isoform chrom strand length exons structural_category associated_gene associated_transcript ref_length ref_exons diff_to_TSS diff_to_TTS diff_to_gene_TSS diff_to_gene_TTS subcategory RTS_stage all_canonical min_sample_cov min_cov min_cov_pos sd_cov FL.BioSample_3 FL_TPM.BioSample_3 FL_TPM.BioSample_3_log10 n_indels n_indels_junc bite iso_exp gene_exp ratio_exp FSM_class coding ORF_length CDS_length CDS_start CDS_end CDS_genomic_start CDS_genomic_end predicted_NMD perc_A_downstream_TTS seq_A_downstream_TTS dist_to_CAGE_peak within_CAGE_peak dist_to_polyA_site within_polyA_site polyA_motif polyA_dist polyA_motif_found ORF_seq ratio_TSS fl_assoc cell_barcodes PB.1.1 chr1 - 1564 10 novel_not_in_catalog WASH7P novel 1351 11 NA NA 211 2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AACAGTGTGCTTTTAATAAA -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.1.5 chr1 - 1423 9 novel_not_in_catalog WASH7P novel 1351 11 NA NA 211 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.1.6 chr1 - 1025 6 novel_not_in_catalog WASH7P novel 1351 11 NA NA 12312 -5 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAAACCAACAGTGTGCTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.1.7 chr1 - 926 6 novel_not_in_catalog WASH7P novel 1351 11 NA NA 231 -2039 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAGCTCTGGACTTCTCACT 17 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.1.8 chr1 - 1075 7 novel_not_in_catalog WASH7P novel 1351 11 NA NA 217 -2040 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGAGCTCTGGACTTCTCAC 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.1.9 chr1 - 1239 8 novel_not_in_catalog WASH7P novel 1351 11 NA NA 211 -2046 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACTGTAGAGCTCTGGACT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.2.2 chr1 + 751 2 novel_not_in_catalog ENSG00000286448 novel 736 2 NA NA -52 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTGAGACTCACCTTGGTTG NA FALSE NA NA AATAGA -13 NA NA NA 2 NA PB.3.3 chr1 - 1691 10 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -8 299 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AACAGTGTGCTTTTAATAAA 4453 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.3.4 chr1 - 1585 10 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -4458 299 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AACAGTGTGCTTTTAATAAA 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.3.6 chr1 - 2207 11 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -4936 294 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.3.7 chr1 - 1951 12 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -4463 294 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.3.8 chr1 - 1957 10 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -4464 294 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.3.11 chr1 - 1581 10 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -4464 294 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.3.12 chr1 - 1619 10 full-splice_match WASH9P ENST00000623083.4 1397 10 72 -294 72 294 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA 4533 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.3.13 chr1 - 1550 10 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -4450 294 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA 11 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.3.14 chr1 - 1487 9 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -4464 294 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.3.15 chr1 - 1469 9 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -4464 294 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.3.16 chr1 - 1420 9 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -4452 294 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.3.17 chr1 - 1252 6 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA 7412 294 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.3.18 chr1 - 990 5 incomplete-splice_match WASH9P ENST00000623083.4 1397 10 7855 -294 7855 294 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.3.19 chr1 - 932 3 incomplete-splice_match WASH9P ENST00000623083.4 1397 10 8660 -294 8660 294 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.3.20 chr1 - 2840 10 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -4464 292 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAAACCAACAGTGTGCTTT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.3.21 chr1 - 1968 10 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -4464 292 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAAACCAACAGTGTGCTTT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.3.22 chr1 - 1269 7 incomplete-splice_match WASH9P ENST00000623083.4 1397 10 7158 -292 7158 292 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAAACCAACAGTGTGCTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.3.23 chr1 - 1205 7 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA 7217 292 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAAACCAACAGTGTGCTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.3.24 chr1 - 1085 6 incomplete-splice_match WASH9P ENST00000623083.4 1397 10 7580 -291 7580 291 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 CAGAAACCAACAGTGTGCTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.6.1 chr1 + 1198 2 antisense novelGene_ENSG00000228463_AS novel NA NA NA NA NA NA multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AACAAGAAAAGTCTTTTCTG NA FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 3 NA PB.7.1 chr1 + 892 2 full-splice_match LINC01409 ENST00000665867.1 1078 2 181 5 18 -5 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTCACTTGTGTCTTCTTCA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.10.3 chr1 + 1698 6 incomplete-splice_match LINC01128 ENST00000691316.1 3092 7 -82 2803 2 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGTGAGGTACAATAGCTATT 774 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 5 NA PB.10.6 chr1 + 1026 3 full-splice_match LINC01128 ENST00000669922.1 5441 3 49 4366 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATTTGATGGCCTCTGTTGT 816 FALSE NA NA AATGAA -44 NA NA NA 2 NA PB.10.7 chr1 + 2625 3 full-splice_match LINC01128 ENST00000669922.1 5441 3 54 2762 0 9 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTCACTCGAATCACTAGAG -9 TRUE NA NA ATTAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.10.11 chr1 + 957 3 full-splice_match LINC01128 ENST00000668541.1 987 3 29 1 -6 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTGATGGCCTCTGTTGTT 79 FALSE NA NA AATGAA -45 NA NA NA 5 NA PB.12.1 chr1 + 1968 3 novel_not_in_catalog ENSG00000272438 novel 351 2 NA NA -21 -8741 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 TAAAAAAAAAAAAAATTGGC -1 TRUE NA NA AAAACA -45 NA NA NA 2 NA PB.13.2 chr1 - 1290 1 full-splice_match LINC00115 ENST00000473798.1 1317 1 20 7 20 -7 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA NA NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGATATTTCCAAAGCTCA 13 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.14.2 chr1 + 1123 4 incomplete-splice_match SAMD11 ENST00000341065.8 2191 12 12207 321 353 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAACAAAAAATTTTAAAAG 206 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.15.3 chr1 - 2254 15 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 3041 1 2243 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTGGTGGCTCCTGGAGATT 4319 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.15.4 chr1 - 1124 6 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000477976.5 4201 17 10300 -1 -1098 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTGGTGGCTCCTGGAGATT 5621 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.15.5 chr1 - 884 4 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 13023 1 827 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTGGTGGCTCCTGGAGATT 7546 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.15.6 chr1 - 810 3 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000483767.5 1611 5 1435 0 1435 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTGGTGGCTCCTGGAGATT 8154 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.15.7 chr1 - 773 3 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 13653 1 1457 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTGGTGGCTCCTGGAGATT 8176 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.15.8 chr1 - 2728 19 novel_not_in_catalog NOC2L novel 2757 19 NA NA 0 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAGTGGTGGCTCCTGGAGAT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.15.10 chr1 - 2776 19 full-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 -21 2 -21 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 307 80.100166 1.903633 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAGTGGTGGCTCCTGGAGAT -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 307 NA PB.15.11 chr1 - 2660 18 novel_in_catalog NOC2L novel 2757 19 NA NA -19 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAGTGGTGGCTCCTGGAGAT -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.15.12 chr1 - 1960 12 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 5366 2 4568 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAGTGGTGGCTCCTGGAGAT 6644 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.15.13 chr1 - 1616 10 novel_not_in_catalog NOC2L novel 4201 17 NA NA 0 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAGTGGTGGCTCCTGGAGAT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.15.14 chr1 - 1112 10 novel_not_in_catalog NOC2L novel 2757 19 NA NA 0 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAGTGGTGGCTCCTGGAGAT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.15.16 chr1 - 1840 11 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 5978 3 5180 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGAGTGGTGGCTCCTGGAGA 7256 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.15.17 chr1 - 1668 10 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000477976.5 4201 17 5935 7 -5463 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTGTGTTGAGTGGTGGCTCC 8011 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.15.18 chr1 - 2393 16 novel_in_catalog NOC2L novel 4201 17 NA NA 1431 -9 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CATTGTGTTGAGTGGTGGCT 9952 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.15.19 chr1 - 2110 14 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 3256 11 2458 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CATTGTGTTGAGTGGTGGCT 4534 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.15.20 chr1 - 1450 9 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 7206 11 -4990 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CATTGTGTTGAGTGGTGGCT 8484 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.15.21 chr1 - 994 5 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 12788 11 592 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.130951 0.495676 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CATTGTGTTGAGTGGTGGCT 7311 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.15.22 chr1 - 2805 20 novel_not_in_catalog NOC2L novel 2757 19 NA NA 0 -10 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CCATTGTGTTGAGTGGTGGC 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.15.23 chr1 - 2780 19 novel_in_catalog NOC2L novel 2757 19 NA NA -20 -10 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 162 42.267841 1.626010 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CCATTGTGTTGAGTGGTGGC -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 162 NA PB.15.24 chr1 - 2250 15 novel_in_catalog NOC2L novel 4201 17 NA NA 2251 -10 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CCATTGTGTTGAGTGGTGGC 4327 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.15.25 chr1 - 1638 10 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 6745 12 -5451 -10 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.435514 0.646944 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CCATTGTGTTGAGTGGTGGC 8023 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.15.26 chr1 - 1280 7 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000477976.5 4201 17 9876 10 -1522 -10 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CCATTGTGTTGAGTGGTGGC 5197 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.15.27 chr1 - 2840 20 novel_not_in_catalog NOC2L novel 2757 19 NA NA -21 -11 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCATTGTGTTGAGTGGTGG -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.15.28 chr1 - 2744 19 novel_not_in_catalog NOC2L novel 2757 19 NA NA -9 -11 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCATTGTGTTGAGTGGTGG -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.15.29 chr1 - 2614 18 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 262 14 262 -12 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGCCATTGTGTTGAGTGGTG 7985 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.15.30 chr1 - 2323 16 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 2282 13 1484 -11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.130951 0.495676 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCATTGTGTTGAGTGGTGG 10005 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.15.31 chr1 - 1938 12 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000477976.5 4201 17 4594 11 4594 -11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.130951 0.495676 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCATTGTGTTGAGTGGTGG 6670 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.15.32 chr1 - 1539 9 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 7115 13 -5081 -11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCATTGTGTTGAGTGGTGG 8393 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.15.33 chr1 - 1412 8 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000477976.5 4201 17 7220 11 -4178 -11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCATTGTGTTGAGTGGTGG 9296 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.15.34 chr1 - 911 4 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000483767.5 1611 5 803 12 803 -11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCATTGTGTTGAGTGGTGG 7522 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.15.35 chr1 - 2609 18 novel_in_catalog NOC2L novel 2757 19 NA NA -19 -12 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGCCATTGTGTTGAGTGGTG -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.15.36 chr1 - 1127 6 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 11067 14 -1129 -12 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.652776 0.562623 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGCCATTGTGTTGAGTGGTG 5590 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.15.37 chr1 - 2162 15 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 3118 16 2320 -14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGGCCATTGTGTTGAGTGG 4396 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.15.38 chr1 - 2139 2 novel_in_catalog NOC2L novel 1611 5 NA NA 332 -14 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGGCCATTGTGTTGAGTGG 7051 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 2 NA PB.15.39 chr1 - 1725 10 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 6654 16 -5542 -14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGGCCATTGTGTTGAGTGG 7932 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.15.40 chr1 - 1259 7 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 10676 16 -1520 -14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGGCCATTGTGTTGAGTGG 5199 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.15.44 chr1 - 853 2 full-splice_match NOC2L ENST00000469563.1 878 2 0 25 0 -25 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 38 9.914679 0.996279 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAGAAAAAGAAAGAAAT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 38 NA PB.16.1 chr1 + 1468 7 novel_in_catalog KLHL17 novel 2567 12 NA NA 119 -6 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCCTCAGGCTGAGCATCTCT 2244 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.16.3 chr1 + 1490 4 novel_in_catalog KLHL17 novel 913 6 NA NA -34 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGCTGAGCATCTCTCTCTG 2916 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.19.1 chr1 - 950 4 novel_not_in_catalog HES4 novel 885 4 NA NA 4 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTCTGCGTCACGAGTTTTC 644 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.19.2 chr1 - 940 2 full-splice_match HES4 ENST00000481869.1 1038 2 101 -3 -14 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTCTGCGTCACGAGTTTTC 817 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.19.3 chr1 - 960 3 novel_in_catalog HES4 novel 885 4 NA NA 1 1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAGTCTGCGTCACGAGTTT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.19.4 chr1 - 921 4 full-splice_match HES4 ENST00000304952.11 885 4 -37 1 -37 1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 68 17.742058 1.249004 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAGTCTGCGTCACGAGTTT 678 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 68 NA PB.19.5 chr1 - 796 3 novel_in_catalog HES4 novel 885 4 NA NA 0 1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAGTCTGCGTCACGAGTTT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.19.6 chr1 - 788 3 full-splice_match HES4 ENST00000484667.2 667 3 -116 -5 0 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.913689 0.592586 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAGTCTGCGTCACGAGTTT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.21.1 chr1 + 791 3 novel_not_in_catalog ISG15 novel 787 3 NA NA -627 -9 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAGAGAAATGGCCGCCTCT 9 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 2 NA PB.21.2 chr1 + 687 2 full-splice_match ISG15 ENST00000649529.1 637 2 -59 9 -59 -9 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAGAGAAATGGCCGCCTCT NA FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 7 NA PB.21.3 chr1 + 631 2 full-splice_match ISG15 ENST00000649529.1 637 2 -3 9 -3 -9 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 143 37.310501 1.571831 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAGAGAAATGGCCGCCTCT -2 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 143 NA PB.22.2 chr1 + 3730 16 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 13489 5 120 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAAAGCATTGCTTTTGTCC 2426 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 3 NA PB.22.3 chr1 + 3497 14 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 13927 4 -496 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 181 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 6 NA PB.22.4 chr1 + 3223 14 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 14201 4 -222 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 455 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.22.5 chr1 + 2991 13 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 14934 4 511 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 1188 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 7 NA PB.22.6 chr1 + 2733 11 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 15481 5 1058 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAAAGCATTGCTTTTGTCC 1735 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 4 NA PB.22.7 chr1 + 2659 12 novel_in_catalog ENSG00000242590 novel 402 2 NA NA -5347 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 1834 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.22.8 chr1 + 2592 11 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 15623 4 1200 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 1877 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 8 NA PB.22.9 chr1 + 2386 9 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 16131 4 1708 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 2385 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 9 NA PB.22.10 chr1 + 2294 8 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 16320 4 -1560 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 2574 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 8 NA PB.22.11 chr1 + 2221 8 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 16393 4 -1487 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 2647 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 11 NA PB.22.12 chr1 + 2040 7 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 16708 4 -1172 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.435514 0.646944 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 2962 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 17 NA PB.22.13 chr1 + 1874 5 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 17372 4 -508 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 3626 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 6 NA PB.22.14 chr1 + 1748 5 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 17498 4 -382 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 3752 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 10 NA PB.22.15 chr1 + 1644 4 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 17684 4 -196 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.957339 0.695249 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 3938 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 19 NA PB.22.16 chr1 + 1515 3 full-splice_match AGRN ENST00000461111.1 3385 3 1870 0 1870 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 20 5.218252 0.717525 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 6004 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 20 NA PB.22.17 chr1 + 1922 2 novel_in_catalog ENSG00000242590 novel 402 2 NA NA -1115 -5 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAAAGCATTGCTTTTGTCC 6066 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.22.19 chr1 + 1377 2 incomplete-splice_match AGRN ENST00000461111.1 3385 3 2477 1 2477 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 20 5.218252 0.717525 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAAAGCATTGCTTTTGTCC 6611 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 20 NA PB.25.3 chr1 - 2013 11 full-splice_match C1orf159 ENST00000379325.7 2010 11 -5 2 -5 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGCTGCGTTCCGAGCTGCT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.25.4 chr1 - 1835 10 full-splice_match C1orf159 ENST00000421241.7 1832 10 -5 2 1 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 36 9.392854 0.972798 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGCTGCGTTCCGAGCTGCT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 36 NA PB.25.5 chr1 - 1728 9 novel_in_catalog C1orf159 novel 2099 12 NA NA -5 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGCTGCGTTCCGAGCTGCT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.25.7 chr1 - 1281 4 incomplete-splice_match C1orf159 ENST00000379319.5 1097 10 20189 -875 1698 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGCTGCGTTCCGAGCTGCT 6090 FALSE NA NA AATGAA -18 NA NA NA 3 NA PB.25.11 chr1 - 2278 10 novel_in_catalog C1orf159 novel 2010 11 NA NA -5 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CAAGCTGCGTTCCGAGCTGC -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.25.12 chr1 - 1432 10 full-splice_match C1orf159 ENST00000421241.7 1832 10 -9 409 -3 3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTCCAGAGCTCTGTGGCCCC -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.26.1 chr1 - 1143 4 novel_in_catalog TNFRSF18 novel 1083 5 NA NA 4 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACCTGAGTGGATGCATGCTG -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.26.2 chr1 - 1972 4 full-splice_match TNFRSF18 ENST00000486728.5 727 4 -910 -335 2 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACCTGAGTGGATGCATGCTG -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.26.3 chr1 - 988 4 novel_in_catalog TNFRSF18 novel 1083 5 NA NA 6 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACCTGAGTGGATGCATGCTG -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.26.4 chr1 - 1305 4 full-splice_match TNFRSF18 ENST00000486728.5 727 4 -244 -334 -244 -2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GACCTGAGTGGATGCATGCT 8228 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.26.5 chr1 - 1054 5 full-splice_match TNFRSF18 ENST00000379265.5 705 5 -15 -334 6 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GACCTGAGTGGATGCATGCT -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.26.6 chr1 - 1068 5 full-splice_match TNFRSF18 ENST00000379268.7 1083 5 13 2 -8 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 45 11.741067 1.069708 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GACCTGAGTGGATGCATGCT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 45 NA PB.26.7 chr1 - 861 4 full-splice_match TNFRSF18 ENST00000486728.5 727 4 200 -334 200 -2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GACCTGAGTGGATGCATGCT 8672 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.26.8 chr1 - 730 5 novel_not_in_catalog TNFRSF18 novel 1083 5 NA NA 6 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GACCTGAGTGGATGCATGCT -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.27.1 chr1 + 970 5 novel_in_catalog ENSG00000217801 novel 1043 5 NA NA 0 30 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATCGCTGTATCTAATTTGTA -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.27.2 chr1 + 1010 4 novel_in_catalog ENSG00000217801 novel 982 4 NA NA 2 1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGTCTCTTGCCTCGGCACC -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.27.3 chr1 + 919 4 full-splice_match ENSG00000217801 ENST00000456409.6 957 4 37 1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTCTCTTGCCTCGGCACCT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.27.4 chr1 + 882 4 novel_in_catalog ENSG00000217801 novel 982 4 NA NA 0 2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TAATAATGATGGATAATTGT -5 TRUE NA NA ATTAAA -23 NA NA NA 2 NA PB.27.5 chr1 + 796 3 full-splice_match ENSG00000217801 ENST00000692821.1 722 3 30 -104 0 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTCTCTTGCCTCGGCACCT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.27.6 chr1 + 720 2 full-splice_match ENSG00000217801 ENST00000433695.1 540 2 -16 -164 -16 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACAGTTTGTGCCTTCAGT 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.28.1 chr1 - 2059 7 full-splice_match SDF4 ENST00000263741.12 2079 7 41 -21 11 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.740077 0.758918 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CATTCTTTGGGCGTGAAACA -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 22 NA PB.28.3 chr1 - 1953 7 full-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 2 -22 2 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 472 123.150749 2.090437 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTCTTTGGGCGTGAAACAA -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 472 NA PB.28.4 chr1 - 1214 3 full-splice_match SDF4 ENST00000494748.1 3516 3 2325 -23 1267 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTCTTTGGGCGTGAAACAA 9821 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.28.5 chr1 - 1093 3 full-splice_match SDF4 ENST00000494748.1 3516 3 2433 -10 1375 9 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTTGGTCAGCTTCATTCTTT 9929 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.28.7 chr1 - 2005 7 full-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 -54 -18 12 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 86 22.438484 1.350994 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CTTCATTCTTTGGGCGTGAA 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 86 NA PB.28.8 chr1 - 1952 7 novel_not_in_catalog SDF4 novel 1933 7 NA NA 349 -6 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTTCATTCTTTGGGCGTG 9317 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.28.9 chr1 - 1872 7 full-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 77 -16 44 -6 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 47 12.262893 1.088593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTTCATTCTTTGGGCGTG 9012 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 47 NA PB.28.11 chr1 - 1413 6 incomplete-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 3481 -16 76 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.130951 0.495676 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTTCATTCTTTGGGCGTG 9313 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.28.13 chr1 - 1325 3 full-splice_match SDF4 ENST00000494748.1 3516 3 2208 -17 1150 -6 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTTCATTCTTTGGGCGTG 9704 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.28.14 chr1 - 976 3 full-splice_match SDF4 ENST00000494748.1 3516 3 2557 -17 1499 -6 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 23 6.000990 0.778223 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTTCATTCTTTGGGCGTG 9918 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 23 NA PB.28.16 chr1 - 1536 6 incomplete-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 3357 -15 -48 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.740077 0.758918 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGCTTCATTCTTTGGGCGT 9189 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 22 NA PB.28.17 chr1 - 1326 5 incomplete-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 8062 -11 -2588 11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 38 9.914679 0.996279 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGGTCAGCTTCATTCTTTGG 8122 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 38 NA PB.28.18 chr1 - 822 2 full-splice_match SDF4 ENST00000478938.1 2591 2 1782 -13 1782 10 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.740077 0.758918 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGGTCAGCTTCATTCTTTG 982 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 22 NA PB.28.20 chr1 - 1143 4 incomplete-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 8705 3 -1945 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 38 9.914679 0.996279 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATAGTTGCCTTTTTTGGTCA 8765 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 38 NA PB.28.21 chr1 - 2018 7 novel_not_in_catalog SDF4 novel 1933 7 NA NA 0 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATAGTTGCCTTTTTTG -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.28.22 chr1 - 1835 7 novel_not_in_catalog SDF4 novel 1933 7 NA NA 5 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATAGTTGCCTTTTTTG -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.28.24 chr1 - 1649 6 incomplete-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 3222 7 -183 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.913689 0.592586 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATAGTTGCCTTTTTTG 9054 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.28.25 chr1 - 1628 6 incomplete-splice_match SDF4 ENST00000263741.12 2079 7 3389 7 -46 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATAGTTGCCTTTTTTG 9191 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.28.26 chr1 - 1193 4 incomplete-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 8651 7 -1999 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.391864 0.530438 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATAGTTGCCTTTTTTG 8711 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.28.28 chr1 - 868 2 full-splice_match SDF4 ENST00000478938.1 2591 2 1719 4 1719 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 23 6.000990 0.778223 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATAGTTGCCTTTTTTG 919 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 23 NA PB.28.30 chr1 - 1383 6 incomplete-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 3352 143 -53 -140 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAATGAGTAGCCAGGAAGTT 9184 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.28.31 chr1 - 1777 7 full-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 11 145 11 -142 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.130951 0.495676 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 GGAAATGAGTAGCCAGGAAG -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.28.32 chr1 - 1038 4 incomplete-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 8668 145 -1982 -142 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 GGAAATGAGTAGCCAGGAAG 8728 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.28.33 chr1 - 1095 6 incomplete-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 5 1602 5 -10 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAGACAGAAAAAAGGAGTT -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.29.1 chr1 + 1424 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 67 1314 67 -1314 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGTTGGCAGTGCGCACGTC 52 FALSE NA NA TATAAA -27 NA NA NA 3 NA PB.29.2 chr1 + 2497 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 302 6 302 -6 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACAAAGCCTGCCCCAGGCT 287 FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 6 NA PB.29.3 chr1 + 1594 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 349 862 349 -862 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTCCCTGGAGTCCGACGC 334 FALSE NA NA AGTAAA -33 NA NA NA 3 NA PB.29.4 chr1 + 1134 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 357 1314 357 -1314 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGTTGGCAGTGCGCACGTC 342 FALSE NA NA TATAAA -27 NA NA NA 2 NA PB.29.5 chr1 + 2176 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 623 6 623 -6 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACAAAGCCTGCCCCAGGCT 608 FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.29.6 chr1 + 1938 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 861 6 861 -6 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACAAAGCCTGCCCCAGGCT 846 FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.29.7 chr1 + 1798 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 1001 6 1001 -6 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACAAAGCCTGCCCCAGGCT 986 FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 3 NA PB.29.8 chr1 + 1626 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 1173 6 1173 -6 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACAAAGCCTGCCCCAGGCT 1158 FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 6 NA PB.29.9 chr1 + 1459 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 1307 39 1307 -39 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TTTTTCAGCCTAAGACATTA 1292 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.29.10 chr1 + 1396 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 1403 6 1403 -6 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACAAAGCCTGCCCCAGGCT 1388 FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 8 NA PB.29.11 chr1 + 1255 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 1544 6 1544 -6 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACAAAGCCTGCCCCAGGCT 1529 FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 7 NA PB.29.12 chr1 + 715 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 2084 6 2084 -6 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACAAAGCCTGCCCCAGGCT 2069 FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 3 NA PB.30.1 chr1 - 2431 7 full-splice_match UBE2J2 ENST00000360466.6 1047 7 -129 -1255 0 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CATGCTGCTTGTGTCTGTGT -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.30.2 chr1 - 2037 6 incomplete-splice_match UBE2J2 ENST00000349431.11 2260 7 5899 -3 -4386 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CATGCTGCTTGTGTCTGTGT 5889 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.30.3 chr1 - 2317 8 full-splice_match UBE2J2 ENST00000400930.8 1021 8 -32 -1264 -1 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTTCATGCTGCTTGTGTC -21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.30.4 chr1 - 2257 7 full-splice_match UBE2J2 ENST00000349431.11 2260 7 -1 4 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 53 13.828368 1.140771 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGAATTTCATGCTGCTTGTG -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 53 NA PB.30.5 chr1 - 2101 6 full-splice_match UBE2J2 ENST00000400929.6 1057 6 26 -1070 -2 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATTTCATGCTGCTTGTGT 15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.30.10 chr1 - 2365 7 full-splice_match UBE2J2 ENST00000347370.6 2387 7 20 2 -1 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGAATTTCATGCTGCTTGTG 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.30.13 chr1 - 1555 7 novel_in_catalog UBE2J2 novel 2387 7 NA NA 1 83 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTAGATGTGGTCACTTAGA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.30.14 chr1 - 1491 8 novel_in_catalog UBE2J2 novel 1256 8 NA NA 0 83 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTAGATGTGGTCACTTAGA -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.30.15 chr1 - 1386 8 full-splice_match UBE2J2 ENST00000464036.5 1256 8 16 -146 1 83 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.391864 0.530438 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTAGATGTGGTCACTTAGA -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.30.16 chr1 - 1382 7 full-splice_match UBE2J2 ENST00000473215.5 1028 7 12 -366 0 83 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.391864 0.530438 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTAGATGTGGTCACTTAGA 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.30.17 chr1 - 1172 6 novel_in_catalog UBE2J2 novel 2260 7 NA NA 0 83 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.391864 0.530438 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTAGATGTGGTCACTTAGA 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.30.19 chr1 - 1113 6 full-splice_match UBE2J2 ENST00000400929.6 1057 6 27 -83 -1 83 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 40 10.436504 1.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTAGATGTGGTCACTTAGA 16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 40 NA PB.30.20 chr1 - 1090 5 novel_in_catalog UBE2J2 novel 1057 6 NA NA -2 83 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTAGATGTGGTCACTTAGA -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.30.21 chr1 - 1083 6 incomplete-splice_match UBE2J2 ENST00000360466.6 1047 7 5732 -262 -4425 83 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTAGATGTGGTCACTTAGA 5850 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.30.22 chr1 - 2061 7 novel_in_catalog UBE2J2 novel 1021 8 NA NA 0 82 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATTAGATGTGGTCACTTAG 11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.30.23 chr1 - 1558 8 novel_in_catalog UBE2J2 novel 1256 8 NA NA 0 82 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATTAGATGTGGTCACTTAG -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.30.24 chr1 - 1541 7 full-splice_match UBE2J2 ENST00000435198.5 1056 7 7 -492 0 82 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATTAGATGTGGTCACTTAG 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.30.26 chr1 - 1425 7 full-splice_match UBE2J2 ENST00000360466.6 1047 7 -117 -261 1 82 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.913689 0.592586 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATTAGATGTGGTCACTTAG 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.30.27 chr1 - 1395 8 novel_not_in_catalog UBE2J2 novel 2455 8 NA NA 0 82 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATTAGATGTGGTCACTTAG 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.30.28 chr1 - 1306 8 full-splice_match UBE2J2 ENST00000400930.8 1021 8 -10 -275 1 82 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATTAGATGTGGTCACTTAG 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.30.29 chr1 - 1269 7 full-splice_match UBE2J2 ENST00000349431.11 2260 7 0 991 0 82 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 316 82.448380 1.916182 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATTAGATGTGGTCACTTAG -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 316 NA PB.30.30 chr1 - 935 5 incomplete-splice_match UBE2J2 ENST00000400929.6 1057 6 10483 -82 197 82 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATTAGATGTGGTCACTTAG 4525 FALSE NA NA AAGAAA -20 NA NA NA 6 NA PB.31.1 chr1 + 906 3 incomplete-splice_match SCNN1D ENST00000325425.12 2679 15 8786 0 3786 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCTGGCGGCCAGTGTGTGC 6893 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 3 NA PB.32.1 chr1 - 1776 4 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 4326 -488 379 8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CCTGGGCTCCCGTGCCTTGC 4191 FALSE NA NA GGGGCT -11 NA NA NA 2 NA PB.32.2 chr1 - 1599 4 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 4499 -484 552 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TGCTCCTGGGCTCCCGTGCC 4364 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.32.4 chr1 - 2072 7 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 3122 -480 -825 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TGCCTGCTCCTGGGCTCCCG 8959 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.32.5 chr1 - 1831 5 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 4174 -480 227 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TGCCTGCTCCTGGGCTCCCG 10011 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.32.7 chr1 - 1404 2 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 5046 -478 1099 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTGCCTGCTCCTGGGCTCC 4911 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.32.12 chr1 - 3288 23 novel_not_in_catalog ACAP3 novel 3793 24 NA NA 26 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.435514 0.646944 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCCCTCATCTCATGTTCTT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.32.13 chr1 - 2381 12 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 744 1 30 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCCCTCATCTCATGTTCTT 9824 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.32.14 chr1 - 1988 10 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 2404 1 -1543 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCCCTCATCTCATGTTCTT 8241 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.32.15 chr1 - 1689 7 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 3024 1 -923 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCCCTCATCTCATGTTCTT 8861 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.32.16 chr1 - 1281 4 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 4332 1 385 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCCCTCATCTCATGTTCTT 4197 FALSE NA NA GGGGCT -5 NA NA NA 8 NA PB.32.17 chr1 - 1101 4 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 4512 1 565 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCCCTCATCTCATGTTCTT 4377 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.32.19 chr1 - 925 2 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 5046 1 1099 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCCCTCATCTCATGTTCTT 4911 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.32.20 chr1 - 2860 18 novel_not_in_catalog ACAP3 novel 3793 24 NA NA -1075 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CAGCCCTCATCTCATGTTCT 7343 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.32.21 chr1 - 1753 8 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 2883 2 -1064 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CAGCCCTCATCTCATGTTCT 8720 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.32.24 chr1 - 972 5 full-splice_match ACAP3 ENST00000479108.5 485 5 -79 -408 21 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.33.2 chr1 + 1284 8 full-splice_match PUSL1 ENST00000379031.10 1257 8 -28 1 -28 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 83 21.655746 1.335573 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACCAGTTTGTTTCTTCAG NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 83 NA PB.33.3 chr1 + 1347 8 novel_not_in_catalog PUSL1 novel 1257 8 NA NA -23 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAGACCAGTTTGTTTCTTCA NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.33.4 chr1 + 1187 7 novel_in_catalog PUSL1 novel 1257 8 NA NA -3 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACCAGTTTGTTTCTTCAG -12 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 11 NA PB.33.5 chr1 + 1436 7 novel_in_catalog PUSL1 novel 1257 8 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACCAGTTTGTTTCTTCAG -9 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 11 NA PB.33.6 chr1 + 1286 7 novel_in_catalog PUSL1 novel 1257 8 NA NA -52 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACCAGTTTGTTTCTTCAG 15 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.33.7 chr1 + 1292 7 incomplete-splice_match PUSL1 ENST00000379031.10 1257 8 158 1 -33 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACCAGTTTGTTTCTTCAG 34 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 11 NA PB.34.1 chr1 - 2116 17 full-splice_match INTS11 ENST00000435064.6 2114 17 0 -2 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 194 50.617046 1.704297 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTGGTACTCTCTTCTTGG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 194 NA PB.34.2 chr1 - 2039 16 novel_in_catalog INTS11 novel 2114 17 NA NA 5 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTGGTACTCTCTTCTTGG -25 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.34.3 chr1 - 2497 15 novel_in_catalog INTS11 novel 2571 19 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACTTGGTACTCTCTTCTTG 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.34.4 chr1 - 2575 16 novel_in_catalog INTS11 novel 2114 17 NA NA -1 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.34.5 chr1 - 2072 17 novel_not_in_catalog INTS11 novel 2114 17 NA NA 0 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.34.6 chr1 - 2055 17 novel_not_in_catalog INTS11 novel 2114 17 NA NA 0 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.34.7 chr1 - 1949 16 incomplete-splice_match INTS11 ENST00000458452.7 2571 19 3633 3 -112 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 3640 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.34.8 chr1 - 1902 15 novel_in_catalog INTS11 novel 2114 17 NA NA 0 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 28 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.34.9 chr1 - 1735 14 incomplete-splice_match INTS11 ENST00000323275.10 2450 16 5215 9 -60 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 5251 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.34.10 chr1 - 1704 14 novel_in_catalog INTS11 novel 2114 17 NA NA 0 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.34.11 chr1 - 1491 11 incomplete-splice_match INTS11 ENST00000323275.10 2450 16 9658 9 178 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 9694 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.34.12 chr1 - 1352 10 incomplete-splice_match INTS11 ENST00000323275.10 2450 16 10255 9 298 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 6708 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.34.13 chr1 - 1257 8 novel_in_catalog INTS11 novel 1618 13 NA NA 19 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 7268 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.34.14 chr1 - 1244 9 incomplete-splice_match INTS11 ENST00000323275.10 2450 16 10742 9 -54 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 7195 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.34.15 chr1 - 993 7 incomplete-splice_match INTS11 ENST00000470030.6 2369 10 2328 24 -405 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.435514 0.646944 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 7969 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.34.16 chr1 - 923 6 incomplete-splice_match INTS11 ENST00000470030.6 2369 10 2483 24 -250 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 8124 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.34.17 chr1 - 730 5 incomplete-splice_match INTS11 ENST00000470030.6 2369 10 2762 24 29 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 8403 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.34.18 chr1 - 1867 3 fusion ENSG00000240731_INTS11 novel 704 4 NA NA 0 7 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACTTTAATTTTTTTTTTT 20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.34.19 chr1 - 1104 4 full-splice_match INTS11 ENST00000429572.5 1104 4 -2 2 -2 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 30 7.827378 0.893616 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TTTGTTGTGAAACTTTAATT -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 30 NA PB.34.20 chr1 - 1552 3 full-splice_match INTS11 ENST00000498173.2 1589 3 37 0 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TTTGTTGTGAAACTTTAATT 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.34.21 chr1 - 1420 4 full-splice_match INTS11 ENST00000470679.3 584 4 -47 -789 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TTTGTTGTGAAACTTTAATT 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.34.22 chr1 - 1289 4 full-splice_match INTS11 ENST00000493534.6 896 4 -14 -379 -1 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TTTGTTGTGAAACTTTAATT -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.34.23 chr1 - 1162 5 incomplete-splice_match INTS11 ENST00000527098.5 2004 18 46 6859 1 -1 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TTTTGTTGTGAAACTTTAAT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.35.1 chr1 - 3038 15 full-splice_match DVL1 ENST00000378888.10 3305 15 266 1 -40 -1 alternative_5end TRUE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACAGATGTGTGGCCTGTGCC 9394 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.35.2 chr1 - 2529 12 incomplete-splice_match DVL1 ENST00000378888.10 3305 15 7322 1 -1731 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACAGATGTGTGGCCTGTGCC 7347 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.35.3 chr1 - 2477 12 incomplete-splice_match DVL1 ENST00000378891.9 2926 15 6993 3 -1754 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACAGATGTGTGGCCTGTGCC 7324 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.35.4 chr1 - 2122 8 incomplete-splice_match DVL1 ENST00000378888.10 3305 15 9301 1 -65 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACAGATGTGTGGCCTGTGCC 9326 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.35.5 chr1 - 1802 5 incomplete-splice_match DVL1 ENST00000378891.9 2926 15 9693 3 3 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACAGATGTGTGGCCTGTGCC 9979 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.35.6 chr1 - 1742 4 incomplete-splice_match DVL1 ENST00000378891.9 2926 15 10461 3 771 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACAGATGTGTGGCCTGTGCC 1432 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.35.7 chr1 - 1509 3 incomplete-splice_match DVL1 ENST00000378891.9 2926 15 10779 3 1089 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACAGATGTGTGGCCTGTGCC 1750 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.35.9 chr1 - 2294 11 incomplete-splice_match DVL1 ENST00000378891.9 2926 15 7422 4 -1325 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GACAGATGTGTGGCCTGTGC 7753 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.35.10 chr1 - 1283 2 incomplete-splice_match DVL1 ENST00000378891.9 2926 15 11089 4 1399 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GACAGATGTGTGGCCTGTGC 2060 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.36.1 chr1 - 2280 10 full-splice_match MXRA8 ENST00000309212.11 2293 10 12 1 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 25 6.522815 0.814435 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACTTGTCCCAGGTATGCT 3 TRUE NA NA AAAACA -30 NA NA NA 25 NA PB.36.2 chr1 - 1995 10 novel_in_catalog MXRA8 novel 2293 10 NA NA 0 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACTTGTCCCAGGTATGCT -9 TRUE NA NA AAAACA -42 NA NA NA 3 NA PB.36.3 chr1 - 1262 5 incomplete-splice_match MXRA8 ENST00000309212.11 2293 10 4076 1 -5 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACTTGTCCCAGGTATGCT 7318 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.36.4 chr1 - 2400 9 novel_in_catalog MXRA8 novel 2293 10 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGACTTGTCCCAGGTATGC 3 TRUE NA NA AAAACA -30 NA NA NA 3 NA PB.36.5 chr1 - 1940 8 novel_not_in_catalog MXRA8 novel 2293 10 NA NA -17 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGACTTGTCCCAGGTATGC 6268 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.36.6 chr1 - 1702 6 incomplete-splice_match MXRA8 ENST00000309212.11 2293 10 3463 2 -76 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGACTTGTCCCAGGTATGC 6705 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.37.1 chr1 - 817 4 full-splice_match AURKAIP1 ENST00000321751.9 798 4 3 -22 3 20 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 51 13.306542 1.124065 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTTGCCGGGTGTGAGGTCTC 20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 51 NA PB.37.2 chr1 - 1169 3 novel_in_catalog AURKAIP1 novel 875 4 NA NA -9 19 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTGCCGGGTGTGAGGTCT 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.37.3 chr1 - 917 4 full-splice_match AURKAIP1 ENST00000378853.3 875 4 -16 -26 -16 19 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 242 63.140850 1.800310 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTGCCGGGTGTGAGGTCT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 242 NA PB.37.4 chr1 - 760 4 full-splice_match AURKAIP1 ENST00000338338.10 753 4 -3 -4 -3 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 519 135.413635 2.131662 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTCCTGCGGGTCTGGAGCTC -24 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 519 NA PB.37.5 chr1 - 1168 3 novel_in_catalog AURKAIP1 novel 753 4 NA NA -149 1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTGCGGGTCTGGAGCTCCAT 159 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.37.6 chr1 - 961 4 novel_not_in_catalog AURKAIP1 novel 798 4 NA NA -308 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCCTGCGGGTCTGGAGCTCC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.37.7 chr1 - 336 2 incomplete-splice_match AURKAIP1 ENST00000338370.7 1072 3 992 3 979 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTTCCTGCGGGTCTGGAGCT 1350 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.37.8 chr1 - 1091 3 full-splice_match AURKAIP1 ENST00000338370.7 1072 3 -26 7 -10 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 76 19.829357 1.297309 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGCCTTTCCTGCGGGTCTGG 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 76 NA PB.37.9 chr1 - 1074 3 novel_in_catalog AURKAIP1 novel 753 4 NA NA -61 1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CCTTTCCTGCGGGTCTGGAG -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.37.10 chr1 - 825 3 novel_in_catalog AURKAIP1 novel 875 4 NA NA 0 1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CCTTTCCTGCGGGTCTGGAG -21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.37.11 chr1 - 634 3 full-splice_match AURKAIP1 ENST00000338370.7 1072 3 433 5 420 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CCTTTCCTGCGGGTCTGGAG 791 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.37.12 chr1 - 883 4 full-splice_match AURKAIP1 ENST00000338338.10 753 4 -132 2 -132 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 149 38.875977 1.589681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CAGCCTTTCCTGCGGGTCTG -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 149 NA PB.37.13 chr1 - 1365 2 incomplete-splice_match AURKAIP1 ENST00000338338.10 753 4 9 1 9 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.174602 0.620615 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGCCTTTCCTGCGGGTCTGG -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.37.14 chr1 - 1204 2 novel_in_catalog AURKAIP1 novel 875 4 NA NA 8 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGCCTTTCCTGCGGGTCTGG -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.37.15 chr1 - 1046 4 full-splice_match AURKAIP1 ENST00000338338.10 753 4 -294 1 -294 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 24 6.261902 0.796706 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGCCTTTCCTGCGGGTCTGG 14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 24 NA PB.37.16 chr1 - 897 4 novel_in_catalog AURKAIP1 novel 753 4 NA NA 0 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGCCTTTCCTGCGGGTCTGG -21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.37.17 chr1 - 747 4 full-splice_match AURKAIP1 ENST00000378853.3 875 4 128 0 99 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGCCTTTCCTGCGGGTCTGG 470 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.37.18 chr1 - 666 3 novel_in_catalog AURKAIP1 novel 753 4 NA NA 0 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGCCTTTCCTGCGGGTCTGG -21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.38.1 chr1 + 2157 3 full-splice_match CPTP ENST00000343938.9 2154 3 2 -5 2 5 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 123 32.092251 1.506400 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGCCTGATTTCCTGCAGGGG -22 TRUE NA NA AATAAA -42 NA NA NA 123 NA PB.38.3 chr1 + 1954 2 full-splice_match CPTP ENST00000464957.1 1101 2 48 -901 2 -1 alternative_3end TRUE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTGGGTGCCTGATTTCCTG -22 TRUE NA NA AATAAA -36 NA NA NA 11 NA PB.38.5 chr1 + 2053 3 full-splice_match CPTP ENST00000343938.9 2154 3 100 1 100 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 46 12.001980 1.079253 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTGGGTGCCTGATTTCCTG 23 FALSE NA NA AATAAA -36 NA NA NA 46 NA PB.38.6 chr1 + 1923 3 full-splice_match CPTP ENST00000343938.9 2154 3 230 1 -209 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTGGGTGCCTGATTTCCTG 117 FALSE NA NA AATAAA -36 NA NA NA 6 NA PB.38.7 chr1 + 1761 2 incomplete-splice_match CPTP ENST00000343938.9 2154 3 2125 1 1686 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTGGGTGCCTGATTTCCTG 59 FALSE NA NA AATAAA -36 NA NA NA 6 NA PB.39.1 chr1 - 5042 11 novel_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA -1 1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTTATGTTCTCCTAATTT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.39.2 chr1 - 2368 12 novel_not_in_catalog CCNL2 novel 1598 12 NA NA 0 1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTTATGTTCTCCTAATTT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.39.4 chr1 - 4361 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 -278 -1001 -87 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATTTTATGTTCTCCTAAT 9438 FALSE NA NA AAGAAA -23 NA NA NA 2 NA PB.39.6 chr1 - 2329 11 novel_not_in_catalog CCNL2 novel 3112 11 NA NA 3 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGGACGTGGTAGGTGGTCG 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.39.7 chr1 - 1939 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 1360 -217 -69 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACATCCGGAGCGTTATGGAC 8158 FALSE NA NA AAGAAA -1 NA NA NA 2 NA PB.39.8 chr1 - 1330 4 incomplete-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 2258 -217 633 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACATCCGGAGCGTTATGGAC 9056 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.39.9 chr1 - 1131 2 incomplete-splice_match CCNL2 ENST00000463260.5 1941 3 892 2 892 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GACATCCGGAGCGTTATGGA 3265 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.39.10 chr1 - 1721 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 1575 -214 -50 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGGACATCCGGAGCGTTATG 8373 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.39.11 chr1 - 4247 11 novel_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA 1 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.479165 0.738714 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCAGGACATCCGGAGCGT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 21 NA PB.39.12 chr1 - 3154 12 novel_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA 1 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCAGGACATCCGGAGCGT -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.39.13 chr1 - 3029 11 novel_not_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCAGGACATCCGGAGCGT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.39.14 chr1 - 2724 13 novel_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA 0 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCAGGACATCCGGAGCGT -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.39.15 chr1 - 2435 12 novel_in_catalog CCNL2 novel 1598 12 NA NA 0 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCAGGACATCCGGAGCGT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.39.16 chr1 - 2309 11 full-splice_match CCNL2 ENST00000400809.8 3112 11 11 792 1 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCAGGACATCCGGAGCGT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.39.17 chr1 - 1713 7 novel_in_catalog CCNL2 novel 1503 9 NA NA 272 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCAGGACATCCGGAGCGT 7946 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.39.18 chr1 - 1429 4 incomplete-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 2152 -210 527 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCAGGACATCCGGAGCGT 8950 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.39.19 chr1 - 1212 3 full-splice_match CCNL2 ENST00000463260.5 1941 3 721 8 721 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCAGGACATCCGGAGCGT 3094 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.39.23 chr1 - 2192 11 full-splice_match CCNL2 ENST00000400809.8 3112 11 10 910 0 87 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.740077 0.758918 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GGATCTGTGTTGAAAGTCGT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 22 NA PB.39.24 chr1 - 2428 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 679 -25 -92 20 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGAACTTGAATCCCGTCAGC 7477 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.39.25 chr1 - 1898 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 1184 0 -245 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGTTAAAGCTATGTATGAA 7982 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.39.26 chr1 - 2814 11 novel_not_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA 3 1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGCTATGTATGAAAACTCA 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.39.27 chr1 - 1374 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 1714 -6 89 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGCTATGTATGAAAACTCA 8512 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.39.28 chr1 - 1218 4 incomplete-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 2159 -6 534 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGCTATGTATGAAAACTCA 8957 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.39.31 chr1 - 3767 11 novel_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA -93 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGCTATGTATGAAAACTC 8777 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.39.32 chr1 - 3530 8 novel_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA -2777 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGCTATGTATGAAAACTC 6748 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.39.33 chr1 - 3015 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 72 -5 72 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGCTATGTATGAAAACTC 9788 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.39.34 chr1 - 2625 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 462 -5 -309 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGCTATGTATGAAAACTC 7260 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.39.35 chr1 - 2226 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 861 -5 -15 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGCTATGTATGAAAACTC 7659 FALSE NA NA TATAAA -12 NA NA NA 6 NA PB.39.36 chr1 - 2043 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 1044 -5 168 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGCTATGTATGAAAACTC 7842 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.39.37 chr1 - 1749 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 1338 -5 -91 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGCTATGTATGAAAACTC 8136 FALSE NA NA ACTAAA -2 NA NA NA 3 NA PB.39.39 chr1 - 4042 11 novel_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 45 11.741067 1.069708 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TAAAGCTATGTATGAAAACT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 45 NA PB.39.40 chr1 - 3392 7 novel_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA -707 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TAAAGCTATGTATGAAAACT 8818 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.39.41 chr1 - 2942 12 novel_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.696427 0.671768 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TAAAGCTATGTATGAAAACT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.39.42 chr1 - 1620 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 1466 -4 37 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TAAAGCTATGTATGAAAACT 8264 FALSE NA NA AATACA -45 NA NA NA 6 NA PB.39.43 chr1 - 1446 3 full-splice_match CCNL2 ENST00000463260.5 1941 3 281 214 281 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TAAAGCTATGTATGAAAACT 2654 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.39.45 chr1 - 3607 12 novel_in_catalog CCNL2 novel 1598 12 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGTTAAAGCTATGTATGAA -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.39.46 chr1 - 2938 12 novel_not_in_catalog CCNL2 novel 4452 13 NA NA -1 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGTTAAAGCTATGTATGAA -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.39.47 chr1 - 2905 11 novel_not_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGTTAAAGCTATGTATGAA -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.39.48 chr1 - 2845 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 237 0 237 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGTTAAAGCTATGTATGAA 9953 FALSE NA NA TATAAA -43 NA NA NA 2 NA PB.39.49 chr1 - 1071 3 full-splice_match CCNL2 ENST00000463260.5 1941 3 652 218 652 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGTTAAAGCTATGTATGAA 3025 FALSE NA NA AAAACA -7 NA NA NA 8 NA PB.39.50 chr1 - 1520 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 1561 1 40 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 CAAGTTAAAGCTATGTATGA 8359 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.39.54 chr1 - 1632 8 novel_not_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA 0 811 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 GAAAAAAGAAAGCACGCTAT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.39.55 chr1 - 1867 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000408918.8 1186 6 -7 -674 1 -461 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTGTGTTGCTTCTGATTCT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.39.56 chr1 - 1193 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000408918.8 1186 6 -11 4 0 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 63 16.437494 1.215836 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATGTTCTCAAGATTTCATTT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 63 NA PB.39.57 chr1 - 1248 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000408918.8 1186 6 -69 7 -51 -7 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TATATGTTCTCAAGATTTCA 8440 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.39.59 chr1 - 1045 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000408918.8 1186 6 -17 158 1 -158 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CAGTGTGGGGTTATGTCATG -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.40.1 chr1 - 940 5 novel_not_in_catalog MRPL20 novel 700 4 NA NA 3 3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TTTAGAGTCATTTTCTGGTA -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.40.2 chr1 - 1345 4 novel_in_catalog MRPL20 novel 700 4 NA NA 12 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTTTTTAGAGTCATTTTCT 18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.40.3 chr1 - 1033 4 novel_in_catalog MRPL20 novel 700 4 NA NA 8 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTTTTTAGAGTCATTTTCT -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.40.4 chr1 - 875 4 novel_not_in_catalog MRPL20 novel 700 4 NA NA -7 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTTTTTAGAGTCATTTTCT -26 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.40.5 chr1 - 820 5 novel_in_catalog MRPL20 novel 700 4 NA NA 0 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTTTTTAGAGTCATTTTCT -19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.40.6 chr1 - 775 5 novel_not_in_catalog MRPL20 novel 700 4 NA NA -9 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTTTTTAGAGTCATTTTCT -28 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.40.7 chr1 - 699 4 full-splice_match MRPL20 ENST00000344843.12 700 4 0 1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 296 77.230133 1.887787 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTTTTTAGAGTCATTTTCT -19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 296 NA PB.40.8 chr1 - 838 5 novel_not_in_catalog MRPL20 novel 700 4 NA NA 0 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAGTTTTTAGAGTCATTTTC -19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.40.9 chr1 - 680 4 novel_not_in_catalog MRPL20 novel 700 4 NA NA 7 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TTCAGTTTTTAGAGTCATTT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.40.10 chr1 - 570 4 full-splice_match MRPL20 ENST00000344843.12 700 4 0 130 0 -126 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTTTGTTTGATTTATACTT -19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.41.1 chr1 + 2189 2 full-splice_match MRPL20-AS1 ENST00000418833.2 2196 2 10 -3 -1 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAACAAACTGCAAATTACTC -24 TRUE NA NA TATAAA -3 NA NA NA 9 NA PB.41.2 chr1 + 1846 3 novel_not_in_catalog MRPL20-AS1 novel 1659 3 NA NA -1 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAACAAACTGCAAATTACTC -24 TRUE NA NA TATAAA -3 NA NA NA 2 NA PB.41.4 chr1 + 1727 3 full-splice_match MRPL20-AS1 ENST00000444362.3 1759 3 26 6 0 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 104 27.134911 1.433528 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAATTACTCTGTCTCTTTTC -23 TRUE NA NA TATAAA -14 NA NA NA 104 NA PB.41.5 chr1 + 2497 1 full-splice_match MRPL20-AS1 ENST00000686850.1 2503 1 3 3 -3 -3 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAATTACTCTGTCTCTTTTC -20 TRUE NA NA TATAAA -14 NA NA NA 7 NA PB.41.6 chr1 + 1661 3 full-splice_match MRPL20-AS1 ENST00000690954.1 1673 3 5 7 0 3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAAATTACTCTGTCTCTTTT -12 TRUE NA NA TATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.41.7 chr1 + 1552 2 novel_in_catalog MRPL20-AS1 novel 1759 3 NA NA 2 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAACTGCAAATTACTCT 0 TRUE NA NA TATAAA -4 NA NA NA 4 NA PB.41.8 chr1 + 1470 1 full-splice_match MRPL20-AS1 ENST00000687493.1 2209 1 725 14 141 -3 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAACAAACTGCAAATTACTC 751 FALSE NA NA TATAAA -3 NA NA NA 3 NA PB.41.9 chr1 + 1385 1 full-splice_match MRPL20-AS1 ENST00000687493.1 2209 1 826 -2 242 -1 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTCTGTCTCTTTTCCTAAT 852 FALSE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.41.10 chr1 + 1152 1 full-splice_match MRPL20-AS1 ENST00000687493.1 2209 1 1043 14 459 -3 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAACAAACTGCAAATTACTC 1069 FALSE NA NA TATAAA -3 NA NA NA 2 NA PB.41.11 chr1 + 914 1 full-splice_match MRPL20-AS1 ENST00000687493.1 2209 1 1281 14 697 -3 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAACAAACTGCAAATTACTC 1307 FALSE NA NA TATAAA -3 NA NA NA 2 NA PB.41.12 chr1 + 832 1 full-splice_match MRPL20-AS1 ENST00000687493.1 2209 1 1374 3 790 -3 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAATTACTCTGTCTCTTTTC 1400 FALSE NA NA TATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.41.13 chr1 + 707 1 full-splice_match MRPL20-AS1 ENST00000687493.1 2209 1 1499 3 915 -3 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAATTACTCTGTCTCTTTTC 1525 FALSE NA NA TATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.42.1 chr1 + 2365 3 full-splice_match VWA1 ENST00000476993.2 4492 3 10 2117 10 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCCTGCAGTCTCGCTAGGA -4 TRUE NA NA AGTAAA -15 NA NA NA 5 NA PB.43.1 chr1 - 1611 2 full-splice_match ANKRD65 ENST00000442470.1 876 2 -19 -716 -3 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTGGGTGTCTGAGAGGTT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.43.2 chr1 - 1561 3 novel_not_in_catalog ANKRD65 novel 1976 3 NA NA -49 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACAACTGGGTGTCTGAGAGG 1050 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.43.3 chr1 - 1471 3 full-splice_match ANKRD65 ENST00000520296.5 1632 3 156 5 -12 -5 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TACAACTGGGTGTCTGAGAG -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.46.2 chr1 + 3471 16 novel_not_in_catalog ATAD3B novel 4314 14 NA NA -2 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCGCCGTGTCTCTCTATTG -9 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.46.4 chr1 + 2342 17 novel_not_in_catalog ATAD3B novel 4098 16 NA NA 7 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CCGCCGTGTCTCTCTATTGA 19 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 5 NA PB.46.5 chr1 + 2071 15 incomplete-splice_match ATAD3B ENST00000673477.1 4098 16 5564 1647 -697 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCGCCGTGTCTCTCTATTG 5557 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.46.6 chr1 + 1798 11 incomplete-splice_match ATAD3B ENST00000472194.6 4314 14 4131 1647 -1328 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCGCCGTGTCTCTCTATTG 4308 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 6 NA PB.46.7 chr1 + 1477 9 incomplete-splice_match ATAD3B ENST00000472194.6 4314 14 7096 1645 553 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CGCCGTGTCTCTCTATTGAC 7273 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 9 NA PB.46.8 chr1 + 1324 7 incomplete-splice_match ATAD3B ENST00000472194.6 4314 14 8128 1647 1585 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCGCCGTGTCTCTCTATTG 8305 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.46.9 chr1 + 1223 3 incomplete-splice_match ATAD3B ENST00000485748.5 3233 10 6542 2 5458 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CACCGCCGTGTCTCTCTATT NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.46.10 chr1 + 1074 3 incomplete-splice_match ATAD3B ENST00000485748.5 3233 10 6692 1 5608 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCGCCGTGTCTCTCTATTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.46.11 chr1 + 890 3 incomplete-splice_match ATAD3B ENST00000485748.5 3233 10 6876 1 5792 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCGCCGTGTCTCTCTATTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 5 NA PB.48.1 chr1 - 1472 5 novel_not_in_catalog SSU72 novel 1284 5 NA NA -21 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTGTGCCTGGTCCTGAATT -29 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.48.2 chr1 - 1304 5 full-splice_match SSU72 ENST00000291386.4 1284 5 -21 1 -21 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 695 181.334259 2.258480 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTGTGCCTGGTCCTGAATT -29 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 695 NA PB.48.3 chr1 - 1063 5 full-splice_match SSU72 ENST00000291386.4 1284 5 220 1 -56 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 307 80.100166 1.903633 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTGTGCCTGGTCCTGAATT -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 307 NA PB.48.4 chr1 - 1007 5 full-splice_match SSU72 ENST00000291386.4 1284 5 276 1 0 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 149 38.875977 1.589681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTGTGCCTGGTCCTGAATT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 149 NA PB.48.5 chr1 - 829 4 incomplete-splice_match SSU72 ENST00000291386.4 1284 5 10015 1 9736 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTGTGCCTGGTCCTGAATT 10007 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.48.6 chr1 - 771 4 incomplete-splice_match SSU72 ENST00000291386.4 1284 5 10073 1 9794 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTGTGCCTGGTCCTGAATT 9843 FALSE NA NA CATAAA -5 NA NA NA 7 NA PB.48.7 chr1 - 631 3 full-splice_match SSU72 ENST00000378726.1 2238 3 1607 0 1607 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTGTGCCTGGTCCTGAATT 1977 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.48.8 chr1 - 539 2 incomplete-splice_match SSU72 ENST00000378726.1 2238 3 2574 0 2574 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTGTGCCTGGTCCTGAATT 2944 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.48.12 chr1 - 2674 2 full-splice_match SSU72 ENST00000359060.5 4176 2 -2 1504 1 -1504 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCTTAGCCTGACATCCTG -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.48.13 chr1 - 2946 2 full-splice_match SSU72 ENST00000359060.5 4176 2 -277 1507 2 -1507 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.696427 0.671768 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATGAAGCTTAGCCTGACATC -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.49.1 chr1 - 1728 1 full-splice_match FNDC10 ENST00000422725.4 2124 1 394 2 394 -2 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAGAGCTGTCTGTGTGTT 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.49.2 chr1 - 1475 1 full-splice_match FNDC10 ENST00000422725.4 2124 1 647 2 647 -2 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAGAGCTGTCTGTGTGTT 643 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.49.3 chr1 - 1093 1 full-splice_match FNDC10 ENST00000422725.4 2124 1 1027 4 1027 -4 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CCAACAGAGCTGTCTGTGTG 1023 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.49.4 chr1 - 660 1 full-splice_match FNDC10 ENST00000422725.4 2124 1 1462 2 1462 -2 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAGAGCTGTCTGTGTGTT 1458 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.49.5 chr1 - 1331 1 full-splice_match FNDC10 ENST00000422725.4 2124 1 790 3 790 -3 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAACAGAGCTGTCTGTGTGT 786 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.49.6 chr1 - 1218 1 full-splice_match FNDC10 ENST00000422725.4 2124 1 901 5 901 -5 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACCAACAGAGCTGTCTGTGT 897 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.50.2 chr1 + 2482 16 full-splice_match ATAD3A ENST00000378756.8 2481 16 -2 1 -2 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 134 34.962288 1.543600 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG 3 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 134 NA PB.50.3 chr1 + 2387 17 novel_not_in_catalog ATAD3A novel 2266 17 NA NA -4 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 43 11.219242 1.049963 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG 14 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 43 NA PB.50.4 chr1 + 2318 15 novel_in_catalog ATAD3A novel 2481 16 NA NA -4 2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GCCCTGTCTGTCTCTTGGCT 14 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.50.5 chr1 + 2351 16 full-splice_match ATAD3A ENST00000378756.8 2481 16 131 -1 -92 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TGCCCTGTCTGTCTCTTGGC 136 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 4 NA PB.50.6 chr1 + 2091 14 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000536055.6 2330 16 4781 1 241 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG 4769 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 10 NA PB.50.8 chr1 + 1975 13 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000536055.6 2330 16 5200 1 109 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.696427 0.671768 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG 5188 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 18 NA PB.50.9 chr1 + 1839 11 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000536055.6 2330 16 7631 1 2540 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.130951 0.495676 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG 7619 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 12 NA PB.50.10 chr1 + 1680 10 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000536055.6 2330 16 8031 1 2940 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.652776 0.562623 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG 8019 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 14 NA PB.50.11 chr1 + 1537 9 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000536055.6 2330 16 10300 1 -1125 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.913689 0.592586 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 15 NA PB.50.12 chr1 + 1363 7 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000536055.6 2330 16 11356 1 -69 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.50.13 chr1 + 1260 6 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000536055.6 2330 16 11767 1 342 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 6 NA PB.50.14 chr1 + 1191 6 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000536055.6 2330 16 11836 1 411 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 6 NA PB.50.15 chr1 + 1094 4 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000536055.6 2330 16 13944 1 2519 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 11 NA PB.50.16 chr1 + 967 3 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000400830.4 830 8 3809 -542 3809 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 7 NA PB.50.17 chr1 + 1409 2 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000400830.4 830 8 4727 -542 4727 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.50.18 chr1 + 796 2 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000400830.4 830 8 5340 -542 5340 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.51.1 chr1 + 991 2 full-splice_match MIB2 ENST00000477990.1 2821 2 -60 1890 2 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAGGATTTGGTTTCTAT NA FALSE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 3 NA PB.51.2 chr1 + 1013 2 full-splice_match MIB2 ENST00000507082.1 1578 2 -13 578 -4 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAGGATTTGGTTTCTAT 10 TRUE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 8 NA PB.52.1 chr1 - 2035 1 full-splice_match ENSG00000272106 ENST00000607222.1 2038 1 -2 5 -2 -5 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 16 4.174602 0.620615 NA NA NA NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACCAACTGTTTTTTGTTTTG -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.53.2 chr1 - 2988 20 full-splice_match CDK11B ENST00000341832.11 2992 20 0 4 0 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAAGCTCCCCGTGTCGTCCT -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.53.3 chr1 - 1900 12 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000341832.11 2992 20 17318 4 17286 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAAGCTCCCCGTGTCGTCCT 7950 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.53.4 chr1 - 1768 10 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000341832.11 2992 20 18593 4 18561 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAAGCTCCCCGTGTCGTCCT 9225 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.53.5 chr1 - 1240 6 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000341832.11 2992 20 21876 4 21844 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAAGCTCCCCGTGTCGTCCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.53.7 chr1 - 2437 16 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000341832.11 2992 20 9455 8 9423 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAGGAAAGCTCCCCGTGTCG 9642 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.53.8 chr1 - 1419 10 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000407249.7 2677 20 18590 2 18550 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGAGCTGTGTTTTCTCCGT 9214 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.53.9 chr1 - 2348 18 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000340677.9 2534 21 3592 -148 3552 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAGAGCTGTGTTTTCTCCG 3771 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.53.10 chr1 - 1659 12 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000407249.7 2677 20 17206 3 17166 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAGAGCTGTGTTTTCTCCG 7830 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.53.11 chr1 - 1102 8 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000407249.7 2677 20 21208 3 21168 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAGAGCTGTGTTTTCTCCG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.53.12 chr1 - 953 6 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000407249.7 2677 20 21810 3 21770 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAGAGCTGTGTTTTCTCCG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.53.13 chr1 - 2626 20 full-splice_match CDK11B ENST00000341832.11 2992 20 0 366 0 -4 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAAAGAGCTGTGTTTTCTCC -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.53.14 chr1 - 1500 11 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000407249.7 2677 20 17912 4 17872 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAAAGAGCTGTGTTTTCTCC 8536 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.53.15 chr1 - 1264 9 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000407249.7 2677 20 20429 4 20389 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAAAGAGCTGTGTTTTCTCC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.53.16 chr1 - 2028 15 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000340677.9 2534 21 13748 -145 13708 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGGAAAGAGCTGTGTTTTCT 4372 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.53.17 chr1 - 1870 14 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000340677.9 2534 21 16523 -145 16483 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGGAAAGAGCTGTGTTTTCT 7147 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.53.19 chr1 - 1153 11 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000340677.9 2534 21 48 5343 8 691 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAGAACGAGAAAATGAAAAC 23 TRUE NA NA AAGAAA -44 NA NA NA 4 NA PB.53.23 chr1 - 901 7 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000407249.7 2677 20 4 6760 -4 -575 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 25 6.522815 0.814435 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTGAGTCTTTTCTGGGGGAT -21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 25 NA PB.53.24 chr1 - 1064 7 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000407249.7 2677 20 -198 6799 -198 -614 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTGAGGCCAGGCCGGCGCCT -19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.53.25 chr1 - 832 7 novel_not_in_catalog CDK11B novel 2534 21 NA NA -4 -614 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTGAGGCCAGGCCGGCGCCT -21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.53.26 chr1 - 578 5 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000340677.9 2534 21 3593 6648 3553 -614 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTGAGGCCAGGCCGGCGCCT 3772 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.53.27 chr1 - 888 8 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000340677.9 2534 21 23 6650 15 -616 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGTGAGGCCAGGCCGGCGC -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.53.28 chr1 - 681 6 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000611150.3 2350 19 46 6650 6 -616 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGTGAGGCCAGGCCGGCGC 21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.54.14 chr1 - 3176 9 full-splice_match SLC35E2B ENST00000611123.1 5948 9 -44 2816 23 -513 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAACAGAGCAATAATTCTGA 49 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.56.3 chr1 - 1031 4 incomplete-splice_match CDK11A ENST00000356937.7 2275 17 17753 -494 214 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAAAGCTCCCCGTGTCGTCC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.56.5 chr1 - 741 5 incomplete-splice_match CDK11A ENST00000356937.7 2275 17 17599 -148 60 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAGAGCTGTGTTTTCTCCG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.56.8 chr1 - 1256 7 novel_in_catalog CDK11A novel 2458 20 NA NA -40 -4525 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAGAAGAGAAAATGGAAG 141 FALSE NA NA CATAAA -2 NA NA NA 2 NA PB.56.9 chr1 - 840 7 incomplete-splice_match CDK11A ENST00000358779.9 2419 20 -3 6598 -3 -4871 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.130951 0.495676 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTGAGTCTTTTCTGGGGGAT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.56.10 chr1 - 840 7 incomplete-splice_match CDK11A ENST00000460465.5 2333 20 -12 6637 -12 -4910 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTGAGGCCAGGCCGGCGCCT -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.58.1 chr1 - 3465 12 novel_in_catalog NADK novel 3235 12 NA NA -13 -7 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.58.2 chr1 - 3180 12 full-splice_match NADK ENST00000341426.9 3235 12 48 7 -2 -7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 46 12.001980 1.079253 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 46 NA PB.58.3 chr1 - 3175 12 novel_in_catalog NADK novel 3235 12 NA NA 36 -7 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.58.4 chr1 - 3027 11 novel_in_catalog NADK novel 3235 12 NA NA -7 -7 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.58.5 chr1 - 2891 11 incomplete-splice_match NADK ENST00000341426.9 3235 12 13179 7 -6716 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 1118 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.58.6 chr1 - 2707 9 incomplete-splice_match NADK ENST00000342348.9 1722 10 1301 -1232 -6 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 9135 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.58.7 chr1 - 2615 8 incomplete-splice_match NADK ENST00000342348.9 1722 10 1965 -1232 -2 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 9799 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.58.8 chr1 - 2487 7 incomplete-splice_match NADK ENST00000342348.9 1722 10 2252 -1232 4 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 2565 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.58.9 chr1 - 2345 6 incomplete-splice_match NADK ENST00000342348.9 1722 10 3175 -1232 -504 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 3488 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.58.10 chr1 - 2248 5 incomplete-splice_match NADK ENST00000342348.9 1722 10 3947 -1232 238 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 4260 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.58.11 chr1 - 2194 5 incomplete-splice_match NADK ENST00000342348.9 1722 10 4001 -1232 -191 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 4314 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.58.12 chr1 - 2093 4 incomplete-splice_match NADK ENST00000342348.9 1722 10 4262 -1232 70 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 4575 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.58.13 chr1 - 2040 3 incomplete-splice_match NADK ENST00000342348.9 1722 10 4390 -1232 198 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 4703 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.58.14 chr1 - 1907 2 incomplete-splice_match NADK ENST00000498806.1 269 3 732 -1736 732 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 5237 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.58.23 chr1 - 3201 12 novel_not_in_catalog NADK novel 3235 12 NA NA -457 -9 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AGAAAATAAGCTGGGTTAAT 9978 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.58.24 chr1 - 1285 8 incomplete-splice_match NADK ENST00000342348.9 1722 10 2024 39 57 -39 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTTGAGCTGCCATGCTTTTC 9858 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.58.25 chr1 - 613 2 incomplete-splice_match NADK ENST00000498806.1 269 3 755 -465 755 -39 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTTGAGCTGCCATGCTTTTC 5260 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.58.26 chr1 - 2178 12 novel_in_catalog NADK novel 3235 12 NA NA -7 -49 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAACCTTCCTTGAGCTGC 13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.58.27 chr1 - 2142 12 novel_in_catalog NADK novel 3098 12 NA NA -58 -49 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAACCTTCCTTGAGCTGC 8569 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.58.28 chr1 - 2042 12 novel_in_catalog NADK novel 3235 12 NA NA -112 -49 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAACCTTCCTTGAGCTGC 9044 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.58.29 chr1 - 1934 12 novel_not_in_catalog NADK novel 3235 12 NA NA -323 -49 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAACCTTCCTTGAGCTGC 8304 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.58.30 chr1 - 1902 12 full-splice_match NADK ENST00000341426.9 3235 12 45 1288 -5 -49 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 40 10.436504 1.