isoform chrom strand length exons structural_category associated_gene associated_transcript ref_length ref_exons diff_to_TSS diff_to_TTS diff_to_gene_TSS diff_to_gene_TTS subcategory RTS_stage all_canonical min_sample_cov min_cov min_cov_pos sd_cov FL.BioSample_2 FL_TPM.BioSample_2 FL_TPM.BioSample_2_log10 n_indels n_indels_junc bite iso_exp gene_exp ratio_exp FSM_class coding ORF_length CDS_length CDS_start CDS_end CDS_genomic_start CDS_genomic_end predicted_NMD perc_A_downstream_TTS seq_A_downstream_TTS dist_to_CAGE_peak within_CAGE_peak dist_to_polyA_site within_polyA_site polyA_motif polyA_dist polyA_motif_found ORF_seq ratio_TSS fl_assoc cell_barcodes PB.1.1 chr1 - 1726 11 novel_not_in_catalog WASH7P novel 1351 11 NA NA 211 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.1.3 chr1 - 1577 10 novel_not_in_catalog WASH7P novel 1351 11 NA NA 211 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.1.4 chr1 - 1547 10 novel_not_in_catalog WASH7P novel 1351 11 NA NA 223 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.1.5 chr1 - 1202 7 novel_not_in_catalog WASH7P novel 1351 11 NA NA 11900 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.1.6 chr1 - 1284 2 novel_not_in_catalog WASH7P novel 1351 11 NA NA 13738 -5 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAAACCAACAGTGTGCTTT 184 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.1.7 chr1 - 1050 6 novel_not_in_catalog WASH7P novel 1351 11 NA NA 11914 -5 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAAACCAACAGTGTGCTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.1.8 chr1 - 1079 7 novel_not_in_catalog WASH7P novel 1351 11 NA NA 211 -2039 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAGCTCTGGACTTCTCACT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.1.9 chr1 - 933 5 novel_not_in_catalog WASH7P novel 1351 11 NA NA 206 -2039 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAGCTCTGGACTTCTCACT -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.3.2 chr1 - 1729 11 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -4464 341 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAAACGTCTCGGGGTCAGTG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.3.4 chr1 - 1629 10 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -4464 337 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GATGCAAACGTCTCGGGGTC -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.3.5 chr1 - 1977 10 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -4466 299 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AACAGTGTGCTTTTAATAAA -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.3.7 chr1 - 1574 10 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -4469 292 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.806923 0.580574 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAAACCAACAGTGTGCTTT -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.3.8 chr1 - 1237 7 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA 7193 299 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AACAGTGTGCTTTTAATAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.3.9 chr1 - 1020 5 incomplete-splice_match WASH9P ENST00000623083.4 1397 10 7830 -299 7830 299 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AACAGTGTGCTTTTAATAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.3.10 chr1 - 2236 11 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -4965 294 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA NA FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.3.13 chr1 - 1925 11 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA 5625 294 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.3.14 chr1 - 1925 9 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -8 294 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA 4453 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.3.15 chr1 - 1839 9 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -4445 294 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA 16 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.3.16 chr1 - 1699 10 full-splice_match WASH9P ENST00000623083.4 1397 10 -8 -294 -8 294 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.520721 0.655208 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA 4453 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.3.17 chr1 - 1484 9 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -4461 294 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.3.18 chr1 - 1456 6 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA 7208 294 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.3.19 chr1 - 1437 9 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -4469 294 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.3.20 chr1 - 1468 9 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -4463 294 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.3.21 chr1 - 1333 8 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -4464 294 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.3.24 chr1 - 932 5 incomplete-splice_match WASH9P ENST00000623083.4 1397 10 7913 -294 7913 294 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.3.25 chr1 - 2673 3 novel_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA 7549 292 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAAACCAACAGTGTGCTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.3.26 chr1 - 2016 11 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -4464 292 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAAACCAACAGTGTGCTTT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.3.27 chr1 - 1787 11 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -4497 292 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAAACCAACAGTGTGCTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.15.1 chr1 + 989 2 full-splice_match ENSG00000236601 ENST00000635159.1 994 2 3 2 3 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATTTTTTCCAGATTTATAC NA FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 3 NA PB.16.1 chr1 - 2945 3 fusion ENSG00000228327_ENSG00000230021 novel 355 2 NA NA -2614 2428 multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATTACAATAGGACTGTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.18.1 chr1 + 1038 3 incomplete-splice_match LINC01409 ENST00000412115.2 1358 5 72 4796 7 -3 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAAGATCCTTTCTTTTTGAG NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.18.2 chr1 + 1349 1 full-splice_match LINC01409 ENST00000591702.1 1873 1 525 -1 525 1 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CACAAAGCCTGTTGGTGGAC NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.19.3 chr1 + 1557 5 full-splice_match LINC01128 ENST00000445118.7 6616 5 0 5059 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGTGAGGTACAATAGCTATT 762 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.19.4 chr1 + 1041 3 full-splice_match LINC01128 ENST00000669922.1 5441 3 35 4365 0 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTGATGGCCTCTGTTGTT 802 FALSE NA NA AATGAA -45 NA NA NA 3 NA PB.19.9 chr1 + 1776 7 full-splice_match LINC01128 ENST00000661237.2 1823 7 47 0 13 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGTGAGGTACAATAGCTATT 40 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.19.11 chr1 + 984 3 novel_in_catalog LINC01128 novel 987 3 NA NA -2 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTGATGGCCTCTGTTGTT 48 FALSE NA NA AATGAA -45 NA NA NA 3 NA PB.20.1 chr1 - 1691 2 fusion ENSG00000230092_LINC00115 novel 872 5 NA NA 0 9659 multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TAAAAAATGTTTCATCTACT -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.20.3 chr1 - 1291 1 full-splice_match LINC00115 ENST00000473798.1 1317 1 19 7 19 -7 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 17 4.044856 0.606903 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGATATTTCCAAAGCTCA 12 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.22.4 chr1 - 2755 19 novel_not_in_catalog NOC2L novel 2757 19 NA NA -20 -11 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCATTGTGTTGAGTGGTGG -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.22.5 chr1 - 2675 19 novel_not_in_catalog NOC2L novel 2757 19 NA NA -20 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTGGTGGCTCCTGGAGATT -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.22.7 chr1 - 2480 17 novel_in_catalog NOC2L novel 4201 17 NA NA 1281 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTGGTGGCTCCTGGAGATT 9802 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.22.8 chr1 - 2075 14 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 3301 1 2503 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTGGTGGCTCCTGGAGATT 4579 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.22.9 chr1 - 1724 10 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 6670 1 -5526 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTGGTGGCTCCTGGAGATT 7948 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.22.10 chr1 - 1285 7 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 10665 1 -1531 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.093125 0.490398 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTGGTGGCTCCTGGAGATT 5188 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.22.11 chr1 - 879 4 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000483767.5 1611 5 847 0 847 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTGGTGGCTCCTGGAGATT 7566 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.22.12 chr1 - 2789 19 novel_not_in_catalog NOC2L novel 2757 19 NA NA 0 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAGTGGTGGCTCCTGGAGAT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.22.13 chr1 - 2774 19 full-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 -20 3 -20 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 351 83.514381 1.921761 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGAGTGGTGGCTCCTGGAGA -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 351 NA PB.22.14 chr1 - 1571 2 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 13225 2 1029 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAGTGGTGGCTCCTGGAGAT 7748 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.22.15 chr1 - 1426 9 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 7239 2 -4957 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAGTGGTGGCTCCTGGAGAT 8517 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.22.16 chr1 - 1013 5 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 12778 2 582 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAGTGGTGGCTCCTGGAGAT 7301 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.22.17 chr1 - 806 3 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000483767.5 1611 5 1438 1 1438 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAGTGGTGGCTCCTGGAGAT 8157 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.22.19 chr1 - 2651 18 novel_in_catalog NOC2L novel 2757 19 NA NA 251 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGAGTGGTGGCTCCTGGAGA 7974 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.22.20 chr1 - 1176 6 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 11029 3 -1167 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGAGTGGTGGCTCCTGGAGA 5552 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.22.21 chr1 - 2574 17 novel_in_catalog NOC2L novel 4201 17 NA NA 1182 -4 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGTTGAGTGGTGGCTCCTGG 9703 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.22.22 chr1 - 2808 20 novel_not_in_catalog NOC2L novel 2757 19 NA NA 0 -7 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.568991 0.552545 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTGTGTTGAGTGGTGGCTCC 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.22.23 chr1 - 2787 19 novel_not_in_catalog NOC2L novel 2757 19 NA NA -21 -8 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTGTGTTGAGTGGTGGCTC -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.22.24 chr1 - 2175 15 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 3111 10 2313 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTGTGTTGAGTGGTGGCTC 4389 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.22.25 chr1 - 1179 6 novel_not_in_catalog NOC2L novel 2757 19 NA NA 22 -8 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTGTGTTGAGTGGTGGCTC 7692 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.22.26 chr1 - 2583 18 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 296 11 296 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CATTGTGTTGAGTGGTGGCT 8019 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.22.27 chr1 - 1951 12 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000477976.5 4201 17 4583 9 4583 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CATTGTGTTGAGTGGTGGCT 6659 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.22.28 chr1 - 1900 12 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 5417 11 4619 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.331058 0.522582 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CATTGTGTTGAGTGGTGGCT 6695 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.22.29 chr1 - 1075 5 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 12707 11 511 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CATTGTGTTGAGTGGTGGCT 7230 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.22.30 chr1 - 1042 5 full-splice_match NOC2L ENST00000483767.5 1611 5 559 10 559 -9 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CATTGTGTTGAGTGGTGGCT 7278 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.22.31 chr1 - 941 4 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000483767.5 1611 5 775 10 775 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CATTGTGTTGAGTGGTGGCT 7494 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.22.32 chr1 - 2414 17 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 2119 12 1321 -10 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.617260 0.417847 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CCATTGTGTTGAGTGGTGGC 9842 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.22.33 chr1 - 2260 15 novel_in_catalog NOC2L novel 4201 17 NA NA 2241 -10 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CCATTGTGTTGAGTGGTGGC 4317 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.22.34 chr1 - 2035 13 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 5170 12 4372 -10 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CCATTGTGTTGAGTGGTGGC 6448 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.22.35 chr1 - 1540 9 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 7115 12 -5081 -10 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.806923 0.580574 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CCATTGTGTTGAGTGGTGGC 8393 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.22.36 chr1 - 858 4 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 13038 12 842 -10 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CCATTGTGTTGAGTGGTGGC 7561 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.22.37 chr1 - 2831 20 novel_not_in_catalog NOC2L novel 2757 19 NA NA -12 -11 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.806923 0.580574 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCATTGTGTTGAGTGGTGG -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.22.38 chr1 - 2771 19 novel_not_in_catalog NOC2L novel 2757 19 NA NA -21 -11 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCATTGTGTTGAGTGGTGG -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.22.39 chr1 - 2717 19 novel_not_in_catalog NOC2L novel 2757 19 NA NA 0 -11 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCATTGTGTTGAGTGGTGG 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.22.40 chr1 - 2323 16 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 2282 13 1484 -11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCATTGTGTTGAGTGGTGG 10005 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.22.41 chr1 - 2244 15 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 3039 13 2241 -11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCATTGTGTTGAGTGGTGG 4317 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.22.42 chr1 - 1633 10 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000477976.5 4201 17 5966 11 -5432 -11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCATTGTGTTGAGTGGTGG 8042 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.22.43 chr1 - 1485 9 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000477976.5 4201 17 6386 11 -5012 -11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCATTGTGTTGAGTGGTGG 8462 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.22.44 chr1 - 1263 7 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000477976.5 4201 17 9892 11 -1506 -11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.282789 0.631727 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCATTGTGTTGAGTGGTGG 5213 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.22.45 chr1 - 752 3 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 13662 13 1466 -11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCATTGTGTTGAGTGGTGG 8185 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.22.46 chr1 - 659 2 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000483767.5 1611 5 1945 12 1945 -11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCATTGTGTTGAGTGGTGG 8664 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.22.48 chr1 - 1768 11 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000477976.5 4201 17 5256 12 5256 -12 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGCCATTGTGTTGAGTGGTG 7332 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.22.49 chr1 - 1528 10 novel_not_in_catalog NOC2L novel 2757 19 NA NA -18 -12 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGCCATTGTGTTGAGTGGTG -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.22.50 chr1 - 3208 19 novel_in_catalog NOC2L novel 2757 19 NA NA -26 -14 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGGCCATTGTGTTGAGTGG 7697 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.22.51 chr1 - 2045 13 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000477976.5 4201 17 4372 15 4372 -15 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CAGGGCCATTGTGTTGAGTG 6448 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.22.52 chr1 - 1275 8 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 8086 67 -4110 -65 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAATTTTTTGTTTTGCATC 9364 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.22.56 chr1 - 857 2 full-splice_match NOC2L ENST00000469563.1 878 2 -4 25 -4 -25 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 28 6.662116 0.823612 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAGAAAAAGAAAGAAAT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 28 NA PB.23.1 chr1 + 1499 4 novel_in_catalog KLHL17 novel 913 6 NA NA -46 -4 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CTCAGGCTGAGCATCTCTCT 2904 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.23.2 chr1 + 1024 4 novel_in_catalog KLHL17 novel 913 6 NA NA 434 1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCTGAGCATCTCTCTCTGGC 3384 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 3 NA PB.23.3 chr1 + 871 2 incomplete-splice_match KLHL17 ENST00000338591.8 2567 12 3832 1 864 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGCTGAGCATCTCTCTCTG 3814 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.26.1 chr1 - 810 3 full-splice_match HES4 ENST00000484667.2 667 3 -136 -7 -20 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTCTGCGTCACGAGTTTTC 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.26.2 chr1 - 1040 2 full-splice_match HES4 ENST00000481869.1 1038 2 -1 -1 0 1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAGTCTGCGTCACGAGTTT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.26.3 chr1 - 962 3 novel_in_catalog HES4 novel 885 4 NA NA 0 1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAGTCTGCGTCACGAGTTT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.26.4 chr1 - 882 4 full-splice_match HES4 ENST00000304952.11 885 4 2 1 1 1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 37 8.803510 0.944656 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAGTCTGCGTCACGAGTTT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 37 NA PB.26.5 chr1 - 877 4 novel_not_in_catalog HES4 novel 885 4 NA NA 0 1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAGTCTGCGTCACGAGTTT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.26.6 chr1 - 804 4 full-splice_match HES4 ENST00000304952.11 885 4 80 1 -36 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAGTCTGCGTCACGAGTTT 795 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.26.7 chr1 - 892 3 novel_in_catalog HES4 novel 885 4 NA NA -47 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAGAGTCTGCGTCACGAGTT 23 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.27.2 chr1 + 628 2 full-splice_match ISG15 ENST00000649529.1 637 2 0 9 0 -9 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 65 15.465626 1.189368 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAGAGAAATGGCCGCCTCT 1 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 65 NA PB.28.2 chr1 + 4446 20 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 12072 4 779 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 1009 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.28.3 chr1 + 4308 19 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 12341 4 -754 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 1278 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.28.4 chr1 + 4113 19 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 12536 4 -559 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 1473 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.28.5 chr1 + 3906 18 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 12826 5 -269 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAAAGCATTGCTTTTGTCC 1763 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.28.6 chr1 + 3633 15 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 13675 4 306 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 2612 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.28.7 chr1 + 3279 14 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 14144 5 -279 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAAAGCATTGCTTTTGTCC 398 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 6 NA PB.28.8 chr1 + 3068 13 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 14857 4 434 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 1111 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 9 NA PB.28.10 chr1 + 2941 12 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 15160 4 737 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 1414 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.28.11 chr1 + 2814 12 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 15287 4 864 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 1541 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 10 NA PB.28.13 chr1 + 2666 11 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 15548 5 1125 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAAAGCATTGCTTTTGTCC 1802 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 8 NA PB.28.14 chr1 + 2561 11 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 15654 4 1231 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 1908 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.28.15 chr1 + 2394 9 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 16123 4 1700 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 2377 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 8 NA PB.28.16 chr1 + 2322 9 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 16195 4 -1685 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 2449 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.28.17 chr1 + 2263 8 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 16351 4 -1529 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 2605 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 8 NA PB.28.18 chr1 + 2129 7 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 16619 4 -1261 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.044856 0.606903 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 2873 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 17 NA PB.28.19 chr1 + 1973 6 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 17190 4 -690 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.568991 0.552545 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 3444 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 15 NA PB.28.20 chr1 + 1737 5 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 17509 4 -371 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.331058 0.522582 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 3763 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 14 NA PB.28.22 chr1 + 1605 3 full-splice_match AGRN ENST00000461111.1 3385 3 1780 0 1780 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.806923 0.580574 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 5914 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 16 NA PB.28.23 chr1 + 1480 3 full-splice_match AGRN ENST00000461111.1 3385 3 1905 0 1905 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 21 4.996587 0.698673 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 6039 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 21 NA PB.30.2 chr1 - 1896 2 full-splice_match RNF223 ENST00000453464.3 1900 2 2 2 2 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CATCTTTGGCAAGAGGGCCT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.30.4 chr1 - 1441 2 full-splice_match RNF223 ENST00000453464.3 1900 2 2 457 2 -457 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CATCGTGGTGGGTGCCTCTT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.31.1 chr1 + 1033 5 novel_in_catalog ENSG00000217801 novel 1043 5 NA NA 3 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTCTCTTGCCTCGGCACCT 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.31.2 chr1 + 931 4 full-splice_match ENSG00000217801 ENST00000456409.6 957 4 7 19 0 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.806923 0.580574 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAAACAGTTTGTGCCTTCAG -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.31.3 chr1 + 1001 4 novel_in_catalog ENSG00000217801 novel 1152 5 NA NA -2 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GCCTTCAGTCTCTTGCCTCG 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.31.4 chr1 + 865 2 full-splice_match ENSG00000217801 ENST00000433695.1 540 2 -145 -180 -145 1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGTCTCTTGCCTCGGCACC 4616 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.31.5 chr1 + 781 2 full-splice_match ENSG00000217801 ENST00000433695.1 540 2 -61 -180 -61 1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGTCTCTTGCCTCGGCACC 4700 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.32.3 chr1 - 2279 10 novel_in_catalog C1orf159 novel 2099 12 NA NA -5 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGCTGCGTTCCGAGCTGCT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.32.5 chr1 - 1883 11 novel_not_in_catalog C1orf159 novel 2099 12 NA NA 1 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGCTGCGTTCCGAGCTGCT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.32.6 chr1 - 1883 10 novel_in_catalog C1orf159 novel 2099 12 NA NA -3 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGCTGCGTTCCGAGCTGCT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.32.7 chr1 - 1839 10 full-splice_match C1orf159 ENST00000421241.7 1832 10 -9 2 -3 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 41 9.755241 0.989238 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGCTGCGTTCCGAGCTGCT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 41 NA PB.32.9 chr1 - 1510 6 incomplete-splice_match C1orf159 ENST00000379319.5 1097 10 18537 -875 46 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGCTGCGTTCCGAGCTGCT 4438 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.32.10 chr1 - 1327 6 novel_not_in_catalog C1orf159 novel 3214 10 NA NA 1672 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGCTGCGTTCCGAGCTGCT 9584 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.32.13 chr1 - 1734 9 novel_in_catalog C1orf159 novel 2010 11 NA NA -12 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CAAGCTGCGTTCCGAGCTGC -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.32.15 chr1 - 1413 10 full-splice_match C1orf159 ENST00000421241.7 1832 10 0 419 0 -7 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 CAGAAAAGTCCTCCAGAGCT 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.33.1 chr1 - 1978 4 full-splice_match TNFRSF18 ENST00000486728.5 727 4 -916 -335 -4 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACCTGAGTGGATGCATGCTG -20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.33.2 chr1 - 1147 4 novel_in_catalog TNFRSF18 novel 1083 5 NA NA 0 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACCTGAGTGGATGCATGCTG -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.33.3 chr1 - 1068 4 novel_not_in_catalog TNFRSF18 novel 1083 5 NA NA 6 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACCTGAGTGGATGCATGCTG -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.33.4 chr1 - 1057 5 full-splice_match TNFRSF18 ENST00000379265.5 705 5 -17 -335 4 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACCTGAGTGGATGCATGCTG -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.33.5 chr1 - 1072 5 full-splice_match TNFRSF18 ENST00000379268.7 1083 5 10 1 10 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 70 16.655289 1.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACCTGAGTGGATGCATGCTG -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 70 NA PB.33.6 chr1 - 1104 5 novel_not_in_catalog TNFRSF18 novel 1083 5 NA NA -8 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GACCTGAGTGGATGCATGCT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.35.1 chr1 - 2069 7 full-splice_match SDF4 ENST00000263741.12 2079 7 32 -22 2 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.520721 0.655208 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTCTTTGGGCGTGAAACAA -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.35.2 chr1 - 1892 7 full-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 63 -22 30 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 83 19.748415 1.295532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTCTTTGGGCGTGAAACAA -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 83 NA PB.35.3 chr1 - 1842 6 incomplete-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 3058 -22 -347 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTCTTTGGGCGTGAAACAA 8890 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.35.4 chr1 - 1293 2 incomplete-splice_match SDF4 ENST00000465727.5 2095 7 13177 -22 1439 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTCTTTGGGCGTGAAACAA -11 TRUE NA NA GGGGCT -25 NA NA NA 2 NA PB.35.5 chr1 - 1192 4 incomplete-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 8681 -22 -1969 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 60 14.275963 1.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTCTTTGGGCGTGAAACAA 8741 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 60 NA PB.35.6 chr1 - 1115 3 full-splice_match SDF4 ENST00000494748.1 3516 3 2424 -23 1366 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTCTTTGGGCGTGAAACAA 9920 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.35.7 chr1 - 873 2 full-splice_match SDF4 ENST00000478938.1 2591 2 1730 -12 1730 9 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.568991 0.552545 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTTGGTCAGCTTCATTCTTT 930 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.35.8 chr1 - 1275 5 novel_in_catalog SDF4 novel 1933 7 NA NA 57 -4 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CTTCATTCTTTGGGCGTGAA 9294 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.35.11 chr1 - 2003 7 full-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 -54 -16 12 -6 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 580 138.000977 2.139882 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTTCATTCTTTGGGCGTG 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 580 NA PB.35.12 chr1 - 1834 6 novel_in_catalog SDF4 novel 1933 7 NA NA -14 -6 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTTCATTCTTTGGGCGTG -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.35.14 chr1 - 1370 3 full-splice_match SDF4 ENST00000494748.1 3516 3 2163 -17 1105 -6 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTTCATTCTTTGGGCGTG 9659 FALSE NA NA AATACA -8 NA NA NA 3 NA PB.35.15 chr1 - 1351 5 incomplete-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 8042 -16 -2608 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 28 6.662116 0.823612 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTTCATTCTTTGGGCGTG 8102 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 28 NA PB.35.19 chr1 - 972 3 full-splice_match SDF4 ENST00000494748.1 3516 3 2560 -16 1502 -7 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.855192 0.455635 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGCTTCATTCTTTGGGCGT 9921 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.35.21 chr1 - 1470 6 incomplete-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 3420 -12 15 -10 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.331058 0.522582 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGTCAGCTTCATTCTTTGGG 9252 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.35.22 chr1 - 1587 6 incomplete-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 3288 3 -117 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.806923 0.580574 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATAGTTGCCTTTTTTGGTCA -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.35.24 chr1 - 2212 7 novel_not_in_catalog SDF4 novel 1933 7 NA NA 66 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATAGTTGCCTTTTTTG 9034 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.35.25 chr1 - 2130 7 full-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 -204 7 -138 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATAGTTGCCTTTTTTG 8731 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.35.26 chr1 - 1905 7 novel_not_in_catalog SDF4 novel 1933 7 NA NA -8858 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATAGTTGCCTTTTTTG 11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.35.28 chr1 - 1393 5 incomplete-splice_match SDF4 ENST00000263741.12 2079 7 8123 7 -2557 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATAGTTGCCTTTTTTG 8153 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.35.29 chr1 - 1252 5 incomplete-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 8118 7 -2532 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATAGTTGCCTTTTTTG 8178 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.35.30 chr1 - 1639 6 incomplete-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 3231 8 -174 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.331058 0.522582 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAATATAGTTGCCTTTTTT 9063 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.35.31 chr1 - 1779 7 full-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 11 143 11 -140 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.617260 0.417847 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAATGAGTAGCCAGGAAGTT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.35.32 chr1 - 1162 6 incomplete-splice_match SDF4 ENST00000263741.12 2079 7 -24 1594 12 -2 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAAGGAGTTTGAGGAGC 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.36.1 chr1 + 1530 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 19 1256 19 -1256 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 16 3.806923 0.580574 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAGAACTTGGTGCCTGTACC 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.36.2 chr1 + 1908 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 35 862 35 -862 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTCCCTGGAGTCCGACGC 20 TRUE NA NA AGTAAA -33 NA NA NA 7 NA PB.36.3 chr1 + 2760 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 39 6 39 -6 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACAAAGCCTGCCCCAGGCT 24 TRUE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 5 NA PB.36.4 chr1 + 1383 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 108 1314 108 -1314 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGTTGGCAGTGCGCACGTC 93 FALSE NA NA TATAAA -27 NA NA NA 3 NA PB.36.5 chr1 + 2514 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 285 6 285 -6 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACAAAGCCTGCCCCAGGCT 270 FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.36.6 chr1 + 1640 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 302 863 302 -863 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAGCTCCCTGGAGTCCGACG 287 FALSE NA NA AGTAAA -32 NA NA NA 4 NA PB.36.7 chr1 + 2325 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 474 6 474 -6 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACAAAGCCTGCCCCAGGCT 459 FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.36.8 chr1 + 902 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 589 1314 589 -1314 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGTTGGCAGTGCGCACGTC 574 FALSE NA NA TATAAA -27 NA NA NA 3 NA PB.36.9 chr1 + 1090 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 853 862 853 -862 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTCCCTGGAGTCCGACGC 838 FALSE NA NA AGTAAA -33 NA NA NA 3 NA PB.36.10 chr1 + 1616 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 1183 6 1183 -6 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACAAAGCCTGCCCCAGGCT 1168 FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 6 NA PB.36.11 chr1 + 1500 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 1299 6 1299 -6 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACAAAGCCTGCCCCAGGCT 1284 FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.36.12 chr1 + 1354 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 1445 6 1445 -6 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACAAAGCCTGCCCCAGGCT 1430 FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 7 NA PB.36.13 chr1 + 1157 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 1642 6 1642 -6 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACAAAGCCTGCCCCAGGCT 1627 FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.36.14 chr1 + 938 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 1861 6 1861 -6 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACAAAGCCTGCCCCAGGCT 1846 FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 3 NA PB.37.1 chr1 - 999 8 fusion C1QTNF12_UBE2J2 novel 1036 8 NA NA 0 0 multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CCCACTGCCTTCGAGTGCTG 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.37.2 chr1 - 1945 5 incomplete-splice_match UBE2J2 ENST00000450390.6 2455 8 10466 -1 182 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATGCTGCTTGTGTCTGTGTG 4510 FALSE NA NA AAGAAA -35 NA NA NA 3 NA PB.37.3 chr1 - 2536 7 full-splice_match UBE2J2 ENST00000435198.5 1056 7 1 -1481 1 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTTCATGCTGCTTGTGTC 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.37.4 chr1 - 2370 7 full-splice_match UBE2J2 ENST00000347370.6 2387 7 17 0 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTTCATGCTGCTTGTGTC 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.37.5 chr1 - 2369 8 full-splice_match UBE2J2 ENST00000464036.5 1256 8 21 -1134 1 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTTCATGCTGCTTGTGTC 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.37.6 chr1 - 2250 7 full-splice_match UBE2J2 ENST00000349431.11 2260 7 8 2 -2 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 84 19.986347 1.300733 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTTCATGCTGCTTGTGTC -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 84 NA PB.37.7 chr1 - 2177 6 novel_in_catalog UBE2J2 novel 2260 7 NA NA 0 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTTCATGCTGCTTGTGTC -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.37.8 chr1 - 2121 6 full-splice_match UBE2J2 ENST00000400929.6 1057 6 7 -1071 1 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.855192 0.455635 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTTCATGCTGCTTGTGTC -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.37.9 chr1 - 2071 6 incomplete-splice_match UBE2J2 ENST00000349431.11 2260 7 5860 2 -4425 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTTCATGCTGCTTGTGTC 5850 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.37.10 chr1 - 2075 5 novel_in_catalog UBE2J2 novel 2387 7 NA NA 1 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTTCATGCTGCTTGTGTC 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.37.15 chr1 - 2104 7 incomplete-splice_match UBE2J2 ENST00000464036.5 1256 8 5958 -1133 -4337 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATTTCATGCTGCTTGTGT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.37.18 chr1 - 2417 7 full-splice_match UBE2J2 ENST00000360466.6 1047 7 -122 -1248 1 -2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGAATTTCATGCTGCTTGTG -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.37.19 chr1 - 1705 3 incomplete-splice_match UBE2J2 ENST00000347370.6 2387 7 16811 2 -708 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGAATTTCATGCTGCTTGTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.37.20 chr1 - 2676 5 novel_in_catalog UBE2J2 novel 767 6 NA NA 0 83 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTAGATGTGGTCACTTAGA 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.37.21 chr1 - 2062 7 novel_in_catalog UBE2J2 novel 1021 8 NA NA 0 83 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTAGATGTGGTCACTTAGA 11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.37.22 chr1 - 1985 8 novel_not_in_catalog UBE2J2 novel 1256 8 NA NA -1 83 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTAGATGTGGTCACTTAGA 16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.37.23 chr1 - 1446 8 full-splice_match UBE2J2 ENST00000450390.6 2455 8 16 993 0 83 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTAGATGTGGTCACTTAGA 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.37.24 chr1 - 1426 7 full-splice_match UBE2J2 ENST00000360466.6 1047 7 -117 -262 1 83 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.568991 0.552545 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTAGATGTGGTCACTTAGA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.37.25 chr1 - 1393 7 full-splice_match UBE2J2 ENST00000473215.5 1028 7 1 -366 1 83 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.617260 0.417847 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTAGATGTGGTCACTTAGA -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.37.26 chr1 - 1413 8 novel_not_in_catalog UBE2J2 novel 2455 8 NA NA 0 83 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTAGATGTGGTCACTTAGA -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.37.27 chr1 - 1385 8 full-splice_match UBE2J2 ENST00000464036.5 1256 8 17 -146 2 83 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.855192 0.455635 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTAGATGTGGTCACTTAGA -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.37.28 chr1 - 1270 7 full-splice_match UBE2J2 ENST00000349431.11 2260 7 -1 991 0 82 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 349 83.038513 1.919280 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATTAGATGTGGTCACTTAG -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 349 NA PB.37.29 chr1 - 1229 6 novel_in_catalog UBE2J2 novel 2260 7 NA NA 0 83 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTAGATGTGGTCACTTAGA -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.37.30 chr1 - 1122 6 full-splice_match UBE2J2 ENST00000400929.6 1057 6 18 -83 0 83 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 32 7.613847 0.881604 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTAGATGTGGTCACTTAGA 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 32 NA PB.37.31 chr1 - 1082 6 incomplete-splice_match UBE2J2 ENST00000360466.6 1047 7 5733 -262 -4424 83 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTAGATGTGGTCACTTAGA 5851 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.37.32 chr1 - 936 5 incomplete-splice_match UBE2J2 ENST00000400929.6 1057 6 10483 -83 197 83 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTAGATGTGGTCACTTAGA 4525 FALSE NA NA AAGAAA -20 NA NA NA 5 NA PB.37.33 chr1 - 1818 6 novel_in_catalog UBE2J2 novel 2260 7 NA NA -2 82 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATTAGATGTGGTCACTTAG -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.37.34 chr1 - 1541 7 full-splice_match UBE2J2 ENST00000435198.5 1056 7 7 -492 0 82 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATTAGATGTGGTCACTTAG 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.37.35 chr1 - 1171 6 novel_in_catalog UBE2J2 novel 2260 7 NA NA 0 82 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATTAGATGTGGTCACTTAG 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.37.36 chr1 - 1091 5 novel_in_catalog UBE2J2 novel 1057 6 NA NA 1 82 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATTAGATGTGGTCACTTAG -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.37.37 chr1 - 787 3 incomplete-splice_match UBE2J2 ENST00000400929.6 1057 6 16743 -82 -777 82 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATTAGATGTGGTCACTTAG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.37.38 chr1 - 1491 8 novel_not_in_catalog UBE2J2 novel 1256 8 NA NA 0 78 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATTTTATTAGATGTGGTCAC -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.38.1 chr1 + 2268 12 incomplete-splice_match SCNN1D ENST00000325425.12 2679 15 3814 0 -1186 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCTGGCGGCCAGTGTGTGC 1921 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 4 NA PB.38.2 chr1 + 1847 10 novel_in_catalog SCNN1D novel 3475 15 NA NA -200 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCTGGCGGCCAGTGTGTGC 2907 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.39.1 chr1 - 2766 12 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 856 -496 142 16 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CCCGTGCCTTGCTCTGCTCT 9936 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.39.3 chr1 - 3773 23 novel_not_in_catalog ACAP3 novel 3793 24 NA NA 26 4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.044856 0.606903 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TGCTCCTGGGCTCCCGTGCC 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.39.5 chr1 - 2169 7 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 3026 -481 -921 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GCCTGCTCCTGGGCTCCCGT 8863 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.39.6 chr1 - 1733 4 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 4362 -481 415 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GCCTGCTCCTGGGCTCCCGT 4227 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.39.7 chr1 - 1973 6 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 3402 -480 -545 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TGCCTGCTCCTGGGCTCCCG 9239 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.39.9 chr1 - 3665 22 novel_not_in_catalog ACAP3 novel 3793 24 NA NA 29 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTGCCTGCTCCTGGGCTCC 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.39.10 chr1 - 1914 6 novel_not_in_catalog ACAP3 novel 2725 14 NA NA -463 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTGCCTGCTCCTGGGCTCC 9321 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.39.11 chr1 - 1590 4 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 4502 -478 555 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTGCCTGCTCCTGGGCTCC 4367 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.39.15 chr1 - 3329 23 novel_not_in_catalog ACAP3 novel 3793 24 NA NA 15 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCCCTCATCTCATGTTCTT -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.39.16 chr1 - 3285 23 novel_not_in_catalog ACAP3 novel 3793 24 NA NA 29 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 21 4.996587 0.698673 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCCCTCATCTCATGTTCTT 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 21 NA PB.39.17 chr1 - 3119 22 novel_not_in_catalog ACAP3 novel 3793 24 NA NA 791 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCCCTCATCTCATGTTCTT 3925 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.39.18 chr1 - 2632 16 novel_not_in_catalog ACAP3 novel 3793 24 NA NA -451 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCCCTCATCTCATGTTCTT 7967 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.39.19 chr1 - 1900 10 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 2492 1 -1455 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCCCTCATCTCATGTTCTT 8329 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.39.20 chr1 - 1720 8 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 2917 1 -1030 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCCCTCATCTCATGTTCTT 8754 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.39.21 chr1 - 1474 6 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 3420 1 -527 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCCCTCATCTCATGTTCTT 9257 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.39.22 chr1 - 1313 5 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 4211 1 264 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCCCTCATCTCATGTTCTT 4076 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.39.23 chr1 - 1084 4 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 4529 1 582 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCCCTCATCTCATGTTCTT 4394 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.39.24 chr1 - 1968 5 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 3555 2 -392 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CAGCCCTCATCTCATGTTCT 9392 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.39.25 chr1 - 2000 10 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 2388 5 -1559 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTGCAGCCCTCATCTCATGT 8225 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.39.27 chr1 - 1753 3 full-splice_match ACAP3 ENST00000478065.5 2393 3 640 0 640 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 3774 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.40.3 chr1 + 1284 8 novel_in_catalog PUSL1 novel 1257 8 NA NA -54 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAGACCAGTTTGTTTCTTCA NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.40.4 chr1 + 1418 7 novel_in_catalog PUSL1 novel 1257 8 NA NA -50 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAGACCAGTTTGTTTCTTCA NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.40.5 chr1 + 1265 8 novel_not_in_catalog PUSL1 novel 1257 8 NA NA -30 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACCAGTTTGTTTCTTCAG NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.40.6 chr1 + 1353 8 novel_not_in_catalog PUSL1 novel 1257 8 NA NA -28 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACCAGTTTGTTTCTTCAG NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.40.7 chr1 + 1222 7 novel_in_catalog PUSL1 novel 1257 8 NA NA -24 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACCAGTTTGTTTCTTCAG NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 7 NA PB.40.8 chr1 + 1265 8 full-splice_match PUSL1 ENST00000379031.10 1257 8 -9 1 -9 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 74 17.607019 1.245686 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACCAGTTTGTTTCTTCAG -32 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 74 NA PB.40.9 chr1 + 1276 8 novel_not_in_catalog PUSL1 novel 1257 8 NA NA -3 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACCAGTTTGTTTCTTCAG -26 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.40.10 chr1 + 1426 7 novel_in_catalog PUSL1 novel 1257 8 NA NA 10 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.331058 0.522582 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACCAGTTTGTTTCTTCAG 1 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 14 NA PB.40.11 chr1 + 1106 7 novel_in_catalog PUSL1 novel 1257 8 NA NA 78 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACCAGTTTGTTTCTTCAG -6 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.40.12 chr1 + 1276 7 incomplete-splice_match PUSL1 ENST00000379031.10 1257 8 174 1 -17 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACCAGTTTGTTTCTTCAG 50 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 10 NA PB.42.1 chr1 - 2117 17 full-splice_match INTS11 ENST00000435064.6 2114 17 -12 9 -1 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 266 63.290100 1.801336 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 266 NA PB.42.2 chr1 - 830 5 incomplete-splice_match INTS11 ENST00000462432.5 2863 13 4542 -4 -208 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTGGTACTCTCTTCTTGG 8166 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.42.3 chr1 - 2088 17 novel_not_in_catalog INTS11 novel 2114 17 NA NA 0 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACTTGGTACTCTCTTCTTG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.42.4 chr1 - 2289 19 novel_in_catalog INTS11 novel 2629 19 NA NA 0 1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAGACTACTTGGTACTCTC -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.42.5 chr1 - 2672 15 novel_in_catalog INTS11 novel 2114 17 NA NA -2 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.42.6 chr1 - 2544 16 novel_in_catalog INTS11 novel 2114 17 NA NA 1 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.42.7 chr1 - 2236 18 novel_in_catalog INTS11 novel 2571 19 NA NA 0 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.42.8 chr1 - 2030 16 novel_in_catalog INTS11 novel 2114 17 NA NA 1 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.42.9 chr1 - 1987 16 novel_not_in_catalog INTS11 novel 2114 17 NA NA 1 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.42.10 chr1 - 2004 17 novel_in_catalog INTS11 novel 2571 19 NA NA 0 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.42.11 chr1 - 1954 16 incomplete-splice_match INTS11 ENST00000458452.7 2571 19 3628 3 -117 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 3635 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.42.12 chr1 - 1856 14 incomplete-splice_match INTS11 ENST00000323275.10 2450 16 5094 9 -181 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 5130 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.42.13 chr1 - 1781 14 incomplete-splice_match INTS11 ENST00000323275.10 2450 16 5169 9 -106 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 5205 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.42.14 chr1 - 1679 14 incomplete-splice_match INTS11 ENST00000323275.10 2450 16 5271 9 -4 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 5307 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.42.15 chr1 - 1526 12 incomplete-splice_match INTS11 ENST00000323275.10 2450 16 9182 9 -6 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 9218 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.42.16 chr1 - 1372 11 incomplete-splice_match INTS11 ENST00000323275.10 2450 16 9777 9 -180 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.093125 0.490398 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 9813 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.42.17 chr1 - 1173 9 incomplete-splice_match INTS11 ENST00000323275.10 2450 16 10813 9 17 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.568991 0.552545 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 7266 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.42.18 chr1 - 949 7 incomplete-splice_match INTS11 ENST00000470030.6 2369 10 2372 24 -361 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.331058 0.522582 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 8013 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.42.19 chr1 - 880 5 incomplete-splice_match INTS11 ENST00000470030.6 2369 10 2612 24 -121 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 8253 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.42.20 chr1 - 840 6 incomplete-splice_match INTS11 ENST00000470030.6 2369 10 2566 24 -167 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 8207 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.42.22 chr1 - 2033 3 fusion ENSG00000240731_INTS11 novel 896 4 NA NA 0 6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAAACTTTAATTTTTTTTTT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.42.23 chr1 - 1094 4 full-splice_match INTS11 ENST00000429572.5 1104 4 16 -6 0 6 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 31 7.375914 0.867816 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAAACTTTAATTTTTTTTTT 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 31 NA PB.42.24 chr1 - 1569 3 full-splice_match INTS11 ENST00000498173.2 1589 3 19 1 -2 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TTTTGTTGTGAAACTTTAAT -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.42.25 chr1 - 1255 4 full-splice_match INTS11 ENST00000493534.6 896 4 -2 -357 0 -6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAATGAAGTATGTTTATCT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.43.2 chr1 - 3022 15 full-splice_match DVL1 ENST00000378891.9 2926 15 -99 3 -99 -1 alternative_5end TRUE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACAGATGTGTGGCCTGTGCC 9335 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.43.3 chr1 - 2451 12 incomplete-splice_match DVL1 ENST00000378891.9 2926 15 7019 3 -1728 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACAGATGTGTGGCCTGTGCC 7350 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.43.4 chr1 - 2439 11 incomplete-splice_match DVL1 ENST00000378888.10 3305 15 7659 1 -1394 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACAGATGTGTGGCCTGTGCC 7684 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.43.5 chr1 - 2253 9 incomplete-splice_match DVL1 ENST00000378888.10 3305 15 9101 1 48 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACAGATGTGTGGCCTGTGCC 9126 FALSE NA NA GGGGCT -13 NA NA NA 2 NA PB.43.6 chr1 - 2210 10 incomplete-splice_match DVL1 ENST00000378891.9 2926 15 8670 3 -77 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACAGATGTGTGGCCTGTGCC 9001 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.43.7 chr1 - 1575 3 incomplete-splice_match DVL1 ENST00000378891.9 2926 15 10713 3 1023 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACAGATGTGTGGCCTGTGCC 1684 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.43.8 chr1 - 1514 3 incomplete-splice_match DVL1 ENST00000378891.9 2926 15 10774 3 1084 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACAGATGTGTGGCCTGTGCC 1745 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.43.9 chr1 - 1918 7 incomplete-splice_match DVL1 ENST00000378891.9 2926 15 9348 4 288 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GACAGATGTGTGGCCTGTGC 9679 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.43.10 chr1 - 1709 4 incomplete-splice_match DVL1 ENST00000378891.9 2926 15 10491 6 801 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.093125 0.490398 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GGGACAGATGTGTGGCCTGT 1462 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.43.11 chr1 - 2127 8 incomplete-splice_match DVL1 ENST00000378888.10 3305 15 9291 6 63 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATGGGACAGATGTGTGGCCT 9316 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.43.14 chr1 - 1354 2 incomplete-splice_match DVL1 ENST00000378891.9 2926 15 10960 62 1270 -60 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTGCTTCTGTGTAAATGC 1931 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.44.1 chr1 - 2498 9 novel_in_catalog MXRA8 novel 2001 10 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACTTGTCCCAGGTATGCT 3 TRUE NA NA AAAACA -30 NA NA NA 2 NA PB.44.2 chr1 - 1983 10 novel_in_catalog MXRA8 novel 2001 10 NA NA 0 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACTTGTCCCAGGTATGCT 3 TRUE NA NA AAAACA -30 NA NA NA 3 NA PB.44.3 chr1 - 2019 8 novel_not_in_catalog MXRA8 novel 2231 9 NA NA -23 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACTTGTCCCAGGTATGCT 3219 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.44.4 chr1 - 1509 6 incomplete-splice_match MXRA8 ENST00000309212.11 2293 10 3657 1 118 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACTTGTCCCAGGTATGCT 6899 FALSE NA NA AAAAAG -27 NA NA NA 2 NA PB.44.7 chr1 - 2273 10 full-splice_match MXRA8 ENST00000309212.11 2293 10 18 2 6 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 28 6.662116 0.823612 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGACTTGTCCCAGGTATGC 9 TRUE NA NA AAAACA -24 NA NA NA 28 NA PB.44.9 chr1 - 1686 8 novel_not_in_catalog MXRA8 novel 2001 10 NA NA 0 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGACTTGTCCCAGGTATGC 3 TRUE NA NA AAAACA -30 NA NA NA 4 NA PB.44.10 chr1 - 1280 5 incomplete-splice_match MXRA8 ENST00000309212.11 2293 10 4057 2 -24 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGACTTGTCCCAGGTATGC 7299 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.44.11 chr1 - 1092 3 incomplete-splice_match MXRA8 ENST00000474033.5 1171 4 161 4 144 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGACTTGTCCCAGGTATGC 7694 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.45.1 chr1 - 1105 3 full-splice_match AURKAIP1 ENST00000338370.7 1072 3 -14 -19 2 19 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 102 24.269136 1.385054 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTGCCGGGTGTGAGGTCT 15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 102 NA PB.45.2 chr1 - 909 4 full-splice_match AURKAIP1 ENST00000378853.3 875 4 -34 0 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 222 52.821060 1.722807 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGCCTTTCCTGCGGGTCTGG -21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 222 NA PB.45.3 chr1 - 759 4 full-splice_match AURKAIP1 ENST00000338338.10 753 4 -4 -2 -4 2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 259 61.624573 1.789754 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTTTCCTGCGGGTCTGGAGC -25 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 259 NA PB.45.4 chr1 - 664 3 full-splice_match AURKAIP1 ENST00000338370.7 1072 3 404 4 391 2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTTTCCTGCGGGTCTGGAGC 762 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.45.5 chr1 - 813 4 full-splice_match AURKAIP1 ENST00000321751.9 798 4 -20 5 -16 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 31 7.375914 0.867816 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGCCTTTCCTGCGGGTCTGG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 31 NA PB.45.6 chr1 - 1356 2 incomplete-splice_match AURKAIP1 ENST00000378853.3 875 4 -16 0 -16 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 25 5.948318 0.774394 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGCCTTTCCTGCGGGTCTGG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 25 NA PB.45.7 chr1 - 1055 4 full-splice_match AURKAIP1 ENST00000338338.10 753 4 -303 1 -303 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.568991 0.552545 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGCCTTTCCTGCGGGTCTGG 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.45.8 chr1 - 1027 4 novel_in_catalog AURKAIP1 novel 875 4 NA NA -7 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGCCTTTCCTGCGGGTCTGG 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.45.9 chr1 - 886 4 novel_in_catalog AURKAIP1 novel 753 4 NA NA 11 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGCCTTTCCTGCGGGTCTGG -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.45.10 chr1 - 880 4 full-splice_match AURKAIP1 ENST00000338338.10 753 4 -128 1 -128 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 78 18.558752 1.268549 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGCCTTTCCTGCGGGTCTGG 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 78 NA PB.45.11 chr1 - 805 3 full-splice_match AURKAIP1 ENST00000338370.7 1072 3 260 7 247 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGCCTTTCCTGCGGGTCTGG 618 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.45.13 chr1 - 934 3 full-splice_match AURKAIP1 ENST00000338370.7 1072 3 130 8 117 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CAGCCTTTCCTGCGGGTCTG 488 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.46.1 chr1 + 2159 3 full-splice_match CPTP ENST00000343938.9 2154 3 0 -5 0 5 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 144 34.262310 1.534817 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGCCTGATTTCCTGCAGGGG -24 TRUE NA NA AATAAA -42 NA NA NA 144 NA PB.46.3 chr1 + 1954 2 full-splice_match CPTP ENST00000464957.1 1101 2 48 -901 2 -1 alternative_3end TRUE canonical NA NA NA NA 17 4.044856 0.606903 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTGGGTGCCTGATTTCCTG -22 TRUE NA NA AATAAA -36 NA NA NA 17 NA PB.46.5 chr1 + 2073 3 full-splice_match CPTP ENST00000343938.9 2154 3 80 1 80 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 54 12.848366 1.108848 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTGGGTGCCTGATTTCCTG 3 TRUE NA NA AATAAA -36 NA NA NA 54 NA PB.46.7 chr1 + 1919 3 full-splice_match CPTP ENST00000343938.9 2154 3 233 2 -206 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CACTGGGTGCCTGATTTCCT 120 FALSE NA NA AATAAA -35 NA NA NA 8 NA PB.46.8 chr1 + 2113 3 full-splice_match CPTP ENST00000488011.1 783 3 94 -1424 94 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTGGGTGCCTGATTTCCTG 92 FALSE NA NA AATAAA -36 NA NA NA 2 NA PB.46.9 chr1 + 1776 2 incomplete-splice_match CPTP ENST00000343938.9 2154 3 2111 0 1672 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTGGGTGCCTGATTTCCTGC 45 FALSE NA NA AATAAA -37 NA NA NA 3 NA PB.47.2 chr1 - 5040 11 novel_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA -1 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATTTTATGTTCTCCTAAT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.47.3 chr1 - 3101 11 full-splice_match CCNL2 ENST00000400809.8 3112 11 10 1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATTTTATGTTCTCCTAAT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.47.6 chr1 - 3898 10 novel_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA -255 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACATCCGGAGCGTTATGGAC 9205 FALSE NA NA TATAAA -41 NA NA NA 3 NA PB.47.7 chr1 - 2213 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 1086 -217 210 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACATCCGGAGCGTTATGGAC 7884 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.47.8 chr1 - 3836 12 novel_in_catalog CCNL2 novel 1598 12 NA NA -3 2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GACATCCGGAGCGTTATGGA -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.47.9 chr1 - 4253 11 novel_in_catalog CCNL2 novel 4452 13 NA NA -1 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 25 5.948318 0.774394 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGGACATCCGGAGCGTTATG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 25 NA PB.47.10 chr1 - 3152 12 novel_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGGACATCCGGAGCGTTATG -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.47.11 chr1 - 1271 3 full-splice_match CCNL2 ENST00000463260.5 1941 3 666 4 666 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGGACATCCGGAGCGTTATG 3039 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.47.12 chr1 - 1134 2 incomplete-splice_match CCNL2 ENST00000463260.5 1941 3 887 4 887 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGGACATCCGGAGCGTTATG 3260 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.47.14 chr1 - 3091 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 202 -211 202 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CTCAGGACATCCGGAGCGTT 9918 FALSE NA NA TTTAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.47.15 chr1 - 4849 10 novel_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA 1 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCAGGACATCCGGAGCGT -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.47.16 chr1 - 2299 11 full-splice_match CCNL2 ENST00000400809.8 3112 11 21 792 3 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.331058 0.522582 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCAGGACATCCGGAGCGT 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.47.17 chr1 - 1663 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 1629 -210 4 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCAGGACATCCGGAGCGT 8427 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.47.19 chr1 - 1485 5 incomplete-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 2008 -209 383 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CACTCAGGACATCCGGAGCG 8806 FALSE NA NA AAGAAA -32 NA NA NA 2 NA PB.47.20 chr1 - 2937 12 novel_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA 0 2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 23 5.472452 0.738182 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 GTTAAAGCTATGTATGAAAA -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 23 NA PB.47.21 chr1 - 3005 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 88 -11 88 6 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 ATGTATGAAAACTCAGAACT 9804 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.47.22 chr1 - 2515 13 novel_not_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA 0 6 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 ATGTATGAAAACTCAGAACT -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.47.23 chr1 - 2529 13 novel_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA -4 6 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 ATGTATGAAAACTCAGAACT -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.47.24 chr1 - 4051 11 novel_in_catalog CCNL2 novel 1598 12 NA NA 0 5 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 61 14.513895 1.161784 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TATGTATGAAAACTCAGAAC -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 61 NA PB.47.25 chr1 - 1713 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 1379 -10 -50 5 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TATGTATGAAAACTCAGAAC 8177 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.47.26 chr1 - 4126 11 novel_not_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA -3 1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGCTATGTATGAAAACTCA -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.47.27 chr1 - 3432 7 novel_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA -746 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGCTATGTATGAAAACTC 8779 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.47.28 chr1 - 3264 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 -177 -5 14 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGCTATGTATGAAAACTC 9539 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.47.29 chr1 - 2836 11 novel_not_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA -2 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGCTATGTATGAAAACTC -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.47.31 chr1 - 2454 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 633 -5 -138 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGCTATGTATGAAAACTC 7431 FALSE NA NA GGGGCT -17 NA NA NA 5 NA PB.47.32 chr1 - 2315 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 772 -5 1 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGCTATGTATGAAAACTC 7570 FALSE NA NA AATAGA -11 NA NA NA 6 NA PB.47.33 chr1 - 1916 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 1171 -5 -258 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGCTATGTATGAAAACTC 7969 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.47.34 chr1 - 1372 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 1715 -5 90 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGCTATGTATGAAAACTC 8513 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.47.35 chr1 - 1288 5 incomplete-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 2001 -5 376 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGCTATGTATGAAAACTC 8799 FALSE NA NA AAGAAA -39 NA NA NA 7 NA PB.47.36 chr1 - 2229 12 novel_in_catalog CCNL2 novel 1598 12 NA NA 0 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TAAAGCTATGTATGAAAACT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.47.37 chr1 - 1784 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 1302 -4 -127 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TAAAGCTATGTATGAAAACT 8100 FALSE NA NA ATTAAA -23 NA NA NA 5 NA PB.47.38 chr1 - 986 3 full-splice_match CCNL2 ENST00000463260.5 1941 3 741 214 741 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TAAAGCTATGTATGAAAACT 3114 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.47.40 chr1 - 2123 11 novel_not_in_catalog CCNL2 novel 3112 11 NA NA -2 2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 GTTAAAGCTATGTATGAAAA -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.47.41 chr1 - 1493 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 1591 -2 -34 2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.568991 0.552545 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 GTTAAAGCTATGTATGAAAA 8389 FALSE NA NA GATAAA -33 NA NA NA 15 NA PB.47.42 chr1 - 3153 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 -71 0 -71 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGTTAAAGCTATGTATGAA 9645 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.47.43 chr1 - 3045 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 37 0 37 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGTTAAAGCTATGTATGAA 9753 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.47.44 chr1 - 2662 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 420 0 -351 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGTTAAAGCTATGTATGAA 7218 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.47.45 chr1 - 2097 11 full-splice_match CCNL2 ENST00000400809.8 3112 11 13 1002 3 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 37 8.803510 0.944656 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGTTAAAGCTATGTATGAA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 37 NA PB.47.46 chr1 - 1720 9 incomplete-splice_match CCNL2 ENST00000400809.8 3112 11 991 1002 22 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGTTAAAGCTATGTATGAA 9482 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.47.48 chr1 - 3595 12 novel_in_catalog CCNL2 novel 1598 12 NA NA 3 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 CAAGTTAAAGCTATGTATGA 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.47.49 chr1 - 2079 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 1002 1 126 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 CAAGTTAAAGCTATGTATGA 7800 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.47.51 chr1 - 2854 8 incomplete-splice_match CCNL2 ENST00000496007.5 4452 13 -19 3843 0 811 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 GAAAAAAGAAAGCACGCTAT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.47.52 chr1 - 913 8 incomplete-splice_match CCNL2 ENST00000400809.8 3112 11 10 4631 0 811 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 GAAAAAAGAAAGCACGCTAT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.47.53 chr1 - 2360 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000408918.8 1186 6 -17 -1157 1 22 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACACGTATTGTCTGACATT -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.47.54 chr1 - 1877 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000408918.8 1186 6 -18 -673 0 -462 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATTGTGTTGCTTCTGATTC -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.47.55 chr1 - 1197 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000408918.8 1186 6 -7 -4 1 4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 92 21.889809 1.340242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGATTTCATTTGTTTTTAA -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 92 NA PB.47.56 chr1 - 861 5 incomplete-splice_match CCNL2 ENST00000408918.8 1186 6 673 -1 -278 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CTCAAGATTTCATTTGTTTT 9182 FALSE NA NA AAGAAA -9 NA NA NA 4 NA PB.47.58 chr1 - 1049 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000408918.8 1186 6 -20 157 -2 -157 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.855192 0.455635 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTGTGGGGTTATGTCATGA -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.48.2 chr1 - 1522 5 novel_not_in_catalog MRPL20 novel 700 4 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTTTTTAGAGTCATTTTCT -19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.48.3 chr1 - 998 4 novel_in_catalog MRPL20 novel 700 4 NA NA -12 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTTTTTAGAGTCATTTTCT 27 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.48.4 chr1 - 704 4 novel_not_in_catalog MRPL20 novel 700 4 NA NA 1 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTTTTTAGAGTCATTTTCT -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.48.5 chr1 - 699 4 full-splice_match MRPL20 ENST00000344843.12 700 4 0 1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 171 40.686493 1.609450 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTTTTTAGAGTCATTTTCT -19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 171 NA PB.48.6 chr1 - 605 4 full-splice_match MRPL20 ENST00000344843.12 700 4 94 1 36 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTTTTTAGAGTCATTTTCT 7793 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.48.7 chr1 - 935 5 novel_not_in_catalog MRPL20 novel 700 4 NA NA 3 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAGTTTTTAGAGTCATTTTC -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.48.8 chr1 - 1718 3 full-splice_match MRPL20 ENST00000487659.1 1693 3 -25 0 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TTCAGTTTTTAGAGTCATTT -19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.48.9 chr1 - 1369 4 novel_in_catalog MRPL20 novel 1693 3 NA NA 7 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TTCAGTTTTTAGAGTCATTT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.48.10 chr1 - 836 5 novel_not_in_catalog MRPL20 novel 700 4 NA NA 0 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TTCAGTTTTTAGAGTCATTT -19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.48.11 chr1 - 690 4 novel_not_in_catalog MRPL20 novel 700 4 NA NA 0 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TTCAGTTTTTAGAGTCATTT -19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.48.12 chr1 - 829 5 novel_in_catalog MRPL20 novel 700 4 NA NA -13 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CTTCAGTTTTTAGAGTCATT -32 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.49.1 chr1 + 1691 3 full-splice_match MRPL20-AS1 ENST00000690954.1 1673 3 -35 17 -3 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAACAAACTGCAAATTACTC 204 FALSE NA NA TATAAA -3 NA NA NA 2 NA PB.49.2 chr1 + 1731 3 full-splice_match MRPL20-AS1 ENST00000448629.7 1759 3 22 6 0 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 103 24.507069 1.389291 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAATTACTCTGTCTCTTTTC -23 TRUE NA NA TATAAA -14 NA NA NA 103 NA PB.49.3 chr1 + 2498 1 full-splice_match MRPL20-AS1 ENST00000686850.1 2503 1 0 5 0 2 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCAAATTACTCTGTCTCTTT -23 TRUE NA NA TATAAA -12 NA NA NA 7 NA PB.49.4 chr1 + 2199 2 full-splice_match MRPL20-AS1 ENST00000418833.2 2196 2 11 -14 0 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 23 5.472452 0.738182 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAATTACTCTGTCTCTTTTC -23 TRUE NA NA TATAAA -14 NA NA NA 23 NA PB.49.5 chr1 + 1574 2 novel_in_catalog MRPL20-AS1 novel 1659 3 NA NA 0 -3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAATTACTCTGTCTCTTTTC -12 TRUE NA NA TATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.49.6 chr1 + 1586 3 full-splice_match MRPL20-AS1 ENST00000444362.3 1759 3 37 136 0 -96 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGAGTGTTTGAGTTTCATT -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.49.7 chr1 + 1392 1 full-splice_match MRPL20-AS1 ENST00000687493.1 2209 1 813 4 229 3 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAAATTACTCTGTCTCTTTT 839 FALSE NA NA TATAAA -13 NA NA NA 4 NA PB.49.8 chr1 + 1181 1 full-splice_match MRPL20-AS1 ENST00000687493.1 2209 1 1030 -2 446 -1 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTCTGTCTCTTTTCCTAAT 1056 FALSE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.50.1 chr1 + 2495 3 novel_in_catalog VWA1 novel 4492 3 NA NA 0 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCCTGCAGTCTCGCTAGGA -14 TRUE NA NA AGTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.50.2 chr1 + 1974 3 full-splice_match VWA1 ENST00000338660.5 2147 3 173 0 6 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCCTGCAGTCTCGCTAGGA -8 TRUE NA NA AGTAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.50.3 chr1 + 2367 3 full-splice_match VWA1 ENST00000476993.2 4492 3 8 2117 8 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 27 6.424183 0.807818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCCTGCAGTCTCGCTAGGA -6 TRUE NA NA AGTAAA -15 NA NA NA 27 NA PB.53.1 chr1 + 2585 17 novel_not_in_catalog ATAD3B novel 4098 16 NA NA -33 2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCGTGTCTCTCTATTGACT 2037 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.53.3 chr1 + 2440 16 full-splice_match ATAD3B ENST00000673477.1 4098 16 11 1647 -8 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 48 11.420770 1.057695 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCGCCGTGTCTCTCTATTG 4 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 48 NA PB.53.5 chr1 + 2355 17 novel_not_in_catalog ATAD3B novel 4098 16 NA NA -5 1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CGCCGTGTCTCTCTATTGAC 7 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.53.7 chr1 + 2190 14 full-splice_match ATAD3B ENST00000472194.6 4314 14 477 1647 477 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCGCCGTGTCTCTCTATTG 654 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.53.8 chr1 + 1975 14 full-splice_match ATAD3B ENST00000472194.6 4314 14 692 1647 -331 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCGCCGTGTCTCTCTATTG 869 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 9 NA PB.53.9 chr1 + 1795 11 incomplete-splice_match ATAD3B ENST00000472194.6 4314 14 4134 1647 -1325 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCGCCGTGTCTCTCTATTG 4311 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 7 NA PB.53.10 chr1 + 1654 10 incomplete-splice_match ATAD3B ENST00000472194.6 4314 14 4516 1647 -943 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCGCCGTGTCTCTCTATTG 4693 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 6 NA PB.53.11 chr1 + 1450 9 incomplete-splice_match ATAD3B ENST00000472194.6 4314 14 7121 1647 578 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCGCCGTGTCTCTCTATTG 7298 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 5 NA PB.53.12 chr1 + 1286 7 incomplete-splice_match ATAD3B ENST00000472194.6 4314 14 8166 1647 1623 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCGCCGTGTCTCTCTATTG 8343 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 9 NA PB.53.13 chr1 + 1146 5 novel_in_catalog ATAD3B novel 2114 14 NA NA 2019 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCGCCGTGTCTCTCTATTG 8739 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.53.14 chr1 + 1098 5 incomplete-splice_match ATAD3B ENST00000472194.6 4314 14 9856 1647 3313 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCGCCGTGTCTCTCTATTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 7 NA PB.53.15 chr1 + 969 3 incomplete-splice_match ATAD3B ENST00000485748.5 3233 10 6797 1 5713 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCGCCGTGTCTCTCTATTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.54.1 chr1 - 1614 2 full-splice_match ANKRD65 ENST00000442470.1 876 2 -22 -716 -6 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTGGGTGTCTGAGAGGTT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.57.1 chr1 + 2519 16 full-splice_match ATAD3A ENST00000378756.8 2481 16 -36 -2 -36 2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 183 43.541687 1.638905 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GCCCTGTCTGTCTCTTGGCT 6437 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 183 NA PB.57.3 chr1 + 2563 17 novel_in_catalog ATAD3A novel 2266 17 NA NA -2 2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GCCCTGTCTGTCTCTTGGCT 3 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.57.4 chr1 + 2326 15 novel_in_catalog ATAD3A novel 2481 16 NA NA -2 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG 3 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.57.5 chr1 + 2387 17 novel_not_in_catalog ATAD3A novel 2266 17 NA NA -4 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 33 7.851779 0.894968 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG 14 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 33 NA PB.57.6 chr1 + 2692 17 novel_not_in_catalog ATAD3A novel 2266 17 NA NA 0 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG 18 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.57.7 chr1 + 2282 16 full-splice_match ATAD3A ENST00000378756.8 2481 16 196 3 -27 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.331058 0.522582 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCATTGCCCTGTCTGTCTCT 201 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 14 NA PB.57.8 chr1 + 2347 16 full-splice_match ATAD3A ENST00000536055.6 2330 16 -18 1 -18 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG 355 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.57.9 chr1 + 2086 14 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000536055.6 2330 16 4786 1 246 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG 4774 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 10 NA PB.57.10 chr1 + 1979 13 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000536055.6 2330 16 5196 1 105 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.617260 0.417847 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG 5184 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 11 NA PB.57.11 chr1 + 1861 11 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000536055.6 2330 16 7609 1 2518 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.093125 0.490398 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG 7597 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 13 NA PB.57.12 chr1 + 1678 10 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000536055.6 2330 16 8033 1 2942 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.806923 0.580574 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG 8021 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 16 NA PB.57.13 chr1 + 1531 9 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000536055.6 2330 16 10306 1 -1119 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 9 NA PB.57.14 chr1 + 1388 7 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000536055.6 2330 16 11331 1 -94 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.855192 0.455635 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 12 NA PB.57.15 chr1 + 1320 7 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000536055.6 2330 16 11398 2 -27 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CATTGCCCTGTCTGTCTCTT NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 8 NA PB.57.16 chr1 + 1254 6 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000536055.6 2330 16 11773 1 348 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 6 NA PB.57.17 chr1 + 1144 5 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000536055.6 2330 16 12725 1 1300 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 9 NA PB.57.18 chr1 + 1007 3 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000400830.4 830 8 3769 -542 3769 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 5 NA PB.57.19 chr1 + 943 3 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000400830.4 830 8 3833 -542 3833 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 7 NA PB.57.20 chr1 + 805 2 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000400830.4 830 8 5331 -542 5331 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 6 NA PB.58.1 chr1 - 1450 5 novel_not_in_catalog SSU72 novel 1284 5 NA NA 2 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGTGCCTGGTCCTGAATTC -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.58.2 chr1 - 1504 5 novel_not_in_catalog SSU72 novel 1284 5 NA NA -1048 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTGTGCCTGGTCCTGAATT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.58.3 chr1 - 1318 5 full-splice_match SSU72 ENST00000291386.4 1284 5 -35 1 -35 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 866 206.049728 2.313972 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTGTGCCTGGTCCTGAATT 476 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 866 NA PB.58.4 chr1 - 1063 5 full-splice_match SSU72 ENST00000291386.4 1284 5 220 1 -56 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 504 119.918083 2.078885 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTGTGCCTGGTCCTGAATT -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 504 NA PB.58.6 chr1 - 895 4 incomplete-splice_match SSU72 ENST00000291386.4 1284 5 9949 1 9670 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTGTGCCTGGTCCTGAATT 9941 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.58.7 chr1 - 738 3 full-splice_match SSU72 ENST00000378726.1 2238 3 1500 0 1500 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTGTGCCTGGTCCTGAATT 1870 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.58.8 chr1 - 662 3 full-splice_match SSU72 ENST00000378726.1 2238 3 1576 0 1576 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTGTGCCTGGTCCTGAATT 1946 FALSE NA NA GGGGCT -10 NA NA NA 5 NA PB.58.9 chr1 - 1060 5 full-splice_match SSU72 ENST00000291386.4 1284 5 -27 251 -27 -250 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 ATGCCAAAACGCCAGATGAA 484 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.58.12 chr1 - 2954 2 full-splice_match SSU72 ENST00000359060.5 4176 2 -277 1499 2 -1499 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 27 6.424183 0.807818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAGCCTGACATCCTGTTTTT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 27 NA PB.58.13 chr1 - 2733 2 full-splice_match SSU72 ENST00000359060.5 4176 2 -56 1499 -53 -1499 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAGCCTGACATCCTGTTTTT -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.59.1 chr1 - 2009 1 full-splice_match FNDC10 ENST00000422725.4 2124 1 113 2 113 -2 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 11 2.617260 0.417847 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAGAGCTGTCTGTGTGTT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.59.2 chr1 - 1712 1 full-splice_match FNDC10 ENST00000422725.4 2124 1 410 2 410 -2 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAGAGCTGTCTGTGTGTT 406 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.59.3 chr1 - 1460 1 full-splice_match FNDC10 ENST00000422725.4 2124 1 662 2 662 -2 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAGAGCTGTCTGTGTGTT 658 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.59.4 chr1 - 1280 1 full-splice_match FNDC10 ENST00000422725.4 2124 1 842 2 842 -2 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAGAGCTGTCTGTGTGTT 838 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.59.5 chr1 - 1100 1 full-splice_match FNDC10 ENST00000422725.4 2124 1 1022 2 1022 -2 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAGAGCTGTCTGTGTGTT 1018 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.59.6 chr1 - 958 1 full-splice_match FNDC10 ENST00000422725.4 2124 1 1164 2 1164 -2 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAGAGCTGTCTGTGTGTT 1160 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.59.7 chr1 - 810 1 full-splice_match FNDC10 ENST00000422725.4 2124 1 1312 2 1312 -2 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAGAGCTGTCTGTGTGTT 1308 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.61.1 chr1 - 1535 1 full-splice_match ENSG00000272106 ENST00000607222.1 2038 1 498 5 498 -5 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACCAACTGTTTTTTGTTTTG 873 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.61.2 chr1 - 2034 1 full-splice_match ENSG00000272106 ENST00000607222.1 2038 1 -2 6 -2 -6 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 16 3.806923 0.580574 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACCAACTGTTTTTTGTTTT -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.61.3 chr1 - 1311 1 full-splice_match ENSG00000272106 ENST00000607222.1 2038 1 721 6 721 -6 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACCAACTGTTTTTTGTTTT 1096 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.62.1 chr1 + 987 2 full-splice_match MIB2 ENST00000477990.1 2821 2 -57 1891 5 -4 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAATAGGATTTGGTTTCTA NA FALSE NA NA AATAAA -23 NA NA NA 3 NA PB.62.3 chr1 + 3294 20 novel_in_catalog MIB2 novel 3252 21 NA NA -3 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GGACGTTGCCTCTGCTGTCT -15 TRUE NA NA TATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.62.4 chr1 + 2402 15 incomplete-splice_match MIB2 ENST00000504599.6 3311 19 8693 2 -84 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GGACGTTGCCTCTGCTGTCT 1085 FALSE NA NA TATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.62.5 chr1 + 1641 7 incomplete-splice_match MIB2 ENST00000511502.5 3326 19 12030 0 22 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACGTTGCCTCTGCTGTCTGC 2455 FALSE NA NA TATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.62.6 chr1 + 1516 8 incomplete-splice_match MIB2 ENST00000514234.5 2562 16 3773 1 53 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GACGTTGCCTCTGCTGTCTG -5 TRUE NA NA TATAAA -15 NA NA NA 8 NA PB.62.7 chr1 + 1221 7 incomplete-splice_match MIB2 ENST00000514234.5 2562 16 4258 0 -429 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACGTTGCCTCTGCTGTCTGC 13 FALSE NA NA TATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.62.8 chr1 + 1034 3 novel_in_catalog MIB2 novel 2562 16 NA NA -194 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACGTTGCCTCTGCTGTCTGC 865 FALSE NA NA TATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.62.9 chr1 + 874 4 incomplete-splice_match MIB2 ENST00000483015.1 1058 5 510 -15 -107 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACGTTGCCTCTGCTGTCTGC 7 TRUE NA NA TATAAA -16 NA NA NA 10 NA PB.62.10 chr1 + 714 4 incomplete-splice_match MIB2 ENST00000483015.1 1058 5 668 -13 51 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GGACGTTGCCTCTGCTGTCT 133 FALSE NA NA TATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.63.3 chr1 - 1755 10 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000341832.11 2992 20 18606 4 18574 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAAGCTCCCCGTGTCGTCCT 9238 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.63.4 chr1 - 1498 8 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000341832.11 2992 20 21165 4 21133 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAAGCTCCCCGTGTCGTCCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.63.5 chr1 - 1372 7 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000341832.11 2992 20 21539 4 21507 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAAGCTCCCCGTGTCGTCCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.63.6 chr1 - 1148 5 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000341832.11 2992 20 22044 4 22012 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAAGCTCCCCGTGTCGTCCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.63.7 chr1 - 2823 20 full-splice_match CDK11B ENST00000341832.11 2992 20 -196 365 -188 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAGAGCTGTGTTTTCTCCG -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.63.8 chr1 - 2627 20 full-splice_match CDK11B ENST00000341832.11 2992 20 0 365 0 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAGAGCTGTGTTTTCTCCG -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.63.9 chr1 - 2056 16 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000340677.9 2534 21 9487 -148 9447 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAGAGCTGTGTTTTCTCCG 9666 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.63.10 chr1 - 1513 11 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000407249.7 2677 20 17900 3 17860 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.044856 0.606903 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAGAGCTGTGTTTTCTCCG 8524 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.63.11 chr1 - 1389 10 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000407249.7 2677 20 18619 3 18579 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAGAGCTGTGTTTTCTCCG 9243 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.63.12 chr1 - 1135 8 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000407249.7 2677 20 21175 3 21135 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.617260 0.417847 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAGAGCTGTGTTTTCTCCG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.63.13 chr1 - 2677 21 full-splice_match CDK11B ENST00000340677.9 2534 21 4 -147 -4 -4 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAAAGAGCTGTGTTTTCTCC -21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.63.14 chr1 - 1768 13 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000407249.7 2677 20 17009 6 16969 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGGAAAGAGCTGTGTTTTCT 7633 FALSE NA NA CATAAA -33 NA NA NA 2 NA PB.63.18 chr1 - 979 9 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000340677.9 2534 21 1709 5343 1669 691 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAGAACGAGAAAATGAAAAC 1888 FALSE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.63.19 chr1 - 1124 7 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000407249.7 2677 20 -219 6760 -219 -575 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTGAGTCTTTTCTGGGGGAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.63.21 chr1 - 926 7 novel_in_catalog CDK11B novel 2534 21 NA NA 19 -614 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTGAGGCCAGGCCGGCGCCT 238 FALSE NA NA AAGAAA -33 NA NA NA 2 NA PB.63.22 chr1 - 883 8 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000340677.9 2534 21 30 6648 -10 -614 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTGAGGCCAGGCCGGCGCCT 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.63.23 chr1 - 867 7 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000407249.7 2677 20 -1 6799 -1 -614 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTGAGGCCAGGCCGGCGCCT -26 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.63.24 chr1 - 815 7 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000407249.7 2677 20 51 6799 11 -614 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.855192 0.455635 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTGAGGCCAGGCCGGCGCCT 26 TRUE NA NA AAGAAA -41 NA NA NA 12 NA PB.63.28 chr1 - 667 4 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000611150.3 2350 19 -188 16689 -188 -10655 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TTACTTTCTTTGACATCATG -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.63.41 chr1 - 3176 9 full-splice_match SLC35E2B ENST00000611123.1 5948 9 -44 2816 23 -513 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAACAGAGCAATAATTCTGA 49 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.63.42 chr1 - 2913 9 full-splice_match SLC35E2B ENST00000611123.1 5948 9 219 2816 200 -513 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAACAGAGCAATAATTCTGA 312 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.63.48 chr1 - 1147 10 incomplete-splice_match CDK11A ENST00000460465.5 2333 20 -31 5332 2 -3605 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAGAACGAGAAAATGAAAAC -31 TRUE NA NA GGGGCT -8 NA NA NA 2 NA PB.63.51 chr1 - 878 7 incomplete-splice_match CDK11A ENST00000460465.5 2333 20 -12 6599 -12 -4872 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTGAGTCTTTTCTGGGGGA -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.63.52 chr1 - 908 8 novel_in_catalog CDK11A novel 2984 20 NA NA 0 -4910 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTGAGGCCAGGCCGGCGCCT -33 TRUE NA NA GGGGCT -10 NA NA NA 3 NA PB.63.53 chr1 - 805 7 incomplete-splice_match CDK11A ENST00000358779.9 2419 20 -9 6639 -9 -4912 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGTGAGGCCAGGCCGGCGC -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.63.58 chr1 - 1167 2 incomplete-splice_match CDK11A ENST00000357760.6 2446 20 -31 18882 2 703 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAAAAAACTTATAAA -31 TRUE NA NA GGGGCT -8 NA NA NA 2 NA PB.64.1 chr1 - 2182 7 full-splice_match SLC35E2A ENST00000647043.1 2078 7 -106 2 -33 -2 alternative_5end TRUE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGAGCTCTCCCTGCTTTGT 45 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.64.2 chr1 - 1953 7 full-splice_match SLC35E2A ENST00000647043.1 2078 7 123 2 123 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGAGCTCTCCCTGCTTTGT 274 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.64.11 chr1 - 1874 7 novel_in_catalog SLC35E2A novel 1430 6 NA NA -54 -28 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAAAAAAAAACTTTTTTT 24 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.64.12 chr1 - 1605 7 novel_in_catalog SLC35E2A novel 1430 6 NA NA 142 -28 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAAAAAAAAACTTTTTTT 293 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.65.1 chr1 - 3452 12 novel_in_catalog NADK novel 3235 12 NA NA 0 -7 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.65.2 chr1 - 3268 12 novel_not_in_catalog NADK novel 3235 12 NA NA -376 -7 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 9954 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.65.3 chr1 - 3185 12 full-splice_match NADK ENST00000341426.9 3235 12 43 7 -7 -7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 57 13.562164 1.132329 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 57 NA PB.65.4 chr1 - 3119 12 full-splice_match NADK ENST00000341991.7 3098 12 -28 7 -28 -7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.65.5 chr1 - 2946 9 novel_in_catalog NADK novel 1722 10 NA NA -11 -7 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 9170 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.65.6 chr1 - 2808 10 incomplete-splice_match NADK ENST00000341426.9 3235 12 16454 7 -3441 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 4393 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.65.7 chr1 - 2789 3 novel_in_catalog NADK novel 1722 10 NA NA 173 -7 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 4195 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.65.8 chr1 - 2686 9 incomplete-splice_match NADK ENST00000342348.9 1722 10 1322 -1232 15 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 9156 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.65.9 chr1 - 2499 7 incomplete-splice_match NADK ENST00000342348.9 1722 10 2240 -1232 -8 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 2553 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.65.10 chr1 - 2380 7 novel_in_catalog NADK novel 1722 10 NA NA 75 -7 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 9876 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.65.11 chr1 - 2266 5 incomplete-splice_match NADK ENST00000342348.9 1722 10 3929 -1232 220 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.617260 0.417847 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 4242 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.65.12 chr1 - 2142 4 incomplete-splice_match NADK ENST00000342348.9 1722 10 4213 -1232 21 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 4526 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.65.21 chr1 - 2990 11 incomplete-splice_match NADK ENST00000341426.9 3235 12 13078 9 -6817 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AGAAAATAAGCTGGGTTAAT 1017 FALSE NA NA AAAACA -4 NA NA NA 8 NA PB.65.22 chr1 - 1893 2 incomplete-splice_match NADK ENST00000498806.1 269 3 744 -1734 744 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AGAAAATAAGCTGGGTTAAT 5249 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.65.23 chr1 - 2553 8 incomplete-splice_match NADK ENST00000342348.9 1722 10 1987 -1192 20 -47 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTACGCTTTTCAGATCCTT 9821 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.65.25 chr1 - 1889 3 incomplete-splice_match NADK ENST00000342348.9 1722 10 4500 -1191 308 -48 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATTACGCTTTTCAGATCCT 4813 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.65.26 chr1 - 1917 12 full-splice_match NADK ENST00000341426.9 3235 12 40 1278 -10 -39 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 39 9.279376 0.967519 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTTGAGCTGCCATGCTTTTC 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 39 NA PB.65.27 chr1 - 1820 12 