isoform chrom strand length exons structural_category associated_gene associated_transcript ref_length ref_exons diff_to_TSS diff_to_TTS diff_to_gene_TSS diff_to_gene_TTS subcategory RTS_stage all_canonical min_sample_cov min_cov min_cov_pos sd_cov FL.BioSample_1 FL_TPM.BioSample_1 FL_TPM.BioSample_1_log10 n_indels n_indels_junc bite iso_exp gene_exp ratio_exp FSM_class coding ORF_length CDS_length CDS_start CDS_end CDS_genomic_start CDS_genomic_end predicted_NMD perc_A_downstream_TTS seq_A_downstream_TTS dist_to_CAGE_peak within_CAGE_peak dist_to_polyA_site within_polyA_site polyA_motif polyA_dist polyA_motif_found ORF_seq ratio_TSS fl_assoc cell_barcodes PB.1.2 chr1 - 1719 11 novel_not_in_catalog WASH7P novel 1351 11 NA NA 223 2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AACAGTGTGCTTTTAATAAA 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.1.3 chr1 - 1718 11 novel_not_in_catalog WASH7P novel 1351 11 NA NA 211 2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AACAGTGTGCTTTTAATAAA -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.1.4 chr1 - 1619 10 novel_not_in_catalog WASH7P novel 1351 11 NA NA 211 2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AACAGTGTGCTTTTAATAAA -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.1.5 chr1 - 1779 11 novel_not_in_catalog WASH7P novel 1351 11 NA NA 225 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA 11 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.1.6 chr1 - 1478 9 novel_not_in_catalog WASH7P novel 1351 11 NA NA 10571 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.1.7 chr1 - 1545 10 novel_not_in_catalog WASH7P novel 1351 11 NA NA 225 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA 11 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.1.8 chr1 - 2598 9 novel_not_in_catalog WASH7P novel 1351 11 NA NA 223 -5 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAAACCAACAGTGTGCTTT 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.1.10 chr1 - 1772 5 novel_not_in_catalog WASH7P novel 1351 11 NA NA 12224 -5 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAAACCAACAGTGTGCTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.1.11 chr1 - 1640 10 novel_not_in_catalog WASH7P novel 1351 11 NA NA 211 -5 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAAACCAACAGTGTGCTTT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.1.12 chr1 - 714 2 novel_not_in_catalog WASH7P novel 1351 11 NA NA 211 -9813 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTGATTTGAGTGCATTAAC -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.4.1 chr1 + 1227 2 antisense novelGene_ENSG00000228463_AS novel NA NA NA NA NA NA multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AACAAGAAAAGTCTTTTCTG NA FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.6.2 chr1 - 2018 10 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -4461 341 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAAACGTCTCGGGGTCAGTG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.6.5 chr1 - 1761 11 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -4464 299 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AACAGTGTGCTTTTAATAAA -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.6.7 chr1 - 1474 9 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -4464 299 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AACAGTGTGCTTTTAATAAA -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.6.8 chr1 - 984 5 incomplete-splice_match WASH9P ENST00000623083.4 1397 10 7866 -299 7866 299 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AACAGTGTGCTTTTAATAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.6.12 chr1 - 1773 12 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -4458 294 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.6.14 chr1 - 1667 10 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA 5834 294 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.6.15 chr1 - 1586 10 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -4464 294 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.6.16 chr1 - 1581 10 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -4464 294 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.6.17 chr1 - 1568 10 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -4464 294 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.831858 0.583409 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.6.18 chr1 - 1631 10 full-splice_match WASH9P ENST00000623083.4 1397 10 60 -294 60 294 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA 4521 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.6.19 chr1 - 1333 8 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -4464 294 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.6.20 chr1 - 1247 7 incomplete-splice_match WASH9P ENST00000623083.4 1397 10 7182 -294 7182 294 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.6.21 chr1 - 1082 6 incomplete-splice_match WASH9P ENST00000623083.4 1397 10 7586 -294 7586 294 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACCAACAGTGTGCTTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.6.23 chr1 - 1954 10 novel_not_in_catalog WASH9P novel 1397 10 NA NA -4464 291 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 CAGAAACCAACAGTGTGCTT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.10.1 chr1 + 991 2 full-splice_match ENSG00000236601 ENST00000635159.1 994 2 1 2 1 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATTTTTTCCAGATTTATAC NA FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 5 NA PB.11.3 chr1 + 1080 3 full-splice_match LINC01128 ENST00000669922.1 5441 3 -5 4366 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATTTGATGGCCTCTGTTGT 762 FALSE NA NA AATGAA -44 NA NA NA 4 NA PB.11.7 chr1 + 1545 5 full-splice_match LINC01128 ENST00000445118.7 6616 5 22 5049 12 1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AATAGCTATTAAAAGAGACA 784 FALSE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 2 NA PB.11.9 chr1 + 1203 5 full-splice_match LINC01128 ENST00000445118.7 6616 5 69 5344 0 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 ACCTACTGTGAAGACACAAA 1 TRUE NA NA AATAAA -23 NA NA NA 2 NA PB.11.13 chr1 + 1215 3 incomplete-splice_match LINC01128 ENST00000688420.1 1200 5 20372 -291 641 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGTGAGGTACAATAGCTATT NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.14.1 chr1 - 1003 5 fusion ENSG00000230092_LINC00115 novel 872 5 NA NA 9 444 multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 ATAGTAGAATGATTTATAAT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.14.4 chr1 - 1301 1 full-splice_match LINC00115 ENST00000473798.1 1317 1 21 -5 21 5 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 24 5.747787 0.759501 NA NA NA NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGCTCACCTTTTATGTTT 14 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 24 NA PB.17.1 chr1 - 1428 1 full-splice_match LINC02593 ENST00000609207.1 4152 1 2717 7 235 -2 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AACCTGATCTGATTACAGAG 7313 FALSE NA NA AAAACA -29 NA NA NA 2 NA PB.17.2 chr1 - 1772 1 full-splice_match LINC02593 ENST00000609207.1 4152 1 2368 12 -114 -7 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CTGGCAACCTGATCTGATTA 6964 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.17.3 chr1 - 1599 1 full-splice_match LINC02593 ENST00000609207.1 4152 1 1843 710 519 -205 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGACAGCTTTATCTTGTTG 6439 FALSE NA NA GGGGCT -41 NA NA NA 2 NA PB.18.2 chr1 + 1624 6 incomplete-splice_match SAMD11 ENST00000341065.8 2191 12 11798 1 7 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCCCGTGTCTACTGCCTCCC -6 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.18.3 chr1 + 1475 5 novel_in_catalog SAMD11 novel 2191 12 NA NA 10 -21 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAATAAATAATAAAGCCT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.18.4 chr1 + 1456 5 incomplete-splice_match SAMD11 ENST00000341065.8 2191 12 12103 22 249 -21 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAATAAATAATAAAGCCT 102 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.19.1 chr1 + 1883 9 novel_not_in_catalog KLHL17 novel 2567 12 NA NA 481 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGCTGAGCATCTCTCTCTG 1328 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.19.3 chr1 + 1757 5 novel_in_catalog KLHL17 novel 2567 12 NA NA -376 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCCTCAGGCTGAGCATCTCT 2574 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.19.4 chr1 + 789 2 incomplete-splice_match KLHL17 ENST00000338591.8 2567 12 3910 5 942 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CCTCAGGCTGAGCATCTCTC 3892 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.20.1 chr1 - 1637 2 novel_in_catalog NOC2L novel 1611 5 NA NA 1504 654 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 8223 FALSE NA NA TTTAAA -26 NA NA NA 2 NA PB.20.3 chr1 - 2607 18 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 282 1 282 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTGGTGGCTCCTGGAGATT 8005 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.20.4 chr1 - 2388 16 novel_not_in_catalog NOC2L novel 2757 19 NA NA 1450 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTGGTGGCTCCTGGAGATT 9971 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.20.5 chr1 - 1869 11 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000477976.5 4201 17 5168 -1 5168 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTGGTGGCTCCTGGAGATT 7244 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.20.6 chr1 - 1740 10 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 6654 1 -5542 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTGGTGGCTCCTGGAGATT 7932 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.20.7 chr1 - 1498 9 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000477976.5 4201 17 6373 11 -5025 -11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCATTGTGTTGAGTGGTGG 8449 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.20.8 chr1 - 1263 7 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000477976.5 4201 17 9904 -1 -1494 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTGGTGGCTCCTGGAGATT 5225 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.20.9 chr1 - 766 3 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 13660 1 1464 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTGGTGGCTCCTGGAGATT 8183 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.20.10 chr1 - 2849 20 novel_not_in_catalog NOC2L novel 2757 19 NA NA -19 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAGTGGTGGCTCCTGGAGAT -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.20.12 chr1 - 2776 19 full-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 -21 2 -21 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 315 75.439705 1.877600 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAGTGGTGGCTCCTGGAGAT -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 315 NA PB.20.13 chr1 - 2196 15 novel_in_catalog NOC2L novel 4201 17 NA NA 2314 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGAGTGGTGGCTCCTGGAGA 4390 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.20.14 chr1 - 1808 12 novel_not_in_catalog NOC2L novel 2757 19 NA NA 5 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGAGTGGTGGCTCCTGGAGA 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.20.15 chr1 - 1062 5 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 12728 3 532 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGAGTGGTGGCTCCTGGAGA 7251 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.20.16 chr1 - 650 2 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 14145 3 1949 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGAGTGGTGGCTCCTGGAGA 8668 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.20.17 chr1 - 1442 9 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 7219 6 -4977 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGTTGAGTGGTGGCTCCTGG 8497 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.20.18 chr1 - 2367 16 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 2242 9 1444 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTGTGTTGAGTGGTGGCTCC 9965 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.20.19 chr1 - 2130 14 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 3238 9 2440 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTGTGTTGAGTGGTGGCTCC 4516 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.20.20 chr1 - 1968 12 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000477976.5 4201 17 4568 7 4568 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTGTGTTGAGTGGTGGCTCC 6644 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.20.21 chr1 - 1347 8 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000477976.5 4201 17 7289 7 -4109 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTGTGTTGAGTGGTGGCTCC 9365 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.20.22 chr1 - 1333 8 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 8086 9 -4110 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.592367 0.555381 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTGTGTTGAGTGGTGGCTCC 9364 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.20.23 chr1 - 2609 18 novel_in_catalog NOC2L novel 2757 19 NA NA 0 -8 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTGTGTTGAGTGGTGGCTC 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.20.24 chr1 - 2461 17 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 2074 10 1276 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTGTGTTGAGTGGTGGCTC 9797 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.20.25 chr1 - 1643 10 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 6742 10 -5454 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTGTGTTGAGTGGTGGCTC 8020 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.20.26 chr1 - 2722 19 novel_not_in_catalog NOC2L novel 2757 19 NA NA 0 -9 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CATTGTGTTGAGTGGTGGCT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.20.27 chr1 - 2781 19 novel_in_catalog NOC2L novel 2757 19 NA NA -20 -9 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 201 48.137718 1.682485 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CATTGTGTTGAGTGGTGGCT -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 201 NA PB.20.28 chr1 - 1852 11 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 5958 11 5160 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CATTGTGTTGAGTGGTGGCT 7236 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.20.29 chr1 - 2050 13 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000477976.5 4201 17 4372 10 4372 -10 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CCATTGTGTTGAGTGGTGGC 6448 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.20.30 chr1 - 1737 10 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000477976.5 4201 17 5863 10 -5535 -10 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CCATTGTGTTGAGTGGTGGC 7939 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.20.31 chr1 - 3200 19 novel_in_catalog NOC2L novel 2757 19 NA NA 0 -11 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCATTGTGTTGAGTGGTGG 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.20.32 chr1 - 2806 19 novel_not_in_catalog NOC2L novel 2757 19 NA NA -21 -11 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCATTGTGTTGAGTGGTGG -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.20.33 chr1 - 2750 19 novel_not_in_catalog NOC2L novel 2757 19 NA NA 0 -11 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCATTGTGTTGAGTGGTGG 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.20.34 chr1 - 2737 19 novel_not_in_catalog NOC2L novel 2757 19 NA NA -2 -11 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCATTGTGTTGAGTGGTGG 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.20.35 chr1 - 2658 18 novel_in_catalog NOC2L novel 2757 19 NA NA 234 -11 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCATTGTGTTGAGTGGTGG 7957 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.20.36 chr1 - 2324 16 novel_in_catalog NOC2L novel 4201 17 NA NA 1498 -11 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCATTGTGTTGAGTGGTGG 9985 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.20.37 chr1 - 2034 13 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 5170 13 4372 -11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCATTGTGTTGAGTGGTGG 6448 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.20.38 chr1 - 1819 11 novel_not_in_catalog NOC2L novel 2757 19 NA NA 5182 -11 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCATTGTGTTGAGTGGTGG 7258 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.20.39 chr1 - 1088 5 full-splice_match NOC2L ENST00000483767.5 1611 5 511 12 511 -11 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCATTGTGTTGAGTGGTGG 7230 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.20.40 chr1 - 1135 6 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 11060 13 -1136 -11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.352876 0.525417 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCATTGTGTTGAGTGGTGG 5583 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.20.41 chr1 - 925 4 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 12970 13 774 -11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCATTGTGTTGAGTGGTGG 7493 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.20.42 chr1 - 2477 17 novel_in_catalog NOC2L novel 4201 17 NA NA 1270 -13 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGGCCATTGTGTTGAGTGGT 9791 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.20.43 chr1 - 1970 13 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000327044.7 2757 19 5232 15 4434 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGGCCATTGTGTTGAGTGGT 6510 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.20.44 chr1 - 1721 10 novel_not_in_catalog NOC2L novel 4201 17 NA NA -5535 -14 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGGCCATTGTGTTGAGTGG 7939 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.20.45 chr1 - 735 3 incomplete-splice_match NOC2L ENST00000483767.5 1611 5 1495 15 1495 -14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGGCCATTGTGTTGAGTGG 8214 FALSE NA NA TTTAAA -35 NA NA NA 7 NA PB.20.50 chr1 - 855 2 full-splice_match NOC2L ENST00000469563.1 878 2 -2 25 -2 -25 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 31 7.424225 0.870651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAGAAAAAGAAAGAAAT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 31 NA PB.21.2 chr1 + 2201 16 novel_in_catalog PLEKHN1 novel 2455 15 NA NA -11 -19 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAATGACCTCCCCACTAT -27 TRUE NA NA GATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.22.1 chr1 - 1040 2 full-splice_match HES4 ENST00000481869.1 1038 2 1 -3 1 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTCTGCGTCACGAGTTTTC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.22.2 chr1 - 708 3 full-splice_match HES4 ENST00000428771.6 1040 3 331 1 140 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTCTGCGTCACGAGTTTTC 971 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.22.3 chr1 - 962 3 novel_in_catalog HES4 novel 885 4 NA NA 0 1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAGTCTGCGTCACGAGTTT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.22.4 chr1 - 960 3 full-splice_match HES4 ENST00000428771.6 1040 3 77 3 1 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAGTCTGCGTCACGAGTTT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.22.5 chr1 - 882 4 full-splice_match HES4 ENST00000304952.11 885 4 2 1 1 1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 55 13.172012 1.119652 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAGTCTGCGTCACGAGTTT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 55 NA PB.22.6 chr1 - 788 3 full-splice_match HES4 ENST00000484667.2 667 3 -116 -5 0 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAGTCTGCGTCACGAGTTT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.23.1 chr1 + 687 2 full-splice_match ISG15 ENST00000649529.1 637 2 -59 9 -59 -9 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAGAGAAATGGCCGCCTCT NA FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 3 NA PB.23.4 chr1 + 628 2 full-splice_match ISG15 ENST00000649529.1 637 2 0 9 0 -9 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 65 15.566923 1.192203 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAGAGAAATGGCCGCCTCT 1 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 65 NA PB.24.2 chr1 + 3908 18 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 12826 3 -269 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGCATTGCTTTTGTCCAT 1763 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.24.3 chr1 + 1307 3 novel_in_catalog AGRN novel 7408 35 NA NA 56 -627 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 2088 FALSE NA NA AAAAAG -17 NA NA NA 2 NA PB.24.4 chr1 + 3859 17 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 13242 5 -127 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAAAGCATTGCTTTTGTCC 2179 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.24.5 chr1 + 3693 16 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 13527 4 158 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 2464 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.24.7 chr1 + 3557 15 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 13751 4 382 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 5 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.24.8 chr1 + 3244 14 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 14179 5 -244 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAAAGCATTGCTTTTGTCC 433 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 4 NA PB.24.9 chr1 + 3046 13 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 14879 4 456 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 1133 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 8 NA PB.24.10 chr1 + 2917 12 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 15184 4 761 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 1438 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 5 NA PB.24.11 chr1 + 2755 11 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 15460 4 1037 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 1714 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 9 NA PB.24.12 chr1 + 2470 10 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 15852 4 1429 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 2106 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 8 NA PB.24.13 chr1 + 2330 9 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 16187 4 -1693 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 2441 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 5 NA PB.24.14 chr1 + 2294 8 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 16320 4 -1560 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 2574 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 6 NA PB.24.15 chr1 + 2197 8 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 16417 4 -1463 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.592367 0.555381 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 2671 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 15 NA PB.24.16 chr1 + 2084 7 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 16664 4 -1216 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 2918 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.24.17 chr1 + 1976 6 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 17186 5 -694 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAAAGCATTGCTTTTGTCC 3440 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 10 NA PB.24.18 chr1 + 1869 5 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 17377 4 -503 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.352876 0.525417 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 3631 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 14 NA PB.24.19 chr1 + 1707 4 incomplete-splice_match AGRN ENST00000652369.1 7408 35 17621 4 -259 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 34 8.142698 0.910768 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 3875 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 34 NA PB.24.20 chr1 + 2423 2 incomplete-splice_match AGRN ENST00000461111.1 3385 3 1233 1 1233 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAAAGCATTGCTTTTGTCC 5367 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.24.21 chr1 + 1586 3 full-splice_match AGRN ENST00000461111.1 3385 3 1799 0 1799 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 5933 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 10 NA PB.24.22 chr1 + 1527 3 full-splice_match AGRN ENST00000461111.1 3385 3 1858 0 1858 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 24 5.747787 0.759501 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 5992 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 24 NA PB.24.24 chr1 + 1387 2 incomplete-splice_match AGRN ENST00000461111.1 3385 3 2468 0 2468 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 25 5.987278 0.777229 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGCATTGCTTTTGTCCA 6602 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 25 NA PB.26.1 chr1 - 1992 3 novel_not_in_catalog ENSG00000273443 novel 829 2 NA NA -1043 941 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGCGATGGCTCATGCCTGAA 9974 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.28.1 chr1 - 1783 2 full-splice_match RNF223 ENST00000453464.3 1900 2 116 1 116 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATCTTTGGCAAGAGGGCCTC 115 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.28.2 chr1 - 1445 2 full-splice_match RNF223 ENST00000453464.3 1900 2 -2 457 -2 -457 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CATCGTGGTGGGTGCCTCTT -3 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.29.2 chr1 - 3210 9 novel_in_catalog C1orf159 novel 2099 12 NA NA -9 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGCTGCGTTCCGAGCTGCT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.29.3 chr1 - 2279 10 novel_in_catalog C1orf159 novel 2099 12 NA NA -5 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGCTGCGTTCCGAGCTGCT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.29.4 chr1 - 2013 11 full-splice_match C1orf159 ENST00000379325.7 2010 11 -5 2 -5 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGCTGCGTTCCGAGCTGCT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.29.6 chr1 - 1949 11 novel_in_catalog C1orf159 novel 2429 12 NA NA -5 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGCTGCGTTCCGAGCTGCT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.29.7 chr1 - 1891 11 novel_not_in_catalog C1orf159 novel 2099 12 NA NA -7 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGCTGCGTTCCGAGCTGCT -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.29.8 chr1 - 1835 10 full-splice_match C1orf159 ENST00000421241.7 1832 10 -5 2 1 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 38 9.100663 0.959073 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGCTGCGTTCCGAGCTGCT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 38 NA PB.29.10 chr1 - 1520 6 incomplete-splice_match C1orf159 ENST00000379319.5 1097 10 18527 -875 36 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGCTGCGTTCCGAGCTGCT 4428 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.29.13 chr1 - 1189 2 incomplete-splice_match C1orf159 ENST00000465822.5 1933 9 7698 3 -307 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CAAGCTGCGTTCCGAGCTGC 7649 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.29.14 chr1 - 1432 10 full-splice_match C1orf159 ENST00000421241.7 1832 10 -18 418 -12 -6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAAAAGTCCTCCAGAGCTC -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.30.1 chr1 - 1978 4 full-splice_match TNFRSF18 ENST00000486728.5 727 4 -916 -335 -4 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACCTGAGTGGATGCATGCTG -20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.30.2 chr1 - 1950 3 incomplete-splice_match TNFRSF18 ENST00000486728.5 727 4 -5 -335 -5 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACCTGAGTGGATGCATGCTG 8467 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.30.3 chr1 - 1348 2 novel_not_in_catalog TNFRSF18 novel 727 4 NA NA -229 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACCTGAGTGGATGCATGCTG 8243 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.30.4 chr1 - 1242 5 full-splice_match TNFRSF18 ENST00000379268.7 1083 5 -160 1 -160 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACCTGAGTGGATGCATGCTG 7400 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.30.5 chr1 - 1141 4 novel_in_catalog TNFRSF18 novel 1083 5 NA NA 6 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACCTGAGTGGATGCATGCTG -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.30.6 chr1 - 1068 4 novel_not_in_catalog TNFRSF18 novel 1083 5 NA NA 6 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACCTGAGTGGATGCATGCTG -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.30.7 chr1 - 1065 5 full-splice_match TNFRSF18 ENST00000379265.5 705 5 -25 -335 -4 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACCTGAGTGGATGCATGCTG -20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.30.8 chr1 - 1076 5 full-splice_match TNFRSF18 ENST00000379268.7 1083 5 6 1 6 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 64 15.327433 1.185469 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACCTGAGTGGATGCATGCTG -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 64 NA PB.30.9 chr1 - 1286 4 full-splice_match TNFRSF18 ENST00000486728.5 727 4 -225 -334 -225 -2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GACCTGAGTGGATGCATGCT 8247 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.30.10 chr1 - 1120 5 novel_not_in_catalog TNFRSF18 novel 1083 5 NA NA -4 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGACCTGAGTGGATGCATGC -20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.30.11 chr1 - 1129 3 novel_not_in_catalog TNFRSF18 novel 1083 5 NA NA 6 -5 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGTGACCTGAGTGGATGCAT -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.31.1 chr1 + 946 4 novel_in_catalog ENSG00000217801 novel 957 4 NA NA 0 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTCTCTTGCCTCGGCACCT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.31.2 chr1 + 937 5 full-splice_match ENSG00000217801 ENST00000394517.7 1043 5 -2 108 -2 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TATAATAATGATGGATAATT 2 TRUE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.31.3 chr1 + 983 4 novel_in_catalog ENSG00000217801 novel 982 4 NA NA 3 -5 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TGAAACAGTTTGTGCCTTCA 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.31.4 chr1 + 834 4 full-splice_match ENSG00000217801 ENST00000456409.6 957 4 18 105 3 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TATAATAATGATGGATAATT 7 TRUE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.32.1 chr1 - 2003 7 full-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 -54 -16 12 -6 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 366 87.653755 1.942770 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTTCATTCTTTGGGCGTG 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 366 NA PB.32.3 chr1 - 2267 3 full-splice_match SDF4 ENST00000494748.1 3516 3 1272 -23 214 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTCTTTGGGCGTGAAACAA 8768 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.32.4 chr1 - 2077 7 novel_in_catalog SDF4 novel 2137 7 NA NA -14 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTCTTTGGGCGTGAAACAA -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.32.5 chr1 - 2060 7 full-splice_match SDF4 ENST00000263741.12 2079 7 41 -22 11 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.634403 0.420682 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTCTTTGGGCGTGAAACAA -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.32.6 chr1 - 1535 6 incomplete-splice_match SDF4 ENST00000263741.12 2079 7 3511 -22 76 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTCTTTGGGCGTGAAACAA 9313 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.32.7 chr1 - 1115 3 full-splice_match SDF4 ENST00000494748.1 3516 3 2424 -23 1366 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTCTTTGGGCGTGAAACAA 9920 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.32.8 chr1 - 879 2 full-splice_match SDF4 ENST00000478938.1 2591 2 1737 -25 1737 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 23 5.508296 0.741017 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTCTTTGGGCGTGAAACAA 937 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 23 NA PB.32.9 chr1 - 822 2 full-splice_match SDF4 ENST00000478938.1 2591 2 1794 -25 1794 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTCTTTGGGCGTGAAACAA 994 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.32.10 chr1 - 1481 3 full-splice_match SDF4 ENST00000494748.1 3516 3 2057 -22 999 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CATTCTTTGGGCGTGAAACA 9553 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.32.11 chr1 - 2230 7 novel_not_in_catalog SDF4 novel 1933 7 NA NA 71 -6 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTTCATTCTTTGGGCGTG 9039 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.32.12 chr1 - 2085 7 novel_not_in_catalog SDF4 novel 2137 7 NA NA -14 -6 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTTCATTCTTTGGGCGTG -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.32.13 chr1 - 1883 7 full-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 66 -16 33 -6 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 60 14.369468 1.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTTCATTCTTTGGGCGTG 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 60 NA PB.32.15 chr1 - 1677 6 incomplete-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 3217 -16 -188 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.873893 0.458471 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTTCATTCTTTGGGCGTG 9049 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.32.16 chr1 - 1378 6 incomplete-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 3516 -16 111 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 36 8.621680 0.935592 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTTCATTCTTTGGGCGTG 9348 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 36 NA PB.32.17 chr1 - 1218 4 incomplete-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 8649 -16 -2001 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 29 6.945243 0.841687 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTTCATTCTTTGGGCGTG 8709 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 29 NA PB.32.20 chr1 - 2121 7 full-splice_match SDF4 ENST00000660930.1 2137 7 9 7 9 -7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGCTTCATTCTTTGGGCGT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.32.21 chr1 - 994 3 full-splice_match SDF4 ENST00000494748.1 3516 3 2533 -11 1475 10 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 20 4.789823 0.680319 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGGTCAGCTTCATTCTTTG 9894 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 20 NA PB.32.23 chr1 - 1930 7 novel_not_in_catalog SDF4 novel 1933 7 NA NA -8883 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATAGTTGCCTTTTTTG -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.32.24 chr1 - 1924 7 full-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 2 7 2 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 229 54.843468 1.739125 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATAGTTGCCTTTTTTG -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 229 NA PB.32.25 chr1 - 1760 6 incomplete-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 3111 7 -294 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.352876 0.525417 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATAGTTGCCTTTTTTG 8943 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.32.26 chr1 - 1593 6 incomplete-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 3278 7 -127 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.352876 0.525417 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATAGTTGCCTTTTTTG 9110 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.32.27 chr1 - 1502 6 incomplete-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 3369 7 -36 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 24 5.747787 0.759501 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATAGTTGCCTTTTTTG 9201 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 24 NA PB.32.28 chr1 - 1419 6 incomplete-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 3452 7 47 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.310840 0.634562 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATAGTTGCCTTTTTTG 9284 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.32.29 chr1 - 1279 5 incomplete-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 8091 7 -2559 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.113385 0.493233 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATAGTTGCCTTTTTTG 8151 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.32.31 chr1 - 1425 6 incomplete-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 3310 143 -95 -140 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAATGAGTAGCCAGGAAGTT 9142 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.32.32 chr1 - 1770 7 full-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 17 146 -16 -143 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TGGAAATGAGTAGCCAGGAA 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.32.33 chr1 - 1811 7 full-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 -44 166 -14 -163 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAATAGATTAAACTTCGC -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.32.34 chr1 - 1093 6 incomplete-splice_match SDF4 ENST00000360001.12 1933 7 7 1602 7 -10 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAGACAGAAAAAAGGAGTT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.33.2 chr1 - 2367 7 full-splice_match UBE2J2 ENST00000347370.6 2387 7 20 0 -1 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTTCATGCTGCTTGTGTC 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.33.3 chr1 - 2310 8 full-splice_match UBE2J2 ENST00000400930.8 1021 8 -25 -1264 -3 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTTCATGCTGCTTGTGTC -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.33.4 chr1 - 2250 7 full-splice_match UBE2J2 ENST00000349431.11 2260 7 8 2 -2 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 80 19.159290 1.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTTCATGCTGCTTGTGTC -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 80 NA PB.33.5 chr1 - 2101 6 full-splice_match UBE2J2 ENST00000400929.6 1057 6 27 -1071 -1 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.634403 0.420682 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTTCATGCTGCTTGTGTC 16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.33.6 chr1 - 1678 3 incomplete-splice_match UBE2J2 ENST00000347370.6 2387 7 16840 0 -679 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTTCATGCTGCTTGTGTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.33.8 chr1 - 2407 7 full-splice_match UBE2J2 ENST00000360466.6 1047 7 -111 -1249 0 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATTTCATGCTGCTTGTGT 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.33.9 chr1 - 2159 6 novel_in_catalog UBE2J2 novel 2260 7 NA NA 0 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATTTCATGCTGCTTGTGT 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.33.11 chr1 - 2289 7 novel_not_in_catalog UBE2J2 novel 2260 7 NA NA 0 -8 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATTTCTGAATTTCATGCTG 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.33.12 chr1 - 1554 7 full-splice_match UBE2J2 ENST00000435198.5 1056 7 -4 -494 1 84 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TTAGATGTGGTCACTTAGAA -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.33.13 chr1 - 1465 8 novel_in_catalog UBE2J2 novel 1256 8 NA NA -1 83 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTAGATGTGGTCACTTAGA 16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.33.14 chr1 - 1431 7 full-splice_match UBE2J2 ENST00000360466.6 1047 7 -122 -262 1 83 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.873893 0.458471 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTAGATGTGGTCACTTAGA -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.33.15 chr1 - 1388 7 full-splice_match UBE2J2 ENST00000473215.5 1028 7 6 -366 1 83 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTAGATGTGGTCACTTAGA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.33.16 chr1 - 1357 8 novel_not_in_catalog UBE2J2 novel 1021 8 NA NA 1 83 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTAGATGTGGTCACTTAGA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.33.17 chr1 - 1284 7 full-splice_match UBE2J2 ENST00000349431.11 2260 7 -14 990 -4 83 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 350 83.821892 1.923357 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTAGATGTGGTCACTTAGA -24 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 350 NA PB.33.18 chr1 - 1292 8 full-splice_match UBE2J2 ENST00000400930.8 1021 8 5 -276 -1 83 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTAGATGTGGTCACTTAGA 16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.33.19 chr1 - 2065 7 novel_in_catalog UBE2J2 novel 2260 7 NA NA 0 82 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATTAGATGTGGTCACTTAG 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.33.20 chr1 - 1809 6 novel_in_catalog UBE2J2 novel 2260 7 NA NA 0 82 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATTAGATGTGGTCACTTAG 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.33.21 chr1 - 1567 9 novel_in_catalog UBE2J2 novel 2455 8 NA NA 0 82 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATTAGATGTGGTCACTTAG 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.33.22 chr1 - 1493 8 novel_in_catalog UBE2J2 novel 1256 8 NA NA 0 82 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATTAGATGTGGTCACTTAG 17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.33.23 chr1 - 1371 8 novel_in_catalog UBE2J2 novel 2455 8 NA NA -1 82 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATTAGATGTGGTCACTTAG 16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.33.24 chr1 - 1380 8 full-splice_match UBE2J2 ENST00000464036.5 1256 8 21 -145 1 82 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATTAGATGTGGTCACTTAG 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.33.25 chr1 - 1171 6 novel_in_catalog UBE2J2 novel 2260 7 NA NA 0 82 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.310840 0.634562 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATTAGATGTGGTCACTTAG 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.33.26 chr1 - 1121 6 full-splice_match UBE2J2 ENST00000400929.6 1057 6 18 -82 0 82 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 39 9.340154 0.970354 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATTAGATGTGGTCACTTAG 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 39 NA PB.33.27 chr1 - 1075 6 incomplete-splice_match UBE2J2 ENST00000400930.8 1021 8 8925 -275 -1339 82 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATTAGATGTGGTCACTTAG 8936 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.33.28 chr1 - 1080 5 novel_in_catalog UBE2J2 novel 1057 6 NA NA 0 82 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATTAGATGTGGTCACTTAG 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.33.29 chr1 - 950 5 incomplete-splice_match UBE2J2 ENST00000400929.6 1057 6 10468 -82 182 82 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATTAGATGTGGTCACTTAG 4510 FALSE NA NA AAGAAA -35 NA NA NA 7 NA PB.34.1 chr1 + 1453 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 30 1322 30 -1322 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATGAGTGTAAGTTGGCAGTG 15 TRUE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 8 NA PB.34.2 chr1 + 2732 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 67 6 67 -6 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACAAAGCCTGCCCCAGGCT 52 FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 6 NA PB.34.3 chr1 + 1393 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 113 1299 113 -1299 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACGTCTCGGTTTTTTTACAT 98 FALSE NA NA TATAAA -42 NA NA NA 4 NA PB.34.4 chr1 + 1641 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 302 862 302 -862 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTCCCTGGAGTCCGACGC 287 FALSE NA NA AGTAAA -33 NA NA NA 7 NA PB.34.5 chr1 + 1180 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 302 1323 302 -1323 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GATGAGTGTAAGTTGGCAGT 287 FALSE NA NA TATAAA -18 NA NA NA 7 NA PB.34.6 chr1 + 2455 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 344 6 344 -6 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACAAAGCCTGCCCCAGGCT 329 FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 6 NA PB.34.7 chr1 + 1430 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 513 862 513 -862 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTCCCTGGAGTCCGACGC 498 FALSE NA NA AGTAAA -33 NA NA NA 2 NA PB.34.8 chr1 + 2132 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 667 6 667 -6 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACAAAGCCTGCCCCAGGCT 652 FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 3 NA PB.34.9 chr1 + 1079 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 867 859 867 -859 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TCCCTGGAGTCCGACGCGGG 852 FALSE NA NA AGTAAA -36 NA NA NA 3 NA PB.34.10 chr1 + 1930 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 869 6 869 -6 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACAAAGCCTGCCCCAGGCT 854 FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 3 NA PB.34.11 chr1 + 1701 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 1098 6 1098 -6 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACAAAGCCTGCCCCAGGCT 1083 FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.34.12 chr1 + 1550 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 1249 6 1249 -6 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACAAAGCCTGCCCCAGGCT 1234 FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.34.13 chr1 + 1493 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 1306 6 1306 -6 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACAAAGCCTGCCCCAGGCT 1291 FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 3 NA PB.34.14 chr1 + 1405 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 1394 6 1394 -6 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACAAAGCCTGCCCCAGGCT 1379 FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 5 NA PB.34.15 chr1 + 1206 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 1593 6 1593 -6 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACAAAGCCTGCCCCAGGCT 1578 FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.34.16 chr1 + 913 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 1884 8 1884 -8 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAACAAAGCCTGCCCCAGG 1869 FALSE NA NA ATTAAA -10 NA NA NA 2 NA PB.34.17 chr1 + 656 1 full-splice_match B3GALT6 ENST00000379198.5 2805 1 2143 6 2143 -6 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACAAAGCCTGCCCCAGGCT 2128 FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.35.1 chr1 - 2502 10 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 2393 -502 -1554 22 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CCTTGCTCTGCTCTGTCTCC 8230 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.35.3 chr1 - 2580 11 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 1109 -484 395 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TGCTCCTGGGCTCCCGTGCC 9995 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.35.5 chr1 - 3321 18 novel_not_in_catalog ACAP3 novel 3793 24 NA NA -1054 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TGCCTGCTCCTGGGCTCCCG 7364 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.35.6 chr1 - 1964 6 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 3411 -480 -536 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TGCCTGCTCCTGGGCTCCCG 9248 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.35.7 chr1 - 1768 4 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 4326 -480 379 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TGCCTGCTCCTGGGCTCCCG 4191 FALSE NA NA GGGGCT -11 NA NA NA 4 NA PB.35.8 chr1 - 2976 15 novel_not_in_catalog ACAP3 novel 3793 24 NA NA -249 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTGCCTGCTCCTGGGCTCC 8169 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.35.10 chr1 - 3283 23 novel_not_in_catalog ACAP3 novel 3793 24 NA NA 14 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCCCTCATCTCATGTTCTT -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.35.11 chr1 - 3288 23 novel_not_in_catalog ACAP3 novel 3793 24 NA NA 26 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.550332 0.658043 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCCCTCATCTCATGTTCTT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.35.12 chr1 - 2558 16 novel_not_in_catalog ACAP3 novel 3793 24 NA NA -377 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCCCTCATCTCATGTTCTT 8041 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.35.13 chr1 - 2230 12 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 895 1 181 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCCCTCATCTCATGTTCTT 9975 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.35.14 chr1 - 1832 9 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 2704 1 -1243 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCCCTCATCTCATGTTCTT 8541 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.35.15 chr1 - 1735 8 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 2902 1 -1045 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCCCTCATCTCATGTTCTT 8739 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.35.16 chr1 - 1580 7 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 3133 1 -814 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCCCTCATCTCATGTTCTT 8970 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.35.17 chr1 - 1272 4 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 4341 1 394 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCCCTCATCTCATGTTCTT 4206 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.35.18 chr1 - 1110 4 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 4503 1 556 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCCCTCATCTCATGTTCTT 4368 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.35.19 chr1 - 3204 22 novel_not_in_catalog ACAP3 novel 3793 24 NA NA 10 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CAGCCCTCATCTCATGTTCT -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.35.20 chr1 - 1985 10 incomplete-splice_match ACAP3 ENST00000467278.5 2725 14 2404 4 -1543 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGCAGCCCTCATCTCATGTT 8241 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.35.22 chr1 - 1774 4 novel_in_catalog ACAP3 novel 485 5 NA NA 23 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.35.23 chr1 - 1571 3 full-splice_match ACAP3 ENST00000478065.5 2393 3 822 0 -819 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 3956 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.35.24 chr1 - 979 5 full-splice_match ACAP3 ENST00000479108.5 485 5 -86 -408 14 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.36.1 chr1 + 1312 8 full-splice_match PUSL1 ENST00000379031.10 1257 8 -56 1 -56 0 alternative_5end TRUE canonical NA NA NA NA 95 22.751657 1.357013 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACCAGTTTGTTTCTTCAG NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 95 NA PB.36.2 chr1 + 1315 8 novel_not_in_catalog PUSL1 novel 1257 8 NA NA -42 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACCAGTTTGTTTCTTCAG NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.36.3 chr1 + 1326 8 novel_not_in_catalog PUSL1 novel 1257 8 NA NA -42 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACCAGTTTGTTTCTTCAG NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.36.4 chr1 + 1214 7 novel_in_catalog PUSL1 novel 1257 8 NA NA -41 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACCAGTTTGTTTCTTCAG NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.36.5 chr1 + 1348 8 novel_not_in_catalog PUSL1 novel 1257 8 NA NA -23 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACCAGTTTGTTTCTTCAG NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 5 NA PB.36.6 chr1 + 1200 7 novel_in_catalog PUSL1 novel 1257 8 NA NA -2 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.352876 0.525417 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACCAGTTTGTTTCTTCAG -25 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 14 NA PB.36.7 chr1 + 1451 7 novel_in_catalog PUSL1 novel 1257 8 NA NA -1 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACCAGTTTGTTTCTTCAG -24 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 6 NA PB.36.8 chr1 + 1363 7 novel_in_catalog PUSL1 novel 1257 8 NA NA 3 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGGAGACCAGTTTGTTTCTT -20 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.36.9 chr1 + 1291 8 novel_not_in_catalog PUSL1 novel 1257 8 NA NA 68 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAGACCAGTTTGTTTCTTCA 59 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.36.10 chr1 + 1289 7 novel_in_catalog PUSL1 novel 1257 8 NA NA -55 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACCAGTTTGTTTCTTCAG 12 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.36.11 chr1 + 1379 6 novel_in_catalog PUSL1 novel 1257 8 NA NA -43 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACCAGTTTGTTTCTTCAG 24 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 4 NA PB.36.12 chr1 + 1292 7 incomplete-splice_match PUSL1 ENST00000379031.10 1257 8 158 1 -33 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.873893 0.458471 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACCAGTTTGTTTCTTCAG 34 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 12 NA PB.37.1 chr1 - 934 6 incomplete-splice_match INTS11 ENST00000470030.6 2369 10 2483 13 -250 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTGGTACTCTCTTCTTGG 8124 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.37.2 chr1 - 1989 16 incomplete-splice_match INTS11 ENST00000458452.7 2571 19 3593 3 -152 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.873893 0.458471 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 3600 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.37.3 chr1 - 1267 9 incomplete-splice_match INTS11 ENST00000323275.10 2450 16 10729 -1 -67 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACTTGGTACTCTCTTCTTG 7182 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.37.4 chr1 - 2297 19 novel_in_catalog INTS11 novel 2629 19 NA NA -2 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.37.5 chr1 - 2222 17 novel_not_in_catalog INTS11 novel 2114 17 NA NA -2 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.37.6 chr1 - 2094 17 novel_not_in_catalog INTS11 novel 2114 17 NA NA -2 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.37.7 chr1 - 2105 17 full-splice_match INTS11 ENST00000435064.6 2114 17 0 9 0 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 237 56.759399 1.754038 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 237 NA PB.37.8 chr1 - 2068 17 novel_not_in_catalog INTS11 novel 2571 19 NA NA 0 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.37.9 chr1 - 1999 16 novel_in_catalog INTS11 novel 2114 17 NA NA 0 -3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.37.10 chr1 - 2004 17 novel_in_catalog INTS11 novel 2571 19 NA NA 0 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.37.11 chr1 - 1774 14 incomplete-splice_match INTS11 ENST00000323275.10 2450 16 5176 9 -99 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 5212 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.37.12 chr1 - 1723 4 incomplete-splice_match INTS11 ENST00000478641.5 3079 6 1577 3 157 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 7481 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.37.13 chr1 - 1601 13 incomplete-splice_match INTS11 ENST00000323275.10 2450 16 9026 9 6 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 9062 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.37.14 chr1 - 1527 12 novel_in_catalog INTS11 novel 2450 16 NA NA 14 -3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 5325 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.37.15 chr1 - 1447 11 incomplete-splice_match INTS11 ENST00000323275.10 2450 16 9702 9 222 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 9738 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.37.16 chr1 - 1392 11 incomplete-splice_match INTS11 ENST00000323275.10 2450 16 9757 9 -200 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 9793 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.37.17 chr1 - 979 7 incomplete-splice_match INTS11 ENST00000470030.6 2369 10 2342 24 -391 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACAAAAGACTACTTGGTAC 7983 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.37.18 chr1 - 990 4 incomplete-splice_match INTS11 ENST00000526797.5 659 7 21 3847 0 6 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAAACTTTAATTTTTTTTTT 20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.37.19 chr1 - 1076 4 full-splice_match INTS11 ENST00000429572.5 1104 4 25 3 1 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 32 7.663716 0.884439 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TTTTGTTGTGAAACTTTAAT 16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 32 NA PB.38.1 chr1 - 3031 15 full-splice_match DVL1 ENST00000378888.10 3305 15 273 1 -33 -1 alternative_5end TRUE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACAGATGTGTGGCCTGTGCC 9401 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.38.2 chr1 - 2549 13 incomplete-splice_match DVL1 ENST00000378891.9 2926 15 6715 3 -2032 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACAGATGTGTGGCCTGTGCC 7046 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.38.3 chr1 - 2067 8 incomplete-splice_match DVL1 ENST00000378891.9 2926 15 8975 3 53 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACAGATGTGTGGCCTGTGCC 9306 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.38.4 chr1 - 1723 4 incomplete-splice_match DVL1 ENST00000378891.9 2926 15 10480 3 790 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACAGATGTGTGGCCTGTGCC 1451 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.38.5 chr1 - 1309 3 incomplete-splice_match DVL1 ENST00000632445.1 785 6 1412 -1133 1412 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACAGATGTGTGGCCTGTGCC 2073 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.38.7 chr1 - 1890 6 incomplete-splice_match DVL1 ENST00000378891.9 2926 15 9462 4 -228 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GACAGATGTGTGGCCTGTGC 9793 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.38.8 chr1 - 1948 6 incomplete-splice_match DVL1 ENST00000378888.10 3305 15 9785 2 -211 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GACAGATGTGTGGCCTGTGC 9810 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.38.9 chr1 - 1408 2 incomplete-splice_match DVL1 ENST00000378891.9 2926 15 10964 4 1274 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GACAGATGTGTGGCCTGTGC 1935 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.38.12 chr1 - 1563 3 incomplete-splice_match DVL1 ENST00000378891.9 2926 15 10723 5 1033 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.352876 0.525417 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GGACAGATGTGTGGCCTGTG 1694 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.38.13 chr1 - 2295 11 incomplete-splice_match DVL1 ENST00000378891.9 2926 15 7416 9 -1331 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATGGGACAGATGTGTGGCC 7747 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.39.2 chr1 + 2153 3 full-splice_match CPTP ENST00000343938.9 2154 3 0 1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 124 29.696899 1.472711 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTGGGTGCCTGATTTCCTG -24 TRUE NA NA AATAAA -36 NA NA NA 124 NA PB.39.3 chr1 + 1956 2 full-splice_match CPTP ENST00000464957.1 1101 2 46 -901 0 -1 alternative_3end TRUE canonical NA NA NA NA 13 3.113385 0.493233 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTGGGTGCCTGATTTCCTG -24 TRUE NA NA AATAAA -36 NA NA NA 13 NA PB.39.4 chr1 + 1858 2 full-splice_match CPTP ENST00000464957.1 1101 2 144 -901 98 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTGGGTGCCTGATTTCCTG 21 FALSE NA NA AATAAA -36 NA NA NA 7 NA PB.39.5 chr1 + 2042 3 full-splice_match CPTP ENST00000343938.9 2154 3 111 1 111 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 26 6.226769 0.794263 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTGGGTGCCTGATTTCCTG -2 TRUE NA NA AATAAA -36 NA NA NA 26 NA PB.39.6 chr1 + 1934 3 full-splice_match CPTP ENST00000343938.9 2154 3 219 1 219 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTGGGTGCCTGATTTCCTG 106 FALSE NA NA AATAAA -36 NA NA NA 5 NA PB.39.7 chr1 + 1846 2 incomplete-splice_match CPTP ENST00000343938.9 2154 3 2040 1 1601 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTGGGTGCCTGATTTCCTG 1599 FALSE NA NA AATAAA -36 NA NA NA 5 NA PB.40.1 chr1 - 2669 8 novel_in_catalog MXRA8 novel 2293 10 NA NA -38 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACTTGTCCCAGGTATGCT 3204 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.40.2 chr1 - 2279 10 full-splice_match MXRA8 ENST00000309212.11 2293 10 13 1 1 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 36 8.621680 0.935592 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACTTGTCCCAGGTATGCT 4 TRUE NA NA AAAACA -29 NA NA NA 36 NA PB.40.3 chr1 - 1984 8 novel_not_in_catalog MXRA8 novel 2231 9 NA NA 0 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACTTGTCCCAGGTATGCT 3 TRUE NA NA AAAACA -30 NA NA NA 3 NA PB.40.4 chr1 - 1982 10 novel_in_catalog MXRA8 novel 2001 10 NA NA 0 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGACTTGTCCCAGGTATGC 3 TRUE NA NA AAAACA -30 NA NA NA 6 NA PB.40.5 chr1 - 1741 6 incomplete-splice_match MXRA8 ENST00000309212.11 2293 10 3424 2 -115 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGACTTGTCCCAGGTATGC 6666 FALSE NA NA GGGGCT -28 NA NA NA 2 NA PB.41.1 chr1 - 902 4 full-splice_match AURKAIP1 ENST00000378853.3 875 4 -19 -8 15 1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 238 56.998890 1.755866 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTGCGGGTCTGGAGCTCCAT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 238 NA PB.41.2 chr1 - 997 3 novel_in_catalog AURKAIP1 novel 753 4 NA NA -141 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CCTGCGGGTCTGGAGCTCCA 167 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.41.3 chr1 - 942 4 novel_in_catalog AURKAIP1 novel 798 4 NA NA 3 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CCTGCGGGTCTGGAGCTCCA 20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.41.4 chr1 - 1221 2 novel_in_catalog AURKAIP1 novel 1072 3 NA NA -3 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCCTGCGGGTCTGGAGCTCC -24 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.41.5 chr1 - 831 3 novel_in_catalog AURKAIP1 novel 753 4 NA NA -13 2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTTTCCTGCGGGTCTGGAGC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.41.6 chr1 - 758 4 full-splice_match AURKAIP1 ENST00000338338.10 753 4 -3 -2 -3 2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 310 74.242249 1.870651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTTTCCTGCGGGTCTGGAGC -24 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 310 NA PB.41.7 chr1 - 868 3 full-splice_match AURKAIP1 ENST00000338370.7 1072 3 199 5 186 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CCTTTCCTGCGGGTCTGGAG 557 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.41.8 chr1 - 1357 2 incomplete-splice_match AURKAIP1 ENST00000378853.3 875 4 -17 0 -17 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.113385 0.493233 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGCCTTTCCTGCGGGTCTGG -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.41.9 chr1 - 1105 3 novel_in_catalog AURKAIP1 novel 875 4 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGCCTTTCCTGCGGGTCTGG 371 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.41.10 chr1 - 1134 2 incomplete-splice_match AURKAIP1 ENST00000338370.7 1072 3 190 7 177 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGCCTTTCCTGCGGGTCTGG 548 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.41.11 chr1 - 1011 3 novel_in_catalog AURKAIP1 novel 753 4 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGCCTTTCCTGCGGGTCTGG -21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.41.12 chr1 - 1030 4 full-splice_match AURKAIP1 ENST00000338338.10 753 4 -278 1 -278 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 26 6.226769 0.794263 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGCCTTTCCTGCGGGTCTGG 30 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 26 NA PB.41.13 chr1 - 862 4 full-splice_match AURKAIP1 ENST00000338338.10 753 4 -111 2 -111 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 105 25.146568 1.400479 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CAGCCTTTCCTGCGGGTCTG -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 105 NA PB.41.14 chr1 - 1096 3 full-splice_match AURKAIP1 ENST00000338370.7 1072 3 -32 8 -16 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 81 19.398781 1.287774 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CAGCCTTTCCTGCGGGTCTG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 81 NA PB.41.15 chr1 - 896 4 novel_in_catalog AURKAIP1 novel 753 4 NA NA 0 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CAGCCTTTCCTGCGGGTCTG -21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.41.16 chr1 - 800 4 full-splice_match AURKAIP1 ENST00000321751.9 798 4 -8 6 -4 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 20 4.789823 0.680319 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CAGCCTTTCCTGCGGGTCTG 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 20 NA PB.43.1 chr1 - 2105 4 incomplete-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 2271 -1005 646 3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTTATGTTCTCCTAATTTGC 9069 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.43.2 chr1 - 5040 11 novel_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA -1 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATTTTATGTTCTCCTAAT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.43.3 chr1 - 3939 12 novel_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATTTTATGTTCTCCTAAT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.43.4 chr1 - 3110 11 full-splice_match CCNL2 ENST00000400809.8 3112 11 1 1 1 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATTTTATGTTCTCCTAAT -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.43.5 chr1 - 1954 2 incomplete-splice_match CCNL2 ENST00000463260.5 1941 3 854 -783 854 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATTTTATGTTCTCCTAAT 3227 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.43.9 chr1 - 1304 3 full-splice_match CCNL2 ENST00000463260.5 1941 3 650 -13 650 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGGACGTGGTAGGTGGTCG 3023 FALSE NA NA AAAACA -9 NA NA NA 2 NA PB.43.10 chr1 - 2329 11 full-splice_match CCNL2 ENST00000400809.8 3112 11 10 773 0 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.268805 0.721712 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTATGGACGTGGTAGGTGGT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 22 NA PB.43.11 chr1 - 1880 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 1419 -217 -10 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACATCCGGAGCGTTATGGAC 8217 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.43.12 chr1 - 3149 12 novel_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGGACATCCGGAGCGTTATG -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.43.13 chr1 - 2918 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 378 -214 378 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGGACATCCGGAGCGTTATG 7176 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.43.14 chr1 - 2509 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 787 -214 16 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGGACATCCGGAGCGTTATG 7585 FALSE NA NA TTTAAA -45 NA NA NA 2 NA PB.43.15 chr1 - 1979 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 1317 -214 -112 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGGACATCCGGAGCGTTATG 8115 FALSE NA NA ATTAAA -8 NA NA NA 8 NA PB.43.16 chr1 - 1411 4 incomplete-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 2174 -214 549 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGGACATCCGGAGCGTTATG 8972 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.43.19 chr1 - 1535 5 incomplete-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 1960 -211 335 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CTCAGGACATCCGGAGCGTT 8758 FALSE NA NA AAAACA -42 NA NA NA 7 NA PB.43.20 chr1 - 4248 11 novel_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 25 5.987278 0.777229 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCAGGACATCCGGAGCGT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 25 NA PB.43.21 chr1 - 3571 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 -279 -210 -88 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCAGGACATCCGGAGCGT 9437 FALSE NA NA AAGAAA -24 NA NA NA 3 NA PB.43.22 chr1 - 2444 12 novel_in_catalog CCNL2 novel 1598 12 NA NA 1 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCAGGACATCCGGAGCGT -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.43.23 chr1 - 1135 2 incomplete-splice_match CCNL2 ENST00000463260.5 1941 3 882 8 882 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCAGGACATCCGGAGCGT 3255 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.43.25 chr1 - 2697 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 594 -209 -177 -2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CACTCAGGACATCCGGAGCG 7392 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.43.26 chr1 - 4151 11 novel_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA -3 95 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 65 15.566923 1.192203 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GTTGAAAGTCGTATATTTTT -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 65 NA PB.43.27 chr1 - 2128 11 full-splice_match CCNL2 ENST00000400809.8 3112 11 0 984 0 13 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 43 10.298119 1.012758 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAACTCAGAACTTGAATCC -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 43 NA PB.43.28 chr1 - 1127 4 incomplete-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 2262 -18 637 13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAACTCAGAACTTGAATCC 9060 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.43.29 chr1 - 2361 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 731 -10 -40 5 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TATGTATGAAAACTCAGAAC 7529 FALSE NA NA AAAACA -8 NA NA NA 2 NA PB.43.30 chr1 - 2078 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 1014 -10 138 5 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TATGTATGAAAACTCAGAAC 7812 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.43.31 chr1 - 1210 4 incomplete-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 2171 -10 546 5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.592367 0.555381 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TATGTATGAAAACTCAGAAC 8969 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.43.32 chr1 - 907 2 incomplete-splice_match CCNL2 ENST00000463260.5 1941 3 910 208 910 5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TATGTATGAAAACTCAGAAC 3283 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.43.33 chr1 - 3986 11 novel_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA 41 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGCTATGTATGAAAACTC 8558 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.43.34 chr1 - 2825 11 novel_not_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA -1 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGCTATGTATGAAAACTC -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.43.35 chr1 - 2498 13 novel_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA 3 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGCTATGTATGAAAACTC 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.43.36 chr1 - 2233 12 novel_in_catalog CCNL2 novel 1598 12 NA NA 0 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.113385 0.493233 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGCTATGTATGAAAACTC -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.43.37 chr1 - 1959 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 1128 -5 252 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGCTATGTATGAAAACTC 7926 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.43.38 chr1 - 1829 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 1258 -5 -171 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGCTATGTATGAAAACTC 8056 FALSE NA NA AATGAA -13 NA NA NA 5 NA PB.43.39 chr1 - 1533 3 full-splice_match CCNL2 ENST00000463260.5 1941 3 195 213 195 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGCTATGTATGAAAACTC 2568 FALSE NA NA AAAACA -42 NA NA NA 5 NA PB.43.42 chr1 - 4149 12 novel_in_catalog CCNL2 novel 4452 13 NA NA 3 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TAAAGCTATGTATGAAAACT 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.43.43 chr1 - 3015 12 novel_not_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TAAAGCTATGTATGAAAACT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.43.44 chr1 - 2939 12 novel_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.352876 0.525417 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TAAAGCTATGTATGAAAACT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.43.45 chr1 - 2722 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 364 -4 364 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TAAAGCTATGTATGAAAACT 7162 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.43.46 chr1 - 1575 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 1511 -4 -10 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TAAAGCTATGTATGAAAACT 8309 FALSE NA NA AGTAAA -4 NA NA NA 6 NA PB.43.47 chr1 - 1006 3 full-splice_match CCNL2 ENST00000463260.5 1941 3 721 214 721 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TAAAGCTATGTATGAAAACT 3094 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.43.48 chr1 - 4115 11 novel_not_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA 0 1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AGTTAAAGCTATGTATGAAA -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.43.49 chr1 - 2152 7 novel_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA 19 1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AGTTAAAGCTATGTATGAAA 9544 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.43.50 chr1 - 4069 11 novel_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGTTAAAGCTATGTATGAA -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.43.51 chr1 - 3681 10 novel_in_catalog CCNL2 novel 2815 12 NA NA -255 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGTTAAAGCTATGTATGAA 9205 FALSE NA NA TATAAA -41 NA NA NA 2 NA PB.43.52 chr1 - 3342 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 -260 0 -69 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGTTAAAGCTATGTATGAA 9456 FALSE NA NA AAGAAA -5 NA NA NA 2 NA PB.43.53 chr1 - 3042 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 40 0 40 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGTTAAAGCTATGTATGAA 9756 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.43.55 chr1 - 2218 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 864 0 -12 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGTTAAAGCTATGTATGAA 7662 FALSE NA NA TATAAA -9 NA NA NA 5 NA PB.43.56 chr1 - 1368 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000418865.6 3082 6 1714 0 89 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGTTAAAGCTATGTATGAA 8512 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.43.58 chr1 - 1333 3 novel_in_catalog CCNL2 novel 3082 6 NA NA 602 -5 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AATACAAGTTAAAGCTATGT 9025 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.43.59 chr1 - 916 8 incomplete-splice_match CCNL2 ENST00000400809.8 3112 11 7 4631 0 811 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 GAAAAAAGAAAGCACGCTAT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.43.60 chr1 - 1821 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000408918.8 1186 6 -11 -624 0 -511 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATGAAATGTTCAGTATTATG -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.43.61 chr1 - 1184 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000408918.8 1186 6 -11 13 0 -13 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 100 23.949114 1.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAGTTTATATGTTCTCAAG -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 100 NA PB.43.62 chr1 - 1037 6 full-splice_match CCNL2 ENST00000408918.8 1186 6 -8 157 0 -157 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTGTGGGGTTATGTCATGA -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.44.1 chr1 + 2489 1 full-splice_match MRPL20-AS1 ENST00000692532.1 2483 1 -9 3 0 -3 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAACAAACTGCAAATTACTC -23 TRUE NA NA TATAAA -3 NA NA NA 8 NA PB.44.2 chr1 + 1730 3 full-splice_match MRPL20-AS1 ENST00000448629.7 1759 3 22 7 0 3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 99 23.709621 1.374925 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAAATTACTCTGTCTCTTTT -23 TRUE NA NA TATAAA -13 NA NA NA 99 NA PB.44.3 chr1 + 1666 3 full-splice_match MRPL20-AS1 ENST00000689419.1 1659 3 -11 4 0 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAACAAACTGCAAATTACTC -23 TRUE NA NA TATAAA -3 NA NA NA 6 NA PB.44.4 chr1 + 1574 2 novel_in_catalog MRPL20-AS1 novel 1759 3 NA NA 0 -3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAACAAACTGCAAATTACTC -23 TRUE NA NA TATAAA -3 NA NA NA 2 NA PB.44.5 chr1 + 2186 2 full-splice_match MRPL20-AS1 ENST00000418833.2 2196 2 13 -3 2 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.071349 0.609738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAACAAACTGCAAATTACTC -21 TRUE NA NA TATAAA -3 NA NA NA 17 NA PB.44.6 chr1 + 2143 2 full-splice_match MRPL20-AS1 ENST00000685968.1 2170 2 21 6 2 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAATTACTCTGTCTCTTTTC -21 TRUE NA NA TATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.44.7 chr1 + 1844 3 novel_not_in_catalog MRPL20-AS1 novel 1659 3 NA NA 0 3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAAATTACTCTGTCTCTTTT -12 TRUE NA NA TATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.44.8 chr1 + 1658 3 full-splice_match MRPL20-AS1 ENST00000444362.3 1759 3 95 6 38 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAATTACTCTGTCTCTTTTC 46 FALSE NA NA TATAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.44.9 chr1 + 1879 2 full-splice_match MRPL20-AS1 ENST00000418833.2 2196 2 320 -3 15 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAACAAACTGCAAATTACTC 41 FALSE NA NA TATAAA -3 NA NA NA 2 NA PB.44.10 chr1 + 1796 2 full-splice_match MRPL20-AS1 ENST00000418833.2 2196 2 413 -13 108 3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAAATTACTCTGTCTCTTTT 134 FALSE NA NA TATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.44.11 chr1 + 1488 2 full-splice_match MRPL20-AS1 ENST00000418833.2 2196 2 711 -3 -178 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAACAAACTGCAAATTACTC 432 FALSE NA NA TATAAA -3 NA NA NA 4 NA PB.44.12 chr1 + 1280 1 full-splice_match MRPL20-AS1 ENST00000687493.1 2209 1 915 14 331 -3 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAACAAACTGCAAATTACTC 941 FALSE NA NA TATAAA -3 NA NA NA 10 NA PB.44.13 chr1 + 1096 1 full-splice_match MRPL20-AS1 ENST00000687493.1 2209 1 1099 14 515 -3 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAACAAACTGCAAATTACTC 1125 FALSE NA NA TATAAA -3 NA NA NA 7 NA PB.44.14 chr1 + 1018 1 full-splice_match MRPL20-AS1 ENST00000687493.1 2209 1 1187 4 603 3 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAAATTACTCTGTCTCTTTT 1213 FALSE NA NA TATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.44.15 chr1 + 883 1 full-splice_match MRPL20-AS1 ENST00000687493.1 2209 1 1312 14 728 -3 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAACAAACTGCAAATTACTC 1338 FALSE NA NA TATAAA -3 NA NA NA 6 NA PB.45.1 chr1 - 1718 3 full-splice_match MRPL20 ENST00000487659.1 1693 3 -22 -3 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTTTTTAGAGTCATTTTCT -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.45.2 chr1 - 1057 4 novel_in_catalog MRPL20 novel 700 4 NA NA -13 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTTTTTAGAGTCATTTTCT -32 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.45.4 chr1 - 868 4 novel_not_in_catalog MRPL20 novel 700 4 NA NA 0 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTTTTTAGAGTCATTTTCT -19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.45.5 chr1 - 820 5 novel_in_catalog MRPL20 novel 700 4 NA NA 0 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTTTTTAGAGTCATTTTCT -19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.45.6 chr1 - 828 5 novel_not_in_catalog MRPL20 novel 700 4 NA NA 8 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTTTTTAGAGTCATTTTCT -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.45.7 chr1 - 699 4 full-splice_match MRPL20 ENST00000344843.12 700 4 0 1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 212 50.772118 1.705625 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTTTTTAGAGTCATTTTCT -19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 212 NA PB.45.8 chr1 - 1629 5 novel_not_in_catalog MRPL20 novel 1693 3 NA NA -7 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TTCAGTTTTTAGAGTCATTT -26 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.45.9 chr1 - 1376 4 novel_in_catalog MRPL20 novel 1693 3 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TTCAGTTTTTAGAGTCATTT -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.45.10 chr1 - 579 3 novel_in_catalog MRPL20 novel 1693 3 NA NA 3 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TTCAGTTTTTAGAGTCATTT -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.45.11 chr1 - 563 4 full-splice_match MRPL20 ENST00000344843.12 700 4 6 131 3 -127 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAGTTTGTTTGATTTATACT -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.46.1 chr1 + 1393 1 full-splice_match MRPL20-DT ENST00000607307.1 1523 1 195 -65 195 65 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA NA NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTTTGTCTCTGTGTCTTTT 1909 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.47.1 chr1 + 1816 2 novel_in_catalog VWA1 novel 2147 3 NA NA 1 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCCTGCAGTCTCGCTAGGA -13 TRUE NA NA AGTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.47.2 chr1 + 1976 3 full-splice_match VWA1 ENST00000338660.5 2147 3 170 1 3 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAGCCTGCAGTCTCGCTAGG -11 TRUE NA NA AGTAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.47.3 chr1 + 2369 3 full-splice_match VWA1 ENST00000476993.2 4492 3 6 2117 6 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.310840 0.634562 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCCTGCAGTCTCGCTAGGA -8 TRUE NA NA AGTAAA -15 NA NA NA 18 NA PB.48.1 chr1 - 1614 2 full-splice_match ANKRD65 ENST00000442470.1 876 2 -22 -716 -6 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTGGGTGTCTGAGAGGTT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.48.2 chr1 - 1538 3 full-splice_match ANKRD65 ENST00000520296.5 1632 3 89 5 -79 -5 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TACAACTGGGTGTCTGAGAG 1020 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.49.3 chr1 + 2116 15 fusion ATAD3B_ATAD3C novel 4314 14 NA NA 159 0 multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCGCCGTGTCTCTCTATTG 170 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.49.6 chr1 + 2440 16 full-splice_match ATAD3B ENST00000673477.1 4098 16 11 1647 -8 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.029314 0.701509 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCGCCGTGTCTCTCTATTG 4 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 21 NA PB.49.7 chr1 + 2356 17 novel_not_in_catalog ATAD3B novel 4098 16 NA NA -8 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCGCCGTGTCTCTCTATTG 4 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.49.9 chr1 + 1859 12 incomplete-splice_match ATAD3B ENST00000472194.6 4314 14 2869 1647 1846 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCGCCGTGTCTCTCTATTG 3046 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 9 NA PB.49.10 chr1 + 2838 11 novel_in_catalog ATAD3B novel 4314 14 NA NA 1849 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCGCCGTGTCTCTCTATTG 3049 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.49.11 chr1 + 1602 10 incomplete-splice_match ATAD3B ENST00000472194.6 4314 14 4568 1647 -891 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCGCCGTGTCTCTCTATTG 4745 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 7 NA PB.49.12 chr1 + 1393 8 incomplete-splice_match ATAD3B ENST00000472194.6 4314 14 7790 1645 1247 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CGCCGTGTCTCTCTATTGAC 7967 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 5 NA PB.49.13 chr1 + 1313 7 incomplete-splice_match ATAD3B ENST00000472194.6 4314 14 8139 1647 1596 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCGCCGTGTCTCTCTATTG 8316 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.49.14 chr1 + 1170 6 incomplete-splice_match ATAD3B ENST00000472194.6 4314 14 8590 1647 2047 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCGCCGTGTCTCTCTATTG 8767 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.49.15 chr1 + 1042 4 incomplete-splice_match ATAD3B ENST00000472194.6 4314 14 11201 1647 4658 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCGCCGTGTCTCTCTATTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 7 NA PB.49.16 chr1 + 1863 3 incomplete-splice_match ATAD3B ENST00000472194.6 4314 14 11362 1647 4819 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCGCCGTGTCTCTCTATTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.49.17 chr1 + 1543 3 incomplete-splice_match ATAD3B ENST00000472194.6 4314 14 11685 1644 5142 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCGTGTCTCTCTATTGACT NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.49.18 chr1 + 1369 3 incomplete-splice_match ATAD3B ENST00000485748.5 3233 10 6397 1 5313 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCGCCGTGTCTCTCTATTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.49.19 chr1 + 1233 3 incomplete-splice_match ATAD3B ENST00000485748.5 3233 10 6533 1 5449 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCGCCGTGTCTCTCTATTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 5 NA PB.49.20 chr1 + 894 3 incomplete-splice_match ATAD3B ENST00000485748.5 3233 10 6872 1 5788 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCGCCGTGTCTCTCTATTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 5 NA PB.51.1 chr1 - 1451 5 novel_not_in_catalog SSU72 novel 1284 5 NA NA 0 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTGTGCCTGGTCCTGAATT -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.51.2 chr1 - 1310 5 full-splice_match SSU72 ENST00000291386.4 1284 5 -27 1 -27 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 823 197.101196 2.294689 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTGTGCCTGGTCCTGAATT 484 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 823 NA PB.51.3 chr1 - 1283 5 novel_not_in_catalog SSU72 novel 1284 5 NA NA -10 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTGTGCCTGGTCCTGAATT -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.51.4 chr1 - 1061 5 full-splice_match SSU72 ENST00000291386.4 1284 5 222 1 -54 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 534 127.888260 2.106831 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTGTGCCTGGTCCTGAATT -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 534 NA PB.51.5 chr1 - 936 5 full-splice_match SSU72 ENST00000291386.4 1284 5 347 1 68 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTGTGCCTGGTCCTGAATT 858 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.51.6 chr1 - 881 4 incomplete-splice_match SSU72 ENST00000291386.4 1284 5 9963 1 9684 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTGTGCCTGGTCCTGAATT 9955 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.51.7 chr1 - 798 4 incomplete-splice_match SSU72 ENST00000291386.4 1284 5 10046 1 9767 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.352876 0.525417 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTGTGCCTGGTCCTGAATT 9816 FALSE NA NA CATAAA -32 NA NA NA 14 NA PB.51.8 chr1 - 615 2 incomplete-splice_match SSU72 ENST00000378726.1 2238 3 2498 0 2498 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTGTGCCTGGTCCTGAATT 2868 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.51.9 chr1 - 656 3 full-splice_match SSU72 ENST00000378726.1 2238 3 1581 1 1581 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATTGTGCCTGGTCCTGAAT 1951 FALSE NA NA GGGGCT -5 NA NA NA 2 NA PB.51.10 chr1 - 1044 5 full-splice_match SSU72 ENST00000291386.4 1284 5 2 238 2 -237 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AGATGAAAGCAATCAAGTTT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.51.12 chr1 - 2955 2 full-splice_match SSU72 ENST00000359060.5 4176 2 -277 1498 2 -1498 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.029314 0.701509 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCCTGACATCCTGTTTTTG -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 21 NA PB.51.15 chr1 - 1201 2 full-splice_match SSU72 ENST00000359060.5 4176 2 -257 3232 22 -3232 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATTTTGTTATAGTGAGTGAT 14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.52.1 chr1 - 1465 1 full-splice_match FNDC10 ENST00000422725.4 2124 1 660 -1 660 1 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGAGCTGTCTGTGTGTTATT 656 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.52.2 chr1 - 2010 1 full-splice_match FNDC10 ENST00000422725.4 2124 1 112 2 112 -2 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAGAGCTGTCTGTGTGTT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.52.3 chr1 - 1862 1 full-splice_match FNDC10 ENST00000422725.4 2124 1 260 2 260 -2 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAGAGCTGTCTGTGTGTT 256 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.52.4 chr1 - 1656 1 full-splice_match FNDC10 ENST00000422725.4 2124 1 466 2 466 -2 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAGAGCTGTCTGTGTGTT 462 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.52.5 chr1 - 1323 1 full-splice_match FNDC10 ENST00000422725.4 2124 1 799 2 799 -2 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAGAGCTGTCTGTGTGTT 795 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.52.6 chr1 - 1165 1 full-splice_match FNDC10 ENST00000422725.4 2124 1 957 2 957 -2 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAGAGCTGTCTGTGTGTT 953 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.52.7 chr1 - 1021 1 full-splice_match FNDC10 ENST00000422725.4 2124 1 1101 2 1101 -2 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAGAGCTGTCTGTGTGTT 1097 FALSE NA NA TATAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.53.1 chr1 + 2509 16 full-splice_match ATAD3A ENST00000378756.8 2481 16 -29 1 -29 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 194 46.461281 1.667091 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG 6444 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 194 NA PB.53.2 chr1 + 2326 15 novel_in_catalog ATAD3A novel 2481 16 NA NA -2 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG 3 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.53.4 chr1 + 2387 17 novel_not_in_catalog ATAD3A novel 2266 17 NA NA -4 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.310840 0.634562 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG 14 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 18 NA PB.53.5 chr1 + 2347 16 full-splice_match ATAD3A ENST00000378756.8 2481 16 133 1 -90 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG 138 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 8 NA PB.53.6 chr1 + 2337 16 full-splice_match ATAD3A ENST00000536055.6 2330 16 -8 1 -8 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG 365 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.53.7 chr1 + 2134 15 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000536055.6 2330 16 3516 1 -1024 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.113385 0.493233 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG 3504 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 13 NA PB.53.8 chr1 + 1988 13 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000536055.6 2330 16 5187 1 96 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.634403 0.420682 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG 5175 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 11 NA PB.53.9 chr1 + 1878 12 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000536055.6 2330 16 6442 1 1351 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.873893 0.458471 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG 6430 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 12 NA PB.53.11 chr1 + 1674 10 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000536055.6 2330 16 8037 1 2946 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.113385 0.493233 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG 8025 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 13 NA PB.53.12 chr1 + 1516 9 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000536055.6 2330 16 10321 1 -1104 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.634403 0.420682 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 11 NA PB.53.13 chr1 + 1588 10 novel_in_catalog ATAD3A novel 2612 16 NA NA -1098 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.53.14 chr1 + 1378 7 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000536055.6 2330 16 11341 1 -84 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.831858 0.583409 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 16 NA PB.53.15 chr1 + 1264 6 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000536055.6 2330 16 11763 1 338 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.113385 0.493233 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 13 NA PB.53.16 chr1 + 1170 6 novel_not_in_catalog ATAD3A novel 830 8 NA NA 381 1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TGCCCTGTCTGTCTCTTGGC NA FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.53.17 chr1 + 1183 6 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000536055.6 2330 16 11844 1 419 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.53.18 chr1 + 1107 4 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000536055.6 2330 16 13931 1 2506 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.873893 0.458471 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 12 NA PB.53.19 chr1 + 981 3 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000400830.4 830 8 3795 -542 3795 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 5 NA PB.53.20 chr1 + 913 3 incomplete-splice_match ATAD3A ENST00000400830.4 830 8 3863 -542 3863 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTGCCCTGTCTGTCTCTTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 5 NA PB.54.1 chr1 + 998 2 full-splice_match MIB2 ENST00000477990.1 2821 2 -67 1890 -5 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAGGATTTGGTTTCTAT NA FALSE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 2 NA PB.54.2 chr1 + 3237 20 full-splice_match MIB2 ENST00000355826.10 3206 20 -34 3 12 -1 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GGACGTTGCCTCTGCTGTCT NA FALSE NA NA TATAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.54.3 chr1 + 1049 2 full-splice_match MIB2 ENST00000507082.1 1578 2 -49 578 -14 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAGGATTTGGTTTCTAT -26 TRUE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 3 NA PB.54.4 chr1 + 3300 20 novel_in_catalog MIB2 novel 3252 21 NA NA -7 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACGTTGCCTCTGCTGTCTGC -19 TRUE NA NA TATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.54.5 chr1 + 3065 19 incomplete-splice_match MIB2 ENST00000355826.10 3206 20 1014 1 203 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACGTTGCCTCTGCTGTCTGC 251 FALSE NA NA TATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.54.6 chr1 + 1537 8 incomplete-splice_match MIB2 ENST00000514234.5 2562 16 3752 1 32 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GACGTTGCCTCTGCTGTCTG 2465 FALSE NA NA TATAAA -15 NA NA NA 7 NA PB.54.7 chr1 + 1400 8 incomplete-splice_match MIB2 ENST00000514234.5 2562 16 3890 0 170 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACGTTGCCTCTGCTGTCTGC 34 FALSE NA NA TATAAA -16 NA NA NA 4 NA PB.54.8 chr1 + 1204 7 incomplete-splice_match MIB2 ENST00000514234.5 2562 16 4274 1 -413 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GACGTTGCCTCTGCTGTCTG 29 FALSE NA NA TATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.54.9 chr1 + 742 3 novel_in_catalog MIB2 novel 2562 16 NA NA 98 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACGTTGCCTCTGCTGTCTGC 7 TRUE NA NA TATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.55.1 chr1 - 1487 1 full-splice_match ENSG00000272106 ENST00000607222.1 2038 1 546 5 546 -5 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACCAACTGTTTTTTGTTTTG 921 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.55.2 chr1 - 1089 1 full-splice_match ENSG00000272106 ENST00000607222.1 2038 1 944 5 944 -5 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACCAACTGTTTTTTGTTTTG 1319 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.55.3 chr1 - 2017 1 full-splice_match ENSG00000272106 ENST00000607222.1 2038 1 15 6 15 -6 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACCAACTGTTTTTTGTTTT 5 TRUE NA NA GGGGCT -40 NA NA NA 10 NA PB.56.1 chr1 + 1348 7 full-splice_match MMP23B ENST00000378675.7 1309 7 -40 1 -24 -1 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGGCTCCTCGCTCATTCTT 8 TRUE NA NA GATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.56.2 chr1 + 1234 8 full-splice_match MMP23B ENST00000356026.10 1248 8 13 1 7 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGGCTCCTCGCTCATTCTT 4 TRUE NA NA GATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.57.1 chr1 - 2988 20 full-splice_match CDK11B ENST00000341832.11 2992 20 0 4 0 -4 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAAGCTCCCCGTGTCGTCCT -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.57.2 chr1 - 1985 12 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000341832.11 2992 20 17233 4 17201 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAAGCTCCCCGTGTCGTCCT 7865 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.57.3 chr1 - 1745 10 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000341832.11 2992 20 18616 4 18584 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAAGCTCCCCGTGTCGTCCT 9248 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.57.4 chr1 - 1181 5 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000341832.11 2992 20 22011 4 21979 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAAGCTCCCCGTGTCGTCCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.57.5 chr1 - 1436 8 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000341832.11 2992 20 21224 7 21192 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGGAAAGCTCCCCGTGTCGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.57.6 chr1 - 1009 4 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000341832.11 2992 20 22277 8 22245 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAGGAAAGCTCCCCGTGTCG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.57.7 chr1 - 2666 20 full-splice_match CDK11B ENST00000407249.7 2677 20 8 3 0 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAGAGCTGTGTTTTCTCCG -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.57.8 chr1 - 2594 20 full-splice_match CDK11B ENST00000341832.11 2992 20 33 365 1 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAGAGCTGTGTTTTCTCCG 16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.57.9 chr1 - 1533 12 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000407249.7 2677 20 17332 3 17292 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.634403 0.420682 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAGAGCTGTGTTTTCTCCG 7956 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.57.10 chr1 - 1240 9 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000407249.7 2677 20 20454 3 20414 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAGAGCTGTGTTTTCTCCG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.57.12 chr1 - 1090 8 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000407249.7 2677 20 21220 3 21180 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAGAGCTGTGTTTTCTCCG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.57.13 chr1 - 599 3 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000407249.7 2677 20 22538 3 22498 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAGAGCTGTGTTTTCTCCG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.57.14 chr1 - 1240 10 novel_not_in_catalog CDK11B novel 2534 21 NA NA -116 691 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAGAACGAGAAAATGAAAAC 63 FALSE NA NA AAGAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.57.17 chr1 - 1186 7 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000407249.7 2677 20 59 6420 19 -235 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 ATAAGTAAAAGAAGAGAAAA 238 FALSE NA NA AAGAAA -33 NA NA NA 2 NA PB.57.18 chr1 - 906 8 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000340677.9 2534 21 45 6610 5 -576 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTGAGTCTTTTCTGGGGGA 20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.57.20 chr1 - 1121 7 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000407249.7 2677 20 -255 6799 -255 -614 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTGAGGCCAGGCCGGCGCCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.57.21 chr1 - 843 7 incomplete-splice_match CDK11B ENST00000407249.7 2677 20 23 6799 15 -614 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.310840 0.634562 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTGAGGCCAGGCCGGCGCCT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.57.33 chr1 - 2920 9 full-splice_match SLC35E2B ENST00000611123.1 5948 9 221 2807 202 -504 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AATAATTCTGACTCATTAAC 314 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.57.34 chr1 - 3259 9 full-splice_match SLC35E2B ENST00000611123.1 5948 9 -127 2816 -60 -513 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAACAGAGCAATAATTCTGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.57.35 chr1 - 3176 9 full-splice_match SLC35E2B ENST00000611123.1 5948 9 -44 2816 23 -513 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAACAGAGCAATAATTCTGA 49 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.57.36 chr1 - 2351 7 incomplete-splice_match SLC35E2B ENST00000611123.1 5948 9 16561 2816 -6028 -513 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAACAGAGCAATAATTCTGA 2662 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.57.42 chr1 - 1194 6 incomplete-splice_match CDK11A ENST00000356200.7 2653 19 18593 -344 15 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAAGCTCCCCGTGTCGTCCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.57.44 chr1 - 1185 8 incomplete-splice_match CDK11A ENST00000356200.7 2653 19 17802 3 -5 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAGAGCTGTGTTTTCTCCG NA FALSE NA NA AATACA -39 NA NA NA 2 NA PB.57.45 chr1 - 1132 7 incomplete-splice_match ENSG00000268575 ENST00000598846.1 5079 20 32659 -3 32659 3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAGAGCTGTGTTTTCTCCG NA FALSE NA NA AATACA -39 NA NA NA 2 NA PB.57.49 chr1 - 877 7 incomplete-splice_match CDK11A ENST00000460465.5 2333 20 -10 6598 -10 -4871 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTGAGTCTTTTCTGGGGGAT -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.57.50 chr1 - 829 7 incomplete-splice_match CDK11A ENST00000358779.9 2419 20 -31 6637 2 -4910 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTGAGGCCAGGCCGGCGCCT -31 TRUE NA NA GGGGCT -8 NA NA NA 8 NA PB.57.53 chr1 - 643 4 novel_in_catalog CDK11A novel 700 5 NA NA 3 -210 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAGAGAAAAGAAAAATGT 267 FALSE NA NA AAGAAA -25 NA NA NA 3 NA PB.57.70 chr1 - 1893 7 novel_in_catalog SLC35E2A novel 1430 6 NA NA -73 -28 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAAAAAAAAACTTTTTTT 5 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.57.71 chr1 - 1436 6 full-splice_match SLC35E2A ENST00000246421.4 1430 6 -34 28 -34 -28 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAAAAAAAAACTTTTTTT 44 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.57.72 chr1 - 1192 6 full-splice_match SLC35E2A ENST00000246421.4 1430 6 210 28 137 -28 