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAACCTTCCTTGAGCTGC 15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 40 NA PB.58.31 chr1 - 1334 8 incomplete-splice_match NADK ENST00000342348.9 1722 10 1965 49 -2 -49 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAACCTTCCTTGAGCTGC 9799 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.58.32 chr1 - 1081 6 incomplete-splice_match NADK ENST00000342348.9 1722 10 3158 49 -521 -49 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAACCTTCCTTGAGCTGC 3471 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.58.33 chr1 - 918 5 incomplete-splice_match NADK ENST00000342348.9 1722 10 3996 49 -196 -49 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAACCTTCCTTGAGCTGC 4309 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.59.2 chr1 + 1970 12 incomplete-splice_match MIB2 ENST00000378708.5 3012 18 9088 2 -212 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GGACGTTGCCTCTGCTGTCT 1559 FALSE NA NA TATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.59.3 chr1 + 1720 11 incomplete-splice_match MIB2 ENST00000514234.5 2562 16 3180 0 122 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACGTTGCCTCTGCTGTCTGC 1893 FALSE NA NA TATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.59.4 chr1 + 1431 8 incomplete-splice_match MIB2 ENST00000514234.5 2562 16 3859 0 139 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACGTTGCCTCTGCTGTCTGC 3 TRUE NA NA TATAAA -16 NA NA NA 4 NA PB.59.5 chr1 + 1050 6 incomplete-splice_match MIB2 ENST00000514234.5 2562 16 4528 -6 -159 5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CCTCTGCTGTCTGCCTGGGG 283 FALSE NA NA TATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.59.6 chr1 + 1002 3 novel_in_catalog MIB2 novel 1058 5 NA NA -164 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GGACGTTGCCTCTGCTGTCT 895 FALSE NA NA TATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.59.7 chr1 + 875 4 incomplete-splice_match MIB2 ENST00000483015.1 1058 5 509 -15 -108 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACGTTGCCTCTGCTGTCTGC 6 TRUE NA NA TATAAA -16 NA NA NA 6 NA PB.59.8 chr1 + 659 3 full-splice_match MIB2 ENST00000511910.1 584 3 -74 -1 -74 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACGTTGCCTCTGCTGTCTGC 8 TRUE NA NA TATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.60.2 chr1 - 2196 4 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 100597 1 3707 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTTTGGTGTGGTGATTATT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.60.3 chr1 - 2044 3 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 101871 4 4981 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.913689 0.592586 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGGACTTTGGTGTGGTGATT 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.60.6 chr1 - 2970 12 novel_not_in_catalog GNB1 novel 3163 12 NA NA 137 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GACTTTGGTGTGGTGATTAT 1491 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.60.7 chr1 - 2572 7 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 84572 2 11871 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.130951 0.495676 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GACTTTGGTGTGGTGATTAT 9286 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.60.8 chr1 - 2463 6 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 86574 2 -10316 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GACTTTGGTGTGGTGATTAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.60.9 chr1 - 3116 12 full-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 43 4 43 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGGACTTTGGTGTGGTGATT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.60.12 chr1 - 2972 12 novel_in_catalog GNB1 novel 3163 12 NA NA -44 -5 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGGACTTTGGTGTGGTGAT 1310 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.60.13 chr1 - 2801 10 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 65628 5 95 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.391864 0.530438 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGGACTTTGGTGTGGTGAT 6890 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.60.14 chr1 - 2328 5 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 97813 5 923 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGGACTTTGGTGTGGTGAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.60.21 chr1 - 2940 12 full-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 217 6 -34 -6 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAGGGACTTTGGTGTGGTGA 885 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.60.22 chr1 - 1895 3 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 102018 6 5128 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAGGGACTTTGGTGTGGTGA 1515 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.60.25 chr1 - 2274 4 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 100513 7 3623 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGAGGGACTTTGGTGTGGTG 10 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.60.28 chr1 - 2367 11 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 51847 530 -6955 -530 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAAAAAAAAAGTTCTGTT NA FALSE NA NA AATAAA -1 NA NA NA 2 NA PB.60.30 chr1 - 2146 8 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 75253 530 2552 -530 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAAAAAAAAAGTTCTGTT 2469 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.60.40 chr1 - 659 4 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 100669 1466 3779 1235 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACTTGAGTGTAATTGTCA 166 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.60.41 chr1 - 1062 6 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 86510 1467 -10380 1234 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.652776 0.562623 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAACTTGAGTGTAATTGTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.60.42 chr1 - 1642 12 full-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 50 1471 50 1230 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAGGTAAACTTGAGTGTAAT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.60.43 chr1 - 1532 11 full-splice_match GNB1 ENST00000610897.4 3145 11 141 1472 -10 1230 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAGGTAAACTTGAGTGTAAT 779 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.60.44 chr1 - 1426 11 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 51847 1471 -6955 1230 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAGGTAAACTTGAGTGTAAT NA FALSE NA NA AATAAA -1 NA NA NA 7 NA PB.60.45 chr1 - 1303 10 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 65660 1471 127 1230 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAGGTAAACTTGAGTGTAAT 6922 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.60.46 chr1 - 1186 8 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 75272 1471 2571 1230 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAGGTAAACTTGAGTGTAAT -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.60.47 chr1 - 942 6 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 86626 1471 -10264 1230 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAGGTAAACTTGAGTGTAAT -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.60.48 chr1 - 824 4 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 100499 1471 3609 1230 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAGGTAAACTTGAGTGTAAT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.60.49 chr1 - 1574 12 full-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 116 1473 -5 1228 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AGAAGGTAAACTTGAGTGTA 784 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.60.50 chr1 - 1491 12 novel_in_catalog GNB1 novel 3163 12 NA NA -31 1228 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.130951 0.495676 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AGAAGGTAAACTTGAGTGTA 1323 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.60.51 chr1 - 723 4 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 100598 1473 3708 1228 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AGAAGGTAAACTTGAGTGTA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.60.52 chr1 - 1716 14 novel_not_in_catalog GNB1 novel 3163 12 NA NA -34 1214 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 TAAAAATGTTAACCAGAAGG 885 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.62.2 chr1 - 1497 3 novel_in_catalog TMEM52 novel 690 4 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCTCTGCCTATGTGGGAAGG 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.62.3 chr1 - 1286 3 incomplete-splice_match TMEM52 ENST00000602604.1 878 4 193 -508 182 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCTCTGCCTATGTGGGAAGG -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.63.1 chr1 - 1607 4 full-splice_match FAAP20 ENST00000400918.7 811 4 -21 -775 0 61 alternative_3end TRUE canonical NA NA NA NA 33 8.610116 0.935009 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATTGTTGTCGAGCTGA -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 33 NA PB.63.2 chr1 - 1942 4 novel_in_catalog FAAP20 novel 2280 8 NA NA 663 -7 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAATCTGCCTAGTATTTGAC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.63.3 chr1 - 1351 3 full-splice_match FAAP20 ENST00000400919.7 1413 3 48 14 12 3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATTTCAATCTGCCTAGTATT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.63.4 chr1 - 1355 4 novel_not_in_catalog FAAP20 novel 2216 7 NA NA 1 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGCATTTCAATCTGCCTAGT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.63.5 chr1 - 1199 3 full-splice_match FAAP20 ENST00000476803.1 701 3 -480 -18 46 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAACGTCTGCCGCTTTTCTT 369 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.63.7 chr1 - 714 4 full-splice_match FAAP20 ENST00000378546.9 727 4 10 3 10 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 59 15.393844 1.187347 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAACGTCTGCCGCTTTTCTT 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 59 NA PB.63.8 chr1 - 542 3 full-splice_match FAAP20 ENST00000476803.1 701 3 176 -17 71 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAAACGTCTGCCGCTTTTCT 1025 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.63.10 chr1 - 840 5 incomplete-splice_match FAAP20 ENST00000428120.5 2313 8 -18 5075 -8 -5 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGAAACGTCTGCCGCTTTTC 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.63.11 chr1 - 1557 4 full-splice_match FAAP20 ENST00000420515.1 1544 4 -14 1 10 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTGGACATTTTGTGCATT 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.64.1 chr1 + 2316 18 full-splice_match PRKCZ ENST00000378567.8 2385 18 66 3 -8 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.740077 0.758918 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAAGCTCCTCTGATGCCTTT -2 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 22 NA PB.64.2 chr1 + 1995 17 incomplete-splice_match PRKCZ ENST00000378567.8 2385 18 5127 2 97 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGCTCCTCTGATGCCTTTT 5059 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.64.6 chr1 + 1472 10 incomplete-splice_match PRKCZ ENST00000479263.5 1747 13 6337 8 5401 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATGTGGAAGCTCCTCTGATG 1696 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.64.7 chr1 + 1165 8 full-splice_match PRKCZ ENST00000505322.5 1859 8 688 6 561 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATGTGGAAGCTCCTCTGATG NA FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 3 NA PB.69.1 chr1 + 1573 2 novel_not_in_catalog ENSG00000287356 novel 5675 3 NA NA 1630 -2854 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTCCTGGTCTCTGGATGCT 77 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.70.3 chr1 - 763 6 incomplete-splice_match MORN1 ENST00000378529.7 1500 11 151 29600 -2 597 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGTGTGCCTTGTGTATACT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.71.2 chr1 - 2807 6 full-splice_match PEX10 ENST00000447513.7 2835 6 21 7 -3 -7 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATCACTTGGTAAAACGT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.71.4 chr1 - 3059 6 novel_not_in_catalog PEX10 novel 2905 6 NA NA 11 34 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACACAAGATGGAACTTGAG -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.71.5 chr1 - 1984 6 full-splice_match PEX10 ENST00000447513.7 2835 6 21 830 -3 34 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 92 24.003960 1.380283 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACACAAGATGGAACTTGAG 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 92 NA PB.71.6 chr1 - 1316 3 incomplete-splice_match PEX10 ENST00000447513.7 2835 6 5696 830 3136 34 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACACAAGATGGAACTTGAG 6971 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.71.8 chr1 - 2109 6 novel_not_in_catalog PEX10 novel 2905 6 NA NA -39 15 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATGTGGGTACGTTACTA 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.71.9 chr1 - 2022 6 novel_not_in_catalog PEX10 novel 2905 6 NA NA -3 15 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATGTGGGTACGTTACTA 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.71.10 chr1 - 2027 6 novel_in_catalog PEX10 novel 2835 6 NA NA -14 15 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.913689 0.592586 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATGTGGGTACGTTACTA -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.71.11 chr1 - 1781 5 incomplete-splice_match PEX10 ENST00000447513.7 2835 6 2144 849 -416 15 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATGTGGGTACGTTACTA 3419 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.71.12 chr1 - 1631 4 incomplete-splice_match PEX10 ENST00000447513.7 2835 6 3806 849 1246 15 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATGTGGGTACGTTACTA 5081 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.71.13 chr1 - 1136 2 incomplete-splice_match PEX10 ENST00000447513.7 2835 6 5957 849 3397 15 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATGTGGGTACGTTACTA 7232 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.71.14 chr1 - 1880 6 novel_in_catalog PEX10 novel 2835 6 NA NA 132 14 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CAAAATGTGGGTACGTTACT 174 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.71.15 chr1 - 1468 4 incomplete-splice_match PEX10 ENST00000447513.7 2835 6 3968 850 1408 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CAAAATGTGGGTACGTTACT 5243 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.72.1 chr1 + 1016 8 novel_not_in_catalog RER1 novel 695 8 NA NA 19 68 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TAAACCAAATCGCATGGATT 6390 FALSE NA NA AAGAAA -9 NA NA NA 9 NA PB.72.2 chr1 + 757 6 full-splice_match RER1 ENST00000378513.7 3000 6 21 2222 21 4 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGTCAAATTTTCTTTTTAAA 6392 FALSE NA NA CATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.72.3 chr1 + 939 7 full-splice_match RER1 ENST00000605895.6 3028 7 -35 2124 -22 85 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 358 93.406715 1.970378 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTTCTTTTTCAGTGACGTT 6402 FALSE NA NA AAGAAA -26 NA NA NA 358 NA PB.72.4 chr1 + 1382 7 novel_not_in_catalog RER1 novel 3028 7 NA NA -21 11 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATTTTGACACATTTCTTTG 6403 FALSE NA NA TATAAA -29 NA NA NA 2 NA PB.72.5 chr1 + 1037 7 full-splice_match RER1 ENST00000378512.5 1404 7 -83 450 -21 74 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATCGCATGGATTTCTTTT 6403 FALSE NA NA AAGAAA -15 NA NA NA 11 NA PB.72.6 chr1 + 1373 7 full-splice_match RER1 ENST00000605895.6 3028 7 -28 1683 -15 2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 104 27.134911 1.433528 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GTTTGAGATTATTTTGACAC 6409 FALSE NA NA TATAAA -20 NA NA NA 104 NA PB.72.7 chr1 + 965 8 novel_not_in_catalog RER1 novel 695 8 NA NA -12 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAATTTTCTTTTTAAAAAGG 6412 FALSE NA NA CATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.72.8 chr1 + 1064 9 novel_not_in_catalog RER1 novel 695 8 NA NA -9 4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGTCAAATTTTCTTTTTAAA 6415 FALSE NA NA CATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.72.9 chr1 + 1461 8 novel_not_in_catalog RER1 novel 695 8 NA NA 1 33 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.652776 0.562623 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACGTAGAGTGTTTTGTTTTT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.72.10 chr1 + 2461 7 full-splice_match RER1 ENST00000605895.6 3028 7 -14 581 -1 -581 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACTCTCTGGCGCAGGTTAA -18 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.72.11 chr1 + 1513 8 novel_not_in_catalog RER1 novel 695 8 NA NA -1 8 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GATTATTTTGACACATTTCT -18 TRUE NA NA TATAAA -26 NA NA NA 5 NA PB.72.12 chr1 + 1055 8 novel_not_in_catalog RER1 novel 695 8 NA NA -1 74 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 25 6.522815 0.814435 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATCGCATGGATTTCTTTT -18 TRUE NA NA AAGAAA -15 NA NA NA 25 NA PB.72.13 chr1 + 993 8 novel_not_in_catalog RER1 novel 695 8 NA NA -1 74 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 63 16.437494 1.215836 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATCGCATGGATTTCTTTT -18 TRUE NA NA AAGAAA -15 NA NA NA 63 NA PB.72.14 chr1 + 3037 7 full-splice_match RER1 ENST00000605895.6 3028 7 -11 2 2 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 37 9.653767 0.984697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TACTTCTGAATTACTTCTCA -15 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 37 NA PB.72.15 chr1 + 1065 9 novel_not_in_catalog RER1 novel 695 8 NA NA -4 74 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATCGCATGGATTTCTTTT -8 TRUE NA NA AAGAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.72.16 chr1 + 1301 7 full-splice_match RER1 ENST00000605895.6 3028 7 63 1664 14 21 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CATTTCTTTGATACGTAGAG 59 FALSE NA NA TATAAA -39 NA NA NA 4 NA PB.72.17 chr1 + 1395 7 novel_not_in_catalog RER1 novel 2469 6 NA NA -524 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGGAGTCAAATTTTCTTT 805 FALSE NA NA CATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.72.18 chr1 + 1189 6 full-splice_match RER1 ENST00000488353.2 2469 6 1284 -4 1284 4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGTCAAATTTTCTTTTTAAA 3444 FALSE NA NA CATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.72.19 chr1 + 1176 6 full-splice_match RER1 ENST00000488353.2 2469 6 1836 -543 1836 8 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GATTATTTTGACACATTTCT 3996 FALSE NA NA TATAAA -26 NA NA NA 3 NA PB.72.20 chr1 + 593 5 incomplete-splice_match RER1 ENST00000488353.2 2469 6 3124 -4 3124 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGTCAAATTTTCTTTTTAAA 5284 FALSE NA NA CATAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.72.21 chr1 + 1057 5 incomplete-splice_match RER1 ENST00000488353.2 2469 6 3188 -532 3188 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAATTGTTTGAGATTATTTT 5348 FALSE NA NA TATAAA -15 NA NA NA 5 NA PB.72.22 chr1 + 2712 4 incomplete-splice_match RER1 ENST00000605895.6 3028 7 7580 -1 -2530 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TTCTGAATTACTTCTCAACT 7576 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.72.23 chr1 + 761 2 full-splice_match RER1 ENST00000462129.1 585 2 370 -546 370 22 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATTTCTTTGATACGTAGAGT NA FALSE NA NA TATAAA -40 NA NA NA 2 NA PB.73.1 chr1 + 1058 1 full-splice_match ENSG00000272449 ENST00000606645.2 1061 1 0 3 0 -3 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA NA NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CAATTTCTGCCTGAGTTTCT 0 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 5 NA PB.74.1 chr1 + 1883 9 novel_in_catalog TNFRSF14 novel 1702 8 NA NA -22 -9 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGAATTCGGCTCCTGTTTTC 1489 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.74.2 chr1 + 1803 9 novel_in_catalog TNFRSF14 novel 1702 8 NA NA -36 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAACTGTCACCTCCCGGTGT 55 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.74.3 chr1 + 1773 9 novel_in_catalog TNFRSF14 novel 1702 8 NA NA -15 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAACTGTCACCTCCCGGTGT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.74.4 chr1 + 1502 9 novel_in_catalog TNFRSF14 novel 1702 8 NA NA -64 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GCTCCTGTTTTCTATTTGTC 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.74.5 chr1 + 1675 8 full-splice_match TNFRSF14 ENST00000355716.5 1702 8 24 3 9 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAACTGTCACCTCCCGGTGT 11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.75.2 chr1 - 3010 18 novel_in_catalog PANK4 novel 2641 19 NA NA -7 -7 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAGAGGCCGGAGCCATCT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.75.3 chr1 - 2634 19 full-splice_match PANK4 ENST00000378466.9 2641 19 0 7 0 -7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAGAGGCCGGAGCCATCT 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.75.4 chr1 - 949 7 incomplete-splice_match PANK4 ENST00000378466.9 2641 19 13658 7 75 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAGAGGCCGGAGCCATCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.75.5 chr1 - 1470 9 incomplete-splice_match PANK4 ENST00000378466.9 2641 19 -4 9388 -3 1279 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTCTGTGTGATCCGGCCTT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.76.1 chr1 + 2731 7 novel_in_catalog PRXL2B novel 2689 7 NA NA -1 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CACTTTTTGTGCTTTCTTCT -29 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.76.2 chr1 + 2747 7 novel_in_catalog PRXL2B novel 2827 7 NA NA 0 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTTTTTGTGCTTTCTTCTT -12 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.76.3 chr1 + 2743 7 full-splice_match PRXL2B ENST00000378424.9 2765 7 18 4 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCCACTTTTTGTGCTTTCT -10 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.76.4 chr1 + 847 7 full-splice_match PRXL2B ENST00000419916.8 2747 7 21 1879 0 -43 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACGCACTGCTTCGCAGGCTC -10 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.76.5 chr1 + 2685 7 full-splice_match PRXL2B ENST00000378427.6 2689 7 3 1 3 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 36 9.392854 0.972798 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GAGCCACTTTTTGTGCTTTC -7 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 36 NA PB.76.6 chr1 + 2709 7 full-splice_match PRXL2B ENST00000419916.8 2747 7 32 6 -8 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 38 9.914679 0.996279 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GAGCCACTTTTTGTGCTTTC 1 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 38 NA PB.76.7 chr1 + 2647 6 full-splice_match PRXL2B ENST00000481683.5 689 6 -8 -1950 -8 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCCACTTTTTGTGCTTTCT 226 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.76.8 chr1 + 2570 6 incomplete-splice_match PRXL2B ENST00000419916.8 2747 7 313 6 5 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GAGCCACTTTTTGTGCTTTC 7 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 10 NA PB.76.9 chr1 + 2534 6 incomplete-splice_match PRXL2B ENST00000378427.6 2689 7 296 1 9 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.957339 0.695249 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GAGCCACTTTTTGTGCTTTC 11 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 19 NA PB.76.10 chr1 + 2148 2 full-splice_match PRXL2B ENST00000476686.1 2506 2 357 1 357 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTTTTTGTGCTTTCTTCTT 1868 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 5 NA PB.77.1 chr1 - 1572 2 full-splice_match MMEL1 ENST00000464195.1 559 2 35 -1048 24 -7 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGAAATCAGAGGCCTTGC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.77.2 chr1 - 1150 3 novel_in_catalog MMEL1 novel 1943 19 NA NA -11 -8 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 CAAAGAAATCAGAGGCCTTG 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.78.1 chr1 + 2866 15 novel_not_in_catalog ARHGEF16 novel 2822 15 NA NA -32 -5 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAACCTGGATTTTCACAG 17 TRUE NA NA ATTAAA -11 NA NA NA 3 NA PB.78.2 chr1 + 2817 15 full-splice_match ARHGEF16 ENST00000378378.9 2822 15 0 5 0 -5 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAACCTGGATTTTCACAG -4 TRUE NA NA ATTAAA -11 NA NA NA 6 NA PB.78.4 chr1 + 1773 10 novel_in_catalog ARHGEF16 novel 2340 8 NA NA 24 -5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAACCTGGATTTTCACAG 24 FALSE NA NA ATTAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.78.5 chr1 + 1237 6 incomplete-splice_match ARHGEF16 ENST00000378371.6 2219 12 9033 5 3235 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAACCTGGATTTTCACAG 4380 FALSE NA NA ATTAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.78.6 chr1 + 1008 4 incomplete-splice_match ARHGEF16 ENST00000485984.1 2340 8 5671 7 5671 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TTAAGAACCTGGATTTTCAC 6816 FALSE NA NA ATTAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.78.7 chr1 + 695 2 incomplete-splice_match ARHGEF16 ENST00000485984.1 2340 8 7110 6 7110 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAGAACCTGGATTTTCACA 8255 FALSE NA NA ATTAAA -10 NA NA NA 2 NA PB.79.4 chr1 - 2945 4 incomplete-splice_match MEGF6 ENST00000294599.8 4501 30 37548 -1968 344 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 ATTAAAAATATACTAAATAG 2181 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.79.12 chr1 - 1092 5 novel_in_catalog MEGF6 novel 7443 37 NA NA -242 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTCGTGGCCTGTGTGTTTGC 1595 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.81.2 chr1 - 2028 11 full-splice_match WRAP73 ENST00000378322.7 1998 11 -35 5 10 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.913689 0.592586 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACTACTTCTCTTCTTGAAA -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.81.3 chr1 - 1897 10 novel_in_catalog WRAP73 novel 1998 11 NA NA 6 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACTACTTCTCTTCTTGAAA -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.81.4 chr1 - 1650 12 novel_not_in_catalog WRAP73 novel 1692 12 NA NA 19 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACTACTTCTCTTCTTGAAA 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.81.5 chr1 - 1499 11 incomplete-splice_match WRAP73 ENST00000270708.12 1692 12 2561 2 2484 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACTACTTCTCTTCTTGAAA 2547 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.81.6 chr1 - 1386 11 incomplete-splice_match WRAP73 ENST00000270708.12 1692 12 2674 2 2597 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACTACTTCTCTTCTTGAAA 2660 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.81.7 chr1 - 985 6 incomplete-splice_match WRAP73 ENST00000270708.12 1692 12 14807 2 137 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACTACTTCTCTTCTTGAAA NA FALSE NA NA AATACA -18 NA NA NA 3 NA PB.81.8 chr1 - 1713 9 incomplete-splice_match WRAP73 ENST00000378322.7 1998 11 3273 7 3241 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACAACTACTTCTCTTCTTGA 3304 FALSE NA NA AAGAAA -36 NA NA NA 2 NA PB.81.9 chr1 - 1681 12 full-splice_match WRAP73 ENST00000270708.12 1692 12 7 4 7 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 124 32.353165 1.509917 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACAACTACTTCTCTTCTTGA -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 124 NA PB.81.11 chr1 - 1231 9 incomplete-splice_match WRAP73 ENST00000270708.12 1692 12 11295 4 817 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACAACTACTTCTCTTCTTGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.81.12 chr1 - 1057 7 incomplete-splice_match WRAP73 ENST00000270708.12 1692 12 14084 4 -569 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACAACTACTTCTCTTCTTGA NA FALSE NA NA ATTAAA -11 NA NA NA 8 NA PB.81.13 chr1 - 873 6 incomplete-splice_match WRAP73 ENST00000270708.12 1692 12 14917 4 247 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACAACTACTTCTCTTCTTGA NA FALSE NA NA GGGGCT -33 NA NA NA 2 NA PB.81.14 chr1 - 610 3 incomplete-splice_match WRAP73 ENST00000270708.12 1692 12 17817 4 3147 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACAACTACTTCTCTTCTTGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.81.16 chr1 - 1522 11 novel_in_catalog WRAP73 novel 1692 12 NA NA -10 -5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TACAACTACTTCTCTTCTTG 16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.81.17 chr1 - 1156 4 incomplete-splice_match WRAP73 ENST00000378322.7 1998 11 15021 8 396 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TACAACTACTTCTCTTCTTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.81.18 chr1 - 2682 10 novel_in_catalog WRAP73 novel 1692 12 NA NA 0 -7 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATACAACTACTTCTCTTCT -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.82.1 chr1 + 3004 13 full-splice_match TP73 ENST00000354437.8 2140 13 -253 -611 -204 536 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACATGGTGGGTCAGCTTTT 0 TRUE NA NA GATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.83.1 chr1 - 3575 5 full-splice_match TP73-AS1 ENST00000648600.1 3088 5 -492 5 -3 1 alternative_5end TRUE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CCTTGTGCTGAAAGCACTCA -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.83.3 chr1 - 5245 4 full-splice_match TP73-AS1 ENST00000452079.5 6358 4 -53 1166 -2 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACCCTTGTGCTGAAAGCACT -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.83.4 chr1 - 3525 5 full-splice_match TP73-AS1 ENST00000423764.6 3525 5 -1 1 -1 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACCCTTGTGCTGAAAGCACT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.83.5 chr1 - 2143 5 full-splice_match TP73-AS1 ENST00000423764.6 3525 5 1381 1 -87 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACCCTTGTGCTGAAAGCACT 1373 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.84.2 chr1 - 2654 7 full-splice_match LRRC47 ENST00000378251.3 4303 7 -12 1661 -12 915 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 132 34.440464 1.537069 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGCTTGTGTAAAGACTCT -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 132 NA PB.84.4 chr1 - 2452 7 full-splice_match LRRC47 ENST00000378251.3 4303 7 190 1661 190 915 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGCTTGTGTAAAGACTCT 189 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.84.5 chr1 - 1866 6 incomplete-splice_match LRRC47 ENST00000378251.3 4303 7 9327 1661 -2996 915 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGCTTGTGTAAAGACTCT 9326 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.84.6 chr1 - 1740 6 incomplete-splice_match LRRC47 ENST00000378251.3 4303 7 9453 1661 -2870 915 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGCTTGTGTAAAGACTCT 9452 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.84.7 chr1 - 1609 6 incomplete-splice_match LRRC47 ENST00000378251.3 4303 7 9584 1661 -2739 915 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.435514 0.646944 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGCTTGTGTAAAGACTCT 9583 FALSE NA NA GGGGCT -15 NA NA NA 17 NA PB.84.8 chr1 - 1467 5 incomplete-splice_match LRRC47 ENST00000378251.3 4303 7 11371 1661 -952 915 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGCTTGTGTAAAGACTCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.84.9 chr1 - 1369 4 full-splice_match LRRC47 ENST00000462356.5 575 4 121 -915 -7 915 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGCTTGTGTAAAGACTCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.84.10 chr1 - 1265 3 incomplete-splice_match LRRC47 ENST00000462356.5 575 4 1457 -915 1329 915 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGCTTGTGTAAAGACTCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.84.13 chr1 - 3627 6 novel_in_catalog LRRC47 novel 4303 7 NA NA -11 914 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CGAGGCTTGTGTAAAGACTC -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.84.14 chr1 - 2456 7 novel_not_in_catalog LRRC47 novel 4303 7 NA NA -21 914 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CGAGGCTTGTGTAAAGACTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.84.15 chr1 - 2316 7 full-splice_match LRRC47 ENST00000378251.3 4303 7 4 1983 4 593 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GATTATTCAAGTGTCAGAAT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.86.2 chr1 + 1302 4 full-splice_match SMIM1 ENST00000444870.7 547 4 -16 -739 0 739 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTTACCTGGCCAGGCGTGA -13 TRUE NA NA AATGAA -24 NA NA NA 4 NA PB.86.3 chr1 + 1247 4 full-splice_match SMIM1 ENST00000642557.4 506 4 22 -763 0 737 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATAGTTACCTGGCCAGGCGT -13 TRUE NA NA AATGAA -22 NA NA NA 3 NA PB.87.1 chr1 - 1441 9 incomplete-splice_match CEP104 ENST00000675966.1 7766 17 16115 2710 1334 443 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGAGAACATCTTTTTTT 7273 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.87.2 chr1 - 1235 7 incomplete-splice_match CEP104 ENST00000675966.1 7766 17 19259 2710 4478 443 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGAGAACATCTTTTTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.87.3 chr1 - 1077 5 incomplete-splice_match CEP104 ENST00000675966.1 7766 17 20191 2710 5410 443 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGAGAACATCTTTTTTT NA FALSE NA NA AATACA -3 NA NA NA 2 NA PB.87.4 chr1 - 1011 4 incomplete-splice_match CEP104 ENST00000675966.1 7766 17 22452 2710 -7095 443 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGAGAACATCTTTTTTT NA FALSE NA NA AATACA -25 NA NA NA 5 NA PB.87.5 chr1 - 851 3 incomplete-splice_match CEP104 ENST00000675966.1 7766 17 22794 2710 -6753 443 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGAGAACATCTTTTTTT NA FALSE NA NA AAAAAG -2 NA NA NA 2 NA PB.87.6 chr1 - 1378 9 incomplete-splice_match CEP104 ENST00000675966.1 7766 17 16177 2711 1396 442 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 CAAAAGAGAACATCTTTTTT 7335 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.87.11 chr1 - 1483 9 incomplete-splice_match CEP104 ENST00000461667.2 3328 20 17482 6567 -2599 349 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAACAAAAGAAAGAAGAA NA FALSE NA NA AAGAAA -12 NA NA NA 3 NA PB.87.13 chr1 - 1130 7 incomplete-splice_match CEP104 ENST00000675966.1 7766 17 8539 17257 -314 349 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAACAAAAGAAAGAAGAA NA FALSE NA NA GGGGCT -26 NA NA NA 3 NA PB.87.16 chr1 - 1583 10 incomplete-splice_match CEP104 ENST00000461667.2 3328 20 12250 6569 1022 347 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AGAAAAACAAAAGAAAGAAG NA FALSE NA NA AAAACA -35 NA NA NA 5 NA PB.87.19 chr1 - 1160 7 novel_not_in_catalog CEP104 novel 1661 4 NA NA -1 1310 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATCTGTTGCCTTAATCCA 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.87.20 chr1 - 1086 5 novel_not_in_catalog CEP104 novel 1661 4 NA NA 1 41 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATTATTTATTGTCCTTAT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.88.1 chr1 + 3035 7 full-splice_match DFFB ENST00000378209.8 2833 7 -211 9 -2 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAATAGACATGTCAAGAA -12 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 5 NA PB.88.2 chr1 + 2842 7 full-splice_match DFFB ENST00000378209.8 2833 7 -18 9 -2 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAATAGACATGTCAAGAA -15 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 6 NA PB.90.6 chr1 + 1605 5 incomplete-splice_match AJAP1 ENST00000378191.5 12102 6 57595 9347 1049 5393 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AACTCACGTCACACACATAT 6772 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 3 NA PB.90.7 chr1 + 1242 5 incomplete-splice_match AJAP1 ENST00000378191.5 12102 6 57818 9487 1272 5253 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACACTTTTTTTGTACTGTAG 6995 FALSE NA NA TATAAA -24 NA NA NA 2 NA PB.90.9 chr1 + 1000 5 incomplete-splice_match AJAP1 ENST00000378191.5 12102 6 58062 9485 1516 5255 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTTTTTTTGTACTGTAGCA 7239 FALSE NA NA TATAAA -26 NA NA NA 2 NA PB.90.12 chr1 + 918 2 incomplete-splice_match AJAP1 ENST00000378190.7 2383 6 117479 2765 61056 -2765 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAATATAAAAATAAGAGATA 5110 FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.91.1 chr1 - 2610 4 full-splice_match C1orf174 ENST00000361605.4 1645 4 34 -999 9 991 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAAGAAGTGTTTCCGCTCTT 22 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.91.2 chr1 - 1812 5 full-splice_match C1orf174 ENST00000680054.1 1779 5 -19 -14 2 -6 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATATTTTGAAAGCAGTC -31 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.91.5 chr1 - 1642 4 full-splice_match C1orf174 ENST00000361605.4 1645 4 -3 6 -3 -6 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 132 34.440464 1.537069 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATATTTTGAAAGCAGTC -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 132 NA PB.91.7 chr1 - 1510 3 incomplete-splice_match C1orf174 ENST00000680169.1 1567 4 7253 -14 7253 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATATTTTGAAAGCAGTC 7292 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.91.8 chr1 - 1063 2 incomplete-splice_match C1orf174 ENST00000680169.1 1567 4 9525 -14 9525 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATATTTTGAAAGCAGTC 9564 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.91.11 chr1 - 1116 2 incomplete-splice_match C1orf174 ENST00000680169.1 1567 4 9471 -13 9471 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 GAAAATATTTTGAAAGCAGT 9510 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.94.3 chr1 - 2553 14 incomplete-splice_match NPHP4 ENST00000478423.6 4467 26 101435 0 -8140 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTCCCTTGGCAGTTTTCTTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.94.4 chr1 - 2363 13 incomplete-splice_match NPHP4 ENST00000478423.6 4467 26 105026 0 -4549 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTCCCTTGGCAGTTTTCTTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.94.5 chr1 - 1529 9 incomplete-splice_match NPHP4 ENST00000478423.6 4467 26 117929 0 -654 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTCCCTTGGCAGTTTTCTTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.94.6 chr1 - 1901 10 incomplete-splice_match NPHP4 ENST00000478423.6 4467 26 117340 1 -1243 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTTCCCTTGGCAGTTTTCTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.94.7 chr1 - 1147 5 incomplete-splice_match NPHP4 ENST00000478423.6 4467 26 125995 1 1223 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTTCCCTTGGCAGTTTTCTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.94.8 chr1 - 1512 8 novel_not_in_catalog NPHP4 novel 5548 33 NA NA 515 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTTCCCTTGGCAGTTTTCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.94.9 chr1 - 4853 30 novel_not_in_catalog NPHP4 novel 4955 30 NA NA -1278 -5 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACACGTCTTCCCTTGGCAGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.95.1 chr1 + 1346 4 full-splice_match KCNAB2 ENST00000435937.6 1336 4 -9 -1 1 1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAATACAAAAATTAGCTG -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.95.2 chr1 + 3813 15 full-splice_match KCNAB2 ENST00000666163.1 3878 15 56 9 2 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.391864 0.530438 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCGGTCTCTGTGACTTTTT 12 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 13 NA PB.95.5 chr1 + 3904 15 full-splice_match KCNAB2 ENST00000352527.6 4001 15 98 -1 -11 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCGGTCTCTGTGACTTTTT 274 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.95.6 chr1 + 1417 4 incomplete-splice_match KCNAB2 ENST00000652845.1 932 5 -86 8025 -11 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 TAAAAATACAAAAATTAGCT 274 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.95.7 chr1 + 3944 16 full-splice_match KCNAB2 ENST00000428161.6 2134 16 250 -2060 -9 0 alternative_3end5end TRUE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCGGTCTCTGTGACTTTTT 276 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.95.8 chr1 + 1135 7 novel_in_catalog KCNAB2 novel 719 7 NA NA -3 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TATTAGCAAATCCCCTGATC 282 FALSE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.95.9 chr1 + 1245 15 full-splice_match KCNAB2 ENST00000352527.6 4001 15 131 2625 0 -8 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAGGACTACAGATCCTA 8 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 3 NA PB.95.10 chr1 + 3832 15 full-splice_match KCNAB2 ENST00000352527.6 4001 15 170 -1 -1 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 60 15.654757 1.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCGGTCTCTGTGACTTTTT -6 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 60 NA PB.95.11 chr1 + 1386 5 incomplete-splice_match KCNAB2 ENST00000656198.1 736 8 40 11572 0 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 TAAAAATACAAAAATTAGCT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.95.12 chr1 + 3871 16 full-splice_match KCNAB2 ENST00000428161.6 2134 16 323 -2060 2 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.174602 0.620615 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCGGTCTCTGTGACTTTTT -3 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 16 NA PB.95.16 chr1 + 3574 13 incomplete-splice_match KCNAB2 ENST00000662363.1 2958 14 7018 -1156 -644 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCGGTCTCTGTGACTTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.95.19 chr1 + 3368 9 incomplete-splice_match KCNAB2 ENST00000662363.1 2958 14 21740 -1167 -8 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGACTTTTTGCTCCTCTCAT NA FALSE NA NA AATAAA -26 NA NA NA 2 NA PB.95.20 chr1 + 3323 8 incomplete-splice_match KCNAB2 ENST00000662363.1 2958 14 23270 -1156 -1273 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCGGTCTCTGTGACTTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.95.21 chr1 + 3203 6 incomplete-splice_match KCNAB2 ENST00000662363.1 2958 14 28663 -1168 16 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GACTTTTTGCTCCTCTCATT NA FALSE NA NA AATAAA -27 NA NA NA 2 NA PB.95.22 chr1 + 2952 4 incomplete-splice_match KCNAB2 ENST00000662363.1 2958 14 29825 -1156 1095 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCGGTCTCTGTGACTTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.95.23 chr1 + 2909 3 incomplete-splice_match KCNAB2 ENST00000671076.1 4620 5 2161 -4 2161 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GACTTTTTGCTCCTCTCATT NA FALSE NA NA AATAAA -27 NA NA NA 3 NA PB.95.24 chr1 + 2716 2 incomplete-splice_match KCNAB2 ENST00000671076.1 4620 5 2854 8 2854 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.652776 0.562623 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCGGTCTCTGTGACTTTTT 46 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 14 NA PB.96.1 chr1 + 1913 3 full-splice_match RNF207 ENST00000484435.1 551 3 -614 -748 40 5 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAAAAAAATTTTTTT 5946 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.96.2 chr1 + 1312 3 full-splice_match RNF207 ENST00000484435.1 551 3 -13 -748 -3 5 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAAAAAAATTTTTTT 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.97.1 chr1 - 2059 4 full-splice_match RPL22 ENST00000234875.9 2061 4 1 1 1 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 74 19.307533 1.285727 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACGAGGCTTTGTTTTTTTTA 11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 74 NA PB.97.2 chr1 - 1893 2 incomplete-splice_match RPL22 ENST00000234875.9 2061 4 6568 2 6526 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.174602 0.620615 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACGAGGCTTTGTTTTTTTT 7852 FALSE NA NA ATTAAA -7 NA NA NA 16 NA PB.97.7 chr1 - 2419 5 novel_in_catalog RPL22 novel 806 5 NA NA 423 -11 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CTCTTACTGTACGAGGCTTT 572 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.97.19 chr1 - 885 4 full-splice_match RPL22 ENST00000234875.9 2061 4 -24 1200 -24 355 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 234 61.053551 1.785711 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATTCGTCTTACTTTCATTT -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 234 NA PB.97.20 chr1 - 746 3 full-splice_match RPL22 ENST00000480661.1 2279 3 1888 -355 1878 355 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATTCGTCTTACTTTCATTT 3204 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.97.21 chr1 - 693 2 incomplete-splice_match RPL22 ENST00000480661.1 2279 3 6538 -355 6528 355 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATTCGTCTTACTTTCATTT 7854 FALSE NA NA ATTAAA -5 NA NA NA 8 NA PB.97.22 chr1 - 1026 4 full-splice_match RPL22 ENST00000234875.9 2061 4 -166 1201 -166 354 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CCATTCGTCTTACTTTCATT 9632 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.97.23 chr1 - 2246 3 full-splice_match RPL22 ENST00000480661.1 2279 3 -11 44 -11 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAATGGTGGTTTATCCTTG 9819 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.97.24 chr1 - 1860 3 full-splice_match RPL22 ENST00000480661.1 2279 3 375 44 365 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAATGGTGGTTTATCCTTG 9608 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.97.25 chr1 - 1207 4 novel_not_in_catalog RPL22 novel 508 4 NA NA -5 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAATGGTGGTTTATCCTTG 9835 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.97.26 chr1 - 989 6 novel_in_catalog RPL22 novel 806 5 NA NA 15 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAATGGTGGTTTATCCTTG 19 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.97.27 chr1 - 1049 4 novel_not_in_catalog RPL22 novel 2061 4 NA NA 153 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAATGGTGGTTTATCCTTG 9993 FALSE NA NA GGGGCT -32 NA NA NA 2 NA PB.97.28 chr1 - 966 6 novel_in_catalog RPL22 novel 806 5 NA NA 15 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAATGGTGGTTTATCCTTG 19 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.97.29 chr1 - 500 4 full-splice_match RPL22 ENST00000234875.9 2061 4 -38 1599 -38 -4 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 79 20.612095 1.314122 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAATGGTGGTTTATCCTTG 9760 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 79 NA PB.97.30 chr1 - 414 3 full-splice_match RPL22 ENST00000480661.1 2279 3 1821 44 1811 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAATGGTGGTTTATCCTTG 3137 FALSE NA NA AATACA -24 NA NA NA 8 NA PB.97.32 chr1 - 878 3 novel_in_catalog RNF207-AS1 novel 378 3 NA NA -3599 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGATATTTGAGCTGTTTTCG 14 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.99.1 chr1 - 1996 6 novel_not_in_catalog ICMT novel 2612 6 NA NA -3 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACCACAGTGTGATTGTCTGG 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.99.2 chr1 - 3697 6 novel_not_in_catalog ICMT novel 2612 6 NA NA -3 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACCACAGTGTGATTGTCTG 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.99.4 chr1 - 3211 6 novel_not_in_catalog ICMT novel 2612 6 NA NA -6 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACCACAGTGTGATTGTCTG -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.99.5 chr1 - 3135 6 novel_not_in_catalog ICMT novel 2612 6 NA NA -9 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACCACAGTGTGATTGTCTG -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.99.6 chr1 - 2012 2 novel_not_in_catalog ICMT novel 328 2 NA NA -1300 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACCACAGTGTGATTGTCTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.99.7 chr1 - 1674 2 novel_not_in_catalog ICMT novel 328 2 NA NA -1576 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACCACAGTGTGATTGTCTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.99.8 chr1 - 1365 3 novel_not_in_catalog ICMT novel 4795 5 NA NA 1 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACCACAGTGTGATTGTCTG 14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.99.9 chr1 - 1298 2 novel_not_in_catalog ICMT novel 328 2 NA NA -586 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACCACAGTGTGATTGTCTG 517 FALSE NA NA AAAACA -9 NA NA NA 3 NA PB.99.14 chr1 - 1162 2 novel_not_in_catalog ICMT novel 328 2 NA NA -100 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAACCACAGTGTGATTGTCT 1003 FALSE NA NA ATTAAA -10 NA NA NA 2 NA PB.99.15 chr1 - 2561 5 full-splice_match ICMT ENST00000343813.10 4795 5 -24 2258 -16 40 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 49 12.784718 1.106691 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGAGGCTTACGGGTTCATT -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 49 NA PB.99.16 chr1 - 2358 4 full-splice_match ICMT ENST00000474756.1 1227 4 16 -1147 8 39 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAGAGGCTTACGGGTTCAT 21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.99.17 chr1 - 2214 4 incomplete-splice_match ICMT ENST00000343813.10 4795 5 1064 2259 1064 39 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAGAGGCTTACGGGTTCAT 1077 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.99.19 chr1 - 1889 2 incomplete-splice_match ICMT ENST00000489498.5 2612 6 3957 -3 3949 3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CATGGCTTAATGAATTTTTT 3962 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.99.20 chr1 - 2307 5 full-splice_match ICMT ENST00000343813.10 4795 5 194 2294 194 4 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATGGCTTAATGAATTTTTTC 207 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.99.21 chr1 - 2617 6 full-splice_match ICMT ENST00000489498.5 2612 6 -6 1 -6 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.479165 0.738714 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTTCATGGCTTAATGAATT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 21 NA PB.99.22 chr1 - 2412 6 full-splice_match ICMT ENST00000489498.5 2612 6 199 1 191 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTTCATGGCTTAATGAATT 204 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.99.23 chr1 - 2234 4 incomplete-splice_match ICMT ENST00000489498.5 2612 6 1493 1 1485 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTTCATGGCTTAATGAATT 1498 FALSE NA NA AATAGA -11 NA NA NA 2 NA PB.99.28 chr1 - 2057 3 incomplete-splice_match ICMT ENST00000489498.5 2612 6 2430 2 2422 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GATTTCATGGCTTAATGAAT 2435 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.99.30 chr1 - 2433 5 full-splice_match ICMT ENST00000343813.10 4795 5 -36 2398 -28 -100 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 TACACAAAAATGGGCAGACA -23 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.99.31 chr1 - 1390 5 full-splice_match ICMT ENST00000343813.10 4795 5 -33 3438 -25 -32 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 GAAAAACACAGACCGCTTTA -20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.99.32 chr1 - 933 4 incomplete-splice_match ICMT ENST00000343813.10 4795 5 1 10500 1 -7094 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAATGTAGTCCTTAATGCTT 14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.99.33 chr1 - 809 4 incomplete-splice_match ICMT ENST00000343813.10 4795 5 8 10617 8 -7211 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATATACAATTAGTGGTT 21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.101.1 chr1 + 2049 5 novel_in_catalog LINC00337 novel 1138 5 NA NA -88 11 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAATATAAGAAAAAAAAG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.102.1 chr1 - 1606 9 full-splice_match ACOT7 ENST00000377855.6 1614 9 8 0 8 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 46 12.001980 1.079253 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCACGTGTCCTGGGTGGT -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 46 NA PB.102.2 chr1 - 1432 9 full-splice_match ACOT7 ENST00000377845.7 1432 9 0 0 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCACGTGTCCTGGGTGGT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.102.3 chr1 - 1436 9 full-splice_match ACOT7 ENST00000608083.5 1403 9 -37 4 -37 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 248 64.706329 1.810947 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCACGTGTCCTGGGTGGT 0 TRUE NA NA GGGGCT -17 NA NA NA 248 NA PB.102.4 chr1 - 1398 9 full-splice_match ACOT7 ENST00000377842.7 1813 9 415 0 415 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.957339 0.695249 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCACGTGTCCTGGGTGGT 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.102.5 chr1 - 1314 9 full-splice_match ACOT7 ENST00000608083.5 1403 9 85 4 85 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCACGTGTCCTGGGTGGT 558 FALSE NA NA GGGGCT -14 NA NA NA 2 NA PB.102.6 chr1 - 1237 8 incomplete-splice_match ACOT7 ENST00000377842.7 1813 9 9535 0 2440 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.652776 0.562623 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCACGTGTCCTGGGTGGT 9766 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.102.7 chr1 - 1059 7 incomplete-splice_match ACOT7 ENST00000377842.7 1813 9 19872 0 12777 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCACGTGTCCTGGGTGGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.102.8 chr1 - 920 5 incomplete-splice_match ACOT7 ENST00000377842.7 1813 9 31938 0 24843 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.957339 0.695249 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCACGTGTCCTGGGTGGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.102.10 chr1 - 727 3 incomplete-splice_match ACOT7 ENST00000377842.7 1813 9 64362 0 522 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCACGTGTCCTGGGTGGT 169 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.102.11 chr1 - 500 2 incomplete-splice_match ACOT7 ENST00000377842.7 1813 9 78166 0 14326 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCACGTGTCCTGGGTGGT 9068 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.103.1 chr1 - 1627 4 full-splice_match TNFRSF25 ENST00000453260.6 984 4 -338 -305 -63 -24 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAGAAAACAAAACAAAACA 7896 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.103.2 chr1 - 1585 10 full-splice_match TNFRSF25 ENST00000356876.8 1968 10 -6 389 -4 -24 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.130951 0.495676 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAGAAAACAAAACAAAACA -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.103.3 chr1 - 1452 9 incomplete-splice_match TNFRSF25 ENST00000356876.8 1968 10 635 389 -68 -24 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAGAAAACAAAACAAAACA 9565 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.104.1 chr1 - 3733 22 full-splice_match PLEKHG5 ENST00000400915.8 3731 22 -3 1 -3 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTGGGAAGAGTCCTTTGCT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.104.2 chr1 - 1299 3 incomplete-splice_match PLEKHG5 ENST00000487949.4 2664 9 2455 1 35 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTGGGAAGAGTCCTTTGCT 5975 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.105.1 chr1 + 2111 8 novel_not_in_catalog ESPN novel 1494 7 NA NA -1896 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTCGCTGTGGCCGCGACTT 751 FALSE NA NA ATTAAA -29 NA NA NA 2 NA PB.105.2 chr1 + 1565 8 novel_not_in_catalog ESPN novel 1494 7 NA NA -1885 3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACATATATTTGCATGTTCGT 762 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.105.3 chr1 + 1598 4 novel_not_in_catalog ESPN novel 879 4 NA NA -1016 1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCGCTGTGGCCGCGACTTGC 1631 FALSE NA NA ATTAAA -31 NA NA NA 2 NA PB.105.4 chr1 + 1340 7 novel_not_in_catalog ESPN novel 1494 7 NA NA -1016 5 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATATATTTGCATGTTCGTTG 1631 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.105.5 chr1 + 1465 6 novel_not_in_catalog ESPN novel 1494 7 NA NA 6 3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACATATATTTGCATGTTCGT 2673 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.105.6 chr1 + 1346 7 novel_not_in_catalog ESPN novel 1339 8 NA NA -15 -7 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATTTGCATGCCGACTTACAT -3 TRUE NA NA AAAAAG -40 NA NA NA 2 NA PB.105.7 chr1 + 1451 6 novel_not_in_catalog ESPN novel 1339 8 NA NA -14 3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACATATATTTGCATGTTCGT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.105.8 chr1 + 1444 6 novel_not_in_catalog ESPN novel 813 7 NA NA 3 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATGCCGACTTACATATATTT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.105.9 chr1 + 1358 7 novel_not_in_catalog ESPN novel 813 7 NA NA 9 3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACATATATTTGCATGTTCGT 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.105.10 chr1 + 2048 5 novel_not_in_catalog ESPN novel 3543 13 NA NA 24 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTCGCTGTGGCCGCGACTTG 0 TRUE NA NA ATTAAA -30 NA NA NA 2 NA PB.105.11 chr1 + 1968 6 novel_not_in_catalog ESPN novel 813 7 NA NA 24 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTCGCTGTGGCCGCGACTT 0 TRUE NA NA ATTAAA -29 NA NA NA 3 NA PB.105.12 chr1 + 1862 7 novel_not_in_catalog ESPN novel 813 7 NA NA 26 3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCTCCGGTTCACTCACTCGC 2 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 8 NA PB.105.13 chr1 + 1596 4 novel_not_in_catalog ESPN novel 1494 7 NA NA 26 5 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATATATTTGCATGTTCGTTG 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.105.14 chr1 + 1510 5 novel_not_in_catalog ESPN novel 1494 7 NA NA 26 3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACATATATTTGCATGTTCGT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.105.15 chr1 + 1110 4 novel_not_in_catalog ESPN novel 1494 7 NA NA -16 5 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATATATTTGCATGTTCGTTG 28 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.105.16 chr1 + 1622 4 novel_not_in_catalog ESPN novel 1494 7 NA NA -11 1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGGCTCCGGTTCACTCACTC 33 FALSE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.105.17 chr1 + 1007 5 novel_not_in_catalog ESPN novel 544 4 NA NA -40 5 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATATATTTGCATGTTCGTTG 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.105.18 chr1 + 1433 4 novel_not_in_catalog ESPN novel 747 6 NA NA -42 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTCGCTGTGGCCGCGACTT 11 TRUE NA NA ATTAAA -29 NA NA NA 2 NA PB.105.19 chr1 + 1241 3 novel_not_in_catalog ESPN novel 879 4 NA NA 175 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTCGCTGTGGCCGCGACTT 287 FALSE NA NA ATTAAA -29 NA NA NA 2 NA PB.106.9 chr1 - 2414 12 full-splice_match NOL9 ENST00000377705.6 6627 12 -12 4225 -12 -4225 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 20 5.218252 0.717525 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGAAAGTTCTTCAGGGACCT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 20 NA PB.107.2 chr1 + 2237 11 novel_in_catalog ZBTB48 novel 2347 11 NA NA 6 -10 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GACTCTCGTATTTCAGCCTG -7 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 7 NA PB.107.3 chr1 + 2295 11 full-splice_match ZBTB48 ENST00000377674.9 2347 11 42 10 19 -10 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.913689 0.592586 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GACTCTCGTATTTCAGCCTG 22 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 15 NA PB.107.4 chr1 + 1416 9 incomplete-splice_match ZBTB48 ENST00000377674.9 2347 11 2091 2 1997 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATTTCAGCCTGACAGTCTG 2024 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 4 NA PB.108.1 chr1 + 3569 4 full-splice_match PHF13 ENST00000377648.5 3632 4 19 44 -12 -44 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 35 9.131941 0.960563 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGTTCATGATTCAAGGTT 3 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 35 NA PB.109.1 chr1 - 4486 4 full-splice_match KLHL21 ENST00000377658.8 4487 4 0 1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTTGGAGTCATTGCCTTTG -2 TRUE NA NA TATAAA -23 NA NA NA 11 NA PB.109.2 chr1 - 3178 3 incomplete-splice_match KLHL21 ENST00000496707.5 824 4 599 -2656 599 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTTGGAGTCATTGCCTTTG 4476 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.109.13 chr1 - 4311 4 full-splice_match KLHL21 ENST00000377658.8 4487 4 174 2 174 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATTTGGAGTCATTGCCTTT 998 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.110.1 chr1 + 2035 5 novel_in_catalog THAP3 novel 2053 5 NA NA -4 -12 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAATAAAAACATCTGATGT -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.110.2 chr1 + 1132 5 novel_not_in_catalog THAP3 novel 1361 6 NA NA -4 3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGTCGCTCCCATCATCATTT -13 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.110.3 chr1 + 1536 4 full-splice_match THAP3 ENST00000472925.1 983 4 -44 -509 5 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACGGTGTCGCTCCCATCAT -4 TRUE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 9 NA PB.110.4 chr1 + 1237 5 incomplete-splice_match THAP3 ENST00000054650.9 1361 6 318 1 5 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 98 25.569435 1.407721 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACGGTGTCGCTCCCATCATC -4 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 98 NA PB.110.5 chr1 + 1307 6 full-splice_match THAP3 ENST00000487819.5 840 6 -27 -440 0 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACGGTGTCGCTCCCATCATC 8 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.110.6 chr1 + 1102 4 incomplete-splice_match THAP3 ENST00000054650.9 1361 6 3661 -1 134 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GGTGTCGCTCCCATCATCAT 3339 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.111.2 chr1 - 3206 16 full-splice_match DNAJC11 ENST00000377577.10 3201 16 -6 1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 118 30.787687 1.488377 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGAGGCTGGCGCTCTTCCGT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 118 NA PB.111.3 chr1 - 3045 15 full-splice_match DNAJC11 ENST00000294401.11 2210 15 107 -942 -1 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGAGGCTGGCGCTCTTCCGT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.111.4 chr1 - 2556 10 incomplete-splice_match DNAJC11 ENST00000377577.10 3201 16 50212 1 -4528 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGAGGCTGGCGCTCTTCCGT 536 FALSE NA NA AAAAAG -34 NA NA NA 6 NA PB.111.5 chr1 - 2363 9 full-splice_match DNAJC11 ENST00000691481.1 3565 9 1215 -13 -749 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGAGGCTGGCGCTCTTCCGT 6279 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.111.6 chr1 - 2087 6 incomplete-splice_match DNAJC11 ENST00000689025.1 3549 9 7008 -13 -527 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGAGGCTGGCGCTCTTCCGT NA FALSE NA NA AATACA -36 NA NA NA 5 NA PB.111.7 chr1 - 1894 5 incomplete-splice_match DNAJC11 ENST00000689025.1 3549 9 8738 -13 1203 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGAGGCTGGCGCTCTTCCGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.111.8 chr1 - 1749 3 incomplete-splice_match DNAJC11 ENST00000689169.1 3872 4 2244 -15 2244 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGAGGCTGGCGCTCTTCCGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.111.9 chr1 - 1648 2 incomplete-splice_match DNAJC11 ENST00000689169.1 3872 4 3296 -15 3296 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGAGGCTGGCGCTCTTCCGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.111.13 chr1 - 1551 2 incomplete-splice_match DNAJC11 ENST00000689169.1 3872 4 3392 -14 3392 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGAGGCTGGCGCTCTTCCG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.111.14 chr1 - 2255 16 full-splice_match DNAJC11 ENST00000377577.10 3201 16 -3 949 0 -6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 25 6.522815 0.814435 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AACAAACGGGTTTGGAAATT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 25 NA PB.111.15 chr1 - 2102 15 full-splice_match DNAJC11 ENST00000294401.11 2210 15 102 6 0 -6 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AACAAACGGGTTTGGAAATT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.111.16 chr1 - 1955 13 incomplete-splice_match DNAJC11 ENST00000686243.1 3712 16 33999 935 405 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AACAAACGGGTTTGGAAATT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.111.17 chr1 - 803 3 incomplete-splice_match DNAJC11 ENST00000689169.1 3872 4 2238 937 2238 -10 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TGAGAACAAACGGGTTTGGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.112.1 chr1 + 2129 3 incomplete-splice_match CAMTA1 ENST00000473578.5 567 4 -26 45010 0 -44830 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAGAAAAAAATGAGAAGT -16 TRUE NA NA GATAAA -24 NA NA NA 3 NA PB.112.2 chr1 + 1062 6 novel_not_in_catalog CAMTA1 novel 431 5 NA NA 0 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTGTGGGTCACTTGCGT -16 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.112.3 chr1 + 978 5 novel_in_catalog CAMTA1 novel 431 5 NA NA 0 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTGTGGGTCACTTGCGT -16 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.112.4 chr1 + 853 4 full-splice_match CAMTA1 ENST00000557126.5 486 4 -37 -330 0 2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACGAATGTGTGGGTCACTT -16 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.112.5 chr1 + 787 3 novel_in_catalog CAMTA1 novel 863 4 NA NA 0 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTGTGGGTCACTTGCGT -16 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 3 NA PB.112.6 chr1 + 752 3 novel_in_catalog CAMTA1 novel 863 4 NA NA 0 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTGTGGGTCACTTGCGT -16 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.112.7 chr1 + 705 5 novel_not_in_catalog CAMTA1 novel 431 5 NA NA 0 -7 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATAAAGTGTAATCTGTG -16 TRUE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.112.8 chr1 + 687 5 novel_not_in_catalog CAMTA1 novel 431 5 NA NA 0 -8 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TAAAATAAAGTGTAATCTGT -16 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 5 NA PB.112.9 chr1 + 530 3 full-splice_match CAMTA1 ENST00000490738.5 538 3 0 8 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.913689 0.592586 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATTTAAGTTTAATGAGT -16 TRUE NA NA AATAAA -26 NA NA NA 15 NA PB.112.10 chr1 + 592 4 full-splice_match CAMTA1 ENST00000473578.5 567 4 -19 -6 -3 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 163 42.528755 1.628683 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TAAAATTTAAGTTTAATGAG -9 TRUE NA NA AATAAA -25 NA NA NA 163 NA PB.112.11 chr1 + 934 5 full-splice_match CAMTA1 ENST00000461311.1 431 5 -95 -408 3 2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 65 16.959320 1.229408 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACGAATGTGTGGGTCACTT -13 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 65 NA PB.112.12 chr1 + 863 4 full-splice_match CAMTA1 ENST00000476163.5 863 4 -2 2 -2 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 55 14.350193 1.156858 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTGTGGGTCACTTGCGT -8 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 55 NA PB.112.13 chr1 + 1033 6 novel_in_catalog CAMTA1 novel 431 5 NA NA 1 2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACGAATGTGTGGGTCACTT -5 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 7 NA PB.117.1 chr1 + 1060 5 full-splice_match VAMP3 ENST00000054666.11 2178 5 -27 1145 -27 481 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGAACTATGGCTATGACC -40 TRUE NA NA TTTAAA -10 NA NA NA 3 NA PB.117.2 chr1 + 1983 3 novel_in_catalog VAMP3 novel 2178 5 NA NA -24 -8 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACATGATTGTGGCACCTG -37 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.117.3 chr1 + 2185 5 full-splice_match VAMP3 ENST00000054666.11 2178 5 -8 1 -8 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 120 31.309513 1.495676 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTGTGGCACCTGTGCTCCT -21 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 120 NA PB.117.4 chr1 + 2141 5 full-splice_match VAMP3 ENST00000054666.11 2178 5 36 1 36 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTGTGGCACCTGTGCTCCT 23 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.117.5 chr1 + 2377 5 full-splice_match VAMP3 ENST00000470357.1 954 5 195 -1618 195 -8 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACATGATTGTGGCACCTG 1593 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.117.6 chr1 + 1977 3 incomplete-splice_match VAMP3 ENST00000054666.11 2178 5 5897 8 96 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.391864 0.530438 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACATGATTGTGGCACCTG 5884 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 13 NA PB.117.7 chr1 + 1832 2 incomplete-splice_match VAMP3 ENST00000054666.11 2178 5 6841 8 1040 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.913689 0.592586 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACATGATTGTGGCACCTG 6828 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 15 NA PB.121.1 chr1 - 591 4 full-splice_match UTS2 ENST00000361696.10 591 4 -1 1 -1 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATATCATGAGTGGTTATTTT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.122.1 chr1 + 4020 6 incomplete-splice_match PER3 ENST00000361923.2 6203 21 41851 1 -10254 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAAATTGTCCTGCCCTGTG NA FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 3 NA PB.122.4 chr1 + 3577 5 incomplete-splice_match PER3 ENST00000613533.4 6318 22 42976 2 -9403 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGAGAAATTGTCCTGCCCTG -14 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.122.7 chr1 + 2778 3 incomplete-splice_match PER3 ENST00000361923.2 6203 21 51119 3 -986 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGAGAAATTGTCCTGCCCTG 4023 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.124.1 chr1 + 852 7 novel_not_in_catalog PARK7 novel 624 7 NA NA -7 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTGATTGTTTCTTGTTTTG 248 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.124.2 chr1 + 936 7 full-splice_match PARK7 ENST00000493678.5 1088 7 -70 222 -41 1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 1226 319.878845 2.504986 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGATTGTTTCTTGTTTTGTC 7586 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 1226 NA PB.124.4 chr1 + 1386 5 incomplete-splice_match PARK7 ENST00000493678.5 1088 7 -27 13572 2 -24 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAAAAAAATAAAATAAAA -26 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.124.5 chr1 + 948 7 full-splice_match PARK7 ENST00000338639.10 1127 7 -46 225 2 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 555 144.806488 2.160788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACTGATTGTTTCTTGTTTT -26 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 555 NA PB.124.6 chr1 + 917 7 novel_in_catalog PARK7 novel 1088 7 NA NA 5 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACTGATTGTTTCTTGTTTT -23 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.124.7 chr1 + 858 7 novel_not_in_catalog PARK7 novel 1088 7 NA NA 7 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACTGATTGTTTCTTGTTTT -21 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.124.8 chr1 + 824 6 full-splice_match PARK7 ENST00000377493.9 795 6 -29 0 9 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTGATTGTTTCTTGTTTTG -19 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.124.9 chr1 + 937 7 full-splice_match PARK7 ENST00000493678.5 1088 7 -12 163 -12 60 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 415 108.278732 2.034543 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTGCAGCTCTTAACTGTC -11 TRUE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 415 NA PB.124.10 chr1 + 873 6 novel_in_catalog PARK7 novel 1127 7 NA NA 13 -5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACTACTGATTGTTTCTTG -15 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.124.11 chr1 + 846 6 novel_in_catalog PARK7 novel 1127 7 NA NA -12 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACTGATTGTTTCTTGTTTT -11 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.124.12 chr1 + 774 6 novel_in_catalog PARK7 novel 1088 7 NA NA -12 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTGATTGTTTCTTGTTTTG -11 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 6 NA PB.124.14 chr1 + 795 6 novel_in_catalog PARK7 novel 1127 7 NA NA 0 -6 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAAACTACTGATTGTTTCTT 20 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.124.15 chr1 + 720 5 full-splice_match PARK7 ENST00000465354.5 949 5 -34 263 3 210 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGTCTCTGTGCCAGAAAGT 23 TRUE NA NA AGTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.124.16 chr1 + 872 7 full-splice_match PARK7 ENST00000338639.10 1127 7 36 219 -1 4 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 51 13.306542 1.124065 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TTGTTTCTTGTTTTGTCTCT 9 FALSE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 51 NA PB.124.17 chr1 + 1152 7 full-splice_match PARK7 ENST00000377491.5 977 7 -145 -30 1 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACTGATTGTTTCTTGTTTT 11 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.124.18 chr1 + 752 6 incomplete-splice_match PARK7 ENST00000377491.5 977 7 937 -31 64 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 41 10.697417 1.029279 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTGATTGTTTCTTGTTTTG 888 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 41 NA PB.125.4 chr1 - 5010 3 incomplete-splice_match ERRFI1 ENST00000377482.10 3097 4 8552 0 -2124 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TACCATTAGTAATGTTTCTT 8552 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.125.7 chr1 - 3171 5 novel_not_in_catalog ERRFI1 novel 3097 4 NA NA 0 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATACCATTAGTAATGTTTCT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.125.8 chr1 - 3096 4 full-splice_match ERRFI1 ENST00000377482.10 3097 4 0 1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 323 84.274773 1.925698 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATACCATTAGTAATGTTTCT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 323 NA PB.125.9 chr1 - 2945 3 incomplete-splice_match ERRFI1 ENST00000377482.10 3097 4 10616 1 -60 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATACCATTAGTAATGTTTCT -3 TRUE NA NA AATAAA -23 NA NA NA 11 NA PB.125.12 chr1 - 4006 3 novel_in_catalog ERRFI1 novel 3097 4 NA NA 0 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GATACCATTAGTAATGTTTC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.125.13 chr1 - 4116 2 incomplete-splice_match ERRFI1 ENST00000474874.5 479 3 -26 7325 0 -2 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GATACCATTAGTAATGTTTC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.125.22 chr1 - 3017 3 full-splice_match ERRFI1 ENST00000469499.5 995 3 -13 -2009 0 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGATACCATTAGTAATGTTT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.125.23 chr1 - 2943 3 incomplete-splice_match ERRFI1 ENST00000487559.1 787 4 10619 -2310 -44 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGATACCATTAGTAATGTTT 4396 FALSE NA NA AATAAA -7 NA NA NA 2 NA PB.125.24 chr1 - 3108 4 full-splice_match ERRFI1 ENST00000487559.1 787 4 -13 -2308 0 -5 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 30 7.827378 0.893616 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TATGATACCATTAGTAATGT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 30 NA PB.125.28 chr1 - 2614 4 full-splice_match ERRFI1 ENST00000377482.10 3097 4 0 483 0 -483 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTCAGTATTTCCTGGGGAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.125.30 chr1 - 1709 4 full-splice_match ERRFI1 ENST00000377482.10 3097 4 0 1388 0 312 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAATAAAATAGTTGAACTC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.125.31 chr1 - 1547 4 full-splice_match ERRFI1 ENST00000377482.10 3097 4 0 1550 0 150 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAACAAAAATGGATCTGG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.125.32 chr1 - 834 3 incomplete-splice_match ERRFI1 ENST00000377482.10 3097 4 0 3174 0 -861 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAATATTCTGTTCCTTGGAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.126.2 chr1 - 3852 5 incomplete-splice_match RERE ENST00000476556.5 4598 13 63815 -1687 2993 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AACCCTTGGGTGTCTCCCGT 7051 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.126.3 chr1 - 3098 4 incomplete-splice_match RERE ENST00000476556.5 4598 13 65416 -1687 -3168 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AACCCTTGGGTGTCTCCCGT 8652 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.126.4 chr1 - 2812 2 incomplete-splice_match RERE ENST00000476556.5 4598 13 68151 -1687 -433 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AACCCTTGGGTGTCTCCCGT 6350 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.129.1 chr1 - 1192 2 intergenic novelGene_98 novel NA NA NA NA NA NA multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 4158 FALSE NA NA TTTAAA -33 NA NA NA 2 NA PB.138.1 chr1 - 1575 12 novel_not_in_catalog ENO1 novel 1819 10 NA NA 0 6957 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AACTTTTTTCTTTCTTTTTG 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.138.2 chr1 - 1049 6 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 5253 -8 5253 6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GTGCCTGTGTATGTCTGGAA -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.138.3 chr1 - 1648 11 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000234590.10 1781 12 3798 -3 -2944 3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 323 84.274773 1.925698 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CGTGTGCCTGTGTATGTCTG 4369 FALSE NA NA AATAGA -34 NA NA NA 323 NA PB.138.4 chr1 - 1823 12 full-splice_match ENO1 ENST00000234590.10 1781 12 -46 4 -12 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 9109 2376.652832 3.375966 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT 525 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9109 NA PB.138.5 chr1 - 1283 7 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 4392 4 4392 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 349 91.058502 1.959321 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATACTCCGTGTGCCTGT -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 349 NA PB.138.6 chr1 - 2349 12 full-splice_match ENO1 ENST00000234590.10 1781 12 -572 4 -68 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.652776 0.562623 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.138.7 chr1 - 2169 12 full-splice_match ENO1 ENST00000234590.10 1781 12 -392 4 14 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.913689 0.592586 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.138.8 chr1 - 1686 11 novel_in_catalog ENO1 novel 1781 12 NA NA 0 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.138.9 chr1 - 1362 10 novel_not_in_catalog ENO1 novel 1837 13 NA NA 0 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.138.10 chr1 - 727 4 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 7553 2 7553 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 141 36.788677 1.565714 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT 9872 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 141 NA PB.138.11 chr1 - 566 3 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 8261 2 8261 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 31 8.088291 0.907857 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 31 NA PB.138.13 chr1 - 2153 12 novel_in_catalog ENO1 novel 1781 12 NA NA -105 2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATACTCCGTGTGCCTGTG -38 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.138.14 chr1 - 2019 13 novel_in_catalog ENO1 novel 1781 12 NA NA 0 2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATACTCCGTGTGCCTGTG 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.138.15 chr1 - 1543 11 novel_not_in_catalog ENO1 novel 1819 10 NA NA 0 2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATACTCCGTGTGCCTGTG -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.138.16 chr1 - 935 5 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 6152 3 6152 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 191 49.834309 1.697528 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATACTCCGTGTGCCTGTG 9997 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 191 NA PB.138.17 chr1 - 3159 11 novel_in_catalog ENO1 novel 1837 13 NA NA 0 1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATACTCCGTGTGCCTGT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.138.18 chr1 - 1737 12 novel_not_in_catalog ENO1 novel 1837 13 NA NA 0 1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATACTCCGTGTGCCTGT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.138.19 chr1 - 1708 8 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 3230 4 3230 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATACTCCGTGTGCCTGT 9724 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.138.20 chr1 - 1153 6 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 5137 4 5137 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 796 207.686432 2.317408 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATACTCCGTGTGCCTGT 8982 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 796 NA PB.138.21 chr1 - 847 5 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 6239 4 6239 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 191 49.834309 1.697528 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATACTCCGTGTGCCTGT 21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 191 NA PB.138.22 chr1 - 1807 12 novel_not_in_catalog ENO1 novel 1837 13 NA NA 0 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAGAATACTCCGTGTGCCTG -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.138.23 chr1 - 1767 12 full-splice_match ENO1 ENST00000234590.10 1781 12 7 7 7 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 1606 419.025635 2.622241 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAGAATACTCCGTGTGCCTG 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 1606 NA PB.138.24 chr1 - 1496 10 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000234590.10 1781 12 6777 7 35 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 235 61.314461 1.787563 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAGAATACTCCGTGTGCCTG 7348 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 235 NA PB.138.26 chr1 - 1409 8 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 3526 7 3526 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 416 108.539642 2.035589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATGAGAATACTCCGTGTGCC 9991 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 416 NA PB.138.27 chr1 - 1620 12 full-splice_match ENO1 ENST00000234590.10 1781 12 22 139 -18 -132 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGTCATTGTTTTTCTCGCC 593 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.138.30 chr1 - 712 7 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000645609.1 1819 10 402 3240 0 7 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AGAAATATGGGAAAGATGCC -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.139.1 chr1 - 2208 12 full-splice_match SLC2A5 ENST00000377424.9 4085 12 35 1842 4 1483 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 33 8.610116 0.935009 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGACGTGCTGCTGTTC -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 33 NA PB.139.2 chr1 - 1928 10 incomplete-splice_match SLC2A5 ENST00000377424.9 4085 12 12111 1842 12080 1483 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGACGTGCTGCTGTTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.139.3 chr1 - 1999 10 novel_in_catalog SLC2A5 novel 4085 12 NA NA -17 1482 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAACAAGACGTGCTGCTGTT -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.139.4 chr1 - 1852 12 full-splice_match SLC2A5 ENST00000377424.9 4085 12 0 2233 0 1092 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTTGCTGGTTCAGCCTTC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.139.5 chr1 - 1705 12 full-splice_match SLC2A5 ENST00000377424.9 4085 12 11 2369 11 956 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATGCAGTCCTCATCTCCAG 11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.147.7 chr1 + 2898 2 full-splice_match SPSB1 ENST00000377399.2 1007 2 63 -1954 63 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACCATTTTTGAATTCCTC 29 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.147.8 chr1 + 1111 2 full-splice_match SPSB1 ENST00000377399.2 1007 2 185 -289 185 1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACATTGAGCTCCAATCTGCT 151 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.147.9 chr1 + 2266 2 full-splice_match SPSB1 ENST00000377399.2 1007 2 687 -1946 687 -11 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATATCAAACCATTTTTG 653 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.147.10 chr1 + 2150 2 full-splice_match SPSB1 ENST00000377399.2 1007 2 811 -1954 811 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACCATTTTTGAATTCCTC 777 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.148.1 chr1 + 976 5 novel_in_catalog SLC25A33 novel 3865 7 NA NA -40 -4892 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGTTGTTTGTGGGTATATC NA FALSE NA NA AGTAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.148.2 chr1 + 1062 6 incomplete-splice_match SLC25A33 ENST00000302692.7 3865 7 -25 4892 -25 -4892 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGTTGTTTGTGGGTATATC -11 TRUE NA NA AGTAAA -14 NA NA NA 6 NA PB.148.3 chr1 + 2324 6 novel_in_catalog SLC25A33 novel 3865 7 NA NA -14 -1454 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAATTTAAT 0 TRUE NA NA TTTAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.148.4 chr1 + 1477 7 full-splice_match SLC25A33 ENST00000302692.7 3865 7 -14 2402 -14 -2402 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 217 56.618034 1.752955 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACATTTGGCTTGTGTCCTC 0 TRUE NA NA ATTAAA -22 NA NA NA 217 NA PB.148.5 chr1 + 1365 6 novel_in_catalog SLC25A33 novel 3865 7 NA NA -12 -2411 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTTAAGTATACATTTGGCT 2 TRUE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 10 NA PB.148.6 chr1 + 1540 8 novel_not_in_catalog SLC25A33 novel 3865 7 NA NA 0 -2401 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACATTTGGCTTGTGTCCTCT 14 TRUE NA NA ATTAAA -23 NA NA NA 3 NA PB.148.7 chr1 + 1283 5 novel_in_catalog SLC25A33 novel 3865 7 NA NA 1 -2402 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACATTTGGCTTGTGTCCTC 15 TRUE NA NA ATTAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.148.8 chr1 + 1286 5 novel_in_catalog SLC25A33 novel 3865 7 NA NA 8 -2403 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATACATTTGGCTTGTGTCCT 22 FALSE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 4 NA PB.148.9 chr1 + 1433 7 novel_not_in_catalog SLC25A33 novel 3865 7 NA NA 22 -2401 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACATTTGGCTTGTGTCCTCT -5 TRUE NA NA ATTAAA -23 NA NA NA 2 NA PB.148.10 chr1 + 1374 6 novel_in_catalog SLC25A33 novel 3865 7 NA NA 22 -2402 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACATTTGGCTTGTGTCCTC -5 TRUE NA NA ATTAAA -22 NA NA NA 3 NA PB.148.12 chr1 + 1293 7 full-splice_match SLC25A33 ENST00000302692.7 3865 7 24 2548 24 -2548 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 46 12.001980 1.079253 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACCTGTTGGACATTTCCTTT -3 TRUE NA NA CATAAA -17 NA NA NA 46 NA PB.148.13 chr1 + 2381 7 full-splice_match SLC25A33 ENST00000302692.7 3865 7 25 1459 25 -1459 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 ACATTAAAAAAAAAAAAAAT -2 TRUE NA NA TTTAAA -13 NA NA NA 3 NA PB.148.15 chr1 + 1366 8 novel_not_in_catalog SLC25A33 novel 3865 7 NA NA 25 -2402 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACATTTGGCTTGTGTCCTC -2 TRUE NA NA ATTAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.148.16 chr1 + 1250 7 full-splice_match SLC25A33 ENST00000302692.7 3865 7 212 2403 212 -2403 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATACATTTGGCTTGTGTCCT 17 FALSE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 8 NA PB.148.17 chr1 + 1149 6 incomplete-splice_match SLC25A33 ENST00000302692.7 3865 7 14192 2402 14192 -2402 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACATTTGGCTTGTGTCCTC 3617 FALSE NA NA ATTAAA -22 NA NA NA 3 NA PB.148.18 chr1 + 1028 6 incomplete-splice_match SLC25A33 ENST00000302692.7 3865 7 14313 2402 14313 -2402 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACATTTGGCTTGTGTCCTC 3738 FALSE NA NA ATTAAA -22 NA NA NA 9 NA PB.148.21 chr1 + 886 4 incomplete-splice_match SLC25A33 ENST00000302692.7 3865 7 30829 2402 30829 -2402 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACATTTGGCTTGTGTCCTC NA FALSE NA NA ATTAAA -22 NA NA NA 10 NA PB.148.22 chr1 + 1840 2 incomplete-splice_match SLC25A33 ENST00000302692.7 3865 7 39403 2402 39403 -2402 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACATTTGGCTTGTGTCCTC NA FALSE NA NA ATTAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.148.23 chr1 + 681 2 incomplete-splice_match SLC25A33 ENST00000302692.7 3865 7 40557 2407 40557 -2407 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGTATACATTTGGCTTGTG NA FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.148.24 chr1 + 496 2 incomplete-splice_match SLC25A33 ENST00000302692.7 3865 7 40745 2404 40745 -2404 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TATACATTTGGCTTGTGTCC NA FALSE NA NA ATTAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.149.1 chr1 + 3972 11 full-splice_match TMEM201 ENST00000340381.11 3815 11 -159 2 -159 2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.391864 0.530438 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGCCTGCTGGCTGTCTGTAT 13 TRUE NA NA AAAAAG -31 NA NA NA 13 NA PB.149.2 chr1 + 4020 6 full-splice_match TMEM201 ENST00000340305.9 3851 6 -168 -1 -157 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GGCGTCAGGTGCCGCGTCTT 15 TRUE NA NA AATAAA -29 NA NA NA 5 NA PB.149.3 chr1 + 3819 11 full-splice_match TMEM201 ENST00000340381.11 3815 11 -11 7 -11 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGATGCCTGCTGGCTGTC 6 TRUE NA NA AAAAAG -26 NA NA NA 3 NA PB.149.4 chr1 + 3377 3 incomplete-splice_match TMEM201 ENST00000340305.9 3851 6 9557 6 1582 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCGCTGGCGTCAGGTGCC 1562 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.149.5 chr1 + 2985 2 incomplete-splice_match TMEM201 ENST00000340305.9 3851 6 12428 6 4453 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCGCTGGCGTCAGGTGCC 4433 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.149.6 chr1 + 3014 8 novel_not_in_catalog TMEM201 novel 893 6 NA NA -4146 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GCCTGCTGGCTGTCTGTATT 5151 FALSE NA NA AAAAAG -32 NA NA NA 2 NA PB.149.7 chr1 + 2787 6 incomplete-splice_match TMEM201 ENST00000340381.11 3815 11 13207 3 -4096 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGCCTGCTGGCTGTCTGTA 5201 FALSE NA NA AAAAAG -30 NA NA NA 2 NA PB.149.11 chr1 + 2404 4 incomplete-splice_match TMEM201 ENST00000340381.11 3815 11 20926 1 2109 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GCCTGCTGGCTGTCTGTATT 2120 FALSE NA NA AAAAAG -32 NA NA NA 4 NA PB.149.12 chr1 + 2203 3 incomplete-splice_match TMEM201 ENST00000416541.5 3447 8 13727 5 2896 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGAATGATGCCTGCTGGCTG 2907 FALSE NA NA AAAAAG -24 NA NA NA 2 NA PB.149.13 chr1 + 1954 2 incomplete-splice_match TMEM201 ENST00000508400.1 893 6 4100 -1629 4100 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GCCTGCTGGCTGTCTGTATT 4111 FALSE NA NA AAAAAG -32 NA NA NA 3 NA PB.150.1 chr1 - 2350 2 full-splice_match LINC02606 ENST00000641325.1 2442 2 91 1 -24 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATGAATGTGTTTGATTCTTA -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.151.1 chr1 - 941 3 full-splice_match PIK3CD-AS2 ENST00000415330.3 978 3 35 2 35 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATTGTGTCTAATGGTTCAT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.152.1 chr1 - 4657 19 full-splice_match CLSTN1 ENST00000377298.9 4760 19 0 103 0 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACTCCAGCCGGAGCGGGG 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.152.2 chr1 - 3132 10 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 7585 -6 6171 5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCCGGAGCGGGGTTTGTCT 7628 FALSE NA NA ACTAAA -4 NA NA NA 2 NA PB.152.3 chr1 - 2924 9 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 10420 -6 -7675 5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCCGGAGCGGGGTTTGTCT 8817 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.152.4 chr1 - 2524 6 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 16426 0 -1669 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT NA FALSE NA NA AAGAAA -18 NA NA NA 9 NA PB.152.5 chr1 - 3010 9 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 10332 -4 -7763 3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CCAGCCGGAGCGGGGTTTGT 8729 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.152.6 chr1 - 4562 17 novel_in_catalog CLSTN1 novel 4647 18 NA NA 9 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.696427 0.671768 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.152.7 chr1 - 4760 19 novel_not_in_catalog CLSTN1 novel 4647 18 NA NA -9 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT 622 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.152.8 chr1 - 3910 14 full-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 -81 0 -81 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT 3566 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.152.9 chr1 - 3680 13 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 1708 0 294 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT 5355 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.152.10 chr1 - 3470 12 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 2035 0 621 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT 5682 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.152.11 chr1 - 3257 12 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000650348.1 4457 19 79210 1 5708 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT 7165 FALSE NA NA GGGGCT -22 NA NA NA 2 NA PB.152.12 chr1 - 3128 11 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000650348.1 4457 19 79728 1 6226 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT 7683 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.152.13 chr1 - 2777 8 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 15612 0 -2483 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.152.15 chr1 - 2223 5 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 17532 0 -563 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.152.16 chr1 - 2081 4 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 18099 0 4 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.152.17 chr1 - 1931 3 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 19753 0 1658 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.152.18 chr1 - 1754 2 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 20300 0 2205 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 28 7.305553 0.863653 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT 21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 28 NA PB.152.21 chr1 - 4627 18 full-splice_match CLSTN1 ENST00000361311.4 4647 18 19 1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.652776 0.562623 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACTCCAGCCGGAGCGGGG 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.152.22 chr1 - 3912 15 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000361311.4 4647 18 72376 1 -27 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACTCCAGCCGGAGCGGGG 3620 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.152.23 chr1 - 3775 14 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000361311.4 4647 18 74072 1 255 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACTCCAGCCGGAGCGGGG 5316 FALSE NA NA AAAACA -31 NA NA NA 4 NA PB.152.24 chr1 - 3495 13 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000361311.4 4647 18 74469 1 652 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACTCCAGCCGGAGCGGGG 5713 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.152.25 chr1 - 3384 11 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 6937 1 5523 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACTCCAGCCGGAGCGGGG 6980 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.152.26 chr1 - 3196 11 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 7125 1 5711 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACTCCAGCCGGAGCGGGG 7168 FALSE NA NA GGGGCT -19 NA NA NA 5 NA PB.152.27 chr1 - 2398 6 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 16551 1 -1544 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACTCCAGCCGGAGCGGGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.152.28 chr1 - 2286 5 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 17468 1 -627 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACTCCAGCCGGAGCGGGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.152.34 chr1 - 3630 17 novel_in_catalog CLSTN1 novel 4760 19 NA NA 0 -941 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AACCCGGGACTGGAATGTAA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.152.35 chr1 - 1793 8 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 15655 941 -2440 -941 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AACCCGGGACTGGAATGTAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.152.36 chr1 - 1602 6 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 16407 941 -1688 -941 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AACCCGGGACTGGAATGTAA NA FALSE NA NA AAGAAA -37 NA NA NA 3 NA PB.152.38 chr1 - 2466 12 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000650348.1 4457 19 79051 951 5549 -950 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGCTAGTGTAACCCGGGACT 7006 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.152.39 chr1 - 3681 18 full-splice_match CLSTN1 ENST00000361311.4 4647 18 13 953 -6 -953 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTGTGCTAGTGTAACCCGGG -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.152.40 chr1 - 2273 11 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 7094 955 5680 -955 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CTTTGTGCTAGTGTAACCCG 7137 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.152.41 chr1 - 954 3 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 19775 955 1680 -955 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CTTTGTGCTAGTGTAACCCG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.152.42 chr1 - 1321 5 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 17477 957 -618 -957 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCCTTTGTGCTAGTGTAACC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.152.45 chr1 - 886 5 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000377298.9 4760 19 -3 22545 -3 -1983 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAATCGAGGAGCCGGCTT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.152.46 chr1 - 853 4 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000361311.4 4647 18 19 22443 0 -1983 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 28 7.305553 0.863653 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAATCGAGGAGCCGGCTT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 28 NA PB.153.3 chr1 - 3075 5 full-splice_match CTNNBIP1 ENST00000400904.7 1206 5 -37 -1832 -37 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TCGTGTGTGAGCTGAGCTGG -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.153.4 chr1 - 2984 6 full-splice_match CTNNBIP1 ENST00000377263.6 3006 6 21 1 21 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TCGTGTGTGAGCTGAGCTGG -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.153.5 chr1 - 2883 4 novel_in_catalog CTNNBIP1 novel 1206 5 NA NA 3 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TCGTGTGTGAGCTGAGCTGG -33 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.153.6 chr1 - 2950 5 full-splice_match CTNNBIP1 ENST00000400904.7 1206 5 88 -1832 21 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 52 13.567455 1.132498 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TCGTGTGTGAGCTGAGCTGG -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 52 NA PB.153.11 chr1 - 1253 6 novel_not_in_catalog CTNNBIP1 novel 3006 6 NA NA 11 1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTGGGGTTTGTGTTTGAT -25 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.153.12 chr1 - 1244 6 novel_not_in_catalog CTNNBIP1 novel 3006 6 NA NA 2 1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTGGGGTTTGTGTTTGAT -34 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.153.13 chr1 - 1155 6 full-splice_match CTNNBIP1 ENST00000377263.6 3006 6 17 1834 17 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.913689 0.592586 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACATTTGGGGTTTGTGTTTG -19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.153.14 chr1 - 1071 5 novel_not_in_catalog CTNNBIP1 novel 1206 5 NA NA -1008 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACATTTGGGGTTTGTGTTTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.153.15 chr1 - 1102 6 full-splice_match CTNNBIP1 ENST00000377263.6 3006 6 70 1834 70 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACATTTGGGGTTTGTGTTTG 34 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.153.16 chr1 - 1032 4 novel_in_catalog CTNNBIP1 novel 1206 5 NA NA 21 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACATTTGGGGTTTGTGTTTG -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.153.17 chr1 - 1038 5 full-splice_match CTNNBIP1 ENST00000400904.7 1206 5 167 1 100 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACATTTGGGGTTTGTGTTTG 64 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.153.18 chr1 - 1133 5 full-splice_match CTNNBIP1 ENST00000400904.7 1206 5 71 2 4 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 212 55.313473 1.742831 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CACATTTGGGGTTTGTGTTT -32 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 212 NA PB.153.19 chr1 - 959 4 novel_in_catalog CTNNBIP1 novel 1206 5 NA NA 94 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACATTTGGGGTTTGTGTTTG 58 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.153.20 chr1 - 815 3 incomplete-splice_match CTNNBIP1 ENST00000377256.1 451 5 6151 -549 6151 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACATTTGGGGTTTGTGTTTG 5955 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.153.21 chr1 - 786 5 full-splice_match CTNNBIP1 ENST00000400904.7 1206 5 84 336 17 5 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.479165 0.738714 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TATTTTTATTTCTGACTCTT -19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 21 NA PB.153.22 chr1 - 900 5 full-splice_match CTNNBIP1 ENST00000400904.7 1206 5 -37 343 -37 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCTTTTATTTTTATTTCT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.153.24 chr1 - 1113 3 novel_not_in_catalog CTNNBIP1 novel 3006 6 NA NA 21 -29292 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAAATATGCTGCTGTTTGGT -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.154.1 chr1 + 5208 24 full-splice_match PIK3CD ENST00000377346.9 5412 24 0 204 0 -204 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 GAAAAGAAAGAAAAAGCCTT -9 TRUE NA NA AGTAAA -8 NA NA NA 2 NA PB.154.2 chr1 + 3481 12 incomplete-splice_match PIK3CD ENST00000361110.6 3508 23 10542 -1679 4464 -203 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAGAAAGAAAAAGCCTTT 2931 FALSE NA NA AGTAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.154.3 chr1 + 2683 7 incomplete-splice_match PIK3CD ENST00000361110.6 3508 23 12129 -1679 6051 -203 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAGAAAGAAAAAGCCTTT 4518 FALSE NA NA AGTAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.154.4 chr1 + 2488 5 incomplete-splice_match PIK3CD ENST00000361110.6 3508 23 13013 -1679 6935 -203 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAGAAAGAAAAAGCCTTT 5402 FALSE NA NA AGTAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.154.5 chr1 + 2057 2 incomplete-splice_match PIK3CD ENST00000361110.6 3508 23 14685 -1679 8607 -203 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAGAAAGAAAAAGCCTTT 7074 FALSE NA NA AGTAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.155.2 chr1 + 937 5 novel_in_catalog NMNAT1 novel 3734 5 NA NA 1 -7 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACAACAGTTTGTGGTAGTC -31 TRUE NA NA AATAAA -7 NA NA NA 2 NA PB.155.3 chr1 + 1631 5 full-splice_match NMNAT1 ENST00000377205.6 3734 5 -41 2144 5 -315 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAGAGAAAAAAAAAAAAGA -27 TRUE NA NA AAAAAG -15 NA NA NA 3 NA PB.155.4 chr1 + 1087 5 full-splice_match NMNAT1 ENST00000403197.5 1094 5 6 1 5 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTCTCCTGCAGTGGTCTC -27 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 5 NA PB.155.5 chr1 + 1075 5 full-splice_match NMNAT1 ENST00000377205.6 3734 5 0 2659 0 -830 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCTCACGCCTGTAATCCCAG 14 TRUE NA NA AGTAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.156.2 chr1 + 1596 3 full-splice_match UBE4B ENST00000377153.5 1273 3 -327 4 -11 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATAATGTTTCCTCTGTATGT -13 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 8 NA PB.156.3 chr1 + 4879 27 full-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 126 -233 0 233 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGAATTTGAATTTCAGTTTT -2 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 5 NA PB.156.5 chr1 + 1044 3 full-splice_match UBE4B ENST00000377153.5 1273 3 -315 544 1 -544 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATGAACACCTCTAATTG -1 TRUE NA NA ATTAAA -10 NA NA NA 5 NA PB.156.6 chr1 + 5505 27 full-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 133 -866 7 -6 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAAATCTTCTTTGAGTCT 5 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 6 NA PB.156.7 chr1 + 2777 17 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 279 35187 153 141 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAACTTGTTGATACCTTAC 67 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.156.8 chr1 + 5332 27 full-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 306 -866 -136 -6 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAAATCTTCTTTGAGTCT -44 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.156.9 chr1 + 4689 27 full-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 316 -233 -126 233 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGAATTTGAATTTCAGTTTT -34 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 6 NA PB.156.10 chr1 + 3658 23 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 70189 -233 2160 233 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGAATTTGAATTTCAGTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.156.11 chr1 + 4190 22 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 72711 -864 4682 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAAGAAATCTTCTTTGAGT NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 4 NA PB.156.12 chr1 + 3471 22 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 72799 -233 4770 233 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGAATTTGAATTTCAGTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.156.14 chr1 + 2906 17 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 96569 -233 1062 233 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGAATTTGAATTTCAGTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.156.16 chr1 + 2448 13 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 102236 -233 6729 233 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGAATTTGAATTTCAGTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.156.17 chr1 + 2399 13 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 102293 -241 6786 241 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTTCAGTTTTTTTTTTCT NA FALSE NA NA AATAAA -26 NA NA NA 2 NA PB.156.18 chr1 + 2825 11 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000343090.11 5905 28 111980 6 -13416 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAAATCTTCTTTGAGTCT NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.156.20 chr1 + 2694 10 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000343090.11 5905 28 114032 8 -11364 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAAGAAATCTTCTTTGAGT NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.156.21 chr1 + 2593 9 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000343090.11 5905 28 116228 6 -9168 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAAATCTTCTTTGAGTCT NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.156.23 chr1 + 2200 7 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000343090.11 5905 28 125456 8 60 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAAGAAATCTTCTTTGAGT 2976 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.156.24 chr1 + 1494 6 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 128316 -233 2794 233 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGAATTTGAATTTCAGTTTT 5710 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.156.25 chr1 + 2119 6 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000343090.11 5905 28 128196 8 2800 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAAGAAATCTTCTTTGAGT 5716 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 5 NA PB.156.26 chr1 + 1411 6 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 128401 -235 2879 235 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATTTGAATTTCAGTTTTTT 5795 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.156.27 chr1 + 1899 5 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000343090.11 5905 28 135267 6 -2731 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAAATCTTCTTTGAGTCT 70 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 10 NA PB.156.28 chr1 + 1743 4 full-splice_match UBE4B ENST00000487244.5 818 4 292 -1217 292 -6 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAAATCTTCTTTGAGTCT -3 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 5 NA PB.156.29 chr1 + 1034 3 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000487244.5 818 4 7689 -591 -371 240 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATTTCAGTTTTTTTTTTC 7394 FALSE NA NA AATAAA -25 NA NA NA 5 NA PB.156.30 chr1 + 1589 3 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000487244.5 818 4 7759 -1216 -301 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAGAAATCTTCTTTGAGTC 7464 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 8 NA PB.156.31 chr1 + 1462 2 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000465408.1 355 3 424 -1283 424 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAAATCTTCTTTGAGTCT 8189 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 5 NA PB.156.32 chr1 + 805 2 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000465408.1 355 3 448 -650 448 233 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGAATTTGAATTTCAGTTTT 8213 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.157.2 chr1 + 3043 21 novel_in_catalog KIF1B novel 7800 21 NA NA -37 -3032 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAGAAATAAAATGCTCAAAA -9 TRUE NA NA GATAAA -7 NA NA NA 2 NA PB.157.3 chr1 + 1606 4 incomplete-splice_match KIF1B ENST00000377093.9 7800 21 -37 49107 -37 -22893 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 TAAAAAAAAAAAAAATTTTT -9 TRUE NA NA ACTAAA -35 NA NA NA 5 NA PB.157.4 chr1 + 1289 9 incomplete-splice_match KIF1B ENST00000377093.9 7800 21 -37 36291 -37 -10077 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GTAAGTTTTATACTTCATTA -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.157.5 chr1 + 2357 19 novel_in_catalog KIF1B novel 10855 49 NA NA -27 4703 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAACAAGGAATTGATATG 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.157.6 chr1 + 2279 19 incomplete-splice_match KIF1B ENST00000377093.9 7800 21 -27 11560 -27 4703 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAACAAGGAATTGATATG 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.157.10 chr1 + 5962 21 full-splice_match KIF1B ENST00000377093.9 7800 21 -3 1841 -3 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.157.16 chr1 + 3718 3 incomplete-splice_match KIF1B ENST00000377083.5 5885 21 66263 1 14577 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 1308 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.157.18 chr1 + 3351 1 full-splice_match RN7SL731P ENST00000584329.2 293 1 -3058 0 -3058 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 7688 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.157.19 chr1 + 2845 1 full-splice_match RN7SL731P ENST00000584329.2 293 1 -2552 0 -2552 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 8194 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.157.20 chr1 + 2661 1 full-splice_match RN7SL731P ENST00000584329.2 293 1 -2369 1 -2369 -1 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 8377 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.157.21 chr1 + 1796 1 full-splice_match RN7SL731P ENST00000584329.2 293 1 -1504 1 -1504 -1 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 9242 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.157.22 chr1 + 1413 1 full-splice_match RN7SL731P ENST00000584329.2 293 1 -1120 0 -1120 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 9626 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.157.23 chr1 + 1035 1 full-splice_match RN7SL731P ENST00000584329.2 293 1 -742 0 -742 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 10004 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.157.24 chr1 + 839 1 full-splice_match RN7SL731P ENST00000584329.2 293 1 -549 3 -549 -3 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.160.2 chr1 + 2224 12 novel_in_catalog PGD novel 2268 13 NA NA -3 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTTGGTCTGATTTATTTC NA FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.160.3 chr1 + 1854 12 novel_in_catalog PGD novel 2268 13 NA NA 1 314 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGCTCTTTCTCCAGATTCTT NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 7 NA PB.160.4 chr1 + 2265 13 full-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 2 1 2 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 36 9.392854 0.972798 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTTGGTCTGATTTATTTC -2 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 36 NA PB.160.5 chr1 + 2063 12 novel_not_in_catalog PGD novel 2268 13 NA NA -109 315 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GCTCTTTCTCCAGATTCTTA -3 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.160.6 chr1 + 2036 12 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 367 368 -67 313 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGCTCTTTCTCCAGATTCT 39 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.160.7 chr1 + 1792 12 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 611 368 43 313 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.652776 0.562623 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGCTCTTTCTCCAGATTCT 283 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 14 NA PB.160.8 chr1 + 1683 11 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 1405 371 837 310 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.391864 0.530438 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CTGATGCTCTTTCTCCAGAT 1077 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 13 NA PB.160.9 chr1 + 1564 10 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 4025 368 3457 313 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 24 6.261902 0.796706 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGCTCTTTCTCCAGATTCT 3697 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 24 NA PB.160.10 chr1 + 1883 9 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 5097 1 4529 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.652776 0.562623 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTTGGTCTGATTTATTTC 4769 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 14 NA PB.160.11 chr1 + 1453 9 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 5160 368 4592 313 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 44 11.480155 1.059948 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGCTCTTTCTCCAGATTCT 4832 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 44 NA PB.160.13 chr1 + 1694 7 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 12354 1 -1416 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTTGGTCTGATTTATTTC NA FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 5 NA PB.160.14 chr1 + 1279 7 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 12402 368 -1368 313 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 35 9.131941 0.960563 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGCTCTTTCTCCAGATTCT NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 35 NA PB.160.15 chr1 + 1559 6 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 13996 3 226 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCAGCTTGGTCTGATTTATT NA FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.160.16 chr1 + 1157 6 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 14032 369 262 312 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 28 7.305553 0.863653 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GATGCTCTTTCTCCAGATTC NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 28 NA PB.160.18 chr1 + 1048 6 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 14142 368 372 313 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 20 5.218252 0.717525 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGCTCTTTCTCCAGATTCT NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 20 NA PB.160.19 chr1 + 931 5 incomplete-splice_match PGD ENST00000498356.1 790 6 1766 -313 -1754 313 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 28 7.305553 0.863653 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGCTCTTTCTCCAGATTCT 62 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 28 NA PB.160.20 chr1 + 1287 5 incomplete-splice_match PGD ENST00000498356.1 790 6 1777 -680 -1743 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTTGGTCTGATTTATTTC 73 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 11 NA PB.160.21 chr1 + 1139 4 incomplete-splice_match PGD ENST00000498356.1 790 6 2182 -679 -1338 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CAGCTTGGTCTGATTTATTT 478 FALSE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 7 NA PB.160.22 chr1 + 739 3 incomplete-splice_match PGD ENST00000498356.1 790 6 3532 -313 12 313 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.174602 0.620615 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGCTCTTTCTCCAGATTCT 1828 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 16 NA PB.161.1 chr1 - 990 8 novel_in_catalog LZIC novel 652 5 NA NA 66 -14 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAATTAATGAGAGTATAG 35 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.161.2 chr1 - 938 8 novel_in_catalog LZIC novel 652 5 NA NA 17 -15 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 TAAAAATTAATGAGAGTATA -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.161.6 chr1 - 2751 8 full-splice_match LZIC ENST00000377213.1 945 8 33 -1839 17 1306 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAATATTTGTTTGAATACCT -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.161.7 chr1 - 1967 8 full-splice_match LZIC ENST00000377223.6 4989 8 35 2987 35 440 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TTCTGTACTGTAAACTACTA 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.161.8 chr1 - 1883 8 full-splice_match LZIC ENST00000377213.1 945 8 33 -971 17 438 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TCTTCTGTACTGTAAACTAC -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.161.10 chr1 - 1689 6 incomplete-splice_match LZIC ENST00000400903.6 1405 7 6149 -437 -999 437 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TTCTTCTGTACTGTAAACTA 6741 FALSE NA NA AATAAA -26 NA NA NA 2 NA PB.161.11 chr1 - 1541 8 full-splice_match LZIC ENST00000377223.6 4989 8 35 3413 35 14 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAGCCTGTAAGCTGTCTGTA 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.161.12 chr1 - 1433 7 full-splice_match LZIC ENST00000400903.6 1405 7 -17 -11 -17 11 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CCCCAGCCTGTAAGCTGTCT 575 FALSE NA NA TATAAA -5 NA NA NA 3 NA PB.161.13 chr1 - 1443 8 full-splice_match LZIC ENST00000377213.1 945 8 30 -528 14 -5 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACACTAAGGGACCATCCCCC -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.161.14 chr1 - 1152 8 full-splice_match LZIC ENST00000377223.6 4989 8 22 3815 22 145 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTAAGGCTGTTTGTTTTTA -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.161.15 chr1 - 1060 8 full-splice_match LZIC ENST00000377213.1 945 8 30 -145 14 145 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTAAGGCTGTTTGTTTTTA -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.161.16 chr1 - 842 8 novel_not_in_catalog LZIC novel 945 8 NA NA 22 6 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTTATGCTCTTCATCATTGT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.161.17 chr1 - 920 8 full-splice_match LZIC ENST00000377213.1 945 8 30 -5 14 5 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 53 13.828368 1.140771 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GTTTATGCTCTTCATCATTG -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 53 NA PB.161.18 chr1 - 1192 7 full-splice_match LZIC ENST00000400903.6 1405 7 -316 529 307 4 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGTTTATGCTCTTCATCATT 276 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.161.19 chr1 - 982 8 full-splice_match LZIC ENST00000377223.6 4989 8 45 3962 45 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 27 7.044641 0.847859 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GGCTTGTGTTTATGCTCTTC 14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 27 NA PB.162.4 chr1 - 1012 2 novel_not_in_catalog DFFA novel 6035 6 NA NA 13519 -18 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGCTGTTTAATTTCCTAATT 768 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.163.1 chr1 + 956 5 full-splice_match CENPS ENST00000309048.8 905 5 -53 2 -53 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGCTTTTCTGGTTACTAAT 303 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.163.2 chr1 + 1147 6 novel_not_in_catalog CENPS-CORT novel 571 6 NA NA 8 -8605 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGCTTTTCTGGTTACTAAT -16 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 4 NA PB.163.3 chr1 + 1124 6 novel_not_in_catalog CENPS-CORT novel 571 6 NA NA -2 -8602 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CTTTTCTGGTTACTAATGTT -26 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.163.4 chr1 + 820 6 full-splice_match CENPS-CORT ENST00000602787.6 571 6 -2 -247 -2 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTGATCTTTCCTCTCCTCC -26 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 5 NA PB.163.5 chr1 + 749 3 novel_in_catalog CENPS novel 905 5 NA NA 0 2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTTTCTGGTTACTAATGTTG -26 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.163.6 chr1 + 626 5 full-splice_match CENPS ENST00000309048.8 905 5 0 279 0 27 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TAGGGTGCTTTTTGTGCTGA -26 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.163.7 chr1 + 902 5 full-splice_match CENPS ENST00000309048.8 905 5 2 1 2 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 105 27.395823 1.437684 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTTTTCTGGTTACTAATG -24 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 105 NA PB.163.8 chr1 + 1144 5 full-splice_match CENPS ENST00000477755.1 914 5 -31 -199 -31 31 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 55 14.350193 1.156858 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTGCTTTTTGTGCTGAATTC -1 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 55 NA PB.163.9 chr1 + 1182 5 fusion CENPS_CORT novel 914 5 NA NA -56 -340 multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTGATCTTTCCTCTCCTCC -26 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 5 NA PB.163.10 chr1 + 931 5 full-splice_match CENPS ENST00000477755.1 914 5 -26 9 -26 -9 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AGAAGAAAAAGAAGTCAGAG 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.163.11 chr1 + 1338 5 full-splice_match CENPS ENST00000477755.1 914 5 -53 -371 -53 48 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 25 6.522815 0.814435 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAACATGGTTGACTTTTTC -23 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 25 NA PB.163.12 chr1 + 1437 5 full-splice_match CENPS ENST00000477755.1 914 5 -50 -473 -50 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 42 10.958329 1.039744 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTTTTCTGGTTACTAATG -20 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 42 NA PB.163.13 chr1 + 1271 3 full-splice_match CENPS ENST00000462462.1 584 3 -381 -306 -41 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GCTTTTCTGGTTACTAATGT -11 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.163.14 chr1 + 1446 5 novel_not_in_catalog CENPS novel 914 5 NA NA -16 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGCTTTTCTGGTTACTAAT 14 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.163.15 chr1 + 1193 5 fusion CENPS_CORT novel 914 5 NA NA -15 -341 multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGTGATCTTTCCTCTCCTC 15 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.163.16 chr1 + 1313 6 fusion CENPS_CORT novel 914 5 NA NA -10 -340 multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTGATCTTTCCTCTCCTCC 20 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 7 NA PB.163.17 chr1 + 692 4 incomplete-splice_match CENPS ENST00000309048.8 905 5 3485 1 2795 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTTTTCTGGTTACTAATG 3165 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.164.1 chr1 + 1919 9 full-splice_match PEX14 ENST00000356607.9 1922 9 0 3 0 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 123 32.092251 1.506400 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TAATTTCTGCCTGTGGCTCC -3 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 123 NA PB.164.2 chr1 + 1831 8 novel_in_catalog PEX14 novel 1922 9 NA NA 4 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AATTTCTGCCTGTGGCTCCC 1 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.164.3 chr1 + 1787 8 novel_in_catalog PEX14 novel 1922 9 NA NA 4 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AATTTCTGCCTGTGGCTCCC 1 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 4 NA PB.164.4 chr1 + 900 5 novel_not_in_catalog PEX14 novel 637 6 NA NA 4 41858 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACCAGATCTACAGGTGATTT 1 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.164.8 chr1 + 1723 6 incomplete-splice_match PEX14 ENST00000356607.9 1922 9 124299 2 63361 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AATTTCTGCCTGTGGCTCCC NA FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 4 NA PB.164.9 chr1 + 1552 5 incomplete-splice_match PEX14 ENST00000356607.9 1922 9 143431 6 82493 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTTAATTTCTGCCTGTGGC NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.164.10 chr1 + 1378 3 incomplete-splice_match PEX14 ENST00000356607.9 1922 9 149424 6 88486 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTTAATTTCTGCCTGTGGC 1335 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.164.11 chr1 + 1272 2 incomplete-splice_match PEX14 ENST00000356607.9 1922 9 152367 3 91429 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TAATTTCTGCCTGTGGCTCC 4278 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 6 NA PB.165.7 chr1 - 1244 5 incomplete-splice_match DFFA ENST00000377038.8 6035 6 3205 4570 3155 551 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAATACAAAAAAAATTAG 3650 FALSE NA NA AATAAA -23 NA NA NA 2 NA PB.165.10 chr1 - 1326 6 full-splice_match DFFA ENST00000377038.8 6035 6 3 4706 3 415 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 66 17.220232 1.236039 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGTAATTGGCAGTGATT -21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 66 NA PB.165.11 chr1 - 1157 6 full-splice_match DFFA ENST00000377038.8 6035 6 172 4706 122 415 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGTAATTGGCAGTGATT 617 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.165.12 chr1 - 976 5 incomplete-splice_match DFFA ENST00000377038.8 6035 6 3337 4706 3287 415 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGTAATTGGCAGTGATT 3782 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.165.13 chr1 - 1370 6 novel_in_catalog DFFA novel 6035 6 NA NA -15 371 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAATATCCCGCCTCCTCT 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.165.14 chr1 - 1174 6 full-splice_match DFFA ENST00000377038.8 6035 6 34 4827 -7 294 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TACGCCGTTCCACCAATTTT 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.165.18 chr1 - 1439 5 full-splice_match DFFA ENST00000377036.2 1403 5 -38 2 3 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 29 7.566465 0.878893 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTCTTCCTGTTGGTGTTGTA -21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 29 NA PB.165.19 chr1 - 1034 5 full-splice_match DFFA ENST00000377036.2 1403 5 -7 376 -7 -376 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 60 15.654757 1.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACAGACTCTGGTCCAAGG 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 60 NA PB.165.20 chr1 - 892 4 incomplete-splice_match DFFA ENST00000476658.5 744 5 -65 1202 -15 -377 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 CAAACAGACTCTGGTCCAAG 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.165.21 chr1 - 1065 5 full-splice_match DFFA ENST00000377036.2 1403 5 -94 432 -53 -432 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 ATTAATCTAAATCAAAATAG -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.166.1 chr1 - 2209 3 full-splice_match MASP2 ENST00000480221.1 2190 3 -20 1 -8 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCTGCTGCCACGTGTCTCT 9468 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.166.2 chr1 - 1207 4 incomplete-splice_match MASP2 ENST00000400897.8 2455 11 -23 18277 -23 -2 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CACCTGCTGCCACGTGTCTC 9453 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.167.1 chr1 + 2725 6 novel_in_catalog TARDBP novel 2269 6 NA NA 0 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT NA FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.167.2 chr1 + 2745 6 full-splice_match TARDBP ENST00000240185.8 4185 6 -15 1455 -14 -6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 480 125.238052 2.097736 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT NA FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 480 NA PB.167.3 chr1 + 1717 7 novel_in_catalog TARDBP novel 1793 10 NA NA -2 -10 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATTTAAATAATATGTGTCTT -8 TRUE NA NA AATAAA -5 NA NA NA 2 NA PB.167.4 chr1 + 2136 7 novel_in_catalog TARDBP novel 1793 10 NA NA 0 -7 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAGTTGTCTCAAGTCAAA -6 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.167.5 chr1 + 1688 7 novel_not_in_catalog TARDBP novel 4185 6 NA NA 0 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT -5 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.167.6 chr1 + 1190 8 novel_in_catalog TARDBP novel 1793 10 NA NA 0 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGTCTCAAGTCAAATGGATT -5 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.167.7 chr1 + 4275 6 full-splice_match TARDBP ENST00000240185.8 4185 6 1 -91 1 91 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.479165 0.738714 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 TAAAGAAAAAAGAAAATAAT -4 TRUE NA NA TTTAAA -12 NA NA NA 21 NA PB.167.8 chr1 + 3444 6 full-splice_match TARDBP ENST00000240185.8 4185 6 1 740 1 -267 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACACTCTCACAATGCATTGT -4 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.167.9 chr1 + 2402 7 novel_in_catalog TARDBP novel 1793 10 NA NA 1 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CAGTTTAGTGTCTGGAGTCT -4 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.167.10 chr1 + 2192 7 novel_in_catalog TARDBP novel 1793 10 NA NA 1 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT -4 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.167.11 chr1 + 1199 8 incomplete-splice_match TARDBP ENST00000614757.4 1793 10 -7 6345 1 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GTCTCAAGTCAAATGGATTC -4 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.167.12 chr1 + 3405 7 novel_in_catalog TARDBP novel 1793 10 NA NA -3 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTTTAGTGTCTGGAGTCTT 0 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.167.13 chr1 + 2870 6 full-splice_match TARDBP ENST00000240185.8 4185 6 5 1310 -3 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGTCTCAAGTCAAATGGATT 0 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 6 NA PB.167.14 chr1 + 2632 7 novel_not_in_catalog TARDBP novel 4185 6 NA NA -3 -7 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAATAATATGTGTCTTTGT 0 TRUE NA NA AATAAA -8 NA NA NA 4 NA PB.167.16 chr1 + 1500 6 full-splice_match TARDBP ENST00000240185.8 4185 6 5 2680 -3 -46 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.652776 0.562623 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAAGGAAGAGCTAAAGGA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.167.18 chr1 + 1176 8 novel_in_catalog TARDBP novel 1793 10 NA NA -3 -6 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT 0 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.167.20 chr1 + 1788 6 full-splice_match TARDBP ENST00000240185.8 4185 6 7 2390 -1 -132 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACAGTGTTTGGTTCTTTTGT 2 TRUE NA NA AAGAAA -27 NA NA NA 3 NA PB.167.21 chr1 + 2845 7 novel_in_catalog TARDBP novel 1793 10 NA NA 0 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT 3 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.167.23 chr1 + 2615 5 incomplete-splice_match TARDBP ENST00000315091.7 1835 6 29 142 17 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATATGTGTCTTTGTTTTGC 1061 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 3 NA PB.167.24 chr1 + 2485 5 incomplete-splice_match TARDBP ENST00000315091.7 1835 6 155 146 143 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT 1187 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 9 NA PB.167.25 chr1 + 2272 4 incomplete-splice_match TARDBP ENST00000611963.4 739 6 -4 156 -4 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 23 6.000990 0.778223 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT 4278 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 23 NA PB.167.26 chr1 + 2159 3 incomplete-splice_match TARDBP ENST00000620632.4 706 5 20 6 20 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT 6116 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 6 NA PB.167.27 chr1 + 2043 2 incomplete-splice_match TARDBP ENST00000614494.1 515 4 38 146 -35 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.696427 0.671768 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT 7787 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 18 NA PB.167.28 chr1 + 3405 2 incomplete-splice_match TARDBP ENST00000477447.6 409 5 -24 -284 -24 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTTTAGTGTCTGGAGTCTT 7879 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.168.1 chr1 - 1273 8 full-splice_match SRM ENST00000376957.7 1260 8 -16 3 -14 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 483 126.020790 2.100442 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGATTGGAGTCCTGTGTC 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 483 NA PB.168.2 chr1 - 1669 7 incomplete-splice_match SRM ENST00000376957.7 1260 8 19 3 19 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGATTGGAGTCCTGTGTC 40 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.168.3 chr1 - 1318 8 novel_in_catalog SRM novel 1260 8 NA NA -24 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGATTGGAGTCCTGTGTC -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.168.4 chr1 - 1246 7 incomplete-splice_match SRM ENST00000376957.7 1260 8 442 3 110 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGATTGGAGTCCTGTGTC 463 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.168.5 chr1 - 1109 7 novel_in_catalog SRM novel 1260 8 NA NA 2 -3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGATTGGAGTCCTGTGTC 23 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.168.6 chr1 - 1045 8 full-splice_match SRM ENST00000376957.7 1260 8 212 3 -120 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 58 15.132931 1.179923 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGATTGGAGTCCTGTGTC 233 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 58 NA PB.168.7 chr1 - 896 6 incomplete-splice_match SRM ENST00000376957.7 1260 8 1124 3 -21 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 33 8.610116 0.935009 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGATTGGAGTCCTGTGTC 1145 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 33 NA PB.168.8 chr1 - 857 6 novel_not_in_catalog SRM novel 1260 8 NA NA 28 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGATTGGAGTCCTGTGTC 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.168.9 chr1 - 803 5 incomplete-splice_match SRM ENST00000376957.7 1260 8 3259 3 -939 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 20 5.218252 0.717525 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGATTGGAGTCCTGTGTC 3280 FALSE NA NA GGGGCT -14 NA NA NA 20 NA PB.168.10 chr1 - 724 5 incomplete-splice_match SRM ENST00000376957.7 1260 8 3338 3 -860 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.913689 0.592586 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGATTGGAGTCCTGTGTC 3359 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.168.11 chr1 - 974 2 full-splice_match SRM ENST00000475189.1 545 2 -438 9 178 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAAAGATTGGAGTCCTGTGT 4397 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.170.1 chr1 - 2782 25 full-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 18 -4 3 4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 225 58.705338 1.768678 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTCCTGACTTTTATTTTGT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 225 NA PB.170.2 chr1 - 1987 19 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 11687 -3 -5559 3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GATTCCTGACTTTTATTTTG 9929 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.170.3 chr1 - 1317 14 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 18955 6 -57 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.652776 0.562623 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.170.4 chr1 - 4257 21 novel_in_catalog EXOSC10 novel 2796 25 NA NA -4 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT -19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.170.5 chr1 - 3364 23 novel_in_catalog EXOSC10 novel 2796 25 NA NA -1 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.170.6 chr1 - 2982 24 novel_in_catalog EXOSC10 novel 2796 25 NA NA 7 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.170.7 chr1 - 2787 25 novel_in_catalog EXOSC10 novel 2796 25 NA NA 3 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.130951 0.495676 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.170.8 chr1 - 2721 24 novel_in_catalog EXOSC10 novel 2796 25 NA NA 3 -3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.170.9 chr1 - 2294 22 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 8358 6 8343 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT 8343 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.170.10 chr1 - 2166 21 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 8799 6 -8447 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT 8784 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.170.11 chr1 - 1658 16 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 16996 6 -250 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT NA FALSE NA NA AAAACA -37 NA NA NA 10 NA PB.170.12 chr1 - 1549 16 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 17105 6 -141 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.170.13 chr1 - 1433 15 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 18670 6 18 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.170.14 chr1 - 1112 12 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 20050 6 -19 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.174602 0.620615 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.170.15 chr1 - 623 7 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 25908 6 -935 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT 5806 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.170.16 chr1 - 2669 25 full-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 120 7 105 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GAAGAAAGCTGATTCCTGAC 105 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.170.17 chr1 - 2380 22 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 8271 7 8256 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GAAGAAAGCTGATTCCTGAC 8256 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.170.18 chr1 - 2036 20 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 9273 7 -7973 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GAAGAAAGCTGATTCCTGAC 9258 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.170.19 chr1 - 1866 18 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 12010 7 -5236 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GAAGAAAGCTGATTCCTGAC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.170.20 chr1 - 2503 23 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 3987 8 3972 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TGAAGAAAGCTGATTCCTGA 3972 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.170.21 chr1 - 2570 23 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 18 2027 3 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GTAAGAACTGCTCCTGGAGG 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.170.22 chr1 - 1543 15 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 12340 2027 -4906 0 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GTAAGAACTGCTCCTGGAGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.170.23 chr1 - 3302 13 novel_in_catalog EXOSC10 novel 2721 24 NA NA 3 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAGAAAAAATAAACAAA 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.170.24 chr1 - 2626 14 novel_in_catalog EXOSC10 novel 2721 24 NA NA 3 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAGAAAAAATAAACAAA 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.170.25 chr1 - 2422 15 novel_in_catalog EXOSC10 novel 2721 24 NA NA -7 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAGAAAAAATAAACAAA -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.171.1 chr1 + 803 2 full-splice_match EXOSC10-AS1 ENST00000447600.1 487 2 -271 -45 -26 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TTAAGAGAATACTTGCTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.173.2 chr1 - 4607 32 incomplete-splice_match MTOR ENST00000361445.9 8721 58 62890 7 -54636 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.173.3 chr1 - 5034 35 incomplete-splice_match MTOR ENST00000361445.9 8721 58 51643 7 51643 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA AAAACA -45 NA NA NA 2 NA PB.173.4 chr1 - 4814 34 incomplete-splice_match MTOR ENST00000361445.9 8721 58 53218 7 53218 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.173.5 chr1 - 4254 29 incomplete-splice_match MTOR ENST00000361445.9 8721 58 105270 7 -12256 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA AAGAAA -22 NA NA NA 3 NA PB.173.6 chr1 - 5618 40 incomplete-splice_match MTOR ENST00000361445.9 8721 58 33829 7 33829 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.173.7 chr1 - 8702 58 full-splice_match MTOR ENST00000361445.9 8721 58 12 7 12 -7 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG 11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.173.8 chr1 - 3937 27 incomplete-splice_match MTOR ENST00000361445.9 8721 58 115846 7 -1680 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA TATAAA -28 NA NA NA 2 NA PB.173.9 chr1 - 3626 21 novel_in_catalog MTOR novel 8721 58 NA NA -2874 -7 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.173.10 chr1 - 3433 22 incomplete-splice_match MTOR ENST00000361445.9 8721 58 128115 7 -2878 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.173.11 chr1 - 3370 22 incomplete-splice_match MTOR ENST00000361445.9 8721 58 128178 7 -2815 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.173.12 chr1 - 3227 20 full-splice_match MTOR ENST00000376838.5 4017 20 783 7 783 -7 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.173.13 chr1 - 3082 20 full-splice_match MTOR ENST00000376838.5 4017 20 928 7 928 -7 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.173.14 chr1 - 2878 18 incomplete-splice_match MTOR ENST00000376838.5 4017 20 2608 7 2608 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA AAAAAG -41 NA NA NA 6 NA PB.173.16 chr1 - 2561 15 incomplete-splice_match MTOR ENST00000376838.5 4017 20 3751 7 3751 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.173.17 chr1 - 2423 15 incomplete-splice_match MTOR ENST00000376838.5 4017 20 3889 7 3889 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.173.18 chr1 - 2319 14 incomplete-splice_match MTOR ENST00000376838.5 4017 20 4472 7 4472 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA ATTAAA -7 NA NA NA 7 NA PB.173.19 chr1 - 2163 13 incomplete-splice_match MTOR ENST00000376838.5 4017 20 4841 7 4841 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.173.20 chr1 - 2038 12 incomplete-splice_match MTOR ENST00000376838.5 4017 20 6954 7 6954 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA AAAACA -41 NA NA NA 6 NA PB.173.21 chr1 - 1840 11 incomplete-splice_match MTOR ENST00000376838.5 4017 20 9523 7 -6372 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.173.22 chr1 - 1745 10 incomplete-splice_match MTOR ENST00000376838.5 4017 20 10228 7 -5667 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.173.23 chr1 - 1579 8 incomplete-splice_match MTOR ENST00000376838.5 4017 20 16088 7 57 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.957339 0.695249 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.173.24 chr1 - 1382 6 full-splice_match MTOR ENST00000473471.5 862 6 223 -743 223 -7 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.130951 0.495676 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.173.25 chr1 - 1197 4 incomplete-splice_match MTOR ENST00000473471.5 862 6 4930 -743 4930 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA AAGAAA -6 NA NA NA 10 NA PB.173.26 chr1 - 1013 2 incomplete-splice_match MTOR ENST00000473471.5 862 6 6395 -743 6395 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.391864 0.530438 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.173.28 chr1 - 2119 13 incomplete-splice_match MTOR ENST00000361445.9 8721 58 20936 106062 20936 -73643 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAATACCTTAGAAGCCGTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.174.1 chr1 + 1745 2 full-splice_match UBIAD1 ENST00000376810.6 3654 2 4 1905 4 -1905 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGAGTGTTGTCCTGCTTTCT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.174.2 chr1 + 1540 2 full-splice_match UBIAD1 ENST00000376810.6 3654 2 28 2086 28 -2086 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 87 22.699396 1.356014 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 CAGAAGGTGAATTAGGCGCA 15 TRUE NA NA TTTAAA -15 NA NA NA 87 NA PB.174.5 chr1 + 1309 2 full-splice_match UBIAD1 ENST00000376810.6 3654 2 268 2077 -62 -2077 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 43 11.219242 1.049963 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATTAGGCGCATGGTCTTTG 0 TRUE NA NA TTTAAA -24 NA NA NA 43 NA PB.174.8 chr1 + 1099 2 full-splice_match UBIAD1 ENST00000376810.6 3654 2 398 2157 68 -2157 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAGATAATATGTTGTTTTT 93 FALSE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.174.9 chr1 + 904 2 full-splice_match UBIAD1 ENST00000376810.6 3654 2 593 2157 -98 -2157 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAGATAATATGTTGTTTTT 288 FALSE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.175.1 chr1 + 1438 8 novel_in_catalog FBXO44 novel 769 6 NA NA -8 -5 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATAAATCACCCAGTCTCGGG 435 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.175.2 chr1 + 2147 4 novel_in_catalog FBXO44 novel 1734 5 NA NA 8 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TAACCTGTGCCCTGTGGTTT -26 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.175.3 chr1 + 2029 5 novel_in_catalog FBXO44 novel 2928 6 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AACCTGTGCCCTGTGGTTTC -14 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 7 NA PB.175.4 chr1 + 1759 5 full-splice_match FBXO44 ENST00000376762.8 1734 5 -28 3 1 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.957339 0.695249 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TAACCTGTGCCCTGTGGTTT -9 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 19 NA PB.175.5 chr1 + 1882 6 full-splice_match FBXO44 ENST00000251547.10 2928 6 7 1039 3 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TAACCTGTGCCCTGTGGTTT -7 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 7 NA PB.175.6 chr1 + 1125 8 novel_not_in_catalog FBXO44 novel 959 6 NA NA 3 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAATCACCCAGTCTCGGGT -7 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.175.7 chr1 + 1296 2 incomplete-splice_match FBXO44 ENST00000471895.1 769 6 193 1036 193 -1 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TAACCTGTGCCCTGTGGTTT 3706 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.176.1 chr1 - 1305 6 novel_not_in_catalog FBXO2 novel 1287 6 NA NA 1 10 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAAATGGATAAACACTGC 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.176.2 chr1 - 1288 6 full-splice_match FBXO2 ENST00000354287.5 1287 6 0 -1 0 1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 90 23.482134 1.370738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 GAATGAATGAAAAAATGGAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 90 NA PB.176.3 chr1 - 1007 5 incomplete-splice_match FBXO2 ENST00000354287.5 1287 6 3758 6 42 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAGGAAGGAATGAATGAAAA 4147 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.177.1 chr1 + 1469 6 full-splice_match FBXO6 ENST00000376753.9 1444 6 -74 49 -74 -49 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAATAATAATAATAATAAA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.177.2 chr1 + 1115 6 full-splice_match FBXO6 ENST00000376753.9 1444 6 5 324 5 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTGTGGCTCACGCCTGTAA -8 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 7 NA PB.179.2 chr1 + 1106 4 novel_in_catalog AGTRAP novel 1130 5 NA NA -1 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGATGGGCTGTGTTTTGAA -30 TRUE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.179.3 chr1 + 1121 5 novel_not_in_catalog AGTRAP novel 1130 5 NA NA 2 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATGGGCTGTGTTTTGAACCA -27 TRUE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.179.4 chr1 + 1083 4 full-splice_match AGTRAP ENST00000376637.7 1067 4 42 -58 2 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGATGGGCTGTGTTTTGAAC -27 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.179.5 chr1 + 1116 5 full-splice_match AGTRAP ENST00000376629.8 1100 5 -19 3 -2 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 61 15.915668 1.201825 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGATGGGCTGTGTTTTGAAC -25 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 61 NA PB.179.6 chr1 + 1349 6 novel_in_catalog AGTRAP novel 1116 6 NA NA 1 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGATGGGCTGTGTTTTGAAC -22 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.179.7 chr1 + 2735 4 novel_in_catalog AGTRAP novel 1130 5 NA NA 2 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGATGGGCTGTGTTTTGAAC -21 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.179.8 chr1 + 1427 6 novel_in_catalog AGTRAP novel 1116 6 NA NA 2 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGATGGGCTGTGTTTTGAAC -21 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.179.9 chr1 + 1209 6 full-splice_match AGTRAP ENST00000452018.6 809 6 -41 -359 2 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.913689 0.592586 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGATGGGCTGTGTTTTGAAC -21 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 15 NA PB.179.10 chr1 + 1230 6 full-splice_match AGTRAP ENST00000400895.6 786 6 8 -452 2 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 26 6.783728 0.831468 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGATGGGCTGTGTTTTGAAC -21 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 26 NA PB.179.11 chr1 + 1094 5 novel_not_in_catalog AGTRAP novel 1100 5 NA NA 2 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATGGGCTGTGTTTTGAACCA -21 TRUE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.179.12 chr1 + 1077 4 novel_not_in_catalog AGTRAP novel 1130 5 NA NA 2 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGATGGGCTGTGTTTTGAA -21 TRUE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.179.13 chr1 + 1351 6 full-splice_match AGTRAP ENST00000476512.5 942 6 32 -441 2 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGATGGGCTGTGTTTTGAA -4 TRUE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 8 NA PB.179.14 chr1 + 922 3 incomplete-splice_match AGTRAP ENST00000513739.5 566 4 1503 -643 0 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGATGGGCTGTGTTTTGAAC 9977 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 9 NA PB.179.15 chr1 + 715 2 incomplete-splice_match AGTRAP ENST00000513739.5 566 4 2578 -642 1075 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGATGGGCTGTGTTTTGAA NA FALSE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 4 NA PB.180.1 chr1 - 1089 9 full-splice_match MAD2L2 ENST00000376692.9 1053 9 -39 3 -39 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 682 177.942398 2.250279 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGAGCTGAGCCATCATTAAC 354 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 682 NA PB.180.2 chr1 - 1103 8 incomplete-splice_match MAD2L2 ENST00000376692.9 1053 9 378 -3 341 3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAGCCATCATTAACTGGAGT 771 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.180.3 chr1 - 1351 8 novel_in_catalog MAD2L2 novel 1053 9 NA NA -2 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.180.4 chr1 - 1202 8 incomplete-splice_match MAD2L2 ENST00000376692.9 1053 9 275 1 238 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG 668 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.180.5 chr1 - 1164 9 full-splice_match MAD2L2 ENST00000376672.5 1002 9 -118 -44 -2 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG 211 FALSE NA NA GGGGCT -43 NA NA NA 3 NA PB.180.6 chr1 - 1137 8 novel_in_catalog MAD2L2 novel 1053 9 NA NA 5 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.180.7 chr1 - 1070 9 full-splice_match MAD2L2 ENST00000376669.9 864 9 -9 -197 4 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.913689 0.592586 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG 11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.180.8 chr1 - 1017 9 novel_not_in_catalog MAD2L2 novel 1053 9 NA NA -176 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.174602 0.620615 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG -20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.180.9 chr1 - 1016 9 novel_not_in_catalog MAD2L2 novel 1053 9 NA NA 5 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.180.10 chr1 - 994 9 novel_not_in_catalog MAD2L2 novel 872 9 NA NA -3 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.180.11 chr1 - 927 7 incomplete-splice_match MAD2L2 ENST00000376669.9 864 9 649 -197 642 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG 1072 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.180.12 chr1 - 909 8 incomplete-splice_match MAD2L2 ENST00000376692.9 1053 9 568 1 531 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG 961 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.180.13 chr1 - 630 5 incomplete-splice_match MAD2L2 ENST00000376692.9 1053 9 4269 1 4232 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG 4662 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.180.14 chr1 - 1469 8 incomplete-splice_match MAD2L2 ENST00000376692.9 1053 9 7 2 7 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAGCTGAGCCATCATTAACT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.180.15 chr1 - 1296 8 incomplete-splice_match MAD2L2 ENST00000376692.9 1053 9 180 2 143 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.696427 0.671768 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAGCTGAGCCATCATTAACT -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.180.16 chr1 - 1035 9 novel_not_in_catalog MAD2L2 novel 1053 9 NA NA -7 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.435514 0.646944 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAGCTGAGCCATCATTAACT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.180.17 chr1 - 1077 9 full-splice_match MAD2L2 ENST00000376667.7 872 9 59 -264 43 -4 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 48 12.523805 1.097736 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CTGAGCTGAGCCATCATTAA 11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 48 NA PB.182.7 chr1 - 2800 12 full-splice_match MTHFR ENST00000376590.9 7018 12 -83 4301 16 17 alternative_3end5end TRUE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CAGTCTGAACCCTTGTGCTT -33 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.183.4 chr1 + 1002 6 incomplete-splice_match CLCN6 ENST00000376490.7 963 11 -56 4924 -6 2515 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAATACAAAATTAGCCGG 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.183.5 chr1 + 5551 23 full-splice_match CLCN6 ENST00000346436.11 5589 23 40 -2 0 2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTGTCTCCTTTAGCCTTTTG -5 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.184.1 chr1 + 1053 2 intergenic novelGene_154 novel NA NA NA NA NA NA multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGACTGAGTTCTTGTTGTT NA FALSE NA NA AGTAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.185.1 chr1 - 1072 3 full-splice_match NPPB ENST00000376468.4 708 3 -365 1 -365 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATCTTTTGAAACTGATTTGT 325 FALSE NA NA AAAACA -20 NA NA NA 2 NA PB.188.1 chr1 + 3003 19 full-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 -28 1 -5 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 327 85.318420 1.931043 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG -29 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 327 NA PB.188.2 chr1 + 2948 19 novel_not_in_catalog PLOD1 novel 2976 19 NA NA -5 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG -29 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.188.3 chr1 + 3123 20 novel_in_catalog PLOD1 novel 2976 19 NA NA -5 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGAAGGGAAGATGCTCAGGG -6 TRUE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 5 NA PB.188.4 chr1 + 2828 18 novel_in_catalog PLOD1 novel 2976 19 NA NA 0 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG -1 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.188.5 chr1 + 2828 18 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 13270 -2 -6314 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAGGGAAGATGCTCAGGGC NA FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 7 NA PB.188.6 chr1 + 2712 17 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 15088 1 -4496 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG 1786 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 10 NA PB.188.7 chr1 + 2584 16 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 15661 6 -3923 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAACCACTGAAGGGAAGATG -8 TRUE NA NA ATTAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.188.8 chr1 + 2448 15 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 17904 1 -1680 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.652776 0.562623 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG -11 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 14 NA PB.188.9 chr1 + 2375 15 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 17977 1 -1607 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.435514 0.646944 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG 62 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 17 NA PB.188.10 chr1 + 2235 13 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 22236 -1 2652 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.696427 0.671768 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGAAGGGAAGATGCTCAGGG 2107 FALSE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 18 NA PB.188.11 chr1 + 2072 11 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 23798 -1 4214 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.391864 0.530438 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGAAGGGAAGATGCTCAGGG -3 TRUE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 13 NA PB.188.12 chr1 + 1924 10 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 25942 1 -4029 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.479165 0.738714 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG 2056 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 21 NA PB.188.13 chr1 + 1814 9 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 28815 2 -1156 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.435514 0.646944 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 CACTGAAGGGAAGATGCTCA 4929 FALSE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 17 NA PB.188.14 chr1 + 1676 8 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 29492 1 -479 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.479165 0.738714 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG 5606 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 21 NA PB.188.15 chr1 + 1573 7 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 29940 -1 -31 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.740077 0.758918 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGAAGGGAAGATGCTCAGGG 419 FALSE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 22 NA PB.188.16 chr1 + 1445 6 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 30760 1 775 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG 1239 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 6 NA PB.188.17 chr1 + 1319 5 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 31544 0 1559 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.696427 0.671768 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CTGAAGGGAAGATGCTCAGG 741 FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 18 NA PB.188.18 chr1 + 1157 4 novel_in_catalog PLOD1 novel 2976 19 NA NA 1575 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGAAGGGAAGATGCTCAGGG 757 FALSE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.188.19 chr1 + 1188 4 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 32344 1 2359 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 40 10.436504 1.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG 1541 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 40 NA PB.188.20 chr1 + 1046 3 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 36064 1 -762 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.740077 0.758918 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG 114 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 22 NA PB.189.1 chr1 + 4614 19 full-splice_match MFN2 ENST00000235329.10 4407 19 -208 1 -1 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.652776 0.562623 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTTTGTGAGATCTGTCTTTT 9569 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 14 NA PB.189.2 chr1 + 4427 18 full-splice_match MFN2 ENST00000674817.1 4514 18 92 -5 0 2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTGAGATCTGTCTTTTTGG 9614 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 4 NA PB.189.3 chr1 + 4553 19 full-splice_match MFN2 ENST00000235329.10 4407 19 -145 -1 0 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGTGAGATCTGTCTTTTTG 9632 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.189.4 chr1 + 4540 20 full-splice_match MFN2 ENST00000675817.1 4766 20 226 0 0 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GGAAATCCTTTGTGAGATCT -7 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.189.5 chr1 + 4259 18 full-splice_match MFN2 ENST00000674817.1 4514 18 252 3 -3 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATCCTTTGTGAGATCTGT -1 TRUE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 8 NA PB.189.6 chr1 + 4406 19 full-splice_match MFN2 ENST00000235329.10 4407 19 0 1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 52 13.567455 1.132498 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTTTGTGAGATCTGTCTTTT 2 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 52 NA PB.189.8 chr1 + 4473 20 novel_in_catalog MFN2 novel 4772 20 NA NA 0 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTTGTGAGATCTGTCTTTTT 4 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.189.10 chr1 + 3827 15 incomplete-splice_match MFN2 ENST00000675483.1 4337 16 3984 -9 81 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGTGAGATCTGTCTTTTTG NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.189.11 chr1 + 3692 14 incomplete-splice_match MFN2 ENST00000675483.1 4337 16 5098 -10 1195 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTGAGATCTGTCTTTTTGG NA FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.189.12 chr1 + 3577 13 full-splice_match MFN2 ENST00000675528.1 3700 13 125 -2 125 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATCCTTTGTGAGATCTGT NA FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.189.13 chr1 + 3511 12 incomplete-splice_match MFN2 ENST00000675528.1 3700 13 307 -9 307 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGTGAGATCTGTCTTTTTG NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.189.14 chr1 + 3342 11 full-splice_match MFN2 ENST00000675404.1 4447 11 1110 -5 1110 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTTGTGAGATCTGTCTTTTT -7 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.189.15 chr1 + 3240 10 incomplete-splice_match MFN2 ENST00000675404.1 4447 11 1420 1 1420 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATCCTTTGTGAGATCTGT 303 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 6 NA PB.189.16 chr1 + 3156 9 incomplete-splice_match MFN2 ENST00000675404.1 4447 11 1655 -5 1655 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTTGTGAGATCTGTCTTTTT 538 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 5 NA PB.189.18 chr1 + 2928 7 incomplete-splice_match MFN2 ENST00000675404.1 4447 11 4163 -7 -2255 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTGAGATCTGTCTTTTTGG 3046 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 7 NA PB.189.19 chr1 + 2791 6 incomplete-splice_match MFN2 ENST00000675404.1 4447 11 4509 -5 -1909 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTTGTGAGATCTGTCTTTTT 3392 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.189.20 chr1 + 2677 5 incomplete-splice_match MFN2 ENST00000675404.1 4447 11 5399 2 -1019 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAAATCCTTTGTGAGATCTG 4282 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 11 NA PB.189.21 chr1 + 2498 4 incomplete-splice_match MFN2 ENST00000675404.1 4447 11 6185 1 -233 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATCCTTTGTGAGATCTGT 5068 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 4 NA PB.189.22 chr1 + 2352 3 full-splice_match MFN2 ENST00000676295.1 2622 3 284 -14 284 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGATCTGTCTTTTTGGGTTC 5585 FALSE NA NA AATAAA -23 NA NA NA 2 NA PB.189.23 chr1 + 2249 3 full-splice_match MFN2 ENST00000676295.1 2622 3 383 -10 383 2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTGAGATCTGTCTTTTTGG 5684 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 7 NA PB.189.24 chr1 + 2149 2 full-splice_match MFN2 ENST00000675043.1 2148 2 37 -38 37 1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGTGAGATCTGTCTTTTTG 8125 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 5 NA PB.189.25 chr1 + 2046 2 full-splice_match MFN2 ENST00000675043.1 2148 2 141 -39 141 2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTGAGATCTGTCTTTTTGG 8229 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 7 NA PB.190.1 chr1 + 1548 10 full-splice_match MIIP ENST00000235332.6 1541 10 -11 4 -11 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 221 57.661686 1.760887 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCAAGTCCCACGTGTGCTGG -13 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 221 NA PB.190.2 chr1 + 1345 9 novel_in_catalog MIIP novel 1541 10 NA NA -2 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 32 8.349203 0.921645 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGTCCCACGTGTGCTGGTT -4 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 32 NA PB.190.3 chr1 + 1790 9 novel_in_catalog MIIP novel 1541 10 NA NA 3 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGTCCCACGTGTGCTGGTT 1 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.190.4 chr1 + 1717 10 novel_in_catalog MIIP novel 1541 10 NA NA 3 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGTCCCACGTGTGCTGGTT 1 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.190.5 chr1 + 1669 9 novel_in_catalog MIIP novel 1541 10 NA NA 3 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGTCCCACGTGTGCTGGTT 1 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 5 NA PB.190.6 chr1 + 1406 9 novel_in_catalog MIIP novel 1541 10 NA NA 3 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGTCCCACGTGTGCTGGTT 1 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.190.7 chr1 + 2146 8 novel_in_catalog MIIP novel 1541 10 NA NA 6 1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 20 5.218252 0.717525 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CTCAAGTCCCACGTGTGCTG 4 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 20 NA PB.190.8 chr1 + 2010 9 novel_in_catalog MIIP novel 1541 10 NA NA 6 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 29 7.566465 0.878893 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAGCTCAAGTCCCACGTGTG 4 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 29 NA PB.190.9 chr1 + 1499 9 novel_in_catalog MIIP novel 1541 10 NA NA 25 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGTCCCACGTGTGCTGGTT 23 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.190.10 chr1 + 2397 9 novel_not_in_catalog MIIP novel 1541 10 NA NA 47 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGTCCCACGTGTGCTGGTT 45 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.190.11 chr1 + 1569 10 novel_not_in_catalog MIIP novel 1392 6 NA NA 71 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGTCCCACGTGTGCTGGTT 69 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.190.12 chr1 + 1999 9 novel_not_in_catalog MIIP novel 1392 6 NA NA 124 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGTCCCACGTGTGCTGGTT 122 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.190.13 chr1 + 1762 7 novel_in_catalog MIIP novel 1541 10 NA NA -118 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGTCCCACGTGTGCTGGTT 2604 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.190.14 chr1 + 1194 8 incomplete-splice_match MIIP ENST00000235332.6 1541 10 2686 7 -38 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTCAAGTCCCACGTGTGC 2684 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 6 NA PB.190.15 chr1 + 925 7 incomplete-splice_match MIIP ENST00000235332.6 1541 10 3345 7 -21 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTCAAGTCCCACGTGTGC 3343 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.190.16 chr1 + 731 5 incomplete-splice_match MIIP ENST00000235332.6 1541 10 9737 5 139 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CTCAAGTCCCACGTGTGCTG 9735 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.192.1 chr1 + 2713 9 incomplete-splice_match TNFRSF8 ENST00000263932.7 3760 15 48668 2 -13928 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGGCTGAGGACATGATCAT 1854 FALSE NA NA CATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.193.1 chr1 + 3592 9 full-splice_match TNFRSF1B ENST00000492361.1 3583 9 -16 7 -4 1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACGTCGACCCCTGGCTCTGC -3 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.193.2 chr1 + 3686 10 full-splice_match TNFRSF1B ENST00000376259.7 3687 10 0 1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.652776 0.562623 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACACGTCGACCCCTGGCTCT 1 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 14 NA PB.193.6 chr1 + 2539 2 incomplete-splice_match TNFRSF1B ENST00000492361.1 3583 9 35112 7 10277 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACGTCGACCCCTGGCTCTGC 9164 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.194.1 chr1 + 1592 9 incomplete-splice_match VPS13D ENST00000620676.6 16357 70 -19 254495 -19 -403 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATGTATTTCCATGTCTTTAG -23 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.197.1 chr1 - 792 2 incomplete-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 3740 2 3716 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CACGACCGGTTTGTGTGTGG 3728 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.197.3 chr1 - 2520 4 novel_not_in_catalog KIAA2013 novel 2170 4 NA NA 0 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACGACCGGTTTGTGTGTGGT 12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.197.7 chr1 - 2322 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 496 1 472 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACGACCGGTTTGTGTGTGGT 484 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.197.8 chr1 - 1930 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 888 1 864 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACGACCGGTTTGTGTGTGGT 876 FALSE NA NA GGGGCT -33 NA NA NA 3 NA PB.197.9 chr1 - 1751 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 1067 1 1043 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACGACCGGTTTGTGTGTGGT 1055 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.197.10 chr1 - 1572 2 incomplete-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 2961 1 2937 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACGACCGGTTTGTGTGTGGT 2949 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.197.11 chr1 - 1409 2 incomplete-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 3124 1 3100 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACGACCGGTTTGTGTGTGGT 3112 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.197.12 chr1 - 1326 2 incomplete-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 3207 1 3183 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACGACCGGTTTGTGTGTGGT 3195 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.197.13 chr1 - 1178 2 incomplete-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 3355 1 3331 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACGACCGGTTTGTGTGTGGT 3343 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.197.14 chr1 - 1022 2 incomplete-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 3511 1 3487 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACGACCGGTTTGTGTGTGGT 3499 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.197.15 chr1 - 898 2 incomplete-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 3635 1 3611 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACGACCGGTTTGTGTGTGGT 3623 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.197.19 chr1 - 2156 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 660 3 636 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TCACGACCGGTTTGTGTGTG 648 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.197.20 chr1 - 2045 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 771 3 747 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TCACGACCGGTTTGTGTGTG 759 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.197.21 chr1 - 2157 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 192 470 168 122 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGAAATGGAACTCACTCCTT 180 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.197.22 chr1 - 2231 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 111 477 87 115 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATACTTGAAATGGAACTC 99 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.197.27 chr1 - 1849 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 493 477 469 115 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATACTTGAAATGGAACTC 481 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.197.28 chr1 - 1728 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 614 477 590 115 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATACTTGAAATGGAACTC 602 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.197.29 chr1 - 1548 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 794 477 770 115 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 23 6.000990 0.778223 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATACTTGAAATGGAACTC 782 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 23 NA PB.197.30 chr1 - 1367 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 975 477 951 115 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.435514 0.646944 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATACTTGAAATGGAACTC 963 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.197.31 chr1 - 1113 2 incomplete-splice_match KIAA2013 ENST00000616327.1 2170 4 2920 -115 2920 115 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.696427 0.671768 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATACTTGAAATGGAACTC 2932 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.197.32 chr1 - 978 2 incomplete-splice_match KIAA2013 ENST00000616327.1 2170 4 3055 -115 3055 115 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATACTTGAAATGGAACTC 3067 FALSE NA NA GGGGCT -11 NA NA NA 3 NA PB.197.33 chr1 - 911 2 incomplete-splice_match KIAA2013 ENST00000616327.1 2170 4 3122 -115 3122 115 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATACTTGAAATGGAACTC 3134 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.197.34 chr1 - 767 2 incomplete-splice_match KIAA2013 ENST00000616327.1 2170 4 3266 -115 3266 115 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATACTTGAAATGGAACTC 3278 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.198.1 chr1 + 3656 16 incomplete-splice_match VPS13D ENST00000646411.1 4522 21 17441 -17 6122 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACCTTGTCACATGTAGCTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.198.2 chr1 + 4851 13 incomplete-splice_match VPS13D ENST00000646411.1 4522 21 26771 -1698 126 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAACTTGTTCTTTTGTTTTC NA FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.198.3 chr1 + 3009 11 incomplete-splice_match VPS13D ENST00000646411.1 4522 21 29844 -14 3199 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TACAACCTTGTCACATGTAG 859 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.198.4 chr1 + 2548 8 incomplete-splice_match VPS13D ENST00000646411.1 4522 21 47548 -14 -3355 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TACAACCTTGTCACATGTAG NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.198.5 chr1 + 1289 6 incomplete-splice_match VPS13D ENST00000646411.1 4522 21 60364 980 6877 336 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAACAGGGTCTGTGCTATGT NA FALSE NA NA AATATA -14 NA NA NA 2 NA PB.198.6 chr1 + 2232 6 incomplete-splice_match VPS13D ENST00000646411.1 4522 21 60418 -17 6931 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACCTTGTCACATGTAGCTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.198.10 chr1 + 1920 4 incomplete-splice_match VPS13D ENST00000645371.1 2024 14 77323 -1331 -4621 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACAACCTTGTCACATGTAGC -3 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.198.13 chr1 + 1687 2 incomplete-splice_match VPS13D ENST00000543766.2 3838 4 41935 1687 9649 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TACAACCTTGTCACATGTAG NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.199.1 chr1 - 1567 6 full-splice_match DHRS3 ENST00000616661.5 2201 6 633 1 633 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTCCTTTGTTCAAATCTT 2391 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.199.2 chr1 - 1347 6 full-splice_match DHRS3 ENST00000616661.5 2201 6 853 1 -562 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.652776 0.562623 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTCCTTTGTTCAAATCTT 2611 FALSE NA NA AATACA -6 NA NA NA 14 NA PB.199.3 chr1 - 1237 6 full-splice_match DHRS3 ENST00000616661.5 2201 6 963 1 -452 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.652776 0.562623 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTCCTTTGTTCAAATCTT 2721 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.199.4 chr1 - 1053 5 incomplete-splice_match DHRS3 ENST00000616661.5 2201 6 37634 1 15732 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTCCTTTGTTCAAATCTT 91 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.199.5 chr1 - 924 4 incomplete-splice_match DHRS3 ENST00000616661.5 2201 6 38873 1 16971 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTCCTTTGTTCAAATCTT 1330 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.199.7 chr1 - 1975 6 full-splice_match DHRS3 ENST00000616661.5 2201 6 224 2 224 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GATTTCCTTTGTTCAAATCT 1982 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.199.8 chr1 - 1664 6 full-splice_match DHRS3 ENST00000616661.5 2201 6 535 2 535 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.652776 0.562623 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GATTTCCTTTGTTCAAATCT 10 TRUE NA NA AAGAAA -5 NA NA NA 14 NA PB.199.12 chr1 - 1478 2 intergenic novelGene_161 novel NA NA NA NA NA NA multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAGAAAAAAAGAGAAAGA 4946 FALSE NA NA AAAACA -26 NA NA NA 2 NA PB.200.1 chr1 - 1870 4 full-splice_match PRAMEF27 ENST00000436041.6 1947 4 75 2 75 -2 alternative_5end TRUE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGAATCTGTCTGGTGCCCTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.202.1 chr1 + 759 3 antisense novelGene_LRRC38_AS novel NA NA NA NA NA NA multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAACTCCCGTCTCGTCTCCA NA FALSE NA NA ATTAAA -35 NA NA NA 2 NA PB.203.2 chr1 + 2822 6 full-splice_match PDPN ENST00000621990.5 2737 6 -87 2 -17 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.391864 0.530438 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AACAATGAGTCAGACTTTTG -27 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 13 NA PB.203.3 chr1 + 1246 6 full-splice_match PDPN ENST00000376057.8 2801 6 -17 1572 -17 126 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TACACATTCTGGTCTAGTTT -27 TRUE NA NA AGTAAA -39 NA NA NA 4 NA PB.203.4 chr1 + 1115 6 full-splice_match PDPN ENST00000621990.5 2737 6 -85 1707 -15 3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.957339 0.695249 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTCTCCGTCTGACCATTCT -25 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.203.5 chr1 + 2764 6 full-splice_match PDPN ENST00000376057.8 2801 6 35 2 -35 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AACAATGAGTCAGACTTTTG 25 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 11 NA PB.203.6 chr1 + 1200 6 full-splice_match PDPN ENST00000621990.5 2737 6 -35 1572 -35 126 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 24 6.261902 0.796706 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TACACATTCTGGTCTAGTTT 25 TRUE NA NA AGTAAA -39 NA NA NA 24 NA PB.203.7 chr1 + 1699 6 full-splice_match PDPN ENST00000376057.8 2801 6 70 1032 0 143 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTTTCTGCCTCTGAGGAAA 60 TRUE NA NA AATAAA -23 NA NA NA 4 NA PB.203.8 chr1 + 1160 6 full-splice_match PDPN ENST00000376057.8 2801 6 70 1571 0 127 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.652776 0.562623 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACACATTCTGGTCTAGTTTG 60 TRUE NA NA AGTAAA -40 NA NA NA 14 NA PB.203.9 chr1 + 1030 6 full-splice_match PDPN ENST00000621990.5 2737 6 0 1707 0 3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTCTCCGTCTGACCATTCT 60 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.203.10 chr1 + 930 6 full-splice_match PDPN ENST00000376057.8 2801 6 70 1801 0 -91 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAGACAAAATTCATAGAAA 60 TRUE NA NA TATAAA -11 NA NA NA 4 NA PB.203.11 chr1 + 846 6 full-splice_match PDPN ENST00000376057.8 2801 6 248 1707 -83 3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTCTCCGTCTGACCATTCT 20 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.203.12 chr1 + 839 6 full-splice_match PDPN ENST00000621990.5 2737 6 191 1707 -70 3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTCTCCGTCTGACCATTCT 33 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.203.13 chr1 + 2166 2 incomplete-splice_match PDPN ENST00000621990.5 2737 6 30466 1 28818 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACAATGAGTCAGACTTTTGT NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.204.1 chr1 + 802 7 incomplete-splice_match PRDM2 ENST00000311066.10 7279 10 0 51889 0 2 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCTTGTGATATTGGCTTG -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.204.2 chr1 + 1432 3 incomplete-splice_match PRDM2 ENST00000413440.5 6175 4 -27 8453 -27 994 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAATATAAAGACCACACAG -10 TRUE NA NA TATAAA -36 NA NA NA 3 NA PB.204.3 chr1 + 580 3 incomplete-splice_match PRDM2 ENST00000376048.9 2688 8 49152 1567 -11 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTTTTTGCTTCTTGAGTTGT 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.204.4 chr1 + 4020 3 incomplete-splice_match PRDM2 ENST00000413440.5 6175 4 12 5826 0 3621 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAAAAAGTTTCTCATTC -12 TRUE NA NA AATAAA -43 NA NA NA 5 NA PB.204.5 chr1 + 2104 3 incomplete-splice_match PRDM2 ENST00000376048.9 2688 8 49199 -4 3 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGAGGAACAAGCCTGGGAGT 12 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.204.8 chr1 + 2832 1 full-splice_match ENSG00000289380 ENST00000690275.1 688 1 245 -2389 245 2389 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA NA NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAATGAGC 221 FALSE NA NA AATACA -43 NA NA NA 2 NA PB.204.21 chr1 + 1896 2 incomplete-splice_match PRDM2 ENST00000343137.8 5797 5 32642 22 10331 -22 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAATAAAATATTTAAAAT 1753 FALSE NA NA TATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.204.23 chr1 + 1230 2 incomplete-splice_match PRDM2 ENST00000343137.8 5797 5 33308 22 10997 -22 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAATAAAATATTTAAAAT 264 FALSE NA NA TATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.226.1 chr1 - 1964 2 full-splice_match LRRC38 ENST00000376085.4 2168 2 207 -3 207 3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATCTCTGGTATTCTGTTAT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.226.2 chr1 - 2203 3 novel_not_in_catalog LRRC38 novel 2168 2 NA NA 27 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTCAATCTCTGGTATTCTG -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.226.4 chr1 - 2159 2 full-splice_match LRRC38 ENST00000376085.4 2168 2 7 2 7 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.652776 0.562623 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CACTCAATCTCTGGTATTCT 11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.226.5 chr1 - 1848 2 full-splice_match LRRC38 ENST00000376085.4 2168 2 314 6 314 -6 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGCCACTCAATCTCTGGTA -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.226.6 chr1 - 1145 2 full-splice_match LRRC38 ENST00000376085.4 2168 2 702 321 702 -321 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATGTTTATGTTCCCCCAGA 3452 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.245.1 chr1 + 1334 5 incomplete-splice_match KAZN ENST00000400797.3 1295 8 98207 -760 98207 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 ATGAAAAAAAAGAAAAAAAG NA FALSE NA NA TTTAAA -42 NA NA NA 2 NA PB.249.1 chr1 + 1948 4 full-splice_match TMEM51 ENST00000376014.7 1843 4 -69 -36 -35 -18 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 CAAAAAAAAAAAAAAAAAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.249.2 chr1 + 1992 4 full-splice_match TMEM51 ENST00000376014.7 1843 4 -14 -135 -14 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTACATTTGGGTGCTGAGT 10 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.249.3 chr1 + 1758 3 full-splice_match TMEM51 ENST00000428417.5 1942 3 82 102 37 -18 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 CAAAAAAAAAAAAAAAAAGA -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.249.4 chr1 + 1905 3 full-splice_match TMEM51 ENST00000400796.7 1842 3 5 -68 5 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.174602 0.620615 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TACATTTGGGTGCTGAGTTA -3 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 16 NA PB.249.5 chr1 + 1864 4 full-splice_match TMEM51 ENST00000376008.3 1971 4 5 102 5 -17 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAGAA 11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.249.6 chr1 + 1963 4 full-splice_match TMEM51 ENST00000376008.3 1971 4 7 1 7 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.391864 0.530438 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACATTTGGGTGCTGAGTTAC 13 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 13 NA PB.249.9 chr1 + 1359 2 incomplete-splice_match TMEM51 ENST00000376008.3 1971 4 61477 2 61456 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TACATTTGGGTGCTGAGTTA NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 4 NA PB.249.10 chr1 + 1256 2 incomplete-splice_match TMEM51 ENST00000376008.3 1971 4 61581 1 61560 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACATTTGGGTGCTGAGTTAC NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 5 NA PB.249.11 chr1 + 1077 2 incomplete-splice_match TMEM51 ENST00000400796.7 1842 3 61673 32 61638 -17 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAGAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.252.1 chr1 + 2406 4 full-splice_match EFHD2 ENST00000375980.9 2422 4 7 9 7 -9 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.130951 0.495676 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATATTCTTATGTGTGTATGG -21 TRUE NA NA GATAAA -6 NA NA NA 12 NA PB.252.3 chr1 + 914 4 full-splice_match EFHD2 ENST00000375980.9 2422 4 7 1501 7 -243 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.130951 0.495676 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAATATCTGTGAATGGAG -21 TRUE NA NA ACTAAA -6 NA NA NA 12 NA PB.252.4 chr1 + 1338 2 novel_not_in_catalog EFHD2 novel 2422 4 NA NA 18 -10 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATATTCTTATGTGTGTATG -10 TRUE NA NA GATAAA -5 NA NA NA 2 NA PB.252.6 chr1 + 2201 4 full-splice_match EFHD2 ENST00000375980.9 2422 4 212 9 -165 -9 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATATTCTTATGTGTGTATGG 184 FALSE NA NA GATAAA -6 NA NA NA 6 NA PB.252.7 chr1 + 2020 3 incomplete-splice_match EFHD2 ENST00000375980.9 2422 4 15992 1 15615 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGTGTGTATGGTTCTTGAT -7 TRUE NA NA GATAAA -14 NA NA NA 9 NA PB.252.8 chr1 + 1793 3 incomplete-splice_match EFHD2 ENST00000375980.9 2422 4 16088 132 15711 -132 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GCTTTTTGCTTCTTTTTTCC 89 FALSE NA NA TATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.252.9 chr1 + 1910 3 incomplete-splice_match EFHD2 ENST00000375980.9 2422 4 16094 9 15717 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATATTCTTATGTGTGTATGG 95 FALSE NA NA GATAAA -6 NA NA NA 10 NA PB.253.1 chr1 - 2360 5 full-splice_match CASP9 ENST00000348549.9 1621 5 126 -865 -4 -4 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGATGTGATTTGCATAGTT 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.253.2 chr1 - 1964 9 full-splice_match CASP9 ENST00000333868.10 2808 9 -8 852 -6 17 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 40 10.436504 1.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CTCATTTTGCTCCAACTCTT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 40 NA PB.253.3 chr1 - 1481 7 incomplete-splice_match CASP9 ENST00000474305.2 1111 9 16312 -667 -836 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTCTCTTTTGCCTATTTCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.253.4 chr1 - 1462 5 full-splice_match CASP9 ENST00000348549.9 1621 5 153 6 -2 -6 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTCTCTTTTGCCTATTTCT 31 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.253.5 chr1 - 1366 6 incomplete-splice_match CASP9 ENST00000400777.7 1878 9 17208 -82 68 -14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATGGACTCTCTTTTGC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.253.6 chr1 - 1156 4 incomplete-splice_match CASP9 ENST00000400777.7 1878 9 19468 -82 2328 -14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATGGACTCTCTTTTGC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.253.7 chr1 - 1554 7 novel_not_in_catalog CASP9 novel 781 5 NA NA -6 4507 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGCTCTTGTTAGATGCCT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.254.2 chr1 + 2666 15 full-splice_match DNAJC16 ENST00000375847.8 6034 15 6 3362 6 310 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGATGAAAATCTTTTCCTCT -21 TRUE NA NA AATGAA -25 NA NA NA 3 NA PB.254.4 chr1 + 3513 15 full-splice_match DNAJC16 ENST00000375847.8 6034 15 15 2506 15 -1054 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TTACCCTAAAAGTGCTGTCT -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.254.5 chr1 + 5295 15 full-splice_match DNAJC16 ENST00000375847.8 6034 15 19 720 19 -718 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAAAAAAAAAATTTGT -8 TRUE NA NA AATACA -12 NA NA NA 2 NA PB.255.1 chr1 + 1801 1 full-splice_match CHCHD2P6 ENST00000454346.1 447 1 -878 -476 -878 476 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATTTGGAGAGTCTGCCGTT -3 TRUE NA NA AATAAA -26 NA NA NA 2 NA PB.255.2 chr1 + 1594 1 full-splice_match CHCHD2P6 ENST00000454346.1 447 1 -878 -269 -878 269 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAGAAAAAAAAAATAG -3 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.256.2 chr1 + 3668 10 full-splice_match DDI2 ENST00000480945.6 10667 10 -17 7016 -17 971 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAGCATACTGTTTTAGAATG -13 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 6 NA PB.256.4 chr1 + 1490 1 full-splice_match RSC1A1 ENST00000345034.2 2321 1 832 -1 832 1 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGTTTTAGAATGAGAGTA 700 FALSE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 2 NA PB.256.5 chr1 + 1350 1 full-splice_match RSC1A1 ENST00000345034.2 2321 1 967 4 967 -4 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGCATACTGTTTTAGAATGA 835 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.256.6 chr1 + 937 1 full-splice_match RSC1A1 ENST00000345034.2 2321 1 1380 4 1380 -4 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGCATACTGTTTTAGAATGA 1248 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.257.1 chr1 + 3455 16 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000375799.8 4134 20 34279 2 -11246 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 697 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.257.2 chr1 + 3282 14 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000375793.2 4004 19 35430 2 -10025 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 1918 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.257.3 chr1 + 2840 12 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000642363.1 3775 21 42570 2 -2719 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 56 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.257.4 chr1 + 2674 12 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000642363.1 3775 21 42736 2 -2553 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 222 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.257.5 chr1 + 2383 12 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000642363.1 3775 21 43027 2 -2262 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 513 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 5 NA PB.257.7 chr1 + 2084 11 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000642363.1 3775 21 43572 2 -1717 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 1058 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 7 NA PB.257.8 chr1 + 1899 8 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000642363.1 3775 21 44554 2 -735 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 2040 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 7 NA PB.257.9 chr1 + 1724 7 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000642363.1 3775 21 45335 2 46 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 2821 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 6 NA PB.257.10 chr1 + 1580 6 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000642363.1 3775 21 46081 2 792 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 3567 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.257.11 chr1 + 1489 5 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000642363.1 3775 21 46641 2 1352 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.130951 0.495676 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 4127 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 12 NA PB.257.12 chr1 + 1303 4 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000477849.1 1057 7 2169 -652 2169 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.391864 0.530438 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 4944 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 13 NA PB.257.13 chr1 + 1072 2 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000477849.1 1057 7 2783 -652 2783 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 5558 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 8 NA PB.258.2 chr1 - 1526 7 full-splice_match AGMAT ENST00000375826.4 3095 7 -27 1596 -27 -1596 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATATTTCTATATCTTCCTTT -29 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.258.5 chr1 - 1388 7 full-splice_match AGMAT ENST00000375826.4 3095 7 -24 1731 -24 -1731 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACTGCTTTGATTTTTTTTC -26 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.258.6 chr1 - 1265 7 full-splice_match AGMAT ENST00000375826.4 3095 7 -27 1857 -27 -1857 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGAAAACTTTCTGCTGAAA -29 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.258.7 chr1 - 1210 7 full-splice_match AGMAT ENST00000375826.4 3095 7 28 1857 28 -1857 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.740077 0.758918 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGAAAACTTTCTGCTGAAA 26 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 22 NA PB.259.2 chr1 + 2117 9 full-splice_match FBLIM1 ENST00000375766.8 3314 9 -34 1231 -23 29 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.913689 0.592586 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTGGTGGCTCATGCCTGT 7 FALSE NA NA AAAAAG -16 NA NA NA 15 NA PB.259.3 chr1 + 3340 9 novel_in_catalog FBLIM1 novel 3314 9 NA NA -20 -8 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAAGCTCTTCCATGTTGTG 10 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 4 NA PB.259.5 chr1 + 1944 9 novel_in_catalog FBLIM1 novel 3314 9 NA NA -13 1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAAAAAAAAAGTGCCTTT -23 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.259.7 chr1 + 1982 8 incomplete-splice_match FBLIM1 ENST00000375766.8 3314 9 5720 1259 16 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAAAAAAAAAGTGCCTTT 90 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.260.1 chr1 - 944 2 novel_not_in_catalog FLJ37453 novel 2473 2 NA NA 13198 15374 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGAACTGTCTGTGTTGTTTT 909 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.261.1 chr1 + 4015 11 novel_in_catalog SPEN novel 12385 15 NA NA -38 40 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAATGAAAAGACAGATA 101 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.261.2 chr1 + 2727 11 incomplete-splice_match SPEN ENST00000375759.8 12385 15 -9 11859 -9 40 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAATGAAAAGACAGATA 130 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.261.3 chr1 + 3870 11 novel_in_catalog SPEN novel 12385 15 NA NA 107 40 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAATGAAAAGACAGATA -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.261.7 chr1 + 1489 5 incomplete-splice_match SPEN ENST00000375759.8 12385 15 115 29155 115 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 GTAAGACACAAGCAAGCTGA -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.261.8 chr1 + 4727 11 incomplete-splice_match SPEN ENST00000375759.8 12385 15 116 9734 116 2165 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 ATGAAAAAGAAGAAAATTAG -5 TRUE NA NA GATAAA -43 NA NA NA 6 NA PB.261.9 chr1 + 2600 11 incomplete-splice_match SPEN ENST00000375759.8 12385 15 118 11859 118 40 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 36 9.392854 0.972798 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAATGAAAAGACAGATA -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 36 NA PB.261.10 chr1 + 2119 10 novel_in_catalog SPEN novel 12385 15 NA NA 122 40 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAATGAAAAGACAGATA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.261.11 chr1 + 2519 11 incomplete-splice_match SPEN ENST00000375759.8 12385 15 199 11859 199 40 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAATGAAAAGACAGATA 78 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.261.12 chr1 + 3650 11 novel_in_catalog SPEN novel 12385 15 NA NA 327 40 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAATGAAAAGACAGATA 206 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.261.13 chr1 + 2042 10 incomplete-splice_match SPEN ENST00000673875.1 3123 12 36953 -40 -454 40 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAATGAAAAGACAGATA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.261.14 chr1 + 1910 9 incomplete-splice_match SPEN ENST00000673875.1 3123 12 40150 -40 -331 40 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAATGAAAAGACAGATA 2077 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.261.15 chr1 + 1792 9 incomplete-splice_match SPEN ENST00000673875.1 3123 12 40268 -40 -213 40 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAATGAAAAGACAGATA 2195 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.261.17 chr1 + 1558 9 incomplete-splice_match SPEN ENST00000673875.1 3123 12 40502 -40 21 40 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAATGAAAAGACAGATA 2429 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.261.19 chr1 + 1116 6 incomplete-splice_match SPEN ENST00000673875.1 3123 12 80031 -40 -22457 40 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAATGAAAAGACAGATA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.261.20 chr1 + 963 5 incomplete-splice_match SPEN ENST00000673875.1 3123 12 82830 -40 -19658 40 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAATGAAAAGACAGATA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.262.1 chr1 - 2511 6 incomplete-splice_match ZBTB17 ENST00000537142.5 2511 15 32363 -1459 210 1457 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACAAAACTGCGCTGAGA 9187 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.262.2 chr1 - 2706 16 full-splice_match ZBTB17 ENST00000375743.9 2720 16 12 2 -10 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.696427 0.671768 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCTGCCTATAGGTCCCT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.262.3 chr1 - 2136 13 incomplete-splice_match ZBTB17 ENST00000375743.9 2720 16 29147 2 151 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCTGCCTATAGGTCCCT 5949 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.262.4 chr1 - 3895 15 novel_in_catalog ZBTB17 novel 2720 16 NA NA -8 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAATGCTGCCTATAGGTCCC 7 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.262.5 chr1 - 2738 16 full-splice_match ZBTB17 ENST00000375733.6 2770 16 31 1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAATGCTGCCTATAGGTCCC -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.262.6 chr1 - 2323 14 incomplete-splice_match ZBTB17 ENST00000375743.9 2720 16 27792 3 -1017 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAATGCTGCCTATAGGTCCC 4594 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.262.7 chr1 - 1726 10 incomplete-splice_match ZBTB17 ENST00000537142.5 2511 15 30999 1 -652 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAATGCTGCCTATAGGTCCC 7823 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.262.8 chr1 - 1575 9 incomplete-splice_match ZBTB17 ENST00000537142.5 2511 15 31247 1 -404 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAATGCTGCCTATAGGTCCC 8071 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.262.9 chr1 - 1282 8 incomplete-splice_match ZBTB17 ENST00000537142.5 2511 15 31636 1 -15 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAATGCTGCCTATAGGTCCC 8460 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.262.10 chr1 - 1049 6 incomplete-splice_match ZBTB17 ENST00000537142.5 2511 15 32365 1 212 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAATGCTGCCTATAGGTCCC 9189 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.263.1 chr1 - 2126 3 full-splice_match HSPB7 ENST00000411503.5 2128 3 0 2 0 -1 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTCTGGAGGCCGCCTGCC 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.263.3 chr1 - 2139 3 full-splice_match HSPB7 ENST00000311890.14 2144 3 2 3 0 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.435514 0.646944 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGACTTCTGGAGGCCGCCTG 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.263.4 chr1 - 1256 3 full-splice_match HSPB7 ENST00000311890.14 2144 3 2 886 0 459 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACTGCATGAAACTCCTGC 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.264.1 chr1 - 1697 7 full-splice_match FAM131C ENST00000375662.5 1720 7 22 1 3 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGACCTTGGCCTGGTCTCT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.265.2 chr1 + 919 2 full-splice_match SRARP ENST00000329454.2 3039 2 0 2120 0 -2120 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACAGCGATGAATGCTCTGC 0 TRUE NA NA AATAAA -35 NA NA NA 8 NA PB.266.1 chr1 - 3926 17 novel_not_in_catalog EPHA2 novel 3946 17 NA NA 2737 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCTTGGCTTTCAGTCTTGG 2755 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.266.2 chr1 - 2191 10 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 21537 1 -970 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCTTGGCTTTCAGTCTTGG NA FALSE NA NA AAGAAA -3 NA NA NA 3 NA PB.266.3 chr1 - 3490 15 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 7186 2 -2433 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GATCTTGGCTTTCAGTCTTG 7187 FALSE NA NA AGTAAA -31 NA NA NA 2 NA PB.266.4 chr1 - 2599 13 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 18113 2 -4394 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GATCTTGGCTTTCAGTCTTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.266.5 chr1 - 2023 8 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 22509 2 2 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GATCTTGGCTTTCAGTCTTG NA FALSE NA NA GGGGCT -14 NA NA NA 4 NA PB.266.7 chr1 - 3940 17 full-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 0 6 0 -6 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCGATCTTGGCTTTCAGT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.266.8 chr1 - 3166 15 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 7505 7 -2114 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACCGATCTTGGCTTTCAG 7506 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.266.9 chr1 - 2405 12 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 20384 7 -2123 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACCGATCTTGGCTTTCAG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.266.10 chr1 - 2267 11 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 20987 7 -1520 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACCGATCTTGGCTTTCAG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.266.11 chr1 - 1865 7 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 22774 7 267 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACCGATCTTGGCTTTCAG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.266.12 chr1 - 1545 5 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 23938 7 1431 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACCGATCTTGGCTTTCAG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.266.13 chr1 - 1055 2 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 26558 7 4051 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACCGATCTTGGCTTTCAG 880 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.266.16 chr1 - 1732 6 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 23646 8 1139 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAAACCGATCTTGGCTTTCA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.266.17 chr1 - 1261 3 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 25715 8 3208 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAAACCGATCTTGGCTTTCA 37 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.267.1 chr1 - 883 4 incomplete-splice_match ARHGEF19 ENST00000478117.5 2035 11 4541 248 4056 -248 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTGGAGTCTGTGATCCATCT 7766 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.267.2 chr1 - 1841 11 incomplete-splice_match ARHGEF19 ENST00000270747.8 3322 16 5620 249 -21 -249 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CTTGGAGTCTGTGATCCATC 5607 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.267.3 chr1 - 1947 10 incomplete-splice_match ARHGEF19 ENST00000270747.8 3322 16 6120 250 -6 -250 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GCTTGGAGTCTGTGATCCAT 6107 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.267.4 chr1 - 1226 6 incomplete-splice_match ARHGEF19 ENST00000270747.8 3322 16 7486 250 1360 -250 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GCTTGGAGTCTGTGATCCAT 7473 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.268.1 chr1 - 996 2 full-splice_match ANO7L1 ENST00000475369.2 998 2 1 1 1 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTGCCACCTCTCCACGGCC 9510 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.269.1 chr1 - 1462 4 full-splice_match CPLANE2 ENST00000434014.1 336 4 -539 -587 -15 -2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACTCCAGAGACGTGTTCGT -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.269.2 chr1 - 1551 5 full-splice_match CPLANE2 ENST00000375599.8 1574 5 14 9 14 -9 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGTGCTGAACTCCAGAGACG 11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.272.4 chr1 - 2566 11 novel_not_in_catalog FBXO42 novel 6227 10 NA NA 14 429 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TCCTTTTCTGTGGCTTTTAA -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.272.5 chr1 - 2506 11 novel_not_in_catalog FBXO42 novel 6227 10 NA NA 38 427 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TTTCCTTTTCTGTGGCTTTT 14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.272.6 chr1 - 1337 4 incomplete-splice_match FBXO42 ENST00000375592.8 6227 10 98806 3823 -81 419 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAAACCCCTTTCCTTTTCTG 3075 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.272.7 chr1 - 2370 10 full-splice_match FBXO42 ENST00000375592.8 6227 10 41 3816 41 426 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 23 6.000990 0.778223 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTTCCTTTTCTGTGGCTTT 17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 23 NA PB.272.9 chr1 - 2579 12 novel_not_in_catalog FBXO42 novel 6227 10 NA NA 35 420 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAACCCCTTTCCTTTTCTGT 11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.272.10 chr1 - 1419 5 incomplete-splice_match FBXO42 ENST00000375592.8 6227 10 96745 3823 -2142 419 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAAACCCCTTTCCTTTTCTG 1014 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.273.1 chr1 + 1034 5 full-splice_match SZRD1 ENST00000475554.5 583 5 -31 -420 -13 186 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAATATCCTTTCTTTTTTT 45 FALSE NA NA AAAAAG -14 NA NA NA 2 NA PB.273.2 chr1 + 1673 3 full-splice_match SZRD1 ENST00000401089.3 3447 3 -11 1785 -11 954 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 203 52.965260 1.723991 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAAGAACAGCTTTGCTTT 47 FALSE NA NA AATAAA -6 NA NA NA 203 NA PB.273.3 chr1 + 935 4 full-splice_match SZRD1 ENST00000401088.9 3480 4 -8 2553 -1 186 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 28 7.305553 0.863653 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAATATCCTTTCTTTTTTT -5 TRUE NA NA AAAAAG -14 NA NA NA 28 NA PB.273.4 chr1 + 3502 4 full-splice_match SZRD1 ENST00000471507.5 892 4 130 -2740 -7 1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 96 25.047609 1.398766 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATCTTTGTCCTCATTTCAGT 51 FALSE NA NA TATAAA -34 NA NA NA 96 NA PB.273.5 chr1 + 3438 3 full-splice_match SZRD1 ENST00000401089.3 3447 3 8 1 -2 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 262 68.359100 1.834796 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGATCTTTGTCCTCATTTCA -6 TRUE NA NA TATAAA -32 NA NA NA 262 NA PB.273.8 chr1 + 3558 5 full-splice_match SZRD1 ENST00000472351.5 791 5 -13 -2754 -1 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGATCTTTGTCCTCATTTCA -5 TRUE NA NA TATAAA -32 NA NA NA 2 NA PB.273.9 chr1 + 3461 3 novel_not_in_catalog SZRD1 novel 3447 3 NA NA -1 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GTCAGATCTTTGTCCTCATT -5 TRUE NA NA TATAAA -29 NA NA NA 2 NA PB.273.10 chr1 + 963 3 full-splice_match SZRD1 ENST00000401089.3 3447 3 16 2468 -1 271 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 66 17.220232 1.236039 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TTTAGTGGTTTAATGAATTT 2 TRUE NA NA AAAAAG -15 NA NA NA 66 NA PB.273.11 chr1 + 1700 4 full-splice_match SZRD1 ENST00000401088.9 3480 4 -5 1785 2 954 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 57 14.872019 1.172370 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAAGAACAGCTTTGCTTT -2 TRUE NA NA AATAAA -6 NA NA NA 57 NA PB.273.14 chr1 + 3270 2 incomplete-splice_match SZRD1 ENST00000492354.1 3401 3 26055 -2 25609 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGATCTTTGTCCTCATTTCA NA FALSE NA NA TATAAA -32 NA NA NA 3 NA PB.273.15 chr1 + 1477 2 incomplete-splice_match SZRD1 ENST00000472461.1 843 4 25618 -1087 25618 954 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAAGAACAGCTTTGCTTT NA FALSE NA NA AATAAA -6 NA NA NA 8 NA PB.276.1 chr1 + 1045 8 full-splice_match NECAP2 ENST00000337132.10 2018 8 -38 1011 -35 -6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACACTGTTTCCTGGGATTCA 3 TRUE NA NA AGTAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.276.3 chr1 + 606 2 full-splice_match NECAP2 ENST00000486390.1 572 2 -36 2 -21 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCTGGCCTATGGCTATTT 17 FALSE NA NA ATTAAA -27 NA NA NA 3 NA PB.276.4 chr1 + 2028 8 full-splice_match NECAP2 ENST00000337132.10 2018 8 -11 1 -8 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 234 61.053551 1.785711 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATTGTATGTGAAAGATGAAT -16 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 234 NA PB.276.5 chr1 + 1950 8 full-splice_match NECAP2 ENST00000457722.6 935 8 -11 -1004 -8 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATTGTATGTGAAAGATGAAT -16 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.276.6 chr1 + 3057 8 novel_in_catalog NECAP2 novel 2018 8 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATTGTATGTGAAAGATGAAT -5 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.276.7 chr1 + 2134 9 full-splice_match NECAP2 ENST00000459640.5 981 9 -32 -1121 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATTGTATGTGAAAGATGAAT -5 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.276.8 chr1 + 2150 9 novel_not_in_catalog NECAP2 novel 1787 9 NA NA 4 3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TATGTGAAAGATGAATGTGT -1 