAACAAAAT 3694 FALSE NA NA ATTAAA -33 NA NA NA 8 NA PB.511.32 chr1 + 1710 5 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 23143 3 22829 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.018365 0.604049 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGTAAATGTGATGAATTG 3728 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 15 NA PB.511.33 chr1 + 1271 6 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000484270.2 1989 11 23651 1 23651 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATGAATGGTCCCACTCTGGT 4550 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.511.35 chr1 + 949 4 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000492989.1 1215 8 23975 -658 23789 -595 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAACAACAAAAT 4688 FALSE NA NA ATTAAA -33 NA NA NA 7 NA PB.511.36 chr1 + 1496 4 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 24148 3 23834 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 24 6.429385 0.808169 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGTAAATGTGATGAATTG 4733 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 24 NA PB.511.37 chr1 + 1449 3 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000307714.12 2738 9 24653 2 24397 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAGTAAATGTGATGAATTGT 5296 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.511.38 chr1 + 1391 2 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000307714.12 2738 9 25605 3 25349 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.893603 0.770381 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGTAAATGTGATGAATTG 6248 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 22 NA PB.511.39 chr1 + 967 4 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000484270.2 1989 11 25367 -1 25367 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAATGGTCCCACTCTGGTAG 6266 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.511.48 chr1 + 1119 3 novel_not_in_catalog KHDRBS1 novel 1989 11 NA NA 30268 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGAATGGTCCCACTCTGGTA NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.511.49 chr1 + 787 2 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000484270.2 1989 11 31109 1 31109 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATGAATGGTCCCACTCTGGT NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.512.1 chr1 + 1674 7 novel_not_in_catalog TMEM39B novel 1538 7 NA NA -126 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAACAAGCCTGTGTCCTGTG NA FALSE NA NA AAAAAG -18 NA NA NA 2 NA PB.512.2 chr1 + 1512 7 novel_in_catalog TMEM39B novel 1538 7 NA NA -36 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAACAAGCCTGTGTCCTGTG -1 TRUE NA NA AAAAAG -18 NA NA NA 3 NA PB.512.3 chr1 + 1682 8 novel_in_catalog TMEM39B novel 1778 9 NA NA -23 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG 12 FALSE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 2 NA PB.512.5 chr1 + 1654 8 novel_in_catalog TMEM39B novel 1778 9 NA NA -10 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG -41 TRUE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 2 NA PB.512.6 chr1 + 1871 10 full-splice_match TMEM39B ENST00000468135.5 1834 10 -42 5 -8 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG -39 TRUE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 2 NA PB.512.7 chr1 + 3141 9 novel_not_in_catalog TMEM39B novel 1778 9 NA NA -2 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG -33 TRUE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 2 NA PB.512.8 chr1 + 1788 9 novel_not_in_catalog TMEM39B novel 1778 9 NA NA 0 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG -31 TRUE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 2 NA PB.512.9 chr1 + 1625 8 novel_in_catalog TMEM39B novel 1778 9 NA NA 0 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG -31 TRUE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 6 NA PB.512.10 chr1 + 1541 7 full-splice_match TMEM39B ENST00000441402.5 1538 7 -8 5 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 46 12.322988 1.090716 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG -31 TRUE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 46 NA PB.512.11 chr1 + 1545 7 novel_not_in_catalog TMEM39B novel 1778 9 NA NA 0 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG -27 TRUE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 4 NA PB.512.12 chr1 + 1769 9 full-splice_match TMEM39B ENST00000336294.10 1778 9 7 2 3 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 47 12.590878 1.100056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG -20 TRUE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 47 NA PB.512.13 chr1 + 1475 7 incomplete-splice_match TMEM39B ENST00000336294.10 1778 9 2725 2 -467 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG 2698 FALSE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 5 NA PB.512.14 chr1 + 1213 5 incomplete-splice_match TMEM39B ENST00000441402.5 1538 7 2744 5 -444 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG 2721 FALSE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 3 NA PB.512.15 chr1 + 1064 4 incomplete-splice_match TMEM39B ENST00000468135.5 1834 10 18719 5 15557 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG 8247 FALSE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 2 NA PB.512.16 chr1 + 984 4 incomplete-splice_match TMEM39B ENST00000468135.5 1834 10 18799 5 15637 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG 8327 FALSE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 5 NA PB.513.1 chr1 + 4088 15 novel_not_in_catalog KPNA6 novel 7355 14 NA NA -13 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA -11 TRUE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.513.2 chr1 + 2240 14 full-splice_match KPNA6 ENST00000373625.8 7355 14 -11 5126 -11 -1736 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 24 6.429385 0.808169 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GATTGAGTTATTTAATTTTT -9 TRUE NA NA AAAACA -42 NA NA NA 24 NA PB.513.3 chr1 + 2343 15 novel_not_in_catalog KPNA6 novel 7355 14 NA NA -3 -1735 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATTGAGTTATTTAATTTTTT -1 TRUE NA NA AAAACA -43 NA NA NA 2 NA PB.513.4 chr1 + 3955 14 full-splice_match KPNA6 ENST00000373625.8 7355 14 9 3391 7 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 26 6.965167 0.842932 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 11 TRUE NA NA ATTAAA -20 NA NA NA 26 NA PB.513.6 chr1 + 3660 11 incomplete-splice_match KPNA6 ENST00000373625.8 7355 14 49289 3390 483 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.513.7 chr1 + 1715 9 incomplete-splice_match KPNA6 ENST00000373625.8 7355 14 51358 5125 2552 -1735 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATTGAGTTATTTAATTTTTT NA FALSE NA NA AAAACA -43 NA NA NA 2 NA PB.513.8 chr1 + 3383 9 incomplete-splice_match KPNA6 ENST00000373625.8 7355 14 51417 3398 2611 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 TACAGTTTAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.513.9 chr1 + 1538 8 incomplete-splice_match KPNA6 ENST00000471599.5 3941 14 52615 1736 3811 -1736 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GATTGAGTTATTTAATTTTT NA FALSE NA NA AAAACA -42 NA NA NA 3 NA PB.513.10 chr1 + 3195 7 incomplete-splice_match KPNA6 ENST00000471599.5 3941 14 53936 1 5132 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA ATTAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.513.11 chr1 + 1382 6 incomplete-splice_match KPNA6 ENST00000471599.5 3941 14 54305 1759 5501 -1759 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAATATTAATCTTGTACGC NA FALSE NA NA AAAACA -19 NA NA NA 3 NA PB.513.12 chr1 + 3068 6 incomplete-splice_match KPNA6 ENST00000471599.5 3941 14 54377 1 5573 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA ATTAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.513.13 chr1 + 2849 4 incomplete-splice_match KPNA6 ENST00000471599.5 3941 14 58098 0 9294 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 8 NA PB.513.14 chr1 + 2703 3 incomplete-splice_match KPNA6 ENST00000471599.5 3941 14 59182 0 10378 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 3 NA PB.514.1 chr1 + 3779 12 novel_not_in_catalog TXLNA novel 4865 11 NA NA 3 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTTGTTTCTCTCCTGACCTG -2 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.514.2 chr1 + 4810 11 full-splice_match TXLNA ENST00000373610.8 4865 11 54 1 54 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 23 6.161494 0.789686 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTGTTTCTCTCCTGACCT 4 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 23 NA PB.514.4 chr1 + 5011 10 full-splice_match TXLNA ENST00000373609.1 5012 10 0 1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTGTTTCTCTCCTGACCT -25 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 6 NA PB.514.5 chr1 + 1852 9 incomplete-splice_match TXLNA ENST00000373609.1 5012 10 9 3892 9 -3892 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AGAAAAAAACGGGTGCCAGT -16 TRUE NA NA AATAAA -6 NA NA NA 2 NA PB.514.6 chr1 + 1461 3 incomplete-splice_match TXLNA ENST00000373609.1 5012 10 41 13045 41 -13045 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CCACTTTGTTGTAACATTGT 16 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.514.7 chr1 + 4371 9 incomplete-splice_match TXLNA ENST00000373609.1 5012 10 1371 -3 1371 3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GTTTCTCTCCTGACCTGTGT 1284 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.514.8 chr1 + 3878 6 incomplete-splice_match TXLNA ENST00000373609.1 5012 10 10073 2 10073 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACTTGTTTCTCTCCTGACC 6690 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.514.9 chr1 + 3636 4 incomplete-splice_match TXLNA ENST00000373609.1 5012 10 12603 1 12603 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTGTTTCTCTCCTGACCT 9220 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 6 NA PB.514.10 chr1 + 3419 2 incomplete-splice_match TXLNA ENST00000373609.1 5012 10 14060 1 14060 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTGTTTCTCTCCTGACCT NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 7 NA PB.515.1 chr1 + 1415 5 full-splice_match CCDC28B ENST00000421922.6 1415 5 -11 11 -11 -7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGAAAGCAAGCGGCTCCG -9 TRUE NA NA ATTAAA -5 NA NA NA 7 NA PB.515.2 chr1 + 1283 2 full-splice_match CCDC28B ENST00000680626.1 3507 2 10 2214 -2 -28 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAACAAAAAAAAAATTTTTT 15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.515.3 chr1 + 818 6 full-splice_match CCDC28B ENST00000373602.10 880 6 51 11 -2 -7 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 41 10.983533 1.040742 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGAAAGCAAGCGGCTCCG 15 TRUE NA NA ATTAAA -5 NA NA NA 41 NA PB.515.4 chr1 + 989 5 incomplete-splice_match CCDC28B ENST00000373602.10 880 6 1083 11 -18 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGAAAGCAAGCGGCTCCG -1 TRUE NA NA ATTAAA -5 NA NA NA 8 NA PB.516.14 chr1 - 1944 6 full-splice_match PTP4A2 ENST00000647444.2 3910 6 134 1832 -48 10 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.946801 0.469351 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAACAAA 105 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.516.16 chr1 - 1786 6 novel_in_catalog PTP4A2 novel 2213 8 NA NA 6753 10 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAACAAA 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.516.17 chr1 - 1546 5 full-splice_match PTP4A2 ENST00000602725.5 3353 5 -25 1832 -25 10 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAACAAA 97 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.516.18 chr1 - 1382 5 full-splice_match PTP4A2 ENST00000602725.5 3353 5 139 1832 15 10 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.018365 0.604049 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAACAAA 261 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.516.20 chr1 - 1033 4 full-splice_match PTP4A2 ENST00000457805.6 1032 4 280 -281 21 10 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAACAAA 517 FALSE NA NA AATAAA -5 NA NA NA 3 NA PB.516.21 chr1 - 865 3 incomplete-splice_match PTP4A2 ENST00000457805.6 1032 4 7591 -281 -497 10 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAACAAA 7828 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.516.25 chr1 - 1824 6 full-splice_match PTP4A2 ENST00000647444.2 3910 6 253 1833 71 9 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAACAA 224 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.516.26 chr1 - 1696 5 full-splice_match PTP4A2 ENST00000602725.5 3353 5 -176 1833 -176 9 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAACAA NA FALSE NA NA AGTAAA -28 NA NA NA 8 NA PB.516.27 chr1 - 1260 5 full-splice_match PTP4A2 ENST00000602725.5 3353 5 260 1833 -51 9 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.625712 0.750178 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAACAA 382 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 21 NA PB.516.28 chr1 - 1180 4 full-splice_match PTP4A2 ENST00000457805.6 1032 4 132 -280 -64 9 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAACAA 369 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.516.29 chr1 - 1060 5 full-splice_match PTP4A2 ENST00000602725.5 3353 5 460 1833 86 9 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 24 6.429385 0.808169 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAACAA 582 FALSE NA NA GGGGCT -20 NA NA NA 24 NA PB.516.30 chr1 - 2056 6 full-splice_match PTP4A2 ENST00000647444.2 3910 6 20 1834 10 8 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 ATAAAAAAAAAAAAAAAACA -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.516.31 chr1 - 1763 5 novel_in_catalog PTP4A2 novel 3910 6 NA NA 38 8 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 ATAAAAAAAAAAAAAAAACA 191 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.516.32 chr1 - 1498 4 novel_in_catalog PTP4A2 novel 3910 6 NA NA -5 8 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 ATAAAAAAAAAAAAAAAACA 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.516.33 chr1 - 1658 6 full-splice_match PTP4A2 ENST00000647444.2 3910 6 12 2240 2 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.554148 0.658407 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.516.39 chr1 - 1525 6 full-splice_match PTP4A2 ENST00000647444.2 3910 6 145 2240 -37 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 20 5.357821 0.728988 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 116 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 20 NA PB.516.42 chr1 - 1409 6 full-splice_match PTP4A2 ENST00000647444.2 3910 6 261 2240 -65 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.482584 0.541902 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 232 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.516.43 chr1 - 1349 6 novel_not_in_catalog PTP4A2 novel 3910 6 NA NA 4228 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 4792 FALSE NA NA AATACA -17 NA NA NA 2 NA PB.516.44 chr1 - 1386 6 novel_in_catalog PTP4A2 novel 2213 8 NA NA 6745 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.516.45 chr1 - 1357 6 full-splice_match PTP4A2 ENST00000647444.2 3910 6 313 2240 -13 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 284 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.516.46 chr1 - 1323 6 novel_in_catalog PTP4A2 novel 3910 6 NA NA 6 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.750474 0.574086 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.516.47 chr1 - 1309 6 novel_in_catalog PTP4A2 novel 2213 8 NA NA 0 -3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.516.48 chr1 - 1265 5 full-splice_match PTP4A2 ENST00000602725.5 3353 5 -152 2240 -152 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.554148 0.658407 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA NA FALSE NA NA AGTAAA -4 NA NA NA 17 NA PB.516.49 chr1 - 1243 5 novel_not_in_catalog PTP4A2 novel 3910 6 NA NA 192 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 756 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.516.50 chr1 - 1114 4 novel_in_catalog PTP4A2 novel 3910 6 NA NA -9 -3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.516.51 chr1 - 1218 5 novel_in_catalog PTP4A2 novel 3910 6 NA NA 0 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.516.52 chr1 - 1124 5 full-splice_match PTP4A2 ENST00000602725.5 3353 5 -11 2240 -11 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 29 7.768840 0.890356 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 111 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 29 NA PB.516.53 chr1 - 946 5 full-splice_match PTP4A2 ENST00000602725.5 3353 5 167 2240 43 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 30 8.036731 0.905079 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 289 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 30 NA PB.516.54 chr1 - 908 4 full-splice_match PTP4A2 ENST00000457805.6 1032 4 -3 127 -3 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 234 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.516.55 chr1 - 721 5 full-splice_match PTP4A2 ENST00000602725.5 3353 5 392 2240 18 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 514 FALSE NA NA AATAAA -8 NA NA NA 2 NA PB.516.59 chr1 - 1485 5 novel_in_catalog PTP4A2 novel 3910 6 NA NA 81 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 TAAGAAAAGAGAAAGAGAAA 62 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.516.60 chr1 - 1211 4 novel_in_catalog PTP4A2 novel 2213 8 NA NA 6751 -4 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 TAAGAAAAGAGAAAGAGAAA 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.517.1 chr1 + 2680 3 novel_in_catalog IQCC novel 2252 5 NA NA -23 4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GAGTCTGGCTGCTTTCATTT -11 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.517.2 chr1 + 2243 4 full-splice_match IQCC ENST00000617816.1 2089 4 -23 -131 -23 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGATTCTGAGTCTGGCTGCT -11 TRUE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 3 NA PB.517.3 chr1 + 2040 5 full-splice_match IQCC ENST00000291358.11 2012 5 -23 -5 -23 5 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.893603 0.770381 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTCTGGCTGCTTTCATTTC -11 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 22 NA PB.518.1 chr1 + 1457 11 full-splice_match EIF3I ENST00000677711.1 1700 11 242 1 -35 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 1942 520.244385 2.716208 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTTGTGGTGTCTGTTTCA 786 FALSE NA NA AATAAA -33 NA NA NA 1942 NA PB.518.2 chr1 + 998 7 full-splice_match EIF3I ENST00000679290.1 987 7 -10 -1 -8 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTTGTGGTGTCTGTTTCA -7 TRUE NA NA AATAAA -33 NA NA NA 3 NA PB.518.3 chr1 + 1708 10 full-splice_match EIF3I ENST00000677183.1 1652 10 -11 -45 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTTGTGGTGTCTGTTTCA 3 TRUE NA NA AATAAA -33 NA NA NA 2 NA PB.518.4 chr1 + 1515 10 full-splice_match EIF3I ENST00000678883.1 1400 10 -17 -98 0 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTTGTGGTGTCTGTTTCA 3 TRUE NA NA AATAAA -33 NA NA NA 4 NA PB.518.5 chr1 + 1292 10 full-splice_match EIF3I ENST00000677580.1 1200 10 -26 -66 0 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTTGTGGTGTCTGTTTCA 3 TRUE NA NA AATAAA -33 NA NA NA 2 NA PB.518.6 chr1 + 1308 11 full-splice_match EIF3I ENST00000677711.1 1700 11 279 113 0 -10 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 226 60.543373 1.782067 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAGAAGAAGG 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 226 NA PB.518.7 chr1 + 1273 11 full-splice_match EIF3I ENST00000678689.1 1276 11 2 1 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATATTTTGTGGTGTCTGTTT 3 TRUE NA NA AATAAA -31 NA NA NA 10 NA PB.518.8 chr1 + 1269 10 full-splice_match EIF3I ENST00000677353.1 1250 10 -21 2 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATTTTGTGGTGTCTGTTTC 3 TRUE NA NA AATAAA -32 NA NA NA 9 NA PB.518.9 chr1 + 1254 10 full-splice_match EIF3I ENST00000678968.1 1256 10 0 2 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATTTTGTGGTGTCTGTTTC 3 TRUE NA NA AATAAA -32 NA NA NA 7 NA PB.518.10 chr1 + 1145 11 full-splice_match EIF3I ENST00000677711.1 1700 11 279 276 0 -5 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 257 68.848000 1.837891 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAATACAAAAATTAGCCA 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 257 NA PB.518.11 chr1 + 845 6 novel_in_catalog EIF3I novel 1069 8 NA NA 0 -6 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAAATGGCTTCTGGTCAG 3 TRUE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.518.12 chr1 + 1256 9 novel_in_catalog EIF3I novel 1652 10 NA NA 0 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGATATTTTGTGGTGTCTGT 9 TRUE NA NA AATAAA -29 NA NA NA 2 NA PB.518.13 chr1 + 1201 8 full-splice_match EIF3I ENST00000474371.2 688 8 14 -527 1 -6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAAATGGCTTCTGGTCAG 0 TRUE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.518.14 chr1 + 1202 8 incomplete-splice_match EIF3I ENST00000677844.1 1264 9 715 -148 0 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATTTTGTGGTGTCTGTTTC 18 FALSE NA NA AATAAA -32 NA NA NA 3 NA PB.518.15 chr1 + 1368 10 full-splice_match EIF3I ENST00000471486.6 1482 10 3 111 0 -10 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAGAAGAAGG 19 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.518.16 chr1 + 1473 10 full-splice_match EIF3I ENST00000471486.6 1482 10 9 0 6 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.554148 0.658407 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATTTTGTGGTGTCTGTTTC 25 FALSE NA NA AATAAA -32 NA NA NA 17 NA PB.518.17 chr1 + 1198 10 full-splice_match EIF3I ENST00000471486.6 1482 10 10 274 7 -5 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAATACAAAAATTAGCCA 26 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.518.18 chr1 + 1361 10 full-splice_match EIF3I ENST00000471486.6 1482 10 100 21 97 -6 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 72 19.288155 1.285291 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAAATGGCTTCTGGTCAG 116 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 72 NA PB.518.19 chr1 + 1261 9 incomplete-splice_match EIF3I ENST00000471486.6 1482 10 1625 -1 1622 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 56 15.001898 1.176146 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTTGTGGTGTCTGTTTCA 1641 FALSE NA NA AATAAA -33 NA NA NA 56 NA PB.518.20 chr1 + 964 9 incomplete-splice_match EIF3I ENST00000471486.6 1482 10 1647 274 1644 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAATACAAAAATTAGCCA 1663 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.518.21 chr1 + 1134 7 incomplete-splice_match EIF3I ENST00000471486.6 1482 10 3734 0 -1167 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 33 8.840405 0.946472 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATTTTGTGGTGTCTGTTTC 3750 FALSE NA NA AATAAA -32 NA NA NA 33 NA PB.518.22 chr1 + 1004 7 incomplete-splice_match EIF3I ENST00000471486.6 1482 10 3865 -1 -1036 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.482584 0.541902 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTTGTGGTGTCTGTTTCA 3881 FALSE NA NA AATAAA -33 NA NA NA 13 NA PB.518.23 chr1 + 891 7 incomplete-splice_match EIF3I ENST00000677183.1 1652 10 3885 67 -1035 -10 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAGAAGAAGG 3882 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.518.24 chr1 + 912 6 incomplete-splice_match EIF3I ENST00000471486.6 1482 10 4036 2 -865 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 34 9.108295 0.959437 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GATATTTTGTGGTGTCTGTT -6 TRUE NA NA AATAAA -30 NA NA NA 34 NA PB.518.25 chr1 + 616 6 incomplete-splice_match EIF3I ENST00000489353.6 2961 9 4063 66 -841 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAATACAAAAATTAGCCA 18 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.518.26 chr1 + 790 5 full-splice_match EIF3I ENST00000678306.1 1795 5 1227 -222 951 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.214692 0.507139 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATTTTGTGGTGTCTGTTTC 2086 FALSE NA NA AATAAA -32 NA NA NA 12 NA PB.518.27 chr1 + 654 3 full-splice_match EIF3I ENST00000678106.1 2075 3 1521 -100 1521 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATATTTTGTGGTGTCTGTTT 2656 FALSE NA NA AATAAA -31 NA NA NA 5 NA PB.520.1 chr1 + 946 2 full-splice_match FAM167B ENST00000373582.4 947 2 0 1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATCAAGGTCTCTTGCAGTCG -6 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 9 NA PB.521.2 chr1 + 2344 3 novel_in_catalog LCK novel 2126 12 NA NA 0 40 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.521.3 chr1 + 2181 13 novel_not_in_catalog LCK novel 2091 13 NA NA 0 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACATCTCTTTGCTGTCCACT -9 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.521.4 chr1 + 2112 11 full-splice_match LCK ENST00000373564.7 2137 11 25 0 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACATCTCTTTGCTGTCCACT -9 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.521.5 chr1 + 1938 12 novel_in_catalog LCK novel 2091 13 NA NA 0 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.750474 0.574086 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACATCTCTTTGCTGTCCACT -9 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 14 NA PB.521.6 chr1 + 2090 13 full-splice_match LCK ENST00000336890.10 2091 13 0 1 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 130 34.825836 1.541902 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACATCTCTTTGCTGTCCACT -8 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 130 NA PB.521.7 chr1 + 1936 12 novel_in_catalog LCK novel 2099 13 NA NA 0 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACATCTCTTTGCTGTCCACT -1 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 3 NA PB.521.8 chr1 + 2099 13 novel_in_catalog LCK novel 2099 13 NA NA 0 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACATCTCTTTGCTGTCCACT 10 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.521.9 chr1 + 2166 12 incomplete-splice_match LCK ENST00000336890.10 2091 13 22875 3 8 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GTACATCTCTTTGCTGTCCA 0 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 7 NA PB.521.10 chr1 + 2069 13 full-splice_match LCK ENST00000619559.4 2099 13 29 1 8 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 60 16.073462 1.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACATCTCTTTGCTGTCCAC 0 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 60 NA PB.521.11 chr1 + 1963 12 incomplete-splice_match LCK ENST00000619559.4 2099 13 233 1 212 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACATCTCTTTGCTGTCCAC 7 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 9 NA PB.521.12 chr1 + 1828 11 incomplete-splice_match LCK ENST00000619559.4 2099 13 670 1 649 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACATCTCTTTGCTGTCCAC 444 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 6 NA PB.521.13 chr1 + 1686 9 incomplete-splice_match LCK ENST00000619559.4 2099 13 1224 0 -285 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACATCTCTTTGCTGTCCACT 998 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 10 NA PB.521.14 chr1 + 1451 7 incomplete-splice_match LCK ENST00000619559.4 2099 13 1849 0 340 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACATCTCTTTGCTGTCCACT 1623 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 6 NA PB.521.15 chr1 + 1340 6 incomplete-splice_match LCK ENST00000619559.4 2099 13 2232 1 723 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACATCTCTTTGCTGTCCAC 2006 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 8 NA PB.521.16 chr1 + 1240 6 incomplete-splice_match LCK ENST00000619559.4 2099 13 2332 1 823 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.214692 0.507139 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACATCTCTTTGCTGTCCAC 2106 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 12 NA PB.521.17 chr1 + 1194 5 incomplete-splice_match LCK ENST00000619559.4 2099 13 2495 1 986 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACATCTCTTTGCTGTCCAC 2269 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.522.1 chr1 - 946 4 novel_in_catalog TMEM234 novel 1107 5 NA NA 0 1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAGGTTAGTAAGTATTCT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.522.2 chr1 - 1412 4 full-splice_match TMEM234 ENST00000373593.5 1411 4 -4 3 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 CAAGAGGTTAGTAAGTATTC -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.522.3 chr1 - 1376 4 incomplete-splice_match TMEM234 ENST00000309777.11 1107 5 12 7 2 -7 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAACAGACAAGAGGTTAGTA 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.522.4 chr1 - 1094 5 full-splice_match TMEM234 ENST00000309777.11 1107 5 6 7 0 -7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 23 6.161494 0.789686 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAACAGACAAGAGGTTAGTA -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 23 NA PB.523.1 chr1 - 1794 2 full-splice_match MARCKSL1 ENST00000329421.8 1546 2 0 -248 0 248 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAATGAAAATAGTATCTC -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.523.2 chr1 - 1552 2 full-splice_match MARCKSL1 ENST00000329421.8 1546 2 0 -6 0 6 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3077 824.300720 2.916086 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CTTTAATGAGTGGTCTTCTG -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3077 NA PB.523.7 chr1 - 1320 2 novel_not_in_catalog MARCKSL1 novel 1546 2 NA NA 0 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTGGTGCTTTAATGAGTGG -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.523.8 chr1 - 1332 2 full-splice_match MARCKSL1 ENST00000329421.8 1546 2 213 1 213 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 33 8.840405 0.946472 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTGGTGCTTTAATGAGTGG 3653 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 33 NA PB.523.9 chr1 - 1506 3 novel_not_in_catalog MARCKSL1 novel 1546 2 NA NA -15171 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGTGGTGCTTTAATGAGTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.523.16 chr1 - 1442 2 full-splice_match MARCKSL1 ENST00000329421.8 1546 2 0 104 0 -104 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 19 5.089930 0.706712 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACCCCAGATTTGTACTTT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.523.17 chr1 - 1313 2 full-splice_match MARCKSL1 ENST00000329421.8 1546 2 -4 237 -4 -237 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 138 36.968964 1.567837 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGCCTGTGAATCAACTGTGT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 138 NA PB.523.19 chr1 - 1038 2 full-splice_match MARCKSL1 ENST00000329421.8 1546 2 270 238 270 -238 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAGCCTGTGAATCAACTGTG 3710 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.523.21 chr1 - 1148 2 full-splice_match MARCKSL1 ENST00000329421.8 1546 2 153 245 153 -245 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACCTCCAGCCTGTGAATC 3593 FALSE NA NA GGGGCT -2 NA NA NA 3 NA PB.524.2 chr1 + 2108 14 full-splice_match HDAC1 ENST00000373548.8 2118 14 12 -2 12 2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 994 266.283691 2.425344 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTCCTGAGCTTGTTTCCTAT 5 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 994 NA PB.524.3 chr1 + 2022 13 novel_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA 18 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATATCCTCCTGAGCTTGTTT 11 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.524.4 chr1 + 2480 14 novel_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA 21 2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTCCTGAGCTTGTTTCCTAT 14 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 7 NA PB.524.5 chr1 + 1243 3 novel_not_in_catalog HDAC1 novel 895 5 NA NA -21 -22209 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATCTCTTTGATGAGCATTTG 24 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.524.6 chr1 + 3466 13 novel_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA -11 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCTCCTGAGCTTGTTTCC -17 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 5 NA PB.524.7 chr1 + 2533 13 novel_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA -11 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCTCCTGAGCTTGTTTC -17 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.524.8 chr1 + 1982 13 novel_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA -11 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.946801 0.469351 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCTCCTGAGCTTGTTTC -17 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 11 NA PB.524.9 chr1 + 1712 12 novel_not_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA -10 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.822039 0.683231 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCTCCTGAGCTTGTTTCC -16 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 18 NA PB.524.10 chr1 + 1959 13 novel_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA -7 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCTCCTGAGCTTGTTTCC -13 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 5 NA PB.524.11 chr1 + 1368 12 incomplete-splice_match HDAC1 ENST00000373548.8 2118 14 48 1427 -4 418 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 23 6.161494 0.789686 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAACAGAGGATGAAAAAGA -10 TRUE NA NA AAAAAG -12 NA NA NA 23 NA PB.524.12 chr1 + 2166 14 novel_not_in_catalog HDAC1 novel 2409 7 NA NA 90 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATATCCTCCTGAGCTTGTTT 11 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.524.13 chr1 + 1901 13 incomplete-splice_match HDAC1 ENST00000373548.8 2118 14 10621 -2 10543 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTCCTGAGCTTGTTTCCTAT NA FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 10 NA PB.524.14 chr1 + 1748 11 incomplete-splice_match HDAC1 ENST00000373548.8 2118 14 32398 1 -2708 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 39 10.447750 1.019023 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCTCCTGAGCTTGTTTCC 1733 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 39 NA PB.524.15 chr1 + 1461 9 incomplete-splice_match HDAC1 ENST00000373548.8 2118 14 35527 2 336 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 23 6.161494 0.789686 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCTCCTGAGCTTGTTTC 4862 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 23 NA PB.524.16 chr1 + 1392 8 incomplete-splice_match HDAC1 ENST00000373548.8 2118 14 36986 2 -411 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 23 6.161494 0.789686 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCTCCTGAGCTTGTTTC 6321 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 23 NA PB.524.17 chr1 + 2634 7 full-splice_match HDAC1 ENST00000476391.5 2409 7 -235 10 -235 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCTCCTGAGCTTGTTTCC 6497 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.524.18 chr1 + 1227 7 full-splice_match HDAC1 ENST00000476391.5 2409 7 1172 10 503 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 20 5.357821 0.728988 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCTCCTGAGCTTGTTTCC 7904 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 20 NA PB.524.19 chr1 + 1094 6 incomplete-splice_match HDAC1 ENST00000476391.5 2409 7 1385 11 -671 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 25 6.697276 0.825898 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCTCCTGAGCTTGTTTC 34 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 25 NA PB.524.20 chr1 + 698 3 incomplete-splice_match HDAC1 ENST00000471488.1 726 4 670 -549 670 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTCCTGAGCTTGTTTCCTAT 1375 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 4 NA PB.525.1 chr1 - 2824 11 full-splice_match BSDC1 ENST00000455895.7 3309 11 10 475 0 5 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 62 16.609243 1.220350 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGAAAGGTGTCTGGGGGTCT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 62 NA PB.525.2 chr1 - 1805 3 incomplete-splice_match BSDC1 ENST00000455895.7 3309 11 18026 475 -1633 5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGAAAGGTGTCTGGGGGTCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.525.3 chr1 - 2880 11 full-splice_match BSDC1 ENST00000446293.6 1505 11 -10 -1365 1 1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCTGAAAGGTGTCTGGGG -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.525.4 chr1 - 2313 6 incomplete-splice_match BSDC1 ENST00000455895.7 3309 11 15679 480 -3980 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAAGCTGAAAGGTGTCTGGG 8014 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.525.5 chr1 - 2208 4 incomplete-splice_match BSDC1 ENST00000455895.7 3309 11 16390 480 -3269 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAAGCTGAAAGGTGTCTGGG 8725 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.525.6 chr1 - 1606 2 incomplete-splice_match BSDC1 ENST00000444377.5 2925 12 25918 0 6272 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.214692 0.507139 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAAGCTGAAAGGTGTCTGGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.525.9 chr1 - 2592 9 incomplete-splice_match BSDC1 ENST00000455895.7 3309 11 7609 555 7593 -17 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAGAAAGAAAAAAGAA 7602 FALSE NA NA CATAAA -6 NA NA NA 3 NA PB.525.10 chr1 - 2443 8 incomplete-splice_match BSDC1 ENST00000455895.7 3309 11 10539 555 -9120 -17 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAGAAAGAAAAAAGAA 2874 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.525.17 chr1 - 1727 10 full-splice_match BSDC1 ENST00000341071.11 4599 10 -5 2877 0 -15 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAAAAAAAAAAAAGGAAA 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.525.18 chr1 - 1675 10 incomplete-splice_match BSDC1 ENST00000455895.7 3309 11 10 3416 0 -16 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 23 6.161494 0.789686 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 GAAAAAAAAAAAAAAAGGAA 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 23 NA PB.525.19 chr1 - 1617 10 full-splice_match BSDC1 ENST00000373520.8 1630 10 -3 16 0 -16 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 GAAAAAAAAAAAAAAAGGAA 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.525.20 chr1 - 1490 8 incomplete-splice_match BSDC1 ENST00000455895.7 3309 11 7642 3416 7626 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 GAAAAAAAAAAAAAAAGGAA 7635 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.525.21 chr1 - 1924 9 incomplete-splice_match BSDC1 ENST00000444377.5 2925 12 -3 10398 0 1119 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGGTGTCAGTCAGCCTTTTT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.527.1 chr1 - 1100 3 intergenic novelGene_422 novel NA NA NA NA NA NA multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA TRUE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TATATAATGGAATTGTGTAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.528.2 chr1 + 1913 5 full-splice_match ZBTB8A ENST00000373510.9 7077 5 -232 5396 -232 -445 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACTTGCATGCTTTCTGAAC 25 TRUE NA NA AAGAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.528.5 chr1 + 1888 5 full-splice_match ZBTB8A ENST00000373510.9 7077 5 28 5161 26 -210 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACCAAACTTTATGTAAGAC 7 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.529.1 chr1 - 1939 6 full-splice_match ZBTB8OS ENST00000436661.6 514 6 -411 -1014 -68 4 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTTATTGTTGTTTTTGTTTA 257 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.529.2 chr1 - 1613 7 full-splice_match ZBTB8OS ENST00000373501.6 598 7 -10 -1005 0 -5 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAATTTCTTTATTGTTGT 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.529.3 chr1 - 1585 7 novel_in_catalog ZBTB8OS novel 1567 7 NA NA 0 -5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAATTTCTTTATTGTTGT 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.529.4 chr1 - 1605 7 full-splice_match ZBTB8OS ENST00000468695.6 1567 7 -43 5 -28 -5 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAATTTCTTTATTGTTGT 635 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.529.5 chr1 - 1184 3 full-splice_match ZBTB8OS ENST00000467652.5 388 3 209 -1005 209 -5 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAATTTCTTTATTGTTGT NA FALSE NA NA AAGAAA -6 NA NA NA 2 NA PB.529.8 chr1 - 1553 6 novel_in_catalog ZBTB8OS novel 1567 7 NA NA -2 -6 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAATTTCTTTATTGTTG 661 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.529.9 chr1 - 1535 6 novel_in_catalog ZBTB8OS novel 620 7 NA NA 0 -6 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAATTTCTTTATTGTTG 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.529.10 chr1 - 1507 6 full-splice_match ZBTB8OS ENST00000436661.6 514 6 11 -1004 0 -6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAATTTCTTTATTGTTG -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.529.11 chr1 - 1546 7 full-splice_match ZBTB8OS ENST00000468695.6 1567 7 15 6 0 -6 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 28 7.500949 0.875116 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAATTTCTTTATTGTTG 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 28 NA PB.529.12 chr1 - 1568 6 novel_in_catalog ZBTB8OS novel 548 6 NA NA 4 -7 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGAAAAATTTCTTTATTGTT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.529.13 chr1 - 1247 6 novel_in_catalog ZBTB8OS novel 1567 7 NA NA 0 -5 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGAACTGTTTTTGTTTTCC -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.529.14 chr1 - 997 7 full-splice_match ZBTB8OS ENST00000468695.6 1567 7 -445 1015 -92 -5 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGAACTGTTTTTGTTTTCC 233 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.529.15 chr1 - 510 6 full-splice_match ZBTB8OS ENST00000436661.6 514 6 -1 5 -1 -5 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGAACTGTTTTTGTTTTCC 667 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.529.16 chr1 - 537 7 full-splice_match ZBTB8OS ENST00000468695.6 1567 7 15 1015 0 -5 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGAACTGTTTTTGTTTTCC 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.530.1 chr1 + 2373 12 full-splice_match RBBP4 ENST00000373493.10 7883 12 -50 5560 16 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 753 201.721954 2.304753 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT 10 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 753 NA PB.530.2 chr1 + 2212 12 full-splice_match RBBP4 ENST00000373493.10 7883 12 -38 5709 -8 -149 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 157 42.058891 1.623858 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAAGAGTTGCTTTTTTTTTT -39 TRUE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 157 NA PB.530.3 chr1 + 1600 12 novel_not_in_catalog RBBP4 novel 7883 12 NA NA 0 19678 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAGAACAAGGCAGAAGTG -31 TRUE NA NA AGTAAA -7 NA NA NA 2 NA PB.530.4 chr1 + 1440 11 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000373485.5 1417 12 -56 7657 0 99 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTTTACTCCCAGGTGTGATT -31 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.530.6 chr1 + 2355 12 novel_not_in_catalog RBBP4 novel 7883 12 NA NA -12 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATAACCCCATGCTGATGGGT -13 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.530.8 chr1 + 1624 13 novel_in_catalog RBBP4 novel 7883 12 NA NA -9 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT -10 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.530.9 chr1 + 1505 13 novel_in_catalog RBBP4 novel 7883 12 NA NA -9 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT -10 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 7 NA PB.530.11 chr1 + 704 2 full-splice_match RBBP4 ENST00000465780.1 690 2 -27 13 -9 -13 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAAGAAAAAAGTATTA -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.530.12 chr1 + 2787 10 novel_in_catalog RBBP4 novel 7883 12 NA NA -7 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT -8 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.530.13 chr1 + 1437 12 full-splice_match RBBP4 ENST00000373485.5 1417 12 -26 6 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.893603 0.770381 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT -1 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 22 NA PB.530.16 chr1 + 2461 12 full-splice_match RBBP4 ENST00000373493.10 7883 12 1 5421 -1 133 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AGCTGTAGAAAAGAACTTTA 0 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.530.18 chr1 + 2444 13 novel_in_catalog RBBP4 novel 7883 12 NA NA -1 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 6 NA PB.530.20 chr1 + 2411 13 novel_not_in_catalog RBBP4 novel 7883 12 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACCCCATGCTGATGGGTT 8 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.530.21 chr1 + 2399 13 novel_in_catalog RBBP4 novel 7883 12 NA NA -4 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATGCTGATGGGTTTTATTTA 21 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.530.22 chr1 + 2286 12 full-splice_match RBBP4 ENST00000373493.10 7883 12 37 5560 11 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 90 24.110193 1.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT 36 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 90 NA PB.530.23 chr1 + 2138 12 full-splice_match RBBP4 ENST00000373493.10 7883 12 37 5708 11 -148 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGAGTTGCTTTTTTTTTTT 36 TRUE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 7 NA PB.530.25 chr1 + 2231 12 full-splice_match RBBP4 ENST00000373493.10 7883 12 92 5560 22 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 67 17.948700 1.254033 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT 91 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 67 NA PB.530.26 chr1 + 2280 12 novel_not_in_catalog RBBP4 novel 882 8 NA NA -50 -148 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGAGTTGCTTTTTTTTTTT 226 FALSE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.530.29 chr1 + 2041 11 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000458695.6 1674 12 577 -463 446 -148 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGAGTTGCTTTTTTTTTTT 197 FALSE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 3 NA PB.530.30 chr1 + 2058 10 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000458695.6 1674 12 6073 -611 5942 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT 5693 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 10 NA PB.530.33 chr1 + 1824 10 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000458695.6 1674 12 6159 -463 6028 -148 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGAGTTGCTTTTTTTTTTT 5779 FALSE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 7 NA PB.530.35 chr1 + 1915 9 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000458695.6 1674 12 16867 -610 -96 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 36 9.644077 0.984261 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACCCCATGCTGATGGGTT 6315 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 36 NA PB.530.36 chr1 + 1689 9 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000458695.6 1674 12 16945 -462 -18 -149 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAAGAGTTGCTTTTTTTTTT 6393 FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 4 NA PB.530.37 chr1 + 1804 9 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000458695.6 1674 12 16979 -611 16 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.893603 0.770381 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT 6427 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 22 NA PB.530.40 chr1 + 1652 8 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000492348.6 1547 10 17609 -446 257 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 33 8.840405 0.946472 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACCCCATGCTGATGGGTT 6918 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 33 NA PB.530.42 chr1 + 1549 7 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000460669.5 783 8 -60 2 -46 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.554148 0.658407 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT 7139 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 17 NA PB.530.44 chr1 + 1368 7 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000460669.5 783 8 -27 150 -13 -148 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.822039 0.683231 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGAGTTGCTTTTTTTTTTT 7172 FALSE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 18 NA PB.530.45 chr1 + 1461 6 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000460669.5 783 8 126 2 -23 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 26 6.965167 0.842932 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT 7325 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 26 NA PB.530.47 chr1 + 1174 5 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000460669.5 783 8 392 151 243 -149 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAAGAGTTGCTTTTTTTTTT 7591 FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 7 NA PB.530.48 chr1 + 1322 5 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000460669.5 783 8 393 2 244 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 41 10.983533 1.040742 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT 7592 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 41 NA PB.530.49 chr1 + 1025 3 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000460669.5 783 8 3542 151 3393 -149 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAAGAGTTGCTTTTTTTTTT NA FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 6 NA PB.530.50 chr1 + 1164 3 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000460669.5 783 8 3551 3 3402 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 56 15.001898 1.176146 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACCCCATGCTGATGGGTT NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 56 NA PB.530.52 chr1 + 906 2 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000460669.5 783 8 3753 150 3604 -148 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGAGTTGCTTTTTTTTTTT NA FALSE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 10 NA PB.532.4 chr1 - 1396 3 incomplete-splice_match SYNC ENST00000373484.4 1824 4 7827 -836 7827 -749 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 GTTATGTAGAAAAGCAATTT 7867 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.532.5 chr1 - 1963 5 full-splice_match SYNC ENST00000409190.8 3503 5 26 1514 12 71 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACATGGGTTTACAATTTCCA 16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.533.1 chr1 + 4167 2 incomplete-splice_match KIAA1522 ENST00000373480.1 5294 7 4714 0 4714 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCTGTGGCTACTGCTTCTTA 2450 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.533.2 chr1 + 3640 2 incomplete-splice_match KIAA1522 ENST00000373480.1 5294 7 5240 1 5240 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GGCTGTGGCTACTGCTTCTT 195 FALSE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.533.3 chr1 + 2721 2 incomplete-splice_match KIAA1522 ENST00000373480.1 5294 7 6159 1 6159 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GGCTGTGGCTACTGCTTCTT 293 FALSE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 7 NA PB.533.4 chr1 + 2536 2 incomplete-splice_match KIAA1522 ENST00000373480.1 5294 7 6345 0 6345 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCTGTGGCTACTGCTTCTTA 479 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 5 NA PB.533.5 chr1 + 2191 2 incomplete-splice_match KIAA1522 ENST00000373480.1 5294 7 6690 0 6690 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCTGTGGCTACTGCTTCTTA 824 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 10 NA PB.535.1 chr1 - 2909 13 full-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 -2 -464 -2 462 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCTAGGTCAAGCTCATTT -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.535.2 chr1 - 2464 13 full-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 -22 1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 580 155.376801 2.191386 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GTGTCTGGATGTGAGCTGGA -30 TRUE NA NA AAAAAG -18 NA NA NA 580 NA PB.535.4 chr1 - 2486 14 novel_in_catalog YARS1 novel 2443 13 NA NA 3 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGTCTGGATGTGAGCTGGAC -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.535.5 chr1 - 2036 11 novel_in_catalog YARS1 novel 2443 13 NA NA -3 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGTCTGGATGTGAGCTGGAC 30 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.535.6 chr1 - 1487 6 full-splice_match YARS1 ENST00000478828.1 1044 6 309 -752 309 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 20 5.357821 0.728988 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGTCTGGATGTGAGCTGGAC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 20 NA PB.535.7 chr1 - 1053 3 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000469100.5 2247 4 1953 10 561 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 32 8.572514 0.933108 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 32 NA PB.535.8 chr1 - 905 2 full-splice_match YARS1 ENST00000490826.1 2178 2 1270 3 1270 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.822039 0.683231 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.535.9 chr1 - 2126 11 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 6590 1 879 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.214692 0.507139 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GTGTCTGGATGTGAGCTGGA 7384 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.535.11 chr1 - 1318 5 full-splice_match YARS1 ENST00000487404.5 2197 5 1320 -441 -332 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GTGTCTGGATGTGAGCTGGA NA FALSE NA NA ATTAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.535.13 chr1 - 1211 4 full-splice_match YARS1 ENST00000469100.5 2247 4 1032 4 -360 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 43 11.519315 1.061427 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGTGTCTGGATGTGAGCTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 43 NA PB.535.14 chr1 - 2035 11 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 6678 4 967 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.554148 0.658407 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGGTGTCTGGATGTGAGCT 7472 FALSE NA NA GGGGCT -12 NA NA NA 17 NA PB.535.15 chr1 - 2931 13 novel_in_catalog YARS1 novel 3263 13 NA NA 2 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG 35 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.535.17 chr1 - 2923 12 novel_in_catalog YARS1 novel 3263 13 NA NA 3 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.535.19 chr1 - 2349 13 full-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 86 8 0 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 36 9.644077 0.984261 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG 880 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 36 NA PB.535.20 chr1 - 2175 11 novel_in_catalog YARS1 novel 2443 13 NA NA -3 -3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG 30 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.535.21 chr1 - 2235 12 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 6330 8 619 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 19 5.089930 0.706712 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG 7124 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.535.22 chr1 - 2123 11 full-splice_match YARS1 ENST00000674629.1 2075 11 -12 -36 0 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG -19 TRUE NA NA AAAAAG -7 NA NA NA 9 NA PB.535.23 chr1 - 1868 10 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 10820 8 42 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.625712 0.750178 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 21 NA PB.535.24 chr1 - 1771 9 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 19555 8 411 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.286257 0.632078 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG 1302 FALSE NA NA TTTAAA -28 NA NA NA 16 NA PB.535.25 chr1 - 1637 7 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 30283 8 -341 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 27 7.233058 0.859322 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 27 NA PB.535.26 chr1 - 1580 7 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 30340 8 -284 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.535.27 chr1 - 1376 5 full-splice_match YARS1 ENST00000487404.5 2197 5 1255 -434 -397 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 25 6.697276 0.825898 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 25 NA PB.535.29 chr1 - 2152 13 full-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 -11 302 0 140 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAGGAAAGGGAAGGGAAA -19 TRUE NA NA AAAAAG -7 NA NA NA 2 NA PB.535.30 chr1 - 2023 13 full-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 -22 442 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 64 17.145027 1.234138 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATGCCACAGTCCTTATAATT -30 TRUE NA NA AAAAAG -18 NA NA NA 64 NA PB.535.32 chr1 - 1964 13 full-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 37 442 -4 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 69 18.484482 1.266807 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATGCCACAGTCCTTATAATT 29 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 69 NA PB.535.33 chr1 - 1888 14 novel_not_in_catalog YARS1 novel 2443 13 NA NA 0 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATGCCACAGTCCTTATAATT -19 TRUE NA NA AAAAAG -7 NA NA NA 2 NA PB.535.34 chr1 - 1803 12 