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAAAAAAAAACTTTTTTT 288 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.58.1 chr1 - 3452 12 novel_in_catalog NADK novel 3235 12 NA NA 0 -7 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.58.2 chr1 - 3232 12 novel_not_in_catalog NADK novel 3235 12 NA NA -340 -7 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 9990 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.58.3 chr1 - 3178 12 full-splice_match NADK ENST00000341426.9 3235 12 50 7 0 -7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 47 11.256083 1.051387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 47 NA PB.58.4 chr1 - 3123 12 full-splice_match NADK ENST00000341426.9 3235 12 105 7 54 -7 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 9052 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.58.5 chr1 - 3182 2 full-splice_match NADK ENST00000497615.1 534 2 316 -2964 -197 -7 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 4308 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.58.6 chr1 - 3026 11 novel_in_catalog NADK novel 3235 12 NA NA -6 -7 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.58.7 chr1 - 2839 10 novel_in_catalog NADK novel 1722 10 NA NA -1254 -7 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 6580 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.58.8 chr1 - 2912 11 incomplete-splice_match NADK ENST00000341426.9 3235 12 13158 7 -6737 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 1097 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.58.9 chr1 - 2778 10 novel_not_in_catalog NADK novel 1722 10 NA NA -3350 -7 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 4484 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.58.10 chr1 - 2592 8 incomplete-splice_match NADK ENST00000342348.9 1722 10 1988 -1232 21 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 9822 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.58.11 chr1 - 2454 7 incomplete-splice_match NADK ENST00000342348.9 1722 10 2285 -1232 37 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 2598 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.58.12 chr1 - 2312 5 incomplete-splice_match NADK ENST00000342348.9 1722 10 3883 -1232 174 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 4196 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.58.13 chr1 - 2193 5 incomplete-splice_match NADK ENST00000342348.9 1722 10 4002 -1232 -190 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 4315 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.58.14 chr1 - 2108 4 incomplete-splice_match NADK ENST00000342348.9 1722 10 4247 -1232 55 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 4560 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.58.15 chr1 - 1907 2 incomplete-splice_match NADK ENST00000498806.1 269 3 732 -1736 732 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.113385 0.493233 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAATAAGCTGGGTTAATAA 5237 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.58.23 chr1 - 2455 7 novel_in_catalog NADK novel 1722 10 NA NA -1 -8 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 GAAAATAAGCTGGGTTAATA 9800 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.58.25 chr1 - 3083 12 novel_not_in_catalog NADK novel 3235 12 NA NA -340 -10 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TAGAAAATAAGCTGGGTTAA 9990 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.58.27 chr1 - 1904 12 full-splice_match NADK ENST00000341426.9 3235 12 43 1288 -7 -49 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 47 11.256083 1.051387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAACCTTCCTTGAGCTGC 13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 47 NA PB.58.28 chr1 - 1576 11 incomplete-splice_match NADK ENST00000341426.9 3235 12 13223 1278 -6672 -39 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTTGAGCTGCCATGCTTTTC 1162 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.58.29 chr1 - 1893 12 novel_in_catalog NADK novel 3235 12 NA NA 38 -48 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAACCTTCCTTGAGCTGCC 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.58.30 chr1 - 1037 5 incomplete-splice_match NADK ENST00000342348.9 1722 10 3878 48 169 -48 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAACCTTCCTTGAGCTGCC 4191 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.58.31 chr1 - 2042 12 novel_in_catalog NADK novel 3235 12 NA NA -112 -49 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAACCTTCCTTGAGCTGC 9044 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.58.32 chr1 - 1810 12 full-splice_match NADK ENST00000341991.7 3098 12 0 1288 0 -49 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAACCTTCCTTGAGCTGC 8627 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.58.33 chr1 - 1698 11 incomplete-splice_match NADK ENST00000341426.9 3235 12 13091 1288 -6804 -49 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAACCTTCCTTGAGCTGC 1030 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.58.34 chr1 - 1399 9 incomplete-splice_match NADK ENST00000342348.9 1722 10 1328 49 -19 -49 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAACCTTCCTTGAGCTGC 9162 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.58.35 chr1 - 1180 7 incomplete-splice_match NADK ENST00000342348.9 1722 10 2278 49 30 -49 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.873893 0.458471 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAACCTTCCTTGAGCTGC 2591 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.58.36 chr1 - 909 5 incomplete-splice_match NADK ENST00000342348.9 1722 10 4005 49 -187 -49 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAACCTTCCTTGAGCTGC 4318 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.61.2 chr1 - 2786 9 novel_in_catalog GNB1 novel 3145 11 NA NA 75 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTTTGGTGTGGTGATTATT 6870 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.61.4 chr1 - 2980 12 novel_not_in_catalog GNB1 novel 3163 12 NA NA 127 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GACTTTGGTGTGGTGATTAT 1481 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.61.5 chr1 - 2931 11 full-splice_match GNB1 ENST00000610897.4 3145 11 211 3 60 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GACTTTGGTGTGGTGATTAT 849 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.61.6 chr1 - 2402 6 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 86635 2 -10255 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GACTTTGGTGTGGTGATTAT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.61.7 chr1 - 2216 4 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 100576 2 3686 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 27 6.466260 0.810653 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GACTTTGGTGTGGTGATTAT 73 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 27 NA PB.61.10 chr1 - 3062 12 full-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 97 4 -24 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGGACTTTGGTGTGGTGATT 765 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.61.11 chr1 - 2472 6 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 86563 4 -10327 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.634403 0.420682 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGGACTTTGGTGTGGTGATT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.61.12 chr1 - 1916 3 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 101999 4 5109 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.550332 0.658043 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGGACTTTGGTGTGGTGATT 1496 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.61.13 chr1 - 2974 12 full-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 184 5 63 -5 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.310840 0.634562 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGGACTTTGGTGTGGTGAT 852 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.61.14 chr1 - 2931 12 novel_in_catalog GNB1 novel 3163 12 NA NA -3 -5 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 20 4.789823 0.680319 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGGACTTTGGTGTGGTGAT 1351 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 20 NA PB.61.15 chr1 - 2774 10 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 65655 5 122 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGGACTTTGGTGTGGTGAT 6917 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.61.17 chr1 - 2036 3 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 101878 5 4988 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.634403 0.420682 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGGACTTTGGTGTGGTGAT 16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.61.23 chr1 - 2628 8 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 75295 6 2594 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.831858 0.583409 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAGGGACTTTGGTGTGGTGA 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.61.26 chr1 - 3156 12 full-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 0 7 0 -7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGAGGGACTTTGGTGTGGTG 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.61.32 chr1 - 2160 8 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 75239 530 2538 -530 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAAAAAAAAAGTTCTGTT 2455 FALSE NA NA AATAAA -25 NA NA NA 9 NA PB.61.43 chr1 - 1470 12 novel_in_catalog GNB1 novel 3163 12 NA NA -3 1235 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACTTGAGTGTAATTGTCA 1351 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.61.44 chr1 - 1368 10 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 65600 1466 67 1235 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACTTGAGTGTAATTGTCA 6862 FALSE NA NA AATAAA -8 NA NA NA 8 NA PB.61.45 chr1 - 1277 9 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 73212 1466 511 1235 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.634403 0.420682 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACTTGAGTGTAATTGTCA 428 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.61.46 chr1 - 984 6 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 86582 1473 -10308 1228 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.592367 0.555381 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AGAAGGTAAACTTGAGTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.61.47 chr1 - 792 4 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 100536 1466 3646 1235 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACTTGAGTGTAATTGTCA 33 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.61.48 chr1 - 722 4 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 100606 1466 3716 1235 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACTTGAGTGTAATTGTCA 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.61.49 chr1 - 1600 12 full-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 92 1471 -29 1230 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.071349 0.609738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAGGTAAACTTGAGTGTAAT 760 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.61.50 chr1 - 1542 11 full-splice_match GNB1 ENST00000610897.4 3145 11 131 1472 -20 1230 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAGGTAAACTTGAGTGTAAT 769 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.61.51 chr1 - 1490 12 full-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 202 1471 -49 1230 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 28 6.705751 0.826447 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAGGTAAACTTGAGTGTAAT 870 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 28 NA PB.61.52 chr1 - 1166 8 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 75292 1471 2591 1230 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAGGTAAACTTGAGTGTAAT 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.61.53 chr1 - 881 5 incomplete-splice_match GNB1 ENST00000378609.9 3163 12 97794 1471 904 1230 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAGGTAAACTTGAGTGTAAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.61.54 chr1 - 1548 12 novel_in_catalog GNB1 novel 3163 12 NA NA -88 1228 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AGAAGGTAAACTTGAGTGTA 1266 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.63.1 chr1 - 1620 2 full-splice_match TMEM52 ENST00000378602.3 1118 2 -502 0 -20 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CTCTGCCTATGTGGGAAGGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.63.2 chr1 - 1411 2 full-splice_match TMEM52 ENST00000378602.3 1118 2 -294 1 167 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCTCTGCCTATGTGGGAAGG 183 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.63.3 chr1 - 1306 3 incomplete-splice_match TMEM52 ENST00000602604.1 878 4 173 -508 162 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCTCTGCCTATGTGGGAAGG 178 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.63.4 chr1 - 1491 3 novel_in_catalog TMEM52 novel 690 4 NA NA 0 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGTGGTCTCTGCCTATGTG 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.64.1 chr1 + 2673 18 novel_in_catalog PRKCZ novel 2385 18 NA NA 18 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATGTGGAAGCTCCTCTGATG 7 TRUE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.64.2 chr1 + 2314 18 full-splice_match PRKCZ ENST00000378567.8 2385 18 66 5 -8 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 32 7.663716 0.884439 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGGAAGCTCCTCTGATGCCT -2 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 32 NA PB.64.3 chr1 + 2129 18 full-splice_match PRKCZ ENST00000378567.8 2385 18 251 5 -146 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGGAAGCTCCTCTGATGCCT 183 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.64.5 chr1 + 1848 15 novel_in_catalog PRKCZ novel 1859 8 NA NA 132 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATGTGGAAGCTCCTCTGATG 154 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.64.6 chr1 + 2141 15 novel_in_catalog PRKCZ novel 1859 8 NA NA 50 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAAGCTCCTCTGATGCCTTT -17 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.64.7 chr1 + 1982 15 novel_in_catalog PRKCZ novel 1859 8 NA NA -63 -4 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GATGTGGAAGCTCCTCTGAT 1 TRUE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.64.8 chr1 + 1606 12 incomplete-splice_match PRKCZ ENST00000479263.5 1747 13 1575 8 639 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATGTGGAAGCTCCTCTGATG 639 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 4 NA PB.64.9 chr1 + 1428 10 incomplete-splice_match PRKCZ ENST00000479263.5 1747 13 6387 2 5451 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGCTCCTCTGATGCCTTTT 1746 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.64.10 chr1 + 2040 8 full-splice_match PRKCZ ENST00000505322.5 1859 8 -188 7 -188 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GATGTGGAAGCTCCTCTGAT NA FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.64.11 chr1 + 1151 8 full-splice_match PRKCZ ENST00000505322.5 1859 8 701 7 574 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GATGTGGAAGCTCCTCTGAT NA FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 5 NA PB.65.1 chr1 - 1388 3 full-splice_match FAAP20 ENST00000400919.7 1413 3 16 9 -8 -6 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATCTGCCTAGTATTTGACT 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.65.2 chr1 - 1116 2 incomplete-splice_match FAAP20 ENST00000400919.7 1413 3 1069 5 402 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGCCTAGTATTTGACTGCCA 1356 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.65.3 chr1 - 1510 4 full-splice_match FAAP20 ENST00000400918.7 811 4 0 -699 0 2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 28 6.705751 0.826447 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CATTTCAATCTGCCTAGTAT 311 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 28 NA PB.65.5 chr1 - 1030 4 full-splice_match FAAP20 ENST00000400918.7 811 4 7 -226 -3 226 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GACTGGTCGATCCTCTTTAT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.65.6 chr1 - 1021 3 full-splice_match FAAP20 ENST00000476803.1 701 3 -301 -19 225 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AACGTCTGCCGCTTTTCTTT 548 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.65.7 chr1 - 1326 4 incomplete-splice_match FAAP20 ENST00000428120.5 2313 8 52 5073 50 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAACGTCTGCCGCTTTTCTT 373 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.65.8 chr1 - 1199 3 full-splice_match FAAP20 ENST00000476803.1 701 3 -480 -18 46 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAACGTCTGCCGCTTTTCTT 369 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.65.9 chr1 - 711 4 full-splice_match FAAP20 ENST00000378546.9 727 4 13 3 -8 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 24 5.747787 0.759501 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAACGTCTGCCGCTTTTCTT 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 24 NA PB.65.10 chr1 - 833 5 incomplete-splice_match FAAP20 ENST00000428120.5 2313 8 -10 5074 0 -4 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.634403 0.420682 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAAACGTCTGCCGCTTTTCT 311 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.65.11 chr1 - 657 4 novel_not_in_catalog FAAP20 novel 727 4 NA NA 3 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAAACGTCTGCCGCTTTTCT 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.65.12 chr1 - 1554 4 full-splice_match FAAP20 ENST00000420515.1 1544 4 -11 1 -8 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTGGACATTTTGTGCATT 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.72.1 chr1 - 1881 2 incomplete-splice_match PEX10 ENST00000288774.8 2905 6 6067 4 3507 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAACGTTGAGAGTATTTCT 7342 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.72.2 chr1 - 2083 3 incomplete-splice_match PEX10 ENST00000288774.8 2905 6 5764 5 3204 5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAACGTTGAGAGTATTTC 7039 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.72.3 chr1 - 2811 6 full-splice_match PEX10 ENST00000447513.7 2835 6 17 7 -7 -7 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATCACTTGGTAAAACGT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.72.4 chr1 - 1984 6 full-splice_match PEX10 ENST00000447513.7 2835 6 21 830 -3 34 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 127 30.415373 1.483093 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AACACAAGATGGAACTTGAG 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 127 NA PB.72.5 chr1 - 2150 6 novel_not_in_catalog PEX10 novel 2905 6 NA NA -80 15 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATGTGGGTACGTTACTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.72.6 chr1 - 2022 6 novel_not_in_catalog PEX10 novel 2905 6 NA NA -3 15 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.268805 0.721712 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATGTGGGTACGTTACTA 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 22 NA PB.72.7 chr1 - 2043 6 novel_in_catalog PEX10 novel 2835 6 NA NA -30 15 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.113385 0.493233 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATGTGGGTACGTTACTA 12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.72.8 chr1 - 1699 4 incomplete-splice_match PEX10 ENST00000447513.7 2835 6 3738 849 1178 15 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATGTGGGTACGTTACTA 5013 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.72.9 chr1 - 1532 4 incomplete-splice_match PEX10 ENST00000447513.7 2835 6 3905 849 1345 15 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATGTGGGTACGTTACTA 5180 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.72.10 chr1 - 1400 4 incomplete-splice_match PEX10 ENST00000447513.7 2835 6 4037 849 1477 15 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATGTGGGTACGTTACTA 5312 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.72.11 chr1 - 1212 3 incomplete-splice_match PEX10 ENST00000447513.7 2835 6 5781 849 3221 15 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATGTGGGTACGTTACTA 7056 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.72.13 chr1 - 1101 2 incomplete-splice_match PEX10 ENST00000447513.7 2835 6 5991 850 3431 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CAAAATGTGGGTACGTTACT 7266 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.73.1 chr1 + 1532 8 novel_not_in_catalog RER1 novel 695 8 NA NA -24 4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TTGAGATTATTTTGACACAT 6400 FALSE NA NA TATAAA -22 NA NA NA 8 NA PB.73.2 chr1 + 955 7 full-splice_match RER1 ENST00000378512.5 1404 7 -86 535 -24 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGGGAGTCAAATTTTCTTTT 6400 FALSE NA NA CATAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.73.3 chr1 + 3146 8 novel_not_in_catalog RER1 novel 695 8 NA NA -21 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TACTTCTGAATTACTTCTCA 6403 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.73.4 chr1 + 1399 7 full-splice_match RER1 ENST00000605895.6 3028 7 -34 1663 -21 22 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 175 41.910946 1.622327 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATTTCTTTGATACGTAGAGT 6403 FALSE NA NA TATAAA -40 NA NA NA 175 NA PB.73.5 chr1 + 921 7 full-splice_match RER1 ENST00000605895.6 3028 7 -28 2135 -15 74 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 312 74.721230 1.873444 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATCGCATGGATTTCTTTT 6409 FALSE NA NA AAGAAA -15 NA NA NA 312 NA PB.73.6 chr1 + 1036 8 novel_not_in_catalog RER1 novel 1404 7 NA NA -15 4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGTCAAATTTTCTTTTTAAA 6409 FALSE NA NA CATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.73.7 chr1 + 3200 8 novel_not_in_catalog RER1 novel 695 8 NA NA -12 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCTGAATTACTTCTCAA 6412 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.73.8 chr1 + 978 8 novel_not_in_catalog RER1 novel 695 8 NA NA -12 10 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGGAGCTTCAATGATT 6412 FALSE NA NA CATAAA -35 NA NA NA 2 NA PB.73.9 chr1 + 1538 9 novel_not_in_catalog RER1 novel 695 8 NA NA -3 11 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATTTTGACACATTTCTTTG -20 TRUE NA NA TATAAA -29 NA NA NA 2 NA PB.73.10 chr1 + 996 9 novel_not_in_catalog RER1 novel 695 8 NA NA -3 4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGTCAAATTTTCTTTTTAAA -20 TRUE NA NA CATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.73.11 chr1 + 3124 8 novel_not_in_catalog RER1 novel 3028 7 NA NA -1 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CTTCTGAATTACTTCTCAAC -18 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.73.12 chr1 + 1464 7 full-splice_match RER1 ENST00000378512.5 1404 7 -63 3 -1 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAATTGTTTGAGATTATTTT -18 TRUE NA NA TATAAA -15 NA NA NA 5 NA PB.73.13 chr1 + 1441 8 novel_not_in_catalog RER1 novel 695 8 NA NA -1 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.352876 0.525417 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATTGTTTGAGATTATTTTG -18 TRUE NA NA TATAAA -16 NA NA NA 14 NA PB.73.14 chr1 + 978 8 novel_not_in_catalog RER1 novel 695 8 NA NA 1 74 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 59 14.129976 1.150141 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATCGCATGGATTTCTTTT -3 TRUE NA NA AAGAAA -15 NA NA NA 59 NA PB.73.15 chr1 + 1442 8 novel_not_in_catalog RER1 novel 695 8 NA NA 0 4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TTGAGATTATTTTGACACAT -17 TRUE NA NA TATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.73.16 chr1 + 1053 8 novel_not_in_catalog RER1 novel 695 8 NA NA 1 74 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 32 7.663716 0.884439 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATCGCATGGATTTCTTTT -16 TRUE NA NA AAGAAA -15 NA NA NA 32 NA PB.73.17 chr1 + 3038 7 full-splice_match RER1 ENST00000605895.6 3028 7 -11 1 2 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 48 11.495574 1.060531 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCTGAATTACTTCTCAA -15 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 48 NA PB.73.18 chr1 + 901 8 novel_not_in_catalog RER1 novel 695 8 NA NA 2 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGGGAGTCAAATTTTCTTTT -15 TRUE NA NA CATAAA -14 NA NA NA 7 NA PB.73.20 chr1 + 1060 9 novel_not_in_catalog RER1 novel 695 8 NA NA -2 9 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TAAAAAGGAGCTTCAATGAT -6 TRUE NA NA CATAAA -34 NA NA NA 2 NA PB.73.21 chr1 + 1430 8 novel_not_in_catalog RER1 novel 695 8 NA NA 16 4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TTGAGATTATTTTGACACAT 61 FALSE NA NA TATAAA -22 NA NA NA 6 NA PB.73.22 chr1 + 803 7 novel_not_in_catalog RER1 novel 2469 6 NA NA 154 74 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATCGCATGGATTTCTTTT 1483 FALSE NA NA AAGAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.73.23 chr1 + 1212 6 full-splice_match RER1 ENST00000488353.2 2469 6 1796 -539 1796 4 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TTGAGATTATTTTGACACAT 3956 FALSE NA NA TATAAA -22 NA NA NA 4 NA PB.73.24 chr1 + 1023 4 incomplete-splice_match RER1 ENST00000488353.2 2469 6 5416 -532 -2530 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAATTGTTTGAGATTATTTT 7576 FALSE NA NA TATAAA -15 NA NA NA 7 NA PB.73.25 chr1 + 911 3 incomplete-splice_match RER1 ENST00000488353.2 2469 6 6878 -540 -1068 5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGAGATTATTTTGACACATT 9038 FALSE NA NA TATAAA -23 NA NA NA 2 NA PB.73.26 chr1 + 871 2 full-splice_match RER1 ENST00000462129.1 585 2 260 -546 260 22 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATTTCTTTGATACGTAGAGT NA FALSE NA NA TATAAA -40 NA NA NA 2 NA PB.74.1 chr1 + 1102 1 full-splice_match ENSG00000272449 ENST00000606645.2 1061 1 -43 2 -43 -2 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA NA NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTTCTGCCTGAGTTTCTG NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.75.1 chr1 + 1490 9 novel_in_catalog TNFRSF14 novel 1702 8 NA NA -22 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTCCTGTTTTCTATTTGTCA 1489 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.75.2 chr1 + 2198 8 full-splice_match TNFRSF14 ENST00000355716.5 1702 8 -577 81 3 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GCTCCTGTTTTCTATTTGTC -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.75.3 chr1 + 1777 9 novel_in_catalog TNFRSF14 novel 1702 8 NA NA -10 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAACTGTCACCTCCCGGTGT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.75.4 chr1 + 1767 9 novel_in_catalog TNFRSF14 novel 1702 8 NA NA -9 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAACTGTCACCTCCCGGTGT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.75.5 chr1 + 1597 9 novel_in_catalog TNFRSF14 novel 1702 8 NA NA 91 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GGCTCCTGTTTTCTATTTGT 100 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.75.6 chr1 + 1905 8 full-splice_match TNFRSF14 ENST00000355716.5 1702 8 -283 80 108 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTCCTGTTTTCTATTTGTCA 117 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.75.7 chr1 + 1567 9 novel_in_catalog TNFRSF14 novel 1702 8 NA NA 112 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GGCTCCTGTTTTCTATTTGT 121 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.75.8 chr1 + 1589 9 novel_in_catalog TNFRSF14 novel 1702 8 NA NA -73 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAACTGTCACCTCCCGGTGT 20 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.75.9 chr1 + 1675 8 full-splice_match TNFRSF14 ENST00000355716.5 1702 8 24 3 9 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAACTGTCACCTCCCGGTGT 11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.75.10 chr1 + 1296 8 full-splice_match TNFRSF14 ENST00000355716.5 1702 8 327 79 127 1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TCCTGTTTTCTATTTGTCAT 96 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.75.11 chr1 + 1136 6 incomplete-splice_match TNFRSF14 ENST00000355716.5 1702 8 1985 81 543 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GCTCCTGTTTTCTATTTGTC 598 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.75.12 chr1 + 1063 5 incomplete-splice_match TNFRSF14 ENST00000466750.5 2603 6 2048 0 281 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAACTGTCACCTCCCGGTGT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.76.1 chr1 + 2650 7 full-splice_match PRXL2B ENST00000493183.5 840 7 27 -1837 -22 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TTTTTGTGCTTTCTTCTTTT -4 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.76.2 chr1 + 2799 7 full-splice_match PRXL2B ENST00000444521.6 2827 7 27 1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CACTTTTTGTGCTTTCTTCT -31 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.76.3 chr1 + 872 7 full-splice_match PRXL2B ENST00000378424.9 2765 7 18 1875 0 -40 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CACTGCTTCGCAGGCTCCGA -10 TRUE NA NA ATTAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.76.4 chr1 + 2719 7 full-splice_match PRXL2B ENST00000419916.8 2747 7 27 1 6 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 43 10.298119 1.012758 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTTTTTGTGCTTTCTTCTT -4 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 43 NA PB.76.5 chr1 + 2702 7 novel_in_catalog PRXL2B novel 2765 7 NA NA -8 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTTTTTGTGCTTTCTTCTT 1 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.76.6 chr1 + 2677 7 full-splice_match PRXL2B ENST00000378427.6 2689 7 11 1 -8 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 43 10.298119 1.012758 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GAGCCACTTTTTGTGCTTTC 1 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 43 NA PB.76.7 chr1 + 2726 7 novel_in_catalog PRXL2B novel 2747 7 NA NA 1 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTTTTGTGCTTTCTTCTTT 10 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.76.8 chr1 + 2576 6 full-splice_match PRXL2B ENST00000378425.9 2665 6 89 0 6 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTTTTTGTGCTTTCTTCTT 31 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.76.9 chr1 + 2901 5 novel_in_catalog PRXL2B novel 2747 7 NA NA -18 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTTTTTGTGCTTTCTTCTT -23 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.76.10 chr1 + 2575 6 incomplete-splice_match PRXL2B ENST00000419916.8 2747 7 312 2 4 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.592367 0.555381 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CACTTTTTGTGCTTTCTTCT 6 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 15 NA PB.76.11 chr1 + 2539 6 incomplete-splice_match PRXL2B ENST00000378427.6 2689 7 291 1 4 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 24 5.747787 0.759501 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GAGCCACTTTTTGTGCTTTC 6 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 24 NA PB.76.12 chr1 + 2147 2 full-splice_match PRXL2B ENST00000476686.1 2506 2 358 1 358 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTTTTTGTGCTTTCTTCTT 1869 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 7 NA PB.78.1 chr1 + 2846 15 novel_not_in_catalog ARHGEF16 novel 2822 15 NA NA 4 -5 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAACCTGGATTTTCACAG 0 TRUE NA NA ATTAAA -11 NA NA NA 4 NA PB.78.2 chr1 + 2814 15 novel_not_in_catalog ARHGEF16 novel 2822 15 NA NA 20 -5 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAACCTGGATTTTCACAG 16 FALSE NA NA ATTAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.78.3 chr1 + 2778 15 full-splice_match ARHGEF16 ENST00000378378.9 2822 15 39 5 39 -5 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAACCTGGATTTTCACAG -2 TRUE NA NA ATTAAA -11 NA NA NA 4 NA PB.78.7 chr1 + 1827 11 incomplete-splice_match ARHGEF16 ENST00000378371.6 2219 12 1929 5 356 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAACCTGGATTTTCACAG 374 FALSE NA NA ATTAAA -11 NA NA NA 3 NA PB.78.8 chr1 + 1711 10 incomplete-splice_match ARHGEF16 ENST00000378371.6 2219 12 2539 7 966 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TTAAGAACCTGGATTTTCAC 984 FALSE NA NA ATTAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.78.9 chr1 + 1434 8 incomplete-splice_match ARHGEF16 ENST00000378371.6 2219 12 6464 5 666 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAACCTGGATTTTCACAG 1811 FALSE NA NA ATTAAA -11 NA NA NA 3 NA PB.78.10 chr1 + 1257 6 incomplete-splice_match ARHGEF16 ENST00000378371.6 2219 12 9013 5 3215 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAACCTGGATTTTCACAG 4360 FALSE NA NA ATTAAA -11 NA NA NA 3 NA PB.79.2 chr1 - 2634 19 full-splice_match PANK4 ENST00000378466.9 2641 19 0 7 0 -7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAGAGGCCGGAGCCATCT 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.79.3 chr1 - 1207 9 incomplete-splice_match PANK4 ENST00000378466.9 2641 19 12174 7 -19 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAGAGGCCGGAGCCATCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.81.4 chr1 - 2908 4 incomplete-splice_match MEGF6 ENST00000294599.8 4501 30 37584 -1967 -378 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 CATTAAAAATATACTAAATA 2217 FALSE NA NA AATGAA -29 NA NA NA 2 NA PB.81.5 chr1 - 4872 6 novel_in_catalog MEGF6 novel 4501 30 NA NA -22 -19 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAACAGACTAGACTGCAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.81.12 chr1 - 1601 9 incomplete-splice_match MEGF6 ENST00000356575.9 7443 37 114745 1969 -46 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTCGTGGCCTGTGTGTTTGC NA FALSE NA NA GGGGCT -14 NA NA NA 2 NA PB.81.13 chr1 - 977 4 incomplete-splice_match MEGF6 ENST00000294599.8 4501 30 37548 0 344 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTCGTGGCCTGTGTGTTTGC 2181 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.84.1 chr1 - 1683 12 full-splice_match WRAP73 ENST00000270708.12 1692 12 7 2 7 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 109 26.104532 1.416716 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACTACTTCTCTTCTTGAAA -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 109 NA PB.84.2 chr1 - 1982 11 novel_not_in_catalog WRAP73 novel 1998 11 NA NA -13 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACTACTTCTCTTCTTGAAA 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.84.5 chr1 - 1526 11 novel_in_catalog WRAP73 novel 1692 12 NA NA -11 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACTACTTCTCTTCTTGAAA 15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.84.6 chr1 - 1291 10 incomplete-splice_match WRAP73 ENST00000270708.12 1692 12 3394 2 3317 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACTACTTCTCTTCTTGAAA 3380 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.84.7 chr1 - 1243 5 incomplete-splice_match WRAP73 ENST00000378322.7 1998 11 14852 5 227 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACTACTTCTCTTCTTGAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.84.8 chr1 - 1112 8 incomplete-splice_match WRAP73 ENST00000270708.12 1692 12 13067 2 21 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACTACTTCTCTTCTTGAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.84.9 chr1 - 984 2 incomplete-splice_match WRAP73 ENST00000378322.7 1998 11 17748 5 3123 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACTACTTCTCTTCTTGAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.84.10 chr1 - 951 6 incomplete-splice_match WRAP73 ENST00000270708.12 1692 12 14841 2 171 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACTACTTCTCTTCTTGAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.84.11 chr1 - 823 5 incomplete-splice_match WRAP73 ENST00000270708.12 1692 12 15054 2 384 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACTACTTCTCTTCTTGAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.84.12 chr1 - 1986 11 full-splice_match WRAP73 ENST00000378322.7 1998 11 5 7 5 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.310840 0.634562 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACAACTACTTCTCTTCTTGA -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.84.13 chr1 - 1710 9 incomplete-splice_match WRAP73 ENST00000378322.7 1998 11 3275 8 3243 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TACAACTACTTCTCTTCTTG 3306 FALSE NA NA AAGAAA -34 NA NA NA 2 NA PB.84.14 chr1 - 1490 11 incomplete-splice_match WRAP73 ENST00000270708.12 1692 12 2567 5 2490 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TACAACTACTTCTCTTCTTG 2553 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.85.1 chr1 - 3526 5 full-splice_match TP73-AS1 ENST00000423764.6 3525 5 -2 1 -2 -1 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACCCTTGTGCTGAAAGCACT -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.88.3 chr1 - 2716 5 novel_in_catalog LRRC47 novel 4303 7 NA NA -2871 915 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGCTTGTGTAAAGACTCT 9451 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.88.4 chr1 - 2655 7 full-splice_match LRRC47 ENST00000378251.3 4303 7 -13 1661 -13 915 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 162 38.797562 1.588804 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGCTTGTGTAAAGACTCT -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 162 NA PB.88.5 chr1 - 2527 7 full-splice_match LRRC47 ENST00000378251.3 4303 7 115 1661 115 915 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGCTTGTGTAAAGACTCT 114 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.88.7 chr1 - 2439 7 full-splice_match LRRC47 ENST00000378251.3 4303 7 203 1661 203 915 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGCTTGTGTAAAGACTCT 202 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.88.8 chr1 - 2273 7 full-splice_match LRRC47 ENST00000378251.3 4303 7 369 1661 369 915 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGCTTGTGTAAAGACTCT 368 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.88.9 chr1 - 1955 6 incomplete-splice_match LRRC47 ENST00000378251.3 4303 7 9238 1661 -3085 915 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGCTTGTGTAAAGACTCT 9237 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.88.10 chr1 - 1784 6 incomplete-splice_match LRRC47 ENST00000378251.3 4303 7 9409 1661 -2914 915 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.268805 0.721712 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGCTTGTGTAAAGACTCT 9408 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 22 NA PB.88.11 chr1 - 1486 5 incomplete-splice_match LRRC47 ENST00000378251.3 4303 7 11352 1661 -971 915 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.592367 0.555381 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGCTTGTGTAAAGACTCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.88.12 chr1 - 1367 4 full-splice_match LRRC47 ENST00000462356.5 575 4 123 -915 -5 915 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.873893 0.458471 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGCTTGTGTAAAGACTCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.88.13 chr1 - 1258 3 incomplete-splice_match LRRC47 ENST00000462356.5 575 4 1464 -915 1336 915 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 20 4.789823 0.680319 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGCTTGTGTAAAGACTCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 20 NA PB.88.14 chr1 - 1142 2 incomplete-splice_match LRRC47 ENST00000462356.5 575 4 2639 -915 2511 915 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.071349 0.609738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGCTTGTGTAAAGACTCT NA FALSE NA NA AAAACA -8 NA NA NA 17 NA PB.88.17 chr1 - 2124 7 full-splice_match LRRC47 ENST00000378251.3 4303 7 517 1662 517 914 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CGAGGCTTGTGTAAAGACTC 516 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.88.18 chr1 - 1805 3 incomplete-splice_match LRRC47 ENST00000378251.3 4303 7 4 5935 4 -3204 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TAGGGTGAGTTGCTGTGTCG 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.89.1 chr1 + 1290 4 full-splice_match SMIM1 ENST00000444870.7 547 4 -16 -727 0 727 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCCCTTGCCATAGTTACCT -13 TRUE NA NA AATGAA -12 NA NA NA 2 NA PB.89.2 chr1 + 1238 4 full-splice_match SMIM1 ENST00000642557.4 506 4 22 -754 0 728 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GCCCTTGCCATAGTTACCTG -13 TRUE NA NA AATGAA -13 NA NA NA 2 NA PB.89.3 chr1 + 1089 4 full-splice_match SMIM1 ENST00000444870.7 547 4 -16 -526 0 526 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAGTAAGTGGGCACAGTTCT -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.89.4 chr1 + 1040 4 full-splice_match SMIM1 ENST00000642557.4 506 4 22 -556 0 530 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGTGGGCACAGTTCTTCCT -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.90.1 chr1 - 1028 5 novel_not_in_catalog CEP104 novel 7766 17 NA NA -7095 469 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGTTTTTTTGAGAATTGGT NA FALSE NA NA AATACA -25 NA NA NA 3 NA PB.90.2 chr1 - 922 4 incomplete-splice_match CEP104 ENST00000675966.1 7766 17 22561 2690 -6986 463 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAATCGTAGTTTTTTTGAGA NA FALSE NA NA AAAACA -22 NA NA NA 2 NA PB.90.3 chr1 - 2860 17 incomplete-splice_match CEP104 ENST00000675334.1 4953 19 2769 1752 1070 456 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTTTTTTTAATCGTAGTTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.90.4 chr1 - 3721 22 full-splice_match CEP104 ENST00000378230.8 6431 22 0 2710 0 443 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGAGAACATCTTTTTTT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.90.5 chr1 - 1631 10 incomplete-splice_match CEP104 ENST00000675966.1 7766 17 14877 2710 96 443 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGAGAACATCTTTTTTT 6035 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.90.6 chr1 - 1197 6 incomplete-splice_match CEP104 ENST00000675966.1 7766 17 19568 2710 4787 443 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGAGAACATCTTTTTTT NA FALSE NA NA ATTAAA -38 NA NA NA 6 NA PB.90.7 chr1 - 3320 20 full-splice_match CEP104 ENST00000461667.2 3328 20 2 6 2 -6 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACGATTCTCTTTCCTACC 154 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.90.13 chr1 - 1751 12 incomplete-splice_match CEP104 ENST00000461667.2 3328 20 9656 6567 127 349 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAACAAAAGAAAGAAGAA 9808 FALSE NA NA AAAACA -5 NA NA NA 3 NA PB.90.21 chr1 - 1625 6 incomplete-splice_match CEP104 ENST00000674879.1 7030 21 9603 24408 96 1322 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 9777 FALSE NA NA AAAACA -36 NA NA NA 2 NA PB.90.23 chr1 - 1159 7 novel_not_in_catalog CEP104 novel 1661 4 NA NA 0 1297 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGATTTAGACTTTAAATCTG -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.90.24 chr1 - 1617 5 novel_not_in_catalog CEP104 novel 1661 4 NA NA 0 34 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATAATAGATTATTTATTG -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.91.1 chr1 + 1796 8 novel_in_catalog DFFB novel 3152 8 NA NA 0 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAATAGACATGTCAAGAA -10 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.91.2 chr1 + 3029 7 full-splice_match DFFB ENST00000378209.8 2833 7 -205 9 4 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAATAGACATGTCAAGAA -6 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.91.3 chr1 + 2849 7 full-splice_match DFFB ENST00000378209.8 2833 7 -25 9 -9 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAATAGACATGTCAAGAA 174 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.91.4 chr1 + 2661 7 full-splice_match DFFB ENST00000378209.8 2833 7 163 9 39 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAATAGACATGTCAAGAA 166 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.91.5 chr1 + 1972 2 incomplete-splice_match DFFB ENST00000475969.5 2731 7 14915 9 4852 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAATAGACATGTCAAGAA NA FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.92.1 chr1 - 1645 4 full-splice_match C1orf174 ENST00000361605.4 1645 4 -6 6 0 -6 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 178 42.629421 1.629709 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATATTTTGAAAGCAGTC -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 178 NA PB.92.5 chr1 - 1368 2 incomplete-splice_match C1orf174 ENST00000680169.1 1567 4 9220 -14 9220 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATATTTTGAAAGCAGTC 9259 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.92.6 chr1 - 1120 2 incomplete-splice_match C1orf174 ENST00000680169.1 1567 4 9468 -14 9468 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATATTTTGAAAGCAGTC 9507 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.92.7 chr1 - 1049 2 incomplete-splice_match C1orf174 ENST00000680169.1 1567 4 9539 -14 9539 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATATTTTGAAAGCAGTC 9578 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.94.7 chr1 + 1391 5 incomplete-splice_match AJAP1 ENST00000378190.7 2383 6 57437 0 1014 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCTGTGCCTTCCCACTTTG 6737 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.94.9 chr1 + 940 3 incomplete-splice_match AJAP1 ENST00000378190.7 2383 6 115118 2765 58695 -2765 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAATATAAAAATAAGAGATA 2749 FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.94.10 chr1 + 880 3 incomplete-splice_match AJAP1 ENST00000378191.5 12102 6 117674 9485 61128 5255 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTTTTTTTGTACTGTAGCA 5182 FALSE NA NA TATAAA -26 NA NA NA 4 NA PB.97.1 chr1 + 2195 3 intergenic novelGene_59 novel NA NA NA NA NA NA multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TTCACTCTGTGAAGTTTGAT NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.99.3 chr1 - 3613 21 novel_in_catalog NPHP4 novel 4955 30 NA NA -28005 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTCCCTTGGCAGTTTTCTTG NA FALSE NA NA ATTAAA -40 NA NA NA 2 NA PB.99.4 chr1 - 1369 2 incomplete-splice_match NPHP4 ENST00000460696.1 3967 3 3169 0 3169 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTCCCTTGGCAGTTTTCTTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.99.5 chr1 - 1205 6 incomplete-splice_match NPHP4 ENST00000478423.6 4467 26 125367 0 595 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTCCCTTGGCAGTTTTCTTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.99.6 chr1 - 4340 27 novel_in_catalog NPHP4 novel 5548 33 NA NA 23277 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTTCCCTTGGCAGTTTTCTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.99.7 chr1 - 1531 9 incomplete-splice_match NPHP4 ENST00000478423.6 4467 26 117926 1 -657 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTTCCCTTGGCAGTTTTCTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.99.8 chr1 - 2332 11 incomplete-splice_match NPHP4 ENST00000478423.6 4467 26 114911 7 -47 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACACGTCTTCCCTTGGCAGT NA FALSE NA NA ATTAAA -40 NA NA NA 2 NA PB.100.1 chr1 + 3855 16 full-splice_match KCNAB2 ENST00000378097.6 4302 16 433 14 2 0 alternative_5end TRUE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCGGTCTCTGTGACTTTTT 12 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.100.2 chr1 + 3801 15 full-splice_match KCNAB2 ENST00000666163.1 3878 15 67 10 0 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CATCGGTCTCTGTGACTTTT 23 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 9 NA PB.100.5 chr1 + 1346 4 incomplete-splice_match KCNAB2 ENST00000652845.1 932 5 -14 8024 -1 1 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAATACAAAAATTAGCTG -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.100.6 chr1 + 1206 15 full-splice_match KCNAB2 ENST00000352527.6 4001 15 170 2625 -1 -8 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAGGACTACAGATCCTA -6 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 4 NA PB.100.7 chr1 + 660 7 full-splice_match KCNAB2 ENST00000663169.1 719 7 61 -2 -1 2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATCCCCTGATCACGTCTT -6 TRUE NA NA ATTAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.100.8 chr1 + 3861 16 full-splice_match KCNAB2 ENST00000428161.6 2134 16 333 -2060 1 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.592367 0.555381 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCGGTCTCTGTGACTTTTT 7 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 15 NA PB.100.9 chr1 + 3819 15 full-splice_match KCNAB2 ENST00000352527.6 4001 15 183 -1 1 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 44 10.537610 1.022742 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCGGTCTCTGTGACTTTTT 7 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 44 NA PB.100.10 chr1 + 1064 7 novel_in_catalog KCNAB2 novel 719 7 NA NA 0 2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATCCCCTGATCACGTCTT 8 TRUE NA NA ATTAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.100.14 chr1 + 3547 12 incomplete-splice_match KCNAB2 ENST00000662363.1 2958 14 7979 -1156 317 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCGGTCTCTGTGACTTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 6 NA PB.100.18 chr1 + 3300 7 incomplete-splice_match KCNAB2 ENST00000662363.1 2958 14 24630 -1156 87 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCGGTCTCTGTGACTTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 6 NA PB.100.19 chr1 + 3155 6 incomplete-splice_match KCNAB2 ENST00000662363.1 2958 14 28699 -1156 -31 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCGGTCTCTGTGACTTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 5 NA PB.100.20 chr1 + 2967 4 incomplete-splice_match KCNAB2 ENST00000662363.1 2958 14 29818 -1164 1088 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTGTGACTTTTTGCTCCTCT NA FALSE NA NA AATAAA -23 NA NA NA 7 NA PB.100.21 chr1 + 2731 2 incomplete-splice_match KCNAB2 ENST00000671076.1 4620 5 2839 8 2839 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCGGTCTCTGTGACTTTTT 31 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.101.1 chr1 + 1573 2 novel_in_catalog RNF207 novel 551 3 NA NA -31 5 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAAAAAAATTTTTTT -23 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.101.2 chr1 + 1334 3 full-splice_match RNF207 ENST00000484435.1 551 3 -35 -748 -25 5 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.113385 0.493233 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAAAAAAATTTTTTT -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.102.7 chr1 - 2052 4 full-splice_match RPL22 ENST00000234875.9 2061 4 2 7 2 -7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 57 13.650994 1.135164 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACTGTACGAGGCTTTGTTT 12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 57 NA PB.102.8 chr1 - 1910 2 incomplete-splice_match RPL22 ENST00000234875.9 2061 4 6541 12 6499 -12 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.352876 0.525417 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTCTTACTGTACGAGGCTT 7825 FALSE NA NA ATTAAA -34 NA NA NA 14 NA PB.102.15 chr1 - 1732 2 incomplete-splice_match RPL22 ENST00000234875.9 2061 4 6646 85 6604 -85 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTTTCTATGTCTTTTTGAAC 7930 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.102.17 chr1 - 1057 4 full-splice_match RPL22 ENST00000234875.9 2061 4 1 1003 1 552 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TCTACAGGTCTTTGCAACAA 11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.102.18 chr1 - 890 4 full-splice_match RPL22 ENST00000234875.9 2061 4 -29 1200 -29 355 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 251 60.112274 1.778963 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATTCGTCTTACTTTCATTT -19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 251 NA PB.102.19 chr1 - 765 4 novel_not_in_catalog RPL22 novel 2061 4 NA NA -9 356 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTCGTCTTACTTTCATTTT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.102.20 chr1 - 1040 4 full-splice_match RPL22 ENST00000465387.5 508 4 -29 -503 13 355 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATTCGTCTTACTTTCATTT 23 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.102.21 chr1 - 844 4 novel_not_in_catalog RPL22 novel 2061 4 NA NA 0 355 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATTCGTCTTACTTTCATTT 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.102.22 chr1 - 750 3 full-splice_match RPL22 ENST00000480661.1 2279 3 1884 -355 1874 355 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.831858 0.583409 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATTCGTCTTACTTTCATTT 3200 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.102.23 chr1 - 679 2 incomplete-splice_match RPL22 ENST00000480661.1 2279 3 6552 -355 6542 355 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.310840 0.634562 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATTCGTCTTACTTTCATTT 7868 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.102.24 chr1 - 1066 4 full-splice_match RPL22 ENST00000497965.5 786 4 114 -394 114 354 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CCATTCGTCTTACTTTCATT 8665 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.102.25 chr1 - 2251 3 full-splice_match RPL22 ENST00000480661.1 2279 3 -16 44 16 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.352876 0.525417 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAATGGTGGTTTATCCTTG 9814 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.102.26 chr1 - 1213 4 novel_not_in_catalog RPL22 novel 508 4 NA NA -1 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAATGGTGGTTTATCCTTG 9829 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.102.27 chr1 - 1067 3 full-splice_match RPL22 ENST00000480661.1 2279 3 1168 44 1158 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAATGGTGGTTTATCCTTG 2484 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.102.28 chr1 - 966 6 novel_in_catalog RPL22 novel 806 5 NA NA 15 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAATGGTGGTTTATCCTTG 19 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.102.29 chr1 - 984 6 novel_in_catalog RPL22 novel 806 5 NA NA 20 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAATGGTGGTTTATCCTTG 24 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.102.30 chr1 - 962 3 full-splice_match RPL22 ENST00000480661.1 2279 3 1273 44 1263 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAATGGTGGTTTATCCTTG 2589 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.102.31 chr1 - 652 4 full-splice_match RPL22 ENST00000234875.9 2061 4 -190 1599 -190 -4 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAATGGTGGTTTATCCTTG -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.102.32 chr1 - 741 5 full-splice_match RPL22 ENST00000471204.5 524 5 -144 -73 1 -4 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAATGGTGGTTTATCCTTG 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.102.33 chr1 - 461 4 full-splice_match RPL22 ENST00000234875.9 2061 4 1 1599 1 -4 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 55 13.172012 1.119652 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAATGGTGGTTTATCCTTG 11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 55 NA PB.102.35 chr1 - 911 3 novel_in_catalog RNF207-AS1 novel 378 3 NA NA -3631 1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GATATTTGAGCTGTTTTCGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.104.1 chr1 - 3698 6 novel_not_in_catalog ICMT novel 2612 6 NA NA -9 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACCACAGTGTGATTGTCTG -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.104.3 chr1 - 3328 7 novel_not_in_catalog ICMT novel 2612 6 NA NA -16 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACCACAGTGTGATTGTCTG -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.104.4 chr1 - 2861 4 novel_not_in_catalog ICMT novel 4795 5 NA NA 2320 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACCACAGTGTGATTGTCTG 2333 FALSE NA NA AAAAAG -34 NA NA NA 2 NA PB.104.5 chr1 - 2644 3 novel_not_in_catalog ICMT novel 1227 4 NA NA 3891 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACCACAGTGTGATTGTCTG 3904 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.104.6 chr1 - 2432 5 novel_not_in_catalog ICMT novel 4795 5 NA NA -11 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACCACAGTGTGATTGTCTG -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.104.11 chr1 - 3526 6 novel_in_catalog ICMT novel 2612 6 NA NA -3 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAACCACAGTGTGATTGTCT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.104.12 chr1 - 1201 2 novel_not_in_catalog ICMT novel 328 2 NA NA -493 -6 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTCAACCACAGTGTGATTG 610 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.104.13 chr1 - 1127 2 novel_not_in_catalog ICMT novel 328 2 NA NA -16 -7 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CACTCAACCACAGTGTGATT -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.104.14 chr1 - 2547 5 full-splice_match ICMT ENST00000343813.10 4795 5 -11 2259 -3 39 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 48 11.495574 1.060531 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAGAGGCTTACGGGTTCAT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 48 NA PB.104.15 chr1 - 1901 2 incomplete-splice_match ICMT ENST00000489498.5 2612 6 3981 -39 3973 39 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAGAGGCTTACGGGTTCAT 3986 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.104.17 chr1 - 2365 4 full-splice_match ICMT ENST00000474756.1 1227 4 6 -1144 -2 36 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.352876 0.525417 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACCAAAGAGGCTTACGGGTT 11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.104.19 chr1 - 2678 6 full-splice_match ICMT ENST00000489498.5 2612 6 -33 -33 -33 33 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 25 5.987278 0.777229 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TATACCAAAGAGGCTTACGG -28 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 25 NA PB.104.20 chr1 - 2150 3 novel_in_catalog ICMT novel 1227 4 NA NA -25 8 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CTTAATGAATTTTTTCATTG -20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.104.21 chr1 - 2351 5 full-splice_match ICMT ENST00000343813.10 4795 5 150 2294 150 4 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATGGCTTAATGAATTTTTTC 163 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.104.23 chr1 - 2318 5 incomplete-splice_match ICMT ENST00000489498.5 2612 6 1039 -3 1031 3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CATGGCTTAATGAATTTTTT 1044 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.104.24 chr1 - 2022 3 incomplete-splice_match ICMT ENST00000489498.5 2612 6 2466 1 2458 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTTCATGGCTTAATGAATT 2471 FALSE NA NA AAGAAA -39 NA NA NA 8 NA PB.104.30 chr1 - 2157 3 incomplete-splice_match ICMT ENST00000489498.5 2612 6 2328 4 2320 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAGATTTCATGGCTTAATGA 2333 FALSE NA NA AAAAAG -34 NA NA NA 6 NA PB.104.31 chr1 - 2246 4 full-splice_match ICMT ENST00000474756.1 1227 4 -11 -1008 -11 -100 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 TACACAAAAATGGGCAGACA -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.104.32 chr1 - 2368 5 full-splice_match ICMT ENST00000343813.10 4795 5 -14 2441 -6 -143 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGATGTGGGAGCGACATCAA -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.104.33 chr1 - 1440 5 full-splice_match ICMT ENST00000343813.10 4795 5 -17 3372 -9 34 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAATACTTCCTCATAGGA -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.104.34 chr1 - 953 4 incomplete-splice_match ICMT ENST00000343813.10 4795 5 -19 10500 -11 -7094 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAATGTAGTCCTTAATGCTT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.106.1 chr1 + 1490 4 novel_in_catalog LINC00337 novel 1138 5 NA NA -58 11 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAATATAAGAAAAAAAAG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.107.1 chr1 - 1427 9 full-splice_match ACOT7 ENST00000377845.7 1432 9 5 0 5 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.634403 0.420682 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCACGTGTCCTGGGTGGT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.107.2 chr1 - 1402 9 full-splice_match ACOT7 ENST00000377842.7 1813 9 411 0 411 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 25 5.987278 0.777229 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCACGTGTCCTGGGTGGT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 25 NA PB.107.3 chr1 - 1276 8 novel_in_catalog ACOT7 novel 1804 9 NA NA -62 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCACGTGTCCTGGGTGGT 411 FALSE NA NA GGGGCT -42 NA NA NA 2 NA PB.107.4 chr1 - 1233 8 incomplete-splice_match ACOT7 ENST00000377842.7 1813 9 9539 0 2444 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.113385 0.493233 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCACGTGTCCTGGGTGGT 9770 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.107.5 chr1 - 1119 7 incomplete-splice_match ACOT7 ENST00000377842.7 1813 9 19812 0 12717 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCACGTGTCCTGGGTGGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.107.6 chr1 - 979 6 incomplete-splice_match ACOT7 ENST00000377842.7 1813 9 25816 0 18721 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.831858 0.583409 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCACGTGTCCTGGGTGGT 4505 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.107.7 chr1 - 793 4 incomplete-splice_match ACOT7 ENST00000377842.7 1813 9 40785 0 -23055 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCACGTGTCCTGGGTGGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.107.8 chr1 - 1612 9 full-splice_match ACOT7 ENST00000377855.6 1614 9 1 1 1 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 62 14.848450 1.171681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GACCCACGTGTCCTGGGTGG -25 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 62 NA PB.107.9 chr1 - 1347 8 novel_in_catalog ACOT7 novel 1806 9 NA NA -36 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GACCCACGTGTCCTGGGTGG 1 TRUE NA NA GGGGCT -16 NA NA NA 2 NA PB.107.10 chr1 - 1434 9 full-splice_match ACOT7 ENST00000608083.5 1403 9 -36 5 -36 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 234 56.040924 1.748505 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GACCCACGTGTCCTGGGTGG 1 TRUE NA NA GGGGCT -16 NA NA NA 234 NA PB.108.1 chr1 - 1579 10 full-splice_match TNFRSF25 ENST00000356876.8 1968 10 0 389 0 -24 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.873893 0.458471 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAGAAAACAAAACAAAACA -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.109.1 chr1 - 2138 5 novel_in_catalog PLEKHG5 novel 2664 9 NA NA 475 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTGGGAAGAGTCCTTTGCT 4846 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.109.2 chr1 - 1320 3 incomplete-splice_match PLEKHG5 ENST00000487949.4 2664 9 2434 1 14 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTGGGAAGAGTCCTTTGCT 5954 FALSE NA NA GGGGCT -5 NA NA NA 2 NA PB.110.1 chr1 + 2918 13 novel_not_in_catalog ESPN novel 3543 13 NA NA 0 5 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATATATTTGCATGTTCGTTG -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.110.3 chr1 + 1529 5 novel_not_in_catalog ESPN novel 3543 13 NA NA -1474 7 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATATTTGCATGTTCGTTGAC 1173 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.110.4 chr1 + 1963 6 novel_not_in_catalog ESPN novel 1494 7 NA NA -1016 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTCGCTGTGGCCGCGACTT 1631 FALSE NA NA ATTAAA -29 NA NA NA 2 NA PB.110.5 chr1 + 1454 6 novel_not_in_catalog ESPN novel 1339 8 NA NA -15 5 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATATATTTGCATGTTCGTTG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.110.6 chr1 + 1982 6 novel_not_in_catalog ESPN novel 1339 8 NA NA -10 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTCGCTGTGGCCGCGACTT 2 TRUE NA NA ATTAAA -29 NA NA NA 6 NA PB.110.7 chr1 + 1871 7 novel_not_in_catalog ESPN novel 1339 8 NA NA -2 4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTCCGGTTCACTCACTCGCT -26 TRUE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.110.8 chr1 + 1304 7 novel_not_in_catalog ESPN novel 1339 8 NA NA 45 5 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATATATTTGCATGTTCGTTG 21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.110.9 chr1 + 2018 6 novel_not_in_catalog ESPN novel 813 7 NA NA -26 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTCGCTGTGGCCGCGACTT 374 FALSE NA NA ATTAAA -29 NA NA NA 5 NA PB.110.10 chr1 + 1513 5 novel_not_in_catalog ESPN novel 1494 7 NA NA 6 -8 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATTTGCATGCCGACTTACA 1 TRUE NA NA AAAAAG -39 NA NA NA 4 NA PB.110.11 chr1 + 1486 6 novel_not_in_catalog ESPN novel 813 7 NA NA 20 52 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCCCCGTGGGTGGTGACTT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.110.12 chr1 + 2120 4 novel_not_in_catalog ESPN novel 1494 7 NA NA 21 3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCTCCGGTTCACTCACTCGC -3 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.110.13 chr1 + 1329 7 novel_not_in_catalog ESPN novel 813 7 NA NA -25 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATGCCGACTTACATATATTT 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.110.14 chr1 + 1944 6 novel_in_catalog ESPN novel 1339 8 NA NA 26 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTCGCTGTGGCCGCGACTT 2 TRUE NA NA ATTAAA -29 NA NA NA 2 NA PB.110.15 chr1 + 1862 7 novel_not_in_catalog ESPN novel 813 7 NA NA 26 3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCTCCGGTTCACTCACTCGC 2 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 6 NA PB.110.16 chr1 + 1570 5 novel_not_in_catalog ESPN novel 1494 7 NA NA -101 3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCTCCGGTTCACTCACTCGC 437 FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.110.17 chr1 + 952 5 novel_not_in_catalog ESPN novel 1494 7 NA NA 55 2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TACATATATTTGCATGTTCG 44 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.110.18 chr1 + 1553 5 novel_not_in_catalog ESPN novel 544 4 NA NA -53 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTCGCTGTGGCCGCGACTT -1 TRUE NA NA ATTAAA -29 NA NA NA 3 NA PB.110.19 chr1 + 1609 4 novel_not_in_catalog ESPN novel 544 4 NA NA -25 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTCGCTGTGGCCGCGACTT -3 TRUE NA NA ATTAAA -29 NA NA NA 2 NA PB.110.20 chr1 + 1025 2 novel_not_in_catalog ESPN novel 879 4 NA NA -3313 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTCGCTGTGGCCGCGACTT 5590 FALSE NA NA ATTAAA -29 NA NA NA 4 NA PB.111.1 chr1 - 2105 9 novel_not_in_catalog NOL9 novel 6627 12 NA NA 0 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATTTAGTTGTGTAATTTTA 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.111.12 chr1 - 2416 12 full-splice_match NOL9 ENST00000377705.6 6627 12 -14 4225 -14 -4225 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.268805 0.721712 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGAAAGTTCTTCAGGGACCT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 22 NA PB.111.13 chr1 - 1245 6 incomplete-splice_match NOL9 ENST00000377705.6 6627 12 21143 4225 15 -4225 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGAAAGTTCTTCAGGGACCT NA FALSE NA NA AATATA -19 NA NA NA 4 NA PB.111.14 chr1 - 1598 9 incomplete-splice_match NOL9 ENST00000377705.6 6627 12 9365 4242 -131 -4242 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TAAAACAGAGATTCCTCAGA 9623 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.111.15 chr1 - 2105 8 novel_in_catalog NOL9 novel 6627 12 NA NA -23 68 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACACTTGTGTGGTTTTCTGT -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.112.3 chr1 + 2267 11 novel_in_catalog ZBTB48 novel 2347 11 NA NA 6 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTCAGCCTGACAGTCTGT -7 TRUE NA NA AATAAA -23 NA NA NA 8 NA PB.112.5 chr1 + 2308 11 full-splice_match ZBTB48 ENST00000377674.9 2347 11 30 9 7 -9 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTCTCGTATTTCAGCCTGA 10 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.112.8 chr1 + 1337 9 incomplete-splice_match ZBTB48 ENST00000377674.9 2347 11 2170 2 2076 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATTTCAGCCTGACAGTCTG 2103 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.112.9 chr1 + 1171 7 full-splice_match ZBTB48 ENST00000482360.5 2484 7 1312 1 407 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTCAGCCTGACAGTCTGT 6553 FALSE NA NA AATAAA -23 NA NA NA 2 NA PB.112.10 chr1 + 910 5 incomplete-splice_match ZBTB48 ENST00000466813.1 790 6 222 -119 222 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTCAGCCTGACAGTCTGT 7417 FALSE NA NA AATAAA -23 NA NA NA 3 NA PB.113.1 chr1 + 3582 4 full-splice_match PHF13 ENST00000377648.5 3632 4 14 36 14 -36 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 29 6.945243 0.841687 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TGATTCAAGGTTCAGGCGAT -2 TRUE NA NA AATAAA -23 NA NA NA 29 NA PB.113.2 chr1 + 1638 4 full-splice_match PHF13 ENST00000377648.5 3632 4 21 1973 -10 -588 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCTTTTTCTTGAGTGTTA 5 TRUE NA NA AATGAA -14 NA NA NA 4 NA PB.114.1 chr1 - 4256 4 full-splice_match KLHL21 ENST00000377658.8 4487 4 236 -5 236 5 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTCATTGCCTTTGTCCTCC 1060 FALSE NA NA GGGGCT -38 NA NA NA 3 NA PB.114.2 chr1 - 4486 4 full-splice_match KLHL21 ENST00000377658.8 4487 4 0 1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.634403 0.420682 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTTGGAGTCATTGCCTTTG -2 TRUE NA NA TATAAA -23 NA NA NA 11 NA PB.114.3 chr1 - 3911 4 full-splice_match KLHL21 ENST00000377658.8 4487 4 575 1 575 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTTGGAGTCATTGCCTTTG 1399 FALSE NA NA AATGAA -5 NA NA NA 2 NA PB.114.4 chr1 - 3563 4 full-splice_match KLHL21 ENST00000377658.8 4487 4 923 1 923 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTTGGAGTCATTGCCTTTG 1747 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.114.5 chr1 - 3370 3 incomplete-splice_match KLHL21 ENST00000496707.5 824 4 407 -2656 407 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTTGGAGTCATTGCCTTTG 4284 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.115.1 chr1 + 1360 6 full-splice_match THAP3 ENST00000054650.9 1361 6 0 1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACGGTGTCGCTCCCATCATC 0 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.115.2 chr1 + 1261 5 novel_in_catalog THAP3 novel 840 6 NA NA 5 2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GTGTCGCTCCCATCATCATT -4 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.115.3 chr1 + 1237 5 incomplete-splice_match THAP3 ENST00000054650.9 1361 6 318 1 5 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 100 23.949114 1.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACGGTGTCGCTCCCATCATC -4 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 100 NA PB.115.4 chr1 + 1530 4 full-splice_match THAP3 ENST00000472925.1 983 4 -35 -512 -3 1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GGTGTCGCTCCCATCATCAT 5 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 7 NA PB.115.5 chr1 + 1112 5 novel_not_in_catalog THAP3 novel 1361 6 NA NA -3 1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GGTGTCGCTCCCATCATCAT 5 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 10 NA PB.115.6 chr1 + 1304 6 full-splice_match THAP3 ENST00000487819.5 840 6 -24 -440 3 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACGGTGTCGCTCCCATCATC 11 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 6 NA PB.115.7 chr1 + 793 3 novel_not_in_catalog THAP3 novel 744 4 NA NA 1923 3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGTCGCTCCCATCATCATTT 5128 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.115.8 chr1 + 903 3 incomplete-splice_match THAP3 ENST00000307896.10 1046 5 5143 -195 1929 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GGTGTCGCTCCCATCATCAT 5134 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.116.1 chr1 - 2912 13 incomplete-splice_match DNAJC11 ENST00000377577.10 3201 16 34004 -1 398 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGGCTGGCGCTCTTCCGTGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.116.3 chr1 - 3202 16 full-splice_match DNAJC11 ENST00000377577.10 3201 16 -2 1 1 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 124 29.696899 1.472711 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGAGGCTGGCGCTCTTCCGT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 124 NA PB.116.4 chr1 - 3080 15 incomplete-splice_match DNAJC11 ENST00000377577.10 3201 16 20811 1 32 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGAGGCTGGCGCTCTTCCGT NA FALSE NA NA AAGAAA -10 NA NA NA 6 NA PB.116.5 chr1 - 2679 11 incomplete-splice_match DNAJC11 ENST00000377577.10 3201 16 48863 1 -5877 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGAGGCTGGCGCTCTTCCGT NA FALSE NA NA AATGAA -26 NA NA NA 10 NA PB.116.6 chr1 - 2552 10 incomplete-splice_match DNAJC11 ENST00000377577.10 3201 16 50216 1 -4524 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGAGGCTGGCGCTCTTCCGT 540 FALSE NA NA AAAAAG -30 NA NA NA 7 NA PB.116.7 chr1 - 2287 8 incomplete-splice_match DNAJC11 ENST00000691481.1 3565 9 1953 -13 -11 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGAGGCTGGCGCTCTTCCGT 7017 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.116.8 chr1 - 2144 7 incomplete-splice_match DNAJC11 ENST00000689025.1 3549 9 2451 -13 498 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGAGGCTGGCGCTCTTCCGT 7526 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.116.9 chr1 - 2012 6 incomplete-splice_match DNAJC11 ENST00000689025.1 3549 9 7083 -13 -452 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGAGGCTGGCGCTCTTCCGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.116.10 chr1 - 1876 5 incomplete-splice_match DNAJC11 ENST00000689025.1 3549 9 8756 -13 1221 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGAGGCTGGCGCTCTTCCGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.116.11 chr1 - 1749 3 incomplete-splice_match DNAJC11 ENST00000689169.1 3872 4 2244 -15 2244 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGAGGCTGGCGCTCTTCCGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.116.12 chr1 - 1576 2 incomplete-splice_match DNAJC11 ENST00000689169.1 3872 4 3368 -15 3368 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGAGGCTGGCGCTCTTCCGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.116.19 chr1 - 2255 16 full-splice_match DNAJC11 ENST00000377577.10 3201 16 -3 949 0 -6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 34 8.142698 0.910768 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AACAAACGGGTTTGGAAATT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 34 NA PB.116.20 chr1 - 2114 15 novel_in_catalog DNAJC11 novel 3201 16 NA NA 1 -6 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AACAAACGGGTTTGGAAATT 12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.116.21 chr1 - 1801 16 full-splice_match DNAJC11 ENST00000377577.10 3201 16 -20 1420 -13 -477 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATGTTTTTATTTTATATT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.116.28 chr1 - 745 4 full-splice_match DNAJC11 ENST00000465911.1 745 4 -3 3 0 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAGCCTGTAATATCTTATT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.117.1 chr1 + 1368 7 novel_not_in_catalog CAMTA1 novel 431 5 NA NA -11 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTGTGGGTCACTTGCGT -27 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 3 NA PB.117.2 chr1 + 2129 3 incomplete-splice_match CAMTA1 ENST00000473578.5 567 4 -26 45010 0 -44830 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAGAAAAAAATGAGAAGT -16 TRUE NA NA GATAAA -24 NA NA NA 3 NA PB.117.3 chr1 + 1048 6 novel_in_catalog CAMTA1 novel 431 5 NA NA 0 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.113385 0.493233 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTGTGGGTCACTTGCGT -16 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 13 NA PB.117.4 chr1 + 978 5 novel_in_catalog CAMTA1 novel 431 5 NA NA 0 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTGTGGGTCACTTGCGT -16 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.117.5 chr1 + 965 5 novel_in_catalog CAMTA1 novel 431 5 NA NA 0 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTGTGGGTCACTTGCGTC -16 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.117.6 chr1 + 937 5 full-splice_match CAMTA1 ENST00000461311.1 431 5 -98 -408 0 2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 84 20.117254 1.303569 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACGAATGTGTGGGTCACTT -16 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 84 NA PB.117.7 chr1 + 857 4 full-splice_match CAMTA1 ENST00000557126.5 486 4 -37 -334 0 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.634403 0.420682 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTGTGGGTCACTTGCGT -16 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 11 NA PB.117.8 chr1 + 859 4 novel_in_catalog CAMTA1 novel 863 4 NA NA 0 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTGTGGGTCACTTGCGT -16 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.117.9 chr1 + 783 3 novel_in_catalog CAMTA1 novel 863 4 NA NA 0 2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACGAATGTGTGGGTCACTT -16 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 3 NA PB.117.10 chr1 + 752 3 novel_in_catalog CAMTA1 novel 863 4 NA NA 0 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTGTGGGTCACTTGCGT -16 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 4 NA PB.117.11 chr1 + 735 5 novel_not_in_catalog CAMTA1 novel 431 5 NA NA 0 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TTTAAAATTTAAGTTTAATG -16 TRUE NA NA AATAAA -23 NA NA NA 7 NA PB.117.12 chr1 + 688 5 novel_not_in_catalog CAMTA1 novel 431 5 NA NA 0 -7 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATAAAGTGTAATCTGTG -16 TRUE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 4 NA PB.117.13 chr1 + 529 3 full-splice_match CAMTA1 ENST00000490738.5 538 3 0 9 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.029314 0.701509 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TAAAATTTAAGTTTAATGAG -16 TRUE NA NA AATAAA -25 NA NA NA 21 NA PB.117.14 chr1 + 597 4 full-splice_match CAMTA1 ENST00000473578.5 567 4 -23 -7 3 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 139 33.289268 1.522304 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATTTAAGTTTAATGAGT -13 TRUE NA NA AATAAA -26 NA NA NA 139 NA PB.117.15 chr1 + 592 5 full-splice_match CAMTA1 ENST00000461311.1 431 5 -87 -74 1 -4 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAATGAAATAGAATAAAG -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.117.16 chr1 + 856 4 full-splice_match CAMTA1 ENST00000476163.5 863 4 5 2 5 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 37 8.861172 0.947491 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTGTGGGTCACTTGCGT -1 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 37 NA PB.121.2 chr1 + 1150 2 intergenic novelGene_157 novel NA NA NA NA NA NA multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTTCCGGAGGTTTGTGTGTT NA FALSE NA NA AAAACA -37 NA NA NA 2 NA PB.126.1 chr1 + 2192 5 full-splice_match VAMP3 ENST00000054666.11 2178 5 -15 1 -15 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 115 27.541479 1.439987 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTGTGGCACCTGTGCTCCT -28 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 115 NA PB.126.2 chr1 + 1048 5 full-splice_match VAMP3 ENST00000054666.11 2178 5 -15 1145 -15 481 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGAACTATGGCTATGACC -28 TRUE NA NA TTTAAA -10 NA NA NA 4 NA PB.126.3 chr1 + 1841 5 full-splice_match VAMP3 ENST00000054666.11 2178 5 24 313 24 -313 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACACAGCTTCCATTTCTTTA 11 TRUE NA NA TATAAA -26 NA NA NA 2 NA PB.126.4 chr1 + 2141 5 full-splice_match VAMP3 ENST00000054666.11 2178 5 36 1 36 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTGTGGCACCTGTGCTCCT 23 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.126.5 chr1 + 920 5 full-splice_match VAMP3 ENST00000054666.11 2178 5 36 1222 36 404 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TACATTGTTGTTATTGTTAT 23 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.126.6 chr1 + 3131 5 full-splice_match VAMP3 ENST00000470357.1 954 5 -559 -1618 -559 -8 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACATGATTGTGGCACCTG 839 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.126.7 chr1 + 2854 5 full-splice_match VAMP3 ENST00000470357.1 954 5 -282 -1618 -282 -8 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACATGATTGTGGCACCTG 1116 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.126.8 chr1 + 2659 5 full-splice_match VAMP3 ENST00000470357.1 954 5 -87 -1618 -87 -8 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACATGATTGTGGCACCTG 1311 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.126.9 chr1 + 2011 3 incomplete-splice_match VAMP3 ENST00000054666.11 2178 5 5863 8 62 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACATGATTGTGGCACCTG 5850 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 7 NA PB.126.10 chr1 + 1876 3 incomplete-splice_match VAMP3 ENST00000054666.11 2178 5 5998 8 197 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.873893 0.458471 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACATGATTGTGGCACCTG 5985 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 12 NA PB.128.1 chr1 - 591 4 full-splice_match UTS2 ENST00000361696.10 591 4 -1 1 -1 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.873893 0.458471 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATATCATGAGTGGTTATTTT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.129.1 chr1 + 2186 13 incomplete-splice_match PER3 ENST00000377532.8 6365 22 0 34235 0 595 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TAAAATGAAAATCCCTTTCT -11 TRUE NA NA AATAAA -7 NA NA NA 2 NA PB.129.6 chr1 + 3955 6 incomplete-splice_match PER3 ENST00000361923.2 6203 21 41914 3 -10191 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGAGAAATTGTCCTGCCCTG 9 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.129.8 chr1 + 3321 5 incomplete-splice_match PER3 ENST00000361923.2 6203 21 42957 1 -9148 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAAATTGTCCTGCCCTGTG 241 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.129.10 chr1 + 2654 2 full-splice_match PER3 ENST00000494684.1 555 2 191 -2290 191 -2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGAGAAATTGTCCTGCCCTG 5200 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.132.1 chr1 + 860 7 full-splice_match PARK7 ENST00000493373.5 624 7 -5 -231 -5 1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGATTGTTTCTTGTTTTGTC 250 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.132.2 chr1 + 845 7 novel_not_in_catalog PARK7 novel 624 7 NA NA 2 1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGATTGTTTCTTGTTTTGTC 257 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.132.3 chr1 + 1307 7 full-splice_match PARK7 ENST00000493678.5 1088 7 -443 224 -414 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTGATTGTTTCTTGTTTTG 7213 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.132.4 chr1 + 958 7 full-splice_match PARK7 ENST00000493678.5 1088 7 -33 163 -4 60 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 1709 409.290344 2.612031 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTGCAGCTCTTAACTGTC -32 TRUE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 1709 NA PB.132.6 chr1 + 964 7 full-splice_match PARK7 ENST00000338639.10 1127 7 0 163 0 60 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 624 149.442459 2.174474 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTGCAGCTCTTAACTGTC 20 TRUE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 624 NA PB.132.7 chr1 + 864 6 novel_in_catalog PARK7 novel 1127 7 NA NA 0 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTGATTGTTTCTTGTTTTG -28 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.132.8 chr1 + 789 6 novel_in_catalog PARK7 novel 1088 7 NA NA 2 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTGATTGTTTCTTGTTTTG -26 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 6 NA PB.132.9 chr1 + 1379 5 incomplete-splice_match PARK7 ENST00000493678.5 1088 7 -20 13572 9 -24 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAAAAAAATAAAATAAAA -19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.132.10 chr1 + 1087 7 full-splice_match PARK7 ENST00000493678.5 1088 7 -16 17 13 -17 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAATACCAATGAGGGCT -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.132.11 chr1 + 817 6 full-splice_match PARK7 ENST00000377493.9 795 6 -22 0 -13 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTGATTGTTTCTTGTTTTG -12 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 6 NA PB.132.13 chr1 + 948 7 novel_not_in_catalog PARK7 novel 1127 7 NA NA 2 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTGATTGTTTCTTGTTTTG 12 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.132.14 chr1 + 835 7 full-splice_match PARK7 ENST00000493678.5 1088 7 27 226 8 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 39 9.340154 0.970354 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTACTGATTGTTTCTTGTTT 28 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 39 NA PB.132.15 chr1 + 784 6 novel_in_catalog PARK7 novel 1127 7 NA NA 17 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTGATTGTTTCTTGTTTTG 37 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.132.16 chr1 + 724 6 incomplete-splice_match PARK7 ENST00000377491.5 977 7 964 -30 91 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACTGATTGTTTCTTGTTTT 915 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 9 NA PB.132.17 chr1 + 576 4 incomplete-splice_match PARK7 ENST00000377491.5 977 7 7479 -30 4022 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACTGATTGTTTCTTGTTTT 7430 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 6 NA PB.135.2 chr1 - 3101 4 full-splice_match ERRFI1 ENST00000377482.10 3097 4 0 -4 0 4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 452 108.249992 2.034428 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTAGTAATGTTTCTTGCCT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 452 NA PB.135.6 chr1 - 3429 4 full-splice_match ERRFI1 ENST00000377482.10 3097 4 -332 0 -332 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TACCATTAGTAATGTTTCTT NA FALSE NA NA CATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.135.8 chr1 - 4120 2 incomplete-splice_match ERRFI1 ENST00000474874.5 479 3 -29 7324 -3 -1 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATACCATTAGTAATGTTTCT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.135.9 chr1 - 2972 4 full-splice_match ERRFI1 ENST00000377482.10 3097 4 124 1 98 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATACCATTAGTAATGTTTCT 124 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.135.10 chr1 - 2811 3 incomplete-splice_match ERRFI1 ENST00000377482.10 3097 4 10750 1 74 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATACCATTAGTAATGTTTCT 4514 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.135.13 chr1 - 4006 3 novel_in_catalog ERRFI1 novel 3097 4 NA NA 0 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GATACCATTAGTAATGTTTC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.135.14 chr1 - 3018 3 full-splice_match ERRFI1 ENST00000469499.5 995 3 -13 -2010 0 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GATACCATTAGTAATGTTTC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.135.22 chr1 - 3105 4 full-splice_match ERRFI1 ENST00000487559.1 787 4 -10 -2308 3 -5 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 34 8.142698 0.910768 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TATGATACCATTAGTAATGT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 34 NA PB.135.24 chr1 - 3164 5 novel_not_in_catalog ERRFI1 novel 3097 4 NA NA 0 -8 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATTTATGATACCATTAGTAA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.135.26 chr1 - 2614 4 full-splice_match ERRFI1 ENST00000377482.10 3097 4 0 483 0 -483 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTCAGTATTTCCTGGGGAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.135.28 chr1 - 2342 4 full-splice_match ERRFI1 ENST00000377482.10 3097 4 0 755 0 -755 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TGACTAATTTTCCCTTACAG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.135.30 chr1 - 1747 4 full-splice_match ERRFI1 ENST00000487559.1 787 4 -13 -947 0 334 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGTCTTCATGTGGAAGGTTT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.135.31 chr1 - 1731 4 full-splice_match ERRFI1 ENST00000377482.10 3097 4 0 1366 0 334 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.634403 0.420682 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGTCTTCATGTGGAAGGTTT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.136.2 chr1 - 3895 5 incomplete-splice_match RERE ENST00000476556.5 4598 13 63772 -1687 2950 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AACCCTTGGGTGTCTCCCGT 7008 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.136.3 chr1 - 3448 4 incomplete-splice_match RERE ENST00000476556.5 4598 13 65066 -1687 -3518 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AACCCTTGGGTGTCTCCCGT 8302 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.141.2 chr1 + 1046 4 incomplete-splice_match SLC45A1 ENST00000471889.7 2496 9 -6 17895 -6 -9839 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TTATATTCGTGGATTCTCAT 4 TRUE NA NA TATAAA -10 NA NA NA 4 NA PB.141.3 chr1 + 2496 9 full-splice_match SLC45A1 ENST00000471889.7 2496 9 0 0 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TATGGTTTCTAGGCATTGCT 10 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 6 NA PB.152.1 chr1 - 1823 12 full-splice_match ENO1 ENST00000234590.10 1781 12 -46 4 -12 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 12061 2888.502441 3.460673 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT 525 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12061 NA PB.152.2 chr1 - 2373 12 novel_in_catalog ENO1 novel 1837 13 NA NA 0 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATACTCCGTGTGCCTGTGTA -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.152.3 chr1 - 3157 11 novel_in_catalog ENO1 novel 1781 12 NA NA 0 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.152.4 chr1 - 1885 13 novel_in_catalog ENO1 novel 1837 13 NA NA 0 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.152.6 chr1 - 1750 12 full-splice_match ENO1 ENST00000234590.10 1781 12 27 4 -13 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.152.7 chr1 - 1726 12 novel_in_catalog ENO1 novel 1781 12 NA NA 1 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.152.8 chr1 - 1724 11 novel_in_catalog ENO1 novel 1782 12 NA NA 0 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.152.9 chr1 - 1687 11 novel_in_catalog ENO1 novel 1837 13 NA NA 0 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.152.10 chr1 - 1544 11 novel_not_in_catalog ENO1 novel 1819 10 NA NA 0 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.152.11 chr1 - 1112 6 novel_not_in_catalog ENO1 novel 2548 9 NA NA 4326 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATACTCCGTGTGCCTGTGT 8171 FALSE NA NA AATGAA -21 NA NA NA 2 NA PB.152.12 chr1 - 1772 9 novel_not_in_catalog ENO1 novel 2548 9 NA NA 2784 2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATACTCCGTGTGCCTGTG 9919 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.152.13 chr1 - 1625 9 full-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 920 3 920 2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATACTCCGTGTGCCTGTG 8601 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.152.14 chr1 - 1281 7 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 4395 3 4395 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 377 90.288155 1.955631 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATACTCCGTGTGCCTGTG -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 377 NA PB.152.15 chr1 - 995 5 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 6092 3 6092 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 424 101.544235 2.006655 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATACTCCGTGTGCCTGTG 9937 FALSE NA NA AAAACA -18 NA NA NA 424 NA PB.152.16 chr1 - 571 3 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 8255 3 8255 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.592367 0.555381 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATACTCCGTGTGCCTGTG 8623 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.152.17 chr1 - 2355 12 full-splice_match ENO1 ENST00000234590.10 1781 12 -580 6 -76 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.071349 0.609738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATACTCCGTGTGCCTGT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.152.18 chr1 - 2179 12 full-splice_match ENO1 ENST00000234590.10 1781 12 -404 6 2 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.550332 0.658043 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATACTCCGTGTGCCTGT -19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.152.19 chr1 - 1816 12 novel_in_catalog ENO1 novel 1781 12 NA NA -95 1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATACTCCGTGTGCCTGT 895 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.152.20 chr1 - 1688 12 full-splice_match ENO1 ENST00000234590.10 1781 12 87 6 47 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 310 74.242249 1.870651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATACTCCGTGTGCCTGT 658 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 310 NA PB.152.21 chr1 - 1550 10 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000234590.10 1781 12 6724 6 -18 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 401 96.035942 1.982434 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATACTCCGTGTGCCTGT 7295 FALSE NA NA AAAAAG -8 NA NA NA 401 NA PB.152.22 chr1 - 1432 10 novel_not_in_catalog ENO1 novel 1837 13 NA NA 0 1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATACTCCGTGTGCCTGT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.152.24 chr1 - 1371 5 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 5715 4 5715 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATACTCCGTGTGCCTGT 9560 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.152.25 chr1 - 1421 8 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 3517 4 3517 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 590 141.299759 2.150141 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATACTCCGTGTGCCTGT 9982 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 590 NA PB.152.26 chr1 - 1150 6 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 5140 4 5140 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 324 77.595123 1.889834 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATACTCCGTGTGCCTGT 8985 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 324 NA PB.152.27 chr1 - 1083 6 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 5207 4 5207 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 343 82.145454 1.914584 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATACTCCGTGTGCCTGT 9052 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 343 NA PB.152.28 chr1 - 862 5 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 6224 4 6224 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 136 32.570793 1.512828 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATACTCCGTGTGCCTGT 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 136 NA PB.152.29 chr1 - 712 4 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 7566 4 7566 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 67 16.045906 1.205364 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAATACTCCGTGTGCCTGT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 67 NA PB.152.30 chr1 - 2133 12 novel_in_catalog ENO1 novel 1837 13 NA NA -87 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAGAATACTCCGTGTGCCTG -20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.152.31 chr1 - 1881 12 novel_not_in_catalog ENO1 novel 1837 13 NA NA 2604 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAGAATACTCCGTGTGCCTG -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.152.32 chr1 - 1736 12 novel_not_in_catalog ENO1 novel 1837 13 NA NA 0 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAGAATACTCCGTGTGCCTG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.152.33 chr1 - 1737 8 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 3200 5 3200 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAGAATACTCCGTGTGCCTG 9694 FALSE NA NA AATAAA -1 NA NA NA 2 NA PB.152.34 chr1 - 1505 8 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 3432 5 3432 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAGAATACTCCGTGTGCCTG 9926 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.152.35 chr1 - 1438 9 full-splice_match ENO1 ENST00000464920.2 2548 9 1105 5 1105 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAGAATACTCCGTGTGCCTG 8786 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.152.36 chr1 - 848 8 novel_not_in_catalog ENO1 novel 1837 13 NA NA -5 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAGAATACTCCGTGTGCCTG 532 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.152.37 chr1 - 710 7 incomplete-splice_match ENO1 ENST00000645609.1 1819 10 406 3238 0 9 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATATGGGAAAGATGCCAC 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.153.1 chr1 - 1608 8 incomplete-splice_match SLC2A5 ENST00000377424.9 4085 12 27820 1838 -1920 1487 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGACGTGCTGCTGTTCTTTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.153.2 chr1 - 2208 12 full-splice_match SLC2A5 ENST00000377424.9 4085 12 35 1842 4 1483 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 34 8.142698 0.910768 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGACGTGCTGCTGTTC -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 34 NA PB.153.3 chr1 - 2047 11 incomplete-splice_match SLC2A5 ENST00000377424.9 4085 12 11449 1842 11418 1483 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGACGTGCTGCTGTTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.153.4 chr1 - 1763 9 incomplete-splice_match SLC2A5 ENST00000377424.9 4085 12 21989 1842 -7751 1483 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGACGTGCTGCTGTTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.153.6 chr1 - 1865 12 full-splice_match SLC2A5 ENST00000377424.9 4085 12 -14 2234 -14 1091 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CACTTTGCTGGTTCAGCCTT -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.153.7 chr1 - 1677 12 full-splice_match SLC2A5 ENST00000377424.9 4085 12 39 2369 8 956 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATGCAGTCCTCATCTCCAG -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.158.1 chr1 + 2307 5 fusion H6PD_SPSB1 novel 9147 5 NA NA 0 0 multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TACATTGAGCTCCAATCTGC -23 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.158.7 chr1 + 1380 2 novel_not_in_catalog H6PD novel 2701 2 NA NA 1182 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATCCGGGCTTTAATTCT NA FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.158.21 chr1 + 1281 3 full-splice_match SPSB1 ENST00000328089.11 3106 3 157 1668 157 1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACATTGAGCTCCAATCTGCT 156 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.158.22 chr1 + 2905 2 full-splice_match SPSB1 ENST00000377399.2 1007 2 56 -1954 56 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACCATTTTTGAATTCCTC 22 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 3 NA PB.158.23 chr1 + 2576 2 full-splice_match SPSB1 ENST00000377399.2 1007 2 385 -1954 385 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACCATTTTTGAATTCCTC 351 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.158.24 chr1 + 2119 2 full-splice_match SPSB1 ENST00000377399.2 1007 2 834 -1946 834 -11 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATATCAAACCATTTTTG 800 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.159.1 chr1 + 1498 7 full-splice_match SLC25A33 ENST00000302692.7 3865 7 -40 2407 -40 -2407 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 236 56.519905 1.752201 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGTATACATTTGGCTTGTG NA FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 236 NA PB.159.2 chr1 + 960 5 novel_in_catalog SLC25A33 novel 3865 7 NA NA -23 -4891 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTTGTTTGTGGGTATATCT -9 TRUE NA NA AGTAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.159.3 chr1 + 2386 7 full-splice_match SLC25A33 ENST00000302692.7 3865 7 19 1460 19 -1460 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AACATTAAAAAAAAAAAAAA -8 TRUE NA NA TTTAAA -12 NA NA NA 8 NA PB.159.4 chr1 + 1375 6 novel_in_catalog SLC25A33 novel 3865 7 NA NA 22 -2401 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACATTTGGCTTGTGTCCTCT -5 TRUE NA NA ATTAAA -23 NA NA NA 5 NA PB.159.5 chr1 + 1295 7 full-splice_match SLC25A33 ENST00000302692.7 3865 7 22 2548 22 -2548 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 37 8.861172 0.947491 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACCTGTTGGACATTTCCTTT -5 TRUE NA NA CATAAA -17 NA NA NA 37 NA PB.159.6 chr1 + 1273 5 novel_in_catalog SLC25A33 novel 3865 7 NA NA 22 -2402 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACATTTGGCTTGTGTCCTC -5 TRUE NA NA ATTAAA -22 NA NA NA 5 NA PB.159.7 chr1 + 1516 8 novel_not_in_catalog SLC25A33 novel 3865 7 NA NA 24 -2401 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACATTTGGCTTGTGTCCTCT -3 TRUE NA NA ATTAAA -23 NA NA NA 2 NA PB.159.8 chr1 + 1338 6 novel_in_catalog SLC25A33 novel 3865 7 NA NA 24 -2402 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 20 4.789823 0.680319 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACATTTGGCTTGTGTCCTC -3 TRUE NA NA ATTAAA -22 NA NA NA 20 NA PB.159.9 chr1 + 1113 6 novel_in_catalog SLC25A33 novel 3865 7 NA NA 24 -2627 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGAGAATTTTTTTTCCCCAT -3 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.159.10 chr1 + 1014 6 incomplete-splice_match SLC25A33 ENST00000302692.7 3865 7 24 4891 24 -4891 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTTGTTTGTGGGTATATCT -3 TRUE NA NA AGTAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.159.12 chr1 + 1233 6 novel_in_catalog SLC25A33 novel 3865 7 NA NA 129 -2402 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACATTTGGCTTGTGTCCTC 102 FALSE NA NA ATTAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.159.13 chr1 + 1248 7 full-splice_match SLC25A33 ENST00000302692.7 3865 7 218 2399 218 -2399 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTTGGCTTGTGTCCTCTTT 23 FALSE NA NA ATTAAA -25 NA NA NA 3 NA PB.159.14 chr1 + 1067 6 incomplete-splice_match SLC25A33 ENST00000302692.7 3865 7 14274 2402 14274 -2402 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.352876 0.525417 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACATTTGGCTTGTGTCCTC 3699 FALSE NA NA ATTAAA -22 NA NA NA 14 NA PB.159.15 chr1 + 877 4 incomplete-splice_match SLC25A33 ENST00000302692.7 3865 7 30839 2401 30839 -2401 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACATTTGGCTTGTGTCCTCT NA FALSE NA NA ATTAAA -23 NA NA NA 8 NA PB.159.16 chr1 + 755 2 incomplete-splice_match SLC25A33 ENST00000302692.7 3865 7 40489 2401 40489 -2401 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACATTTGGCTTGTGTCCTCT NA FALSE NA NA ATTAAA -23 NA NA NA 4 NA PB.160.1 chr1 + 3975 11 full-splice_match TMEM201 ENST00000340381.11 3815 11 -160 0 -160 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CCTGCTGGCTGTCTGTATTC 12 TRUE NA NA AAAAAG -33 NA NA NA 8 NA PB.160.2 chr1 + 3856 6 full-splice_match TMEM201 ENST00000340305.9 3851 6 -11 6 0 -6 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCGCTGGCGTCAGGTGCC 17 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.160.3 chr1 + 3311 3 incomplete-splice_match TMEM201 ENST00000340305.9 3851 6 9622 7 1647 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACCCGCTGGCGTCAGGTGC 1627 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.160.6 chr1 + 2103 3 incomplete-splice_match TMEM201 ENST00000416541.5 3447 8 13836 -4 3005 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CCTGCTGGCTGTCTGTATTC 3016 FALSE NA NA AAAAAG -33 NA NA NA 3 NA PB.161.1 chr1 - 2348 2 full-splice_match LINC02606 ENST00000641325.1 2442 2 91 3 -24 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACATGAATGTGTTTGATTCT -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.163.1 chr1 - 4719 20 fusion