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.276.9 chr1 + 1922 7 full-splice_match NECAP2 ENST00000443980.6 1929 7 7 0 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATTGTATGTGAAAGATGAAT 14 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 9 NA PB.276.11 chr1 + 1134 8 full-splice_match NECAP2 ENST00000337132.10 2018 8 21 863 2 142 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGAAGAGGTTGAGTTTG 16 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 11 NA PB.276.12 chr1 + 1887 7 incomplete-splice_match NECAP2 ENST00000492095.5 1787 9 2889 0 2860 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATTGTATGTGAAAGATGAAT 2903 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 5 NA PB.276.13 chr1 + 1682 5 incomplete-splice_match NECAP2 ENST00000492095.5 1787 9 7316 0 7287 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATTGTATGTGAAAGATGAAT 7330 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 7 NA PB.276.14 chr1 + 1547 4 incomplete-splice_match NECAP2 ENST00000492095.5 1787 9 8402 0 -6376 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATTGTATGTGAAAGATGAAT 8416 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 5 NA PB.278.3 chr1 - 4489 28 novel_not_in_catalog NBPF1 novel 5932 29 NA NA -2 -16 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAGAAAAGAAGGAGAAGGGG -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.278.5 chr1 - 3201 2 incomplete-splice_match NBPF1 ENST00000392963.5 2672 19 10609 26170 8724 2539 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAACAAACAAACAAAAA NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.278.7 chr1 - 742 5 novel_in_catalog NBPF1 novel 488 4 NA NA 12 -88 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACACAGAATGTCAGGTCTCC 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.278.16 chr1 - 4216 3 novel_not_in_catalog NBPF1 novel 2752 3 NA NA 10 7 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAATACATGTTGTGCTTAGA 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.278.17 chr1 - 2727 3 full-splice_match NBPF1 ENST00000599069.5 2752 3 10 15 10 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TAACATCTAAATACATGTTG 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.278.18 chr1 - 4013 3 novel_not_in_catalog NBPF1 novel 2752 3 NA NA 0 -206 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 GAAAAGAAAGAATTGAAGCT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.278.19 chr1 - 2570 3 novel_not_in_catalog NBPF1 novel 2752 3 NA NA -10 -1659 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTCTGCTTCTGTCTGTTA -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.278.21 chr1 - 2761 3 full-splice_match NBPF1 ENST00000449853.2 2755 3 -21 15 7 -15 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AACATTCTTGTATAAGTCAT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.278.23 chr1 - 2170 3 full-splice_match NBPF1 ENST00000449853.2 2755 3 -18 603 10 -603 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GCAGGATTTTGAGTGAACTT 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.279.2 chr1 - 1076 3 incomplete-splice_match CROCCP2 ENST00000640476.1 1750 6 2842 2 576 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTATGTCAGTGTTCTCCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.279.5 chr1 - 1323 4 full-splice_match CROCCP2 ENST00000639481.1 1296 4 -33 6 -33 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACTATGTCAGTGTTCTCC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.279.7 chr1 - 974 2 incomplete-splice_match CROCCP2 ENST00000639481.1 1296 4 6413 6 6413 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACTATGTCAGTGTTCTCC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.279.8 chr1 - 1402 5 novel_not_in_catalog CROCCP2 novel 2773 18 NA NA -779 7 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAGTGTAACTATGTCAGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.281.1 chr1 + 1111 1 full-splice_match ENSG00000261135 ENST00000562878.1 1110 1 -2 1 -2 -1 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA NA NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATCTGCTGACTCATCTTTGA NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 5 NA PB.283.1 chr1 + 3021 11 novel_not_in_catalog MST1P2 novel 2291 18 NA NA -50 57 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACCAAGGACTTTCTTAAATG 814 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.283.2 chr1 + 2808 12 novel_not_in_catalog MST1P2 novel 2291 18 NA NA -35 57 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACCAAGGACTTTCTTAAATG 829 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.283.3 chr1 + 2757 13 novel_in_catalog MST1P2 novel 2291 18 NA NA -35 129 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAGTGCAGTTTGTTTTCATG 829 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.283.4 chr1 + 2561 13 novel_not_in_catalog MST1P2 novel 2291 18 NA NA -20 135 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTTTGTTTTCATGGTCTTA -1 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.283.5 chr1 + 2676 13 novel_not_in_catalog MST1P2 novel 2291 18 NA NA -1 56 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 CACCAAGGACTTTCTTAAAT 18 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.283.6 chr1 + 2001 7 novel_not_in_catalog MST1P2 novel 2291 18 NA NA 2016 135 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTTTGTTTTCATGGTCTTA 2035 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.283.7 chr1 + 1608 8 novel_in_catalog MST1P2 novel 2291 18 NA NA 2338 57 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACCAAGGACTTTCTTAAATG 264 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.287.1 chr1 - 1018 1 full-splice_match ENSG00000238142 ENST00000666544.1 1048 1 27 3 27 2 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACTTACGTTGGTTTTATC 105 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.287.2 chr1 - 1104 1 full-splice_match ENSG00000238142 ENST00000685908.1 1097 1 -16 9 -5 -4 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATCTTTAAACTTACGTTGGT 13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.290.1 chr1 + 2412 11 incomplete-splice_match CROCC ENST00000375541.10 6660 37 38950 5 -5147 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAAGTTTGTACAGCTGTG 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.290.3 chr1 + 911 3 incomplete-splice_match CROCC ENST00000375541.10 6660 37 48708 6 854 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAAAGTTTGTACAGCTGT 9761 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.291.1 chr1 - 1096 7 novel_in_catalog MFAP2 novel 1045 9 NA NA -30 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAGATCAAGTCACTTTTTC 946 FALSE NA NA GGGGCT -34 NA NA NA 2 NA PB.291.2 chr1 - 1917 7 novel_in_catalog MFAP2 novel 1045 9 NA NA -3 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGATCAAGTCACTTTTT 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.291.3 chr1 - 1811 8 novel_in_catalog MFAP2 novel 1045 9 NA NA 0 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGATCAAGTCACTTTTT 14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.291.4 chr1 - 1173 8 novel_in_catalog MFAP2 novel 1045 9 NA NA -18 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGATCAAGTCACTTTTT -16 TRUE NA NA GGGGCT -22 NA NA NA 9 NA PB.291.5 chr1 - 1099 9 novel_not_in_catalog MFAP2 novel 1045 9 NA NA -973 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.435514 0.646944 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGATCAAGTCACTTTTT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.291.7 chr1 - 1077 9 full-splice_match MFAP2 ENST00000375535.4 1045 9 -36 4 -24 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 553 144.284668 2.159220 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGATCAAGTCACTTTTT -22 TRUE NA NA GGGGCT -28 NA NA NA 553 NA PB.291.8 chr1 - 992 9 novel_not_in_catalog MFAP2 novel 1045 9 NA NA 0 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGATCAAGTCACTTTTT 14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.291.9 chr1 - 954 8 novel_in_catalog MFAP2 novel 1045 9 NA NA 0 -4 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGATCAAGTCACTTTTT 14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.291.10 chr1 - 975 8 novel_in_catalog MFAP2 novel 1045 9 NA NA -12 -4 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGATCAAGTCACTTTTT -10 TRUE NA NA GGGGCT -16 NA NA NA 6 NA PB.291.11 chr1 - 869 7 incomplete-splice_match MFAP2 ENST00000375534.7 970 8 1138 4 1138 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGATCAAGTCACTTTTT 4470 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.291.12 chr1 - 1010 9 novel_not_in_catalog MFAP2 novel 1045 9 NA NA -6 -6 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 ACAAAAGATCAAGTCACTTT -4 TRUE NA NA GGGGCT -10 NA NA NA 2 NA PB.292.1 chr1 - 4032 29 full-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 -36 0 -36 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA 9 FALSE NA NA GGGGCT -14 NA NA NA 4 NA PB.292.2 chr1 - 3193 23 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 9611 0 -1470 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA 9656 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.292.3 chr1 - 3029 21 novel_not_in_catalog ATP13A2 novel 3996 29 NA NA -165 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.292.4 chr1 - 2492 16 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 15636 0 -9 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.292.5 chr1 - 2237 14 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 18120 0 -1950 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.292.6 chr1 - 1984 13 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 19420 0 -650 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.292.7 chr1 - 1839 12 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 19648 0 -422 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.292.8 chr1 - 1630 10 novel_in_catalog ATP13A2 novel 3996 29 NA NA -270 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.292.9 chr1 - 1607 10 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 20143 0 73 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.292.10 chr1 - 1338 8 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 21981 0 56 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.292.11 chr1 - 1213 7 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 22222 0 297 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.292.12 chr1 - 1047 5 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 23691 0 1766 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.292.13 chr1 - 944 4 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 24662 0 2737 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.292.14 chr1 - 835 4 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 24771 0 2846 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.292.15 chr1 - 3980 29 full-splice_match ATP13A2 ENST00000452699.5 3981 29 0 1 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTCTGCTGTGCCTGTCTTGT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.292.16 chr1 - 2295 15 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 15921 1 276 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTCTGCTGTGCCTGTCTTGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.292.17 chr1 - 3869 29 full-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 125 2 112 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GCTCTGCTGTGCCTGTCTTG 170 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.292.18 chr1 - 2238 15 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000452699.5 3981 29 -32 9529 -32 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAATTACT 13 FALSE NA NA GGGGCT -10 NA NA NA 2 NA PB.293.2 chr1 - 1081 8 full-splice_match SDHB ENST00000375499.8 1015 8 -79 13 -79 -13 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 1185 309.181427 2.490213 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAGAACCTG 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 1185 NA PB.293.3 chr1 - 840 7 incomplete-splice_match SDHB ENST00000375499.8 1015 8 9221 13 66 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAGAACCTG 9331 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.293.4 chr1 - 746 6 incomplete-splice_match SDHB ENST00000375499.8 1015 8 20930 13 -9942 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAGAACCTG NA FALSE NA NA ATTAAA -32 NA NA NA 10 NA PB.293.5 chr1 - 935 8 novel_in_catalog SDHB novel 1015 8 NA NA -14 -10 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAGAAATAAATGTTATTCTA 96 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.293.6 chr1 - 876 7 incomplete-splice_match SDHB ENST00000375499.8 1015 8 9158 40 3 -10 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAGAAATAAATGTTATTCTA 9268 FALSE NA NA AAAAAG -10 NA NA NA 9 NA PB.293.7 chr1 - 972 8 full-splice_match SDHB ENST00000375499.8 1015 8 -9 52 -9 -22 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 84 21.916658 1.340774 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATAAAAATTTTAAGAAATA -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 84 NA PB.294.1 chr1 - 2882 5 novel_not_in_catalog PADI2 novel 4361 16 NA NA -230 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATATGGCTGTTGGTGTGATG NA FALSE NA NA AATATA -2 NA NA NA 2 NA PB.294.2 chr1 - 1807 5 novel_not_in_catalog PADI2 novel 4361 16 NA NA -227 -48 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATTTTGAAGAACCGATTTAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.296.1 chr1 + 2106 9 incomplete-splice_match ARHGEF10L ENST00000375408.7 3685 20 21936 1 499 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GACTTGGATTGAGGTTTTGT 76 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.296.3 chr1 + 1469 4 incomplete-splice_match ARHGEF10L ENST00000375408.7 3685 20 46130 0 24693 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTTGGATTGAGGTTTTGTT NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 6 NA PB.296.4 chr1 + 1367 4 incomplete-splice_match ARHGEF10L ENST00000375408.7 3685 20 46232 0 24795 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTTGGATTGAGGTTTTGTT NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.296.5 chr1 + 1197 3 incomplete-splice_match ARHGEF10L ENST00000375408.7 3685 20 69379 0 -6352 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTTGGATTGAGGTTTTGTT NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.296.6 chr1 + 1083 2 full-splice_match ARHGEF10L ENST00000495593.1 2261 2 1172 6 1172 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTTGGATTGAGGTTTTGTT 6170 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.297.1 chr1 - 4072 13 full-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 -32 0 -32 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGGATTTTGCATTTCTTTT 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.297.2 chr1 - 3614 11 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 10478 0 9362 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGGATTTTGCATTTCTTTT 9363 FALSE NA NA AAAAAG -25 NA NA NA 6 NA PB.297.3 chr1 - 3536 11 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 10556 0 9440 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.391864 0.530438 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGGATTTTGCATTTCTTTT 9441 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.297.4 chr1 - 3400 10 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 14113 0 12997 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGGATTTTGCATTTCTTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.297.5 chr1 - 3245 8 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 17385 0 -13246 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGGATTTTGCATTTCTTTT 3247 FALSE NA NA AAGAAA -42 NA NA NA 4 NA PB.297.6 chr1 - 3093 7 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 18911 0 -11720 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGGATTTTGCATTTCTTTT 4773 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.297.7 chr1 - 2626 4 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 26565 0 -4066 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGGATTTTGCATTTCTTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.297.8 chr1 - 2584 3 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 27485 0 -3146 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.479165 0.738714 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGGATTTTGCATTTCTTTT 82 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 21 NA PB.297.15 chr1 - 3757 12 full-splice_match RCC2 ENST00000375433.3 2030 12 188 -1915 188 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTTGGATTTTGCATTTCTTT 3104 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.297.16 chr1 - 2993 6 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 23077 1 -7554 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 20 5.218252 0.717525 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTTGGATTTTGCATTTCTTT 8939 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 20 NA PB.297.17 chr1 - 2782 5 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 26050 1 -4581 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 25 6.522815 0.814435 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTTGGATTTTGCATTTCTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 25 NA PB.297.18 chr1 - 2478 2 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 29660 1 -971 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 24 6.261902 0.796706 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTTGGATTTTGCATTTCTTT 2257 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 24 NA PB.297.21 chr1 - 3187 8 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 17441 2 -13190 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TCTTGGATTTTGCATTTCTT 3303 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.297.28 chr1 - 3300 9 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 16890 27 -13741 -27 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.652776 0.562623 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAATAAACAACAACATTGTC 2752 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.297.32 chr1 - 2499 10 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375433.3 2030 12 12991 -1009 12991 172 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATGATGTAGTTGTTGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.297.33 chr1 - 2224 7 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375433.3 2030 12 17757 -1009 -11758 172 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATGATGTAGTTGTTGT 4735 FALSE NA NA AAGAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.297.34 chr1 - 1680 3 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375433.3 2030 12 26366 -1009 -3149 172 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATGATGTAGTTGTTGT 79 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.297.37 chr1 - 1014 7 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375433.3 2030 12 17778 180 -11737 -180 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATAGTTGATTTACCATTCCT 4756 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.299.1 chr1 - 3212 16 novel_not_in_catalog ALDH4A1 novel 3139 15 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATCACAGTGGTGGATGGTC -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.299.2 chr1 - 3353 15 full-splice_match ALDH4A1 ENST00000375341.8 3139 15 -216 2 -47 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATCACAGTGGTGGATGGTC -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.299.3 chr1 - 3134 15 full-splice_match ALDH4A1 ENST00000375341.8 3139 15 3 2 1 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 43 11.219242 1.049963 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATCACAGTGGTGGATGGTC -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 43 NA PB.299.4 chr1 - 2857 12 incomplete-splice_match ALDH4A1 ENST00000538309.5 1940 15 4379 -1301 -893 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATCACAGTGGTGGATGGTC 4251 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.299.5 chr1 - 2647 10 incomplete-splice_match ALDH4A1 ENST00000538309.5 1940 15 7468 -1301 2196 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATCACAGTGGTGGATGGTC 7340 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.299.6 chr1 - 2171 6 incomplete-splice_match ALDH4A1 ENST00000538309.5 1940 15 13273 -1301 8001 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATCACAGTGGTGGATGGTC 8413 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.299.7 chr1 - 1968 5 incomplete-splice_match ALDH4A1 ENST00000538309.5 1940 15 13636 -1301 8364 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATCACAGTGGTGGATGGTC 8776 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.299.8 chr1 - 1819 4 incomplete-splice_match ALDH4A1 ENST00000538309.5 1940 15 14525 -1301 9253 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATCACAGTGGTGGATGGTC 9665 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.299.9 chr1 - 1698 3 incomplete-splice_match ALDH4A1 ENST00000538309.5 1940 15 15457 -1301 10185 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATCACAGTGGTGGATGGTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.299.13 chr1 - 3088 14 novel_in_catalog ALDH4A1 novel 3139 15 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAATCACAGTGGTGGATGGT -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.299.14 chr1 - 2312 8 incomplete-splice_match ALDH4A1 ENST00000538309.5 1940 15 9118 -1300 3846 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAATCACAGTGGTGGATGGT 8990 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.299.15 chr1 - 1271 7 incomplete-splice_match ALDH4A1 ENST00000375341.8 3139 15 0 11133 0 -3 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAGATTTGGATGTAGTCT -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.299.16 chr1 - 833 8 novel_in_catalog ALDH4A1 novel 844 6 NA NA -14 -4 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAAAGATTTGGATGTAGTC 196 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.301.1 chr1 - 3708 25 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 103357 4 -1993 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGGAAGGTGTTGCCTGC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.301.2 chr1 - 3006 20 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 796 0 796 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGGAAGGTGTTGCCTGC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.301.3 chr1 - 1967 12 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 10934 0 -542 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGGAAGGTGTTGCCTGC 6167 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.301.4 chr1 - 1504 9 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 16094 0 4618 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.652776 0.562623 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGGAAGGTGTTGCCTGC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.301.5 chr1 - 1271 7 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 18150 0 -4526 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGGAAGGTGTTGCCTGC 1128 FALSE NA NA TATAAA -15 NA NA NA 11 NA PB.301.6 chr1 - 960 4 full-splice_match UBR4 ENST00000375225.7 1533 4 569 4 -365 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.435514 0.646944 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGGAAGGTGTTGCCTGC -29 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.301.7 chr1 - 799 4 full-splice_match UBR4 ENST00000375225.7 1533 4 730 4 -204 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGGAAGGTGTTGCCTGC 6384 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.301.8 chr1 - 665 4 full-splice_match UBR4 ENST00000375225.7 1533 4 864 4 -70 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGGAAGGTGTTGCCTGC 6518 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.301.9 chr1 - 3209 21 full-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 265 1 265 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAGGAAGGTGTTGCCTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.301.10 chr1 - 2556 16 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 7647 1 -1347 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAGGAAGGTGTTGCCTG 2880 FALSE NA NA AAAACA -3 NA NA NA 9 NA PB.301.11 chr1 - 2436 15 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 8309 1 -685 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAGGAAGGTGTTGCCTG 3542 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.301.12 chr1 - 1718 10 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 12038 1 562 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAGGAAGGTGTTGCCTG 7271 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.301.13 chr1 - 1404 8 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 17022 1 5546 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAGGAAGGTGTTGCCTG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.301.14 chr1 - 2106 12 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 10793 2 -683 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGAAAAGGAAGGTGTTGCCT 6026 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.301.15 chr1 - 1091 6 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 18736 2 -3940 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.130951 0.495676 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGAAAAGGAAGGTGTTGCCT 1714 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.301.16 chr1 - 4309 29 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 97499 8 -80 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATTGAAAAGGAAGGTGTTGC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.301.17 chr1 - 5398 36 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 91322 8 -95 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATTGAAAAGGAAGGTGTTGC NA FALSE NA NA AGTAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.301.18 chr1 - 3559 24 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 103612 8 -1738 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATTGAAAAGGAAGGTGTTGC NA FALSE NA NA AATAGA -27 NA NA NA 2 NA PB.301.19 chr1 - 3419 23 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 104478 8 -872 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATTGAAAAGGAAGGTGTTGC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.301.20 chr1 - 2843 18 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 4343 4 -447 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATTGAAAAGGAAGGTGTTGC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.301.21 chr1 - 2729 18 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 4457 4 -333 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATTGAAAAGGAAGGTGTTGC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.301.22 chr1 - 2267 14 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 9345 4 351 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.130951 0.495676 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATTGAAAAGGAAGGTGTTGC 4578 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.301.23 chr1 - 1605 9 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 15989 4 4513 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATTGAAAAGGAAGGTGTTGC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.301.24 chr1 - 931 5 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 20340 4 -2336 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATTGAAAAGGAAGGTGTTGC 3318 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.301.25 chr1 - 1842 11 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 11516 5 40 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 CATTGAAAAGGAAGGTGTTG 6749 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.301.27 chr1 - 1984 15 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 96517 22683 -1062 -3098 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GTAGATCATGGCACTGCACA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.301.28 chr1 - 1338 11 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 100118 22683 410 -3098 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GTAGATCATGGCACTGCACA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.301.29 chr1 - 2883 15 novel_in_catalog UBR4 novel 15892 106 NA NA -2162 -3100 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGGTAGATCATGGCACTGCA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.301.30 chr1 - 2460 18 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 94734 22685 -2845 -3100 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGGTAGATCATGGCACTGCA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.302.1 chr1 + 1799 3 full-splice_match ACTL8 ENST00000375406.2 1841 3 40 2 40 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 32 8.349203 0.921645 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGGCTCCTGTGATGG 24 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 32 NA PB.302.2 chr1 + 1706 3 full-splice_match ACTL8 ENST00000375406.2 1841 3 133 2 133 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGGCTCCTGTGATGG 117 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.302.3 chr1 + 1823 3 novel_not_in_catalog ACTL8 novel 1670 2 NA NA 3998 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGGCTCCTGTGATGG 1 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 6 NA PB.304.1 chr1 - 4584 30 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 50096 46719 7885 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 6543 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.304.2 chr1 - 4209 28 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 53473 46719 -5093 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 9920 FALSE NA NA AGTAAA -12 NA NA NA 3 NA PB.304.4 chr1 - 3500 24 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 56470 46719 -2096 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 3030 FALSE NA NA AAGAAA -38 NA NA NA 2 NA PB.304.5 chr1 - 3085 21 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 58427 46719 -139 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 4987 FALSE NA NA AAGAAA -1 NA NA NA 5 NA PB.304.6 chr1 - 2294 16 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 64336 46719 198 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 7828 FALSE NA NA AAGAAA -30 NA NA NA 7 NA PB.304.7 chr1 - 2186 16 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 64444 46719 306 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 7936 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.304.8 chr1 - 1893 13 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 68518 46719 4380 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.435514 0.646944 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA NA FALSE NA NA AAGAAA -8 NA NA NA 17 NA PB.304.9 chr1 - 1543 11 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 69444 46719 5306 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.304.10 chr1 - 1358 9 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000425413.5 2954 21 13531 29 7959 -16 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.174602 0.620615 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA NA FALSE NA NA AAAAAG -16 NA NA NA 16 NA PB.304.11 chr1 - 1230 9 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000425413.5 2954 21 13659 29 8087 -16 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.304.13 chr1 - 932 6 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000425413.5 2954 21 24019 29 20 -16 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 3597 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.304.14 chr1 - 776 5 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000425413.5 2954 21 25142 29 1143 -16 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 4720 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.304.15 chr1 - 4026 20 novel_in_catalog UBR4 novel 15892 106 NA NA -114 -17 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 TAAAAAGAGCAAGAAAGAAG 5012 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.304.16 chr1 - 2911 21 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 58600 46720 34 -17 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 TAAAAAGAGCAAGAAAGAAG 5160 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.304.17 chr1 - 1684 12 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 68848 46720 4710 -17 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 TAAAAAGAGCAAGAAAGAAG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.304.18 chr1 - 2410 17 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 63325 46722 -813 -19 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 ACTAAAAAGAGCAAGAAAGA 9885 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.306.1 chr1 - 3011 13 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000375208.7 4084 22 13478 -58 2524 58 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CACTGTTTAAGTCCTCTTTT 4383 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.306.2 chr1 - 2251 7 full-splice_match EMC1 ENST00000693007.1 4889 7 1352 1286 -1 57 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACACTGTTTAAGTCCTCTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.306.5 chr1 - 4204 23 full-splice_match EMC1 ENST00000477853.6 6640 23 0 2436 0 52 alternative_3end TRUE canonical NA NA NA NA 25 6.522815 0.814435 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAATGACACTGTTTAAGTCC 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 25 NA PB.306.6 chr1 - 1903 5 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000691945.1 4156 6 4705 1291 -478 52 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAATGACACTGTTTAAGTCC NA FALSE NA NA AATAAA -30 NA NA NA 2 NA PB.306.8 chr1 - 4104 23 full-splice_match EMC1 ENST00000477853.6 6640 23 -13 2549 5 -61 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AGAGTTGGGGAATGACAGAA -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.306.9 chr1 - 2123 7 full-splice_match EMC1 ENST00000693007.1 4889 7 1349 1417 -4 -74 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTTCCTTGGTCATAGAGTTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.306.10 chr1 - 1314 2 full-splice_match EMC1 ENST00000461353.1 2175 2 1584 -723 1584 -74 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTTCCTTGGTCATAGAGTTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.306.11 chr1 - 3628 23 full-splice_match EMC1 ENST00000477853.6 6640 23 -3 3015 -1 270 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTATTAGGCTGGGCCACC 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.306.12 chr1 - 2764 18 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000375199.7 5408 23 10442 2060 -499 11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CCTTTTGTGTTTCTCAATTT 1360 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.306.13 chr1 - 2590 17 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000375208.7 4084 22 11201 786 247 11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CCTTTTGTGTTTCTCAATTT 2106 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.306.14 chr1 - 1495 8 full-splice_match EMC1 ENST00000688918.1 4034 8 410 2129 -385 11 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CCTTTTGTGTTTCTCAATTT 9801 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.306.15 chr1 - 931 4 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000691945.1 4156 6 5399 2130 -30 10 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCTTTTGTGTTTCTCAATT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.306.16 chr1 - 3208 22 full-splice_match EMC1 ENST00000690732.1 6478 22 -13 3283 5 2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTTACTTTGCCTTTTGTGTT -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.306.18 chr1 - 1120 5 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000691945.1 4156 6 4639 2140 -544 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTTACTTTGCCTTTTGTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.306.19 chr1 - 1223 6 full-splice_match EMC1 ENST00000691945.1 4156 6 792 2141 547 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GACTTTACTTTGCCTTTTGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.306.20 chr1 - 3360 23 full-splice_match EMC1 ENST00000477853.6 6640 23 -7 3287 -5 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 110 28.700386 1.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGACTTTACTTTGCCTTTTG -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 110 NA PB.306.21 chr1 - 1971 11 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000375208.7 4084 22 16328 799 -2878 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGACTTTACTTTGCCTTTTG 7233 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.306.22 chr1 - 843 4 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000691945.1 4156 6 5475 2142 46 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGACTTTACTTTGCCTTTTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.306.23 chr1 - 2650 17 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000375208.7 4084 22 11124 803 170 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATTGACTTTACTTTGCCT 2029 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.306.24 chr1 - 2118 12 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000375208.7 4084 22 14288 803 3334 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATTGACTTTACTTTGCCT 5193 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.306.25 chr1 - 1363 7 full-splice_match EMC1 ENST00000693007.1 4889 7 1380 2146 27 -6 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATTGACTTTACTTTGCCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.306.26 chr1 - 1553 8 full-splice_match EMC1 ENST00000688918.1 4034 8 334 2147 334 -7 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAATTGACTTTACTTTGCC 9725 FALSE NA NA AAGAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.306.27 chr1 - 1746 10 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000486405.2 2991 24 18516 -338 -677 -20 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGTGAGGCCTGTTTAAATTG 9434 FALSE NA NA GGGGCT -8 NA NA NA 4 NA PB.308.1 chr1 + 1407 8 full-splice_match MRTO4 ENST00000330263.5 2049 8 -222 864 -222 525 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 36 9.392854 0.972798 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAAAGAATACA 11 TRUE NA NA AGTAAA -11 NA NA NA 36 NA PB.308.3 chr1 + 1130 8 full-splice_match MRTO4 ENST00000330263.5 2049 8 -222 1141 -222 248 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.130951 0.495676 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CGCGGTGGCTCACGCCTGGA 11 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 12 NA PB.308.4 chr1 + 1583 8 full-splice_match MRTO4 ENST00000330263.5 2049 8 -216 682 -216 -682 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.652776 0.562623 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTGCCTGTGGTCCCCACT 17 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 14 NA PB.308.9 chr1 + 923 8 full-splice_match MRTO4 ENST00000330263.5 2049 8 -10 1136 -10 253 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGGCTCACGCCTGGAATCCC -19 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 8 NA PB.308.12 chr1 + 1185 8 full-splice_match MRTO4 ENST00000330263.5 2049 8 0 864 0 525 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 127 33.135902 1.520299 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAAAGAATACA -9 TRUE NA NA AGTAAA -11 NA NA NA 127 NA PB.308.13 chr1 + 1023 9 novel_not_in_catalog MRTO4 novel 2049 8 NA NA 0 1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGTGGCCCTCTTTTTTCTGC -9 TRUE NA NA AGTAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.308.14 chr1 + 1789 6 novel_in_catalog MRTO4 novel 2049 8 NA NA -15 525 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAAAGAATACA 6 TRUE NA NA AGTAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.308.15 chr1 + 1001 9 novel_not_in_catalog MRTO4 novel 2049 8 NA NA -15 525 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAAAGAATACA 6 TRUE NA NA AGTAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.308.17 chr1 + 1349 8 full-splice_match MRTO4 ENST00000330263.5 2049 8 17 683 -13 -683 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 58 15.132931 1.179923 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CACTTGCCTGTGGTCCCCAC 8 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 58 NA PB.308.20 chr1 + 1069 6 incomplete-splice_match MRTO4 ENST00000330263.5 2049 8 4141 864 -1766 525 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAAAGAATACA 4132 FALSE NA NA AGTAAA -11 NA NA NA 4 NA PB.308.22 chr1 + 1199 6 incomplete-splice_match MRTO4 ENST00000330263.5 2049 8 4193 682 -1714 -682 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTGCCTGTGGTCCCCACT 4184 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.308.23 chr1 + 1064 4 incomplete-splice_match MRTO4 ENST00000330263.5 2049 8 5647 683 -260 -683 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CACTTGCCTGTGGTCCCCAC 5638 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.308.24 chr1 + 864 4 incomplete-splice_match MRTO4 ENST00000330263.5 2049 8 5666 864 -241 525 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAAAGAATACA 5657 FALSE NA NA AGTAAA -11 NA NA NA 4 NA PB.308.25 chr1 + 962 3 full-splice_match MRTO4 ENST00000479559.1 409 3 151 -704 151 -685 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GCCACTTGCCTGTGGTCCCC 6049 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.308.26 chr1 + 654 2 incomplete-splice_match MRTO4 ENST00000479559.1 409 3 772 -525 772 525 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAAAGAATACA 6670 FALSE NA NA AGTAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.308.27 chr1 + 805 2 incomplete-splice_match MRTO4 ENST00000479559.1 409 3 802 -706 802 -683 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CACTTGCCTGTGGTCCCCAC 6700 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.309.2 chr1 - 1022 7 novel_not_in_catalog AKR7A2 novel 989 3 NA NA 20 4961 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAATTGACTGTGTATATAAC -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.309.3 chr1 - 1356 7 full-splice_match AKR7A2 ENST00000235835.8 1360 7 7 -3 7 3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 312 81.404732 1.910650 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GCTTTCTCTGCTGTTAACAC -27 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 312 NA PB.309.4 chr1 - 1229 6 novel_in_catalog AKR7A2 novel 1360 7 NA NA -12 -5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAAACTTGCTTTCTCTGCT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.309.5 chr1 - 1292 7 full-splice_match AKR7A2 ENST00000235835.8 1360 7 63 5 13 -5 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 97 25.308523 1.403267 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAAACTTGCTTTCTCTGCT 29 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 97 NA PB.309.6 chr1 - 1228 6 full-splice_match AKR7A2 ENST00000330072.9 1171 6 -28 -29 -19 -5 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAAACTTGCTTTCTCTGCT -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.309.7 chr1 - 1068 7 full-splice_match AKR7A2 ENST00000235835.8 1360 7 287 5 50 -5 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.652776 0.562623 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAAACTTGCTTTCTCTGCT 253 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.309.9 chr1 - 931 6 incomplete-splice_match AKR7A2 ENST00000235835.8 1360 7 3608 5 -31 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAAACTTGCTTTCTCTGCT 3574 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.309.10 chr1 - 771 5 incomplete-splice_match AKR7A2 ENST00000235835.8 1360 7 3960 5 321 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAAACTTGCTTTCTCTGCT 3926 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.310.2 chr1 + 1680 8 novel_in_catalog SLC66A1 novel 1805 9 NA NA -38 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GAGACCTGCTTCTGTTGCTC NA FALSE NA NA AATAAA -32 NA NA NA 2 NA PB.310.3 chr1 + 1817 9 full-splice_match SLC66A1 ENST00000375155.7 1805 9 -16 4 -16 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.913689 0.592586 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGAGACCTGCTTCTGTTGC -5 TRUE NA NA AATAAA -30 NA NA NA 15 NA PB.310.5 chr1 + 2164 8 full-splice_match SLC66A1 ENST00000375153.8 2175 8 7 4 3 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGAGACCTGCTTCTGTTGC 18 TRUE NA NA AATAAA -30 NA NA NA 2 NA PB.310.6 chr1 + 1068 4 incomplete-splice_match SLC66A1 ENST00000497827.1 1428 8 13555 -269 1530 -28 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAATAAAAAAGATAAC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.311.1 chr1 - 1703 9 full-splice_match CAPZB ENST00000264202.8 1675 9 -10 -18 -10 18 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 1136 296.396729 2.471873 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CCTTCTCGCCGGCCTCGCTT 94 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 1136 NA PB.311.2 chr1 - 1633 9 full-splice_match CAPZB ENST00000264202.8 1675 9 41 1 -13 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 20 5.218252 0.717525 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGCGCTGGCCTTCTGTGTTC -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 20 NA PB.311.3 chr1 - 1566 8 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 64918 -583 -9 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGCGCTGGCCTTCTGTGTTC 8 TRUE NA NA AATACA -28 NA NA NA 10 NA PB.311.4 chr1 - 1374 7 novel_in_catalog CAPZB novel 1675 9 NA NA -13 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGCGCTGGCCTTCTGTGTTC -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.311.8 chr1 - 1479 7 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 99037 -581 -63 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.652776 0.562623 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTAGCGCTGGCCTTCTGTGT NA FALSE NA NA AAAACA -10 NA NA NA 14 NA PB.311.9 chr1 - 1545 8 novel_in_catalog CAPZB novel 1675 9 NA NA 6 -4 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTAGCGCTGGCCTTCTGT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.311.10 chr1 - 1371 7 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 99143 -579 43 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 28 7.305553 0.863653 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTAGCGCTGGCCTTCTGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 28 NA PB.311.11 chr1 - 1239 5 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 127101 -578 -11201 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 25 6.522815 0.814435 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGTTAGCGCTGGCCTTCTG 84 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 25 NA PB.311.12 chr1 - 959 3 full-splice_match CAPZB ENST00000674299.1 1734 3 1131 -356 1131 -5 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 38 9.914679 0.996279 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGTTAGCGCTGGCCTTCTG 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 38 NA PB.311.15 chr1 - 1238 6 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 106083 -535 6983 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.479165 0.738714 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAGAAAAGAAAAGAA -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 21 NA PB.311.16 chr1 - 1004 4 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 127963 -535 -10339 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.130951 0.495676 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAGAAAAGAAAAGAA 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.311.18 chr1 - 872 2 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000674299.1 1734 3 1926 -312 1926 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAAAGAAAAGAAAAGA 797 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.311.19 chr1 - 1049 10 novel_not_in_catalog CAPZB novel 1686 10 NA NA -5 33 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTCCGTGTGTGTTTGGGAG -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.311.20 chr1 - 796 5 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 127221 -255 -11081 33 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTCCGTGTGTGTTTGGGAG 204 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.311.21 chr1 - 656 3 full-splice_match CAPZB ENST00000674299.1 1734 3 1111 -33 1111 33 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTCCGTGTGTGTTTGGGAG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.311.22 chr1 - 1348 9 full-splice_match CAPZB ENST00000264202.8 1675 9 -3 330 -3 32 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 524 136.718201 2.135826 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATTCCGTGTGTGTTTGGGA -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 524 NA PB.311.23 chr1 - 1110 7 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 99079 -254 -21 32 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.130951 0.495676 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATTCCGTGTGTGTTTGGGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.311.24 chr1 - 1345 9 novel_not_in_catalog CAPZB novel 1675 9 NA NA -32098 26 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAATCTTATTCCGTGTGTGT -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.311.25 chr1 - 1007 7 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 99142 -214 42 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACTGTGGTGTGTGAAAGAG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.311.26 chr1 - 1178 10 full-splice_match CAPZB ENST00000375142.5 1686 10 -26 534 2 2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTCCGGCTCCGAGCCTGCTT 17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.311.27 chr1 - 1080 9 novel_not_in_catalog CAPZB novel 1675 9 NA NA -32079 2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTCCGGCTCCGAGCCTGCTT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.311.28 chr1 - 1095 9 full-splice_match CAPZB ENST00000264202.8 1675 9 -2 582 -2 2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 203 52.965260 1.723991 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTCCGGCTCCGAGCCTGCTT -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 203 NA PB.311.29 chr1 - 955 8 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 64948 -2 21 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTCCGGCTCCGAGCCTGCTT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.311.30 chr1 - 769 6 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 106019 -2 6919 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTCCGGCTCCGAGCCTGCTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.311.31 chr1 - 564 5 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 127200 -2 -11102 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTCCGGCTCCGAGCCTGCTT 183 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.311.40 chr1 - 684 5 novel_not_in_catalog CAPZB novel 4666 2 NA NA 2 -126 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GTCTTGCCCCTGTTCCTGCC 17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.311.41 chr1 - 1082 6 novel_not_in_catalog CAPZB novel 4666 2 NA NA 7 -127 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TGTCTTGCCCCTGTTCCTGC -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.312.1 chr1 + 458 3 full-splice_match MICOS10 ENST00000617872.4 3678 3 4 3216 2 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAATAAATTAAACAAAAAGA -29 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.312.2 chr1 + 534 4 full-splice_match MICOS10 ENST00000322753.7 3723 4 2 3187 2 3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 115 30.004950 1.477193 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTGCATGGCCTTTGTTTCT -29 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 115 NA PB.312.6 chr1 + 579 5 full-splice_match MICOS10 ENST00000467029.5 583 5 14 -10 14 3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTGCATGGCCTTTGTTTCT 5 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 11 NA PB.312.7 chr1 + 3293 3 incomplete-splice_match MICOS10 ENST00000498642.5 669 5 -44 -18 2 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAATAAATTAAACAAAAAGA -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.312.11 chr1 + 445 4 full-splice_match MICOS10 ENST00000322753.7 3723 4 63 3215 1 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 40 10.436504 1.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAATAAATTAAACAAAAAGA 32 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 40 NA PB.312.13 chr1 + 784 4 novel_not_in_catalog MICOS10 novel 655 4 NA NA 202 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAATAAATTAAACAAAAAGA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.312.16 chr1 + 1546 1 full-splice_match ENSG00000226396 ENST00000457263.1 455 1 -1046 -45 -1046 45 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAATAAATAAAAAAAGT 9259 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.312.17 chr1 + 1142 1 full-splice_match ENSG00000226396 ENST00000457263.1 455 1 -642 -45 -642 45 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAATAAATAAAAAAAGT 9663 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 5 NA PB.314.1 chr1 + 2022 4 full-splice_match NBL1 ENST00000375136.8 2024 4 2 0 2 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 61 15.915668 1.201825 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTGTTCTCCTCCTCACTGA -13 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 61 NA PB.314.2 chr1 + 912 4 full-splice_match NBL1 ENST00000375136.8 2024 4 2 1110 2 213 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCAGAGGTCTTCAGGGCT -13 TRUE NA NA AATATA -19 NA NA NA 2 NA PB.314.3 chr1 + 1889 3 incomplete-splice_match NBL1 ENST00000548815.2 1953 4 7401 4 7401 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTGTTCTCCTCCTCACTGA 7448 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 6 NA PB.314.4 chr1 + 1599 4 novel_not_in_catalog NBL1 novel 2024 4 NA NA 7552 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTGTTCTCCTCCTCACTGA 97 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.315.1 chr1 + 2368 8 full-splice_match OTUD3 ENST00000375120.4 6515 8 0 4147 0 1854 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACATTTATTTCTTTTTATTT -17 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.316.2 chr1 - 1238 2 incomplete-splice_match TMCO4 ENST00000489814.5 1722 5 43956 -5 6747 3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACCACTTCTTGAGCATGTAC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.316.3 chr1 - 2935 16 full-splice_match TMCO4 ENST00000294543.11 2946 16 -10 21 -10 -19 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AATAAATAATAATAAGAAGA 396 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.316.4 chr1 - 2872 15 novel_in_catalog TMCO4 novel 2946 16 NA NA -2 -19 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AATAAATAATAATAAGAAGA 380 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.317.1 chr1 - 845 5 full-splice_match PLA2G2A ENST00000482011.2 608 5 0 -237 0 2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATGTATATGTGTGTGTGTAT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.320.1 chr1 + 986 4 full-splice_match CDA ENST00000375071.4 809 4 -176 -1 -165 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.652776 0.562623 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CAAAGCGTGTGTCTTGCTCT -37 TRUE NA NA TATAAA -21 NA NA NA 14 NA PB.320.2 chr1 + 913 3 full-splice_match CDA ENST00000461985.1 762 3 -149 -2 -149 2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAAGCGTGTGTCTTGCTCTG -21 TRUE NA NA TATAAA -22 NA NA NA 3 NA PB.320.3 chr1 + 805 4 full-splice_match CDA ENST00000375071.4 809 4 3 1 3 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 37 9.653767 0.984697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATCAAAGCGTGTGTCTTGCT 10 TRUE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 37 NA PB.320.4 chr1 + 747 3 full-splice_match CDA ENST00000461985.1 762 3 14 1 3 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATCAAAGCGTGTGTCTTGCT 10 TRUE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 5 NA PB.321.1 chr1 - 2431 4 novel_not_in_catalog MUL1 novel 2428 4 NA NA 12 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGTGCTAGCCTGTTGCTTT -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.321.2 chr1 - 2436 4 full-splice_match MUL1 ENST00000264198.5 2428 4 -10 2 -10 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 139 36.266853 1.559510 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGTGCTAGCCTGTTGCTTT -33 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 139 NA PB.321.3 chr1 - 2340 4 full-splice_match MUL1 ENST00000264198.5 2428 4 86 2 86 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGTGCTAGCCTGTTGCTTT 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.321.4 chr1 - 2049 2 incomplete-splice_match MUL1 ENST00000264198.5 2428 4 6004 2 6004 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGTGCTAGCCTGTTGCTTT 5981 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.322.1 chr1 - 1857 12 novel_not_in_catalog DDOST novel 2126 11 NA NA -52 2407 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACTAGCCTTTACCTTCCTA 83 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.322.2 chr1 - 1791 12 novel_not_in_catalog DDOST novel 2126 11 NA NA 9 2406 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACTAGCCTTTACCTTCCT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.322.8 chr1 - 1952 11 full-splice_match DDOST ENST00000602624.7 1941 11 -14 3 5 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 259 67.576363 1.829795 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAACTTCACCTGGCCCCGGT -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 259 NA PB.322.12 chr1 - 1703 10 incomplete-splice_match DDOST ENST00000602624.7 1941 11 377 66 377 -66 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAATATAAATAAATAAATAA 531 FALSE NA NA AAGAAA -40 NA NA NA 2 NA PB.322.17 chr1 - 910 3 incomplete-splice_match DDOST ENST00000602624.7 1941 11 8402 66 117 -66 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.391864 0.530438 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAATATAAATAAATAAATAA 8556 FALSE NA NA GATAAA -37 NA NA NA 13 NA PB.322.21 chr1 - 1565 11 full-splice_match DDOST ENST00000602624.7 1941 11 -10 386 9 -386 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 161 42.006927 1.623321 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATGTGCAGTCACTCCTCTCA -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 161 NA PB.322.22 chr1 - 1496 11 novel_not_in_catalog DDOST novel 2126 11 NA NA 3 -404 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGTGGCATTTTTCCTAT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.322.23 chr1 - 1627 10 novel_in_catalog DDOST novel 1941 11 NA NA 0 -406 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CTAAAAGTGGCATTTTTCCT 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.322.24 chr1 - 1666 11 full-splice_match DDOST ENST00000415136.6 2126 11 39 421 39 -411 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 880 229.603088 2.360978 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AATTGCTAAAAGTGGCATTT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 880 NA PB.322.25 chr1 - 1354 10 incomplete-splice_match DDOST ENST00000602624.7 1941 11 381 411 381 -411 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.652776 0.562623 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AATTGCTAAAAGTGGCATTT 535 FALSE NA NA AAGAAA -36 NA NA NA 14 NA PB.322.26 chr1 - 1242 9 incomplete-splice_match DDOST ENST00000602624.7 1941 11 5186 411 -3099 -411 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 25 6.522815 0.814435 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AATTGCTAAAAGTGGCATTT 5340 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 25 NA PB.322.27 chr1 - 857 5 incomplete-splice_match DDOST ENST00000602624.7 1941 11 7007 411 -1278 -411 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.435514 0.646944 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AATTGCTAAAAGTGGCATTT 7161 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.322.28 chr1 - 1076 8 incomplete-splice_match DDOST ENST00000602624.7 1941 11 5672 412 -2613 -412 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 26 6.783728 0.831468 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GAATTGCTAAAAGTGGCATT 5826 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 26 NA PB.322.29 chr1 - 1401 11 full-splice_match DDOST ENST00000602624.7 1941 11 123 417 123 -417 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTTTGAATTGCTAAAAGTG 277 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.323.1 chr1 - 1475 2 incomplete-splice_match KIF17 ENST00000477167.5 1805 6 18246 2 -2351 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGCTCCCCTTCTCTGACCC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.323.2 chr1 - 1568 7 novel_in_catalog KIF17 novel 1931 9 NA NA -29 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAAGCTCCCCTTCTCTGACC -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.324.1 chr1 - 2473 2 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 29407 -7 4149 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AACCGTAGCTTATATTTAAA 4266 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.324.2 chr1 - 2821 5 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 17819 -4 -6935 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CTGAACCGTAGCTTATATTT 8299 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.324.5 chr1 - 3430 9 full-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 1395 -3 1395 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GCTGAACCGTAGCTTATATT 6933 FALSE NA NA TTTAAA -44 NA NA NA 4 NA PB.324.6 chr1 - 2236 13 novel_in_catalog HP1BP3 novel 6406 13 NA NA -3 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GCTGAACCGTAGCTTATATT -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.324.8 chr1 - 3880 12 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000312239.10 3884 13 6111 1 0 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TGCTGAACCGTAGCTTATAT 2 TRUE NA NA ACTAAA -2 NA NA NA 8 NA PB.324.9 chr1 - 4000 13 full-splice_match HP1BP3 ENST00000438032.6 6406 13 -8 2414 -3 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.913689 0.592586 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TGCTGAACCGTAGCTTATAT -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.324.16 chr1 - 4020 13 novel_in_catalog HP1BP3 novel 3884 13 NA NA 5 -5 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAAGCTGCTGAACCGTAG -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.324.17 chr1 - 3788 12 novel_in_catalog HP1BP3 novel 6406 13 NA NA 1 -5 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.174602 0.620615 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAAGCTGCTGAACCGTAG 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.324.18 chr1 - 3901 13 novel_in_catalog HP1BP3 novel 3884 13 NA NA 5 1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAGAAAAGGAA -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.324.19 chr1 - 3107 10 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000312239.10 3884 13 9924 455 -124 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAGAAAAGGAA 9924 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.324.20 chr1 - 1969 14 novel_in_catalog HP1BP3 novel 6406 13 NA NA 0 1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAGAAAAGGAA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.324.23 chr1 - 3562 13 novel_in_catalog HP1BP3 novel 3884 13 NA NA 1 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAAAAAAAGAAAAGGA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.324.24 chr1 - 3301 9 full-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 1068 453 1068 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAAAAAAAGAAAAGGA 6606 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.324.25 chr1 - 2810 8 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 3936 453 3936 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAAAAAAAGAAAAGGA 9474 FALSE NA NA ATTAAA -28 NA NA NA 5 NA PB.324.26 chr1 - 2464 6 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 9599 453 9599 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAAAAAAAGAAAAGGA 9582 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.324.31 chr1 - 3527 13 full-splice_match HP1BP3 ENST00000438032.6 6406 13 8 2871 8 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 37 9.653767 0.984697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 ATTAAAAAAAAAAAGAAAAG 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 37 NA PB.324.32 chr1 - 3338 12 novel_in_catalog HP1BP3 novel 6406 13 NA NA 1 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 55 14.350193 1.156858 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 ATTAAAAAAAAAAAGAAAAG 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 55 NA PB.324.33 chr1 - 2588 6 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 9473 455 9473 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 ATTAAAAAAAAAAAGAAAAG 9456 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.324.34 chr1 - 2310 4 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 25154 455 -104 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 ATTAAAAAAAAAAAGAAAAG 13 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.324.35 chr1 - 2213 4 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 25251 455 -7 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 ATTAAAAAAAAAAAGAAAAG 110 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.324.36 chr1 - 2030 2 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 29388 455 4130 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 ATTAAAAAAAAAAAGAAAAG 4247 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.324.38 chr1 - 2951 9 full-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 1414 457 1414 -4 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 ATATTAAAAAAAAAAAGAAA 6952 FALSE NA NA TTTAAA -25 NA NA NA 2 NA PB.324.39 chr1 - 2666 7 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 7341 457 7341 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 ATATTAAAAAAAAAAAGAAA 8344 FALSE NA NA AGTAAA -41 NA NA NA 4 NA PB.324.41 chr1 - 3255 12 novel_in_catalog HP1BP3 novel 3884 13 NA NA -15 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AGATATTAAAAAAAAAAAGA -29 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.324.43 chr1 - 3225 12 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000312239.10 3884 13 6235 532 124 -76 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTTGTGGGTTTTTTTCCCC 6890 FALSE NA NA TTTAAA -22 NA NA NA 3 NA PB.324.44 chr1 - 2399 5 novel_not_in_catalog HP1BP3 novel 4822 9 NA NA -6953 -76 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTTGTGGGTTTTTTTCCCC 8281 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.324.47 chr1 - 2357 5 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 17746 533 -7008 -80 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTATTTGTGGGTTTTTTT 8226 FALSE NA NA GATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.324.48 chr1 - 2035 13 full-splice_match HP1BP3 ENST00000438032.6 6406 13 -8 4379 -3 947 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTTGCTAGCTTTAGGTGCT -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.324.49 chr1 - 1922 12 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000312239.10 3884 13 6111 1959 0 954 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTTTAGGTGCTTTTATTG 2 TRUE NA NA ACTAAA -2 NA NA NA 2 NA PB.324.50 chr1 - 661 3 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000488722.5 639 5 2111 1503 2111 954 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTTTAGGTGCTTTTATTG 2228 FALSE NA NA AATGAA -7 NA NA NA 3 NA PB.324.51 chr1 - 2387 9 novel_not_in_catalog HP1BP3 novel 4822 9 NA NA 571 953 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAGCTTTAGGTGCTTTTATT 6109 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.324.52 chr1 - 1111 7 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 7396 1957 7396 953 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAGCTTTAGGTGCTTTTATT 8399 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.324.53 chr1 - 950 6 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 9609 1957 9609 953 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAGCTTTAGGTGCTTTTATT 9592 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.324.54 chr1 - 2062 13 novel_in_catalog HP1BP3 novel 3884 13 NA NA -6 950 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGCTAGCTTTAGGTGCTTTT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.324.55 chr1 - 1836 12 novel_in_catalog HP1BP3 novel 6406 13 NA NA -1 946 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATTTGCTAGCTTTAGGTGC -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.324.57 chr1 - 1690 12 novel_in_catalog HP1BP3 novel 6406 13 NA NA -4 786 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAAGTAAATTTTATAGGA -20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.324.58 chr1 - 1699 13 novel_not_in_catalog HP1BP3 novel 3884 13 NA NA -3 785 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 GAAAAAGTAAATTTTATAGG -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.324.59 chr1 - 1868 13 full-splice_match HP1BP3 ENST00000438032.6 6406 13 -8 4546 -3 780 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AGAGTGAAAAAGTAAATTTT -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.324.62 chr1 - 2351 9 novel_not_in_catalog HP1BP3 novel 970 8 NA NA -1 3141 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTTTCTAGTCTGGATGTCT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.324.64 chr1 - 2561 10 novel_not_in_catalog HP1BP3 novel 970 8 NA NA 6 3141 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTTTCTAGTCTGGATGTCT 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.324.65 chr1 - 2541 10 novel_not_in_catalog HP1BP3 novel 970 8 NA NA 0 3141 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTTTCTAGTCTGGATGTCT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.324.66 chr1 - 2446 10 novel_not_in_catalog HP1BP3 novel 970 8 NA NA -1 3140 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGTTTCTAGTCTGGATGTC -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.324.69 chr1 - 1936 10 novel_not_in_catalog HP1BP3 novel 970 8 NA NA 1 2537 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGATTCTGAGTTCTCTTTTG 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.324.73 chr1 - 3382 3 novel_not_in_catalog HP1BP3 novel 473 4 NA NA 0 -8 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAGAAAAGGAGAAGAAAGT -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.324.74 chr1 - 887 6 novel_not_in_catalog HP1BP3 novel 928 5 NA NA 0 -8 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAGAAAAGGAGAAGAAAGT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.324.75 chr1 - 2879 5 novel_in_catalog HP1BP3 novel 928 5 NA NA -3 -111 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCCTCCCTGGTCTTTTC -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.324.76 chr1 - 2440 5 novel_in_catalog HP1BP3 novel 928 5 NA NA 0 -542 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 ACAAAATTGTTTTGATAAAC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.324.79 chr1 - 1513 3 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000424732.5 970 8 -10 18267 1 -16 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAACAAAGACACAAGCCG -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.324.80 chr1 - 1834 4 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000417710.5 572 5 -375 2099 -6 -31 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAATATAATATAAAAGAT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.324.81 chr1 - 1474 4 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000438032.6 6406 13 0 35420 0 -31 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.913689 0.592586 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAATATAATATAAAAGAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.324.82 chr1 - 1379 4 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000312239.10 3884 13 -14 33007 0 -31 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAATATAATATAAAAGAT -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.324.83 chr1 - 1278 3 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000424732.5 970 8 5 18487 0 -31 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.391864 0.530438 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAATATAATATAAAAGAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.324.85 chr1 - 883 5 novel_in_catalog HP1BP3 novel 928 5 NA NA 0 -31 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAATATAATATAAAAGAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.324.87 chr1 - 1811 3 novel_in_catalog HP1BP3 novel 3884 13 NA NA 0 -32 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 TAAAAATATAATATAAAAGA -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.324.88 chr1 - 1498 4 novel_in_catalog HP1BP3 novel 928 5 NA NA 1 -32 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 TAAAAATATAATATAAAAGA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.324.89 chr1 - 1245 5 novel_in_catalog HP1BP3 novel 928 5 NA NA 5 -32 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 TAAAAATATAATATAAAAGA -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.324.90 chr1 - 1182 3 novel_in_catalog HP1BP3 novel 3884 13 NA NA 0 -32 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 TAAAAATATAATATAAAAGA -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.324.91 chr1 - 908 5 full-splice_match HP1BP3 ENST00000375000.5 928 5 -12 32 0 -32 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 TAAAAATATAATATAAAAGA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.324.92 chr1 - 1103 4 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000438032.6 6406 13 -8 35799 -3 -410 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TATATAAAGTGATGGCAGTT -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.325.1 chr1 + 1848 8 full-splice_match PINK1 ENST00000321556.5 2657 8 36 773 36 -578 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTGTCGTGATGGTCTGTGA 19 TRUE NA NA ACTAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.325.2 chr1 + 2410 8 full-splice_match PINK1 ENST00000321556.5 2657 8 52 195 52 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATGACGTATGTGCCTTGA -2 TRUE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.325.3 chr1 + 1597 8 full-splice_match PINK1 ENST00000321556.5 2657 8 287 773 287 -578 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTGTCGTGATGGTCTGTGA 233 FALSE NA NA ACTAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.325.4 chr1 + 1987 7 incomplete-splice_match PINK1 ENST00000321556.5 2657 8 4381 195 -290 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATGACGTATGTGCCTTGA 4327 FALSE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 7 NA PB.325.5 chr1 + 1280 7 incomplete-splice_match PINK1 ENST00000321556.5 2657 8 4510 773 -161 -578 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTGTCGTGATGGTCTGTGA 4456 FALSE NA NA ACTAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.325.6 chr1 + 1763 7 incomplete-splice_match PINK1 ENST00000321556.5 2657 8 4605 195 -66 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATGACGTATGTGCCTTGA 4551 FALSE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 5 NA PB.325.7 chr1 + 1593 5 incomplete-splice_match PINK1 ENST00000321556.5 2657 8 11034 195 -1016 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATGACGTATGTGCCTTGA NA FALSE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.325.8 chr1 + 1534 5 incomplete-splice_match PINK1 ENST00000321556.5 2657 8 11098 190 -952 5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACGTATGTGCCTTGAACTGA NA FALSE NA NA ATTAAA -23 NA NA NA 3 NA PB.325.9 chr1 + 1322 4 full-splice_match PINK1 ENST00000400490.2 1658 4 142 194 142 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATGACGTATGTGCCTTGA NA FALSE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 6 NA PB.325.10 chr1 + 1216 3 incomplete-splice_match PINK1 ENST00000400490.2 1658 4 3029 194 3029 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATGACGTATGTGCCTTGA NA FALSE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.325.11 chr1 + 924 2 incomplete-splice_match PINK1 ENST00000400490.2 1658 4 3683 194 3683 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATGACGTATGTGCCTTGA NA FALSE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.326.1 chr1 - 2213 10 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681717.1 5993 34 199470 -5 -212 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAGAAAGTAAAGTGACTT NA FALSE NA NA AAAACA -37 NA NA NA 2 NA PB.326.2 chr1 - 1249 3 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000435383.2 1597 11 38027 -542 38027 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAGAAAGTAAAGTGACTT NA FALSE NA NA AATAAA -32 NA NA NA 2 NA PB.326.3 chr1 - 1066 2 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000435383.2 1597 11 40483 -542 40483 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAGAAAGTAAAGTGACTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.326.5 chr1 - 3752 21 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681767.1 5884 33 155459 -4 -44223 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 TAAAAGAAAGTAAAGTGACT NA FALSE NA NA AATATA -24 NA NA NA 2 NA PB.326.8 chr1 - 1958 12 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681717.1 5993 34 195940 399 -3742 117 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGATGCACCTCATGTTTGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.326.9 chr1 - 4186 24 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681767.1 5884 33 108839 529 -627 8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAAAAAAAAGTTGAGA NA FALSE NA NA GGGGCT -16 NA NA NA 2 NA PB.326.10 chr1 - 2845 19 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681717.1 5993 34 164709 529 -34973 8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAAAAAAAAGTTGAGA 113 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.326.11 chr1 - 1967 13 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681717.1 5993 34 193470 529 -6212 8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAAAAAAAAGTTGAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.326.12 chr1 - 1665 10 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681717.1 5993 34 199484 529 -198 8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAAAAAAAAGTTGAGA NA FALSE NA NA AAAACA -23 NA NA NA 7 NA PB.326.13 chr1 - 1392 9 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681717.1 5993 34 201484 529 1802 8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAAAAAAAAGTTGAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.326.14 chr1 - 838 4 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000435383.2 1597 11 33752 -8 33752 8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAAAAAAAAGTTGAGA NA FALSE NA NA CATAAA -17 NA NA NA 5 NA PB.326.15 chr1 - 4253 25 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681717.1 5993 34 108868 544 -598 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAATGTTTAGCAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.326.16 chr1 - 2411 16 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681717.1 5993 34 186271 544 -13411 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAATGTTTAGCAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.326.17 chr1 - 2209 15 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681717.1 5993 34 188616 544 -11066 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAATGTTTAGCAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.326.18 chr1 - 1908 2 novel_not_in_catalog EIF4G3 novel 1597 11 NA NA 41475 -7 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAATGTTTAGCAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.326.19 chr1 - 1591 10 novel_in_catalog EIF4G3 novel 5793 31 NA NA -2367 -7 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAATGTTTAGCAAAAA NA FALSE NA NA TTTAAA -34 NA NA NA 2 NA PB.326.20 chr1 - 1537 10 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681717.1 5993 34 199597 544 -85 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAATGTTTAGCAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.326.21 chr1 - 1439 9 novel_in_catalog EIF4G3 novel 1597 11 NA NA -134 -7 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAATGTTTAGCAAAAA NA FALSE NA NA GGGGCT -7 NA NA NA 2 NA PB.326.22 chr1 - 2041 15 novel_in_catalog EIF4G3 novel 5793 31 NA NA -13237 -56 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATATTTTCTGTTTTAAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.326.23 chr1 - 2829 21 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681767.1 5884 33 155561 817 -44121 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAATGAAACAAAAGAAACA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.326.24 chr1 - 953 8 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000435383.2 1597 11 10339 280 10339 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAATGAAACAAAAGAAACA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.326.25 chr1 - 752 6 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000435383.2 1597 11 23571 280 23571 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAATGAAACAAAAGAAACA NA FALSE NA NA AAGAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.326.29 chr1 - 1015 7 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681767.1 5884 33 155472 55814 -44210 30809 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AGAAAATTGTGAAAGAAAGA NA FALSE NA NA AATATA -11 NA NA NA 3 NA PB.341.2 chr1 + 4190 19 novel_not_in_catalog NBPF3 novel 4401 18 NA NA 1 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTCTGGACTGTTGGATTGT 19 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 6 NA PB.341.3 chr1 + 1064 3 novel_not_in_catalog NBPF3 novel 1417 3 NA NA 1 1131 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTCTGCTTCTGTCTGTTA 19 TRUE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 5 NA PB.341.4 chr1 + 518 3 novel_not_in_catalog NBPF3 novel 1417 3 NA NA 1 -3124 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAGAAAAAGAATCGTACTGC 19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.341.5 chr1 + 4373 19 novel_not_in_catalog NBPF3 novel 4401 18 NA NA -3 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTCTGGACTGTTGGATTGTT 23 TRUE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.341.7 chr1 + 2586 9 incomplete-splice_match NBPF3 ENST00000619554.1 1831 14 4922 -1484 77 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATCACTCTGGACTGTTGGAT 5015 FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.342.1 chr1 - 4102 12 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 23500 -1335 668 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GCCATGTGTCTGGGTGTCTG 5882 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.342.2 chr1 - 3023 3 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 54255 -1334 -3213 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GGCCATGTGTCTGGGTGTCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.342.6 chr1 - 3610 8 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 42722 -1332 1523 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGGGCCATGTGTCTGGGTGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.342.7 chr1 - 3084 3 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 54192 -1332 -3276 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGGGCCATGTGTCTGGGTGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.342.10 chr1 - 5099 19 full-splice_match ECE1 ENST00000415912.6 5099 19 -6 6 -6 -3 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GAGGGCCATGTGTCTGGGTG 385 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.342.11 chr1 - 4256 13 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 21955 -1330 -877 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGAGGGCCATGTGTCTGGGT 4337 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.342.14 chr1 - 3917 11 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 32263 -1330 -8936 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGAGGGCCATGTGTCTGGGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.342.18 chr1 - 3713 18 full-splice_match ECE1 ENST00000264205.10 2381 18 0 -1332 0 -21 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAGAAAAGAGAAAC 8745 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.342.19 chr1 - 3760 19 full-splice_match ECE1 ENST00000415912.6 5099 19 -19 1358 -19 -21 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAGAAAAGAGAAAC -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.342.20 chr1 - 3673 19 full-splice_match ECE1 ENST00000374893.11 5067 19 39 1355 39 -21 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAGAAAAGAGAAAC 15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.342.21 chr1 - 3135 15 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 19192 21 -3640 -21 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAGAAAAGAGAAAC 1574 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.342.22 chr1 - 2545 11 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 32284 21 -8915 -21 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAGAAAAGAGAAAC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.342.23 chr1 - 2387 9 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 41303 21 104 -21 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAGAAAAGAGAAAC NA FALSE NA NA AAAACA -43 NA NA NA 4 NA PB.342.24 chr1 - 2130 7 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 43667 21 2468 -21 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAGAAAAGAGAAAC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.342.25 chr1 - 1668 3 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 54255 21 -3213 -21 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAGAAAAGAGAAAC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.342.29 chr1 - 2806 19 full-splice_match ECE1 ENST00000415912.6 5099 19 4 2289 4 278 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGAATTGGTATATTTATT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.342.30 chr1 - 2759 19 full-splice_match ECE1 ENST00000374893.11 5067 19 22 2286 22 278 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGAATTGGTATATTTATT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.342.31 chr1 - 1792 12 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 23523 952 691 278 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGAATTGGTATATTTATT 5905 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.342.32 chr1 - 2732 18 full-splice_match ECE1 ENST00000264205.10 2381 18 46 -397 46 274 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGGAAAGAATTGGTATATT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.342.33 chr1 - 1258 8 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 42786 956 1587 274 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGGAAAGAATTGGTATATT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.342.34 chr1 - 761 3 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 54227 956 -3241 274 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGGAAAGAATTGGTATATT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.343.2 chr1 - 3336 25 full-splice_match RAP1GAP ENST00000495204.5 2489 25 -62 -785 5 -1 alternative_3end5end TRUE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACCCAGAGTTGGGCCTGGC -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.343.3 chr1 - 3285 25 full-splice_match RAP1GAP ENST00000374765.9 3322 25 35 2 -14 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACCCAGAGTTGGGCCTGGC 21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.343.4 chr1 - 1150 3 incomplete-splice_match RAP1GAP ENST00000374763.6 3334 23 22014 4 22014 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGTACCCAGAGTTGGGCCTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.343.5 chr1 - 1523 15 incomplete-splice_match RAP1GAP ENST00000495204.5 2489 25 -21 12342 -21 3686 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CATAGTAGACTGGCCTCTCC -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.344.1 chr1 + 2477 11 novel_in_catalog ALPL novel 2536 12 NA NA -49 1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGAGCTGAGTCTTTGTGGTC 369 FALSE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 2 NA PB.344.2 chr1 + 2524 6 incomplete-splice_match ALPL ENST00000374840.8 2536 12 -65 12582 -39 1617 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAAGAAAGAAG 379 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 3 NA PB.344.3 chr1 + 2552 12 full-splice_match ALPL ENST00000374840.8 2536 12 -24 8 2 3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 20 5.218252 0.717525 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TCCGAGGACAGAGCTGAGTC 420 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 20 NA PB.344.4 chr1 + 1864 7 incomplete-splice_match ALPL ENST00000374832.5 2193 12 12762 -397 -6262 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGAGCTGAGTCTTTGTGG 794 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.344.5 chr1 + 1328 3 incomplete-splice_match ALPL ENST00000374829.2 1595 4 1252 4 1252 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAATATTTCCGAGGACAGAG -5 TRUE NA NA AATAAA -8 NA NA NA 2 NA PB.344.6 chr1 + 1198 3 incomplete-splice_match ALPL ENST00000374829.2 1595 4 1388 -2 1388 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TTCCGAGGACAGAGCTGAGT -11 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.345.1 chr1 - 3874 27 novel_in_catalog USP48 novel 4419 27 NA NA -15 2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CTAAGTGTGGAAAAGTGTCT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.345.2 chr1 - 2940 22 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 31552 604 -3406 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CCTAAGTGTGGAAAAGTGTC 4876 FALSE NA NA AATAAA -23 NA NA NA 2 NA PB.345.3 chr1 - 1916 15 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 61444 604 -559 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CCTAAGTGTGGAAAAGTGTC 3380 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.345.4 chr1 - 1229 8 incomplete-splice_match USP48 ENST00000529637.5 3228 27 78609 -465 233 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CCTAAGTGTGGAAAAGTGTC 1383 FALSE NA NA AAAACA -23 NA NA NA 3 NA PB.345.5 chr1 - 1154 8 incomplete-splice_match USP48 ENST00000529637.5 3228 27 78684 -465 308 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CCTAAGTGTGGAAAAGTGTC 1458 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.345.6 chr1 - 959 6 incomplete-splice_match USP48 ENST00000529637.5 3228 27 81431 -465 3055 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CCTAAGTGTGGAAAAGTGTC 4205 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.345.7 chr1 - 3769 27 full-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 44 606 44 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GTCCTAAGTGTGGAAAAGTG -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.345.8 chr1 - 1351 9 incomplete-splice_match USP48 ENST00000529637.5 3228 27 77151 -463 -1225 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GTCCTAAGTGTGGAAAAGTG NA FALSE NA NA AATATA -23 NA NA NA 2 NA PB.345.9 chr1 - 3490 27 full-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 0 929 0 -28 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGACTTGAAGGAAATGTTTC 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.345.10 chr1 - 857 8 incomplete-splice_match USP48 ENST00000529637.5 3228 27 78662 -146 286 -22 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GAAGGAAATGTTTCCAATTT 1436 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.345.11 chr1 - 1305 12 incomplete-splice_match USP48 ENST00000529637.5 3228 27 76158 -145 -2218 -23 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TGAAGGAAATGTTTCCAATT NA FALSE NA NA TTTAAA -5 NA NA NA 3 NA PB.345.12 chr1 - 1583 15 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 61454 927 -549 -26 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTTGAAGGAAATGTTTCCA 3390 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.345.13 chr1 - 1400 13 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 67691 934 5688 -33 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 ACATCAGACTTGAAGGAAAT 9627 FALSE NA NA AATACA -34 NA NA NA 3 NA PB.345.16 chr1 - 2280 16 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 0 28446 0 8380 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GTACTGAACGCTACTGACAT 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.345.17 chr1 - 6560 13 novel_in_catalog USP48 novel 4419 27 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.345.18 chr1 - 2564 14 incomplete-splice_match USP48 ENST00000400301.5 4309 26 -432 42738 -21 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.345.19 chr1 - 2103 14 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 -17 42738 -17 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 105 27.395823 1.437684 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 105 NA PB.345.20 chr1 - 2120 14 novel_in_catalog USP48 novel 4309 26 NA NA -21 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.345.21 chr1 - 2044 14 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 42 42738 42 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 78 20.351183 1.308590 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 78 NA PB.345.22 chr1 - 1884 13 novel_in_catalog USP48 novel 4309 26 NA NA 19 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.345.23 chr1 - 1888 13 novel_in_catalog USP48 novel 4419 27 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.345.24 chr1 - 1850 14 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 236 42738 30 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT 288 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.345.25 chr1 - 1710 13 incomplete-splice_match USP48 ENST00000529637.5 3228 27 25255 41669 -9545 0 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.345.26 chr1 - 1752 12 novel_not_in_catalog USP48 novel 4309 26 NA NA 25 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.345.27 chr1 - 1527 12 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 26559 42738 -8399 0 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.345.28 chr1 - 1525 3 incomplete-splice_match USP48 ENST00000487880.2 524 4 1394 0 -57 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.345.29 chr1 - 1321 10 incomplete-splice_match USP48 ENST00000529637.5 3228 27 30370 41669 -4430 0 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT 3852 FALSE NA NA CATAAA -45 NA NA NA 2 NA PB.345.30 chr1 - 1321 11 novel_in_catalog USP48 novel 4309 26 NA NA -8391 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.345.31 chr1 - 1132 8 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 34866 42738 -92 0 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT 8190 FALSE NA NA GATAAA -3 NA NA NA 7 NA PB.345.32 chr1 - 891 3 incomplete-splice_match USP48 ENST00000487880.2 524 4 2028 0 577 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT 543 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.345.33 chr1 - 827 6 novel_in_catalog USP48 novel 4309 26 NA NA -3716 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.345.34 chr1 - 1102 3 incomplete-splice_match USP48 ENST00000529637.5 3228 27 46437 48486 -3718 -2 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTGTACTTGTGGTTTGTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.345.35 chr1 - 2333 11 full-splice_match USP48 ENST00000421625.6 2818 11 482 3 25 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 46 12.001980 1.079253 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAATTGTACTTGTGGTTTGT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 46 NA PB.345.36 chr1 - 1913 9 incomplete-splice_match USP48 ENST00000421625.6 2818 11 26902 3 -8513 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAATTGTACTTGTGGTTTGT NA FALSE NA NA TATAAA -23 NA NA NA 5 NA PB.345.37 chr1 - 1628 7 incomplete-splice_match USP48 ENST00000421625.6 2818 11 30953 3 -4462 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAATTGTACTTGTGGTTTGT 3820 FALSE NA NA AAGAAA -26 NA NA NA 2 NA PB.345.38 chr1 - 1421 6 incomplete-splice_match USP48 ENST00000421625.6 2818 11 32071 3 -3344 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAATTGTACTTGTGGTTTGT 4938 FALSE NA NA CATAAA -12 NA NA NA 4 NA PB.345.39 chr1 - 1884 11 full-splice_match USP48 ENST00000421625.6 2818 11 457 477 0 284 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CACTCTGCATCCATGAGTAT 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.345.42 chr1 - 1301 9 incomplete-splice_match USP48 ENST00000421625.6 2818 11 471 8643 14 -7882 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAGATGGAGGGGAAGAAA 22 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.345.43 chr1 - 963 6 incomplete-splice_match USP48 ENST00000421625.6 2818 11 457 23659 0 1497 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGGTATTCAAATTTTGGTG 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.345.44 chr1 - 592 3 incomplete-splice_match USP48 ENST00000532737.1 680 5 77 3523 0 903 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGAAGAAAAAGGTGGGTGG 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.346.2 chr1 - 2276 11 full-splice_match HSPG2 ENST00000486901.1 3586 11 1310 0 1310 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.391864 0.530438 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGGGGCCTCCTGAGTCTTTG 7440 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.346.3 chr1 - 1677 7 incomplete-splice_match HSPG2 ENST00000486901.1 3586 11 2832 0 2832 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGGGGCCTCCTGAGTCTTTG 8962 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.346.4 chr1 - 1345 2 full-splice_match HSPG2 ENST00000481644.1 839 2 550 -1056 550 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGGGGCCTCCTGAGTCTTTG 166 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.346.8 chr1 - 1955 9 incomplete-splice_match HSPG2 ENST00000486901.1 3586 11 2341 1 2341 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGGGGCCTCCTGAGTCTTT 8471 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.346.9 chr1 - 1523 2 full-splice_match HSPG2 ENST00000481644.1 839 2 371 -1055 371 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGGGGCCTCCTGAGTCTTT -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.346.10 chr1 - 1447 4 incomplete-splice_match HSPG2 ENST00000486901.1 3586 11 6392 1 -55 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGGGGCCTCCTGAGTCTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.346.11 chr1 - 3681 21 incomplete-splice_match HSPG2 ENST00000374695.8 14341 97 102476 3 -1257 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CCAGGGGCCTCCTGAGTCTT 2009 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.349.2 chr1 + 1071 2 full-splice_match LINC00339 ENST00000416769.2 1077 2 0 6 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAAATATGTGCTGTGGTG 6 TRUE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 8 NA PB.350.2 chr1 + 1580 6 full-splice_match CDC42 ENST00000656825.1 10503 6 -24 8947 17 -510 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 88 22.960310 1.360978 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTCATTGTCTTATATGCTT 10 FALSE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 88 NA PB.350.3 chr1 + 2098 6 full-splice_match CDC42 ENST00000656825.1 10503 6 -13 8418 -11 -4 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 268 69.924576 1.844630 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACAAGCCAGCCTGAGGGTTG -9 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 268 NA PB.350.5 chr1 + 747 6 full-splice_match CDC42 ENST00000656825.1 10503 6 11 9745 3 39 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 76 19.829357 1.297309 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 CAATAATGACAAATGCCCTG 15 TRUE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 76 NA PB.350.6 chr1 + 972 6 full-splice_match CDC42 ENST00000656825.1 10503 6 8 9523 0 261 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.435514 0.646944 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GTGGATGACTCTGTAACAGA 12 TRUE NA NA TTTAAA -15 NA NA NA 17 NA PB.350.7 chr1 + 1869 6 full-splice_match CDC42 ENST00000656825.1 10503 6 10 8624 2 -187 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.435514 0.646944 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATGCAGACTCTTCTTAAGT 14 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 17 NA PB.350.9 chr1 + 875 7 full-splice_match CDC42 ENST00000344548.7 2256 7 51 1330 2 40 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AATAATGACAAATGCCCTGC 14 TRUE NA NA ATTAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.350.10 chr1 + 1419 6 full-splice_match CDC42 ENST00000315554.13 1435 6 11 5 3 -5 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATAAATGCCTGATGAAGCTT 15 TRUE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 7 NA PB.350.11 chr1 + 2198 7 full-splice_match CDC42 ENST00000344548.7 2256 7 55 3 6 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.391864 0.530438 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAAGCCAGCCTGAGGGTTGT 18 FALSE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 13 NA PB.350.12 chr1 + 2175 6 full-splice_match CDC42 ENST00000400259.5 2274 6 118 -19 28 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACAAGCCAGCCTGAGGGTTG 16 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.350.16 chr1 + 917 5 incomplete-splice_match CDC42 ENST00000662562.1 1645 7 24972 -261 24972 261 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.740077 0.758918 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GTGGATGACTCTGTAACAGA NA FALSE NA NA TTTAAA -15 NA NA NA 22 NA PB.350.18 chr1 + 1345 4 incomplete-splice_match CDC42 ENST00000662562.1 1645 7 28258 -837 28258 -510 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTCATTGTCTTATATGCTT NA FALSE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.350.19 chr1 + 1242 3 incomplete-splice_match CDC42 ENST00000662562.1 1645 7 33005 -837 33005 -510 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTCATTGTCTTATATGCTT 2129 FALSE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.350.20 chr1 + 1714 2 incomplete-splice_match CDC42 ENST00000344548.7 2256 7 34000 4 33182 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.652776 0.562623 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACAAGCCAGCCTGAGGGTTG 2306 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 14 NA PB.350.21 chr1 + 1460 2 incomplete-splice_match CDC42 ENST00000344548.7 2256 7 34046 212 33228 -189 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TTAATGCAGACTCTTCTTAA 2352 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.350.24 chr1 + 1017 2 incomplete-splice_match CDC42 ENST00000662562.1 1645 7 33350 -837 33350 -510 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTCATTGTCTTATATGCTT 2474 FALSE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 6 NA PB.353.1 chr1 + 2274 11 novel_in_catalog ZBTB40 novel 2000 9 NA NA 42 -20 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAACAAAGAAGATGAAAA NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.353.3 chr1 + 4583 13 incomplete-splice_match ZBTB40 ENST00000375647.5 8701 18 54197 2729 54181 -2729 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAGAAAAAACAAACAAC NA FALSE NA NA AAAACA -42 NA NA NA 2 NA PB.353.4 chr1 + 2309 2 incomplete-splice_match ZBTB40 ENST00000375647.5 8701 18 72509 2729 72493 -2729 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAGAAAAAACAAACAAC NA FALSE NA NA AAAACA -42 NA NA NA 2 NA PB.357.4 chr1 - 5156 2 incomplete-splice_match LUZP1 ENST00000302291.8 8898 5 85551 936 41422 -936 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATACTCTGTGCGAGTCTGTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.358.3 chr1 - 1173 4 full-splice_match LUZP1 ENST00000471849.5 1190 4 6 11 6 -11 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAACAAGAAACAAATCAGAA -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.358.4 chr1 - 1107 3 incomplete-splice_match LUZP1 ENST00000302291.8 8898 5 8969 9424 6 -11 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 32 8.349203 0.921645 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAACAAGAAACAAATCAGAA -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 32 NA PB.359.1 chr1 + 1478 10 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000692975.1 3793 18 25 14473 0 -7411 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CTGTATTTTCTTCATAGCTG -37 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.359.2 chr1 + 3058 20 novel_in_catalog KDM1A novel 3085 21 NA NA 9 1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAATTGGCCCTCTCTTTTGT -28 TRUE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 9 NA PB.359.3 chr1 + 2995 19 full-splice_match KDM1A ENST00000356634.7 3033 19 31 7 11 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG -26 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 10 NA PB.359.4 chr1 + 2784 19 full-splice_match KDM1A ENST00000356634.7 3033 19 242 7 222 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG 185 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 8 NA PB.359.5 chr1 + 2596 19 full-splice_match KDM1A ENST00000356634.7 3033 19 430 7 410 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG 373 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 5 NA PB.359.6 chr1 + 2647 20 novel_in_catalog KDM1A novel 3085 21 NA NA 419 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.130951 0.495676 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG 382 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 12 NA PB.359.7 chr1 + 2476 19 novel_in_catalog KDM1A novel 3085 21 NA NA 11111 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG 11 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 4 NA PB.359.8 chr1 + 2407 18 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000356634.7 3033 19 11140 7 11120 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG 20 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 7 NA PB.359.9 chr1 + 2395 18 novel_in_catalog KDM1A novel 3085 21 NA NA -5965 1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CCCTCTCTTTTGTTCCTTTG NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.359.10 chr1 + 2274 17 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000356634.7 3033 19 31025 7 48 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG 76 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 9 NA PB.359.11 chr1 + 731 8 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000688680.1 3984 15 31045 7411 63 -7411 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CTGTATTTTCTTCATAGCTG 91 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.359.12 chr1 + 2207 16 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000356634.7 3033 19 34339 0 3362 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GCCCTCTCTTTTGTTCCTTT 3390 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 10 NA PB.359.13 chr1 + 2020 14 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000356634.7 3033 19 36519 6 5542 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 31 8.088291 0.907857 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAATTGGCCCTCTCTTTTGT 5570 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 31 NA PB.359.14 chr1 + 1865 12 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000356634.7 3033 19 39624 8 -6127 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 20 5.218252 0.717525 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAAAATTGGCCCTCTCTTTT -5 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 20 NA PB.359.16 chr1 + 1933 11 full-splice_match KDM1A ENST00000686793.1 2133 11 206 -6 206 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG 9299 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 2 NA PB.359.17 chr1 + 1739 11 full-splice_match KDM1A ENST00000686793.1 2133 11 396 -2 396 2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATATAAAATTGGCCCTCTCT 9489 FALSE NA NA AATAAA -6 NA NA NA 11 NA PB.359.18 chr1 + 1560 10 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000686793.1 2133 11 957 -5 957 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 38 9.914679 0.996279 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAAAATTGGCCCTCTCTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 38 NA PB.359.19 chr1 + 1404 8 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000686793.1 2133 11 3952 -7 765 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.479165 0.738714 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAATTGGCCCTCTCTTTTGT 760 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 21 NA PB.359.20 chr1 + 1336 7 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000689971.1 1823 8 2436 -17 1933 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GCCCTCTCTTTTGTTCCTTT 1928 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 10 NA PB.359.21 chr1 + 1201 6 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000689971.1 1823 8 6388 -10 8 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 23 6.000990 0.778223 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG 5880 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 23 NA PB.359.22 chr1 + 1079 5 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000494920.1 905 6 1759 -328 -20 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.391864 0.530438 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG 7631 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 13 NA PB.359.23 chr1 + 935 5 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000494920.1 905 6 1904 -329 125 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 20 5.218252 0.717525 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAATTGGCCCTCTCTTTTGT 7776 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 20 NA PB.359.24 chr1 + 4173 2 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000685243.1 1123 6 129 -3 129 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GCCCTCTCTTTTGTTCCTTT 7780 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.359.25 chr1 + 811 4 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000494920.1 905 6 2402 -328 273 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.652776 0.562623 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG 8274 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 14 NA PB.359.26 chr1 + 1517 3 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000685243.1 1123 6 2431 -3 571 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GCCCTCTCTTTTGTTCCTTT NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.359.27 chr1 + 759 3 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000494920.1 905 6 4239 -335 600 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GCCCTCTCTTTTGTTCCTTT NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.359.28 chr1 + 1430 3 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000685243.1 1123 6 2512 3 652 1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAATTGGCCCTCTCTTTTGT NA FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 3 NA PB.359.29 chr1 + 1205 1 full-splice_match KDM1A ENST00000602503.1 2810 1 1605 0 1605 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG NA FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 3 NA PB.359.30 chr1 + 617 1 full-splice_match KDM1A ENST00000602503.1 2810 1 2193 0 2193 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG NA FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 2 NA PB.360.1 chr1 - 1772 2 full-splice_match LINC01355 ENST00000604481.1 400 2 -1396 24 -98 -24 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAAAGAAGAGAGAAA NA FALSE NA NA AAAAAG -17 NA NA NA 2 NA PB.360.2 chr1 - 605 1 full-splice_match LINC01355 ENST00000566551.1 5444 1 1768 3071 470 -24 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAAAGAAGAGAGAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.361.1 chr1 - 1703 2 full-splice_match HNRNPR ENST00000464516.1 557 2 -1140 -6 -1140 6 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTTTTGGTTAGTGTTTTCCA 2384 FALSE NA NA CATAAA -4 NA NA NA 2 NA PB.363.4 chr1 - 1639 2 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000476660.1 1637 3 585 -248 585 247 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAAAAAAAAACAGGTTC 7321 FALSE NA NA TATAAA -30 NA NA NA 4 NA PB.363.10 chr1 - 2682 11 full-splice_match HNRNPR ENST00000374612.5 2694 11 6 6 1 -6 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 170 44.355145 1.646944 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 334 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 170 NA PB.363.11 chr1 - 2384 9 full-splice_match HNRNPR ENST00000606561.5 1837 9 11 -558 0 8 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 30 7.827378 0.893616 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAATTCAATTGTGTCCTAAA -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 30 NA PB.363.12 chr1 - 1459 3 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000641107.1 646 5 4 5812 4 8 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 63 16.437494 1.215836 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAATTCAATTGTGTCCTAAA 5032 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 63 NA PB.363.15 chr1 - 1617 4 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000427764.3 1788 9 22456 -662 -4951 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 40 10.436504 1.