full-splice_match NADK ENST00000341991.7 3098 12 0 1278 0 -39 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTTGAGCTGCCATGCTTTTC 8627 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.65.28 chr1 - 2040 13 novel_in_catalog NADK novel 3235 12 NA NA 11 -49 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAACCTTCCTTGAGCTGC -19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.65.29 chr1 - 1839 12 full-splice_match NADK ENST00000341426.9 3235 12 108 1288 57 -49 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAACCTTCCTTGAGCTGC 9055 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.65.30 chr1 - 1678 10 novel_in_catalog NADK novel 3235 12 NA NA -22 -49 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAACCTTCCTTGAGCTGC -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.65.31 chr1 - 1655 11 incomplete-splice_match NADK ENST00000341426.9 3235 12 13134 1288 -6761 -49 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAACCTTCCTTGAGCTGC 1073 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.65.32 chr1 - 1551 10 novel_in_catalog NADK novel 1722 10 NA NA -1247 -49 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAACCTTCCTTGAGCTGC 6587 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.65.33 chr1 - 1356 9 incomplete-splice_match NADK ENST00000342348.9 1722 10 1371 49 24 -49 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAACCTTCCTTGAGCTGC 9205 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.65.34 chr1 - 1182 7 incomplete-splice_match NADK ENST00000342348.9 1722 10 2276 49 28 -49 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAACCTTCCTTGAGCTGC 2589 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.65.35 chr1 - 886 4 incomplete-splice_match NADK ENST00000342348.9 1722 10 4188 49 -4 -49 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAACCTTCCTTGAGCTGC 4501 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.65.36 chr1 - 923 5 incomplete-splice_match NADK ENST00000342348.9 1722 10 3990 50 -202 -50 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CAAAAACCTTCCTTGAGCTG 4303 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.66.3 chr1 - 3075 12 full-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 85 3 -36 -3 alternative_5end TRUE canonical NA NA NA NA 15 3.568991 0.552545 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GGACTTTGGTGTGGTGATTA 753 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.66.7 chr1 - 3012 11 full-splice_match GNB1 ENST00000610897.4 3145 11 127 6 -24 -5 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGGACTTTGGTGTGGTGAT 765 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.66.8 chr1 - 2911 12 full-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 247 5 -4 -5 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 28 6.662116 0.823612 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGGACTTTGGTGTGGTGAT 915 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 28 NA PB.66.9 chr1 - 2641 8 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 75283 5 2582 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.044856 0.606903 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGGACTTTGGTGTGGTGAT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.66.10 chr1 - 2444 6 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 86590 5 -10300 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.855192 0.455635 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGGACTTTGGTGTGGTGAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.66.11 chr1 - 2299 4 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 100490 5 3600 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.331058 0.522582 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGGACTTTGGTGTGGTGAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.66.12 chr1 - 2185 4 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 100604 5 3714 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 27 6.424183 0.807818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGGACTTTGGTGTGGTGAT 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 27 NA PB.66.14 chr1 - 1952 3 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 101962 5 5072 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 39 9.279376 0.967519 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGGACTTTGGTGTGGTGAT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 39 NA PB.66.19 chr1 - 2981 12 novel_in_catalog GNB1 novel 3163 12 NA NA -54 -6 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAGGGACTTTGGTGTGGTGA 1300 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.66.26 chr1 - 2303 10 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 65601 530 68 -530 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAAAAAAAAAGTTCTGTT 6863 FALSE NA NA AATAAA -7 NA NA NA 4 NA PB.66.38 chr1 - 1558 11 full-splice_match GNB1 ENST00000610897.4 3145 11 120 1467 -31 1235 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACTTGAGTGTAATTGTCA 758 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.66.39 chr1 - 1142 8 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 75317 1470 2616 1231 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.044856 0.606903 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGGTAAACTTGAGTGTAATT 2533 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.66.40 chr1 - 1598 12 full-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 94 1471 -27 1230 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 25 5.948318 0.774394 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAGGTAAACTTGAGTGTAAT 762 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 25 NA PB.66.41 chr1 - 1512 12 novel_in_catalog GNB1 novel 3163 12 NA NA -50 1230 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAGGTAAACTTGAGTGTAAT 1304 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.66.42 chr1 - 1441 11 full-splice_match GNB1 ENST00000610897.4 3145 11 232 1472 -49 1230 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAGGTAAACTTGAGTGTAAT 870 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.66.43 chr1 - 954 6 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 86614 1471 -10276 1230 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAGGTAAACTTGAGTGTAAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.66.44 chr1 - 833 4 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 100490 1471 3600 1230 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAGGTAAACTTGAGTGTAAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.66.45 chr1 - 715 4 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 100608 1471 3718 1230 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAGGTAAACTTGAGTGTAAT 105 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.66.46 chr1 - 1284 10 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 65677 1473 144 1228 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.806923 0.580574 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AGAAGGTAAACTTGAGTGTA 6939 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.68.1 chr1 - 1283 3 incomplete-splice_match TMEM52 ENST00000602604.1 878 4 196 -508 185 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCTCTGCCTATGTGGGAAGG -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.70.1 chr1 + 2297 17 novel_in_catalog PRKCZ novel 2385 18 NA NA -10 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATGTGGAAGCTCCTCTGATG -21 TRUE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.70.2 chr1 + 2316 18 full-splice_match PRKCZ ENST00000378567.8 2385 18 64 5 -10 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 38 9.041443 0.956238 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGGAAGCTCCTCTGATGCCT -4 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 38 NA PB.70.3 chr1 + 1926 16 incomplete-splice_match PRKCZ ENST00000378567.8 2385 18 6110 9 842 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GATGTGGAAGCTCCTCTGAT 6042 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.70.7 chr1 + 1567 12 incomplete-splice_match PRKCZ ENST00000479263.5 1747 13 1616 6 680 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GTGGAAGCTCCTCTGATGCC 680 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.70.8 chr1 + 1457 10 incomplete-splice_match PRKCZ ENST00000479263.5 1747 13 6350 10 5414 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGATGTGGAAGCTCCTCTGA 1709 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 3 NA PB.71.1 chr1 - 1864 3 novel_not_in_catalog FAAP20 novel 811 4 NA NA 46 -5 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATCTGCCTAGTATTTGACTG 369 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.71.2 chr1 - 1346 3 full-splice_match FAAP20 ENST00000400919.7 1413 3 58 9 22 -6 alternative_5end TRUE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATCTGCCTAGTATTTGACT 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.71.3 chr1 - 1487 4 novel_not_in_catalog FAAP20 novel 811 4 NA NA -6 3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATTTCAATCTGCCTAGTATT 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.71.4 chr1 - 1510 4 full-splice_match FAAP20 ENST00000400918.7 811 4 0 -699 0 2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 25 5.948318 0.774394 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CATTTCAATCTGCCTAGTAT 311 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 25 NA PB.71.6 chr1 - 1326 4 incomplete-splice_match FAAP20 ENST00000428120.5 2313 8 52 5073 50 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAACGTCTGCCGCTTTTCTT 373 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.71.7 chr1 - 1195 3 full-splice_match FAAP20 ENST00000476803.1 701 3 -476 -18 50 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAACGTCTGCCGCTTTTCTT 373 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.71.8 chr1 - 1108 4 novel_not_in_catalog FAAP20 novel 727 4 NA NA 10 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAACGTCTGCCGCTTTTCTT 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.71.9 chr1 - 840 5 incomplete-splice_match FAAP20 ENST00000428120.5 2313 8 -16 5073 -6 -3 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAACGTCTGCCGCTTTTCTT 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.71.11 chr1 - 711 4 full-splice_match FAAP20 ENST00000378546.9 727 4 13 3 -8 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 41 9.755241 0.989238 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAACGTCTGCCGCTTTTCTT 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 41 NA PB.71.12 chr1 - 578 3 full-splice_match FAAP20 ENST00000378543.2 569 3 -12 3 10 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAACGTCTGCCGCTTTTCTT 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.71.14 chr1 - 683 4 novel_not_in_catalog FAAP20 novel 727 4 NA NA 10 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAAACGTCTGCCGCTTTTCT 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.71.15 chr1 - 1545 4 full-splice_match FAAP20 ENST00000420515.1 1544 4 -3 2 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATTTGGACATTTTGTGCAT 311 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.79.1 chr1 - 1680 14 full-splice_match MORN1 ENST00000378531.8 1645 14 -36 1 -36 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGGAGGGCACTGCTCCTTG 121 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.80.3 chr1 - 2807 6 full-splice_match PEX10 ENST00000447513.7 2835 6 21 7 -3 -7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATCACTTGGTAAAACGT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.80.5 chr1 - 1708 4 incomplete-splice_match PEX10 ENST00000447513.7 2835 6 3748 830 1188 34 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACACAAGATGGAACTTGAG 5023 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.80.6 chr1 - 2157 6 novel_not_in_catalog PEX10 novel 2905 6 NA NA -87 15 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATGTGGGTACGTTACTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.80.7 chr1 - 2022 6 novel_not_in_catalog PEX10 novel 2905 6 NA NA -3 15 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.331058 0.522582 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATGTGGGTACGTTACTA 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.80.8 chr1 - 2027 6 novel_in_catalog PEX10 novel 2835 6 NA NA -14 15 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.093125 0.490398 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATGTGGGTACGTTACTA -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.80.9 chr1 - 1975 6 full-splice_match PEX10 ENST00000447513.7 2835 6 11 849 11 15 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 140 33.310577 1.522582 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATGTGGGTACGTTACTA -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 140 NA PB.80.10 chr1 - 1825 6 full-splice_match PEX10 ENST00000447513.7 2835 6 161 849 53 15 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATGTGGGTACGTTACTA 1436 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.80.11 chr1 - 1477 4 incomplete-splice_match PEX10 ENST00000447513.7 2835 6 3960 849 1400 15 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATGTGGGTACGTTACTA 5235 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.80.12 chr1 - 1335 3 incomplete-splice_match PEX10 ENST00000447513.7 2835 6 5658 849 3098 15 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATGTGGGTACGTTACTA 6933 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.80.13 chr1 - 1147 2 incomplete-splice_match PEX10 ENST00000447513.7 2835 6 5946 849 3386 15 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATGTGGGTACGTTACTA 7221 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.81.1 chr1 + 3219 8 novel_not_in_catalog RER1 novel 695 8 NA NA -24 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATTACTTCTCAACTGTATG 6400 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 4 NA PB.81.2 chr1 + 1039 7 full-splice_match RER1 ENST00000378512.5 1404 7 -85 450 -23 74 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATCGCATGGATTTCTTTT 6401 FALSE NA NA AAGAAA -15 NA NA NA 5 NA PB.81.3 chr1 + 1090 9 novel_not_in_catalog RER1 novel 695 8 NA NA -21 3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAGTCAAATTTTCTTTTTAA 6403 FALSE NA NA CATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.81.4 chr1 + 921 7 full-splice_match RER1 ENST00000605895.6 3028 7 -28 2135 -15 74 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 275 65.431496 1.815787 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATCGCATGGATTTCTTTT 6409 FALSE NA NA AAGAAA -15 NA NA NA 275 NA PB.81.5 chr1 + 1379 7 full-splice_match RER1 ENST00000605895.6 3028 7 -14 1663 -1 22 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 191 45.445148 1.657488 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATTTCTTTGATACGTAGAGT -18 TRUE NA NA TATAAA -40 NA NA NA 191 NA PB.81.6 chr1 + 3135 8 novel_not_in_catalog RER1 novel 695 8 NA NA -9 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCTGAATTACTTCTCAA 6415 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 10 NA PB.81.7 chr1 + 1055 8 novel_not_in_catalog RER1 novel 695 8 NA NA -1 74 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 35 8.327644 0.920522 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATCGCATGGATTTCTTTT -18 TRUE NA NA AAGAAA -15 NA NA NA 35 NA PB.81.8 chr1 + 989 9 novel_not_in_catalog RER1 novel 695 8 NA NA -1 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGGAGTCAAATTTTCTTT -18 TRUE NA NA CATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.81.9 chr1 + 815 7 novel_not_in_catalog RER1 novel 3028 7 NA NA -1 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGGAGTCAAATTTTCTTT -18 TRUE NA NA CATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.81.10 chr1 + 3040 7 full-splice_match RER1 ENST00000605895.6 3028 7 -13 1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 65 15.465626 1.189368 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCTGAATTACTTCTCAA -17 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 65 NA PB.81.11 chr1 + 907 8 novel_not_in_catalog RER1 novel 695 8 NA NA 0 4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGTCAAATTTTCTTTTTAAA -17 TRUE NA NA CATAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.81.12 chr1 + 989 8 novel_not_in_catalog RER1 novel 695 8 NA NA 3 74 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 48 11.420770 1.057695 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATCGCATGGATTTCTTTT -14 TRUE NA NA AAGAAA -15 NA NA NA 48 NA PB.81.13 chr1 + 1435 8 novel_not_in_catalog RER1 novel 695 8 NA NA 2 -5 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.568991 0.552545 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TTTAATTGTTTGAGATTATT -15 TRUE NA NA TATAAA -13 NA NA NA 15 NA PB.81.14 chr1 + 1492 8 novel_not_in_catalog RER1 novel 695 8 NA NA -4 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAATTGTTTGAGATTATTTT -8 TRUE NA NA TATAAA -15 NA NA NA 8 NA PB.81.15 chr1 + 1297 7 novel_not_in_catalog RER1 novel 2469 6 NA NA 169 4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TTGAGATTATTTTGACACAT 214 FALSE NA NA TATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.81.16 chr1 + 887 7 novel_not_in_catalog RER1 novel 2469 6 NA NA -16 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGGAGTCAAATTTTCTTT 1313 FALSE NA NA CATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.81.17 chr1 + 1347 7 novel_not_in_catalog RER1 novel 2469 6 NA NA 64 4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TTGAGATTATTTTGACACAT 1393 FALSE NA NA TATAAA -22 NA NA NA 3 NA PB.81.18 chr1 + 693 6 full-splice_match RER1 ENST00000488353.2 2469 6 1784 -8 1784 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAATTTTCTTTTTAAAAAGG 3944 FALSE NA NA CATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.81.19 chr1 + 2894 6 full-splice_match RER1 ENST00000488353.2 2469 6 1793 -2218 1793 -2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TACTTCTGAATTACTTCTCA 3953 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.81.20 chr1 + 1191 6 full-splice_match RER1 ENST00000488353.2 2469 6 1822 -544 1822 9 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATTATTTTGACACATTTCTT 3982 FALSE NA NA TATAAA -27 NA NA NA 4 NA PB.81.21 chr1 + 1028 4 incomplete-splice_match RER1 ENST00000488353.2 2469 6 5416 -537 -2530 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GTTTGAGATTATTTTGACAC 7576 FALSE NA NA TATAAA -20 NA NA NA 6 NA PB.81.22 chr1 + 2528 2 full-splice_match RER1 ENST00000462129.1 585 2 271 -2214 271 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAATTACTTCTCAACTGTAT NA FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 5 NA PB.81.23 chr1 + 835 2 full-splice_match RER1 ENST00000462129.1 585 2 271 -521 271 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAATTGTTTGAGATTATTTT NA FALSE NA NA TATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.82.1 chr1 + 1059 1 full-splice_match ENSG00000272449 ENST00000606645.2 1061 1 0 2 0 -2 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA NA NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTTCTGCCTGAGTTTCTG 0 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 5 NA PB.83.1 chr1 + 1564 9 novel_in_catalog TNFRSF14 novel 1702 8 NA NA -19 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAACTGTCACCTCCCGGTGT 1492 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.83.2 chr1 + 2269 8 full-splice_match TNFRSF14 ENST00000355716.5 1702 8 -570 3 -1 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAACTGTCACCTCCCGGTGT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.83.3 chr1 + 1767 9 novel_in_catalog TNFRSF14 novel 1702 8 NA NA -9 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAACTGTCACCTCCCGGTGT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.83.4 chr1 + 2010 8 full-splice_match TNFRSF14 ENST00000355716.5 1702 8 -395 87 -4 -7 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTCGGCTCCTGTTTTCTA 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.83.5 chr1 + 1843 8 full-splice_match TNFRSF14 ENST00000355716.5 1702 8 -144 3 5 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAACTGTCACCTCCCGGTGT 27 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.83.6 chr1 + 1673 8 full-splice_match TNFRSF14 ENST00000355716.5 1702 8 26 3 -8 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAACTGTCACCTCCCGGTGT 13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.83.7 chr1 + 1508 8 full-splice_match TNFRSF14 ENST00000355716.5 1702 8 191 3 5 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAACTGTCACCTCCCGGTGT -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.84.2 chr1 - 1262 9 incomplete-splice_match PANK4 ENST00000378466.9 2641 19 12129 -3 -64 3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GGAGCCATCTGCGATGTTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.84.3 chr1 - 1208 9 incomplete-splice_match PANK4 ENST00000378466.9 2641 19 12182 -2 -11 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CGGAGCCATCTGCGATGTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.84.4 chr1 - 2634 19 full-splice_match PANK4 ENST00000378466.9 2641 19 0 7 0 -7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.093125 0.490398 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAGAGGCCGGAGCCATCT 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.84.5 chr1 - 1483 11 incomplete-splice_match PANK4 ENST00000378466.9 2641 19 8357 7 1056 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAGAGGCCGGAGCCATCT 8363 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.84.6 chr1 - 1097 8 incomplete-splice_match PANK4 ENST00000505228.5 1913 16 6819 -251 3 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAGAGGCCGGAGCCATCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.84.7 chr1 - 1470 9 incomplete-splice_match PANK4 ENST00000378466.9 2641 19 -4 9388 -3 1279 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTCTGTGTGATCCGGCCTT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.85.1 chr1 + 2649 7 full-splice_match PRXL2B ENST00000474659.5 785 7 -55 -1809 -6 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTTTTTGTGCTTTCTTCTT 863 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.85.2 chr1 + 2797 7 full-splice_match PRXL2B ENST00000444521.6 2827 7 25 5 -2 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GAGCCACTTTTTGTGCTTTC -33 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.85.3 chr1 + 2725 7 full-splice_match PRXL2B ENST00000419916.8 2747 7 21 1 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 37 8.803510 0.944656 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTTTTTGTGCTTTCTTCTT -10 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 37 NA PB.85.5 chr1 + 2677 7 full-splice_match PRXL2B ENST00000378427.6 2689 7 11 1 -8 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 49 11.658703 1.066650 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GAGCCACTTTTTGTGCTTTC 1 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 49 NA PB.85.6 chr1 + 839 7 full-splice_match PRXL2B ENST00000419916.8 2747 7 32 1876 -8 -40 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CACTGCTTCGCAGGCTCCGA 1 TRUE NA NA ATTAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.85.7 chr1 + 2692 7 novel_in_catalog PRXL2B novel 2765 7 NA NA 2 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTTTTTGTGCTTTCTTCTT 11 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.85.9 chr1 + 2664 6 incomplete-splice_match PRXL2B ENST00000444521.6 2827 7 301 4 9 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCCACTTTTTGTGCTTTCT -32 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.85.10 chr1 + 2904 5 novel_in_catalog PRXL2B novel 2747 7 NA NA 15 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTTTTTGTGCTTTCTTCTT -26 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.85.11 chr1 + 2591 6 full-splice_match PRXL2B ENST00000484099.5 2577 6 -16 2 -16 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTTTTTGTGCTTTCTTCTT -21 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.85.12 chr1 + 2969 5 incomplete-splice_match PRXL2B ENST00000419916.8 2747 7 288 1 -13 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTTTTTGTGCTTTCTTCTT -18 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.85.13 chr1 + 2571 6 incomplete-splice_match PRXL2B ENST00000419916.8 2747 7 313 5 5 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.234519 0.718877 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCCACTTTTTGTGCTTTCT 7 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 22 NA PB.85.14 chr1 + 2534 6 incomplete-splice_match PRXL2B ENST00000378427.6 2689 7 296 1 9 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 21 4.996587 0.698673 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GAGCCACTTTTTGTGCTTTC 11 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 21 NA PB.85.15 chr1 + 2493 6 incomplete-splice_match PRXL2B ENST00000419916.8 2747 7 390 6 82 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GAGCCACTTTTTGTGCTTTC 84 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 5 NA PB.85.16 chr1 + 2255 3 incomplete-splice_match PRXL2B ENST00000419916.8 2747 7 1771 1 -46 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTTTTTGTGCTTTCTTCTT 1465 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 5 NA PB.88.1 chr1 - 2819 3 full-splice_match MEGF6 ENST00000494257.1 1174 3 718 -2363 718 2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAATATACTAAATAGTAT 3313 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.89.1 chr1 + 2904 15 novel_not_in_catalog ARHGEF16 novel 2822 15 NA NA -54 -5 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAACCTGGATTTTCACAG -5 TRUE NA NA ATTAAA -11 NA NA NA 3 NA PB.89.2 chr1 + 2817 15 full-splice_match ARHGEF16 ENST00000378378.9 2822 15 0 5 0 -5 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAACCTGGATTTTCACAG -4 TRUE NA NA ATTAAA -11 NA NA NA 6 NA PB.89.3 chr1 + 2717 15 novel_not_in_catalog ARHGEF16 novel 2822 15 NA NA 133 -5 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAACCTGGATTTTCACAG 92 FALSE NA NA ATTAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.89.6 chr1 + 1939 12 full-splice_match ARHGEF16 ENST00000378371.6 2219 12 275 5 275 -5 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAACCTGGATTTTCACAG 403 FALSE NA NA ATTAAA -11 NA NA NA 3 NA PB.89.7 chr1 + 1661 10 incomplete-splice_match ARHGEF16 ENST00000378371.6 2219 12 2599 -3 1026 3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GGATTTTCACAGTGACTCTG 1044 FALSE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.89.8 chr1 + 1777 7 incomplete-splice_match ARHGEF16 ENST00000485984.1 2340 8 720 5 720 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAACCTGGATTTTCACAG 1865 FALSE NA NA ATTAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.89.9 chr1 + 1219 6 incomplete-splice_match ARHGEF16 ENST00000378371.6 2219 12 9050 6 3252 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAGAACCTGGATTTTCACA 4397 FALSE NA NA ATTAAA -10 NA NA NA 2 NA PB.89.10 chr1 + 1058 5 incomplete-splice_match ARHGEF16 ENST00000378371.6 2219 12 11024 5 5226 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAACCTGGATTTTCACAG 6371 FALSE NA NA ATTAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.89.11 chr1 + 1230 4 incomplete-splice_match ARHGEF16 ENST00000485984.1 2340 8 5451 5 5451 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAACCTGGATTTTCACAG 6596 FALSE NA NA ATTAAA -11 NA NA NA 3 NA PB.90.1 chr1 - 1919 1 full-splice_match ENSG00000238260 ENST00000692374.1 1921 1 0 2 0 -2 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA NA NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TATGGATGAGTTTCCTGGGG -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.93.1 chr1 - 1683 12 full-splice_match WRAP73 ENST00000270708.12 1692 12 7 2 7 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 64 15.227694 1.182634 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACTACTTCTCTTCTTGAAA -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 64 NA PB.93.3 chr1 - 1867 10 novel_in_catalog WRAP73 novel 1998 11 NA NA -4 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACTACTTCTCTTCTTGAAA 22 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.93.5 chr1 - 1555 11 novel_in_catalog WRAP73 novel 1692 12 NA NA 0 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.331058 0.522582 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACTACTTCTCTTCTTGAAA -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.93.7 chr1 - 1494 7 incomplete-splice_match WRAP73 ENST00000378322.7 1998 11 12986 7 -15 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACAACTACTTCTCTTCTTGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.93.8 chr1 - 1399 11 incomplete-splice_match WRAP73 ENST00000270708.12 1692 12 2659 4 2582 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACAACTACTTCTCTTCTTGA 2645 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.93.9 chr1 - 1109 3 incomplete-splice_match WRAP73 ENST00000378322.7 1998 11 16562 7 1937 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACAACTACTTCTCTTCTTGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.93.10 chr1 - 1047 7 incomplete-splice_match WRAP73 ENST00000270708.12 1692 12 14093 5 -560 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TACAACTACTTCTCTTCTTG NA FALSE NA NA ATTAAA -2 NA NA NA 6 NA PB.93.11 chr1 - 870 6 novel_in_catalog WRAP73 novel 1692 12 NA NA -518 -5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TACAACTACTTCTCTTCTTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.93.12 chr1 - 1203 9 incomplete-splice_match WRAP73 ENST00000270708.12 1692 12 11321 6 843 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATACAACTACTTCTCTTCTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.95.1 chr1 - 2929 5 full-splice_match TP73-AS1 ENST00000647831.1 3831 5 -39 941 -2 9 alternative_3end TRUE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CACTCACATTTCTGTGTTCA -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.95.2 chr1 - 5245 4 full-splice_match TP73-AS1 ENST00000452079.5 6358 4 -53 1166 -2 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACCCTTGTGCTGAAAGCACT -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.95.3 chr1 - 3521 5 full-splice_match TP73-AS1 ENST00000423764.6 3525 5 3 1 3 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACCCTTGTGCTGAAAGCACT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.96.4 chr1 - 2655 7 full-splice_match LRRC47 ENST00000378251.3 4303 7 -13 1661 -13 915 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 181 43.065819 1.634133 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGCTTGTGTAAAGACTCT -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 181 NA PB.96.5 chr1 - 2539 7 full-splice_match LRRC47 ENST00000378251.3 4303 7 103 1661 103 915 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGCTTGTGTAAAGACTCT 102 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.96.6 chr1 - 2434 7 novel_not_in_catalog LRRC47 novel 4303 7 NA NA 2 915 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGCTTGTGTAAAGACTCT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.96.8 chr1 - 2079 7 full-splice_match LRRC47 ENST00000378251.3 4303 7 563 1661 563 915 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGCTTGTGTAAAGACTCT 562 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.96.9 chr1 - 1889 6 incomplete-splice_match LRRC47 ENST00000378251.3 4303 7 9304 1661 -3019 915 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGCTTGTGTAAAGACTCT 9303 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.96.10 chr1 - 1750 6 incomplete-splice_match LRRC47 ENST00000378251.3 4303 7 9443 1661 -2880 915 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.568991 0.552545 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGCTTGTGTAAAGACTCT 9442 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.96.11 chr1 - 1601 6 incomplete-splice_match LRRC47 ENST00000378251.3 4303 7 9592 1661 -2731 915 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.044856 0.606903 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGCTTGTGTAAAGACTCT 9591 FALSE NA NA GGGGCT -7 NA NA NA 17 NA PB.96.12 chr1 - 1337 4 full-splice_match LRRC47 ENST00000462356.5 575 4 153 -915 25 915 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 28 6.662116 0.823612 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGCTTGTGTAAAGACTCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 28 NA PB.96.13 chr1 - 1247 3 incomplete-splice_match LRRC47 ENST00000462356.5 575 4 1475 -915 1347 915 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGCTTGTGTAAAGACTCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.96.17 chr1 - 2303 7 full-splice_match LRRC47 ENST00000378251.3 4303 7 -8 2008 -8 568 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGTGATTTTACGGTTTTT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.96.18 chr1 - 1554 7 full-splice_match LRRC47 ENST00000378251.3 4303 7 0 2749 0 -18 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AGAAAATAAAGAGGAAGGAT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.97.1 chr1 + 1289 4 full-splice_match SMIM1 ENST00000444870.7 547 4 -16 -726 0 726 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAGCCCTTGCCATAGTTACC -13 TRUE NA NA AATGAA -11 NA NA NA 5 NA PB.97.2 chr1 + 536 4 full-splice_match SMIM1 ENST00000444870.7 547 4 -16 27 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACACGTGAGAGCACAGGCCT -13 TRUE NA NA AATAAA -34 NA NA NA 3 NA PB.98.1 chr1 - 3721 22 full-splice_match CEP104 ENST00000378230.8 6431 22 0 2710 0 443 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGAGAACATCTTTTTTT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.98.2 chr1 - 2140 13 incomplete-splice_match CEP104 ENST00000675966.1 7766 17 9438 2710 569 443 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGAGAACATCTTTTTTT 596 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.98.3 chr1 - 1111 5 incomplete-splice_match CEP104 ENST00000675966.1 7766 17 20157 2710 5376 443 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGAGAACATCTTTTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -5 NA NA NA 4 NA PB.98.4 chr1 - 1722 10 incomplete-splice_match CEP104 ENST00000675966.1 7766 17 14783 2713 2 440 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 GGCAAAAGAGAACATCTTTT 5941 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.98.5 chr1 - 3131 21 full-splice_match CEP104 ENST00000428079.6 3152 21 22 -1 0 1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTTCATGTTCTGGTTCCTTA -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.98.11 chr1 - 738 5 incomplete-splice_match CEP104 ENST00000438539.6 1666 12 2079 13020 2063 349 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAACAAAAGAAAGAAGAA 2090 FALSE NA NA AAAACA -19 NA NA NA 2 NA PB.98.16 chr1 - 2316 12 full-splice_match CEP104 ENST00000494653.5 2174 12 -13 -129 0 129 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AATAGAAATATTTTCATTCT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.98.21 chr1 - 1160 7 novel_not_in_catalog CEP104 novel 1661 4 NA NA 0 1298 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GATTTAGACTTTAAATCTGT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.98.22 chr1 - 1068 5 novel_not_in_catalog CEP104 novel 1661 4 NA NA -1 34 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATAATAGATTATTTATTG 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.99.1 chr1 + 1423 7 incomplete-splice_match DFFB ENST00000491998.5 3152 8 -34 12132 -20 752 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTGTAGCCTTGCCCTTGC NA FALSE NA NA TTTAAA -23 NA NA NA 2 NA PB.99.2 chr1 + 3035 7 full-splice_match DFFB ENST00000378209.8 2833 7 -211 9 -2 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAATAGACATGTCAAGAA -12 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 6 NA PB.99.3 chr1 + 2849 7 full-splice_match DFFB ENST00000378209.8 2833 7 -25 9 -9 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAATAGACATGTCAAGAA 174 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 3 NA PB.99.4 chr1 + 2262 4 incomplete-splice_match DFFB ENST00000475969.5 2731 7 10378 9 315 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAATAGACATGTCAAGAA 6900 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 3 NA PB.99.5 chr1 + 2061 3 incomplete-splice_match DFFB ENST00000475969.5 2731 7 12130 9 2067 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAATAGACATGTCAAGAA 8652 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.101.1 chr1 + 1941 5 incomplete-splice_match AJAP1 ENST00000378190.7 2383 6 519 2765 519 -2765 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAATATAAAAATAAGAGATA 352 FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.101.4 chr1 + 1376 5 incomplete-splice_match AJAP1 ENST00000378191.5 12102 6 57821 9350 1275 5390 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GGCAACTCACGTCACACACA 6998 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.103.3 chr1 - 3464 3 full-splice_match C1orf174 ENST00000474140.1 3499 3 21 14 0 -6 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATATTTTGAAAGCAGTC -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.103.5 chr1 - 1793 5 full-splice_match C1orf174 ENST00000680054.1 1779 5 0 -14 0 -6 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATATTTTGAAAGCAGTC -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.103.7 chr1 - 1682 2 incomplete-splice_match C1orf174 ENST00000680169.1 1567 4 8906 -14 8906 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATATTTTGAAAGCAGTC 8945 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.103.8 chr1 - 1645 4 full-splice_match C1orf174 ENST00000361605.4 1645 4 -6 6 0 -6 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 194 46.158947 1.664256 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATATTTTGAAAGCAGTC -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 194 NA PB.103.9 chr1 - 1394 2 incomplete-splice_match C1orf174 ENST00000680169.1 1567 4 9194 -14 9194 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATATTTTGAAAGCAGTC 9233 FALSE NA NA AAGAAA -10 NA NA NA 4 NA PB.103.10 chr1 - 1282 2 incomplete-splice_match C1orf174 ENST00000680169.1 1567 4 9306 -14 9306 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATATTTTGAAAGCAGTC 9345 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.103.11 chr1 - 1114 2 incomplete-splice_match C1orf174 ENST00000680169.1 1567 4 9474 -14 9474 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATATTTTGAAAGCAGTC 9513 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.103.12 chr1 - 1058 2 incomplete-splice_match C1orf174 ENST00000680169.1 1567 4 9530 -14 9530 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATATTTTGAAAGCAGTC 9569 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.103.13 chr1 - 991 2 incomplete-splice_match C1orf174 ENST00000680169.1 1567 4 9595 -12 9595 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TGAAAATATTTTGAAAGCAG 9634 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.104.1 chr1 + 1780 2 intergenic novelGene_62 novel NA NA NA NA NA NA multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATGTATTGTTTGTGTGTTAA NA FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.106.2 chr1 - 1658 9 novel_not_in_catalog NPHP4 novel 4467 26 NA NA -777 2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CCCTTGGCAGTTTTCTTGAG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.106.3 chr1 - 729 2 incomplete-splice_match NPHP4 ENST00000478423.6 4467 26 128403 -2 3631 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CCCTTGGCAGTTTTCTTGAG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.106.5 chr1 - 2139 12 incomplete-splice_match NPHP4 ENST00000478423.6 4467 26 112296 0 -2662 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTCCCTTGGCAGTTTTCTTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.106.6 chr1 - 1606 4 novel_in_catalog NPHP4 novel 4467 26 NA NA 1249 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTCCCTTGGCAGTTTTCTTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.106.7 chr1 - 1297 7 incomplete-splice_match NPHP4 ENST00000478423.6 4467 26 124650 1 -122 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTTCCCTTGGCAGTTTTCTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.107.1 chr1 + 3899 16 full-splice_match KCNAB2 ENST00000378097.6 4302 16 396 7 -8 -1 alternative_5end TRUE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGTGACTTTTTGCTCCTC -25 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 3 NA PB.107.2 chr1 + 3832 15 full-splice_match KCNAB2 ENST00000666163.1 3878 15 37 9 1 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.617260 0.417847 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCGGTCTCTGTGACTTTTT -7 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 11 NA PB.107.3 chr1 + 3668 14 novel_in_catalog KCNAB2 novel 3835 16 NA NA 0 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCGGTCTCTGTGACTTTTT 28 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.107.5 chr1 + 3855 15 full-splice_match KCNAB2 ENST00000352527.6 4001 15 150 -4 -7 2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 58 13.800097 1.139882 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GGTCTCTGTGACTTTTTGCT 13 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 58 NA PB.107.8 chr1 + 714 8 novel_in_catalog KCNAB2 novel 736 8 NA NA -1 2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATCCCCTGATCACGTCTT -6 TRUE NA NA ATTAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.107.10 chr1 + 3871 16 full-splice_match KCNAB2 ENST00000428161.6 2134 16 323 -2060 2 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCGGTCTCTGTGACTTTTT -3 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 9 NA PB.107.11 chr1 + 1196 15 full-splice_match KCNAB2 ENST00000352527.6 4001 15 180 2625 -2 -8 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAGGACTACAGATCCTA 4 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 4 NA PB.107.12 chr1 + 3766 15 full-splice_match KCNAB2 ENST00000352527.6 4001 15 236 -1 38 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCGGTCTCTGTGACTTTTT 25 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.107.16 chr1 + 3599 13 incomplete-splice_match KCNAB2 ENST00000662363.1 2958 14 6993 -1156 -669 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCGGTCTCTGTGACTTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.107.18 chr1 + 3432 10 incomplete-splice_match KCNAB2 ENST00000662363.1 2958 14 19447 -1156 -2301 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCGGTCTCTGTGACTTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.107.19 chr1 + 3203 6 incomplete-splice_match KCNAB2 ENST00000662363.1 2958 14 28651 -1156 4 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCGGTCTCTGTGACTTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.107.20 chr1 + 2897 3 incomplete-splice_match KCNAB2 ENST00000671076.1 4620 5 2168 1 2168 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGTGACTTTTTGCTCCTC NA FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 4 NA PB.107.21 chr1 + 2742 2 incomplete-splice_match KCNAB2 ENST00000671076.1 4620 5 2828 8 2828 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCGGTCTCTGTGACTTTTT 20 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.108.1 chr1 + 1324 3 full-splice_match RNF207 ENST00000484435.1 551 3 -25 -748 -15 5 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.617260 0.417847 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAAAAAAATTTTTTT -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.108.2 chr1 + 1545 2 novel_in_catalog RNF207 novel 551 3 NA NA -3 5 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAAAAAAATTTTTTT 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.110.5 chr1 - 2056 4 full-splice_match RPL22 ENST00000234875.9 2061 4 -1 6 -1 -6 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 92 21.889809 1.340242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTGTACGAGGCTTTGTTTT 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 92 NA PB.110.9 chr1 - 1933 3 full-splice_match RPL22 ENST00000480661.1 2279 3 1888 -1542 1878 -13 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.617260 0.417847 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TACTCTTACTGTACGAGGCT 3204 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.110.17 chr1 - 1074 4 full-splice_match RPL22 ENST00000234875.9 2061 4 -212 1199 -212 356 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTCGTCTTACTTTCATTTT 9586 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.110.18 chr1 - 891 4 full-splice_match RPL22 ENST00000234875.9 2061 4 -29 1199 -29 356 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 242 57.579716 1.760270 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTCGTCTTACTTTCATTTT -19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 242 NA PB.110.19 chr1 - 784 3 full-splice_match RPL22 ENST00000480661.1 2279 3 1851 -356 1841 356 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.568991 0.552545 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTCGTCTTACTTTCATTTT 3167 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.110.20 chr1 - 708 2 incomplete-splice_match RPL22 ENST00000480661.1 2279 3 6523 -355 6513 355 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 21 4.996587 0.698673 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATTCGTCTTACTTTCATTT 7839 FALSE NA NA ATTAAA -20 NA NA NA 21 NA PB.110.21 chr1 - 2240 3 full-splice_match RPL22 ENST00000480661.1 2279 3 -5 44 -5 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAATGGTGGTTTATCCTTG 9825 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.110.22 chr1 - 1222 4 novel_not_in_catalog RPL22 novel 508 4 NA NA -10 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAATGGTGGTTTATCCTTG 9820 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.110.23 chr1 - 1061 4 novel_not_in_catalog RPL22 novel 2061 4 NA NA 141 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAATGGTGGTTTATCCTTG 9981 FALSE NA NA GGGGCT -44 NA NA NA 2 NA PB.110.24 chr1 - 1009 6 novel_in_catalog RPL22 novel 806 5 NA NA -5 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAATGGTGGTTTATCCTTG -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.110.25 chr1 - 966 6 novel_in_catalog RPL22 novel 806 5 NA NA 15 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAATGGTGGTTTATCCTTG 19 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.110.26 chr1 - 804 4 full-splice_match RPL22 ENST00000497965.5 786 4 -22 4 -22 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAATGGTGGTTTATCCTTG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.110.27 chr1 - 843 5 novel_in_catalog RPL22 novel 806 5 NA NA 411 -4 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAATGGTGGTTTATCCTTG 560 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.110.28 chr1 - 704 5 full-splice_match RPL22 ENST00000471204.5 524 5 -107 -73 38 -4 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAATGGTGGTTTATCCTTG -26 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.110.29 chr1 - 461 4 full-splice_match RPL22 ENST00000234875.9 2061 4 1 1599 1 -4 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 68 16.179424 1.208963 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAATGGTGGTTTATCCTTG 11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 68 NA PB.110.31 chr1 - 862 3 novel_in_catalog RNF207-AS1 novel 378 3 NA NA -3584 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAGATATTTGAGCTGTTTTC 29 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.112.2 chr1 - 3689 6 novel_not_in_catalog ICMT novel 2612 6 NA NA -3 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACCACAGTGTGATTGTCTGG 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.112.3 chr1 - 3631 6 novel_not_in_catalog ICMT novel 2612 6 NA NA -29 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACCACAGTGTGATTGTCTG -24 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.112.4 chr1 - 3518 6 novel_in_catalog ICMT novel 2612 6 NA NA -2 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACCACAGTGTGATTGTCTG 11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.112.5 chr1 - 3525 6 novel_not_in_catalog ICMT novel 2612 6 NA NA -16 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACCACAGTGTGATTGTCTG -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.112.6 chr1 - 3208 6 novel_not_in_catalog ICMT novel 2612 6 NA NA -3 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACCACAGTGTGATTGTCTG 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.112.7 chr1 - 3042 5 novel_not_in_catalog ICMT novel 4795 5 NA NA -7 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACCACAGTGTGATTGTCTG -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.112.8 chr1 - 2594 6 novel_not_in_catalog ICMT novel 2612 6 NA NA -3 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACCACAGTGTGATTGTCTG 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.112.10 chr1 - 2347 2 novel_not_in_catalog ICMT novel 328 2 NA NA -1635 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACCACAGTGTGATTGTCTG NA FALSE NA NA AAAAAG -24 NA NA NA 2 NA PB.112.11 chr1 - 2326 2 novel_not_in_catalog ICMT novel 328 2 NA NA -1263 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACCACAGTGTGATTGTCTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.112.13 chr1 - 1391 2 novel_not_in_catalog ICMT novel 328 2 NA NA -679 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACCACAGTGTGATTGTCTG 424 FALSE NA NA AATAAA -32 NA NA NA 2 NA PB.112.16 chr1 - 2600 6 full-splice_match ICMT ENST00000489498.5 2612 6 51 -39 43 39 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAGAGGCTTACGGGTTCAT 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.112.17 chr1 - 2563 5 full-splice_match ICMT ENST00000343813.10 4795 5 -27 2259 -19 39 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 151 35.927837 1.555431 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAGAGGCTTACGGGTTCAT -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 151 NA PB.112.18 chr1 - 2106 3 incomplete-splice_match ICMT ENST00000489498.5 2612 6 2422 -39 2414 39 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAGAGGCTTACGGGTTCAT 2427 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.112.20 chr1 - 2294 5 novel_not_in_catalog ICMT novel 4795 5 NA NA 201 2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TCATGGCTTAATGAATTTTT 214 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.112.21 chr1 - 2617 6 full-splice_match ICMT ENST00000489498.5 2612 6 -6 1 -6 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.520721 0.655208 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTTCATGGCTTAATGAATT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.112.22 chr1 - 1917 2 incomplete-splice_match ICMT ENST00000489498.5 2612 6 3925 1 3917 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTTCATGGCTTAATGAATT 3930 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.112.26 chr1 - 2339 4 full-splice_match ICMT ENST00000474756.1 1227 4 -7 -1105 -7 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGATTTCATGGCTTAATGAA -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.112.30 chr1 - 2424 5 full-splice_match ICMT ENST00000343813.10 4795 5 -24 2395 -16 -97 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 ACAAAAATGGGCAGACATTT -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.112.31 chr1 - 1437 5 full-splice_match ICMT ENST00000343813.10 4795 5 -14 3372 -6 34 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAATACTTCCTCATAGGA -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.112.32 chr1 - 954 4 incomplete-splice_match ICMT ENST00000343813.10 4795 5 -19 10499 -11 -7093 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATGTAGTCCTTAATGCTTT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.112.33 chr1 - 841 4 incomplete-splice_match ICMT ENST00000343813.10 4795 5 -24 10617 -16 -7211 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATATACAATTAGTGGTT -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.114.1 chr1 + 2048 5 novel_not_in_catalog LINC00337 novel 1138 5 NA NA -90 11 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAATATAAGAAAAAAAAG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.115.1 chr1 - 1453 10 novel_not_in_catalog ACOT7 novel 1472 10 NA NA 3 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCACGTGTCCTGGGTGGT -7 TRUE NA NA CATAAA -7 NA NA NA 2 NA PB.115.2 chr1 - 1426 9 full-splice_match ACOT7 ENST00000377845.7 1432 9 6 0 6 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCACGTGTCCTGGGTGGT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.115.3 chr1 - 1398 9 full-splice_match ACOT7 ENST00000377842.7 1813 9 415 0 415 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 23 5.472452 0.738182 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCACGTGTCCTGGGTGGT 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 23 NA PB.115.4 chr1 - 1437 9 full-splice_match ACOT7 ENST00000608083.5 1403 9 -38 4 -38 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 277 65.907356 1.818934 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCACGTGTCCTGGGTGGT -1 TRUE NA NA GGGGCT -18 NA NA NA 277 NA PB.115.6 chr1 - 1288 8 incomplete-splice_match ACOT7 ENST00000377842.7 1813 9 9484 0 2389 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.617260 0.417847 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCACGTGTCCTGGGTGGT 9715 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.115.7 chr1 - 1242 8 novel_in_catalog ACOT7 novel 1804 9 NA NA -28 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCACGTGTCCTGGGTGGT 445 FALSE NA NA CATAAA -38 NA NA NA 3 NA PB.115.8 chr1 - 1151 7 incomplete-splice_match ACOT7 ENST00000377842.7 1813 9 19780 0 12685 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCACGTGTCCTGGGTGGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.115.9 chr1 - 1039 7 incomplete-splice_match ACOT7 ENST00000377842.7 1813 9 19892 0 12797 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 25 5.948318 0.774394 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCACGTGTCCTGGGTGGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 25 NA PB.115.10 chr1 - 886 5 incomplete-splice_match ACOT7 ENST00000377842.7 1813 9 31972 0 24877 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.093125 0.490398 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCACGTGTCCTGGGTGGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.115.11 chr1 - 708 3 incomplete-splice_match ACOT7 ENST00000377842.7 1813 9 64381 0 541 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCACGTGTCCTGGGTGGT 188 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.115.12 chr1 - 1612 9 full-splice_match ACOT7 ENST00000377855.6 1614 9 1 1 1 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 50 11.896635 1.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GACCCACGTGTCCTGGGTGG -25 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 50 NA PB.116.1 chr1 - 2581 9 novel_not_in_catalog TNFRSF25 novel 1726 9 NA NA -6 -24 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAGAAAACAAAACAAAACA -20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.116.2 chr1 - 1577 10 full-splice_match TNFRSF25 ENST00000356876.8 1968 10 2 389 2 -24 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.044856 0.606903 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAGAAAACAAAACAAAACA -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.116.3 chr1 - 1446 8 novel_not_in_catalog TNFRSF25 novel 1198 9 NA NA -55 -24 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAGAAAACAAAACAAAACA 9418 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.116.4 chr1 - 1277 4 full-splice_match TNFRSF25 ENST00000473343.5 1591 4 290 24 15 -24 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAGAAAACAAAACAAAACA 8249 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.117.1 chr1 - 2314 10 incomplete-splice_match PLEKHG5 ENST00000489097.6 3938 19 5967 1 -38 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTGGGAAGAGTCCTTTGCT 3482 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.119.2 chr1 + 2154 8 novel_not_in_catalog ESPN novel 1494 7 NA NA -1939 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTCGCTGTGGCCGCGACTT 708 FALSE NA NA ATTAAA -29 NA NA NA 2 NA PB.119.3 chr1 + 1949 6 novel_not_in_catalog ESPN novel 1494 7 NA NA -1016 3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCTCCGGTTCACTCACTCGC 1631 FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 5 NA PB.119.4 chr1 + 1913 7 novel_not_in_catalog ESPN novel 1339 8 NA NA 116 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATGCCGACTTACATATATTT 105 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.119.5 chr1 + 1435 6 novel_not_in_catalog ESPN novel 1339 8 NA NA -15 -8 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATTTGCATGCCGACTTACA -3 TRUE NA NA AAAAAG -39 NA NA NA 2 NA PB.119.6 chr1 + 1537 5 novel_not_in_catalog ESPN novel 1339 8 NA NA -14 5 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATATATTTGCATGTTCGTTG -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.119.7 chr1 + 1969 6 novel_not_in_catalog ESPN novel 1339 8 NA NA -10 4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTCCGGTTCACTCACTCGCT 2 TRUE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 4 NA PB.119.8 chr1 + 1927 6 novel_not_in_catalog ESPN novel 1339 8 NA NA 45 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTCGCTGTGGCCGCGACTT 21 TRUE NA NA ATTAAA -29 NA NA NA 2 NA PB.119.9 chr1 + 1382 6 novel_not_in_catalog ESPN novel 1339 8 NA NA 45 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATGCCGACTTACATATATTT 21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.119.10 chr1 + 1822 7 novel_not_in_catalog ESPN novel 1339 8 NA NA 46 3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCTCCGGTTCACTCACTCGC 22 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.119.11 chr1 + 1622 6 novel_not_in_catalog ESPN novel 1339 8 NA NA 47 3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCTCCGGTTCACTCACTCGC 23 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.119.12 chr1 + 1300 7 novel_not_in_catalog ESPN novel 1339 8 NA NA 47 3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACATATATTTGCATGTTCGT 23 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.119.13 chr1 + 1541 6 novel_not_in_catalog ESPN novel 813 7 NA NA -35 52 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCCCCGTGGGTGGTGACTT 365 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.119.14 chr1 + 1882 7 novel_not_in_catalog ESPN novel 813 7 NA NA 6 3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCTCCGGTTCACTCACTCGC 1 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 6 NA PB.119.15 chr1 + 1348 7 novel_not_in_catalog ESPN novel 813 7 NA NA 21 5 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATATATTTGCATGTTCGTTG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.119.17 chr1 + 2047 5 novel_not_in_catalog ESPN novel 1494 7 NA NA 24 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTCGCTGTGGCCGCGACTT 0 TRUE NA NA ATTAAA -29 NA NA NA 2 NA PB.119.18 chr1 + 1966 6 novel_not_in_catalog ESPN novel 813 7 NA NA 26 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTCGCTGTGGCCGCGACTT 2 TRUE NA NA ATTAAA -29 NA NA NA 8 NA PB.119.19 chr1 + 1955 6 novel_not_in_catalog ESPN novel 1339 8 NA NA 26 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTCGCTGTGGCCGCGACTT 2 TRUE NA NA ATTAAA -29 NA NA NA 2 NA PB.119.20 chr1 + 1500 5 novel_not_in_catalog ESPN novel 1494 7 NA NA 26 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATGCCGACTTACATATATTT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.119.21 chr1 + 1506 5 novel_not_in_catalog ESPN novel 813 7 NA NA -20 1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TTACATATATTTGCATGTTC 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.119.22 chr1 + 953 5 novel_not_in_catalog ESPN novel 1494 7 NA NA 44 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CATGCCGACTTACATATATT 33 FALSE NA NA AAAAAG -45 NA NA NA 3 NA PB.119.23 chr1 + 1469 5 novel_not_in_catalog ESPN novel 1494 7 NA NA 61 4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTCCGGTTCACTCACTCGCT 50 FALSE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.119.24 chr1 + 1038 3 novel_not_in_catalog ESPN novel 879 4 NA NA 365 4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTCCGGTTCACTCACTCGCT 477 FALSE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.120.4 chr1 - 1157 3 incomplete-splice_match NOL9 ENST00000377705.6 6627 12 25339 3815 4211 -3815 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAGAAAAGAAAAATTT NA FALSE NA NA AATGAA -42 NA NA NA 2 NA PB.120.5 chr1 - 2402 12 full-splice_match NOL9 ENST00000377705.6 6627 12 0 4225 0 -4225 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 26 6.186250 0.791427 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGAAAGTTCTTCAGGGACCT 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 26 NA PB.120.6 chr1 - 2074 9 novel_in_catalog NOL9 novel 6627 12 NA NA -3 -4225 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGAAAGTTCTTCAGGGACCT 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.120.7 chr1 - 922 5 incomplete-splice_match NOL9 ENST00000377705.6 6627 12 21886 4324 758 -4324 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATTTGTTCTAGTCTTCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.121.3 chr1 + 2314 11 full-splice_match ZBTB48 ENST00000377674.9 2347 11 24 9 1 -9 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTCTCGTATTTCAGCCTGA 4 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 10 NA PB.121.4 chr1 + 2255 11 novel_in_catalog ZBTB48 novel 2347 11 NA NA 1 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATTTCAGCCTGACAGTCTG 4 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 7 NA PB.121.6 chr1 + 1428 9 incomplete-splice_match ZBTB48 ENST00000377674.9 2347 11 2072 9 1978 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTCTCGTATTTCAGCCTGA 2005 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.121.7 chr1 + 1407 7 full-splice_match ZBTB48 ENST00000482360.5 2484 7 1076 1 171 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTCAGCCTGACAGTCTGT 6317 FALSE NA NA AATAAA -23 NA NA NA 2 NA PB.121.8 chr1 + 1021 7 full-splice_match ZBTB48 ENST00000482360.5 2484 7 1453 10 -501 -10 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GACTCTCGTATTTCAGCCTG 6694 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.122.2 chr1 + 3569 4 full-splice_match PHF13 ENST00000377648.5 3632 4 29 34 -2 -34 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 46 10.944904 1.039212 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATTCAAGGTTCAGGCGATTG 13 TRUE NA NA AATAAA -25 NA NA NA 46 NA PB.122.3 chr1 + 3466 4 full-splice_match PHF13 ENST00000377648.5 3632 4 131 35 100 -35 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GATTCAAGGTTCAGGCGATT 39 FALSE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 3 NA PB.123.1 chr1 - 4307 4 full-splice_match KLHL21 ENST00000377658.8 4487 4 179 1 179 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTTGGAGTCATTGCCTTTG 1003 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.123.2 chr1 - 3358 3 incomplete-splice_match KLHL21 ENST00000496707.5 824 4 419 -2656 419 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTTGGAGTCATTGCCTTTG 4296 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.123.17 chr1 - 4510 4 full-splice_match KLHL21 ENST00000377658.8 4487 4 -25 2 -25 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATTTGGAGTCATTGCCTTT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.123.18 chr1 - 3610 4 full-splice_match KLHL21 ENST00000377658.8 4487 4 875 2 875 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATTTGGAGTCATTGCCTTT 1699 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.123.19 chr1 - 3166 3 incomplete-splice_match KLHL21 ENST00000496707.5 824 4 610 -2655 610 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATTTGGAGTCATTGCCTTT 4487 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.123.20 chr1 - 3780 4 full-splice_match KLHL21 ENST00000377658.8 4487 4 702 5 702 -5 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATCCATTTGGAGTCATTGCC 1526 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.124.1 chr1 + 1536 4 full-splice_match THAP3 ENST00000472925.1 983 4 -44 -509 5 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACGGTGTCGCTCCCATCAT -4 TRUE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 4 NA PB.124.2 chr1 + 1242 5 incomplete-splice_match THAP3 ENST00000054650.9 1361 6 327 -13 -3 13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 99 23.555338 1.372089 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATCATCATTTTCTCTAGTGC 5 TRUE NA NA AATAAA -27 NA NA NA 99 NA PB.124.3 chr1 + 1121 5 novel_not_in_catalog THAP3 novel 1361 6 NA NA 5 1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GGTGTCGCTCCCATCATCAT -4 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 7 NA PB.124.4 chr1 + 1309 6 full-splice_match THAP3 ENST00000487819.5 840 6 -30 -439 -3 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACGGTGTCGCTCCCATCAT 5 TRUE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.124.5 chr1 + 2666 6 novel_not_in_catalog THAP3 novel 1361 6 NA NA 7 -12 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAATAAAAACATCTGATGT 15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.124.7 chr1 + 1175 4 incomplete-splice_match THAP3 ENST00000307896.10 1046 5 3273 -196 59 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GTGTCGCTCCCATCATCATT 3264 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.124.8 chr1 + 1062 4 incomplete-splice_match THAP3 ENST00000054650.9 1361 6 3702 -2 175 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GTGTCGCTCCCATCATCATT 3380 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 5 NA PB.125.1 chr1 - 2093 6 incomplete-splice_match DNAJC11 ENST00000689025.1 3549 9 7008 -19 -527 3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGGCGCTCTTCCGTGTATTG NA FALSE NA NA AATACA -36 NA NA NA 2 NA PB.125.2 chr1 - 4164 15 full-splice_match DNAJC11 ENST00000690452.1 4153 15 3 -14 0 1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGGCTGGCGCTCTTCCGTGT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.125.3 chr1 - 3298 15 full-splice_match DNAJC11 ENST00000690062.1 3297 15 16 -17 -2 1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGGCTGGCGCTCTTCCGTGT 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.125.4 chr1 - 2657 11 incomplete-splice_match DNAJC11 ENST00000377577.10 3201 16 48887 -1 -5853 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGGCTGGCGCTCTTCCGTGT NA FALSE NA NA AATGAA -2 NA NA NA 2 NA PB.125.5 chr1 - 1664 2 incomplete-splice_match DNAJC11 ENST00000689169.1 3872 4 3282 -17 3282 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGGCTGGCGCTCTTCCGTGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.125.8 chr1 - 3147 16 full-splice_match DNAJC11 ENST00000377577.10 3201 16 53 1 39 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGAGGCTGGCGCTCTTCCGT 50 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.125.9 chr1 - 3045 15 full-splice_match DNAJC11 ENST00000294401.11 2210 15 107 -942 -1 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGAGGCTGGCGCTCTTCCGT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.125.10 chr1 - 2807 12 incomplete-splice_match DNAJC11 ENST00000377577.10 3201 16 47776 1 -6964 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGAGGCTGGCGCTCTTCCGT NA FALSE NA NA AAAACA -36 NA NA NA 8 NA PB.125.11 chr1 - 2481 9 full-splice_match DNAJC11 ENST00000691481.1 3565 9 1097 -13 -867 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGAGGCTGGCGCTCTTCCGT 6161 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.125.12 chr1 - 2137 7 incomplete-splice_match DNAJC11 ENST00000689025.1 3549 9 2458 -13 505 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGAGGCTGGCGCTCTTCCGT 7533 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.125.13 chr1 - 1990 4 incomplete-splice_match DNAJC11 ENST00000690062.1 3297 15 63505 -15 1213 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGAGGCTGGCGCTCTTCCGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.125.14 chr1 - 1954 6 incomplete-splice_match DNAJC11 ENST00000689025.1 3549 9 7141 -13 -394 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGAGGCTGGCGCTCTTCCGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.125.15 chr1 - 1888 5 incomplete-splice_match DNAJC11 ENST00000689025.1 3549 9 8744 -13 1209 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.617260 0.417847 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGAGGCTGGCGCTCTTCCGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.125.16 chr1 - 1742 3 incomplete-splice_match DNAJC11 ENST00000689169.1 3872 4 2251 -15 2251 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.855192 0.455635 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGAGGCTGGCGCTCTTCCGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.125.21 chr1 - 3205 16 full-splice_match DNAJC11 ENST00000377577.10 3201 16 -6 2 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 150 35.689907 1.552545 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGAGGCTGGCGCTCTTCCG -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 150 NA PB.125.22 chr1 - 2694 12 incomplete-splice_match DNAJC11 ENST00000686243.1 3712 16 47876 -12 -6852 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGAGGCTGGCGCTCTTCCG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.125.24 chr1 - 2353 17 novel_not_in_catalog DNAJC11 novel 3201 16 NA NA -4 -6 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AACAAACGGGTTTGGAAATT -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.125.25 chr1 - 2255 16 full-splice_match DNAJC11 ENST00000377577.10 3201 16 -3 949 0 -6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 33 7.851779 0.894968 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AACAAACGGGTTTGGAAATT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 33 NA PB.125.26 chr1 - 2086 15 full-splice_match DNAJC11 ENST00000294401.11 2210 15 118 6 -2 -6 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AACAAACGGGTTTGGAAATT 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.125.27 chr1 - 1608 10 incomplete-splice_match DNAJC11 ENST00000686243.1 3712 16 50200 935 -4528 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AACAAACGGGTTTGGAAATT 536 FALSE NA NA AAAAAG -34 NA NA NA 2 NA PB.125.28 chr1 - 1275 8 incomplete-splice_match DNAJC11 ENST00000691481.1 3565 9 2017 935 53 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AACAAACGGGTTTGGAAATT 7081 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.125.30 chr1 - 1817 5 full-splice_match DNAJC11 ENST00000688162.1 1773 5 0 -44 0 30 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAATACAAAACTTAGCTG -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.125.31 chr1 - 1285 5 full-splice_match DNAJC11 ENST00000688162.1 1773 5 -3 491 0 -241 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTACCCTCGTGGTCACATG -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.125.35 chr1 - 1560 2 intergenic novelGene_74 novel NA NA NA NA NA NA multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAATACGAAAAAAAAAAA 4934 FALSE NA NA GATAAA -10 NA NA NA 2 NA PB.128.1 chr1 + 599 4 full-splice_match CAMTA1 ENST00000473578.5 567 4 -26 -6 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 119 28.313992 1.452001 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TAAAATTTAAGTTTAATGAG -16 TRUE NA NA AATAAA -25 NA NA NA 119 NA PB.128.2 chr1 + 798 3 novel_in_catalog CAMTA1 novel 863 4 NA NA -11 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTGTGGGTCACTTGCGT -27 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 5 NA PB.128.3 chr1 + 2355 5 novel_in_catalog CAMTA1 novel 431 5 NA NA 0 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTGTGGGTCACTTGCGT -16 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.128.4 chr1 + 2059 2 incomplete-splice_match CAMTA1 ENST00000490738.5 538 3 0 45025 0 -44830 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAGAAAAAAATGAGAAGT -16 TRUE NA NA GATAAA -24 NA NA NA 3 NA PB.128.5 chr1 + 1353 7 novel_not_in_catalog CAMTA1 novel 431 5 NA NA 0 2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACGAATGTGTGGGTCACTT -16 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.128.6 chr1 + 1062 6 novel_not_in_catalog CAMTA1 novel 431 5 NA NA 0 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTGTGGGTCACTTGCGT -16 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 3 NA PB.128.7 chr1 + 978 5 novel_in_catalog CAMTA1 novel 431 5 NA NA 0 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTGTGGGTCACTTGCGT -16 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 6 NA PB.128.8 chr1 + 941 5 full-splice_match CAMTA1 ENST00000461311.1 431 5 -98 -412 0 -2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 45 10.706972 1.029667 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTGTGGGTCACTTGCGT -16 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 45 NA PB.128.9 chr1 + 871 4 full-splice_match CAMTA1 ENST00000476163.5 863 4 -10 2 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 43 10.231107 1.009923 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTGTGGGTCACTTGCGT -16 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 43 NA PB.128.10 chr1 + 853 4 full-splice_match CAMTA1 ENST00000557126.5 486 4 -37 -330 0 2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACGAATGTGTGGGTCACTT -16 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 4 NA PB.128.11 chr1 + 730 5 novel_not_in_catalog CAMTA1 novel 431 5 NA NA 0 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATCCTTTTAAAATTTAAGTT -16 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.128.12 chr1 + 617 4 novel_not_in_catalog CAMTA1 novel 538 3 NA NA 0 -8 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TAAAATAAAGTGTAATCTGT -16 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.128.13 chr1 + 570 4 full-splice_match CAMTA1 ENST00000476163.5 863 4 -10 303 0 33 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATCCGGAGTTATTACGAAGG -16 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.128.14 chr1 + 489 3 full-splice_match CAMTA1 ENST00000490738.5 538 3 8 41 -2 -7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATAAAGTGTAATCTGTG -8 TRUE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 9 NA PB.128.15 chr1 + 1617 4 novel_in_catalog CAMTA1 novel 863 4 NA NA 1 -245 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACCCAGATGTCTCCTCCTCT -5 TRUE NA NA AATATA -18 NA NA NA 2 NA PB.128.16 chr1 + 1037 6 novel_in_catalog CAMTA1 novel 431 5 NA NA 1 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTGTGGGTCACTTGCGT -5 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 7 NA PB.128.17 chr1 + 650 5 novel_in_catalog CAMTA1 novel 392 4 NA NA -3 -7 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATAAAGTGTAATCTGTG 7 TRUE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.128.18 chr1 + 829 4 novel_in_catalog CAMTA1 novel 863 4 NA NA -1 1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAACGAATGTGTGGGTCACT 9 TRUE NA NA AATAAA -8 NA NA NA 2 NA PB.128.19 chr1 + 809 4 full-splice_match CAMTA1 ENST00000476163.5 863 4 52 2 -2 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTGTGGGTCACTTGCGT 9 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 3 NA PB.128.20 chr1 + 869 5 full-splice_match CAMTA1 ENST00000461311.1 431 5 -26 -412 8 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTGTGGGTCACTTGCGT -1 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 3 NA PB.130.1 chr1 + 2185 5 full-splice_match VAMP3 ENST00000054666.11 2178 5 -14 7 -14 -7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 128 30.455387 1.483664 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACATGATTGTGGCACCTGT -27 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 128 NA PB.130.2 chr1 + 1188 5 full-splice_match VAMP3 ENST00000054666.11 2178 5 -3 993 -3 633 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAACCTTCTACATCTTCATA -16 TRUE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.130.3 chr1 + 997 5 full-splice_match VAMP3 ENST00000054666.11 2178 5 36 1145 36 481 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGAACTATGGCTATGACC 23 TRUE NA NA TTTAAA -10 NA NA NA 3 NA PB.130.4 chr1 + 2099 5 novel_not_in_catalog VAMP3 novel 274 2 NA NA 602 -8 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACATGATTGTGGCACCTG 589 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.130.5 chr1 + 2030 4 incomplete-splice_match VAMP3 ENST00000054666.11 2178 5 2196 8 785 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.617260 0.417847 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACATGATTGTGGCACCTG 2183 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 11 NA PB.130.6 chr1 + 1942 3 incomplete-splice_match VAMP3 ENST00000054666.11 2178 5 5932 8 131 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACATGATTGTGGCACCTG 5919 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 7 NA PB.133.1 chr1 - 591 4 full-splice_match UTS2 ENST00000361696.10 591 4 -1 1 -1 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATATCATGAGTGGTTATTTT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.134.1 chr1 + 5943 21 novel_in_catalog PER3 novel 6365 22 NA NA 264 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAGAAATTGTCCTGCCCTGT 320 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.134.6 chr1 + 3550 5 incomplete-splice_match PER3 ENST00000613533.4 6318 22 42998 7 -9381 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACGTGAGAAATTGTCCTG 8 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.134.7 chr1 + 3332 5 incomplete-splice_match PER3 ENST00000361923.2 6203 21 42938 9 -9167 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAACGTGAGAAATTGTCCT 222 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.134.9 chr1 + 3253 5 incomplete-splice_match PER3 ENST00000361923.2 6203 21 43025 1 -9080 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAAATTGTCCTGCCCTGTG -4 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 4 NA PB.134.10 chr1 + 2701 3 incomplete-splice_match PER3 ENST00000361923.2 6203 21 51198 1 -907 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAAATTGTCCTGCCCTGTG 4102 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.134.11 chr1 + 2527 2 full-splice_match PER3 ENST00000494684.1 555 2 319 -2291 319 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAGAAATTGTCCTGCCCTGT 5328 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 6 NA PB.136.1 chr1 + 873 7 novel_not_in_catalog PARK7 novel 624 7 NA NA -27 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTGATTGTTTCTTGTTTTGT 228 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.136.2 chr1 + 1276 7 full-splice_match PARK7 ENST00000493678.5 1088 7 -412 224 -383 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTGATTGTTTCTTGTTTTG 7244 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.136.3 chr1 + 941 7 full-splice_match PARK7 ENST00000493678.5 1088 7 -16 163 13 60 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 1598 380.216461 2.580031 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTGCAGCTCTTAACTGTC -15 TRUE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 1598 NA PB.136.4 chr1 + 868 7 novel_not_in_catalog PARK7 novel 1088 7 NA NA -8 -6 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAAACTACTGATTGTTTCTT -36 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 4 NA PB.136.5 chr1 + 835 6 full-splice_match PARK7 ENST00000377493.9 795 6 -40 0 -2 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTGATTGTTTCTTGTTTTG -30 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 5 NA PB.136.7 chr1 + 791 6 novel_in_catalog PARK7 novel 1088 7 NA NA 0 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTGATTGTTTCTTGTTTTG -28 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 5 NA PB.136.8 chr1 + 713 5 incomplete-splice_match PARK7 ENST00000493678.5 1088 7 -29 14247 0 210 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGTCTCTGTGCCAGAAAGT -28 TRUE NA NA AGTAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.136.9 chr1 + 1386 5 incomplete-splice_match PARK7 ENST00000493678.5 1088 7 -27 13572 2 -24 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAAAAAAATAAAATAAAA -26 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.136.10 chr1 + 964 7 full-splice_match PARK7 ENST00000338639.10 1127 7 0 163 0 60 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 606 144.187225 2.158927 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTGCAGCTCTTAACTGTC 20 TRUE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 606 NA PB.136.12 chr1 + 754 5 full-splice_match PARK7 ENST00000465354.5 949 5 -68 263 -12 210 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGTCTCTGTGCCAGAAAGT -11 TRUE NA NA AGTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.136.14 chr1 + 1183 7 full-splice_match PARK7 ENST00000377491.5 977 7 -175 -31 8 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTGATTGTTTCTTGTTTTG 28 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 4 NA PB.136.15 chr1 + 742 6 incomplete-splice_match PARK7 ENST00000377491.5 977 7 947 -31 74 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 25 5.948318 0.774394 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTGATTGTTTCTTGTTTTG 898 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 25 NA PB.136.16 chr1 + 574 4 incomplete-splice_match PARK7 ENST00000377491.5 977 7 7482 -31 4025 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTGATTGTTTCTTGTTTTG 7433 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.137.1 chr1 - 3099 4 full-splice_match ERRFI1 ENST00000377482.10 3097 4 0 -2 0 2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 443 105.404190 2.022858 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CCATTAGTAATGTTTCTTGC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 443 NA PB.137.2 chr1 - 4117 2 incomplete-splice_match ERRFI1 ENST00000474874.5 479 3 -26 7324 0 -1 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.617260 0.417847 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATACCATTAGTAATGTTTCT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.137.3 chr1 - 3171 5 novel_not_in_catalog ERRFI1 novel 3097 4 NA NA 0 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATACCATTAGTAATGTTTCT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.137.4 chr1 - 3019 3 full-splice_match ERRFI1 ENST00000469499.5 995 3 -13 -2011 0 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.855192 0.455635 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATACCATTAGTAATGTTTCT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.137.5 chr1 - 3014 4 full-splice_match ERRFI1 ENST00000377482.10 3097 4 74 9 48 -9 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TATTTATGATACCATTAGTA 74 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.137.12 chr1 - 4006 3 novel_in_catalog ERRFI1 novel 3097 4 NA NA 0 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GATACCATTAGTAATGTTTC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.137.13 chr1 - 3111 4 full-splice_match ERRFI1 ENST00000487559.1 787 4 -13 -2311 0 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 36 8.565578 0.932757 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GATACCATTAGTAATGTTTC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 36 NA PB.137.14 chr1 - 2858 3 incomplete-splice_match ERRFI1 ENST00000377482.10 3097 4 10702 2 26 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GATACCATTAGTAATGTTTC 4466 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.137.21 chr1 - 2703 4 novel_not_in_catalog ERRFI1 novel 3097 4 NA NA 0 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGATACCATTAGTAATGTTT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.137.22 chr1 - 2725 2 incomplete-splice_match ERRFI1 ENST00000377482.10 3097 4 10944 3 268 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGATACCATTAGTAATGTTT -7 TRUE NA NA AAAAAG -35 NA NA NA 4 NA PB.137.26 chr1 - 3203 3 novel_in_catalog ERRFI1 novel 3097 4 NA NA 0 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATGATACCATTAGTAATGTT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.137.30 chr1 - 2543 3 full-splice_match ERRFI1 ENST00000469499.5 995 3 -13 -1535 0 -477 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATTTCCTGGGGATTGTTTG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.137.31 chr1 - 2536 4 full-splice_match ERRFI1 ENST00000377482.10 3097 4 78 483 52 -483 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTCAGTATTTCCTGGGGAT 78 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.137.32 chr1 - 2613 4 full-splice_match ERRFI1 ENST00000377482.10 3097 4 0 484 0 -484 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.044856 0.606903 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATTCAGTATTTCCTGGGGA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.137.34 chr1 - 2342 4 full-splice_match ERRFI1 ENST00000377482.10 3097 4 0 755 0 -755 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TGACTAATTTTCCCTTACAG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.137.35 chr1 - 1997 4 full-splice_match ERRFI1 ENST00000377482.10 3097 4 0 1100 0 600 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAATGAGTCCTGATAGACTG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.137.36 chr1 - 1732 4 full-splice_match ERRFI1 ENST00000377482.10 3097 4 0 1365 0 335 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GTCTTCATGTGGAAGGTTTA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.137.37 chr1 - 1447 4 full-splice_match ERRFI1 ENST00000377482.10 3097 4 0 1650 0 50 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAATTTTTTAGGGAAGCA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.137.38 chr1 - 835 3 incomplete-splice_match ERRFI1 ENST00000377482.10 3097 4 0 3173 0 -860 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATATTCTGTTCCTTGGATC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.138.1 chr1 - 2846 2 incomplete-splice_match RERE ENST00000476556.5 4598 13 68118 -1688 -466 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACCCTTGGGTGTCTCCCGTG 6317 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.138.3 chr1 - 3846 5 incomplete-splice_match RERE ENST00000476556.5 4598 13 63821 -1687 2999 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AACCCTTGGGTGTCTCCCGT 7057 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.142.2 chr1 + 2496 9 full-splice_match SLC45A1 ENST00000471889.7 2496 9 0 0 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TATGGTTTCTAGGCATTGCT 10 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 8 NA PB.161.2 chr1 - 2171 12 full-splice_match ENO1 ENST00000234590.10 1781 12 -396 6 10 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.855192 0.455635 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATACTCCGTGTGCCTGT -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.161.3 chr1 - 1823 12 full-splice_match ENO1 ENST00000234590.10 1781 12 -46 4 -12 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 12727 3028.169678 3.481180 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT 525 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12727 NA PB.161.5 chr1 - 1937 12 novel_in_catalog ENO1 novel 1781 12 NA NA 15 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATACTCCGTGTGCCTGTGTA -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.161.6 chr1 - 3161 11 novel_in_catalog ENO1 novel 1837 13 NA NA 0 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.161.7 chr1 - 2372 12 novel_in_catalog ENO1 novel 1837 13 NA NA 0 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.161.8 chr1 - 2361 12 full-splice_match ENO1 ENST00000234590.10 1781 12 -584 4 -80 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.044856 0.606903 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.161.9 chr1 - 2165 8 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 2775 2 2775 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT 9910 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.161.10 chr1 - 1885 13 novel_in_catalog ENO1 novel 1837 13 NA NA 0 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.161.11 chr1 - 1833 13 novel_in_catalog ENO1 novel 1837 13 NA NA -1 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.161.12 chr1 - 1811 12 novel_not_in_catalog ENO1 novel 1837 13 NA NA 0 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.161.14 chr1 - 1869 9 full-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 677 2 677 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT 8358 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.161.15 chr1 - 1741 12 novel_not_in_catalog ENO1 novel 1837 13 NA NA 0 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.161.16 chr1 - 1689 11 novel_in_catalog ENO1 novel 1837 13 NA NA 0 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.161.17 chr1 - 1746 8 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 3194 2 3194 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT 9688 FALSE NA NA AATAAA -7 NA NA NA 2 NA PB.161.18 chr1 - 1604 8 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 3336 2 3336 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT 9830 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.161.19 chr1 - 1012 6 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 5280 2 5280 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 200 47.586540 1.677484 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT 9125 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 200 NA PB.161.20 chr1 - 830 8 novel_not_in_catalog ENO1 novel 1837 13 NA NA -12 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT 553 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.161.21 chr1 - 538 3 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 8289 2 8289 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.806923 0.580574 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.161.22 chr1 - 1704 12 full-splice_match ENO1 ENST00000234590.10 1781 12 72 5 32 2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 92 21.889809 1.340242 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATACTCCGTGTGCCTGTG 643 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 92 NA PB.161.23 chr1 - 2159 9 full-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 385 4 385 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATACTCCGTGTGCCTGT 8066 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.161.24 chr1 - 1816 12 novel_in_catalog ENO1 novel 1781 12 NA NA -95 1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATACTCCGTGTGCCTGT 895 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.161.25 chr1 - 1670 11 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000234590.10 1781 12 3767 6 -2975 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 247 58.769379 1.769151 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATACTCCGTGTGCCTGT 4338 FALSE NA NA AAGAAA -41 NA NA NA 247 NA PB.161.26 chr1 - 1570 10 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000234590.10 1781 12 6704 6 -38 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 179 42.589954 1.629307 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATACTCCGTGTGCCTGT 7275 FALSE NA NA AAAAAG -28 NA NA NA 179 NA PB.161.27 chr1 - 1506 10 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000234590.10 1781 12 6768 6 26 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 501 119.204285 2.076292 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATACTCCGTGTGCCTGT 7339 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 501 NA PB.161.28 chr1 - 1374 8 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 3564 4 3564 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 382 90.890297 1.958518 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATACTCCGTGTGCCTGT 9969 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 382 NA PB.161.29 chr1 - 1260 7 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 4415 4 4415 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 317 75.424667 1.877513 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATACTCCGTGTGCCTGT 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 317 NA PB.161.30 chr1 - 1155 6 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 5134 5 5134 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 627 149.183807 2.173722 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAGAATACTCCGTGTGCCTG 8979 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 627 NA PB.161.31 chr1 - 940 5 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 6146 4 6146 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 327 77.803993 1.891002 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATACTCCGTGTGCCTGT 9991 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 327 NA PB.161.32 chr1 - 717 4 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 7561 4 7561 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 71 16.893223 1.227713 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATACTCCGTGTGCCTGT 9880 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 71 NA PB.161.33 chr1 - 1540 11 novel_not_in_catalog ENO1 novel 1819 10 NA NA 0 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGAGAATACTCCGTGTGCCT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.161.35 chr1 - 1714 11 novel_in_catalog ENO1 novel 1837 13 NA NA 0 -5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CCCATGAGAATACTCCGTGT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.161.36 chr1 - 1454 9 full-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 1065 29 1065 -24 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAATAAAAAGCCTCAGTGAC 8746 FALSE NA NA TTTAAA -9 NA NA NA 3 NA PB.162.1 chr1 - 2204 12 full-splice_match SLC2A5 ENST00000377424.9 4085 12 39 1842 8 1483 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 40 9.517308 0.978514 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGACGTGCTGCTGTTC -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 40 NA PB.162.2 chr1 - 1574 7 incomplete-splice_match SLC2A5 ENST00000377424.9 4085 12 29445 1842 -295 1483 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGACGTGCTGCTGTTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.162.3 chr1 - 1393 6 incomplete-splice_match SLC2A5 ENST00000377424.9 4085 12 29702 1842 -38 1483 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGACGTGCTGCTGTTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.162.4 chr1 - 1032 3 incomplete-splice_match SLC2A5 ENST00000377424.9 4085 12 31143 1842 1403 1483 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGACGTGCTGCTGTTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.162.5 chr1 - 1677 12 full-splice_match SLC2A5 ENST00000377424.9 4085 12 39 2369 8 956 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATGCAGTCCTCATCTCCAG -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.162.6 chr1 - 1267 9 incomplete-splice_match SLC2A5 ENST00000377424.9 4085 12 21956 2371 -7784 954 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GGAATGCAGTCCTCATCTCC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.163.1 chr1 - 2158 2 novel_not_in_catalog GPR157 novel 5197 4 NA NA 0 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATGTGTTTGGTAAAGTGAT 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.170.6 chr1 + 1293 3 full-splice_match SPSB1 ENST00000328089.11 3106 3 144 1669 144 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TACATTGAGCTCCAATCTGC 143 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.170.8 chr1 + 2675 2 full-splice_match SPSB1 ENST00000377399.2 1007 2 285 -1953 285 -4 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CAAACCATTTTTGAATTCCT 251 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.170.9 chr1 + 2432 2 full-splice_match SPSB1 ENST00000377399.2 1007 2 529 -1954 529 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACCATTTTTGAATTCCTC 495 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 3 NA PB.171.2 chr1 + 1236 4 novel_in_catalog SLC25A33 novel 3865 7 NA NA -18 -2401 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACATTTGGCTTGTGTCCTCT -4 TRUE NA NA ATTAAA -23 NA NA NA 2 NA PB.171.3 chr1 + 1475 7 full-splice_match SLC25A33 ENST00000302692.7 3865 7 -12 2402 -12 -2402 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 254 60.434906 1.781288 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACATTTGGCTTGTGTCCTC 2 TRUE NA NA ATTAAA -22 NA NA NA 254 NA PB.171.4 chr1 + 1306 5 novel_in_catalog SLC25A33 novel 3865 7 NA NA -12 -2403 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATACATTTGGCTTGTGTCCT 2 TRUE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 6 NA PB.171.5 chr1 + 1034 6 incomplete-splice_match SLC25A33 ENST00000302692.7 3865 7 4 4891 4 -4891 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTTGTTTGTGGGTATATCT 18 TRUE NA NA AGTAAA -15 NA NA NA 5 NA PB.171.6 chr1 + 1504 8 novel_not_in_catalog SLC25A33 novel 3865 7 NA NA 19 -2403 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATACATTTGGCTTGTGTCCT -8 TRUE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 3 NA PB.171.7 chr1 + 2387 7 full-splice_match SLC25A33 ENST00000302692.7 3865 7 24 1454 24 -1454 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAATTTAAT -3 TRUE NA NA TTTAAA -18 NA NA NA 7 NA PB.171.8 chr1 + 1510 8 novel_not_in_catalog SLC25A33 novel 3865 7 NA NA 24 -2407 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGTATACATTTGGCTTGTG -3 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.171.9 chr1 + 1339 6 novel_in_catalog SLC25A33 novel 3865 7 NA NA 24 -2401 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 25 5.948318 0.774394 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACATTTGGCTTGTGTCCTCT -3 TRUE NA NA ATTAAA -23 NA NA NA 25 NA PB.171.10 chr1 + 1293 7 full-splice_match SLC25A33 ENST00000302692.7 3865 7 24 2548 24 -2548 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 52 12.372500 1.092458 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACCTGTTGGACATTTCCTTT -3 TRUE NA NA CATAAA -17 NA NA NA 52 NA PB.171.11 chr1 + 1113 6 novel_in_catalog SLC25A33 novel 3865 7 NA NA 24 -2627 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGAGAATTTTTTTTCCCCAT -3 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.171.13 chr1 + 1408 7 full-splice_match SLC25A33 ENST00000302692.7 3865 7 50 2407 50 -2407 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.617260 0.417847 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGTATACATTTGGCTTGTG 23 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 11 NA PB.171.14 chr1 + 1322 7 full-splice_match SLC25A33 ENST00000302692.7 3865 7 136 2407 136 -2407 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGTATACATTTGGCTTGTG 109 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 5 NA PB.171.15 chr1 + 1207 7 full-splice_match SLC25A33 ENST00000302692.7 3865 7 250 2408 250 -2408 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAGTATACATTTGGCTTGT 55 FALSE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.171.16 chr1 + 1134 6 incomplete-splice_match SLC25A33 ENST00000302692.7 3865 7 14207 2402 14207 -2402 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACATTTGGCTTGTGTCCTC 3632 FALSE NA NA ATTAAA -22 NA NA NA 5 NA PB.171.17 chr1 + 1051 6 incomplete-splice_match SLC25A33 ENST00000302692.7 3865 7 14285 2407 14285 -2407 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGTATACATTTGGCTTGTG 3710 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.171.18 chr1 + 945 5 incomplete-splice_match SLC25A33 ENST00000302692.7 3865 7 27875 2401 27875 -2401 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACATTTGGCTTGTGTCCTCT NA FALSE NA NA ATTAAA -23 NA NA NA 6 NA PB.171.19 chr1 + 1247 5 novel_not_in_catalog SLC25A33 novel 3865 7 NA NA 30869 3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAATTTTAGTTTTCTGCTTC NA FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.171.20 chr1 + 673 2 incomplete-splice_match SLC25A33 ENST00000302692.7 3865 7 40571 2401 40571 -2401 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACATTTGGCTTGTGTCCTCT NA FALSE NA NA ATTAAA -23 NA NA NA 2 NA PB.172.1 chr1 + 4018 6 full-splice_match TMEM201 ENST00000340305.9 3851 6 -173 6 -162 -6 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCGCTGGCGTCAGGTGCC 10 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 5 NA PB.172.2 chr1 + 3962 11 full-splice_match TMEM201 ENST00000340381.11 3815 11 -147 0 -147 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.093125 0.490398 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CCTGCTGGCTGTCTGTATTC -16 TRUE NA NA AAAAAG -33 NA NA NA 13 NA PB.172.3 chr1 + 3903 10 novel_in_catalog TMEM201 novel 3815 11 NA NA -162 2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGCCTGCTGGCTGTCTGTAT 10 TRUE NA NA AAAAAG -31 NA NA NA 2 NA PB.172.4 chr1 + 3897 6 full-splice_match TMEM201 ENST00000340305.9 3851 6 -53 7 -42 -7 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACCCGCTGGCGTCAGGTGC -25 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.172.5 chr1 + 3810 11 full-splice_match TMEM201 ENST00000340381.11 3815 11 2 3 2 1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGCCTGCTGGCTGTCTGTA 19 TRUE NA NA AAAAAG -30 NA NA NA 4 NA PB.172.6 chr1 + 3375 9 incomplete-splice_match TMEM201 ENST00000340381.11 3815 11 8127 7 141 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGATGCCTGCTGGCTGTC 121 FALSE NA NA AAAAAG -26 NA NA NA 2 NA PB.172.11 chr1 + 2431 5 incomplete-splice_match TMEM201 ENST00000340381.11 3815 11 18850 0 33 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CCTGCTGGCTGTCTGTATTC 44 FALSE NA NA AAAAAG -33 NA NA NA 2 NA PB.172.12 chr1 + 2126 3 incomplete-splice_match TMEM201 ENST00000416541.5 3447 8 13816 -7 2985 3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GCTGGCTGTCTGTATTCGTT 2996 FALSE NA NA AAAAAG -36 NA NA NA 2 NA PB.174.1 chr1 - 1615 2 incomplete-splice_match PIK3CD-AS2 ENST00000415330.3 978 3 29 7326 29 -7326 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAACATGACGAGGAAGAAG 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.175.1 chr1 - 3976 15 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000361311.4 4647 18 72319 -6 -84 5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCCGGAGCGGGGTTTGTCT 3563 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.175.2 chr1 - 3524 13 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000361311.4 4647 18 74447 -6 630 5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCCGGAGCGGGGTTTGTCT 5691 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.175.3 chr1 - 1777 2 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 20277 0 2182 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 23 5.472452 0.738182 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 23 NA PB.175.6 chr1 - 2508 6 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 16447 -5 -1648 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGCCGGAGCGGGGTTTGTC NA FALSE NA NA AAAACA -12 NA NA NA 10 NA PB.175.7 chr1 - 2069 4 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 18116 -5 21 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGCCGGAGCGGGGTTTGTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.175.8 chr1 - 4362 16 novel_not_in_catalog CLSTN1 novel 4647 18 NA NA -6 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.175.9 chr1 - 4706 19 full-splice_match CLSTN1 ENST00000377298.9 4760 19 -48 102 -29 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.617260 0.417847 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT 602 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.175.10 chr1 - 3904 15 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000361311.4 4647 18 72385 0 -18 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT 3629 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.175.11 chr1 - 3965 15 novel_in_catalog CLSTN1 novel 4647 18 NA NA -3568 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT 79 FALSE NA NA AATGAA -18 NA NA NA 4 NA PB.175.12 chr1 - 3818 14 full-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 11 0 11 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.175.13 chr1 - 3557 12 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 1948 0 534 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT 5595 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.175.14 chr1 - 3195 11 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000650348.1 4457 19 79661 1 6159 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT 7616 FALSE NA NA ACTAAA -16 NA NA NA 6 NA PB.175.15 chr1 - 3160 11 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 7162 0 5748 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT 7205 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.175.16 chr1 - 3037 10 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 7674 0 6260 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT 7717 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.175.17 chr1 - 2816 8 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 15573 0 -2522 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.568991 0.552545 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.175.18 chr1 - 2633 7 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 16025 0 -2070 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.175.19 chr1 - 2324 5 novel_not_in_catalog CLSTN1 novel 3829 14 NA NA -600 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.175.20 chr1 - 2001 3 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 19683 0 1588 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.520721 0.655208 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.175.23 chr1 - 4576 17 novel_in_catalog CLSTN1 novel 4647 18 NA NA -6 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 45 10.706972 1.029667 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACTCCAGCCGGAGCGGGG -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 45 NA PB.175.24 chr1 - 4627 18 full-splice_match CLSTN1 ENST00000361311.4 4647 18 19 1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.044856 0.606903 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACTCCAGCCGGAGCGGGG 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.175.25 chr1 - 4412 17 novel_not_in_catalog CLSTN1 novel 4760 19 NA NA 0 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACTCCAGCCGGAGCGGGG 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.175.26 chr1 - 4172 16 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000361311.4 4647 18 68684 1 -3719 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACTCCAGCCGGAGCGGGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.175.27 chr1 - 3623 13 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000361311.4 4647 18 74341 1 524 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACTCCAGCCGGAGCGGGG 5585 FALSE NA NA AAAACA -4 NA NA NA 3 NA PB.175.28 chr1 - 3071 10 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000650348.1 4457 19 82411 2 -7772 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACTCCAGCCGGAGCGGGG 8720 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.175.30 chr1 - 2509 3 novel_in_catalog CLSTN1 novel 3829 14 NA NA -55 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACTCCAGCCGGAGCGGGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.175.31 chr1 - 2405 6 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 16544 1 -1551 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACTCCAGCCGGAGCGGGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.175.32 chr1 - 2253 5 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 17501 1 -594 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 21 4.996587 0.698673 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACTCCAGCCGGAGCGGGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 21 NA PB.175.33 chr1 - 2124 4 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 18055 1 -40 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.093125 0.490398 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACTCCAGCCGGAGCGGGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.175.37 chr1 - 3015 15 novel_in_catalog CLSTN1 novel 4647 18 NA NA -3559 -941 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AACCCGGGACTGGAATGTAA 88 FALSE NA NA AATGAA -9 NA NA NA 2 NA PB.175.38 chr1 - 2197 10 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 7573 941 6159 -941 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AACCCGGGACTGGAATGTAA 7616 FALSE NA NA ACTAAA -16 NA NA NA 5 NA PB.175.39 chr1 - 1222 5 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 17592 941 -503 -941 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AACCCGGGACTGGAATGTAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.175.40 chr1 - 3686 18 full-splice_match CLSTN1 ENST00000361311.4 4647 18 19 942 0 -942 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAACCCGGGACTGGAATGTA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.175.41 chr1 - 3611 17 novel_in_catalog CLSTN1 novel 4647 18 NA NA 18 -942 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAACCCGGGACTGGAATGTA 668 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.175.42 chr1 - 1657 7 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 16050 951 -2045 -951 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GTGCTAGTGTAACCCGGGAC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.175.43 chr1 - 2290 12 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000650348.1 4457 19 79225 953 5723 -952 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGTGCTAGTGTAACCCGGGA 7180 FALSE NA NA GGGGCT -7 NA NA NA 2 NA PB.175.44 chr1 - 2095 10 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000650348.1 4457 19 82431 958 -7752 -957 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCCTTTGTGCTAGTGTAACC 8740 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.175.45 chr1 - 1836 8 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 15596 957 -2499 -957 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCCTTTGTGCTAGTGTAACC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.175.49 chr1 - 859 4 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000361311.4 4647 18 13 22443 -6 -1983 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.806923 0.580574 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAATCGAGGAGCCGGCTT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.175.50 chr1 - 883 5 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000377298.9 4760 19 0 22545 0 -1983 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAATCGAGGAGCCGGCTT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.176.2 chr1 - 3083 5 full-splice_match CTNNBIP1 ENST00000400904.7 1206 5 -51 -1826 -51 -7 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATAGGTTCGTGTGTGAGCTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.176.3 chr1 - 3045 6 novel_not_in_catalog CTNNBIP1 novel 3006 6 NA NA 33 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CGTGTGTGAGCTGAGCTGGT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.176.5 chr1 - 2991 6 full-splice_match CTNNBIP1 ENST00000377263.6 3006 6 14 1 14 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TCGTGTGTGAGCTGAGCTGG -22 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.176.10 chr1 - 2949 5 full-splice_match CTNNBIP1 ENST00000400904.7 1206 5 88 -1831 21 -2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 63 14.989760 1.175795 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTCGTGTGTGAGCTGAGCTG -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 63 NA PB.176.12 chr1 - 2696 3 incomplete-splice_match CTNNBIP1 ENST00000377256.1 451 5 6101 -2380 6101 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTTCGTGTGTGAGCTGAGCT 5905 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.176.13 chr1 - 1343 5 full-splice_match CTNNBIP1 ENST00000377258.5 852 5 -149 -342 -149 1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTGGGGTTTGTGTTTGAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.176.14 chr1 - 1165 6 full-splice_match CTNNBIP1 ENST00000377263.6 3006 6 9 1832 9 1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 20 4.758654 0.677484 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTGGGGTTTGTGTTTGAT -27 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 20 NA PB.176.15 chr1 - 1312 6 novel_not_in_catalog CTNNBIP1 novel 3006 6 NA NA 21 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACATTTGGGGTTTGTGTTTG -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.176.16 chr1 - 1140 5 full-splice_match CTNNBIP1 ENST00000400904.7 1206 5 65 1 -2 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 221 52.583130 1.720846 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACATTTGGGGTTTGTGTTTG -38 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 221 NA PB.176.17 chr1 - 1053 4 novel_in_catalog CTNNBIP1 novel 3006 6 NA NA 0 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACATTTGGGGTTTGTGTTTG -36 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.176.18 chr1 - 1044 5 full-splice_match CTNNBIP1 ENST00000400904.7 1206 5 161 1 94 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.568991 0.552545 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACATTTGGGGTTTGTGTTTG 58 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.176.19 chr1 - 854 3 incomplete-splice_match CTNNBIP1 ENST00000377256.1 451 5 6112 -549 6112 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACATTTGGGGTTTGTGTTTG 5916 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.176.20 chr1 - 1296 6 novel_not_in_catalog CTNNBIP1 novel 3006 6 NA NA 14 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CACATTTGGGGTTTGTGTTT -22 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.176.21 chr1 - 779 5 full-splice_match CTNNBIP1 ENST00000400904.7 1206 5 81 346 14 -5 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGAAACCTTTTATTTTTATT -22 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.177.1 chr1 + 5104 23 novel_in_catalog PIK3CD novel 5412 24 NA NA 0 -203 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAGAAAGAAAAAGCCTTT -9 TRUE NA NA AGTAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.177.2 chr1 + 5209 24 full-splice_match PIK3CD ENST00000377346.9 5412 24 0 203 0 -203 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAGAAAGAAAAAGCCTTT -9 TRUE NA NA AGTAAA -9 NA NA NA 8 NA PB.177.3 chr1 + 2943 8 incomplete-splice_match PIK3CD ENST00000361110.6 3508 23 11779 -1679 5701 -203 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAGAAAGAAAAAGCCTTT 4168 FALSE NA NA AGTAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.177.4 chr1 + 2571 5 incomplete-splice_match PIK3CD ENST00000361110.6 3508 23 12930 -1679 6852 -203 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAGAAAGAAAAAGCCTTT 5319 FALSE NA NA AGTAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.177.5 chr1 + 2155 3 incomplete-splice_match PIK3CD ENST00000361110.6 3508 23 14202 -1676 8124 -206 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 ATGAAAAGAAAGAAAAAGCC 6591 FALSE NA NA AGTAAA -6 NA NA NA 2 NA PB.178.1 chr1 + 1434 5 full-splice_match NMNAT1 ENST00000377205.6 3734 5 -56 2356 -9 -527 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.806923 0.580574 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAAATAAGTTTTTGTTTGT NA FALSE NA NA AGTAAA -15 NA NA NA 16 NA PB.178.2 chr1 + 1640 5 full-splice_match NMNAT1 ENST00000377205.6 3734 5 -50 2144 -3 -315 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAGAGAAAAAAAAAAAAGA NA FALSE NA NA AAAAAG -15 NA NA NA 3 NA PB.178.3 chr1 + 1067 5 full-splice_match NMNAT1 ENST00000403197.5 1094 5 26 1 -21 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTCTCCTGCAGTGGTCTC -7 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 9 NA PB.179.1 chr1 + 1742 4 novel_not_in_catalog UBE4B novel 1273 3 NA NA -12 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAATGTTTCCTCTGTATGTC -14 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.179.2 chr1 + 5513 27 full-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 123 -864 -3 -8 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAAGAAATCTTCTTTGAGT -5 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.179.3 chr1 + 1586 3 full-splice_match UBE4B ENST00000377153.5 1273 3 -316 3 0 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAATGTTTCCTCTGTATGTC -2 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 7 NA PB.179.4 chr1 + 4885 27 full-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 127 -240 1 240 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATTTCAGTTTTTTTTTTC -1 TRUE NA NA AATAAA -25 NA NA NA 2 NA PB.179.5 chr1 + 1131 4 novel_not_in_catalog UBE4B novel 1273 3 NA NA 1 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTTTCCTCTGTATGTCT -1 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.179.6 chr1 + 2755 17 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 301 35187 -141 141 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAACTTGTTGATACCTTAC -49 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.179.7 chr1 + 4692 27 full-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 313 -233 -129 233 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGAATTTGAATTTCAGTTTT -37 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.179.8 chr1 + 5271 27 full-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 367 -866 -75 -6 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.617260 0.417847 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAAATCTTCTTTGAGTCT 17 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 11 NA PB.179.9 chr1 + 4632 27 full-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 381 -241 -61 241 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTTCAGTTTTTTTTTTCT 31 TRUE NA NA AATAAA -26 NA NA NA 2 NA PB.179.10 chr1 + 1332 3 full-splice_match UBE4B ENST00000377153.5 1273 3 -61 2 -61 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTTTCCTCTGTATGTCT 31 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.179.11 chr1 + 5012 27 full-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 624 -864 182 -8 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAAGAAATCTTCTTTGAGT 274 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.179.12 chr1 + 3727 23 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 70127 -240 2098 240 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATTTCAGTTTTTTTTTTC NA FALSE NA NA AATAAA -25 NA NA NA 2 NA PB.179.13 chr1 + 4282 23 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 70198 -866 2169 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAAATCTTCTTTGAGTCT NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.179.14 chr1 + 4026 22 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 72877 -866 4848 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAAATCTTCTTTGAGTCT NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.179.15 chr1 + 3251 21 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 84733 -233 -4477 233 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGAATTTGAATTTCAGTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.179.16 chr1 + 3400 16 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000343090.11 5905 28 97633 6 2252 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAAATCTTCTTTGAGTCT NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 5 NA PB.179.18 chr1 + 3254 14 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000343090.11 5905 28 99432 6 4051 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAAATCTTCTTTGAGTCT NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.179.19 chr1 + 2566 14 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 99612 -232 4105 232 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CAGAATTTGAATTTCAGTTT NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.179.20 chr1 + 2265 12 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 104299 -233 8792 233 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGAATTTGAATTTCAGTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 5 NA PB.179.21 chr1 + 2819 11 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000343090.11 5905 28 111986 6 -13410 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAAATCTTCTTTGAGTCT NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.179.23 chr1 + 2567 9 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000343090.11 5905 28 116252 8 -9144 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAAGAAATCTTCTTTGAGT NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.179.24 chr1 + 1895 9 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 116419 -233 -9103 233 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGAATTTGAATTTCAGTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.179.25 chr1 + 2394 8 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000343090.11 5905 28 118468 8 -6928 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAAGAAATCTTCTTTGAGT NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 5 NA PB.179.27 chr1 + 1543 7 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 125608 -233 86 233 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGAATTTGAATTTCAGTTTT 3002 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 7 NA PB.179.28 chr1 + 1852 4 full-splice_match UBE4B ENST00000487244.5 818 4 181 -1215 181 -8 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAAGAAATCTTCTTTGAGT 786 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 9 NA PB.179.29 chr1 + 1118 4 full-splice_match UBE4B ENST00000487244.5 818 4 284 -584 284 233 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGAATTTGAATTTCAGTTTT -11 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 8 NA PB.179.30 chr1 + 1743 4 full-splice_match UBE4B ENST00000487244.5 818 4 292 -1217 292 -6 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAAATCTTCTTTGAGTCT -3 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.179.31 chr1 + 989 3 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000487244.5 818 4 7729 -586 -331 235 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATTTGAATTTCAGTTTTTT 7434 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 5 NA PB.179.32 chr1 + 1615 3 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000487244.5 818 4 7734 -1217 -326 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAAATCTTCTTTGAGTCT 7439 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 10 NA PB.179.33 chr1 + 1439 2 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000465408.1 355 3 447 -1283 447 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAAATCTTCTTTGAGTCT 8212 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.180.1 chr1 - 1034 8 novel_in_catalog LZIC novel 652 5 NA NA 22 -14 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAATTAATGAGAGTATAG -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.180.2 chr1 - 916 7 novel_in_catalog LZIC novel 652 5 NA NA -17 -14 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAATTAATGAGAGTATAG 575 FALSE NA NA TATAAA -5 NA NA NA 6 NA PB.180.8 chr1 - 2846 8 full-splice_match LZIC ENST00000377223.6 4989 8 35 2108 35 1319 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATACCTGTTTTCAATTTTT 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.180.9 chr1 - 2751 8 full-splice_match LZIC ENST00000377213.1 945 8 33 -1839 17 1306 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAATATTTGTTTGAATACCT -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.180.10 chr1 - 2242 8 full-splice_match LZIC ENST00000377213.1 945 8 16 -1313 0 780 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATATGTGACCTTTTTATGTA -31 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.180.11 chr1 - 2093 8 full-splice_match LZIC ENST00000377223.6 4989 8 35 2861 35 566 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TGTACCATTCGTTGGCAGAA 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.180.12 chr1 - 1950 8 full-splice_match LZIC ENST00000377223.6 4989 8 51 2988 51 439 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CTTCTGTACTGTAAACTACT 20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.180.13 chr1 - 1879 8 full-splice_match LZIC ENST00000377213.1 945 8 38 -972 22 439 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.093125 0.490398 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CTTCTGTACTGTAAACTACT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.180.14 chr1 - 1179 5 novel_in_catalog LZIC novel 945 8 NA NA 17 11 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CCCCAGCCTGTAAGCTGTCT -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.180.15 chr1 - 1534 8 full-splice_match LZIC ENST00000377223.6 4989 8 35 3420 35 7 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CATCCCCCAGCCTGTAAGCT 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.180.16 chr1 - 1471 8 full-splice_match LZIC ENST00000377213.1 945 8 7 -533 7 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGGGACCATCCCCCAGCCT -40 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.180.17 chr1 - 1343 7 full-splice_match LZIC ENST00000400903.6 1405 7 -17 79 -17 -79 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAAAATAATTAACACTA 575 FALSE NA NA TATAAA -5 NA NA NA 2 NA PB.180.18 chr1 - 1037 7 full-splice_match LZIC ENST00000400903.6 1405 7 -17 385 -17 148 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGGCTGTTTGTTTTTAAGT 575 FALSE NA NA TATAAA -5 NA NA NA 3 NA PB.180.19 chr1 - 460 4 incomplete-splice_match LZIC ENST00000400903.6 1405 7 7948 515 800 18 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCATTGTGCGTTGTGTGCG 8540 FALSE NA NA TTTAAA -38 NA NA NA 2 NA PB.180.20 chr1 - 1435 7 full-splice_match LZIC ENST00000400903.6 1405 7 -557 527 66 6 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTTATGCTCTTCATCATTGT 35 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.180.21 chr1 - 913 8 full-splice_match LZIC ENST00000377213.1 945 8 38 -6 22 6 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 64 15.227694 1.182634 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTTATGCTCTTCATCATTGT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 64 NA PB.180.22 chr1 - 1183 7 full-splice_match LZIC ENST00000400903.6 1405 7 -307 529 -307 4 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGTTTATGCTCTTCATCATT 285 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.180.23 chr1 - 995 8 full-splice_match LZIC ENST00000377223.6 4989 8 34 3960 34 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 45 10.706972 1.029667 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTTGTGTTTATGCTCTTCAT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 45 NA PB.181.2 chr1 + 1597 4 incomplete-splice_match KIF1B ENST00000377093.9 7800 21 -27 49106 -27 -22892 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.093125 0.490398 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAAAAAAAAAATTTTTT 1 TRUE NA NA ACTAAA -36 NA NA NA 13 NA PB.181.3 chr1 + 2296 19 incomplete-splice_match KIF1B ENST00000377093.9 7800 21 -24 11540 -24 4723 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAACAAGAGATGGAGAAAAG 4 TRUE NA NA AAAACA -14 NA NA NA 4 NA PB.181.4 chr1 + 2938 21 full-splice_match KIF1B ENST00000377093.9 7800 21 -10 4872 -10 -3032 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAGAAATAAAATGCTCAAAA 18 FALSE NA NA GATAAA -7 NA NA NA 4 NA PB.181.5 chr1 + 5960 21 full-splice_match KIF1B ENST00000377093.9 7800 21 0 1840 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.181.12 chr1 + 3878 4 incomplete-splice_match KIF1B ENST00000377083.5 5885 21 65873 0 14187 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 918 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.181.14 chr1 + 3276 1 full-splice_match RN7SL731P ENST00000584329.2 293 1 -2983 0 -2983 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 7763 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.181.15 chr1 + 3101 1 full-splice_match RN7SL731P ENST00000584329.2 293 1 -2808 0 -2808 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 7938 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.181.16 chr1 + 2848 1 full-splice_match RN7SL731P ENST00000584329.2 293 1 -2556 1 -2556 -1 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 8190 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.181.17 chr1 + 2485 1 full-splice_match RN7SL731P ENST00000584329.2 293 1 -2195 3 -2195 -3 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA 8551 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.181.18 chr1 + 2223 1 full-splice_match RN7SL731P ENST00000584329.2 293 1 -1932 2 -1932 -2 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TTAAAAAAAAAAAAAAAAAA 8814 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.181.19 chr1 + 2014 1 full-splice_match RN7SL731P ENST00000584329.2 293 1 -1724 3 -1724 -3 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA 9022 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.181.20 chr1 + 1954 1 full-splice_match RN7SL731P ENST00000584329.2 293 1 -1661 0 -1661 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 9085 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.181.22 chr1 + 1563 1 full-splice_match RN7SL731P ENST00000584329.2 293 1 -1271 1 -1271 -1 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 9475 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.181.23 chr1 + 1479 1 full-splice_match RN7SL731P ENST00000584329.2 293 1 -1186 0 -1186 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 9560 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.181.24 chr1 + 1070 1 full-splice_match RN7SL731P ENST00000584329.2 293 1 -777 0 -777 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 9969 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.181.25 chr1 + 921 1 full-splice_match RN7SL731P ENST00000584329.2 293 1 -628 0 -628 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.181.26 chr1 + 705 1 full-splice_match RN7SL731P ENST00000584329.2 293 1 -413 1 -413 -1 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.181.27 chr1 + 1959 1 full-splice_match RN7SL731P ENST00000584329.2 293 1 160 -1826 160 1826 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGTCATCTTTTAAGAGTGT NA FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.183.2 chr1 + 1868 12 novel_in_catalog PGD novel 2268 13 NA NA -12 315 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GCTCTTTCTCCAGATTCTTA NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 9 NA PB.183.3 chr1 + 2290 13 full-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 -23 1 -3 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 69 16.417356 1.215303 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTTGGTCTGATTTATTTC NA FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 69 NA PB.183.5 chr1 + 2234 13 full-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 33 1 -15 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTTGGTCTGATTTATTTC 29 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 7 NA PB.183.6 chr1 + 2036 12 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 367 368 -67 313 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGCTCTTTCTCCAGATTCT 39 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.183.7 chr1 + 1726 11 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 1365 368 797 313 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.282789 0.631727 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGCTCTTTCTCCAGATTCT 1037 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 18 NA PB.183.8 chr1 + 2053 11 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 1405 1 837 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTTGGTCTGATTTATTTC 1077 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 7 NA PB.183.9 chr1 + 1950 10 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 4006 1 3438 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTTGGTCTGATTTATTTC 3678 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 7 NA PB.183.10 chr1 + 1572 10 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 4017 368 3449 313 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 30 7.137981 0.853575 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGCTCTTTCTCCAGATTCT 3689 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 30 NA PB.183.11 chr1 + 1441 9 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 5172 368 4604 313 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 41 9.755241 0.989238 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGCTCTTTCTCCAGATTCT 4844 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 41 NA PB.183.14 chr1 + 1764 8 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 9007 1 -4763 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTTGGTCTGATTTATTTC 8679 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 7 NA PB.183.15 chr1 + 1291 7 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 12389 369 -1381 312 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 40 9.517308 0.978514 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GATGCTCTTTCTCCAGATTC NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 40 NA PB.183.16 chr1 + 1643 7 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 12405 1 -1365 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTTGGTCTGATTTATTTC NA FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 6 NA PB.183.17 chr1 + 1175 6 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 14015 368 245 313 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 25 5.948318 0.774394 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGCTCTTTCTCCAGATTCT NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 25 NA PB.183.18 chr1 + 1477 6 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 14080 1 310 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTTGGTCTGATTTATTTC NA FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 7 NA PB.183.19 chr1 + 1324 5 incomplete-splice_match PGD ENST00000498356.1 790 6 1740 -680 1740 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.568991 0.552545 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTTGGTCTGATTTATTTC 36 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 15 NA PB.183.20 chr1 + 918 5 incomplete-splice_match PGD ENST00000498356.1 790 6 1779 -313 -1741 313 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.093125 0.490398 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGCTCTTTCTCCAGATTCT 75 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 13 NA PB.183.21 chr1 + 1188 4 incomplete-splice_match PGD ENST00000498356.1 790 6 2134 -680 -1386 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTTGGTCTGATTTATTTC 430 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.183.22 chr1 + 777 4 incomplete-splice_match PGD ENST00000498356.1 790 6 2178 -313 -1342 313 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGCTCTTTCTCCAGATTCT 474 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 7 NA PB.183.23 chr1 + 1085 3 incomplete-splice_match PGD ENST00000498356.1 790 6 3553 -680 33 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.093125 0.490398 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTTGGTCTGATTTATTTC 1849 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 13 NA PB.183.24 chr1 + 620 2 incomplete-splice_match PGD ENST00000498356.1 790 6 4141 -312 621 312 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GATGCTCTTTCTCCAGATTC 2437 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 7 NA PB.183.25 chr1 + 926 2 incomplete-splice_match PGD ENST00000498356.1 790 6 4203 -680 683 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTTGGTCTGATTTATTTC 12 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 7 NA PB.186.1 chr1 + 959 5 full-splice_match CENPS ENST00000309048.8 905 5 -53 -1 -53 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CTTTTCTGGTTACTAATGTT 303 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 5 NA PB.186.2 chr1 + 1434 6 novel_in_catalog CENPS-CORT novel 571 6 NA NA -3 -8601 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTTTCTGGTTACTAATGTTG -27 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.186.3 chr1 + 823 6 full-splice_match CENPS-CORT ENST00000602787.6 571 6 -2 -250 -2 2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GATCTTTCCTCTCCTCCTTC -26 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.186.4 chr1 + 899 5 full-splice_match CENPS ENST00000309048.8 905 5 4 2 4 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 81 19.272549 1.284939 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGCTTTTCTGGTTACTAAT -22 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 81 NA PB.186.5 chr1 + 742 3 novel_in_catalog CENPS novel 905 5 NA NA 5 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GCTTTTCTGGTTACTAATGT -21 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.186.6 chr1 + 595 5 full-splice_match CENPS ENST00000309048.8 905 5 5 305 5 1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAATAAAATAAAAAGG -21 TRUE NA NA AATAGA -6 NA NA NA 4 NA PB.186.7 chr1 + 1145 5 full-splice_match CENPS ENST00000477755.1 914 5 -31 -200 -31 32 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 37 8.803510 0.944656 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGCTTTTTGTGCTGAATTCT -1 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 37 NA PB.186.9 chr1 + 917 5 full-splice_match CENPS ENST00000477755.1 914 5 -10 7 -10 -7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAGAAAAAGAAGTCAGAGGA 20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.186.10 chr1 + 1254 3 full-splice_match CENPS ENST00000462462.1 584 3 -366 -304 -26 -2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGCTTTTCTGGTTACTAAT 4 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 4 NA PB.186.11 chr1 + 1570 6 fusion CENPS_CORT novel 914 5 NA NA -13 -86 multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AGAATAACATCTTATTTCAG 17 TRUE NA NA AATAAA -30 NA NA NA 2 NA PB.186.12 chr1 + 1397 5 full-splice_match CENPS ENST00000477755.1 914 5 -10 -473 -10 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 87 20.700146 1.315973 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTTTTCTGGTTACTAATG 20 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 87 NA PB.186.13 chr1 + 1279 4 novel_in_catalog CENPS-CORT novel 1326 4 NA NA -31 -8598 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCTGGTTACTAATGTTGTTT 20 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.186.14 chr1 + 1069 4 novel_in_catalog CENPS-CORT novel 1326 4 NA NA -31 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTGATCTTTCCTCTCCTCC 20 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.186.15 chr1 + 935 3 full-splice_match CENPS ENST00000462462.1 584 3 -350 -1 -10 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAATAAAATAAAAAGG 20 TRUE NA NA AATAGA -6 NA NA NA 2 NA PB.186.16 chr1 + 1325 4 novel_in_catalog CENPS-CORT novel 1326 4 NA NA -27 -8605 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGCTTTTCTGGTTACTAAT 24 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.186.17 chr1 + 1309 6 fusion CENPS_CORT novel 914 5 NA NA -6 -340 multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTGATCTTTCCTCTCCTCC 24 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 7 NA PB.186.18 chr1 + 1045 2 incomplete-splice_match CENPS ENST00000477755.1 914 5 -6 8073 -6 3131 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAACGTTTTTATATCACCCA 24 TRUE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.186.19 chr1 + 1043 5 full-splice_match CENPS ENST00000477755.1 914 5 266 -395 -74 72 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATCAGTTCATCTTTTG 296 FALSE NA NA ATTAAA -39 NA NA NA 2 NA PB.186.20 chr1 + 728 4 incomplete-splice_match CENPS ENST00000309048.8 905 5 3449 1 2759 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTTTTCTGGTTACTAATG 3129 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.187.2 chr1 - 1278 6 novel_not_in_catalog DFFA novel 6035 6 NA NA 3140 1745 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAAAATTTAAGTTAG 3635 FALSE NA NA AATAAA -38 NA NA NA 2 NA PB.187.8 chr1 - 1417 6 novel_in_catalog DFFA novel 6035 6 NA NA -18 415 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGTAATTGGCAGTGATT 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.187.9 chr1 - 1329 6 full-splice_match DFFA ENST00000377038.8 6035 6 0 4706 0 415 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 103 24.507069 1.389291 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGTAATTGGCAGTGATT 445 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 103 NA PB.187.10 chr1 - 1207 6 full-splice_match DFFA ENST00000377038.8 6035 6 -3 4831 -3 290 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AACATACGCCGTTCCACCAA 442 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.187.14 chr1 - 815 2 incomplete-splice_match DFFA ENST00000377036.2 1403 5 8992 -7 8983 7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TTGGTGTTGTAAGAAAAGGC 9478 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.187.15 chr1 - 1443 5 full-splice_match DFFA ENST00000377036.2 1403 5 -41 1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 27 6.424183 0.807818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TCTTCCTGTTGGTGTTGTAA 445 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 27 NA PB.187.16 chr1 - 1065 5 full-splice_match DFFA ENST00000377036.2 1403 5 -38 376 3 -376 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 67 15.941491 1.202529 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACAGACTCTGGTCCAAGG -21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 67 NA PB.187.17 chr1 - 829 4 incomplete-splice_match DFFA ENST00000377036.2 1403 5 3149 409 3140 -409 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 TAAAGAAAAATGCATACACT 3635 FALSE NA NA AATAAA -38 NA NA NA 4 NA PB.189.1 chr1 + 3149 8 novel_in_catalog PEX14 novel 1922 9 NA NA -11 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AATTTCTGCCTGTGGCTCCC -14 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.189.2 chr1 + 1490 4 novel_not_in_catalog PEX14 novel 637 6 NA NA -11 5772 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TACACTTTACTCGTATACTT -14 TRUE NA NA AATACA -15 NA NA NA 4 NA PB.189.3 chr1 + 1916 9 full-splice_match PEX14 ENST00000356607.9 1922 9 4 2 4 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 125 29.741589 1.473364 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AATTTCTGCCTGTGGCTCCC 1 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 125 NA PB.189.5 chr1 + 1072 2 novel_not_in_catalog PEX14 novel 637 6 NA NA 4 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TAATTTCTGCCTGTGGCTCC 1 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.189.6 chr1 + 1779 8 novel_in_catalog PEX14 novel 1922 9 NA NA 11 -3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TAATTTCTGCCTGTGGCTCC 8 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 10 NA PB.189.9 chr1 + 1732 6 incomplete-splice_match PEX14 ENST00000356607.9 1922 9 124286 6 63348 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTTAATTTCTGCCTGTGGC NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 6 NA PB.189.10 chr1 + 1520 4 incomplete-splice_match PEX14 ENST00000356607.9 1922 9 148067 3 87129 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TAATTTCTGCCTGTGGCTCC 24 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 6 NA PB.189.11 chr1 + 1381 3 incomplete-splice_match PEX14 ENST00000356607.9 1922 9 149424 3 88486 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TAATTTCTGCCTGTGGCTCC 1335 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.189.12 chr1 + 1267 2 incomplete-splice_match PEX14 ENST00000356607.9 1922 9 152372 3 91434 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TAATTTCTGCCTGTGGCTCC 4283 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 5 NA PB.190.1 chr1 + 2712 6 novel_in_catalog TARDBP novel 2269 6 NA NA 13 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT NA FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.190.2 chr1 + 2984 6 full-splice_match TARDBP ENST00000240185.8 4185 6 -254 1455 -24 -6 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT NA FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 4 NA PB.190.4 chr1 + 2865 7 novel_in_catalog TARDBP novel 4185 6 NA NA -11 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT -17 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 3 NA PB.190.6 chr1 + 3412 7 novel_in_catalog TARDBP novel 1793 10 NA NA -2 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CAGTTTAGTGTCTGGAGTCT -8 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.190.7 chr1 + 2733 6 full-splice_match TARDBP ENST00000240185.8 4185 6 -3 1455 -2 -6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 557 132.528519 2.122309 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT -8 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 557 NA PB.190.8 chr1 + 1721 7 novel_in_catalog TARDBP novel 1793 10 NA NA -2 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT -8 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 5 NA PB.190.9 chr1 + 1508 6 full-splice_match TARDBP ENST00000240185.8 4185 6 -3 2680 -2 -46 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAAGGAAGAGCTAAAGGA -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.190.10 chr1 + 1213 8 incomplete-splice_match TARDBP ENST00000614757.4 1793 10 -11 6335 -2 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATGGATTCATCACCTGTC -8 TRUE NA NA AATAAA -26 NA NA NA 7 NA PB.190.11 chr1 + 2675 8 novel_in_catalog TARDBP novel 1793 10 NA NA 0 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CAGTTTAGTGTCTGGAGTCT -5 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.190.12 chr1 + 1708 7 novel_in_catalog TARDBP novel 4185 6 NA NA 1 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT -4 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 3 NA PB.190.13 chr1 + 4272 6 full-splice_match TARDBP ENST00000240185.8 4185 6 5 -92 -3 92 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 23 5.472452 0.738182 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAGAAAAAAGAAAATAATA 0 TRUE NA NA TTTAAA -13 NA NA NA 23 NA PB.190.14 chr1 + 2870 6 full-splice_match TARDBP ENST00000240185.8 4185 6 5 1310 -3 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.617260 0.417847 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGTCTCAAGTCAAATGGATT 0 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 11 NA PB.190.15 chr1 + 2633 7 novel_not_in_catalog TARDBP novel 4185 6 NA NA -3 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT 0 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 5 NA PB.190.16 chr1 + 2561 5 full-splice_match TARDBP ENST00000439080.6 1388 5 6 -1179 -3 -6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT 0 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 4 NA PB.190.17 chr1 + 2554 5 full-splice_match TARDBP ENST00000621715.4 816 5 -11 -1727 -3 -6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT 0 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 3 NA PB.190.20 chr1 + 2137 7 novel_in_catalog TARDBP novel 1793 10 NA NA -3 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GTCTCAAGTCAAATGGATTC 0 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 6 NA PB.190.21 chr1 + 1796 7 novel_in_catalog TARDBP novel 1835 6 NA NA -3 16 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 GCAGCCCTGAATGCAAAGAA 0 TRUE NA NA AATAAA -31 NA NA NA 2 NA PB.190.22 chr1 + 1747 7 novel_in_catalog TARDBP novel 4185 6 NA NA -3 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT 0 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.190.24 chr1 + 1167 8 novel_in_catalog TARDBP novel 1793 10 NA NA -3 -6 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT 0 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.190.25 chr1 + 2856 7 full-splice_match TARDBP ENST00000472476.5 1001 7 6 -1861 -2 -6 alternative_3end TRUE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT 1 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 3 NA PB.190.26 chr1 + 1188 8 novel_in_catalog TARDBP novel 1793 10 NA NA 0 4 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAGTCAAATGGATTCATCAC 3 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 3 NA PB.190.27 chr1 + 2612 5 incomplete-splice_match TARDBP ENST00000315091.7 1835 6 28 146 16 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT 1060 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 10 NA PB.190.28 chr1 + 2484 5 incomplete-splice_match TARDBP ENST00000315091.7 1835 6 156 146 144 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.855192 0.455635 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT 1188 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 12 NA PB.190.29 chr1 + 2303 4 incomplete-splice_match TARDBP ENST00000611963.4 739 6 -35 156 -35 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT 4247 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 10 NA PB.190.30 chr1 + 2171 3 incomplete-splice_match TARDBP ENST00000620632.4 706 5 8 6 8 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.234519 0.718877 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT 6104 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 22 NA PB.190.31 chr1 + 2043 2 incomplete-splice_match TARDBP ENST00000614494.1 515 4 38 146 -35 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 37 8.803510 0.944656 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT 7787 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 37 NA PB.190.34 chr1 + 1200 2 full-splice_match TARDBP ENST00000621573.1 992 2 -294 86 -54 3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 CAAGTCAAATGGATTCATCA 9570 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.190.46 chr1 + 1325 2 full-splice_match TARDBP ENST00000480464.2 790 2 -537 2 69 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CAGTTTAGTGTCTGGAGTCT NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.191.1 chr1 - 1634 6 incomplete-splice_match CASZ1 ENST00000344008.5 4405 16 143038 7 -2512 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TTATTTATATCGCCTGAGTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.192.1 chr1 - 2357 2 novel_in_catalog MASP2 novel 2455 11 NA NA 0 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CACCTGCTGCCACGTGTCTC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.193.1 chr1 + 847 1 full-splice_match TARDBP ENST00000607145.1 870 1 22 1 22 -1 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTGTGTGTTTGTAGTAGTC 22 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.194.1 chr1 - 1292 8 full-splice_match SRM ENST00000376957.7 1260 8 -35 3 -33 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 1027 244.356888 2.388025 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGATTGGAGTCCTGTGTC -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 1027 NA PB.194.3 chr1 - 1421 7 incomplete-splice_match SRM ENST00000376957.7 1260 8 267 3 -65 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGATTGGAGTCCTGTGTC 288 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.194.4 chr1 - 1344 8 novel_in_catalog SRM novel 1260 8 NA NA 3 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGATTGGAGTCCTGTGTC 24 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.194.5 chr1 - 1333 7 novel_in_catalog SRM novel 1260 8 NA NA 0 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGATTGGAGTCCTGTGTC 21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.194.6 chr1 - 1308 8 novel_in_catalog SRM novel 1260 8 NA NA -14 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGATTGGAGTCCTGTGTC 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.194.7 chr1 - 1292 8 novel_not_in_catalog SRM novel 1260 8 NA NA -23 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGATTGGAGTCCTGTGTC -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.194.8 chr1 - 1245 8 novel_not_in_catalog SRM novel 1260 8 NA NA -1 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGATTGGAGTCCTGTGTC 18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.194.9 chr1 - 1181 8 novel_in_catalog SRM novel 1260 8 NA NA -166 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGATTGGAGTCCTGTGTC 187 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.194.10 chr1 - 1205 7 incomplete-splice_match SRM ENST00000376957.7 1260 8 483 3 151 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGATTGGAGTCCTGTGTC 504 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.194.11 chr1 - 1095 8 full-splice_match SRM ENST00000376957.7 1260 8 162 3 162 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGATTGGAGTCCTGTGTC 183 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.194.12 chr1 - 1111 7 novel_in_catalog SRM novel 1260 8 NA NA 0 -3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGATTGGAGTCCTGTGTC 21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.194.13 chr1 - 1005 7 incomplete-splice_match SRM ENST00000376957.7 1260 8 683 3 351 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 43 10.231107 1.009923 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGATTGGAGTCCTGTGTC 704 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 43 NA PB.194.14 chr1 - 861 6 incomplete-splice_match SRM ENST00000376957.7 1260 8 1159 3 14 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 24 5.710385 0.756665 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGATTGGAGTCCTGTGTC 1180 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 24 NA PB.194.15 chr1 - 736 5 incomplete-splice_match SRM ENST00000376957.7 1260 8 3326 3 -872 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGATTGGAGTCCTGTGTC 3347 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.196.1 chr1 - 1567 16 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 17097 -4 -149 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTCCTGACTTTTATTTTGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.196.2 chr1 - 2781 25 full-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 18 -3 3 3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 236 56.152119 1.749366 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GATTCCTGACTTTTATTTTG 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 236 NA PB.196.3 chr1 - 1838 18 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 12048 -3 -5198 3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GATTCCTGACTTTTATTTTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.196.4 chr1 - 3345 23 novel_in_catalog EXOSC10 novel 2796 25 NA NA 3 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.196.5 chr1 - 2730 24 novel_in_catalog EXOSC10 novel 2796 25 NA NA -6 -3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.196.6 chr1 - 2693 24 novel_in_catalog EXOSC10 novel 2796 25 NA NA 3 -3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.196.7 chr1 - 2697 24 full-splice_match EXOSC10 ENST00000304457.11 2721 24 18 6 3 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.196.8 chr1 - 2632 24 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 1722 6 1707 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT 1707 FALSE NA NA AAGAAA -25 NA NA NA 8 NA PB.196.9 chr1 - 2277 21 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 8688 6 -8558 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT 8673 FALSE NA NA AATACA -35 NA NA NA 7 NA PB.196.10 chr1 - 1911 18 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 11966 6 -5280 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT NA FALSE NA NA AATATA -6 NA NA NA 4 NA PB.196.11 chr1 - 1625 16 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 17029 6 -217 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT NA FALSE NA NA AAAACA -4 NA NA NA 10 NA PB.196.12 chr1 - 1394 15 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 18709 6 57 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.806923 0.580574 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.196.13 chr1 - 1162 9 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 22632 6 414 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT 2530 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.196.14 chr1 - 1115 12 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 20047 6 -22 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.520721 0.655208 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.196.15 chr1 - 1064 12 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 20098 6 29 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.196.16 chr1 - 874 9 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 22920 6 702 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT 2818 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.196.17 chr1 - 695 8 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 25614 6 -1229 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT 5512 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.196.18 chr1 - 2990 24 novel_in_catalog EXOSC10 novel 2796 25 NA NA -2 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GAAGAAAGCTGATTCCTGAC -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.196.19 chr1 - 2784 25 novel_in_catalog EXOSC10 novel 2796 25 NA NA 5 -4 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.568991 0.552545 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GAAGAAAGCTGATTCCTGAC 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.196.20 chr1 - 2143 16 novel_in_catalog EXOSC10 novel 2796 25 NA NA -5288 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GAAGAAAGCTGATTCCTGAC NA FALSE NA NA AATATA -14 NA NA NA 2 NA PB.196.21 chr1 - 1993 19 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 11671 7 -5575 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GAAGAAAGCTGATTCCTGAC 9913 FALSE NA NA AATAAA -38 NA NA NA 2 NA PB.196.22 chr1 - 2470 23 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 4020 8 4005 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TGAAGAAAGCTGATTCCTGA 4005 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.196.24 chr1 - 2570 23 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 18 2027 3 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GTAAGAACTGCTCCTGGAGG 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.196.25 chr1 - 2214 20 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 18 5517 3 2153 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAAGACTCTAAAGAAGCT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.196.26 chr1 - 1948 17 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000304457.11 2721 24 11 10289 -4 102 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAGAAGATAACTTGCTG -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.196.27 chr1 - 2296 14 novel_in_catalog EXOSC10 novel 2721 24 NA NA 7 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAGAAAAAATAAACAAA 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.196.34 chr1 - 1359 4 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000304457.11 2721 24 9215 19903 -8031 4982 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAAGAAAAATAGAAGAA 9200 FALSE NA NA AAAACA -10 NA NA NA 2 NA PB.197.1 chr1 + 780 2 full-splice_match EXOSC10-AS1 ENST00000447600.1 487 2 -245 -48 0 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGAGAATACTTGCTTTTCAC -1 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.198.3 chr1 - 8702 58 full-splice_match MTOR ENST00000361445.9 8721 58 12 7 12 -7 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 12 2.855192 0.455635 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG 11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.198.4 chr1 - 4941 34 incomplete-splice_match MTOR ENST00000361445.9 8721 58 53091 7 53091 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.198.5 chr1 - 4445 31 incomplete-splice_match MTOR ENST00000361445.9 8721 58 63189 7 -54337 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.198.6 chr1 - 5273 37 incomplete-splice_match MTOR ENST00000361445.9 8721 58 49678 7 49678 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.198.7 chr1 - 3679 24 incomplete-splice_match MTOR ENST00000361445.9 8721 58 122935 7 44 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.198.8 chr1 - 3507 22 incomplete-splice_match MTOR ENST00000361445.9 8721 58 128041 7 -2952 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.198.9 chr1 - 3537 23 incomplete-splice_match MTOR ENST00000361445.9 8721 58 123174 7 283 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA ACTAAA -10 NA NA NA 2 NA PB.198.10 chr1 - 3373 22 incomplete-splice_match MTOR ENST00000361445.9 8721 58 128175 7 -2818 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.198.11 chr1 - 3205 20 full-splice_match MTOR ENST00000376838.5 4017 20 805 7 805 -7 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.198.12 chr1 - 3040 20 full-splice_match MTOR ENST00000376838.5 4017 20 970 7 970 -7 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.198.13 chr1 - 2882 18 incomplete-splice_match MTOR ENST00000376838.5 4017 20 2604 7 2604 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA AAAAAG -45 NA NA NA 5 NA PB.198.14 chr1 - 2509 15 incomplete-splice_match MTOR ENST00000376838.5 4017 20 3803 7 3803 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.198.15 chr1 - 2381 14 incomplete-splice_match MTOR ENST00000376838.5 4017 20 4410 7 4410 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.198.16 chr1 - 2291 14 incomplete-splice_match MTOR ENST00000376838.5 4017 20 4500 7 4500 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.198.17 chr1 - 1986 12 incomplete-splice_match MTOR ENST00000376838.5 4017 20 7006 7 7006 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.198.18 chr1 - 1826 11 incomplete-splice_match MTOR ENST00000376838.5 4017 20 9537 7 -6358 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.198.19 chr1 - 1719 10 incomplete-splice_match MTOR ENST00000376838.5 4017 20 10254 7 -5641 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.855192 0.455635 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.198.20 chr1 - 1579 8 incomplete-splice_match MTOR ENST00000376838.5 4017 20 16088 7 57 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.093125 0.490398 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.198.21 chr1 - 1448 7 incomplete-splice_match MTOR ENST00000376838.5 4017 20 16727 7 -202 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.331058 0.522582 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.198.22 chr1 - 1345 6 full-splice_match MTOR ENST00000473471.5 862 6 260 -743 260 -7 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.198.23 chr1 - 1213 4 incomplete-splice_match MTOR ENST00000473471.5 862 6 4914 -743 4914 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.331058 0.522582 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA AAGAAA -22 NA NA NA 14 NA PB.198.24 chr1 - 1062 2 incomplete-splice_match MTOR ENST00000473471.5 862 6 6346 -743 6346 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.855192 0.455635 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA AAAACA -25 NA NA NA 12 NA PB.198.30 chr1 - 950 6 incomplete-splice_match MTOR ENST00000361445.9 8721 58 11 147304 11 -114885 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GTGAGAAGCCACGGCAGAGG 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.199.1 chr1 + 1543 2 full-splice_match UBIAD1 ENST00000376810.6 3654 2 28 2083 28 -2083 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 105 24.982935 1.397643 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGGTGAATTAGGCGCATGG 15 TRUE NA NA TTTAAA -18 NA NA NA 105 NA PB.199.4 chr1 + 3624 2 full-splice_match UBIAD1 ENST00000376810.6 3654 2 28 2 28 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CACCAATGGTCTGGCTTCTG 15 TRUE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 4 NA PB.199.5 chr1 + 1721 2 full-splice_match UBIAD1 ENST00000376810.6 3654 2 28 1905 28 -1905 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGAGTGTTGTCCTGCTTTCT 15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.199.6 chr1 + 1273 2 full-splice_match UBIAD1 ENST00000376810.6 3654 2 297 2084 -33 -2084 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 52 12.372500 1.092458 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAGGTGAATTAGGCGCATG -8 TRUE NA NA TTTAAA -17 NA NA NA 52 NA PB.199.8 chr1 + 1108 2 full-splice_match UBIAD1 ENST00000376810.6 3654 2 312 2234 -18 -2234 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGGAATGTGATTTGGCAGT 7 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.199.9 chr1 + 1027 2 full-splice_match UBIAD1 ENST00000376810.6 3654 2 470 2157 140 -2157 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAGATAATATGTTGTTTTT 165 FALSE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.200.1 chr1 + 2037 5 novel_in_catalog FBXO44 novel 2928 6 NA NA -8 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AACCTGTGCCCTGTGGTTTC -22 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 4 NA PB.200.2 chr1 + 1767 5 full-splice_match FBXO44 ENST00000376762.8 1734 5 -35 2 -2 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.331058 0.522582 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AACCTGTGCCCTGTGGTTTC -16 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 14 NA PB.200.3 chr1 + 2137 6 novel_in_catalog FBXO44 novel 822 6 NA NA 0 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AACCTGTGCCCTGTGGTTTC -14 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 5 NA PB.200.4 chr1 + 1889 6 full-splice_match FBXO44 ENST00000251547.10 2928 6 0 1039 0 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TAACCTGTGCCCTGTGGTTT -14 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 5 NA PB.200.5 chr1 + 1818 9 novel_not_in_catalog FBXO44 novel 3320 7 NA NA 3 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACCCAGTCTCGGGTATTTCT -7 TRUE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.200.6 chr1 + 1252 9 novel_not_in_catalog FBXO44 novel 3320 7 NA NA 4 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACCCAGTCTCGGGTATTTCT -6 TRUE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.200.7 chr1 + 1473 4 incomplete-splice_match FBXO44 ENST00000251547.10 2928 6 3436 1038 -229 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AACCTGTGCCCTGTGGTTTC 3284 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.201.1 chr1 - 976 5 incomplete-splice_match FBXO2 ENST00000354287.5 1287 6 3801 -6 85 6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATGAAAAAATGGATAAACA 4190 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.201.2 chr1 - 1290 6 full-splice_match FBXO2 ENST00000354287.5 1287 6 0 -3 0 3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 111 26.410530 1.421777 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 ATGAATGAAAAAATGGATAA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 111 NA PB.201.3 chr1 - 1294 6 novel_not_in_catalog FBXO2 novel 1287 6 NA NA 0 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAGGAATGAATGAAAAAATG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.202.1 chr1 + 1485 6 full-splice_match FBXO6 ENST00000376753.9 1444 6 -45 4 -45 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAACCAGCCTGGGGTTGGT 29 FALSE NA NA AATAAA -26 NA NA NA 10 NA PB.202.3 chr1 + 1119 6 full-splice_match FBXO6 ENST00000376753.9 1444 6 0 325 0 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.855192 0.455635 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CACTGTGGCTCACGCCTGTA -13 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 12 NA PB.204.3 chr1 + 1104 4 novel_in_catalog AGTRAP novel 1130 5 NA NA 2 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGATGGGCTGTGTTTTGAAC -27 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.204.4 chr1 + 1118 5 full-splice_match AGTRAP ENST00000376629.8 1100 5 -21 3 2 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 75 17.844954 1.251515 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGATGGGCTGTGTTTTGAAC -27 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 75 NA PB.204.5 chr1 + 2735 4 novel_in_catalog AGTRAP novel 1130 5 NA NA 2 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGATGGGCTGTGTTTTGAAC -21 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.204.6 chr1 + 1369 6 full-splice_match AGTRAP ENST00000476512.5 942 6 15 -442 2 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGATGGGCTGTGTTTTGAAC -21 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 10 NA PB.204.7 chr1 + 1230 6 full-splice_match AGTRAP ENST00000400895.6 786 6 8 -452 2 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 23 5.472452 0.738182 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGATGGGCTGTGTTTTGAAC -21 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 23 NA PB.204.8 chr1 + 1209 6 full-splice_match AGTRAP ENST00000452018.6 809 6 -41 -359 2 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.093125 0.490398 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGATGGGCTGTGTTTTGAAC -21 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 13 NA PB.204.10 chr1 + 944 3 incomplete-splice_match AGTRAP ENST00000513739.5 566 4 1480 -642 -23 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGATGGGCTGTGTTTTGAA 9954 FALSE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 8 NA PB.205.1 chr1 - 1078 9 full-splice_match MAD2L2 ENST00000376692.9 1053 9 -26 1 -26 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 655 155.845917 2.192695 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG -36 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 655 NA PB.205.2 chr1 - 1456 8 incomplete-splice_match MAD2L2 ENST00000376692.9 1053 9 21 1 4 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG 11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.205.3 chr1 - 1344 8 novel_in_catalog MAD2L2 novel 1053 9 NA NA 5 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG 12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.205.4 chr1 - 1281 8 incomplete-splice_match MAD2L2 ENST00000376692.9 1053 9 196 1 159 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.093125 0.490398 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.205.5 chr1 - 1223 9 full-splice_match MAD2L2 ENST00000376672.5 1002 9 -177 -44 -4 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG 152 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.205.6 chr1 - 1133 9 full-splice_match MAD2L2 ENST00000376667.7 872 9 6 -267 6 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 27 6.424183 0.807818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG 203 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 27 NA PB.205.7 chr1 - 1127 8 novel_in_catalog MAD2L2 novel 1053 9 NA NA -2 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.568991 0.552545 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.205.8 chr1 - 1101 8 incomplete-splice_match MAD2L2 ENST00000376692.9 1053 9 376 1 339 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG 769 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.205.9 chr1 - 1036 9 novel_not_in_catalog MAD2L2 novel 1053 9 NA NA -7 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.568991 0.552545 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.205.10 chr1 - 1049 9 full-splice_match MAD2L2 ENST00000376667.7 872 9 90 -267 -42 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 35 8.327644 0.920522 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG 42 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 35 NA PB.205.11 chr1 - 1016 9 novel_not_in_catalog MAD2L2 novel 1053 9 NA NA 5 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.205.12 chr1 - 1017 9 novel_not_in_catalog MAD2L2 novel 1053 9 NA NA -176 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.520721 0.655208 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG -20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.205.13 chr1 - 892 7 incomplete-splice_match MAD2L2 ENST00000376692.9 1053 9 675 1 638 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.093125 0.490398 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG 1068 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.205.14 chr1 - 802 7 incomplete-splice_match MAD2L2 ENST00000376692.9 1053 9 765 1 728 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG 1158 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.205.15 chr1 - 1077 9 full-splice_match MAD2L2 ENST00000376669.9 864 9 -17 -196 -4 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.234519 0.718877 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAGCTGAGCCATCATTAACT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 22 NA PB.205.16 chr1 - 1268 8 novel_in_catalog MAD2L2 novel 872 9 NA NA -1 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CTGAGCTGAGCCATCATTAA -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.209.2 chr1 + 5587 23 full-splice_match CLCN6 ENST00000346436.11 5589 23 0 2 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCCTCTGTCTCCTTTAGCCT -6 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.209.6 chr1 + 1216 6 full-splice_match CLCN6 ENST00000376497.7 814 6 28 -430 10 430 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCCTGAGAGAGGTTATTTA 5 TRUE NA NA AATAAA -31 NA NA NA 2 NA PB.209.7 chr1 + 989 6 incomplete-splice_match CLCN6 ENST00000376490.7 963 11 -22 4903 10 2536 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAATACAAAATTAGCCGG 5 TRUE NA NA AGTAAA -19 NA NA NA 4 NA PB.209.9 chr1 + 5540 23 full-splice_match CLCN6 ENST00000346436.11 5589 23 53 -4 13 4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GTCTCCTTTAGCCTTTTGTC 8 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.209.12 chr1 + 4110 9 novel_not_in_catalog CLCN6 novel 5631 22 NA NA 4027 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCCTCTGTCTCCTTTAGCCT NA FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.209.13 chr1 + 3829 7 incomplete-splice_match CLCN6 ENST00000346436.11 5589 23 28292 3 4634 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTCCTCTGTCTCCTTTAGCC NA FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.209.14 chr1 + 2251 5 novel_in_catalog CLCN6 novel 3993 27 NA NA -2450 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACCGCCGTGCCTCAGGATTC NA FALSE NA NA AGTAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.209.15 chr1 + 3009 2 incomplete-splice_match CLCN6 ENST00000346436.11 5589 23 32449 0 -2377 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTCTGTCTCCTTTAGCCTTT NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.210.1 chr1 - 706 3 full-splice_match NPPB ENST00000376468.4 708 3 0 2 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATCTTTTGAAACTGATTTG -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.212.1 chr1 + 3153 19 full-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 -174 -3 -151 2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGGGAAGATGCTCAGGGCG NA FALSE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.212.2 chr1 + 3001 19 full-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 -28 3 -5 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 376 89.462700 1.951642 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CCACTGAAGGGAAGATGCTC -29 TRUE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 376 NA PB.212.3 chr1 + 3827 18 novel_in_catalog PLOD1 novel 2976 19 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGAAGGGAAGATGCTCAGGG -24 TRUE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.212.4 chr1 + 2851 18 novel_in_catalog PLOD1 novel 2976 19 NA NA 0 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG -24 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.212.5 chr1 + 3035 20 novel_not_in_catalog PLOD1 novel 2976 19 NA NA -3 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGAAGGGAAGATGCTCAGGG -4 TRUE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.212.6 chr1 + 3072 20 novel_not_in_catalog PLOD1 novel 2976 19 NA NA -3 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG -4 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.212.7 chr1 + 2805 18 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 13292 -1 -6292 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGAAGGGAAGATGCTCAGGG NA FALSE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 10 NA PB.212.8 chr1 + 2699 17 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 15101 1 -4483 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 26 6.186250 0.791427 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG 5 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 26 NA PB.212.9 chr1 + 2575 16 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 15678 -2 -3906 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAGGGAAGATGCTCAGGGC 9 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 9 NA PB.212.10 chr1 + 2481 16 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 15769 1 -3815 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.093125 0.490398 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG 52 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 13 NA PB.212.11 chr1 + 2365 15 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 17987 1 -1597 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.234519 0.718877 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG 72 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 22 NA PB.212.12 chr1 + 2243 13 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 22226 1 2642 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 25 5.948318 0.774394 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG 2097 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 25 NA PB.212.13 chr1 + 2053 11 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 23815 1 4231 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.520721 0.655208 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG 14 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 19 NA PB.212.14 chr1 + 1887 10 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 25980 0 -3991 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 29 6.900049 0.838852 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CTGAAGGGAAGATGCTCAGG 2094 FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 29 NA PB.212.15 chr1 + 1773 9 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 28858 0 -1113 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.855192 0.455635 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CTGAAGGGAAGATGCTCAGG 4972 FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 12 NA PB.212.16 chr1 + 1677 8 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 29491 1 -480 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 23 5.472452 0.738182 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG 5605 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 23 NA PB.212.17 chr1 + 1551 7 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 29960 1 -11 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 35 8.327644 0.920522 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG 439 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 35 NA PB.212.18 chr1 + 1388 6 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 30817 1 832 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 24 5.710385 0.756665 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG 14 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 24 NA PB.212.19 chr1 + 1241 4 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 32291 1 2306 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 28 6.662116 0.823612 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG 1488 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 28 NA PB.212.20 chr1 + 1119 3 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 35991 1 -835 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 42 9.993174 0.999703 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG 41 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 42 NA PB.212.21 chr1 + 1008 2 full-splice_match PLOD1 ENST00000481933.1 2339 2 1331 0 1331 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG 2207 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 7 NA PB.213.1 chr1 + 4602 19 full-splice_match MFN2 ENST00000235329.10 4407 19 -203 8 3 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GGAAATCCTTTGTGAGATCT 9574 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 8 NA PB.213.2 chr1 + 4467 18 full-splice_match MFN2 ENST00000674817.1 4514 18 52 -5 3 2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTGAGATCTGTCTTTTTGG 9574 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 4 NA PB.213.3 chr1 + 4578 19 novel_in_catalog MFN2 novel 4772 20 NA NA 0 2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTGAGATCTGTCTTTTTGG -7 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 5 NA PB.213.4 chr1 + 4262 18 full-splice_match MFN2 ENST00000674817.1 4514 18 255 -3 0 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTTGTGAGATCTGTCTTTTT 2 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 8 NA PB.213.6 chr1 + 4404 19 full-splice_match MFN2 ENST00000235329.10 4407 19 2 1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 42 9.993174 0.999703 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTTTGTGAGATCTGTCTTTT 4 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 42 NA PB.213.7 chr1 + 3434 12 novel_in_catalog MFN2 novel 4407 19 NA NA 0 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATCCTTTGTGAGATCTGT 4 TRUE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.213.8 chr1 + 3954 16 full-splice_match MFN2 ENST00000675483.1 4337 16 382 1 382 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TGGAAATCCTTTGTGAGATC 7866 FALSE NA NA AATAAA -8 NA NA NA 2 NA PB.213.9 chr1 + 3590 13 full-splice_match MFN2 ENST00000675528.1 3700 13 118 -8 118 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTTGTGAGATCTGTCTTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.213.10 chr1 + 3274 11 full-splice_match MFN2 ENST00000675404.1 4447 11 1180 -7 1180 2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTGAGATCTGTCTTTTTGG 63 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 4 NA PB.213.11 chr1 + 3162 9 incomplete-splice_match MFN2 ENST00000675404.1 4447 11 1651 -7 1651 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTGAGATCTGTCTTTTTGG 534 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 7 NA PB.213.12 chr1 + 2932 7 incomplete-splice_match MFN2 ENST00000675404.1 4447 11 4157 -5 -2261 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTTGTGAGATCTGTCTTTTT 3040 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 8 NA PB.213.13 chr1 + 2800 6 incomplete-splice_match MFN2 ENST00000675404.1 4447 11 4494 1 -1924 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATCCTTTGTGAGATCTGT 3377 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.213.14 chr1 + 2618 5 incomplete-splice_match MFN2 ENST00000675404.1 4447 11 5466 -6 -952 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.617260 0.417847 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGTGAGATCTGTCTTTTTG 4349 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 11 NA PB.213.15 chr1 + 2457 4 incomplete-splice_match MFN2 ENST00000675404.1 4447 11 6226 1 -192 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATCCTTTGTGAGATCTGT 5109 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 8 NA PB.213.16 chr1 + 2372 4 incomplete-splice_match MFN2 ENST00000675404.1 4447 11 6319 -7 -99 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTGAGATCTGTCTTTTTGG 5202 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 5 NA PB.213.17 chr1 + 2247 3 full-splice_match MFN2 ENST00000676295.1 2622 3 384 -9 384 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGTGAGATCTGTCTTTTTG 5685 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 9 NA PB.213.18 chr1 + 2144 2 full-splice_match MFN2 ENST00000675043.1 2148 2 43 -39 43 2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTGAGATCTGTCTTTTTGG 8131 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 4 NA PB.213.20 chr1 + 2051 2 full-splice_match MFN2 ENST00000675043.1 2148 2 134 -37 134 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTTGTGAGATCTGTCTTTTT 8222 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 10 NA PB.214.1 chr1 + 1558 10 full-splice_match MIIP ENST00000235332.6 1541 10 -19 2 13 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 223 53.058994 1.724759 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGTCCCACGTGTGCTGGTT -21 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 223 NA PB.214.2 chr1 + 1729 10 novel_in_catalog MIIP novel 1541 10 NA NA -9 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGTCCCACGTGTGCTGGTT -11 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 5 NA PB.214.3 chr1 + 1517 9 novel_in_catalog MIIP novel 1541 10 NA NA 2 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTCAAGTCCCACGTGTGC 0 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.214.4 chr1 + 2100 8 novel_in_catalog MIIP novel 1541 10 NA NA 3 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGTCCCACGTGTGCTGGTT 1 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 5 NA PB.214.5 chr1 + 2014 9 novel_in_catalog MIIP novel 1541 10 NA NA 3 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 40 9.517308 0.978514 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTCAAGTCCCACGTGTGC 1 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 40 NA PB.214.6 chr1 + 1664 9 novel_in_catalog MIIP novel 1541 10 NA NA 3 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTCAAGTCCCACGTGTGC 1 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.214.7 chr1 + 2146 8 novel_in_catalog MIIP novel 1541 10 NA NA 4 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.806923 0.580574 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTCAAGTCCCACGTGTGC 2 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 16 NA PB.214.8 chr1 + 1491 10 novel_not_in_catalog MIIP novel 1541 10 NA NA 6 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAGCTCAAGTCCCACGTGTG 4 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.214.9 chr1 + 1331 9 novel_in_catalog MIIP novel 1541 10 NA NA 6 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 39 9.279376 0.967519 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAGCTCAAGTCCCACGTGTG 4 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 39 NA PB.214.10 chr1 + 1582 10 novel_not_in_catalog MIIP novel 1541 10 NA NA 53 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTCAAGTCCCACGTGTGC 51 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.214.11 chr1 + 1388 9 incomplete-splice_match MIIP ENST00000235332.6 1541 10 2243 2 -481 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGTCCCACGTGTGCTGGTT 2241 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.214.12 chr1 + 1193 8 incomplete-splice_match MIIP ENST00000235332.6 1541 10 2687 7 -37 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTCAAGTCCCACGTGTGC 2685 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 5 NA PB.214.13 chr1 + 1063 8 incomplete-splice_match MIIP ENST00000235332.6 1541 10 2822 2 98 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGTCCCACGTGTGCTGGTT 2820 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 8 NA PB.214.14 chr1 + 936 7 incomplete-splice_match MIIP ENST00000235332.6 1541 10 3339 2 -27 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGTCCCACGTGTGCTGGTT 3337 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.214.15 chr1 + 875 7 incomplete-splice_match MIIP ENST00000235332.6 1541 10 3400 2 34 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGTCCCACGTGTGCTGGTT 3398 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.214.16 chr1 + 1037 4 incomplete-splice_match MIIP ENST00000498685.5 1392 6 6546 5 314 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTCAAGTCCCACGTGTGC 9910 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.215.1 chr1 + 2278 12 novel_in_catalog TNFRSF8 novel 3760 15 NA NA 25 -79 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGTGCCTGTGGTTGTTTCTC -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.215.2 chr1 + 2152 3 incomplete-splice_match TNFRSF8 ENST00000413146.6 2363 5 9690 2 9655 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGGCTGAGGACATGATCAT 9638 FALSE NA NA CATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.216.2 chr1 + 3686 10 full-splice_match TNFRSF1B ENST00000376259.7 3687 10 0 1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACACGTCGACCCCTGGCTCT 1 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 8 NA PB.216.4 chr1 + 2860 3 novel_in_catalog TNFRSF1B novel 3583 9 NA NA 4 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACACGTCGACCCCTGGCTCT 5 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.219.1 chr1 + 904 7 novel_in_catalog VPS13D novel 5369 34 NA NA -9591 37 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATACTTCTTGACTGTTGT NA FALSE NA NA AGTAAA -8 NA NA NA 2 NA PB.220.2 chr1 - 2644 4 novel_not_in_catalog KIAA2013 novel 2170 4 NA NA -9 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACGACCGGTTTGTGTGTGGT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.220.4 chr1 - 2487 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 331 1 307 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACGACCGGTTTGTGTGTGGT 319 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.220.5 chr1 - 2413 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 405 1 381 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACGACCGGTTTGTGTGTGGT 393 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.220.6 chr1 - 2305 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 513 1 489 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACGACCGGTTTGTGTGTGGT 501 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.220.7 chr1 - 2020 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 798 1 774 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACGACCGGTTTGTGTGTGGT 786 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.220.8 chr1 - 1938 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 880 1 856 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACGACCGGTTTGTGTGTGGT 868 FALSE NA NA GGGGCT -41 NA NA NA 5 NA PB.220.9 chr1 - 1545 2 incomplete-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 2988 1 2964 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACGACCGGTTTGTGTGTGGT 2976 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.220.10 chr1 - 1463 2 incomplete-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 3070 1 3046 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACGACCGGTTTGTGTGTGGT 3058 FALSE NA NA GGGGCT -20 NA NA NA 7 NA PB.220.11 chr1 - 1370 2 incomplete-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 3163 1 3139 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACGACCGGTTTGTGTGTGGT 3151 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.220.12 chr1 - 1181 2 incomplete-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 3352 1 3328 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.855192 0.455635 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACGACCGGTTTGTGTGTGGT 3340 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.220.13 chr1 - 1031 2 incomplete-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 3502 1 3478 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACGACCGGTTTGTGTGTGGT 3490 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.220.14 chr1 - 841 2 incomplete-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 3692 1 3668 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACGACCGGTTTGTGTGTGGT 3680 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.220.16 chr1 - 2724 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 93 2 69 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CACGACCGGTTTGTGTGTGG 81 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.220.18 chr1 - 1722 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 1095 2 1071 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.855192 0.455635 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CACGACCGGTTTGTGTGTGG 1083 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.220.19 chr1 - 1628 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 1189 2 1165 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CACGACCGGTTTGTGTGTGG 1177 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.220.20 chr1 - 2599 3 novel_not_in_catalog KIAA2013 novel 2819 3 NA NA 189 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TCACGACCGGTTTGTGTGTG 201 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.220.22 chr1 - 2179 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 163 477 139 115 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATACTTGAAATGGAACTC 151 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.220.23 chr1 - 2047 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 295 477 271 115 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATACTTGAAATGGAACTC 283 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.220.26 chr1 - 1817 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 525 477 501 115 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATACTTGAAATGGAACTC 513 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.220.28 chr1 - 1680 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 662 477 638 115 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.093125 0.490398 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATACTTGAAATGGAACTC 650 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.220.29 chr1 - 1393 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 949 477 925 115 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATACTTGAAATGGAACTC 937 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.220.30 chr1 - 1228 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 1114 477 1090 115 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATACTTGAAATGGAACTC 1102 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.220.31 chr1 - 1068 3 novel_not_in_catalog KIAA2013 novel 2819 3 NA NA 9 115 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATACTTGAAATGGAACTC 21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.220.32 chr1 - 899 2 incomplete-splice_match KIAA2013 ENST00000616327.1 2170 4 3134 -115 3134 115 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATACTTGAAATGGAACTC 3146 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.220.33 chr1 - 808 2 incomplete-splice_match KIAA2013 ENST00000616327.1 2170 4 3225 -115 3225 115 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATACTTGAAATGGAACTC 3237 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.220.34 chr1 - 2153 4 novel_not_in_catalog KIAA2013 novel 2170 4 NA NA 5 114 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 CAAATACTTGAAATGGAACT 17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.220.36 chr1 - 1507 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 834 478 810 114 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 CAAATACTTGAAATGGAACT 822 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.221.1 chr1 + 3003 11 incomplete-splice_match VPS13D ENST00000646411.1 4522 21 29851 -15 3206 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACAACCTTGTCACATGTAGC 866 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.221.3 chr1 + 2282 6 incomplete-splice_match VPS13D ENST00000646411.1 4522 21 60368 -17 6881 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACCTTGTCACATGTAGCTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.221.4 chr1 + 1213 5 incomplete-splice_match VPS13D ENST00000645371.1 2024 14 73033 -404 -8911 404 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TATTGCACTAATTCTAGATG NA FALSE NA NA TATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.221.5 chr1 + 3560 4 incomplete-splice_match VPS13D ENST00000645371.1 2024 14 77365 -3013 -4579 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CAAACTTGTTCTTTTGTTTT 13 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.221.10 chr1 + 1794 3 incomplete-splice_match VPS13D ENST00000543766.2 3838 4 32610 1684 324 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACCTTGTCACATGTAGCTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.222.1 chr1 - 979 4 novel_in_catalog DHRS3 novel 2201 6 NA NA -551 1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTCCTTTGTTCAAATCTTCC 2622 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.222.2 chr1 - 899 4 incomplete-splice_match DHRS3 ENST00000616661.5 2201 6 38899 0 16997 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTTCCTTTGTTCAAATCTTC 1356 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.222.3 chr1 - 1669 6 full-splice_match DHRS3 ENST00000616661.5 2201 6 531 1 531 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.806923 0.580574 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTCCTTTGTTCAAATCTT 6 TRUE NA NA AAGAAA -9 NA NA NA 16 NA PB.222.4 chr1 - 1331 6 full-splice_match DHRS3 ENST00000616661.5 2201 6 869 1 -546 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTCCTTTGTTCAAATCTT 2627 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.222.5 chr1 - 1249 6 novel_in_catalog DHRS3 novel 2201 6 NA NA 31 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTCCTTTGTTCAAATCTT 3303 FALSE NA NA GGGGCT -6 NA NA NA 2 NA PB.222.6 chr1 - 1194 6 full-splice_match DHRS3 ENST00000616661.5 2201 6 1006 1 -409 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTCCTTTGTTCAAATCTT 2764 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.222.7 chr1 - 1049 5 incomplete-splice_match DHRS3 ENST00000616661.5 2201 6 37636 3 15734 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGATTTCCTTTGTTCAAATC 93 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.222.8 chr1 - 2032 6 full-splice_match DHRS3 ENST00000616661.5 2201 6 167 2 167 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GATTTCCTTTGTTCAAATCT 1925 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.224.1 chr1 - 1480 2 incomplete-splice_match PRAMEF11 ENST00000619922.1 1845 4 3576 5 3576 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCTGTCTGGTGCCCTCTA 3598 FALSE NA NA AATAGA -40 NA NA NA 2 NA PB.225.1 chr1 - 1867 4 full-splice_match PRAMEF8 ENST00000357367.6 1844 4 -21 -2 -1 2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATCTGGTGTCCTCCGTAATT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.227.1 chr1 + 774 3 antisense novelGene_LRRC38_AS novel NA NA NA NA NA NA multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CAGAAATCAAGTTGCTTTTT NA FALSE NA NA AATACA -26 NA NA NA 2 NA PB.228.1 chr1 + 2829 6 full-splice_match PDPN ENST00000376057.8 2801 6 -30 2 -30 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AACAATGAGTCAGACTTTTG -40 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 6 NA PB.228.2 chr1 + 1779 6 full-splice_match PDPN ENST00000376057.8 2801 6 -17 1039 -17 136 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACATTCACTTTCTGCCTCT -27 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.228.4 chr1 + 2146 6 full-splice_match PDPN ENST00000376057.8 2801 6 -15 670 -15 505 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GGAAGCACAGCCCATTCCTC -25 TRUE NA NA AGTAAA -10 NA NA NA 4 NA PB.228.6 chr1 + 2778 6 full-splice_match PDPN ENST00000621990.5 2737 6 -43 2 27 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.568991 0.552545 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AACAATGAGTCAGACTTTTG 17 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 15 NA PB.228.8 chr1 + 1058 6 full-splice_match PDPN ENST00000376057.8 2801 6 35 1708 -35 2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 40 9.517308 0.978514 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTGTCTCCGTCTGACCATTC 25 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 40 NA PB.228.9 chr1 + 1189 6 full-splice_match PDPN ENST00000621990.5 2737 6 -24 1572 -24 126 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 34 8.089712 0.907933 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TACACATTCTGGTCTAGTTT 36 TRUE NA NA AGTAAA -39 NA NA NA 34 NA PB.228.10 chr1 + 1719 6 full-splice_match PDPN ENST00000621990.5 2737 6 -21 1039 -21 136 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACATTCACTTTCTGCCTCT 39 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 4 NA PB.228.11 chr1 + 2729 6 full-splice_match PDPN ENST00000376057.8 2801 6 70 2 0 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AACAATGAGTCAGACTTTTG 60 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 10 NA PB.228.12 chr1 + 1159 6 full-splice_match PDPN ENST00000376057.8 2801 6 70 1572 0 126 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 28 6.662116 0.823612 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TACACATTCTGGTCTAGTTT 60 TRUE NA NA AGTAAA -39 NA NA NA 28 NA PB.228.13 chr1 + 1029 6 full-splice_match PDPN ENST00000621990.5 2737 6 0 1708 0 2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 37 8.803510 0.944656 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTGTCTCCGTCTGACCATTC 60 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 37 NA PB.228.14 chr1 + 2701 6 full-splice_match PDPN ENST00000621990.5 2737 6 34 2 33 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AACAATGAGTCAGACTTTTG 94 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.228.15 chr1 + 926 6 full-splice_match PDPN ENST00000621990.5 2737 6 104 1707 103 3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTCTCCGTCTGACCATTCT 164 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.228.16 chr1 + 2190 3 incomplete-splice_match PDPN ENST00000621990.5 2737 6 29867 2 28219 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AACAATGAGTCAGACTTTTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.229.1 chr1 + 1091 7 novel_in_catalog PRDM2 novel 2688 8 NA NA -4 -3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGCTTTTTGCTTCTTGAGTT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.229.2 chr1 + 697 7 incomplete-splice_match PRDM2 ENST00000311066.10 7279 10 10 51984 0 -31 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAATAAAAACAAAGGAAAC 4 TRUE NA NA AATAAA -40 NA NA NA 3 NA PB.229.4 chr1 + 2280 4 full-splice_match PRDM2 ENST00000505823.5 568 4 -57 -1655 -24 -5 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AACAAGCCTGGGAGTGATCA -7 TRUE NA NA AATAAA -23 NA NA NA 2 NA PB.229.5 chr1 + 4040 3 incomplete-splice_match PRDM2 ENST00000413440.5 6175 4 -8 5826 -8 3621 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAAAAAGTTTCTCATTC 9 TRUE NA NA AATAAA -43 NA NA NA 2 NA PB.229.6 chr1 + 2133 3 incomplete-splice_match PRDM2 ENST00000376048.9 2688 8 49175 -9 0 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AACAAGCCTGGGAGTGATCA -12 TRUE NA NA AATAAA -23 NA NA NA 4 NA PB.229.11 chr1 + 2601 1 full-splice_match ENSG00000289380 ENST00000690275.1 688 1 475 -2388 475 2388 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA NA NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAAAAAAAAAAATGAG 451 FALSE NA NA AATACA -42 NA NA NA 2 NA PB.229.25 chr1 + 1936 2 incomplete-splice_match PRDM2 ENST00000343137.8 5797 5 32626 -2 10315 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAAATTGTTTTGGACGCTTC 1737 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.229.26 chr1 + 1780 2 incomplete-splice_match PRDM2 ENST00000343137.8 5797 5 32782 -2 10471 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAAATTGTTTTGGACGCTTC 1893 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.229.27 chr1 + 1556 2 incomplete-splice_match PRDM2 ENST00000343137.8 5797 5 32982 22 10671 -22 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAATAAAATATTTAAAAT 2093 FALSE NA NA TATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.229.28 chr1 + 1842 2 incomplete-splice_match PRDM2 ENST00000413440.5 6175 4 33154 -2 10831 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TGTGAAAGGACTGCATTTTG 98 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.229.29 chr1 + 1253 2 incomplete-splice_match PRDM2 ENST00000343137.8 5797 5 33285 22 10974 -22 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAATAAAATATTTAAAAT 241 FALSE NA NA TATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.233.1 chr1 - 1456 2 novel_not_in_catalog LRRC38 novel 2168 2 NA NA 235 66761 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTTTTTACAGAGTCTCTT -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.233.2 chr1 - 1354 2 full-splice_match LRRC38 ENST00000376085.4 2168 2 817 -3 817 3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATCTCTGGTATTCTGTTAT 3567 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.233.3 chr1 - 2172 2 full-splice_match LRRC38 ENST00000376085.4 2168 2 -10 6 -10 -6 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGCCACTCAATCTCTGGTA -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.233.4 chr1 - 1921 2 full-splice_match LRRC38 ENST00000376085.4 2168 2 240 7 240 -7 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.093125 0.490398 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAGCCACTCAATCTCTGGT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.233.5 chr1 - 1598 2 full-splice_match LRRC38 ENST00000376085.4 2168 2 249 321 249 -321 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATGTTTATGTTCCCCCAGA 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.243.1 chr1 + 1144 2 intergenic novelGene_243 novel NA NA NA NA NA NA multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAAAAAAAAAAAGGAAAA NA FALSE NA NA AATACA -23 NA NA NA 2 NA PB.273.1 chr1 + 1931 8 full-splice_match KAZN ENST00000361144.9 3838 8 315 1592 315 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAAAAAGAAAAAAAGAAA 300 FALSE NA NA TTTAAA -45 NA NA NA 3 NA PB.274.2 chr1 - 2327 2 novel_not_in_catalog TMEM51-AS1 novel 7100 6 NA NA 0 -15381 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATTCTTTTGTGTCTAGCTT 2648 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.275.1 chr1 + 1965 3 full-splice_match TMEM51 ENST00000428417.5 1942 3 -22 -1 -22 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATTTGGGTGCTGAGTTACT NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.275.2 chr1 + 1384 2 novel_in_catalog TMEM51 novel 1942 3 NA NA -14 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TACATTTGGGTGCTGAGTTA 10 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.275.3 chr1 + 1978 4 full-splice_match TMEM51 ENST00000376014.7 1843 4 2 -137 2 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.617260 0.417847 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TACATTTGGGTGCTGAGTTA 2 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 11 NA PB.275.4 chr1 + 1829 4 full-splice_match TMEM51 ENST00000376014.7 1843 4 152 -138 141 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACATTTGGGTGCTGAGTTAC 102 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.275.5 chr1 + 1264 2 novel_in_catalog TMEM51 novel 1842 3 NA NA -6 -18 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 CAAAAAAAAAAAAAAAAAGA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.275.6 chr1 + 1880 3 full-splice_match TMEM51 ENST00000400796.7 1842 3 30 -68 -5 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 27 6.424183 0.807818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TACATTTGGGTGCTGAGTTA 22 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 27 NA PB.275.7 chr1 + 1953 4 full-splice_match TMEM51 ENST00000376008.3 1971 4 16 2 -5 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 40 9.517308 0.978514 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TACATTTGGGTGCTGAGTTA 22 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 40 NA PB.275.8 chr1 + 1344 2 novel_in_catalog TMEM51 novel 1971 4 NA NA -5 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACATTTGGGTGCTGAGTTAC 22 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.275.12 chr1 + 1689 2 incomplete-splice_match TMEM51 ENST00000376008.3 1971 4 61147 2 61126 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TACATTTGGGTGCTGAGTTA NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.275.13 chr1 + 1602 2 incomplete-splice_match TMEM51 ENST00000376008.3 1971 4 61234 2 61213 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TACATTTGGGTGCTGAGTTA NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 7 NA PB.275.14 chr1 + 1493 2 incomplete-splice_match TMEM51 ENST00000376008.3 1971 4 61346 -1 61325 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTTGGGTGCTGAGTTACTT NA FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.275.15 chr1 + 1336 2 incomplete-splice_match TMEM51 ENST00000400796.7 1842 3 61413 33 61378 -18 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 CAAAAAAAAAAAAAAAAAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.275.16 chr1 + 1232 2 incomplete-splice_match TMEM51 ENST00000376008.3 1971 4 61604 2 61583 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TACATTTGGGTGCTGAGTTA NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.278.1 chr1 + 1049 2 novel_not_in_catalog EFHD2 novel 2422 4 NA NA 14 -10 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATATTCTTATGTGTGTATG -14 TRUE NA NA GATAAA -5 NA NA NA 2 NA PB.278.4 chr1 + 2378 4 full-splice_match EFHD2 ENST00000375980.9 2422 4 34 10 34 -10 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 27 6.424183 0.807818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATATTCTTATGTGTGTATG 6 TRUE NA NA GATAAA -5 NA NA NA 27 NA PB.278.5 chr1 + 898 4 full-splice_match EFHD2 ENST00000375980.9 2422 4 34 1490 34 -232 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGAATGGAGCAAGTTCAGGG 6 TRUE NA NA ACTAAA -17 NA NA NA 8 NA PB.278.6 chr1 + 2253 4 full-splice_match EFHD2 ENST00000375980.9 2422 4 37 132 37 -132 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GCTTTTTGCTTCTTTTTTCC 9 TRUE NA NA TATAAA -17 NA NA NA 10 NA PB.278.7 chr1 + 2218 4 full-splice_match EFHD2 ENST00000375980.9 2422 4 195 9 -182 -9 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATATTCTTATGTGTGTATGG 167 FALSE NA NA GATAAA -6 NA NA NA 10 NA PB.278.8 chr1 + 1982 3 novel_in_catalog EFHD2 novel 2422 4 NA NA -82 -10 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATATTCTTATGTGTGTATG 8 FALSE NA NA GATAAA -5 NA NA NA 3 NA PB.278.9 chr1 + 2069 4 full-splice_match EFHD2 ENST00000375980.9 2422 4 344 9 -33 -9 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATATTCTTATGTGTGTATGG 57 FALSE NA NA GATAAA -6 NA NA NA 5 NA PB.278.10 chr1 + 1900 3 incomplete-splice_match EFHD2 ENST00000375980.9 2422 4 15983 130 15606 -130 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TTTTTGCTTCTTTTTTCCCC NA FALSE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 4 NA PB.278.11 chr1 + 2016 3 incomplete-splice_match EFHD2 ENST00000375980.9 2422 4 15987 10 15610 -10 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATATTCTTATGTGTGTATG NA FALSE NA NA GATAAA -5 NA NA NA 6 NA PB.278.12 chr1 + 1903 3 incomplete-splice_match EFHD2 ENST00000375980.9 2422 4 16100 10 15723 -10 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATATTCTTATGTGTGTATG 101 FALSE NA NA GATAAA -5 NA NA NA 6 NA PB.278.13 chr1 + 1781 3 incomplete-splice_match EFHD2 ENST00000375980.9 2422 4 16100 132 15723 -132 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GCTTTTTGCTTCTTTTTTCC 101 FALSE NA NA TATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.279.1 chr1 - 1740 8 incomplete-splice_match CASP9 ENST00000333868.10 2808 9 5868 873 5845 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTCTTTTGCCTATTTCTTC 8131 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.279.2 chr1 - 1933 9 full-splice_match CASP9 ENST00000333868.10 2808 9 -9 884 -7 -15 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 67 15.941491 1.202529 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAAATATGGACTCTCTTTTG 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 67 NA PB.279.3 chr1 - 1524 5 full-splice_match CASP9 ENST00000348549.9 1621 5 83 14 -47 -14 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATGGACTCTCTTTTGC -39 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.279.4 chr1 - 1458 5 full-splice_match CASP9 ENST00000348549.9 1621 5 149 14 2 -14 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATGGACTCTCTTTTGC 27 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.279.5 chr1 - 1176 4 incomplete-splice_match CASP9 ENST00000400777.7 1878 9 19448 -82 2308 -14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATGGACTCTCTTTTGC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.279.6 chr1 - 962 3 incomplete-splice_match CASP9 ENST00000400777.7 1878 9 28820 -82 11680 -14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATGGACTCTCTTTTGC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.280.2 chr1 + 5299 15 full-splice_match DNAJC16 ENST00000375847.8 6034 15 15 720 15 -718 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAAAAAAAAAATTTGT -12 TRUE NA NA AATACA -12 NA NA NA 6 NA PB.280.4 chr1 + 5112 14 incomplete-splice_match DNAJC16 ENST00000375847.8 6034 15 2331 720 2331 -718 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAAAAAAAAAATTTGT 2304 FALSE NA NA AATACA -12 NA NA NA 2 NA PB.280.5 chr1 + 4293 9 incomplete-splice_match DNAJC16 ENST00000375847.8 6034 15 21450 720 -11310 -718 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAAAAAAAAAATTTGT NA FALSE NA NA