CLSTN1_CTNNBIP1 novel 4760 19 NA NA 6 5 multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCCGGAGCGGGGTTTGTCT -30 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.163.2 chr1 - 4640 18 full-splice_match CLSTN1 ENST00000361311.4 4647 18 13 -6 -6 5 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.352876 0.525417 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCCGGAGCGGGGTTTGTCT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.163.3 chr1 - 3469 12 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 2042 -6 628 5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCCGGAGCGGGGTTTGTCT 5689 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.163.4 chr1 - 3179 11 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 7149 -6 5735 5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCCGGAGCGGGGTTTGTCT 7192 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.163.5 chr1 - 4559 17 novel_in_catalog CLSTN1 novel 4647 18 NA NA 12 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 33 7.903207 0.897803 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT 13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 33 NA PB.163.6 chr1 - 4512 19 full-splice_match CLSTN1 ENST00000377298.9 4760 19 146 102 146 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT 796 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.163.7 chr1 - 3572 12 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 1933 0 519 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT 5580 FALSE NA NA AAAACA -9 NA NA NA 3 NA PB.163.8 chr1 - 3598 13 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000361311.4 4647 18 74367 0 550 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT 5611 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.163.9 chr1 - 3280 11 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 7042 0 5628 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT 7085 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.163.10 chr1 - 2657 7 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 16001 0 -2094 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.163.11 chr1 - 2340 6 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 16610 0 -1485 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.163.12 chr1 - 2239 5 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 17516 0 -579 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 24 5.747787 0.759501 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 24 NA PB.163.13 chr1 - 2065 4 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 18115 0 20 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.163.14 chr1 - 1785 2 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 20269 0 2174 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTCCAGCCGGAGCGGGGT -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.163.20 chr1 - 4652 19 full-splice_match CLSTN1 ENST00000377298.9 4760 19 5 103 5 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACTCCAGCCGGAGCGGGG 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.163.21 chr1 - 4337 16 novel_not_in_catalog CLSTN1 novel 4647 18 NA NA 18 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACTCCAGCCGGAGCGGGG 668 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.163.22 chr1 - 4210 17 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000361311.4 4647 18 50684 1 -21719 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACTCCAGCCGGAGCGGGG 25 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.163.23 chr1 - 3903 14 full-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 -75 1 -75 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACTCCAGCCGGAGCGGGG 3572 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.163.24 chr1 - 3926 15 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000361311.4 4647 18 72362 1 -41 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACTCCAGCCGGAGCGGGG 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.163.25 chr1 - 3348 12 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000650348.1 4457 19 79118 2 5616 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACTCCAGCCGGAGCGGGG 7073 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.163.26 chr1 - 3007 9 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 10330 1 -7765 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACTCCAGCCGGAGCGGGG 8727 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.163.27 chr1 - 2964 10 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000650348.1 4457 19 82518 2 -7665 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACTCCAGCCGGAGCGGGG 8827 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.163.28 chr1 - 2838 8 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 15550 1 -2545 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACTCCAGCCGGAGCGGGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.163.29 chr1 - 2669 8 novel_not_in_catalog CLSTN1 novel 3829 14 NA NA -2417 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACTCCAGCCGGAGCGGGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.163.30 chr1 - 2506 6 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 16443 1 -1652 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.592367 0.555381 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACTCCAGCCGGAGCGGGG NA FALSE NA NA AAGAAA -1 NA NA NA 15 NA PB.163.31 chr1 - 2078 4 novel_in_catalog CLSTN1 novel 3829 14 NA NA -604 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACTCCAGCCGGAGCGGGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.163.32 chr1 - 1926 3 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 19757 1 1662 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.592367 0.555381 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACTCCAGCCGGAGCGGGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.163.36 chr1 - 2738 13 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 1709 941 295 -941 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AACCCGGGACTGGAATGTAA 5356 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.163.38 chr1 - 1710 7 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 16007 941 -2088 -941 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AACCCGGGACTGGAATGTAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.163.39 chr1 - 1376 5 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 17438 941 -657 -941 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AACCCGGGACTGGAATGTAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.163.40 chr1 - 3610 17 novel_in_catalog CLSTN1 novel 4647 18 NA NA 9 -952 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGTGCTAGTGTAACCCGGGA 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.163.41 chr1 - 3685 18 full-splice_match CLSTN1 ENST00000361311.4 4647 18 10 952 -9 -952 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGTGCTAGTGTAACCCGGGA -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.163.42 chr1 - 1800 8 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 15637 952 -2458 -952 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGTGCTAGTGTAACCCGGGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.163.43 chr1 - 1399 6 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 16599 952 -1496 -952 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGTGCTAGTGTAACCCGGGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.163.44 chr1 - 1470 6 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 16527 953 -1568 -953 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTGTGCTAGTGTAACCCGGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.163.45 chr1 - 2955 14 full-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 -81 955 -81 -955 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CTTTGTGCTAGTGTAACCCG 3566 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.163.46 chr1 - 1189 4 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000435891.5 3829 14 18036 955 -59 -955 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CTTTGTGCTAGTGTAACCCG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.163.48 chr1 - 987 7 fusion CLSTN1_CTNNBIP1 novel 4647 18 NA NA 14 -1983 multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAATCGAGGAGCCGGCTT -22 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.163.49 chr1 - 853 4 incomplete-splice_match CLSTN1 ENST00000361311.4 4647 18 19 22443 0 -1983 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.029314 0.701509 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAATCGAGGAGCCGGCTT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 21 NA PB.163.50 chr1 - 2704 3 incomplete-splice_match CTNNBIP1 ENST00000377256.1 451 5 6099 -2386 6099 3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTGTGAGCTGAGCTGGTTTC 5903 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.163.51 chr1 - 2996 5 full-splice_match CTNNBIP1 ENST00000400904.7 1206 5 43 -1833 -24 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 63 15.087941 1.178630 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CGTGTGTGAGCTGAGCTGGT 79 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 63 NA PB.163.52 chr1 - 3092 6 full-splice_match CTNNBIP1 ENST00000377263.6 3006 6 -86 0 -19 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CGTGTGTGAGCTGAGCTGGT -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.163.57 chr1 - 3057 5 full-splice_match CTNNBIP1 ENST00000400904.7 1206 5 -19 -1832 -19 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TCGTGTGTGAGCTGAGCTGG -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.163.59 chr1 - 3151 6 novel_not_in_catalog CTNNBIP1 novel 3006 6 NA NA 14 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTCGTGTGTGAGCTGAGCTG -22 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.163.60 chr1 - 2885 4 novel_in_catalog CTNNBIP1 novel 3006 6 NA NA 0 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTCGTGTGTGAGCTGAGCTG -36 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.163.64 chr1 - 2980 6 full-splice_match CTNNBIP1 ENST00000377263.6 3006 6 21 5 21 -5 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGTTCGTGTGTGAGCTGAG -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.163.65 chr1 - 1266 6 full-splice_match CTNNBIP1 ENST00000377263.6 3006 6 -92 1832 -25 1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTGGGGTTTGTGTTTGAT 11 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.163.66 chr1 - 1041 4 novel_in_catalog CTNNBIP1 novel 1206 5 NA NA 14 1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTGGGGTTTGTGTTTGAT -22 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.163.67 chr1 - 1158 6 full-splice_match CTNNBIP1 ENST00000377263.6 3006 6 14 1834 14 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.029314 0.701509 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACATTTGGGGTTTGTGTTTG -22 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 21 NA PB.163.68 chr1 - 1218 5 full-splice_match CTNNBIP1 ENST00000400904.7 1206 5 -13 1 -13 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.831858 0.583409 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACATTTGGGGTTTGTGTTTG -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.163.69 chr1 - 1150 6 novel_not_in_catalog CTNNBIP1 novel 3006 6 NA NA 94 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACATTTGGGGTTTGTGTTTG 58 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.163.70 chr1 - 1132 5 full-splice_match CTNNBIP1 ENST00000400904.7 1206 5 73 1 6 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 268 64.183624 1.807424 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACATTTGGGGTTTGTGTTTG -30 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 268 NA PB.163.71 chr1 - 1013 5 full-splice_match CTNNBIP1 ENST00000400904.7 1206 5 192 1 125 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACATTTGGGGTTTGTGTTTG 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.163.72 chr1 - 1117 5 novel_not_in_catalog CTNNBIP1 novel 1206 5 NA NA 14 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CACATTTGGGGTTTGTGTTT -22 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.163.73 chr1 - 1014 5 full-splice_match CTNNBIP1 ENST00000377258.5 852 5 -149 -13 -149 13 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTTCTGACTCTTATTTTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.163.74 chr1 - 789 5 full-splice_match CTNNBIP1 ENST00000400904.7 1206 5 81 336 14 5 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.550332 0.658043 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TATTTTTATTTCTGACTCTT -22 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.163.75 chr1 - 889 5 full-splice_match CTNNBIP1 ENST00000400904.7 1206 5 -19 336 -19 5 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TATTTTTATTTCTGACTCTT -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.163.77 chr1 - 1079 2 novel_not_in_catalog CTNNBIP1 novel 3006 6 NA NA 21 -29292 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAAATATGCTGCTGTTTGGT -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.164.1 chr1 + 5111 23 novel_in_catalog PIK3CD novel 5412 24 NA NA -7 -203 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAGAAAGAAAAAGCCTTT -16 TRUE NA NA AGTAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.164.2 chr1 + 5208 24 full-splice_match PIK3CD ENST00000377346.9 5412 24 1 203 0 -203 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAGAAAGAAAAAGCCTTT -8 TRUE NA NA AGTAAA -9 NA NA NA 4 NA PB.164.3 chr1 + 3525 13 incomplete-splice_match PIK3CD ENST00000361110.6 3508 23 10418 -1679 4340 -203 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAGAAAGAAAAAGCCTTT 2807 FALSE NA NA AGTAAA -9 NA NA NA 4 NA PB.164.4 chr1 + 3341 12 incomplete-splice_match PIK3CD ENST00000361110.6 3508 23 10682 -1679 4604 -203 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAGAAAGAAAAAGCCTTT 3071 FALSE NA NA AGTAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.164.5 chr1 + 2654 6 incomplete-splice_match PIK3CD ENST00000361110.6 3508 23 12329 -1679 6251 -203 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAGAAAGAAAAAGCCTTT 4718 FALSE NA NA AGTAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.164.6 chr1 + 2524 5 incomplete-splice_match PIK3CD ENST00000361110.6 3508 23 12977 -1679 6899 -203 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAGAAAGAAAAAGCCTTT 5366 FALSE NA NA AGTAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.164.7 chr1 + 2406 4 incomplete-splice_match PIK3CD ENST00000361110.6 3508 23 13770 -1678 7692 -204 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 GAAAAGAAAGAAAAAGCCTT 6159 FALSE NA NA AGTAAA -8 NA NA NA 2 NA PB.164.8 chr1 + 2162 3 incomplete-splice_match PIK3CD ENST00000361110.6 3508 23 14197 -1678 8119 -204 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 GAAAAGAAAGAAAAAGCCTT 6586 FALSE NA NA AGTAAA -8 NA NA NA 2 NA PB.165.1 chr1 + 933 5 novel_in_catalog NMNAT1 novel 3734 5 NA NA 5 -7 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACAACAGTTTGTGGTAGTC -27 TRUE NA NA AATAAA -7 NA NA NA 2 NA PB.165.3 chr1 + 1611 5 full-splice_match NMNAT1 ENST00000377205.6 3734 5 -21 2144 -21 -315 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAGAGAAAAAAAAAAAAGA -7 TRUE NA NA AAAAAG -15 NA NA NA 4 NA PB.165.4 chr1 + 1006 6 novel_not_in_catalog NMNAT1 novel 3734 5 NA NA -21 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TTGTGGTAGTCTGATGGAGA -7 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.165.6 chr1 + 1389 5 full-splice_match NMNAT1 ENST00000377205.6 3734 5 -11 2356 -11 -527 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.310840 0.634562 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAAATAAGTTTTTGTTTGT 3 TRUE NA NA AGTAAA -15 NA NA NA 18 NA PB.165.7 chr1 + 1046 5 full-splice_match NMNAT1 ENST00000403197.5 1094 5 47 1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTCTCCTGCAGTGGTCTC 14 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 8 NA PB.166.1 chr1 + 4884 27 full-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 123 -235 -3 235 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATTTGAATTTCAGTTTTTT -5 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 8 NA PB.166.2 chr1 + 5512 27 full-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 126 -866 0 -6 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAAATCTTCTTTGAGTCT -2 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 5 NA PB.166.3 chr1 + 1584 3 full-splice_match UBE4B ENST00000377153.5 1273 3 -315 4 1 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATAATGTTTCCTCTGTATGT -1 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 5 NA PB.166.4 chr1 + 1006 3 full-splice_match UBE4B ENST00000377153.5 1273 3 -262 529 54 -529 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATTGCAGATTTCCTCGTCT 52 FALSE NA NA ATTAAA -25 NA NA NA 2 NA PB.166.5 chr1 + 5332 27 full-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 306 -866 -136 -6 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAAATCTTCTTTGAGTCT -44 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.166.6 chr1 + 4675 27 full-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 332 -235 -110 235 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATTTGAATTTCAGTTTTTT -18 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 6 NA PB.166.7 chr1 + 5257 27 full-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 381 -866 -61 -6 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAAATCTTCTTTGAGTCT 31 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.166.8 chr1 + 3848 25 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 62736 -233 -5293 233 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGAATTTGAATTTCAGTTTT 7838 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.166.9 chr1 + 4269 23 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 70209 -864 2180 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAAGAAATCTTCTTTGAGT NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.166.10 chr1 + 3280 21 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 84711 -240 -4499 240 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATTTCAGTTTTTTTTTTC NA FALSE NA NA AATAAA -25 NA NA NA 2 NA PB.166.11 chr1 + 3745 19 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000343090.11 5905 28 89006 6 -78 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAAATCTTCTTTGAGTCT NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.166.12 chr1 + 2892 17 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 96590 -240 1083 240 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATTTCAGTTTTTTTTTTC NA FALSE NA NA AATAAA -25 NA NA NA 2 NA PB.166.13 chr1 + 3342 15 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000343090.11 5905 28 97789 6 2408 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAAATCTTCTTTGAGTCT NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.166.14 chr1 + 3131 13 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000343090.11 5905 28 102057 9 6676 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 CAGAAGAAATCTTCTTTGAG NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.166.15 chr1 + 2478 13 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 102206 -233 6699 233 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGAATTTGAATTTCAGTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 6 NA PB.166.16 chr1 + 3025 13 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000343090.11 5905 28 102164 8 6783 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAAGAAATCTTCTTTGAGT NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.166.17 chr1 + 2814 11 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000343090.11 5905 28 111989 8 -13407 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAAGAAATCTTCTTTGAGT NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 5 NA PB.166.18 chr1 + 1962 9 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 116352 -233 -9170 233 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGAATTTGAATTTCAGTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.166.19 chr1 + 2490 8 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000343090.11 5905 28 118374 6 -7022 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAAATCTTCTTTGAGTCT NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.166.20 chr1 + 1621 7 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 125532 -235 10 235 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATTTGAATTTCAGTTTTTT 2926 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.166.21 chr1 + 2241 7 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000343090.11 5905 28 125417 6 21 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAAATCTTCTTTGAGTCT 2937 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.166.22 chr1 + 1414 6 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000253251.12 4772 27 128404 -241 2882 241 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTTCAGTTTTTTTTTTCT 5798 FALSE NA NA AATAAA -26 NA NA NA 3 NA PB.166.23 chr1 + 2037 6 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000343090.11 5905 28 128280 6 2884 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAAATCTTCTTTGAGTCT 5800 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.166.24 chr1 + 1156 4 full-splice_match UBE4B ENST00000487244.5 818 4 248 -586 248 235 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATTTGAATTTCAGTTTTTT 853 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 6 NA PB.166.25 chr1 + 1773 4 full-splice_match UBE4B ENST00000487244.5 818 4 260 -1215 260 -8 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.634403 0.420682 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAAGAAATCTTCTTTGAGT 865 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 11 NA PB.166.26 chr1 + 1035 3 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000487244.5 818 4 7689 -592 -371 241 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTTCAGTTTTTTTTTTCT 7394 FALSE NA NA AATAAA -26 NA NA NA 4 NA PB.166.27 chr1 + 1609 3 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000487244.5 818 4 7738 -1215 -322 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAAGAAATCTTCTTTGAGT 7443 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 6 NA PB.166.28 chr1 + 879 3 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000487244.5 818 4 7837 -584 -223 233 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGAATTTGAATTTCAGTTTT 7542 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.166.29 chr1 + 1371 2 incomplete-splice_match UBE4B ENST00000465408.1 355 3 515 -1283 515 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.873893 0.458471 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAAATCTTCTTTGAGTCT 8280 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 12 NA PB.167.1 chr1 + 1607 4 incomplete-splice_match KIF1B ENST00000377093.9 7800 21 -37 49106 -37 -22892 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAAAAAAAAAATTTTTT -9 TRUE NA NA ACTAAA -36 NA NA NA 9 NA PB.167.4 chr1 + 2277 19 incomplete-splice_match KIF1B ENST00000377093.9 7800 21 -26 11561 -26 4702 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 GAAAAACAAGGAATTGATAT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.167.5 chr1 + 5984 21 full-splice_match KIF1B ENST00000377093.9 7800 21 -24 1840 -24 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.167.6 chr1 + 5875 21 novel_not_in_catalog KIF1B novel 7800 21 NA NA 0 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.167.13 chr1 + 4217 8 incomplete-splice_match KIF1B ENST00000377083.5 5885 21 60376 1 8690 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.167.18 chr1 + 3593 1 full-splice_match RN7SL731P ENST00000584329.2 293 1 -3300 0 -3300 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 7446 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.167.19 chr1 + 3472 1 full-splice_match RN7SL731P ENST00000584329.2 293 1 -3179 0 -3179 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 7567 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.167.20 chr1 + 3292 1 full-splice_match RN7SL731P ENST00000584329.2 293 1 -3000 1 -3000 -1 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 7746 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.167.21 chr1 + 3051 1 full-splice_match RN7SL731P ENST00000584329.2 293 1 -2759 1 -2759 -1 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 7987 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.167.22 chr1 + 2803 1 full-splice_match RN7SL731P ENST00000584329.2 293 1 -2510 0 -2510 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 8236 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.167.24 chr1 + 2501 1 full-splice_match RN7SL731P ENST00000584329.2 293 1 -2209 1 -2209 -1 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 8537 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.167.25 chr1 + 2260 1 full-splice_match RN7SL731P ENST00000584329.2 293 1 -1968 1 -1968 -1 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 8778 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.167.26 chr1 + 1641 1 full-splice_match RN7SL731P ENST00000584329.2 293 1 -1349 1 -1349 -1 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 9397 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.167.27 chr1 + 1444 1 full-splice_match RN7SL731P ENST00000584329.2 293 1 -1151 0 -1151 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 9595 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.167.28 chr1 + 1298 1 full-splice_match RN7SL731P ENST00000584329.2 293 1 -1005 0 -1005 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 9741 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.167.29 chr1 + 1231 1 full-splice_match RN7SL731P ENST00000584329.2 293 1 -939 1 -939 -1 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 9807 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.172.1 chr1 - 1034 8 novel_in_catalog LZIC novel 652 5 NA NA 22 -14 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAATTAATGAGAGTATAG -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.172.5 chr1 - 1885 8 full-splice_match LZIC ENST00000377213.1 945 8 33 -973 17 440 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TTCTGTACTGTAAACTACTA -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.172.6 chr1 - 1950 8 full-splice_match LZIC ENST00000377223.6 4989 8 51 2988 51 439 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CTTCTGTACTGTAAACTACT 20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.172.7 chr1 - 1538 8 full-splice_match LZIC ENST00000377223.6 4989 8 35 3416 35 11 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CCCCAGCCTGTAAGCTGTCT 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.172.8 chr1 - 1465 8 full-splice_match LZIC ENST00000377213.1 945 8 24 -544 8 11 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CCCCAGCCTGTAAGCTGTCT -23 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.172.9 chr1 - 1391 7 novel_in_catalog LZIC novel 4989 8 NA NA 62 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGGGACCATCCCCCAGCCT 31 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.172.10 chr1 - 1127 8 full-splice_match LZIC ENST00000377223.6 4989 8 49 3813 49 147 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAAGGCTGTTTGTTTTTAAG 18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.172.11 chr1 - 1056 8 full-splice_match LZIC ENST00000377213.1 945 8 33 -144 17 144 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TATTAAGGCTGTTTGTTTTT -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.172.12 chr1 - 834 6 novel_in_catalog LZIC novel 4989 8 NA NA 35 18 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCATTGTGCGTTGTGTGCG 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.172.13 chr1 - 1216 7 full-splice_match LZIC ENST00000400903.6 1405 7 -340 529 283 4 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGTTTATGCTCTTCATCATT 252 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.172.14 chr1 - 858 8 novel_not_in_catalog LZIC novel 945 8 NA NA 9 9 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGCTCTTCATCATTGTGCG -22 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.172.15 chr1 - 941 8 full-splice_match LZIC ENST00000377223.6 4989 8 95 3953 95 7 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTATGCTCTTCATCATTGTG 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.172.16 chr1 - 914 8 full-splice_match LZIC ENST00000377213.1 945 8 35 -4 19 4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 48 11.495574 1.060531 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGTTTATGCTCTTCATCATT -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 48 NA PB.172.17 chr1 - 987 8 full-splice_match LZIC ENST00000377223.6 4989 8 42 3960 42 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 36 8.621680 0.935592 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTTGTGTTTATGCTCTTCAT 11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 36 NA PB.175.1 chr1 + 1927 13 novel_not_in_catalog PGD novel 2268 13 NA NA -26 311 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGATGCTCTTTCTCCAGATT NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.175.2 chr1 + 1940 13 full-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 -40 368 -20 313 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 313 74.960724 1.874834 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGCTCTTTCTCCAGATTCT NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 313 NA PB.175.7 chr1 + 2275 13 full-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 -8 1 -8 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 48 11.495574 1.060531 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTTGGTCTGATTTATTTC -12 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 48 NA PB.175.8 chr1 + 1833 12 novel_in_catalog PGD novel 2268 13 NA NA 0 312 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GATGCTCTTTCTCCAGATTC -4 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.175.9 chr1 + 2019 12 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 385 367 -49 314 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGCTCTTTCTCCAGATTCTT 57 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 7 NA PB.175.10 chr1 + 1726 11 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 1365 368 797 313 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 35 8.382190 0.923357 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGCTCTTTCTCCAGATTCT 1037 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 35 NA PB.175.11 chr1 + 2068 11 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 1390 1 822 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTTGGTCTGATTTATTTC 1062 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.175.12 chr1 + 1582 10 novel_in_catalog PGD novel 2268 13 NA NA 874 312 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GATGCTCTTTCTCCAGATTC 1114 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.175.13 chr1 + 1582 10 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 4007 368 3439 313 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 27 6.466260 0.810653 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGCTCTTTCTCCAGATTCT 3679 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 27 NA PB.175.14 chr1 + 1883 9 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 5097 1 4529 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTTGGTCTGATTTATTTC 4769 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.175.16 chr1 + 1433 9 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 5178 370 4610 311 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 41 9.819137 0.992073 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGATGCTCTTTCTCCAGATT 4850 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 41 NA PB.175.17 chr1 + 1794 9 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 5185 2 4617 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CAGCTTGGTCTGATTTATTT 4857 FALSE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.175.18 chr1 + 1694 7 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 12356 -1 -1414 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTTGGTCTGATTTATTTCCT NA FALSE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.175.19 chr1 + 1312 7 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 12367 370 -1403 311 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 35 8.382190 0.923357 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGATGCTCTTTCTCCAGATT NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 35 NA PB.175.20 chr1 + 1551 6 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 14006 1 236 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTTGGTCTGATTTATTTC NA FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 8 NA PB.175.21 chr1 + 1178 6 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 14012 368 242 313 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 32 7.663716 0.884439 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGCTCTTTCTCCAGATTCT NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 32 NA PB.175.22 chr1 + 1412 6 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 14145 1 375 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.634403 0.420682 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTTGGTCTGATTTATTTC NA FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 11 NA PB.175.23 chr1 + 1023 6 incomplete-splice_match PGD ENST00000270776.13 2268 13 14167 368 397 313 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 24 5.747787 0.759501 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGCTCTTTCTCCAGATTCT NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 24 NA PB.175.24 chr1 + 920 5 incomplete-splice_match PGD ENST00000498356.1 790 6 1777 -313 -1743 313 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.071349 0.609738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGCTCTTTCTCCAGATTCT 73 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 17 NA PB.175.27 chr1 + 798 4 incomplete-splice_match PGD ENST00000498356.1 790 6 2156 -312 -1364 312 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.113385 0.493233 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GATGCTCTTTCTCCAGATTC 452 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 13 NA PB.175.28 chr1 + 1097 3 incomplete-splice_match PGD ENST00000498356.1 790 6 3541 -680 21 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.831858 0.583409 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCTTGGTCTGATTTATTTC 1837 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 16 NA PB.175.29 chr1 + 719 3 incomplete-splice_match PGD ENST00000498356.1 790 6 3553 -314 33 314 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGCTCTTTCTCCAGATTCTT 1849 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.176.2 chr1 - 1850 2 antisense novelGene_PGD_AS novel NA NA NA NA NA NA multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TAAAAAGCCCCAACTTTGAC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.177.1 chr1 + 948 5 full-splice_match CENPS ENST00000309048.8 905 5 -44 1 -44 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 76 18.201326 1.260103 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTTTTCTGGTTACTAATG 312 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 76 NA PB.177.2 chr1 + 757 3 novel_in_catalog CENPS novel 905 5 NA NA -4 6 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CTGGTTACTAATGTTGTTTT -30 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.177.3 chr1 + 1068 6 full-splice_match CENPS-CORT ENST00000602787.6 571 6 -3 -494 -3 -98 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AGAGTTCAGAATAACATCTT -27 TRUE NA NA AATAAA -23 NA NA NA 2 NA PB.177.4 chr1 + 1430 6 novel_in_catalog CENPS-CORT novel 571 6 NA NA -2 -8604 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTTTTCTGGTTACTAATG -26 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.177.5 chr1 + 1121 6 novel_not_in_catalog CENPS-CORT novel 571 6 NA NA -2 -8605 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGCTTTTCTGGTTACTAAT -26 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 3 NA PB.177.6 chr1 + 819 6 full-splice_match CENPS-CORT ENST00000602787.6 571 6 -2 -246 -2 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGTGATCTTTCCTCTCCTC -26 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 5 NA PB.177.7 chr1 + 803 5 full-splice_match CENPS ENST00000309048.8 905 5 0 102 0 49 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACATGGTTGACTTTTTCA -26 TRUE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 8 NA PB.177.8 chr1 + 780 4 novel_in_catalog CENPS novel 905 5 NA NA 0 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTTTTCTGGTTACTAATG -26 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.177.9 chr1 + 627 5 full-splice_match CENPS ENST00000309048.8 905 5 0 278 0 28 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGGTGCTTTTTGTGCTGAA -26 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.177.10 chr1 + 848 5 full-splice_match CENPS ENST00000309048.8 905 5 61 -4 -18 4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTCTGGTTACTAATGTTGTT 35 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 6 NA PB.177.12 chr1 + 1356 4 novel_in_catalog CENPS-CORT novel 1326 4 NA NA -76 -103 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AATTAAGAGTTCAGAATAAC -25 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.177.13 chr1 + 1425 5 full-splice_match CENPS ENST00000477755.1 914 5 -39 -472 -39 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 95 22.751657 1.357013 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGCTTTTCTGGTTACTAAT -9 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 95 NA PB.177.14 chr1 + 1299 4 novel_in_catalog CENPS-CORT novel 1326 4 NA NA -54 -8601 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTTTCTGGTTACTAATGTTG -3 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.177.15 chr1 + 1245 3 full-splice_match CENPS ENST00000462462.1 584 3 -353 -308 -13 2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTTTCTGGTTACTAATGTTG 17 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 8 NA PB.177.16 chr1 + 1133 5 full-splice_match CENPS ENST00000477755.1 914 5 -20 -199 -20 31 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 39 9.340154 0.970354 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTGCTTTTTGTGCTGAATTC 10 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 39 NA PB.177.17 chr1 + 1139 5 fusion CENPS_CORT novel 914 5 NA NA -13 -340 multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTGATCTTTCCTCTCCTCC 17 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.177.18 chr1 + 1316 6 fusion CENPS_CORT novel 914 5 NA NA -11 -338 multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGATCTTTCCTCTCCTCCTT 19 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 8 NA PB.177.19 chr1 + 900 5 full-splice_match CENPS ENST00000477755.1 914 5 -7 21 -7 -21 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AACGAAAAGCACAGAAGAAA 23 TRUE NA NA AATACA -40 NA NA NA 8 NA PB.177.20 chr1 + 1176 5 full-splice_match CENPS ENST00000477755.1 914 5 211 -473 -129 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTTTTCTGGTTACTAATG 241 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.177.21 chr1 + 945 5 full-splice_match CENPS ENST00000477755.1 914 5 442 -473 102 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTTTTCTGGTTACTAATG 472 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.178.2 chr1 + 1920 9 full-splice_match PEX14 ENST00000356607.9 1922 9 -1 3 -1 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 134 32.091812 1.506394 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TAATTTCTGCCTGTGGCTCC -4 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 134 NA PB.178.3 chr1 + 1741 3 incomplete-splice_match PEX14 ENST00000491661.2 637 6 -33 85435 -1 1279 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAAAAAGAGAGAGAGA -4 TRUE NA NA AATAAA -23 NA NA NA 2 NA PB.178.4 chr1 + 1787 8 novel_in_catalog PEX14 novel 1922 9 NA NA 4 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AATTTCTGCCTGTGGCTCCC 1 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 7 NA PB.178.5 chr1 + 1852 8 incomplete-splice_match PEX14 ENST00000356607.9 1922 9 20339 2 20307 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AATTTCTGCCTGTGGCTCCC NA FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.178.11 chr1 + 1605 5 incomplete-splice_match PEX14 ENST00000356607.9 1922 9 143382 2 82444 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AATTTCTGCCTGTGGCTCCC NA FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 7 NA PB.178.12 chr1 + 1473 4 incomplete-splice_match PEX14 ENST00000356607.9 1922 9 148114 3 87176 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TAATTTCTGCCTGTGGCTCC 25 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.178.13 chr1 + 1298 2 incomplete-splice_match PEX14 ENST00000356607.9 1922 9 152341 3 91403 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TAATTTCTGCCTGTGGCTCC 4252 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 10 NA PB.179.1 chr1 + 1791 7 novel_in_catalog TARDBP novel 1835 6 NA NA -11 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT -17 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.179.2 chr1 + 2736 6 full-splice_match TARDBP ENST00000240185.8 4185 6 -6 1455 -5 -6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 518 124.056404 2.093619 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT -11 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 518 NA PB.179.3 chr1 + 4280 6 full-splice_match TARDBP ENST00000240185.8 4185 6 -3 -92 -2 92 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.550332 0.658043 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAGAAAAAAGAAAATAATA -8 TRUE NA NA TTTAAA -13 NA NA NA 19 NA PB.179.4 chr1 + 2878 6 full-splice_match TARDBP ENST00000240185.8 4185 6 -3 1310 -2 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.634403 0.420682 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGTCTCAAGTCAAATGGATT -8 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 11 NA PB.179.6 chr1 + 2853 7 novel_in_catalog TARDBP novel 4185 6 NA NA 0 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT -5 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 5 NA PB.179.7 chr1 + 2559 5 full-splice_match TARDBP ENST00000621715.4 816 5 -16 -1727 0 -6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT -5 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 3 NA PB.179.8 chr1 + 1210 8 incomplete-splice_match TARDBP ENST00000614757.4 1793 10 -8 6335 0 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATGGATTCATCACCTGTC -5 TRUE NA NA AATAAA -26 NA NA NA 4 NA PB.179.9 chr1 + 1129 8 novel_in_catalog TARDBP novel 1793 10 NA NA 0 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGTCTCAAGTCAAATGGATT -5 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.179.11 chr1 + 1355 8 novel_in_catalog TARDBP novel 1793 10 NA NA 2 -3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGTTTAGTGTCTGGAGTC -3 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.179.12 chr1 + 2857 7 full-splice_match TARDBP ENST00000472476.5 1001 7 5 -1861 -3 -6 alternative_3end TRUE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT 0 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 4 NA PB.179.13 chr1 + 1713 7 novel_in_catalog TARDBP novel 1793 10 NA NA -3 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT 0 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 6 NA PB.179.15 chr1 + 1661 7 novel_not_in_catalog TARDBP novel 1793 10 NA NA -3 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT 0 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.179.16 chr1 + 1500 6 full-splice_match TARDBP ENST00000240185.8 4185 6 5 2680 -3 -46 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAAGGAAGAGCTAAAGGA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.179.18 chr1 + 1246 8 novel_in_catalog TARDBP novel 1793 10 NA NA -3 -6 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT 0 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.179.19 chr1 + 1176 8 novel_in_catalog TARDBP novel 1793 10 NA NA -3 -6 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT 0 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 6 NA PB.179.20 chr1 + 2559 5 full-splice_match TARDBP ENST00000439080.6 1388 5 8 -1179 -1 -6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT 2 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 3 NA PB.179.21 chr1 + 2629 7 novel_not_in_catalog TARDBP novel 4185 6 NA NA 1 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT 4 TRUE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.179.22 chr1 + 2603 5 incomplete-splice_match TARDBP ENST00000315091.7 1835 6 37 146 25 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.873893 0.458471 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT 1069 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 12 NA PB.179.23 chr1 + 3930 5 incomplete-splice_match TARDBP ENST00000473869.5 1946 7 164 -472 152 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTTTAGTGTCTGGAGTCTT 1196 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.179.24 chr1 + 2473 5 incomplete-splice_match TARDBP ENST00000315091.7 1835 6 167 146 155 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.352876 0.525417 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT 1199 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 14 NA PB.179.25 chr1 + 2490 4 incomplete-splice_match TARDBP ENST00000611963.4 739 6 -77 11 11 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGTCTCAAGTCAAATGGATT 4205 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.179.26 chr1 + 2343 4 incomplete-splice_match TARDBP ENST00000611963.4 739 6 -75 156 13 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT 4207 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 7 NA PB.179.27 chr1 + 2204 3 incomplete-splice_match TARDBP ENST00000620632.4 706 5 -25 6 -25 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.352876 0.525417 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT 6071 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 14 NA PB.179.28 chr1 + 2041 2 incomplete-splice_match TARDBP ENST00000614494.1 515 4 40 146 -33 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 27 6.466260 0.810653 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATAATATGTGTCTTTGTT 7789 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 27 NA PB.179.29 chr1 + 2095 2 incomplete-splice_match TARDBP ENST00000614494.1 515 4 132 0 -22 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GTCTCAAGTCAAATGGATTC 7881 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.180.15 chr1 - 1366 6 novel_in_catalog DFFA novel 6035 6 NA NA -7 416 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAGTAATTGGCAGTGATTG 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.180.16 chr1 - 2654 5 full-splice_match DFFA ENST00000377036.2 1403 5 -11 -1240 -11 415 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGTAATTGGCAGTGATT 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.180.17 chr1 - 1343 6 full-splice_match DFFA ENST00000377038.8 6035 6 -14 4706 -14 415 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 62 14.848450 1.171681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGTAATTGGCAGTGATT 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 62 NA PB.180.18 chr1 - 1291 6 full-splice_match DFFA ENST00000377038.8 6035 6 38 4706 -3 415 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 38 9.100663 0.959073 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGTAATTGGCAGTGATT 14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 38 NA PB.180.19 chr1 - 1201 6 full-splice_match DFFA ENST00000377038.8 6035 6 3 4831 3 290 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AACATACGCCGTTCCACCAA -21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.180.22 chr1 - 820 2 incomplete-splice_match DFFA ENST00000377036.2 1403 5 8981 -1 8972 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTCCTGTTGGTGTTGTAAGA 9467 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.180.23 chr1 - 1441 5 full-splice_match DFFA ENST00000377036.2 1403 5 -39 1 2 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 39 9.340154 0.970354 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TCTTCCTGTTGGTGTTGTAA -22 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 39 NA PB.180.24 chr1 - 1050 5 full-splice_match DFFA ENST00000377036.2 1403 5 -55 408 -14 -408 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 59 14.129976 1.150141 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAGAAAAATGCATACACTT 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 59 NA PB.181.1 chr1 - 2377 2 novel_in_catalog MASP2 novel 2190 3 NA NA -19 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCTGCTGCCACGTGTCTCT 9457 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.181.2 chr1 - 1204 4 incomplete-splice_match MASP2 ENST00000400897.8 2455 11 -19 18276 -19 -1 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCTGCTGCCACGTGTCTCT 9457 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.181.3 chr1 - 731 5 full-splice_match MASP2 ENST00000400898.3 726 5 -6 1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCTGCTGCCACGTGTCTCT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.182.1 chr1 + 1323 1 full-splice_match TARDBP ENST00000607145.1 870 1 -454 1 -454 -1 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTGTGTGTTTGTAGTAGTC 5658 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.182.2 chr1 + 1151 1 full-splice_match TARDBP ENST00000607145.1 870 1 -282 1 -282 -1 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTGTGTGTTTGTAGTAGTC 5830 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.183.1 chr1 - 736 5 incomplete-splice_match SRM ENST00000376957.7 1260 8 3327 2 -871 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGATTGGAGTCCTGTGTCT 3348 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.183.2 chr1 - 1449 7 incomplete-splice_match SRM ENST00000376957.7 1260 8 239 3 -93 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGATTGGAGTCCTGTGTC 260 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.183.3 chr1 - 1357 7 novel_in_catalog SRM novel 1260 8 NA NA -14 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGATTGGAGTCCTGTGTC 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.183.4 chr1 - 1308 8 novel_in_catalog SRM novel 1260 8 NA NA -14 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGATTGGAGTCCTGTGTC 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.183.5 chr1 - 1330 7 novel_in_catalog SRM novel 1260 8 NA NA 3 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGATTGGAGTCCTGTGTC 24 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.183.6 chr1 - 1279 8 novel_not_in_catalog SRM novel 1260 8 NA NA -10 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGATTGGAGTCCTGTGTC 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.183.7 chr1 - 1288 8 full-splice_match SRM ENST00000376957.7 1260 8 -31 3 -29 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 823 197.101196 2.294689 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGATTGGAGTCCTGTGTC -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 823 NA PB.183.8 chr1 - 1241 7 incomplete-splice_match SRM ENST00000376957.7 1260 8 447 3 115 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGATTGGAGTCCTGTGTC 468 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.183.9 chr1 - 1116 8 full-splice_match SRM ENST00000376957.7 1260 8 141 3 141 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 39 9.340154 0.970354 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGATTGGAGTCCTGTGTC 162 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 39 NA PB.183.10 chr1 - 1012 7 incomplete-splice_match SRM ENST00000376957.7 1260 8 676 3 344 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 35 8.382190 0.923357 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGATTGGAGTCCTGTGTC 697 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 35 NA PB.183.11 chr1 - 803 5 incomplete-splice_match SRM ENST00000376957.7 1260 8 3259 3 -939 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.071349 0.609738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGATTGGAGTCCTGTGTC 3280 FALSE NA NA GGGGCT -14 NA NA NA 17 NA PB.183.12 chr1 - 1113 7 novel_in_catalog SRM novel 1260 8 NA NA -1 -4 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAAAGATTGGAGTCCTGTGT 18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.183.13 chr1 - 1116 7 incomplete-splice_match SRM ENST00000376957.7 1260 8 569 6 237 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCAAAGATTGGAGTCCTGT 590 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.185.2 chr1 - 2986 24 novel_in_catalog EXOSC10 novel 2796 25 NA NA 3 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.185.3 chr1 - 2857 11 novel_in_catalog EXOSC10 novel 2796 25 NA NA 57 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.185.4 chr1 - 2787 25 novel_in_catalog EXOSC10 novel 2796 25 NA NA 3 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.185.5 chr1 - 2721 24 novel_in_catalog EXOSC10 novel 2796 25 NA NA 3 -3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.185.6 chr1 - 2779 25 full-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 11 6 -4 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 260 62.267693 1.794263 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 260 NA PB.185.7 chr1 - 2702 24 novel_in_catalog EXOSC10 novel 2796 25 NA NA -6 -3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.185.8 chr1 - 2602 24 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 1752 6 1737 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.185.9 chr1 - 2381 22 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 8271 6 8256 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT 8256 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.185.10 chr1 - 2158 21 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 8807 6 -8439 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT 8792 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.185.11 chr1 - 2011 20 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 9299 6 -7947 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT 9284 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.185.12 chr1 - 1074 12 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 20088 6 19 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.873893 0.458471 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.185.13 chr1 - 750 8 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 25559 6 -1284 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAGCTGATTCCTGACT 5457 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.185.14 chr1 - 2696 24 full-splice_match EXOSC10 ENST00000304457.11 2721 24 18 7 3 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GAAGAAAGCTGATTCCTGAC 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.185.15 chr1 - 2456 23 novel_in_catalog EXOSC10 novel 2796 25 NA NA 4035 -4 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GAAGAAAGCTGATTCCTGAC 4035 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.185.16 chr1 - 1808 17 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 12276 7 -4970 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GAAGAAAGCTGATTCCTGAC NA FALSE NA NA AAAACA -16 NA NA NA 6 NA PB.185.17 chr1 - 1663 16 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 16990 7 -256 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GAAGAAAGCTGATTCCTGAC NA FALSE NA NA AAAACA -43 NA NA NA 10 NA PB.185.18 chr1 - 1382 15 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 18720 7 68 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.831858 0.583409 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GAAGAAAGCTGATTCCTGAC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.185.19 chr1 - 1245 14 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 19026 7 14 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GAAGAAAGCTGATTCCTGAC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.185.20 chr1 - 1006 9 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 22787 7 569 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GAAGAAAGCTGATTCCTGAC 2685 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.185.21 chr1 - 953 10 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 22424 7 206 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GAAGAAAGCTGATTCCTGAC 2322 FALSE NA NA ATTAAA -43 NA NA NA 8 NA PB.185.22 chr1 - 3564 22 novel_in_catalog EXOSC10 novel 2796 25 NA NA -4 -5 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TGAAGAAAGCTGATTCCTGA -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.185.23 chr1 - 2570 23 incomplete-splice_match EXOSC10 ENST00000376936.9 2796 25 18 2027 3 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GTAAGAACTGCTCCTGGAGG 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.185.24 chr1 - 2419 15 novel_in_catalog EXOSC10 novel 2721 24 NA NA -4 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAGAAAAAATAAACAAA -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.185.25 chr1 - 1909 13 novel_not_in_catalog EXOSC10 novel 622 5 NA NA -7 -396 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACGTTTTGTGATCTTGAT -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.186.1 chr1 + 779 2 full-splice_match EXOSC10-AS1 ENST00000447600.1 487 2 -245 -47 0 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAGAATACTTGCTTTTCA -1 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.186.2 chr1 + 679 2 full-splice_match EXOSC10-AS1 ENST00000435388.2 685 2 0 6 0 -6 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGTTAAGAGAATACTTGCTT -1 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.187.1 chr1 - 3043 20 full-splice_match MTOR ENST00000376838.5 4017 20 973 1 973 -1 alternative_5end TRUE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATGTATATGAGTGGCGTTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.187.3 chr1 - 4211 29 incomplete-splice_match MTOR ENST00000361445.9 8721 58 105313 7 -12213 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.187.4 chr1 - 8703 58 full-splice_match MTOR ENST00000361445.9 8721 58 11 7 11 -7 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.187.5 chr1 - 4017 27 incomplete-splice_match MTOR ENST00000361445.9 8721 58 115766 7 -1760 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.187.6 chr1 - 3710 24 incomplete-splice_match MTOR ENST00000361445.9 8721 58 122904 7 13 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.187.7 chr1 - 3493 22 incomplete-splice_match MTOR ENST00000361445.9 8721 58 128055 7 -2938 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.187.8 chr1 - 2854 18 incomplete-splice_match MTOR ENST00000376838.5 4017 20 2632 7 2632 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA AAAAAG -17 NA NA NA 6 NA PB.187.9 chr1 - 2739 17 incomplete-splice_match MTOR ENST00000376838.5 4017 20 3049 7 3049 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.187.10 chr1 - 2501 15 incomplete-splice_match MTOR ENST00000376838.5 4017 20 3811 7 3811 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.187.11 chr1 - 2335 14 incomplete-splice_match MTOR ENST00000376838.5 4017 20 4456 7 4456 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA ATTAAA -23 NA NA NA 9 NA PB.187.12 chr1 - 2201 13 incomplete-splice_match MTOR ENST00000376838.5 4017 20 4803 7 4803 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.187.13 chr1 - 2013 3 incomplete-splice_match MTOR ENST00000473471.5 862 6 4392 -743 4392 -7 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA AAAAAG -17 NA NA NA 2 NA PB.187.14 chr1 - 1921 11 incomplete-splice_match MTOR ENST00000376838.5 4017 20 9442 7 -6453 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.113385 0.493233 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.187.15 chr1 - 1780 10 incomplete-splice_match MTOR ENST00000376838.5 4017 20 10193 7 -5702 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.187.16 chr1 - 1620 9 incomplete-splice_match MTOR ENST00000376838.5 4017 20 14512 7 -1383 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.113385 0.493233 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.187.17 chr1 - 1460 7 incomplete-splice_match MTOR ENST00000376838.5 4017 20 16715 7 -214 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.310840 0.634562 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.187.18 chr1 - 1396 6 full-splice_match MTOR ENST00000473471.5 862 6 209 -743 209 -7 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.187.19 chr1 - 1203 4 incomplete-splice_match MTOR ENST00000473471.5 862 6 4924 -743 4924 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.634403 0.420682 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA AAGAAA -12 NA NA NA 11 NA PB.187.20 chr1 - 1065 2 incomplete-splice_match MTOR ENST00000473471.5 862 6 6343 -743 6343 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACATATGTATATGAGTGG NA FALSE NA NA AAAACA -28 NA NA NA 9 NA PB.187.22 chr1 - 4340 30 incomplete-splice_match MTOR ENST00000361445.9 8721 58 95033 8 -22493 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TAAACATATGTATATGAGTG NA FALSE NA NA AAAACA -41 NA NA NA 2 NA PB.187.32 chr1 - 947 6 incomplete-splice_match MTOR ENST00000361445.9 8721 58 14 147304 14 -114885 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GTGAGAAGCCACGGCAGAGG 13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.188.1 chr1 + 3652 2 full-splice_match UBIAD1 ENST00000376810.6 3654 2 1 1 1 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACCAATGGTCTGGCTTCTGG -12 TRUE NA NA ATTAAA -22 NA NA NA 3 NA PB.188.2 chr1 + 1735 2 full-splice_match UBIAD1 ENST00000376810.6 3654 2 10 1909 10 -1909 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGGCAGAGTGTTGTCCTGCT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.188.3 chr1 + 1556 2 full-splice_match UBIAD1 ENST00000376810.6 3654 2 21 2077 21 -2077 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 110 26.344025 1.420682 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATTAGGCGCATGGTCTTTG 8 TRUE NA NA TTTAAA -24 NA NA NA 110 NA PB.188.5 chr1 + 1345 2 full-splice_match UBIAD1 ENST00000376810.6 3654 2 152 2157 152 -2157 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAGATAATATGTTGTTTTT 139 FALSE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.188.8 chr1 + 3339 2 full-splice_match UBIAD1 ENST00000376810.6 3654 2 312 3 -18 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCACCAATGGTCTGGCTTCT 7 TRUE NA NA ATTAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.188.9 chr1 + 1206 2 full-splice_match UBIAD1 ENST00000376810.6 3654 2 312 2136 -18 -2136 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 40 9.579645 0.981349 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGTTTTTTGTTTTTTCCATT 7 TRUE NA NA TATAAA -40 NA NA NA 40 NA PB.188.11 chr1 + 863 2 full-splice_match UBIAD1 ENST00000376810.6 3654 2 634 2157 -57 -2157 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAGATAATATGTTGTTTTT 329 FALSE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.189.1 chr1 + 2041 5 novel_in_catalog FBXO44 novel 2928 6 NA NA 7 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TAACCTGTGCCCTGTGGTTT -27 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.189.2 chr1 + 1898 6 full-splice_match FBXO44 ENST00000251547.10 2928 6 -8 1038 -8 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AACCTGTGCCCTGTGGTTTC -22 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 5 NA PB.189.3 chr1 + 1401 8 novel_not_in_catalog FBXO44 novel 3320 7 NA NA -8 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAATCACCCAGTCTCGGGT -22 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.189.4 chr1 + 1764 5 full-splice_match FBXO44 ENST00000376762.8 1734 5 -33 3 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.310840 0.634562 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TAACCTGTGCCCTGTGGTTT -14 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 18 NA PB.190.1 chr1 - 809 4 incomplete-splice_match FBXO2 ENST00000354287.5 1287 6 4363 -10 647 10 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAAATGGATAAACACTGC 4752 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.190.2 chr1 - 1285 6 full-splice_match FBXO2 ENST00000354287.5 1287 6 0 2 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 79 18.919800 1.276917 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAGGAATGAATGAAAAAATG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 79 NA PB.190.3 chr1 - 1115 5 incomplete-splice_match FBXO2 ENST00000354287.5 1287 6 3654 2 -5 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAGGAATGAATGAAAAAATG 4043 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.190.4 chr1 - 893 5 incomplete-splice_match FBXO2 ENST00000354287.5 1287 6 3872 6 156 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAGGAAGGAATGAATGAAAA 4261 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.191.1 chr1 + 1495 6 full-splice_match FBXO6 ENST00000376753.9 1444 6 -100 49 -100 -49 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAATAATAATAATAATAAA 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.191.2 chr1 + 1120 6 full-splice_match FBXO6 ENST00000376753.9 1444 6 0 324 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTGTGGCTCACGCCTGTAA -13 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 10 NA PB.191.3 chr1 + 1393 6 full-splice_match FBXO6 ENST00000376753.9 1444 6 2 49 2 -49 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAATAATAATAATAATAAA -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.193.1 chr1 - 1095 9 full-splice_match MAD2L2 ENST00000376692.9 1053 9 -43 1 -43 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 686 164.290909 2.215614 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG 350 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 686 NA PB.193.2 chr1 - 1462 8 incomplete-splice_match MAD2L2 ENST00000376692.9 1053 9 15 1 -2 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.193.3 chr1 - 1326 9 full-splice_match MAD2L2 ENST00000376692.9 1053 9 -274 1 -274 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG 119 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.193.4 chr1 - 1222 8 incomplete-splice_match MAD2L2 ENST00000376692.9 1053 9 255 1 218 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG 648 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.193.5 chr1 - 1160 8 novel_in_catalog MAD2L2 novel 1860 11 NA NA -18 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.352876 0.525417 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG -28 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.193.6 chr1 - 1127 9 full-splice_match MAD2L2 ENST00000376667.7 872 9 12 -267 -4 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 30 7.184734 0.856411 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG 209 FALSE NA NA GGGGCT -45 NA NA NA 30 NA PB.193.7 chr1 - 1086 9 full-splice_match MAD2L2 ENST00000376669.9 864 9 -25 -197 5 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.193.8 chr1 - 1030 9 novel_not_in_catalog MAD2L2 novel 872 9 NA NA -39 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG 354 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.193.9 chr1 - 1052 9 full-splice_match MAD2L2 ENST00000376667.7 872 9 87 -267 -45 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.113385 0.493233 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG 39 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.193.10 chr1 - 1039 9 novel_not_in_catalog MAD2L2 novel 1053 9 NA NA 7 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.592367 0.555381 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.193.11 chr1 - 1098 8 incomplete-splice_match MAD2L2 ENST00000376692.9 1053 9 379 1 342 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG 772 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.193.12 chr1 - 1005 9 novel_not_in_catalog MAD2L2 novel 1053 9 NA NA -1 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.193.13 chr1 - 888 7 incomplete-splice_match MAD2L2 ENST00000376692.9 1053 9 679 1 642 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.113385 0.493233 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG 1072 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.193.14 chr1 - 745 6 incomplete-splice_match MAD2L2 ENST00000376692.9 1053 9 3560 1 3523 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG 3953 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.193.15 chr1 - 553 4 incomplete-splice_match MAD2L2 ENST00000376692.9 1053 9 5053 1 5016 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCTGAGCCATCATTAACTG 5446 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.193.16 chr1 - 1350 8 novel_in_catalog MAD2L2 novel 1053 9 NA NA -2 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAGCTGAGCCATCATTAACT 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.193.17 chr1 - 1009 9 novel_not_in_catalog MAD2L2 novel 1053 9 NA NA -169 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.550332 0.658043 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAGCTGAGCCATCATTAACT -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.193.18 chr1 - 1770 7 novel_in_catalog MAD2L2 novel 1053 9 NA NA 2 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGAGCTGAGCCATCATTAAC 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.193.19 chr1 - 1286 8 incomplete-splice_match MAD2L2 ENST00000376692.9 1053 9 188 4 151 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 20 4.789823 0.680319 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CTGAGCTGAGCCATCATTAA -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 20 NA PB.194.3 chr1 + 2741 4 novel_in_catalog AGTRAP novel 1130 5 NA NA 2 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGATGGGCTGTGTTTTGAAC -27 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.194.4 chr1 + 1236 6 full-splice_match AGTRAP ENST00000400895.6 786 6 2 -452 2 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.071349 0.609738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGATGGGCTGTGTTTTGAAC -27 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 17 NA PB.194.5 chr1 + 1214 6 full-splice_match AGTRAP ENST00000452018.6 809 6 -46 -359 3 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.352876 0.525417 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGATGGGCTGTGTTTTGAAC -26 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 14 NA PB.194.6 chr1 + 1113 5 full-splice_match AGTRAP ENST00000376629.8 1100 5 -16 3 1 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 70 16.764380 1.224388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGATGGGCTGTGTTTTGAAC -22 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 70 NA PB.194.7 chr1 + 1369 6 full-splice_match AGTRAP ENST00000476512.5 942 6 15 -442 2 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.831858 0.583409 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGATGGGCTGTGTTTTGAAC -21 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 16 NA PB.194.8 chr1 + 937 3 incomplete-splice_match AGTRAP ENST00000513739.5 566 4 1488 -643 -15 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGATGGGCTGTGTTTTGAAC 9962 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.196.1 chr1 + 1330 5 incomplete-splice_match CLCN6 ENST00000376497.7 814 6 -22 313 0 -313 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAGAAAAAACATCAATGGGG -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.196.4 chr1 + 5536 23 full-splice_match CLCN6 ENST00000346436.11 5589 23 53 0 13 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTCTGTCTCCTTTAGCCTTT 8 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 6 NA PB.196.8 chr1 + 1636 4 novel_in_catalog CLCN6 novel 1032 4 NA NA -240 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACCGCCGTGCCTCAGGATTC NA FALSE NA NA AGTAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.196.9 chr1 + 843 2 novel_not_in_catalog CLCN6 novel 1032 4 NA NA -166 5 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTCCTTTAGCCTTTTGTCT NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.197.1 chr1 + 2891 18 novel_in_catalog PLOD1 novel 2976 19 NA NA -16 1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAGGGAAGATGCTCAGGGC -40 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.197.2 chr1 + 3148 20 novel_in_catalog PLOD1 novel 2976 19 NA NA -5 2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGGGAAGATGCTCAGGGCG -29 TRUE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.197.3 chr1 + 3003 19 full-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 -28 1 -5 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 321 76.876656 1.885795 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG -29 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 321 NA PB.197.4 chr1 + 3025 19 novel_not_in_catalog PLOD1 novel 2976 19 NA NA 0 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG -24 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.197.5 chr1 + 2841 18 novel_in_catalog PLOD1 novel 2976 19 NA NA 10 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG -14 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.197.6 chr1 + 2861 19 full-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 116 -1 90 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGAAGGGAAGATGCTCAGGG 115 FALSE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 10 NA PB.197.8 chr1 + 2688 17 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 15115 -2 -4469 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.071349 0.609738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAGGGAAGATGCTCAGGGC 19 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 17 NA PB.197.9 chr1 + 2551 16 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 15699 1 -3885 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.550332 0.658043 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG -18 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 19 NA PB.197.10 chr1 + 2409 15 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 17943 1 -1641 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.550332 0.658043 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG 28 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 19 NA PB.197.11 chr1 + 2235 13 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 22234 1 2650 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 28 6.705751 0.826447 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG 2105 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 28 NA PB.197.12 chr1 + 2070 11 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 23798 1 4214 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 26 6.226769 0.794263 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG -3 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 26 NA PB.197.13 chr1 + 1896 10 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 25970 1 -4001 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 25 5.987278 0.777229 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG 2084 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 25 NA PB.197.14 chr1 + 1775 9 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 28855 1 -1116 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 29 6.945243 0.841687 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG 4969 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 29 NA PB.197.15 chr1 + 1609 8 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 29559 1 -412 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 31 7.424225 0.870651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG 38 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 31 NA PB.197.16 chr1 + 1447 6 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 30760 -1 775 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 24 5.747787 0.759501 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGAAGGGAAGATGCTCAGGG 1239 FALSE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 24 NA PB.197.17 chr1 + 1324 5 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 31538 1 1553 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 25 5.987278 0.777229 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG 735 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 25 NA PB.197.18 chr1 + 1601 5 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 31549 -287 1564 286 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CAGGTTGGTCTGGCTGGTCT 746 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.197.19 chr1 + 1187 4 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 32345 1 2360 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 43 10.298119 1.012758 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG 1542 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 43 NA PB.197.20 chr1 + 1046 3 incomplete-splice_match PLOD1 ENST00000196061.5 2976 19 36064 1 -762 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 27 6.466260 0.810653 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTGAAGGGAAGATGCTCAG 114 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 27 NA PB.198.2 chr1 + 4609 19 full-splice_match MFN2 ENST00000235329.10 4407 19 -208 6 -1 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATCCTTTGTGAGATCTGT 9569 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 8 NA PB.198.3 chr1 + 4560 19 full-splice_match MFN2 ENST00000235329.10 4407 19 -153 0 -8 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.873893 0.458471 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTTGTGAGATCTGTCTTTTT 9624 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 12 NA PB.198.4 chr1 + 4577 19 novel_in_catalog MFN2 novel 4772 20 NA NA -2 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTTTGTGAGATCTGTCTTTT -9 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.198.5 chr1 + 4547 20 full-splice_match MFN2 ENST00000675817.1 4766 20 226 -7 0 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTTTGTGAGATCTGTCTTTT -7 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.198.6 chr1 + 4406 19 full-splice_match MFN2 ENST00000235329.10 4407 19 0 1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 51 12.214047 1.086860 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTTTGTGAGATCTGTCTTTT 2 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 51 NA PB.198.8 chr1 + 4260 18 full-splice_match MFN2 ENST00000674817.1 4514 18 257 -3 0 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTTGTGAGATCTGTCTTTTT 4 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 5 NA PB.198.9 chr1 + 3944 16 full-splice_match MFN2 ENST00000675483.1 4337 16 403 -10 403 2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTGAGATCTGTCTTTTTGG 7887 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 5 NA PB.198.10 chr1 + 3739 14 incomplete-splice_match MFN2 ENST00000675483.1 4337 16 5043 -2 1140 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATCCTTTGTGAGATCTGT NA FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.198.11 chr1 + 3612 13 full-splice_match MFN2 ENST00000675528.1 3700 13 100 -12 100 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGAGATCTGTCTTTTTGGGT NA FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 4 NA PB.198.12 chr1 + 3377 11 full-splice_match MFN2 ENST00000675404.1 4447 11 1068 2 1068 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAAATCCTTTGTGAGATCTG NA FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 5 NA PB.198.13 chr1 + 3203 10 incomplete-splice_match MFN2 ENST00000675404.1 4447 11 1457 1 1457 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATCCTTTGTGAGATCTGT 340 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 4 NA PB.198.14 chr1 + 3109 9 incomplete-splice_match MFN2 ENST00000675404.1 4447 11 1696 1 1696 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATCCTTTGTGAGATCTGT 579 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 5 NA PB.198.15 chr1 + 3028 8 incomplete-splice_match MFN2 ENST00000675404.1 4447 11 3665 1 -2753 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATCCTTTGTGAGATCTGT 2548 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 4 NA PB.198.16 chr1 + 2932 7 incomplete-splice_match MFN2 ENST00000675404.1 4447 11 4157 -5 -2261 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTTGTGAGATCTGTCTTTTT 3040 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.198.17 chr1 + 2819 6 incomplete-splice_match MFN2 ENST00000675404.1 4447 11 4475 1 -1943 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATCCTTTGTGAGATCTGT 3358 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 9 NA PB.198.18 chr1 + 2566 5 incomplete-splice_match MFN2 ENST00000675404.1 4447 11 5511 1 -907 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATCCTTTGTGAGATCTGT 4394 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 6 NA PB.198.19 chr1 + 2434 4 incomplete-splice_match MFN2 ENST00000675404.1 4447 11 6249 1 -169 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATCCTTTGTGAGATCTGT 5132 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 6 NA PB.198.20 chr1 + 2348 3 full-splice_match MFN2 ENST00000676295.1 2622 3 284 -10 284 2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTGAGATCTGTCTTTTTGG 5585 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.198.21 chr1 + 2239 3 full-splice_match MFN2 ENST00000676295.1 2622 3 392 -9 392 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGTGAGATCTGTCTTTTTG 5693 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 6 NA PB.198.22 chr1 + 2100 2 full-splice_match MFN2 ENST00000675043.1 2148 2 91 -43 91 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGATCTGTCTTTTTGGGTTC 8179 FALSE NA NA AATAAA -23 NA NA NA 7 NA PB.199.1 chr1 + 1576 10 full-splice_match MIIP ENST00000235332.6 1541 10 -43 8 -11 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 245 58.675327 1.768456 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAGCTCAAGTCCCACGTGTG 15 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 245 NA PB.199.2 chr1 + 1553 9 novel_in_catalog MIIP novel 1541 10 NA NA 3 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGTCCCACGTGTGCTGGTT -31 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.199.3 chr1 + 1681 9 novel_in_catalog MIIP novel 1541 10 NA NA -9 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGTCCCACGTGTGCTGGTT -11 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 5 NA PB.199.4 chr1 + 1571 10 novel_not_in_catalog MIIP novel 1541 10 NA NA -1 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGTCCCACGTGTGCTGGTT -3 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.199.5 chr1 + 2152 8 novel_in_catalog MIIP novel 1541 10 NA NA 3 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.592367 0.555381 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGTCCCACGTGTGCTGGTT 1 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 15 NA PB.199.6 chr1 + 2013 9 novel_in_catalog MIIP novel 1541 10 NA NA 3 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 41 9.819137 0.992073 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAGCTCAAGTCCCACGTGTG 1 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 41 NA PB.199.7 chr1 + 1951 7 novel_in_catalog MIIP novel 1541 10 NA NA 3 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTCAAGTCCCACGTGTGC 1 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.199.8 chr1 + 1331 9 novel_in_catalog MIIP novel 1541 10 NA NA 6 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 36 8.621680 0.935592 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAGCTCAAGTCCCACGTGTG 4 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 36 NA PB.199.9 chr1 + 2369 7 novel_in_catalog MIIP novel 1541 10 NA NA 35 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTCAAGTCCCACGTGTGC 33 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.199.10 chr1 + 1571 10 novel_not_in_catalog MIIP novel 1709 6 NA NA 68 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CAAGTCCCACGTGTGCTGGT 66 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 4 NA PB.199.11 chr1 + 1999 7 novel_in_catalog MIIP novel 1541 10 NA NA -481 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTCAAGTCCCACGTGTGC 2241 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.199.12 chr1 + 1351 9 incomplete-splice_match MIIP ENST00000235332.6 1541 10 2275 7 -449 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTCAAGTCCCACGTGTGC 2273 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 7 NA PB.199.13 chr1 + 1466 8 novel_in_catalog MIIP novel 1541 10 NA NA -129 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTCAAGTCCCACGTGTGC 2593 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.199.14 chr1 + 1337 8 novel_in_catalog MIIP novel 1541 10 NA NA 0 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTCAAGTCCCACGTGTGC 2722 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.199.15 chr1 + 1755 6 full-splice_match MIIP ENST00000466860.5 1709 6 17 -63 17 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTCAAGTCCCACGTGTGC 2739 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.199.16 chr1 + 1027 8 incomplete-splice_match MIIP ENST00000235332.6 1541 10 2858 2 134 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGTCCCACGTGTGCTGGTT 2856 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.199.17 chr1 + 1201 4 incomplete-splice_match MIIP ENST00000498685.5 1392 6 6382 5 150 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTCAAGTCCCACGTGTGC 9746 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.199.18 chr1 + 1302 3 incomplete-splice_match MIIP ENST00000466860.5 1709 6 7056 -63 182 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTCAAGTCCCACGTGTGC 9778 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.202.2 chr1 + 2218 10 full-splice_match TNFRSF1B ENST00000376259.7 3687 10 -4 1473 -4 -1473 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAATACAGAAATTAGCCG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.202.4 chr1 + 2146 10 novel_not_in_catalog TNFRSF1B novel 3687 10 NA NA -2 -5514 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTTCTTGGATTCGTCTGAT -1 TRUE NA NA TATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.202.5 chr1 + 3690 10 full-splice_match TNFRSF1B ENST00000376259.7 3687 10 4 -7 4 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.113385 0.493233 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACCCCTGGCTCTGCCTGGGG 5 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 13 NA PB.202.6 chr1 + 3585 9 full-splice_match TNFRSF1B ENST00000492361.1 3583 9 -12 10 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACACGTCGACCCCTGGCTC 1 TRUE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.203.4 chr1 + 2670 18 novel_in_catalog VPS13D novel 16245 69 NA NA 17 15407 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AACATTTTAAGACCTGAGGG 13 TRUE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.206.2 chr1 - 2417 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 401 1 377 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACGACCGGTTTGTGTGTGGT 389 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.206.3 chr1 - 2234 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 584 1 560 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACGACCGGTTTGTGTGTGGT 572 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.206.4 chr1 - 1778 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 1040 1 1016 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACGACCGGTTTGTGTGTGGT 1028 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.206.5 chr1 - 1580 2 incomplete-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 2953 1 2929 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACGACCGGTTTGTGTGTGGT 2941 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.206.6 chr1 - 1439 2 incomplete-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 3094 1 3070 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACGACCGGTTTGTGTGTGGT 3082 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.206.7 chr1 - 1290 2 incomplete-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 3243 1 3219 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.873893 0.458471 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACGACCGGTTTGTGTGTGGT 3231 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.206.8 chr1 - 1169 2 incomplete-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 3364 1 3340 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACGACCGGTTTGTGTGTGGT 3352 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.206.9 chr1 - 1021 2 incomplete-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 3512 1 3488 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACGACCGGTTTGTGTGTGGT 3500 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.206.10 chr1 - 787 2 incomplete-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 3746 1 3722 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACGACCGGTTTGTGTGTGGT 3734 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.206.13 chr1 - 1983 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 834 2 810 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CACGACCGGTTTGTGTGTGG 822 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.206.14 chr1 - 1656 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 1161 2 1137 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CACGACCGGTTTGTGTGTGG 1149 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.206.15 chr1 - 2150 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 192 477 168 115 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATACTTGAAATGGAACTC 180 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.206.17 chr1 - 2045 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 297 477 273 115 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATACTTGAAATGGAACTC 285 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.206.20 chr1 - 1907 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 435 477 411 115 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATACTTGAAATGGAACTC 423 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.206.21 chr1 - 1813 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 529 477 505 115 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATACTTGAAATGGAACTC 517 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.206.23 chr1 - 1762 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 580 477 556 115 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATACTTGAAATGGAACTC 568 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.206.25 chr1 - 1469 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 873 477 849 115 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATACTTGAAATGGAACTC 861 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.206.26 chr1 - 1299 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 1043 477 1019 115 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 25 5.987278 0.777229 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATACTTGAAATGGAACTC 1031 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 25 NA PB.206.27 chr1 - 1181 3 full-splice_match KIAA2013 ENST00000376572.8 2819 3 1161 477 1137 115 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATACTTGAAATGGAACTC 1149 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.206.28 chr1 - 1121 2 incomplete-splice_match KIAA2013 ENST00000616327.1 2170 4 2912 -115 2912 115 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATACTTGAAATGGAACTC 2924 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.206.29 chr1 - 967 2 incomplete-splice_match KIAA2013 ENST00000616327.1 2170 4 3066 -115 3066 115 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATACTTGAAATGGAACTC 3078 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.206.30 chr1 - 880 2 incomplete-splice_match KIAA2013 ENST00000616327.1 2170 4 3153 -115 3153 115 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATACTTGAAATGGAACTC 3165 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.206.31 chr1 - 746 2 incomplete-splice_match KIAA2013 ENST00000616327.1 2170 4 3287 -115 3287 115 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATACTTGAAATGGAACTC 3299 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.206.32 chr1 - 2168 4 novel_not_in_catalog KIAA2013 novel 2170 4 NA NA -10 114 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 CAAATACTTGAAATGGAACT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.208.1 chr1 + 4505 21 incomplete-splice_match VPS13D ENST00000011700.10 10969 52 81338 1 2108 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TACAACCTTGTCACATGTAG 2169 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.208.2 chr1 + 3557 15 incomplete-splice_match VPS13D ENST00000646411.1 4522 21 22104 -12 -4541 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TCTACAACCTTGTCACATGT NA FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.208.3 chr1 + 3266 13 incomplete-splice_match VPS13D ENST00000646411.1 4522 21 26673 -15 28 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACAACCTTGTCACATGTAGC NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.208.5 chr1 + 1462 7 incomplete-splice_match VPS13D ENST00000646411.1 4522 21 58754 979 5267 337 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAGGGTCTGTGCTATGTG NA FALSE NA NA AATATA -15 NA NA NA 2 NA PB.208.6 chr1 + 2088 5 incomplete-splice_match VPS13D ENST00000645371.1 2024 14 73085 -1331 -8859 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACAACCTTGTCACATGTAGC NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.208.7 chr1 + 1916 4 incomplete-splice_match VPS13D ENST00000645371.1 2024 14 77327 -1331 -4617 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACAACCTTGTCACATGTAGC 1 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.208.11 chr1 + 1576 2 incomplete-splice_match VPS13D ENST00000543766.2 3838 4 42049 1684 9763 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACCTTGTCACATGTAGCTG NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.209.1 chr1 - 2217 6 full-splice_match DHRS3 ENST00000616661.5 2201 6 -15 -1 -15 1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTCCTTTGTTCAAATCTTCC -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.209.2 chr1 - 1757 6 full-splice_match DHRS3 ENST00000616661.5 2201 6 443 1 443 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTCCTTTGTTCAAATCTT 2201 FALSE NA NA ATTAAA -27 NA NA NA 2 NA PB.209.3 chr1 - 1669 6 full-splice_match DHRS3 ENST00000616661.5 2201 6 531 1 531 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.352876 0.525417 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTCCTTTGTTCAAATCTT 6 TRUE NA NA AAGAAA -9 NA NA NA 14 NA PB.209.4 chr1 - 1487 6 full-splice_match DHRS3 ENST00000616661.5 2201 6 713 1 -702 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTCCTTTGTTCAAATCTT 2471 FALSE NA NA GATAAA -2 NA NA NA 7 NA PB.209.5 chr1 - 1507 7 novel_not_in_catalog DHRS3 novel 2201 6 NA NA 531 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTCCTTTGTTCAAATCTT 6 TRUE NA NA AAGAAA -9 NA NA NA 3 NA PB.209.6 chr1 - 1368 6 novel_in_catalog DHRS3 novel 2201 6 NA NA 11 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTCCTTTGTTCAAATCTT -6 TRUE NA NA AAAAAG -17 NA NA NA 2 NA PB.209.7 chr1 - 1133 5 incomplete-splice_match DHRS3 ENST00000616661.5 2201 6 37554 1 15652 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTCCTTTGTTCAAATCTT -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.209.8 chr1 - 1049 5 incomplete-splice_match DHRS3 ENST00000616661.5 2201 6 37638 1 15736 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTCCTTTGTTCAAATCTT 95 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.209.9 chr1 - 1297 6 full-splice_match DHRS3 ENST00000616661.5 2201 6 902 2 -513 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.113385 0.493233 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GATTTCCTTTGTTCAAATCT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.209.10 chr1 - 1272 6 novel_in_catalog DHRS3 novel 2201 6 NA NA 193 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GATTTCCTTTGTTCAAATCT 5925 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.209.11 chr1 - 665 3 incomplete-splice_match DHRS3 ENST00000616661.5 2201 6 39467 2 17565 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GATTTCCTTTGTTCAAATCT 1924 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.209.12 chr1 - 1394 7 novel_not_in_catalog DHRS3 novel 2201 6 NA NA -48 -5 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGTGATTTCCTTTGTTCAAA 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.210.1 chr1 - 1639 3 novel_not_in_catalog PRAMEF11 novel 1845 4 NA NA 3062 -7 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGAATCTGTCTGGTGCCCTC 3084 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.213.1 chr1 + 2120 6 full-splice_match PDPN ENST00000621990.5 2737 6 -45 662 25 513 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCCCATTCCTCCCATTTTT 15 TRUE NA NA AGTAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.213.2 chr1 + 1063 6 full-splice_match PDPN ENST00000376057.8 2801 6 31 1707 31 3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 26 6.226769 0.794263 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTCTCCGTCTGACCATTCT 21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 26 NA PB.213.3 chr1 + 2772 6 full-splice_match PDPN ENST00000621990.5 2737 6 -37 2 33 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.634403 0.420682 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AACAATGAGTCAGACTTTTG 23 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 11 NA PB.213.4 chr1 + 2766 6 full-splice_match PDPN ENST00000376057.8 2801 6 33 2 33 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.831858 0.583409 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AACAATGAGTCAGACTTTTG 23 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 16 NA PB.213.5 chr1 + 1202 6 full-splice_match PDPN ENST00000621990.5 2737 6 -37 1572 33 126 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 28 6.705751 0.826447 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TACACATTCTGGTCTAGTTT 23 TRUE NA NA AGTAAA -39 NA NA NA 28 NA PB.213.6 chr1 + 1197 6 full-splice_match PDPN ENST00000376057.8 2801 6 33 1571 33 127 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 27 6.466260 0.810653 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACACATTCTGGTCTAGTTTG 23 TRUE NA NA AGTAAA -40 NA NA NA 27 NA PB.213.7 chr1 + 1066 6 full-splice_match PDPN ENST00000621990.5 2737 6 -37 1708 33 2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 41 9.819137 0.992073 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTGTCTCCGTCTGACCATTC 23 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 41 NA PB.213.9 chr1 + 937 6 full-splice_match PDPN ENST00000621990.5 2737 6 93 1707 92 3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTCTCCGTCTGACCATTCT 153 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.213.10 chr1 + 1042 6 full-splice_match PDPN ENST00000376057.8 2801 6 190 1569 119 129 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACATTCTGGTCTAGTTTGGT 180 FALSE NA NA AGTAAA -42 NA NA NA 2 NA PB.213.11 chr1 + 931 6 full-splice_match PDPN ENST00000621990.5 2737 6 234 1572 -27 126 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TACACATTCTGGTCTAGTTT 76 FALSE NA NA AGTAAA -39 NA NA NA 2 NA PB.213.12 chr1 + 2108 2 incomplete-splice_match PDPN ENST00000488631.1 794 5 28866 -1693 28866 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TACAACAATGAGTCAGACTT 3 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.214.1 chr1 + 802 7 incomplete-splice_match PRDM2 ENST00000311066.10 7279 10 0 51889 0 2 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCTTGTGATATTGGCTTG -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.214.5 chr1 + 1112 3 incomplete-splice_match PRDM2 ENST00000376048.9 2688 8 49140 1047 -23 519 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAAATGGGAAGATTA -6 TRUE NA NA AAAACA -13 NA NA NA 2 NA PB.214.6 chr1 + 2153 3 incomplete-splice_match PRDM2 ENST00000376048.9 2688 8 49155 -9 -8 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AACAAGCCTGGGAGTGATCA 9 TRUE NA NA AATAAA -23 NA NA NA 3 NA PB.214.7 chr1 + 3828 3 incomplete-splice_match PRDM2 ENST00000413440.5 6175 4 12 6018 0 3429 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAGAAAAAAAATCAGCTAGT -12 TRUE NA NA ATTAAA -8 NA NA NA 3 NA PB.214.20 chr1 + 1521 2 incomplete-splice_match PRDM2 ENST00000343137.8 5797 5 33225 -186 10914 186 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAAGGGGTTGTCCATTGA 181 FALSE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.214.21 chr1 + 1743 2 incomplete-splice_match PRDM2 ENST00000413440.5 6175 4 33253 -2 10930 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TGTGAAAGGACTGCATTTTG 197 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.214.22 chr1 + 1279 2 incomplete-splice_match PRDM2 ENST00000343137.8 5797 5 33259 22 10948 -22 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAATAAAATATTTAAAAT 215 FALSE NA NA TATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.244.1 chr1 - 1168 2 novel_not_in_catalog LRRC38 novel 2168 2 NA NA 1973 2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAATCTCTGGTATTCTGTTA 4723 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.244.2 chr1 - 1691 2 full-splice_match LRRC38 ENST00000376085.4 2168 2 476 1 476 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTCAATCTCTGGTATTCTG 3226 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.244.3 chr1 - 1549 2 full-splice_match LRRC38 ENST00000376085.4 2168 2 618 1 618 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTCAATCTCTGGTATTCTG 3368 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.244.4 chr1 - 1899 2 full-splice_match LRRC38 ENST00000376085.4 2168 2 267 2 267 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CACTCAATCTCTGGTATTCT 3017 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.244.5 chr1 - 2161 2 full-splice_match LRRC38 ENST00000376085.4 2168 2 0 7 0 -7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAGCCACTCAATCTCTGGT 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.244.6 chr1 - 2019 2 full-splice_match LRRC38 ENST00000376085.4 2168 2 142 7 142 -7 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAGCCACTCAATCTCTGGT 2892 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.244.7 chr1 - 1517 2 full-splice_match LRRC38 ENST00000376085.4 2168 2 330 321 330 -321 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATGTTTATGTTCCCCCAGA -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.244.8 chr1 - 1638 2 novel_not_in_catalog LRRC38 novel 2168 2 NA NA -13 -18171 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 GAAAATCAGAATTGCTTGTA -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.255.1 chr1 + 1902 8 novel_not_in_catalog KAZN novel 3838 8 NA NA 339 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAAAAAGAAAAAAAGAAA 324 FALSE NA NA TTTAAA -45 NA NA NA 2 NA PB.255.2 chr1 + 1740 7 incomplete-splice_match KAZN ENST00000400797.3 1295 8 14826 -761 14826 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TGAAAAAAAAGAAAAAAAGA NA FALSE NA NA TTTAAA -43 NA NA NA 2 NA PB.255.4 chr1 + 1345 5 incomplete-splice_match KAZN ENST00000400797.3 1295 8 98199 -763 98199 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAAAAAGAAAAAAAGAAA NA FALSE NA NA TTTAAA -45 NA NA NA 2 NA PB.258.1 chr1 + 1996 4 full-splice_match TMEM51 ENST00000376014.7 1843 4 -16 -137 -16 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TACATTTGGGTGCTGAGTTA 8 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.258.2 chr1 + 1903 3 full-splice_match TMEM51 ENST00000428417.5 1942 3 36 3 2 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTACATTTGGGTGCTGAGT 2 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 8 NA PB.258.3 chr1 + 1682 4 full-splice_match TMEM51 ENST00000376014.7 1843 4 198 -37 187 -17 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAGAA 148 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.258.4 chr1 + 1969 4 full-splice_match TMEM51 ENST00000376008.3 1971 4 1 1 1 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.831858 0.583409 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACATTTGGGTGCTGAGTTAC 7 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 16 NA PB.258.5 chr1 + 1853 4 full-splice_match TMEM51 ENST00000376008.3 1971 4 16 102 -5 -17 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAGAA 22 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.258.6 chr1 + 1880 3 full-splice_match TMEM51 ENST00000400796.7 1842 3 30 -68 -5 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 26 6.226769 0.794263 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TACATTTGGGTGCTGAGTTA 22 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 26 NA PB.258.7 chr1 + 1343 2 novel_in_catalog TMEM51 novel 1971 4 NA NA -5 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TACATTTGGGTGCTGAGTTA 22 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 4 NA PB.258.10 chr1 + 1659 2 incomplete-splice_match TMEM51 ENST00000376008.3 1971 4 61178 1 61157 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACATTTGGGTGCTGAGTTAC NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.258.11 chr1 + 1472 2 incomplete-splice_match TMEM51 ENST00000376008.3 1971 4 61365 1 61344 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACATTTGGGTGCTGAGTTAC NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 5 NA PB.258.12 chr1 + 1281 2 incomplete-splice_match TMEM51 ENST00000400796.7 1842 3 61469 32 61434 -17 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAGAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.258.13 chr1 + 1245 2 incomplete-splice_match TMEM51 ENST00000376008.3 1971 4 61591 2 61570 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TACATTTGGGTGCTGAGTTA NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.259.1 chr1 - 1995 3 full-splice_match TMEM51-AS1 ENST00000669314.1 3126 3 1143 -12 -11 12 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAGAAAAAAAA 3791 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.259.3 chr1 - 2323 2 novel_not_in_catalog TMEM51-AS1 novel 7100 6 NA NA 6 -15379 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTCTTTTGTGTCTAGCTTCT 2654 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.261.1 chr1 + 2284 4 full-splice_match EFHD2 ENST00000375980.9 2422 4 7 131 7 -131 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTTTTGCTTCTTTTTTCCC -21 TRUE NA NA TATAAA -18 NA NA NA 7 NA PB.261.2 chr1 + 925 4 full-splice_match EFHD2 ENST00000375980.9 2422 4 7 1490 7 -232 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGAATGGAGCAAGTTCAGGG -21 TRUE NA NA ACTAAA -17 NA NA NA 10 NA PB.261.3 chr1 + 2406 4 full-splice_match EFHD2 ENST00000375980.9 2422 4 14 2 14 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.310840 0.634562 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TATGTGTGTATGGTTCTTGA -14 TRUE NA NA GATAAA -13 NA NA NA 18 NA PB.261.4 chr1 + 2260 4 full-splice_match EFHD2 ENST00000375980.9 2422 4 152 10 152 -10 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATATTCTTATGTGTGTATG 124 FALSE NA NA GATAAA -5 NA NA NA 2 NA PB.261.5 chr1 + 2071 4 full-splice_match EFHD2 ENST00000375980.9 2422 4 221 130 -156 -130 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TTTTTGCTTCTTTTTTCCCC 193 FALSE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.261.6 chr1 + 2180 4 full-splice_match EFHD2 ENST00000375980.9 2422 4 239 3 -138 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTATGTGTGTATGGTTCTTG 211 FALSE NA NA GATAAA -12 NA NA NA 10 NA PB.261.7 chr1 + 1931 4 full-splice_match EFHD2 ENST00000375980.9 2422 4 361 130 -16 -130 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TTTTTGCTTCTTTTTTCCCC 74 FALSE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.261.8 chr1 + 2058 4 full-splice_match EFHD2 ENST00000375980.9 2422 4 362 2 -15 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TATGTGTGTATGGTTCTTGA 75 FALSE NA NA GATAAA -13 NA NA NA 9 NA PB.261.9 chr1 + 1977 3 incomplete-splice_match EFHD2 ENST00000375980.9 2422 4 16028 8 15651 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TATTCTTATGTGTGTATGGT 29 FALSE NA NA GATAAA -7 NA NA NA 4 NA PB.261.10 chr1 + 1905 3 incomplete-splice_match EFHD2 ENST00000375980.9 2422 4 16099 9 15722 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.113385 0.493233 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATATTCTTATGTGTGTATGG 100 FALSE NA NA GATAAA -6 NA NA NA 13 NA PB.261.11 chr1 + 1654 2 incomplete-splice_match EFHD2 ENST00000375980.9 2422 4 17358 132 16981 -132 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GCTTTTTGCTTCTTTTTTCC 24 FALSE NA NA TATAAA -17 NA NA NA 7 NA PB.261.12 chr1 + 1764 2 incomplete-splice_match EFHD2 ENST00000375980.9 2422 4 17370 10 16993 -10 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATATTCTTATGTGTGTATG 36 FALSE NA NA GATAAA -5 NA NA NA 2 NA PB.262.1 chr1 - 960 3 incomplete-splice_match CASP9 ENST00000400777.7 1878 9 28832 -92 11692 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTCTTTTGCCTATTTCTTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.262.2 chr1 - 1941 9 full-splice_match CASP9 ENST00000333868.10 2808 9 -8 875 -6 -6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 60 14.369468 1.