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 5057 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 40 NA PB.363.19 chr1 - 2454 10 novel_in_catalog HNRNPR novel 7751 11 NA NA 31 1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 35 9.131941 0.960563 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TACCTATTTCAAATTCAATT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 35 NA PB.363.20 chr1 - 2681 11 full-splice_match HNRNPR ENST00000374616.7 2691 11 1 9 1 -6 reference_match FALSE noncanonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 341 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.363.22 chr1 - 2556 10 novel_in_catalog HNRNPR novel 7751 11 NA NA 3 -6 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.913689 0.592586 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 343 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.363.23 chr1 - 2498 10 novel_in_catalog HNRNPR novel 2694 11 NA NA 1 -6 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 341 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.363.24 chr1 - 2514 10 novel_in_catalog HNRNPR novel 2694 11 NA NA 0 -6 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 321 83.752945 1.923000 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 333 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 321 NA PB.363.25 chr1 - 2505 10 full-splice_match HNRNPR ENST00000478691.5 7646 10 37 5104 -4 -6 alternative_3end FALSE noncanonical NA NA NA NA 29 7.566465 0.878893 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 29 NA PB.363.26 chr1 - 2573 10 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000374612.5 2694 11 3305 6 -9 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 3633 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.363.28 chr1 - 2317 9 novel_in_catalog HNRNPR novel 2694 11 NA NA -2 -6 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.363.30 chr1 - 2341 9 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000374612.5 2694 11 5780 6 7 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.174602 0.620615 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 6108 FALSE NA NA ATTAAA -38 NA NA NA 16 NA PB.363.31 chr1 - 2230 8 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000374612.5 2694 11 6519 6 746 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 6847 FALSE NA NA CATAAA -7 NA NA NA 11 NA PB.363.32 chr1 - 2245 8 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000427764.3 1788 9 2448 -662 -11 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 6090 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.363.33 chr1 - 2165 7 novel_in_catalog HNRNPR novel 1837 9 NA NA 1 -6 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 341 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.363.34 chr1 - 2136 7 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000427764.3 1788 9 3185 -662 726 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 6827 FALSE NA NA CATAAA -27 NA NA NA 2 NA PB.363.35 chr1 - 2070 6 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000427764.3 1788 9 17272 -662 9895 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.174602 0.620615 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 8096 FALSE NA NA AATAAA -45 NA NA NA 16 NA PB.363.36 chr1 - 1950 6 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000427764.3 1788 9 17392 -662 -10015 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.435514 0.646944 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.363.38 chr1 - 1834 5 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000427764.3 1788 9 19400 -662 -8007 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.740077 0.758918 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 2001 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 22 NA PB.363.39 chr1 - 1698 4 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000427764.3 1788 9 22375 -662 -5032 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.479165 0.738714 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 21 NA PB.363.46 chr1 - 2373 9 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000374612.5 2694 11 5726 28 -47 -28 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATAAAACTAAAAAATCTAT 6054 FALSE NA NA ATTAAA -27 NA NA NA 3 NA PB.363.47 chr1 - 1868 5 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000427764.3 1788 9 19344 -640 -8063 -28 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATAAAACTAAAAAATCTAT 1945 FALSE NA NA AAGAAA -39 NA NA NA 2 NA PB.363.48 chr1 - 1492 3 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000641107.1 646 5 -68 5851 -68 -28 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATAAAACTAAAAAATCTAT 9940 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.363.49 chr1 - 1349 2 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000476660.1 1637 3 597 30 597 -28 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATAAAACTAAAAAATCTAT 7333 FALSE NA NA TATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.363.63 chr1 - 1629 8 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000374612.5 2694 11 6519 607 746 -60 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAAAAATTGGCTTAA 6847 FALSE NA NA CATAAA -7 NA NA NA 7 NA PB.363.64 chr1 - 1420 6 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000427764.3 1788 9 17321 -61 9944 -60 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAAAAATTGGCTTAA 8145 FALSE NA NA TATAAA -32 NA NA NA 8 NA PB.363.69 chr1 - 1328 10 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000302271.11 7751 11 -6 6563 5 -797 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 54 14.089281 1.148889 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAGAAAAGGAAAGAGCGCCA -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 54 NA PB.363.70 chr1 - 1179 9 novel_in_catalog HNRNPR novel 2694 11 NA NA 3 -797 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 111 28.961300 1.461818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAGAAAAGGAAAGAGCGCCA 343 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 111 NA PB.363.71 chr1 - 1075 8 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000606561.5 1837 9 -22 918 0 -797 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAGAAAAGGAAAGAGCGCCA 333 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.363.72 chr1 - 996 8 novel_in_catalog HNRNPR novel 2694 11 NA NA -6 -797 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAGAAAAGGAAAGAGCGCCA -19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.363.79 chr1 - 777 6 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000427764.3 1788 9 3168 848 709 -848 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAGAAATAGAAGGGGAAGA 6810 FALSE NA NA AATAAA -4 NA NA NA 2 NA PB.363.80 chr1 - 540 5 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000427764.3 1788 9 17426 848 -9981 -848 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAGAAATAGAAGGGGAAGA 8250 FALSE NA NA GATAAA -30 NA NA NA 2 NA PB.363.81 chr1 - 660 5 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000427764.3 1788 9 17304 850 9927 -850 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 GCAAAGAAATAGAAGGGGAA 8128 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.363.82 chr1 - 1227 9 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000302271.11 7751 11 -25 8913 1 -2 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAGATTATGCATTTGTTCA 341 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.363.83 chr1 - 1058 8 novel_in_catalog HNRNPR novel 2694 11 NA NA 4 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAGATTATGCATTTGTTCA 344 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.363.86 chr1 - 950 8 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000302271.11 7751 11 -15 13960 -4 -165 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.174602 0.620615 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGAAGAATCGGGGGTT -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.363.88 chr1 - 790 7 novel_in_catalog HNRNPR novel 1032 8 NA NA 5 -165 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.957339 0.695249 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGAAGAATCGGGGGTT 345 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.363.89 chr1 - 688 6 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000606561.5 1837 9 -22 8315 0 -165 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGAAGAATCGGGGGTT 333 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.363.100 chr1 - 680 5 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000478691.5 7646 10 24 18808 -2 -5013 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAATGTTTGTAGTTAACA 338 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.366.1 chr1 - 4245 3 full-splice_match ZNF436 ENST00000374608.3 3788 3 71 -528 71 1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 CAAACCTGAGAATTATTTTA 20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.366.4 chr1 - 3716 3 full-splice_match ZNF436 ENST00000374608.3 3788 3 71 1 71 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGCTTCTGTGAGCCACTATG 20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.367.1 chr1 - 1585 11 full-splice_match TCEA3 ENST00000450454.7 1719 11 -19 153 -19 -153 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACCTGAGGTGTCATATCTTT 44 FALSE NA NA GGGGCT -45 NA NA NA 6 NA PB.367.2 chr1 - 1157 7 novel_not_in_catalog TCEA3 novel 1719 11 NA NA 14366 -155 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGACCTGAGGTGTCATATCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.367.3 chr1 - 1133 11 full-splice_match TCEA3 ENST00000450454.7 1719 11 129 457 -1 -457 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCTGTCTGAGTGGGATG 192 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.367.4 chr1 - 1221 10 novel_in_catalog TCEA3 novel 1719 11 NA NA -31 -466 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATACTGAACTCTGTCTG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.367.5 chr1 - 900 7 novel_not_in_catalog TCEA3 novel 1719 11 NA NA 14312 -466 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATACTGAACTCTGTCTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.367.6 chr1 - 1239 11 full-splice_match TCEA3 ENST00000450454.7 1719 11 13 467 13 -467 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 25 6.522815 0.814435 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GAAAATACTGAACTCTGTCT -6 TRUE NA NA GGGGCT -13 NA NA NA 25 NA PB.368.1 chr1 + 2827 1 full-splice_match ZNF436-AS1 ENST00000335648.3 2547 1 -277 -3 -4 -1 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACAATTGTCATAGTTTTTTG -3 TRUE NA NA AATAAA -25 NA NA NA 7 NA PB.368.2 chr1 + 895 3 full-splice_match ZNF436-AS1 ENST00000437367.4 898 3 -5 8 -4 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CAGCACAATTGTCATAGTTT -3 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 6 NA PB.368.3 chr1 + 1192 2 full-splice_match ZNF436-AS1 ENST00000454117.2 1266 2 17 57 2 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCACAATTGTCATAGTTTT 4 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 7 NA PB.368.4 chr1 + 702 3 full-splice_match ZNF436-AS1 ENST00000690463.1 706 3 5 -1 5 1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATTGTCATAGTTTTTTGTA 7 TRUE NA NA AATAAA -27 NA NA NA 2 NA PB.368.5 chr1 + 951 1 full-splice_match ZNF436-AS1 ENST00000335648.3 2547 1 1596 0 1594 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCACAATTGTCATAGTTTT 1615 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.369.1 chr1 - 4109 25 full-splice_match ASAP3 ENST00000336689.8 4051 25 -59 1 -46 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTCCAGTGGTTTCATTTATG -32 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.369.2 chr1 - 1434 2 incomplete-splice_match ASAP3 ENST00000465372.5 936 5 2428 -965 2428 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTTTCCAGTGGTTTCATTT 5571 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.371.1 chr1 - 1888 8 novel_not_in_catalog E2F2 novel 5196 7 NA NA 322 767 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATGGTTGCAGGCGCCTGTA -33 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.371.2 chr1 - 5205 7 full-splice_match E2F2 ENST00000361729.3 5196 7 0 -9 0 9 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCTTGTCTTTGTCGTGCTT -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.373.2 chr1 + 619 6 full-splice_match RPL11 ENST00000374550.8 660 6 39 2 -25 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 467 121.846184 2.085812 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATGTGCAATTCTGTTGTG -1 TRUE NA NA AATAAA -42 NA NA NA 467 NA PB.373.3 chr1 + 1603 5 full-splice_match RPL11 ENST00000443624.6 1600 5 0 -3 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATGTGCAATTCTGTTGTG 5 TRUE NA NA AATAAA -42 NA NA NA 5 NA PB.373.4 chr1 + 813 6 full-splice_match RPL11 ENST00000467075.2 823 6 0 10 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATGTGCAATTCTGTTGTG 20 FALSE NA NA AATAAA -42 NA NA NA 6 NA PB.373.5 chr1 + 903 5 full-splice_match RPL11 ENST00000458455.2 879 5 -27 3 -27 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATGTGCAATTCTGTTGTG 478 FALSE NA NA AATAAA -42 NA NA NA 2 NA PB.373.6 chr1 + 454 5 full-splice_match RPL11 ENST00000458455.2 879 5 422 3 119 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATGTGCAATTCTGTTGTG 37 FALSE NA NA AATAAA -42 NA NA NA 5 NA PB.373.7 chr1 + 1391 3 incomplete-splice_match RPL11 ENST00000443624.6 1600 5 2038 -3 1235 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATGTGCAATTCTGTTGTG -4 TRUE NA NA AATAAA -42 NA NA NA 2 NA PB.373.8 chr1 + 1783 2 incomplete-splice_match RPL11 ENST00000458455.2 879 5 1581 3 1278 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATGTGCAATTCTGTTGTG 6 TRUE NA NA AATAAA -42 NA NA NA 2 NA PB.373.9 chr1 + 222 3 incomplete-splice_match RPL11 ENST00000458455.2 879 5 2447 3 2144 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATGTGCAATTCTGTTGTG 91 FALSE NA NA AATAAA -42 NA NA NA 2 NA PB.373.12 chr1 + 804 2 incomplete-splice_match RPL11 ENST00000458455.2 879 5 2879 -5 2576 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AATTCTGTTGTGTGTTCTGT 523 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.375.1 chr1 - 1433 3 full-splice_match ID3 ENST00000374561.6 950 3 2 -485 2 485 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GCCTGGTTTCATTTCCTTCT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.375.2 chr1 - 976 3 full-splice_match ID3 ENST00000374561.6 950 3 -28 2 -28 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2156 562.527588 2.750144 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATATGATGACACCCGTCTC 312 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2156 NA PB.375.3 chr1 - 872 3 full-splice_match ID3 ENST00000374561.6 950 3 65 13 7 -5 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.740077 0.758918 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACACTTGTGTATATGATG 405 FALSE NA NA AAGAAA -21 NA NA NA 22 NA PB.375.4 chr1 - 1291 3 full-splice_match ID3 ENST00000374561.6 950 3 -343 2 -343 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATATGATGACACCCGTCTC -3 TRUE NA NA CATAAA -24 NA NA NA 2 NA PB.375.5 chr1 - 1094 3 full-splice_match ID3 ENST00000374561.6 950 3 -146 2 -146 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATATGATGACACCCGTCTC 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.375.6 chr1 - 1053 2 full-splice_match ID3 ENST00000463312.1 623 2 -424 -6 2 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATATGATGACACCCGTCTC 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.375.10 chr1 - 1460 2 full-splice_match ID3 ENST00000486541.1 892 2 -56 -512 2 1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 34 8.871029 0.947974 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TTGTGTATATGATGACACCC 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 34 NA PB.375.11 chr1 - 1024 3 full-splice_match ID3 ENST00000374561.6 950 3 -87 13 -87 -5 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACACTTGTGTATATGATG 253 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.375.12 chr1 - 930 3 novel_not_in_catalog ID3 novel 950 3 NA NA 0 -5 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACACTTGTGTATATGATG -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.375.13 chr1 - 880 3 novel_not_in_catalog ID3 novel 950 3 NA NA 0 -5 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACACTTGTGTATATGATG -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.375.14 chr1 - 785 3 full-splice_match ID3 ENST00000374561.6 950 3 152 13 94 -5 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACACTTGTGTATATGATG 492 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.375.15 chr1 - 701 3 full-splice_match ID3 ENST00000374561.6 950 3 236 13 178 -5 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACACTTGTGTATATGATG 576 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.376.2 chr1 + 4820 11 full-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 -1 19 -1 -9 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.696427 0.671768 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAATAAAAAACAAACTCCAT -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.376.3 chr1 + 1338 4 incomplete-splice_match ELOA ENST00000609199.2 5075 10 26 10110 3 969 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 81 21.133921 1.324980 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAATGACTCTAAAAG -7 TRUE NA NA GATAAA -7 NA NA NA 81 NA PB.376.4 chr1 + 1148 4 incomplete-splice_match ELOA ENST00000609199.2 5075 10 23 10303 0 776 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AGAAGGGAAAGTCAAAACTA -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.376.5 chr1 + 2682 11 full-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 1 2155 1 -2119 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 78 20.351183 1.308590 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCCAGGTTTGTTTTT -9 TRUE NA NA AATAAA -26 NA NA NA 78 NA PB.376.8 chr1 + 2322 8 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 7463 2155 6900 -2119 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCCAGGTTTGTTTTT 7453 FALSE NA NA AATAAA -26 NA NA NA 3 NA PB.376.10 chr1 + 2056 8 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 7729 2155 7166 -2119 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCCAGGTTTGTTTTT 7719 FALSE NA NA AATAAA -26 NA NA NA 8 NA PB.376.11 chr1 + 1646 8 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 8134 2160 7571 -2124 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATATTATCCCCCAGGTTTG 8124 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 5 NA PB.376.12 chr1 + 1455 8 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 8325 2160 7762 -2124 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATATTATCCCCCAGGTTTG 8315 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 5 NA PB.376.13 chr1 + 1332 8 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 8453 2155 7890 -2119 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCCAGGTTTGTTTTT 8443 FALSE NA NA AATAAA -26 NA NA NA 2 NA PB.376.14 chr1 + 1106 6 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 10632 2159 10069 -2123 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATATTATCCCCCAGGTTTGT NA FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 4 NA PB.376.15 chr1 + 978 6 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 10764 2155 10201 -2119 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCCAGGTTTGTTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -26 NA NA NA 6 NA PB.376.16 chr1 + 791 4 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 12441 2154 11878 -2118 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCCCCAGGTTTGTTTTTG NA FALSE NA NA AATAAA -27 NA NA NA 8 NA PB.376.17 chr1 + 2736 3 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 12881 19 12318 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAATAAAAAACAAACTCCAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.377.2 chr1 + 1620 6 full-splice_match PITHD1 ENST00000246151.9 1590 6 -32 2 -32 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 192 50.095219 1.699796 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTTTGTATTTTCTTTTG -18 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 192 NA PB.377.3 chr1 + 1568 5 novel_in_catalog PITHD1 novel 1590 6 NA NA -25 -3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAATGTTTGTATTTTCTTTT -11 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 8 NA PB.377.4 chr1 + 1532 5 novel_in_catalog PITHD1 novel 1590 6 NA NA -23 -3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAATGTTTGTATTTTCTTTT -9 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.377.5 chr1 + 1062 6 full-splice_match PITHD1 ENST00000246151.9 1590 6 -4 532 -4 -532 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGATTGTTGTGTGACTTGT 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.377.7 chr1 + 1410 6 full-splice_match PITHD1 ENST00000246151.9 1590 6 178 2 178 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTTTGTATTTTCTTTTG 192 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 6 NA PB.377.8 chr1 + 1065 2 incomplete-splice_match PITHD1 ENST00000374524.1 1292 4 1123 2 1123 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTTTGTATTTTCTTTTG 7911 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 11 NA PB.378.1 chr1 - 974 4 full-splice_match ELOA-AS1 ENST00000427796.6 1112 4 1 137 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAAGTTGCCTTCAGGGCTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.378.2 chr1 - 843 4 full-splice_match ELOA-AS1 ENST00000664563.2 970 4 24 103 -10 -103 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAACAAACCAATTTCCAAC -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.379.1 chr1 - 2011 10 novel_in_catalog GALE novel 1516 12 NA NA -1 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCAGGTTCTCACAGATGGTC -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.379.2 chr1 - 1688 13 novel_not_in_catalog GALE novel 1516 12 NA NA 0 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCAGGTTCTCACAGATGGTC 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.379.3 chr1 - 1503 10 novel_in_catalog GALE novel 1516 12 NA NA -3 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCAGGTTCTCACAGATGGTC -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.379.4 chr1 - 1451 10 novel_in_catalog GALE novel 1516 12 NA NA -7 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCAGGTTCTCACAGATGGTC 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.379.5 chr1 - 1534 11 novel_in_catalog GALE novel 1516 12 NA NA -117 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCAGGTTCTCACAGATGGTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.379.6 chr1 - 1405 11 novel_in_catalog GALE novel 1516 12 NA NA -3 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCAGGTTCTCACAGATGGTC -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.379.7 chr1 - 1316 10 novel_in_catalog GALE novel 1516 12 NA NA 3 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCAGGTTCTCACAGATGGTC -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.379.8 chr1 - 1278 9 incomplete-splice_match GALE ENST00000374497.7 1488 12 1670 -1 381 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCAGGTTCTCACAGATGGTC 2043 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.379.9 chr1 - 1653 12 full-splice_match GALE ENST00000374497.7 1488 12 -165 0 -44 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GGCAGGTTCTCACAGATGGT 208 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.379.10 chr1 - 1519 12 full-splice_match GALE ENST00000617979.5 1516 12 -4 1 3 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 269 70.185493 1.846247 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GGCAGGTTCTCACAGATGGT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 269 NA PB.379.11 chr1 - 1577 11 incomplete-splice_match GALE ENST00000374497.7 1488 12 860 1 -9 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GGGCAGGTTCTCACAGATGG 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.379.12 chr1 - 1437 11 novel_in_catalog GALE novel 1516 12 NA NA -1 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GGGCAGGTTCTCACAGATGG -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.379.13 chr1 - 753 5 incomplete-splice_match GALE ENST00000374497.7 1488 12 3460 1 0 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GGGCAGGTTCTCACAGATGG 3833 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.379.14 chr1 - 1620 11 full-splice_match GALE ENST00000459934.5 1563 11 1 -58 0 1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.652776 0.562623 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGGGGCAGGTTCTCACAGAT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.379.15 chr1 - 1384 11 novel_in_catalog GALE novel 1516 12 NA NA 0 1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 44 11.480155 1.059948 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGGGGCAGGTTCTCACAGAT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 44 NA PB.379.16 chr1 - 1896 11 novel_in_catalog GALE novel 1516 12 NA NA -2 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTGGGGCAGGTTCTCACAG -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.379.17 chr1 - 1688 11 novel_not_in_catalog GALE novel 1516 12 NA NA 0 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTGGGGCAGGTTCTCACAG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.379.18 chr1 - 1116 8 incomplete-splice_match GALE ENST00000374497.7 1488 12 2210 5 921 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTGGGGCAGGTTCTCACAG 2583 FALSE NA NA CATAAA -19 NA NA NA 7 NA PB.379.19 chr1 - 909 7 incomplete-splice_match GALE ENST00000374497.7 1488 12 2662 5 -671 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTGGGGCAGGTTCTCACAG 3035 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.379.20 chr1 - 956 7 incomplete-splice_match GALE ENST00000374497.7 1488 12 2582 38 -751 23 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAGTATTTAAAAATAAAAA 2955 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.380.1 chr1 - 1588 9 full-splice_match HMGCL ENST00000374490.8 1570 9 -11 -7 -11 7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 260 67.837280 1.831468 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTCGGTTGTGCAGCTGTGT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 260 NA PB.380.2 chr1 - 1352 7 novel_not_in_catalog HMGCL novel 1354 7 NA NA -12 7 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTCGGTTGTGCAGCTGTGT -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.380.3 chr1 - 1182 5 incomplete-splice_match HMGCL ENST00000374490.8 1570 9 11124 -7 16 7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTCGGTTGTGCAGCTGTGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.380.4 chr1 - 920 3 incomplete-splice_match HMGCL ENST00000235958.4 1101 5 17161 -32 6080 7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTCGGTTGTGCAGCTGTGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.380.5 chr1 - 1366 7 full-splice_match HMGCL ENST00000436439.6 1354 7 -7 -5 -6 3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.740077 0.758918 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CAGCATTCGGTTGTGCAGCT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 22 NA PB.380.6 chr1 - 1474 9 novel_in_catalog HMGCL novel 1570 9 NA NA -14 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATTCCAGCATTCGGTTGTG -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.380.7 chr1 - 1372 7 incomplete-splice_match HMGCL ENST00000374490.8 1570 9 7884 2 -12 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATTCCAGCATTCGGTTGTG 7928 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.380.8 chr1 - 1552 9 novel_not_in_catalog HMGCL novel 1570 9 NA NA -9 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.130951 0.495676 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAATTCCAGCATTCGGTTGT -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.380.9 chr1 - 1542 9 novel_not_in_catalog HMGCL novel 1570 9 NA NA -9 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAATTCCAGCATTCGGTTGT -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.380.10 chr1 - 1031 4 incomplete-splice_match HMGCL ENST00000374490.8 1570 9 14655 3 3547 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.130951 0.495676 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAATTCCAGCATTCGGTTGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.380.12 chr1 - 2062 6 full-splice_match HMGCL ENST00000513148.1 2011 6 -22 -29 -9 29 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAT -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.381.1 chr1 + 1633 10 full-splice_match LYPLA2 ENST00000374514.8 1635 10 0 2 0 -2 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 587 153.155701 2.185133 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT -9 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 587 NA PB.381.2 chr1 + 1700 9 incomplete-splice_match LYPLA2 ENST00000374514.8 1635 10 14 2 14 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 5 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.381.4 chr1 + 1715 10 novel_in_catalog LYPLA2 novel 1635 10 NA NA -19 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.130951 0.495676 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 14 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 12 NA PB.381.5 chr1 + 1711 9 novel_in_catalog LYPLA2 novel 1635 10 NA NA -19 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 14 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 9 NA PB.381.7 chr1 + 1485 10 full-splice_match LYPLA2 ENST00000374503.7 868 10 -35 -582 -19 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 14 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 5 NA PB.381.8 chr1 + 1851 9 novel_in_catalog LYPLA2 novel 1635 10 NA NA -13 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT -9 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.381.9 chr1 + 1782 8 full-splice_match LYPLA2 ENST00000374502.7 1072 8 -43 -667 -9 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT -5 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 9 NA PB.381.11 chr1 + 1566 9 novel_in_catalog LYPLA2 novel 1635 10 NA NA -7 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.130951 0.495676 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT -3 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 12 NA PB.381.12 chr1 + 1571 10 novel_not_in_catalog LYPLA2 novel 1635 10 NA NA -1 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 3 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.381.13 chr1 + 1579 10 full-splice_match LYPLA2 ENST00000374514.8 1635 10 54 2 -4 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 74 19.307533 1.285727 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 16 FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 74 NA PB.381.14 chr1 + 1577 10 novel_in_catalog LYPLA2 novel 717 9 NA NA -3 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT -9 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 6 NA PB.381.15 chr1 + 1392 7 incomplete-splice_match LYPLA2 ENST00000492577.1 717 9 1179 -825 -503 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.913689 0.592586 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 1173 FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 15 NA PB.381.16 chr1 + 1223 5 incomplete-splice_match LYPLA2 ENST00000374501.1 1117 6 261 -260 -178 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.652776 0.562623 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 252 FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 14 NA PB.381.17 chr1 + 1129 3 incomplete-splice_match LYPLA2 ENST00000374501.1 1117 6 574 -260 135 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 565 FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 9 NA PB.381.18 chr1 + 992 2 incomplete-splice_match LYPLA2 ENST00000472213.1 822 3 373 -456 373 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 803 FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 9 NA PB.381.19 chr1 + 918 2 incomplete-splice_match LYPLA2 ENST00000472213.1 822 3 447 -456 447 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 877 FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.382.2 chr1 - 1892 7 novel_in_catalog FUCA1 novel 2043 8 NA NA -47 -7 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAAACATGGTATAGCTT -16 TRUE NA NA AAAAAG -8 NA NA NA 2 NA PB.382.3 chr1 - 1599 7 incomplete-splice_match FUCA1 ENST00000374479.4 2043 8 2709 7 2709 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAAACATGGTATAGCTT 2740 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.382.4 chr1 - 1470 6 incomplete-splice_match FUCA1 ENST00000374479.4 2043 8 5057 7 5057 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAAACATGGTATAGCTT 5088 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.382.5 chr1 - 1102 4 incomplete-splice_match FUCA1 ENST00000374479.4 2043 8 13892 7 13892 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAAACATGGTATAGCTT 285 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.382.6 chr1 - 2206 8 novel_not_in_catalog FUCA1 novel 2043 8 NA NA 3 -8 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 CAAAAAAACATGGTATAGCT 34 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.382.7 chr1 - 2078 8 full-splice_match FUCA1 ENST00000374479.4 2043 8 -43 8 -43 -8 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 148 38.615067 1.586757 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 CAAAAAAACATGGTATAGCT -12 TRUE NA NA AAAAAG -4 NA NA NA 148 NA PB.382.8 chr1 - 954 3 incomplete-splice_match FUCA1 ENST00000374479.4 2043 8 19553 14 19553 -14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TTCTACCAAAAAAACATGGT 5946 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.382.9 chr1 - 1805 8 full-splice_match FUCA1 ENST00000374479.4 2043 8 218 20 218 -20 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AATCATTTCTACCAAAAAAA 249 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.382.11 chr1 - 1869 8 full-splice_match FUCA1 ENST00000374479.4 2043 8 152 22 152 -22 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 ACAATCATTTCTACCAAAAA 183 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.382.12 chr1 - 1250 4 incomplete-splice_match FUCA1 ENST00000374479.4 2043 8 13729 22 13729 -22 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 ACAATCATTTCTACCAAAAA 122 FALSE NA NA AGTAAA -15 NA NA NA 5 NA PB.383.3 chr1 - 3496 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000344989.10 3487 6 4 -13 0 13 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 23 6.000990 0.778223 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAGATTTTGCTCTTAGATT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 23 NA PB.383.4 chr1 - 3707 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000374452.9 1194 6 -19 -2494 0 -9 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAATAAATCTTGGGTTTT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.383.5 chr1 - 3438 5 full-splice_match SRSF10 ENST00000484146.6 1089 5 11 -2360 11 -9 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAATAAATCTTGGGTTTT 16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.383.12 chr1 - 3311 5 full-splice_match SRSF10 ENST00000484146.6 1089 5 29 -2251 0 -118 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATTGAGAACTAACCGTAGTT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.383.13 chr1 - 3402 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000453840.7 1808 6 -77 -1517 -17 -124 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.130951 0.495676 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATTCATTGAGAACTAACC -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.383.16 chr1 - 2285 7 novel_in_catalog SRSF10 novel 2839 7 NA NA 9 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATGTTTTGGATTCCTTAG 14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.383.17 chr1 - 5102 6 novel_in_catalog SRSF10 novel 2839 7 NA NA -4 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATGTTTTGGATTCCTTA -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.383.19 chr1 - 3013 4 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000341154.10 2839 7 4433 4 1158 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATGTTTTGGATTCCTTA 3867 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.383.22 chr1 - 2335 7 novel_not_in_catalog SRSF10 novel 2839 7 NA NA -52 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATGTTTTGGATTCCTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.383.23 chr1 - 2163 4 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000453840.7 1808 6 4649 4 -595 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATGTTTTGGATTCCTTA 4714 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.383.24 chr1 - 2071 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000374452.9 1194 6 -19 -858 0 -4 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATGTTTTGGATTCCTTA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.383.26 chr1 - 1940 7 novel_not_in_catalog SRSF10 novel 7656 6 NA NA 0 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.696427 0.671768 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATGTTTTGGATTCCTTA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.383.27 chr1 - 1880 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000344989.10 3487 6 -38 1645 -13 -4 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 238 62.097198 1.793072 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATGTTTTGGATTCCTTA -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 238 NA PB.383.28 chr1 - 1784 5 full-splice_match SRSF10 ENST00000484146.6 1089 5 29 -724 0 -4 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 24 6.261902 0.796706 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATGTTTTGGATTCCTTA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 24 NA PB.383.29 chr1 - 1658 5 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000344989.10 3487 6 1557 1645 172 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATGTTTTGGATTCCTTA 1587 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.383.30 chr1 - 1492 3 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000341154.10 2839 7 8915 4 3040 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATGTTTTGGATTCCTTA 8349 FALSE NA NA ATTAAA -11 NA NA NA 11 NA PB.383.32 chr1 - 1316 2 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000484146.6 1089 5 8466 -724 3162 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATGTTTTGGATTCCTTA 8471 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.383.41 chr1 - 1576 3 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000374453.7 866 6 8426 -1167 3184 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACAAAATGTTTTGGATTCCT 8493 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.383.44 chr1 - 1669 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000344989.10 3487 6 -40 1858 -15 -217 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATAAGTATTTAACTTTG -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.383.45 chr1 - 974 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000344989.10 3487 6 -25 2538 0 -35 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACAGTGCCTCTGTTGGTCTG 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.383.46 chr1 - 1096 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000374453.7 866 6 -75 -155 -13 155 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TACTTGTGGAAACTAATCCC -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.383.47 chr1 - 926 7 novel_not_in_catalog SRSF10 novel 7656 6 NA NA 0 155 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TACTTGTGGAAACTAATCCC 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.383.48 chr1 - 824 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000344989.10 3487 6 4 2659 0 155 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 43 11.219242 1.049963 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TACTTGTGGAAACTAATCCC 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 43 NA PB.383.50 chr1 - 2901 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000492112.3 7656 6 0 4755 0 -19 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 35 9.131941 0.960563 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AATAAAAACAAAATGAAGGA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 35 NA PB.383.51 chr1 - 2450 3 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000485841.5 3957 4 5745 -1277 3145 -19 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AATAAAAACAAAATGAAGGA 8454 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.383.63 chr1 - 4921 6 novel_in_catalog SRSF10 novel 7656 6 NA NA -12 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.383.64 chr1 - 4455 7 novel_in_catalog SRSF10 novel 7656 6 NA NA -3 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.383.65 chr1 - 3302 4 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000338597.9 813 5 937 -596 652 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA 3361 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.383.66 chr1 - 3087 4 full-splice_match SRSF10 ENST00000485841.5 3957 4 870 0 870 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA 3579 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.383.67 chr1 - 2212 6 novel_in_catalog SRSF10 novel 1390 5 NA NA -3 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.383.68 chr1 - 2040 7 novel_not_in_catalog SRSF10 novel 7656 6 NA NA 0 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.383.69 chr1 - 2050 7 novel_in_catalog SRSF10 novel 7656 6 NA NA 0 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.383.70 chr1 - 2009 4 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000484146.6 1089 5 0 3206 0 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.383.71 chr1 - 1879 5 novel_in_catalog SRSF10 novel 7656 6 NA NA -3 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.383.72 chr1 - 1795 4 full-splice_match SRSF10 ENST00000485841.5 3957 4 2162 0 -438 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA 4871 FALSE NA NA AAAAAG -38 NA NA NA 2 NA PB.383.73 chr1 - 1789 5 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000374452.9 1194 6 -51 3072 -3 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.383.74 chr1 - 1691 6 novel_not_in_catalog SRSF10 novel 7656 6 NA NA -3 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.383.75 chr1 - 1660 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000492112.3 7656 6 -36 6032 -7 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 244 63.662674 1.803885 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 244 NA PB.383.77 chr1 - 1480 5 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000492112.3 7656 6 1517 6032 136 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA 1551 FALSE NA NA CATAAA -29 NA NA NA 6 NA PB.383.79 chr1 - 1317 4 full-splice_match SRSF10 ENST00000485841.5 3957 4 2640 0 40 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA 5349 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.383.80 chr1 - 1185 3 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000485841.5 3957 4 5733 0 3133 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA 8442 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.383.86 chr1 - 1196 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000492112.3 7656 6 0 6460 0 168 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTTGGTAGAACTGTTAACC 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.383.87 chr1 - 3836 7 novel_in_catalog SRSF10 novel 7656 6 NA NA -6 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCTTAAGAGTCCAGTTTG -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.383.88 chr1 - 1443 7 novel_not_in_catalog SRSF10 novel 7656 6 NA NA 0 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCTTAAGAGTCCAGTTTG 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.383.89 chr1 - 1453 7 novel_in_catalog SRSF10 novel 7656 6 NA NA 0 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCTTAAGAGTCCAGTTTG 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.383.90 chr1 - 1027 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000492112.3 7656 6 0 6629 0 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 78 20.351183 1.308590 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCTTAAGAGTCCAGTTTG 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 78 NA PB.383.91 chr1 - 912 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000492112.3 7656 6 115 6629 59 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCTTAAGAGTCCAGTTTG 149 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.383.92 chr1 - 4276 6 novel_in_catalog SRSF10 novel 7656 6 NA NA 0 -8 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAAGCCACTCTTAAGAGTC 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.383.93 chr1 - 794 5 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000492112.3 7656 6 1598 6637 217 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GAGAAGCCACTCTTAAGAGT 1632 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.383.102 chr1 - 820 2 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000343255.9 2917 6 0 9052 0 20 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.435514 0.646944 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAGAAAAAATAAAGAAAA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.383.104 chr1 - 440 3 full-splice_match SRSF10 ENST00000485292.1 790 3 4 346 0 19 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 GAAAAGAAAAAATAAAGAAA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.384.1 chr1 + 1575 3 full-splice_match PNRC2 ENST00000471915.5 380 3 17 -1212 17 -769 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAAAGTTTTCTTGGCCTTTA NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.384.2 chr1 + 2283 3 full-splice_match PNRC2 ENST00000471915.5 380 3 88 -1991 88 -6 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAAAATGGTTTTGATTGCT -7 TRUE NA NA AATAAA -29 NA NA NA 6 NA PB.384.7 chr1 + 2413 3 novel_not_in_catalog PNRC2 novel 2428 4 NA NA 179 -6 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAAAATGGTTTTGATTGCT 3 TRUE NA NA AATAAA -29 NA NA NA 5 NA PB.384.8 chr1 + 2518 3 full-splice_match PNRC2 ENST00000334351.8 2400 3 -124 6 -124 -6 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAAAATGGTTTTGATTGCT 419 FALSE NA NA AATAAA -29 NA NA NA 2 NA PB.384.10 chr1 + 1495 3 full-splice_match PNRC2 ENST00000334351.8 2400 3 -8 913 -8 669 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATTCTAATAGTGCTCTGGC 3 TRUE NA NA AATACA -27 NA NA NA 5 NA PB.384.11 chr1 + 1886 3 full-splice_match PNRC2 ENST00000334351.8 2400 3 -6 520 -6 -504 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GAAATGCAGTATGGGACTAT 5 TRUE NA NA AAAAAG -34 NA NA NA 7 NA PB.384.12 chr1 + 1621 3 full-splice_match PNRC2 ENST00000334351.8 2400 3 -6 785 -6 -769 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 111 28.961300 1.461818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAAAGTTTTCTTGGCCTTTA 5 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 111 NA PB.384.14 chr1 + 2398 3 full-splice_match PNRC2 ENST00000334351.8 2400 3 -4 6 -4 -6 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 260 67.837280 1.831468 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAAAATGGTTTTGATTGCT 7 TRUE NA NA AATAAA -29 NA NA NA 260 NA PB.384.15 chr1 + 3309 2 incomplete-splice_match PNRC2 ENST00000471915.5 380 3 719 -1976 0 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GGCTTGGTTTTATTTTAAAA 11 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.384.16 chr1 + 1745 3 full-splice_match PNRC2 ENST00000334351.8 2400 3 0 655 0 -639 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGCCCTTGTGCTAAAGTGCC 11 TRUE NA NA TTTAAA -28 NA NA NA 3 NA PB.384.19 chr1 + 2314 3 full-splice_match PNRC2 ENST00000334351.8 2400 3 80 6 80 -6 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAAAATGGTTTTGATTGCT 91 FALSE NA NA AATAAA -29 NA NA NA 3 NA PB.384.20 chr1 + 1493 3 full-splice_match PNRC2 ENST00000334351.8 2400 3 122 785 122 -769 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAAAGTTTTCTTGGCCTTTA 133 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.384.22 chr1 + 1404 2 incomplete-splice_match PNRC2 ENST00000334351.8 2400 3 1142 784 1142 -768 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAGTTTTCTTGGCCTTTAT 1153 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.384.25 chr1 + 2063 2 incomplete-splice_match PNRC2 ENST00000334351.8 2400 3 1261 6 1261 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAAAATGGTTTTGATTGCT 1272 FALSE NA NA AATAAA -29 NA NA NA 7 NA PB.386.1 chr1 - 2090 8 incomplete-splice_match MYOM3 ENST00000338909.9 2693 10 2438 1 2438 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACACCTGCCTCTGATTTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.387.1 chr1 + 699 3 intergenic novelGene_318 novel NA NA NA NA NA NA multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AACATTCCTGTACATATCTA NA FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 2 NA PB.388.1 chr1 - 2833 7 full-splice_match IL22RA1 ENST00000270800.2 2817 7 -16 0 -16 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CCTGTTGTGATTTTTTTTTT -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.389.1 chr1 - 4555 7 full-splice_match IFNLR1 ENST00000327535.6 4566 7 1 10 1 -10 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAGAAAAAAGGTACAATTG -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.389.2 chr1 - 714 4 full-splice_match IFNLR1 ENST00000374418.3 674 4 -41 1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATGATGACCTACAGGAGGCC -19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.390.1 chr1 + 3630 3 antisense novelGene_IFNLR1_AS novel NA NA NA NA NA NA multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TCTTTTTACTTAATTTAACA NA FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.391.1 chr1 + 1719 12 full-splice_match NIPAL3 ENST00000339255.2 1676 12 -52 9 -40 -9 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 28 7.305553 0.863653 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAATTAAAAATAAATAAAT 2228 FALSE NA NA AAGAAA -15 NA NA NA 28 NA PB.391.2 chr1 + 5389 12 full-splice_match NIPAL3 ENST00000374399.9 5372 12 -19 2 -19 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GACAGCTGAGTTCGTGTCTT -16 TRUE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.391.5 chr1 + 1774 8 incomplete-splice_match NIPAL3 ENST00000339255.2 1676 12 -21 9405 -9 2081 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GTGTATGCCACCACACCCGG -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.391.6 chr1 + 1763 12 novel_not_in_catalog NIPAL3 novel 1676 12 NA NA -6 -13 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 TCCTAAAATTAAAAATAAAT -3 TRUE NA NA AAGAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.391.7 chr1 + 1380 11 novel_in_catalog NIPAL3 novel 5372 12 NA NA -6 2950 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGGATGCGTTATCTTGGT -3 TRUE NA NA AAAAAG -15 NA NA NA 2 NA PB.391.8 chr1 + 899 2 full-splice_match NIPAL3 ENST00000488155.1 931 2 -16 48 -6 -48 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAGGAAAAAAAAAAAAAA -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.391.11 chr1 + 3153 12 full-splice_match NIPAL3 ENST00000374399.9 5372 12 0 2219 0 -2219 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAACTGACATCTGTTGTC 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.391.12 chr1 + 1724 12 full-splice_match NIPAL3 ENST00000374399.9 5372 12 0 3648 0 2950 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 23 6.000990 0.778223 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGGATGCGTTATCTTGGT 3 TRUE NA NA AAAAAG -15 NA NA NA 23 NA PB.391.13 chr1 + 1322 11 incomplete-splice_match NIPAL3 ENST00000339255.2 1676 12 3731 9 3687 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAATTAAAAATAAATAAAT 3685 FALSE NA NA AAGAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.391.16 chr1 + 1280 10 incomplete-splice_match NIPAL3 ENST00000339255.2 1676 12 24303 10 -16049 -10 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 TAAAATTAAAAATAAATAAA NA FALSE NA NA AAGAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.392.1 chr1 - 2394 7 incomplete-splice_match STPG1 ENST00000337248.9 2726 9 22187 1 84 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTTTTGGGTACCCCTTAA NA FALSE NA NA TTTAAA -5 NA NA NA 2 NA PB.392.2 chr1 - 2697 9 full-splice_match STPG1 ENST00000337248.9 2726 9 27 2 27 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.174602 0.620615 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAGCTTTTGGGTACCCCTTA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.392.3 chr1 - 2578 8 full-splice_match STPG1 ENST00000003583.12 2544 8 -30 -4 27 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAGCTTTTGGGTACCCCTTA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.392.4 chr1 - 1570 9 full-splice_match STPG1 ENST00000337248.9 2726 9 57 1099 0 -1093 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTCCTGCCTTTCTCATTTG 30 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.392.5 chr1 - 988 5 incomplete-splice_match STPG1 ENST00000337248.9 2726 9 42 22263 -15 11 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAATAGGTGTTTTAACAGT 15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.393.1 chr1 + 1383 5 full-splice_match RCAN3 ENST00000538532.6 2421 5 -7 1045 -7 -106 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ACTCAGTATACATGAAATTT -16 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.393.3 chr1 + 2805 5 full-splice_match RCAN3 ENST00000374395.9 6863 5 31 4027 -30 -6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAACTCAGCATTGTGCCCAT -1 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 5 NA PB.393.4 chr1 + 943 5 full-splice_match RCAN3 ENST00000374395.9 6863 5 41 5879 -20 -118 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAACTGAAGAGGAAGAAGAG 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.393.5 chr1 + 2733 5 novel_in_catalog RCAN3 novel 6863 5 NA NA 9 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAACTCAGCATTGTGCCCAT -18 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 7 NA PB.393.6 chr1 + 1486 5 full-splice_match RCAN3 ENST00000374395.9 6863 5 89 5288 28 -109 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 GTTACTCAGTATACATGAAA 1 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.393.8 chr1 + 2680 5 full-splice_match RCAN3 ENST00000374395.9 6863 5 162 4021 101 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCATTGTGCCCATTTTTTA -15 TRUE NA NA AATAAA -23 NA NA NA 3 NA PB.393.9 chr1 + 2453 2 novel_not_in_catalog RCAN3 novel 2574 4 NA NA 101 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTCCATTGAGTTGAGTTTT -15 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.393.10 chr1 + 1131 4 incomplete-splice_match RCAN3 ENST00000538532.6 2421 5 12092 1048 70 -109 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 GTTACTCAGTATACATGAAA 74 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.394.1 chr1 + 864 2 novel_not_in_catalog NCMAP novel 3980 4 NA NA -11 -52112 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AATGAATGCATATGAAGTAC -24 TRUE NA NA AATACA -18 NA NA NA 2 NA PB.394.2 chr1 + 1257 4 full-splice_match NCMAP ENST00000374392.3 3980 4 18 2705 18 -2705 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCTTTGTCCTTCCTGGTCA 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.395.2 chr1 + 586 5 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000468822.5 768 7 -84 2499 -81 -17 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAGATAAAAGAGATAAGGA 71 FALSE NA NA AAAAAG -13 NA NA NA 2 NA PB.395.3 chr1 + 3747 17 novel_in_catalog SRRM1 novel 3735 17 NA NA 1 -11 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGCCACTCTTACTTAGTAGT -18 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 5 NA PB.395.4 chr1 + 2907 6 novel_in_catalog SRRM1 novel 3735 17 NA NA 1 -17 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAATTCCAAAAAAGAA -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.395.6 chr1 + 2500 3 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000600523.5 575 6 -15 -114 1 114 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 GAAGAAAGAAGAAATAAAAC -18 TRUE NA NA AAGAAA -35 NA NA NA 11 NA PB.395.10 chr1 + 1793 14 novel_in_catalog SRRM1 novel 3735 17 NA NA 1 -52 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGAGAAGAACGGCTTCAC -18 TRUE NA NA AATACA -28 NA NA NA 2 NA PB.395.12 chr1 + 1322 9 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000479034.5 2671 17 -35 16513 1 -47 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAAAGTCGTGTTTCTG -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.395.13 chr1 + 748 7 full-splice_match SRRM1 ENST00000468822.5 768 7 -2 22 1 -17 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAATTCCAAAAAAGAA -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.395.14 chr1 + 634 6 full-splice_match SRRM1 ENST00000490543.5 673 6 -32 71 1 -17 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAGATAAAAGAGATAAGGA -18 TRUE NA NA AAAAAG -13 NA NA NA 6 NA PB.395.17 chr1 + 3775 18 novel_in_catalog SRRM1 novel 3110 18 NA NA 3 -20 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAAATTTTGCCACTCTTA -13 TRUE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 6 NA PB.395.18 chr1 + 833 7 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000479034.5 2671 17 -30 19103 3 -17 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 147 38.354153 1.583812 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAATTCCAAAAAAGAA -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 147 NA PB.395.19 chr1 + 2518 16 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 -9 1812 0 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 39 10.175591 1.007560 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAACACAAGAAGGAAAA 2 TRUE NA NA AAAAAG -43 NA NA NA 39 NA PB.395.20 chr1 + 3767 18 novel_in_catalog SRRM1 novel 3110 18 NA NA 0 -19 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 27 7.044641 0.847859 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATTTTGCCACTCTTAC 2 TRUE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 27 NA PB.395.21 chr1 + 3725 17 full-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 -9 19 0 -19 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 33 8.610116 0.935009 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATTTTGCCACTCTTAC 2 TRUE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 33 NA PB.395.22 chr1 + 2560 17 full-splice_match SRRM1 ENST00000479034.5 2671 17 -15 126 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 32 8.349203 0.921645 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAACACAAGAAGGAAAA 2 TRUE NA NA AAAAAG -43 NA NA NA 32 NA PB.395.23 chr1 + 2553 4 full-splice_match SRRM1 ENST00000462710.5 2624 4 0 71 0 -17 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAGATAAAAGAGATAAGGA 2 TRUE NA NA AAAAAG -13 NA NA NA 10 NA PB.395.25 chr1 + 2317 15 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 -9 3083 0 690 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAAGCCCCCAGCACCTCC 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.395.27 chr1 + 2191 4 full-splice_match SRRM1 ENST00000466910.5 799 4 21 -1413 0 114 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 GAAGAAAGAAGAAATAAAAC 2 TRUE NA NA AAGAAA -35 NA NA NA 9 NA PB.395.28 chr1 + 1999 15 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000479034.5 2671 17 -15 2289 0 42 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAACAAAGAAGCTCCCCAGT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.395.29 chr1 + 1449 6 novel_in_catalog SRRM1 novel 673 6 NA NA 0 -17 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAGATAAAAGAGATAAGGA 2 TRUE NA NA AAAAAG -13 NA NA NA 3 NA PB.395.30 chr1 + 948 8 novel_in_catalog SRRM1 novel 3735 17 NA NA 0 -17 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAATTCCAAAAAAGAA 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.395.31 chr1 + 514 5 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000468822.5 768 7 24 2463 0 19 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 54 14.089281 1.148889 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AGAGAAAAAAGGGAGCGGTC 8 TRUE NA NA GATAAA -28 NA NA NA 54 NA PB.395.32 chr1 + 4215 5 novel_in_catalog SRRM1 novel 3735 17 NA NA -1 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAAGAAAAGGAGAAGGA 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.395.33 chr1 + 2295 5 novel_in_catalog SRRM1 novel 673 6 NA NA -1 19 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 31 8.088291 0.907857 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AGAGAAAAAAGGGAGCGGTC 7 TRUE NA NA GATAAA -28 NA NA NA 31 NA PB.395.34 chr1 + 3626 17 novel_in_catalog SRRM1 novel 3735 17 NA NA 1 -18 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATTTTGCCACTCTTACT 9 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.395.36 chr1 + 2591 7 novel_in_catalog SRRM1 novel 3735 17 NA NA 1 -17 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAATTCCAAAAAAGAA 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.395.41 chr1 + 2347 16 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000479034.5 2671 17 -3 1397 0 690 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAAGCCCCCAGCACCTCC 14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.395.42 chr1 + 1568 11 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000479034.5 2671 17 -3 10136 0 484 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACATCTGTGTGTGCAGCA 14 TRUE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.395.43 chr1 + 596 5 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000596378.1 2314 15 7 19493 7 -17 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAGATAAAAGAGATAAGGA 275 FALSE NA NA AAAAAG -13 NA NA NA 2 NA PB.395.45 chr1 + 1256 2 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000495561.1 563 3 -799 1518 -715 -17 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAGATAAAAGAGATAAGGA 4243 FALSE NA NA AAAAAG -13 NA NA NA 2 NA PB.395.47 chr1 + 1060 2 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000495561.1 563 3 -603 1518 -519 -17 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAGATAAAAGAGATAAGGA 4439 FALSE NA NA AAAAAG -13 NA NA NA 2 NA PB.395.48 chr1 + 3468 15 novel_in_catalog SRRM1 novel 2671 17 NA NA 271 -20 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAAATTTTGCCACTCTTA 5313 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.395.54 chr1 + 2910 12 novel_in_catalog SRRM1 novel 2671 17 NA NA 32 -19 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATTTTGCCACTCTTAC 3595 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.395.58 chr1 + 2551 9 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 11671 1 -38 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTAGTAGTGCTTATGTAA 86 FALSE NA NA AATAAA -30 NA NA NA 2 NA PB.395.59 chr1 + 2567 10 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000374389.8 3110 18 11690 -644 -22 -11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGCCACTCTTACTTAGTAGT 102 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.395.61 chr1 + 1253 9 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000479034.5 2671 17 11780 126 34 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAACACAAGAAGGAAAA 201 FALSE NA NA AAAAAG -43 NA NA NA 2 NA PB.395.63 chr1 + 2419 9 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000374389.8 3110 18 17418 -635 5663 -20 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAAATTTTGCCACTCTTA 4931 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.395.67 chr1 + 2223 7 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000374389.8 3110 18 19387 -635 -3869 -20 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAAATTTTGCCACTCTTA 6900 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 4 NA PB.395.71 chr1 + 2071 5 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 23513 11 260 -11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGCCACTCTTACTTAGTAGT NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.395.73 chr1 + 1893 4 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 25880 19 -401 -19 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATTTTGCCACTCTTAC NA FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 6 NA PB.395.74 chr1 + 1822 4 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 25967 3 -314 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TTACTTAGTAGTGCTTATGT NA FALSE NA NA AATAAA -28 NA NA NA 2 NA PB.395.75 chr1 + 1670 4 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 26112 10 -169 -10 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCCACTCTTACTTAGTAGTG NA FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 5 NA PB.395.76 chr1 + 1537 4 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 26236 19 -45 -19 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.740077 0.758918 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATTTTGCCACTCTTAC NA FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 22 NA PB.395.77 chr1 + 1393 3 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 26912 19 631 -19 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATTTTGCCACTCTTAC NA FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 8 NA PB.395.78 chr1 + 1275 2 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 28099 20 1818 -20 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.957339 0.695249 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAAATTTTGCCACTCTTA NA FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 19 NA PB.395.79 chr1 + 1195 2 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 28180 19 1899 -19 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.652776 0.562623 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATTTTGCCACTCTTAC NA FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 14 NA PB.395.80 chr1 + 1128 2 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 28247 19 1966 -19 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.652776 0.562623 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATTTTGCCACTCTTAC NA FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 14 NA PB.396.1 chr1 - 1139 6 fusion NCMAP-DT_RCAN3AS novel 1445 3 NA NA 21 -8160 multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACCTAATGTTCACATGTTTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.397.1 chr1 + 4340 6 full-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 -91 4 -26 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 311 81.143822 1.909256 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGTGTTTGAGACTACTA -3 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 311 NA PB.397.3 chr1 + 982 7 novel_in_catalog CLIC4 novel 2723 7 NA NA 0 1041 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAAGAGATGTCTTCATGT 23 TRUE NA NA AGTAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.397.4 chr1 + 4295 7 novel_in_catalog CLIC4 novel 4253 6 NA NA 3 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATCATAAAGGATTCTTTTTT 26 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.397.5 chr1 + 2734 6 full-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 -62 1581 3 -1527 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAGGAAGATGCACTATTCAG 26 TRUE NA NA ATTAAA -23 NA NA NA 5 NA PB.397.6 chr1 + 2300 6 full-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 -62 2015 3 -1961 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TATTTACTCTTTTTTAAAAG 26 TRUE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 5 NA PB.397.7 chr1 + 943 6 full-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 -62 3372 3 1042 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 76 19.829357 1.297309 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAGAGATGTCTTCATGTC 26 TRUE NA NA AGTAAA -12 NA NA NA 76 NA PB.397.8 chr1 + 801 6 full-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 -62 3514 3 900 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAGAAATGACTGGCATCT 26 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.397.9 chr1 + 1775 6 full-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 -54 2532 11 1882 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.652776 0.562623 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATCATAGAGCTTGCTATTT 34 FALSE NA NA AAAAAG -14 NA NA NA 14 NA PB.397.10 chr1 + 1675 6 full-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 45 2533 45 1881 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAATCATAGAGCTTGCTATT 7 FALSE NA NA AAAAAG -13 NA NA NA 2 NA PB.397.11 chr1 + 794 6 full-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 87 3372 87 1042 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAGAGATGTCTTCATGTC 49 FALSE NA NA AGTAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.397.12 chr1 + 4084 6 full-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 115 54 115 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATAAAGGATTCTTTTTTCCC 77 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 5 NA PB.397.18 chr1 + 3933 5 incomplete-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 52382 54 52382 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATAAAGGATTCTTTTTTCCC 31 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.397.22 chr1 + 3801 4 incomplete-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 68756 54 68756 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATAAAGGATTCTTTTTTCCC 79 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.397.24 chr1 + 3729 2 incomplete-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 94411 4 94411 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGTGTTTGAGACTACTA NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 6 NA PB.397.25 chr1 + 3609 2 incomplete-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 94481 54 94481 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATAAAGGATTCTTTTTTCCC NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.398.5 chr1 - 2407 5 full-splice_match RUNX3 ENST00000308873.11 4267 5 318 1542 318 -24 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAACAAA 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.398.6 chr1 - 2081 5 full-splice_match RUNX3 ENST00000308873.11 4267 5 644 1542 644 -24 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAACAAA 642 FALSE NA NA GGGGCT -25 NA NA NA 3 NA PB.399.2 chr1 - 1345 7 full-splice_match SYF2 ENST00000236273.9 1757 7 6 406 6 283 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 187 48.790657 1.688337 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAACATTTTTAGTCTATCAT 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 187 NA PB.399.3 chr1 - 1154 5 incomplete-splice_match SYF2 ENST00000236273.9 1757 7 3409 406 3339 283 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAACATTTTTAGTCTATCAT 7165 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.399.4 chr1 - 822 2 incomplete-splice_match SYF2 ENST00000354361.3 926 6 7407 -277 7353 277 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATTTCTAACATTTTTAGTC 7422 FALSE NA NA AATGAA -9 NA NA NA 6 NA PB.399.6 chr1 - 988 4 incomplete-splice_match SYF2 ENST00000354361.3 926 6 4320 -282 4266 282 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CTAACATTTTTAGTCTATCA 8092 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.399.7 chr1 - 913 6 full-splice_match SYF2 ENST00000354361.3 926 6 -13 26 3 -26 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAATGTATATGGCTGTTTA 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.399.8 chr1 - 856 5 incomplete-splice_match SYF2 ENST00000236273.9 1757 7 3398 715 3328 -26 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAATGTATATGGCTGTTTA 7154 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.399.9 chr1 - 955 6 incomplete-splice_match SYF2 ENST00000236273.9 1757 7 315 719 245 -30 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTTTAAATGTATATGGCTG -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.399.10 chr1 - 1034 7 full-splice_match SYF2 ENST00000236273.9 1757 7 3 720 3 -31 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 128 33.396812 1.523705 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TATTTTAAATGTATATGGCT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 128 NA PB.399.11 chr1 - 773 6 incomplete-splice_match SYF2 ENST00000236273.9 1757 7 381 835 311 -146 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATATCCTTTCATGTATATTT 4137 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.399.12 chr1 - 918 7 full-splice_match SYF2 ENST00000236273.9 1757 7 3 836 3 -147 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 99 25.830347 1.412130 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATATCCTTTCATGTATATT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 99 NA PB.400.1 chr1 - 1762 6 novel_not_in_catalog RSRP1 novel 1425 5 NA NA 0 11 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 ATATATATAACCTAATGGAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.400.3 chr1 - 2164 6 novel_in_catalog RSRP1 novel 1425 5 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGTCTTTATTGTATATATAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.400.4 chr1 - 2056 2 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000566395.5 824 5 1386 -5 59 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGTCTTTATTGTATATATAT 2339 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.400.5 chr1 - 1701 2 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000566395.5 824 5 1741 -5 414 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGTCTTTATTGTATATATAT 2694 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.400.6 chr1 - 1260 2 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000566395.5 824 5 2182 -5 -248 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGTCTTTATTGTATATATAT 3135 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.400.7 chr1 - 1172 2 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000566395.5 824 5 2270 -5 -160 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGTCTTTATTGTATATATAT 3223 FALSE NA NA TTTAAA -7 NA NA NA 4 NA PB.400.8 chr1 - 802 2 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000566395.5 824 5 2640 -5 210 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGTCTTTATTGTATATATAT 3593 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.400.9 chr1 - 696 2 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000566395.5 824 5 2746 -5 -135 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGTCTTTATTGTATATATAT 3699 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.400.10 chr1 - 2201 4 novel_in_catalog RSRP1 novel 3034 6 NA NA 357 3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TTAGTCTTTATTGTATATAT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.400.11 chr1 - 1421 5 full-splice_match RSRP1 ENST00000243189.12 1425 5 0 4 0 2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 43 11.219242 1.049963 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CTTAGTCTTTATTGTATATA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 43 NA PB.400.12 chr1 - 1075 3 full-splice_match RSRP1 ENST00000569495.5 901 3 -178 4 -178 2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CTTAGTCTTTATTGTATATA 3205 FALSE NA NA TTTAAA -25 NA NA NA 2 NA PB.400.13 chr1 - 2172 6 novel_in_catalog RSRP1 novel 2013 5 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TTCTTAGTCTTTATTGTATA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.400.14 chr1 - 2010 5 full-splice_match RSRP1 ENST00000568254.5 2013 5 3 0 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TTCTTAGTCTTTATTGTATA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.400.15 chr1 - 2934 4 full-splice_match RSRP1 ENST00000498238.1 2941 4 0 7 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 52 13.567455 1.132498 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTCTTAGTCTTTATTGTAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 52 NA PB.400.16 chr1 - 2822 5 novel_in_catalog RSRP1 novel 2941 4 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTCTTAGTCTTTATTGTAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.400.17 chr1 - 2469 3 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000498238.1 2941 4 744 7 -70 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTCTTAGTCTTTATTGTAT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.400.18 chr1 - 2283 5 novel_in_catalog RSRP1 novel 3034 6 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.696427 0.671768 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTCTTAGTCTTTATTGTAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.400.19 chr1 - 2144 2 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000566395.5 824 5 1292 1 -35 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTCTTAGTCTTTATTGTAT 2245 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.400.20 chr1 - 2054 6 novel_in_catalog RSRP1 novel 3034 6 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTCTTAGTCTTTATTGTAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.400.21 chr1 - 1463 6 novel_in_catalog RSRP1 novel 3034 6 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTCTTAGTCTTTATTGTAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.400.22 chr1 - 1338 7 novel_in_catalog RSRP1 novel 3034 6 NA NA 0 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTCTTAGTCTTTATTGTAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.400.23 chr1 - 1330 4 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000243189.12 1425 5 367 7 359 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTCTTAGTCTTTATTGTAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.400.24 chr1 - 1430 2 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000566395.5 824 5 2006 1 -424 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTCTTAGTCTTTATTGTAT 2959 FALSE NA NA AATGAA -1 NA NA NA 5 NA PB.400.25 chr1 - 1075 3 full-splice_match RSRP1 ENST00000564223.5 395 3 -646 -34 -195 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CATTCTTAGTCTTTATTGTA 3188 FALSE NA NA TTTAAA -42 NA NA NA 2 NA PB.400.26 chr1 - 945 2 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000566395.5 824 5 2490 2 60 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CATTCTTAGTCTTTATTGTA 3443 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.400.29 chr1 - 1962 3 full-splice_match RSRP1 ENST00000431849.3 1954 3 -8 0 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 20 5.218252 0.717525 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAAAAAATGCTGTAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 20 NA PB.400.30 chr1 - 1311 4 novel_in_catalog RSRP1 novel 2941 4 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.435514 0.646944 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAAAAAATGCTGTAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.400.31 chr1 - 1225 3 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000566395.5 824 5 -554 1817 357 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAAAAAATGCTGTAT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.400.32 chr1 - 1082 5 novel_in_catalog RSRP1 novel 3034 6 NA NA 0 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAAAAAATGCTGTAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.400.33 chr1 - 1076 3 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000566395.5 824 5 -405 1817 -300 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAAAAAATGCTGTAT 548 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.400.34 chr1 - 1036 4 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000568254.5 2013 5 3 1818 0 -1 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 TAAAAAAAAAAAATGCTGTA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.403.2 chr1 - 2180 2 genic RSRP1 novel 629 2 NA NA -2 -10240 multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAAATTGCCTAGTCTCGGGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.406.1 chr1 + 900 7 full-splice_match TMEM50A ENST00000374358.5 2266 7 -28 1394 -11 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 742 193.597153 2.286899 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAATAAAAAGAAATTACA -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 742 NA PB.406.2 chr1 + 1165 8 novel_not_in_catalog TMEM50A novel 2266 7 NA NA -9 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAATAAAAAGAAATTACA -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.406.3 chr1 + 679 5 full-splice_match TMEM50A ENST00000491936.5 965 5 -12 298 -9 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAATAAAAAGAAATTACA -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.406.4 chr1 + 2288 7 full-splice_match TMEM50A ENST00000374358.5 2266 7 -24 2 -7 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 148 38.615067 1.586757 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGTTTTTAGTCTTTAATTT -12 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 148 NA PB.406.5 chr1 + 1068 7 novel_not_in_catalog TMEM50A novel 2266 7 NA NA -7 6343 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CAAAGTGTGGTGTTTCTCTG -12 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.406.6 chr1 + 689 5 novel_in_catalog TMEM50A novel 776 6 NA NA -7 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 TAAAAATAAAAAGAAATTAC -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.406.7 chr1 + 1528 7 novel_not_in_catalog TMEM50A novel 2266 7 NA NA -5 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGTTTTTAGTCTTTAATTT -10 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.406.8 chr1 + 1441 7 full-splice_match TMEM50A ENST00000374358.5 2266 7 -22 847 -5 235 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATCTGTGTACTGAACCACTA -10 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 5 NA PB.406.9 chr1 + 799 6 full-splice_match TMEM50A ENST00000480937.5 1102 6 -9 312 -3 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAATAAAAAGAAATTACA -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.406.11 chr1 + 1057 7 full-splice_match TMEM50A ENST00000374358.5 2266 7 -16 1225 1 -129 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 48 12.523805 1.097736 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATATTCCGTGGTCAAAA -4 TRUE NA NA TATAAA -16 NA NA NA 48 NA PB.406.12 chr1 + 944 6 full-splice_match TMEM50A ENST00000498135.5 776 6 1 -169 1 -129 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATATTCCGTGGTCAAAA -4 TRUE NA NA TATAAA -16 NA NA NA 6 NA PB.406.13 chr1 + 775 6 full-splice_match TMEM50A ENST00000498135.5 776 6 1 0 1 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 26 6.783728 0.831468 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAATAAAAAGAAATTACA -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 26 NA PB.406.14 chr1 + 2156 6 full-splice_match TMEM50A ENST00000498135.5 776 6 11 -1391 5 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAGTTTTTAGTCTTTAATT 6 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 8 NA PB.406.15 chr1 + 2174 6 full-splice_match TMEM50A ENST00000480937.5 1102 6 8 -1080 -3 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGTTTTTAGTCTTTAATTT 9 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.406.16 chr1 + 982 7 full-splice_match TMEM50A ENST00000374358.5 2266 7 59 1225 59 -129 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATATTCCGTGGTCAAAA 13 FALSE NA NA TATAAA -16 NA NA NA 4 NA PB.406.17 chr1 + 1113 7 novel_in_catalog TMEM50A novel 799 6 NA NA -6 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 20 5.218252 0.717525 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAATAAAAAGAAATTACA 74 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 20 NA PB.406.18 chr1 + 2502 7 novel_in_catalog TMEM50A novel 799 6 NA NA -3 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGTTTTTAGTCTTTAATTT 77 FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.406.20 chr1 + 743 6 incomplete-splice_match TMEM50A ENST00000374358.5 2266 7 2146 1394 2020 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.130951 0.495676 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAATAAAAAGAAATTACA 2100 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.406.21 chr1 + 2010 6 incomplete-splice_match TMEM50A ENST00000374358.5 2266 7 2180 93 2054 -93 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AATAATGTGTCTGTAACCAA 2134 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.406.22 chr1 + 2026 5 incomplete-splice_match TMEM50A ENST00000374358.5 2266 7 4636 2 378 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGTTTTTAGTCTTTAATTT 2432 FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 7 NA PB.406.23 chr1 + 633 5 incomplete-splice_match TMEM50A ENST00000374358.5 2266 7 4636 1395 378 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 TAAAAATAAAAAGAAATTAC 2432 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.406.24 chr1 + 679 4 incomplete-splice_match TMEM50A ENST00000491936.5 965 5 13325 130 9053 -130 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TAAAATATTCCGTGGTCAAA NA FALSE NA NA TATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.406.25 chr1 + 508 4 incomplete-splice_match TMEM50A ENST00000498135.5 776 6 13331 0 9056 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAATAAAAAGAAATTACA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.406.26 chr1 + 1784 4 incomplete-splice_match TMEM50A ENST00000374358.5 2266 7 13339 93 9081 -93 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AATAATGTGTCTGTAACCAA NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.406.27 chr1 + 1855 3 incomplete-splice_match TMEM50A ENST00000374358.5 2266 7 14546 3 10288 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAGTTTTTAGTCTTTAATT NA FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 5 NA PB.406.28 chr1 + 1740 2 incomplete-splice_match TMEM50A ENST00000374358.5 2266 7 18479 3 14221 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAGTTTTTAGTCTTTAATT NA FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.407.3 chr1 + 2562 11 full-splice_match MACO1 ENST00000374343.5 3940 11 -27 1405 12 -426 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.130951 0.495676 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AACCCTTTATGTTTGTTTTG 12 FALSE NA NA AAAAAG -18 NA NA NA 12 NA PB.407.4 chr1 + 971 6 incomplete-splice_match MACO1 ENST00000647928.1 2887 11 -83 40743 19 -296 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.435514 0.646944 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AGAATACCGAGAAAAAGGGA 19 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.407.6 chr1 + 1307 6 incomplete-splice_match MACO1 ENST00000647928.1 2887 11 -63 40387 0 60 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAACTGTATTCCTAATAAC -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.407.7 chr1 + 2371 11 full-splice_match MACO1 ENST00000374343.5 3940 11 91 1478 28 -499 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCCAACTTTGCCTTTTATG 22 TRUE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 4 NA PB.407.8 chr1 + 1490 8 incomplete-splice_match MACO1 ENST00000374343.5 3940 11 125 14497 62 -13518 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAACAGTTAATGGAAGAGAA -10 TRUE NA NA AAAAAG -37 NA NA NA 6 NA PB.407.12 chr1 + 1553 6 incomplete-splice_match MACO1 ENST00000374343.5 3940 11 27545 1482 9549 -503 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGTAGCCAACTTTGCCTTT NA FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.407.13 chr1 + 1337 6 incomplete-splice_match MACO1 ENST00000374343.5 3940 11 27764 1479 9768 -500 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGCCAACTTTGCCTTTTAT NA FALSE NA NA ATTAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.407.14 chr1 + 1869 6 incomplete-splice_match MACO1 ENST00000374343.5 3940 11 27946 765 9950 214 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TTTTTTTTTGTTTTGTTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.407.15 chr1 + 1145 6 incomplete-splice_match MACO1 ENST00000374343.5 3940 11 27957 1478 9961 -499 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCCAACTTTGCCTTTTATG NA FALSE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 6 NA PB.407.16 chr1 + 1029 5 incomplete-splice_match MACO1 ENST00000647928.1 2887 11 53229 503 35296 -503 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGTAGCCAACTTTGCCTTT NA FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.407.17 chr1 + 898 4 incomplete-splice_match MACO1 ENST00000647928.1 2887 11 54698 503 36765 -503 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGTAGCCAACTTTGCCTTT NA FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.409.1 chr1 + 2933 9 full-splice_match LDLRAP1 ENST00000374338.5 2914 9 -21 2 -21 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.957339 0.695249 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGCAACGCTCATCAGGTGG 0 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 19 NA PB.409.2 chr1 + 797 5 fusion ENSG00000225643_LDLRAP1 novel 2914 9 NA NA -15 42 multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGGACAGGGGTTGAGTCTG 6 FALSE NA NA CATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.409.4 chr1 + 1105 9 fusion ENSG00000225643_LDLRAP1 novel 2914 9 NA NA 0 42 multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGGACAGGGGTTGAGTCTG -29 TRUE NA NA CATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.409.5 chr1 + 4529 8 incomplete-splice_match LDLRAP1 ENST00000374338.5 2914 9 23 2 23 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGCAACGCTCATCAGGTGG -6 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.409.6 chr1 + 2869 9 full-splice_match LDLRAP1 ENST00000374338.5 2914 9 43 2 43 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 45 11.741067 1.069708 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGCAACGCTCATCAGGTGG 14 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 45 NA PB.409.7 chr1 + 2884 9 novel_in_catalog LDLRAP1 novel 4670 7 NA NA -78 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGCAACGCTCATCAGGTGG -1 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.409.8 chr1 + 1454 2 novel_not_in_catalog LDLRAP1 novel 238 3 NA NA -38 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGCAACGCTCATCAGGTGG 2 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.409.11 chr1 + 2652 8 incomplete-splice_match LDLRAP1 ENST00000374338.5 2914 9 10395 2 637 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGCAACGCTCATCAGGTGG 4080 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.409.12 chr1 + 2427 6 incomplete-splice_match LDLRAP1 ENST00000374338.5 2914 9 13595 2 2320 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGCAACGCTCATCAGGTGG 220 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 5 NA PB.409.13 chr1 + 2279 4 full-splice_match LDLRAP1 ENST00000484476.5 657 4 262 -1884 262 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGCAACGCTCATCAGGTGG 270 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 6 NA PB.409.14 chr1 + 2120 3 full-splice_match LDLRAP1 ENST00000474283.1 913 3 107 -1314 107 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGCAACGCTCATCAGGTGG 82 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.410.1 chr1 + 2062 12 full-splice_match MAN1C1 ENST00000374332.9 3561 12 1490 9 431 -9 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AATAAGAAATATGATTGGGC 824 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.410.2 chr1 + 1909 10 incomplete-splice_match MAN1C1 ENST00000374329.1 2461 11 37065 9 -25402 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AATAAGAAATATGATTGGGC NA FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.410.3 chr1 + 1268 4 incomplete-splice_match MAN1C1 ENST00000475314.5 893 5 536 -465 536 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AATAAGAAATATGATTGGGC 6690 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.411.1 chr1 + 2706 2 incomplete-splice_match SELENON ENST00000361547.7 4314 13 13952 2 13914 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACTAGAGTGGTTCTAAGTG 5490 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.412.1 chr1 - 1594 11 novel_in_catalog RHCE novel 1810 12 NA NA 6 -20 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAATTAAAGACTAAAAA -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.413.1 chr1 - 2114 3 full-splice_match AUNIP ENST00000374298.4 2161 3 47 0 47 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 25 6.522815 0.814435 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GCTCTTGTGATAATTGGTAA -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 25 NA PB.413.3 chr1 - 1297 3 full-splice_match AUNIP ENST00000374298.4 2161 3 43 821 43 -821 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 33 8.610116 0.935009 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGACAGTGGGATTGGCATC -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 33 NA PB.415.1 chr1 - 1463 5 full-splice_match STMN1 ENST00000455785.7 1443 5 -22 2 -22 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 492 128.369003 2.108460 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AACTCCTGTGAAATGACTAA 5 TRUE NA NA GGGGCT -7 NA NA NA 492 NA PB.415.2 chr1 - 1306 3 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 1344 -623 29 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AACTCCTGTGAAATGACTAA -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.415.6 chr1 - 1517 5 novel_not_in_catalog STMN1 novel 1712 5 NA NA 108 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGCAACTCCTGTGAAATGAC -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.415.7 chr1 - 1130 2 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 3475 -620 2160 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 32 8.349203 0.921645 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGCAACTCCTGTGAAATGAC 15 TRUE NA NA AAAAAG -9 NA NA NA 32 NA PB.415.8 chr1 - 3395 4 full-splice_match STMN1 ENST00000465604.1 2947 4 -2 -446 0 -4 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAGCAACTCCTGTGAAATGA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.415.9 chr1 - 1361 5 novel_not_in_catalog STMN1 novel 1443 5 NA NA 0 -5 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GTAGCAACTCCTGTGAAATG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.415.11 chr1 - 1298 5 full-splice_match STMN1 ENST00000455785.7 1443 5 0 145 0 -143 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 40 10.436504 1.