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 6328 442 617 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATGCCACAGTCCTTATAATT 7122 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.535.35 chr1 - 1594 11 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000675785.1 2248 12 6703 372 970 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATGCCACAGTCCTTATAATT 7475 FALSE NA NA GGGGCT -9 NA NA NA 2 NA PB.535.36 chr1 - 1380 9 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000675785.1 2248 12 19534 372 368 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.946801 0.469351 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATGCCACAGTCCTTATAATT 1259 FALSE NA NA CATAAA -27 NA NA NA 11 NA PB.535.37 chr1 - 1111 7 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000675785.1 2248 12 30397 372 -249 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATGCCACAGTCCTTATAATT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.535.38 chr1 - 1178 7 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000675785.1 2248 12 30329 373 -317 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TATGCCACAGTCCTTATAAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.535.39 chr1 - 818 4 full-splice_match YARS1 ENST00000469100.5 2247 4 984 445 -408 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TATGCCACAGTCCTTATAAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.535.43 chr1 - 1973 7 novel_in_catalog YARS1 novel 1018 9 NA NA 2 173 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAG -17 TRUE NA NA AAAAAG -5 NA NA NA 3 NA PB.535.46 chr1 - 1329 7 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000616261.2 1018 9 -15 4282 -15 1 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAGTGT 18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.535.47 chr1 - 1296 6 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 12 15413 11 1 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.946801 0.469351 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAGTGT 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.536.1 chr1 - 1285 2 antisense novelGene_HPCA_AS novel NA NA NA NA NA NA multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TACCCAGGTGCCACAAAACT 7730 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.537.1 chr1 - 1052 6 novel_not_in_catalog TMEM54 novel 1030 6 NA NA -5 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATTTGGCTGCATGCAGGGG 11 TRUE NA NA GGGGCT -23 NA NA NA 9 NA PB.537.2 chr1 - 989 6 full-splice_match TMEM54 ENST00000373463.8 1030 6 41 0 4 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 52 13.930334 1.143962 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATTTGGCTGCATGCAGGGG 20 TRUE NA NA GGGGCT -14 NA NA NA 52 NA PB.537.3 chr1 - 918 6 full-splice_match TMEM54 ENST00000474144.5 748 6 -24 -146 13 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATTTGGCTGCATGCAGGGG -8 TRUE NA NA GGGGCT -42 NA NA NA 2 NA PB.537.4 chr1 - 1173 5 novel_in_catalog TMEM54 novel 1030 6 NA NA -16 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCCATTTGGCTGCATGCAGG 0 TRUE NA NA GGGGCT -34 NA NA NA 2 NA PB.538.1 chr1 - 1861 8 incomplete-splice_match RNF19B ENST00000235150.5 2677 9 15090 2 14966 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTTACCTCATTTTCCTTG 9565 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.538.2 chr1 - 1602 7 incomplete-splice_match RNF19B ENST00000373456.11 2560 9 16430 6 16430 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTTACCTCATTTTCCTTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.538.3 chr1 - 1231 4 incomplete-splice_match RNF19B ENST00000373456.11 2560 9 20585 6 20585 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTTACCTCATTTTCCTTG NA FALSE NA NA CATAAA -22 NA NA NA 5 NA PB.538.4 chr1 - 994 3 incomplete-splice_match RNF19B ENST00000373456.11 2560 9 22381 6 22381 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTTACCTCATTTTCCTTG -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.538.5 chr1 - 2240 9 full-splice_match RNF19B ENST00000235150.5 2677 9 430 7 306 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATTCAACTTACCTCATTTT 544 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.538.6 chr1 - 1492 6 incomplete-splice_match RNF19B ENST00000373456.11 2560 9 18192 11 18192 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATTCAACTTACCTCATTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.538.7 chr1 - 1064 3 incomplete-splice_match RNF19B ENST00000373456.11 2560 9 22306 11 22306 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATTCAACTTACCTCATTTT NA FALSE NA NA AATACA -38 NA NA NA 4 NA PB.541.1 chr1 + 3297 7 full-splice_match S100PBP ENST00000373475.10 4220 7 -98 1021 -2 0 alternative_3end5end TRUE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CCTAAGTGTTTACTGTTTTT -15 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.541.2 chr1 + 1622 8 novel_not_in_catalog S100PBP novel 4220 7 NA NA 13 5 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CATTGCCGACTTGAATTTTT -12 TRUE NA NA TTTAAA -26 NA NA NA 2 NA PB.541.3 chr1 + 1621 7 full-splice_match S100PBP ENST00000373475.10 4220 7 -47 2646 14 44 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 54 14.466116 1.160352 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTTTGTGTGTGTGTGTCTG -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 54 NA PB.541.5 chr1 + 4258 7 full-splice_match S100PBP ENST00000373475.10 4220 7 -39 1 22 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.625712 0.750178 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACATATGTACTGTGGCGGTC -3 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 21 NA PB.541.7 chr1 + 1651 7 novel_in_catalog S100PBP novel 4220 7 NA NA -13 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAAATGCCCATTGCCGACTT 33 FALSE NA NA TTTAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.541.8 chr1 + 1574 7 novel_not_in_catalog S100PBP novel 665 2 NA NA 333 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATGCCCATTGCCGACTTG 418 FALSE NA NA TTTAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.541.11 chr1 + 1120 5 novel_in_catalog S100PBP novel 3320 7 NA NA 1459 5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CATTGCCGACTTGAATTTTT 8703 FALSE NA NA TTTAAA -26 NA NA NA 2 NA PB.541.13 chr1 + 833 5 incomplete-splice_match S100PBP ENST00000373476.5 3320 7 9197 1671 1742 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATGCCCATTGCCGACTTG 8986 FALSE NA NA TTTAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.541.14 chr1 + 3272 5 incomplete-splice_match S100PBP ENST00000373475.10 4220 7 9238 1 1994 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACATATGTACTGTGGCGGTC 9238 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.541.15 chr1 + 2993 2 full-splice_match S100PBP ENST00000475486.1 665 2 361 -2689 361 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACATATGTACTGTGGCGGTC 6751 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.542.3 chr1 - 3572 7 full-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 24 1 4 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.750474 0.574086 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGAGGTTCTGCATGCATTAT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.542.7 chr1 - 2788 8 novel_in_catalog AK2 novel 886 7 NA NA -7 11 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTATTGTTTGTTTGCTTC -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.542.8 chr1 - 2556 6 incomplete-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 12314 895 -2866 11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTATTGTTTGTTTGCTTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.542.12 chr1 - 3842 7 novel_in_catalog AK2 novel 2840 8 NA NA -5 10 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GAGCTATTGTTTGTTTGCTT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.542.13 chr1 - 2245 4 incomplete-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 15493 896 300 10 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GAGCTATTGTTTGTTTGCTT 620 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.542.15 chr1 - 1998 2 incomplete-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 23631 896 35 10 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GAGCTATTGTTTGTTTGCTT 8758 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.542.16 chr1 - 5038 6 full-splice_match AK2 ENST00000672715.1 5970 6 35 897 -4 9 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGAGCTATTGTTTGTTTGCT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.542.17 chr1 - 2708 7 full-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 -8 897 -5 9 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 339 90.815063 1.958158 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGAGCTATTGTTTGTTTGCT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 339 NA PB.542.18 chr1 - 2587 6 novel_in_catalog AK2 novel 3597 7 NA NA 2 9 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGAGCTATTGTTTGTTTGCT 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.542.19 chr1 - 2550 6 full-splice_match AK2 ENST00000548033.5 936 6 -19 -1595 4 9 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGAGCTATTGTTTGTTTGCT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.542.20 chr1 - 2442 6 incomplete-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 12426 897 -2754 9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGAGCTATTGTTTGTTTGCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.542.21 chr1 - 2117 2 incomplete-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 23511 897 -85 9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGAGCTATTGTTTGTTTGCT 8638 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.542.27 chr1 - 2746 8 full-splice_match AK2 ENST00000467905.5 880 8 5 -1871 2 8 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTGAGCTATTGTTTGTTTGC 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.542.28 chr1 - 4011 6 full-splice_match AK2 ENST00000672715.1 5970 6 24 1935 4 198 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.625712 0.750178 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCCCTGTTGTGGCATTTT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 21 NA PB.542.30 chr1 - 1702 8 novel_not_in_catalog AK2 novel 880 8 NA NA 9 198 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCCCTGTTGTGGCATTTT 77 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.542.32 chr1 - 4119 7 full-splice_match AK2 ENST00000550338.5 886 7 52 -3285 -6 197 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCTGTTGTGGCATTT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.542.33 chr1 - 2765 7 novel_in_catalog AK2 novel 2840 8 NA NA 9 197 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.018365 0.604049 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCTGTTGTGGCATTT 77 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.542.36 chr1 - 1747 8 novel_in_catalog AK2 novel 886 7 NA NA -7 197 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.554148 0.658407 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCTGTTGTGGCATTT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.542.37 chr1 - 1782 7 full-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 -121 1936 0 197 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCTGTTGTGGCATTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.542.39 chr1 - 1672 7 full-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 -11 1936 -8 197 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 758 203.061401 2.307627 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCTGTTGTGGCATTT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 758 NA PB.542.40 chr1 - 1688 8 full-splice_match AK2 ENST00000467905.5 880 8 25 -833 2 197 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 25 6.697276 0.825898 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCTGTTGTGGCATTT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 25 NA PB.542.41 chr1 - 1534 6 full-splice_match AK2 ENST00000548033.5 936 6 -42 -556 1 197 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.286257 0.632078 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCTGTTGTGGCATTT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.542.42 chr1 - 1468 6 incomplete-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 12361 1936 -2819 197 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 24 6.429385 0.808169 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCTGTTGTGGCATTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 24 NA PB.542.44 chr1 - 1240 4 incomplete-splice_match AK2 ENST00000548033.5 936 6 15415 -556 265 197 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.625712 0.750178 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCTGTTGTGGCATTT 585 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 21 NA PB.542.45 chr1 - 1074 2 incomplete-splice_match AK2 ENST00000548033.5 936 6 23472 -556 -81 197 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.018365 0.604049 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCTGTTGTGGCATTT 8642 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.542.47 chr1 - 1518 7 full-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 -1 2080 -1 53 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 68 18.216591 1.260467 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGATTGTCCTTTCCATTC 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 68 NA PB.542.48 chr1 - 1608 8 novel_in_catalog AK2 novel 886 7 NA NA -2 39 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAGCTATGTCATCCAAAGAT 61 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.542.49 chr1 - 1560 8 full-splice_match AK2 ENST00000467905.5 880 8 -5 -675 -5 39 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAGCTATGTCATCCAAAGAT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.542.50 chr1 - 1219 7 full-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 29 2349 9 143 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 GAAAGAGATGTAAGGTGTAT 77 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.542.51 chr1 - 1003 7 full-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 29 2565 9 -32 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAGGAATCGGGTTTTCATT 77 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.542.52 chr1 - 1765 6 full-splice_match AK2 ENST00000672715.1 5970 6 35 4170 -4 888 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CTTTTGAATTCAGATTGTCT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.542.53 chr1 - 2001 5 novel_in_catalog AK2 novel 5970 6 NA NA 9 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCTTTGGCGTGTGTGCTAC 77 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.542.54 chr1 - 994 7 full-splice_match AK2 ENST00000550338.5 886 7 54 -162 -4 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.822039 0.683231 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCTTTGGCGTGTGTGCTAC 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.542.55 chr1 - 910 6 full-splice_match AK2 ENST00000672715.1 5970 6 1 5059 1 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 388 103.941719 2.016790 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCTTTGGCGTGTGTGCTAC 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 388 NA PB.542.56 chr1 - 792 5 full-splice_match AK2 ENST00000480134.5 811 5 18 1 4 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 20 5.357821 0.728988 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCTTTGGCGTGTGTGCTAC 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 20 NA PB.542.57 chr1 - 697 5 incomplete-splice_match AK2 ENST00000550338.5 886 7 12401 -162 -2798 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCTTTGGCGTGTGTGCTAC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.542.58 chr1 - 1648 6 novel_not_in_catalog AK2 novel 5970 6 NA NA -1 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCTTTGGCGTGTGTGCTA 86 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.542.62 chr1 - 1032 5 full-splice_match AK2 ENST00000487289.1 920 5 -7 -105 -7 105 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATATTCATTTTCTTTTCAA -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.542.63 chr1 - 950 5 full-splice_match AK2 ENST00000487289.1 920 5 -35 5 -2 -5 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCCATGTGTTTGTAGTCCAT 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.544.2 chr1 + 1709 9 novel_not_in_catalog AZIN2 novel 1806 8 NA NA 0 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGCGGAATCTGGCAGTTTGA -2 TRUE NA NA AATAAA -27 NA NA NA 2 NA PB.544.3 chr1 + 1639 9 incomplete-splice_match AZIN2 ENST00000373443.7 2048 11 1166 8 83 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAACTGCAGCGGAATCTG 145 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.545.1 chr1 - 2703 3 incomplete-splice_match TRIM62 ENST00000543586.1 1638 5 16604 -1302 16604 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCCAGTTCCATTCATTTTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.545.4 chr1 - 2871 5 full-splice_match TRIM62 ENST00000291416.10 3817 5 942 4 942 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGTAGCCAGTTCCATTCATT 976 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.545.5 chr1 - 3814 5 full-splice_match TRIM62 ENST00000291416.10 3817 5 -6 9 4 -9 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 29 7.768840 0.890356 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATGTCAGTAGCCAGTTCCAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 29 NA PB.545.6 chr1 - 3190 6 novel_not_in_catalog TRIM62 novel 3817 5 NA NA 0 -9 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATGTCAGTAGCCAGTTCCAT 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.546.1 chr1 + 1581 5 novel_in_catalog ZNF362 novel 3187 9 NA NA -6 380 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCATATGATTCATCCATTT -40 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.546.4 chr1 + 3035 8 novel_in_catalog ZNF362 novel 3187 9 NA NA 26 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GTGGCGGTGGTGTTTGGCGT -8 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 9 NA PB.546.5 chr1 + 2547 8 novel_in_catalog ZNF362 novel 3187 9 NA NA -22 -483 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTTTTTAAGCCTTAACTCG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.546.8 chr1 + 1948 2 incomplete-splice_match ZNF362 ENST00000373428.5 2936 8 24573 0 14798 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GTGGCGGTGGTGTTTGGCGT NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.549.1 chr1 - 2033 5 incomplete-splice_match PHC2 ENST00000373418.7 2550 7 17507 -1 2878 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTCTTTGGTGCCTTTCTCCC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.549.2 chr1 - 1694 3 incomplete-splice_match PHC2 ENST00000373418.7 2550 7 19793 -1 5164 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTCTTTGGTGCCTTTCTCCC 2180 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.549.3 chr1 - 3937 15 full-splice_match PHC2 ENST00000683057.1 3993 15 56 0 -19 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TCTCTTTGGTGCCTTTCTCC 2678 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.549.4 chr1 - 2167 6 novel_in_catalog PHC2 novel 2548 8 NA NA 963 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TCTCTTTGGTGCCTTTCTCC NA FALSE NA NA AAAACA -27 NA NA NA 2 NA PB.549.5 chr1 - 2158 6 incomplete-splice_match PHC2 ENST00000373418.7 2550 7 15696 0 1067 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TCTCTTTGGTGCCTTTCTCC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.549.6 chr1 - 1815 3 incomplete-splice_match PHC2 ENST00000373418.7 2550 7 19671 0 5042 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TCTCTTTGGTGCCTTTCTCC 2058 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.549.7 chr1 - 1614 2 incomplete-splice_match