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTCTCTTTTGCCTATTTCT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 60 NA PB.262.3 chr1 - 1969 9 full-splice_match CASP9 ENST00000400777.7 1878 9 -2 -89 -2 -7 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GACTCTCTTTTGCCTATTTC 31 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.262.4 chr1 - 1500 5 full-splice_match CASP9 ENST00000348549.9 1621 5 114 7 -16 -7 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GACTCTCTTTTGCCTATTTC -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.262.5 chr1 - 1828 9 novel_in_catalog CASP9 novel 2808 9 NA NA -12 -14 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATGGACTCTCTTTTGC 1577 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.262.6 chr1 - 1730 9 novel_not_in_catalog CASP9 novel 2808 9 NA NA -189 -14 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATGGACTCTCTTTTGC 1400 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.262.7 chr1 - 1349 6 incomplete-splice_match CASP9 ENST00000400777.7 1878 9 17225 -82 85 -14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATGGACTCTCTTTTGC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.262.8 chr1 - 1029 3 incomplete-splice_match CASP9 ENST00000400777.7 1878 9 28753 -82 11613 -14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATGGACTCTCTTTTGC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.264.3 chr1 + 5298 15 full-splice_match DNAJC16 ENST00000375847.8 6034 15 16 720 16 -718 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAAAAAAAAAATTTGT -11 TRUE NA NA AATACA -12 NA NA NA 3 NA PB.264.5 chr1 + 5100 14 full-splice_match DNAJC16 ENST00000616884.4 5882 14 64 718 29 -718 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAAAAAAAAAATTTGT 2 TRUE NA NA AATACA -12 NA NA NA 2 NA PB.264.6 chr1 + 5996 15 full-splice_match DNAJC16 ENST00000375847.8 6034 15 35 3 35 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAATTATGGGGTAGCCCTTG 8 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.265.1 chr1 + 3669 10 full-splice_match DDI2 ENST00000480945.6 10667 10 -18 7016 -18 971 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAGCATACTGTTTTAGAATG -14 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 7 NA PB.265.4 chr1 + 3837 10 full-splice_match DDI2 ENST00000480945.6 10667 10 66 6764 -19 1223 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATATCTTATCGTAGAGTGG 8 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.265.6 chr1 + 1581 1 full-splice_match RSC1A1 ENST00000345034.2 2321 1 735 5 735 -5 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAGCATACTGTTTTAGAATG 603 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.266.2 chr1 + 3014 13 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000375793.2 4004 19 41095 1 -4360 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGGCTTGTCACTGGCCCTTT 7583 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 4 NA PB.266.3 chr1 + 3085 12 novel_in_catalog PLEKHM2 novel 4004 19 NA NA -4350 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 7593 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.266.4 chr1 + 2686 12 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000642363.1 3775 21 42724 2 -2565 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 210 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 10 NA PB.266.5 chr1 + 2392 12 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000642363.1 3775 21 43018 2 -2271 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 504 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 6 NA PB.266.6 chr1 + 2169 12 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000642363.1 3775 21 43241 2 -2048 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 727 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 9 NA PB.266.7 chr1 + 1974 9 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000642363.1 3775 21 44111 2 -1178 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 1597 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 5 NA PB.266.8 chr1 + 1845 8 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000642363.1 3775 21 44608 2 -681 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 2094 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.266.10 chr1 + 1709 7 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000642363.1 3775 21 45350 2 61 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 2836 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.266.11 chr1 + 1523 6 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000642363.1 3775 21 46138 2 849 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.634403 0.420682 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 3624 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 11 NA PB.266.12 chr1 + 1425 4 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000477849.1 1057 7 2047 -652 2047 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 4822 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 10 NA PB.266.13 chr1 + 1314 4 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000477849.1 1057 7 2158 -652 2158 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 4933 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.266.14 chr1 + 1193 3 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000477849.1 1057 7 2580 -652 2580 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 5355 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 9 NA PB.266.15 chr1 + 1049 2 incomplete-splice_match PLEKHM2 ENST00000477849.1 1057 7 2806 -652 2806 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGGCTTGTCACTGGCCCTT 5581 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.267.2 chr1 - 1513 7 full-splice_match AGMAT ENST00000375826.4 3095 7 -15 1597 -15 -1597 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 48 11.495574 1.060531 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CATATTTCTATATCTTCCTT -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 48 NA PB.267.3 chr1 - 1351 7 full-splice_match AGMAT ENST00000375826.4 3095 7 14 1730 14 -1730 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.592367 0.555381 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTGCTTTGATTTTTTTTCC 12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.267.4 chr1 - 1151 7 full-splice_match AGMAT ENST00000375826.4 3095 7 214 1730 214 -1730 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTGCTTTGATTTTTTTTCC 3679 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.267.5 chr1 - 1289 7 full-splice_match AGMAT ENST00000375826.4 3095 7 -51 1857 -51 -1857 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGAAAACTTTCTGCTGAAA 3414 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.267.6 chr1 - 1214 7 full-splice_match AGMAT ENST00000375826.4 3095 7 24 1857 24 -1857 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.550332 0.658043 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGAAAACTTTCTGCTGAAA 22 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.267.7 chr1 - 1115 7 full-splice_match AGMAT ENST00000375826.4 3095 7 123 1857 123 -1857 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGAAAACTTTCTGCTGAAA 3588 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.268.1 chr1 + 2125 9 full-splice_match FBLIM1 ENST00000375766.8 3314 9 -42 1231 -31 29 alternative_3end TRUE canonical NA NA NA NA 17 4.071349 0.609738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTGGTGGCTCATGCCTGT -1 TRUE NA NA AAAAAG -16 NA NA NA 17 NA PB.268.3 chr1 + 1955 9 novel_in_catalog FBLIM1 novel 3314 9 NA NA -24 1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAAAAAAAAAGTGCCTTT 6 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.268.6 chr1 + 3334 9 novel_in_catalog FBLIM1 novel 3314 9 NA NA -15 -9 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGAAGCTCTTCCATGTTGT -25 TRUE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 10 NA PB.270.1 chr1 + 2766 11 incomplete-splice_match SPEN ENST00000375759.8 12385 15 -48 11859 -48 40 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAATGAAAAGACAGATA 91 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.270.2 chr1 + 2759 11 incomplete-splice_match SPEN ENST00000375759.8 12385 15 120 11698 120 201 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 32 7.663716 0.884439 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAGAAAATGAGCGAGAGCAA -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 32 NA PB.270.3 chr1 + 2132 10 novel_in_catalog SPEN novel 12385 15 NA NA 109 40 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAATGAAAAGACAGATA -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.270.4 chr1 + 3862 11 novel_in_catalog SPEN novel 12385 15 NA NA 115 40 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAATGAAAAGACAGATA -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.270.6 chr1 + 1484 5 incomplete-splice_match SPEN ENST00000375759.8 12385 15 118 29157 118 -2 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AGGTAAGACACAAGCAAGCT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.270.8 chr1 + 2244 2 incomplete-splice_match SPEN ENST00000375759.8 12385 15 158 65683 158 -1938 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAATAAAAGAGAAACTCATT 37 TRUE NA NA TATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.270.9 chr1 + 2397 11 incomplete-splice_match SPEN ENST00000375759.8 12385 15 321 11859 321 40 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAATGAAAAGACAGATA 200 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.270.10 chr1 + 2331 11 incomplete-splice_match SPEN ENST00000375759.8 12385 15 387 11859 387 40 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAATGAAAAGACAGATA 266 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.270.11 chr1 + 1984 10 incomplete-splice_match SPEN ENST00000673875.1 3123 12 37011 -40 -396 40 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAATGAAAAGACAGATA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.270.12 chr1 + 2299 10 novel_in_catalog SPEN novel 891 7 NA NA 548 40 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAATGAAAAGACAGATA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.270.13 chr1 + 2185 10 novel_in_catalog SPEN novel 891 7 NA NA 662 40 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAATGAAAAGACAGATA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.270.15 chr1 + 1771 9 incomplete-splice_match SPEN ENST00000673875.1 3123 12 40289 -40 -192 40 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAATGAAAAGACAGATA 2216 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.270.19 chr1 + 1281 7 incomplete-splice_match SPEN ENST00000673875.1 3123 12 75040 -40 -27448 40 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAATGAAAAGACAGATA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.271.9 chr1 - 1231 2 novel_not_in_catalog FLJ37453 novel 2473 2 NA NA 12340 -5 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAAGAAAAAAAAAAAAAG 4 TRUE NA NA AAAAAG -33 NA NA NA 2 NA PB.273.1 chr1 - 2939 15 novel_in_catalog ZBTB17 novel 2770 16 NA NA 14 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCTGCCTATAGGTCCCT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.273.2 chr1 - 2718 16 full-splice_match ZBTB17 ENST00000375743.9 2720 16 0 2 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 26 6.226769 0.794263 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCTGCCTATAGGTCCCT -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 26 NA PB.273.3 chr1 - 2112 12 incomplete-splice_match ZBTB17 ENST00000537142.5 2511 15 29789 0 -206 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCTGCCTATAGGTCCCT 6613 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.273.4 chr1 - 1577 9 incomplete-splice_match ZBTB17 ENST00000537142.5 2511 15 31246 0 -405 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCTGCCTATAGGTCCCT 8070 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.273.5 chr1 - 1443 8 incomplete-splice_match ZBTB17 ENST00000537142.5 2511 15 31476 0 -175 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCTGCCTATAGGTCCCT 8300 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.273.6 chr1 - 1207 8 incomplete-splice_match ZBTB17 ENST00000537142.5 2511 15 31712 0 -9 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCTGCCTATAGGTCCCT 8536 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.273.7 chr1 - 1086 7 incomplete-splice_match ZBTB17 ENST00000537142.5 2511 15 32237 0 84 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCTGCCTATAGGTCCCT 9061 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.273.8 chr1 - 2555 15 novel_in_catalog ZBTB17 novel 2770 16 NA NA -3 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAATGCTGCCTATAGGTCCC 12 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.273.9 chr1 - 2594 15 incomplete-splice_match ZBTB17 ENST00000375743.9 2720 16 2980 3 2958 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAATGCTGCCTATAGGTCCC 2998 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.273.10 chr1 - 1940 11 incomplete-splice_match ZBTB17 ENST00000537142.5 2511 15 30273 1 278 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAATGCTGCCTATAGGTCCC 7097 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.274.2 chr1 - 2156 3 full-splice_match HSPB7 ENST00000487046.1 844 3 32 -1344 0 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTCTGGAGGCCGCCTGCC 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.274.3 chr1 - 2143 3 full-splice_match HSPB7 ENST00000311890.14 2144 3 0 1 0 -1 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 16 3.831858 0.583409 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTCTGGAGGCCGCCTGCC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.275.1 chr1 - 1691 7 full-splice_match FAM131C ENST00000375662.5 1720 7 27 2 8 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GATGACCTTGGCCTGGTCTC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.275.2 chr1 - 1524 6 novel_in_catalog FAM131C novel 1720 7 NA NA -8 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GATGACCTTGGCCTGGTCTC -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.276.1 chr1 - 1922 7 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 22723 1 216 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCTTGGCTTTCAGTCTTGG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.276.2 chr1 - 3944 17 full-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 0 2 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.113385 0.493233 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GATCTTGGCTTTCAGTCTTG 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.276.3 chr1 - 3831 17 full-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 113 2 96 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GATCTTGGCTTTCAGTCTTG 114 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.276.5 chr1 - 3103 15 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 7573 2 -2046 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GATCTTGGCTTTCAGTCTTG 7574 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.276.6 chr1 - 1263 3 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 25719 2 3212 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GATCTTGGCTTTCAGTCTTG 41 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.276.7 chr1 - 3540 15 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 7131 7 -2488 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACCGATCTTGGCTTTCAG 7132 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.276.8 chr1 - 2606 13 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 18101 7 -4406 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACCGATCTTGGCTTTCAG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.276.9 chr1 - 2243 11 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 21011 7 -1496 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACCGATCTTGGCTTTCAG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.276.10 chr1 - 1734 6 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 23645 7 1138 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACCGATCTTGGCTTTCAG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.276.11 chr1 - 1618 5 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 23865 7 1358 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACCGATCTTGGCTTTCAG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.276.12 chr1 - 1024 2 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 26589 7 4082 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.592367 0.555381 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACCGATCTTGGCTTTCAG 911 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.276.14 chr1 - 2906 14 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 17711 8 -4796 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAAACCGATCTTGGCTTTCA NA FALSE NA NA GGGGCT -17 NA NA NA 2 NA PB.276.15 chr1 - 2266 10 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 21455 8 -1052 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAAACCGATCTTGGCTTTCA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.276.16 chr1 - 1381 4 incomplete-splice_match EPHA2 ENST00000358432.8 3946 17 24294 8 1787 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAAACCGATCTTGGCTTTCA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.277.1 chr1 - 1711 10 incomplete-splice_match ARHGEF19 ENST00000270747.8 3322 16 6362 244 236 -244 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTCTGTGATCCATCTGATG 6349 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.277.2 chr1 - 1955 10 incomplete-splice_match ARHGEF19 ENST00000270747.8 3322 16 6112 250 3 -250 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GCTTGGAGTCTGTGATCCAT 6099 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.277.3 chr1 - 1812 11 incomplete-splice_match ARHGEF19 ENST00000270747.8 3322 16 5648 250 7 -250 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GCTTGGAGTCTGTGATCCAT 5635 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.277.4 chr1 - 1596 9 incomplete-splice_match ARHGEF19 ENST00000270747.8 3322 16 6567 250 441 -250 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GCTTGGAGTCTGTGATCCAT 6554 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.277.5 chr1 - 826 3 incomplete-splice_match ARHGEF19 ENST00000478117.5 2035 11 5150 250 4665 -250 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GCTTGGAGTCTGTGATCCAT 8375 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.278.1 chr1 - 994 2 full-splice_match ANO7L1 ENST00000475369.2 998 2 1 3 1 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACTGCCACCTCTCCACGG 9510 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.279.1 chr1 - 1551 5 full-splice_match CPLANE2 ENST00000375599.8 1574 5 14 9 14 -9 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGTGCTGAACTCCAGAGACG 11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.279.3 chr1 - 1439 4 full-splice_match CPLANE2 ENST00000434014.1 336 4 -523 -580 1 -9 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGTGCTGAACTCCAGAGACG -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.281.2 chr1 + 926 2 full-splice_match SRARP ENST00000329454.2 3039 2 0 2113 0 -2113 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATGAATGCTCTGCAGGAACT 0 TRUE NA NA AATAAA -42 NA NA NA 6 NA PB.282.1 chr1 + 1674 3 full-splice_match SZRD1 ENST00000401089.3 3447 3 10 1763 0 976 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 255 61.070236 1.785830 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGATTGATGACAGACTGG -4 TRUE NA NA AATAAA -28 NA NA NA 255 NA PB.282.3 chr1 + 917 3 full-splice_match SZRD1 ENST00000401089.3 3447 3 6 2524 -4 215 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 74 17.722343 1.248521 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATTTTTGTTTGTTTATACAA -8 TRUE NA NA AAAAAG -43 NA NA NA 74 NA PB.282.4 chr1 + 928 4 full-splice_match SZRD1 ENST00000401088.9 3480 4 -1 2553 -1 186 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 44 10.537610 1.022742 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAATATCCTTTCTTTTTTT 2 TRUE NA NA AAAAAG -14 NA NA NA 44 NA PB.282.5 chr1 + 3438 3 full-splice_match SZRD1 ENST00000401089.3 3447 3 8 1 -2 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 292 69.931412 1.844672 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGATCTTTGTCCTCATTTCA -6 TRUE NA NA TATAAA -32 NA NA NA 292 NA PB.282.6 chr1 + 1681 3 novel_not_in_catalog SZRD1 novel 3447 3 NA NA -2 954 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAAGAACAGCTTTGCTTT -6 TRUE NA NA AATAAA -6 NA NA NA 3 NA PB.282.7 chr1 + 3487 4 full-splice_match SZRD1 ENST00000401088.9 3480 4 -8 1 -1 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 102 24.428095 1.387890 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGATCTTTGTCCTCATTTCA -5 TRUE NA NA TATAAA -32 NA NA NA 102 NA PB.282.9 chr1 + 1780 5 full-splice_match SZRD1 ENST00000475554.5 583 5 -9 -1188 -1 954 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAAGAACAGCTTTGCTTT -5 TRUE NA NA AATAAA -6 NA NA NA 3 NA PB.282.10 chr1 + 1714 4 full-splice_match SZRD1 ENST00000401088.9 3480 4 -5 1771 2 968 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 85 20.356747 1.308708 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGCTTTGCAAAGATTGATGA -2 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 85 NA PB.282.11 chr1 + 1566 2 incomplete-splice_match SZRD1 ENST00000472461.1 843 4 25551 -1109 25551 976 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGATTGATGACAGACTGG NA FALSE NA NA AATAAA -28 NA NA NA 3 NA PB.282.12 chr1 + 3255 2 incomplete-splice_match SZRD1 ENST00000492354.1 3401 3 26068 0 25622 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCAGATCTTTGTCCTCATTT -12 TRUE NA NA TATAAA -30 NA NA NA 2 NA PB.282.13 chr1 + 647 2 incomplete-splice_match SZRD1 ENST00000472461.1 843 4 25680 -319 25680 186 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAATATCCTTTCTTTTTTT 46 FALSE NA NA AAAAAG -14 NA NA NA 2 NA PB.283.3 chr1 - 1562 6 incomplete-splice_match FBXO42 ENST00000375592.8 6227 10 95828 3813 -3059 429 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TCCTTTTCTGTGGCTTTTAA 97 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.283.4 chr1 - 2668 11 novel_not_in_catalog FBXO42 novel 6227 10 NA NA 36 428 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTCCTTTTCTGTGGCTTTTA 12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.283.5 chr1 - 1896 8 incomplete-splice_match FBXO42 ENST00000375592.8 6227 10 46585 3814 9472 428 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTCCTTTTCTGTGGCTTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.283.6 chr1 - 2376 10 full-splice_match FBXO42 ENST00000375592.8 6227 10 36 3815 36 427 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 33 7.903207 0.897803 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TTTCCTTTTCTGTGGCTTTT 12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 33 NA PB.283.7 chr1 - 2103 9 incomplete-splice_match FBXO42 ENST00000375592.8 6227 10 37128 3815 15 427 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TTTCCTTTTCTGTGGCTTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.283.8 chr1 - 1328 4 incomplete-splice_match FBXO42 ENST00000375592.8 6227 10 98823 3815 -64 427 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TTTCCTTTTCTGTGGCTTTT 3092 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.283.9 chr1 - 1166 2 incomplete-splice_match FBXO42 ENST00000456164.5 1153 3 1105 -427 1105 427 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TTTCCTTTTCTGTGGCTTTT 4427 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.283.10 chr1 - 2508 11 novel_not_in_catalog FBXO42 novel 6227 10 NA NA 38 426 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.592367 0.555381 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTTCCTTTTCTGTGGCTTT 14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.283.12 chr1 - 2276 9 novel_in_catalog FBXO42 novel 6227 10 NA NA 11 419 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAAACCCCTTTCCTTTTCTG -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.285.1 chr1 + 1025 8 full-splice_match NECAP2 ENST00000337132.10 2018 8 -18 1011 -15 -6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACACTGTTTCCTGGGATTCA -23 TRUE NA NA AGTAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.285.3 chr1 + 2028 8 full-splice_match NECAP2 ENST00000337132.10 2018 8 -11 1 -8 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 284 68.015480 1.832608 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATTGTATGTGAAAGATGAAT -16 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 284 NA PB.285.4 chr1 + 1166 8 full-splice_match NECAP2 ENST00000337132.10 2018 8 -11 863 -8 142 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGAAGAGGTTGAGTTTG -16 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 6 NA PB.285.5 chr1 + 1918 7 novel_not_in_catalog NECAP2 novel 1787 9 NA NA -5 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATTGTATGTGAAAGATGAAT -13 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.285.6 chr1 + 1812 9 novel_not_in_catalog NECAP2 novel 1787 9 NA NA 0 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATTGTATGTGAAAGATGAAT -5 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.285.7 chr1 + 1923 7 full-splice_match NECAP2 ENST00000443980.6 1929 7 6 0 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.071349 0.609738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATTGTATGTGAAAGATGAAT 13 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 17 NA PB.285.10 chr1 + 3036 8 novel_in_catalog NECAP2 novel 1787 9 NA NA 2 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATTGTATGTGAAAGATGAAT 16 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.285.11 chr1 + 2129 9 novel_not_in_catalog NECAP2 novel 1787 9 NA NA 2 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATTGTATGTGAAAGATGAAT 16 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.285.12 chr1 + 2094 9 novel_not_in_catalog NECAP2 novel 1787 9 NA NA 2 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATTGTATGTGAAAGATGAAT 16 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.285.13 chr1 + 2113 9 full-splice_match NECAP2 ENST00000459640.5 981 9 -11 -1121 2 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATTGTATGTGAAAGATGAAT 16 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.285.14 chr1 + 1818 7 novel_in_catalog NECAP2 novel 1787 9 NA NA 2 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATTGTATGTGAAAGATGAAT 16 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 5 NA PB.285.15 chr1 + 1889 7 incomplete-splice_match NECAP2 ENST00000492095.5 1787 9 2887 0 2858 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.113385 0.493233 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATTGTATGTGAAAGATGAAT 2901 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 13 NA PB.285.16 chr1 + 1799 6 incomplete-splice_match NECAP2 ENST00000492095.5 1787 9 7123 -9 7094 8 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAGATGAATGTGTTTCTG 7137 FALSE NA NA AATAAA -26 NA NA NA 2 NA PB.285.17 chr1 + 1682 5 incomplete-splice_match NECAP2 ENST00000492095.5 1787 9 7316 0 7287 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATTGTATGTGAAAGATGAAT 7330 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 7 NA PB.285.18 chr1 + 1518 4 incomplete-splice_match NECAP2 ENST00000492095.5 1787 9 8431 0 -6347 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATTGTATGTGAAAGATGAAT 8445 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 10 NA PB.285.19 chr1 + 1310 2 full-splice_match NECAP2 ENST00000509727.1 550 2 299 -1059 299 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATTGTATGTGAAAGATGAAT NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 6 NA PB.289.3 chr1 - 746 5 novel_in_catalog NBPF1 novel 488 4 NA NA 10 -86 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACAGAATGTCAGGTCTCCCA 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.289.10 chr1 - 911 4 novel_in_catalog NBPF1 novel 5932 29 NA NA 12 -757 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATGCACATTGTGCTTAT 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.289.14 chr1 - 4207 3 novel_not_in_catalog NBPF1 novel 2752 3 NA NA 12 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AACATCTAAATACATGTTGT 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.289.15 chr1 - 1921 1 full-splice_match NBPF1 ENST00000599908.1 3447 1 1321 205 1321 -205 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAGAAAGAATTGAAGCTG NA FALSE NA NA AAGAAA -13 NA NA NA 3 NA PB.289.16 chr1 - 2532 3 full-splice_match NBPF1 ENST00000599069.5 2752 3 0 220 0 -206 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 GAAAAGAAAGAATTGAAGCT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.289.18 chr1 - 2530 3 novel_not_in_catalog NBPF1 novel 2752 3 NA NA -3 -1664 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAGATTTCTGCTTCTGTC 21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.289.19 chr1 - 2764 3 full-splice_match NBPF1 ENST00000449853.2 2755 3 -12 3 -12 -3 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 32 7.663716 0.884439 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAGTCATTTTCTGGACATA 12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 32 NA PB.289.24 chr1 - 2174 3 full-splice_match NBPF1 ENST00000449853.2 2755 3 -30 611 -2 -611 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTTCTGTGCAGGATTTTGA -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.290.1 chr1 + 1113 1 full-splice_match ENSG00000261135 ENST00000562878.1 1110 1 -3 0 -3 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA NA NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCTGCTGACTCATCTTTGAC NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.291.3 chr1 - 1554 2 novel_not_in_catalog CROCCP2 novel 1296 4 NA NA 4772 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTATGTCAGTGTTCTCCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.291.5 chr1 - 1683 2 incomplete-splice_match CROCCP2 ENST00000639481.1 1296 4 5704 6 5704 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACTATGTCAGTGTTCTCC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.291.7 chr1 - 1394 4 full-splice_match CROCCP2 ENST00000639481.1 1296 4 -104 6 -104 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACTATGTCAGTGTTCTCC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.291.9 chr1 - 2570 12 novel_in_catalog CROCCP2 novel 2575 13 NA NA -28 -4 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GTAACTATGTCAGTGTTCTC -28 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.292.1 chr1 + 2486 13 novel_not_in_catalog MST1P2 novel 2291 18 NA NA -23 57 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACCAAGGACTTTCTTAAATG -4 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.292.2 chr1 + 3073 11 novel_not_in_catalog MST1P2 novel 2291 18 NA NA -20 135 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTTTGTTTTCATGGTCTTA -1 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 3 NA PB.292.3 chr1 + 2866 12 novel_not_in_catalog MST1P2 novel 2291 18 NA NA -19 56 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 CACCAAGGACTTTCTTAAAT 0 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.292.4 chr1 + 2673 12 novel_not_in_catalog MST1P2 novel 2291 18 NA NA -1 56 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 CACCAAGGACTTTCTTAAAT 18 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.292.5 chr1 + 2681 13 novel_in_catalog MST1P2 novel 2291 18 NA NA -1 57 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACCAAGGACTTTCTTAAATG 18 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.292.6 chr1 + 1820 9 novel_in_catalog MST1P2 novel 2291 18 NA NA 1919 52 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTTCACCAAGGACTTTCTT 1938 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.292.7 chr1 + 1812 6 novel_in_catalog MST1P2 novel 2291 18 NA NA 2505 129 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAGTGCAGTTTGTTTTCATG 431 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.292.8 chr1 + 1353 8 novel_in_catalog MST1P2 novel 2291 18 NA NA 2593 57 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACCAAGGACTTTCTTAAATG 519 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.292.9 chr1 + 1137 8 incomplete-splice_match MST1P2 ENST00000457982.3 2291 18 2809 -57 2809 57 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACCAAGGACTTTCTTAAATG 735 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.292.10 chr1 + 936 8 incomplete-splice_match MST1P2 ENST00000457982.3 2291 18 3010 -57 3010 57 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACCAAGGACTTTCTTAAATG 936 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.292.11 chr1 + 1212 4 novel_in_catalog MST1P2 novel 2291 18 NA NA 3284 129 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAGTGCAGTTTGTTTTCATG 1210 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 5 NA PB.294.1 chr1 + 2120 2 novel_not_in_catalog ENSG00000282143 novel 817 3 NA NA 10425 2588 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATTCCCTTGCCTATGATTT NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.295.1 chr1 + 1537 6 novel_in_catalog CROCC novel 3931 24 NA NA 417 1935 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 ATTTAAAAATGTAAAAAAAA 8850 FALSE NA NA AAGAAA -37 NA NA NA 2 NA PB.296.1 chr1 - 829 2 full-splice_match ENSG00000238142 ENST00000690818.1 845 2 17 -1 0 1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACGTTGGTTTTATCATTTTA 166 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.296.2 chr1 - 1128 1 full-splice_match ENSG00000238142 ENST00000688320.1 1135 1 0 7 0 2 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACTTACGTTGGTTTTATC -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.296.3 chr1 - 956 1 full-splice_match ENSG00000238142 ENST00000692736.1 964 1 0 8 0 1 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAACTTACGTTGGTTTTAT 166 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.297.1 chr1 - 2075 6 novel_in_catalog MFAP2 novel 1045 9 NA NA 0 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGATCAAGTCACTTTTT 14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.297.2 chr1 - 1913 7 novel_in_catalog MFAP2 novel 1045 9 NA NA 0 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGATCAAGTCACTTTTT 14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.297.3 chr1 - 1811 8 novel_in_catalog MFAP2 novel 1045 9 NA NA 0 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGATCAAGTCACTTTTT 14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.297.4 chr1 - 1823 6 novel_in_catalog MFAP2 novel 1045 9 NA NA 0 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGATCAAGTCACTTTTT 14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.297.5 chr1 - 1140 8 novel_in_catalog MFAP2 novel 1045 9 NA NA 3 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.634403 0.420682 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGATCAAGTCACTTTTT 17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.297.6 chr1 - 1138 9 novel_not_in_catalog MFAP2 novel 1045 9 NA NA -4 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGATCAAGTCACTTTTT -2 TRUE NA NA GGGGCT -8 NA NA NA 5 NA PB.297.7 chr1 - 1080 9 full-splice_match MFAP2 ENST00000375535.4 1045 9 -39 4 -27 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 632 151.358398 2.180007 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGATCAAGTCACTTTTT -25 TRUE NA NA GGGGCT -31 NA NA NA 632 NA PB.297.8 chr1 - 1080 7 novel_in_catalog MFAP2 novel 1045 9 NA NA -15 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGATCAAGTCACTTTTT -13 TRUE NA NA GGGGCT -19 NA NA NA 3 NA PB.297.9 chr1 - 1067 9 novel_not_in_catalog MFAP2 novel 1045 9 NA NA -941 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.352876 0.525417 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGATCAAGTCACTTTTT 35 TRUE NA NA AAGAAA -29 NA NA NA 14 NA PB.297.10 chr1 - 992 9 novel_not_in_catalog MFAP2 novel 1045 9 NA NA 0 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGATCAAGTCACTTTTT 14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.297.11 chr1 - 951 8 novel_in_catalog MFAP2 novel 1045 9 NA NA 0 -4 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.352876 0.525417 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGATCAAGTCACTTTTT 14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.297.12 chr1 - 864 7 incomplete-splice_match MFAP2 ENST00000375534.7 970 8 1143 4 1143 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGATCAAGTCACTTTTT 4475 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.298.1 chr1 - 4001 29 full-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 -5 0 -5 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.298.2 chr1 - 3784 28 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000452699.5 3981 29 6147 0 -16 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA 6192 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.298.3 chr1 - 3969 29 full-splice_match ATP13A2 ENST00000452699.5 3981 29 12 0 -1 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA 12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.298.4 chr1 - 3173 22 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 9823 0 -1258 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA 9868 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.298.5 chr1 - 2956 20 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 11626 0 10 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.298.6 chr1 - 2767 18 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 14753 0 -481 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.298.7 chr1 - 2594 17 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 15449 0 -196 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.298.8 chr1 - 2454 15 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 15763 0 118 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.298.9 chr1 - 2341 15 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 15876 0 231 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.298.10 chr1 - 2112 14 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 18245 0 -1825 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.298.11 chr1 - 1911 12 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 19576 0 -494 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA GGGGCT -5 NA NA NA 5 NA PB.298.12 chr1 - 1802 11 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 19798 0 -272 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.298.13 chr1 - 1649 10 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 20101 0 31 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.298.14 chr1 - 1464 9 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 21732 0 -193 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.298.15 chr1 - 1265 7 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 22170 0 245 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.298.16 chr1 - 1047 5 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 23691 0 1766 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.298.17 chr1 - 915 4 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 24691 0 2766 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.298.18 chr1 - 773 4 incomplete-splice_match ATP13A2 ENST00000326735.13 3996 29 24833 0 2908 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGCTGTGCCTGTCTTGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.298.19 chr1 - 3976 29 novel_in_catalog ATP13A2 novel 3996 29 NA NA -9 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GCTCTGCTGTGCCTGTCTTG -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.299.2 chr1 - 1098 8 full-splice_match SDHB ENST00000375499.8 1015 8 -96 13 -96 -13 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 62 14.848450 1.171681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAGAACCTG 14 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 62 NA PB.299.3 chr1 - 1019 8 full-splice_match SDHB ENST00000375499.8 1015 8 -17 13 -17 -13 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 1402 335.766571 2.526037 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAGAACCTG 93 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 1402 NA PB.299.4 chr1 - 840 7 incomplete-splice_match SDHB ENST00000375499.8 1015 8 9221 13 66 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAGAACCTG 9331 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.299.5 chr1 - 705 5 incomplete-splice_match SDHB ENST00000375499.8 1015 8 25294 13 -5578 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAGAACCTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.299.6 chr1 - 602 5 incomplete-splice_match SDHB ENST00000375499.8 1015 8 25397 13 -5475 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAGAACCTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.299.7 chr1 - 881 7 incomplete-splice_match SDHB ENST00000375499.8 1015 8 9153 40 -2 -10 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.873893 0.458471 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAGAAATAAATGTTATTCTA 9263 FALSE NA NA AAAAAG -15 NA NA NA 12 NA PB.299.8 chr1 - 758 6 incomplete-splice_match SDHB ENST00000375499.8 1015 8 20891 40 -9981 -10 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAGAAATAAATGTTATTCTA NA FALSE NA NA AAGAAA -35 NA NA NA 3 NA PB.300.3 chr1 + 1810 8 incomplete-splice_match CROCC ENST00000375541.10 6660 37 44536 7 439 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TAAAAAAGTTTGTACAGCTG 5589 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.300.4 chr1 + 1190 5 incomplete-splice_match CROCC ENST00000375541.10 6660 37 47928 7 74 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TAAAAAAGTTTGTACAGCTG 8981 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.301.1 chr1 + 3180 16 full-splice_match PADI3 ENST00000375460.3 3189 16 0 9 0 -9 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACACAAATGGCTTGGCTC 1 TRUE NA NA AATAAA -8 NA NA NA 2 NA PB.302.1 chr1 - 4401 16 full-splice_match PADI2 ENST00000375486.9 4361 16 -41 1 -41 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATATGGCTGTTGGTGTGATG 4089 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.302.2 chr1 - 2874 5 novel_not_in_catalog PADI2 novel 4361 16 NA NA -222 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATATGGCTGTTGGTGTGATG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.302.3 chr1 - 1803 5 novel_not_in_catalog PADI2 novel 4361 16 NA NA -223 -48 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATTTTGAAGAACCGATTTAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.306.1 chr1 + 2488 12 incomplete-splice_match ARHGEF10L ENST00000375408.7 3685 20 16613 1 672 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GACTTGGATTGAGGTTTTGT 1020 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.306.3 chr1 + 1853 6 incomplete-splice_match ARHGEF10L ENST00000375408.7 3685 20 37563 -6 16126 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTGAGGTTTTGTTGTGGTT NA FALSE NA NA AATAAA -26 NA NA NA 2 NA PB.306.4 chr1 + 1702 6 incomplete-splice_match ARHGEF10L ENST00000375408.7 3685 20 37708 0 16271 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTTGGATTGAGGTTTTGTT NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.306.5 chr1 + 1366 4 incomplete-splice_match ARHGEF10L ENST00000375408.7 3685 20 46233 0 24796 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTTGGATTGAGGTTTTGTT NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.306.6 chr1 + 1257 3 incomplete-splice_match ARHGEF10L ENST00000375408.7 3685 20 69319 0 -6412 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTTGGATTGAGGTTTTGTT NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.307.1 chr1 + 1959 4 novel_not_in_catalog ACTL8 novel 1841 3 NA NA 0 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGGCTCCTGTGATGG -16 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.307.2 chr1 + 1818 3 full-splice_match ACTL8 ENST00000375406.2 1841 3 21 2 21 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 50 11.974557 1.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGGCTCCTGTGATGG 5 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 50 NA PB.307.3 chr1 + 1823 3 novel_not_in_catalog ACTL8 novel 1670 2 NA NA 3998 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGGCTCCTGTGATGG 1 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 7 NA PB.307.4 chr1 + 1361 2 full-splice_match ACTL8 ENST00000617065.1 1670 2 308 1 308 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CAATGCTGGCTCCTGTGATG NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.309.1 chr1 - 3635 12 full-splice_match RCC2 ENST00000375433.3 2030 12 311 -1916 311 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.831858 0.583409 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGGATTTTGCATTTCTTTT 3227 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.309.2 chr1 - 3487 10 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 14026 0 12910 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.634403 0.420682 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGGATTTTGCATTTCTTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.309.3 chr1 - 3233 8 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 17397 0 -13234 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.634403 0.420682 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGGATTTTGCATTTCTTTT 3259 FALSE NA NA AAGAAA -30 NA NA NA 11 NA PB.309.4 chr1 - 3122 7 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 18881 1 -11750 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.873893 0.458471 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTTGGATTTTGCATTTCTTT 4743 FALSE NA NA AAGAAA -3 NA NA NA 12 NA PB.309.5 chr1 - 2806 5 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 26027 0 -4604 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGGATTTTGCATTTCTTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.309.7 chr1 - 2678 4 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 26498 15 -4133 -15 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.634403 0.420682 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACATTGTCTACTGTCTTGGA NA FALSE NA NA AAAACA -34 NA NA NA 11 NA PB.309.8 chr1 - 2482 2 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 29657 0 -974 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.634403 0.420682 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGGATTTTGCATTTCTTTT 2254 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.309.19 chr1 - 2940 6 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 23123 8 -7508 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 23 5.508296 0.741017 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CTACTGTCTTGGATTTTGCA 8985 FALSE NA NA AATGAA -42 NA NA NA 23 NA PB.309.20 chr1 - 2586 3 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 27482 1 -3149 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.310840 0.634562 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTTGGATTTTGCATTTCTTT 79 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.309.24 chr1 - 3340 9 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375436.9 4040 13 16873 4 -13758 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.029314 0.701509 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTCTTGGATTTTGCATTTC 2735 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 21 NA PB.309.26 chr1 - 3692 12 full-splice_match RCC2 ENST00000375433.3 2030 12 227 -1889 227 -27 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAATAAACAACAACATTGTC 3143 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.309.27 chr1 - 2437 2 novel_in_catalog RCC2 novel 2030 12 NA NA -3104 -27 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAATAAACAACAACATTGTC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.309.30 chr1 - 2489 10 incomplete-splice_match RCC2 ENST00000375433.3 2030 12 13001 -1009 13001 172 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATGATGTAGTTGTTGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.309.35 chr1 - 1343 2 intergenic novelGene_309 novel NA NA NA NA NA NA multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 9795 FALSE NA NA AATGAA -11 NA NA NA 2 NA PB.311.1 chr1 - 2759 11 incomplete-splice_match ALDH4A1 ENST00000538309.5 1940 15 5313 -1302 41 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATCACAGTGGTGGATGGTCT 5185 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.311.2 chr1 - 3132 15 full-splice_match ALDH4A1 ENST00000375341.8 3139 15 5 2 3 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 36 8.621680 0.935592 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATCACAGTGGTGGATGGTC -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 36 NA PB.311.3 chr1 - 2615 10 incomplete-splice_match ALDH4A1 ENST00000538309.5 1940 15 7500 -1301 2228 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATCACAGTGGTGGATGGTC 7372 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.311.4 chr1 - 2215 7 incomplete-splice_match ALDH4A1 ENST00000538309.5 1940 15 11542 -1301 6270 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATCACAGTGGTGGATGGTC 6682 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.311.5 chr1 - 2119 16 full-splice_match ALDH4A1 ENST00000290597.9 2124 16 3 2 3 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATCACAGTGGTGGATGGTC -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.311.6 chr1 - 1922 4 incomplete-splice_match ALDH4A1 ENST00000538309.5 1940 15 14422 -1301 9150 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATCACAGTGGTGGATGGTC 9562 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.311.7 chr1 - 1633 2 incomplete-splice_match ALDH4A1 ENST00000538309.5 1940 15 16322 -1301 11050 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATCACAGTGGTGGATGGTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.311.10 chr1 - 2017 6 incomplete-splice_match ALDH4A1 ENST00000538309.5 1940 15 13426 -1300 8154 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAATCACAGTGGTGGATGGT 8566 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.311.11 chr1 - 1818 4 incomplete-splice_match ALDH4A1 ENST00000538309.5 1940 15 14525 -1300 9253 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAATCACAGTGGTGGATGGT 9665 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.311.14 chr1 - 819 8 novel_in_catalog ALDH4A1 novel 844 6 NA NA 0 -4 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGAAAGATTTGGATGTAGTC -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.311.15 chr1 - 1282 7 incomplete-splice_match ALDH4A1 ENST00000375341.8 3139 15 -14 11136 -14 -6 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AGAGAAAGATTTGGATGTAG 196 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.313.1 chr1 - 1342 9 novel_not_in_catalog IFFO2 novel 6179 9 NA NA -15138 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GACTTTGCAGTGTTAACTGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.314.1 chr1 - 5416 36 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 91308 4 -109 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGGAAGGTGTTGCCTGC NA FALSE NA NA AGTAAA -32 NA NA NA 2 NA PB.314.2 chr1 - 3854 26 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 100082 4 374 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGGAAGGTGTTGCCTGC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.314.3 chr1 - 3570 24 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 103605 4 -1745 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGGAAGGTGTTGCCTGC NA FALSE NA NA AATAGA -34 NA NA NA 6 NA PB.314.4 chr1 - 3408 23 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 104493 4 -857 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGGAAGGTGTTGCCTGC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.314.5 chr1 - 2704 18 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 4486 0 -304 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGGAAGGTGTTGCCTGC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.314.6 chr1 - 2593 17 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 5295 0 505 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGGAAGGTGTTGCCTGC 528 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.314.7 chr1 - 2296 14 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 9320 0 326 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGGAAGGTGTTGCCTGC 4553 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.314.8 chr1 - 2180 13 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 9955 0 961 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGGAAGGTGTTGCCTGC 5188 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.314.9 chr1 - 1717 10 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 12040 0 564 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGGAAGGTGTTGCCTGC 7273 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.314.10 chr1 - 1582 9 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 16016 0 4540 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGGAAGGTGTTGCCTGC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.314.11 chr1 - 1178 4 full-splice_match UBR4 ENST00000375225.7 1533 4 351 4 351 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGGAAGGTGTTGCCTGC 6005 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.314.12 chr1 - 1047 5 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 20228 0 -2448 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGGAAGGTGTTGCCTGC 3206 FALSE NA NA AATGAA -14 NA NA NA 4 NA PB.314.13 chr1 - 845 4 full-splice_match UBR4 ENST00000375225.7 1533 4 684 4 -250 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGGAAGGTGTTGCCTGC 6338 FALSE NA NA AATAAA -5 NA NA NA 6 NA PB.314.14 chr1 - 723 4 full-splice_match UBR4 ENST00000375225.7 1533 4 806 4 -128 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGGAAGGTGTTGCCTGC 6460 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.314.15 chr1 - 4568 31 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 96295 5 -1284 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAGGAAGGTGTTGCCTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.314.17 chr1 - 2537 16 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 7666 1 -1328 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAGGAAGGTGTTGCCTG 2899 FALSE NA NA GATAAA -40 NA NA NA 3 NA PB.314.18 chr1 - 2421 15 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 8324 1 -670 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAGGAAGGTGTTGCCTG 3557 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.314.19 chr1 - 2181 13 novel_in_catalog UBR4 novel 3475 21 NA NA 320 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAGGAAGGTGTTGCCTG 4547 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.314.20 chr1 - 1928 11 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 11434 1 -42 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAGGAAGGTGTTGCCTG 6667 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.314.21 chr1 - 1429 8 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 16997 1 5521 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 23 5.508296 0.741017 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAGGAAGGTGTTGCCTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 23 NA PB.314.22 chr1 - 1311 7 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 18109 1 -4567 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAGGAAGGTGTTGCCTG 1087 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.314.23 chr1 - 4036 28 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 99465 6 -243 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGAAAAGGAAGGTGTTGCCT NA FALSE NA NA AATAGA -3 NA NA NA 3 NA PB.314.24 chr1 - 2868 19 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 3374 2 -1416 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGAAAAGGAAGGTGTTGCCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.314.25 chr1 - 933 5 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 20339 3 -2337 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TTGAAAAGGAAGGTGTTGCC 3317 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.314.26 chr1 - 5105 34 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 92984 8 1567 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATTGAAAAGGAAGGTGTTGC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.314.27 chr1 - 3784 26 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 100148 8 440 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATTGAAAAGGAAGGTGTTGC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.314.28 chr1 - 3028 20 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 770 4 770 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATTGAAAAGGAAGGTGTTGC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.314.29 chr1 - 2072 12 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 10825 4 -651 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATTGAAAAGGAAGGTGTTGC 6058 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.314.30 chr1 - 949 4 full-splice_match UBR4 ENST00000375225.7 1533 4 576 8 -358 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.592367 0.555381 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATTGAAAAGGAAGGTGTTGC -22 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.314.31 chr1 - 1164 6 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375224.1 3475 21 18660 5 -4016 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 CATTGAAAAGGAAGGTGTTG 1638 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.314.36 chr1 - 2956 22 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 90689 22683 -728 -3098 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GTAGATCATGGCACTGCACA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.314.37 chr1 - 1345 11 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 100111 22683 403 -3098 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GTAGATCATGGCACTGCACA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.315.1 chr1 - 5119 33 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 48395 46719 6184 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 4842 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.315.2 chr1 - 5323 34 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 47669 46719 5458 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 4116 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.315.3 chr1 - 3980 26 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 54647 46719 -3919 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 1207 FALSE NA NA CATAAA -3 NA NA NA 2 NA PB.315.4 chr1 - 3742 25 novel_not_in_catalog UBR4 novel 15892 106 NA NA -3319 -16 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 1807 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.315.5 chr1 - 3162 22 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 57897 46719 -669 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 4457 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.315.6 chr1 - 3033 21 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 58479 46719 -87 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 5039 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.315.7 chr1 - 2604 18 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 62142 46719 -1996 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 8702 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.315.8 chr1 - 2386 17 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 63352 46719 -786 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 9912 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.315.9 chr1 - 2119 15 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 65396 46719 1258 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 8888 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.315.10 chr1 - 1988 14 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 66221 46719 2083 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 9713 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.315.11 chr1 - 2051 6 novel_in_catalog UBR4 novel 2954 21 NA NA -603 -16 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 2974 FALSE NA NA AAAACA -14 NA NA NA 3 NA PB.315.12 chr1 - 1812 13 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 68599 46719 4461 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.315.13 chr1 - 1615 11 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 69372 46719 5234 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.315.14 chr1 - 1410 10 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000425413.5 2954 21 12578 29 7006 -16 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.634403 0.420682 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.315.15 chr1 - 1257 9 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000425413.5 2954 21 13632 29 8060 -16 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 20 4.789823 0.680319 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 20 NA PB.315.16 chr1 - 875 5 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000425413.5 2954 21 25043 29 1044 -16 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 4621 FALSE NA NA AATACA -32 NA NA NA 2 NA PB.315.17 chr1 - 824 5 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000425413.5 2954 21 25094 29 1095 -16 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAGAGCAAGAAAGAAGA 4672 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.315.18 chr1 - 3631 24 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 56338 46720 -2228 -17 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 TAAAAAGAGCAAGAAAGAAG 2898 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.315.19 chr1 - 2922 21 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 58589 46720 23 -17 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 TAAAAAGAGCAAGAAAGAAG 5149 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.315.20 chr1 - 1972 14 novel_not_in_catalog UBR4 novel 15892 106 NA NA 2092 -17 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 TAAAAAGAGCAAGAAAGAAG 9722 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.315.21 chr1 - 1012 7 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000425413.5 2954 21 23467 30 -532 -17 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 34 8.142698 0.910768 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 TAAAAAGAGCAAGAAAGAAG 3045 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 34 NA PB.318.1 chr1 + 2072 1 full-splice_match KLHDC7A ENST00000400664.3 5045 1 2983 -10 2983 10 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAATGATC 2752 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.318.2 chr1 + 1099 1 full-splice_match KLHDC7A ENST00000400664.3 5045 1 3956 -10 3956 10 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAATGATC 3725 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 3 NA PB.319.1 chr1 - 2683 17 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 0 108820 0 -32406 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAAAAAATATGTCTTTTA -3 TRUE NA NA GGGGCT -34 NA NA NA 2 NA PB.319.2 chr1 - 1943 9 incomplete-splice_match UBR4 ENST00000375254.8 15892 106 2 118139 2 -41725 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAGAGGATATTGAACTCT -1 TRUE NA NA GGGGCT -32 NA NA NA 2 NA PB.320.5 chr1 + 976 2 full-splice_match EMC1-AS1 ENST00000437898.2 653 2 40 -363 34 363 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 CTGAAGGGAACAACTCCGAG -2 TRUE NA NA ATTAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.321.1 chr1 - 4211 23 full-splice_match EMC1 ENST00000477853.6 6640 23 0 2429 0 59 alternative_3end TRUE canonical NA NA NA NA 26 6.226769 0.794263 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTGTTTAAGTCCTCTTTTG 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 26 NA PB.321.2 chr1 - 2961 12 novel_not_in_catalog EMC1 novel 5903 21 NA NA 3350 59 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTGTTTAAGTCCTCTTTTG 5209 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.321.4 chr1 - 3619 18 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000375208.7 4084 22 10446 -57 -508 57 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACACTGTTTAAGTCCTCTTT 1351 FALSE NA NA AATACA -8 NA NA NA 2 NA PB.321.5 chr1 - 2275 8 full-splice_match EMC1 ENST00000688918.1 4034 8 473 1286 -322 57 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACACTGTTTAAGTCCTCTTT 9864 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.321.6 chr1 - 1566 4 novel_in_catalog EMC1 novel 425 4 NA NA 112 57 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACACTGTTTAAGTCCTCTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.321.8 chr1 - 3402 16 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000375199.7 5408 23 11522 1222 581 52 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAATGACACTGTTTAAGTCC 2440 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.321.9 chr1 - 2515 9 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000375208.7 4084 22 18791 -52 -415 52 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAATGACACTGTTTAAGTCC 9696 FALSE NA NA AAAAAG -9 NA NA NA 2 NA PB.321.11 chr1 - 4092 23 full-splice_match EMC1 ENST00000477853.6 6640 23 -13 2561 5 -73 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.113385 0.493233 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTCCTTGGTCATAGAGTTGG -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.321.13 chr1 - 3625 23 full-splice_match EMC1 ENST00000375199.7 5408 23 -33 1816 0 255 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAGTTTCGTGCTGTCATTTA -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.321.14 chr1 - 3406 23 full-splice_match EMC1 ENST00000477853.6 6640 23 -7 3241 -5 44 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 127 30.415373 1.483093 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTCTGACTTTTTCCATCTCT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 127 NA PB.321.15 chr1 - 1450 8 full-splice_match EMC1 ENST00000688918.1 4034 8 456 2128 -339 12 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTTTTGTGTTTCTCAATTTT 9847 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.321.16 chr1 - 3204 22 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000477853.6 6640 23 6546 3274 -811 11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CCTTTTGTGTTTCTCAATTT 6551 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.321.17 chr1 - 2339 14 novel_not_in_catalog EMC1 novel 6640 23 NA NA 0 10 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCTTTTGTGTTTCTCAATT 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.321.18 chr1 - 1890 10 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000486405.2 2991 24 18402 -368 -791 10 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCTTTTGTGTTTCTCAATT 9320 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.321.19 chr1 - 1172 6 full-splice_match EMC1 ENST00000691945.1 4156 6 854 2130 609 10 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCCTTTTGTGTTTCTCAATT NA FALSE NA NA AATGAA -28 NA NA NA 4 NA PB.321.20 chr1 - 3336 23 full-splice_match EMC1 ENST00000688667.1 5475 23 4 2135 4 5 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTTTGCCTTTTGTGTTTCT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.321.21 chr1 - 2114 12 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000375208.7 4084 22 14303 792 3349 5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTTTGCCTTTTGTGTTTCT 5208 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.321.22 chr1 - 1668 9 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000486405.2 2991 24 18780 -362 -413 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TACTTTGCCTTTTGTGTTTC 9698 FALSE NA NA AAAAAG -7 NA NA NA 2 NA PB.321.23 chr1 - 3248 22 full-splice_match EMC1 ENST00000688219.1 6517 22 -16 3285 2 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTTACTTTGCCTTTTGTG -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.321.24 chr1 - 2613 17 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000375208.7 4084 22 11167 797 213 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTTACTTTGCCTTTTGTG 2072 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.321.25 chr1 - 1982 11 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000375208.7 4084 22 16319 797 -2887 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTTACTTTGCCTTTTGTG 7224 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.321.26 chr1 - 917 4 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000691945.1 4156 6 5403 2140 -26 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTTACTTTGCCTTTTGTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.321.27 chr1 - 2439 16 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000375208.7 4084 22 11651 798 697 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GACTTTACTTTGCCTTTTGT 2556 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.321.28 chr1 - 1268 6 full-splice_match EMC1 ENST00000691945.1 4156 6 746 2142 501 -2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.873893 0.458471 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGACTTTACTTTGCCTTTTG NA FALSE NA NA AAAAAG -25 NA NA NA 12 NA PB.321.29 chr1 - 2789 18 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000375199.7 5408 23 10400 2077 -541 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATTGACTTTACTTTGCCT 1318 FALSE NA NA AATACA -41 NA NA NA 2 NA PB.321.30 chr1 - 1106 5 incomplete-splice_match EMC1 ENST00000691945.1 4156 6 4647 2146 -536 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATTGACTTTACTTTGCCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.321.31 chr1 - 744 3 full-splice_match EMC1 ENST00000480380.1 3892 3 1071 2077 360 -6 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATTGACTTTACTTTGCCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.321.32 chr1 - 3249 23 full-splice_match EMC1 ENST00000375199.7 5408 23 70 2089 26 -18 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TGAGGCCTGTTTAAATTGAC 90 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.324.1 chr1 + 1617 8 full-splice_match MRTO4 ENST00000330263.5 2049 8 -250 682 -250 -682 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTGCCTGTGGTCCCCACT -17 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 5 NA PB.324.4 chr1 + 1407 8 full-splice_match MRTO4 ENST00000330263.5 2049 8 -222 864 -222 525 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 24 5.747787 0.759501 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAAAGAATACA 11 TRUE NA NA AGTAAA -11 NA NA NA 24 NA PB.324.5 chr1 + 1032 9 novel_not_in_catalog MRTO4 novel 2049 8 NA NA -16 525 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAAAGAATACA -25 TRUE NA NA AGTAAA -11 NA NA NA 3 NA PB.324.7 chr1 + 1367 8 full-splice_match MRTO4 ENST00000330263.5 2049 8 0 682 0 -682 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 90 21.554201 1.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTGCCTGTGGTCCCCACT -9 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 90 NA PB.324.8 chr1 + 1192 8 full-splice_match MRTO4 ENST00000330263.5 2049 8 -7 864 -7 525 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 130 31.133846 1.493233 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAAAGAATACA -16 TRUE NA NA AGTAAA -11 NA NA NA 130 NA PB.324.11 chr1 + 1020 9 novel_not_in_catalog MRTO4 novel 2049 8 NA NA 0 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACAGTGGCCCTCTTTTTTC -9 TRUE NA NA AGTAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.324.14 chr1 + 2045 8 full-splice_match MRTO4 ENST00000330263.5 2049 8 3 1 3 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACAGTGGCCCTCTTTTTTCT -6 TRUE NA NA AGTAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.324.15 chr1 + 949 8 novel_not_in_catalog MRTO4 novel 2049 8 NA NA 13 267 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATCCCAGCACTTTGGGAAG 4 TRUE NA NA AATAAA -33 NA NA NA 2 NA PB.324.16 chr1 + 896 8 full-splice_match MRTO4 ENST00000330263.5 2049 8 13 1140 13 249 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 25 5.987278 0.777229 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GCGGTGGCTCACGCCTGGAA 4 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 25 NA PB.324.18 chr1 + 1521 8 novel_in_catalog MRTO4 novel 2049 8 NA NA 19 525 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAAAGAATACA 40 FALSE NA NA AGTAAA -11 NA NA NA 3 NA PB.324.20 chr1 + 941 5 incomplete-splice_match MRTO4 ENST00000330263.5 2049 8 5281 864 -626 525 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAAAGAATACA 5272 FALSE NA NA AGTAAA -11 NA NA NA 10 NA PB.324.21 chr1 + 1114 5 incomplete-splice_match MRTO4 ENST00000330263.5 2049 8 5289 683 -618 -683 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CACTTGCCTGTGGTCCCCAC 5280 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.324.23 chr1 + 814 2 incomplete-splice_match MRTO4 ENST00000479559.1 409 3 793 -706 793 -683 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CACTTGCCTGTGGTCCCCAC 6691 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.325.1 chr1 - 1251 6 novel_in_catalog AKR7A2 novel 1360 7 NA NA 7 -5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAAACTTGCTTTCTCTGCT -27 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.325.2 chr1 - 1354 7 full-splice_match AKR7A2 ENST00000235835.8 1360 7 1 5 1 -5 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 407 97.472893 1.988884 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAAACTTGCTTTCTCTGCT -33 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 407 NA PB.325.3 chr1 - 1245 6 full-splice_match AKR7A2 ENST00000330072.9 1171 6 -45 -29 5 -5 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAAACTTGCTTTCTCTGCT -29 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.325.4 chr1 - 1134 7 full-splice_match AKR7A2 ENST00000235835.8 1360 7 221 5 -16 -5 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.592367 0.555381 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAAACTTGCTTTCTCTGCT 187 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.325.5 chr1 - 1005 6 incomplete-splice_match AKR7A2 ENST00000235835.8 1360 7 3534 5 -105 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAAACTTGCTTTCTCTGCT 3500 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.325.6 chr1 - 900 6 incomplete-splice_match AKR7A2 ENST00000235835.8 1360 7 3639 5 0 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAAACTTGCTTTCTCTGCT 3605 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.326.1 chr1 + 1838 9 novel_in_catalog SLC66A1 novel 1805 9 NA NA -68 -4 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGAGACCTGCTTCTGTTGC NA FALSE NA NA AATAAA -30 NA NA NA 2 NA PB.326.2 chr1 + 1711 8 novel_in_catalog SLC66A1 novel 1805 9 NA NA -68 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGACCTGCTTCTGTTGCTCC NA FALSE NA NA AATAAA -33 NA NA NA 3 NA PB.326.3 chr1 + 1826 9 full-splice_match SLC66A1 ENST00000375155.7 1805 9 -25 4 -25 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 26 6.226769 0.794263 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATGAGACCTGCTTCTGTTGC -14 TRUE NA NA AATAAA -30 NA NA NA 26 NA PB.326.5 chr1 + 2123 8 full-splice_match SLC66A1 ENST00000375153.8 2175 8 8 44 4 -28 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAATAAAAAAGATAAC 19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.328.1 chr1 - 1688 9 full-splice_match CAPZB ENST00000264202.8 1675 9 -15 2 -15 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 1451 347.501617 2.540957 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TAGCGCTGGCCTTCTGTGTT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 1451 NA PB.328.2 chr1 - 1751 10 novel_not_in_catalog CAPZB novel 1686 10 NA NA -13 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGCGCTGGCCTTCTGTGTTC -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.328.3 chr1 - 1057 4 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 127910 -535 -10392 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.634403 0.420682 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAGAAAAGAAAAGAA 893 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.328.5 chr1 - 1667 9 novel_not_in_catalog CAPZB novel 1675 9 NA NA -32086 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.113385 0.493233 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TAGCGCTGGCCTTCTGTGTT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.328.6 chr1 - 1507 8 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 64976 -582 49 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TAGCGCTGGCCTTCTGTGTT 66 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.328.7 chr1 - 1356 6 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 106012 -582 6912 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 50 11.974557 1.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TAGCGCTGGCCTTCTGTGTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 50 NA PB.328.8 chr1 - 1236 5 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 127108 -582 -11194 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 36 8.621680 0.935592 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TAGCGCTGGCCTTCTGTGTT 91 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 36 NA PB.328.10 chr1 - 1041 4 novel_not_in_catalog CAPZB novel 1675 9 NA NA -10 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTAGCGCTGGCCTTCTGT 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.328.11 chr1 - 978 3 full-splice_match CAPZB ENST00000674299.1 1734 3 1113 -357 1113 -4 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 26 6.226769 0.794263 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTAGCGCTGGCCTTCTGT -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 26 NA PB.328.12 chr1 - 892 2 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000674299.1 1734 3 1951 -357 1951 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 43 10.298119 1.012758 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTAGCGCTGGCCTTCTGT 822 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 43 NA PB.328.14 chr1 - 1143 5 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 127197 -578 -11105 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.550332 0.658043 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGTTAGCGCTGGCCTTCTG 180 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.328.15 chr1 - 1359 7 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 99111 -535 11 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAGAAAAGAAAAGAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.328.18 chr1 - 1698 10 novel_not_in_catalog CAPZB novel 1686 10 NA NA -1 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAAAGAAAAGAAAAGA -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.328.19 chr1 - 1432 7 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 99037 -534 -63 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAAAGAAAAGAAAAGA NA FALSE NA NA AAAACA -10 NA NA NA 6 NA PB.328.21 chr1 - 1356 9 full-splice_match CAPZB ENST00000264202.8 1675 9 -10 329 -10 33 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 552 132.199097 2.121228 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTCCGTGTGTGTTTGGGAG 94 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 552 NA PB.328.22 chr1 - 859 5 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 127158 -255 -11144 33 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTCCGTGTGTGTTTGGGAG 141 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.328.23 chr1 - 739 4 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 127948 -255 -10354 33 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTCCGTGTGTGTTTGGGAG -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.328.25 chr1 - 1204 8 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 64951 -254 24 32 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATTCCGTGTGTGTTTGGGA 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.328.26 chr1 - 1086 7 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 99103 -254 3 32 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATTCCGTGTGTGTTTGGGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.328.27 chr1 - 950 6 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 106090 -254 6990 32 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATTCCGTGTGTGTTTGGGA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.328.28 chr1 - 1145 7 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 99037 -247 -63 25 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAAATCTTATTCCGTGTGTG NA FALSE NA NA AAAACA -10 NA NA NA 3 NA PB.328.29 chr1 - 1103 10 novel_not_in_catalog CAPZB novel 1686 10 NA NA -24 14 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAGAAAAACTGGAAATCTTA 80 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.328.30 chr1 - 644 4 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 128002 -214 -10300 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACTGTGGTGTGTGAAAGAG 985 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.328.31 chr1 - 1347 10 full-splice_match CAPZB ENST00000375142.5 1686 10 -15 354 13 -40 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAATGTAAAACAAAAAA 143 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.328.32 chr1 - 1203 9 novel_not_in_catalog CAPZB novel 1675 9 NA NA -10367 -40 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAATGTAAAACAAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.328.33 chr1 - 949 6 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 106019 -182 6919 -40 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAATGTAAAACAAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.328.34 chr1 - 1178 10 full-splice_match CAPZB ENST00000375142.5 1686 10 -26 534 2 2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTCCGGCTCCGAGCCTGCTT 17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.328.35 chr1 - 1083 9 full-splice_match CAPZB ENST00000264202.8 1675 9 10 582 8 2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 204 48.856190 1.688920 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTCCGGCTCCGAGCCTGCTT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 204 NA PB.328.36 chr1 - 768 6 incomplete-splice_match CAPZB ENST00000433834.5 1462 9 106020 -2 6920 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTCCGGCTCCGAGCCTGCTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.328.45 chr1 - 695 5 novel_not_in_catalog CAPZB novel 4666 2 NA NA -10 -127 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TGTCTTGCCCCTGTTCCTGC 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.329.1 chr1 + 458 3 full-splice_match MICOS10 ENST00000617872.4 3678 3 4 3216 2 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAATAAATTAAACAAAAAGA -29 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.329.3 chr1 + 503 4 full-splice_match MICOS10 ENST00000322753.7 3723 4 32 3188 10 2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 131 31.373339 1.496561 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CATTGCATGGCCTTTGTTTC 1 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 131 NA PB.329.4 chr1 + 676 5 full-splice_match MICOS10 ENST00000481464.5 657 5 -43 24 1 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAATAAATTAAACAAAAAGA -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.329.5 chr1 + 2002 4 full-splice_match NBL1 ENST00000602662.1 1623 4 18 -397 18 1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTGTTCTCCTCCTCACTGAC -13 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.329.9 chr1 + 524 5 full-splice_match MICOS10 ENST00000467029.5 583 5 41 18 1 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAATAAATTAAACAAAAAGA 32 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.329.15 chr1 + 2028 4 full-splice_match NBL1 ENST00000375136.8 2024 4 -4 0 -4 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 112 26.823006 1.428507 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTGTTCTCCTCCTCACTGA -19 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 112 NA PB.329.16 chr1 + 1721 2 novel_in_catalog NBL1 novel 2024 4 NA NA 2 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTGTTCTCCTCCTCACTGA -13 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.329.17 chr1 + 912 4 full-splice_match NBL1 ENST00000375136.8 2024 4 2 1110 2 213 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCAGAGGTCTTCAGGGCT -13 TRUE NA NA AATATA -19 NA NA NA 4 NA PB.329.18 chr1 + 1867 3 incomplete-splice_match NBL1 ENST00000548815.2 1953 4 7423 4 7423 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTGTTCTCCTCCTCACTGA 7470 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 8 NA PB.331.1 chr1 - 2951 16 full-splice_match TMCO4 ENST00000294543.11 2946 16 0 -5 0 5 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CACTTCTTGAGCATGTACCA -20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.331.3 chr1 - 1644 5 incomplete-splice_match TMCO4 ENST00000294543.11 2946 16 59977 -2 -1520 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TACCACTTCTTGAGCATGTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.331.4 chr1 - 2856 15 novel_in_catalog TMCO4 novel 2946 16 NA NA -10 -19 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AATAAATAATAATAAGAAGA 396 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.331.5 chr1 - 2045 10 novel_not_in_catalog TMCO4 novel 2946 16 NA NA -5 -19 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AATAAATAATAATAAGAAGA 401 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.331.6 chr1 - 1421 3 incomplete-splice_match TMCO4 ENST00000489814.5 1722 5 37533 19 324 -19 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AATAAATAATAATAAGAAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.331.7 chr1 - 1543 11 novel_not_in_catalog TMCO4 novel 804 7 NA NA -11 3850 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCCCTTCCTATGCACTGGC 395 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.331.8 chr1 - 1462 10 novel_not_in_catalog TMCO4 novel 804 7 NA NA -10 3849 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCCCTTCCTATGCACTGG 396 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.331.10 chr1 - 1714 12 novel_not_in_catalog TMCO4 novel 804 7 NA NA -10 3846 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACCAAGCCCTTCCTATGCAC 396 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.332.1 chr1 - 845 5 full-splice_match PLA2G2A ENST00000482011.2 608 5 0 -237 0 2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATGTATATGTGTGTGTGTAT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.332.2 chr1 - 914 5 full-splice_match PLA2G2A ENST00000400520.8 871 5 -53 10 -39 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATCATGTATATGTGTGTG 4352 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.335.1 chr1 + 976 4 full-splice_match CDA ENST00000375071.4 809 4 -165 -2 -154 2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAAGCGTGTGTCTTGCTCTG -26 TRUE NA NA TATAAA -22 NA NA NA 9 NA PB.335.2 chr1 + 913 3 full-splice_match CDA ENST00000461985.1 762 3 -149 -2 -149 2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAAGCGTGTGTCTTGCTCTG -21 TRUE NA NA TATAAA -22 NA NA NA 4 NA PB.335.3 chr1 + 813 4 full-splice_match CDA ENST00000375071.4 809 4 -7 3 4 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 30 7.184734 0.856411 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GGATCAAAGCGTGTGTCTTG 0 TRUE NA NA TATAAA -17 NA NA NA 30 NA PB.335.5 chr1 + 1063 3 incomplete-splice_match CDA ENST00000375071.4 809 4 15392 -2 15392 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAAGCGTGTGTCTTGCTCTG NA FALSE NA NA TATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.336.1 chr1 - 2426 4 full-splice_match MUL1 ENST00000264198.5 2428 4 0 2 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 184 44.066368 1.644107 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGTGCTAGCCTGTTGCTTT -23 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 184 NA PB.336.2 chr1 - 2315 4 full-splice_match MUL1 ENST00000264198.5 2428 4 111 2 111 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGTGCTAGCCTGTTGCTTT 88 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.336.4 chr1 - 2058 2 incomplete-splice_match MUL1 ENST00000264198.5 2428 4 5995 2 5995 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.873893 0.458471 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGTGCTAGCCTGTTGCTTT 5972 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.337.1 chr1 - 1821 12 novel_not_in_catalog DDOST novel 2126 11 NA NA -20 2407 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACTAGCCTTTACCTTCCTA -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.337.2 chr1 - 1376 6 incomplete-splice_match DDOST ENST00000602624.7 1941 11 6661 -4 -1624 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACCTGGCCCCGGTCCTGGTT 6815 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.337.17 chr1 - 912 3 incomplete-splice_match DDOST ENST00000602624.7 1941 11 8400 66 115 -66 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAATATAAATAAATAAATAA 8554 FALSE NA NA GATAAA -39 NA NA NA 4 NA PB.337.18 chr1 - 1552 11 full-splice_match DDOST ENST00000602624.7 1941 11 1 388 1 -388 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 223 53.406521 1.727594 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CTATGTGCAGTCACTCCTCT 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 223 NA PB.337.19 chr1 - 1209 9 incomplete-splice_match DDOST ENST00000602624.7 1941 11 5226 404 -3059 -404 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 36 8.621680 0.935592 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAGTGGCATTTTTCCTAT 5380 FALSE NA NA AATAAA -45 NA NA NA 36 NA PB.337.21 chr1 - 1674 10 novel_in_catalog DDOST novel 2126 11 NA NA -2 -411 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AATTGCTAAAAGTGGCATTT -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.337.22 chr1 - 1658 11 full-splice_match DDOST ENST00000415136.6 2126 11 47 421 47 -411 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 1031 246.915359 2.392548 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AATTGCTAAAAGTGGCATTT 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 1031 NA PB.337.23 chr1 - 1424 10 novel_in_catalog DDOST novel 2126 11 NA NA -5 -411 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AATTGCTAAAAGTGGCATTT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.337.24 chr1 - 1406 11 full-splice_match DDOST ENST00000602624.7 1941 11 124 411 124 -411 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AATTGCTAAAAGTGGCATTT 278 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.337.25 chr1 - 1295 10 incomplete-splice_match DDOST ENST00000602624.7 1941 11 440 411 440 -411 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 32 7.663716 0.884439 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AATTGCTAAAAGTGGCATTT 594 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 32 NA PB.337.26 chr1 - 933 6 incomplete-splice_match DDOST ENST00000602624.7 1941 11 6689 411 -1596 -411 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AATTGCTAAAAGTGGCATTT 6843 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.337.27 chr1 - 827 5 incomplete-splice_match DDOST ENST00000602624.7 1941 11 7037 411 -1248 -411 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.634403 0.420682 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AATTGCTAAAAGTGGCATTT 7191 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.337.28 chr1 - 675 4 incomplete-splice_match DDOST ENST00000602624.7 1941 11 7637 411 -648 -411 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AATTGCTAAAAGTGGCATTT 7791 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.337.29 chr1 - 612 4 incomplete-splice_match DDOST ENST00000602624.7 1941 11 7700 411 -585 -411 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AATTGCTAAAAGTGGCATTT 7854 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.337.31 chr1 - 1040 7 incomplete-splice_match DDOST ENST00000602624.7 1941 11 5849 412 -2436 -412 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 26 6.226769 0.794263 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GAATTGCTAAAAGTGGCATT 6003 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 26 NA PB.338.1 chr1 - 1471 2 incomplete-splice_match KIF17 ENST00000477167.5 1805 6 18249 3 -2348 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAAGCTCCCCTTCTCTGACC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.339.1 chr1 + 2442 8 full-splice_match PINK1 ENST00000321556.5 2657 8 20 195 20 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 25 5.987278 0.777229 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATGACGTATGTGCCTTGA 3 TRUE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 25 NA PB.339.2 chr1 + 1849 8 full-splice_match PINK1 ENST00000321556.5 2657 8 35 773 35 -578 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTGTCGTGATGGTCTGTGA 18 TRUE NA NA ACTAAA -17 NA NA NA 9 NA PB.339.3 chr1 + 2253 8 full-splice_match PINK1 ENST00000321556.5 2657 8 209 195 209 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATGACGTATGTGCCTTGA 155 FALSE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.339.4 chr1 + 1477 8 full-splice_match PINK1 ENST00000321556.5 2657 8 405 775 405 -580 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCTGTGTCGTGATGGTCTGT 351 FALSE NA NA ACTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.339.5 chr1 + 1371 7 incomplete-splice_match PINK1 ENST00000321556.5 2657 8 4419 773 -252 -578 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTGTCGTGATGGTCTGTGA 4365 FALSE NA NA ACTAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.339.6 chr1 + 1271 7 incomplete-splice_match PINK1 ENST00000321556.5 2657 8 4519 773 -152 -578 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTGTCGTGATGGTCTGTGA 4465 FALSE NA NA ACTAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.339.7 chr1 + 1659 6 incomplete-splice_match PINK1 ENST00000321556.5 2657 8 6471 195 1800 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATGACGTATGTGCCTTGA 6417 FALSE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 8 NA PB.339.8 chr1 + 1483 5 incomplete-splice_match PINK1 ENST00000321556.5 2657 8 11144 195 -906 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATGACGTATGTGCCTTGA NA FALSE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 5 NA PB.339.9 chr1 + 1156 3 incomplete-splice_match PINK1 ENST00000400490.2 1658 4 3088 195 3088 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAGATGACGTATGTGCCTTG NA FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 10 NA PB.339.10 chr1 + 928 2 incomplete-splice_match PINK1 ENST00000400490.2 1658 4 3679 194 3679 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGATGACGTATGTGCCTTGA NA FALSE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.340.1 chr1 - 2507 13 novel_in_catalog HP1BP3 novel 6406 13 NA NA -191 4 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AACCGTAGCTTATATTTAAA 6575 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.340.2 chr1 - 3883 12 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000312239.10 3884 13 6111 -2 0 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGAACCGTAGCTTATATTTA 2 TRUE NA NA ACTAAA -2 NA NA NA 4 NA PB.340.3 chr1 - 3988 13 full-splice_match HP1BP3 ENST00000438032.6 6406 13 5 2413 5 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.029314 0.701509 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GCTGAACCGTAGCTTATATT 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 21 NA PB.340.4 chr1 - 3699 12 novel_not_in_catalog HP1BP3 novel 3884 13 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GCTGAACCGTAGCTTATATT -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.340.5 chr1 - 3112 7 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 7355 -3 7355 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GCTGAACCGTAGCTTATATT 8358 FALSE NA NA AGTAAA -27 NA NA NA 6 NA PB.340.6 chr1 - 2926 6 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 9593 -3 9593 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GCTGAACCGTAGCTTATATT 9576 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.340.7 chr1 - 2598 3 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 27391 -3 2133 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GCTGAACCGTAGCTTATATT 2250 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.340.14 chr1 - 4012 13 novel_in_catalog HP1BP3 novel 3884 13 NA NA 0 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAGCTGCTGAACCGTAGC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.340.15 chr1 - 3790 12 novel_in_catalog HP1BP3 novel 6406 13 NA NA 0 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 30 7.184734 0.856411 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAGCTGCTGAACCGTAGC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 30 NA PB.340.16 chr1 - 2454 2 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 29415 4 4157 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAGCTGCTGAACCGTAGC 4274 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.340.22 chr1 - 3782 9 full-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 588 452 588 1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAGAAAAGGAA 6126 FALSE NA NA GATAAA -31 NA NA NA 2 NA PB.340.23 chr1 - 3452 12 novel_in_catalog HP1BP3 novel 6406 13 NA NA 5 1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAGAAAAGGAA 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.340.24 chr1 - 3253 12 novel_in_catalog HP1BP3 novel 3884 13 NA NA -6 1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAGAAAAGGAA -20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.340.25 chr1 - 3178 9 full-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 1192 452 1192 1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAGAAAAGGAA 6730 FALSE NA NA CATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.340.26 chr1 - 2782 8 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 3965 452 3965 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAGAAAAGGAA 9503 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.340.27 chr1 - 2699 8 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 4047 453 4047 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAAAAAAAGAAAAGGA 9585 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.340.28 chr1 - 1984 14 novel_in_catalog HP1BP3 novel 6406 13 NA NA 0 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAAAAAAAGAAAAGGA -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.340.30 chr1 - 3896 13 novel_in_catalog HP1BP3 novel 3884 13 NA NA -6 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 TTAAAAAAAAAAAGAAAAGG -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.340.31 chr1 - 3702 12 novel_in_catalog HP1BP3 novel 3884 13 NA NA 5 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 ATTAAAAAAAAAAAGAAAAG -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.340.32 chr1 - 3561 13 novel_in_catalog HP1BP3 novel 3884 13 NA NA 0 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 ATTAAAAAAAAAAAGAAAAG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.340.33 chr1 - 3534 13 full-splice_match HP1BP3 ENST00000438032.6 6406 13 1 2871 1 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 53 12.693029 1.103565 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 ATTAAAAAAAAAAAGAAAAG 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 53 NA PB.340.34 chr1 - 3338 12 novel_in_catalog HP1BP3 novel 6406 13 NA NA 1 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 58 13.890486 1.142717 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 ATTAAAAAAAAAAAGAAAAG 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 58 NA PB.340.35 chr1 - 2976 9 full-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 1391 455 1391 -2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 ATTAAAAAAAAAAAGAAAAG 6929 FALSE NA NA AAAACA -45 NA NA NA 9 NA PB.340.36 chr1 - 2580 6 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 9481 455 9481 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 ATTAAAAAAAAAAAGAAAAG 9464 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.340.37 chr1 - 2462 5 novel_in_catalog HP1BP3 novel 6406 13 NA NA -3 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 ATTAAAAAAAAAAAGAAAAG -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.340.38 chr1 - 2144 3 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 27387 455 2129 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 ATTAAAAAAAAAAAGAAAAG 2246 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.340.39 chr1 - 2014 2 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 29404 455 4146 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 ATTAAAAAAAAAAAGAAAAG 4263 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.340.47 chr1 - 3442 13 full-splice_match HP1BP3 ENST00000312239.10 3884 13 -17 459 -3 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.352876 0.525417 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TATTAAAAAAAAAAAGAAAA -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.340.48 chr1 - 2342 4 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 25121 456 -137 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.873893 0.458471 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TATTAAAAAAAAAAAGAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.340.49 chr1 - 3314 12 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000312239.10 3884 13 6215 463 104 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 GAGATATTAAAAAAAAAAAG 6870 FALSE NA NA TTTAAA -42 NA NA NA 2 NA PB.340.50 chr1 - 2139 4 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000488722.5 639 5 -7 76 -7 -76 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTTGTGGGTTTTTTTCCCC 110 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.340.51 chr1 - 2335 5 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000375003.6 4822 9 17771 530 -6983 -77 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATTTGTGGGTTTTTTTCCC 8251 FALSE NA NA AAGAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.340.53 chr1 - 2043 13 full-splice_match HP1BP3 ENST00000438032.6 6406 13 -16 4379 0 947 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.550332 0.658043 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTTGCTAGCTTTAGGTGCT -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.340.54 chr1 - 2059 13 novel_in_catalog HP1BP3 novel 3884 13 NA NA 0 953 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAGCTTTAGGTGCTTTTATT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.340.55 chr1 - 1944 13 full-splice_match HP1BP3 ENST00000312239.10 3884 13 -20 1960 -6 953 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAGCTTTAGGTGCTTTTATT -20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.340.56 chr1 - 1836 12 novel_in_catalog HP1BP3 novel 6406 13 NA NA 1 953 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.550332 0.658043 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAGCTTTAGGTGCTTTTATT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.340.57 chr1 - 1529 10 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000312239.10 3884 13 9997 1960 -51 953 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAGCTTTAGGTGCTTTTATT 9997 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.340.60 chr1 - 2566 10 novel_not_in_catalog HP1BP3 novel 970 8 NA NA 1 3141 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTTTCTAGTCTGGATGTCT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.340.61 chr1 - 2541 10 novel_not_in_catalog HP1BP3 novel 970 8 NA NA 0 3141 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTTTCTAGTCTGGATGTCT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.340.62 chr1 - 2121 7 novel_not_in_catalog HP1BP3 novel 970 8 NA NA -129 3147 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAGTCTGGATGTCTTTTACT 9919 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.340.63 chr1 - 1589 3 novel_not_in_catalog HP1BP3 novel 970 8 NA NA 9480 3143 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTTCTAGTCTGGATGTCTTT 9463 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.340.65 chr1 - 1880 6 novel_not_in_catalog HP1BP3 novel 970 8 NA NA 1494 3142 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTTTCTAGTCTGGATGTCTT 7032 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.340.66 chr1 - 2461 10 novel_not_in_catalog HP1BP3 novel 970 