AATACA -12 NA NA NA 2 NA PB.280.6 chr1 + 2327 8 incomplete-splice_match DNAJC16 ENST00000375847.8 6034 15 32690 2543 -70 -1091 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AACTTAAAATTTCTCAACAA NA FALSE NA NA AGTAAA -27 NA NA NA 2 NA PB.281.1 chr1 + 1584 1 full-splice_match CHCHD2P6 ENST00000454346.1 447 1 -868 -269 -868 269 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA NA NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAGAAAAAAAAAATAG 7 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 6 NA PB.282.3 chr1 - 1470 7 full-splice_match AGMAT ENST00000375826.4 3095 7 28 1597 28 -1597 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 57 13.562164 1.132329 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CATATTTCTATATCTTCCTT 26 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 57 NA PB.282.5 chr1 - 1454 7 full-splice_match AGMAT ENST00000375826.4 3095 7 -32 1673 -32 -1673 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 29 6.900049 0.838852 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATTTCTTTCAAGATTATCT -34 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 29 NA PB.282.6 chr1 - 1211 6 novel_in_catalog AGMAT novel 3095 7 NA NA -27 -1731 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACTGCTTTGATTTTTTTTC -29 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.282.7 chr1 - 1363 7 full-splice_match AGMAT ENST00000375826.4 3095 7 -50 1782 -50 -1782 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AACATTTCTAAGGAACTTGG 3415 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.282.8 chr1 - 1220 7 full-splice_match AGMAT ENST00000375826.4 3095 7 18 1857 18 -1857 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 33 7.851779 0.894968 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGAAAACTTTCTGCTGAAA 16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 33 NA PB.283.2 chr1 + 3650 10 full-splice_match DDI2 ENST00000480945.6 10667 10 1 7016 1 971 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAGCATACTGTTTTAGAATG 5 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 7 NA PB.283.3 chr1 + 3827 10 full-splice_match DDI2 ENST00000480945.6 10667 10 68 6772 -17 1215 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AATAATTGAATATCTTATCG 10 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.283.5 chr1 + 1555 1 full-splice_match RSC1A1 ENST00000345034.2 2321 1 761 5 761 -5 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAGCATACTGTTTTAGAATG 629 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.283.6 chr1 + 1089 1 full-splice_match RSC1A1 ENST00000345034.2 2321 1 1233 -1 1233 1 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGTTTTAGAATGAGAGTA 1101 FALSE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 2 NA PB.283.7 chr1 + 750 1 full-splice_match RSC1A1 ENST00000345034.2 2321 1 1567 4 1567 -4 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGCATACTGTTTTAGAATGA 1435 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.284.1 chr1 + 3523 16 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000375793.2 4004 19 33536 2 -11919 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 24 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.284.2 chr1 + 3242 14 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000375799.8 4134 20 37008 2 -8517 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 3426 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.284.3 chr1 + 2981 13 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000375793.2 4004 19 41127 2 -4328 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 7615 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 6 NA PB.284.4 chr1 + 2854 12 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000642363.1 3775 21 42556 2 -2733 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 42 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 6 NA PB.284.5 chr1 + 2630 12 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000642363.1 3775 21 42780 2 -2509 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 266 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 9 NA PB.284.6 chr1 + 2479 12 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000642363.1 3775 21 42931 2 -2358 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 417 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 6 NA PB.284.7 chr1 + 2196 12 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000642363.1 3775 21 43214 2 -2075 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 700 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 8 NA PB.284.8 chr1 + 1861 8 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000642363.1 3775 21 44592 2 -697 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 2078 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 10 NA PB.284.9 chr1 + 1687 6 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000642363.1 3775 21 45974 2 685 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 3460 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 8 NA PB.284.10 chr1 + 1568 6 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000642363.1 3775 21 46093 2 804 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 3579 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 8 NA PB.284.11 chr1 + 1425 4 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000477849.1 1057 7 2047 -652 2047 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.093125 0.490398 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 4822 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 13 NA PB.284.12 chr1 + 1303 4 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000477849.1 1057 7 2169 -652 2169 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 4944 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 8 NA PB.284.13 chr1 + 1185 2 novel_in_catalog PLEKHM2 novel 1057 7 NA NA 2670 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 5445 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.284.14 chr1 + 1026 2 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000477849.1 1057 7 2829 -652 2829 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 5604 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 10 NA PB.285.2 chr1 + 2120 9 novel_not_in_catalog FBLIM1 novel 3314 9 NA NA -31 29 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTGGTGGCTCATGCCTGT -1 TRUE NA NA AAAAAG -16 NA NA NA 2 NA PB.285.3 chr1 + 3203 9 novel_in_catalog FBLIM1 novel 3314 9 NA NA -24 -8 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAAGCTCTTCCATGTTGTG 6 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.285.4 chr1 + 2120 9 novel_in_catalog FBLIM1 novel 3314 9 NA NA -23 29 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.568991 0.552545 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTGGTGGCTCATGCCTGT 7 FALSE NA NA AAAAAG -16 NA NA NA 15 NA PB.291.1 chr1 + 2715 11 incomplete-splice_match SPEN ENST00000375759.8 12385 15 3 11859 3 40 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAATGAAAAGACAGATA -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.291.3 chr1 + 2900 11 novel_in_catalog SPEN novel 12385 15 NA NA 107 332 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAGAGAAAGAGGGAAAGGT -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.291.6 chr1 + 2603 11 incomplete-splice_match SPEN ENST00000375759.8 12385 15 115 11859 115 40 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 34 8.089712 0.907933 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAATGAAAAGACAGATA -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 34 NA PB.291.7 chr1 + 1489 5 incomplete-splice_match SPEN ENST00000375759.8 12385 15 115 29155 115 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 GTAAGACACAAGCAAGCTGA -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.291.8 chr1 + 2125 10 novel_in_catalog SPEN novel 12385 15 NA NA 116 40 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAATGAAAAGACAGATA -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.291.9 chr1 + 4728 11 incomplete-splice_match SPEN ENST00000375759.8 12385 15 118 9731 118 2168 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAGAAGAAAATTAGGAC -3 TRUE NA NA AAGAAA -42 NA NA NA 3 NA PB.291.11 chr1 + 3859 11 novel_in_catalog SPEN novel 12385 15 NA NA 118 40 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.568991 0.552545 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAATGAAAAGACAGATA -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.291.13 chr1 + 1854 10 novel_in_catalog SPEN novel 12385 15 NA NA 125 -222 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAGGGAACGAGAAAGAGAA 4 TRUE NA NA AATATA -10 NA NA NA 2 NA PB.291.15 chr1 + 2730 10 novel_in_catalog SPEN novel 891 7 NA NA 117 40 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAATGAAAAGACAGATA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.291.18 chr1 + 1676 9 incomplete-splice_match SPEN ENST00000673875.1 3123 12 40383 -39 -98 39 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 CAAAAAATGAAAAGACAGAT 2310 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.291.21 chr1 + 1391 8 incomplete-splice_match SPEN ENST00000673875.1 3123 12 73311 -40 -29177 40 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAATGAAAAGACAGATA 9840 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.291.22 chr1 + 1254 7 incomplete-splice_match SPEN ENST00000673875.1 3123 12 75067 -40 -27421 40 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAATGAAAAGACAGATA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.291.24 chr1 + 680 3 incomplete-splice_match SPEN ENST00000673875.1 3123 12 84817 -40 -17671 40 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAATGAAAAGACAGATA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.293.1 chr1 - 2810 15 novel_in_catalog ZBTB17 novel 2720 16 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCTGCCTATAGGTCCCT -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.293.2 chr1 - 2756 16 full-splice_match ZBTB17 ENST00000375733.6 2770 16 14 0 14 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCTGCCTATAGGTCCCT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.293.3 chr1 - 2322 14 incomplete-splice_match ZBTB17 ENST00000375743.9 2720 16 27794 2 -1015 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCTGCCTATAGGTCCCT 4596 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.293.4 chr1 - 2118 12 incomplete-splice_match ZBTB17 ENST00000537142.5 2511 15 29783 0 -212 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCTGCCTATAGGTCCCT 6607 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.293.5 chr1 - 1839 10 incomplete-splice_match ZBTB17 ENST00000537142.5 2511 15 30887 0 -764 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCTGCCTATAGGTCCCT 7711 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.293.6 chr1 - 1632 10 incomplete-splice_match ZBTB17 ENST00000537142.5 2511 15 31094 0 -557 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCTGCCTATAGGTCCCT 7918 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.293.7 chr1 - 1264 6 novel_in_catalog ZBTB17 novel 2770 16 NA NA 14 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCTGCCTATAGGTCCCT 8991 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.293.8 chr1 - 1344 8 incomplete-splice_match ZBTB17 ENST00000537142.5 2511 15 31575 0 -76 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCTGCCTATAGGTCCCT 8399 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.293.9 chr1 - 2753 14 novel_in_catalog ZBTB17 novel 2720 16 NA NA 3003 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAATGCTGCCTATAGGTCCC 3043 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.293.10 chr1 - 2717 16 full-splice_match ZBTB17 ENST00000375743.9 2720 16 0 3 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 34 8.089712 0.907933 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAATGCTGCCTATAGGTCCC -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 34 NA PB.293.11 chr1 - 1501 9 incomplete-splice_match ZBTB17 ENST00000375733.6 2770 16 31395 1 -309 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAATGCTGCCTATAGGTCCC 8166 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.293.12 chr1 - 1498 9 incomplete-splice_match ZBTB17 ENST00000537142.5 2511 15 31324 1 -327 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAATGCTGCCTATAGGTCCC 8148 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.293.13 chr1 - 1010 6 incomplete-splice_match ZBTB17 ENST00000537142.5 2511 15 32404 1 251 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAATGCTGCCTATAGGTCCC 9228 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.294.1 chr1 - 2158 3 full-splice_match HSPB7 ENST00000487046.1 844 3 30 -1344 0 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTCTGGAGGCCGCCTGCC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.294.2 chr1 - 1940 3 full-splice_match HSPB7 ENST00000311890.14 2144 3 203 1 -15 -1 alternative_5end TRUE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTCTGGAGGCCGCCTGCC 2630 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.294.3 chr1 - 2142 3 full-splice_match HSPB7 ENST00000311890.14 2144 3 0 2 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 24 5.710385 0.756665 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GACTTCTGGAGGCCGCCTGC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 24 NA PB.294.5 chr1 - 1258 3 full-splice_match HSPB7 ENST00000311890.14 2144 3 0 886 0 459 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACTGCATGAAACTCCTGC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.295.1 chr1 - 1697 7 full-splice_match FAM131C ENST00000375662.5 1720 7 22 1 3 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.044856 0.606903 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGACCTTGGCCTGGTCTCT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.296.1 chr1 + 917 2 full-splice_match SRARP ENST00000329454.2 3039 2 0 2122 0 -2122 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGAACAGCGATGAATGCTCT 0 TRUE NA NA AATAAA -33 NA NA NA 8 NA PB.297.1 chr1 - 2963 14 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 17661 1 -4846 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCTTGGCTTTCAGTCTTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.297.2 chr1 - 2756 13 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 17951 7 -4556 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACCGATCTTGGCTTTCAG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.297.3 chr1 - 2344 11 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 20916 1 -1591 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCTTGGCTTTCAGTCTTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.297.4 chr1 - 3574 15 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 7102 2 -2517 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GATCTTGGCTTTCAGTCTTG 7103 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.297.5 chr1 - 3380 15 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 7296 2 -2323 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GATCTTGGCTTTCAGTCTTG 7297 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.297.8 chr1 - 3936 17 full-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 3 7 3 -7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.044856 0.606903 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACCGATCTTGGCTTTCAG 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.297.9 chr1 - 3735 17 full-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 204 7 187 -7 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACCGATCTTGGCTTTCAG 205 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.297.10 chr1 - 3096 14 novel_not_in_catalog EPHA2 novel 3946 17 NA NA -4842 -7 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACCGATCTTGGCTTTCAG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.297.11 chr1 - 2493 12 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 20296 7 -2211 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACCGATCTTGGCTTTCAG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.297.12 chr1 - 2220 10 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 21502 7 -1005 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACCGATCTTGGCTTTCAG NA FALSE NA NA AAGAAA -38 NA NA NA 2 NA PB.297.13 chr1 - 2067 8 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 22460 7 -47 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACCGATCTTGGCTTTCAG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.297.14 chr1 - 1941 7 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 22698 7 191 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACCGATCTTGGCTTTCAG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.297.15 chr1 - 1591 5 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 23892 7 1385 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACCGATCTTGGCTTTCAG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.297.16 chr1 - 1388 4 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 24288 7 1781 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACCGATCTTGGCTTTCAG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.297.17 chr1 - 1036 2 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 26577 7 4070 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACCGATCTTGGCTTTCAG 899 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.297.18 chr1 - 1666 5 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 23816 8 1309 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAAACCGATCTTGGCTTTCA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.298.1 chr1 - 2203 10 incomplete-splice_match ARHGEF19 ENST00000270747.8 3322 16 6112 2 3 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATTTGTTTCCTGTGGCTTC 6099 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.298.2 chr1 - 1804 9 novel_in_catalog ARHGEF19 novel 3322 16 NA NA 13 -244 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTCTGTGATCCATCTGATG -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.298.3 chr1 - 1861 10 novel_not_in_catalog ARHGEF19 novel 3322 16 NA NA -2 -249 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CTTGGAGTCTGTGATCCATC 6094 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.298.4 chr1 - 1959 10 incomplete-splice_match ARHGEF19 ENST00000270747.8 3322 16 6108 250 -1 -250 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.044856 0.606903 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GCTTGGAGTCTGTGATCCAT 6095 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.298.5 chr1 - 1826 11 incomplete-splice_match ARHGEF19 ENST00000270747.8 3322 16 5634 250 -7 -250 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GCTTGGAGTCTGTGATCCAT 5621 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.298.6 chr1 - 1652 10 incomplete-splice_match ARHGEF19 ENST00000270747.8 3322 16 6415 250 289 -250 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GCTTGGAGTCTGTGATCCAT 6402 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.299.1 chr1 - 976 2 full-splice_match ANO7L1 ENST00000475369.2 998 2 21 1 21 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTGCCACCTCTCCACGGCC 9530 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.300.2 chr1 - 1436 4 full-splice_match CPLANE2 ENST00000434014.1 336 4 -507 -593 17 4 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAGACGTGTTCGTTCTCAC 14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.300.3 chr1 - 1641 3 novel_in_catalog CPLANE2 novel 336 4 NA NA 16 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TGAACTCCAGAGACGTGTTC 13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.300.4 chr1 - 1556 5 full-splice_match CPLANE2 ENST00000375599.8 1574 5 14 4 14 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TGAACTCCAGAGACGTGTTC 11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.303.4 chr1 - 2441 11 novel_not_in_catalog FBXO42 novel 6227 10 NA NA 58 428 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTCCTTTTCTGTGGCTTTTA 34 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.303.5 chr1 - 2511 11 novel_not_in_catalog FBXO42 novel 6227 10 NA NA 36 427 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TTTCCTTTTCTGTGGCTTTT 12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.303.6 chr1 - 2246 10 full-splice_match FBXO42 ENST00000375592.8 6227 10 166 3815 166 427 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TTTCCTTTTCTGTGGCTTTT 142 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.303.7 chr1 - 2124 9 incomplete-splice_match FBXO42 ENST00000375592.8 6227 10 37107 3815 -6 427 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TTTCCTTTTCTGTGGCTTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.303.8 chr1 - 1788 7 incomplete-splice_match FBXO42 ENST00000375592.8 6227 10 57577 3815 20464 427 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TTTCCTTTTCTGTGGCTTTT NA FALSE NA NA AATACA -21 NA NA NA 2 NA PB.303.9 chr1 - 1514 5 incomplete-splice_match FBXO42 ENST00000375592.8 6227 10 96658 3815 -2229 427 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TTTCCTTTTCTGTGGCTTTT 927 FALSE NA NA AAAAAG -39 NA NA NA 2 NA PB.303.10 chr1 - 2375 10 full-splice_match FBXO42 ENST00000375592.8 6227 10 36 3816 36 426 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 29 6.900049 0.838852 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTTCCTTTTCTGTGGCTTT 12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 29 NA PB.303.11 chr1 - 1270 3 full-splice_match FBXO42 ENST00000456164.5 1153 3 309 -426 309 426 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTTCCTTTTCTGTGGCTTT 3631 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.303.12 chr1 - 1888 8 incomplete-splice_match FBXO42 ENST00000375592.8 6227 10 46585 3822 9472 420 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAACCCCTTTCCTTTTCTGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.303.13 chr1 - 1547 6 incomplete-splice_match FBXO42 ENST00000375592.8 6227 10 95833 3823 -3054 419 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAAACCCCTTTCCTTTTCTG 102 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.303.18 chr1 - 1039 4 novel_not_in_catalog FBXO42 novel 6227 10 NA NA 17 -3458 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACATTGGACTTTATGTGTGG -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.304.1 chr1 + 3507 4 full-splice_match SZRD1 ENST00000401088.9 3480 4 -28 1 -11 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 98 23.317406 1.367680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGATCTTTGTCCTCATTTCA 47 FALSE NA NA TATAAA -32 NA NA NA 98 NA PB.304.2 chr1 + 3440 3 full-splice_match SZRD1 ENST00000401089.3 3447 3 6 1 -4 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 289 68.762550 1.837352 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGATCTTTGTCCTCATTTCA -8 TRUE NA NA TATAAA -32 NA NA NA 289 NA PB.304.3 chr1 + 883 3 full-splice_match SZRD1 ENST00000401089.3 3447 3 6 2558 -4 181 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 56 13.324231 1.124642 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTTGAAAATATCCTTTCTT -8 TRUE NA NA AAAAAG -9 NA NA NA 56 NA PB.304.8 chr1 + 1679 3 full-splice_match SZRD1 ENST00000492354.1 3401 3 -31 1753 -1 983 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 218 51.869331 1.714911 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GATGACAGACTGGTTCCTCA -5 TRUE NA NA AATAAA -35 NA NA NA 218 NA PB.304.9 chr1 + 1702 4 full-splice_match SZRD1 ENST00000401088.9 3480 4 -7 1785 0 954 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 82 19.510483 1.290268 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAAGAACAGCTTTGCTTT -4 TRUE NA NA AATAAA -6 NA NA NA 82 NA PB.304.10 chr1 + 932 4 full-splice_match SZRD1 ENST00000401088.9 3480 4 -5 2553 2 186 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 28 6.662116 0.823612 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAATATCCTTTCTTTTTTT -2 TRUE NA NA AAAAAG -14 NA NA NA 28 NA PB.304.12 chr1 + 3300 2 incomplete-splice_match SZRD1 ENST00000492354.1 3401 3 26025 -2 25579 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGATCTTTGTCCTCATTTCA NA FALSE NA NA TATAAA -32 NA NA NA 5 NA PB.304.13 chr1 + 1538 2 incomplete-splice_match SZRD1 ENST00000472461.1 843 4 25579 -1109 25579 976 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGATTGATGACAGACTGG NA FALSE NA NA AATAAA -28 NA NA NA 2 NA PB.304.14 chr1 + 1394 2 incomplete-splice_match SZRD1 ENST00000472461.1 843 4 25701 -1087 25701 954 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAAGAACAGCTTTGCTTT 67 FALSE NA NA AATAAA -6 NA NA NA 2 NA PB.304.15 chr1 + 1362 2 incomplete-splice_match SZRD1 ENST00000472461.1 843 4 25754 -1108 25754 975 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 CAAAGATTGATGACAGACTG 120 FALSE NA NA AATAAA -27 NA NA NA 2 NA PB.304.16 chr1 + 3123 2 incomplete-splice_match SZRD1 ENST00000492354.1 3401 3 26202 -2 25756 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGATCTTTGTCCTCATTTCA 122 FALSE NA NA TATAAA -32 NA NA NA 5 NA PB.306.1 chr1 + 1781 6 novel_in_catalog NECAP2 novel 1929 7 NA NA -15 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATTGTATGTGAAAGATGAAT -23 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.306.2 chr1 + 2028 8 full-splice_match NECAP2 ENST00000337132.10 2018 8 -11 1 -8 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 288 68.524620 1.835847 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATTGTATGTGAAAGATGAAT -16 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 288 NA PB.306.3 chr1 + 1941 7 full-splice_match NECAP2 ENST00000443980.6 1929 7 -12 0 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.282789 0.631727 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATTGTATGTGAAAGATGAAT -5 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 18 NA PB.306.4 chr1 + 1155 8 full-splice_match NECAP2 ENST00000337132.10 2018 8 0 863 0 142 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGAAGAGGTTGAGTTTG -5 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 7 NA PB.306.6 chr1 + 580 2 full-splice_match NECAP2 ENST00000486390.1 572 2 -12 4 0 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACAACCTGGCCTATGGCTAT -5 TRUE NA NA ATTAAA -25 NA NA NA 2 NA PB.306.9 chr1 + 1303 2 incomplete-splice_match NECAP2 ENST00000508680.5 470 5 0 3528 0 3203 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TAAAAAATCATTTGTTTTTA 13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.306.10 chr1 + 2094 9 novel_not_in_catalog NECAP2 novel 1787 9 NA NA 2 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATTGTATGTGAAAGATGAAT 16 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.306.11 chr1 + 1821 7 novel_in_catalog NECAP2 novel 2018 8 NA NA 2 2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTATGTGAAAGATGAATGTG 16 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.306.12 chr1 + 992 8 full-splice_match NECAP2 ENST00000337132.10 2018 8 21 1005 2 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TTTCCTGGGATTCAAGTATG 16 TRUE NA NA AGTAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.306.13 chr1 + 1869 7 incomplete-splice_match NECAP2 ENST00000492095.5 1787 9 2907 0 2878 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATTGTATGTGAAAGATGAAT 2921 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 7 NA PB.306.14 chr1 + 1658 5 incomplete-splice_match NECAP2 ENST00000492095.5 1787 9 7340 0 7311 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.093125 0.490398 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATTGTATGTGAAAGATGAAT 7354 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 13 NA PB.306.15 chr1 + 1540 4 incomplete-splice_match NECAP2 ENST00000492095.5 1787 9 8409 0 -6369 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATTGTATGTGAAAGATGAAT 8423 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 7 NA PB.306.16 chr1 + 1432 3 incomplete-splice_match NECAP2 ENST00000496239.5 4619 7 11138 0 -3625 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATTGTATGTGAAAGATGAAT NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 6 NA PB.306.17 chr1 + 1265 2 full-splice_match NECAP2 ENST00000509727.1 550 2 344 -1059 344 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.617260 0.417847 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATTGTATGTGAAAGATGAAT NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 11 NA PB.309.3 chr1 - 1349 2 incomplete-splice_match NBPF1 ENST00000392963.5 2672 19 12461 26170 10576 2539 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAACAAACAAACAAAAA NA FALSE NA NA AATACA -6 NA NA NA 2 NA PB.309.5 chr1 - 799 5 novel_in_catalog NBPF1 novel 488 4 NA NA 7 -36 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TTGATACGTCTTAAAGCGGT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.309.9 chr1 - 2108 3 novel_not_in_catalog NBPF1 novel 5932 29 NA NA 4 -2504 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CTCCATGTCCAGTATTTTCA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.309.11 chr1 - 1049 3 novel_not_in_catalog NBPF1 novel 5932 29 NA NA -2 2458 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAATAGATAAATGGACTT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.309.12 chr1 - 4216 3 novel_not_in_catalog NBPF1 novel 2752 3 NA NA 10 7 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAATACATGTTGTGCTTAGA 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.309.13 chr1 - 2747 3 full-splice_match NBPF1 ENST00000599069.5 2752 3 -2 7 -2 7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAATACATGTTGTGCTTAGA -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.309.14 chr1 - 4039 3 novel_not_in_catalog NBPF1 novel 2752 3 NA NA -26 -206 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 GAAAAGAAAGAATTGAAGCT -30 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.309.15 chr1 - 2556 3 novel_not_in_catalog NBPF1 novel 2752 3 NA NA 4 -1659 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTCTGCTTCTGTCTGTTA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.309.16 chr1 - 1062 3 full-splice_match NBPF1 ENST00000599069.5 2752 3 12 1678 12 -1664 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAGATTTCTGCTTCTGTC 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.309.18 chr1 - 2768 3 full-splice_match NBPF1 ENST00000449853.2 2755 3 -18 5 10 -5 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 24 5.710385 0.756665 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TATAAGTCATTTTCTGGACA 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 24 NA PB.309.20 chr1 - 3572 2 incomplete-splice_match NBPF1 ENST00000599069.5 2752 3 12 5832 12 -15 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AACATTCTTGTATAAGTCAT 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.309.24 chr1 - 3009 2 incomplete-splice_match NBPF1 ENST00000599069.5 2752 3 -16 6423 -16 -606 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TGTGCAGGATTTTGAGTGAA -20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.309.26 chr1 - 2173 3 full-splice_match NBPF1 ENST00000449853.2 2755 3 -30 612 -2 -612 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACTTCTGTGCAGGATTTTG -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.310.1 chr1 + 1099 1 full-splice_match ENSG00000261135 ENST00000562878.1 1110 1 10 1 10 -1 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA NA NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATCTGCTGACTCATCTTTGA NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 7 NA PB.311.1 chr1 + 2306 13 novel_not_in_catalog MST1P2 novel 2291 18 NA NA -51 129 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAGTGCAGTTTGTTTTCATG 813 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.311.2 chr1 + 2390 15 novel_not_in_catalog MST1P2 novel 2291 18 NA NA -35 57 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACCAAGGACTTTCTTAAATG 829 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.311.3 chr1 + 2767 12 novel_not_in_catalog MST1P2 novel 2291 18 NA NA -29 130 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTGCAGTTTGTTTTCATGG 835 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.311.4 chr1 + 2484 13 novel_not_in_catalog MST1P2 novel 2291 18 NA NA -20 58 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 CCAAGGACTTTCTTAAATGA -1 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 3 NA PB.311.5 chr1 + 2484 14 novel_not_in_catalog MST1P2 novel 2291 18 NA NA -17 54 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TTCACCAAGGACTTTCTTAA 2 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.311.6 chr1 + 2678 13 novel_not_in_catalog MST1P2 novel 2291 18 NA NA -1 58 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 CCAAGGACTTTCTTAAATGA 18 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.311.7 chr1 + 2250 6 novel_in_catalog MST1P2 novel 2291 18 NA NA 2068 130 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTGCAGTTTGTTTTCATGG -6 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.311.8 chr1 + 1673 8 novel_in_catalog MST1P2 novel 2291 18 NA NA 2346 130 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTGCAGTTTGTTTTCATGG 272 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.311.9 chr1 + 1867 6 novel_in_catalog MST1P2 novel 2291 18 NA NA 2378 57 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACCAAGGACTTTCTTAAATG 304 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 5 NA PB.311.10 chr1 + 1459 8 novel_in_catalog MST1P2 novel 2291 18 NA NA 2488 58 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 CCAAGGACTTTCTTAAATGA 414 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.311.11 chr1 + 1628 6 novel_not_in_catalog MST1P2 novel 2291 18 NA NA 2694 130 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTGCAGTTTGTTTTCATGG 620 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.311.12 chr1 + 1114 8 incomplete-splice_match MST1P2 ENST00000457982.3 2291 18 2832 -57 2832 57 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACCAAGGACTTTCTTAAATG 758 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.311.13 chr1 + 1052 4 novel_in_catalog MST1P2 novel 2291 18 NA NA 3367 52 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTTCACCAAGGACTTTCTT 1293 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.311.14 chr1 + 898 4 novel_in_catalog MST1P2 novel 2291 18 NA NA 3599 130 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTGCAGTTTGTTTTCATGG 1525 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 5 NA PB.312.2 chr1 - 1515 2 incomplete-splice_match CROCCP2 ENST00000639481.1 1296 4 5879 -1 5879 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GTCAGTGTTCTCCTGCTGTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.312.3 chr1 - 2519 12 novel_in_catalog CROCCP2 novel 2575 13 NA NA -9 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTCAGTGTTCTCCTGCTG -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.312.4 chr1 - 930 2 incomplete-splice_match CROCCP2 ENST00000639481.1 1296 4 6462 1 6462 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTCAGTGTTCTCCTGCTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.312.5 chr1 - 1234 3 incomplete-splice_match CROCCP2 ENST00000639481.1 1296 4 407 2 407 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATGTCAGTGTTCTCCTGCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.312.6 chr1 - 997 2 incomplete-splice_match CROCCP2 ENST00000639481.1 1296 4 6394 2 6394 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATGTCAGTGTTCTCCTGCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.312.7 chr1 - 2693 13 novel_in_catalog CROCCP2 novel 2575 13 NA NA -7 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTATGTCAGTGTTCTCCT -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.312.8 chr1 - 870 2 incomplete-splice_match CROCCP2 ENST00000639481.1 1296 4 6518 5 6518 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTATGTCAGTGTTCTCCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.313.1 chr1 - 1084 8 full-splice_match MST1L ENST00000455405.6 3184 8 -111 2211 -111 7 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACCAAGGACTTTCTTAAACG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.314.1 chr1 - 1116 1 full-splice_match ENSG00000238142 ENST00000688320.1 1135 1 18 1 -5 1 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACGTTGGTTTTATCATTTTA 13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.314.2 chr1 - 956 1 full-splice_match ENSG00000238142 ENST00000684832.1 958 1 0 2 0 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACGTTGGTTTTATCATTTT 172 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.314.3 chr1 - 1018 1 full-splice_match ENSG00000238142 ENST00000666544.1 1048 1 27 3 27 2 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACTTACGTTGGTTTTATC 105 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.318.1 chr1 + 1109 3 incomplete-splice_match CROCC ENST00000445545.6 3931 24 31973 4362 1571 1935 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 ATTTAAAAATGTAAAAAAAA NA FALSE NA NA AAGAAA -37 NA NA NA 2 NA PB.321.1 chr1 - 1076 9 novel_not_in_catalog MFAP2 novel 1045 9 NA NA -4 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAGATCAAGTCACTTTTTC -2 TRUE NA NA GGGGCT -8 NA NA NA 2 NA PB.321.2 chr1 - 2077 6 novel_not_in_catalog MFAP2 novel 1045 9 NA NA -26 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGATCAAGTCACTTTTT -24 TRUE NA NA GGGGCT -30 NA NA NA 4 NA PB.321.3 chr1 - 1913 7 novel_in_catalog MFAP2 novel 1045 9 NA NA 0 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGATCAAGTCACTTTTT 14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.321.4 chr1 - 1847 8 novel_in_catalog MFAP2 novel 1045 9 NA NA -24 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGATCAAGTCACTTTTT -22 TRUE NA NA GGGGCT -28 NA NA NA 3 NA PB.321.5 chr1 - 1288 9 full-splice_match MFAP2 ENST00000375535.4 1045 9 -247 4 -235 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGATCAAGTCACTTTTT 741 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.321.6 chr1 - 1122 9 novel_not_in_catalog MFAP2 novel 1045 9 NA NA -27 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGATCAAGTCACTTTTT -25 TRUE NA NA GGGGCT -31 NA NA NA 2 NA PB.321.7 chr1 - 1135 9 novel_not_in_catalog MFAP2 novel 1045 9 NA NA -1 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGATCAAGTCACTTTTT 1 TRUE NA NA GGGGCT -5 NA NA NA 4 NA PB.321.8 chr1 - 1106 9 novel_not_in_catalog MFAP2 novel 1045 9 NA NA -980 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGATCAAGTCACTTTTT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.321.9 chr1 - 1143 8 novel_in_catalog MFAP2 novel 1045 9 NA NA 0 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.617260 0.417847 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGATCAAGTCACTTTTT 14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.321.10 chr1 - 1057 7 novel_in_catalog MFAP2 novel 1045 9 NA NA -3 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGATCAAGTCACTTTTT 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.321.11 chr1 - 1083 9 full-splice_match MFAP2 ENST00000375535.4 1045 9 -42 4 -30 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 569 135.383713 2.131567 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGATCAAGTCACTTTTT 946 FALSE NA NA GGGGCT -34 NA NA NA 569 NA PB.321.12 chr1 - 999 9 novel_not_in_catalog MFAP2 novel 1045 9 NA NA 5 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGATCAAGTCACTTTTT 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.321.13 chr1 - 981 8 novel_in_catalog MFAP2 novel 1045 9 NA NA -15 -4 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGATCAAGTCACTTTTT -13 TRUE NA NA GGGGCT -19 NA NA NA 3 NA PB.321.14 chr1 - 964 8 novel_in_catalog MFAP2 novel 1045 9 NA NA -1 -4 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGATCAAGTCACTTTTT 1 TRUE NA NA GGGGCT -5 NA NA NA 6 NA PB.321.15 chr1 - 919 7 incomplete-splice_match MFAP2 ENST00000375534.7 970 8 1088 4 1088 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGATCAAGTCACTTTTT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.321.16 chr1 - 839 6 incomplete-splice_match MFAP2 ENST00000375534.7 970 8 1352 5 1352 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 CAAAAGATCAAGTCACTTTT 4684 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.322.1 chr1 - 4012 29 full-splice_match ATP13A2 ENST00000452699.5 3981 29 -32 1 -32 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.855192 0.455635 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTCTGCTGTGCCTGTCTTGT 13 FALSE NA NA GGGGCT -10 NA NA NA 12 NA PB.322.2 chr1 - 3996 29 full-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 0 0 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.617260 0.417847 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.322.3 chr1 - 3989 29 novel_in_catalog ATP13A2 novel 3996 29 NA NA -20 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA -20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.322.4 chr1 - 3159 22 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 9837 0 -1244 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA 9882 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.322.5 chr1 - 2901 19 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 11784 0 147 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.322.6 chr1 - 2371 15 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 15845 1 200 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTCTGCTGTGCCTGTCTTGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.322.7 chr1 - 2249 14 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 18108 0 -1962 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.322.8 chr1 - 2088 14 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 18269 0 -1801 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.322.9 chr1 - 1851 12 novel_in_catalog ATP13A2 novel 3996 29 NA NA -687 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.322.10 chr1 - 1628 10 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 20122 0 52 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.322.11 chr1 - 1478 9 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 21718 0 -207 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.617260 0.417847 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.322.12 chr1 - 1175 6 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 23476 0 1551 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.322.13 chr1 - 1046 5 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 23692 0 1767 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.322.14 chr1 - 853 4 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 24753 0 2828 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.322.15 chr1 - 724 3 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 24971 0 3046 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.322.16 chr1 - 3449 25 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 7116 1 260 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTCTGCTGTGCCTGTCTTGT 7161 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.322.17 chr1 - 1792 11 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 19807 1 -263 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTCTGCTGTGCCTGTCTTGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.322.18 chr1 - 2033 12 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 19452 2 -618 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GCTCTGCTGTGCCTGTCTTG NA FALSE NA NA GGGGCT -22 NA NA NA 2 NA PB.322.19 chr1 - 3870 28 novel_in_catalog ATP13A2 novel 3981 29 NA NA -9 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GGCTCTGCTGTGCCTGTCTT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.323.1 chr1 - 1011 8 full-splice_match SDHB ENST00000375499.8 1015 8 -9 13 -9 -13 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 857 203.908325 2.309435 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAGAACCTG -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 857 NA PB.323.2 chr1 - 843 7 novel_in_catalog SDHB novel 699 7 NA NA -9 -10 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAAAAAAAGAACCTGTTC -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.323.4 chr1 - 1112 8 full-splice_match SDHB ENST00000375499.8 1015 8 -110 13 -110 -13 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 544 129.435394 2.112053 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAGAACCTG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 544 NA PB.323.5 chr1 - 995 7 novel_in_catalog SDHB novel 1015 8 NA NA -79 -13 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAGAACCTG 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.323.6 chr1 - 832 7 incomplete-splice_match SDHB ENST00000375499.8 1015 8 9229 13 74 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAGAACCTG 9339 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.323.7 chr1 - 774 6 incomplete-splice_match SDHB ENST00000375499.8 1015 8 20902 13 -9970 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAGAACCTG NA FALSE NA NA AAGAAA -24 NA NA NA 6 NA PB.323.8 chr1 - 677 5 incomplete-splice_match SDHB ENST00000375499.8 1015 8 25322 13 -5550 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAGAACCTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.323.9 chr1 - 596 5 incomplete-splice_match SDHB ENST00000375499.8 1015 8 25403 13 -5469 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAGAACCTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.323.10 chr1 - 954 8 novel_not_in_catalog SDHB novel 1015 8 NA NA 2 -14 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 TAACAAAAAAAAAAGAACCT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.324.1 chr1 - 2885 5 novel_not_in_catalog PADI2 novel 4361 16 NA NA -233 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATATGGCTGTTGGTGTGATG NA FALSE NA NA AATATA -5 NA NA NA 2 NA PB.324.3 chr1 - 1802 5 novel_not_in_catalog PADI2 novel 4361 16 NA NA -222 -48 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATTTTGAAGAACCGATTTAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.325.1 chr1 + 1381 6 incomplete-splice_match CROCC ENST00000375541.10 6660 37 47294 6 -560 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAAAGTTTGTACAGCTGT 8347 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.325.2 chr1 + 1170 5 novel_in_catalog CROCC novel 6660 37 NA NA -518 8 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTGTGTCCCTTTTCTAGA 8389 FALSE NA NA AAAAAG -8 NA NA NA 2 NA PB.326.1 chr1 - 1625 11 full-splice_match PADI2 ENST00000375481.1 1607 11 -18 0 -2 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 GAAAGGTGTATAATGAGATT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.327.1 chr1 + 3187 16 full-splice_match PADI3 ENST00000375460.3 3189 16 0 2 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGGCTTGGCTCTCATGTT 1 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.329.5 chr1 + 2250 10 incomplete-splice_match ARHGEF10L ENST00000375408.7 3685 20 20281 0 -1156 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTTGGATTGAGGTTTTGTT 2461 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.329.7 chr1 + 1732 6 incomplete-splice_match ARHGEF10L ENST00000375408.7 3685 20 37676 2 16239 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GGACTTGGATTGAGGTTTTG NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.329.8 chr1 + 1586 5 incomplete-splice_match ARHGEF10L ENST00000375408.7 3685 20 38274 1 16837 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GACTTGGATTGAGGTTTTGT NA FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.329.9 chr1 + 1444 4 incomplete-splice_match ARHGEF10L ENST00000375408.7 3685 20 46153 2 24716 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GGACTTGGATTGAGGTTTTG NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.329.10 chr1 + 1103 2 full-splice_match ARHGEF10L ENST00000495593.1 2261 2 1146 12 1146 2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATCTGGACTTGGATTGAGGT 6144 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.329.11 chr1 + 1049 2 full-splice_match ARHGEF10L ENST00000495593.1 2261 2 1206 6 1206 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTTGGATTGAGGTTTTGTT 6204 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.330.1 chr1 + 1809 3 full-splice_match ACTL8 ENST00000375406.2 1841 3 30 2 30 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 37 8.803510 0.944656 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGGCTCCTGTGATGG 14 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 37 NA PB.330.2 chr1 + 1909 4 novel_not_in_catalog ACTL8 novel 1841 3 NA NA 50 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGGCTCCTGTGATGG 34 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.330.3 chr1 + 1822 3 novel_not_in_catalog ACTL8 novel 1670 2 NA NA 3998 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CAATGCTGGCTCCTGTGATG 1 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 6 NA PB.330.4 chr1 + 1646 2 full-splice_match ACTL8 ENST00000617065.1 1670 2 24 0 24 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGGCTCCTGTGATGG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.331.1 chr1 + 1926 10 full-splice_match IGSF21 ENST00000251296.4 1892 10 -35 1 -35 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACCTCGGTTTGTGGCTCTGC 6 FALSE NA NA ATTAAA -22 NA NA NA 6 NA PB.332.1 chr1 - 3065 7 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 18940 -1 -11691 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 23 5.472452 0.738182 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGGATTTTGCATTTCTTTTT 4802 FALSE NA NA AATAGA -39 NA NA NA 23 NA PB.332.2 chr1 - 4131 13 full-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 -91 0 -91 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGGATTTTGCATTTCTTTT 1709 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.332.3 chr1 - 3761 12 full-splice_match RCC2 ENST00000375433.3 2030 12 185 -1916 185 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGGATTTTGCATTTCTTTT 3101 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.332.4 chr1 - 3532 10 novel_in_catalog RCC2 novel 4040 13 NA NA 6 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGGATTTTGCATTTCTTTT -1 TRUE NA NA AAAACA -12 NA NA NA 2 NA PB.332.5 chr1 - 3489 10 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 14024 0 12908 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.806923 0.580574 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGGATTTTGCATTTCTTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.332.6 chr1 - 3605 11 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 10487 0 9371 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGGATTTTGCATTTCTTTT 9372 FALSE NA NA AAAAAG -16 NA NA NA 9 NA PB.332.7 chr1 - 3363 9 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 16854 0 -13777 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.806923 0.580574 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGGATTTTGCATTTCTTTT 2716 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.332.8 chr1 - 2906 6 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 23165 0 -7466 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.617260 0.417847 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGGATTTTGCATTTCTTTT 9027 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.332.17 chr1 - 1156 2 novel_not_in_catalog RCC2 novel 4040 13 NA NA 842 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGGATTTTGCATTTCTTTT 4070 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.332.22 chr1 - 2822 5 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 26010 1 -4621 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.806923 0.580574 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTTGGATTTTGCATTTCTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.332.23 chr1 - 2513 2 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 29625 1 -1006 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 45 10.706972 1.029667 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTTGGATTTTGCATTTCTTT 2222 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 45 NA PB.332.25 chr1 - 2691 4 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 26498 2 -4133 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TCTTGGATTTTGCATTTCTT NA FALSE NA NA AAAACA -34 NA NA NA 4 NA PB.332.27 chr1 - 3834 12 full-splice_match RCC2 ENST00000375433.3 2030 12 85 -1889 85 -27 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAATAAACAACAACATTGTC 3001 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.332.28 chr1 - 3213 8 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 17390 27 -13241 -27 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.617260 0.417847 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAATAAACAACAACATTGTC 3252 FALSE NA NA AAGAAA -37 NA NA NA 11 NA PB.332.29 chr1 - 2971 6 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 23073 27 -7558 -27 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAATAAACAACAACATTGTC 8935 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.332.30 chr1 - 2685 5 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 26121 27 -4510 -27 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAATAAACAACAACATTGTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.332.35 chr1 - 3641 12 full-splice_match RCC2 ENST00000375433.3 2030 12 274 -1885 274 -31 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 TTTTAAATAAACAACAACAT 3190 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.332.36 chr1 - 2707 11 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375433.3 2030 12 9362 -1009 9362 172 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATGATGTAGTTGTTGT 9363 FALSE NA NA AAAAAG -25 NA NA NA 2 NA PB.332.37 chr1 - 1898 5 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375433.3 2030 12 24912 -1009 -4603 172 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATGATGTAGTTGTTGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.332.38 chr1 - 1679 3 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375433.3 2030 12 26367 -1009 -3148 172 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATGATGTAGTTGTTGT 80 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.332.40 chr1 - 1325 8 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375433.3 2030 12 16274 -1 -13241 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAATGTCCCTTACAGGA 3252 FALSE NA NA AAGAAA -37 NA NA NA 2 NA PB.333.1 chr1 - 3381 15 full-splice_match ALDH4A1 ENST00000375341.8 3139 15 -244 2 -75 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATCACAGTGGTGGATGGTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.333.2 chr1 - 3089 14 novel_in_catalog ALDH4A1 novel 3139 15 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATCACAGTGGTGGATGGTC -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.333.3 chr1 - 2984 14 full-splice_match ALDH4A1 ENST00000538839.5 2957 14 -27 0 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATCACAGTGGTGGATGGTC -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.333.4 chr1 - 2951 13 incomplete-splice_match ALDH4A1 ENST00000538309.5 1940 15 1435 -1301 1435 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATCACAGTGGTGGATGGTC 1307 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.333.5 chr1 - 2835 12 incomplete-splice_match ALDH4A1 ENST00000538309.5 1940 15 4401 -1301 -871 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATCACAGTGGTGGATGGTC 4273 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.333.6 chr1 - 2618 10 incomplete-splice_match ALDH4A1 ENST00000538309.5 1940 15 7497 -1301 2225 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATCACAGTGGTGGATGGTC 7369 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.333.7 chr1 - 2239 7 incomplete-splice_match ALDH4A1 ENST00000538309.5 1940 15 11518 -1301 6246 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATCACAGTGGTGGATGGTC 6658 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.333.8 chr1 - 1860 2 incomplete-splice_match ALDH4A1 ENST00000538309.5 1940 15 16095 -1301 10823 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATCACAGTGGTGGATGGTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.333.12 chr1 - 3131 15 full-splice_match ALDH4A1 ENST00000375341.8 3139 15 5 3 3 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 37 8.803510 0.944656 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAATCACAGTGGTGGATGGT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 37 NA PB.333.13 chr1 - 1897 4 incomplete-splice_match ALDH4A1 ENST00000538309.5 1940 15 14446 -1300 9174 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAATCACAGTGGTGGATGGT 9586 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.333.14 chr1 - 1275 7 incomplete-splice_match ALDH4A1 ENST00000375341.8 3139 15 -3 11132 -3 -2 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAGATTTGGATGTAGTCTC -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.333.15 chr1 - 860 8 novel_in_catalog ALDH4A1 novel 844 6 NA NA -39 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAGATTTGGATGTAGTCTC 171 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.334.2 chr1 - 5170 8 incomplete-splice_match IFFO2 ENST00000455833.7 6179 9 35553 2 -9131 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GATGGTGCTTTTTTTTGTTT 5045 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.336.1 chr1 + 1277 1 full-splice_match KLHDC7A ENST00000400664.3 5045 1 3778 -10 3778 10 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA NA NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAATGATC 3547 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.337.1 chr1 - 5136 34 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 92957 4 1540 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGGAAGGTGTTGCCTGC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.337.2 chr1 - 3513 24 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 103662 4 -1688 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGGAAGGTGTTGCCTGC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.337.3 chr1 - 3020 20 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 778 4 778 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATTGAAAAGGAAGGTGTTGC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.337.4 chr1 - 2330 14 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 9286 0 292 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGGAAGGTGTTGCCTGC 4519 FALSE NA NA AAGAAA -18 NA NA NA 5 NA PB.337.5 chr1 - 1633 9 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 15965 0 4489 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.806923 0.580574 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGGAAGGTGTTGCCTGC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.337.6 chr1 - 957 5 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 20318 0 -2358 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGGAAGGTGTTGCCTGC 3296 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.337.7 chr1 - 714 4 full-splice_match UBR4 ENST00000375225.7 1533 4 815 4 -119 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGGAAGGTGTTGCCTGC 6469 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.337.8 chr1 - 5002 33 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 94673 5 -2906 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAGGAAGGTGTTGCCTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.337.9 chr1 - 5240 34 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 92852 5 1435 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAGGAAGGTGTTGCCTG NA FALSE NA NA AATACA -42 NA NA NA 2 NA PB.337.10 chr1 - 3633 24 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 103541 5 -1809 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAGGAAGGTGTTGCCTG NA FALSE NA NA AGTAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.337.11 chr1 - 3116 20 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 685 1 685 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAGGAAGGTGTTGCCTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.337.12 chr1 - 2846 18 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 4343 1 -447 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAGGAAGGTGTTGCCTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.337.13 chr1 - 2619 17 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 5268 1 478 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAGGAAGGTGTTGCCTG 501 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.337.14 chr1 - 2166 13 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 9968 1 974 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.855192 0.455635 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAGGAAGGTGTTGCCTG 5201 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.337.15 chr1 - 1440 8 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 16986 1 5510 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.568991 0.552545 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAGGAAGGTGTTGCCTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.337.16 chr1 - 1354 8 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 17072 1 5596 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAGGAAGGTGTTGCCTG 50 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.337.17 chr1 - 923 4 full-splice_match UBR4 ENST00000375225.7 1533 4 605 5 -329 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.282789 0.631727 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAGGAAGGTGTTGCCTG 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.337.18 chr1 - 2751 18 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 4437 2 -353 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGAAAAGGAAGGTGTTGCCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.337.19 chr1 - 2420 15 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 8324 2 -670 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.093125 0.490398 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGAAAAGGAAGGTGTTGCCT 3557 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.337.20 chr1 - 1931 11 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 11430 2 -46 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGAAAAGGAAGGTGTTGCCT 6663 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.337.21 chr1 - 1532 9 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 16064 2 4588 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGAAAAGGAAGGTGTTGCCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.337.22 chr1 - 4102 29 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 97706 8 127 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATTGAAAAGGAAGGTGTTGC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.337.23 chr1 - 1812 11 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 11547 4 71 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 20 4.758654 0.677484 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATTGAAAAGGAAGGTGTTGC 6780 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 20 NA PB.337.24 chr1 - 1245 7 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 18172 4 -4504 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATTGAAAAGGAAGGTGTTGC 1150 FALSE NA NA GGGGCT -38 NA NA NA 9 NA PB.337.25 chr1 - 3937 27 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 99838 9 130 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 CATTGAAAAGGAAGGTGTTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.337.30 chr1 - 1661 14 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 97671 22683 92 -3098 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GTAGATCATGGCACTGCACA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.337.31 chr1 - 1096 9 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 103599 22683 -1751 -3098 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GTAGATCATGGCACTGCACA NA FALSE NA NA AATAGA -40 NA NA NA 2 NA PB.337.32 chr1 - 1976 15 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 96523 22685 -1056 -3100 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGGTAGATCATGGCACTGCA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.337.34 chr1 - 1365 11 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 99489 25866 -219 6190 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAATGACCATAGGACAGTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.337.35 chr1 - 5253 34 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 47739 46719 5528 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 4186 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.337.36 chr1 - 5013 32 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 48591 46719 6380 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 5038 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.337.37 chr1 - 4796 31 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 49249 46719 7038 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 5696 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.337.38 chr1 - 3745 25 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 55247 46719 -3319 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 1807 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.337.39 chr1 - 3314 23 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 56921 46719 -1645 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 3481 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.337.40 chr1 - 3024 21 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 58488 46719 -78 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 5048 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.337.41 chr1 - 2944 20 novel_in_catalog UBR4 novel 6175 41 NA NA -103 -16 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 5023 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.337.42 chr1 - 2822 20 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 59539 46719 973 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 6099 FALSE NA NA CATAAA -36 NA NA NA 5 NA PB.337.43 chr1 - 2474 17 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 63264 46719 -874 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 9824 FALSE NA NA AAAACA -43 NA NA NA 5 NA PB.337.44 chr1 - 2288 16 novel_not_in_catalog UBR4 novel 15892 106 NA NA 198 -16 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 7828 FALSE NA NA AAGAAA -30 NA NA NA 2 NA PB.337.45 chr1 - 2290 16 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 64340 46719 202 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 7832 FALSE NA NA AAGAAA -26 NA NA NA 8 NA PB.337.46 chr1 - 2085 15 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 65430 46719 1292 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 8922 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.337.47 chr1 - 1906 13 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 68505 46719 4367 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.568991 0.552545 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA NA FALSE NA NA AAGAAA -21 NA NA NA 15 NA PB.337.48 chr1 - 1815 13 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 68596 46719 4458 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.337.49 chr1 - 1708 12 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 68825 46719 4687 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.337.50 chr1 - 1587 11 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 69400 46719 5262 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.337.51 chr1 - 1478 10 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000425413.5 2954 21 12510 29 6938 -16 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.282789 0.631727 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.337.52 chr1 - 1251 9 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000425413.5 2954 21 13638 29 8066 -16 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 25 5.948318 0.774394 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 25 NA PB.337.53 chr1 - 1053 7 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000425413.5 2954 21 23427 29 -572 -16 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 21 4.996587 0.698673 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 3005 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 21 NA PB.337.54 chr1 - 933 6 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000425413.5 2954 21 24018 29 19 -16 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 3596 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.337.55 chr1 - 809 5 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000425413.5 2954 21 25109 29 1110 -16 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 4687 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.337.56 chr1 - 2692 20 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 59668 46720 1102 -17 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 TAAAAAGAGCAAGAAAGAAG 6228 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.337.57 chr1 - 1979 14 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000425413.5 2954 21 6864 30 1292 -17 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 TAAAAAGAGCAAGAAAGAAG 8922 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.339.2 chr1 - 2659 2 novel_not_in_catalog UBR4 novel 15892 106 NA NA 0 -54734 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AGGAAAAAAAAAAAAAAAGC -3 TRUE NA NA GGGGCT -34 NA NA NA 2 NA PB.340.3 chr1 + 968 2 full-splice_match EMC1-AS1 ENST00000437898.2 653 2 40 -355 34 355 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TCACATGGCTGAAGGGAACA -2 TRUE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.341.2 chr1 - 4224 23 full-splice_match EMC1 ENST00000477853.6 6640 23 0 2416 0 72 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 34 8.089712 0.907933 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TCTTTTGTGTCTTAGAAGAT 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 34 NA PB.341.3 chr1 - 1974 5 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000691945.1 4156 6 4641 1284 -542 59 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTGTTTAAGTCCTCTTTTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.341.5 chr1 - 3263 15 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000375208.7 4084 22 12197 -57 1243 57 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACACTGTTTAAGTCCTCTTT 3102 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.341.6 chr1 - 2625 10 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000375208.7 4084 22 18524 -57 -682 57 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACACTGTTTAAGTCCTCTTT 9429 FALSE NA NA GGGGCT -13 NA NA NA 5 NA PB.341.7 chr1 - 2080 6 full-splice_match EMC1 ENST00000691945.1 4156 6 790 1286 545 57 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACACTGTTTAAGTCCTCTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.341.8 chr1 - 1680 4 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000691945.1 4156 6 5494 1286 65 57 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACACTGTTTAAGTCCTCTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.341.9 chr1 - 2847 11 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000375208.7 4084 22 16303 -52 -2903 52 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAATGACACTGTTTAAGTCC 7208 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.341.10 chr1 - 1538 3 full-splice_match EMC1 ENST00000480380.1 3892 3 1132 1222 421 52 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAATGACACTGTTTAAGTCC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.341.13 chr1 - 2753 11 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000375208.7 4084 22 16272 73 -2934 -73 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTCCTTGGTCATAGAGTTGG 7177 FALSE NA NA GGGGCT -12 NA NA NA 2 NA PB.341.15 chr1 - 4084 23 full-splice_match EMC1 ENST00000477853.6 6640 23 -6 2562 -4 -74 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTTCCTTGGTCATAGAGTTG -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.341.16 chr1 - 3369 23 full-splice_match EMC1 ENST00000477853.6 6640 23 -13 3284 5 1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 143 34.024376 1.531790 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTTTACTTTGCCTTTTGTGT -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 143 NA PB.341.17 chr1 - 2136 12 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000375208.7 4084 22 14288 785 3334 12 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTTTTGTGTTTCTCAATTTT 5193 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.341.18 chr1 - 2717 17 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000375208.7 4084 22 11074 786 120 11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CCTTTTGTGTTTCTCAATTT 1979 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.341.19 chr1 - 1800 10 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000486405.2 2991 24 18482 -358 -711 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTTACTTTGCCTTTTGTG 9400 FALSE NA NA CATAAA -27 NA NA NA 6 NA PB.341.20 chr1 - 3319 23 novel_in_catalog EMC1 novel 6640 23 NA NA 0 5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTTTGCCTTTTGTGTTTCT 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.341.21 chr1 - 1123 5 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000691945.1 4156 6 4640 2136 -543 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TACTTTGCCTTTTGTGTTTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.341.22 chr1 - 3103 21 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000692207.1 5360 22 7518 2138 171 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTTACTTTGCCTTTTGTGTT 7533 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.341.23 chr1 - 3250 22 full-splice_match EMC1 ENST00000688219.1 6517 22 -18 3285 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTTACTTTGCCTTTTGTG -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.341.24 chr1 - 1527 8 full-splice_match EMC1 ENST00000688918.1 4034 8 367 2140 367 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTTACTTTGCCTTTTGTG 9758 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.341.25 chr1 - 1307 7 full-splice_match EMC1 ENST00000693007.1 4889 7 1427 2155 74 -15 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.855192 0.455635 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GGCCTGTTTAAATTGACTTT NA FALSE NA NA AATAGA -44 NA NA NA 12 NA PB.341.26 chr1 - 938 4 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000691945.1 4156 6 5382 2140 -47 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTTACTTTGCCTTTTGTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.341.27 chr1 - 845 4 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000691945.1 4156 6 5475 2140 46 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTTACTTTGCCTTTTGTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.341.28 chr1 - 3291 22 full-splice_match EMC1 ENST00000375208.7 4084 22 -5 798 -1 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GACTTTACTTTGCCTTTTGT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.341.29 chr1 - 2278 14 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000375208.7 4084 22 12700 798 1746 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GACTTTACTTTGCCTTTTGT 3605 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.341.30 chr1 - 1398 7 full-splice_match EMC1 ENST00000693007.1 4889 7 1349 2142 -4 -2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGACTTTACTTTGCCTTTTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.341.31 chr1 - 3280 22 novel_in_catalog EMC1 novel 6640 23 NA NA -4 -6 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATTGACTTTACTTTGCCT 11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.341.32 chr1 - 3177 22 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000477853.6 6640 23 6546 3301 -811 -16 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGGCCTGTTTAAATTGACTT 6551 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.341.33 chr1 - 1984 11 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000375208.7 4084 22 16311 803 -2895 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATTGACTTTACTTTGCCT 7216 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.341.34 chr1 - 1184 6 full-splice_match EMC1 ENST00000691945.1 4156 6 826 2146 581 -6 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATTGACTTTACTTTGCCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.341.35 chr1 - 1042 5 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000691945.1 4156 6 4711 2146 -472 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATTGACTTTACTTTGCCT NA FALSE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 2 NA PB.341.36 chr1 - 2773 18 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000375208.7 4084 22 10431 804 -523 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAATTGACTTTACTTTGCC 1336 FALSE NA NA AATACA -23 NA NA NA 2 NA PB.341.37 chr1 - 2060 12 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000375208.7 4084 22 14345 804 3391 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAATTGACTTTACTTTGCC 5250 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.341.38 chr1 - 1338 5 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000486405.2 2991 24 -18 22231 -1 -23 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAACACAACAAAGA 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.342.1 chr1 - 1269 7 full-splice_match AKR7A3 ENST00000361640.5 1215 7 -46 -8 -46 8 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGTGTTAGTCTGTTTGCGTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.345.4 chr1 + 1400 8 full-splice_match MRTO4 ENST00000330263.5 2049 8 -215 864 -215 525 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 23 5.472452 0.738182 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAAAGAATACA 18 TRUE NA NA AGTAAA -11 NA NA NA 23 NA PB.345.5 chr1 + 1578 8 full-splice_match MRTO4 ENST00000330263.5 2049 8 -211 682 -211 -682 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.568991 0.552545 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTGCCTGTGGTCCCCACT 22 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 15 NA PB.345.7 chr1 + 2047 8 full-splice_match MRTO4 ENST00000330263.5 2049 8 0 2 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACAGTGGCCCTCTTTTTTC -9 TRUE NA NA AGTAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.345.8 chr1 + 1388 8 full-splice_match MRTO4 ENST00000330263.5 2049 8 -26 687 -26 -687 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 85 20.224279 1.305873 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GTGCCACTTGCCTGTGGTCC 122 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 85 NA PB.345.9 chr1 + 1192 8 full-splice_match MRTO4 ENST00000330263.5 2049 8 -7 864 -7 525 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 129 30.693319 1.487044 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAAAGAATACA -16 TRUE NA NA AGTAAA -11 NA NA NA 129 NA PB.345.16 chr1 + 1518 8 novel_in_catalog MRTO4 novel 2049 8 NA NA 22 525 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAAAGAATACA 43 FALSE NA NA AGTAAA -11 NA NA NA 4 NA PB.345.19 chr1 + 1197 6 incomplete-splice_match MRTO4 ENST00000330263.5 2049 8 4195 682 -1712 -682 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTGCCTGTGGTCCCCACT 4186 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 3 NA PB.345.20 chr1 + 1088 5 incomplete-splice_match MRTO4 ENST00000330263.5 2049 8 5316 682 -591 -682 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTGCCTGTGGTCCCCACT 5307 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.346.1 chr1 - 1026 7 novel_not_in_catalog AKR7A2 novel 989 3 NA NA 17 4962 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AATTGACTGTGTATATAACT -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.346.3 chr1 - 1532 6 novel_in_catalog AKR7A2 novel 1360 7 NA NA -16 5 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTTCTCTGCTGTTAACACTT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.346.4 chr1 - 1354 7 full-splice_match AKR7A2 ENST00000235835.8 1360 7 1 5 1 -5 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 410 97.552406 1.989238 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAAACTTGCTTTCTCTGCT -33 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 410 NA PB.346.5 chr1 - 1272 6 full-splice_match AKR7A2 ENST00000330072.9 1171 6 -72 -29 -22 -5 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAAACTTGCTTTCTCTGCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.346.6 chr1 - 1217 6 novel_in_catalog AKR7A2 novel 1360 7 NA NA 0 -5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAAACTTGCTTTCTCTGCT 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.346.7 chr1 - 1195 7 full-splice_match AKR7A2 ENST00000235835.8 1360 7 160 5 -77 -5 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 20 4.758654 0.677484 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAAACTTGCTTTCTCTGCT 126 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 20 NA PB.346.8 chr1 - 1039 6 incomplete-splice_match AKR7A2 ENST00000235835.8 1360 7 3500 5 -139 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.806923 0.580574 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAAACTTGCTTTCTCTGCT 3466 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.347.1 chr1 + 2502 7 novel_in_catalog SLC66A1 novel 1805 9 NA NA -44 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGACCTGCTTCTGTTGCTCC NA FALSE NA NA AATAAA -33 NA NA NA 2 NA PB.347.2 chr1 + 1821 9 full-splice_match SLC66A1 ENST00000375155.7 1805 9 -20 4 -20 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.282789 0.631727 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGAGACCTGCTTCTGTTGC -9 TRUE NA NA AATAAA -30 NA NA NA 18 NA PB.347.4 chr1 + 2174 8 full-splice_match SLC66A1 ENST00000375153.8 2175 8 0 1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGACCTGCTTCTGTTGCTCC 11 TRUE NA NA AATAAA -33 NA NA NA 6 NA PB.347.5 chr1 + 1494 9 full-splice_match SLC66A1 ENST00000375155.7 1805 9 -1 312 -1 1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCTCGCACCTGTAATCCTAG 10 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 6 NA PB.347.6 chr1 + 1492 7 incomplete-splice_match SLC66A1 ENST00000375153.8 2175 8 5349 44 4946 -28 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAATAAAAAAGATAAC 5325 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.347.7 chr1 + 1303 6 incomplete-splice_match SLC66A1 ENST00000400548.6 1548 8 12346 12 -67 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACCTCCCCATGAGACCTGCT NA FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 5 NA PB.348.3 chr1 + 449 3 full-splice_match MICOS10 ENST00000617872.4 3678 3 13 3216 -1 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAATAAATTAAACAAAAAGA -20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.348.4 chr1 + 498 4 full-splice_match MICOS10 ENST00000322753.7 3723 4 38 3187 16 3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 149 35.451973 1.549640 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTGCATGGCCTTTGTTTCT 7 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 149 NA PB.348.5 chr1 + 3290 3 incomplete-splice_match MICOS10 ENST00000498642.5 669 5 -41 -18 -1 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAATAAATTAAACAAAAAGA -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.348.6 chr1 + 558 5 full-splice_match MICOS10 ENST00000467029.5 583 5 7 18 7 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAATAAATTAAACAAAAAGA -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.348.8 chr1 + 711 5 full-splice_match MICOS10 ENST00000498642.5 669 5 -24 -18 16 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAATAAATTAAACAAAAAGA 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.348.11 chr1 + 811 4 novel_not_in_catalog MICOS10 novel 655 4 NA NA 175 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAATAAATTAAACAAAAAGA 104 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.348.14 chr1 + 1428 1 full-splice_match ENSG00000226396 ENST00000457263.1 455 1 -929 -44 -929 44 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAATAAATAAAAAAAG 9376 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.348.15 chr1 + 1109 1 full-splice_match ENSG00000226396 ENST00000457263.1 455 1 -609 -45 -609 45 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAATAAATAAAAAAAGT 9696 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.349.1 chr1 + 2023 4 full-splice_match NBL1 ENST00000375136.8 2024 4 0 1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 173 41.162357 1.614500 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTGTGTTCTCCTCCTCACTG -15 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 173 NA PB.349.2 chr1 + 1912 3 novel_in_catalog NBL1 novel 2024 4 NA NA 0 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTGTTCTCCTCCTCACTGA -15 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.349.3 chr1 + 911 4 full-splice_match NBL1 ENST00000375136.8 2024 4 2 1111 2 212 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAAGCAGAGGTCTTCAGGGC -13 TRUE NA NA AATATA -18 NA NA NA 2 NA PB.349.4 chr1 + 1874 3 incomplete-splice_match NBL1 ENST00000548815.2 1953 4 7417 3 7417 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTGTTCTCCTCCTCACTGAC 7464 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 5 NA PB.350.1 chr1 - 1797 10 full-splice_match CAPZB ENST00000375142.5 1686 10 -64 -47 -10 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGCGCTGGCCTTCTGTGTTC 94 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.350.2 chr1 - 1668 9 novel_not_in_catalog CAPZB novel 1675 9 NA NA -32086 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGCGCTGGCCTTCTGTGTTC -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.350.3 chr1 - 1773 10 novel_not_in_catalog CAPZB novel 1686 10 NA NA -10 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TAGCGCTGGCCTTCTGTGTT -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.350.4 chr1 - 1688 9 full-splice_match CAPZB ENST00000264202.8 1675 9 -15 2 -15 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 1465 348.571411 2.542292 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TAGCGCTGGCCTTCTGTGTT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 1465 NA PB.350.5 chr1 - 1534 8 novel_in_catalog CAPZB novel 1675 9 NA NA -4 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TAGCGCTGGCCTTCTGTGTT 11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.350.6 chr1 - 1403 7 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 99114 -582 14 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 43 10.231107 1.009923 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TAGCGCTGGCCTTCTGTGTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 43 NA PB.350.7 chr1 - 1241 5 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 127102 -581 -11200 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 35 8.327644 0.920522 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTAGCGCTGGCCTTCTGTGT 85 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 35 NA PB.350.8 chr1 - 1565 8 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 64915 -579 -12 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.331058 0.522582 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTAGCGCTGGCCTTCTGT 5 TRUE NA NA AATACA -31 NA NA NA 14 NA PB.350.9 chr1 - 953 3 full-splice_match CAPZB ENST00000674299.1 1734 3 1138 -357 1138 -4 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 33 7.851779 0.894968 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTAGCGCTGGCCTTCTGT 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 33 NA PB.350.10 chr1 - 1124 5 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 127216 -578 -11086 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 30 7.137981 0.853575 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGTTAGCGCTGGCCTTCTG 199 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 30 NA PB.350.14 chr1 - 985 4 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 127982 -535 -10320 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.855192 0.455635 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAGAAAAGAAAAGAA 22 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.350.15 chr1 - 1683 10 full-splice_match CAPZB ENST00000375142.5 1686 10 1 2 1 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAAAGAAAAGAAAAGA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.350.16 chr1 - 1459 8 novel_in_catalog CAPZB novel 1675 9 NA NA -10 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAAAGAAAAGAAAAGA -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.350.18 chr1 - 1339 9 full-splice_match CAPZB ENST00000264202.8 1675 9 6 330 4 32 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 516 122.773277 2.089104 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATTCCGTGTGTGTTTGGGA -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 516 NA PB.350.19 chr1 - 1074 7 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 99115 -254 15 32 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATTCCGTGTGTGTTTGGGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.350.20 chr1 - 1007 6 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 106033 -254 6933 32 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.806923 0.580574 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATTCCGTGTGTGTTTGGGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.350.21 chr1 - 862 5 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 127136 -236 -11166 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAGAAAAACTGGAAATCTTA 119 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.350.22 chr1 - 776 4 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 127910 -254 -10392 32 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATTCCGTGTGTGTTTGGGA 893 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.350.23 chr1 - 1242 9 full-splice_match CAPZB ENST00000264202.8 1675 9 62 371 0 -9 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.568991 0.552545 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAACTGTGGTGTGTGAAAGA 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.350.24 chr1 - 1216 10 full-splice_match CAPZB ENST00000375142.5 1686 10 -64 534 -10 2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTCCGGCTCCGAGCCTGCTT 94 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.350.25 chr1 - 1094 9 full-splice_match CAPZB ENST00000264202.8 1675 9 -1 582 -1 2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 224 53.296925 1.726702 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTCCGGCTCCGAGCCTGCTT -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 224 NA PB.350.26 chr1 - 807 7 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 99130 -2 30 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTCCGGCTCCGAGCCTGCTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.350.27 chr1 - 1016 9 novel_not_in_catalog CAPZB novel 1675 9 NA NA 2 1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CCTCCGGCTCCGAGCCTGCT 17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.350.36 chr1 - 691 5 novel_not_in_catalog CAPZB novel 4666 2 NA NA -6 -127 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TGTCTTGCCCCTGTTCCTGC 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.351.1 chr1 + 2964 4 novel_not_in_catalog HTR6 novel 3800 3 NA NA -47 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTGGCTGTGGTGTGGACTG 6428 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.353.1 chr1 + 1080 7 incomplete-splice_match OTUD3 ENST00000375120.4 6515 8 24 6364 24 -363 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAACAAAGCAAATAAA 7 TRUE NA NA AATGAA -41 NA NA NA 2 NA PB.354.2 chr1 - 1314 2 incomplete-splice_match TMCO4 ENST00000489814.5 1722 5 43879 -4 6670 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TACCACTTCTTGAGCATGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.354.3 chr1 - 2935 16 full-splice_match TMCO4 ENST00000294543.11 2946 16 -10 21 -10 -19 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AATAAATAATAATAAGAAGA 396 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.354.4 chr1 - 2205 10 incomplete-splice_match TMCO4 ENST00000294543.11 2946 16 44247 21 15758 -19 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AATAAATAATAATAAGAAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.354.5 chr1 - 1694 6 incomplete-splice_match TMCO4 ENST00000294543.11 2946 16 59088 21 -2409 -19 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AATAAATAATAATAAGAAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.354.6 chr1 - 1422 3 incomplete-splice_match TMCO4 ENST00000489814.5 1722 5 37532 19 323 -19 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AATAAATAATAATAAGAAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.356.1 chr1 - 845 5 full-splice_match PLA2G2A ENST00000482011.2 608 5 0 -237 0 2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATGTATATGTGTGTGTGTAT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.358.1 chr1 + 1071 2 full-splice_match ENSG00000227066 ENST00000652935.1 1094 2 21 2 21 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AACCTGGTGTCTGAGGGGTT 240 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.359.1 chr1 + 915 3 full-splice_match CDA ENST00000461985.1 762 3 -154 1 -154 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATCAAAGCGTGTGTCTTGCT -26 TRUE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.359.2 chr1 + 968 4 full-splice_match CDA ENST00000375071.4 809 4 -160 1 -149 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 27 6.424183 0.807818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATCAAAGCGTGTGTCTTGCT -21 TRUE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 27 NA PB.359.3 chr1 + 747 3 full-splice_match CDA ENST00000461985.1 762 3 12 3 1 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GGATCAAAGCGTGTGTCTTG 8 TRUE NA NA TATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.359.4 chr1 + 804 4 full-splice_match CDA ENST00000375071.4 809 4 3 2 3 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 34 8.089712 0.907933 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GATCAAAGCGTGTGTCTTGC 10 TRUE NA NA TATAAA -18 NA NA NA 34 NA PB.360.1 chr1 - 2434 4 novel_not_in_catalog MUL1 novel 2428 4 NA NA 10 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTGCTAGCCTGTTGCTTTG -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.360.2 chr1 - 2426 4 full-splice_match MUL1 ENST00000264198.5 2428 4 0 2 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 216 51.393463 1.710908 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGTGCTAGCCTGTTGCTTT -23 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 216 NA PB.360.3 chr1 - 2093 2 incomplete-splice_match MUL1 ENST00000264198.5 2428 4 5960 2 5960 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGTGCTAGCCTGTTGCTTT 5937 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.361.1 chr1 - 1790 12 novel_not_in_catalog DDOST novel 2126 11 NA NA -8 2407 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACTAGCCTTTACCTTCCTA -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.361.2 chr1 - 1961 11 full-splice_match DDOST ENST00000602624.7 1941 11 -16 -4 3 4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 334 79.469521 1.900201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACCTGGCCCCGGTCCTGGTT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 334 NA PB.361.11 chr1 - 1703 10 incomplete-splice_match DDOST ENST00000602624.7 1941 11 377 66 377 -66 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAATATAAATAAATAAATAA 531 FALSE NA NA AAGAAA -40 NA NA NA 6 NA PB.361.16 chr1 - 874 3 incomplete-splice_match DDOST ENST00000602624.7 1941 11 8438 66 153 -66 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAATATAAATAAATAAATAA 8592 FALSE NA NA GATAAA -1 NA NA NA 5 NA PB.361.19 chr1 - 1569 11 full-splice_match DDOST ENST00000602624.7 1941 11 -39 411 -20 -411 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 1146 272.670868 2.435639 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AATTGCTAAAAGTGGCATTT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 1146 NA PB.361.20 chr1 - 1663 11 full-splice_match DDOST ENST00000415136.6 2126 11 49 414 49 -404 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 103 24.507069 1.389291 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGTGGCATTTTTCCTAT 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 103 NA PB.361.21 chr1 - 1590 11 novel_not_in_catalog DDOST novel 2126 11 NA NA -20 -411 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AATTGCTAAAAGTGGCATTT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.361.22 chr1 - 1339 10 incomplete-splice_match DDOST ENST00000602624.7 1941 11 396 411 396 -411 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 30 7.137981 0.853575 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AATTGCTAAAAGTGGCATTT 550 FALSE NA NA AAGAAA -21 NA NA NA 30 NA PB.361.23 chr1 - 1238 9 incomplete-splice_match DDOST ENST00000602624.7 1941 11 5190 411 -3095 -411 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 21 4.996587 0.698673 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AATTGCTAAAAGTGGCATTT 5344 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 21 NA PB.361.24 chr1 - 1112 8 incomplete-splice_match DDOST ENST00000602624.7 1941 11 5637 411 -2648 -411 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 32 7.613847 0.881604 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AATTGCTAAAAGTGGCATTT 5791 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 32 NA PB.361.25 chr1 - 1007 7 incomplete-splice_match DDOST ENST00000602624.7 1941 11 5883 411 -2402 -411 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AATTGCTAAAAGTGGCATTT 6037 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.361.26 chr1 - 850 5 incomplete-splice_match DDOST ENST00000602624.7 1941 11 7014 411 -1271 -411 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.617260 0.417847 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AATTGCTAAAAGTGGCATTT 7168 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.361.27 chr1 - 698 4 incomplete-splice_match DDOST ENST00000602624.7 1941 11 7614 411 -671 -411 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AATTGCTAAAAGTGGCATTT 7768 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.364.2 chr1 - 3167 8 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 4037 -5 4037 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGAACCGTAGCTTATATTTA 9575 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.364.3 chr1 - 1778 10 novel_in_catalog HP1BP3 novel 4822 9 NA NA 1480 2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGAACCGTAGCTTATATTTA 7018 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.364.4 chr1 - 4347 13 novel_in_catalog HP1BP3 novel 3884 13 NA NA 1 1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CTGAACCGTAGCTTATATTT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.364.6 chr1 - 4007 13 novel_in_catalog HP1BP3 novel 3884 13 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GCTGAACCGTAGCTTATATT 12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.364.7 chr1 - 3272 8 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 3930 -3 3930 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GCTGAACCGTAGCTTATATT 9468 FALSE NA NA ATTAAA -34 NA NA NA 4 NA PB.364.11 chr1 - 3795 12 novel_in_catalog HP1BP3 novel 6406 13 NA NA 1 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 23 5.472452 0.738182 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TGCTGAACCGTAGCTTATAT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 23 NA PB.364.14 chr1 - 3985 13 full-splice_match HP1BP3 ENST00000438032.6 6406 13 1 2420 1 -4 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 27 6.424183 0.807818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAGCTGCTGAACCGTAGC 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 27 NA PB.364.15 chr1 - 3108 7 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 7352 4 7352 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAGCTGCTGAACCGTAGC 8355 FALSE NA NA AGTAAA -30 NA NA NA 3 NA PB.364.16 chr1 - 2586 3 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 27396 4 2138 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAGCTGCTGAACCGTAGC 2255 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.364.17 chr1 - 2456 2 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 29413 4 4155 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAGCTGCTGAACCGTAGC 4272 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.364.21 chr1 - 3893 13 full-splice_match HP1BP3 ENST00000312239.10 3884 13 -17 8 -3 -5 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAAGCTGCTGAACCGTAG -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.364.22 chr1 - 3500 10 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000312239.10 3884 13 9978 8 -70 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAAGCTGCTGAACCGTAG 9978 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.364.24 chr1 - 3892 13 novel_in_catalog HP1BP3 novel 3884 13 NA NA 0 1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAGAAAAGGAA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.364.25 chr1 - 3518 13 novel_not_in_catalog HP1BP3 novel 3884 13 NA NA 5 1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAGAAAAGGAA -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.364.26 chr1 - 2406 4 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 25061 452 -197 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAGAAAAGGAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.364.28 chr1 - 3562 13 novel_in_catalog HP1BP3 novel 3884 13 NA NA 1 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.044856 0.606903 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAAAAAAAGAAAAGGA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.364.29 chr1 - 2742 8 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 4004 453 4004 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAAAAAAAGAAAAGGA 9542 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.364.30 chr1 - 2591 6 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 9472 453 9472 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAAAAAAAGAAAAGGA 9455 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.364.31 chr1 - 2453 5 novel_in_catalog HP1BP3 novel 6406 13 NA NA 3 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAAAAAAAGAAAAGGA 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.364.32 chr1 - 1976 14 novel_in_catalog HP1BP3 novel 6406 13 NA NA -3 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAAAAAAAGAAAAGGA -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.364.33 chr1 - 2033 2 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 29387 453 4129 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAAAAAAAGAAAAGGA 4246 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.364.36 chr1 - 3640 9 full-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 727 455 727 -2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 ATTAAAAAAAAAAAGAAAAG 6265 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.364.37 chr1 - 3530 13 full-splice_match HP1BP3 ENST00000438032.6 6406 13 5 2871 5 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 44 10.469039 1.019907 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 ATTAAAAAAAAAAAGAAAAG 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 44 NA PB.364.38 chr1 - 3339 12 novel_in_catalog HP1BP3 novel 6406 13 NA NA 0 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 79 18.796684 1.274081 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 ATTAAAAAAAAAAAGAAAAG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 79 NA PB.364.39 chr1 - 3227 11 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000312239.10 3884 13 6740 458 629 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 ATTAAAAAAAAAAAGAAAAG 7395 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 6 NA PB.364.41 chr1 - 2981 9 full-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 1386 455 1386 -2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 ATTAAAAAAAAAAAGAAAAG 6924 FALSE NA NA TATAAA -4 NA NA NA 5 NA PB.364.42 chr1 - 2171 3 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 27360 455 2102 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 ATTAAAAAAAAAAAGAAAAG 2219 FALSE NA NA AATGAA -16 NA NA NA 9 NA PB.364.48 chr1 - 3421 12 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000312239.10 3884 13 6111 460 0 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 ATATTAAAAAAAAAAAGAAA 2 TRUE NA NA ACTAAA -2 NA NA NA 8 NA PB.364.49 chr1 - 2374 5 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 17805 457 -6949 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 ATATTAAAAAAAAAAAGAAA 8285 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.364.50 chr1 - 3949 9 full-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 414 459 414 -6 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AGATATTAAAAAAAAAAAGA 5952 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.364.51 chr1 - 3813 14 novel_not_in_catalog HP1BP3 novel 6406 13 NA NA 0 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AGATATTAAAAAAAAAAAGA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.364.53 chr1 - 3380 12 novel_in_catalog HP1BP3 novel 6406 13 NA NA 0 -76 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTTGTGGGTTTTTTTCCCC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.364.56 chr1 - 1235 8 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 4010 1954 4010 956 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTTTAGGTGCTTTTATTGGT 9548 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.364.57 chr1 - 2065 13 novel_in_catalog HP1BP3 novel 3884 13 NA NA -6 953 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAGCTTTAGGTGCTTTTATT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.364.58 chr1 - 2030 13 full-splice_match HP1BP3 ENST00000438032.6 6406 13 3 4373 3 953 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.044856 0.606903 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAGCTTTAGGTGCTTTTATT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.364.59 chr1 - 1837 12 novel_in_catalog HP1BP3 novel 6406 13 NA NA 0 953 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.520721 0.655208 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAGCTTTAGGTGCTTTTATT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.364.60 chr1 - 2109 12 novel_in_catalog HP1BP3 novel 6406 13 NA NA 0 950 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGCTAGCTTTAGGTGCTTTT 12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.364.61 chr1 - 1668 11 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000312239.10 3884 13 6791 1966 680 947 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTTGCTAGCTTTAGGTGCT 7446 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.364.62 chr1 - 1882 13 full-splice_match HP1BP3 ENST00000438032.6 6406 13 -16 4540 0 786 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAAGTAAATTTTATAGGA -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.364.63 chr1 - 1678 12 novel_in_catalog HP1BP3 novel 6406 13 NA NA -3 786 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAAGTAAATTTTATAGGA -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.364.64 chr1 - 1911 6 novel_not_in_catalog HP1BP3 novel 970 8 NA NA 1464 3143 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTTCTAGTCTGGATGTCTTT 7002 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.364.65 chr1 - 2565 10 novel_not_in_catalog HP1BP3 novel 970 8 NA NA 3 3142 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTTTCTAGTCTGGATGTCTT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.364.66 chr1 - 2263 9 novel_not_in_catalog HP1BP3 novel 970 8 NA NA -12 3142 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTTTCTAGTCTGGATGTCTT -26 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.364.68 chr1 - 2541 10 novel_not_in_catalog HP1BP3 novel 970 8 NA NA 0 3141 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTTTCTAGTCTGGATGTCT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.364.69 chr1 - 2345 9 novel_not_in_catalog HP1BP3 novel 970 8 NA NA 0 3141 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTTTCTAGTCTGGATGTCT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.364.73 chr1 - 2900 10 novel_not_in_catalog HP1BP3 novel 970 8 NA NA -6 3140 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGTTTCTAGTCTGGATGTC -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.364.76 chr1 - 2427 9 novel_not_in_catalog HP1BP3 novel 970 8 NA NA 0 3139 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTTGTTTCTAGTCTGGATGT 2 TRUE NA NA ACTAAA -2 NA NA NA 6 NA PB.364.77 chr1 - 1527 9 novel_not_in_catalog HP1BP3 novel 970 8 NA NA 0 2323 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TACGTTTTAAGAGTTTTATA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.364.78 chr1 - 1370 9 novel_not_in_catalog HP1BP3 novel 970 8 NA NA -3 2158 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAGTCTCATCAGATTTTTT -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.364.79 chr1 - 1251 8 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000438032.6 6406 13 -16 24979 0 -8046 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TATTTTTTTGCCCCATTATG -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.364.80 chr1 - 3565 4 novel_in_catalog HP1BP3 novel 6406 13 NA NA 0 -8 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAGAAAAGGAGAAGAAAGT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.364.81 chr1 - 850 6 novel_not_in_catalog HP1BP3 novel 6406 13 NA NA 10 -9 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 TAAAGAAAAGGAGAAGAAAG 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.364.82 chr1 - 2872 5 novel_in_catalog HP1BP3 novel 928 5 NA NA 0 -110 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCCTCCCTGGTCTTTTCC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.364.84 chr1 - 2054 4 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000417710.5 572 5 -375 1879 -6 -16 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAACAAAGACACAAGCCG -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.364.85 chr1 - 1702 4 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000438032.6 6406 13 -8 35200 -3 -16 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAACAAAGACACAAGCCG -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.364.86 chr1 - 1498 3 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000424732.5 970 8 5 18267 0 -16 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAACAAAGACACAAGCCG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.364.87 chr1 - 1827 4 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000417710.5 572 5 -368 2099 1 -31 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAATATAATATAAAAGAT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.364.88 chr1 - 1502 4 novel_in_catalog HP1BP3 novel 928 5 NA NA -2 -31 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAATATAATATAAAAGAT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.364.89 chr1 - 1474 4 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000438032.6 6406 13 0 35420 0 -31 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 20 4.758654 0.677484 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAATATAATATAAAAGAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 20 NA PB.364.90 chr1 - 1278 3 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000424732.5 970 8 5 18487 0 -31 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.855192 0.455635 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAATATAATATAAAAGAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.364.91 chr1 - 895 5 full-splice_match HP1BP3 ENST00000375000.5 928 5 2 31 2 -31 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAATATAATATAAAAGAT 14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.364.92 chr1 - 883 5 novel_in_catalog HP1BP3 novel 928 5 NA NA 0 -31 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.093125 0.490398 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAATATAATATAAAAGAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.364.94 chr1 - 1230 5 novel_in_catalog HP1BP3 novel 928 5 NA NA 1 -32 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 TAAAAATATAATATAAAAGA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.365.1 chr1 + 2635 8 full-splice_match PINK1 ENST00000321556.5 2657 8 20 2 20 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GAGCTGTTCTAGTTTTCTCT 3 TRUE NA NA AGTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.365.2 chr1 + 2442 8 full-splice_match PINK1 ENST00000321556.5 2657 8 20 195 20 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 31 7.375914 0.867816 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATGACGTATGTGCCTTGA 3 TRUE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 31 NA PB.365.3 chr1 + 1861 8 full-splice_match PINK1 ENST00000321556.5 2657 8 23 773 23 -578 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.855192 0.455635 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTGTCGTGATGGTCTGTGA 6 TRUE NA NA ACTAAA -17 NA NA NA 12 NA PB.365.4 chr1 + 2259 8 full-splice_match PINK1 ENST00000321556.5 2657 8 203 195 203 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATGACGTATGTGCCTTGA 149 FALSE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.365.5 chr1 + 2013 8 full-splice_match PINK1 ENST00000321556.5 2657 8 449 195 449 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATGACGTATGTGCCTTGA 395 FALSE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 5 NA PB.365.6 chr1 + 1364 7 incomplete-splice_match PINK1 ENST00000321556.5 2657 8 4425 774 -246 -579 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTGTGTCGTGATGGTCTGTG 4371 FALSE NA NA ACTAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.365.7 chr1 + 1900 7 incomplete-splice_match PINK1 ENST00000321556.5 2657 8 4468 195 -203 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATGACGTATGTGCCTTGA 4414 FALSE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 6 NA PB.365.8 chr1 + 1689 6 incomplete-splice_match PINK1 ENST00000321556.5 2657 8 6441 195 1770 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATGACGTATGTGCCTTGA 6387 FALSE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.365.9 chr1 + 1091 6 incomplete-splice_match PINK1 ENST00000321556.5 2657 8 6461 773 1790 -578 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTGTCGTGATGGTCTGTGA 6407 FALSE NA NA ACTAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.365.10 chr1 + 1597 5 incomplete-splice_match PINK1 ENST00000321556.5 2657 8 11030 195 -1020 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATGACGTATGTGCCTTGA NA FALSE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.365.11 chr1 + 1310 4 full-splice_match PINK1 ENST00000400490.2 1658 4 154 194 154 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATGACGTATGTGCCTTGA NA FALSE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.365.12 chr1 + 1410 3 incomplete-splice_match PINK1 ENST00000400490.2 1658 4 3029 0 3029 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTGTTCTAGTTTTCTCTT NA FALSE NA NA AGTAAA -16 NA NA NA 4 NA PB.365.13 chr1 + 1150 3 incomplete-splice_match PINK1 ENST00000400490.2 1658 4 3095 194 3095 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATGACGTATGTGCCTTGA NA FALSE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.365.14 chr1 + 923 2 incomplete-splice_match PINK1 ENST00000400490.2 1658 4 3684 194 3684 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATGACGTATGTGCCTTGA NA FALSE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.366.1 chr1 - 2059 10 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681717.1 5993 34 199624 -5 -58 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAGAAAGTAAAGTGACTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.366.5 chr1 - 2808 16 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681717.1 5993 34 186326 92 -13356 -92 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAATATTTAAAAAAACA NA FALSE NA NA AATAAA -44 NA NA NA 2 NA PB.366.7 chr1 - 3942 24 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681767.1 5884 33 109083 529 -383 8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAAAAAAAAGTTGAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.366.8 chr1 - 2853 19 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681717.1 5993 34 164701 529 -34981 8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAAAAAAAAGTTGAGA 105 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.366.9 chr1 - 2442 16 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681717.1 5993 34 186255 529 -13427 8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAAAAAAAAGTTGAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.366.10 chr1 - 2045 14 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681717.1 5993 34 190505 529 -9177 8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAAAAAAAAGTTGAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.366.11 chr1 - 1660 10 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681717.1 5993 34 199489 529 -193 8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAAAAAAAAGTTGAGA NA FALSE NA NA AAAACA -18 NA NA NA 4 NA PB.366.12 chr1 - 1345 9 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681717.1 5993 34 201517 543 1835 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAATGTTTAGCAAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.366.13 chr1 - 2702 18 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681717.1 5993 34 171517 544 -28165 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAATGTTTAGCAAAAA 6921 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.366.14 chr1 - 2584 17 novel_in_catalog EIF4G3 novel 5793 31 NA NA -28194 -7 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAATGTTTAGCAAAAA 6892 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.366.15 chr1 - 2268 16 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681717.1 5993 34 186414 544 -13268 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAATGTTTAGCAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.366.16 chr1 - 1862 12 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681717.1 5993 34 195891 544 -3791 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAATGTTTAGCAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.366.17 chr1 - 1503 10 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681717.1 5993 34 199631 544 -51 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.093125 0.490398 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAATGTTTAGCAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.366.18 chr1 - 1159 7 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000435383.2 1597 11 21989 7 21989 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAATGTTTAGCAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.366.19 chr1 - 987 6 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000435383.2 1597 11 23608 8 23608 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 TAAAAAAATGTTTAGCAAAA NA FALSE NA NA AGTAAA -28 NA NA NA 2 NA PB.366.20 chr1 - 2959 22 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681767.1 5884 33 151236 817 41684 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAATGAAACAAAAGAAACA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.366.21 chr1 - 2283 17 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681717.1 5993 34 185723 817 -13959 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAATGAAACAAAAGAAACA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.366.22 chr1 - 2069 16 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681717.1 5993 34 186340 817 -13342 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAATGAAACAAAAGAAACA NA FALSE NA NA AATAAA -30 NA NA NA 2 NA PB.366.23 chr1 - 1962 16 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681717.1 5993 34 186447 817 -13235 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAATGAAACAAAAGAAACA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.366.24 chr1 - 1314 10 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681717.1 5993 34 199547 817 -135 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAATGAAACAAAAGAAACA NA FALSE NA NA GGGGCT -8 NA NA NA 3 NA PB.366.31 chr1 - 1379 9 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681767.1 5884 33 145976 55812 36424 30811 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAATTGTGAAAGAAAGAAA NA FALSE NA NA AATACA -44 NA NA NA 2 NA PB.366.32 chr1 - 1014 7 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681767.1 5884 33 155472 55815 -44210 30808 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 GAGAAAATTGTGAAAGAAAG NA FALSE NA NA AATATA -11 NA NA NA 4 NA PB.369.1 chr1 - 2295 1 full-splice_match RPS15AP6 ENST00000420703.1 385 1 -1552 -358 -1552 358 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA NA NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TGAAAAAAAAAAAAAAAAAA 7656 FALSE NA NA AATAGA -14 NA NA NA 2 NA PB.378.1 chr1 - 5053 19 full-splice_match ECE1 ENST00000374893.11 5067 19 14 0 14 0 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GGCCATGTGTCTGGGTGTCT -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.378.2 chr1 - 3644 9 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 41401 -1334 202 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GGCCATGTGTCTGGGTGTCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.378.3 chr1 - 3487 7 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 43665 -1334 2466 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GGCCATGTGTCTGGGTGTCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.378.4 chr1 - 3171 3 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 54107 -1334 -3361 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GGCCATGTGTCTGGGTGTCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.378.5 chr1 - 3018 3 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 54260 -1334 -3208 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GGCCATGTGTCTGGGTGTCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.378.12 chr1 - 3382 6 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 45956 -1332 4757 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGGGCCATGTGTCTGGGTGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.378.15 chr1 - 5093 19 full-splice_match ECE1 ENST00000415912.6 5099 19 0 6 0 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GAGGGCCATGTGTCTGGGTG -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.378.16 chr1 - 4920 18 full-splice_match ECE1 ENST00000264205.10 2381 18 145 -2684 145 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GAGGGCCATGTGTCTGGGTG 8890 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.378.19 chr1 - 5111 18 full-splice_match ECE1 ENST00000264205.10 2381 18 -47 -2683 -47 -4 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGAGGGCCATGTGTCTGGGT 8698 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.378.20 chr1 - 5481 19 full-splice_match ECE1 ENST00000415912.6 5099 19 -389 7 -321 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGAGGGCCATGTGTCTGGGT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.378.21 chr1 - 4271 14 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 20838 -1330 -1994 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGAGGGCCATGTGTCTGGGT 3220 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.378.25 chr1 - 3760 19 full-splice_match ECE1 ENST00000415912.6 5099 19 -19 1358 -19 -21 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAGAAAAGAGAAAC -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.378.26 chr1 - 3743 18 full-splice_match ECE1 ENST00000264205.10 2381 18 -30 -1332 -30 -21 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAGAAAAGAGAAAC 8715 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.378.28 chr1 - 3070 15 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 19257 21 -3575 -21 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAGAAAAGAGAAAC 1639 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.378.29 chr1 - 1814 3 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 54109 21 -3359 -21 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAGAAAAGAGAAAC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.378.32 chr1 - 2388 16 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 6702 952 6702 278 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGAATTGGTATATTTATT 6839 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.378.33 chr1 - 1624 11 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 32274 952 -8925 278 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGAATTGGTATATTTATT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.378.34 chr1 - 1490 10 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 34525 952 -6674 278 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGAATTGGTATATTTATT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.378.35 chr1 - 1145 6 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 45909 952 4710 278 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGAATTGGTATATTTATT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.378.36 chr1 - 801 3 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 54191 952 -3277 278 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGAATTGGTATATTTATT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.378.37 chr1 - 2815 19 full-splice_match ECE1 ENST00000415912.6 5099 19 -6 2290 -6 277 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.331058 0.522582 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 GAAAGAATTGGTATATTTAT 385 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.378.38 chr1 - 2786 18 full-splice_match ECE1 ENST00000264205.10 2381 18 -5 -400 -5 277 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 GAAAGAATTGGTATATTTAT 8740 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.378.39 chr1 - 2746 19 full-splice_match ECE1 ENST00000374893.11 5067 19 31 2290 31 274 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGGAAAGAATTGGTATATT 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.380.1 chr1 + 4384 19 novel_not_in_catalog NBPF3 novel 4401 18 NA NA 0 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTCTGGACTGTTGGATTGT 11 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.380.2 chr1 + 3560 14 full-splice_match NBPF3 ENST00000454000.6 2133 14 5 -1432 2 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTCTGGACTGTTGGATTGT 13 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.380.3 chr1 + 4295 18 full-splice_match NBPF3 ENST00000318220.10 4401 18 0 106 0 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTCTGGACTGTTGGATTGT 17 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 5 NA PB.380.4 chr1 + 2735 3 novel_not_in_catalog NBPF3 novel 3767 15 NA NA 0 2800 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGTAACTTCTAAATACATG 17 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.380.7 chr1 + 770 5 novel_not_in_catalog NBPF3 novel 4401 18 NA NA 0 -1766 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 GAAAATACATTTACTTAAAG 17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.380.8 chr1 + 4067 18 novel_in_catalog NBPF3 novel 4401 18 NA NA 15 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTCTGGACTGTTGGATTGT 8 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.380.11 chr1 + 3320 14 full-splice_match NBPF3 ENST00000619554.1 1831 14 -3 -1486 -3 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CACTCTGGACTGTTGGATTG 90 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.381.1 chr1 - 2027 4 novel_not_in_catalog NBPF2P novel 661 5 NA NA 900 1517 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTCTGGACTGTTGGATTGT NA FALSE NA NA AATAAA -35 NA NA NA 2 NA PB.382.3 chr1 - 3334 25 full-splice_match RAP1GAP ENST00000495204.5 2489 25 -60 -785 7 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACCCAGAGTTGGGCCTGGC 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.382.4 chr1 - 2062 11 incomplete-splice_match RAP1GAP ENST00000374761.6 3318 23 12929 2 10402 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACCCAGAGTTGGGCCTGGC 7837 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.382.5 chr1 - 1313 5 incomplete-splice_match RAP1GAP ENST00000374763.6 3334 23 20524 5 20524 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTGTACCCAGAGTTGGGCCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.383.1 chr1 + 2569 12 full-splice_match ALPL ENST00000374840.8 2536 12 -38 5 -12 -5 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.282789 0.631727 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGACAGAGCTGAGTCTTT 406 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 18 NA PB.383.2 chr1 + 2420 11 novel_in_catalog ALPL novel 2536 12 NA NA 2 -5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGACAGAGCTGAGTCTTT 420 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 7 NA PB.383.3 chr1 + 2442 11 incomplete-splice_match ALPL ENST00000374832.5 2193 12 2697 -397 2697 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGAGCTGAGTCTTTGTGG 2698 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.383.4 chr1 + 2037 8 incomplete-splice_match ALPL ENST00000374832.5 2193 12 11829 -393 -7195 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGACAGAGCTGAGTCTTT 1422 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.383.5 chr1 + 1622 6 incomplete-splice_match ALPL ENST00000374832.5 2193 12 16893 -399 -2131 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGAGCTGAGTCTTTGTGGTC 34 FALSE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 3 NA PB.383.6 chr1 + 1461 4 incomplete-splice_match ALPL ENST00000374832.5 2193 12 22385 -383 -814 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAATATTTCCGAGGACAGAG -27 TRUE NA NA AATAAA -8 NA NA NA 4 NA PB.383.7 chr1 + 1336 3 incomplete-splice_match ALPL ENST00000374829.2 1595 4 1254 -6 1254 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGACAGAGCTGAGTCTTT -3 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 9 NA PB.383.8 chr1 + 1177 3 incomplete-splice_match ALPL ENST00000374829.2 1595 4 1414 -7 1414 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGGACAGAGCTGAGTCTTTG 15 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.384.1 chr1 - 2244 17 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 54509 604 -2070 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CCTAAGTGTGGAAAAGTGTC NA FALSE NA NA AATACA -22 NA NA NA 3 NA PB.384.2 chr1 - 1702 13 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 67719 604 5716 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CCTAAGTGTGGAAAAGTGTC 9655 FALSE NA NA AATACA -6 NA NA NA 5 NA PB.384.3 chr1 - 1537 11 incomplete-splice_match USP48 ENST00000529637.5 3228 27 76400 -465 -1976 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CCTAAGTGTGGAAAAGTGTC NA FALSE NA NA AATGAA -38 NA NA NA 4 NA PB.384.4 chr1 - 1328 9 incomplete-splice_match USP48 ENST00000529637.5 3228 27 77176 -465 -1200 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CCTAAGTGTGGAAAAGTGTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.384.5 chr1 - 3536 27 full-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 278 605 72 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TCCTAAGTGTGGAAAAGTGT 330 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.384.6 chr1 - 2149 16 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 59077 605 1047 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TCCTAAGTGTGGAAAAGTGT 1013 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.384.7 chr1 - 829 5 incomplete-splice_match USP48 ENST00000529637.5 3228 27 87836 -464 9460 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TCCTAAGTGTGGAAAAGTGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.384.8 chr1 - 3784 27 full-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 29 606 29 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GTCCTAAGTGTGGAAAAGTG 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.384.9 chr1 - 1795 14 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 62046 606 43 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GTCCTAAGTGTGGAAAAGTG 3982 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.384.10 chr1 - 1131 8 incomplete-splice_match USP48 ENST00000529637.5 3228 27 78705 -463 329 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GTCCTAAGTGTGGAAAAGTG 1479 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.384.11 chr1 - 1408 13 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 67694 923 5691 -22 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GAAGGAAATGTTTCCAATTT 9630 FALSE NA NA AATACA -31 NA NA NA 2 NA PB.384.12 chr1 - 3409 27 novel_in_catalog USP48 novel 4419 27 NA NA -79 -27 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GACTTGAAGGAAATGTTTCC 20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.384.13 chr1 - 1518 14 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 62000 929 -3 -28 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGACTTGAAGGAAATGTTTC 3936 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.384.14 chr1 - 1190 11 incomplete-splice_match USP48 ENST00000529637.5 3228 27 76418 -136 -1958 -32 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 CATCAGACTTGAAGGAAATG NA FALSE NA NA AATGAA -20 NA NA NA 8 NA PB.384.15 chr1 - 3485 27 full-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 0 934 0 -33 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 ACATCAGACTTGAAGGAAAT 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.384.16 chr1 - 2206 19 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 46620 934 -3693 -33 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 ACATCAGACTTGAAGGAAAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.384.17 chr1 - 3260 26 novel_in_catalog USP48 novel 4419 27 NA NA 23 -37 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATGGACATCAGACTTGAAGG -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.384.19 chr1 - 2220 16 novel_in_catalog USP48 novel 4309 26 NA NA 57 8380 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GTACTGAACGCTACTGACAT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.384.21 chr1 - 2103 14 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 -17 42738 -17 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 209 49.727936 1.696600 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 209 NA PB.384.22 chr1 - 1961 14 novel_not_in_catalog USP48 novel 4309 26 NA NA 44 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.384.23 chr1 - 1964 14 novel_in_catalog USP48 novel 4309 26 NA NA -39 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 26 6.186250 0.791427 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 26 NA PB.384.24 chr1 - 1925 13 novel_in_catalog USP48 novel 4309 26 NA NA 9 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT 15 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.384.25 chr1 - 1883 13 novel_in_catalog USP48 novel 4309 26 NA NA 23 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.384.26 chr1 - 1869 13 novel_in_catalog USP48 novel 4309 26 NA NA 19 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.384.27 chr1 - 1847 14 novel_in_catalog USP48 novel 4309 26 NA NA 30 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT 288 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.384.28 chr1 - 1747 13 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 25379 42738 -9579 0 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT NA FALSE NA NA TTTAAA -5 NA NA NA 4 NA PB.384.29 chr1 - 1700 3 incomplete-splice_match USP48 ENST00000374732.7 3037 15 -235 42133 -235 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT NA FALSE NA NA TATAAA -37 NA NA NA 2 NA PB.384.30 chr1 - 1548 12 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 26538 42738 -8420 0 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT NA FALSE NA NA AAGAAA -11 NA NA NA 8 NA PB.384.31 chr1 - 1416 3 incomplete-splice_match USP48 ENST00000487880.2 524 4 1503 0 52 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT 18 FALSE NA NA AGTAAA -10 NA NA NA 5 NA PB.384.32 chr1 - 1331 10 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 30521 42738 -4437 0 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT 3845 FALSE NA NA AAGAAA -1 NA NA NA 10 NA PB.384.33 chr1 - 1329 9 novel_not_in_catalog USP48 novel 4309 26 NA NA 14 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT 22 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.384.34 chr1 - 1185 9 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 31578 42738 -3380 0 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT 4902 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.384.35 chr1 - 1056 3 incomplete-splice_match USP48 ENST00000487880.2 524 4 1863 0 412 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT 378 FALSE NA NA AAGAAA -29 NA NA NA 2 NA PB.384.36 chr1 - 1082 8 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 34916 42738 -42 0 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT 8240 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.384.37 chr1 - 928 7 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 36058 42738 1100 0 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT 9382 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.384.38 chr1 - 767 6 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 46660 42738 -3653 0 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT NA FALSE NA NA ATTAAA -28 NA NA NA 7 NA PB.384.39 chr1 - 1619 7 incomplete-splice_match USP48 ENST00000421625.6 2818 11 30963 2 -4452 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTGTACTTGTGGTTTGTC 3830 FALSE NA NA AAGAAA -16 NA NA NA 4 NA PB.384.40 chr1 - 1040 3 incomplete-splice_match USP48 ENST00000421625.6 2818 11 47117 2 -3653 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTGTACTTGTGGTTTGTC NA FALSE NA NA ATTAAA -28 NA NA NA 2 NA PB.384.41 chr1 - 2352 11 full-splice_match USP48 ENST00000421625.6 2818 11 463 3 6 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 46 10.944904 1.039212 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAATTGTACTTGTGGTTTGT 14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 46 NA PB.384.42 chr1 - 2235 11 incomplete-splice_match USP48 ENST00000529637.5 3228 27 -39 48488 -39 -4 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATAATTGTACTTGTGGTTTG -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.384.43 chr1 - 1912 9 incomplete-splice_match USP48 ENST00000421625.6 2818 11 26902 4 -8513 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATAATTGTACTTGTGGTTTG NA FALSE NA NA TATAAA -23 NA NA NA 2 NA PB.384.44 chr1 - 1333 5 incomplete-splice_match USP48 ENST00000529637.5 3228 27 34775 48488 -25 -4 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATAATTGTACTTGTGGTTTG 8257 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.384.45 chr1 - 1862 11 full-splice_match USP48 ENST00000421625.6 2818 11 480 476 23 285 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCTGCATCCATGAGTATT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.384.48 chr1 - 1313 9 incomplete-splice_match USP48 ENST00000421625.6 2818 11 457 8645 0 -7884 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.617260 0.417847 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AGAAAAGATGGAGGGGAAGA 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.384.49 chr1 - 1053 3 incomplete-splice_match USP48 ENST00000532737.1 680 5 -384 3523 -4 903 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGAAGAAAAAGGTGGGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.385.4 chr1 - 3515 20 incomplete-splice_match HSPG2 ENST00000374695.8 14341 97 103396 2 -337 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGGGGCCTCCTGAGTCTTT 2929 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.385.5 chr1 - 2913 16 incomplete-splice_match HSPG2 ENST00000374695.8 14341 97 105640 2 -957 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGGGGCCTCCTGAGTCTTT 5173 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.385.6 chr1 - 2838 15 incomplete-splice_match HSPG2 ENST00000374695.8 14341 97 105804 2 -793 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGGGGCCTCCTGAGTCTTT 5337 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.385.7 chr1 - 2673 13 incomplete-splice_match HSPG2 ENST00000374695.8 14341 97 106231 2 -366 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGGGGCCTCCTGAGTCTTT 5764 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.385.8 chr1 - 2495 12 incomplete-splice_match HSPG2 ENST00000374695.8 14341 97 107299 2 702 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGGGGCCTCCTGAGTCTTT 6832 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.385.9 chr1 - 2257 10 incomplete-splice_match HSPG2 ENST00000486901.1 3586 11 1631 1 1631 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGGGGCCTCCTGAGTCTTT 7761 FALSE NA NA GGGGCT -6 NA NA NA 3 NA PB.385.10 chr1 - 1891 9 incomplete-splice_match HSPG2 ENST00000486901.1 3586 11 2405 1 2405 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.617260 0.417847 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGGGGCCTCCTGAGTCTTT 8535 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.385.11 chr1 - 1506 2 full-splice_match HSPG2 ENST00000481644.1 839 2 388 -1055 388 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGGGGCCTCCTGAGTCTTT 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.385.12 chr1 - 1371 3 incomplete-splice_match HSPG2 ENST00000486901.1 3586 11 6569 1 122 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.617260 0.417847 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGGGGCCTCCTGAGTCTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.385.16 chr1 - 3759 21 incomplete-splice_match HSPG2 ENST00000374695.8 14341 97 102398 3 -1335 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CCAGGGGCCTCCTGAGTCTT 1931 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.385.17 chr1 - 2075 10 incomplete-splice_match HSPG2 ENST00000486901.1 3586 11 1812 2 1812 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CCAGGGGCCTCCTGAGTCTT 7942 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.385.18 chr1 - 1671 13 incomplete-splice_match HSPG2 ENST00000374695.8 14341 97 106251 984 -346 73 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAGAAACCGAGGCGATGCC 5784 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.387.5 chr1 + 1071 2 full-splice_match LINC00339 ENST00000416769.2 1077 2 0 6 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAAATATGTGCTGTGGTG 6 TRUE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 8 NA PB.387.8 chr1 + 833 1 full-splice_match ENSG00000285794 ENST00000642137.1 222 1 -142 -469 -142 469 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA NA NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAAATATGTGCTGTGGTG 4829 FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 4 NA PB.388.1 chr1 + 839 6 full-splice_match CDC42 ENST00000315554.13 1435 6 -82 678 0 119 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTCTGCGTCTTTTTACTCAC NA FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.388.2 chr1 + 1018 6 full-splice_match CDC42 ENST00000656825.1 10503 6 -38 9523 3 261 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 694 165.125305 2.217814 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GTGGATGACTCTGTAACAGA -4 TRUE NA NA TTTAAA -15 NA NA NA 694 NA PB.388.3 chr1 + 2107 6 full-splice_match CDC42 ENST00000656825.1 10503 6 -22 8418 19 -4 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 374 88.986832 1.949326 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACAAGCCAGCCTGAGGGTTG -18 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 374 NA PB.388.4 chr1 + 1695 7 full-splice_match CDC42 ENST00000344548.7 2256 7 28 533 -11 -510 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTCATTGTCTTATATGCTT -9 TRUE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 5 NA PB.388.5 chr1 + 1567 6 full-splice_match CDC42 ENST00000656825.1 10503 6 -11 8947 -9 -510 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 94 22.365675 1.349582 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTCATTGTCTTATATGCTT -7 TRUE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 94 NA PB.388.9 chr1 + 1422 6 full-splice_match CDC42 ENST00000315554.13 1435 6 8 5 0 -5 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATAAATGCCTGATGAAGCTT 12 TRUE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 9 NA PB.388.10 chr1 + 751 6 full-splice_match CDC42 ENST00000656825.1 10503 6 8 9744 0 40 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 63 14.989760 1.175795 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AATAATGACAAATGCCCTGC 12 TRUE NA NA ATTAAA -20 NA NA NA 63 NA PB.388.12 chr1 + 874 7 full-splice_match CDC42 ENST00000344548.7 2256 7 52 1330 3 40 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AATAATGACAAATGCCCTGC 15 TRUE NA NA ATTAAA -20 NA NA NA 5 NA PB.388.13 chr1 + 2199 7 full-splice_match CDC42 ENST00000344548.7 2256 7 53 4 4 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACAAGCCAGCCTGAGGGTTG 16 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 10 NA PB.388.14 chr1 + 1867 6 full-splice_match CDC42 ENST00000656825.1 10503 6 12 8624 4 -187 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 21 4.996587 0.698673 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATGCAGACTCTTCTTAAGT 16 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 21 NA PB.388.15 chr1 + 2177 6 full-splice_match CDC42 ENST00000400259.5 2274 6 118 -21 28 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCCAGCCTGAGGGTTGTT 16 FALSE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.388.18 chr1 + 1986 5 incomplete-splice_match CDC42 ENST00000344548.7 2256 7 25828 2 25010 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCCAGCCTGAGGGTTGTT NA FALSE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 9 NA PB.388.20 chr1 + 1416 5 incomplete-splice_match CDC42 ENST00000662562.1 1645 7 25048 -836 25048 -511 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAGTCATTGTCTTATATGCT NA FALSE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.388.22 chr1 + 1787 3 incomplete-splice_match CDC42 ENST00000344548.7 2256 7 33807 4 32989 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACAAGCCAGCCTGAGGGTTG 2113 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 10 NA PB.388.23 chr1 + 1207 3 incomplete-splice_match CDC42 ENST00000662562.1 1645 7 33040 -837 33040 -510 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTCATTGTCTTATATGCTT 2164 FALSE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 7 NA PB.388.24 chr1 + 1643 2 incomplete-splice_match CDC42 ENST00000344548.7 2256 7 34071 4 33253 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACAAGCCAGCCTGAGGGTTG 2377 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 9 NA PB.388.25 chr1 + 1008 2 incomplete-splice_match CDC42 ENST00000662562.1 1645 7 33359 -837 33359 -510 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTCATTGTCTTATATGCTT 2483 FALSE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 6 NA PB.391.1 chr1 + 3588 8 incomplete-splice_match ZBTB40 ENST00000375647.5 8701 18 59984 2729 59968 -2729 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAGAAAAAACAAACAAC 1691 FALSE NA NA AAAACA -42 NA NA NA 2 NA PB.391.2 chr1 + 2338 2 incomplete-splice_match ZBTB40 ENST00000375647.5 8701 18 72480 2729 72464 -2729 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAGAAAAAACAAACAAC NA FALSE NA NA AAAACA -42 NA NA NA 5 NA PB.393.1 chr1 + 2535 14 incomplete-splice_match EPHB2 ENST00000400191.7 10816 17 73909 7748 9696 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAAAGGGAATGGGAA NA FALSE NA NA AAGAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.393.4 chr1 + 1150 6 incomplete-splice_match EPHB2 ENST00000374632.7 3677 16 195845 518 41656 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAAAGGGAATGGGAA NA FALSE NA NA AAGAAA -21 NA NA NA 5 NA PB.393.5 chr1 + 1932 2 incomplete-splice_match EPHB2 ENST00000374632.7 3677 16 201559 -1052 47370 1052 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAATATGACCCCTGTTCTCT NA FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.398.1 chr1 - 5275 2 incomplete-splice_match LUZP1 ENST00000302291.8 8898 5 86364 4 42235 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAAAGGCTCAGACTTTGTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.398.5 chr1 - 5535 2 incomplete-splice_match LUZP1 ENST00000302291.8 8898 5 85173 935 41044 -935 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACTCTGTGCGAGTCTGTGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.399.2 chr1 - 1172 4 full-splice_match LUZP1 ENST00000471849.5 1190 4 7 11 7 -11 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.855192 0.455635 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAACAAGAAACAAATCAGAA -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.399.3 chr1 - 1107 3 incomplete-splice_match LUZP1 ENST00000302291.8 8898 5 8969 9424 6 -11 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.044856 0.606903 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAACAAGAAACAAATCAGAA -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.400.2 chr1 - 2057 2 full-splice_match LINC01355 ENST00000660265.1 3554 2 1496 1 1207 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTGAGTTTTTTTTGTCTTA NA FALSE NA NA AAGAAA -23 NA NA NA 2 NA PB.400.3 chr1 - 1602 1 full-splice_match LINC01355 ENST00000566551.1 5444 1 3841 1 2543 -1 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTGAGTTTTTTTTGTCTTA NA FALSE NA NA ATTAAA -39 NA NA NA 3 NA PB.400.4 chr1 - 1200 1 full-splice_match LINC01355 ENST00000566551.1 5444 1 4243 1 2945 -1 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTGAGTTTTTTTTGTCTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.401.1 chr1 + 3743 19 full-splice_match KDM1A ENST00000691682.1 3710 19 24 -57 -1 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GCCCTCTCTTTTGTTCCTTT -38 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.401.2 chr1 + 1470 10 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000692975.1 3793 18 25 14481 0 -7419 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GTGAAATTCTGTATTTTCTT -37 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.401.3 chr1 + 3016 19 full-splice_match KDM1A ENST00000465864.2 3039 19 32 -9 7 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAAAATTGGCCCTCTCTTTT -30 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.401.4 chr1 + 2997 19 full-splice_match KDM1A ENST00000356634.7 3033 19 29 7 9 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 99 23.555338 1.372089 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG -28 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 99 NA PB.401.5 chr1 + 3041 20 novel_in_catalog KDM1A novel 3085 21 NA NA 24 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 54 12.848366 1.108848 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAAAATTGGCCCTCTCTTTT -13 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 54 NA PB.401.6 chr1 + 3777 20 novel_in_catalog KDM1A novel 3085 21 NA NA 25 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GCCCTCTCTTTTGTTCCTTT -12 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.401.7 chr1 + 1513 11 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000688680.1 3984 15 50 7411 25 -7411 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CTGTATTTTCTTCATAGCTG -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.401.8 chr1 + 2940 20 novel_in_catalog KDM1A novel 3085 21 NA NA 126 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG 89 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 4 NA PB.401.9 chr1 + 2863 20 novel_in_catalog KDM1A novel 3085 21 NA NA 210 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GCCCTCTCTTTTGTTCCTTT 173 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 6 NA PB.401.10 chr1 + 2776 19 full-splice_match KDM1A ENST00000356634.7 3033 19 250 7 230 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG 193 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 4 NA PB.401.11 chr1 + 2810 20 novel_in_catalog KDM1A novel 3085 21 NA NA 264 1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CCCTCTCTTTTGTTCCTTTG 227 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.401.12 chr1 + 2728 19 full-splice_match KDM1A ENST00000356634.7 3033 19 304 1 284 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GGCCCTCTCTTTTGTTCCTT 247 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.401.13 chr1 + 2643 19 full-splice_match KDM1A ENST00000356634.7 3033 19 382 8 362 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAAAATTGGCCCTCTCTTTT 325 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 4 NA PB.401.14 chr1 + 2624 20 novel_in_catalog KDM1A novel 3085 21 NA NA 443 1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAATTGGCCCTCTCTTTTGT 406 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 7 NA PB.401.15 chr1 + 2546 19 full-splice_match KDM1A ENST00000356634.7 3033 19 480 7 460 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG 423 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 7 NA PB.401.17 chr1 + 2527 19 novel_in_catalog KDM1A novel 3085 21 NA NA 11067 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GCCCTCTCTTTTGTTCCTTT 2796 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.401.20 chr1 + 2360 17 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000356634.7 3033 19 30938 8 -39 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.093125 0.490398 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAAAATTGGCCCTCTCTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 13 NA PB.401.21 chr1 + 2253 17 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000356634.7 3033 19 31045 8 68 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.044856 0.606903 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAAAATTGGCCCTCTCTTTT 96 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 17 NA PB.401.22 chr1 + 2060 14 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000356634.7 3033 19 36484 1 5507 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 25 5.948318 0.774394 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GGCCCTCTCTTTTGTTCCTT 5535 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 25 NA PB.401.23 chr1 + 2677 13 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000691682.1 3710 19 38040 -50 7058 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG 7086 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 2 NA PB.401.24 chr1 + 1948 13 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000356634.7 3033 19 38035 7 7058 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG 7086 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 10 NA PB.401.25 chr1 + 1882 13 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000356634.7 3033 19 38101 7 7124 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 35 8.327644 0.920522 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG 7152 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 35 NA PB.401.27 chr1 + 1745 11 full-splice_match KDM1A ENST00000686793.1 2133 11 393 -5 393 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 23 5.472452 0.738182 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAAAATTGGCCCTCTCTTTT 9486 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 23 NA PB.401.28 chr1 + 1608 10 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000686793.1 2133 11 909 -5 909 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 24 5.710385 0.756665 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAAAATTGGCCCTCTCTTTT 10002 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 24 NA PB.401.31 chr1 + 1540 9 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000686793.1 2133 11 3058 -13 -129 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 28 6.662116 0.823612 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GCCCTCTCTTTTGTTCCTTT NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 28 NA PB.401.32 chr1 + 1398 8 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000686793.1 2133 11 3958 -7 771 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.520721 0.655208 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAATTGGCCCTCTCTTTTGT 766 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 19 NA PB.401.33 chr1 + 1333 7 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000689971.1 1823 8 2439 -17 1936 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.044856 0.606903 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GCCCTCTCTTTTGTTCCTTT 1931 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 17 NA PB.401.35 chr1 + 1919 6 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000687202.1 5783 18 57818 -58 27 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CCCTCTCTTTTGTTCCTTTG 5899 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.401.36 chr1 + 1126 6 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000689971.1 1823 8 6463 -10 83 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 34 8.089712 0.907933 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG 5955 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 34 NA PB.401.37 chr1 + 930 5 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000494920.1 905 6 1908 -328 129 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.806923 0.580574 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG 7780 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 16 NA PB.401.38 chr1 + 841 4 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000494920.1 905 6 2372 -328 243 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.806923 0.580574 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG 8244 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 16 NA PB.401.39 chr1 + 1564 4 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000685243.1 1123 6 608 -5 258 2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CCTCTCTTTTGTTCCTTTGA 8259 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 4 NA PB.401.40 chr1 + 1578 2 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000685243.1 1123 6 2446 4 586 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG NA FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 2 NA PB.401.41 chr1 + 722 3 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000494920.1 905 6 4269 -328 630 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG NA FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 4 NA PB.401.42 chr1 + 1160 1 full-splice_match KDM1A ENST00000602503.1 2810 1 1657 -7 1657 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GCCCTCTCTTTTGTTCCTTT NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.402.1 chr1 - 1447 2 full-splice_match LINC01355 ENST00000604481.1 400 2 -1071 24 20 -24 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAAAGAAGAGAGAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.402.2 chr1 - 1249 1 full-splice_match LINC01355 ENST00000566551.1 5444 1 1124 3071 115 -24 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAAAGAAGAGAGAAA NA FALSE NA NA AAAAAG -12 NA NA NA 2 NA PB.402.3 chr1 - 1178 2 full-splice_match LINC01355 ENST00000604481.1 400 2 -802 24 289 -24 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAAAGAAGAGAGAAA NA FALSE NA NA AATACA -4 NA NA NA 2 NA PB.409.2 chr1 - 2832 10 novel_in_catalog HNRNPR novel 7751 11 NA NA 1 310 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAACAAATAAAATGTGGCT 334 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.409.4 chr1 - 2060 5 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000427764.3 1788 9 19430 -918 -7977 247 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAAAAAAAAACAGGTTC 2031 FALSE NA NA AAAAAG -32 NA NA NA 2 NA PB.409.10 chr1 - 2681 11 full-splice_match HNRNPR ENST00000302271.11 7751 11 -34 5104 -1 -6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 204 48.538273 1.686084 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 332 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 204 NA PB.409.11 chr1 - 2405 9 full-splice_match HNRNPR ENST00000606561.5 1837 9 -10 -558 5 8 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 45 10.706972 1.029667 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAATTCAATTGTGTCCTAAA 345 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 45 NA PB.409.12 chr1 - 2514 10 full-splice_match HNRNPR ENST00000478691.5 7646 10 28 5104 2 -6 alternative_3end FALSE noncanonical NA NA NA NA 40 9.517308 0.978514 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 342 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 40 NA PB.409.13 chr1 - 2514 10 novel_in_catalog HNRNPR novel 2694 11 NA NA 0 -6 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 355 84.466110 1.926682 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 333 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 355 NA PB.409.18 chr1 - 3130 11 full-splice_match HNRNPR ENST00000302271.11 7751 11 -483 5104 -431 -6 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.409.19 chr1 - 3013 11 full-splice_match HNRNPR ENST00000302271.11 7751 11 -366 5104 -314 -6 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.409.20 chr1 - 2668 11 full-splice_match HNRNPR ENST00000374616.7 2691 11 14 9 -1 -6 reference_match FALSE noncanonical NA NA NA NA 28 6.662116 0.823612 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 28 NA PB.409.22 chr1 - 2568 10 novel_in_catalog HNRNPR novel 2694 11 NA NA -35 -6 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 279 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.409.23 chr1 - 2479 10 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000374612.5 2694 11 3399 6 85 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 3727 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.409.24 chr1 - 2479 10 novel_in_catalog HNRNPR novel 2694 11 NA NA 5 -6 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.409.25 chr1 - 2431 9 full-splice_match HNRNPR ENST00000427764.3 1788 9 19 -662 19 -6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 3661 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.409.26 chr1 - 2447 10 novel_in_catalog HNRNPR novel 7751 11 NA NA 31 -6 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 44 10.469039 1.019907 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 44 NA PB.409.28 chr1 - 2320 9 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000374612.5 2694 11 5801 6 28 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.855192 0.455635 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 6129 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 12 NA PB.409.29 chr1 - 2316 9 novel_in_catalog HNRNPR novel 2694 11 NA NA -1 -6 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.044856 0.606903 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.409.31 chr1 - 2196 8 novel_in_catalog HNRNPR novel 1837 9 NA NA 5 -6 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.409.32 chr1 - 2231 8 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000374612.5 2694 11 6518 6 745 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.855192 0.455635 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 6846 FALSE NA NA CATAAA -8 NA NA NA 12 NA PB.409.33 chr1 - 2176 7 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000427764.3 1788 9 3145 -662 686 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 6787 FALSE NA NA AATAAA -27 NA NA NA 2 NA PB.409.35 chr1 - 2093 7 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000374612.5 2694 11 10778 6 87 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 33 7.851779 0.894968 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 33 NA PB.409.36 chr1 - 2046 6 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000427764.3 1788 9 17274 -640 9897 -28 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 27 6.424183 0.807818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATAAAACTAAAAAATCTAT 8098 FALSE NA NA AATAAA -43 NA NA NA 27 NA PB.409.37 chr1 - 1876 5 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000427764.3 1788 9 19358 -662 -8049 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.806923 0.580574 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 1959 FALSE NA NA AAGAAA -25 NA NA NA 16 NA PB.409.38 chr1 - 1797 5 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000427764.3 1788 9 19437 -662 -7970 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 2038 FALSE NA NA AAAAAG -25 NA NA NA 10 NA PB.409.39 chr1 - 1743 4 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000427764.3 1788 9 22330 -662 -5077 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.282789 0.631727 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 4931 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.409.40 chr1 - 1633 4 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000427764.3 1788 9 22440 -662 -4967 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 57 13.562164 1.132329 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 5041 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 57 NA PB.409.41 chr1 - 1459 3 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000641107.1 646 5 -13 5829 -13 -6 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 39 9.279376 0.967519 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 9995 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 39 NA PB.409.42 chr1 - 1373 2 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000476660.1 1637 3 595 8 595 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 29 6.900049 0.838852 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 7331 FALSE NA NA TATAAA -20 NA NA NA 29 NA PB.409.50 chr1 - 2552 10 novel_in_catalog HNRNPR novel 2694 11 NA NA -6 -7 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.044856 0.606903 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 CAAAACATTACCTATTTCAA -19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.409.59 chr1 - 1575 7 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000427764.3 1788 9 3145 -61 686 -60 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAAAAATTGGCTTAA 6787 FALSE NA NA AATAAA -27 NA NA NA 2 NA PB.409.60 chr1 - 1711 9 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000374612.5 2694 11 5809 607 36 -60 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAAAAATTGGCTTAA 6137 FALSE NA NA ATTAAA -9 NA NA NA 5 NA PB.409.63 chr1 - 1424 5 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000427764.3 1788 9 19209 -61 -8198 -60 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAAAAATTGGCTTAA 1810 FALSE NA NA TTTAAA -30 NA NA NA 2 NA PB.409.67 chr1 - 1343 10 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000374612.5 2694 11 20 1465 -7 -797 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 70 16.655289 1.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAGAAAAGGAAAGAGCGCCA 348 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 70 NA PB.409.69 chr1 - 1171 9 novel_in_catalog HNRNPR novel 2694 11 NA NA -4 -797 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 123 29.265722 1.466359 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAGAAAAGGAAAGAGCGCCA -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 123 NA PB.409.70 chr1 - 934 7 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000374612.5 2694 11 6490 1465 717 -797 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAGAAAAGGAAAGAGCGCCA 6818 FALSE NA NA CATAAA -36 NA NA NA 5 NA PB.409.79 chr1 - 692 5 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000427764.3 1788 9 17274 848 9897 -848 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAGAAATAGAAGGGGAAGA 8098 FALSE NA NA AATAAA -43 NA NA NA 2 NA PB.409.81 chr1 - 1825 3 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000427764.3 1788 9 20869 851 -6538 -851 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 GGCAAAGAAATAGAAGGGGA 3470 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.409.82 chr1 - 1240 9 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000302271.11 7751 11 -38 8913 0 -2 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAGATTATGCATTTGTTCA -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.409.83 chr1 - 1056 8 novel_in_catalog HNRNPR novel 2694 11 NA NA 6 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAGATTATGCATTTGTTCA 346 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.409.84 chr1 - 962 8 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000374612.5 2694 11 14 8862 2 -165 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.855192 0.455635 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGAAGAATCGGGGGTT 342 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.409.85 chr1 - 858 7 novel_in_catalog HNRNPR novel 7751 11 NA NA 1 -165 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGAAGAATCGGGGGTT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.409.87 chr1 - 795 7 novel_in_catalog HNRNPR novel 1032 8 NA NA 0 -165 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGAAGAATCGGGGGTT 340 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.409.88 chr1 - 613 6 novel_in_catalog HNRNPR novel 1032 8 NA NA 5 -165 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGAAGAATCGGGGGTT 345 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.409.91 chr1 - 875 7 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000374612.5 2694 11 23 11779 -4 -3082 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAGAAAACATTTTGGAAGA -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.409.99 chr1 - 854 6 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000374612.5 2694 11 5 13710 0 -5013 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAATGTTTGTAGTTAACA 333 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.409.100 chr1 - 677 5 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000478691.5 7646 10 27 18808 1 -5013 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAATGTTTGTAGTTAACA 341 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.411.1 chr1 - 4163 3 full-splice_match ZNF436 ENST00000374608.3 3788 3 151 -526 151 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AGCAAACCTGAGAATTATTT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.411.5 chr1 - 3638 3 full-splice_match ZNF436 ENST00000374608.3 3788 3 149 1 149 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGCTTCTGTGAGCCACTATG -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.412.1 chr1 - 1507 10 novel_in_catalog TCEA3 novel 1719 11 NA NA -6 -155 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGACCTGAGGTGTCATATCT 57 FALSE NA NA GGGGCT -32 NA NA NA 2 NA PB.412.2 chr1 - 1551 11 full-splice_match TCEA3 ENST00000450454.7 1719 11 13 155 13 -155 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGACCTGAGGTGTCATATCT -6 TRUE NA NA GGGGCT -13 NA NA NA 6 NA PB.412.3 chr1 - 1120 7 novel_not_in_catalog TCEA3 novel 1719 11 NA NA 14403 -155 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGACCTGAGGTGTCATATCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.412.4 chr1 - 863 7 novel_not_in_catalog TCEA3 novel 1719 11 NA NA 14357 -458 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAACTCTGTCTGAGTGGGAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.412.5 chr1 - 1243 11 full-splice_match TCEA3 ENST00000450454.7 1719 11 10 466 10 -466 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 21 4.996587 0.698673 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATACTGAACTCTGTCTG -9 TRUE NA NA GGGGCT -16 NA NA NA 21 NA PB.412.6 chr1 - 1155 11 full-splice_match TCEA3 ENST00000450454.7 1719 11 98 466 -32 -466 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATACTGAACTCTGTCTG -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.412.7 chr1 - 1192 10 novel_in_catalog TCEA3 novel 1719 11 NA NA -2 -466 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.617260 0.417847 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATACTGAACTCTGTCTG -21 TRUE NA NA GGGGCT -28 NA NA NA 11 NA PB.412.8 chr1 - 1088 10 novel_in_catalog TCEA3 novel 1719 11 NA NA -28 -466 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATACTGAACTCTGTCTG 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.412.9 chr1 - 971 9 incomplete-splice_match TCEA3 ENST00000450454.7 1719 11 6774 466 324 -466 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATACTGAACTCTGTCTG 6837 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.413.1 chr1 + 1005 2 full-splice_match ZNF436-AS1 ENST00000671509.2 984 2 -23 2 2 1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CACAATTGTCATAGTTTTTT 4 TRUE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 2 NA PB.413.2 chr1 + 2814 1 full-splice_match ZNF436-AS1 ENST00000335648.3 2547 1 -267 0 5 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCACAATTGTCATAGTTTT 7 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 10 NA PB.413.3 chr1 + 1189 2 full-splice_match ZNF436-AS1 ENST00000454117.2 1266 2 20 57 5 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCACAATTGTCATAGTTTT 7 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 6 NA PB.413.4 chr1 + 2362 1 full-splice_match ZNF436-AS1 ENST00000335648.3 2547 1 185 0 183 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCACAATTGTCATAGTTTT 204 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 3 NA PB.415.1 chr1 - 4077 25 full-splice_match ASAP3 ENST00000336689.8 4051 25 -26 0 -13 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCCAGTGGTTTCATTTATGT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.415.2 chr1 - 1893 5 incomplete-splice_match ASAP3 ENST00000495646.5 2552 10 3238 0 93 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCCAGTGGTTTCATTTATGT 3236 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.415.3 chr1 - 1770 4 incomplete-splice_match ASAP3 ENST00000495646.5 2552 10 3513 0 368 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCCAGTGGTTTCATTTATGT 3511 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.415.5 chr1 - 3097 16 incomplete-splice_match ASAP3 ENST00000336689.8 4051 25 43038 4 1130 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTTTCCAGTGGTTTCATTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.415.6 chr1 - 2187 8 incomplete-splice_match ASAP3 ENST00000495646.5 2552 10 2124 4 -1021 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTTTCCAGTGGTTTCATTT 2122 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.417.1 chr1 - 2001 7 novel_not_in_catalog E2F2 novel 550 2 NA NA 0 768 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATGGTTGCAGGCGCCTGTAA -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.417.3 chr1 - 4673 7 novel_not_in_catalog E2F2 novel 5196 7 NA NA -15 14 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GTCTTTGTCGTGCTTTCTGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.417.12 chr1 - 5197 7 full-splice_match E2F2 ENST00000361729.3 5196 7 -3 2 -3 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.331058 0.522582 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGCTCTGGGCATCTTGTCT -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.417.13 chr1 - 4133 4 incomplete-splice_match E2F2 ENST00000361729.3 5196 7 10205 2 -1632 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGCTCTGGGCATCTTGTCT 9944 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.418.1 chr1 - 980 3 full-splice_match ID3 ENST00000374561.6 950 3 -31 1 -31 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 1916 455.879059 2.658850 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATATGATGACACCCGTCTCC 309 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 1916 NA PB.418.2 chr1 - 1045 3 full-splice_match ID3 ENST00000374561.6 950 3 -90 -5 -90 5 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TGACACCCGTCTCCATTAAG 250 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.418.4 chr1 - 900 3 novel_not_in_catalog ID3 novel 950 3 NA NA -2 5 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TGACACCCGTCTCCATTAAG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.418.6 chr1 - 917 3 full-splice_match ID3 ENST00000374561.6 950 3 31 2 -27 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 21 4.996587 0.698673 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATATGATGACACCCGTCTC 371 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 21 NA PB.418.7 chr1 - 789 3 full-splice_match ID3 ENST00000374561.6 950 3 159 2 101 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATATGATGACACCCGTCTC 499 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.418.8 chr1 - 934 3 novel_not_in_catalog ID3 novel 950 3 NA NA 2 1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TTGTGTATATGATGACACCC 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.418.9 chr1 - 1454 2 full-splice_match ID3 ENST00000486541.1 892 2 -56 -506 2 -5 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 43 10.231107 1.009923 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACACTTGTGTATATGATG 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 43 NA PB.418.10 chr1 - 1119 3 full-splice_match ID3 ENST00000374561.6 950 3 -182 13 -182 -5 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACACTTGTGTATATGATG 158 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.418.11 chr1 - 1044 2 full-splice_match ID3 ENST00000463312.1 623 2 -426 5 0 -5 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.282789 0.631727 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACACTTGTGTATATGATG -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.418.12 chr1 - 685 3 full-splice_match ID3 ENST00000374561.6 950 3 252 13 -174 -5 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACACTTGTGTATATGATG 592 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.420.2 chr1 + 612 6 full-splice_match RPL11 ENST00000643754.2 1017 6 -15 420 -15 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 278 66.145294 1.820499 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATGTGCAATTCTGTTGTG -10 TRUE NA NA AATAAA -42 NA NA NA 278 NA PB.420.3 chr1 + 2038 4 incomplete-splice_match RPL11 ENST00000443624.6 1600 5 0 -3 0 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATGTGCAATTCTGTTGTG 5 TRUE NA NA AATAAA -42 NA NA NA 3 NA PB.420.4 chr1 + 1598 5 full-splice_match RPL11 ENST00000443624.6 1600 5 5 -3 5 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATGTGCAATTCTGTTGTG 10 TRUE NA NA AATAAA -42 NA NA NA 10 NA PB.420.5 chr1 + 813 6 full-splice_match RPL11 ENST00000467075.2 823 6 0 10 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATGTGCAATTCTGTTGTG 20 FALSE NA NA AATAAA -42 NA NA NA 4 NA PB.420.6 chr1 + 448 5 full-splice_match RPL11 ENST00000458455.2 879 5 435 -4 132 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAATTCTGTTGTGTGTTCTG 50 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 6 NA PB.420.8 chr1 + 1277 2 incomplete-splice_match RPL11 ENST00000443624.6 1600 5 2906 -11 2103 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AATTCTGTTGTGTGTTCTGT 50 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.420.10 chr1 + 1034 2 incomplete-splice_match RPL11 ENST00000458455.2 879 5 2641 3 2338 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATGTGCAATTCTGTTGTG 285 FALSE NA NA AATAAA -42 NA NA NA 2 NA PB.420.11 chr1 + 820 2 incomplete-splice_match RPL11 ENST00000458455.2 879 5 2855 3 2552 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATGTGCAATTCTGTTGTG 499 FALSE NA NA AATAAA -42 NA NA NA 2 NA PB.423.1 chr1 - 1603 2 antisense novelGene_MDS2_AS novel NA NA NA NA NA NA multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA TRUE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTCCATGTGTCATGTGGTTT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.424.1 chr1 + 1200 4 incomplete-splice_match ELOA ENST00000609199.2 5075 10 -16 10290 -16 789 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAACTAATTTGGATAGAAA 277 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.424.2 chr1 + 4634 11 full-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 -17 221 6 -185 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGATCCTTGGTGTACTGAGC -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.424.3 chr1 + 2681 11 full-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 0 2157 0 -2121 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 98 23.317406 1.367680 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTATCCCCCAGGTTTGTTT -10 TRUE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 98 NA PB.424.4 chr1 + 1338 4 incomplete-splice_match ELOA ENST00000609199.2 5075 10 26 10110 3 969 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 100 23.793270 1.376454 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAATGACTCTAAAAG -7 TRUE NA NA GATAAA -7 NA NA NA 100 NA PB.424.5 chr1 + 4815 11 full-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 4 19 4 -9 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 21 4.996587 0.698673 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAATAAAAAACAAACTCCAT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 21 NA PB.424.8 chr1 + 2333 8 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 7453 2154 6890 -2118 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCCCCAGGTTTGTTTTTG 7443 FALSE NA NA AATAAA -27 NA NA NA 5 NA PB.424.10 chr1 + 4039 8 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 7900 1 7337 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATATACTGTGTCTTCCTTAC 7890 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 3 NA PB.424.11 chr1 + 1850 8 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 7927 2163 7364 -2127 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATTTATATTATCCCCCAGGT 7917 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.424.12 chr1 + 1795 8 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 7990 2155 7427 -2119 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCCAGGTTTGTTTTT 7980 FALSE NA NA AATAAA -26 NA NA NA 3 NA PB.424.13 chr1 + 1716 8 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 8061 2163 7498 -2127 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATTTATATTATCCCCCAGGT 8051 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 5 NA PB.424.14 chr1 + 3667 8 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 8254 19 7691 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAATAAAAAACAAACTCCAT 8244 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.424.15 chr1 + 1475 8 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 8310 2155 7747 -2119 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCCAGGTTTGTTTTT 8300 FALSE NA NA AATAAA -26 NA NA NA 4 NA PB.424.16 chr1 + 1341 8 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 8439 2160 7876 -2124 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATATTATCCCCCAGGTTTG 8429 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 5 NA PB.424.17 chr1 + 3438 8 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 8483 19 7920 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAATAAAAAACAAACTCCAT 8473 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.424.18 chr1 + 1206 7 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 8956 2154 8393 -2118 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCCCCAGGTTTGTTTTTG 8946 FALSE NA NA AATAAA -27 NA NA NA 3 NA PB.424.19 chr1 + 3180 6 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 10698 19 10135 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAATAAAAAACAAACTCCAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.424.20 chr1 + 1004 6 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 10734 2159 10171 -2123 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATATTATCCCCCAGGTTTGT NA FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 7 NA PB.424.21 chr1 + 884 5 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 10969 2151 10406 -2115 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CCCCAGGTTTGTTTTTGTTT NA FALSE NA NA AATAAA -30 NA NA NA 3 NA PB.424.22 chr1 + 775 4 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 12457 2154 11894 -2118 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCCCCAGGTTTGTTTTTG NA FALSE NA NA AATAAA -27 NA NA NA 4 NA PB.425.1 chr1 + 1619 6 full-splice_match PITHD1 ENST00000246151.9 1590 6 -32 3 -32 -3 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 208 49.490002 1.694517 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAATGTTTGTATTTTCTTTT -18 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 208 NA PB.425.3 chr1 + 1083 6 full-splice_match PITHD1 ENST00000246151.9 1590 6 -25 532 -25 -532 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGATTGTTGTGTGACTTGT -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.425.4 chr1 + 1567 5 novel_in_catalog PITHD1 novel 1590 6 NA NA -23 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.855192 0.455635 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTTTGTATTTTCTTTTG -9 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 12 NA PB.425.5 chr1 + 2333 5 novel_in_catalog PITHD1 novel 1590 6 NA NA -21 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTTTGTATTTTCTTTTG -7 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.425.6 chr1 + 1625 6 novel_not_in_catalog PITHD1 novel 1590 6 NA NA -20 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTTTGTATTTTCTTTTG -6 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.425.7 chr1 + 1563 6 full-splice_match PITHD1 ENST00000246151.9 1590 6 25 2 25 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 41 9.755241 0.989238 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTTTGTATTTTCTTTTG 39 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 41 NA PB.425.8 chr1 + 1465 6 full-splice_match PITHD1 ENST00000246151.9 1590 6 123 2 123 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTTTGTATTTTCTTTTG 137 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 8 NA PB.425.9 chr1 + 1314 6 full-splice_match PITHD1 ENST00000246151.9 1590 6 273 3 273 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAATGTTTGTATTTTCTTTT 287 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 8 NA PB.425.10 chr1 + 1170 3 incomplete-splice_match PITHD1 ENST00000374524.1 1292 4 483 2 483 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.044856 0.606903 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTTTGTATTTTCTTTTG 7271 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 17 NA PB.426.1 chr1 - 947 4 full-splice_match ELOA-AS1 ENST00000427796.6 1112 4 28 137 -7 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.093125 0.490398 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAAGTTGCCTTCAGGGCTA -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.426.2 chr1 - 829 3 full-splice_match ELOA-AS1 ENST00000686609.1 808 3 -25 4 -13 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAAGTTGCCTTCAGGGCTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.427.1 chr1 - 1904 11 novel_in_catalog GALE novel 1516 12 NA NA 3 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCAGGTTCTCACAGATGGTC -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.427.2 chr1 - 1565 12 novel_not_in_catalog GALE novel 1516 12 NA NA -1 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCAGGTTCTCACAGATGGTC -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.427.3 chr1 - 1528 12 full-splice_match GALE ENST00000617979.5 1516 12 -18 6 1 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 371 88.273033 1.945828 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTGGGGCAGGTTCTCACAG 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 371 NA PB.427.4 chr1 - 1507 10 novel_in_catalog GALE novel 1516 12 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCAGGTTCTCACAGATGGTC -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.427.5 chr1 - 1449 11 novel_in_catalog GALE novel 1516 12 NA NA -32 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCAGGTTCTCACAGATGGTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.427.6 chr1 - 1404 10 incomplete-splice_match GALE ENST00000374497.7 1488 12 1388 -1 99 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCAGGTTCTCACAGATGGTC 1761 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.427.7 chr1 - 1157 8 incomplete-splice_match GALE ENST00000374497.7 1488 12 2175 -1 886 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCAGGTTCTCACAGATGGTC 2548 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.427.8 chr1 - 1509 10 novel_in_catalog GALE novel 1563 11 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GGCAGGTTCTCACAGATGGT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.427.9 chr1 - 864 6 incomplete-splice_match GALE ENST00000374497.7 1488 12 3259 0 -74 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GGCAGGTTCTCACAGATGGT 3632 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.427.10 chr1 - 1625 11 full-splice_match GALE ENST00000459934.5 1563 11 -2 -60 -1 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.806923 0.580574 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GGGCAGGTTCTCACAGATGG -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.427.11 chr1 - 1633 12 full-splice_match GALE ENST00000374497.7 1488 12 -147 2 -26 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GGGGCAGGTTCTCACAGATG -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.427.12 chr1 - 1310 10 novel_in_catalog GALE novel 1516 12 NA NA -1 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GGGGCAGGTTCTCACAGATG -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.427.13 chr1 - 1022 7 incomplete-splice_match GALE ENST00000374497.7 1488 12 2549 5 -784 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTGGGGCAGGTTCTCACAG 2922 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.427.14 chr1 - 1597 11 incomplete-splice_match GALE ENST00000374497.7 1488 12 835 6 3 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CACTGGGGCAGGTTCTCACA -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.427.15 chr1 - 1222 9 incomplete-splice_match GALE ENST00000374497.7 1488 12 1719 6 430 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CACTGGGGCAGGTTCTCACA 2092 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.427.16 chr1 - 1431 11 novel_in_catalog GALE novel 1516 12 NA NA -1 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.806923 0.580574 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACACTGGGGCAGGTTCTCAC -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.427.17 chr1 - 1392 11 novel_in_catalog GALE novel 1516 12 NA NA 0 -3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACACTGGGGCAGGTTCTCAC 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.427.18 chr1 - 1383 11 novel_in_catalog GALE novel 1516 12 NA NA -1 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 47 11.182837 1.048552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACACTGGGGCAGGTTCTCAC -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 47 NA PB.427.19 chr1 - 1156 2 novel_in_catalog GALE novel 598 4 NA NA -3 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAAGGTGA -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.428.1 chr1 - 1441 8 novel_in_catalog HMGCL novel 1570 9 NA NA -13 7 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTCGGTTGTGCAGCTGTGT -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.428.2 chr1 - 1588 9 full-splice_match HMGCL ENST00000374490.8 1570 9 -13 -5 -13 5 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 311 73.997070 1.869215 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCATTCGGTTGTGCAGCTGT -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 311 NA PB.428.3 chr1 - 1044 4 incomplete-splice_match HMGCL ENST00000374490.8 1570 9 14649 -4 3541 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCATTCGGTTGTGCAGCTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.428.4 chr1 - 1478 9 novel_in_catalog HMGCL novel 1570 9 NA NA -13 3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CAGCATTCGGTTGTGCAGCT -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.428.5 chr1 - 1557 9 novel_not_in_catalog HMGCL novel 2151 10 NA NA -13 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.093125 0.490398 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATTCCAGCATTCGGTTGTG -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.428.6 chr1 - 1355 7 incomplete-splice_match HMGCL ENST00000374490.8 1570 9 7901 2 5 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATTCCAGCATTCGGTTGTG 7945 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.428.7 chr1 - 1173 5 incomplete-splice_match HMGCL ENST00000374490.8 1570 9 11124 2 16 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATTCCAGCATTCGGTTGTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.428.8 chr1 - 1633 9 full-splice_match HMGCL ENST00000374490.8 1570 9 -66 3 -66 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAATTCCAGCATTCGGTTGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.428.9 chr1 - 1512 8 novel_in_catalog HMGCL novel 1570 9 NA NA -9 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAATTCCAGCATTCGGTTGT -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.428.10 chr1 - 1363 7 full-splice_match HMGCL ENST00000436439.6 1354 7 -10 1 -9 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 25 5.948318 0.774394 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAATTCCAGCATTCGGTTGT -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 25 NA PB.428.12 chr1 - 1104 6 full-splice_match HMGCL ENST00000513148.1 2011 6 -22 929 -9 -929 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TGAAATCAGGTATCAAACCC -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.429.2 chr1 + 1633 10 full-splice_match LYPLA2 ENST00000374514.8 1635 10 0 2 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 824 196.056549 2.292381 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT -9 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 824 NA PB.429.5 chr1 + 1706 9 novel_in_catalog LYPLA2 novel 1635 10 NA NA 14 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 5 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.429.6 chr1 + 1700 9 incomplete-splice_match LYPLA2 ENST00000374514.8 1635 10 14 2 14 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 5 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.429.7 chr1 + 1544 9 full-splice_match LYPLA2 ENST00000495365.5 842 9 -40 -662 18 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 9 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.429.8 chr1 + 1792 8 full-splice_match LYPLA2 ENST00000374502.7 1072 8 -53 -667 -19 -2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.568991 0.552545 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 14 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 15 NA PB.429.9 chr1 + 1715 10 novel_in_catalog LYPLA2 novel 1635 10 NA NA -19 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.855192 0.455635 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 14 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 12 NA PB.429.10 chr1 + 1711 9 novel_in_catalog LYPLA2 novel 1635 10 NA NA -19 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.855192 0.455635 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 14 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 12 NA PB.429.11 chr1 + 1643 10 novel_not_in_catalog LYPLA2 novel 1635 10 NA NA -19 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 14 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.429.13 chr1 + 1568 9 novel_in_catalog LYPLA2 novel 1635 10 NA NA -9 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.331058 0.522582 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT -5 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 14 NA PB.429.15 chr1 + 1473 10 full-splice_match LYPLA2 ENST00000374503.7 868 10 -23 -582 -7 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT -3 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 6 NA PB.429.17 chr1 + 1621 10 novel_not_in_catalog LYPLA2 novel 717 9 NA NA -8 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAACGCTCAGGCCTGGCTGA -14 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.429.18 chr1 + 1566 10 novel_in_catalog LYPLA2 novel 717 9 NA NA 8 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.806923 0.580574 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 2 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 16 NA PB.429.19 chr1 + 1392 7 incomplete-splice_match LYPLA2 ENST00000492577.1 717 9 1179 -825 -503 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.855192 0.455635 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 1173 FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 12 NA PB.429.20 chr1 + 1196 4 incomplete-splice_match LYPLA2 ENST00000374501.1 1117 6 420 -260 -19 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.282789 0.631727 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 411 FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 18 NA PB.429.21 chr1 + 1048 3 incomplete-splice_match LYPLA2 ENST00000374501.1 1117 6 655 -260 216 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.093125 0.490398 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 646 FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 13 NA PB.429.22 chr1 + 1093 2 incomplete-splice_match LYPLA2 ENST00000472213.1 822 3 272 -456 272 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 702 FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.429.23 chr1 + 950 2 incomplete-splice_match LYPLA2 ENST00000472213.1 822 3 415 -456 415 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 845 FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 6 NA PB.430.1 chr1 - 2083 8 full-splice_match FUCA1 ENST00000374479.4 2043 8 -47 7 -47 -7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 188 44.731350 1.650612 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAAACATGGTATAGCTT -16 TRUE NA NA AAAAAG -8 NA NA NA 188 NA PB.430.2 chr1 - 1850 7 novel_in_catalog FUCA1 novel 2043 8 NA NA -5 -7 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAAACATGGTATAGCTT 26 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.430.3 chr1 - 1808 8 full-splice_match FUCA1 ENST00000374479.4 2043 8 228 7 228 -7 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAAACATGGTATAGCTT 259 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.430.4 chr1 - 1595 7 incomplete-splice_match FUCA1 ENST00000374479.4 2043 8 2713 7 2713 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAAACATGGTATAGCTT 2744 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.430.5 chr1 - 1489 6 incomplete-splice_match FUCA1 ENST00000374479.4 2043 8 5038 7 5038 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAAACATGGTATAGCTT 5069 FALSE NA NA AAAACA -16 NA NA NA 2 NA PB.430.6 chr1 - 1160 4 incomplete-splice_match FUCA1 ENST00000374479.4 2043 8 13834 7 13834 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.093125 0.490398 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAAACATGGTATAGCTT 227 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.430.7 chr1 - 860 2 incomplete-splice_match FUCA1 ENST00000374479.4 2043 8 22129 7 22129 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAAACATGGTATAGCTT 8522 FALSE NA NA AAAACA -28 NA NA NA 3 NA PB.430.8 chr1 - 2200 8 novel_not_in_catalog FUCA1 novel 2043 8 NA NA 3 -14 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TTCTACCAAAAAAACATGGT 34 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.430.9 chr1 - 954 3 incomplete-splice_match FUCA1 ENST00000374479.4 2043 8 19547 20 19547 -20 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AATCATTTCTACCAAAAAAA 5940 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.430.10 chr1 - 1299 5 incomplete-splice_match FUCA1 ENST00000374479.4 2043 8 8444 21 8444 -21 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 CAATCATTTCTACCAAAAAA 8475 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.431.1 chr1 + 1602 3 full-splice_match PNRC2 ENST00000471915.5 380 3 -9 -1213 -9 -768 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAGTTTTCTTGGCCTTTAT NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.431.2 chr1 + 2319 3 full-splice_match PNRC2 ENST00000471915.5 380 3 53 -1992 53 -5 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAATGGTTTTGATTGCTT -4 TRUE NA NA AATAAA -30 NA NA NA 7 NA PB.431.3 chr1 + 2935 3 full-splice_match PNRC2 ENST00000334351.8 2400 3 -541 6 178 -6 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAAAATGGTTTTGATTGCT 2 TRUE NA NA AATAAA -29 NA NA NA 4 NA PB.431.4 chr1 + 2414 3 novel_not_in_catalog PNRC2 novel 2428 4 NA NA 178 -6 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAAAATGGTTTTGATTGCT 2 TRUE NA NA AATAAA -29 NA NA NA 2 NA PB.431.8 chr1 + 2399 3 full-splice_match PNRC2 ENST00000334351.8 2400 3 -4 5 -4 -5 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 307 73.045341 1.863593 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAATGGTTTTGATTGCTT 7 TRUE NA NA AATAAA -30 NA NA NA 307 NA PB.431.12 chr1 + 1615 3 full-splice_match PNRC2 ENST00000334351.8 2400 3 0 785 0 -769 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 106 25.220867 1.401760 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAAAGTTTTCTTGGCCTTTA 11 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 106 NA PB.431.13 chr1 + 1420 3 full-splice_match PNRC2 ENST00000334351.8 2400 3 0 980 0 602 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 GAAACAGTATTTAATGGTCA 11 TRUE NA NA AATACA -19 NA NA NA 3 NA PB.431.15 chr1 + 2331 2 incomplete-splice_match PNRC2 ENST00000334351.8 2400 3 215 784 215 -768 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAGTTTTCTTGGCCTTTAT 226 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.431.16 chr1 + 2423 3 novel_not_in_catalog PNRC2 novel 2428 4 NA NA 287 -6 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAAAATGGTTTTGATTGCT 298 FALSE NA NA AATAAA -29 NA NA NA 2 NA PB.431.17 chr1 + 2223 2 incomplete-splice_match PNRC2 ENST00000334351.8 2400 3 1101 6 1101 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.093125 0.490398 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAAAATGGTTTTGATTGCT 1112 FALSE NA NA AATAAA -29 NA NA NA 13 NA PB.431.18 chr1 + 1346 2 incomplete-splice_match PNRC2 ENST00000334351.8 2400 3 1200 784 1200 -768 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAGTTTTCTTGGCCTTTAT 1211 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 7 NA PB.431.20 chr1 + 1295 2 incomplete-splice_match PNRC2 ENST00000334351.8 2400 3 1257 778 1257 -762 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTCTTGGCCTTTATCTTACA 1268 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.431.21 chr1 + 2059 2 incomplete-splice_match PNRC2 ENST00000334351.8 2400 3 1266 5 1266 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAATGGTTTTGATTGCTT 1277 FALSE NA NA AATAAA -30 NA NA NA 8 NA PB.432.1 chr1 - 3605 7 novel_not_in_catalog SRSF10 novel 7656 6 NA NA 0 -9 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAATAAATCTTGGGTTTT 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.432.2 chr1 - 3474 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000344989.10 3487 6 4 9 0 -9 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 26 6.186250 0.791427 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAATAAATCTTGGGTTTT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 26 NA PB.432.3 chr1 - 3420 5 full-splice_match SRSF10 ENST00000484146.6 1089 5 29 -2360 0 -9 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAATAAATCTTGGGTTTT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.432.6 chr1 - 3367 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000344989.10 3487 6 4 116 0 -116 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGAGAACTAACCGTAGTTTG 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.432.7 chr1 - 3311 5 full-splice_match SRSF10 ENST00000484146.6 1089 5 29 -2251 0 -118 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATTGAGAACTAACCGTAGTT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.432.13 chr1 - 2376 8 novel_not_in_catalog SRSF10 novel 2839 7 NA NA -6 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATGTTTTGGATTCCTTA -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.432.15 chr1 - 2251 7 novel_not_in_catalog SRSF10 novel 2839 7 NA NA 0 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATGTTTTGGATTCCTTA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.432.17 chr1 - 2071 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000374452.9 1194 6 -19 -858 0 -4 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.093125 0.490398 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATGTTTTGGATTCCTTA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.432.18 chr1 - 1880 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000344989.10 3487 6 -38 1645 -13 -4 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 287 68.286690 1.834336 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATGTTTTGGATTCCTTA -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 287 NA PB.432.19 chr1 - 1784 5 full-splice_match SRSF10 ENST00000484146.6 1089 5 29 -724 0 -4 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 32 7.613847 0.881604 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATGTTTTGGATTCCTTA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 32 NA PB.432.20 chr1 - 1766 4 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000341154.10 2839 7 5680 4 -195 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATGTTTTGGATTCCTTA 5114 FALSE NA NA TATAAA -45 NA NA NA 5 NA PB.432.21 chr1 - 1670 5 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000344989.10 3487 6 1545 1645 160 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATGTTTTGGATTCCTTA 1575 FALSE NA NA CATAAA -5 NA NA NA 8 NA PB.432.23 chr1 - 1477 3 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000341154.10 2839 7 8930 4 3055 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.568991 0.552545 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATGTTTTGGATTCCTTA 8364 FALSE NA NA AATACA -24 NA NA NA 15 NA PB.432.24 chr1 - 1357 3 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000341154.10 2839 7 9050 4 3175 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATGTTTTGGATTCCTTA 8484 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.432.31 chr1 - 5132 6 novel_in_catalog SRSF10 novel 2839 7 NA NA -10 -5 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAAAATGTTTTGGATTCCTT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.432.32 chr1 - 2292 7 novel_in_catalog SRSF10 novel 2839 7 NA NA -3 -5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAAAATGTTTTGGATTCCTT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.432.33 chr1 - 1939 7 novel_not_in_catalog SRSF10 novel 7656 6 NA NA 0 -5 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.617260 0.417847 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAAAATGTTTTGGATTCCTT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.432.35 chr1 - 1436 2 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000484146.6 1089 5 8344 -722 3040 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACAAAATGTTTTGGATTCCT 8349 FALSE NA NA ATTAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.432.36 chr1 - 1697 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000344989.10 3487 6 -93 1883 -68 -242 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAACACATGCTAGGATATAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.432.37 chr1 - 1559 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000344989.10 3487 6 4 1924 0 -283 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AATATACTAGAGTTATAATA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.432.38 chr1 - 960 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000453840.7 1808 6 -63 911 -3 -49 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGCCATAGTCTCTTACAGTG 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.432.39 chr1 - 1057 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000374452.9 1194 6 -19 156 0 155 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TACTTGTGGAAACTAATCCC 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.432.40 chr1 - 823 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000344989.10 3487 6 4 2660 0 154 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 41 9.755241 0.989238 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GTACTTGTGGAAACTAATCC 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 41 NA PB.432.41 chr1 - 4042 6 novel_in_catalog SRSF10 novel 2839 7 NA NA -13 75 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 GAAAACTACATGGAATAATT -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.432.43 chr1 - 2978 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000492112.3 7656 6 -77 4755 -48 -19 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AATAAAAACAAAATGAAGGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.432.44 chr1 - 2901 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000492112.3 7656 6 0 4755 0 -19 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 43 10.231107 1.009923 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AATAAAAACAAAATGAAGGA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 43 NA PB.432.45 chr1 - 2515 3 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000338597.9 813 5 5962 -1873 3077 -19 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AATAAAAACAAAATGAAGGA 8386 FALSE NA NA AATACA -2 NA NA NA 3 NA PB.432.59 chr1 - 4906 6 novel_in_catalog SRSF10 novel 2917 6 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.432.60 chr1 - 5103 5 novel_in_catalog SRSF10 novel 7656 6 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.432.61 chr1 - 2041 7 novel_not_in_catalog SRSF10 novel 7656 6 NA NA -1 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.432.62 chr1 - 2050 7 novel_in_catalog SRSF10 novel 7656 6 NA NA 0 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.432.63 chr1 - 1754 5 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000374453.7 866 6 -33 2761 0 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.432.64 chr1 - 1625 4 full-splice_match SRSF10 ENST00000485841.5 3957 4 2332 0 -268 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA 5041 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.432.65 chr1 - 1636 5 full-splice_match SRSF10 ENST00000338597.9 813 5 -227 -596 88 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA 2197 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.432.66 chr1 - 1666 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000492112.3 7656 6 -42 6032 -13 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 264 62.814236 1.798058 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 264 NA PB.432.67 chr1 - 1360 4 full-splice_match SRSF10 ENST00000485841.5 3957 4 2597 0 -3 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA 5306 FALSE NA NA GGGGCT -9 NA NA NA 6 NA PB.432.68 chr1 - 1254 3 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000485841.5 3957 4 5664 0 3064 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA 8373 FALSE NA NA AATACA -15 NA NA NA 7 NA PB.432.71 chr1 - 5259 4 novel_in_catalog SRSF10 novel 1390 5 NA NA 5 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 CAAAAAAAAAAAAAAACCGG 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.432.73 chr1 - 1196 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000492112.3 7656 6 0 6460 0 168 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTTGGTAGAACTGTTAACC 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.432.74 chr1 - 2685 4 full-splice_match SRSF10 ENST00000485841.5 3957 4 675 597 675 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCTTAAGAGTCCAGTTTG 3384 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.432.75 chr1 - 1487 7 novel_in_catalog SRSF10 novel 1390 5 NA NA -13 -9 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GAGAAGCCACTCTTAAGAGT -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.432.76 chr1 - 1500 4 full-splice_match SRSF10 ENST00000485841.5 3957 4 1860 597 -740 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCTTAAGAGTCCAGTTTG 4569 FALSE NA NA AATATA -15 NA NA NA 2 NA PB.432.77 chr1 - 1051 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000492112.3 7656 6 -24 6629 5 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 107 25.458799 1.405838 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCTTAAGAGTCCAGTTTG 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 107 NA PB.432.78 chr1 - 804 5 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000492112.3 7656 6 1596 6629 215 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCTTAAGAGTCCAGTTTG 1630 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.432.79 chr1 - 504 2 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000338597.9 813 5 6325 1 3440 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCTTAAGAGTCCAGTTTG 8749 FALSE NA NA AAAAAG -29 NA NA NA 2 NA PB.432.90 chr1 - 820 2 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000343255.9 2917 6 0 9052 0 20 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAGAAAAAATAAAGAAAA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.432.91 chr1 - 455 3 full-splice_match SRSF10 ENST00000485292.1 790 3 -10 345 -10 20 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAGAAAAAATAAAGAAAA 20 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.432.93 chr1 - 601 3 full-splice_match SRSF10 ENST00000485292.1 790 3 -157 346 -132 19 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 GAAAAGAAAAAATAAAGAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.433.1 chr1 + 733 3 intergenic novelGene_360 novel NA NA NA NA NA NA multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATATCTATTTGTGCAGCCAT NA FALSE NA NA AATAAA -23 NA NA NA 2 NA PB.434.1 chr1 - 2841 7 full-splice_match IL22RA1 ENST00000270800.2 2817 7 -24 0 -24 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CCTGTTGTGATTTTTTTTTT -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.435.1 chr1 + 3588 3 antisense novelGene_IFNLR1_AS novel NA NA NA NA NA NA multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGTCTCTTTTTACTTAATTT NA FALSE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.436.1 chr1 - 4535 7 full-splice_match IFNLR1 ENST00000327535.6 4566 7 21 10 -7 -10 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAGAAAAAAGGTACAATTG 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.437.1 chr1 + 1023 3 incomplete-splice_match GRHL3 ENST00000236255.4 1870 16 24495 -824 10037 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACATTACTTCACATGCTGCT NA FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.438.1 chr1 - 2498 7 novel_in_catalog STPG1 novel 6016 10 NA NA 6 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTTTTGGGTACCCCTTAA -21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.438.3 chr1 - 2674 9 full-splice_match STPG1 ENST00000337248.9 2726 9 50 2 -7 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.568991 0.552545 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAGCTTTTGGGTACCCCTTA 23 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.438.4 chr1 - 2578 8 full-splice_match STPG1 ENST00000003583.12 2544 8 -30 -4 27 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAGCTTTTGGGTACCCCTTA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.438.5 chr1 - 2794 10 novel_in_catalog STPG1 novel 6016 10 NA NA -15 1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTGAGCTTTTGGGTACCCC 15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.438.6 chr1 - 1584 9 full-splice_match STPG1 ENST00000337248.9 2726 9 43 1099 -14 -1093 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTCCTGCCTTTCTCATTTG 16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.438.7 chr1 - 1682 10 novel_in_catalog STPG1 novel 6016 10 NA NA 0 -1096 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTCACTCCTGCCTTTCTCAT 30 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.438.8 chr1 - 993 5 incomplete-splice_match STPG1 ENST00000337248.9 2726 9 37 22263 -20 11 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAATAGGTGTTTTAACAGT 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.439.1 chr1 + 1038 2 novel_not_in_catalog NIPAL3 novel 5372 12 NA NA -2275 -48 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAGGAAAAAAAAAAAAAA -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.439.2 chr1 + 3159 12 full-splice_match NIPAL3 ENST00000374399.9 5372 12 -6 2219 -6 -2219 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAACTGACATCTGTTGTC -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.439.3 chr1 + 899 2 full-splice_match NIPAL3 ENST00000488155.1 931 2 -16 48 -6 -48 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAGGAAAAAAAAAAAAAA -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.439.4 chr1 + 5375 12 full-splice_match NIPAL3 ENST00000374399.9 5372 12 0 -3 0 3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTGAGTTCGTGTCTTATGTT 3 TRUE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.439.7 chr1 + 3562 11 incomplete-splice_match NIPAL3 ENST00000339255.2 1676 12 -12 9 0 -9 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAATTAAAAATAAATAAAT 3 TRUE NA NA AAGAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.439.9 chr1 + 2083 12 full-splice_match NIPAL3 ENST00000339255.2 1676 12 -12 -395 0 327 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTTTAGGTGTATTCCTGTT 3 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.439.10 chr1 + 1724 12 full-splice_match NIPAL3 ENST00000374399.9 5372 12 0 3648 0 2950 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 30 7.137981 0.853575 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGGATGCGTTATCTTGGT 3 TRUE NA NA AAAAAG -15 NA NA NA 30 NA PB.439.11 chr1 + 1679 12 full-splice_match NIPAL3 ENST00000339255.2 1676 12 -12 9 0 -9 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 27 6.424183 0.807818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAATTAAAAATAAATAAAT 3 TRUE NA NA AAGAAA -15 NA NA NA 27 NA PB.439.12 chr1 + 1327 11 novel_in_catalog NIPAL3 novel 1676 12 NA NA 1 -9 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAATTAAAAATAAATAAAT 5 TRUE NA NA AAGAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.439.13 chr1 + 1134 3 full-splice_match NIPAL3 ENST00000475663.2 694 3 -54 -386 1 386 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGACTCATCTCTCCCTGCCT 5 TRUE NA NA AAAACA -19 NA NA NA 2 NA PB.439.14 chr1 + 1371 11 novel_in_catalog NIPAL3 novel 5372 12 NA NA 2 2950 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGGATGCGTTATCTTGGT 6 TRUE NA NA AAAAAG -15 NA NA NA 3 NA PB.439.15 chr1 + 1333 11 incomplete-splice_match NIPAL3 ENST00000339255.2 1676 12 3720 9 3676 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAATTAAAAATAAATAAAT 3674 FALSE NA NA AAGAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.440.1 chr1 + 1591 5 full-splice_match RCAN3 ENST00000374395.9 6863 5 -16 5288 -16 -109 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 GTTACTCAGTATACATGAAA 270 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.440.2 chr1 + 1554 5 novel_in_catalog RCAN3 novel 6863 5 NA NA 0 -97 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACATGAAATTTTTTGCAGGA -1 TRUE NA NA AATAAA -26 NA NA NA 2 NA PB.440.4 chr1 + 2753 5 full-splice_match RCAN3 ENST00000374395.9 6863 5 83 4027 22 -6 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAACTCAGCATTGTGCCCAT -5 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 7 NA PB.440.5 chr1 + 2711 5 novel_in_catalog RCAN3 novel 6863 5 NA NA 31 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAACTCAGCATTGTGCCCAT 4 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 8 NA PB.440.6 chr1 + 1473 5 full-splice_match RCAN3 ENST00000374395.9 6863 5 92 5298 31 -119 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATCAAAGGTTGTTACTCAGT 4 TRUE NA NA AATAAA -4 NA NA NA 2 NA PB.440.7 chr1 + 856 5 novel_in_catalog RCAN3 novel 6863 5 NA NA 34 -118 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAACTGAAGAGGAAGAAGAG 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.440.8 chr1 + 1403 5 novel_in_catalog RCAN3 novel 6863 5 NA NA 88 -99 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATACATGAAATTTTTTGCAG -28 TRUE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 2 NA PB.440.9 chr1 + 2650 5 novel_in_catalog RCAN3 novel 6863 5 NA NA 98 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCATTGTGCCCATTTTTTA -18 TRUE NA NA AATAAA -23 NA NA NA 2 NA PB.440.10 chr1 + 1405 5 full-splice_match RCAN3 ENST00000374395.9 6863 5 173 5285 112 -106 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ACTCAGTATACATGAAATTT -4 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 7 NA PB.440.11 chr1 + 2643 5 full-splice_match RCAN3 ENST00000374395.9 6863 5 193 4027 132 -6 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAACTCAGCATTGTGCCCAT 16 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.443.1 chr1 + 605 5 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000468822.5 768 7 -103 2499 -100 -17 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAGATAAAAGAGATAAGGA 52 FALSE NA NA AAAAAG -13 NA NA NA 2 NA PB.443.2 chr1 + 1542 6 novel_in_catalog SRRM1 novel 673 6 NA NA -72 -17 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAGATAAAAGAGATAAGGA 80 FALSE NA NA AAAAAG -13 NA NA NA 2 NA PB.443.3 chr1 + 892 7 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000479034.5 2671 17 -78 19092 -42 -6 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 142 33.786446 1.528742 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAAGAAAAGGAGAAGGA 9 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 142 NA PB.443.5 chr1 + 3747 17 novel_in_catalog SRRM1 novel 3735 17 NA NA 1 -11 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGCCACTCTTACTTAGTAGT -18 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 10 NA PB.443.6 chr1 + 3745 17 full-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 -29 19 1 -19 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 26 6.186250 0.791427 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATTTTGCCACTCTTAC -18 TRUE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 26 NA PB.443.7 chr1 + 2574 17 novel_in_catalog SRRM1 novel 2671 17 NA NA 1 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.331058 0.522582 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAACACAAGAAGGAAAA -18 TRUE NA NA AAAAAG -43 NA NA NA 14 NA PB.443.8 chr1 + 2538 16 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 -29 1812 1 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 51 12.134568 1.084024 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAACACAAGAAGGAAAA -18 TRUE NA NA AAAAAG -43 NA NA NA 51 NA PB.443.11 chr1 + 2330 15 novel_in_catalog SRRM1 novel 3735 17 NA NA 1 689 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAAAGCCCCCAGCACCTC -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.443.12 chr1 + 1944 12 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000479034.5 2671 17 -35 8529 1 -2 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AACTCCTGAACATCTTTGAA -18 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.443.13 chr1 + 1883 14 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 -29 4069 1 -52 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGAGAAGAACGGCTTCAC -18 TRUE NA NA AATACA -28 NA NA NA 2 NA PB.443.14 chr1 + 920 8 novel_not_in_catalog SRRM1 novel 3735 17 NA NA 1 -6 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAAGAAAAGGAGAAGGA -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.443.15 chr1 + 2578 17 full-splice_match SRRM1 ENST00000479034.5 2671 17 -33 126 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 33 7.851779 0.894968 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAACACAAGAAGGAAAA -16 TRUE NA NA AAAAAG -43 NA NA NA 33 NA PB.443.16 chr1 + 425 4 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000468822.5 768 7 0 3517 0 110 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AACTGAAGAAAGAAGAAATA -16 TRUE NA NA AAGAAA -31 NA NA NA 2 NA PB.443.17 chr1 + 743 7 full-splice_match SRRM1 ENST00000468822.5 768 7 3 22 3 -17 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAATTCCAAAAAAGAA -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.443.18 chr1 + 667 6 full-splice_match SRRM1 ENST00000490543.5 673 6 -27 33 3 21 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AGAAAAAAGGGAGCGGTCTC -13 TRUE NA NA GATAAA -30 NA NA NA 5 NA PB.443.19 chr1 + 535 5 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000468822.5 768 7 3 2463 3 19 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 36 8.565578 0.932757 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AGAGAAAAAAGGGAGCGGTC -13 TRUE NA NA GATAAA -28 NA NA NA 36 NA PB.443.20 chr1 + 3643 17 novel_in_catalog SRRM1 novel 3735 17 NA NA 6 -20 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAAATTTTGCCACTCTTA -10 TRUE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.443.22 chr1 + 3761 18 novel_in_catalog SRRM1 novel 3110 18 NA NA 0 -19 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATTTTGCCACTCTTAC 2 TRUE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 7 NA PB.443.23 chr1 + 3775 18 novel_in_catalog SRRM1 novel 3110 18 NA NA 0 -11 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 30 7.137981 0.853575 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGCCACTCTTACTTAGTAGT 2 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 30 NA PB.443.24 chr1 + 2598 7 novel_in_catalog SRRM1 novel 3735 17 NA NA 0 -17 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAATTCCAAAAAAGAA 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.443.25 chr1 + 2553 4 full-splice_match SRRM1 ENST00000462710.5 2624 4 0 71 0 -17 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.806923 0.580574 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAGATAAAAGAGATAAGGA 2 TRUE NA NA AAAAAG -13 NA NA NA 16 NA PB.443.28 chr1 + 2317 15 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 -9 3083 0 690 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAAGCCCCCAGCACCTCC 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.443.32 chr1 + 2192 4 full-splice_match SRRM1 ENST00000466910.5 799 4 21 -1414 0 115 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAGAAGAAATAAAACA 2 TRUE NA NA AAGAAA -36 NA NA NA 5 NA PB.443.33 chr1 + 2139 6 novel_in_catalog SRRM1 novel 3735 17 NA NA 0 -18 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 GAAAAAAATTCCAAAAAAGA 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.443.34 chr1 + 1999 15 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000479034.5 2671 17 -15 2289 0 42 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAACAAAGAAGCTCCCCAGT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.443.35 chr1 + 948 8 novel_in_catalog SRRM1 novel 3735 17 NA NA 0 -17 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.093125 0.490398 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAATTCCAAAAAAGAA 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.443.36 chr1 + 2263 5 novel_in_catalog SRRM1 novel 673 6 NA NA 1 -17 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 32 7.613847 0.881604 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAGATAAAAGAGATAAGGA 3 TRUE NA NA AAAAAG -13 NA NA NA 32 NA PB.443.37 chr1 + 2884 6 novel_in_catalog SRRM1 novel 3735 17 NA NA 3 -17 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAATTCCAAAAAAGAA 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.443.39 chr1 + 2354 16 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000479034.5 2671 17 -10 1397 -1 690 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAAGCCCCCAGCACCTCC 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.443.41 chr1 + 1297 9 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000479034.5 2671 17 -10 16513 -1 -47 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAAAGTCGTGTTTCTG 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.443.42 chr1 + 2474 3 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000600523.5 575 6 11 -114 0 114 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.568991 0.552545 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 GAAGAAAGAAGAAATAAAAC 8 TRUE NA NA AAGAAA -35 NA NA NA 15 NA PB.443.46 chr1 + 2150 2 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000495561.1 563 3 -1674 1499 -1590 2 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAGAAAAAGAAAGCAGCAGA 3368 FALSE NA NA GATAAA -11 NA NA NA 3 NA PB.443.47 chr1 + 1143 2 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000495561.1 563 3 -686 1518 -602 -17 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAGATAAAAGAGATAAGGA 4356 FALSE NA NA AAAAAG -13 NA NA NA 5 NA PB.443.48 chr1 + 1103 2 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000495561.1 563 3 -610 1482 -526 19 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AGAGAAAAAAGGGAGCGGTC 4432 FALSE NA NA GATAAA -28 NA NA NA 4 NA PB.443.49 chr1 + 3354 14 novel_in_catalog SRRM1 novel 3735 17 NA NA 340 -20 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAAATTTTGCCACTCTTA 24 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 3 NA PB.443.56 chr1 + 2920 12 novel_in_catalog SRRM1 novel 2671 17 NA NA 21 -20 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAAATTTTGCCACTCTTA 3584 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.443.58 chr1 + 2762 10 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 9619 20 424 -20 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAAATTTTGCCACTCTTA 3987 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 4 NA PB.443.61 chr1 + 2660 9 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 11552 11 -157 -11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGCCACTCTTACTTAGTAGT 5920 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.443.62 chr1 + 2675 10 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000374389.8 3110 18 11573 -635 -139 -20 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAAATTTTGCCACTCTTA 5938 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.443.64 chr1 + 2582 9 novel_in_catalog SRRM1 novel 3735 17 NA NA -94 -20 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAAATTTTGCCACTCTTA 30 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.443.67 chr1 + 2500 10 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000374389.8 3110 18 11748 -635 -7 -20 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAAATTTTGCCACTCTTA 160 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 4 NA PB.443.69 chr1 + 2314 8 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000374389.8 3110 18 18033 -635 -5223 -20 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAAATTTTGCCACTCTTA 5546 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.443.70 chr1 + 2236 7 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 18066 20 -5187 -20 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAAATTTTGCCACTCTTA 5582 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 3 NA PB.443.71 chr1 + 2202 6 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 19364 19 -3889 -19 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATTTTGCCACTCTTAC 6880 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.443.72 chr1 + 2207 7 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000374389.8 3110 18 19404 -636 -3852 -19 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATTTTGCCACTCTTAC 6917 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.443.74 chr1 + 891 5 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000479034.5 2671 17 19882 126 -3365 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAACACAAGAAGGAAAA 7404 FALSE NA NA AAAAAG -43 NA NA NA 6 NA PB.443.78 chr1 + 2064 5 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 23511 20 258 -20 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAAATTTTGCCACTCTTA NA FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 8 NA PB.443.80 chr1 + 1904 4 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 25868 20 -413 -20 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAAATTTTGCCACTCTTA NA FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 6 NA PB.443.81 chr1 + 1708 4 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 26065 19 -216 -19 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 25 5.948318 0.774394 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATTTTGCCACTCTTAC NA FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 25 NA PB.443.82 chr1 + 1507 4 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 26265 20 -16 -20 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 24 5.710385 0.756665 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAAATTTTGCCACTCTTA NA FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 24 NA PB.443.83 chr1 + 1440 3 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 26873 11 592 -11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGCCACTCTTACTTAGTAGT NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.443.84 chr1 + 1320 3 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 26985 19 704 -19 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATTTTGCCACTCTTAC NA FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 10 NA PB.443.85 chr1 + 1241 2 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 28134 19 1853 -19 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 38 9.041443 0.956238 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATTTTGCCACTCTTAC NA FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 38 NA PB.443.86 chr1 + 1130 2 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 28245 19 1964 -19 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.093125 0.490398 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATTTTGCCACTCTTAC NA FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 13 NA PB.446.6 chr1 - 2404 5 full-splice_match RUNX3 ENST00000308873.11 4267 5 321 1542 321 -24 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAACAAA 11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.446.7 chr1 - 2198 5 full-splice_match RUNX3 ENST00000308873.11 4267 5 527 1542 527 -24 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAACAAA 525 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.446.8 chr1 - 1773 2 incomplete-splice_match RUNX3 ENST00000496967.1 572 5 21381 -1519 21381 -24 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAACAAA 3797 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.447.1 chr1 + 2361 6 full-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 -108 2000 -43 -1946 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAGACAAAAGCAAAACCA -20 TRUE NA NA AATAAA -27 NA NA NA 3 NA PB.447.3 chr1 + 4314 6 full-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 -65 4 0 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 315 74.948799 1.874765 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGTGTTTGAGACTACTA 23 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 315 NA PB.447.4 chr1 + 5146 6 full-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 -62 -831 3 831 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AGGAAAAAAAAAAACAAAAA 26 TRUE NA NA AATACA -19 NA NA NA 2 NA PB.447.5 chr1 + 4298 7 novel_in_catalog CLIC4 novel 2723 7 NA NA 3 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATAAAGGATTCTTTTTTCCC 26 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.447.6 chr1 + 801 6 full-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 -62 3514 3 900 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAGAAATGACTGGCATCT 26 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.447.8 chr1 + 935 6 full-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 -55 3373 10 1041 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 50 11.896635 1.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAAGAGATGTCTTCATGT 33 FALSE NA NA AGTAAA -11 NA NA NA 50 NA PB.447.9 chr1 + 1737 6 full-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 -16 2532 -16 1882 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 21 4.996587 0.698673 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATCATAGAGCTTGCTATTT 72 FALSE NA NA AAAAAG -14 NA NA NA 21 NA PB.447.10 chr1 + 4249 6 full-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 0 4 0 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 72 17.131155 1.233787 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGTGTTTGAGACTACTA 0 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 72 NA PB.447.11 chr1 + 2245 6 full-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 0 2008 0 -1954 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TCTTTTTTAAAAGACAAAAG 0 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.447.12 chr1 + 4190 6 full-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 66 -3 66 3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TTTGAGACTACTATTTTTTT 28 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 7 NA PB.447.13 chr1 + 741 6 full-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 140 3372 140 1042 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAGAGATGTCTTCATGTC 102 FALSE NA NA AGTAAA -12 NA NA NA 3 NA PB.447.17 chr1 + 3989 5 incomplete-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 52326 54 52326 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATAAAGGATTCTTTTTTCCC -25 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.447.21 chr1 + 3962 4 incomplete-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 68645 4 68645 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGTGTTTGAGACTACTA NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.447.22 chr1 + 3861 4 incomplete-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 68696 54 68696 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATAAAGGATTCTTTTTTCCC 19 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 7 NA PB.447.26 chr1 + 3790 3 incomplete-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 81607 4 81607 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGTGTTTGAGACTACTA NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 9 NA PB.447.27 chr1 + 3643 2 incomplete-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 94497 4 94497 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGTGTTTGAGACTACTA -7 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 8 NA PB.450.1 chr1 - 1691 7 full-splice_match SYF2 ENST00000236273.9 1757 7 3 63 3 -63 alternative_3end TRUE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TAAAACTCCAGAGGGAAAGG 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.450.2 chr1 - 895 3 incomplete-splice_match SYF2 ENST00000354361.3 926 6 5000 -284 4946 284 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACATTTTTAGTCTATCATT 8772 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.450.3 chr1 - 1351 7 full-splice_match SYF2 ENST00000236273.9 1757 7 0 406 0 283 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 258 61.386639 1.788074 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAACATTTTTAGTCTATCAT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 258 NA PB.450.4 chr1 - 1148 5 incomplete-splice_match SYF2 ENST00000236273.9 1757 7 3415 406 3345 283 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAACATTTTTAGTCTATCAT 7171 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.450.5 chr1 - 1001 4 incomplete-splice_match SYF2 ENST00000354361.3 926 6 4308 -283 4254 283 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAACATTTTTAGTCTATCAT 8080 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.450.7 chr1 - 1420 7 full-splice_match SYF2 ENST00000236273.9 1757 7 -75 412 -75 277 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATTTCTAACATTTTTAGTC 3681 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.450.8 chr1 - 843 2 incomplete-splice_match SYF2 ENST00000354361.3 926 6 7386 -277 7332 277 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATTTCTAACATTTTTAGTC 7401 FALSE NA NA TATAAA -11 NA NA NA 3 NA PB.450.9 chr1 - 1214 6 full-splice_match SYF2 ENST00000354361.3 926 6 -13 -275 3 275 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAATTTCTAACATTTTTAG 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.450.10 chr1 - 1196 6 incomplete-splice_match SYF2 ENST00000236273.9 1757 7 379 414 309 275 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAATTTCTAACATTTTTAG 4135 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.450.11 chr1 - 898 6 incomplete-splice_match SYF2 ENST00000236273.9 1757 7 376 715 306 -26 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAATGTATATGGCTGTTTA 4132 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.450.12 chr1 - 904 6 full-splice_match SYF2 ENST00000354361.3 926 6 -7 29 -7 -29 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TTTTAAATGTATATGGCTGT 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.450.13 chr1 - 1035 7 full-splice_match SYF2 ENST00000236273.9 1757 7 3 719 3 -30 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 145 34.500244 1.537822 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTTTAAATGTATATGGCTG 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 145 NA PB.450.14 chr1 - 1134 6 incomplete-splice_match SYF2 ENST00000236273.9 1757 7 20 835 4 -146 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATATCCTTTCATGTATATTT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.450.15 chr1 - 663 5 incomplete-splice_match SYF2 ENST00000236273.9 1757 7 3471 835 3401 -146 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATATCCTTTCATGTATATTT 7227 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.450.16 chr1 - 918 7 full-splice_match SYF2 ENST00000236273.9 1757 7 3 836 3 -147 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 106 25.220867 1.401760 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATATCCTTTCATGTATATT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 106 NA PB.452.1 chr1 + 1216 1 full-splice_match ENSG00000272432 ENST00000607698.1 485 1 -723 -8 -723 8 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA NA NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATTGTGGGTTAATTGCC NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.453.1 chr1 - 1314 6 novel_in_catalog RSRP1 novel 1425 5 NA NA 0 1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TCTTTATTGTATATATATAA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.453.2 chr1 - 3613 4 novel_in_catalog RSRP1 novel 3034 6 NA NA 242 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGTCTTTATTGTATATATAT 499 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.453.3 chr1 - 2580 3 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000498238.1 2941 4 639 1 -175 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGTCTTTATTGTATATATAT 673 FALSE NA NA AAAAAG -15 NA NA NA 3 NA PB.453.4 chr1 - 1948 7 novel_in_catalog RSRP1 novel 3034 6 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGTCTTTATTGTATATATAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.453.5 chr1 - 1737 4 novel_in_catalog RSRP1 novel 3034 6 NA NA 4 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGTCTTTATTGTATATATAT 865 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.453.6 chr1 - 1673 2 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000566395.5 824 5 1769 -5 442 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGTCTTTATTGTATATATAT 2722 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.453.7 chr1 - 1394 2 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000566395.5 824 5 2048 -5 -382 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGTCTTTATTGTATATATAT 3001 FALSE NA NA GATAAA -13 NA NA NA 7 NA PB.453.8 chr1 - 1140 2 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000566395.5 824 5 2302 -5 -128 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.855192 0.455635 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGTCTTTATTGTATATATAT 3255 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.453.9 chr1 - 1021 2 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000566395.5 824 5 2421 -5 -9 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGTCTTTATTGTATATATAT 3374 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.453.10 chr1 - 901 2 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000566395.5 824 5 2541 -5 111 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGTCTTTATTGTATATATAT 3494 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.453.11 chr1 - 2939 4 full-splice_match RSRP1 ENST00000498238.1 2941 4 0 2 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 62 14.751828 1.168846 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAGTCTTTATTGTATATATA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 62 NA PB.453.12 chr1 - 2288 5 novel_in_catalog RSRP1 novel 1425 5 NA NA 0 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 47 11.182837 1.048552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAGTCTTTATTGTATATATA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 47 NA PB.453.13 chr1 - 2176 6 novel_in_catalog RSRP1 novel 1425 5 NA NA 0 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAGTCTTTATTGTATATATA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.453.14 chr1 - 2163 6 novel_in_catalog RSRP1 novel 1425 5 NA NA 0 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAGTCTTTATTGTATATATA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.453.15 chr1 - 2234 3 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000498238.1 2941 4 984 2 65 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAGTCTTTATTGTATATATA 1018 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.453.16 chr1 - 1634 4 novel_in_catalog RSRP1 novel 3034 6 NA NA 14 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAGTCTTTATTGTATATATA 967 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.453.18 chr1 - 1597 2 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000566395.5 824 5 1841 -1 514 1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TCTTAGTCTTTATTGTATAT 2794 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.453.19 chr1 - 2054 6 novel_in_catalog RSRP1 novel 3034 6 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTCTTAGTCTTTATTGTAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.453.21 chr1 - 1889 2 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000566395.5 824 5 1547 1 220 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTCTTAGTCTTTATTGTAT 2500 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.453.23 chr1 - 1463 6 novel_in_catalog RSRP1 novel 3034 6 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.617260 0.417847 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTCTTAGTCTTTATTGTAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.453.24 chr1 - 1418 5 full-splice_match RSRP1 ENST00000243189.12 1425 5 0 7 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 46 10.944904 1.039212 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTCTTAGTCTTTATTGTAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 46 NA PB.453.25 chr1 - 1333 4 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000243189.12 1425 5 364 7 356 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTCTTAGTCTTTATTGTAT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.453.26 chr1 - 1301 6 novel_in_catalog RSRP1 novel 1425 5 NA NA -5 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTCTTAGTCTTTATTGTAT 26 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.453.27 chr1 - 988 3 full-splice_match RSRP1 ENST00000564223.5 395 3 -558 -35 -107 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTCTTAGTCTTTATTGTAT 3276 FALSE NA NA AATATA -29 NA NA NA 2 NA PB.453.28 chr1 - 869 3 full-splice_match RSRP1 ENST00000569495.5 901 3 25 7 25 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTCTTAGTCTTTATTGTAT 3408 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.453.29 chr1 - 750 2 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000566395.5 824 5 2686 1 -195 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTCTTAGTCTTTATTGTAT 3639 FALSE NA NA TTTAAA -34 NA NA NA 5 NA PB.453.32 chr1 - 731 2 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000569495.5 901 3 -107 389 -107 -275 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAATAGATCAGAAAAAAA 3276 FALSE NA NA AATATA -29 NA NA NA 2 NA PB.453.33 chr1 - 1962 3 full-splice_match RSRP1 ENST00000431849.3 1954 3 -8 0 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 21 4.996587 0.698673 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAAAAAATGCTGTAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 21 NA PB.453.34 chr1 - 1311 4 novel_in_catalog RSRP1 novel 2941 4 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 21 4.996587 0.698673 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAAAAAATGCTGTAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 21 NA PB.453.35 chr1 - 1082 5 novel_in_catalog RSRP1 novel 3034 6 NA NA 0 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAAAAAATGCTGTAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.453.40 chr1 - 1168 2 full-splice_match RSRP1 ENST00000450820.2 970 2 -12 -186 -12 186 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCTGACCTTTCCG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.453.45 chr1 - 1023 1 full-splice_match SDHDP6 ENST00000414693.1 480 1 256 -799 256 799 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA NA NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAAAAGATGAA NA FALSE NA NA AAAACA -13 NA NA NA 2 NA PB.454.1 chr1 + 982 6 full-splice_match TMEM50A ENST00000480937.5 1102 6 -23 143 -17 -129 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATATTCCGTGGTCAAAA NA FALSE NA NA TATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.454.2 chr1 + 906 7 full-splice_match TMEM50A ENST00000374358.5 2266 7 -34 1394 -17 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 824 196.056549 2.292381 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAATAAAAAGAAATTACA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 824 NA PB.454.3 chr1 + 679 5 full-splice_match TMEM50A ENST00000491936.5 965 5 -12 298 -9 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAATAAAAAGAAATTACA -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.454.4 chr1 + 2288 7 full-splice_match TMEM50A ENST00000374358.5 2266 7 -24 2 -7 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 182 43.303753 1.636526 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGTTTTTAGTCTTTAATTT -12 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 182 NA PB.454.5 chr1 + 2155 7 full-splice_match TMEM50A ENST00000374358.5 2266 7 -24 135 -7 -135 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGAATCTTAAGAATTGTC -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.454.6 chr1 + 1186 7 novel_not_in_catalog TMEM50A novel 2266 7 NA NA -7 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAGTTTTTAGTCTTTAATT -12 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.454.7 chr1 + 799 6 full-splice_match TMEM50A ENST00000480937.5 1102 6 -9 312 -3 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.617260 0.417847 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAATAAAAAGAAATTACA -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.454.8 chr1 + 779 6 full-splice_match TMEM50A ENST00000498135.5 776 6 -3 0 -3 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 24 5.710385 0.756665 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAATAAAAAGAAATTACA -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 24 NA PB.454.9 chr1 + 1059 7 full-splice_match TMEM50A ENST00000374358.5 2266 7 -18 1225 -1 -129 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 65 15.465626 1.189368 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATATTCCGTGGTCAAAA -6 TRUE NA NA TATAAA -16 NA NA NA 65 NA PB.454.11 chr1 + 2166 6 full-splice_match TMEM50A ENST00000498135.5 776 6 1 -1391 1 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAGTTTTTAGTCTTTAATT -4 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 8 NA PB.454.12 chr1 + 1435 7 full-splice_match TMEM50A ENST00000374358.5 2266 7 -16 847 1 235 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATCTGTGTACTGAACCACTA -4 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 7 NA PB.454.13 chr1 + 837 5 full-splice_match TMEM50A ENST00000491936.5 965 5 -2 130 1 -130 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TAAAATATTCCGTGGTCAAA -4 TRUE NA NA TATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.454.14 chr1 + 1139 8 novel_not_in_catalog TMEM50A novel 2266 7 NA NA 0 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAATAAAAAGAAATTACA 12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.454.15 chr1 + 775 7 full-splice_match TMEM50A ENST00000374358.5 2266 7 97 1394 -29 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAATAAAAAGAAATTACA 51 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.454.16 chr1 + 2517 7 novel_in_catalog TMEM50A novel 2266 7 NA NA -18 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGTTTTTAGTCTTTAATTT 62 FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.454.17 chr1 + 1118 7 novel_in_catalog TMEM50A novel 799 6 NA NA -11 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 26 6.186250 0.791427 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAATAAAAAGAAATTACA 69 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 26 NA PB.454.18 chr1 + 2091 6 incomplete-splice_match TMEM50A ENST00000374358.5 2266 7 2190 2 2064 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGTTTTTAGTCTTTAATTT 2144 FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.454.19 chr1 + 697 6 incomplete-splice_match TMEM50A ENST00000374358.5 2266 7 2192 1394 2066 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAATAAAAAGAAATTACA 2146 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.454.20 chr1 + 1241 6 incomplete-splice_match TMEM50A ENST00000374358.5 2266 7 2195 847 -2063 235 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATCTGTGTACTGAACCACTA 2149 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 3 NA PB.454.21 chr1 + 627 5 incomplete-splice_match TMEM50A ENST00000374358.5 2266 7 4643 1394 385 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAATAAAAAGAAATTACA 2439 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.454.22 chr1 + 1950 5 incomplete-splice_match TMEM50A ENST00000374358.5 2266 7 4711 3 453 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAGTTTTTAGTCTTTAATT 2507 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.454.23 chr1 + 865 3 incomplete-splice_match TMEM50A ENST00000498135.5 776 6 14162 0 9887 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAATAAAAAGAAATTACA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.454.24 chr1 + 1811 3 incomplete-splice_match TMEM50A ENST00000374358.5 2266 7 14590 3 10332 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.617260 0.417847 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAGTTTTTAGTCTTTAATT NA FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 11 NA PB.455.3 chr1 + 2569 11 full-splice_match MACO1 ENST00000374343.5 3940 11 -27 1398 12 -419 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.331058 0.522582 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATGTTTGTTTTGTTTTATT 12 FALSE NA NA AAAAAG -25 NA NA NA 14 NA PB.455.4 chr1 + 2304 11 full-splice_match MACO1 ENST00000374343.5 3940 11 -13 1649 -13 -670 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATTTTGTGGAACTGTATCT 26 FALSE NA NA GATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.455.7 chr1 + 2473 11 full-splice_match MACO1 ENST00000374343.5 3940 11 68 1399 5 -420 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTATGTTTGTTTTGTTTTAT -1 TRUE NA NA AAAAAG -24 NA NA NA 2 NA PB.455.8 chr1 + 2332 11 full-splice_match MACO1 ENST00000374343.5 3940 11 126 1482 63 -503 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGTAGCCAACTTTGCCTTT -9 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.455.15 chr1 + 1905 8 incomplete-splice_match MACO1 ENST00000374343.5 3940 11 23367 1479 5371 -500 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGCCAACTTTGCCTTTTAT NA FALSE NA NA ATTAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.455.16 chr1 + 923 4 incomplete-splice_match MACO1 ENST00000374343.5 3940 11 25771 14499 7775 -13520 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AGAAACAGTTAATGGAAGAG NA FALSE NA NA AAAAAG -35 NA NA NA 2 NA PB.455.17 chr1 + 1639 7 incomplete-splice_match MACO1 ENST00000374343.5 3940 11 25900 1482 7904 -503 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGTAGCCAACTTTGCCTTT NA FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.455.18 chr1 + 1440 6 incomplete-splice_match MACO1 ENST00000374343.5 3940 11 27492 1648 9496 -669 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTTGTGGAACTGTATCTG NA FALSE NA NA GATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.455.19 chr1 + 1515 6 incomplete-splice_match MACO1 ENST00000374343.5 3940 11 27586 1479 9590 -500 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGCCAACTTTGCCTTTTAT NA FALSE NA NA ATTAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.455.20 chr1 + 1243 6 incomplete-splice_match MACO1 ENST00000374343.5 3940 11 27862 1475 9866 -496 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAACTTTGCCTTTTATGTAT NA FALSE NA NA ATTAAA -24 NA NA NA 4 NA PB.455.23 chr1 + 2520 5 incomplete-splice_match MACO1 ENST00000374343.5 3940 11 53279 4 35283 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAACTAGTTTTCTGCCTTT NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.455.24 chr1 + 1045 5 incomplete-splice_match MACO1 ENST00000647928.1 2887 11 53217 499 35284 -499 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCCAACTTTGCCTTTTATG NA FALSE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 5 NA PB.455.25 chr1 + 896 4 incomplete-splice_match MACO1 ENST00000647928.1 2887 11 54700 503 36767 -503 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGTAGCCAACTTTGCCTTT NA FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.456.1 chr1 + 3048 10 novel_not_in_catalog LDLRAP1 novel 2914 9 NA NA -29 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGCAACGCTCATCAGGTGG NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.456.2 chr1 + 2677 7 novel_in_catalog LDLRAP1 novel 2914 9 NA NA -21 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGCAACGCTCATCAGGTGG 0 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.456.3 chr1 + 1111 9 fusion ENSG00000225643_LDLRAP1 novel 2914 9 NA NA 0 48 multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGGGGTTGAGTCTGTCTTGT -29 TRUE NA NA CATAAA -22 NA NA NA 4 NA PB.456.4 chr1 + 2911 9 full-splice_match LDLRAP1 ENST00000374338.5 2914 9 1 2 1 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 80 19.034616 1.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGCAACGCTCATCAGGTGG -28 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 80 NA PB.456.5 chr1 + 2798 9 full-splice_match LDLRAP1 ENST00000374338.5 2914 9 114 2 114 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGCAACGCTCATCAGGTGG 85 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.456.6 chr1 + 2884 9 novel_in_catalog LDLRAP1 novel 4670 7 NA NA -78 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGCAACGCTCATCAGGTGG -1 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 7 NA PB.456.9 chr1 + 2667 8 incomplete-splice_match LDLRAP1 ENST00000374338.5 2914 9 10380 2 622 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGCAACGCTCATCAGGTGG 4065 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 5 NA PB.456.10 chr1 + 2424 6 incomplete-splice_match LDLRAP1 ENST00000374338.5 2914 9 13598 2 2323 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGCAACGCTCATCAGGTGG 223 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.456.11 chr1 + 2243 4 full-splice_match LDLRAP1 ENST00000484476.5 657 4 298 -1884 298 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGCAACGCTCATCAGGTGG 306 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 6 NA PB.456.12 chr1 + 2095 3 incomplete-splice_match LDLRAP1 ENST00000484476.5 657 4 953 -1884 135 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGCAACGCTCATCAGGTGG 110 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.456.14 chr1 + 1393 2 novel_not_in_catalog LDLRAP1 novel 4670 7 NA NA 2351 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGCAACGCTCATCAGGTGG 3283 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.457.1 chr1 + 1971 11 incomplete-splice_match MAN1C1 ENST00000263979.7 2627 13 68624 9 -28 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AATAAGAAATATGATTGGGC 15 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.457.3 chr1 + 1387 5 incomplete-splice_match MAN1C1 ENST00000374329.1 2461 11 62070 11 -397 -11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TGAATAAGAAATATGATTGG 237 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 3 NA PB.457.4 chr1 + 1092 4 incomplete-splice_match MAN1C1 ENST00000475314.5 893 5 712 -465 712 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AATAAGAAATATGATTGGGC 6866 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.457.5 chr1 + 957 3 full-splice_match MAN1C1 ENST00000487493.1 1145 3 337 -149 337 -9 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AATAAGAAATATGATTGGGC 9616 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.458.1 chr1 + 3929 11 incomplete-splice_match SELENON ENST00000374315.1 4212 12 910 2 872 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACTAGAGTGGTTCTAAGTG -6 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.458.2 chr1 + 3402 7 incomplete-splice_match SELENON ENST00000361547.7 4314 13 9489 3 9451 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAACTAGAGTGGTTCTAAGT 1027 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.458.3 chr1 + 3155 5 incomplete-splice_match SELENON ENST00000361547.7 4314 13 11525 2 11487 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACTAGAGTGGTTCTAAGTG 3063 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 8 NA PB.458.4 chr1 + 2933 4 incomplete-splice_match SELENON ENST00000361547.7 4314 13 12554 2 12516 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACTAGAGTGGTTCTAAGTG 4092 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.459.1 chr1 - 1585 11 novel_in_catalog RHCE novel 1810 12 NA NA 15 -20 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAATTAAAGACTAAAAA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.462.1 chr1 - 2114 3 full-splice_match AUNIP ENST00000374298.4 2161 3 47 0 47 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 40 9.517308 0.978514 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GCTCTTGTGATAATTGGTAA -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 40 NA PB.462.5 chr1 - 1300 3 full-splice_match AUNIP ENST00000374298.4 2161 3 40 821 40 -821 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 25 5.948318 0.774394 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGACAGTGGGATTGGCATC -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 25 NA PB.464.1 chr1 - 1052 2 genic STMN1 novel 1783 2 NA NA -388 -2266 multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAACAAAACAAAACAA 8673 FALSE NA NA AATATA -31 NA NA NA 2 NA PB.465.1 chr1 - 1612 5 full-splice_match STMN1 ENST00000399728.5 1712 5 115 -15 115 13 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 ACTAAAGGGAACCTTAATTA 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.465.2 chr1 - 1503 5 full-splice_match STMN1 ENST00000455785.7 1443 5 -63 3 -16 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 623 148.232071 2.170942 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 CAACTCCTGTGAAATGACTA 523 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 623 NA PB.465.3 chr1 - 3420 4 full-splice_match STMN1 ENST00000465604.1 2947 4 -26 -447 23 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGCAACTCCTGTGAAATGAC 3 TRUE NA NA GGGGCT -9 NA NA NA 2 NA PB.465.5 chr1 - 1350 4 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 447 -620 447 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.093125 0.490398 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGCAACTCCTGTGAAATGAC 2324 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.465.6 chr1 - 1201 3 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 1446 -620 131 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 20 4.758654 0.677484 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGCAACTCCTGTGAAATGAC 3323 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 20 NA PB.465.8 chr1 - 1041 2 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 3563 -619 2248 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 21 4.996587 0.698673 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAGCAACTCCTGTGAAATGA 5440 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 21 NA PB.465.10 chr1 - 1298 5 full-splice_match STMN1 ENST00000455785.7 1443 5 0 145 0 -143 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 35 8.327644 0.920522 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AACAGTTGAGAGAGAATCTC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 35 NA PB.465.11 chr1 - 1102 5 full-splice_match STMN1 ENST00000455785.7 1443 5 0 341 0 111 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 34 8.089712 0.907933 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATGACCGCACGTTCTCTG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 34 NA PB.465.12 chr1 - 2197 5 novel_in_catalog STMN1 novel 1712 5 NA NA 47 10 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTTCTTTTGAGTTAGGTTA 635 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.465.13 chr1 - 1037 5 full-splice_match STMN1 ENST00000455785.7 1443 5 -45 451 2 1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5846 1390.954590 3.143313 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GTGGCAGTGACTTCTTTTGA 0 TRUE NA NA GGGGCT -30 NA NA NA 5846 NA PB.465.14 chr1 - 2789 2 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 1375 -179 60 6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTGACTTCTTTTGAGTTAG 3252 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.465.15 chr1 - 1150 5 full-splice_match STMN1 ENST00000399728.5 1712 5 111 451 111 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 25 5.948318 0.774394 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGGTGGCAGTGACTTCTTTT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 25 NA PB.465.16 chr1 - 966 4 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 387 -176 387 3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 53 12.610434 1.100730 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GGCAGTGACTTCTTTTGAGT -6 TRUE NA NA AAAACA -32 NA NA NA 53 NA PB.465.17 chr1 - 1071 5 novel_not_in_catalog STMN1 novel 1712 5 NA NA 108 1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.617260 0.417847 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GTGGCAGTGACTTCTTTTGA -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.465.19 chr1 - 892 3 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 1309 -174 -6 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 79 18.796684 1.274081 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GTGGCAGTGACTTCTTTTGA 3186 FALSE NA NA AATAAA -2 NA NA NA 79 NA PB.465.20 chr1 - 571 2 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 3588 -174 2273 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.093125 0.490398 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GTGGCAGTGACTTCTTTTGA 5465 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.465.21 chr1 - 2949 4 full-splice_match STMN1 ENST00000465604.1 2947 4 -2 0 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.093125 0.490398 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGTGGCAGTGACTTCTTTTG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.465.22 chr1 - 1697 2 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 2461 -173 1146 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGTGGCAGTGACTTCTTTTG 4338 FALSE NA NA AAAAAG -4 NA NA NA 2 NA PB.465.23 chr1 - 1301 5 novel_not_in_catalog STMN1 novel 1712 5 NA NA -123 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGTGGCAGTGACTTCTTTTG 729 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.465.24 chr1 - 1137 5 novel_not_in_catalog STMN1 novel 1712 5 NA NA 111 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGTGGCAGTGACTTCTTTTG -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.465.25 chr1 - 993 5 full-splice_match STMN1 ENST00000399728.5 1712 5 269 450 269 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGTGGCAGTGACTTCTTTTG 1121 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.465.26 chr1 - 1307 5 novel_in_catalog STMN1 novel 1443 5 NA NA -2 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGGTGGCAGTGACTTCTTTT -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.465.27 chr1 - 915 5 novel_not_in_catalog STMN1 novel 1443 5 NA NA 0 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGGTGGCAGTGACTTCTTTT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.465.28 chr1 - 759 3 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 1439 -171 124 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 103 24.507069 1.389291 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGGTGGCAGTGACTTCTTT 3316 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 103 NA PB.465.29 chr1 - 1369 5 full-splice_match STMN1 ENST00000399728.5 1712 5 -110 453 -110 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTTGGTGGCAGTGACTTCTT 742 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.465.30 chr1 - 1525 2 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 2629 -169 1314 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTTGGTGGCAGTGACTTCT 4506 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.465.31 chr1 - 1378 2 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 2776 -169 1461 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTTGGTGGCAGTGACTTCT 4653 FALSE NA NA GATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.465.32 chr1 - 968 4 novel_not_in_catalog STMN1 novel 1712 5 NA NA 123 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTTGGTGGCAGTGACTTCT 975 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.465.33 chr1 - 860 5 full-splice_match STMN1 ENST00000455785.7 1443 5 0 583 0 42 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.855192 0.455635 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAGAGTATGTAGTGGCTT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.465.34 chr1 - 1040 5 full-splice_match STMN1 ENST00000399728.5 1712 5 89 583 89 40 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TGAAAAGAGTATGTAGTGGC 941 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.465.35 chr1 - 589 5 full-splice_match STMN1 ENST00000455785.7 1443 5 0 854 0 -229 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAGACTGTACTGGCCAGTG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.466.2 chr1 + 1963 7 full-splice_match MTFR1L ENST00000374303.7 1953 7 -7 -3 -7 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 213 50.679668 1.704834 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTGCTGTGTCCATCTCTT -24 TRUE NA NA ATTAAA -24 NA NA NA 213 NA PB.466.3 chr1 + 2028 8 novel_in_catalog MTFR1L novel 1953 7 NA NA 8 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.331058 0.522582 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCATTTGCTGTGTCCAT -8 TRUE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 14 NA PB.466.5 chr1 + 1286 7 full-splice_match MTFR1L ENST00000374303.7 1953 7 15 652 -9 -48 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 20 4.758654 0.677484 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAGAGAAGTTGTTTCTGG -2 TRUE NA NA AATGAA -20 NA NA NA 20 NA PB.466.6 chr1 + 1169 7 full-splice_match MTFR1L ENST00000474295.5 1873 7 48 656 -1 -48 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAGAGAAGTTGTTTCTGG 6 TRUE NA NA AATGAA -20 NA NA NA 5 NA PB.466.7 chr1 + 2338 6 novel_in_catalog MTFR1L novel 1873 7 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTGCTGTGTCCATCTCTT 7 TRUE NA NA ATTAAA -24 NA NA NA 2 NA PB.466.8 chr1 + 2134 8 novel_in_catalog MTFR1L novel 1953 7 NA NA 0 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTGCTGTGTCCATCTCTT 7 TRUE NA NA ATTAAA -24 NA NA NA 2 NA PB.466.9 chr1 + 1822 7 full-splice_match MTFR1L ENST00000474295.5 1873 7 49 2 0 2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 38 9.041443 0.956238 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CATTTGCTGTGTCCATCTCT 7 TRUE NA NA ATTAAA -23 NA NA NA 38 NA PB.466.10 chr1 + 2442 6 novel_in_catalog MTFR1L novel 1953 7 NA NA 2 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTGCTGTGTCCATCTCTT 12 TRUE NA NA ATTAAA -24 NA NA NA 3 NA PB.466.11 chr1 + 1950 7 full-splice_match MTFR1L ENST00000524618.5 1217 7 -3 -730 2 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTGCTGTGTCCATCTCTT 12 TRUE NA NA ATTAAA -24 NA NA NA 2 NA PB.466.12 chr1 + 1881 7 full-splice_match MTFR1L ENST00000374307.9 1868 7 -15 2 2 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.806923 0.580574 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCATTTGCTGTGTCCAT 17 TRUE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 16 NA PB.466.13 chr1 + 1809 6 novel_in_catalog MTFR1L novel 1953 7 NA NA 4 2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CATTTGCTGTGTCCATCTCT 19 TRUE NA NA ATTAAA -23 NA NA NA 6 NA PB.466.14 chr1 + 2459 8 novel_in_catalog MTFR1L novel 1201 7 NA NA -21 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTGCTGTGTCCATCTCTT 135 FALSE NA NA ATTAAA -24 NA NA NA 2 NA PB.466.15 chr1 + 1956 7 novel_in_catalog MTFR1L novel 2053 7 NA NA 13 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCATTTGCTGTGTCCAT 0 TRUE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.466.16 chr1 + 1187 6 incomplete-splice_match MTFR1L ENST00000374300.7 2053 7 2229 652 61 -48 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAGAGAAGTTGTTTCTGG 2192 FALSE NA NA AATGAA -20 NA NA NA 2 NA PB.466.17 chr1 + 1533 4 incomplete-splice_match MTFR1L ENST00000466284.1 3262 6 4797 0 688 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCATTTGCTGTGTCCAT 5455 FALSE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.466.18 chr1 + 1631 4 incomplete-splice_match MTFR1L ENST00000374300.7 2053 7 5503 2 699 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCATTTGCTGTGTCCAT 5466 FALSE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 8 NA PB.466.19 chr1 + 1437 3 incomplete-splice_match MTFR1L ENST00000466284.1 3262 6 5096 0 987 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCATTTGCTGTGTCCAT 5754 FALSE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.466.20 chr1 + 1425 3 incomplete-splice_match MTFR1L ENST00000374307.9 1868 7 6706 -3 1077 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTGCTGTGTCCATCTCTT 5844 FALSE NA NA ATTAAA -24 NA NA NA 2 NA PB.466.21 chr1 + 1380 3 full-splice_match MTFR1L ENST00000497956.1 2531 3 1150 1 1150 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAGAATGCATTTGCTGTGTC 5917 FALSE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.466.22 chr1 + 1272 2 incomplete-splice_match MTFR1L ENST00000497956.1 2531 3 3948 -7 3948 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTGCTGTGTCCATCTCTT 8715 FALSE NA NA ATTAAA -24 NA NA NA 5 NA PB.467.1 chr1 + 4357 3 full-splice_match PDIK1L ENST00000619836.4 4252 3 -105 0 -105 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AACAAAAAAAAAACTGAAAA NA FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 2 NA PB.467.2 chr1 + 4333 4 full-splice_match PDIK1L ENST00000374271.8 4279 4 -66 12 -53 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 ACAAAAAAAAAACTGAAAAT 565 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 3 NA PB.467.5 chr1 + 3808 2 novel_not_in_catalog PDIK1L novel 4113 3 NA NA -3 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AACAAAAAAAAAACTGAAAA -9 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 4 NA PB.467.6 chr1 + 1813 4 full-splice_match PDIK1L ENST00000374271.8 4279 4 -13 2479 0 940 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTTGATGTAGGTTTGGGTT -6 TRUE NA NA TTTAAA -3 NA NA NA 2 NA PB.467.7 chr1 + 4084 3 full-splice_match PDIK1L ENST00000374269.2 4113 3 4 25 4 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 35 8.327644 0.920522 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AACAAAAAAAAAACTGAAAA -2 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 35 NA PB.467.11 chr1 + 1680 3 full-splice_match PDIK1L ENST00000374269.2 4113 3 17 2416 4 1015 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTCTGCCCCTCCCCCTAAT 11 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.467.12 chr1 + 3807 2 incomplete-splice_match PDIK1L ENST00000374271.8 4279 4 2644 13 2644 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AACAAAAAAAAAACTGAAAA 2651 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 2 NA PB.468.1 chr1 + 1524 2 full-splice_match FAM110D ENST00000374268.5 2799 2 -59 1334 -59 -1334 alternative_3end5end TRUE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 CCGAATGAGTACTAACACTG NA FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 3 NA PB.469.1 chr1 + 630 3 full-splice_match ZNF593 ENST00000374266.7 638 3 0 8 0 -8 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.520721 0.655208 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGAGAACTTGCCTCCAAC -21 TRUE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 19 NA PB.470.1 chr1 + 2525 21 full-splice_match CNKSR1 ENST00000361530.11 2535 21 5 5 5 -3 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGAATGAGTCTACATGTAA -13 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 7 NA PB.470.2 chr1 + 2545 21 full-splice_match CNKSR1 ENST00000374253.9 2538 21 -12 5 -6 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGAATGAGTCTACATGTAA -12 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 4 NA PB.471.2 chr1 + 4042 15 novel_not_in_catalog CEP85 novel 3934 14 NA NA -12 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCCTCAGTTTTCCATACCCT -22 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.471.5 chr1 + 1496 8 incomplete-splice_match CEP85 ENST00000252992.8 3935 14 0 10302 0 -3887 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.331058 0.522582 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AATAATTTGAAAAAGAAATG -8 TRUE NA NA GATAAA -7 NA NA NA 14 NA PB.471.6 chr1 + 3848 13 novel_in_catalog CEP85 novel 3934 14 NA NA 5 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTCCTCAGTTTTCCATACC -3 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.471.7 chr1 + 3925 14 full-splice_match CEP85 ENST00000451429.8 3934 14 7 2 5 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 42 9.993174 0.999703 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTCCTCAGTTTTCCATACC -3 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 42 NA PB.471.8 chr1 + 2517 8 incomplete-splice_match CEP85 ENST00000453146.1 2821 10 2073 -1 2073 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCCTCAGTTTTCCATACCCT 4459 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.471.9 chr1 + 2223 6 incomplete-splice_match CEP85 ENST00000453146.1 2821 10 11869 1 252 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTCCTCAGTTTTCCATACC 268 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 5 NA PB.471.10 chr1 + 2093 5 incomplete-splice_match CEP85 ENST00000453146.1 2821 10 13393 6 38 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAGACTCCTCAGTTTTCC 1792 FALSE NA NA AATAAA -8 NA NA NA 2 NA PB.471.11 chr1 + 1992 3 incomplete-splice_match CEP85 ENST00000453146.1 2821 10 17306 -1 3514 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCCTCAGTTTTCCATACCCT 5705 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 7 NA PB.472.8 chr1 - 958 3 incomplete-splice_match PAFAH2 ENST00000374284.5 2523 11 23399 677 9464 -677 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TCCAAGTCTTCTCATTGTAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.473.2 chr1 - 2804 15 novel_in_catalog UBXN11 novel 1792 16 NA NA -2 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AACCCGCTGCTCCGCCAGGC -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.473.9 chr1 - 1620 14 full-splice_match UBXN11 ENST00000357089.8 1555 14 -65 0 -52 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AACCCGCTGCTCCGCCAGGC -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.473.12 chr1 - 1437 12 novel_in_catalog UBXN11 novel 1944 15 NA NA -4 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AACCCGCTGCTCCGCCAGGC -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.473.15 chr1 - 1214 9 novel_in_catalog UBXN11 novel 1944 15 NA NA -14 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AACCCGCTGCTCCGCCAGGC 405 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.473.18 chr1 - 1111 10 novel_not_in_catalog UBXN11 novel 1944 15 NA NA 1 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AACCCGCTGCTCCGCCAGGC 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.473.20 chr1 - 1424 13 novel_in_catalog UBXN11 novel 1660 15 NA NA 0 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CAACCCGCTGCTCCGCCAGG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.474.1 chr1 + 1704 3 full-splice_match SH3BGRL3 ENST00000270792.10 751 3 -954 1 -954 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTGTGTCTGGTTGGTTGTG -2 TRUE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 3 NA PB.474.2 chr1 + 1104 3 full-splice_match SH3BGRL3 ENST00000270792.10 751 3 -356 3 -356 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GCACTGTGTCTGGTTGGTTG 596 FALSE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 4 NA PB.474.3 chr1 + 917 2 full-splice_match SH3BGRL3 ENST00000319041.6 768 2 -78 -71 -42 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 30 7.137981 0.853575 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTGTGTCTGGTTGGTTGTG 282 FALSE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 30 NA PB.474.4 chr1 + 788 3 full-splice_match SH3BGRL3 ENST00000270792.10 751 3 -38 1 -38 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 750 178.449524 2.251515 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTGTGTCTGGTTGGTTGTG 286 FALSE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 750 NA PB.474.5 chr1 + 737 3 novel_not_in_catalog SH3BGRL3 novel 751 3 NA NA -3 -7 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTGGCACTGTGTCTGGTTG 0 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.474.6 chr1 + 731 3 full-splice_match SH3BGRL3 ENST00000270792.10 751 3 13 7 13 -7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 23 5.472452 0.738182 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTGGCACTGTGTCTGGTTG 16 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 23 NA PB.476.2 chr1 + 1616 5 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3458 5 NA NA -45 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACTGTCATCCCCTTGTCA 2 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.476.6 chr1 + 2221 5 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3458 5 NA NA -40 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACTGTCATCCCCTTGTCA 7 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.476.9 chr1 + 3343 5 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3458 5 NA NA 1 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.617260 0.417847 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAAACTGTCATCCCCTTGTC 1 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 11 NA PB.476.11 chr1 + 3240 4 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 636 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATCCCCTTGTCAGATGTTTT 608 FALSE NA NA AATAAA -28 NA NA NA 3 NA PB.476.19 chr1 + 2652 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3458 5 NA NA 15690 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACTGTCATCCCCTTGTCA NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.476.20 chr1 + 2521 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 15829 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATCCCCTTGTCAGATGTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -28 NA NA NA 4 NA PB.476.23 chr1 + 2219 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3458 5 NA NA 16063 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACTGTCATCCCCTTGTCA 187 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.476.24 chr1 + 2187 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3458 5 NA NA 16147 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACTGTCATCCCCTTGTCA 271 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.476.25 chr1 + 2050 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 16230 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCAAACTGTCATCCCCTTGT 39 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.476.26 chr1 + 2032 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3458 5 NA NA 16310 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACTGTCATCCCCTTGTCA 119 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 6 NA PB.476.29 chr1 + 1668 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 16675 1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTGTCATCCCCTTGTCAG 484 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 7 NA PB.476.32 chr1 + 1555 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3458 5 NA NA 16727 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACTGTCATCCCCTTGTCA 536 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.476.33 chr1 + 1459 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 16821 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCAAACTGTCATCCCCTTGT 630 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.476.36 chr1 + 1442 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3458 5 NA NA 16900 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACTGTCATCCCCTTGTCA 709 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.476.38 chr1 + 1347 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 16994 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAAACTGTCATCCCCTTGTC 803 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 5 NA PB.476.43 chr1 + 1246 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 17104 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.093125 0.490398 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATCCCCTTGTCAGATGTTTT -3 TRUE NA NA AATAAA -28 NA NA NA 13 NA PB.476.44 chr1 + 1161 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 17129 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATCCCCTTGTCAGATGTTTT 22 FALSE NA NA AATAAA -28 NA NA NA 5 NA PB.476.47 chr1 + 1041 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 17300 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAAACTGTCATCCCCTTGTC 42 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 7 NA PB.476.48 chr1 + 965 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3458 5 NA NA 17317 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACTGTCATCCCCTTGTCA 59 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 7 NA PB.476.52 chr1 + 901 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3458 5 NA NA 17441 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACTGTCATCCCCTTGTCA 183 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.477.1 chr1 - 1136 8 incomplete-splice_match CRYBG2 ENST00000308182.10 5239 20 17682 -7 -65 7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CTCTGTGCACCTTGATATTT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.477.2 chr1 - 1013 7 novel_in_catalog CRYBG2 novel 5239 20 NA NA -64 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACCCTTGTCTCTGTGCACC -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.479.1 chr1 + 3180 8 full-splice_match DHDDS ENST00000525682.6 1235 8 -16 -1929 0 -4 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAACTTGTTTGCTAACTGC -5 TRUE NA NA AATAGA -23 NA NA NA 4 NA PB.479.2 chr1 + 3173 8 novel_in_catalog DHDDS novel 3288 9 NA NA 0 -5 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAAACTTGTTTGCTAACTG -5 TRUE NA NA AATAGA -22 NA NA NA 2 NA PB.479.3 chr1 + 941 7 full-splice_match DHDDS ENST00000427245.6 868 7 7 -80 0 80 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAAATAACCCAGGAGATG -5 TRUE NA NA AGTAAA -12 NA NA NA 5 NA PB.479.4 chr1 + 1385 9 full-splice_match DHDDS ENST00000236342.12 3288 9 3 1900 1 33 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CAGCTGCCTGTCTCTTAGAT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.479.5 chr1 + 3280 9 full-splice_match DHDDS ENST00000236342.12 3288 9 24 -16 0 16 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 24 5.710385 0.756665 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AACGGAAGAACACCTTCTTT 17 TRUE NA NA AATAGA -43 NA NA NA 24 NA PB.479.6 chr1 + 1184 9 full-splice_match DHDDS ENST00000236342.12 3288 9 21 2083 0 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.806923 0.580574 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAATGAATGGTGTTCCCTTT 14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.479.7 chr1 + 1520 6 full-splice_match DHDDS ENST00000374185.7 1148 6 14 -386 1 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATTTGGTCCCTCTCAT 28 TRUE NA NA ATTAAA -26 NA NA NA 2 NA PB.479.9 chr1 + 3369 9 novel_in_catalog DHDDS novel 3245 9 NA NA 4 2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGATGTAAAACTTGTTTGCT -9 TRUE NA NA AATAGA -17 NA NA NA 2 NA PB.479.10 chr1 + 1190 2 incomplete-splice_match DHDDS ENST00000531955.5 559 3 -351 4166 4 -11 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAGAAAAAAAAAATGACATT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.479.13 chr1 + 1287 9 novel_in_catalog DHDDS novel 703 6 NA NA -4 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGAATGGTGTTCCCTTTG -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.479.14 chr1 + 1184 9 novel_in_catalog DHDDS novel 703 6 NA NA -4 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGAATGGTGTTCCCTTTG -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.481.1 chr1 + 1528 6 full-splice_match HMGN2 ENST00000361427.6 1940 6 -261 673 -261 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATGCTGCCTCTGATCTTT 1845 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 6 NA PB.481.3 chr1 + 1290 6 full-splice_match HMGN2 ENST00000361427.6 1940 6 -23 673 -23 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 9753 2320.557617 3.365592 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATGCTGCCTCTGATCTTT -15 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 9753 NA PB.481.5 chr1 + 549 6 full-splice_match HMGN2 ENST00000361427.6 1940 6 -20 1411 -20 3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATTTTGTTTTACTTTTT -12 TRUE NA NA TATAAA -6 NA NA NA 2 NA PB.481.7 chr1 + 1236 6 full-splice_match HMGN2 ENST00000361427.6 1940 6 31 673 -6 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 230 54.724522 1.738182 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATGCTGCCTCTGATCTTT -14 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 230 NA PB.481.8 chr1 + 616 6 full-splice_match HMGN2 ENST00000361427.6 1940 6 31 1293 -6 -11 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATTGATGTGGAGAAAACACC -14 TRUE NA NA AATAGA -17 NA NA NA 7 NA PB.481.11 chr1 + 3028 2 full-splice_match HMGN2 ENST00000493418.1 1496 2 -923 -609 0 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATGCTGCCTCTGATCTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 3 NA PB.481.12 chr1 + 2603 2 incomplete-splice_match HMGN2 ENST00000467700.5 932 6 -11 -337 0 -7 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGCTTGGAATGCTGCCTCTG 0 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.481.13 chr1 + 2584 3 novel_in_catalog HMGN2 novel 1148 7 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 21 4.996587 0.698673 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 21 NA PB.481.14 chr1 + 2057 5 full-splice_match HMGN2 ENST00000466194.1 952 5 -700 -405 0 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 3 NA PB.481.15 chr1 + 1872 6 full-splice_match HMGN2 ENST00000361427.6 1940 6 66 2 0 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 23 5.472452 0.738182 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTGCTTTGTCCATTCCCT 0 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 23 NA PB.481.16 chr1 + 1729 4 full-splice_match HMGN2 ENST00000479815.5 1030 4 43 -742 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.617260 0.417847 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 11 NA PB.481.17 chr1 + 1554 5 full-splice_match HMGN2 ENST00000460563.5 1045 5 29 -538 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 34 8.089712 0.907933 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 34 NA PB.481.18 chr1 + 1287 6 full-splice_match HMGN2 ENST00000467700.5 932 6 -11 -344 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 41 9.755241 0.989238 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 41 NA PB.481.19 chr1 + 1260 6 full-splice_match HMGN2 ENST00000463817.5 853 6 -5 -402 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 4 NA PB.481.20 chr1 + 1207 6 novel_not_in_catalog HMGN2 novel 1940 6 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATGCTGCCTCTGATCTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 7 NA PB.481.22 chr1 + 1190 6 novel_not_in_catalog HMGN2 novel 1148 7 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.617260 0.417847 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 11 NA PB.481.23 chr1 + 1196 6 novel_not_in_catalog HMGN2 novel 1148 7 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 7 NA PB.481.25 chr1 + 1132 6 novel_not_in_catalog HMGN2 novel 1940 6 NA NA 0 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATGCTGCCTCTGATCTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.481.26 chr1 + 1106 5 novel_in_catalog HMGN2 novel 1148 7 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 4 NA PB.481.27 chr1 + 2172 3 incomplete-splice_match HMGN2 ENST00000479815.5 1030 4 45 -742 2 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 2 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 3 NA PB.481.28 chr1 + 1370 5 full-splice_match HMGN2 ENST00000464888.5 565 5 7 -812 -2 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 7 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 9 NA PB.481.29 chr1 + 2400 4 novel_in_catalog HMGN2 novel 1148 7 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 9 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.481.30 chr1 + 1990 4 incomplete-splice_match HMGN2 ENST00000460563.5 1045 5 38 -538 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 9 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.481.32 chr1 + 1163 5 novel_in_catalog HMGN2 novel 1148 7 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 9 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 3 NA PB.481.33 chr1 + 1139 6 novel_not_in_catalog HMGN2 novel 1148 7 NA NA 0 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 9 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 8 NA PB.481.35 chr1 + 981 4 full-splice_match HMGN2 ENST00000479815.5 1030 4 52 -3 0 3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATTTTGTTTTACTTTTT 9 FALSE NA NA TATAAA -6 NA NA NA 2 NA PB.481.36 chr1 + 1169 6 full-splice_match HMGN2 ENST00000361427.6 1940 6 99 672 22 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 206 49.014137 1.690321 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 33 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 206 NA PB.481.37 chr1 + 1329 5 full-splice_match HMGN2 ENST00000466194.1 952 5 28 -405 28 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 11 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 6 NA PB.481.38 chr1 + 1240 6 novel_not_in_catalog HMGN2 novel 952 5 NA NA 35 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 18 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.481.39 chr1 + 1615 3 incomplete-splice_match HMGN2 ENST00000479815.5 1030 4 1012 -742 46 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 252 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 4 NA PB.481.40 chr1 + 1024 4 incomplete-splice_match HMGN2 ENST00000466194.1 952 5 507 -404 284 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 102 24.269136 1.385054 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATGCTGCCTCTGATCTTT 490 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 102 NA PB.481.41 chr1 + 1370 3 incomplete-splice_match HMGN2 ENST00000460563.5 1045 5 1243 -538 291 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 497 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 4 NA PB.481.42 chr1 + 1266 3 incomplete-splice_match HMGN2 ENST00000466194.1 952 5 617 -404 394 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATGCTGCCTCTGATCTTT 600 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 4 NA PB.481.43 chr1 + 1668 2 full-splice_match HMGN2 ENST00000493418.1 1496 2 431 -603 431 -7 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGCTTGGAATGCTGCCTCTG 637 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.481.44 chr1 + 1085 3 incomplete-splice_match HMGN2 ENST00000466194.1 952 5 799 -405 576 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 782 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 3 NA PB.481.46 chr1 + 955 2 incomplete-splice_match HMGN2 ENST00000466194.1 952 5 1365 -405 1142 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 328 78.041931 1.892328 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 1348 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 328 NA PB.481.48 chr1 + 875 2 incomplete-splice_match HMGN2 ENST00000466194.1 952 5 1445 -405 1222 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 20 4.758654 0.677484 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 1428 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 20 NA PB.484.1 chr1 + 3154 22 full-splice_match RPS6KA1 ENST00000374168.7 3192 22 36 2 19 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.282789 0.631727 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCACGCTCTCCTGCACTC 23 TRUE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 18 NA PB.484.2 chr1 + 2975 21 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000526792.5 2596 22 5705 -598 5595 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCTCTCCTGCACTCTTCATC 5508 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.484.3 chr1 + 3021 21 full-splice_match RPS6KA1 ENST00000530003.5 3023 21 11 -9 -7 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCACGCTCTCCTGCACTC -4 TRUE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 6 NA PB.484.4 chr1 + 3113 21 full-splice_match RPS6KA1 ENST00000531382.5 2359 21 -7 -747 0 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 21 4.996587 0.698673 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCACGCTCTCCTGCACTC -8 TRUE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 21 NA PB.484.5 chr1 + 2820 20 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000531382.5 2359 21 1116 -746 68 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAAGCACGCTCTCCTGCACT 1115 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 4 NA PB.484.6 chr1 + 2641 17 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000531382.5 2359 21 5791 -745 197 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGAAGCACGCTCTCCTGCAC 5790 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 3 NA PB.484.7 chr1 + 2509 16 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000374163.5 3202 22 7601 8 -1756 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAAGCACGCTCTCCTGCACT 65 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 4 NA PB.484.8 chr1 + 2275 13 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000374163.5 3202 22 9308 7 -49 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCACGCTCTCCTGCACTC 946 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 6 NA PB.484.9 chr1 + 2049 10 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000374163.5 3202 22 11156 7 -45 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCACGCTCTCCTGCACTC 2794 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 5 NA PB.484.10 chr1 + 1884 9 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000374163.5 3202 22 13026 8 1825 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAAGCACGCTCTCCTGCACT 4664 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.484.11 chr1 + 1770 8 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000374163.5 3202 22 14929 7 3728 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCACGCTCTCCTGCACTC 6567 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 5 NA PB.484.12 chr1 + 1674 7 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000374163.5 3202 22 15222 3 4021 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACGCTCTCCTGCACTCTTCA 6860 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 7 NA PB.484.13 chr1 + 1558 6 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000374163.5 3202 22 15708 3 4507 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACGCTCTCCTGCACTCTTCA 7346 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 9 NA PB.484.14 chr1 + 1398 5 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000374163.5 3202 22 25648 8 261 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAAGCACGCTCTCCTGCACT NA FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 10 NA PB.484.15 chr1 + 2535 3 novel_in_catalog RPS6KA1 novel 2359 21 NA NA 304 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAAGCACGCTCTCCTGCACT NA FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.484.16 chr1 + 1267 4 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000374163.5 3202 22 26022 3 -406 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACGCTCTCCTGCACTCTTCA NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 7 NA PB.484.17 chr1 + 1163 3 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000438977.1 639 4 -56 -289 -56 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCACGCTCTCCTGCACTC NA FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 10 NA PB.488.1 chr1 + 5639 18 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000636219.1 7058 19 1764 943 1764 15 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAATA 200 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.488.8 chr1 + 4999 14 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000636219.1 7058 19 32502 944 -2106 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.488.9 chr1 + 4871 14 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000374152.7 6460 19 33378 -402 -1975 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.488.10 chr1 + 4485 12 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000636219.1 7058 19 36604 944 -9 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.488.11 chr1 + 4258 10 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000374152.7 6460 19 38893 -403 -1369 15 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAATA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.488.12 chr1 + 4051 9 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000636219.1 7058 19 41471 943 -1835 15 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAATA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.488.13 chr1 + 3939 9 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000374152.7 6460 19 42331 -403 -1720 15 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAATA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.488.14 chr1 + 3684 7 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000636219.1 7058 19 43192 944 -114 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 1599 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.488.15 chr1 + 3572 7 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000636219.1 7058 19 43304 944 -2 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 1711 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.488.16 chr1 + 3384 5 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000636219.1 7058 19 43933 944 623 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 2340 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.488.17 chr1 + 3152 3 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000636219.1 7058 19 44680 943 -533 15 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAATA 3087 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.488.18 chr1 + 2993 3 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000636219.1 7058 19 44838 944 -375 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 3245 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.488.19 chr1 + 2729 3 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000636219.1 7058 19 45102 944 -111 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.855192 0.455635 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 3509 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.488.20 chr1 + 2431 3 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000636219.1 7058 19 45400 944 187 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 3807 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.488.21 chr1 + 2261 2 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000466382.2 2699 6 2619 22 713 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.617260 0.417847 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 4333 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.488.22 chr1 + 3168 2 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000466382.2 2699 6 2655 -921 749 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAGACTTTTGTGAAGCTTT 4369 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.488.23 chr1 + 2343 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 718 -15 718 15 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAATA 7567 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.488.24 chr1 + 2118 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 942 -14 942 14 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 7791 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.488.25 chr1 + 1952 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 1108 -14 1108 14 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 14 3.331058 0.522582 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 7957 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.488.26 chr1 + 1840 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 1221 -15 1221 15 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 14 3.331058 0.522582 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAATA 8070 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.488.27 chr1 + 1699 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 1361 -14 1361 14 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 18 4.282789 0.631727 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 8210 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.488.28 chr1 + 1558 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 1502 -14 1502 14 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 20 4.758654 0.677484 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 8351 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 20 NA PB.488.29 chr1 + 1395 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 1665 -14 1665 14 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 16 3.806923 0.580574 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 8514 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.488.30 chr1 + 1279 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 1781 -14 1781 14 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 17 4.044856 0.606903 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 8630 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.488.31 chr1 + 1151 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 1910 -15 1910 15 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 29 6.900049 0.838852 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAATA 8759 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 29 NA PB.488.32 chr1 + 1042 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 2018 -14 2018 14 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 11 2.617260 0.417847 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 8867 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.488.33 chr1 + 830 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 2231 -15 2231 15 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAATA 9080 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.488.34 chr1 + 695 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 2366 -15 2366 15 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAATA 9215 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.488.35 chr1 + 1461 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 2540 -955 2540 -3 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GGTAAGACTTTTGTGAAGCT 9389 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.488.36 chr1 + 1292 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 2712 -958 2712 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGACTTTTGTGAAGCTTTT 9561 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 4 NA PB.488.37 chr1 + 1072 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 2932 -958 2932 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 19 4.520721 0.655208 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGACTTTTGTGAAGCTTTT 9781 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 19 NA PB.490.1 chr1 + 2324 4 novel_in_catalog PIGV novel 1624 5 NA NA -173 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATGCGACATTGTTTCTGA NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.490.2 chr1 + 1936 4 full-splice_match PIGV ENST00000688522.1 2396 4 -2 462 0 113 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TCTGCTGCCCTGGGATCATT -30 TRUE NA NA AGTAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.490.3 chr1 + 1402 5 novel_in_catalog PIGV novel 932 5 NA NA 0 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATGCGACATTGTTTCTGA -28 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.490.4 chr1 + 2413 4 full-splice_match PIGV ENST00000688522.1 2396 4 2 -19 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AATGAATTGCCTTTTTAAAA -26 TRUE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 5 NA PB.490.5 chr1 + 2126 4 full-splice_match PIGV ENST00000674222.1 4377 4 -15 2266 0 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 54 12.848366 1.108848 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATACATGCAATGAATTGCCT -26 TRUE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 54 NA PB.490.6 chr1 + 2295 4 full-splice_match PIGV ENST00000688522.1 2396 4 13 88 -1 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.044856 0.606903 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATGCGACATTGTTTCTGA -15 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 17 NA PB.490.7 chr1 + 2278 4 full-splice_match PIGV ENST00000687468.1 2247 4 0 -31 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACATTGTTTCTGATGTTTTT -11 TRUE NA NA AATAAA -25 NA NA NA 2 NA PB.490.8 chr1 + 1634 4 full-splice_match PIGV ENST00000674222.1 4377 4 3 2740 3 112 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTCTGCTGCCCTGGGATCAT -8 TRUE NA NA AGTAAA -19 NA NA NA 4 NA PB.490.9 chr1 + 2067 4 full-splice_match PIGV ENST00000688522.1 2396 4 241 88 -4 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATGCGACATTGTTTCTGA -3 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 8 NA PB.490.10 chr1 + 2691 4 full-splice_match PIGV ENST00000674273.1 4972 4 30 2251 30 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AATGAATTGCCTTTTTAAAA 31 FALSE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 4 NA PB.490.11 chr1 + 1701 2 incomplete-splice_match PIGV ENST00000674317.1 2245 4 4957 8 4957 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATGCGACATTGTTTCTGA 6072 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.490.12 chr1 + 1032 2 incomplete-splice_match PIGV ENST00000674317.1 2245 4 5632 2 5632 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GACATTGTTTCTGATGTTTT 6747 FALSE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 2 NA PB.490.13 chr1 + 870 2 incomplete-splice_match PIGV ENST00000674317.1 2245 4 5795 1 5795 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACATTGTTTCTGATGTTTTT 6910 FALSE NA NA AATAAA -25 NA NA NA 2 NA PB.491.1 chr1 + 2739 7 incomplete-splice_match ZDHHC18 ENST00000374141.6 1002 8 406 -1750 390 1750 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGAGTTGCTTTGCTTTGGT 359 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.491.2 chr1 + 2539 6 incomplete-splice_match ZDHHC18 ENST00000374141.6 1002 8 16606 -1750 -1752 1750 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGAGTTGCTTTGCTTTGGT NA FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 6 NA PB.491.3 chr1 + 2157 3 incomplete-splice_match ZDHHC18 ENST00000488397.3 1275 7 812 1891 45 1748 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATAAGAGTTGCTTTGCTTTG NA FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.494.1 chr1 - 1421 5 full-splice_match GPN2 ENST00000374135.9 4665 5 0 3244 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 131 31.169184 1.493725 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGTGACTTCCAAACTTTTCT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 131 NA PB.494.2 chr1 - 1978 4 incomplete-splice_match GPN2 ENST00000374135.9 4665 5 0 3247 0 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TTTTGTGACTTCCAAACTTT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.494.3 chr1 - 1318 5 full-splice_match GPN2 ENST00000374135.9 4665 5 97 3250 74 -6 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTTTTTGTGACTTCCAAAC 9875 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.494.4 chr1 - 838 5 full-splice_match GPN2 ENST00000374135.9 4665 5 577 3250 554 -6 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTTTTTGTGACTTCCAAAC 620 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.494.5 chr1 - 1014 5 full-splice_match GPN2 ENST00000374135.9 4665 5 400 3251 377 -7 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TACTTTTTGTGACTTCCAAA 443 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.495.1 chr1 + 1308 1 full-splice_match SFN ENST00000339276.6 1308 1 0 0 0 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 350 83.276451 1.920522 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTCCTGTCTCTCTTCCAGTT 0 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 350 NA PB.495.4 chr1 + 1179 1 full-splice_match SFN ENST00000339276.6 1308 1 129 0 129 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTCCTGTCTCTCTTCCAGTT 129 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 7 NA PB.495.5 chr1 + 1078 1 full-splice_match SFN ENST00000339276.6 1308 1 230 0 230 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTCCTGTCTCTCTTCCAGTT 230 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 5 NA PB.495.6 chr1 + 954 1 full-splice_match SFN ENST00000339276.6 1308 1 354 0 354 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTCCTGTCTCTCTTCCAGTT 354 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 8 NA PB.496.1 chr1 - 1988 7 novel_not_in_catalog GPATCH3 novel 2125 7 NA NA 6 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTCCCTTACTTTTCTAAT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.496.2 chr1 - 1385 6 incomplete-splice_match GPATCH3 ENST00000361720.10 2125 7 3005 1 3005 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTCCCTTACTTTTCTAAT 2994 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.496.3 chr1 - 2113 7 full-splice_match GPATCH3 ENST00000361720.10 2125 7 10 2 10 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 49 11.658703 1.066650 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAGCTCCCTTACTTTTCTAA -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 49 NA PB.496.4 chr1 - 1755 7 full-splice_match GPATCH3 ENST00000361720.10 2125 7 368 2 368 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAGCTCCCTTACTTTTCTAA 357 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.497.1 chr1 - 1168 2 full-splice_match NR0B2 ENST00000254227.4 1165 2 -2 -1 -2 1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 228 54.248657 1.734389 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGGAGCCTGATACTGTCATT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 228 NA PB.497.3 chr1 - 1477 2 novel_not_in_catalog NR0B2 novel 1165 2 NA NA 0 -6 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.044856 0.606903 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACACTTGGAGCCTGATAC -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.497.4 chr1 - 1287 3 novel_not_in_catalog NR0B2 novel 1165 2 NA NA 3 -6 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACACTTGGAGCCTGATAC 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.498.2 chr1 + 1364 9 full-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 -47 475 -47 212 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2573 612.200867 2.786894 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CCTTCTGTGTCCTCTCTTGC NA FALSE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 2573 NA PB.498.3 chr1 + 1351 9 novel_not_in_catalog NUDC novel 1792 9 NA NA -9 213 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTCTGTGTCCTCTCTTGCC -21 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.498.4 chr1 + 1801 9 full-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 2 -11 2 11 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 101 24.031204 1.380776 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATGTATGTTTCTGAGCAAAG -10 TRUE NA NA AATAAA -25 NA NA NA 101 NA PB.498.5 chr1 + 1488 10 novel_not_in_catalog NUDC novel 1792 9 NA NA 0 212 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 67 15.941491 1.202529 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CCTTCTGTGTCCTCTCTTGC -12 TRUE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 67 NA PB.498.7 chr1 + 1410 8 novel_in_catalog NUDC novel 1792 9 NA NA 2 213 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTCTGTGTCCTCTCTTGCC -10 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.498.8 chr1 + 1410 8 novel_in_catalog NUDC novel 1792 9 NA NA 2 213 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTCTGTGTCCTCTCTTGCC -10 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.498.9 chr1 + 1046 7 novel_in_catalog NUDC novel 1792 9 NA NA 2 213 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTCTGTGTCCTCTCTTGCC -10 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 6 NA PB.498.10 chr1 + 1004 7 novel_in_catalog NUDC novel 1792 9 NA NA 2 213 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.093125 0.490398 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTCTGTGTCCTCTCTTGCC -10 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 13 NA PB.498.12 chr1 + 1930 10 novel_not_in_catalog NUDC novel 1792 9 NA NA 9 -24 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAATAAATAAATAAAA -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.498.14 chr1 + 1307 9 full-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 9 476 9 211 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TCCTTCTGTGTCCTCTCTTG -3 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.498.15 chr1 + 1303 9 novel_not_in_catalog NUDC novel 1792 9 NA NA 9 213 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTCTGTGTCCTCTCTTGCC -3 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.498.16 chr1 + 1484 9 full-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 13 295 13 -295 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.331058 0.522582 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGTGATGGTTCATGTCTGTA 1 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 14 NA PB.498.18 chr1 + 1583 8 incomplete-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 2344 24 1945 -24 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAATAAATAAATAAAA 2276 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.498.19 