PHC2 ENST00000373418.7 2550 7 20796 0 6167 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TCTCTTTGGTGCCTTTCTCC 3183 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.549.8 chr1 - 1454 2 incomplete-splice_match PHC2 ENST00000373418.7 2550 7 20956 0 6327 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.554148 0.658407 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TCTCTTTGGTGCCTTTCTCC 3343 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.549.14 chr1 - 2318 7 full-splice_match PHC2 ENST00000373418.7 2550 7 231 1 -4 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GTCTCTTTGGTGCCTTTCTC 247 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.549.15 chr1 - 1751 3 incomplete-splice_match PHC2 ENST00000373418.7 2550 7 19734 1 5105 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.946801 0.469351 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GTCTCTTTGGTGCCTTTCTC 2121 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.549.16 chr1 - 1944 5 incomplete-splice_match PHC2 ENST00000373418.7 2550 7 17587 8 2958 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATCTGTCTCTTTGGTGC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.550.1 chr1 + 3448 8 novel_not_in_catalog ZSCAN20 novel 4316 8 NA NA 0 -859 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGGCACTTTTAAGTGTAAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.550.3 chr1 + 3281 6 novel_in_catalog ZSCAN20 novel 4316 8 NA NA 3 -855 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CACTTTTAAGTGTAATTTGT 12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.551.1 chr1 + 1352 2 full-splice_match GJB5 ENST00000338513.1 1355 2 3 0 3 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCCAGGTGCCCTCTGGTTGT -15 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.552.1 chr1 - 1015 3 incomplete-splice_match CSMD2 ENST00000373381.9 13655 71 5 518226 5 -239727 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAGAAATAAAATAAGCAA 6 TRUE NA NA AATGAA -43 NA NA NA 2 NA PB.554.1 chr1 - 2776 2 full-splice_match SMIM12 ENST00000423898.1 897 2 -61 -1818 -23 1519 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAATAGTAAATGTCATTT -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.554.3 chr1 - 2525 2 full-splice_match SMIM12 ENST00000521580.3 5694 2 0 3169 0 1519 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.946801 0.469351 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAATAGTAAATGTCATTT 13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.554.5 chr1 - 3020 2 novel_not_in_catalog SMIM12 novel 2817 2 NA NA -2 4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AATGATCGAATCTTATCATC 25 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.554.6 chr1 - 1045 2 full-splice_match SMIM12 ENST00000521580.3 5694 2 -35 4684 -29 4 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 183 49.024059 1.690409 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AATGATCGAATCTTATCATC -22 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 183 NA PB.554.8 chr1 - 1208 2 full-splice_match SMIM12 ENST00000423898.1 897 2 -9 -302 9 3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 25 6.697276 0.825898 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAATGATCGAATCTTATCAT 7903 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 25 NA PB.554.9 chr1 - 1151 2 novel_not_in_catalog SMIM12 novel 5694 2 NA NA -4 1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 CATAATGATCGAATCTTATC 23 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.554.10 chr1 - 1094 2 full-splice_match SMIM12 ENST00000521580.3 5694 2 -92 4692 -86 -4 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AGAACCATAATGATCGAATC 7788 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.555.3 chr1 - 1770 1 full-splice_match GPR199P ENST00000642415.1 926 1 -75 -769 -75 -2 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA NA NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CACTGCTGTATCTCCTGTGG 7853 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.555.4 chr1 - 2026 3 fusion GPR199P_TMEM35B novel 1887 3 NA NA 12 -3 multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TCACTGCTGTATCTCCTGTG -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.555.6 chr1 - 903 3 full-splice_match TMEM35B ENST00000373337.3 922 3 28 -9 28 9 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 184 49.291950 1.692776 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTTTTGCCTCATTGCTGTT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 184 NA PB.555.7 chr1 - 939 3 full-splice_match TMEM35B ENST00000373337.3 922 3 -26 9 -26 -9 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATAACACTGTTTCATGTCTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.556.1 chr1 + 2028 2 full-splice_match GJB3 ENST00000373366.3 2192 2 162 2 162 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACAGGTTGGCTCTGTCTCT 164 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 5 NA PB.557.2 chr1 + 1891 10 novel_not_in_catalog ZMYM1 novel 4161 10 NA NA -11 396 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAGATAAAGGAGAAGAAA NA FALSE NA NA AATAAA -33 NA NA NA 2 NA PB.557.4 chr1 + 2773 9 full-splice_match ZMYM1 ENST00000373329.5 3980 9 -11 1218 -2 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AGAAAAGAAGAAAAATTCAG -14 TRUE NA NA TTTAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.557.5 chr1 + 1188 4 incomplete-splice_match ZMYM1 ENST00000359858.9 4161 10 -5 17661 -2 604 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GGATTTTCCAAGATGTGGAA -14 TRUE NA NA ACTAAA -26 NA NA NA 2 NA PB.557.7 chr1 + 2940 10 full-splice_match ZMYM1 ENST00000359858.9 4161 10 0 1221 0 2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAGAAGAAAAATTCAGAA -9 TRUE NA NA TTTAAA -22 NA NA NA 5 NA PB.557.10 chr1 + 792 5 incomplete-splice_match ZMYM1 ENST00000373329.5 3980 9 -2 11058 -2 -6981 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TATTAACTGGCCTATGAATG -5 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.557.11 chr1 + 2728 9 novel_not_in_catalog ZMYM1 novel 3980 9 NA NA 0 2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAGAAGAAAAATTCAGAA -3 TRUE NA NA TTTAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.557.13 chr1 + 2465 7 incomplete-splice_match ZMYM1 ENST00000373329.5 3980 9 18098 1218 4250 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AGAAAAGAAGAAAAATTCAG NA FALSE NA NA TTTAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.557.16 chr1 + 3221 4 incomplete-splice_match ZMYM1 ENST00000373329.5 3980 9 30896 3 6044 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TTATCAAATGTTTTGATCTT NA FALSE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.558.3 chr1 - 2259 4 incomplete-splice_match ZMYM6 ENST00000357182.9 5122 16 26701 817 3548 -817 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCCCTTTTTGTTGAGGAATT NA FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 3 NA PB.558.7 chr1 - 3058 16 novel_in_catalog ZMYM6 novel 5122 16 NA NA 6 -2008 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAATTGGAAACATTGTGTTG 18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.558.12 chr1 - 1619 10 incomplete-splice_match ZMYM6 ENST00000357182.9 5122 16 -28 24388 -28 -6 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAGAAGAAAAATAAAGTTGT -33 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.560.3 chr1 - 1538 12 novel_in_catalog SFPQ novel 874 9 NA NA 770 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTTGGTTTTGTTTTTGTTT 769 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.560.4 chr1 - 2168 2 novel_not_in_catalog SFPQ novel 1431 3 NA NA -13 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TCCTTTGGTTTTGTTTTTGT 5283 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.560.5 chr1 - 1678 12 novel_in_catalog SFPQ novel 874 9 NA NA 628 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TCCTTTGGTTTTGTTTTTGT 627 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.560.6 chr1 - 5386 3 full-splice_match SFPQ ENST00000466213.5 1431 3 -3956 1 -1596 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 9942 FALSE NA NA ACTAAA -30 NA NA NA 2 NA PB.560.7 chr1 - 5016 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 -2184 3 -1223 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 9170 FALSE NA NA AATAAA -27 NA NA NA 4 NA PB.560.8 chr1 - 4489 3 full-splice_match SFPQ ENST00000466213.5 1431 3 -3059 1 -699 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 9694 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.560.9 chr1 - 4596 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 -1764 3 -803 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 9590 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.560.10 chr1 - 3687 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 -855 3 106 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 9989 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.560.11 chr1 - 3237 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 -405 3 294 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 9895 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.560.12 chr1 - 2600 3 full-splice_match SFPQ ENST00000466213.5 1431 3 -1170 1 229 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 8931 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.560.13 chr1 - 2411 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 421 3 421 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 9123 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.560.14 chr1 - 2305 12 novel_in_catalog SFPQ novel 874 9 NA NA 0 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.560.15 chr1 - 2300 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 532 3 532 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 9234 FALSE NA NA AAGAAA -41 NA NA NA 9 NA PB.560.16 chr1 - 1810 4 full-splice_match SFPQ ENST00000490668.5 434 4 -1377 1 -1115 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 9278 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.560.17 chr1 - 1784 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 1048 3 -351 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 9750 FALSE NA NA ATTAAA -22 NA NA NA 7 NA PB.560.18 chr1 - 1576 2 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000466745.5 662 4 302 1 302 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 5739 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.560.19 chr1 - 1637 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 1195 3 -204 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 9897 FALSE NA NA ATTAAA -26 NA NA NA 6 NA PB.560.20 chr1 - 1531 3 full-splice_match SFPQ ENST00000466213.5 1431 3 -101 1 -101 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 10000 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.560.21 chr1 - 1319 11 novel_in_catalog SFPQ novel 874 9 NA NA -893 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 1677 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.560.22 chr1 - 1270 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 1562 3 22 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 5459 FALSE NA NA AATAAA -1 NA NA NA 3 NA PB.560.23 chr1 - 1269 4 full-splice_match SFPQ ENST00000490668.5 434 4 -836 1 -574 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 9819 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.560.24 chr1 - 1170 10 novel_in_catalog SFPQ novel 874 9 NA NA -825 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 1745 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.560.26 chr1 - 1110 4 full-splice_match SFPQ ENST00000490668.5 434 4 -677 1 -415 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 9978 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.560.27 chr1 - 1069 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 1763 3 223 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.554148 0.658407 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.560.28 chr1 - 980 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 1852 3 312 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 5749 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.560.29 chr1 - 855 9 full-splice_match SFPQ ENST00000470472.5 874 9 16 3 16 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 2586 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.560.30 chr1 - 617 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 2215 3 -294 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 6112 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.560.31 chr1 - 4732 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 -1901 4 -940 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCTTTGGTTTTGTTTTT 9453 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.560.32 chr1 - 3467 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 -636 4 63 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCTTTGGTTTTGTTTTT 9664 FALSE NA NA AAAACA -10 NA NA NA 6 NA PB.560.33 chr1 - 2989 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 -158 4 -158 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCTTTGGTTTTGTTTTT 10022 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.560.34 chr1 - 2750 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 81 4 81 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCTTTGGTTTTGTTTTT 8783 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.560.35 chr1 - 2619 4 full-splice_match SFPQ ENST00000485365.1 693 4 -1928 2 -1928 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCTTTGGTTTTGTTTTT 9610 FALSE NA NA TATAAA -8 NA NA NA 2 NA PB.560.36 chr1 - 2118 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 713 4 -686 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCTTTGGTTTTGTTTTT 9415 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.560.37 chr1 - 1913 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 918 4 -481 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCTTTGGTTTTGTTTTT 9620 FALSE NA NA AATAAA -45 NA NA NA 4 NA PB.560.38 chr1 - 1418 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 1413 4 14 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCTTTGGTTTTGTTTTT 5310 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.560.39 chr1 - 1013 10 novel_in_catalog SFPQ novel 874 9 NA NA -243 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCTTTGGTTTTGTTTTT 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.560.41 chr1 - 812 2 full-splice_match SFPQ ENST00000471991.5 440 2 -376 4 99 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCTTTGGTTTTGTTTTT 6505 FALSE NA NA AATAAA -1 NA NA NA 2 NA PB.560.42 chr1 - 759 3 full-splice_match SFPQ ENST00000466213.5 1431 3 670 2 -440 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCTTTGGTTTTGTTTTT 5966 FALSE NA NA TTTAAA -36 NA NA NA 3 NA PB.560.43 chr1 - 2049 6 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 3942 1 -1161 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTCCATGGTGTTGTCAGTTA 3941 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.560.53 chr1 - 2320 9 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 1649 463 -922 -463 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAATACAAAAAATTAGCT -7 TRUE NA NA AAAAAG -6 NA NA NA 2 NA PB.560.57 chr1 - 3074 10 full-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 0 666 0 -666 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.286257 0.632078 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGTCTTTTCATGTATTCAA -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.560.58 chr1 - 2959 10 full-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 115 666 115 -666 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGTCTTTTCATGTATTCAA 114 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.560.59 chr1 - 2548 10 full-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 526 666 526 -666 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGTCTTTTCATGTATTCAA 525 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.560.60 chr1 - 2390 10 full-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 684 666 684 -666 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGTCTTTTCATGTATTCAA 683 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.560.61 chr1 - 1651 7 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 2553 673 -18 -673 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 25 6.697276 0.825898 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACATGAAGTCTTTTCATG 2552 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 25 NA PB.560.62 chr1 - 1216 4 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 5120 666 17 -666 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 52 13.930334 1.143962 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGTCTTTTCATGTATTCAA 5119 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 52 NA PB.560.65 chr1 - 2198 10 full-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 869 673 869 -673 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 19 5.089930 0.706712 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACATGAAGTCTTTTCATG 868 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.560.66 chr1 - 2043 9 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 1716 673 -855 -673 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 27 7.233058 0.859322 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACATGAAGTCTTTTCATG 1715 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 27 NA PB.560.67 chr1 - 1899 8 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 2205 673 -366 -673 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.286257 0.632078 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACATGAAGTCTTTTCATG 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.560.68 chr1 - 1762 8 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 2342 673 -229 -673 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 24 6.429385 0.808169 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACATGAAGTCTTTTCATG 22 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 24 NA PB.560.69 chr1 - 1507 6 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 3812 673 1241 -673 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 37 9.911968 0.996160 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACATGAAGTCTTTTCATG 14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 37 NA PB.560.70 chr1 - 1410 6 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 3909 673 -1194 -673 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 42 11.251424 1.051207 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACATGAAGTCTTTTCATG 3908 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 42 NA PB.560.71 chr1 - 1181 3 novel_not_in_catalog SFPQ novel 3740 10 NA NA 820 -673 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACATGAAGTCTTTTCATG 5922 FALSE NA NA AAGAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.560.72 chr1 - 1108 2 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 6022 673 919 -673 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 40 10.715641 1.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACATGAAGTCTTTTCATG 6021 FALSE NA NA AAAACA -42 NA NA NA 40 NA PB.560.74 chr1 - 1508 7 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 2552 817 -19 -817 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATGATCTATCCTTTACTTGA 2551 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.560.75 chr1 - 1307 6 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 3868 817 -1235 -817 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATGATCTATCCTTTACTTGA 3867 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.560.76 chr1 - 982 3 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 5924 817 821 -817 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATGATCTATCCTTTACTTGA 5923 FALSE NA NA AAGAAA -11 NA NA NA 4 NA PB.560.77 chr1 - 1080 4 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 5104 818 1 -818 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATGATCTATCCTTTACTTG 5103 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.560.79 chr1 - 967 6 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 3852 1173 -1251 -1173 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 31 8.304622 0.919320 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTTTGCCATTCATGCTTC 3851 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 31 NA PB.560.80 chr1 - 1133 7 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 2557 1187 -14 -1187 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAATATTGATCTTCAACTTT 2556 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.560.83 chr1 - 1804 10 full-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 750 1186 750 -1186 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.750474 0.574086 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATATTGATCTTCAACTTTG 749 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.560.84 chr1 - 2234 10 full-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 320 1186 320 -1186 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATATTGATCTTCAACTTTG 319 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.560.85 chr1 - 2112 10 full-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 442 1186 442 -1186 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATATTGATCTTCAACTTTG 441 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.560.86 chr1 - 1946 10 full-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 608 1186 608 -1186 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATATTGATCTTCAACTTTG 607 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.560.87 chr1 - 1663 10 full-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 891 1186 891 -1186 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 20 5.357821 0.728988 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATATTGATCTTCAACTTTG 890 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 20 NA PB.560.88 chr1 - 1248 8 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 2343 1186 -228 -1186 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 34 9.108295 0.959437 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATATTGATCTTCAACTTTG 23 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 34 NA PB.560.89 chr1 - 1031 6 novel_not_in_catalog SFPQ novel 3740 10 NA NA 1258 -1186 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATATTGATCTTCAACTTTG 31 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.560.90 chr1 - 743 4 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 5073 1186 -30 -1186 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.750474 0.574086 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATATTGATCTTCAACTTTG 5072 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.560.91 chr1 - 614 3 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 5923 1186 820 -1186 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATATTGATCTTCAACTTTG 5922 FALSE NA NA AAGAAA -12 NA NA NA 3 NA PB.560.92 chr1 - 2553 10 full-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 0 1187 0 -1187 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 32 8.572514 0.933108 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAATATTGATCTTCAACTTT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 32 NA PB.560.93 chr1 - 1527 9 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 1718 1187 -853 -1187 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 28 7.500949 0.875116 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAATATTGATCTTCAACTTT 1717 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 28 NA PB.560.94 chr1 - 1435 8 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 2155 1187 -416 -1187 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 33 8.840405 0.946472 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAATATTGATCTTCAACTTT 2154 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 33 NA PB.560.95 chr1 - 1165 8 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 2425 1187 -146 -1187 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAATATTGATCTTCAACTTT 2424 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.560.96 chr1 - 1064 7 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 2626 1187 55 -1187 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 20 5.357821 0.728988 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAATATTGATCTTCAACTTT 2625 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 20 NA PB.560.97 chr1 - 842 5 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 4061 1187 -1042 -1187 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.750474 0.574086 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAATATTGATCTTCAACTTT 4060 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.560.100 chr1 - 1109 5 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 531 6318 531 -6318 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAGACAAATTGGAAAGTG 530 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.561.2 chr1 + 725 3 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000314607.11 7366 30 -14 62846 -14 -17 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAATGAAATACAAATTCAA -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.561.3 chr1 + 773 4 full-splice_match ZMYM4 ENST00000441447.1 466 4 -324 17 0 -17 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAATGAAATACAAATTCAA 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.561.12 chr1 + 3498 21 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000314607.11 7366 30 116815 1879 -7156 -1879 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAAGATAGTGAAGTGGT NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.561.13 chr1 + 4996 19 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000314607.11 7366 30 118375 115 -5596 -115 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGGGTGAGTTCTTCTTCTT NA FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.561.14 chr1 + 2887 17 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000314607.11 7366 30 120199 1880 -3772 -1880 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 TAAAAAAGATAGTGAAGTGG NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.561.15 chr1 + 4636 17 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000314607.11 7366 30 120215 115 -3756 -115 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGGGTGAGTTCTTCTTCTT NA FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.561.17 chr1 + 2424 14 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000314607.11 7366 30 123934 1880 -37 -1880 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 TAAAAAAGATAGTGAAGTGG NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.561.18 chr1 + 3998 12 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000457946.1 6003 24 34845 121 3870 -121 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TATTTGATGGGTGAGTTCTT 2356 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.561.19 chr1 + 1830 9 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000457946.1 6003 24 37224 1880 -5915 -1880 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 TAAAAAAGATAGTGAAGTGG 4735 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.561.20 chr1 + 3570 9 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000457946.1 6003 24 37249 115 -5890 -115 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGGGTGAGTTCTTCTTCTT 4760 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 4 NA PB.561.21 chr1 + 1681 8 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000457946.1 6003 24 37812 1879 -5327 -1879 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAAGATAGTGAAGTGGT 5323 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.561.23 chr1 + 1508 7 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000457946.1 6003 24 43430 1880 291 -1880 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 TAAAAAAGATAGTGAAGTGG NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.561.27 chr1 + 3093 5 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000457946.1 6003 24 46322 120 3183 -120 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTTGATGGGTGAGTTCTTC NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.561.28 chr1 + 1294 5 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000457946.1 6003 24 46361 1880 3222 -1880 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 TAAAAAAGATAGTGAAGTGG NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.561.29 chr1 + 2992 5 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000457946.1 6003 24 46423 120 3284 -120 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTTGATGGGTGAGTTCTTC NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.561.30 chr1 + 2496 5 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000457946.1 6003 24 46433 606 3294 -606 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGTGTAATAGTCCCCACTA NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 4 NA PB.561.31 chr1 + 4074 3 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000457946.1 6003 24 52050 120 8911 -120 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTTGATGGGTGAGTTCTTC NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.561.32 chr1 + 1125 4 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000457946.1 6003 24 52342 1880 9203 -1880 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 TAAAAAAGATAGTGAAGTGG NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 6 NA PB.561.33 chr1 + 2821 3 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000457946.1 6003 24 53787 121 10648 -121 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TATTTGATGGGTGAGTTCTT NA FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.561.34 chr1 + 924 3 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000457946.1 6003 24 53925 1880 10786 -1880 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 TAAAAAAGATAGTGAAGTGG NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.561.35 chr1 + 2650 3 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000457946.1 6003 24 53958 121 10819 -121 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TATTTGATGGGTGAGTTCTT NA FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 5 NA PB.562.4 chr1 - 4183 21 full-splice_match KIAA0319L ENST00000325722.8 4777 21 -19 613 -17 0 alternative_3end TRUE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 238 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.562.5 chr1 - 2556 13 incomplete-splice_match KIAA0319L ENST00000325722.8 4777 21 97055 613 -5641 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.562.6 chr1 - 2406 12 incomplete-splice_match KIAA0319L ENST00000325722.8 4777 21 101268 613 -1428 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.562.7 chr1 - 1785 8 incomplete-splice_match KIAA0319L ENST00000373266.8 2377 12 4290 0 -411 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 4297 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.562.8 chr1 - 1526 6 incomplete-splice_match KIAA0319L ENST00000373266.8 2377 12 6435 0 -73 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 6442 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.562.9 chr1 - 3658 20 novel_in_catalog KIAA0319L novel 4777 21 NA NA -17 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 238 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.562.12 chr1 - 2866 17 incomplete-splice_match KIAA0319L ENST00000325722.8 4777 21 82493 777 -4004 -164 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAATAAAAAAAAAAATTA NA FALSE NA NA AGTAAA -39 NA NA NA 2 NA PB.562.23 chr1 - 2270 13 incomplete-splice_match KIAA0319L ENST00000325722.8 4777 21 10 18143 -5 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.946801 0.469351 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAGAAGGTACCTCTCTGCC 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.562.24 chr1 - 2125 13 novel_in_catalog KIAA0319L novel 2171 13 NA NA 0 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAGAAGGTACCTCTCTGCC -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.562.25 chr1 - 1679 11 incomplete-splice_match KIAA0319L ENST00000440579.5 2171 13 48086 0 -34 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAGAAGGTACCTCTCTGCC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.562.26 chr1 - 1243 10 incomplete-splice_match KIAA0319L ENST00000440579.5 2171 13 75921 0 -8160 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAGAAGGTACCTCTCTGCC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.562.27 chr1 - 1844 8 novel_not_in_catalog KIAA0319L novel 1489 6 NA NA 3 2100 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CACCCAAGTCACCTCTTGAA -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.562.28 chr1 - 1708 8 novel_not_in_catalog KIAA0319L novel 1489 6 NA NA -14 2100 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CACCCAAGTCACCTCTTGAA 241 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.563.1 chr1 + 3960 7 novel_in_catalog NCDN novel 3698 7 NA NA -2 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GACGAGAAGCCTCCTGCGTG -25 TRUE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.563.3 chr1 + 3430 8 full-splice_match NCDN ENST00000356090.8 3433 8 -2 5 -2 2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 54 14.466116 1.160352 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAGAAGCCTCCTGCGTGGTC -25 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 54 NA PB.563.4 chr1 + 3690 7 full-splice_match NCDN ENST00000373243.7 3698 7 1 7 1 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACGAGAAGCCTCCTGCGTGG -15 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 6 NA PB.563.7 chr1 + 3233 6 incomplete-splice_match NCDN ENST00000373243.7 3698 7 1343 5 636 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAGAAGCCTCCTGCGTGGTC 43 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.563.8 chr1 + 2985 5 incomplete-splice_match NCDN ENST00000373243.7 3698 7 2670 4 1963 3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGAAGCCTCCTGCGTGGTCT 83 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 5 NA PB.563.9 chr1 + 2668 5 incomplete-splice_match NCDN ENST00000373243.7 3698 7 2984 7 -1685 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACGAGAAGCCTCCTGCGTGG 203 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.563.10 chr1 + 2109 4 incomplete-splice_match NCDN ENST00000373243.7 3698 7 4639 8 -30 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GACGAGAAGCCTCCTGCGTG 1858 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 6 NA PB.563.11 chr1 + 1727 3 incomplete-splice_match NCDN ENST00000373243.7 3698 7 5589 8 920 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GACGAGAAGCCTCCTGCGTG 2808 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 4 NA PB.563.12 chr1 + 1632 2 incomplete-splice_match NCDN ENST00000373243.7 3698 7 6025 7 1356 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACGAGAAGCCTCCTGCGTGG 3244 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.564.1 chr1 - 884 3 full-splice_match TFAP2E-AS1 ENST00000444348.2 902 3 7 11 7 -5 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.946801 0.469351 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACACATCAATGGATGGTG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.565.1 chr1 + 2264 7 full-splice_match TFAP2E ENST00000373235.4 2245 7 -24 5 -24 -5 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAATGTCCAGTGCAACTT 6579 FALSE NA NA ATTAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.566.8 chr1 - 1745 7 novel_not_in_catalog PSMB2 novel 4426 6 NA NA -8 1049 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATTTGGGTGTCTTATACA -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.566.10 chr1 - 2364 6 full-splice_match PSMB2 ENST00000373237.4 4426 6 17 2045 17 1048 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGATTTGGGTGTCTTATAC 24 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.566.12 chr1 - 2129 6 full-splice_match PSMB2 ENST00000373237.4 4426 6 17 2280 17 813 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.018365 0.604049 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATGTGTGTTTCAGAATGT 24 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.566.13 chr1 - 1785 7 novel_not_in_catalog PSMB2 novel 4426 6 NA NA -38 813 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATGTGTGTTTCAGAATGT -31 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.566.15 chr1 - 1719 3 incomplete-splice_match PSMB2 ENST00000630477.1 1127 5 22177 -813 22177 813 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATGTGTGTTTCAGAATGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.566.25 chr1 - 862 6 full-splice_match PSMB2 ENST00000373237.4 4426 6 -35 3599 -35 -506 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 542 145.196945 2.161958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GAGCCCTCTGGTCCAGGTCT -28 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 542 NA PB.566.26 chr1 - 760 6 novel_not_in_catalog PSMB2 novel 4426 6 NA NA -8 -506 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.946801 0.469351 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GAGCCCTCTGGTCCAGGTCT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.566.27 chr1 - 883 6 novel_not_in_catalog PSMB2 novel 4426 6 NA NA -31 -507 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGAGCCCTCTGGTCCAGGTC -24 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.566.28 chr1 - 641 5 incomplete-splice_match PSMB2 ENST00000373237.4 4426 6 5094 3600 -4895 -507 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGAGCCCTCTGGTCCAGGTC 5101 FALSE NA NA AAGAAA -35 NA NA NA 4 NA PB.566.29 chr1 - 803 6 full-splice_match PSMB2 ENST00000373237.4 4426 6 20 3603 20 -510 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 105 28.128559 1.449147 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATTGAGCCCTCTGGTCCAG 27 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 105 NA PB.567.1 chr1 - 2965 2 novel_in_catalog C1orf216 novel 492 3 NA NA 13 1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTTCTTGAGTATGTGTTTT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.567.3 chr1 - 2921 2 full-splice_match C1orf216 ENST00000270815.5 2628 2 -300 7 -290 -7 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAATTACATTTCTTGAGTA 6966 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.567.4 chr1 - 2600 2 full-splice_match C1orf216 ENST00000270815.5 2628 2 21 7 21 -7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 49 13.126660 1.118154 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAATTACATTTCTTGAGTA 11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 49 NA PB.571.1 chr1 - 4582 17 incomplete-splice_match CLSPN ENST00000318121.8 8512 25 16144 2141 -5060 2028 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGATTTGCTGTCCAGCTTG 6714 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.571.2 chr1 - 3295 9 incomplete-splice_match CLSPN ENST00000373220.7 3977 24 26400 -2152 5246 2028 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGATTTGCTGTCCAGCTTG NA FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.571.7 chr1 - 2578 3 incomplete-splice_match CLSPN ENST00000466308.1 717 4 442 -2027 442 2027 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAAGATTTGCTGTCCAGCTT 422 FALSE NA NA AAGAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.571.13 chr1 - 1985 10 incomplete-splice_match CLSPN ENST00000373220.7 3977 24 -66 13382 -16 -2822 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAGAAATAGAAACAAAAGAT -16 TRUE NA NA GGGGCT -9 NA NA NA 4 NA PB.571.15 chr1 - 1742 9 incomplete-splice_match CLSPN ENST00000318121.8 8512 25 5442 17675 5392 -2822 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAGAAATAGAAACAAAAGAT 5442 FALSE NA NA TATAAA -12 NA