8 NA NA -15 3141 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTTTCTAGTCTGGATGTCT -29 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.340.67 chr1 - 2345 9 novel_not_in_catalog HP1BP3 novel 970 8 NA NA 0 3141 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTTTCTAGTCTGGATGTCT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.340.69 chr1 - 1696 5 novel_not_in_catalog HP1BP3 novel 970 8 NA NA 4053 3140 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTGTTTCTAGTCTGGATGTC 9591 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.340.72 chr1 - 2778 4 novel_in_catalog HP1BP3 novel 6406 13 NA NA 0 -8 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAGAAAAGGAGAAGAAAGT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.340.73 chr1 - 893 6 novel_not_in_catalog HP1BP3 novel 928 5 NA NA -6 -8 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAGAAAAGGAGAAGAAAGT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.340.74 chr1 - 2897 5 full-splice_match HP1BP3 ENST00000375000.5 928 5 -11 -1958 1 -110 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCCTCCCTGGTCTTTTCC 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.340.77 chr1 - 1702 4 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000438032.6 6406 13 -8 35200 -3 -16 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAACAAAGACACAAGCCG -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.340.78 chr1 - 1501 3 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000424732.5 970 8 2 18267 2 -16 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAACAAAGACACAAGCCG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.340.79 chr1 - 1406 3 novel_in_catalog HP1BP3 novel 3884 13 NA NA -3 -16 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAACAAAGACACAAGCCG -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.340.80 chr1 - 1103 5 novel_in_catalog HP1BP3 novel 928 5 NA NA 0 -16 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAACAAAGACACAAGCCG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.340.81 chr1 - 1816 4 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000417710.5 572 5 -357 2099 0 -31 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAATATAATATAAAAGAT 12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.340.82 chr1 - 1497 4 novel_in_catalog HP1BP3 novel 928 5 NA NA 3 -31 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAATATAATATAAAAGAT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.340.83 chr1 - 1474 4 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000438032.6 6406 13 0 35420 0 -31 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.592367 0.555381 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAATATAATATAAAAGAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.340.84 chr1 - 1241 5 novel_in_catalog HP1BP3 novel 928 5 NA NA -4 -31 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAATATAATATAAAAGAT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.340.85 chr1 - 1286 3 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000424732.5 970 8 -3 18487 -3 -31 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAATATAATATAAAAGAT -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.340.86 chr1 - 908 5 full-splice_match HP1BP3 ENST00000375000.5 928 5 -11 31 1 -31 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAATATAATATAAAAGAT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.340.87 chr1 - 891 5 novel_in_catalog HP1BP3 novel 928 5 NA NA -3 -31 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAATATAATATAAAAGAT -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.340.88 chr1 - 1381 4 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000312239.10 3884 13 -17 33008 -3 -32 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 TAAAAATATAATATAAAAGA -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.340.90 chr1 - 1123 4 incomplete-splice_match HP1BP3 ENST00000438032.6 6406 13 -8 35779 -3 -390 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTTTTTAATTTTTAATTTT -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.340.91 chr1 - 897 3 novel_not_in_catalog HP1BP3 novel 6406 13 NA NA 0 -409 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATATAAAGTGATGGCAGTTA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.340.92 chr1 - 841 4 full-splice_match HP1BP3 ENST00000414993.1 727 4 0 -114 0 92 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 CAAAAAGGAGTAAGGAGTTA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.341.1 chr1 - 1044 2 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000435383.2 1597 11 40505 -542 40505 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAGAAAGTAAAGTGACTT NA FALSE NA NA CATAAA -32 NA NA NA 3 NA PB.341.8 chr1 - 4000 24 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681767.1 5884 33 109025 529 -441 8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAAAAAAAAGTTGAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.341.9 chr1 - 2110 14 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681717.1 5993 34 190440 529 -9242 8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAAAAAAAAGTTGAGA NA FALSE NA NA TATAAA -37 NA NA NA 2 NA PB.341.10 chr1 - 1987 13 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681717.1 5993 34 193450 529 -6232 8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAAAAAAAAGTTGAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.341.11 chr1 - 1797 11 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681717.1 5993 34 197271 529 -2411 8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAAAAAAAAGTTGAGA NA FALSE NA NA AATACA -21 NA NA NA 4 NA PB.341.12 chr1 - 1329 8 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000435383.2 1597 11 10251 -8 10251 8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAAAAAAAAGTTGAGA NA FALSE NA NA AAGAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.341.13 chr1 - 1167 7 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000435383.2 1597 11 21996 -8 21996 8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAAAAAAAAGTTGAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.341.14 chr1 - 944 5 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000435383.2 1597 11 26085 -8 26085 8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAAAAAAAAGTTGAGA NA FALSE NA NA GATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.341.15 chr1 - 2387 16 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681717.1 5993 34 186295 544 -13387 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAATGTTTAGCAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.341.16 chr1 - 1483 10 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681717.1 5993 34 199651 544 -31 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAATGTTTAGCAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.341.17 chr1 - 1490 9 novel_in_catalog EIF4G3 novel 1597 11 NA NA -185 -7 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAATGTTTAGCAAAAA NA FALSE NA NA AAAACA -10 NA NA NA 2 NA PB.341.18 chr1 - 997 6 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000435383.2 1597 11 23599 7 23599 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAATGTTTAGCAAAAA NA FALSE NA NA AGTAAA -37 NA NA NA 4 NA PB.341.19 chr1 - 2796 18 novel_in_catalog EIF4G3 novel 5793 31 NA NA -35087 -8 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 TAAAAAAATGTTTAGCAAAA -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.341.20 chr1 - 1210 10 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681717.1 5993 34 199651 817 -31 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAATGAAACAAAAGAAACA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.341.21 chr1 - 1054 8 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000435383.2 1597 11 10238 280 10238 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAATGAAACAAAAGAAACA NA FALSE NA NA AAGAAA -33 NA NA NA 2 NA PB.341.26 chr1 - 1129 8 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681717.1 5993 34 155480 55803 -44202 30820 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAGAAAGAAAAACCTCATC NA FALSE NA NA AATATA -3 NA NA NA 2 NA PB.341.27 chr1 - 883 6 incomplete-splice_match EIF4G3 ENST00000681767.1 5884 33 157346 55803 -42336 30820 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAGAAAGAAAAACCTCATC NA FALSE NA NA AAAAAG -6 NA NA NA 2 NA PB.345.2 chr1 - 1203 2 genic EIF4G3 novel 6397 37 NA NA -86 -8219 multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAAAAAAAAAATTTTT NA FALSE NA NA AAGAAA -36 NA NA NA 2 NA PB.363.1 chr1 - 768 2 intergenic novelGene_381 novel NA NA NA NA NA NA multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 GAAAAAAAAAAAAAAGATGG NA FALSE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 2 NA PB.366.2 chr1 - 5102 19 full-splice_match ECE1 ENST00000415912.6 5099 19 -6 3 -6 0 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GGCCATGTGTCTGGGTGTCT 385 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.366.3 chr1 - 3768 10 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 34533 -1334 -6666 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GGCCATGTGTCTGGGTGTCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.366.7 chr1 - 3578 8 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 42754 -1332 1555 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGGGCCATGTGTCTGGGTGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.366.16 chr1 - 5022 18 full-splice_match ECE1 ENST00000264205.10 2381 18 42 -2683 42 -4 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGAGGGCCATGTGTCTGGGT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.366.17 chr1 - 3074 3 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 54200 -1330 -3268 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGAGGGCCATGTGTCTGGGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.366.18 chr1 - 2970 2 full-splice_match ECE1 ENST00000531334.1 653 2 243 -2560 243 -4 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGAGGGCCATGTGTCTGGGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.366.20 chr1 - 3774 19 full-splice_match ECE1 ENST00000415912.6 5099 19 -33 1358 -33 -21 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAGAAAAGAGAAAC 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.366.21 chr1 - 3681 19 full-splice_match ECE1 ENST00000374893.11 5067 19 31 1355 31 -21 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAGAAAAGAGAAAC 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.366.22 chr1 - 3694 18 full-splice_match ECE1 ENST00000264205.10 2381 18 19 -1332 19 -21 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAGAAAAGAGAAAC 8764 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.366.23 chr1 - 3125 15 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 19202 21 -3630 -21 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAGAAAAGAGAAAC 1584 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.366.24 chr1 - 2212 8 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 42767 21 1568 -21 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAGAAAAGAGAAAC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.366.25 chr1 - 2043 6 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 45942 21 4743 -21 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAGAAAAGAGAAAC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.366.26 chr1 - 1683 3 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 54240 21 -3228 -21 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAGAAAAGAGAAAC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.366.27 chr1 - 1551 2 full-splice_match ECE1 ENST00000531334.1 653 2 311 -1209 311 -21 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAGAAAAGAGAAAC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.366.29 chr1 - 2836 12 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 23409 22 577 -22 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 CAAAAAAAAGAAAAGAGAAA 5791 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.366.30 chr1 - 2577 17 full-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 254 932 254 298 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATGTTCTGTTTTTCTAAATA 3562 FALSE NA NA GGGGCT -26 NA NA NA 2 NA PB.366.31 chr1 - 2750 19 full-splice_match ECE1 ENST00000374893.11 5067 19 31 2286 31 278 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGAATTGGTATATTTATT 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.366.32 chr1 - 1772 12 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 23543 952 711 278 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGAATTGGTATATTTATT 5925 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.366.33 chr1 - 1392 9 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 41367 952 168 278 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGAATTGGTATATTTATT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.366.34 chr1 - 2828 19 full-splice_match ECE1 ENST00000415912.6 5099 19 -19 2290 -19 277 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 GAAAGAATTGGTATATTTAT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.366.35 chr1 - 2773 18 full-splice_match ECE1 ENST00000264205.10 2381 18 5 -397 5 274 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGGAAAGAATTGGTATATT 8750 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.366.36 chr1 - 2114 14 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 20709 956 -2123 274 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGGAAAGAATTGGTATATT 3091 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.366.37 chr1 - 1004 5 incomplete-splice_match ECE1 ENST00000357071.8 3763 17 51562 956 -5906 274 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGGAAAGAATTGGTATATT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.368.2 chr1 + 4208 19 novel_not_in_catalog NBPF3 novel 4401 18 NA NA -7 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTCTGGACTGTTGGATTGT 1 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.368.3 chr1 + 4311 18 full-splice_match NBPF3 ENST00000318220.10 4401 18 -16 106 -7 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTCTGGACTGTTGGATTGT 1 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.368.4 chr1 + 4393 19 novel_not_in_catalog NBPF3 novel 4401 18 NA NA -6 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTCTGGACTGTTGGATTGT 2 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.370.2 chr1 - 3319 25 full-splice_match RAP1GAP ENST00000495204.5 2489 25 -44 -786 23 0 alternative_3end TRUE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACCCAGAGTTGGGCCTGGCT 17 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.370.3 chr1 - 1324 5 incomplete-splice_match RAP1GAP ENST00000374763.6 3334 23 20516 2 20516 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACCCAGAGTTGGGCCTGGC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.371.1 chr1 + 2570 12 full-splice_match ALPL ENST00000374840.8 2536 12 -45 11 -19 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.268805 0.721712 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTTCCGAGGACAGAGCTGA 399 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 22 NA PB.371.2 chr1 + 2355 11 incomplete-splice_match ALPL ENST00000374832.5 2193 12 2784 -397 2784 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGAGCTGAGTCTTTGTGG 5 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.371.3 chr1 + 2148 9 incomplete-splice_match ALPL ENST00000374832.5 2193 12 9818 -390 -9206 3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TCCGAGGACAGAGCTGAGTC -4 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.371.4 chr1 + 1787 7 novel_in_catalog ALPL novel 2241 10 NA NA -7074 1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGAGCTGAGTCTTTGTGGTC 29 FALSE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 2 NA PB.371.5 chr1 + 1731 7 incomplete-splice_match ALPL ENST00000374832.5 2193 12 12894 -396 -6130 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GACAGAGCTGAGTCTTTGTG 0 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 3 NA PB.371.6 chr1 + 1571 6 incomplete-splice_match ALPL ENST00000374832.5 2193 12 16938 -393 -2086 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAGGACAGAGCTGAGTCTTT 27 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.371.7 chr1 + 1639 6 novel_not_in_catalog ALPL novel 733 4 NA NA -1619 1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGAGCTGAGTCTTTGTGGTC 494 FALSE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 2 NA PB.371.8 chr1 + 1359 4 incomplete-splice_match ALPL ENST00000374832.5 2193 12 22486 -382 -713 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 CAAATATTTCCGAGGACAGA 21 FALSE NA NA AATAAA -7 NA NA NA 3 NA PB.371.9 chr1 + 1087 2 incomplete-splice_match ALPL ENST00000374829.2 1595 4 2106 -12 2106 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGAGCTGAGTCTTTGTGGTC -1 TRUE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 2 NA PB.372.3 chr1 - 1832 11 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 76570 297 -1964 -297 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AGAAGAGTAAATCAGACTGA NA FALSE NA NA AATGAA -26 NA NA NA 2 NA PB.372.4 chr1 - 2821 21 novel_in_catalog USP48 novel 4419 27 NA NA -55 1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CCTAAGTGTGGAAAAGTGTC 8227 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.372.5 chr1 - 1893 15 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 61467 604 -536 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CCTAAGTGTGGAAAAGTGTC 3403 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.372.6 chr1 - 1760 14 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 62083 604 80 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CCTAAGTGTGGAAAAGTGTC 4019 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.372.7 chr1 - 1530 11 incomplete-splice_match USP48 ENST00000529637.5 3228 27 76407 -465 -1969 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CCTAAGTGTGGAAAAGTGTC NA FALSE NA NA AATGAA -31 NA NA NA 2 NA PB.372.8 chr1 - 1194 8 incomplete-splice_match USP48 ENST00000529637.5 3228 27 78644 -465 268 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CCTAAGTGTGGAAAAGTGTC 1418 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.372.9 chr1 - 889 5 incomplete-splice_match USP48 ENST00000529637.5 3228 27 87777 -465 9401 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CCTAAGTGTGGAAAAGTGTC NA FALSE NA NA AAGAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.372.10 chr1 - 3844 27 full-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 -39 614 7 -9 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAACTTGTCCTAAGTGTG 13 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.372.11 chr1 - 1315 9 incomplete-splice_match USP48 ENST00000529637.5 3228 27 77188 -464 -1188 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TCCTAAGTGTGGAAAAGTGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.372.12 chr1 - 1129 8 incomplete-splice_match USP48 ENST00000529637.5 3228 27 78708 -464 332 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TCCTAAGTGTGGAAAAGTGT 1482 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.372.13 chr1 - 1673 16 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 59231 927 1201 -26 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTTGAAGGAAATGTTTCCA 1167 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.372.14 chr1 - 900 8 incomplete-splice_match USP48 ENST00000529637.5 3228 27 78615 -142 239 -26 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACTTGAAGGAAATGTTTCCA 1389 FALSE NA NA AAAACA -17 NA NA NA 4 NA PB.372.15 chr1 - 3467 27 full-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 23 929 23 -28 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.634403 0.420682 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGACTTGAAGGAAATGTTTC -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.372.16 chr1 - 2971 25 novel_in_catalog USP48 novel 4419 27 NA NA -8445 -28 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGACTTGAAGGAAATGTTTC NA FALSE NA NA AAGAAA -36 NA NA NA 3 NA PB.372.17 chr1 - 2278 19 novel_in_catalog USP48 novel 4419 27 NA NA -3763 -28 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGACTTGAAGGAAATGTTTC NA FALSE NA NA AGTAAA -1 NA NA NA 2 NA PB.372.18 chr1 - 1795 16 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 59107 929 1077 -28 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGACTTGAAGGAAATGTTTC 1043 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.372.19 chr1 - 1533 14 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 61985 929 -18 -28 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGACTTGAAGGAAATGTTTC 3921 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.372.20 chr1 - 1147 11 incomplete-splice_match USP48 ENST00000529637.5 3228 27 76462 -137 -1914 -31 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATCAGACTTGAAGGAAATGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.372.21 chr1 - 3562 27 full-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 -77 934 0 -33 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 ACATCAGACTTGAAGGAAAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.372.22 chr1 - 2623 22 novel_in_catalog USP48 novel 4419 27 NA NA -3422 -33 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 ACATCAGACTTGAAGGAAAT 4860 FALSE NA NA AATAAA -39 NA NA NA 2 NA PB.372.23 chr1 - 2201 16 novel_not_in_catalog USP48 novel 4419 27 NA NA 661 -33 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 ACATCAGACTTGAAGGAAAT 627 FALSE NA NA CATAAA -10 NA NA NA 2 NA PB.372.24 chr1 - 1968 17 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 54454 935 -2125 -34 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 GACATCAGACTTGAAGGAAA NA FALSE NA NA AAGAAA -29 NA NA NA 4 NA PB.372.25 chr1 - 2350 16 novel_in_catalog USP48 novel 4309 26 NA NA 4 8380 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GTACTGAACGCTACTGACAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.372.27 chr1 - 2099 14 novel_in_catalog USP48 novel 4419 27 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.372.28 chr1 - 2086 14 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 0 42738 0 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 190 45.503315 1.658043 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 190 NA PB.372.29 chr1 - 1923 13 novel_in_catalog USP48 novel 4309 26 NA NA -17 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.372.30 chr1 - 1955 3 incomplete-splice_match USP48 ENST00000487880.2 524 4 964 0 -487 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.372.31 chr1 - 1865 13 novel_in_catalog USP48 novel 4309 26 NA NA 23 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.372.32 chr1 - 1844 14 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 242 42738 36 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT 294 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.372.33 chr1 - 1664 13 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 25462 42738 -9496 0 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.372.34 chr1 - 1645 3 incomplete-splice_match USP48 ENST00000374732.7 3037 15 -180 42133 -180 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT NA FALSE NA NA AATGAA -34 NA NA NA 2 NA PB.372.35 chr1 - 1554 12 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 26532 42738 -8426 0 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT NA FALSE NA NA AAGAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.372.36 chr1 - 1488 3 incomplete-splice_match USP48 ENST00000374732.7 3037 15 -23 42133 -23 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.372.37 chr1 - 1413 11 novel_in_catalog USP48 novel 4309 26 NA NA -4862 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT 3420 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.372.38 chr1 - 1226 9 novel_not_in_catalog USP48 novel 4309 26 NA NA -41 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.372.39 chr1 - 1256 3 incomplete-splice_match USP48 ENST00000487880.2 524 4 1663 0 212 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT 178 FALSE NA NA CATAAA -19 NA NA NA 4 NA PB.372.40 chr1 - 1094 3 incomplete-splice_match USP48 ENST00000487880.2 524 4 1825 0 374 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT 340 FALSE NA NA GATAAA -36 NA NA NA 3 NA PB.372.41 chr1 - 1027 8 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 34971 42738 13 0 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT 8295 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.372.42 chr1 - 932 7 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 36054 42738 1096 0 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT 9378 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.372.43 chr1 - 797 6 incomplete-splice_match USP48 ENST00000308271.14 4419 27 46630 42738 -3683 0 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTAACACTTTAAACCTATGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.372.44 chr1 - 1743 12 novel_not_in_catalog USP48 novel 2818 11 NA NA 23 -8 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAATAAAGGTAACACTTTAA -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.372.45 chr1 - 3079 11 full-splice_match USP48 ENST00000421625.6 2818 11 457 -718 0 718 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TAAAATCTAAGCCTCAGTAG 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.372.46 chr1 - 1641 6 novel_not_in_catalog USP48 novel 2818 11 NA NA -19 4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTGTGGTTTGTCTTTTTA -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.372.47 chr1 - 2245 11 full-splice_match USP48 ENST00000421625.6 2818 11 572 1 -43 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTGTACTTGTGGTTTGTCT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.372.48 chr1 - 2359 11 full-splice_match USP48 ENST00000421625.6 2818 11 457 2 0 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 73 17.482853 1.242612 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTGTACTTGTGGTTTGTC 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 73 NA PB.372.49 chr1 - 2164 11 full-splice_match USP48 ENST00000421625.6 2818 11 652 2 -11 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTGTACTTGTGGTTTGTC 247 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.372.50 chr1 - 1870 9 incomplete-splice_match USP48 ENST00000421625.6 2818 11 26946 2 -8469 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTGTACTTGTGGTTTGTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.372.51 chr1 - 1497 6 novel_not_in_catalog USP48 novel 2818 11 NA NA -39 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTGTACTTGTGGTTTGTC -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.372.52 chr1 - 1013 3 incomplete-splice_match USP48 ENST00000421625.6 2818 11 47144 2 -3626 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTGTACTTGTGGTTTGTC NA FALSE NA NA ATTAAA -1 NA NA NA 2 NA PB.372.53 chr1 - 2374 11 novel_in_catalog USP48 novel 4419 27 NA NA 0 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAATTGTACTTGTGGTTTGT 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.372.54 chr1 - 1676 8 incomplete-splice_match USP48 ENST00000421625.6 2818 11 30564 4 -4851 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATAATTGTACTTGTGGTTTG 3431 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.372.55 chr1 - 1422 6 incomplete-splice_match USP48 ENST00000421625.6 2818 11 32069 4 -3346 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATAATTGTACTTGTGGTTTG 4936 FALSE NA NA CATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.372.56 chr1 - 1773 11 full-splice_match USP48 ENST00000421625.6 2818 11 576 469 -39 292 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATCCATGAGTATTGTAGATA -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.372.57 chr1 - 1861 11 full-splice_match USP48 ENST00000421625.6 2818 11 478 479 21 282 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGCACTCTGCATCCATGAGT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.372.58 chr1 - 1288 9 incomplete-splice_match USP48 ENST00000421625.6 2818 11 482 8645 25 -7884 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AGAAAAGATGGAGGGGAAGA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.372.59 chr1 - 952 6 incomplete-splice_match USP48 ENST00000421625.6 2818 11 467 23660 10 1496 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAGGTATTCAAATTTTGGT 18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.374.1 chr1 + 1351 4 novel_in_catalog CELA3A novel 906 8 NA NA -2130 -7 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAATTCCAAGTTGAATCTT 2310 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.375.2 chr1 + 1078 2 full-splice_match LINC00339 ENST00000416769.2 1077 2 -7 6 6 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 25 5.987278 0.777229 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAAATATGTGCTGTGGTG -1 TRUE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 25 NA PB.376.1 chr1 + 972 6 full-splice_match CDC42 ENST00000656825.1 10503 6 8 9523 0 261 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 603 144.413147 2.159607 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GTGGATGACTCTGTAACAGA 12 TRUE NA NA TTTAAA -15 NA NA NA 603 NA PB.376.2 chr1 + 2109 6 full-splice_match CDC42 ENST00000656825.1 10503 6 -24 8418 17 -4 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 213 51.011612 1.707669 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACAAGCCAGCCTGAGGGTTG 10 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 213 NA PB.376.4 chr1 + 1566 6 full-splice_match CDC42 ENST00000656825.1 10503 6 -10 8947 -8 -510 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 114 27.301989 1.436194 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTCATTGTCTTATATGCTT -6 TRUE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 114 NA PB.376.5 chr1 + 880 7 full-splice_match CDC42 ENST00000344548.7 2256 7 46 1330 2 40 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AATAATGACAAATGCCCTGC 9 TRUE NA NA ATTAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.376.6 chr1 + 1421 6 full-splice_match CDC42 ENST00000315554.13 1435 6 8 6 0 -6 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TATAAATGCCTGATGAAGCT 12 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 5 NA PB.376.7 chr1 + 742 6 full-splice_match CDC42 ENST00000315554.13 1435 6 8 685 0 112 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGAAAGCCTCTGCGTCTTTT 12 TRUE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.376.8 chr1 + 757 6 full-splice_match CDC42 ENST00000656825.1 10503 6 11 9735 3 49 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 103 24.667585 1.392127 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATGCCCTGCACCTACCCA 15 TRUE NA NA ATTAAA -29 NA NA NA 103 NA PB.376.9 chr1 + 2201 7 full-splice_match CDC42 ENST00000344548.7 2256 7 51 4 2 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACAAGCCAGCCTGAGGGTTG 14 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 8 NA PB.376.10 chr1 + 1671 7 full-splice_match CDC42 ENST00000344548.7 2256 7 52 533 3 -510 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTCATTGTCTTATATGCTT 15 TRUE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 5 NA PB.376.12 chr1 + 1865 6 full-splice_match CDC42 ENST00000656825.1 10503 6 14 8624 6 -187 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 23 5.508296 0.741017 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATGCAGACTCTTCTTAAGT 18 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 23 NA PB.376.15 chr1 + 2060 5 incomplete-splice_match CDC42 ENST00000344548.7 2256 7 25759 -3 24941 3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 94 22.512167 1.352417 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCCTGAGGGTTGTTATTTT NA FALSE NA NA ATTAAA -24 NA NA NA 94 NA PB.376.16 chr1 + 1896 4 incomplete-splice_match CDC42 ENST00000344548.7 2256 7 29054 4 28236 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACAAGCCAGCCTGAGGGTTG NA FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.376.17 chr1 + 1663 4 incomplete-splice_match CDC42 ENST00000344548.7 2256 7 29080 211 28262 -188 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAATGCAGACTCTTCTTAAG NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.376.18 chr1 + 1296 3 incomplete-splice_match CDC42 ENST00000662562.1 1645 7 32951 -837 32951 -510 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTCATTGTCTTATATGCTT 2075 FALSE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.376.19 chr1 + 1788 3 incomplete-splice_match CDC42 ENST00000344548.7 2256 7 33806 4 32988 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.873893 0.458471 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACAAGCCAGCCTGAGGGTTG 2112 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 12 NA PB.376.20 chr1 + 1712 2 incomplete-splice_match CDC42 ENST00000344548.7 2256 7 34002 4 33184 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.634403 0.420682 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACAAGCCAGCCTGAGGGTTG 2308 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 11 NA PB.376.21 chr1 + 1131 2 incomplete-splice_match CDC42 ENST00000662562.1 1645 7 33236 -837 33236 -510 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTCATTGTCTTATATGCTT 2360 FALSE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.376.22 chr1 + 1545 2 incomplete-splice_match CDC42 ENST00000344548.7 2256 7 34171 2 33353 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.592367 0.555381 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCCAGCCTGAGGGTTGTT 2477 FALSE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 15 NA PB.377.1 chr1 + 5435 4 incomplete-splice_match ZBTB40 ENST00000375647.5 8701 18 7 25275 7 -362 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 GAAACAGAATAAGGAAGAAA 4 TRUE NA NA AAGAAA -45 NA NA NA 2 NA PB.378.1 chr1 + 2934 6 incomplete-splice_match ZBTB40 ENST00000375647.5 8701 18 65592 2733 65576 -2733 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 ATTTAAAAAGAAAAAACAAA 7299 FALSE NA NA AAAACA -38 NA NA NA 2 NA PB.379.2 chr1 - 2893 15 incomplete-splice_match HSPG2 ENST00000374695.8 14341 97 105750 1 -847 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGGGGCCTCCTGAGTCTTTG 5283 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.379.3 chr1 - 2631 13 incomplete-splice_match HSPG2 ENST00000374695.8 14341 97 106274 1 -323 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGGGGCCTCCTGAGTCTTTG 5807 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.379.4 chr1 - 2502 12 incomplete-splice_match HSPG2 ENST00000374695.8 14341 97 107293 1 696 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGGGGCCTCCTGAGTCTTTG 6826 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.379.5 chr1 - 2218 10 incomplete-splice_match HSPG2 ENST00000486901.1 3586 11 1671 0 1671 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGGGGCCTCCTGAGTCTTTG 7801 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.379.6 chr1 - 2085 10 incomplete-splice_match HSPG2 ENST00000486901.1 3586 11 1804 0 1804 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGGGGCCTCCTGAGTCTTTG 7934 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.379.7 chr1 - 1541 5 incomplete-splice_match HSPG2 ENST00000486901.1 3586 11 6139 0 -308 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGGGGCCTCCTGAGTCTTTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.379.8 chr1 - 1492 2 full-splice_match HSPG2 ENST00000481644.1 839 2 403 -1056 403 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGGGGCCTCCTGAGTCTTTG 19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.379.10 chr1 - 1875 9 incomplete-splice_match HSPG2 ENST00000486901.1 3586 11 2421 1 2421 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGGGGCCTCCTGAGTCTTT 8551 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.379.11 chr1 - 1685 7 incomplete-splice_match HSPG2 ENST00000486901.1 3586 11 2823 1 2823 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGGGGCCTCCTGAGTCTTT 8953 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.379.12 chr1 - 1410 3 incomplete-splice_match HSPG2 ENST00000486901.1 3586 11 6530 1 83 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGGGGCCTCCTGAGTCTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.379.13 chr1 - 1347 2 full-splice_match HSPG2 ENST00000481644.1 839 2 547 -1055 547 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CAGGGGCCTCCTGAGTCTTT 163 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.379.16 chr1 - 3506 20 incomplete-splice_match HSPG2 ENST00000374695.8 14341 97 103404 3 -329 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CCAGGGGCCTCCTGAGTCTT 2937 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.379.17 chr1 - 3889 22 incomplete-splice_match HSPG2 ENST00000374695.8 14341 97 101672 5 1279 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CGCCAGGGGCCTCCTGAGTC 1205 FALSE NA NA TATAAA -45 NA NA NA 2 NA PB.384.8 chr1 - 5829 2 incomplete-splice_match LUZP1 ENST00000302291.8 8898 5 84876 938 40747 -938 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GTATACTCTGTGCGAGTCTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.385.1 chr1 + 3820 20 novel_in_catalog KDM1A novel 3099 20 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG 0 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 2 NA PB.385.2 chr1 + 1484 10 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000692975.1 3793 18 19 14473 -6 -7411 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CTGTATTTTCTTCATAGCTG -43 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.385.3 chr1 + 1538 11 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000688680.1 3984 15 25 7411 0 -7411 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CTGTATTTTCTTCATAGCTG -37 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.385.4 chr1 + 3055 20 novel_in_catalog KDM1A novel 3085 21 NA NA 11 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 37 8.861172 0.947491 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG -26 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 37 NA PB.385.5 chr1 + 2991 19 full-splice_match KDM1A ENST00000356634.7 3033 19 35 7 15 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 60 14.369468 1.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG -22 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 60 NA PB.385.6 chr1 + 2864 19 full-splice_match KDM1A ENST00000356634.7 3033 19 169 0 149 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GCCCTCTCTTTTGTTCCTTT 112 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 6 NA PB.385.7 chr1 + 2782 20 novel_in_catalog KDM1A novel 3085 21 NA NA 284 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG 247 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 6 NA PB.385.8 chr1 + 2729 19 full-splice_match KDM1A ENST00000356634.7 3033 19 304 0 284 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GCCCTCTCTTTTGTTCCTTT 247 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 5 NA PB.385.9 chr1 + 1227 11 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000688680.1 3984 15 336 7411 311 -7411 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CTGTATTTTCTTCATAGCTG 274 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.385.10 chr1 + 1083 10 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000692975.1 3793 18 420 14473 395 -7411 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CTGTATTTTCTTCATAGCTG 358 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.385.11 chr1 + 2670 20 novel_in_catalog KDM1A novel 3085 21 NA NA 396 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG 359 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 3 NA PB.385.13 chr1 + 2528 18 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000356634.7 3033 19 11019 7 10999 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG 2728 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 6 NA PB.385.14 chr1 + 2395 18 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000356634.7 3033 19 11153 6 11133 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAATTGGCCCTCTCTTTTGT 33 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.385.15 chr1 + 2407 18 novel_in_catalog KDM1A novel 3085 21 NA NA -5986 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.352876 0.525417 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAAAATTGGCCCTCTCTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 14 NA PB.385.16 chr1 + 2310 17 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000356634.7 3033 19 30989 7 12 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.634403 0.420682 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG 40 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 11 NA PB.385.17 chr1 + 2217 16 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000356634.7 3033 19 34328 1 3351 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GGCCCTCTCTTTTGTTCCTT 3379 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 8 NA PB.385.18 chr1 + 2107 15 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000356634.7 3033 19 35661 7 4684 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG 4712 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 4 NA PB.385.19 chr1 + 2024 14 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000356634.7 3033 19 36521 0 5544 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 24 5.747787 0.759501 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GCCCTCTCTTTTGTTCCTTT 5572 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 24 NA PB.385.20 chr1 + 1941 13 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000356634.7 3033 19 38042 7 7065 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 25 5.987278 0.777229 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG 7093 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 25 NA PB.385.21 chr1 + 1871 12 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000356634.7 3033 19 39627 -1 -6124 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.592367 0.555381 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CCCTCTCTTTTGTTCCTTTG -2 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 15 NA PB.385.22 chr1 + 1754 11 full-splice_match KDM1A ENST00000686793.1 2133 11 385 -6 385 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.029314 0.701509 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG 9478 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 21 NA PB.385.23 chr1 + 1567 10 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000686793.1 2133 11 952 -7 952 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 29 6.945243 0.841687 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAATTGGCCCTCTCTTTTGT NA FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 29 NA PB.385.24 chr1 + 1395 8 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000686793.1 2133 11 3960 -6 773 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 24 5.747787 0.759501 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG 768 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 24 NA PB.385.25 chr1 + 1302 7 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000689971.1 1823 8 2462 -9 1959 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.268805 0.721712 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAAAATTGGCCCTCTCTTTT 1954 FALSE NA NA AATAAA -9 NA NA NA 22 NA PB.385.27 chr1 + 1179 6 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000689971.1 1823 8 6410 -10 30 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.029314 0.701509 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG 5902 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 21 NA PB.385.28 chr1 + 1145 6 full-splice_match KDM1A ENST00000685243.1 1123 6 -26 4 -26 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG 7625 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 2 NA PB.385.29 chr1 + 1088 5 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000494920.1 905 6 1755 -333 -24 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 24 5.747787 0.759501 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TGGCCCTCTCTTTTGTTCCT 7627 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 24 NA PB.385.30 chr1 + 930 5 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000494920.1 905 6 1908 -328 129 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.310840 0.634562 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAATTGGCCCTCTCTTTTG 7780 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 18 NA PB.385.31 chr1 + 1599 4 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000685243.1 1123 6 572 -4 222 1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CCCTCTCTTTTGTTCCTTTG 8223 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.385.32 chr1 + 848 4 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000494920.1 905 6 2372 -335 243 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.634403 0.420682 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GCCCTCTCTTTTGTTCCTTT 8244 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 11 NA PB.385.33 chr1 + 739 3 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000494920.1 905 6 4259 -335 620 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GCCCTCTCTTTTGTTCCTTT NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 8 NA PB.385.34 chr1 + 1452 3 incomplete-splice_match KDM1A ENST00000685243.1 1123 6 2496 -3 636 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GCCCTCTCTTTTGTTCCTTT NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.386.2 chr1 - 1173 4 full-splice_match LUZP1 ENST00000471849.5 1190 4 6 11 6 -11 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.831858 0.583409 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAACAAGAAACAAATCAGAA -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.386.3 chr1 - 1106 3 incomplete-splice_match LUZP1 ENST00000302291.8 8898 5 8970 9424 7 -11 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 30 7.184734 0.856411 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAACAAGAAACAAATCAGAA -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 30 NA PB.387.1 chr1 - 3162 2 novel_not_in_catalog HTR1D novel 3319 2 NA NA -20 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GCCAGTAATGTCTTTGGGTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.388.1 chr1 - 1378 1 full-splice_match LINC01355 ENST00000566551.1 5444 1 4064 2 2766 -2 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GAGTGAGTTTTTTTTGTCTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.388.2 chr1 - 1075 1 full-splice_match LINC01355 ENST00000566551.1 5444 1 4367 2 3069 -2 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GAGTGAGTTTTTTTTGTCTT NA FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 4 NA PB.388.3 chr1 - 872 1 full-splice_match LINC01355 ENST00000566551.1 5444 1 4570 2 3272 -2 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GAGTGAGTTTTTTTTGTCTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.390.1 chr1 - 638 1 full-splice_match LINC01355 ENST00000566551.1 5444 1 1733 3073 435 -26 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 TTAAGAAAAAAGAAGAGAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.396.8 chr1 - 2688 11 full-splice_match HNRNPR ENST00000302271.11 7751 11 -18 5081 -7 14 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 217 51.969574 1.715749 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AATTGTGTCCTAAAACATTA 348 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 217 NA PB.396.9 chr1 - 2506 10 novel_in_catalog HNRNPR novel 7751 11 NA NA -2 14 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 61 14.608959 1.164619 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AATTGTGTCCTAAAACATTA -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 61 NA PB.396.11 chr1 - 2566 10 novel_in_catalog HNRNPR novel 2694 11 NA NA -25 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 334 79.990036 1.903036 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACCTATTTCAAATTCAATTG 289 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 334 NA PB.396.12 chr1 - 2332 9 novel_in_catalog HNRNPR novel 2694 11 NA NA -2 -6 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.592367 0.555381 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 338 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.396.13 chr1 - 1372 2 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000476660.1 1637 3 604 0 604 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 53 12.693029 1.103565 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACCTATTTCAAATTCAATTG 7340 FALSE NA NA TATAAA -11 NA NA NA 53 NA PB.396.16 chr1 - 2494 10 novel_in_catalog HNRNPR novel 7751 11 NA NA 3 -5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAACATTACCTATTTCAAAT 343 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.396.17 chr1 - 3129 11 full-splice_match HNRNPR ENST00000302271.11 7751 11 -482 5104 -430 -6 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.396.18 chr1 - 3019 11 full-splice_match HNRNPR ENST00000374612.5 2694 11 -331 6 -317 -6 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.396.19 chr1 - 2847 10 novel_in_catalog HNRNPR novel 2694 11 NA NA -314 -6 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.396.21 chr1 - 2617 11 novel_in_catalog HNRNPR novel 2694 11 NA NA -2 -6 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 331 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.396.22 chr1 - 2566 10 novel_in_catalog HNRNPR novel 2694 11 NA NA 3 -6 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.113385 0.493233 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 336 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.396.23 chr1 - 2516 10 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000374612.5 2694 11 3362 6 48 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 3690 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.396.24 chr1 - 2505 10 full-splice_match HNRNPR ENST00000478691.5 7646 10 37 5104 -4 -6 alternative_3end FALSE noncanonical NA NA NA NA 45 10.777101 1.032502 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 45 NA PB.396.27 chr1 - 2388 9 full-splice_match HNRNPR ENST00000606561.5 1837 9 -10 -541 5 -6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 39 9.340154 0.970354 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 345 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 39 NA PB.396.28 chr1 - 2312 9 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000374612.5 2694 11 5809 6 36 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.268805 0.721712 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 6137 FALSE NA NA ATTAAA -9 NA NA NA 22 NA PB.396.29 chr1 - 2214 8 novel_in_catalog HNRNPR novel 1837 9 NA NA 2 -6 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 342 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.396.30 chr1 - 2277 8 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000427764.3 1788 9 2416 -662 -43 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 6058 FALSE NA NA ATTAAA -23 NA NA NA 6 NA PB.396.31 chr1 - 2182 7 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000374612.5 2694 11 10689 6 -2 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 30 7.184734 0.856411 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA NA FALSE NA NA ACTAAA -13 NA NA NA 30 NA PB.396.32 chr1 - 2147 8 novel_in_catalog HNRNPR novel 7751 11 NA NA 24 -6 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 6125 FALSE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.396.34 chr1 - 2043 6 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000427764.3 1788 9 17299 -662 9922 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 40 9.579645 0.981349 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 8123 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 40 NA PB.396.35 chr1 - 1934 6 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000427764.3 1788 9 17408 -662 -9999 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.634403 0.420682 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 8232 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.396.36 chr1 - 1797 5 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000427764.3 1788 9 19437 -662 -7970 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.268805 0.721712 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 2038 FALSE NA NA AAAAAG -25 NA NA NA 22 NA PB.396.37 chr1 - 1709 4 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000427764.3 1788 9 22364 -662 -5043 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 33 7.903207 0.897803 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 4965 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 33 NA PB.396.38 chr1 - 1604 4 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000427764.3 1788 9 22469 -662 -4938 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 50 11.974557 1.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 5070 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 50 NA PB.396.39 chr1 - 1452 3 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000641107.1 646 5 -6 5829 -6 -6 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 38 9.100663 0.959073 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAACATTACCTATTTCAAA 10002 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 38 NA PB.396.45 chr1 - 2072 10 novel_in_catalog HNRNPR novel 2694 11 NA NA -4 76 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTGGGCTTGCAGAGTTCCC 310 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.396.46 chr1 - 1291 4 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000427764.3 1788 9 22316 -196 -5091 75 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TATTGGGCTTGCAGAGTTCC 4917 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.396.56 chr1 - 1721 9 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000374612.5 2694 11 5799 607 26 -60 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAAAAATTGGCTTAA 6127 FALSE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 4 NA PB.396.58 chr1 - 1408 6 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000427764.3 1788 9 17333 -61 9956 -60 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAAAAATTGGCTTAA 8157 FALSE NA NA TATAAA -20 NA NA NA 10 NA PB.396.59 chr1 - 1321 6 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000427764.3 1788 9 17420 -61 -9987 -60 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAAAAATTGGCTTAA 8244 FALSE NA NA GATAAA -36 NA NA NA 2 NA PB.396.62 chr1 - 788 2 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000476660.1 1637 3 579 609 579 -60 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAAAAATTGGCTTAA 7315 FALSE NA NA TATAAA -36 NA NA NA 7 NA PB.396.64 chr1 - 1328 10 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000302271.11 7751 11 -6 6563 5 -797 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 54 12.932521 1.111683 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAGAAAAGGAAAGAGCGCCA -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 54 NA PB.396.65 chr1 - 1241 9 novel_in_catalog HNRNPR novel 7751 11 NA NA 0 -797 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAGAAAAGGAAAGAGCGCCA 333 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.396.66 chr1 - 1173 9 novel_in_catalog HNRNPR novel 2694 11 NA NA -6 -797 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 91 21.793694 1.338331 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAGAAAAGGAAAGAGCGCCA -19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 91 NA PB.396.67 chr1 - 1075 8 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000606561.5 1837 9 -22 918 0 -797 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAGAAAAGGAAAGAGCGCCA 333 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.396.68 chr1 - 774 6 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000374612.5 2694 11 10772 1465 81 -797 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAGAAAAGGAAAGAGCGCCA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.396.70 chr1 - 1274 3 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000427764.3 1788 9 21423 848 -5984 -848 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAGAAATAGAAGGGGAAGA 4024 FALSE NA NA CATAAA -2 NA NA NA 2 NA PB.396.73 chr1 - 795 6 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000374612.5 2694 11 10700 1516 9 -848 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAGAAATAGAAGGGGAAGA NA FALSE NA NA ACTAAA -2 NA NA NA 3 NA PB.396.74 chr1 - 1230 9 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000374612.5 2694 11 13 3815 1 -2 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAGATTATGCATTTGTTCA 341 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.396.75 chr1 - 1059 8 novel_in_catalog HNRNPR novel 2694 11 NA NA 3 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAGATTATGCATTTGTTCA 343 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.396.77 chr1 - 955 8 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000374612.5 2694 11 21 8862 -6 -165 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.550332 0.658043 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGAAGAATCGGGGGTT -19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.396.79 chr1 - 793 7 novel_in_catalog HNRNPR novel 1032 8 NA NA 2 -165 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.634403 0.420682 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGAAGAATCGGGGGTT 342 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.396.82 chr1 - 893 7 incomplete-splice_match HNRNPR ENST00000374616.7 2691 11 6 11766 6 -3066 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAGAATTCAGTAAAGTCACA 346 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.398.1 chr1 - 4168 3 full-splice_match ZNF436 ENST00000374608.3 3788 3 149 -529 149 2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACCTGAGAATTATTTTAG -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.398.2 chr1 - 4286 3 full-splice_match ZNF436 ENST00000374608.3 3788 3 28 -526 28 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AGCAAACCTGAGAATTATTT -23 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.398.4 chr1 - 3768 3 full-splice_match ZNF436 ENST00000374608.3 3788 3 20 0 20 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GCTTCTGTGAGCCACTATGG -31 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.399.1 chr1 - 1170 7 novel_not_in_catalog TCEA3 novel 1719 11 NA NA 14353 -155 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGACCTGAGGTGTCATATCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.399.2 chr1 - 1534 11 full-splice_match TCEA3 ENST00000450454.7 1719 11 29 156 -12 -156 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAGACCTGAGGTGTCATATC 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.399.3 chr1 - 1250 11 full-splice_match TCEA3 ENST00000450454.7 1719 11 3 466 3 -466 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 38 9.100663 0.959073 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATACTGAACTCTGTCTG -16 TRUE NA NA GGGGCT -23 NA NA NA 38 NA PB.399.4 chr1 - 1177 10 novel_in_catalog TCEA3 novel 1719 11 NA NA 13 -466 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATACTGAACTCTGTCTG -6 TRUE NA NA GGGGCT -13 NA NA NA 7 NA PB.400.1 chr1 + 895 3 full-splice_match ZNF436-AS1 ENST00000437367.4 898 3 -5 8 -4 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CAGCACAATTGTCATAGTTT -3 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 4 NA PB.400.2 chr1 + 1197 2 full-splice_match ZNF436-AS1 ENST00000454117.2 1266 2 15 54 0 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACAATTGTCATAGTTTTTTG 2 TRUE NA NA AATAAA -25 NA NA NA 9 NA PB.400.3 chr1 + 2816 1 full-splice_match ZNF436-AS1 ENST00000335648.3 2547 1 -270 1 2 -1 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CAGCACAATTGTCATAGTTT 4 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 8 NA PB.400.4 chr1 + 1237 1 full-splice_match ZNF436-AS1 ENST00000335648.3 2547 1 1310 0 1308 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGCACAATTGTCATAGTTTT 1329 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.401.1 chr1 - 4127 25 full-splice_match ASAP3 ENST00000336689.8 4051 25 -76 0 -63 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCCAGTGGTTTCATTTATGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.401.2 chr1 - 2854 12 incomplete-splice_match ASAP3 ENST00000336689.8 4051 25 46859 0 -352 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCCAGTGGTTTCATTTATGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.401.3 chr1 - 1658 3 incomplete-splice_match ASAP3 ENST00000465372.5 936 5 1638 -969 1638 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCCAGTGGTTTCATTTATGT 4781 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.401.4 chr1 - 1770 4 incomplete-splice_match ASAP3 ENST00000495646.5 2552 10 3512 1 367 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTCCAGTGGTTTCATTTATG 3510 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.401.5 chr1 - 3102 16 incomplete-splice_match ASAP3 ENST00000336689.8 4051 25 43033 4 1125 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTTTCCAGTGGTTTCATTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.401.6 chr1 - 2031 6 incomplete-splice_match ASAP3 ENST00000495646.5 2552 10 3003 4 -142 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTTTCCAGTGGTTTCATTT 3001 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.401.8 chr1 - 1416 12 incomplete-splice_match ASAP3 ENST00000336689.8 4051 25 -42 9958 -29 -1557 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATATTTGAGTGGATTTGGGT -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.402.1 chr1 - 2000 7 novel_not_in_catalog E2F2 novel 550 2 NA NA 0 767 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATGGTTGCAGGCGCCTGTA -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.402.2 chr1 - 2226 8 novel_not_in_catalog E2F2 novel 5196 7 NA NA -17 766 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCATGGTTGCAGGCGCCTGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.402.3 chr1 - 5270 7 novel_not_in_catalog E2F2 novel 5196 7 NA NA -71 9 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCTTGTCTTTGTCGTGCTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.402.6 chr1 - 4305 5 incomplete-splice_match E2F2 ENST00000361729.3 5196 7 9278 -8 -2559 8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CATCTTGTCTTTGTCGTGCT 9268 FALSE NA NA AATGAA -12 NA NA NA 2 NA PB.402.7 chr1 - 5200 7 full-splice_match E2F2 ENST00000361729.3 5196 7 -5 1 -5 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTCTGGGCATCTTGTCTT -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.402.17 chr1 - 2202 7 full-splice_match E2F2 ENST00000361729.3 5196 7 -71 3065 -71 -3065 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTTCAGGTTGAGTTGTTTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.404.1 chr1 + 734 6 full-splice_match RPL11 ENST00000643754.2 1017 6 -136 419 -72 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGTGCAATTCTGTTGTGT NA FALSE NA NA AATAAA -43 NA NA NA 2 NA PB.404.2 chr1 + 615 6 full-splice_match RPL11 ENST00000643754.2 1017 6 -18 420 -18 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 288 68.973442 1.838682 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATGTGCAATTCTGTTGTG 6 FALSE NA NA AATAAA -42 NA NA NA 288 NA PB.404.3 chr1 + 1604 5 full-splice_match RPL11 ENST00000443624.6 1600 5 -1 -3 -1 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATGTGCAATTCTGTTGTG 4 TRUE NA NA AATAAA -42 NA NA NA 5 NA PB.404.4 chr1 + 2366 4 novel_in_catalog RPL11 novel 823 6 NA NA 0 2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAAATGTGCAATTCTGTTGT 20 FALSE NA NA AATAAA -41 NA NA NA 2 NA PB.404.5 chr1 + 1361 5 full-splice_match RPL11 ENST00000458455.2 879 5 -485 3 0 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATGTGCAATTCTGTTGTG 20 FALSE NA NA AATAAA -42 NA NA NA 2 NA PB.404.6 chr1 + 813 6 full-splice_match RPL11 ENST00000467075.2 823 6 0 10 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATGTGCAATTCTGTTGTG 20 FALSE NA NA AATAAA -42 NA NA NA 5 NA PB.404.7 chr1 + 447 5 full-splice_match RPL11 ENST00000458455.2 879 5 429 3 126 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATGTGCAATTCTGTTGTG 44 FALSE NA NA AATAAA -42 NA NA NA 4 NA PB.404.9 chr1 + 1032 2 incomplete-splice_match RPL11 ENST00000458455.2 879 5 2651 -5 2348 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AATTCTGTTGTGTGTTCTGT 295 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.404.10 chr1 + 953 2 incomplete-splice_match RPL11 ENST00000458455.2 879 5 2730 -5 2427 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AATTCTGTTGTGTGTTCTGT 374 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.404.11 chr1 + 849 2 incomplete-splice_match RPL11 ENST00000458455.2 879 5 2825 4 2522 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAAATGTGCAATTCTGTTGT 469 FALSE NA NA AATAAA -41 NA NA NA 2 NA PB.406.1 chr1 - 1431 3 full-splice_match ID3 ENST00000374561.6 950 3 -2 -479 -2 479 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AACTGGGCCTGGTTTCATTT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.406.2 chr1 - 1047 3 full-splice_match ID3 ENST00000374561.6 950 3 -90 -7 -90 7 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACACCCGTCTCCATTAAGTA 250 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.406.3 chr1 - 760 3 full-splice_match ID3 ENST00000374561.6 950 3 197 -7 139 7 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACACCCGTCTCCATTAAGTA 537 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.406.5 chr1 - 974 3 full-splice_match ID3 ENST00000374561.6 950 3 -26 2 -26 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2102 503.410339 2.701922 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATATGATGACACCCGTCTC 314 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2102 NA PB.406.6 chr1 - 1466 2 full-splice_match ID3 ENST00000486541.1 892 2 -56 -518 2 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 34 8.142698 0.910768 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATATGATGACACCCGTCTCC 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 34 NA PB.406.7 chr1 - 1331 3 full-splice_match ID3 ENST00000374561.6 950 3 -382 1 -382 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATATGATGACACCCGTCTCC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.406.8 chr1 - 1098 3 full-splice_match ID3 ENST00000374561.6 950 3 -149 1 -149 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATATGATGACACCCGTCTCC 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.406.10 chr1 - 943 3 novel_not_in_catalog ID3 novel 950 3 NA NA -2 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATATGATGACACCCGTCTC -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.406.11 chr1 - 888 3 full-splice_match ID3 ENST00000374561.6 950 3 49 13 -9 -5 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.029314 0.701509 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACACTTGTGTATATGATG 389 FALSE NA NA AAGAAA -37 NA NA NA 21 NA PB.406.13 chr1 - 1042 2 full-splice_match ID3 ENST00000463312.1 623 2 -424 5 2 -5 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.113385 0.493233 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACACTTGTGTATATGATG 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.407.1 chr1 + 4836 11 full-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 0 2 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.310840 0.634562 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CATATACTGTGTCTTCCTTA -10 TRUE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 18 NA PB.407.3 chr1 + 1341 4 incomplete-splice_match ELOA ENST00000609199.2 5075 10 23 10110 0 969 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 88 21.075220 1.323772 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAATGACTCTAAAAG -10 TRUE NA NA GATAAA -7 NA NA NA 88 NA PB.407.4 chr1 + 1161 4 incomplete-splice_match ELOA ENST00000609199.2 5075 10 23 10290 0 789 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAACTAATTTGGATAGAAA -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.407.5 chr1 + 2680 11 full-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 3 2155 3 -2119 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 89 21.314711 1.328679 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCCAGGTTTGTTTTT -7 TRUE NA NA AATAAA -26 NA NA NA 89 NA PB.407.6 chr1 + 2508 9 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 6373 2163 5810 -2127 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATTTATATTATCCCCCAGGT 6363 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 5 NA PB.407.9 chr1 + 4381 8 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 7558 1 6995 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATATACTGTGTCTTCCTTAC 7548 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.407.11 chr1 + 2021 8 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 7764 2155 7201 -2119 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCCAGGTTTGTTTTT 7754 FALSE NA NA AATAAA -26 NA NA NA 10 NA PB.407.12 chr1 + 1780 8 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 8000 2160 7437 -2124 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.634403 0.420682 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATATTATCCCCCAGGTTTG 7990 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 11 NA PB.407.13 chr1 + 1650 8 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 8136 2154 7573 -2118 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCCCCAGGTTTGTTTTTG 8126 FALSE NA NA AATAAA -27 NA NA NA 2 NA PB.407.14 chr1 + 3694 8 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 8227 19 7664 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAATAAAAAACAAACTCCAT 8217 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.407.15 chr1 + 1492 8 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 8289 2159 7726 -2123 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATATTATCCCCCAGGTTTGT 8279 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 4 NA PB.407.16 chr1 + 1391 8 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 8385 2164 7822 -2128 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATTTATATTATCCCCCAGG 8375 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 7 NA PB.407.17 chr1 + 3490 8 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 8431 19 7868 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAATAAAAAACAAACTCCAT 8421 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.407.18 chr1 + 1227 7 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 8935 2154 8372 -2118 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCCCCAGGTTTGTTTTTG 8925 FALSE NA NA AATAAA -27 NA NA NA 4 NA PB.407.19 chr1 + 1072 6 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 10670 2155 10107 -2119 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCCAGGTTTGTTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -26 NA NA NA 6 NA PB.407.20 chr1 + 3143 6 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 10735 19 10172 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAATAAAAAACAAACTCCAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.407.21 chr1 + 860 4 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 12372 2154 11809 -2118 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCCCCAGGTTTGTTTTTG NA FALSE NA NA AATAAA -27 NA NA NA 4 NA PB.407.22 chr1 + 2938 4 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 12429 19 11866 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAATAAAAAACAAACTCCAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.407.23 chr1 + 2761 3 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 12874 1 12311 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATATACTGTGTCTTCCTTAC NA FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.407.24 chr1 + 2593 2 incomplete-splice_match ELOA ENST00000613537.5 4838 11 13608 2 13045 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CATATACTGTGTCTTCCTTA NA FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 3 NA PB.408.1 chr1 + 1641 6 full-splice_match PITHD1 ENST00000246151.9 1590 6 -53 2 -53 -2 alternative_5end TRUE canonical NA NA NA NA 267 63.944130 1.805801 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTTTGTATTTTCTTTTG NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 267 NA PB.408.3 chr1 + 2336 5 novel_in_catalog PITHD1 novel 1590 6 NA NA -25 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAATGTTTGTATTTTCTTTT -11 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.408.4 chr1 + 1078 6 full-splice_match PITHD1 ENST00000246151.9 1590 6 -20 532 -20 -532 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGATTGTTGTGTGACTTGT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.408.5 chr1 + 2709 4 novel_in_catalog PITHD1 novel 1590 6 NA NA -15 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTTTGTATTTTCTTTTG -1 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.408.6 chr1 + 1545 5 novel_in_catalog PITHD1 novel 1590 6 NA NA -1 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.352876 0.525417 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTTTGTATTTTCTTTTG 13 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 14 NA PB.408.7 chr1 + 1493 6 full-splice_match PITHD1 ENST00000246151.9 1590 6 95 2 95 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTTTGTATTTTCTTTTG 109 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.408.8 chr1 + 1315 6 full-splice_match PITHD1 ENST00000246151.9 1590 6 273 2 273 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTTTGTATTTTCTTTTG 287 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 9 NA PB.408.9 chr1 + 1170 3 incomplete-splice_match PITHD1 ENST00000374524.1 1292 4 483 2 483 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.113385 0.493233 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTTTGTATTTTCTTTTG 7271 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 13 NA PB.408.10 chr1 + 1026 2 incomplete-splice_match PITHD1 ENST00000374524.1 1292 4 1162 2 1162 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.071349 0.609738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGTTTGTATTTTCTTTTG 7950 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 17 NA PB.409.1 chr1 - 1132 5 novel_in_catalog ELOA-AS1 novel 970 4 NA NA 9 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAAGTTGCCTTCAGGGCTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.409.2 chr1 - 947 4 full-splice_match ELOA-AS1 ENST00000427796.6 1112 4 28 137 -7 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.831858 0.583409 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAAGTTGCCTTCAGGGCTA -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.409.3 chr1 - 861 4 novel_not_in_catalog ELOA-AS1 novel 1112 4 NA NA -3 -78 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATTACAGCCTTTAAAACCAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.409.4 chr1 - 729 3 full-splice_match ELOA-AS1 ENST00000686609.1 808 3 -11 90 0 -86 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AACATAGCATTACAGCCTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.409.5 chr1 - 1018 5 novel_in_catalog ELOA-AS1 novel 970 4 NA NA -3 -103 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAACAAACCAATTTCCAAC -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.409.6 chr1 - 1011 6 novel_not_in_catalog ELOA-AS1 novel 970 4 NA NA 62 -103 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAACAAACCAATTTCCAAC 5949 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.409.7 chr1 - 865 4 full-splice_match ELOA-AS1 ENST00000427796.6 1112 4 7 240 -5 -103 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAACAAACCAATTTCCAAC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.410.2 chr1 - 1501 10 novel_in_catalog GALE novel 1516 12 NA NA -1 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCAGGTTCTCACAGATGGTC -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.410.3 chr1 - 1453 10 novel_in_catalog GALE novel 1516 12 NA NA -9 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCAGGTTCTCACAGATGGTC 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.410.4 chr1 - 1322 10 novel_in_catalog GALE novel 1516 12 NA NA -3 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCAGGTTCTCACAGATGGTC 11 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.410.5 chr1 - 1157 8 incomplete-splice_match GALE ENST00000374497.7 1488 12 2175 -1 886 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCAGGTTCTCACAGATGGTC 2548 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.410.6 chr1 - 1584 12 full-splice_match GALE ENST00000617979.5 1516 12 -69 1 -42 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GGCAGGTTCTCACAGATGGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.410.7 chr1 - 1438 11 novel_in_catalog GALE novel 1516 12 NA NA -1 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GGCAGGTTCTCACAGATGGT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.410.8 chr1 - 1404 11 novel_in_catalog GALE novel 1516 12 NA NA -3 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GGCAGGTTCTCACAGATGGT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.410.9 chr1 - 1383 10 incomplete-splice_match GALE ENST00000374497.7 1488 12 1408 0 119 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GGCAGGTTCTCACAGATGGT 1781 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.410.10 chr1 - 1025 7 incomplete-splice_match GALE ENST00000374497.7 1488 12 2551 0 -782 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GGCAGGTTCTCACAGATGGT 2924 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.410.11 chr1 - 1622 11 full-splice_match GALE ENST00000459934.5 1563 11 1 -60 0 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.592367 0.555381 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GGGCAGGTTCTCACAGATGG 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.410.12 chr1 - 1521 12 full-splice_match GALE ENST00000617979.5 1516 12 -7 2 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 315 75.439705 1.877600 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GGGCAGGTTCTCACAGATGG -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 315 NA PB.410.13 chr1 - 1633 12 full-splice_match GALE ENST00000374497.7 1488 12 -147 2 -26 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GGGGCAGGTTCTCACAGATG -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.410.14 chr1 - 1437 11 novel_in_catalog GALE novel 1516 12 NA NA -26 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTGGGGCAGGTTCTCACAG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.410.15 chr1 - 1910 11 novel_in_catalog GALE novel 1516 12 NA NA 1 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACACTGGGGCAGGTTCTCAC 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.410.16 chr1 - 1380 11 novel_in_catalog GALE novel 1516 12 NA NA 0 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 59 14.129976 1.150141 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACACTGGGGCAGGTTCTCAC 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 59 NA PB.410.17 chr1 - 2002 10 novel_in_catalog GALE novel 1563 11 NA NA -1 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TACACTGGGGCAGGTTCTCA -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.410.18 chr1 - 1501 11 novel_in_catalog GALE novel 1488 12 NA NA -26 -4 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TACACTGGGGCAGGTTCTCA -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.411.1 chr1 - 1132 5 incomplete-splice_match HMGCL ENST00000374490.8 1570 9 11174 -7 66 7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTCGGTTGTGCAGCTGTGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.411.2 chr1 - 833 3 incomplete-splice_match HMGCL ENST00000235958.4 1101 5 17248 -32 6167 7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTCGGTTGTGCAGCTGTGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.411.3 chr1 - 1589 9 full-splice_match HMGCL ENST00000374490.8 1570 9 -14 -5 -14 5 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 327 78.313599 1.893837 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCATTCGGTTGTGCAGCTGT -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 327 NA PB.411.4 chr1 - 1559 9 novel_not_in_catalog HMGCL novel 1570 9 NA NA -9 4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCATTCGGTTGTGCAGCTG -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.411.5 chr1 - 937 3 incomplete-splice_match HMGCL ENST00000235958.4 1101 5 17141 -29 6060 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGCATTCGGTTGTGCAGCTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.411.6 chr1 - 1423 8 novel_in_catalog HMGCL novel 1570 9 NA NA -4 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATTCCAGCATTCGGTTGTG -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.411.7 chr1 - 1364 7 full-splice_match HMGCL ENST00000436439.6 1354 7 -10 0 -9 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.310840 0.634562 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATTCCAGCATTCGGTTGTG -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.411.8 chr1 - 1179 6 novel_in_catalog HMGCL novel 1354 7 NA NA -14 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAATTCCAGCATTCGGTTGT -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.411.9 chr1 - 1635 10 novel_not_in_catalog HMGCL novel 1570 9 NA NA -9 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATAATTCCAGCATTCGGTTG -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.411.10 chr1 - 1467 8 novel_in_catalog HMGCL novel 1570 9 NA NA -9 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATAATTCCAGCATTCGGTTG -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.411.11 chr1 - 1431 8 incomplete-splice_match HMGCL ENST00000374490.8 1570 9 4897 4 -2999 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATAATTCCAGCATTCGGTTG 4941 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.411.12 chr1 - 1042 4 novel_in_catalog HMGCL novel 1570 9 NA NA 81 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATAATTCCAGCATTCGGTTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.411.13 chr1 - 1795 6 full-splice_match HMGCL ENST00000513148.1 2011 6 -27 243 -14 -243 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACGGTGGCTCACGCCTGTAA -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.412.1 chr1 - 1785 8 full-splice_match FUCA1 ENST00000374479.4 2043 8 251 7 251 -7 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAAACATGGTATAGCTT 282 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.412.2 chr1 - 1723 8 full-splice_match FUCA1 ENST00000374479.4 2043 8 313 7 313 -7 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAAACATGGTATAGCTT 344 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.412.3 chr1 - 1239 4 incomplete-splice_match FUCA1 ENST00000374479.4 2043 8 13755 7 13755 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAAACATGGTATAGCTT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.412.4 chr1 - 1145 4 incomplete-splice_match FUCA1 ENST00000374479.4 2043 8 13849 7 13849 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAAACATGGTATAGCTT 242 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.412.5 chr1 - 1064 3 incomplete-splice_match FUCA1 ENST00000374479.4 2043 8 19450 7 19450 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.071349 0.609738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAAACATGGTATAGCTT 5843 FALSE NA NA AATGAA -29 NA NA NA 17 NA PB.412.6 chr1 - 936 3 incomplete-splice_match FUCA1 ENST00000374479.4 2043 8 19578 7 19578 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAAACATGGTATAGCTT 5971 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.412.8 chr1 - 2078 8 full-splice_match FUCA1 ENST00000374479.4 2043 8 -43 8 -43 -8 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 205 49.095680 1.691043 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 CAAAAAAACATGGTATAGCT -12 TRUE NA NA AAAAAG -4 NA NA NA 205 NA PB.412.9 chr1 - 1559 7 incomplete-splice_match FUCA1 ENST00000374479.4 2043 8 2748 8 2748 -8 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 CAAAAAAACATGGTATAGCT 2779 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.412.10 chr1 - 2228 8 novel_not_in_catalog FUCA1 novel 2043 8 NA NA -31 -20 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AATCATTTCTACCAAAAAAA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.412.11 chr1 - 1328 5 incomplete-splice_match FUCA1 ENST00000374479.4 2043 8 8415 21 8415 -21 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 CAATCATTTCTACCAAAAAA 8446 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.413.2 chr1 + 1633 10 full-splice_match LYPLA2 ENST00000374514.8 1635 10 0 2 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 810 193.987808 2.287775 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT -9 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 810 NA PB.413.3 chr1 + 1489 10 full-splice_match LYPLA2 ENST00000374503.7 868 10 -39 -582 19 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 10 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.413.4 chr1 + 1508 8 novel_not_in_catalog LYPLA2 novel 1635 10 NA NA 20 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAACGCTCAGGCCTGGCTGA 11 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.413.5 chr1 + 1792 8 full-splice_match LYPLA2 ENST00000374502.7 1072 8 -53 -667 -19 -2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.113385 0.493233 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 14 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 13 NA PB.413.6 chr1 + 1711 9 novel_in_catalog LYPLA2 novel 1635 10 NA NA -19 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 14 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 5 NA PB.413.7 chr1 + 1715 10 novel_in_catalog LYPLA2 novel 1635 10 NA NA -19 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 14 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 9 NA PB.413.8 chr1 + 1691 9 incomplete-splice_match LYPLA2 ENST00000374514.8 1635 10 23 2 -19 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 14 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.413.9 chr1 + 1643 10 novel_not_in_catalog LYPLA2 novel 1635 10 NA NA -19 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 14 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.413.10 chr1 + 1578 9 novel_in_catalog LYPLA2 novel 1635 10 NA NA -19 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 14 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 9 NA PB.413.11 chr1 + 1516 9 incomplete-splice_match LYPLA2 ENST00000374514.8 1635 10 1523 2 676 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.310840 0.634562 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 691 FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 18 NA PB.413.12 chr1 + 1298 6 full-splice_match LYPLA2 ENST00000374501.1 1117 6 79 -260 79 -2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.873893 0.458471 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 70 FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 12 NA PB.413.13 chr1 + 1384 2 incomplete-splice_match LYPLA2 ENST00000472213.1 822 3 -25 -456 -25 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 405 FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.413.14 chr1 + 1168 4 incomplete-splice_match LYPLA2 ENST00000374501.1 1117 6 448 -260 9 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 20 4.789823 0.680319 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 439 FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 20 NA PB.413.15 chr1 + 1003 2 incomplete-splice_match LYPLA2 ENST00000472213.1 822 3 362 -456 362 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 792 FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 6 NA PB.413.16 chr1 + 891 2 incomplete-splice_match LYPLA2 ENST00000472213.1 822 3 474 -456 474 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACGCTCAGGCCTGGCTGAT 904 FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 5 NA PB.415.1 chr1 - 3497 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000344989.10 3487 6 4 -14 0 14 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 24 5.747787 0.759501 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGATTTTGCTCTTAGATTT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 24 NA PB.415.2 chr1 - 3430 5 full-splice_match SRSF10 ENST00000484146.6 1089 5 19 -2360 -6 -9 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAATAAATCTTGGGTTTT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.415.15 chr1 - 3359 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000344989.10 3487 6 4 124 0 -124 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATTCATTGAGAACTAACC 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.415.16 chr1 - 2926 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000453840.7 1808 6 -72 -1046 -12 -595 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATGGTTGTGTGGCTCAGAGA -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.415.17 chr1 - 2365 4 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000374453.7 866 6 4679 -1170 -563 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATGTTTTGGATTCCTTAG 4746 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.415.18 chr1 - 2265 7 novel_in_catalog SRSF10 novel 2839 7 NA NA 0 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.634403 0.420682 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATGTTTTGGATTCCTTAG 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.415.19 chr1 - 4683 7 novel_in_catalog SRSF10 novel 2839 7 NA NA -17 -4 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATGTTTTGGATTCCTTA -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.415.20 chr1 - 5126 6 novel_in_catalog SRSF10 novel 2839 7 NA NA -3 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATGTTTTGGATTCCTTA 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.415.23 chr1 - 2283 7 novel_not_in_catalog SRSF10 novel 2839 7 NA NA 0 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATGTTTTGGATTCCTTA 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.415.25 chr1 - 2071 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000374452.9 1194 6 -19 -858 0 -4 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.352876 0.525417 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATGTTTTGGATTCCTTA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.415.26 chr1 - 1870 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000344989.10 3487 6 -28 1645 -3 -4 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 256 61.309731 1.787529 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATGTTTTGGATTCCTTA 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 256 NA PB.415.27 chr1 - 1686 5 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000344989.10 3487 6 1529 1645 144 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATGTTTTGGATTCCTTA 1559 FALSE NA NA CATAAA -21 NA NA NA 6 NA PB.415.28 chr1 - 1784 5 full-splice_match SRSF10 ENST00000484146.6 1089 5 29 -724 0 -4 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 39 9.340154 0.970354 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATGTTTTGGATTCCTTA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 39 NA PB.415.29 chr1 - 1590 4 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000341154.10 2839 7 5856 4 -19 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATGTTTTGGATTCCTTA 5290 FALSE NA NA GGGGCT -25 NA NA NA 9 NA PB.415.30 chr1 - 1575 4 novel_in_catalog SRSF10 novel 2839 7 NA NA -3 -4 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATGTTTTGGATTCCTTA 2421 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.415.32 chr1 - 1361 2 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000484146.6 1089 5 8421 -724 3117 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATGTTTTGGATTCCTTA 8426 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.415.39 chr1 - 1939 7 novel_not_in_catalog SRSF10 novel 7656 6 NA NA 0 -5 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 20 4.789823 0.680319 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAAAATGTTTTGGATTCCTT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 20 NA PB.415.41 chr1 - 1487 4 novel_not_in_catalog SRSF10 novel 3957 4 NA NA 3146 -5 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAAAATGTTTTGGATTCCTT 8455 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.415.44 chr1 - 1558 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000344989.10 3487 6 4 1925 0 -284 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TAATATACTAGAGTTATAAT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.415.45 chr1 - 1536 5 full-splice_match SRSF10 ENST00000484146.6 1089 5 -3 -444 -3 -284 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TAATATACTAGAGTTATAAT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.415.47 chr1 - 823 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000344989.10 3487 6 4 2660 0 154 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 49 11.735065 1.069486 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GTACTTGTGGAAACTAATCC 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 49 NA PB.415.49 chr1 - 2901 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000492112.3 7656 6 0 4755 0 -19 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.071349 0.609738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AATAAAAACAAAATGAAGGA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.415.50 chr1 - 2832 4 full-splice_match SRSF10 ENST00000485841.5 3957 4 2402 -1277 -198 -19 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AATAAAAACAAAATGAAGGA 5111 FALSE NA NA AATACA -1 NA NA NA 2 NA PB.415.51 chr1 - 2555 3 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000485841.5 3957 4 5640 -1277 3040 -19 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AATAAAAACAAAATGAAGGA 8349 FALSE NA NA ATTAAA -11 NA NA NA 4 NA PB.415.64 chr1 - 4901 6 novel_in_catalog SRSF10 novel 2917 6 NA NA 5 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.415.65 chr1 - 3241 4 full-splice_match SRSF10 ENST00000485841.5 3957 4 716 0 716 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA 3425 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.415.66 chr1 - 2050 7 novel_in_catalog SRSF10 novel 7656 6 NA NA 0 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.415.67 chr1 - 1980 4 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000484146.6 1089 5 29 3206 0 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.415.68 chr1 - 1847 5 novel_in_catalog SRSF10 novel 7656 6 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.415.69 chr1 - 1789 5 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000374452.9 1194 6 -51 3072 -3 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.415.70 chr1 - 1663 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000492112.3 7656 6 -39 6032 -10 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 230 55.082958 1.741017 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 230 NA PB.415.71 chr1 - 1484 5 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000492112.3 7656 6 1513 6032 132 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA 1547 FALSE NA NA CATAAA -33 NA NA NA 2 NA PB.415.72 chr1 - 1419 4 novel_in_catalog SRSF10 novel 3957 4 NA NA 0 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.415.74 chr1 - 1182 3 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000485841.5 3957 4 5736 0 3136 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAACCGGA 8445 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.415.79 chr1 - 1218 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000492112.3 7656 6 -24 6462 5 166 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATATTTGGTAGAACTGTTAA 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.415.80 chr1 - 1446 7 novel_not_in_catalog SRSF10 novel 7656 6 NA NA 0 2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CTTAAGAGTCCAGTTTGTTT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.415.81 chr1 - 4312 6 novel_in_catalog SRSF10 novel 7656 6 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCTTAAGAGTCCAGTTTG 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.415.82 chr1 - 1453 7 novel_in_catalog SRSF10 novel 7656 6 NA NA 0 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCTTAAGAGTCCAGTTTG 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.415.83 chr1 - 1007 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000492112.3 7656 6 20 6629 1 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 23 5.508296 0.741017 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCTTAAGAGTCCAGTTTG 54 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 23 NA PB.415.84 chr1 - 822 4 full-splice_match SRSF10 ENST00000485841.5 3957 4 2538 597 -62 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTCTTAAGAGTCCAGTTTG 5247 FALSE NA NA AATGAA -39 NA NA NA 2 NA PB.415.85 chr1 - 1058 6 full-splice_match SRSF10 ENST00000492112.3 7656 6 -32 6630 -3 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 96 22.991148 1.361561 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CACTCTTAAGAGTCCAGTTT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 96 NA PB.415.99 chr1 - 849 2 incomplete-splice_match SRSF10 ENST00000343255.9 2917 6 -29 9052 0 20 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.831858 0.583409 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAGAAAAAATAAAGAAAA 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.415.100 chr1 - 441 3 full-splice_match SRSF10 ENST00000485292.1 790 3 4 345 0 20 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAGAAAAAATAAAGAAAA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.417.1 chr1 - 2138 8 novel_in_catalog MYOM3 novel 2693 10 NA NA 610 -7 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AACACCACAAAGTAACACCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.418.1 chr1 - 2847 7 full-splice_match IL22RA1 ENST00000270800.2 2817 7 -30 0 -30 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CCTGTTGTGATTTTTTTTTT -22 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.421.1 chr1 + 4022 2 incomplete-splice_match PNRC2 ENST00000647887.1 2428 4 2291 -10 21 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAAAATGGTTTTGATTGCT NA FALSE NA NA AATAAA -29 NA NA NA 2 NA PB.421.2 chr1 + 1571 3 full-splice_match PNRC2 ENST00000471915.5 380 3 21 -1212 21 -769 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAAAGTTTTCTTGGCCTTTA NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.421.4 chr1 + 2417 3 novel_not_in_catalog PNRC2 novel 2428 4 NA NA 175 -6 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAAAATGGTTTTGATTGCT -1 TRUE NA NA AATAAA -29 NA NA NA 3 NA PB.421.7 chr1 + 2157 3 full-splice_match PNRC2 ENST00000334351.8 2400 3 -541 784 178 -768 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAGTTTTCTTGGCCTTTAT 2 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.421.8 chr1 + 1636 3 novel_not_in_catalog PNRC2 novel 2428 4 NA NA 178 -768 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAAGTTTTCTTGGCCTTTAT 2 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.421.9 chr1 + 2483 3 full-splice_match PNRC2 ENST00000334351.8 2400 3 0 -83 0 83 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 331 79.271561 1.899117 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACTCTTGGATTTCTCAGA 11 TRUE NA NA AATACA -14 NA NA NA 331 NA PB.421.10 chr1 + 1871 3 full-splice_match PNRC2 ENST00000334351.8 2400 3 0 529 0 -513 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGAGATGTGAAATGCAGTA 11 TRUE NA NA AAAAAG -25 NA NA NA 5 NA PB.421.11 chr1 + 1494 3 full-splice_match PNRC2 ENST00000334351.8 2400 3 -6 912 -6 670 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTCTAATAGTGCTCTGGCC 5 TRUE NA NA AATACA -28 NA NA NA 9 NA PB.421.13 chr1 + 2351 3 full-splice_match PNRC2 ENST00000334351.8 2400 3 0 49 0 -33 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 ATAAAATTAAATAAAATTTT 11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.421.15 chr1 + 1615 3 full-splice_match PNRC2 ENST00000334351.8 2400 3 0 785 0 -769 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 110 26.344025 1.420682 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAAAGTTTTCTTGGCCTTTA 11 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 110 NA PB.421.17 chr1 + 2220 2 incomplete-splice_match PNRC2 ENST00000334351.8 2400 3 1104 6 1104 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAAAATGGTTTTGATTGCT 1115 FALSE NA NA AATAAA -29 NA NA NA 6 NA PB.421.18 chr1 + 1345 2 incomplete-splice_match PNRC2 ENST00000334351.8 2400 3 1200 785 1200 -769 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAAAGTTTTCTTGGCCTTTA 1211 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 8 NA PB.421.20 chr1 + 2044 2 incomplete-splice_match PNRC2 ENST00000334351.8 2400 3 1269 17 1269 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.268805 0.721712 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGGTTTTATTTTAAAAATGG 1280 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 22 NA PB.422.1 chr1 + 1351 11 novel_in_catalog NIPAL3 novel 1676 12 NA NA -22 -9 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAATTAAAAATAAATAAAT -19 TRUE NA NA AAGAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.422.3 chr1 + 3172 12 full-splice_match NIPAL3 ENST00000374399.9 5372 12 -19 2219 -19 -2219 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAACTGACATCTGTTGTC -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.422.4 chr1 + 1545 10 novel_in_catalog NIPAL3 novel 1676 12 NA NA -19 -9 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAATTAAAAATAAATAAAT -16 TRUE NA NA AAGAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.422.6 chr1 + 5376 12 full-splice_match NIPAL3 ENST00000374399.9 5372 12 -6 2 -6 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GACAGCTGAGTTCGTGTCTT -3 TRUE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 3 NA PB.422.7 chr1 + 1724 12 full-splice_match NIPAL3 ENST00000374399.9 5372 12 0 3648 0 2950 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.268805 0.721712 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGGATGCGTTATCTTGGT 3 TRUE NA NA AAAAAG -15 NA NA NA 22 NA PB.422.8 chr1 + 899 2 full-splice_match NIPAL3 ENST00000488155.1 931 2 -16 48 -6 -48 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAGGAAAAAAAAAAAAAA -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.422.11 chr1 + 2081 12 full-splice_match NIPAL3 ENST00000339255.2 1676 12 -12 -393 0 325 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGACTTTAGGTGTATTCCTG 3 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.422.12 chr1 + 1679 12 full-splice_match NIPAL3 ENST00000339255.2 1676 12 -12 9 0 -9 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 36 8.621680 0.935592 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAATTAAAAATAAATAAAT 3 TRUE NA NA AAGAAA -15 NA NA NA 36 NA PB.422.13 chr1 + 1138 3 full-splice_match NIPAL3 ENST00000475663.2 694 3 -56 -388 0 388 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTCATCTCTCCCTGCCTTC 3 TRUE NA NA AAAACA -21 NA NA NA 3 NA PB.422.15 chr1 + 1801 12 novel_not_in_catalog NIPAL3 novel 5372 12 NA NA 1 2947 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GGGAAAGGATGCGTTATCTT 5 TRUE NA NA AAAAAG -12 NA NA NA 2 NA PB.423.1 chr1 + 2642 5 full-splice_match RCAN3 ENST00000538532.6 2421 5 -7 -214 -7 -5 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACTCAGCATTGTGCCCATT -16 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 5 NA PB.423.2 chr1 + 1546 5 novel_in_catalog RCAN3 novel 6863 5 NA NA 7 -98 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TACATGAAATTTTTTGCAGG 6 FALSE NA NA AATAAA -25 NA NA NA 3 NA PB.423.3 chr1 + 1568 5 full-splice_match RCAN3 ENST00000374395.9 6863 5 9 5286 9 -107 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TACTCAGTATACATGAAATT 8 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 5 NA PB.423.4 chr1 + 2820 5 full-splice_match RCAN3 ENST00000374395.9 6863 5 17 4026 17 -5 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACTCAGCATTGTGCCCATT -15 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 8 NA PB.423.6 chr1 + 2699 5 novel_in_catalog RCAN3 novel 6863 5 NA NA 43 -6 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAACTCAGCATTGTGCCCAT 16 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 6 NA PB.423.7 chr1 + 2663 5 full-splice_match RCAN3 ENST00000374395.9 6863 5 173 4027 112 -6 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.634403 0.420682 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAACTCAGCATTGTGCCCAT -4 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 11 NA PB.423.8 chr1 + 2397 4 incomplete-splice_match RCAN3 ENST00000538532.6 2421 5 12088 -214 66 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACTCAGCATTGTGCCCATT 70 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.423.9 chr1 + 2087 2 incomplete-splice_match RCAN3 ENST00000482807.1 497 3 -26 -1151 -26 -7 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TGAACTCAGCATTGTGCCCA NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.425.1 chr1 + 2132 5 novel_not_in_catalog NCMAP novel 3980 4 NA NA 23 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA TRUE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATGTGTTGAGTTTATTTC 10 TRUE NA NA AATAAA -41 NA NA NA 3 NA PB.426.1 chr1 + 607 5 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000468822.5 768 7 -105 2499 -102 -17 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAGATAAAAGAGATAAGGA 50 FALSE NA NA AAAAAG -13 NA NA NA 2 NA PB.426.2 chr1 + 932 7 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000479034.5 2671 17 -129 19103 -93 -17 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAATTCCAAAAAAGAA 59 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.426.4 chr1 + 3747 17 novel_in_catalog SRRM1 novel 3735 17 NA NA 1 -11 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGCCACTCTTACTTAGTAGT -18 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 9 NA PB.426.5 chr1 + 3715 18 novel_in_catalog SRRM1 novel 3110 18 NA NA 1 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTAGTAGTGCTTATGTAA -18 TRUE NA NA AATAAA -30 NA NA NA 3 NA PB.426.6 chr1 + 2549 17 novel_in_catalog SRRM1 novel 2671 17 NA NA -1 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.352876 0.525417 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAACACAAGAAGGAAAA 7 TRUE NA NA AAAAAG -43 NA NA NA 14 NA PB.426.7 chr1 + 2573 4 full-splice_match SRRM1 ENST00000462710.5 2624 4 -20 71 1 -17 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAGATAAAAGAGATAAGGA -18 TRUE NA NA AAAAAG -13 NA NA NA 9 NA PB.426.9 chr1 + 2212 4 full-splice_match SRRM1 ENST00000466910.5 799 4 1 -1414 1 115 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAGAAGAAATAAAACA -18 TRUE NA NA AAGAAA -36 NA NA NA 6 NA PB.426.10 chr1 + 1322 9 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000479034.5 2671 17 -35 16513 1 -47 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGAAAAAGTCGTGTTTCTG -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.426.11 chr1 + 838 7 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000479034.5 2671 17 -35 19103 1 -17 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 150 35.923668 1.555381 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAATTCCAAAAAAGAA -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 150 NA PB.426.12 chr1 + 670 6 full-splice_match SRRM1 ENST00000490543.5 673 6 -32 35 1 19 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AGAGAAAAAAGGGAGCGGTC -18 TRUE NA NA GATAAA -28 NA NA NA 4 NA PB.426.13 chr1 + 3770 18 novel_in_catalog SRRM1 novel 3110 18 NA NA 0 -25 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.634403 0.420682 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATTTAAAAATTTTGCCAC -16 TRUE NA NA AATAAA -6 NA NA NA 11 NA PB.426.15 chr1 + 2533 16 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 -24 1812 3 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 55 13.172012 1.119652 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAACACAAGAAGGAAAA -13 TRUE NA NA AAAAAG -43 NA NA NA 55 NA PB.426.17 chr1 + 2329 15 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 -21 3083 6 690 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAAGCCCCCAGCACCTCC -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.426.19 chr1 + 3766 18 novel_in_catalog SRRM1 novel 3110 18 NA NA 0 -20 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 32 7.663716 0.884439 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAAATTTTGCCACTCTTA 2 TRUE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 32 NA PB.426.20 chr1 + 3733 17 novel_in_catalog SRRM1 novel 3735 17 NA NA 1 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 39 9.340154 0.970354 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTAGTAGTGCTTATGTAA 9 TRUE NA NA AATAAA -30 NA NA NA 39 NA PB.426.21 chr1 + 2598 7 novel_in_catalog SRRM1 novel 3735 17 NA NA 0 -17 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAATTCCAAAAAAGAA 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.426.22 chr1 + 2560 17 full-splice_match SRRM1 ENST00000479034.5 2671 17 -15 126 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 38 9.100663 0.959073 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAACACAAGAAGGAAAA 2 TRUE NA NA AAAAAG -43 NA NA NA 38 NA PB.426.26 chr1 + 2293 5 novel_in_catalog SRRM1 novel 673 6 NA NA 1 19 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 33 7.903207 0.897803 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AGAGAAAAAAGGGAGCGGTC 9 TRUE NA NA GATAAA -28 NA NA NA 33 NA PB.426.27 chr1 + 948 8 novel_in_catalog SRRM1 novel 3735 17 NA NA 0 -17 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAATTCCAAAAAAGAA 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.426.28 chr1 + 726 7 full-splice_match SRRM1 ENST00000468822.5 768 7 18 24 0 -19 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 GGAAAAAAATTCCAAAAAAG 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.426.29 chr1 + 520 5 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000468822.5 768 7 18 2463 0 19 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 41 9.819137 0.992073 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AGAGAAAAAAGGGAGCGGTC 2 TRUE NA NA GATAAA -28 NA NA NA 41 NA PB.426.30 chr1 + 2479 3 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000600523.5 575 6 6 -114 1 114 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.071349 0.609738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 GAAGAAAGAAGAAATAAAAC 3 TRUE NA NA AAGAAA -35 NA NA NA 17 NA PB.426.31 chr1 + 3895 19 novel_in_catalog SRRM1 novel 3110 18 NA NA 2 -19 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATTTTGCCACTCTTAC 4 TRUE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.426.36 chr1 + 2352 16 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000479034.5 2671 17 -8 1397 1 690 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAAGCCCCCAGCACCTCC 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.426.37 chr1 + 629 5 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000596378.1 2314 15 10 19457 10 19 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AGAGAAAAAAGGGAGCGGTC 278 FALSE NA NA GATAAA -28 NA NA NA 2 NA PB.426.39 chr1 + 604 5 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000596378.1 2314 15 3177 17016 -1798 -17 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAATTCCAAAAAAGAA 3160 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.426.41 chr1 + 1692 2 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000495561.1 563 3 -1235 1518 -1151 -17 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAGATAAAAGAGATAAGGA 3807 FALSE NA NA AAAAAG -13 NA NA NA 2 NA PB.426.42 chr1 + 1065 2 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000495561.1 563 3 -608 1518 -524 -17 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAGATAAAAGAGATAAGGA 4434 FALSE NA NA AAAAAG -13 NA NA NA 7 NA PB.426.44 chr1 + 3451 15 novel_in_catalog SRRM1 novel 2671 17 NA NA 289 -19 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATTTTGCCACTCTTAC 5331 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 3 NA PB.426.46 chr1 + 3282 13 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 6673 19 -13 -19 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATTTTGCCACTCTTAC 1041 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.426.47 chr1 + 970 2 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000485441.5 561 4 713 137 713 -18 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 GAAAAAAATTCCAAAAAAGA 1767 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.426.48 chr1 + 3131 13 novel_in_catalog SRRM1 novel 2671 17 NA NA -22 -11 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGCCACTCTTACTTAGTAGT 2564 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.426.54 chr1 + 2362 8 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 17431 19 5679 -19 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATTTTGCCACTCTTAC 4947 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 3 NA PB.426.58 chr1 + 1073 6 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 18023 1812 -5230 0 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAACACAAGAAGGAAAA 5539 FALSE NA NA AAAAAG -43 NA NA NA 4 NA PB.426.59 chr1 + 2323 8 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000374389.8 3110 18 18033 -644 -5223 -11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGCCACTCTTACTTAGTAGT 5546 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.426.60 chr1 + 2235 7 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 18067 20 -5186 -20 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAAATTTTGCCACTCTTA 5583 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 4 NA PB.426.62 chr1 + 2151 7 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000374389.8 3110 18 19460 -636 -3796 -19 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATTTTGCCACTCTTAC 6973 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 4 NA PB.426.65 chr1 + 1993 5 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 23582 20 329 -20 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAAATTTTGCCACTCTTA NA FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.426.66 chr1 + 1892 4 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 25880 20 -401 -20 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAAATTTTGCCACTCTTA NA FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.426.67 chr1 + 1804 4 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 25970 18 -311 -18 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATTTTGCCACTCTTACT NA FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 6 NA PB.426.68 chr1 + 1722 4 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 26051 19 -230 -19 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.634403 0.420682 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATTTTGCCACTCTTAC NA FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 11 NA PB.426.69 chr1 + 1571 4 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 26201 20 -80 -20 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.550332 0.658043 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAAATTTTGCCACTCTTA NA FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 19 NA PB.426.70 chr1 + 1364 3 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 26940 20 659 -20 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 25 5.987278 0.777229 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAAATTTTGCCACTCTTA NA FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 25 NA PB.426.71 chr1 + 1292 2 incomplete-splice_match SRRM1 ENST00000323848.14 3735 17 28091 11 1810 -11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 42 10.058627 1.002539 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGCCACTCTTACTTAGTAGT NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 42 NA PB.428.2 chr1 - 2681 9 full-splice_match STPG1 ENST00000337248.9 2726 9 42 3 -15 3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.831858 0.583409 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGAGCTTTTGGGTACCCCTT 15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.428.3 chr1 - 2552 8 full-splice_match STPG1 ENST00000003583.12 2544 8 -7 -1 -7 1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTGAGCTTTTGGGTACCCC 23 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.428.6 chr1 - 1028 5 incomplete-splice_match STPG1 ENST00000337248.9 2726 9 0 22265 0 9 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AGAAAATAGGTGTTTTAACA -27 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.429.1 chr1 + 3690 6 full-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 -94 657 -29 -603 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GTAATTTTGGCTTTCACAAT -6 TRUE NA NA GATAAA -25 NA NA NA 2 NA PB.429.2 chr1 + 4310 6 full-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 -62 5 3 -5 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 342 81.905968 1.913316 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAAGTGTTTGAGACTACT 26 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 342 NA PB.429.3 chr1 + 4301 7 novel_in_catalog CLIC4 novel 2723 7 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATAAAGGATTCTTTTTTCCC 23 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.429.4 chr1 + 4151 5 novel_in_catalog CLIC4 novel 2723 7 NA NA 3 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATAAAGGATTCTTTTTTCCC 26 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.429.5 chr1 + 4135 5 novel_in_catalog CLIC4 novel 2723 7 NA NA 3 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATAAAGGATTCTTTTTTCCC 26 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.429.6 chr1 + 3113 6 full-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 -62 1202 3 -1148 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAATGTTCTAGGAAGGCATG 26 TRUE NA NA ATTAAA -28 NA NA NA 2 NA PB.429.8 chr1 + 1783 6 full-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 -62 2532 3 1882 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.550332 0.658043 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATCATAGAGCTTGCTATTT 26 TRUE NA NA AAAAAG -14 NA NA NA 19 NA PB.429.9 chr1 + 780 6 full-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 -41 3514 -3 900 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAGAAATGACTGGCATCT 47 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.429.10 chr1 + 913 6 full-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 -33 3373 5 1041 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 59 14.129976 1.150141 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAAGAGATGTCTTCATGT 55 FALSE NA NA AGTAAA -11 NA NA NA 59 NA PB.429.11 chr1 + 5087 6 full-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 0 -834 0 834 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAAAAAAAACAAAAAACA 0 TRUE NA NA AATACA -22 NA NA NA 2 NA PB.429.12 chr1 + 2672 6 full-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 0 1581 0 -1527 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAGGAAGATGCACTATTCAG 0 TRUE NA NA ATTAAA -23 NA NA NA 7 NA PB.429.13 chr1 + 2238 6 full-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 0 2015 0 -1961 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TATTTACTCTTTTTTAAAAG 0 TRUE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 4 NA PB.429.14 chr1 + 4162 6 full-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 37 54 37 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATAAAGGATTCTTTTTTCCC -1 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 9 NA PB.429.15 chr1 + 4128 6 full-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 121 4 121 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGTGTTTGAGACTACTA 83 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 8 NA PB.429.26 chr1 + 3978 5 incomplete-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 52387 4 52387 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGTGTTTGAGACTACTA 36 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.429.31 chr1 + 3911 4 incomplete-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 68646 54 68646 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATAAAGGATTCTTTTTTCCC NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 10 NA PB.429.33 chr1 + 1274 3 incomplete-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 81595 2532 81595 1882 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATCATAGAGCTTGCTATTT NA FALSE NA NA AAAAAG -14 NA NA NA 2 NA PB.429.35 chr1 + 3665 2 incomplete-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 94425 54 94425 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.310840 0.634562 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATAAAGGATTCTTTTTTCCC NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 18 NA PB.429.36 chr1 + 3652 2 incomplete-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 94487 5 94487 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAAGTGTTTGAGACTACT NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 9 NA PB.429.37 chr1 + 3538 2 incomplete-splice_match CLIC4 ENST00000374379.9 4253 6 94549 57 94549 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATCATAAAGGATTCTTTTTT 45 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.430.7 chr1 - 2410 5 full-splice_match RUNX3 ENST00000308873.11 4267 5 315 1542 315 -24 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAACAAA 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.430.8 chr1 - 2144 5 full-splice_match RUNX3 ENST00000308873.11 4267 5 581 1542 581 -24 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAACAAA 15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.430.9 chr1 - 2036 4 incomplete-splice_match RUNX3 ENST00000496967.1 572 5 1067 -1519 1067 -24 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAACAAA 2543 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.431.1 chr1 - 1681 7 full-splice_match SYF2 ENST00000236273.9 1757 7 22 54 6 -54 alternative_3end TRUE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGAGGGAAAGGTTGTTATTT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.431.2 chr1 - 1569 6 incomplete-splice_match SYF2 ENST00000236273.9 1757 7 15 405 -1 284 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACATTTTTAGTCTATCATT -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.431.3 chr1 - 1352 7 full-splice_match SYF2 ENST00000236273.9 1757 7 0 405 0 284 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 275 65.860062 1.818622 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACATTTTTAGTCTATCATT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 275 NA PB.431.4 chr1 - 1205 6 incomplete-splice_match SYF2 ENST00000236273.9 1757 7 379 405 309 284 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACATTTTTAGTCTATCATT 4135 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.431.5 chr1 - 1033 4 incomplete-splice_match SYF2 ENST00000354361.3 926 6 4277 -284 4223 284 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 27 6.466260 0.810653 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACATTTTTAGTCTATCATT 8049 FALSE NA NA AAAAAG -17 NA NA NA 27 NA PB.431.7 chr1 - 1414 7 full-splice_match SYF2 ENST00000236273.9 1757 7 -72 415 -72 274 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAGAATTTCTAACATTTTTA 3684 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.431.8 chr1 - 952 6 incomplete-splice_match SYF2 ENST00000236273.9 1757 7 329 708 259 -19 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATATGGCTGTTTAATCTTTG -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.431.9 chr1 - 1034 7 full-splice_match SYF2 ENST00000236273.9 1757 7 3 720 3 -31 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 179 42.868912 1.632142 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TATTTTAAATGTATATGGCT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 179 NA PB.431.10 chr1 - 826 5 incomplete-splice_match SYF2 ENST00000236273.9 1757 7 3424 719 3354 -30 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTTTAAATGTATATGGCTG 7180 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.431.11 chr1 - 718 4 incomplete-splice_match SYF2 ENST00000354361.3 926 6 4278 30 4224 -30 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATTTTAAATGTATATGGCTG 8050 FALSE NA NA AAAAAG -16 NA NA NA 3 NA PB.431.12 chr1 - 1796 6 novel_in_catalog SYF2 novel 1757 7 NA NA 3 -31 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TATTTTAAATGTATATGGCT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.431.13 chr1 - 918 7 full-splice_match SYF2 ENST00000236273.9 1757 7 3 836 3 -147 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 113 27.062498 1.432368 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATATCCTTTCATGTATATT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 113 NA PB.432.1 chr1 + 829 2 antisense novelGene_ENSG00000233755_AS novel NA NA NA NA NA NA multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA TRUE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAATCGAC NA FALSE NA NA AAAACA -10 NA NA NA 4 NA PB.433.1 chr1 + 1217 1 full-splice_match ENSG00000272432 ENST00000607698.1 485 1 -724 -8 -724 8 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA NA NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATTGTGGGTTAATTGCC NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.434.1 chr1 + 1635 10 full-splice_match RHD ENST00000328664.9 2814 10 -110 1289 6 -5 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AACAACATCTTGGTAAACAA -2 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.435.1 chr1 - 3231 3 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000498238.1 2941 4 0 -11 0 11 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 ATATATATAACCTAATGGAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.435.2 chr1 - 2324 3 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000498238.1 2941 4 894 2 -25 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAGTCTTTATTGTATATATA 928 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.435.3 chr1 - 2828 5 novel_in_catalog RSRP1 novel 2941 4 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGTCTTTATTGTATATATAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.435.4 chr1 - 2815 5 novel_in_catalog RSRP1 novel 2941 4 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGTCTTTATTGTATATATAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.435.6 chr1 - 2164 6 novel_in_catalog RSRP1 novel 1425 5 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGTCTTTATTGTATATATAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.435.7 chr1 - 1948 7 novel_in_catalog RSRP1 novel 3034 6 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGTCTTTATTGTATATATAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.435.8 chr1 - 1890 6 novel_in_catalog RSRP1 novel 2013 5 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGTCTTTATTGTATATATAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.435.9 chr1 - 1665 2 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000566395.5 824 5 1777 -5 450 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGTCTTTATTGTATATATAT 2730 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.435.10 chr1 - 1469 6 novel_in_catalog RSRP1 novel 1425 5 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGTCTTTATTGTATATATAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.435.11 chr1 - 1464 5 novel_in_catalog RSRP1 novel 1425 5 NA NA -10 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGTCTTTATTGTATATATAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.435.12 chr1 - 1069 2 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000566395.5 824 5 2373 -5 -57 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGTCTTTATTGTATATATAT 3326 FALSE NA NA AATAAA -38 NA NA NA 4 NA PB.435.13 chr1 - 1066 4 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000243189.12 1425 5 637 1 -177 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGTCTTTATTGTATATATAT 671 FALSE NA NA AAAAAG -17 NA NA NA 6 NA PB.435.14 chr1 - 938 2 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000566395.5 824 5 2504 -5 74 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGTCTTTATTGTATATATAT 3457 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.435.15 chr1 - 2939 4 full-splice_match RSRP1 ENST00000498238.1 2941 4 0 2 0 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 62 14.848450 1.171681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAGTCTTTATTGTATATATA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 62 NA PB.435.16 chr1 - 2288 5 novel_in_catalog RSRP1 novel 1425 5 NA NA 0 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 36 8.621680 0.935592 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAGTCTTTATTGTATATATA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 36 NA PB.435.17 chr1 - 1846 2 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000566395.5 824 5 1595 -4 268 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAGTCTTTATTGTATATATA 2548 FALSE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 2 NA PB.435.19 chr1 - 1330 2 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000566395.5 824 5 2111 -4 -319 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAGTCTTTATTGTATATATA 3064 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.435.20 chr1 - 822 2 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000566395.5 824 5 2619 -4 189 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAGTCTTTATTGTATATATA 3572 FALSE NA NA AAGAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.435.21 chr1 - 708 2 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000566395.5 824 5 2733 -4 -148 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAGTCTTTATTGTATATATA 3686 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.435.22 chr1 - 2833 4 full-splice_match RSRP1 ENST00000498238.1 2941 4 105 3 97 3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TTAGTCTTTATTGTATATAT 139 FALSE NA NA GGGGCT -9 NA NA NA 2 NA PB.435.23 chr1 - 2428 3 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000498238.1 2941 4 789 3 -25 3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TTAGTCTTTATTGTATATAT 823 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.435.24 chr1 - 1767 4 novel_in_catalog RSRP1 novel 3034 6 NA NA -16 2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CTTAGTCTTTATTGTATATA 832 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.435.25 chr1 - 1421 5 full-splice_match RSRP1 ENST00000243189.12 1425 5 0 4 0 2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 36 8.621680 0.935592 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CTTAGTCTTTATTGTATATA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 36 NA PB.435.26 chr1 - 2056 6 novel_in_catalog RSRP1 novel 3034 6 NA NA 0 1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TCTTAGTCTTTATTGTATAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.435.28 chr1 - 1949 7 novel_in_catalog RSRP1 novel 3034 6 NA NA 10 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTCTTAGTCTTTATTGTAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.435.30 chr1 - 1538 2 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000566395.5 824 5 1898 1 -532 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTCTTAGTCTTTATTGTAT 2851 FALSE NA NA AATGAA -5 NA NA NA 2 NA PB.435.31 chr1 - 1332 4 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000243189.12 1425 5 365 7 357 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTCTTAGTCTTTATTGTAT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.435.32 chr1 - 1396 2 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000566395.5 824 5 2040 1 -390 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTCTTAGTCTTTATTGTAT 2993 FALSE NA NA GATAAA -21 NA NA NA 4 NA PB.435.33 chr1 - 1219 2 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000566395.5 824 5 2217 1 -213 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTCTTAGTCTTTATTGTAT 3170 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.435.34 chr1 - 878 4 incomplete-splice_match RSRP1 ENST00000243189.12 1425 5 819 7 5 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTCTTAGTCTTTATTGTAT 853 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.435.35 chr1 - 2170 6 novel_in_catalog RSRP1 novel 1425 5 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CATTCTTAGTCTTTATTGTA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.435.37 chr1 - 1962 3 full-splice_match RSRP1 ENST00000431849.3 1954 3 -8 0 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.113385 0.493233 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAAAAAATGCTGTAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.435.38 chr1 - 1311 4 novel_in_catalog RSRP1 novel 2941 4 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.831858 0.583409 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAAAAAATGCTGTAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.435.40 chr1 - 1082 5 novel_in_catalog RSRP1 novel 3034 6 NA NA 0 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAAAAAAAAATGCTGTAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.435.44 chr1 - 1165 2 novel_in_catalog RSRP1 novel 970 2 NA NA -10 186 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCTGACCTTTCCG 134 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.436.1 chr1 + 906 7 full-splice_match TMEM50A ENST00000374358.5 2266 7 -34 1394 -17 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 805 192.790359 2.285085 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAATAAAAAGAAATTACA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 805 NA PB.436.2 chr1 + 1031 9 novel_not_in_catalog TMEM50A novel 2266 7 NA NA -9 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 TAAAAATAAAAAGAAATTAC -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.436.3 chr1 + 2285 7 full-splice_match TMEM50A ENST00000374358.5 2266 7 -22 3 -5 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 174 41.671455 1.619839 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAGTTTTTAGTCTTTAATT -10 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 174 NA PB.436.4 chr1 + 1441 7 full-splice_match TMEM50A ENST00000374358.5 2266 7 -22 847 -5 235 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATCTGTGTACTGAACCACTA -10 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 3 NA PB.436.5 chr1 + 1184 7 novel_not_in_catalog TMEM50A novel 2266 7 NA NA -5 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAGTTTTTAGTCTTTAATT -10 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.436.6 chr1 + 2171 6 full-splice_match TMEM50A ENST00000498135.5 776 6 -3 -1392 -3 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.634403 0.420682 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGTTTTTAGTCTTTAATTT -8 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 11 NA PB.436.8 chr1 + 1061 7 full-splice_match TMEM50A ENST00000374358.5 2266 7 -20 1225 -3 -129 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 70 16.764380 1.224388 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATATTCCGTGGTCAAAA -8 TRUE NA NA TATAAA -16 NA NA NA 70 NA PB.436.9 chr1 + 2187 6 full-splice_match TMEM50A ENST00000480937.5 1102 6 -5 -1080 1 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGTTTTTAGTCTTTAATTT -4 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 5 NA PB.436.12 chr1 + 944 6 full-splice_match TMEM50A ENST00000498135.5 776 6 1 -169 1 -129 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAATATTCCGTGGTCAAAA -4 TRUE NA NA TATAAA -16 NA NA NA 7 NA PB.436.13 chr1 + 795 6 full-splice_match TMEM50A ENST00000480937.5 1102 6 -5 312 1 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.113385 0.493233 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAATAAAAAGAAATTACA -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.436.14 chr1 + 775 6 full-splice_match TMEM50A ENST00000498135.5 776 6 1 0 1 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 20 4.789823 0.680319 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAATAAAAAGAAATTACA -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 20 NA PB.436.15 chr1 + 845 7 full-splice_match TMEM50A ENST00000374358.5 2266 7 27 1394 27 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 104 24.907078 1.396323 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAATAAAAAGAAATTACA 39 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 104 NA PB.436.16 chr1 + 1127 7 novel_in_catalog TMEM50A novel 799 6 NA NA -20 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.310840 0.634562 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAATAAAAAGAAATTACA 60 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.436.17 chr1 + 2488 7 novel_in_catalog TMEM50A novel 799 6 NA NA 10 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAGTTTTTAGTCTTTAATT 90 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 6 NA PB.436.18 chr1 + 2090 6 incomplete-splice_match TMEM50A ENST00000374358.5 2266 7 2191 2 2065 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGTTTTTAGTCTTTAATTT 2145 FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.436.19 chr1 + 689 6 incomplete-splice_match TMEM50A ENST00000374358.5 2266 7 2200 1394 -2058 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAATAAAAAGAAATTACA 2154 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.436.20 chr1 + 1902 4 incomplete-splice_match TMEM50A ENST00000374358.5 2266 7 13311 3 9053 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAGTTTTTAGTCTTTAATT NA FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 9 NA PB.437.1 chr1 + 3990 11 full-splice_match MACO1 ENST00000374343.5 3940 11 -55 5 -16 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAAACTAGTTTTCTGCCTT 504 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.437.2 chr1 + 2501 11 full-splice_match MACO1 ENST00000374343.5 3940 11 -44 1483 -5 -504 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.873893 0.458471 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAAGTAGCCAACTTTGCCTT 515 FALSE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 12 NA PB.437.4 chr1 + 1114 6 incomplete-splice_match MACO1 ENST00000647928.1 2887 11 -90 40607 12 -160 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAGATTAAATAATGATCT 12 FALSE NA NA AATACA -35 NA NA NA 2 NA PB.437.7 chr1 + 1303 6 incomplete-splice_match MACO1 ENST00000647928.1 2887 11 -59 40387 4 60 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAACTGTATTCCTAATAAC -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.437.8 chr1 + 2353 11 full-splice_match MACO1 ENST00000374343.5 3940 11 108 1479 45 -500 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGCCAACTTTGCCTTTTAT -1 TRUE NA NA ATTAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.437.11 chr1 + 2248 11 full-splice_match MACO1 ENST00000374343.5 3940 11 209 1483 146 -504 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAAGTAGCCAACTTTGCCTT 74 FALSE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.437.13 chr1 + 1773 7 incomplete-splice_match MACO1 ENST00000374343.5 3940 11 25769 1479 7773 -500 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGCCAACTTTGCCTTTTAT NA FALSE NA NA ATTAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.437.16 chr1 + 1540 6 incomplete-splice_match MACO1 ENST00000374343.5 3940 11 27558 1482 9562 -503 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGTAGCCAACTTTGCCTTT NA FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.437.17 chr1 + 1406 6 incomplete-splice_match MACO1 ENST00000374343.5 3940 11 27692 1482 9696 -503 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGTAGCCAACTTTGCCTTT NA FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.437.18 chr1 + 1200 6 incomplete-splice_match MACO1 ENST00000374343.5 3940 11 27902 1478 9906 -499 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCCAACTTTGCCTTTTATG NA FALSE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 8 NA PB.437.19 chr1 + 991 5 incomplete-splice_match MACO1 ENST00000647928.1 2887 11 53271 499 35338 -499 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCCAACTTTGCCTTTTATG NA FALSE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.437.20 chr1 + 872 4 incomplete-splice_match MACO1 ENST00000647928.1 2887 11 54728 499 36795 -499 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCCAACTTTGCCTTTTATG NA FALSE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 3 NA PB.437.21 chr1 + 1151 2 intergenic novelGene_434 novel NA NA NA NA NA NA multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAACAAAAAAAAATTCCTG 2865 FALSE NA NA TATAAA -31 NA NA NA 2 NA PB.438.2 chr1 + 1351 9 fusion ENSG00000225643_LDLRAP1 novel 2914 9 NA NA -21 267 multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAATGTTAACAGGAAGTATT 0 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.438.3 chr1 + 2914 9 full-splice_match LDLRAP1 ENST00000374338.5 2914 9 -2 2 -2 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 71 17.003870 1.230548 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGCAACGCTCATCAGGTGG -31 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 71 NA PB.438.4 chr1 + 1025 6 incomplete-splice_match LDLRAP1 ENST00000374338.5 2914 9 0 5417 0 -3531 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTAGTCAGGTTCTC -29 TRUE NA NA AATACA -14 NA NA NA 2 NA PB.438.5 chr1 + 2861 9 full-splice_match LDLRAP1 ENST00000374338.5 2914 9 50 3 50 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.352876 0.525417 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CAAGCAACGCTCATCAGGTG 21 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 14 NA PB.438.6 chr1 + 2882 9 novel_in_catalog LDLRAP1 novel 4670 7 NA NA -76 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGCAACGCTCATCAGGTGG 1 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 6 NA PB.438.11 chr1 + 2191 3 incomplete-splice_match LDLRAP1 ENST00000484476.5 657 4 857 -1884 39 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGCAACGCTCATCAGGTGG 14 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 6 NA PB.440.1 chr1 + 1535 7 incomplete-splice_match MAN1C1 ENST00000374329.1 2461 11 49071 9 -13396 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AATAAGAAATATGATTGGGC NA FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.440.2 chr1 + 1240 4 incomplete-splice_match MAN1C1 ENST00000475314.5 893 5 564 -465 564 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AATAAGAAATATGATTGGGC 6718 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 4 NA PB.440.3 chr1 + 920 3 full-splice_match MAN1C1 ENST00000487493.1 1145 3 374 -149 374 -9 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AATAAGAAATATGATTGGGC 9653 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.441.1 chr1 + 4022 12 full-splice_match SELENON ENST00000374315.1 4212 12 188 2 150 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACTAGAGTGGTTCTAAGTG 176 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.441.2 chr1 + 3245 6 incomplete-splice_match SELENON ENST00000361547.7 4314 13 11280 2 11242 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACTAGAGTGGTTCTAAGTG 2818 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.441.3 chr1 + 3072 5 incomplete-splice_match SELENON ENST00000361547.7 4314 13 11608 2 11570 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACTAGAGTGGTTCTAAGTG 3146 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.441.4 chr1 + 2832 3 incomplete-splice_match SELENON ENST00000361547.7 4314 13 13743 2 13705 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACTAGAGTGGTTCTAAGTG 5281 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.442.1 chr1 - 1601 11 novel_in_catalog RHCE novel 1810 12 NA NA -1 -20 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAATTAAAGACTAAAAA -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.443.1 chr1 - 1359 4 full-splice_match AUNIP ENST00000538789.5 1392 4 35 -2 34 2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AATAATAGCTTGAGTACTTA -15 TRUE NA NA GGGGCT -2 NA NA NA 2 NA PB.443.2 chr1 - 2033 3 full-splice_match AUNIP ENST00000374298.4 2161 3 131 -3 131 3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CTTGTGATAATTGGTAATTA 2685 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.443.3 chr1 - 2118 3 full-splice_match AUNIP ENST00000374298.4 2161 3 43 0 43 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 31 7.424225 0.870651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GCTCTTGTGATAATTGGTAA -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 31 NA PB.443.4 chr1 - 1935 2 incomplete-splice_match AUNIP ENST00000374298.4 2161 3 21951 0 41 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GCTCTTGTGATAATTGGTAA 6086 FALSE NA NA ATTAAA -8 NA NA NA 4 NA PB.443.8 chr1 - 1296 3 full-splice_match AUNIP ENST00000374298.4 2161 3 43 822 43 -822 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 37 8.861172 0.947491 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAGACAGTGGGATTGGCAT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 37 NA PB.443.9 chr1 - 1164 2 incomplete-splice_match AUNIP ENST00000374298.4 2161 3 21900 822 -10 -822 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAGACAGTGGGATTGGCAT 6035 FALSE NA NA ATTAAA -9 NA NA NA 2 NA PB.444.1 chr1 - 1461 5 full-splice_match STMN1 ENST00000455785.7 1443 5 -20 2 -20 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 592 141.778748 2.151611 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AACTCCTGTGAAATGACTAA 7 TRUE NA NA GGGGCT -5 NA NA NA 592 NA PB.444.2 chr1 - 1186 3 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 1464 -623 149 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AACTCCTGTGAAATGACTAA 3341 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.444.6 chr1 - 1298 3 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 1351 -622 36 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 CAACTCCTGTGAAATGACTA 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.444.7 chr1 - 1381 4 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 416 -620 416 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGCAACTCCTGTGAAATGAC 2293 FALSE NA NA AAAACA -3 NA NA NA 8 NA PB.444.8 chr1 - 1058 2 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 3547 -620 2232 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.550332 0.658043 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGCAACTCCTGTGAAATGAC 5424 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.444.9 chr1 - 3395 4 full-splice_match STMN1 ENST00000465604.1 2947 4 -2 -446 0 -4 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAGCAACTCCTGTGAAATGA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.444.10 chr1 - 1487 5 novel_not_in_catalog STMN1 novel 1712 5 NA NA 137 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAGCAACTCCTGTGAAATGA -20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.444.12 chr1 - 1598 5 full-splice_match STMN1 ENST00000399728.5 1712 5 108 6 108 -6 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGTAGCAACTCCTGTGAAAT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.444.13 chr1 - 1296 5 full-splice_match STMN1 ENST00000455785.7 1443 5 0 147 0 -145 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 34 8.142698 0.910768 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AGAACAGTTGAGAGAGAATC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 34 NA PB.444.14 chr1 - 965 2 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 3495 -475 2180 -148 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 TAGAGAACAGTTGAGAGAGA -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.444.15 chr1 - 1100 5 full-splice_match STMN1 ENST00000455785.7 1443 5 0 343 0 109 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5112 1224.278687 3.087880 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACAAATGACCGCACGTTCTC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5112 NA PB.444.17 chr1 - 1300 5 novel_in_catalog STMN1 novel 1443 5 NA NA 6 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGTGGCAGTGACTTCTTTTG -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.444.18 chr1 - 1241 5 novel_not_in_catalog STMN1 novel 1712 5 NA NA 13 6 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTGACTTCTTTTGAGTTAG 865 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.444.19 chr1 - 1040 5 full-splice_match STMN1 ENST00000455785.7 1443 5 -45 448 2 4 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 449 107.531517 2.031536 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GCAGTGACTTCTTTTGAGTT 0 TRUE NA NA GGGGCT -30 NA NA NA 449 NA PB.444.20 chr1 - 775 3 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 1431 -179 116 6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 80 19.159290 1.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTGACTTCTTTTGAGTTAG 3308 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 80 NA PB.444.21 chr1 - 635 2 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 3529 -179 2214 6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 33 7.903207 0.897803 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTGACTTCTTTTGAGTTAG 5406 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 33 NA PB.444.23 chr1 - 1075 5 novel_not_in_catalog STMN1 novel 1712 5 NA NA 108 5 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.113385 0.493233 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAGTGACTTCTTTTGAGTTA -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.444.24 chr1 - 880 3 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 1325 -178 10 5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 58 13.890486 1.142717 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAGTGACTTCTTTTGAGTTA -22 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 58 NA PB.444.25 chr1 - 917 5 novel_not_in_catalog STMN1 novel 1443 5 NA NA 0 1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GTGGCAGTGACTTCTTTTGA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.444.26 chr1 - 1145 5 full-splice_match STMN1 ENST00000399728.5 1712 5 117 450 117 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.268805 0.721712 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GGTGGCAGTGACTTCTTTTG 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 22 NA PB.444.28 chr1 - 2948 4 full-splice_match STMN1 ENST00000465604.1 2947 4 -2 1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.592367 0.555381 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGGTGGCAGTGACTTCTTTT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.444.29 chr1 - 1358 2 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 2799 -172 1484 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGGTGGCAGTGACTTCTTTT 4676 FALSE NA NA AAGAAA -30 NA NA NA 2 NA PB.444.30 chr1 - 998 2 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 3159 -172 1844 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGGTGGCAGTGACTTCTTTT 5036 FALSE NA NA AATAAA -5 NA NA NA 3 NA PB.444.31 chr1 - 1913 2 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 2242 -170 927 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTTGGTGGCAGTGACTTCTT 4119 FALSE NA NA TTTAAA -31 NA NA NA 3 NA PB.444.32 chr1 - 801 2 incomplete-splice_match STMN1 ENST00000374291.5 867 5 3354 -170 2039 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTTGGTGGCAGTGACTTCTT 5231 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.444.33 chr1 - 860 5 full-splice_match STMN1 ENST00000455785.7 1443 5 0 583 0 42 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.550332 0.658043 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAGAGTATGTAGTGGCTT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.444.34 chr1 - 598 5 full-splice_match STMN1 ENST00000455785.7 1443 5 0 845 0 -220 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTGGCCAGTGTCATTTTAT 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.445.2 chr1 + 1290 7 full-splice_match MTFR1L ENST00000374307.9 1868 7 -74 652 0 -48 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAGAGAAGTTGTTTCTGG 3486 FALSE NA NA AATGAA -20 NA NA NA 3 NA PB.445.3 chr1 + 2175 8 novel_in_catalog MTFR1L novel 1953 7 NA NA 3 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCATTTGCTGTGTCCAT 3489 FALSE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.445.4 chr1 + 1862 6 novel_in_catalog MTFR1L novel 1953 7 NA NA 3 1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAATGCATTTGCTGTGTCCA 3489 FALSE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 5 NA PB.445.5 chr1 + 2472 6 novel_in_catalog MTFR1L novel 1953 7 NA NA -1 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTGCTGTGTCCATCTCTT -18 TRUE NA NA ATTAAA -24 NA NA NA 2 NA PB.445.6 chr1 + 1952 7 full-splice_match MTFR1L ENST00000374303.7 1953 7 -1 2 -1 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 171 40.952984 1.612285 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCATTTGCTGTGTCCAT -18 TRUE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 171 NA PB.445.7 chr1 + 1193 7 full-splice_match MTFR1L ENST00000474295.5 1873 7 24 656 -1 -48 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAGAGAAGTTGTTTCTGG -18 TRUE NA NA AATGAA -20 NA NA NA 3 NA PB.445.8 chr1 + 1910 7 full-splice_match MTFR1L ENST00000374307.9 1868 7 -44 2 4 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 20 4.789823 0.680319 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCATTTGCTGTGTCCAT -12 TRUE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 20 NA PB.445.9 chr1 + 1833 7 full-splice_match MTFR1L ENST00000474295.5 1873 7 34 6 8 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 38 9.100663 0.959073 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCATTTGCTGTGTCCAT -8 TRUE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 38 NA PB.445.10 chr1 + 1877 7 novel_not_in_catalog MTFR1L novel 1953 7 NA NA -8 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCATTTGCTGTGTCCAT -1 TRUE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.445.11 chr1 + 2018 8 novel_in_catalog MTFR1L novel 1953 7 NA NA 0 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTGCTGTGTCCATCTCTT 7 TRUE NA NA ATTAAA -24 NA NA NA 2 NA PB.445.12 chr1 + 1275 7 full-splice_match MTFR1L ENST00000374303.7 1953 7 26 652 -1 -48 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.071349 0.609738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAGAGAAGTTGTTTCTGG 9 TRUE NA NA AATGAA -20 NA NA NA 17 NA PB.445.13 chr1 + 2001 7 novel_in_catalog MTFR1L novel 2053 7 NA NA 12 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTGCTGTGTCCATCTCTT 570 FALSE NA NA ATTAAA -24 NA NA NA 2 NA PB.445.14 chr1 + 1960 7 novel_in_catalog MTFR1L novel 2053 7 NA NA 13 2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CATTTGCTGTGTCCATCTCT 0 TRUE NA NA ATTAAA -23 NA NA NA 2 NA PB.445.15 chr1 + 2013 7 full-splice_match MTFR1L ENST00000374300.7 2053 7 37 3 37 1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAATGCATTTGCTGTGTCCA 0 TRUE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.445.16 chr1 + 1721 6 full-splice_match MTFR1L ENST00000466284.1 3262 6 1546 -5 73 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTGCTGTGTCCATCTCTT 2204 FALSE NA NA ATTAAA -24 NA NA NA 3 NA PB.445.17 chr1 + 1738 5 incomplete-splice_match MTFR1L ENST00000374300.7 2053 7 2848 -3 680 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTGCTGTGTCCATCTCTT 2811 FALSE NA NA ATTAAA -24 NA NA NA 8 NA PB.445.18 chr1 + 1588 4 incomplete-splice_match MTFR1L ENST00000374300.7 2053 7 5546 2 742 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCATTTGCTGTGTCCAT 5509 FALSE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 5 NA PB.445.19 chr1 + 1371 3 full-splice_match MTFR1L ENST00000497956.1 2531 3 1167 -7 1167 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTGCTGTGTCCATCTCTT 5934 FALSE NA NA ATTAAA -24 NA NA NA 2 NA PB.445.20 chr1 + 1205 2 incomplete-splice_match MTFR1L ENST00000497956.1 2531 3 4010 -2 4010 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCATTTGCTGTGTCCAT 8777 FALSE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.445.21 chr1 + 1148 2 incomplete-splice_match MTFR1L ENST00000497956.1 2531 3 4067 -2 4067 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGCATTTGCTGTGTCCAT 8834 FALSE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 8 NA PB.446.7 chr1 - 2117 9 incomplete-splice_match PAFAH2 ENST00000374284.5 2523 11 8580 54 -5355 -54 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAGAAAAA 8669 FALSE NA NA ATTAAA -25 NA NA NA 2 NA PB.446.11 chr1 - 1805 11 full-splice_match PAFAH2 ENST00000374282.8 3487 11 -14 1696 -14 -693 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACATTTTCTATTTATTTCCA -7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.447.1 chr1 + 1810 6 incomplete-splice_match EXTL1 ENST00000374280.4 4020 11 9772 17 -583 -17 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ACGCTCCAGGCTATAAATAC 9029 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.448.1 chr1 + 4255 3 full-splice_match PDIK1L ENST00000619836.4 4252 3 -3 0 -3 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AACAAAAAAAAAACTGAAAA 4 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 4 NA PB.448.4 chr1 + 4084 3 full-splice_match PDIK1L ENST00000374269.2 4113 3 4 25 4 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 40 9.579645 0.981349 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AACAAAAAAAAAACTGAAAA -2 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 40 NA PB.448.5 chr1 + 4275 4 full-splice_match PDIK1L ENST00000374271.8 4279 4 -9 13 4 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AACAAAAAAAAAACTGAAAA -2 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 3 NA PB.448.6 chr1 + 2035 3 full-splice_match PDIK1L ENST00000374269.2 4113 3 5 2073 5 1358 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAACTTTGCTATGTGTGAA -1 TRUE NA NA TATAAA -26 NA NA NA 3 NA PB.448.7 chr1 + 1681 3 full-splice_match PDIK1L ENST00000374269.2 4113 3 16 2416 3 1015 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTCTGCCCCTCCCCCTAAT 10 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.448.8 chr1 + 3783 2 novel_not_in_catalog PDIK1L novel 4113 3 NA NA 9 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AACAAAAAAAAAACTGAAAA 16 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 3 NA PB.449.1 chr1 + 630 3 full-splice_match ZNF593 ENST00000374266.7 638 3 0 8 0 -8 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.831858 0.583409 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGAGAACTTGCCTCCAAC -21 TRUE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 16 NA PB.450.3 chr1 + 2523 21 full-splice_match CNKSR1 ENST00000361530.11 2535 21 7 5 -5 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAGAATGAGTCTACATGTAA -11 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 6 NA PB.450.4 chr1 + 2566 20 novel_in_catalog CNKSR1 novel 2535 21 NA NA -2 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TAAGAATGAGTCTACATGTA -2 TRUE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.451.1 chr1 + 3925 14 full-splice_match CEP85 ENST00000451429.8 3934 14 7 2 5 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 58 13.890486 1.142717 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTCCTCAGTTTTCCATACC -3 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 58 NA PB.451.2 chr1 + 3741 13 novel_in_catalog CEP85 novel 3934 14 NA NA 5 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCCTCAGTTTTCCATACCCT -3 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.451.3 chr1 + 1484 8 incomplete-splice_match CEP85 ENST00000252992.8 3935 14 12 10302 12 -3887 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.310840 0.634562 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AATAATTTGAAAAAGAAATG 4 TRUE NA NA GATAAA -7 NA NA NA 18 NA PB.451.4 chr1 + 4830 13 novel_in_catalog CEP85 novel 3934 14 NA NA 15 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCCTCAGTTTTCCATACCCT 7 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.451.5 chr1 + 3223 11 incomplete-splice_match CEP85 ENST00000451429.8 3934 14 21334 7 956 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAGACTCCTCAGTTTTCC 247 FALSE NA NA AATAAA -8 NA NA NA 2 NA PB.451.6 chr1 + 2810 10 full-splice_match CEP85 ENST00000453146.1 2821 10 14 -3 14 2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CTCAGTTTTCCATACCCTTC 2400 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.451.7 chr1 + 2584 8 incomplete-splice_match CEP85 ENST00000453146.1 2821 10 2006 -1 2006 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCCTCAGTTTTCCATACCCT 4392 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.451.9 chr1 + 2311 6 incomplete-splice_match CEP85 ENST00000469609.5 2384 7 167 1 167 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACTCCTCAGTTTTCCATACC 183 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 6 NA PB.451.10 chr1 + 2058 4 incomplete-splice_match CEP85 ENST00000469609.5 2384 7 2734 -1 559 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCCTCAGTTTTCCATACCCT 2750 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.451.11 chr1 + 1980 3 incomplete-splice_match CEP85 ENST00000469609.5 2384 7 5704 -1 3529 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.634403 0.420682 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCCTCAGTTTTCCATACCCT 5720 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 11 NA PB.451.12 chr1 + 1786 2 incomplete-splice_match CEP85 ENST00000453146.1 2821 10 18975 -1 5183 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCCTCAGTTTTCCATACCCT 109 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 5 NA PB.453.1 chr1 + 1726 3 full-splice_match SH3BGRL3 ENST00000270792.10 751 3 -978 3 -978 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GCACTGTGTCTGGTTGGTTG 2569 FALSE NA NA ATTAAA -19 NA NA NA 4 NA PB.453.2 chr1 + 1097 3 full-splice_match SH3BGRL3 ENST00000270792.10 751 3 -354 8 -354 -8 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CATTGGCACTGTGTCTGGTT 598 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.453.3 chr1 + 974 3 full-splice_match SH3BGRL3 ENST00000270792.10 751 3 -224 1 -224 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTGTGTCTGGTTGGTTGTG 100 FALSE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 4 NA PB.453.4 chr1 + 788 3 full-splice_match SH3BGRL3 ENST00000270792.10 751 3 -38 1 -38 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 891 213.386597 2.329167 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTGTGTCTGGTTGGTTGTG 286 FALSE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 891 NA PB.453.5 chr1 + 778 3 novel_not_in_catalog SH3BGRL3 novel 751 3 NA NA -38 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTGTGTCTGGTTGGTTGTG 286 FALSE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 3 NA PB.453.6 chr1 + 580 3 full-splice_match SH3BGRL3 ENST00000270792.10 751 3 -28 199 -28 -127 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CATTAGTCTCAGAAATTGTC 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.453.7 chr1 + 878 2 full-splice_match SH3BGRL3 ENST00000319041.6 768 2 -39 -71 -3 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 25 5.987278 0.777229 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTGTGTCTGGTTGGTTGTG 0 TRUE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 25 NA PB.453.8 chr1 + 766 3 novel_not_in_catalog SH3BGRL3 novel 751 3 NA NA 13 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTGTGTCTGGTTGGTTGTG 16 TRUE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.453.9 chr1 + 621 2 incomplete-splice_match SH3BGRL3 ENST00000270792.10 751 3 690 1 654 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ACTGTGTCTGGTTGGTTGTG 3 FALSE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 3 NA PB.454.4 chr1 - 1670 15 full-splice_match UBXN11 ENST00000374222.6 1660 15 -12 2 -3 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AACCCGCTGCTCCGCCAGGC -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.454.17 chr1 - 1114 4 novel_in_catalog UBXN11 novel 2325 10 NA NA 13235 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AACCCGCTGCTCCGCCAGGC 97 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.455.1 chr1 + 466 2 full-splice_match CD52 ENST00000374213.3 467 2 0 1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 AGTGGGGTCCTGCTTGTGGT 0 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.456.2 chr1 + 3385 5 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3458 5 NA NA -42 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCAAACTGTCATCCCCTTGT 5 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 7 NA PB.456.3 chr1 + 2424 4 full-splice_match LIN28A ENST00000326279.11 3975 4 -39 1590 -39 -1581 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TCTCCGTGTTCTTTGGGGGT -1 TRUE NA NA AATATA -14 NA NA NA 2 NA PB.456.5 chr1 + 1103 4 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3458 5 NA NA -18 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACTGTCATCCCCTTGTCA 9 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.456.8 chr1 + 3396 5 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3458 5 NA NA 1 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACTGTCATCCCCTTGTCA 1 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.456.9 chr1 + 3342 5 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 11 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATCCCCTTGTCAGATGTTTT 11 TRUE NA NA AATAAA -28 NA NA NA 2 NA PB.456.11 chr1 + 3286 4 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3458 5 NA NA 582 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACTGTCATCCCCTTGTCA 554 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.456.14 chr1 + 1087 2 incomplete-splice_match LIN28A ENST00000254231.4 3458 5 14537 2525 14537 -2525 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATTTTTGTATATTTTAATCT NA FALSE NA NA TATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.456.18 chr1 + 2567 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 15783 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATCCCCTTGTCAGATGTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -28 NA NA NA 4 NA PB.456.19 chr1 + 2482 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3458 5 NA NA 15860 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACTGTCATCCCCTTGTCA NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.456.21 chr1 + 2345 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 15936 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAAACTGTCATCCCCTTGTC 60 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 4 NA PB.456.23 chr1 + 2349 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 16001 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATCCCCTTGTCAGATGTTTT 125 FALSE NA NA AATAAA -28 NA NA NA 4 NA PB.456.25 chr1 + 2072 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3458 5 NA NA 16270 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACTGTCATCCCCTTGTCA 79 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.456.28 chr1 + 1956 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3458 5 NA NA 16326 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACTGTCATCCCCTTGTCA 135 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.456.30 chr1 + 1905 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3458 5 NA NA 16447 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAAACTGTCATCCCCTTGTC 256 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.456.33 chr1 + 1587 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3458 5 NA NA 16755 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACTGTCATCCCCTTGTCA 564 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.456.34 chr1 + 1507 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3458 5 NA NA 16775 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACTGTCATCCCCTTGTCA 584 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.456.37 chr1 + 1394 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3458 5 NA NA 16948 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACTGTCATCCCCTTGTCA 757 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 5 NA PB.456.38 chr1 + 1327 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 16953 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GCAAACTGTCATCCCCTTGT 762 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.456.41 chr1 + 1260 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3458 5 NA NA 17082 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACTGTCATCCCCTTGTCA 46 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.456.42 chr1 + 1207 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 17083 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATCCCCTTGTCAGATGTTTT 47 FALSE NA NA AATAAA -28 NA NA NA 4 NA PB.456.47 chr1 + 1117 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3458 5 NA NA 17225 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACTGTCATCCCCTTGTCA 118 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.456.49 chr1 + 1068 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 17281 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATCCCCTTGTCAGATGTTT 23 FALSE NA NA AATAAA -27 NA NA NA 3 NA PB.456.51 chr1 + 943 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 17338 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAAACTGTCATCCCCTTGTC 80 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 4 NA PB.456.57 chr1 + 722 2 novel_not_in_catalog LIN28A novel 3975 4 NA NA 17567 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATCCCCTTGTCAGATGTTT 309 FALSE NA NA AATAAA -27 NA NA NA 2 NA PB.457.1 chr1 - 1146 8 incomplete-splice_match CRYBG2 ENST00000308182.10 5239 20 17671 -6 -76 6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCTCTGTGCACCTTGATATT -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.457.2 chr1 - 1015 7 novel_in_catalog CRYBG2 novel 5239 20 NA NA -65 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.634403 0.420682 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACCCTTGTCTCTGTGCACCT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.459.1 chr1 + 3201 8 full-splice_match DHDDS ENST00000525682.6 1235 8 -18 -1948 0 15 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 CAACGGAAGAACACCTTCTT -7 TRUE NA NA AATAGA -42 NA NA NA 2 NA PB.459.2 chr1 + 839 2 full-splice_match DHDDS ENST00000527611.1 297 2 0 -542 0 542 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG -5 TRUE NA NA AAAAAG -24 NA NA NA 2 NA PB.459.3 chr1 + 3281 9 full-splice_match DHDDS ENST00000236342.12 3288 9 3 4 1 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 23 5.508296 0.741017 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAACTTGTTTGCTAACTGC -4 TRUE NA NA AATAGA -23 NA NA NA 23 NA PB.459.4 chr1 + 1349 9 full-splice_match DHDDS ENST00000236342.12 3288 9 5 1934 3 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AATAGGGTTTGGAGAGCAAA -2 TRUE NA NA ACTAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.459.5 chr1 + 1620 6 full-splice_match DHDDS ENST00000374185.7 1148 6 -3 -469 0 80 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAAATAACCCAGGAGATG 11 TRUE NA NA AGTAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.459.6 chr1 + 1188 9 full-splice_match DHDDS ENST00000236342.12 3288 9 18 2082 0 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.831858 0.583409 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGAATGGTGTTCCCTTTG 11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.459.7 chr1 + 1078 8 novel_in_catalog DHDDS novel 3245 9 NA NA 5 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGAATGGTGTTCCCTTTG 22 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.459.9 chr1 + 3265 9 novel_in_catalog DHDDS novel 3288 9 NA NA 4 4 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATGTAAAACTTGTTTGCTAA -9 TRUE NA NA AATAGA -19 NA NA NA 6 NA PB.459.10 chr1 + 3243 9 novel_in_catalog DHDDS novel 3288 9 NA NA 4 2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGATGTAAAACTTGTTTGCT -9 TRUE NA NA AATAGA -17 NA NA NA 3 NA PB.459.11 chr1 + 1353 9 novel_in_catalog DHDDS novel 3288 9 NA NA 4 57 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGATACCTTTGGGCTGCCTG -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.459.12 chr1 + 1191 9 novel_in_catalog DHDDS novel 3288 9 NA NA 4 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATGAATGGTGTTCCCTTTG -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.459.13 chr1 + 1190 2 incomplete-splice_match DHDDS ENST00000531955.5 559 3 -351 4166 4 -11 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAGAAAAAAAAAATGACATT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.459.14 chr1 + 3737 8 incomplete-splice_match DHDDS ENST00000360009.6 3245 9 24 -2 -7 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGATGTAAAACTTGTTTGCT -5 TRUE NA NA AATAGA -17 NA NA NA 2 NA PB.459.15 chr1 + 3364 9 novel_in_catalog DHDDS novel 703 6 NA NA -4 -5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAAACTTGTTTGCTAACTG -2 TRUE NA NA AATAGA -22 NA NA NA 2 NA PB.459.17 chr1 + 3045 7 incomplete-splice_match DHDDS ENST00000236342.12 3288 9 5911 5 -4604 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAAACTTGTTTGCTAACTG 5424 FALSE NA NA AATAGA -22 NA NA NA 2 NA PB.461.1 chr1 + 1019 6 full-splice_match HMGN2 ENST00000361427.6 1940 6 -25 946 -25 70 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CACTTCCTGAAAGTCAGGGT -17 TRUE NA NA GATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.461.2 chr1 + 1292 6 full-splice_match HMGN2 ENST00000361427.6 1940 6 -24 672 -24 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 10499 2514.417480 3.400437 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT -16 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 10499 NA PB.461.4 chr1 + 1235 6 full-splice_match HMGN2 ENST00000361427.6 1940 6 31 674 -6 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 278 66.578537 1.823334 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GGAATGCTGCCTCTGATCTT -14 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 278 NA PB.461.5 chr1 + 1155 6 novel_not_in_catalog HMGN2 novel 1148 7 NA NA -7 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 14 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 5 NA PB.461.8 chr1 + 3028 2 full-splice_match HMGN2 ENST00000493418.1 1496 2 -923 -609 0 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATGCTGCCTCTGATCTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 6 NA PB.461.9 chr1 + 2584 3 novel_in_catalog HMGN2 novel 1148 7 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.831858 0.583409 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 16 NA PB.461.10 chr1 + 2174 3 incomplete-splice_match HMGN2 ENST00000479815.5 1030 4 43 -742 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 8 NA PB.461.11 chr1 + 2055 5 full-splice_match HMGN2 ENST00000466194.1 952 5 -700 -403 0 -2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GGAATGCTGCCTCTGATCTT 0 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.461.12 chr1 + 1872 6 full-splice_match HMGN2 ENST00000361427.6 1940 6 66 2 0 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 38 9.100663 0.959073 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTGCTTTGTCCATTCCCT 0 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 38 NA PB.461.13 chr1 + 1723 4 full-splice_match HMGN2 ENST00000479815.5 1030 4 43 -736 0 -6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.310840 0.634562 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GCTTGGAATGCTGCCTCTGA 0 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 18 NA PB.461.14 chr1 + 1554 5 full-splice_match HMGN2 ENST00000460563.5 1045 5 29 -538 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 24 5.747787 0.759501 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 24 NA PB.461.15 chr1 + 1377 5 full-splice_match HMGN2 ENST00000464888.5 565 5 0 -812 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 8 NA PB.461.16 chr1 + 1224 6 novel_not_in_catalog HMGN2 novel 1940 6 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATGCTGCCTCTGATCTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.461.17 chr1 + 1208 6 novel_not_in_catalog HMGN2 novel 1148 7 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.634403 0.420682 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 11 NA PB.461.18 chr1 + 1189 6 novel_not_in_catalog HMGN2 novel 1940 6 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 20 4.789823 0.680319 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATGCTGCCTCTGATCTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 20 NA PB.461.19 chr1 + 1172 5 novel_in_catalog HMGN2 novel 1148 7 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 8 NA PB.461.20 chr1 + 1157 5 novel_in_catalog HMGN2 novel 1148 7 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 0 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 3 NA PB.461.21 chr1 + 1131 6 novel_not_in_catalog HMGN2 novel 1940 6 NA NA 0 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GGAATGCTGCCTCTGATCTT 0 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.461.22 chr1 + 499 6 full-splice_match HMGN2 ENST00000361427.6 1940 6 75 1366 0 48 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AGCACACAGAACACTTCATT 9 FALSE NA NA TTTAAA -13 NA NA NA 7 NA PB.461.23 chr1 + 1285 6 full-splice_match HMGN2 ENST00000467700.5 932 6 -9 -344 2 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 27 6.466260 0.810653 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 2 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 27 NA PB.461.24 chr1 + 1995 4 incomplete-splice_match HMGN2 ENST00000460563.5 1045 5 33 -538 -1 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 4 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.461.26 chr1 + 1256 6 full-splice_match HMGN2 ENST00000463817.5 853 6 -1 -402 -1 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.113385 0.493233 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 4 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 13 NA PB.461.27 chr1 + 2400 4 novel_in_catalog HMGN2 novel 1148 7 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 9 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 4 NA PB.461.28 chr1 + 1160 6 full-splice_match HMGN2 ENST00000361427.6 1940 6 108 672 31 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 44 10.537610 1.022742 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT -31 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 44 NA PB.461.29 chr1 + 1908 3 incomplete-splice_match HMGN2 ENST00000479815.5 1030 4 719 -742 -24 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 504 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.461.30 chr1 + 1609 3 incomplete-splice_match HMGN2 ENST00000479815.5 1030 4 1012 -736 46 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GCTTGGAATGCTGCCTCTGA 252 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 4 NA PB.461.31 chr1 + 1082 5 full-splice_match HMGN2 ENST00000466194.1 952 5 275 -405 52 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 182 43.587387 1.639361 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 258 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 182 NA PB.461.32 chr1 + 1411 4 incomplete-splice_match HMGN2 ENST00000460563.5 1045 5 1027 -538 75 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 281 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.461.33 chr1 + 1287 3 incomplete-splice_match HMGN2 ENST00000466194.1 952 5 596 -404 373 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATGCTGCCTCTGATCTTT 579 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.461.34 chr1 + 1189 3 incomplete-splice_match HMGN2 ENST00000466194.1 952 5 689 -399 466 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GCTTGGAATGCTGCCTCTGA 672 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.461.35 chr1 + 1066 3 incomplete-splice_match HMGN2 ENST00000466194.1 952 5 818 -405 595 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 801 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 3 NA PB.461.36 chr1 + 1004 3 incomplete-splice_match HMGN2 ENST00000466194.1 952 5 879 -404 656 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 361 86.456299 1.936797 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATGCTGCCTCTGATCTTT 862 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 361 NA PB.461.38 chr1 + 1626 2 incomplete-splice_match HMGN2 ENST00000361427.6 1940 6 2130 2 1141 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTGCTTTGTCCATTCCCT 1347 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.461.39 chr1 + 952 2 incomplete-splice_match HMGN2 ENST00000466194.1 952 5 1368 -405 1145 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATGCTGCCTCTGATCTTTT 1351 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 4 NA PB.464.1 chr1 + 3130 22 full-splice_match RPS6KA1 ENST00000374168.7 3192 22 59 3 42 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAAGCACGCTCTCCTGCACT 46 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 7 NA PB.464.2 chr1 + 3038 21 full-splice_match RPS6KA1 ENST00000530003.5 3023 21 0 -15 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCTCTCCTGCACTCTTCATC -15 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.464.3 chr1 + 3113 21 full-splice_match RPS6KA1 ENST00000531382.5 2359 21 -7 -747 0 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCACGCTCTCCTGCACTC -8 TRUE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 10 NA PB.464.4 chr1 + 2923 20 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000531382.5 2359 21 1014 -747 -34 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCACGCTCTCCTGCACTC 1013 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 5 NA PB.464.5 chr1 + 2661 18 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000531382.5 2359 21 5607 -747 13 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCACGCTCTCCTGCACTC 5606 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 5 NA PB.464.6 chr1 + 2439 15 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000374163.5 3202 22 8388 7 -969 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCACGCTCTCCTGCACTC 26 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 4 NA PB.464.7 chr1 + 2301 14 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000374163.5 3202 22 8870 7 -487 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCACGCTCTCCTGCACTC 508 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 4 NA PB.464.8 chr1 + 2049 10 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000374163.5 3202 22 11156 7 -45 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCACGCTCTCCTGCACTC 2794 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 8 NA PB.464.9 chr1 + 1815 8 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000374163.5 3202 22 14884 7 3683 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCACGCTCTCCTGCACTC 6522 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 10 NA PB.464.10 chr1 + 1689 7 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000374163.5 3202 22 15203 7 4002 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCACGCTCTCCTGCACTC 6841 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 9 NA PB.464.11 chr1 + 1533 6 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000374163.5 3202 22 15729 7 4528 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCACGCTCTCCTGCACTC 7367 FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 8 NA PB.464.12 chr1 + 1396 5 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000374163.5 3202 22 25651 7 264 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCACGCTCTCCTGCACTC NA FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 8 NA PB.464.13 chr1 + 1181 3 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000438977.1 639 4 -74 -289 -74 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.634403 0.420682 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGCACGCTCTCCTGCACTC NA FALSE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 11 NA PB.464.14 chr1 + 1001 2 incomplete-splice_match RPS6KA1 ENST00000438977.1 639 4 1035 -288 1035 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAAGCACGCTCTCCTGCACT NA FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.465.1 chr1 - 1027 1 full-splice_match ENSG00000260063 ENST00000569378.1 2000 1 1168 -195 1168 195 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAATAAAAAATAAAATAAGT 5221 FALSE NA NA GATAAA -25 NA NA NA 2 NA PB.474.1 chr1 + 4558 13 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000374152.7 6460 19 34344 -402 -1009 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.474.2 chr1 + 4489 12 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000374152.7 6460 19 37348 -402 -10 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.474.3 chr1 + 4428 12 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000374152.7 6460 19 37409 -402 51 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.474.4 chr1 + 4212 10 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000636219.1 7058 19 38190 944 -1327 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.474.5 chr1 + 4085 10 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000374152.7 6460 19 39066 -403 -1196 15 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAATA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.474.7 chr1 + 3909 9 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000636219.1 7058 19 41612 944 -1694 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 19 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.474.8 chr1 + 3845 8 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000636219.1 7058 19 42849 944 -457 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 1256 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.474.9 chr1 + 3564 7 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000636219.1 7058 19 43312 944 2 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 1719 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.474.10 chr1 + 3378 5 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000636219.1 7058 19 43939 944 629 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.634403 0.420682 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 2346 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.474.11 chr1 + 3161 3 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000636219.1 7058 19 44670 944 -543 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 3077 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.474.12 chr1 + 2906 3 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000636219.1 7058 19 44926 943 -287 15 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAATA 3333 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.474.13 chr1 + 2668 3 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000636219.1 7058 19 45163 944 -50 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 20 4.789823 0.680319 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 3570 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 20 NA PB.474.14 chr1 + 2428 3 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000636219.1 7058 19 45403 944 190 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 3810 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.474.15 chr1 + 2323 3 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000636219.1 7058 19 45509 943 296 15 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAATA 3916 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.474.16 chr1 + 2164 2 incomplete-splice_match ARID1A ENST00000466382.2 2699 6 2716 22 810 14 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 4430 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.474.17 chr1 + 3186 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 -126 -14 -126 14 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 6723 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.474.18 chr1 + 2260 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 800 -14 800 14 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 7649 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.474.19 chr1 + 2052 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 1008 -14 1008 14 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 7857 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.474.20 chr1 + 1937 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 1124 -15 1124 15 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAATA 7973 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.474.21 chr1 + 1816 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 1244 -14 1244 14 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 11 2.634403 0.420682 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 8093 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.474.22 chr1 + 1720 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 1341 -15 1341 15 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAATA 8190 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.474.23 chr1 + 1560 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 1500 -14 1500 14 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 22 5.268805 0.721712 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 8349 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 22 NA PB.474.24 chr1 + 1411 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 1649 -14 1649 14 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 8498 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.474.25 chr1 + 1300 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 1760 -14 1760 14 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 8609 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.474.26 chr1 + 1122 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 1938 -14 1938 14 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 26 6.226769 0.794263 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 8787 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 26 NA PB.474.27 chr1 + 942 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 2118 -14 2118 14 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 8967 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.474.28 chr1 + 779 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 2281 -14 2281 14 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 9130 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.474.29 chr1 + 673 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 2387 -14 2387 14 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 9236 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.474.30 chr1 + 1473 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 2528 -955 2528 -3 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GGTAAGACTTTTGTGAAGCT 9377 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.474.31 chr1 + 1215 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 2788 -957 2788 -1 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAGACTTTTGTGAAGCTTT 9637 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.474.33 chr1 + 984 1 full-splice_match ARID1A ENST00000637788.1 3046 1 3018 -956 3018 -2 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 29 6.945243 0.841687 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GTAAGACTTTTGTGAAGCTT 9867 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 29 NA PB.476.1 chr1 + 1079 4 novel_not_in_catalog PIGV novel 4377 4 NA NA -5 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATGCGACATTGTTTCTGA -39 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.476.2 chr1 + 1654 4 full-splice_match PIGV ENST00000674222.1 4377 4 -17 2740 0 112 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTCTGCTGCCCTGGGATCAT -28 TRUE NA NA AGTAAA -19 NA NA NA 5 NA PB.476.3 chr1 + 2406 4 full-splice_match PIGV ENST00000688522.1 2396 4 2 -12 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 28 6.705751 0.826447 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TACATGCAATGAATTGCCTT -26 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 28 NA PB.476.4 chr1 + 2122 4 full-splice_match PIGV ENST00000674222.1 4377 4 -11 2266 -2 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 46 11.016592 1.042047 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATACATGCAATGAATTGCCT -22 TRUE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 46 NA PB.476.5 chr1 + 1281 3 incomplete-splice_match PIGV ENST00000687468.1 2247 4 0 3314 0 -743 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGGATGTCTACTGGAATGTT -11 TRUE NA NA AATATA -12 NA NA NA 2 NA PB.476.6 chr1 + 2073 4 full-splice_match PIGV ENST00000688522.1 2396 4 241 82 -4 -2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GACATTGTTTCTGATGTTTT -3 TRUE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 3 NA PB.476.7 chr1 + 2615 4 full-splice_match PIGV ENST00000674273.1 4972 4 5 2352 5 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GACATTGTTTCTGATGTTTT 6 TRUE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 2 NA PB.476.8 chr1 + 2284 4 full-splice_match PIGV ENST00000374145.6 2181 4 30 -133 12 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AATGAATTGCCTTTTTAAAA 13 TRUE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.476.9 chr1 + 1878 2 incomplete-splice_match PIGV ENST00000674317.1 2245 4 4881 -93 4881 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACATGCAATGAATTGCCTTT 5996 FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.476.10 chr1 + 1533 2 incomplete-splice_match PIGV ENST00000674317.1 2245 4 5225 -92 5225 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TACATGCAATGAATTGCCTT 6340 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.476.11 chr1 + 1380 2 incomplete-splice_match PIGV ENST00000674317.1 2245 4 5278 8 5278 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAATGCGACATTGTTTCTGA 6393 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 5 NA PB.476.12 chr1 + 804 2 incomplete-splice_match PIGV ENST00000674317.1 2245 4 5859 3 5859 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CGACATTGTTTCTGATGTTT 6974 FALSE NA NA AATAAA -23 NA NA NA 3 NA PB.477.1 chr1 + 2900 8 full-splice_match ZDHHC18 ENST00000374142.9 5045 8 254 1891 254 1750 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGAGTTGCTTTGCTTTGGT 0 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 4 NA PB.477.2 chr1 + 2700 7 incomplete-splice_match ZDHHC18 ENST00000374141.6 1002 8 445 -1750 429 1750 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGAGTTGCTTTGCTTTGGT 398 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.477.3 chr1 + 2542 6 incomplete-splice_match ZDHHC18 ENST00000374141.6 1002 8 16603 -1750 -1755 1750 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGAGTTGCTTTGCTTTGGT NA FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 5 NA PB.477.4 chr1 + 2351 5 incomplete-splice_match ZDHHC18 ENST00000488397.3 1275 7 -21 1889 -21 1750 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGAGTTGCTTTGCTTTGGT NA FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 4 NA PB.479.2 chr1 - 747 2 novel_not_in_catalog GPN2 novel 4665 5 NA NA 9 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATATTTTGTGTATTCTCTTT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.479.5 chr1 - 1428 5 full-splice_match GPN2 ENST00000374135.9 4665 5 -13 3250 -13 -6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 162 38.797562 1.588804 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTTTTTGTGACTTCCAAAC -19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 162 NA PB.479.6 chr1 - 918 5 full-splice_match GPN2 ENST00000374135.9 4665 5 497 3250 474 -6 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTTTTTGTGACTTCCAAAC 540 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.479.7 chr1 - 1470 5 novel_not_in_catalog GPN2 novel 4665 5 NA NA -31 -7 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TACTTTTTGTGACTTCCAAA 9747 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.479.8 chr1 - 1243 5 full-splice_match GPN2 ENST00000374135.9 4665 5 171 3251 148 -7 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TACTTTTTGTGACTTCCAAA 9949 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.480.1 chr1 + 1308 1 full-splice_match SFN ENST00000339276.6 1308 1 0 0 0 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 321 76.876656 1.885795 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTCCTGTCTCTCTTCCAGTT 0 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 321 NA PB.480.3 chr1 + 1092 1 full-splice_match SFN ENST00000339276.6 1308 1 216 0 216 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 15 3.592367 0.555381 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTCCTGTCTCTCTTCCAGTT 216 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 15 NA PB.480.4 chr1 + 905 1 full-splice_match SFN ENST00000339276.6 1308 1 403 0 403 0 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTCCTGTCTCTCTTCCAGTT 403 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 7 NA PB.481.1 chr1 - 1964 7 novel_not_in_catalog GPATCH3 novel 2125 7 NA NA 30 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTCCCTTACTTTTCTAAT 19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.481.2 chr1 - 1762 7 full-splice_match GPATCH3 ENST00000361720.10 2125 7 362 1 362 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTCCCTTACTTTTCTAAT 351 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.481.3 chr1 - 1050 4 incomplete-splice_match GPATCH3 ENST00000361720.10 2125 7 7017 1 -2 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTCCCTTACTTTTCTAAT 7006 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.481.4 chr1 - 769 2 novel_not_in_catalog GPATCH3 novel 2125 7 NA NA 0 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCTCCCTTACTTTTCTAAT -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.481.5 chr1 - 2117 7 full-splice_match GPATCH3 ENST00000361720.10 2125 7 6 2 6 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 62 14.848450 1.171681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAGCTCCCTTACTTTTCTAA -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 62 NA PB.481.6 chr1 - 1216 5 incomplete-splice_match GPATCH3 ENST00000361720.10 2125 7 6063 2 -956 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAGCTCCCTTACTTTTCTAA 6052 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.481.7 chr1 - 1512 6 incomplete-splice_match GPATCH3 ENST00000361720.10 2125 7 2876 3 2876 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GGAGCTCCCTTACTTTTCTA 2865 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.482.3 chr1 + 1960 10 novel_not_in_catalog NUDC novel 1792 9 NA NA -21 -24 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAATAAATAAATAAAA -33 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.482.4 chr1 + 1338 9 full-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 -21 475 -21 212 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2622 627.945740 2.797922 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CCTTCTGTGTCCTCTCTTGC -33 TRUE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 2622 NA PB.482.5 chr1 + 1442 10 novel_not_in_catalog NUDC novel 1792 9 NA NA -19 213 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTCTGTGTCCTCTCTTGCC -31 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.482.7 chr1 + 1414 8 novel_in_catalog NUDC novel 1792 9 NA NA -3 212 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CCTTCTGTGTCCTCTCTTGC -15 TRUE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 4 NA PB.482.9 chr1 + 1801 9 full-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 2 -11 2 11 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 114 27.301989 1.436194 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATGTATGTTTCTGAGCAAAG -10 TRUE NA NA AATAAA -25 NA NA NA 114 NA PB.482.10 chr1 + 1410 8 novel_in_catalog NUDC novel 1792 9 NA NA 0 213 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTCTGTGTCCTCTCTTGCC -12 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.482.11 chr1 + 1310 9 novel_not_in_catalog NUDC novel 1792 9 NA NA 0 211 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TCCTTCTGTGTCCTCTCTTG -12 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.482.13 chr1 + 1487 10 novel_not_in_catalog NUDC novel 1792 9 NA NA 2 213 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 55 13.172012 1.119652 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTCTGTGTCCTCTCTTGCC -10 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 55 NA PB.482.14 chr1 + 1338 9 novel_not_in_catalog NUDC novel 1792 9 NA NA 2 211 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TCCTTCTGTGTCCTCTCTTG -10 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.482.15 chr1 + 1004 7 novel_in_catalog NUDC novel 1792 9 NA NA 2 213 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 20 4.789823 0.680319 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTCTGTGTCCTCTCTTGCC -10 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 20 NA PB.482.17 chr1 + 1891 8 novel_in_catalog NUDC novel 1792 9 NA NA 3 10 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TATGTATGTTTCTGAGCAAA -9 TRUE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 2 NA PB.482.18 chr1 + 1492 9 full-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 5 295 5 -295 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.352876 0.525417 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGTGATGGTTCATGTCTGTA -7 TRUE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 14 NA PB.482.19 chr1 + 1041 7 novel_in_catalog NUDC novel 1792 9 NA NA 5 211 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TCCTTCTGTGTCCTCTCTTG -7 TRUE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.482.21 chr1 + 1543 9 novel_in_catalog NUDC novel 816 5 NA NA -62 212 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CCTTCTGTGTCCTCTCTTGC 269 FALSE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.482.22 chr1 + 1123 8 incomplete-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 2354 474 1955 213 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 50 11.974557 1.