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AACAGTTGAGAGAGAATCTC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 40 NA PB.415.12 chr1 - 950 2 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 3515 -480 2200 -143 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AACAGTTGAGAGAGAATCTC 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.415.13 chr1 - 1102 5 full-splice_match STMN1 ENST00000455785.7 1443 5 0 341 0 111 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 29 7.566465 0.878893 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATGACCGCACGTTCTCTG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 29 NA PB.415.15 chr1 - 1035 5 full-splice_match STMN1 ENST00000455785.7 1443 5 -46 454 1 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5177 1350.744507 3.130573 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGGTGGCAGTGACTTCTTT -1 TRUE NA NA GGGGCT -31 NA NA NA 5177 NA PB.415.16 chr1 - 951 4 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 409 -183 409 10 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 45 11.741067 1.069708 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTTCTTTTGAGTTAGGTTA 2286 FALSE NA NA AAAACA -10 NA NA NA 45 NA PB.415.17 chr1 - 907 2 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 3261 -183 1946 10 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTTCTTTTGAGTTAGGTTA 5138 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.415.18 chr1 - 1076 5 novel_not_in_catalog STMN1 novel 1712 5 NA NA 108 6 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTGACTTCTTTTGAGTTAG -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.415.21 chr1 - 1351 5 full-splice_match STMN1 ENST00000399728.5 1712 5 -84 445 -84 5 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAGTGACTTCTTTTGAGTTA 768 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.415.22 chr1 - 984 5 novel_not_in_catalog STMN1 novel 1443 5 NA NA 0 1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GTGGCAGTGACTTCTTTTGA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.415.23 chr1 - 780 3 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 1421 -174 106 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 45 11.741067 1.069708 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GTGGCAGTGACTTCTTTTGA 3298 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 45 NA PB.415.24 chr1 - 2949 4 full-splice_match STMN1 ENST00000465604.1 2947 4 -2 0 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 20 5.218252 0.717525 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGTGGCAGTGACTTCTTTTG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 20 NA PB.415.25 chr1 - 1291 5 novel_in_catalog STMN1 novel 1443 5 NA NA 15 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGTGGCAGTGACTTCTTTTG 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.415.26 chr1 - 1140 5 novel_not_in_catalog STMN1 novel 1712 5 NA NA 108 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGTGGCAGTGACTTCTTTTG -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.415.27 chr1 - 916 5 novel_not_in_catalog STMN1 novel 1443 5 NA NA 0 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGTGGCAGTGACTTCTTTTG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.415.28 chr1 - 885 5 novel_not_in_catalog STMN1 novel 1443 5 NA NA 0 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGTGGCAGTGACTTCTTTTG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.415.29 chr1 - 998 2 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 3159 -172 1844 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGGTGGCAGTGACTTCTTTT 5036 FALSE NA NA AATAAA -5 NA NA NA 2 NA PB.415.30 chr1 - 884 3 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 1315 -172 0 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 27 7.044641 0.847859 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGGTGGCAGTGACTTCTTTT 3192 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 27 NA PB.415.31 chr1 - 677 2 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 3480 -172 2165 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 34 8.871029 0.947974 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGGTGGCAGTGACTTCTTTT 20 TRUE NA NA AAAAAG -4 NA NA NA 34 NA PB.415.32 chr1 - 559 2 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 3597 -171 2282 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.913689 0.592586 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGGTGGCAGTGACTTCTTT -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.415.33 chr1 - 1123 5 full-splice_match STMN1 ENST00000399728.5 1712 5 136 453 136 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 29 7.566465 0.878893 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTTGGTGGCAGTGACTTCTT -21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 29 NA PB.415.34 chr1 - 860 5 full-splice_match STMN1 ENST00000455785.7 1443 5 0 583 0 42 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 26 6.783728 0.831468 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAGAGTATGTAGTGGCTT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 26 NA PB.415.35 chr1 - 744 5 full-splice_match STMN1 ENST00000399728.5 1712 5 125 843 125 -220 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTGGCCAGTGTCATTTTAT 977 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.415.36 chr1 - 597 5 full-splice_match STMN1 ENST00000455785.7 1443 5 0 846 0 -221 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TACTGGCCAGTGTCATTTTA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.416.2 chr1 + 1966 7 full-splice_match MTFR1L ENST00000374303.7 1953 7 -10 -3 4 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 147 38.354153 1.583812 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTGCTGTGTCCATCTCTT -27 TRUE NA NA ATTAAA -24 NA NA NA 147 NA PB.416.3 chr1 + 1980 7 novel_in_catalog MTFR1L novel 1953 7 NA NA -1 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTGCTGTGTCCATCTCTT -18 TRUE NA NA ATTAAA -24 NA NA NA 5 NA PB.416.4 chr1 + 1847 6 novel_in_catalog MTFR1L novel 1953 7 NA NA -1 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTGCTGTGTCCATCTCTT -18 TRUE NA NA ATTAAA -24 NA NA NA 4 NA PB.416.5 chr1 + 1193 7 full-splice_match MTFR1L ENST00000474295.5 1873 7 24 656 -1 -48 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAGAGAAGTTGTTTCTGG -18 TRUE NA NA AATGAA -20 NA NA NA 3 NA PB.416.6 chr1 + 1296 7 full-splice_match MTFR1L ENST00000374303.7 1953 7 5 652 4 -48 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.479165 0.738714 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAGAGAAGTTGTTTCTGG -12 TRUE NA NA AATGAA -20 NA NA NA 21 NA PB.416.7 chr1 + 1833 7 full-splice_match MTFR1L ENST00000474295.5 1873 7 39 1 -10 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 28 7.305553 0.863653 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTGCTGTGTCCATCTCTT -3 TRUE NA NA ATTAAA -24 NA NA NA 28 NA PB.416.8 chr1 + 1309 7 novel_in_catalog MTFR1L novel 1953 7 NA NA -9 -48 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAGAGAAGTTGTTTCTGG -2 TRUE NA NA AATGAA -20 NA NA NA 2 NA PB.416.9 chr1 + 2008 8 novel_in_catalog MTFR1L novel 1953 7 NA NA 2 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCATTTGCTGTGTCCAT 12 TRUE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 4 NA PB.416.10 chr1 + 1883 7 full-splice_match MTFR1L ENST00000374307.9 1868 7 -17 2 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCATTTGCTGTGTCCAT 15 TRUE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 8 NA PB.416.11 chr1 + 2086 7 full-splice_match MTFR1L ENST00000374301.7 2099 7 16 -3 16 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTGCTGTGTCCATCTCTT 5 TRUE NA NA ATTAAA -24 NA NA NA 2 NA PB.416.12 chr1 + 1792 6 incomplete-splice_match MTFR1L ENST00000374300.7 2053 7 2274 2 106 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCATTTGCTGTGTCCAT 2237 FALSE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.416.13 chr1 + 1582 5 incomplete-splice_match MTFR1L ENST00000466284.1 3262 6 2200 -5 727 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTGCTGTGTCCATCTCTT 2858 FALSE NA NA ATTAAA -24 NA NA NA 2 NA PB.416.14 chr1 + 1471 3 full-splice_match MTFR1L ENST00000497956.1 2531 3 1067 -7 1067 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTGCTGTGTCCATCTCTT 5834 FALSE NA NA ATTAAA -24 NA NA NA 2 NA PB.416.15 chr1 + 1359 3 full-splice_match MTFR1L ENST00000497956.1 2531 3 1174 -2 1174 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCATTTGCTGTGTCCAT 5941 FALSE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.416.16 chr1 + 1218 2 incomplete-splice_match MTFR1L ENST00000497956.1 2531 3 3998 -3 3998 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGCATTTGCTGTGTCCATC 8765 FALSE NA NA ATTAAA -20 NA NA NA 5 NA PB.416.17 chr1 + 1071 2 incomplete-splice_match MTFR1L ENST00000497956.1 2531 3 4148 -6 4148 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CATTTGCTGTGTCCATCTCT 8915 FALSE NA NA ATTAAA -23 NA NA NA 8 NA PB.417.1 chr1 + 4368 3 full-splice_match PDIK1L ENST00000619836.4 4252 3 -116 0 -116 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AACAAAAAAAAAACTGAAAA NA FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 2 NA PB.417.2 chr1 + 3800 2 novel_in_catalog PDIK1L novel 4113 3 NA NA -14 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AACAAAAAAAAAACTGAAAA -20 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 3 NA PB.417.4 chr1 + 3815 2 novel_not_in_catalog PDIK1L novel 4113 3 NA NA -10 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AACAAAAAAAAAACTGAAAA -16 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 2 NA PB.417.5 chr1 + 4279 4 full-splice_match PDIK1L ENST00000374271.8 4279 4 -13 13 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AACAAAAAAAAAACTGAAAA -6 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 4 NA PB.417.7 chr1 + 4084 3 full-splice_match PDIK1L ENST00000374269.2 4113 3 4 25 4 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 20 5.218252 0.717525 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AACAAAAAAAAAACTGAAAA -2 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 20 NA PB.418.1 chr1 + 630 3 full-splice_match ZNF593 ENST00000374266.7 638 3 0 8 0 -8 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 35 9.131941 0.960563 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGAGAACTTGCCTCCAAC -21 TRUE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 35 NA PB.419.1 chr1 + 2557 21 full-splice_match CNKSR1 ENST00000374253.9 2538 21 -25 6 0 -4 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TAAGAATGAGTCTACATGTA -25 TRUE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.419.2 chr1 + 2514 21 full-splice_match CNKSR1 ENST00000361530.11 2535 21 16 5 -2 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGAATGAGTCTACATGTAA -2 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 5 NA PB.419.3 chr1 + 1760 14 incomplete-splice_match CNKSR1 ENST00000531191.5 2673 20 3207 -33 171 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGAATGAGTCTACATGTAA 1342 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.419.4 chr1 + 1046 6 incomplete-splice_match CNKSR1 ENST00000531191.5 2673 20 7287 -32 162 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TAAGAATGAGTCTACATGTA 5422 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.420.1 chr1 + 3856 13 novel_in_catalog CEP85 novel 3934 14 NA NA 0 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CTCCTCAGTTTTCCATACCC -10 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.420.3 chr1 + 1491 8 incomplete-splice_match CEP85 ENST00000252992.8 3935 14 5 10302 5 -3887 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.913689 0.592586 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AATAATTTGAAAAAGAAATG -3 TRUE NA NA GATAAA -7 NA NA NA 15 NA PB.420.4 chr1 + 3920 14 full-splice_match CEP85 ENST00000451429.8 3934 14 14 0 12 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 30 7.827378 0.893616 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCCTCAGTTTTCCATACCCT 4 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 30 NA PB.420.5 chr1 + 2995 11 incomplete-splice_match CEP85 ENST00000252992.8 3935 14 21570 0 1194 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCCTCAGTTTTCCATACCCT 485 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.420.6 chr1 + 2825 10 incomplete-splice_match CEP85 ENST00000252992.8 3935 14 23468 3 -3 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GACTCCTCAGTTTTCCATAC 2383 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.420.7 chr1 + 2290 6 incomplete-splice_match CEP85 ENST00000453146.1 2821 10 11804 -1 187 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCCTCAGTTTTCCATACCCT 203 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.420.8 chr1 + 2052 4 incomplete-splice_match CEP85 ENST00000453146.1 2821 10 14354 -1 562 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCCTCAGTTTTCCATACCCT 2753 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 5 NA PB.420.9 chr1 + 2017 3 incomplete-splice_match CEP85 ENST00000453146.1 2821 10 17281 -1 3489 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCCTCAGTTTTCCATACCCT 5680 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.420.10 chr1 + 1727 2 incomplete-splice_match CEP85 ENST00000469609.5 2384 7 7413 6 5238 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAGACTCCTCAGTTTTCC 164 FALSE NA NA AATAAA -8 NA NA NA 6 NA PB.421.8 chr1 - 1607 4 incomplete-splice_match PAFAH2 ENST00000374284.5 2523 11 21341 55 7406 -55 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAGAAAA NA FALSE NA NA AATGAA -19 NA NA NA 3 NA PB.421.9 chr1 - 1788 11 full-splice_match PAFAH2 ENST00000374282.8 3487 11 0 1699 0 -696 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATCACATTTTCTATTTATTT 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.422.3 chr1 - 2407 11 novel_in_catalog UBXN11 novel 1944 15 NA NA -2 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AACCCGCTGCTCCGCCAGGC -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.422.4 chr1 - 1660 15 full-splice_match UBXN11 ENST00000374222.6 1660 15 -2 2 -2 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AACCCGCTGCTCCGCCAGGC -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.422.7 chr1 - 1561 14 full-splice_match UBXN11 ENST00000357089.8 1555 14 -6 0 -2 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AACCCGCTGCTCCGCCAGGC -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.422.12 chr1 - 1203 9 novel_in_catalog UBXN11 novel 1944 15 NA NA -3 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AACCCGCTGCTCCGCCAGGC -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.422.17 chr1 - 2552 13 full-splice_match UBXN11 ENST00000475591.5 2542 13 -13 3 -4 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CAACCCGCTGCTCCGCCAGG -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.422.19 chr1 - 1485 8 novel_not_in_catalog UBXN11 novel 793 9 NA NA -2 2788 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CGTTCTCTTCCTTCTTTTGT -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.423.1 chr1 + 1077 3 full-splice_match SH3BGRL3 ENST00000270792.10 751 3 -327 1 -327 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTGTGTCTGGTTGGTTGTG 625 FALSE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 3 NA PB.423.2 chr1 + 979 3 full-splice_match SH3BGRL3 ENST00000270792.10 751 3 -229 1 -229 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTGTGTCTGGTTGGTTGTG 95 FALSE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 3 NA PB.423.3 chr1 + 792 3 full-splice_match SH3BGRL3 ENST00000270792.10 751 3 -42 1 -42 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 1339 349.361969 2.543276 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTGTGTCTGGTTGGTTGTG 282 FALSE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 1339 NA PB.423.4 chr1 + 703 2 full-splice_match SH3BGRL3 ENST00000319041.6 768 2 -68 133 -32 -133 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CTTACCCATTAGTCTCAGAA -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.423.5 chr1 + 575 3 full-splice_match SH3BGRL3 ENST00000270792.10 751 3 -27 203 -27 -131 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TACCCATTAGTCTCAGAAAT 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.423.6 chr1 + 815 3 novel_not_in_catalog SH3BGRL3 novel 751 3 NA NA -21 -8 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CATTGGCACTGTGTCTGGTT -18 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.423.7 chr1 + 919 3 full-splice_match SH3BGRL3 ENST00000270792.10 751 3 -3 -165 -3 165 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 CAAATACCTGTATGGACCAG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.423.8 chr1 + 876 2 full-splice_match SH3BGRL3 ENST00000319041.6 768 2 -39 -69 -3 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 37 9.653767 0.984697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GCACTGTGTCTGGTTGGTTG 0 TRUE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 37 NA PB.423.9 chr1 + 776 3 novel_not_in_catalog SH3BGRL3 novel 751 3 NA NA 3 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTGTGTCTGGTTGGTTGTG 6 TRUE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.423.10 chr1 + 603 2 incomplete-splice_match SH3BGRL3 ENST00000270792.10 751 3 708 1 672 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTGTGTCTGGTTGGTTGTG 8 TRUE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 7 NA PB.424.2 chr1 + 3434 5 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3458 5 NA NA -39 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCAAACTGTCATCCCCTTGT -1 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.424.6 chr1 + 3340 5 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3458 5 NA NA 5 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.130951 0.495676 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACTGTCATCCCCTTGTCA 5 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 12 NA PB.424.7 chr1 + 2387 4 full-splice_match LIN28A ENST00000326279.11 3975 4 5 1583 5 -1574 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GTTCTTTGGGGGTTTTGTTT 5 TRUE NA NA AATATA -21 NA NA NA 3 NA PB.424.8 chr1 + 1435 4 full-splice_match LIN28A ENST00000326279.11 3975 4 5 2535 5 -2526 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATTTTTGTATATTTTAATC 5 TRUE NA NA TATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.424.10 chr1 + 780 3 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3458 5 NA NA 14613 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACTGTCATCCCCTTGTCA NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.424.12 chr1 + 2559 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 15791 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATCCCCTTGTCAGATGTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -28 NA NA NA 2 NA PB.424.14 chr1 + 2414 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3458 5 NA NA 15868 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACTGTCATCCCCTTGTCA NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.424.15 chr1 + 2390 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 15950 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCAAACTGTCATCCCCTTGT 74 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.424.16 chr1 + 2165 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 16125 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATCCCCTTGTCAGATGTTTT 249 FALSE NA NA AATAAA -28 NA NA NA 2 NA PB.424.17 chr1 + 2194 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 16147 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAAACTGTCATCCCCTTGTC 271 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.424.21 chr1 + 1964 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 16377 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAAACTGTCATCCCCTTGTC 186 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.424.23 chr1 + 1828 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 16462 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATCCCCTTGTCAGATGTTTT 271 FALSE NA NA AATAAA -28 NA NA NA 2 NA PB.424.24 chr1 + 1861 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3458 5 NA NA 16481 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACTGTCATCCCCTTGTCA 290 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 5 NA PB.424.28 chr1 + 1614 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 16719 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAAACTGTCATCCCCTTGTC 528 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.424.29 chr1 + 1606 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 16744 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATCCCCTTGTCAGATGTTTT 553 FALSE NA NA AATAAA -28 NA NA NA 4 NA PB.424.31 chr1 + 1501 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 16893 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAAACTGTCATCCCCTTGTC 702 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 4 NA PB.424.32 chr1 + 1392 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3458 5 NA NA 16950 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACTGTCATCCCCTTGTCA 759 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 6 NA PB.424.33 chr1 + 1371 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3458 5 NA NA 16963 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACTGTCATCCCCTTGTCA 772 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.424.35 chr1 + 1265 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 17076 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAAACTGTCATCCCCTTGTC 40 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.424.38 chr1 + 1130 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 17160 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATCCCCTTGTCAGATGTTTT 53 FALSE NA NA AATAAA -28 NA NA NA 2 NA PB.424.41 chr1 + 1158 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 17236 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAAACTGTCATCCCCTTGTC 129 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.424.44 chr1 + 979 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3458 5 NA NA 17363 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACTGTCATCCCCTTGTCA 105 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 5 NA PB.425.1 chr1 - 1019 7 novel_in_catalog CRYBG2 novel 5239 20 NA NA -70 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACCCTTGTCTCTGTGCACC -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.425.2 chr1 - 1151 8 incomplete-splice_match CRYBG2 ENST00000308182.10 5239 20 17657 3 -90 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTACCCTTGTCTCTGTGCAC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.427.1 chr1 + 3174 8 full-splice_match DHDDS ENST00000525682.6 1235 8 -16 -1923 0 2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGATGTAAAACTTGTTTGCT -5 TRUE NA NA AATAGA -17 NA NA NA 9 NA PB.427.2 chr1 + 1105 8 novel_in_catalog DHDDS novel 3245 9 NA NA 0 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGAATGGTGTTCCCTTTG -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.427.3 chr1 + 868 7 novel_not_in_catalog DHDDS novel 868 7 NA NA 0 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATTTGGTCCCTCTCAT -5 TRUE NA NA ATTAAA -26 NA NA NA 2 NA PB.427.4 chr1 + 3270 9 full-splice_match DHDDS ENST00000236342.12 3288 9 4 14 2 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 20 5.218252 0.717525 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TCTTAGATGTAAAACTTGTT -3 TRUE NA NA AATAGA -13 NA NA NA 20 NA PB.427.5 chr1 + 1189 9 full-splice_match DHDDS ENST00000236342.12 3288 9 16 2083 -2 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.696427 0.671768 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAATGAATGGTGTTCCCTTT 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.427.6 chr1 + 1090 9 novel_in_catalog DHDDS novel 3288 9 NA NA 0 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATCAGTTCCCTGCTCCAT 11 TRUE NA NA AGTAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.427.8 chr1 + 3274 8 novel_in_catalog DHDDS novel 1235 8 NA NA 0 -4 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAACTTGTTTGCTAACTGC -13 TRUE NA NA AATAGA -23 NA NA NA 3 NA PB.427.9 chr1 + 3736 8 novel_in_catalog DHDDS novel 3338 9 NA NA 4 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TTAGATGTAAAACTTGTTTG -9 TRUE NA NA AATAGA -15 NA NA NA 2 NA PB.427.10 chr1 + 1480 9 novel_in_catalog DHDDS novel 3288 9 NA NA 4 37 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGCCTGTCTCTTAGATGCAC -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.427.11 chr1 + 1173 9 novel_in_catalog DHDDS novel 3245 9 NA NA 4 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAATGAATGGTGTTCCCTTT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.427.13 chr1 + 1031 7 incomplete-splice_match DHDDS ENST00000236342.12 3288 9 5847 2083 -4668 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAATGAATGGTGTTCCCTTT 5360 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.427.14 chr1 + 3067 7 incomplete-splice_match DHDDS ENST00000236342.12 3288 9 5882 12 -4633 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TTAGATGTAAAACTTGTTTG 5395 FALSE NA NA AATAGA -15 NA NA NA 3 NA PB.427.15 chr1 + 2723 4 incomplete-splice_match DHDDS ENST00000236342.12 3288 9 15238 14 1195 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TCTTAGATGTAAAACTTGTT NA FALSE NA NA AATAGA -13 NA NA NA 2 NA PB.429.1 chr1 + 1525 6 full-splice_match HMGN2 ENST00000361427.6 1940 6 -257 672 -257 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 1849 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 3 NA PB.429.2 chr1 + 1292 6 full-splice_match HMGN2 ENST00000361427.6 1940 6 -24 672 -24 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5384 1404.753418 3.147600 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT -16 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 5384 NA PB.429.4 chr1 + 1229 6 full-splice_match HMGN2 ENST00000361427.6 1940 6 31 680 -6 -8 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2593 676.546387 2.830297 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGGCTTGGAATGCTGCCTCT -14 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2593 NA PB.429.5 chr1 + 1987 6 full-splice_match HMGN2 ENST00000467700.5 932 6 -41 -1014 -1 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTGCTTTGTCCATTCCCT -9 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.429.8 chr1 + 3029 2 full-splice_match HMGN2 ENST00000493418.1 1496 2 -923 -610 0 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 4 NA PB.429.9 chr1 + 2584 3 novel_in_catalog HMGN2 novel 1148 7 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.913689 0.592586 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 15 NA PB.429.11 chr1 + 2174 3 incomplete-splice_match HMGN2 ENST00000479815.5 1030 4 43 -742 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 4 NA PB.429.12 chr1 + 1999 4 incomplete-splice_match HMGN2 ENST00000460563.5 1045 5 29 -538 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 3 NA PB.429.13 chr1 + 1871 6 full-splice_match HMGN2 ENST00000361427.6 1940 6 66 3 0 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 29 7.566465 0.878893 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAATTGCTTTGTCCATTCCC 0 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 29 NA PB.429.14 chr1 + 1729 4 full-splice_match HMGN2 ENST00000479815.5 1030 4 43 -742 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 9 NA PB.429.17 chr1 + 1554 5 full-splice_match HMGN2 ENST00000460563.5 1045 5 29 -538 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.696427 0.671768 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 18 NA PB.429.18 chr1 + 1260 6 full-splice_match HMGN2 ENST00000463817.5 853 6 -5 -402 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 8 NA PB.429.19 chr1 + 1287 6 full-splice_match HMGN2 ENST00000467700.5 932 6 -11 -344 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.957339 0.695249 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 19 NA PB.429.20 chr1 + 1196 6 novel_not_in_catalog HMGN2 novel 1148 7 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.429.21 chr1 + 1208 6 novel_not_in_catalog HMGN2 novel 1148 7 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 3 NA PB.429.22 chr1 + 1196 6 novel_not_in_catalog HMGN2 novel 1148 7 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.429.23 chr1 + 1190 6 novel_not_in_catalog HMGN2 novel 1148 7 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.913689 0.592586 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 15 NA PB.429.24 chr1 + 1165 5 novel_in_catalog HMGN2 novel 932 6 NA NA 0 -7 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGCTTGGAATGCTGCCTCTG 0 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 5 NA PB.429.25 chr1 + 1133 6 novel_not_in_catalog HMGN2 novel 1148 7 NA NA 0 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.429.26 chr1 + 1106 5 novel_in_catalog HMGN2 novel 1148 7 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 3 NA PB.429.27 chr1 + 1002 4 full-splice_match HMGN2 ENST00000479815.5 1030 4 43 -15 0 15 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACTTTTTTTTTTTTTTTAA 0 TRUE NA NA TATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.429.28 chr1 + 721 6 full-splice_match HMGN2 ENST00000361427.6 1940 6 66 1153 0 57 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATGTCCTCTTCTCCCTTTCC 0 TRUE NA NA AAAACA -12 NA NA NA 2 NA PB.429.29 chr1 + 515 6 full-splice_match HMGN2 ENST00000361427.6 1940 6 66 1359 0 55 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGAACACTTCATTGTTGTTT 0 TRUE NA NA TTTAAA -20 NA NA NA 11 NA PB.429.30 chr1 + 1367 5 full-splice_match HMGN2 ENST00000464888.5 565 5 9 -811 0 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATGCTGCCTCTGATCTTT 9 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 7 NA PB.429.31 chr1 + 1184 6 full-splice_match HMGN2 ENST00000361427.6 1940 6 84 672 7 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 75 19.568445 1.291556 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 18 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 75 NA PB.429.32 chr1 + 1392 6 novel_not_in_catalog HMGN2 novel 952 5 NA NA -117 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 411 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.429.33 chr1 + 1471 5 full-splice_match HMGN2 ENST00000466194.1 952 5 -114 -405 -114 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 414 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.429.34 chr1 + 1367 5 full-splice_match HMGN2 ENST00000466194.1 952 5 -11 -404 -11 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATGCTGCCTCTGATCTTT -28 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.429.35 chr1 + 1074 5 full-splice_match HMGN2 ENST00000466194.1 952 5 283 -405 60 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 259 67.576363 1.829795 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 266 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 259 NA PB.429.36 chr1 + 1568 3 incomplete-splice_match HMGN2 ENST00000479815.5 1030 4 1059 -742 93 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 299 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.429.37 chr1 + 1431 3 incomplete-splice_match HMGN2 ENST00000460563.5 1045 5 1177 -533 225 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CTTGGAATGCTGCCTCTGAT 431 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.429.38 chr1 + 1113 3 incomplete-splice_match HMGN2 ENST00000466194.1 952 5 771 -405 548 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 754 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 4 NA PB.429.39 chr1 + 1652 3 incomplete-splice_match HMGN2 ENST00000361427.6 1940 6 1667 3 678 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAATTGCTTTGTCCATTCCC 884 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.429.40 chr1 + 942 2 incomplete-splice_match HMGN2 ENST00000466194.1 952 5 1378 -405 1155 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 211 55.052559 1.740777 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 1361 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 211 NA PB.432.1 chr1 + 3157 22 full-splice_match RPS6KA1 ENST00000374168.7 3192 22 33 2 16 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCACGCTCTCCTGCACTC 20 TRUE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 5 NA PB.432.2 chr1 + 3031 21 full-splice_match RPS6KA1 ENST00000530003.5 3023 21 0 -8 0 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAAGCACGCTCTCCTGCACT -15 TRUE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.432.3 chr1 + 3129 21 full-splice_match RPS6KA1 ENST00000531382.5 2359 21 -17 -753 -7 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.435514 0.646944 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCTCTCCTGCACTCTTCATC -18 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 17 NA PB.432.4 chr1 + 2860 20 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000531382.5 2359 21 1077 -747 29 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCACGCTCTCCTGCACTC 1076 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.432.5 chr1 + 2455 15 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000374163.5 3202 22 8372 7 -985 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCACGCTCTCCTGCACTC 10 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 4 NA PB.432.6 chr1 + 2329 14 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000374163.5 3202 22 8841 8 -516 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAAGCACGCTCTCCTGCACT 479 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.432.7 chr1 + 2092 11 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000374163.5 3202 22 10834 7 -367 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCACGCTCTCCTGCACTC 2472 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.432.8 chr1 + 1866 9 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000374163.5 3202 22 13045 7 1844 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCACGCTCTCCTGCACTC 4683 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 4 NA PB.432.9 chr1 + 1705 8 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000374163.5 3202 22 14994 7 3793 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCACGCTCTCCTGCACTC 6632 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 6 NA PB.432.10 chr1 + 1623 7 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000374163.5 3202 22 15267 9 4066 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGAAGCACGCTCTCCTGCAC 6905 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 4 NA PB.432.11 chr1 + 1564 6 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000374163.5 3202 22 15698 7 4497 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.652776 0.562623 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCACGCTCTCCTGCACTC 7336 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 14 NA PB.432.12 chr1 + 1410 5 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000374163.5 3202 22 25637 7 250 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCACGCTCTCCTGCACTC NA FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 10 NA PB.432.13 chr1 + 1279 4 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000374163.5 3202 22 26006 7 -422 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCACGCTCTCCTGCACTC NA FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 3 NA PB.432.14 chr1 + 1128 3 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000438977.1 639 4 -21 -289 -21 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCACGCTCTCCTGCACTC NA FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 4 NA PB.432.15 chr1 + 991 2 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000438977.1 639 4 1046 -289 1046 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCACGCTCTCCTGCACTC NA FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 5 NA PB.436.6 chr1 + 4782 13 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000374152.7 6460 19 34121 -403 -1232 15 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAATA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.436.7 chr1 + 4506 12 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000374152.7 6460 19 37332 -403 -26 15 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAATA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.436.8 chr1 + 4213 10 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000374152.7 6460 19 38938 -403 -1324 15 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAATA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.436.10 chr1 + 3951 9 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000374152.7 6460 19 42318 -402 -1733 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.436.11 chr1 + 3657 7 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000636219.1 7058 19 43219 944 -87 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 1626 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.436.12 chr1 + 3462 6 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000636219.1 7058 19 43772 944 462 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 2179 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.436.13 chr1 + 3161 3 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000636219.1 7058 19 44670 944 -543 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 3077 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.436.14 chr1 + 3022 3 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000636219.1 7058 19 44809 944 -404 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 3216 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.436.15 chr1 + 2834 3 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000636219.1 7058 19 44997 944 -216 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 3404 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.436.16 chr1 + 2685 3 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000636219.1 7058 19 45146 944 -67 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 3553 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.436.17 chr1 + 2476 3 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000636219.1 7058 19 45355 944 142 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 3762 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.436.18 chr1 + 2282 3 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000636219.1 7058 19 45549 944 336 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 3956 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.436.19 chr1 + 2155 2 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000466382.2 2699 6 2725 22 819 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 4439 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.436.20 chr1 + 2053 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 1007 -14 1007 14 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 13 3.391864 0.530438 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 7856 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.436.21 chr1 + 1888 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 1172 -14 1172 14 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 8021 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.436.22 chr1 + 1756 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 1304 -14 1304 14 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 15 3.913689 0.592586 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 8153 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.436.23 chr1 + 1615 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 1445 -14 1445 14 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 15 3.913689 0.592586 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 8294 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.436.24 chr1 + 1462 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 1598 -14 1598 14 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 12 3.130951 0.495676 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 8447 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.436.25 chr1 + 1344 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 1717 -15 1717 15 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAATA 8566 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.436.26 chr1 + 1134 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 1926 -14 1926 14 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 35 9.131941 0.960563 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 8775 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 35 NA PB.436.27 chr1 + 917 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 2143 -14 2143 14 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 8992 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.436.28 chr1 + 774 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 2287 -15 2287 15 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAATA 9136 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.436.29 chr1 + 662 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 2398 -14 2398 14 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 9247 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.436.30 chr1 + 1250 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 2751 -955 2751 -3 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GGTAAGACTTTTGTGAAGCT 9600 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.436.31 chr1 + 1077 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 2927 -958 2927 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 15 3.913689 0.592586 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGACTTTTGTGAAGCTTTT 9776 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 15 NA PB.436.33 chr1 + 976 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 3028 -958 3028 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGACTTTTGTGAAGCTTTT 9877 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 9 NA PB.438.1 chr1 + 1965 4 full-splice_match PIGV ENST00000688522.1 2396 4 -31 462 -25 113 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TCTGCTGCCCTGGGATCATT 245 FALSE NA NA AGTAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.438.2 chr1 + 1038 3 incomplete-splice_match PIGV ENST00000472757.5 932 5 -25 2843 -5 -735 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACTGGAATGTTGGCTTTTT -39 TRUE NA NA AATATA -20 NA NA NA 2 NA PB.438.3 chr1 + 2129 4 full-splice_match PIGV ENST00000674222.1 4377 4 -17 2265 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 40 10.436504 1.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TACATGCAATGAATTGCCTT -28 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 40 NA PB.438.4 chr1 + 2413 4 full-splice_match PIGV ENST00000688522.1 2396 4 2 -19 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AATGAATTGCCTTTTTAAAA -26 TRUE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 7 NA PB.438.5 chr1 + 1652 4 full-splice_match PIGV ENST00000674222.1 4377 4 -15 2740 0 112 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTCTGCTGCCCTGGGATCAT -26 TRUE NA NA AGTAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.438.6 chr1 + 2960 4 full-splice_match PIGV ENST00000674273.1 4972 4 -239 2251 -2 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AATGAATTGCCTTTTTAAAA -22 TRUE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.438.7 chr1 + 2284 4 full-splice_match PIGV ENST00000688522.1 2396 4 24 88 -4 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.130951 0.495676 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATGCGACATTGTTTCTGA -4 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 12 NA PB.438.8 chr1 + 1689 4 full-splice_match PIGV ENST00000688522.1 2396 4 245 462 0 113 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TCTGCTGCCCTGGGATCATT 1 TRUE NA NA AGTAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.438.9 chr1 + 2059 4 full-splice_match PIGV ENST00000688522.1 2396 4 249 88 4 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATGCGACATTGTTTCTGA 5 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 7 NA PB.438.10 chr1 + 1441 2 incomplete-splice_match PIGV ENST00000674317.1 2245 4 5224 1 5224 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACATTGTTTCTGATGTTTTT 6339 FALSE NA NA AATAAA -25 NA NA NA 4 NA PB.438.11 chr1 + 771 2 incomplete-splice_match PIGV ENST00000674317.1 2245 4 5887 8 5887 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATGCGACATTGTTTCTGA 7002 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.439.1 chr1 + 2923 8 full-splice_match ZDHHC18 ENST00000374142.9 5045 8 237 1885 237 1756 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TGCTTTGCTTTGGTTTGGTT -17 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.439.2 chr1 + 2812 8 full-splice_match ZDHHC18 ENST00000374142.9 5045 8 349 1884 349 1757 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GCTTTGCTTTGGTTTGGTTT 7 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.439.3 chr1 + 2342 5 incomplete-splice_match ZDHHC18 ENST00000488397.3 1275 7 -12 1889 -12 1750 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGAGTTGCTTTGCTTTGGT NA FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 8 NA PB.439.4 chr1 + 2159 3 incomplete-splice_match ZDHHC18 ENST00000488397.3 1275 7 812 1889 45 1750 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGAGTTGCTTTGCTTTGGT NA FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 4 NA PB.439.5 chr1 + 2107 2 incomplete-splice_match ZDHHC18 ENST00000488397.3 1275 7 2391 1883 1624 1756 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TGCTTTGCTTTGGTTTGGTT NA FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.441.1 chr1 - 1427 5 full-splice_match GPN2 ENST00000374135.9 4665 5 -12 3250 -12 -6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 127 33.135902 1.520299 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTTTTTGTGACTTCCAAAC -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 127 NA PB.441.2 chr1 - 1357 5 novel_not_in_catalog GPN2 novel 4665 5 NA NA -11 -6 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTTTTTGTGACTTCCAAAC -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.441.3 chr1 - 1204 5 full-splice_match GPN2 ENST00000374135.9 4665 5 210 3251 187 -7 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TACTTTTTGTGACTTCCAAA 9988 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.441.4 chr1 - 1069 5 full-splice_match GPN2 ENST00000374135.9 4665 5 345 3251 322 -7 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TACTTTTTGTGACTTCCAAA 388 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.441.5 chr1 - 920 5 full-splice_match GPN2 ENST00000374135.9 4665 5 494 3251 471 -7 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TACTTTTTGTGACTTCCAAA 537 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.442.1 chr1 - 2255 6 novel_in_catalog GPATCH3 novel 2125 7 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTCCCTTACTTTTCTAAT -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.442.2 chr1 - 1756 7 full-splice_match GPATCH3 ENST00000361720.10 2125 7 368 1 368 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTCCCTTACTTTTCTAAT 357 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.442.3 chr1 - 821 2 incomplete-splice_match GPATCH3 ENST00000450844.1 521 3 399 -568 399 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTCCCTTACTTTTCTAAT 7963 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.442.4 chr1 - 2117 7 full-splice_match GPATCH3 ENST00000361720.10 2125 7 6 2 6 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 42 10.958329 1.039744 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAGCTCCCTTACTTTTCTAA -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 42 NA PB.442.5 chr1 - 1987 7 full-splice_match GPATCH3 ENST00000361720.10 2125 7 136 2 136 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAGCTCCCTTACTTTTCTAA 125 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.442.6 chr1 - 989 3 full-splice_match GPATCH3 ENST00000450844.1 521 3 99 -567 99 -2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAGCTCCCTTACTTTTCTAA 7663 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.442.7 chr1 - 1156 5 incomplete-splice_match GPATCH3 ENST00000361720.10 2125 7 6122 3 -897 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GGAGCTCCCTTACTTTTCTA 6111 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.443.1 chr1 + 1489 1 full-splice_match SFN ENST00000339276.6 1308 1 -181 0 -181 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTCCTGTCTCTCTTCCAGTT 642 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.443.2 chr1 + 1308 1 full-splice_match SFN ENST00000339276.6 1308 1 0 0 0 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 369 96.276749 1.983521 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTCCTGTCTCTCTTCCAGTT 0 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 369 NA PB.443.5 chr1 + 1227 1 full-splice_match SFN ENST00000339276.6 1308 1 81 0 81 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTCCTGTCTCTCTTCCAGTT 81 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 11 NA PB.443.6 chr1 + 1068 1 full-splice_match SFN ENST00000339276.6 1308 1 240 0 240 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 19 4.957339 0.695249 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTCCTGTCTCTCTTCCAGTT 240 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 19 NA PB.443.7 chr1 + 845 1 full-splice_match SFN ENST00000339276.6 1308 1 463 0 463 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTCCTGTCTCTCTTCCAGTT 463 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 6 NA PB.443.8 chr1 + 777 1 full-splice_match SFN ENST00000339276.6 1308 1 531 0 531 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTCCTGTCTCTCTTCCAGTT 531 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 7 NA PB.444.1 chr1 - 977 2 full-splice_match NR0B2 ENST00000254227.4 1165 2 190 -2 190 2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GGAGCCTGATACTGTCATTT 7656 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.444.2 chr1 - 1168 2 full-splice_match NR0B2 ENST00000254227.4 1165 2 -2 -1 -2 1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 200 52.182522 1.717525 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGGAGCCTGATACTGTCATT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 200 NA PB.444.3 chr1 - 1477 2 novel_not_in_catalog NR0B2 novel 1165 2 NA NA 0 -6 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACACTTGGAGCCTGATAC -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.444.4 chr1 - 1035 2 full-splice_match NR0B2 ENST00000254227.4 1165 2 124 6 124 -6 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACACTTGGAGCCTGATAC 7590 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.445.1 chr1 - 1782 4 full-splice_match KDF1 ENST00000320567.6 1855 4 77 -4 77 4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 26 6.783728 0.831468 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCTGCCTGCTTTCTTGGC -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 26 NA PB.445.4 chr1 - 1776 4 novel_not_in_catalog KDF1 novel 1855 4 NA NA 12 -8 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAGGTAATTGGTATCTGCC -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.445.5 chr1 - 1620 3 incomplete-splice_match KDF1 ENST00000320567.6 1855 4 8164 8 8164 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAGGTAATTGGTATCTGCC 8140 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.446.1 chr1 - 2379 2 full-splice_match TENT5B ENST00000289166.6 2382 2 1 2 1 -2 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 13 3.391864 0.530438 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCTTAGTGCCATGCTTCC 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.447.2 chr1 + 1339 9 full-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 -21 474 -21 213 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2100 547.916443 2.738714 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTCTGTGTCCTCTCTTGCC -33 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 2100 NA PB.447.4 chr1 + 1422 10 novel_not_in_catalog NUDC novel 1792 9 NA NA 0 212 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CCTTCTGTGTCCTCTCTTGC -12 TRUE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.447.5 chr1 + 1411 8 novel_in_catalog NUDC novel 1792 9 NA NA 0 212 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CCTTCTGTGTCCTCTCTTGC -12 TRUE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 4 NA PB.447.6 chr1 + 1340 9 novel_not_in_catalog NUDC novel 1792 9 NA NA 0 211 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TCCTTCTGTGTCCTCTCTTG -12 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.447.7 chr1 + 1801 9 full-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 2 -11 2 11 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 71 18.524796 1.267753 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATGTATGTTTCTGAGCAAAG -10 TRUE NA NA AATAAA -25 NA NA NA 71 NA PB.447.8 chr1 + 1407 8 novel_in_catalog NUDC novel 1792 9 NA NA 2 212 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CCTTCTGTGTCCTCTCTTGC -10 TRUE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 6 NA PB.447.9 chr1 + 1308 9 novel_not_in_catalog NUDC novel 1792 9 NA NA 2 211 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TCCTTCTGTGTCCTCTCTTG -10 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.447.10 chr1 + 1004 7 novel_in_catalog NUDC novel 1792 9 NA NA 2 213 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.696427 0.671768 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTCTGTGTCCTCTCTTGCC -10 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 18 NA PB.447.11 chr1 + 1494 9 full-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 3 295 3 -295 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGTGATGGTTCATGTCTGTA -9 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 8 NA PB.447.13 chr1 + 1478 10 novel_not_in_catalog NUDC novel 1792 9 NA NA 9 211 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 53 13.828368 1.140771 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TCCTTCTGTGTCCTCTCTTG -3 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 53 NA PB.447.14 chr1 + 1403 8 novel_in_catalog NUDC novel 1792 9 NA NA 9 213 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTCTGTGTCCTCTCTTGCC -3 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 5 NA PB.447.15 chr1 + 1228 8 novel_in_catalog NUDC novel 1792 9 NA NA 10 211 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TCCTTCTGTGTCCTCTCTTG -2 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.447.16 chr1 + 1926 10 novel_not_in_catalog NUDC novel 1792 9 NA NA 13 -24 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAATAAATAAATAAAA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.447.17 chr1 + 1660 9 full-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 108 24 108 -24 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAATAAATAAATAAAA 40 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.447.18 chr1 + 1209 9 full-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 109 474 109 213 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 58 15.132931 1.179923 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTCTGTGTCCTCTCTTGCC 41 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 58 NA PB.447.19 chr1 + 1544 9 novel_in_catalog NUDC novel 816 5 NA NA -62 213 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTCTGTGTCCTCTCTTGCC 269 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.447.21 chr1 + 1046 7 incomplete-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 19721 474 -3671 213 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 46 12.001980 1.079253 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTCTGTGTCCTCTCTTGCC 5255 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 46 NA PB.447.22 chr1 + 1482 7 incomplete-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 19735 24 -3657 -24 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAATAAATAAATAAAA 5269 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.447.24 chr1 + 909 7 incomplete-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 19856 476 -3536 211 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 50 13.045630 1.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TCCTTCTGTGTCCTCTCTTG 5390 FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 50 NA PB.447.25 chr1 + 1234 5 incomplete-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 20916 24 -2476 -24 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAATAAATAAATAAAA 6450 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.447.26 chr1 + 769 5 incomplete-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 20930 475 -2462 212 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 25 6.522815 0.814435 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CCTTCTGTGTCCTCTCTTGC 6464 FALSE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 25 NA PB.447.27 chr1 + 650 4 incomplete-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 21144 474 -2248 213 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.391864 0.530438 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTCTGTGTCCTCTCTTGCC 6678 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 13 NA PB.447.28 chr1 + 985 4 incomplete-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 21259 24 -2133 -24 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAATAAATAAATAAAA 6793 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.447.30 chr1 + 877 3 incomplete-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 23691 24 299 -24 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAATAAATAAATAAAA 53 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.448.1 chr1 + 4291 16 full-splice_match WDTC1 ENST00000319394.8 4706 16 19 396 -17 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TAGGTGTGGCTGGTGGCATT 10 TRUE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 3 NA PB.448.2 chr1 + 2661 4 incomplete-splice_match WDTC1 ENST00000361771.7 4275 16 66557 3 -3789 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGGTGTGGCTGGTGGCATTT NA FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.448.3 chr1 + 2424 3 incomplete-splice_match WDTC1 ENST00000361771.7 4275 16 68952 4 -1394 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TAGGTGTGGCTGGTGGCATT NA FALSE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 5 NA PB.448.4 chr1 + 2278 3 incomplete-splice_match WDTC1 ENST00000361771.7 4275 16 69099 3 -1247 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGGTGTGGCTGGTGGCATTT NA FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.448.5 chr1 + 2178 2 incomplete-splice_match WDTC1 ENST00000472249.2 628 3 58 -1351 58 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGGTGTGGCTGGTGGCATTT NA FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.449.1 chr1 + 1598 6 full-splice_match TMEM222 ENST00000374076.9 1596 6 -3 1 -3 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTGGTGCCCTGTCATTGT -9 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.449.2 chr1 + 2610 5 full-splice_match TMEM222 ENST00000464813.5 1071 5 -36 -1503 -2 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTGGTGCCCTGTCATTGT -26 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.449.3 chr1 + 1601 7 full-splice_match TMEM222 ENST00000478104.5 986 7 -40 -575 -2 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTGGTGCCCTGTCATTGT -26 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.449.4 chr1 + 1510 6 full-splice_match TMEM222 ENST00000608611.5 1511 6 0 1 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 170 44.355145 1.646944 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTGGTGCCCTGTCATTGT -23 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 170 NA PB.449.6 chr1 + 1656 7 full-splice_match TMEM222 ENST00000464720.5 1665 7 8 1 1 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTGGTGCCCTGTCATTGT -16 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 8 NA PB.449.8 chr1 + 1316 2 novel_not_in_catalog TMEM222 novel 368 4 NA NA 1 -6034 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAGGGAAAAAAAAG -16 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 8 NA PB.449.9 chr1 + 1493 6 novel_not_in_catalog TMEM222 novel 1613 6 NA NA 2 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTGGTGCCCTGTCATTGT -15 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.449.10 chr1 + 1715 1 full-splice_match ACTG1P20 ENST00000486001.1 468 1 -518 -729 -518 729 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAGGGAAAAAAAAG 2540 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.449.11 chr1 + 1600 1 full-splice_match ACTG1P20 ENST00000486001.1 468 1 -403 -729 -403 729 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAGGGAAAAAAAAG 2655 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.449.12 chr1 + 1398 1 full-splice_match ACTG1P20 ENST00000486001.1 468 1 -201 -729 -201 729 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAGGGAAAAAAAAG 2857 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.449.15 chr1 + 1330 5 incomplete-splice_match TMEM222 ENST00000608611.5 1511 6 8508 1 -1590 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTGGTGCCCTGTCATTGT 4434 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.449.16 chr1 + 1243 3 full-splice_match TMEM222 ENST00000471456.1 2861 3 1618 0 501 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTGGTGCCCTGTCATTGT 7642 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.449.17 chr1 + 1211 3 incomplete-splice_match TMEM222 ENST00000478104.5 986 7 11895 -575 717 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTGGTGCCCTGTCATTGT 7858 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.450.1 chr1 - 3861 12 full-splice_match SLC9A1 ENST00000263980.8 4737 12 870 6 343 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAGAGTCAAGGGCTGCTT 1233 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.450.2 chr1 - 3366 11 incomplete-splice_match SLC9A1 ENST00000263980.8 4737 12 41061 6 -10042 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAGAGTCAAGGGCTGCTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.450.3 chr1 - 2953 10 incomplete-splice_match SLC9A1 ENST00000263980.8 4737 12 45522 6 -5581 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAGAGTCAAGGGCTGCTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.450.4 chr1 - 2187 5 incomplete-splice_match SLC9A1 ENST00000374089.5 3165 7 1571 0 344 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAGAGTCAAGGGCTGCTT NA FALSE NA NA GGGGCT -6 NA NA NA 3 NA PB.450.10 chr1 - 4190 12 full-splice_match SLC9A1 ENST00000263980.8 4737 12 540 7 13 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAATAGAGTCAAGGGCTGCT 903 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.450.11 chr1 - 2564 8 incomplete-splice_match SLC9A1 ENST00000263980.8 4737 12 49131 7 -1972 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAATAGAGTCAAGGGCTGCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.450.14 chr1 - 2074 4 incomplete-splice_match SLC9A1 ENST00000374089.5 3165 7 1936 2 709 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TTAATAGAGTCAAGGGCTGC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.451.1 chr1 + 2077 13 novel_in_catalog SYTL1 novel 1936 15 NA NA 1 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAAAAGGCTGGTGTCTGC -30 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.451.3 chr1 + 2167 14 novel_in_catalog SYTL1 novel 1936 15 NA NA -12 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAAAAGGCTGGTGTCTGC -8 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.451.4 chr1 + 1906 15 full-splice_match SYTL1 ENST00000616558.5 1936 15 28 2 -7 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.740077 0.758918 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAAAAGGCTGGTGTCTGC -3 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 22 NA PB.451.5 chr1 + 1451 13 incomplete-splice_match SYTL1 ENST00000543823.1 2229 14 2673 0 2 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAAAAGGCTGGTGTCTGC 2732 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.451.6 chr1 + 1253 10 incomplete-splice_match SYTL1 ENST00000543823.1 2229 14 4262 0 -341 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAAAAGGCTGGTGTCTGC 4321 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.451.7 chr1 + 1619 4 full-splice_match SYTL1 ENST00000615284.1 793 4 -833 7 495 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAAAAGGCTGGTGTCTGC 5428 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.451.8 chr1 + 1298 4 full-splice_match SYTL1 ENST00000615284.1 793 4 -512 7 -512 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAAAAGGCTGGTGTCTGC 5749 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.452.2 chr1 - 1585 11 incomplete-splice_match MAP3K6 ENST00000493901.6 3654 27 5970 -28 -990 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGTCCTGGCAATTTTGGAGG 8153 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.452.3 chr1 - 2949 23 incomplete-splice_match MAP3K6 ENST00000493901.6 3654 27 1899 -22 -140 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCTTTGTCCTGGCAATTT 4082 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.452.4 chr1 - 1699 12 incomplete-splice_match MAP3K6 ENST00000493901.6 3654 27 5300 -22 -1660 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCTTTGTCCTGGCAATTT 7483 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.452.5 chr1 - 1077 8 incomplete-splice_match MAP3K6 ENST00000671291.1 3287 20 4933 -22 12 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCTTTGTCCTGGCAATTT 9155 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.452.6 chr1 - 830 7 incomplete-splice_match MAP3K6 ENST00000671291.1 3287 20 5314 -22 199 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCTTTGTCCTGGCAATTT 9536 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.452.7 chr1 - 1380 10 incomplete-splice_match MAP3K6 ENST00000493901.6 3654 27 6265 -21 -695 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAACCTTTGTCCTGGCAATT 8448 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.452.8 chr1 - 1879 13 incomplete-splice_match MAP3K6 ENST00000493901.6 3654 27 4783 -20 -2177 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGAACCTTTGTCCTGGCAAT 6966 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.454.1 chr1 + 2122 2 full-splice_match GPR3 ENST00000374024.4 2137 2 12 3 12 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATGTTTCCCTATGTGT 8 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 11 NA PB.455.21 chr1 - 3218 2 incomplete-splice_match WASF2 ENST00000618852.5 5681 9 79973 1402 79857 -1402 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 8811 FALSE NA NA AAAAAG -17 NA NA NA 4 NA PB.455.35 chr1 - 3253 9 full-splice_match WASF2 ENST00000618852.5 5681 9 9 2419 9 1548 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAGCCAACAGTGAGGTTTCT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.455.36 chr1 - 1860 9 full-splice_match WASF2 ENST00000618852.5 5681 9 0 3821 0 146 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGATATATCCAAGTGCTT -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.455.37 chr1 - 759 5 incomplete-splice_match WASF2 ENST00000536657.1 1083 8 -116 7791 0 -7791 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 249 64.967239 1.812694 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGGGTGAGGGGAAAGGGGCC -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 249 NA PB.456.1 chr1 - 985 2 incomplete-splice_match AHDC1 ENST00000644989.1 6103 6 55848 30 5914 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAGAAATGAAAAAAAGC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.456.2 chr1 - 5853 8 novel_in_catalog AHDC1 novel 6428 9 NA NA 0 4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAAGACAAAAAAAAAAAA 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.456.3 chr1 - 2392 2 incomplete-splice_match AHDC1 ENST00000644989.1 6103 6 54063 408 4129 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAAGACAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.456.4 chr1 - 1906 2 incomplete-splice_match AHDC1 ENST00000644989.1 6103 6 54549 408 4615 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAAGACAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA GGGGCT -12 NA NA NA 4 NA PB.456.5 chr1 - 1560 2 incomplete-splice_match AHDC1 ENST00000644989.1 6103 6 54895 408 4961 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAAGACAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.456.6 chr1 - 1275 2 incomplete-splice_match AHDC1 ENST00000644989.1 6103 6 55180 408 5246 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAAGACAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.456.7 chr1 - 1136 2 incomplete-splice_match AHDC1 ENST00000644989.1 6103 6 55319 408 5385 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAAGACAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.456.8 chr1 - 2906 2 incomplete-splice_match AHDC1 ENST00000644989.1 6103 6 53546 411 3612 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAGAAAAAGACAAAAAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.457.1 chr1 - 2361 13 full-splice_match FGR ENST00000374005.8 2637 13 48 228 -3 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATACCCTTGAACCTTCCT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.457.2 chr1 - 1371 5 incomplete-splice_match FGR ENST00000374004.5 2350 11 8452 -8 8452 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATACCCTTGAACCTTCCT 9622 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.457.3 chr1 - 1101 3 incomplete-splice_match FGR ENST00000374004.5 2350 11 9494 -7 9494 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAATACCCTTGAACCTTCC 9369 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.457.4 chr1 - 2386 13 full-splice_match FGR ENST00000399173.5 2483 13 89 8 -16 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAACCATGAAATACCCTTGA 9366 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.457.5 chr1 - 1127 4 incomplete-splice_match FGR ENST00000374004.5 2350 11 9195 0 9195 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAACCATGAAATACCCTTGA 10004 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.459.2 chr1 + 2045 9 full-splice_match FAM76A ENST00000373954.11 3579 9 21 1513 -14 130 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATATCAGTTGTCATACTGGG 7 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 4 NA PB.459.3 chr1 + 1115 5 novel_not_in_catalog FAM76A novel 1027 8 NA NA -14 -19925 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 TAAAAAAAATAGGCTATGGT 7 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.459.4 chr1 + 1158 9 novel_in_catalog FAM76A novel 3579 9 NA NA 0 8 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATTATAGATTCTGTTTATC 21 TRUE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 2 NA PB.460.2 chr1 + 858 7 incomplete-splice_match STX12 ENST00000373943.9 3034 9 26 6374 -10 -5 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAGAAAGAAAGAAAGA 16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.460.3 chr1 + 3003 9 full-splice_match STX12 ENST00000373943.9 3034 9 28 3 -8 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.652776 0.562623 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATTCTCCTTATCTGTGCC 18 TRUE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 14 NA PB.460.4 chr1 + 2865 9 full-splice_match STX12 ENST00000373943.9 3034 9 29 140 -7 -140 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.130951 0.495676 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATACTGTGTGACCTGTGGT 19 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 12 NA PB.460.5 chr1 + 2326 9 full-splice_match STX12 ENST00000373943.9 3034 9 33 675 -3 -675 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 41 10.697417 1.029279 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TTTGTAGTATGTTTTTATGA 23 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 41 NA PB.460.6 chr1 + 2033 9 full-splice_match STX12 ENST00000373943.9 3034 9 33 968 -3 -968 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAAATGTTGTCCACTTCCCT 23 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 5 NA PB.461.1 chr1 + 2317 7 full-splice_match PPP1R8 ENST00000311772.10 2340 7 27 -4 -5 4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AATGAGAGAATGTAGTCCCC 9 TRUE NA NA AATAAA -28 NA NA NA 5 NA PB.461.2 chr1 + 2634 7 full-splice_match PPP1R8 ENST00000431586.1 1029 7 -510 -1095 0 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTGGGTGCAGGCTGTGAA 14 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.461.4 chr1 + 2159 7 full-splice_match PPP1R8 ENST00000311772.10 2340 7 32 149 0 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 102 26.613085 1.425095 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTGGGTGCAGGCTGTGAA 14 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 102 NA PB.461.5 chr1 + 1012 7 full-splice_match PPP1R8 ENST00000311772.10 2340 7 32 1296 0 -52 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAGAAGAAGAAATATGCAAA 14 TRUE NA NA AATGAA -4 NA NA NA 8 NA PB.461.6 chr1 + 2080 7 novel_not_in_catalog PPP1R8 novel 2340 7 NA NA 1 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTGGGTGCAGGCTGTGAA 15 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.461.8 chr1 + 1773 4 incomplete-splice_match PPP1R8 ENST00000373931.8 2651 7 10285 145 -8986 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTGGGTGCAGGCTGTGAA 89 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 7 NA PB.461.9 chr1 + 1585 3 incomplete-splice_match PPP1R8 ENST00000236412.11 2414 6 12432 1 -6847 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTGGGTGCAGGCTGTGAA 2228 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 7 NA PB.462.1 chr1 - 830 5 full-splice_match IFI6 ENST00000339145.8 822 5 -14 6 0 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAACACTTTGTCCTGCTGT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.462.2 chr1 - 806 5 full-splice_match IFI6 ENST00000361157.11 812 5 0 6 0 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 238 62.097198 1.793072 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAACACTTTGTCCTGCTGT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 238 NA PB.462.3 chr1 - 595 3 incomplete-splice_match IFI6 ENST00000339145.8 822 5 3682 6 3682 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAACACTTTGTCCTGCTGT 3694 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.462.4 chr1 - 462 2 incomplete-splice_match IFI6 ENST00000339145.8 822 5 3897 6 3897 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAACACTTTGTCCTGCTGT 3909 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.462.5 chr1 - 817 5 full-splice_match IFI6 ENST00000362020.4 828 5 6 5 0 -5 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 37 9.653767 0.984697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAAAACACTTTGTCCTGCTG -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 37 NA PB.463.1 chr1 + 1130 3 novel_in_catalog THEMIS2 novel 1082 4 NA NA -43 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TATGAATGAGAACGGTATCA 9022 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.463.2 chr1 + 1228 4 full-splice_match THEMIS2 ENST00000373927.7 1082 4 -5 -141 0 1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATGAATGAGAACGGTATCAT -5 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 8 NA PB.463.3 chr1 + 2705 6 full-splice_match THEMIS2 ENST00000373921.8 2713 6 7 1 2 1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.740077 0.758918 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATGAATGAGAACGGTATCAT 2 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 22 NA PB.463.4 chr1 + 1519 3 incomplete-splice_match THEMIS2 ENST00000456990.1 1926 5 2756 2 -911 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TCTATGAATGAGAACGGTAT 2834 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.463.5 chr1 + 1313 3 incomplete-splice_match THEMIS2 ENST00000456990.1 1926 5 2964 0 -703 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TATGAATGAGAACGGTATCA 120 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.463.6 chr1 + 998 2 full-splice_match THEMIS2 ENST00000492877.1 2861 2 1863 0 1863 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TATGAATGAGAACGGTATCA 1671 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.464.2 chr1 + 1857 8 full-splice_match SMPDL3B ENST00000373894.8 1866 8 7 2 7 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.174602 0.620615 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GATTCTGTGTTGTGTTCCTT 13 FALSE NA NA AAAACA -18 NA NA NA 16 NA PB.464.3 chr1 + 1621 7 incomplete-splice_match SMPDL3B ENST00000373894.8 1866 8 10231 1 10121 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTCTGTGTTGTGTTCCTTT 1563 FALSE NA NA AAAACA -19 NA NA NA 2 NA PB.464.4 chr1 + 1216 5 incomplete-splice_match SMPDL3B ENST00000548116.5 1913 8 18278 6 18197 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTCTGTGTTGTGTTCCTTT 9639 FALSE NA NA AAAACA -19 NA NA NA 2 NA PB.465.1 chr1 - 1579 9 full-splice_match RPA2 ENST00000373912.8 1584 9 0 5 0 -5 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 775 202.207275 2.305797 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAAATTCTCGTTTTTCTTT -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 775 NA PB.465.2 chr1 - 1462 8 novel_in_catalog RPA2 novel 1584 9 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AGTAACTTGTAAAAATTCTC -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.465.3 chr1 - 1589 9 novel_in_catalog RPA2 novel 1584 9 NA NA -6 1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAACTTGTAAAAATTCTCGT -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.465.5 chr1 - 1874 8 full-splice_match RPA2 ENST00000313433.11 1237 8 -100 -537 -25 2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AACTTGTAAAAATTCTCGTT 120 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.465.6 chr1 - 789 2 incomplete-splice_match RPA2 ENST00000373912.8 1584 9 20486 13 2996 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAACTTGTAAAAATTCTCGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.465.7 chr1 - 1490 8 novel_in_catalog RPA2 novel 1584 9 NA NA 4 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 29 7.566465 0.878893 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AGTAACTTGTAAAAATTCTC -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 29 NA PB.465.8 chr1 - 1406 8 full-splice_match RPA2 ENST00000313433.11 1237 8 365 -534 365 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.913689 0.592586 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AGTAACTTGTAAAAATTCTC 585 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.465.9 chr1 - 1092 5 incomplete-splice_match RPA2 ENST00000373912.8 1584 9 16880 15 -610 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.696427 0.671768 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AGTAACTTGTAAAAATTCTC NA FALSE NA NA ATTAAA -10 NA NA NA 18 NA PB.465.10 chr1 - 1719 9 novel_not_in_catalog RPA2 novel 1584 9 NA NA 0 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TAGTAACTTGTAAAAATTCT -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.465.11 chr1 - 1543 9 full-splice_match RPA2 ENST00000373909.7 1162 9 3 -384 3 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TAGTAACTTGTAAAAATTCT -10 TRUE NA NA AAGAAA -12 NA NA NA 6 NA PB.465.12 chr1 - 1461 9 full-splice_match RPA2 ENST00000373912.8 1584 9 107 16 45 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TAGTAACTTGTAAAAATTCT 265 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.465.13 chr1 - 1236 7 incomplete-splice_match RPA2 ENST00000373912.8 1584 9 7376 16 7314 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.957339 0.695249 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TAGTAACTTGTAAAAATTCT 7534 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.465.14 chr1 - 1734 9 full-splice_match RPA2 ENST00000373912.8 1584 9 -167 17 4 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 23 6.000990 0.778223 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 GTAGTAACTTGTAAAAATTC -9 TRUE NA NA AAGAAA -11 NA NA NA 23 NA PB.465.15 chr1 - 912 3 incomplete-splice_match RPA2 ENST00000373912.8 1584 9 20175 18 2685 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.479165 0.738714 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TGTAGTAACTTGTAAAAATT NA FALSE NA NA AAGAAA -41 NA NA NA 21 NA PB.467.8 chr1 - 1741 16 incomplete-splice_match EYA3 ENST00000373871.8 5999 18 21 18124 8 5 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATTTTCTAGCCCCTCTTGT 21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.467.9 chr1 - 1619 15 incomplete-splice_match EYA3 ENST00000373863.3 1729 17 -51 11205 -5 1 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATGCACCTATTATTTTCTAG -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.467.10 chr1 - 1752 16 novel_not_in_catalog EYA3 novel 1806 17 NA NA 6 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATGATGCACCTATTATTTTC -21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.467.11 chr1 - 1697 16 novel_in_catalog EYA3 novel 1806 17 NA NA 9 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATGATGCACCTATTATTTTC -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.467.14 chr1 - 1094 9 incomplete-splice_match EYA3 ENST00000373863.3 1729 17 -67 33527 6 -4 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAGAAAAATGTAAAAAGA -21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.468.1 chr1 + 2152 3 full-splice_match XKR8 ENST00000373884.6 2178 3 26 0 26 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 31 8.088291 0.907857 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAACCTAGTCTGTGTCATCA -3 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 31 NA PB.468.2 chr1 + 1734 2 incomplete-splice_match XKR8 ENST00000373884.6 2178 3 3579 -1 3290 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACCTAGTCTGTGTCATCAA 3507 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.469.2 chr1 - 1806 2 full-splice_match PTAFR ENST00000373857.8 3993 2 0 2187 0 320 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA -9 TRUE NA NA AAGAAA -44 NA NA NA 3 NA PB.469.4 chr1 - 1242 3 incomplete-splice_match DNAJC8 ENST00000603289.5 483 5 17 825 17 -3 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAGCGTCCAGCTCACAGTC NA FALSE NA NA AAGAAA -8 NA NA NA 3 NA PB.469.5 chr1 - 1746 9 full-splice_match DNAJC8 ENST00000263697.6 1763 9 13 4 4 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 40 10.436504 1.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAGCGTCCAGCTCACAGT 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 40 NA PB.469.6 chr1 - 1486 9 full-splice_match DNAJC8 ENST00000263697.6 1763 9 -4 281 -4 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 1347 351.449280 2.545863 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 1347 NA PB.469.8 chr1 - 3541 7 novel_in_catalog DNAJC8 novel 1600 10 NA NA -1 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.469.9 chr1 - 1992 8 novel_in_catalog DNAJC8 novel 1600 10 NA NA -6 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.469.10 chr1 - 1600 10 full-splice_match DNAJC8 ENST00000489277.5 1600 10 0 0 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 24 6.261902 0.796706 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 24 NA PB.469.11 chr1 - 1509 9 novel_in_catalog DNAJC8 novel 1600 10 NA NA 0 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.469.12 chr1 - 1385 8 novel_in_catalog DNAJC8 novel 1600 10 NA NA 0 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC 21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.469.13 chr1 - 1374 8 novel_in_catalog DNAJC8 novel 1600 10 NA NA 4 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.469.14 chr1 - 1377 8 novel_in_catalog DNAJC8 novel 1600 10 NA NA -1 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.469.15 chr1 - 1367 8 novel_not_in_catalog DNAJC8 novel 1763 9 NA NA 0 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.469.16 chr1 - 1273 7 incomplete-splice_match DNAJC8 ENST00000489277.5 1600 10 18027 0 -6189 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 25 6.522815 0.814435 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC NA FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 25 NA PB.469.17 chr1 - 1143 5 incomplete-splice_match DNAJC8 ENST00000489277.5 1600 10 22963 0 -1253 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 31 8.088291 0.907857 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC NA FALSE NA NA AAAACA -34 NA NA NA 31 NA PB.469.18 chr1 - 1037 4 novel_not_in_catalog DNAJC8 novel 1600 10 NA NA 0 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 53 13.828368 1.140771 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 53 NA PB.469.19 chr1 - 1043 4 incomplete-splice_match DNAJC8 ENST00000489277.5 1600 10 24621 0 405 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 27 7.044641 0.847859 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC NA FALSE NA NA AAAAAG -34 NA NA NA 27 NA PB.469.20 chr1 - 938 3 incomplete-splice_match DNAJC8 ENST00000603289.5 483 5 43 1103 43 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 23 6.000990 0.778223 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 23 NA PB.469.22 chr1 - 914 7 incomplete-splice_match DNAJC8 ENST00000489277.5 1600 10 18061 325 -6155 -325 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACAGTGTTGCTGTGACTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.469.23 chr1 - 1153 9 full-splice_match DNAJC8 ENST00000263697.6 1763 9 3 607 -1 -326 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 113 29.483124 1.469573 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAACAGTGTTGCTGTGACT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 113 NA PB.469.24 chr1 - 717 4 novel_not_in_catalog DNAJC8 novel 1763 9 NA NA -1 -326 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAACAGTGTTGCTGTGACT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.469.25 chr1 - 583 7 incomplete-splice_match DNAJC8 ENST00000263697.6 1763 9 4 4987 0 -7 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 ATGAAAGGTACATATCAGTA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.470.2 chr1 + 501 3 full-splice_match ATP5IF1 ENST00000335514.10 503 3 0 2 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 138 36.005939 1.556374 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AACTGTGTTTGATGCCTTCT -15 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 138 NA PB.470.3 chr1 + 573 3 full-splice_match ATP5IF1 ENST00000497986.5 599 3 18 8 3 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAACTGTGTTTGATGCCTTC -12 TRUE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 8 NA PB.470.4 chr1 + 1877 2 full-splice_match ATP5IF1 ENST00000465645.1 1855 2 -23 1 7 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 71 18.524796 1.267753 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAACTGTGTTTGATGCCTTC -8 TRUE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 71 NA PB.473.2 chr1 + 1288 4 novel_not_in_catalog MED18 novel 1106 4 NA NA -9 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.740077 0.758918 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACATGTCTGTGTAATTCTGA -26 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 22 NA PB.473.3 chr1 + 897 3 full-splice_match MED18 ENST00000373842.9 1829 3 -19 951 19 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAAATATGTTTGCTTTTT -36 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.473.7 chr1 + 1048 4 novel_not_in_catalog MED18 novel 1106 4 NA NA -8 1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATGTCTGTGTAATTCTGATT -25 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.473.8 chr1 + 1122 4 full-splice_match MED18 ENST00000398997.2 1106 4 -21 5 -6 -5 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAGACATGTCTGTGTAAT -23 TRUE NA NA AATAAA -8 NA NA NA 2 NA PB.474.3 chr1 + 2165 12 incomplete-splice_match PHACTR4 ENST00000373839.8 6048 14 -24 8576 6 -5368 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TACCTGGAAAGCACTCTCTT 20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.474.5 chr1 + 3369 14 full-splice_match PHACTR4 ENST00000373839.8 6048 14 1 2678 1 141 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG 45 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 5 NA PB.474.7 chr1 + 2219 13 novel_not_in_catalog PHACTR4 novel 6048 14 NA NA 18 -5368 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TACCTGGAAAGCACTCTCTT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.474.15 chr1 + 1407 7 incomplete-splice_match PHACTR4 ENST00000373836.4 3107 13 28385 5515 -25139 -5368 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TACCTGGAAAGCACTCTCTT 6288 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.474.17 chr1 + 1857 8 incomplete-splice_match PHACTR4 ENST00000373836.4 3107 13 35792 -226 -17732 -16 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.474.18 chr1 + 1722 7 incomplete-splice_match PHACTR4 ENST00000373836.4 3107 13 38039 -383 -15485 141 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG NA FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 3 NA PB.474.20 chr1 + 1381 6 incomplete-splice_match PHACTR4 ENST00000373836.4 3107 13 42382 -226 -11142 -16 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.474.21 chr1 + 1431 4 incomplete-splice_match PHACTR4 ENST00000373836.4 3107 13 52780 -384 -744 142 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAGC NA FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 3 NA PB.474.22 chr1 + 1273 4 incomplete-splice_match PHACTR4 ENST00000373836.4 3107 13 52780 -226 -744 -16 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.474.23 chr1 + 1324 3 incomplete-splice_match PHACTR4 ENST00000632964.1 1853 4 -3 2680 -3 139 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 GCAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.474.24 chr1 + 1015 2 incomplete-splice_match PHACTR4 ENST00000632964.1 1853 4 1378 2835 1378 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.476.1 chr1 + 2627 13 novel_in_catalog RCC1 novel 2686 14 NA NA -2 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAAATAGGCCACTTGTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.476.2 chr1 + 942 3 full-splice_match SNHG3 ENST00000413987.1 2201 3 0 1259 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.130951 0.495676 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTTGTGGTTCATTTTTG NA FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 12 NA PB.476.3 chr1 + 2598 14 novel_in_catalog RCC1 novel 2686 14 NA NA -2 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC -6 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.476.4 chr1 + 1550 2 incomplete-splice_match SNHG3 ENST00000413987.1 2201 3 61 1259 61 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTTGTGGTTCATTTTTG -6 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 7 NA PB.476.5 chr1 + 2136 3 full-splice_match SNHG3 ENST00000413987.1 2201 3 63 2 63 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACCAGTGGTTTTAGTATGT -4 TRUE NA NA AGTAAA -15 NA NA NA 5 NA PB.476.6 chr1 + 986 4 novel_not_in_catalog SNHG3 novel 2201 3 NA NA 63 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CATGTTTGTGGTTCATTTTT -4 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 5 NA PB.476.7 chr1 + 879 3 full-splice_match SNHG3 ENST00000413987.1 2201 3 63 1259 63 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 179 46.703358 1.669348 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTTGTGGTTCATTTTTG -4 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 179 NA PB.476.8 chr1 + 895 3 novel_not_in_catalog SNHG3 novel 2201 3 NA NA 63 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTTGTGGTTCATTTTTG -4 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 4 NA PB.476.9 chr1 + 3589 1 full-splice_match SNORA73A ENST00000364938.1 206 1 -1322 -2061 -1322 2061 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA NA NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CATGTTTGTGGTTCATTTTT -3 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.476.10 chr1 + 2544 13 full-splice_match RCC1 ENST00000683442.1 2551 13 1 6 1 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC -3 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 7 NA PB.476.11 chr1 + 2401 12 full-splice_match RCC1 ENST00000398958.6 2715 12 101 213 1 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC -3 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.476.12 chr1 + 1792 13 full-splice_match RCC1 ENST00000683442.1 2551 13 1 758 1 67 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGGAACATGGCTCACTC -3 TRUE NA NA AATAAA -25 NA NA NA 2 NA PB.476.13 chr1 + 965 4 novel_not_in_catalog SNHG3 novel 2201 3 NA NA 64 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TGAACCAGTGGTTTTAGTAT -3 TRUE NA NA AGTAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.476.14 chr1 + 845 2 novel_in_catalog SNHG3 novel 2201 3 NA NA 64 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.740077 0.758918 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTTGTGGTTCATTTTTG -3 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 22 NA PB.476.15 chr1 + 1723 1 full-splice_match SNORA73B ENST00000363217.1 204 1 -648 -871 -648 871 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTTGTGGTTCATTTTTG 488 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 2 NA PB.476.16 chr1 + 1533 1 full-splice_match SNORA73B ENST00000363217.1 204 1 -461 -868 -461 868 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGCATGTTTGTGGTTCATTT 675 FALSE NA NA AATAAA -7 NA NA NA 2 NA PB.476.17 chr1 + 837 2 full-splice_match SNHG3 ENST00000437681.1 2614 2 1777 0 1777 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTTGTGGTTCATTTTTG 705 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 3 NA PB.476.18 chr1 + 1166 1 full-splice_match SNORA73B ENST00000363217.1 204 1 -91 -871 -91 871 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTTGTGGTTCATTTTTG 282 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 5 NA PB.476.22 chr1 + 2643 10 full-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 90 -309 -31 -8 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAAAAATTTTTTTTTTTT -16 TRUE NA NA AATAGA -29 NA NA NA 2 NA PB.476.23 chr1 + 2323 10 full-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 100 1 -21 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 244 63.662674 1.803885 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAAATAGGCCACTTGTTTT -6 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 244 NA PB.476.24 chr1 + 1572 10 full-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 100 752 -21 67 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 27 7.044641 0.847859 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGGAACATGGCTCACTC -6 TRUE NA NA AATAAA -25 NA NA NA 27 NA PB.476.25 chr1 + 1343 10 full-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 114 967 -7 118 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGAGGGCCTGGCTTCTGTCC 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.476.26 chr1 + 2398 11 full-splice_match RCC1 ENST00000373831.7 1577 11 -2 -819 -2 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC 13 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 6 NA PB.476.27 chr1 + 2406 10 full-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 119 -101 -2 95 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.391864 0.530438 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GTTGAGGCTACAACTTAAGT 13 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 13 NA PB.476.28 chr1 + 2351 11 novel_in_catalog RCC1 novel 1577 11 NA NA 3 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 56 14.611106 1.164683 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC 18 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 56 NA PB.476.29 chr1 + 1521 11 novel_in_catalog RCC1 novel 1577 11 NA NA 4 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTCCTTCCTCCTCTTTGGAA -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.476.30 chr1 + 2160 9 novel_in_catalog RCC1 novel 2424 10 NA NA 14 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC -1 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 5 NA PB.476.32 chr1 + 2170 8 incomplete-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 13666 0 -133 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 8 NA PB.476.33 chr1 + 2077 8 incomplete-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 13759 0 -40 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.652776 0.562623 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 14 NA PB.476.34 chr1 + 2257 8 incomplete-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 13791 -212 -8 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATTTTGTTTGGGTATTTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.476.35 chr1 + 2177 7 incomplete-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 14034 -195 235 -18 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAGGAAAAGTTTTGTTTGAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.476.36 chr1 + 1114 7 incomplete-splice_match RCC1 ENST00000373831.7 1577 11 13961 1 283 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTCCTTCCTCCTCTTTGGAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.476.37 chr1 + 1923 7 incomplete-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 14093 0 294 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 20 5.218252 0.717525 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 20 NA PB.476.38 chr1 + 1861 7 incomplete-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 14153 2 354 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATAAAATAGGCCACTTGTTT NA FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.476.39 chr1 + 1758 6 incomplete-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 16957 0 -1000 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.957339 0.695249 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 19 NA PB.476.40 chr1 + 1599 5 incomplete-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 17227 0 -730 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.391864 0.530438 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 13 NA PB.476.41 chr1 + 1339 3 full-splice_match RCC1 ENST00000478232.1 509 3 255 -1085 255 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.479165 0.738714 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 21 NA PB.476.42 chr1 + 1256 2 incomplete-splice_match RCC1 ENST00000478232.1 509 3 702 -1084 702 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.479165 0.738714 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAAATAGGCCACTTGTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 21 NA PB.478.1 chr1 + 1113 9 full-splice_match TRNAU1AP ENST00000373830.4 1799 9 -105 791 -105 -10 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGATCATGAATGTTTCTACA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.478.2 chr1 + 1206 10 novel_in_catalog TRNAU1AP novel 1132 10 NA NA -63 -5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATGAATGTTTCTACAACACT 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.478.3 chr1 + 1002 9 full-splice_match TRNAU1AP ENST00000373830.4 1799 9 15 782 1 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 117 30.526775 1.484681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATGTTTCTACAACACTGCTG 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 117 NA PB.478.4 chr1 + 1167 10 full-splice_match TRNAU1AP ENST00000480930.5 1132 10 -6 -29 -4 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACACTGCTGCATTCATTTG -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.478.5 chr1 + 840 8 novel_in_catalog TRNAU1AP novel 1799 9 NA NA -2 -5 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATGAATGTTTCTACAACACT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.478.6 chr1 + 1783 9 full-splice_match TRNAU1AP ENST00000373830.4 1799 9 15 1 1 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTAGTCTTTTTATTCTTCT 5 TRUE NA NA AATATA -6 NA NA NA 6 NA PB.478.7 chr1 + 1056 9 novel_in_catalog TRNAU1AP novel 1008 8 NA NA -7 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACACTGCTGCATTCATTTG 131 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.478.9 chr1 + 876 4 incomplete-splice_match TRNAU1AP ENST00000491577.5 1610 8 13889 5 6362 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATGAATGTTTCTACAACACT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.479.3 chr1 + 786 2 full-splice_match RAB42 ENST00000465518.3 2236 2 237 1213 237 -1207 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTCATGCTTCCTGGATTTT 0 TRUE NA NA TATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.480.1 chr1 - 2090 3 novel_in_catalog SNHG12 novel 1800 4 NA NA 1 20 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAAAGAAGAATAAAAAG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.480.2 chr1 - 1513 4 novel_in_catalog SNHG12 novel 1082 5 NA NA 0 20 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAAAGAAGAATAAAAAG -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.480.3 chr1 - 1048 5 full-splice_match SNHG12 ENST00000461832.2 1082 5 1 33 1 20 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 27 7.044641 0.847859 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAAAGAAGAATAAAAAG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 27 NA PB.480.4 chr1 - 843 5 full-splice_match SNHG12 ENST00000461832.2 1082 5 206 33 -44 20 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAAAGAAGAATAAAAAG 202 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.480.5 chr1 - 724 6 full-splice_match SNHG12 ENST00000648127.1 1871 6 1114 33 1 20 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAAAGAAGAATAAAAAG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.480.6 chr1 - 728 4 incomplete-splice_match SNHG12 ENST00000461832.2 1082 5 681 33 -182 20 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAAAGAAGAATAAAAAG 677 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.482.2 chr1 - 1123 6 full-splice_match TAF12 ENST00000373824.9 1335 6 -37 249 0 2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 303 79.056519 1.897938 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGACAGGGTACCTTTGAA -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 303 NA PB.482.3 chr1 - 899 5 incomplete-splice_match TAF12 ENST00000263974.4 1359 6 20951 -2 179 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGACAGGGTACCTTTGAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.482.4 chr1 - 753 4 incomplete-splice_match TAF12 ENST00000263974.4 1359 6 24980 -2 -2420 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGACAGGGTACCTTTGAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.482.5 chr1 - 1440 6 full-splice_match TAF12 ENST00000263974.4 1359 6 -80 -1 0 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GAAAGACAGGGTACCTTTGA 5185 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.482.6 chr1 - 851 5 full-splice_match TAF12 ENST00000691050.1 785 5 -70 4 0 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GAAAGACAGGGTACCTTTGA 5185 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.482.7 chr1 - 1188 7 full-splice_match TAF12 ENST00000690860.1 1196 7 0 8 0 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AATCGAAAGACAGGGTACCT 5185 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.482.8 chr1 - 911 6 full-splice_match TAF12 ENST00000373824.9 1335 6 8 416 4 -39 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 41 10.697417 1.029279 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 GAATATGGGACAAAGCATTA -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 41 NA PB.482.9 chr1 - 932 6 full-splice_match TAF12 ENST00000373824.9 1335 6 -47 450 1 66 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGATTTTATTTGTGGTTTA 5156 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.483.1 chr1 + 1961 10 full-splice_match GMEB1 ENST00000294409.2 1912 10 -49 0 -47 0 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAAACAAAATC 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.483.2 chr1 + 1882 10 full-splice_match GMEB1 ENST00000373816.6 6358 10 -4 4480 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAAACAAAATC 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.483.4 chr1 + 1966 10 novel_not_in_catalog GMEB1 novel 2063 9 NA NA -2479 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAAACAAAATC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.483.5 chr1 + 1648 8 incomplete-splice_match GMEB1 ENST00000480454.1 2063 9 6555 193 6555 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 TAAAAAAAAAAAAACAAAAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.483.6 chr1 + 1211 5 incomplete-splice_match GMEB1 ENST00000480454.1 2063 9 13504 192 13504 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAAACAAAATC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.483.7 chr1 + 1088 4 incomplete-splice_match GMEB1 ENST00000480454.1 2063 9 18980 192 18980 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAAACAAAATC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.484.1 chr1 + 2429 5 full-splice_match YTHDF2 ENST00000373812.8 2744 5 -339 654 -20 -4 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.484.2 chr1 + 1947 4 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000373812.8 2744 5 -143 25882 -143 891 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATTATAGCCAGCTACAA -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.484.3 chr1 + 2728 4 full-splice_match YTHDF2 ENST00000478283.5 2594 4 -138 4 -128 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.484.4 chr1 + 2218 5 full-splice_match YTHDF2 ENST00000373812.8 2744 5 -128 654 -128 -4 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 34 8.871029 0.947974 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 34 NA PB.484.5 chr1 + 2095 5 full-splice_match YTHDF2 ENST00000373812.8 2744 5 -5 654 -5 -4 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 372 97.059486 1.987038 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 372 NA PB.484.6 chr1 + 511 4 novel_in_catalog YTHDF2 novel 2744 5 NA NA -5 -4 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.484.8 chr1 + 2743 5 full-splice_match YTHDF2 ENST00000373812.8 2744 5 0 1 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.913689 0.592586 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCTAGTACCATTTAGTA -11 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 15 NA PB.484.9 chr1 + 2186 6 novel_in_catalog YTHDF2 novel 2744 5 NA NA 0 -4 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.484.10 chr1 + 2046 5 novel_not_in_catalog YTHDF2 novel 2744 5 NA NA 0 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.484.11 chr1 + 2064 4 full-splice_match YTHDF2 ENST00000541996.5 2719 4 1 654 1 -4 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.484.12 chr1 + 2589 4 full-splice_match YTHDF2 ENST00000478283.5 2594 4 1 4 1 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.484.13 chr1 + 1148 4 novel_in_catalog YTHDF2 novel 2825 6 NA NA 1 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 37 9.653767 0.984697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCTAGTACCATTTAGTA 0 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 37 NA PB.484.16 chr1 + 1981 5 full-splice_match YTHDF2 ENST00000373812.8 2744 5 109 654 84 -4 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.484.17 chr1 + 1796 3 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000478283.5 2594 4 1370 4 570 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.435514 0.646944 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA 228 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.484.18 chr1 + 1575 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000478283.5 2594 4 5655 4 3514 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA 4513 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.484.19 chr1 + 1300 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000478283.5 2594 4 5929 5 3788 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 GAAAATGAAAAAAAAAAGAA 4787 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.484.20 chr1 + 1176 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000478283.5 2594 4 6054 4 3913 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA 4912 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.484.21 chr1 + 1719 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000373812.8 2744 5 6174 1 4023 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCTAGTACCATTTAGTA 5022 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.484.22 chr1 + 1028 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000478283.5 2594 4 6202 4 4061 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.913689 0.592586 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA 5060 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.484.23 chr1 + 954 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000478283.5 2594 4 6276 4 4135 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA 5134 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.484.24 chr1 + 825 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000478283.5 2594 4 6405 4 4264 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA 5263 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.484.25 chr1 + 1279 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000373812.8 2744 5 6614 1 4463 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCTAGTACCATTTAGTA 5462 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 8 NA PB.484.26 chr1 + 614 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000478283.5 2594 4 6616 4 4475 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA 5474 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.484.27 chr1 + 1105 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000373812.8 2744 5 6788 1 4637 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.652776 0.562623 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCTAGTACCATTTAGTA 5636 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 14 NA PB.484.28 chr1 + 1013 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000373812.8 2744 5 6880 1 4729 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.652776 0.562623 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCTAGTACCATTTAGTA 5728 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 14 NA PB.485.1 chr1 - 1604 1 full-splice_match ENSG00000289291 ENST00000691740.1 1627 1 15 8 15 -8 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATCGCTATCAGTCTTTC 14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.485.2 chr1 - 1402 1 full-splice_match ENSG00000289291 ENST00000691740.1 1627 1 216 9 216 -9 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CAAAATCGCTATCAGTCTTT 215 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.489.1 chr1 - 2286 6 full-splice_match SRSF4 ENST00000373795.7 2300 6 10 4 0 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 60 15.654757 1.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATTTCATGGTGTTTGAA -20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 60 NA PB.489.2 chr1 - 2073 6 full-splice_match SRSF4 ENST00000373795.7 2300 6 223 4 203 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATTTCATGGTGTTTGAA 5177 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.489.3 chr1 - 1812 4 incomplete-splice_match SRSF4 ENST00000634348.1 8128 7 14094 -106 140 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATTTCATGGTGTTTGAA 1033 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.489.4 chr1 - 1559 2 incomplete-splice_match SRSF4 ENST00000634348.1 8128 7 23313 -106 9359 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATTTCATGGTGTTTGAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.489.10 chr1 - 2211 6 full-splice_match SRSF4 ENST00000373795.7 2300 6 -21 110 -21 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 131 34.179550 1.533766 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAGAAAAGAAAAGAAT 4933 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 131 NA PB.489.11 chr1 - 1989 6 full-splice_match SRSF4 ENST00000373795.7 2300 6 201 110 181 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAGAAAAGAAAAGAAT 5155 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.489.12 chr1 - 1862 5 full-splice_match SRSF4 ENST00000466448.4 1264 5 220 -818 218 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAGAAAAGAAAAGAAT 5192 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.489.13 chr1 - 1789 4 incomplete-splice_match SRSF4 ENST00000634348.1 8128 7 14011 0 57 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAGAAAAGAAAAGAAT 950 FALSE NA NA AATAAA -28 NA NA NA 8 NA PB.489.14 chr1 - 1614 3 incomplete-splice_match SRSF4 ENST00000634348.1 8128 7 18649 0 4695 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAGAAAAGAAAAGAAT 5588 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.489.16 chr1 - 2114 5 full-splice_match SRSF4 ENST00000466448.4 1264 5 -33 -817 -15 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAAGAAAAGAAAAGAA -45 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.489.17 chr1 - 1526 3 incomplete-splice_match SRSF4 ENST00000634348.1 8128 7 18736 1 4782 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAAGAAAAGAAAAGAA 5675 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.489.23 chr1 - 1864 6 full-splice_match SRSF4 ENST00000373795.7 2300 6 -45 481 -45 -371 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 GACTGAAAAAAATTTTCTCT 4909 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.489.28 chr1 - 1230 6 full-splice_match SRSF4 ENST00000373795.7 2300 6 -20 1090 -20 -162 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGGGCAGGAAGAGAAGCAG 4934 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.489.40 chr1 - 1139 2 novel_not_in_catalog SRSF4 novel 1399 8 NA NA 2361 -13339 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAT NA FALSE NA NA GATAAA -39 NA NA NA 2 NA PB.490.1 chr1 + 5816 19 novel_in_catalog EPB41 novel 5925 21 NA NA -2 -18 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAACAACAACAAAAAGA -25 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.490.2 chr1 + 1995 13 incomplete-splice_match EPB41 ENST00000646800.1 6388 19 -3 14456 0 4123 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACACAGGTTTGTGCCAAT -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.490.4 chr1 + 5739 18 full-splice_match EPB41 ENST00000647103.1 5772 18 12 21 0 -18 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAACAACAACAAAAAGA -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.490.5 chr1 + 5796 19 novel_in_catalog EPB41 novel 5925 21 NA NA 0 -18 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAACAACAACAAAAAGA -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.490.7 chr1 + 2104 6 incomplete-splice_match EPB41 ENST00000373797.2 2407 15 -58 48515 -28 -37808 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAAGAAAATGGAAAATC -34 TRUE NA NA TATAAA -11 NA NA NA 3 NA PB.490.9 chr1 + 778 3 incomplete-splice_match EPB41 ENST00000373797.2 2407 15 -4 71788 1 -61081 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.174602 0.620615 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAGCAGAAACAGAATTAA 20 TRUE NA NA AGTAAA -19 NA NA NA 16 NA PB.490.10 chr1 + 5848 18 novel_in_catalog EPB41 novel 6031 21 NA NA 0 -18 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAACAACAACAAAAAGA 19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.490.11 chr1 + 2049 12 incomplete-splice_match EPB41 ENST00000373797.2 2407 15 -5 11912 0 -1205 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGGTATGTCATCAGTCCAA 19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.490.12 chr1 + 2100 13 incomplete-splice_match EPB41 ENST00000373797.2 2407 15 -4 6584 1 4123 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACACAGGTTTGTGCCAAT 20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.490.16 chr1 + 4181 8 incomplete-splice_match EPB41 ENST00000647103.1 5772 18 152160 21 -167 -18 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAACAACAACAAAAAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.490.17 chr1 + 3659 6 full-splice_match EPB41 ENST00000490308.2 922 6 162 -2899 162 -18 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAACAACAACAAAAAGA 2452 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.490.18 chr1 + 3460 4 incomplete-splice_match EPB41 ENST00000460378.1 5212 5 13134 18 11779 -18 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAACAACAACAAAAAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.490.19 chr1 + 3355 3 incomplete-splice_match EPB41 ENST00000460378.1 5212 5 16169 18 14814 -18 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAACAACAACAAAAAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.491.1 chr1 + 3997 22 incomplete-splice_match PTPRU ENST00000373779.8 5573 30 42489 1 -540 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGAGCAGCCCTGTGTGTG 7028 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.491.2 chr1 + 3564 19 incomplete-splice_match PTPRU ENST00000373779.8 5573 30 46171 1 -1030 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGAGCAGCCCTGTGTGTG NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.491.3 chr1 + 3290 18 incomplete-splice_match PTPRU ENST00000373779.8 5573 30 47435 1 234 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGAGCAGCCCTGTGTGTG 228 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.491.4 chr1 + 2906 15 incomplete-splice_match PTPRU ENST00000373779.8 5573 30 67400 1 -7424 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGAGCAGCCCTGTGTGTG NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.491.5 chr1 + 2654 13 incomplete-splice_match PTPRU ENST00000373779.8 5573 30 68882 1 -5942 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGAGCAGCCCTGTGTGTG NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.491.6 chr1 + 2534 11 incomplete-splice_match PTPRU ENST00000373779.8 5573 30 74992 1 168 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGAGCAGCCCTGTGTGTG NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.491.7 chr1 + 2300 9 incomplete-splice_match PTPRU ENST00000428026.6 5550 30 76080 14 1283 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGAGCAGCCCTGTGTGTG NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.491.8 chr1 + 2156 8 incomplete-splice_match PTPRU ENST00000428026.6 5550 30 78889 14 -2322 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGAGCAGCCCTGTGTGTG NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.491.9 chr1 + 2035 7 incomplete-splice_match PTPRU ENST00000428026.6 5550 30 79504 14 -1707 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGAGCAGCCCTGTGTGTG NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.491.10 chr1 + 1605 4 full-splice_match PTPRU ENST00000492954.1 625 4 169 -1149 169 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGAGCAGCCCTGTGTGTG NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.491.11 chr1 + 1553 4 full-splice_match PTPRU ENST00000492954.1 625 4 221 -1149 221 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGAGCAGCCCTGTGTGTG NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.491.12 chr1 + 1391 3 incomplete-splice_match PTPRU ENST00000492954.1 625 4 517 -1149 517 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGAGCAGCCCTGTGTGTG NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 5 NA PB.491.13 chr1 + 1278 2 incomplete-splice_match PTPRU ENST00000492954.1 625 4 2032 -1149 2032 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGAGCAGCCCTGTGTGTG NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.493.1 chr1 - 2431 10 full-splice_match MECR ENST00000373791.7 2416 10 -24 9 -6 -9 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AATTACCATAGTGACTAATG -34 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.493.2 chr1 - 2301 10 full-splice_match MECR ENST00000263702.11 2515 10 -11 225 -3 -9 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.913689 0.592586 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AATTACCATAGTGACTAATG -31 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.493.3 chr1 - 1359 10 full-splice_match MECR ENST00000263702.11 2515 10 -9 1165 -1 -5 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 145 37.832329 1.577863 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGTAGAAGTCATCCCT -29 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 145 NA PB.493.4 chr1 - 939 8 incomplete-splice_match MECR ENST00000373791.7 2416 10 14898 948 3 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGTAGAAGTCATCCCTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.493.5 chr1 - 1531 11 novel_in_catalog MECR novel 2416 10 NA NA 2 -5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGTAGAAGTCATCCCT 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.493.6 chr1 - 1485 11 novel_in_catalog MECR novel 2515 10 NA NA 0 -5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGTAGAAGTCATCCCT -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.493.7 chr1 - 1474 10 full-splice_match MECR ENST00000373791.7 2416 10 -7 949 3 -5 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.913689 0.592586 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGTAGAAGTCATCCCT -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.493.8 chr1 - 1431 11 novel_in_catalog MECR novel 2515 10 NA NA 3 -5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGTAGAAGTCATCCCT -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.493.9 chr1 - 1134 9 incomplete-splice_match MECR ENST00000373791.7 2416 10 14251 949 -60 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGTAGAAGTCATCCCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.493.10 chr1 - 1154 8 novel_in_catalog MECR novel 2515 10 NA NA -3 -6 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 CAAAAAGTAGAAGTCATCCC -31 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.495.1 chr1 - 2944 7 novel_in_catalog LAPTM5 novel 2177 8 NA NA -28 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGTCTGGCTGATGTGTTTCT 8203 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.495.2 chr1 - 2287 8 full-splice_match LAPTM5 ENST00000464569.1 953 8 86 -1420 86 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGTCTGGCTGATGTGTTTCT 8563 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.495.3 chr1 - 2112 7 novel_in_catalog LAPTM5 novel 2177 8 NA NA -12 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGTCTGGCTGATGTGTTTCT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.495.4 chr1 - 2083 7 novel_in_catalog LAPTM5 novel 2177 8 NA NA 0 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGTCTGGCTGATGTGTTTCT 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.495.5 chr1 - 2035 7 incomplete-splice_match LAPTM5 ENST00000464569.1 953 8 3706 -1420 3706 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.479165 0.738714 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGTCTGGCTGATGTGTTTCT 9823 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 21 NA PB.495.6 chr1 - 2006 6 novel_in_catalog LAPTM5 novel 2177 8 NA NA 0 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.435514 0.646944 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGTCTGGCTGATGTGTTTCT 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.495.7 chr1 - 1963 6 incomplete-splice_match LAPTM5 ENST00000464569.1 953 8 4517 -1420 4517 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.130951 0.495676 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGTCTGGCTGATGTGTTTCT -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.495.8 chr1 - 1862 5 novel_in_catalog LAPTM5 novel 2177 8 NA NA -33 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGTCTGGCTGATGTGTTTCT 12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.495.9 chr1 - 1816 5 incomplete-splice_match LAPTM5 ENST00000464569.1 953 8 6366 -1420 6366 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGTCTGGCTGATGTGTTTCT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.495.10 chr1 - 1600 3 incomplete-splice_match LAPTM5 ENST00000464569.1 953 8 8568 -1420 8568 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 30 7.827378 0.893616 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGTCTGGCTGATGTGTTTCT 8503 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 30 NA PB.495.17 chr1 - 2250 8 full-splice_match LAPTM5 ENST00000294507.4 2177 8 -74 1 -74 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 382 99.668617 1.998558 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTGTCTGGCTGATGTGTTTC -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 382 NA PB.495.18 chr1 - 1282 8 full-splice_match LAPTM5 ENST00000294507.4 2177 8 -75 970 -75 450 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACAACAGTCTATTGCATT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.495.19 chr1 - 1207 8 full-splice_match LAPTM5 ENST00000294507.4 2177 8 0 970 0 450 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 58 15.132931 1.179923 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACAACAGTCTATTGCATT 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 58 NA PB.495.20 chr1 - 922 5 incomplete-splice_match LAPTM5 ENST00000464569.1 953 8 6290 -450 6290 450 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACAACAGTCTATTGCATT 8064 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.496.17 chr1 - 4965 5 novel_not_in_catalog SDC3 novel 5246 5 NA NA 8 -6 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAAATGATGTGCCGTGTCCA -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.498.1 chr1 + 1760 4 novel_in_catalog MATN1-AS1 novel 1530 5 NA NA 3 29 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATATAAAATTCAAATAAAT -9 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 2 NA PB.500.8 chr1 - 1062 5 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000498419.5 3068 17 49683 -91 -4 91 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAACAAACAAAAACAAA NA FALSE NA NA GGGGCT -38 NA NA NA 3 NA PB.500.11 chr1 - 1800 9 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000373742.6 3515 20 101007 -326 94 90 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAACAAACAAAAACAA 9977 FALSE NA NA TATAAA -24 NA NA NA 2 NA PB.500.13 chr1 - 783 2 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000530669.1 582 5 8536 -551 8536 90 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAACAAACAAAAACAA NA FALSE NA NA GATAAA -37 NA NA NA 5 NA PB.500.14 chr1 - 2097 10 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000373742.6 3515 20 99534 -221 129 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAAAAAGCTTTAAAAA 8504 FALSE NA NA AAGAAA -10 NA NA NA 2 NA PB.500.15 chr1 - 1850 10 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000373742.6 3515 20 99780 -220 375 -10 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAAAAAAGCTTTAAAA 8750 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.500.16 chr1 - 1318 7 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000373742.6 3515 20 113425 -220 1384 -10 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAAAAAAGCTTTAAAA NA FALSE NA NA AGTAAA -31 NA NA NA 5 NA PB.500.17 chr1 - 4123 23 novel_not_in_catalog PUM1 novel 5360 22 NA NA 0 -13 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.500.18 chr1 - 3886 21 novel_in_catalog PUM1 novel 5360 22 NA NA 0 -13 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.500.19 chr1 - 4000 22 full-splice_match PUM1 ENST00000257075.9 5360 22 3 1357 0 -13 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 35 9.131941 0.960563 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 35 NA PB.500.21 chr1 - 4004 22 full-splice_match PUM1 ENST00000426105.7 5385 22 24 1357 2 -13 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 24 6.261902 0.796706 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 24 NA PB.500.22 chr1 - 3917 22 novel_in_catalog PUM1 novel 5360 22 NA NA 2 -13 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.500.23 chr1 - 3791 21 novel_in_catalog PUM1 novel 5385 22 NA NA 0 -13 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.500.24 chr1 - 3735 21 novel_in_catalog PUM1 novel 4528 21 NA NA 12 -13 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 334 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.500.25 chr1 - 4018 22 novel_in_catalog PUM1 novel 5360 22 NA NA 0 -13 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.500.26 chr1 - 3718 20 novel_in_catalog PUM1 novel 5385 22 NA NA 0 -13 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.500.27 chr1 - 3534 20 novel_not_in_catalog PUM1 novel 5360 22 NA NA 33061 -13 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA AATAGA -25 NA NA NA 2 NA PB.500.28 chr1 - 3129 17 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000373741.8 4242 22 70837 13 -50 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.500.29 chr1 - 2324 12 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000373742.6 3515 20 97372 -217 -2033 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 6342 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.500.30 chr1 - 1953 10 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000373742.6 3515 20 99674 -217 269 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 8644 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.500.31 chr1 - 1692 9 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000498419.5 3068 17 30286 19 99 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 9982 FALSE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 4 NA PB.500.32 chr1 - 1459 8 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000498419.5 3068 17 41211 19 -91 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.500.33 chr1 - 1522 8 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000373742.6 3515 20 111868 -217 -160 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.500.34 chr1 - 1360 8 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000498419.5 3068 17 41310 19 -5 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.500.35 chr1 - 1260 6 novel_not_in_catalog PUM1 novel 3068 17 NA NA -3829 -13 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.500.37 chr1 - 1212 7 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000373742.6 3515 20 113528 -217 1487 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.500.38 chr1 - 1155 6 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000498419.5 3068 17 44837 19 3522 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.500.39 chr1 - 993 5 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000498419.5 3068 17 49642 19 -45 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.500.40 chr1 - 848 4 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000498419.5 3068 17 53009 19 3322 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.500.41 chr1 - 711 2 novel_not_in_catalog PUM1 novel 582 5 NA NA 9600 -13 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.500.42 chr1 - 717 3 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000530669.1 582 5 4178 -442 4178 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.500.48 chr1 - 1992 12 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000257075.9 5360 22 -8 35560 -2 159 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATATCGGTTCTACCCTGTAA -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.500.55 chr1 - 1811 2 intergenic novelGene_423 novel NA NA NA NA NA NA multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 6252 FALSE NA NA AGTAAA -45 NA NA NA 2 NA PB.500.59 chr1 - 835 6 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000440538.6 3936 22 -11 62353 0 -15 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 25 6.522815 0.814435 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 GAAAACGACAAAGGTGAAAA 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 25 NA PB.504.1 chr1 - 1847 11 novel_not_in_catalog SNRNP40 novel 1615 10 NA NA -12 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGAAGCTGCTCACTTGTTT 16 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.504.2 chr1 - 1613 10 full-splice_match SNRNP40 ENST00000263694.9 1615 10 0 2 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 118 30.787687 1.488377 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGAAGCTGCTCACTTGTTT -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 118 NA PB.504.3 chr1 - 1453 10 full-splice_match SNRNP40 ENST00000263694.9 1615 10 160 2 154 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGAAGCTGCTCACTTGTTT 188 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.504.4 chr1 - 1174 7 incomplete-splice_match SNRNP40 ENST00000263694.9 1615 10 7406 2 37 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGAAGCTGCTCACTTGTTT 7434 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.504.5 chr1 - 1020 6 full-splice_match SNRNP40 ENST00000489853.1 1928 6 1012 -104 1012 -2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGAAGCTGCTCACTTGTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.504.6 chr1 - 1304 8 incomplete-splice_match SNRNP40 ENST00000263694.9 1615 10 4782 3 -2587 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAAGAAGCTGCTCACTTGTT 4810 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.504.7 chr1 - 659 2 full-splice_match SNRNP40 ENST00000486941.1 743 2 186 -102 186 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAAGAAGCTGCTCACTTGTT 7589 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.504.8 chr1 - 1522 10 full-splice_match SNRNP40 ENST00000263694.9 1615 10 -12 105 -12 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 859 224.123932 2.350488 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCCATGTGGATTGGATTTAT 16 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 859 NA PB.504.9 chr1 - 1722 11 novel_not_in_catalog SNRNP40 novel 1615 10 NA NA 0 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.696427 0.671768 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAGCCATGTGGATTGGAT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.504.10 chr1 - 1417 9 novel_in_catalog SNRNP40 novel 1615 10 NA NA 21 -3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAGCCATGTGGATTGGAT 15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.504.11 chr1 - 729 5 incomplete-splice_match SNRNP40 ENST00000489853.1 1928 6 11070 3 -1747 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAGCCATGTGGATTGGAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.504.12 chr1 - 613 3 incomplete-splice_match SNRNP40 ENST00000373720.3 1087 4 1732 -33 1732 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAGCCATGTGGATTGGAT 1291 FALSE NA NA GATAAA -43 NA NA NA 5 NA PB.504.13 chr1 - 1017 7 incomplete-splice_match SNRNP40 ENST00000263694.9 1615 10 7454 111 85 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.391864 0.530438 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACAAGAGCCATGTGGATTGG 7482 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.504.14 chr1 - 858 6 full-splice_match SNRNP40 ENST00000489853.1 1928 6 1065 5 1065 -5 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACAAGAGCCATGTGGATTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.504.16 chr1 - 781 5 novel_not_in_catalog SNRNP40 novel 677 2 NA NA -10 5882 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGCGTGTATGTGTGTATGTA 18 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.505.1 chr1 + 1499 7 novel_in_catalog ZCCHC17 novel 1568 8 NA NA -5 -3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACTTACTGAGTTATTTTT -5 TRUE NA NA ACTAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.505.3 chr1 + 1593 8 full-splice_match ZCCHC17 ENST00000344147.10 1568 8 -28 3 -4 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 114 29.744038 1.473400 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACTTACTGAGTTATTTTT -14 TRUE NA NA ACTAAA -20 NA NA NA 114 NA PB.505.5 chr1 + 1667 9 full-splice_match ZCCHC17 ENST00000546109.5 1705 9 18 20 2 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACTTACTGAGTTATTTTT -18 TRUE NA NA ACTAAA -20 NA NA NA 11 NA PB.505.6 chr1 + 1349 6 novel_in_catalog ZCCHC17 novel 1489 7 NA NA 2 -4 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAACTTACTGAGTTATTTT -18 TRUE NA NA ACTAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.505.7 chr1 + 1411 7 full-splice_match ZCCHC17 ENST00000616859.4 1458 7 26 21 0 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAACTTACTGAGTTATTTT -10 TRUE NA NA ACTAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.505.9 chr1 + 663 7 incomplete-splice_match ZCCHC17 ENST00000344147.10 1568 8 -13 15975 11 -7 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.740077 0.758918 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAAGAAAGAAGGTGAATG 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 22 NA PB.505.10 chr1 + 866 8 novel_in_catalog ZCCHC17 novel 761 8 NA NA -10 -9 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AGAAAAAGAAAGAAGGTGAA 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.505.11 chr1 + 1717 8 full-splice_match ZCCHC17 ENST00000373714.5 1730 8 15 -2 -9 2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TACTGAGTTATTTTTCCTAT 5 TRUE NA NA ACTAAA -25 NA NA NA 3 NA PB.505.12 chr1 + 1227 8 novel_not_in_catalog ZCCHC17 novel 1568 8 NA NA -9 12531 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGAAATGTCTGTTTAGTA 5 TRUE NA NA AATAAA -26 NA NA NA 2 NA PB.505.14 chr1 + 914 7 incomplete-splice_match ZCCHC17 ENST00000344147.10 1568 8 -9 15720 -9 248 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAGAAAAATGAA 5 TRUE NA NA AAAAAG -15 NA NA NA 2 NA PB.505.15 chr1 + 729 8 full-splice_match ZCCHC17 ENST00000479629.5 761 8 25 7 -9 -7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAAGAAAGAAGGTGAATG 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.505.16 chr1 + 1585 8 novel_in_catalog ZCCHC17 novel 1730 8 NA NA 1 -3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACTTACTGAGTTATTTTT 15 TRUE NA NA ACTAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.505.18 chr1 + 758 7 incomplete-splice_match ZCCHC17 ENST00000373714.5 1730 8 54 15975 26 -7 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAAGAAAGAAGGTGAATG 44 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.505.19 chr1 + 1465 7 novel_not_in_catalog ZCCHC17 novel 1489 7 NA NA 15767 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACTTACTGAGTTATTTTT NA FALSE NA NA ACTAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.505.22 chr1 + 1343 5 incomplete-splice_match ZCCHC17 ENST00000344147.10 1568 8 40141 4 40137 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAACTTACTGAGTTATTTT NA FALSE NA NA ACTAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.505.23 chr1 + 1232 4 incomplete-splice_match ZCCHC17 ENST00000344147.10 1568 8 41934 3 41930 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACTTACTGAGTTATTTTT NA FALSE NA NA ACTAAA -20 NA NA NA 7 NA PB.505.27 chr1 + 1038 2 incomplete-splice_match ZCCHC17 ENST00000344147.10 1568 8 51812 -2 51808 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TACTGAGTTATTTTTCCTAT 2160 FALSE NA NA ACTAAA -25 NA NA NA 11 NA PB.505.28 chr1 + 926 2 incomplete-splice_match ZCCHC17 ENST00000344147.10 1568 8 51903 19 51899 -19 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATGTGTTTGGTTTTAAAC 2251 FALSE NA NA ACTAAA -4 NA NA NA 2 NA PB.506.1 chr1 + 1914 10 full-splice_match SERINC2 ENST00000373709.8 1900 10 -11 -3 -11 1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 156 40.702366 1.609620 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TCTGTGCCCCTCACCCTCAG -18 TRUE NA NA AATAAA -23 NA NA NA 156 NA PB.506.2 chr1 + 1972 11 novel_not_in_catalog SERINC2 novel 1900 10 NA NA -7 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTCTGTGCCCCTCACCC -14 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.506.3 chr1 + 1708 9 novel_in_catalog SERINC2 novel 1900 10 NA NA 0 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTCTGTGCCCCTCACCC -7 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.506.4 chr1 + 2056 10 full-splice_match SERINC2 ENST00000536384.2 2062 10 -1 7 -1 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACCATGTTCTGTGCCCCTC -29 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.506.5 chr1 + 1680 9 incomplete-splice_match SERINC2 ENST00000491976.1 2807 11 10006 1 10006 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CATGTTCTGTGCCCCTCACC 23 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.506.6 chr1 + 1502 8 incomplete-splice_match SERINC2 ENST00000491976.1 2807 11 11013 0 11013 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTCTGTGCCCCTCACCC 1030 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.506.7 chr1 + 1399 7 incomplete-splice_match SERINC2 ENST00000536384.2 2062 10 11575 0 11575 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTCTGTGCCCCTCACCCTCA 53 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 3 NA PB.506.8 chr1 + 1189 5 incomplete-splice_match SERINC2 ENST00000491976.1 2807 11 12888 0 12888 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTCTGTGCCCCTCACCC 39 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 5 NA PB.506.9 chr1 + 991 4 incomplete-splice_match SERINC2 ENST00000491976.1 2807 11 15236 4 15236 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACCATGTTCTGTGCCCCTC 37 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 8 NA PB.506.10 chr1 + 821 2 incomplete-splice_match SERINC2 ENST00000491976.1 2807 11 19166 0 19166 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTCTGTGCCCCTCACCC 3476 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.508.2 chr1 - 889 4 full-splice_match FABP3 ENST00000373713.7 1097 4 0 208 0 -208 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACGTTGCCTTTACACTGCCC -1 TRUE NA NA TTTAAA -23 NA NA NA 3 NA PB.508.3 chr1 - 723 4 full-splice_match FABP3 ENST00000373713.7 1097 4 0 374 0 86 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.696427 0.671768 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AACTCTGGGAGTCTTGGTTT -1 TRUE NA NA TTTAAA -23 NA NA NA 18 NA PB.509.2 chr1 - 1633 5 full-splice_match PEF1 ENST00000373703.5 1614 5 -20 1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 368 96.015839 1.982343 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTTCCATGTTTTCCACCAT 277 FALSE NA NA GGGGCT -45 NA NA NA 368 NA PB.509.3 chr1 - 1445 4 incomplete-splice_match PEF1 ENST00000373703.5 1614 5 9486 1 82 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTTCCATGTTTTCCACCAT 9783 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.509.5 chr1 - 1341 4 incomplete-splice_match PEF1 ENST00000373703.5 1614 5 9590 1 -26 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTTCCATGTTTTCCACCAT 9887 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.509.6 chr1 - 1171 6 novel_not_in_catalog PEF1 novel 1614 5 NA NA -9 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTTCCATGTTTTCCACCAT -7 TRUE NA NA GGGGCT -34 NA NA NA 5 NA PB.509.7 chr1 - 1147 3 incomplete-splice_match PEF1 ENST00000373703.5 1614 5 11691 1 2075 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.130951 0.495676 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTTCCATGTTTTCCACCAT 2350 FALSE NA NA AATGAA -43 NA NA NA 12 NA PB.509.10 chr1 - 1419 4 novel_not_in_catalog PEF1 novel 1614 5 NA NA -9 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAGTTCCATGTTTTCCACCA -7 TRUE NA NA GGGGCT -34 NA NA NA 4 NA PB.509.11 chr1 - 1305 4 full-splice_match PEF1 ENST00000478502.5 750 4 26 -581 6 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.696427 0.671768 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAGTTCCATGTTTTCCACCA 8 TRUE NA NA GGGGCT -19 NA NA NA 18 NA PB.510.2 chr1 - 1867 24 novel_in_catalog COL16A1 novel 5418 71 NA NA 664 -11 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAATAATAAAGAAACAAAAC 742 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.510.3 chr1 - 1121 10 incomplete-splice_match COL16A1 ENST00000373672.8 5418 71 43377 259 1120 -11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAATAATAAAGAAACAAAAC 9780 FALSE NA NA AAAAAG -34 NA NA NA 4 NA PB.510.4 chr1 - 878 6 incomplete-splice_match COL16A1 ENST00000373672.8 5418 71 47583 259 -586 -11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAATAATAAAGAAACAAAAC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.512.1 chr1 - 1975 12 incomplete-splice_match ADGRB2 ENST00000398556.7 4879 29 22707 1 -37 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTTGCTGCTGAGCTGTTT 7972 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.512.2 chr1 - 1339 6 incomplete-splice_match ADGRB2 ENST00000398556.7 4879 29 27268 3 3192 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGATTTTGCTGCTGAGCTGT 4584 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.513.1 chr1 + 1880 11 novel_in_catalog TINAGL1 novel 2207 12 NA NA 0 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACTACAGTGTCTTGGAACC -1 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.513.2 chr1 + 2194 12 full-splice_match TINAGL1 ENST00000271064.12 2207 12 10 3 10 1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAACTACAGTGTCTTGGAAC 9 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 11 NA PB.513.3 chr1 + 1360 6 incomplete-splice_match TINAGL1 ENST00000537531.2 1841 11 6784 -2 -222 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACTACAGTGTCTTGGAACC 1417 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.515.1 chr1 - 1957 8 novel_in_catalog SPOCD1 novel 2105 9 NA NA 10 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GATTGCATCTGCTAGCTGGT 6 TRUE NA NA GGGGCT -2 NA NA NA 2 NA PB.515.2 chr1 - 1994 9 incomplete-splice_match SPOCD1 ENST00000533231.5 3774 15 16702 -58 -42 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GGATTGCATCTGCTAGCTGG 28 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.515.3 chr1 - 2581 3 full-splice_match SPOCD1 ENST00000468720.5 2667 3 47 39 -8 -19 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAACAAACAAACAAACA -23 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.517.2 chr1 + 2711 9 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 -2 4 -2 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 25 6.522815 0.814435 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 CAAAGTAAATGTGATGAATT 2 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 25 NA PB.517.3 chr1 + 1752 9 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 -2 963 -2 290 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 139 36.266853 1.559510 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATAAAAAAAAGAAGTTGAG 2 TRUE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 139 NA PB.517.4 chr1 + 2118 9 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 0 595 0 -595 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.391864 0.530438 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAACAACAAAAT 4 TRUE NA NA ATTAAA -33 NA NA NA 13 NA PB.517.5 chr1 + 1483 9 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 1 1229 1 24 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGTTATGAGCAAAGTTGTTA 5 TRUE NA NA ATTAAA -24 NA NA NA 2 NA PB.517.7 chr1 + 1631 8 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000492989.1 1215 8 -126 -290 2 290 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATAAAAAAAAGAAGTTGAG 6 TRUE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 5 NA PB.517.8 chr1 + 1618 9 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 132 963 4 290 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATAAAAAAAAGAAGTTGAG 136 FALSE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 8 NA PB.517.9 chr1 + 2426 9 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 284 3 -30 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGTAAATGTGATGAATTG 288 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.517.10 chr1 + 1763 9 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 354 596 40 -596 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 TAAAAAAAAAAACAACAAAA 30 FALSE NA NA ATTAAA -32 NA NA NA 2 NA PB.517.11 chr1 + 1353 9 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 397 963 83 290 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.652776 0.562623 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATAAAAAAAAGAAGTTGAG 9 TRUE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 14 NA PB.517.12 chr1 + 2308 9 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 402 3 88 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGTAAATGTGATGAATTG 14 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.517.17 chr1 + 2185 8 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 16445 3 16131 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGTAAATGTGATGAATTG NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.517.18 chr1 + 1170 8 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 16500 963 16186 290 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 28 7.305553 0.863653 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATAAAAAAAAGAAGTTGAG NA FALSE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 28 NA PB.517.19 chr1 + 1055 7 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 17716 963 17402 290 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 38 9.914679 0.996279 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATAAAAAAAAGAAGTTGAG NA FALSE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 38 NA PB.517.20 chr1 + 1982 7 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 17749 3 17435 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGTAAATGTGATGAATTG NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 5 NA PB.517.22 chr1 + 1357 6 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000492989.1 1215 8 19201 -658 19015 -595 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAACAACAAAAT NA FALSE NA NA ATTAAA -33 NA NA NA 3 NA PB.517.23 chr1 + 892 6 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000492989.1 1215 8 19299 -291 19113 291 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.957339 0.695249 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 ATAAAAAAAAGAAGTTGAGT 12 FALSE NA NA TATAAA -20 NA NA NA 19 NA PB.517.24 chr1 + 1802 5 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 23051 3 22737 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.130951 0.495676 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGTAAATGTGATGAATTG 3636 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 12 NA PB.517.25 chr1 + 766 5 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000492989.1 1215 8 22999 -290 22813 290 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATAAAAAAAAGAAGTTGAG 3712 FALSE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 11 NA PB.517.26 chr1 + 1679 4 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 23965 3 23651 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGTAAATGTGATGAATTG 4550 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.517.27 chr1 + 1071 4 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000492989.1 1215 8 23853 -658 23667 -595 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAACAACAAAAT 4566 FALSE NA NA ATTAAA -33 NA NA NA 5 NA PB.517.28 chr1 + 702 4 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000492989.1 1215 8 23874 -310 23688 310 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAAAAAAAACACACAA 4587 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 8 NA PB.517.29 chr1 + 1611 4 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 24033 3 23719 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGTAAATGTGATGAATTG 4618 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.517.30 chr1 + 591 4 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000492989.1 1215 8 23965 -290 23779 290 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATAAAAAAAAGAAGTTGAG 4678 FALSE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.517.33 chr1 + 782 2 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000492989.1 1215 8 25552 -658 25366 -595 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAACAACAAAAT 6265 FALSE NA NA ATTAAA -33 NA NA NA 6 NA PB.517.34 chr1 + 865 3 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000484270.2 1989 11 28421 0 28421 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGAATGGTCCCACTCTGGTA 9320 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.517.42 chr1 + 789 2 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000484270.2 1989 11 31109 -1 31109 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAATGGTCCCACTCTGGTAG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 5 NA PB.518.1 chr1 + 1768 9 full-splice_match TMEM39B ENST00000336294.10 1778 9 8 2 4 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 62 16.176582 1.208887 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG -19 TRUE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 62 NA PB.518.2 chr1 + 2933 7 novel_not_in_catalog TMEM39B novel 1538 7 NA NA -33 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG 2 TRUE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 3 NA PB.518.3 chr1 + 1661 8 novel_in_catalog TMEM39B novel 1778 9 NA NA -2 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG -33 TRUE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 3 NA PB.518.4 chr1 + 1627 8 novel_in_catalog TMEM39B novel 1778 9 NA NA -2 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG -33 TRUE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 4 NA PB.518.5 chr1 + 1712 9 novel_in_catalog TMEM39B novel 1778 9 NA NA 0 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG -27 TRUE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 4 NA PB.518.6 chr1 + 1534 7 full-splice_match TMEM39B ENST00000441402.5 1538 7 -1 5 -1 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 56 14.611106 1.164683 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG -24 TRUE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 56 NA PB.518.7 chr1 + 3126 9 novel_not_in_catalog TMEM39B novel 1778 9 NA NA 5 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG -18 TRUE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 2 NA PB.518.8 chr1 + 1651 8 incomplete-splice_match TMEM39B ENST00000336294.10 1778 9 2024 2 -1168 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG 1997 FALSE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 2 NA PB.518.9 chr1 + 1335 6 incomplete-splice_match TMEM39B ENST00000441402.5 1538 7 2097 5 -1091 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG 2074 FALSE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 5 NA PB.518.10 chr1 + 1066 4 incomplete-splice_match TMEM39B ENST00000468135.5 1834 10 18717 5 15555 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG 8245 FALSE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 8 NA PB.518.11 chr1 + 941 4 incomplete-splice_match TMEM39B ENST00000468135.5 1834 10 18842 5 15680 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG 8370 FALSE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 2 NA PB.519.16 chr1 - 2006 5 novel_in_catalog PTP4A2 novel 3910 6 NA NA -21 10 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAACAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.519.19 chr1 - 1869 5 novel_in_catalog PTP4A2 novel 3910 6 NA NA -66 10 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAACAAA 87 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.519.21 chr1 - 1794 6 novel_in_catalog PTP4A2 novel 2213 8 NA NA 6745 10 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAACAAA -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.519.22 chr1 - 1642 5 novel_in_catalog PTP4A2 novel 3910 6 NA NA 2 10 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAACAAA -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.519.23 chr1 - 1580 5 full-splice_match PTP4A2 ENST00000602725.5 3353 5 -59 1832 -59 10 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAACAAA 63 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.519.24 chr1 - 1180 4 full-splice_match PTP4A2 ENST00000457805.6 1032 4 133 -281 -63 10 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAACAAA 370 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.519.25 chr1 - 2065 6 full-splice_match PTP4A2 ENST00000647444.2 3910 6 12 1833 2 9 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAACAA -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.519.27 chr1 - 1963 6 full-splice_match PTP4A2 ENST00000647444.2 3910 6 114 1833 -68 9 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAACAA 85 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.519.32 chr1 - 1853 6 full-splice_match PTP4A2 ENST00000647444.2 3910 6 224 1833 42 9 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAACAA 195 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.519.34 chr1 - 1787 6 full-splice_match PTP4A2 ENST00000647444.2 3910 6 290 1833 -36 9 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAACAA 261 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.519.35 chr1 - 1696 5 full-splice_match PTP4A2 ENST00000602725.5 3353 5 -176 1833 -176 9 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.652776 0.562623 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAACAA NA FALSE NA NA AGTAAA -28 NA NA NA 14 NA PB.519.36 chr1 - 1466 5 full-splice_match PTP4A2 ENST00000602725.5 3353 5 54 1833 35 9 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAACAA 176 FALSE NA NA ATTAAA -28 NA NA NA 11 NA PB.519.37 chr1 - 1330 5 full-splice_match PTP4A2 ENST00000602725.5 3353 5 190 1833 66 9 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.435514 0.646944 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAACAA 312 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.519.39 chr1 - 1092 5 full-splice_match PTP4A2 ENST00000602725.5 3353 5 428 1833 54 9 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAACAA 550 FALSE NA NA AATAAA -28 NA NA NA 11 NA PB.519.41 chr1 - 975 4 full-splice_match PTP4A2 ENST00000457805.6 1032 4 337 -280 78 9 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAACAA 574 FALSE NA NA AATAAA -4 NA NA NA 2 NA PB.519.43 chr1 - 1222 5 full-splice_match PTP4A2 ENST00000602725.5 3353 5 297 1834 -14 8 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 ATAAAAAAAAAAAAAAAACA 419 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.519.44 chr1 - 1796 7 novel_in_catalog PTP4A2 novel 3910 6 NA NA 65 6 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AGATAAAAAAAAAAAAAAAA -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.519.45 chr1 - 1650 6 full-splice_match PTP4A2 ENST00000647444.2 3910 6 20 2240 10 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.913689 0.592586 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.519.49 chr1 - 1455 7 novel_in_catalog PTP4A2 novel 3910 6 NA NA 2 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.519.53 chr1 - 1501 6 full-splice_match PTP4A2 ENST00000647444.2 3910 6 169 2240 -13 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 140 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.519.55 chr1 - 1536 5 novel_in_catalog PTP4A2 novel 3910 6 NA NA 31 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.519.58 chr1 - 1359 6 novel_in_catalog PTP4A2 novel 3910 6 NA NA 5033 -3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 5597 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.519.59 chr1 - 1384 6 novel_in_catalog PTP4A2 novel 2213 8 NA NA 6747 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.519.60 chr1 - 1309 6 novel_in_catalog PTP4A2 novel 2213 8 NA NA 0 -3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.519.61 chr1 - 1317 6 novel_in_catalog PTP4A2 novel 3910 6 NA NA -6 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.957339 0.695249 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.519.62 chr1 - 1188 4 full-splice_match PTP4A2 ENST00000457805.6 1032 4 -283 127 -168 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA NA FALSE NA NA AGTAAA -20 NA NA NA 6 NA PB.519.63 chr1 - 1164 5 full-splice_match PTP4A2 ENST00000602725.5 3353 5 -51 2240 -51 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.391864 0.530438 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 71 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.519.64 chr1 - 943 4 full-splice_match PTP4A2 ENST00000457805.6 1032 4 -38 127 -38 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 199 FALSE NA NA ATTAAA -5 NA NA NA 4 NA PB.519.65 chr1 - 974 5 full-splice_match PTP4A2 ENST00000602725.5 3353 5 139 2240 15 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 25 6.522815 0.814435 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 261 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 25 NA PB.519.66 chr1 - 842 5 full-splice_match PTP4A2 ENST00000602725.5 3353 5 271 2240 -40 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.696427 0.671768 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 393 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.519.67 chr1 - 643 5 full-splice_match PTP4A2 ENST00000602725.5 3353 5 470 2240 96 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 592 FALSE NA NA GGGGCT -10 NA NA NA 2 NA PB.519.68 chr1 - 377 2 full-splice_match PTP4A2 ENST00000489313.1 1551 2 1166 8 1166 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 9491 FALSE NA NA AAGAAA -40 NA NA NA 2 NA PB.519.70 chr1 - 1397 6 full-splice_match PTP4A2 ENST00000647444.2 3910 6 255 2258 -71 -21 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAATGAATAAAATGTTTAA 226 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.519.71 chr1 - 1301 6 novel_in_catalog PTP4A2 novel 3910 6 NA NA -18 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AACAAAAGCAAACAAAAAAG 435 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.519.72 chr1 - 1015 5 full-splice_match PTP4A2 ENST00000602725.5 3353 5 48 2290 29 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AACAAAAGCAAACAAAAAAG 170 FALSE NA NA ATTAAA -34 NA NA NA 2 NA PB.520.1 chr1 + 4094 15 novel_not_in_catalog KPNA6 novel 7355 14 NA NA -19 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA -17 TRUE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 3 NA PB.520.3 chr1 + 3955 14 full-splice_match KPNA6 ENST00000373625.8 7355 14 9 3391 7 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 49 12.784718 1.106691 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 11 TRUE NA NA ATTAAA -20 NA NA NA 49 NA PB.520.4 chr1 + 2202 14 full-splice_match KPNA6 ENST00000373625.8 7355 14 25 5128 23 -1738 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.696427 0.671768 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TGGATTGAGTTATTTAATTT -8 TRUE NA NA AAAACA -40 NA NA NA 18 NA PB.520.5 chr1 + 2075 13 incomplete-splice_match KPNA6 ENST00000373625.8 7355 14 46608 5125 -2198 -1735 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATTGAGTTATTTAATTTTTT NA FALSE NA NA AAAACA -43 NA NA NA 2 NA PB.520.6 chr1 + 3775 13 incomplete-splice_match KPNA6 ENST00000373625.8 7355 14 46644 3389 -2162 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA ATTAAA -22 NA NA NA 3 NA PB.520.7 chr1 + 3659 11 incomplete-splice_match KPNA6 ENST00000373625.8 7355 14 49289 3391 483 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA ATTAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.520.8 chr1 + 1787 10 incomplete-splice_match KPNA6 ENST00000373625.8 7355 14 50231 5142 1425 -1752 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAATCTTGTACGCTTGGATT NA FALSE NA NA AAAACA -26 NA NA NA 2 NA PB.520.10 chr1 + 1656 9 incomplete-splice_match KPNA6 ENST00000373625.8 7355 14 51417 5125 2611 -1735 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATTGAGTTATTTAATTTTTT NA FALSE NA NA AAAACA -43 NA NA NA 5 NA PB.520.11 chr1 + 1222 5 incomplete-splice_match KPNA6 ENST00000471599.5 3941 14 55182 1752 6378 -1752 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAATCTTGTACGCTTGGATT NA FALSE NA NA AAAACA -26 NA NA NA 3 NA PB.520.12 chr1 + 2936 5 incomplete-splice_match KPNA6 ENST00000471599.5 3941 14 55220 0 6416 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 5 NA PB.520.13 chr1 + 2842 4 incomplete-splice_match KPNA6 ENST00000471599.5 3941 14 58104 1 9300 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA ATTAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.520.14 chr1 + 2648 2 incomplete-splice_match KPNA6 ENST00000471599.5 3941 14 61822 0 13018 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.130951 0.495676 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 12 NA PB.520.15 chr1 + 845 2 incomplete-splice_match KPNA6 ENST00000471599.5 3941 14 61888 1737 13084 -1737 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GGATTGAGTTATTTAATTTT NA FALSE NA NA AAAACA -41 NA NA NA 2 NA PB.521.2 chr1 + 4794 11 full-splice_match TXLNA ENST00000373610.8 4865 11 69 2 69 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.479165 0.738714 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACTTGTTTCTCTCCTGACC 19 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 21 NA PB.521.3 chr1 + 5005 10 full-splice_match TXLNA ENST00000373609.1 5012 10 6 1 6 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTGTTTCTCTCCTGACCT -19 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 10 NA PB.521.4 chr1 + 3929 6 incomplete-splice_match TXLNA ENST00000373609.1 5012 10 10023 1 10023 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTGTTTCTCTCCTGACCT 6640 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.521.5 chr1 + 3771 5 incomplete-splice_match TXLNA ENST00000373609.1 5012 10 12244 -1 12244 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTGTTTCTCTCCTGACCTGT 8861 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.521.6 chr1 + 3507 3 incomplete-splice_match TXLNA ENST00000373609.1 5012 10 13208 1 13208 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTGTTTCTCTCCTGACCT 9825 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.522.1 chr1 + 842 6 full-splice_match CCDC28B ENST00000373602.10 880 6 27 11 -11 -7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 83 21.655746 1.335573 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGAAAGCAAGCGGCTCCG -9 TRUE NA NA ATTAAA -5 NA NA NA 83 NA PB.522.2 chr1 + 1208 4 incomplete-splice_match CCDC28B ENST00000681230.1 633 5 -13 11 -1 -7 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGAAAGCAAGCGGCTCCG 4 TRUE NA NA ATTAAA -5 NA NA NA 2 NA PB.522.3 chr1 + 1386 5 full-splice_match CCDC28B ENST00000421922.6 1415 5 18 11 -2 -7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGAAAGCAAGCGGCTCCG 20 TRUE NA NA ATTAAA -5 NA NA NA 5 NA PB.522.4 chr1 + 983 5 incomplete-splice_match CCDC28B ENST00000373602.10 880 6 1089 11 -12 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.435514 0.646944 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGAAAGCAAGCGGCTCCG 5 TRUE NA NA ATTAAA -5 NA NA NA 17 NA PB.522.5 chr1 + 776 4 full-splice_match CCDC28B ENST00000483009.1 615 4 1 -162 1 -7 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGAAAGCAAGCGGCTCCG -24 TRUE NA NA ATTAAA -5 NA NA NA 2 NA PB.524.1 chr1 + 2675 3 novel_in_catalog IQCC novel 2252 5 NA NA -23 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTCTGAGTCTGGCTGCTTT -11 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 4 NA PB.524.2 chr1 + 2029 5 full-splice_match IQCC ENST00000291358.11 2012 5 -20 3 -20 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.740077 0.758918 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGATTCTGAGTCTGGCTGCT -8 TRUE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 22 NA PB.524.3 chr1 + 1763 3 incomplete-splice_match IQCC ENST00000291358.11 2012 5 895 -5 895 5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTCTGGCTGCTTTCATTTC 876 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.525.1 chr1 + 1788 12 full-splice_match EIF3I ENST00000676801.1 1849 12 191 -130 -10 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTTGTGGTGTCTGTTTCA 130 FALSE NA NA AATAAA -33 NA NA NA 2 NA PB.525.2 chr1 + 1441 11 full-splice_match EIF3I ENST00000677711.1 1700 11 258 1 -19 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 1725 450.074249 2.653284 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTTGTGGTGTCTGTTTCA 802 FALSE NA NA AATAAA -33 NA NA NA 1725 NA PB.525.3 chr1 + 1518 10 full-splice_match EIF3I ENST00000678883.1 1400 10 -20 -98 -1 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTTGTGGTGTCTGTTTCA 0 TRUE NA NA AATAAA -33 NA NA NA 2 NA PB.525.4 chr1 + 1707 10 full-splice_match EIF3I ENST00000677183.1 1652 10 -11 -44 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATTTTGTGGTGTCTGTTTC 3 TRUE NA NA AATAAA -32 NA NA NA 3 NA PB.525.5 chr1 + 1433 10 full-splice_match EIF3I ENST00000677183.1 1652 10 -11 230 0 -5 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAATACAAAAATTAGCCA 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.525.6 chr1 + 1414 11 full-splice_match EIF3I ENST00000373586.2 1417 11 2 1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTTGTGGTGTCTGTTTCA 3 TRUE NA NA AATAAA -33 NA NA NA 2 NA PB.525.7 chr1 + 1324 10 full-splice_match EIF3I ENST00000677767.1 1343 10 0 19 0 -6 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAAATGGCTTCTGGTCAG 3 TRUE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.525.8 chr1 + 1273 11 full-splice_match EIF3I ENST00000678689.1 1276 11 2 1 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.913689 0.592586 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATATTTTGTGGTGTCTGTTT 3 TRUE NA NA AATAAA -31 NA NA NA 15 NA PB.525.9 chr1 + 1269 10 full-splice_match EIF3I ENST00000677353.1 1250 10 -21 2 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATTTTGTGGTGTCTGTTTC 3 TRUE NA NA AATAAA -32 NA NA NA 11 NA PB.525.10 chr1 + 1308 11 full-splice_match EIF3I ENST00000677711.1 1700 11 279 113 0 -10 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 218 56.878948 1.754952 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAGAAGAAGG 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 218 NA PB.525.11 chr1 + 1254 10 full-splice_match EIF3I ENST00000678968.1 1256 10 0 2 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATTTTGTGGTGTCTGTTTC 3 TRUE NA NA AATAAA -32 NA NA NA 8 NA PB.525.12 chr1 + 1163 11 full-splice_match EIF3I ENST00000678689.1 1276 11 2 111 0 -10 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAGAAGAAGG 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.525.13 chr1 + 1145 11 full-splice_match EIF3I ENST00000677711.1 1700 11 279 276 0 -5 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 284 74.099182 1.869813 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAATACAAAAATTAGCCA 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 284 NA PB.525.14 chr1 + 995 10 full-splice_match EIF3I ENST00000677353.1 1250 10 -21 276 0 -5 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAATACAAAAATTAGCCA 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.525.15 chr1 + 986 7 full-splice_match EIF3I ENST00000679290.1 987 7 0 1 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATATTTTGTGGTGTCTGTTT 3 TRUE NA NA AATAAA -31 NA NA NA 9 NA PB.525.16 chr1 + 1206 8 incomplete-splice_match EIF3I ENST00000677844.1 1264 9 712 -149 -1 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTTGTGGTGTCTGTTTCA 15 FALSE NA NA AATAAA -33 NA NA NA 2 NA PB.525.17 chr1 + 1206 10 full-splice_match EIF3I ENST00000471486.6 1482 10 2 274 0 -5 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAATACAAAAATTAGCCA 18 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.525.18 chr1 + 1478 10 full-splice_match EIF3I ENST00000471486.6 1482 10 3 1 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.957339 0.695249 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATATTTTGTGGTGTCTGTTT 19 FALSE NA NA AATAAA -31 NA NA NA 19 NA PB.525.19 chr1 + 1048 10 full-splice_match EIF3I ENST00000471486.6 1482 10 160 274 157 -5 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAATACAAAAATTAGCCA 176 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.525.20 chr1 + 1318 10 full-splice_match EIF3I ENST00000471486.6 1482 10 165 -1 162 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 42 10.958329 1.039744 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTTGTGGTGTCTGTTTCA 181 FALSE NA NA AATAAA -33 NA NA NA 42 NA PB.525.21 chr1 + 1170 9 incomplete-splice_match EIF3I ENST00000471486.6 1482 10 1604 111 1601 -10 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAGAAGAAGG 1620 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.525.22 chr1 + 1000 7 incomplete-splice_match EIF3I ENST00000677640.1 1141 9 1636 1 1603 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATATTTTGTGGTGTCTGTTT 1622 FALSE NA NA AATAAA -31 NA NA NA 2 NA PB.525.23 chr1 + 912 8 incomplete-splice_match EIF3I ENST00000677183.1 1652 10 2006 230 1984 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAATACAAAAATTAGCCA 2003 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.525.24 chr1 + 1180 8 incomplete-splice_match EIF3I ENST00000471486.6 1482 10 1989 4 1986 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 31 8.088291 0.907857 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CAGATATTTTGTGGTGTCTG 2005 FALSE NA NA AATAAA -28 NA NA NA 31 NA PB.525.25 chr1 + 1004 7 incomplete-splice_match EIF3I ENST00000677183.1 1652 10 3772 67 -1148 -10 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAGAAGAAGG 3769 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.525.26 chr1 + 1058 7 incomplete-splice_match EIF3I ENST00000471486.6 1482 10 3810 0 -1091 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 36 9.392854 0.972798 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATTTTGTGGTGTCTGTTTC 3826 FALSE NA NA AATAAA -32 NA NA NA 36 NA PB.525.27 chr1 + 970 6 incomplete-splice_match EIF3I ENST00000471486.6 1482 10 3981 -1 -920 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.740077 0.758918 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTTGTGGTGTCTGTTTCA 3997 FALSE NA NA AATAAA -33 NA NA NA 22 NA PB.525.28 chr1 + 853 6 incomplete-splice_match EIF3I ENST00000677183.1 1652 10 4005 67 -915 -10 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAGAAGAAGG 4002 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.525.29 chr1 + 839 5 full-splice_match EIF3I ENST00000678306.1 1795 5 1179 -223 903 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 26 6.783728 0.831468 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTTGTGGTGTCTGTTTCA 2038 FALSE NA NA AATAAA -33 NA NA NA 26 NA PB.525.30 chr1 + 682 4 incomplete-splice_match EIF3I ENST00000678306.1 1795 5 1452 -222 1176 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.696427 0.671768 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATTTTGTGGTGTCTGTTTC 2311 FALSE NA NA AATAAA -32 NA NA NA 18 NA PB.525.31 chr1 + 526 2 incomplete-splice_match EIF3I ENST00000678106.1 2075 3 3367 -100 3367 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATATTTTGTGGTGTCTGTTT 4502 FALSE NA NA AATAAA -31 NA NA NA 2 NA PB.526.1 chr1 + 934 2 full-splice_match FAM167B ENST00000373582.4 947 2 12 1 12 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATCAAGGTCTCTTGCAGTCG 6 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 7 NA PB.527.1 chr1 + 2502 11 novel_in_catalog LCK novel 2091 13 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACATCTCTTTGCTGTCCACT -9 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.527.3 chr1 + 2090 13 full-splice_match LCK ENST00000336890.10 2091 13 -1 2 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 117 30.526775 1.484681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACATCTCTTTGCTGTCCAC -9 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 117 NA PB.527.4 chr1 + 1937 12 novel_in_catalog LCK novel 2091 13 NA NA 0 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACATCTCTTTGCTGTCCAC -9 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 8 NA PB.527.5 chr1 + 2037 13 novel_not_in_catalog LCK novel 2091 13 NA NA 0 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACATCTCTTTGCTGTCCACT -8 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.527.6 chr1 + 2135 13 novel_in_catalog LCK novel 2099 13 NA NA -16 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACATCTCTTTGCTGTCCAC NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.527.7 chr1 + 1935 12 novel_in_catalog LCK novel 2099 13 NA NA 0 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACATCTCTTTGCTGTCCAC -1 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 7 NA PB.527.8 chr1 + 2071 13 full-splice_match LCK ENST00000619559.4 2099 13 27 1 6 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 55 14.350193 1.156858 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACATCTCTTTGCTGTCCAC -2 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 55 NA PB.527.9 chr1 + 2168 12 incomplete-splice_match LCK ENST00000336890.10 2091 13 22875 1 8 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACATCTCTTTGCTGTCCACT 0 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 6 NA PB.527.10 chr1 + 1936 12 incomplete-splice_match LCK ENST00000619559.4 2099 13 261 0 240 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACATCTCTTTGCTGTCCACT 35 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 6 NA PB.527.11 chr1 + 1592 8 incomplete-splice_match LCK ENST00000619559.4 2099 13 1466 1 -43 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.130951 0.495676 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACATCTCTTTGCTGTCCAC 1240 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 12 NA PB.527.12 chr1 + 1495 7 incomplete-splice_match LCK ENST00000619559.4 2099 13 1802 3 293 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTACATCTCTTTGCTGTCC 1576 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 5 NA PB.527.13 chr1 + 1275 6 incomplete-splice_match LCK ENST00000619559.4 2099 13 2295 3 786 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTACATCTCTTTGCTGTCC 2069 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 11 NA PB.527.14 chr1 + 1145 5 incomplete-splice_match LCK ENST00000619559.4 2099 13 2545 0 1036 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACATCTCTTTGCTGTCCACT 2319 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 10 NA PB.527.15 chr1 + 932 3 incomplete-splice_match LCK ENST00000333070.4 2166 13 5713 -1 4225 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACATCTCTTTGCTGTCCAC 5508 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 10 NA PB.528.1 chr1 - 2929 7 novel_in_catalog TMEM234 novel 1538 11 NA NA 2 35 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 CAACCTAGCAAGAAGGTATT -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.528.2 chr1 - 2237 7 novel_in_catalog TMEM234 novel 1866 9 NA NA 0 -376 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AATTCGGTCTGGTTCCTTTG -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.528.3 chr1 - 1419 4 full-splice_match TMEM234 ENST00000373593.5 1411 4 -10 2 0 1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAGGTTAGTAAGTATTCT -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.528.4 chr1 - 1243 6 novel_in_catalog TMEM234 novel 1538 11 NA NA 0 1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAGGTTAGTAAGTATTCT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.528.5 chr1 - 950 4 novel_in_catalog TMEM234 novel 1866 9 NA NA 0 1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAGGTTAGTAAGTATTCT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.528.6 chr1 - 1349 4 incomplete-splice_match TMEM234 ENST00000309777.11 1107 5 39 7 5 -7 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAACAGACAAGAGGTTAGTA 31 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.528.7 chr1 - 1094 5 full-splice_match TMEM234 ENST00000309777.11 1107 5 6 7 0 -7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 32 8.349203 0.921645 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAACAGACAAGAGGTTAGTA -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 32 NA PB.529.1 chr1 - 1555 2 full-splice_match MARCKSL1 ENST00000329421.8 1546 2 -3 -6 -3 6 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2715 708.377747 2.850265 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CTTTAATGAGTGGTCTTCTG -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2715 NA PB.529.4 chr1 - 1512 3 novel_not_in_catalog MARCKSL1 novel 1546 2 NA NA -15176 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTGGTGCTTTAATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.529.6 chr1 - 1280 2 full-splice_match MARCKSL1 ENST00000329421.8 1546 2 265 1 265 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 48 12.523805 1.097736 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTGGTGCTTTAATGAGTGG 3705 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 48 NA PB.529.9 chr1 - 718 3 novel_not_in_catalog MARCKSL1 novel 1546 2 NA NA 0 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTGGTGCTTTAATGAGTGG -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.529.12 chr1 - 1319 2 novel_not_in_catalog MARCKSL1 novel 1546 2 NA NA 0 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGTGGTGCTTTAATGAGTG -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.529.18 chr1 - 1442 2 full-splice_match MARCKSL1 ENST00000329421.8 1546 2 0 104 0 -104 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.130951 0.495676 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACCCCAGATTTGTACTTT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.529.19 chr1 - 1309 2 full-splice_match MARCKSL1 ENST00000329421.8 1546 2 0 237 0 -237 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 137 35.745026 1.553216 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGCCTGTGAATCAACTGTGT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 137 NA PB.529.21 chr1 - 1099 2 full-splice_match MARCKSL1 ENST00000329421.8 1546 2 210 237 210 -237 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGCCTGTGAATCAACTGTGT 3650 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.530.2 chr1 - 665 2 full-splice_match FAM229A ENST00000416512.1 2759 2 2094 0 -305 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTCCGGGCTGGCAGTGTAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.531.1 chr1 + 1226 2 incomplete-splice_match HDAC1 ENST00000463172.5 895 5 -68 23749 -14 -23749 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAATATGAAAAAAATTA -21 TRUE NA NA AAGAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.531.3 chr1 + 2104 14 full-splice_match HDAC1 ENST00000373548.8 2118 14 12 2 12 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 848 221.253891 2.344891 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCTCCTGAGCTTGTTTC 5 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 848 NA PB.531.4 chr1 + 1262 3 novel_not_in_catalog HDAC1 novel 895 5 NA NA 12 -22209 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATCTCTTTGATGAGCATTTG 5 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.531.5 chr1 + 3488 13 novel_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA 18 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCTCCTGAGCTTGTTTC 11 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.531.6 chr1 + 2060 14 novel_not_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA 18 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCTCCTGAGCTTGTTTCC 11 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.531.7 chr1 + 2023 13 novel_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA 18 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCTCCTGAGCTTGTTTC 11 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.531.9 chr1 + 2000 13 novel_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA 24 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCTCCTGAGCTTGTTTCC 17 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 11 NA PB.531.10 chr1 + 1392 12 incomplete-splice_match HDAC1 ENST00000373548.8 2118 14 24 1427 24 418 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.957339 0.695249 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAACAGAGGATGAAAAAGA 17 TRUE NA NA AAAAAG -12 NA NA NA 19 NA PB.531.12 chr1 + 2458 14 novel_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA -12 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCTCCTGAGCTTGTTTCC -18 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 11 NA PB.531.13 chr1 + 1713 12 novel_not_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA -12 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.652776 0.562623 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCTCCTGAGCTTGTTTC -18 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 14 NA PB.531.14 chr1 + 5611 10 novel_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA 0 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATATCCTCCTGAGCTTGTTT -6 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.531.15 chr1 + 2016 13 novel_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA 0 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCTCCTGAGCTTGTTTCC -6 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.531.16 chr1 + 5329 11 novel_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA 1 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCTCCTGAGCTTGTTTCC -5 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.531.17 chr1 + 1951 13 novel_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA 1 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCTCCTGAGCTTGTTTCC -5 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 5 NA PB.531.18 chr1 + 2157 14 novel_not_in_catalog HDAC1 novel 2409 7 NA NA 100 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCTCCTGAGCTTGTTTC 21 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.531.19 chr1 + 1918 13 incomplete-splice_match HDAC1 ENST00000373548.8 2118 14 10600 2 10522 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCTCCTGAGCTTGTTTC NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 7 NA PB.531.21 chr1 + 1664 10 incomplete-splice_match HDAC1 ENST00000373548.8 2118 14 34867 1 -239 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 26 6.783728 0.831468 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCTCCTGAGCTTGTTTCC 4202 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 26 NA PB.531.22 chr1 + 2010 10 novel_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA -201 2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTCCTGAGCTTGTTTCCTAT 4240 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.531.23 chr1 + 1258 8 novel_not_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA -197 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCTCCTGAGCTTGTTTC 4244 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.531.24 chr1 + 1504 9 incomplete-splice_match HDAC1 ENST00000373548.8 2118 14 35484 2 293 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 29 7.566465 0.878893 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCTCCTGAGCTTGTTTC 4819 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 29 NA PB.531.25 chr1 + 1830 8 incomplete-splice_match HDAC1 ENST00000373548.8 2118 14 36547 3 -850 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATATCCTCCTGAGCTTGTTT 5882 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.531.26 chr1 + 2749 7 full-splice_match HDAC1 ENST00000476391.5 2409 7 -351 11 -351 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCTCCTGAGCTTGTTTC 6381 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.531.27 chr1 + 1329 8 incomplete-splice_match HDAC1 ENST00000373548.8 2118 14 37048 3 -349 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.479165 0.738714 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATATCCTCCTGAGCTTGTTT 6383 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 21 NA PB.531.28 chr1 + 2218 7 full-splice_match HDAC1 ENST00000476391.5 2409 7 181 10 181 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCTCCTGAGCTTGTTTCC 6913 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.531.29 chr1 + 1232 6 novel_not_in_catalog HDAC1 novel 2409 7 NA NA -313 430 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 GAAAAAGAGAAAGACCCAGA 7088 FALSE NA NA AAAAAG -24 NA NA NA 2 NA PB.531.30 chr1 + 1584 7 full-splice_match HDAC1 ENST00000476391.5 2409 7 812 13 143 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TATATCCTCCTGAGCTTGTT 7544 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.531.31 chr1 + 1214 7 full-splice_match HDAC1 ENST00000476391.5 2409 7 1184 11 515 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.957339 0.695249 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCTCCTGAGCTTGTTTC 7916 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 19 NA PB.531.32 chr1 + 1070 6 incomplete-splice_match HDAC1 ENST00000476391.5 2409 7 1410 10 -646 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.740077 0.758918 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCTCCTGAGCTTGTTTCC 59 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 22 NA PB.531.33 chr1 + 857 4 incomplete-splice_match HDAC1 ENST00000476391.5 2409 7 2280 11 224 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCTCCTGAGCTTGTTTC 929 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 9 NA PB.531.34 chr1 + 763 3 incomplete-splice_match HDAC1 ENST00000471488.1 726 4 602 -546 602 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCTCCTGAGCTTGTTTCC 1307 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 11 NA PB.531.35 chr1 + 686 3 incomplete-splice_match HDAC1 ENST00000471488.1 726 4 682 -549 682 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTCCTGAGCTTGTTTCCTAT 1387 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 7 NA PB.532.1 chr1 - 2880 11 full-splice_match BSDC1 ENST00000446293.6 1505 11 -4 -1371 -3 7 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.130951 0.495676 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAAGGTGTCTGGGGGTCTGT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.532.2 chr1 - 2820 11 full-splice_match BSDC1 ENST00000455895.7 3309 11 15 474 0 6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 47 12.262893 1.088593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAAAGGTGTCTGGGGGTCTG 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 47 NA PB.532.3 chr1 - 1633 2 incomplete-splice_match BSDC1 ENST00000444377.5 2925 12 25891 0 6245 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAAGCTGAAAGGTGTCTGGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.532.4 chr1 - 2085 4 incomplete-splice_match BSDC1 ENST00000455895.7 3309 11 16438 555 -3221 -17 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAGAAAGAAAAAAGAA 8773 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.532.5 chr1 - 1953 3 incomplete-splice_match BSDC1 ENST00000455895.7 3309 11 17798 555 -1861 -17 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAGAAAGAAAAAAGAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.532.6 chr1 - 1811 3 incomplete-splice_match BSDC1 ENST00000455895.7 3309 11 17940 555 -1719 -17 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAGAAAGAAAAAAGAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.532.11 chr1 - 1654 3 incomplete-splice_match BSDC1 ENST00000455895.7 3309 11 18096 556 -1563 -18 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAAGAAAGAAAAAAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.532.12 chr1 - 2604 9 incomplete-splice_match BSDC1 ENST00000455895.7 3309 11 7593 559 7577 -21 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AATTAAAAAAGAAAGAAAAA 7586 FALSE NA NA CATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.532.14 chr1 - 1132 4 incomplete-splice_match BSDC1 ENST00000373520.8 1630 10 16144 15 -3502 -15 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAAAAAAAAAAAAGGAAA 8492 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.532.15 chr1 - 1729 10 full-splice_match BSDC1 ENST00000341071.11 4599 10 -8 2878 -3 -16 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 GAAAAAAAAAAAAAAAGGAA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.532.16 chr1 - 1669 10 incomplete-splice_match BSDC1 ENST00000455895.7 3309 11 16 3416 0 -16 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 31 8.088291 0.907857 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 GAAAAAAAAAAAAAAAGGAA 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 31 NA PB.532.17 chr1 - 1617 10 full-splice_match BSDC1 ENST00000373520.8 1630 10 -3 16 0 -16 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 GAAAAAAAAAAAAAAAGGAA 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.532.18 chr1 - 768 2 incomplete-splice_match BSDC1 ENST00000373520.8 1630 10 17901 16 -1745 -16 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 GAAAAAAAAAAAAAAAGGAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.532.19 chr1 - 1783 11 incomplete-splice_match BSDC1 ENST00000444377.5 2925 12 -3 2937 0 -17 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TGAAAAAAAAAAAAAAAGGA 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.532.20 chr1 - 1925 9 incomplete-splice_match BSDC1 ENST00000444377.5 2925 12 -6 10400 -3 1117 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTTGGTGTCAGTCAGCCTTT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.533.2 chr1 + 1925 5 full-splice_match ZBTB8A ENST00000373510.9 7077 5 -5 5157 -5 -206 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAACTTTATGTAAGACAATT -26 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.537.1 chr1 - 1599 7 novel_in_catalog ZBTB8OS novel 1567 7 NA NA 0 -5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAATTTCTTTATTGTTGT -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.537.2 chr1 - 1542 6 novel_in_catalog ZBTB8OS novel 620 7 NA NA 4 -5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAATTTCTTTATTGTTGT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.537.3 chr1 - 1503 6 full-splice_match ZBTB8OS ENST00000436661.6 514 6 15 -1004 4 -6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.913689 0.592586 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAATTTCTTTATTGTTG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.537.4 chr1 - 1546 7 full-splice_match ZBTB8OS ENST00000468695.6 1567 7 15 6 0 -6 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 20 5.218252 0.717525 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAATTTCTTTATTGTTG 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 20 NA PB.537.6 chr1 - 1157 2 incomplete-splice_match ZBTB8OS ENST00000467652.5 388 3 4516 -1003 4516 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGAAAAATTTCTTTATTGTT NA FALSE NA NA ATTAAA -30 NA NA NA 2 NA PB.537.7 chr1 - 1040 7 novel_in_catalog ZBTB8OS novel 588 7 NA NA -97 -5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGAACTGTTTTTGTTTTCC 228 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.537.8 chr1 - 993 7 full-splice_match ZBTB8OS ENST00000468695.6 1567 7 -441 1015 -88 -5 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGAACTGTTTTTGTTTTCC 237 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.537.9 chr1 - 618 7 full-splice_match ZBTB8OS ENST00000373501.6 598 7 -25 5 0 -5 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGAACTGTTTTTGTTTTCC -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.537.10 chr1 - 575 7 novel_in_catalog ZBTB8OS novel 588 7 NA NA 0 -5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGAACTGTTTTTGTTTTCC 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.537.11 chr1 - 547 7 full-splice_match ZBTB8OS ENST00000468695.6 1567 7 5 1015 4 -5 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGAACTGTTTTTGTTTTCC -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.537.12 chr1 - 510 6 full-splice_match ZBTB8OS ENST00000436661.6 514 6 -1 5 -1 -5 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGAACTGTTTTTGTTTTCC 667 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.537.13 chr1 - 1251 6 novel_in_catalog ZBTB8OS novel 598 7 NA NA -2 4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CGAAGAACTGTTTTTGTTTT -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.538.1 chr1 + 2373 12 full-splice_match RBBP4 ENST00000373493.10 7883 12 -1 5511 -1 43 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 665 173.506882 2.239317 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGTCTCTGGCTTCTAGAAGA -2 TRUE NA NA TATAAA -17 NA NA NA 665 NA PB.538.3 chr1 + 2192 12 full-splice_match RBBP4 ENST00000373493.10 7883 12 -17 5708 13 -148 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 118 30.787687 1.488377 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGAGTTGCTTTTTTTTTTT -18 TRUE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 118 NA PB.538.4 chr1 + 1503 13 novel_in_catalog RBBP4 novel 7883 12 NA NA -9 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATAACCCCATGCTGATGGGT -10 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 5 NA PB.538.5 chr1 + 1422 11 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000373485.5 1417 12 -35 7654 -9 102 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TACTCCCAGGTGTGATTTTA -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.538.7 chr1 + 704 2 full-splice_match RBBP4 ENST00000465780.1 690 2 -27 13 -9 -13 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.740077 0.758918 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAAGAAAAAAGTATTA -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 22 NA PB.538.9 chr1 + 1570 12 novel_not_in_catalog RBBP4 novel 7883 12 NA NA 0 19678 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAGAACAAGGCAGAAGTG -1 TRUE NA NA AGTAAA -7 NA NA NA 2 NA PB.538.10 chr1 + 1615 13 novel_in_catalog RBBP4 novel 7883 12 NA NA 0 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT -1 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.538.12 chr1 + 2418 13 novel_not_in_catalog RBBP4 novel 7883 12 NA NA -1 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATAACCCCATGCTGATGGGT 0 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 4 NA PB.538.13 chr1 + 1435 12 full-splice_match RBBP4 ENST00000373485.5 1417 12 -25 7 -1 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 24 6.261902 0.796706 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACCCCATGCTGATGGGTT 0 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 24 NA PB.538.14 chr1 + 2228 12 novel_not_in_catalog RBBP4 novel 7883 12 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT 1 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.538.18 chr1 + 2263 12 full-splice_match RBBP4 ENST00000373493.10 7883 12 60 5560 -10 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 117 30.526775 1.484681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT 59 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 117 NA PB.538.21 chr1 + 2089 12 full-splice_match RBBP4 ENST00000373493.10 7883 12 86 5708 16 -148 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 23 6.000990 0.778223 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGAGTTGCTTTTTTTTTTT 85 FALSE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 23 NA PB.538.23 chr1 + 2187 11 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000458695.6 1674 12 579 -611 448 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.130951 0.495676 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT 199 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 12 NA PB.538.24 chr1 + 2032 10 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000458695.6 1674 12 6099 -611 5968 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.957339 0.695249 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT 5719 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 19 NA PB.538.25 chr1 + 1767 9 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000458695.6 1674 12 16868 -463 -95 -148 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGAGTTGCTTTTTTTTTTT 6316 FALSE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 8 NA PB.538.26 chr1 + 1895 9 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000458695.6 1674 12 16887 -610 -76 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 39 10.175591 1.007560 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACCCCATGCTGATGGGTT 6335 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 39 NA PB.538.28 chr1 + 1750 8 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000492348.6 1547 10 17512 -447 160 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.479165 0.738714 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT 6821 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 21 NA PB.538.29 chr1 + 1653 8 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000492348.6 1547 10 17609 -447 257 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 36 9.392854 0.972798 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT 6918 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 36 NA PB.538.31 chr1 + 1475 7 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000460669.5 783 8 -135 151 -121 -149 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAAGAGTTGCTTTTTTTTTT 7064 FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 8 NA PB.538.34 chr1 + 1521 7 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000460669.5 783 8 -32 2 -18 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 33 8.610116 0.935009 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT 7167 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 33 NA PB.538.35 chr1 + 1347 7 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000460669.5 783 8 -6 150 -6 -148 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGAGTTGCTTTTTTTTTTT 7193 FALSE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.538.36 chr1 + 1429 6 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000460669.5 783 8 158 2 9 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT 7357 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.538.39 chr1 + 1266 6 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000460669.5 783 8 171 152 22 -150 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATAAGAGTTGCTTTTTTTTT 7370 FALSE NA NA ATTAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.538.40 chr1 + 1361 6 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000460669.5 783 8 226 2 77 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.652776 0.562623 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT 7425 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 14 NA PB.538.42 chr1 + 1285 5 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000460669.5 783 8 431 1 282 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACCCCATGCTGATGGGTTTT 7630 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 10 NA PB.538.43 chr1 + 1088 4 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000460669.5 783 8 3365 150 3216 -148 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.130951 0.495676 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGAGTTGCTTTTTTTTTTT NA FALSE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 12 NA PB.538.44 chr1 + 1164 3 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000460669.5 783 8 3552 2 3403 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 43 11.219242 1.049963 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 43 NA PB.538.46 chr1 + 1122 2 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000460669.5 783 8 3683 4 3534 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATAACCCCATGCTGATGGGT NA FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.539.5 chr1 - 2414 5 full-splice_match SYNC ENST00000409190.8 3503 5 23 1066 9 519 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATCTTGCCTTAAATTCTC 13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.539.6 chr1 - 905 4 incomplete-splice_match SYNC ENST00000409190.8 3503 5 7665 1496 7651 89 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATTCTTTTGTGCCACGAGT 7691 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.540.1 chr1 + 3277 2 incomplete-splice_match KIAA1522 ENST00000373480.1 5294 7 5604 0 5604 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCTGTGGCTACTGCTTCTTA 3 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.540.2 chr1 + 3115 2 incomplete-splice_match KIAA1522 ENST00000373480.1 5294 7 5765 1 5765 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GGCTGTGGCTACTGCTTCTT 164 FALSE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.540.3 chr1 + 2715 2 incomplete-splice_match KIAA1522 ENST00000373480.1 5294 7 6165 1 6165 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GGCTGTGGCTACTGCTTCTT 299 FALSE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 3 NA PB.540.4 chr1 + 2179 2 incomplete-splice_match KIAA1522 ENST00000373480.1 5294 7 6700 2 6700 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGGCTGTGGCTACTGCTTCT 834 FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 3 NA PB.542.2 chr1 + 1647 7 novel_in_catalog S100PBP novel 4220 7 NA NA 2 44 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 38 9.914679 0.996279 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTTTGTGTGTGTGTGTCTG 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 38 NA PB.542.6 chr1 + 4266 7 full-splice_match S100PBP ENST00000373475.10 4220 7 -48 2 13 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.174602 0.620615 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GACATATGTACTGTGGCGGT -12 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 16 NA PB.542.7 chr1 + 1601 8 novel_in_catalog S100PBP novel 4220 7 NA NA 16 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATGCCCATTGCCGACTTG -9 TRUE NA NA TTTAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.542.9 chr1 + 1649 7 novel_in_catalog S100PBP novel 4220 7 NA NA -12 -4 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GGAAATGCCCATTGCCGACT 34 FALSE NA NA TTTAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.542.10 chr1 + 4322 7 novel_in_catalog S100PBP novel 706 3 NA NA 6 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGACATATGTACTGTGGCGG 52 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.542.12 chr1 + 3914 5 novel_in_catalog S100PBP novel 4220 7 NA NA 1348 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GACATATGTACTGTGGCGGT 8592 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.542.13 chr1 + 3833 5 incomplete-splice_match S100PBP ENST00000373475.10 4220 7 8679 -1 1435 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATATGTACTGTGGCGGTCTG 8679 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.542.14 chr1 + 1067 5 novel_in_catalog S100PBP novel 3320 7 NA NA 1505 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATGCCCATTGCCGACTTG 8749 FALSE NA NA TTTAAA -19 NA NA NA 5 NA PB.542.15 chr1 + 3523 5 incomplete-splice_match S100PBP ENST00000373475.10 4220 7 8989 -1 1745 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATATGTACTGTGGCGGTCTG 8989 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.542.16 chr1 + 2485 5 incomplete-splice_match S100PBP ENST00000373476.5 3320 7 9216 0 1761 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CCTAAGTGTTTACTGTTTTT 9005 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.542.17 chr1 + 2992 2 full-splice_match S100PBP ENST00000475486.1 665 2 362 -2689 362 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACATATGTACTGTGGCGGTC 6752 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.543.1 chr1 - 2867 13 full-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 39 -463 -2 461 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TACTCTAGGTCAAGCTCATT 31 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.543.2 chr1 - 2465 13 full-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 -22 0 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 377 98.364052 1.992836 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGTCTGGATGTGAGCTGGAC -30 TRUE NA NA AAAAAG -18 NA NA NA 377 NA PB.543.3 chr1 - 2949 12 novel_in_catalog YARS1 novel 3263 13 NA NA 0 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG -30 TRUE NA NA AAAAAG -18 NA NA NA 6 NA PB.543.4 chr1 - 2371 12 novel_in_catalog YARS1 novel 2443 13 NA NA 2 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGTCTGGATGTGAGCTGGAC -17 TRUE NA NA AAAAAG -5 NA NA NA 3 NA PB.543.5 chr1 - 2406 13 full-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 37 0 -4 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 94 24.525785 1.389623 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGTCTGGATGTGAGCTGGAC 29 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 94 NA PB.543.6 chr1 - 2129 11 full-splice_match YARS1 ENST00000674629.1 2075 11 -10 -44 2 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGTCTGGATGTGAGCTGGAC -17 TRUE NA NA AAAAAG -5 NA NA NA 5 NA PB.543.7 chr1 - 1103 3 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000469100.5 2247 4 1911 2 519 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGTCTGGATGTGAGCTGGAC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.543.9 chr1 - 3126 13 full-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 -684 1 -662 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GTGTCTGGATGTGAGCTGGA 110 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.543.11 chr1 - 2351 12 novel_in_catalog YARS1 novel 2443 13 NA NA 2 -3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG -17 TRUE NA NA AAAAAG -5 NA NA NA 3 NA PB.543.12 chr1 - 2260 12 full-splice_match YARS1 ENST00000675785.1 2248 12 50 -62 -13 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG 20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.543.13 chr1 - 2219 12 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 6346 8 635 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 23 6.000990 0.778223 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG 7140 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 23 NA PB.543.14 chr1 - 2062 11 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 6647 8 936 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 23 6.000990 0.778223 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG 7441 FALSE NA NA GGGGCT -43 NA NA NA 23 NA PB.543.15 chr1 - 1898 10 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 10790 8 12 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.543.16 chr1 - 1762 9 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 19564 8 420 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.696427 0.671768 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG 1311 FALSE NA NA TTTAAA -19 NA NA NA 18 NA PB.543.17 chr1 - 1613 7 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 30307 8 -317 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.391864 0.530438 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.543.18 chr1 - 1271 4 full-splice_match YARS1 ENST00000469100.5 2247 4 966 10 -426 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 39 10.175591 1.007560 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 39 NA PB.543.19 chr1 - 1149 3 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000469100.5 2247 4 1857 10 465 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 32 8.349203 0.921645 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 32 NA PB.543.20 chr1 - 905 2 full-splice_match YARS1 ENST00000490826.1 2178 2 1270 3 1270 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.543.21 chr1 - 1501 6 full-splice_match YARS1 ENST00000478828.1 1044 6 286 -743 286 -4 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 23 6.000990 0.778223 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAACAAGGGTGTCTGGATGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 23 NA PB.543.22 chr1 - 2168 13 full-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 -27 302 -5 140 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAGGAAAGGGAAGGGAAA 767 FALSE NA NA AAAAAG -23 NA NA NA 3 NA PB.543.23 chr1 - 2034 14 novel_in_catalog YARS1 novel 2443 13 NA NA 13 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATGCCACAGTCCTTATAATT 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.543.24 chr1 - 1882 13 full-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 119 442 33 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATGCCACAGTCCTTATAATT 913 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.543.25 chr1 - 1797 12 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 6334 442 623 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATGCCACAGTCCTTATAATT 7128 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.543.26 chr1 - 1372 9 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000675785.1 2248 12 19542 372 376 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATGCCACAGTCCTTATAATT 1267 FALSE NA NA CATAAA -19 NA NA NA 7 NA PB.543.27 chr1 - 1112 7 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000675785.1 2248 12 30396 372 -250 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.391864 0.530438 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATGCCACAGTCCTTATAATT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.543.28 chr1 - 959 5 full-splice_match YARS1 ENST00000487404.5 2197 5 1238 0 -414 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATGCCACAGTCCTTATAATT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.543.29 chr1 - 2011 13 full-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 -11 443 0 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 101 26.352173 1.420816 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TATGCCACAGTCCTTATAAT -19 TRUE NA NA AAAAAG -7 NA NA NA 101 NA PB.543.30 chr1 - 1529 11 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000675785.1 2248 12 6767 373 1034 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TATGCCACAGTCCTTATAAT 7539 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.543.38 chr1 - 850 7 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 -13 11798 0 -97 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAGAAAAAACTGAAGAAGGC -21 TRUE NA NA AAAAAG -9 NA NA NA 2 NA PB.543.40 chr1 - 1319 6 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 -11 15413 0 1 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAGTGT -19 TRUE NA NA AAAAAG -7 NA NA NA 8 NA PB.543.42 chr1 - 1208 6 novel_not_in_catalog YARS1 novel 773 2 NA NA 0 -5729 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAAAAAAACAAAAAAGAA -30 TRUE NA NA AAAAAG -18 NA NA NA 2 NA PB.544.1 chr1 - 1052 6 novel_not_in_catalog TMEM54 novel 1030 6 NA NA -5 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATTTGGCTGCATGCAGGGG 11 TRUE NA NA GGGGCT -23 NA NA NA 5 NA PB.544.2 chr1 - 998 6 full-splice_match TMEM54 ENST00000373463.8 1030 6 32 0 -5 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 82 21.394835 1.330309 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATTTGGCTGCATGCAGGGG 11 TRUE NA NA GGGGCT -23 NA NA NA 82 NA PB.544.3 chr1 - 890 6 full-splice_match TMEM54 ENST00000474144.5 748 6 4 -146 4 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATTTGGCTGCATGCAGGGG 20 TRUE NA NA GGGGCT -14 NA NA NA 5 NA PB.545.2 chr1 - 1879 8 incomplete-splice_match RNF19B ENST00000356990.9 2598 9 14998 -3 14998 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTTACCTCATTTTCCTTG 9597 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.545.3 chr1 - 1681 7 incomplete-splice_match RNF19B ENST00000373456.11 2560 9 16351 6 16351 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTTACCTCATTTTCCTTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.545.4 chr1 - 1523 6 incomplete-splice_match RNF19B ENST00000373456.11 2560 9 18166 6 18166 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTTACCTCATTTTCCTTG NA FALSE NA NA GGGGCT -4 NA NA NA 5 NA PB.545.5 chr1 - 1206 4 incomplete-splice_match RNF19B ENST00000373456.11 2560 9 20610 6 20610 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTTACCTCATTTTCCTTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.547.1 chr1 + 1404 2 incomplete-splice_match HPCA ENST00000373467.4 1412 4 6615 2 -418 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CAGTGGGCTGGGTGGTGGGG 3874 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.549.8 chr1 - 3575 7 full-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 20 2 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGAGGTTCTGCATGCATTA -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.549.10 chr1 - 2785 8 novel_in_catalog AK2 novel 886 7 NA NA -4 11 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTATTGTTTGTTTGCTTC 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.549.11 chr1 - 2777 8 full-splice_match AK2 ENST00000467905.5 880 8 -23 -1874 2 11 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTATTGTTTGTTTGCTTC 22 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.549.12 chr1 - 2587 8 novel_not_in_catalog AK2 novel 880 8 NA NA 1 11 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTATTGTTTGTTTGCTTC 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.549.16 chr1 - 2560 6 full-splice_match AK2 ENST00000548033.5 936 6 -28 -1596 0 10 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GAGCTATTGTTTGTTTGCTT 63 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.549.17 chr1 - 2103 2 incomplete-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 23526 896 -70 10 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GAGCTATTGTTTGTTTGCTT 8653 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.549.18 chr1 - 5044 6 full-splice_match AK2 ENST00000672715.1 5970 6 29 897 9 9 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGAGCTATTGTTTGTTTGCT 77 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.549.19 chr1 - 2701 7 full-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 -1 897 -1 9 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 255 66.532715 1.823035 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGAGCTATTGTTTGTTTGCT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 255 NA PB.549.20 chr1 - 2453 6 incomplete-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 12415 897 -2765 9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.130951 0.495676 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGAGCTATTGTTTGTTTGCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.549.21 chr1 - 2348 5 incomplete-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 15258 897 65 9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGAGCTATTGTTTGTTTGCT 385 FALSE NA NA AAGAAA -39 NA NA NA 5 NA PB.549.27 chr1 - 2820 7 full-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 -121 898 0 8 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTGAGCTATTGTTTGTTTGC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.549.28 chr1 - 4006 6 full-splice_match AK2 ENST00000672715.1 5970 6 29 1935 9 198 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.740077 0.758918 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCCCTGTTGTGGCATTTT 77 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 22 NA PB.549.29 chr1 - 2766 7 novel_in_catalog AK2 novel 2840 8 NA NA 9 198 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCCCTGTTGTGGCATTTT 77 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.549.31 chr1 - 1689 8 full-splice_match AK2 ENST00000467905.5 880 8 25 -834 2 198 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.174602 0.620615 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCCCTGTTGTGGCATTTT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.549.32 chr1 - 1532 6 full-splice_match AK2 ENST00000548033.5 936 6 -39 -557 -2 198 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCCCTGTTGTGGCATTTT 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.549.34 chr1 - 1265 4 incomplete-splice_match AK2 ENST00000548033.5 936 6 15391 -557 241 198 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCCCTGTTGTGGCATTTT 561 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.549.37 chr1 - 1741 8 novel_in_catalog AK2 novel 886 7 NA NA -1 197 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCTGTTGTGGCATTT 86 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.549.38 chr1 - 1683 7 novel_not_in_catalog AK2 novel 886 7 NA NA -1 197 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCTGTTGTGGCATTT 86 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.549.39 chr1 - 1669 7 full-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 -8 1936 -5 197 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 650 169.593185 2.229409 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCTGTTGTGGCATTT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 650 NA PB.549.40 chr1 - 1537 6 full-splice_match AK2 ENST00000629371.2 3576 6 57 1982 9 197 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCTGTTGTGGCATTT 77 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.549.42 chr1 - 1467 6 incomplete-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 12362 1936 -2818 197 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.435514 0.646944 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCTGTTGTGGCATTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.549.43 chr1 - 1378 5 incomplete-splice_match AK2 ENST00000548033.5 936 6 15146 -556 -4 197 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCTGTTGTGGCATTT 316 FALSE NA NA TTTAAA -7 NA NA NA 10 NA PB.549.44 chr1 - 1106 2 incomplete-splice_match AK2 ENST00000548033.5 936 6 23440 -556 -113 197 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.696427 0.671768 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCTGTTGTGGCATTT 8610 FALSE NA NA AATGAA -24 NA NA NA 18 NA PB.549.46 chr1 - 994 2 incomplete-splice_match AK2 ENST00000548033.5 936 6 23552 -556 -1 197 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.391864 0.530438 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCTGTTGTGGCATTT 8722 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.549.48 chr1 - 1479 7 full-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 38 2080 -1 53 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 69 18.002970 1.255344 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGATTGTCCTTTCCATTC 86 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 69 NA PB.549.49 chr1 - 1104 4 incomplete-splice_match AK2 ENST00000548033.5 936 6 15393 -398 243 39 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAGCTATGTCATCCAAAGAT 563 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.549.51 chr1 - 1003 7 full-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 29 2565 9 -32 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAGGAATCGGGTTTTCATT 77 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.549.52 chr1 - 887 6 full-splice_match AK2 ENST00000672715.1 5970 6 30 5053 -9 5 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.913689 0.592586 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGCGTGTGTGCTACTCTCAT 78 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.549.54 chr1 - 994 7 full-splice_match AK2 ENST00000550338.5 886 7 54 -162 -4 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 26 6.783728 0.831468 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCTTTGGCGTGTGTGCTAC 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 26 NA PB.549.55 chr1 - 793 5 full-splice_match AK2 ENST00000354858.11 5059 5 113 4153 -5 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCTTTGGCGTGTGTGCTAC -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.549.56 chr1 - 794 5 full-splice_match AK2 ENST00000480134.5 811 5 16 1 2 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 48 12.523805 1.097736 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCTTTGGCGTGTGTGCTAC 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 48 NA PB.549.57 chr1 - 934 6 full-splice_match AK2 ENST00000672715.1 5970 6 -24 5060 4 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 668 174.289627 2.241271 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCTTTGGCGTGTGTGCTA 24 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 668 NA PB.549.58 chr1 - 763 5 incomplete-splice_match AK2 ENST00000550338.5 886 7 12334 -161 -2865 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCTTTGGCGTGTGTGCTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.549.63 chr1 - 1043 5 full-splice_match AK2 ENST00000487289.1 920 5 -17 -106 2 106 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATATTCATTTTCTTTTCAAA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.549.64 chr1 - 908 5 full-splice_match AK2 ENST00000487289.1 920 5 -12 24 7 -24 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATGAGGTTGAACATCTTTT 75 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.553.1 chr1 - 3243 6 novel_in_catalog TRIM62 novel 3817 5 NA NA 0 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGCCAGTTCCATTCATTTT 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.553.3 chr1 - 3811 5 full-splice_match TRIM62 ENST00000291416.10 3817 5 0 6 0 -6 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 23 6.000990 0.778223 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TCAGTAGCCAGTTCCATTCA 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 23 NA PB.554.1 chr1 + 3061 8 novel_in_catalog ZNF362 novel 3187 9 NA NA 0 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GTGGCGGTGGTGTTTGGCGT -34 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 6 NA PB.554.3 chr1 + 3175 9 full-splice_match ZNF362 ENST00000539719.6 3187 9 13 -1 13 1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TGGCGGTGGTGTTTGGCGTG -21 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.554.5 chr1 + 2744 6 incomplete-splice_match ZNF362 ENST00000373428.5 2936 8 5861 2 -3914 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GGGTGGCGGTGGTGTTTGGC NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.555.1 chr1 - 4124 15 novel_in_catalog PHC2 novel 3993 15 NA NA 215 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TCTCTTTGGTGCCTTTCTCC 3286 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.555.2 chr1 - 2250 6 incomplete-splice_match PHC2 ENST00000373418.7 2550 7 15604 0 975 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TCTCTTTGGTGCCTTTCTCC NA FALSE NA NA AAAACA -15 NA NA NA 5 NA PB.555.3 chr1 - 1579 2 incomplete-splice_match PHC2 ENST00000373418.7 2550 7 20831 0 6202 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TCTCTTTGGTGCCTTTCTCC 3218 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.555.4 chr1 - 1659 2 incomplete-splice_match PHC2 ENST00000373418.7 2550 7 20751 0 6122 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.652776 0.562623 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TCTCTTTGGTGCCTTTCTCC 3138 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.555.9 chr1 - 2102 6 incomplete-splice_match PHC2 ENST00000373418.7 2550 7 15751 1 1122 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GTCTCTTTGGTGCCTTTCTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.555.10 chr1 - 1944 5 incomplete-splice_match PHC2 ENST00000373418.7 2550 7 17594 1 2965 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GTCTCTTTGGTGCCTTTCTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.555.11 chr1 - 1748 3 incomplete-splice_match PHC2 ENST00000373418.7 2550 7 19737 1 5108 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GTCTCTTTGGTGCCTTTCTC 2124 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.555.14 chr1 - 2035 5 incomplete-splice_match PHC2 ENST00000373418.7 2550 7 17502 2 2873 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TGTCTCTTTGGTGCCTTTCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.555.15 chr1 - 1467 1 full-splice_match RN7SKP16 ENST00000410180.1 299 1 -1077 -91 -1077 91 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA NA NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAACAAACAAAAAAAACTTC 9717 FALSE NA NA AATGAA -33 NA NA NA 2 NA PB.556.1 chr1 + 880 2 novel_not_in_catalog PHC2-AS1 novel 490 3 NA NA -296 2859 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGATGTATTGAGATATAT NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.561.1 chr1 + 1351 2 full-splice_match GJB5 ENST00000338513.1 1355 2 3 1 3 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTCCAGGTGCCCTCTGGTTG -15 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.563.1 chr1 - 2552 2 full-splice_match SMIM12 ENST00000521580.3 5694 2 -27 3169 -21 1519 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.174602 0.620615 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAATAGTAAATGTCATTT -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.563.3 chr1 - 1208 2 full-splice_match SMIM12 ENST00000423898.1 897 2 -1 -310 -1 11 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 35 9.131941 0.960563 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAATCTTATCATCCAGGTGG 7911 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 35 NA PB.563.4 chr1 - 1056 2 full-splice_match SMIM12 ENST00000521580.3 5694 2 -46 4684 -40 4 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 245 63.923588 1.805661 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AATGATCGAATCTTATCATC 7834 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 245 NA PB.563.7 chr1 - 1921 2 novel_not_in_catalog SMIM12 novel 2817 2 NA NA -43 2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATAATGATCGAATCTTATCA 7831 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.565.1 chr1 - 899 3 full-splice_match TMEM35B ENST00000373337.3 922 3 24 -1 24 1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 296 77.230133 1.887787 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTCATGTCTCTTTTGCCTCA -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 296 NA PB.566.1 chr1 + 2013 2 full-splice_match GJB3 ENST00000373366.3 2192 2 178 1 178 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACAGGTTGGCTCTGTCTCTG 180 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.567.2 chr1 - 5373 14 novel_in_catalog ZMYM6 novel 5122 16 NA NA -7993 -809 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TGTTGAGGAATTTAATAATT NA FALSE NA NA AAAAAG -17 NA NA NA 2 NA PB.567.3 chr1 - 2964 8 incomplete-splice_match ZMYM6 ENST00000357182.9 5122 16 20983 817 1494 -817 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCCCTTTTTGTTGAGGAATT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.567.5 chr1 - 3099 16 full-splice_match ZMYM6 ENST00000357182.9 5122 16 14 2009 4 -2009 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGAATTGGAAACATTGTGTT 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.568.1 chr1 + 4192 10 full-splice_match ZMYM1 ENST00000359858.9 4161 10 -37 6 -34 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATCAAATGTTTTGATCTTTC NA FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.568.2 chr1 + 2916 10 novel_not_in_catalog ZMYM1 novel 3055 11 NA NA -11 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AGAAAAGAAGAAAAATTCAG NA FALSE NA NA TTTAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.568.7 chr1 + 2936 10 full-splice_match ZMYM1 ENST00000359858.9 4161 10 2 1223 1 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AGAAAAGAAGAAAAATTCAG -7 TRUE NA NA TTTAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.568.9 chr1 + 3509 10 full-splice_match ZMYM1 ENST00000359858.9 4161 10 6 646 0 -411 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 CAATGAAATTGTGGAAAAGT -3 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.568.10 chr1 + 2778 9 incomplete-splice_match ZMYM1 ENST00000373330.1 4203 11 14625 1223 777 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AGAAAAGAAGAAAAATTCAG NA FALSE NA NA TTTAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.569.1 chr1 - 1283 4 full-splice_match SFPQ ENST00000485365.1 693 4 -590 0 -590 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TCCTTTGGTTTTGTTTTTGT 9803 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.569.2 chr1 - 4780 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 -1948 3 -987 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 9406 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 4 NA PB.569.3 chr1 - 3657 2 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000485365.1 693 4 722 1 -239 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 9941 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.569.4 chr1 - 3615 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 -783 3 -84 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 9517 FALSE NA NA TATAAA -8 NA NA NA 4 NA PB.569.5 chr1 - 3336 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 -504 3 195 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 9796 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.569.6 chr1 - 2616 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 216 3 216 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 8918 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.569.7 chr1 - 2497 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 335 3 335 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 9037 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.569.8 chr1 - 2038 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 794 3 -605 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.391864 0.530438 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 9496 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.569.9 chr1 - 1815 4 full-splice_match SFPQ ENST00000490668.5 434 4 -1382 1 -1120 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 9273 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.569.10 chr1 - 1611 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 1221 3 -178 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 9923 FALSE NA NA AATACA -42 NA NA NA 5 NA PB.569.11 chr1 - 1602 4 full-splice_match SFPQ ENST00000490668.5 434 4 -1169 1 -907 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 9486 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.569.12 chr1 - 1416 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 1416 3 17 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.696427 0.671768 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 5313 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.569.13 chr1 - 1128 3 full-splice_match SFPQ ENST00000466213.5 1431 3 302 1 161 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 5598 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.569.14 chr1 - 886 3 full-splice_match SFPQ ENST00000466213.5 1431 3 544 1 403 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 5840 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.569.15 chr1 - 630 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 2202 3 -307 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 6099 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.569.16 chr1 - 4926 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 -2095 4 -1134 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCTTTGGTTTTGTTTTT 9259 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.569.17 chr1 - 5282 3 full-splice_match SFPQ ENST00000466213.5 1431 3 -3853 2 -1493 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCTTTGGTTTTGTTTTT 8900 FALSE NA NA AATAGA -29 NA NA NA 2 NA PB.569.18 chr1 - 3834 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 -1003 4 -42 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCTTTGGTTTTGTTTTT 9872 FALSE NA NA AAAACA -42 NA NA NA 5 NA PB.569.19 chr1 - 3189 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 -358 4 341 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCTTTGGTTTTGTTTTT 9942 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.569.20 chr1 - 3092 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 -261 4 -261 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCTTTGGTTTTGTTTTT 9919 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.569.21 chr1 - 2724 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 107 4 107 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCTTTGGTTTTGTTTTT 8809 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.569.22 chr1 - 2414 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 417 4 417 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCTTTGGTTTTGTTTTT 9119 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.569.23 chr1 - 2243 4 full-splice_match SFPQ ENST00000485365.1 693 4 -1552 2 -1552 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCTTTGGTTTTGTTTTT 9986 FALSE NA NA ACTAAA -3 NA NA NA 2 NA PB.569.24 chr1 - 2278 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 553 4 553 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCTTTGGTTTTGTTTTT 9255 FALSE NA NA AAGAAA -20 NA NA NA 6 NA PB.569.25 chr1 - 1917 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 914 4 -485 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCTTTGGTTTTGTTTTT 9616 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.569.26 chr1 - 1844 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 987 4 -412 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCTTTGGTTTTGTTTTT 9689 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.569.27 chr1 - 1740 3 full-splice_match SFPQ ENST00000466213.5 1431 3 -311 2 -311 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCTTTGGTTTTGTTTTT 9790 FALSE NA NA TTTAAA -31 NA NA NA 9 NA PB.569.28 chr1 - 1737 2 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000466745.5 662 4 140 2 140 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCTTTGGTTTTGTTTTT 5577 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.569.29 chr1 - 1243 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 1588 4 48 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCTTTGGTTTTGTTTTT 5485 FALSE NA NA ACTAAA -6 NA NA NA 11 NA PB.569.30 chr1 - 980 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 1851 4 311 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCTTTGGTTTTGTTTTT 5748 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.569.31 chr1 - 922 4 full-splice_match SFPQ ENST00000490668.5 434 4 -490 2 -228 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCTTTGGTTTTGTTTTT 9686 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.569.32 chr1 - 1048 4 full-splice_match SFPQ ENST00000490668.5 434 4 -619 5 -357 -5 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTATCCTTTGGTTTTGTT 9557 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.569.33 chr1 - 736 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 2092 7 -417 -5 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTATCCTTTGGTTTTGTT 5989 FALSE NA NA TTTAAA -13 NA NA NA 6 NA PB.569.35 chr1 - 1532 2 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 6100 171 997 -171 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CTAAGAGCTAGTGGTGATTG 6099 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.569.46 chr1 - 3074 10 full-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 0 666 0 -666 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.130951 0.495676 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGTCTTTTCATGTATTCAA -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.569.47 chr1 - 2543 10 full-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 531 666 531 -666 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGTCTTTTCATGTATTCAA 530 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.569.48 chr1 - 2067 9 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 1692 673 -879 -673 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.435514 0.646944 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACATGAAGTCTTTTCATG 1691 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.569.49 chr1 - 1907 8 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 2204 666 -367 -666 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGTCTTTTCATGTATTCAA 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.569.50 chr1 - 1826 8 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 2285 666 -286 -666 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGTCTTTTCATGTATTCAA 2284 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.569.51 chr1 - 1629 7 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 2582 666 11 -666 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.957339 0.695249 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGTCTTTTCATGTATTCAA 2581 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.569.52 chr1 - 1252 4 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 5084 666 -19 -666 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 59 15.393844 1.187347 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGTCTTTTCATGTATTCAA 5083 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 59 NA PB.569.56 chr1 - 2298 10 full-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 769 673 769 -673 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACATGAAGTCTTTTCATG 768 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.569.57 chr1 - 2199 10 full-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 868 673 868 -673 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.435514 0.646944 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACATGAAGTCTTTTCATG 867 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.569.58 chr1 - 1752 8 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 2352 673 -219 -673 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.130951 0.495676 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACATGAAGTCTTTTCATG 2351 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.569.60 chr1 - 1403 6 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 3916 673 -1187 -673 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 37 9.653767 0.984697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACATGAAGTCTTTTCATG 3915 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 37 NA PB.569.61 chr1 - 1077 2 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 6053 673 950 -673 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 27 7.044641 0.847859 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACATGAAGTCTTTTCATG 6052 FALSE NA NA AAAACA -11 NA NA NA 27 NA PB.569.62 chr1 - 1885 9 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 1730 817 -841 -817 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATGATCTATCCTTTACTTGA 1729 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.569.63 chr1 - 981 3 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 5924 818 821 -818 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATGATCTATCCTTTACTTG 5923 FALSE NA NA AAGAAA -11 NA NA NA 5 NA PB.569.64 chr1 - 1355 8 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 2248 1174 -323 -1174 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAACTTTGCCATTCATGCTT 2247 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.569.65 chr1 - 2023 10 full-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 537 1180 537 -1180 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GATCTTCAACTTTGCCATTC 536 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.569.66 chr1 - 2554 10 full-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 0 1186 0 -1186 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.391864 0.530438 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATATTGATCTTCAACTTTG -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.569.67 chr1 - 1657 10 full-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 897 1186 897 -1186 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 16 4.174602 0.620615 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATATTGATCTTCAACTTTG 896 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.569.68 chr1 - 1549 9 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 1697 1186 -874 -1186 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.652776 0.562623 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATATTGATCTTCAACTTTG 1696 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.569.69 chr1 - 1456 9 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 1790 1186 -781 -1186 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.479165 0.738714 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATATTGATCTTCAACTTTG 1789 FALSE NA NA GATAAA -27 NA NA NA 21 NA PB.569.70 chr1 - 1291 8 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 2300 1186 -271 -1186 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.696427 0.671768 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATATTGATCTTCAACTTTG -20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.569.71 chr1 - 968 6 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 3838 1186 -1265 -1186 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 35 9.131941 0.960563 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATATTGATCTTCAACTTTG 3837 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 35 NA PB.569.72 chr1 - 844 5 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 4060 1186 -1043 -1186 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 28 7.305553 0.863653 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATATTGATCTTCAACTTTG 4059 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 28 NA PB.569.73 chr1 - 579 2 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 6038 1186 935 -1186 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATATTGATCTTCAACTTTG 6037 FALSE NA NA AAAACA -26 NA NA NA 4 NA PB.569.74 chr1 - 2245 10 full-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 308 1187 308 -1187 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAATATTGATCTTCAACTTT 307 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.569.75 chr1 - 1832 10 full-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 721 1187 721 -1187 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.391864 0.530438 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAATATTGATCTTCAACTTT 720 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.569.76 chr1 - 1177 8 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 2413 1187 -158 -1187 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 30 7.827378 0.893616 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAATATTGATCTTCAACTTT 2412 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 30 NA PB.569.77 chr1 - 702 4 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 5113 1187 10 -1187 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAATATTGATCTTCAACTTT 5112 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.569.78 chr1 - 1097 7 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 2592 1188 21 -1188 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.913689 0.592586 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATAATATTGATCTTCAACTT 2591 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.569.80 chr1 - 1814 7 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 0 5134 0 -5134 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAGAGAGGAAGAGATGATGA -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.569.81 chr1 - 699 4 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 1614 6337 -957 -6337 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAACATGAAAGATGCA -11 TRUE NA NA AAAAAG -41 NA NA NA 7 NA PB.571.1 chr1 + 789 4 full-splice_match ZMYM4 ENST00000441447.1 466 4 -344 21 -20 -21 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATGAAAATGAAATACAAAT -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.571.2 chr1 + 723 3 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000314607.11 7366 30 -12 62846 -12 -17 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.652776 0.562623 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAATGAAATACAAATTCAA -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.571.4 chr1 + 542 4 full-splice_match ZMYM4 ENST00000441447.1 466 4 -97 21 -97 -21 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATGAAAATGAAATACAAAT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.571.5 chr1 + 5236 31 novel_in_catalog ZMYM4 novel 7366 30 NA NA -11 -1879 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAAGATAGTGAAGTGGT -7 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.571.10 chr1 + 1450 1 full-splice_match RPL5P4 ENST00000434805.1 886 1 -508 -56 -508 56 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA NA NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AACAACAACAACAAAAAACA NA FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.571.11 chr1 + 4697 28 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000314607.11 7366 30 90582 1880 -2414 -1880 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 TAAAAAAGATAGTGAAGTGG NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.571.15 chr1 + 3417 20 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000314607.11 7366 30 117376 1880 -6595 -1880 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 TAAAAAAGATAGTGAAGTGG NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.571.16 chr1 + 2663 16 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000314607.11 7366 30 121289 1879 -2682 -1879 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAAGATAGTGAAGTGGT NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.571.19 chr1 + 2543 15 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000314607.11 7366 30 123522 1879 -449 -1879 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAAGATAGTGAAGTGGT NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.571.20 chr1 + 2367 13 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000314607.11 7366 30 124901 1880 930 -1880 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 TAAAAAAGATAGTGAAGTGG NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.571.21 chr1 + 1882 9 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000457946.1 6003 24 37172 1880 -5967 -1880 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 TAAAAAAGATAGTGAAGTGG 4683 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.571.22 chr1 + 3514 9 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000457946.1 6003 24 37300 120 -5839 -120 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTTGATGGGTGAGTTCTTC 4811 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.571.26 chr1 + 3316 7 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000457946.1 6003 24 43386 116 247 -116 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GATGGGTGAGTTCTTCTTCT NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.571.27 chr1 + 2817 7 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000457946.1 6003 24 43395 606 256 -606 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGTGTAATAGTCCCCACTA NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.571.28 chr1 + 1478 7 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000457946.1 6003 24 43461 1879 322 -1879 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAAGATAGTGAAGTGGT NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 6 NA PB.571.29 chr1 + 2687 6 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000457946.1 6003 24 43709 600 570 -600 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AATAGTCCCCACTATACGAA NA FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.571.31 chr1 + 1222 5 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000457946.1 6003 24 46433 1880 3294 -1880 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 TAAAAAAGATAGTGAAGTGG NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 5 NA PB.571.33 chr1 + 2875 4 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000457946.1 6003 24 52356 116 9217 -116 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GATGGGTGAGTTCTTCTTCT NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.571.34 chr1 + 2679 3 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000457946.1 6003 24 53929 121 10790 -121 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TATTTGATGGGTGAGTTCTT NA FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.571.35 chr1 + 921 3 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000457946.1 6003 24 53929 1879 10790 -1879 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAAGATAGTGAAGTGGT NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 4 NA PB.571.36 chr1 + 797 2 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000457946.1 6003 24 56781 1879 13642 -1879 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAAGATAGTGAAGTGGT NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.571.37 chr1 + 2023 2 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000457946.1 6003 24 56828 606 13689 -606 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGTGTAATAGTCCCCACTA NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.572.5 chr1 - 4164 21 full-splice_match KIAA0319L ENST00000325722.8 4777 21 0 613 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.572.6 chr1 - 1283 4 incomplete-splice_match KIAA0319L ENST00000373266.8 2377 12 11679 0 227 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 4409 FALSE NA NA AAGAAA -25 NA NA NA 4 NA PB.572.7 chr1 - 1063 2 incomplete-splice_match KIAA0319L ENST00000373266.8 2377 12 13575 0 2123 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 6305 FALSE NA NA AAAACA -35 NA NA NA 2 NA PB.572.9 chr1 - 2887 16 incomplete-splice_match KIAA0319L ENST00000325722.8 4777 21 86479 614 -18 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.572.15 chr1 - 1862 9 incomplete-splice_match KIAA0319L ENST00000373266.8 2377 12 2931 164 -1770 -164 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAATAAAAAAAAAAATTA 2938 FALSE NA NA AAAAAG -39 NA NA NA 2 NA PB.572.19 chr1 - 1035 4 incomplete-splice_match KIAA0319L ENST00000373266.8 2377 12 11763 164 311 -164 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAATAAAAAAAAAAATTA 4493 FALSE NA NA AAAAAG -33 NA NA NA 2 NA PB.572.27 chr1 - 2274 13 incomplete-splice_match KIAA0319L ENST00000325722.8 4777 21 6 18143 6 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.391864 0.530438 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAGAAGGTACCTCTCTGCC -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.572.28 chr1 - 2158 13 incomplete-splice_match KIAA0319L ENST00000426982.6 3213 21 31 16670 -12 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAGAAGGTACCTCTCTGCC 36 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.572.29 chr1 - 2122 13 novel_in_catalog KIAA0319L novel 2171 13 NA NA 3 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAGAAGGTACCTCTCTGCC -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.573.1 chr1 + 3421 8 full-splice_match NCDN ENST00000356090.8 3433 8 8 4 1 3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 38 9.914679 0.996279 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGAAGCCTCCTGCGTGGTCT -15 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 38 NA PB.573.2 chr1 + 3678 7 full-splice_match NCDN ENST00000373243.7 3698 7 15 5 15 2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAGAAGCCTCCTGCGTGGTC -1 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 5 NA PB.573.3 chr1 + 3053 5 incomplete-splice_match NCDN ENST00000373243.7 3698 7 2598 8 1891 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GACGAGAAGCCTCCTGCGTG 11 TRUE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.573.4 chr1 + 2400 5 incomplete-splice_match NCDN ENST00000373243.7 3698 7 3252 7 -1417 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACGAGAAGCCTCCTGCGTGG 471 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 4 NA PB.573.5 chr1 + 2279 5 incomplete-splice_match NCDN ENST00000373243.7 3698 7 3376 4 -1293 3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGAAGCCTCCTGCGTGGTCT 595 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 4 NA PB.573.6 chr1 + 1877 3 incomplete-splice_match NCDN ENST00000373243.7 3698 7 5443 4 774 3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGAAGCCTCCTGCGTGGTCT 2662 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 7 NA PB.573.7 chr1 + 1631 2 incomplete-splice_match NCDN ENST00000373243.7 3698 7 6026 7 1357 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACGAGAAGCCTCCTGCGTGG 3245 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.574.1 chr1 - 878 3 full-splice_match TFAP2E-AS1 ENST00000444348.2 902 3 13 11 13 -5 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.130951 0.495676 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACACATCAATGGATGGTG 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.575.7 chr1 - 2399 6 full-splice_match PSMB2 ENST00000373237.4 4426 6 -17 2044 -17 1049 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATTTGGGTGTCTTATACA -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.575.16 chr1 - 2158 6 full-splice_match PSMB2 ENST00000373237.4 4426 6 -12 2280 -12 813 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATGTGTGTTTCAGAATGT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.575.18 chr1 - 1740 7 novel_not_in_catalog PSMB2 novel 4426 6 NA NA 7 813 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATGTGTGTTTCAGAATGT 14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.575.19 chr1 - 1693 7 novel_not_in_catalog PSMB2 novel 4426 6 NA NA 4 813 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATGTGTGTTTCAGAATGT 11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.575.23 chr1 - 1600 7 novel_not_in_catalog PSMB2 novel 4426 6 NA NA 7 813 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATGTGTGTTTCAGAATGT 14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.575.31 chr1 - 1151 6 full-splice_match PSMB2 ENST00000373237.4 4426 6 17 3258 17 -165 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGAGCTGGGTGTGGTGGCT 24 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.575.32 chr1 - 864 6 full-splice_match PSMB2 ENST00000373237.4 4426 6 -37 3599 -37 -506 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 1234 321.966156 2.507810 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GAGCCCTCTGGTCCAGGTCT -30 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 1234 NA PB.575.33 chr1 - 767 6 novel_not_in_catalog PSMB2 novel 4426 6 NA NA -14 -505 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCCCTCTGGTCCAGGTCTC -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.575.34 chr1 - 795 6 full-splice_match PSMB2 ENST00000373237.4 4426 6 31 3600 31 -507 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 134 34.962288 1.543600 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGAGCCCTCTGGTCCAGGTC 38 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 134 NA PB.575.35 chr1 - 644 5 incomplete-splice_match PSMB2 ENST00000373237.4 4426 6 5093 3598 -4896 -505 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCCCTCTGGTCCAGGTCTC 5100 FALSE NA NA AAGAAA -36 NA NA NA 8 NA PB.575.36 chr1 - 583 5 incomplete-splice_match PSMB2 ENST00000373237.4 4426 6 5154 3598 -4835 -505 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCCCTCTGGTCCAGGTCTC 15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.575.37 chr1 - 697 5 novel_in_catalog PSMB2 novel 4426 6 NA NA 7 -506 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GAGCCCTCTGGTCCAGGTCT 14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.575.38 chr1 - 910 7 novel_not_in_catalog PSMB2 novel 4426 6 NA NA -14 -507 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGAGCCCTCTGGTCCAGGTC -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.575.39 chr1 - 1368 6 full-splice_match PSMB2 ENST00000373237.4 4426 6 -544 3602 -544 -509 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTGAGCCCTCTGGTCCAGG NA FALSE NA NA AATACA -42 NA NA NA 3 NA PB.576.1 chr1 - 2741 2 full-splice_match C1orf216 ENST00000270815.5 2628 2 -112 -1 -102 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTTCTTGAGTATGTGTTTT 7154 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.576.5 chr1 - 2968 2 full-splice_match C1orf216 ENST00000270815.5 2628 2 -347 7 -337 -7 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAATTACATTTCTTGAGTA 6919 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.576.6 chr1 - 2835 2 full-splice_match C1orf216 ENST00000270815.5 2628 2 -214 7 -204 -7 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAATTACATTTCTTGAGTA 7052 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.576.7 chr1 - 2593 2 full-splice_match C1orf216 ENST00000270815.5 2628 2 28 7 28 -7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 36 9.392854 0.972798 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAATTACATTTCTTGAGTA 18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 36 NA PB.577.5 chr1 - 3305 14 incomplete-splice_match CLSPN ENST00000373220.7 3977 24 20431 -1435 -723 1311 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATTGCCATCATTCTCCATT NA FALSE NA NA AAGAAA -2 NA NA NA 2 NA PB.577.7 chr1 - 1376 11 incomplete-splice_match CLSPN ENST00000373220.7 3977 24 20396 1669 -758 -1669 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 GAAGAAGAAGAAGAAATTGG NA FALSE NA NA AGTAAA -32 NA NA NA 2 NA PB.577.8 chr1 - 1071 9 incomplete-splice_match CLSPN ENST00000373220.7 3977 24 21906 1669 752 -1669 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 GAAGAAGAAGAAGAAATTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.581.4 chr1 + 7446 19 full-splice_match AGO1 ENST00000674304.1 7478 19 24 8 24 -8 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTCTAAAGTGCGGTCTTT -4 TRUE NA NA TATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.583.1 chr1 - 2212 11 incomplete-splice_match CLSPN ENST00000318121.8 8512 25 -16 17640 -16 -2787 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 60 15.654757 1.194646 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAGAAAATAATGATGGCAG -16 TRUE NA NA GGGGCT -9 NA NA NA 60 NA PB.583.9 chr1 - 1396 8 incomplete-splice_match CLSPN ENST00000318121.8 8512 25 6732 17675 6682 -2822 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAGAAATAGAAACAAAAGAT 6732 FALSE NA NA AAAAAG -33 NA NA NA 8 NA PB.583.10 chr1 - 1234 6 incomplete-splice_match CLSPN ENST00000318121.8 8512 25 7905 17675 7855 -2822 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAGAAATAGAAACAAAAGAT 7905 FALSE NA NA AAGAAA -44 NA NA NA 11 NA PB.583.11 chr1 - 1133 5 incomplete-splice_match CLSPN ENST00000318121.8 8512 25 8799 17675 8749 -2822 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAGAAATAGAAACAAAAGAT 8799 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 6 NA PB.583.14 chr1 - 1893 9 incomplete-splice_match CLSPN ENST00000520551.1 4010 25 4674 14884 4674 -4324 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 GAGAAAGAAGAGGAGGAGGA 4724 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.583.15 chr1 - 2077 10 incomplete-splice_match CLSPN ENST00000520551.1 4010 25 -39 14893 0 -4333 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 GAAGAGGAGGAGAAAGAAGA 11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.583.16 chr1 - 778 3 incomplete-splice_match CLSPN ENST00000520551.1 4010 25 9210 14893 9210 -4333 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 GAAGAGGAGGAGAAAGAAGA 9260 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.583.17 chr1 - 1775 8 incomplete-splice_match CLSPN ENST00000520551.1 4010 25 5282 14897 5282 -4337 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AGAGGAAGAGGAGGAGAAAG 5332 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.584.3 chr1 + 3623 19 full-splice_match AGO3 ENST00000373191.9 19660 19 0 16037 0 1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATTCTACTTTTATTTTGCA -8 TRUE NA NA TATAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.584.4 chr1 + 3240 19 full-splice_match AGO3 ENST00000373191.9 19660 19 25 16395 25 -134 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAATACACACCTTCATG 17 TRUE NA NA AGTAAA -21 NA NA NA 11 NA PB.584.6 chr1 + 1554 6 incomplete-splice_match AGO3 ENST00000373191.9 19660 19 163 67423 10 21668 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAATAAAAATAAAAATAA 34 TRUE NA NA GATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.584.7 chr1 + 3230 19 full-splice_match AGO3 ENST00000373191.9 19660 19 169 16261 16 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATATATATCTAGATCTGGAT 40 TRUE NA NA AATATA -21 NA NA NA 2 NA PB.584.14 chr1 + 1422 8 incomplete-splice_match AGO3 ENST00000634486.1 3599 21 96174 94 -15995 -94 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AGAATTATGTGTGCAAAAAA NA FALSE NA NA AATACA -31 NA NA NA 2 NA PB.589.1 chr1 + 1518 10 full-splice_match TEKT2 ENST00000207457.8 1490 10 -29 1 -29 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGGCCGGCTGTTCTCTGCCC 72 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.591.1 chr1 + 1665 6 full-splice_match ADPRS ENST00000373178.5 1651 6 -15 1 -15 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 318 82.970207 1.918922 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCACTGTTTCTTGTTTCTC -17 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 318 NA PB.591.2 chr1 + 1548 5 novel_in_catalog ADPRS novel 1651 6 NA NA 5 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCACTGTTTCTTGTTTCTC 3 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 10 NA PB.591.3 chr1 + 1479 6 full-splice_match ADPRS ENST00000373178.5 1651 6 163 9 163 -9 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAATCTCACCACTGTTTCT 161 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.591.4 chr1 + 1368 5 incomplete-splice_match ADPRS ENST00000373178.5 1651 6 2410 1 2410 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCACTGTTTCTTGTTTCTC 2408 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 10 NA PB.591.5 chr1 + 1140 4 incomplete-splice_match ADPRS ENST00000373178.5 1651 6 2915 1 2915 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCACTGTTTCTTGTTTCTC 2913 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 9 NA PB.591.6 chr1 + 990 3 incomplete-splice_match ADPRS ENST00000373178.5 1651 6 3149 1 3149 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCACTGTTTCTTGTTTCTC 3147 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.592.1 chr1 + 3364 17 novel_in_catalog MAP7D1 novel 3372 17 NA NA -21 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCCTGCCTGTTCTTGGAG -20 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.592.2 chr1 + 3256 16 full-splice_match MAP7D1 ENST00000316156.8 3456 16 198 2 3 -2 alternative_5end TRUE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCCTGCCTGTTCTTGGAG 4 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 5 NA PB.592.3 chr1 + 3160 17 novel_in_catalog MAP7D1 novel 3238 18 NA NA 3 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCCTGCCTGTTCTTGGAG 4 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 6 NA PB.592.7 chr1 + 3349 17 full-splice_match MAP7D1 ENST00000474796.2 3372 17 20 3 5 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 34 8.871029 0.947974 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CAATCCTGCCTGTTCTTGGA 21 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 34 NA PB.592.8 chr1 + 3253 18 full-splice_match MAP7D1 ENST00000373150.8 3238 18 -17 2 6 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.913689 0.592586 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCCTGCCTGTTCTTGGAG 22 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 15 NA PB.592.10 chr1 + 2723 15 incomplete-splice_match MAP7D1 ENST00000474796.2 3372 17 15351 2 -457 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCCTGCCTGTTCTTGGAG 353 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.592.11 chr1 + 2303 12 incomplete-splice_match MAP7D1 ENST00000316156.8 3456 16 17473 2 1470 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCCTGCCTGTTCTTGGAG 884 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.592.12 chr1 + 2150 12 incomplete-splice_match MAP7D1 ENST00000373150.8 3238 18 20017 2 -502 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCCTGCCTGTTCTTGGAG 3661 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.592.13 chr1 + 2106 11 incomplete-splice_match MAP7D1 ENST00000373150.8 3238 18 20157 2 -362 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCCTGCCTGTTCTTGGAG 3801 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.592.14 chr1 + 1953 11 incomplete-splice_match MAP7D1 ENST00000373150.8 3238 18 20310 2 -209 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCCTGCCTGTTCTTGGAG 3954 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 5 NA PB.592.15 chr1 + 1583 9 incomplete-splice_match MAP7D1 ENST00000373150.8 3238 18 21825 2 -388 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCCTGCCTGTTCTTGGAG 520 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 10 NA PB.592.16 chr1 + 1464 8 incomplete-splice_match MAP7D1 ENST00000373148.5 1797 10 890 -15 -52 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCCTGCCTGTTCTTGGAG 85 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.592.17 chr1 + 1352 8 incomplete-splice_match MAP7D1 ENST00000373148.5 1797 10 1002 -15 60 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCCTGCCTGTTCTTGGAG 197 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 5 NA PB.592.19 chr1 + 1145 7 incomplete-splice_match MAP7D1 ENST00000373148.5 1797 10 1297 -15 -255 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 27 7.044641 0.847859 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCCTGCCTGTTCTTGGAG 286 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 27 NA PB.592.20 chr1 + 974 5 incomplete-splice_match MAP7D1 ENST00000373148.5 1797 10 1801 -15 249 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.652776 0.562623 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCCTGCCTGTTCTTGGAG 136 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 14 NA PB.592.21 chr1 + 886 3 incomplete-splice_match MAP7D1 ENST00000487114.1 890 4 644 -532 644 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCCTGCCTGTTCTTGGAG 531 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 5 NA PB.592.22 chr1 + 779 2 incomplete-splice_match MAP7D1 ENST00000487114.1 890 4 868 -532 868 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCCTGCCTGTTCTTGGAG 755 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 7 NA PB.593.1 chr1 - 1758 4 novel_in_catalog TRAPPC3 novel 1282 5 NA NA -5 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCATGTCCTGTTTTCTTT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.593.2 chr1 - 1357 5 full-splice_match TRAPPC3 ENST00000373163.5 951 5 -35 -371 0 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCATGTCCTGTTTTCTTT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.593.3 chr1 - 1323 5 full-splice_match TRAPPC3 ENST00000373162.5 1056 5 206 -473 -4 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATCCCAATCATGTCCTGT 6660 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.593.4 chr1 - 1294 5 full-splice_match TRAPPC3 ENST00000373166.8 1282 5 -14 2 -3 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 649 169.332275 2.228740 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCATGTCCTGTTTTCTTT -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 649 NA PB.593.5 chr1 - 1292 5 novel_not_in_catalog TRAPPC3 novel 1282 5 NA NA -7 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCATGTCCTGTTTTCTTT -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.593.6 chr1 - 1304 5 full-splice_match TRAPPC3 ENST00000616395.4 1336 5 28 4 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCATGTCCTGTTTTCTTT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.593.7 chr1 - 1075 3 full-splice_match TRAPPC3 ENST00000616074.4 1114 3 28 11 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATCCCAATCATGTCCTGT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.593.8 chr1 - 1032 3 incomplete-splice_match TRAPPC3 ENST00000373166.8 1282 5 9667 2 1179 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.479165 0.738714 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCATGTCCTGTTTTCTTT 9667 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 21 NA PB.593.10 chr1 - 1366 5 full-splice_match TRAPPC3 ENST00000373166.8 1282 5 -93 9 -65 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATCCCAATCATGTCCTGT 6372 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.593.11 chr1 - 897 2 full-splice_match TRAPPC3 ENST00000469757.1 221 2 5 -681 -5 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATCCCAATCATGTCCTGT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.593.12 chr1 - 1517 5 full-splice_match TRAPPC3 ENST00000373162.5 1056 5 11 -472 0 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 33 8.610116 0.935009 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAATCCCAATCATGTCCTG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 33 NA PB.593.13 chr1 - 1463 3 full-splice_match TRAPPC3 ENST00000462715.1 2428 3 514 451 514 22 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACCCCATGTGTGCACATTCA 9002 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.593.14 chr1 - 895 5 full-splice_match TRAPPC3 ENST00000373162.5 1056 5 183 -22 -27 22 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACCCCATGTGTGCACATTCA 6637 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.593.15 chr1 - 822 5 full-splice_match TRAPPC3 ENST00000373166.8 1282 5 0 460 0 22 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 109 28.439474 1.453922 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACCCCATGTGTGCACATTCA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 109 NA PB.593.16 chr1 - 1294 4 novel_in_catalog TRAPPC3 novel 1282 5 NA NA 0 21 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TACCCCATGTGTGCACATTC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.593.17 chr1 - 1058 5 full-splice_match TRAPPC3 ENST00000373162.5 1056 5 11 -13 0 13 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.696427 0.671768 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTCCATTTACCCCATGTGT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.596.8 chr1 + 4413 12 full-splice_match THRAP3 ENST00000354618.10 4405 12 -12 4 -1 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAAACGGGTTCTGTTCATTG -20 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 11 NA PB.596.13 chr1 + 1998 6 incomplete-splice_match THRAP3 ENST00000354618.10 4405 12 -1 13929 -1 -2741 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AACAAAAAGGAACAGGAGTT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.596.16 chr1 + 2365 9 incomplete-splice_match THRAP3 ENST00000354618.10 4405 12 4 8718 4 2470 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAACATAAGGAGAGAGA -4 TRUE NA NA AATACA -42 NA NA NA 2 NA PB.596.25 chr1 + 3334 9 incomplete-splice_match THRAP3 ENST00000354618.10 4405 12 62658 4 -2617 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAAACGGGTTCTGTTCATTG NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.596.28 chr1 + 2386 8 incomplete-splice_match THRAP3 ENST00000469141.6 3339 13 64622 -421 -664 421 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGTTTGGGACCAAACTGCTT NA FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.596.29 chr1 + 2941 8 incomplete-splice_match THRAP3 ENST00000354618.10 4405 12 64840 4 -435 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAAACGGGTTCTGTTCATTG NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.596.31 chr1 + 2793 8 incomplete-splice_match THRAP3 ENST00000354618.10 4405 12 64989 3 -286 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAACGGGTTCTGTTCATTGT NA FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.596.34 chr1 + 2636 8 incomplete-splice_match THRAP3 ENST00000354618.10 4405 12 65145 4 -130 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAAACGGGTTCTGTTCATTG NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.596.35 chr1 + 2285 6 incomplete-splice_match THRAP3 ENST00000354618.10 4405 12 68156 4 2881 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAAACGGGTTCTGTTCATTG NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.596.37 chr1 + 2087 4 novel_not_in_catalog THRAP3 novel 4405 12 NA NA 6864 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAAACGGGTTCTGTTCATTG 590 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.596.38 chr1 + 1991 4 incomplete-splice_match THRAP3 ENST00000354618.10 4405 12 72239 3 6964 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAACGGGTTCTGTTCATTGT 690 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 3 NA PB.596.39 chr1 + 1670 2 incomplete-splice_match THRAP3 ENST00000354618.10 4405 12 77143 3 11868 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAACGGGTTCTGTTCATTGT 37 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 4 NA PB.597.1 chr1 - 809 3 full-splice_match EVA1B ENST00000490466.2 980 3 170 1 170 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTCAGTCTCTCCCTCTGTT 630 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.598.1 chr1 - 2875 6 incomplete-splice_match STK40 ENST00000373129.7 3846 12 31465 -3 6921 3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GGCCTGCGTCTCCTGCCTTC 192 FALSE NA NA AAAACA -44 NA NA NA 3 NA PB.598.3 chr1 - 2435 2 incomplete-splice_match STK40 ENST00000373129.7 3846 12 42436 0 17892 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TGTGGCCTGCGTCTCCTGCC 5670 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.598.4 chr1 - 2533 3 incomplete-splice_match STK40 ENST00000373129.7 3846 12 41921 6 17377 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AACCACTGTGGCCTGCGTCT 5155 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.598.9 chr1 - 2923 7 incomplete-splice_match STK40 ENST00000373129.7 3846 12 30617 8 6073 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GGAACCACTGTGGCCTGCGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.598.11 chr1 - 3618 11 full-splice_match STK40 ENST00000373132.4 3645 11 22 5 -14 -5 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 9 2.348213 0.370738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGGAACCACTGTGGCCTGCG 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.598.13 chr1 - 1732 11 full-splice_match STK40 ENST00000373132.4 3645 11 46 1867 1 -1867 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACCTCTGTCTCTTTAACCAT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.598.14 chr1 - 1174 7 incomplete-splice_match STK40 ENST00000373129.7 3846 12 30503 1871 5959 -1867 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACCTCTGTCTCTTTAACCAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.599.1 chr1 - 779 2 novel_not_in_catalog LSM10 novel 860 2 NA NA 7 16 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCCATTTCTCATGCAGTTGT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.599.2 chr1 - 879 2 full-splice_match LSM10 ENST00000315732.3 860 2 -11 -8 -11 8 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 277 72.272789 1.858975 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAAGTGTCTCCATTTCTCAT -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 277 NA PB.599.4 chr1 - 975 3 novel_not_in_catalog LSM10 novel 860 2 NA NA 0 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCCACCTCTAAGTGTCTCC -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.600.1 chr1 - 1450 10 full-splice_match OSCP1 ENST00000235532.9 1455 10 3 2 3 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.913689 0.592586 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GACCTTTCCCATTTTATTCT -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.600.2 chr1 - 766 5 full-splice_match OSCP1 ENST00000354267.3 767 5 -5 6 3 -6 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGAAATGCAATGTATTTAG -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.600.3 chr1 - 770 5 novel_not_in_catalog OSCP1 novel 767 5 NA NA -23 -6 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGAAATGCAATGTATTTAG 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.601.1 chr1 - 1334 8 full-splice_match MRPS15 ENST00000373116.6 953 8 13 -394 13 394 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TGAAGCTGAAGTGTGAGAAG -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.601.2 chr1 - 938 8 full-splice_match MRPS15 ENST00000373116.6 953 8 13 2 13 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 677 176.637833 2.247084 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGAGGAGAAGGAATTTATT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 677 NA PB.601.3 chr1 - 820 8 full-splice_match MRPS15 ENST00000373116.6 953 8 92 41 53 13 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.130951 0.495676 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAGAATGATAGGAGAGATGA 8384 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.601.4 chr1 - 787 6 novel_in_catalog MRPS15 novel 953 8 NA NA -12 1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CTTTCTGTCTTGAAGAATGA 8280 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.601.5 chr1 - 691 7 incomplete-splice_match MRPS15 ENST00000373116.6 953 8 503 54 464 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TCTTTCTGTCTTGAAGAATG 8795 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.601.6 chr1 - 841 7 novel_in_catalog MRPS15 novel 953 8 NA NA 2 -5 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCATTTCTTTCTGTCTTG -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.601.7 chr1 - 813 7 novel_in_catalog MRPS15 novel 953 8 NA NA -15 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTCTTTCTGTCTTGAAGA 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.601.8 chr1 - 820 8 novel_not_in_catalog MRPS15 novel 953 8 NA NA 3 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTCTTTCTGTCTTGAAGA -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.601.9 chr1 - 811 7 novel_in_catalog MRPS15 novel 953 8 NA NA 0 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTCTTTCTGTCTTGAAGA -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.601.10 chr1 - 807 7 novel_in_catalog MRPS15 novel 953 8 NA NA 13 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTCTTTCTGTCTTGAAGA -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.601.11 chr1 - 673 5 novel_in_catalog MRPS15 novel 953 8 NA NA 13 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTCTTTCTGTCTTGAAGA -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.601.12 chr1 - 529 5 incomplete-splice_match MRPS15 ENST00000373116.6 953 8 3079 57 -1602 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTCTTTCTGTCTTGAAGA 8428 FALSE NA NA GATAAA -33 NA NA NA 2 NA PB.602.1 chr1 - 3007 17 full-splice_match CSF3R ENST00000373106.6 3008 17 0 1 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 20 5.218252 0.717525 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACCTGAGTCTCTGTTATTTA 8 TRUE NA NA GGGGCT -14 NA NA NA 20 NA PB.602.2 chr1 - 2846 16 novel_not_in_catalog CSF3R novel 3008 17 NA NA 1 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACCTGAGTCTCTGTTATTT -12 TRUE NA NA GGGGCT -34 NA NA NA 2 NA PB.602.3 chr1 - 1275 6 incomplete-splice_match CSF3R ENST00000361632.8 2847 15 10325 12 -1118 -12 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTCTTGGGTGTACCTGAGT 7551 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.602.4 chr1 - 2006 11 incomplete-splice_match CSF3R ENST00000361632.8 2847 15 6943 35 -189 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTTTTTGTTGTTGTTTATA 9879 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.602.5 chr1 - 1700 8 incomplete-splice_match CSF3R ENST00000361632.8 2847 15 7891 35 -154 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTTTTTGTTGTTGTTTATA 5117 FALSE NA NA AAAAAG -10 NA NA NA 2 NA PB.602.6 chr1 - 1316 6 incomplete-splice_match CSF3R ENST00000361632.8 2847 15 10261 35 -1182 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTTTTTGTTGTTGTTTATA 7487 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.602.7 chr1 - 908 4 incomplete-splice_match CSF3R ENST00000373106.6 3008 17 -9 8979 -9 -1653 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAAAAAGAAGAAAAAAAA -1 TRUE NA NA GGGGCT -23 NA NA NA 2 NA PB.602.8 chr1 - 1075 4 full-splice_match CSF3R ENST00000526980.5 928 4 -14 -133 0 133 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAAAAAAAAAAATCAAAA 8 TRUE NA NA GGGGCT -14 NA NA NA 2 NA PB.604.1 chr1 - 1289 3 full-splice_match LINC01137 ENST00000424989.2 1419 3 128 2 82 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CAGTTATTTTTCTCTGCTAG 5422 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.604.2 chr1 - 1389 3 full-splice_match LINC01137 ENST00000424989.2 1419 3 25 5 -3 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.479165 0.738714 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCAGTTATTTTTCTCTGC -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 21 NA PB.604.3 chr1 - 1296 2 full-splice_match LINC01137 ENST00000689160.1 1306 2 5 5 -3 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCAGTTATTTTTCTCTGC -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.605.1 chr1 - 2176 8 full-splice_match MEAF6 ENST00000475828.5 1408 8 2 -770 2 10 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTTTGACTCTGGCTATTTAG 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.605.2 chr1 - 1671 4 incomplete-splice_match MEAF6 ENST00000475828.5 1408 8 12909 -762 11673 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTTTTTTTTTTTGACTCTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.605.3 chr1 - 2110 7 full-splice_match MEAF6 ENST00000296214.10 4702 7 7 2585 -3 -3 alternative_3end TRUE canonical NA NA NA NA 29 7.566465 0.878893 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTTTTTTTTTTTTTTTTGAC 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 29 NA PB.605.5 chr1 - 1550 7 full-splice_match MEAF6 ENST00000296214.10 4702 7 12 3140 2 178 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 164 42.789669 1.631339 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATGTCGTTCTTAAGTGGAG 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 164 NA PB.605.6 chr1 - 1857 7 full-splice_match MEAF6 ENST00000296214.10 4702 7 -348 3193 -348 125 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAATCACCATGGCATATG NA FALSE NA NA AGTAAA -36 NA NA NA 2 NA PB.605.7 chr1 - 1580 8 novel_not_in_catalog MEAF6 novel 2147 8 NA NA 2 125 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAATCACCATGGCATATG 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.605.8 chr1 - 1555 8 full-splice_match MEAF6 ENST00000475828.5 1408 8 2 -149 2 125 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.913689 0.592586 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAATCACCATGGCATATG 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.605.9 chr1 - 1303 6 full-splice_match MEAF6 ENST00000373074.5 2005 6 827 -125 78 125 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAATCACCATGGCATATG 1320 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.605.10 chr1 - 1185 6 full-splice_match MEAF6 ENST00000373073.8 603 6 -6 -576 -3 125 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAATCACCATGGCATATG -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.605.11 chr1 - 1252 5 incomplete-splice_match MEAF6 ENST00000373074.5 2005 6 4758 -125 4009 125 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAATCACCATGGCATATG 5251 FALSE NA NA AAGAAA -3 NA NA NA 4 NA PB.605.12 chr1 - 1081 3 incomplete-splice_match MEAF6 ENST00000373074.5 2005 6 12341 -125 11592 125 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAATCACCATGGCATATG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.605.13 chr1 - 1009 2 incomplete-splice_match MEAF6 ENST00000373074.5 2005 6 18298 -125 17549 125 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAATCACCATGGCATATG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.605.16 chr1 - 1396 7 full-splice_match MEAF6 ENST00000296214.10 4702 7 5 3301 2 17 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 247 64.445412 1.809192 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAACCCGAGATTGTTTTTT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 247 NA PB.605.17 chr1 - 984 3 incomplete-splice_match MEAF6 ENST00000373074.5 2005 6 12330 -17 11581 17 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAACCCGAGATTGTTTTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.605.19 chr1 - 1452 9 full-splice_match MEAF6 ENST00000487788.5 1351 9 -17 -84 -3 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATTCTCATGCTTTACTTT 13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.605.20 chr1 - 1427 8 full-splice_match MEAF6 ENST00000475828.5 1408 8 2 -21 2 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.435514 0.646944 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATTCTCATGCTTTACTTT 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.605.21 chr1 - 1110 5 incomplete-splice_match MEAF6 ENST00000373074.5 2005 6 4772 3 4023 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATTCTCATGCTTTACTTT 5265 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.605.22 chr1 - 1042 6 full-splice_match MEAF6 ENST00000373073.8 603 6 9 -448 2 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATTCTCATGCTTTACTTT 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.605.23 chr1 - 912 3 incomplete-splice_match MEAF6 ENST00000373074.5 2005 6 12382 3 11633 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATTCTCATGCTTTACTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.605.25 chr1 - 1183 7 full-splice_match MEAF6 ENST00000296214.10 4702 7 3 3516 0 -111 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGTAAAATGGGAAACTTGC -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.605.26 chr1 - 889 7 full-splice_match MEAF6 ENST00000296214.10 4702 7 7 3806 -3 -37 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAACTGGCTGGCACCAGCT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.605.27 chr1 - 936 5 incomplete-splice_match MEAF6 ENST00000448519.2 666 8 -9 5536 1 5 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GATCTTTGCCTACTCTTATT 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.606.1 chr1 + 3443 4 novel_not_in_catalog ZC3H12A novel 2721 6 NA NA 0 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGAGGTGATTGTCTTTGTT 0 TRUE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 2 NA PB.606.2 chr1 + 2651 6 full-splice_match ZC3H12A ENST00000373087.7 2654 6 1 2 1 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.652776 0.562623 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGAGGTGATTGTCTTTGTT 1 TRUE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 14 NA PB.606.3 chr1 + 2403 5 incomplete-splice_match ZC3H12A ENST00000373087.7 2654 6 1067 13 1067 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TGAGCCCTTTCAAGAGGTGA 1067 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.606.4 chr1 + 1836 3 incomplete-splice_match ZC3H12A ENST00000373087.7 2654 6 7157 11 47 6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGCCCTTTCAAGAGGTGATT 63 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.607.6 chr1 - 2121 4 full-splice_match SNIP1 ENST00000296215.8 4554 4 4 2429 1 -188 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AATAACATGTATAGATCTAA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.608.1 chr1 - 1830 12 incomplete-splice_match GNL2 ENST00000373062.8 2350 16 8465 -2 -4126 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGAAATTGTGTTTTCTTCC 8468 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.608.2 chr1 - 2352 16 full-splice_match GNL2 ENST00000373062.8 2350 16 -14 12 -14 -7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 328 85.579338 1.932369 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 CAAAAACAGGCAGTTAGAAA -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 328 NA PB.608.3 chr1 - 1931 13 incomplete-splice_match GNL2 ENST00000373062.8 2350 16 5151 1 3306 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGTTAGAAATTGTGTTTTCT 5154 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.608.4 chr1 - 1408 4 novel_in_catalog GNL2 novel 2350 16 NA NA -3529 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGTTAGAAATTGTGTTTTCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.608.5 chr1 - 1305 8 incomplete-splice_match GNL2 ENST00000373062.8 2350 16 19401 1 -5643 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGTTAGAAATTGTGTTTTCT NA FALSE NA NA AATACA -11 NA NA NA 4 NA PB.608.6 chr1 - 2213 16 full-splice_match GNL2 ENST00000373062.8 2350 16 135 2 133 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAGTTAGAAATTGTGTTTTC 138 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.608.7 chr1 - 1724 12 incomplete-splice_match GNL2 ENST00000373062.8 2350 16 8567 2 -4024 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAGTTAGAAATTGTGTTTTC 8570 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.608.8 chr1 - 3278 15 novel_in_catalog GNL2 novel 2350 16 NA NA -9 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAACAGGCAGTTAGAAAT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.608.9 chr1 - 2510 16 novel_not_in_catalog GNL2 novel 2350 16 NA NA 0 -6 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAACAGGCAGTTAGAAAT 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.608.10 chr1 - 2541 17 novel_in_catalog GNL2 novel 2350 16 NA NA 0 -6 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.913689 0.592586 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAACAGGCAGTTAGAAAT 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.608.11 chr1 - 1981 13 incomplete-splice_match GNL2 ENST00000373062.8 2350 16 5091 11 3246 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.435514 0.646944 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAACAGGCAGTTAGAAAT 5094 FALSE NA NA AATAAA -36 NA NA NA 17 NA PB.608.12 chr1 - 1590 10 incomplete-splice_match GNL2 ENST00000373062.8 2350 16 12999 11 -15 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAACAGGCAGTTAGAAAT NA FALSE NA NA AATAAA -7 NA NA NA 11 NA PB.608.13 chr1 - 1496 10 incomplete-splice_match GNL2 ENST00000373062.8 2350 16 13093 11 -35 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAACAGGCAGTTAGAAAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.608.14 chr1 - 1339 9 incomplete-splice_match GNL2 ENST00000373062.8 2350 16 13691 11 563 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.130951 0.495676 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAACAGGCAGTTAGAAAT NA FALSE NA NA AATGAA -45 NA NA NA 12 NA PB.608.15 chr1 - 1115 7 incomplete-splice_match GNL2 ENST00000373062.8 2350 16 20309 11 -4735 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 20 5.218252 0.717525 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAACAGGCAGTTAGAAAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 20 NA PB.608.16 chr1 - 950 6 incomplete-splice_match GNL2 ENST00000373062.8 2350 16 21245 11 -3799 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAACAGGCAGTTAGAAAT NA FALSE NA NA AAGAAA -37 NA NA NA 8 NA PB.608.17 chr1 - 893 2 full-splice_match GNL2 ENST00000490029.1 635 2 -269 11 33 -6 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAACAGGCAGTTAGAAAT 569 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.608.18 chr1 - 753 4 full-splice_match GNL2 ENST00000462812.5 2409 4 1646 10 -830 -6 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAACAGGCAGTTAGAAAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.608.24 chr1 - 957 6 incomplete-splice_match GNL2 ENST00000373062.8 2350 16 19424 1501 -5620 -1496 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAGAACAAAGAAAAACACTG NA FALSE NA NA AATGAA -41 NA NA NA 5 NA PB.609.1 chr1 + 945 6 full-splice_match DNALI1 ENST00000296218.8 2648 6 -1 1704 -1 6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AATAAAAAGCTAGTTTCCTG -24 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.610.1 chr1 + 2401 10 full-splice_match CDCA8 ENST00000373055.6 2371 10 -33 3 2 -3 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 190 49.573395 1.695249 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAATCACTGTTCATCCTGCC 0 TRUE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 190 NA PB.610.2 chr1 + 482 6 incomplete-splice_match CDCA8 ENST00000327331.2 2303 11 2 9244 2 -9244 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 GGAAGAGGAAGAAGAAGAAG 0 TRUE NA NA AATACA -19 NA NA NA 2 NA PB.610.3 chr1 + 2297 11 full-splice_match CDCA8 ENST00000327331.2 2303 11 8 -2 8 2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 75 19.568445 1.291556 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GTAATCACTGTTCATCCTGC 6 TRUE NA NA AATAAA -23 NA NA NA 75 NA PB.610.6 chr1 + 2244 10 full-splice_match CDCA8 ENST00000373055.6 2371 10 -20 147 15 -141 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 32 8.349203 0.921645 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGTTGTATTCTTTTAAGTT 13 TRUE NA NA AGTAAA -13 NA NA NA 32 NA PB.610.7 chr1 + 2132 11 full-splice_match CDCA8 ENST00000327331.2 2303 11 15 156 15 -156 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.652776 0.562623 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAACAGTCCTGTTCAAGTT 13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.610.9 chr1 + 2005 10 full-splice_match CDCA8 ENST00000373055.6 2371 10 203 163 203 -157 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAACAGTCCTGTTCAAGT 183 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.610.10 chr1 + 2084 9 incomplete-splice_match CDCA8 ENST00000373055.6 2371 10 405 2 405 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATCACTGTTCATCCTGCCT 385 FALSE NA NA AATAAA -25 NA NA NA 4 NA PB.610.11 chr1 + 1930 7 incomplete-splice_match CDCA8 ENST00000373055.6 2371 10 6389 2 6389 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATCACTGTTCATCCTGCCT 5947 FALSE NA NA AATAAA -25 NA NA NA 6 NA PB.610.12 chr1 + 1823 6 incomplete-splice_match CDCA8 ENST00000373055.6 2371 10 7954 2 7954 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATCACTGTTCATCCTGCCT 1491 FALSE NA NA AATAAA -25 NA NA NA 7 NA PB.610.13 chr1 + 1673 6 incomplete-splice_match CDCA8 ENST00000373055.6 2371 10 7966 140 7966 -134 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTCTTTTAAGTTCTTTTAT 1503 FALSE NA NA AGTAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.610.15 chr1 + 1707 4 incomplete-splice_match CDCA8 ENST00000373055.6 2371 10 10734 3 10734 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAATCACTGTTCATCCTGCC 4271 FALSE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 11 NA PB.610.16 chr1 + 1891 2 incomplete-splice_match CDCA8 ENST00000373055.6 2371 10 14053 3 14053 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAATCACTGTTCATCCTGCC 7590 FALSE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 3 NA PB.610.17 chr1 + 1484 2 incomplete-splice_match CDCA8 ENST00000373055.6 2371 10 14460 3 14460 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.435514 0.646944 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAATCACTGTTCATCCTGCC 7997 FALSE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 17 NA PB.610.18 chr1 + 1339 2 incomplete-splice_match CDCA8 ENST00000373055.6 2371 10 14460 148 14460 -142 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAAGTTGTATTCTTTTAAGT 7997 FALSE NA NA AGTAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.611.1 chr1 - 2475 5 novel_in_catalog C1orf109 novel 2696 5 NA NA -3 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 92 24.003960 1.380283 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTTAAGTGTCAAGTCTTAT -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 92 NA PB.611.3 chr1 - 2684 5 full-splice_match C1orf109 ENST00000486637.2 2696 5 4 8 4 -7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.479165 0.738714 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAGCATTTAAGTGTCAA -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 21 NA PB.611.4 chr1 - 2607 6 novel_in_catalog C1orf109 novel 2570 7 NA NA 0 -7 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAGCATTTAAGTGTCAA 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.611.5 chr1 - 2530 5 novel_in_catalog C1orf109 novel 2696 5 NA NA -56 -7 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAGCATTTAAGTGTCAA 1667 FALSE NA NA AATATA -40 NA NA NA 3 NA PB.611.6 chr1 - 2478 6 novel_in_catalog C1orf109 novel 2570 7 NA NA 0 -7 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAGCATTTAAGTGTCAA 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.611.7 chr1 - 2345 5 full-splice_match C1orf109 ENST00000358011.8 2355 5 2 8 2 -7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAGCATTTAAGTGTCAA -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.611.9 chr1 - 2330 5 novel_in_catalog C1orf109 novel 2696 5 NA NA 314 -7 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAGCATTTAAGTGTCAA 2084 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.611.10 chr1 - 2162 4 incomplete-splice_match C1orf109 ENST00000358011.8 2355 5 635 8 -196 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAGCATTTAAGTGTCAA 2367 FALSE NA NA GATAAA -36 NA NA NA 5 NA PB.611.11 chr1 - 1924 4 incomplete-splice_match C1orf109 ENST00000358011.8 2355 5 873 8 42 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAGCATTTAAGTGTCAA 2605 FALSE NA NA TTTAAA -21 NA NA NA 6 NA PB.611.12 chr1 - 1666 2 incomplete-splice_match C1orf109 ENST00000358011.8 2355 5 7119 8 791 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAGCATTTAAGTGTCAA 8851 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.611.13 chr1 - 1529 1 full-splice_match C1orf109 ENST00000609516.1 2622 1 1086 7 1086 -7 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAGCATTTAAGTGTCAA 9146 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.611.14 chr1 - 1386 1 full-splice_match C1orf109 ENST00000609516.1 2622 1 1229 7 1229 -7 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAGCATTTAAGTGTCAA 9289 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.611.15 chr1 - 967 1 full-splice_match C1orf109 ENST00000609516.1 2622 1 1648 7 1648 -7 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAGCATTTAAGTGTCAA 9708 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.611.16 chr1 - 801 1 full-splice_match C1orf109 ENST00000609516.1 2622 1 1814 7 1814 -7 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAGCATTTAAGTGTCAA 9874 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.611.17 chr1 - 675 1 full-splice_match C1orf109 ENST00000609516.1 2622 1 1940 7 1940 -7 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAGCATTTAAGTGTCAA 10000 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.611.19 chr1 - 2052 5 full-splice_match C1orf109 ENST00000486637.2 2696 5 0 644 0 522 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAATGAAAATAACTTTTT -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.611.20 chr1 - 1838 5 novel_in_catalog C1orf109 novel 2696 5 NA NA 4 522 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAATGAAAATAACTTTTT -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.611.21 chr1 - 1361 5 novel_in_catalog C1orf109 novel 2355 5 NA NA 0 50 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAGAAAAAGTGGTTTTGA -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.612.1 chr1 + 1736 4 full-splice_match MANEAL ENST00000397631.7 2327 4 589 2 -11 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGTAAGCATTCCTTTTGCT 376 FALSE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.612.2 chr1 + 1979 4 full-splice_match MANEAL ENST00000373045.11 2640 4 659 2 23 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGTAAGCATTCCTTTTGCT -6 TRUE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.612.3 chr1 + 1797 4 full-splice_match MANEAL ENST00000373045.11 2640 4 841 2 205 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGTAAGCATTCCTTTTGCT 176 FALSE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.613.1 chr1 - 1820 5 full-splice_match YRDC ENST00000373044.3 1848 5 30 -2 30 2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTTTTTCTTCTTTTGAATT 14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.613.2 chr1 - 1586 5 novel_not_in_catalog YRDC novel 1848 5 NA NA 468 2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTTTTTCTTCTTTTGAATT 9847 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.613.3 chr1 - 1274 3 incomplete-splice_match YRDC ENST00000373044.3 1848 5 1276 -2 1276 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTTTTTCTTCTTTTGAATT 1260 FALSE NA NA CATAAA -37 NA NA NA 2 NA PB.613.4 chr1 - 1639 5 full-splice_match YRDC ENST00000373044.3 1848 5 210 -1 210 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGTTTTTCTTCTTTTGAAT 9589 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.613.5 chr1 - 1432 4 incomplete-splice_match YRDC ENST00000373044.3 1848 5 993 -1 993 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGTTTTTCTTCTTTTGAAT 977 FALSE NA NA AATAAA -29 NA NA NA 5 NA PB.613.7 chr1 - 1497 5 full-splice_match YRDC ENST00000373044.3 1848 5 350 1 350 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GTTTGTTTTTCTTCTTTTGA 9729 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.613.8 chr1 - 1114 2 incomplete-splice_match YRDC ENST00000373044.3 1848 5 3840 6 3840 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAATGGTTTGTTTTTCTTCT 3824 FALSE NA NA GGGGCT -41 NA NA NA 5 NA PB.613.11 chr1 - 1178 5 full-splice_match YRDC ENST00000373044.3 1848 5 26 644 26 -644 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTGAGAGCCTCCTCTCTGG 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.615.3 chr1 - 2701 11 full-splice_match MTF1 ENST00000373036.5 7937 11 -6 5242 -6 -5242 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGGGTGTGGTTTCCATCA -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.615.4 chr1 - 812 2 incomplete-splice_match MTF1 ENST00000373036.5 7937 11 42113 5242 41060 -5242 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGGGTGTGGTTTCCATCA 6095 FALSE NA NA AAAAAG -38 NA NA NA 2 NA PB.615.7 chr1 - 1671 7 incomplete-splice_match MTF1 ENST00000373036.5 7937 11 23842 5380 22789 -5380 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAAAACAAAAAACAAAAA NA FALSE NA NA AATAGA -12 NA NA NA 3 NA PB.616.1 chr1 - 4435 24 full-splice_match INPP5B ENST00000373024.8 4450 24 15 0 13 0 reference_match FALSE noncanonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCGGTTGTGTATGTTTTTAT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.616.2 chr1 - 3907 18 full-splice_match INPP5B ENST00000373027.5 3905 18 -2 0 -2 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.826388 0.261593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCGGTTGTGTATGTTTTTAT -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.616.3 chr1 - 2936 19 novel_not_in_catalog INPP5B novel 4694 24 NA NA -2 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCGGTTGTGTATGTTTTTAT -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.616.4 chr1 - 2514 19 novel_not_in_catalog INPP5B novel 3905 18 NA NA 10 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCGGTTGTGTATGTTTTTAT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.616.5 chr1 - 2507 7 incomplete-splice_match INPP5B ENST00000373027.5 3905 18 57657 2 -705 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGGCGGTTGTGTATGTTTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.616.7 chr1 - 2517 18 full-splice_match INPP5B ENST00000373027.5 3905 18 -2 1390 -2 -19 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.913689 0.592586 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AACTTTAGTTATTTAACACA -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.617.1 chr1 + 1169 3 full-splice_match C1orf122 ENST00000468084.1 1234 3 70 -5 27 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTGGTGACCGACGTTTCCTT -8 TRUE NA NA ATTAAA -20 NA NA NA 5 NA PB.617.2 chr1 + 1028 3 full-splice_match C1orf122 ENST00000468084.1 1234 3 209 -3 166 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TCCTGGTGACCGACGTTTCC 93 FALSE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.617.3 chr1 + 717 3 full-splice_match C1orf122 ENST00000468084.1 1234 3 522 -5 479 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.740077 0.758918 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTGGTGACCGACGTTTCCTT -12 TRUE NA NA ATTAAA -20 NA NA NA 22 NA PB.617.5 chr1 + 817 3 full-splice_match C1orf122 ENST00000373042.5 1329 3 506 6 506 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTCTCCTGGTGACCGACGT 15 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 5 NA PB.617.6 chr1 + 601 2 full-splice_match C1orf122 ENST00000373043.1 2229 2 1625 3 814 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.913689 0.592586 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTCTCCTGGTGACCGACGTT -7 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 15 NA PB.618.2 chr1 - 2615 16 incomplete-splice_match SF3A3 ENST00000373019.5 2774 17 426 7 54 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAAATGTTAATCTTTTT 9831 FALSE NA NA AAAACA -41 NA NA NA 4 NA PB.618.3 chr1 - 2434 14 incomplete-splice_match SF3A3 ENST00000373019.5 2774 17 2423 7 2051 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAAATGTTAATCTTTTT 9680 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.618.4 chr1 - 2121 10 incomplete-splice_match SF3A3 ENST00000373019.5 2774 17 9336 7 103 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAAATGTTAATCTTTTT 9404 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.618.5 chr1 - 1832 18 novel_not_in_catalog SF3A3 novel 2774 17 NA NA 7 -7 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAAATGTTAATCTTTTT 4 TRUE NA NA AAGAAA -10 NA NA NA 2 NA PB.618.6 chr1 - 1846 7 incomplete-splice_match SF3A3 ENST00000373019.5 2774 17 11231 8 408 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.565476 0.194646 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TAAAAAAATGTTAATCTTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.618.7 chr1 - 1429 3 incomplete-splice_match SF3A3 ENST00000373019.5 2774 17 21888 7 -7441 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAAATGTTAATCTTTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.618.8 chr1 - 1306 2 full-splice_match SF3A3 ENST00000487062.1 775 2 550 -1081 550 -7 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 12 3.130951 0.495676 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAAATGTTAATCTTTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.618.10 chr1 - 2773 17 full-splice_match SF3A3 ENST00000373019.5 2774 17 -7 8 -7 -8 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 94 24.525785 1.389623 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TAAAAAAATGTTAATCTTTT -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 94 NA PB.618.11 chr1 - 2600 15 novel_in_catalog SF3A3 novel 2774 17 NA NA 7 -8 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TAAAAAAATGTTAATCTTTT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.618.12 chr1 - 2634 18 novel_not_in_catalog SF3A3 novel 2774 17 NA NA 7 -8 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TAAAAAAATGTTAATCTTTT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.618.13 chr1 - 2507 14 novel_in_catalog SF3A3 novel 2774 17 NA NA 13 -8 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TAAAAAAATGTTAATCTTTT 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.618.14 chr1 - 2269 12 incomplete-splice_match SF3A3 ENST00000373019.5 2774 17 5826 8 -3407 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TAAAAAAATGTTAATCTTTT 5894 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.618.15 chr1 - 1952 8 incomplete-splice_match SF3A3 ENST00000373019.5 2774 17 10965 8 142 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TAAAAAAATGTTAATCTTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.618.16 chr1 - 1674 5 incomplete-splice_match SF3A3 ENST00000373019.5 2774 17 20317 8 -9012 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TAAAAAAATGTTAATCTTTT NA FALSE NA NA CATAAA -3 NA NA NA 4 NA PB.618.17 chr1 - 1539 4 incomplete-splice_match SF3A3 ENST00000373019.5 2774 17 20558 8 -8771 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TAAAAAAATGTTAATCTTTT NA FALSE NA NA AAAAAG -42 NA NA NA 2 NA PB.618.23 chr1 - 1965 13 incomplete-splice_match SF3A3 ENST00000373019.5 2774 17 5264 428 -3969 -428 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAAAAAAAGGGGGGG 5332 FALSE NA NA AGTAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.618.24 chr1 - 1816 11 incomplete-splice_match SF3A3 ENST00000373019.5 2774 17 8216 428 -1017 -428 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAAAAAAAGGGGGGG 8284 FALSE NA NA AAGAAA -28 NA NA NA 2 NA PB.618.25 chr1 - 1658 10 incomplete-splice_match SF3A3 ENST00000373019.5 2774 17 9378 428 145 -428 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAAAAAAAGGGGGGG 9446 FALSE NA NA AAAAAG -44 NA NA NA 2 NA PB.618.26 chr1 - 1341 6 incomplete-splice_match SF3A3 ENST00000373019.5 2774 17 13082 428 2259 -428 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAAAAAAAGGGGGGG NA FALSE NA NA AAAAAG -27 NA NA NA 4 NA PB.618.34 chr1 - 1616 10 incomplete-splice_match SF3A3 ENST00000373019.5 2774 17 9296 552 63 536 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAAAAAAAAAGGCATG 9364 FALSE NA NA AAAAAG -17 NA NA NA 5 NA PB.618.36 chr1 - 957 4 incomplete-splice_match SF3A3 ENST00000373019.5 2774 17 20596 552 -8733 536 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAAAAAAAAAGGCATG NA FALSE NA NA AAAAAG -4 NA NA NA 4 NA PB.618.38 chr1 - 2156 17 full-splice_match SF3A3 ENST00000373019.5 2774 17 -56 674 -3 414 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 ATAAAGAAAGGAGTTGGAGC -6 TRUE NA NA AAGAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.618.39 chr1 - 1846 17 full-splice_match SF3A3 ENST00000373019.5 2774 17 -56 984 -3 104 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 412 107.495995 2.031392 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAGCCCAGGGTTATGGACC -6 TRUE NA NA AAGAAA -20 NA NA NA 412 NA PB.618.40 chr1 - 646 5 incomplete-splice_match SF3A3 ENST00000373019.5 2774 17 20389 964 -8940 124 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCAGTGCTTCAGGTCTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.618.41 chr1 - 2229 16 novel_in_catalog SF3A3 novel 2774 17 NA NA 7 104 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAGCCCAGGGTTATGGACC -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.618.42 chr1 - 1618 15 novel_in_catalog SF3A3 novel 2774 17 NA NA 13 104 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.609126 0.416495 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAGCCCAGGGTTATGGACC 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.618.43 chr1 - 1568 14 novel_in_catalog SF3A3 novel 2774 17 NA NA -24 104 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAGCCCAGGGTTATGGACC 9381 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.618.44 chr1 - 1561 15 incomplete-splice_match SF3A3 ENST00000373019.5 2774 17 2214 984 1842 104 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.652776 0.562623 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAGCCCAGGGTTATGGACC 9471 FALSE NA NA AATACA -7 NA NA NA 14 NA PB.618.45 chr1 - 1504 15 novel_in_catalog SF3A3 novel 2774 17 NA NA 78 104 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAGCCCAGGGTTATGGACC 9532 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.618.46 chr1 - 1071 10 incomplete-splice_match SF3A3 ENST00000373019.5 2774 17 9409 984 176 104 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.435514 0.646944 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAGCCCAGGGTTATGGACC 9477 FALSE NA NA AAAAAG -13 NA NA NA 17 NA PB.618.47 chr1 - 865 7 incomplete-splice_match SF3A3 ENST00000373019.5 2774 17 11236 984 413 104 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 2.087301 0.319585 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAGCCCAGGGTTATGGACC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.618.48 chr1 - 1729 16 novel_in_catalog SF3A3 novel 2774 17 NA NA 7 103 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAAGCCCAGGGTTATGGAC -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.618.49 chr1 - 1726 16 novel_in_catalog SF3A3 novel 2774 17 NA NA 7 103 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAAGCCCAGGGTTATGGAC -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.618.50 chr1 - 1697 16 novel_in_catalog SF3A3 novel 2774 17 NA NA -16 103 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAAGCCCAGGGTTATGGAC -24 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.618.51 chr1 - 1446 14 incomplete-splice_match SF3A3 ENST00000373019.5 2774 17 2433 985 2061 103 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.913689 0.592586 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAAGCCCAGGGTTATGGAC 9690 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.618.52 chr1 - 1343 12 incomplete-splice_match SF3A3 ENST00000373019.5 2774 17 5775 985 -3458 103 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAAGCCCAGGGTTATGGAC 5843 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.618.53 chr1 - 1209 11 incomplete-splice_match SF3A3 ENST00000373019.5 2774 17 8266 985 -967 103 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.652776 0.562623 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAAGCCCAGGGTTATGGAC 8334 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.618.54 chr1 - 702 5 incomplete-splice_match SF3A3 ENST00000373019.5 2774 17 20312 985 -9017 103 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAAGCCCAGGGTTATGGAC NA FALSE NA NA CATAAA -8 NA NA NA 11 NA PB.618.55 chr1 - 1102 13 incomplete-splice_match SF3A3 ENST00000373019.5 2774 17 21 12700 -6 -288 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.740077 0.758918 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 GAGAAGAAGAGGAAGAAGAG 13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 22 NA PB.620.1 chr1 + 1041 8 full-splice_match UTP11 ENST00000373014.5 2023 8 -37 1019 -37 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 831 216.818375 2.336096 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATTGTTTTTGGATTGTGAA NA FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 831 NA PB.620.2 chr1 + 1136 7 novel_in_catalog UTP11 novel 2023 8 NA NA -32 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATTGTTTTTGGATTGTGAA NA FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.620.4 chr1 + 2033 8 full-splice_match UTP11 ENST00000373014.5 2023 8 -7 -3 -7 3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 133 34.701378 1.540347 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CATAGTGTTTTATCTAGTGG -4 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 133 NA PB.620.5 chr1 + 1127 9 novel_not_in_catalog UTP11 novel 2023 8 NA NA -7 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATTGTTTTTGGATTGTGAA -4 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.620.7 chr1 + 1594 8 full-splice_match UTP11 ENST00000373014.5 2023 8 0 429 0 -429 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TACTTTTTTTTTTTTTTTTT 3 TRUE NA NA AGTAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.620.8 chr1 + 942 7 novel_in_catalog UTP11 novel 2023 8 NA NA 0 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATTGTTTTTGGATTGTGAA 3 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 5 NA PB.620.9 chr1 + 863 8 full-splice_match UTP11 ENST00000373014.5 2023 8 0 1160 0 -141 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAAATCTGTTGTCGTTTTC 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.620.10 chr1 + 1636 5 incomplete-splice_match UTP11 ENST00000488453.1 1895 6 1974 -1022 1974 3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CATAGTGTTTTATCTAGTGG 5779 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 4 NA PB.620.11 chr1 + 1515 3 incomplete-splice_match UTP11 ENST00000488453.1 1895 6 2668 -1014 2668 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.782738 -0.106384 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATGATTGCATAGTGTTTTA 6473 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 3 NA PB.620.12 chr1 + 1367 2 incomplete-splice_match UTP11 ENST00000488453.1 1895 6 6139 -1022 6139 3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CATAGTGTTTTATCTAGTGG 9944 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.621.1 chr1 - 1436 5 incomplete-splice_match FHL3 ENST00000373016.4 1656 6 6152 -8 70 8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTCCGTGTGTGTGTGTGTGT 6294 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.621.3 chr1 - 1654 6 full-splice_match FHL3 ENST00000373016.4 1656 6 0 2 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 40 10.436504 1.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGCAGGGGCCTCCGTGTGT -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 40 NA PB.621.4 chr1 - 1599 6 full-splice_match FHL3 ENST00000477194.5 1091 6 65 -573 -27 -2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.870039 0.457888 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGCAGGGGCCTCCGTGTGT 7212 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.621.5 chr1 - 1518 6 novel_not_in_catalog FHL3 novel 1656 6 NA NA -88 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGCAGGGGCCTCCGTGTGT 7059 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.621.6 chr1 - 1506 5 full-splice_match FHL3 ENST00000485803.5 1468 5 -40 2 -28 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGCAGGGGCCTCCGTGTGT 7211 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.621.7 chr1 - 1353 5 incomplete-splice_match FHL3 ENST00000373016.4 1656 6 6225 2 143 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGCAGGGGCCTCCGTGTGT 6367 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.621.8 chr1 - 1146 3 incomplete-splice_match FHL3 ENST00000485803.5 1468 5 7369 2 1299 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563 0.115465 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGCAGGGGCCTCCGTGTGT 7523 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.621.9 chr1 - 875 2 incomplete-splice_match FHL3 ENST00000485803.5 1468 5 7732 2 1662 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 1.043650 0.018555 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGCAGGGGCCTCCGTGTGT 7886 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.621.10 chr1 - 1299 4 full-splice_match FHL3 ENST00000475084.5 882 4 -4 -413 -4 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAAGCAGGGGCCTCCGTGTG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.622.1 chr1 - 2413 7 full-splice_match RRAGC ENST00000373001.4 2681 7 264 4 264 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.521825 -0.282475 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAATCAGCGTTTCTCCTTG 4530 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.622.2 chr1 - 1653 2 full-splice_match RRAGC ENST00000474456.1 2492 2 1986 -1147 1986 -4 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.304563