NA NA 6 NA PB.571.17 chr1 - 1448 8 incomplete-splice_match CLSPN ENST00000318121.8 8512 25 6680 17675 6630 -2822 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAGAAATAGAAACAAAAGAT 6680 FALSE NA NA CATAAA -12 NA NA NA 9 NA PB.571.18 chr1 - 1269 7 incomplete-splice_match CLSPN ENST00000318121.8 8512 25 7537 17675 7487 -2822 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.482584 0.541902 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAGAAATAGAAACAAAAGAT 7537 FALSE NA NA AAGAAA -1 NA NA NA 13 NA PB.571.21 chr1 - 1220 6 incomplete-splice_match CLSPN ENST00000520551.1 4010 25 7490 14866 7490 -4306 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 GAAGAAGAAGGAAATCAGGA 7540 FALSE NA NA AATGAA -40 NA NA NA 2 NA PB.571.22 chr1 - 1530 8 incomplete-splice_match CLSPN ENST00000520551.1 4010 25 5543 14881 5543 -4321 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAGAAGAGGAGGAGGAAGA 5593 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.571.23 chr1 - 2099 10 incomplete-splice_match CLSPN ENST00000520551.1 4010 25 -51 14883 -1 -4323 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AGAAAGAAGAGGAGGAGGAA -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.571.25 chr1 - 2626 8 incomplete-splice_match CLSPN ENST00000373220.7 3977 24 -67 23015 -17 -12455 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAATAAATAACATGAAGAA -17 TRUE NA NA GGGGCT -10 NA NA NA 2 NA PB.572.4 chr1 + 3071 19 full-splice_match AGO1 ENST00000674304.1 7478 19 24 4383 24 -104 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTCACAGTGCTAAAGACTC -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.574.2 chr1 + 3187 20 novel_not_in_catalog AGO3 novel 19660 19 NA NA 51 -134 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAATACACACCTTCATG -3 TRUE NA NA AGTAAA -21 NA NA NA 3 NA PB.574.3 chr1 + 3366 19 full-splice_match AGO3 ENST00000373191.9 19660 19 27 16267 27 -6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 19 5.089930 0.706712 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATATGCATATATATCTAGAT 19 TRUE NA NA AATATA -15 NA NA NA 19 NA PB.574.4 chr1 + 1717 6 incomplete-splice_match AGO3 ENST00000373191.9 19660 19 0 67423 0 21668 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAATAAAAATAAAAATAA -8 TRUE NA NA GATAAA -22 NA NA NA 3 NA PB.574.6 chr1 + 3288 19 full-splice_match AGO3 ENST00000373191.9 19660 19 111 16261 -42 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATATATATCTAGATCTGGAT -18 TRUE NA NA AATATA -21 NA NA NA 2 NA PB.574.7 chr1 + 3467 19 full-splice_match AGO3 ENST00000373191.9 19660 19 154 16039 1 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGAATTCTACTTTTATTTTG 25 TRUE NA NA TATAAA -13 NA NA NA 4 NA PB.574.8 chr1 + 896 5 incomplete-splice_match AGO3 ENST00000397828.3 1035 6 186 9062 10 -2 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TACATACTGGTGTCTCGAAG 34 TRUE NA NA CATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.574.9 chr1 + 976 3 incomplete-splice_match AGO3 ENST00000373191.9 19660 19 41026 67423 5176 21668 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAATAAAAATAAAAATAA 652 FALSE NA NA GATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.576.1 chr1 + 1494 10 full-splice_match TEKT2 ENST00000207457.8 1490 10 -3 -1 -3 1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GCCGGCTGTTCTCTGCCCCA -9 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.578.1 chr1 + 1666 6 full-splice_match ADPRS ENST00000373178.5 1651 6 -16 1 -16 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 364 97.512337 1.989060 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCACTGTTTCTTGTTTCTC -18 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 364 NA PB.578.2 chr1 + 1548 5 novel_in_catalog ADPRS novel 1651 6 NA NA 5 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.750474 0.574086 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCACTGTTTCTTGTTTCTC 3 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 14 NA PB.578.3 chr1 + 1464 6 full-splice_match ADPRS ENST00000373178.5 1651 6 186 1 186 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCACTGTTTCTTGTTTCTC 184 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 8 NA PB.578.4 chr1 + 1201 4 incomplete-splice_match ADPRS ENST00000373178.5 1651 6 2854 1 2854 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCACTGTTTCTTGTTTCTC 2852 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.578.5 chr1 + 1032 3 incomplete-splice_match ADPRS ENST00000373178.5 1651 6 3107 1 3107 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCACTGTTTCTTGTTTCTC 3105 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 4 NA PB.579.1 chr1 + 3367 17 full-splice_match MAP7D1 ENST00000474796.2 3372 17 3 2 3 -2 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 43 11.519315 1.061427 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCCTGCCTGTTCTTGGAG 4 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 43 NA PB.579.2 chr1 + 3256 16 full-splice_match MAP7D1 ENST00000316156.8 3456 16 198 2 3 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 29 7.768840 0.890356 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCCTGCCTGTTCTTGGAG 4 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 29 NA PB.579.3 chr1 + 1449 5 novel_not_in_catalog MAP7D1 novel 3456 16 NA NA 3 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CAATCCTGCCTGTTCTTGGA 4 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.579.5 chr1 + 3252 18 full-splice_match MAP7D1 ENST00000373150.8 3238 18 -17 3 6 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 31 8.304622 0.919320 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CAATCCTGCCTGTTCTTGGA 22 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 31 NA PB.579.6 chr1 + 3142 17 novel_in_catalog MAP7D1 novel 3238 18 NA NA 6 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.482584 0.541902 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCCTGCCTGTTCTTGGAG 22 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 13 NA PB.579.8 chr1 + 2679 17 incomplete-splice_match MAP7D1 ENST00000373150.8 3238 18 15064 2 -706 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCCTGCCTGTTCTTGGAG 104 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.579.9 chr1 + 2489 13 incomplete-splice_match MAP7D1 ENST00000474796.2 3372 17 17203 2 1395 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCCTGCCTGTTCTTGGAG 809 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.579.10 chr1 + 2364 14 incomplete-splice_match MAP7D1 ENST00000373150.8 3238 18 17194 2 1424 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCCTGCCTGTTCTTGGAG 838 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.579.11 chr1 + 2261 11 incomplete-splice_match MAP7D1 ENST00000373151.6 3324 17 20001 -7 -514 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCCTGCCTGTTCTTGGAG 3649 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.579.12 chr1 + 2000 11 incomplete-splice_match MAP7D1 ENST00000373150.8 3238 18 20263 2 -256 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCCTGCCTGTTCTTGGAG 3907 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.579.13 chr1 + 1867 10 incomplete-splice_match MAP7D1 ENST00000373150.8 3238 18 20511 2 -8 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCCTGCCTGTTCTTGGAG 179 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 6 NA PB.579.14 chr1 + 1584 9 incomplete-splice_match MAP7D1 ENST00000373150.8 3238 18 21824 2 -389 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCCTGCCTGTTCTTGGAG 519 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 9 NA PB.579.15 chr1 + 1200 7 incomplete-splice_match MAP7D1 ENST00000373148.5 1797 10 1242 -15 300 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.893603 0.770381 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCCTGCCTGTTCTTGGAG 231 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 22 NA PB.579.16 chr1 + 1078 6 incomplete-splice_match MAP7D1 ENST00000373148.5 1797 10 1461 -15 -91 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCCTGCCTGTTCTTGGAG 450 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 10 NA PB.579.17 chr1 + 934 4 full-splice_match MAP7D1 ENST00000487114.1 890 4 488 -532 488 -2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.018365 0.604049 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCCTGCCTGTTCTTGGAG 375 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 15 NA PB.580.1 chr1 - 1323 5 full-splice_match TRAPPC3 ENST00000373162.5 1056 5 206 -473 -4 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATCCCAATCATGTCCTGT 6660 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.580.2 chr1 - 1753 4 novel_in_catalog TRAPPC3 novel 1282 5 NA NA 0 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCATGTCCTGTTTTCTTT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.580.3 chr1 - 1304 5 full-splice_match TRAPPC3 ENST00000616395.4 1336 5 28 4 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.946801 0.469351 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCATGTCCTGTTTTCTTT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.580.4 chr1 - 1293 5 full-splice_match TRAPPC3 ENST00000373166.8 1282 5 -14 3 -3 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 653 174.932846 2.242871 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CAATCATGTCCTGTTTTCTT -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 653 NA PB.580.5 chr1 - 1200 4 novel_in_catalog TRAPPC3 novel 1282 5 NA NA -7 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCATGTCCTGTTTTCTTT -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.580.6 chr1 - 1196 5 full-splice_match TRAPPC3 ENST00000373166.8 1282 5 84 2 49 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCATGTCCTGTTTTCTTT 6549 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.580.7 chr1 - 1057 4 incomplete-splice_match TRAPPC3 ENST00000373166.8 1282 5 9392 3 904 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CAATCATGTCCTGTTTTCTT 9392 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.580.8 chr1 - 1518 5 full-splice_match TRAPPC3 ENST00000373162.5 1056 5 11 -473 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 48 12.858769 1.109199 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATCCCAATCATGTCCTGT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 48 NA PB.580.9 chr1 - 1152 3 novel_in_catalog TRAPPC3 novel 1282 5 NA NA 0 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATCCCAATCATGTCCTGT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.580.10 chr1 - 1075 3 full-splice_match TRAPPC3 ENST00000616074.4 1114 3 28 11 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.482584 0.541902 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATCCCAATCATGTCCTGT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.580.11 chr1 - 923 2 incomplete-splice_match TRAPPC3 ENST00000373166.8 1282 5 11510 9 3022 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATCCCAATCATGTCCTGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.580.13 chr1 - 1990 4 novel_in_catalog TRAPPC3 novel 1282 5 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAATCCCAATCATGTCCTG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.580.14 chr1 - 827 5 full-splice_match TRAPPC3 ENST00000373166.8 1282 5 0 455 0 27 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 63 16.877134 1.227299 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATGTGTGCACATTCAGGAGC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 63 NA PB.580.15 chr1 - 927 5 full-splice_match TRAPPC3 ENST00000373162.5 1056 5 151 -22 -59 22 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACCCCATGTGTGCACATTCA 6605 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.580.16 chr1 - 1062 5 full-splice_match TRAPPC3 ENST00000373162.5 1056 5 11 -17 0 17 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.946801 0.469351 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CATTTACCCCATGTGTGCAC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.581.7 chr1 + 2009 6 incomplete-splice_match THRAP3 ENST00000354618.10 4405 12 -12 13929 -1 -2741 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AACAAAAAGGAACAGGAGTT -20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.581.10 chr1 + 2378 9 incomplete-splice_match THRAP3 ENST00000354618.10 4405 12 -9 8718 1 2470 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAACATAAGGAGAGAGA -17 TRUE NA NA AATACA -42 NA NA NA 2 NA PB.581.15 chr1 + 4400 12 novel_not_in_catalog THRAP3 novel 4405 12 NA NA -1 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.482584 0.541902 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAACGGGTTCTGTTCATTGT -9 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 13 NA PB.581.18 chr1 + 2858 11 novel_not_in_catalog THRAP3 novel 4405 12 NA NA 4 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAACGGGTTCTGTTCATTGT -4 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.581.19 chr1 + 1888 5 novel_in_catalog THRAP3 novel 4405 12 NA NA 6 -2741 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AACAAAAAGGAACAGGAGTT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.581.26 chr1 + 3187 9 incomplete-splice_match THRAP3 ENST00000354618.10 4405 12 62805 4 -2470 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAAACGGGTTCTGTTCATTG NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.581.28 chr1 + 2930 8 incomplete-splice_match THRAP3 ENST00000354618.10 4405 12 64852 3 -423 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAACGGGTTCTGTTCATTGT NA FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 4 NA PB.581.29 chr1 + 2139 8 incomplete-splice_match THRAP3 ENST00000469141.6 3339 13 64869 -421 -417 421 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGTTTGGGACCAAACTGCTT NA FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.581.31 chr1 + 2512 8 incomplete-splice_match THRAP3 ENST00000354618.10 4405 12 65270 3 -5 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAACGGGTTCTGTTCATTGT NA FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 3 NA PB.581.32 chr1 + 2274 6 incomplete-splice_match THRAP3 ENST00000354618.10 4405 12 68168 3 2893 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAACGGGTTCTGTTCATTGT NA FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 5 NA PB.581.33 chr1 + 2017 4 incomplete-splice_match THRAP3 ENST00000354618.10 4405 12 72213 3 6938 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAACGGGTTCTGTTCATTGT 664 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 8 NA PB.581.34 chr1 + 1884 3 incomplete-splice_match THRAP3 ENST00000354618.10 4405 12 76461 3 11186 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAACGGGTTCTGTTCATTGT 120 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 6 NA PB.583.1 chr1 - 3626 11 full-splice_match STK40 ENST00000373132.4 3645 11 25 -6 -11 2 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TGGCCTGCGTCTCCTGCCTT 11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.583.4 chr1 - 2612 4 incomplete-splice_match STK40 ENST00000373129.7 3846 12 41707 1 17163 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTGTGGCCTGCGTCTCCTGC 4941 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.583.6 chr1 - 3712 12 novel_not_in_catalog STK40 novel 3846 12 NA NA -8599 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTGTGGCCTGCGTCTCCTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.583.7 chr1 - 2748 5 incomplete-splice_match STK40 ENST00000373129.7 3846 12 37131 6 12587 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AACCACTGTGGCCTGCGTCT 5858 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.583.8 chr1 - 2397 2 incomplete-splice_match STK40 ENST00000373129.7 3846 12 42468 6 17924 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.946801 0.469351 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AACCACTGTGGCCTGCGTCT 5702 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.583.12 chr1 - 3851 12 full-splice_match STK40 ENST00000373129.7 3846 12 -13 8 -9 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GGAACCACTGTGGCCTGCGT 13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.583.14 chr1 - 1720 11 full-splice_match STK40 ENST00000373132.4 3645 11 27 1898 -9 -1898 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAATCTGCTTTTAATCACGA 13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.585.2 chr1 - 2159 4 full-splice_match LSM10 ENST00000476041.1 1006 4 -34 -1119 -13 1119 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTTGAATTCCTGTATTTTG -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.585.3 chr1 - 1548 4 full-splice_match LSM10 ENST00000476041.1 1006 4 -32 -510 -11 510 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AATAACAGGTAGTTTTATTT -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.585.4 chr1 - 872 2 full-splice_match LSM10 ENST00000315732.3 860 2 2 -14 2 14 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 138 36.968964 1.567837 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCTCCATTTCTCATGCAGTT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 138 NA PB.585.5 chr1 - 990 3 novel_not_in_catalog LSM10 novel 860 2 NA NA 2 16 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCCATTTCTCATGCAGTTGT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.586.1 chr1 - 1458 10 full-splice_match OSCP1 ENST00000235532.9 1455 10 -12 9 -12 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.018365 0.604049 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAACTTGACCTTTCCCATT 5798 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.586.2 chr1 - 1178 8 incomplete-splice_match OSCP1 ENST00000235532.9 1455 10 3 2430 3 -3 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATAGCCCACCAGGATGAA -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.586.3 chr1 - 786 5 full-splice_match OSCP1 ENST00000354267.3 767 5 -25 6 -17 -6 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGAAATGCAATGTATTTAG 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.587.1 chr1 - 1340 8 full-splice_match MRPS15 ENST00000373116.6 953 8 8 -395 8 395 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GAAGCTGAAGTGTGAGAAGC -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.587.2 chr1 - 943 8 full-splice_match MRPS15 ENST00000373116.6 953 8 8 2 8 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 382 102.334373 2.010021 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGAGGAGAAGGAATTTATT -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 382 NA PB.587.3 chr1 - 763 6 novel_in_catalog MRPS15 novel 953 8 NA NA 13 2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TTTCTGTCTTGAAGAATGAT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.587.4 chr1 - 826 8 novel_not_in_catalog MRPS15 novel 953 8 NA NA 0 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TCTTTCTGTCTTGAAGAATG -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.587.5 chr1 - 758 8 full-splice_match MRPS15 ENST00000373116.6 953 8 141 54 102 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TCTTTCTGTCTTGAAGAATG -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.587.6 chr1 - 805 7 incomplete-splice_match MRPS15 ENST00000373116.6 953 8 386 57 347 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTCTTTCTGTCTTGAAGA 8678 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.587.7 chr1 - 801 7 novel_in_catalog MRPS15 novel 953 8 NA NA 19 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTCTTTCTGTCTTGAAGA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.588.1 chr1 - 3094 17 full-splice_match CSF3R ENST00000373103.5 3454 17 359 1 -6 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACCTGAGTCTCTGTTATTTA 2 TRUE NA NA GGGGCT -20 NA NA NA 4 NA PB.588.2 chr1 - 3007 17 full-splice_match CSF3R ENST00000373106.6 3008 17 0 1 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 25 6.697276 0.825898 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACCTGAGTCTCTGTTATTTA 8 TRUE NA NA GGGGCT -14 NA NA NA 25 NA PB.588.3 chr1 - 1793 9 incomplete-splice_match CSF3R ENST00000361632.8 2847 15 7379 35 247 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTTTTTGTTGTTGTTTATA 4605 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.588.4 chr1 - 2163 12 incomplete-splice_match CSF3R ENST00000373106.6 3008 17 2 2707 2 -2 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAATAAATAAATAAATAA 10 TRUE NA NA GGGGCT -12 NA NA NA 3 NA PB.590.1 chr1 - 1386 3 full-splice_match LINC01137 ENST00000424989.2 1419 3 28 5 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 24 6.429385 0.808169 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCAGTTATTTTTCTCTGC -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 24 NA PB.590.2 chr1 - 1369 3 novel_in_catalog LINC01137 novel 1419 3 NA NA -3 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCAGTTATTTTTCTCTGC -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.590.3 chr1 - 1302 2 full-splice_match LINC01137 ENST00000689160.1 1306 2 -1 5 -1 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCAGTTATTTTTCTCTGC -22 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.590.4 chr1 - 1184 3 novel_in_catalog LINC01137 novel 1419 3 NA NA 36 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCAGTTATTTTTCTCTGC 5376 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.591.2 chr1 - 2182 8 full-splice_match MEAF6 ENST00000475828.5 1408 8 -16 -758 -6 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTTTTTTTTTTTTTTTGACT -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.591.3 chr1 - 2126 7 full-splice_match MEAF6 ENST00000296214.10 4702 7 -8 2584 -8 -2 alternative_3end TRUE canonical NA NA NA NA 36 9.644077 0.984261 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTTTTTTTTTTTTTTTGACT -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 36 NA PB.591.4 chr1 - 1560 8 full-splice_match MEAF6 ENST00000475828.5 1408 8 -3 -149 -3 125 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.286257 0.632078 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAATCACCATGGCATATG 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.591.5 chr1 - 1541 7 full-splice_match MEAF6 ENST00000296214.10 4702 7 -32 3193 -32 125 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 206 55.185555 1.741825 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAATCACCATGGCATATG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 206 NA PB.591.6 chr1 - 1468 6 novel_in_catalog MEAF6 novel 4702 7 NA NA -3 125 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAATCACCATGGCATATG 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.591.7 chr1 - 1360 6 full-splice_match MEAF6 ENST00000373074.5 2005 6 770 -125 21 125 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAATCACCATGGCATATG 1263 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.591.8 chr1 - 1299 6 full-splice_match MEAF6 ENST00000373074.5 2005 6 831 -125 82 125 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAATCACCATGGCATATG 1324 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.591.9 chr1 - 1185 6 full-splice_match MEAF6 ENST00000373073.8 603 6 -6 -576 -3 125 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAATCACCATGGCATATG -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.591.10 chr1 - 1149 3 incomplete-splice_match MEAF6 ENST00000373074.5 2005 6 12273 -125 11524 125 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAATCACCATGGCATATG NA FALSE NA NA AATAAA -37 NA NA NA 4 NA PB.591.11 chr1 - 990 3 incomplete-splice_match MEAF6 ENST00000373074.5 2005 6 12432 -125 11683 125 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAATCACCATGGCATATG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.591.13 chr1 - 1042 3 incomplete-splice_match MEAF6 ENST00000373074.5 2005 6 12273 -18 11524 18 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACCCGAGATTGTTTTTTC NA FALSE NA NA AATAAA -37 NA NA NA 4 NA PB.591.14 chr1 - 1766 7 full-splice_match MEAF6 ENST00000296214.10 4702 7 -365 3301 -365 17 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAACCCGAGATTGTTTTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.591.15 chr1 - 1389 7 full-splice_match MEAF6 ENST00000296214.10 4702 7 12 3301 2 17 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 311 83.314110 1.920719 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAACCCGAGATTGTTTTTT 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 311 NA PB.591.16 chr1 - 1048 6 full-splice_match MEAF6 ENST00000373073.8 603 6 9 -454 2 3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.946801 0.469351 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TCATGCTTTACTTTTAAACC 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.591.17 chr1 - 1436 7 full-splice_match MEAF6 ENST00000296214.10 4702 7 -55 3321 -55 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATTCTCATGCTTTACTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.591.18 chr1 - 1428 8 full-splice_match MEAF6 ENST00000475828.5 1408 8 1 -21 1 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 24 6.429385 0.808169 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATTCTCATGCTTTACTTT 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 24 NA PB.591.19 chr1 - 1272 6 full-splice_match MEAF6 ENST00000373074.5 2005 6 730 3 -19 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATTCTCATGCTTTACTTT 1223 FALSE NA NA TTTAAA -11 NA NA NA 8 NA PB.591.20 chr1 - 1094 7 novel_in_catalog MEAF6 novel 4702 7 NA NA -6 -3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATTCTCATGCTTTACTTT -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.591.21 chr1 - 1058 4 incomplete-splice_match MEAF6 ENST00000373074.5 2005 6 4955 3 4206 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.143128 0.331048 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATTCTCATGCTTTACTTT 5448 FALSE NA NA AAGAAA -32 NA NA NA 8 NA PB.591.23 chr1 - 3885 3 novel_not_in_catalog MEAF6 novel 1408 8 NA NA 11895 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAAATTCTCATGCTTTACTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.591.24 chr1 - 1197 7 full-splice_match MEAF6 ENST00000296214.10 4702 7 -8 3513 -8 -108 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAATGGGAAACTTGCCTC -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.591.25 chr1 - 1029 7 full-splice_match MEAF6 ENST00000296214.10 4702 7 -8 3681 -8 88 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATATTGTTTTATGTTTTCTT -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.592.1 chr1 + 2647 6 novel_not_in_catalog ZC3H12A novel 2654 6 NA NA 1 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.554148 0.658407 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAAGAGGTGATTGTCTTTGT 1 TRUE NA NA AATAAA -23 NA NA NA 17 NA PB.592.2 chr1 + 2175 5 incomplete-splice_match ZC3H12A ENST00000373087.7 2654 6 1304 4 1304 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TCAAGAGGTGATTGTCTTTG 1304 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.592.3 chr1 + 1754 3 incomplete-splice_match ZC3H12A ENST00000373087.7 2654 6 7237 13 127 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TGAGCCCTTTCAAGAGGTGA 143 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.593.1 chr1 - 1506 2 full-splice_match SNIP1 ENST00000638725.1 2761 2 1409 -154 1409 154 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATTTCAAAGAGTAATGCTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.593.2 chr1 - 2479 4 full-splice_match SNIP1 ENST00000296215.8 4554 4 -13 2088 -13 153 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.018365 0.604049 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 CATTTCAAAGAGTAATGCTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.593.7 chr1 - 1709 2 full-splice_match SNIP1 ENST00000638725.1 2761 2 843 209 843 -209 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACAGCGTTCTTTCTTTATTC NA FALSE NA NA TTTAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.594.1 chr1 - 2468 16 full-splice_match GNL2 ENST00000373062.8 2350 16 2 -120 0 120 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAGGATTTCAGTGATAAGAG 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.594.2 chr1 - 625 4 full-splice_match GNL2 ENST00000462812.5 2409 4 1788 -4 -688 3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAAATTGTGTTTTCTTCCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.594.3 chr1 - 1185 7 incomplete-splice_match GNL2 ENST00000373062.8 2350 16 20252 -2 -4792 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGAAATTGTGTTTTCTTCC NA FALSE NA NA AAAAAG -20 NA NA NA 3 NA PB.594.4 chr1 - 1851 12 incomplete-splice_match GNL2 ENST00000373062.8 2350 16 8442 0 -4149 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GTTAGAAATTGTGTTTTCTT 8445 FALSE NA NA AAGAAA -14 NA NA NA 6 NA PB.594.5 chr1 - 2349 16 full-splice_match GNL2 ENST00000373062.8 2350 16 0 1 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 427 114.389473 2.058386 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGTTAGAAATTGTGTTTTCT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 427 NA PB.594.6 chr1 - 1076 6 incomplete-splice_match GNL2 ENST00000373062.8 2350 16 21119 11 -3925 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.554148 0.658407 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAACAGGCAGTTAGAAAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.594.7 chr1 - 2541 17 novel_in_catalog GNL2 novel 2350 16 NA NA 0 -6 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 23 6.161494 0.789686 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAACAGGCAGTTAGAAAT 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 23 NA PB.594.9 chr1 - 2373 16 novel_not_in_catalog GNL2 novel 2350 16 NA NA -27 -6 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAACAGGCAGTTAGAAAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.594.10 chr1 - 2127 15 incomplete-splice_match GNL2 ENST00000373062.8 2350 16 2124 11 279 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.286257 0.632078 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAACAGGCAGTTAGAAAT 2127 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.594.11 chr1 - 1967 13 incomplete-splice_match GNL2 ENST00000373062.8 2350 16 5105 11 3260 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.822039 0.683231 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAACAGGCAGTTAGAAAT 5108 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 18 NA PB.594.12 chr1 - 1708 12 incomplete-splice_match GNL2 ENST00000373062.8 2350 16 8574 11 -4017 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAACAGGCAGTTAGAAAT 8577 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.594.13 chr1 - 1589 10 incomplete-splice_match GNL2 ENST00000373062.8 2350 16 13000 11 -14 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.750474 0.574086 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAACAGGCAGTTAGAAAT NA FALSE NA NA AATAAA -6 NA NA NA 14 NA PB.594.14 chr1 - 1468 10 incomplete-splice_match GNL2 ENST00000373062.8 2350 16 13121 11 -7 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.214692 0.507139 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAACAGGCAGTTAGAAAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.594.15 chr1 - 1301 8 incomplete-splice_match GNL2 ENST00000373062.8 2350 16 19395 11 -5649 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.946801 0.469351 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAACAGGCAGTTAGAAAT NA FALSE NA NA AATACA -17 NA NA NA 11 NA PB.594.16 chr1 - 1210 8 incomplete-splice_match GNL2 ENST00000373062.8 2350 16 19486 11 -5558 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAACAGGCAGTTAGAAAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.594.17 chr1 - 912 5 incomplete-splice_match GNL2 ENST00000373062.8 2350 16 21491 11 -3553 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAACAGGCAGTTAGAAAT NA FALSE NA NA ATTAAA -10 NA NA NA 10 NA PB.594.18 chr1 - 745 4 full-splice_match GNL2 ENST00000462812.5 2409 4 1654 10 -822 -6 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAACAGGCAGTTAGAAAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.594.20 chr1 - 2064 14 incomplete-splice_match GNL2 ENST00000373062.8 2350 16 2 1459 0 -1454 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 157 42.058891 1.623858 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 GTGAAGTTAAATTATTTCAA 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 157 NA PB.594.23 chr1 - 1666 11 incomplete-splice_match GNL2 ENST00000373062.8 2350 16 5091 1501 3246 -1496 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAGAACAAAGAAAAACACTG 5094 FALSE NA NA AATAAA -36 NA NA NA 5 NA PB.594.28 chr1 - 851 5 incomplete-splice_match GNL2 ENST00000373062.8 2350 16 20258 1501 -4786 -1496 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAGAACAAAGAAAAACACTG NA FALSE NA NA AATATA -40 NA NA NA 3 NA PB.596.1 chr1 + 2307 11 full-splice_match CDCA8 ENST00000327331.2 2303 11 0 -4 0 -2 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 101 27.056995 1.432280 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATCACTGTTCATCCTGCCT -2 TRUE NA NA AATAAA -25 NA NA NA 101 NA PB.596.2 chr1 + 2403 10 full-splice_match CDCA8 ENST00000373055.6 2371 10 -35 3 0 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 251 67.240646 1.827632 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAATCACTGTTCATCCTGCC -2 TRUE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 251 NA PB.596.4 chr1 + 2229 10 full-splice_match CDCA8 ENST00000373055.6 2371 10 -20 162 15 -156 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 34 9.108295 0.959437 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAACAGTCCTGTTCAAGTT 13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 34 NA PB.596.5 chr1 + 2132 11 full-splice_match CDCA8 ENST00000327331.2 2303 11 15 156 15 -156 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 19 5.089930 0.706712 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAACAGTCCTGTTCAAGTT 13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.596.7 chr1 + 2253 9 novel_in_catalog CDCA8 novel 2371 10 NA NA 21 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TCTTTTGTAATCACTGTTCA 1 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.596.8 chr1 + 2090 9 incomplete-splice_match CDCA8 ENST00000373055.6 2371 10 391 10 391 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TCTTTTGTAATCACTGTTCA 371 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.596.9 chr1 + 2013 9 incomplete-splice_match CDCA8 ENST00000373055.6 2371 10 475 3 475 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.018365 0.604049 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAATCACTGTTCATCCTGCC 33 FALSE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 15 NA PB.596.11 chr1 + 1818 6 incomplete-splice_match CDCA8 ENST00000373055.6 2371 10 7952 9 7952 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 4.018365 0.604049 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CTTTTGTAATCACTGTTCAT 1489 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 15 NA PB.596.12 chr1 + 1708 4 incomplete-splice_match CDCA8 ENST00000373055.6 2371 10 10734 2 10734 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.875237 0.273056 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATCACTGTTCATCCTGCCT 4271 FALSE NA NA AATAAA -25 NA NA NA 7 NA PB.596.13 chr1 + 1548 4 incomplete-splice_match CDCA8 ENST00000373055.6 2371 10 10734 162 10734 -156 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAACAGTCCTGTTCAAGTT 4271 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.596.14 chr1 + 1641 4 incomplete-splice_match CDCA8 ENST00000373055.6 2371 10 10801 2 10801 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATCACTGTTCATCCTGCCT 4338 FALSE NA NA AATAAA -25 NA NA NA 4 NA PB.596.15 chr1 + 1569 3 incomplete-splice_match CDCA8 ENST00000373055.6 2371 10 12960 8 12960 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.678910 0.427958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TTTTGTAATCACTGTTCATC 6497 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 10 NA PB.596.16 chr1 + 1367 3 incomplete-splice_match CDCA8 ENST00000373055.6 2371 10 13008 162 13008 -156 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAACAGTCCTGTTCAAGTT 6545 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.596.17 chr1 + 1417 2 incomplete-splice_match CDCA8 ENST00000373055.6 2371 10 14528 2 14528 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATCACTGTTCATCCTGCCT 8065 FALSE NA NA AATAAA -25 NA NA NA 3 NA PB.598.1 chr1 + 2050 4 full-splice_match MANEAL ENST00000373045.11 2640 4 588 2 -48 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGTAAGCATTCCTTTTGCT 339 FALSE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.598.2 chr1 + 1697 4 full-splice_match MANEAL ENST00000397631.7 2327 4 628 2 28 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGTAAGCATTCCTTTTGCT -1 TRUE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.598.3 chr1 + 1733 3 incomplete-splice_match MANEAL ENST00000525897.1 1294 4 348 -683 268 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGTAAGCATTCCTTTTGCT 359 FALSE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.598.4 chr1 + 1427 3 incomplete-splice_match MANEAL ENST00000397631.7 2327 4 1902 2 297 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.071564 0.030018 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGTAAGCATTCCTTTTGCT 388 FALSE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.598.5 chr1 + 1603 2 incomplete-splice_match MANEAL ENST00000525897.1 1294 4 1379 -687 1299 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGCATTCCTTTTGCTCTCT 1390 FALSE NA NA ATTAAA -22 NA NA NA 3 NA PB.599.2 chr1 - 2676 5 full-splice_match C1orf109 ENST00000486637.2 2696 5 12 8 3 -7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 26 6.965167 0.842932 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAGCATTTAAGTGTCAA -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 26 NA PB.599.3 chr1 - 2596 6 novel_in_catalog C1orf109 novel 2570 7 NA NA 0 -7 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAGCATTTAAGTGTCAA 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.599.4 chr1 - 2449 5 novel_not_in_catalog C1orf109 novel 2696 5 NA NA -1 -7 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.535782 -0.271012 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAGCATTTAAGTGTCAA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.599.5 chr1 - 2470 5 novel_in_catalog C1orf109 novel 2696 5 NA NA 4 -7 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 118 31.611143 1.499840 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAGCATTTAAGTGTCAA -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 118 NA PB.599.6 chr1 - 2376 5 novel_in_catalog C1orf109 novel 919 5 NA NA 0 -7 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.339455 0.126928 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAGCATTTAAGTGTCAA 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.599.7 chr1 - 2354 5 full-splice_match C1orf109 ENST00000358011.8 2355 5 -7 8 2 -7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.411019 0.382201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAGCATTTAAGTGTCAA -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.599.8 chr1 - 2315 5 novel_in_catalog C1orf109 novel 2696 5 NA NA 112 -7 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.803673 -0.094921 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAGCATTTAAGTGTCAA 1882 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.599.9 chr1 - 2125 4 incomplete-splice_match C1orf109 ENST00000358011.8 2355 5 672 8 -159 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.607346 0.206109 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAGCATTTAAGTGTCAA 2404 FALSE NA NA AAAAAG