chr1 + 1131 8 incomplete-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 2346 474 1947 213 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 44 10.469039 1.019907 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTCTGTGTCCTCTCTTGCC 2278 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 44 NA PB.498.22 chr1 + 1500 7 incomplete-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 19717 24 -3675 -24 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAATAAATAAATAAAA 5251 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.498.23 chr1 + 973 7 incomplete-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 19792 476 -3600 211 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 49 11.658703 1.066650 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TCCTTCTGTGTCCTCTCTTG 5326 FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 49 NA PB.498.24 chr1 + 1340 7 incomplete-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 19877 24 -3515 -24 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAATAAATAAATAAAA 5411 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.498.25 chr1 + 843 6 incomplete-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 20016 474 -3376 213 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 31 7.375914 0.867816 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTCTGTGTCCTCTCTTGCC 5550 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 31 NA PB.498.26 chr1 + 1233 5 incomplete-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 20917 24 -2475 -24 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAATAAATAAATAAAA 6451 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.498.27 chr1 + 762 5 incomplete-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 20938 474 -2454 213 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTCTGTGTCCTCTCTTGCC 6472 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 9 NA PB.498.28 chr1 + 615 4 incomplete-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 21179 474 -2213 213 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTCTGTGTCCTCTCTTGCC 6713 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.498.29 chr1 + 1021 4 incomplete-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 21223 24 -2169 -24 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAATAAATAAATAAAA 6757 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.499.1 chr1 - 1781 4 full-splice_match KDF1 ENST00000320567.6 1855 4 72 2 72 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 28 6.662116 0.823612 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTGGTATCTGCCTGCTTT 48 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 28 NA PB.499.2 chr1 - 1395 3 incomplete-splice_match KDF1 ENST00000320567.6 1855 4 8394 3 8394 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAATTGGTATCTGCCTGCTT 8370 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.499.3 chr1 - 1775 4 novel_not_in_catalog KDF1 novel 1855 4 NA NA 12 -9 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CAAAGGTAATTGGTATCTGC -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.500.2 chr1 - 2378 2 full-splice_match TENT5B ENST00000289166.6 2382 2 1 3 1 -3 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 34 8.089712 0.907933 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAACCTTAGTGCCATGCTTC 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 34 NA PB.501.1 chr1 + 1126 2 full-splice_match TRNP1 ENST00000522111.3 1961 2 836 -1 209 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 CTCAGGGATGAGAATGCACA 30 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.502.2 chr1 + 4233 16 full-splice_match WDTC1 ENST00000319394.8 4706 16 77 396 41 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.617260 0.417847 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TAGGTGTGGCTGGTGGCATT 11 TRUE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 11 NA PB.502.4 chr1 + 3690 12 incomplete-splice_match WDTC1 ENST00000319394.8 4706 16 48728 396 -4349 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TAGGTGTGGCTGGTGGCATT NA FALSE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 5 NA PB.502.5 chr1 + 3285 10 incomplete-splice_match WDTC1 ENST00000319394.8 4706 16 57710 396 4633 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TAGGTGTGGCTGGTGGCATT NA FALSE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.502.6 chr1 + 3000 7 incomplete-splice_match WDTC1 ENST00000319394.8 4706 16 61712 396 8635 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TAGGTGTGGCTGGTGGCATT NA FALSE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.502.8 chr1 + 2523 4 incomplete-splice_match WDTC1 ENST00000361771.7 4275 16 66695 3 -3651 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGGTGTGGCTGGTGGCATTT NA FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 7 NA PB.502.9 chr1 + 2242 2 incomplete-splice_match WDTC1 ENST00000472249.2 628 3 -6 -1351 -6 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGGTGTGGCTGGTGGCATTT NA FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.503.1 chr1 + 1516 6 full-splice_match TMEM222 ENST00000608611.5 1511 6 -6 1 -5 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 238 56.627983 1.753031 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTGGTGCCCTGTCATTGT -29 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 238 NA PB.503.2 chr1 + 4281 1 full-splice_match ACTG1P20 ENST00000486001.1 468 1 -3084 -729 -3084 729 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAGGGAAAAAAAAG -26 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.503.3 chr1 + 2604 5 full-splice_match TMEM222 ENST00000464813.5 1071 5 -30 -1503 3 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTGGTGCCCTGTCATTGT -20 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.503.4 chr1 + 1592 7 full-splice_match TMEM222 ENST00000478104.5 986 7 -32 -574 -1 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGTTGGTGCCCTGTCATTG -18 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.503.5 chr1 + 1494 6 novel_not_in_catalog TMEM222 novel 1613 6 NA NA 1 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTGGTGCCCTGTCATTGT -16 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.503.7 chr1 + 1314 2 novel_not_in_catalog TMEM222 novel 368 4 NA NA 3 -6034 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAGGGAAAAAAAAG -14 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 6 NA PB.503.9 chr1 + 1623 7 full-splice_match TMEM222 ENST00000464720.5 1665 7 41 1 3 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 24 5.710385 0.756665 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTGGTGCCCTGTCATTGT 17 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 24 NA PB.503.10 chr1 + 1983 1 full-splice_match ACTG1P20 ENST00000486001.1 468 1 -786 -729 -786 729 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAGGGAAAAAAAAG 2272 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.503.11 chr1 + 1300 5 incomplete-splice_match TMEM222 ENST00000608611.5 1511 6 8538 1 -1560 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.855192 0.455635 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTGGTGCCCTGTCATTGT 4464 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 12 NA PB.503.12 chr1 + 1105 2 incomplete-splice_match TMEM222 ENST00000471456.1 2861 3 1852 0 735 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTGGTGCCCTGTCATTGT 7876 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 5 NA PB.503.13 chr1 + 1109 2 incomplete-splice_match TMEM222 ENST00000478104.5 986 7 12382 -575 1204 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTGGTGCCCTGTCATTGT 8345 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.504.1 chr1 - 2272 5 incomplete-splice_match SLC9A1 ENST00000374089.5 3165 7 1491 -5 264 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTCAAGGGCTGCTTTCTGG NA FALSE NA NA ATTAAA -34 NA NA NA 2 NA PB.504.2 chr1 - 4770 12 full-splice_match SLC9A1 ENST00000263980.8 4737 12 -39 6 -39 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAGAGTCAAGGGCTGCTT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.504.3 chr1 - 3948 12 full-splice_match SLC9A1 ENST00000263980.8 4737 12 783 6 256 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAGAGTCAAGGGCTGCTT 1146 FALSE NA NA AGTAAA -12 NA NA NA 3 NA PB.504.4 chr1 - 3401 13 novel_in_catalog SLC9A1 novel 4737 12 NA NA 596 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAGAGTCAAGGGCTGCTT 1486 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.504.5 chr1 - 3166 11 incomplete-splice_match SLC9A1 ENST00000263980.8 4737 12 41261 6 -9842 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAGAGTCAAGGGCTGCTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.504.6 chr1 - 2494 8 incomplete-splice_match SLC9A1 ENST00000263980.8 4737 12 49202 6 -1901 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAGAGTCAAGGGCTGCTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.504.7 chr1 - 2201 5 incomplete-splice_match SLC9A1 ENST00000374089.5 3165 7 1557 0 330 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAGAGTCAAGGGCTGCTT NA FALSE NA NA GGGGCT -20 NA NA NA 5 NA PB.504.8 chr1 - 1930 3 incomplete-splice_match SLC9A1 ENST00000374089.5 3165 7 2271 0 1044 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAGAGTCAAGGGCTGCTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.504.11 chr1 - 4624 12 full-splice_match SLC9A1 ENST00000263980.8 4737 12 106 7 106 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAATAGAGTCAAGGGCTGCT 469 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.505.1 chr1 + 2343 13 novel_in_catalog SYTL1 novel 1936 15 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAAAAGGCTGGTGTCTGC -31 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.505.2 chr1 + 2154 14 novel_in_catalog SYTL1 novel 1900 15 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAAAAGGCTGGTGTCTGC -31 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.505.3 chr1 + 2151 15 novel_in_catalog SYTL1 novel 1936 15 NA NA 0 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAAAAGGCTGGTGTCTGC -31 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.505.4 chr1 + 2938 11 novel_in_catalog SYTL1 novel 2525 13 NA NA -17 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAAAAGGCTGGTGTCTGC -13 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.505.5 chr1 + 1755 14 novel_in_catalog SYTL1 novel 1936 15 NA NA -15 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAAAAGGCTGGTGTCTGC -11 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 4 NA PB.505.6 chr1 + 1897 15 full-splice_match SYTL1 ENST00000616558.5 1936 15 37 2 2 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 29 6.900049 0.838852 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAAAAGGCTGGTGTCTGC 6 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 29 NA PB.505.7 chr1 + 2365 13 novel_in_catalog SYTL1 novel 1936 15 NA NA 28 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAAAAGGCTGGTGTCTGC 32 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.505.8 chr1 + 1641 14 full-splice_match SYTL1 ENST00000543823.1 2229 14 587 1 587 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CAATAAAAGGCTGGTGTCTG 646 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.505.9 chr1 + 1327 11 incomplete-splice_match SYTL1 ENST00000543823.1 2229 14 3121 0 450 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAAAAGGCTGGTGTCTGC 3180 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 6 NA PB.505.10 chr1 + 1502 5 novel_in_catalog SYTL1 novel 2229 14 NA NA 356 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAAAAGGCTGGTGTCTGC 5289 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.505.11 chr1 + 1024 6 incomplete-splice_match SYTL1 ENST00000543823.1 2229 14 5351 0 477 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAAAAGGCTGGTGTCTGC 5410 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.506.2 chr1 - 1898 13 incomplete-splice_match MAP3K6 ENST00000493901.6 3654 27 4772 -28 -2188 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGTCCTGGCAATTTTGGAGG 6955 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.506.3 chr1 - 4067 29 full-splice_match MAP3K6 ENST00000357582.3 4438 29 369 2 266 0 alternative_5end TRUE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCTTTGTCCTGGCAATTT 8231 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.506.4 chr1 - 3760 28 full-splice_match MAP3K6 ENST00000374040.7 4309 28 549 0 549 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCTTTGTCCTGGCAATTT 8514 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.507.1 chr1 + 2132 2 full-splice_match GPR3 ENST00000374024.4 2137 2 2 3 2 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATGTTTCCCTATGTGT -2 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 10 NA PB.509.15 chr1 - 3845 7 incomplete-splice_match WASF2 ENST00000618852.5 5681 9 71158 1402 71042 -1402 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA -4 TRUE NA NA AGTAAA -4 NA NA NA 4 NA PB.509.35 chr1 - 3220 2 incomplete-splice_match WASF2 ENST00000618852.5 5681 9 79970 1403 79854 -1403 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 8808 FALSE NA NA AAAAAG -20 NA NA NA 3 NA PB.509.36 chr1 - 1885 9 full-splice_match WASF2 ENST00000618852.5 5681 9 0 3796 0 171 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGTCAACATGTATTTCCTC -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.509.37 chr1 - 758 5 incomplete-splice_match WASF2 ENST00000536657.1 1083 8 -112 7788 4 -7788 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 144 34.262310 1.534817 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GTGAGGGGAAAGGGGCCTCT -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 144 NA PB.511.1 chr1 - 3015 2 incomplete-splice_match AHDC1 ENST00000644989.1 6103 6 53440 408 3506 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAAGACAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.511.2 chr1 - 2304 2 incomplete-splice_match AHDC1 ENST00000644989.1 6103 6 54151 408 4217 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAAGACAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.511.3 chr1 - 1914 4 novel_not_in_catalog AHDC1 novel 6428 9 NA NA 0 4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAAGACAAAAAAAAAAAA 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.511.4 chr1 - 1792 2 incomplete-splice_match AHDC1 ENST00000644989.1 6103 6 54663 408 4729 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAAGACAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.511.5 chr1 - 1292 2 incomplete-splice_match AHDC1 ENST00000644989.1 6103 6 55163 408 5229 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAAGACAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.511.6 chr1 - 1142 2 incomplete-splice_match AHDC1 ENST00000644989.1 6103 6 55313 408 5379 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAAGACAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.511.7 chr1 - 3322 2 incomplete-splice_match AHDC1 ENST00000644989.1 6103 6 53131 410 3197 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AGAAAAAGACAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.511.8 chr1 - 2175 2 incomplete-splice_match AHDC1 ENST00000644989.1 6103 6 54277 411 4343 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAGAAAAAGACAAAAAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.512.1 chr1 - 2390 13 full-splice_match FGR ENST00000399173.5 2483 13 93 0 -12 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATACCCTTGAACCTTCCT 9370 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.512.2 chr1 - 2471 13 full-splice_match FGR ENST00000399173.5 2483 13 4 8 4 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAACCATGAAATACCCTTGA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.512.3 chr1 - 2401 13 full-splice_match FGR ENST00000374005.8 2637 13 0 236 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAACCATGAAATACCCTTGA -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.512.4 chr1 - 1354 5 incomplete-splice_match FGR ENST00000374004.5 2350 11 8461 0 8461 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAACCATGAAATACCCTTGA 9631 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.513.1 chr1 + 1654 2 antisense novelGene_AHDC1_AS novel NA NA NA NA NA NA multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AATAATAATGGCAGCTGTCA -4 TRUE NA NA AATACA -16 NA NA NA 2 NA PB.514.1 chr1 + 2319 8 full-splice_match FAM76A ENST00000373949.5 2273 8 -46 0 -14 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAGGAA 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.514.3 chr1 + 2010 9 full-splice_match FAM76A ENST00000373954.11 3579 9 56 1513 -11 130 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATATCAGTTGTCATACTGGG -4 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 4 NA PB.514.4 chr1 + 985 8 novel_in_catalog FAM76A novel 3579 9 NA NA 1413 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGATGTCTGAATTATAGATT 1449 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.515.1 chr1 + 2078 9 full-splice_match STX12 ENST00000373943.9 3034 9 -12 968 -12 -968 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAAATGTTGTCCACTTCCCT -22 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 6 NA PB.515.4 chr1 + 3031 9 full-splice_match STX12 ENST00000373943.9 3034 9 0 3 0 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.617260 0.417847 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATTCTCCTTATCTGTGCC -10 TRUE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 11 NA PB.515.5 chr1 + 2884 9 full-splice_match STX12 ENST00000373943.9 3034 9 10 140 -6 -140 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.568991 0.552545 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATACTGTGTGACCTGTGGT 0 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 15 NA PB.515.6 chr1 + 2327 9 full-splice_match STX12 ENST00000373943.9 3034 9 32 675 -4 -675 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 43 10.231107 1.009923 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TTTGTAGTATGTTTTTATGA 22 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 43 NA PB.515.7 chr1 + 851 7 incomplete-splice_match STX12 ENST00000373943.9 3034 9 33 6374 -3 -5 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAGAAAGAAAGAAAGA 23 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.515.10 chr1 + 2661 6 incomplete-splice_match STX12 ENST00000373943.9 3034 9 28463 -8 -8241 8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATCTGTGCCTTGATTATCAT NA FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 3 NA PB.515.11 chr1 + 1872 6 incomplete-splice_match STX12 ENST00000373943.9 3034 9 28563 681 -8141 -681 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGCTTTTGTAGTATGTTT NA FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.515.13 chr1 + 2319 4 incomplete-splice_match STX12 ENST00000373943.9 3034 9 38960 140 1932 -140 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATACTGTGTGACCTGTGGT NA FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.515.14 chr1 + 1758 4 incomplete-splice_match STX12 ENST00000373943.9 3034 9 38987 674 1959 -674 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TTGTAGTATGTTTTTATGAG NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 4 NA PB.515.15 chr1 + 2539 2 incomplete-splice_match STX12 ENST00000373943.9 3034 9 45513 675 8485 -675 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TTTGTAGTATGTTTTTATGA NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.516.1 chr1 + 1901 7 full-splice_match PPP1R8 ENST00000311772.10 2340 7 16 423 -16 -275 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAGGAAAAGATTTGTTT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.516.2 chr1 + 2169 7 full-splice_match PPP1R8 ENST00000311772.10 2340 7 22 149 -10 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 99 23.555338 1.372089 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTGGGTGCAGGCTGTGAA 4 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 99 NA PB.516.5 chr1 + 2636 7 full-splice_match PPP1R8 ENST00000431586.1 1029 7 -512 -1095 -2 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTGGGTGCAGGCTGTGAA 12 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.516.6 chr1 + 2300 7 full-splice_match PPP1R8 ENST00000311772.10 2340 7 32 8 0 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TGTGGAAATTCTAATGAGAG 14 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 5 NA PB.516.7 chr1 + 1012 7 full-splice_match PPP1R8 ENST00000311772.10 2340 7 32 1296 0 -52 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAGAAGAAGAAATATGCAAA 14 TRUE NA NA AATGAA -4 NA NA NA 8 NA PB.516.10 chr1 + 2388 7 full-splice_match PPP1R8 ENST00000431586.1 1029 7 -263 -1096 239 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTTGGGTGCAGGCTGTGAAT 261 FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.516.11 chr1 + 1955 5 incomplete-splice_match PPP1R8 ENST00000373931.8 2651 7 7942 145 7440 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTGGGTGCAGGCTGTGAA 4362 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.516.12 chr1 + 1709 4 incomplete-splice_match PPP1R8 ENST00000373931.8 2651 7 10349 145 -8922 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTGGGTGCAGGCTGTGAA 153 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 8 NA PB.516.13 chr1 + 1595 3 incomplete-splice_match PPP1R8 ENST00000236412.11 2414 6 12423 0 -6856 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTTGGGTGCAGGCTGTGAAT 2219 FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.516.14 chr1 + 1476 2 incomplete-splice_match PPP1R8 ENST00000236412.11 2414 6 16238 1 -3041 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTGGGTGCAGGCTGTGAA 6034 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 6 NA PB.517.1 chr1 - 816 5 full-splice_match IFI6 ENST00000361157.11 812 5 0 -4 0 4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 230 54.724522 1.738182 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GTCCTGCTGTCAATCATGTT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 230 NA PB.517.2 chr1 - 895 5 full-splice_match IFI6 ENST00000679644.1 911 5 20 -4 0 3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGTCCTGCTGTCAATCATGT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.517.3 chr1 - 830 5 full-splice_match IFI6 ENST00000339145.8 822 5 -14 6 0 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAACACTTTGTCCTGCTGT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.517.4 chr1 - 818 5 full-splice_match IFI6 ENST00000362020.4 828 5 6 4 0 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 36 8.565578 0.932757 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAACACTTTGTCCTGCTGT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 36 NA PB.517.5 chr1 - 635 3 incomplete-splice_match IFI6 ENST00000339145.8 822 5 3642 6 3642 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.855192 0.455635 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAACACTTTGTCCTGCTGT 3654 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.518.1 chr1 + 2303 5 novel_in_catalog THEMIS2 novel 2713 6 NA NA 0 1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GAATGAGAACGGTATCATTT -5 TRUE NA NA AATAAA -23 NA NA NA 3 NA PB.518.2 chr1 + 1229 4 full-splice_match THEMIS2 ENST00000373927.7 1082 4 -5 -142 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TGAATGAGAACGGTATCATT -5 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 10 NA PB.518.3 chr1 + 2707 6 full-splice_match THEMIS2 ENST00000373921.8 2713 6 5 1 0 1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.520721 0.655208 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATGAATGAGAACGGTATCAT 0 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 19 NA PB.518.4 chr1 + 1081 3 novel_in_catalog THEMIS2 novel 1082 4 NA NA 0 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TATGAATGAGAACGGTATCA 0 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 5 NA PB.518.5 chr1 + 2567 5 novel_in_catalog THEMIS2 novel 2713 6 NA NA 2 2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AATGAGAACGGTATCATTTA 2 TRUE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 2 NA PB.518.6 chr1 + 1866 3 incomplete-splice_match THEMIS2 ENST00000456990.1 1926 5 2415 -4 -1252 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AATGAGAACGGTATCATTTA 2493 FALSE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 2 NA PB.518.7 chr1 + 1732 3 incomplete-splice_match THEMIS2 ENST00000456990.1 1926 5 2545 0 -1122 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TATGAATGAGAACGGTATCA 2623 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.518.8 chr1 + 1487 3 incomplete-splice_match THEMIS2 ENST00000456990.1 1926 5 2791 -1 -876 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATGAATGAGAACGGTATCAT 2869 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 6 NA PB.518.9 chr1 + 1180 3 incomplete-splice_match THEMIS2 ENST00000456990.1 1926 5 3101 -4 -566 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AATGAGAACGGTATCATTTA 257 FALSE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 2 NA PB.518.10 chr1 + 959 2 full-splice_match THEMIS2 ENST00000492877.1 2861 2 1904 -2 1904 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TGAATGAGAACGGTATCATT -10 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 9 NA PB.519.1 chr1 + 1864 8 full-splice_match SMPDL3B ENST00000373894.8 1866 8 0 2 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.282789 0.631727 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GATTCTGTGTTGTGTTCCTT 6 TRUE NA NA AAAACA -18 NA NA NA 18 NA PB.519.3 chr1 + 1137 4 incomplete-splice_match SMPDL3B ENST00000549094.1 1611 7 19271 0 19271 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTCTGTGTTGTGTTCCTTT NA FALSE NA NA AAAACA -19 NA NA NA 4 NA PB.520.1 chr1 - 1608 9 full-splice_match RPA2 ENST00000373912.8 1584 9 -29 5 -16 -5 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 1014 241.263763 2.382492 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAAATTCTCGTTTTTCTTT -37 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 1014 NA PB.520.2 chr1 - 1493 8 novel_in_catalog RPA2 novel 1584 9 NA NA 1 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 33 7.851779 0.894968 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AGTAACTTGTAAAAATTCTC -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 33 NA PB.520.3 chr1 - 1586 9 novel_in_catalog RPA2 novel 1584 9 NA NA 4 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAAAATTCTCGTTTTTCTT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.520.4 chr1 - 1201 6 incomplete-splice_match RPA2 ENST00000373912.8 1584 9 7552 14 7490 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.520721 0.655208 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACTTGTAAAAATTCTCG 7710 FALSE NA NA AAGAAA -18 NA NA NA 19 NA PB.520.5 chr1 - 1729 9 full-splice_match RPA2 ENST00000373912.8 1584 9 -160 15 11 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 32 7.613847 0.881604 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AGTAACTTGTAAAAATTCTC -2 TRUE NA NA AAGAAA -4 NA NA NA 32 NA PB.520.6 chr1 - 1544 9 full-splice_match RPA2 ENST00000373909.7 1162 9 3 -385 3 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AGTAACTTGTAAAAATTCTC -10 TRUE NA NA AAGAAA -12 NA NA NA 9 NA PB.520.7 chr1 - 1319 7 incomplete-splice_match RPA2 ENST00000373912.8 1584 9 7294 15 7232 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AGTAACTTGTAAAAATTCTC 7452 FALSE NA NA AAGAAA -39 NA NA NA 9 NA PB.520.8 chr1 - 1129 10 novel_in_catalog RPA2 novel 1584 9 NA NA 0 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AGTAACTTGTAAAAATTCTC -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.520.9 chr1 - 1719 9 novel_not_in_catalog RPA2 novel 1584 9 NA NA 0 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TAGTAACTTGTAAAAATTCT -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.520.10 chr1 - 1457 8 novel_in_catalog RPA2 novel 1584 9 NA NA 4 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TAGTAACTTGTAAAAATTCT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.520.11 chr1 - 1431 8 full-splice_match RPA2 ENST00000313433.11 1237 8 339 -533 339 -2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 20 4.758654 0.677484 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TAGTAACTTGTAAAAATTCT 559 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 20 NA PB.520.12 chr1 - 775 2 incomplete-splice_match RPA2 ENST00000373912.8 1584 9 20497 16 3007 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.806923 0.580574 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TAGTAACTTGTAAAAATTCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.522.4 chr1 - 1126 7 incomplete-splice_match EYA3 ENST00000373864.5 2459 14 58036 603 11035 -603 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAATGAAAAAGAAAAGG NA FALSE NA NA AAGAAA -35 NA NA NA 4 NA PB.522.7 chr1 - 1754 16 incomplete-splice_match EYA3 ENST00000373871.8 5999 18 0 18132 0 -3 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCACCTATTATTTTCTAGCC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.522.8 chr1 - 1617 15 incomplete-splice_match EYA3 ENST00000373863.3 1729 17 -49 11205 -3 1 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATGCACCTATTATTTTCTAG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.522.12 chr1 - 1075 9 incomplete-splice_match EYA3 ENST00000373863.3 1729 17 -49 33528 -3 -5 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 TAAAAGAAAAATGTAAAAAG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.522.15 chr1 - 1506 1 full-splice_match RN7SL559P ENST00000476501.3 297 1 -1209 0 -1209 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA NA NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAGAAAAAAAAAATGTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.523.1 chr1 - 1806 2 full-splice_match PTAFR ENST00000373857.8 3993 2 0 2187 0 320 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA -9 TRUE NA NA AAGAAA -44 NA NA NA 2 NA PB.524.1 chr1 + 2152 3 full-splice_match XKR8 ENST00000373884.6 2178 3 26 0 26 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 40 9.517308 0.978514 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAACCTAGTCTGTGTCATCA -3 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 40 NA PB.524.2 chr1 + 2001 3 full-splice_match XKR8 ENST00000373884.6 2178 3 177 0 105 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAACCTAGTCTGTGTCATCA 105 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.525.1 chr1 - 1707 10 novel_in_catalog DNAJC8 novel 1600 10 NA NA -1 827 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGAATGCCTGCTGGAAAG 20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.525.2 chr1 - 1755 9 full-splice_match DNAJC8 ENST00000263697.6 1763 9 4 4 0 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 49 11.658703 1.066650 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAGCGTCCAGCTCACAGT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 49 NA PB.525.3 chr1 - 1891 10 full-splice_match DNAJC8 ENST00000489277.5 1600 10 -15 -276 -11 -5 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGAAAGCGTCCAGCTCACAG -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.525.5 chr1 - 1493 9 novel_not_in_catalog DNAJC8 novel 1600 10 NA NA 0 4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATTGATGTACTTTTCCTTG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.525.6 chr1 - 3544 7 novel_in_catalog DNAJC8 novel 1763 9 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.525.7 chr1 - 1591 10 full-splice_match DNAJC8 ENST00000489277.5 1600 10 9 0 4 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 31 7.375914 0.867816 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 31 NA PB.525.8 chr1 - 1545 10 novel_not_in_catalog DNAJC8 novel 1600 10 NA NA 0 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.525.9 chr1 - 1496 9 novel_in_catalog DNAJC8 novel 1600 10 NA NA 4 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.331058 0.522582 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.525.10 chr1 - 1463 9 incomplete-splice_match DNAJC8 ENST00000489277.5 1600 10 2805 0 2784 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC 7712 FALSE NA NA AAAACA -5 NA NA NA 2 NA PB.525.11 chr1 - 1486 9 full-splice_match DNAJC8 ENST00000263697.6 1763 9 -4 281 -4 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 1540 366.416382 2.563975 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 1540 NA PB.525.12 chr1 - 1397 8 novel_in_catalog DNAJC8 novel 1600 10 NA NA 4 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.525.13 chr1 - 1406 8 novel_in_catalog DNAJC8 novel 1763 9 NA NA 0 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.525.14 chr1 - 1390 8 novel_in_catalog DNAJC8 novel 1763 9 NA NA 0 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.525.15 chr1 - 1377 8 novel_in_catalog DNAJC8 novel 1600 10 NA NA -1 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.525.16 chr1 - 1389 9 full-splice_match DNAJC8 ENST00000263697.6 1763 9 93 281 68 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 34 8.089712 0.907933 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC 4996 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 34 NA PB.525.17 chr1 - 1374 8 novel_in_catalog DNAJC8 novel 1600 10 NA NA 4 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.331058 0.522582 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.525.18 chr1 - 1263 4 incomplete-splice_match DNAJC8 ENST00000489277.5 1600 10 24401 0 185 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC NA FALSE NA NA AATGAA -24 NA NA NA 2 NA PB.525.19 chr1 - 1260 7 incomplete-splice_match DNAJC8 ENST00000489277.5 1600 10 18040 0 -6176 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 27 6.424183 0.807818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC NA FALSE NA NA CATAAA -12 NA NA NA 27 NA PB.525.20 chr1 - 1043 4 novel_not_in_catalog DNAJC8 novel 1600 10 NA NA -1 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 63 14.989760 1.175795 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 63 NA PB.525.21 chr1 - 1092 5 incomplete-splice_match DNAJC8 ENST00000489277.5 1600 10 23014 0 -1202 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 43 10.231107 1.009923 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 43 NA PB.525.22 chr1 - 933 3 incomplete-splice_match DNAJC8 ENST00000603289.5 483 5 48 1103 48 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 31 7.375914 0.867816 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 31 NA PB.525.25 chr1 - 1274 10 full-splice_match DNAJC8 ENST00000489277.5 1600 10 0 326 0 -326 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAACAGTGTTGCTGTGACT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.525.26 chr1 - 1153 9 full-splice_match DNAJC8 ENST00000263697.6 1763 9 3 607 -1 -326 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 135 32.120914 1.506788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAACAGTGTTGCTGTGACT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 135 NA PB.525.27 chr1 - 1071 8 novel_in_catalog DNAJC8 novel 1763 9 NA NA 4 -326 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAACAGTGTTGCTGTGACT 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.525.28 chr1 - 918 7 incomplete-splice_match DNAJC8 ENST00000489277.5 1600 10 18056 326 -6160 -326 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAACAGTGTTGCTGTGACT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.525.29 chr1 - 783 5 incomplete-splice_match DNAJC8 ENST00000489277.5 1600 10 22997 326 -1219 -326 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAACAGTGTTGCTGTGACT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.525.30 chr1 - 695 4 novel_not_in_catalog DNAJC8 novel 1763 9 NA NA 0 -326 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAACAGTGTTGCTGTGACT 21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.525.31 chr1 - 1056 8 novel_in_catalog DNAJC8 novel 1600 10 NA NA 0 -327 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAAACAGTGTTGCTGTGAC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.525.32 chr1 - 771 9 full-splice_match DNAJC8 ENST00000263697.6 1763 9 0 992 0 -711 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAATGGAGCAACGTGAGT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.526.2 chr1 + 494 3 novel_not_in_catalog ATP5IF1 novel 503 3 NA NA 0 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AACTGTGTTTGATGCCTTCT -15 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.526.3 chr1 + 1882 2 full-splice_match ATP5IF1 ENST00000465645.1 1855 2 -27 0 3 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 120 28.551926 1.455635 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AACTGTGTTTGATGCCTTCT -12 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 120 NA PB.526.5 chr1 + 491 3 full-splice_match ATP5IF1 ENST00000335514.10 503 3 10 2 -8 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 62 14.751828 1.168846 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AACTGTGTTTGATGCCTTCT -5 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 62 NA PB.527.1 chr1 + 3473 10 full-splice_match SESN2 ENST00000253063.4 3462 10 -14 3 -14 -3 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATACTCCCTTTTTATGGGCT -11 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 7 NA PB.528.2 chr1 + 1849 3 full-splice_match MED18 ENST00000373842.9 1829 3 -19 -1 19 1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATGTCTGTGTAATTCTGATT -36 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.528.5 chr1 + 1292 4 novel_not_in_catalog MED18 novel 1106 4 NA NA -13 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.234519 0.718877 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACATGTCTGTGTAATTCTGA -30 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 22 NA PB.528.6 chr1 + 891 3 full-splice_match MED18 ENST00000373842.9 1829 3 -13 951 -13 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAAATATGTTTGCTTTTT -30 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.528.7 chr1 + 1041 4 novel_not_in_catalog MED18 novel 1106 4 NA NA -8 -5 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAGACATGTCTGTGTAAT -25 TRUE NA NA AATAAA -8 NA NA NA 4 NA PB.529.3 chr1 + 3369 14 full-splice_match PHACTR4 ENST00000373839.8 6048 14 1 2678 1 141 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG 45 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 6 NA PB.529.5 chr1 + 2001 11 novel_in_catalog PHACTR4 novel 3078 17 NA NA 1 -7893 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTTGTATGTTTCTGACTTTA 45 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.529.6 chr1 + 2110 12 incomplete-splice_match PHACTR4 ENST00000373839.8 6048 14 31 8576 27 -5368 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TACCTGGAAAGCACTCTCTT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.529.8 chr1 + 3171 14 full-splice_match PHACTR4 ENST00000373839.8 6048 14 42 2835 38 -16 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.529.16 chr1 + 1867 8 incomplete-splice_match PHACTR4 ENST00000373836.4 3107 13 20913 8012 20913 -7865 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAGAAAAAAGAAGCGTTT NA FALSE NA NA AATAAA -44 NA NA NA 2 NA PB.529.17 chr1 + 1270 5 incomplete-splice_match PHACTR4 ENST00000373836.4 3107 13 28359 8040 -25165 -7893 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTTGTATGTTTCTGACTTTA 6262 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.529.18 chr1 + 2335 9 incomplete-splice_match PHACTR4 ENST00000373836.4 3107 13 28529 -226 -24995 -16 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 6432 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.529.19 chr1 + 2450 9 incomplete-splice_match PHACTR4 ENST00000373836.4 3107 13 28571 -383 -24953 141 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG 6474 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.529.21 chr1 + 1908 8 incomplete-splice_match PHACTR4 ENST00000373836.4 3107 13 35898 -383 -17626 141 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG NA FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.529.22 chr1 + 1600 7 incomplete-splice_match PHACTR4 ENST00000373836.4 3107 13 38004 -226 -15520 -16 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.529.23 chr1 + 1726 7 incomplete-splice_match PHACTR4 ENST00000373836.4 3107 13 38035 -383 -15489 141 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG NA FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 4 NA PB.529.24 chr1 + 1473 5 incomplete-splice_match PHACTR4 ENST00000373836.4 3107 13 51012 -383 -2512 141 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG NA FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.529.25 chr1 + 1278 3 incomplete-splice_match PHACTR4 ENST00000632964.1 1853 4 44 2679 44 140 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.531.1 chr1 + 942 3 full-splice_match SNHG3 ENST00000413987.1 2201 3 0 1259 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTTGTGGTTCATTTTTG NA FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 10 NA PB.531.2 chr1 + 1552 2 incomplete-splice_match SNHG3 ENST00000413987.1 2201 3 61 1257 61 2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GTTTGTGGTTCATTTTTGTG -6 TRUE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 3 NA PB.531.3 chr1 + 897 3 novel_not_in_catalog SNHG3 novel 2201 3 NA NA 61 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTTGTGGTTCATTTTTG -6 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 7 NA PB.531.4 chr1 + 2137 3 full-splice_match SNHG3 ENST00000413987.1 2201 3 62 2 62 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACCAGTGGTTTTAGTATGT -5 TRUE NA NA AGTAAA -15 NA NA NA 5 NA PB.531.5 chr1 + 1237 4 novel_not_in_catalog SNHG3 novel 2201 3 NA NA 62 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TGAACCAGTGGTTTTAGTAT -5 TRUE NA NA AGTAAA -13 NA NA NA 4 NA PB.531.7 chr1 + 2511 12 novel_in_catalog RCC1 novel 2551 13 NA NA 0 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAAATAGGCCACTTGTTTT -4 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.531.8 chr1 + 879 3 full-splice_match SNHG3 ENST00000413987.1 2201 3 63 1259 63 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 156 37.117504 1.569579 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTTGTGGTTCATTTTTG -4 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 156 NA PB.531.9 chr1 + 2595 14 novel_in_catalog RCC1 novel 2686 14 NA NA 1 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC -3 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.531.10 chr1 + 2543 13 full-splice_match RCC1 ENST00000683442.1 2551 13 1 7 1 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAAATAGGCCACTTGTTTT -3 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 9 NA PB.531.11 chr1 + 986 4 novel_not_in_catalog SNHG3 novel 2201 3 NA NA 64 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTTGTGGTTCATTTTTG -3 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 5 NA PB.531.12 chr1 + 845 2 novel_in_catalog SNHG3 novel 2201 3 NA NA 64 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 23 5.472452 0.738182 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTTGTGGTTCATTTTTG -3 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 23 NA PB.531.13 chr1 + 3588 1 full-splice_match SNORA73A ENST00000364938.1 206 1 -1321 -2061 -1321 2061 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA NA NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CATGTTTGTGGTTCATTTTT -2 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 3 NA PB.531.14 chr1 + 1831 13 novel_not_in_catalog RCC1 novel 2686 14 NA NA 2 66 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 CAAAAGGAACATGGCTCACT -2 TRUE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 2 NA PB.531.15 chr1 + 1721 1 full-splice_match SNORA73B ENST00000363217.1 204 1 -646 -871 -646 871 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTTGTGGTTCATTTTTG 490 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 2 NA PB.531.16 chr1 + 1033 2 full-splice_match SNHG3 ENST00000437681.1 2614 2 1586 -5 1586 5 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTGGTTCATTTTTGTGGAG 514 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.531.17 chr1 + 1426 1 full-splice_match SNORA73B ENST00000363217.1 204 1 -351 -871 -351 871 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTTGTGGTTCATTTTTG 22 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 3 NA PB.531.18 chr1 + 1173 1 full-splice_match SNORA73B ENST00000363217.1 204 1 -98 -871 -98 871 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTTGTGGTTCATTTTTG 275 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 3 NA PB.531.22 chr1 + 2418 11 novel_in_catalog RCC1 novel 2424 10 NA NA -31 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC -16 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.531.23 chr1 + 2406 10 full-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 116 -98 -5 92 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 322 76.614334 1.884310 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GGTGTTGAGGCTACAACTTA 10 TRUE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 322 NA PB.531.24 chr1 + 2144 9 novel_in_catalog RCC1 novel 2424 10 NA NA -21 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC -6 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.531.25 chr1 + 2527 10 full-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 109 -212 -12 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATTTTGTTTGGGTATTTC 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.531.26 chr1 + 1929 10 full-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 109 386 -12 -371 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGAAAAAAGTGATTCTCCC 3 TRUE NA NA AAAAAG -20 NA NA NA 2 NA PB.531.27 chr1 + 2403 11 full-splice_match RCC1 ENST00000373831.7 1577 11 -7 -819 -7 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC 8 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 5 NA PB.531.28 chr1 + 1609 11 novel_in_catalog RCC1 novel 1577 11 NA NA -7 67 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.617260 0.417847 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGGAACATGGCTCACTC 8 TRUE NA NA AATAAA -25 NA NA NA 11 NA PB.531.29 chr1 + 1558 10 full-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 114 752 -7 67 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 30 7.137981 0.853575 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGGAACATGGCTCACTC 8 TRUE NA NA AATAAA -25 NA NA NA 30 NA PB.531.30 chr1 + 2459 11 novel_in_catalog RCC1 novel 1577 11 NA NA -5 94 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 69 16.417356 1.215303 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGTTGAGGCTACAACTTAAG 10 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 69 NA PB.531.31 chr1 + 1369 9 novel_in_catalog RCC1 novel 1577 11 NA NA -5 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TCCTTCCTCCTCTTTGGAAT 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.531.32 chr1 + 2517 11 full-splice_match RCC1 ENST00000373831.7 1577 11 -4 -936 -4 -96 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGTGATGTCAAGATGTCCT 11 TRUE NA NA AATAAA -30 NA NA NA 2 NA PB.531.33 chr1 + 2423 12 novel_in_catalog RCC1 novel 1577 11 NA NA 6 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC -9 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.531.34 chr1 + 2292 10 novel_not_in_catalog RCC1 novel 538 6 NA NA 45 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC 30 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.531.37 chr1 + 2486 8 incomplete-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 13349 1 -450 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAAATAGGCCACTTGTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.531.38 chr1 + 2307 8 incomplete-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 13528 1 -271 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAAATAGGCCACTTGTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.531.39 chr1 + 2199 8 incomplete-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 13737 -100 -62 94 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 25 5.948318 0.774394 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGTTGAGGCTACAACTTAAG NA FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 25 NA PB.531.40 chr1 + 2028 7 incomplete-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 14086 -98 287 92 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.520721 0.655208 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GGTGTTGAGGCTACAACTTA NA FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 19 NA PB.531.41 chr1 + 1866 7 incomplete-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 14150 0 351 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 10 NA PB.531.42 chr1 + 1758 6 incomplete-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 16957 0 -1000 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.234519 0.718877 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 22 NA PB.531.43 chr1 + 1622 5 incomplete-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 17204 0 -753 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.806923 0.580574 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 16 NA PB.531.44 chr1 + 1588 4 incomplete-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 17826 -98 -131 92 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 24 5.710385 0.756665 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GGTGTTGAGGCTACAACTTA NA FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 24 NA PB.531.45 chr1 + 1411 3 full-splice_match RCC1 ENST00000478232.1 509 3 183 -1085 183 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.531.46 chr1 + 1288 2 incomplete-splice_match RCC1 ENST00000478232.1 509 3 671 -1085 671 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 21 4.996587 0.698673 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 21 NA PB.532.1 chr1 - 1101 2 genic ENSG00000270605 novel 1945 1 NA NA -5733 -2 multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATGATTGTTTCTTGAACTT 12 TRUE NA NA GGGGCT -33 NA NA NA 2 NA PB.533.1 chr1 + 1118 9 full-splice_match TRNAU1AP ENST00000373830.4 1799 9 -105 786 -105 -5 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATGAATGTTTCTACAACACT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.533.3 chr1 + 1032 8 novel_in_catalog TRNAU1AP novel 1799 9 NA NA -56 -8 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATCATGAATGTTTCTACAAC 15 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.533.4 chr1 + 1792 9 full-splice_match TRNAU1AP ENST00000373830.4 1799 9 15 -8 1 8 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTTATTCTTCTTTTATTGAT 5 TRUE NA NA AATATA -15 NA NA NA 9 NA PB.533.5 chr1 + 1012 9 full-splice_match TRNAU1AP ENST00000373830.4 1799 9 15 772 1 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 127 30.217453 1.480258 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACACTGCTGCATTCATTTG 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 127 NA PB.533.6 chr1 + 883 8 novel_in_catalog TRNAU1AP novel 1799 9 NA NA -2 -5 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATGAATGTTTCTACAACACT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.533.7 chr1 + 1128 10 novel_in_catalog TRNAU1AP novel 1132 10 NA NA 1 -5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.617260 0.417847 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATGAATGTTTCTACAACACT 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.533.8 chr1 + 917 6 incomplete-splice_match TRNAU1AP ENST00000373830.4 1799 9 15 10756 1 457 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATTTTTAGCCTTATTTATAT 5 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.533.9 chr1 + 1143 10 full-splice_match TRNAU1AP ENST00000480930.5 1132 10 4 -15 -3 -5 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATGAATGTTTCTACAACACT 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.533.10 chr1 + 1057 9 novel_in_catalog TRNAU1AP novel 1008 8 NA NA -19 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATGTTTCTACAACACTGCT 119 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.534.1 chr1 - 1592 4 novel_in_catalog SNHG12 novel 682 6 NA NA 90 20 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAAAGAAGAATAAAAAG 141 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.534.2 chr1 - 1295 3 incomplete-splice_match SNHG12 ENST00000461448.6 1644 4 676 33 -171 20 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAAAGAAGAATAAAAAG 688 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.534.3 chr1 - 1065 5 full-splice_match SNHG12 ENST00000470977.6 1104 5 6 33 1 20 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAAAGAAGAATAAAAAG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.534.4 chr1 - 1048 5 full-splice_match SNHG12 ENST00000461832.2 1082 5 1 33 1 20 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 24 5.710385 0.756665 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAAAGAAGAATAAAAAG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 24 NA PB.534.6 chr1 - 866 5 full-splice_match SNHG12 ENST00000461832.2 1082 5 183 33 -67 20 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAAAGAAGAATAAAAAG 179 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.534.7 chr1 - 724 6 full-splice_match SNHG12 ENST00000648127.1 1871 6 1114 33 1 20 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAAAGAAGAATAAAAAG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.535.2 chr1 + 2019 2 full-splice_match RAB42 ENST00000465518.3 2236 2 216 1 216 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATCTCAGAATCTGCCTCCTG 216 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.537.1 chr1 + 2024 10 full-splice_match GMEB1 ENST00000361872.8 1894 10 -47 -83 -47 83 alternative_3end TRUE canonical NA NA NA NA 25 5.948318 0.774394 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGTTGAGAGTAGGTCATTC 2 TRUE NA NA AAAACA -15 NA NA NA 25 NA PB.537.2 chr1 + 1881 10 full-splice_match GMEB1 ENST00000373816.6 6358 10 -41 4518 -35 -38 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATCATTGTCCCACTCATTTC 14 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.537.4 chr1 + 1930 10 full-splice_match GMEB1 ENST00000294409.2 1912 10 11 -29 7 16 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAACTGAAAATGTTGGGTTC 12 TRUE NA NA TTTAAA -27 NA NA NA 6 NA PB.537.5 chr1 + 1195 4 incomplete-splice_match GMEB1 ENST00000480454.1 2063 9 18873 192 18873 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAAACAAAATC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.538.1 chr1 - 1381 6 full-splice_match TAF12 ENST00000263974.4 1359 6 -20 -2 -6 2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGACAGGGTACCTTTGAA 30 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.538.2 chr1 - 1122 6 full-splice_match TAF12 ENST00000373824.9 1335 6 -37 250 0 1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 347 82.562653 1.916784 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GAAAGACAGGGTACCTTTGA -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 347 NA PB.538.3 chr1 - 1173 6 full-splice_match TAF12 ENST00000689843.1 1099 6 -78 4 0 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GAAAGACAGGGTACCTTTGA 5185 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.538.4 chr1 - 1009 5 novel_in_catalog TAF12 novel 1438 7 NA NA -2 1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GAAAGACAGGGTACCTTTGA -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.538.5 chr1 - 933 5 incomplete-splice_match TAF12 ENST00000263974.4 1359 6 20916 -1 144 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GAAAGACAGGGTACCTTTGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.538.6 chr1 - 824 5 incomplete-splice_match TAF12 ENST00000263974.4 1359 6 21025 -1 253 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GAAAGACAGGGTACCTTTGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.538.7 chr1 - 1071 6 full-splice_match TAF12 ENST00000263974.4 1359 6 285 3 285 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AATCGAAAGACAGGGTACCT 5550 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.538.8 chr1 - 947 6 full-splice_match TAF12 ENST00000373824.9 1335 6 -20 408 -2 -31 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 36 8.565578 0.932757 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GACAAAGCATTATGGTCTTT 5183 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 36 NA PB.540.1 chr1 + 2439 5 full-splice_match YTHDF2 ENST00000373812.8 2744 5 -349 654 -30 -4 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.540.2 chr1 + 2042 6 full-splice_match YTHDF2 ENST00000542507.5 2825 6 130 653 130 -4 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA 131 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.540.3 chr1 + 1297 4 novel_in_catalog YTHDF2 novel 2825 6 NA NA -138 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCTAGTACCATTTAGTA -12 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.540.4 chr1 + 2871 5 full-splice_match YTHDF2 ENST00000373812.8 2744 5 -128 1 -128 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCTAGTACCATTTAGTA -2 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.540.5 chr1 + 2218 5 full-splice_match YTHDF2 ENST00000373812.8 2744 5 -128 654 -128 -4 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 42 9.993174 0.999703 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 42 NA PB.540.7 chr1 + 2095 5 full-splice_match YTHDF2 ENST00000373812.8 2744 5 -5 654 -5 -4 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 455 108.259384 2.034466 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 455 NA PB.540.8 chr1 + 1158 4 novel_in_catalog YTHDF2 novel 2825 6 NA NA 1 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 43 10.231107 1.009923 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCTAGTACCATTTAGTA -10 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 43 NA PB.540.9 chr1 + 2732 5 full-splice_match YTHDF2 ENST00000373812.8 2744 5 11 1 1 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.520721 0.655208 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCTAGTACCATTTAGTA 0 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 19 NA PB.540.10 chr1 + 2589 4 full-splice_match YTHDF2 ENST00000478283.5 2594 4 1 4 1 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.806923 0.580574 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.540.11 chr1 + 2052 4 full-splice_match YTHDF2 ENST00000541996.5 2719 4 13 654 3 -4 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.540.12 chr1 + 1905 4 novel_in_catalog YTHDF2 novel 358 3 NA NA 0 -4 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA 655 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.540.13 chr1 + 1914 4 novel_in_catalog YTHDF2 novel 657 3 NA NA 23 -4 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.540.14 chr1 + 1838 3 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000478283.5 2594 4 1328 4 528 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 23 5.472452 0.738182 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA 186 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 23 NA PB.540.15 chr1 + 1678 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000478283.5 2594 4 5552 4 3411 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA 4410 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.540.16 chr1 + 1513 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000478283.5 2594 4 5717 4 3576 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.568991 0.552545 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA 4575 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.540.17 chr1 + 1357 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000478283.5 2594 4 5873 4 3732 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.093125 0.490398 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA 4731 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.540.18 chr1 + 1281 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000478283.5 2594 4 5949 4 3808 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.093125 0.490398 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA 4807 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.540.19 chr1 + 1055 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000478283.5 2594 4 6175 4 4034 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 30 7.137981 0.853575 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA 5033 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 30 NA PB.540.20 chr1 + 1590 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000373812.8 2744 5 6303 1 4152 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCTAGTACCATTTAGTA 5151 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.540.21 chr1 + 846 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000478283.5 2594 4 6384 4 4243 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA 5242 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.540.22 chr1 + 1480 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000373812.8 2744 5 6413 1 4262 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCTAGTACCATTTAGTA 5261 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 4 NA PB.540.23 chr1 + 1305 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000373812.8 2744 5 6588 1 4437 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.855192 0.455635 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCTAGTACCATTTAGTA 5436 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 12 NA PB.540.24 chr1 + 1205 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000373812.8 2744 5 6688 1 4537 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.855192 0.455635 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCTAGTACCATTTAGTA 5536 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 12 NA PB.540.25 chr1 + 1067 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000373812.8 2744 5 6826 1 4675 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.568991 0.552545 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCTAGTACCATTTAGTA 5674 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 15 NA PB.540.26 chr1 + 933 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000373812.8 2744 5 6960 1 4809 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.520721 0.655208 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCTAGTACCATTTAGTA 5808 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 19 NA PB.540.27 chr1 + 1064 2 intergenic novelGene_449 novel NA NA NA NA NA NA multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 CCAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA AATGAA -12 NA NA NA 2 NA PB.541.1 chr1 - 1404 1 full-splice_match ENSG00000289291 ENST00000691740.1 1627 1 216 7 216 -7 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATCGCTATCAGTCTTTCG 215 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.541.2 chr1 - 1666 1 full-splice_match ENSG00000289291 ENST00000691740.1 1627 1 -47 8 -47 -8 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATCGCTATCAGTCTTTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.543.1 chr1 - 2494 2 full-splice_match TMEM200B ENST00000521452.2 2468 2 -23 -3 -23 3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTGTGGTGTGTCTGAGTCA -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.543.2 chr1 - 2883 2 full-splice_match TMEM200B ENST00000420504.2 2553 2 -326 -4 -326 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTTACTGTGGTGTGTCTGA 7855 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.543.4 chr1 - 2769 2 full-splice_match TMEM200B ENST00000420504.2 2553 2 -215 -1 -215 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTGTTACTGTGGTGTGTC 7966 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.544.1 chr1 - 2269 6 novel_not_in_catalog SRSF4 novel 2300 6 NA NA 0 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATTTCATGGTGTTTGAA -20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.544.2 chr1 - 2294 6 full-splice_match SRSF4 ENST00000373795.7 2300 6 2 4 2 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 76 18.082886 1.257268 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATTTCATGGTGTTTGAA -28 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 76 NA PB.544.3 chr1 - 2196 5 full-splice_match SRSF4 ENST00000466448.4 1264 5 -8 -924 0 -4 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATTTCATGGTGTTTGAA -20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.544.4 chr1 - 2000 5 full-splice_match SRSF4 ENST00000466448.4 1264 5 188 -924 186 -4 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATTTCATGGTGTTTGAA 5160 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.544.5 chr1 - 2080 6 full-splice_match SRSF4 ENST00000373795.7 2300 6 216 4 196 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATTTCATGGTGTTTGAA 5170 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.544.6 chr1 - 1778 3 incomplete-splice_match SRSF4 ENST00000634348.1 8128 7 18591 -106 4637 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATTTCATGGTGTTTGAA 5530 FALSE NA NA AAAAAG -27 NA NA NA 8 NA PB.544.7 chr1 - 1632 3 incomplete-splice_match SRSF4 ENST00000634348.1 8128 7 18737 -106 4783 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATTTCATGGTGTTTGAA 5676 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.544.8 chr1 - 1690 2 incomplete-splice_match SRSF4 ENST00000466448.4 1264 5 26977 -924 4635 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATTTCATGGTGTTTGAA 5528 FALSE NA NA AAAAAG -29 NA NA NA 3 NA PB.544.9 chr1 - 1550 2 incomplete-splice_match SRSF4 ENST00000634348.1 8128 7 23322 -106 9368 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATTTCATGGTGTTTGAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.544.18 chr1 - 1976 5 incomplete-splice_match SRSF4 ENST00000691479.1 2952 10 21937 -12 -392 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACAAAATTTCATGGTGTTTG 490 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.544.19 chr1 - 2214 6 full-splice_match SRSF4 ENST00000373795.7 2300 6 -24 110 -24 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 151 35.927837 1.555431 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAGAAAAGAAAAGAAT 4930 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 151 NA PB.544.20 chr1 - 2080 5 full-splice_match SRSF4 ENST00000466448.4 1264 5 2 -818 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAGAAAAGAAAAGAAT -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.544.21 chr1 - 1784 4 incomplete-splice_match SRSF4 ENST00000634348.1 8128 7 14016 0 62 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAGAAAAGAAAAGAAT 955 FALSE NA NA AATAAA -23 NA NA NA 7 NA PB.544.22 chr1 - 1559 3 incomplete-splice_match SRSF4 ENST00000634348.1 8128 7 18704 0 4750 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAGAAAAGAAAAGAAT 5643 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.544.24 chr1 - 1924 5 incomplete-splice_match SRSF4 ENST00000373795.7 2300 6 21393 111 56 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAAGAAAAGAAAAGAA NA FALSE NA NA AAGAAA -22 NA NA NA 4 NA PB.544.29 chr1 - 1800 6 full-splice_match SRSF4 ENST00000373795.7 2300 6 20 480 0 -370 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ACTGAAAAAAATTTTCTCTT -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.544.33 chr1 - 1216 6 full-splice_match SRSF4 ENST00000373795.7 2300 6 2 1082 2 -154 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 GAAGAGAAGCAGAGAGGAGA -28 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.545.1 chr1 + 1966 6 incomplete-splice_match EPB41 ENST00000482464.6 2154 14 -41 49031 -13 -37809 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 TAAAAAAGAAAATGGAAAAT -36 TRUE NA NA TATAAA -10 NA NA NA 2 NA PB.545.3 chr1 + 5742 18 full-splice_match EPB41 ENST00000647103.1 5772 18 9 21 0 -18 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAACAACAACAAAAAGA -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.545.5 chr1 + 778 3 incomplete-splice_match EPB41 ENST00000373797.2 2407 15 -4 71788 1 -61081 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.568991 0.552545 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAGCAGAAACAGAATTAA 20 TRUE NA NA AGTAAA -19 NA NA NA 15 NA PB.545.7 chr1 + 2081 6 incomplete-splice_match EPB41 ENST00000373797.2 2407 15 -35 48515 -5 -37808 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAAGAAAATGGAAAATC -11 TRUE NA NA TATAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.545.8 chr1 + 5734 17 novel_in_catalog EPB41 novel 2937 20 NA NA 7 -18 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAACAACAACAAAAAGA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.545.9 chr1 + 5642 17 novel_in_catalog EPB41 novel 2937 20 NA NA 0 -18 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAACAACAACAAAAAGA 12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.545.10 chr1 + 5848 18 novel_in_catalog EPB41 novel 6031 21 NA NA 0 -18 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.093125 0.490398 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAACAACAACAAAAAGA 19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.545.11 chr1 + 5904 19 novel_in_catalog EPB41 novel 2937 20 NA NA 1 -18 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAACAACAACAAAAAGA 20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.545.12 chr1 + 5592 17 novel_in_catalog EPB41 novel 6031 21 NA NA 1 -18 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAACAACAACAAAAAGA 20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.545.15 chr1 + 5048 16 incomplete-splice_match EPB41 ENST00000647103.1 5772 18 106364 21 5844 -18 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAACAACAACAAAAAGA 5953 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.545.16 chr1 + 4037 8 incomplete-splice_match EPB41 ENST00000647103.1 5772 18 152304 21 -23 -18 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAACAACAACAAAAAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.545.17 chr1 + 3826 7 incomplete-splice_match EPB41 ENST00000647103.1 5772 18 166192 21 119 -18 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAACAACAACAAAAAGA 6012 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.545.20 chr1 + 3705 6 full-splice_match EPB41 ENST00000490308.2 922 6 116 -2899 116 -18 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAACAACAACAAAAAGA 2406 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.545.22 chr1 + 3385 3 incomplete-splice_match EPB41 ENST00000460378.1 5212 5 16139 18 14784 -18 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAACAACAACAAAAAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.545.23 chr1 + 3308 2 incomplete-splice_match EPB41 ENST00000460378.1 5212 5 19466 18 18111 -18 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAACAACAACAAAAAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.546.1 chr1 + 5589 30 full-splice_match PTPRU ENST00000373779.8 5573 30 -17 1 -11 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGAGCAGCCCTGTGTGTG -16 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.546.2 chr1 + 3584 19 incomplete-splice_match PTPRU ENST00000373779.8 5573 30 46151 1 -1050 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGAGCAGCCCTGTGTGTG NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.546.3 chr1 + 2494 10 incomplete-splice_match PTPRU ENST00000428026.6 5550 30 75094 14 297 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGAGCAGCCCTGTGTGTG NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.546.4 chr1 + 2225 8 incomplete-splice_match PTPRU ENST00000428026.6 5550 30 78820 14 -2391 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGAGCAGCCCTGTGTGTG NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 8 NA PB.546.5 chr1 + 2015 7 incomplete-splice_match PTPRU ENST00000428026.6 5550 30 79524 14 -1687 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGAGCAGCCCTGTGTGTG NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.546.6 chr1 + 1596 4 full-splice_match PTPRU ENST00000492954.1 625 4 180 -1151 180 1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGAGCAGCCCTGTGTGTGTC NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.546.7 chr1 + 1333 2 incomplete-splice_match PTPRU ENST00000492954.1 625 4 1977 -1149 1977 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGAGCAGCCCTGTGTGTG NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.547.1 chr1 - 2279 10 full-splice_match MECR ENST00000263702.11 2515 10 10 226 0 -10 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.044856 0.606903 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TAATTACCATAGTGACTAAT -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.547.3 chr1 - 1545 12 novel_in_catalog MECR novel 2515 10 NA NA 0 -5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGTAGAAGTCATCCCT -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.547.4 chr1 - 1531 11 novel_not_in_catalog MECR novel 2416 10 NA NA -1 -5 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGTAGAAGTCATCCCT 12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.547.5 chr1 - 1506 11 novel_in_catalog MECR novel 2515 10 NA NA -3 -5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGTAGAAGTCATCCCT -31 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.547.6 chr1 - 1467 10 full-splice_match MECR ENST00000373791.7 2416 10 0 949 0 -5 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.568991 0.552545 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGTAGAAGTCATCCCT -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.547.7 chr1 - 1424 11 novel_in_catalog MECR novel 2515 10 NA NA 0 -5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.806923 0.580574 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGTAGAAGTCATCCCT -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.547.8 chr1 - 1390 10 novel_in_catalog MECR novel 2515 10 NA NA -3 -5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGTAGAAGTCATCCCT -31 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.547.9 chr1 - 1355 9 novel_in_catalog MECR novel 2416 10 NA NA 0 -5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGTAGAAGTCATCCCT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.547.10 chr1 - 1364 10 full-splice_match MECR ENST00000263702.11 2515 10 -14 1165 -6 -5 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 172 40.924427 1.611983 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGTAGAAGTCATCCCT -34 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 172 NA PB.547.11 chr1 - 1243 10 full-splice_match MECR ENST00000263702.11 2515 10 107 1165 64 -5 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGTAGAAGTCATCCCT 5636 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.547.13 chr1 - 1001 8 incomplete-splice_match MECR ENST00000373791.7 2416 10 14835 949 -60 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGTAGAAGTCATCCCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.549.1 chr1 - 2250 8 full-splice_match LAPTM5 ENST00000294507.4 2177 8 -73 0 -73 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 453 107.783516 2.032552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGTCTGGCTGATGTGTTTCT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 453 NA PB.549.2 chr1 - 2083 7 novel_in_catalog LAPTM5 novel 2177 8 NA NA 0 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGTCTGGCTGATGTGTTTCT 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.549.3 chr1 - 2122 7 novel_in_catalog LAPTM5 novel 2177 8 NA NA -22 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGTCTGGCTGATGTGTTTCT 8209 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.549.4 chr1 - 2037 7 incomplete-splice_match LAPTM5 ENST00000464569.1 953 8 3704 -1420 3704 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 29 6.900049 0.838852 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGTCTGGCTGATGTGTTTCT 9821 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 29 NA PB.549.5 chr1 - 2006 6 novel_in_catalog LAPTM5 novel 2177 8 NA NA 0 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.282789 0.631727 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGTCTGGCTGATGTGTTTCT 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.549.6 chr1 - 1968 6 incomplete-splice_match LAPTM5 ENST00000464569.1 953 8 4512 -1420 4512 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGTCTGGCTGATGTGTTTCT -20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.549.7 chr1 - 1825 5 incomplete-splice_match LAPTM5 ENST00000464569.1 953 8 6357 -1420 6357 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGTCTGGCTGATGTGTTTCT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.549.8 chr1 - 1668 4 incomplete-splice_match LAPTM5 ENST00000464569.1 953 8 7260 -1420 7260 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 21 4.996587 0.698673 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGTCTGGCTGATGTGTTTCT 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 21 NA PB.549.9 chr1 - 1494 2 incomplete-splice_match LAPTM5 ENST00000464569.1 953 8 11012 -1420 11012 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 35 8.327644 0.920522 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGTCTGGCTGATGTGTTTCT 7320 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 35 NA PB.549.16 chr1 - 1309 8 full-splice_match LAPTM5 ENST00000294507.4 2177 8 -102 970 -102 450 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACAACAGTCTATTGCATT 8129 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.549.17 chr1 - 1207 8 full-splice_match LAPTM5 ENST00000294507.4 2177 8 0 970 0 450 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 59 14.038030 1.147306 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACAACAGTCTATTGCATT 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 59 NA PB.550.2 chr1 + 1785 4 novel_in_catalog MATN1-AS1 novel 2131 4 NA NA 0 -13 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACTAATTAAATTTAGCT -12 TRUE NA NA AATAAA -32 NA NA NA 2 NA PB.556.11 chr1 - 1836 9 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000373742.6 3515 20 100971 -326 58 90 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAACAAACAAAAACAA 9941 FALSE NA NA TATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.556.14 chr1 - 3772 21 novel_in_catalog PUM1 novel 5385 22 NA NA 0 -10 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAAAAAAGCTTTAAAA 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.556.15 chr1 - 4004 22 full-splice_match PUM1 ENST00000426105.7 5385 22 24 1357 2 -13 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 23 5.472452 0.738182 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 23 NA PB.556.16 chr1 - 3933 21 novel_in_catalog PUM1 novel 5385 22 NA NA 2 -13 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA -25 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.556.17 chr1 - 3919 22 novel_in_catalog PUM1 novel 5360 22 NA NA 0 -13 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.556.18 chr1 - 4043 22 novel_in_catalog PUM1 novel 5385 22 NA NA 0 -13 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.556.19 chr1 - 4003 22 full-splice_match PUM1 ENST00000257075.9 5360 22 0 1357 0 -13 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 25 5.948318 0.774394 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 25 NA PB.556.20 chr1 - 3925 22 novel_in_catalog PUM1 novel 5385 22 NA NA 0 -13 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.855192 0.455635 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.556.21 chr1 - 3893 21 novel_in_catalog PUM1 novel 5360 22 NA NA 3 -13 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.556.22 chr1 - 3715 20 novel_in_catalog PUM1 novel 5360 22 NA NA 0 -13 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.556.23 chr1 - 3737 20 novel_in_catalog PUM1 novel 5385 22 NA NA 3 -13 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.556.24 chr1 - 3634 20 novel_in_catalog PUM1 novel 3936 22 NA NA 0 -13 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.556.25 chr1 - 3652 21 novel_in_catalog PUM1 novel 5360 22 NA NA 2526 -13 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 6608 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.556.26 chr1 - 3417 19 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000257075.9 5360 22 58656 1357 -11938 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.556.27 chr1 - 3414 19 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000373747.7 5375 22 58674 1357 -11926 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.556.28 chr1 - 3288 18 full-splice_match PUM1 ENST00000424085.6 4631 18 -14 1357 -5 -13 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.556.29 chr1 - 2977 10 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000373742.6 3515 20 98650 -217 -755 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 7620 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.556.30 chr1 - 2576 14 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000373742.6 3515 20 85703 -217 51 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.556.31 chr1 - 2551 13 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000498419.5 3068 17 20267 19 67 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA AAGAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.556.32 chr1 - 2359 12 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000373742.6 3515 20 97337 -217 -2068 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 6307 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.556.33 chr1 - 2364 12 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000498419.5 3068 17 26612 19 -2067 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 6308 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.556.34 chr1 - 2223 11 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000373742.6 3515 20 98516 -217 -889 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 7486 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.556.35 chr1 - 1994 10 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000373742.6 3515 20 99633 -217 228 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 8603 FALSE NA NA GGGGCT -27 NA NA NA 5 NA PB.556.36 chr1 - 1988 10 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000498419.5 3068 17 28919 19 240 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 8615 FALSE NA NA GGGGCT -15 NA NA NA 4 NA PB.556.37 chr1 - 1825 9 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000373742.6 3515 20 100873 -217 -40 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 9843 FALSE NA NA ATTAAA -37 NA NA NA 2 NA PB.556.38 chr1 - 1761 9 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000373742.6 3515 20 100937 -217 24 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 9907 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.556.39 chr1 - 1745 9 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000498419.5 3068 17 30233 19 46 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 9929 FALSE NA NA TATAAA -27 NA NA NA 2 NA PB.556.40 chr1 - 1587 8 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000373742.6 3515 20 111803 -217 -225 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.556.41 chr1 - 1578 8 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000498419.5 3068 17 41092 19 -210 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.556.42 chr1 - 1464 8 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000498419.5 3068 17 41206 19 -96 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.556.43 chr1 - 1448 8 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000373742.6 3515 20 111942 -217 -86 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.556.44 chr1 - 1260 6 novel_not_in_catalog PUM1 novel 3068 17 NA NA -3829 -13 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.556.45 chr1 - 1289 7 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000373742.6 3515 20 113451 -217 1410 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA AGTAAA -5 NA NA NA 6 NA PB.556.46 chr1 - 1306 7 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000498419.5 3068 17 42714 19 1399 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA AGTAAA -16 NA NA NA 5 NA PB.556.47 chr1 - 1185 6 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000373742.6 3515 20 115527 -217 3486 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.556.48 chr1 - 1128 6 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000498419.5 3068 17 44864 19 3549 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.556.49 chr1 - 1001 5 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000498419.5 3068 17 49634 19 -53 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.331058 0.522582 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.556.50 chr1 - 796 3 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000530669.1 582 5 4099 -442 4099 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 8 NA PB.556.52 chr1 - 705 3 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000530669.1 582 5 4190 -442 4190 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.556.53 chr1 - 711 2 novel_not_in_catalog PUM1 novel 582 5 NA NA 9600 -13 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.556.66 chr1 - 836 6 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000440538.6 3936 22 -11 62352 0 -14 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.568991 0.552545 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAACGACAAAGGTGAAAAG 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.557.1 chr1 - 2521 6 incomplete-splice_match NKAIN1 ENST00000373736.7 2922 7 51706 1 -28 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCTTCCTGTCCTGCCCATT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.557.2 chr1 - 2390 5 incomplete-splice_match NKAIN1 ENST00000373736.7 2922 7 54559 1 2825 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCTTCCTGTCCTGCCCATT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.557.3 chr1 - 2018 2 incomplete-splice_match NKAIN1 ENST00000526106.5 569 5 6243 -1843 -234 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCTTCCTGTCCTGCCCATT 681 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.561.1 chr1 - 1835 11 novel_not_in_catalog SNRNP40 novel 1615 10 NA NA 0 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGAAGCTGCTCACTTGTTT -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.561.2 chr1 - 1613 10 full-splice_match SNRNP40 ENST00000263694.9 1615 10 0 2 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 149 35.451973 1.549640 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGAAGCTGCTCACTTGTTT -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 149 NA PB.561.3 chr1 - 1258 8 incomplete-splice_match SNRNP40 ENST00000263694.9 1615 10 4829 2 -2540 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGAAGCTGCTCACTTGTTT 4857 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.561.4 chr1 - 1099 7 incomplete-splice_match SNRNP40 ENST00000263694.9 1615 10 7481 2 112 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGAAGCTGCTCACTTGTTT 7509 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.561.5 chr1 - 924 5 incomplete-splice_match SNRNP40 ENST00000489853.1 1928 6 10982 -104 -1835 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGAAGCTGCTCACTTGTTT NA FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 5 NA PB.561.6 chr1 - 792 4 full-splice_match SNRNP40 ENST00000373720.3 1087 4 435 -140 435 -2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGAAGCTGCTCACTTGTTT -6 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 7 NA PB.561.7 chr1 - 1528 10 novel_not_in_catalog SNRNP40 novel 1615 10 NA NA 0 2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CATGTGGATTGGATTTATTG -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.561.8 chr1 - 1525 10 full-splice_match SNRNP40 ENST00000263694.9 1615 10 -19 109 -19 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 1111 264.343231 2.422168 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAGCCATGTGGATTGGAT 9 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 1111 NA PB.561.9 chr1 - 1713 11 novel_not_in_catalog SNRNP40 novel 1615 10 NA NA 9 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 28 6.662116 0.823612 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAGCCATGTGGATTGGAT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 28 NA PB.561.11 chr1 - 1429 9 novel_in_catalog SNRNP40 novel 1615 10 NA NA 9 -3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAGCCATGTGGATTGGAT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.561.12 chr1 - 1413 9 novel_not_in_catalog SNRNP40 novel 1615 10 NA NA -2580 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAGCCATGTGGATTGGAT 4817 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.561.13 chr1 - 1384 10 full-splice_match SNRNP40 ENST00000263694.9 1615 10 122 109 116 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.331058 0.522582 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAGCCATGTGGATTGGAT 150 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.561.14 chr1 - 1179 8 incomplete-splice_match SNRNP40 ENST00000263694.9 1615 10 4801 109 -2568 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 39 9.279376 0.967519 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAGCCATGTGGATTGGAT 4829 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 39 NA PB.561.15 chr1 - 982 7 incomplete-splice_match SNRNP40 ENST00000263694.9 1615 10 7491 109 122 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 25 5.948318 0.774394 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAGCCATGTGGATTGGAT 7519 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 25 NA PB.561.16 chr1 - 855 6 full-splice_match SNRNP40 ENST00000489853.1 1928 6 1070 3 1070 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.568991 0.552545 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAGCCATGTGGATTGGAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.561.17 chr1 - 757 5 incomplete-splice_match SNRNP40 ENST00000489853.1 1928 6 11042 3 -1775 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAGCCATGTGGATTGGAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.561.18 chr1 - 1519 10 novel_not_in_catalog SNRNP40 novel 1615 10 NA NA 36 -5 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACAAGAGCCATGTGGATTGG 70 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.561.20 chr1 - 1213 1 full-splice_match ENSG00000229447 ENST00000452686.2 437 1 -891 115 -891 -115 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAATT 4653 FALSE NA NA AATATA -29 NA NA NA 4 NA PB.562.1 chr1 + 1389 8 novel_not_in_catalog ZCCHC17 novel 1568 8 NA NA -9 12525 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AGAAGTAAAGAAATGTCTGT NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.562.2 chr1 + 1550 7 novel_in_catalog ZCCHC17 novel 1568 8 NA NA 6 -4 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAACTTACTGAGTTATTTT 6 FALSE NA NA ACTAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.562.4 chr1 + 1599 8 full-splice_match ZCCHC17 ENST00000344147.10 1568 8 -34 3 0 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 175 41.638226 1.619492 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACTTACTGAGTTATTTTT -20 TRUE NA NA ACTAAA -20 NA NA NA 175 NA PB.562.5 chr1 + 1498 7 full-splice_match ZCCHC17 ENST00000616393.4 1534 7 16 20 0 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACTTACTGAGTTATTTTT -20 TRUE NA NA ACTAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.562.6 chr1 + 1618 8 novel_in_catalog ZCCHC17 novel 1730 8 NA NA 2 -3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACTTACTGAGTTATTTTT -18 TRUE NA NA ACTAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.562.7 chr1 + 1566 8 novel_in_catalog ZCCHC17 novel 1705 9 NA NA 2 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACTTACTGAGTTATTTTT -18 TRUE NA NA ACTAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.562.8 chr1 + 1350 6 novel_in_catalog ZCCHC17 novel 1489 7 NA NA 2 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACTTACTGAGTTATTTTT -18 TRUE NA NA ACTAAA -20 NA NA NA 5 NA PB.562.10 chr1 + 680 7 incomplete-splice_match ZCCHC17 ENST00000344147.10 1568 8 -32 15977 2 -9 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 23 5.472452 0.738182 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AGAAAAAGAAAGAAGGTGAA -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 23 NA PB.562.11 chr1 + 1468 7 novel_in_catalog ZCCHC17 novel 1730 8 NA NA 0 -3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACTTACTGAGTTATTTTT -10 TRUE NA NA ACTAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.562.12 chr1 + 1061 10 novel_not_in_catalog ZCCHC17 novel 1705 9 NA NA 4 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAACTTACTGAGTTATTTT -6 TRUE NA NA ACTAAA -19 NA NA NA 4 NA PB.562.14 chr1 + 918 7 incomplete-splice_match ZCCHC17 ENST00000344147.10 1568 8 -13 15720 11 248 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAGAAAAATGAA 1 TRUE NA NA AAAAAG -15 NA NA NA 6 NA PB.562.15 chr1 + 1644 9 full-splice_match ZCCHC17 ENST00000546109.5 1705 9 41 20 -9 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.331058 0.522582 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACTTACTGAGTTATTTTT 5 TRUE NA NA ACTAAA -20 NA NA NA 14 NA PB.562.16 chr1 + 780 7 incomplete-splice_match ZCCHC17 ENST00000373714.5 1730 8 32 15975 4 -7 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAAGAAAGAAGGTGAATG 22 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.562.18 chr1 + 1673 8 full-splice_match ZCCHC17 ENST00000373714.5 1730 8 54 3 26 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACTTACTGAGTTATTTTT 44 FALSE NA NA ACTAAA -20 NA NA NA 6 NA PB.562.20 chr1 + 1441 7 incomplete-splice_match ZCCHC17 ENST00000344147.10 1568 8 13092 3 13088 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACTTACTGAGTTATTTTT NA FALSE NA NA ACTAAA -20 NA NA NA 6 NA PB.562.24 chr1 + 1242 4 incomplete-splice_match ZCCHC17 ENST00000344147.10 1568 8 41923 4 41919 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.855192 0.455635 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAACTTACTGAGTTATTTT NA FALSE NA NA ACTAAA -19 NA NA NA 12 NA PB.562.25 chr1 + 1140 3 incomplete-splice_match ZCCHC17 ENST00000344147.10 1568 8 49617 3 49613 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACTTACTGAGTTATTTTT NA FALSE NA NA ACTAAA -20 NA NA NA 7 NA PB.562.26 chr1 + 957 2 incomplete-splice_match ZCCHC17 ENST00000344147.10 1568 8 51887 4 51883 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAACTTACTGAGTTATTTT 2235 FALSE NA NA ACTAAA -19 NA NA NA 10 NA PB.563.1 chr1 + 1934 11 full-splice_match SERINC2 ENST00000373710.5 2146 11 211 1 211 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CATGTTCTGTGCCCCTCACC -1 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.563.3 chr1 + 1923 10 full-splice_match SERINC2 ENST00000373709.8 1900 10 -24 1 -24 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 151 35.927837 1.555431 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTCTGTGCCCCTCACCC -31 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 151 NA PB.563.4 chr1 + 1949 11 novel_not_in_catalog SERINC2 novel 1900 10 NA NA 0 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTCTGTGCCCCTCACCC -7 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.563.5 chr1 + 1819 9 novel_in_catalog SERINC2 novel 1900 10 NA NA 0 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTCTGTGCCCCTCACCC -7 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.563.6 chr1 + 2062 10 full-splice_match SERINC2 ENST00000536384.2 2062 10 0 0 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTCTGTGCCCCTCACCCTCA -28 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.563.7 chr1 + 1666 9 incomplete-splice_match SERINC2 ENST00000491976.1 2807 11 10017 4 10017 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.331058 0.522582 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACCATGTTCTGTGCCCCTC 34 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 14 NA PB.563.8 chr1 + 1434 7 incomplete-splice_match SERINC2 ENST00000491976.1 2807 11 11533 4 11533 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACCATGTTCTGTGCCCCTC 11 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 8 NA PB.563.9 chr1 + 1291 6 incomplete-splice_match SERINC2 ENST00000491976.1 2807 11 12042 4 12042 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACCATGTTCTGTGCCCCTC 56 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 7 NA PB.563.10 chr1 + 1105 5 incomplete-splice_match SERINC2 ENST00000491976.1 2807 11 12972 0 12972 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTCTGTGCCCCTCACCC 27 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 7 NA PB.563.11 chr1 + 969 3 incomplete-splice_match SERINC2 ENST00000491976.1 2807 11 15586 4 15586 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACCATGTTCTGTGCCCCTC 387 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.563.12 chr1 + 990 2 incomplete-splice_match SERINC2 ENST00000491976.1 2807 11 18994 3 18994 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACCATGTTCTGTGCCCCTCA 3304 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.563.13 chr1 + 798 2 incomplete-splice_match SERINC2 ENST00000491976.1 2807 11 19185 4 19185 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACCATGTTCTGTGCCCCTC 3495 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.564.1 chr1 - 889 4 full-splice_match FABP3 ENST00000373713.7 1097 4 0 208 0 -208 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACGTTGCCTTTACACTGCCC -1 TRUE NA NA TTTAAA -23 NA NA NA 4 NA PB.564.2 chr1 - 729 4 full-splice_match FABP3 ENST00000373713.7 1097 4 -36 404 -36 56 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.568991 0.552545 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCAGTTGCCTTTTTGCCT 228 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.565.3 chr1 - 1518 5 novel_not_in_catalog PEF1 novel 1614 5 NA NA 3 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTTCCATGTTTTCCACCAT 5 TRUE NA NA GGGGCT -22 NA NA NA 3 NA PB.565.4 chr1 - 1448 4 incomplete-splice_match PEF1 ENST00000373703.5 1614 5 9483 1 79 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.520721 0.655208 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTTCCATGTTTTCCACCAT 9780 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.565.5 chr1 - 1309 4 full-splice_match PEF1 ENST00000478502.5 750 4 23 -582 3 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 25 5.948318 0.774394 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTTCCATGTTTTCCACCAT 5 TRUE NA NA GGGGCT -22 NA NA NA 25 NA PB.565.6 chr1 - 1175 6 novel_not_in_catalog PEF1 novel 1614 5 NA NA 7 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTTCCATGTTTTCCACCAT -11 TRUE NA NA GGGGCT -38 NA NA NA 5 NA PB.565.9 chr1 - 1632 5 full-splice_match PEF1 ENST00000373703.5 1614 5 -20 2 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 415 98.742073 1.994502 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAGTTCCATGTTTTCCACCA 277 FALSE NA NA GGGGCT -45 NA NA NA 415 NA PB.565.10 chr1 - 1011 2 incomplete-splice_match PEF1 ENST00000373703.5 1614 5 12346 2 2730 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.093125 0.490398 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAGTTCCATGTTTTCCACCA 3005 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.565.11 chr1 - 2140 4 novel_in_catalog PEF1 novel 1614 5 NA NA -9 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GGAGTTCCATGTTTTCCACC -7 TRUE NA NA GGGGCT -34 NA NA NA 2 NA PB.565.12 chr1 - 1951 5 full-splice_match PEF1 ENST00000373703.5 1614 5 -340 3 -320 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GGAGTTCCATGTTTTCCACC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.565.14 chr1 - 1352 4 incomplete-splice_match PEF1 ENST00000373703.5 1614 5 9576 4 -40 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGGAGTTCCATGTTTTCCAC 9873 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.566.1 chr1 - 5159 71 full-splice_match COL16A1 ENST00000373672.8 5418 71 0 259 0 -11 alternative_3end TRUE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAATAATAAAGAAACAAAAC -5 TRUE NA NA GGGGCT -7 NA NA NA 2 NA PB.566.2 chr1 - 2207 30 incomplete-splice_match COL16A1 ENST00000373672.8 5418 71 24351 259 4082 -11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAATAATAAAGAAACAAAAC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.566.3 chr1 - 1219 12 incomplete-splice_match COL16A1 ENST00000373672.8 5418 71 42558 259 301 -11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAATAATAAAGAAACAAAAC 8961 FALSE NA NA AAAAAG -39 NA NA NA 2 NA PB.566.4 chr1 - 1101 10 incomplete-splice_match COL16A1 ENST00000373672.8 5418 71 43397 259 1140 -11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAATAATAAAGAAACAAAAC 9800 FALSE NA NA AAAAAG -14 NA NA NA 3 NA PB.567.1 chr1 - 1257 5 incomplete-splice_match ADGRB2 ENST00000398556.7 4879 29 28047 1 3971 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTTGCTGCTGAGCTGTTT 5363 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.568.1 chr1 + 2182 12 full-splice_match TINAGL1 ENST00000271064.12 2207 12 23 2 -4 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.331058 0.522582 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACTACAGTGTCTTGGAACC -3 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 14 NA PB.568.2 chr1 + 1780 10 incomplete-splice_match TINAGL1 ENST00000537531.2 1841 11 1082 -6 -526 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGTGTCTTGGAACCTCTG 35 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.569.1 chr1 - 1374 5 incomplete-splice_match SPOCD1 ENST00000452755.6 2105 9 4977 -54 4753 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTGCATCTGCTAGCTGGTC 4905 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.569.2 chr1 - 2045 9 incomplete-splice_match SPOCD1 ENST00000533231.5 3774 15 16645 -52 -14 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATTGGGATTGCATCTGCT -29 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.569.3 chr1 - 1137 4 incomplete-splice_match SPOCD1 ENST00000452755.6 2105 9 5523 -45 5299 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATTGGGATTGCATCTGC 5451 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.569.4 chr1 - 2823 3 full-splice_match SPOCD1 ENST00000468720.5 2667 3 7 -163 7 -106 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AGAAAAATAAACCACATCCT 3 TRUE NA NA GGGGCT -5 NA NA NA 2 NA PB.569.5 chr1 - 2618 3 full-splice_match SPOCD1 ENST00000468720.5 2667 3 10 39 10 -19 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAACAAACAAACAAACA 6 TRUE NA NA GGGGCT -2 NA NA NA 3 NA PB.569.6 chr1 - 1972 3 full-splice_match SPOCD1 ENST00000468720.5 2667 3 23 672 23 -652 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 CAATAGACGTCAAGAGTCTT 19 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.573.20 chr1 - 2009 5 novel_in_catalog PTP4A2 novel 3910 6 NA NA -24 10 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAACAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.573.21 chr1 - 1946 6 full-splice_match PTP4A2 ENST00000647444.2 3910 6 132 1832 -50 10 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAACAAA 103 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.573.22 chr1 - 1873 4 novel_in_catalog PTP4A2 novel 3910 6 NA NA -1 10 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAACAAA -30 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.573.24 chr1 - 1697 5 full-splice_match PTP4A2 ENST00000602725.5 3353 5 -176 1832 -176 10 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.282789 0.631727 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAACAAA NA FALSE NA NA AGTAAA -28 NA NA NA 18 NA PB.573.25 chr1 - 977 4 incomplete-splice_match PTP4A2 ENST00000602725.5 3353 5 3526 1832 3152 10 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 31 7.375914 0.867816 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAACAAA 3648 FALSE NA NA TTTAAA -14 NA NA NA 31 NA PB.573.26 chr1 - 2062 6 full-splice_match PTP4A2 ENST00000647444.2 3910 6 15 1833 5 9 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 43 10.231107 1.009923 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAACAA -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 43 NA PB.573.28 chr1 - 1824 6 full-splice_match PTP4A2 ENST00000647444.2 3910 6 253 1833 71 9 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAACAA 224 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.573.31 chr1 - 1718 6 novel_in_catalog PTP4A2 novel 2213 8 NA NA -2 9 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAACAA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.573.32 chr1 - 1583 4 full-splice_match PTP4A2 ENST00000457805.6 1032 4 -271 -280 -156 9 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAACAA NA FALSE NA NA AGTAAA -8 NA NA NA 6 NA PB.573.33 chr1 - 1520 5 full-splice_match PTP4A2 ENST00000602725.5 3353 5 0 1833 0 9 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.806923 0.580574 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAACAA 122 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.573.34 chr1 - 1405 5 full-splice_match PTP4A2 ENST00000602725.5 3353 5 115 1833 0 9 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAACAA 237 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.573.35 chr1 - 1262 4 full-splice_match PTP4A2 ENST00000457805.6 1032 4 50 -280 41 9 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAACAA 287 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.573.36 chr1 - 1260 5 full-splice_match PTP4A2 ENST00000602725.5 3353 5 260 1833 -51 9 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.044856 0.606903 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAACAA 382 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.573.37 chr1 - 783 2 full-splice_match PTP4A2 ENST00000489313.1 1551 2 1167 -399 1167 9 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 20 4.758654 0.677484 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAACAA 9492 FALSE NA NA AAGAAA -39 NA NA NA 20 NA PB.573.39 chr1 - 1999 5 novel_in_catalog PTP4A2 novel 3910 6 NA NA 2 8 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 ATAAAAAAAAAAAAAAAACA -27 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.573.42 chr1 - 1729 7 novel_in_catalog PTP4A2 novel 3910 6 NA NA 2 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.573.43 chr1 - 1671 6 full-splice_match PTP4A2 ENST00000647444.2 3910 6 -1 2240 -1 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 46 10.944904 1.039212 