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTCTGTGTCCTCTCTTGCC 2286 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 50 NA PB.482.23 chr1 + 1418 7 incomplete-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 19799 24 -3593 -24 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAATAAATAAATAAAA 5333 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.482.24 chr1 + 955 7 incomplete-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 19812 474 -3580 213 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 47 11.256083 1.051387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CTTCTGTGTCCTCTCTTGCC 5346 FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 47 NA PB.482.25 chr1 + 1239 5 incomplete-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 20911 24 -2481 -24 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAATAAATAAATAAAA 6445 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.482.26 chr1 + 784 5 incomplete-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 20914 476 -2478 211 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.592367 0.555381 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TCCTTCTGTGTCCTCTCTTG 6448 FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 15 NA PB.482.27 chr1 + 660 4 incomplete-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 21132 476 -2260 211 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TCCTTCTGTGTCCTCTCTTG 6666 FALSE NA NA ATTAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.482.28 chr1 + 550 4 incomplete-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 21243 475 -2149 212 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 CCTTCTGTGTCCTCTCTTGC 6777 FALSE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.482.29 chr1 + 965 4 incomplete-splice_match NUDC ENST00000321265.10 1792 9 21279 24 -2113 -24 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAATAAATAAATAAAA 6813 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.483.1 chr1 - 1302 3 novel_not_in_catalog NR0B2 novel 1165 2 NA NA -2 4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCCTGATACTGTCATTTGT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.483.2 chr1 - 1171 2 full-splice_match NR0B2 ENST00000254227.4 1165 2 -2 -4 -2 4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 224 53.646011 1.729537 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCCTGATACTGTCATTTGT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 224 NA PB.483.3 chr1 - 1477 2 novel_not_in_catalog NR0B2 novel 1165 2 NA NA 0 -6 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.268805 0.721712 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACACTTGGAGCCTGATAC -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 22 NA PB.485.2 chr1 - 1866 4 novel_not_in_catalog KDF1 novel 1855 4 NA NA 62 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAATTGGTATCTGCCTGCTT 38 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.485.3 chr1 - 1791 4 novel_not_in_catalog KDF1 novel 1855 4 NA NA -3 -8 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAGGTAATTGGTATCTGCC -27 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.485.4 chr1 - 1774 4 full-splice_match KDF1 ENST00000320567.6 1855 4 72 9 72 -9 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 39 9.340154 0.970354 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 CAAAGGTAATTGGTATCTGC 48 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 39 NA PB.486.5 chr1 - 2378 2 full-splice_match TENT5B ENST00000289166.6 2382 2 1 3 1 -3 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 22 5.268805 0.721712 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAACCTTAGTGCCATGCTTC 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 22 NA PB.488.1 chr1 + 4193 16 full-splice_match WDTC1 ENST00000319394.8 4706 16 118 395 82 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGGTGTGGCTGGTGGCATTT 12 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 6 NA PB.488.2 chr1 + 3713 12 incomplete-splice_match WDTC1 ENST00000319394.8 4706 16 48706 395 -4371 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGGTGTGGCTGGTGGCATTT NA FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.488.3 chr1 + 3518 11 incomplete-splice_match WDTC1 ENST00000319394.8 4706 16 53125 395 48 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGGTGTGGCTGGTGGCATTT NA FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.488.4 chr1 + 3122 8 incomplete-splice_match WDTC1 ENST00000319394.8 4706 16 59895 395 6818 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGGTGTGGCTGGTGGCATTT NA FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.488.5 chr1 + 2781 5 incomplete-splice_match WDTC1 ENST00000361771.7 4275 16 63322 4 -7024 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TAGGTGTGGCTGGTGGCATT NA FALSE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 6 NA PB.488.7 chr1 + 2658 4 incomplete-splice_match WDTC1 ENST00000361771.7 4275 16 66559 4 -3787 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TAGGTGTGGCTGGTGGCATT NA FALSE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 3 NA PB.488.8 chr1 + 2329 3 incomplete-splice_match WDTC1 ENST00000361771.7 4275 16 69051 0 -1295 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGTGGCTGGTGGCATTTGTG NA FALSE NA NA ATTAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.488.9 chr1 + 2135 2 incomplete-splice_match WDTC1 ENST00000472249.2 628 3 101 -1351 101 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGGTGTGGCTGGTGGCATTT NA FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.489.1 chr1 + 1766 7 full-splice_match TMEM222 ENST00000464720.5 1665 7 -102 1 0 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTGGTGCCCTGTCATTGT NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.489.2 chr1 + 1516 6 full-splice_match TMEM222 ENST00000608611.5 1511 6 -6 1 -5 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 211 50.532627 1.703572 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTGGTGCCCTGTCATTGT -29 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 211 NA PB.489.3 chr1 + 2610 5 full-splice_match TMEM222 ENST00000464813.5 1071 5 -36 -1503 -2 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTGGTGCCCTGTCATTGT -26 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.489.5 chr1 + 1660 7 full-splice_match TMEM222 ENST00000464720.5 1665 7 4 1 3 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.113385 0.493233 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTGGTGCCCTGTCATTGT -20 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 13 NA PB.489.6 chr1 + 1492 6 novel_not_in_catalog TMEM222 novel 1613 6 NA NA 3 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTGGTGCCCTGTCATTGT -14 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.489.7 chr1 + 1308 2 novel_not_in_catalog TMEM222 novel 368 4 NA NA 9 -6034 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAGGGAAAAAAAAG -8 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 7 NA PB.489.8 chr1 + 4260 1 full-splice_match ACTG1P20 ENST00000486001.1 468 1 -3063 -729 -3063 729 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAGGGAAAAAAAAG -5 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 4 NA PB.489.9 chr1 + 1577 7 full-splice_match TMEM222 ENST00000478104.5 986 7 -16 -575 -12 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTGGTGCCCTGTCATTGT -2 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 6 NA PB.489.11 chr1 + 1758 1 full-splice_match ACTG1P20 ENST00000486001.1 468 1 -561 -729 -561 729 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAGGGAAAAAAAAG 2497 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.489.12 chr1 + 1551 1 full-splice_match ACTG1P20 ENST00000486001.1 468 1 -354 -729 -354 729 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAGGGAAAAAAAAG 2704 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.489.13 chr1 + 1374 1 full-splice_match ACTG1P20 ENST00000486001.1 468 1 -178 -728 -178 728 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 CAAAAAAAAGGGAAAAAAAA 2880 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.489.14 chr1 + 1249 3 full-splice_match TMEM222 ENST00000471456.1 2861 3 1612 0 495 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTGGTGCCCTGTCATTGT 7636 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 6 NA PB.489.15 chr1 + 1111 2 incomplete-splice_match TMEM222 ENST00000471456.1 2861 3 1846 0 729 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGTTGGTGCCCTGTCATTGT 7870 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.490.2 chr1 - 4767 12 full-splice_match SLC9A1 ENST00000263980.8 4737 12 -36 6 -36 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAGAGTCAAGGGCTGCTT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.490.3 chr1 - 3306 11 incomplete-splice_match SLC9A1 ENST00000263980.8 4737 12 41121 6 -9982 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAGAGTCAAGGGCTGCTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.490.4 chr1 - 3082 10 incomplete-splice_match SLC9A1 ENST00000263980.8 4737 12 45393 6 -5710 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAGAGTCAAGGGCTGCTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.490.5 chr1 - 2640 8 incomplete-splice_match SLC9A1 ENST00000263980.8 4737 12 49056 6 -2047 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAGAGTCAAGGGCTGCTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.490.6 chr1 - 2120 4 incomplete-splice_match SLC9A1 ENST00000374089.5 3165 7 1892 0 665 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAGAGTCAAGGGCTGCTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.491.2 chr1 + 1738 14 full-splice_match SYTL1 ENST00000618673.4 1712 14 3 -29 1 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAAAAGGCTGGTGTCTGC -30 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.491.3 chr1 + 1887 15 full-splice_match SYTL1 ENST00000318074.9 1900 15 11 2 11 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAAAAGGCTGGTGTCTGC -20 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 5 NA PB.491.4 chr1 + 1922 15 full-splice_match SYTL1 ENST00000616558.5 1936 15 12 2 12 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 20 4.789823 0.680319 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAAAAGGCTGGTGTCTGC -19 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 20 NA PB.491.5 chr1 + 2140 14 novel_in_catalog SYTL1 novel 1936 15 NA NA 15 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAAAAGGCTGGTGTCTGC 19 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.491.6 chr1 + 1991 13 novel_in_catalog SYTL1 novel 2229 14 NA NA 491 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AGCAATAAAAGGCTGGTGTC 550 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.491.7 chr1 + 1568 13 incomplete-splice_match SYTL1 ENST00000543823.1 2229 14 2556 0 -115 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAAAAGGCTGGTGTCTGC 2615 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.491.8 chr1 + 1258 10 incomplete-splice_match SYTL1 ENST00000543823.1 2229 14 4257 0 -346 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAAAAGGCTGGTGTCTGC 4316 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.491.9 chr1 + 1137 8 incomplete-splice_match SYTL1 ENST00000543823.1 2229 14 4776 0 -98 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAAAAGGCTGGTGTCTGC 4835 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.491.10 chr1 + 1956 5 novel_in_catalog SYTL1 novel 2525 13 NA NA -48 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAAAAGGCTGGTGTCTGC 4885 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.491.11 chr1 + 1371 4 full-splice_match SYTL1 ENST00000615284.1 793 4 -585 7 -585 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATAAAAGGCTGGTGTCTGC 5676 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.492.2 chr1 - 1388 10 incomplete-splice_match MAP3K6 ENST00000493901.6 3654 27 6264 -28 -696 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGTCCTGGCAATTTTGGAGG 8447 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.492.3 chr1 - 1097 8 incomplete-splice_match MAP3K6 ENST00000671291.1 3287 20 4919 -28 -2 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGTCCTGGCAATTTTGGAGG 9141 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.492.4 chr1 - 2099 15 incomplete-splice_match MAP3K6 ENST00000493901.6 3654 27 3988 -27 1949 3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTGTCCTGGCAATTTTGGAG 6171 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.492.5 chr1 - 1593 11 incomplete-splice_match MAP3K6 ENST00000493901.6 3654 27 5955 -21 -1005 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAACCTTTGTCCTGGCAATT 8138 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.492.6 chr1 - 1489 10 incomplete-splice_match MAP3K6 ENST00000493901.6 3654 27 6156 -21 -804 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAACCTTTGTCCTGGCAATT 8339 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.492.7 chr1 - 743 6 incomplete-splice_match MAP3K6 ENST00000671291.1 3287 20 5685 -21 123 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAACCTTTGTCCTGGCAATT 9907 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.493.1 chr1 + 1553 2 full-splice_match GPR3 ENST00000374024.4 2137 2 -21 605 -21 -605 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAGACAGTGTCTATTTATG 792 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.493.2 chr1 + 2132 2 full-splice_match GPR3 ENST00000374024.4 2137 2 2 3 2 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.592367 0.555381 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATATGTTTCCCTATGTGT -2 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 15 NA PB.494.34 chr1 - 3265 9 full-splice_match WASF2 ENST00000618852.5 5681 9 0 2416 0 1551 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CCAACAGTGAGGTTTCTTTT -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.494.35 chr1 - 3043 9 full-splice_match WASF2 ENST00000618852.5 5681 9 0 2638 0 1329 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAAACTTCAGTCCCTCAGGC -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.494.36 chr1 - 2343 9 full-splice_match WASF2 ENST00000618852.5 5681 9 -3 3341 -3 626 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATGATGCCTTTCTGTA 16 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.494.37 chr1 - 1855 9 full-splice_match WASF2 ENST00000618852.5 5681 9 5 3821 5 146 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGATATATCCAAGTGCTT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.494.38 chr1 - 2927 4 novel_in_catalog WASF2 novel 5681 9 NA NA 0 -7789 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GGTGAGGGGAAAGGGGCCTC -14 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.494.39 chr1 - 762 5 incomplete-splice_match WASF2 ENST00000536657.1 1083 8 -119 7791 -3 -7791 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 193 46.221786 1.664847 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGGGTGAGGGGAAAGGGGCC 16 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 193 NA PB.495.2 chr1 - 1014 2 incomplete-splice_match AHDC1 ENST00000644989.1 6103 6 55819 30 5885 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAGAAATGAAAAAAAGC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.495.3 chr1 - 2765 2 incomplete-splice_match AHDC1 ENST00000644989.1 6103 6 53690 408 3756 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAAGACAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.495.4 chr1 - 1641 2 incomplete-splice_match AHDC1 ENST00000644989.1 6103 6 54814 408 4880 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAAGACAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.495.5 chr1 - 1424 2 incomplete-splice_match AHDC1 ENST00000644989.1 6103 6 55031 408 5097 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAAGACAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.495.6 chr1 - 1275 2 incomplete-splice_match AHDC1 ENST00000644989.1 6103 6 55180 408 5246 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAAGACAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.495.7 chr1 - 872 2 incomplete-splice_match AHDC1 ENST00000644989.1 6103 6 55581 410 5647 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AGAAAAAGACAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.497.1 chr1 - 1376 5 incomplete-splice_match FGR ENST00000374004.5 2350 11 8448 -9 8448 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATACCCTTGAACCTTCCTT 9618 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.497.2 chr1 - 2467 13 full-splice_match FGR ENST00000399173.5 2483 13 8 8 8 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAACCATGAAATACCCTTGA 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.497.3 chr1 - 2398 13 full-splice_match FGR ENST00000374005.8 2637 13 3 236 3 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAACCATGAAATACCCTTGA 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.497.4 chr1 - 2367 13 full-splice_match FGR ENST00000399173.5 2483 13 108 8 3 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAACCATGAAATACCCTTGA -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.497.5 chr1 - 1946 10 incomplete-splice_match FGR ENST00000374004.5 2350 11 950 0 950 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAACCATGAAATACCCTTGA 9799 FALSE NA NA AATGAA -36 NA NA NA 2 NA PB.497.6 chr1 - 1166 4 novel_not_in_catalog FGR novel 2350 11 NA NA 8939 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAACCATGAAATACCCTTGA 9916 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.499.1 chr1 + 2067 9 full-splice_match FAM76A ENST00000373954.11 3579 9 0 1512 0 131 alternative_3end TRUE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TATCAGTTGTCATACTGGGC -14 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.499.2 chr1 + 2305 8 full-splice_match FAM76A ENST00000373949.5 2273 8 -32 0 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAGGAA 21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.499.3 chr1 + 1070 5 novel_not_in_catalog FAM76A novel 1027 8 NA NA 0 -19924 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAAAAATAGGCTATGGTA 7 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.500.2 chr1 + 1781 4 full-splice_match STX12 ENST00000468761.1 703 4 -48 -1030 -12 1030 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAATGGAGAATGGAGAGA -22 TRUE NA NA AAGAAA -8 NA NA NA 2 NA PB.500.3 chr1 + 1268 9 novel_not_in_catalog STX12 novel 3034 9 NA NA -12 2256 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TCCTTCGCCCACTTTTTGAT -22 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 3 NA PB.500.4 chr1 + 862 7 incomplete-splice_match STX12 ENST00000373943.9 3034 9 22 6374 6 -5 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAGAAAGAAAGAAAGA 12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.500.5 chr1 + 2868 9 full-splice_match STX12 ENST00000373943.9 3034 9 26 140 -10 -140 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.071349 0.609738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AATACTGTGTGACCTGTGGT 16 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 17 NA PB.500.6 chr1 + 2998 9 full-splice_match STX12 ENST00000373943.9 3034 9 33 3 -3 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.113385 0.493233 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAATTCTCCTTATCTGTGCC 23 TRUE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 13 NA PB.500.7 chr1 + 2326 9 full-splice_match STX12 ENST00000373943.9 3034 9 33 675 -3 -675 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 40 9.579645 0.981349 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TTTGTAGTATGTTTTTATGA 23 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 40 NA PB.500.10 chr1 + 2105 8 incomplete-splice_match STX12 ENST00000373943.9 3034 9 16391 674 16355 -674 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TTGTAGTATGTTTTTATGAG NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.500.11 chr1 + 1828 5 incomplete-splice_match STX12 ENST00000373943.9 3034 9 37045 673 17 -673 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGTAGTATGTTTTTATGAGT NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 5 NA PB.500.12 chr1 + 1402 3 incomplete-splice_match STX12 ENST00000373943.9 3034 9 44631 968 7603 -968 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAAATGTTGTCCACTTCCCT NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.500.13 chr1 + 1628 2 incomplete-splice_match STX12 ENST00000373943.9 3034 9 46424 675 9396 -675 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TTTGTAGTATGTTTTTATGA NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 8 NA PB.501.1 chr1 + 2650 7 full-splice_match PPP1R8 ENST00000431586.1 1029 7 -526 -1095 -16 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTGGGTGCAGGCTGTGAA -2 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.501.2 chr1 + 1281 7 full-splice_match PPP1R8 ENST00000311772.10 2340 7 18 1041 -14 203 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AACACTTGCATTGTAGAGAA 0 TRUE NA NA CATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.501.3 chr1 + 1948 6 novel_in_catalog PPP1R8 novel 2340 7 NA NA -10 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTGGGTGCAGGCTGTGAA 4 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.501.4 chr1 + 2086 7 novel_not_in_catalog PPP1R8 novel 2340 7 NA NA -5 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTGGGTGCAGGCTGTGAA 9 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.501.5 chr1 + 2159 7 full-splice_match PPP1R8 ENST00000311772.10 2340 7 32 149 0 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 108 25.865042 1.412713 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTGGGTGCAGGCTGTGAA 14 TRUE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 108 NA PB.501.6 chr1 + 1162 7 full-splice_match PPP1R8 ENST00000311772.10 2340 7 32 1146 0 98 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTCCATGTGTGCGGTATCGT 14 TRUE NA NA AATGAA -16 NA NA NA 2 NA PB.501.7 chr1 + 1012 7 full-splice_match PPP1R8 ENST00000311772.10 2340 7 32 1296 0 -52 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAGAAGAAGAAATATGCAAA 14 TRUE NA NA AATGAA -4 NA NA NA 4 NA PB.501.9 chr1 + 2290 7 full-splice_match PPP1R8 ENST00000311772.10 2340 7 41 9 1 -5 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GTGTGGAAATTCTAATGAGA 23 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 10 NA PB.501.10 chr1 + 1895 5 incomplete-splice_match PPP1R8 ENST00000373931.8 2651 7 8002 145 7500 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTGGGTGCAGGCTGTGAA 4422 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.501.12 chr1 + 1700 4 incomplete-splice_match PPP1R8 ENST00000373931.8 2651 7 10358 145 -8913 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTGGGTGCAGGCTGTGAA 162 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.501.14 chr1 + 1585 3 incomplete-splice_match PPP1R8 ENST00000236412.11 2414 6 12432 1 -6847 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTGGGTGCAGGCTGTGAA 2228 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.502.1 chr1 - 829 5 full-splice_match IFI6 ENST00000361157.11 812 5 -14 -3 6 3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 197 47.179752 1.673756 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGTCCTGCTGTCAATCATGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 197 NA PB.502.3 chr1 - 829 5 full-splice_match IFI6 ENST00000339145.8 822 5 -13 6 1 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAACACTTTGTCCTGCTGT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.502.4 chr1 - 818 5 full-splice_match IFI6 ENST00000362020.4 828 5 6 4 0 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 35 8.382190 0.923357 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAACACTTTGTCCTGCTGT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 35 NA PB.502.5 chr1 - 724 4 incomplete-splice_match IFI6 ENST00000361157.11 812 5 2858 6 2844 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAACACTTTGTCCTGCTGT -23 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.503.1 chr1 + 1131 3 novel_in_catalog THEMIS2 novel 1082 4 NA NA -43 1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATGAATGAGAACGGTATCAT 9022 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 4 NA PB.503.2 chr1 + 2711 6 full-splice_match THEMIS2 ENST00000373921.8 2713 6 0 2 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.831858 0.583409 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TATGAATGAGAACGGTATCA -5 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 16 NA PB.503.3 chr1 + 2573 5 novel_in_catalog THEMIS2 novel 2713 6 NA NA 0 1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GAATGAGAACGGTATCATTT -5 TRUE NA NA AATAAA -23 NA NA NA 3 NA PB.503.4 chr1 + 2300 5 novel_in_catalog THEMIS2 novel 2713 6 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TATGAATGAGAACGGTATCA -5 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.503.5 chr1 + 1227 4 full-splice_match THEMIS2 ENST00000373927.7 1082 4 -5 -140 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.634403 0.420682 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TATGAATGAGAACGGTATCA -5 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 11 NA PB.503.6 chr1 + 2001 3 incomplete-splice_match THEMIS2 ENST00000373921.8 2713 6 9464 1 -1390 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATGAATGAGAACGGTATCAT 2355 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 3 NA PB.503.7 chr1 + 1517 3 incomplete-splice_match THEMIS2 ENST00000456990.1 1926 5 2761 -1 -906 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATGAATGAGAACGGTATCAT 2839 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 3 NA PB.503.8 chr1 + 958 2 full-splice_match THEMIS2 ENST00000492877.1 2861 2 1904 -1 1904 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATGAATGAGAACGGTATCAT -10 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 4 NA PB.504.1 chr1 - 1867 8 full-splice_match RPA2 ENST00000313433.11 1237 8 -86 -544 -11 -5 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAAATTCTCGTTTTTCTTT -32 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.504.2 chr1 - 1594 9 full-splice_match RPA2 ENST00000373912.8 1584 9 -25 15 -12 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 998 239.012146 2.378420 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AGTAACTTGTAAAAATTCTC -33 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 998 NA PB.504.3 chr1 - 1230 6 incomplete-splice_match RPA2 ENST00000373912.8 1584 9 7532 5 7470 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAAATTCTCGTTTTTCTTT 7690 FALSE NA NA AAAAAG -20 NA NA NA 5 NA PB.504.4 chr1 - 1554 9 full-splice_match RPA2 ENST00000373909.7 1162 9 2 -394 2 -6 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAAAATTCTCGTTTTTCTT -11 TRUE NA NA AAGAAA -13 NA NA NA 4 NA PB.504.5 chr1 - 1441 8 full-splice_match RPA2 ENST00000313433.11 1237 8 339 -543 339 -6 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.071349 0.609738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TAAAAATTCTCGTTTTTCTT 559 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.504.6 chr1 - 1242 7 incomplete-splice_match RPA2 ENST00000373912.8 1584 9 7374 12 7312 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 23 5.508296 0.741017 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AACTTGTAAAAATTCTCGTT 7532 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 23 NA PB.504.7 chr1 - 1729 9 full-splice_match RPA2 ENST00000373912.8 1584 9 -160 15 11 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 23 5.508296 0.741017 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AGTAACTTGTAAAAATTCTC -2 TRUE NA NA AAGAAA -4 NA NA NA 23 NA PB.504.8 chr1 - 1577 9 novel_in_catalog RPA2 novel 1584 9 NA NA 4 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.634403 0.420682 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AGTAACTTGTAAAAATTCTC -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.504.9 chr1 - 1458 8 novel_in_catalog RPA2 novel 1584 9 NA NA 4 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AGTAACTTGTAAAAATTCTC -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.504.10 chr1 - 915 3 incomplete-splice_match RPA2 ENST00000373912.8 1584 9 20175 15 2685 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 22 5.268805 0.721712 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AGTAACTTGTAAAAATTCTC NA FALSE NA NA AAGAAA -41 NA NA NA 22 NA PB.504.11 chr1 - 1719 9 novel_not_in_catalog RPA2 novel 1584 9 NA NA 0 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TAGTAACTTGTAAAAATTCT -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.504.12 chr1 - 1470 8 novel_in_catalog RPA2 novel 1584 9 NA NA 23 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 28 6.705751 0.826447 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TAGTAACTTGTAAAAATTCT 15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 28 NA PB.504.13 chr1 - 1063 5 incomplete-splice_match RPA2 ENST00000373912.8 1584 9 16908 16 -582 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.550332 0.658043 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TAGTAACTTGTAAAAATTCT NA FALSE NA NA CATAAA -1 NA NA NA 19 NA PB.504.14 chr1 - 780 2 incomplete-splice_match RPA2 ENST00000373912.8 1584 9 20488 20 2998 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 ATTGTAGTAACTTGTAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.505.1 chr1 + 1629 7 full-splice_match SMPDL3B ENST00000373888.8 1548 7 -83 2 -44 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TACTCAAGGCTTCCCACAGT -8 TRUE NA NA GATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.505.2 chr1 + 1870 8 full-splice_match SMPDL3B ENST00000373894.8 1866 8 -5 1 -5 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.071349 0.609738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTCTGTGTTGTGTTCCTTT 1 TRUE NA NA AAAACA -19 NA NA NA 17 NA PB.505.3 chr1 + 1358 6 incomplete-splice_match SMPDL3B ENST00000548116.5 1913 8 14083 7 14002 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GATTCTGTGTTGTGTTCCTT 5444 FALSE NA NA AAAACA -18 NA NA NA 2 NA PB.507.9 chr1 - 1752 16 incomplete-splice_match EYA3 ENST00000373871.8 5999 18 0 18134 0 1 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATGCACCTATTATTTTCTAG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.507.10 chr1 - 1630 15 incomplete-splice_match EYA3 ENST00000373863.3 1729 17 -62 11205 11 1 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.352876 0.525417 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATGCACCTATTATTTTCTAG -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.507.11 chr1 - 1669 15 incomplete-splice_match EYA3 ENST00000436342.6 5943 17 27 18134 0 -2 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATGATGCACCTATTATTTTC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.507.13 chr1 - 1232 10 incomplete-splice_match EYA3 ENST00000471498.5 1806 17 -34 22321 6 -4 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAGAAAAATGTAAAAAGA -21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.508.1 chr1 - 1791 2 full-splice_match PTAFR ENST00000373857.8 3993 2 15 2187 15 320 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 6 TRUE NA NA AAGAAA -29 NA NA NA 2 NA PB.509.1 chr1 + 2341 4 novel_in_catalog XKR8 novel 2427 6 NA NA -15 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAACCTAGTCTGTGTCATCA NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.509.2 chr1 + 2390 4 full-splice_match XKR8 ENST00000675359.1 1578 4 -292 -520 -3 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CCAACCTAGTCTGTGTCATC -32 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.509.3 chr1 + 2155 3 full-splice_match XKR8 ENST00000373884.6 2178 3 23 0 23 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 30 7.184734 0.856411 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAACCTAGTCTGTGTCATCA -6 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 30 NA PB.509.4 chr1 + 2037 3 full-splice_match XKR8 ENST00000373884.6 2178 3 141 0 69 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAACCTAGTCTGTGTCATCA 69 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 6 NA PB.509.5 chr1 + 1656 2 incomplete-splice_match XKR8 ENST00000373884.6 2178 3 3656 0 3367 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAACCTAGTCTGTGTCATCA 3584 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.510.1 chr1 + 576 3 full-splice_match ATP5IF1 ENST00000497986.5 599 3 15 8 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAACTGTGTTTGATGCCTTC -15 TRUE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 4 NA PB.510.2 chr1 + 1881 2 full-splice_match ATP5IF1 ENST00000465645.1 1855 2 -27 1 3 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 103 24.667585 1.392127 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAACTGTGTTTGATGCCTTC -12 TRUE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 103 NA PB.510.3 chr1 + 498 3 full-splice_match ATP5IF1 ENST00000335514.10 503 3 3 2 3 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 77 18.440817 1.265780 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AACTGTGTTTGATGCCTTCT -12 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 77 NA PB.511.1 chr1 - 1748 9 full-splice_match DNAJC8 ENST00000263697.6 1763 9 20 -5 -5 5 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 53 12.693029 1.103565 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAGCTCACAGTCTATGCTTA 16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 53 NA PB.511.2 chr1 - 1199 3 incomplete-splice_match DNAJC8 ENST00000603289.5 483 5 60 825 60 -3 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAGCGTCCAGCTCACAGTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.511.4 chr1 - 1361 5 incomplete-splice_match DNAJC8 ENST00000263697.6 1763 9 23023 7 -1197 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TATGAAAGCGTCCAGCTCAC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.511.5 chr1 - 1383 8 novel_not_in_catalog DNAJC8 novel 1763 9 NA NA -5 5 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTGATGTACTTTTCCTTGT 16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.511.6 chr1 - 3531 7 novel_in_catalog DNAJC8 novel 1600 10 NA NA 4 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.511.7 chr1 - 2006 8 novel_in_catalog DNAJC8 novel 1600 10 NA NA -20 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC -24 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.511.8 chr1 - 1678 9 novel_not_in_catalog DNAJC8 novel 1600 10 NA NA -1 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.511.9 chr1 - 1636 10 novel_not_in_catalog DNAJC8 novel 1600 10 NA NA -5 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.511.10 chr1 - 1650 10 novel_not_in_catalog DNAJC8 novel 1600 10 NA NA -3454 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC 1449 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.511.11 chr1 - 1579 10 full-splice_match DNAJC8 ENST00000489277.5 1600 10 21 0 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 38 9.100663 0.959073 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC 21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 38 NA PB.511.12 chr1 - 1505 9 novel_in_catalog DNAJC8 novel 1600 10 NA NA 0 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.511.13 chr1 - 1469 9 novel_not_in_catalog DNAJC8 novel 1600 10 NA NA -1 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC 20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.511.14 chr1 - 1488 9 full-splice_match DNAJC8 ENST00000263697.6 1763 9 -6 281 -6 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 1764 422.462341 2.625788 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 1764 NA PB.511.15 chr1 - 1426 9 novel_not_in_catalog DNAJC8 novel 1600 10 NA NA 4 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.511.16 chr1 - 1407 8 novel_in_catalog DNAJC8 novel 1600 10 NA NA -1 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.511.17 chr1 - 1377 8 novel_in_catalog DNAJC8 novel 1600 10 NA NA -1 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.511.18 chr1 - 1383 8 novel_in_catalog DNAJC8 novel 1600 10 NA NA 0 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.831858 0.583409 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.511.19 chr1 - 1273 7 incomplete-splice_match DNAJC8 ENST00000489277.5 1600 10 18027 0 -6189 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 33 7.903207 0.897803 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC NA FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 33 NA PB.511.20 chr1 - 1147 6 novel_in_catalog DNAJC8 novel 1600 10 NA NA -6158 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.511.21 chr1 - 1042 4 novel_not_in_catalog DNAJC8 novel 1600 10 NA NA 0 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 56 13.411503 1.127477 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 56 NA PB.511.22 chr1 - 1101 5 incomplete-splice_match DNAJC8 ENST00000489277.5 1600 10 23005 0 -1211 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 64 15.327433 1.185469 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 64 NA PB.511.23 chr1 - 921 3 incomplete-splice_match DNAJC8 ENST00000603289.5 483 5 60 1103 60 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 32 7.663716 0.884439 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCCATTGATGTACTTTTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 32 NA PB.511.26 chr1 - 1160 9 full-splice_match DNAJC8 ENST00000263697.6 1763 9 3 600 -1 -319 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 137 32.810284 1.516010 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGTTGCTGTGACTTCAGAGA -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 137 NA PB.511.27 chr1 - 696 4 novel_not_in_catalog DNAJC8 novel 1763 9 NA NA 0 -325 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAACAGTGTTGCTGTGACTT 21 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.511.28 chr1 - 1278 10 full-splice_match DNAJC8 ENST00000489277.5 1600 10 -4 326 0 -326 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAACAGTGTTGCTGTGACT -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.511.29 chr1 - 1020 8 incomplete-splice_match DNAJC8 ENST00000489277.5 1600 10 4029 326 4008 -326 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAACAGTGTTGCTGTGACT 8936 FALSE NA NA ATTAAA -4 NA NA NA 3 NA PB.511.30 chr1 - 851 6 incomplete-splice_match DNAJC8 ENST00000489277.5 1600 10 22425 326 -1791 -326 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAACAGTGTTGCTGTGACT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.512.3 chr1 + 3452 10 full-splice_match SESN2 ENST00000253063.4 3462 10 6 4 6 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATACTCCCTTTTTATGGGC 9 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 8 NA PB.512.10 chr1 + 2579 6 incomplete-splice_match SESN2 ENST00000253063.4 3462 10 13079 0 13079 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTCCCTTTTTATGGGCTGTT NA FALSE NA NA AATAAA -25 NA NA NA 2 NA PB.512.11 chr1 + 2380 5 incomplete-splice_match SESN2 ENST00000253063.4 3462 10 13839 3 13839 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATACTCCCTTTTTATGGGCT NA FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.513.2 chr1 + 1299 4 novel_not_in_catalog MED18 novel 1106 4 NA NA -18 1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.592367 0.555381 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATGTCTGTGTAATTCTGATT -35 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 15 NA PB.513.4 chr1 + 887 3 full-splice_match MED18 ENST00000373842.9 1829 3 -9 951 -9 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAAATATGTTTGCTTTTT -26 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.513.5 chr1 + 1545 4 novel_not_in_catalog MED18 novel 1106 4 NA NA -8 -9 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AATGAAGAGACATGTCTGTG -25 TRUE NA NA AATAAA -4 NA NA NA 2 NA PB.513.6 chr1 + 1028 4 novel_not_in_catalog MED18 novel 1106 4 NA NA -3 1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATGTCTGTGTAATTCTGATT -5 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.514.2 chr1 + 2071 10 incomplete-splice_match PHACTR4 ENST00000373839.8 6048 14 -93 11101 38 -7893 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTTGTATGTTTCTGACTTTA -49 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.514.3 chr1 + 3256 14 full-splice_match PHACTR4 ENST00000373839.8 6048 14 -43 2835 -13 -16 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.514.4 chr1 + 3394 14 full-splice_match PHACTR4 ENST00000373839.8 6048 14 -24 2678 6 141 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG 20 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 3 NA PB.514.5 chr1 + 2165 12 incomplete-splice_match PHACTR4 ENST00000373839.8 6048 14 -24 8576 6 -5368 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TACCTGGAAAGCACTCTCTT 20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.514.14 chr1 + 2282 11 incomplete-splice_match PHACTR4 ENST00000373836.4 3107 13 -21 5515 -1 -5368 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TACCTGGAAAGCACTCTCTT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.514.15 chr1 + 3097 12 incomplete-splice_match PHACTR4 ENST00000373836.4 3107 13 21047 -383 21047 141 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG 113 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.514.18 chr1 + 2141 8 incomplete-splice_match PHACTR4 ENST00000373836.4 3107 13 35664 -382 -17860 140 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.514.19 chr1 + 1844 8 incomplete-splice_match PHACTR4 ENST00000373836.4 3107 13 35961 -382 -17563 140 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.514.20 chr1 + 1509 7 incomplete-splice_match PHACTR4 ENST00000373836.4 3107 13 38095 -226 -15429 -16 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.514.21 chr1 + 1601 6 incomplete-splice_match PHACTR4 ENST00000373836.4 3107 13 42318 -382 -11206 140 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 CAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 6 NA PB.514.22 chr1 + 1356 6 incomplete-splice_match PHACTR4 ENST00000373836.4 3107 13 42407 -226 -11117 -16 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.517.1 chr1 + 942 3 full-splice_match SNHG3 ENST00000413987.1 2201 3 0 1259 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.634403 0.420682 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTTGTGGTTCATTTTTG NA FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 11 NA PB.517.2 chr1 + 2473 12 novel_in_catalog RCC1 novel 2686 14 NA NA -1 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAAATAGGCCACTTGTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.517.3 chr1 + 2437 11 novel_in_catalog RCC1 novel 2551 13 NA NA -1 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC -5 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 3 NA PB.517.4 chr1 + 3591 1 full-splice_match SNORA73A ENST00000364938.1 206 1 -1323 -2062 -1323 2062 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA NA NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTTGTGGTTCATTTTTG -4 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 2 NA PB.517.5 chr1 + 2544 13 full-splice_match RCC1 ENST00000683442.1 2551 13 0 7 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAAATAGGCCACTTGTTTT -4 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 8 NA PB.517.6 chr1 + 1548 2 incomplete-splice_match SNHG3 ENST00000413987.1 2201 3 63 1259 63 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTTGTGGTTCATTTTTG -4 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 4 NA PB.517.7 chr1 + 1237 4 novel_not_in_catalog SNHG3 novel 2201 3 NA NA 63 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAACCAGTGGTTTTAGTATG -4 TRUE NA NA AGTAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.517.8 chr1 + 987 4 novel_not_in_catalog SNHG3 novel 2201 3 NA NA 63 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTTGTGGTTCATTTTTG -4 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 9 NA PB.517.9 chr1 + 846 2 novel_in_catalog SNHG3 novel 2201 3 NA NA 63 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 26 6.226769 0.794263 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTTGTGGTTCATTTTTG -4 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 26 NA PB.517.10 chr1 + 879 3 full-splice_match SNHG3 ENST00000413987.1 2201 3 63 1259 63 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 200 47.898228 1.680319 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTTGTGGTTCATTTTTG -4 TRUE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 200 NA PB.517.11 chr1 + 2920 2 full-splice_match SNHG3 ENST00000437681.1 2614 2 -304 -2 67 2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GTTTGTGGTTCATTTTTGTG 0 TRUE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.517.13 chr1 + 1194 1 full-splice_match SNORA73B ENST00000363217.1 204 1 -114 -876 -114 876 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTGGTTCATTTTTGTGGAG 259 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.517.14 chr1 + 963 1 full-splice_match SNORA73B ENST00000363217.1 204 1 112 -871 112 871 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTTGTGGTTCATTTTTG 110 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 4 NA PB.517.15 chr1 + 894 1 full-splice_match SNORA73B ENST00000363217.1 204 1 181 -871 181 871 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTTGTGGTTCATTTTTG 179 FALSE NA NA AATAAA -10 NA NA NA 2 NA PB.517.21 chr1 + 2408 10 full-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 115 -99 -6 93 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 299 71.607849 1.854961 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GTGTTGAGGCTACAACTTAA 9 TRUE NA NA AATAAA -12 NA NA NA 299 NA PB.517.22 chr1 + 2624 10 full-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 109 -309 -12 -8 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAAAAATTTTTTTTTTTT 3 TRUE NA NA AATAGA -29 NA NA NA 7 NA PB.517.23 chr1 + 2393 11 novel_in_catalog RCC1 novel 1577 11 NA NA -7 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAAATAGGCCACTTGTTTT 8 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 4 NA PB.517.24 chr1 + 1541 11 novel_in_catalog RCC1 novel 1577 11 NA NA -7 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TTCCTTCCTCCTCTTTGGAA 8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.517.25 chr1 + 1558 10 full-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 114 752 -7 67 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.071349 0.609738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGGAACATGGCTCACTC 8 TRUE NA NA AATAAA -25 NA NA NA 17 NA PB.517.26 chr1 + 2400 11 full-splice_match RCC1 ENST00000373831.7 1577 11 -4 -819 -4 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC 11 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 9 NA PB.517.27 chr1 + 2456 11 novel_in_catalog RCC1 novel 1577 11 NA NA -2 94 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TGTTGAGGCTACAACTTAAG 13 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.517.28 chr1 + 2340 11 novel_in_catalog RCC1 novel 1577 11 NA NA 4 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 57 13.650994 1.135164 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAAATAGGCCACTTGTTTT -11 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 57 NA PB.517.29 chr1 + 2171 9 novel_in_catalog RCC1 novel 2424 10 NA NA 4 1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATAGGCCACTTGTTTTCT -11 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.517.30 chr1 + 2110 9 novel_in_catalog RCC1 novel 2424 10 NA NA 4 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC -11 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.517.31 chr1 + 2280 10 novel_not_in_catalog RCC1 novel 538 6 NA NA 57 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC 42 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.517.33 chr1 + 2166 8 incomplete-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 13670 0 -129 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 8 NA PB.517.34 chr1 + 2192 8 incomplete-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 13761 -117 -38 -96 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGTGATGTCAAGATGTCCT NA FALSE NA NA AATAAA -30 NA NA NA 3 NA PB.517.35 chr1 + 2028 8 incomplete-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 13817 -9 18 3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.029314 0.701509 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CACTTGTTTTCTACACATTC NA FALSE NA NA AATAAA -23 NA NA NA 21 NA PB.517.36 chr1 + 1918 7 incomplete-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 14097 1 298 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAAATAGGCCACTTGTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 9 NA PB.517.37 chr1 + 1854 7 incomplete-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 14163 -1 364 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATAGGCCACTTGTTTTCT NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 5 NA PB.517.39 chr1 + 1764 6 incomplete-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 16951 0 -1006 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.310840 0.634562 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 18 NA PB.517.40 chr1 + 939 5 incomplete-splice_match RCC1 ENST00000373831.7 1577 11 17014 -67 -822 67 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGGAACATGGCTCACTC NA FALSE NA NA AATAAA -25 NA NA NA 2 NA PB.517.41 chr1 + 1639 5 incomplete-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 17186 1 -771 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAAATAGGCCACTTGTTTT NA FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 9 NA PB.517.42 chr1 + 1515 4 incomplete-splice_match RCC1 ENST00000373832.5 2424 10 17801 0 -156 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.873893 0.458471 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 12 NA PB.517.43 chr1 + 1275 2 incomplete-splice_match RCC1 ENST00000478232.1 509 3 684 -1085 684 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 28 6.705751 0.826447 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATAGGCCACTTGTTTTC NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 28 NA PB.517.44 chr1 + 1295 2 incomplete-splice_match RCC1 ENST00000478232.1 509 3 774 -1195 774 -103 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ACAACTTAAGTGATGTCAAG NA FALSE NA NA AATAAA -23 NA NA NA 4 NA PB.519.1 chr1 + 1057 9 full-splice_match TRNAU1AP ENST00000373830.4 1799 9 -68 810 -68 -9 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAATAATGACTGTTTTTGGA 3 TRUE NA NA TTTAAA -40 NA NA NA 9 NA PB.519.2 chr1 + 1453 10 novel_in_catalog TRNAU1AP novel 1132 10 NA NA -44 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATGTTTCTACAACACTGCT 27 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.519.3 chr1 + 849 8 novel_in_catalog TRNAU1AP novel 1799 9 NA NA 0 -6 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 CATGAATGTTTCTACAACAC -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.519.4 chr1 + 1165 10 full-splice_match TRNAU1AP ENST00000480930.5 1132 10 -4 -29 -2 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACACTGCTGCATTCATTTG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.519.5 chr1 + 1012 9 full-splice_match TRNAU1AP ENST00000373830.4 1799 9 15 772 1 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 135 32.331303 1.509623 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACACTGCTGCATTCATTTG 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 135 NA PB.519.6 chr1 + 1782 9 full-splice_match TRNAU1AP ENST00000373830.4 1799 9 15 2 1 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TATTAGTCTTTTTATTCTTC 5 TRUE NA NA AATATA -5 NA NA NA 8 NA PB.519.7 chr1 + 1128 10 novel_in_catalog TRNAU1AP novel 1132 10 NA NA 1 -5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.634403 0.420682 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATGAATGTTTCTACAACACT 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.519.8 chr1 + 878 8 novel_in_catalog TRNAU1AP novel 1799 9 NA NA 1 -5 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATGAATGTTTCTACAACACT 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.519.9 chr1 + 1058 9 novel_not_in_catalog TRNAU1AP novel 1008 8 NA NA -19 -5 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATGAATGTTTCTACAACACT 119 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.519.10 chr1 + 1018 8 full-splice_match TRNAU1AP ENST00000484775.1 1008 8 -1 -9 -1 9 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATTCATTTGACCATTTGAGT 7537 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.519.12 chr1 + 1049 2 incomplete-splice_match TRNAU1AP ENST00000373830.4 1799 9 18784 29 11236 -29 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAATACAAACACAAAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.520.1 chr1 - 1863 3 novel_in_catalog SNHG12 novel 1800 4 NA NA -22 20 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAAAGAAGAATAAAAAG 224 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.520.2 chr1 - 1626 4 full-splice_match SNHG12 ENST00000461448.6 1644 4 -15 33 1 20 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAAAGAAGAATAAAAAG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.520.3 chr1 - 1360 4 novel_in_catalog SNHG12 novel 1104 5 NA NA -97 20 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAAAGAAGAATAAAAAG 149 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.520.4 chr1 - 1280 3 novel_in_catalog SNHG12 novel 1644 4 NA NA -22 20 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAAAGAAGAATAAAAAG 224 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.520.5 chr1 - 1065 5 full-splice_match SNHG12 ENST00000470977.6 1104 5 6 33 1 20 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAAAGAAGAATAAAAAG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.520.6 chr1 - 1048 5 full-splice_match SNHG12 ENST00000461832.2 1082 5 1 33 1 20 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 24 5.747787 0.759501 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAAAGAAGAATAAAAAG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 24 NA PB.520.8 chr1 - 822 5 full-splice_match SNHG12 ENST00000461832.2 1082 5 227 33 -23 20 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAAAGAAGAATAAAAAG 223 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.520.9 chr1 - 724 6 full-splice_match SNHG12 ENST00000648127.1 1871 6 1114 33 1 20 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAAAGAAGAATAAAAAG -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.521.2 chr1 + 813 2 full-splice_match RAB42 ENST00000465518.3 2236 2 210 1213 210 -1207 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGTCATGCTTCCTGGATTTT 210 FALSE NA NA TATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.523.1 chr1 - 1402 6 full-splice_match TAF12 ENST00000263974.4 1359 6 -41 -2 17 2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGACAGGGTACCTTTGAA 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.523.2 chr1 - 1123 6 full-splice_match TAF12 ENST00000373824.9 1335 6 -37 249 0 2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 372 89.090698 1.949832 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGACAGGGTACCTTTGAA -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 372 NA PB.523.3 chr1 - 1016 5 novel_in_catalog TAF12 novel 1438 7 NA NA 6 2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGACAGGGTACCTTTGAA -20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.523.4 chr1 - 1037 6 full-splice_match TAF12 ENST00000263974.4 1359 6 324 -2 324 2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGACAGGGTACCTTTGAA 5589 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.523.5 chr1 - 854 5 full-splice_match TAF12 ENST00000691050.1 785 5 -72 3 -2 2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGACAGGGTACCTTTGAA 5183 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.523.6 chr1 - 878 5 incomplete-splice_match TAF12 ENST00000263974.4 1359 6 20971 -1 199 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GAAAGACAGGGTACCTTTGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.523.7 chr1 - 755 4 incomplete-splice_match TAF12 ENST00000263974.4 1359 6 24977 -1 -2423 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 GAAAGACAGGGTACCTTTGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.523.8 chr1 - 941 6 full-splice_match TAF12 ENST00000373824.9 1335 6 -14 408 0 -31 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 31 7.424225 0.870651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GACAAAGCATTATGGTCTTT 5189 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 31 NA PB.524.1 chr1 + 1931 10 full-splice_match GMEB1 ENST00000373816.6 6358 10 -53 4480 -47 0 alternative_3end5end TRUE canonical NA NA NA NA 11 2.634403 0.420682 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAAACAAAATC 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.524.2 chr1 + 1940 10 full-splice_match GMEB1 ENST00000294409.2 1912 10 -28 0 -26 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAAACAAAATC -27 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.524.3 chr1 + 1725 9 incomplete-splice_match GMEB1 ENST00000361872.8 1894 10 14902 13 116 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAAACAAAATC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.524.4 chr1 + 1524 7 incomplete-splice_match GMEB1 ENST00000480454.1 2063 9 8078 192 8078 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAAACAAAATC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.524.5 chr1 + 1195 4 incomplete-splice_match GMEB1 ENST00000480454.1 2063 9 18873 192 18873 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAAACAAAATC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.524.6 chr1 + 1010 3 incomplete-splice_match GMEB1 ENST00000480454.1 2063 9 20680 192 20680 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAAACAAAATC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.525.1 chr1 + 671 4 novel_in_catalog YTHDF2 novel 2744 5 NA NA 154 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA 9 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.525.2 chr1 + 2883 5 full-splice_match YTHDF2 ENST00000373812.8 2744 5 -140 1 -140 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCTAGTACCATTTAGTA -14 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 3 NA PB.525.3 chr1 + 1297 4 novel_in_catalog YTHDF2 novel 2825 6 NA NA -138 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCTAGTACCATTTAGTA -12 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.525.4 chr1 + 2218 5 full-splice_match YTHDF2 ENST00000373812.8 2744 5 -128 654 -128 -4 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 43 10.298119 1.012758 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 43 NA PB.525.5 chr1 + 3181 3 novel_in_catalog YTHDF2 novel 2594 4 NA NA -5 -4 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.525.6 chr1 + 2189 6 novel_in_catalog YTHDF2 novel 2744 5 NA NA -5 -6 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 GGAAAATGAAAAAAAAAAGA -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.525.7 chr1 + 2095 5 full-splice_match YTHDF2 ENST00000373812.8 2744 5 -5 654 -5 -4 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 471 112.800323 2.052310 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA -16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 471 NA PB.525.8 chr1 + 506 4 novel_in_catalog YTHDF2 novel 2744 5 NA NA 0 -4 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.525.9 chr1 + 2735 5 full-splice_match YTHDF2 ENST00000373812.8 2744 5 8 1 -2 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.873893 0.458471 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCTAGTACCATTTAGTA -3 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 12 NA PB.525.10 chr1 + 2589 4 full-splice_match YTHDF2 ENST00000478283.5 2594 4 1 4 1 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.525.13 chr1 + 1138 4 novel_in_catalog YTHDF2 novel 2825 6 NA NA -4 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 30 7.184734 0.856411 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCTAGTACCATTTAGTA 10 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 30 NA PB.525.14 chr1 + 941 3 novel_in_catalog YTHDF2 novel 2825 6 NA NA -82 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCTAGTACCATTTAGTA 573 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.525.15 chr1 + 1832 3 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000478283.5 2594 4 1334 4 534 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 20 4.789823 0.680319 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA 192 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 20 NA PB.525.16 chr1 + 1606 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000478283.5 2594 4 5624 4 3483 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.592367 0.555381 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA 4482 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.525.17 chr1 + 1475 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000478283.5 2594 4 5755 4 3614 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA 4613 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.525.18 chr1 + 2129 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000373812.8 2744 5 5772 -7 3621 7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TACCATTTAGTATTATTTGA 4620 FALSE NA NA AATAAA -30 NA NA NA 2 NA PB.525.19 chr1 + 1359 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000478283.5 2594 4 5869 6 3728 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.873893 0.458471 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 GGAAAATGAAAAAAAAAAGA 4727 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.525.20 chr1 + 1084 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000478283.5 2594 4 6146 4 4005 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 24 5.747787 0.759501 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA 5004 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 24 NA PB.525.21 chr1 + 1006 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000478283.5 2594 4 6224 4 4083 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA 5082 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.525.22 chr1 + 817 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000478283.5 2594 4 6413 4 4272 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.592367 0.555381 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAATGAAAAAAAAAAGAAA 5271 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.525.23 chr1 + 1390 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000373812.8 2744 5 6503 1 4352 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.634403 0.420682 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCTAGTACCATTTAGTA 5351 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 11 NA PB.525.24 chr1 + 588 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000478283.5 2594 4 6640 6 4499 -6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 GGAAAATGAAAAAAAAAAGA 5498 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.525.25 chr1 + 1138 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000373812.8 2744 5 6755 1 4604 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 25 5.987278 0.777229 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCTAGTACCATTTAGTA 5603 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 25 NA PB.525.26 chr1 + 983 2 incomplete-splice_match YTHDF2 ENST00000373812.8 2744 5 6910 1 4759 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ACTTCTAGTACCATTTAGTA 5758 FALSE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 10 NA PB.526.1 chr1 - 1801 1 full-splice_match ENSG00000289291 ENST00000691740.1 1627 1 -182 8 -182 -8 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATCGCTATCAGTCTTTC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.526.2 chr1 - 1407 1 full-splice_match ENSG00000289291 ENST00000691740.1 1627 1 212 8 212 -8 mono-exon ???? NA NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA NA NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATCGCTATCAGTCTTTC 211 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.527.3 chr1 + 5739 18 full-splice_match EPB41 ENST00000647103.1 5772 18 12 21 0 -18 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAACAACAACAAAAAGA -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.527.4 chr1 + 1992 13 incomplete-splice_match EPB41 ENST00000646800.1 6388 19 0 14456 0 4123 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACACAGGTTTGTGCCAAT -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.527.5 chr1 + 1937 6 incomplete-splice_match EPB41 ENST00000482464.6 2154 14 -11 49030 5 -37808 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAAGAAAATGGAAAATC -6 TRUE NA NA TATAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.527.6 chr1 + 5781 19 novel_in_catalog EPB41 novel 5925 21 NA NA 0 -18 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAACAACAACAAAAAGA 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.527.10 chr1 + 5929 19 novel_in_catalog EPB41 novel 6031 21 NA NA 7 -18 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAACAACAACAAAAAGA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.527.11 chr1 + 5850 18 novel_in_catalog EPB41 novel 2937 20 NA NA 0 -18 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAACAACAACAAAAAGA 17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.527.12 chr1 + 1735 4 novel_in_catalog EPB41 novel 5496 17 NA NA 0 -37808 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAAGAAAATGGAAAATC 17 TRUE NA NA TATAAA -11 NA NA NA 3 NA PB.527.13 chr1 + 2051 6 incomplete-splice_match EPB41 ENST00000373797.2 2407 15 -5 48515 0 -37808 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAAAGAAAATGGAAAATC 19 TRUE NA NA TATAAA -11 NA NA NA 4 NA PB.527.14 chr1 + 2100 13 incomplete-splice_match EPB41 ENST00000373797.2 2407 15 -4 6584 1 4123 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACACAGGTTTGTGCCAAT 20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.527.16 chr1 + 5739 18 novel_in_catalog EPB41 novel 2937 20 NA NA 52 -18 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAACAACAACAAAAAGA 6 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.527.20 chr1 + 4934 15 novel_in_catalog EPB41 novel 5772 18 NA NA 9627 -18 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAACAACAACAAAAAGA 9736 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.527.24 chr1 + 3644 6 full-splice_match EPB41 ENST00000490308.2 922 6 177 -2899 177 -18 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAACAACAACAAAAAGA 2467 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.527.26 chr1 + 3560 5 novel_not_in_catalog EPB41 novel 5772 18 NA NA 8529 -18 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAACAACAACAAAAAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.527.27 chr1 + 3362 3 incomplete-splice_match EPB41 ENST00000460378.1 5212 5 16162 18 14807 -18 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AATAAACAACAACAAAAAGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.528.1 chr1 - 2746 2 full-splice_match TMEM200B ENST00000420504.2 2553 2 -185 -8 -185 3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACTGTGGTGTGTCTGAGTCA 7996 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.528.2 chr1 - 2501 2 full-splice_match TMEM200B ENST00000521452.2 2468 2 -40 7 -40 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAGAGTTGTTACTGTGGTGT 6739 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.529.2 chr1 - 1780 3 incomplete-splice_match SRSF4 ENST00000634348.1 8128 7 18596 -113 4642 3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CATGGTGTTTGAATTGAAGT 5535 FALSE NA NA AAAAAG -22 NA NA NA 2 NA PB.529.3 chr1 - 2296 5 full-splice_match SRSF4 ENST00000466448.4 1264 5 -108 -924 -90 -4 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATTTCATGGTGTTTGAA 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.529.4 chr1 - 2276 6 full-splice_match SRSF4 ENST00000373795.7 2300 6 20 4 0 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 61 14.608959 1.164619 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATTTCATGGTGTTTGAA -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 61 NA PB.529.5 chr1 - 2122 6 full-splice_match SRSF4 ENST00000373795.7 2300 6 174 4 154 -4 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATTTCATGGTGTTTGAA 5128 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.529.6 chr1 - 1995 5 incomplete-splice_match SRSF4 ENST00000373795.7 2300 6 21429 4 92 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATTTCATGGTGTTTGAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.529.7 chr1 - 1648 3 incomplete-splice_match SRSF4 ENST00000634348.1 8128 7 18721 -106 4767 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.634403 0.420682 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAATTTCATGGTGTTTGAA 5660 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.529.14 chr1 - 1618 3 incomplete-splice_match SRSF4 ENST00000634348.1 8128 7 18645 0 4691 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAGAAAAGAAAAGAAT 5584 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.529.15 chr1 - 1504 3 incomplete-splice_match SRSF4 ENST00000634348.1 8128 7 18759 0 4805 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.113385 0.493233 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAGAAAAGAAAAGAAT 5698 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.529.19 chr1 - 2204 6 full-splice_match SRSF4 ENST00000373795.7 2300 6 -15 111 -15 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 145 34.726215 1.540657 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAAGAAAAGAAAAGAA -45 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 145 NA PB.529.20 chr1 - 2087 5 full-splice_match SRSF4 ENST00000466448.4 1264 5 -6 -817 2 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAAGAAAAGAAAAGAA -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.529.21 chr1 - 2062 6 novel_in_catalog SRSF4 novel 2952 10 NA NA -5454 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAAGAAAAGAAAAGAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.529.22 chr1 - 1893 5 incomplete-splice_match SRSF4 ENST00000373795.7 2300 6 21424 111 87 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAAGAAAAGAAAAGAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.529.23 chr1 - 1715 4 incomplete-splice_match SRSF4 ENST00000634348.1 8128 7 14084 1 130 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.873893 0.458471 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAAGAAAAGAAAAGAA 1023 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.529.26 chr1 - 1913 4 incomplete-splice_match SRSF4 ENST00000634348.1 8128 7 13884 3 -59 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 ATTAAAAAAGAAAAGAAAAG 823 FALSE NA NA AATAGA -25 NA NA NA 2 NA PB.529.27 chr1 - 1393 2 incomplete-splice_match SRSF4 ENST00000634348.1 8128 7 23339 34 9385 -34 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATATTCTGGTATTGTGATTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.529.30 chr1 - 1048 5 incomplete-splice_match SRSF4 ENST00000373795.7 2300 6 21401 979 64 -51 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAGAAGAAGAAGAAGGAAGA NA FALSE NA NA AAGAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.529.31 chr1 - 920 4 incomplete-splice_match SRSF4 ENST00000634348.1 8128 7 14011 869 57 -51 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAGAAGAAGAAGAAGGAAGA 950 FALSE NA NA AATAAA -28 NA NA NA 4 NA PB.529.33 chr1 - 1254 6 full-splice_match SRSF4 ENST00000373795.7 2300 6 -45 1091 -45 -163 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 GAAGGGCAGGAAGAGAAGCA 4909 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.531.1 chr1 + 5092 28 incomplete-splice_match PTPRU ENST00000373779.8 5573 30 22135 1 -1524 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGAGCAGCCCTGTGTGTG NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.531.2 chr1 + 3968 22 incomplete-splice_match PTPRU ENST00000373779.8 5573 30 42518 1 -511 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGAGCAGCCCTGTGTGTG 7057 FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.531.3 chr1 + 2929 15 incomplete-splice_match PTPRU ENST00000373779.8 5573 30 67377 1 -7447 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGAGCAGCCCTGTGTGTG NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.531.4 chr1 + 2831 15 incomplete-splice_match PTPRU ENST00000428026.6 5550 30 67439 14 -7358 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGAGCAGCCCTGTGTGTG NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.531.5 chr1 + 2399 10 incomplete-splice_match PTPRU ENST00000428026.6 5550 30 75189 14 392 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGAGCAGCCCTGTGTGTG NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.531.6 chr1 + 2174 8 incomplete-splice_match PTPRU ENST00000428026.6 5550 30 78871 14 -2340 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGAGCAGCCCTGTGTGTG NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.531.7 chr1 + 1979 7 incomplete-splice_match PTPRU ENST00000428026.6 5550 30 79560 14 -1651 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGAGCAGCCCTGTGTGTG NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 7 NA PB.531.8 chr1 + 1869 6 incomplete-splice_match PTPRU ENST00000428026.6 5550 30 81266 14 55 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGAGCAGCCCTGTGTGTG NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.531.9 chr1 + 1597 4 full-splice_match PTPRU ENST00000492954.1 625 4 177 -1149 177 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGAGCAGCCCTGTGTGTG NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.531.10 chr1 + 1496 3 incomplete-splice_match PTPRU ENST00000492954.1 625 4 412 -1149 412 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGAGCAGCCCTGTGTGTG NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.531.11 chr1 + 1393 3 incomplete-splice_match PTPRU ENST00000492954.1 625 4 515 -1149 515 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACAGAGCAGCCCTGTGTGTG NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 5 NA PB.532.1 chr1 - 2300 10 full-splice_match MECR ENST00000263702.11 2515 10 -11 226 -3 -10 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TAATTACCATAGTGACTAAT -31 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.532.4 chr1 - 1238 9 novel_in_catalog MECR novel 2515 10 NA NA 0 -4 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAGTAGAAGTCATCCCTG -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.532.5 chr1 - 1652 12 novel_in_catalog MECR novel 2416 10 NA NA 2 -5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGTAGAAGTCATCCCT 10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.532.6 chr1 - 1548 9 novel_in_catalog MECR novel 2515 10 NA NA -6 -5 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGTAGAAGTCATCCCT -34 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.532.7 chr1 - 1516 11 novel_not_in_catalog MECR novel 2416 10 NA NA 0 -5 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGTAGAAGTCATCCCT 23 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.532.8 chr1 - 1437 10 full-splice_match MECR ENST00000373791.7 2416 10 30 949 0 -5 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.592367 0.555381 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGTAGAAGTCATCCCT 20 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.532.9 chr1 - 1424 11 novel_in_catalog MECR novel 2515 10 NA NA 0 -5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGTAGAAGTCATCCCT -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.532.10 chr1 - 1361 10 full-splice_match MECR ENST00000263702.11 2515 10 -11 1165 -3 -5 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 184 44.066368 1.644107 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGTAGAAGTCATCCCT -31 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 184 NA PB.532.11 chr1 - 1146 9 incomplete-splice_match MECR ENST00000373791.7 2416 10 14239 949 -72 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGTAGAAGTCATCCCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.532.12 chr1 - 1022 8 incomplete-splice_match MECR ENST00000373791.7 2416 10 14814 949 -81 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGTAGAAGTCATCCCT NA FALSE NA NA ATTAAA -4 NA NA NA 2 NA PB.532.13 chr1 - 898 7 incomplete-splice_match MECR ENST00000373791.7 2416 10 24037 949 -59 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGTAGAAGTCATCCCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.532.14 chr1 - 775 6 incomplete-splice_match MECR ENST00000373791.7 2416 10 27688 949 -35 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAAAGTAGAAGTCATCCCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.534.1 chr1 - 2487 8 full-splice_match LAPTM5 ENST00000464569.1 953 8 -114 -1420 -114 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGTCTGGCTGATGTGTTTCT 8363 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.534.2 chr1 - 2252 8 full-splice_match LAPTM5 ENST00000294507.4 2177 8 -75 0 -75 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 118 28.259953 1.451171 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGTCTGGCTGATGTGTTTCT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 118 NA PB.534.3 chr1 - 2189 8 full-splice_match LAPTM5 ENST00000294507.4 2177 8 -12 0 -12 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 321 76.876656 1.885795 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGTCTGGCTGATGTGTTTCT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 321 NA PB.534.4 chr1 - 2100 7 novel_in_catalog LAPTM5 novel 2177 8 NA NA 0 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGTCTGGCTGATGTGTTTCT 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.534.5 chr1 - 2029 6 novel_in_catalog LAPTM5 novel 2177 8 NA NA -23 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGTCTGGCTGATGTGTTTCT 8208 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.534.6 chr1 - 2035 7 incomplete-splice_match LAPTM5 ENST00000464569.1 953 8 3706 -1420 3706 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 36 8.621680 0.935592 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGTCTGGCTGATGTGTTTCT 9823 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 36 NA PB.534.7 chr1 - 1857 5 novel_in_catalog LAPTM5 novel 2177 8 NA NA -28 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGTCTGGCTGATGTGTTTCT 8203 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.534.8 chr1 - 1885 5 incomplete-splice_match LAPTM5 ENST00000464569.1 953 8 6297 -1420 6297 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.592367 0.555381 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGTCTGGCTGATGTGTTTCT -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.534.9 chr1 - 1597 3 incomplete-splice_match LAPTM5 ENST00000464569.1 953 8 8571 -1420 8571 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 32 7.663716 0.884439 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGTCTGGCTGATGTGTTTCT 8506 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 32 NA PB.534.16 chr1 - 1207 8 full-splice_match LAPTM5 ENST00000294507.4 2177 8 0 970 0 450 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 85 20.356747 1.308708 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACAACAGTCTATTGCATT 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 85 NA PB.534.17 chr1 - 1065 7 incomplete-splice_match LAPTM5 ENST00000464569.1 953 8 3706 -450 3706 450 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACAACAGTCTATTGCATT 9823 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.534.18 chr1 - 922 5 incomplete-splice_match LAPTM5 ENST00000464569.1 953 8 6290 -450 6290 450 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAACAACAGTCTATTGCATT 8064 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.537.1 chr1 + 1786 4 novel_in_catalog MATN1-AS1 novel 1530 5 NA NA -11 -23 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAATAAATTCAAAACTAATT -23 TRUE NA NA AATAAA -22 NA NA NA 2 NA PB.541.5 chr1 - 1395 7 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000498419.5 3068 17 42735 -91 1420 91 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAACAAACAAAAACAAA NA FALSE NA NA AATGAA -13 NA NA NA 4 NA PB.541.6 chr1 - 1157 5 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000498419.5 3068 17 49588 -91 -99 91 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAACAAACAAAAACAAA NA FALSE NA NA AAGAAA -21 NA NA NA 9 NA PB.541.13 chr1 - 3931 21 novel_in_catalog PUM1 novel 5360 22 NA NA 2 -9 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAAAAAGCTTTAAAAA -25 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.541.14 chr1 - 3202 17 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000373747.7 5375 22 70484 1353 -116 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAAAAAGCTTTAAAAA NA FALSE NA NA TTTAAA -42 NA NA NA 2 NA PB.541.15 chr1 - 2267 12 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000440538.6 3936 22 97257 15 -2047 -9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAAAAAGCTTTAAAAA 6328 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.541.16 chr1 - 1263 6 novel_not_in_catalog PUM1 novel 3068 17 NA NA -3829 -10 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAAAAAAGCTTTAAAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.541.17 chr1 - 3907 21 novel_in_catalog PUM1 novel 5375 22 NA NA 0 -13 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.541.18 chr1 - 3925 22 novel_in_catalog PUM1 novel 5385 22 NA NA 0 -13 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.541.19 chr1 - 4018 22 novel_in_catalog PUM1 novel 5360 22 NA NA 0 -13 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.541.20 chr1 - 3998 22 full-splice_match PUM1 ENST00000257075.9 5360 22 5 1357 2 -13 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.071349 0.609738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.541.21 chr1 - 3736 20 novel_in_catalog PUM1 novel 5375 22 NA NA 0 -13 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.541.22 chr1 - 3922 22 novel_in_catalog PUM1 novel 5360 22 NA NA 0 -13 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.113385 0.493233 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.541.23 chr1 - 3763 21 novel_in_catalog PUM1 novel 5360 22 NA NA 0 -13 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.541.24 chr1 - 4006 22 full-splice_match PUM1 ENST00000426105.7 5385 22 22 1357 0 -13 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 24 5.747787 0.759501 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 24 NA PB.541.25 chr1 - 3710 21 novel_in_catalog PUM1 novel 5385 22 NA NA 0 -13 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.541.26 chr1 - 3946 22 novel_in_catalog PUM1 novel 3936 22 NA NA 3 -13 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.541.27 chr1 - 3065 17 novel_in_catalog PUM1 novel 5360 22 NA NA -11913 -13 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.541.28 chr1 - 3081 17 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000257075.9 5360 22 70586 1357 -8 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.541.29 chr1 - 2782 16 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000257075.9 5360 22 73278 1357 2639 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 164 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.541.30 chr1 - 2526 14 novel_in_catalog PUM1 novel 5375 22 NA NA 737 -13 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA AAAACA -34 NA NA NA 3 NA PB.541.31 chr1 - 2434 13 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000373742.6 3515 20 91104 -217 178 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 74 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.541.33 chr1 - 2115 10 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000373742.6 3515 20 99512 -217 107 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 8482 FALSE NA NA AAGAAA -32 NA NA NA 4 NA PB.541.34 chr1 - 1898 10 novel_in_catalog PUM1 novel 3068 17 NA NA 2601 -13 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 126 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.541.36 chr1 - 1771 9 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000498419.5 3068 17 30207 19 20 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 9903 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.541.37 chr1 - 1780 9 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000373742.6 3515 20 100918 -217 5 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA 9888 FALSE NA NA ACTAAA -3 NA NA NA 4 NA PB.541.38 chr1 - 1590 8 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000498419.5 3068 17 41080 19 -222 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.541.39 chr1 - 1362 8 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000498419.5 3068 17 41308 19 6 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.541.40 chr1 - 1272 7 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000373742.6 3515 20 113468 -217 1427 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA AATGAA -6 NA NA NA 4 NA PB.541.41 chr1 - 1142 6 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000373742.6 3515 20 115570 -217 3529 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.541.42 chr1 - 1131 6 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000498419.5 3068 17 44861 19 3546 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.592367 0.555381 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.541.43 chr1 - 828 4 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000498419.5 3068 17 53029 19 3342 -13 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AACAAAAAAAAAAAGCTTTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.541.44 chr1 - 3083 17 novel_in_catalog PUM1 novel 5385 22 NA NA -86 -14 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 TAACAAAAAAAAAAAGCTTT NA FALSE NA NA TTTAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.541.47 chr1 - 1981 12 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000440538.6 3936 22 -11 34225 0 156 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTATATCGGTTCTACCCTG 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.541.58 chr1 - 837 6 incomplete-splice_match PUM1 ENST00000440538.6 3936 22 -11 62351 0 -13 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 20 4.789823 0.680319 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAACGACAAAGGTGAAAAGA 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 20 NA PB.542.4 chr1 - 2359 5 incomplete-splice_match NKAIN1 ENST00000373736.7 2922 7 54589 2 2855 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCTTCCTGTCCTGCCCAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.545.1 chr1 - 799 4 full-splice_match SNRNP40 ENST00000373720.3 1087 4 429 -141 429 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGAAGCTGCTCACTTGTTTT -12 TRUE NA NA AATAAA -26 NA NA NA 3 NA PB.545.2 chr1 - 1829 11 novel_not_in_catalog SNRNP40 novel 1615 10 NA NA 0 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGAAGCTGCTCACTTGTTT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.545.3 chr1 - 1536 9 novel_in_catalog SNRNP40 novel 1615 10 NA NA 9 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGAAGCTGCTCACTTGTTT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.545.4 chr1 - 1610 10 full-splice_match SNRNP40 ENST00000263694.9 1615 10 3 2 -3 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 157 37.600109 1.575189 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGAAGCTGCTCACTTGTTT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 157 NA PB.545.5 chr1 - 1322 9 incomplete-splice_match SNRNP40 ENST00000263694.9 1615 10 3553 2 3547 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGAAGCTGCTCACTTGTTT 3581 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.545.6 chr1 - 1040 6 full-splice_match SNRNP40 ENST00000489853.1 1928 6 992 -104 992 -2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGAAGCTGCTCACTTGTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.545.7 chr1 - 907 5 incomplete-splice_match SNRNP40 ENST00000489853.1 1928 6 10998 -103 -1819 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 CAAGAAGCTGCTCACTTGTT NA FALSE NA NA AAAACA -26 NA NA NA 2 NA PB.545.8 chr1 - 1525 10 full-splice_match SNRNP40 ENST00000263694.9 1615 10 -19 109 -19 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 1144 273.977844 2.437716 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAGCCATGTGGATTGGAT 9 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 1144 NA PB.545.9 chr1 - 864 6 full-splice_match SNRNP40 ENST00000489853.1 1928 6 1066 -2 1066 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CCATGTGGATTGGATTTATT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.545.10 chr1 - 1722 11 novel_not_in_catalog SNRNP40 novel 1615 10 NA NA 0 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 25 5.987278 0.777229 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAGCCATGTGGATTGGAT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 25 NA PB.545.11 chr1 - 1444 9 novel_in_catalog SNRNP40 novel 1615 10 NA NA 0 -3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAGCCATGTGGATTGGAT -12 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.545.12 chr1 - 1284 9 incomplete-splice_match SNRNP40 ENST00000263694.9 1615 10 3484 109 3478 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 32 7.663716 0.884439 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAGCCATGTGGATTGGAT 3512 FALSE NA NA GGGGCT -33 NA NA NA 32 NA PB.545.13 chr1 - 1180 8 incomplete-splice_match SNRNP40 ENST00000263694.9 1615 10 4800 109 -2569 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 24 5.747787 0.759501 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAGCCATGTGGATTGGAT 4828 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 24 NA PB.545.14 chr1 - 775 5 incomplete-splice_match SNRNP40 ENST00000489853.1 1928 6 11024 3 -1793 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGAGCCATGTGGATTGGAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.545.15 chr1 - 1210 4 full-splice_match SNRNP40 ENST00000373720.3 1087 4 -93 -30 -93 -6 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TACAAGAGCCATGTGGATTG NA FALSE NA NA AGTAAA -31 NA NA NA 2 NA PB.545.16 chr1 - 1257 6 incomplete-splice_match SNRNP40 ENST00000263694.9 1615 10 27 11339 21 301 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACACACTCTTGCTCTTTCT 15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.545.17 chr1 - 1062 7 novel_not_in_catalog SNRNP40 novel 581 3 NA NA 25 301 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACACACTCTTGCTCTTTCT 19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.546.1 chr1 + 1376 6 novel_in_catalog ZCCHC17 novel 1534 7 NA NA 0 -4 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAACTTACTGAGTTATTTT -20 TRUE NA NA ACTAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.546.2 chr1 + 1596 8 full-splice_match ZCCHC17 ENST00000344147.10 1568 8 -32 4 2 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 114 27.301989 1.436194 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAACTTACTGAGTTATTTT -18 TRUE NA NA ACTAAA -19 NA NA NA 114 NA PB.546.3 chr1 + 1350 6 novel_in_catalog ZCCHC17 novel 1489 7 NA NA 2 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACTTACTGAGTTATTTTT -18 TRUE NA NA ACTAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.546.4 chr1 + 937 7 incomplete-splice_match ZCCHC17 ENST00000344147.10 1568 8 -32 15720 2 248 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAGAAAAATGAA -18 TRUE NA NA AAAAAG -15 NA NA NA 7 NA PB.546.6 chr1 + 682 7 incomplete-splice_match ZCCHC17 ENST00000344147.10 1568 8 -32 15975 2 -7 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.873893 0.458471 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAAGAAAGAAGGTGAATG -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.546.7 chr1 + 1456 7 novel_in_catalog ZCCHC17 novel 1568 8 NA NA 11 -4 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAACTTACTGAGTTATTTT 1 TRUE NA NA ACTAAA -19 NA NA NA 5 NA PB.546.9 chr1 + 1595 8 novel_in_catalog ZCCHC17 novel 1730 8 NA NA -9 -3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACTTACTGAGTTATTTTT 5 TRUE NA NA ACTAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.546.10 chr1 + 1516 7 novel_in_catalog ZCCHC17 novel 1568 8 NA NA -9 -3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACTTACTGAGTTATTTTT 5 TRUE NA NA ACTAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.546.12 chr1 + 1641 9 full-splice_match ZCCHC17 ENST00000546109.5 1705 9 43 21 -7 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAACTTACTGAGTTATTTT 7 TRUE NA NA ACTAAA -19 NA NA NA 9 NA PB.546.13 chr1 + 1323 8 novel_not_in_catalog ZCCHC17 novel 1568 8 NA NA 8 12530 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAAGAAATGTCTGTTTAGT 26 TRUE NA NA AATAAA -25 NA NA NA 2 NA PB.546.15 chr1 + 1686 8 full-splice_match ZCCHC17 ENST00000373714.5 1730 8 41 3 13 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACTTACTGAGTTATTTTT 31 FALSE NA NA ACTAAA -20 NA NA NA 6 NA PB.546.19 chr1 + 1462 7 incomplete-splice_match ZCCHC17 ENST00000344147.10 1568 8 13070 4 13066 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.873893 0.458471 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAACTTACTGAGTTATTTT NA FALSE NA NA ACTAAA -19 NA NA NA 12 NA PB.546.22 chr1 + 1342 5 incomplete-splice_match ZCCHC17 ENST00000344147.10 1568 8 40142 4 40138 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAACTTACTGAGTTATTTT NA FALSE NA NA ACTAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.546.23 chr1 + 1289 5 incomplete-splice_match ZCCHC17 ENST00000344147.10 1568 8 40195 4 40191 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAACTTACTGAGTTATTTT NA FALSE NA NA ACTAAA -19 NA NA NA 7 NA PB.546.24 chr1 + 1018 2 incomplete-splice_match ZCCHC17 ENST00000344147.10 1568 8 51827 3 51823 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACTTACTGAGTTATTTTT 2175 FALSE NA NA ACTAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.547.1 chr1 + 1895 10 full-splice_match SERINC2 ENST00000373709.8 1900 10 0 5 0 -4 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 158 37.839600 1.577947 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACCATGTTCTGTGCCCCTC -7 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 158 NA PB.547.2 chr1 + 1816 9 novel_in_catalog SERINC2 novel 1900 10 NA NA 0 -3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACCATGTTCTGTGCCCCTCA -7 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.547.3 chr1 + 1675 9 novel_in_catalog SERINC2 novel 1900 10 NA NA 30 -3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACCATGTTCTGTGCCCCTCA 23 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.547.4 chr1 + 1733 9 incomplete-splice_match SERINC2 ENST00000491976.1 2807 11 9951 3 9951 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACCATGTTCTGTGCCCCTCA 36 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 7 NA PB.547.5 chr1 + 1621 8 incomplete-splice_match SERINC2 ENST00000491976.1 2807 11 10890 4 10890 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACCATGTTCTGTGCCCCTC 907 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.547.6 chr1 + 1455 7 incomplete-splice_match SERINC2 ENST00000491976.1 2807 11 11516 0 11516 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTCTGTGCCCCTCACCC -6 TRUE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 8 NA PB.547.7 chr1 + 1322 6 incomplete-splice_match SERINC2 ENST00000491976.1 2807 11 12015 0 12015 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTCTGTGCCCCTCACCC 29 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 9 NA PB.547.8 chr1 + 1084 5 incomplete-splice_match SERINC2 ENST00000491976.1 2807 11 12993 0 12993 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTCTGTGCCCCTCACCC 48 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 5 NA PB.547.9 chr1 + 1239 2 incomplete-splice_match SERINC2 ENST00000491976.1 2807 11 18748 0 18748 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATGTTCTGTGCCCCTCACCC 3058 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.548.1 chr1 - 886 4 full-splice_match FABP3 ENST00000373713.7 1097 4 0 211 0 -211 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TACACGTTGCCTTTACACTG -1 TRUE NA NA TTTAAA -23 NA NA NA 2 NA PB.548.2 chr1 - 740 4 full-splice_match FABP3 ENST00000373713.7 1097 4 -17 374 -17 86 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.873893 0.458471 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AACTCTGGGAGTCTTGGTTT 247 FALSE NA NA TTTAAA -40 NA NA NA 12 NA PB.549.2 chr1 - 1626 5 full-splice_match PEF1 ENST00000373703.5 1614 5 -13 1 7 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 343 82.145454 1.914584 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTTCCATGTTTTCCACCAT -11 TRUE NA NA GGGGCT -38 NA NA NA 343 NA PB.549.3 chr1 - 1500 5 novel_in_catalog PEF1 novel 1614 5 NA NA 3 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTTCCATGTTTTCCACCAT 5 TRUE NA NA GGGGCT -22 NA NA NA 4 NA PB.549.4 chr1 - 1496 4 incomplete-splice_match PEF1 ENST00000373703.5 1614 5 9435 1 31 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.310840 0.634562 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTTCCATGTTTTCCACCAT 9732 FALSE NA NA GGGGCT -2 NA NA NA 18 NA PB.549.5 chr1 - 1165 6 novel_not_in_catalog PEF1 novel 1614 5 NA NA -3 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTTCCATGTTTTCCACCAT -1 TRUE NA NA GGGGCT -28 NA NA NA 5 NA PB.549.6 chr1 - 1170 3 incomplete-splice_match PEF1 ENST00000373703.5 1614 5 11668 1 2052 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.550332 0.658043 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTTCCATGTTTTCCACCAT 2327 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.549.7 chr1 - 1014 2 incomplete-splice_match PEF1 ENST00000373703.5 1614 5 12344 1 2728 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.873893 0.458471 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTTCCATGTTTTCCACCAT 3003 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.549.10 chr1 - 2071 5 novel_in_catalog PEF1 novel 1614 5 NA NA -17 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GGAGTTCCATGTTTTCCACC 555 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.549.11 chr1 - 1968 5 full-splice_match PEF1 ENST00000373703.5 1614 5 -357 3 -337 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GGAGTTCCATGTTTTCCACC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.549.12 chr1 - 1464 4 novel_in_catalog PEF1 novel 1614 5 NA NA 3 -3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GGAGTTCCATGTTTTCCACC 5 TRUE NA NA GGGGCT -22 NA NA NA 2 NA PB.549.13 chr1 - 1300 4 full-splice_match PEF1 ENST00000478502.5 750 4 30 -580 10 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 25 5.987278 0.777229 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GGAGTTCCATGTTTTCCACC 12 TRUE NA NA GGGGCT -15 NA NA NA 25 NA PB.550.2 chr1 - 1695 21 incomplete-splice_match COL16A1 ENST00000373672.8 5418 71 35799 259 -1833 -11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAATAATAAAGAAACAAAAC 5012 FALSE NA NA AAGAAA -40 NA NA NA 4 NA PB.550.3 chr1 - 1373 15 incomplete-splice_match COL16A1 ENST00000373672.8 5418 71 41375 259 814 -11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAATAATAAAGAAACAAAAC 7778 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.550.4 chr1 - 1211 12 incomplete-splice_match COL16A1 ENST00000373672.8 5418 71 42566 259 309 -11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAATAATAAAGAAACAAAAC 8969 FALSE NA NA AAAAAG -31 NA NA NA 3 NA PB.550.5 chr1 - 1120 10 incomplete-splice_match COL16A1 ENST00000373672.8 5418 71 43378 259 1121 -11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAATAATAAAGAAACAAAAC 9781 FALSE NA NA AAAAAG -33 NA NA NA 3 NA PB.550.6 chr1 - 879 6 incomplete-splice_match COL16A1 ENST00000373672.8 5418 71 47582 259 -587 -11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAATAATAAAGAAACAAAAC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.551.1 chr1 - 1424 7 incomplete-splice_match ADGRB2 ENST00000398556.7 4879 29 26823 1 2747 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTTGCTGCTGAGCTGTTT 4139 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.551.2 chr1 - 1031 5 incomplete-splice_match ADGRB2 ENST00000398556.7 4879 29 28273 1 4197 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTTGCTGCTGAGCTGTTT 5589 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.552.1 chr1 - 2075 9 incomplete-splice_match SPOCD1 ENST00000533231.5 3774 15 16614 -51 10 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATTGGGATTGCATCTGC 6 TRUE NA NA GGGGCT -2 NA NA NA 4 NA PB.552.2 chr1 - 1941 9 full-splice_match SPOCD1 ENST00000452755.6 2105 9 217 -53 -7 -2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GATTGCATCTGCTAGCTGGT -18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.552.4 chr1 - 1513 6 incomplete-splice_match SPOCD1 ENST00000452755.6 2105 9 4603 -45 4379 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAATTGGGATTGCATCTGC 4531 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.552.5 chr1 - 1948 8 novel_in_catalog SPOCD1 novel 2105 9 NA NA 10 -5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAAAATTGGGATTGCATCTG 6 TRUE NA NA GGGGCT -2 NA NA NA 4 NA PB.552.6 chr1 - 2689 2 full-splice_match SPOCD1 ENST00000460061.5 2625 2 -83 19 2 -19 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAACAAACAAACAAACA -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.552.7 chr1 - 2437 3 full-splice_match SPOCD1 ENST00000468720.5 2667 3 191 39 35 -19 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAACAAACAAACAAACA 24 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.553.1 chr1 + 2377 12 full-splice_match TINAGL1 ENST00000271064.12 2207 12 -172 2 -142 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACTACAGTGTCTTGGAACC NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.553.2 chr1 + 2182 12 full-splice_match TINAGL1 ENST00000271064.12 2207 12 23 2 -4 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 23 5.508296 0.741017 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AACTACAGTGTCTTGGAACC -3 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 23 NA PB.553.3 chr1 + 920 3 incomplete-splice_match TINAGL1 ENST00000463112.1 3075 5 2334 4 696 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATAACTACAGTGTCTTGGAA 2335 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.557.1 chr1 + 2305 9 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 -187 595 -187 -595 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAACAACAAAAT NA FALSE NA NA ATTAAA -33 NA NA NA 3 NA PB.557.3 chr1 + 2623 8 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000492989.1 1215 8 -158 -1250 -30 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGTAAATGTGATGAATTG NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.557.4 chr1 + 2331 11 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000484270.2 1989 11 -344 2 -30 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GATGAATGGTCCCACTCTGG NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.557.5 chr1 + 1641 8 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000492989.1 1215 8 -136 -290 -8 290 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATAAAAAAAAGAAGTTGAG -4 TRUE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 5 NA PB.557.6 chr1 + 903 2 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000492989.1 1215 8 -133 11939 -5 -11939 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAGAAAAAAAAATTAAAAC -1 TRUE NA NA AAAAAG -36 NA NA NA 2 NA PB.557.8 chr1 + 1752 9 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 -2 963 -2 290 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 179 42.868912 1.632142 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATAAAAAAAAGAAGTTGAG 2 TRUE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 179 NA PB.557.9 chr1 + 2711 9 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 -1 3 -1 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 43 10.298119 1.012758 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGTAAATGTGATGAATTG 3 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 43 NA PB.557.11 chr1 + 2115 9 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 2 596 2 -596 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 TAAAAAAAAAAACAACAAAA 6 TRUE NA NA ATTAAA -32 NA NA NA 10 NA PB.557.12 chr1 + 2608 9 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 102 3 -26 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGTAAATGTGATGAATTG 106 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.557.13 chr1 + 1625 9 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 125 963 -3 290 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATAAAAAAAAGAAGTTGAG 129 FALSE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 7 NA PB.557.14 chr1 + 1482 8 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000492989.1 1215 8 44 -311 44 311 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAAACACACAAA 176 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.557.15 chr1 + 2475 9 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 235 3 -79 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGTAAATGTGATGAATTG 239 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.557.17 chr1 + 1434 9 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 316 963 2 290 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.071349 0.609738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATAAAAAAAAGAAGTTGAG -8 TRUE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 17 NA PB.557.18 chr1 + 1779 9 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 339 595 25 -595 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAACAACAAAAT 15 FALSE NA NA ATTAAA -33 NA NA NA 3 NA PB.557.19 chr1 + 2348 9 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 362 3 48 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGTAAATGTGATGAATTG -26 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.557.20 chr1 + 1299 9 full-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 451 963 137 290 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.592367 0.555381 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATAAAAAAAAGAAGTTGAG 63 FALSE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 15 NA PB.557.23 chr1 + 2179 8 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 16451 3 16137 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGTAAATGTGATGAATTG NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 6 NA PB.557.24 chr1 + 1195 8 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 16475 963 16161 290 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 35 8.382190 0.923357 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATAAAAAAAAGAAGTTGAG NA FALSE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 35 NA PB.557.25 chr1 + 1519 8 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 16519 595 16205 -595 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAACAACAAAAT NA FALSE NA NA ATTAAA -33 NA NA NA 6 NA PB.557.26 chr1 + 1060 7 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 17711 963 17397 290 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.873893 0.458471 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATAAAAAAAAGAAGTTGAG NA FALSE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 12 NA PB.557.27 chr1 + 1391 7 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 17748 595 17434 -595 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAACAACAAAAT NA FALSE NA NA ATTAAA -33 NA NA NA 4 NA PB.557.28 chr1 + 1960 6 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 19318 3 19004 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGTAAATGTGATGAATTG NA FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 8 NA PB.557.29 chr1 + 1000 6 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000492989.1 1215 8 19190 -290 19004 290 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 24 5.747787 0.759501 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATAAAAAAAAGAAGTTGAG NA FALSE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 24 NA PB.557.30 chr1 + 1287 6 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000492989.1 1215 8 19270 -657 19084 -596 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 TAAAAAAAAAAACAACAAAA NA FALSE NA NA ATTAAA -32 NA NA NA 4 NA PB.557.31 chr1 + 1394 5 novel_in_catalog KHDRBS1 novel 1989 11 NA NA 19125 290 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATAAAAAAAAGAAGTTGAG 24 FALSE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.557.32 chr1 + 870 6 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000492989.1 1215 8 19320 -290 19134 290 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATAAAAAAAAGAAGTTGAG 33 FALSE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 9 NA PB.557.34 chr1 + 1811 5 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 23041 4 22727 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 CAAAGTAAATGTGATGAATT 3626 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 8 NA PB.557.35 chr1 + 776 5 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000492989.1 1215 8 22989 -290 22803 290 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATAAAAAAAAGAAGTTGAG 3702 FALSE NA NA TATAAA -19 NA NA NA 10 NA PB.557.36 chr1 + 1072 4 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000492989.1 1215 8 23852 -658 23666 -595 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAACAACAAAAT 4565 FALSE NA NA ATTAAA -33 NA NA NA 6 NA PB.557.37 chr1 + 1660 4 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000327300.12 2713 9 23984 3 23670 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.310840 0.634562 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGTAAATGTGATGAATTG 4569 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 18 NA PB.557.39 chr1 + 883 3 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000492989.1 1215 8 24556 -658 24370 -595 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAACAACAAAAT 5269 FALSE NA NA ATTAAA -33 NA NA NA 5 NA PB.557.41 chr1 + 1407 2 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000307714.12 2738 9 25589 3 25333 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 32 7.663716 0.884439 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AAAGTAAATGTGATGAATTG 6232 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 32 NA PB.557.42 chr1 + 784 2 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000492989.1 1215 8 25550 -658 25364 -595 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAAAAAACAACAAAAT 6263 FALSE NA NA ATTAAA -33 NA NA NA 3 NA PB.557.51 chr1 + 2311 2 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000484270.2 1989 11 29583 3 29583 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGATGAATGGTCCCACTCTG NA FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.557.52 chr1 + 797 2 incomplete-splice_match KHDRBS1 ENST00000484270.2 1989 11 31098 2 31098 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GATGAATGGTCCCACTCTGG NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.558.1 chr1 + 1740 9 novel_not_in_catalog TMEM39B novel 1778 9 NA NA -72 -1804 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATTTGGTTGTAGATCTTTGA NA FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.558.2 chr1 + 1936 10 novel_not_in_catalog TMEM39B novel 1834 10 NA NA -33 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG 2 TRUE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 2 NA PB.558.3 chr1 + 2910 7 novel_not_in_catalog TMEM39B novel 1538 7 NA NA -10 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG -41 TRUE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 4 NA PB.558.4 chr1 + 1543 7 full-splice_match TMEM39B ENST00000441402.5 1538 7 -10 5 -2 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 71 17.003870 1.230548 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG -33 TRUE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 71 NA PB.558.5 chr1 + 3139 9 novel_not_in_catalog TMEM39B novel 1778 9 NA NA 0 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG -31 TRUE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 2 NA PB.558.6 chr1 + 1880 10 novel_in_catalog TMEM39B novel 1834 10 NA NA -1 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG -28 TRUE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 4 NA PB.558.7 chr1 + 1621 8 novel_in_catalog TMEM39B novel 1778 9 NA NA 0 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG -27 TRUE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 5 NA PB.558.8 chr1 + 1775 9 full-splice_match TMEM39B ENST00000336294.10 1778 9 1 2 1 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 45 10.777101 1.032502 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG -26 TRUE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 45 NA PB.558.9 chr1 + 1532 7 novel_not_in_catalog TMEM39B novel 1538 7 NA NA -7 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG -14 TRUE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 2 NA PB.558.10 chr1 + 1499 7 incomplete-splice_match TMEM39B ENST00000336294.10 1778 9 2701 2 -491 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG 2674 FALSE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 2 NA PB.558.11 chr1 + 1284 6 incomplete-splice_match TMEM39B ENST00000468135.5 1834 10 3826 5 664 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG 3829 FALSE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 2 NA PB.558.12 chr1 + 891 4 incomplete-splice_match TMEM39B ENST00000468135.5 1834 10 18892 5 15730 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACAAGCCTGTGTCCTGTGG 8420 FALSE NA NA AAAAAG -19 NA NA NA 4 NA PB.559.1 chr1 + 4108 15 novel_not_in_catalog KPNA6 novel 7355 14 NA NA -33 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.559.3 chr1 + 3967 14 full-splice_match KPNA6 ENST00000373625.8 7355 14 -3 3391 -3 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 29 6.945243 0.841687 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA -1 TRUE NA NA ATTAAA -20 NA NA NA 29 NA PB.559.4 chr1 + 2227 14 full-splice_match KPNA6 ENST00000373625.8 7355 14 -1 5129 -1 -1739 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.831858 0.583409 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TTGGATTGAGTTATTTAATT 1 TRUE NA NA AAAACA -39 NA NA NA 16 NA PB.559.5 chr1 + 3777 13 incomplete-splice_match KPNA6 ENST00000373625.8 7355 14 46640 3391 -2166 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA ATTAAA -20 NA NA NA 7 NA PB.559.6 chr1 + 1925 11 incomplete-splice_match KPNA6 ENST00000373625.8 7355 14 49289 5125 483 -1735 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATTGAGTTATTTAATTTTTT NA FALSE NA NA AAAACA -43 NA NA NA 2 NA PB.559.7 chr1 + 3632 11 incomplete-splice_match KPNA6 ENST00000373625.8 7355 14 49316 3391 510 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA ATTAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.559.8 chr1 + 3144 6 incomplete-splice_match KPNA6 ENST00000471599.5 3941 14 54301 1 5497 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA ATTAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.559.9 chr1 + 1226 7 novel_in_catalog ENSG00000250135 novel 667 2 NA NA -8240 -11 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAGTTCTAAATTGTCTTCT NA FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 2 NA PB.559.10 chr1 + 1221 5 incomplete-splice_match KPNA6 ENST00000471599.5 3941 14 55199 1736 6395 -1736 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GATTGAGTTATTTAATTTTT NA FALSE NA NA AAAACA -42 NA NA NA 2 NA PB.559.11 chr1 + 2924 5 incomplete-splice_match KPNA6 ENST00000471599.5 3941 14 55229 3 6425 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 TTTAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.559.12 chr1 + 2902 4 incomplete-splice_match KPNA6 ENST00000471599.5 3941 14 58045 0 9241 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 3 NA PB.559.13 chr1 + 996 3 incomplete-splice_match KPNA6 ENST00000471599.5 3941 14 59151 1738 10347 -1738 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TGGATTGAGTTATTTAATTT NA FALSE NA NA AAAACA -40 NA NA NA 2 NA PB.559.14 chr1 + 2689 3 incomplete-splice_match KPNA6 ENST00000471599.5 3941 14 59195 1 10391 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA ATTAAA -20 NA NA NA 4 NA PB.559.15 chr1 + 2532 2 incomplete-splice_match KPNA6 ENST00000471599.5 3941 14 61938 0 13134 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NA FALSE NA NA ATTAAA -21 NA NA NA 7 NA PB.560.2 chr1 + 4802 11 full-splice_match TXLNA ENST00000373610.8 4865 11 62 1 62 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.071349 0.609738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTGTTTCTCTCCTGACCT 12 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 17 NA PB.560.3 chr1 + 4994 10 full-splice_match TXLNA ENST00000373609.1 5012 10 17 1 17 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.873893 0.458471 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTGTTTCTCTCCTGACCT -8 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 12 NA PB.560.4 chr1 + 4134 7 incomplete-splice_match TXLNA ENST00000373609.1 5012 10 7888 1 7888 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTTGTTTCTCTCCTGACCT 4505 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.560.5 chr1 + 3765 5 incomplete-splice_match TXLNA ENST00000373609.1 5012 10 12244 5 12244 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CCTTACTTGTTTCTCTCCTG 8861 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 3 NA PB.560.6 chr1 + 3599 4 incomplete-splice_match TXLNA ENST00000373609.1 5012 10 12639 2 12639 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TACTTGTTTCTCTCCTGACC 9256 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 5 NA PB.561.1 chr1 + 673 5 full-splice_match CCDC28B ENST00000681230.1 633 5 -51 11 2 -7 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGAAAGCAAGCGGCTCCG -34 TRUE NA NA ATTAAA -5 NA NA NA 2 NA PB.561.2 chr1 + 1402 5 full-splice_match CCDC28B ENST00000421922.6 1415 5 2 11 -1 -7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGAAAGCAAGCGGCTCCG 4 TRUE NA NA ATTAAA -5 NA NA NA 6 NA PB.561.3 chr1 + 819 6 full-splice_match CCDC28B ENST00000373602.10 880 6 50 11 1 -7 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 53 12.693029 1.103565 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGAAAGCAAGCGGCTCCG 14 TRUE NA NA ATTAAA -5 NA NA NA 53 NA PB.561.4 chr1 + 800 4 full-splice_match CCDC28B ENST00000483009.1 615 4 -23 -162 -23 -7 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGAAAGCAAGCGGCTCCG -6 TRUE NA NA ATTAAA -5 NA NA NA 3 NA PB.561.5 chr1 + 970 5 incomplete-splice_match CCDC28B ENST00000373602.10 880 6 1102 11 1 -7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.113385 0.493233 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAGAAAGCAAGCGGCTCCG -24 TRUE NA NA ATTAAA -5 NA NA NA 13 NA PB.562.17 chr1 - 1955 6 full-splice_match PTP4A2 ENST00000647444.2 3910 6 123 1832 -59 10 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAACAAA 94 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.562.18 chr1 - 1696 5 full-splice_match PTP4A2 ENST00000602725.5 3353 5 -175 1832 -175 10 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAACAAA NA FALSE NA NA AGTAAA -27 NA NA NA 9 NA PB.562.19 chr1 - 1665 5 novel_in_catalog PTP4A2 novel 2213 8 NA NA 2 10 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAACAAA -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.562.20 chr1 - 1452 5 full-splice_match PTP4A2 ENST00000602725.5 3353 5 69 1832 -46 10 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAACAAA 191 FALSE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 4 NA PB.562.21 chr1 - 1363 5 full-splice_match PTP4A2 ENST00000602725.5 3353 5 158 1832 34 10 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.592367 0.555381 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAACAAA 280 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 15 NA PB.562.22 chr1 - 1282 4 novel_in_catalog PTP4A2 novel 3910 6 NA NA 4 10 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAACAAA -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.562.23 chr1 - 1261 5 full-splice_match PTP4A2 ENST00000602725.5 3353 5 260 1832 -51 10 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 29 6.945243 0.841687 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 95.000000 AAAAAAAAAAAAAAAACAAA 382 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 29 NA PB.562.25 chr1 - 1984 5 novel_in_catalog PTP4A2 novel 3910 6 NA NA 0 9 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAACAA -29 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.562.26 chr1 - 2057 6 full-splice_match PTP4A2 ENST00000647444.2 3910 6 20 1833 10 9 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 30 7.184734 0.856411 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAACAA -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 30 NA PB.562.29 chr1 - 1867 5 novel_in_catalog PTP4A2 novel 3910 6 NA NA -65 9 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAACAA 88 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.562.30 chr1 - 1793 6 novel_in_catalog PTP4A2 novel 2213 8 NA NA 6745 9 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAACAA -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.562.32 chr1 - 1540 5 full-splice_match PTP4A2 ENST00000602725.5 3353 5 -20 1833 -20 9 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.310840 0.634562 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAACAA 102 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 18 NA PB.562.33 chr1 - 1197 4 full-splice_match PTP4A2 ENST00000602683.5 667 4 -126 -404 -63 9 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAACAA 370 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.562.34 chr1 - 1071 4 novel_in_catalog PTP4A2 novel 3910 6 NA NA 42 9 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAACAA 195 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.562.35 chr1 - 947 4 incomplete-splice_match PTP4A2 ENST00000602725.5 3353 5 3555 1833 3181 9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 28 6.705751 0.826447 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAACAA 3677 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 28 NA PB.562.36 chr1 - 766 2 full-splice_match PTP4A2 ENST00000489313.1 1551 2 1184 -399 1184 9 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAACAA 9509 FALSE NA NA AAGAAA -22 NA NA NA 6 NA PB.562.39 chr1 - 1851 6 full-splice_match PTP4A2 ENST00000647444.2 3910 6 225 1834 43 8 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 ATAAAAAAAAAAAAAAAACA 196 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.562.40 chr1 - 1722 6 novel_in_catalog PTP4A2 novel 3910 6 NA NA -5 8 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 ATAAAAAAAAAAAAAAAACA 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.562.41 chr1 - 1165 4 full-splice_match PTP4A2 ENST00000457805.6 1032 4 143 -276 -53 5 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 TAGATAAAAAAAAAAAAAAA 380 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.562.42 chr1 - 1656 6 full-splice_match PTP4A2 ENST00000647444.2 3910 6 14 2240 4 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 59 14.129976 1.150141 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA -15 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 59 NA PB.562.44 chr1 - 1525 7 novel_in_catalog PTP4A2 novel 2213 8 NA NA 1 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.562.46 chr1 - 1540 6 full-splice_match PTP4A2 ENST00000647444.2 3910 6 130 2240 -52 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 24 5.747787 0.759501 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 101 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 24 NA PB.562.50 chr1 - 1434 6 full-splice_match PTP4A2 ENST00000647444.2 3910 6 236 2240 54 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.113385 0.493233 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 207 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.562.54 chr1 - 1325 6 novel_in_catalog PTP4A2 novel 3910 6 NA NA 4 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.352876 0.525417 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.562.55 chr1 - 1309 6 novel_in_catalog PTP4A2 novel 2213 8 NA NA 0 -3 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.562.57 chr1 - 1248 5 novel_in_catalog PTP4A2 novel 3910 6 NA NA 21 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 318 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.562.58 chr1 - 1288 5 full-splice_match PTP4A2 ENST00000602725.5 3353 5 -175 2240 -175 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.831858 0.583409 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA NA FALSE NA NA AGTAAA -27 NA NA NA 16 NA PB.562.60 chr1 - 1118 5 full-splice_match PTP4A2 ENST00000602725.5 3353 5 -5 2240 -5 -3 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 30 7.184734 0.856411 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 117 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 30 NA PB.562.61 chr1 - 1083 4 full-splice_match PTP4A2 ENST00000457805.6 1032 4 -178 127 -63 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 59 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.562.62 chr1 - 969 5 full-splice_match PTP4A2 ENST00000602725.5 3353 5 144 2240 20 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 32 7.663716 0.884439 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 266 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 32 NA PB.562.63 chr1 - 863 5 full-splice_match PTP4A2 ENST00000602725.5 3353 5 250 2240 -61 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.113385 0.493233 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAGAAAAGAGAAAGAGAAAA 372 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.562.64 chr1 - 1360 6 novel_in_catalog PTP4A2 novel 2213 8 NA NA 6770 -4 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 TAAGAAAAGAGAAAGAGAAA 7334 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.562.65 chr1 - 1327 6 novel_not_in_catalog PTP4A2 novel 3910 6 NA NA 182 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 TAAGAAAAGAGAAAGAGAAA 746 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.562.67 chr1 - 1405 7 novel_in_catalog PTP4A2 novel 3910 6 NA NA 2 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AACAAAAGCAAACAAAAAAG -17 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.562.69 chr1 - 1253 4 novel_in_catalog PTP4A2 novel 3910 6 NA NA 13 30 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGTGAGTATGAAGTTTTTGT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.562.70 chr1 - 1085 5 novel_in_catalog PTP4A2 novel 2213 8 NA NA 6745 30 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGTGAGTATGAAGTTTTTGT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.563.1 chr1 + 2245 4 full-splice_match IQCC ENST00000617816.1 2089 4 -23 -133 -23 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTCTGAGTCTGGCTGCTTT -11 TRUE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.563.2 chr1 + 2022 5 full-splice_match IQCC ENST00000291358.11 2012 5 -13 3 -13 -3 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 24 5.747787 0.759501 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AGATTCTGAGTCTGGCTGCT -1 TRUE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 24 NA PB.563.3 chr1 + 1730 3 incomplete-splice_match IQCC ENST00000291358.11 2012 5 922 1 922 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTCTGAGTCTGGCTGCTTT 903 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 5 NA PB.564.1 chr1 + 1454 11 full-splice_match EIF3I ENST00000677711.1 1700 11 244 2 -33 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 1804 432.041992 2.635526 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATTTTGTGGTGTCTGTTTC 788 FALSE NA NA AATAAA -32 NA NA NA 1804 NA PB.564.2 chr1 + 1181 11 full-splice_match EIF3I ENST00000678689.1 1276 11 -16 111 -16 -10 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAGAAGAAGG 805 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.564.3 chr1 + 1513 10 full-splice_match EIF3I ENST00000678883.1 1400 10 -17 -96 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATATTTTGTGGTGTCTGTTT 3 TRUE NA NA AATAAA -31 NA NA NA 3 NA PB.564.4 chr1 + 1308 11 full-splice_match EIF3I ENST00000677711.1 1700 11 279 113 0 -10 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 187 44.784840 1.651131 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAGAAGAAGG 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 187 NA PB.564.5 chr1 + 1269 10 full-splice_match EIF3I ENST00000677353.1 1250 10 -21 2 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.071349 0.609738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATTTTGTGGTGTCTGTTTC 3 TRUE NA NA AATAAA -32 NA NA NA 17 NA PB.564.6 chr1 + 1254 10 full-splice_match EIF3I ENST00000678968.1 1256 10 0 2 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATTTTGTGGTGTCTGTTTC 3 TRUE NA NA AATAAA -32 NA NA NA 6 NA PB.564.7 chr1 + 1145 11 full-splice_match EIF3I ENST00000677711.1 1700 11 279 276 0 -5 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 246 58.914818 1.770225 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAATACAAAAATTAGCCA 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 246 NA PB.564.8 chr1 + 1030 9 full-splice_match EIF3I ENST00000677640.1 1141 9 0 111 0 -10 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAGAAGAAGG 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.564.9 chr1 + 987 7 full-splice_match EIF3I ENST00000679290.1 987 7 0 0 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATTTTGTGGTGTCTGTTTC 3 TRUE NA NA AATAAA -32 NA NA NA 7 NA PB.564.10 chr1 + 867 9 full-splice_match EIF3I ENST00000677640.1 1141 9 0 274 0 -5 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAATACAAAAATTAGCCA 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.564.11 chr1 + 1270 11 full-splice_match EIF3I ENST00000678689.1 1276 11 7 -1 -1 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 26 6.226769 0.794263 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTTGTGGTGTCTGTTTCA 8 TRUE NA NA AATAAA -33 NA NA NA 26 NA PB.564.12 chr1 + 1152 10 full-splice_match EIF3I ENST00000677353.1 1250 10 -15 113 0 -10 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAGAAGAAGG 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.564.13 chr1 + 1401 11 full-splice_match EIF3I ENST00000677711.1 1700 11 296 3 0 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.634403 0.420682 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATATTTTGTGGTGTCTGTTT 3 TRUE NA NA AATAAA -31 NA NA NA 11 NA PB.564.14 chr1 + 1369 10 full-splice_match EIF3I ENST00000471486.6 1482 10 2 111 0 -10 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAGAAGAAGG 18 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.564.15 chr1 + 1200 8 incomplete-splice_match EIF3I ENST00000677844.1 1264 9 716 -147 0 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATATTTTGTGGTGTCTGTTT 19 FALSE NA NA AATAAA -31 NA NA NA 4 NA PB.564.16 chr1 + 1472 10 full-splice_match EIF3I ENST00000471486.6 1482 10 10 0 7 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 20 4.789823 0.680319 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATTTTGTGGTGTCTGTTTC 26 FALSE NA NA AATAAA -32 NA NA NA 20 NA PB.564.17 chr1 + 1198 10 full-splice_match EIF3I ENST00000471486.6 1482 10 10 274 7 -5 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAATACAAAAATTAGCCA 26 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.564.18 chr1 + 1381 10 full-splice_match EIF3I ENST00000471486.6 1482 10 100 1 97 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 38 9.100663 0.959073 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATATTTTGTGGTGTCTGTTT 116 FALSE NA NA AATAAA -31 NA NA NA 38 NA PB.564.19 chr1 + 1063 10 full-splice_match EIF3I ENST00000471486.6 1482 10 145 274 142 -5 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAATACAAAAATTAGCCA 161 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.564.20 chr1 + 1003 9 incomplete-splice_match EIF3I ENST00000471486.6 1482 10 1608 274 1605 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAATACAAAAATTAGCCA 1624 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.564.21 chr1 + 990 7 incomplete-splice_match EIF3I ENST00000677640.1 1141 9 1648 -1 1615 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTTGTGGTGTCTGTTTCA 1634 FALSE NA NA AATAAA -33 NA NA NA 2 NA PB.564.22 chr1 + 1199 8 incomplete-splice_match EIF3I ENST00000471486.6 1482 10 1973 1 1970 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 44 10.537610 1.022742 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATATTTTGTGGTGTCTGTTT 1989 FALSE NA NA AATAAA -31 NA NA NA 44 NA PB.564.23 chr1 + 1088 8 incomplete-splice_match EIF3I ENST00000677183.1 1652 10 1993 67 1971 -10 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 20 4.789823 0.680319 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAGAAGAAGG 1990 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 20 NA PB.564.25 chr1 + 1088 7 incomplete-splice_match EIF3I ENST00000471486.6 1482 10 3781 -1 -1120 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 56 13.411503 1.127477 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTTGTGGTGTCTGTTTCA 3797 FALSE NA NA AATAAA -33 NA NA NA 56 NA PB.564.26 chr1 + 672 6 incomplete-splice_match EIF3I ENST00000489353.6 2961 9 4007 66 -897 -5 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAATACAAAAATTAGCCA 4020 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.564.27 chr1 + 923 6 incomplete-splice_match EIF3I ENST00000471486.6 1482 10 4026 1 -875 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 48 11.495574 1.060531 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATATTTTGTGGTGTCTGTTT 4042 FALSE NA NA AATAAA -31 NA NA NA 48 NA PB.564.28 chr1 + 810 6 incomplete-splice_match EIF3I ENST00000677183.1 1652 10 4048 67 -872 -10 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAGAAGAAGG 4045 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.564.29 chr1 + 828 5 full-splice_match EIF3I ENST00000678306.1 1795 5 1191 -224 915 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 30 7.184734 0.856411 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TTTTGTGGTGTCTGTTTCAT 2050 FALSE NA NA AATAAA -34 NA NA NA 30 NA PB.564.30 chr1 + 642 3 full-splice_match EIF3I ENST00000678106.1 2075 3 1533 -100 1533 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATATTTTGTGGTGTCTGTTT 2668 FALSE NA NA AATAAA -31 NA NA NA 9 NA PB.566.1 chr1 + 946 2 full-splice_match FAM167B ENST00000373582.4 947 2 0 1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATCAAGGTCTCTTGCAGTCG -6 TRUE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.567.1 chr1 + 2128 13 full-splice_match LCK ENST00000336890.10 2091 13 -38 1 -12 0 reference_match TRUE canonical NA NA NA NA 146 34.965706 1.543642 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACATCTCTTTGCTGTCCACT 233 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 146 NA PB.567.2 chr1 + 2039 13 novel_not_in_catalog LCK novel 2091 13 NA NA -2 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACATCTCTTTGCTGTCCAC -11 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.567.3 chr1 + 2264 12 novel_in_catalog LCK novel 2091 13 NA NA 0 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.873893 0.458471 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACATCTCTTTGCTGTCCAC -9 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 12 NA PB.567.4 chr1 + 1678 8 novel_in_catalog LCK novel 2126 12 NA NA 0 40 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.567.5 chr1 + 1937 12 novel_in_catalog LCK novel 2091 13 NA NA 0 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 15 3.592367 0.555381 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACATCTCTTTGCTGTCCACT -8 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 15 NA PB.567.6 chr1 + 2258 12 novel_in_catalog LCK novel 2099 13 NA NA 4 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACATCTCTTTGCTGTCCAC 3 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.567.7 chr1 + 2175 13 full-splice_match LCK ENST00000333070.4 2166 13 -7 -2 4 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACATCTCTTTGCTGTCCACT 3 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.567.8 chr1 + 2084 13 full-splice_match LCK ENST00000619559.4 2099 13 14 1 4 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 59 14.129976 1.150141 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACATCTCTTTGCTGTCCAC 3 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 59 NA PB.567.9 chr1 + 2167 12 incomplete-splice_match LCK ENST00000336890.10 2091 13 22875 2 8 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACATCTCTTTGCTGTCCAC 0 TRUE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 7 NA PB.567.10 chr1 + 1917 12 novel_in_catalog LCK novel 2099 13 NA NA 8 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACATCTCTTTGCTGTCCACT 0 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.567.11 chr1 + 2030 13 full-splice_match LCK ENST00000619559.4 2099 13 67 2 46 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GTACATCTCTTTGCTGTCCA 38 FALSE NA NA AATAAA -19 NA NA NA 3 NA PB.567.12 chr1 + 1811 11 novel_in_catalog LCK novel 2099 13 NA NA 212 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACATCTCTTTGCTGTCCACT 7 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 2 NA PB.567.13 chr1 + 1808 11 incomplete-splice_match LCK ENST00000619559.4 2099 13 691 0 670 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACATCTCTTTGCTGTCCACT 465 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 9 NA PB.567.14 chr1 + 1678 9 incomplete-splice_match LCK ENST00000619559.4 2099 13 1231 1 -278 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACATCTCTTTGCTGTCCAC 1005 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 5 NA PB.567.15 chr1 + 1622 9 incomplete-splice_match LCK ENST00000619559.4 2099 13 1287 1 -222 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACATCTCTTTGCTGTCCAC 1061 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.567.16 chr1 + 1452 7 incomplete-splice_match LCK ENST00000619559.4 2099 13 1848 0 339 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACATCTCTTTGCTGTCCACT 1622 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 4 NA PB.567.17 chr1 + 1389 7 incomplete-splice_match LCK ENST00000619559.4 2099 13 1911 0 402 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACATCTCTTTGCTGTCCACT 1685 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 3 NA PB.567.18 chr1 + 1322 6 incomplete-splice_match LCK ENST00000619559.4 2099 13 2250 1 741 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACATCTCTTTGCTGTCCAC 2024 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 3 NA PB.567.19 chr1 + 1181 5 incomplete-splice_match LCK ENST00000619559.4 2099 13 2508 1 999 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACATCTCTTTGCTGTCCAC 2282 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 9 NA PB.567.20 chr1 + 1060 5 incomplete-splice_match LCK ENST00000619559.4 2099 13 2630 0 1121 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACATCTCTTTGCTGTCCACT 2404 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 9 NA PB.567.21 chr1 + 975 4 incomplete-splice_match LCK ENST00000333070.4 2166 13 5577 -1 4089 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TACATCTCTTTGCTGTCCAC 5372 FALSE NA NA AATAAA -20 NA NA NA 8 NA PB.568.1 chr1 - 1097 5 full-splice_match TMEM234 ENST00000309777.11 1107 5 10 0 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 37 8.861172 0.947491 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 CAAGAGGTTAGTAAGTATTC 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 37 NA PB.568.2 chr1 - 1277 5 novel_not_in_catalog TMEM234 novel 1107 5 NA NA 0 -7 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAACAGACAAGAGGTTAGTA -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.570.1 chr1 - 1794 2 full-splice_match MARCKSL1 ENST00000329421.8 1546 2 0 -248 0 248 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAATGAAAATAGTATCTC -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.570.3 chr1 - 1581 2 full-splice_match MARCKSL1 ENST00000329421.8 1546 2 -37 2 -37 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 3101 742.661987 2.870791 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAGTGGTGCTTTAATGAGTG 3403 FALSE NA NA TTTAAA -22 NA NA NA 3101 NA PB.570.5 chr1 - 1320 2 novel_not_in_catalog MARCKSL1 novel 1546 2 NA NA 0 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTGGTGCTTTAATGAGTGG -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.570.6 chr1 - 1318 2 full-splice_match MARCKSL1 ENST00000329421.8 1546 2 227 1 227 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 72 17.243361 1.236622 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTGGTGCTTTAATGAGTGG 3667 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 72 NA PB.570.7 chr1 - 1080 2 novel_not_in_catalog MARCKSL1 novel 1546 2 NA NA -3 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGTGGTGCTTTAATGAGTGG -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.570.16 chr1 - 1442 2 full-splice_match MARCKSL1 ENST00000329421.8 1546 2 0 104 0 -104 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.634403 0.420682 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACCCCAGATTTGTACTTT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.570.17 chr1 - 1309 2 full-splice_match MARCKSL1 ENST00000329421.8 1546 2 0 237 0 -237 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 151 36.163162 1.558266 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGCCTGTGAATCAACTGTGT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 151 NA PB.571.2 chr1 + 2106 14 full-splice_match HDAC1 ENST00000373548.8 2118 14 12 0 12 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 1015 243.083496 2.385756 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TCCTCCTGAGCTTGTTTCCT 5 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 1015 NA PB.571.4 chr1 + 5373 11 novel_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA 17 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GAGCTTGTTTCCTATGTGTC 10 TRUE NA NA AATAAA -24 NA NA NA 3 NA PB.571.5 chr1 + 4905 12 novel_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA 17 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATATCCTCCTGAGCTTGTTT 10 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.571.6 chr1 + 2149 15 novel_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA 21 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCTCCTGAGCTTGTTTCC 14 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.571.8 chr1 + 1392 12 incomplete-splice_match HDAC1 ENST00000373548.8 2118 14 36 1415 -16 430 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.029314 0.701509 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 GAAAAAGAGAAAGACCCAGA -22 TRUE NA NA AAAAAG -24 NA NA NA 21 NA PB.571.9 chr1 + 2036 14 novel_not_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA -12 -3 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATATCCTCCTGAGCTTGTTT -18 TRUE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.571.10 chr1 + 2456 14 novel_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA -11 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCTCCTGAGCTTGTTTC -17 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 6 NA PB.571.11 chr1 + 1983 13 novel_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA -11 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.310840 0.634562 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCTCCTGAGCTTGTTTCC -17 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 18 NA PB.571.12 chr1 + 1713 12 novel_not_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA -11 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.029314 0.701509 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCTCCTGAGCTTGTTTCC -17 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 21 NA PB.571.13 chr1 + 1955 13 novel_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA -4 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCTCCTGAGCTTGTTTC -10 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 6 NA PB.571.14 chr1 + 3915 12 novel_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA -3 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCTCCTGAGCTTGTTTC -9 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 5 NA PB.571.15 chr1 + 2351 13 novel_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA -3 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCTCCTGAGCTTGTTTCC -9 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.571.16 chr1 + 3446 13 novel_in_catalog HDAC1 novel 2118 14 NA NA 4 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCTCCTGAGCTTGTTTCC 3 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 6 NA PB.571.17 chr1 + 2142 14 novel_not_in_catalog HDAC1 novel 2409 7 NA NA 113 -4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TATATCCTCCTGAGCTTGTT 34 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.571.18 chr1 + 1972 13 incomplete-splice_match HDAC1 ENST00000373548.8 2118 14 10547 1 10469 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.831858 0.583409 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCTCCTGAGCTTGTTTCC NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 16 NA PB.571.19 chr1 + 1786 12 incomplete-splice_match HDAC1 ENST00000373548.8 2118 14 24663 2 -10443 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.071349 0.609738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCTCCTGAGCTTGTTTC NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 17 NA PB.571.21 chr1 + 1638 10 incomplete-splice_match HDAC1 ENST00000373548.8 2118 14 34893 1 -213 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 31 7.424225 0.870651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCTCCTGAGCTTGTTTCC 4228 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 31 NA PB.571.22 chr1 + 1455 9 incomplete-splice_match HDAC1 ENST00000373548.8 2118 14 35534 1 343 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 33 7.903207 0.897803 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCTCCTGAGCTTGTTTCC 4869 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 33 NA PB.571.23 chr1 + 4100 7 full-splice_match HDAC1 ENST00000476391.5 2409 7 -1702 11 504 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCTCCTGAGCTTGTTTC 5030 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.571.24 chr1 + 2574 7 full-splice_match HDAC1 ENST00000476391.5 2409 7 -175 10 -175 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCTCCTGAGCTTGTTTCC 6557 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.571.25 chr1 + 2356 7 full-splice_match HDAC1 ENST00000476391.5 2409 7 42 11 42 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCTCCTGAGCTTGTTTC 6774 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.571.26 chr1 + 1945 7 full-splice_match HDAC1 ENST00000476391.5 2409 7 453 11 -216 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCTCCTGAGCTTGTTTC 7185 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 4 NA PB.571.27 chr1 + 1301 7 full-splice_match HDAC1 ENST00000476391.5 2409 7 1097 11 428 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.550332 0.658043 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCTCCTGAGCTTGTTTC 7829 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 19 NA PB.571.28 chr1 + 1192 6 incomplete-splice_match HDAC1 ENST00000476391.5 2409 7 1287 11 618 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 27 6.466260 0.810653 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCTCCTGAGCTTGTTTC 8019 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 27 NA PB.571.29 chr1 + 1093 6 incomplete-splice_match HDAC1 ENST00000476391.5 2409 7 1392 5 -664 4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 29 6.945243 0.841687 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CCTGAGCTTGTTTCCTATGT 41 FALSE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 29 NA PB.571.30 chr1 + 896 4 incomplete-splice_match HDAC1 ENST00000476391.5 2409 7 2241 11 185 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 41 9.819137 0.992073 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCTCCTGAGCTTGTTTC 890 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 41 NA PB.571.31 chr1 + 1170 3 incomplete-splice_match HDAC1 ENST00000471488.1 726 4 195 -546 195 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCTCCTGAGCTTGTTTCC 900 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.571.32 chr1 + 779 3 incomplete-splice_match HDAC1 ENST00000471488.1 726 4 583 -543 583 -4 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.634403 0.420682 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TATATCCTCCTGAGCTTGTT 1288 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 11 NA PB.571.33 chr1 + 697 3 incomplete-splice_match HDAC1 ENST00000471488.1 726 4 668 -546 668 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCTCCTGAGCTTGTTTCC 1373 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 7 NA PB.572.1 chr1 - 2228 5 incomplete-splice_match BSDC1 ENST00000455895.7 3309 11 16211 473 -3448 7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAAGGTGTCTGGGGGTCTGT 8546 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.572.2 chr1 - 1909 3 incomplete-splice_match BSDC1 ENST00000455895.7 3309 11 17924 473 -1735 7 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAAGGTGTCTGGGGGTCTGT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.572.4 chr1 - 1644 2 incomplete-splice_match BSDC1 ENST00000444377.5 2925 12 25886 -6 6240 6 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAAAGGTGTCTGGGGGTCTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.572.7 chr1 - 2820 11 full-splice_match BSDC1 ENST00000455895.7 3309 11 10 479 0 1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 47 11.256083 1.051387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCTGAAAGGTGTCTGGGG 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 47 NA PB.572.8 chr1 - 1783 3 incomplete-splice_match BSDC1 ENST00000455895.7 3309 11 18044 479 -1615 1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGCTGAAAGGTGTCTGGGG NA FALSE NA NA GGGGCT -34 NA NA NA 4 NA PB.572.10 chr1 - 2873 11 full-splice_match BSDC1 ENST00000446293.6 1505 11 -4 -1364 -3 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 GAAGCTGAAAGGTGTCTGGG 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.572.11 chr1 - 2266 6 incomplete-splice_match BSDC1 ENST00000455895.7 3309 11 15651 555 -4008 -17 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAGAAAGAAAAAAGAA 7986 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.572.12 chr1 - 1655 3 incomplete-splice_match BSDC1 ENST00000455895.7 3309 11 18096 555 -1563 -17 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 AAAAAAGAAAGAAAAAAGAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.572.13 chr1 - 2451 8 incomplete-splice_match BSDC1 ENST00000455895.7 3309 11 10530 556 -9129 -18 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAAGAAAGAAAAAAGA 2865 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.572.20 chr1 - 1727 10 full-splice_match BSDC1 ENST00000341071.11 4599 10 -5 2877 0 -15 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAAAAAAAAAAAAGGAAA 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.572.21 chr1 - 1048 3 incomplete-splice_match BSDC1 ENST00000373520.8 1630 10 16394 15 -3252 -15 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 AAAAAAAAAAAAAAAGGAAA 8742 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.572.22 chr1 - 2092 7 incomplete-splice_match BSDC1 ENST00000373520.8 1630 10 9808 16 9805 -16 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 GAAAAAAAAAAAAAAAGGAA 9814 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.572.23 chr1 - 1675 10 incomplete-splice_match BSDC1 ENST00000455895.7 3309 11 10 3416 0 -16 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 20 4.789823 0.680319 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 GAAAAAAAAAAAAAAAGGAA 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 20 NA PB.572.24 chr1 - 1526 8 incomplete-splice_match BSDC1 ENST00000455895.7 3309 11 7606 3416 7590 -16 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 GAAAAAAAAAAAAAAAGGAA 7599 FALSE NA NA CATAAA -9 NA NA NA 5 NA PB.572.26 chr1 - 916 2 incomplete-splice_match BSDC1 ENST00000373520.8 1630 10 17753 16 -1893 -16 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 85.000000 GAAAAAAAAAAAAAAAGGAA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.572.27 chr1 - 1557 9 novel_in_catalog BSDC1 novel 3309 11 NA NA 0 -17 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TGAAAAAAAAAAAAAAAGGA 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.572.28 chr1 - 1978 9 incomplete-splice_match BSDC1 ENST00000446293.6 1505 11 -1 9031 0 1122 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGTCAGTCAGCCTTTTTGCC 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.573.2 chr1 + 1927 5 full-splice_match ZBTB8A ENST00000373510.9 7077 5 3 5147 1 -196 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAAGACAATTTCAAGGTGTT -18 TRUE NA NA AATAAA -23 NA NA NA 2 NA PB.575.1 chr1 - 1137 3 intergenic novelGene_549 novel NA NA NA NA NA NA multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA TRUE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TATATAATGGAATTGTGTAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.578.1 chr1 - 1526 6 full-splice_match ZBTB8OS ENST00000436661.6 514 6 -7 -1005 -2 -5 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.113385 0.493233 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAATTTCTTTATTGTTGT 661 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.578.2 chr1 - 1507 5 novel_in_catalog ZBTB8OS novel 620 7 NA NA 0 -5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAATTTCTTTATTGTTGT 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.578.3 chr1 - 1282 3 novel_in_catalog ZBTB8OS novel 817 4 NA NA 1 -5 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAAAATTTCTTTATTGTTGT -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.578.4 chr1 - 1584 7 novel_in_catalog ZBTB8OS novel 1567 7 NA NA 0 -6 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAATTTCTTTATTGTTG 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.578.5 chr1 - 1559 6 novel_in_catalog ZBTB8OS novel 548 6 NA NA 0 -6 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAATTTCTTTATTGTTG 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.578.6 chr1 - 1546 7 full-splice_match ZBTB8OS ENST00000468695.6 1567 7 15 6 0 -6 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 26 6.226769 0.794263 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAAAAATTTCTTTATTGTTG 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 26 NA PB.578.8 chr1 - 983 7 full-splice_match ZBTB8OS ENST00000468695.6 1567 7 -431 1015 -78 -5 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGAACTGTTTTTGTTTTCC 247 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.578.9 chr1 - 940 6 full-splice_match ZBTB8OS ENST00000436661.6 514 6 -431 5 -88 -5 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGAACTGTTTTTGTTTTCC 237 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.578.10 chr1 - 610 7 novel_in_catalog ZBTB8OS novel 598 7 NA NA -3 -5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGAACTGTTTTTGTTTTCC 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.578.11 chr1 - 550 6 novel_in_catalog ZBTB8OS novel 548 6 NA NA 0 -5 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGAACTGTTTTTGTTTTCC 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.578.12 chr1 - 537 7 full-splice_match ZBTB8OS ENST00000468695.6 1567 7 15 1015 0 -5 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AAGAACTGTTTTTGTTTTCC 7 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.578.13 chr1 - 998 6 novel_in_catalog ZBTB8OS novel 598 7 NA NA -50 5 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GAAGAACTGTTTTTGTTTTC 275 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.579.1 chr1 + 2326 12 full-splice_match RBBP4 ENST00000373493.10 7883 12 -151 5708 -85 -148 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGAGTTGCTTTTTTTTTTT NA FALSE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.579.2 chr1 + 2359 12 full-splice_match RBBP4 ENST00000373493.10 7883 12 -30 5554 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 870 208.357285 2.318809 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ATGCTGATGGGTTTTATTTA -31 TRUE NA NA AATAAA -21 NA NA NA 870 NA PB.579.4 chr1 + 2303 13 novel_not_in_catalog RBBP4 novel 7883 12 NA NA 0 -148 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGAGTTGCTTTTTTTTTTT -31 TRUE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.579.5 chr1 + 2205 12 full-splice_match RBBP4 ENST00000373493.10 7883 12 -30 5708 0 -148 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 155 37.121124 1.569621 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGAGTTGCTTTTTTTTTTT -31 TRUE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 155 NA PB.579.6 chr1 + 1644 13 novel_in_catalog RBBP4 novel 7883 12 NA NA 2 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACCCCATGCTGATGGGTTTT -29 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 6 NA PB.579.9 chr1 + 2430 13 novel_not_in_catalog RBBP4 novel 7883 12 NA NA -9 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT -10 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 5 NA PB.579.10 chr1 + 2275 13 novel_in_catalog RBBP4 novel 7883 12 NA NA -9 -149 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAAGAGTTGCTTTTTTTTTT -10 TRUE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.579.11 chr1 + 2239 12 novel_not_in_catalog RBBP4 novel 7883 12 NA NA -9 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT -10 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.579.13 chr1 + 1447 12 full-splice_match RBBP4 ENST00000373485.5 1417 12 -35 5 -9 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.550332 0.658043 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACCCCATGCTGATGGGTTTT -10 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 19 NA PB.579.14 chr1 + 1466 2 full-splice_match RBBP4 ENST00000465780.1 690 2 -27 -749 -9 749 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAAACAAAGAGGAGGGTA -10 TRUE NA NA AAGAAA -10 NA NA NA 2 NA PB.579.15 chr1 + 1406 12 novel_not_in_catalog RBBP4 novel 7883 12 NA NA -9 -351 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 CTTCCTGGCCTAATCTGTTG -10 TRUE NA NA TATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.579.16 chr1 + 704 2 full-splice_match RBBP4 ENST00000465780.1 690 2 -27 13 -9 -13 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 27 6.466260 0.810653 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 75.000000 AAAAAAAGAAAAAAGTATTA -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 27 NA PB.579.21 chr1 + 1490 13 novel_in_catalog RBBP4 novel 7883 12 NA NA 0 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT 5 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 9 NA PB.579.22 chr1 + 2406 13 novel_in_catalog RBBP4 novel 7883 12 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT 8 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.579.25 chr1 + 2726 12 full-splice_match RBBP4 ENST00000373493.10 7883 12 62 5095 -8 459 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TCCCAATCGCTTAGTTTTTT 61 FALSE NA NA GATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.579.28 chr1 + 1345 12 full-splice_match RBBP4 ENST00000373485.5 1417 12 66 6 22 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT 91 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.579.32 chr1 + 2168 11 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000458695.6 1674 12 597 -610 466 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 25 5.987278 0.777229 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACCCCATGCTGATGGGTT 217 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 25 NA PB.579.34 chr1 + 1933 11 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000458695.6 1674 12 685 -463 554 -148 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGAGTTGCTTTTTTTTTTT 305 FALSE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 5 NA PB.579.36 chr1 + 2006 10 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000458695.6 1674 12 6125 -611 5994 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 38 9.100663 0.959073 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT 5745 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 38 NA PB.579.37 chr1 + 1793 10 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000458695.6 1674 12 6190 -463 6059 -148 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGAGTTGCTTTTTTTTTTT 5810 FALSE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 3 NA PB.579.39 chr1 + 1909 9 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000458695.6 1674 12 16874 -611 -89 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.831858 0.583409 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT 6322 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 16 NA PB.579.40 chr1 + 1789 8 novel_in_catalog RBBP4 novel 7883 12 NA NA -87 -2 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATAACCCCATGCTGATGGGT 6324 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.579.41 chr1 + 1722 9 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000458695.6 1674 12 16913 -463 -50 -148 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGAGTTGCTTTTTTTTTTT 6361 FALSE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 5 NA PB.579.42 chr1 + 1808 9 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000458695.6 1674 12 16975 -611 12 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 18 4.310840 0.634562 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT 6423 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 18 NA PB.579.43 chr1 + 939 10 novel_in_catalog RBBP4 novel 7883 12 NA NA 52 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATAACCCCATGCTGATGGGT 6463 FALSE NA NA AATAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.579.44 chr1 + 1616 9 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000458695.6 1674 12 17019 -463 56 -148 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGAGTTGCTTTTTTTTTTT 6467 FALSE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.579.47 chr1 + 1697 8 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000492348.6 1547 10 17565 -447 213 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 24 5.747787 0.759501 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT 6874 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 24 NA PB.579.48 chr1 + 1461 7 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000460669.5 783 8 -121 151 -107 -149 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.113385 0.493233 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAAGAGTTGCTTTTTTTTTT 7078 FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 13 NA PB.579.49 chr1 + 1550 7 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000460669.5 783 8 -62 3 -48 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 52 12.453539 1.095293 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACCCCATGCTGATGGGTT 7137 FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 52 NA PB.579.50 chr1 + 1417 6 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000460669.5 783 8 170 2 21 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.873893 0.458471 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT 7369 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 12 NA PB.579.52 chr1 + 1296 5 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000460669.5 783 8 420 1 271 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 45 10.777101 1.032502 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ACCCCATGCTGATGGGTTTT 7619 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 45 NA PB.579.54 chr1 + 1067 4 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000460669.5 783 8 3385 151 3236 -149 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.831858 0.583409 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAAGAGTTGCTTTTTTTTTT NA FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 16 NA PB.579.57 chr1 + 1172 3 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000460669.5 783 8 3544 2 3395 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 45 10.777101 1.032502 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACCCCATGCTGATGGGTTT NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 45 NA PB.579.58 chr1 + 948 2 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000460669.5 783 8 3711 150 3562 -148 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AAGAGTTGCTTTTTTTTTTT NA FALSE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 6 NA PB.579.59 chr1 + 1066 2 incomplete-splice_match RBBP4 ENST00000460669.5 783 8 3740 3 3591 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 33 7.903207 0.897803 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TAACCCCATGCTGATGGGTT NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 33 NA PB.582.1 chr1 - 3215 4 full-splice_match SYNC ENST00000373484.4 1824 4 12 -1403 12 -182 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTTCATGGCTCAGACACCT 16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.582.6 chr1 - 2797 4 full-splice_match SYNC ENST00000373484.4 1824 4 -7 -966 -7 -619 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 TAAAAAAAAAAAGCAACTCT -3 TRUE NA NA GGGGCT -5 NA NA NA 3 NA PB.582.9 chr1 - 1821 4 incomplete-splice_match SYNC ENST00000409190.8 3503 5 7503 742 7489 -742 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 AGAAAAGCAATTTATTCCAT -3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.582.10 chr1 - 1314 4 incomplete-splice_match SYNC ENST00000409190.8 3503 5 7257 1495 7243 90 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTCTTTTGTGCCACGAGTG 7283 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.583.1 chr1 + 4711 3 incomplete-splice_match KIAA1522 ENST00000373480.1 5294 7 4075 2 4075 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGGCTGTGGCTACTGCTTCT 1811 FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.583.2 chr1 + 3962 2 incomplete-splice_match KIAA1522 ENST00000373480.1 5294 7 4918 1 4918 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GGCTGTGGCTACTGCTTCTT 2654 FALSE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.583.3 chr1 + 3214 2 incomplete-splice_match KIAA1522 ENST00000373480.1 5294 7 5666 1 5666 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GGCTGTGGCTACTGCTTCTT 65 FALSE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 4 NA PB.583.4 chr1 + 2807 2 incomplete-splice_match KIAA1522 ENST00000373480.1 5294 7 6074 0 6074 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCTGTGGCTACTGCTTCTTA 208 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.583.5 chr1 + 2658 2 incomplete-splice_match KIAA1522 ENST00000373480.1 5294 7 6221 2 6221 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TGGCTGTGGCTACTGCTTCT 355 FALSE NA NA ATTAAA -12 NA NA NA 2 NA PB.583.6 chr1 + 2462 2 incomplete-splice_match KIAA1522 ENST00000373480.1 5294 7 6418 1 6418 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 GGCTGTGGCTACTGCTTCTT 552 FALSE NA NA ATTAAA -13 NA NA NA 2 NA PB.583.7 chr1 + 2198 2 incomplete-splice_match KIAA1522 ENST00000373480.1 5294 7 6683 0 6683 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GCTGTGGCTACTGCTTCTTA 817 FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 6 NA PB.585.1 chr1 - 1627 3 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000469100.5 2247 4 1850 -461 458 461 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TACTCTAGGTCAAGCTCATT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.585.3 chr1 - 2341 12 full-splice_match YARS1 ENST00000675785.1 2248 12 -21 -72 -21 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TCTGGATGTGAGCTGGACCA 10 TRUE NA NA AAAAAG -39 NA NA NA 3 NA PB.585.4 chr1 - 2465 13 full-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 -22 0 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 583 139.623322 2.144958 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGTCTGGATGTGAGCTGGAC -30 TRUE NA NA AAAAAG -18 NA NA NA 583 NA PB.585.5 chr1 - 2142 11 full-splice_match YARS1 ENST00000674629.1 2075 11 -23 -44 0 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGTCTGGATGTGAGCTGGAC -30 TRUE NA NA AAAAAG -18 NA NA NA 7 NA PB.585.6 chr1 - 1925 10 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 10771 0 -7 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TGTCTGGATGTGAGCTGGAC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.585.7 chr1 - 2495 14 novel_in_catalog YARS1 novel 2443 13 NA NA 5 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GTGTCTGGATGTGAGCTGGA -14 TRUE NA NA AAAAAG -2 NA NA NA 2 NA PB.585.8 chr1 - 2357 12 novel_in_catalog YARS1 novel 2443 13 NA NA 3 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GTGTCTGGATGTGAGCTGGA -4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.585.9 chr1 - 2269 12 full-splice_match YARS1 ENST00000675785.1 2248 12 48 -69 -15 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GTGTCTGGATGTGAGCTGGA 18 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.585.10 chr1 - 2011 10 novel_in_catalog YARS1 novel 2248 12 NA NA 0 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GTGTCTGGATGTGAGCTGGA -30 TRUE NA NA AAAAAG -18 NA NA NA 2 NA PB.585.11 chr1 - 1820 9 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 19513 1 369 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GTGTCTGGATGTGAGCTGGA 1260 FALSE NA NA CATAAA -26 NA NA NA 6 NA PB.585.12 chr1 - 1101 3 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000469100.5 2247 4 1912 3 520 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 29 6.945243 0.841687 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GTGTCTGGATGTGAGCTGGA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 29 NA PB.585.13 chr1 - 2949 12 novel_in_catalog YARS1 novel 3263 13 NA NA 0 -3 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG -30 TRUE NA NA AAAAAG -18 NA NA NA 4 NA PB.585.14 chr1 - 2228 12 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 6337 8 626 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG 7131 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.585.15 chr1 - 2119 11 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 6590 8 879 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 20 4.789823 0.680319 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG 7384 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 20 NA PB.585.16 chr1 - 1994 11 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 6715 8 1004 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 25 5.987278 0.777229 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG 7509 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 25 NA PB.585.17 chr1 - 1708 8 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 26126 8 -4498 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 31 7.424225 0.870651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG 7873 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 31 NA PB.585.18 chr1 - 1546 7 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 30374 8 -250 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 43 10.298119 1.012758 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 43 NA PB.585.19 chr1 - 1413 5 full-splice_match YARS1 ENST00000487404.5 2197 5 1218 -434 -434 -3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 26 6.226769 0.794263 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG NA FALSE NA NA GATAAA -17 NA NA NA 26 NA PB.585.20 chr1 - 1279 4 full-splice_match YARS1 ENST00000469100.5 2247 4 958 10 -434 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 26 6.226769 0.794263 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 26 NA PB.585.21 chr1 - 1157 3 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000469100.5 2247 4 1849 10 457 -3 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.352876 0.525417 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.585.22 chr1 - 984 2 full-splice_match YARS1 ENST00000490826.1 2178 2 1191 3 1191 -3 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 25 5.987278 0.777229 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AACAAGGGTGTCTGGATGTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 25 NA PB.585.26 chr1 - 1961 13 full-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 62 420 21 22 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 76 18.201326 1.260103 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAAAATACTGGTGCCCAGGT 856 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 76 NA PB.585.27 chr1 - 2023 13 full-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 -22 442 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 76 18.201326 1.260103 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATGCCACAGTCCTTATAATT -30 TRUE NA NA AAAAAG -18 NA NA NA 76 NA PB.585.28 chr1 - 1685 11 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000675785.1 2248 12 6612 372 879 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATGCCACAGTCCTTATAATT 7384 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.585.29 chr1 - 1607 10 novel_in_catalog YARS1 novel 2248 12 NA NA -37 0 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATGCCACAGTCCTTATAATT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.585.30 chr1 - 1574 11 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000675785.1 2248 12 6723 372 990 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATGCCACAGTCCTTATAATT 7495 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.585.31 chr1 - 1164 7 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000675785.1 2248 12 30344 372 -302 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATGCCACAGTCCTTATAATT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.585.32 chr1 - 1040 6 full-splice_match YARS1 ENST00000478828.1 1044 6 306 -302 306 -8 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAAAATTTATGCCACAGTCC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.585.33 chr1 - 1945 12 novel_in_catalog YARS1 novel 2443 13 NA NA -4 -1 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TATGCCACAGTCCTTATAAT 768 FALSE NA NA AAAAAG -22 NA NA NA 2 NA PB.585.34 chr1 - 1805 12 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 6325 443 614 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TATGCCACAGTCCTTATAAT 7119 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.585.35 chr1 - 1699 11 full-splice_match YARS1 ENST00000674629.1 2075 11 -23 399 0 -1 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TATGCCACAGTCCTTATAAT -30 TRUE NA NA AAAAAG -18 NA NA NA 2 NA PB.585.36 chr1 - 1423 10 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000675785.1 2248 12 10852 373 52 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TATGCCACAGTCCTTATAAT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.585.37 chr1 - 1239 8 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000675785.1 2248 12 26182 373 -4464 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TATGCCACAGTCCTTATAAT 7907 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.585.40 chr1 - 2057 8 novel_in_catalog YARS1 novel 3263 13 NA NA 5 4082 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 100.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA -14 TRUE NA NA AAAAAG -2 NA NA NA 2 NA PB.585.49 chr1 - 1975 7 novel_in_catalog YARS1 novel 3263 13 NA NA 0 173 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 90.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAAAG -19 TRUE NA NA AAAAAG -7 NA NA NA 6 NA PB.585.52 chr1 - 1289 6 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000373477.9 2443 13 19 15413 18 1 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 AAAAAAAAAAAAAAAAGTGT 11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.585.53 chr1 - 1316 7 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000616261.2 1018 9 -3 4283 -3 0 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 80.000000 TAAAAAAAAAAAAAAAAGTG 30 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.585.57 chr1 - 861 3 incomplete-splice_match YARS1 ENST00000616261.2 1018 9 -63 23876 0 485 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAGAAAAATATTTCACTTA -30 TRUE NA NA AAAAAG -18 NA NA NA 2 NA PB.586.1 chr1 - 1178 5 novel_in_catalog TMEM54 novel 1030 6 NA NA 18 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATTTGGCTGCATGCAGGGG -3 TRUE NA NA GGGGCT -37 NA NA NA 3 NA PB.586.2 chr1 - 1040 6 novel_not_in_catalog TMEM54 novel 1030 6 NA NA -5 0 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATTTGGCTGCATGCAGGGG 11 TRUE NA NA GGGGCT -23 NA NA NA 2 NA PB.586.3 chr1 - 1009 6 full-splice_match TMEM54 ENST00000373463.8 1030 6 21 0 -16 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 111 26.583515 1.424612 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATTTGGCTGCATGCAGGGG 0 TRUE NA NA GGGGCT -34 NA NA NA 111 NA PB.586.4 chr1 - 949 5 full-splice_match TMEM54 ENST00000475208.5 768 5 70 -251 -16 0 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CATTTGGCTGCATGCAGGGG 0 TRUE NA NA GGGGCT -34 NA NA NA 2 NA PB.586.6 chr1 - 1051 6 novel_not_in_catalog TMEM54 novel 1030 6 NA NA -5 -1 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CCATTTGGCTGCATGCAGGG 11 TRUE NA NA GGGGCT -23 NA NA NA 4 NA PB.587.1 chr1 - 2200 9 full-splice_match RNF19B ENST00000235150.5 2677 9 475 2 351 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTTACCTCATTTTCCTTG 589 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.587.2 chr1 - 1947 9 full-splice_match RNF19B ENST00000235150.5 2677 9 728 2 604 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTTACCTCATTTTCCTTG 842 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.587.3 chr1 - 1813 8 incomplete-splice_match RNF19B ENST00000235150.5 2677 9 15138 2 15014 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTTACCTCATTTTCCTTG 9613 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.587.4 chr1 - 1680 7 incomplete-splice_match RNF19B ENST00000356990.9 2598 9 16402 -3 16402 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTTACCTCATTTTCCTTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.587.5 chr1 - 1492 6 incomplete-splice_match RNF19B ENST00000373456.11 2560 9 18197 6 18197 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTTACCTCATTTTCCTTG NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.587.6 chr1 - 1044 3 incomplete-splice_match RNF19B ENST00000373456.11 2560 9 22331 6 22331 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTTACCTCATTTTCCTTG NA FALSE NA NA AATACA -13 NA NA NA 9 NA PB.587.7 chr1 - 1179 4 incomplete-splice_match RNF19B ENST00000373456.11 2560 9 20636 7 20636 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAACTTACCTCATTTTCCTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.587.8 chr1 - 1316 5 incomplete-splice_match RNF19B ENST00000373456.11 2560 9 19141 11 19141 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATTCAACTTACCTCATTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.588.1 chr1 + 3272 7 novel_in_catalog S100PBP novel 4220 7 NA NA 2 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CCTAAGTGTTTACTGTTTTT 7 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.588.3 chr1 + 637 3 incomplete-splice_match S100PBP ENST00000356689.7 3583 7 -4 10663 -4 -23 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AGAAAAGAATCTTATAAAAG 18 TRUE NA NA ATTAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.588.5 chr1 + 1635 7 full-splice_match S100PBP ENST00000373475.10 4220 7 -61 2646 0 44 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 37 8.861172 0.947491 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATTTTGTGTGTGTGTGTCTG 22 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 37 NA PB.588.6 chr1 + 4260 7 full-splice_match S100PBP ENST00000373475.10 4220 7 -41 1 20 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.352876 0.525417 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACATATGTACTGTGGCGGTC -5 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 14 NA PB.588.7 chr1 + 2069 5 incomplete-splice_match S100PBP ENST00000356689.7 3583 7 25 6258 25 4307 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAAAAAAAAATTAGCCAGGC 0 TRUE NA NA TATAAA -27 NA NA NA 6 NA PB.588.8 chr1 + 1556 8 novel_in_catalog S100PBP novel 4220 7 NA NA 0 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATGCCCATTGCCGACTTG 0 TRUE NA NA TTTAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.588.9 chr1 + 1648 7 novel_in_catalog S100PBP novel 4220 7 NA NA -12 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATGCCCATTGCCGACTTG 34 FALSE NA NA TTTAAA -19 NA NA NA 6 NA PB.588.10 chr1 + 4296 7 novel_in_catalog S100PBP novel 706 3 NA NA -6 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 GACATATGTACTGTGGCGGT 79 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 3 NA PB.588.14 chr1 + 1411 6 incomplete-splice_match S100PBP ENST00000373476.5 3320 7 7951 1671 496 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATGCCCATTGCCGACTTG 7740 FALSE NA NA TTTAAA -19 NA NA NA 4 NA PB.588.15 chr1 + 4071 5 incomplete-splice_match S100PBP ENST00000373475.10 4220 7 8439 1 1195 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACATATGTACTGTGGCGGTC 8439 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 4 NA PB.588.16 chr1 + 1243 5 incomplete-splice_match S100PBP ENST00000373476.5 3320 7 8787 1671 1332 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATGCCCATTGCCGACTTG 8576 FALSE NA NA TTTAAA -19 NA NA NA 6 NA PB.588.17 chr1 + 3926 5 incomplete-splice_match S100PBP ENST00000373475.10 4220 7 8584 1 1340 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 ACATATGTACTGTGGCGGTC 8584 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.588.18 chr1 + 1003 5 incomplete-splice_match S100PBP ENST00000373476.5 3320 7 9027 1671 1572 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATGCCCATTGCCGACTTG 8816 FALSE NA NA TTTAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.589.5 chr1 - 3583 7 full-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 13 1 -2 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.071349 0.609738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGAGGTTCTGCATGCATTAT 61 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.589.8 chr1 - 2791 8 novel_in_catalog AK2 novel 886 7 NA NA 9 11 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTATTGTTTGTTTGCTTC 77 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.589.9 chr1 - 2572 6 full-splice_match AK2 ENST00000548033.5 936 6 -39 -1597 -2 11 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTATTGTTTGTTTGCTTC 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.589.10 chr1 - 2054 2 incomplete-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 23576 895 -20 11 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTATTGTTTGTTTGCTTC 8703 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.589.11 chr1 - 1840 8 novel_not_in_catalog AK2 novel 880 8 NA NA -5 11 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 AGCTATTGTTTGTTTGCTTC -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.589.15 chr1 - 5124 6 full-splice_match AK2 ENST00000672715.1 5970 6 -50 896 -22 10 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GAGCTATTGTTTGTTTGCTT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.589.16 chr1 - 2727 8 full-splice_match AK2 ENST00000467905.5 880 8 25 -1872 2 9 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGAGCTATTGTTTGTTTGCT 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.589.17 chr1 - 2703 7 full-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 -3 897 0 9 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 303 72.565811 1.860732 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGAGCTATTGTTTGTTTGCT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 303 NA PB.589.18 chr1 - 2597 8 novel_not_in_catalog AK2 novel 880 8 NA NA -8 9 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGAGCTATTGTTTGTTTGCT -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.589.19 chr1 - 2427 5 incomplete-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 15179 897 -1 9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGAGCTATTGTTTGTTTGCT 306 FALSE NA NA TTTAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.589.20 chr1 - 2222 3 incomplete-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 22287 897 -1309 9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGAGCTATTGTTTGTTTGCT 7414 FALSE NA NA AATGAA -34 NA NA NA 6 NA PB.589.21 chr1 - 2123 2 incomplete-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 23505 897 -91 9 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TGAGCTATTGTTTGTTTGCT 8632 FALSE NA NA AATGAA -2 NA NA NA 3 NA PB.589.28 chr1 - 1730 8 novel_not_in_catalog AK2 novel 880 8 NA NA 1 198 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCCCTGTTGTGGCATTTT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.589.29 chr1 - 1680 7 full-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 -19 1936 0 197 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 809 193.748322 2.287238 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCTGTTGTGGCATTT 29 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 809 NA PB.589.30 chr1 - 1516 6 incomplete-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 12314 1935 -2866 198 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCCCTGTTGTGGCATTTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.589.32 chr1 - 1241 4 incomplete-splice_match AK2 ENST00000548033.5 936 6 15415 -557 265 198 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 29 6.945243 0.841687 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCCCCTGTTGTGGCATTTT 585 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 29 NA PB.589.35 chr1 - 3763 4 incomplete-splice_match AK2 ENST00000354858.11 5059 5 15298 1030 -3 197 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCTGTTGTGGCATTT 304 FALSE NA NA TTTAAA -19 NA NA NA 2 NA PB.589.36 chr1 - 2765 7 novel_in_catalog AK2 novel 2840 8 NA NA 9 197 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCTGTTGTGGCATTT 77 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.589.37 chr1 - 1750 8 novel_in_catalog AK2 novel 886 7 NA NA 9 197 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.071349 0.609738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCTGTTGTGGCATTT 77 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.589.38 chr1 - 1686 8 full-splice_match AK2 ENST00000467905.5 880 8 27 -833 4 197 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.831858 0.583409 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCTGTTGTGGCATTT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 16 NA PB.589.39 chr1 - 1506 6 full-splice_match AK2 ENST00000548033.5 936 6 -14 -556 9 197 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCTGTTGTGGCATTT 77 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 10 NA PB.589.41 chr1 - 1403 6 incomplete-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 12426 1936 -2754 197 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.352876 0.525417 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCTGTTGTGGCATTT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.589.42 chr1 - 995 2 incomplete-splice_match AK2 ENST00000548033.5 936 6 23551 -556 -2 197 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 17 4.071349 0.609738 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCCCCTGTTGTGGCATTT 8721 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 17 NA PB.589.43 chr1 - 4004 6 full-splice_match AK2 ENST00000672715.1 5970 6 29 1937 9 196 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 26 6.226769 0.794263 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GTATCCCCTGTTGTGGCATT 77 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 26 NA PB.589.44 chr1 - 1482 7 full-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 35 2080 -4 53 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 67 16.045906 1.205364 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAAGATTGTCCTTTCCATTC 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 67 NA PB.589.45 chr1 - 1114 4 incomplete-splice_match AK2 ENST00000548033.5 936 6 15393 -408 243 49 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATCCAAAGATTGTCCTTTCC 563 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.589.46 chr1 - 2601 7 novel_in_catalog AK2 novel 2840 8 NA NA -4 39 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAGCTATGTCATCCAAAGAT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.589.47 chr1 - 1586 8 novel_in_catalog AK2 novel 886 7 NA NA -4 39 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAGCTATGTCATCCAAAGAT 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.589.48 chr1 - 1562 8 full-splice_match AK2 ENST00000467905.5 880 8 -8 -674 -8 38 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 TAAGCTATGTCATCCAAAGA -9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.589.49 chr1 - 1224 7 full-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 24 2349 4 143 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 GAAAGAGATGTAAGGTGTAT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.589.50 chr1 - 1009 7 full-splice_match AK2 ENST00000373449.7 3597 7 24 2564 4 -31 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAGGAATCGGGTTTTCATTT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.589.51 chr1 - 930 6 novel_in_catalog AK2 novel 886 7 NA NA -2 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCTTTGGCGTGTGTGCTAC 6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.589.52 chr1 - 918 6 full-splice_match AK2 ENST00000672715.1 5970 6 -8 5060 -5 -2 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 704 168.601761 2.226862 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCTTTGGCGTGTGTGCTA -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 704 NA PB.589.53 chr1 - 792 5 full-splice_match AK2 ENST00000480134.5 811 5 18 1 4 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 41 9.819137 0.992073 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCTTTGGCGTGTGTGCTAC 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 41 NA PB.589.54 chr1 - 783 5 full-splice_match AK2 ENST00000354858.11 5059 5 123 4153 2 -1 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATCTTTGGCGTGTGTGCTAC 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.589.55 chr1 - 993 7 full-splice_match AK2 ENST00000550338.5 886 7 54 -161 -4 -2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 28 6.705751 0.826447 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCTTTGGCGTGTGTGCTA 2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 28 NA PB.589.56 chr1 - 996 6 full-splice_match AK2 ENST00000672715.1 5970 6 -86 5060 35 -2 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCTTTGGCGTGTGTGCTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.589.57 chr1 - 747 5 incomplete-splice_match AK2 ENST00000550338.5 886 7 12350 -161 -2849 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TATCTTTGGCGTGTGTGCTA NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.589.62 chr1 - 1043 5 full-splice_match AK2 ENST00000487289.1 920 5 -17 -106 2 106 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 ATATTCATTTTCTTTTCAAA 1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.589.63 chr1 - 882 5 full-splice_match AK2 ENST00000487289.1 920 5 -9 47 -9 -47 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AGACATTATTACTTTGATTT 78 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.591.2 chr1 + 1713 9 novel_in_catalog AZIN2 novel 1806 8 NA NA 0 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AGCGGAATCTGGCAGTTTGA -2 TRUE NA NA AATAAA -27 NA NA NA 3 NA PB.591.3 chr1 + 1632 7 novel_in_catalog AZIN2 novel 1806 8 NA NA 0 0 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 CAGCGGAATCTGGCAGTTTG -2 TRUE NA NA AATAAA -26 NA NA NA 2 NA PB.592.1 chr1 - 3832 5 full-splice_match TRIM62 ENST00000291416.10 3817 5 -16 1 0 -1 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 20 4.789823 0.680319 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AGCCAGTTCCATTCATTTTG -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 20 NA PB.592.8 chr1 - 1986 3 novel_not_in_catalog TRIM62 novel 306 2 NA NA 0 -3803 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 GAACTTTTCTCTGTGCTGAG -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.593.1 chr1 + 3165 8 novel_in_catalog ZNF362 novel 3187 9 NA NA -104 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GTGGCGGTGGTGTTTGGCGT 78 FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.593.3 chr1 + 3024 8 novel_in_catalog ZNF362 novel 3187 9 NA NA -16 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GTGGCGGTGGTGTTTGGCGT 3 TRUE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 4 NA PB.593.8 chr1 + 1938 2 incomplete-splice_match ZNF362 ENST00000373428.5 2936 8 24583 0 14808 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GTGGCGGTGGTGTTTGGCGT NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 3 NA PB.594.1 chr1 + 944 2 novel_not_in_catalog PHC2-AS1 novel 490 3 NA NA -363 2856 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 45.000000 GACAAAGATGTATTGAGATA NA FALSE NA NA AATAAA -17 NA NA NA 2 NA PB.595.2 chr1 - 2309 7 full-splice_match PHC2 ENST00000373418.7 2550 7 241 0 6 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TCTCTTTGGTGCCTTTCTCC 257 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.595.3 chr1 - 2215 7 novel_in_catalog PHC2 novel 3870 14 NA NA 454 0 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TCTCTTTGGTGCCTTTCTCC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.595.4 chr1 - 2056 5 incomplete-splice_match PHC2 ENST00000373418.7 2550 7 17483 0 2854 0 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 13 3.113385 0.493233 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TCTCTTTGGTGCCTTTCTCC NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 13 NA PB.595.5 chr1 - 1509 2 incomplete-splice_match PHC2 ENST00000373418.7 2550 7 20900 1 6271 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 21 5.029314 0.701509 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GTCTCTTTGGTGCCTTTCTC 3287 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 21 NA PB.595.8 chr1 - 3923 15 full-splice_match PHC2 ENST00000683057.1 3993 15 69 1 -6 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GTCTCTTTGGTGCCTTTCTC 2691 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.595.9 chr1 - 1918 4 incomplete-splice_match PHC2 ENST00000373418.7 2550 7 18432 1 3803 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.352876 0.525417 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GTCTCTTTGGTGCCTTTCTC 819 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.595.10 chr1 - 1720 3 incomplete-splice_match PHC2 ENST00000373418.7 2550 7 19765 1 5136 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 27 6.466260 0.810653 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 GTCTCTTTGGTGCCTTTCTC 2152 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 27 NA PB.595.13 chr1 - 2155 6 incomplete-splice_match PHC2 ENST00000373418.7 2550 7 15697 2 1068 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TGTCTCTTTGGTGCCTTTCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.595.14 chr1 - 2089 6 incomplete-splice_match PHC2 ENST00000467894.5 1466 8 17522 -1061 2894 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TGTCTCTTTGGTGCCTTTCT NA FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.595.15 chr1 - 1433 2 incomplete-splice_match PHC2 ENST00000373418.7 2550 7 20975 2 6346 -2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TGTCTCTTTGGTGCCTTTCT 3362 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.595.22 chr1 - 1906 10 novel_in_catalog PHC2 novel 767 6 NA NA -25 -3 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAACATCTGAGACTTTTTTT 2672 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.597.1 chr1 + 3470 8 full-splice_match ZSCAN20 ENST00000684572.1 9456 8 -4 5990 -4 -854 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ACTTTTAAGTGTAATTTGTT -10 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.600.1 chr1 - 2534 2 full-splice_match SMIM12 ENST00000521580.3 5694 2 0 3160 0 1528 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.634403 0.420682 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AAATGTCATTTTGGATGAAA 13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.600.2 chr1 - 1209 2 full-splice_match SMIM12 ENST00000423898.1 897 2 -1 -311 -1 12 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 43 10.298119 1.012758 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AATCTTATCATCCAGGTGGT 7911 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 43 NA PB.600.3 chr1 - 1114 2 novel_not_in_catalog SMIM12 novel 5694 2 NA NA 18 4 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AATGATCGAATCTTATCATC 7930 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.600.6 chr1 - 1071 2 full-splice_match SMIM12 ENST00000521580.3 5694 2 -62 4685 -56 3 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 272 65.141586 1.813858 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 TAATGATCGAATCTTATCAT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 272 NA PB.600.7 chr1 - 1852 2 novel_not_in_catalog SMIM12 novel 2817 2 NA NA 6 2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 ATAATGATCGAATCTTATCA 33 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.600.8 chr1 - 788 2 full-splice_match SMIM12 ENST00000521580.3 5694 2 -4 4910 2 77 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ATTTTGCCCTATCCTTTGTG 9 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.601.1 chr1 - 936 2 novel_not_in_catalog DLGAP3 novel 3587 10 NA NA 38865 -2 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CACTCGAGCCAGCTGCTCTC 1111 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.602.1 chr1 - 2013 3 fusion GPR199P_TMEM35B novel 1887 3 NA NA 28 0 multi-exon FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CTGCTGTATCTCCTGTGGTT -2 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.602.2 chr1 - 1826 2 full-splice_match ENSG00000284773 ENST00000417456.1 3163 2 -7 1344 -7 -1344 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 ACTGCTGTATCTCCTGTGGT 3 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.602.3 chr1 - 902 3 full-splice_match TMEM35B ENST00000373337.3 922 3 22 -2 22 2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 318 76.158180 1.881717 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TCATGTCTCTTTTGCCTCAT -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 318 NA PB.602.4 chr1 - 670 2 incomplete-splice_match TMEM35B ENST00000373337.3 922 3 1504 -2 1504 2 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 TCATGTCTCTTTTGCCTCAT 1474 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.603.1 chr1 + 1996 2 full-splice_match GJB3 ENST00000373366.3 2192 2 196 0 196 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA A non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 CAGGTTGGCTCTGTCTCTGG 198 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 7 NA PB.604.6 chr1 - 3043 16 novel_in_catalog ZMYM6 novel 5122 16 NA NA 0 -2008 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 GAATTGGAAACATTGTGTTG 33 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.604.8 chr1 - 1591 10 incomplete-splice_match ZMYM6 ENST00000357182.9 5122 16 0 24388 0 -6 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 60.000000 AAGAAGAAAAATAAAGTTGT -5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.604.10 chr1 - 753 4 incomplete-splice_match ENSG00000271741 ENST00000487874.1 3099 17 41 37639 41 -37639 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA B non_coding NA NA NA NA NA NA NA 40.000000 AGAATATTGCCTAAACCAGT 23 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.605.1 chr1 + 4168 10 full-splice_match ZMYM1 ENST00000359858.9 4161 10 -14 7 -11 -2 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 TATCAAATGTTTTGATCTTT NA FALSE NA NA ATTAAA -14 NA NA NA 4 NA PB.605.2 chr1 + 1062 2 incomplete-splice_match ZMYM1 ENST00000466390.5 508 4 -11 2691 -11 -2575 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATGAAAGAAAAAAATCACT NA FALSE NA NA AAAAAG -40 NA NA NA 4 NA PB.605.3 chr1 + 2943 10 full-splice_match ZMYM1 ENST00000359858.9 4161 10 -5 1223 -2 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AGAAAAGAAGAAAAATTCAG -14 TRUE NA NA TTTAAA -20 NA NA NA 6 NA PB.605.9 chr1 + 3983 9 full-splice_match ZMYM1 ENST00000373329.5 3980 9 -1 -2 -1 0 reference_match FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 AAATGTTTTGATCTTTCCTA -4 TRUE NA NA ATTAAA -18 NA NA NA 2 NA PB.605.10 chr1 + 2762 9 full-splice_match ZMYM1 ENST00000373329.5 3980 9 0 1218 0 0 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AGAAAAGAAGAAAAATTCAG -3 TRUE NA NA TTTAAA -20 NA NA NA 2 NA PB.605.14 chr1 + 1043 3 incomplete-splice_match ZMYM1 ENST00000488455.5 3055 11 32163 1025 7306 396 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAAGATAAAGGAGAAGAAA NA FALSE NA NA AATAAA -33 NA NA NA 2 NA PB.607.2 chr1 - 902 4 full-splice_match SFPQ ENST00000485365.1 693 4 -209 0 -209 0 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 0.000000 TCCTTTGGTTTTGTTTTTGT 9705 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.607.3 chr1 - 5015 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 -2183 3 -1222 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 9171 FALSE NA NA AATAAA -26 NA NA NA 2 NA PB.607.4 chr1 - 4221 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 -1389 3 -428 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 9965 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.607.5 chr1 - 3392 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 -560 3 139 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 9740 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.607.6 chr1 - 3071 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 -239 3 -239 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 9941 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.607.7 chr1 - 2688 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 144 3 144 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 8846 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.607.8 chr1 - 2302 12 novel_in_catalog SFPQ novel 874 9 NA NA 0 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.607.9 chr1 - 2351 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 481 3 481 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 9183 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.607.10 chr1 - 2024 4 full-splice_match SFPQ ENST00000485365.1 693 4 -1332 1 -1332 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 9061 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.607.11 chr1 - 2078 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 754 3 -645 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 9456 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.607.12 chr1 - 1660 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 1172 3 -227 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.634403 0.420682 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 9874 FALSE NA NA AATACA -14 NA NA NA 11 NA PB.607.13 chr1 - 1631 2 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000466745.5 662 4 247 1 247 -1 intron_retention FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 5684 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.607.14 chr1 - 1549 3 full-splice_match SFPQ ENST00000466213.5 1431 3 -119 1 -119 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 9982 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.607.15 chr1 - 1447 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 1385 3 -14 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 5282 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.607.16 chr1 - 1278 11 novel_in_catalog SFPQ novel 874 9 NA NA -852 -1 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 1718 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.607.17 chr1 - 1280 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 1552 3 12 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 16 3.831858 0.583409 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 5449 FALSE NA NA AATAAA -11 NA NA NA 16 NA PB.607.19 chr1 - 1051 3 full-splice_match SFPQ ENST00000466213.5 1431 3 379 1 238 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 24 5.747787 0.759501 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 5675 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 24 NA PB.607.20 chr1 - 760 3 full-splice_match SFPQ ENST00000466213.5 1431 3 670 1 -440 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 ATCCTTTGGTTTTGTTTTTG 5966 FALSE NA NA TTTAAA -36 NA NA NA 7 NA PB.607.21 chr1 - 6724 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 -3893 4 -2932 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCTTTGGTTTTGTTTTT 4 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.607.22 chr1 - 4385 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 -1554 4 -593 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCTTTGGTTTTGTTTTT 9800 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.607.23 chr1 - 3833 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 -1002 4 -41 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCTTTGGTTTTGTTTTT 9873 FALSE NA NA AAAACA -41 NA NA NA 3 NA PB.607.25 chr1 - 2850 3 full-splice_match SFPQ ENST00000466213.5 1431 3 -1421 2 -22 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCTTTGGTTTTGTTTTT 8680 FALSE NA NA AATGAA -19 NA NA NA 3 NA PB.607.26 chr1 - 2223 4 full-splice_match SFPQ ENST00000490668.5 434 4 -1791 2 -1529 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCTTTGGTTTTGTTTTT 8864 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 4 NA PB.607.27 chr1 - 1940 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 891 4 -508 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 10 2.394911 0.379289 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCTTTGGTTTTGTTTTT 9593 FALSE NA NA AATAGA -2 NA NA NA 10 NA PB.607.28 chr1 - 1801 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 1030 4 -369 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCTTTGGTTTTGTTTTT 9732 FALSE NA NA ATTAAA -40 NA NA NA 2 NA PB.607.29 chr1 - 1506 12 novel_in_catalog SFPQ novel 874 9 NA NA 798 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCTTTGGTTTTGTTTTT 797 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.607.30 chr1 - 1422 12 novel_in_catalog SFPQ novel 874 9 NA NA 882 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCTTTGGTTTTGTTTTT 881 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.607.31 chr1 - 1337 11 novel_in_catalog SFPQ novel 874 9 NA NA 883 -2 combination_of_known_splicesites FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCTTTGGTTTTGTTTTT 882 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.607.32 chr1 - 1005 10 novel_in_catalog SFPQ novel 874 9 NA NA -235 -2 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 8 1.915929 0.282379 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCTTTGGTTTTGTTTTT 16 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 8 NA PB.607.33 chr1 - 903 3 full-splice_match SFPQ ENST00000466213.5 1431 3 526 2 385 -2 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 5.000000 TATCCTTTGGTTTTGTTTTT 5822 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.607.34 chr1 - 2562 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 266 7 266 -5 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTATCCTTTGGTTTTGTT 8968 FALSE NA NA AAAAAG -38 NA NA NA 4 NA PB.607.35 chr1 - 1918 2 full-splice_match SFPQ ENST00000471991.5 440 2 -1485 7 -41 -5 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 AATTATCCTTTGGTTTTGTT 5396 FALSE NA NA AGTAAA -1 NA NA NA 2 NA PB.607.36 chr1 - 4764 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 -1937 8 -976 -6 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TAATTATCCTTTGGTTTTGT 9417 FALSE NA NA AATAAA -5 NA NA NA 2 NA PB.607.37 chr1 - 3510 3 full-splice_match SFPQ ENST00000468598.5 2835 3 -684 9 15 -7 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 CTAATTATCCTTTGGTTTTG 9616 FALSE NA NA AAGAAA -26 NA NA NA 2 NA PB.607.41 chr1 - 2993 10 full-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 746 1 746 -1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTCCATGGTGTTGTCAGTTA 745 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.607.42 chr1 - 2159 6 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 3832 1 1261 -1 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TTCCATGGTGTTGTCAGTTA 34 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.607.55 chr1 - 3074 10 full-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 0 666 0 -666 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 29 6.945243 0.841687 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGTCTTTTCATGTATTCAA -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 29 NA PB.607.57 chr1 - 2591 11 novel_not_in_catalog SFPQ novel 3740 10 NA NA 150 -666 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGTCTTTTCATGTATTCAA 149 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.607.58 chr1 - 2640 10 full-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 434 666 434 -666 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGTCTTTTCATGTATTCAA 433 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.607.59 chr1 - 2442 10 full-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 632 666 632 -666 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGTCTTTTCATGTATTCAA 631 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.607.60 chr1 - 2365 10 full-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 709 666 709 -666 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGTCTTTTCATGTATTCAA 708 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.607.61 chr1 - 2182 10 full-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 892 666 892 -666 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 23 5.508296 0.741017 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGTCTTTTCATGTATTCAA 891 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 23 NA PB.607.62 chr1 - 1750 8 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 2361 666 -210 -666 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 28 6.705751 0.826447 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGTCTTTTCATGTATTCAA 2360 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 28 NA PB.607.63 chr1 - 1678 8 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 2433 666 -138 -666 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGTCTTTTCATGTATTCAA 2432 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.607.64 chr1 - 1478 6 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 3848 666 -1255 -666 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 41 9.819137 0.992073 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AAGTCTTTTCATGTATTCAA 3847 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 41 NA PB.607.67 chr1 - 2953 10 full-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 114 673 114 -673 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACATGAAGTCTTTTCATG 113 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.607.68 chr1 - 2743 11 novel_not_in_catalog SFPQ novel 3740 10 NA NA 15 -673 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACATGAAGTCTTTTCATG 14 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.607.69 chr1 - 2010 9 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 1749 673 -822 -673 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 20 4.789823 0.680319 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACATGAAGTCTTTTCATG 1748 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 20 NA PB.607.70 chr1 - 1915 8 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 2189 673 -382 -673 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 7 1.676438 0.224387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACATGAAGTCTTTTCATG -11 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 7 NA PB.607.71 chr1 - 1578 7 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 2626 673 55 -673 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.352876 0.525417 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACATGAAGTCTTTTCATG 2625 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.607.72 chr1 - 1342 5 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 4075 673 -1028 -673 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 38 9.100663 0.959073 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACATGAAGTCTTTTCATG 4074 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 38 NA PB.607.73 chr1 - 1221 4 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 5108 673 5 -673 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 47 11.256083 1.051387 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACATGAAGTCTTTTCATG 5107 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 47 NA PB.607.74 chr1 - 1072 2 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 6058 673 955 -673 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 36 8.621680 0.935592 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAACATGAAGTCTTTTCATG 6057 FALSE NA NA AAAACA -6 NA NA NA 36 NA PB.607.78 chr1 - 2977 10 novel_not_in_catalog SFPQ novel 3740 10 NA NA 0 -817 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 25.000000 ATGATCTATCCTTTACTTGA -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.607.80 chr1 - 599 2 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 6031 1173 928 -1173 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 AACTTTGCCATTCATGCTTC 6030 FALSE NA NA AAAACA -33 NA NA NA 3 NA PB.607.81 chr1 - 1793 10 full-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 761 1186 761 -1186 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 24 5.747787 0.759501 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATATTGATCTTCAACTTTG 760 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 24 NA PB.607.82 chr1 - 982 6 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 3829 1181 1258 -1181 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 43 10.298119 1.012758 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGATCTTCAACTTTGCCATT 31 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 43 NA PB.607.83 chr1 - 844 5 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 4058 1188 -1045 -1188 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 23 5.508296 0.741017 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 ATAATATTGATCTTCAACTT 4057 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 23 NA PB.607.85 chr1 - 1125 7 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 2571 1181 0 -1181 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.352876 0.525417 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 20.000000 TGATCTTCAACTTTGCCATT 2570 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.607.87 chr1 - 2397 10 full-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 157 1186 157 -1186 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATATTGATCTTCAACTTTG 156 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 9 NA PB.607.89 chr1 - 2224 10 full-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 330 1186 330 -1186 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATATTGATCTTCAACTTTG 329 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.607.90 chr1 - 2041 10 full-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 513 1186 513 -1186 alternative_3end5end FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATATTGATCTTCAACTTTG 512 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.607.91 chr1 - 1632 9 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 1614 1186 -957 -1186 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.873893 0.458471 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATATTGATCTTCAACTTTG -11 TRUE NA NA AAAAAG -41 NA NA NA 12 NA PB.607.93 chr1 - 1315 8 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 2276 1186 -295 -1186 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 6 1.436947 0.157441 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATATTGATCTTCAACTTTG 2275 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 6 NA PB.607.94 chr1 - 690 4 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 5126 1186 23 -1186 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.550332 0.658043 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 AATATTGATCTTCAACTTTG 5125 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.607.95 chr1 - 2553 10 full-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 0 1187 0 -1187 alternative_3end FALSE canonical NA NA NA NA 65 15.566923 1.192203 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAATATTGATCTTCAACTTT -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 65 NA PB.607.96 chr1 - 1567 9 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 1678 1187 -893 -1187 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 11 2.634403 0.420682 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAATATTGATCTTCAACTTT 1677 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 11 NA PB.607.97 chr1 - 1499 9 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 1746 1187 -825 -1187 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.352876 0.525417 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAATATTGATCTTCAACTTT 1745 FALSE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.607.98 chr1 - 1385 8 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 2205 1187 -366 -1187 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 19 4.550332 0.658043 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAATATTGATCTTCAACTTT 5 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 19 NA PB.607.99 chr1 - 1224 8 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 2366 1187 -205 -1187 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 41 9.819137 0.992073 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAATATTGATCTTCAACTTT -13 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 41 NA PB.607.100 chr1 - 1042 6 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 3763 1187 1192 -1187 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 28 6.705751 0.826447 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAATATTGATCTTCAACTTT -35 TRUE NA NA AATACA -40 NA NA NA 28 NA PB.607.101 chr1 - 610 3 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 5926 1187 823 -1187 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 30.000000 TAATATTGATCTTCAACTTT 5925 FALSE NA NA AAGAAA -9 NA NA NA 4 NA PB.607.103 chr1 - 1640 5 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 0 6318 0 -6318 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 5 1.197456 0.078259 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 55.000000 AAAAGACAAATTGGAAAGTG -1 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 5 NA PB.607.105 chr1 - 674 4 incomplete-splice_match SFPQ ENST00000357214.6 3740 10 1615 6361 -956 -6361 internal_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAAACAGCAAAGGGAACAA -10 TRUE NA NA AAAAAG -40 NA NA NA 2 NA PB.609.1 chr1 + 5523 30 full-splice_match ZMYM4 ENST00000314607.11 7366 30 -36 1879 -36 -1879 alternative_3end TRUE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAAGATAGTGAAGTGGT -30 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.609.2 chr1 + 736 3 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000314607.11 7366 30 -25 62846 -25 -17 5prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 14 3.352876 0.525417 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAATGAAATACAAATTCAA -19 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 14 NA PB.609.3 chr1 + 787 4 full-splice_match ZMYM4 ENST00000441447.1 466 4 -338 17 -14 -17 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 12 2.873893 0.458471 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAATGAAATACAAATTCAA -8 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 12 NA PB.609.4 chr1 + 815 5 novel_not_in_catalog ZMYM4 novel 466 4 NA NA -12 -21 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA TRUE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AATGAAAATGAAATACAAAT -6 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 2 NA PB.609.6 chr1 + 707 4 full-splice_match ZMYM4 ENST00000441447.1 466 4 -240 -1 84 1 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 70.000000 AAAATAAGTTAAAAAAAGAC 1 TRUE NA NA AATACA -6 NA NA NA 2 NA PB.609.8 chr1 + 5290 31 novel_in_catalog ZMYM4 novel 7366 30 NA NA -66 -1880 combination_of_known_junctions FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 TAAAAAAGATAGTGAAGTGG 0 TRUE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.609.9 chr1 + 515 4 full-splice_match ZMYM4 ENST00000441447.1 466 4 -66 17 -66 -17 alternative_5end FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 65.000000 AAAATGAAATACAAATTCAA 0 TRUE NA NA NA NA NA NA NA 3 NA PB.609.10 chr1 + 5165 30 novel_not_in_catalog ZMYM4 novel 7366 30 NA NA 7 -1879 at_least_one_novel_splicesite FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAAGATAGTGAAGTGGT 11 TRUE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.609.24 chr1 + 4054 24 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000314607.11 7366 30 101832 1880 8824 -1880 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 TAAAAAAGATAGTGAAGTGG 172 FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 2 NA PB.609.26 chr1 + 5628 23 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000314607.11 7366 30 112649 120 -11322 -120 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 ATTTGATGGGTGAGTTCTTC NA FALSE NA NA AATAAA -14 NA NA NA 2 NA PB.609.27 chr1 + 3738 22 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000314607.11 7366 30 112892 1879 -11079 -1879 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAAGATAGTGAAGTGGT NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.609.28 chr1 + 5459 22 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000314607.11 7366 30 112934 116 -11037 -116 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GATGGGTGAGTTCTTCTTCT NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 3 NA PB.609.29 chr1 + 3500 21 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000314607.11 7366 30 116813 1879 -7158 -1879 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAAGATAGTGAAGTGGT NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.609.30 chr1 + 3353 20 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000314607.11 7366 30 117441 1879 -6530 -1879 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAAGATAGTGAAGTGGT NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.609.31 chr1 + 3272 19 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000314607.11 7366 30 118335 1879 -5636 -1879 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAAGATAGTGAAGTGGT NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.609.33 chr1 + 2715 16 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000314607.11 7366 30 121237 1879 -2734 -1879 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAAGATAGTGAAGTGGT NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.609.35 chr1 + 1925 10 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000457946.1 6003 24 36733 1879 5758 -1879 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 3 0.718473 -0.143589 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 AAAAAAGATAGTGAAGTGGT 4244 FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 3 NA PB.609.38 chr1 + 2805 7 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000457946.1 6003 24 43407 606 268 -606 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 35.000000 AAGTGTAATAGTCCCCACTA NA FALSE NA NA AATAAA -16 NA NA NA 2 NA PB.609.39 chr1 + 1500 7 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000457946.1 6003 24 43438 1880 299 -1880 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 9 2.155420 0.333532 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 50.000000 TAAAAAAGATAGTGAAGTGG NA FALSE NA NA AATAAA -15 NA NA NA 9 NA PB.609.41 chr1 + 3118 5 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000457946.1 6003 24 46301 116 3162 -116 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 4 0.957965 -0.018651 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 10.000000 GATGGGTGAGTTCTTCTTCT NA FALSE NA NA AATAAA -18 NA NA NA 4 NA PB.609.43 chr1 + 2918 4 incomplete-splice_match ZMYM4 ENST00000457946.1 6003 24 52308 121 9169 -121 3prime_fragment FALSE canonical NA NA NA NA 2 0.478982 -0.319681 NA NA FALSE NA NA NA C non_coding NA NA NA NA NA NA NA 15.000000 TATTTGATGGGTGAGTTCTT NA FALSE NA NA