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA -30 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 46 NA PB.573.45 chr1 - 1569 5 novel_in_catalog PTP4A2 novel 3910 6 NA NA -2 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA -21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.573.48 chr1 - 1596 5 novel_in_catalog PTP4A2 novel 3910 6 NA NA -1 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA -30 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.573.50 chr1 - 1546 6 full-splice_match PTP4A2 ENST00000647444.2 3910 6 124 2240 -58 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 36 8.565578 0.932757 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 95 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 36 NA PB.573.53 chr1 - 1479 5 novel_in_catalog PTP4A2 novel 3910 6 NA NA -84 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 69 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.573.57 chr1 - 1481 6 novel_not_in_catalog PTP4A2 novel 3910 6 NA NA 10 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.573.58 chr1 - 1447 6 full-splice_match PTP4A2 ENST00000647444.2 3910 6 223 2240 41 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 194 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.573.63 chr1 - 1386 6 novel_in_catalog PTP4A2 novel 2213 8 NA NA 6745 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.573.64 chr1 - 1357 6 novel_in_catalog PTP4A2 novel 3910 6 NA NA 7 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.573.65 chr1 - 1327 6 novel_in_catalog PTP4A2 novel 3910 6 NA NA 2 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.855192 0.455635 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.573.66 chr1 - 1342 6 novel_not_in_catalog PTP4A2 novel 3910 6 NA NA 208 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 772 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.573.67 chr1 - 1374 6 full-splice_match PTP4A2 ENST00000647444.2 3910 6 296 2240 -30 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.331058 0.522582 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 267 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.573.68 chr1 - 1310 6 novel_in_catalog PTP4A2 novel 3910 6 NA NA 23 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 476 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.573.69 chr1 - 1287 5 novel_in_catalog PTP4A2 novel 2213 8 NA NA 6751 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.573.70 chr1 - 1289 5 full-splice_match PTP4A2 ENST00000602725.5 3353 5 -176 2240 -176 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.520721 0.655208 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA NA FALSE NA NA AGTAAA -28 NA NA NA 19 NA PB.573.71 chr1 - 1125 5 full-splice_match PTP4A2 ENST00000602725.5 3353 5 -12 2240 -12 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 26 6.186250 0.791427 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 110 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 26 NA PB.573.72 chr1 - 1095 4 full-splice_match PTP4A2 ENST00000457805.6 1032 4 -190 127 -75 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 47 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.573.73 chr1 - 982 4 full-splice_match PTP4A2 ENST00000457805.6 1032 4 -77 127 19 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 160 FALSE NA NA ATTAAA -44 NA NA NA 4 NA PB.573.74 chr1 - 949 5 full-splice_match PTP4A2 ENST00000602725.5 3353 5 164 2240 40 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 36 8.565578 0.932757 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 286 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 36 NA PB.573.75 chr1 - 804 5 full-splice_match PTP4A2 ENST00000602725.5 3353 5 309 2240 -2 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 431 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.573.76 chr1 - 772 4 full-splice_match PTP4A2 ENST00000457805.6 1032 4 133 127 -63 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 370 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.573.77 chr1 - 717 5 full-splice_match PTP4A2 ENST00000602725.5 3353 5 396 2240 22 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 518 FALSE NA NA AATAAA -4 NA NA NA 5 NA PB.573.78 chr1 - 403 3 incomplete-splice_match PTP4A2 ENST00000457805.6 1032 4 7645 127 -443 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 7882 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.573.79 chr1 - 598 4 incomplete-splice_match PTP4A2 ENST00000602725.5 3353 5 3497 2240 3123 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 3619 FALSE NA NA TTTAAA -43 NA NA NA 3 NA PB.573.81 chr1 - 1395 7 novel_in_catalog PTP4A2 novel 2213 8 NA NA -6 -4 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 TAAGAAAAGAGAAAGAGAAA 548 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.573.83 chr1 - 1259 6 novel_in_catalog PTP4A2 novel 2213 8 NA NA 0 -3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AACAAAAGCAAACAAAAAAG 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.574.1 chr1 + 2277 9 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 -159 595 -159 -595 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAACAACAAAAT NA FALSE NA NA ATTAAA -33 NA NA NA 2 NA PB.574.2 chr1 + 1905 9 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 -155 963 -155 290 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATAAAAAAAAGAAGTTGAG NA FALSE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 8 NA PB.574.3 chr1 + 1852 9 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 -82 943 -82 310 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAAAAAAAACACACAA NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.574.5 chr1 + 2612 8 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000492989.1 1215 8 -147 -1250 -19 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGTAAATGTGATGAATTG -15 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.574.6 chr1 + 1783 9 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 -13 943 -13 310 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 260 61.862503 1.791427 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAAAAAAAACACACAA -9 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 260 NA PB.574.7 chr1 + 1635 8 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000492989.1 1215 8 -130 -290 -2 290 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATAAAAAAAAGAAGTTGAG 2 TRUE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 4 NA PB.574.8 chr1 + 2118 9 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 0 595 0 -595 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 23 5.472452 0.738182 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAACAACAAAAT 4 TRUE NA NA ATTAAA -33 NA NA NA 23 NA PB.574.9 chr1 + 898 2 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000492989.1 1215 8 -128 11939 0 -11939 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAGAAAAAAAAATTAAAAC 4 TRUE NA NA AAAAAG -36 NA NA NA 3 NA PB.574.10 chr1 + 2708 9 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 2 3 2 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 40 9.517308 0.978514 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGTAAATGTGATGAATTG 6 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 40 NA PB.574.12 chr1 + 1278 5 novel_in_catalog KHDRBS1 novel 2713 9 NA NA 9 290 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATAAAAAAAAGAAGTTGAG 13 TRUE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.574.13 chr1 + 1984 9 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 125 604 -3 -604 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATTGATATAAAAAAAAAAA 129 FALSE NA NA ATTAAA -24 NA NA NA 2 NA PB.574.14 chr1 + 1623 9 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 127 963 -1 290 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATAAAAAAAAGAAGTTGAG 131 FALSE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 6 NA PB.574.15 chr1 + 2550 9 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 160 3 32 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGTAAATGTGATGAATTG 164 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 6 NA PB.574.16 chr1 + 1527 9 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 223 963 -91 290 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATAAAAAAAAGAAGTTGAG 227 FALSE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 5 NA PB.574.17 chr1 + 1397 9 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 353 963 39 290 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.331058 0.522582 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATAAAAAAAAGAAGTTGAG 29 FALSE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 14 NA PB.574.18 chr1 + 2276 9 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 434 3 120 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGTAAATGTGATGAATTG 46 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 5 NA PB.574.19 chr1 + 1285 9 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 465 963 151 290 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATAAAAAAAAGAAGTTGAG 77 FALSE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 6 NA PB.574.24 chr1 + 1127 7 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000492989.1 1215 8 16299 -291 16113 291 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 ATAAAAAAAAGAAGTTGAGT NA FALSE NA NA TATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.574.25 chr1 + 1205 8 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 16465 963 16151 290 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 44 10.469039 1.019907 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATAAAAAAAAGAAGTTGAG NA FALSE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 44 NA PB.574.26 chr1 + 1523 8 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 16515 595 16201 -595 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAACAACAAAAT NA FALSE NA NA ATTAAA -33 NA NA NA 9 NA PB.574.27 chr1 + 2077 7 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 17654 3 17340 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGTAAATGTGATGAATTG NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.574.28 chr1 + 1104 7 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 17687 943 17373 310 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAAAAAAAACACACAA NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 5 NA PB.574.29 chr1 + 1994 7 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 17737 3 17423 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGTAAATGTGATGAATTG NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.574.30 chr1 + 1581 9 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000484270.2 1989 11 17428 1 17428 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATGAATGGTCCCACTCTGGT NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.574.31 chr1 + 1015 7 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 17756 963 17442 290 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 32 7.613847 0.881604 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATAAAAAAAAGAAGTTGAG NA FALSE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 32 NA PB.574.32 chr1 + 1354 6 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000492989.1 1215 8 19203 -657 19017 -596 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 TAAAAAAAAAAACAACAAAA NA FALSE NA NA ATTAAA -32 NA NA NA 3 NA PB.574.33 chr1 + 1274 6 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000492989.1 1215 8 19284 -658 19098 -595 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAACAACAAAAT -3 TRUE NA NA ATTAAA -33 NA NA NA 4 NA PB.574.35 chr1 + 1789 5 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 23064 3 22750 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.093125 0.490398 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGTAAATGTGATGAATTG 3649 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 13 NA PB.574.36 chr1 + 1102 5 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000492989.1 1215 8 23031 -658 22845 -595 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.855192 0.455635 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAACAACAAAAT 3744 FALSE NA NA ATTAAA -33 NA NA NA 12 NA PB.574.37 chr1 + 713 4 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000492989.1 1215 8 23863 -310 23677 310 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAAAAAAAACACACAA 4576 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 6 NA PB.574.38 chr1 + 961 4 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000492989.1 1215 8 23963 -658 23777 -595 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAACAACAAAAT 4676 FALSE NA NA ATTAAA -33 NA NA NA 4 NA PB.574.39 chr1 + 1540 4 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 24104 3 23790 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.331058 0.522582 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGTAAATGTGATGAATTG 4689 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 14 NA PB.574.40 chr1 + 838 3 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000492989.1 1215 8 24601 -658 24415 -595 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAACAACAAAAT 5314 FALSE NA NA ATTAAA -33 NA NA NA 5 NA PB.574.42 chr1 + 1407 2 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000307714.12 2738 9 25588 4 25332 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 30 7.137981 0.853575 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 CAAAGTAAATGTGATGAATT 6231 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 30 NA PB.574.52 chr1 + 780 2 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000484270.2 1989 11 31119 -2 31119 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGGTCCCACTCTGGTAGC NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.574.57 chr1 + 3445 6 incomplete-splice_match TMEM39B ENST00000441402.5 1538 7 -44 5 -36 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG -1 TRUE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 2 NA PB.574.58 chr1 + 2933 7 novel_not_in_catalog TMEM39B novel 1538 7 NA NA -33 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG 2 TRUE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 2 NA PB.574.59 chr1 + 1925 10 novel_not_in_catalog TMEM39B novel 1834 10 NA NA -23 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAACAAGCCTGTGTCCTGTG 12 FALSE NA NA AAAAAG -18 NA NA NA 2 NA PB.574.60 chr1 + 1835 10 novel_not_in_catalog TMEM39B novel 1834 10 NA NA -10 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG -41 TRUE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 2 NA PB.574.61 chr1 + 1549 7 full-splice_match TMEM39B ENST00000441402.5 1538 7 -16 5 -8 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 74 17.607019 1.245686 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG -39 TRUE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 74 NA PB.574.62 chr1 + 1551 7 novel_not_in_catalog TMEM39B novel 1538 7 NA NA -2 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG -33 TRUE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 3 NA PB.574.63 chr1 + 1780 9 full-splice_match TMEM39B ENST00000336294.10 1778 9 -4 2 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 61 14.513895 1.161784 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG -31 TRUE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 61 NA PB.574.64 chr1 + 1608 8 novel_in_catalog TMEM39B novel 1778 9 NA NA -7 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG -14 TRUE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 4 NA PB.574.66 chr1 + 1601 8 novel_in_catalog TMEM39B novel 1778 9 NA NA 8 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG 27 TRUE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 2 NA PB.574.67 chr1 + 1586 8 incomplete-splice_match TMEM39B ENST00000336294.10 1778 9 2089 2 -1103 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG 2062 FALSE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 2 NA PB.574.68 chr1 + 1128 5 incomplete-splice_match TMEM39B ENST00000441402.5 1538 7 2829 5 -359 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG 2806 FALSE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 2 NA PB.574.69 chr1 + 1300 6 incomplete-splice_match TMEM39B ENST00000468135.5 1834 10 3810 5 648 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG 3813 FALSE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 4 NA PB.574.70 chr1 + 3092 3 novel_not_in_catalog TMEM39B novel 1538 7 NA NA 15548 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG 8238 FALSE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 2 NA PB.574.71 chr1 + 1008 4 incomplete-splice_match TMEM39B ENST00000468135.5 1834 10 18775 5 15613 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG 8303 FALSE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 5 NA PB.574.72 chr1 + 2358 4 novel_not_in_catalog TMEM39B novel 1538 7 NA NA 15623 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACAAGCCTGTGTCCTGTGGT 8313 FALSE NA NA AAAAAG -20 NA NA NA 2 NA PB.574.77 chr1 + 3964 14 full-splice_match KPNA6 ENST00000373625.8 7355 14 0 3391 0 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 39 9.279376 0.967519 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 2 TRUE NA NA ATTAAA -20 NA NA NA 39 NA PB.574.78 chr1 + 2218 14 full-splice_match KPNA6 ENST00000373625.8 7355 14 9 5128 7 -1738 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 23 5.472452 0.738182 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TGGATTGAGTTATTTAATTT 11 TRUE NA NA AAAACA -40 NA NA NA 23 NA PB.574.80 chr1 + 3686 12 incomplete-splice_match KPNA6 ENST00000373625.8 7355 14 48863 3390 57 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.574.81 chr1 + 2814 13 novel_not_in_catalog KPNA6 novel 7355 14 NA NA 57 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.574.82 chr1 + 1925 11 incomplete-splice_match KPNA6 ENST00000373625.8 7355 14 49289 5125 483 -1735 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATTGAGTTATTTAATTTTTT NA FALSE NA NA AAAACA -43 NA NA NA 4 NA PB.574.83 chr1 + 3497 10 incomplete-splice_match KPNA6 ENST00000373625.8 7355 14 50272 3391 1466 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA ATTAAA -20 NA NA NA 5 NA PB.574.84 chr1 + 1745 10 incomplete-splice_match KPNA6 ENST00000373625.8 7355 14 50290 5125 1484 -1735 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATTGAGTTATTTAATTTTTT NA FALSE NA NA AAAACA -43 NA NA NA 2 NA PB.574.85 chr1 + 3300 8 incomplete-splice_match KPNA6 ENST00000471599.5 3941 14 52588 1 3784 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA ATTAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.574.86 chr1 + 3195 7 incomplete-splice_match KPNA6 ENST00000471599.5 3941 14 53936 1 5132 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA ATTAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.574.88 chr1 + 2926 5 incomplete-splice_match KPNA6 ENST00000471599.5 3941 14 55230 0 6426 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 4 NA PB.574.89 chr1 + 2817 4 incomplete-splice_match KPNA6 ENST00000471599.5 3941 14 58129 1 9325 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA ATTAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.574.90 chr1 + 930 3 incomplete-splice_match KPNA6 ENST00000471599.5 3941 14 59217 1738 10413 -1738 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TGGATTGAGTTATTTAATTT NA FALSE NA NA AAAACA -40 NA NA NA 2 NA PB.575.1 chr1 + 3742 12 novel_not_in_catalog TXLNA novel 4865 11 NA NA 38 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACTTGTTTCTCTCCTGACC -12 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.575.2 chr1 + 1668 10 incomplete-splice_match TXLNA ENST00000373610.8 4865 11 48 3890 48 -3890 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAAACGGGTGCCAGTGA -2 TRUE NA NA AATAAA -8 NA NA NA 3 NA PB.575.3 chr1 + 4793 11 full-splice_match TXLNA ENST00000373610.8 4865 11 71 1 71 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 24 5.710385 0.756665 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTGTTTCTCTCCTGACCT 21 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 24 NA PB.575.4 chr1 + 5011 10 full-splice_match TXLNA ENST00000373609.1 5012 10 0 1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTGTTTCTCTCCTGACCT -25 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 9 NA PB.575.5 chr1 + 3542 10 novel_not_in_catalog TXLNA novel 5012 10 NA NA 294 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTGTTTCTCTCCTGACCT 207 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.575.6 chr1 + 4592 10 full-splice_match TXLNA ENST00000373609.1 5012 10 419 1 419 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTGTTTCTCTCCTGACCT 332 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.575.7 chr1 + 4164 8 incomplete-splice_match TXLNA ENST00000373609.1 5012 10 4521 1 4521 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTGTTTCTCTCCTGACCT 1138 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.575.8 chr1 + 3946 6 incomplete-splice_match TXLNA ENST00000373609.1 5012 10 10006 1 10006 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTGTTTCTCTCCTGACCT 6623 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.576.1 chr1 + 1399 5 full-splice_match CCDC28B ENST00000421922.6 1415 5 5 11 2 -7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGAAAGCAAGCGGCTCCG 7 TRUE NA NA ATTAAA -5 NA NA NA 6 NA PB.576.2 chr1 + 816 6 full-splice_match CCDC28B ENST00000373602.10 880 6 53 11 0 -7 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 55 13.086299 1.116817 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGAAAGCAAGCGGCTCCG 17 TRUE NA NA ATTAAA -5 NA NA NA 55 NA PB.576.3 chr1 + 984 5 incomplete-splice_match CCDC28B ENST00000373602.10 880 6 1088 11 -13 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.282789 0.631727 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGAAAGCAAGCGGCTCCG 4 TRUE NA NA ATTAAA -5 NA NA NA 18 NA PB.578.1 chr1 + 2673 3 novel_in_catalog IQCC novel 2252 5 NA NA -23 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGATTCTGAGTCTGGCTGCT -11 TRUE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 4 NA PB.578.2 chr1 + 2245 4 full-splice_match IQCC ENST00000617816.1 2089 4 -23 -133 -23 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTCTGAGTCTGGCTGCTTT -11 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.578.3 chr1 + 2031 5 full-splice_match IQCC ENST00000291358.11 2012 5 -20 1 -20 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 29 6.900049 0.838852 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTCTGAGTCTGGCTGCTTT -8 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 29 NA PB.578.4 chr1 + 1984 5 full-splice_match IQCC ENST00000291358.11 2012 5 33 -5 33 5 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTCTGGCTGCTTTCATTTC 14 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.579.1 chr1 - 1877 11 novel_in_catalog TMEM234 novel 1538 11 NA NA 2 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACCCTGCTGTGCCAAATATA 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.579.2 chr1 - 1243 6 novel_in_catalog TMEM234 novel 1538 11 NA NA 0 1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAGGTTAGTAAGTATTCT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.579.3 chr1 - 1398 4 full-splice_match TMEM234 ENST00000373593.5 1411 4 3 10 -2 -7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAACAGACAAGAGGTTAGTA 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.579.4 chr1 - 1094 5 full-splice_match TMEM234 ENST00000309777.11 1107 5 6 7 0 -7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 37 8.803510 0.944656 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAACAGACAAGAGGTTAGTA -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 37 NA PB.580.1 chr1 + 1730 12 full-splice_match EIF3I ENST00000676801.1 1849 12 245 -126 44 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGATATTTTGTGGTGTCTGT 184 FALSE NA NA AATAAA -29 NA NA NA 2 NA PB.580.2 chr1 + 1455 11 full-splice_match EIF3I ENST00000677711.1 1700 11 244 1 -33 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 1989 473.248169 2.675089 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTTGTGGTGTCTGTTTCA 788 FALSE NA NA AATAAA -33 NA NA NA 1989 NA PB.580.3 chr1 + 1463 8 novel_in_catalog EIF3I novel 1250 10 NA NA -1 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTTGTGGTGTCTGTTTCA 0 TRUE NA NA AATAAA -33 NA NA NA 2 NA PB.580.4 chr1 + 1296 10 full-splice_match EIF3I ENST00000677580.1 1200 10 -29 -67 -1 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTTTGTGGTGTCTGTTTCAT 0 TRUE NA NA AATAAA -34 NA NA NA 2 NA PB.580.5 chr1 + 2674 11 full-splice_match EIF3I ENST00000678711.1 2660 11 -13 -1 0 1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAATTGTAAGCCCTTCTGA 3 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.580.6 chr1 + 2022 9 novel_in_catalog EIF3I novel 1736 10 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGATATTTTGTGGTGTCTGT 3 TRUE NA NA AATAAA -29 NA NA NA 2 NA PB.580.7 chr1 + 1704 10 full-splice_match EIF3I ENST00000677183.1 1652 10 -11 -41 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGATATTTTGTGGTGTCTGT 3 TRUE NA NA AATAAA -29 NA NA NA 4 NA PB.580.8 chr1 + 1516 10 full-splice_match EIF3I ENST00000678883.1 1400 10 -17 -99 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTTTGTGGTGTCTGTTTCAT 3 TRUE NA NA AATAAA -34 NA NA NA 3 NA PB.580.10 chr1 + 1414 11 full-splice_match EIF3I ENST00000373586.2 1417 11 2 1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTTGTGGTGTCTGTTTCA 3 TRUE NA NA AATAAA -33 NA NA NA 3 NA PB.580.11 chr1 + 1308 11 full-splice_match EIF3I ENST00000677711.1 1700 11 279 113 0 -10 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 162 38.545097 1.585969 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAGAAGAAGG 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 162 NA PB.580.12 chr1 + 1269 10 full-splice_match EIF3I ENST00000677353.1 1250 10 -21 2 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.617260 0.417847 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATTTTGTGGTGTCTGTTTC 3 TRUE NA NA AATAAA -32 NA NA NA 11 NA PB.580.13 chr1 + 1253 10 full-splice_match EIF3I ENST00000678968.1 1256 10 0 3 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATATTTTGTGGTGTCTGTTT 3 TRUE NA NA AATAAA -31 NA NA NA 5 NA PB.580.14 chr1 + 1274 11 full-splice_match EIF3I ENST00000678689.1 1276 11 2 0 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.331058 0.522582 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATTTTGTGGTGTCTGTTTC 3 TRUE NA NA AATAAA -32 NA NA NA 14 NA PB.580.15 chr1 + 1145 11 full-splice_match EIF3I ENST00000677711.1 1700 11 279 276 0 -5 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 273 64.955627 1.812617 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAATACAAAAATTAGCCA 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 273 NA PB.580.16 chr1 + 988 7 full-splice_match EIF3I ENST00000679290.1 987 7 0 -1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTTGTGGTGTCTGTTTCA 3 TRUE NA NA AATAAA -33 NA NA NA 4 NA PB.580.17 chr1 + 1725 10 full-splice_match EIF3I ENST00000678889.1 1736 10 11 0 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATATTTTGTGGTGTCTGTTT -3 TRUE NA NA AATAAA -31 NA NA NA 2 NA PB.580.18 chr1 + 1122 9 full-splice_match EIF3I ENST00000677640.1 1141 9 18 1 1 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 20 4.758654 0.677484 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATATTTTGTGGTGTCTGTTT 4 TRUE NA NA AATAAA -31 NA NA NA 20 NA PB.580.19 chr1 + 1203 10 full-splice_match EIF3I ENST00000471486.6 1482 10 4 275 1 -6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 TAAAAATACAAAAATTAGCC 20 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.580.20 chr1 + 1472 10 full-splice_match EIF3I ENST00000471486.6 1482 10 10 0 7 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 20 4.758654 0.677484 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATTTTGTGGTGTCTGTTTC 26 FALSE NA NA AATAAA -32 NA NA NA 20 NA PB.580.21 chr1 + 1358 10 full-splice_match EIF3I ENST00000471486.6 1482 10 13 111 10 -10 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAGAAGAAGG 29 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.580.22 chr1 + 1190 8 incomplete-splice_match EIF3I ENST00000677640.1 1141 9 45 -1 12 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTTGTGGTGTCTGTTTCA 31 FALSE NA NA AATAAA -33 NA NA NA 2 NA PB.580.23 chr1 + 1271 10 full-splice_match EIF3I ENST00000471486.6 1482 10 100 111 97 -10 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 51 12.134568 1.084024 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAGAAGAAGG 116 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 51 NA PB.580.24 chr1 + 1225 8 novel_in_catalog EIF3I novel 1482 10 NA NA 97 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGATATTTTGTGGTGTCTGT 116 FALSE NA NA AATAAA -29 NA NA NA 2 NA PB.580.25 chr1 + 1200 7 incomplete-splice_match EIF3I ENST00000677640.1 1141 9 130 -1 97 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTTGTGGTGTCTGTTTCA 116 FALSE NA NA AATAAA -33 NA NA NA 2 NA PB.580.26 chr1 + 1350 10 full-splice_match EIF3I ENST00000471486.6 1482 10 129 3 126 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 46 10.944904 1.039212 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGATATTTTGTGGTGTCTGT 145 FALSE NA NA AATAAA -29 NA NA NA 46 NA PB.580.27 chr1 + 1177 9 incomplete-splice_match EIF3I ENST00000471486.6 1482 10 1597 111 1594 -10 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAGAAGAAGG 1613 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.580.28 chr1 + 1249 9 incomplete-splice_match EIF3I ENST00000471486.6 1482 10 1636 0 1633 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 59 14.038030 1.147306 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATTTTGTGGTGTCTGTTTC 1652 FALSE NA NA AATAAA -32 NA NA NA 59 NA PB.580.29 chr1 + 1089 8 incomplete-splice_match EIF3I ENST00000677183.1 1652 10 1992 67 1970 -10 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAGAAGAAGG 1989 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.580.30 chr1 + 882 8 incomplete-splice_match EIF3I ENST00000677183.1 1652 10 2036 230 2014 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAATACAAAAATTAGCCA 2033 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.580.31 chr1 + 1130 7 incomplete-splice_match EIF3I ENST00000471486.6 1482 10 3738 0 -1163 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 37 8.803510 0.944656 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATTTTGTGGTGTCTGTTTC 3754 FALSE NA NA AATAAA -32 NA NA NA 37 NA PB.580.32 chr1 + 938 7 incomplete-splice_match EIF3I ENST00000677183.1 1652 10 3838 67 -1082 -10 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAGAAGAAGG 3835 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.580.33 chr1 + 1028 7 incomplete-splice_match EIF3I ENST00000471486.6 1482 10 3839 1 -1062 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 24 5.710385 0.756665 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATATTTTGTGGTGTCTGTTT 3855 FALSE NA NA AATAAA -31 NA NA NA 24 NA PB.580.34 chr1 + 901 6 incomplete-splice_match EIF3I ENST00000471486.6 1482 10 4048 1 -853 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 50 11.896635 1.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATATTTTGTGGTGTCTGTTT 6 TRUE NA NA AATAAA -31 NA NA NA 50 NA PB.580.35 chr1 + 779 5 full-splice_match EIF3I ENST00000678306.1 1795 5 1238 -222 962 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.520721 0.655208 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATTTTGTGGTGTCTGTTTC 2097 FALSE NA NA AATAAA -32 NA NA NA 19 NA PB.580.36 chr1 + 636 3 full-splice_match EIF3I ENST00000678106.1 2075 3 1540 -101 1540 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATTTTGTGGTGTCTGTTTC 2675 FALSE NA NA AATAAA -32 NA NA NA 8 NA PB.581.2 chr1 + 946 2 full-splice_match FAM167B ENST00000373582.4 947 2 0 1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATCAAGGTCTCTTGCAGTCG -6 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 9 NA PB.582.3 chr1 + 2091 13 full-splice_match LCK ENST00000336890.10 2091 13 -1 1 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 131 31.169184 1.493725 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACATCTCTTTGCTGTCCACT -9 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 131 NA PB.582.4 chr1 + 1938 12 novel_in_catalog LCK novel 2091 13 NA NA 0 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACATCTCTTTGCTGTCCACT -9 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 7 NA PB.582.5 chr1 + 2156 13 novel_in_catalog LCK novel 2099 13 NA NA -37 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACATCTCTTTGCTGTCCAC NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.582.6 chr1 + 2076 13 full-splice_match LCK ENST00000619559.4 2099 13 23 0 2 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 57 13.562164 1.132329 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACATCTCTTTGCTGTCCACT 12 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 57 NA PB.582.7 chr1 + 1918 12 novel_in_catalog LCK novel 2099 13 NA NA 6 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACATCTCTTTGCTGTCCAC -2 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 8 NA PB.582.8 chr1 + 2481 11 novel_in_catalog LCK novel 2099 13 NA NA 8 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACATCTCTTTGCTGTCCACT 0 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.582.9 chr1 + 2244 12 novel_in_catalog LCK novel 2099 13 NA NA 8 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACATCTCTTTGCTGTCCACT 0 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 5 NA PB.582.10 chr1 + 2165 12 incomplete-splice_match LCK ENST00000336890.10 2091 13 22875 4 8 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTACATCTCTTTGCTGTCC 0 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 6 NA PB.582.11 chr1 + 1965 12 incomplete-splice_match LCK ENST00000619559.4 2099 13 232 0 211 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.568991 0.552545 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACATCTCTTTGCTGTCCACT 6 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 15 NA PB.582.12 chr1 + 1708 9 incomplete-splice_match LCK ENST00000619559.4 2099 13 1202 0 -307 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACATCTCTTTGCTGTCCACT 976 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 10 NA PB.582.13 chr1 + 1598 8 incomplete-splice_match LCK ENST00000619559.4 2099 13 1458 3 -51 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTACATCTCTTTGCTGTCC 1232 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.582.14 chr1 + 1488 7 incomplete-splice_match LCK ENST00000619559.4 2099 13 1802 10 293 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGACTGTTGTACATCTCTTT 1576 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 8 NA PB.582.15 chr1 + 1290 6 incomplete-splice_match LCK ENST00000619559.4 2099 13 2283 0 774 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACATCTCTTTGCTGTCCACT 2057 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 8 NA PB.582.16 chr1 + 1225 6 incomplete-splice_match LCK ENST00000619559.4 2099 13 2346 2 837 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.093125 0.490398 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GTACATCTCTTTGCTGTCCA 2120 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 13 NA PB.582.17 chr1 + 1008 4 incomplete-splice_match LCK ENST00000333070.4 2166 13 5544 -1 4056 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACATCTCTTTGCTGTCCAC 5339 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 10 NA PB.582.18 chr1 + 856 3 incomplete-splice_match LCK ENST00000333070.4 2166 13 5789 -1 4301 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACATCTCTTTGCTGTCCAC 5584 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.583.1 chr1 - 1525 7 novel_in_catalog MTMR9LP novel 1635 8 NA NA 3 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATCAGCTTGCTGGGGTGTCA 26 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.583.2 chr1 - 2695 6 full-splice_match MTMR9LP ENST00000690989.1 2666 6 -34 5 2 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CATCAGCTTGCTGGGGTGTC -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.584.1 chr1 - 1794 2 full-splice_match MARCKSL1 ENST00000329421.8 1546 2 0 -248 0 248 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAATGAAAATAGTATCTC -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.584.2 chr1 - 1552 2 full-splice_match MARCKSL1 ENST00000329421.8 1546 2 0 -6 0 6 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3237 770.188171 2.886597 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CTTTAATGAGTGGTCTTCTG -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3237 NA PB.584.8 chr1 - 1515 3 novel_not_in_catalog MARCKSL1 novel 1546 2 NA NA -15180 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGTGGTGCTTTAATGAGTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.584.10 chr1 - 1319 2 novel_not_in_catalog MARCKSL1 novel 1546 2 NA NA 0 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.568991 0.552545 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGTGGTGCTTTAATGAGTG -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.584.11 chr1 - 1354 2 full-splice_match MARCKSL1 ENST00000329421.8 1546 2 190 2 190 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 54 12.848366 1.108848 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGTGGTGCTTTAATGAGTG 3630 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 54 NA PB.584.17 chr1 - 1442 2 full-splice_match MARCKSL1 ENST00000329421.8 1546 2 0 104 0 -104 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.093125 0.490398 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACCCCAGATTTGTACTTT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.584.18 chr1 - 1309 2 full-splice_match MARCKSL1 ENST00000329421.8 1546 2 0 237 0 -237 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 148 35.214039 1.546716 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGCCTGTGAATCAACTGTGT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 148 NA PB.585.2 chr1 + 2104 14 full-splice_match HDAC1 ENST00000373548.8 2118 14 12 2 12 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 973 231.508530 2.364567 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCTCCTGAGCTTGTTTC 5 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 973 NA PB.585.3 chr1 + 1641 14 full-splice_match HDAC1 ENST00000373548.8 2118 14 21 456 21 91 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ACAGAAACCAAGGCCCCGAG 14 TRUE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.585.4 chr1 + 5293 12 novel_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA 23 1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTTGTTTCCTATGTGTCCCT 16 TRUE NA NA AATAAA -27 NA NA NA 2 NA PB.585.5 chr1 + 2466 14 novel_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA -21 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCTCCTGAGCTTGTTTC 24 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 10 NA PB.585.7 chr1 + 2536 13 novel_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA -14 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCTCCTGAGCTTGTTTC -20 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 10 NA PB.585.8 chr1 + 1970 13 novel_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA -12 -4 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTGAGCTTGTTTCCTATGTG -18 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 5 NA PB.585.9 chr1 + 1714 12 novel_not_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA -12 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.520721 0.655208 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCTCCTGAGCTTGTTTCC -18 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 19 NA PB.585.10 chr1 + 2129 15 novel_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA -11 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCTCCTGAGCTTGTTTCC -17 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 7 NA PB.585.11 chr1 + 3463 13 novel_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA -10 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATATCCTCCTGAGCTTGTTT -16 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.585.12 chr1 + 1383 12 incomplete-splice_match HDAC1 ENST00000373548.8 2118 14 45 1415 -7 430 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.234519 0.718877 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 GAAAAAGAGAAAGACCCAGA -13 TRUE NA NA AAAAAG -24 NA NA NA 22 NA PB.585.13 chr1 + 1976 13 novel_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA -4 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.331058 0.522582 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCTCCTGAGCTTGTTTCC -10 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 14 NA PB.585.14 chr1 + 2019 14 novel_not_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA 0 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATATCCTCCTGAGCTTGTTT -1 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.585.15 chr1 + 1217 3 novel_not_in_catalog HDAC1 novel 664 6 NA NA 0 -22209 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATCTCTTTGATGAGCATTTG -1 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.585.16 chr1 + 4864 12 novel_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA 2 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCTCCTGAGCTTGTTTC 1 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.585.17 chr1 + 2144 14 novel_not_in_catalog HDAC1 novel 2409 7 NA NA 113 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCTCCTGAGCTTGTTTC 34 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.585.18 chr1 + 1969 13 incomplete-splice_match HDAC1 ENST00000373548.8 2118 14 10550 1 10472 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.520721 0.655208 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCTCCTGAGCTTGTTTCC NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 19 NA PB.585.19 chr1 + 1832 12 incomplete-splice_match HDAC1 ENST00000373548.8 2118 14 24618 1 -10488 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.568991 0.552545 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCTCCTGAGCTTGTTTCC NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 15 NA PB.585.20 chr1 + 1675 10 incomplete-splice_match HDAC1 ENST00000373548.8 2118 14 34855 2 -251 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 23 5.472452 0.738182 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCTCCTGAGCTTGTTTC 4190 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 23 NA PB.585.21 chr1 + 1521 9 incomplete-splice_match HDAC1 ENST00000373548.8 2118 14 35468 1 277 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 21 4.996587 0.698673 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCTCCTGAGCTTGTTTCC 4803 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 21 NA PB.585.22 chr1 + 3906 7 full-splice_match HDAC1 ENST00000476391.5 2409 7 -1508 11 698 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCTCCTGAGCTTGTTTC 5224 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.585.23 chr1 + 2366 8 incomplete-splice_match HDAC1 ENST00000373548.8 2118 14 36016 -2 825 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTCCTGAGCTTGTTTCCTAT 5351 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.585.24 chr1 + 1395 8 incomplete-splice_match HDAC1 ENST00000373548.8 2118 14 36984 1 -413 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCTCCTGAGCTTGTTTCC 6319 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 9 NA PB.585.25 chr1 + 1351 8 incomplete-splice_match HDAC1 ENST00000373548.8 2118 14 37036 -7 -361 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GAGCTTGTTTCCTATGTGTC 6371 FALSE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 4 NA PB.585.26 chr1 + 2381 7 full-splice_match HDAC1 ENST00000476391.5 2409 7 15 13 15 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TATATCCTCCTGAGCTTGTT 6747 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.585.27 chr1 + 1795 7 full-splice_match HDAC1 ENST00000476391.5 2409 7 602 12 -67 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATATCCTCCTGAGCTTGTTT 7334 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.585.28 chr1 + 1594 7 full-splice_match HDAC1 ENST00000476391.5 2409 7 808 7 139 2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTCCTGAGCTTGTTTCCTAT 7540 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.585.29 chr1 + 1289 7 full-splice_match HDAC1 ENST00000476391.5 2409 7 1110 10 441 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 27 6.424183 0.807818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCTCCTGAGCTTGTTTCC 7842 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 27 NA PB.585.30 chr1 + 1134 6 incomplete-splice_match HDAC1 ENST00000476391.5 2409 7 1344 12 675 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 30 7.137981 0.853575 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATATCCTCCTGAGCTTGTTT -7 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 30 NA PB.585.31 chr1 + 997 5 incomplete-splice_match HDAC1 ENST00000476391.5 2409 7 2047 11 -9 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 28 6.662116 0.823612 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCTCCTGAGCTTGTTTC 696 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 28 NA PB.585.32 chr1 + 837 4 incomplete-splice_match HDAC1 ENST00000476391.5 2409 7 2301 10 245 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.234519 0.718877 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCTCCTGAGCTTGTTTCC 950 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 22 NA PB.585.33 chr1 + 745 3 incomplete-splice_match HDAC1 ENST00000471488.1 726 4 619 -545 619 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCTCCTGAGCTTGTTTC 1324 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 8 NA PB.585.34 chr1 + 644 2 incomplete-splice_match HDAC1 ENST00000471488.1 726 4 1178 -545 1178 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCTCCTGAGCTTGTTTC 1883 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.586.1 chr1 - 2198 4 incomplete-splice_match BSDC1 ENST00000455895.7 3309 11 16407 473 -3252 7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAAGGTGTCTGGGGGTCTGT 8742 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.586.3 chr1 - 1955 3 incomplete-splice_match BSDC1 ENST00000455895.7 3309 11 17876 475 -1783 5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGAAAGGTGTCTGGGGGTCT NA FALSE NA NA GGGGCT -4 NA NA NA 4 NA PB.586.4 chr1 - 2874 11 full-splice_match BSDC1 ENST00000446293.6 1505 11 -4 -1365 -3 1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCTGAAAGGTGTCTGGGG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.586.5 chr1 - 2256 5 incomplete-splice_match BSDC1 ENST00000455895.7 3309 11 16177 479 -3482 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCTGAAAGGTGTCTGGGG 8512 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.586.7 chr1 - 2822 11 full-splice_match BSDC1 ENST00000455895.7 3309 11 7 480 -3 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 71 16.893223 1.227713 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAAGCTGAAAGGTGTCTGGG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 71 NA PB.586.9 chr1 - 2627 9 incomplete-splice_match BSDC1 ENST00000455895.7 3309 11 7574 555 7558 -17 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAGAAAGAAAAAAGAA 7567 FALSE NA NA CATAAA -41 NA NA NA 3 NA PB.586.10 chr1 - 1730 3 incomplete-splice_match BSDC1 ENST00000455895.7 3309 11 18021 555 -1638 -17 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAGAAAGAAAAAAGAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.586.11 chr1 - 1573 2 incomplete-splice_match BSDC1 ENST00000444377.5 2925 12 25876 75 6230 -17 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAGAAAGAAAAAAGAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.586.13 chr1 - 2607 9 incomplete-splice_match BSDC1 ENST00000446293.6 1505 11 7633 -1288 7628 -18 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAAGAAAGAAAAAAGA 7637 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.586.14 chr1 - 2421 8 incomplete-splice_match BSDC1 ENST00000455895.7 3309 11 10560 556 -9099 -18 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAAGAAAGAAAAAAGA 2895 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.586.20 chr1 - 1740 10 full-splice_match BSDC1 ENST00000341071.11 4599 10 -18 2877 -3 -15 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAAAAAAAAAAAAGGAAA -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.586.21 chr1 - 1402 7 incomplete-splice_match BSDC1 ENST00000373520.8 1630 10 10499 15 -9147 -15 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAAAAAAAAAAAAGGAAA 2847 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.586.22 chr1 - 1123 4 incomplete-splice_match BSDC1 ENST00000373520.8 1630 10 16153 15 -3493 -15 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAAAAAAAAAAAAGGAAA 8501 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.586.23 chr1 - 1053 2 novel_not_in_catalog BSDC1 novel 616 2 NA NA -743 -15 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAAAAAAAAAAAAGGAAA NA FALSE NA NA CATAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.586.24 chr1 - 1675 10 incomplete-splice_match BSDC1 ENST00000455895.7 3309 11 10 3416 0 -16 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 29 6.900049 0.838852 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 GAAAAAAAAAAAAAAAGGAA 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 29 NA PB.586.26 chr1 - 1498 10 novel_not_in_catalog BSDC1 novel 3309 11 NA NA 0 -17 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TGAAAAAAAAAAAAAAAGGA -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.587.1 chr1 + 1924 6 novel_not_in_catalog ZBTB8A novel 7077 5 NA NA -263 -206 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAACTTTATGTAAGACAATT -6 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.590.1 chr1 - 1659 7 novel_in_catalog ZBTB8OS novel 1567 7 NA NA 0 -5 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAATTTCTTTATTGTTGT -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.590.2 chr1 - 1614 7 novel_in_catalog ZBTB8OS novel 588 7 NA NA 2 -5 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAATTTCTTTATTGTTGT 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.590.3 chr1 - 1585 7 novel_in_catalog ZBTB8OS novel 1567 7 NA NA 0 -5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAATTTCTTTATTGTTGT 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.590.4 chr1 - 1515 6 full-splice_match ZBTB8OS ENST00000436661.6 514 6 4 -1005 -2 -5 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAATTTCTTTATTGTTGT -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.590.5 chr1 - 1268 3 novel_in_catalog ZBTB8OS novel 766 6 NA NA 0 -5 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAATTTCTTTATTGTTGT 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.590.6 chr1 - 1299 4 incomplete-splice_match ZBTB8OS ENST00000468695.6 1567 7 16821 5 332 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAATTTCTTTATTGTTGT NA FALSE NA NA AAAACA -5 NA NA NA 2 NA PB.590.7 chr1 - 1162 2 incomplete-splice_match ZBTB8OS ENST00000467652.5 388 3 4513 -1005 4513 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAATTTCTTTATTGTTGT NA FALSE NA NA ATTAAA -33 NA NA NA 2 NA PB.590.10 chr1 - 1612 7 full-splice_match ZBTB8OS ENST00000373501.6 598 7 -10 -1004 0 -6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAATTTCTTTATTGTTG 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.590.11 chr1 - 1610 7 novel_not_in_catalog ZBTB8OS novel 1567 7 NA NA 2 -6 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAATTTCTTTATTGTTG 665 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.590.12 chr1 - 1559 6 novel_in_catalog ZBTB8OS novel 548 6 NA NA 0 -6 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAATTTCTTTATTGTTG 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.590.13 chr1 - 1546 7 full-splice_match ZBTB8OS ENST00000468695.6 1567 7 15 6 0 -6 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 30 7.137981 0.853575 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAATTTCTTTATTGTTG 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 30 NA PB.590.14 chr1 - 1298 4 full-splice_match ZBTB8OS ENST00000492007.6 817 4 4 -485 4 -6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAATTTCTTTATTGTTG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.590.16 chr1 - 969 7 full-splice_match ZBTB8OS ENST00000468695.6 1567 7 -417 1015 -64 -5 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGAACTGTTTTTGTTTTCC 261 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.590.17 chr1 - 562 7 full-splice_match ZBTB8OS ENST00000468695.6 1567 7 -10 1015 0 -5 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.855192 0.455635 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGAACTGTTTTTGTTTTCC 668 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.590.18 chr1 - 494 6 full-splice_match ZBTB8OS ENST00000436661.6 514 6 15 5 4 -5 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGAACTGTTTTTGTTTTCC -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.590.19 chr1 - 1241 6 novel_in_catalog ZBTB8OS novel 598 7 NA NA 4 5 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAAGAACTGTTTTTGTTTTC -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.591.1 chr1 + 2480 13 novel_not_in_catalog RBBP4 novel 7883 12 NA NA 6 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACCCCATGCTGATGGGTT 0 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.591.2 chr1 + 1523 12 full-splice_match RBBP4 ENST00000373493.10 7883 12 -60 6420 6 -117 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATTCAGCTATCCCTCTATA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.591.4 chr1 + 2359 12 full-splice_match RBBP4 ENST00000373493.10 7883 12 -36 5560 -6 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 819 194.866882 2.289738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT -37 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 819 NA PB.591.7 chr1 + 2192 12 full-splice_match RBBP4 ENST00000373493.10 7883 12 -17 5708 13 -148 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 161 38.307167 1.583280 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGAGTTGCTTTTTTTTTTT -18 TRUE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 161 NA PB.591.8 chr1 + 2237 12 novel_not_in_catalog RBBP4 novel 7883 12 NA NA -9 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATAACCCCATGCTGATGGGT -10 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.591.11 chr1 + 2141 11 novel_in_catalog RBBP4 novel 7883 12 NA NA -9 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATAACCCCATGCTGATGGGT -10 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.591.12 chr1 + 1948 12 full-splice_match RBBP4 ENST00000373493.10 7883 12 -9 5944 -9 63 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATATATTTTTGCTCGTTAGT -10 TRUE NA NA AAAACA -27 NA NA NA 2 NA PB.591.13 chr1 + 1622 13 novel_in_catalog RBBP4 novel 7883 12 NA NA -9 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATAACCCCATGCTGATGGGT -10 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 4 NA PB.591.14 chr1 + 1499 13 novel_in_catalog RBBP4 novel 7883 12 NA NA -3 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT -4 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 9 NA PB.591.15 chr1 + 2793 12 full-splice_match RBBP4 ENST00000373493.10 7883 12 -1 5091 -1 463 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATCGCTTAGTTTTTTGTTG -2 TRUE NA NA GATAAA -17 NA NA NA 6 NA PB.591.17 chr1 + 695 2 full-splice_match RBBP4 ENST00000465780.1 690 2 -18 13 0 -13 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.806923 0.580574 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAAGAAAAAAGTATTA -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.591.18 chr1 + 2414 13 novel_in_catalog RBBP4 novel 7883 12 NA NA -1 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.591.19 chr1 + 1434 12 full-splice_match RBBP4 ENST00000373485.5 1417 12 -24 7 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 29 6.900049 0.838852 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACCCCATGCTGATGGGTT 1 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 29 NA PB.591.22 chr1 + 2451 12 full-splice_match RBBP4 ENST00000373493.10 7883 12 9 5423 0 131 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AGAGCTGTAGAAAAGAACTT 8 TRUE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.591.23 chr1 + 2436 13 novel_in_catalog RBBP4 novel 7883 12 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT 8 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.591.25 chr1 + 2267 12 full-splice_match RBBP4 ENST00000373493.10 7883 12 62 5554 -8 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 103 24.507069 1.389291 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATGCTGATGGGTTTTATTTA 61 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 103 NA PB.591.26 chr1 + 2086 12 full-splice_match RBBP4 ENST00000414241.7 1788 12 152 -450 16 -148 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGAGTTGCTTTTTTTTTTT 85 FALSE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 3 NA PB.591.29 chr1 + 2185 11 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000458695.6 1674 12 580 -610 449 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 24 5.710385 0.756665 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACCCCATGCTGATGGGTT 200 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 24 NA PB.591.30 chr1 + 1930 11 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000458695.6 1674 12 687 -462 556 -149 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAAGAGTTGCTTTTTTTTTT 307 FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 4 NA PB.591.31 chr1 + 2031 10 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000458695.6 1674 12 6100 -611 5969 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 26 6.186250 0.791427 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT 5720 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 26 NA PB.591.32 chr1 + 1864 9 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000458695.6 1674 12 16917 -609 -46 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 41 9.755241 0.989238 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATAACCCCATGCTGATGGGT 6365 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 41 NA PB.591.34 chr1 + 1711 9 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000458695.6 1674 12 16923 -462 -40 -149 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAAGAGTTGCTTTTTTTTTT 6371 FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 6 NA PB.591.35 chr1 + 1593 8 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000492348.6 1547 10 17521 -299 169 -148 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGAGTTGCTTTTTTTTTTT 6830 FALSE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 7 NA PB.591.36 chr1 + 1702 8 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000492348.6 1547 10 17560 -447 208 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 32 7.613847 0.881604 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT 6869 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 32 NA PB.591.39 chr1 + 1586 7 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000460669.5 783 8 -97 2 -83 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 35 8.327644 0.920522 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT 7102 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 35 NA PB.591.40 chr1 + 1383 7 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000460669.5 783 8 -42 150 -28 -148 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGAGTTGCTTTTTTTTTTT 7157 FALSE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 8 NA PB.591.41 chr1 + 1463 6 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000460669.5 783 8 124 2 -25 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 27 6.424183 0.807818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT 7323 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 27 NA PB.591.42 chr1 + 1337 5 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000460669.5 783 8 378 2 229 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 26 6.186250 0.791427 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT 7577 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 26 NA PB.591.43 chr1 + 1134 5 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000460669.5 783 8 433 150 284 -148 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGAGTTGCTTTTTTTTTTT 7632 FALSE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 10 NA PB.591.46 chr1 + 1210 4 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000460669.5 783 8 3391 2 3242 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 59 14.038030 1.147306 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 59 NA PB.591.47 chr1 + 1179 3 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000460669.5 783 8 3543 -4 3394 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATGCTGATGGGTTTTATTTA NA FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.591.49 chr1 + 1079 2 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000460669.5 783 8 3727 3 3578 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 63 14.989760 1.175795 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACCCCATGCTGATGGGTT NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 63 NA PB.594.6 chr1 - 2883 5 full-splice_match SYNC ENST00000409190.8 3503 5 0 620 0 -620 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 CTAAAAAAAAAAAGCAACTC -10 TRUE NA NA GGGGCT -12 NA NA NA 2 NA PB.594.7 chr1 - 1982 5 full-splice_match SYNC ENST00000409190.8 3503 5 26 1495 12 90 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTCTTTTGTGCCACGAGTG 16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.594.8 chr1 - 1341 4 incomplete-splice_match SYNC ENST00000409190.8 3503 5 7230 1495 7216 90 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTCTTTTGTGCCACGAGTG 7256 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.594.9 chr1 - 1901 4 full-splice_match SYNC ENST00000373484.4 1824 4 12 -89 12 89 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATTCTTTTGTGCCACGAGT 16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.595.1 chr1 + 4189 2 incomplete-splice_match KIAA1522 ENST00000373480.1 5294 7 4692 0 4692 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCTGTGGCTACTGCTTCTTA 2428 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.595.2 chr1 + 3686 2 incomplete-splice_match KIAA1522 ENST00000373480.1 5294 7 5193 2 5193 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGGCTGTGGCTACTGCTTCT 148 FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.595.3 chr1 + 3119 2 incomplete-splice_match KIAA1522 ENST00000373480.1 5294 7 5762 0 5762 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCTGTGGCTACTGCTTCTTA 161 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 5 NA PB.595.4 chr1 + 2907 2 incomplete-splice_match KIAA1522 ENST00000373480.1 5294 7 5974 0 5974 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCTGTGGCTACTGCTTCTTA 108 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.595.5 chr1 + 2814 2 incomplete-splice_match KIAA1522 ENST00000373480.1 5294 7 6067 0 6067 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCTGTGGCTACTGCTTCTTA 201 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.595.6 chr1 + 2680 2 incomplete-splice_match KIAA1522 ENST00000373480.1 5294 7 6201 0 6201 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCTGTGGCTACTGCTTCTTA 335 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.595.7 chr1 + 2372 2 incomplete-splice_match KIAA1522 ENST00000373480.1 5294 7 6509 0 6509 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCTGTGGCTACTGCTTCTTA 643 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 6 NA PB.595.8 chr1 + 2147 2 incomplete-splice_match KIAA1522 ENST00000373480.1 5294 7 6734 0 6734 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCTGTGGCTACTGCTTCTTA 868 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 10 NA PB.597.2 chr1 + 1622 7 novel_in_catalog S100PBP novel 4220 7 NA NA 10 44 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 42 9.993174 0.999703 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTTTGTGTGTGTGTGTCTG 32 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 42 NA PB.597.3 chr1 + 4265 7 full-splice_match S100PBP ENST00000373475.10 4220 7 -48 3 13 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 27 6.424183 0.807818 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGACATATGTACTGTGGCGG -12 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 27 NA PB.597.5 chr1 + 2073 5 incomplete-splice_match S100PBP ENST00000356689.7 3583 7 20 6259 20 4306 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 GAAAAAAAAAATTAGCCAGG -5 TRUE NA NA TATAAA -26 NA NA NA 2 NA PB.597.9 chr1 + 1648 7 novel_in_catalog S100PBP novel 706 3 NA NA -2 5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CATTGCCGACTTGAATTTTT 44 FALSE NA NA TTTAAA -26 NA NA NA 6 NA PB.597.11 chr1 + 1544 7 novel_in_catalog S100PBP novel 706 3 NA NA 62 4 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CCATTGCCGACTTGAATTTT 147 FALSE NA NA TTTAAA -25 NA NA NA 2 NA PB.597.14 chr1 + 1417 6 incomplete-splice_match S100PBP ENST00000373476.5 3320 7 7945 1671 490 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATGCCCATTGCCGACTTG 7734 FALSE NA NA TTTAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.597.15 chr1 + 1193 5 novel_in_catalog S100PBP novel 3320 7 NA NA 1379 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATGCCCATTGCCGACTTG 8623 FALSE NA NA TTTAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.597.16 chr1 + 3570 5 incomplete-splice_match S100PBP ENST00000373475.10 4220 7 8942 -1 1698 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATATGTACTGTGGCGGTCTG 8942 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.597.17 chr1 + 3376 5 incomplete-splice_match S100PBP ENST00000373475.10 4220 7 9134 1 1890 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACATATGTACTGTGGCGGTC 9134 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.597.18 chr1 + 3268 5 incomplete-splice_match S100PBP ENST00000373475.10 4220 7 9244 -1 2000 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATATGTACTGTGGCGGTCTG 9244 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.598.1 chr1 - 2902 13 full-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 4 -463 3 461 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TACTCTAGGTCAAGCTCATT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.598.2 chr1 - 2767 13 full-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 -22 -302 0 300 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACACAGTTTTCTTCATGT -30 TRUE NA NA AAAAAG -18 NA NA NA 2 NA PB.598.3 chr1 - 2472 13 full-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 -22 -7 0 5 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 555 132.052658 2.120747 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATGTGAGCTGGACCATCTCA -30 TRUE NA NA AAAAAG -18 NA NA NA 555 NA PB.598.4 chr1 - 1824 9 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 19512 -2 368 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.520721 0.655208 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TCTGGATGTGAGCTGGACCA 1259 FALSE NA NA CATAAA -27 NA NA NA 19 NA PB.598.5 chr1 - 2318 12 full-splice_match YARS1 ENST00000675785.1 2248 12 0 -70 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGTCTGGATGTGAGCTGGAC -30 TRUE NA NA AAAAAG -18 NA NA NA 4 NA PB.598.6 chr1 - 2245 12 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 6328 0 617 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 25 5.948318 0.774394 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGTCTGGATGTGAGCTGGAC 7122 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 25 NA PB.598.7 chr1 - 2060 11 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 6649 8 938 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 25 5.948318 0.774394 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG 7443 FALSE NA NA GGGGCT -41 NA NA NA 25 NA PB.598.8 chr1 - 1358 5 full-splice_match YARS1 ENST00000487404.5 2197 5 1281 -442 -371 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.617260 0.417847 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGTCTGGATGTGAGCTGGAC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.598.11 chr1 - 2350 12 novel_in_catalog YARS1 novel 2443 13 NA NA 3 -3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.598.12 chr1 - 2347 13 full-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 88 8 2 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 39 9.279376 0.967519 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG 882 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 39 NA PB.598.13 chr1 - 2121 11 full-splice_match YARS1 ENST00000674629.1 2075 11 -10 -36 2 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG -17 TRUE NA NA AAAAAG -5 NA NA NA 6 NA PB.598.14 chr1 - 1993 10 novel_in_catalog YARS1 novel 2075 11 NA NA 0 -3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG -19 TRUE NA NA AAAAAG -7 NA NA NA 2 NA PB.598.15 chr1 - 1905 10 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 10783 8 5 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.598.16 chr1 - 1690 8 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 26144 8 -4480 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.568991 0.552545 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG 7891 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.598.17 chr1 - 1441 6 full-splice_match YARS1 ENST00000478828.1 1044 6 347 -744 347 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.568991 0.552545 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.598.18 chr1 - 1210 4 full-splice_match YARS1 ENST00000469100.5 2247 4 1027 10 -365 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.282789 0.631727 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.598.19 chr1 - 1142 3 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000469100.5 2247 4 1864 10 472 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 36 8.565578 0.932757 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 36 NA PB.598.20 chr1 - 985 2 full-splice_match YARS1 ENST00000490826.1 2178 2 1190 3 1190 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.855192 0.455635 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.598.21 chr1 - 888 2 full-splice_match YARS1 ENST00000490826.1 2178 2 1287 3 1287 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 23 5.472452 0.738182 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 23 NA PB.598.23 chr1 - 3136 13 full-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 -702 9 -680 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAACAAGGGTGTCTGGATGT 92 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.598.24 chr1 - 1042 3 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000469100.5 2247 4 1962 12 570 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.093125 0.490398 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TGAACAAGGGTGTCTGGATG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.598.26 chr1 - 2037 13 full-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 -14 420 -1 22 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 63 14.989760 1.175795 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATACTGGTGCCCAGGT -22 TRUE NA NA AAAAAG -10 NA NA NA 63 NA PB.598.28 chr1 - 1964 13 full-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 37 442 -4 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 80 19.034616 1.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATGCCACAGTCCTTATAATT 29 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 80 NA PB.598.30 chr1 - 1788 12 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 6343 442 632 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATGCCACAGTCCTTATAATT 7137 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.598.31 chr1 - 1613 11 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000675785.1 2248 12 6684 372 951 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATGCCACAGTCCTTATAATT 7456 FALSE NA NA GGGGCT -28 NA NA NA 7 NA PB.598.32 chr1 - 1513 10 novel_in_catalog YARS1 novel 2248 12 NA NA 970 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATGCCACAGTCCTTATAATT 7475 FALSE NA NA GGGGCT -9 NA NA NA 2 NA PB.598.33 chr1 - 1507 10 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000675785.1 2248 12 10769 372 -31 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATGCCACAGTCCTTATAATT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.598.34 chr1 - 1338 9 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000675785.1 2248 12 19576 372 410 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATGCCACAGTCCTTATAATT 1301 FALSE NA NA TTTAAA -29 NA NA NA 2 NA PB.598.35 chr1 - 1245 8 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000675785.1 2248 12 26177 372 -4469 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATGCCACAGTCCTTATAATT 7902 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.598.36 chr1 - 1110 7 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000675785.1 2248 12 30397 373 -249 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TATGCCACAGTCCTTATAAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.598.37 chr1 - 1039 6 full-splice_match YARS1 ENST00000478828.1 1044 6 314 -309 314 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TATGCCACAGTCCTTATAAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.598.40 chr1 - 1581 9 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 -22 6762 0 4082 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA -30 TRUE NA NA AAAAAG -18 NA NA NA 3 NA PB.598.44 chr1 - 1987 7 novel_in_catalog YARS1 novel 1018 9 NA NA 0 174 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAGA -30 TRUE NA NA AAAAAG -18 NA NA NA 3 NA PB.598.47 chr1 - 1358 7 novel_in_catalog YARS1 novel 1018 9 NA NA 0 173 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAG -30 TRUE NA NA AAAAAG -18 NA NA NA 3 NA PB.598.48 chr1 - 848 7 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 -11 11798 0 -97 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAGAAAAAACTGAAGAAGGC -19 TRUE NA NA AAAAAG -7 NA NA NA 3 NA PB.598.50 chr1 - 1326 6 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 -18 15413 4 1 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.093125 0.490398 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAGTGT -26 TRUE NA NA AAAAAG -14 NA NA NA 13 NA PB.598.51 chr1 - 1675 3 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000616261.2 1018 9 -50 23049 2 1312 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAGAAAAGAAAGA -17 TRUE NA NA AAAAAG -5 NA NA NA 2 NA PB.599.1 chr1 - 1155 5 novel_in_catalog TMEM54 novel 1030 6 NA NA 4 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATTTGGCTGCATGCAGGGG 20 TRUE NA NA GGGGCT -14 NA NA NA 2 NA PB.599.2 chr1 - 1052 6 novel_not_in_catalog TMEM54 novel 1030 6 NA NA -5 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.617260 0.417847 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATTTGGCTGCATGCAGGGG 11 TRUE NA NA GGGGCT -23 NA NA NA 11 NA PB.599.3 chr1 - 1009 6 full-splice_match TMEM54 ENST00000373463.8 1030 6 21 0 -16 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 126 29.979521 1.476825 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATTTGGCTGCATGCAGGGG 0 TRUE NA NA GGGGCT -34 NA NA NA 126 NA PB.599.4 chr1 - 901 6 full-splice_match TMEM54 ENST00000474144.5 748 6 -7 -146 -7 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATTTGGCTGCATGCAGGGG 9 TRUE NA NA GGGGCT -25 NA NA NA 5 NA PB.600.1 chr1 - 832 2 incomplete-splice_match RNF19B ENST00000373456.11 2560 9 26267 5 26267 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTTACCTCATTTTCCTTGG 3882 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.600.2 chr1 - 1824 8 incomplete-splice_match RNF19B ENST00000373456.11 2560 9 15006 6 15006 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTTACCTCATTTTCCTTG 9605 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.600.3 chr1 - 1362 5 incomplete-splice_match RNF19B ENST00000373456.11 2560 9 19100 6 19100 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTTACCTCATTTTCCTTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.600.4 chr1 - 1188 4 incomplete-splice_match RNF19B ENST00000373456.11 2560 9 20628 6 20628 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTTACCTCATTTTCCTTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.600.5 chr1 - 1162 3 incomplete-splice_match RNF19B ENST00000356990.9 2598 9 22258 2 22258 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATTCAACTTACCTCATTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.600.6 chr1 - 887 2 incomplete-splice_match RNF19B ENST00000373456.11 2560 9 26206 11 26206 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATTCAACTTACCTCATTTT 3821 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.602.1 chr1 + 1058 3 novel_not_in_catalog HPCA novel 503 2 NA NA -454 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGTGGGCTGGGTGGTGGGGG 3838 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.603.2 chr1 + 2052 11 full-splice_match AZIN2 ENST00000373443.7 2048 11 -12 8 0 0 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAACTGCAGCGGAATCTG -2 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 9 NA PB.604.8 chr1 - 3154 4 incomplete-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 15486 -6 293 6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CTGCATGCATTATCTCATTT 613 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.604.9 chr1 - 3609 7 full-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 -11 -1 -8 1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 24 5.710385 0.756665 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGGTTCTGCATGCATTATCT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 24 NA PB.604.11 chr1 - 5945 6 full-splice_match AK2 ENST00000672715.1 5970 6 24 1 4 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGAGGTTCTGCATGCATTAT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.604.12 chr1 - 3811 7 novel_in_catalog AK2 novel 2840 8 NA NA 4 11 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTATTGTTTGTTTGCTTC 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.604.13 chr1 - 2731 8 full-splice_match AK2 ENST00000467905.5 880 8 23 -1874 0 11 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTATTGTTTGTTTGCTTC -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.604.14 chr1 - 2554 6 full-splice_match AK2 ENST00000548033.5 936 6 -21 -1597 2 11 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTATTGTTTGTTTGCTTC 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.604.16 chr1 - 2224 3 incomplete-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 22287 895 -1309 11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTATTGTTTGTTTGCTTC 7414 FALSE NA NA AATGAA -34 NA NA NA 6 NA PB.604.19 chr1 - 5069 6 full-splice_match AK2 ENST00000672715.1 5970 6 4 897 -2 9 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGAGCTATTGTTTGTTTGCT 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.604.20 chr1 - 2752 7 full-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 -52 897 -24 9 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGAGCTATTGTTTGTTTGCT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.604.21 chr1 - 2699 7 full-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 1 897 1 9 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 295 70.190147 1.846276 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGAGCTATTGTTTGTTTGCT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 295 NA PB.604.22 chr1 - 2457 6 incomplete-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 12411 897 -2769 9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGAGCTATTGTTTGTTTGCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.604.23 chr1 - 2113 2 incomplete-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 23515 897 -81 9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGAGCTATTGTTTGTTTGCT 8642 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.604.30 chr1 - 2779 8 novel_in_catalog AK2 novel 886 7 NA NA -1 8 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTGAGCTATTGTTTGTTTGC 86 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.604.31 chr1 - 2337 5 incomplete-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 15268 898 75 8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTGAGCTATTGTTTGTTTGC 395 FALSE NA NA AAGAAA -29 NA NA NA 2 NA PB.604.32 chr1 - 1672 7 full-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 -11 1936 -8 197 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 867 206.287659 2.314473 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCTGTTGTGGCATTT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 867 NA PB.604.34 chr1 - 2780 7 novel_in_catalog AK2 novel 2840 8 NA NA 0 198 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCCCTGTTGTGGCATTTT 63 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.604.37 chr1 - 1230 4 incomplete-splice_match AK2 ENST00000548033.5 936 6 15426 -557 276 198 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.568991 0.552545 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCCCTGTTGTGGCATTTT 596 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.604.39 chr1 - 4012 6 full-splice_match AK2 ENST00000672715.1 5970 6 22 1936 2 197 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.234519 0.718877 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCTGTTGTGGCATTT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 22 NA PB.604.40 chr1 - 3904 5 full-splice_match AK2 ENST00000480134.5 811 5 29 -3122 -4 197 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCTGTTGTGGCATTT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.604.41 chr1 - 3879 5 full-splice_match AK2 ENST00000354858.11 5059 5 150 1030 9 197 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCTGTTGTGGCATTT 77 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.604.46 chr1 - 1848 8 novel_in_catalog AK2 novel 886 7 NA NA -41 197 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCTGTTGTGGCATTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.604.47 chr1 - 1743 8 novel_in_catalog AK2 novel 886 7 NA NA -3 197 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 23 5.472452 0.738182 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCTGTTGTGGCATTT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 23 NA PB.604.48 chr1 - 1681 8 full-splice_match AK2 ENST00000467905.5 880 8 32 -833 9 197 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.282789 0.631727 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCTGTTGTGGCATTT 77 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.604.49 chr1 - 1516 6 full-splice_match AK2 ENST00000548033.5 936 6 -24 -556 -1 197 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCTGTTGTGGCATTT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.604.51 chr1 - 1361 5 incomplete-splice_match AK2 ENST00000548033.5 936 6 15163 -556 13 197 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.093125 0.490398 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCTGTTGTGGCATTT 333 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.604.52 chr1 - 1098 2 incomplete-splice_match AK2 ENST00000548033.5 936 6 23448 -556 -105 197 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.617260 0.417847 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCTGTTGTGGCATTT 8618 FALSE NA NA AATGAA -16 NA NA NA 11 NA PB.604.53 chr1 - 972 2 incomplete-splice_match AK2 ENST00000548033.5 936 6 23574 -556 21 197 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.568991 0.552545 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCTGTTGTGGCATTT 8744 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.604.55 chr1 - 1479 6 incomplete-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 12349 1937 -2831 196 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.617260 0.417847 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTATCCCCTGTTGTGGCATT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.604.57 chr1 - 1270 6 full-splice_match AK2 ENST00000548033.5 936 6 77 -411 77 52 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAAAGATTGTCCTTTCCATT 168 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.604.58 chr1 - 1000 3 incomplete-splice_match AK2 ENST00000548033.5 936 6 22282 -411 -1271 52 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAAAGATTGTCCTTTCCATT 7452 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.604.59 chr1 - 1524 8 full-splice_match AK2 ENST00000467905.5 880 8 41 -685 -1 49 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATCCAAAGATTGTCCTTTCC 86 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.604.60 chr1 - 1511 7 full-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 2 2084 2 49 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 79 18.796684 1.274081 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATCCAAAGATTGTCCTTTCC 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 79 NA PB.604.61 chr1 - 1346 6 full-splice_match AK2 ENST00000548033.5 936 6 -8 -402 -4 43 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TATGTCATCCAAAGATTGTC 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.604.62 chr1 - 3854 6 full-splice_match AK2 ENST00000672715.1 5970 6 22 2094 2 39 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAGCTATGTCATCCAAAGAT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.604.63 chr1 - 1222 7 full-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 22 2353 2 139 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATTTGAAAGAGATGTAAGGT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.604.64 chr1 - 1041 7 full-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 -8 2564 -5 -31 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.665529 0.221552 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGGAATCGGGTTTTCATTT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.604.65 chr1 - 1762 6 full-splice_match AK2 ENST00000672715.1 5970 6 38 4170 -1 888 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CTTTTGAATTCAGATTGTCT 86 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.604.66 chr1 - 2006 5 novel_in_catalog AK2 novel 5970 6 NA NA 4 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCTTTGGCGTGTGTGCTAC 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.604.67 chr1 - 919 6 full-splice_match AK2 ENST00000672715.1 5970 6 -8 5059 -5 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 548 130.387131 2.115235 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCTTTGGCGTGTGTGCTAC -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 548 NA PB.604.68 chr1 - 794 5 full-splice_match AK2 ENST00000480134.5 811 5 16 1 2 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 44 10.469039 1.019907 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCTTTGGCGTGTGTGCTAC 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 44 NA PB.604.69 chr1 - 756 5 full-splice_match AK2 ENST00000354858.11 5059 5 150 4153 9 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCTTTGGCGTGTGTGCTAC 77 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.604.70 chr1 - 993 7 full-splice_match AK2 ENST00000550338.5 886 7 54 -161 -4 -2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 28 6.662116 0.823612 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCTTTGGCGTGTGTGCTA 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 28 NA PB.604.73 chr1 - 3061 5 full-splice_match AK2 ENST00000487289.1 920 5 -15 -2126 4 -97 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAGAGCAGTGTGTGGGAG 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.604.79 chr1 - 1044 5 full-splice_match AK2 ENST00000487289.1 920 5 -17 -107 2 107 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATTCATTTTCTTTTCAAAT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.604.80 chr1 - 952 5 full-splice_match AK2 ENST00000487289.1 920 5 -50 18 -8 -18 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GTTGAACATCTTTTCCATGT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.606.2 chr1 - 3825 5 full-splice_match TRIM62 ENST00000291416.10 3817 5 -10 2 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.234519 0.718877 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGCCAGTTCCATTCATTTT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 22 NA PB.607.1 chr1 + 3167 8 novel_in_catalog ZNF362 novel 3187 9 NA NA -108 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GGGTGGCGGTGGTGTTTGGC 74 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.607.4 chr1 + 3059 8 novel_in_catalog ZNF362 novel 3187 9 NA NA 0 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GGGTGGCGGTGGTGTTTGGC -34 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 6 NA PB.607.7 chr1 + 2899 7 incomplete-splice_match ZNF362 ENST00000373428.5 2936 8 5524 0 -4251 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GTGGCGGTGGTGTTTGGCGT NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.611.2 chr1 - 2265 6 incomplete-splice_match PHC2 ENST00000373418.7 2550 7 15589 0 960 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TCTCTTTGGTGCCTTTCTCC NA FALSE NA NA AAAACA -30 NA NA NA 6 NA PB.611.3 chr1 - 2056 5 incomplete-splice_match PHC2 ENST00000373418.7 2550 7 17483 0 2854 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.568991 0.552545 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TCTCTTTGGTGCCTTTCTCC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.611.4 chr1 - 1814 3 incomplete-splice_match PHC2 ENST00000373418.7 2550 7 19672 0 5043 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TCTCTTTGGTGCCTTTCTCC 2059 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.611.5 chr1 - 1591 2 incomplete-splice_match PHC2 ENST00000373418.7 2550 7 20819 0 6190 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TCTCTTTGGTGCCTTTCTCC 3206 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.611.6 chr1 - 1510 2 incomplete-splice_match PHC2 ENST00000373418.7 2550 7 20900 0 6271 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TCTCTTTGGTGCCTTTCTCC 3287 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.611.8 chr1 - 3910 15 novel_not_in_catalog PHC2 novel 3993 15 NA NA -22 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GTCTCTTTGGTGCCTTTCTC 2675 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.611.9 chr1 - 3942 15 full-splice_match PHC2 ENST00000683057.1 3993 15 50 1 -25 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GTCTCTTTGGTGCCTTTCTC 2672 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.611.10 chr1 - 1944 5 incomplete-splice_match PHC2 ENST00000373418.7 2550 7 17594 1 2965 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.855192 0.455635 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GTCTCTTTGGTGCCTTTCTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.611.11 chr1 - 1645 2 incomplete-splice_match PHC2 ENST00000373418.7 2550 7 20764 1 6135 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GTCTCTTTGGTGCCTTTCTC 3151 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.611.14 chr1 - 2212 7 novel_in_catalog PHC2 novel 2548 8 NA NA 6 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TGTCTCTTTGGTGCCTTTCT 257 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.611.15 chr1 - 2202 6 incomplete-splice_match PHC2 ENST00000373418.7 2550 7 15650 2 1021 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TGTCTCTTTGGTGCCTTTCT NA FALSE NA NA GGGGCT -35 NA NA NA 3 NA PB.611.16 chr1 - 1748 3 incomplete-splice_match PHC2 ENST00000373418.7 2550 7 19736 2 5107 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.617260 0.417847 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TGTCTCTTTGGTGCCTTTCT 2123 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.611.18 chr1 - 1820 4 incomplete-splice_match PHC2 ENST00000373418.7 2550 7 18523 8 3894 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATCTGTCTCTTTGGTGC 910 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.613.1 chr1 + 4130 7 novel_not_in_catalog ZSCAN20 novel 9456 8 NA NA -4 -114 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATTGGTGAAGTGATTTGAG -10 TRUE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.616.1 chr1 + 1370 2 full-splice_match GJB5 ENST00000338513.1 1355 2 -15 0 -15 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCCAGGTGCCCTCTGGTTGT -33 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.619.5 chr1 - 2572 2 full-splice_match SMIM12 ENST00000521580.3 5694 2 -38 3160 -32 1528 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.520721 0.655208 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAATGTCATTTTGGATGAAA -25 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.619.7 chr1 - 2735 2 full-splice_match SMIM12 ENST00000423898.1 897 2 -20 -1818 -2 1519 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAATAGTAAATGTCATTT 25 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.619.8 chr1 - 1059 2 full-splice_match SMIM12 ENST00000521580.3 5694 2 -35 4670 -29 18 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 229 54.486591 1.736290 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATCATCCAGGTGGTATTTGG -22 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 229 NA PB.619.9 chr1 - 1209 2 full-splice_match SMIM12 ENST00000423898.1 897 2 -9 -303 9 4 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 33 7.851779 0.894968 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AATGATCGAATCTTATCATC 7903 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 33 NA PB.619.12 chr1 - 1849 2 novel_not_in_catalog SMIM12 novel 2817 2 NA NA 9 2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATAATGATCGAATCTTATCA 7903 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.620.1 chr1 - 1058 3 full-splice_match TMEM35B ENST00000373337.3 922 3 17 -153 17 153 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATTTTCTTCCCCTAGAAGT -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.620.2 chr1 - 908 3 full-splice_match TMEM35B ENST00000373337.3 922 3 23 -9 23 9 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 280 66.621155 1.823612 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTTTTGCCTCATTGCTGTT -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 280 NA PB.620.3 chr1 - 706 2 incomplete-splice_match TMEM35B ENST00000373337.3 922 3 1466 0 1466 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTTCATGTCTCTTTTGCCTC 1436 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.621.1 chr1 + 2213 2 full-splice_match GJB3 ENST00000373366.3 2192 2 -23 2 -23 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACAGGTTGGCTCTGTCTCT 5 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 3 NA PB.621.2 chr1 + 1973 2 full-splice_match GJB3 ENST00000373366.3 2192 2 217 2 217 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACAGGTTGGCTCTGTCTCT -4 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 6 NA PB.622.6 chr1 - 1326 6 incomplete-splice_match ZMYM6 ENST00000357182.9 5122 16 23119 2001 -34 -2001 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAACATTGTGTTGGTCTCTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.622.7 chr1 - 3055 16 novel_in_catalog ZMYM6 novel 5122 16 NA NA 9 -2008 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAATTGGAAACATTGTGTTG 21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.622.8 chr1 - 3178 16 novel_in_catalog ZMYM6 novel 5122 16 NA NA 170 -2009 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGAATTGGAAACATTGTGTT 478 FALSE NA NA AAGAAA -5 NA NA NA 2 NA PB.622.9 chr1 - 1461 7 incomplete-splice_match ZMYM6 ENST00000357182.9 5122 16 21447 2016 -1706 -2016 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATCTCTGAATTGGAAACA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.622.11 chr1 - 1608 10 incomplete-splice_match ZMYM6 ENST00000357182.9 5122 16 -17 24388 -17 -6 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAGAAGAAAAATAAAGTTGT -22 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.623.4 chr1 + 4163 10 full-splice_match ZMYM1 ENST00000359858.9 4161 10 -5 3 -2 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATGTTTTGATCTTTCCTA -14 TRUE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.623.5 chr1 + 2945 10 full-splice_match ZMYM1 ENST00000359858.9 4161 10 -5 1221 -2 2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAGAAGAAAAATTCAGAA -14 TRUE NA NA TTTAAA -22 NA NA NA 4 NA PB.623.6 chr1 + 1918 10 full-splice_match ZMYM1 ENST00000359858.9 4161 10 -5 2248 -2 396 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAGATAAAGGAGAAGAAA -14 TRUE NA NA AATAAA -33 NA NA NA 3 NA PB.623.9 chr1 + 4122 10 novel_not_in_catalog ZMYM1 novel 4161 10 NA NA -1 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATCAAATGTTTTGATCTTT -13 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.623.10 chr1 + 1745 9 full-splice_match ZMYM1 ENST00000373329.5 3980 9 -8 2243 1 396 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAGATAAAGGAGAAGAAA -11 TRUE NA NA AATAAA -33 NA NA NA 2 NA PB.623.14 chr1 + 4274 11 novel_in_catalog ZMYM1 novel 4203 11 NA NA 0 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATGTTTTGATCTTTCCTA -3 TRUE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.624.1 chr1 - 5015 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 -2182 2 -1221 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TCCTTTGGTTTTGTTTTTGT 9172 FALSE NA NA AATAAA -25 NA NA NA 3 NA PB.624.2 chr1 - 4738 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 -1905 2 -944 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TCCTTTGGTTTTGTTTTTGT 9449 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.624.3 chr1 - 4004 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 -1172 3 -211 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 9703 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.624.4 chr1 - 3425 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 -593 3 106 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 9707 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.624.5 chr1 - 2636 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 196 3 196 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 8898 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.624.6 chr1 - 2431 4 full-splice_match SFPQ ENST00000490668.5 434 4 -1998 1 -1736 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 9802 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.624.7 chr1 - 2305 12 novel_in_catalog SFPQ novel 874 9 NA NA 0 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.379327 0.376454 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.624.8 chr1 - 2404 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 428 3 428 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 9130 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.624.9 chr1 - 2255 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 577 3 577 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.903462 0.279544 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 9279 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.624.10 chr1 - 2089 4 full-splice_match SFPQ ENST00000485365.1 693 4 -1397 1 -1397 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 8996 FALSE NA NA AAAACA -14 NA NA NA 2 NA PB.624.11 chr1 - 1826 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 1006 3 -393 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 9708 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.624.12 chr1 - 1246 11 novel_in_catalog SFPQ novel 874 9 NA NA -820 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 1750 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.624.13 chr1 - 1191 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 1641 3 101 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.855192 0.455635 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 5538 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.624.14 chr1 - 998 10 novel_in_catalog SFPQ novel 874 9 NA NA -227 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.951731 -0.021486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 24 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.624.15 chr1 - 1014 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 1818 3 278 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 20 4.758654 0.677484 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 5715 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 20 NA PB.624.16 chr1 - 693 3 full-splice_match SFPQ ENST00000466213.5 1431 3 737 1 -373 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.855192 0.455635 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 6033 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.624.17 chr1 - 4553 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 -1722 4 -761 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCTTTGGTTTTGTTTTT 9632 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.624.18 chr1 - 4179 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 -1348 4 -387 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCTTTGGTTTTGTTTTT 10006 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.624.19 chr1 - 3727 3 full-splice_match SFPQ ENST00000466213.5 1431 3 -2298 2 62 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCTTTGGTTTTGTTTTT 9976 FALSE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 5 NA PB.624.20 chr1 - 3170 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 -339 4 -339 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCTTTGGTTTTGTTTTT 9961 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.624.21 chr1 - 2844 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 -13 4 -13 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.331058 0.522582 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCTTTGGTTTTGTTTTT 8689 FALSE NA NA AATGAA -10 NA NA NA 14 NA PB.624.22 chr1 - 2690 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 141 4 141 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCTTTGGTTTTGTTTTT 8843 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.624.23 chr1 - 2304 4 full-splice_match SFPQ ENST00000485365.1 693 4 -1613 2 -1613 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCTTTGGTTTTGTTTTT 9925 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.624.24 chr1 - 2223 11 novel_in_catalog SFPQ novel 874 9 NA NA 0 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCTTTGGTTTTGTTTTT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.624.25 chr1 - 2074 3 full-splice_match SFPQ ENST00000466213.5 1431 3 -645 2 -645 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCTTTGGTTTTGTTTTT 9456 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.624.26 chr1 - 1942 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 889 4 -510 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.427596 0.154605 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCTTTGGTTTTGTTTTT 9591 FALSE NA NA AATAGA -4 NA NA NA 6 NA PB.624.28 chr1 - 1695 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 1136 4 -263 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.617260 0.417847 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCTTTGGTTTTGTTTTT 9838 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.624.29 chr1 - 1513 12 novel_in_catalog SFPQ novel 874 9 NA NA 791 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCTTTGGTTTTGTTTTT 790 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.624.30 chr1 - 1581 2 full-splice_match SFPQ ENST00000471991.5 440 2 -1145 4 299 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCTTTGGTTTTGTTTTT 5736 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.624.31 chr1 - 1494 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 1337 4 -62 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.806923 0.580574 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCTTTGGTTTTGTTTTT 5234 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.624.32 chr1 - 1336 4 full-splice_match SFPQ ENST00000490668.5 434 4 -904 2 -642 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.713798 -0.146425 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCTTTGGTTTTGTTTTT 9751 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.624.33 chr1 - 1316 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 1515 4 -25 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.568991 0.552545 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCTTTGGTTTTGTTTTT 5412 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.624.34 chr1 - 1269 4 full-splice_match SFPQ ENST00000485365.1 693 4 -578 2 -578 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCTTTGGTTTTGTTTTT 9815 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.624.35 chr1 - 912 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 1919 4 379 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.141394 0.330697 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCTTTGGTTTTGTTTTT 5816 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.624.36 chr1 - 5388 3 full-splice_match SFPQ ENST00000466213.5 1431 3 -3962 5 -1602 -5 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTATCCTTTGGTTTTGTT 9936 FALSE NA NA ACTAAA -36 NA NA NA 2 NA PB.624.39 chr1 - 1948 4 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 5053 1 -50 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.475865 -0.322516 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTCCATGGTGTTGTCAGTTA 5052 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.624.47 chr1 - 3074 10 full-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 0 666 0 -666 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 74 17.607019 1.245686 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGTCTTTTCATGTATTCAA -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 74 NA PB.624.51 chr1 - 2754 10 full-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 320 666 320 -666 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.189664 0.075424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGTCTTTTCATGTATTCAA 319 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.624.52 chr1 - 2057 9 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 1709 666 -862 -666 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 31 7.375914 0.867816 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGTCTTTTCATGTATTCAA 1708